Mercurial > repos > richjp > cloudmap_zebrafish_hom_mapping
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| author | richjp |
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| date | Mon, 13 Oct 2014 08:42:19 -0400 |
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| files | CloudMapzebrafishhomozygositymapping/CloudMapzebrafishhomozygositymapping.py CloudMapzebrafishhomozygositymapping/CloudMapzebrafishhomozygositymapping.xml CloudMapzebrafishhomozygositymapping/test-data/CloudMapzebrafishhomozygositymapping_test1_input.xls CloudMapzebrafishhomozygositymapping/test-data/CloudMapzebrafishhomozygositymapping_test1_output.html CloudMapzebrafishhomozygositymapping/test-data/test1_out.log CloudMapzebrafishhomozygositymapping/tool_dependencies.xml cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.py cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.xml cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/cloudmap_zf_hom_mapping_test1_input.xls cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/cloudmap_zf_hom_mapping_test1_output.html cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/test1_out.log cloudmap_zf_hom_mapping/tool_dependencies.xml |
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--- a/CloudMapzebrafishhomozygositymapping/CloudMapzebrafishhomozygositymapping.py Mon Oct 13 08:26:32 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,742 +0,0 @@ -# CloudMapzebrafishhomozygositymapping/CloudMapzebrafishhomozygositymapping.py - a self annotated version of rgToolFactory.py generated by running rgToolFactory.py -# to make a new Galaxy tool called CloudMapzebrafishhomozygositymapping -# User r.poole@ucl.ac.uk at 13/10/2014 13:24:10 -# rgToolFactory.py -# see https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/wiki/Home -# -# copyright ross lazarus (ross stop lazarus at gmail stop com) May 2012 -# -# all rights reserved -# Licensed under the LGPL -# suggestions for improvement and bug fixes welcome at https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/wiki/Home -# -# August 2014 -# merged John Chilton's citation addition and ideas from Marius van den Beek to enable arbitrary -# data types for input and output - thanks! -# -# march 2014 -# had to remove dependencies because cross toolshed dependencies are not possible - can't pre-specify a toolshed url for graphicsmagick and ghostscript -# grrrrr - night before a demo -# added dependencies to a tool_dependencies.xml if html page generated so generated tool is properly portable -# -# added ghostscript and graphicsmagick as dependencies -# fixed a wierd problem where gs was trying to use the new_files_path from universe (database/tmp) as ./database/tmp -# errors ensued -# -# august 2013 -# found a problem with GS if $TMP or $TEMP missing - now inject /tmp and warn -# -# july 2013 -# added ability to combine images and individual log files into html output -# just make sure there's a log file foo.log and it will be output -# together with all images named like "foo_*.pdf -# otherwise old format for html -# -# January 2013 -# problem pointed out by Carlos Borroto -# added escaping for <>$ - thought I did that ages ago... -# -# August 11 2012 -# changed to use shell=False and cl as a sequence - -# This is a Galaxy tool factory for simple scripts in python, R or whatever ails ye. -# It also serves as the wrapper for the new tool. -# -# you paste and run your script -# Only works for simple scripts that read one input from the history. -# Optionally can write one new history dataset, -# and optionally collect any number of outputs into links on an autogenerated HTML page. - -# DO NOT install on a public or important site - please. - -# installed generated tools are fine if the script is safe. -# They just run normally and their user cannot do anything unusually insecure -# but please, practice safe toolshed. -# Read the fucking code before you install any tool -# especially this one - -# After you get the script working on some test data, you can -# optionally generate a toolshed compatible gzip file -# containing your script safely wrapped as an ordinary Galaxy script in your local toolshed for -# safe and largely automated installation in a production Galaxy. - -# If you opt for an HTML output, you get all the script outputs arranged -# as a single Html history item - all output files are linked, thumbnails for all the pdfs. -# Ugly but really inexpensive. -# -# Patches appreciated please. -# -# -# long route to June 2012 product -# Behold the awesome power of Galaxy and the toolshed with the tool factory to bind them -# derived from an integrated script model -# called rgBaseScriptWrapper.py -# Note to the unwary: -# This tool allows arbitrary scripting on your Galaxy as the Galaxy user -# There is nothing stopping a malicious user doing whatever they choose -# Extremely dangerous!! -# Totally insecure. So, trusted users only -# -# preferred model is a developer using their throw away workstation instance - ie a private site. -# no real risk. The universe_wsgi.ini admin_users string is checked - only admin users are permitted to run this tool. -# - -import sys -import shutil -import subprocess -import os -import time -import tempfile -import optparse -import tarfile -import re -import shutil -import math - -progname = os.path.split(sys.argv[0])[1] -myversion = 'V001.1 March 2014' -verbose = False -debug = False -toolFactoryURL = 'https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory' - -# if we do html we need these dependencies specified in a tool_dependencies.xml file and referred to in the generated -# tool xml -toolhtmldepskel = """<?xml version="1.0"?> -<tool_dependency> - <package name="ghostscript" version="9.10"> - <repository name="package_ghostscript_9_10" owner="devteam" prior_installation_required="True" /> - </package> - <package name="graphicsmagick" version="1.3.18"> - <repository name="package_graphicsmagick_1_3" owner="iuc" prior_installation_required="True" /> - </package> - <readme> - %s - </readme> -</tool_dependency> -""" - -protorequirements = """<requirements> - <requirement type="package" version="9.10">ghostscript</requirement> - <requirement type="package" version="1.3.18">graphicsmagick</requirement> - </requirements>""" - -def timenow(): - """return current time as a string - """ - return time.strftime('%d/%m/%Y %H:%M:%S', time.localtime(time.time())) - -html_escape_table = { - "&": "&", - ">": ">", - "<": "<", - "$": "\$" - } - -def html_escape(text): - """Produce entities within text.""" - return "".join(html_escape_table.get(c,c) for c in text) - -def cmd_exists(cmd): - return subprocess.call("type " + cmd, shell=True, - stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE) == 0 - - -def parse_citations(citations_text): - """ - """ - citations = [c for c in citations_text.split("**ENTRY**") if c.strip()] - citation_tuples = [] - for citation in citations: - if citation.startswith("doi"): - citation_tuples.append( ("doi", citation[len("doi"):].strip() ) ) - else: - citation_tuples.append( ("bibtex", citation[len("bibtex"):].strip() ) ) - return citation_tuples - - -class ScriptRunner: - """class is a wrapper for an arbitrary script - """ - - def __init__(self,opts=None,treatbashSpecial=True): - """ - cleanup inputs, setup some outputs - - """ - self.useGM = cmd_exists('gm') - self.useIM = cmd_exists('convert') - self.useGS = cmd_exists('gs') - self.temp_warned = False # we want only one warning if $TMP not set - self.treatbashSpecial = treatbashSpecial - if opts.output_dir: # simplify for the tool tarball - os.chdir(opts.output_dir) - self.thumbformat = 'png' - self.opts = opts - self.toolname = re.sub('[^a-zA-Z0-9_]+', '', opts.tool_name) # a sanitizer now does this but.. - self.toolid = self.toolname - self.myname = sys.argv[0] # get our name because we write ourselves out as a tool later - self.pyfile = self.myname # crude but efficient - the cruft won't hurt much - self.xmlfile = '%s.xml' % self.toolname - s = open(self.opts.script_path,'r').readlines() - s = [x.rstrip() for x in s] # remove pesky dos line endings if needed - self.script = '\n'.join(s) - fhandle,self.sfile = tempfile.mkstemp(prefix=self.toolname,suffix=".%s" % (opts.interpreter)) - tscript = open(self.sfile,'w') # use self.sfile as script source for Popen - tscript.write(self.script) - tscript.close() - self.indentedScript = '\n'.join([' %s' % html_escape(x) for x in s]) # for restructured text in help - self.escapedScript = '\n'.join([html_escape(x) for x in s]) - self.elog = os.path.join(self.opts.output_dir,"%s_error.log" % self.toolname) - if opts.output_dir: # may not want these complexities - self.tlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"%s_runner.log" % self.toolname) - art = '%s.%s' % (self.toolname,opts.interpreter) - artpath = os.path.join(self.opts.output_dir,art) # need full path - artifact = open(artpath,'w') # use self.sfile as script source for Popen - artifact.write(self.script) - artifact.close() - self.cl = [] - self.html = [] - a = self.cl.append - a(opts.interpreter) - if self.treatbashSpecial and opts.interpreter in ['bash','sh']: - a(self.sfile) - else: - a('-') # stdin - a(opts.input_tab) - a(opts.output_tab) - self.outputFormat = self.opts.output_format - self.inputFormats = self.opts.input_formats - self.test1Input = '%s_test1_input.xls' % self.toolname - self.test1Output = '%s_test1_output.xls' % self.toolname - self.test1HTML = '%s_test1_output.html' % self.toolname - - def makeXML(self): - """ - Create a Galaxy xml tool wrapper for the new script as a string to write out - fixme - use templating or something less fugly than this example of what we produce - - <tool id="reverse" name="reverse" version="0.01"> - <description>a tabular file</description> - <command interpreter="python"> - reverse.py --script_path "$runMe" --interpreter "python" - --tool_name "reverse" --input_tab "$input1" --output_tab "$tab_file" - </command> - <inputs> - <param name="input1" type="data" format="tabular" label="Select a suitable input file from your history"/><param name="job_name" type="text" label="Supply a name for the outputs to remind you what they contain" value="reverse"/> - - </inputs> - <outputs> - <data format="tabular" name="tab_file" label="${job_name}"/> - - </outputs> - <help> - -**What it Does** - -Reverse the columns in a tabular file - - </help> - <configfiles> - <configfile name="runMe"> - -# reverse order of columns in a tabular file -import sys -inp = sys.argv[1] -outp = sys.argv[2] -i = open(inp,'r') -o = open(outp,'w') -for row in i: - rs = row.rstrip().split('\t') - rs.reverse() - o.write('\t'.join(rs)) - o.write('\n') -i.close() -o.close() - - - </configfile> - </configfiles> - </tool> - - """ - newXML="""<tool id="%(toolid)s" name="%(toolname)s" version="%(tool_version)s"> -%(tooldesc)s -%(requirements)s -<command interpreter="python"> -%(command)s -</command> -<inputs> -%(inputs)s -</inputs> -<outputs> -%(outputs)s -</outputs> -<configfiles> -<configfile name="runMe"> -%(script)s -</configfile> -</configfiles> - -%(tooltests)s - -<help> - -%(help)s - -</help> -<citations> - %(citations)s - <citation type="doi">10.1093/bioinformatics/bts573</citation> -</citations> -</tool>""" # needs a dict with toolname, toolid, interpreter, scriptname, command, inputs as a multi line string ready to write, outputs ditto, help ditto - - newCommand=""" - %(toolname)s.py --script_path "$runMe" --interpreter "%(interpreter)s" - --tool_name "%(toolname)s" %(command_inputs)s %(command_outputs)s """ - # may NOT be an input or htmlout - appended later - tooltestsTabOnly = """ - <tests> - <test> - <param name="input1" value="%(test1Input)s" ftype="%(inputFormats)s"/> - <param name="job_name" value="test1"/> - <param name="runMe" value="$runMe"/> - <output name="tab_file" file="%(test1Output)s" ftype="%(outputFormat)s"/> - </test> - </tests> - """ - tooltestsHTMLOnly = """ - <tests> - <test> - <param name="input1" value="%(test1Input)s" ftype="%(inputFormats)s"/> - <param name="job_name" value="test1"/> - <param name="runMe" value="$runMe"/> - <output name="html_file" file="%(test1HTML)s" ftype="html" lines_diff="5"/> - </test> - </tests> - """ - tooltestsBoth = """<tests> - <test> - <param name="input1" value="%(test1Input)s" ftype="%(inputFormats)s"/> - <param name="job_name" value="test1"/> - <param name="runMe" value="$runMe"/> - <output name="tab_file" file="%(test1Output)s" ftype="%(outputFormat)s" /> - <output name="html_file" file="%(test1HTML)s" ftype="html" lines_diff="10"/> - </test> - </tests> - """ - xdict = {} - xdict['outputFormat'] = self.outputFormat - xdict['inputFormats'] = self.inputFormats - xdict['requirements'] = '' - if self.opts.make_HTML: - if self.opts.include_dependencies == "yes": - xdict['requirements'] = protorequirements - xdict['tool_version'] = self.opts.tool_version - xdict['test1Input'] = self.test1Input - xdict['test1HTML'] = self.test1HTML - xdict['test1Output'] = self.test1Output - if self.opts.make_HTML and self.opts.output_tab <> 'None': - xdict['tooltests'] = tooltestsBoth % xdict - elif self.opts.make_HTML: - xdict['tooltests'] = tooltestsHTMLOnly % xdict - else: - xdict['tooltests'] = tooltestsTabOnly % xdict - xdict['script'] = self.escapedScript - # configfile is least painful way to embed script to avoid external dependencies - # but requires escaping of <, > and $ to avoid Mako parsing - if self.opts.help_text: - helptext = open(self.opts.help_text,'r').readlines() - helptext = [html_escape(x) for x in helptext] # must html escape here too - thanks to Marius van den Beek - xdict['help'] = ''.join([x for x in helptext]) - else: - xdict['help'] = 'Please ask the tool author (%s) for help as none was supplied at tool generation\n' % (self.opts.user_email) - if self.opts.citations: - citationstext = open(self.opts.citations,'r').read() - citation_tuples = parse_citations(citationstext) - citations_xml = "" - for citation_type, citation_content in citation_tuples: - citation_xml = """<citation type="%s">%s</citation>""" % (citation_type, html_escape(citation_content)) - citations_xml += citation_xml - xdict['citations'] = citations_xml - else: - xdict['citations'] = "" - coda = ['**Script**','Pressing execute will run the following code over your input file and generate some outputs in your history::'] - coda.append('\n') - coda.append(self.indentedScript) - coda.append('\n**Attribution**\nThis Galaxy tool was created by %s at %s\nusing the Galaxy Tool Factory.\n' % (self.opts.user_email,timenow())) - coda.append('See %s for details of that project' % (toolFactoryURL)) - coda.append('Please cite: Creating re-usable tools from scripts: The Galaxy Tool Factory. Ross Lazarus; Antony Kaspi; Mark Ziemann; The Galaxy Team. ') - coda.append('Bioinformatics 2012; doi: 10.1093/bioinformatics/bts573\n') - xdict['help'] = '%s\n%s' % (xdict['help'],'\n'.join(coda)) - if self.opts.tool_desc: - xdict['tooldesc'] = '<description>%s</description>' % self.opts.tool_desc - else: - xdict['tooldesc'] = '' - xdict['command_outputs'] = '' - xdict['outputs'] = '' - if self.opts.input_tab <> 'None': - xdict['command_inputs'] = '--input_tab "$input1" ' # the space may matter a lot if we append something - xdict['inputs'] = '<param name="input1" type="data" format="%s" label="Select a suitable input file from your history"/> \n' % self.inputFormats - else: - xdict['command_inputs'] = '' # assume no input - eg a random data generator - xdict['inputs'] = '' - xdict['inputs'] += '<param name="job_name" type="text" label="Supply a name for the outputs to remind you what they contain" value="%s"/> \n' % self.toolname - xdict['toolname'] = self.toolname - xdict['toolid'] = self.toolid - xdict['interpreter'] = self.opts.interpreter - xdict['scriptname'] = self.sfile - if self.opts.make_HTML: - xdict['command_outputs'] += ' --output_dir "$html_file.files_path" --output_html "$html_file" --make_HTML "yes"' - xdict['outputs'] += ' <data format="html" name="html_file" label="${job_name}.html"/>\n' - else: - xdict['command_outputs'] += ' --output_dir "./"' - if self.opts.output_tab <> 'None': - xdict['command_outputs'] += ' --output_tab "$tab_file"' - xdict['outputs'] += ' <data format="%s" name="tab_file" label="${job_name}"/>\n' % self.outputFormat - xdict['command'] = newCommand % xdict - xmls = newXML % xdict - xf = open(self.xmlfile,'w') - xf.write(xmls) - xf.write('\n') - xf.close() - # ready for the tarball - - - def makeTooltar(self): - """ - a tool is a gz tarball with eg - /toolname/tool.xml /toolname/tool.py /toolname/test-data/test1_in.foo ... - """ - retval = self.run() - if retval: - print >> sys.stderr,'## Run failed. Cannot build yet. Please fix and retry' - sys.exit(1) - tdir = self.toolname - os.mkdir(tdir) - self.makeXML() - if self.opts.make_HTML: - if self.opts.help_text: - hlp = open(self.opts.help_text,'r').read() - else: - hlp = 'Please ask the tool author for help as none was supplied at tool generation\n' - if self.opts.include_dependencies: - tooldepcontent = toolhtmldepskel % hlp - depf = open(os.path.join(tdir,'tool_dependencies.xml'),'w') - depf.write(tooldepcontent) - depf.write('\n') - depf.close() - if self.opts.input_tab <> 'None': # no reproducible test otherwise? TODO: maybe.. - testdir = os.path.join(tdir,'test-data') - os.mkdir(testdir) # make tests directory - shutil.copyfile(self.opts.input_tab,os.path.join(testdir,self.test1Input)) - if self.opts.output_tab <> 'None': - shutil.copyfile(self.opts.output_tab,os.path.join(testdir,self.test1Output)) - if self.opts.make_HTML: - shutil.copyfile(self.opts.output_html,os.path.join(testdir,self.test1HTML)) - if self.opts.output_dir: - shutil.copyfile(self.tlog,os.path.join(testdir,'test1_out.log')) - outpif = '%s.py' % self.toolname # new name - outpiname = os.path.join(tdir,outpif) # path for the tool tarball - pyin = os.path.basename(self.pyfile) # our name - we rewrite ourselves (TM) - notes = ['# %s - a self annotated version of %s generated by running %s\n' % (outpiname,pyin,pyin),] - notes.append('# to make a new Galaxy tool called %s\n' % self.toolname) - notes.append('# User %s at %s\n' % (self.opts.user_email,timenow())) - pi = open(self.pyfile,'r').readlines() # our code becomes new tool wrapper (!) - first Galaxy worm - notes += pi - outpi = open(outpiname,'w') - outpi.write(''.join(notes)) - outpi.write('\n') - outpi.close() - stname = os.path.join(tdir,self.sfile) - if not os.path.exists(stname): - shutil.copyfile(self.sfile, stname) - xtname = os.path.join(tdir,self.xmlfile) - if not os.path.exists(xtname): - shutil.copyfile(self.xmlfile,xtname) - tarpath = "%s.gz" % self.toolname - tar = tarfile.open(tarpath, "w:gz") - tar.add(tdir,arcname=self.toolname) - tar.close() - shutil.copyfile(tarpath,self.opts.new_tool) - shutil.rmtree(tdir) - ## TODO: replace with optional direct upload to local toolshed? - return retval - - - def compressPDF(self,inpdf=None,thumbformat='png'): - """need absolute path to pdf - note that GS gets confoozled if no $TMP or $TEMP - so we set it - """ - assert os.path.isfile(inpdf), "## Input %s supplied to %s compressPDF not found" % (inpdf,self.myName) - hlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"compress_%s.txt" % os.path.basename(inpdf)) - sto = open(hlog,'a') - our_env = os.environ.copy() - our_tmp = our_env.get('TMP',None) - if not our_tmp: - our_tmp = our_env.get('TEMP',None) - if not (our_tmp and os.path.exists(our_tmp)): - newtmp = os.path.join(self.opts.output_dir,'tmp') - try: - os.mkdir(newtmp) - except: - sto.write('## WARNING - cannot make %s - it may exist or permissions need fixing\n' % newtmp) - our_env['TEMP'] = newtmp - if not self.temp_warned: - sto.write('## WARNING - no $TMP or $TEMP!!! Please fix - using %s temporarily\n' % newtmp) - self.temp_warned = True - outpdf = '%s_compressed' % inpdf - cl = ["gs", "-sDEVICE=pdfwrite", "-dNOPAUSE", "-dUseCIEColor", "-dBATCH","-dPDFSETTINGS=/printer", "-sOutputFile=%s" % outpdf,inpdf] - x = subprocess.Popen(cl,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir,env=our_env) - retval1 = x.wait() - sto.close() - if retval1 == 0: - os.unlink(inpdf) - shutil.move(outpdf,inpdf) - os.unlink(hlog) - hlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"thumbnail_%s.txt" % os.path.basename(inpdf)) - sto = open(hlog,'w') - outpng = '%s.%s' % (os.path.splitext(inpdf)[0],thumbformat) - if self.useGM: - cl2 = ['gm', 'convert', inpdf, outpng] - else: # assume imagemagick - cl2 = ['convert', inpdf, outpng] - x = subprocess.Popen(cl2,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir,env=our_env) - retval2 = x.wait() - sto.close() - if retval2 == 0: - os.unlink(hlog) - retval = retval1 or retval2 - return retval - - - def getfSize(self,fpath,outpath): - """ - format a nice file size string - """ - size = '' - fp = os.path.join(outpath,fpath) - if os.path.isfile(fp): - size = '0 B' - n = float(os.path.getsize(fp)) - if n > 2**20: - size = '%1.1f MB' % (n/2**20) - elif n > 2**10: - size = '%1.1f KB' % (n/2**10) - elif n > 0: - size = '%d B' % (int(n)) - return size - - def makeHtml(self): - """ Create an HTML file content to list all the artifacts found in the output_dir - """ - - galhtmlprefix = """<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> - <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en"> - <head> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" /> - <meta name="generator" content="Galaxy %s tool output - see http://g2.trac.bx.psu.edu/" /> - <title></title> - <link rel="stylesheet" href="/static/style/base.css" type="text/css" /> - </head> - <body> - <div class="toolFormBody"> - """ - galhtmlattr = """<hr/><div class="infomessage">This tool (%s) was generated by the <a href="https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/overview">Galaxy Tool Factory</a></div><br/>""" - galhtmlpostfix = """</div></body></html>\n""" - - flist = os.listdir(self.opts.output_dir) - flist = [x for x in flist if x <> 'Rplots.pdf'] - flist.sort() - html = [] - html.append(galhtmlprefix % progname) - html.append('<div class="infomessage">Galaxy Tool "%s" run at %s</div><br/>' % (self.toolname,timenow())) - fhtml = [] - if len(flist) > 0: - logfiles = [x for x in flist if x.lower().endswith('.log')] # log file names determine sections - logfiles.sort() - logfiles = [x for x in logfiles if os.path.abspath(x) <> os.path.abspath(self.tlog)] - logfiles.append(os.path.abspath(self.tlog)) # make it the last one - pdflist = [] - npdf = len([x for x in flist if os.path.splitext(x)[-1].lower() == '.pdf']) - for rownum,fname in enumerate(flist): - dname,e = os.path.splitext(fname) - sfsize = self.getfSize(fname,self.opts.output_dir) - if e.lower() == '.pdf' : # compress and make a thumbnail - thumb = '%s.%s' % (dname,self.thumbformat) - pdff = os.path.join(self.opts.output_dir,fname) - retval = self.compressPDF(inpdf=pdff,thumbformat=self.thumbformat) - if retval == 0: - pdflist.append((fname,thumb)) - else: - pdflist.append((fname,fname)) - if (rownum+1) % 2 == 0: - fhtml.append('<tr class="odd_row"><td><a href="%s">%s</a></td><td>%s</td></tr>' % (fname,fname,sfsize)) - else: - fhtml.append('<tr><td><a href="%s">%s</a></td><td>%s</td></tr>' % (fname,fname,sfsize)) - for logfname in logfiles: # expect at least tlog - if more - if os.path.abspath(logfname) == os.path.abspath(self.tlog): # handled later - sectionname = 'All tool run' - if (len(logfiles) > 1): - sectionname = 'Other' - ourpdfs = pdflist - else: - realname = os.path.basename(logfname) - sectionname = os.path.splitext(realname)[0].split('_')[0] # break in case _ added to log - ourpdfs = [x for x in pdflist if os.path.basename(x[0]).split('_')[0] == sectionname] - pdflist = [x for x in pdflist if os.path.basename(x[0]).split('_')[0] <> sectionname] # remove - nacross = 1 - npdf = len(ourpdfs) - - if npdf > 0: - nacross = math.sqrt(npdf) ## int(round(math.log(npdf,2))) - if int(nacross)**2 != npdf: - nacross += 1 - nacross = int(nacross) - width = min(400,int(1200/nacross)) - html.append('<div class="toolFormTitle">%s images and outputs</div>' % sectionname) - html.append('(Click on a thumbnail image to download the corresponding original PDF image)<br/>') - ntogo = nacross # counter for table row padding with empty cells - html.append('<div><table class="simple" cellpadding="2" cellspacing="2">\n<tr>') - for i,paths in enumerate(ourpdfs): - fname,thumb = paths - s= """<td><a href="%s"><img src="%s" title="Click to download a PDF of %s" hspace="5" width="%d" - alt="Image called %s"/></a></td>\n""" % (fname,thumb,fname,width,fname) - if ((i+1) % nacross == 0): - s += '</tr>\n' - ntogo = 0 - if i < (npdf - 1): # more to come - s += '<tr>' - ntogo = nacross - else: - ntogo -= 1 - html.append(s) - if html[-1].strip().endswith('</tr>'): - html.append('</table></div>\n') - else: - if ntogo > 0: # pad - html.append('<td> </td>'*ntogo) - html.append('</tr></table></div>\n') - logt = open(logfname,'r').readlines() - logtext = [x for x in logt if x.strip() > ''] - html.append('<div class="toolFormTitle">%s log output</div>' % sectionname) - if len(logtext) > 1: - html.append('\n<pre>\n') - html += logtext - html.append('\n</pre>\n') - else: - html.append('%s is empty<br/>' % logfname) - if len(fhtml) > 0: - fhtml.insert(0,'<div><table class="colored" cellpadding="3" cellspacing="3"><tr><th>Output File Name (click to view)</th><th>Size</th></tr>\n') - fhtml.append('</table></div><br/>') - html.append('<div class="toolFormTitle">All output files available for downloading</div>\n') - html += fhtml # add all non-pdf files to the end of the display - else: - html.append('<div class="warningmessagelarge">### Error - %s returned no files - please confirm that parameters are sane</div>' % self.opts.interpreter) - html.append(galhtmlpostfix) - htmlf = file(self.opts.output_html,'w') - htmlf.write('\n'.join(html)) - htmlf.write('\n') - htmlf.close() - self.html = html - - - def run(self): - """ - scripts must be small enough not to fill the pipe! - """ - if self.treatbashSpecial and self.opts.interpreter in ['bash','sh']: - retval = self.runBash() - else: - if self.opts.output_dir: - ste = open(self.elog,'w') - sto = open(self.tlog,'w') - sto.write('## Toolfactory generated command line = %s\n' % ' '.join(self.cl)) - sto.flush() - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdout=sto,stderr=ste,stdin=subprocess.PIPE,cwd=self.opts.output_dir) - else: - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdin=subprocess.PIPE) - p.stdin.write(self.script) - p.stdin.close() - retval = p.wait() - if self.opts.output_dir: - sto.close() - ste.close() - err = open(self.elog,'r').readlines() - if retval <> 0 and err: # problem - print >> sys.stderr,err - if self.opts.make_HTML: - self.makeHtml() - return retval - - def runBash(self): - """ - cannot use - for bash so use self.sfile - """ - if self.opts.output_dir: - s = '## Toolfactory generated command line = %s\n' % ' '.join(self.cl) - sto = open(self.tlog,'w') - sto.write(s) - sto.flush() - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir) - else: - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False) - retval = p.wait() - if self.opts.output_dir: - sto.close() - if self.opts.make_HTML: - self.makeHtml() - return retval - - -def main(): - u = """ - This is a Galaxy wrapper. It expects to be called by a special purpose tool.xml as: - <command interpreter="python">rgBaseScriptWrapper.py --script_path "$scriptPath" --tool_name "foo" --interpreter "Rscript" - </command> - """ - op = optparse.OptionParser() - a = op.add_option - a('--script_path',default=None) - a('--tool_name',default=None) - a('--interpreter',default=None) - a('--output_dir',default='./') - a('--output_html',default=None) - a('--input_tab',default="None") - a('--input_formats',default="tabular,text") - a('--output_tab',default="None") - a('--output_format',default="tabular") - a('--user_email',default='Unknown') - a('--bad_user',default=None) - a('--make_Tool',default=None) - a('--make_HTML',default=None) - a('--help_text',default=None) - a('--citations',default=None) - a('--tool_desc',default=None) - a('--new_tool',default=None) - a('--tool_version',default=None) - a('--include_dependencies',default=None) - opts, args = op.parse_args() - assert not opts.bad_user,'UNAUTHORISED: %s is NOT authorized to use this tool until Galaxy admin adds %s to admin_users in universe_wsgi.ini' % (opts.bad_user,opts.bad_user) - assert opts.tool_name,'## Tool Factory expects a tool name - eg --tool_name=DESeq' - assert opts.interpreter,'## Tool Factory wrapper expects an interpreter - eg --interpreter=Rscript' - assert os.path.isfile(opts.script_path),'## Tool Factory wrapper expects a script path - eg --script_path=foo.R' - if opts.output_dir: - try: - os.makedirs(opts.output_dir) - except: - pass - r = ScriptRunner(opts) - if opts.make_Tool: - retcode = r.makeTooltar() - else: - retcode = r.run() - os.unlink(r.sfile) - if retcode: - sys.exit(retcode) # indicate failure to job runner - - -if __name__ == "__main__": - main() - - -
--- a/CloudMapzebrafishhomozygositymapping/CloudMapzebrafishhomozygositymapping.xml Mon Oct 13 08:26:32 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,1301 +0,0 @@ -<tool id="CloudMapzebrafishhomozygositymapping" name="CloudMapzebrafishhomozygositymapping" version="0.01"> -<description>Map a zebrafish mutant using bulk sergeant homozygosity mapping</description> -<requirements> - <requirement type="package" version="9.10">ghostscript</requirement> - <requirement type="package" version="1.3.18">graphicsmagick</requirement> - </requirements> -<command interpreter="python"> - - CloudMapzebrafishhomozygositymapping.py --script_path "$runMe" --interpreter "Rscript" - --tool_name "CloudMapzebrafishhomozygositymapping" --input_tab "$input1" --output_dir "$html_file.files_path" --output_html "$html_file" --make_HTML "yes" -</command> -<inputs> -<param name="input1" type="data" format="vcf" label="Select a suitable input file from your history"/> -<param name="job_name" type="text" label="Supply a name for the outputs to remind you what they contain" value="CloudMapzebrafishhomozygositymapping"/> - -</inputs> -<outputs> - <data format="html" name="html_file" label="${job_name}.html"/> - -</outputs> -<configfiles> -<configfile name="runMe"> -#homozygosity-mapping script -#input file: Q200 variants no wildtype -ourargs = commandArgs(TRUE) -inf = ourargs[1] -outf = ourargs[2] -Q200var = read.table(inf) - - -het <- Q200var[grep("AF=0.5",Q200var\$V8), ] -hom <- Q200var[grep("AF=1.0",Q200var\$V8), ] - -get_hom1 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr1") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr1") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom2 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr2") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr2") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom3 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr3") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr3") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom4 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr4") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr4") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom5 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr5") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr5") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom6 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr6") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr6") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom7 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr7") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr7") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom8 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr8") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr8") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom9 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr9") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr9") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom10 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr10") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr10") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom11 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr11") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr11") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom12 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr12") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr12") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom13 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr13") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr13") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom14 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr14") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr14") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom15 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr15") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr15") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom16 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr16") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr16") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom17 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr17") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr17") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom18 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr18") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr18") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom19 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr19") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr19") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom20 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr20") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr20") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom21 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr21") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr21") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom22 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr22") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr22") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom23 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr23") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr23") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom24 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr24") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr24") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom25 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr25") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr25") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -h1 <- get_hom1(hom,het) -h2 <- get_hom2(hom,het) -h3 <- get_hom3(hom,het) -h4 <- get_hom4(hom,het) -h5 <- get_hom5(hom,het) -h6 <- get_hom6(hom,het) -h7 <- get_hom7(hom,het) -h8 <- get_hom8(hom,het) -h9 <- get_hom9(hom,het) -h10 <- get_hom10(hom,het) -h11 <- get_hom11(hom,het) -h12 <- get_hom12(hom,het) -h13 <- get_hom13(hom,het) -h14 <- get_hom14(hom,het) -h15 <- get_hom15(hom,het) -h16 <- get_hom16(hom,het) -h17 <- get_hom17(hom,het) -h18 <- get_hom18(hom,het) -h19 <- get_hom19(hom,het) -h20 <- get_hom20(hom,het) -h21 <- get_hom21(hom,het) -h22 <- get_hom22(hom,het) -h23 <- get_hom23(hom,het) -h24 <- get_hom24(hom,het) -h25 <- get_hom25(hom,het) - - - -#Extracting maxima (homozygosity-mapping) - -zero_crossings_maxima <- function(x,y){ - - dy <- diff(y) - xn <- x[2:length(x)] - - n <- length(dy) - t1 <- dy[1:n-1]; - t2 <- dy[2:n]; - tt <- t1*t2 - ind <- which(tt < 0) - - # print out the maxima - d2y <- diff(dy) - vind <- c() - vy <- c() - vxn <- c() - - xnn <- x[3:length(x)] - for(i in 1:length(ind)){ - ### cat( ind[i], d2y[ind[i]], '\n') - if( d2y[ind[i]] < 0 ){ - ### cat(ind[i], y[ind[i]], xn[ind[i]], "\n" ) - vind <- c(vind, ind[i]) - vy <- c(vy, y[ind[i]]) - vxn <- c(vxn, xn[ind[i]]) - } - } - - maxima <- data.frame(ind=vind, y=vy, x=vxn) - maxima <- maxima[order(maxima\$y),] - - #print( maxima ) - - results <- list() - results\$dy <- dy - results\$xn <- xn - results\$maxima <- maxima[ order(maxima\$y, decreasing=T), ] - - return(results) -} - -res1 <- zero_crossings_maxima(h1\$x,h1\$ratio) -res2 <- zero_crossings_maxima(h2\$x,h2\$ratio) -res3 <- zero_crossings_maxima(h3\$x,h3\$ratio) -res4 <- zero_crossings_maxima(h4\$x,h4\$ratio) -res5 <- zero_crossings_maxima(h5\$x,h5\$ratio) -res6 <- zero_crossings_maxima(h6\$x,h6\$ratio) -res7 <- zero_crossings_maxima(h7\$x,h7\$ratio) -res8 <- zero_crossings_maxima(h8\$x,h8\$ratio) -res9 <- zero_crossings_maxima(h9\$x,h9\$ratio) -res10 <- zero_crossings_maxima(h10\$x,h10\$ratio) -res11 <- zero_crossings_maxima(h11\$x,h11\$ratio) -res12 <- zero_crossings_maxima(h12\$x,h12\$ratio) -res13 <- zero_crossings_maxima(h13\$x,h13\$ratio) -res14 <- zero_crossings_maxima(h14\$x,h14\$ratio) -res15 <- zero_crossings_maxima(h15\$x,h15\$ratio) -res16 <- zero_crossings_maxima(h16\$x,h16\$ratio) -res17 <- zero_crossings_maxima(h17\$x,h17\$ratio) -res18 <- zero_crossings_maxima(h18\$x,h18\$ratio) -res19 <- zero_crossings_maxima(h19\$x,h19\$ratio) -res20 <- zero_crossings_maxima(h20\$x,h20\$ratio) -res21 <- zero_crossings_maxima(h21\$x,h21\$ratio) -res22 <- zero_crossings_maxima(h22\$x,h22\$ratio) -res23 <- zero_crossings_maxima(h23\$x,h23\$ratio) -res24 <- zero_crossings_maxima(h24\$x,h24\$ratio) -res25 <- zero_crossings_maxima(h25\$x,h25\$ratio) - - -#plotting (including maxima and adjusting to max ratio) -# all on one plot -pdf("allchrs.pdf",height=10, width=20) -library(Hmisc) -ymax <- 1.05*max( c(h1\$ratio,h2\$ratio,h3\$ratio,h4\$ratio,h5\$ratio,h6\$ratio,h7\$ratio,h8\$ratio,h9\$ratio,h10\$ratio,h11\$ratio,h12\$ratio,h13\$ratio,h14\$ratio,h15\$ratio,h16\$ratio,h17\$ratio,h18\$ratio,h19\$ratio,h20\$ratio,h21\$ratio,h22\$ratio,h23\$ratio,h24\$ratio,h25\$ratio)) -par(mfrow=c(5,5)) -plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") -points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") -points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") -points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") -points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") -points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") -points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") -points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") -points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") -points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") -points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") -points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") -points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") -points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") -points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") -points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") -points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") -points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") -points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") -points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") -points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") -points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") -points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") -points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") -points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") -points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(10) -dev.off() - -# seperate plots -pdf("chr1.pdf",height=5, width=10) -plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") -points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr2.pdf",height=5, width=10) -plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") -points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr3.pdf",height=5, width=10) -plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") -points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr4.pdf",height=5, width=10) -plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") -points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr5.pdf",height=5, width=10) -plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") -points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr6.pdf",height=5, width=10) -plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") -points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr7.pdf",height=5, width=10) -plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") -points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr8.pdf",height=5, width=10) -plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") -points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr9.pdf",height=5, width=10) -plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") -points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr10.pdf",height=5, width=10) -plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") -points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr11.pdf",height=5, width=10) -plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") -points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr12.pdf",height=5, width=10) -plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") -points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr13.pdf",height=5, width=10) -plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") -points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr14.pdf",height=5, width=10) -plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") -points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr15.pdf",height=5, width=10) -plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") -points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr16.pdf",height=5, width=10) -plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") -points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr17.pdf",height=5, width=10) -plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") -points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr18.pdf",height=5, width=10) -plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") -points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr19.pdf",height=5, width=10) -plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") -points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr20.pdf",height=5, width=10) -plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") -points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr21.pdf",height=5, width=10) -plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") -points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr22.pdf",height=5, width=10) -plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") -points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr23.pdf",height=5, width=10) -plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") -points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr24.pdf",height=5, width=10) -plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") -points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr25.pdf",height=5, width=10) -plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") -points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(10) -dev.off() -</configfile> -</configfiles> - - - <tests> - <test> - <param name="input1" value="CloudMapzebrafishhomozygositymapping_test1_input.xls" ftype="vcf"/> - <param name="job_name" value="test1"/> - <param name="runMe" value="$runMe"/> - <output name="html_file" file="CloudMapzebrafishhomozygositymapping_test1_output.html" ftype="html" lines_diff="5"/> - </test> - </tests> - - -<help> - - -**What it Does** - -This tool is part of an update to the CloudMap pipeline (Minevich et al. 2012) to incorporate homozygosity mapping in zebrafish. This tool facilitates the mapping of zebrafish mutants from WGS or RNA-Seq data using bulk segregant homozygosity mapping. As input it takes a VCF list of variants (usually quality filtered for Q200 with WT SNPs/indels removed). This file is produced when running the CloudMap zebrafish pipeline. It plots an adjusted homozygosity ratio such that a high ratio indicates mapping region. It outputs an HTML file with combined and individual chromosome plots as PDFs. The adjusted homozygosity ratio is calculated as described in: - -IN SUBMISSION - -**Script** -Pressing execute will run the following code over your input file and generate some outputs in your history:: - - - #homozygosity-mapping script - #input file: Q200 variants no wildtype - ourargs = commandArgs(TRUE) - inf = ourargs[1] - outf = ourargs[2] - Q200var = read.table(inf) - - - het <- Q200var[grep("AF=0.5",Q200var\$V8), ] - hom <- Q200var[grep("AF=1.0",Q200var\$V8), ] - - get_hom1 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr1") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr1") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom2 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr2") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr2") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom3 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr3") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr3") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom4 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr4") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr4") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom5 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr5") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr5") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom6 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr6") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr6") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom7 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr7") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr7") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom8 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr8") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr8") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom9 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr9") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr9") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom10 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr10") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr10") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom11 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr11") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr11") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom12 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr12") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr12") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom13 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr13") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr13") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom14 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr14") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr14") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom15 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr15") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr15") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom16 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr16") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr16") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom17 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr17") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr17") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom18 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr18") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr18") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom19 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr19") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr19") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom20 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr20") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr20") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom21 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr21") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr21") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom22 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr22") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr22") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom23 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr23") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr23") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom24 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr24") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr24") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom25 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr25") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr25") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - h1 <- get_hom1(hom,het) - h2 <- get_hom2(hom,het) - h3 <- get_hom3(hom,het) - h4 <- get_hom4(hom,het) - h5 <- get_hom5(hom,het) - h6 <- get_hom6(hom,het) - h7 <- get_hom7(hom,het) - h8 <- get_hom8(hom,het) - h9 <- get_hom9(hom,het) - h10 <- get_hom10(hom,het) - h11 <- get_hom11(hom,het) - h12 <- get_hom12(hom,het) - h13 <- get_hom13(hom,het) - h14 <- get_hom14(hom,het) - h15 <- get_hom15(hom,het) - h16 <- get_hom16(hom,het) - h17 <- get_hom17(hom,het) - h18 <- get_hom18(hom,het) - h19 <- get_hom19(hom,het) - h20 <- get_hom20(hom,het) - h21 <- get_hom21(hom,het) - h22 <- get_hom22(hom,het) - h23 <- get_hom23(hom,het) - h24 <- get_hom24(hom,het) - h25 <- get_hom25(hom,het) - - - - #Extracting maxima (homozygosity-mapping) - - zero_crossings_maxima <- function(x,y){ - - dy <- diff(y) - xn <- x[2:length(x)] - - n <- length(dy) - t1 <- dy[1:n-1]; - t2 <- dy[2:n]; - tt <- t1*t2 - ind <- which(tt < 0) - - # print out the maxima - d2y <- diff(dy) - vind <- c() - vy <- c() - vxn <- c() - - xnn <- x[3:length(x)] - for(i in 1:length(ind)){ - ### cat( ind[i], d2y[ind[i]], '\n') - if( d2y[ind[i]] < 0 ){ - ### cat(ind[i], y[ind[i]], xn[ind[i]], "\n" ) - vind <- c(vind, ind[i]) - vy <- c(vy, y[ind[i]]) - vxn <- c(vxn, xn[ind[i]]) - } - } - - maxima <- data.frame(ind=vind, y=vy, x=vxn) - maxima <- maxima[order(maxima\$y),] - - #print( maxima ) - - results <- list() - results\$dy <- dy - results\$xn <- xn - results\$maxima <- maxima[ order(maxima\$y, decreasing=T), ] - - return(results) - } - - res1 <- zero_crossings_maxima(h1\$x,h1\$ratio) - res2 <- zero_crossings_maxima(h2\$x,h2\$ratio) - res3 <- zero_crossings_maxima(h3\$x,h3\$ratio) - res4 <- zero_crossings_maxima(h4\$x,h4\$ratio) - res5 <- zero_crossings_maxima(h5\$x,h5\$ratio) - res6 <- zero_crossings_maxima(h6\$x,h6\$ratio) - res7 <- zero_crossings_maxima(h7\$x,h7\$ratio) - res8 <- zero_crossings_maxima(h8\$x,h8\$ratio) - res9 <- zero_crossings_maxima(h9\$x,h9\$ratio) - res10 <- zero_crossings_maxima(h10\$x,h10\$ratio) - res11 <- zero_crossings_maxima(h11\$x,h11\$ratio) - res12 <- zero_crossings_maxima(h12\$x,h12\$ratio) - res13 <- zero_crossings_maxima(h13\$x,h13\$ratio) - res14 <- zero_crossings_maxima(h14\$x,h14\$ratio) - res15 <- zero_crossings_maxima(h15\$x,h15\$ratio) - res16 <- zero_crossings_maxima(h16\$x,h16\$ratio) - res17 <- zero_crossings_maxima(h17\$x,h17\$ratio) - res18 <- zero_crossings_maxima(h18\$x,h18\$ratio) - res19 <- zero_crossings_maxima(h19\$x,h19\$ratio) - res20 <- zero_crossings_maxima(h20\$x,h20\$ratio) - res21 <- zero_crossings_maxima(h21\$x,h21\$ratio) - res22 <- zero_crossings_maxima(h22\$x,h22\$ratio) - res23 <- zero_crossings_maxima(h23\$x,h23\$ratio) - res24 <- zero_crossings_maxima(h24\$x,h24\$ratio) - res25 <- zero_crossings_maxima(h25\$x,h25\$ratio) - - - #plotting (including maxima and adjusting to max ratio) - # all on one plot - pdf("allchrs.pdf",height=10, width=20) - library(Hmisc) - ymax <- 1.05*max( c(h1\$ratio,h2\$ratio,h3\$ratio,h4\$ratio,h5\$ratio,h6\$ratio,h7\$ratio,h8\$ratio,h9\$ratio,h10\$ratio,h11\$ratio,h12\$ratio,h13\$ratio,h14\$ratio,h15\$ratio,h16\$ratio,h17\$ratio,h18\$ratio,h19\$ratio,h20\$ratio,h21\$ratio,h22\$ratio,h23\$ratio,h24\$ratio,h25\$ratio)) - par(mfrow=c(5,5)) - plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") - points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") - points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") - points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") - points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") - points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") - points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") - points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") - points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") - points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") - points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") - points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") - points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") - points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") - points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") - points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") - points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") - points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") - points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") - points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") - points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") - points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") - points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") - points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") - points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") - points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(10) - dev.off() - - # seperate plots - pdf("chr1.pdf",height=5, width=10) - plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") - points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr2.pdf",height=5, width=10) - plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") - points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr3.pdf",height=5, width=10) - plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") - points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr4.pdf",height=5, width=10) - plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") - points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr5.pdf",height=5, width=10) - plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") - points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr6.pdf",height=5, width=10) - plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") - points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr7.pdf",height=5, width=10) - plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") - points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr8.pdf",height=5, width=10) - plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") - points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr9.pdf",height=5, width=10) - plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") - points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr10.pdf",height=5, width=10) - plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") - points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr11.pdf",height=5, width=10) - plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") - points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr12.pdf",height=5, width=10) - plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") - points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) - 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Ross Lazarus; Antony Kaspi; Mark Ziemann; The Galaxy Team. -Bioinformatics 2012; doi: 10.1093/bioinformatics/bts573 - - -</help> -<citations> - <citation type="doi">10.1534/genetics.112.144204</citation> - <citation type="doi">10.1093/bioinformatics/bts573</citation> -</citations> -</tool>
--- a/CloudMapzebrafishhomozygositymapping/test-data/CloudMapzebrafishhomozygositymapping_test1_input.xls Mon Oct 13 08:26:32 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,35467 +0,0 @@ -##fileformat=VCFv4.1 -##FILTER=<ID=LowQual,Description="Low quality"> -##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed"> -##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)"> -##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality"> -##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype"> -##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification"> -##GATKCommandLine=<ID=HaplotypeCaller,Version=nightly-2014-01-31-gc6765ad,Date="Thu Oct 09 18:33:16 BST 2014",Epoch=1412875996785,CommandLineOptions="analysis_type=HaplotypeCaller 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sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=/Users/galaxy/galaxy-dist/database/tmp/tmp-gatk-DvBGms/input_variant.vcf) discordance=(RodBinding name=discordance source=/Volumes/ngs/database/files/002/dataset_2093.dat) concordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sample_name=[] sample_expressions=null sample_file=null exclude_sample_name=[] exclude_sample_file=[] select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false restrictAllelesTo=ALL keepOriginalAC=false mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_fraction=0.0 remove_fraction_genotypes=0.0 selectTypeToInclude=[] keepIDs=null fullyDecode=false forceGenotypesDecode=false justRead=false maxIndelSize=2147483647 ALLOW_NONOVERLAPPING_COMMAND_LINE_SAMPLES=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false"> -##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed"> -##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed"> -##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called 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-##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency (not necessarily the same as the AF), for each ALT allele, in the same order as listed"> -##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality"> -##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads"> -##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities"> -##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth"> -##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias"> -##contig=<ID=Zv9_scaffold3453,length=203829> -##contig=<ID=Zv9_scaffold3454,length=91011> -##contig=<ID=Zv9_scaffold3455,length=543129> -##contig=<ID=Zv9_scaffold3456,length=253302> -##contig=<ID=Zv9_scaffold3457,length=101278> -##contig=<ID=Zv9_scaffold3458,length=223119> 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=-0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:366,0,173 -Zv9_scaffold3454 26976 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=1.730;DP=60;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:255,0,1436 -Zv9_scaffold3454 51156 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=1.299;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:395,0,2689 -Zv9_scaffold3455 135276 . T A 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.081;DP=118;FS=13.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,37:118:99:903,0,2675 -Zv9_scaffold3455 135370 . G T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-0.925;DP=81;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:556,0,1925 -Zv9_scaffold3455 135725 . A C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.086;DP=133;FS=14.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,32:127:99:333,0,3421 -Zv9_scaffold3455 136044 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.840;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:392,0,2025 -Zv9_scaffold3455 136520 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.782;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.161;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,38:127:99:742,0,3068 -Zv9_scaffold3455 136810 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=1.286;DP=142;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=1.43;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,23:141:99:231,0,3872 -Zv9_scaffold3455 136935 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.791;DP=121;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:364,0,3403 -Zv9_scaffold3455 137214 . T C 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.314;DP=136;FS=1.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,34:136:99:636,0,3253 -Zv9_scaffold3455 137636 . G C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.852;DP=113;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:456,0,3069 -Zv9_scaffold3455 147943 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.912;DP=132;FS=2.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,25:132:99:307,0,3552 -Zv9_scaffold3455 148081 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=-0.584;DP=172;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,32:172:99:341,0,4752 -Zv9_scaffold3455 152119 . T G 2160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=1.087;DP=164;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:2189,0,2216 -Zv9_scaffold3455 157545 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.715;DP=141;FS=8.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,27:141:99:400,0,3421 -Zv9_scaffold3455 157578 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.277;DP=154;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:306,0,4108 -Zv9_scaffold3455 167332 . T C 1969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.356;DP=136;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1998,0,2100 -Zv9_scaffold3455 339404 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.921;DP=33;FS=11.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:265,0,875 -Zv9_scaffold3455 339823 . T C 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-0.888;DP=46;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:536,0,863 -Zv9_scaffold3455 347685 . G GT 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.843;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:342,0,1233 -Zv9_scaffold3455 348721 . A AT 406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.714;DP=47;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:499,0,390 -Zv9_scaffold3455 349421 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.002;DP=190;FS=4.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,39:189:99:358,0,4455 -Zv9_scaffold3455 349519 . T A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.239;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,35:169:99:456,0,3957 -Zv9_scaffold3455 371724 . A G 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=1.258;DP=92;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,32:92:99:870,0,1648 -Zv9_scaffold3455 371760 . A T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=-0.794;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,27:87:99:622,0,1821 -Zv9_scaffold3455 422810 . G GT 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.647;DP=76;FS=3.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:358,0,1040 -Zv9_scaffold3456 26353 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -Zv9_scaffold3459 217553 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,196 -Zv9_scaffold3459 218425 . AG A 628.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.183;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:666,0,483 -Zv9_scaffold3459 269495 . C A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -Zv9_scaffold3460 55143 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.267;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:236,0,337 -Zv9_scaffold3463 654984 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.416;DP=55;FS=3.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:795,0,582 -Zv9_scaffold3465 207470 . A G 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=-1.191;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=33.36;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:562,0,117 -Zv9_scaffold3465 207475 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-1.237;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:378,0,378 -Zv9_scaffold3465 422655 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:239,0,105 -Zv9_scaffold3465 426185 . T C 211.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:239,0,11 -Zv9_scaffold3469 60188 . G A 304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:333,33,0 -Zv9_scaffold3469 60253 . A G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -Zv9_scaffold3471 94534 . A T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=1.891;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:387,0,487 -Zv9_scaffold3471 95384 . G C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.236;DP=49;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:582,0,806 -Zv9_scaffold3471 95783 . TCCTGAGGGAAGATGGATACAAGTGTGGTAAGGATTTTAATAATGACATGTGAATGTTCTGTAGAAGAAAAAAACGATGTAAAACAGATGGCCTA T 2423.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.284;DP=54;FS=6.377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:99:2461,224,0 -Zv9_scaffold3471 124444 . T C 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=-0.219;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:987,0,734 -Zv9_scaffold3471 139711 . T C 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.227;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:907,0,658 -Zv9_scaffold3471 139876 . T C 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-0.045;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:990,0,909 -Zv9_scaffold3471 139944 . A G 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-1.125;DP=56;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:787,0,873 -Zv9_scaffold3471 164627 . G T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-1.056;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:321,0,524 -Zv9_scaffold3474 45049 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,338 -Zv9_scaffold3476 136818 . G A 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:461,36,0 -Zv9_scaffold3476 136900 . G A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.361;DP=62;FS=11.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=16.75;ReadPosRankSum=-2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1067,0,574 -Zv9_scaffold3476 136915 . T A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.188;DP=53;FS=9.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=4.18;ReadPosRankSum=2.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:250,0,887 -Zv9_scaffold3476 136927 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.162;DP=42;FS=23.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=14.52;ReadPosRankSum=-2.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:638,0,354 -Zv9_scaffold3476 137166 . A G 586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:615,48,0 -Zv9_scaffold3476 137208 . G A 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.082;DP=65;FS=12.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:80:971,0,80 -Zv9_scaffold3476 137266 . T C 770.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=21.41;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:60:799,60,0 -Zv9_scaffold3484 55665 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.014;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:572,0,588 -Zv9_scaffold3484 71430 . G A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.734;DP=49;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:741,0,688 -Zv9_scaffold3484 71897 . C T 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-0.352;DP=67;FS=8.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,40:67:99:1148,0,736 -Zv9_scaffold3484 82283 . G A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.217;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:635,0,1095 -Zv9_scaffold3484 96372 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=1.477;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=24.19;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:899,0,294 -Zv9_scaffold3484 96403 . A C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.462;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=14.67;ReadPosRankSum=-2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:395,0,427 -Zv9_scaffold3484 96480 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.903;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:638,0,315 -Zv9_scaffold3484 96522 . A G 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.181;DP=57;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=24.00;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,44:57:99:1396,0,230 -Zv9_scaffold3484 103897 . G A 1967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.203;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.108;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,58:76:99:1996,0,320 -Zv9_scaffold3484 104476 . TC T 623.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.575;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:55:661,0,55 -Zv9_scaffold3484 105015 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.482;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:278,0,802 -Zv9_scaffold3484 105257 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=1.833;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:541,0,234 -Zv9_scaffold3484 105616 . T TA 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=31.46;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:48:325,0,48 -Zv9_scaffold3484 105652 . A G 225.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:16:254,0,16 -Zv9_scaffold3484 106037 . G C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=24.45;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:395,0,145 -Zv9_scaffold3485 225332 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-0.502;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:299,0,1661 -Zv9_scaffold3485 227018 . C T 2158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-0.183;DP=88;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=24.53;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,69:87:99:2187,0,252 -Zv9_scaffold3485 243810 . G C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=-1.156;DP=86;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:424,0,1933 -Zv9_scaffold3485 253644 . AAGGTAGTGAAGTCTTTAAGTGTCAGACTGACTTGAGTTTTGGATGTCATGTTGCAGTCCCCTTAGATCCCATTGCTGTGTTTCTCCAAC A 2988.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.739;DP=66;FS=6.359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:3026,261,0 -Zv9_scaffold3485 256563 . CT C,CTT 563.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-0.567;DP=44;FS=14.880;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,19,19:43:99:724,347,570,365,0,541 -Zv9_scaffold3485 257154 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:57:249,0,57 -Zv9_scaffold3485 299291 . A G 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:540,39,0 -Zv9_scaffold3485 299308 . G A 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 -Zv9_scaffold3487 176875 . A T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -Zv9_scaffold3491 3018 . G A 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 -Zv9_scaffold3493 21401 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:315,27,0 -Zv9_scaffold3493 21495 . A C 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:732,66,0 -Zv9_scaffold3493 159055 . AG A 262.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:300,24,0 -Zv9_scaffold3494 18966 . A T 334.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:363,33,0 -Zv9_scaffold3494 208033 . T C 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -Zv9_scaffold3497 29349 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:60:244,0,60 -Zv9_scaffold3497 29430 . G T 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -Zv9_scaffold3497 32983 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:335,0,179 -Zv9_scaffold3497 74469 . G C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -Zv9_scaffold3497 93556 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.214;DP=59;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:586,0,999 -Zv9_scaffold3497 93610 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=2.022;DP=67;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.24;ReadPosRankSum=-2.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:67:99:379,0,3774 -Zv9_scaffold3497 93618 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=3.451;DP=68;FS=17.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:371,0,3774 -Zv9_scaffold3503 25644 . G A 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:688,63,0 -Zv9_scaffold3503 25670 . G A 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:427,33,0 -Zv9_scaffold3503 26296 . T C 1176.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=-0.045;DP=28;FS=3.033;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:41:1205,41,0 -Zv9_scaffold3503 26298 . G T 1176.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.201;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=35.22;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:41:1205,41,0 -Zv9_scaffold3503 26997 . T G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.032;DP=42;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:78:840,0,78 -Zv9_scaffold3504 21360 . G A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -Zv9_scaffold3510 20897 . G T 329.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:358,30,0 -Zv9_scaffold3510 21562 . GT G 336.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:374,36,0 -Zv9_scaffold3510 21601 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -Zv9_scaffold3510 22370 . C A 323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:352,30,0 -Zv9_scaffold3510 23778 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -Zv9_scaffold3510 93460 . G C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -Zv9_scaffold3510 93558 . T C 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:518,45,0 -Zv9_scaffold3510 93908 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:267,0,101 -Zv9_scaffold3510 101776 . T G 254.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:283,0,22 -Zv9_scaffold3510 220471 . T A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -Zv9_scaffold3511 28019 . C T 4479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-2.263;DP=240;FS=0.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=18.67;ReadPosRankSum=2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,124:240:99:4508,0,8426 -Zv9_scaffold3511 28022 . G A 4479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.330;DP=241;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=18.59;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,128:241:99:4508,0,8426 -Zv9_scaffold3512 28701 . A T 1034.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1063,84,0 -Zv9_scaffold3512 35163 . T C 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:554,45,0 -Zv9_scaffold3512 64942 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:267,0,318 -Zv9_scaffold3512 82244 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-1.531;DP=13;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:60:258,0,60 -Zv9_scaffold3514 175450 . A T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=-0.848;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:61:482,0,61 -Zv9_scaffold3514 203934 . C T 788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:817,87,0 -Zv9_scaffold3514 204766 . T G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -Zv9_scaffold3514 204808 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=27.64;ReadPosRankSum=2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:80:581,0,80 -Zv9_scaffold3514 204952 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.551;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:307,0,100 -Zv9_scaffold3515 10008 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:60:246,0,60 -Zv9_scaffold3516 746 . T C 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=1.259;DP=51;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:683,0,971 -Zv9_scaffold3516 974 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.379;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:232,0,653 -Zv9_scaffold3516 1133 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-0.949;DP=51;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:327,0,1674 -Zv9_scaffold3516 2662 . T A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.326;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:407,0,1032 -Zv9_scaffold3516 3375 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.258;DP=23;FS=7.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:495,0,146 -Zv9_scaffold3516 5285 . G C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=21.30;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:369,0,173 -Zv9_scaffold3516 6275 . A T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.456;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:45:476,0,45 -Zv9_scaffold3516 6788 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-1.382;DP=28;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:567,0,1063 -Zv9_scaffold3516 7577 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-0.734;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:402,0,1269 -Zv9_scaffold3516 9700 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.855;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:385,0,540 -Zv9_scaffold3516 10433 . A C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.754;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:334,0,673 -Zv9_scaffold3516 11655 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=1.362;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:413,0,1089 -Zv9_scaffold3516 12145 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-2.407;DP=55;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:263,0,1425 -Zv9_scaffold3516 12580 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.370;DP=73;FS=8.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:509,0,1552 -Zv9_scaffold3516 12814 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-1.166;DP=71;FS=3.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:267,0,1940 -Zv9_scaffold3516 74225 . C G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=3.704;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:563,0,2247 -Zv9_scaffold3516 95322 . G T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-0.063;DP=93;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:622,0,2056 -Zv9_scaffold3516 100014 . TA T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:84:314,0,84 -Zv9_scaffold3518 12016 . T TA 275.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:313,24,0 -Zv9_scaffold3519 148855 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:234,0,138 -Zv9_scaffold3519 149428 . A G 236.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:9:264,0,9 -Zv9_scaffold3519 149479 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:293,0,134 -Zv9_scaffold3519 180370 . C T 259.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:19:288,0,19 -Zv9_scaffold3519 186060 . G A 204.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:233,0,22 -Zv9_scaffold3519 187130 . T A 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:831,69,0 -Zv9_scaffold3522 20503 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.844;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:311,0,438 -Zv9_scaffold3522 20525 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.954;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:329,0,343 -Zv9_scaffold3522 65856 . C T 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.282;DP=233;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,72:232:99:1365,0,4776 -Zv9_scaffold3522 66417 . T G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.207;DP=168;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:246,0,3778 -Zv9_scaffold3524 37411 . C A 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:408,36,0 -Zv9_scaffold3524 37932 . G T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=-1.115;DP=239;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,48:203:99:1049,0,7892 -Zv9_scaffold3524 37949 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-0.270;DP=226;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,44:192:99:1040,0,11575 -Zv9_scaffold3524 37958 . C T 3112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=-1.038;DP=212;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,133:189:99:3141,0,2085 -Zv9_scaffold3524 38774 . C A 241.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=24.14;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:8:269,0,8 -Zv9_scaffold3524 53286 . G C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=1.219;DP=51;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:553,0,612 -Zv9_scaffold3524 104134 . G C 231.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:260,0,22 -Zv9_scaffold3524 104795 . T C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.122;DP=143;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:741,0,187 -Zv9_scaffold3524 104838 . A C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.988;DP=48;FS=13.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:515,0,418 -Zv9_scaffold3524 104852 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.689;DP=15;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:230,0,249 -Zv9_scaffold3524 104856 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=28.82;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:230,0,249 -Zv9_scaffold3524 104964 . CA C 1480.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1518,124,0 -Zv9_scaffold3524 105053 . C G 1859.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1888,159,0 -Zv9_scaffold3525 62325 . A G 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.777;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:601,0,2260 -Zv9_scaffold3525 76423 . A C 288.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:317,27,0 -Zv9_scaffold3530 931810 . T C 270.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:299,27,0 -Zv9_scaffold3530 1454599 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.146;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:392,0,373 -Zv9_scaffold3530 1454725 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.421;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:376,0,175 -Zv9_scaffold3533 120804 . C A 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:66:943,66,0 -Zv9_scaffold3533 120808 . G A 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:943,66,0 -Zv9_scaffold3533 120914 . A G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:484,33,0 -Zv9_scaffold3533 120920 . T G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:484,33,0 -Zv9_scaffold3533 191438 . G C 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -Zv9_scaffold3533 191443 . G A 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:238,0,24 -Zv9_scaffold3533 191906 . C A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -Zv9_scaffold3534 74643 . C T 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.513;DP=72;FS=6.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.982;QD=16.97;ReadPosRankSum=2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1250,0,932 -Zv9_scaffold3534 74719 . T A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-1.430;DP=56;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:488,0,2414 -Zv9_scaffold3534 74720 . A G 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=1.352;DP=56;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:943,0,1459 -Zv9_scaffold3534 74923 . C T 2302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-4.590;DP=73;FS=3.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=31.54;ReadPosRankSum=2.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,50:72:99:2331,0,1113 -Zv9_scaffold3534 74933 . A G 2106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-2.352;DP=76;FS=8.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,52:76:99:2135,0,1213 -Zv9_scaffold3536 347863 . G A 285.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:314,27,0 -Zv9_scaffold3536 349440 . G A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -Zv9_scaffold3536 349694 . A G 237.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:266,21,0 -Zv9_scaffold3537 3162 . A AGT 1018.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-2.098;DP=86;FS=7.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:80:99:1056,0,1362 -Zv9_scaffold3537 20805 . GAGGTGAGTTCAGCTCAGTGTGTGAATCTGCAGATCCTGAATGCTGTTACTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTC G 4190.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.711;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=31.30;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,94:99:99:4228,161,0 -Zv9_scaffold3537 20915 . G C 2099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-1.729;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:2128,0,1998 -Zv9_scaffold3537 20948 . C T 2624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-2.639;DP=168;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:2653,0,2387 -Zv9_scaffold3537 21023 . C T 2670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-1.044;DP=177;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,100:176:99:2699,0,2396 -Zv9_scaffold3537 25153 . C G 2611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-1.835;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,93:169:99:2640,0,2427 -Zv9_scaffold3537 25507 . A T 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=-1.804;DP=85;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:1306,0,1358 -Zv9_scaffold3537 25568 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.211;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:368,0,875 -Zv9_scaffold3539 2551 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-1.179;DP=48;FS=7.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:234,0,1104 -Zv9_scaffold3539 22364 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.777;DP=18;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=24.65;ReadPosRankSum=2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:53:472,0,53 -Zv9_scaffold3539 22710 . A C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.162;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:308,0,742 -Zv9_scaffold3539 22906 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.694;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:314,0,941 -Zv9_scaffold3539 34125 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.614;DP=46;FS=9.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:277,0,1088 -Zv9_scaffold3539 39902 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.610;DP=40;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:499,0,796 -Zv9_scaffold3539 44188 . G A 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-0.865;DP=187;FS=1.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,56:186:99:1117,0,4058 -Zv9_scaffold3539 180648 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.456;DP=21;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.127;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:321,0,269 -Zv9_scaffold3539 181335 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=23.78;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,105 -Zv9_scaffold3540 135029 . T C 218.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:247,30,0 -Zv9_scaffold3540 163826 . A C 299.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.00;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:328,0,13 -Zv9_scaffold3540 221469 . A AAG 1731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-2.829;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,76:91:99:1769,0,155 -Zv9_scaffold3540 221616 . G GT 978.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=-1.777;DP=90;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,55:74:99:1167,0,529 -Zv9_scaffold3544 24791 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.968;DP=27;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:658,0,118 -Zv9_scaffold3545 107767 . C T 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.202;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=19.19;ReadPosRankSum=-1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:796,0,267 -Zv9_scaffold3545 107809 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.951;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:631,0,155 -Zv9_scaffold3545 110583 . G T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=1.162;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:456,0,668 -Zv9_scaffold3545 110981 . C G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-2.282;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=33.83;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:468,0,139 -Zv9_scaffold3545 110984 . A C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.516;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=29.32;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:468,0,139 -Zv9_scaffold3545 111078 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=2.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:275,0,226 -Zv9_scaffold3545 111522 . AGT A 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.755;DP=20;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:306,0,237 -Zv9_scaffold3545 141382 . T TA 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=2.143;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=20.25;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:21:422,0,21 -Zv9_scaffold3545 141507 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=2.592;DP=49;FS=55.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=7.14;ReadPosRankSum=-4.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:378,0,3315 -Zv9_scaffold3545 141510 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=2.788;DP=53;FS=55.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=6.60;ReadPosRankSum=-3.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:378,0,3315 -Zv9_scaffold3545 141517 . T A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-3.410;DP=62;FS=46.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:832,0,1675 -Zv9_scaffold3545 141710 . T A 1233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.612;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1262,99,0 -Zv9_scaffold3546 15860 . G T 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -Zv9_scaffold3546 142177 . T A 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:490,39,0 -Zv9_scaffold3546 142263 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:232,0,128 -Zv9_scaffold3546 142267 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=33.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:232,0,128 -Zv9_scaffold3546 143475 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.952;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:360,0,535 -Zv9_scaffold3546 144485 . G A 212.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:241,0,15 -Zv9_scaffold3546 145599 . G T 243.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:272,0,22 -Zv9_scaffold3546 145622 . C A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.228;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,142 -Zv9_scaffold3546 147265 . G T 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.42;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:22:275,0,22 -Zv9_scaffold3546 148730 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:298,0,326 -Zv9_scaffold3546 148866 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=24.92;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:402,0,660 -Zv9_scaffold3546 149048 . A T 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:644,48,0 -Zv9_scaffold3546 149128 . G C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.552;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:31:403,0,31 -Zv9_scaffold3546 149176 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:288,0,296 -Zv9_scaffold3546 149369 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.520;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:393,0,571 -Zv9_scaffold3546 149417 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-1.013;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:395,0,508 -Zv9_scaffold3546 149520 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:414,0,731 -Zv9_scaffold3546 149524 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-0.077;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:249,0,1008 -Zv9_scaffold3548 3677 . C T 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1624,140,0 -Zv9_scaffold3548 3787 . G C 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.465;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=22.07;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1220,0,249 -Zv9_scaffold3548 23459 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:279,0,541 -Zv9_scaffold3548 40426 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:83:351,0,83 -Zv9_scaffold3548 233743 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.375;DP=23;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:232,0,372 -Zv9_scaffold3548 299313 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.594;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:482,0,556 -Zv9_scaffold3548 299758 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.058;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:413,0,361 -Zv9_scaffold3548 299845 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-1.385;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:454,0,411 -Zv9_scaffold3553 102886 . G T 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:482,33,0 -Zv9_scaffold3553 103098 . G GT 252.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:290,32,0 -Zv9_scaffold3553 103269 . G A 236.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:265,24,0 -Zv9_scaffold3553 104450 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=1.214;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:449,0,374 -Zv9_scaffold3553 104479 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.032;DP=25;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:242,0,390 -Zv9_scaffold3556 48960 . AATATCCTTTTCTGTGGTCAATTCTGACACATTTACATATGCAAATGTTTGTATGCATTGTTCAAATGTCATAAGATGTGTTTTTATCCTTTACAATGCATCAC A 2080.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=2.345;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=31.70;ReadPosRankSum=-2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:99:2118,172,0 -Zv9_scaffold3557 7787 . CAT C 793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.354;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=20.35;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:831,0,690 -Zv9_scaffold3557 21995 . T A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-1.515;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:407,0,727 -Zv9_scaffold3557 40148 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-1.207;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:513,0,524 -Zv9_scaffold3557 61824 . C A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.517;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:310,0,535 -Zv9_scaffold3557 72142 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=1.741;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:282,0,386 -Zv9_scaffold3561 94943 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=3.223;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:471,0,333 -Zv9_scaffold3561 148257 . A T 513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:542,48,0 -Zv9_scaffold3561 150309 . T C 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:419,42,0 -Zv9_scaffold3561 150330 . C A 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -Zv9_scaffold3562 11589 . C T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-1.211;DP=36;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:595,0,530 -Zv9_scaffold3563 42444 . A G 1771.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1800,156,0 -Zv9_scaffold3563 48075 . C T 553.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:582,54,0 -Zv9_scaffold3563 48097 . G A 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:519,45,0 -Zv9_scaffold3563 49240 . C A 315.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:344,0,14 -Zv9_scaffold3563 49390 . T A 1785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1814,135,0 -Zv9_scaffold3563 49411 . G C 401.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=33.45;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:429,0,8 -Zv9_scaffold3563 61647 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=32.98;ReadPosRankSum=2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:490,0,122 -Zv9_scaffold3563 61686 . C T 491.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.361;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.937;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,24:28:7:519,7,0 -Zv9_scaffold3563 61711 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=13.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=27.61;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:89:470,0,89 -Zv9_scaffold3563 61871 . G C 1046.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1075,90,0 -Zv9_scaffold3563 62005 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-1.369;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:30:335,0,30 -Zv9_scaffold3563 102654 . G C 362.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:391,45,0 -Zv9_scaffold3563 174406 . A G 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.377;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:678,0,725 -Zv9_scaffold3563 181574 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.290;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:264,0,499 -Zv9_scaffold3563 189663 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:257,0,251 -Zv9_scaffold3563 190821 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.835;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:250,0,400 -Zv9_scaffold3563 208093 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.268;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:491,0,419 -Zv9_scaffold3563 240971 . C A 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.679;DP=117;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1700,0,1670 -Zv9_scaffold3563 252255 . A T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.930;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:417,0,2927 -Zv9_scaffold3563 252670 . TGTACGGTTTTCGTTTCCTTTCATTCCTCTTTAAATATTTTCAGAATTTAAAAATAGTTTGAACCTATAATGGGTGCTTTTAATGTTGATCTAGGAACTATCAAAAACTTTTTACCATATTAACTCAAACAATGTGTTTTAG T 5856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=2.771;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=25.36;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,142:146:99:5886,0,206 -Zv9_NA654 4127 . C CAA 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.513;DP=47;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=5.31;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:302,0,1215 -Zv9_NA772 1232 . A G 1179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1208,117,0 -Zv9_NA237 11110 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:422,0,173 -Zv9_NA237 11637 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=4.583;DP=116;FS=44.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=7.20;ReadPosRankSum=-4.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,33:116:99:864,0,3151 -Zv9_NA237 14926 . A C 3379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=1.023;DP=204;FS=5.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,96:203:99:3408,0,3411 -Zv9_NA237 17277 . G T 4397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.210;DP=230;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,134:229:99:4426,0,3293 -Zv9_NA237 17329 . CCACCTTTTGGACCAAAGAAAATAACTTTAAGTCTTGCAGAAAAGTAATTAAGAGTACAGATGACGTTCTGACCCTCATTAAAGTGTGAAGAACG C 10685.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.806;DP=240;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=34.46;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,228:230:99:10723,994,0 -Zv9_NA237 18076 . C T 2874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=-2.922;DP=263;FS=9.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,88:251:99:2903,0,5688 -Zv9_NA237 24605 . G A 3442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.541;DP=191;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=18.02;ReadPosRankSum=-1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,97:189:99:3471,0,3338 -Zv9_NA237 26707 . G A 3292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.225;DP=174;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,98:173:99:3321,0,2661 -Zv9_NA834 10039 . A G 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -Zv9_NA834 10071 . T A 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -Zv9_NA834 13536 . A C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -Zv9_NA834 15387 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 -Zv9_NA540 796 . G C 3601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=-0.992;DP=303;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,101:257:99:3630,0,5526 -Zv9_NA540 5742 . TCTGCGAGACCACACACACATTCACACACAGTCAGTTTGATAAACACTATGAATATGCCAGAAAGCTGTTGTTGACAGAAAGTGTGTGTAC T 11659.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.522;DP=298;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=31.50;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,293:296:99:11697,861,0 -Zv9_NA945 638 . ATC A 928.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-2.773;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:966,0,1465 -Zv9_NA945 906 . C G 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-0.443;DP=66;FS=6.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=15.94;ReadPosRankSum=-2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:1080,0,1185 -Zv9_NA760 3928 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.436;DP=34;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:310,0,684 -Zv9_NA426 11914 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.376;DP=28;FS=8.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:494,0,344 -Zv9_NA426 12595 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,179 -Zv9_NA426 12865 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.363;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:380,0,346 -Zv9_NA303 22316 . GA G 319.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:357,30,0 -Zv9_NA303 69305 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:283,0,325 -Zv9_NA303 69410 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:341,0,1055 -Zv9_NA303 69413 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:341,0,1055 -Zv9_NA692 6351 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.296;DP=100;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=2.29;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,18:100:99:257,0,3059 -Zv9_NA692 6363 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=-0.734;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:407,0,2759 -Zv9_NA333 563 . A T 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -Zv9_NA333 1318 . C A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,177 -Zv9_NA333 12174 . T A 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -Zv9_NA333 17390 . AT A 283.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:321,33,0 -Zv9_NA530 4249 . A C 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.866;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1377,0,1023 -Zv9_NA530 4438 . T G 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.536;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:1097,0,2863 -Zv9_NA530 4818 . A G 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.351;DP=70;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,35:70:99:1320,0,1626 -Zv9_NA530 5385 . C A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-2.332;DP=62;FS=21.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:766,0,1376 -Zv9_NA530 5902 . T G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.182;DP=78;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:978,0,1735 -Zv9_NA530 5983 . C T 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.519;DP=65;FS=6.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1130,0,1104 -Zv9_NA530 6601 . C T 1585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.482;DP=101;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:1614,0,1895 -Zv9_NA530 6640 . A T 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.016;DP=90;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=15.14;ReadPosRankSum=2.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:1391,0,1744 -Zv9_NA530 7185 . A C 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=-0.501;DP=75;FS=2.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:567,0,1997 -Zv9_NA530 7309 . A G 2790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.258;DP=103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=27.09;ReadPosRankSum=-1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,73:103:99:2819,0,829 -Zv9_NA530 8572 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.826;DP=122;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,35:122:99:869,0,3396 -Zv9_NA530 9090 . C T 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-0.403;DP=62;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1132,0,977 -Zv9_NA530 9245 . G GA 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.634;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:539,0,448 -Zv9_NA530 10283 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=1.694;DP=61;FS=3.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:893,0,1204 -Zv9_NA530 10410 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=-0.053;DP=138;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:99:611,0,6651 -Zv9_NA235 6054 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.083;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:542,0,709 -Zv9_NA235 8746 . C T 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-1.080;DP=73;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1554,0,907 -Zv9_NA235 9178 . C G 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=2.396;DP=72;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:923,0,1555 -Zv9_NA235 9189 . C A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=3.692;DP=73;FS=1.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:965,0,1470 -Zv9_NA235 11306 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=-0.814;DP=56;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=5.94;ReadPosRankSum=-2.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:361,0,1580 -Zv9_NA500 8166 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.525;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=26.03;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:627,0,155 -Zv9_NA500 8307 . C A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.046;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:530,0,159 -Zv9_NA500 8931 . G T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-1.181;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:615,0,455 -Zv9_NA500 9462 . A G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=1.386;DP=21;FS=9.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:380,0,265 -Zv9_NA86 62060 . T C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-1.106;DP=62;FS=2.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,30:62:99:1053,0,994 -Zv9_NA86 77716 . A G 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.655;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=16.66;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1078,0,1016 -Zv9_NA357 29517 . TA T 825.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=1.523;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=22.92;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,30:34:4:861,4,0 -Zv9_NA495 4636 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=21.34;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,143 -Zv9_NA495 8232 . C A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.970;DP=30;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.854;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:438,0,401 -Zv9_NA759 6889 . TA T 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -Zv9_NA887 24711 . G T 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:629,45,0 -Zv9_NA887 24722 . T A 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:478,33,0 -Zv9_NA892 104174 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:380,0,48 -Zv9_NA910 8005 . GAAGAACACAAAA G 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:43:397,0,43 -Zv9_NA433 4010 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -Zv9_NA433 4043 . T G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -Zv9_NA941 1117 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.225;DP=15;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:306,0,398 -Zv9_NA928 35405 . GT G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.202;DP=26;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:271,0,178 -Zv9_NA747 1202 . A C 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -Zv9_NA747 12862 . G T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:345,24,0 -Zv9_NA266 33019 . A C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.931;DP=41;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:288,0,1075 -Zv9_NA266 33343 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-0.453;DP=54;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:639,0,1234 -Zv9_NA407 34924 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=1.909;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=22.11;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:382,0,127 -Zv9_NA407 40880 . G A 1721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.058;DP=71;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,47:69:99:1750,0,592 -Zv9_NA985 810 . C T 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-0.485;DP=362;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,78:353:99:1490,0,10376 -Zv9_NA327 7647 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-0.896;DP=89;FS=5.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:378,0,2601 -Zv9_NA771 53487 . T A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:316,0,136 -Zv9_NA169 779 . G C 404.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:432,0,8 -Zv9_NA169 7892 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:352,0,89 -Zv9_NA169 7914 . T G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=32.05;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:49:477,0,49 -Zv9_NA169 8109 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.393;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:431,0,755 -Zv9_NA169 8288 . T C 785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:814,60,0 -Zv9_NA169 8317 . G A 593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:622,45,0 -Zv9_NA169 8686 . T C 206.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:235,0,21 -Zv9_NA169 8920 . T A 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:646,45,0 -Zv9_NA661 4549 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-0.729;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:319,0,1849 -Zv9_NA661 9779 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.167;DP=30;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:467,0,838 -Zv9_NA27 23784 . A T 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -Zv9_NA573 1935 . G A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.938;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:636,0,1245 -Zv9_NA573 5116 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.042;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:643,0,685 -Zv9_NA573 5225 . G A 1236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.510;DP=63;FS=13.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1265,0,841 -Zv9_NA573 22002 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.594;DP=50;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:586,0,1159 -Zv9_NA631 7792 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.399;DP=105;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,18:100:99:253,0,3258 -Zv9_NA683 609 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.110;DP=33;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:994,0,152 -Zv9_NA683 637 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.140;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.348;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1460,0,177 -Zv9_NA683 4528 . GGGTACATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTAATGATGATCTTGATTTTGTGTGTGCA G 3012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=1.489;DP=99;FS=5.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=30.43;ReadPosRankSum=-2.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,72:99:99:3050,0,4169 -Zv9_NA683 4711 . G A 2478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.091;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,70:87:99:2507,0,275 -Zv9_NA683 4815 . CGGTCAGGGGAACACACACACACACACACAGATACGCAGACACAAACAGTTTGTAACTCCTCCTCCTGTCCAGCA C 3233.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-0.883;DP=85;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,75:84:99:3329,131,0 -Zv9_NA683 5499 . C T 3793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3822,277,0 -Zv9_NA683 6813 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=1.981;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=16.61;ReadPosRankSum=-2.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:676,0,1482 -Zv9_NA683 6852 . C T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=2.390;DP=66;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,39:65:99:1335,0,1855 -Zv9_NA683 7462 . C G 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.688;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=26.07;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1436,0,281 -Zv9_NA683 8330 . T C 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -Zv9_NA683 13447 . T G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.126;DP=34;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:350,0,728 -Zv9_NA683 17029 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=29.56;ReadPosRankSum=-1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:383,0,217 -Zv9_NA683 17775 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -Zv9_NA683 20420 . A C,T 2214.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,55,11:66:99:2451,316,153,2146,0,2163 -Zv9_NA683 25414 . T A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-1.177;DP=25;FS=7.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.768;QD=28.39;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:738,0,140 -Zv9_NA683 25810 . CGGT C 2198.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2236,167,0 -Zv9_NA683 26533 . G A 3636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.724;ClippingRankSum=-0.176;DP=138;FS=1.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,105:137:99:3665,0,700 -Zv9_NA683 27074 . G A 2586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.097;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=22.49;ReadPosRankSum=2.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,76:115:99:2615,0,1234 -Zv9_NA683 29058 . C CTG 710.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=2.272;DP=41;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.578;QD=17.33;ReadPosRankSum=-2.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:748,0,259 -Zv9_NA683 29420 . T G 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:54:782,54,0 -Zv9_NA683 29635 . C T 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.551;DP=46;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:919,0,599 -Zv9_NA683 29681 . C T 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.122;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=20.03;ReadPosRankSum=2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:629,0,416 -Zv9_NA683 41920 . G A 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -Zv9_NA683 119596 . G A 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:612,42,0 -Zv9_NA918 211 . TTG T 730.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.539;DP=24;FS=7.659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=30.45;ReadPosRankSum=-2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:17:768,17,0 -Zv9_NA918 2964 . A C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:359,0,488 -Zv9_NA918 5329 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=3.016;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,227 -Zv9_NA918 5753 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.218;DP=36;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:360,0,1184 -Zv9_NA918 5819 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-0.954;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,420 -Zv9_NA918 18866 . A C 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-3.331;DP=82;FS=7.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=18.70;ReadPosRankSum=3.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1562,0,1371 -Zv9_NA918 19288 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=1.354;DP=39;FS=3.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:319,0,1016 -Zv9_NA918 42355 . T G 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=-1.586;DP=116;FS=9.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:721,0,3336 -Zv9_NA918 43757 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=-1.736;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:375,0,1382 -Zv9_NA918 43758 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=15.08;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:375,0,1335 -Zv9_NA918 45423 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-0.294;DP=33;FS=8.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:287,0,872 -Zv9_NA918 45465 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.986;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:333,0,688 -Zv9_NA918 46683 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=-0.921;DP=28;FS=5.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:440,0,527 -Zv9_NA918 46973 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-1.536;DP=22;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:331,0,462 -Zv9_NA918 47076 . T C 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=1.992;DP=42;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:1071,0,290 -Zv9_NA130 80180 . G A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -Zv9_NA544 6911 . G A 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -Zv9_NA899 4444 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.791;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,206 -Zv9_NA899 40944 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.710;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:478,0,192 -Zv9_NA899 41446 . C G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.530;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:314,0,311 -Zv9_NA899 45361 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:278,0,58 -Zv9_NA899 45841 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -Zv9_NA899 46308 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -Zv9_NA899 81086 . G C 203.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.14;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:13:232,0,13 -Zv9_NA689 5425 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,335 -Zv9_NA689 5811 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=1.032;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:264,0,453 -Zv9_NA689 8192 . C T 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -Zv9_NA689 30828 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.088;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:360,0,408 -Zv9_NA807 23494 . G T 14125.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.615;DP=341;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=29.05;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,340:341:99:14154,1002,0 -Zv9_NA807 23668 . G A 3695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-4.437;DP=292;FS=11.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,101:292:99:3724,0,12503 -Zv9_NA807 23669 . A T 3695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.811;ClippingRankSum=-4.316;DP=289;FS=12.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,102:289:99:3724,0,12480 -Zv9_NA807 25435 . AACAGGTGCACTATCAGTTTTAATAAGCGGTTTCATTGAAGAACTGTTAGAAGTCCATTTCAGAACCATTTCTCAGTATCGGCTTACTTTATGATAATCTCTGTTATTGTTTTCATCT A 14650.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-1.570;DP=426;FS=7.150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=34.39;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,400:405:99:14688,1092,0 -Zv9_NA807 25708 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=3.645;DP=39;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=11.87;ReadPosRankSum=-3.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:491,0,1774 -Zv9_NA807 25709 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=3.145;DP=35;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=13.22;ReadPosRankSum=-3.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:491,0,1774 -Zv9_NA807 25742 . A G 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -Zv9_NA363 2866 . C T 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=-1.645;DP=144;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,55:144:99:2003,0,3119 -Zv9_NA363 21511 . G A 2563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=-2.375;DP=174;FS=18.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,76:173:99:2592,0,3189 -Zv9_NA787 59063 . G A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -Zv9_NA787 59082 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -Zv9_NA787 70959 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:317,0,54 -Zv9_NA787 78151 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,416 -Zv9_NA883 35418 . TCCTGAAAGAAAACACGATTTTAGTAAAACATATTTTTTCTTTAAAACATGCAAGGAGTGATGACTCCAGAAATAATGATGGTA T 4877.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=2.224;DP=165;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=29.56;ReadPosRankSum=-1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,133:141:99:4915,0,380 -Zv9_NA883 35598 . CACCTGCAATACACAACAATTAGCCATTGATTAAAAAGTGTTGAATTATGGTAACATCAGCAACATCAAATGTTGCACCT C 15499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=2.873;DP=373;FS=5.065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=32.41;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,360:371:99:15537,1347,0 -Zv9_NA984 1695 . G A 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -Zv9_NA732 64984 . A C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-0.561;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:531,0,493 -Zv9_NA732 84612 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.736;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=11.17;ReadPosRankSum=-2.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:274,0,469 -Zv9_NA732 84870 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.293;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:498,0,1236 -Zv9_NA732 84872 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:498,0,1230 -Zv9_NA732 84982 . G GT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.027;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:276,0,643 -Zv9_NA732 85085 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.438;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:648,0,1720 -Zv9_NA732 85086 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.463;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:648,0,1684 -Zv9_NA732 87320 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-1.073;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:292,0,524 -Zv9_NA732 96197 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.367;DP=39;FS=5.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:263,0,1109 -Zv9_NA732 113593 . A C 4335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.928;DP=202;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,124:202:99:4364,0,2692 -Zv9_NA732 113883 . T A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.215;DP=35;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:555,0,1293 -Zv9_NA732 113890 . T A 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-1.413;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:810,0,1214 -Zv9_NA732 124844 . G C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 -Zv9_NA732 124882 . A C 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -Zv9_NA732 125341 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.613;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:241,0,1058 -Zv9_NA542 17408 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -Zv9_NA542 17410 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -Zv9_NA994 41139 . T TTA 405.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.248;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:10:442,10,0 -Zv9_NA437 8694 . G A 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.029;DP=88;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.767;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1520,0,1517 -Zv9_NA437 23409 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-0.414;DP=37;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:483,0,660 -Zv9_NA437 35145 . A G 836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:63:865,63,0 -Zv9_NA437 35154 . T G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-1.398;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:354,0,331 -Zv9_NA437 35481 . T G 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -Zv9_NA224 2901 . C A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.725;DP=36;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:449,0,844 -Zv9_NA224 4761 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=-0.633;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:511,0,511 -Zv9_NA947 3643 . G C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-1.293;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:519,0,645 -Zv9_NA947 4447 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=1.381;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:481,0,606 -Zv9_NA947 4580 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.241;ClippingRankSum=0.168;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:560,0,3059 -Zv9_NA947 4601 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.637;DP=54;FS=4.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:563,0,3059 -Zv9_NA947 62648 . C T 656.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:685,48,0 -Zv9_NA947 62719 . G A 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:598,42,0 -Zv9_NA947 62907 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.228;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:328,0,370 -Zv9_NA947 63440 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,291 -Zv9_NA947 65774 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=2.217;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:412,0,482 -Zv9_NA947 67346 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.829;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=20.27;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:697,0,471 -Zv9_NA947 67440 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=2.499;DP=41;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:556,0,848 -Zv9_NA947 67591 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.468;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:271,0,822 -Zv9_NA947 67697 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.864;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:589,0,769 -Zv9_NA947 76103 . G T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=-1.782;DP=30;FS=9.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:271,0,721 -Zv9_NA947 96138 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=2.180;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=20.81;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:278,0,124 -Zv9_NA947 182124 . C A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-1.330;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=16.32;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:779,0,760 -Zv9_NA947 188484 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -Zv9_NA735 120394 . TA T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.595;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:261,0,1478 -Zv9_NA735 120609 . C T 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=-1.828;DP=31;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=27.38;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:877,0,189 -Zv9_NA735 120969 . C T 1394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.579;DP=83;FS=5.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:1423,0,1367 -Zv9_NA735 121558 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=33.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:95:230,0,95 -Zv9_NA735 122793 . G A 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-2.330;DP=75;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,32:75:99:1171,0,1462 -Zv9_NA735 134539 . G A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=0.630;DP=101;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:1280,0,1899 -Zv9_NA735 134587 . G A 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=-0.770;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:1386,0,1340 -Zv9_NA735 135927 . T A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-1.010;DP=52;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:634,0,1222 -Zv9_NA735 135942 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.699;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:623,0,1273 -Zv9_NA735 137138 . G A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.076;DP=72;FS=8.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.69;ReadPosRankSum=2.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:1014,0,1403 -Zv9_NA735 146157 . C T 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.433;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1443,0,2463 -Zv9_NA735 146466 . G A 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=-1.831;DP=81;FS=7.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=15.70;ReadPosRankSum=3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1300,0,1238 -Zv9_NA735 146579 . C T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-1.292;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1084,0,596 -Zv9_NA735 146667 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=1.177;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:780,0,362 -Zv9_NA735 146788 . T A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.143;DP=76;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:99:1003,0,1550 -Zv9_NA735 148333 . T C 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.406;DP=75;FS=6.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1302,0,1251 -Zv9_NA900 4747 . T A 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.059;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:869,0,287 -Zv9_NA900 6976 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,323 -Zv9_NA900 17661 . C T 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=-0.111;DP=142;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,40:142:99:1009,0,3855 -Zv9_NA694 37685 . C T 1244.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1273,87,0 -Zv9_NA694 37836 . A C 7334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.386;DP=264;FS=12.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,188:229:99:7363,0,630 -Zv9_NA694 37942 . G A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.521;ClippingRankSum=-1.482;DP=88;FS=24.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=13.35;ReadPosRankSum=-3.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1203,0,1777 -Zv9_NA694 37962 . T C 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:47:625,47,0 -Zv9_NA694 39254 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.101;DP=24;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:229,0,579 -Zv9_NA694 39260 . A T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.101;DP=24;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:263,0,499 -Zv9_NA694 39301 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.101;DP=24;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,229 -Zv9_NA694 40151 . G A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -Zv9_NA694 45808 . T C 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:93:1369,93,0 -Zv9_NA694 45816 . C A 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1369,93,0 -Zv9_NA992 2730 . C T 2013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-1.296;DP=167;FS=3.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,64:166:99:2042,0,3274 -Zv9_NA992 3785 . T G 2421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.202;DP=158;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=15.33;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:2450,0,2627 -Zv9_NA992 10030 . A T 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.446;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:990,0,680 -Zv9_NA265 12057 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.272;DP=30;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,830 -Zv9_NA276 16291 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-1.041;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:483,0,709 -Zv9_NA276 58875 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=1.448;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:233,0,2099 -Zv9_NA276 66792 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.457;DP=63;FS=3.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:830,0,1204 -Zv9_NA276 68260 . T G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=1.110;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.92;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:402,0,167 -Zv9_NA276 68595 . C A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.830;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=27.66;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:1024,0,295 -Zv9_NA276 68724 . A G 681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:710,48,0 -Zv9_NA276 68866 . T A 684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:713,51,0 -Zv9_NA276 69235 . A C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.655;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:498,0,580 -Zv9_NA276 69247 . G C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.132;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:363,0,561 -Zv9_NA276 69634 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:310,0,580 -Zv9_NA276 69768 . T A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-2.353;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=29.23;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:642,0,117 -Zv9_NA276 70010 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=-2.134;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:482,0,1132 -Zv9_NA276 71918 . T A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -Zv9_NA276 74812 . A G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.990;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:769,0,514 -Zv9_NA276 75747 . G A 1414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.733;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:99:1443,105,0 -Zv9_NA276 75843 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-2.701;DP=38;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:604,0,722 -Zv9_NA276 75858 . A T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.466;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:620,0,637 -Zv9_NA276 76188 . T C 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.422;DP=32;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:679,0,474 -Zv9_NA276 76233 . A T 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:414,30,0 -Zv9_NA276 76298 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=2.048;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:279,0,288 -Zv9_NA276 77368 . C T 1627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-1.588;DP=62;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,43:62:99:1656,0,510 -Zv9_NA276 77457 . G T 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-1.453;DP=82;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1241,0,1589 -Zv9_NA276 77574 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.808;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:634,0,328 -Zv9_NA276 77596 . C T 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:857,63,0 -Zv9_NA276 79268 . C G 1446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.783;DP=84;FS=2.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1475,0,1455 -Zv9_NA276 80264 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.601;DP=51;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:659,0,2436 -Zv9_NA276 80266 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.490;DP=52;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:659,0,2438 -Zv9_NA276 80793 . C A 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1624,117,0 -Zv9_NA276 80982 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-1.360;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:244,0,1331 -Zv9_NA276 81065 . G A 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.307;DP=78;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:943,0,1701 -Zv9_NA276 81102 . G A 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.460;DP=79;FS=6.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=21.55;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,50:79:99:1731,0,992 -Zv9_NA276 81767 . TCCTGCTAAGAGAAGAGATTTCACCGTGAGAGACCTGAAGACCTCAGGTGCTTCAAACTGGCAGGCAGTGATTTA T 652.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=-0.025;DP=71;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=9.19;ReadPosRankSum=-2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:690,0,4614 -Zv9_NA276 81771 . GCTAAGAGAAGAGATTTCACCGTGAGAGACCTGAAGACCTCAGGTGCTTCAAACTGGCAGGCAGTGATTTAC G 1476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.941;DP=70;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,42:70:99:1514,0,3539 -Zv9_NA276 82084 . A G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-0.022;DP=46;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:837,0,818 -Zv9_NA561 44522 . A G 233.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:262,21,0 -Zv9_NA561 44679 . C A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=17.74;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:596,0,514 -Zv9_NA561 49550 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.513;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:624,0,548 -Zv9_NA561 71152 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-2.472;DP=26;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:628,0,202 -Zv9_NA561 72253 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.131;DP=30;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:243,0,770 -Zv9_NA561 81424 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-1.030;DP=49;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:403,0,1285 -Zv9_NA561 81640 . C A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.061;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:774,0,159 -Zv9_NA561 96179 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.205;DP=30;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:421,0,1354 -Zv9_NA561 104377 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=1.116;DP=41;FS=9.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:647,0,730 -Zv9_NA409 23416 . G C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.137;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:413,0,530 -Zv9_NA904 2064 . A C 2578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-1.283;DP=75;FS=1.520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.145;QD=34.38;ReadPosRankSum=-1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,66:73:45:2607,45,0 -Zv9_NA904 8840 . AG A 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.67;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:53:324,0,53 -Zv9_NA904 8842 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.95;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:53:324,0,53 -Zv9_NA15 647 . C T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-0.586;DP=45;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:674,0,839 -Zv9_NA15 3127 . T C 411.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=34.32;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:2:438,2,0 -Zv9_NA15 6541 . T C 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.368;DP=67;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=29.07;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,55:67:99:1976,0,146 -Zv9_NA15 16672 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=19.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:307,0,291 -Zv9_NA981 726 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=3.489;DP=102;FS=11.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:312,0,7032 -Zv9_NA157 1245 . A T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.895;DP=82;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,42:82:99:1520,0,1456 -Zv9_NA257 74002 . C A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -Zv9_NA257 111345 . C T 281.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:310,0,19 -Zv9_NA851 23391 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -Zv9_NA851 23394 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -Zv9_NA851 24581 . G A 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 -Zv9_NA851 24967 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.324;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:293,0,526 -Zv9_NA851 25665 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-1.216;DP=34;FS=1.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=23.02;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:49:811,0,49 -Zv9_NA806 9036 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:241,0,218 -Zv9_NA203 44910 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.263;DP=54;FS=4.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:315,0,1626 -Zv9_NA470 77408 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.409;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:287,0,1609 -Zv9_NA466 5833 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-1.405;DP=231;FS=10.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,35:231:99:306,0,7381 -Zv9_NA466 17339 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=1.898;DP=183;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,30:182:99:378,0,5940 -Zv9_NA466 20543 . T A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.695;DP=284;FS=0.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,50:284:99:710,0,8972 -Zv9_NA466 27347 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-0.195;DP=89;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:382,0,2773 -Zv9_NA466 27905 . G A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.728;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1370,0,753 -Zv9_NA466 29805 . T A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.258;DP=71;FS=8.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:311,0,2152 -Zv9_NA466 29923 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-1.769;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:236,0,257 -Zv9_NA466 30333 . A G 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.245;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:853,0,1134 -Zv9_NA466 30516 . G T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.361;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=18.71;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:627,0,500 -Zv9_NA466 32502 . C T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.117;DP=50;FS=12.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:761,0,864 -Zv9_NA466 32514 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=2.563;DP=45;FS=16.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:559,0,926 -Zv9_NA466 32568 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=2.808;DP=42;FS=6.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:729,0,691 -Zv9_NA466 40338 . A T 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.066;ClippingRankSum=0.842;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,43:79:99:1386,0,1310 -Zv9_NA466 58654 . G A 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-1.173;DP=70;FS=6.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:1262,0,1147 -Zv9_NA466 61347 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=-0.245;DP=72;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:519,0,1938 -Zv9_NA466 67239 . G C 1582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=-0.772;DP=93;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1611,0,1630 -Zv9_NA466 72715 . T A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -Zv9_NA466 93961 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.395;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:281,0,2108 -Zv9_NA466 101268 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-1.606;DP=33;FS=4.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:260,0,778 -Zv9_NA466 101559 . T C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=-2.039;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:555,0,442 -Zv9_NA466 101640 . C T 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.111;DP=80;FS=7.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=17.12;ReadPosRankSum=2.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:1398,0,1263 -Zv9_NA466 143510 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.516;DP=69;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:285,0,2049 -Zv9_NA466 155844 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-2.981;DP=31;FS=9.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:231,0,820 -Zv9_NA908 63587 . A G 281.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.32;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:310,0,18 -Zv9_NA908 73827 . C T 274.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:303,0,17 -Zv9_NA908 84862 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.495;DP=77;FS=6.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1324,0,1315 -Zv9_NA908 87271 . A T 1995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.032;DP=100;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,61:100:99:2024,0,1317 -Zv9_NA908 87337 . G T 1893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-1.204;DP=94;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,59:94:99:1922,0,1163 -Zv9_NA908 87514 . A G 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.330;DP=45;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:766,0,730 -Zv9_NA908 90175 . TGGTAAGGGATCGTCTTGTCAACCGATGCATTCGGATGCAAGCTGCTCGATACTCAGGTGTGTTTATCTGCGCA T 4392.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=2.341;DP=101;FS=1.893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=27.68;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,96:101:99:4430,355,0 -Zv9_NA908 91436 . C G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -Zv9_NA908 91716 . G A 2073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.246;DP=81;FS=4.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,57:81:99:2102,0,586 -Zv9_NA908 91851 . A G 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=1.096;DP=63;FS=2.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1289,0,2484 -Zv9_NA908 92617 . C A 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.021;DP=87;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:1592,0,1362 -Zv9_NA908 92657 . T C 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=-0.892;DP=94;FS=1.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=18.50;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1767,0,1585 -Zv9_NA908 92793 . T TA 1599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.950;DP=71;FS=3.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,47:70:99:1637,0,566 -Zv9_NA908 93093 . T C 2859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.009;DP=114;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=25.09;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,78:114:99:2888,0,997 -Zv9_NA908 93434 . CTT C 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.396;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.256;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:40:365,0,40 -Zv9_NA908 104721 . G A 4992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.493;DP=193;FS=5.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,130:193:99:5021,0,1698 -Zv9_NA908 105799 . T C 1782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.276;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,48:68:99:1811,0,527 -Zv9_NA908 105994 . T G 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.435;ClippingRankSum=0.205;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1091,0,1440 -Zv9_NA908 106379 . A G 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-1.043;DP=68;FS=11.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:890,0,1551 -Zv9_NA908 106663 . C A 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.694;DP=36;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:1010,0,234 -Zv9_NA908 106683 . G T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.417;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:503,0,148 -Zv9_NA908 129311 . G T 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 -Zv9_NA908 129314 . A G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:400,30,0 -Zv9_NA55 2137 . A T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-1.501;DP=85;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:367,0,2578 -Zv9_NA55 9082 . G A 1972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.350;DP=69;FS=11.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=28.59;ReadPosRankSum=4.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,55:69:99:2001,0,239 -Zv9_NA55 9247 . C T 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.227;DP=163;FS=4.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,37:162:99:670,0,4538 -Zv9_NA55 13435 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-2.843;DP=168;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,41:168:99:857,0,7593 -Zv9_NA55 13507 . G C 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.747;DP=173;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,49:172:99:1170,0,4615 -Zv9_NA55 14454 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:234,0,64 -Zv9_NA55 19002 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.623;DP=182;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,40:182:99:760,0,5362 -Zv9_NA362 5327 . G T 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:485,33,0 -Zv9_NA362 5332 . A T 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:485,33,0 -Zv9_NA362 5758 . G A 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -Zv9_NA362 6056 . T G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -Zv9_NA820 1819 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=-0.257;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:240,0,1166 -Zv9_NA972 18803 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:234,0,708 -Zv9_NA972 18926 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.175;DP=65;FS=13.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:359,0,1851 -Zv9_NA972 18961 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.299;DP=68;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:435,0,1950 -Zv9_NA129 6149 . C A 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.927;DP=168;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:899,0,8975 -Zv9_NA129 6150 . A G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.823;DP=169;FS=4.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,39:169:99:899,0,8975 -Zv9_NA129 7218 . G A 2397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.101;DP=207;FS=6.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,73:207:99:2426,0,4560 -Zv9_NA786 94780 . G A 353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:382,30,0 -Zv9_NA784 9794 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -Zv9_NA784 9795 . T A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -Zv9_NA784 10505 . A G 709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:51:738,51,0 -Zv9_NA681 82985 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=14;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,110 -Zv9_NA866 11258 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=1.423;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:344,0,2517 -Zv9_NA48 75642 . C T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.616;DP=51;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:778,0,949 -Zv9_NA925 4479 . CGTGAGTACAGCAGCGATACACACACACACACACACACACACACAGATAACCACACTGCTCCCCAAGGCGTCACACAGTGATTGCGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGTGCGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGACACAG C 3228.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.885;ClippingRankSum=1.934;DP=105;FS=3.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,76:89:99:3265,0,3023 -Zv9_NA925 4861 . C T 4157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.107;DP=175;FS=5.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=23.76;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,120:168:99:4186,0,1167 -Zv9_NA925 4921 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=1.893;DP=159;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,34:158:99:637,0,4680 -Zv9_NA925 5443 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.570;DP=140;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,36:140:99:763,0,3867 -Zv9_NA925 6141 . C G 2414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.287;DP=146;FS=0.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:2443,0,2546 -Zv9_NA5 3294 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.340;DP=26;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,225 -Zv9_NA5 6155 . T C 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -Zv9_NA5 6506 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.589;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=5.54;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:344,0,135 -Zv9_NA5 6512 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=41;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:344,0,135 -Zv9_NA345 119070 . C G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -Zv9_NA345 119327 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,230 -Zv9_NA345 122976 . A T 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 -Zv9_NA345 126525 . C T 329.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.92;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:357,0,10 -Zv9_NA888 4115 . C G 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -Zv9_NA888 4141 . A AT 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:551,51,0 -Zv9_NA974 440 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,166 -Zv9_NA701 1459 . A C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DP=21;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:50:565,0,50 -Zv9_NA701 1499 . A C 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=-1.299;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=27.92;ReadPosRankSum=2.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1145,0,139 -Zv9_NA701 11136 . A G 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.717;DP=42;FS=1.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=25.80;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1112,0,221 -Zv9_NA18 2011 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.580;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:472,0,1493 -Zv9_NA279 2083 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-1.379;DP=140;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,28:139:99:457,0,4184 -Zv9_NA89 17457 . C T 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.795;DP=65;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.630;QD=20.43;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1356,0,785 -Zv9_NA89 19119 . C A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.378;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:578,0,619 -Zv9_NA89 19137 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.104;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:624,0,537 -Zv9_NA89 19283 . A G 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=-2.044;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:493,0,534 -Zv9_NA89 19298 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.919;DP=36;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:588,0,1016 -Zv9_NA89 22633 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.472;DP=54;FS=9.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=19.63;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1088,0,822 -Zv9_NA89 31454 . ACAGCAG A 297.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:28:335,28,0 -Zv9_NA89 31543 . C A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-1.742;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:585,0,606 -Zv9_NA89 33952 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.585;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=11.33;ReadPosRankSum=3.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:402,0,644 -Zv9_NA89 34622 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,316 -Zv9_NA89 34711 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.380;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:540,0,610 -Zv9_NA89 35003 . T A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:355,0,52 -Zv9_NA89 73562 . C T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.416;DP=116;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,42:116:99:1387,0,2582 -Zv9_NA89 85732 . GAGGTGAGATCAGACGGCGTGTGTTTTCCACACCACTGGAATATAACGCTGTATATACCGCTGCTTCTCTGAGCTCTTCTGTCCTCTTCTGTCCAC G 5272.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=1.769;DP=122;FS=2.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=30.60;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,119:122:99:5310,440,0 -Zv9_NA190 8433 . C T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -Zv9_NA190 8445 . G C 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -Zv9_NA684 2983 . G A 2549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2578,193,0 -Zv9_NA603 2616 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:340,0,159 -Zv9_NA603 3671 . T C 206.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:235,0,23 -Zv9_NA90 9600 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=25.34;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:99:410,0,540 -Zv9_NA231 1242 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-1.082;DP=47;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:339,0,1308 -Zv9_NA231 2624 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-1.790;DP=54;FS=4.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:440,0,1492 -Zv9_NA231 2814 . A T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-0.773;DP=92;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:477,0,2518 -Zv9_NA231 3518 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-1.508;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:323,0,1028 -Zv9_NA231 4123 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-1.050;DP=63;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:368,0,1804 -Zv9_NA163 18062 . G T 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-0.010;DP=107;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:1470,0,2312 -Zv9_NA163 19282 . G C 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.438;DP=105;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,34:99:99:1150,0,2259 -Zv9_NA163 24177 . GCCTGCAGAAAGAAAAGACGTTACACCTCGCACACAGACCGCCATTATTCAAGTTAGCTCCGACTAAAAACACGCTTAATAGTCAAACTTA G 3241.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.775;DP=83;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,78:83:5:3278,0,5 -Zv9_NA927 4969 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:347,0,215 -Zv9_NA927 5597 . T G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-0.113;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:418,0,153 -Zv9_NA927 5659 . C G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.962;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:484,0,110 -Zv9_NA927 5683 . A C 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.331;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=30.29;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:634,0,200 -Zv9_NA927 7346 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -Zv9_NA907 10637 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-1.925;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=31.15;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:92:1399,0,92 -Zv9_NA907 23094 . G A 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.022;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=30.42;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,47:56:99:1762,0,124 -Zv9_NA907 25202 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.250;DP=23;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=21.82;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:530,0,111 -Zv9_NA623 15865 . T C 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -Zv9_NA698 37394 . A G 1030.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1059,75,0 -Zv9_NA698 37486 . T A 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:536,39,0 -Zv9_NA698 38408 . T C 605.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:45:634,45,0 -Zv9_NA698 38839 . GT G 1866.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1904,154,0 -Zv9_NA698 40148 . C T 1183.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=39.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1212,93,0 -Zv9_NA698 41073 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -Zv9_NA698 43191 . T A 1443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1472,108,0 -Zv9_NA698 56365 . C A 5765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:5794,427,0 -Zv9_NA698 57431 . G A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -Zv9_NA698 57432 . G A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:354,24,0 -Zv9_NA698 58116 . A G 898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:927,66,0 -Zv9_NA698 58517 . C T 1781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1810,126,0 -Zv9_NA698 58636 . A G 893.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:922,66,0 -Zv9_NA698 58728 . C T 1564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1593,114,0 -Zv9_NA698 59042 . G A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -Zv9_NA698 59090 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -Zv9_NA698 59143 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:990,69,0 -Zv9_NA698 60372 . T C 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 -Zv9_NA698 60414 . C T 809.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.734;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=32.60;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:838,57,0 -Zv9_NA698 60608 . T C 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:49:714,49,0 -Zv9_NA698 60609 . G A 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:49:714,49,0 -Zv9_NA698 61037 . G A 3495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3524,241,0 -Zv9_NA698 61592 . G A 1647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-0.565;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=29.62;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,42:46:84:1676,84,0 -Zv9_NA698 62122 . C T 1357.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1386,96,0 -Zv9_NA698 62898 . T C 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:803,54,0 -Zv9_NA698 62962 . CT C 1371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1409,106,0 -Zv9_NA698 62985 . C T 1539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1568,108,0 -Zv9_NA698 63078 . G T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -Zv9_NA698 63085 . A T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:300,21,0 -Zv9_NA698 63786 . G GGA 901.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.069;DP=28;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=32.20;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:939,72,0 -Zv9_NA698 63965 . T G 1814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1843,129,0 -Zv9_NA698 64064 . A G 1487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1516,105,0 -Zv9_NA698 64112 . C T 1575.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1604,117,0 -Zv9_NA698 64181 . T A 3328.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3357,239,0 -Zv9_NA698 75201 . C A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -Zv9_NA698 86884 . G A 3157.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3186,223,0 -Zv9_NA708 11590 . C CAT 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=1.861;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=7.76;ReadPosRankSum=-2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:239,0,768 -Zv9_NA493 4990 . CGATAAGCGGCG C 946.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:93:984,93,0 -Zv9_NA493 7082 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-1.386;DP=30;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=12.93;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:416,0,300 -Zv9_NA92 3024 . C A 898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:927,66,0 -Zv9_NA92 15829 . G A 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:645,48,0 -Zv9_NA92 19005 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:315,0,165 -Zv9_NA92 19035 . A C 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:555,39,0 -Zv9_NA92 19908 . G A 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -Zv9_NA92 21741 . C A 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -Zv9_NA92 43917 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.655;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:459,0,469 -Zv9_NA946 1272 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.443;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:573,0,887 -Zv9_NA962 1252 . T C 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -Zv9_NA382 1275 . A G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-2.033;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:709,0,145 -Zv9_NA382 19643 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:366,0,152 -Zv9_NA382 58301 . T TTG 373.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.594;DP=20;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:26:411,0,26 -Zv9_NA382 58928 . G GA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:83:246,0,83 -Zv9_NA382 58930 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:83:246,0,83 -Zv9_NA590 4471 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -Zv9_NA590 4938 . C T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -Zv9_NA590 4980 . A T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -Zv9_NA463 28109 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=2.062;DP=23;FS=19.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.42;ReadPosRankSum=2.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:429,0,864 -Zv9_NA463 28110 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=2.062;DP=23;FS=19.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=17.42;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:429,0,864 -Zv9_NA463 28165 . G A 1319.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:93:1348,93,0 -Zv9_NA463 28172 . A G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=-1.489;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:583,0,520 -Zv9_NA463 29899 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=2.831;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=16.04;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:333,0,922 -Zv9_NA463 29906 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=2.738;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:333,0,931 -Zv9_NA463 30385 . C G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.246;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:248,0,967 -Zv9_NA463 30470 . C T 1476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:99:1505,108,0 -Zv9_NA463 30557 . T A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -Zv9_NA995 5186 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.704;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:460,0,477 -Zv9_NA995 21779 . G C 239.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:268,0,19 -Zv9_NA995 21905 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:323,0,247 -Zv9_NA585 446 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=1.867;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:637,0,1224 -Zv9_NA585 3351 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-0.783;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:313,0,1804 -Zv9_NA255 4975 . A G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -Zv9_NA255 11286 . T C 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 -Zv9_NA255 12126 . G T 813.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:842,60,0 -Zv9_NA255 12351 . C T 681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:710,51,0 -Zv9_NA132 15530 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.636;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=22.49;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:703,0,177 -Zv9_NA132 36067 . T G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=2.377;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:428,0,247 -Zv9_NA331 44183 . G A 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.690;ClippingRankSum=1.914;DP=150;FS=3.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,36:149:99:855,0,9645 -Zv9_NA331 44262 . C G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=1.517;DP=150;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,26:150:99:346,0,4643 -Zv9_NA383 10534 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.557;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:423,0,85 -Zv9_NA428 92030 . G C 245.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:274,21,0 -Zv9_NA428 92102 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -Zv9_NA913 14416 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=1.449;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:233,0,420 -Zv9_NA913 14825 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=3.087;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:426,0,1119 -Zv9_NA913 15233 . C T 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -Zv9_NA913 15256 . G A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:30:432,30,0 -Zv9_NA913 16754 . TGA T 487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:37:525,37,0 -Zv9_NA933 1013 . A T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:352,24,0 -Zv9_NA337 64885 . T TC 1407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.702;DP=190;FS=12.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.818;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1445,0,2219 -Zv9_NA337 65534 . G A 3733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-1.790;DP=183;FS=6.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,109:183:99:3762,0,2545 -Zv9_NA337 66344 . T G 3811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.420;DP=97;FS=13.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=25.31;ReadPosRankSum=-4.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,67:95:99:3840,0,635 -Zv9_NA337 66359 . GT G 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=-1.743;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,38:50:99:403,0,2973 -Zv9_NA337 66395 . A G 2359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.294;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=28.15;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:2388,0,1945 -Zv9_NA337 66513 . T A 1068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1097,81,0 -Zv9_NA337 66688 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-1.335;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:336,0,952 -Zv9_NA337 67542 . C T 8420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=-1.248;DP=446;FS=11.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=18.88;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,279:444:99:8449,0,5158 -Zv9_NA337 67667 . CACACACACACACACAT C 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=-2.403;DP=42;FS=1.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=12.04;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:543,0,922 -Zv9_NA337 67690 . A G 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,0:6:99:1595,0,622 -Zv9_NA337 67692 . A G 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=29.83;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:99:1595,0,669 -Zv9_NA337 68005 . C T 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.045;DP=94;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1622,0,1647 -Zv9_NA337 68697 . C G 4722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.447;DP=233;FS=0.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,131:226:99:4751,0,3012 -Zv9_NA337 68737 . C T 5440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.261;DP=258;FS=0.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.375;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,150:258:99:5469,0,3526 -Zv9_NA337 68904 . G A 4774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-1.760;DP=259;FS=5.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,150:259:99:4803,0,5787 -Zv9_NA337 69090 . C G 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.511;DP=278;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.250;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,67:278:99:1356,0,7744 -Zv9_NA337 69261 . T A 6909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-1.011;DP=286;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,191:286:99:6938,0,2510 -Zv9_NA135 17499 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,125 -Zv9_NA905 13646 . T A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:311,0,244 -Zv9_NA905 46236 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-1.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:366,0,403 -Zv9_NA905 46349 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:362,0,131 -Zv9_NA905 46383 . A G 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.364;DP=22;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:606,0,153 -Zv9_NA905 47150 . G C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.136;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.094;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:420,0,360 -Zv9_NA905 49020 . A C 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 -Zv9_NA905 49204 . T A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.517;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:609,0,400 -Zv9_NA905 49380 . T G 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -Zv9_NA905 50128 . A G 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:350,24,0 -Zv9_NA905 50515 . ATC A 274.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:312,22,0 -Zv9_NA783 18454 . G A 666.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.091;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:695,17,0 -Zv9_NA783 26626 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,246 -Zv9_NA783 26631 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:236,0,246 -Zv9_NA783 27004 . C A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -Zv9_NA783 27089 . G T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:311,0,98 -Zv9_NA783 27256 . C G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:255,0,126 -Zv9_NA62 7575 . T C 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:234,0,23 -Zv9_NA880 22869 . GAGCGTT G 658.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-1.378;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.097;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:34:696,34,0 -Zv9_NA399 22115 . T G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.162;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:573,0,273 -Zv9_NA675 159231 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.401;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:307,0,424 -Zv9_NA478 119 . TAC T 494.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.711;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:13:534,0,13 -Zv9_NA478 823 . T C 2035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2064,151,0 -Zv9_NA478 951 . T C 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:804,63,0 -Zv9_NA566 3327 . AAGGTCAGTGCACAGCTTCAGTGATGTGTGTTTAATATCCCGAGGTGCTACTGAATCTGTATGATCTGTGTCCTCCAC A 7633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.784;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=27.08;ReadPosRankSum=-2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,174:183:99:7671,585,0 -Zv9_NA398 30768 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.871;DP=23;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:263,0,477 -Zv9_NA429 5878 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.412;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:409,0,266 -Zv9_NA429 10040 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:276,0,158 -Zv9_NA429 10045 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=27.53;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:276,0,158 -Zv9_NA429 10448 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:335,0,372 -Zv9_NA429 15241 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,143 -Zv9_NA429 17230 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -Zv9_NA429 18431 . A T 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 -Zv9_NA429 19549 . G A 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 -Zv9_NA429 19606 . T TTC 360.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -Zv9_NA429 57571 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.460;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:558,0,451 -Zv9_NA429 63160 . C G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 -Zv9_NA429 63161 . A G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 -Zv9_NA813 6170 . G C 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.819;DP=20;FS=16.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=27.54;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:579,0,152 -Zv9_NA813 6172 . A G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=2.143;DP=19;FS=20.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=28.99;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:579,0,152 -Zv9_NA553 5900 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -Zv9_NA553 6153 . A C 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 -Zv9_NA824 43011 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:300,0,50 -Zv9_NA824 45650 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.932;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:289,0,120 -Zv9_NA824 46974 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -Zv9_NA824 87812 . C G 221.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:250,0,15 -Zv9_NA824 87979 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:36:292,0,36 -Zv9_NA534 8903 . G C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.713;DP=66;FS=5.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:647,0,2234 -Zv9_NA534 8982 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=1.389;DP=55;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.69;ReadPosRankSum=-3.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:616,0,1319 -Zv9_NA534 9214 . C G 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:476,33,0 -Zv9_NA534 9227 . T G 299.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 -Zv9_NA534 9311 . A G 1114.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1143,81,0 -Zv9_NA534 9355 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=1.942;DP=50;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:289,0,1377 -Zv9_NA534 13752 . TCCTGCAACACACACACACACACACGCACAGGTCAGTCAGTCAGTGTCACAGATCAGCTAGGGGTCAGATGTCACACACACACTCA T 2576.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=1.673;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2614,191,0 -Zv9_NA534 17182 . G A 1840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.003;DP=107;FS=7.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1869,0,1824 -Zv9_NA534 17339 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.484;DP=82;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=6.84;ReadPosRankSum=2.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:589,0,2137 -Zv9_NA501 72474 . T C 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 -Zv9_NA831 5075 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -Zv9_NA403 43537 . G C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:315,0,131 -Zv9_NA403 83797 . G C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-1.376;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:332,0,180 -Zv9_NA911 12938 . T A 2232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-1.935;DP=86;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,59:86:99:2261,0,722 -Zv9_NA911 14008 . A T 3027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-0.942;DP=178;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.029;QD=17.01;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,83:178:99:3056,0,3375 -Zv9_NA911 14089 . G A 3920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.562;DP=215;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=18.24;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,109:215:99:3949,0,3802 -Zv9_NA911 15107 . A C 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -Zv9_NA192 18252 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.266;DP=74;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:571,0,1942 -Zv9_NA166 1488 . C T 863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:892,60,0 -Zv9_NA166 1489 . C T 863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:892,60,0 -Zv9_NA166 2575 . CA C 248.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:286,27,0 -Zv9_NA166 4146 . A C 302.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.66;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:331,0,15 -Zv9_NA166 4357 . T G 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:803,57,0 -Zv9_NA166 7556 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.478;DP=23;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:541,0,201 -Zv9_NA166 7638 . A T 249.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.158;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:278,0,13 -Zv9_NA408 10522 . A C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.978;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:308,0,219 -Zv9_NA291 1005 . C T 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-1.761;DP=48;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,42:48:60:1577,0,60 -Zv9_NA167 1911 . G C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=1.370;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=23.25;ReadPosRankSum=2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:563,0,184 -Zv9_NA167 1962 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=2.196;DP=28;FS=3.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:565,0,383 -Zv9_NA189 19987 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -Zv9_NA395 34200 . A G 2423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.385;DP=73;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=33.20;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,56:73:99:2452,0,874 -Zv9_NA662 4397 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.209;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1194 -Zv9_NA662 4398 . T A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.162;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1183 -Zv9_NA662 4661 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.315;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:247,0,1119 -Zv9_NA662 6648 . T G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -Zv9_NA662 8457 . A T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.271;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.10;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:390,0,203 -Zv9_NA662 11435 . A C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:373,0,245 -Zv9_NA662 11575 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:270,0,183 -Zv9_NA662 11731 . G T 378.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.92;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:9:406,0,9 -Zv9_NA662 11743 . A G 378.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:9:406,0,9 -Zv9_NA662 13470 . G T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:238,0,134 -Zv9_NA563 5776 . A T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -Zv9_NA563 6049 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -Zv9_NA563 6057 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=32.67;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:51:320,0,51 -Zv9_NA563 6619 . C T 358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:387,30,0 -Zv9_NA384 16845 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:365,0,323 -Zv9_NA384 18806 . C T 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.114;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:739,0,478 -Zv9_NA384 57994 . GGGTAAAAAACACTGAGCATCATCATATCCGTCTGTCACTGAAGCGCTTGTGTTTCTCATCTCTCTTATTTCTGCA G 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=26.43;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:328,0,1650 -Zv9_NA384 60933 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-1.678;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.85;ReadPosRankSum=-2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,305 -Zv9_NA832 7811 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-1.356;DP=39;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:387,0,1013 -Zv9_NA706 2677 . C T 3429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.493;DP=198;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,96:198:99:3458,0,3390 -Zv9_NA706 11048 . C T 4674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.793;DP=254;FS=1.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,139:254:99:4703,0,4239 -Zv9_NA533 2457 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-1.447;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:237,0,282 -Zv9_NA119 1316 . A G 1843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=-2.047;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,56:96:99:1872,0,1405 -Zv9_NA119 1685 . G A 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-3.796;DP=64;FS=6.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:956,0,1167 -Zv9_NA119 2010 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=-1.905;DP=53;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:462,0,3030 -Zv9_NA119 2013 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-1.984;DP=53;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:459,0,3030 -Zv9_NA119 3111 . G A 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.482;DP=89;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:1284,0,1448 -Zv9_NA988 923 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=14.44;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:317,0,866 -Zv9_NA988 1985 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.550;QD=16.99;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:317,0,290 -Zv9_NA991 7116 . T A 1739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.534;DP=85;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,51:85:99:1768,0,1218 -Zv9_NA991 7206 . C T 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.076;DP=84;FS=9.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1466,0,1478 -Zv9_NA160 1397 . C G 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=-0.188;DP=75;FS=14.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1096,0,1525 -Zv9_NA160 1573 . G T 801.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=2.215;DP=72;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:990,0,1358 -Zv9_NA160 1951 . T A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.409;DP=50;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:1089,0,2237 -Zv9_NA160 2423 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=1.265;DP=51;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:800,0,1006 -Zv9_NA160 4788 . G T 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.091;DP=69;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1330,0,1020 -Zv9_NA897 16147 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.589;DP=26;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:459,0,725 -Zv9_NA897 16250 . ATG A 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=-1.858;DP=67;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:334,0,1222 -Zv9_NA600 8570 . G C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.639;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=26.40;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:477,0,46 -Zv9_NA107 55236 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.343;DP=151;FS=4.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:531,0,4590 -Zv9_NA378 7811 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=-0.272;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:590,0,212 -Zv9_NA378 7931 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.945;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=17.58;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:415,0,375 -Zv9_NA378 8098 . A C 294.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=29.48;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:20:323,0,20 -Zv9_NA378 10380 . T G 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -Zv9_NA923 2011 . A C 1722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.209;DP=107;FS=2.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1751,0,1760 -Zv9_NA923 4151 . C T 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.095;DP=82;FS=17.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,27:82:99:740,0,2134 -Zv9_NA923 10069 . A T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.168;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:78:641,0,78 -Zv9_NA963 4639 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.910;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:257,0,771 -Zv9_NA963 4657 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:99:257,0,771 -Zv9_NA963 11261 . G A 1642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.595;DP=328;FS=3.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,79:326:99:1671,0,9357 -Zv9_NA154 28377 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.531;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:285,0,91 -Zv9_NA154 28668 . C A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -Zv9_NA154 31606 . A T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.334;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:528,0,721 -Zv9_NA290 24423 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.88;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:257,0,97 -Zv9_NA290 24537 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,105 -Zv9_NA932 1073 . T A 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.293;DP=57;FS=4.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1253,0,1348 -Zv9_NA417 5626 . C T 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 -Zv9_NA261 5696 . A C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=-1.004;DP=71;FS=6.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:372,0,1847 -Zv9_NA261 10207 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.269;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:555,0,603 -chr1 20361 . G A 1994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2023,153,0 -chr1 37556 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=-2.391;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,344 -chr1 37616 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=28.34;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:340,0,52 -chr1 47585 . G T 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:591,42,0 -chr1 77838 . A G 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:694,54,0 -chr1 93242 . C T 551.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:580,42,0 -chr1 96385 . A G 1037.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1066,78,0 -chr1 98791 . G A 1031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1060,75,0 -chr1 144561 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=5.353;DP=70;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=3.57;ReadPosRankSum=-4.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:278,0,2107 -chr1 149197 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-1.151;DP=79;FS=5.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:373,0,2375 -chr1 152315 . C T 2162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-2.289;DP=89;FS=4.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=24.30;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,60:89:99:2191,0,740 -chr1 153011 . G C 1735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.209;DP=68;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,48:68:99:1764,0,509 -chr1 193439 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.219;DP=85;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:448,0,2338 -chr1 204800 . C T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-1.310;DP=78;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:957,0,1581 -chr1 232428 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.303;DP=57;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:255,0,1601 -chr1 232569 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.818;DP=72;FS=2.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:306,0,2161 -chr1 236381 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.294;DP=62;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:246,0,2411 -chr1 317603 . T G 310.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:6:338,0,6 -chr1 342286 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:99:1019,109,0 -chr1 345263 . GCCTGGAGAGAGACAGATGATGTTAACTCAAACTAGTCCTGCTGTTCTGAGTGTAAATGATGTAACACACACACAGACACACA G 2566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.121;DP=91;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=28.21;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,80:86:99:2604,0,128 -chr1 358970 . TCTGCAGACACAAAAACACTCAAGACCATCACTGTTAAACACTGTACAACATTCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAC T 974.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.757;DP=29;FS=7.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=33.61;ReadPosRankSum=-2.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:99:1012,0,441 -chr1 364000 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.665;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:771,0,729 -chr1 371646 . G C 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=-2.171;DP=65;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,36:65:99:1194,0,917 -chr1 424766 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.488;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:381,0,217 -chr1 430212 . CA C 225.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr1 430217 . C G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 -chr1 463223 . C T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=2.234;DP=78;FS=2.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:916,0,3477 -chr1 485990 . C A 14321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.501;DP=451;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.874;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,334:449:99:14350,0,6091 -chr1 485999 . A C 14321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.078;ClippingRankSum=0.487;DP=446;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=32.11;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,329:444:99:14350,0,5848 -chr1 500423 . G A 8167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.094;DP=320;FS=2.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,228:318:99:8196,0,2086 -chr1 546238 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.052;DP=53;FS=5.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:618,0,626 -chr1 548510 . G A 6507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=-2.312;DP=215;FS=2.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,176:215:99:6536,0,562 -chr1 560468 . CTCTGCAGGTGAGCGTACTGTAGTCAAACACCCTGCTGTGACCCTGCTCCTCCTATAACACACACCTGATGT C 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:472,0,112 -chr1 568504 . C T 3052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.756;DP=99;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=30.84;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,83:99:99:3081,0,216 -chr1 571487 . G T 2899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.687;DP=88;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,76:88:74:2928,0,74 -chr1 572567 . C T 2164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=3.493;DP=77;FS=21.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=28.11;ReadPosRankSum=1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,63:77:99:2193,0,202 -chr1 572661 . G A 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=3.828;DP=67;FS=8.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1326,0,788 -chr1 573969 . C T 5971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.507;DP=216;FS=3.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,166:216:99:6000,0,1043 -chr1 593614 . TCCTGCAGCACACAGAGGGTTACACAGACTCACACACACACACACACACACACACACACTCTACTGTAGAAACTGA T 1851.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=1.300;DP=56;FS=8.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=33.07;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,48:56:99:1889,0,1009 -chr1 624970 . C T 3182.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3211,238,0 -chr1 634046 . CACAGGTGAGTTCATAATTTGGATATTCATGAGCAGCGGCGCGGTGCTGATGCTGCAGCTGATATTGTGTGTTTACCTGATTCACGGTCAGGTTCATCTGTAAAGCGCCTCTTAACTGAATCTGTGTGAAACTGATCTGTCTTCATGTGTTCTGG C 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=2.074;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=31.21;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:443,0,1071 -chr1 638526 . C T 1097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1126,87,0 -chr1 638559 . T A 2207.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2236,166,0 -chr1 640869 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:567,42,0 -chr1 655201 . GAGGTCAGTGTGTGTTTGGGTGGGCAGCAGTTTGAAGCTGTGCTGCGTGTTTGTGGGTAATGATGTGGACACACACAGCTCTGACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTC G 3829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=3.539;DP=128;FS=3.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=29.92;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,114:128:99:3867,0,459 -chr1 658695 . TCA T 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.140;DP=60;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:394,0,745 -chr1 680891 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.200;DP=28;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,543 -chr1 681486 . A C 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-1.164;DP=44;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.021;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:755,0,268 -chr1 681493 . T G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.890;DP=49;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:755,0,258 -chr1 681613 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=1.991;DP=33;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:276,0,536 -chr1 684100 . A G 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.624;DP=74;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1169,0,1300 -chr1 684880 . A G 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.455;DP=67;FS=13.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1141,0,1103 -chr1 697201 . T C 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 -chr1 697546 . G A 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr1 766124 . A G 882.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:911,69,0 -chr1 779691 . TATATGTGTAGTGTGTGTGTATGTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGC T 1711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1749,155,0 -chr1 779928 . TG T 224.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.448;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=6.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:270,0,4 -chr1 779930 . TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG T 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.493;DP=36;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:41:242,0,41 -chr1 986525 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-3.379;DP=54;FS=6.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:296,0,1604 -chr1 997045 . C A 2840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.225;DP=175;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,87:175:99:2869,0,2903 -chr1 997622 . TCTACACACACACACACAAAAACACACACACACACAAAAACACACACACACCATGATGATGGTGATGAAACGGTCACTGCAGTGTATGAAAAGTTCACGATAC T 9459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=2.651;DP=247;FS=1.624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=29.64;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,239:245:99:9497,696,0 -chr1 997815 . A C 4657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.856;ClippingRankSum=-0.845;DP=264;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,133:264:99:4686,0,4317 -chr1 1001796 . C T 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-0.760;DP=169;FS=11.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,56:169:99:1537,0,4166 -chr1 1013803 . C T 3305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-2.341;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,96:195:99:3334,0,3369 -chr1 1021349 . T C 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.029;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:594,0,718 -chr1 1027049 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=1.847;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:430,0,259 -chr1 1029207 . C A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:403,0,640 -chr1 1075728 . C A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=-1.631;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:347,0,395 -chr1 1076359 . T A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.958;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:414,0,1677 -chr1 1078818 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.575;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:401,0,487 -chr1 1093026 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=1.012;DP=44;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:1031,0,1218 -chr1 1093029 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.901;DP=45;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:1031,0,1218 -chr1 1446910 . TGGTGCGAAATCAATGCATTTAACATAATTTCCATTATTTAAATCAACAGTGTTGGCTATGTAGTAAGATTCAATGGTGTTTTTCTTTATGCA T 7970.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.058;DP=195;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,190:192:99:8008,722,0 -chr1 1456143 . T C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.096;DP=167;FS=8.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=3.94;ReadPosRankSum=-3.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,37:167:99:687,0,5347 -chr1 1459974 . C T 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.723;DP=178;FS=3.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,48:178:99:1185,0,4989 -chr1 1460987 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.785;DP=160;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,25:160:99:263,0,5268 -chr1 1475023 . C T 3500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=-0.629;DP=394;FS=17.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.096;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,129:394:99:3529,0,17466 -chr1 1475932 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=-0.401;DP=351;FS=13.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,68:346:99:274,0,12396 -chr1 1478468 . GGGTGAGTACTGGCATTGCTATACTACGCATTTCCATGCGACGCGTTCCTTCAACGTGTTGTTTCTCCACA G 14559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.759;DP=343;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=30.58;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,318:321:99:14597,0,8255 -chr1 1478841 . G T 1332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.714;ClippingRankSum=-1.919;DP=405;FS=2.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=3.29;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,87:404:99:1361,0,12381 -chr1 1479426 . G A 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.808;DP=427;FS=1.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,89:427:99:1572,0,12914 -chr1 1480288 . C T 2721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.659;DP=373;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,111:373:99:2750,0,27579 -chr1 1480293 . TGGTAAGCACTGCATTTGATTGGTTCTATTTAATAGCTGGTTGGTGAGGTTAATAAATGATATTGTCCTGTTATCGTCAA T 2720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-3.090;DP=383;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,116:382:99:2758,0,27579 -chr1 1489002 . G GTC 907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-0.748;DP=86;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:945,0,1906 -chr1 1491996 . T C 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.702;DP=49;FS=16.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:714,0,1027 -chr1 1492139 . G A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.760;DP=78;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:725,0,2071 -chr1 1492176 . C G 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.551;DP=88;FS=4.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:1123,0,1969 -chr1 1492274 . G C 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=1.269;DP=51;FS=25.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.17;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1618,0,186 -chr1 1492695 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=-0.059;DP=72;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:439,0,2081 -chr1 1550022 . T C 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=-0.585;DP=218;FS=0.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=6.30;ReadPosRankSum=2.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,59:218:99:1401,0,6346 -chr1 1550217 . A T 1353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:1382,102,0 -chr1 1551848 . C T 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=-0.376;DP=246;FS=1.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=5.31;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,60:245:99:1334,0,7095 -chr1 1564574 . AAGGTAAACAACAAACAAACAAAGACTTAAAAGTTGGCTTATTGTTGATCTCATGAAAACATCCCTGGCTTGCTCATCTCTCC A 1542.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=1.019;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1580,148,0 -chr1 1565130 . T C 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=4.685;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:848,0,1225 -chr1 1568574 . A G 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr1 1568962 . C T 741.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=2.216;DP=21;FS=10.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=29.14;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:18:770,18,0 -chr1 1602563 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,102 -chr1 1602587 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.396;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:50:394,0,50 -chr1 1603093 . GT G 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=2.637;DP=15;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:248,0,416 -chr1 1603095 . ATGTCATATTTTGGGAACTTCCTTGACTGAATAATTCTGAAGACTCACATCTCAAACATATCTTCCACTTCAGGC A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=1.109;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:248,0,418 -chr1 1603300 . G T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=21.38;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:242,0,98 -chr1 1607338 . A AC 347.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr1 1607342 . G T 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:385,27,0 -chr1 1608081 . G A 980.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1009,69,0 -chr1 1608839 . G A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr1 1608844 . A T 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr1 1609029 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr1 1610407 . A T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr1 1610612 . G T 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 -chr1 1612582 . GA G 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:499,48,0 -chr1 1631288 . A C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=12;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=26.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:30:632,0,30 -chr1 1631310 . A T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=-0.592;DP=19;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=31.78;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:30:632,0,30 -chr1 1714191 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr1 1858564 . G C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.217;DP=51;FS=4.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:397,0,1361 -chr1 1886267 . A T 1393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.184;DP=72;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,43:72:99:1422,0,1011 -chr1 1942956 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.181;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:67:99:251,0,4028 -chr1 1942960 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.739;DP=63;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:251,0,4028 -chr1 1970068 . A G 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr1 1971185 . TA T 503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=1.561;DP=23;FS=13.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=21.90;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:58:541,58,0 -chr1 1971665 . C CA 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.508;DP=52;FS=4.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,35:51:99:1409,0,267 -chr1 1971675 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.437;DP=60;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,28:60:99:968,0,1503 -chr1 1972655 . T A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.759;DP=75;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:1370,0,1320 -chr1 1973879 . C CA 470.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:72:644,72,0 -chr1 1974194 . TTA T 1872.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1910,150,0 -chr1 2043750 . C T 2104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-1.309;DP=345;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,90:345:99:2133,0,9857 -chr1 2055852 . C CGT 3029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=-1.124;DP=122;FS=1.847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,85:91:99:3067,173,0 -chr1 2055960 . C T 2568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.314;DP=201;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,79:201:99:2597,0,4040 -chr1 2056045 . G A 1128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1157,81,0 -chr1 2056272 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-0.919;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:427,0,2407 -chr1 2058904 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.026;DP=44;FS=4.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:319,0,1148 -chr1 2166805 . T G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr1 2167092 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr1 2171812 . G A 201.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:230,0,25 -chr1 2183228 . T C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=1.283;DP=91;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:535,0,3769 -chr1 2200860 . G A 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-1.277;DP=68;FS=4.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1309,0,1020 -chr1 2201365 . TG T 534.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.175;DP=36;FS=2.593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:8:571,8,0 -chr1 2207217 . C A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr1 2703271 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr1 2704750 . G C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.288;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:373,0,295 -chr1 2704764 . A T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.102;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:322,0,385 -chr1 2705161 . A T 320.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:349,23,0 -chr1 2705218 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr1 2705990 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:250,0,388 -chr1 2706074 . A G 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:564,42,0 -chr1 2706107 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:346,24,0 -chr1 4173577 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-1.230;DP=156;FS=4.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.328;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,36:156:99:561,0,7546 -chr1 4244528 . C A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;ClippingRankSum=2.307;DP=85;FS=7.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:319,0,2640 -chr1 4244594 . A ATG 747.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-2.455;DP=93;FS=4.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:785,0,940 -chr1 4247866 . A T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.348;DP=104;FS=5.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:728,0,2985 -chr1 4254940 . A C 1087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-0.709;DP=118;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,39:118:99:1116,0,2998 -chr1 4264473 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.867;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.997;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:322,0,3490 -chr1 4283814 . A G 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.360;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1295,0,410 -chr1 4291807 . C CA 451.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.356;DP=364;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=1.24;ReadPosRankSum=3.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,68:360:99:489,0,8063 -chr1 4307806 . GT G 19856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-5.039;DP=273;FS=18.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=32.66;ReadPosRankSum=-5.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,23:258:99:19894,0,4763 -chr1 4320168 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.912;DP=56;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:297,0,1688 -chr1 4325117 . A G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:261,18,0 -chr1 4381489 . T C 1477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.911;DP=379;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.357;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:294,83:377:99:1506,0,11322 -chr1 4384476 . CACA C 5033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.543;DP=302;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.972;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,131:299:99:5071,0,15027 -chr1 4384477 . ACAGGTAAATATGGCCACACATCAGAGAGCTATTCAACCATGAATGCCATATTAATTTGAATGTTTGTTT A 5670.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-2.663;DP=299;FS=8.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,161:295:99:5708,0,9974 -chr1 4384480 . GGTAAATATGGCCACACATCAGAGAGCTATTCAACCATGAATGCCATATTAATTTGAATGTTTGTTT G 5033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.440;DP=284;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,120:284:99:5071,0,14810 -chr1 4384563 . T G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.164;DP=259;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=1.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,43:259:99:511,0,28027 -chr1 4392693 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.801;DP=168;FS=18.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=1.61;ReadPosRankSum=-3.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,30:165:99:299,0,6664 -chr1 4393877 . T TG 4085.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-1.732;DP=133;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=30.72;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:4123,390,0 -chr1 4395605 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=21.82;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:421,0,248 -chr1 4396687 . G A 7024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.385;DP=419;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,207:418:99:7053,0,7554 -chr1 4398403 . ACTGTTGGGTTGAAGGGAACAATGTCGGCATCAGATATGTATGCATATTAAGCTTTCATCAAAGCTTGAATTTCCTTTTTTAC A 15771.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=356;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,356:356:99:15809,1290,0 -chr1 4400679 . GTGCTGTAATTGCATAGAGTGAAAATAAAAGTTTAA G 9329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.157;DP=413;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,260:381:99:9367,0,3146 -chr1 4400716 . GTCATAGCGAGCAATGTCAGTCAATTAAATTTGAGAATTCACCTCAAATCAGCACTATTTAGGTAAAGCTACTTTGTAC G 9329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.378;DP=398;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=23.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,250:370:99:9367,0,3113 -chr1 4400882 . AACCTGATGTATGGAATACAGTTATTTCAATTATTGGCAATACCCCAACATCATAAAAAAAAACAAAAGTTTGTAATAAATTGAAGAAACTTCATACATTTTAGACACTAAAACAATAATAACCACAGTATACTTTAAATGAAGTGTCTTTGCATCCAATATTTTAAGTTTATAATCCCTGGGTTAGTTTATCCAGTGGTTGACAATTTTTTGGGCATTATGTATAGTTGCTT A 14367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.554;ClippingRankSum=6.843;DP=376;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,339:375:99:14405,0,1847 -chr1 4402783 . GCCTGAAAGTGAAGAAAAGCCATAAAAAAACATTAATAGTCAGAAAGCCCTGATACAAATGCCTTTAGCATGTGTGCTTA G 13390.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.207;DP=330;FS=3.024;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=27.33;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,326:330:99:13428,1090,0 -chr1 4405477 . TAATACAAAAGTAAAATACAAACAATATGATAACCCTCCTAGTGGAAGTTATCATAGTGCATTCCTCAAGAATGCA T 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,1:10:99:390,0,3506 -chr1 4407769 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=1.281;DP=61;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:288,0,1930 -chr1 4408926 . GCTAACGTGAAAAAGCAAAGAGGAATGAAGTCTAGTATTATTCTTGAACAGCAGTTCCTTTCATATCTTGTAATAGAGCTTATCCCTGGATCTACTAGACCTCAGTCTTTGTAGCAAGAAATAAACTACCTTTAGATTCAGGCAAAAGTAGGACTGGTTTAAATTAGTCTCATAGTAGCTTAC G 16333.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=-1.573;DP=358;FS=3.695;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=28.14;ReadPosRankSum=2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,352:358:99:16371,1398,0 -chr1 4425292 . G A 2965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=-2.034;DP=267;FS=8.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=11.11;ReadPosRankSum=4.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,92:267:99:2994,0,17790 -chr1 4425401 . ACTGAAAATCAAATCAGTCAAAAAAAACAAAAACAAATGGTAAGCACTTGATCCACTAATTCACACCCTATCGAAAAGACCAAGAAACTGATTTATTTTGGTATACCGTTACGATATTTTCTTGGTCAAAAGAGGCTCTGAGATGCACTTAC A 17356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=376;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,375:375:99:17394,1491,0 -chr1 4495682 . C CT 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-0.712;DP=200;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=2.14;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,42:181:99:465,0,3707 -chr1 4495925 . A G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=-2.578;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=11.87;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:883,0,1650 -chr1 4496394 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=-0.038;DP=98;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:379,0,3077 -chr1 4496776 . A G 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-2.371;DP=101;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:686,0,2766 -chr1 4497072 . A T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.376;DP=127;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,35:126:99:847,0,3083 -chr1 4497199 . T G 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.507;DP=144;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,32:144:99:643,0,4380 -chr1 4520097 . C T 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.216;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=22.06;ReadPosRankSum=3.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,39:59:99:1330,0,677 -chr1 4565543 . A G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-1.913;DP=89;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:728,0,2173 -chr1 4673240 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,259 -chr1 4673591 . T C 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:236,0,25 -chr1 5015547 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:230,0,471 -chr1 5038797 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.951;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,553 -chr1 5130430 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.176;DP=60;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:322,0,1628 -chr1 5221815 . TAC T 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr1 5231216 . TC T 462.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:500,48,0 -chr1 5383384 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr1 5522273 . G A 1070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-2.367;DP=138;FS=7.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:1099,0,3888 -chr1 5526478 . G GA 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-1.110;DP=85;FS=14.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:758,0,849 -chr1 6764393 . AT A 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=-3.387;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:331,0,517 -chr1 6771074 . G T,GT 2506.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,15,97:112:99:2953,2892,7351,343,0,107 -chr1 6885498 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr1 6885499 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr1 6890425 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.437;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:450,0,489 -chr1 6890575 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:261,0,250 -chr1 6890580 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:261,0,250 -chr1 7051796 . T G 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:43:632,43,0 -chr1 7051848 . T C 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:618,45,0 -chr1 7053516 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-0.382;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:375,0,638 -chr1 7053576 . A T 835.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:864,63,0 -chr1 7053840 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:361,0,370 -chr1 7055117 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-0.331;DP=34;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:692,0,398 -chr1 7055128 . G A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-1.283;DP=38;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:690,0,504 -chr1 7055270 . G T 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:598,42,0 -chr1 7055461 . C T 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr1 7664325 . A G 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-1.027;DP=81;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:711,0,2102 -chr1 8056540 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=-2.489;DP=18;FS=12.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=16.71;ReadPosRankSum=-2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:329,0,242 -chr1 8056656 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=-0.437;DP=29;FS=8.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:240,0,690 -chr1 8056659 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=1.711;DP=27;FS=9.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:245,0,594 -chr1 8183191 . ACTGATGAAGATACCATCAGAAAATCAATCAAAAATCTGGTTCTCTCGATAATTTTTTTATGCTAAAACACTGTGAATTGAGAATAGGCTAGTGAAGCTCTTTAC A 1500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=1.628;DP=34;FS=4.046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=27.81;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1538,140,0 -chr1 8204120 . ACTGAAATTATAAGACGAATGAAACATGAGCGAGTGATGGATAGTTTTAGTTCAGGTGTTTAAAATACACATGATGGTTTGTTAC A 1076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-1.317;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:88:1114,88,0 -chr1 8588441 . AATACCTGCAGCAGACAAAACCCTCTCTTACTCGGGAGGAAAAACAATCCAACATTGCATTCATAGTGTAAATCTCCACACACTG A 1817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=1.074;DP=54;FS=7.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=33.66;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,49:54:99:1855,0,550 -chr1 8719419 . T C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr1 9618296 . CGGTGAGACGCACTCTGACACACACACACACAAACACACATTCAGACCGATAGTCTTTCAGCAGGCTTTGTCAGCTGTCGCTGTCTGTTAACACA C 1077.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=-1.041;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1115,0,1328 -chr1 9872946 . ATG A 819.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:58:857,58,0 -chr1 9915080 . G GCC 468.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:36:506,36,0 -chr1 10962718 . G GA 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.313;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:327,0,524 -chr1 10963760 . G GT 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.773;DP=139;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1264,0,1213 -chr1 10964003 . CA C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.042;DP=148;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=3.30;ReadPosRankSum=-1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,34:128:99:525,0,2564 -chr1 10964690 . T C 1898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.379;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:1927,0,204 -chr1 10964703 . T C 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.176;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=20.62;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:1018,0,1660 -chr1 10964850 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.674;DP=78;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:274,0,2841 -chr1 10965691 . T C 1336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:96:1365,96,0 -chr1 10965692 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=1.345;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:99:330,0,811 -chr1 11043691 . TCCTGTGCAGATGTGCAAAAGAACAAAGCAGGTCATTTAATAAGCTACATTTATTGCAAATGTACAGTATGTGTTGATGGGGTTGCACCGA T 1049.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.036;DP=29;FS=10.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=35.55;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:99:1087,0,368 -chr1 11079903 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.914;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:340,0,1277 -chr1 11080071 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.282;DP=38;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:274,0,1075 -chr1 11080483 . TA T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.876;DP=30;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:347,0,602 -chr1 11080694 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.190;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:405,0,2428 -chr1 11080702 . G C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-0.251;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:405,0,2428 -chr1 11081082 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.023;DP=46;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:422,0,1219 -chr1 11081180 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=1.213;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.164;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:297,0,1294 -chr1 11081246 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.326;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:304,0,1815 -chr1 11081377 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.192;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:459,0,1659 -chr1 11082124 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=-0.036;DP=60;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=3.90;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:262,0,1805 -chr1 11082403 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-2.272;DP=50;FS=7.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:240,0,1530 -chr1 11082487 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.438;DP=55;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:266,0,1626 -chr1 11082733 . T G 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.263;DP=74;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:743,0,1680 -chr1 11083244 . T C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.887;DP=73;FS=8.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:694,0,1924 -chr1 11149230 . C G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=2.035;DP=47;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=7.34;ReadPosRankSum=-2.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:373,0,1263 -chr1 11170170 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.827;DP=58;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:346,0,1725 -chr1 11258855 . CCCTGGAATATAGCACATTTCTTAATAAATCTTTAAGAATAAAATATGTGAGTGTGTGTGTGCGTGTATTTGCACATTA C 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:299,0,684 -chr1 11290610 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr1 11290617 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr1 11290876 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr1 11292327 . A T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr1 11292462 . T C 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 -chr1 11293630 . C T 746.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:775,54,0 -chr1 11383599 . G A 365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:394,35,0 -chr1 11651184 . CGGTAAACGCAAACCTGACCCCTGGATGCTTTTATATAGATGCATTTAAAGTTTGAAGTTCATTTAGGGTTGACGAATGTTTCTCTTCA C 16149.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.707;DP=421;FS=6.013;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=28.06;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,418:421:99:16187,1354,0 -chr1 11691389 . CGTAGGTTTAGTCTATACAGTGTATTTCAGACATCAAGAAGAGATTTTCATTGCTAACATGCAACTTGTTATAATATTAATATTACAG C 1697.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.976;DP=40;FS=2.246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:99:1735,145,0 -chr1 12097463 . G GC 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.788;DP=50;FS=9.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:421,0,1546 -chr1 12125137 . C T 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.201;DP=76;FS=15.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:535,0,1805 -chr1 12147108 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.849;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:542,0,1647 -chr1 12153364 . T G 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-0.930;DP=68;FS=5.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:811,0,1560 -chr1 12153602 . A T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.175;DP=74;FS=6.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:344,0,4820 -chr1 12153610 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.666;DP=78;FS=3.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:344,0,4820 -chr1 12155248 . G A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.594;DP=86;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:728,0,2186 -chr1 12842288 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.096;DP=67;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:544,0,3558 -chr1 12842293 . T G 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.873;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.056;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,30:61:99:1145,0,1958 -chr1 12842401 . CAA C 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.479;DP=57;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:760,0,1256 -chr1 12842949 . C T 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.273;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:872,0,1154 -chr1 12843062 . C T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-1.735;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:693,0,2264 -chr1 12843335 . G T 1812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-2.871;DP=65;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=27.89;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:1841,0,716 -chr1 12843597 . C T 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.618;DP=91;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,37:91:99:1141,0,1731 -chr1 12873905 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.102;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:271,0,1460 -chr1 12900731 . A T 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:571,42,0 -chr1 12981871 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.606;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:326,0,1268 -chr1 13078316 . C G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;ClippingRankSum=-1.370;DP=101;FS=10.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:391,0,3034 -chr1 13296109 . AAGGTATGTACAAGATTAAATGATCAAATATTGTTAGTGTTTTTTAATTTTCTGCTAATTTTGCTCTCTGGTCGTTT A 3316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=1.371;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=29.44;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:3354,254,0 -chr1 13348182 . AG A 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.927;DP=46;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:314,0,1196 -chr1 13384347 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.309;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=24.06;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:341,0,248 -chr1 13384356 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=2.069;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=13.09;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:277,0,627 -chr1 13384484 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.025;DP=73;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:245,0,1947 -chr1 13384538 . A G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.162;DP=64;FS=5.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:640,0,1340 -chr1 13411867 . G A 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=2.246;DP=85;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.512;QD=11.04;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:967,0,1584 -chr1 13412027 . T A 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=3.925;DP=54;FS=10.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:962,0,1837 -chr1 13412037 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=2.743;DP=50;FS=20.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=17.74;ReadPosRankSum=-2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:915,0,2189 -chr1 13412078 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=2.336;DP=64;FS=10.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:483,0,1719 -chr1 13412121 . G A 1564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-0.173;DP=96;FS=2.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:1593,0,1731 -chr1 13412331 . G A 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.552;DP=74;FS=5.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:840,0,1539 -chr1 13412362 . T A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.437;DP=65;FS=8.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:346,0,4081 -chr1 13412460 . T C 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.330;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:912,0,907 -chr1 13412613 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.166;DP=90;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,33:89:99:1126,0,1955 -chr1 13412628 . C G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.852;DP=91;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:438,0,2724 -chr1 13412654 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.677;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:408,0,2434 -chr1 13412785 . T C 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.581;DP=67;FS=0.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:631,0,1751 -chr1 13412821 . G A 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=2.202;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1583,0,1150 -chr1 13412847 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.453;DP=88;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:440,0,2766 -chr1 13413123 . A G 1382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.827;DP=69;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1411,0,2093 -chr1 13972848 . C A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=1.968;DP=76;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:1023,0,1620 -chr1 14018044 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-0.639;DP=58;FS=4.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:409,0,3195 -chr1 14321274 . G T 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 -chr1 15202170 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.887;DP=21;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:423,0,269 -chr1 15375524 . C T 1895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.807;DP=83;FS=9.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,54:83:99:1924,0,1002 -chr1 15376406 . TCAGGTTTAGAATGTCATGTCATTCAATATCACATCAGTGTTTGTTTTAAAGGATATTGCTGAATTTTGCAGCTCGGTGTATTTGATCACTGCTTTGTCACTCAATG T 2301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.540;DP=71;FS=12.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=32.42;ReadPosRankSum=2.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,58:66:99:2339,0,535 -chr1 16187936 . A G 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-2.157;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,41:140:99:1031,0,3731 -chr1 16224475 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=3.098;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,18:104:99:246,0,3388 -chr1 16226744 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=1.045;DP=123;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,35:123:99:884,0,3469 -chr1 16226790 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.466;DP=136;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,40:136:99:1039,0,3679 -chr1 16238241 . A T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.014;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.193;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:653,0,3823 -chr1 16249567 . A C 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.970;DP=120;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:910,0,3018 -chr1 16251562 . C T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.143;DP=122;FS=8.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,32:122:99:727,0,3255 -chr1 16264530 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-3.332;DP=159;FS=6.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,33:159:99:516,0,8490 -chr1 16264773 . A AT 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-2.198;DP=130;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,37:122:99:458,0,2218 -chr1 16265065 . A G 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.450;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:1002,0,772 -chr1 16265365 . A G 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-2.004;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:1180,0,637 -chr1 16265996 . GT G 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-2.796;DP=97;FS=2.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=2.94;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:322,0,1770 -chr1 16266348 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.811;DP=36;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:332,0,1141 -chr1 16266359 . C CA 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.620;DP=47;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:735,0,483 -chr1 16277402 . C CA 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=-0.149;DP=100;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:289,0,2090 -chr1 16277503 . G A 1920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.108;DP=122;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1949,0,2405 -chr1 16277683 . A G 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=1.212;DP=50;FS=4.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=20.68;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:1062,0,1030 -chr1 16280059 . A G 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.577;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:864,0,1004 -chr1 16431374 . C G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=1.569;DP=34;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:297,0,926 -chr1 16437442 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:82:304,0,82 -chr1 16437754 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-1.630;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=8.12;ReadPosRankSum=2.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:548,0,1538 -chr1 16440195 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=1.545;DP=38;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:306,0,1100 -chr1 16440279 . C A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.190;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:708,0,691 -chr1 16440896 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.107;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=8.31;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:369,0,1415 -chr1 16483827 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,254 -chr1 16484054 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,338 -chr1 16487402 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.156;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:519,0,430 -chr1 16487424 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=-1.844;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=27.71;ReadPosRankSum=2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:915,0,236 -chr1 16491514 . GCTATATTAAACATTTAATAACATTTTAGTAATAGAACATCATTAGTGAATAGTCAAAATTAAAGTGCTAAAAAATACTTAC G 2173.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=1.667;DP=53;FS=3.263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=31.82;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2211,168,0 -chr1 16503503 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.589;DP=34;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:312,0,890 -chr1 16504400 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-0.607;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:488,0,463 -chr1 17318012 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.338;DP=44;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:232,0,1097 -chr1 17320170 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.256;DP=76;FS=5.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=6.26;ReadPosRankSum=2.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:504,0,2171 -chr1 17322213 . A T 727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:756,54,0 -chr1 17322373 . C T 360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:389,30,0 -chr1 17329260 . C G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.305;ClippingRankSum=0.039;DP=100;FS=5.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:371,0,3027 -chr1 17336220 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:356,0,246 -chr1 17337263 . T C 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-2.491;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=16.66;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:778,0,829 -chr1 17337942 . G A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.893;DP=49;FS=5.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:687,0,1434 -chr1 17400040 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.395;DP=91;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:359,0,2687 -chr1 17459809 . T G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=1.113;DP=67;FS=3.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=12.32;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:854,0,1419 -chr1 17468337 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-1.430;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:287,0,1799 -chr1 17468463 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-1.996;DP=79;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:240,0,2472 -chr1 17530422 . ACTACAGAGAATTACAGTCGTTTATAATCTGACATGCTGAATGAAAAGCAACACAAAATGCTAAACAACACTGAC A 3673.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=2.390;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=34.15;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:3711,288,0 -chr1 17539332 . G T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.159;DP=99;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:645,0,4274 -chr1 17609817 . G A 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-1.908;DP=265;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=5.03;ReadPosRankSum=2.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,65:265:99:1360,0,7243 -chr1 17666228 . T A 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.464;DP=341;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,78:339:99:1524,0,9594 -chr1 17674994 . A AAC 865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-1.069;DP=235;FS=7.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,50:207:99:903,0,5332 -chr1 17676006 . T TA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.700;DP=80;FS=2.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=3.73;ReadPosRankSum=-2.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:336,0,775 -chr1 17676291 . C A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.721;DP=122;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:583,0,3772 -chr1 17677148 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.148;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:406,0,2706 -chr1 17677198 . G GT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.516;DP=136;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,26:135:99:280,0,3408 -chr1 17677809 . A T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-2.310;DP=161;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,40:161:99:890,0,5082 -chr1 17677983 . A AT 797.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-0.041;DP=136;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:835,0,3500 -chr1 17678113 . T A 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-1.514;DP=211;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,59:211:99:1456,0,5879 -chr1 17678735 . GTT G 910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.226;DP=172;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,42:122:99:1263,0,2274 -chr1 17743863 . A T 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.109;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:939,0,1771 -chr1 17744269 . T G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.410;DP=61;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:326,0,1685 -chr1 17767235 . G T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-0.663;DP=42;FS=4.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:508,0,880 -chr1 17769991 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=1.637;DP=59;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:293,0,1786 -chr1 17776385 . CGTGAGTCACACTGAACACACCCACACGCAGACACGCTTAACAGGCTCATATGCATGCCTGTGTACATTTTCTGGCTTCTGTGCGTAG C 2535.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=1.674;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=29.19;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:2573,188,0 -chr1 17789668 . G T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.963;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:344,0,1957 -chr1 17809070 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.111;DP=36;FS=9.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:576,0,665 -chr1 17809390 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.791;DP=49;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:788,0,798 -chr1 17809912 . G A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=-0.689;DP=56;FS=9.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:933,0,983 -chr1 17847486 . G A 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.682;DP=80;FS=7.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:843,0,1827 -chr1 17847624 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;ClippingRankSum=0.584;DP=75;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:501,0,2076 -chr1 17874842 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:293,0,247 -chr1 17905833 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.594;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,579 -chr1 18097844 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-1.274;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:400,0,3034 -chr1 18097869 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.319;DP=41;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:405,0,3034 -chr1 18209941 . TA T 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.429;DP=24;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:275,0,227 -chr1 18305321 . CTG C 1079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.582;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:1117,0,1649 -chr1 18502573 . TA T 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.274;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=23.17;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:73:477,0,73 -chr1 18563974 . A C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr1 18564859 . T C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr1 18565557 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:229,0,67 -chr1 18566420 . G T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr1 18567086 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:93:242,0,93 -chr1 18567390 . A C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:46:413,0,46 -chr1 18568887 . T C 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr1 18573423 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,170 -chr1 18577377 . C A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr1 18583347 . ACTAAACACAACAATAAAACTCAGTGCATGATTAACAAGCAAATGTATGCGAATATTAATAGTTGGTTTAAATAC A 9399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=1.560;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=30.22;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,229:250:99:9437,0,877 -chr1 18608104 . CAGGTATAAACAAACCCAGACTTCATCATGTTCAGTAATGTATCAAACTGGCGTATCTAACTGTGTGTGTGCGCATTT C 1545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.384;DP=44;FS=3.107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1583,133,0 -chr1 18627752 . CGT C 1575.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1613,115,0 -chr1 18628531 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.884;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:249,0,470 -chr1 18628901 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:273,0,222 -chr1 18628913 . T G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:273,0,222 -chr1 18629245 . TA T 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.973;DP=32;FS=3.081;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=31.15;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:58:1034,58,0 -chr1 18701222 . GAGGTATGATCCATTTGAGGCCACATGATTAAGAAAATAATACGTTTTATCCACATTGACCAATCACTTTTTCTGTATCT G 2654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=1.083;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:3023,286,0 -chr1 18734847 . AT A 1272.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.698;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=28.28;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:89:1310,89,0 -chr1 18739020 . C T 1304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1333,93,0 -chr1 18850746 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=16.17;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,263 -chr1 18884930 . A T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr1 18950387 . G A 2167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2196,160,0 -chr1 18950510 . G A 2265.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2294,163,0 -chr1 18959646 . G A 1965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1994,138,0 -chr1 19650368 . T A 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr1 19650670 . A C 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.365;DP=31;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:1917,0,527 -chr1 19650699 . G A 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.382;DP=36;FS=16.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.26;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:99:1917,0,431 -chr1 19650733 . C A 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=2.000;DP=32;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.000;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:1916,0,602 -chr1 19650747 . A C 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-1.660;DP=37;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=28.42;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:1916,0,601 -chr1 19650785 . T G 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.980;DP=37;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=29.62;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,22:23:99:1916,0,554 -chr1 19650849 . A G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.639;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=31.25;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:99:747,0,778 -chr1 19650856 . AG A 710.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,21:21:99:748,0,778 -chr1 19651010 . T C 6682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6711,491,0 -chr1 19651102 . A C,T 2624.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,16,63:79:99:2845,2368,2436,489,0,341 -chr1 19651342 . T G 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-1.609;DP=76;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1011,0,1041 -chr1 19651359 . T A 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=1.674;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=28.27;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,39:49:99:1583,0,248 -chr1 19719505 . C T 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr1 19719602 . G T 2122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=-0.483;DP=83;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=25.58;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,55:74:99:2151,0,844 -chr1 19936586 . TACCTTAAGAAAAAGTAGCAGACAAAATTAAAAGAAATTGTCTAAATTGTCTATTTGACTTCTTAAATTCAGCTTAAGACCAA T 1549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=1.657;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,48:49:99:1807,0,557 -chr1 20124223 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=-1.135;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:473,0,1757 -chr1 20127711 . T C 1564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.044;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=29.45;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1593,114,0 -chr1 20431293 . G A 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr1 20556735 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=1.160;DP=30;FS=7.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:584,0,402 -chr1 20787051 . C T 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr1 21422059 . G GA 1069.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1107,102,0 -chr1 21451240 . T TAA 570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:608,47,0 -chr1 21451519 . A AC 244.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr1 21468906 . G GTTTGAGTTTGAGTGT 598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:44:636,44,0 -chr1 21579539 . G T 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:570,39,0 -chr1 21579547 . A C 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:39:570,39,0 -chr1 21580957 . T TA 862.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:900,63,0 -chr1 21619665 . GCCTAGAATGCAGGAAATACATCAAAGCTTTATCCACACACACATGCAAACACACACACTGCAGATGCTCTCAAATAAACATACTCA G 1244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=2.301;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=32.76;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,32:37:99:1310,0,818 -chr1 21619836 . TCTAAAAGCAATAATTATCAGTCATATTGTAAAACTTAATGATTTGACATAAATGAGTAAACAGTATAAATGTATTTCTTAC T 2500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=2.365;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=31.84;ReadPosRankSum=-2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:2538,194,0 -chr1 22097688 . AAG A 1062.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1100,105,0 -chr1 22111692 . AACCTGAGGCATGGAAAGAAAAAAATTGCGCACATGGTATTTAAAAGTCTTTTTTAAAAATAAAAACTACTACATTTGCAATTGCAAACATT A 7911.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.229;DP=198;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=34.22;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,196:198:99:7949,754,0 -chr1 22272537 . TGGTAAGTAAAATTATTAACAAAAAAGGTTATGCAATTCTGTCTTGATATTTACTGTCCGTTAATGTTTGTACA T 2372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=1.992;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:2410,195,0 -chr1 22639007 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.499;DP=82;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:456,0,2210 -chr1 22720543 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.439;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:840,0,867 -chr1 22988682 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=1.202;DP=48;FS=3.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:253,0,1444 -chr1 23028024 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-1.249;DP=40;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:345,0,961 -chr1 23029114 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=2.097;DP=36;FS=5.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:374,0,906 -chr1 23031022 . T A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.071;DP=34;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:494,0,1404 -chr1 23031032 . A T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.562;DP=29;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:494,0,1451 -chr1 23038438 . G T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.753;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:396,0,869 -chr1 23369072 . T G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=30.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:94:275,0,94 -chr1 23383056 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.640;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:494,0,626 -chr1 23764834 . C A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-1.096;DP=82;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=6.67;ReadPosRankSum=2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:575,0,2146 -chr1 24140619 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.168;DP=53;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:402,0,1451 -chr1 24300178 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.405;DP=54;FS=4.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:368,0,1573 -chr1 24347374 . A AT 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.547;DP=191;FS=2.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,43:174:99:458,0,3396 -chr1 24348302 . T A 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.668;DP=142;FS=1.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.772;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,42:142:99:1120,0,3911 -chr1 24348922 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-2.144;DP=199;FS=5.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,45:199:99:953,0,6145 -chr1 24353037 . C G 1617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.233;DP=304;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,76:304:99:1646,0,8712 -chr1 24479101 . T C 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:413,30,0 -chr1 24508449 . C A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-0.295;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,36:122:99:871,0,3134 -chr1 24513528 . G A 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.235;DP=134;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,46:134:99:1518,0,3049 -chr1 24535683 . G A 3181.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.141;DP=351;FS=23.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,116:351:99:3210,0,8941 -chr1 24536715 . G C 3197.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3226,248,0 -chr1 24536716 . TG T 3188.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3226,248,0 -chr1 24710128 . A AAC 314.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr1 24733957 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.489;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,629 -chr1 24815708 . A G 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 -chr1 24815733 . G A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr1 24928973 . A T 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=-0.223;DP=144;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,49:144:99:1704,0,3434 -chr1 24929534 . C G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.105;DP=183;FS=13.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,42:183:99:883,0,5560 -chr1 24982292 . T C 2801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.394;ClippingRankSum=-1.155;DP=433;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,119:432:99:2830,0,11385 -chr1 24989889 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.637;DP=33;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:464,0,648 -chr1 25175009 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=2.328;DP=69;FS=8.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:840,0,1522 -chr1 25266758 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.945;DP=81;FS=9.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:472,0,2287 -chr1 25266799 . A G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=-0.059;DP=67;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:778,0,1588 -chr1 25268661 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.095;DP=65;FS=3.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:417,0,1915 -chr1 25269083 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-0.410;DP=66;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:466,0,1892 -chr1 25274358 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:393,0,385 -chr1 25277050 . TACCTGTTAATGACGCACCATTTGAGACTACAGTCATAAATGAAGACAATACCTAGAGTATATATAACCCGTTAAAAATGACCC T 1808.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=2.377;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=34.06;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,43:50:99:1846,0,1000 -chr1 25327633 . A C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.520;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:294,0,1375 -chr1 25346140 . A G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.215;DP=132;FS=6.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,33:132:99:779,0,3966 -chr1 25346406 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.464;DP=78;FS=4.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:322,0,2434 -chr1 25347030 . A G 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.533;DP=104;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:793,0,2842 -chr1 25347620 . GA G 694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.683;DP=129;FS=1.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:732,0,4941 -chr1 25347806 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.557;ClippingRankSum=0.717;DP=145;FS=6.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,29:144:99:500,0,4511 -chr1 25350541 . A C 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=1.133;DP=137;FS=0.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=6.90;ReadPosRankSum=2.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,39:137:99:973,0,3675 -chr1 25358893 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-0.078;DP=81;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:609,0,2254 -chr1 25359108 . T C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-0.253;DP=86;FS=4.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:697,0,2216 -chr1 25359141 . T A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=1.704;DP=88;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1031,0,1876 -chr1 25389854 . TA T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=1.573;DP=75;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:342,0,1129 -chr1 25417785 . C T 1054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=30.19;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1083,84,0 -chr1 25424978 . C T 1054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1083,75,0 -chr1 25439222 . T G 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1317,99,0 -chr1 25481781 . A C 1172.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1201,84,0 -chr1 25592973 . C T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=1.280;DP=135;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,37:135:99:848,0,3640 -chr1 25627205 . TCCTGTCATCAACAAGGCGTTGGAATTAAATCCGACTTTAACCCTTCAAATACACAAAACACAAAATTGAACTTGTA T 16580.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=4.041;DP=389;FS=1.149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=29.50;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,378:389:99:16618,1310,0 -chr1 25645866 . T G 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.446;DP=55;FS=5.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:725,0,1273 -chr1 25646354 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.132;DP=80;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:885,0,1873 -chr1 25651759 . C G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.927;DP=82;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:637,0,2133 -chr1 25653905 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-0.247;DP=93;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:614,0,2481 -chr1 25666024 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.214;DP=71;FS=3.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:470,0,1923 -chr1 26262846 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-2.700;DP=29;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:276,0,721 -chr1 26262895 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.414;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:566,0,760 -chr1 26455743 . G A 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr1 26692622 . C A 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr1 26816934 . A T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr1 27831184 . T A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-1.044;DP=79;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:361,0,2335 -chr1 27891168 . T TA 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.137;DP=60;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:410,0,493 -chr1 27892556 . T C 342.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:371,18,0 -chr1 27892560 . T C 342.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:371,18,0 -chr1 27895675 . G C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.057;DP=80;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:388,0,2320 -chr1 27991735 . ACTAGTAAAGGAAGAAAACAACACTGCGATGAAACATGTAAGTTCGACGAGTTTTTTCTTACAACAATACATTTAACAACCAAAATACAGCGATATATTTGACAACGAAAAACTTAATCCACTTCTCAC A 1180.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.667;DP=67;FS=15.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1218,0,17704 -chr1 28030736 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-1.359;DP=168;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=4.09;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:715,0,4945 -chr1 28030833 . G T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=1.421;DP=104;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:784,0,2751 -chr1 28031379 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=1.935;DP=67;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.642;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:230,0,1999 -chr1 28094135 . A T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.858;DP=52;FS=8.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:490,0,1338 -chr1 28109552 . T C 669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:698,48,0 -chr1 28109599 . AAGGTATTGAACAAATGAATAGCACAATAGCAAAACGCAATGTAAAGCACACAATATACGCACACACACTCAGCTTCTTAGGGAGATTTGAGATTGTTTGAGGGGTTGAGGGTGAAAAAGATTCAAATGTGCAAATGCCTGTGAAAC A 919.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=2.266;DP=40;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:957,0,8183 -chr1 28109874 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.211;DP=18;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=32.60;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:31:615,0,31 -chr1 28109904 . A G 507.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.579;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:533,0,1 -chr1 28257387 . A G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.273;DP=17;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:48:553,0,48 -chr1 28257428 . G T 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 -chr1 28257451 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.079;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:37:563,0,37 -chr1 28438398 . G T 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:438,30,0 -chr1 28485525 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr1 28664128 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.523;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:330,0,1227 -chr1 28685405 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-1.437;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:384,0,2592 -chr1 28685406 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-2.253;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:384,0,2592 -chr1 28685521 . A C 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=1.634;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:538,0,2711 -chr1 28686859 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=-1.596;DP=61;FS=6.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=5.54;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:366,0,1667 -chr1 28702455 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-1.193;DP=44;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:246,0,1242 -chr1 28706360 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=2.228;DP=40;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:320,0,1140 -chr1 28706377 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=2.283;DP=35;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:234,0,1059 -chr1 28708999 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.253;DP=39;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:448,0,972 -chr1 28712003 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.957;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:422,0,1713 -chr1 28724489 . C T 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.992;DP=157;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,42:156:99:1018,0,4505 -chr1 28726741 . G A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.283;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,49:193:99:1097,0,5342 -chr1 28729043 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.545;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:432,0,997 -chr1 28732148 . A G 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=-0.434;DP=116;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,42:116:99:1314,0,2545 -chr1 28732526 . G A 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=-0.722;DP=137;FS=2.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:880,0,4454 -chr1 28732589 . C A 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.175;DP=143;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,46:142:99:1145,0,3553 -chr1 28743025 . T C 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.475;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:641,0,901 -chr1 28769312 . T C 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-6.620;DP=306;FS=7.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=4.59;ReadPosRankSum=2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,69:306:99:1432,0,15687 -chr1 28837153 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=1.439;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,35:143:99:788,0,3999 -chr1 28845932 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=1.309;DP=105;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:609,0,3012 -chr1 29020160 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr1 29064095 . T G 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=1.151;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=28.32;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:906,0,222 -chr1 29064156 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:384,0,819 -chr1 29064162 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:384,0,819 -chr1 29064444 . A T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.862;DP=80;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:655,0,2484 -chr1 29064501 . A G 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-1.628;DP=69;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.105;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1130,0,1190 -chr1 29066296 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.637;DP=63;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:291,0,1945 -chr1 29066791 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.221;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:336,0,1461 -chr1 29071086 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.90;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:291,0,141 -chr1 29071110 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=4.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.196;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:482,0,352 -chr1 29076879 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=1.262;DP=40;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:494,0,907 -chr1 29087779 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.349;DP=56;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:263,0,1435 -chr1 29115774 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.779;DP=46;FS=2.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:362,0,1182 -chr1 29163265 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-1.230;DP=60;FS=3.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:854,0,1194 -chr1 29332820 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:248,0,387 -chr1 29333141 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-1.528;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:327,0,392 -chr1 29334156 . G C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=-0.962;DP=36;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:315,0,843 -chr1 29335146 . A G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-0.483;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:512,0,767 -chr1 29427001 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.332;DP=68;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:280,0,2113 -chr1 29427273 . A T 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.976;DP=63;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:789,0,1398 -chr1 29429634 . G A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.020;DP=99;FS=4.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,27:99:99:672,0,2738 -chr1 29595156 . C G 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr1 29595276 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.226;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:593,0,340 -chr1 29595480 . G C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.041;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:377,0,389 -chr1 29605843 . T A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:347,0,351 -chr1 29818275 . A C 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.130;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:883,0,1726 -chr1 29885893 . T A 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr1 29910263 . A G 1249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1278,90,0 -chr1 29910418 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=1.180;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:279,0,1090 -chr1 29910479 . T A 1514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1543,111,0 -chr1 29910835 . A C 1745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-1.814;DP=54;FS=1.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=32.33;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,46:54:99:1774,0,108 -chr1 29911022 . T G 2025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=1.026;DP=69;FS=4.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=29.36;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,54:69:99:2054,0,287 -chr1 29911207 . T C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.337;DP=54;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:740,0,1181 -chr1 29911300 . T C 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.266;DP=35;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1078,0,121 -chr1 29911390 . T C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr1 29911782 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,101 -chr1 29911802 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:298,0,166 -chr1 30120456 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.993;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:864,0,924 -chr1 30476916 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:92:248,0,92 -chr1 30741817 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:451,0,237 -chr1 30962889 . TA T 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.845;DP=32;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:438,0,131 -chr1 30963401 . GCAGC G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.340;DP=72;FS=11.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:258,0,3043 -chr1 30963404 . GCCTGAAAATCCAAATCCAATAGTCATATAAAGCAGAGAGTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAATCAAATCCAATATTGTCTGACCTGATGGCACTTA G 837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.074;DP=73;FS=3.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:875,0,2480 -chr1 30963408 . GAAAATCCAAATCCAATAGTCATATAAAGCAGAGAGTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAATCAAATCCAATATTGTCTGACCTGATGGCACTTA G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.238;DP=70;FS=10.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:255,0,3506 -chr1 30966141 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-2.049;DP=60;FS=11.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:346,0,1754 -chr1 30986520 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.254;DP=41;FS=4.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:552,0,927 -chr1 30987754 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.888;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:396,0,1472 -chr1 31050272 . C G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.431;DP=78;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:536,0,2158 -chr1 31051981 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.401;DP=89;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:474,0,2601 -chr1 31108431 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.134;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:284,0,1345 -chr1 31111873 . GGGTACTGATGGCATGTTTTCAGCTGTATATGTTTATAGACTGTTTATTTTTATATTCTGTTGCCTACTGATCGCAGTCATTTTCTCATCA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=2.202;DP=14;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,3871 -chr1 31114082 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.267;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:369,0,982 -chr1 31153567 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=-2.773;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:627,0,421 -chr1 31263534 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-1.642;DP=166;FS=0.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,39:166:99:848,0,4971 -chr1 31319272 . G A 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=-0.826;DP=188;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,51:188:99:1194,0,5234 -chr1 31416275 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.822;DP=65;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:247,0,1875 -chr1 31432169 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.469;DP=80;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:484,0,2160 -chr1 31433244 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.179;DP=44;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.423;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:649,0,879 -chr1 31433422 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.132;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:346,0,1035 -chr1 31433706 . GA G 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.116;DP=44;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.271;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:678,0,161 -chr1 31471585 . C T 618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:647,45,0 -chr1 31471678 . G T 560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:589,42,0 -chr1 31926459 . C T 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr1 32016908 . T C 674.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:703,48,0 -chr1 32052178 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr1 32052197 . A C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr1 32052280 . G T 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr1 32997892 . G A 1751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1780,129,0 -chr1 32998361 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:433,33,0 -chr1 33020913 . AT A 1990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=1.470;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=28.44;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,65:66:99:2028,193,0 -chr1 33021500 . C CA 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:246,23,0 -chr1 33024192 . AT A 216.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:254,24,0 -chr1 33024205 . A G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr1 33028405 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.888;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:285,0,930 -chr1 33029043 . T C 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=1.319;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=32.15;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:1025,0,134 -chr1 33029284 . T C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.889;DP=24;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:730,0,178 -chr1 33201395 . A AT 1233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=1.145;DP=82;FS=21.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=15.05;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,50:72:99:1292,0,375 -chr1 33201657 . G T 4148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=1.138;DP=91;FS=7.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,59:90:99:4177,0,1521 -chr1 33330278 . G A 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr1 33331008 . C A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.548;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:93:654,0,93 -chr1 33882732 . C G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,213 -chr1 34009064 . G C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.140;DP=28;FS=7.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:837,0,128 -chr1 34045797 . T A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.962;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.321;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:501,0,210 -chr1 34046447 . A C 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.020;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=27.45;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:989,0,192 -chr1 34046964 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:232,0,61 -chr1 34226983 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.281;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:509,0,160 -chr1 34227681 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,123 -chr1 34309646 . G A 777.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.460;DP=25;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=31.08;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:12:805,0,12 -chr1 34328084 . A T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.167;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:664,0,146 -chr1 34328865 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:94:262,0,94 -chr1 34331233 . T C 217.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:246,0,24 -chr1 34332432 . A T 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 -chr1 34339237 . A AT 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.597;DP=34;FS=5.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:463,0,542 -chr1 34340639 . T C 3725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=-0.205;DP=115;FS=27.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,94:114:99:3754,0,373 -chr1 34343965 . A T 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:236,0,24 -chr1 34888395 . T A 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 -chr1 35120671 . T A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=-1.496;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:263,0,1434 -chr1 35133331 . T C 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 -chr1 35133338 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:251,0,53 -chr1 35190239 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr1 35190245 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:258,18,0 -chr1 35316726 . A AG 313.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:351,29,0 -chr1 35321558 . T A 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:805,54,0 -chr1 35322087 . CT C 278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:316,21,0 -chr1 35361886 . GA G 262.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:300,30,0 -chr1 35520030 . T TG 2141.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2179,150,0 -chr1 35605250 . GA G 572.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.413;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:610,60,0 -chr1 35605801 . G C 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-2.387;DP=89;FS=4.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=33.96;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,76:89:99:3051,0,128 -chr1 35606084 . A G 3619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=1.072;DP=110;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=32.91;ReadPosRankSum=-1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,96:110:59:3648,0,59 -chr1 35623643 . G A 3023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.811;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=27.49;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,81:110:99:3052,0,697 -chr1 35726818 . CA C 460.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:35:498,35,0 -chr1 35728200 . TC T 337.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=-0.913;DP=19;FS=3.039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:2:373,2,0 -chr1 35728243 . G A 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.350;DP=37;FS=1.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=28.86;ReadPosRankSum=3.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1096,0,193 -chr1 35729360 . G A 1883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.113;DP=73;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=25.81;ReadPosRankSum=2.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,50:73:99:1912,0,646 -chr1 35730903 . C CT 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.646;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:520,0,231 -chr1 35734858 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-1.064;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:384,0,335 -chr1 35740437 . T C 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.575;DP=84;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=24.29;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,57:84:99:2069,0,700 -chr1 35826708 . T C 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.077;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1762,0,537 -chr1 35827161 . G A 2392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=1.126;DP=78;FS=10.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.129;QD=30.68;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,64:78:99:2421,0,229 -chr1 35827520 . G A 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.054;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,40:52:99:1492,0,261 -chr1 35827584 . T C 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-1.201;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=27.11;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,53:69:99:1899,0,277 -chr1 35827717 . A G 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.467;DP=55;FS=19.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1068,0,800 -chr1 35854289 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr1 35854496 . A G 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:591,42,0 -chr1 35856404 . G A 755.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:784,57,0 -chr1 36056873 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.888;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=29.27;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:438,0,52 -chr1 36057015 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.271;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:360,0,839 -chr1 36057269 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.831;DP=14;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=17.63;ReadPosRankSum=2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:275,0,174 -chr1 36145018 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.022;DP=35;FS=1.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:991,0,105 -chr1 36146954 . A AC 1044.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.192;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.259;QD=24.87;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1082,0,180 -chr1 36147131 . T A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.457;DP=31;FS=9.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=26.22;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:841,0,261 -chr1 36147588 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.879;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:564,0,336 -chr1 36410062 . C CA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.489;DP=27;FS=12.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.66;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:352,0,386 -chr1 36410114 . C T 1288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.911;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1317,0,452 -chr1 36410719 . C A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-1.302;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:499,0,109 -chr1 36411386 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,264 -chr1 36458002 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.567;DP=21;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.746;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:67:654,0,67 -chr1 36463337 . G T 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.829;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:31:881,31,0 -chr1 36471462 . C A 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:658,48,0 -chr1 36620282 . C T 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-0.571;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:1882,0,330 -chr1 36620737 . G A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.016;DP=37;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:858,0,441 -chr1 36620840 . C CA 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=29.36;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:86:507,0,86 -chr1 36643924 . C A 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr1 37046132 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:533,39,0 -chr1 37062205 . C T 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:592,42,0 -chr1 37062235 . G A 1358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1387,102,0 -chr1 37209120 . A G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.813;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:631,0,982 -chr1 37422173 . GGGTGAGGAAATTCTTATTAATATTACATGTAGTCATGAAAAATTGTAAGTGTTACTATTATTGTCATTTTTTCAGTA G 601.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.868;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:639,0,351 -chr1 37422443 . C T 1540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.150;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,41:55:99:1569,0,643 -chr1 37422501 . C T 815.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.927;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=31.38;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:22:844,22,0 -chr1 37429154 . G A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 -chr1 37429163 . G A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:529,36,0 -chr1 37484906 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=1.534;DP=56;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:477,0,1382 -chr1 37484939 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.285;DP=53;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:353,0,1385 -chr1 37535055 . A C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 -chr1 37586600 . G A 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr1 37602403 . G T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.237;DP=21;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=27.85;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:645,0,103 -chr1 37828196 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.286;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:335,0,368 -chr1 38579694 . TCTAGAAGAGAGAGAGAAAATTAAAATAAAAAACTAAGAAAAATAGTCACACAAGACTTCAGAAGCACATTTGCACGCTACTCAC T 12651.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-0.743;DP=293;FS=4.301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=24.95;ReadPosRankSum=-2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,288:293:99:12689,947,0 -chr1 38827438 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,293 -chr1 39003945 . GA G 2643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.622;DP=195;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,113:180:99:2681,0,1443 -chr1 39020253 . G A 5862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-0.546;DP=416;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,168:416:99:5891,0,8239 -chr1 39063802 . G T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=24.29;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:344,0,139 -chr1 39159748 . A G 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.964;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:549,0,581 -chr1 39160022 . C T 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=-1.573;DP=44;FS=5.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=23.90;ReadPosRankSum=-1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1080,0,387 -chr1 40063026 . T C 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.765;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1112,0,1262 -chr1 40134753 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.543;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:647,0,1846 -chr1 40136753 . C T 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.736;DP=88;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:1433,0,1618 -chr1 40137419 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-1.387;DP=75;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,29:75:99:991,0,1537 -chr1 40137659 . C T 1752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.440;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1781,0,1821 -chr1 40140364 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.367;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:655,0,763 -chr1 40140503 . A T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.517;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:534,0,727 -chr1 40140905 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=1.950;DP=49;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:759,0,2036 -chr1 40140910 . T C 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.917;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:759,0,2050 -chr1 40141189 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.099;DP=44;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:549,0,2113 -chr1 40141191 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.548;DP=43;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:549,0,2122 -chr1 40141493 . TA T 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.264;DP=55;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:693,0,1008 -chr1 40175983 . G C 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.461;DP=36;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:442,0,804 -chr1 40232634 . G GT 703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.034;DP=43;FS=9.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:754,0,127 -chr1 40233064 . T A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-1.370;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=30.44;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:64:637,0,64 -chr1 40234391 . T A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr1 40234478 . A T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr1 40242508 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.432;DP=28;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:767,0,216 -chr1 40243335 . AG A 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,575 -chr1 40244399 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=20.83;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:62:299,0,62 -chr1 40244683 . A G 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.349;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:89:749,0,89 -chr1 40247893 . C A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.116;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=27.11;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:41:571,0,41 -chr1 40248513 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:399,0,193 -chr1 40248658 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr1 40248789 . G A 746.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:775,54,0 -chr1 40248990 . G A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr1 40249239 . G T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr1 40249357 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:307,0,55 -chr1 40249882 . CT C 243.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:281,27,0 -chr1 40250124 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.52;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:58:386,0,58 -chr1 40250158 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=30.52;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:30:425,0,30 -chr1 40250245 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=24.06;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,129 -chr1 40250496 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:391,0,173 -chr1 40251424 . CACCTGAGAACAATCCACACGCAATAAATAATGAGAAATGGAACAAATATCACATGATTTAAATGAAGGCGACCTGAGAGATTTAATTAACTTCAGCTTAAAAATCTCATGCTGAAGTTTATGAATAGAGTTTGTT C 4648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=2.909;DP=137;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=33.93;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,120:137:99:4686,0,2101 -chr1 40252063 . G A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr1 40252490 . T C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr1 40262191 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.104;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:401,0,498 -chr1 40262584 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.160;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.139;QD=20.48;ReadPosRankSum=-2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1052,0,677 -chr1 40263278 . C T 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.414;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=28.02;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1093,0,275 -chr1 40264186 . A AT 553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:51:591,51,0 -chr1 40264257 . T C 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.893;DP=32;FS=4.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:909,0,118 -chr1 40269819 . A C 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=1.667;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:838,0,154 -chr1 40270139 . C T 763.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.698;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:1:789,0,1 -chr1 40339454 . C T 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:835,63,0 -chr1 40339519 . T A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.690;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=25.10;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:480,0,112 -chr1 40339646 . G C 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:626,48,0 -chr1 40344322 . A G 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.220;DP=66;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,49:66:99:1857,0,406 -chr1 40346153 . T C 214.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:243,0,25 -chr1 40372054 . T C 2886.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2915,205,0 -chr1 40372164 . A T 551.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:580,39,0 -chr1 40372199 . C A 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 -chr1 40389291 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.065;DP=31;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:884,0,256 -chr1 40395083 . T A 7100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.178;DP=254;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=27.96;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,191:254:99:7129,0,1388 -chr1 40395103 . A C 7333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=-0.999;DP=251;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=29.22;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,189:251:99:7362,0,1428 -chr1 40395343 . A G 5916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=1.365;DP=225;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=26.30;ReadPosRankSum=-1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,162:225:99:5945,0,1529 -chr1 40395378 . G C 5523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.439;DP=209;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,147:209:99:5552,0,1555 -chr1 40401076 . C T 7165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=1.357;DP=230;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=31.16;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,174:230:99:7194,0,3164 -chr1 40401077 . A G 7165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=1.248;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,170:226:99:7194,0,3155 -chr1 40401398 . T A 5962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.384;DP=203;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,155:203:99:5991,0,1039 -chr1 40401553 . A G 4515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-1.003;DP=138;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=32.72;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,114:138:99:4544,0,383 -chr1 40401681 . C CTA 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=2.704;DP=48;FS=9.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=10.60;ReadPosRankSum=-3.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:546,0,1060 -chr1 40401695 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-1.466;DP=28;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=7.81;ReadPosRankSum=-2.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:247,0,712 -chr1 40401769 . AT A 904.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=-0.705;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:942,0,271 -chr1 40407783 . C T 3208.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=6.088;DP=169;FS=13.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,99:162:99:3237,0,2075 -chr1 40417400 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.092;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=20.06;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:289,0,242 -chr1 40420082 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=23.29;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,124 -chr1 40420726 . C A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=2.729;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=26.49;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:452,0,122 -chr1 40421131 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.820;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=33.57;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:36:599,0,36 -chr1 40421681 . T C 243.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:8:271,0,8 -chr1 40437080 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.718;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:407,0,131 -chr1 40447768 . CAG C 1592.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-1.509;DP=57;FS=8.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,40:57:99:1630,0,571 -chr1 40448658 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.792;QD=14.91;ReadPosRankSum=-2.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:237,0,262 -chr1 40453378 . T C 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=1.070;DP=70;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=28.21;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,54:70:99:2003,0,331 -chr1 40453687 . G A 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.193;DP=76;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.959;QD=30.31;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,63:76:99:2332,0,195 -chr1 40453803 . C T 1942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=-1.816;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=32.38;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,52:60:41:1971,0,41 -chr1 40455111 . T G 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.981;DP=59;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,40:59:99:1508,0,558 -chr1 40458817 . G A 2166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.799;DP=68;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=31.86;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,57:68:99:2195,0,153 -chr1 40500393 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.733;DP=48;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:459,0,1152 -chr1 40504789 . C A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.339;DP=40;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:830,0,565 -chr1 40505231 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=22.99;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:488,0,332 -chr1 40505340 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.358;DP=35;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:358,0,1829 -chr1 40509341 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.610;DP=36;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.310;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:736,0,500 -chr1 40509407 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.159;DP=47;FS=8.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:289,0,1356 -chr1 40509695 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.564;DP=112;FS=10.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,24:112:99:455,0,3378 -chr1 40509863 . G A 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.854;DP=125;FS=0.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:2114,0,2219 -chr1 40510310 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=-1.552;DP=84;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:1008,0,1334 -chr1 40512735 . GCTGCAGGAGAGAATGATTATGTGAATGTATCTGGTCTAACTTCAAGAGTCAGTGAAGGAAACACTAGTTTAGGTTTAC G 3805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=3.361;DP=93;FS=2.048;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=30.07;ReadPosRankSum=-2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,89:93:99:3843,320,0 -chr1 40516482 . C T 1983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.266;DP=130;FS=8.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:2012,0,2473 -chr1 40517990 . A T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr1 40524868 . A G 3029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.389;DP=110;FS=8.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=27.54;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,87:109:99:3058,0,354 -chr1 40525203 . C CA 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.105;DP=66;FS=5.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:645,0,904 -chr1 40602179 . C CA 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-1.156;DP=22;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:385,0,131 -chr1 40602660 . T A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,144 -chr1 40602800 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=2.180;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:427,0,84 -chr1 40603383 . G T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=-1.172;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:382,0,344 -chr1 40603566 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=1.085;DP=29;FS=8.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:409,0,572 -chr1 40603983 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.276;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.174;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:517,0,269 -chr1 40604493 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.042;DP=50;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:387,0,1358 -chr1 40604602 . C A 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.118;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:836,0,1486 -chr1 40604823 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-0.671;DP=52;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:719,0,1035 -chr1 40619547 . T G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-2.062;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.222;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:604,0,454 -chr1 40633950 . G T 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr1 40659150 . A AG 1023.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=421;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:67:1061,67,0 -chr1 40727026 . C CAA 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=-0.271;DP=35;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:528,0,360 -chr1 40727161 . C G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.632;DP=46;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:718,0,861 -chr1 40727502 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.115;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:480,0,923 -chr1 40728215 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=-2.075;DP=36;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=12.10;ReadPosRankSum=2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:464,0,1372 -chr1 40728480 . GCA G 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.247;DP=53;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:419,0,1326 -chr1 40728684 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-0.940;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=32.85;ReadPosRankSum=2.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:61:718,0,61 -chr1 40728752 . C G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=-1.043;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:452,0,687 -chr1 40728827 . GA G 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-0.070;DP=24;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.66;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:605,0,483 -chr1 40729097 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.224;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:608,0,554 -chr1 40729982 . C A 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.371;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:72:99:982,0,1351 -chr1 40733116 . C T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=1.746;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:1045,0,694 -chr1 40803570 . G A 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=1.747;DP=54;FS=4.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.734;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,40:54:99:1523,0,324 -chr1 40960281 . C T 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=1.286;DP=56;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1075,0,930 -chr1 40962124 . A AT 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.735;DP=49;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:521,0,917 -chr1 40963770 . G T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:263,0,391 -chr1 40965968 . G A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=1.144;DP=109;FS=8.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,36:109:99:1071,0,5572 -chr1 40978183 . C A 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:430,36,0 -chr1 40983712 . G A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.204;DP=145;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,36:145:99:761,0,4198 -chr1 40994065 . G A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.252;DP=147;FS=0.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:1142,0,6481 -chr1 40994113 . G C 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.887;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,34:130:99:819,0,3742 -chr1 41024730 . A G 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.547;DP=128;FS=5.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1847,0,2511 -chr1 41073574 . T G 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.671;ClippingRankSum=-0.177;DP=107;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,40:107:99:1399,0,2124 -chr1 41077996 . A G 6303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.361;DP=181;FS=6.009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=34.83;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,160:181:26:6332,26,0 -chr1 41078153 . A G 3864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.548;DP=117;FS=3.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=33.03;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,99:117:99:3893,0,214 -chr1 41078195 . G T 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=2.167;DP=125;FS=3.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,36:125:99:909,0,3411 -chr1 41078369 . C G 1852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=1.000;DP=63;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=29.41;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,49:63:99:1881,0,271 -chr1 41078381 . T C 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.149;DP=47;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=30.82;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,38:47:99:1477,0,158 -chr1 41194246 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=2.078;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:348,0,447 -chr1 41513217 . T A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-1.603;DP=83;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:431,0,2439 -chr1 41513229 . A T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-1.045;DP=99;FS=7.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,31:99:99:866,0,2536 -chr1 41521646 . C T 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-1.757;DP=66;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:1187,0,1073 -chr1 41523302 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr1 41595809 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.215;DP=30;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:390,0,683 -chr1 41676359 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:287,0,250 -chr1 41678467 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.434;DP=54;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:336,0,1465 -chr1 41697137 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-1.019;DP=75;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:1459,0,1141 -chr1 41701572 . G C 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.938;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1143,0,1124 -chr1 41711539 . G A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.494;DP=55;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1197,0,715 -chr1 41711566 . G C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.296;DP=68;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:278,0,2004 -chr1 41714475 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-1.279;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:425,0,802 -chr1 41736314 . T C 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.255;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:718,0,1985 -chr1 41736323 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.775;DP=43;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:718,0,1993 -chr1 41862187 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.28;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,214 -chr1 41913737 . G A 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:393,27,0 -chr1 41916635 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.693;DP=45;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:800,0,1363 -chr1 41916714 . C T 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.551;DP=74;FS=7.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1155,0,1485 -chr1 41916841 . T A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.822;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:675,0,4936 -chr1 41982868 . GAGGTAGAAATCTGCTTTCCTCAATCTCTGAGCTCATTCTAAAACTAATAATGTATCCAGAATCCTGACTGTGTTTTGCTTTGAATC G 934.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=1.043;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=31.76;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:92:972,0,92 -chr1 41994722 . T C 3676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3705,265,0 -chr1 41994743 . G C 3403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3432,246,0 -chr1 42073492 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:234,0,163 -chr1 42153232 . GA G 249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:287,31,0 -chr1 42354514 . A T 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:401,27,0 -chr1 42354522 . T A 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:401,27,0 -chr1 42773614 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.705;DP=47;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:657,0,916 -chr1 42857344 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-0.513;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:299,0,1791 -chr1 42857425 . C T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=-0.108;DP=95;FS=4.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,30:95:99:716,0,2337 -chr1 43364646 . T C 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.693;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:978,0,1793 -chr1 43373848 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.050;DP=91;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:422,0,2633 -chr1 43417536 . G C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.812;DP=128;FS=1.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,33:128:99:751,0,3462 -chr1 43418003 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:428,0,828 -chr1 43418081 . AT A 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=-0.330;DP=37;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:242,0,830 -chr1 44073932 . C A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.651;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:576,0,893 -chr1 44074129 . T G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.322;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:504,0,1701 -chr1 44077097 . T C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr1 44380783 . C T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.518;DP=38;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:677,0,685 -chr1 44403802 . T C 429.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:4:456,4,0 -chr1 44404311 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.052;DP=26;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:375,0,518 -chr1 44404430 . G GT 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.099;DP=35;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:380,0,402 -chr1 44404567 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.469;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.29;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:630,0,864 -chr1 44404579 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.244;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:630,0,864 -chr1 44424166 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-1.160;DP=46;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:720,0,1749 -chr1 44424169 . T A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-0.782;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:720,0,1743 -chr1 44428730 . G A 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.759;DP=62;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:1278,0,845 -chr1 44621859 . G T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=-0.679;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:916,0,1249 -chr1 44622082 . C T 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.268;DP=86;FS=2.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:1438,0,1521 -chr1 44622356 . CT C 2834.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.487;DP=187;FS=6.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,101:186:99:2872,0,4857 -chr1 44622368 . G A 1176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.081;DP=195;FS=8.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,53:195:99:1205,0,9216 -chr1 44622523 . A G 3351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-2.613;DP=186;FS=6.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,93:185:99:3380,0,3389 -chr1 44622557 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.557;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,43:199:99:815,0,6351 -chr1 44622575 . A G 3412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-0.439;DP=197;FS=9.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=17.32;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:197:99:3441,0,3427 -chr1 44622731 . T C 3337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.446;DP=192;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,94:192:99:3366,0,3557 -chr1 44622888 . T A 1806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.678;DP=134;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:2482,0,2236 -chr1 44623000 . A G 3272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=1.793;DP=91;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=29.00;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,62:91:99:3301,0,597 -chr1 44623048 . C A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.660;DP=59;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.59;ReadPosRankSum=-4.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1007,0,1136 -chr1 44623103 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=2.978;DP=74;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:433,0,2943 -chr1 44623263 . T C 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-1.409;DP=65;FS=5.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1391,0,910 -chr1 44623320 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=1.095;DP=132;FS=8.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,20:132:99:237,0,4528 -chr1 44623506 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.495;DP=167;FS=2.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,37:167:99:746,0,6200 -chr1 44623514 . A C 5912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.266;DP=173;FS=11.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=34.18;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,148:173:99:5941,0,256 -chr1 44623691 . C G 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.915;DP=201;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,39:201:99:634,0,6197 -chr1 44645259 . C T 3025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.609;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,97:170:99:3054,0,2476 -chr1 44766683 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr1 44769284 . C T 920.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:949,66,0 -chr1 44776753 . G A 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1020,72,0 -chr1 44787639 . T TAA 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.290;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:359,0,113 -chr1 44846052 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-0.015;DP=80;FS=0.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1033,0,1653 -chr1 44878145 . G A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-1.734;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:505,0,780 -chr1 44996202 . C T 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.961;DP=56;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:889,0,1000 -chr1 45000167 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.551;DP=52;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:856,0,1317 -chr1 45002644 . C T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=1.697;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1135,0,890 -chr1 45014456 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-0.134;DP=43;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:752,0,678 -chr1 45015187 . C T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.653;DP=54;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:800,0,969 -chr1 45021299 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.270;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:545,0,507 -chr1 45026248 . T C 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-1.919;DP=87;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:1328,0,1742 -chr1 45027162 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=2.641;DP=76;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1184,0,1473 -chr1 45027217 . C T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.144;DP=79;FS=6.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:976,0,1728 -chr1 45030920 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=4.674;DP=76;FS=5.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=3.08;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:262,0,3079 -chr1 45030971 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=4.365;DP=86;FS=3.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:640,0,2302 -chr1 45037892 . C A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.133;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:603,0,518 -chr1 45040175 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-1.538;DP=64;FS=2.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1033,0,1087 -chr1 45040416 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.303;DP=65;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:872,0,1378 -chr1 45047767 . T A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:397,0,447 -chr1 45059434 . C A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.714;DP=48;FS=2.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:774,0,875 -chr1 45059614 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.611;DP=27;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1516 -chr1 45059617 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.583;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:237,0,1516 -chr1 45107817 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-1.931;DP=68;FS=7.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:453,0,1777 -chr1 45108507 . C A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=1.018;DP=54;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:842,0,1077 -chr1 45108720 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=1.606;DP=32;FS=6.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:267,0,866 -chr1 45109191 . C T 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=1.105;DP=97;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:1309,0,1968 -chr1 45133763 . G C 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=1.146;DP=77;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1386,0,1378 -chr1 45165097 . TCTGAGCAGTAATAACAGGTTATAAATGCATTACATGGTTGCATGTGCCTCTAAAGCATTTGCACACTTTAGGACCATAGTGATATGGAATGATTTCTGCTTAAAGATGCATGTTAACACACAGAACAAAATACTATCTGAC T 2364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.229;DP=224;FS=7.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,85:213:99:2402,0,12478 -chr1 45165100 . GA G 3458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.905;DP=210;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,110:203:99:3496,0,12272 -chr1 45165102 . GCAGTAATAACAGGTTATAAATGCATTACATGGTTGCATGTGCCTCTAAAGCATTTGCACACTTTAGGACCATAGTGATATGGAATGATTTCTGCTTAAAGATGCATGTTAACACACAGAACAAAATACTATCTGACCTGC G 3856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.974;DP=225;FS=7.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,112:219:99:3894,0,12277 -chr1 45165264 . G T 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=-0.249;DP=198;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,102:198:99:3315,0,3293 -chr1 45167248 . C CGGA 577.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:615,51,0 -chr1 45256140 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=27.25;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:328,0,51 -chr1 45256367 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=23.71;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:83:289,0,83 -chr1 45257811 . G T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:90:362,0,90 -chr1 45278144 . G T 2985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=-0.560;DP=130;FS=6.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,82:129:99:3014,0,1667 -chr1 45278390 . G T 7342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.732;DP=266;FS=5.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=27.60;ReadPosRankSum=-1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,191:265:99:7371,0,1861 -chr1 45292056 . A T 351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:380,30,0 -chr1 45308313 . C T 1564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.864;DP=96;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:1593,0,2825 -chr1 45321657 . T A 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=1.196;DP=78;FS=1.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:1270,0,1419 -chr1 45458553 . G T 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-0.507;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1120,0,925 -chr1 45605706 . C A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr1 45797991 . AAGGTAGGACAAATAATTCCAGGAGTATGTTTGTTTAGATGTGTGTGTTTTACTAATGTAATCCTATTCTCCT A 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=10;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.27;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:300,0,1410 -chr1 46040937 . T TA 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=3.629;DP=120;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=6.90;ReadPosRankSum=-4.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:865,0,974 -chr1 46121436 . A ATG 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.610;DP=51;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:643,0,770 -chr1 46134953 . G A 2802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.584;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:2831,0,2830 -chr1 46168618 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,650 -chr1 46169412 . G T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.053;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:304,0,292 -chr1 46169475 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:379,0,615 -chr1 46170195 . GA G 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-0.392;DP=45;FS=6.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:612,0,347 -chr1 46214904 . TA T 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.568;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:411,0,380 -chr1 46305238 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=2.599;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:243,0,846 -chr1 46306148 . A T 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.250;DP=61;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:725,0,1456 -chr1 46327601 . C CA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.635;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.904;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:247,0,529 -chr1 46330096 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:250,0,489 -chr1 46339228 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=2.887;DP=55;FS=14.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1031,0,998 -chr1 46346276 . AAC A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.769;DP=42;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:267,0,983 -chr1 46348061 . T TA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=1.099;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:247,0,463 -chr1 46348354 . AAT A 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=1.354;DP=35;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:256,0,992 -chr1 46349986 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:313,0,139 -chr1 46363162 . C G 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-1.398;DP=42;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=16.04;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:702,0,708 -chr1 46423860 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-4.204;DP=94;FS=5.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:286,0,2960 -chr1 46507012 . TGGTGAGTTTTCCAGACAGTTGTTTTTTATTTGATGTGAGCTATTATTGCTAGACGTTGATGTGCTTCAGCTATAATAATTATATTTGTGCA T 5089.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.422;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:5127,441,0 -chr1 46920483 . T A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-0.761;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:441,0,1317 -chr1 47113791 . T C 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=2.098;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=24.06;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1183,0,699 -chr1 47113970 . C T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.658;DP=78;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=18.93;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,44:78:99:1505,0,2045 -chr1 47151192 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:32:448,0,32 -chr1 47151352 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.919;DP=17;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:377,0,177 -chr1 47151582 . G C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.867;DP=21;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:343,0,176 -chr1 47207824 . GTT G 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.276;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:484,0,794 -chr1 47354358 . TCA T 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.279;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=2.00;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,28:135:99:388,0,4672 -chr1 47354362 . A ACG 995.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=1.121;DP=155;FS=4.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,46:139:99:1033,0,4207 -chr1 47494340 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.913;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:306,0,369 -chr1 47504228 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-1.295;DP=61;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:392,0,1696 -chr1 47513746 . TG T 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=-1.116;DP=44;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:381,0,708 -chr1 47522389 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-3.439;DP=57;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:336,0,1610 -chr1 47631720 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.388;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:291,0,552 -chr1 47631743 . A C 716.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-2.009;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=32.58;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:22:745,0,22 -chr1 47653331 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.320;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:409,0,334 -chr1 47657760 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.461;DP=34;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:462,0,766 -chr1 47658965 . C G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=2.735;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:681,0,652 -chr1 47977140 . G A 2078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=-0.603;DP=177;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,60:169:99:2107,0,3832 -chr1 48180022 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.883;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:229,0,303 -chr1 49801609 . T TA 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.270;DP=33;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:536,0,423 -chr1 50419748 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=2.858;DP=347;FS=20.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=2.11;ReadPosRankSum=3.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,59:346:99:760,0,11203 -chr1 50419797 . TCCTGAGAAGAAATAAATAATAATACTAAGTGATAAATAACACTAAAGTGTGCACACATGGATTACACAATACTTA T 13103.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.925;DP=341;FS=4.115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=34.11;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,327:332:99:13141,958,0 -chr1 50422314 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-1.290;DP=211;FS=7.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,34:211:99:404,0,6834 -chr1 50422681 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.902;DP=250;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,41:250:99:508,0,8033 -chr1 50692298 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=1.220;DP=22;FS=5.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,370 -chr1 50695445 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:346,0,408 -chr1 50696471 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-1.002;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:324,0,367 -chr1 50696472 . T A 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.766;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:395,0,361 -chr1 50696675 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=1.765;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:471,0,536 -chr1 50777351 . A G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.024;DP=44;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:836,0,678 -chr1 50811072 . G A 1997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=1.741;DP=300;FS=12.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=6.66;ReadPosRankSum=2.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,84:300:99:2026,0,8065 -chr1 50824734 . T A 3107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=-1.213;DP=387;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,130:387:99:3136,0,12217 -chr1 51010355 . T C 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.442;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:774,0,3032 -chr1 51010371 . C T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.039;DP=117;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,30:117:99:713,0,3365 -chr1 51023264 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.745;DP=88;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:586,0,2422 -chr1 51028924 . C G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=1.716;DP=98;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=4.58;ReadPosRankSum=-2.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:477,0,2917 -chr1 51034953 . T A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.417;DP=61;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:713,0,1411 -chr1 51053389 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.164;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:747,0,738 -chr1 51064595 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.246;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:416,0,488 -chr1 51065278 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.109;DP=33;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:257,0,994 -chr1 51065287 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.230;DP=29;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:482,0,533 -chr1 51102937 . G A 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.252;DP=82;FS=1.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:1256,0,1506 -chr1 51102952 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.556;DP=82;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1208,0,1571 -chr1 51115657 . C A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=1.767;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:312,0,1888 -chr1 51154005 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,330 -chr1 51199066 . G T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:263,0,158 -chr1 51207367 . ATC A 1360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.931;DP=166;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,52:161:99:1398,0,7807 -chr1 51207368 . TCTAGAAAGAATGGCAGAAATACCTCAGCCTGTGTAGTTAATCATTTCTAGGCCTCCATGAAGTGAATTTACTTATTTGCATACTTAC T 3574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=1.525;DP=167;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=21.41;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,104:163:99:3612,0,5497 -chr1 51207371 . AGAAAGAATGGCAGAAATACCTCAGCCTGTGTAGTTAATCATTTCTAGGCCTCCATGAAGTGAATTTACTTATTTGCATACTTACG A 1337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-1.044;DP=165;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,52:164:99:1375,0,7807 -chr1 51209957 . ACTGCATGGGGAGCATGATTAATTATACTCTTTTAAAGTACATTGTATTTCATAGACCTCACGAGGGATTGTTGTTTTAC A 4979.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.538;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=30.31;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,115:120:99:5017,331,0 -chr1 51434106 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-1.771;DP=39;FS=3.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:469,0,893 -chr1 51438459 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=1.018;DP=64;FS=8.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:324,0,1765 -chr1 51489289 . G C 2851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.995;DP=326;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,100:307:99:2880,0,12532 -chr1 51522532 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.786;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:315,0,947 -chr1 51525693 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.897;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:336,0,814 -chr1 51526095 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.817;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:321,0,1531 -chr1 51531177 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=-0.361;DP=70;FS=2.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:482,0,1685 -chr1 51533364 . GCCTTAAACAAATAAATAAATAAAACACACACAATCACATGTAAAAGCCCAGTGAATACACACACTGGACACAGCAGAATGGGTTTTA G 2100.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=2.354;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=26.27;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:2138,179,0 -chr1 51557439 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.518;DP=27;FS=5.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:394,0,563 -chr1 51562678 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.092;DP=67;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:378,0,1756 -chr1 51563293 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-1.616;DP=101;FS=4.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:342,0,2904 -chr1 51565440 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.472;DP=71;FS=5.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:305,0,2145 -chr1 51566049 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.933;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:351,0,2857 -chr1 51567468 . A C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.101;DP=96;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:346,0,2844 -chr1 51616491 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:327,0,335 -chr1 51617740 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.478;DP=60;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,11:60:99:328,0,3641 -chr1 51644689 . A T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.350;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:239,0,1513 -chr1 51650059 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.039;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:546,0,858 -chr1 51650438 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.559;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:307,0,1065 -chr1 51651441 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.313;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:392,0,1201 -chr1 51666042 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=-0.048;DP=44;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:683,0,1973 -chr1 51706654 . G C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=1.465;DP=30;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:443,0,553 -chr1 51708499 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.330;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:292,0,756 -chr1 51717469 . G A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.033;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:812,0,1715 -chr1 51731402 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.261;DP=80;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:433,0,1971 -chr1 51734550 . A G 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.189;DP=72;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:806,0,1476 -chr1 51737856 . G T 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-1.317;DP=74;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:634,0,1763 -chr1 51739910 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=1.733;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:381,0,354 -chr1 51756358 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=1.218;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:318,0,677 -chr1 51774937 . G A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.460;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:535,0,478 -chr1 51884761 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.91;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,222 -chr1 51886915 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.154;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,237 -chr1 51916414 . C CA 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.745;DP=198;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,55:191:99:781,0,3668 -chr1 51925812 . G A 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.795;DP=246;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,69:245:99:1637,0,6626 -chr1 51933991 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.756;DP=140;FS=4.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,41:140:99:1023,0,3826 -chr1 51935102 . CT C 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.985;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:735,0,400 -chr1 51935361 . G T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.145;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:644,0,1329 -chr1 51935695 . T TA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.152;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:323,0,1229 -chr1 51936492 . GT G 2961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=-1.954;DP=166;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.84;ReadPosRankSum=2.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,121:159:99:2999,0,408 -chr1 51936862 . T TG 372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.645;DP=34;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=10.96;ReadPosRankSum=-2.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:410,0,651 -chr1 51958403 . A C 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-2.266;DP=55;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1051,0,790 -chr1 51958498 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.061;DP=79;FS=2.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:523,0,2219 -chr1 51958627 . G A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=2.279;DP=68;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=15.32;ReadPosRankSum=-2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1070,0,1241 -chr1 51968133 . C T 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=-0.515;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=22.15;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,40:57:99:1313,0,471 -chr1 51991561 . C CT 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-3.485;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=5.26;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,39:125:99:700,0,2294 -chr1 52033416 . C A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.107;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,28:103:99:642,0,3040 -chr1 52052606 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:351,0,563 -chr1 52066985 . C G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-1.172;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,33:119:99:687,0,4397 -chr1 52067129 . A G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.391;DP=76;FS=1.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:931,0,1765 -chr1 52067543 . G A 2377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.830;DP=195;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,72:195:99:2406,0,4148 -chr1 52068219 . G A 1598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.747;DP=125;FS=5.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,47:124:99:1627,0,2712 -chr1 52068274 . C CA 448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=2.071;DP=101;FS=13.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,29:94:99:486,0,1716 -chr1 52115210 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.479;DP=95;FS=10.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:369,0,2793 -chr1 52127656 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.144;DP=24;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:432,0,395 -chr1 52127687 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:347,0,395 -chr1 52206871 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr1 52207408 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.563;DP=137;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,28:137:99:548,0,4158 -chr1 52209801 . G A 250.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:279,0,20 -chr1 52210482 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.854;DP=156;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,32:156:99:598,0,4887 -chr1 52215884 . A C 3867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.363;DP=590;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:430,160:590:99:3896,0,17086 -chr1 52601058 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.419;DP=66;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:240,0,3563 -chr1 52601182 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.206;DP=44;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:349,0,1180 -chr1 52601529 . T C 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:316,24,0 -chr1 52601965 . G A 316.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=31.69;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:345,0,15 -chr1 52604287 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.290;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:666,0,703 -chr1 52604560 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.776;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:270,0,1821 -chr1 52606205 . C CT 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.921;DP=110;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:339,0,2603 -chr1 52606210 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=-1.013;DP=103;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:332,0,2603 -chr1 52610737 . C A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.144;DP=101;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:719,0,2630 -chr1 52619130 . G A 2061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.355;DP=171;FS=9.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,62:171:99:2090,0,5239 -chr1 52629878 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.136;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:236,0,756 -chr1 52631449 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.235;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:387,0,593 -chr1 52645118 . C G 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.154;DP=69;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,50:69:99:1944,0,486 -chr1 52645360 . A G 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.066;DP=46;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:775,0,926 -chr1 52645608 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=1.394;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:489,0,3116 -chr1 52645909 . G T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.138;DP=64;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:294,0,1971 -chr1 52693150 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.962;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:317,0,943 -chr1 52859163 . A C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr1 52861633 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,307 -chr1 52861635 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,307 -chr1 52863384 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:62:234,0,62 -chr1 52863399 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:62:234,0,62 -chr1 52863895 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:265,0,288 -chr1 52863926 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=26.31;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:265,0,288 -chr1 52869050 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.132;DP=39;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:492,0,856 -chr1 52872781 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.754;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:375,0,730 -chr1 52873034 . T A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=-1.762;DP=44;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:781,0,814 -chr1 52873209 . T A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-1.272;DP=42;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:745,0,1554 -chr1 52873213 . A C 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.930;DP=40;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:745,0,1578 -chr1 52873832 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-1.445;DP=39;FS=7.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:433,0,962 -chr1 52890943 . A T 3118.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:3147,242,0 -chr1 52891110 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,539 -chr1 52891114 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=1.002;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=21.72;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:354,0,539 -chr1 52893078 . GT G 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.214;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=33.82;ReadPosRankSum=2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:99:1390,0,954 -chr1 52893080 . GCAGTGTCCTCAGCATCTACAGCTTCTACAAGTGCAGTGTCATCACCATCCTCCGCTCCTACAAGTGCAGTGTCCTCAGCATCTACAGCTCCTACAAGT G 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.087;ClippingRankSum=-1.134;DP=50;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=27.05;ReadPosRankSum=2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:1390,0,861 -chr1 52946885 . GAC G 2495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.909;DP=99;FS=2.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,67:98:99:2533,0,989 -chr1 52950665 . G A 3515.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.068;DP=103;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=34.14;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,89:101:13:3544,0,13 -chr1 52955719 . C G 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.205;DP=74;FS=3.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1213,0,1202 -chr1 52973147 . ATTGTTTATATTGTGCAACAAATTTTGTTCGT A 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=23.73;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:417,0,1422 -chr1 52976005 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:250,0,285 -chr1 52977748 . G C 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.664;DP=119;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,30:119:99:707,0,3407 -chr1 52981572 . G A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.297;DP=46;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=17.26;ReadPosRankSum=2.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:822,0,763 -chr1 52982107 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.492;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:265,0,759 -chr1 52982373 . TC T 1387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.442;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=31.54;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:1425,0,1365 -chr1 52982746 . T TTG 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-1.227;DP=35;FS=3.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:242,0,1219 -chr1 52987432 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.861;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:279,0,1540 -chr1 53055275 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.746;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:438,0,1057 -chr1 53089823 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=-0.048;DP=57;FS=12.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:265,0,1656 -chr1 53093176 . C A 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.752;DP=67;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:823,0,1813 -chr1 53093783 . T C 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.776;DP=68;FS=5.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:793,0,1516 -chr1 53109694 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.522;DP=69;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=7.14;ReadPosRankSum=2.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:521,0,1844 -chr1 53111099 . G A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.219;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,33:103:99:833,0,2588 -chr1 53112231 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.539;DP=141;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=2.23;ReadPosRankSum=3.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:343,0,4309 -chr1 53116205 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=1.373;DP=89;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:663,0,5343 -chr1 53116208 . C T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.856;DP=94;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:674,0,5343 -chr1 53118301 . C T 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.587;DP=65;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1011,0,1110 -chr1 53118342 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.202;DP=81;FS=9.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:361,0,2347 -chr1 53118357 . C A 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=1.264;DP=91;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,41:90:99:1427,0,1522 -chr1 53122389 . A G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=-1.115;DP=63;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.824;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:523,0,1652 -chr1 53132346 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.141;DP=46;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:389,0,1168 -chr1 53132439 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=-0.448;DP=53;FS=2.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:479,0,1395 -chr1 53146917 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=1.298;DP=58;FS=10.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:394,0,1682 -chr1 53147117 . C T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-0.777;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:744,0,1481 -chr1 53147123 . T C 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.271;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:744,0,1481 -chr1 53171068 . A G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.175;DP=70;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:621,0,1755 -chr1 53183054 . CGGTAAACTCTCATTTTATTATCATTCTCCTCGTCTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTTCTGCGTTCACTCCTGTGTGTGTATCTCTGTCTTTCCCTCAA C 1721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=2.609;DP=93;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=18.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,81:90:99:1759,0,1261 -chr1 53195999 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.556;DP=24;FS=9.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:361,0,787 -chr1 53255494 . C G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=20.58;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,106 -chr1 53260212 . C T 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.094;DP=149;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,52:149:99:1730,0,3426 -chr1 53290562 . C T 2877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=1.019;DP=361;FS=3.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,113:361:99:2906,0,9354 -chr1 53310395 . T A 3151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=-3.728;DP=377;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,125:377:99:3180,0,9479 -chr1 53316250 . A G 4554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.516;ClippingRankSum=-2.437;DP=310;FS=0.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=14.69;ReadPosRankSum=2.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,132:310:99:4583,0,5333 -chr1 53769219 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=1.921;DP=149;FS=7.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=6.78;ReadPosRankSum=-2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:1039,0,4049 -chr1 53771865 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.893;DP=103;FS=1.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:419,0,3018 -chr1 53838863 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.682;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:350,0,589 -chr1 53849142 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-1.377;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:269,0,721 -chr1 53855985 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-1.997;DP=36;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:336,0,849 -chr1 53858690 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.281;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:414,0,779 -chr1 53858823 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:282,0,470 -chr1 53860407 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,181 -chr1 53860639 . C A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.472;DP=26;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:235,0,717 -chr1 53874242 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=-0.335;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:266,0,1776 -chr1 53874245 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-0.922;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:266,0,1776 -chr1 53874419 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.793;DP=47;FS=7.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:278,0,1297 -chr1 53890055 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=-2.762;DP=70;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=4.90;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:371,0,2052 -chr1 53890457 . G GA 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.455;DP=103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,31:100:99:519,0,2106 -chr1 53891316 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=1.639;DP=92;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:490,0,2797 -chr1 53891470 . A G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.816;DP=128;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,28:128:99:479,0,4422 -chr1 53897485 . T C 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.291;DP=115;FS=8.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,34:115:99:880,0,3080 -chr1 54245144 . G C 4252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.543;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,48:167:99:4281,0,3029 -chr1 54263746 . G T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.287;ClippingRankSum=-5.242;DP=498;FS=43.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=0.67;ReadPosRankSum=4.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:427,71:498:99:363,0,16172 -chr1 54265082 . A G 4796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=1.883;DP=393;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,141:374:99:4825,0,7894 -chr1 54317275 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=1.732;DP=46;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:292,0,1275 -chr1 54448873 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.043;DP=140;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.988;QD=3.93;ReadPosRankSum=-2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,30:140:99:579,0,4325 -chr1 54462212 . T C 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-0.206;DP=225;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,50:225:99:899,0,6938 -chr1 54486099 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=2.150;DP=82;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=3.41;ReadPosRankSum=-2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:308,0,2211 -chr1 54504177 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-1.147;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,26:122:99:508,0,3737 -chr1 54506358 . C T 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.811;DP=162;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,35:162:99:671,0,4849 -chr1 54520030 . G T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-1.563;DP=134;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,39:134:99:287,0,11319 -chr1 54525017 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.805;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:241,0,380 -chr1 54530311 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=17.91;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,209 -chr1 54549996 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.862;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:301,0,594 -chr1 54588888 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=6.865;DP=205;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=1.37;ReadPosRankSum=-3.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,43:204:99:309,0,18264 -chr1 54588891 . C T 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=6.393;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=3.69;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,37:209:99:804,0,9088 -chr1 54592727 . G GT 1817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-2.228;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1855,0,1941 -chr1 54629517 . ACTGAAGAAAGAAAAGGACAACAAACATTGAAAGCTTCATTTACACTGTAAAGCACCAGATGAATTATTTATATTGAATTTAC A 7913.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.441;DP=171;FS=3.017;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,168:171:99:7951,790,0 -chr1 54647115 . T G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-1.569;DP=54;FS=9.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:333,0,1861 -chr1 54651202 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.102;DP=50;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:275,0,1868 -chr1 54658957 . ACTGAAACAACAAACCCAAAGTTAGATTACTGTGTGACAGCATATCTGACAGTGTGCATCTGTGTGTAC A 2118.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=2.106;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=33.35;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:99:2156,0,1339 -chr1 54665045 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.609;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:656,0,1817 -chr1 54667549 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.188;DP=62;FS=3.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:531,0,1623 -chr1 54673760 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.166;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:293,0,2467 -chr1 54674000 . C A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=1.177;DP=40;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:430,0,908 -chr1 54683283 . T G 1695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=-0.862;DP=158;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,53:158:99:1724,0,3612 -chr1 54734421 . C A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.309;DP=83;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:682,0,3785 -chr1 54734430 . A G 1388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.370;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:1417,0,2534 -chr1 54734999 . A G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=-1.644;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=12.89;ReadPosRankSum=2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:505,0,1177 -chr1 54741276 . C A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-0.452;DP=204;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,47:203:99:1011,0,6052 -chr1 54745445 . A T 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=1.588;DP=160;FS=0.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:1212,0,4215 -chr1 54746085 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=1.277;DP=61;FS=9.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=3.47;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:240,0,1861 -chr1 54760558 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.437;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:476,0,624 -chr1 54795544 . G C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=1.991;DP=52;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:740,0,1028 -chr1 54812362 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.681;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:566,0,1033 -chr1 54812410 . CAAGGTTACACAGAGACGCAGTCTGCTTTACTCTGTGTTTATTACTTACTGAAGCGTTTGTGTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT C 847.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.514;DP=30;FS=8.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:44:885,0,44 -chr1 54818912 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.011;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:472,0,1432 -chr1 54821476 . A C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.154;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:563,0,2064 -chr1 54821591 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.110;DP=66;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:571,0,1834 -chr1 54822399 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:99:295,0,340 -chr1 54829396 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:259,0,381 -chr1 54858271 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:346,0,307 -chr1 54882607 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.849;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:235,0,816 -chr1 54903369 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.276;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:488,0,796 -chr1 54905538 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:267,0,394 -chr1 54914222 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.525;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:274,0,1340 -chr1 55030792 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:238,0,148 -chr1 55227111 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:391,0,301 -chr1 55233363 . C A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.403;DP=44;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:588,0,1015 -chr1 55239895 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.201;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:300,0,6256 -chr1 55240641 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=2.237;DP=183;FS=5.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=1.91;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,35:183:99:378,0,16499 -chr1 55240655 . TCTGACAGCCGAGGTCAAGGGTCATGAACAACACAACCGAGTCTACAACAGCAGAAACTGCTCATACAGTGTAAAGGATAC T 9545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=1.560;DP=182;FS=7.256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=26.79;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,169:178:99:9583,689,0 -chr1 55248869 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.197;DP=127;FS=4.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=4.33;ReadPosRankSum=2.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,27:127:99:578,0,7737 -chr1 55254569 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.031;DP=106;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:432,0,5622 -chr1 55258155 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=-2.539;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,34:140:99:663,0,3822 -chr1 55258223 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-0.050;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:363,0,1449 -chr1 55297055 . A T 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr1 55312427 . C T 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 -chr1 55324298 . T C 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr1 55410699 . C G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:236,0,62 -chr1 55432675 . G C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.746;DP=51;FS=10.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.305;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:689,0,1058 -chr1 55437899 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.167;DP=51;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:267,0,1443 -chr1 55442578 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,404 -chr1 55470400 . A T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-2.624;DP=44;FS=9.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:530,0,1061 -chr1 55493376 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.910;DP=50;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:406,0,1330 -chr1 55495834 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.479;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:241,0,2412 -chr1 55499973 . T TAA 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-0.756;DP=29;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=16.40;ReadPosRankSum=3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:581,0,384 -chr1 55501819 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-2.528;DP=183;FS=15.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,31:183:99:335,0,5636 -chr1 55502724 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.093;DP=188;FS=7.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,34:187:99:425,0,5392 -chr1 55505243 . AACCTGTCCAATCAGAACAAGACAATGTCACACTGCAGCATGTTAGCCAATTGATAATGATTGACCAATTAAATACAC A 521.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.133;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:559,0,567 -chr1 55520410 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.638;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:57:676,0,57 -chr1 55523582 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.349;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:624,0,622 -chr1 55527686 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.510;DP=35;FS=6.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:329,0,1832 -chr1 55536964 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.688;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:259,0,417 -chr1 55548158 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.434;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:815,0,3582 -chr1 55549282 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:408,0,351 -chr1 55552760 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-1.116;DP=53;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:260,0,1538 -chr1 55576940 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.680;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:573,0,524 -chr1 55576955 . T G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.315;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:453,0,473 -chr1 55638467 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.040;DP=54;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:279,0,1592 -chr1 55639553 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.465;DP=51;FS=2.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:406,0,1353 -chr1 55652877 . C G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=-0.449;DP=75;FS=1.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:355,0,2164 -chr1 55681167 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-2.515;DP=52;FS=6.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:310,0,1481 -chr1 55705805 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.233;DP=45;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:329,0,1114 -chr1 55751531 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-1.440;DP=31;FS=16.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:417,0,873 -chr1 55753026 . TAA T,TAAA 312.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,5,8:13:99:387,224,349,200,0,213 -chr1 55759977 . TCTGCAGAAATAACTCATGAAACACTGTATCTGCTCAGATAGAGTCAGTAACCCATGAATAATCCTGACACACAC T 3619.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.014;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:3657,299,0 -chr1 55769611 . C CTCG 273.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:22:311,22,0 -chr1 55826612 . T G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr1 55826623 . C G 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr1 55838796 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.912;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=4.30;ReadPosRankSum=-2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:282,0,549 -chr1 55838846 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.115;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:520,0,576 -chr1 56286183 . GCT G 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:251,0,56 -chr1 56289525 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-2.039;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:330,0,3057 -chr1 56316430 . T C 6803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.375;DP=249;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=27.32;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,109:248:99:6832,0,4709 -chr1 56317311 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-3.031;DP=49;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:246,0,1476 -chr1 56318335 . AG A 457.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:26:495,0,26 -chr1 56318670 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.030;DP=40;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:277,0,1121 -chr1 56460439 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.838;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:499,0,2631 -chr1 56460964 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.659;DP=104;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,32:104:99:839,0,2786 -chr1 56494806 . T C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.869;DP=68;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,23:68:99:779,0,1570 -chr1 56579709 . C T 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=2.117;DP=118;FS=10.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,70:115:99:2398,0,1579 -chr1 56586292 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.659;DP=135;FS=9.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,24:134:99:367,0,4231 -chr1 56586432 . A G 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=1.922;DP=110;FS=1.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.715;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:1503,0,2232 -chr1 56588189 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.910;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:537,0,5692 -chr1 56590481 . C G 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.053;DP=81;FS=7.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:1073,0,1614 -chr1 56593633 . C A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=-0.444;DP=150;FS=5.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,44:150:99:1127,0,4017 -chr1 56600538 . C T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.343;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,38:135:99:904,0,3715 -chr1 56612438 . G C 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.864;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,36:106:99:1079,0,2428 -chr1 56614602 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.532;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:546,0,2340 -chr1 56618903 . A T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-0.491;DP=85;FS=6.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:668,0,2512 -chr1 56626747 . G A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-0.592;DP=62;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:941,0,1249 -chr1 56643885 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=4.965;DP=59;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=4.13;ReadPosRankSum=-4.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:272,0,2384 -chr1 56643892 . TCTAGCATTGACAAAGAGACTGACGTGAGCTCCTGACAGACGCCTCATACTGCTGATGGAGAAAAACACACTCTTAC T 2430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.577;DP=51;FS=3.096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=31.96;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:2468,175,0 -chr1 56643976 . T G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.140;DP=40;FS=9.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:552,0,2457 -chr1 56643980 . G T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-0.834;DP=39;FS=10.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:552,0,2444 -chr1 56677070 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.852;ClippingRankSum=4.300;DP=124;FS=10.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=3.27;ReadPosRankSum=-6.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,26:124:99:434,0,4275 -chr1 56677241 . G T 1620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.305;DP=509;FS=3.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=3.18;ReadPosRankSum=5.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:409,98:507:99:1649,0,16140 -chr1 56694466 . C T 5375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.375;DP=380;FS=0.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,152:380:99:5404,0,9221 -chr1 56714226 . G C 5585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.930;DP=416;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,162:414:99:5614,0,8562 -chr1 56764304 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.178;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:364,0,1838 -chr1 56764744 . A C 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.534;DP=199;FS=5.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:1110,0,5591 -chr1 56764912 . A G 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.084;DP=216;FS=6.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,66:216:99:1513,0,8443 -chr1 56764960 . C T 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=-0.310;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,70:194:99:1822,0,7182 -chr1 56807862 . T C 303.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=30.30;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:331,0,12 -chr1 56810322 . A C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=-3.470;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=16.15;ReadPosRankSum=-4.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:658,0,696 -chr1 56810700 . C A 5520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:5549,394,0 -chr1 56810761 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=2.498;DP=156;FS=5.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,25:155:99:326,0,5102 -chr1 56813218 . C T 1107.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1136,81,0 -chr1 56823856 . A AGAGATCC 4977.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.007;DP=172;FS=5.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=28.94;ReadPosRankSum=2.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,134:161:99:5015,0,769 -chr1 56823858 . A G 4984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=1.025;DP=178;FS=5.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,133:160:99:5013,0,811 -chr1 56834833 . AAGGTGAACGGTCTTTGGACATCATAGTGAAAACACTTGATGACTATTCCTGACCAAAAATGTATGGTTTTCCTCCCTCT A 7094.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=1.711;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=31.31;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:7132,596,0 -chr1 56846900 . TGGTACGTCTGATGCAGTTTCAGGACTTAATATGATAGATCTTTCTCATATGTTTCAATAGATCAAGTAGAGTTCCACTGATAGTTAACATGCTCTCTTTCTTTCA T 5485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=1.312;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=28.98;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,123:126:99:5523,471,0 -chr1 56865178 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=1.203;DP=54;FS=6.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:440,0,1449 -chr1 56891200 . T G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,104 -chr1 56970419 . TAA T 2024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=1.421;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=24.39;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,1:78:99:2062,0,2885 -chr1 56970552 . T C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.971;DP=64;FS=2.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:484,0,4648 -chr1 56971904 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.990;DP=71;FS=6.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:239,0,2065 -chr1 57107493 . A T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=5.110;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=16.63;ReadPosRankSum=-4.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:627,0,679 -chr1 57108186 . T C 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.377;DP=58;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=20.82;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,36:58:99:1236,0,1589 -chr1 57108325 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=3.303;DP=31;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=13.67;ReadPosRankSum=-2.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:452,0,655 -chr1 57109624 . C A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=-0.847;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=4.53;ReadPosRankSum=-4.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:386,0,4869 -chr1 57109627 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.026;ClippingRankSum=-0.996;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=4.59;ReadPosRankSum=-4.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:386,0,4869 -chr1 57110260 . AT A 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.892;DP=39;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:577,0,128 -chr1 57111868 . T A 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.217;DP=74;FS=9.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1316,0,1344 -chr1 57112429 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,106 -chr1 57116802 . T A 11088.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.358;DP=231;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=37.29;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,228:230:99:11117,783,0 -chr1 57117778 . C T 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=-0.902;DP=114;FS=7.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.458;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,42:114:99:1366,0,2528 -chr1 57150010 . A T 366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:395,30,0 -chr1 57150107 . T A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.206;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=25.34;ReadPosRankSum=-2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:535,0,380 -chr1 57150742 . A G 797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:826,57,0 -chr1 57150743 . A T 797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:826,57,0 -chr1 57151057 . T A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr1 57151058 . A G 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr1 57151588 . T A 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:414,33,0 -chr1 57455963 . G A 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr1 58375010 . A C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.047;DP=40;FS=9.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:777,0,1220 -chr1 58375012 . C A 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=-0.183;DP=39;FS=12.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:777,0,1220 -chr1 58375120 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=2.270;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=12.53;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:313,0,217 -chr1 58375252 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=3.460;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=8.27;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:293,0,1935 -chr1 58375524 . G A 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.547;DP=60;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,37:60:99:1291,0,798 -chr1 58375589 . C CGA 1422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.706;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=26.35;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,36:54:99:1460,0,637 -chr1 58375718 . GTT G 1393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-1.437;DP=53;FS=14.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=26.30;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,36:51:99:1431,0,411 -chr1 58375990 . TAA T 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.767;DP=35;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:779,0,508 -chr1 58377690 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=2.049;DP=31;FS=26.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:232,0,813 -chr1 58649785 . T C 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr1 58716552 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:294,0,93 -chr1 58722837 . G T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.054;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:578,0,589 -chr1 58961108 . C G 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:683,48,0 -chr1 58963740 . T A 1264.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1293,90,0 -chr1 58963934 . A G 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:489,36,0 -chr1 58964198 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.134;DP=21;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=31.08;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:67:681,0,67 -chr1 58964279 . G A 1575.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-0.194;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,44:50:15:1604,0,15 -chr1 58964371 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr1 58964379 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:258,18,0 -chr1 58964592 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr1 58964601 . C T 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:471,33,0 -chr1 59184753 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=2.363;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=14.11;ReadPosRankSum=-2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:254,0,286 -chr1 59439734 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.486;DP=53;FS=2.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:299,0,1608 -chr1 59447806 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.330;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:497,0,659 -chr1 59498888 . A T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.787;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:263,0,1162 -chr1 59500427 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=1.545;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:395,0,558 -chr1 59500673 . A G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.062;DP=31;FS=5.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=28.61;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:915,0,353 -chr1 59500687 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-1.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:259,0,901 -chr1 59514583 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,251 -chr1 59543637 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.139;DP=26;FS=6.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:240,0,1429 -chr1 59625655 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.209;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:299,0,342 -chr1 59668533 . T C 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=2.402;DP=100;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:846,0,2516 -chr1 59669431 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.867;DP=52;FS=2.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:358,0,1450 -chr1 59670264 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.468;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:407,0,1819 -chr1 59670296 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-1.253;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:247,0,1779 -chr1 59697444 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=1.907;DP=56;FS=4.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=3.92;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:248,0,1577 -chr1 59697480 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=2.284;DP=63;FS=9.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=3.50;ReadPosRankSum=-2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:249,0,3621 -chr1 59701374 . TCCTGGAAACACGAGCGCAGGTGTGATTTCATCAGTCACACACACACACACACGCTCGCTCACACACACACA T 1023.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.788;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:99:1061,138,0 -chr1 59772209 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=-1.315;DP=34;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:387,0,808 -chr1 59799397 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.779;DP=49;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:351,0,1221 -chr1 59799712 . C G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.842;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:434,0,1654 -chr1 59846637 . T G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.377;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:293,0,598 -chr1 59916860 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=-0.148;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:270,0,724 -chr1 59916896 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.688;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:445,0,925 -chr1 59918651 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=15.87;ReadPosRankSum=-2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:298,0,281 -chr1 59964557 . C T 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.842;DP=353;FS=5.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,94:353:99:2146,0,9511 -chr1 60013928 . TCCTGAAGCACATGAGAGGGTGAGACTGGAAGACCCTTAGTGTGGCAGAGCTCAGAGATGCTTTGAGATGTCGTTGGCGTTA T 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=26.13;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:377,0,1409 -chr1 60027548 . CA C 1274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1312,105,0 -chr1 60058880 . G C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.991;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:429,0,3443 -chr1 60181545 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.780;DP=77;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:429,0,2191 -chr1 60187996 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.891;DP=56;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:458,0,1412 -chr1 60231730 . C T 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.109;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,86:282:99:2114,0,7128 -chr1 60232580 . C T 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.481;ClippingRankSum=0.039;DP=337;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,84:337:99:1517,0,9491 -chr1 60250086 . C T 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.052;DP=337;FS=0.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.190;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,77:336:99:1511,0,9395 -chr1 60254445 . G A 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=-0.217;DP=295;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=6.17;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,79:295:99:1847,0,8077 -chr1 60254813 . C T 3439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.984;DP=334;FS=19.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=10.30;ReadPosRankSum=3.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,111:331:99:3468,0,7290 -chr1 60286102 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.194;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:325,0,926 -chr1 60297374 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.897;DP=155;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,34:155:99:646,0,4421 -chr1 60300103 . C CGT 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-0.755;DP=109;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:536,0,190 -chr1 60311476 . CGTATGTCGAAGATCTGATTGTTCACTCTCACACACTCGACACCGATTGGACTCATTTTATTATATGAATCTTCACAACACCCTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCAG C 875.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.476;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:913,0,1866 -chr1 60325015 . G C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=4.037;DP=54;FS=9.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:358,0,2519 -chr1 60325016 . C A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=3.855;DP=55;FS=9.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:364,0,2519 -chr1 60326170 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.027;DP=58;FS=6.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:338,0,1598 -chr1 60326171 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.118;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:316,0,1670 -chr1 60326340 . A G 563.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.070;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=31.32;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:21:592,0,21 -chr1 60331960 . G GGTA 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=2.606;DP=22;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=17.03;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:412,0,145 -chr1 60345775 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.010;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:316,0,1522 -chr10 28122 . A G 1200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.234;DP=107;FS=3.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,38:106:99:1229,0,2132 -chr10 29072 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.728;DP=106;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:407,0,3810 -chr10 56068 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-0.664;DP=92;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:474,0,2660 -chr10 58095 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.660;DP=98;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:571,0,2637 -chr10 59132 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.015;DP=68;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:310,0,2665 -chr10 59795 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.164;DP=50;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:598,0,1164 -chr10 60094 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:288,0,60 -chr10 61479 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=2.463;DP=33;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:328,0,846 -chr10 100919 . CGTGAGTTTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTCTGACCTCTGCTGTTTTCAG C 4376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=2.533;DP=106;FS=11.804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,101:106:99:4414,345,0 -chr10 101255 . GCAGGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGCGTGCGTGCGCATGTGTGTGTGTGTTTGTGTGAACGCCTCTCTCTGTCTGTGTTT G 4620.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=2.272;DP=119;FS=1.839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=36.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,114:119:99:4658,372,0 -chr10 103464 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=1.052;DP=49;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:407,0,1250 -chr10 107237 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.496;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:341,0,3440 -chr10 168139 . CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=46;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:275,0,3078 -chr10 188766 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-1.029;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:381,0,2238 -chr10 188805 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-1.285;DP=74;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:342,0,2118 -chr10 194974 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-1.050;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,14:77:99:245,0,2395 -chr10 195514 . C G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.623;DP=65;FS=3.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:427,0,1785 -chr10 201488 . A AAC 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.906;DP=60;FS=8.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:404,0,555 -chr10 219234 . C T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.189;DP=123;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,44:122:99:1084,0,2441 -chr10 219623 . G A 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-1.277;DP=99;FS=15.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:1241,0,2005 -chr10 220520 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.211;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,34:210:99:338,0,7873 -chr10 222259 . T A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=1.537;DP=115;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,39:113:99:1242,0,3036 -chr10 225141 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=-0.492;DP=33;FS=8.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:429,0,596 -chr10 227297 . A C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.214;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:438,0,1454 -chr10 252928 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.577;DP=27;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,655 -chr10 261775 . G A 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=-0.683;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:611,0,968 -chr10 289572 . A G 1855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.362;DP=105;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1884,0,2057 -chr10 289864 . A G 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-2.054;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,29:120:99:643,0,4382 -chr10 290053 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-0.280;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,36:170:99:706,0,5337 -chr10 290233 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=1.678;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=11.41;ReadPosRankSum=-2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:245,0,1000 -chr10 290236 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=2.550;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:278,0,1005 -chr10 290566 . AAC A 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-1.159;DP=107;FS=5.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,35:103:99:1264,0,2543 -chr10 348079 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.307;DP=73;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:357,0,2169 -chr10 357760 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.640;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:406,0,1213 -chr10 359218 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.297;DP=92;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:397,0,2570 -chr10 359788 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=-0.756;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:331,0,3594 -chr10 360175 . A G 1660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=1.145;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,51:78:99:1689,0,735 -chr10 361722 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-0.473;DP=94;FS=3.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:634,0,2339 -chr10 419246 . T C 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.083;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=25.22;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:684,0,232 -chr10 419414 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=-1.272;DP=39;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:708,0,901 -chr10 419558 . G C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=1.377;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=7.96;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:251,0,735 -chr10 420173 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=16.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,207 -chr10 420517 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.873;DP=33;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:319,0,1363 -chr10 420980 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.712;DP=26;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:713,0,722 -chr10 421024 . A G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=2.799;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=36.92;ReadPosRankSum=-3.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:714,0,722 -chr10 422376 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:337,0,206 -chr10 430203 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:283,0,167 -chr10 437714 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=4.048;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=11.11;ReadPosRankSum=-3.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:306,0,563 -chr10 437813 . T A 2607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.031;DP=119;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,50:85:99:2636,0,928 -chr10 437981 . A T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:99:656,0,1191 -chr10 438177 . T G 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.080;DP=56;FS=7.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:99:1541,0,2560 -chr10 438217 . C T 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=-3.742;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=23.27;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:1541,0,2580 -chr10 438589 . A G 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-2.554;DP=32;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=25.34;ReadPosRankSum=-2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:839,0,741 -chr10 438622 . G T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.128;DP=50;FS=8.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:827,0,741 -chr10 438769 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-1.330;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:826,0,169 -chr10 439390 . T G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.282;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:559,0,197 -chr10 582621 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=1.667;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,28:125:99:573,0,8780 -chr10 590018 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=1.241;DP=66;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=3.51;ReadPosRankSum=-1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:260,0,4058 -chr10 590019 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=1.757;DP=66;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:260,0,4058 -chr10 595365 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=1.383;DP=68;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:418,0,1912 -chr10 1011635 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.010;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:357,0,1509 -chr10 1014303 . GAAAACAGGAAGAGGAAGAGAACGGGAAAAAGAAAAGGAAGAAAACAGGAAGAGGAAGAGAACGGGAAAAAGAAAAGGAAGA G 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=1.631;DP=41;FS=10.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:402,0,1666 -chr10 1014821 . G A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-1.140;DP=53;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:1015,0,837 -chr10 1119473 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.637;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=11.29;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:559,0,955 -chr10 1119614 . C T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=2.164;DP=61;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=15.14;ReadPosRankSum=-2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:952,0,980 -chr10 1194825 . C G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,176 -chr10 1195140 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:478,0,489 -chr10 1195203 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=1.225;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:638,0,607 -chr10 1195977 . A C 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.869;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:460,0,427 -chr10 1196855 . T C 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.921;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=32.77;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:52:913,0,52 -chr10 1197593 . TAGAGCGCCATCTGCTGTTAAACACTAGTCA T 243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:31:281,31,0 -chr10 1201181 . G A 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.296;DP=126;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,39:126:99:976,0,3202 -chr10 1207502 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:320,0,1604 -chr10 1207525 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-0.356;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=5.14;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:388,0,1886 -chr10 1207546 . A C 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=2.340;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,45:66:99:1644,0,558 -chr10 1455649 . G T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:721,0,167 -chr10 1521991 . C G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.442;DP=99;FS=4.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,33:99:99:939,0,2493 -chr10 1525748 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=4.202;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=18.09;ReadPosRankSum=4.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:607,0,556 -chr10 1577349 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=19.78;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:325,0,205 -chr10 1586872 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:79:258,0,79 -chr10 1609781 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.032;DP=23;FS=11.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:278,0,520 -chr10 1624202 . TCTGCAAGACACCGTGGTGAGACACAGGTAAAAGCACTGGGAGATGTGATGGTGGTGATGATGGTGTGGTGGTGCTAAC T 6167.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.342;DP=140;FS=2.953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=27.88;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:6205,506,0 -chr10 1631315 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.842;DP=113;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=7.67;ReadPosRankSum=2.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:895,0,2951 -chr10 1632526 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.562;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,26:130:99:431,0,4931 -chr10 1647175 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.458;DP=114;FS=4.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:251,0,4170 -chr10 1714149 . G C 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=-2.021;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,36:156:99:685,0,4079 -chr10 1740253 . C T 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=2.552;DP=468;FS=12.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=3.31;ReadPosRankSum=2.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:370,96:466:99:1577,0,13810 -chr10 1785108 . G C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.774;DP=58;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=6.25;ReadPosRankSum=-1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:391,0,1543 -chr10 1790473 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=1.813;DP=56;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:758,0,1062 -chr10 1790563 . C T 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.628;DP=61;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1070,0,1076 -chr10 1802855 . G A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-1.365;DP=57;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1038,0,997 -chr10 1854304 . A AT 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-1.342;DP=32;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:300,0,565 -chr10 1897689 . G A 3875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-1.537;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,106:131:99:3904,0,510 -chr10 1905664 . T A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr10 1909007 . G A 2364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-1.123;DP=89;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=26.57;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,65:89:99:2393,0,1378 -chr10 1912708 . T G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.319;DP=130;FS=3.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,22:130:99:310,0,4078 -chr10 1914536 . G A 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=-0.682;DP=158;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.481;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,45:158:99:1171,0,4323 -chr10 1916117 . C A 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.465;DP=148;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,48:148:99:1313,0,6940 -chr10 1920083 . G C 3123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.637;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,99:181:99:3152,0,2964 -chr10 1920732 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=2.979;DP=60;FS=6.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=3.50;ReadPosRankSum=-3.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:238,0,3218 -chr10 1921000 . A T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-2.414;DP=114;FS=3.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:896,0,3159 -chr10 1921023 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-1.800;DP=124;FS=14.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.173;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:668,0,4497 -chr10 2016443 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-1.310;DP=60;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:262,0,1761 -chr10 2016531 . A C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=2.666;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:379,0,941 -chr10 2016976 . C G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr10 2017005 . A T 656.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:685,51,0 -chr10 2017128 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:571,0,511 -chr10 2017192 . G C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:240,18,0 -chr10 2018756 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:317,0,136 -chr10 2526960 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-0.585;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:408,0,377 -chr10 2528138 . C T 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=-0.617;DP=38;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:749,0,603 -chr10 2528214 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.713;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:237,0,873 -chr10 2529496 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:303,0,254 -chr10 2529625 . G C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-2.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:432,0,225 -chr10 2530606 . T C 923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:952,69,0 -chr10 2530658 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.564;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:924,0,425 -chr10 2530756 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.489;DP=27;FS=6.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:229,0,664 -chr10 2532681 . G A 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.227;DP=35;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=29.11;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1047,0,157 -chr10 2541987 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=1.610;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:336,0,232 -chr10 2543746 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,468 -chr10 2543797 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.516;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:363,0,653 -chr10 2588719 . AC A 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr10 2595431 . G A 2253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-1.338;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:2282,0,1573 -chr10 2602607 . A AT 767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.743;DP=42;FS=3.332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:86:862,86,0 -chr10 2602847 . T A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-1.010;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:628,0,212 -chr10 2603051 . C A 2203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.571;DP=71;FS=6.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,57:71:99:2232,0,277 -chr10 2603220 . T TCA 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.182;DP=28;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:345,0,366 -chr10 2603740 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-2.329;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=31.39;ReadPosRankSum=2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:656,0,113 -chr10 2603994 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.868;DP=30;FS=12.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:631,0,419 -chr10 2604045 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:531,0,458 -chr10 2604556 . GT G 1443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.505;DP=58;FS=5.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,36:58:99:1481,0,1439 -chr10 2605263 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.274;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:251,0,1283 -chr10 2605557 . A T 1845.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-2.294;DP=48;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=29.55;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,44:48:13:1874,0,13 -chr10 2605558 . C A 1845.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-2.173;DP=49;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=28.79;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,45:49:13:1874,0,13 -chr10 2606384 . C T 2906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.555;DP=104;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,79:104:99:2935,0,1089 -chr10 2606456 . C A 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.694;DP=102;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=21.44;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,69:102:99:2215,0,878 -chr10 2606858 . GA G 1052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.510;DP=89;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,49:80:99:1090,0,598 -chr10 2607123 . G T 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-1.034;DP=80;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1576,0,1096 -chr10 2621785 . A C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.315;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=27.93;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:71:531,0,71 -chr10 2622092 . C T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.891;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=30.37;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:60:757,0,60 -chr10 2628449 . C G 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=-0.139;DP=49;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=24.04;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,33:49:99:1206,0,442 -chr10 2641183 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr10 2641216 . C A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr10 2664780 . T C 1540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.863;DP=54;FS=2.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,42:54:99:1569,0,257 -chr10 2667194 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:425,0,764 -chr10 2674747 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.902;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:462,0,236 -chr10 2695711 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-3.308;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,469 -chr10 2695712 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-3.308;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=23.36;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,469 -chr10 2703836 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,282 -chr10 2703837 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,282 -chr10 2705238 . T C 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=-1.162;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:558,0,450 -chr10 2705469 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-2.862;DP=24;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:527,0,293 -chr10 2705873 . TAC T 279.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:317,22,0 -chr10 2706085 . G A 878.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:907,66,0 -chr10 2706137 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:260,0,91 -chr10 2707169 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr10 2707173 . C A 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 -chr10 2707230 . A G 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr10 2708859 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-2.522;DP=29;FS=8.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=24.72;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:745,0,255 -chr10 2709407 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:514,0,433 -chr10 2709425 . C A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=-0.568;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:573,0,141 -chr10 2722835 . C G 242.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:271,0,20 -chr10 2723947 . CG C 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.036;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:482,0,815 -chr10 2758994 . G A 239.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:268,0,22 -chr10 2776816 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:82:360,0,82 -chr10 2786260 . G C 3928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-0.132;DP=111;FS=3.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=29.34;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,93:111:99:3957,0,213 -chr10 2786489 . G C 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=1.497;DP=98;FS=3.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=17.33;ReadPosRankSum=4.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:1727,0,5398 -chr10 2786491 . C A 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=2.333;DP=101;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=16.82;ReadPosRankSum=4.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:1727,0,5226 -chr10 2813253 . T C 5091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-1.067;DP=198;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.751;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,140:198:99:5120,0,1358 -chr10 2859387 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.862;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:84:614,0,84 -chr10 2864714 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-2.533;DP=20;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=11.69;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:262,0,223 -chr10 2865096 . T C 656.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=30.38;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14:685,14,0 -chr10 2868518 . T A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=2.204;DP=33;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:668,0,1076 -chr10 2868539 . A T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=2.900;DP=33;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=21.17;ReadPosRankSum=-2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:727,0,400 -chr10 2868556 . G A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=2.937;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:738,0,478 -chr10 2879551 . AT A 682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:720,67,0 -chr10 2879887 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=2.443;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:278,0,376 -chr10 2880004 . T C 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.689;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=31.64;ReadPosRankSum=3.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:56:756,0,56 -chr10 2880202 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=24.81;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:98:326,0,98 -chr10 2881484 . A T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=29.12;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:465,0,113 -chr10 2881869 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.635;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,344 -chr10 2886484 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-1.157;DP=43;FS=6.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:813,0,1626 -chr10 2886488 . C G 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-1.057;DP=43;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:813,0,1626 -chr10 2888868 . C T 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.087;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1149,0,710 -chr10 2896951 . C T 2045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2074,147,0 -chr10 2903254 . T TA 615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:653,63,0 -chr10 2903710 . G A 1987.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2016,147,0 -chr10 2963319 . T C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr10 2965444 . A G 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:709,51,0 -chr10 2974735 . A G 921.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.491;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=32.90;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:4:948,4,0 -chr10 3036766 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr10 3054334 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.077;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:269,0,706 -chr10 3054680 . C A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr10 3056369 . A T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-1.803;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:469,0,321 -chr10 3056617 . G A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.074;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=28.67;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:1003,0,769 -chr10 3056623 . A T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-1.119;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:1003,0,769 -chr10 3103250 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr10 3145163 . A G 997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:72:1026,72,0 -chr10 3145517 . G GT 426.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:464,36,0 -chr10 3147716 . G C 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:678,48,0 -chr10 3147805 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.249;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:317,0,415 -chr10 3148339 . T G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr10 3149146 . A ATG 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.003;DP=15;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:318,0,264 -chr10 3150104 . AG A 228.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:266,18,0 -chr10 3150112 . G A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr10 3150189 . T A 292.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr10 3150910 . C A 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr10 3151182 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.096;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:589,0,189 -chr10 3193180 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=28.60;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:89:400,0,89 -chr10 3193215 . G C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.039;DP=21;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:259,0,1919 -chr10 3193223 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:259,0,1919 -chr10 3193248 . G C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-1.043;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:447,0,1019 -chr10 3193571 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.794;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:504,0,226 -chr10 3194609 . A G 842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:871,63,0 -chr10 3201761 . C T 1187.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.214;DP=38;FS=2.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:12:1215,0,12 -chr10 3205208 . C T 1419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.255;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,40:50:99:1448,0,188 -chr10 3214345 . G A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.401;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,31:42:99:1067,0,245 -chr10 3274731 . C T 3021.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.808;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=32.75;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:3050,219,0 -chr10 3274762 . C T 3804.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.638;DP=95;FS=3.343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=33.16;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:3833,277,0 -chr10 3275132 . C T 284.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:9:312,0,9 -chr10 3275195 . C T 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:688,51,0 -chr10 3276516 . T C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.177;DP=35;FS=6.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1076,0,288 -chr10 3276518 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.310;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:265,0,1279 -chr10 3276641 . T C 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.009;DP=56;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:464,0,1961 -chr10 3276855 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=-2.044;DP=69;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:548,0,2031 -chr10 3277218 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-1.864;DP=113;FS=4.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=2.82;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:347,0,3498 -chr10 3281491 . T A 787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:57:816,57,0 -chr10 3325469 . A T 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:478,36,0 -chr10 3325860 . G T 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr10 3326083 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:277,0,62 -chr10 3328653 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,367 -chr10 3328840 . A C 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:646,45,0 -chr10 3330310 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr10 3332282 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.152;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:445,0,117 -chr10 3332681 . G A 606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:635,48,0 -chr10 3332708 . A T 300.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:8:328,0,8 -chr10 3367956 . G GT 252.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:290,30,0 -chr10 3373224 . A AC 301.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:339,23,0 -chr10 3373232 . A G 310.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:23:339,23,0 -chr10 3373668 . C T 1620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1649,111,0 -chr10 3375353 . C T 4540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4569,340,0 -chr10 3407862 . G A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.323;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=28.81;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:979,0,535 -chr10 3415798 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.654;DP=43;FS=1.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=26.44;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1165,0,319 -chr10 3420097 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=2.165;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,291 -chr10 3427909 . C CA 1468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.952;DP=95;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,64:95:99:1602,0,717 -chr10 3459738 . T G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.109;DP=14;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=18.05;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:281,0,202 -chr10 3459816 . T C 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.686;DP=64;FS=5.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,42:64:99:1491,0,768 -chr10 3501588 . C A 1099.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.619;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=31.31;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1128,81,0 -chr10 3511760 . GGTAA G 818.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:64:856,64,0 -chr10 3518456 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=22.87;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,206 -chr10 3522476 . G T 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:470,33,0 -chr10 3557408 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.944;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=26.91;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:56:378,0,56 -chr10 4095505 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,418 -chr10 4095622 . A G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-1.076;DP=17;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.28;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:509,0,109 -chr10 5096542 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.572;DP=54;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:279,0,1709 -chr10 5097521 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.608;DP=88;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=3.82;ReadPosRankSum=-2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:364,0,3084 -chr10 5113932 . CCCTGAACACAACACAAACACAAACACACTCTGGTATCGGCCACAGGACCACAAATAATGGACCTGCGCGTGTGCTATTCAGCTGTGCGTGAGTGTATATCGTA C 3264.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=1.549;DP=91;FS=2.169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=30.01;ReadPosRankSum=-2.891 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,80:83:99:3302,241,0 -chr10 6212746 . G C 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 -chr10 6245179 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.019;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:277,0,1074 -chr10 6246893 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.244;DP=41;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:329,0,1140 -chr10 6250150 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.612;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:382,0,375 -chr10 6269565 . CTG C 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=-1.034;DP=111;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,25:110:99:582,0,4260 -chr10 6271084 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=32.98;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:58:358,0,58 -chr10 6271086 . A C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=33.62;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:58:358,0,58 -chr10 6377152 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:271,0,57 -chr10 6690024 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.224;DP=34;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:608,0,641 -chr10 6694296 . TCTGAAAGGATCAGATTGGCTCATTTGCAATTCAAACACAGATTTAATGTTTAGCAGTGCAGGACGTTTGGACGTTTCCTCAC T 3021.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=2.077;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=33.95;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,80:86:99:3059,0,696 -chr10 6742236 . T C 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-2.036;DP=113;FS=3.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.935;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:844,0,3055 -chr10 6749917 . G A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-0.680;DP=90;FS=2.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,30:90:99:858,0,2287 -chr10 6751064 . GA G 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.460;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:262,0,520 -chr10 6837890 . AAT A 1427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.295;DP=241;FS=3.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,58:218:99:1465,0,6260 -chr10 6937547 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:332,0,45 -chr10 7004983 . CACCTGAATCACATAGGATTCATTAAATATTAGCAATGCAAACACTTTAAGCGCCTATAAGAGCTTTACATGAATATAAAAAGTA C 8355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.105;DP=382;FS=9.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.480;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,248:352:99:8393,0,2800 -chr10 7004988 . GAATCACATAGGATTCATTAAATATTA G 2390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.625;DP=370;FS=9.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,101:356:99:2428,0,9916 -chr10 7005016 . CAATGCAAACACTTTAAGCGCCTATAAGAGCTTTACATGAATATAAAAAGTAACCTGGA C 2435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.604;DP=391;FS=10.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,107:376:99:2473,0,9915 -chr10 7005390 . TCCTGGAGAGAGAGACGATTTATATTGAAACTGCTGTGAAATTAAATGGCTGCATCTGAAACATGAATGCAGCAGAGTA T 14447.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=4.255;DP=340;FS=2.333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.402;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,327:340:99:14485,1170,0 -chr10 7005588 . TCCTAAAGAACAAACATTCATGTTGAGGGCTCATTTCATTCCTTTGAGGACTGATTTTGGTTCAGATCAACGCA T 13708.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=2.720;DP=323;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.961;QD=25.42;ReadPosRankSum=-1.998 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,317:323:99:13746,1129,0 -chr10 7009462 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.731;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.192;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:237,0,1017 -chr10 7009708 . G A 1687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=-0.375;DP=83;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=20.33;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,49:83:99:1716,0,1193 -chr10 7009847 . G T 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.743;DP=182;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,53:182:99:1389,0,8214 -chr10 7009848 . T A 2727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.521;DP=182;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,75:182:99:2756,0,5838 -chr10 7009924 . C A 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=-2.565;DP=163;FS=4.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,60:163:99:2068,0,3585 -chr10 7010116 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.370;DP=40;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:246,0,2181 -chr10 7010121 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.406;DP=36;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:246,0,2218 -chr10 7011427 . G GA 532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=1.699;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=6.34;ReadPosRankSum=-3.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:570,0,3023 -chr10 7011436 . G T 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.472;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=14.85;ReadPosRankSum=2.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1927,0,1118 -chr10 7012208 . C G 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=-1.841;DP=165;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,55:165:99:1580,0,4255 -chr10 7017951 . G A 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.205;DP=99;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:1286,0,2123 -chr10 7020765 . TCTGAAACAGAGGTAACACATACAATGAATTCACAAATACTACAGTAAAAAAAGATGTGTGGTACAGTGATTCCATGTGTTTTTCGTATGTATAATCAAACACTCAC T 4356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.616;DP=100;FS=8.479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,92:100:99:4394,402,0 -chr10 7038373 . C T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.918;DP=59;FS=9.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:827,0,1201 -chr10 7038457 . G T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=-2.732;DP=62;FS=11.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=14.74;ReadPosRankSum=2.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:942,0,1188 -chr10 7061836 . G A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=-0.612;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:911,0,1063 -chr10 7066075 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:380,0,219 -chr10 7066166 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.961;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:353,0,458 -chr10 7066357 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-1.053;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:377,0,726 -chr10 7074429 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:45:258,0,45 -chr10 7074549 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr10 7074564 . A G 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr10 7074741 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr10 7080616 . A T 482.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.504;DP=15;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=32.19;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:2:509,2,0 -chr10 7087869 . C T 5206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.711;DP=179;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,136:178:99:5235,0,961 -chr10 7157166 . T C 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:482,33,0 -chr10 7181363 . T A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.226;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:297,0,1491 -chr10 7184024 . G A 845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:874,66,0 -chr10 7193158 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.759;DP=36;FS=8.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:273,0,985 -chr10 7198231 . A T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.842;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:558,0,844 -chr10 7207664 . G C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-0.087;DP=40;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:356,0,989 -chr10 7211855 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=1.025;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:389,0,820 -chr10 7213477 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.279;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:254,0,712 -chr10 7220065 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-2.922;DP=24;FS=6.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=20.70;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:525,0,303 -chr10 7221007 . T C 1874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.127;DP=119;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1903,0,1977 -chr10 7236822 . G A 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.718;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:1560,0,1598 -chr10 7251254 . T C 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=-0.157;DP=117;FS=4.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1715,0,2332 -chr10 7267083 . G A 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.595;DP=105;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1823,0,1739 -chr10 7275221 . A G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=-0.438;DP=99;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:1598,0,1820 -chr10 7289133 . TA T 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-1.172;DP=31;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:311,0,400 -chr10 7289208 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.660;DP=51;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:503,0,1170 -chr10 7292436 . GCTTTGACAAAGAGAAAGGTGTTAATGCACATGATCATCACCATTGTAGTATATTCACGTTTTTCCGGTTCCCGTTCTACCAAGCATTGCTGATTAAGCAGTGCCTCATTTATTATTCTAGCTAACTCAACTCTAAAATTCTGGCATGACGCATCAAATCTGAGTCAACCACACCACCTAC G 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=3.171;DP=153;FS=4.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=4.50;ReadPosRankSum=-3.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,138:148:99:771,0,3629 -chr10 7381624 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:286,0,248 -chr10 7489800 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-2.409;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:297,0,754 -chr10 7490776 . G GA 1375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.769;DP=59;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1413,0,253 -chr10 7491431 . A C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-2.318;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:246,0,1274 -chr10 7492895 . T G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.899;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=14.82;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:369,0,461 -chr10 7492912 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.457;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:373,0,451 -chr10 7494064 . A C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-1.695;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:456,0,1315 -chr10 7557982 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.151;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:393,0,183 -chr10 8360001 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=2.964;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=16.11;ReadPosRankSum=-2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:431,0,473 -chr10 8360329 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,580 -chr10 8416829 . T A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr10 8720294 . C T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.226;DP=54;FS=8.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:904,0,1033 -chr10 8720754 . A G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=1.531;DP=53;FS=9.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:626,0,1267 -chr10 8720825 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.668;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:773,0,800 -chr10 8721048 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=1.037;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:404,0,592 -chr10 8749764 . GA G 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=1.866;DP=83;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:519,0,1764 -chr10 8750914 . C T 2434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.104;DP=109;FS=9.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=22.34;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,70:109:99:2463,0,1344 -chr10 8751159 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.562;DP=42;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:659,0,703 -chr10 8751352 . G A 2325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-1.353;DP=138;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:2354,0,2315 -chr10 8760958 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:405,0,51 -chr10 8761345 . GT G 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:261,0,187 -chr10 8762833 . T G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:298,0,219 -chr10 8880800 . C A 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1064,72,0 -chr10 8880809 . G T 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:72:1064,72,0 -chr10 8890883 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.165;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:455,0,823 -chr10 8893026 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.019;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:382,0,788 -chr10 8893125 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.261;DP=58;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:502,0,1516 -chr10 8897813 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.122;DP=47;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:583,0,1049 -chr10 8900287 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.195;DP=46;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:405,0,2650 -chr10 8900288 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.477;DP=47;FS=2.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:398,0,2650 -chr10 8903228 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-1.535;DP=38;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=17.10;ReadPosRankSum=2.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:678,0,682 -chr10 8919659 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.528;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:523,0,848 -chr10 8920456 . A T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-0.161;DP=43;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:618,0,930 -chr10 8925511 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.687;DP=43;FS=5.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:268,0,1200 -chr10 8928594 . AGTACACTTTTCTACATGATTGTGTTCTTTTACAGTTCTGCCACGTGTGATCTGTTAGTAATGCACATTTTCTTATCTAAAAAAATATTCCTCTATAG A 1273.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=2.286;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=36.74;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:99:1311,145,0 -chr10 8931892 . A T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.708;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:627,0,1124 -chr10 8933396 . T C 628.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.327;DP=17;FS=4.523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=29.42;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:11:656,11,0 -chr10 8949505 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,449 -chr10 8949593 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=24.98;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:303,0,93 -chr10 9010465 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=2.239;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:306,0,540 -chr10 9012644 . T C 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.414;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:702,0,144 -chr10 9012797 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.919;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:298,0,367 -chr10 9023746 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,288 -chr10 9033744 . G C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,645 -chr10 9034794 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=24.80;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:301,0,100 -chr10 9036129 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=2.013;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:287,0,474 -chr10 9065189 . C G 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.147;DP=70;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:1174,0,1106 -chr10 9065917 . T A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=1.002;DP=52;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,44:52:99:1674,0,115 -chr10 9066047 . C A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-1.382;DP=68;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1160,0,1904 -chr10 9066091 . T C 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-1.948;DP=64;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=16.26;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1069,0,1106 -chr10 9179853 . A AT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.100;DP=47;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:289,0,452 -chr10 9184219 . G T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:271,0,301 -chr10 9249874 . G A 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.891;DP=78;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,41:78:99:1384,0,1350 -chr10 9249995 . A G 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.109;DP=128;FS=4.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:2118,0,2154 -chr10 9265046 . A T 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=1.941;DP=117;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.885;QD=13.41;ReadPosRankSum=2.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,45:117:99:1597,0,2599 -chr10 9267679 . C T 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-2.139;DP=101;FS=9.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:1512,0,1995 -chr10 9325534 . A G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.667;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=33.92;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:571,0,114 -chr10 9351192 . C T 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.766;DP=163;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,48:163:99:1213,0,4226 -chr10 9367021 . A T 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 -chr10 9367050 . A G 586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:615,47,0 -chr10 9367134 . G A 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:527,36,0 -chr10 9367400 . A C 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr10 9375510 . A C 2600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2629,186,0 -chr10 9375591 . T C 2560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2589,187,0 -chr10 9398542 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-0.422;DP=47;FS=9.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:413,0,1214 -chr10 9485515 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.684;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,739 -chr10 9729495 . GAGGTTTAAATTTATATTGCATGTTGTGATTTTTGAATGTTTTTCTTCAGCTTTTAGAATGATTCATGTTCTCCTCTGTTTTC G 853.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=2.246;DP=26;FS=7.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=32.84;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:99:891,0,351 -chr10 9798379 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-2.117;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:235,0,330 -chr10 10150327 . A T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr10 10668047 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,110 -chr10 10724467 . C G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.137;DP=36;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:290,0,935 -chr10 10967197 . AT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:251,0,1072 -chr10 11480088 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:233,0,446 -chr10 11923468 . A C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr10 11974584 . A C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-1.447;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:234,0,283 -chr10 11974879 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=2.431;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=16.58;ReadPosRankSum=-2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,267 -chr10 11977301 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-1.087;DP=35;FS=11.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:549,0,603 -chr10 11979677 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=-1.791;DP=50;FS=10.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:517,0,2280 -chr10 11979704 . T C 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=1.128;DP=142;FS=35.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=9.92;ReadPosRankSum=4.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:1437,0,3560 -chr10 11979718 . T G 2454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.523;ClippingRankSum=-7.098;DP=171;FS=110.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=14.36;ReadPosRankSum=-5.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:2483,0,3465 -chr10 11979811 . C A 9498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=-0.040;DP=262;FS=6.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=26.95;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,104:122:88:9527,0,88 -chr10 11979869 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=4.308;DP=33;FS=32.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:367,0,1961 -chr10 12576481 . A T 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:543,42,0 -chr10 12577187 . C G 583.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-1.335;DP=27;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=21.62;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:24:612,0,24 -chr10 12734573 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,326 -chr10 12950945 . T A 599.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.123;DP=19;FS=3.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=31.55;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:8:627,8,0 -chr10 12950947 . T C 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 -chr10 14571818 . C CA 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.657;DP=163;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,40:158:99:539,0,2332 -chr10 14949561 . G GT 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-1.044;DP=126;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:261,0,1604 -chr10 15090641 . G C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 -chr10 15090648 . A T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr10 15627054 . A G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.073;DP=75;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:347,0,2584 -chr10 16031375 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.210;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:330,0,806 -chr10 16031402 . A G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=-0.782;DP=37;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:577,0,704 -chr10 16090459 . T C 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.850;DP=31;FS=11.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:543,0,689 -chr10 16517421 . A G 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr10 16517452 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.775;DP=20;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=12.14;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:271,0,409 -chr10 16608562 . C T 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr10 18937166 . G GT 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-0.929;DP=102;FS=7.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:402,0,1688 -chr10 19024715 . C CCA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-2.154;DP=16;FS=6.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=17.86;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:86:323,0,86 -chr10 19549573 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:237,0,65 -chr10 19550366 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.454;DP=20;FS=16.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=19.04;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:409,0,293 -chr10 19576422 . CGTAAGTCAAGCGCATAAACACACTCCTCCGCTCATCACACCAGTTATCCTTCATTATCCTTTTTTTCTGAATCATCCACAG C 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:416,0,496 -chr10 19622763 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:260,0,290 -chr10 19622765 . A C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr10 20117904 . AAGGTAAGCTCAACACATCTTGTCTTTCTTGATTCACAATTGTGACACAACATTTATGTGATGTGTGTGTGTTTTTC A 5427.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=1.716;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,122:124:99:5465,476,0 -chr10 20134983 . G GT 848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.925;DP=159;FS=5.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,49:140:99:886,0,2299 -chr10 20181127 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.348;DP=58;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:564,0,1510 -chr10 20269991 . TA T 822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.196;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,31:107:99:860,0,6079 -chr10 20290797 . G GA 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.186;DP=47;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:427,0,533 -chr10 20405291 . A AT 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=-2.474;DP=162;FS=1.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:655,0,2781 -chr10 20405892 . G A 1696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.056;DP=235;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,68:235:99:1725,0,6593 -chr10 20429360 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:237,0,506 -chr10 20429397 . CGGTAATGCTTCCAGACATAATGCCATGTTACACACTAACACAAACACACACTCTGACATTTTTAATGTGGTGCA C 1135.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.133;DP=26;FS=4.607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:96:1173,96,0 -chr10 20433262 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.910;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=15.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,292 -chr10 20439681 . T C 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=1.524;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:1156,0,1779 -chr10 20440068 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-2.149;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:366,0,1141 -chr10 20440702 . G GA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.380;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:339,0,414 -chr10 20441034 . A G 2191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-1.431;DP=87;FS=11.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,59:87:99:2220,0,768 -chr10 20441137 . A C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.515;DP=34;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:328,0,888 -chr10 20441393 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=-0.338;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:253,0,1180 -chr10 20441540 . T C 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.315;DP=57;FS=5.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:844,0,1166 -chr10 20444248 . A T 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.315;DP=75;FS=14.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:1173,0,1437 -chr10 20468172 . G T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.113;DP=87;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:751,0,2066 -chr10 20482670 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=13.52;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,368 -chr10 20482999 . G C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.403;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:363,0,445 -chr10 20487686 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=2.010;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=3.67;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:278,0,2126 -chr10 20487754 . A T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.533;DP=26;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=31.99;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:62:860,0,62 -chr10 20487885 . T TA 219.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:254,0,1 -chr10 20488040 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,466 -chr10 20488418 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.466;DP=18;FS=14.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:277,0,360 -chr10 20488543 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.427;DP=28;FS=13.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:255,0,1208 -chr10 20488551 . T C 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.373;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:518,0,398 -chr10 20488777 . A C 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=-2.961;DP=80;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:1152,0,1647 -chr10 20488846 . A T 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=-1.710;DP=110;FS=9.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:110:99:1000,0,2964 -chr10 20488942 . A C 2700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.899;DP=86;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,71:86:99:2729,0,236 -chr10 20489038 . C A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:96:865,0,96 -chr10 20491615 . A T 2203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.324;DP=76;FS=3.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=29.00;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,57:76:99:2232,0,440 -chr10 20525140 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=4.980;DP=117;FS=8.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=6.35;ReadPosRankSum=-2.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:771,0,3265 -chr10 20526578 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.397;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=2.36;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:358,0,4487 -chr10 20540448 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.136;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:237,0,1377 -chr10 20544112 . TCTGAGAAGAGACCAGCAGAATTATCAGTACATGATCATTTATGTATCCAGCATTCTGAACATTAAAGAGAATATTTGAC T 1785.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=1.528;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=30.37;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1823,164,0 -chr10 20554461 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.954;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:230,0,2133 -chr10 20598790 . T A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.151;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:471,0,939 -chr10 20621758 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.411;DP=33;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,1036 -chr10 20621917 . T C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=1.545;DP=18;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=37.22;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:753,0,130 -chr10 20622207 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.160;DP=27;FS=10.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:389,0,612 -chr10 20622286 . A G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.502;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:531,0,1178 -chr10 20622330 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.494;DP=53;FS=2.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:423,0,1419 -chr10 20624440 . A C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.147;DP=65;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:577,0,1656 -chr10 20624499 . T C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-0.757;DP=84;FS=3.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,24:84:99:595,0,2270 -chr10 20624541 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-1.655;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:541,0,2636 -chr10 20630338 . C T 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 -chr10 20639111 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-1.275;DP=68;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=5.50;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:402,0,1889 -chr10 20679550 . C G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.858;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,31:139:99:548,0,4115 -chr10 20999749 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,136 -chr10 21124729 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=-0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=15.55;ReadPosRankSum=-2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:277,0,292 -chr10 21523717 . G T 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.135;DP=320;FS=15.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,71:319:99:1393,0,9477 -chr10 21524827 . G GT 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=-0.851;DP=165;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,36:150:99:546,0,3970 -chr10 21551139 . C T 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.563;DP=163;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,56:161:99:1680,0,3696 -chr10 21551732 . G GA 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.215;DP=26;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:253,0,264 -chr10 21613905 . T C 212.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:21:241,0,21 -chr10 21614037 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:280,0,108 -chr10 21647055 . C T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr10 21659474 . A G 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:275,0,22 -chr10 21659906 . T A 271.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:300,0,19 -chr10 21696452 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-2.026;DP=69;FS=2.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.625;QD=5.19;ReadPosRankSum=3.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:386,0,2001 -chr10 21728706 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.391;DP=58;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:250,0,2611 -chr10 21729391 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-2.916;DP=66;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:447,0,1792 -chr10 21729438 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.617;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:404,0,2243 -chr10 21729712 . TA T,TAA 671.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.099;DP=100;FS=5.993;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:21,42,28:91:99:1080,244,909,539,0,1266 -chr10 21738604 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:318,0,59 -chr10 21738684 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr10 21739223 . T G 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr10 21739494 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.380;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:514,0,161 -chr10 21739556 . T C 1010.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.040;DP=25;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1039,72,0 -chr10 21739892 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.283;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:480,0,491 -chr10 21739894 . C G 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.392;DP=22;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=31.53;ReadPosRankSum=1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:83:722,0,83 -chr10 21740184 . C A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.069;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:499,0,510 -chr10 21750054 . C T 500.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.594;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=33.39;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:27:529,0,27 -chr10 21750276 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr10 21753668 . T C 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr10 21757793 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,137 -chr10 21757851 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:36:340,0,36 -chr10 21764195 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:327,0,93 -chr10 21768065 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-2.258;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:298,0,288 -chr10 21768532 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr10 21792362 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:264,0,56 -chr10 21792630 . G A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr10 21798695 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,266 -chr10 21798698 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,266 -chr10 21799583 . G A 227.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=22.71;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:11:255,11,0 -chr10 21805873 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.217;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=31.12;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:495,0,199 -chr10 21805876 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.361;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=31.12;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:495,0,199 -chr10 21806778 . T C 342.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.18;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:371,0,13 -chr10 21814612 . G GT 219.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:257,21,0 -chr10 21814742 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr10 21816524 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.099;DP=24;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:370,0,447 -chr10 21835014 . C G 247.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:276,0,13 -chr10 21852056 . A T 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.639;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:730,0,247 -chr10 21852443 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=30.77;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:39:459,0,39 -chr10 21852801 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.170;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:437,0,488 -chr10 21852879 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.157;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=10.08;ReadPosRankSum=2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:260,0,1420 -chr10 21852889 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.087;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:260,0,1420 -chr10 21853107 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:280,0,419 -chr10 21853123 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:282,0,411 -chr10 21853796 . A T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.504;DP=29;FS=8.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:563,0,459 -chr10 21853910 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr10 21854072 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.109;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=16.92;ReadPosRankSum=-2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:519,0,521 -chr10 21862530 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:414,0,251 -chr10 21862693 . T C 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 -chr10 21862942 . A G 789.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:22:818,22,0 -chr10 21863057 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,136 -chr10 21863130 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,171 -chr10 21863268 . G A 437.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=33.66;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:464,0,3 -chr10 21863688 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-1.999;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:401,0,541 -chr10 21863996 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:314,0,133 -chr10 21864433 . A T 245.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:274,0,15 -chr10 22004030 . A C 730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:759,54,0 -chr10 22004504 . A G 2061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-1.297;DP=90;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,60:90:99:2090,0,968 -chr10 22019737 . C T 2252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2281,163,0 -chr10 22020547 . G A 2274.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2303,166,0 -chr10 22020559 . C T 2145.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2174,160,0 -chr10 22020988 . G A 2351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2380,178,0 -chr10 22021037 . G A 2768.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2797,205,0 -chr10 22021198 . T C 2015.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2044,141,0 -chr10 22021284 . G A 2050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2079,144,0 -chr10 22021318 . T C 1933.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1962,141,0 -chr10 22021344 . C A 1762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1791,126,0 -chr10 22021405 . A G 2664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2693,190,0 -chr10 22021786 . T G 2171.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2200,154,0 -chr10 22022086 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-2.647;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:331,0,2210 -chr10 22026061 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:314,0,249 -chr10 22028252 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,334 -chr10 22582586 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,248 -chr10 22710594 . A T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.553;DP=40;FS=4.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:473,0,918 -chr10 22716974 . T TGAC 2416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=1.168;DP=86;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.822;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,66:83:99:2454,0,373 -chr10 22733193 . TA T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:342,0,329 -chr10 22807463 . T C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=1.695;DP=45;FS=11.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=9.77;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:468,0,2180 -chr10 22945811 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.995;DP=180;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,36:179:99:590,0,5640 -chr10 22947531 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.896;DP=185;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,37:185:99:559,0,5579 -chr10 22949285 . A G 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.324;DP=135;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,42:134:99:1126,0,3653 -chr10 22953731 . C T 1899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=1.579;DP=170;FS=2.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.099;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,58:170:99:1928,0,3895 -chr10 22954282 . T C 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.570;DP=120;FS=3.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=7.74;ReadPosRankSum=2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,36:120:99:957,0,3246 -chr10 22958324 . AGTGAGTGCAGTGTTGAGGTATTCAAGTTTTCGACACCTATTTTACTGTACTATGGCATTCCAGCTCCTCCTCCTCATCTTCTCTTTCAG A 9028.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=1.302;DP=208;FS=5.444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=28.56;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,199:208:99:9066,666,0 -chr10 22958540 . TGTGAGGAACATTAAGTATACTGAAGGCATATGATATTGTGTAATGATTCGTTTTATGTGAGTGTGCATATGTGCATATGTGTATGTGTGTTGAACAG T 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=5.584;DP=213;FS=4.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=2.90;ReadPosRankSum=-4.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,189:212:99:656,0,5856 -chr10 22961837 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=1.072;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:473,0,1212 -chr10 22961862 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.714;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:299,0,807 -chr10 22962939 . A AT 564.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.473;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=24.55;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:65:649,65,0 -chr10 22963096 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-0.133;DP=40;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:303,0,1642 -chr10 22976309 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=-1.611;DP=51;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:682,0,979 -chr10 23037731 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.714;DP=67;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:426,0,1805 -chr10 23037745 . T C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.146;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:730,0,1390 -chr10 23041986 . GACCTGAGAAACAGTGAAGGTGACAATTGGTAAACTGTCACACGTCAGTTTTGAAGATGCACTTAACATTGAAGGAAGACACAGAGATGGGGTTCACTC G 3372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=1.885;DP=79;FS=12.026;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=32.14;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3410,292,0 -chr10 23050762 . G C 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.310;DP=47;FS=9.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:738,0,888 -chr10 23055942 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.076;DP=38;FS=9.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:473,0,900 -chr10 23097096 . C A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-0.842;DP=77;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:932,0,2119 -chr10 23097294 . T C 1387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.287;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:1416,0,1423 -chr10 23097523 . C A 2523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.468;DP=84;FS=5.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=30.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,67:84:99:2552,0,299 -chr10 23106748 . C T 2161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=1.267;DP=86;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=25.14;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,58:86:99:2190,0,792 -chr10 23107022 . A T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.978;DP=76;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:695,0,2031 -chr10 23107097 . T C 2080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.352;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=28.50;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,55:73:99:2109,0,433 -chr10 23107158 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.486;DP=71;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:321,0,2267 -chr10 23107498 . C G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.186;DP=58;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:677,0,1326 -chr10 23107555 . TA T 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.698;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:514,0,697 -chr10 23107644 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.98;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,133 -chr10 23110526 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.083;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:360,0,492 -chr10 23112404 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr10 23112597 . G T 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr10 23112854 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.136;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:248,0,792 -chr10 23112861 . C T 1238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1267,90,0 -chr10 23118754 . C T 1122.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1151,81,0 -chr10 23118778 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-2.434;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:314,0,782 -chr10 23126436 . A T 1938.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1967,138,0 -chr10 23126507 . A T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.227;DP=38;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:496,0,893 -chr10 23126708 . A C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.631;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:410,0,827 -chr10 23126751 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=-0.083;DP=37;FS=3.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:316,0,902 -chr10 23146747 . A G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr10 23285550 . TA T 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.340;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:97:283,0,97 -chr10 23331139 . G C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.408;DP=37;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:284,0,955 -chr10 23338083 . TCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAATATTTCACAATACAGCATTTTAGATCTAGCAGACTATACATAGAAATCTCAGACTTGCAATCAATACTGCATATGCTCAC T 1923.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.829;DP=46;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1961,176,0 -chr10 23366899 . A G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.013;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:512,0,880 -chr10 24753019 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=1.271;DP=30;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:347,0,704 -chr10 24822444 . GT G 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:68:314,0,68 -chr10 24822731 . A T 3676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:99:3705,287,0 -chr10 24822888 . C G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.792;ClippingRankSum=7.492;DP=188;FS=21.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=1.83;ReadPosRankSum=-7.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,34:188:99:373,0,5933 -chr10 24822990 . T A 1520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=1.054;DP=86;FS=13.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,49:85:99:1549,0,1354 -chr10 24823710 . CT C 368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:406,39,0 -chr10 24825010 . A T 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 -chr10 24837625 . G A 1107.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1136,81,0 -chr10 24856453 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-0.219;DP=154;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:360,0,4843 -chr10 24873592 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.975;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=8.57;ReadPosRankSum=2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:414,0,1604 -chr10 24995243 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.495;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:449,0,1649 -chr10 24995547 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.055;DP=61;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:424,0,1635 -chr10 24996335 . A T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-2.029;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=5.52;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:332,0,3310 -chr10 25004999 . G T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.309;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:748,0,882 -chr10 25031366 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.364;DP=79;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:604,0,1983 -chr10 25052730 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.824;DP=82;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:302,0,3242 -chr10 25054308 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.424;DP=59;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:249,0,2318 -chr10 25054574 . A G 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.503;DP=37;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:598,0,702 -chr10 25055615 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.969;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:255,0,1053 -chr10 25081170 . C CA 962.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.516;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,57:68:50:1293,0,50 -chr10 25081643 . C T 2498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.011;DP=118;FS=1.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:2527,0,1689 -chr10 25081710 . T TA 629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.088;DP=68;FS=5.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:667,0,618 -chr10 25081776 . T TA 1080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=-0.924;DP=90;FS=5.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:1118,0,989 -chr10 25085161 . T C 1422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.176;DP=117;FS=9.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=12.16;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,43:116:99:1460,0,2564 -chr10 25087676 . CCCTTAAAAGTCCCAATAAAATCCACAATGAATTCAAAAGATTTACATCTGGCAATATGTTTTTAAACATTTATATAGTAAATCAGCTCA C 7111.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-0.419;DP=191;FS=5.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,181:189:99:7149,533,0 -chr10 25090181 . GACCTGAAGAAGCACATTAAATGGGTAAACACATGCAAAACACTGCAGAATTAGTTACACAATTTCAACAC G 5676.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=1.577;DP=145;FS=2.149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=24.59;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,142:145:99:5714,460,0 -chr10 25090726 . T A 3375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-3.303;DP=128;FS=17.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=26.37;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,88:128:99:3404,0,1152 -chr10 25123645 . AGTAAGTAAGCTAATAAATTGCTGACACAATGACGCATTGGCATTGTTATTATTCTTGCATGTCATTCTGATTTGTTTTGCAG A 7175.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.008;DP=187;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=31.02;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,183:187:99:7213,530,0 -chr10 25127004 . A ATCAGAGAGGTCG 5233.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5271,364,0 -chr10 25140388 . A T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.176;DP=48;FS=4.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:871,0,788 -chr10 25140932 . C CA 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.227;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:390,0,1051 -chr10 25140941 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.665;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:497,0,1417 -chr10 25150646 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.758;DP=61;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1043,0,1072 -chr10 25155274 . G T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.733;DP=50;FS=4.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:750,0,912 -chr10 25155289 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.123;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:527,0,1094 -chr10 25155405 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.936;DP=33;FS=5.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:313,0,875 -chr10 25155477 . T G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:357,0,734 -chr10 25157628 . T TC 2542.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-1.189;DP=162;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:2580,0,2470 -chr10 25157796 . T A 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-4.153;DP=51;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=14.78;ReadPosRankSum=3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:782,0,1469 -chr10 25164000 . A G 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.359;DP=180;FS=3.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,94:180:99:3051,0,3049 -chr10 25947633 . T TA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-1.363;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:393,0,412 -chr10 25947676 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.813;DP=44;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:818,0,722 -chr10 25953479 . AACCTGAAAAGATAAACAGGTGAGATGAGGACCTCTAATAAGATGTTAAATTCATCTGTTCAAATCACAATTT A 1991.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.604;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:2029,181,0 -chr10 25959635 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-2.036;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:624,0,1213 -chr10 25959641 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-2.092;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:624,0,1213 -chr10 25972390 . G A 2674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=1.377;DP=418;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=6.40;ReadPosRankSum=3.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,112:417:99:2703,0,11731 -chr10 25972654 . ACTGTAAAAAAAGATATATATTATTACAAACAAAATAAAAAGGATCTTTGTGACAGTACAGTAAAGCAATCACGCATTAC A 7292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-2.471;DP=274;FS=5.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=26.62;ReadPosRankSum=-2.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,157:273:99:7330,0,8653 -chr10 25972655 . CTGT C 4107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.139;DP=272;FS=5.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=15.10;ReadPosRankSum=2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,114:271:99:4145,0,8372 -chr10 25972659 . AAAAAAAGATATATATTATTACAAACAAAATAAAAAGGATCTTTGTGACAGTACAGTAAAGCAATCACGCATTACCG A 4107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.446;DP=284;FS=4.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=14.46;ReadPosRankSum=2.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,114:282:99:4145,0,8397 -chr10 26016133 . C T 673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:702,51,0 -chr10 26017493 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.465;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:395,0,482 -chr10 26017886 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=21.86;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:378,0,205 -chr10 26208779 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.568;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:296,0,1793 -chr10 26291701 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.183;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:254,0,1927 -chr10 26335971 . G A 4102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=-1.176;DP=234;FS=10.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,121:233:99:4131,0,3885 -chr10 26336505 . A G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-0.547;DP=192;FS=3.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,48:192:99:978,0,5376 -chr10 26342776 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.000;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:424,0,576 -chr10 26345348 . C T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-1.637;DP=175;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=3.91;ReadPosRankSum=2.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,37:174:99:713,0,5145 -chr10 26396969 . C CT 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.826;DP=25;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:429,0,115 -chr10 26400029 . TCTGAGAAGAAAATAATAATCAATTAAAACTTTAATATCTGATTCTTCCTCATATCAATACGAGTTATGAAGCCACAAAC T 1242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=3.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:99:1280,106,0 -chr10 26405102 . C G 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:766,54,0 -chr10 26409127 . A T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.032;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:759,0,145 -chr10 26417908 . C T 811.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:840,60,0 -chr10 26595308 . T TA 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-1.669;DP=106;FS=4.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:473,0,4346 -chr10 26595498 . G C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.298;DP=44;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:276,0,3004 -chr10 26595503 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.932;DP=43;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:276,0,3004 -chr10 26595540 . T A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-1.147;DP=33;FS=10.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:493,0,659 -chr10 26596103 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.709;DP=21;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:241,0,484 -chr10 26619552 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-1.281;DP=29;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:646,0,385 -chr10 26619951 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.437;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:268,0,657 -chr10 26727262 . A T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=1.338;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=30.47;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:56:729,0,56 -chr10 26737699 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:364,0,176 -chr10 26744992 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.105;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=26.16;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:630,0,141 -chr10 26747829 . G A 419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:448,33,0 -chr10 26748836 . A ATT 697.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=30.34;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:22:735,22,0 -chr10 26766449 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.473;DP=55;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:234,0,1754 -chr10 26775605 . A T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.981;DP=79;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:922,0,1604 -chr10 26778472 . G A 1848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-0.598;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,50:67:99:1877,0,372 -chr10 26778685 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-3.001;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=21.32;ReadPosRankSum=2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:348,0,150 -chr10 26903931 . T TTC 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:448,0,147 -chr10 27175575 . G A 1644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.242;DP=58;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,45:58:99:1673,0,313 -chr10 27468822 . GT G 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.07;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:368,0,120 -chr10 27559152 . GGGTAAGTCTCTGATTCACAAATTGAGAACACAACCTTACAATTCATATGCACTGAATGTCTTTTGTATATGCA G 1074.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.847;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:99:1112,0,401 -chr10 27562234 . A G 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-1.180;DP=62;FS=8.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:791,0,1373 -chr10 27604713 . TACAGGTATCCCATATCTGTTATATTTAGGATAAATCAAACTCTAAATGCATATAATCATGCTGCTGTTTTCTTTTTAA T 2307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=1.019;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:2345,175,0 -chr10 27796702 . G T 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=1.147;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=19.13;ReadPosRankSum=-2.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:889,0,660 -chr10 27796896 . T G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.225;DP=73;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:840,0,1662 -chr10 28659555 . C T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.575;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:665,0,1331 -chr10 28712182 . GT G 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.213;DP=75;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:602,0,1114 -chr10 28739031 . C T 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.963;DP=86;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1192,0,1385 -chr10 28852619 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.875;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:445,0,880 -chr10 28853884 . CA C 278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:316,21,0 -chr10 28853891 . A C 287.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:316,21,0 -chr10 28860793 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=1.266;DP=71;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:637,0,1874 -chr10 28872747 . ACTGCTCCAAAACATTCAAACAGAGATATTTAATTGTGGATAAGAGATACAAAGGATATAATTTAGTTTGTCCACTTTGACATACTCAC A 3387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=2.320;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=29.06;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:76:99:3425,284,0 -chr10 28880446 . AC A 1766.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.118;ClippingRankSum=1.862;DP=188;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:1804,0,3427 -chr10 28880471 . C T 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=1.531;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1214,0,2236 -chr10 28993399 . AC A 4993.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:5031,488,0 -chr10 29050478 . A ATGG 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.135;DP=58;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:73:412,0,73 -chr10 29107357 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 -chr10 29109459 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 -chr10 29125445 . T A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr10 29125457 . A C 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr10 29144857 . C T 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:670,48,0 -chr10 29145727 . T A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr10 29165221 . G T 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1007,72,0 -chr10 29372691 . G A 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.701;DP=42;FS=11.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=32.07;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,36:42:52:1375,0,52 -chr10 29377650 . T A 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=-0.654;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,55:71:99:1965,0,414 -chr10 29965392 . A AT 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=-0.757;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:805,0,396 -chr10 29993819 . G T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr10 30005040 . A G 257.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:286,0,21 -chr10 30005063 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr10 30008493 . T TA 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-1.431;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:330,0,189 -chr10 30012721 . TCTGTTGGGTTTTAAACGGGAAACGTTCATATACAGCATTAGAGACCAAACTTGCGTTGTAATATATTTGCATATAAAAAGCGAACTTGC T 2295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.355;ClippingRankSum=1.209;DP=75;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=30.61;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,55:65:99:2333,0,3093 -chr10 30593359 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=30.37;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:423,0,48 -chr10 30598731 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-1.504;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,425 -chr10 30633922 . ACTGAAACACACATTGCCATTAAAACCACATAGAAAGTAGGTGAAAATAATAGGTGTAAATAAGTGACAAACAGTCTCAC A 4074.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=1.695;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=32.40;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:4112,331,0 -chr10 30652661 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=-0.475;DP=62;FS=6.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:365,0,1674 -chr10 30725034 . TTTTA T 927.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=1.600;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=23.79;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:99:965,103,0 -chr10 30760556 . GGGTAAGCACGTCACTCCCTAAATATTTAAATGAATTTACATCAGTCATTTCAGAAGTTAACTTAAGATGCATTTCA G 6371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:6409,584,0 -chr10 32518314 . T TG 1574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1612,113,0 -chr10 32687620 . G T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr10 33454878 . AT A 221.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:259,28,0 -chr10 33455699 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=2.963;DP=72;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=4.69;ReadPosRankSum=-3.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:366,0,592 -chr10 33455700 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=3.416;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=4.90;ReadPosRankSum=-3.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:366,0,592 -chr10 33455961 . C CT 268.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:38:381,38,0 -chr10 33456060 . C T 718.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:747,51,0 -chr10 33459978 . A T 3312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3341,241,0 -chr10 33536456 . T TCA 636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:674,45,0 -chr10 33538020 . G C 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr10 33544767 . TG T 367.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr10 33545735 . T G 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 -chr10 33627182 . GA G 375.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:2:411,0,2 -chr10 33790025 . ACTTAAAGCAACGAGAAAGAAACAATTCCAGTCACGCAAGAGAACTAATGCACCATTTATGAAATAAATTAATAAGAAAGACAAATGGAGAGACGCTAC A 2042.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=2.067;DP=47;FS=10.224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=30.69;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:99:2080,178,0 -chr10 33813207 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=3.056;DP=32;FS=13.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=21.27;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:709,0,406 -chr10 33855967 . GA G 2000.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=1.098;DP=92;FS=5.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=21.75;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,74:84:85:2039,85,0 -chr10 34128868 . GAGGTCAGCTTTTTCCACCATTCACAAACTTCAACATCTGATTTTCTAGTATTATTTTGAGACTTACATCTGAAAACCTGATTGCTTTCTT G 17525.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.308;DP=456;FS=2.361;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,439:442:99:17563,1298,0 -chr10 34134145 . AGTAAGTCAATTTATGTAAATATGAACTTGTTTCAGCACATTTAAATGAACAACTTTTAATTTCTCCTTTTAATGTCTTATTTTCTCCTTATAG A 2809.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=1.723;DP=411;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=6.84;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,373:374:99:2847,950,0 -chr10 34134553 . C T 18505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=-0.761;DP=460;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,457:459:99:18534,1349,0 -chr10 34138928 . T C 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr10 34156567 . C A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr10 34199395 . G A 1498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1527,108,0 -chr10 34202818 . C T 2191.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2220,163,0 -chr10 34209220 . A G 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.193;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=31.64;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:33:660,33,0 -chr10 34218188 . G A 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:419,29,0 -chr10 34218232 . G A 2472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2501,181,0 -chr10 34221348 . T C 4213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:4242,310,0 -chr10 34221660 . T A 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:442,30,0 -chr10 34221661 . T A 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:442,30,0 -chr10 34221704 . A T 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 -chr10 34222783 . T TA 223.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:261,24,0 -chr10 34224008 . G GT 231.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:269,24,0 -chr10 34227077 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr10 34249093 . G T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr10 34249478 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr10 34253042 . C T 560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:589,42,0 -chr10 34257673 . G C 651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:680,48,0 -chr10 34257890 . T G 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:930,63,0 -chr10 34257900 . G A 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:930,63,0 -chr10 34257955 . A G 983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1012,72,0 -chr10 34257970 . A G 1069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1098,75,0 -chr10 34258510 . G A 911.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:940,66,0 -chr10 34258529 . C CA 654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:65:692,65,0 -chr10 34258557 . C T 911.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:940,69,0 -chr10 34258845 . C A 2838.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2867,202,0 -chr10 34258877 . T C 2092.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.556;DP=53;FS=4.690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=29.14;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2121,154,0 -chr10 34258931 . T G 2190.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2219,157,0 -chr10 34259180 . A T 897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:926,66,0 -chr10 34259306 . C A 2014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2043,141,0 -chr10 34259512 . G A 1456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1485,102,0 -chr10 34259519 . A G 1456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:1485,102,0 -chr10 34259794 . G T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:430,30,0 -chr10 34259828 . G A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:32:440,32,0 -chr10 34259949 . T A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:26:344,26,0 -chr10 34260098 . A G 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:665,48,0 -chr10 34260178 . C G 2404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2433,172,0 -chr10 34260316 . T A 918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:947,66,0 -chr10 34260317 . A G 918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:66:947,66,0 -chr10 34260500 . T C 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:672,45,0 -chr10 34260587 . G A 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 -chr10 34260692 . A T 1011.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1040,72,0 -chr10 34260752 . C G 1644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1673,117,0 -chr10 34261128 . A G 2494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2523,171,0 -chr10 34261190 . T C 1871.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1900,132,0 -chr10 34261373 . G A 1345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1374,99,0 -chr10 34261435 . C A 1440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1469,99,0 -chr10 34261437 . G T 1440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1469,99,0 -chr10 34261581 . C A 1866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1895,132,0 -chr10 34261661 . G C 2497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2526,178,0 -chr10 34262094 . G A 1751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1780,129,0 -chr10 34262118 . G C 1563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1592,120,0 -chr10 34262149 . G A 1910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1939,138,0 -chr10 34262313 . C G 3978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:4007,295,0 -chr10 34270605 . T C 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 -chr10 34283330 . C G 1141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1170,87,0 -chr10 34286997 . C T 950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:979,69,0 -chr10 34288851 . G A 2309.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2338,169,0 -chr10 34288935 . A G 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 -chr10 34293693 . C T 688.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:717,54,0 -chr10 34303149 . C T 485.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=34.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:512,2,0 -chr10 34319220 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr10 34321428 . A G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr10 34330205 . G A 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1046,72,0 -chr10 34332328 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr10 34332340 . A C 591.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:620,45,0 -chr10 34333201 . G A 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:782,57,0 -chr10 34333263 . C A 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:999,69,0 -chr10 34346675 . T C 2459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2488,182,0 -chr10 34355490 . A C 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.476;DP=64;FS=11.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,41:64:99:1354,0,776 -chr10 34428536 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr10 34428899 . C A 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr10 34431109 . T A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr10 34435140 . A G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 -chr10 34475997 . A T 1535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1564,114,0 -chr10 34479564 . A T 1422.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1451,102,0 -chr10 34496403 . C T 1453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1482,108,0 -chr10 34506295 . C T 783.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:812,57,0 -chr10 34564736 . G T 1931.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1960,138,0 -chr10 34568158 . A T 1934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.873;DP=82;FS=3.029;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=23.59;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:99:1963,102,0 -chr10 34568292 . T C 2329.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:2367,164,0 -chr10 34568301 . C A 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.440;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:905,0,851 -chr10 34568464 . A G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:651,48,0 -chr10 34617220 . A G 2179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2208,160,0 -chr10 34621775 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr10 34643283 . T C 5623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:5652,406,0 -chr10 34645488 . C CA 204.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr10 34930488 . A G 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:50:645,50,0 -chr10 34974468 . G T 2377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2406,169,0 -chr10 34984945 . A C 1361.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1390,105,0 -chr10 34985843 . C T 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr10 34989075 . C T 851.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:880,63,0 -chr10 34989111 . C A 1149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1178,84,0 -chr10 34989414 . T A 2768.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2797,199,0 -chr10 35014422 . G A 3240.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3269,223,0 -chr10 35025303 . A T 2787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2816,208,0 -chr10 35039444 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr10 35055592 . G T 6280.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:6309,466,0 -chr10 35238587 . G T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 -chr10 35246848 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr10 35246919 . A T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.043;DP=22;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=30.17;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:69:692,0,69 -chr10 35405863 . C T 1330.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1359,99,0 -chr10 35406586 . C T 1189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1218,90,0 -chr10 35408549 . T C 633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:662,48,0 -chr10 35423931 . G C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=33.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,1:7:99:263,0,192 -chr10 35430993 . T A 275.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:304,24,0 -chr10 35431152 . C T 1117.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=1.609;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1146,81,0 -chr10 35431267 . T A 1497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1526,108,0 -chr10 35431575 . A T 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 -chr10 35432493 . A G 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:645,48,0 -chr10 36461374 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,134 -chr10 36623762 . G A 3936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3965,286,0 -chr10 36626913 . T G 1782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1811,129,0 -chr10 36627131 . C T 1850.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1879,135,0 -chr10 36630866 . G A 1783.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1812,141,0 -chr10 36631635 . C G 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2255,157,0 -chr10 36631638 . T C 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2255,157,0 -chr10 36633886 . C T 1379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1408,102,0 -chr10 36634371 . T G 2836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2865,205,0 -chr10 36634518 . G A 1800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1829,132,0 -chr10 36634557 . A C 1833.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1862,138,0 -chr10 36634842 . T A 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1544,117,0 -chr10 36635205 . C G 1020.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1049,75,0 -chr10 36635237 . A C 1077.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1106,81,0 -chr10 36635284 . C T 1479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1508,108,0 -chr10 36635346 . G T 2150.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2179,157,0 -chr10 36635459 . C G 1650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1679,120,0 -chr10 36635557 . C A 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr10 36635567 . A T 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:548,39,0 -chr10 36635579 . C T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr10 36635612 . T G 1431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1460,105,0 -chr10 36635751 . C T 1599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1628,111,0 -chr10 36635752 . A G 1599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1628,111,0 -chr10 36635821 . T C 1787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1816,132,0 -chr10 36636174 . A T 1842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1871,135,0 -chr10 36636228 . A C 1253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1282,93,0 -chr10 36673059 . A T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:309,21,0 -chr10 36673060 . A G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr10 37242466 . T TTA 14703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.803;DP=322;FS=6.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=32.63;ReadPosRankSum=-3.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,140:303:99:14741,0,4037 -chr10 37242592 . CA C 1742.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.461;DP=259;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,110:245:99:1780,0,9706 -chr10 37243788 . TCTGAGGAAGAAAAGAAGAAAAAAAAAAGTTGGGATAGGAGGGGAAAATGGCTTTAACACGATGTAAATGAGAGGTGTGACTGAC T 14687.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=1.435;DP=437;FS=4.541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=33.61;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,392:411:99:14725,1208,0 -chr10 37543912 . AT A 1553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-1.214;DP=56;FS=2.935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:1591,158,0 -chr10 37544696 . TG T 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.592;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=26.82;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:681,0,743 -chr10 37586198 . T G 910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:939,63,0 -chr10 37586205 . T A 910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:63:939,63,0 -chr10 37586309 . G A 1260.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1289,96,0 -chr10 37687569 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=1.852;DP=67;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.457;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:406,0,1994 -chr10 37698853 . G T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=2.571;DP=70;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:745,0,1866 -chr10 37699795 . A G 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.409;DP=88;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:1661,0,1610 -chr10 37738540 . TCCTGCATATCCAAGAAGAAGAATATTCAAGTGACCGACAGTCTGAGAAATCACAGATCAGTGCAAACAGTCAGACTTTACTCA T 4050.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.842;DP=99;FS=1.893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,87:91:99:4088,356,0 -chr10 37800264 . GA G,GAAA 361.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=1.542;DP=22;FS=3.680;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=16.42;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,11,6:18:99:451,187,224,286,0,471 -chr10 37802059 . C CT 675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=1.599;DP=41;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:76:713,0,76 -chr10 37815679 . G A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr10 37816009 . G A 4675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=2.418;DP=257;FS=3.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,130:257:99:4704,0,4545 -chr10 37828628 . A G 3861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.844;ClippingRankSum=1.763;DP=225;FS=19.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,110:225:99:3890,0,3751 -chr10 37856481 . GA G 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-1.080;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,36:45:50:831,0,50 -chr10 37856541 . T C 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=-2.660;DP=60;FS=9.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,33:60:99:1085,0,988 -chr10 37856845 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=3.852;DP=71;FS=5.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:476,0,3062 -chr10 37857242 . A T 2329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=-2.438;DP=86;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,65:84:99:2358,0,955 -chr10 37857245 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=1.013;DP=83;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:348,0,4825 -chr10 37859988 . C A 2487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=-0.877;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,86:155:99:2516,0,2350 -chr10 37898332 . C G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-2.178;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=20.93;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:656,0,323 -chr10 37911010 . C A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:306,21,0 -chr10 37912200 . C T 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr10 37912844 . CGTAAGTTTATAAAACTTTTTATATATATACTCCTTCACCCTTTAGGACTATTCAATGGATGGGTTTTCTTTTTTAG C 15156.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=336;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,332:333:99:15194,1023,0 -chr10 37917333 . A C 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=-0.828;DP=46;FS=20.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1086,0,455 -chr10 37929976 . TCTAAACACACAACACCAATAAATCGATCACACACAACAGGACACATTATATCACGACATATCAAAATTGCACACTTTTGCATTTACTCCAC T 3184.65 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.884;DP=82;FS=1.991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=33.10;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,78:82:99:3222,311,0 -chr10 37946100 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,167 -chr10 37946160 . C A 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:625,45,0 -chr10 37948966 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr10 37952480 . A G 1922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=1.022;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.585;QD=22.10;ReadPosRankSum=2.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,57:87:99:1951,0,933 -chr10 37952492 . G A 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.542;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,44:120:99:1507,0,2583 -chr10 37952532 . C T 2034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-1.575;DP=158;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=12.88;ReadPosRankSum=3.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,62:157:99:2063,0,3151 -chr10 37952637 . T C 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:264,21,0 -chr10 37952714 . A C 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:569,42,0 -chr10 37954282 . C G 227.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:19:256,19,0 -chr10 37954373 . G A 569.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.21;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:4:596,4,0 -chr10 37954637 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=-0.157;DP=143;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,53:143:99:1654,0,4815 -chr10 37954638 . A C 2884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=1.084;DP=142;FS=3.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:2913,0,2075 -chr10 37954678 . C T 2431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-2.179;DP=171;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,70:171:99:2460,0,3462 -chr10 37954796 . GT G 1464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.815;DP=184;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1502,0,1805 -chr10 37954950 . G A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=-0.633;DP=151;FS=5.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,43:151:99:1097,0,4103 -chr10 37954972 . G T 4281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=-1.008;DP=167;FS=7.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,116:166:99:4310,0,1326 -chr10 37955115 . T TA 1229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.582;DP=169;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,58:161:99:1267,0,2442 -chr10 37955170 . A C 5943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:5972,438,0 -chr10 37955303 . A T 6622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6651,473,0 -chr10 37955408 . T A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-1.332;DP=100;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:606,0,2906 -chr10 38133733 . G T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=-0.055;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:467,0,1991 -chr10 38148335 . TCTGAAGGAGGAGAAAATGATTGAAATTACTCTAAAGAGATCACACCATTTTTTTTCTCTTAAATGTTTAAAATGGCATAC T 2116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=1.663;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=30.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2154,180,0 -chr10 38148663 . GAGCTGAAAATAGACAATAATTCATCATAAAC G 1921.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.060;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=22.61;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,56:85:99:1959,0,1047 -chr10 38148665 . GCTGAAAATAGACAATAATTCATCATAAACGGATGTGAACACAAACTTCTGTAAGAGGTTTTGAGTAATATTTCATAC G 663.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.930;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:701,0,3046 -chr10 38148696 . GATGTGAACACAAACTTCTGTAAGAGGTTTTGAGTAATATTTCATAC G 1923.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.564;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,55:84:99:1961,0,1047 -chr10 38302737 . T C 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-0.160;DP=74;FS=10.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,30:74:99:1290,0,3105 -chr10 38302746 . A G 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.376;DP=73;FS=8.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.293;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:1290,0,3132 -chr10 38374605 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=1.821;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=13.51;ReadPosRankSum=-2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:447,0,624 -chr10 38403277 . T C 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.510;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:504,0,430 -chr10 38457208 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:288,0,64 -chr10 38460793 . C G 1438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-1.459;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=28.97;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1467,102,0 -chr10 38462707 . A G 3094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-2.138;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=20.10;ReadPosRankSum=2.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,88:154:99:3123,0,2976 -chr10 38462718 . A G 6294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.799;DP=154;FS=2.603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.322;QD=29.73;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,142:154:99:6323,285,0 -chr10 38718415 . GGGTATGTAAAGTGCTGCATGTAGACTTTGTAGATGTACAGTAGTTGGTTTTAATGTTCTGGAACTTTTTTTA G 1145.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.847;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.918;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:44:1183,44,0 -chr10 38730063 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.601;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:313,0,535 -chr10 38730181 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=2.684;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.87;ReadPosRankSum=-2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,747 -chr10 39097700 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=-0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:354,0,344 -chr10 39116768 . T TTA 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:245,0,52 -chr10 39623585 . GA G 447.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.658;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=17.91;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:30:485,0,30 -chr10 39624284 . CG C 511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-1.344;DP=51;FS=2.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:549,0,1071 -chr10 39881757 . A T 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.664;DP=92;FS=9.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.45;ReadPosRankSum=-3.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:714,0,2423 -chr10 39882051 . A T 5903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.219;DP=236;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=25.02;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,160:235:99:5932,0,2021 -chr10 39885130 . C T 5716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.703;DP=220;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,156:220:99:5745,0,1571 -chr10 39885142 . GCAGGTACGAACCAATTTAAGTAAACATTAGTTATAACCTCATCTGTGAATTCAGTTGCTGATATAGCCTCACTTTTCCTTA G 8162.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.661;DP=228;FS=3.186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=30.29;ReadPosRankSum=2.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,206:215:99:8200,542,0 -chr10 39886113 . G A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-1.068;DP=34;FS=2.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:890,0,333 -chr10 39886196 . T TC 753.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=1.507;DP=48;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:791,0,793 -chr10 39886210 . T C 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.239;DP=45;FS=8.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=17.04;ReadPosRankSum=-2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:795,0,768 -chr10 39886455 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-1.301;DP=63;FS=10.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:464,0,1677 -chr10 39887819 . C T 2724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=-0.836;DP=119;FS=2.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,77:117:99:2753,0,1855 -chr10 39960057 . C T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=-0.778;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=29.30;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:80:995,0,80 -chr10 39964924 . TGGTAATGTTTATTAAATATTAGCATTTGTGATGCTGCAAAACAACCTGAAACGTGCACACCTAATCATTGACTTTAACCAAACA T 4280.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:4318,332,0 -chr10 39965136 . ACAGGTAAACATAGACTGAAAAGGTTTTTTAAAGTAAATATGTGCTGTGACAAGACTGATCTGACCTGTGGCGCTCTTTATTTG A 4145.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.683;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,98:103:99:4183,346,0 -chr10 39977558 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.678;DP=20;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,121 -chr10 39979605 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=2.431;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.05;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,251 -chr10 39994094 . A G 288.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.02;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:4:315,0,4 -chr10 40011579 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:296,0,214 -chr10 40027510 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.509;DP=66;FS=12.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:1222,0,1110 -chr10 40027759 . T C 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=-0.565;DP=82;FS=14.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1563,0,1243 -chr10 40027811 . A G 2581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-1.472;DP=125;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,79:125:99:2610,0,1584 -chr10 40036608 . A G 4665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.098;DP=182;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,129:179:99:4694,0,1229 -chr10 40059580 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:240,0,434 -chr10 40116394 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=18.47;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:490,0,306 -chr10 40116423 . T A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.936;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:495,0,250 -chr10 40427430 . ACG A 28678.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=640;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,640:640:99:28716,2142,0 -chr10 40427433 . TGAGTATACTTTTTAAATGTATATAATTCACATATATTCAACAGCTATAGGAAGTATTCCCAGTTGTTTACATATTAATTGATGTGTTATTACTCTCTTCGTTTTCAG T 28594.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=2.543;DP=640;FS=8.926;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,636:640:99:28632,2138,0 -chr10 40450307 . TGTAAATGTTGCATTTTTTCATTTGCTTTACAAATTTAAACATGATTTCCTAATTTATTAGTTTTTTTTCACTTGTCAG T 2705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.049;DP=84;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=32.21;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,77:84:99:2955,0,1026 -chr10 40477449 . G A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr10 40563493 . G A 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=-1.279;DP=280;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,94:279:99:3260,0,6664 -chr10 40574605 . C T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr10 40575050 . T A 588.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:617,42,0 -chr10 40586121 . G A 4181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.156;DP=366;FS=9.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,127:365:99:4210,0,8020 -chr10 40592160 . G A 5640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.688;DP=466;FS=10.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,165:466:99:5669,0,10374 -chr10 40595304 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.252;DP=364;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=1.24;ReadPosRankSum=-6.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:309,55:364:99:478,0,11876 -chr10 40608522 . CT C 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-1.547;DP=80;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:296,0,1757 -chr10 40609853 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-0.635;DP=40;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:312,0,1083 -chr10 40610283 . C CA 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.479;DP=45;FS=6.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:543,0,1851 -chr10 40610460 . C A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-2.327;DP=75;FS=5.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:588,0,1755 -chr10 40610570 . T C 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.260;DP=69;FS=13.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=12.87;ReadPosRankSum=-2.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,27:69:99:916,0,1398 -chr10 40612307 . CCCTAAAAAAATGGCTTGCATTAATAGCATGTTTAAAAAAAAGGAGATACACGATAGAGATGTAAAGATTTGCA C 3132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=2.266;DP=90;FS=2.364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=34.81;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,81:84:99:3170,233,0 -chr10 40648015 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,247 -chr10 40650842 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.072;DP=48;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:874,0,791 -chr10 40652890 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=-1.649;DP=38;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:356,0,1197 -chr10 40657280 . G T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr10 40658056 . A T 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr10 40658225 . A G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr10 40972476 . G A 363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:392,30,0 -chr10 41479699 . G T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.387;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=20.99;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:553,0,308 -chr10 41644412 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.034;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:344,0,84 -chr10 41644803 . GT G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,147 -chr10 41644812 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:243,0,147 -chr10 41663001 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.485;DP=48;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:876,0,857 -chr10 42441253 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-0.035;DP=21;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:368,0,362 -chr10 42567344 . C A 4717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-3.910;DP=187;FS=6.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,141:187:99:4746,0,4040 -chr10 42567396 . C T 6440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=2.747;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=30.49;ReadPosRankSum=-2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,133:160:99:6469,0,142 -chr10 42654867 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.817;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:319,0,370 -chr10 42655085 . C T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:672,48,0 -chr10 42657371 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:254,0,348 -chr10 42681923 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=22.23;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,109 -chr10 43202429 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.954;DP=93;FS=2.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:488,0,2691 -chr10 43205948 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.782;DP=90;FS=3.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:299,0,2729 -chr10 43227126 . A T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:485,0,158 -chr10 43230939 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=-1.589;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:305,0,330 -chr10 43286973 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.580;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:277,0,475 -chr10 43289286 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:283,0,354 -chr10 43290492 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.134;DP=21;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=31.32;ReadPosRankSum=2.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:686,0,111 -chr10 43291112 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.359;DP=56;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:500,0,505 -chr10 43296685 . C A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:367,0,402 -chr10 43319577 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:331,0,181 -chr10 43324625 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-1.154;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,258 -chr10 43324853 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:274,0,115 -chr10 43324854 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.72;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:274,0,115 -chr10 43325139 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.53;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:94:231,0,94 -chr10 43327387 . A T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr10 43348607 . A C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.383;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:472,0,703 -chr10 43360377 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.440;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:259,0,1258 -chr10 43361115 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.183;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:267,0,782 -chr10 43385690 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-0.747;DP=46;FS=10.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:262,0,1367 -chr10 43455026 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.537;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:275,0,577 -chr10 43469407 . A C 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.463;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:612,0,1133 -chr10 43473009 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.662;DP=47;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:545,0,1190 -chr10 43477020 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.866;DP=42;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:498,0,1101 -chr10 43477352 . G T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=-3.246;DP=71;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:976,0,1632 -chr10 43484935 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.093;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:252,0,3190 -chr10 43500464 . G C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,326 -chr10 43500833 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr10 43502032 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=2.064;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:290,0,457 -chr10 43527724 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=1.503;DP=29;FS=10.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=27.89;ReadPosRankSum=-1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:837,0,175 -chr10 43528018 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.949;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:232,0,638 -chr10 43528480 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.42;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:230,0,108 -chr10 43560970 . G GA 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-2.009;DP=43;FS=5.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:634,0,292 -chr10 43561077 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=1.126;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:310,0,353 -chr10 43561079 . A T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.318;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:310,0,353 -chr10 43561105 . C A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.139;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,491 -chr10 43561469 . C T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=1.127;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:622,0,2675 -chr10 43561649 . A G 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=1.253;DP=104;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=13.05;ReadPosRankSum=-2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:1385,0,1739 -chr10 43565106 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.433;DP=75;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:680,0,1858 -chr10 43662625 . G GA 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-1.308;DP=84;FS=6.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:650,0,1161 -chr10 43726093 . A AGGGGTGCACAC 2008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.540;DP=70;FS=4.236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.70;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:2046,172,0 -chr10 43866192 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.093;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:669,0,2155 -chr10 43878757 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:260,0,67 -chr10 43891338 . C T 3118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.117;DP=387;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,122:386:99:3147,0,9779 -chr10 43904755 . C T 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.363;DP=283;FS=7.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,71:282:99:1151,0,9273 -chr10 43904895 . C CA 1273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-1.175;DP=248;FS=15.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,84:223:99:1311,0,3247 -chr10 43905842 . T TC 1069.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-1.604;DP=68;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=15.73;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1107,0,836 -chr10 43905851 . A G 1018.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=-1.418;DP=68;FS=6.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:1056,0,2113 -chr10 43921424 . T C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 -chr10 44026792 . G C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-1.503;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:503,0,1598 -chr10 44028881 . C A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.302;DP=28;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:339,0,789 -chr10 44106744 . G T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.423;DP=99;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:388,0,3104 -chr10 44110376 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.126;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:587,0,4498 -chr10 44293610 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.919;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:354,0,342 -chr10 44417111 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.469;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:314,0,424 -chr10 44672846 . G T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-0.002;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,34:168:99:558,0,8493 -chr10 44703256 . A G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;ClippingRankSum=-0.238;DP=214;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=3.70;ReadPosRankSum=2.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,45:213:99:821,0,6124 -chr10 44703604 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-1.231;DP=141;FS=6.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,34:141:99:700,0,4067 -chr10 44827980 . T G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 -chr10 44928257 . T A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-1.581;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:403,0,911 -chr10 44928264 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.102;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:403,0,911 -chr10 45020950 . A G 333.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:362,27,0 -chr10 45028348 . C G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:334,0,160 -chr10 45035181 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr10 45067804 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=2.369;DP=46;FS=7.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:257,0,1362 -chr10 45067815 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=2.087;DP=44;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:245,0,1233 -chr10 45078274 . G A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.955;DP=152;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,42:152:99:979,0,4793 -chr10 45083355 . C T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=1.210;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:1280,0,4419 -chr10 45088334 . G A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-0.622;DP=160;FS=0.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,42:160:99:991,0,4500 -chr10 45163961 . G GA 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-3.207;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:484,0,809 -chr10 45213259 . C G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.023;DP=104;FS=5.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,25:104:99:543,0,2999 -chr10 45218110 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-1.123;DP=107;FS=1.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,25:107:99:562,0,3247 -chr10 45263682 . AT A 743.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:79:781,79,0 -chr10 45264750 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-0.069;DP=98;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:265,0,4803 -chr10 45270767 . G A 1759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-3.257;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,54:159:99:1788,0,3541 -chr10 45301886 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.971;DP=42;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:444,0,752 -chr10 45302048 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-0.581;DP=73;FS=15.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:385,0,2692 -chr10 45305146 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:91:249,0,91 -chr10 45305148 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:91:249,0,91 -chr10 45334226 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr10 45437101 . T G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.724;DP=43;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:608,0,822 -chr10 45437214 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=1.566;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:503,0,415 -chr10 45501872 . TGGCCTTCATAATCAAACACAATAC T 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.229;DP=83;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,31:81:99:1057,0,1796 -chr10 45501874 . GCCTTCATAATCAAACACAATACTGATTTTAGTTCACCTATGACCTATAAATATATACATTAAGAATGTTCACGATGCCCTA G 1539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.485;DP=83;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,48:81:99:1577,0,1175 -chr10 45501898 . GATTTTAGTTCACCTATGACCTATAAATATATACATTAAGAATGTTCACGATGCCCTA G 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-1.168;DP=82;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1057,0,1786 -chr10 45513279 . A T 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=1.158;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1513,0,1687 -chr10 45517770 . G A 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-2.724;DP=87;FS=2.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1001,0,1865 -chr10 45552553 . G T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=4.416;DP=31;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=24.93;ReadPosRankSum=-4.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:801,0,684 -chr10 45552554 . A T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.663;ClippingRankSum=4.190;DP=26;FS=12.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=29.72;ReadPosRankSum=-4.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:801,0,688 -chr10 45554111 . C CG 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=3.075;DP=26;FS=7.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=17.53;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:493,0,456 -chr10 45554114 . G C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=33.52;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:490,0,456 -chr10 45559936 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=-0.359;DP=59;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=6.37;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:404,0,1512 -chr10 45560315 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.406;DP=50;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:698,0,1038 -chr10 45573930 . C G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.594;DP=25;FS=9.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,923 -chr10 45575089 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:421,0,48 -chr10 45584626 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.921;DP=30;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:444,0,575 -chr10 45584643 . T A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.213;DP=34;FS=7.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:441,0,691 -chr10 45608941 . G T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-2.001;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:497,0,809 -chr10 45619715 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.283;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=24.88;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:874,0,267 -chr10 45619731 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.556;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:270,0,1032 -chr10 45619810 . C G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.301;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:629,0,1079 -chr10 45621070 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-1.604;DP=22;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:293,0,491 -chr10 45621094 . G C 673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:702,51,0 -chr10 45653142 . C T 2178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.206;DP=309;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,89:309:99:2207,0,8319 -chr10 45658672 . CGGTAAGTCATCCTGTGTTTGATATTGGACTATTGTTCAGAAACGCTGGACAGCACTTGCGTTTACCTGTCCTGCA C 10309.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=3.565;DP=329;FS=7.364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.815;QD=31.34;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,295:311:99:10347,765,0 -chr10 45659747 . CGGTAAAGCTGCTGTTTCCTATATTTTCCTCTTCTTCGCTGTCCTTCATGAAATCTCATCATTATTATTCTGTGTTTTCTGCCTCA C 13900.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=302;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,302:302:99:13938,1144,0 -chr10 45661557 . CCA C 1894.32 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-1.223;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,63:73:54:1940,54,0 -chr10 45689592 . G C 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=1.451;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:460,0,374 -chr10 45692274 . T G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.346;DP=33;FS=5.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:481,0,654 -chr10 45709263 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-0.395;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:422,0,765 -chr10 45712688 . CG C 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:58:297,0,58 -chr10 45718779 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=1.151;DP=47;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=4.42;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:236,0,1101 -chr10 45719943 . C T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-0.839;DP=59;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:779,0,1294 -chr10 45726034 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-1.529;DP=37;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:402,0,663 -chr10 45865693 . C T 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-1.060;DP=77;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1033,0,1574 -chr10 45922566 . TCA T 1194.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1232,103,0 -chr10 45922779 . GA G 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-1.905;DP=71;FS=7.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:468,0,1059 -chr10 45923864 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=-0.989;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:351,0,1417 -chr10 45924275 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.526;ClippingRankSum=-0.338;DP=74;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:274,0,2387 -chr10 45924667 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=1.500;DP=75;FS=4.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:651,0,3863 -chr10 45926038 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.628;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:288,0,294 -chr10 45926494 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.523;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:364,0,2234 -chr10 45978985 . G A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=1.383;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:463,0,459 -chr10 45988367 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.455;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:473,0,731 -chr10 46005470 . A C 3070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.168;DP=183;FS=18.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,84:182:99:3099,0,3258 -chr10 46007764 . C T 5529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.007;DP=519;FS=5.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,175:519:99:5558,0,11258 -chr10 46012631 . C CT 536.20 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-1.364;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:38:735,38,0 -chr10 46014994 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.549;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,1613 -chr10 46015103 . GT G 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.419;DP=35;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:326,0,418 -chr10 46015797 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.300;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.781;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:475,0,666 -chr10 46015865 . A G 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=-2.130;DP=50;FS=6.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=11.70;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:613,0,1202 -chr10 46016151 . T G 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.125;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:756,0,916 -chr10 46016168 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.621;DP=43;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:718,0,773 -chr10 46016425 . G C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=2.702;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:279,0,1027 -chr10 46017571 . T A 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.363;DP=74;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1336,0,1226 -chr10 46024754 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.239;DP=75;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1283,0,1108 -chr10 46032058 . G A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.474;DP=77;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1398,0,1363 -chr10 46032386 . C T 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.818;DP=81;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:1334,0,1361 -chr10 46046266 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=-0.121;DP=54;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:251,0,1586 -chr10 46152011 . T A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.202;DP=66;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:486,0,1828 -chr10 46152957 . T C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.544;DP=39;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=19.38;ReadPosRankSum=-1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:784,0,614 -chr10 46153832 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=-0.485;DP=40;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:285,0,2307 -chr10 46153842 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.512;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:285,0,2307 -chr10 46154043 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=9.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:335,0,672 -chr10 46154136 . T C 2514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=1.402;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=27.69;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,22:29:63:2543,63,0 -chr10 46154143 . T C 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.680;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=33.59;ReadPosRankSum=-1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:1566,0,275 -chr10 46156637 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=1.006;DP=92;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:475,0,2500 -chr10 46178105 . C T 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.916;DP=103;FS=13.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:1499,0,2418 -chr10 46181248 . A C 1322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.385;DP=78;FS=7.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:1351,0,1303 -chr10 46205227 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=1.927;DP=66;FS=4.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:232,0,2001 -chr10 46292868 . G A 1962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.753;DP=186;FS=6.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,62:186:99:1991,0,4219 -chr10 46298864 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=1.312;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:666,0,2924 -chr10 46311792 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=-2.081;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:248,0,1242 -chr10 46312657 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-1.256;DP=42;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:554,0,818 -chr10 46320825 . G T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.644;DP=46;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:562,0,946 -chr10 46323656 . C T 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-1.188;DP=57;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:737,0,1080 -chr10 46337719 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.451;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=31.10;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:35:930,35,0 -chr10 46337769 . C T 662.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.964;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.96;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:13:691,13,0 -chr10 46362875 . C CA 1773.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.640;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,75:217:99:1811,0,3687 -chr10 46366771 . G A 2775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-1.318;DP=446;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=6.22;ReadPosRankSum=2.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,120:446:99:2804,0,12310 -chr10 46376775 . G A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.092;DP=64;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:662,0,1378 -chr10 46377297 . G A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.256;DP=108;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:925,0,2632 -chr10 46377974 . CT C 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.879;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:373,0,184 -chr10 46378095 . T A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=1.284;DP=38;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:521,0,807 -chr10 46379222 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.217;DP=77;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:453,0,6009 -chr10 46379503 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-0.242;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=3.28;ReadPosRankSum=2.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:258,0,2256 -chr10 46379715 . A T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-3.032;DP=53;FS=15.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:669,0,1195 -chr10 46380741 . T A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.939;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:463,0,3211 -chr10 46380952 . G T 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.987;DP=50;FS=5.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:859,0,2680 -chr10 46380982 . G A 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=-1.005;DP=51;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:789,0,3561 -chr10 46381830 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.092;DP=55;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:264,0,1758 -chr10 46382252 . T C 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=1.100;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:604,0,2249 -chr10 46411827 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.254;DP=16;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:351,0,81 -chr10 46432351 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=13.42;ReadPosRankSum=-2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,325 -chr10 46443028 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.138;DP=46;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:244,0,1260 -chr10 46451793 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=2.923;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.08;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:398,0,360 -chr10 46452131 . C G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-1.295;DP=62;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:369,0,2149 -chr10 46460290 . T A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=1.282;DP=101;FS=8.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,30:101:99:678,0,2647 -chr10 46466272 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=-1.607;DP=88;FS=8.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:586,0,2355 -chr10 46466353 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.359;DP=96;FS=5.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:330,0,2901 -chr10 46467079 . T C 1747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=-0.512;DP=103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.803;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1776,0,1668 -chr10 46470358 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:283,0,194 -chr10 46475603 . G T 2351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.464;DP=106;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=22.19;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,70:106:99:2380,0,1198 -chr10 46480341 . A T 3974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.495;DP=243;FS=0.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,113:242:99:4003,0,4136 -chr10 46490176 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.807;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:463,0,485 -chr10 46495885 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.898;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=23.18;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:376,0,155 -chr10 46503240 . G T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.585;DP=44;FS=8.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:621,0,847 -chr10 46524941 . GC G 610.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:648,49,0 -chr10 46530841 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.380;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:563,0,2188 -chr10 46530862 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-2.617;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=4.71;ReadPosRankSum=2.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:372,0,2451 -chr10 46530940 . G A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=1.095;DP=47;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:668,0,918 -chr10 46533037 . C T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=1.117;DP=93;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:626,0,2424 -chr10 46534384 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.600;DP=50;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:610,0,1056 -chr10 46537559 . G T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.373;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=11.14;ReadPosRankSum=3.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:864,0,1652 -chr10 46549693 . TGC T 792.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-1.881;DP=35;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=22.65;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:830,0,244 -chr10 46557339 . G GGA 1357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-1.784;DP=105;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.278;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:1395,0,1774 -chr10 46557371 . G A 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-0.839;DP=97;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,31:97:99:850,0,2420 -chr10 46557601 . T A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=4.043;DP=28;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:562,0,766 -chr10 46557639 . C T 1761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=1.514;DP=69;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=25.53;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,49:69:99:1790,0,449 -chr10 46572044 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.512;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:269,0,1469 -chr10 46572228 . CA C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.607;DP=135;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=2.37;ReadPosRankSum=-2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:357,0,2947 -chr11 22474 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.107;DP=56;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:902,0,845 -chr11 35120 . G C 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.316;DP=70;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:788,0,1557 -chr11 36610 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=-0.924;DP=58;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:784,0,1273 -chr11 40649 . C G 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=-0.151;DP=25;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:675,0,175 -chr11 45099 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=-0.199;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:524,0,742 -chr11 74779 . AACCTGCACAGCACAGCACAGAACACACTCTCAGCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGTGTGTATATATGTGTGTGTCTT A 9488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.269;DP=229;FS=8.402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,221:229:99:9526,765,0 -chr11 80772 . ACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGCTTTACTGCAGATCT A 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=2.061;DP=118;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:492,0,23923 -chr11 110517 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:250,0,212 -chr11 111242 . CCCTGCAGAACACAGACGACTTGTCAGCCGGATGCTGTTCAGTAAAGATAGAGCTCAGTAATCCTCAATGCCTCA C 16404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=2.156;DP=388;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=35.85;ReadPosRankSum=-2.987 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,383:386:99:16442,1317,0 -chr11 136221 . ACTGCACACACACACACACACACACACACACACATGAGAGCGCGCATCAGCAGTGACGATCAGCTGTGATCTGATTGGTCGTCAGCACTGAC A 9231.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=2.327;DP=210;FS=10.754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=35.97;ReadPosRankSum=-1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,201:210:99:9269,746,0 -chr11 141177 . A T 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.820;DP=56;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:855,0,982 -chr11 150216 . G GTT 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-1.334;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:501,0,517 -chr11 183783 . T C 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.444;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=33.43;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,39:44:99:1499,0,198 -chr11 183945 . T C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-1.099;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:609,0,1272 -chr11 183952 . T C 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=1.275;DP=49;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:655,0,1131 -chr11 184228 . T C 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.830;DP=32;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=31.71;ReadPosRankSum=-2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1043,0,149 -chr11 207559 . AAGGTCAAACACTCTCGCGGGCACTAACTGAACACGGCTAGCATGAGGCTAACATGATGATGATGATGATGCTGTTATTGTGTTTGTCCTGT A 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:292,0,583 -chr11 212438 . TCCTGAGGAGCAGAAGAACAGTCAGAAACACACACTAACACACACACTCAAGCAGCAAGGGTGTGTGTGTGTGTGTA T 16988.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.997;DP=394;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,378:381:99:17026,1209,0 -chr11 212971 . C T 7766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=-0.968;DP=377;FS=0.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,241:376:99:7795,0,4428 -chr11 268851 . G C 7252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7281,538,0 -chr11 283826 . AGT A 611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:649,49,0 -chr11 439958 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.108;DP=29;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:253,0,1232 -chr11 439963 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=1.257;DP=32;FS=6.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:242,0,1146 -chr11 440086 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.801;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:351,0,969 -chr11 440890 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-1.244;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:331,0,457 -chr11 441528 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,378 -chr11 441576 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr11 463566 . GCTGGTTTACATGTCAAGCAATCAGAGAAGTGATCAGAGATATGCCATTACAGAGATCAGACATTGCTGGCTTCGAGAGACGCTCAC G 4798.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=1.700;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=31.84;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:4836,396,0 -chr11 558371 . T G 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-1.059;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1108,0,1027 -chr11 667677 . G A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=-1.548;DP=33;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:688,0,464 -chr11 667771 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-1.267;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:433,0,245 -chr11 795226 . C T 3362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.999;DP=188;FS=12.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,106:187:99:3391,0,2802 -chr11 799302 . C T 2731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-2.306;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=18.33;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:2760,0,2303 -chr11 800294 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=3.271;DP=30;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=20.86;ReadPosRankSum=-3.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:654,0,381 -chr11 1053298 . G A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr11 1053374 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr11 1053378 . C T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr11 1174009 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.542;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:590,0,808 -chr11 1204361 . A T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr11 1300767 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:231,0,380 -chr11 1301842 . T A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:250,0,475 -chr11 1302517 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=1.083;DP=59;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:434,0,1766 -chr11 1495769 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=4.328;DP=228;FS=10.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=1.24;ReadPosRankSum=-3.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,34:228:99:311,0,7655 -chr11 1539179 . A G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.141;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=24.35;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:710,0,456 -chr11 2232494 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.394;DP=23;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:388,0,402 -chr11 2589619 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,121 -chr11 2589705 . A G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr11 2596481 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-2.249;DP=76;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:508,0,2082 -chr11 2660802 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=1.430;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:238,0,1069 -chr11 2807082 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=1.009;DP=54;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:305,0,1759 -chr11 2953901 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=1.682;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:309,0,261 -chr11 3252081 . C CT 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-0.203;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:99:322,0,2515 -chr11 3252186 . C CT 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=1.400;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:382,0,500 -chr11 3367460 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.141;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:372,0,540 -chr11 3367499 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.412;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:467,0,444 -chr11 3656003 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.031;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,487 -chr11 3666945 . GCTGCAAAGCAAAAGGAGCAGAATACAGTTTGTGTTGAGACAATGACAGACTAGTTGAACAATTAATTTAATAAACGCTCAC G 1172.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=1.362;DP=32;FS=6.743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=23.12;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:71:1210,71,0 -chr11 3955490 . T TA 3245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-1.708;DP=364;FS=3.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,167:349:99:3283,0,4501 -chr11 4011963 . A G 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 -chr11 5556765 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.731;DP=29;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:409,0,599 -chr11 5765020 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:394,0,558 -chr11 5765024 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:319,0,617 -chr11 5765071 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:376,0,242 -chr11 5846046 . G GT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.717;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:296,0,163 -chr11 5847993 . C G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-1.480;DP=27;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:483,0,711 -chr11 5848025 . C T 836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:865,66,0 -chr11 5990947 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.028;DP=25;FS=6.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,514 -chr11 5998302 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,377 -chr11 5998642 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=2.127;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=15.89;ReadPosRankSum=-2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:346,0,404 -chr11 6151604 . TGGTAAGCTTCGGAGGTCTTCAGAGTGCTGTTAAACGTGTTTTTTTCCCCCTCAGACTCTGACTTCTTCGGCTTACTGTCTGCA T 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-3.930;DP=96;FS=14.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=6.49;ReadPosRankSum=-4.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:660,0,19129 -chr11 6466464 . C A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.248;DP=53;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:693,0,1154 -chr11 6466724 . T C 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.960;ClippingRankSum=-0.251;DP=74;FS=3.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:783,0,1719 -chr11 6475600 . G A 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=1.277;DP=68;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:950,0,1329 -chr11 6475684 . A G 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-2.966;DP=78;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:691,0,1951 -chr11 6482860 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.839;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:645,0,874 -chr11 6487900 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-0.781;DP=31;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:458,0,644 -chr11 7065646 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=17.80;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:313,0,242 -chr11 7128195 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,325 -chr11 8128028 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=23.21;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:330,0,261 -chr11 8766299 . A G 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-3.210;DP=61;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:658,0,1420 -chr11 8768140 . A G 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.935;DP=62;FS=1.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=28.11;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,47:61:99:1771,0,279 -chr11 10602372 . A T 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:559,39,0 -chr11 10612185 . GA G 877.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=1.065;DP=93;FS=1.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:915,0,1042 -chr11 10613584 . T G 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.051;DP=84;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1094,0,1759 -chr11 10614080 . T C 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.548;DP=66;FS=3.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,39:66:99:1380,0,991 -chr11 10614162 . TA T 826.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:864,70,0 -chr11 10631938 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.484;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:259,0,526 -chr11 10648209 . G A 566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:595,42,0 -chr11 10666690 . GCTGAAGATGAACAACACAAACAGACATTACATGCTGAAAAACATTTTTTTAAATACCTCTAAACCATACAGCAATAAAAGAGGATTCAC G 654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.302;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=32.89;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:57:692,57,0 -chr11 10733703 . T G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.127;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.25;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:501,0,549 -chr11 10733927 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.988;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:500,0,514 -chr11 10735246 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:423,0,90 -chr11 10735388 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-2.253;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:262,0,1208 -chr11 10735630 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-0.935;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:266,0,728 -chr11 10735817 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,307 -chr11 10777557 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.399;DP=47;FS=11.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:414,0,1147 -chr11 10875211 . A G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr11 10875795 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,170 -chr11 10875866 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:234,0,55 -chr11 10876064 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:415,0,769 -chr11 11285409 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:250,0,139 -chr11 11298602 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.795;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=15.82;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:313,0,335 -chr11 11313454 . G C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:338,0,301 -chr11 11331300 . G A 5480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.263;DP=387;FS=1.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,160:387:99:5509,0,7576 -chr11 11352051 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:239,0,104 -chr11 11395929 . GA G 2972.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-0.663;DP=312;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,127:282:99:3010,0,3272 -chr11 11590187 . CCACCTGAAAGCAGAGAGAGACAGGATTCAGCAATGCACCGTAGTTCACAGTAGTACCTAAAACAGTTCATCCCACAACATGTGTGTGTAAAGAGAAATGTTCAT C 10386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=2.430;DP=278;FS=1.154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=29.76;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,267:278:99:10424,801,0 -chr11 11591121 . ACTAAAAATAAGACAGAAACACACATTATAAGTAAGAGCATTTCTCATCTTTCAGCTTAAATTTACAGCTTCTTAC A 13037.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=3.574;DP=317;FS=4.917;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=30.31;ReadPosRankSum=-1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,306:315:99:13075,928,0 -chr11 12028250 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=2.062;DP=15;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,207 -chr11 12068550 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=14.57;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:305,0,368 -chr11 12069044 . T G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:518,0,238 -chr11 12123225 . G T 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:457,33,0 -chr11 12311095 . C T 2522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=2.534;DP=177;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=14.25;ReadPosRankSum=2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,73:177:99:2551,0,3585 -chr11 12326558 . TGGTAATAACAACTGTTGTCCTGGCAATACAAGATTTAATCAGAGCTGAAATAATTGGTTTTGATTTTTTTTTCCTCCCCTCTA T 464.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:99:502,187,0 -chr11 12488076 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.415;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:501,0,448 -chr11 12488169 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=0.589;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:430,0,375 -chr11 12488325 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,408 -chr11 12840502 . C CA 581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:74:694,74,0 -chr11 12872714 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.978;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:269,0,436 -chr11 12916730 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.336;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:230,0,542 -chr11 12918832 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.659;DP=54;FS=26.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:280,0,1093 -chr11 13113571 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr11 13280744 . AT A 1368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.577;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1406,115,0 -chr11 13368243 . GAGGTATCGTTCATCATTGTAGCTGAGTAATACAAAAATGCTTATTCCACCTTTTTTTTCTAAATATTTTCTTTTGTCCTCCT G 2129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=1.258;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=33.28;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:99:2167,0,1144 -chr11 13375088 . A T 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-0.696;DP=48;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:980,0,696 -chr11 13396083 . G T 3537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=1.268;DP=282;FS=5.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,104:264:99:3566,0,5255 -chr11 13396146 . C A 5235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.858;DP=399;FS=4.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,147:356:99:5264,0,7276 -chr11 13396243 . AAGGTGACTTAAAGATCTTCTCAGATCCACTCGTAGAGAAGTAAAGCTAAAAGGTTTATGCTTGTAAACTTTAGAACTGCATTAAATTACAAGGTCCTCTTGATTGTT A 14393.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=1.282;DP=340;FS=3.020;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,328:330:99:14431,1108,0 -chr11 13397683 . C T 4277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.615;DP=217;FS=12.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,120:216:99:4306,0,7681 -chr11 13397879 . CAGGTGAGCACAGGTTTCATTTCAGCACTACATCTGATATTTTACCTTTATTCTTGACCTGGTTTCTTGCTCTTCTCTTCAT C 12718.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-0.401;DP=276;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,270:272:99:12756,1097,0 -chr11 13398417 . C CA 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=-0.698;DP=294;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=1.35;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,53:273:99:434,0,5920 -chr11 13468288 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=1.084;DP=18;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=26.82;ReadPosRankSum=-1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:511,0,165 -chr11 13514981 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:36:444,0,36 -chr11 13609889 . C G 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.376;DP=55;FS=6.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1216,0,676 -chr11 13631532 . C T 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.400;DP=77;FS=12.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1076,0,1559 -chr11 13690263 . A G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.940;DP=48;FS=4.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:834,0,845 -chr11 13690628 . TA T 857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.169;DP=33;FS=3.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:60:895,60,0 -chr11 13715820 . ACTCCAGGTAACAGCGGAAACCCGAAATAACATTTAAGTTTTTGATCTCACTGGAGATGTTCTAACATGCCTTGACTTCCT A 3581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.830;DP=106;FS=2.196;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=33.79;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,98:101:99:3619,272,0 -chr11 13719153 . A T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.358;DP=66;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:571,0,1743 -chr11 13974728 . T C 1774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.975;DP=101;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1803,0,1795 -chr11 13974886 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.804;DP=25;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:335,0,539 -chr11 14268017 . G A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr11 14268695 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr11 14315881 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.373;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.162;QD=31.57;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:31:565,0,31 -chr11 14316248 . G A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=-2.203;DP=43;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.53;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:739,0,636 -chr11 14319847 . G A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=17.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=18.27;ReadPosRankSum=1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:832,0,676 -chr11 14333483 . C T 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-0.161;DP=59;FS=2.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,34:59:99:1179,0,902 -chr11 14342463 . C T 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.710;DP=67;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:1331,0,1157 -chr11 14360807 . C A 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=1.428;DP=64;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1201,0,1014 -chr11 14507682 . T G 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.837;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:1426,0,1396 -chr11 14530638 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.554;DP=29;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=24.20;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:730,0,819 -chr11 14532073 . GAGGTAAGATGAGGTTTTCAATGTCTTGTGCGTTCTGTTGATCCAGTTTGATCATGTTGTGTAACTGTGGTTTCTCTGC G 1267.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=2.306;DP=34;FS=6.698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=27.49;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:99:1305,105,0 -chr11 14553780 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=1.796;DP=31;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:382,0,766 -chr11 14576538 . G A 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.276;DP=134;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=21.81;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:2951,0,5006 -chr11 14576547 . T C 2910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.972;DP=140;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:2939,0,5006 -chr11 14581759 . G A 3580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.120;DP=183;FS=0.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,105:183:99:3609,0,2844 -chr11 14582128 . G A 3753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.166;DP=200;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,112:200:99:3782,0,3215 -chr11 14582352 . A G 3113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.144;DP=176;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,88:176:99:3142,0,3207 -chr11 14583127 . G A 3538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3567,259,0 -chr11 14583465 . C CT 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=-0.405;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:441,0,1351 -chr11 14584826 . C T 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-1.228;DP=49;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1300,0,371 -chr11 16120138 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=3.136;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=11.76;ReadPosRankSum=-3.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:334,0,596 -chr11 16121889 . C G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.463;DP=47;FS=19.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:899,0,716 -chr11 16300000 . T G 2710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2739,193,0 -chr11 16391342 . G GT 389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:427,42,0 -chr11 16488640 . TCTGTAACACTTTAAGTGATGGAAAGTATTTTAGGTAATATATCCCAATACCCCACCAAGTACAAAATACAAACATTTCTTAAGAAGATCTTAACAGTGGTAACATTGATATCTGAGAAAAGGATAC T 2422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=2.580;DP=77;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=31.46;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,64:76:99:2707,0,5288 -chr11 16550495 . C T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.026;DP=26;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:564,0,631 -chr11 16564808 . G A 998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:76:1027,76,0 -chr11 16564810 . G A 998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:76:1027,76,0 -chr11 16599623 . G T 3432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.142;DP=178;FS=6.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,102:178:99:3461,0,5690 -chr11 16695527 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=26.75;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:78:376,0,78 -chr11 16708998 . G A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.033;DP=56;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1028,0,889 -chr11 16714754 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-1.083;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=25.92;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:71:443,0,71 -chr11 16715615 . A G 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:903,63,0 -chr11 16716572 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=3.135;DP=49;FS=19.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:419,0,1285 -chr11 16716781 . TA T 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.112;DP=24;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:48:431,0,48 -chr11 16717184 . AAC A 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-2.179;DP=33;FS=13.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:262,0,933 -chr11 16730469 . C T 1594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.211;DP=78;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,48:78:99:1623,0,1020 -chr11 16741273 . C T 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.402;DP=74;FS=4.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,44:74:99:1535,0,1178 -chr11 16969102 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:322,0,265 -chr11 17888540 . G A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr11 17888619 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:475,39,0 -chr11 17888640 . C T 364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:393,30,0 -chr11 18223721 . T A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=15.36;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:320,0,369 -chr11 18226620 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=20.59;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:646,0,369 -chr11 18234309 . AACCTGTGAACAACACAAAATTTCGATTAGACAGAAGTTTGCTGTAAGTGTAGAGTAAAGTGGAGCAGAAATTGTTT A 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=2.205;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=25.18;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:566,0,333 -chr11 18257719 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.401;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:671,0,678 -chr11 18274449 . G A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.158;DP=63;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:1089,0,1108 -chr11 18282155 . C G 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.326;DP=72;FS=6.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1429,0,1033 -chr11 18288646 . TCCTTCAAATACAACATGGACAACATTTCAGCTGTATCCACATTCAAACATTTATAGCATTTAGCATATGCTGTTCAAGTTACTAA T 6236.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.072;DP=154;FS=2.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,152:154:99:6274,550,0 -chr11 18476586 . G C 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.324;DP=39;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=23.30;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:937,0,315 -chr11 18493792 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=21.10;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:408,0,257 -chr11 18497057 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.184;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=12.61;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:356,0,552 -chr11 18510124 . G T 2473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-2.728;DP=143;FS=0.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:2502,0,1966 -chr11 18517307 . TG T 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-2.644;DP=63;FS=2.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:448,0,1181 -chr11 18577726 . GCTAATATGAAAAGGAAGAAAATAGTTAAACGGTTGAAAAAACAAACAATACAAGTGAACACTGGGTTAC G 2059.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=2.271;DP=66;FS=13.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,55:66:99:2097,0,2417 -chr11 18579175 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.442;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=16.26;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:321,0,321 -chr11 18586176 . C T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 -chr11 18588223 . G C 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=2.163;DP=42;FS=12.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:799,0,551 -chr11 18593406 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:233,0,66 -chr11 18680903 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.105;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.95;ReadPosRankSum=-2.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:488,0,942 -chr11 18681547 . A T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=2.160;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:486,0,503 -chr11 18698646 . G T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-0.822;DP=36;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:866,0,418 -chr11 18767377 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.546;DP=28;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:413,0,112 -chr11 18818785 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=14.88;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:311,0,259 -chr11 18819144 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:249,0,342 -chr11 18956233 . C CCCGG 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=1.312;DP=40;FS=12.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:414,0,1310 -chr11 18956453 . ATCGAACTCCTTGCCCCGT A 274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:36:312,36,0 -chr11 18959636 . A T 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.039;DP=87;FS=16.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:1332,0,1719 -chr11 19098323 . A G 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.505;DP=87;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.983;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1457,0,1425 -chr11 19101408 . C T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=-2.809;DP=56;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:688,0,1218 -chr11 19118045 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=4.366;DP=69;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=5.74;ReadPosRankSum=-2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:424,0,1846 -chr11 19118166 . A G 1643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.093;DP=100;FS=9.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1672,0,1743 -chr11 19118418 . GT G,GTT 1114.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-1.716;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,25,33:64:99:1274,657,982,569,0,829 -chr11 19119109 . TTA T 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.119;DP=39;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:238,0,614 -chr11 19119164 . G GT 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.136;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:308,0,310 -chr11 19124980 . C T 7607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-4.712;DP=216;FS=3.153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=30.10;ReadPosRankSum=2.898 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,196:216:99:7636,218,0 -chr11 19223248 . G T 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.062;DP=73;FS=8.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1161,0,1362 -chr11 19226460 . G A 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.879;DP=83;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1156,0,1711 -chr11 19293952 . A T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-2.082;DP=33;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=19.57;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:674,0,441 -chr11 19294101 . G A 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.437;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:790,0,589 -chr11 19433839 . C A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.795;ClippingRankSum=-0.991;DP=109;FS=4.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1856,0,1576 -chr11 19505307 . G GA 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=-1.285;DP=75;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:587,0,777 -chr11 19505623 . C CT 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.241;DP=94;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:327,0,1860 -chr11 19505936 . G A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-0.015;DP=79;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:1081,0,1824 -chr11 19507944 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,133 -chr11 19509520 . C A 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.990;DP=82;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:1321,0,1337 -chr11 19509577 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-1.548;DP=73;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,27:73:99:905,0,1606 -chr11 19510051 . C T 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-2.438;DP=92;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1684,0,1389 -chr11 19888311 . A G 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=-0.657;DP=50;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1047,0,613 -chr11 19888386 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-1.156;DP=39;FS=7.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:449,0,856 -chr11 19924258 . G A 1864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-5.296;DP=210;FS=78.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,70:210:99:1893,0,5294 -chr11 19933976 . A C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,415 -chr11 19934987 . T A 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 -chr11 19935939 . C T 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr11 19943953 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.818;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,320 -chr11 19944692 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=1.708;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:298,0,101 -chr11 20031626 . T A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.910;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:738,0,1401 -chr11 20149637 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-1.484;DP=60;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:959,0,1184 -chr11 20153462 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=1.791;DP=80;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:885,0,1830 -chr11 20163431 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-3.464;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:324,0,1256 -chr11 20163473 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=2.257;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:255,0,1581 -chr11 20443224 . A G 212.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.42;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:14:241,0,14 -chr11 20536093 . T C 3762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=1.652;DP=313;FS=0.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,112:312:99:3791,0,6863 -chr11 20536219 . T C 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=7.163;DP=272;FS=37.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=4.40;ReadPosRankSum=-3.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,50:252:99:1226,0,13796 -chr11 20536221 . TG T 1192.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=7.635;DP=272;FS=30.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=4.39;ReadPosRankSum=-4.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,47:252:99:1230,0,13796 -chr11 20536591 . C A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.162;DP=193;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:507,0,5087 -chr11 20540602 . A AT 2933.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.697;DP=242;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,27:211:99:2971,0,4456 -chr11 20541196 . C T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.520;DP=308;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=2.32;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,55:288:99:743,0,12360 -chr11 20541232 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=-1.607;DP=340;FS=4.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=0.80;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,47:318:99:301,0,14348 -chr11 20542699 . A C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-0.336;DP=203;FS=8.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,47:196:99:1053,0,6012 -chr11 20542733 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.067;DP=234;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,57:230:99:1283,0,7823 -chr11 21273290 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.532;DP=88;FS=6.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=5.77;ReadPosRankSum=3.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:536,0,2386 -chr11 21280140 . C A 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.676;DP=97;FS=5.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:1567,0,1689 -chr11 21286798 . C T 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=-0.258;DP=70;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:986,0,1385 -chr11 21287038 . C A 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.801;DP=68;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:877,0,1430 -chr11 21356637 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-2.684;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:235,0,412 -chr11 21534077 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-1.056;DP=39;FS=10.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:645,0,684 -chr11 21538463 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.255;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:284,0,3318 -chr11 21538470 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.188;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:284,0,3318 -chr11 21558898 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-0.639;DP=28;FS=13.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:255,0,723 -chr11 21577830 . G A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-0.143;DP=382;FS=14.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,94:381:99:931,0,27567 -chr11 21578190 . G A 18282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=2.515;DP=124;FS=4.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,86:113:99:18311,0,2550 -chr11 21578445 . C T 3001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=-0.368;DP=219;FS=3.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,86:219:99:3030,0,7138 -chr11 21792131 . GCCTGACAACAAACAGGACAACAGCTATCAGCTCTGGTAAAGTAGTACACAATTTGGTCGAACAGAATGTAAAAGTCTCA G 1287.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=2.301;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=27.29;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:99:1325,111,0 -chr11 21863095 . G A 4571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.557;DP=311;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,133:309:99:4600,0,18847 -chr11 21988235 . TA T 1254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.624;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1292,0,901 -chr11 22095142 . T A 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-1.137;DP=128;FS=4.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1858,0,2495 -chr11 22100581 . C A 2260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.450;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:2289,0,1635 -chr11 22137326 . A C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,217 -chr11 22240274 . C A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=3.665;DP=51;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=17.09;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:900,0,983 -chr11 22240592 . A AAC 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-1.784;DP=44;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:583,0,602 -chr11 22241044 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.109;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.39;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,624 -chr11 22241063 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=1.628;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:279,0,381 -chr11 22241242 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.739;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.950;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:417,0,161 -chr11 22241456 . C CA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.106;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:319,0,530 -chr11 22241482 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.930;DP=40;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:583,0,764 -chr11 22242301 . G GT 460.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:498,41,0 -chr11 22243119 . G GA 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.098;DP=64;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:735,0,604 -chr11 22243210 . A G 1528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.189;DP=73;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1557,0,2131 -chr11 22243300 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=-0.994;DP=77;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:99:1063,0,1601 -chr11 22247130 . C T 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.035;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1323,0,1438 -chr11 22418317 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:385,0,384 -chr11 22426970 . G GA 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=-2.347;DP=45;FS=8.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:636,0,394 -chr11 22428004 . C T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.154;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:731,0,341 -chr11 22428816 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.038;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:362,0,377 -chr11 22430024 . GA G 245.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=22.35;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:2:281,2,0 -chr11 22430462 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.634;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,458 -chr11 22430943 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=2.549;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:351,0,277 -chr11 22868865 . C T 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.645;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,52:140:99:1752,0,3005 -chr11 22923477 . TG T 352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:390,37,0 -chr11 22926574 . GA G 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.564;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:432,0,997 -chr11 23804431 . T G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr11 23806034 . C G 567.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:596,42,0 -chr11 23806448 . A G 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 -chr11 23825969 . G GT 1859.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=-3.454;DP=89;FS=18.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,58:81:99:2126,0,1482 -chr11 24514422 . G GT 475.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:59:584,59,0 -chr11 24764851 . G T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.674;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:598,0,476 -chr11 24768095 . G T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-1.532;DP=56;FS=5.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:751,0,1121 -chr11 24802966 . GA G 647.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:685,67,0 -chr11 24806485 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,175 -chr11 24891859 . C G 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=1.719;DP=91;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=17.96;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:1663,0,1651 -chr11 24996115 . C A 4035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=-1.708;DP=215;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,128:214:99:4064,0,6818 -chr11 25001032 . C G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.480;DP=35;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:912,0,336 -chr11 25006975 . C T 1863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.901;DP=84;FS=7.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,54:84:99:1892,0,1010 -chr11 25018065 . GCTAGAAAACAAATTAACAGCTCTGTGAACACACTTCCTTGGAACAAAAACCATTTCAAGACTGTTCAATGATTGTGTCCGACTTAC G 13686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=1.722;DP=363;FS=3.208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.82;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,336:337:99:13724,1191,0 -chr11 25018341 . C T 4002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-0.879;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,125:227:99:4031,0,3586 -chr11 25019182 . TCTGCAGCACAAAATTAAAGAAAAATAAACTGTTTGATTCTACCAACAACAACAACAACAACATTTTTGTACCACTAGTACGAAC T 10595.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.237;DP=233;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=31.83;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,226:232:99:10633,907,0 -chr11 25022118 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.130;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:568,0,453 -chr11 25124013 . G A 2970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=1.928;DP=196;FS=9.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=15.16;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,85:195:99:2999,0,3511 -chr11 25124088 . A C 3211.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;ClippingRankSum=4.672;DP=178;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.04;ReadPosRankSum=2.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,88:177:99:3240,0,3140 -chr11 25274547 . T TA 1637.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.147;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=25.20;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:1755,150,0 -chr11 25278061 . AGTATGAAGCCTTAAGCTATGCCATTTAATTACTGTCATTAACGTGAAGTTTGTGTTTAATTTGTTATTCTTAACTCTCTCATCAG A 11700.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.714;DP=267;FS=9.435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=32.88;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,261:265:99:11738,464,0 -chr11 25278542 . T G 10583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=252;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,252:252:99:10612,773,0 -chr11 25278601 . T TA 5734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.421;DP=216;FS=2.039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,208:212:99:6025,616,0 -chr11 25292177 . CTT C 272.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:310,22,0 -chr11 25293209 . CT C 239.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:277,28,0 -chr11 25312943 . G A 1877.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1906,147,0 -chr11 25316106 . C T 1636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1665,123,0 -chr11 25365147 . AT A 410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:448,39,0 -chr11 25399090 . A T 476.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:1:502,1,0 -chr11 25399091 . C T 476.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:1:502,1,0 -chr11 25399157 . A C 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:766,54,0 -chr11 25399181 . A C 920.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:949,66,0 -chr11 25399265 . GA G 822.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-1.738;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=23.51;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:45:860,45,0 -chr11 25715964 . TGGTGCAGATCCCTCCTTGTGCTTCTAGAGAAATTGTAAGTATTTTCAACAGATTGTGAATAAGTATTCGCCCCCTATTAACA T 1539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.555;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=31.96;ReadPosRankSum=2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,36:39:99:1577,0,425 -chr11 25716187 . CCAGGTCAGATTTTCTACTTTATTTAAAATTAATTCAGGTAAATGATCGACTGACTTTTACCTAAAAAATGAATGCTTG C 2928.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=71;FS=2.925;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=30.97;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:2966,212,0 -chr11 25747170 . T TA 1211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:1771,119,0 -chr11 25747918 . TA T 1125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1163,121,0 -chr11 25776778 . C T 7385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:7414,560,0 -chr11 25781852 . TGGTGAGTCGGTGACCTCTGATGTTTTAATAAATCTCACAGAGTGCTTGTAAACGTCTGGATGTGAACAGCTGGGAACCTGTGGTGTGTTCTA T 7197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=1.391;DP=180;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=30.13;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,164:174:99:7328,269,0 -chr11 25809994 . A AT 369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:407,42,0 -chr11 25820415 . C A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr11 25820418 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:349,24,0 -chr11 25820799 . GT G 390.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:428,42,0 -chr11 25839085 . G T 750.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:779,57,0 -chr11 25964921 . C T 4163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:4192,324,0 -chr11 25970576 . C T 4173.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4202,301,0 -chr11 25986683 . TCAGGTTTGACTATTTAACCGTAAAACATGTGAGTACTGTACTTGTGCAATATTATTGCTTTATTATTTATCTCTCTTTTC T 1959.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.855;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=26.62;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,46:49:99:1997,0,252 -chr11 25987035 . CGTGAGTAAAGATCTATACTAAGCACATTTACACAGTCATGAATGATCTTGAATTAGTGATGACTGAATTGACTTCTCACAG C 1940.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=2.341;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=35.66;ReadPosRankSum=-2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1978,151,0 -chr11 25996406 . G C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr11 25996415 . C T 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:387,27,0 -chr11 26130104 . ACTAAAACAAAGGCATTATAGTGGATTACTGATTCCTGACTCATTCTAGACCCATTAACAGTCCTGTTACTATTTATCCAGCAAATGAACATAC A 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=25.63;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:473,0,1982 -chr11 26140867 . TCTGAAATGCACAAAGCAAGATTATGAGGTCAATGATTTTTGGTTAATAACAGGTCAATCTAATATTTTGTTGTTACACATTTACAGTGTTCATCATAC T 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=1.575;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=32.69;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:593,0,1060 -chr11 26236268 . C CA 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.678;DP=500;FS=11.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=1.23;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:386,92:478:99:652,0,10888 -chr11 26244636 . T C 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=2.479;DP=32;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:644,0,140 -chr11 26262230 . G A 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:636,48,0 -chr11 26262283 . C T 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 -chr11 26269965 . A AT 402.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:440,30,0 -chr11 26339332 . G A 7434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7463,536,0 -chr11 26348649 . C G 1312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1341,99,0 -chr11 26348761 . A G 839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:868,63,0 -chr11 26371300 . A G 6812.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:6841,489,0 -chr11 26377237 . C T 1443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-1.733;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1472,114,0 -chr11 26419433 . AGTGAGTAACTTATCTCTCACACTTTCTATTTAAAGCGAGCGTTAAAAAGATCTGTTGACACAAGTGATTTTACTTATTAATATACGTTCACTATGTTACAG A 1267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=2.301;DP=33;FS=4.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=30.08;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,31:33:99:1305,0,776 -chr11 26424582 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr11 26431994 . G T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr11 26434146 . C T 4023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:4052,295,0 -chr11 26453707 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,176 -chr11 26453896 . C A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 -chr11 26456177 . G A 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:675,48,0 -chr11 26457084 . CAT C 298.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr11 26475958 . G A 3233.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3260,235,0 -chr11 26535254 . C A 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:895,63,0 -chr11 26546278 . A G 1176.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1205,90,0 -chr11 26546374 . C T 976.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1005,72,0 -chr11 26551091 . A AT 310.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:348,33,0 -chr11 26560069 . C A 1570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1599,120,0 -chr11 26563594 . GAGGTGTGTTTTGACCATTTCATCTGCAGATATCAGAAATCTTGAATTTGCCGCTAAATCCTTCTGTCTCTCCTTTTCTGTCTACTTTCTTCAC G 1775.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.648;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=29.01;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1813,143,0 -chr11 26563950 . G A 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr11 26615368 . C G 4948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:4977,373,0 -chr11 26616442 . G A 4700.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4729,340,0 -chr11 26627362 . TG T 646.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:684,51,0 -chr11 26629319 . G A 1299.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1328,96,0 -chr11 26646803 . A G 604.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:633,45,0 -chr11 26647379 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:367,0,325 -chr11 26651613 . C T 1225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1254,87,0 -chr11 26664022 . A C 423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:452,36,0 -chr11 26716279 . CT C 831.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.331;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,33:39:4:867,4,0 -chr11 26812930 . C CA 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1034,69,0 -chr11 26816526 . CACACACACACACACACACACACACACACACAT C 233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr11 26821073 . G A 1689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1718,129,0 -chr11 27164124 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=2.976;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,369 -chr11 27166185 . T G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:338,0,288 -chr11 27166199 . TA T 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.048;DP=20;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:282,0,268 -chr11 27167071 . GA G 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.633;DP=29;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:439,0,149 -chr11 27167083 . A T 847.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.502;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:11:974,0,11 -chr11 27245331 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.939;DP=42;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:760,0,581 -chr11 27314659 . C T 1704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=-0.501;DP=146;FS=3.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,55:146:99:1733,0,3222 -chr11 27314704 . C T 1713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.928;DP=146;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.081;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,51:146:99:1742,0,3406 -chr11 27314872 . T A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.578;DP=133;FS=4.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:1674,0,2991 -chr11 27325892 . A T 7446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=1.449;DP=345;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,215:337:99:7475,0,4315 -chr11 27326237 . GAGGTTTTTGGTCACTTTTATTCACTTAGAAAACTAATGTTGGTTTGCACATGCAGATTTTGCTGACTTTCTTTTACCAACCACTCACTGT G 1756.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.064;ClippingRankSum=0.365;DP=273;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=6.43;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,258:264:99:1794,622,0 -chr11 27329660 . AAGGTTTGAACAACCTTTCTGTAATGTTAAAAAAACATTTGATTGCAGAATAGTTTTACAGTAATCATAATAAATCCCCACACTGTCTTTC A 13773.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.290;DP=299;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.141;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,281:284:99:13811,1148,0 -chr11 27331061 . G A 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 -chr11 27334206 . C T 1706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=-0.905;DP=89;FS=4.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,50:89:99:1735,0,1391 -chr11 27496251 . A AGT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-1.733;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=20.07;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:40:258,0,40 -chr11 27496417 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.983;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:311,0,756 -chr11 27496828 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,256 -chr11 27497022 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=-0.822;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:531,0,1456 -chr11 27498051 . A AT 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-1.927;DP=37;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:454,0,690 -chr11 27499346 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.092;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:922,0,1058 -chr11 27499510 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,342 -chr11 27500056 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=-1.656;DP=35;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:457,0,755 -chr11 27501816 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,404 -chr11 27501976 . CTT C 596.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.297;DP=47;FS=4.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:634,0,1143 -chr11 27502361 . A C 4100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=-0.923;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=31.32;ReadPosRankSum=-1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,82:112:99:4129,0,1758 -chr11 27541888 . AT A 5527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.376;DP=233;FS=0.977;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=23.72;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,204:221:99:5616,462,0 -chr11 27548675 . TA T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.293;DP=67;FS=2.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:249,0,1065 -chr11 27550641 . A G 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-3.295;DP=40;FS=11.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=27.94;ReadPosRankSum=3.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1146,0,387 -chr11 27550841 . AT A 907.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:91:945,91,0 -chr11 27550917 . C G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=1.547;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:275,0,930 -chr11 27553008 . T C 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.657;DP=60;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=20.96;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,37:60:99:1286,0,822 -chr11 27616332 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:231,0,64 -chr11 27616915 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:366,0,293 -chr11 27618934 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.633;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,150 -chr11 27619008 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-2.069;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,291 -chr11 27619078 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:275,0,227 -chr11 27619454 . C A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-2.237;DP=15;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=29.18;ReadPosRankSum=2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:466,0,185 -chr11 27619564 . G GT 335.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:473,50,0 -chr11 27619604 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=2.177;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:373,0,247 -chr11 27619908 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-0.329;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:839,0,808 -chr11 27620275 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.953;DP=42;FS=8.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:631,0,801 -chr11 27630009 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-1.130;DP=43;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:599,0,883 -chr11 27638187 . A G 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.091;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:1402,0,1164 -chr11 27639346 . A G 1813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=1.111;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,54:91:99:1842,0,1333 -chr11 27640720 . G A 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=2.576;DP=91;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:809,0,4781 -chr11 27640925 . C A 2034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=2.982;DP=128;FS=4.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:2063,0,2023 -chr11 27641222 . C T 1922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=-1.020;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1951,0,1665 -chr11 27641252 . T C 1977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.437;DP=113;FS=8.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=17.50;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:2006,0,1829 -chr11 27641507 . T A 318.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=31.89;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:347,0,16 -chr11 27644298 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:254,0,290 -chr11 27644399 . A C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:272,0,199 -chr11 27645809 . C T 275.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:304,0,17 -chr11 27647071 . AG A 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:74:253,0,74 -chr11 27663939 . G A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.045;DP=78;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:1362,0,1362 -chr11 27673580 . T C 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.145;DP=67;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:1153,0,1099 -chr11 27673781 . C T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.226;DP=85;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:1520,0,1449 -chr11 27673970 . C T 1626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.573;DP=89;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:1655,0,1466 -chr11 27675355 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-1.071;DP=87;FS=4.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:639,0,2293 -chr11 27675427 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.549;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:417,0,2015 -chr11 27675505 . A G 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.448;DP=65;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,45:65:99:1645,0,466 -chr11 28777823 . C CA 260.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:298,20,0 -chr11 28777828 . G A 269.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:20:298,20,0 -chr11 29300811 . CTCTT C 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=2.292;DP=20;FS=19.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:555,0,220 -chr11 29315290 . T A 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:782,54,0 -chr11 29490922 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-1.844;DP=55;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:397,0,1360 -chr11 30633924 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:414,0,90 -chr11 30638893 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-0.301;DP=23;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.704;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:616,0,206 -chr11 30670936 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-3.725;DP=70;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=7.45;ReadPosRankSum=2.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:550,0,1954 -chr11 30794910 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.741;DP=31;FS=5.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:424,0,616 -chr11 30795043 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=2.430;DP=20;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,380 -chr11 30795044 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:331,0,358 -chr11 30964837 . A G 284.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.60;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:8:312,0,8 -chr11 30982718 . C T 2917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=1.428;DP=171;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,80:170:99:2946,0,3040 -chr11 31107416 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:304,0,215 -chr11 31162260 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,275 -chr11 31198929 . T C 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.088;DP=93;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1583,0,1715 -chr11 31207398 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:274,0,98 -chr11 31268030 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=16.36;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,296 -chr11 31575601 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:56:249,0,56 -chr11 31575611 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:56:249,0,56 -chr11 31620600 . AAGGTGACCACATCTACTGTTTTTACTGTCAATACTGCTTTTTACTTCATGCGTTTCTTGTTGTTTATGACTAAAACATGAGTAGATTGGTCTCTAGCTATTTAAATTGTGTTGAATTTGTGTTTTGC A 13784.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=1.839;DP=312;FS=7.275;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=29.31;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,307:312:99:13822,1194,0 -chr11 31902956 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,133 -chr11 31903023 . A C 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-1.057;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:586,0,200 -chr11 31907392 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=2.472;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:344,0,335 -chr11 32025352 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=1.399;DP=22;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:496,0,287 -chr11 32025582 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=1.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:242,0,660 -chr11 32026063 . CT C 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-0.033;DP=52;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:787,0,391 -chr11 32576550 . GTA G 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=11;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,112 -chr11 34436877 . A C 2234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-0.466;DP=141;FS=3.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:2263,0,2470 -chr11 34439031 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,293 -chr11 34493276 . G A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-1.743;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,252 -chr11 34576127 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:288,0,539 -chr11 34591329 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:316,0,344 -chr11 34608702 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.370;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:388,0,519 -chr11 34608749 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.669;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:414,0,661 -chr11 34609562 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:313,0,396 -chr11 34609565 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=23.73;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:313,0,396 -chr11 34610121 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,299 -chr11 34611299 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.916;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.903;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:577,0,191 -chr11 34697743 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:229,0,302 -chr11 34698200 . C A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,155 -chr11 34707980 . T A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=1.018;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:658,0,663 -chr11 34708550 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.286;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:282,0,341 -chr11 34711952 . G A 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-0.375;DP=66;FS=8.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=15.06;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1022,0,1280 -chr11 34712150 . A T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.408;DP=66;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:1261,0,973 -chr11 34712234 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-1.749;DP=51;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:901,0,755 -chr11 34736697 . G C 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-1.439;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:981,0,977 -chr11 34758197 . A G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=1.586;DP=149;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:550,0,14245 -chr11 34759521 . C T 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=3.047;DP=108;FS=6.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,36:108:99:1025,0,2691 -chr11 34770760 . G T 4442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=-2.346;DP=250;FS=6.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,125:248:99:4471,0,4195 -chr11 34770841 . G A 4820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.388;DP=267;FS=11.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,134:266:99:4849,0,4790 -chr11 34773199 . T A 6572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=-0.967;DP=353;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=18.62;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,199:348:99:6601,0,5123 -chr11 34782170 . A G 8302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.488;DP=463;FS=4.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=17.93;ReadPosRankSum=3.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,256:463:99:8331,0,7252 -chr11 34786471 . C A 4807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=-0.448;DP=278;FS=0.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,150:277:99:4836,0,4615 -chr11 34834844 . GA G 2946.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-1.173;DP=322;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,134:293:99:2984,0,3191 -chr11 34846478 . A T 10305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=2.194;DP=540;FS=1.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,313:537:99:10334,0,7781 -chr11 34952796 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:389,0,51 -chr11 35024624 . C CA 509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.794;DP=45;FS=6.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:547,0,401 -chr11 35025254 . C T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.618;DP=51;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:935,0,806 -chr11 35025662 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=2.640;DP=47;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:399,0,2638 -chr11 35033422 . G A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=2.560;DP=75;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=17.89;ReadPosRankSum=-2.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1370,0,1241 -chr11 35035788 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=3.265;DP=33;FS=11.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=8.51;ReadPosRankSum=-3.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:309,0,753 -chr11 35036428 . G A 1231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-1.032;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:1260,0,1124 -chr11 35103053 . T A 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.596;DP=30;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=29.86;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:924,0,123 -chr11 35236432 . G A 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 -chr11 35237345 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:259,0,366 -chr11 35240298 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-1.115;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:384,0,268 -chr11 35302672 . A C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=2.034;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:351,0,93 -chr11 35325027 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=1.377;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:253,0,739 -chr11 35329703 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.819;DP=47;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:537,0,1025 -chr11 35329817 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.531;DP=39;FS=5.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=6.05;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:264,0,1109 -chr11 35330138 . T C 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.684;DP=55;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1147,0,733 -chr11 35330177 . C T 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-1.908;DP=65;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,39:65:99:1311,0,895 -chr11 35335978 . C T 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.935;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1483,0,1000 -chr11 35355090 . C G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=2.009;DP=31;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:430,0,560 -chr11 35357644 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.197;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:506,0,162 -chr11 35389053 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=1.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:367,0,491 -chr11 35392400 . A T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-0.171;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:410,0,506 -chr11 35397458 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.730;DP=37;FS=1.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:354,0,941 -chr11 35407151 . C T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=-1.219;DP=43;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:557,0,817 -chr11 35428319 . C G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=1.157;DP=75;FS=5.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:331,0,2310 -chr11 35635677 . A T 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-2.726;DP=133;FS=10.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=8.21;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,41:133:99:1120,0,3424 -chr11 35767020 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=2.067;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,247 -chr11 35787029 . A C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.629;DP=32;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:230,0,866 -chr11 35820794 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-1.917;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:252,0,954 -chr11 35905415 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.002;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:650,0,685 -chr11 35913257 . A T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.461;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:484,0,458 -chr11 36004306 . ACTGGTGCACATGTTAAGCAAATATCATAAACAAAAAGAATGAACAAAAATGATTTACAAGTATAATGGTAATAAACGGCATATTTATGTGATAAGGATAC A 1486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=2.142;DP=37;FS=2.334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:80:1524,80,0 -chr11 36289624 . C T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-0.537;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:746,0,953 -chr11 36289678 . G GA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.449;DP=38;FS=7.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:352,0,548 -chr11 36289805 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-1.540;DP=37;FS=5.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:284,0,2188 -chr11 36289812 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-1.243;DP=38;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:291,0,2188 -chr11 36305771 . G C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,376 -chr11 36336086 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.436;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:366,0,729 -chr11 36600984 . A C 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-1.284;DP=150;FS=6.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,52:149:99:1717,0,3381 -chr11 36601106 . A T 1499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.259;DP=122;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,44:122:99:1528,0,2739 -chr11 36883162 . T A 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.973;DP=199;FS=11.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,56:198:99:1457,0,5474 -chr11 36883819 . GACCTTAAAACATCAAGCAGTAGTTAAAATGAGGGTTATTTAAAACAAAATAAACCTGAAAATGTATTTATGAAATCCATGAAAACAT G 13710.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.496;DP=355;FS=13.552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=32.50;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,345:355:99:15702,1283,0 -chr11 36999354 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:302,0,91 -chr11 36999508 . C A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.740;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:273,0,485 -chr11 37046954 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=2.292;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:283,0,539 -chr11 37049066 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=-0.467;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:327,0,435 -chr11 37055978 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,261 -chr11 37056637 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,334 -chr11 37060420 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.694;DP=73;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:245,0,2210 -chr11 37070869 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=-0.766;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:291,0,1518 -chr11 37099047 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.530;ClippingRankSum=-1.635;DP=220;FS=5.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,43:220:99:449,0,6381 -chr11 37099644 . C T 3031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;ClippingRankSum=0.006;DP=199;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,107:199:99:3060,0,3152 -chr11 37124380 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=1.317;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:366,0,459 -chr11 37126259 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-0.140;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:402,0,614 -chr11 37127775 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.629;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:239,0,886 -chr11 37128638 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=1.341;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:460,0,644 -chr11 37134670 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-1.344;DP=26;FS=1.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:349,0,535 -chr11 37214293 . C G 2965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:2994,217,0 -chr11 37215235 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=5.085;DP=97;FS=3.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=4.34;ReadPosRankSum=-2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:449,0,2904 -chr11 37215592 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=-1.263;DP=58;FS=6.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=4.44;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:286,0,2350 -chr11 37215869 . C T 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.949;DP=107;FS=2.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1658,0,1929 -chr11 37215955 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-1.227;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:571,0,813 -chr11 37216254 . A C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.253;DP=82;FS=9.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:411,0,2517 -chr11 37216310 . A C 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-1.387;DP=77;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:717,0,2065 -chr11 37216340 . T C 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.062;DP=83;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:1057,0,1948 -chr11 37216558 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.533;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:261,0,2944 -chr11 37239256 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.688;DP=46;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:293,0,1243 -chr11 37239485 . C A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.069;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:534,0,652 -chr11 37270964 . TTACCTGCAAACATACAATTTCAGACACGTTGCCATTATATTTATTTCCACTTAAAAGCCTGAAATTTTAAAACAGCAGTGCAAGCATGG T 1440.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=1.798;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=29.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:99:1478,119,0 -chr11 37281468 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.033;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:339,0,406 -chr11 37293637 . A G 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.878;DP=75;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:930,0,1710 -chr11 37296700 . TCTGTGGAGGCAATCATTTGAAATGATGTTGCAAAACAGAATTTAAAAAAAATAAAGAAACATTTCATCATGGTCAGAC T 3961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.190;DP=104;FS=1.890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=30.34;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,95:100:99:3999,290,0 -chr11 37303626 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-0.442;DP=66;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:441,0,1677 -chr11 37325625 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.025;DP=72;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.515;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:558,0,1981 -chr11 37325703 . TGGTACAGTATTGCTTTTAAACGGGCATTTTCACCTGGAGTTAGTTTCGGAATCATCTTGTTTTTGTGTATTTCA T 344.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=3.257;DP=84;FS=2.011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,68:72:99:382,149,0 -chr11 37325831 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.069;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:697,0,2055 -chr11 37329958 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=1.873;DP=79;FS=8.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=3.86;ReadPosRankSum=2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:333,0,2359 -chr11 37583563 . G A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.090;DP=38;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:834,0,529 -chr11 37632864 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:300,0,368 -chr11 37632911 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:316,0,134 -chr11 37647085 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,306 -chr11 37656960 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.766;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:285,0,302 -chr11 37658657 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:341,0,180 -chr11 37659609 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,359 -chr11 37889515 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-0.860;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:339,0,959 -chr11 37889699 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.518;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:347,0,1529 -chr11 37910206 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.702;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:306,0,1147 -chr11 37932750 . C T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=-1.282;DP=71;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.824;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:743,0,1893 -chr11 37932784 . A C 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=-2.389;DP=72;FS=3.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:815,0,2734 -chr11 37933237 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.515;DP=47;FS=2.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:233,0,1395 -chr11 37940072 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.425;DP=26;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:287,0,594 -chr11 37940338 . T C 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=1.424;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=22.73;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:733,0,382 -chr11 37941261 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.930;DP=40;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=19.17;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:795,0,868 -chr11 37962685 . G T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr11 37983991 . T TC 498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:44:536,44,0 -chr11 38018086 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,147 -chr11 38049058 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=1.701;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:372,0,367 -chr11 38050538 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.445;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:263,0,372 -chr11 38118003 . G T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=-0.413;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:619,0,564 -chr11 38118044 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=1.414;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:413,0,475 -chr11 38118494 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:257,0,335 -chr11 38120129 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.066;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:422,0,580 -chr11 38124543 . C T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-1.059;DP=50;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:627,0,1012 -chr11 38193496 . C G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr11 38194038 . A T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr11 38216092 . A C 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr11 38220136 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.954;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:333,0,443 -chr11 38220389 . A C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.531;DP=15;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=22.58;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:367,0,175 -chr11 38220860 . T C 220.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:249,21,0 -chr11 38221263 . A T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=-1.469;DP=37;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:547,0,863 -chr11 38221438 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.207;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:584,0,1207 -chr11 38221547 . G A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr11 38221885 . C A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:85:357,0,85 -chr11 38224640 . T TA 407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:445,42,0 -chr11 38225365 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:313,0,107 -chr11 38331867 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.029;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:373,0,342 -chr11 38366970 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=23.10;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:421,0,103 -chr11 38367533 . C G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=-1.265;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=21.87;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:728,0,405 -chr11 38368551 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-2.450;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=29.62;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:85:591,0,85 -chr11 38371837 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.034;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:271,0,509 -chr11 38437494 . C G 2390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2419,181,0 -chr11 38514215 . T A 1097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1126,78,0 -chr11 38515202 . A AG 851.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1052,110,0 -chr11 38515470 . C T 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr11 38581963 . C T 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 -chr11 38586012 . A G 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 -chr11 38586021 . T C 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:398,27,0 -chr11 38600403 . T A 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr11 38622628 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.434;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=29.60;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:561,0,119 -chr11 38623457 . C CA 216.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:254,26,0 -chr11 38779353 . G A 4555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=-1.345;DP=434;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,146:434:99:4584,0,16196 -chr11 38794244 . G A 9170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=-1.237;DP=273;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.706;QD=33.59;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,93:270:99:9199,0,5754 -chr11 38874699 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=1.240;DP=31;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:261,0,872 -chr11 39011200 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,100 -chr11 39014465 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,191 -chr11 39089184 . CGGTAAGATCAGCCCTTCTGTCTTTAGTTTTGTGCTGTTTTACTTCAGCTAAATCTGTCTTTTGTGCTCTGTCA C 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.972;DP=39;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=32.30;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:99:1297,0,1651 -chr11 39098211 . A G 495.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=32.25;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:522,3,0 -chr11 39216738 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=1.266;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=14.83;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:310,0,340 -chr11 39316514 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:311,0,404 -chr11 39316778 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-0.429;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:351,0,402 -chr11 39317043 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.667;DP=33;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:229,0,853 -chr11 39317146 . T G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-1.779;DP=49;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:283,0,1446 -chr11 39319875 . A C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.162;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=11.38;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:324,0,612 -chr11 39320604 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.607;DP=29;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:392,0,598 -chr11 39321769 . A C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr11 39323565 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=-0.444;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:279,0,810 -chr11 39327056 . C CT 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,291 -chr11 39329820 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.573;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:380,0,214 -chr11 39330499 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-1.723;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:483,0,412 -chr11 39774806 . AT A 2260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-1.708;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,79:132:99:2298,0,1569 -chr11 39774923 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-0.084;DP=231;FS=9.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,41:231:99:578,0,13741 -chr11 39775010 . A AAT 3034.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=-0.561;DP=148;FS=3.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,116:132:99:3072,107,0 -chr11 39775957 . TAG T 1062.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-0.517;DP=151;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=7.04;ReadPosRankSum=4.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,43:143:99:1100,0,3837 -chr11 39776332 . A AT 1275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-3.064;DP=220;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,67:196:99:1313,0,3227 -chr11 39776411 . A T 4432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-2.246;DP=204;FS=7.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,129:204:99:4461,0,2705 -chr11 39777202 . C CT 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-1.211;DP=353;FS=6.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,61:326:99:418,0,7377 -chr11 40240961 . T A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-2.179;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:352,0,1018 -chr11 40309838 . T C 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:36:508,36,0 -chr11 40313525 . ACTAAGAAGCAAACAGAATGTATCAGTTAAAACATTTTGAAACAAATGACCATAAAGCTGTACAGGTTTAAAACGGCAAAC A 6071.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.810;DP=140;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,130:135:99:6109,521,0 -chr11 40347579 . A T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=2.060;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:435,0,247 -chr11 40381741 . GT G 948.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.481;DP=139;FS=3.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,44:125:99:986,0,1907 -chr11 41480515 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-2.358;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=14.52;ReadPosRankSum=2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:275,0,313 -chr11 41493549 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.991;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:280,0,170 -chr11 41524576 . AGTCAGTATAATCGTTCCCTTCCTGTAATTTGGCTCATCCGTCCTTATTCAACTGGGTTTAAATAGAGCTGATCTTTCTCTTCGCAG A 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.817;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=23.44;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,33:35:99:1419,0,196 -chr11 41549122 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.386;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:430,0,563 -chr11 41609769 . A C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=3.021;DP=32;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:427,0,692 -chr11 41609885 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-1.085;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=12.99;ReadPosRankSum=2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:405,0,565 -chr11 41610158 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.165;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:365,0,412 -chr11 41613210 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=1.079;DP=69;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:350,0,2008 -chr11 41636974 . CAGGTAATCACAGCACACTGACTACAGCTGATCTGGTTTTTAGTCATGACTAACCACTGAATCATGAGTGTGTTTT C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,1243 -chr11 42093223 . G T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.49;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,146 -chr11 42095964 . A T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=19.24;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:336,0,241 -chr11 42097219 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.718;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,451 -chr11 42142334 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:300,0,147 -chr11 42143218 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.22;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:278,0,67 -chr11 42145173 . C T 277.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:306,0,17 -chr11 42154007 . AG A 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=-0.662;DP=175;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,50:162:99:823,0,3857 -chr11 42154746 . GCTGTTGAAATCAAACAGGTATTTTTTTAAATTAAAAGATCATGACAATAAATGTTTTGCTTTTATAAATGGTACTATCAAAAATAAAATGCAAAGTCAAACTCAC G 17059.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.104;DP=413;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,403:413:99:17097,573,0 -chr11 42319504 . G T 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=2.307;DP=64;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=16.53;ReadPosRankSum=-2.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:1086,0,1210 -chr11 42320284 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=-1.950;DP=87;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1095,0,1859 -chr11 42410756 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=23.55;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:405,0,493 -chr11 42411519 . C A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.623;DP=60;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:812,0,1269 -chr11 42558689 . G T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.945;DP=136;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:861,0,3877 -chr11 42658363 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.65;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:264,0,167 -chr11 42783396 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-2.209;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:443,0,262 -chr11 42793060 . C A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.630;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:375,0,812 -chr11 42797411 . C CA 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:375,0,610 -chr11 42799490 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:332,0,330 -chr11 42799582 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:344,0,180 -chr11 42800741 . T A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:429,0,997 -chr11 42800742 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:429,0,997 -chr11 42804498 . T A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.753;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:472,0,571 -chr11 42806570 . G A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr11 42806864 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.465;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:350,0,446 -chr11 42844299 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-2.044;DP=28;FS=4.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:830,0,381 -chr11 42853407 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.042;DP=42;FS=2.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=6.59;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:305,0,1151 -chr11 42858968 . G A 624.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=-1.327;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=27.16;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:42:653,42,0 -chr11 42931059 . C A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.902;DP=43;FS=4.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:615,0,799 -chr11 42949430 . ACAGGTACAATCATCTCAGAATTTAACACTGAGGAGTCATTTTAGACCTAAAAAGTTGCATATTATAACTGTACCGTTATTAAAGCTGATCAATGGTATGACATGTT A 3039.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.744;DP=68;FS=6.086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:99:3077,281,0 -chr11 42951385 . C A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.118;DP=108;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:922,0,2962 -chr11 42964745 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:351,0,668 -chr11 43037017 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:324,0,282 -chr11 43037453 . T A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.038;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:514,0,1346 -chr11 43037569 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:273,0,59 -chr11 43040158 . C G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.678;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,541 -chr11 43065404 . C T 1676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-1.088;DP=151;FS=6.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,51:151:99:1705,0,3505 -chr11 43067578 . A G 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.075;DP=151;FS=6.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,53:150:99:1772,0,3163 -chr11 43068629 . C A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.249;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.09;ReadPosRankSum=-2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:541,0,561 -chr11 43068979 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:235,0,52 -chr11 43069123 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:235,0,57 -chr11 43069847 . AG A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:267,0,406 -chr11 43074080 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.305;DP=60;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:487,0,1561 -chr11 43090742 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.888;DP=55;FS=6.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:513,0,1379 -chr11 43090949 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.572;DP=57;FS=20.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=4.61;ReadPosRankSum=-3.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:291,0,1660 -chr11 43091220 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.172;DP=66;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:375,0,1964 -chr11 43102203 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:89:311,0,89 -chr11 43102204 . T A 416.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=34.69;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:1:442,1,0 -chr11 43102513 . G A 2588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.554;DP=219;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,75:219:99:2617,0,5164 -chr11 43103561 . T G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=-2.293;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=31.98;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:32:508,0,32 -chr11 43121556 . G GAT 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=2.123;DP=319;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=1.53;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:70:526,0,70 -chr11 43125151 . G GA 1028.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.210;DP=104;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,50:87:99:1066,0,798 -chr11 43132402 . T C 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=3.359;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=25.88;ReadPosRankSum=-3.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,48:67:99:1762,0,495 -chr11 43132550 . T C 1216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.272;DP=54;FS=4.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=22.53;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1245,0,646 -chr11 43143217 . T C 1653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-3.716;DP=86;FS=18.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=19.23;ReadPosRankSum=-2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1682,0,1316 -chr11 43150486 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.641;DP=114;FS=10.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.722;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:323,0,3246 -chr11 43150713 . A G 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=1.034;DP=133;FS=4.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,46:132:99:1622,0,3248 -chr11 43161208 . T C 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-2.996;DP=253;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,88:248:99:2398,0,5535 -chr11 43165444 . A T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-0.912;DP=59;FS=10.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=6.66;ReadPosRankSum=-3.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:421,0,1670 -chr11 43166156 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.941;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:318,0,2430 -chr11 43176273 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=2.257;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,298 -chr11 43176376 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-1.125;DP=59;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:271,0,1726 -chr11 43176808 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.905;DP=120;FS=44.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,20:120:99:252,0,3992 -chr11 43289535 . TG T 883.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:73:921,73,0 -chr11 43289540 . A T 892.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:73:921,73,0 -chr11 43455639 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=1.278;DP=154;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=1.63;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,24:154:99:280,0,10307 -chr11 43608589 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,450 -chr11 43608596 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:231,0,450 -chr11 43611983 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,328 -chr11 43640172 . A G 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=1.826;DP=251;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=7.58;ReadPosRankSum=-3.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,75:251:99:1931,0,6560 -chr11 43684790 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.094;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:281,0,1648 -chr11 43690745 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.034;DP=49;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:365,0,2992 -chr11 43811333 . GAGGTGAGATGAAGCATGTGTGTGTGTGTTTTATGACCGTATATATGTCATACTGATACACTCAGATGACTCTCTCTGCCTTTTCTTCCCAC G 602.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:47:640,47,0 -chr11 43889637 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.205;DP=75;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:420,0,2185 -chr11 43890159 . G A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-1.007;DP=53;FS=5.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:861,0,890 -chr11 44022152 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.137;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:874,0,280 -chr11 44028884 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.636;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:242,0,1769 -chr11 44056799 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-1.765;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=14.34;ReadPosRankSum=2.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:401,0,542 -chr11 44105301 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=-1.091;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:694,0,519 -chr11 44113872 . AAG A 4345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.903;DP=293;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,145:221:99:4383,0,2114 -chr11 44120331 . C T 2232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.042;DP=329;FS=0.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=6.79;ReadPosRankSum=2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,92:327:99:2261,0,8882 -chr11 44139712 . C T 4238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.987;DP=136;FS=8.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=31.17;ReadPosRankSum=5.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,105:136:99:4267,0,1976 -chr11 44140458 . C G 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.397;DP=297;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,64:297:99:1124,0,8525 -chr11 44165912 . C T 8681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.844;DP=312;FS=0.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=27.83;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,233:312:99:8710,0,1801 -chr11 44488447 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=-2.447;DP=170;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=5.16;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,51:169:99:906,0,4046 -chr11 44578665 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr11 44583134 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:376,0,126 -chr11 44692106 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.330;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:282,0,2802 -chr11 44693442 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.656;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,27:103:99:614,0,3054 -chr11 44693456 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.013;DP=97;FS=3.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:548,0,2926 -chr11 44707617 . TA T 636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:42:674,42,0 -chr11 44713270 . C CT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.450;DP=35;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:266,0,542 -chr11 44715256 . A AC 841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-2.055;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:879,0,252 -chr11 45101375 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.409;DP=46;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:325,0,940 -chr11 45172695 . A G 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr11 45248361 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.016;DP=37;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:427,0,755 -chr11 45248862 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.745;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:343,0,739 -chr11 45358514 . C CT 746.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:62:784,62,0 -chr11 45358814 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:250,0,60 -chr11 45358968 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.471;DP=88;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:266,0,2858 -chr11 45368959 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.628;DP=91;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:403,0,2658 -chr11 45438103 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.662;DP=161;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,28:161:99:343,0,4868 -chr11 45443794 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=1.500;DP=150;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,37:150:99:818,0,4342 -chr11 45447681 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.892;DP=63;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:374,0,1839 -chr11 45447712 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=1.614;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=6.85;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:275,0,944 -chr11 45449279 . G GT 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.964;DP=54;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:288,0,947 -chr11 45453082 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.295;DP=45;FS=5.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:262,0,1277 -chr11 45465486 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.375;DP=50;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:231,0,1531 -chr11 45467343 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.682;DP=43;FS=5.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:267,0,1214 -chr11 45471007 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.113;DP=75;FS=5.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:293,0,2349 -chr11 45474683 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.520;DP=79;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:398,0,2144 -chr11 45478309 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-0.993;DP=68;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:285,0,2066 -chr11 45483855 . T G 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=-0.989;DP=360;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,68:358:99:1073,0,10640 -chr11 45656500 . AGTAAGAGCGCCTGATACACTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATGTGTAACTATACACATCCTGTTTGTGACGCAG A 754.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.102;DP=25;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=30.19;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:792,0,1384 -chr11 45705736 . G GT 200.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:6:237,0,6 -chr11 45714557 . T A 2830.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2859,229,0 -chr11 45718144 . A C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:521,39,0 -chr11 45718203 . A C 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:943,66,0 -chr11 45718427 . A G 913.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:942,66,0 -chr11 45718889 . A G 2725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2754,190,0 -chr11 45719189 . TTG T,TTGTG 1627.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.771;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,25,24:51:99:1663,835,1125,904,0,1265 -chr11 45719286 . TGA T 459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:497,37,0 -chr11 45724186 . G T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.211;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=33.54;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:30:632,0,30 -chr11 45724204 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:500,0,118 -chr11 45728179 . A G 2402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2431,178,0 -chr11 45728765 . A C 214.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:243,0,24 -chr11 45728796 . A C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr11 45728969 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr11 45736674 . C G 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-2.241;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:809,0,241 -chr11 45736768 . G C 2290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.202;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,49:55:53:2319,53,0 -chr11 45737018 . G T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=1.296;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=33.21;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,29:33:38:1124,0,38 -chr11 45737087 . T G 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.427;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=32.31;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:39:1062,0,39 -chr11 45751119 . G T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:42:491,0,42 -chr11 45752267 . AACCTGGCGGAGAAACAGGAGTGAGTGCAGGGGTCCAGTTCATTAACGGAGCACACTATCTAGCATTCTC A 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.34;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:393,0,411 -chr11 45752385 . G C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.594;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=31.85;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:45:506,0,45 -chr11 45753169 . A T 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 -chr11 45769156 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr11 45871983 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.996;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:235,0,417 -chr11 45903722 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.975;DP=52;FS=8.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:488,0,1323 -chr11 45977110 . GCAGGTCAGTGTGTGTCTCTGTGTGCATGTGTGTGTGCGCGCGAGCATTTGTGTGTGACTCGGTGTGTTCTCTGCT G 3047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-1.491;DP=72;FS=3.068;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:3085,249,0 -chr11 45979410 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.057;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:485,0,925 -chr11 46094988 . G A 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=1.425;DP=207;FS=7.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,52:202:99:1223,0,5653 -chr11 46099104 . AAC A 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=1.737;DP=73;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:479,0,346 -chr11 46167380 . TCTGACACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGATTATTTATCACAGAAAACAAAACAGCTGAGGAGGAAAATAATGCTTTTATCTATCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAC T 2829.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-1.728;DP=69;FS=3.052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.298;QD=35.95;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,67:69:99:3128,302,0 -chr11 46194187 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:321,0,615 -chr11 46197127 . G GCT 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.740;DP=201;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,43:143:99:852,0,3048 -chr11 46197527 . A T 2182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.658;DP=285;FS=11.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,86:285:99:2211,0,7751 -chr11 46219439 . T C 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=-1.393;DP=61;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1232,0,1462 -chr11 46219442 . C T 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.586;DP=54;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1242,0,1462 -chr11 46225334 . C T 1995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=1.837;DP=120;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:2024,0,2110 -chr11 46259426 . C T 1349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.808;DP=91;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=14.83;ReadPosRankSum=2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:1378,0,1767 -chr11 46263342 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=34.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:305,0,64 -chr11 46263729 . GTTTTATTTCTCAGATTTGTGAGGAAAAAGTA G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=1.922;DP=65;FS=3.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:454,0,11640 -chr11 46291093 . G A 2136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-2.799;DP=189;FS=11.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=11.31;ReadPosRankSum=2.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,69:189:99:2165,0,3459 -chr11 46294057 . A G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=1.417;DP=37;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:626,0,813 -chr11 46294150 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.260;DP=40;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:264,0,1773 -chr11 46296774 . A G 325.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=32.59;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:354,0,16 -chr11 46368804 . C A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.565;DP=45;FS=2.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:304,0,1074 -chr11 46407589 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=2.177;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:289,0,199 -chr11 46442510 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=11.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:370,0,284 -chr11 46461825 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.090;DP=110;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:412,0,3166 -chr12 2278 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:378,0,240 -chr12 15061 . G A 1969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-1.710;DP=154;FS=7.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,58:154:99:1998,0,3280 -chr12 19438 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.039;DP=53;FS=4.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:367,0,1739 -chr12 62915 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.408;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:450,0,436 -chr12 277946 . C T 4131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.702;DP=250;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,118:250:99:4160,0,4244 -chr12 278070 . G C 3083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.058;DP=181;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:181:99:3112,0,3187 -chr12 278247 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-1.136;DP=160;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,34:159:99:613,0,4569 -chr12 281907 . C T 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.714;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,98:195:99:3263,0,3188 -chr12 281988 . C T 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.261;DP=169;FS=0.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,47:169:99:1173,0,4658 -chr12 285105 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.691;DP=127;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,48:126:99:1816,0,5233 -chr12 285111 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.694;DP=122;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:1816,0,5201 -chr12 285177 . G A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=-1.165;DP=160;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,38:160:99:767,0,4449 -chr12 285517 . C T 3078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.172;DP=178;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,95:177:99:3107,0,2944 -chr12 286180 . G T 2586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.254;DP=187;FS=10.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,91:173:99:2615,0,2758 -chr12 291354 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-1.837;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:346,0,558 -chr12 295784 . T C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr12 295794 . A G 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:400,27,0 -chr12 297818 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-1.389;DP=64;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=15.29;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1007,0,1147 -chr12 426094 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=26.37;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:94:371,0,94 -chr12 467564 . A C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-2.329;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=18.74;ReadPosRankSum=2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,230 -chr12 467676 . T A 3526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-0.812;DP=131;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=26.92;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,89:130:99:3555,0,1160 -chr12 508498 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-1.179;DP=145;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,33:144:99:684,0,4093 -chr12 509075 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.005;DP=87;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,19:87:99:361,0,2550 -chr12 509345 . G A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.486;DP=95;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1562,0,1565 -chr12 511729 . C T 1908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.313;DP=77;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,53:77:99:1937,0,631 -chr12 515322 . A G 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.517;DP=44;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,30:44:99:1108,0,337 -chr12 520167 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:437,0,269 -chr12 520324 . G A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=1.161;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1035,0,453 -chr12 520344 . C A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.326;DP=53;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=25.66;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1388,0,399 -chr12 520406 . G A 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=2.594;DP=54;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,44:54:99:1657,0,233 -chr12 520539 . T C 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.502;DP=63;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,39:63:99:1279,0,828 -chr12 520596 . T G 2076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.045;DP=66;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=31.47;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,56:66:99:2105,0,109 -chr12 520737 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-2.517;DP=66;FS=4.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=3.42;ReadPosRankSum=2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:254,0,2338 -chr12 520770 . G C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-2.773;DP=75;FS=7.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:340,0,2571 -chr12 521424 . G A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.125;DP=58;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1014,0,930 -chr12 521441 . G T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.218;DP=58;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1012,0,965 -chr12 539259 . C G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-1.193;DP=45;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=13.79;ReadPosRankSum=3.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:649,0,892 -chr12 539276 . A C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-0.809;DP=49;FS=2.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=11.34;ReadPosRankSum=2.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:584,0,1134 -chr12 545481 . T C 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.585;DP=35;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=27.39;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:987,0,224 -chr12 545531 . C T 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.660;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=25.76;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:930,0,214 -chr12 545621 . G A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.491;DP=29;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:76:900,0,76 -chr12 545657 . A G 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-0.161;DP=39;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=21.74;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:876,0,431 -chr12 545844 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.907;DP=36;FS=10.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:550,0,697 -chr12 545868 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.380;DP=36;FS=13.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:548,0,737 -chr12 545936 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.206;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:386,0,746 -chr12 545964 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.101;DP=33;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=6.63;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:247,0,879 -chr12 546281 . T C 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=1.870;DP=42;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.115;QD=26.73;ReadPosRankSum=-1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,33:42:99:1151,0,159 -chr12 546411 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.618;DP=36;FS=4.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:276,0,987 -chr12 546631 . T C 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.444;DP=41;FS=3.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=30.29;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1270,0,113 -chr12 546651 . A T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.902;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:654,0,668 -chr12 546801 . T C 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=-0.202;DP=29;FS=6.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:638,0,343 -chr12 547209 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=-0.750;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=22.61;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:616,0,221 -chr12 547298 . T C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.807;DP=36;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:652,0,656 -chr12 550616 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.689;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:695,0,402 -chr12 552250 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,267 -chr12 552522 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:303,0,218 -chr12 553734 . T C 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.646;DP=33;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=25.39;ReadPosRankSum=-2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:866,0,288 -chr12 553887 . T G 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=3.100;DP=34;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:623,0,634 -chr12 554228 . T G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=1.293;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:441,0,466 -chr12 554991 . AG A 1047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.733;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=34.92;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1085,87,0 -chr12 555069 . A G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.727;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:543,0,503 -chr12 555104 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.756;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:493,0,433 -chr12 556227 . G A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=21.67;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:505,0,285 -chr12 556341 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.985;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=17.74;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:454,0,396 -chr12 556381 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.469;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:391,0,565 -chr12 556476 . A C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.504;DP=29;FS=8.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:533,0,442 -chr12 556670 . G C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=-1.349;DP=32;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:705,0,1131 -chr12 556673 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-1.179;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:705,0,1131 -chr12 558384 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.566;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:609,0,549 -chr12 558784 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.713;DP=33;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:447,0,717 -chr12 559842 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,218 -chr12 559843 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,218 -chr12 559980 . T A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.262;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:658,0,231 -chr12 560085 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:43:521,0,43 -chr12 560239 . C A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=1.142;DP=32;FS=13.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:74:1084,0,74 -chr12 560343 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:246,0,379 -chr12 560826 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-0.579;DP=24;FS=14.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:455,0,387 -chr12 560890 . A G 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.260;DP=26;FS=1.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=29.84;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:95:804,0,95 -chr12 561197 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.929;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=24.60;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:348,0,138 -chr12 563801 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.376;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:251,0,338 -chr12 566084 . T C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=1.085;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:409,0,594 -chr12 572549 . T G 1410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.746;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=27.44;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:1439,0,169 -chr12 572834 . A T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-1.355;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=21.65;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:353,0,222 -chr12 576524 . G T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.579;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=19.67;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:756,0,469 -chr12 577445 . C G 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=1.392;DP=33;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:586,0,497 -chr12 580762 . A C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.087;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:686,0,480 -chr12 583681 . C T 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.370;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.937;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:753,0,502 -chr12 583747 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-1.554;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:362,0,574 -chr12 583807 . T C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-1.134;DP=34;FS=8.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:446,0,740 -chr12 584727 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.215;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:614,0,615 -chr12 586601 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-2.007;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:321,0,345 -chr12 586703 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=-0.371;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:474,0,490 -chr12 588155 . C T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.245;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:619,0,147 -chr12 594523 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:234,0,372 -chr12 594590 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.277;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:388,0,389 -chr12 594660 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.835;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:506,0,303 -chr12 598965 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-2.524;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=20.37;ReadPosRankSum=-1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:293,0,148 -chr12 601557 . T C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=1.906;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:65:709,0,65 -chr12 602561 . A T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=-0.309;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:983,0,223 -chr12 606113 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-0.482;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=31.15;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:51:807,0,51 -chr12 611268 . T C 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-0.113;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=26.02;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:835,0,203 -chr12 616233 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.527;DP=24;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=26.87;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:65:673,0,65 -chr12 616312 . G A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=-0.375;DP=28;FS=5.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=30.28;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:50:876,0,50 -chr12 618570 . T C 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.094;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:98:853,0,98 -chr12 618582 . A C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.640;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:704,0,103 -chr12 619276 . C A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:409,0,120 -chr12 620630 . A T 682.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-0.063;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=34.15;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:15:711,15,0 -chr12 621214 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.983;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:391,0,190 -chr12 623134 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,238 -chr12 658832 . C G 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-3.802;DP=58;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.56;ReadPosRankSum=-2.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:525,0,1795 -chr12 665309 . A G 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.329;DP=54;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1224,0,646 -chr12 684147 . C G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.137;DP=36;FS=12.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:304,0,905 -chr12 698602 . T C 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -chr12 698653 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.88;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:84:297,0,84 -chr12 700808 . T A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr12 706801 . A T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:694,48,0 -chr12 706807 . C T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:48:694,48,0 -chr12 707167 . A G 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:550,39,0 -chr12 707772 . GAC G 363.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:401,27,0 -chr12 749902 . A G 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:350,27,0 -chr12 788134 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr12 790746 . C T 2132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:2161,147,0 -chr12 816242 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=23.71;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:289,0,58 -chr12 818119 . T C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=9.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:50:832,0,50 -chr12 823999 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.531;DP=27;FS=4.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:91:860,0,91 -chr12 824059 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:267,0,63 -chr12 827347 . A G 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.228;DP=44;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,36:44:99:1418,0,132 -chr12 827380 . T A 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-0.463;DP=58;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=29.15;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1719,0,336 -chr12 827430 . G A 2956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.484;DP=103;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,76:103:99:2985,0,677 -chr12 827524 . C T 1789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.147;DP=72;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=24.86;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1818,0,1879 -chr12 827530 . C T 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.058;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=26.77;ReadPosRankSum=-2.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1822,0,1879 -chr12 1045061 . AGTGTGT A 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:51:326,0,51 -chr12 1118985 . G A 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.326;DP=93;FS=2.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:1216,0,1835 -chr12 1153579 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.902;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:457,0,1940 -chr12 1153643 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.348;DP=74;FS=10.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:271,0,1793 -chr12 1173484 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.982;DP=85;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=5.07;ReadPosRankSum=2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:459,0,2405 -chr12 1190457 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.214;DP=54;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:295,0,1497 -chr12 1228910 . TCTAACAGAAGAAAGAGAGCAGAAAGGATGAAGACAGACGCCTAACTCTGCAGTGTGACGATCATGTTTACATTTAC T 3189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=1.585;DP=77;FS=2.856;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=33.23;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,75:77:99:3227,286,0 -chr12 1238025 . TCTGTTAATGAACGAAACACAAATTTATCTTCGATTTTTATATTTGTGCTTCAAAAAAGCTAAAGCTAATTGTGTTCAGTAATAATGTGTATTGTGAC T 302.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:32:340,32,0 -chr12 1702738 . CCA C 287.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr12 1723569 . G C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:382,0,54 -chr12 1724245 . G T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:352,0,48 -chr12 1787035 . GT G 269.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:307,23,0 -chr12 2646191 . C A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.022;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:476,0,763 -chr12 2655349 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:299,0,385 -chr12 2758393 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr12 2759524 . G T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr12 2759753 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.925;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:74:311,0,74 -chr12 2759798 . A T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:350,27,0 -chr12 2766471 . G GA 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-3.185;DP=101;FS=8.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:686,0,1243 -chr12 2767414 . G T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:402,0,639 -chr12 2769574 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.211;DP=52;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:309,0,2681 -chr12 2770479 . C G 2801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:2830,202,0 -chr12 2770865 . CG C 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.100;DP=79;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=3.57;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:319,0,2039 -chr12 2772024 . T C 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=1.454;DP=70;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:816,0,1679 -chr12 2776865 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=1.000;DP=50;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:706,0,1081 -chr12 3354190 . CT C 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.244;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:299,0,177 -chr12 3459142 . TAAAGCTTTCAGTATGCTCATGTGAAATCATACCATGTTATCAACACATCAATTTACCCACATTTTTTTTCTCCCCCCAGGC T 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.614;DP=47;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:280,0,1520 -chr12 3473706 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-1.272;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:236,0,452 -chr12 3473868 . T A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.066;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:459,0,918 -chr12 3476062 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.811;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,217 -chr12 3477908 . G T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.170;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:468,0,521 -chr12 3479597 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,315 -chr12 3479607 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,315 -chr12 3479915 . A T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.154;DP=22;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:410,0,447 -chr12 3487569 . A T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr12 3487631 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=23.52;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:381,0,172 -chr12 3487763 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=21.16;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:261,0,144 -chr12 3488947 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.822;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=27.92;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:475,0,46 -chr12 3489430 . C G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.088;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:329,0,405 -chr12 3490345 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,618 -chr12 3491544 . C CA 354.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr12 3491546 . G A 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr12 3497683 . A G 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:307,21,0 -chr12 3512091 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=22.48;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:343,0,206 -chr12 3633571 . T TA 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.240;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:718,0,144 -chr12 3644136 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.591;DP=27;FS=6.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:253,0,712 -chr12 3648622 . T C 413.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=34.44;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:440,0,4 -chr12 3654699 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=24.49;ReadPosRankSum=-2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:420,0,418 -chr12 3660487 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=-1.457;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:403,0,1327 -chr12 3660518 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=1.834;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:425,0,1368 -chr12 3684483 . C A 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.740;DP=67;FS=6.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=12.76;ReadPosRankSum=2.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:883,0,2242 -chr12 3687913 . C CA 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.941;DP=235;FS=15.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,61:218:99:893,0,4208 -chr12 3688068 . CA C 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=1.790;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,39:182:99:463,0,4160 -chr12 3688291 . C CG 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.513;DP=270;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,60:244:99:572,0,11024 -chr12 3688600 . T C 1923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=1.289;DP=369;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,91:369:99:1952,0,10492 -chr12 3701592 . CCCTGCAGATTTGAAGGCATAAGAAATATTATTCATTTGGAACAGCATTTGGTTATTTCATAAAATCACCAATAAAGTTTGCTGA C 18005.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.559;DP=427;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,377:379:99:18043,1500,0 -chr12 3701710 . G A 2641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.084;DP=432;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,119:429:99:2670,0,20460 -chr12 3709017 . A G 3700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=3.055;DP=742;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=4.99;ReadPosRankSum=6.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:542,176:718:99:3729,0,19941 -chr12 3709035 . A C 3240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.733;ClippingRankSum=0.625;DP=685;FS=6.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.033;QD=4.73;ReadPosRankSum=3.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:523,161:684:99:3269,0,19029 -chr12 3714858 . CCCTACAAAAGAGAACGATAACTATTACTAAAACAGCAGAGGTTTTAGTAGGAATGATTTGTGTTTTAAAGATACCTA C 15428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.030;DP=420;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=30.29;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,395:398:99:15466,1170,0 -chr12 3716172 . A G 8634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-1.719;DP=495;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,274:492:99:8663,0,7379 -chr12 3717778 . A G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=-0.571;DP=733;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:563,169:732:99:3263,0,20409 -chr12 3721363 . G A 7927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=-5.316;DP=446;FS=34.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=17.78;ReadPosRankSum=5.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,249:446:99:7956,0,6517 -chr12 3805135 . C CT,CTT 2302.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.846;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=11.23;ReadPosRankSum=-2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:31,103,40:174:99:3399,463,634,1951,0,2618 -chr12 3881106 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-2.011;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:239,0,471 -chr12 3881576 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=17.90;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:243,0,335 -chr12 3882225 . AT A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.854;DP=45;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:447,0,538 -chr12 3897940 . A G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.589;DP=35;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:492,0,708 -chr12 3898132 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:410,0,473 -chr12 3903663 . T A 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:438,30,0 -chr12 3907942 . CT C 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,997 -chr12 3907945 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.976;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,1001 -chr12 4168222 . G C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.184;DP=133;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,31:133:99:682,0,3823 -chr12 4305559 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-1.883;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=2.32;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,19:111:99:286,0,3750 -chr12 4356747 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:275,0,411 -chr12 4357004 . T A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.042;DP=30;FS=12.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:463,0,605 -chr12 4357086 . A T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.475;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:619,0,2747 -chr12 4357111 . T A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=1.291;DP=47;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:614,0,2747 -chr12 4361076 . G T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.214;ClippingRankSum=-0.716;DP=88;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:970,0,1883 -chr12 4368394 . C T 1712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-0.622;DP=95;FS=3.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.133;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1741,0,1701 -chr12 4368419 . A T 1443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=-1.779;DP=91;FS=7.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.934;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1472,0,1465 -chr12 4368701 . T C 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.068;DP=69;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:846,0,1534 -chr12 4484748 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:260,18,0 -chr12 4484753 . T A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr12 4487820 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:547,0,426 -chr12 4488024 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.590;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:292,0,847 -chr12 4488054 . A G 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.018;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:676,0,484 -chr12 4488108 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.510;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=16.47;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:473,0,460 -chr12 4488117 . A G 1292.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1321,93,0 -chr12 4488342 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.882;DP=37;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:425,0,772 -chr12 4490972 . A G 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:356,27,0 -chr12 4556240 . T C 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.098;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=28.34;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1020,0,202 -chr12 4625099 . TCTATAGCAGTGACAGAGAACAGAAAAACAATAATGTTGAGCTCCAGGAGTGACTCGTGTAAGATTTACTGCTCAAGGAAGAACAAGAGTGTGAGGAAGAGATGGTGGAAGGGCTTTGTATATTGGTAAATGGCCACCAAATTCATTGGTGAAGGCAGAAAAGAGTGAAGGGTGTGAAAGTAAAGTGGATGAAGAGTAAGAGAGAGGAGTGAATGATTAAACATTTAATAAC T 14963.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.770;ClippingRankSum=6.358;DP=485;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=30.85;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,402:423:99:15001,0,782 -chr12 4637381 . C CCA 4375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-2.267;DP=403;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.461;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,124:372:99:4413,0,9146 -chr12 4645750 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=-1.095;DP=244;FS=15.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=2.20;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,43:244:99:565,0,7363 -chr12 4653800 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.423;DP=218;FS=5.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,39:218:99:604,0,6852 -chr12 4729877 . GT G 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-1.490;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=4.27;ReadPosRankSum=2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:362,0,1710 -chr12 4729889 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=-0.567;DP=68;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:419,0,1964 -chr12 4737560 . C G 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-1.712;DP=234;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,51:234:99:965,0,6965 -chr12 4897969 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.400;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:341,0,2215 -chr12 4912397 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=-0.839;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:242,0,1253 -chr12 5001095 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.603;DP=45;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:293,0,1268 -chr12 5001292 . C A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.977;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:405,0,1984 -chr12 5001311 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.778;ClippingRankSum=1.370;DP=76;FS=4.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=3.23;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:274,0,2205 -chr12 5058526 . A C 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=-2.459;DP=246;FS=9.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,59:245:99:1285,0,7003 -chr12 5229509 . A G 227.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:256,0,22 -chr12 5230561 . A G 348.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:376,0,9 -chr12 5245390 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.693;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:316,0,1713 -chr12 5245876 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.072;DP=140;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,22:140:99:267,0,8241 -chr12 5245878 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.124;DP=139;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,22:139:99:267,0,8241 -chr12 5247546 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-0.635;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.89;ReadPosRankSum=2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:769,0,1378 -chr12 5288770 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.086;DP=133;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,28:133:99:538,0,3770 -chr12 5358183 . A C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.664;DP=134;FS=6.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:860,0,3969 -chr12 5363947 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=-0.645;DP=249;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,38:249:99:301,0,8358 -chr12 5477685 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.528;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:322,0,659 -chr12 5494657 . A G 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:736,51,0 -chr12 5494785 . A G 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr12 5651576 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=1.442;DP=38;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:275,0,1064 -chr12 5653136 . T C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=-1.265;DP=49;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:689,0,1178 -chr12 5760165 . T C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:29:552,0,29 -chr12 5760541 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.369;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:467,0,165 -chr12 5760763 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:354,0,101 -chr12 5760767 . T C 650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:48:679,48,0 -chr12 6077413 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.116;DP=134;FS=7.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,26:133:99:504,0,8447 -chr12 6077414 . T A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.163;DP=133;FS=5.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,25:132:99:497,0,8447 -chr12 6290862 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.572;DP=61;FS=3.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:482,0,1482 -chr12 6344220 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.390;DP=29;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:314,0,622 -chr12 6387230 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.684;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,414 -chr12 6387330 . T C 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-0.593;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=29.81;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:91:833,0,91 -chr12 6731381 . A G 1819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-2.220;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,30:113:99:1848,0,2724 -chr12 6734301 . TCCTGCCCAAACACAGTAATTAATACAAAAGCATAAATATTGGCATTCTGTGGATATTATACTGAAACACTGGACGTTGTCAAATCAATGAATTAAATTGGTGGCCCA T 3132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.253;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:99:3170,255,0 -chr12 6848718 . TCTGCAAAAACCCAGGCAAAATGGTCCTTGGAGAAATATTCTCTAATCACCAATAGATGTTTTCGCTGAGGGTATGAGTGTAC T 3209.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=1.759;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=28.79;ReadPosRankSum=-2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3247,271,0 -chr12 7935463 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.149;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,23:135:99:285,0,4321 -chr12 7935688 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.464;DP=43;FS=1.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:396,0,1147 -chr12 8271818 . T C 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=1.350;DP=19;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=31.67;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:41:630,0,41 -chr12 8272825 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.158;DP=55;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:354,0,1386 -chr12 8301607 . G GT 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-2.488;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:296,0,3026 -chr12 8311974 . GTA G 708.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:746,52,0 -chr12 8313997 . G A 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.258;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,39:194:99:689,0,6227 -chr12 8317682 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr12 8822511 . T C 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.107;DP=62;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1232,0,925 -chr12 8830646 . G A 1795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.281;DP=81;FS=14.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,52:81:99:1824,0,984 -chr12 8841821 . A G 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-3.360;DP=56;FS=12.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:919,0,1055 -chr12 8850752 . G T 2103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.505;DP=107;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=19.66;ReadPosRankSum=-1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:2132,0,1568 -chr12 8868806 . G T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;ClippingRankSum=-0.342;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:504,0,577 -chr12 8868844 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.889;DP=31;FS=11.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:521,0,509 -chr12 8944324 . T C 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr12 9136951 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.597;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:545,0,613 -chr12 9229283 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-0.339;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,24:103:99:494,0,2916 -chr12 9229685 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.860;DP=144;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,24:144:99:269,0,4526 -chr12 9230461 . T TG 1058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=1.602;DP=56;FS=7.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=18.91;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,34:56:99:1096,0,658 -chr12 9362447 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.459;DP=90;FS=3.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:302,0,2743 -chr12 9369446 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=1.078;DP=98;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:360,0,3056 -chr12 9376894 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=1.658;DP=136;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=1.95;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:294,0,4420 -chr12 9381440 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.406;DP=117;FS=3.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:507,0,3621 -chr12 9954514 . G T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-1.296;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:726,0,484 -chr12 10060138 . T G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.922;DP=37;FS=6.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:438,0,848 -chr12 10060224 . A C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.070;DP=48;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:413,0,1128 -chr12 10060235 . G T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.573;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:565,0,1155 -chr12 10069642 . T C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.735;DP=52;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:613,0,1123 -chr12 10069860 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.637;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:593,0,1016 -chr12 10112042 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-0.132;DP=54;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=14.50;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:811,0,2266 -chr12 10113027 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:417,0,286 -chr12 10113077 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:436,0,444 -chr12 10113796 . G T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=1.173;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:525,0,776 -chr12 10114049 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.473;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:394,0,767 -chr12 10114456 . G A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=-1.230;DP=57;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=15.87;ReadPosRankSum=2.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:933,0,1216 -chr12 10128232 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.763;DP=53;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:802,0,1038 -chr12 10143742 . T G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=-1.424;DP=48;FS=3.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:836,0,788 -chr12 10152469 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.818;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:542,0,994 -chr12 10158046 . T G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-1.003;DP=68;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:900,0,1415 -chr12 10158091 . T C 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.089;DP=82;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1293,0,1591 -chr12 10168579 . T C 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.765;DP=43;FS=4.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=24.79;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1094,0,344 -chr12 10198386 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=-0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:297,0,407 -chr12 10200020 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.794;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:373,0,390 -chr12 10200704 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.626;DP=22;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:374,0,408 -chr12 10204076 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-1.268;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:413,0,815 -chr12 10222851 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=23.64;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:241,0,98 -chr12 10264361 . A C 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.196;DP=123;FS=4.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1693,0,2525 -chr12 10314159 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.800;DP=39;FS=10.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:440,0,905 -chr12 10336413 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.607;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:283,0,917 -chr12 10336489 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:300,0,433 -chr12 10336712 . A G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.226;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.743;QD=25.49;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:640,0,229 -chr12 10368088 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:266,0,129 -chr12 10406989 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:232,0,305 -chr12 10423119 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,328 -chr12 10428857 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.414;DP=26;FS=13.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:431,0,485 -chr12 10538325 . T A 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr12 10555928 . A G 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr12 10562551 . T C 267.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:296,24,0 -chr12 10565672 . C T 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr12 10609866 . C T 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:950,69,0 -chr12 10611212 . A G 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -chr12 10624438 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.598;DP=40;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:506,0,702 -chr12 10632904 . C T 967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:996,72,0 -chr12 10662333 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.42;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:257,0,60 -chr12 10662559 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr12 10747892 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=1.354;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:461,0,327 -chr12 10751783 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:296,0,382 -chr12 10756406 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.267;DP=30;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,767 -chr12 10757796 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=1.110;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:242,0,1875 -chr12 10757867 . T G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=1.505;DP=40;FS=7.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:510,0,853 -chr12 10758297 . C T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.408;DP=39;FS=12.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:774,0,1324 -chr12 10758300 . A G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.169;DP=37;FS=13.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:774,0,1324 -chr12 10764046 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,335 -chr12 10799247 . T C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.066;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:647,0,792 -chr12 10799542 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.840;DP=48;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:236,0,1407 -chr12 10814681 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.809;DP=51;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:481,0,1291 -chr12 10815021 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.822;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:278,0,978 -chr12 10855493 . GA G 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=1.719;DP=78;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:798,0,1022 -chr12 10858187 . G A 5946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=-1.857;DP=337;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,179:333:99:5975,0,5618 -chr12 10858405 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:461,0,1918 -chr12 10858415 . A G 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.748;DP=40;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:798,0,1116 -chr12 10858428 . A G 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-1.630;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:771,0,1930 -chr12 10858645 . TA T 993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.194;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,2:209:99:1031,0,12994 -chr12 10858680 . G A 2813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.035;DP=163;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=17.26;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:2842,0,8363 -chr12 10921392 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr12 10923989 . G C 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr12 11144729 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:378,0,273 -chr12 11145131 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:296,0,210 -chr12 11148076 . C A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:86:449,0,86 -chr12 11150636 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,338 -chr12 11159392 . TGTGAGTATGTCTCTCTCTTTCTGACATGCGTACAGTGTCATTGCTGTTTACCGCACACACTATGCAAAAACCATGCTTTTCCTTGCTCTAG T 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:339,0,566 -chr12 11177585 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=1.914;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:327,0,514 -chr12 11195059 . A G 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-1.265;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:844,0,950 -chr12 11195121 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.910;DP=60;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:760,0,1302 -chr12 11203864 . A T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-2.070;DP=71;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:611,0,1811 -chr12 11204028 . G C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-1.824;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,32:77:99:1076,0,1632 -chr12 11204475 . A G 1967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.917;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=32.13;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,49:56:39:1996,0,39 -chr12 11204659 . A G 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=-1.319;DP=91;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,36:91:99:1316,0,2018 -chr12 11204790 . A C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.307;DP=55;FS=6.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:286,0,1680 -chr12 11205668 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.854;DP=61;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:254,0,1882 -chr12 11205783 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-1.453;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:598,0,2061 -chr12 11205806 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.598;DP=76;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:618,0,1829 -chr12 11206898 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.272;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:287,0,493 -chr12 11207932 . C A 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=1.532;DP=116;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,43:116:99:1633,0,4887 -chr12 11207933 . A T 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=2.158;DP=117;FS=0.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:1633,0,4883 -chr12 11208146 . G C 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-0.313;DP=85;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,28:85:99:776,0,2167 -chr12 11208504 . AT A 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-1.649;DP=59;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:560,0,620 -chr12 11222490 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=1.908;DP=40;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:257,0,1061 -chr12 11230261 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.173;DP=34;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=13.32;ReadPosRankSum=2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:481,0,647 -chr12 11236266 . C T 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-2.100;DP=69;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1036,0,1315 -chr12 11239804 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:349,0,704 -chr12 11246394 . T C 4760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-1.413;DP=344;FS=9.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,135:344:99:4789,0,7184 -chr12 11246413 . AAGGTTTGACAGACATTTATTTCCTGATATACAAATCAAGGGTGAGACTGCAGTGCTGTTTTTCAATTGTATATTTATTCTTGTTTTT A 12277.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=-0.153;DP=330;FS=1.615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,296:302:99:12315,883,0 -chr12 11251079 . A T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-3.119;DP=290;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,100:282:99:1152,0,9898 -chr12 11251127 . T C 7301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-1.430;DP=319;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=22.89;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,123:318:99:7330,0,6596 -chr12 11253841 . C A 5196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=-0.625;DP=417;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,181:414:99:5225,0,7546 -chr12 11278650 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.749;DP=25;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:326,0,485 -chr12 11288481 . A C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=1.411;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:382,0,618 -chr12 11296782 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:271,0,133 -chr12 11299152 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=4.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:392,0,286 -chr12 11314940 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.217;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:322,0,495 -chr12 11316127 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:367,0,358 -chr12 11418000 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.179;DP=38;FS=2.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:494,0,839 -chr12 11423650 . G C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.148;DP=50;FS=2.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:401,0,1269 -chr12 11426444 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.232;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:328,0,1282 -chr12 11433862 . A G 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.533;DP=132;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.397;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:1719,0,2795 -chr12 11435375 . A G 2196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;ClippingRankSum=-3.392;DP=147;FS=7.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=14.94;ReadPosRankSum=3.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,56:147:99:2225,0,6389 -chr12 11437186 . C T 1909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.257;DP=181;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,60:178:99:1938,0,4136 -chr12 11437553 . C T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-0.750;DP=158;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=6.76;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,43:158:99:1096,0,4358 -chr12 11447180 . AT A 5477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=-2.983;DP=232;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=23.61;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,85:218:99:5515,0,3382 -chr12 11447352 . C A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-3.174;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,62:212:99:596,0,20021 -chr12 11447417 . C T 4747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=3.180;DP=392;FS=1.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,139:392:99:4776,0,8799 -chr12 11448133 . G A 2841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.427;DP=344;FS=11.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=8.26;ReadPosRankSum=2.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,97:342:99:2870,0,20037 -chr12 11450483 . C T 4247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.231;DP=294;FS=5.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,121:294:99:4276,0,5979 -chr12 11450575 . G A 3297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.542;DP=279;FS=1.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,98:279:99:3326,0,6397 -chr12 11452170 . T C 3577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.727;DP=385;FS=23.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,128:385:99:3606,0,9979 -chr12 11452203 . A C 4289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.035;ClippingRankSum=-0.001;DP=362;FS=17.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,129:362:99:4318,0,8328 -chr12 11453733 . C T 5121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.251;DP=352;FS=18.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,148:352:99:5150,0,6697 -chr12 11454917 . G A 4777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-0.897;DP=286;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,132:286:99:4806,0,5105 -chr12 11461120 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.059;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:509,0,1375 -chr12 11461144 . A T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.701;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:586,0,1672 -chr12 11477906 . A G 4448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.573;DP=331;FS=3.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,130:331:99:4477,0,6868 -chr12 11503827 . C G 1812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.401;ClippingRankSum=-2.279;DP=105;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=17.26;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1841,0,2333 -chr12 11504527 . A G 5837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=1.093;DP=335;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,163:334:99:5866,0,6389 -chr12 11504716 . A T 8056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-1.557;DP=515;FS=9.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=15.64;ReadPosRankSum=4.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,226:514:99:8085,0,9767 -chr12 11518705 . C A 7911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.034;DP=538;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,227:532:99:7949,0,10302 -chr12 11544515 . C A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=-0.508;DP=253;FS=6.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=2.19;ReadPosRankSum=2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,50:251:99:583,0,8740 -chr12 11555302 . C A 1208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.048;DP=313;FS=2.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,68:310:99:1246,0,9075 -chr12 11596718 . G A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr12 11614420 . TCTGGAATTTAAACCAATGCAGTTTCAGATATAATAGAAGCCTTGTCACATTTATTATAAACAAAGGAAAACTGCTAGAACAC T 2434.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.385;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:2472,186,0 -chr12 11702300 . T C 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.206;DP=72;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,43:72:99:1438,0,1058 -chr12 11702593 . G A 7093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-1.292;DP=339;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,209:339:99:7122,0,4411 -chr12 11702742 . TGGTAAAGTTAAACCTGTATGATATTTATCACATATATAGAGCTTTTCCTATTAATGATATTGATCCAAACCAGCCTTCATTAACATTGCACTCTGAATATATACA T 1961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.720;DP=278;FS=3.042;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,275:276:99:1999,671,0 -chr12 11713930 . TGTGAGACACCACTTCCTTTTCACTTCACAGAGATGACGTGCTCTCCATATTGACTTCTAAAACTCTCCTTCCTCCTTTCAG T 7080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=3.181;DP=297;FS=6.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=23.84;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,253:273:99:7118,0,1074 -chr12 12274527 . C T 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=2.440;DP=74;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=21.66;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1631,0,941 -chr12 12290100 . ACAGGTTAGCCAGAAACATACAGTAGATATTAAAAAGATAATATGACATTGATGTTGTCAGAGCACTTCATTGCTCTTCTTTTGTTTCTTTC A 455.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=1.685;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:493,169,0 -chr12 14238279 . T C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.527;DP=312;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,55:312:99:779,0,9998 -chr12 14246563 . G GACTGTGGACCC 1464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.441;DP=400;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,78:361:99:1502,0,11883 -chr12 14295066 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.816;DP=70;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:314,0,2672 -chr12 14295179 . T C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.592;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:1030,0,1825 -chr12 14418344 . TCTATTGAAAAGAAATGTCATTTAAAAACTGCACTGTAGCATTATCATCAACGCATTGTTTGACGTTTCCTTAC T 5597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=2.412;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,128:130:99:5635,418,0 -chr12 15339482 . C T 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=-0.057;DP=25;FS=10.414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:40:980,40,0 -chr12 15339636 . T C 900.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=1.043;DP=42;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=21.45;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:15:929,0,15 -chr12 15339641 . A T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.423;DP=37;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:558,0,338 -chr12 15339793 . T C 993.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=-1.734;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:1022,69,0 -chr12 15341590 . G A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr12 15342283 . G A 1560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=1.024;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=33.93;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,39:43:32:1589,32,0 -chr12 15342612 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=1.386;DP=24;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,99 -chr12 15543862 . C A 427.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=32.89;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:455,0,7 -chr12 15543873 . C T 541.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.116;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:567,0,1 -chr12 15544010 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.62;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,142 -chr12 15544018 . G T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,142 -chr12 15734721 . G T 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:749,51,0 -chr12 16658628 . C T 277.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:306,24,0 -chr12 16670013 . AT A 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-1.486;DP=59;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:511,0,1084 -chr12 17401212 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-2.524;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:259,0,262 -chr12 17402270 . G GT 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.728;DP=30;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:459,0,266 -chr12 17402342 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:477,0,458 -chr12 17479274 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr12 17515838 . AAGGTACAAAATTTGTAGTTTGACAGGCAATCAGGTTTAATAATGTATCTGATAAGTCTGACACACTGGCCATCCTC A 2462.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=1.257;DP=60;FS=1.912;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=30.67;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,55:60:99:2500,212,0 -chr12 17518234 . A G 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.755;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:590,0,534 -chr12 17524594 . C A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.188;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:827,0,1333 -chr12 17543464 . C A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.754;DP=39;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:553,0,762 -chr12 17543524 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.909;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,758 -chr12 17550537 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=3.285;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:519,0,871 -chr12 17552333 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr12 17552482 . C T 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:478,33,0 -chr12 17552486 . C G 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:478,33,0 -chr12 17585286 . C T 1607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.800;DP=252;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,69:252:99:1636,0,7037 -chr12 17585818 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.638;DP=100;FS=4.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,33:100:99:875,0,2658 -chr12 17660198 . A G 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.231;DP=32;FS=10.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=31.81;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1046,0,131 -chr12 17684168 . C CA 637.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.215;DP=38;FS=8.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:675,0,316 -chr12 17684223 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=-1.632;DP=31;FS=6.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:231,0,819 -chr12 17684877 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.601;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=19.71;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,56:95:99:1901,0,1259 -chr12 17703580 . G T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 -chr12 17703581 . A T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:42:585,42,0 -chr12 17811793 . G T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=-1.948;DP=57;FS=16.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=6.45;ReadPosRankSum=-3.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:396,0,1542 -chr12 17828186 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:290,0,502 -chr12 17943533 . G A 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-4.944;DP=169;FS=23.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,52:169:99:1389,0,4458 -chr12 17943854 . T A 2648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.265;DP=153;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:2677,0,2773 -chr12 17986548 . A C 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-1.285;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=29.71;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1276,0,234 -chr12 18016652 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:333,0,414 -chr12 18018091 . T A 3222.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.169;DP=126;FS=22.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=25.58;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,87:126:99:3251,0,999 -chr12 18026140 . C T 1500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-1.301;DP=126;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,46:124:99:1529,0,2563 -chr12 18037041 . A T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-1.110;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:432,0,775 -chr12 18043144 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=-0.349;DP=36;FS=13.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:584,0,650 -chr12 18053731 . TA T 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.104;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:370,0,490 -chr12 18053785 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:293,0,581 -chr12 18053795 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:293,0,581 -chr12 18223742 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.158;DP=31;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:262,0,1815 -chr12 18229228 . C T 3608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.834;ClippingRankSum=0.280;DP=247;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=14.61;ReadPosRankSum=3.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,101:247:99:3637,0,4888 -chr12 18271607 . A G 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.750;DP=58;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=13.65;ReadPosRankSum=2.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:820,0,1130 -chr12 18278818 . A T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.415;DP=75;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:599,0,1812 -chr12 18390552 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=3.442;DP=29;FS=6.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:450,0,535 -chr12 18390607 . T G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=1.606;DP=37;FS=8.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:384,0,2046 -chr12 18466667 . CT C 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.099;DP=74;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:481,0,768 -chr12 18475462 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:277,0,107 -chr12 18509684 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.729;DP=75;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:549,0,2072 -chr12 18514102 . A G 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.981;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.978;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,34:56:99:1142,0,740 -chr12 18523624 . TA T 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=-1.659;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:655,0,1122 -chr12 18530189 . C T 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.528;DP=101;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:101:99:1278,0,4513 -chr12 18536118 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.435;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.059;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,29:88:99:759,0,2226 -chr12 18536145 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.360;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:678,0,1979 -chr12 18540430 . C T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.555;DP=102;FS=7.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:1450,0,2045 -chr12 18590150 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.867;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.023;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:276,0,383 -chr12 18638223 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.483;DP=83;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:324,0,2555 -chr12 18638801 . TCTTTAAAGAAACAAGATCATTTTCATACAAATCTTTAAACAACAAATAATATTAATCAAAAAGACTTTTTTCATAC T 2604.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=1.177;DP=84;FS=6.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=31.01;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,64:81:99:2642,0,5012 -chr12 18700856 . AAGGTCTATATAGTTCATTTCCCTGATTTCAAGCAAAAAAAGTAATGTTATAATTTACAAGATGATTTATTTC A 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=1.058;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=23.99;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:565,0,1468 -chr12 18706200 . C T 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-1.277;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,62:222:99:1432,0,5945 -chr12 18736709 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=1.302;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:564,0,2893 -chr12 18959833 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.243;DP=85;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,20:85:99:431,0,2459 -chr12 18991696 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.898;DP=107;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:358,0,3278 -chr12 19015031 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.500;DP=70;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:603,0,1636 -chr12 19075576 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.046;DP=128;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=3.69;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,27:127:99:501,0,3858 -chr12 19363407 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.950;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:245,0,880 -chr12 19365068 . GGGTAAGATGATTTCAGAGTGTTCCTAAAAATAAAAACTGAAGCAAAATGTTTTTTATAACTTTTTATATCAATTTATATATCCATAAA G 863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=2.237;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=29.33;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:99:901,0,432 -chr12 19403122 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.943;DP=89;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:99:319,0,6434 -chr12 19403204 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.315;DP=91;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:497,0,2635 -chr12 19403905 . T A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-2.343;DP=104;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,25:104:99:545,0,3188 -chr12 19404389 . A AG 526.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=-1.528;DP=117;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:564,0,2279 -chr12 19406914 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=-0.531;DP=79;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=4.45;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:380,0,2395 -chr12 19407722 . A C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.273;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:490,0,1383 -chr12 19433036 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-0.403;DP=92;FS=7.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:554,0,2432 -chr12 19557778 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.728;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:229,0,665 -chr12 19571105 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-1.285;DP=54;FS=16.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:476,0,1429 -chr12 19576411 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.204;DP=71;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:293,0,2169 -chr12 19600738 . CCCTTTAAAAACAAAATCAAACCGAATGCACTAGAATTTGAGGTCTTGTTTTGTTTTACTGAAAATGAGAGAAGTCTTCATTTTCTTA C 2856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=2.446;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,68:72:99:2894,239,0 -chr12 19806614 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=-1.027;DP=118;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:282,0,3631 -chr12 19806740 . AGTAAAAAAAAAAACAGTGACCACTTAATTCTTCTGGCAATTTTGGAACCAGATTATGTATTTTTTTTGAGTGAGTTATAAGAGAAATTGATTAATTTTTCAAATTGACTTTATTTCACCTCTAG A 4079.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=1.034;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,85:87:99:4117,384,0 -chr12 19808604 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.536;ClippingRankSum=2.017;DP=87;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:361,0,2512 -chr12 19809397 . C A 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.294;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:114:99:853,0,3086 -chr12 19811035 . AGTATGGCCTTTACTTGTGCTCATTCTTTCTTTCGCCTTTATTCTTTCACCTTCTGCTTCTGTTTTTATTTAATTATTGTGTCATTAATTATATTCTCTGTTTTTAG A 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=3.466;DP=42;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.241;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1297,0,4742 -chr12 19812250 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.353;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:413,0,3226 -chr12 19812560 . A G 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-1.131;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,26:111:99:595,0,3291 -chr12 19812621 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.519;DP=93;FS=3.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:342,0,6317 -chr12 19812633 . G T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.747;DP=100;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=3.14;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:342,0,6317 -chr12 19925471 . A C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.561;DP=44;FS=1.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:624,0,916 -chr12 19925513 . G A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=-1.816;DP=64;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:710,0,1499 -chr12 19928014 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:264,0,265 -chr12 19930164 . A G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.598;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:714,0,1212 -chr12 19938607 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.599;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:375,0,736 -chr12 19938822 . TAC T 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.431;DP=65;FS=7.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:766,0,834 -chr12 19953815 . TA T 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-1.789;DP=54;FS=5.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.153;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:523,0,741 -chr12 19954023 . T A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-2.232;DP=70;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:401,0,2081 -chr12 19954106 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=1.087;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:478,0,1770 -chr12 19954402 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.821;DP=42;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:283,0,1148 -chr12 19954775 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.231;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:254,0,687 -chr12 19955140 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.516;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:389,0,4014 -chr12 19955142 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=-0.726;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:389,0,4014 -chr12 19957294 . T C 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=2.575;DP=64;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:738,0,1269 -chr12 19957352 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.500;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:244,0,2010 -chr12 19957374 . G T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=1.666;DP=63;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:367,0,1775 -chr12 19969422 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.031;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:449,0,1688 -chr12 20083522 . CAGGTAGATACAATGCCTTTTTTTTTTCGTATATGCACTCCAAAATTTGGTTGTTCATGTTGCATTCTGCTCTTTGT C 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.638;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=12.99;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:766,0,3875 -chr12 20104526 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.306;DP=57;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:352,0,1715 -chr12 20121712 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-0.864;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:476,0,2943 -chr12 20160160 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.116;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:298,0,1613 -chr12 20204071 . T C 2360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.687;DP=382;FS=7.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,104:382:99:2389,0,14004 -chr12 20206720 . C A 1673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.265;DP=415;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,88:415:99:1702,0,12966 -chr12 20208379 . T C 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.668;DP=327;FS=8.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,68:327:99:1198,0,9959 -chr12 20212665 . G A 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.699;DP=326;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=2.19;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,57:326:99:742,0,10073 -chr12 20212755 . T G 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.626;ClippingRankSum=-2.592;DP=339;FS=16.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.698;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,69:339:99:1167,0,9576 -chr12 20212809 . A G 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.088;DP=349;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,65:349:99:1018,0,11056 -chr12 20241482 . A C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.718;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:256,0,1878 -chr12 20241534 . GA G 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.365;DP=52;FS=4.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:521,0,504 -chr12 20241635 . G A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.109;DP=50;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:679,0,1111 -chr12 20241661 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.426;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:390,0,1689 -chr12 20252579 . AT A 388.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=1.641;DP=119;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=3.27;ReadPosRankSum=-1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:426,0,6412 -chr12 20252583 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.475;DP=116;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,22:116:99:422,0,6473 -chr12 20253877 . A C 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-1.041;DP=145;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,37:145:99:791,0,4952 -chr12 20254610 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.663;DP=180;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,39:180:99:722,0,5486 -chr12 20254714 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.951;DP=53;FS=10.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:330,0,2050 -chr12 20254731 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-2.097;DP=30;FS=10.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:348,0,2050 -chr12 20254870 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:237,0,427 -chr12 20254871 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.172;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:329,0,571 -chr12 20255468 . T C 1831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DP=124;FS=5.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1860,0,2435 -chr12 20263551 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.975;DP=101;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:622,0,2906 -chr12 20263569 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-1.027;DP=158;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,28:158:99:356,0,5192 -chr12 20265705 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.597;DP=288;FS=0.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,72:288:99:1565,0,8248 -chr12 20267005 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.233;DP=136;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,33:135:99:706,0,6821 -chr12 20267266 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.566;DP=168;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:756,0,5018 -chr12 20286387 . G C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.949;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:613,0,1093 -chr12 20287193 . T A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=18.73;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,306 -chr12 20296215 . A G 1993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.640;DP=402;FS=20.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,97:395:99:2031,0,11494 -chr12 20299592 . C T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.603;ClippingRankSum=-0.483;DP=263;FS=5.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,55:263:99:1057,0,8087 -chr12 20397865 . C T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.212;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,30:148:99:538,0,4626 -chr12 20406228 . TGTATGCTCTTTAAACAATGCATTATTTAAAGCAGCGCAGTTCAAATCTGCATTCGTTTGCTCACGTTGTGGCTTTTTTGTATCTGTGTCAG T 498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.826;DP=92;FS=2.837;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,86:88:99:536,213,0 -chr12 20406463 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=-1.326;DP=94;FS=3.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=2.41;ReadPosRankSum=3.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:255,0,5081 -chr12 20429823 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-1.333;DP=97;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:99:399,0,3061 -chr12 20429847 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.257;DP=110;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,23:110:99:465,0,3414 -chr12 20434541 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.223;DP=61;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:546,0,1556 -chr12 20434996 . C CA 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.629;DP=56;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:349,0,863 -chr12 20437532 . CA C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.791;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:276,0,1952 -chr12 20438046 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.416;DP=109;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,22:108:99:390,0,2668 -chr12 20469478 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-0.102;DP=77;FS=5.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:402,0,2239 -chr12 20509132 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.329;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:373,0,609 -chr12 21028525 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.358;DP=70;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:304,0,2208 -chr12 21218880 . GAGGTTTGTATAAACCAGTCTGTTTTTTTCCGAAACGCCAAAACGTAGAATCAGAAGTTTATTCCTTTTGTTTGC G 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=4.410;DP=50;FS=18.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:740,0,11942 -chr12 21380598 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 -chr12 21380630 . G A 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -chr12 21381619 . T A 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:649,48,0 -chr12 21404885 . T A 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:500,36,0 -chr12 21431847 . A G 582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:611,45,0 -chr12 21688786 . C A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.080;DP=64;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:294,0,1940 -chr12 21691937 . T C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.748;DP=79;FS=7.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.39;ReadPosRankSum=-1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:533,0,2253 -chr12 21692053 . C G 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.447;DP=526;FS=4.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:434,91:525:99:1187,0,16479 -chr12 21702556 . GCTGAAACAGAGGAAAACAAACGGAACAGGTGAGTCTCAGACAAACAGGTATGTAAAATTGTGTTTACTGTACTGTAATGTTTGCTCAC G 15554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=-2.799;DP=410;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=29.47;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,368:397:99:15592,0,1469 -chr12 21702866 . CCCTGTAAAATACAACAAATGCATAATTTAAAATGATAATAGGCCTAATGTATTTTTACTATATAAATTATGATATTGGGAATACATA C 13762.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=1.886;DP=362;FS=5.338;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=32.84;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,340:348:99:13800,1001,0 -chr12 21705902 . C A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=1.081;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:616,0,1113 -chr12 21723305 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=1.675;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:304,0,2135 -chr12 21723375 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.571;DP=42;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.76;ReadPosRankSum=2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:312,0,1154 -chr12 21724300 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.690;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:599,0,1091 -chr12 21830860 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.192;DP=72;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:255,0,2116 -chr12 21916882 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-2.360;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=3.13;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:282,0,2484 -chr12 21917312 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.118;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,16:92:99:275,0,6055 -chr12 21990377 . C CA 2915.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=-0.669;DP=126;FS=4.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,89:111:99:2953,0,288 -chr12 22128670 . G A 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr12 22129126 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr12 22129278 . A G 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr12 22129390 . G A 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:470,33,0 -chr12 22129560 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr12 22129561 . G C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr12 22129723 . T A 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr12 22129843 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr12 22129899 . G T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr12 22129909 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr12 22130020 . A G 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:554,39,0 -chr12 22130053 . C T 662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:691,51,0 -chr12 22130236 . A C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr12 22133516 . C T 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 -chr12 22139076 . G GA 399.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:437,39,0 -chr12 22139132 . A G 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:607,45,0 -chr12 22140244 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr12 23036031 . GACCTACGGGGGAGAGACAGCTAATCAATACTAATCCATTCAGCAAATGCACCTTAATACCTCATGCCAGTGCTTTTTAACAACTCGGGAAAAGTATCAAAAGCGCACAGAGCACTGAAAGCAACAGTGACAGCAGAGATGAGCACTGCAGGCAAACACTGCCACCT G 1494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=3.801;DP=49;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=30.50;ReadPosRankSum=-2.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1532,0,4479 -chr12 23036443 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-1.079;DP=50;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:289,0,1460 -chr12 23452745 . C T 450.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=34.66;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:478,0,7 -chr12 23728539 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.939;DP=67;FS=2.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:473,0,1794 -chr12 23779595 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.516;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:277,0,2462 -chr12 23786885 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.376;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:311,0,2295 -chr12 23790761 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.444;DP=52;FS=10.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:302,0,1475 -chr12 23799675 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=-0.115;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:387,0,1582 -chr12 23800567 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.636;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:256,0,782 -chr12 23924150 . G A 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=2.479;DP=266;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,44:266:99:511,0,8775 -chr12 23924659 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.082;DP=164;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,25:164:99:266,0,5249 -chr12 23927397 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=-1.194;DP=161;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,29:161:99:593,0,10004 -chr12 23927400 . G T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.402;DP=150;FS=2.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,33:150:99:593,0,10004 -chr12 23959422 . C T 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.253;DP=183;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:1178,0,5241 -chr12 23986401 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.605;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,22:113:99:347,0,3312 -chr12 23988229 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.342;DP=105;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:893,0,2796 -chr12 24095000 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.050;DP=39;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:233,0,1110 -chr12 24117666 . G C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.227;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:236,0,1022 -chr12 24233602 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.626;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:473,0,2031 -chr12 24233778 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.964;DP=70;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:448,0,1972 -chr12 24256978 . C T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.065;DP=90;FS=4.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:529,0,2618 -chr12 24527307 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.426;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,451 -chr12 24676263 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:67:279,0,67 -chr12 24795431 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.147;DP=207;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=1.40;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,33:207:99:318,0,6856 -chr12 24825559 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.107;DP=235;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,37:235:99:433,0,7733 -chr12 24846844 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.458;DP=195;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,39:195:99:706,0,6423 -chr12 25334842 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.111;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=2.78;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:329,0,3430 -chr12 25342837 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-1.834;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,31:116:99:718,0,3015 -chr12 25345412 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.466;DP=106;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:772,0,2937 -chr12 25345466 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.969;DP=100;FS=13.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:350,0,3097 -chr12 25532970 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.230;DP=103;FS=6.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:331,0,3178 -chr12 25540568 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=2.025;DP=121;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,28:121:99:561,0,3567 -chr12 25551379 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-1.257;DP=130;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,22:130:99:290,0,4170 -chr12 25562755 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.211;DP=134;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:676,0,4040 -chr12 25753084 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr12 25753093 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr12 25855194 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.817;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:362,0,563 -chr12 25971905 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.193;DP=38;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:292,0,967 -chr12 26142900 . CT C 382.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.672;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:23:420,0,23 -chr12 26349101 . CA C 325.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=1.826;DP=19;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:7:382,0,7 -chr12 26411272 . G GT 296.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:403,40,0 -chr12 26424395 . CCCTAAGGCACAGATCAACAAATGAAAAAAAAGAAAGATGCAAGAAGATTAATATCGAAATGCTTAAACAGGAATCTAAACTAGGTTCAGTTA C 2378.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=-0.689;DP=57;FS=3.871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=30.37;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,51:57:99:2416,223,0 -chr12 26797214 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:237,0,248 -chr12 26905453 . C CT 704.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=-0.612;DP=131;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,40:109:99:742,0,1399 -chr12 26907518 . G GA 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;ClippingRankSum=-1.739;DP=154;FS=7.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,44:138:99:679,0,2212 -chr12 27394123 . A T 5675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=-0.795;DP=283;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,170:282:99:5704,0,3995 -chr12 27394195 . G A 8091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-2.758;DP=398;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,240:398:99:8120,0,5470 -chr12 27408906 . A C 5350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.160;DP=251;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,155:251:99:5379,0,3474 -chr12 27413823 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,232 -chr12 27468231 . AT A 730.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-0.501;DP=43;FS=13.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:768,0,203 -chr12 27479485 . ACTGTATGGGGCCGCATTATAGAGAGTGAATGCAAACACTTTGCAAATTGTGCTGTGTACAGCATCGCATGATTATTTCTCAC A 7689.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=1.712;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=29.86;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:7727,629,0 -chr12 27526984 . AATACCTACACAGAAAGAAAAGGACATTTAAATAAATGACAGACATAATCATGCTTTGAAAGGTGCCAACGTTGTCACAACCTAAAATACACTATAACGTAAAAC A 2849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=2.107;DP=93;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=30.64;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,79:92:99:2887,0,3009 -chr12 28118526 . AATCTGGAAAATGAGGTCATGAATCGACACTATAAATGGGGAAAGCCTCAGAATTGATCAGAATATTAAGATCTATCAGGATTCTC A 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.485;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=27.55;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:423,0,1719 -chr12 28466536 . G C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.735;DP=24;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,453 -chr12 28466567 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=1.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:309,0,263 -chr12 28467144 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.245;DP=28;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:646,0,143 -chr12 28600734 . TCCTACAGGAGAAAGAATATTGCTTGTAAATGAATGTAAAAAAGTCAACCAAATATCAAATGACACCTCATTA T 9563.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=1.699;DP=250;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=27.47;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,238:248:99:9601,704,0 -chr12 28791463 . ACAGGTATGCGTTATCAGATGCGAAGGACAACATTTACTTATTCTATGACTGAATAATGTCCAAAGTCTTGTTGTTGTC A 2072.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=1.143;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=33.98;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,54:61:99:2110,0,253 -chr12 28800160 . A G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.072;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:524,0,1907 -chr12 29141694 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=1.067;DP=40;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:313,0,497 -chr12 29514274 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:320,0,243 -chr12 29899195 . GA G 1733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.689;DP=115;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=15.08;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,69:100:99:1771,0,443 -chr12 29899237 . GCACACACA G 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=4.383;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:463,0,1869 -chr12 29917851 . C T 2824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.166;DP=162;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:2853,0,2839 -chr12 29920819 . A AC 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.637;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:664,0,1889 -chr12 30321460 . T G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr12 30340150 . TCTGTAAGAAAGCATAACGTTAGAATCACAATGCGACAAGTGCCAGCAGAAAATGACATTGAACACCAGTTTTTCCAATAC T 1526.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=1.529;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1564,140,0 -chr12 30375758 . AGTGAGCTATGATGGTCATTTATTGTAACATAATGGCTTTTACACATACTAACAAATAACATTTGTGTTTCACAG A 258.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.964;DP=85;FS=3.041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:296,116,0 -chr12 30392480 . GCTGTAGGAAGAAGTGGAATGTGAAGATTGGATTCGTGCAGTTCAATACAACAAAACAAGTAACAAAAACAAACAATATTAAC G 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=1.710;DP=184;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,164:165:99:621,0,155 -chr12 30418780 . AT A 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.207;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:736,0,737 -chr12 30460742 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-1.938;DP=163;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,40:163:99:763,0,4213 -chr12 30493183 . G C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=1.359;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:545,0,713 -chr12 30493880 . T C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.124;DP=34;FS=8.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:454,0,715 -chr12 30493904 . GC G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.865;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:267,0,181 -chr12 30493913 . A T 399.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:0:425,0,0 -chr12 30771850 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.536;DP=41;FS=20.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:486,0,1885 -chr12 30772008 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.528;DP=33;FS=8.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:681,0,499 -chr12 30772082 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=-0.148;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:270,0,875 -chr12 30776212 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-1.112;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:408,0,1236 -chr12 30792327 . CCAGGTACGTCAGAGACCCTTTATTTAACAGACTTATCATTGAAGAGAACTGTATATTGTCTGAACAGTGAATCTTG C 242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.386;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,68:71:99:280,120,0 -chr12 30792490 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-1.239;DP=65;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:506,0,3739 -chr12 30792493 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-1.067;DP=65;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:511,0,3739 -chr12 31392153 . A AAAAACGTGCTGCATTTTCTCACAACGCAAACAATTTACG 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.227;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:420,0,274 -chr12 31415865 . T TA 594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.080;DP=36;FS=13.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:632,0,1339 -chr12 31522920 . C A 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.207;DP=72;FS=3.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.458;QD=26.22;ReadPosRankSum=-2.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,52:72:99:1916,0,517 -chr12 31552691 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.555;DP=55;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=25.90;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:1453,0,476 -chr12 31795251 . T TA 870.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-1.727;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:908,0,392 -chr12 31868030 . G A 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=-1.039;DP=48;FS=9.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1227,0,422 -chr12 31874828 . C T 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=-2.016;DP=53;FS=1.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=29.13;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,40:53:99:1572,0,301 -chr12 31969261 . T TA 289.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.736;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:18:388,18,0 -chr12 31972202 . A T 734.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:763,54,0 -chr12 31990315 . A G 2464.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2493,181,0 -chr12 31994268 . C G 1762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1791,129,0 -chr12 31994672 . C A 1273.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1302,96,0 -chr12 31994889 . C A 1447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.359;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=28.78;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:79:1476,79,0 -chr12 31995006 . T C 2059.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2088,153,0 -chr12 32034326 . C G 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=-1.853;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:753,0,435 -chr12 32034345 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=-1.137;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:707,0,112 -chr12 32034990 . T C 2185.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2214,162,0 -chr12 32035005 . G A 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2255,160,0 -chr12 32035258 . T A 1069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1098,78,0 -chr12 32035438 . G GA 769.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:807,72,0 -chr12 32035957 . T A 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:24:321,24,0 -chr12 32035967 . A G 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:321,24,0 -chr12 32036194 . A G 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.135;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:94:1395,0,94 -chr12 32036218 . G A 1758.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1787,132,0 -chr12 32036338 . A C 1587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-1.644;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=34.25;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1616,114,0 -chr12 32036558 . A C 1346.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1375,96,0 -chr12 32036612 . G T 847.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:876,60,0 -chr12 32036654 . T C 842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:871,63,0 -chr12 32036671 . A T 875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:904,63,0 -chr12 32063428 . C T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1868,126,0 -chr12 32063431 . C T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1868,126,0 -chr12 32214955 . TCTGTTTCATCAAGAACAAAAAGAGTGAAAATATTAGTGTCTGTTTGTGTGTGTATGTTTGCACTATGTTTCTTTTTTCTATACTTTTTTTTTAC T 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.714;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=20.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:99:704,0,447 -chr12 32256969 . T TTC 3562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-1.538;DP=124;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=28.73;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,94:120:99:3600,0,501 -chr12 32278912 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.099;DP=141;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,29:141:99:513,0,4219 -chr12 32281916 . A G 1462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:99:1491,104,0 -chr12 32281921 . A G 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.190;DP=37;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:618,0,690 -chr12 32282049 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-0.252;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:313,0,1026 -chr12 32345958 . TA T 1455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=-0.883;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:1493,0,1016 -chr12 32348696 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.580;DP=168;FS=6.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,32:167:99:438,0,5990 -chr12 32471031 . ACG A 683.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:721,48,0 -chr12 32471128 . T A 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 -chr12 32471143 . C T 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 -chr12 32471263 . A G 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:537,39,0 -chr12 32471382 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:313,0,407 -chr12 32480208 . C T 1925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1954,141,0 -chr12 32483407 . C T 2994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3023,211,0 -chr12 32494093 . TGA T 910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.388;DP=47;FS=6.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:948,0,779 -chr12 32494191 . T C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=1.156;DP=33;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:939,0,596 -chr12 32494195 . A G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.842;DP=33;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:939,0,647 -chr12 32494431 . T A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=2.267;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:494,0,158 -chr12 32494462 . C A 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=3.000;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=28.04;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:849,0,221 -chr12 32494470 . T C 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=2.124;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:849,0,221 -chr12 32494559 . C T 2630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.259;DP=84;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.120;QD=31.32;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,66:84:99:2659,0,354 -chr12 32494612 . A T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-1.857;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:632,0,980 -chr12 32494861 . G GT 803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:841,75,0 -chr12 32494924 . A C 604.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:633,45,0 -chr12 32495195 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:332,0,917 -chr12 32495216 . T C 1916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1945,141,0 -chr12 32495251 . T A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;ClippingRankSum=-1.391;DP=44;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=14.77;ReadPosRankSum=5.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:678,0,822 -chr12 32495632 . G C 2015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.040;DP=76;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,52:75:99:2044,0,651 -chr12 32495662 . T C 3388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3417,244,0 -chr12 32495828 . A T 3364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3393,241,0 -chr12 32495913 . A G 2079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=1.113;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=30.14;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,56:69:99:2108,0,236 -chr12 32525347 . C A 4046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.007;ClippingRankSum=-2.832;DP=131;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=30.89;ReadPosRankSum=1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,103:131:99:4075,0,538 -chr12 32525521 . C T 6906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.892;ClippingRankSum=0.417;DP=266;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,199:266:99:6935,0,1452 -chr12 32525786 . G A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.671;DP=247;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,57:247:99:1137,0,7051 -chr12 32525807 . G A 8340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:8369,608,0 -chr12 32564804 . C T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr12 32565558 . A C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr12 32570113 . A C 2310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=1.537;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,60:87:99:2339,0,1643 -chr12 32570114 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-1.522;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:591,0,4995 -chr12 32571519 . T A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr12 32571972 . A G 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=1.233;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=29.96;ReadPosRankSum=-1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,39:43:31:1556,0,31 -chr12 32572179 . A T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr12 32572326 . A G 1186.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:90:1215,90,0 -chr12 32572451 . A G 2024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-2.011;DP=58;FS=6.002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=34.91;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,51:56:46:2053,46,0 -chr12 32572657 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:266,0,368 -chr12 32572767 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=2.424;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=15.48;ReadPosRankSum=-2.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:245,0,217 -chr12 32668580 . GA G 916.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.595;DP=63;FS=4.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:954,0,272 -chr12 32668896 . G A 6296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.865;DP=227;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,175:227:99:6325,0,1058 -chr12 32673103 . C CA 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.200;DP=26;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:345,0,204 -chr12 32673553 . G A 3894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-2.542;DP=135;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.323;QD=28.85;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,106:134:99:3923,0,480 -chr12 32847499 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.373;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:361,0,976 -chr12 32848471 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.826;DP=47;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:340,0,1181 -chr12 33217713 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.566;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:233,0,961 -chr12 33279829 . T C 793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:822,60,0 -chr12 33282983 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.610;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:506,0,438 -chr12 33285449 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:265,0,58 -chr12 33316550 . CGGTAAGTGTTGTTCTATGTCAAAAGCTGAGTTTGTCTGATGTCCATACTTGAACTCATTATTTTATGTGTCTGATGTGCTCTCA C 871.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.912;DP=268;FS=2.403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,236:239:99:909,355,0 -chr12 33388275 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.230;DP=71;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:586,0,1777 -chr12 33389413 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=1.611;DP=65;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:312,0,1962 -chr12 33395720 . T A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:284,0,58 -chr12 33409169 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.639;DP=155;FS=3.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,32:154:99:617,0,4741 -chr12 33451495 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.203;DP=43;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:277,0,1069 -chr12 33453930 . C CT 1085.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,38:44:87:1101,87,0 -chr12 33873711 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.720;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=14.89;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:460,0,504 -chr12 34076888 . T C 682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:711,54,0 -chr12 34076968 . T A 663.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=-1.018;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:16:692,16,0 -chr12 34077774 . T C 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr12 34489843 . C T 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=-0.188;DP=49;FS=2.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1278,0,337 -chr12 34489858 . A T 1961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1990,147,0 -chr12 34517718 . A G 2408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2437,178,0 -chr12 34787494 . T C 725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:754,54,0 -chr12 34787873 . G A 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 -chr12 34788072 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr12 34820720 . TGGTATGAGTCAAAATAAAGAATTATTTAGCCTTCAGTACACTGGGTTTGGTTTTATAATCCTCTTTTTGTTTTTTATATAACCTTGCATACATTA T 13422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=1.017;DP=303;FS=2.143;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=30.90;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,300:303:99:13460,1043,0 -chr12 34831111 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.652;DP=72;FS=9.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:454,0,2004 -chr12 34845953 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.872;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:424,0,561 -chr12 34846065 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:258,0,371 -chr12 34846081 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,359 -chr12 34857233 . C T 454.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:483,33,0 -chr12 34863692 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr12 34867035 . G A 1554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1583,114,0 -chr12 34871452 . A G 1596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1625,114,0 -chr12 34873902 . G A 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:477,36,0 -chr12 34873910 . A T 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:477,36,0 -chr12 34873933 . G A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:434,33,0 -chr12 34876639 . C T 800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:68:829,68,0 -chr12 34881357 . C T 900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:929,66,0 -chr12 34923842 . A G 782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:811,57,0 -chr12 34943595 . A T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr12 34943783 . A C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr12 34944237 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr12 34944277 . C A 566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:595,42,0 -chr12 34944410 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 -chr12 34944939 . C G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr12 34944954 . G A 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:502,39,0 -chr12 34944985 . T C 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 -chr12 34947947 . T TTC 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr12 34948642 . T A 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 -chr12 34951367 . A T 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:492,39,0 -chr12 34951441 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 -chr12 34951442 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 -chr12 34967056 . A T 1681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1710,117,0 -chr12 34968554 . T C 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:980,72,0 -chr12 34968586 . A C 1932.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1961,138,0 -chr12 34979396 . T C 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 -chr12 34979435 . T G 1879.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1908,141,0 -chr12 35033729 . T TC 465.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53:503,53,0 -chr12 35034482 . C G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:285,0,171 -chr12 35035193 . CT C 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=1.276;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:49:505,0,49 -chr12 35036299 . G A 583.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=34.30;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:12:611,12,0 -chr12 35049290 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.238;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:370,0,3411 -chr12 35099272 . C A 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=-1.094;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=27.05;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:921,0,104 -chr12 35100317 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:267,0,54 -chr12 35256970 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.618;DP=105;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=6.15;ReadPosRankSum=2.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:674,0,2743 -chr12 35464308 . T TA 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.645;DP=50;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:455,0,863 -chr12 35480710 . GTGTGTTGTAAGTGATTTTGCTT G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.235;ClippingRankSum=-0.754;DP=125;FS=11.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=1.87;ReadPosRankSum=-4.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:271,0,4396 -chr12 35484797 . A AT 1536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.153;DP=114;FS=14.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1574,0,1000 -chr12 35688723 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.157;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=29.40;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:675,0,109 -chr12 35688784 . G A 1104.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=2.105;DP=31;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:1:1130,0,1 -chr12 35754597 . T C 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=-3.020;DP=59;FS=3.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:971,0,1084 -chr12 35763331 . CAAGGTAAAAGCATAAATTTAGGCTTCATTTAAGAACAAAATGGTTTTATTCCATTATATTATGCTTTTTATCAATATGAATCTCTTTA C 5402.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.686;DP=138;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=33.47;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,135:138:99:5440,480,0 -chr12 35775739 . A G 1858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=2.024;DP=102;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=18.22;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1887,0,1531 -chr12 35779028 . C G 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-2.495;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1537,0,928 -chr12 35938423 . T TA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:250,0,213 -chr12 35941229 . A G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.563;DP=79;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:878,0,1780 -chr12 35944279 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-1.903;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:372,0,238 -chr12 35997152 . TACTAACCTACTCAAAAAGAGACATTTGTCATATTGCAGAATTACTGTAGGCGTCGACTGCATTTGAGTTAGGAGTTTTCTGTGGGTGTGAG T 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=31.67;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:544,0,241 -chr12 36219778 . C G 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:472,0,278 -chr12 36271589 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:282,0,54 -chr12 36272551 . CCACCTGAATGGAGATTGCCATTAAAATAAAATTCTCAACAACATAAAATCTTTAATAGCCACTATTATTAGCATTTAGGTCATTGTGTCTTGCT C 6922.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=4.462;DP=180;FS=1.079;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=29.64;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,165:179:99:6960,228,0 -chr12 36299359 . G C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,284 -chr12 36300715 . C CA 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-1.156;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:71:525,0,71 -chr12 36302816 . TA T 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr12 36303254 . A T 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr12 36305058 . T G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.822;DP=69;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:327,0,2237 -chr12 36306051 . TA T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=10;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=23.57;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:273,0,155 -chr12 36306421 . A G 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-1.360;DP=82;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=26.48;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,57:82:99:2200,0,659 -chr12 36440143 . CAGGTGAATAAATTGGTTTATTTTATTGCTACTTGTTTGCTTCTGAATAGTTGTTGTTTAGTCTTCTCTAAATTTTATTTCAATTTCTA C 1759.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=2.840;DP=47;FS=5.381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=24.26;ReadPosRankSum=-2.840 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:99:1797,148,0 -chr12 36492674 . TCTGAAATCATGACAGTCAAGGTCCACTGATGGCAAAGCATTCATTATTCTGCCGTACTCAGTTCTCTTCCGCAATGCCACAAAAAGGATAC T 848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=1.047;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:886,0,162 -chr12 36498372 . A G 202.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:11:230,0,11 -chr12 36502011 . TA T 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.216;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:416,0,131 -chr12 36749157 . G GCCCT 206.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:10:243,10,0 -chr12 37048810 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:281,0,501 -chr12 37186324 . TA T 216.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.741;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:251,0,1 -chr12 37186595 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:481,0,147 -chr12 37400265 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,417 -chr12 37501827 . T G 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=-0.420;DP=102;FS=1.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,39:102:99:1015,0,6496 -chr12 37507934 . T A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.326;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:553,0,3383 -chr12 37628362 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:360,0,554 -chr12 37665082 . A T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.626;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,359 -chr12 37670464 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:233,0,58 -chr12 37679181 . GT G 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 -chr12 37689530 . C T 2523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.734;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:2552,0,2190 -chr12 37693111 . C A 1884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=1.240;DP=102;FS=4.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1913,0,1613 -chr12 37693240 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=3.281;DP=16;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:229,0,369 -chr12 37696188 . G C 2320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.843;DP=136;FS=2.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:2349,0,2394 -chr12 37784432 . T C 762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:791,57,0 -chr12 37786990 . A G 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.578;DP=48;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:856,0,837 -chr12 37791936 . T C 670.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:699,48,0 -chr12 37813535 . G T 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.792;DP=58;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=26.17;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,42:58:99:1546,0,412 -chr12 37813550 . A G 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.829;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=26.39;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1242,0,333 -chr12 37820459 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.297;DP=22;FS=13.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,394 -chr12 37821456 . T A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=3.911;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:621,0,1816 -chr12 37821467 . G T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=3.677;DP=36;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:621,0,1858 -chr12 37822069 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:43:316,0,43 -chr12 37822072 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.78;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:43:316,0,43 -chr12 37822297 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.964;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:254,0,416 -chr12 37822311 . A T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 -chr12 37823297 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=3.181;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:309,0,492 -chr12 37894660 . C T 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr12 37925479 . A G 2340.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-2.368;DP=67;FS=5.875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=34.94;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,60:67:14:2369,14,0 -chr12 37925549 . A G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.763;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=17.79;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:633,0,462 -chr12 37925648 . G T 2064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:2093,141,0 -chr12 37925657 . T C 2064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2093,141,0 -chr12 37925858 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=2.773;DP=72;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:306,0,2255 -chr12 37925887 . A G 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=2.961;DP=57;FS=5.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:500,0,1460 -chr12 37925923 . A G 1139.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.362;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=32.98;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1168,81,0 -chr12 37925984 . T A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=-3.464;DP=17;FS=12.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=18.93;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:350,0,287 -chr12 37925996 . T A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr12 37926619 . G C 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:438,33,0 -chr12 37926991 . G A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr12 37927218 . A T 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:354,24,0 -chr12 37928186 . C T 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 -chr12 37928205 . G A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr12 37928559 . G T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.633;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:526,0,505 -chr12 37928612 . C A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.597;DP=33;FS=10.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:551,0,649 -chr12 37928665 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr12 37928668 . A T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:236,18,0 -chr12 37928757 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.643;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:386,0,377 -chr12 37929091 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:391,0,97 -chr12 37929358 . A C 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:490,36,0 -chr12 37929481 . G C 1412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1441,102,0 -chr12 37929920 . C G 919.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:948,66,0 -chr12 37929994 . T C 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr12 37934331 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.230;DP=27;FS=8.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:332,0,580 -chr12 37936877 . C G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.093;DP=62;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:290,0,1828 -chr12 37936893 . C A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.883;DP=65;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:844,0,1346 -chr12 37936993 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-2.082;DP=42;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:229,0,1246 -chr12 37952024 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-1.473;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:758,0,707 -chr12 37961577 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.889;DP=61;FS=6.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:244,0,1882 -chr12 37961886 . A G 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.298;DP=62;FS=8.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=27.66;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,46:62:99:1743,0,382 -chr12 37961994 . C T 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.772;DP=43;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=31.13;ReadPosRankSum=1.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1367,0,299 -chr12 37962089 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=-0.269;DP=45;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:313,0,1230 -chr12 37962313 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-1.067;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:656,0,550 -chr12 38070546 . C A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.886;DP=58;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:778,0,1178 -chr12 38071046 . T C 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-1.222;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=30.79;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:644,0,114 -chr12 38208853 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr12 38497392 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.247;DP=80;FS=2.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.616;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:246,0,2390 -chr12 38497539 . G T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.953;DP=87;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:415,0,2520 -chr12 38497715 . GA G 825.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-1.855;DP=58;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:863,0,244 -chr12 38542019 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.391;DP=30;FS=13.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.06;ReadPosRankSum=-3.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:420,0,435 -chr12 38542491 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.678;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:410,0,1627 -chr12 38543040 . A C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.796;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:308,0,1816 -chr12 38813795 . T C 4090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.961;DP=193;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,118:193:99:4119,0,2930 -chr12 38813801 . T C 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.948;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=9.42;ReadPosRankSum=2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,65:194:99:1856,0,5750 -chr12 38813890 . G A 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-1.113;DP=238;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,60:238:99:1336,0,7046 -chr12 38815197 . A AT 3369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=-1.065;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,90:102:99:3407,165,0 -chr12 38815382 . G GA 1292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.834;DP=84;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,55:69:99:1372,0,168 -chr12 38815511 . T C 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-0.090;DP=252;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.862;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,60:252:99:1518,0,7429 -chr12 38815869 . T A 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-1.363;DP=323;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,73:323:99:1492,0,9374 -chr12 38928097 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr12 38946534 . T C 1370.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=2.480;DP=25;FS=5.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=33.43;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:16:1399,0,16 -chr12 38946751 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.070;DP=28;FS=1.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:425,0,804 -chr12 38947123 . G C 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=-1.099;DP=101;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,32:101:99:795,0,5644 -chr12 40090268 . T C 2481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.533;DP=96;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,65:86:99:2510,0,800 -chr12 40090513 . T A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr12 40091433 . T G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.072;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:80:476,0,80 -chr12 40099818 . A G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.872;DP=38;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:573,0,803 -chr12 40099835 . G T 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.538;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1162,0,1390 -chr12 40100299 . T G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:301,0,240 -chr12 40106360 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-1.415;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,422 -chr12 40194549 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=74;FS=5.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:354,0,2122 -chr12 40231287 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=14.35;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:344,0,416 -chr12 40231697 . A AT 486.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:545,54,0 -chr12 40232143 . T A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=2.885;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:784,0,454 -chr12 40232801 . AT A,ATT 364.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-1.175;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,19,10:36:99:525,117,301,359,0,611 -chr12 40233566 . AT A 621.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.337;DP=26;FS=2.944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=23.91;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:47:659,47,0 -chr12 40234531 . G A 1795.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1824,132,0 -chr12 40234596 . T C 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:69:1000,69,0 -chr12 40234640 . T G 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr12 40341737 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-2.426;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,207 -chr12 40343491 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-1.248;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:339,0,386 -chr12 40394645 . C T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-0.977;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:603,0,784 -chr12 40402202 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.109;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=16.85;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:517,0,522 -chr12 40403818 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-1.799;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=19.67;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:343,0,285 -chr12 40513112 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:379,0,412 -chr12 40595384 . TGGTTGGATTCATTTTACTACAACATTAAAAAATATATTCATTCTTGATTTTATTTTGGTTCCTGGTCATCGCTGACATTCTCTTGGATGCGTTCTCTCTCA T 1598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.850;DP=34;FS=6.978;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=33.40;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:99:1636,168,0 -chr12 43009036 . G A 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-0.662;DP=45;FS=8.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1122,0,413 -chr12 43009084 . G T 3315.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3344,257,0 -chr12 43165682 . G A 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=1.251;DP=79;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1326,0,1349 -chr12 43166282 . CT C,CTT 1541.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.766;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=33.50;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,29,14:44:99:1541,373,898,1285,0,2162 -chr12 43166754 . AT A 327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:365,36,0 -chr12 43167386 . A G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.584;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:559,0,315 -chr12 43168194 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-2.800;DP=14;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=23.63;ReadPosRankSum=2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:359,0,162 -chr12 43230223 . ATG A 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.847;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:372,0,263 -chr12 43230712 . C CT 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=1.046;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:293,0,872 -chr12 43230777 . T A 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=1.117;DP=52;FS=3.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:1334,0,2305 -chr12 43230784 . T G 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.399;DP=60;FS=5.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1362,0,2304 -chr12 43230902 . GA G 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:673,67,0 -chr12 43239753 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.521;DP=171;FS=2.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,49:171:99:1249,0,4611 -chr12 43250256 . G A 2154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.468;DP=171;FS=2.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=12.60;ReadPosRankSum=3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,64:171:99:2183,0,3707 -chr12 43261077 . A G 1985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.139;DP=120;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:2014,0,2125 -chr12 43267836 . G A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=-1.676;DP=89;FS=3.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,34:89:99:1070,0,1903 -chr12 43280318 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=1.170;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:305,0,2010 -chr12 43281233 . CA C 758.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.231;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=22.32;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:34:796,34,0 -chr12 43282903 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:257,0,724 -chr12 43291300 . G C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.736;DP=59;FS=2.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:666,0,1356 -chr12 43291538 . G A 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.004;DP=88;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1241,0,1764 -chr12 43305689 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=1.884;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:342,0,1616 -chr12 43310534 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.531;DP=84;FS=2.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:537,0,2519 -chr12 43312946 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.059;DP=21;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:301,0,234 -chr12 44140688 . C CT,CTT 689.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=1.723;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,31,10:45:99:1386,223,112,704,0,689 -chr12 44140951 . A T 1577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-2.408;DP=161;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,69:160:99:1606,0,6972 -chr12 44141559 . CT C 803.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=1.447;DP=274;FS=2.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,63:251:99:841,0,4997 -chr12 44313164 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.388;QD=23.52;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:381,0,310 -chr12 44340764 . AACAGGTAAAGACAGATACATGCAGACTCGCTTCTGTACGGCTGGACGCGTTTAAACATTCTCTCTTCTG A 12770.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=2.995;DP=313;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=29.06;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,307:313:99:12808,1006,0 -chr12 45094840 . G A 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:626,48,0 -chr12 45629355 . T C 1803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.283;DP=57;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,47:57:99:1832,0,179 -chr12 45990748 . C CT 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-2.652;DP=164;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,41:154:99:572,0,3077 -chr12 46103875 . TCTGTTGACAGATGTTAAAAAAAAATATTAGTAGATTTACAATATTTGCTAAATTATAAACACATATCGCATGCAGTAC T 964.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=1.967;DP=27;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=28.06;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:99:1002,0,751 -chr12 46994872 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=1.877;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:323,0,1026 -chr12 46995967 . T G 234.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:53:264,53,0 -chr12 46996651 . G A 2554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-3.028;DP=114;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=22.41;ReadPosRankSum=2.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,75:114:99:2583,0,929 -chr12 47270056 . T C 393.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=32.77;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:421,0,9 -chr12 47284038 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr12 47284050 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr12 47288228 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr12 47429173 . A C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:232,0,67 -chr12 47704471 . C G 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr12 47704528 . A G 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=-0.260;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,34:50:99:1323,0,437 -chr12 47704629 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.396;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:85:385,0,85 -chr12 47717249 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.489;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=15.49;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:431,0,412 -chr12 47770984 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:99:318,0,133 -chr12 47773247 . G T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.081;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=14.77;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:560,0,1513 -chr12 47773250 . T A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=1.067;DP=34;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:560,0,1523 -chr12 47796552 . T A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.423;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,39:136:99:979,0,3703 -chr12 47798807 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.065;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=3.46;ReadPosRankSum=2.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:444,0,3701 -chr12 47798934 . C T 1613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.773;DP=131;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,49:131:99:1642,0,2826 -chr12 47798969 . G A 1823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.043;DP=124;FS=0.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1852,0,2178 -chr12 47808194 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.110;DP=147;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,36:147:99:783,0,4280 -chr12 47902269 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.539;DP=158;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,33:158:99:605,0,4701 -chr12 47902298 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=1.433;DP=149;FS=6.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,33:148:99:607,0,6374 -chr12 47905483 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.540;DP=131;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,30:131:99:643,0,3804 -chr12 47905579 . A G 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-0.980;DP=172;FS=5.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,50:172:99:1149,0,4202 -chr12 47910404 . T C 1677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-0.638;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,71:227:99:1706,0,5674 -chr12 47912678 . GCAGGTCAGATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCGATCTATCTATTATGTTTGTTTCTCCTGTAAATCTGTGCTGTTGCTGTCCCT G 6444.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=1.121;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=33.92;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,185:190:99:6482,617,0 -chr12 47913691 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=-1.076;DP=35;FS=22.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:519,0,819 -chr12 47913702 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.156;DP=26;FS=18.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:372,0,693 -chr12 47914638 . T A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=-2.619;DP=32;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:413,0,1498 -chr12 47914644 . T A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=-2.698;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:413,0,1542 -chr12 47914733 . T TA 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.602;DP=28;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=22.10;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:56:656,0,56 -chr12 47915266 . A C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.209;DP=76;FS=7.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:406,0,5460 -chr12 47915316 . AC A 3535.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.869;DP=88;FS=3.624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=35.23;ReadPosRankSum=-2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,79:86:99:3573,216,0 -chr12 47915438 . C A 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.350;DP=86;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1525,0,1653 -chr12 47915859 . TA T 229.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=25.50;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:7:266,7,0 -chr12 47916158 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.149;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:255,0,2245 -chr12 47944758 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=-0.885;DP=28;FS=8.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:267,0,721 -chr12 47945280 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:335,0,970 -chr12 47968447 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.348;DP=38;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:458,0,793 -chr12 47968570 . C T 1520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1549,114,0 -chr12 47968831 . G A 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 -chr12 48038710 . G C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.202;DP=164;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,31:164:99:440,0,10342 -chr12 48038950 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=2.277;DP=159;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,28:159:99:368,0,9817 -chr12 48052313 . A C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.941;DP=69;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.58;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:482,0,1917 -chr12 48058193 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:284,0,162 -chr12 48074222 . C T 1796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-1.436;DP=95;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=18.91;ReadPosRankSum=1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1825,0,1940 -chr12 48076795 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.243;DP=67;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:233,0,1772 -chr12 48077267 . C T 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-1.051;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,47:71:99:1629,0,1378 -chr12 48077276 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.793;DP=69;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:273,0,4163 -chr12 48077321 . A G 3005.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3034,228,0 -chr12 48079453 . A G 2786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.886;DP=96;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=29.03;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,75:96:99:2815,0,482 -chr12 48079483 . C T 2467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.573;DP=100;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,68:100:99:2496,0,832 -chr12 48088212 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=1.812;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=16.85;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:382,0,317 -chr12 48155210 . G A 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-1.695;DP=46;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:721,0,872 -chr12 48161494 . G A 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:53:644,53,0 -chr12 48161861 . T C 2114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.419;DP=106;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,67:106:99:2143,0,1236 -chr12 48183416 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-1.309;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:312,0,3977 -chr12 48206345 . G A 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.159;DP=45;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=25.19;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:1162,0,375 -chr12 48210767 . C T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.854;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:948,0,584 -chr12 48486592 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,186 -chr12 48614108 . C A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:320,0,921 -chr12 48614293 . T G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=1.383;DP=37;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=16.29;ReadPosRankSum=-2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:631,0,1592 -chr12 48614510 . C G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.005;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:356,0,2282 -chr12 48614576 . A G 2308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2337,169,0 -chr12 48614692 . G A 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=-1.694;DP=85;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,28:84:99:956,0,1848 -chr12 48674368 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.132;DP=51;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:444,0,1365 -chr12 48674597 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.212;DP=57;FS=4.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.938;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:488,0,1394 -chr12 48745116 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=23.52;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:84:287,0,84 -chr12 48745487 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-2.548;DP=53;FS=8.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:445,0,1378 -chr12 48745577 . G A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.296;DP=70;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1031,0,1321 -chr12 48745697 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.539;DP=77;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:649,0,3965 -chr12 48745706 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-1.343;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:652,0,3965 -chr12 48773518 . G T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr12 48853950 . G C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=-0.405;DP=52;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:671,0,993 -chr12 48854015 . G A 2515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-3.184;DP=179;FS=8.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,72:179:99:2544,0,3567 -chr12 48854109 . C G 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=7.652;DP=180;FS=25.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=6.29;ReadPosRankSum=-6.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,26:180:99:1161,0,12618 -chr12 48854115 . C T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=7.143;DP=186;FS=4.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.00;ReadPosRankSum=-6.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,23:185:99:1145,0,12618 -chr12 48857050 . G A 13774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=340;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,340:340:99:13803,1021,0 -chr12 48857167 . C T 14274.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=345;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,345:345:99:14303,1038,0 -chr12 48858475 . T C 4977.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:5006,352,0 -chr12 48858485 . T A 4977.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:5006,352,0 -chr12 48858571 . T C 12870.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=269;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,269:269:99:12899,890,0 -chr12 48858577 . G A 7116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-4.103;DP=303;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=23.49;ReadPosRankSum=4.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,198:302:99:7145,0,7409 -chr12 48858580 . G A 3641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-0.566;DP=312;FS=3.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,105:312:99:3670,0,14063 -chr12 48859770 . C T 3340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.801;DP=423;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,136:423:99:3369,0,10600 -chr12 48860306 . G A 11918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.953;DP=353;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=33.76;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,337:338:99:11947,1014,0 -chr12 48882182 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=-1.060;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:673,0,1296 -chr12 48935792 . T C 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 -chr12 48991200 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:231,0,67 -chr12 49060253 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=-0.473;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:353,0,526 -chr12 49060701 . C G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.724;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:491,0,472 -chr12 49084811 . G T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-0.168;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:337,0,640 -chr12 49095016 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.794;DP=26;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:470,0,396 -chr12 49161837 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.220;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:353,0,498 -chr12 49222638 . C A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.293;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:435,0,597 -chr12 49247636 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=26.92;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:432,0,111 -chr12 49339304 . TA T 1067.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1105,109,0 -chr12 49379118 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=-1.389;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=25.57;ReadPosRankSum=4.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1051,0,376 -chr12 49442854 . T A 2100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-2.920;DP=285;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,86:269:99:2129,0,6640 -chr12 49571763 . C T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr12 49635290 . GT G 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=-1.462;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=6.90;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:458,0,1049 -chr12 49709268 . G T 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:42:621,42,0 -chr12 49709367 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=1.663;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=22.43;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:275,0,136 -chr12 49709429 . A T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=-1.273;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:389,0,296 -chr12 49710397 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=3.220;DP=24;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:312,0,536 -chr12 49710654 . GA G 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.468;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:600,0,266 -chr12 49711930 . A G 616.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:7:644,7,0 -chr12 49712904 . C CA 610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-1.178;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:648,0,220 -chr12 49718115 . G C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:306,0,143 -chr12 49734109 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=-0.113;DP=46;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:281,0,1226 -chr12 49768635 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr12 49841960 . T C 266.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:294,0,12 -chr12 49845552 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr12 49898774 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=-0.579;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,391 -chr12 49915444 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:321,0,142 -chr12 49939128 . C T 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr12 49947781 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=1.045;DP=48;FS=4.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:763,0,815 -chr12 50216519 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=23.31;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:238,0,66 -chr12 50217719 . C T 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr12 50230159 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:451,0,434 -chr12 50243645 . C T 4658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.718;DP=250;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,143:250:99:4687,0,3731 -chr12 50259933 . G A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=1.819;DP=239;FS=7.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=4.74;ReadPosRankSum=2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,59:239:99:1161,0,6038 -chr12 50261738 . G A 4701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=-0.943;DP=303;FS=19.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,135:303:99:4730,0,5414 -chr12 50261768 . C T 4566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.971;ClippingRankSum=-0.347;DP=330;FS=15.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,154:329:99:4595,0,5531 -chr12 50266219 . C T 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-1.043;DP=280;FS=16.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,79:279:99:1947,0,7500 -chr12 50312870 . C G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=-1.867;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:489,0,533 -chr12 50316951 . G A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.052;DP=60;FS=5.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1071,0,1090 -chr12 50324305 . A G 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=-0.569;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:956,0,1060 -chr12 50324469 . G T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.533;DP=82;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:649,0,1936 -chr12 50422994 . G T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=1.048;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:596,0,583 -chr12 50425126 . T A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 -chr12 50434225 . T G 1809.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1838,129,0 -chr12 50434452 . G C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.576;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=2.13;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:231,0,3769 -chr12 50434476 . G C 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.121;DP=118;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:586,0,2753 -chr12 50444527 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-1.985;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:600,0,501 -chr12 50445150 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=22.25;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,138 -chr12 50541894 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-2.236;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,858 -chr12 50544851 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.676;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:288,0,970 -chr12 50548166 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.755;DP=47;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:841,0,826 -chr12 50661756 . ACAGGTCACACACACACACTCAGCGCACGCACCGCTCACACCGCAACCCTAGAGTCAACACAACATAATGTTATAAATGACGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT A 10811.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.625;ClippingRankSum=1.943;DP=262;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=28.94;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,242:261:99:10849,957,0 -chr12 50683830 . T C 2857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2886,208,0 -chr12 50687292 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.953;DP=41;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:230,0,1153 -chr12 50692175 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.352;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:353,0,548 -chr12 50692293 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.521;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=17.20;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:441,0,402 -chr12 50693181 . G A 982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.733;DP=25;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=29.08;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1011,72,0 -chr13 1013 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=1.681;DP=34;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:533,0,597 -chr13 1063 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.469;DP=75;FS=1.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:345,0,1946 -chr13 4203 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=2.014;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:587,0,939 -chr13 5246 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.184;DP=47;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:659,0,957 -chr13 5621 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.184;DP=50;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=6.14;ReadPosRankSum=-2.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:335,0,1330 -chr13 5636 . G A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=3.396;DP=46;FS=13.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=6.76;ReadPosRankSum=-2.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:348,0,889 -chr13 5642 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=3.411;DP=44;FS=10.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=6.52;ReadPosRankSum=-2.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:315,0,1861 -chr13 23557 . C A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:292,0,166 -chr13 42295 . G A 2478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.618;DP=144;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:2507,0,2228 -chr13 46784 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.270;DP=54;FS=5.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:755,0,930 -chr13 54422 . CGGTCTGATCCCCTGCCCTGACGCTCTGTGTGTGTGTGTGTTGAGATTGTGCACACTCACCCTGTTTCCCCTCA C 5075.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=3.388;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=33.60;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,121:125:99:5113,403,0 -chr13 54899 . G A 2242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-1.083;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:2271,0,1582 -chr13 59225 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-2.644;DP=80;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:375,0,2355 -chr13 61089 . G C 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-1.119;DP=92;FS=7.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1544,0,1481 -chr13 61131 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=-0.593;DP=80;FS=12.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:308,0,2047 -chr13 62196 . C T 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.299;DP=79;FS=7.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,40:79:99:1196,0,1121 -chr13 62621 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=0.221;DP=60;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:649,0,917 -chr13 63991 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.269;DP=23;FS=12.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:439,0,307 -chr13 64544 . T C 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.754;DP=85;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=29.01;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,66:85:99:2494,0,396 -chr13 64585 . A T 1986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.887;DP=61;FS=3.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=32.57;ReadPosRankSum=1.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,53:61:47:2015,0,47 -chr13 65211 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 454.20 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.434;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:99:479,0,327 -chr13 69741 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-2.454;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,19:111:99:261,0,3568 -chr13 73075 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.349;DP=131;FS=8.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,36:129:99:901,0,3542 -chr13 74312 . T A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.971;DP=87;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:1331,0,1605 -chr13 76114 . C A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.049;DP=129;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,22:129:99:303,0,4051 -chr13 76306 . G A 3830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-1.095;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,122:226:99:3859,0,3579 -chr13 78183 . C T 3024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.005;DP=172;FS=3.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,96:172:99:3053,0,2544 -chr13 78374 . T A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.689;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:636,0,4757 -chr13 80230 . A AGCACACACACAC 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=-4.979;DP=51;FS=11.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=4.27;ReadPosRankSum=4.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:255,0,393 -chr13 91777 . C G 821.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.262;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=34.21;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:12:849,0,12 -chr13 94306 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.470;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=27.29;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:656,0,103 -chr13 94497 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=2.797;DP=16;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:306,0,190 -chr13 98581 . CACCTTAGAAAGCAAAGAGAGAGAGGGGTGAAGCAGGATGGAGGAGTGGAGGACAGATAAAGGATGGAGCAGTGATGGAGGCCCGAGGGTGGAGGCTGT C 1497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=1.280;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=34.04;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1535,0,2159 -chr13 100049 . G A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=1.172;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:463,0,583 -chr13 102595 . G A 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=-0.454;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1266,0,1672 -chr13 104611 . G A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-1.296;DP=177;FS=5.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,45:175:99:1028,0,4830 -chr13 112891 . AGTGTGTGTGTGTGT A 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.749;DP=65;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:601,0,849 -chr13 163060 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=5.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,995 -chr13 179064 . T C 5691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.651;DP=283;FS=0.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,170:282:99:5720,0,3876 -chr13 181983 . G A 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-2.818;DP=56;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:1017,0,911 -chr13 182389 . CTGTA C 751.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.450;DP=337;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,58:337:99:789,0,11522 -chr13 182394 . CGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCTGAGGTGTAAAGAGCCCGTATTATGTGTGTTTGATAATGACTATGAATGTGTGACTGGGCTCTAAGTGGATGAAAACGTCCTGATGAGGGGTAAATCTGAAAGTTGTGTGTTCCTCAG C 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.384;DP=337;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,58:337:99:774,0,11522 -chr13 184407 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=2.246;DP=326;FS=15.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=1.94;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,57:326:99:660,0,10737 -chr13 224621 . C T 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-0.164;DP=80;FS=6.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.609;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,50:80:99:1523,0,981 -chr13 225020 . C A 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.070;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:945,0,1324 -chr13 233277 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=1.067;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:263,0,2389 -chr13 242953 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-0.443;DP=60;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:322,0,3978 -chr13 246524 . C G 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=1.062;DP=135;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,42:135:99:1019,0,4272 -chr13 247321 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.081;DP=124;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,28:124:99:512,0,3666 -chr13 257946 . TCCTTAACATGTGAAGCAGATGAAAAAACATCCAACAGATCAGAAAGCAAGAGCTGATGCCTGCAGCTGCTACTGAATGAAGACTGAACTGAATGAAGGATTGCTGAA T 3544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=3.112;DP=113;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=31.37;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,96:103:99:3582,0,928 -chr13 258638 . GCTTCAGACAGATGTTATGGTTAGAGTTTGAGCTTTTCACTACTGAGAGAAGAGGTGAGAAAGGTGGAGATGATCTAAGCAGGACGTAC G 3954.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=4.678;DP=104;FS=3.316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=33.64;ReadPosRankSum=-1.643 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,96:104:99:3992,113,0 -chr13 310672 . G T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.012;DP=70;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:509,0,1725 -chr13 311416 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=1.157;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:330,0,135 -chr13 335027 . C G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=-0.505;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:235,0,940 -chr13 335172 . TCTGACCAACACACAGCAATCAGTTATATTGCGTGTGTGTTTGTGTGTGCATGTTGTACTAGTGGTGCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGTAC T 1810.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=3.140;DP=59;FS=6.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=30.69;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,52:58:99:2165,0,1619 -chr13 337070 . GTTACCTGAAGAGAAAACCAGCTGAGGAAAATGCTTTCAAAACTAAGCAGAAGAGATCTAACCAAACAGACAGTTTAATTCAGCTGGTGGAGATGTGTCAGGGCTGGTCGT G 1010.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=1.758;DP=33;FS=3.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:1048,0,2263 -chr13 350787 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=1.076;DP=30;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:345,0,650 -chr13 383142 . A G 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.604;DP=216;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,53:215:99:1161,0,6121 -chr13 395249 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.051;DP=81;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:345,0,3576 -chr13 395587 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-1.199;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:291,0,1560 -chr13 418237 . T C 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.083;DP=83;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:848,0,4497 -chr13 418242 . A T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.572;DP=82;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:839,0,4497 -chr13 419421 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=1.500;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:291,0,1256 -chr13 420187 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-1.067;DP=88;FS=3.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:467,0,2522 -chr13 426052 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-1.055;DP=41;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,9:41:99:500,0,1312 -chr13 426546 . T C 1347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.715;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1376,0,2214 -chr13 427615 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.414;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=16.93;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:587,0,743 -chr13 427673 . G A 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.101;DP=33;FS=13.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:903,0,325 -chr13 433442 . C T 2027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.107;DP=165;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,60:165:99:2056,0,3508 -chr13 444453 . A G 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.274;DP=64;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=27.29;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,47:64:99:1775,0,403 -chr13 449340 . G A 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-2.455;DP=119;FS=2.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=15.92;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1923,0,1943 -chr13 458009 . C A 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.667;DP=110;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1947,0,2005 -chr13 464116 . G T 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=1.622;DP=83;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1525,0,1276 -chr13 464144 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=2.158;DP=85;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=18.14;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,48:85:99:1570,0,1286 -chr13 464199 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.777;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,33:70:99:1165,0,1265 -chr13 464637 . A G 2110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-2.926;DP=125;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:2139,0,2147 -chr13 524138 . C T 2732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=1.617;DP=167;FS=7.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=16.36;ReadPosRankSum=3.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:2761,0,2821 -chr13 525871 . G A 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=1.132;DP=170;FS=8.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,63:170:99:2079,0,3672 -chr13 526511 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=1.468;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:418,0,8877 -chr13 526519 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=1.186;DP=109;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:412,0,8877 -chr13 529202 . A G 1869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.106;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1898,0,2681 -chr13 530167 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=1.148;DP=187;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,28:186:99:247,0,5807 -chr13 530367 . G A 2713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.416;DP=152;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:2742,0,2234 -chr13 530412 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-3.494;DP=139;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,22:139:99:273,0,4450 -chr13 530494 . G A 2137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.444;DP=137;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:2166,0,2274 -chr13 530649 . G A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=-0.948;DP=123;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,38:122:99:970,0,3105 -chr13 530719 . C T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-3.014;DP=146;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,37:146:99:801,0,4129 -chr13 532035 . GAGGAAAGACTCTTTTCACTGTTTAAACTTCAGTGTCAGAGTGTGTGTGTGAGTGGATATTAGTATGTCATAGACACTAACGACACTGTTCTGATGTTTGTTTGCTTGAAC G 4981.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=0.985;DP=175;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.161;QD=28.47;ReadPosRankSum=-2.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,129:175:99:5019,0,14035 -chr13 534453 . G A 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=0.326;DP=57;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=22.05;ReadPosRankSum=2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1285,0,600 -chr13 535577 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.728;DP=44;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:656,0,983 -chr13 550378 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,379 -chr13 554194 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.262;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:330,0,1212 -chr13 580025 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.059;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,33:60:99:1092,0,934 -chr13 592285 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.259;DP=60;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:390,0,1602 -chr13 681704 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=24.77;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:375,0,122 -chr13 685919 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.442;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:261,0,2098 -chr13 686386 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.132;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:582,0,708 -chr13 687535 . C T 932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=-1.704;DP=40;FS=5.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:961,0,345 -chr13 694394 . G A 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-0.047;DP=51;FS=3.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:956,0,788 -chr13 701400 . A C 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-4.221;DP=192;FS=6.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,41:192:99:825,0,6825 -chr13 701445 . G A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=2.844;DP=130;FS=7.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,39:126:99:1018,0,5600 -chr13 702391 . TGTACACATCAGCTATACAACTGATCAATAATCATTAGTTTGTTCAGCCGTCATCATTGACTGATGTACTTTTGTTCCTGAAG T 3671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=2.920;DP=88;FS=2.191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=21.01;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,85:88:99:3709,299,0 -chr13 702540 . T G 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1317,102,0 -chr13 702546 . C A 1249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:99:1278,99,0 -chr13 703773 . A C 6760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.229;DP=201;FS=3.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=33.64;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,163:199:99:6789,0,404 -chr13 710858 . TGTACACCTCAGCTATACAACTGATCAATAATCATTAGTTTGTTCAGCCGTCATCATTGACTGATGTACTTTTGTTCCTGAAG T 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=32.90;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:465,0,1037 -chr13 711699 . T C 1788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1817,135,0 -chr13 715880 . G C 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.678;DP=35;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.269;QD=34.79;ReadPosRankSum=-1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,32:35:32:1246,0,32 -chr13 720821 . T A 4392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-1.101;DP=235;FS=10.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=18.69;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,135:235:99:4421,0,3195 -chr13 723865 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=4.145;DP=93;FS=13.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.711;QD=5.40;ReadPosRankSum=2.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:530,0,2629 -chr13 728173 . ACTGCACACAATCAGAAGCAGAATTCAGAAACAATAACACAAACACACACACTGCTGTCAGCACAGCGCACTTTACACACTGCACACACAAGCAGAAAGCTGCTTTAC A 3781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.693;DP=88;FS=4.821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=26.57;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:3819,295,0 -chr13 732326 . GCATCAGTGCTGGATGTTATCGTCATGGTAACAGCCTCAGTGCTGCTGGTCCAGCACTGTTAGGAGGGCATCAGTGTTGGATGTTGTTGCCATGGTAACTGCCTCCGTGCAGCTGGTCCAGTGCTGTGAGGAAGC G 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.204;DP=26;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=19.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:534,0,258 -chr13 732918 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=5.217;DP=60;FS=10.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:363,0,3589 -chr13 784030 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.599;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:598,0,316 -chr13 849469 . C A 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.435;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:272,0,890 -chr13 851194 . A AC 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-2.180;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:385,0,405 -chr13 855892 . T C 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.582;DP=36;FS=7.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=18.44;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:692,0,298 -chr13 857122 . C T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=-2.346;DP=37;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1045,0,145 -chr13 857955 . A G 1938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.048;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1967,0,1771 -chr13 986983 . G A 4186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.991;DP=259;FS=4.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,119:259:99:4215,0,4673 -chr13 992464 . GTA G,GTATA 1192.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.400;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,16,22:39:99:1237,731,1123,573,0,810 -chr13 993362 . T G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-2.297;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:576,0,398 -chr13 995107 . G T 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=-0.869;DP=90;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,54:90:99:2036,0,1911 -chr13 995189 . T G 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.247;DP=97;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,33:97:99:1125,0,2338 -chr13 995245 . G A 2300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-1.168;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:2329,0,1888 -chr13 995484 . T C 5347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.232;DP=117;FS=1.531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=29.59;ReadPosRankSum=-4.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,106:113:99:5376,387,0 -chr13 995947 . G T 2898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2927,215,0 -chr13 995981 . T C 3414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3443,249,0 -chr13 997118 . T A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=1.842;DP=74;FS=8.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:934,0,1549 -chr13 998811 . ACTGCAAAAGCACACACAGAAGTCAGCGTATAAAATAGAGTACTCATACAAAATAGCTCAGATTTCAGACTGACTTAC A 15633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=2.166;DP=363;FS=8.720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,345:349:99:15671,1241,0 -chr13 998938 . C T 6017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-1.961;DP=315;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,183:314:99:6046,0,4599 -chr13 1007768 . G A 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.812;DP=50;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.340;QD=29.92;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,40:50:99:1524,0,195 -chr13 1011809 . A C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.464;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:323,0,1197 -chr13 1012930 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=1.479;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:229,0,451 -chr13 1014503 . C G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-1.588;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:345,0,287 -chr13 1040246 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-2.971;DP=111;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=5.12;ReadPosRankSum=3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:597,0,9197 -chr13 1040908 . A AT 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=4.478;DP=144;FS=1.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=4.42;ReadPosRankSum=-3.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,40:139:99:674,0,2874 -chr13 1041097 . A T 1731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-1.091;DP=135;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=12.83;ReadPosRankSum=-6.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:1760,0,2996 -chr13 1041127 . A G 1930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=3.424;DP=145;FS=23.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,58:145:99:1959,0,4019 -chr13 1041501 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr13 1041879 . G GT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,187 -chr13 1041883 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.818;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,187 -chr13 1041961 . C G 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.262;DP=73;FS=9.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,48:73:99:1710,0,865 -chr13 1080945 . A T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.642;DP=30;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:424,0,584 -chr13 1083124 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.16;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:305,0,102 -chr13 1084483 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:274,0,182 -chr13 1086996 . A G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.099;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:614,0,723 -chr13 1087286 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.884;DP=39;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:273,0,1102 -chr13 1177421 . A T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.367;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:491,0,684 -chr13 1178878 . T TA 390.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53:508,53,0 -chr13 1179134 . A G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.572;DP=42;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:776,0,607 -chr13 1179269 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.509;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:358,0,757 -chr13 1179710 . C A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.390;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=7.97;ReadPosRankSum=-2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:650,0,1994 -chr13 1179954 . CT C 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.126;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:390,0,894 -chr13 1269310 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:265,0,109 -chr13 1288026 . C A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-2.423;DP=67;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:584,0,1667 -chr13 1397358 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.866;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:456,0,889 -chr13 1412032 . GAGGTCTGCTCTTCCCCAGATTCGTTTTTTTTTTTTATGCCTAAAAAGCGTTTAAATGTTGTAAACCTGACCCTTGATGTGCAATCTAGATCCTAAAACAGAAAGTTTTGTATTATAGTAATGATCTGACCTCTCGTTCTGATGCATGC G 2641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=2.272;DP=76;FS=2.261;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=34.76;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,68:71:99:2679,198,0 -chr13 1465952 . A G 2045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.360;DP=80;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,58:75:99:2074,0,304 -chr13 1508933 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-0.355;DP=95;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:518,0,2627 -chr13 1523854 . C T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=3.142;DP=182;FS=11.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,41:182:99:819,0,5338 -chr13 1555280 . C G 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-2.444;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1110,0,1294 -chr13 1563195 . A T 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.621;DP=143;FS=5.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,41:142:99:925,0,3811 -chr13 1565723 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=1.010;DP=116;FS=5.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=5.99;ReadPosRankSum=3.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,26:116:99:723,0,7480 -chr13 1565729 . C T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=1.269;DP=124;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:722,0,7441 -chr13 1574261 . G C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,439 -chr13 1657148 . TA T 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.314;DP=81;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1390,0,435 -chr13 1657321 . GT G 353.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:391,39,0 -chr13 1951697 . C A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.475;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:431,0,247 -chr13 1969875 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:247,0,97 -chr13 1971384 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=-0.533;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:395,0,322 -chr13 2034193 . TA T 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.889;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:583,0,269 -chr13 2034500 . TA T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.565;DP=63;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:273,0,1221 -chr13 2087967 . T C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.034;DP=60;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:813,0,1177 -chr13 2088062 . GT G 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.280;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=7.23;ReadPosRankSum=-3.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:507,0,918 -chr13 2088101 . C T 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.028;DP=73;FS=8.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=17.28;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1290,0,1294 -chr13 2127233 . T A 6055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-1.482;DP=337;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,175:337:99:6084,0,8147 -chr13 2127860 . T A 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.116;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:343,0,1277 -chr13 2128582 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=5.292;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=4.68;ReadPosRankSum=-4.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:281,0,12929 -chr13 2128583 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=5.292;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.68;ReadPosRankSum=-4.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:281,0,12929 -chr13 2128600 . TTTTGAAAA T 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.386;ClippingRankSum=5.403;DP=58;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:281,0,12929 -chr13 2128610 . TACTAA T 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=5.403;DP=58;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=4.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:281,0,12929 -chr13 2128782 . C T 5080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.260;DP=121;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,93:119:99:5109,0,355 -chr13 2129955 . AT A 2295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.047;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=27.01;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:2333,230,0 -chr13 2130804 . A G 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=1.188;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1388,0,742 -chr13 2131886 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.613;DP=39;FS=15.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:266,0,1120 -chr13 2132702 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=-0.149;DP=59;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:759,0,2144 -chr13 2171923 . G T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-0.570;DP=38;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:430,0,1014 -chr13 2201684 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.493;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.464;QD=26.93;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:513,0,159 -chr13 2207453 . GT G,GTT 508.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.619;DP=42;FS=3.757;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,9,23:33:99:684,512,676,229,0,258 -chr13 2209029 . C A 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.774;DP=114;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1980,0,1572 -chr13 2209115 . TCTGCTGGGAGAACACAAGCAGACCACTGAGAGAGGAGCAGTAAACACACACACAAAACACAGCACTGGCTGAGGAATGTGGGATGAAGTCATACAGGCAAACAGAC T 4417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=3.105;DP=125;FS=6.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,107:125:99:4455,0,5534 -chr13 2251809 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=23.63;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:359,0,116 -chr13 2373784 . G GATCTTTCGAGGCTTTTTTAAGA 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-0.929;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=12.69;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:380,0,405 -chr13 2374041 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.55;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:330,0,162 -chr13 2374720 . C A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.330;DP=112;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,30:112:99:667,0,3773 -chr13 2374738 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-3.578;DP=93;FS=10.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:603,0,2835 -chr13 2398786 . G T 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.451;DP=77;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:661,0,1976 -chr13 2424816 . TC T 745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:783,55,0 -chr13 2541907 . G C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=1.031;DP=33;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:238,0,939 -chr13 2796533 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.535;DP=36;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:492,0,780 -chr13 2796832 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:266,0,388 -chr13 2798072 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-1.867;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=22.13;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:338,0,165 -chr13 2798092 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.680;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=25.24;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:432,0,165 -chr13 2975666 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-0.478;DP=107;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=5.54;ReadPosRankSum=2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,28:107:99:621,0,2911 -chr13 3481551 . A T 759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:788,54,0 -chr13 3482195 . T G 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:336,24,0 -chr13 3482449 . G T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=3.056;DP=36;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=8.13;ReadPosRankSum=-2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:321,0,1958 -chr13 3482659 . G T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=1.309;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:505,0,927 -chr13 3483340 . G C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=3.031;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=14.52;ReadPosRankSum=-2.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:275,0,327 -chr13 3484226 . T G 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr13 3486099 . T C 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 -chr13 3486285 . C G 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:434,33,0 -chr13 3486668 . C T 989.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:69:1018,69,0 -chr13 3490088 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:99:254,0,379 -chr13 3490779 . C A 1961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=-1.733;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=33.20;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1990,136,0 -chr13 3491838 . C T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.220;DP=61;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,40:61:99:1369,0,700 -chr13 3492262 . C A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=3.987;DP=63;FS=5.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:761,0,1460 -chr13 3492286 . A T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=3.620;DP=66;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.66;ReadPosRankSum=-3.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:732,0,1559 -chr13 3492509 . T A 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.111;DP=75;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:1404,0,2538 -chr13 3492512 . G GA 1335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.905;DP=78;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:1373,0,2538 -chr13 3492636 . GA G 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=1.191;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:472,0,358 -chr13 3525657 . T C 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.707;DP=45;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:633,0,942 -chr13 3525979 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-2.435;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:260,0,355 -chr13 3528689 . T C 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-1.712;DP=34;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:781,0,332 -chr13 3528876 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.219;DP=36;FS=5.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:581,0,391 -chr13 3529193 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=-1.354;DP=45;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:637,0,1224 -chr13 3571914 . T A 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:241,0,24 -chr13 3573991 . G T 2496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.235;DP=185;FS=5.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=13.50;ReadPosRankSum=-6.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,65:185:99:2525,0,6193 -chr13 3574027 . C T 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-0.642;DP=141;FS=10.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,42:141:99:1048,0,3973 -chr13 3575124 . A T 6016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.656;DP=298;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,182:296:99:6054,0,3756 -chr13 3580746 . T A 2335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=-4.830;DP=181;FS=18.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=12.90;ReadPosRankSum=3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,65:181:99:2364,0,8867 -chr13 3605296 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.894;DP=54;FS=5.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:565,0,3141 -chr13 3611370 . A C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=29.29;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:409,0,52 -chr13 3619508 . C A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=1.866;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,134 -chr13 3619578 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:363,0,56 -chr13 3634817 . G GA 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.262;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:49:389,0,49 -chr13 3635631 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,301 -chr13 3635694 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:314,0,248 -chr13 3635732 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,482 -chr13 3635858 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:237,0,378 -chr13 3636591 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-3.486;DP=30;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=12.36;ReadPosRankSum=2.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:399,0,680 -chr13 3886236 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-1.517;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:268,0,1423 -chr13 3886340 . A G 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.274;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=17.19;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:905,0,872 -chr13 3886453 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=1.717;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:309,0,1178 -chr13 3965548 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-2.241;DP=101;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=2.59;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:290,0,3181 -chr13 3972391 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.554;DP=85;FS=5.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:400,0,2511 -chr13 3993569 . G GA 200.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:43:348,43,0 -chr13 3999029 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-1.291;DP=115;FS=6.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:401,0,3579 -chr13 4053655 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.703;DP=69;FS=5.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:394,0,2409 -chr13 4053795 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.410;DP=62;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=3.45;ReadPosRankSum=-1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:242,0,2685 -chr13 4053994 . A T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.093;DP=48;FS=8.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:801,0,1291 -chr13 4054475 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=3.927;DP=43;FS=7.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:374,0,1075 -chr13 4054525 . C A 1179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1208,87,0 -chr13 4061521 . T A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-0.576;DP=50;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:634,0,1157 -chr13 4265594 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.367;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:342,0,808 -chr13 4326644 . A T 4272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-2.885;DP=360;FS=0.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,129:357:99:4301,0,9328 -chr13 4337208 . G C 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,15:15:99:831,0,439 -chr13 4337908 . T G 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr13 4369370 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.386;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:276,0,1501 -chr13 4370080 . CT C 615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:64:653,64,0 -chr13 4370619 . G T 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 -chr13 4372214 . G GA 391.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:428,0,7 -chr13 4375260 . GT G 306.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-1.737;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:8:343,8,0 -chr13 4375376 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=33.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:231,0,325 -chr13 4645995 . A G 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.531;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=28.79;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:1167,0,113 -chr13 4645996 . A G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.063;DP=17;FS=7.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=30.53;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:714,0,259 -chr13 4655331 . AGTAGCGGGTGGTGTTTTCGTAGCGGGTGGTGTTTTC A 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.124;DP=44;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=10.83;ReadPosRankSum=-3.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:514,0,1633 -chr13 4655923 . T G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-1.517;DP=23;FS=15.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:430,0,632 -chr13 4662997 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.976;DP=83;FS=3.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:305,0,6576 -chr13 4677176 . TA T 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.382;DP=116;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:300,0,2792 -chr13 4702599 . CGTAAGTGCCCATGTTTGTTCCTCTTCTTGCTCTGTT C 808.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=373;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:99:846,369,0 -chr13 4705565 . TA T 996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=1.032;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:1034,0,1051 -chr13 4706549 . A G 216.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:245,0,18 -chr13 4753551 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-1.146;DP=44;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.34;ReadPosRankSum=2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:307,0,2229 -chr13 4921853 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,143 -chr13 5141405 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,455 -chr13 5167380 . CT C 966.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-1.519;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,62:214:99:1004,0,4106 -chr13 5167604 . TA T 3484.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=2.096;DP=266;FS=9.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=13.10;ReadPosRankSum=-2.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,139:249:99:3522,0,1973 -chr13 5168069 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:245,0,107 -chr13 5170129 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:266,0,350 -chr13 5170227 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.215;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:403,0,408 -chr13 5227848 . T C 1775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-0.963;DP=434;FS=1.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:336,97:433:99:1804,0,12127 -chr13 5227860 . G A 1778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.268;DP=421;FS=1.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:328,93:421:99:1807,0,12396 -chr13 5248866 . C CT 394.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:432,42,0 -chr13 5542099 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:42:413,0,42 -chr13 5543048 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-0.573;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=17.12;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:559,0,537 -chr13 5543878 . G C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=1.085;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:361,0,460 -chr13 5544389 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.181;DP=45;FS=5.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:423,0,1164 -chr13 5545441 . A T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.010;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:597,0,1213 -chr13 5548253 . T TA 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.424;DP=21;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:278,0,277 -chr13 5548371 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-1.372;DP=51;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:772,0,1684 -chr13 5549284 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.094;DP=63;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:663,0,1346 -chr13 5549521 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.592;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:478,0,2832 -chr13 5613912 . C CT 978.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.004;DP=98;FS=2.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1016,0,1004 -chr13 5624002 . A T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-0.514;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:775,0,1107 -chr13 5627390 . T A 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.740;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:310,0,212 -chr13 5667934 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.81;ReadPosRankSum=-1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:230,0,429 -chr13 5753183 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.827;DP=93;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:450,0,2661 -chr13 5754260 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-1.119;DP=308;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,47:308:99:425,0,9773 -chr13 5754284 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.219;DP=299;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,49:299:99:608,0,9528 -chr13 5754446 . G T 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.786;DP=251;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,66:248:99:1300,0,8501 -chr13 5754449 . G T 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.173;DP=250;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,49:248:99:797,0,9901 -chr13 5754749 . G A 1464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.655;DP=250;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,66:249:99:1493,0,6752 -chr13 5755278 . G T 3190.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.949;DP=264;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,85:264:99:3219,0,13112 -chr13 5755281 . A C 3190.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=1.151;DP=268;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=11.91;ReadPosRankSum=-2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,90:268:99:3219,0,13121 -chr13 5755393 . TCCTGCCAAATCCAATGAACGAGCGAGTTAGAACATTAATAATAAAGTCAACTCATACGACACCTAAATTGCTTATCATATTTATTAAACAGAACAAAAACTTA T 12684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.830;DP=283;FS=1.817;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,277:282:99:12722,1111,0 -chr13 5755522 . C A 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-1.454;DP=238;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,53:237:99:1026,0,9898 -chr13 5757860 . TCTGTGAACAGTTTGACGTTAGAGTTGCATCACTGCATCATAAGAATAAGCTGGTCTGAATTGCACTCCCATTTAACGTTAC T 12249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=1.951;DP=317;FS=4.254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=28.72;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,271:276:99:12287,971,0 -chr13 5801573 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,334 -chr13 5802070 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:330,0,356 -chr13 5872359 . C T 9529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.381;DP=204;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=24.37;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,70:204:99:9558,0,4886 -chr13 5872570 . A T 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.108;DP=246;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,89:245:99:1663,0,11746 -chr13 5876773 . C T 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-3.418;DP=208;FS=23.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,53:207:99:1220,0,5695 -chr13 5877101 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=1.671;DP=340;FS=0.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,65:340:99:1063,0,10579 -chr13 5882358 . A C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.269;DP=195;FS=10.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,44:195:99:879,0,5893 -chr13 5914359 . G A 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.438;DP=92;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:1017,0,2160 -chr13 5915790 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.112;DP=163;FS=4.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:579,0,4794 -chr13 5915891 . C T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=0.438;DP=139;FS=5.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,30:139:99:584,0,7344 -chr13 5916048 . T C 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=1.023;DP=104;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:1488,0,1977 -chr13 5916190 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-2.563;DP=112;FS=7.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:563,0,3758 -chr13 5917047 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=9.95;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:267,0,727 -chr13 5917154 . GA G 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.189;DP=23;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:244,0,254 -chr13 5918799 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-2.262;DP=14;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:302,0,97 -chr13 6278840 . A G 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.492;DP=30;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=27.89;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:865,0,217 -chr13 6278860 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.586;DP=36;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:282,0,1051 -chr13 6279156 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=32.91;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:456,0,117 -chr13 6279170 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:352,0,310 -chr13 6279937 . CT C 896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.984;DP=51;FS=7.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:934,0,307 -chr13 6321956 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=1.208;DP=32;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:522,0,523 -chr13 6323536 . G C 217.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:246,0,20 -chr13 6324889 . C G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=-0.312;DP=48;FS=5.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:780,0,983 -chr13 6326005 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,226 -chr13 6330869 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=1.598;DP=192;FS=69.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,39:192:99:694,0,5767 -chr13 6331094 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=-1.047;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.236;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:331,0,529 -chr13 6341186 . A G 6259.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:6288,471,0 -chr13 6341241 . GCTACAAAAACATCAATGCAGCGCATCACAAATCTCTCAAAACGACAATAATGGGCAGACCGTTACGCTGCGGGTGTGCTTTCTGGATTCCTAC G 6422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=1.366;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=30.52;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:6460,569,0 -chr13 6471047 . G A 1630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.118;DP=127;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:1659,0,2491 -chr13 6471100 . G A 3838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=-0.127;DP=286;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,111:285:99:3867,0,5775 -chr13 6471380 . G T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr13 6473945 . CAGGTAGGAATCCAGAAAGCACACCCGCAGCGTAACGCTCTGCCCATTATTGTCATTTTGAGAGATTTGTGATGCGCTGCATTGATGTTTTTGT C 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=2.123;DP=16;FS=5.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=31.42;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:540,0,1267 -chr13 6474090 . A G 1233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1262,96,0 -chr13 6478477 . G T 1795.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1824,138,0 -chr13 6482117 . T G 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.405;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:934,0,1172 -chr13 6484296 . T C 1825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1854,132,0 -chr13 6484412 . CAG C 2907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.409;DP=168;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:2945,0,2490 -chr13 6487520 . A T 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 -chr13 6490534 . C A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:746,51,0 -chr13 6490945 . C T 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:415,33,0 -chr13 6491099 . G C 912.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.427;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=33.80;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:3:939,0,3 -chr13 6491184 . C A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=2.188;DP=19;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=23.20;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:469,0,566 -chr13 6491190 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=2.110;DP=23;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=19.16;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:469,0,566 -chr13 6494437 . A G 706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:735,57,0 -chr13 6517566 . T C 1576.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1605,117,0 -chr13 6525227 . C A 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.897;DP=47;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=28.63;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,37:47:99:1374,0,187 -chr13 6540032 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.558;DP=56;FS=12.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:338,0,1614 -chr13 6547151 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-1.252;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:322,0,1917 -chr13 7093503 . G T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:238,0,59 -chr13 7139832 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-2.353;DP=25;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:280,0,680 -chr13 7270815 . G C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-0.121;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:602,0,896 -chr13 7457340 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,445 -chr13 7458311 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=-0.298;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,502 -chr13 7462272 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.338;DP=35;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:309,0,1970 -chr13 7464905 . A G 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.553;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:549,0,359 -chr13 7465091 . A C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.401;DP=22;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:324,0,673 -chr13 7465435 . G T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.298;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:723,0,335 -chr13 7466096 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.601;DP=23;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:455,0,326 -chr13 7466149 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-1.132;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:319,0,974 -chr13 7532709 . T G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.311;DP=14;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:427,0,90 -chr13 7533937 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:313,0,598 -chr13 7533971 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-1.034;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:412,0,801 -chr13 7534274 . T C 254.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:283,0,14 -chr13 7534440 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=29.89;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:357,0,48 -chr13 7574532 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:404,0,404 -chr13 7593219 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.212;DP=25;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=25.91;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:676,0,190 -chr13 7623608 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-2.044;DP=82;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:415,0,2461 -chr13 7633562 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=-0.646;DP=93;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:613,0,2576 -chr13 7648955 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.683;DP=80;FS=3.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:443,0,2242 -chr13 7670149 . T A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=1.763;DP=31;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:900,0,600 -chr13 7670153 . G A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=1.153;DP=33;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:900,0,594 -chr13 7678813 . G T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.880;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:772,0,792 -chr13 7684347 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=-0.010;DP=55;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:271,0,1623 -chr13 7687531 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr13 7703506 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.507;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:491,0,716 -chr13 7703824 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.210;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:276,0,2149 -chr13 7703833 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.557;DP=39;FS=3.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:265,0,2149 -chr13 7711618 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-1.273;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:686,0,1050 -chr13 7711698 . A T 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=-1.525;DP=53;FS=5.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1148,0,756 -chr13 7739943 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-1.269;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:309,0,431 -chr13 7741009 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:372,0,51 -chr13 7765675 . AACCTGACAGAACAACCATTATCTTATGAGTTACACCAGATCTGACTTCAGGTTAGCACTTATTTTAAAGGAGAAGTTATTG A 1002.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-0.052;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:88:1040,88,0 -chr13 7985839 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.434;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=26.16;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:630,0,197 -chr13 8049072 . G GT 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.072;DP=88;FS=5.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:345,0,3175 -chr13 8143139 . C T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.246;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:588,0,694 -chr13 8143470 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.586;DP=35;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:317,0,920 -chr13 8146269 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,127 -chr13 8208491 . ACAGGTTTGTTCTTCCTTCAGAGTTTATAAGGTCTCGTTTTCCAAACGCAACTTCTAATTTAACATGTCCTTCTATTG A 15076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-2.249;DP=416;FS=2.859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=29.29;ReadPosRankSum=2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,379:385:99:15114,147,0 -chr13 8274370 . G T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=1.571;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:555,0,121 -chr13 8291697 . A T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.913;DP=18;FS=7.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=31.93;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:32:603,0,32 -chr13 8307799 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:347,0,176 -chr13 8327384 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=1.727;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:499,0,759 -chr13 8327394 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=1.741;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=22.42;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:499,0,759 -chr13 8334931 . C A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.099;DP=21;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:515,0,151 -chr13 8346329 . T A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:411,0,312 -chr13 8347926 . T A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.763;DP=36;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:803,0,750 -chr13 8347993 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:316,0,334 -chr13 8347996 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:316,0,334 -chr13 8348444 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,272 -chr13 8348693 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,178 -chr13 8665238 . C G 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.490;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1124,0,1340 -chr13 8665476 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.698;DP=78;FS=9.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:447,0,2361 -chr13 8665561 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-0.305;DP=32;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=8.02;ReadPosRankSum=-3.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:285,0,847 -chr13 8683803 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:350,0,124 -chr13 8705755 . A C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-1.317;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:766,0,731 -chr13 8705937 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=-0.490;DP=42;FS=9.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:365,0,1103 -chr13 8710267 . CACTGTTTTACAGAGACAAATAGTTTTCAATAGCTTAAAATGAGTTCAAATCACACCAATGGTTGGAAGAACACTTTTAGAAAACCAAGCAGGTCACTTA C 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.040;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:385,0,3335 -chr13 8710442 . TCTGTTTAGGGGTGAAAGAGACATTAAGACTGAGGTGTTTTTGGGGTAAATGGTTATGTACCATGATTGCTGGGATATGTGTGTGCGCCTTAC T 4773.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.723;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=32.17;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,103:105:99:4811,431,0 -chr13 8723761 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-1.748;DP=62;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1243,0,918 -chr13 8739816 . G A 1425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.139;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=32.79;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1454,102,0 -chr13 8741402 . A G 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.903;DP=23;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.115;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:549,0,237 -chr13 8750353 . T A 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.373;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=16.46;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:802,0,1046 -chr13 8750661 . A T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-1.615;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:806,0,698 -chr13 8760073 . A G 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=-1.293;DP=51;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=25.03;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1305,0,203 -chr13 8760967 . A T 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=3.464;DP=38;FS=12.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=29.89;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:1164,0,2139 -chr13 8768760 . G GT 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr13 8802647 . A G 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr13 8835767 . G T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr13 8920040 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=-0.711;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:419,0,577 -chr13 8920974 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.53;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,105 -chr13 8921218 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=11.04;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,444 -chr13 8946938 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:262,0,131 -chr13 8947022 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,242 -chr13 8988774 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.983;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:291,0,2172 -chr13 8988784 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.257;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:291,0,2172 -chr13 9011782 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=2.716;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:230,0,433 -chr13 9021570 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=1.361;DP=39;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:490,0,874 -chr13 9120331 . C A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr13 9120395 . T A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr13 9213335 . T C 10895.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,259:259:99:10924,780,0 -chr13 9221082 . GT G,GTT 869.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.023;DP=51;FS=6.532;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,18,26:47:99:938,557,782,424,0,561 -chr13 9221941 . A C 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.182;DP=61;FS=3.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,27:61:99:986,0,1932 -chr13 9221961 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-0.636;DP=38;FS=8.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:986,0,1922 -chr13 9244402 . TCTGAGTTAGAAAATAAACGCATCATTTATGGTTGACTTAAAAATAAACAATATACTGTAAATTAATCTTCCAAAC T 1213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-0.271;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=30.34;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:99:1517,0,226 -chr13 9798167 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-0.673;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:349,0,472 -chr13 9824136 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-0.199;DP=67;FS=3.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:522,0,1813 -chr13 10249054 . T TC 459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.899;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:497,0,749 -chr13 10249144 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-1.047;DP=41;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:246,0,2673 -chr13 10249158 . T G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-2.388;DP=44;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:248,0,2673 -chr13 10258037 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-1.255;DP=49;FS=6.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:577,0,1097 -chr13 10375338 . C T 1504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=-0.685;DP=174;FS=11.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1533,0,4197 -chr13 10460946 . A G 885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.315;DP=107;FS=0.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,34:107:99:923,0,2771 -chr13 10547935 . A T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:577,39,0 -chr13 10547937 . A C 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:577,39,0 -chr13 10548645 . A T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-1.721;DP=51;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:281,0,1450 -chr13 10552699 . TTTCCTAAATG T 1652.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.679;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:1690,0,5017 -chr13 10552701 . TCCTAAATGGTACAGAGTAATTAGGAAAATGTACAAGTCAAAAATATTCACAATAAGGCATTCATCATTAATGAACTCA T 1734.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.895;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1772,0,5510 -chr13 10552711 . TACAGAGTAATTAGGAAAATGTACAAGTCAAAAATATTCACAATAAGGCATTCATCATTAATGAACTCA T 1652.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.700;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:1690,0,5563 -chr13 10567431 . G A 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.439;DP=85;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:732,0,4418 -chr13 10567455 . T C 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=1.999;DP=87;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:991,0,1735 -chr13 10567833 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.210;DP=125;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:377,0,3793 -chr13 10568220 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.626;DP=154;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:451,0,4767 -chr13 10568299 . T G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.835;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,25:145:99:356,0,4571 -chr13 10572299 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.485;DP=120;FS=4.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:459,0,3658 -chr13 10585726 . A T 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.639;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:926,0,1206 -chr13 10594757 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=-1.668;DP=97;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,24:97:99:551,0,2798 -chr13 10606307 . C T 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.645;DP=94;FS=2.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,30:94:99:836,0,2454 -chr13 10950926 . C G 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr13 11157775 . T C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.327;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,31:115:99:773,0,3248 -chr13 11158027 . T A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-1.592;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:719,0,618 -chr13 11158660 . G GA 765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.012;DP=160;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,46:136:99:803,0,2317 -chr13 11158799 . T C 2407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-0.699;DP=107;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=22.50;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:2436,0,2300 -chr13 11158897 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.148;DP=124;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,31:124:99:288,0,6217 -chr13 11159296 . G GTT 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=-1.502;DP=95;FS=3.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:1003,0,1840 -chr13 11159618 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.802;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:910,0,3985 -chr13 11160285 . T TA 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=-1.312;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:492,0,1125 -chr13 11203583 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.098;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=18.21;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:520,0,421 -chr13 11203996 . C A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.191;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:419,0,684 -chr13 11204199 . A T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.454;DP=79;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:531,0,1981 -chr13 11204254 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.277;DP=66;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:376,0,1993 -chr13 11205180 . G T 385.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:414,13,0 -chr13 11206112 . G GA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.190;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:415,0,3540 -chr13 11206115 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.426;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:415,0,3540 -chr13 11299778 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.234;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:381,0,814 -chr13 11304119 . T C 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-2.527;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:550,0,800 -chr13 11304198 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.355;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=10.64;ReadPosRankSum=-2.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:273,0,523 -chr13 11325850 . T C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-0.336;DP=60;FS=14.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:879,0,1139 -chr13 11330069 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.693;DP=35;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:339,0,1906 -chr13 11391128 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.767;DP=29;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.039;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:517,0,494 -chr13 11482846 . TA T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,240 -chr13 11482979 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.629;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:254,0,1005 -chr13 11624439 . GA G 301.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-1.240;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:15:339,15,0 -chr13 11625308 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.531;DP=69;FS=7.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:450,0,1860 -chr13 11730134 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=3.505;DP=81;FS=5.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=3.70;ReadPosRankSum=-3.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:328,0,6094 -chr13 11730140 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=3.351;DP=87;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:338,0,6094 -chr13 11739505 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.520;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:396,0,1044 -chr13 11739753 . C T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr13 11743268 . G A 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.206;DP=156;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,53:156:99:1815,0,3653 -chr13 11743938 . C CT 1478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-1.801;DP=159;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1516,0,1959 -chr13 11744050 . C A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=-1.761;DP=187;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=7.37;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,64:187:99:1406,0,6045 -chr13 11744585 . G GT 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=-0.050;DP=228;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,47:162:99:557,0,2815 -chr13 11744714 . A C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=2.482;DP=229;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,45:225:99:438,0,10530 -chr13 11745862 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:254,0,90 -chr13 11752075 . A AT 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.707;DP=38;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:449,0,984 -chr13 11756912 . C T 1171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=1.304;DP=206;FS=0.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,52:206:99:1200,0,6033 -chr13 11765269 . C A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.449;DP=75;FS=5.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:472,0,2029 -chr13 11770160 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=-0.149;DP=60;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:561,0,1425 -chr13 11770456 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.544;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:338,0,1091 -chr13 11772313 . T A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=1.179;DP=49;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:460,0,1235 -chr13 11841545 . C T 1875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.224;DP=158;FS=6.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,57:158:99:1904,0,3411 -chr13 11842249 . A G 2505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.117;DP=162;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:2534,0,3651 -chr13 11842321 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.923;DP=145;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,37:145:99:789,0,4870 -chr13 11842350 . G A 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.987;DP=160;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,40:160:99:898,0,5027 -chr13 11842397 . T C 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.309;DP=148;FS=1.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,39:148:99:830,0,4554 -chr13 11842518 . T A 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.587;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,45:153:99:1151,0,4255 -chr13 11842669 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.785;DP=134;FS=5.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,26:134:99:415,0,4380 -chr13 11842789 . T C 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.190;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:620,0,585 -chr13 12501570 . TG T 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-1.695;DP=251;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,65:217:99:1032,0,3768 -chr13 12502305 . A T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.420;DP=115;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=7.13;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,34:115:99:848,0,3393 -chr13 12502355 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.391;DP=47;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:337,0,1319 -chr13 12502632 . GCTGTAAGATAGGGGAAAAAATGTTATGATCTGACAGGATTAACTAAAAATATAACCAAAAAAACTTGATAAATGTAC G 11774.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-1.301;DP=281;FS=10.736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=39.26;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,267:270:99:11812,837,0 -chr13 12504846 . TCTGAGGTGAAAAACATTCACGTTCAGCATTTAAATGAGTATAGAAATGCAGTGTATGCGTGCGTGTTAGTTAGGGCTTAC T 7144.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.189;ClippingRankSum=0.921;DP=313;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=22.83;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,258:272:99:9877,0,1697 -chr13 12504848 . TGAGGTGAAAAACATTCACGTTCAGCATTTAAATGAGTATAGAAATGCAGTGTATGCGTGCGTGTTAGTTAGGGCTTACC T 1030.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=2.455;DP=305;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,63:304:99:1068,0,12004 -chr13 12550543 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=-2.386;DP=65;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=4.30;ReadPosRankSum=4.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:308,0,2009 -chr13 12721195 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.216;DP=53;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:600,0,1241 -chr13 12735310 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.772;DP=44;FS=3.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:319,0,1080 -chr13 12752776 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-2.077;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:419,0,747 -chr13 12763378 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.327;DP=67;FS=5.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:452,0,1814 -chr13 12763423 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.238;DP=67;FS=5.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:376,0,1881 -chr13 12774369 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.661;DP=43;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:364,0,1069 -chr13 12780415 . A ACTCCG 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.825;DP=63;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:273,0,1892 -chr13 12824516 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=-2.230;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:440,0,1298 -chr13 12832220 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.249;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:368,0,2251 -chr13 12849637 . G T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.154;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1004,0,1675 -chr13 12854422 . TAA T 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.895;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:305,0,1058 -chr13 12854693 . G C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.577;DP=49;FS=2.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:318,0,2719 -chr13 12877862 . G T 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-0.560;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:1207,0,2262 -chr13 12885829 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.817;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.106;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:99:648,0,2936 -chr13 12895709 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.792;DP=87;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:314,0,4408 -chr13 12896599 . T C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=1.461;DP=120;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:591,0,3253 -chr13 12899829 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.951;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:469,0,2859 -chr13 12944406 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.044;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:751,0,1038 -chr13 12971068 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.197;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:402,0,405 -chr13 13083431 . A T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.365;DP=61;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:772,0,1774 -chr13 13083563 . AGC A 869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.073;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:64:907,64,0 -chr13 13083940 . T A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.407;DP=89;FS=1.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,29:89:99:1005,0,2187 -chr13 13084788 . G T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.619;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:521,0,1416 -chr13 13086826 . C T 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.703;DP=36;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:733,0,599 -chr13 13086950 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-1.665;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,25:87:99:616,0,2630 -chr13 13086963 . G T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.879;DP=90;FS=3.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:748,0,2589 -chr13 13087852 . G GT 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1262,134,0 -chr13 13097922 . A G 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-1.336;DP=101;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,31:101:99:831,0,2639 -chr13 13104601 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.709;DP=89;FS=7.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:692,0,2322 -chr13 13108639 . A G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.177;DP=61;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:536,0,1564 -chr13 13125022 . C G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=1.406;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:666,0,2773 -chr13 13561409 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.684;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:244,0,2625 -chr13 13565038 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.511;DP=131;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,30:130:99:638,0,3811 -chr13 13569474 . CGTGAGTTTCTCTACACTAACATGCAACTTCATTGCACGTTTTTCATTATCTTTTAATTGCTTTATTTCATTTTTTCACAATTTCCTTACGCAG C 2871.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.022;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=28.93;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,69:74:99:2909,0,674 -chr13 13592709 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=-2.671;DP=35;FS=10.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=13.68;ReadPosRankSum=-1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:507,0,1379 -chr13 13593484 . G T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 -chr13 13594133 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.857;DP=41;FS=10.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:380,0,1355 -chr13 13598456 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=3.731;DP=54;FS=16.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=11.13;ReadPosRankSum=-3.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:629,0,2414 -chr13 13599652 . T A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.156;DP=80;FS=17.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:380,0,2464 -chr13 13600214 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=-2.132;DP=117;FS=1.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=4.55;ReadPosRankSum=2.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:561,0,3387 -chr13 13803474 . G GTT 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=-1.315;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:882,0,1340 -chr13 13804022 . TAA T 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.055;DP=49;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:598,0,562 -chr13 13846373 . A G 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.136;DP=123;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,35:122:99:906,0,3293 -chr13 13849633 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.575;DP=120;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:749,0,3411 -chr13 13864155 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.734;ClippingRankSum=1.426;DP=79;FS=13.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:511,0,2341 -chr13 13867456 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.976;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:320,0,1186 -chr13 13928290 . C G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.100;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:366,0,1298 -chr13 13950016 . G C 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.900;DP=86;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:922,0,1930 -chr13 13963158 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-0.337;DP=52;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:563,0,1196 -chr13 14042752 . C T 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-2.037;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.52;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,321 -chr13 14043028 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.463;DP=43;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:347,0,1119 -chr13 15144995 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,414 -chr13 15291751 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:298,0,432 -chr13 15292176 . G C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:316,0,249 -chr13 15301194 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,177 -chr13 15380881 . C A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=1.158;DP=163;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,33:163:99:622,0,5262 -chr13 15382372 . G A 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=-3.630;DP=110;FS=80.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=14.25;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:1596,0,2020 -chr13 15382553 . A AT 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-1.866;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:454,0,743 -chr13 15383218 . A C 2556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=1.612;DP=109;FS=108.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=23.46;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,75:109:99:2585,0,915 -chr13 15383546 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.913;ClippingRankSum=6.180;DP=116;FS=14.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=2.66;ReadPosRankSum=-6.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,20:116:99:337,0,7549 -chr13 15383547 . A AT 1348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-3.568;DP=116;FS=7.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.63;ReadPosRankSum=3.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,67:104:99:1539,0,1543 -chr13 15383632 . A G 3056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.104;DP=166;FS=16.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,87:162:99:3085,0,2775 -chr13 15384564 . ATT A 3286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.642;ClippingRankSum=-1.237;DP=255;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,121:223:99:4041,0,2332 -chr13 15384885 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-1.257;DP=127;FS=30.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,21:126:99:281,0,4316 -chr13 15384991 . C T 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=-0.798;DP=213;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,52:213:99:1234,0,6819 -chr13 15548982 . T G 1758.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1787,126,0 -chr13 15549098 . G A 1263.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-1.570;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:17:1292,17,0 -chr13 15549389 . G T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.694;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:247,0,407 -chr13 15549454 . A G 4253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:4282,304,0 -chr13 15549515 . T C 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-0.366;DP=54;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:1384,0,977 -chr13 15549529 . C T 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.530;DP=58;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:1156,0,1986 -chr13 15549616 . C T 1718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-1.624;DP=50;FS=2.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=34.38;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1747,0,305 -chr13 15549680 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.953;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=32.63;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:99:746,0,1109 -chr13 15549733 . G T 2633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-2.341;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=27.50;ReadPosRankSum=2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:2662,0,125 -chr13 15549770 . G A 2633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=1.467;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=34.19;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,25:26:85:2662,0,85 -chr13 15549836 . A C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-3.303;DP=35;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:627,0,1594 -chr13 15549864 . G C 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,31:31:99:1577,0,239 -chr13 15549992 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.330;DP=34;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:320,0,948 -chr13 15550034 . A G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.842;DP=40;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:802,0,384 -chr13 15550136 . C T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=1.899;DP=52;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1124,0,819 -chr13 15550274 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.436;DP=56;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=29.03;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,42:55:99:1654,0,361 -chr13 15550345 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-1.115;DP=19;FS=18.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,789 -chr13 15550346 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=14.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.161;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:287,0,817 -chr13 15550403 . C T 478.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:3:505,3,0 -chr13 15550440 . A G 3638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.733;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=22.58;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:3667,259,0 -chr13 15550612 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=1.402;DP=51;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:731,0,954 -chr13 15717676 . C G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.646;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:277,0,822 -chr13 15796554 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-0.592;DP=153;FS=8.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,40:153:99:859,0,4128 -chr13 15860318 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=2.561;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:314,0,315 -chr13 15869185 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.890;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:282,0,426 -chr13 15869645 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.286;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:489,0,1249 -chr13 15869655 . T A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-0.769;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:489,0,1161 -chr13 15872450 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.716;DP=38;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:446,0,859 -chr13 16459088 . G A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.727;DP=69;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,28:69:99:983,0,1425 -chr13 16471874 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.710;DP=54;FS=8.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:425,0,1420 -chr13 16497476 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=-0.205;DP=58;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=7.63;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:471,0,3160 -chr13 16497484 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.715;DP=54;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:475,0,3160 -chr13 16544766 . C A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-1.143;DP=75;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:620,0,1887 -chr13 16920785 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=1.112;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:231,0,897 -chr13 16934868 . C T 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.296;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1085,0,961 -chr13 16937372 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-1.663;DP=60;FS=20.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=6.03;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:390,0,1880 -chr13 17147674 . T C 3430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3459,250,0 -chr13 17148299 . C CT 581.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.468;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:40:771,40,0 -chr13 17513895 . A T 327.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.71;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:11:355,0,11 -chr13 17730068 . T C 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.040;DP=96;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1691,0,1732 -chr13 17823843 . A C 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:751,54,0 -chr13 18082443 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.217;DP=44;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:472,0,731 -chr13 18095183 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.766;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:261,0,1833 -chr13 18102366 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=1.058;DP=48;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:391,0,2451 -chr13 18113337 . T G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.401;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:282,0,830 -chr13 18126033 . G A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.368;DP=51;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:864,0,822 -chr13 18132364 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.589;DP=69;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:233,0,2042 -chr13 18282484 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:249,0,50 -chr13 18284206 . A G 655.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.156;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=29.81;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:20:684,0,20 -chr13 18289769 . A G 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr13 18344523 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.725;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:229,0,386 -chr13 18347980 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=26.92;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:432,0,117 -chr13 18348617 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,429 -chr13 18389463 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,213 -chr13 18405866 . TAAGGTACTGTTTATATATAATATATGCTGCTAGAAATAACAGTTTTACTTGTTAGTCTATTACAGAGCTGCATTTGAATTCGTGAATTGTTCTTTATTA T 2553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.817;DP=81;FS=2.087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=31.53;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,77:81:99:2591,274,0 -chr13 18420216 . G A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-1.821;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,34:68:99:1097,0,1139 -chr13 18420267 . C G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.639;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:459,0,1956 -chr13 18552948 . TTGAAAATGGCTTCATTATTTTTTTTATTTGA T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:286,0,436 -chr13 18556576 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,303 -chr13 18556688 . A C 3755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=5.417;DP=224;FS=33.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,95:173:99:3784,0,668 -chr13 18558874 . C T 5896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-0.490;DP=292;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,158:291:99:5925,0,9009 -chr13 18673152 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:346,0,517 -chr13 18723098 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=-1.747;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=16.54;ReadPosRankSum=-2.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:359,0,339 -chr13 18729000 . G A 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.434;DP=68;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1328,0,1028 -chr13 18848594 . A C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.128;DP=51;FS=14.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:662,0,2233 -chr13 18848595 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-1.173;DP=51;FS=14.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:662,0,2237 -chr13 19351723 . C G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-0.078;DP=191;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,37:191:99:439,0,5048 -chr13 19362017 . A AT 2359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=-0.101;DP=278;FS=9.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,125:253:99:2397,0,2881 -chr13 19755610 . A G 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.317;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=22.45;ReadPosRankSum=-1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:567,0,272 -chr13 19757771 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.593;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:293,0,571 -chr13 19757813 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=1.045;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:415,0,540 -chr13 20350842 . C A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,175 -chr13 21777135 . GT G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.716;DP=63;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:242,0,1203 -chr13 21807961 . T TA 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.765;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:427,0,149 -chr13 21835404 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:433,30,0 -chr13 21915763 . T A 2474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=-1.069;DP=152;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:2503,0,2810 -chr13 21950865 . C G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=1.488;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:497,0,484 -chr13 21958063 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:233,0,237 -chr13 21961476 . A C 284.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:313,0,15 -chr13 21961592 . CA C 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.591;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:368,0,109 -chr13 21977414 . T C 1757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.863;DP=105;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.74;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1786,0,1687 -chr13 22006650 . C A 1737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.830;DP=112;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1766,0,1955 -chr13 22025705 . GA G 481.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:519,52,0 -chr13 22204890 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.775;DP=67;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:318,0,1958 -chr13 22347215 . C T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.126;DP=188;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,40:188:99:761,0,5622 -chr13 22381510 . GT G 2042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.710;DP=165;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,88:157:99:2080,0,1701 -chr13 22381795 . G GT 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.102;DP=162;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,54:161:99:1297,0,2755 -chr13 22382409 . G C 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.450;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,50:171:99:1232,0,7816 -chr13 22382511 . C G 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.873;DP=152;FS=0.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,36:152:99:809,0,4643 -chr13 22383423 . A C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-1.693;DP=119;FS=6.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:682,0,3516 -chr13 22397051 . G A 1216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.088;DP=86;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:1245,0,1724 -chr13 22401170 . G A 2620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-1.050;DP=137;FS=5.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=19.13;ReadPosRankSum=3.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:2649,0,1984 -chr13 22403536 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-1.015;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:365,0,2332 -chr13 22415075 . G A 4098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-1.849;DP=234;FS=11.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,119:234:99:4127,0,4181 -chr13 22415138 . G C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.213;DP=228;FS=6.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,47:226:99:784,0,6933 -chr13 22417409 . G A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.207;DP=191;FS=3.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.467;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,50:191:99:1142,0,5502 -chr13 22417526 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.586;DP=222;FS=0.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,52:222:99:1106,0,6530 -chr13 22417726 . C T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=1.151;DP=220;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,49:220:99:916,0,6614 -chr13 22457253 . C CT 711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.494;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:88:835,88,0 -chr13 22457278 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.273;DP=33;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:238,0,851 -chr13 22498065 . G T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.766;DP=72;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1209,0,1240 -chr13 22501930 . A C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=3.205;DP=66;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:317,0,1737 -chr13 22505567 . G A 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.010;DP=56;FS=9.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:938,0,1019 -chr13 22513379 . G C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.026;DP=55;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:794,0,1161 -chr13 22513485 . G A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.992;DP=49;FS=8.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:842,0,868 -chr13 22513604 . T A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.566;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:355,0,2194 -chr13 22514192 . G T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.690;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:559,0,126 -chr13 22620840 . GGGTGGGCCTAAATTCATTACTTTACGCTGGTTATCTTGACCTGCTTGGCCTGGAGATTTTTTAATTTTCGTGTTGGAGAGGTGTGAGTGTTACCTGCATTTTACACATTTTTTTCTTCTTCTTTTTTCA G 1924.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-3.641;DP=302;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=6.37;ReadPosRankSum=-6.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,76:285:99:1962,0,68488 -chr13 22621057 . C CT 621.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-1.279;DP=324;FS=6.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,63:299:99:659,0,6557 -chr13 22676427 . C G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:281,0,124 -chr13 22676446 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:242,0,173 -chr13 22682723 . GCTCATGCAGCAGCCTCCA G 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.950;ClippingRankSum=2.059;DP=166;FS=9.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=1.93;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,19:97:99:358,0,10017 -chr13 22683283 . C T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.221;DP=178;FS=14.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,49:178:99:1147,0,4662 -chr13 22685586 . C A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.213;DP=150;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,32:150:99:601,0,4634 -chr13 22691932 . T TA 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.658;DP=61;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:537,0,393 -chr13 22758663 . C CT 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.688;DP=68;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:459,0,813 -chr13 22759369 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=1.007;DP=135;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,26:135:99:477,0,4406 -chr13 22759766 . A T 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.679;DP=97;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1554,0,1829 -chr13 22760673 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.037;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:526,0,1216 -chr13 22761976 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.217;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:542,0,543 -chr13 22807314 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=-2.325;DP=85;FS=25.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=4.99;ReadPosRankSum=-6.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:452,0,2355 -chr13 22812684 . G A 5378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.282;DP=182;FS=2.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=29.55;ReadPosRankSum=2.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,140:182:99:5407,0,1709 -chr13 22816130 . C CT 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=-2.767;DP=541;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:427,105:532:99:553,0,11263 -chr13 22818062 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=-0.079;DP=451;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:383,68:451:99:430,0,16144 -chr13 22819440 . TAA T 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=-1.122;DP=44;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:583,0,889 -chr13 22827077 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.020;DP=236;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=1.71;ReadPosRankSum=3.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,37:236:99:432,0,7643 -chr13 22839135 . T TA 682.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.444;DP=186;FS=9.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,50:181:99:720,0,3585 -chr13 22873238 . C T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-0.440;DP=62;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=15.00;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:958,0,1163 -chr13 22880086 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr13 22884622 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.284;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:704,0,100 -chr13 22969600 . G T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.419;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,884 -chr13 22971309 . A G 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=-0.375;DP=63;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:749,0,1333 -chr13 22973931 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.435;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:291,0,971 -chr13 22980175 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.033;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:368,0,404 -chr13 22986582 . TCCTGCAAGTAAAAAAAGCACAAAACTCAGTGAATTCAGACCAAAACCAACATACTGTACAGTATTAGTTTTGTGTCTACAAGATGTGTTTTTGTCATA T 2317.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=2.212;DP=59;FS=2.490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,55:58:99:2355,206,0 -chr13 22997286 . GCCTGACAATGCAAAATACTGAGAACAGCATCAACAAAAAATAACTCAACTGTTGTCATGCTTAAACTTGGCAGGTA G 1148.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=1.481;DP=33;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=34.81;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:99:1186,0,1303 -chr13 22997390 . GTTCCTGGAA G 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=32.15;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:52:560,0,52 -chr13 22997401 . TAAATCAGCATGTTCAGACCAAAGCTGGCTACTTAGTTTTGAGAAACCGTATTAGTTTTATGTCTACAAGATGTATATTTGTCATA T 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=34.85;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:52:560,0,52 -chr13 23008734 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=-0.186;DP=48;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:432,0,1198 -chr13 23008764 . TGTAAGAAATTTGTTCAATTAAAAATGAAGCTGTAATTGCTGTTGTGTAAGTGTTTTTGGTTTGTCTTTTTCAG T 1406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-0.630;DP=44;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=31.97;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1444,0,3072 -chr13 23012162 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.142;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:259,0,1922 -chr13 23027963 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.134;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:391,0,1283 -chr13 23038323 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.492;DP=83;FS=7.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:355,0,2555 -chr13 23040852 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-2.087;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:495,0,2406 -chr13 23043174 . T G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=1.954;DP=54;FS=7.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:235,0,1566 -chr13 23065546 . TA T 641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:57:679,57,0 -chr13 23066077 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.103;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:331,0,1235 -chr13 23082107 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-0.283;DP=39;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:395,0,988 -chr13 23114137 . A T 2501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.252;DP=146;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:2530,0,2494 -chr13 23116264 . C A 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=-3.568;DP=144;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,35:144:99:790,0,4091 -chr13 23116441 . ACTAGAGGGAGGAAACACATTTTAGCCCGCGAACCTAACATATTCCTGACAGGATATTTTGGCTTTCAATGTGTCTGTTTTGCGAGATGAAAATGCTTCAATAC A 8961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=2.426;DP=217;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=28.35;ReadPosRankSum=-2.438 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,205:207:99:8999,661,0 -chr13 23118469 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.538;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,25:137:99:418,0,4249 -chr13 23123450 . C T 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.271;DP=190;FS=4.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,51:190:99:1223,0,5412 -chr13 23126008 . C G 3166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.556;DP=183;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,99:183:99:3195,0,3026 -chr13 23178071 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.692;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:351,0,407 -chr13 23182641 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.828;DP=27;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:546,0,311 -chr13 23199613 . G A 2693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.819;DP=119;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,78:119:99:2722,0,1351 -chr13 23202504 . T TATTTGG 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=-0.005;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:566,0,2104 -chr13 23397595 . A T 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr13 23420117 . C T 2182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=-0.744;DP=75;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,59:75:99:2211,0,342 -chr13 23429908 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:324,0,240 -chr13 23444465 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-1.729;DP=129;FS=5.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,29:129:99:601,0,3857 -chr13 23855448 . CT C 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.746;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:353,0,197 -chr13 23856699 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=-1.271;DP=28;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=10.67;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:327,0,664 -chr13 23857417 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=1.943;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:293,0,366 -chr13 23858382 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.197;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:269,0,739 -chr13 23873979 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=-0.740;DP=38;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:265,0,1022 -chr13 23889161 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:345,0,373 -chr13 24121935 . T G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=4.327;DP=174;FS=20.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=2.00;ReadPosRankSum=-3.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,28:174:99:377,0,5862 -chr13 24220325 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-2.050;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:309,0,1596 -chr13 24294620 . C T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.716;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:595,0,1096 -chr13 24320327 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.524;DP=80;FS=5.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:330,0,2307 -chr13 24492353 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.788;DP=39;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:253,0,1103 -chr13 24508782 . A T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.602;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:427,0,559 -chr13 24514175 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.836;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:268,0,746 -chr13 24516799 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.283;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:246,0,958 -chr13 24517768 . TA T 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.119;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=11.49;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:359,0,205 -chr13 24593981 . T G 765.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:20:794,0,20 -chr13 24595788 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,600 -chr13 24596893 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.048;DP=58;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:302,0,1693 -chr13 24602723 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.310;DP=42;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:240,0,2425 -chr13 24602724 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.605;DP=42;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:240,0,2425 -chr13 24602787 . A C 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.485;DP=40;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.241;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1089,0,261 -chr13 24610140 . ACTGTGGCAGAAAGTTCACACAAGAAAGGTAAACTCACATACTGCCGTTTGTTCACCAAGAATGTAGAAAGACACAACAGCAAGTGTGCAGGTGACATTCATAC A 4793.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=1.261;DP=114;FS=6.101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=33.43;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,109:112:99:4831,386,0 -chr13 24659044 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.358;DP=283;FS=5.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=3.13;ReadPosRankSum=-1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,57:283:99:915,0,8695 -chr13 24659953 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=-2.086;DP=208;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=3.57;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,44:208:99:770,0,10063 -chr13 24743801 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.954;DP=24;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:452,0,969 -chr13 24743811 . G T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.684;DP=21;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:461,0,969 -chr13 24744391 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.312;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:419,0,1265 -chr13 24772038 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=1.545;DP=40;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:252,0,1114 -chr13 24779017 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 -chr13 24784391 . AT A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.306;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=24.81;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:21:459,21,0 -chr13 24805248 . T C 3614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=2.498;DP=205;FS=3.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=17.63;ReadPosRankSum=4.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,108:205:99:3643,0,11669 -chr13 24805391 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=1.330;DP=181;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,30:181:99:373,0,5814 -chr13 24805409 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=1.416;DP=198;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=2.42;ReadPosRankSum=3.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,34:198:99:507,0,6237 -chr13 24887515 . C A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.701;DP=48;FS=6.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:901,0,868 -chr13 24888028 . C CT 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.933;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:345,0,770 -chr13 24888376 . A AT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=1.330;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:326,0,510 -chr13 24925883 . G T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.040;DP=177;FS=7.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,32:177:99:332,0,7109 -chr13 24927383 . CA C 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.149;DP=65;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:343,0,928 -chr13 24927968 . C T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-1.028;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,46:219:99:848,0,6727 -chr13 24928265 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=1.044;DP=194;FS=2.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,29:194:99:272,0,6307 -chr13 24935668 . GCCTGCAAATGTTAACACAGAATTAAATAAATCAAAACTAAAACCTTATTAAAAAATAGCAATATAAAAAAAAATGATA G 7344.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=1.713;DP=180;FS=3.415;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:7382,613,0 -chr13 24936086 . A T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=-0.803;DP=161;FS=4.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,32:161:99:565,0,5063 -chr13 25095375 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.469;DP=106;FS=5.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:624,0,2815 -chr13 25109397 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=1.322;DP=43;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:263,0,1235 -chr13 25129671 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.139;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:263,0,1566 -chr13 25142704 . T A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.173;DP=136;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,34:136:99:812,0,4005 -chr13 25143888 . C CT 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=1.942;DP=115;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,22:114:99:349,0,3463 -chr13 25434347 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-0.152;DP=31;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:245,0,1634 -chr13 25436565 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-1.916;DP=143;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=1.73;ReadPosRankSum=2.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,23:143:99:276,0,4765 -chr13 25445194 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.236;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,20:120:99:238,0,3795 -chr13 25448820 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.761;DP=140;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,27:140:99:405,0,4427 -chr13 25628705 . G C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=1.584;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:381,0,349 -chr13 25674195 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=1.018;DP=96;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,16:96:99:241,0,3175 -chr13 25696059 . CA C 2866.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2904,277,0 -chr13 25696202 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-2.025;DP=213;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,40:213:99:678,0,6804 -chr13 25696302 . CA C 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=-0.889;DP=174;FS=2.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,42:142:99:759,0,1569 -chr13 25699640 . TCTGTTTAAAGAGAAAAGCATGAGTCACATGAGCGAGCATCGACACTAACAGTGTGAAAAGCCCAGTGCAGATGTAAAATGTAC T 16732.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.773;DP=357;FS=2.665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=29.95;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,333:344:99:16770,1183,0 -chr13 25701590 . C CT 919.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.937;DP=82;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:957,0,597 -chr13 25702713 . TA T 969.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=1.062;DP=83;FS=9.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.401;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1007,0,1028 -chr13 25795224 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.815;DP=61;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:294,0,1789 -chr13 25827753 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=1.227;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:229,0,978 -chr13 26060641 . G GA 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.303;DP=222;FS=2.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,38:195:99:321,0,4241 -chr13 27266674 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-0.362;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:258,0,851 -chr13 27266895 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=1.795;DP=34;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:296,0,1012 -chr13 27266935 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=3.261;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:426,0,1191 -chr13 27434727 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:328,0,306 -chr13 27477988 . A T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.261;DP=21;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:480,0,279 -chr13 27501241 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=3.038;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:464,0,361 -chr13 27512992 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:492,0,246 -chr13 27513131 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.205;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:470,0,478 -chr13 27536956 . G T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:454,0,370 -chr13 27537126 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-1.939;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:393,0,347 -chr13 27537200 . T A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=2.478;DP=45;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:714,0,871 -chr13 27537917 . A T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.956;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,853 -chr13 27538094 . T A 1768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.444;DP=42;FS=1.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,29:41:99:1797,0,273 -chr13 27545161 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-1.222;DP=30;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:243,0,775 -chr13 27857796 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:244,0,468 -chr13 27995497 . T G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.972;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:741,0,620 -chr13 28006370 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,333 -chr13 28175429 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,260 -chr13 28175485 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=1.399;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:481,0,225 -chr13 28233785 . G A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.255;DP=113;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.888;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:1734,0,2004 -chr13 28632675 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.085;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:396,0,91 -chr13 28648899 . C T 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.056;DP=77;FS=5.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:1219,0,1407 -chr13 28655807 . C A 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=2.003;DP=73;FS=1.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1304,0,1331 -chr13 28666352 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.964;DP=32;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:267,0,1761 -chr13 28666353 . A C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=1.197;DP=31;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:267,0,1761 -chr13 28736638 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.257;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:341,0,1888 -chr13 28819764 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-2.805;DP=67;FS=4.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:277,0,2470 -chr13 28819895 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.188;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:272,0,1947 -chr13 28820261 . C T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.627;DP=46;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=15.69;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:750,0,782 -chr13 28820744 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.190;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:664,0,617 -chr13 28822699 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:337,0,407 -chr13 28825934 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-0.425;DP=31;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=29.90;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:955,0,106 -chr13 28834143 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.577;DP=42;FS=2.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=22.28;ReadPosRankSum=2.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:964,0,508 -chr13 28873450 . A C 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.625;DP=54;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:774,0,1121 -chr13 28874346 . T TA 646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=-1.183;DP=64;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:684,0,2139 -chr13 28956038 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=27.44;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:82:385,0,82 -chr13 28956562 . T G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:88:436,0,88 -chr13 28967663 . C A 5328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-1.334;DP=292;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,157:292:99:5357,0,5005 -chr13 28968292 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-6.857;DP=211;FS=22.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,36:211:99:500,0,6981 -chr13 28968377 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=7.240;DP=200;FS=38.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,36:198:99:572,0,6494 -chr13 28968790 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.127;DP=299;FS=3.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,48:299:99:573,0,10200 -chr13 28968953 . A G 5363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=2.016;DP=176;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=30.48;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,145:176:99:5392,0,434 -chr13 28969082 . A G 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.023;DP=209;FS=2.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=3.95;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,45:209:99:853,0,7087 -chr13 28969090 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=1.197;DP=226;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,34:225:99:295,0,8168 -chr13 28969403 . T G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.222;DP=35;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:609,0,1285 -chr13 28969536 . C A 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.625;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=25.59;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,36:52:99:1359,0,439 -chr13 28969635 . G A 1546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-0.530;DP=61;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,41:61:99:1575,0,541 -chr13 28969951 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,141 -chr13 28978147 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.590;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:299,0,832 -chr13 28978160 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.810;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:332,0,966 -chr13 29043939 . G T 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-2.093;DP=39;FS=6.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:687,0,804 -chr13 29090015 . A T 3765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.774;DP=129;FS=10.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,83:128:99:3794,0,990 -chr13 29090673 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.604;DP=124;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:384,0,3633 -chr13 29448415 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-1.135;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:591,0,577 -chr13 29449157 . G A 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.939;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1188,0,328 -chr13 29450117 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=1.405;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:241,0,963 -chr13 29452887 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.898;DP=78;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=3.77;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:322,0,2399 -chr13 29453353 . T G 679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.535;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:717,0,826 -chr13 29478439 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:419,0,550 -chr13 29632841 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:392,0,180 -chr13 29641566 . TCTGCAGGAAAACATCCGTTTTTACTATAATAGAACTTGATATGAACATAAAATATAACATAAAGTATTACCTTAC T 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.764;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=34.52;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:33:555,0,33 -chr13 29645803 . TC T 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=-0.236;DP=49;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:391,0,918 -chr13 29646019 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-1.774;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=10.61;ReadPosRankSum=-2.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:251,0,433 -chr13 29994639 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=2.092;DP=85;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=3.66;ReadPosRankSum=-2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:339,0,2506 -chr13 29994925 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-1.875;DP=73;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:391,0,2103 -chr13 30026413 . GTT G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.584;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:420,0,130 -chr13 30176949 . C T 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=-2.911;DP=87;FS=28.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:1070,0,1937 -chr13 30203489 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=1.131;DP=156;FS=7.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=4.07;ReadPosRankSum=2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,34:156:99:663,0,4673 -chr13 30262660 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=1.797;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:99:456,0,2961 -chr13 30267046 . AGTGAGTCGATGCTTTTACTTTTCTTCTCTAAATGTACAGTTGTTTATTTTCTGCTTTCTTTTCTCTGAGCAAACACTTTGGTTTACCGTTTCAG A 4833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.191;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,103:106:99:4871,449,0 -chr13 30357109 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-1.867;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:260,0,1701 -chr13 30391580 . G A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-1.814;DP=291;FS=0.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,55:291:99:862,0,9207 -chr13 30391767 . C T 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=-0.249;DP=291;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,59:291:99:1119,0,9120 -chr13 30392276 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.501;DP=214;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,41:210:99:282,0,6979 -chr13 30782668 . A C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.786;DP=115;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,20:115:99:293,0,3538 -chr13 30785322 . C A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-0.273;DP=200;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,42:199:99:804,0,5751 -chr13 30788759 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-2.031;DP=120;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,22:120:99:280,0,3621 -chr13 30794017 . GA G 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.037;DP=108;FS=2.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,21:100:99:293,0,1921 -chr13 30805069 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=2.512;DP=39;FS=3.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:311,0,1112 -chr13 31102244 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-2.321;DP=55;FS=4.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:415,0,1450 -chr13 31124110 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-0.339;DP=50;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:383,0,1320 -chr13 31234256 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=1.981;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:251,0,460 -chr13 31369462 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=25.63;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:387,0,449 -chr13 31371675 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.461;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:245,0,1772 -chr13 31512736 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=1.225;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:308,0,2689 -chr13 31513375 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-0.170;DP=56;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:262,0,1735 -chr13 31575648 . G T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.019;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,34:159:99:678,0,4743 -chr13 31603844 . A G 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.934;DP=140;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:99:679,0,5416 -chr13 31603851 . T A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=1.146;DP=132;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:398,0,5271 -chr13 31603854 . T A 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=123;FS=2.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1596,0,3621 -chr13 31603889 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.315;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:381,0,6288 -chr13 31604010 . T A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.602;DP=57;FS=9.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=32.07;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1856,0,853 -chr13 31604018 . A T 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.626;DP=58;FS=14.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,40:56:99:1856,0,868 -chr13 31604150 . C A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-1.678;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:332,0,337 -chr13 31652855 . GACCTGATAAGAGAAAGCCATGAGAGTGGAAGGATCTACAAAATCTGGAATCTACAAATAGAAAAGACGCTGGACTA G 14510.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=2.437;DP=358;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=32.57;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,344:354:99:14548,1132,0 -chr13 31679232 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.896;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,36:205:99:484,0,6584 -chr13 31679259 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-1.466;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.001;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,36:219:99:452,0,6986 -chr13 31679442 . T G 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=-0.023;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,45:226:99:759,0,7185 -chr13 31747963 . T C 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.754;DP=64;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:431,0,1763 -chr13 31759424 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.822;DP=51;FS=4.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:432,0,1634 -chr13 31787838 . T TA 607.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=1.334;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=15.59;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:49:840,49,0 -chr13 32031011 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,232 -chr13 32853843 . C G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-1.768;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:488,0,1552 -chr13 32859331 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.026;DP=44;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:334,0,1519 -chr13 32862279 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.080;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:309,0,1698 -chr13 32864748 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=1.292;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:439,0,930 -chr13 32866566 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.220;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:321,0,482 -chr13 32866770 . C G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.897;DP=33;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:317,0,819 -chr13 32903641 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.619;DP=44;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:265,0,1229 -chr13 32949593 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.472;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:240,0,1470 -chr13 33028089 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=1.436;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:299,0,893 -chr13 33028112 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=1.473;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:319,0,888 -chr13 33028503 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.032;DP=49;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:440,0,1237 -chr13 33028902 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=2.453;DP=48;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=4.56;ReadPosRankSum=-2.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:247,0,1436 -chr13 33039918 . A T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.014;DP=129;FS=5.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,28:129:99:559,0,4019 -chr13 33053857 . G T 2350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.387;DP=145;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:2379,0,2514 -chr13 33228288 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.677;DP=31;FS=7.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:31:99:339,0,1994 -chr13 33228304 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=3.306;DP=37;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:339,0,1994 -chr13 33237639 . C CTTGTGTGTGTGTTTGTGT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:74:270,0,74 -chr13 33243656 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.197;DP=38;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:487,0,849 -chr13 33317326 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:375,0,409 -chr13 33349873 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=-0.168;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:316,0,636 -chr13 33420043 . A C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.019;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:549,0,1968 -chr13 33434999 . T A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-1.065;DP=57;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:831,0,1173 -chr13 33441683 . ACTGCAGAAAACCCACAAAACCCATGAGCCTTCGATTACTTGGGGTGGAAAATAGGTTACATAGAGTAAAGATAAAGAGAACGACAC A 4108.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.258;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,91:94:99:4146,349,0 -chr13 33461654 . A T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=1.463;DP=286;FS=6.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.136;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,41:286:99:332,0,9533 -chr13 33471953 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-3.024;DP=90;FS=23.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:251,0,2944 -chr13 33475767 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.778;ClippingRankSum=-2.661;DP=253;FS=6.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,45:253:99:711,0,16222 -chr13 33486684 . T G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-0.212;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:376,0,1560 -chr13 33488426 . G GT 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-2.254;DP=185;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:363,0,3448 -chr13 33492359 . A T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.314;DP=55;FS=3.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:525,0,1420 -chr13 33494895 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.021;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:426,0,2090 -chr13 33496537 . GAGGTAGTGTACATCATCTGCTTTTCTCTGAATGCTTTTAAAAAGGATTGAGTGGTGCAACATTTCTTTTTCTTTGTTCCGA G 1231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=1.050;DP=43;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=28.64;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,38:42:99:1269,0,431 -chr13 33501554 . CTT C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,147 -chr13 33504740 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.015;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:397,0,1915 -chr13 33536668 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,289 -chr13 33538723 . CCCTGCATTAATAGAGACAGTGAGTAAAAAAAACTGCATGGCTAGAAAAAAAGAAATGTTATTAATGCGAAAAGCTACTTA C 1609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=2.059;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=26.22;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:99:1647,130,0 -chr13 33857819 . G A 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=-2.523;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=15.91;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:1444,0,1491 -chr13 33860509 . A G 2926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-0.095;DP=259;FS=5.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,89:259:99:2955,0,5710 -chr13 33861488 . C T 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-2.767;DP=185;FS=13.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,61:185:99:1653,0,4777 -chr13 33870124 . A T 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.114;DP=127;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,35:126:99:887,0,3632 -chr13 33870367 . C T 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.096;DP=72;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1187,0,1434 -chr13 33870699 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.615;DP=109;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:395,0,4255 -chr13 33906697 . AAT A 2052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=3.630;DP=166;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=12.37;ReadPosRankSum=-3.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:2090,0,1627 -chr13 33907248 . GACCTAAAAGTAAATAAAGATATATTTTATGAAAAACAGAGGAATGTACAGGGATAACCTCCTAAATGTAAATAAGATTTGTGTTATGT G 1565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=372;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,1:3:99:1603,0,311 -chr13 34045526 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.346;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,20:114:99:314,0,3534 -chr13 35026372 . A G 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:234,0,23 -chr13 35592938 . AGTAAGTTCAAGTATAGATTTTTTGCAAAACGTTTTTCTCTTTTTTGTGCTTCATTGAGCTCATTTTCTTGATCTTTTCTCCTCGTTTTTAG A 1656.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=1.639;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1694,134,0 -chr13 35732834 . TA T 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.723;DP=85;FS=7.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,28:85:99:617,0,1420 -chr13 35841700 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr13 36148311 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:438,0,271 -chr13 36148956 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=1.531;DP=27;FS=9.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:332,0,601 -chr13 36149046 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.785;DP=40;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:684,0,666 -chr13 36149100 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.413;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:646,0,664 -chr13 36149226 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.060;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=18.93;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:615,0,460 -chr13 36190574 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.501;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:357,0,627 -chr13 36441962 . T TA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.354;DP=138;FS=14.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,33:116:99:443,0,2087 -chr13 36447025 . ACTGAGACATTAAGAGTAAACACACCCAAATTAAACACACAGTGTTATTGAAATCACAGAAGCATGTGTGTGAAGAAAAAAAACCCTCAC A 13474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=1.721;DP=308;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,306:307:99:13512,1086,0 -chr13 36540000 . GCTGACACACACATCAACATAGACATATATTAATGTTCAAACTGATAAAAAAAAAGAGAGAGAAGGTTTTAAGGATATGAACGCAC G 4697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.826;ClippingRankSum=2.342;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=33.13;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,111:122:99:4735,0,2351 -chr13 36595730 . T C 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr13 36722955 . T TA 941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-2.200;DP=294;FS=9.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,68:253:99:979,0,4932 -chr13 36723458 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-1.406;DP=280;FS=19.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,49:166:99:1005,0,3955 -chr13 36723572 . T A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=-3.625;DP=225;FS=76.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=2.41;ReadPosRankSum=3.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,35:169:99:570,0,5148 -chr13 36845044 . C T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr13 36883689 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.933;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=22.51;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:501,0,243 -chr13 36936257 . GTT G 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=2.319;DP=190;FS=5.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=11.90;ReadPosRankSum=-7.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:2647,0,2925 -chr13 36974553 . AACCTGAGAAAGGAGAAGTGTGTTTTGACAAAGAGAGTGGGACATGTAGAAGTCATGCTAGGGTTGGTTACATTAGTGTCTGTGTTTTT A 7929.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=2.424;DP=205;FS=3.032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=31.90;ReadPosRankSum=-2.437 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,191:193:99:7967,702,0 -chr13 37046224 . GCCTGCATATATACAATAAAATAAAAAACGGTGTGATTATTTGTCATTTCAATTCAGAGTCACAATTAGAGAGCAGTTAACAGTCAGGTCA G 2093.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=0.213;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=30.79;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,56:64:99:2131,0,379 -chr13 37474189 . TG T 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=1.728;DP=81;FS=6.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:461,0,2006 -chr13 37937191 . T G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.111;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:427,0,641 -chr13 37937334 . A T 472.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=24.85;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:4:499,0,4 -chr13 38031334 . T G 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr13 38031440 . A T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.761;DP=30;FS=7.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=24.89;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:775,0,132 -chr13 38031762 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.261;DP=120;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:294,0,2036 -chr13 38069157 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.779;DP=61;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:361,0,1669 -chr13 38991237 . G GT 315.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.810;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:389,17,0 -chr13 39019330 . GA G 497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=-2.275;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:535,0,1709 -chr13 39114893 . C T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.222;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,32:64:99:1152,0,1169 -chr13 39687541 . G T 3622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=0.384;DP=680;FS=5.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.175;QD=5.33;ReadPosRankSum=2.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:511,169:680:99:3651,0,19251 -chr13 39706325 . T C 8736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-0.853;DP=536;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=16.30;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,253:534:99:8765,0,8885 -chr13 39711022 . A T 1953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-1.766;DP=608;FS=7.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=3.21;ReadPosRankSum=3.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:473,117:590:99:1982,0,18222 -chr13 39742339 . A C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=1.329;DP=51;FS=6.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:283,0,1435 -chr13 39761882 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.960;DP=69;FS=10.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:354,0,2032 -chr13 39778577 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=-0.096;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:505,0,2188 -chr13 39820535 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.865;DP=66;FS=2.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:454,0,1829 -chr13 39831827 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:452,0,417 -chr13 39832997 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:245,0,66 -chr13 39833083 . T G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,224 -chr13 39837747 . C T 292.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:320,0,12 -chr13 39837906 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,100 -chr13 39851154 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=1.468;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:287,0,134 -chr13 39857234 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:243,0,172 -chr13 40050936 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-1.150;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:349,0,3855 -chr13 40595494 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.206;DP=36;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:328,0,970 -chr13 40597345 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:418,0,730 -chr13 40602178 . ACTGGCAAACATC A 311.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:27:349,27,0 -chr13 40607208 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.458;DP=44;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:610,0,936 -chr13 40612579 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.246;DP=37;FS=10.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:289,0,910 -chr13 40612792 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.541;DP=45;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.06;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:256,0,1216 -chr13 40757780 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=22.80;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:393,0,149 -chr13 40785267 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.726;DP=62;FS=7.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:372,0,1811 -chr13 40785390 . C T 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-0.933;DP=291;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,69:291:99:1460,0,8504 -chr13 41057645 . A C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.437;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:511,0,531 -chr13 41057859 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.287;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:856,0,1028 -chr13 41058063 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=2.335;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=5.44;ReadPosRankSum=-2.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:235,0,1115 -chr13 41568353 . TTA T 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-1.395;DP=20;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:259,0,532 -chr13 42777596 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.220;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:359,0,399 -chr13 42777610 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.087;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:309,0,509 -chr13 42796366 . G A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-1.533;DP=45;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:605,0,1008 -chr13 43004912 . A AT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-2.047;DP=27;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:305,0,189 -chr13 43013268 . GT G 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.887;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:304,0,146 -chr13 43125143 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.824;DP=31;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:269,0,805 -chr13 43125220 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,310 -chr13 43130008 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=29.58;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:61:324,0,61 -chr13 43169896 . C G 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=1.617;DP=104;FS=5.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,38:104:99:1282,0,2252 -chr13 43172638 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=-0.524;DP=103;FS=3.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,17:99:99:243,0,3260 -chr13 43216441 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.857;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:367,0,337 -chr13 43218109 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=1.045;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:410,0,567 -chr13 43220150 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.684;DP=29;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:229,0,785 -chr13 43220183 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.586;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:284,0,1080 -chr13 43221821 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=1.317;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:328,0,1243 -chr13 43222196 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-2.039;DP=46;FS=5.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:302,0,1272 -chr13 43334495 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.113;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:370,0,1116 -chr13 43334736 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=2.769;DP=56;FS=4.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:657,0,1388 -chr13 43345982 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.847;DP=98;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:449,0,2858 -chr13 43350882 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr13 43381464 . A AT 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.154;DP=149;FS=7.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,18:139:99:369,0,3419 -chr13 43387008 . C T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=1.115;DP=158;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,40:153:99:799,0,8496 -chr13 43892996 . G T 2067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-2.892;DP=372;FS=11.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=5.56;ReadPosRankSum=2.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,93:372:99:2096,0,10958 -chr13 43895139 . A G 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=1.307;DP=386;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,84:386:99:1516,0,11342 -chr13 43896333 . G T 3804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.654;DP=631;FS=11.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:464,165:629:99:3833,0,17773 -chr13 43922106 . C A 1880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.827;ClippingRankSum=-0.291;DP=440;FS=6.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:339,101:440:99:1909,0,12878 -chr13 43922121 . T C 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=-1.085;DP=352;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,66:352:99:1040,0,11079 -chr13 43947904 . A T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.143;DP=43;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:389,0,1101 -chr13 43953574 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.398;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:302,0,1772 -chr13 44034477 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.153;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:296,0,1421 -chr13 44034607 . A T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=1.133;DP=53;FS=2.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:512,0,2897 -chr13 44034617 . G T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=1.782;DP=50;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:515,0,2897 -chr13 44035451 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.760;DP=48;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:235,0,1390 -chr13 44137752 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.142;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:476,0,347 -chr13 44138242 . C G 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-0.061;DP=43;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:692,0,794 -chr13 44139489 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:291,0,63 -chr13 44139491 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:291,0,63 -chr13 44149513 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=1.762;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:350,0,1936 -chr13 44175597 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.913;DP=45;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=11.91;ReadPosRankSum=3.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:564,0,1038 -chr13 44181565 . C A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.369;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:983,0,977 -chr13 44235313 . G C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=1.310;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:508,0,517 -chr13 44243461 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.547;DP=38;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:288,0,975 -chr13 44254484 . T G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-1.445;DP=37;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:314,0,1307 -chr13 44279697 . A C 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.259;DP=82;FS=1.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:635,0,4062 -chr13 44284113 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:276,0,49 -chr13 44288092 . T A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.609;DP=114;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:641,0,3357 -chr13 44288173 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.834;DP=76;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:347,0,2207 -chr13 44288512 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.557;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:384,0,743 -chr13 45322713 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=-0.409;DP=270;FS=8.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=3.36;ReadPosRankSum=2.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,59:270:99:936,0,16950 -chr13 45322718 . GA G 951.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=1.112;DP=279;FS=10.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,56:279:99:989,0,16358 -chr13 45385893 . T TA 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr13 45387377 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=1.888;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:542,0,612 -chr13 45394830 . T C 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:420,30,0 -chr13 45394853 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr13 45428214 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;ClippingRankSum=-2.607;DP=171;FS=7.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=2.02;ReadPosRankSum=2.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,28:170:99:374,0,5551 -chr13 45455478 . G C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,107 -chr13 45683143 . T C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-2.526;DP=100;FS=4.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,33:98:99:1064,0,2223 -chr13 45683208 . T C 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-0.778;DP=56;FS=3.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:696,0,1223 -chr13 46063485 . G A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr13 46101980 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-1.110;DP=163;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,30:162:99:434,0,5267 -chr13 46127388 . C G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=23.71;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:289,0,96 -chr13 46185598 . AGTGAGACTCCCATTCTTCACCATAACATATAACCCAATGCAGTGCTCTAGCTGTGTTAATGCGAATTCTTTGTGTGCACGTTCAG A 4867.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.544;DP=137;FS=6.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=30.94;ReadPosRankSum=-1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,132:137:99:4905,0,216 -chr13 46534705 . C CT 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.049;DP=62;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:263,0,1060 -chr13 46747290 . C T 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=6.563;DP=127;FS=4.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=16.67;ReadPosRankSum=-5.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:2145,0,5131 -chr13 46747508 . CT C 15141.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.322;DP=373;FS=0.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=32.26;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,201:373:99:15179,0,6227 -chr13 46748029 . G GTT 3398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.410;ClippingRankSum=0.723;DP=261;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=13.02;ReadPosRankSum=-2.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,147:218:99:4966,0,1760 -chr13 46909836 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.058;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:1503,0,1501 -chr13 46910968 . A G 2752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.205;DP=196;FS=7.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,79:196:99:2781,0,4081 -chr13 46911581 . GA G 2247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-1.976;DP=180;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=12.49;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:2285,0,2183 -chr13 46911699 . A G 2633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.458;DP=144;FS=3.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.120;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:2662,0,2423 -chr13 46911783 . C T 2488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.593;DP=186;FS=11.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=13.38;ReadPosRankSum=2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,72:185:99:2517,0,3890 -chr13 46930977 . A T 3013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.451;DP=195;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=15.46;ReadPosRankSum=2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,87:195:99:3042,0,3627 -chr13 46955508 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:42:270,0,42 -chr13 46979844 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-1.120;DP=178;FS=2.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,40:178:99:794,0,5098 -chr13 47040291 . C CT 776.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=-0.879;DP=218;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,55:190:99:814,0,3583 -chr13 47219996 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.421;ClippingRankSum=3.287;DP=29;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=8.58;ReadPosRankSum=-3.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:277,0,1534 -chr13 47256454 . T A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.790;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.903;QD=24.91;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:626,0,1110 -chr13 47336074 . A G 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=1.362;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,33:68:99:1181,0,1086 -chr13 47731877 . T G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:230,0,66 -chr13 47882121 . CA C 337.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr13 47884192 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=1.247;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:368,0,190 -chr13 48006885 . GCCCTGTGTAAAACACACACATACAGATTAGAAAAGTCAAAGGTTATACAAAGCAAGGCTATATTGCAAAATAATGTTACTGTATTGCAGT G 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=1.670;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:301,0,2533 -chr13 48148606 . C CT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:276,0,274 -chr13 48185168 . A G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.141;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=27.81;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:946,0,252 -chr13 48193758 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=1.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:255,0,186 -chr13 48193812 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,424 -chr13 48194067 . GA G 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.724;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:350,0,220 -chr13 48409252 . G A 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr13 48727553 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:326,0,95 -chr13 48808162 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.548;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:285,0,917 -chr13 48812243 . C G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.243;DP=39;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:538,0,795 -chr13 48819758 . AT A 270.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=22.56;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:307,6,0 -chr13 48836628 . A AC 443.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:38:532,38,0 -chr13 48861307 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.173;DP=21;FS=10.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:296,0,808 -chr13 48978553 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,452 -chr13 49357161 . AATGGACATCTTGTAATCTGTCGAGACTTTACCTGCAGTTGATTTGATTTTCAACTTTCGCTGCTTCTCTTTTCATCCAGTC A 6296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=3.201;DP=143;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,139:143:99:6334,528,0 -chr13 49359151 . C T 3204.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=-0.355;DP=166;FS=4.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=19.31;ReadPosRankSum=2.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,96:166:99:3232,0,2428 -chr13 49364390 . ATG A 6896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.654;DP=165;FS=3.401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=35.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:6934,580,0 -chr13 49364395 . CAGGTAATCTGAACACACTCCTGCATTATAAACCTTCAGATGAGCAGCTGAAGAATCACTCGTCTCTCTGTTCCCTCT C 6896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.157;DP=163;FS=2.283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=31.19;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,151:154:99:6934,580,0 -chr13 49372253 . TTCAGGTAATATTTCCATCGCTGTCGCTGGACGTTTTGATAACAAGTCTGATATTCAGATAAACAAGCGTGGTGTGAATCTGTCC T 6364.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=1.350;DP=161;FS=1.875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,156:161:99:6402,525,0 -chr13 49375760 . ACAGGTAACGCTCCTTTTCCCAGCATGCATCTGTGATCTGGTGTGATCCTCAGCGTGGATGCTCAGCACTTTTCTTCTTCTTCTGTG A 6403.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=2.786;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,145:155:99:6441,509,0 -chr13 49525058 . C CTCTGTG 278.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:316,24,0 -chr13 49686694 . GAGGTACATGACCAACAGCTAAAAAGTGGGTCCAATTCACCCATTGTGAAATTATTTTTGTTTTTGTCATTTCCTTGGAGGGTATTGAAACTACCCTTTCGGTGATCACTGTGAGAAGACGTGTGTAGATCAGTTAGATTAGAGCAGGGGTGCCTTATTTCTCTGTTTTCTTTT G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=3.352;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=3.43;ReadPosRankSum=-2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,57:67:99:267,0,4727 -chr13 49695899 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=1.271;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:336,0,760 -chr13 49696555 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:254,0,684 -chr13 49696608 . AT A 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.567;DP=36;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:305,0,481 -chr13 49697061 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:295,0,1046 -chr13 49698125 . A G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-0.601;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:703,0,525 -chr13 49846239 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=2.715;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,782 -chr13 49864969 . C T 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.838;DP=51;FS=8.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:950,0,892 -chr13 49930717 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-1.560;DP=51;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:729,0,1004 -chr13 49979010 . G T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=1.595;DP=34;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:468,0,615 -chr13 50311529 . A C 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr13 50420784 . C CA 1729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-0.593;DP=189;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1767,0,1501 -chr13 50542263 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.154;DP=44;FS=5.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:341,0,1221 -chr13 50582814 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=2.654;DP=149;FS=16.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,41:149:99:1009,0,3870 -chr13 50590926 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.540;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,803 -chr13 50592446 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,140 -chr13 50725082 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.294;DP=62;FS=9.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,12:62:99:246,0,4031 -chr13 50842157 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-2.504;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.49;ReadPosRankSum=2.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:304,0,481 -chr13 50842540 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.265;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:348,0,1218 -chr13 50866449 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.103;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=11.19;ReadPosRankSum=3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:375,0,707 -chr13 50956094 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.764;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:320,0,556 -chr13 51106767 . G A 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-2.374;DP=220;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,66:219:99:1736,0,5876 -chr13 51207561 . AACCTGAGTAGCAGAGAATTTGCATTAATAAAGAGCATTTCTGCCTTAAACATGATCATGTATGTGTGTAAATGTCTTGAATACTG A 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.496;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=34.18;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:550,0,824 -chr13 51214006 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-0.172;DP=70;FS=3.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:482,0,1963 -chr13 51214042 . T G 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.683;DP=64;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:963,0,1201 -chr13 51228891 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=-0.258;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:356,0,683 -chr13 51230360 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,191 -chr13 51239915 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.740;DP=38;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:296,0,1021 -chr13 51264191 . TCTGAAAAGAAAAGCACATGGAAGAAATGTAAGACGAAATGCATTTGAGGGAACTAGAAAAAACTTCAGATTTAGTACATTTTCACAC T 1358.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:99:1396,111,0 -chr13 51329735 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-1.388;DP=122;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:405,0,3714 -chr13 51340439 . T C 1092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.341;DP=105;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:101:99:1121,0,2280 -chr13 51360399 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.992;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:384,0,753 -chr13 51362967 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-1.726;DP=44;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:376,0,1183 -chr13 51381261 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=-0.995;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:338,0,1073 -chr13 51399849 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-0.382;DP=37;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=7.89;ReadPosRankSum=2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:320,0,960 -chr13 51399927 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-1.138;DP=41;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:360,0,935 -chr13 52197512 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=-1.557;DP=29;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:341,0,518 -chr13 52203402 . A G 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-2.041;DP=39;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:786,0,612 -chr13 52203453 . C T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-1.676;DP=40;FS=6.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:838,0,501 -chr13 52203956 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=-0.584;DP=86;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:374,0,4431 -chr13 52203957 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=-0.730;DP=89;FS=4.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:374,0,4431 -chr13 52204490 . GT G 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=-2.347;DP=41;FS=19.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:252,0,919 -chr13 52204538 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=1.031;DP=32;FS=6.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:251,0,1594 -chr13 52204666 . A AT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=1.378;DP=21;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:314,0,740 -chr13 52204824 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-1.528;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.32;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:448,0,122 -chr13 52205169 . T A 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.235;DP=76;FS=0.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:1104,0,1710 -chr13 52205178 . T C 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.616;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1160,0,1816 -chr13 52205735 . G C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.540;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:621,0,492 -chr13 52205857 . A G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-1.931;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:630,0,606 -chr13 52262523 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,217 -chr13 52262671 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,253 -chr13 52329159 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,203 -chr13 52330622 . A G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.013;DP=41;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:575,0,1470 -chr13 52331176 . T TA 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.942;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:311,0,620 -chr13 52988501 . C A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-0.508;DP=56;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:970,0,906 -chr13 52990970 . T G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=1.164;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:385,0,167 -chr13 52991769 . C CT 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-1.214;DP=43;FS=5.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:307,0,670 -chr13 52991781 . G T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-1.002;DP=37;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:446,0,885 -chr13 52994727 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,302 -chr13 52998129 . T G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.255;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:88:456,0,88 -chr13 52998623 . C G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.323;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:308,0,641 -chr13 52998918 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:282,0,402 -chr13 52999359 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=1.191;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:309,0,1015 -chr13 53000605 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-3.756;DP=34;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.35;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:856,0,1440 -chr13 53160790 . G A 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=-2.538;DP=118;FS=1.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,42:118:99:1330,0,2614 -chr13 53630031 . A AAC 307.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.668;DP=25;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:5:344,5,0 -chr13 53784662 . A T 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1282,87,0 -chr13 53851567 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.613;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:296,0,1374 -chr13 53876092 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.916;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:435,0,2505 -chr13 53881101 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=1.424;DP=45;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:261,0,1158 -chr13 53889546 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=-1.593;DP=46;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:598,0,990 -chr13 53899600 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=1.004;DP=88;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:287,0,2678 -chr13 53907852 . C T 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=4.287;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=23.96;ReadPosRankSum=3.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:771,0,212 -chr13 53910717 . T A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.39;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:24:379,24,0 -chr13 53979133 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:54:730,54,0 -chr13 53984117 . GGACCTGACCAACACACACAGACACACACACACACACACATCAGCGTCAGTCACACACACACACACACACAGGCAGGCAGAGGGGTGTAGACGCT G 9210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.137;DP=247;FS=1.340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,218:227:99:9248,569,0 -chr13 54022671 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:407,0,242 -chr14 952 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,407 -chr14 1456 . C A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=1.458;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:414,0,1277 -chr14 6725 . G C 5927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.069;DP=327;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,166:327:99:5956,0,5956 -chr14 9996 . C G 1502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.111;DP=87;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:1531,0,1407 -chr14 19069 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=2.008;DP=54;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:267,0,3143 -chr14 39008 . GGA G 1560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.222;DP=82;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:1598,0,1321 -chr14 104819 . C A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.411;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:709,0,239 -chr14 122764 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,241 -chr14 144119 . GTA G 803.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.818;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=29.77;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:26:841,26,0 -chr14 155762 . C G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.904;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:374,0,680 -chr14 192169 . A G 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.449;DP=119;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1995,0,1805 -chr14 196745 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-2.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.55;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:414,0,558 -chr14 197410 . A T 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:18:238,18,0 -chr14 223715 . ACACCTACAGCACAGAGCAGACAGTGTGTGTGTGTGTGTGATCAGCAGCAGTGTTCATCATCTCAGGTACG A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=17.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:243,0,1861 -chr14 226737 . TGGTGAGCAGCTTTACCAACACTGACGTCTCTGAAGAGTGTGTAGAAATGAAGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA T 3790.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.707;DP=151;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,114:137:99:3828,0,6526 -chr14 240244 . T C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr14 246363 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,174 -chr14 274518 . C CA 344.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.741;DP=702;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=0.49;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:16:382,16,0 -chr14 274521 . T C 353.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:16:382,16,0 -chr14 470142 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-0.014;DP=43;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:256,0,1493 -chr14 478208 . G T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-1.099;DP=59;FS=7.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1021,0,1077 -chr14 535731 . C T 1572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1601,122,0 -chr14 536081 . C T 1115.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1144,84,0 -chr14 566782 . TG T 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:62:687,62,0 -chr14 568209 . G T 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 -chr14 569977 . G A 518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:547,39,0 -chr14 585072 . A G 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 -chr14 600001 . T C 1235.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:90:1264,90,0 -chr14 659036 . AAGGTGAGCGGGTCTGCAGATCAGCCACTTCATTCGCTGCCTCATCATGGCTCGTCATCTCTGTGTGTGCTGGTGTGTTTC A 574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=1.379;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=4.63;ReadPosRankSum=-2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,120:124:99:612,236,0 -chr14 937507 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=2.113;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=25.44;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:359,0,170 -chr14 938980 . T TA 388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:426,35,0 -chr14 1000301 . GT G 402.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:440,43,0 -chr14 1033204 . T C 915.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:944,66,0 -chr14 1039680 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:278,0,60 -chr14 1086354 . C G 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr14 1147769 . TCA T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=2.453;DP=38;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,8:38:99:240,0,4014 -chr14 1203629 . C T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=1.252;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1152,0,1341 -chr14 1210114 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=1.988;DP=28;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=28.78;ReadPosRankSum=3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:834,0,119 -chr14 1240249 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-1.813;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:232,0,224 -chr14 1297260 . C G 5822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-1.767;DP=169;FS=3.250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,140:150:99:5851,298,0 -chr14 1297512 . C T 6411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=-1.680;DP=235;FS=7.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=27.28;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,152:185:99:6440,0,1286 -chr14 1297513 . A G 6411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=-0.603;DP=234;FS=9.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=27.40;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,155:186:99:6440,0,1238 -chr14 1297680 . G A 7682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-1.149;DP=220;FS=2.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=34.92;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,190:208:99:7711,282,0 -chr14 1297839 . G C 6732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.220;DP=185;FS=4.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,159:164:99:6761,482,0 -chr14 1767757 . C A 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.046;DP=53;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:711,0,1051 -chr14 1783550 . CA C 790.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=-0.673;DP=193;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,53:173:99:828,0,3128 -chr14 1783780 . T C 3323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.794;DP=297;FS=4.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,101:297:99:3352,0,6808 -chr14 1783796 . G A 3525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=1.581;DP=288;FS=8.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,103:288:99:3554,0,6543 -chr14 1784391 . G T 4075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=1.323;DP=304;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,121:303:99:4104,0,6544 -chr14 1784403 . A T 4067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.888;DP=304;FS=5.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,119:304:99:4096,0,6529 -chr14 1785612 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=-0.590;DP=314;FS=16.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,58:314:99:472,0,10044 -chr14 1785643 . G T 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.109;DP=322;FS=5.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,60:321:99:975,0,10445 -chr14 1786943 . C T 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.363;DP=331;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,78:330:99:1717,0,20039 -chr14 2065292 . A AC 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.345;DP=31;FS=5.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:394,0,637 -chr14 2065934 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-1.793;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:256,0,1035 -chr14 2066026 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.503;DP=33;FS=8.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:253,0,874 -chr14 2229308 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;ClippingRankSum=-1.418;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:321,0,351 -chr14 2229702 . G C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.310;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=10.32;ReadPosRankSum=2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:348,0,681 -chr14 2249210 . C T 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 -chr14 2249217 . G T 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:42:607,42,0 -chr14 2318029 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.454;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:381,0,248 -chr14 2330006 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:366,0,310 -chr14 2330015 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:366,0,310 -chr14 2347264 . T C 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:636,45,0 -chr14 2347285 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:730,54,0 -chr14 2347549 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,213 -chr14 2347688 . C T 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -chr14 2347813 . T C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr14 2347819 . A C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 -chr14 2348371 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr14 2348788 . G C 2051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.482;DP=112;FS=1.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=18.32;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:2094,0,1539 -chr14 2349382 . A C,G 886.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.220;DP=51;FS=7.384;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:8,30,13:51:99:1243,117,325,854,0,1122 -chr14 2380174 . C T 855.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:884,60,0 -chr14 2380514 . A G 767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:796,54,0 -chr14 2380516 . A C 767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:796,54,0 -chr14 2380727 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr14 2380772 . A T 834.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:863,60,0 -chr14 2382245 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:368,0,593 -chr14 2425874 . A T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr14 2426831 . G A 480.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.496;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=34.32;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:3:507,0,3 -chr14 2554955 . A T 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 -chr14 2563955 . G A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr14 2595607 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.333;DP=33;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.978;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:277,0,863 -chr14 2596183 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.749;DP=63;FS=5.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:776,0,1336 -chr14 2596802 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.515;DP=43;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:576,0,965 -chr14 2741777 . T G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.752;DP=50;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:325,0,1572 -chr14 2741798 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.100;DP=58;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:303,0,1755 -chr14 2741810 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.833;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:400,0,1580 -chr14 2765784 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.603;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:396,0,657 -chr14 2766174 . C A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.056;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:740,0,391 -chr14 2766597 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-2.364;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=16.49;ReadPosRankSum=2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:391,0,406 -chr14 2766756 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.010;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:633,0,558 -chr14 2766927 . A T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.155;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:571,0,600 -chr14 2767144 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.086;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:616,0,558 -chr14 2767163 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=1.366;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:666,0,485 -chr14 2767383 . A C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-1.054;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:456,0,433 -chr14 2767401 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.845;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:601,0,222 -chr14 2805812 . C CA 883.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=-0.050;DP=148;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,49:136:99:921,0,1988 -chr14 2809283 . CAA C 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=1.212;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:609,0,2126 -chr14 2872698 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr14 2879103 . T C 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr14 2955326 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.454;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:522,0,783 -chr14 2955330 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-0.858;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=23.51;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:522,0,783 -chr14 2969716 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:385,0,92 -chr14 2971300 . T A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr14 2971531 . A G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr14 2989788 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.392;DP=41;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:481,0,979 -chr14 2989818 . C T 3066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3095,220,0 -chr14 2999363 . G A 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr14 3007775 . T C 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr14 3027409 . G T 2816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=-2.640;DP=234;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,84:234:99:2845,0,5350 -chr14 3069264 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.253;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:276,0,441 -chr14 3110535 . C T 653.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=27.56;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:17:682,17,0 -chr14 3110740 . C G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 -chr14 3110935 . C G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr14 3110994 . C A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr14 3111803 . G A 2130.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:2159,147,0 -chr14 3111813 . T C 2130.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2159,147,0 -chr14 3111966 . G C 1713.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1742,126,0 -chr14 3112070 . T TTA 259.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:297,20,0 -chr14 3166021 . C G 1388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1417,99,0 -chr14 3171606 . C T 1261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1290,90,0 -chr14 3178211 . TGGTGAGTGTTTTAGAGCCGTAAACATCGCACTCAGCACCCATCCGTAAATATTTCTCAATATTTTTCTCTCTCCTGCA T 1570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=1.639;DP=37;FS=3.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=29.56;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1608,126,0 -chr14 3179613 . T C 1112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1141,81,0 -chr14 3179690 . A G 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1020,69,0 -chr14 3179691 . G A 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1020,69,0 -chr14 3183196 . G A 988.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1017,72,0 -chr14 3183866 . CA C 478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:516,42,0 -chr14 3184495 . T C 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 -chr14 3184763 . G C 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:726,54,0 -chr14 3184826 . GT G 583.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:621,57,0 -chr14 3185019 . CA C 1124.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:94:1162,94,0 -chr14 3185218 . A G 938.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:967,69,0 -chr14 3185305 . A AAT 742.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.073;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=28.82;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:59:780,59,0 -chr14 3209141 . C G 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:665,48,0 -chr14 3209184 . C T 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:681,51,0 -chr14 3217402 . C T 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr14 3217423 . A G 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:686,48,0 -chr14 3476338 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=2.386;DP=33;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:452,0,710 -chr14 3481466 . A C 1396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.866;DP=44;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:78:1425,0,78 -chr14 3481507 . C T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.778;DP=32;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=29.52;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:973,0,240 -chr14 3585124 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:293,0,54 -chr14 3585352 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.722;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:357,0,387 -chr14 3589211 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:262,0,61 -chr14 3590251 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=1.194;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:471,0,279 -chr14 3590278 . GT G 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.694;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:268,0,234 -chr14 3590417 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.091;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:652,0,210 -chr14 3591580 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:298,0,188 -chr14 3748855 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.158;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:275,0,256 -chr14 3895106 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.570;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:493,0,202 -chr14 4054986 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-1.926;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:97:614,0,97 -chr14 4120003 . C A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:358,0,366 -chr14 4151408 . G T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.353;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:720,0,495 -chr14 4186661 . C A 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.550;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,31:49:99:1075,0,611 -chr14 4222035 . G A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.604;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:585,0,592 -chr14 4222411 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:654,0,662 -chr14 4263417 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.772;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,229 -chr14 4304675 . G T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.849;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:622,0,670 -chr14 4307785 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=19.28;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:356,0,268 -chr14 4308049 . G T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr14 4312728 . ATGCTGAGGGAGGAAAAATGCAGG A 213.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:251,27,0 -chr14 4312753 . GTTTCTGACTGATTGTTTACATAAATAAAACCTGATGACTATAAAATAACGCAC G 213.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:251,27,0 -chr14 4342496 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=1.813;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:417,0,911 -chr14 4342500 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=2.473;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:417,0,911 -chr14 4368894 . T A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=1.051;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:569,0,165 -chr14 4369764 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr14 4369782 . C T 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr14 4370917 . T G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:327,0,162 -chr14 4371522 . T A 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr14 4371536 . T A 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 -chr14 4472257 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=1.835;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:256,0,134 -chr14 4480003 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.613;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:534,0,536 -chr14 4497524 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.830;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=17.34;ReadPosRankSum=2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:479,0,1352 -chr14 4497525 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-0.830;DP=26;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:531,0,1168 -chr14 4501435 . T G 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=2.562;DP=72;FS=7.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:693,0,1859 -chr14 4501657 . C G 2736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-0.752;DP=56;FS=4.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=39.71;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2765,231,0 -chr14 4503000 . A T 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.617;DP=65;FS=6.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:984,0,1328 -chr14 4503221 . T A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.910;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:532,0,792 -chr14 4504247 . G GT 1872.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-2.299;DP=49;FS=6.295;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=30.26;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:44:1910,44,0 -chr14 4511836 . G A 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=-2.502;DP=123;FS=3.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=13.62;ReadPosRankSum=2.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:1704,0,2461 -chr14 4550822 . C G 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=1.068;DP=58;FS=14.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:867,0,1105 -chr14 4574595 . A C 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=-0.326;DP=41;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:732,0,735 -chr14 4596846 . C A 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.541;DP=52;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:757,0,1064 -chr14 4596851 . T A 2250.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2279,160,0 -chr14 4597008 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.062;DP=64;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,38:64:99:1288,0,924 -chr14 4597147 . G A 2545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=1.173;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=27.33;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,61:62:99:2574,183,0 -chr14 4597200 . A C 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.799;DP=59;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1122,0,983 -chr14 4597410 . C T 2501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2530,195,0 -chr14 4597739 . G A 1518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.806;DP=73;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:1547,0,1032 -chr14 4598429 . C T 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.319;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1358,0,1614 -chr14 4598516 . T C 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.326;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1368,0,920 -chr14 4598994 . G C 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.366;DP=62;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1093,0,1085 -chr14 4599030 . A C 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.535;ClippingRankSum=-0.562;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1039,0,897 -chr14 4599099 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-1.211;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:576,0,492 -chr14 4599173 . G T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.517;DP=38;FS=7.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:774,0,572 -chr14 4599192 . C A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=-0.451;DP=46;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:845,0,1813 -chr14 4599198 . T G 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-0.066;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:845,0,1823 -chr14 4599282 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-1.008;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:556,0,580 -chr14 4599372 . ATT A 281.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:465,37,0 -chr14 4599499 . G A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.055;DP=56;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:894,0,1090 -chr14 4599585 . C A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.044;DP=69;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:837,0,1571 -chr14 4599673 . A T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.505;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:537,0,869 -chr14 4599784 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-1.604;DP=45;FS=4.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:271,0,1230 -chr14 4599939 . T A 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1096,78,0 -chr14 4600059 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.197;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:422,0,295 -chr14 4600139 . T C 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 -chr14 4600183 . C T 912.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:941,66,0 -chr14 4600298 . A G 718.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:747,54,0 -chr14 4600336 . T A 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:661,48,0 -chr14 4600493 . T C 1228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1257,87,0 -chr14 4600542 . T C 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:850,60,0 -chr14 4600604 . A C 888.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-1.410;DP=24;FS=7.877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:38:917,38,0 -chr14 4600633 . T G 791.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:820,57,0 -chr14 4600776 . G T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=2.441;DP=35;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=21.11;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:767,0,467 -chr14 4600811 . C A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.503;DP=36;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:753,0,477 -chr14 4600832 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.419;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:245,0,860 -chr14 4601125 . T A 1702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1731,123,0 -chr14 4601258 . G A 678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:707,51,0 -chr14 4601292 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr14 4601531 . T C 2266.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2295,166,0 -chr14 4601634 . A T 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.864;DP=48;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=20.64;ReadPosRankSum=2.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1019,0,680 -chr14 4601719 . T C 799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.569;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=29.85;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:828,60,0 -chr14 4601754 . G A 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:804,60,0 -chr14 4601791 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.102;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=19.26;ReadPosRankSum=2.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:452,0,284 -chr14 4602019 . A G 1404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1433,99,0 -chr14 4602053 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-0.192;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:447,0,700 -chr14 4602170 . A G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-1.477;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=23.11;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:837,0,411 -chr14 4602320 . T C 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.420;DP=40;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=24.04;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:64:990,0,64 -chr14 4602509 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-2.023;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:331,0,1142 -chr14 4602568 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.773;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:708,0,707 -chr14 4619065 . G T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-1.791;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,234 -chr14 4619309 . A C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.604;DP=45;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:564,0,968 -chr14 4621101 . G A 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:882,66,0 -chr14 4808800 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=1.096;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:366,0,367 -chr14 4821279 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.902;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,443 -chr14 4821610 . A C 1395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1424,102,0 -chr14 4822933 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:243,0,409 -chr14 5130463 . CA C 571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.515;DP=72;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:609,0,1009 -chr14 5131687 . A AT 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.343;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:643,0,661 -chr14 5394694 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.702;DP=61;FS=9.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:493,0,1659 -chr14 5394845 . CT C,CTT 633.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=-1.444;DP=40;FS=2.750;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=15.83;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,14,18:35:99:737,405,574,340,0,471 -chr14 5394945 . TA T 716.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=2.195;DP=31;FS=11.614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=23.12;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:30:754,30,0 -chr14 5594257 . C T 818.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=2.227;DP=22;FS=3.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=37.23;ReadPosRankSum=-1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:25:847,25,0 -chr14 5594995 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-1.311;DP=49;FS=2.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:456,0,1318 -chr14 5596140 . T TA 218.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:256,27,0 -chr14 5596437 . TA T 323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:361,34,0 -chr14 5841372 . G A 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=2.712;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:942,0,1348 -chr14 5841374 . C T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=2.304;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=20.77;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:942,0,1348 -chr14 5861019 . A G 2347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-1.092;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=16.53;ReadPosRankSum=3.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:2376,0,2436 -chr14 5866243 . A T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.432;DP=71;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:970,0,1646 -chr14 5868850 . CAGGTGAGAGTCTAATTACTTTACTAATATTTTTCCTTTTTTTTATTTTTTTATTTATTTAATTTTTATGTATTTTTTTTATTAAATCTTTATTGTGAACCCTGAAATTCTGGAATTTGTATTTTTTCTTT C,CGGTGAGAGTCTAATTACTTTACTAATATTTTTCCTTTTTTTTATTTTTTTATTTATTTAATTTTTATGTATTTTTTTTATTAAATCTTTATTGTGAACCCTGAAATTCTGGAATTTGTATTTTTTCTTT 12043.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-2.194;DP=354;FS=7.063;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=34.02;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,167,176:348:99:14102,6776,6077,6722,0,6078 -chr14 5868852 . GGTGAGAGTCTAATTACTTTACTAATATTTTTCCTTTTTTTTATTTTTTTATTTATTTAATTTTTATGTATTTTTTTTATTAAATCTTTATTGTGAACCCTGAAATTCTGGAATTTGTATTTTTTCTTTA G 5956.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-2.235;DP=347;FS=4.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,173:343:99:5994,0,6815 -chr14 6255114 . GCCTGTGAACACATTTGAGAAACTGAAACATTTTAGCGGTGTGCAGGGTTTCTGCATTCGTGTTCGTGGTGATGTCACTCA G 1175.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=2.281;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=28.62;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:99:1213,110,0 -chr14 6338176 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=-1.105;DP=38;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:495,0,838 -chr14 6348249 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,174 -chr14 6455685 . G GACGGA 2432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.597;DP=169;FS=4.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:2470,0,2873 -chr14 6460010 . G A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=4.464;DP=133;FS=11.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,34:133:99:765,0,3674 -chr14 6484203 . G A 2335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=-1.538;DP=140;FS=4.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:2364,0,2321 -chr14 6484395 . G A 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.775;DP=69;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,36:69:99:1210,0,1229 -chr14 6505985 . AAGGTAAGTCGCAGCTGGCAAAAACAAATTATGTTATCTCTTTAATACCATTGATCATTAATCATTCAAACTCTTTCCTTC A 1123.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=1.561;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:91:1161,91,0 -chr14 6512630 . A C 773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:802,54,0 -chr14 6512635 . T C 773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:802,54,0 -chr14 6546538 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.948;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:755,0,1036 -chr14 6571569 . C G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=1.483;DP=64;FS=5.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:779,0,1484 -chr14 6574366 . A G 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:356,26,0 -chr14 6579336 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,347 -chr14 6579807 . C CA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.57;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:40:363,0,40 -chr14 6579809 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.48;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:40:363,0,40 -chr14 6589631 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.163;DP=52;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=4.44;ReadPosRankSum=-3.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:259,0,1553 -chr14 6590507 . A G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.480;DP=81;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:468,0,2390 -chr14 6591407 . G C 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=2.901;DP=96;FS=19.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1410,0,1972 -chr14 6591685 . T TA 1543.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.866;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1581,139,0 -chr14 6595809 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,128 -chr14 6596027 . A AT 430.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=21.54;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:28:468,28,0 -chr14 6598524 . T C 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:479,33,0 -chr14 6598542 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,264 -chr14 6598602 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr14 6599387 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,249 -chr14 6599404 . A G 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:438,33,0 -chr14 6599592 . T C 568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:597,42,0 -chr14 6599618 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:273,0,536 -chr14 6600292 . T A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:373,0,91 -chr14 6601443 . T A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:242,0,276 -chr14 6900324 . GCTGCAAGAAACAATGATTCATCTTGTGAGTAATGATTTAAAAGTTGTGTTTTGAGATGACTAAAGAAGTTAACTCCAATAAAGGACAAACTCAC G 10960.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=4.645;DP=361;FS=8.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=30.36;ReadPosRankSum=-6.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,305:328:99:10998,0,3353 -chr14 6900505 . A T 6117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=1.372;DP=429;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,176:400:99:6146,0,7176 -chr14 6901483 . TCTAAAATAAAAATAATTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGCATGTCTAAAATGTCAAATAACTGAACAACAACCGAAACTCAAAAGACAATGAC T 2349.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=1.011;DP=369;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=6.37;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,348:360:99:2387,899,0 -chr14 6902058 . ACTGAACCGGCAAAGAAAAAAAGCGCAAGATTAAATCTGTGTTTCATCCAAACGCGCAGAGGAAAAAGATGCAATTGAACAAGATCCGTGACTCAC A 17360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.006;DP=309;FS=3.760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,308:309:99:17398,1365,0 -chr14 6903601 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:259,0,217 -chr14 6906922 . G A 5987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.668;DP=349;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,169:349:99:6016,0,5713 -chr14 6919558 . G GACTCTGTTTGCTGGCTACAC 3864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=3.487;DP=130;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,106:119:99:4326,0,794 -chr14 6925695 . TGTGAGTAAATATAATGAGATTAATTAATTGAAAGCATGTAAAAAAAAAATCTGATTATTATTTTGTATAACTATCTGTTTCAG T 897.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=2.519;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=32.06;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:99:935,0,1981 -chr14 6925894 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,250 -chr14 6929648 . C T 4675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.425;DP=310;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,132:308:99:4704,0,6009 -chr14 6969169 . C G 2487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2516,190,0 -chr14 6980342 . C T 2025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2054,147,0 -chr14 6980473 . C T 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 -chr14 6983780 . T A 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:507,39,0 -chr14 6983810 . G A 571.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:600,42,0 -chr14 7017478 . T A 904.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:933,69,0 -chr14 7076586 . G T 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1081,75,0 -chr14 7076734 . ATG A 271.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:309,22,0 -chr14 7109718 . G A 4557.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:4586,334,0 -chr14 7120024 . A G 5637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:5666,409,0 -chr14 7121516 . C T 1347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1376,93,0 -chr14 7124936 . A C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr14 7128947 . G T 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr14 7129228 . C T 3348.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3377,250,0 -chr14 7129774 . C CT 790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.506;DP=35;FS=2.993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:65:828,65,0 -chr14 7134988 . T TC 438.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:476,36,0 -chr14 7135266 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr14 7135394 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:301,0,173 -chr14 7137166 . AGG A 368.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:406,28,0 -chr14 7141844 . CCG C 8157.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:8195,558,0 -chr14 7141942 . T C 7455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:7484,515,0 -chr14 7142098 . G A 6336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:6365,445,0 -chr14 7142229 . C T 1767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1796,123,0 -chr14 7142439 . C T 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:515,39,0 -chr14 7142547 . A T 2583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2612,184,0 -chr14 7142578 . A T 2002.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2031,144,0 -chr14 7142630 . A AGT 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.264;DP=26;FS=18.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=14.26;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:408,0,141 -chr14 7142693 . A T 3351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3380,247,0 -chr14 7149463 . C G 5781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:5810,418,0 -chr14 7168346 . C T 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 -chr14 7170898 . C T 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1142,84,0 -chr14 7171329 . C T 1372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1401,99,0 -chr14 7171430 . G A 2278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2307,165,0 -chr14 7175934 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr14 7178813 . A G 2564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2593,184,0 -chr14 7179723 . A G 2398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2427,172,0 -chr14 7183229 . A G 1785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1814,126,0 -chr14 7183673 . A C 2053.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2082,147,0 -chr14 7183730 . C A 2300.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2329,169,0 -chr14 7183763 . G A 2473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2502,191,0 -chr14 7184261 . C T 2731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2760,193,0 -chr14 7184632 . C A 3068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3097,223,0 -chr14 7184723 . G A 2676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2705,184,0 -chr14 7184726 . C G 2676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2705,184,0 -chr14 7185187 . G A 1041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1070,75,0 -chr14 7289126 . A AT 328.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:366,36,0 -chr14 7289336 . G A 1371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.733;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=32.37;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1400,113,0 -chr14 7358284 . C T 9984.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=1.445;DP=259;FS=6.558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=28.90;ReadPosRankSum=2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,257:259:99:10013,766,0 -chr14 7487960 . C T 1868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1897,135,0 -chr14 7488800 . C CGA 1450.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1488,103,0 -chr14 7489345 . C T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr14 7489498 . G C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr14 7490273 . C T 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr14 7490318 . A T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr14 7490389 . A C 675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:704,51,0 -chr14 7491035 . T A 573.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:602,42,0 -chr14 7491704 . G T 699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:728,51,0 -chr14 7492117 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr14 7493624 . C T 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 -chr14 7496065 . A C 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 -chr14 7496066 . C T 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 -chr14 7496310 . G A 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:550,39,0 -chr14 7498217 . A T 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr14 7498862 . C A 683.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:712,51,0 -chr14 7499193 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr14 7499282 . C T 594.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:623,48,0 -chr14 7500415 . G T 1474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1503,105,0 -chr14 7500806 . C T 980.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1009,72,0 -chr14 7673280 . ACAGGTAAATCTACACCTCGTAAGTTCTTTTCCCTCTTACGGTGTATTTCTGTCACACACACATAATACATTTGCTCTGTTCATT A 6758.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=-0.061;DP=198;FS=1.635;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=34.14;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,192:198:99:6796,682,0 -chr14 7679437 . T C 9750.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:9779,698,0 -chr14 7685851 . G A 7090.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7119,532,0 -chr14 7685971 . G A 6425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:6454,464,0 -chr14 7686030 . A T 8937.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:226:99:8966,678,0 -chr14 7693871 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr14 7694412 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr14 7694909 . T A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr14 7695729 . C T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr14 7698069 . T A 634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:663,48,0 -chr14 7698557 . A T 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:455,33,0 -chr14 7702319 . GTT G 306.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:344,27,0 -chr14 7702493 . CAG C 218.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr14 7703410 . C T 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:618,42,0 -chr14 7703895 . AT A 305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:343,33,0 -chr14 7707841 . C T 1773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1802,126,0 -chr14 7707883 . T TA 2749.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2787,263,0 -chr14 7707922 . G A 4488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4517,316,0 -chr14 7708508 . GCA G 808.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:58:846,58,0 -chr14 7709333 . G T 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:502,36,0 -chr14 7709426 . A T 1678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1707,120,0 -chr14 7763043 . A C 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 -chr14 7763824 . C T 13563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.128;DP=412;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,397:399:99:13592,1159,0 -chr14 7767528 . C T 752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:781,57,0 -chr14 7823276 . C T 1550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1579,120,0 -chr14 7868438 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr14 7869085 . A T 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:559,39,0 -chr14 7869107 . T G 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr14 7869648 . C T 727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:756,63,0 -chr14 7870145 . C A 734.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:763,54,0 -chr14 7871201 . GTTTTA G 638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.456;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:57:676,57,0 -chr14 7909575 . T C 5697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=1.005;DP=143;FS=3.293;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=26.28;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:5726,418,0 -chr14 7910164 . G A 1875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1904,135,0 -chr14 7935546 . C G 2678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2707,193,0 -chr14 7935711 . C T 3288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3317,243,0 -chr14 7935874 . G A 2472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2501,178,0 -chr14 7936824 . T C 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1189,81,0 -chr14 8044863 . C T 3792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3821,277,0 -chr14 8126483 . G C 1510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1539,111,0 -chr14 8145036 . C T 1200.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.108;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=28.77;ReadPosRankSum=-1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1229,93,0 -chr14 8179096 . T G 2405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2434,178,0 -chr14 8218388 . AT A 372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:410,40,0 -chr14 8233005 . G A 464.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:493,36,0 -chr14 8233949 . G A 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:629,45,0 -chr14 8234102 . GT G 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 -chr14 8234573 . C T 667.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:696,51,0 -chr14 8235323 . A G 716.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:745,54,0 -chr14 8235442 . G A 1311.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1340,96,0 -chr14 8236019 . A T 605.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:634,45,0 -chr14 8236401 . A G 1064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1093,81,0 -chr14 8236510 . G GT 430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:468,42,0 -chr14 8238350 . GT G 243.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.448;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:10:280,10,0 -chr14 8238503 . A C 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:672,45,0 -chr14 8240943 . G A 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:803,57,0 -chr14 8442378 . A C 1330.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:93:1359,93,0 -chr14 8466926 . T A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr14 8574263 . C T 5208.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=1.168;DP=130;FS=3.782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:5237,376,0 -chr14 8585830 . GA G 324.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:13:362,13,0 -chr14 8788084 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,266 -chr14 8788411 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr14 8789236 . CA C 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:499,48,0 -chr14 9036968 . A T 800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:829,63,0 -chr14 9037001 . C A 1969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1998,141,0 -chr14 9040612 . A G 3455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3484,250,0 -chr14 9123287 . G A 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:659,48,0 -chr14 9167093 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:49:282,0,49 -chr14 9232238 . C T 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr14 9232259 . T G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr14 9232456 . C T 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 -chr14 9232509 . T C 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 -chr14 9232585 . G C 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1046,75,0 -chr14 9232654 . A C 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:805,57,0 -chr14 9232683 . C T 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:514,36,0 -chr14 9232779 . C T 374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:403,30,0 -chr14 9233204 . T C 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:721,51,0 -chr14 9234162 . A G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr14 9657329 . CAGGTAAATTGTAGACCCAAGGTTAATGTCTTTTTTTCTTAATGCTAATGTTTTAATTGAAGTAACTTATCCTTTTTTCCCT C 3550.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.563;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=30.00;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:3588,316,0 -chr14 10537221 . CAA C 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.821;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:333,0,573 -chr14 10537474 . T TA 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.944;DP=41;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:442,0,495 -chr14 10538315 . T C 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:280,21,0 -chr14 10538338 . T C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=33.87;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:863,0,317 -chr14 10538358 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.916;DP=26;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:257,0,1081 -chr14 10539131 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=6.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:362,0,636 -chr14 10581928 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=1.039;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:471,0,861 -chr14 10583158 . C T 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.466;DP=47;FS=2.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:683,0,1569 -chr14 10815411 . A C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.033;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:380,0,404 -chr14 10815423 . C G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-0.058;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:465,0,403 -chr14 10816288 . T C 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.496;DP=32;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:554,0,471 -chr14 10816523 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:307,0,104 -chr14 10830533 . G T 3145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-1.371;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.840;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,101:184:99:3174,0,2883 -chr14 10847225 . C A 4274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-1.332;DP=254;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,118:231:99:4303,0,4142 -chr14 10854556 . C CTGTTTTACTTCAG 3606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.297;DP=240;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=15.03;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,106:226:99:3644,0,4037 -chr14 10854766 . TTC T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=1.359;DP=47;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:249,0,1258 -chr14 10881424 . T C 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.060;ClippingRankSum=6.107;DP=238;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,62:228:99:634,0,8055 -chr14 10881484 . G T 3328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=1.861;DP=268;FS=2.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=12.42;ReadPosRankSum=3.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,99:267:99:3357,0,5804 -chr14 10903339 . C T 6161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.166;DP=352;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,176:352:99:6190,0,6201 -chr14 10907927 . T A 6257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.917;DP=354;FS=6.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=17.68;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,177:354:99:6286,0,6454 -chr14 10910737 . A T 5004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.924;DP=283;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=17.68;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,141:282:99:5033,0,5123 -chr14 10935396 . GT G 1886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.311;DP=203;FS=4.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,81:183:99:1924,0,5283 -chr14 10935400 . GT G 2117.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.449;DP=211;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,89:202:99:2155,0,5894 -chr14 10935853 . C T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr14 11112425 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr14 11112453 . C G 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr14 11172096 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-1.334;DP=31;FS=9.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:610,0,415 -chr14 11180404 . A T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-0.777;DP=59;FS=5.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,39:59:99:1399,0,717 -chr14 11244944 . C A 1824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.471;DP=106;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1853,0,1786 -chr14 11249294 . C T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.059;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:1312,0,1085 -chr14 11268362 . G C 1804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-2.363;DP=97;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=18.61;ReadPosRankSum=2.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1833,0,1446 -chr14 11633298 . AGTACATACTTGTCGGTTTTCCTAATAATTGAATACGTATTAGCCCTTTGCCAACCGACTTATTGATTTCTGTCTTTGCTAG A 1893.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=1.125;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=30.84;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1931,158,0 -chr14 11659043 . C CA 2259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-2.219;DP=385;FS=12.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,128:357:99:2297,0,5959 -chr14 12484184 . T C 2105.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.558;DP=53;FS=2.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:2134,113,0 -chr14 12813025 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-1.197;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:247,0,365 -chr14 13304391 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:269,0,149 -chr14 13752663 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.633;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,176 -chr14 13782314 . T A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,0:5:99:528,0,276 -chr14 13782316 . C A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,0:5:99:528,0,282 -chr14 13783349 . C CT 746.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.288;DP=225;FS=6.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,60:204:99:784,0,3407 -chr14 13914182 . G C 1193.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1222,87,0 -chr14 13934750 . G C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.682;DP=36;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.040;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:309,0,266 -chr14 13935484 . C T 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1317,93,0 -chr14 13935565 . T C 4165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=-0.093;DP=292;FS=3.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,121:202:99:4194,0,3414 -chr14 13935612 . A G 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-1.390;DP=190;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,85:149:99:2951,0,2616 -chr14 13936375 . T A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr14 13937661 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr14 13937668 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:262,18,0 -chr14 13937756 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=13;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=17.06;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:250,0,115 -chr14 13937877 . CT C 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-0.030;DP=70;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:377,0,2692 -chr14 13943345 . T A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr14 13943424 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:270,0,145 -chr14 13943432 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:288,0,57 -chr14 14460292 . G GT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.123;DP=46;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:282,0,652 -chr14 14460401 . CT C 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-0.748;DP=47;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:392,0,1000 -chr14 14857441 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:412,0,294 -chr14 14857470 . A T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.538;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:88:503,0,88 -chr14 14858446 . T TA 224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:262,21,0 -chr14 14858461 . T A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-2.282;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:77:386,0,77 -chr14 14858849 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:328,0,216 -chr14 15427095 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:347,0,114 -chr14 16052820 . G A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr14 17471505 . T G 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.225;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,57:145:99:1972,0,6128 -chr14 17471532 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr14 17501833 . A AGT 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=1.434;DP=44;FS=18.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:510,0,552 -chr14 17503398 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-2.017;DP=37;FS=32.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:541,0,715 -chr14 17504328 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.961;DP=38;FS=10.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=5.57;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:240,0,713 -chr14 17504868 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=-0.135;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:854,0,1637 -chr14 17505005 . T A 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=2.589;DP=72;FS=40.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=23.43;ReadPosRankSum=-3.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1715,0,360 -chr14 17505395 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-0.267;DP=23;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:410,0,901 -chr14 17505396 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.277;DP=24;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:410,0,893 -chr14 17506038 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=24;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:96:235,0,96 -chr14 17510695 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.883;DP=38;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=24.10;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:62:944,0,62 -chr14 17510707 . G GA 899.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=2.404;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:57:937,0,57 -chr14 17510805 . A AG 690.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.187;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:728,0,2503 -chr14 17510859 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.361;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1052,0,1695 -chr14 17511431 . G T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-2.461;DP=114;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:383,0,2327 -chr14 17511497 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-2.709;DP=41;FS=26.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=7.21;ReadPosRankSum=-3.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:324,0,920 -chr14 17879260 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr14 17882467 . G A 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:612,42,0 -chr14 17882529 . G C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:644,48,0 -chr14 18494338 . CTG C 893.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.772;DP=236;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,47:229:99:931,0,8232 -chr14 18494662 . A AT 1688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=-0.618;DP=49;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=34.46;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,41:45:99:1726,0,1032 -chr14 18494789 . A G 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.390;DP=52;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=33.53;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:1772,0,1032 -chr14 18494985 . A G 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=1.236;DP=88;FS=2.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:1420,0,1778 -chr14 18600504 . TG T 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-1.857;DP=175;FS=6.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,33:156:99:398,0,3478 -chr14 18601353 . T C 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-1.412;DP=163;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=4.50;ReadPosRankSum=3.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,37:163:99:762,0,4700 -chr14 18622657 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:364,0,581 -chr14 18623435 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=-2.538;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:324,0,407 -chr14 18623440 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,203 -chr14 18624765 . C T 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=1.407;DP=329;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,72:328:99:1401,0,10501 -chr14 18625126 . G GA 1597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=-0.801;DP=257;FS=9.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,90:231:99:1635,0,2894 -chr14 18625519 . GCTGTGCAGAATGAACAACATGTTTCATAGTGTACTTCGCAAACATTTTAGAGTGGAAATTGACTAAAAGAACTTAC G 14178.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.978;DP=320;FS=6.061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,317:320:99:14216,1099,0 -chr14 18628297 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.471;DP=294;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,60:292:99:1065,0,8862 -chr14 18630338 . G T 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.664;DP=452;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:358,94:452:99:1749,0,13856 -chr14 18638905 . G GA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.339;DP=195;FS=4.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=1.08;ReadPosRankSum=-2.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,37:181:99:247,0,3914 -chr14 18639519 . T C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.465;DP=190;FS=5.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,42:189:99:842,0,5817 -chr14 18641848 . T TA 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=-2.212;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,45:161:99:591,0,3062 -chr14 19297488 . A T 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:517,36,0 -chr14 19298111 . GA G 238.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:276,24,0 -chr14 19298174 . T C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr14 19714532 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=2.151;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:239,0,1616 -chr14 19985396 . G A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-1.850;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:699,0,550 -chr14 19986596 . T A 1265.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1294,96,0 -chr14 19986892 . G A 664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:693,48,0 -chr14 20059792 . C T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.555;DP=96;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:580,0,2581 -chr14 20156516 . G GT 1271.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1309,105,0 -chr14 20156550 . C T 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:999,69,0 -chr14 20157070 . C T 286.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:315,0,18 -chr14 20158398 . A G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 -chr14 20158578 . T A 1440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1469,109,0 -chr14 20158834 . T G 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.429;DP=42;FS=21.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=23.14;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:1000,0,566 -chr14 21071447 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr14 21707401 . G T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.656;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:250,0,193 -chr14 21881200 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:240,0,321 -chr14 21967733 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.050;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:317,0,1035 -chr14 21989467 . C T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=2.090;DP=57;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:791,0,1769 -chr14 22001729 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,373 -chr14 22026583 . G C 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr14 22054142 . T C 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=-0.708;DP=134;FS=4.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1595,0,2909 -chr14 22054268 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-1.982;DP=212;FS=4.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,39:212:99:539,0,6246 -chr14 22054324 . G C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=1.455;DP=187;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,42:187:99:855,0,5603 -chr14 22054382 . C G 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=1.278;DP=232;FS=5.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=5.87;ReadPosRankSum=6.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,59:232:99:1390,0,6548 -chr14 22064936 . T TA 1114.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.902;DP=106;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=10.52;ReadPosRankSum=2.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:1152,0,1244 -chr14 22112835 . CAGGTGTGTCTAACAGAATGTTCTTAGTCCATGTGAGTTTTTTTTTCTCATTTAACAACTTAACACCCTTTTTTCTGATGAACTCTTTCTTGTTCCTAT C 788.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=397;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,0:2:99:826,177,0 -chr14 22130561 . G A 1890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.139;DP=115;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1919,0,2054 -chr14 22168947 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-1.639;DP=36;FS=6.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.358;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:230,0,2256 -chr14 22168974 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=1.210;DP=49;FS=7.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:242,0,1458 -chr14 22200296 . G GT 701.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.222;DP=75;FS=6.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:739,0,741 -chr14 22213641 . A G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.195;DP=26;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=27.41;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:94:741,0,94 -chr14 22234505 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-1.551;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=24.22;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:561,0,313 -chr14 22242937 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=1.684;DP=69;FS=3.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:984,0,1270 -chr14 22335524 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.702;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:779,0,795 -chr14 22335659 . G T 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=2.174;DP=60;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:993,0,2320 -chr14 22335661 . G A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=2.129;DP=60;FS=5.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:993,0,2374 -chr14 22624782 . GA G 3729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=1.440;DP=212;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,96:206:99:3767,0,7241 -chr14 22624787 . G T 3738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.527;DP=209;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,96:209:99:3767,0,7182 -chr14 22632257 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.966;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:494,0,365 -chr14 22632381 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-3.512;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=18.10;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,306 -chr14 22633762 . TA T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:83:347,0,83 -chr14 22647243 . G A 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=2.422;DP=246;FS=4.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,66:243:99:1619,0,6849 -chr14 22652750 . G A 3372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.244;DP=227;FS=2.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,97:227:99:3401,0,4408 -chr14 22690862 . GGGTATGAAACTCTTCAGTTTATATGCTTTGCTCATGGGGCGACTGTGGATTAACATGTGTTTCTGTTTTTCTA G 13242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.140;DP=311;FS=8.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,309:311:99:13280,1053,0 -chr14 22700589 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,324 -chr14 22773468 . G T 2288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-1.167;DP=140;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:2317,0,2401 -chr14 22780378 . CAG C 1141.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=32;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,1:9:99:1179,0,222 -chr14 22781439 . T A 4136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.338;DP=77;FS=2.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=29.01;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,60:77:99:4165,0,326 -chr14 22832285 . G A 3263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.324;DP=199;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,93:199:99:3292,0,3459 -chr14 22840475 . G A 6939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=1.053;DP=359;FS=4.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,216:359:99:6968,0,4916 -chr14 22848577 . TTG T 1036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=1.558;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,51:229:99:1074,0,7185 -chr14 22849285 . CA C 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=-0.721;DP=110;FS=5.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,33:94:99:674,0,1377 -chr14 22901311 . T C 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-2.867;DP=59;FS=2.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1107,0,676 -chr14 22902000 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=28.85;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:79:461,0,79 -chr14 22902474 . G T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.574;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.950;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:345,0,696 -chr14 22902500 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=1.910;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=14.18;ReadPosRankSum=-2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,299 -chr14 22903054 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=1.080;DP=37;FS=8.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=5.97;ReadPosRankSum=2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:249,0,1090 -chr14 22904217 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=28.06;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:393,0,179 -chr14 22946028 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:309,0,99 -chr14 22983914 . C CA 1128.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.688;DP=95;FS=2.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,54:90:99:1166,0,777 -chr14 22990091 . G A 6210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-2.512;DP=340;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,189:340:99:6239,0,5376 -chr14 23007486 . TCTGAGAGGAAGAGAAGACACAGATGCAGTTAGCAAAGCCAACAGCGCTTTACATCTGACAGACTGAGAAACTGCAGTGTACTCAC T 12476.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.720;DP=296;FS=3.774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,278:279:99:12514,936,0 -chr14 23007616 . C G 5272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.735;DP=326;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,149:325:99:5301,0,5880 -chr14 23010650 . C A 4201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=-0.802;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,127:215:99:4230,0,4857 -chr14 23100185 . C T 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.919;DP=93;FS=0.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,57:93:99:1931,0,1205 -chr14 23100343 . T TG 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-2.869;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:347,0,658 -chr14 23100356 . T G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-2.451;DP=33;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=23.45;ReadPosRankSum=2.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:802,0,646 -chr14 23100719 . T A 1524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.213;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:1553,0,1292 -chr14 23108177 . A G 3471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.259;DP=190;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,97:190:99:3500,0,3302 -chr14 23108213 . G A 3789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.154;DP=211;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,105:205:99:3818,0,3771 -chr14 23108217 . TCTGCACAGGGAAAAGGAAGTTAACATGCATGTGGTGCACAGAGGAAATAAAATGTGAAAATCCATGAGCTTTTGAAGTGAC T 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=206;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=1.83;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:99:414,0,1314 -chr14 23109650 . A G 4432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.911;DP=230;FS=5.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,133:230:99:4461,0,3365 -chr14 23114210 . T A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.470;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1155,0,1706 -chr14 23135430 . CT C 6192.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.265;DP=358;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,237:357:99:6230,0,2079 -chr14 23139650 . C T 8975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-1.281;DP=515;FS=5.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,269:515:99:9004,0,9108 -chr14 23142594 . C T 3389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.835;DP=230;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,102:230:99:3418,0,4016 -chr14 23143025 . CA C,CAA 4027.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.305;DP=373;FS=3.483;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:97,124,120:341:99:5797,3005,6130,1134,0,9235 -chr14 23148599 . T C 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=-1.551;DP=75;FS=6.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:886,0,1698 -chr14 23148611 . C T 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-1.587;DP=78;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:1030,0,1677 -chr14 23154899 . G A 1833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=-1.500;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,55:65:99:1862,0,108 -chr14 23400505 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.176;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:352,0,358 -chr14 23442030 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.850;DP=54;FS=9.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:959,0,850 -chr14 23444468 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.783;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:697,0,559 -chr14 23444693 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=2.280;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:439,0,887 -chr14 23472866 . C A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.046;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=17.07;ReadPosRankSum=2.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:660,0,877 -chr14 23473175 . C A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.182;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:626,0,905 -chr14 23483651 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.682;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,237 -chr14 23484674 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:281,0,137 -chr14 23485097 . T C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.311;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=26.84;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:404,0,90 -chr14 23526702 . T A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.811;DP=25;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:448,0,406 -chr14 24130205 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr14 24503712 . T C 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr14 24651578 . T TA 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.544;DP=85;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:434,0,1390 -chr14 24903233 . G C 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=-3.372;DP=88;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:910,0,2892 -chr14 24903317 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-1.501;DP=102;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:597,0,2984 -chr14 24903343 . A G 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.265;DP=108;FS=7.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,28:108:99:659,0,3263 -chr14 24903456 . A G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.466;DP=75;FS=5.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:505,0,2061 -chr14 24903470 . G C 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.603;DP=85;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:576,0,2238 -chr14 24903591 . AAT A 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=-1.030;DP=29;FS=7.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:277,0,258 -chr14 25096866 . AT A 240.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:276,3,0 -chr14 25278864 . CTA C 3884.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:3922,326,0 -chr14 25280829 . G GTCTGGC 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=1.159;DP=209;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:69:584,0,69 -chr14 25317824 . T G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=1.631;DP=111;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:398,0,3556 -chr14 25848366 . G A 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr14 25848486 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-1.246;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:397,0,517 -chr14 25873597 . A T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr14 25873615 . T G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 -chr14 26072715 . AGTGGGTTTCATTTTTGTCTACTTGCCTGACTTGATGATGAGTGGGAGAGCGGACTCCTGATGTTTCCATGTGTTTGTTTAG A 970.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=1.583;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=31.10;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:90:1008,90,0 -chr14 26078164 . G GA 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.746;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:64:692,0,64 -chr14 26078533 . T TA 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:56:242,0,56 -chr14 26078548 . A T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr14 26154638 . G GA 222.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr14 26158030 . TA T 2549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.888;DP=122;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,94:119:99:2587,0,277 -chr14 26171829 . CCTAAGAAGAAATCATTTTTAAAACTCTTTTCTAATCATAT C 266.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:99:304,142,0 -chr14 26172651 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=3.127;DP=131;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:865,0,3581 -chr14 26180134 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=20.81;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:278,0,139 -chr14 26186216 . C G 277.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:306,0,18 -chr14 26448278 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-0.206;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:253,0,435 -chr14 26448862 . GA G 268.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.290;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:305,6,0 -chr14 26508829 . G GT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.950;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:437,0,229 -chr14 26520284 . T TA 1046.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-1.546;DP=60;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,47:58:99:1119,0,164 -chr14 26546130 . G C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr14 26548487 . A G 1545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.899;DP=53;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,40:53:99:1574,0,324 -chr14 26600735 . C T 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:378,27,0 -chr14 26915052 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:357,0,488 -chr14 26948555 . T A 549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-1.900;DP=114;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:114:99:587,0,4178 -chr14 26948556 . A T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-2.269;DP=112;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=4.19;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:497,0,4183 -chr14 26950916 . AACCTGATGAAATGTATAGAATATATGTAAATGAAACTTATAGAATAATAGGATGAAACTAGCTAAAATAGTTGTAAAAATGAGACAGCAT A 15077.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-1.396;DP=381;FS=2.084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,364:367:99:15115,1099,0 -chr14 26992601 . G T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-1.073;DP=70;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:1003,0,1434 -chr14 27116358 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-0.659;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:495,0,407 -chr14 27242941 . G T 5450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.870;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=30.19;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,129:140:99:5558,257,0 -chr14 27243354 . C T 1715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-2.650;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=20.67;ReadPosRankSum=2.726 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:58:1744,58,0 -chr14 27243360 . C T 2390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2419,166,0 -chr14 27243512 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=2.122;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=9.30;ReadPosRankSum=-2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:270,0,392 -chr14 27243566 . C G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr14 27243775 . C G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-2.037;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:98:666,0,98 -chr14 27243787 . T G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-2.037;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:98:666,0,98 -chr14 27243872 . T G 537.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.868;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=25.58;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:9:565,9,0 -chr14 27243914 . G A 925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:954,66,0 -chr14 27244023 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.980;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=28.54;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:43:970,0,43 -chr14 27244107 . A T 3050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.190;DP=120;FS=2.109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=25.42;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,75:79:99:3079,141,0 -chr14 27244143 . A C 1896.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-1.221;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.861 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,48:51:61:1925,61,0 -chr14 27244206 . G C 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr14 27244391 . G C 482.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=1.488;DP=28;FS=11.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:509,0,4 -chr14 27245137 . A G 683.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:712,48,0 -chr14 27245187 . T C 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 -chr14 27246059 . T C 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:715,51,0 -chr14 27246161 . C T 2752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.197;DP=76;FS=5.697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=33.86;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:99:2781,193,0 -chr14 27246198 . G A 979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:72:1008,72,0 -chr14 27246242 . C G 213.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:21:242,0,21 -chr14 27246251 . A T 213.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:242,0,21 -chr14 27246413 . G C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.456;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:90:469,0,90 -chr14 27246422 . T C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.20;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:90:469,0,90 -chr14 27246558 . TA T 347.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:386,36,0 -chr14 27271684 . GAGGTTTGTTTTTGGAATGGTGCACTGTTAATTAAGTAGGTTTCAGATATTCACATGCCTCTATGTTTTCGTTTC G 1081.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.678;DP=33;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=32.78;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,27:29:99:1119,0,612 -chr14 27394167 . G A 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.837;DP=60;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:1201,0,856 -chr14 27422753 . TA T 3501.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.263;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=31.27;ReadPosRankSum=-1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,106:110:99:3539,342,0 -chr14 27423406 . TCTGTTTTGCATGAGAAACGACAAGATAAAGCATCAACACAAATCTGCCAATGACCTGAATATGTCAGCCATTTTAC T 11381.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=-0.308;DP=262;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=32.31;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,256:262:99:11419,991,0 -chr14 27434279 . C T 2913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=1.618;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,77:219:99:2942,0,10184 -chr14 27434283 . C A 2913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=1.849;DP=223;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,79:222:99:2942,0,10226 -chr14 27436984 . TCTGTGAAATTAAATGTTCACGCGTGAAATCCCCAGTGATGCCTGAATTTAAAAAGCAAAATGCCCAGAGCATGCTAAACTCAC T 2208.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.379;DP=49;FS=6.673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2246,192,0 -chr14 27443160 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.532;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:457,0,595 -chr14 27444276 . G T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.664;DP=53;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=13.32;ReadPosRankSum=3.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:734,0,1121 -chr14 27461977 . G GA 1103.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.786;DP=74;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:1141,0,2606 -chr14 27478070 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.173;DP=149;FS=6.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,28:149:99:452,0,4831 -chr14 27520520 . CA C 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-0.967;DP=328;FS=32.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=1.85;ReadPosRankSum=2.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,106:322:99:644,0,20586 -chr14 27520937 . G GA 928.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.579;DP=300;FS=6.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,71:271:99:966,0,5411 -chr14 27595337 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.315;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:365,0,468 -chr14 27712565 . TA T 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=-0.597;DP=84;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:442,0,1401 -chr14 27725237 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.225;DP=245;FS=5.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=1.25;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,37:245:99:334,0,8827 -chr14 27726712 . TGTAGGTTTTCATGGTAAAATATATTCGTGTATTGGTAAAAGACATGTGTAATTGTCTTAAATCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTGTGTGTGAATCTAG T 9244.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.803;ClippingRankSum=1.424;DP=238;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=26.49;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,225:238:99:9651,0,958 -chr14 27727173 . GGGTATATGTTTTCTACGATTTAAGCTTGAAACTATACTTATTAAATTGATAACAGAACGTTTTAATTAAGTCTTCTTTAAATAATTTCTGGTGATGATATCAAGCTTTTGTCTGAACATGTCTCTTATTCTTCTA G 10200.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=4.368;DP=268;FS=9.889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,261:268:99:10238,809,0 -chr14 27732056 . CAGGTTCGCATTGAATGCCTGTTAATACAATGGCTTTTGCTGTCTGCAGCTGCATTGAAAGCTTTGTGAGACTGTACTCTGTCTGCATGT C 13735.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.314;DP=389;FS=3.471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,333:339:99:13773,999,0 -chr14 27789042 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.406;DP=180;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,36:180:99:640,0,5835 -chr14 27789064 . C T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.224;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,47:195:99:1078,0,5975 -chr14 27791136 . G T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-1.015;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,26:144:99:416,0,6619 -chr14 27792176 . G A 3837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:3866,273,0 -chr14 27792449 . T C 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.023;ClippingRankSum=10.558;DP=224;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=6.47;ReadPosRankSum=-8.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,64:224:99:1478,0,6235 -chr14 27792547 . T C 1955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1984,141,0 -chr14 27792575 . T A 899.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=29.81;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:928,69,0 -chr14 27793536 . G C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.613;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:735,0,931 -chr14 27793776 . C G 3994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:4023,292,0 -chr14 27796919 . A G 2640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.216;DP=47;FS=4.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=29.94;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:2669,198,0 -chr14 27796925 . A G 2634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2663,198,0 -chr14 27797733 . T C 7756.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:7785,551,0 -chr14 27797816 . A G 5634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:5663,403,0 -chr14 27797826 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.348;DP=135;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,31:135:99:644,0,4121 -chr14 27797954 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=-1.788;DP=321;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=2.22;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,55:321:99:742,0,10601 -chr14 27798263 . C T 4680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=-1.133;DP=288;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,136:288:99:4709,0,4923 -chr14 27798389 . T G 7389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:7418,530,0 -chr14 27799070 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=-1.642;DP=273;FS=45.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=1.49;ReadPosRankSum=4.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,50:267:99:434,0,8883 -chr14 27799163 . A G 7586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-1.525;DP=184;FS=3.354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=31.08;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,183:184:99:7615,555,0 -chr14 27804615 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=1.154;DP=244;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,46:244:99:741,0,7853 -chr14 28109950 . A T 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 -chr14 28109954 . T C 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 -chr14 29048782 . G T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.603;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:510,0,4664 -chr14 29048785 . T A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.750;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:510,0,4664 -chr14 29048825 . C CA 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=1.079;DP=110;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:674,0,1249 -chr14 29049187 . C T 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.214;DP=134;FS=10.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=7.56;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,43:134:99:1041,0,4076 -chr14 29063802 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=-0.141;DP=46;FS=3.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:721,0,775 -chr14 29064055 . T G 1451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1480,108,0 -chr14 29064292 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=2.826;DP=33;FS=9.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=6.72;ReadPosRankSum=-2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:250,0,2932 -chr14 29064299 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.605;ClippingRankSum=-2.221;DP=33;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=25.87;ReadPosRankSum=2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:882,0,952 -chr14 29064301 . A G 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.693;DP=32;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:882,0,952 -chr14 29064307 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=2.115;DP=33;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=6.72;ReadPosRankSum=-2.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:99:250,0,2767 -chr14 29064740 . A G 738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:767,63,0 -chr14 29064834 . A C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.890;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:454,0,394 -chr14 29064839 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-1.120;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=22.41;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:454,0,394 -chr14 29371861 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.182;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=22.42;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:813,0,1240 -chr14 29474750 . G A 2699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=1.878;DP=139;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:2728,0,2261 -chr14 29478813 . AT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=1.827;DP=47;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=4.55;ReadPosRankSum=-2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:251,0,777 -chr14 29483776 . ACTAAAAAACATGGAGTGAAAAAACGGACGAATGTAACGTTAACGTTAGGAGCCAAATGAAACCAATGGTGCGACTTAAAATAACTGTATTTAATAATAAAACAGTAAATTATAATTTATATACACATTGAATGAAATTATAATTTATGTAGCAATAATAGACTCGTACTATCTCAC A 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.065;DP=31;FS=6.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:867,0,3397 -chr14 29485638 . C T 1607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=-0.720;DP=92;FS=6.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1636,0,1526 -chr14 29524727 . AAGGTCTGACCCTGTGACCCATCACCAGATCATACAGCATTGACTTTGACTTGTTCCAAAGGGAGCGAGATATTAATTACCTCTGCATGTGTCTTCC A 9561.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.557;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,229:230:99:9599,891,0 -chr14 29534290 . AGCAGGTCAGTGGTTATAAGGTTTTGTGTCCTCTGTCAAAGTGAGTTTTGCTTGCTGGTTTTGACATCTTTTTTTTCTGACTCTGATGTGT A 8844.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=1.154;DP=208;FS=2.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=36.00;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,186:189:99:8882,811,0 -chr14 29535853 . TGTAAGCAAACATTTGTTTATCTTAGATTTGTGTTCATATTACATTTGAGGATCGTTCATTGGCTGTCAGATGTTAAGTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTCTGTTTCCTCTTAG T 9121.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.791;DP=238;FS=2.747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.147;QD=33.35;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,228:238:99:9159,844,0 -chr14 29545572 . A AAT 764.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.094;DP=62;FS=7.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:802,0,1047 -chr14 29546740 . T G 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=6.158;DP=82;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=10.42;ReadPosRankSum=-5.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,26:82:99:892,0,3909 -chr14 29546747 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=5.258;DP=78;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=8.78;ReadPosRankSum=-4.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:713,0,4156 -chr14 29547380 . C CTT 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=-0.186;DP=97;FS=3.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:73:99:1203,0,1070 -chr14 29548384 . G A 255.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:284,0,22 -chr14 29551257 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,335 -chr14 29565405 . AT A 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.625;DP=60;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:515,0,1002 -chr14 29575128 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-3.691;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:630,0,1532 -chr14 30468852 . T C 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr14 30539860 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr14 30651332 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:83:384,0,83 -chr14 30651636 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.348;DP=38;FS=8.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:497,0,868 -chr14 30669554 . T C 2052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.509;DP=135;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:2081,0,2436 -chr14 30676878 . A T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=-1.370;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:658,0,1155 -chr14 30678029 . C CA 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=1.665;DP=48;FS=8.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:443,0,547 -chr14 30678188 . A C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-0.334;DP=42;FS=7.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=10.66;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:476,0,1186 -chr14 30678268 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.046;DP=55;FS=6.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:368,0,1954 -chr14 30681313 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:274,0,56 -chr14 30684358 . C T 211.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:240,0,19 -chr14 30684559 . G A 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.211;DP=73;FS=8.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1497,0,818 -chr14 30687392 . A G 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=1.436;DP=72;FS=2.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=25.40;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,50:72:99:1857,0,596 -chr14 30687692 . G A 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.139;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1478,0,1520 -chr14 30687877 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:84:491,0,84 -chr14 30688191 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-2.050;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:468,0,1047 -chr14 30688201 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-1.681;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:468,0,1047 -chr14 30688410 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.109;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:303,0,212 -chr14 30688842 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.89;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:280,0,141 -chr14 30695693 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.372;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:295,0,400 -chr14 30715237 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.910;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,626 -chr14 31268856 . GGGTAAGTTCTTGCCTGCCGTACCACAATATTTTCCTTTTTTCACTAAACATTTGTTCTGTTTTTTAAATGTTCAGTTTTAAGTACTAAAATGGTATATTTGTTTTTCTCA G 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:495,0,335 -chr14 31293982 . TA T 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.623;DP=15;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:51:300,0,51 -chr14 31354273 . TCCTTTTAAAAGAATGTGAGAGTGAGATTTTCTGAAATCAGAAGTAGATAATTAACAATTTAACCAAATATACAAGTTGTTATCAAA T 1579.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=1.641;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=26.30;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1617,124,0 -chr14 31583440 . TA T 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-1.006;DP=32;FS=4.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:612,0,150 -chr14 31603368 . G A 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.941;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,37:96:99:1192,0,1971 -chr14 31670287 . CA C 4661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.418;DP=383;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,192:348:99:4699,0,2991 -chr14 31860132 . CT C 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.053;DP=21;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:62:367,0,62 -chr14 31862375 . A T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.335;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=29.07;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:784,0,120 -chr14 31961812 . AAC A 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.075;DP=114;FS=3.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,16:94:99:247,0,3057 -chr14 32371039 . TGGTGAACTTTTCACAGTCCTAATACCGTCTAGAATTACAAACTGTATTGCTGATGTAGAAAAGTTTGTAACCTTTTTTTGTTCGTCTCA T 1538.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=1.592;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:1576,145,0 -chr14 32390216 . GA G 355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:393,40,0 -chr14 32410654 . AAGGTATCGCTTTCTTTTCCTTAATAAATGTTTTATTATTGTTATGCAAGCTTTTGTGCTTTTTATTTATTTCTCTCCTTTGTATGAGT A 2079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=3.369;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=29.71;ReadPosRankSum=-2.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,53:70:99:2117,0,5144 -chr14 32411010 . GGGT G 2087.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=2.007;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,81:87:99:3055,0,2122 -chr14 32411014 . AAGATGGCACACTTGACACTTTTTAATAATGTAGTGGCTTTTTGTAATGTGTTTACACCTGTGAGATGCCGATACATGTTTCTGTGTATGCTCAG A 2529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.697;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,70:95:99:2567,0,1927 -chr14 32486271 . TCCTGTTACAACAAAAGAGATACAAGTGAGGTCGATATCATCAGCAGATTTCTGATTCAGCCAGGAGTTCCTAGGGAAATAAATGTGCATGTACTTA T 9245.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=2.967;DP=225;FS=2.066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=27.49;ReadPosRankSum=-2.977 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,212:215:99:9283,725,0 -chr14 32538253 . GA G 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:57:245,0,57 -chr14 33377223 . TCACAAACACACACACA T 237 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:274,0,12 -chr14 33717228 . ACTGTGACAAGTGAAAAGCATGTTAATAAGCTGAATAATGGCCTAGTTTCTTTTATGGTATCATCAAAACGTATTCCTGTATTGAGCGTATAC A 7845.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DP=179;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=32.43;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:7883,768,0 -chr14 33753690 . C T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr14 33862286 . ACTGAGGGGAACACACTCTTGTCAATGTTATTTTTAGCATGTCAAATCACTGCTGAAATGAACAGGAGGCGTCACTGCTTAC A 2091.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.006;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=29.12;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:2129,164,0 -chr14 34045580 . G GA 459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:497,48,0 -chr14 34196010 . CA C 1105.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=1.239;DP=53;FS=7.169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:48:55:1143,55,0 -chr14 34229154 . TTTTTTGACCTGAATTAACTCAC T 225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:62:263,62,0 -chr14 34240134 . C T 2600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=1.669;DP=161;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:2629,0,2993 -chr14 34276923 . GA G 485.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-2.205;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=23.13;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:27:524,27,0 -chr14 34277288 . A AT 2510.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2586,262,0 -chr14 34289103 . G A 5272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.234;DP=333;FS=8.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,148:332:99:5301,0,6216 -chr14 34314370 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.648;DP=22;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,505 -chr14 34389037 . AAGGTAGACGAAGATTTTTATTATGATTGAAGAATATTACGTTAAATAGACTACTGCAACAGTTTCTTTGTGTTTATACGCTTTTATTTC A 8907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.837;ClippingRankSum=-0.321;DP=310;FS=78.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=28.73;ReadPosRankSum=3.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,207:304:99:8945,0,39474 -chr14 34389238 . AAGGTGAGCGATGATGAACAAGATGTTTAGATTGACTCTGGTTATTGAGACATGTTTTTTAGGAGTAAAGGGTTATATTTGAAACGTATATCTGTGTATATGTCCACTGCAGCATTTAGCACTGCTCTTTTAAACTTT A 13930.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.408;DP=440;FS=1.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=31.66;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,407:417:99:13968,1040,0 -chr14 34417740 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.239;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:455,0,278 -chr14 34448090 . GA G 837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.706;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:875,0,184 -chr14 34448481 . CA C 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.441;DP=47;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:676,0,874 -chr14 34449046 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=2.801;DP=38;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:256,0,1108 -chr14 34449907 . C CA 756.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-2.405;DP=74;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:794,0,900 -chr14 34450271 . CAG C 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=-3.282;DP=122;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:431,0,4173 -chr14 34450447 . C CA 1085.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=-0.590;DP=124;FS=9.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:1123,0,1760 -chr14 34454278 . T C 1576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=3.654;DP=175;FS=29.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1605,0,4267 -chr14 34480002 . C CA 1680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.544;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=16.16;ReadPosRankSum=-3.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,33:91:99:1718,0,1427 -chr14 34491060 . G A 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.358;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:847,0,958 -chr14 34491880 . G C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.489;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:356,0,266 -chr14 34491928 . T A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.172;DP=37;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:799,0,476 -chr14 34541610 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.751;DP=46;FS=8.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:246,0,1269 -chr14 34729349 . C T 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=1.015;DP=60;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1069,0,1523 -chr14 34765308 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,290 -chr14 34770735 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=4.498;DP=40;FS=9.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=11.49;ReadPosRankSum=-2.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:488,0,962 -chr14 34783302 . G A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.831;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:719,0,1391 -chr14 34802519 . G C 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr14 34802558 . CT C 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.212;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:258,0,255 -chr14 34802666 . C A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr14 34803853 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:381,0,281 -chr14 34821764 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.055;DP=34;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:478,0,671 -chr14 34847628 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.317;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:452,0,233 -chr14 34856996 . A C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.478;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:925,0,120 -chr14 34945272 . A C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=1.019;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:606,0,233 -chr14 34956960 . A G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr14 35016380 . A G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr14 35070903 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-1.942;DP=28;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=21.78;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:638,0,314 -chr14 35071200 . C CTT 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.724;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1053,0,881 -chr14 35074028 . A G 6690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-1.507;DP=223;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=30.00;ReadPosRankSum=-0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,177:223:99:6719,0,801 -chr14 35076228 . G A 4431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=-0.150;DP=171;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=25.92;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,130:171:99:4460,0,847 -chr14 35076345 . A T 4480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=-0.102;DP=163;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=27.49;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,123:163:99:4509,0,744 -chr14 35078432 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-2.154;DP=164;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,30:164:99:464,0,5158 -chr14 35078447 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-1.711;DP=165;FS=5.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=1.83;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,27:165:99:330,0,5318 -chr14 35081703 . A G 4423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.690;DP=161;FS=2.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,118:161:99:4452,0,979 -chr14 35084254 . G A 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=1.021;DP=131;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,34:131:99:802,0,3610 -chr14 35084509 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.812;DP=153;FS=11.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.199;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:464,0,4838 -chr14 35084521 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=-0.338;DP=156;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,25:156:99:266,0,4753 -chr14 35084726 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-1.115;DP=180;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,39:180:99:753,0,5401 -chr14 35092082 . G A 2237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.738;DP=141;FS=10.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:2266,0,2444 -chr14 35099593 . CCACCTGAAGCTGCAAAGGGAAACATACAGCCATTACAAAAACCCAAAAATGAAAACGGTCCTAATGAGAACCGGGTAGTTTGGTTT C 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=1.553;DP=159;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,28:146:99:543,0,11877 -chr14 35099602 . GCTGCAAAGGGAAACATACAGCCATTACAAAAACCCAAAAATGAAAACGGTCCTAATGAGAACCGGGTAGTTTGGTTTCAC G 4237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.694;DP=144;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,108:144:99:4275,0,4522 -chr14 35177559 . C CAT 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:277,0,103 -chr14 35178227 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:358,0,322 -chr14 35178286 . A AT 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.222;DP=19;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:264,0,201 -chr14 35214633 . GT G 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=1.115;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:60:347,0,60 -chr14 35219325 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.334;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:302,0,442 -chr14 35678232 . T C 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 -chr14 35691101 . C T 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 -chr14 35693070 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-2.304;DP=35;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=22.36;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:811,0,888 -chr14 35693071 . G C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=2.304;DP=35;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:434,0,1466 -chr14 35700424 . G A 635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:664,51,0 -chr14 35703171 . T C 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 -chr14 35736053 . G T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr14 35765562 . G C 543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:572,39,0 -chr14 35765756 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.220;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:496,0,321 -chr14 35788548 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,134 -chr14 35926691 . A G 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:646,48,0 -chr14 35948343 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.024;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:452,0,486 -chr14 36182586 . C CT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.151;DP=44;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:488,0,605 -chr14 36406399 . T TGG 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.671;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:264,0,785 -chr14 36406897 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=33.42;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:563,0,296 -chr14 36407289 . G A 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr14 36408008 . A T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=-1.067;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=20.52;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:726,0,505 -chr14 36544832 . T C 2259.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2288,166,0 -chr14 36544899 . T C 756.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:785,57,0 -chr14 36545263 . T TA 1454.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1492,145,0 -chr14 36545282 . A T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-0.383;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:684,0,470 -chr14 36545376 . G A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=-1.512;DP=67;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:858,0,1515 -chr14 36562999 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=20.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:83:277,0,83 -chr14 36563026 . C A 259.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:288,0,13 -chr14 36563072 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=2.858;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.05;ReadPosRankSum=-2.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,347 -chr14 36563121 . A C 913.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:942,69,0 -chr14 36563214 . G A 1116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1145,81,0 -chr14 36564238 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.28;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:301,0,48 -chr14 36567392 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.611;DP=39;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:440,0,983 -chr14 36571715 . C T 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr14 36706405 . G A 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:990,72,0 -chr14 36708362 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.900;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:436,0,481 -chr14 36708377 . A G 1087.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1116,81,0 -chr14 36708532 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.701;DP=26;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:299,0,582 -chr14 36708729 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:359,0,316 -chr14 36712868 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-1.444;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:364,0,329 -chr14 36713230 . T A 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr14 36713345 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr14 36713414 . A T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=25.65;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:413,0,128 -chr14 36713428 . T C 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:626,45,0 -chr14 36714432 . C G 284.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:313,21,0 -chr14 36714642 . T C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr14 36715813 . A T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr14 36715923 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr14 36716586 . C CTT 221.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:259,17,0 -chr14 36783983 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr14 36785695 . A C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.429;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:348,0,336 -chr14 36785931 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,434 -chr14 37014114 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-0.104;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:539,0,501 -chr14 37020440 . T C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-2.498;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:806,0,555 -chr14 37020650 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.548;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:441,0,399 -chr14 37094654 . GA G 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 -chr14 37094662 . T G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr14 37095111 . G GA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:329,0,291 -chr14 37097204 . G GA 427.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:465,47,0 -chr14 37102505 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.495;DP=50;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:577,0,1194 -chr14 37102529 . C G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.710;DP=42;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:298,0,1097 -chr14 37116319 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=2.350;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:232,0,464 -chr14 37446989 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-1.070;DP=52;FS=9.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:413,0,1351 -chr14 37447008 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-1.217;DP=62;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=7.01;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:463,0,1638 -chr14 37449748 . A G 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.671;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:1002,0,1279 -chr14 37488041 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=4.398;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=5.28;ReadPosRankSum=-3.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:361,0,1888 -chr14 37508480 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:400,0,319 -chr14 37569788 . GT G 805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=-1.415;DP=129;FS=13.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:843,0,1188 -chr14 37569809 . AT A 857.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.050;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.688;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:895,0,879 -chr14 37635620 . G C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.892;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:486,0,687 -chr14 37649052 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:398,0,405 -chr14 37865342 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.82;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:55:237,0,55 -chr14 37906185 . C T 2304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.048;DP=505;FS=6.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:387,117:504:99:2333,0,14629 -chr14 37906850 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-2.615;DP=463;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=1.90;ReadPosRankSum=4.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:383,78:461:99:910,0,14226 -chr14 37907092 . C T 19132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=2.402;DP=653;FS=5.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,502:653:99:19161,0,2880 -chr14 37999196 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:289,0,189 -chr14 37999272 . A G 880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:64:909,64,0 -chr14 38033946 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.42;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:275,0,56 -chr14 38042786 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:243,0,249 -chr14 38141038 . G A 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=2.245;DP=61;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=21.06;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,39:61:99:1313,0,731 -chr14 38184262 . A T 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.049;DP=76;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1221,0,1294 -chr14 38207531 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.933;DP=90;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:650,0,4070 -chr14 38207532 . T G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-1.258;DP=90;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:650,0,4070 -chr14 38820612 . A AT 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=1.102;DP=73;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:726,0,1067 -chr14 40133584 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr14 40152072 . C T 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:412,36,0 -chr14 40152146 . C T 2638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2667,193,0 -chr14 40155275 . A C 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr14 40182714 . T TC 2843.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.929;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:2881,246,0 -chr14 40182916 . A T 12741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=297;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,297:297:99:12770,893,0 -chr14 40183014 . A T 23182.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-2.445;DP=546;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=28.90;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,544:546:99:23211,1603,0 -chr14 40202553 . A G 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 -chr14 40202690 . G A 1187.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1216,87,0 -chr14 40206488 . T C 1644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1673,120,0 -chr14 40206620 . G C 1184.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1213,84,0 -chr14 40206699 . T G 2069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2098,144,0 -chr14 40258404 . A C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr14 40259309 . C T 976.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1005,75,0 -chr14 40259838 . A G 9684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=1.634;DP=296;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,293:296:99:9713,855,0 -chr14 40264721 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr14 40279618 . A T 10914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=260;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,260:260:99:10943,784,0 -chr14 40287807 . A G 2808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2837,199,0 -chr14 40287901 . T A 2193.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2300,160,0 -chr14 40287916 . G GT 664.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=1.250;DP=35;FS=3.123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=19.00;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:14:702,14,0 -chr14 40288247 . G A 201.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:230,0,23 -chr14 40305671 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr14 40314836 . TCTAAAACAGCAGACGCAAGAAATAATTTAAATCGACATACATAATACTGAAATTCATGGGAAAAAAATGAAATAAAATGTAC T 2611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.857;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=30.03;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,60:62:99:2649,204,0 -chr14 40327630 . AC A 286.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr14 40381051 . CAA C 227.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 -chr14 40381540 . C A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 -chr14 40835714 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=11.43;ReadPosRankSum=2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:371,0,701 -chr14 40847665 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.205;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:429,0,333 -chr14 42067526 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-2.010;DP=52;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=11.65;ReadPosRankSum=2.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:634,0,1218 -chr14 42081058 . T C 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.224;DP=88;FS=1.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:960,0,1937 -chr14 42096344 . C CT 570.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.110;DP=60;FS=7.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:608,0,710 -chr14 42195455 . A C 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-1.487;DP=45;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:969,0,659 -chr14 42719748 . T C 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-0.450;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:641,0,1437 -chr14 42720272 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.765;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:375,0,550 -chr14 42744098 . ACTGAGTAGGGGAAAACAAGCAGAAGAACAACAGAATAACATCCTGTAATACTGCAGCGTTCGCATACATTTAAAAATTAATTAACCACATAATTAACAACTCAC A 3253.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=2.265;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:3291,297,0 -chr14 42753159 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.988;DP=151;FS=2.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,26:151:99:364,0,12658 -chr14 42754586 . T C 1778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-0.071;DP=121;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1807,0,2562 -chr14 42754587 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.900;DP=121;FS=7.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:365,0,4027 -chr14 42754699 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.959;DP=83;FS=3.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:599,0,2401 -chr14 42754715 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-1.869;DP=72;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:500,0,2186 -chr14 42754720 . T C 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-3.087;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:685,0,1293 -chr14 42834471 . C CTG 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,107 -chr14 42863189 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=1.809;DP=44;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:761,0,770 -chr14 42895533 . A T 531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:560,42,0 -chr14 42900316 . G A 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:531,36,0 -chr14 43047016 . C G 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr14 43047018 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:34:260,0,34 -chr14 43463956 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.090;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=16.51;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:573,0,587 -chr14 43464618 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:273,0,313 -chr14 43496252 . T A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=1.115;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:427,0,426 -chr14 43496271 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.464;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:413,0,485 -chr14 43705429 . G A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-1.004;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:778,0,723 -chr14 43705454 . G T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.486;DP=48;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:843,0,789 -chr14 45848502 . CTG C 604.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.468;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,1:148:99:642,0,9301 -chr14 47218056 . A C 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr14 47303847 . T A 1334.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.249;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:62:1363,62,0 -chr14 47568339 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.054;DP=54;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:608,0,1176 -chr14 47569082 . GT G 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.545;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.121;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:275,0,1056 -chr14 47606774 . ACC A 5495.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:5533,417,0 -chr14 47621857 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=2.843;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,417 -chr14 47621859 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=2.843;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,417 -chr14 47656105 . A T 200.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:37:229,37,0 -chr14 47668280 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.683;DP=315;FS=3.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=5.95;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,80:315:99:1901,0,9221 -chr14 47673719 . C G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=1.039;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:446,0,2919 -chr14 47673965 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.459;DP=63;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:674,0,1362 -chr14 47690272 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,141 -chr14 47690471 . C T 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr14 47691875 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=1.249;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:259,0,777 -chr14 47692511 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.876;DP=17;FS=18.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,340 -chr14 47692549 . A C 286.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:315,0,19 -chr14 47692975 . A T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.878;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:672,0,186 -chr14 47692998 . G GA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=1.366;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:347,0,516 -chr14 47693714 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:310,0,49 -chr14 47694336 . T TA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.986;DP=27;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:274,0,365 -chr14 47694819 . C A 1078.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=29.82;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:59:1107,59,0 -chr14 47694823 . C G 1058.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.42;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:39:1087,39,0 -chr14 47695054 . G T 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=1.223;DP=155;FS=0.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,50:155:99:1359,0,4016 -chr14 47707582 . C T 1641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.020;DP=208;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,65:208:99:1670,0,5338 -chr14 47728318 . T TA 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.134;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:37:736,0,37 -chr14 47732837 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=1.287;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=15.96;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:491,0,514 -chr14 47732864 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.235;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:396,0,607 -chr14 47733316 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.193;DP=15;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,349 -chr14 47733370 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:347,0,49 -chr14 47733642 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:425,0,204 -chr14 47735702 . C CA 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.202;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:58:386,0,58 -chr14 47738547 . CT C 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.460;DP=37;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:292,0,423 -chr14 47744128 . A G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.592;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:75:579,0,75 -chr14 47795261 . G T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr14 48235324 . A G 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr14 48281677 . T A 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-1.200;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,30:100:99:769,0,2753 -chr14 48282020 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=1.913;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:414,0,2559 -chr14 48282185 . T A 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=1.422;DP=99;FS=9.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,31:99:99:756,0,2889 -chr14 48282198 . C CT 837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.738;DP=98;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:881,0,884 -chr14 48375093 . T C 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.686;DP=39;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:651,0,480 -chr14 48375402 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.211;DP=88;FS=3.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:255,0,2878 -chr14 48379817 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.069;DP=146;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,35:146:99:767,0,4312 -chr14 48394042 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-1.485;DP=172;FS=4.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,33:172:99:563,0,5407 -chr14 48394082 . C T 2436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.079;DP=208;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,72:208:99:2465,0,4762 -chr14 48417588 . G A 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=1.002;DP=217;FS=5.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,62:217:99:1524,0,5876 -chr14 48422116 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.512;DP=177;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,33:176:99:529,0,5296 -chr14 48438352 . A G 261.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.73;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:290,0,21 -chr14 48444435 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:266,0,60 -chr14 48460096 . C A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.356;DP=240;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,49:238:99:895,0,7255 -chr14 48460153 . A G 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=-0.149;DP=243;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,51:242:99:945,0,7028 -chr14 48460266 . T G 3060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.201;ClippingRankSum=0.143;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=14.44;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,92:210:99:3089,0,4105 -chr14 48465714 . T C 3584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=1.178;DP=210;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,101:209:99:3613,0,3480 -chr14 48469092 . T G 3952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=-0.013;DP=235;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=16.82;ReadPosRankSum=2.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,112:232:99:3981,0,4061 -chr14 48469203 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.976;DP=241;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,42:235:99:599,0,7789 -chr14 48469227 . A G 3341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.402;DP=229;FS=4.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,97:224:99:3370,0,4249 -chr14 48469311 . C T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=2.109;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,51:213:99:1023,0,11017 -chr14 48472141 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-1.551;DP=222;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=2.51;ReadPosRankSum=2.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,39:216:99:586,0,6882 -chr14 48478521 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.917;DP=149;FS=2.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:415,0,4663 -chr14 48480221 . A G 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-1.030;DP=221;FS=3.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,52:204:99:1201,0,5896 -chr14 48488516 . A T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=-1.671;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:577,0,888 -chr14 48488670 . G A 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.766;DP=59;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1047,0,1080 -chr14 48488759 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-1.203;DP=43;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:333,0,1113 -chr14 48488826 . G C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.355;DP=45;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:863,0,652 -chr14 48489333 . A C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.207;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:544,0,592 -chr14 48489622 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.563;DP=35;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:450,0,793 -chr14 48489669 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.177;DP=50;FS=4.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:308,0,1413 -chr14 48489704 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=1.128;DP=47;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:341,0,1279 -chr14 48510272 . G C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.059;DP=47;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:323,0,2821 -chr14 48517442 . C A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=-0.895;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:370,0,1087 -chr14 48519127 . T C 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.250;DP=101;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:1535,0,1947 -chr14 48519355 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=-0.032;DP=66;FS=12.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:286,0,4211 -chr14 48519361 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.100;DP=63;FS=10.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,11:63:99:278,0,4211 -chr14 48521286 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.429;DP=64;FS=7.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:554,0,1713 -chr14 48524180 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.105;DP=76;FS=8.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:518,0,2058 -chr14 48527509 . A G 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=3.469;DP=81;FS=6.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:723,0,2012 -chr14 48527572 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=2.206;DP=75;FS=3.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:458,0,1952 -chr14 48529841 . G C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=2.170;DP=64;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.968;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:650,0,1405 -chr14 48531798 . A T 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.823;DP=92;FS=4.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:1546,0,1446 -chr14 48539441 . C T 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-1.121;DP=132;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,42:132:99:1097,0,3269 -chr14 48572330 . GT G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=-0.946;DP=316;FS=16.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,55:263:99:405,0,3614 -chr14 48572503 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.549;DP=171;FS=22.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=4.60;ReadPosRankSum=5.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,29:171:99:815,0,5358 -chr14 48572569 . C CT 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-3.047;DP=154;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=1.57;ReadPosRankSum=2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,29:132:99:279,0,2177 -chr14 49010064 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=1.323;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:420,0,2956 -chr14 49010463 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.520;DP=56;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:302,0,2123 -chr14 49010803 . C CA 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-1.603;DP=111;FS=2.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,28:103:99:403,0,1693 -chr14 49012085 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=-0.309;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:256,0,1351 -chr14 49024725 . T C 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.507;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1072,0,1525 -chr14 49025121 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:240,0,425 -chr14 49025133 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:37:372,0,37 -chr14 49025330 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:285,0,95 -chr14 49025464 . T C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-1.218;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=23.93;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:794,0,426 -chr14 49025465 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.487;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:414,0,793 -chr14 49051718 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:65:255,0,65 -chr14 49051720 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:65:255,0,65 -chr14 49154769 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.391;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:403,0,773 -chr14 49155041 . TA T 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.718;DP=43;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:626,0,661 -chr14 49156604 . GAA G 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=3.307;DP=24;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=12.32;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:333,0,503 -chr14 49157057 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.365;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,222 -chr14 49157342 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=21.68;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:245,0,172 -chr14 49241945 . TCCTTCAGCAAAAAACAAATTTATAACAAATGCATTTTCCTAACACAATCTAAAAGTACTACAGGAATCGTCTGCACA T 17587.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=1.032;DP=411;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=30.03;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,406:410:99:17625,1368,0 -chr14 49250456 . CGTGAGTTACTCTGGAGTGTGCTCATGCCATTTCCGTCTTGTTTTGTGGAGTGTGTGTGTGTGCCTGACTGGATGTTGTGTTTTTGCAG C 1223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=2.124;DP=376;FS=5.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,330:336:99:1261,0,379 -chr14 49292334 . T A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=1.978;DP=188;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,35:183:99:463,0,5663 -chr14 49322516 . AACCTAGTAAAAATGGAAACTCAATTTTCCCAACTGAAGCGTGACAGAGTTTAATTTGAGACAAAATTATTATTTTTTCTATGCATCTGTTTTCAGTTATTTGTTGCACTC A 1339.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.998;DP=33;FS=3.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=24.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1377,118,0 -chr14 49799359 . A C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-1.858;DP=28;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:372,0,535 -chr14 50718080 . T A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-1.302;DP=98;FS=7.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:693,0,4094 -chr14 50720928 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:256,0,289 -chr14 50723079 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,302 -chr14 50736442 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.105;DP=110;FS=8.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,20:110:99:286,0,3437 -chr14 50737177 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.082;DP=123;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,27:123:99:478,0,3430 -chr14 51119941 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.376;DP=130;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,22:130:99:289,0,4065 -chr14 51144802 . TAC T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.328;DP=40;FS=8.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:249,0,1288 -chr14 51150913 . T C 2877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.263;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,84:210:99:2906,0,4233 -chr14 51150950 . A T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.728;DP=204;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=3.97;ReadPosRankSum=-3.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,44:202:99:839,0,6149 -chr14 51150986 . T A 2608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.255;DP=218;FS=5.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,80:213:99:2637,0,4336 -chr14 51180120 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.103;DP=92;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:252,0,5016 -chr14 51193041 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-1.337;DP=116;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:287,0,3277 -chr14 51224317 . C T 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-1.392;DP=122;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,37:122:99:980,0,3182 -chr14 51290488 . A T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DP=91;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:659,0,1637 -chr14 51290511 . C T 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.650;DP=69;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=22.97;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1613,0,341 -chr14 51328888 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-0.512;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:279,0,493 -chr14 51331875 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.613;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.066;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:319,0,567 -chr14 51345548 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.794;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:462,0,364 -chr14 51376021 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.594;DP=173;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,33:173:99:576,0,5613 -chr14 51378667 . T A 7210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=-0.564;DP=197;FS=5.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=29.77;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,40:195:99:7239,0,4566 -chr14 51384120 . G C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.045;DP=145;FS=3.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,32:145:99:584,0,4349 -chr14 51413562 . A T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.702;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:362,0,1401 -chr14 51451963 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.148;DP=81;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:409,0,2143 -chr14 51452008 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.869;ClippingRankSum=0.072;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=4.12;ReadPosRankSum=-2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:333,0,1944 -chr14 51470360 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=-0.239;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:322,0,728 -chr14 51470891 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:423,0,337 -chr14 51470990 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.835;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:385,0,662 -chr14 51471537 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,143 -chr14 51471538 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,143 -chr14 51690177 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.139;DP=61;FS=10.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:357,0,1928 -chr14 51691784 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.271;DP=45;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:237,0,1984 -chr14 51950247 . T TC 362.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 -chr14 52551115 . C A 692.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.632;DP=45;FS=3.039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:15:721,15,0 -chr14 53213545 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=3.709;DP=137;FS=6.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,35:137:99:816,0,3799 -chr14 53213724 . T A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-2.540;DP=135;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,31:135:99:695,0,4141 -chr14 53214568 . AGT A 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.234;DP=128;FS=8.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=2.56;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,23:126:99:365,0,4001 -chr14 53214764 . G C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=4.457;DP=135;FS=24.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=5.01;ReadPosRankSum=-3.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,33:135:99:705,0,4032 -chr14 53214791 . CTG C,CTGTG 1857.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.385;DP=90;FS=3.188;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,37,24:64:99:1868,745,1167,1224,0,1764 -chr14 53214862 . T C 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.905;DP=97;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,35:97:99:1220,0,2267 -chr14 53215001 . GTA G 459.24 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:52:556,52,0 -chr14 53216020 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=2.126;DP=103;FS=6.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,23:103:99:454,0,3037 -chr14 53217314 . C G 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:237,0,25 -chr14 53217631 . G A 2030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.480;DP=133;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:2059,0,2139 -chr14 53290773 . T A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-0.689;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:725,0,344 -chr14 53293449 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.935;DP=106;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:463,0,4309 -chr14 53293513 . A T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.502;DP=74;FS=3.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:637,0,2134 -chr14 53293582 . A G 1036.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:42:1065,42,0 -chr14 53317781 . T C 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.952;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:926,0,925 -chr14 53317881 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=2.582;DP=53;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:262,0,1538 -chr14 53318300 . GTTGGTCAGTTTGGAGCTCCTCTGATTGGTCAGTTTGGAGCTCCTCTGA G 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=-0.134;DP=42;FS=11.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:314,0,1565 -chr14 53318348 . A G 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.665;DP=33;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=17.48;ReadPosRankSum=3.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:605,0,808 -chr14 53318424 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.425;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=28.49;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:655,0,171 -chr14 53319225 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.380;DP=67;FS=3.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:922,0,1311 -chr14 53319638 . A G 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=1.081;DP=43;FS=5.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:913,0,549 -chr14 53351225 . A G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.496;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:476,0,3397 -chr14 53351967 . A G 2882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.327;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=16.57;ReadPosRankSum=2.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,82:174:99:2911,0,2954 -chr14 53352052 . C T 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.405;DP=132;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:2145,0,2393 -chr14 53357456 . AGCAGGTGAGACCGTGTGATGTGTGTGTGTTGTGTGTGTATTCTGTGTGTGTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 931.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=2.098;DP=44;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:969,0,5361 -chr14 53360922 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-2.337;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:336,0,1052 -chr14 53362181 . T C 1386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-2.590;DP=97;FS=21.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:1424,0,3351 -chr14 53362256 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-2.553;DP=154;FS=2.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,24:154:99:241,0,4945 -chr14 53363105 . G C 255.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:284,0,21 -chr14 53363691 . C G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:298,0,97 -chr14 53390145 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.739;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=29.65;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:90:384,0,90 -chr14 53406691 . C G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr14 53409849 . C T 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.740;DP=55;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=26.12;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1465,0,287 -chr14 53412386 . C T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.367;DP=58;FS=5.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1071,0,928 -chr14 53412408 . A C 2453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2484,184,0 -chr14 53412521 . C T 1539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1568,105,0 -chr14 53412523 . A G 1539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1568,105,0 -chr14 53412874 . G A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-0.354;DP=31;FS=4.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:926,0,153 -chr14 53413043 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.032;DP=36;FS=10.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:627,0,659 -chr14 53413109 . C T 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:903,66,0 -chr14 53413131 . C T 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 -chr14 53413219 . C A 1227.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:90:1256,90,0 -chr14 53413292 . T C 1521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=-0.950;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=31.15;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1550,108,0 -chr14 53413320 . C T 1711.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1740,120,0 -chr14 53413372 . A T 1863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.711;DP=72;FS=3.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=25.89;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,48:72:99:1892,0,688 -chr14 53413494 . T C 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 -chr14 53413676 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr14 53413864 . G T 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:537,39,0 -chr14 53414412 . A T 1206.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:87:1235,87,0 -chr14 53414528 . G A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-2.301;DP=59;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,42:59:99:1566,0,643 -chr14 53414566 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.511;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:316,0,1494 -chr14 53414958 . A G 1458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1487,102,0 -chr14 53415105 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr14 53415106 . C G 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr14 53415126 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr14 53420448 . TGA T 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:68:372,0,68 -chr14 53456046 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr14 53461492 . G A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=6.327;DP=146;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,41:146:99:890,0,4796 -chr14 53461580 . TA T 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=1.076;DP=127;FS=6.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,38:124:99:973,0,2583 -chr14 53466860 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=1.551;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,27:150:99:394,0,4537 -chr14 53501334 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=-1.835;DP=96;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:334,0,2645 -chr14 53561554 . C G 4947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=-0.773;DP=289;FS=8.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,112:176:99:4976,0,2509 -chr14 53561617 . A T 4908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=1.453;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=36.69;ReadPosRankSum=-2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,55:73:99:4937,0,2509 -chr14 53561747 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=1.850;DP=96;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:870,0,994 -chr14 53569659 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-0.524;DP=57;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:296,0,1607 -chr14 53570154 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.156;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:229,0,954 -chr14 53570376 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.020;DP=33;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:345,0,1709 -chr14 53570382 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.508;DP=33;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:339,0,1709 -chr14 53570464 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.994;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:419,0,699 -chr14 53570501 . G T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-0.673;DP=42;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:303,0,1068 -chr14 53573678 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=-1.518;DP=192;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,36:191:99:544,0,5889 -chr14 53573729 . T A 2838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.374;ClippingRankSum=-1.665;DP=170;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:2867,0,2933 -chr14 53576681 . A G 3905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.802;DP=257;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,113:257:99:3934,0,4749 -chr14 53581153 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=1.192;DP=178;FS=6.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,41:178:99:814,0,5214 -chr14 53582138 . G A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.409;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,49:276:99:690,0,8274 -chr14 53591497 . C T 4752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=2.385;DP=280;FS=8.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,134:280:99:4781,0,4749 -chr14 53592945 . C T 5272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=1.299;DP=303;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,152:303:99:5301,0,5332 -chr14 53597197 . C T 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-0.472;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:1352,0,1644 -chr14 53729937 . C G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=1.787;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:236,0,1600 -chr14 53733426 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:340,0,438 -chr15 19280 . A AACACAC 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=2.140;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:244,0,767 -chr15 22442 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.607;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:472,0,441 -chr15 23131 . CACAAACAA C 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.333;DP=35;FS=26.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=24.19;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:896,0,684 -chr15 24246 . T A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-1.031;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:407,0,1086 -chr15 25675 . G T 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.935;DP=89;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,56:87:99:1847,0,1019 -chr15 25745 . G A 1843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-2.999;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1872,0,2938 -chr15 65644 . T C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.669;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:628,0,536 -chr15 65674 . T C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.174;DP=53;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:697,0,1403 -chr15 113355 . C T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.924;DP=73;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1357,0,2703 -chr15 113362 . C T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=1.065;DP=75;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1357,0,2665 -chr15 124685 . G A 2086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.628;DP=119;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:2115,0,1858 -chr15 125454 . G A 2444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.293;DP=115;FS=17.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=21.26;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,73:114:99:2473,0,1323 -chr15 132040 . C T 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=-1.430;DP=75;FS=6.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:1086,0,1111 -chr15 291789 . AC A 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,0:10:99:240,0,1306 -chr15 291791 . ACACGCACACACACACAC A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=2.353;DP=24;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=8.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:243,0,1270 -chr15 296104 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=22.44;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:85:320,0,85 -chr15 471002 . C A 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-3.595;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:1100,0,2861 -chr15 471043 . G C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=3.992;DP=66;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:597,0,1661 -chr15 471377 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=-0.771;DP=31;FS=7.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:517,0,555 -chr15 474469 . C A 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-1.166;DP=53;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:840,0,856 -chr15 477687 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,140 -chr15 481787 . TGTAAGCCTTCGTATTCCTGTAGACACAAACATCAGGATTGAATGGTGCTTTAAACATGCTACCGTTTCCAG T 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:356,0,3707 -chr15 533500 . G A 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.256;DP=78;FS=1.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:1390,0,1234 -chr15 540444 . G A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.861;DP=32;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:651,0,341 -chr15 622061 . A G 1302.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1331,93,0 -chr15 741456 . C T 236.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 -chr15 764475 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.049;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:246,0,387 -chr15 783472 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,115 -chr15 846982 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.251;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=24.46;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:444,0,416 -chr15 846997 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.355;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:238,0,518 -chr15 859621 . G T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:295,0,334 -chr15 861778 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr15 861779 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr15 869705 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,449 -chr15 869806 . A G 253.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=32.07;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:282,0,18 -chr15 877163 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,190 -chr15 890998 . C G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=2.011;DP=30;FS=9.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:423,0,650 -chr15 891061 . A C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.503;DP=29;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:423,0,884 -chr15 891211 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=1.019;DP=39;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:603,0,937 -chr15 900885 . C G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:310,0,130 -chr15 901447 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:337,0,336 -chr15 987317 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:277,0,466 -chr15 988197 . T C 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=1.491;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:542,0,304 -chr15 988214 . T A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.047;ClippingRankSum=1.032;DP=33;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.48;ReadPosRankSum=3.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:341,0,1024 -chr15 988245 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-4.255;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:374,0,1447 -chr15 1041136 . T A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DP=21;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=24.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:79:538,0,79 -chr15 1041237 . G GA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:238,0,179 -chr15 1042658 . T A 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-2.938;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:633,0,1414 -chr15 1043367 . A G 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr15 1159813 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-1.778;DP=91;FS=6.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:387,0,2675 -chr15 1214228 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.566;DP=35;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:289,0,989 -chr15 1550118 . T C 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-1.689;DP=57;FS=9.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=12.89;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,7:52:99:763,0,3294 -chr15 1557577 . A G 236.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:265,0,16 -chr15 1592216 . GTT G 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=3.054;DP=63;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:541,0,852 -chr15 1626734 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.478;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=26.32;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:502,0,109 -chr15 1656938 . T C 2201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.787;DP=85;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,59:85:99:2230,0,694 -chr15 1663197 . A G 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.877;DP=97;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1618,0,1649 -chr15 1667256 . G A 1635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=1.721;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:1664,0,4692 -chr15 1667266 . G A 1765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=2.502;DP=104;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.061;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1794,0,2158 -chr15 1667336 . C T 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-3.950;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=14.69;ReadPosRankSum=3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:1380,0,1797 -chr15 1667580 . A G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.381;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:637,0,803 -chr15 1725635 . AACCTGGAAGAAACACACACACAGCAGCTGAGCACGGGAGACTGACACACATTCAGAAGATCGATCCTCCAGAGTCTG A 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=33.98;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:411,0,620 -chr15 1781528 . CT C 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=3.205;DP=44;FS=7.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:255,0,672 -chr15 1782047 . T C 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.662;DP=52;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:378,0,1296 -chr15 1791703 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=1.466;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:381,0,403 -chr15 1791711 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:336,0,583 -chr15 1791757 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=3.305;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:404,0,427 -chr15 1792125 . A G 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=-0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=30.03;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:51:719,0,51 -chr15 1793507 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:364,0,45 -chr15 1814601 . T TCA 4902.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-2.582;DP=386;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,157:347:99:4940,0,5604 -chr15 1814728 . T C 2112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=-2.116;DP=285;FS=26.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=7.41;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,84:285:99:2141,0,7593 -chr15 1814870 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-1.089;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:497,0,997 -chr15 1817694 . C T 7530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=-0.898;DP=436;FS=4.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,251:436:99:7559,0,6225 -chr15 1818616 . A G 5287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=1.344;DP=282;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=18.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,160:281:99:5316,0,6774 -chr15 1818670 . G A 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.724;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=12.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:879,0,1190 -chr15 1830634 . T C 10520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=1.847;DP=579;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=18.17;ReadPosRankSum=2.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,317:577:99:10549,0,9135 -chr15 1939724 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:293,0,165 -chr15 2188709 . C T 1666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.151;DP=66;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=25.25;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,45:66:99:1695,0,538 -chr15 2188738 . A G 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.357;DP=71;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,42:71:99:1392,0,996 -chr15 2346130 . C G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=2.603;DP=65;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:451,0,1707 -chr15 2403813 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=2.443;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:292,0,393 -chr15 2493690 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.810;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:355,0,342 -chr15 2494412 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53:229,0,53 -chr15 2518175 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.667;DP=92;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:518,0,2643 -chr15 2525848 . GCAGGTAAACAGTAGTGGGGGGTGATTGGTGTGTAATTGAACACACTGATGTTGATCTGATGTGGTGGTCTGCTA G 2910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=2.843;DP=82;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=29.31;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,69:74:99:2948,0,189 -chr15 2529023 . TGGTGAGTGCAGATCAGCGCAGATCACACCACTGAAACCGACTACTGTTGATCAGAGCAAATGAGTGATGTTGTTGCTGGTGTCCGTCA T 3571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.559;DP=88;FS=1.763;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=23.21;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,83:88:99:3609,320,0 -chr15 2551854 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.371;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:304,0,996 -chr15 2572120 . C T 2000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-2.908;DP=57;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:2029,0,172 -chr15 2582084 . T A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=1.701;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:520,0,546 -chr15 2582283 . C CG 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.510;DP=31;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:345,0,316 -chr15 2584342 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=1.560;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:388,0,437 -chr15 2631829 . C T 5379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=-0.026;DP=338;FS=4.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,166:338:99:5408,0,6083 -chr15 2665497 . A C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr15 2698714 . C A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr15 2721558 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.334;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:513,0,520 -chr15 2738147 . T C 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.298;DP=83;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,64:83:99:2512,0,409 -chr15 2769280 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=1.236;DP=36;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:316,0,953 -chr15 2795843 . CT C 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:99:297,0,113 -chr15 2795888 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=31.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:99:297,0,113 -chr15 2797800 . C CG 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=24.87;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:286,0,51 -chr15 2812330 . CTG C 718.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:756,52,0 -chr15 2841515 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=29.31;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:46:380,0,46 -chr15 2964800 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:287,0,54 -chr15 2964832 . T C 277.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.78;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:305,0,12 -chr15 3024419 . C T 239.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:268,0,15 -chr15 3027566 . G C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.997;DP=79;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:290,0,2340 -chr15 3102525 . A C 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.248;ClippingRankSum=-0.850;DP=64;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1136,0,856 -chr15 3113973 . G A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-1.568;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1238,0,1245 -chr15 3195719 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.696;DP=45;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,10:45:99:250,0,2671 -chr15 3195726 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.854;DP=44;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:256,0,2671 -chr15 3268272 . G GT 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.729;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=28.55;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:62:509,0,62 -chr15 3269144 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:449,0,318 -chr15 3269226 . A C 1096.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:78:1125,78,0 -chr15 3336749 . T A 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:631,45,0 -chr15 3391357 . C G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:294,0,612 -chr15 3508873 . A C 1948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:1977,135,0 -chr15 3508933 . A G 1948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:99:1977,135,0 -chr15 3508987 . T C 1165.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:84:1194,84,0 -chr15 3509084 . T C 220.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:19:249,19,0 -chr15 3590269 . TCCTGCACACATCAATAAAACAGGCTGATTGACTACAGGTCAGGTTTGAATGAAAATGAGAAGAGCTTTAAGCAAACGTGTA T 308.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=34.30;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:35:346,35,0 -chr15 4858002 . C T 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=-1.415;DP=282;FS=6.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,73:282:99:1155,0,18293 -chr15 4858711 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.309;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:260,0,1718 -chr15 4858897 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.042;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:238,0,428 -chr15 4859108 . C CT 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.351;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:492,0,1876 -chr15 4975238 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:252,0,511 -chr15 5259435 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:341,0,205 -chr15 5262181 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:234,0,343 -chr15 5477997 . C T 1507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-0.274;DP=55;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=27.41;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1536,0,350 -chr15 5531042 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=-1.755;DP=49;FS=2.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:285,0,1376 -chr15 5616846 . T C 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-1.078;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:542,0,700 -chr15 5617268 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-1.303;DP=57;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:99:390,0,864 -chr15 5688169 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:289,0,371 -chr15 5723749 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.422;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:288,0,1938 -chr15 5724074 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=-0.478;DP=120;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,32:120:99:723,0,3195 -chr15 5765829 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.989;DP=61;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:519,0,1636 -chr15 5773331 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.023;DP=71;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:271,0,1918 -chr15 5781534 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-1.809;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:296,0,2171 -chr15 5792668 . A G 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.662;DP=254;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.242;QD=5.98;ReadPosRankSum=2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,66:252:99:1546,0,7175 -chr15 5793654 . TCTGGAAAAAAGAACCATGCATTAGCCAGGCACATGATAAAATTGTAAACAACAATGAAATTAGCGAGTCTGACAAAACCAACTTAC T 22903.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=6.807;DP=534;FS=2.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=30.64;ReadPosRankSum=-2.836 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,517:534:99:22941,1753,0 -chr15 5793770 . GCTGTTTATGTGGAGAAAACAAGAAATTAAGAAAACAAGACAAACTTGTAACAGTTGTGTTCAAGAATGTGTTAAATGCCACAGTAAAAGAGGCAAACTTAC G 24985.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=7.247;DP=618;FS=1.737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,593:615:99:27152,2035,0 -chr15 5860823 . C CT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.490;DP=194;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:320,0,2716 -chr15 5861011 . G GT 937.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.962;DP=195;FS=9.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1089,0,2009 -chr15 5861354 . C T 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.090;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,45:61:99:1707,0,380 -chr15 5861380 . G C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=-1.076;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:252,0,962 -chr15 5861981 . T A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.014;DP=200;FS=5.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,42:199:99:778,0,5980 -chr15 5864472 . G C 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-2.937;DP=59;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:894,0,1326 -chr15 6013409 . C T 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.254;DP=63;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1125,0,1176 -chr15 6013475 . T C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.639;DP=54;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:710,0,1183 -chr15 6013508 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:441,0,826 -chr15 6034054 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.139;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:237,0,1345 -chr15 6034057 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:237,0,1345 -chr15 6349000 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.814;DP=52;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:286,0,2668 -chr15 6349001 . G T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.398;DP=50;FS=7.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:286,0,2668 -chr15 6400173 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-1.002;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:323,0,195 -chr15 6438221 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:309,0,190 -chr15 6452439 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-2.234;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:357,0,608 -chr15 6498255 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-2.628;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,493 -chr15 6544430 . A C 1826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-1.501;DP=322;FS=2.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,81:309:99:1855,0,8783 -chr15 6692649 . T TA 862.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=-1.881;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=17.25;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:900,0,797 -chr15 6728828 . T A 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:943,66,0 -chr15 6728991 . GT G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-1.520;DP=48;FS=11.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:267,0,2712 -chr15 6728996 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-1.325;DP=49;FS=10.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:267,0,2712 -chr15 6833661 . C G 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-1.965;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=29.61;ReadPosRankSum=2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:887,0,355 -chr15 6866200 . G A 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.624;DP=58;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:881,0,1556 -chr15 6868954 . T G 3549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3578,253,0 -chr15 6868985 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.197;ClippingRankSum=0.270;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:572,0,2033 -chr15 6873696 . T A 1871.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=-0.527;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1900,135,0 -chr15 6873759 . T A 1428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1457,105,0 -chr15 6873811 . T TA 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-1.644;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:370,0,585 -chr15 6873838 . G GA 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.137;DP=45;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.223;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:441,0,621 -chr15 7078483 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.145;DP=55;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=5.87;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:351,0,1592 -chr15 7105907 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=1.319;DP=40;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=8.22;ReadPosRankSum=-2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:357,0,2436 -chr15 7117007 . T C 2443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=-1.885;DP=186;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=13.14;ReadPosRankSum=3.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,70:186:99:2472,0,4048 -chr15 7117635 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-0.621;DP=67;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:491,0,1756 -chr15 7117709 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=1.411;DP=60;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=7.16;ReadPosRankSum=4.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:458,0,3443 -chr15 7117715 . T A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.510;DP=59;FS=2.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=7.28;ReadPosRankSum=4.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:458,0,3443 -chr15 7117985 . A AC 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-1.185;DP=60;FS=8.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:668,0,1270 -chr15 7118045 . C T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-1.607;DP=105;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,34:97:99:1135,0,2312 -chr15 7118479 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-0.844;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:578,0,641 -chr15 7118584 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=-0.816;DP=42;FS=4.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:561,0,1083 -chr15 7118724 . C A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=3.191;DP=96;FS=9.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,34:96:99:1137,0,2187 -chr15 7228840 . G GA 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-2.017;DP=51;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:387,0,561 -chr15 7471044 . A G 611.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:640,48,0 -chr15 7471077 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.787;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=24.94;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:502,0,153 -chr15 7478306 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr15 8260537 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.589;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:330,0,1324 -chr15 8275713 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-1.180;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:353,0,1547 -chr15 8458600 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.224;DP=32;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:289,0,867 -chr15 8460008 . TA T 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.249;DP=41;FS=11.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:680,0,231 -chr15 8461299 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:443,0,246 -chr15 8461716 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr15 8740164 . TA T 305.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:7:330,0,7 -chr15 8934381 . A G 2598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-2.690;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,75:184:99:2627,0,3591 -chr15 8934461 . T A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.745;DP=125;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:760,0,3768 -chr15 9128817 . A G 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-1.437;DP=78;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:1024,0,1756 -chr15 9143502 . AT A 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.742;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:536,0,876 -chr15 9143671 . T C 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=3.681;DP=71;FS=19.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:1275,0,1148 -chr15 9144258 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=1.963;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=7.82;ReadPosRankSum=2.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:638,0,1919 -chr15 9144505 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-1.323;DP=24;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,522 -chr15 9145889 . A T 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=1.307;DP=74;FS=7.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=27.29;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,53:74:99:2048,0,548 -chr15 9146064 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=2.821;DP=37;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=6.70;ReadPosRankSum=-2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:276,0,1061 -chr15 9376338 . G A 3018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-3.682;DP=228;FS=1.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,89:228:99:3047,0,6775 -chr15 9445388 . G A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.750;DP=72;FS=3.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1224,0,1541 -chr15 9468797 . G C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:233,0,283 -chr15 9468810 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:303,0,296 -chr15 9488361 . T A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.190;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:528,0,1939 -chr15 9489038 . AAC A 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=2.387;DP=70;FS=8.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=3.62;ReadPosRankSum=-3.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:291,0,1589 -chr15 9489187 . A T 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=1.560;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=15.92;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1350,0,1325 -chr15 9489401 . G A 3679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-2.460;DP=149;FS=11.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.70;ReadPosRankSum=3.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,96:145:99:3708,0,1336 -chr15 9489471 . T G 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=1.426;DP=75;FS=4.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1400,0,1338 -chr15 9489510 . A C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.255;ClippingRankSum=-0.525;DP=44;FS=9.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.18;ReadPosRankSum=-4.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:476,0,1075 -chr15 9489670 . A G 3752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.368;DP=122;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,91:120:99:3781,0,1536 -chr15 9489671 . T C 3752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.644;DP=122;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,91:120:99:3781,0,1585 -chr15 9489814 . G C 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=3.132;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=13.28;ReadPosRankSum=-2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:732,0,2281 -chr15 9489815 . G T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=3.491;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=14.66;ReadPosRankSum=-3.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:732,0,2283 -chr15 9490397 . T G 2831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-2.221;DP=98;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,62:93:99:2860,0,733 -chr15 9490650 . T A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-1.485;DP=99;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1564,0,1764 -chr15 9491039 . A G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.498;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:439,0,2447 -chr15 9492012 . T C 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=-0.383;DP=94;FS=6.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,57:82:99:2145,0,696 -chr15 9492214 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=-0.865;DP=79;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:384,0,1943 -chr15 9492647 . C T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.532;DP=108;FS=3.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:958,0,2873 -chr15 9495064 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.575;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:391,0,477 -chr15 9495303 . T TA 696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.846;DP=88;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:734,0,1446 -chr15 9495426 . G C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.419;DP=76;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:1044,0,925 -chr15 9495462 . T C 1513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.941;DP=68;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=22.26;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,43:68:99:1542,0,894 -chr15 10384872 . T C 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 -chr15 10810478 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-1.341;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:245,0,874 -chr15 11118631 . A T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr15 11118675 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr15 11120971 . G A 385.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.290;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:413,0,9 -chr15 11845494 . A G 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.411;ClippingRankSum=0.795;DP=97;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:1410,0,1429 -chr15 11859456 . A G 2612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.636;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:2641,0,2642 -chr15 11859570 . G T 2642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=2.025;DP=129;FS=4.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,81:129:99:2671,0,1588 -chr15 11864665 . T C 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.715;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:610,0,394 -chr15 11942367 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.659;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:417,0,1377 -chr15 11942404 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.677;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:392,0,1692 -chr15 12146960 . C T 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 -chr15 12231960 . TA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-0.126;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:367,0,707 -chr15 12367679 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=2.163;DP=71;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:390,0,2143 -chr15 12368006 . T G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-1.843;DP=75;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:343,0,2336 -chr15 12994996 . A T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.291;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:468,0,313 -chr15 12998236 . A AT 267.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:305,30,0 -chr15 13003350 . TA T 288 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:388,45,0 -chr15 13135770 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=18.21;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,219 -chr15 13385231 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=24.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:576,0,169 -chr15 13388196 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=28.74;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:89:488,0,89 -chr15 13388367 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.424;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=24.92;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:427,0,112 -chr15 13392204 . CT C 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.200;DP=26;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:265,0,285 -chr15 13392750 . CT C 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-1.194;DP=23;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:399,0,222 -chr15 13392763 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:394,0,124 -chr15 13394961 . C G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:343,0,204 -chr15 13564528 . C CA 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=-0.370;DP=81;FS=9.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:421,0,1328 -chr15 13780216 . A C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.813;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:401,0,350 -chr15 13894454 . A AT 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=-1.902;DP=20;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=21.69;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:471,0,447 -chr15 13954301 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:295,0,96 -chr15 13988329 . CGTAAGTCCAGGAGACATATTTAAATATTTCCCACTGATCCTTTTTTTTTTAAATCAAAACCAACATTTGACTAATTGTGTTTATTTGCTTCTTTTCAG C 3438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=2.730;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=34.73;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,82:98:99:3475,0,2326 -chr15 13989595 . GGCAGGTGATCTAAAAATTTTGTCATTTGTCATGTTAGATAAAGTCCTGATGCTCATAGAACTTTGAGAACTTTATTTACATAAGGAGACACTCTAT G 3552.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.840;DP=85;FS=4.944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=31.39;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,81:85:99:3590,288,0 -chr15 14009632 . G A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.590;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:931,0,1974 -chr15 14009641 . T G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=1.518;DP=50;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:931,0,1976 -chr15 14115239 . TCCTGAAGAAAGCAAATCCCAGTATGAATGACACAAGTAAACAAGACAACATGACATAATTATTAAAGAAAAGAAAACATGGTA T 439.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=1.691;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:477,177,0 -chr15 14368501 . AT A 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.981;DP=78;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:433,0,855 -chr15 14368985 . A AT 1450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.395;DP=146;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1488,0,1562 -chr15 14426319 . AGTAAGCATTAATCAATAGAGATAAGATGTGTTTGTTGACATGGTTTGATATCAGCTGCTATAAAACGTCTATGTGGAAACACAATTGAATTATTTCATTTTTTTCCCTTCTTTATCTCCAG A 1125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=1.250;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=29.82;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:97:1163,97,0 -chr15 14482513 . TCTACAAAACAGACTGTTTTCATTCTGACTGCTCTGGTGTAGTTATAAAACATTCATCTGTGAACTGACGCTTTGCTCAC T 233.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=1.657;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:271,108,0 -chr15 14606108 . C T 1446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=1.756;DP=87;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1475,0,1454 -chr15 14606132 . C T 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.833;DP=80;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:1354,0,1334 -chr15 14611656 . C G 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.469;DP=66;FS=2.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=15.77;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1069,0,1066 -chr15 14611799 . C A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.866;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:704,0,532 -chr15 14805270 . CTG C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=1.562;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,303 -chr15 15095246 . TCCTGCTGAACAGAGAAACAAACAACGCTTTTCGAGTCTGATAAACAACGGCTATTTGTGTGCCTCGCGAAATACGGTAAATAAACCGCAACCAACATTAGATTTAAAACAAAGAGACTTA T 1292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.233;ClippingRankSum=-0.791;DP=230;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,60:230:99:1330,0,13521 -chr15 15095250 . GCTGAACAGAGAAACAAACAACGCTTTTCGAGTCTGATAAACAACGGCTATTTGTGTGCCTCGCGAAATACGGTAAATAAACCGCAACCAACATTAGATTTAAAACAAAGAGACTTAC G 6078.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.543;DP=223;FS=1.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=27.26;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,150:219:99:6116,0,5217 -chr15 15174789 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.173;DP=34;FS=8.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:657,0,538 -chr15 15197988 . A C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=1.220;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:378,0,593 -chr15 15197997 . G C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:378,0,593 -chr15 15213187 . T A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=1.381;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:535,0,480 -chr15 15342572 . C A 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.467;DP=91;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1595,0,1271 -chr15 15400063 . G T 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.027;DP=77;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,43:76:99:1446,0,1130 -chr15 15425402 . CT C 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-0.717;DP=45;FS=16.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=6.15;ReadPosRankSum=2.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:314,0,575 -chr15 15425451 . A AC 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.072;DP=47;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:635,0,590 -chr15 15756781 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:270,0,62 -chr15 15758372 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.281;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.410;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:577,0,805 -chr15 15794923 . A G 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.245;DP=67;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1156,0,1236 -chr15 15880633 . G T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=2.320;DP=59;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1068,0,978 -chr15 15890374 . A G 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-1.947;DP=50;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:819,0,917 -chr15 15890406 . A G 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.100;DP=63;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:964,0,1175 -chr15 15891580 . T G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.205;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=28.51;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:912,0,171 -chr15 15893225 . A G 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.166;DP=39;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:636,0,645 -chr15 15893388 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.498;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:523,0,474 -chr15 15908228 . C T 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=-0.004;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,55:91:99:1943,0,1275 -chr15 15912542 . CT C 1232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.096;DP=97;FS=8.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:1270,0,1351 -chr15 15913142 . AT A 863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.881;DP=76;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:901,0,929 -chr15 15933426 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:247,0,114 -chr15 15935037 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.47;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:240,0,56 -chr15 15935974 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr15 15939391 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.07;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:337,0,45 -chr15 15954882 . C T 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-1.339;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1108,0,1028 -chr15 15955353 . C CT 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.183;DP=34;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:589,0,188 -chr15 15955738 . CA C 2436.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:2474,186,0 -chr15 15956194 . T C 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=2.384;DP=67;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:965,0,2156 -chr15 15956343 . T C 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-1.574;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:1198,0,851 -chr15 15956677 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.134;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=18.49;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:435,0,321 -chr15 15958603 . G A 1722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.631;DP=88;FS=7.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=19.58;ReadPosRankSum=2.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,53:88:99:1751,0,1172 -chr15 15965548 . A G 1611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.471;DP=83;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,50:82:99:1640,0,1068 -chr15 16062664 . AGTAGGTTGATCTTTAGATGAACTCACAGAGGTATACAGTAATGTAATCAAATTTCTAGCAAGTCATTTTATTGCTTTTGTTTTTAG A 857.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-1.753;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=34.31;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:99:895,0,119 -chr15 16067274 . T C 1266.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-2.086;DP=34;FS=7.899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=29.29;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:56:1295,56,0 -chr15 16068164 . AT A 599.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:637,60,0 -chr15 16142206 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:478,0,501 -chr15 16142208 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.395;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:478,0,501 -chr15 16164544 . ACACG A 339.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.28;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8:376,8,0 -chr15 16164679 . C T 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.791;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1134,0,1144 -chr15 16171366 . G A 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.336;DP=58;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1109,0,942 -chr15 16287082 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.090;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:568,0,579 -chr15 16299803 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:253,0,504 -chr15 16336023 . T A 4788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.489;DP=275;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,133:275:99:4817,0,4695 -chr15 16336104 . T A 4037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=1.649;DP=230;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=17.56;ReadPosRankSum=2.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,112:230:99:4066,0,3787 -chr15 16339866 . T C 3434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.209;DP=203;FS=9.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,107:203:99:3463,0,3480 -chr15 16358093 . C T 4173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-0.917;DP=243;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,134:243:99:4202,0,3837 -chr15 16358386 . C CT 1200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.115;DP=200;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,93:182:99:1754,0,1771 -chr15 16391734 . A AT 1055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-1.859;DP=145;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:1093,0,7694 -chr15 16391807 . CAT C 2012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-1.435;DP=134;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=15.02;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:2050,0,2670 -chr15 16421064 . CCCTGTACACAGCGGATAAACACAACTGAATAAGTGTCATTTCAGTGAATTGACTGTCTGTTATTGATGAAAAATTAGTCATTTGTA C 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=1.397;DP=24;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.45;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:816,0,236 -chr15 16442630 . CTCAGGTAATGGTGTTTTCTTTTTTAGACTTCTACATTTGACCAATAATAAATGGAGCAATTCCAATTTGACCTCAGCGTCTCCTACCTT C 7766.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.952;DP=187;FS=7.298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,185:187:99:7804,620,0 -chr15 16443735 . GT G 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.050;DP=21;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:291,0,135 -chr15 16462692 . T C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.584;DP=18;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:97:530,0,97 -chr15 16506888 . T TAA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:250,0,256 -chr15 16839764 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:317,0,355 -chr15 16842536 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-1.455;DP=21;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:248,0,919 -chr15 16844670 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=21.72;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:354,0,166 -chr15 16846092 . C T 370.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:399,27,0 -chr15 16857865 . C T 1646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-1.024;DP=95;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1675,0,1710 -chr15 16858979 . A T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:441,0,457 -chr15 16889839 . G C 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=-0.609;DP=50;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,29:50:99:980,0,759 -chr15 16891064 . T C 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-0.394;DP=49;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:940,0,713 -chr15 16892002 . C A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-2.247;DP=48;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1091,0,632 -chr15 16910264 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.887;DP=55;FS=5.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:882,0,993 -chr15 16964344 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.283;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:627,0,844 -chr15 16964467 . C T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.340;DP=44;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:784,0,755 -chr15 17092281 . G T 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=1.290;DP=77;FS=3.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:1597,0,2950 -chr15 17092301 . TGGTGAGTCGTGTCATTTTCATTTATTTGAAATAGTTTTCCCTCAGTCTGTGTGATGTTATTTGACTCTGTGTTTGTCA T 2067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.725;ClippingRankSum=3.333;DP=97;FS=3.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=21.32;ReadPosRankSum=-4.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,64:82:99:2105,0,6278 -chr15 17099468 . AT A 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.470;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:655,0,1417 -chr15 17099473 . C T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.675;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=16.07;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:655,0,1417 -chr15 17201502 . GA G 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:489,48,0 -chr15 17332320 . C A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr15 17379539 . T G 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.967;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:865,0,613 -chr15 18032487 . G A 1319.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1350,96,0 -chr15 18033575 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.190;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:455,0,442 -chr15 18033862 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=1.463;DP=46;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:542,0,963 -chr15 18036556 . ACATATCTAAAGACAGCAGAG A 1532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1570,135,0 -chr15 18036581 . TTAGACACAGCTACAGAACAGATTTGTACATTTTAAGAAGACGATGTGAGTTTTGTCTGTGCATGCAAACGTCCGTGCCACTGTTGACCATGTAATAATGAAACTTAC T 1532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=1.386;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:99:1570,135,0 -chr15 18036871 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=17.04;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:369,0,282 -chr15 18037040 . T TA 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.437;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.861;QD=15.74;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:478,0,483 -chr15 18075521 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.623;DP=37;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:637,0,603 -chr15 18216939 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.165;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:412,0,360 -chr15 18217038 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-1.457;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:399,0,208 -chr15 18217272 . A T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.425;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:370,0,1199 -chr15 18217274 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:370,0,1200 -chr15 18217328 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=2.358;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:271,0,341 -chr15 18225344 . TA T 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-2.725;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:546,0,527 -chr15 18231368 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:271,0,202 -chr15 18232235 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.080;DP=45;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:660,0,842 -chr15 18232495 . TCTGTAAAAATGATTCATAAACTGATTCTCATTATCTGCTTCTTAAGCGCTCAGTATATTGACTCCTCAC T 996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.061;DP=36;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:1034,0,2544 -chr15 18236226 . G T 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=-0.552;DP=85;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:1178,0,1717 -chr15 18237316 . G A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=-1.145;DP=61;FS=3.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:845,0,1149 -chr15 18239485 . C A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr15 18248399 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=2.414;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:293,0,2806 -chr15 18248410 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.918;DP=41;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:293,0,2806 -chr15 18248601 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.674;DP=30;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=7.53;ReadPosRankSum=2.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:254,0,864 -chr15 18632794 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:412,0,423 -chr15 18644097 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.80;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,141 -chr15 18869391 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.893;DP=37;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:481,0,838 -chr15 18889199 . T C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.245;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:676,0,142 -chr15 18889698 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:277,0,52 -chr15 18890894 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.932;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:312,0,137 -chr15 18892639 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,246 -chr15 18953955 . AGGTC A 1385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=1.209;DP=36;FS=6.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1423,0,328 -chr15 18953960 . AGTATTGAGAATTACATACAAAATACATCTGTTTGAGATCAACATAAACATTACATAACAAGCTTGTCTGAAATTCTGCACCATCAG A 1385.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=1.052;DP=37;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=32.41;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:14:1423,0,14 -chr15 18969962 . C T 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.714;DP=69;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1268,0,1260 -chr15 18973696 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-0.492;DP=60;FS=12.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.928;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:432,0,1538 -chr15 19035969 . C T 1987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.774;DP=99;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,59:99:99:2016,0,1441 -chr15 19038364 . G A 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=-0.771;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1156,0,1092 -chr15 19042945 . G T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=2.238;DP=73;FS=8.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:822,0,1618 -chr15 19043510 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=-0.009;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:783,0,995 -chr15 19049007 . G A 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.577;DP=79;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=19.63;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,48:79:99:1579,0,1054 -chr15 19086289 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.330;DP=52;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:866,0,887 -chr15 19166461 . G A 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.206;DP=72;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,43:71:99:1512,0,983 -chr15 19166603 . A T 1178.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=-0.990;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=24.82;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1207,81,0 -chr15 19300265 . TGTAAGTCACCATCATTTGTCATCTGATTTCGTACTGTTCTTTTAATGTCTACAAATAAACATTTCTCTTTCAGGATTTAGACAATGCAGGCTAATGTTTTTTCTCTCTTGTGTTTGTTTTAAG T 1456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.448;DP=39;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=30.72;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:99:1494,0,545 -chr15 19307023 . A G 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.541;DP=86;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:1460,0,1544 -chr15 19307105 . G A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.198;DP=51;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:857,0,914 -chr15 19308583 . G A 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-2.968;DP=57;FS=2.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:805,0,1146 -chr15 19308629 . T C 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.634;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:872,0,2605 -chr15 19309205 . A T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=-2.149;DP=51;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:1007,0,1818 -chr15 19309206 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-2.122;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:1022,0,1818 -chr15 19310139 . G T 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.783;DP=40;FS=3.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=28.14;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1154,0,375 -chr15 19310473 . C T 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-1.388;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=19.46;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1585,0,1195 -chr15 19310653 . C T 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.641;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,66:102:99:2292,0,1238 -chr15 19310878 . A T 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.133;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1262,0,662 -chr15 19311006 . G T 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-1.084;DP=52;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:787,0,993 -chr15 19311562 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:235,0,343 -chr15 19312068 . A C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-1.101;DP=24;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:406,0,440 -chr15 19326308 . A T 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=-2.115;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,58:97:99:2215,0,3118 -chr15 19326309 . C T 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-2.202;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,60:99:99:2215,0,3118 -chr15 19332664 . C A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr15 19336025 . G A 3767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=-0.715;DP=205;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,115:205:99:3796,0,3172 -chr15 19345561 . C T 4027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.707;DP=228;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,113:228:99:4056,0,4135 -chr15 19345609 . G T 3958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-2.027;DP=224;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,124:224:99:3987,0,3465 -chr15 19346074 . TGTGAGGATCGTTCGGATGCTCGGATACTTTTCTTTTTTCTGTATTGAGATTATATTAAAGTGAGTGTGTTTTTGCACCATAG T 5960.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.220;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=25.92;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:5998,580,0 -chr15 19356496 . T TA 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=2.007;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=15.98;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:293,0,164 -chr15 19372984 . T A 478.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=34.21;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:505,0,2 -chr15 19373799 . A G 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:636,45,0 -chr15 19425257 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:380,0,457 -chr15 19429845 . T TA 1519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.210;DP=115;FS=4.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,65:100:99:1585,0,802 -chr15 19490030 . G A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.265;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:993,0,215 -chr15 19492318 . G T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.835;DP=83;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:1335,0,1338 -chr15 19502151 . G A 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=1.694;DP=51;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:943,0,730 -chr15 19605428 . G C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:325,0,292 -chr15 19605500 . G T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:396,0,370 -chr15 19605687 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.634;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.40;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:426,0,156 -chr15 19605737 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:334,0,374 -chr15 19607215 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.935;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:313,0,445 -chr15 19609480 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,331 -chr15 19609625 . G T 291.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.42;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:320,0,19 -chr15 19610047 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,206 -chr15 19610546 . AG A 585.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:43:623,43,0 -chr15 19614859 . CTG C 1831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.139;DP=158;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1869,0,1967 -chr15 19671051 . T C 3618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-1.649;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,107:161:99:3647,0,1815 -chr15 19671567 . G A 2443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.639;DP=145;FS=6.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:2472,0,2474 -chr15 19693045 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:243,0,222 -chr15 19797632 . G A 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.681;DP=69;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,46:69:99:1744,0,619 -chr15 19799778 . TCTACAAAAACACAGACATTACGTTCAACCCAGTTAATCATCCAAACAGAATATGCAGAGCTGGCAATTTTGATTCAC T 1315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=2.297;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=29.16;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:99:1353,106,0 -chr15 19805088 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=19.28;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:356,0,235 -chr15 19805748 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.304;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:367,0,310 -chr15 19847817 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=-0.503;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:345,0,610 -chr15 19855551 . G GT 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=1.083;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:49:328,0,49 -chr15 19868015 . G A 2120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=-1.028;DP=108;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=19.64;ReadPosRankSum=2.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:2149,0,1630 -chr15 19870291 . G T 3289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-0.139;DP=171;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,100:171:99:3318,0,2381 -chr15 19903198 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:273,0,228 -chr15 19904146 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.248;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:415,0,406 -chr15 19956806 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:362,0,140 -chr15 19966391 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-2.002;DP=31;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=21.99;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:710,0,383 -chr15 19973459 . TCTACAAATATTTGCATACAACAAGGTCAACACTGATAACACTGCAGAGATAAAATAATTAAAAATTAGAAAAATGTTACTCAC T 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=2.807;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=28.12;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:459,0,2459 -chr15 20055067 . C T 741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.569;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:770,60,0 -chr15 20074380 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-1.672;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=12.03;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:293,0,489 -chr15 20075651 . A AT 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.340;DP=41;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:501,0,569 -chr15 20075747 . T A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.470;DP=108;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=6.94;ReadPosRankSum=-2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:778,0,3144 -chr15 20075796 . A C 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.345;DP=144;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:1090,0,3960 -chr15 20078509 . T C 2375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.209;DP=165;FS=5.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,67:165:99:2404,0,3365 -chr15 20078554 . G T 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=1.129;DP=76;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=18.00;ReadPosRankSum=-2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:1396,0,1390 -chr15 20078626 . T A 2907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.378;DP=173;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.435;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,83:173:99:2936,0,2911 -chr15 20079908 . A G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.221;DP=151;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,34:151:99:727,0,4598 -chr15 20080050 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-0.287;DP=140;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:289,0,4463 -chr15 20083130 . A C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=8.279;DP=170;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=2.47;ReadPosRankSum=-7.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,29:160:99:448,0,5143 -chr15 20084937 . C A 2025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=2.642;DP=223;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,74:223:99:2054,0,5756 -chr15 20085031 . A G 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=1.354;DP=203;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=6.09;ReadPosRankSum=-2.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,56:203:99:1264,0,5724 -chr15 20085322 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=6.043;DP=152;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=4.01;ReadPosRankSum=-1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,34:151:99:638,0,4353 -chr15 20085733 . G T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.806;ClippingRankSum=6.905;DP=122;FS=8.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=1.66;ReadPosRankSum=-3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,19:122:99:231,0,4026 -chr15 20085987 . T A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=4.397;DP=198;FS=6.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,40:198:99:774,0,6221 -chr15 20103111 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=-0.697;DP=77;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:351,0,2397 -chr15 20103130 . T A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=-0.115;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,33:86:99:1107,0,1938 -chr15 20103149 . GCCTGCAGCATAAAAATAACAACACAAACAACATTAGAATCAATGGTAGATGATGTCTGAGAGCTGTTTGATGTGACCTGA G 3293.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=1.116;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=30.08;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,83:85:99:3331,257,0 -chr15 20103711 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.234;DP=99;FS=3.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:446,0,3514 -chr15 20103807 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=1.024;DP=114;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,23:114:99:432,0,3482 -chr15 20108016 . T A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-2.283;DP=79;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:997,0,1772 -chr15 20110285 . G C 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=-4.643;DP=92;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:809,0,2418 -chr15 20110352 . T C 1716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;ClippingRankSum=-0.649;DP=118;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=14.55;ReadPosRankSum=3.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:1745,0,2946 -chr15 20110400 . C A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.415;DP=113;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:1743,0,2197 -chr15 20110609 . C G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.557;DP=98;FS=7.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,26:98:99:701,0,2667 -chr15 20111205 . A C 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=1.556;DP=97;FS=5.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=14.11;ReadPosRankSum=-2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,38:97:99:1397,0,2060 -chr15 20116390 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=4.261;DP=74;FS=21.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=4.39;ReadPosRankSum=-2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:353,0,2305 -chr15 20120233 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=2.140;DP=63;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=5.49;ReadPosRankSum=2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:374,0,1785 -chr15 20120251 . G T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.138;DP=66;FS=3.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:567,0,1719 -chr15 20120614 . A G 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.630;DP=63;FS=5.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:839,0,1350 -chr15 20126464 . A G 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 -chr15 20131471 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.964;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=7.27;ReadPosRankSum=2.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,1791 -chr15 20131476 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.667;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:261,0,1791 -chr15 20138197 . A G 202.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:231,0,23 -chr15 20161155 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=2.363;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=15.49;ReadPosRankSum=-2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:276,0,281 -chr15 20161634 . C A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,140 -chr15 20214744 . CT C 2544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.324;DP=146;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,87:144:99:2582,0,1717 -chr15 20216672 . G A 2755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=1.367;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,82:132:99:2784,0,1736 -chr15 20227623 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,284 -chr15 20228198 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,465 -chr15 20483422 . A G 1026.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1055,78,0 -chr15 20502906 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.985;DP=59;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,39:59:99:1399,0,749 -chr15 20504529 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.042;DP=63;FS=5.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:720,0,1474 -chr15 20509988 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.311;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:271,0,545 -chr15 20510045 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:516,0,857 -chr15 20515968 . C T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.342;DP=44;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:807,0,1825 -chr15 20515974 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.485;DP=46;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:807,0,1813 -chr15 20517889 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.064;DP=71;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,41:71:99:1399,0,1070 -chr15 20523540 . C T 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.099;DP=81;FS=2.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:1465,0,1396 -chr15 20535840 . T A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.704;DP=65;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:1157,0,1072 -chr15 20544691 . G A 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-0.019;DP=67;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1180,0,1166 -chr15 20545024 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-1.137;DP=46;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:478,0,900 -chr15 20545072 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.069;DP=43;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:467,0,918 -chr15 20631112 . T A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.761;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:683,0,1448 -chr15 20839217 . GCTGAAAAGAAATACAGTTTCATGAGTCATTGTAAAAATTCTATCAAAACTAATAAATCACGTATGAAATACTACAAAC G 3319.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.272;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,75:80:99:3357,266,0 -chr15 21108877 . TC T 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-1.768;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=13.89;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:440,0,439 -chr15 21404778 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.196;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:257,0,901 -chr15 21890776 . T C 560.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.217;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:587,2,0 -chr15 21893014 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=27.56;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:359,0,90 -chr15 21893062 . A C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:317,0,96 -chr15 21893552 . G T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr15 21893565 . A T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr15 22613218 . CAGGTAAAGTTCACTGACAACCCAGAGCTTTTAAGCACCCTGAATCTGTCAGTGCACTGAATCTCGCTGTTTATGTCCCT C 1281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=2.324;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,39:46:99:1319,0,1049 -chr15 22613402 . CTCGGGTACTGTGAAGTGTAAAGCTTTTATCTGCATTCAGACAGTCTGCCAGTTTGGGTTGAAGGTGTAATATTGTGTTTCTGTCCTTGT C 768.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.127;DP=61;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:806,0,2078 -chr15 22733627 . C CA 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.225;DP=65;FS=1.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:474,0,469 -chr15 22734699 . A AG 946.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.606;DP=90;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:984,0,986 -chr15 22744026 . TCCTGTATAAAAAAAAAAAGGACATTTAACTTTTCTGCAGTGTGATTTCTTTATCATAGACAAGCCCCCTGTAACAACATACAGA T 3574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.115;DP=88;FS=2.132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=25.90;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,85:88:99:3612,291,0 -chr15 22806455 . AACCTGAAACATAATAACCAGATTTTAAAAGGTATCTAGAAATGTGGAAATTGCTACACATTTGTGAGCAGGTCTC A 459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=2.123;DP=15;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=30.65;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:497,0,710 -chr15 22831962 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.213;DP=26;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=28.91;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:780,0,152 -chr15 22865572 . TAC T 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.947;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:454,0,2039 -chr15 22895164 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,137 -chr15 22895491 . T G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.092;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:419,0,382 -chr15 22998392 . GCTGTGAGAGGACCATAGTGAATGTCAGTATCATCTTGCATGTTGTGTGGATATCGAGACAACATAAGGCTGATACATAC G 2745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2783,199,0 -chr15 23037683 . GCTACGGGATGCATGAAAATGCTCATTATTTAGCTTCAATATTAAGTCAGTATCACTAACAAAAACTACAAAGCAACTTAC G 2014.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=1.924;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:99:2052,180,0 -chr15 23077701 . G A 4695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.471;DP=296;FS=0.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=15.86;ReadPosRankSum=2.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,134:295:99:4724,0,5222 -chr15 23092583 . A AT 663.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=1.941;DP=106;FS=10.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=6.26;ReadPosRankSum=-2.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,34:93:99:701,0,1213 -chr15 23143530 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.706;ClippingRankSum=-1.973;DP=52;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:464,0,1295 -chr15 23171065 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.496;DP=34;FS=7.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.410;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:451,0,733 -chr15 23172487 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:245,0,95 -chr15 23379118 . A T 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.503;DP=94;FS=3.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:1275,0,1944 -chr15 23429973 . A C 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-1.629;DP=118;FS=2.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:99:1347,0,2670 -chr15 23998240 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.475;DP=145;FS=1.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,31:145:99:499,0,4085 -chr15 24025538 . G GA 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-3.725;DP=79;FS=11.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:391,0,1774 -chr15 24025621 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-1.385;DP=104;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:393,0,3302 -chr15 24091431 . C CT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.228;DP=244;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,43:237:99:324,0,5493 -chr15 24106803 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:233,0,57 -chr15 24199470 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-1.348;DP=58;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:424,0,1634 -chr15 24443892 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.098;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:261,0,503 -chr15 24445158 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,559 -chr15 24602425 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:482,0,476 -chr15 24603767 . A AT 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.236;DP=142;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,34:134:99:428,0,2569 -chr15 24604803 . T TC 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-0.276;DP=222;FS=3.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=2.99;ReadPosRankSum=2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,47:222:99:700,0,6926 -chr15 24665030 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.500;DP=72;FS=12.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:472,0,1980 -chr15 24708230 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.708;DP=29;FS=6.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=7.34;ReadPosRankSum=2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:241,0,1594 -chr15 24708248 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=2.633;DP=31;FS=6.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:241,0,1594 -chr15 24813693 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=-0.369;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=4.87;ReadPosRankSum=2.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:301,0,1591 -chr15 24816248 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=1.116;DP=42;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.42;ReadPosRankSum=2.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:256,0,1317 -chr15 24816719 . CT C 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-1.216;DP=36;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:272,0,581 -chr15 24835145 . TC T 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.716;ClippingRankSum=-2.412;DP=279;FS=35.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=2.13;ReadPosRankSum=3.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,61:276:99:631,0,22928 -chr15 24840196 . TCTGCTGAAACAAACCCTTAAACGTCAAATGGTTCAAATTCAACAAATAATAAATACACAAACAAACCCTCATACACAC T 15540.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.911;DP=367;FS=3.543;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=27.53;ReadPosRankSum=-3.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,356:362:99:15578,1059,0 -chr15 24842640 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.193;DP=431;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,96:431:99:1901,0,12810 -chr15 24927734 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=16.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:242,0,281 -chr15 24937824 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.395;DP=56;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:484,0,1392 -chr15 24942765 . TCCTGAGTGAAAACAAAGAGAGCAGGAGAATTTCAAACACTACAGCTCTGAGTGGAGGAATGAGAAAAAGCCATCACTCA T 2237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.723;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=35.71;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2275,197,0 -chr15 24975962 . A C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.223;DP=154;FS=13.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,23:154:99:235,0,5235 -chr15 26015339 . TA T 264.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:7:301,7,0 -chr15 26046641 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-0.109;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:450,0,262 -chr15 26720218 . G GA 853.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:64:891,64,0 -chr15 27052279 . AT A 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-2.198;DP=111;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,59:85:99:1419,0,452 -chr15 27713454 . TGGTAAGAGTCATCTAGAGCTGATTTATTTCAGGTTATTTCTCTAACACAGGTGCTATAGATTTTCTTTATTTACTGCA T 763.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=30.14;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:67:801,67,0 -chr15 27754603 . C CA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.576;DP=252;FS=7.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=1.61;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,55:231:99:443,0,4223 -chr15 27755829 . A T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.047;DP=224;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,41:223:99:648,0,7393 -chr15 27756300 . T A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.079;DP=203;FS=12.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,43:202:99:763,0,6344 -chr15 27756508 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.895;DP=225;FS=6.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,41:225:99:426,0,8411 -chr15 27770377 . AAGGTGCATTTTGATTCTGTATCTGAAGCTCCATTTATTTTTTTGTAGTCATGTGGCTGATCATGTAGTTTATGTGTGTTGC A 7305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.442;DP=203;FS=6.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,201:203:99:7343,598,0 -chr15 27788343 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.585;DP=64;FS=5.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:299,0,1842 -chr15 27898458 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-1.079;DP=82;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:398,0,2266 -chr15 28107848 . C G 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.540;DP=283;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,50:283:99:605,0,8677 -chr15 28108289 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.791;DP=320;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,45:320:99:240,0,10546 -chr15 28108863 . AAT A 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.225;DP=176;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,30:149:99:458,0,4192 -chr15 28110154 . T G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-1.952;DP=282;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,42:282:99:350,0,9756 -chr15 28111614 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=1.046;DP=267;FS=8.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=1.91;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,46:266:99:537,0,9473 -chr15 28112669 . G A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.637;DP=309;FS=3.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,54:308:99:799,0,10234 -chr15 28114438 . TTA T 902.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.406;DP=280;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,52:269:99:940,0,9215 -chr15 28114577 . C T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-2.132;DP=236;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,41:236:99:604,0,7974 -chr15 28115913 . G GA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.106;DP=107;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=2.03;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:255,0,1424 -chr15 28118220 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.583;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.587;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:455,0,2712 -chr15 28136146 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-0.074;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:324,0,816 -chr15 28354215 . TTC T 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-1.626;DP=90;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:502,0,1941 -chr15 28355461 . G A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=1.382;DP=87;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:944,0,1907 -chr15 28356044 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.769;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:261,0,820 -chr15 28439092 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-0.730;DP=266;FS=6.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,40:266:99:234,0,10375 -chr15 28501135 . G T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.233;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:428,0,634 -chr15 28735068 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.673;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,756 -chr15 28735137 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.020;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:285,0,957 -chr15 28742976 . C A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-2.104;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:272,0,1396 -chr15 29082094 . AAGGTAAACATTTATGCATATTGACAGTTTTTACAAATTAATACGACTTATTCTGTGGTAAGTCCTGCTGATTCTTTTCC A 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=2.700;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:369,0,1953 -chr15 29508407 . T C 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-1.354;DP=112;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:550,0,7253 -chr15 29508410 . A C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=-0.430;DP=116;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,25:116:99:544,0,7253 -chr15 29511339 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.070;DP=92;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:287,0,2793 -chr15 29511409 . C CA 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.409;DP=103;FS=7.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,29:96:99:509,0,1821 -chr15 29517257 . G GT 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-2.003;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:311,0,1051 -chr15 29682335 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.265;DP=39;FS=5.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:360,0,2240 -chr15 29682345 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.313;DP=39;FS=7.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:356,0,2240 -chr15 29714721 . GAGGTGCTTCTTATTGCTTGTTTTTTTATACAATAGTGTTTATAAGTTCTTTAGTAGTCTTGCTTTCTGCTGTCTTATGGCCTGC G 401.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:6:438,0,6 -chr15 29735567 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-1.036;DP=78;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:461,0,2572 -chr15 30136479 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.749;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:358,0,531 -chr15 30137091 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.695;DP=47;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:293,0,1380 -chr15 30140967 . GACCTGCATGAGAAAATTGGCCATTAAATTATGTTACTTGTAAACAGCATCAACATAAATGTCATGCATTAATGAATGATTTAAAGACTC G 3516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=2.391;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=31.09;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:3554,255,0 -chr15 30141279 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.119;DP=76;FS=6.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:257,0,2452 -chr15 30150648 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.221;DP=72;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:229,0,2123 -chr15 30178240 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=-1.239;DP=50;FS=6.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:291,0,1426 -chr15 30189206 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.870;DP=54;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:267,0,1543 -chr15 30221081 . A AGCACAACCATCAACG 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.483;DP=49;FS=9.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.836;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:554,0,1496 -chr15 30459619 . GC G 7041.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.569;ClippingRankSum=-8.830;DP=292;FS=29.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=24.12;ReadPosRankSum=-5.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,53:258:99:7079,0,7422 -chr15 30459865 . T C 10007.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-1.010;DP=145;FS=3.413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=31.17;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,123:141:44:10036,44,0 -chr15 30459866 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.655;DP=148;FS=7.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,36:148:99:422,0,9210 -chr15 30460004 . T C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=1.929;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:724,0,2879 -chr15 30460013 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=1.822;DP=74;FS=2.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:441,0,3761 -chr15 30483940 . C CA 369.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-1.267;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:11:406,0,11 -chr15 30484629 . GT G 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.336;DP=26;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=11.22;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:329,0,279 -chr15 30534737 . T TC 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.805;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:273,0,178 -chr15 30538407 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=1.768;DP=42;FS=5.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:296,0,1126 -chr15 30538581 . C T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.279;DP=40;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:538,0,859 -chr15 30538776 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.109;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:502,0,648 -chr15 30538941 . G GT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.883;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:319,0,632 -chr15 30539003 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:455,0,391 -chr15 30539018 . C G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:429,0,404 -chr15 30539693 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-1.428;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:572,0,976 -chr15 30539702 . CT C 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-2.152;DP=34;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:482,0,1167 -chr15 30540262 . G A 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=-0.296;DP=73;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,42:73:99:1468,0,1034 -chr15 30540930 . T A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-1.254;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1161,0,1123 -chr15 30541891 . A T 2673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.740;DP=134;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:2702,0,4343 -chr15 30541901 . G A 2595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.324;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:2624,0,5693 -chr15 30811058 . A G 5953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-1.898;DP=283;FS=5.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,175:283:99:5982,0,3754 -chr15 30811940 . G A 8889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.338;DP=435;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,261:435:99:8918,0,6072 -chr15 30813128 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,323 -chr15 30871834 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,99 -chr15 31128242 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.099;DP=18;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=25.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:484,0,152 -chr15 31525181 . T G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,290 -chr15 31581613 . G A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=1.400;DP=44;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:801,0,721 -chr15 31598232 . C CA 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.377;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:460,0,217 -chr15 32045574 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:261,0,58 -chr15 32064292 . T TG 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:253,0,127 -chr15 32129543 . GA G 2463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.337;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,96:137:99:2501,0,594 -chr15 32266403 . A T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=27.65;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:360,0,52 -chr15 32985627 . CT C 701.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.009;DP=54;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:739,0,547 -chr15 32986225 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=32.90;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:373,0,150 -chr15 32986349 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:393,0,325 -chr15 32986810 . T C 834.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.175;DP=24;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=34.76;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:10:862,0,10 -chr15 32986846 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:255,0,1131 -chr15 32988869 . T C 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.733;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:1595,0,1493 -chr15 33056360 . C A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:351,0,666 -chr15 33134604 . C A 4413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=-0.824;DP=268;FS=21.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,122:268:99:4442,0,4952 -chr15 33134669 . C CT 2873.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-1.152;DP=354;FS=12.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,139:317:99:2911,0,3693 -chr15 33135948 . G T 301.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:346,27,0 -chr15 33136929 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:336,0,665 -chr15 33137015 . C G 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.054;DP=33;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:601,0,533 -chr15 33137626 . A AAG 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-2.499;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=7.89;ReadPosRankSum=3.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:274,0,228 -chr15 33138242 . G T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=1.389;DP=43;FS=6.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.86;ReadPosRankSum=2.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:538,0,979 -chr15 33138499 . C G 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=1.356;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:980,0,1615 -chr15 33138634 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.320;DP=50;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:684,0,1119 -chr15 33138940 . G C 585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:614,42,0 -chr15 33139507 . C G 1689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.032;DP=29;FS=2.062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=29.40;ReadPosRankSum=2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:50:1718,50,0 -chr15 33139796 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,281 -chr15 33139924 . T G 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-1.149;DP=47;FS=4.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:1017,0,690 -chr15 33140139 . G A 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-1.609;DP=255;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=3.73;ReadPosRankSum=-2.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,52:255:99:980,0,7859 -chr15 33141715 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.21;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,179 -chr15 33142755 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.28;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:311,0,147 -chr15 33143640 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.32;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:423,0,126 -chr15 33155981 . C CA 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.431;DP=391;FS=12.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=1.24;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,74:380:99:523,0,8437 -chr15 33436772 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.917;DP=90;FS=12.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:574,0,2389 -chr15 33437252 . G T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-2.396;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:422,0,723 -chr15 33437256 . AAT A 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=1.262;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:291,0,854 -chr15 33437312 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.794;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:300,0,914 -chr15 33869709 . A C 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.282;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:963,0,317 -chr15 33870236 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.321;DP=32;FS=3.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:288,0,820 -chr15 33877124 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.708;DP=50;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:329,0,1414 -chr15 33918174 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-3.529;DP=164;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,32:164:99:544,0,5116 -chr15 34182846 . C A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=2.491;DP=14;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=26.41;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:88:398,0,88 -chr15 34196074 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=-2.378;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:415,0,1651 -chr15 34224222 . G A 2453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.087;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=34.56;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,60:71:99:2482,0,489 -chr15 34224225 . C T 2453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.139;DP=69;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,58:69:99:2482,0,467 -chr15 34262323 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=-3.389;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=10.58;ReadPosRankSum=-2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:314,0,612 -chr15 34266283 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=2.489;DP=33;FS=19.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:763,0,411 -chr15 34339318 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.633;DP=51;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:261,0,1518 -chr15 34387760 . GA G 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.534;DP=69;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.330;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:428,0,883 -chr15 34530422 . T A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:320,0,129 -chr15 34634830 . A AAC 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=-2.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=27.80;ReadPosRankSum=2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:60:482,0,60 -chr15 34635133 . GA G 533.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.390;DP=74;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:571,0,1117 -chr15 34635546 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.552;DP=34;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:304,0,882 -chr15 34636038 . G A 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-1.695;DP=72;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1094,0,1418 -chr15 35157989 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.417;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:516,0,478 -chr15 35158929 . C G 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.872;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:771,0,266 -chr15 35411443 . A G 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 -chr15 35411545 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 -chr15 35456100 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.104;DP=76;FS=6.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:876,0,1828 -chr15 35456145 . A G 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.241;DP=79;FS=4.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:945,0,1789 -chr15 35481214 . AGTGAGTCTTTTAACAGAGATAGTTCTGTTTTCCATCTGTCTTGTTTTTTTTTTTCCTCACTTGCCCTTTCTCACTGTTTTCTTATTCTAATTCTCTTTGCTGCCACCAG A 2259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.452;ClippingRankSum=6.756;DP=109;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=20.73;ReadPosRankSum=-4.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,72:107:99:2297,0,19030 -chr15 35483395 . A C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-1.733;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:348,0,176 -chr15 35483714 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:277,0,539 -chr15 35485376 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.842;DP=42;FS=3.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:234,0,2608 -chr15 35485380 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.854;DP=44;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:234,0,2608 -chr15 35490337 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=-0.776;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:444,0,876 -chr15 35491656 . T A 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr15 35491868 . C CAT 202.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr15 35493568 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=-1.354;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:331,0,505 -chr15 35493696 . C T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr15 35714295 . TA T 633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-0.659;DP=30;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:83:671,0,83 -chr15 35714298 . CAAT C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-1.749;DP=39;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:660,0,120 -chr15 35715229 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-1.885;DP=27;FS=6.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:229,0,764 -chr15 35720138 . T TA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.370;DP=14;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:56:238,0,56 -chr15 36157887 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,107 -chr15 36158303 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.460;DP=30;FS=11.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:455,0,582 -chr15 36180189 . A G 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.390;DP=95;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=13.25;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1287,0,1929 -chr15 36181158 . A AAC 805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.526;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:843,0,1289 -chr15 36181160 . C CATTAAACGGCCCCGT 796.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:834,0,1406 -chr15 36214188 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=3.880;DP=53;FS=18.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=6.64;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:380,0,1377 -chr15 36231358 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.188;DP=77;FS=12.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:869,0,1836 -chr15 36231500 . C T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-1.034;DP=62;FS=2.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:929,0,1248 -chr15 36231619 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.596;DP=71;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:721,0,3655 -chr15 36248329 . C T 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.674;DP=261;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,58:261:99:1114,0,8007 -chr15 36248562 . C CA 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.995;DP=110;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,27:109:99:337,0,2193 -chr15 36258394 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.365;DP=50;FS=4.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:346,0,2490 -chr15 36272115 . G C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.441;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:270,0,1146 -chr15 36295373 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.475;DP=55;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:519,0,1404 -chr15 36320745 . C A 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr15 36429876 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.594;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:44:503,0,44 -chr15 36431502 . G C 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 -chr15 36431516 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr15 36534521 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=1.485;DP=72;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:363,0,2136 -chr15 36534794 . C T 1741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-2.045;DP=89;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,54:89:99:1770,0,1170 -chr15 36534832 . C T 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.099;DP=92;FS=2.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:859,0,2296 -chr15 36994473 . A C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-1.912;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:379,0,2155 -chr15 37280514 . C T 1167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=-0.693;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1196,87,0 -chr15 37280581 . T C 1020.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1049,75,0 -chr15 37774058 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.104;DP=120;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,21:120:99:236,0,3830 -chr15 37776746 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=-1.605;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,16:87:99:257,0,2670 -chr15 37792642 . C A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.363;DP=89;FS=7.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:339,0,2780 -chr15 38642738 . TA T 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.532;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:375,0,802 -chr15 38665961 . GCT G 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.867;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:295,0,444 -chr15 38825407 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=1.521;DP=43;FS=4.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:312,0,1062 -chr15 39356201 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:242,0,258 -chr15 39515511 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.020;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:275,0,929 -chr15 39517608 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.042;DP=22;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,500 -chr15 39699223 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.182;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:246,0,1168 -chr15 39764452 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=27.51;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:419,0,191 -chr15 39817415 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=2.127;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:322,0,349 -chr15 39817438 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.123;DP=21;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,473 -chr15 39817673 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=1.356;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:488,0,721 -chr15 39817742 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=1.427;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:297,0,1299 -chr15 39867869 . A G 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=18.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:408,0,55 -chr15 39926526 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.991;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:318,0,176 -chr15 40132126 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr15 40197021 . A T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.990;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:379,0,714 -chr15 40197122 . T G 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.597;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:805,0,548 -chr15 40203667 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.676;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:491,0,470 -chr15 40219721 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.739;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:788,0,828 -chr15 40220441 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-2.249;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:251,0,1361 -chr15 40220739 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.661;DP=57;FS=3.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:454,0,1924 -chr15 40220901 . A G 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=2.292;DP=59;FS=5.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:725,0,1249 -chr15 40221017 . T C 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.066;DP=62;FS=5.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1410,0,801 -chr15 40221095 . T C 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.460;DP=44;FS=6.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=17.20;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:785,0,719 -chr15 40221261 . C T 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=2.132;DP=54;FS=7.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=15.68;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:875,0,1039 -chr15 40222077 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=1.551;DP=28;FS=9.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:326,0,1799 -chr15 40226284 . T C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=2.508;DP=51;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:486,0,1268 -chr15 40296015 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-0.681;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:326,0,968 -chr15 40364510 . C T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.082;DP=63;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=13.62;ReadPosRankSum=3.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:886,0,1171 -chr15 40371870 . A T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.148;DP=57;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:983,0,960 -chr15 40476278 . GA G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-2.627;DP=22;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:271,0,610 -chr15 40476658 . G GT 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.099;DP=34;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:336,0,359 -chr15 40800234 . C T 3352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=1.990;DP=224;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,95:224:99:3381,0,4409 -chr15 40800459 . A G 3512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.579;DP=204;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,97:204:99:3541,0,3542 -chr15 40802490 . C A 3849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=2.529;DP=223;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=17.26;ReadPosRankSum=1.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,108:223:99:3878,0,3588 -chr15 40806871 . T A 2864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.388;DP=211;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,84:211:99:2893,0,4242 -chr15 40827250 . T C 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=-0.295;DP=119;FS=2.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,46:118:99:1513,0,2277 -chr15 40869846 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.238;DP=67;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:846,0,1322 -chr15 40873488 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-0.609;DP=42;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:407,0,853 -chr15 41081448 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=29.89;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:47:357,0,47 -chr15 41219678 . C A 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:591,42,0 -chr15 42020961 . T C 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-1.047;DP=90;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1094,0,2321 -chr15 42021941 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.347;DP=34;FS=5.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:536,0,679 -chr15 42022178 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.493;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:556,0,186 -chr15 42023165 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.116;DP=75;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:915,0,1761 -chr15 42023467 . AT A 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=2.414;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:239,0,2527 -chr15 42023688 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=2.252;DP=57;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:401,0,3384 -chr15 42024064 . A G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.013;DP=41;FS=4.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:614,0,839 -chr15 42024207 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-1.571;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:256,0,1405 -chr15 42024723 . T A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=-2.461;DP=60;FS=5.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=6.90;ReadPosRankSum=2.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:442,0,1642 -chr15 42084589 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=-1.346;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:401,0,1738 -chr15 42180738 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.787;DP=59;FS=5.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:514,0,1450 -chr15 42209733 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=-1.813;DP=32;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:498,0,581 -chr15 42341410 . A G 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr15 42362206 . TAA T 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.577;DP=59;FS=2.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:370,0,2018 -chr15 42592481 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.093;DP=49;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:301,0,1915 -chr15 42592483 . A G 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.248;DP=48;FS=2.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:832,0,862 -chr15 42592705 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=1.146;DP=44;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:282,0,1431 -chr15 42759328 . T A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-0.530;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:344,0,709 -chr15 42759339 . A C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:344,0,709 -chr15 42783186 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:297,0,555 -chr15 42949334 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-1.178;DP=50;FS=6.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:272,0,2969 -chr15 42949335 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-3.662;DP=51;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:251,0,3036 -chr15 42949449 . A G 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.574;DP=46;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:653,0,1003 -chr15 43109636 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.227;DP=43;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:834,0,1378 -chr15 43109642 . G T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.212;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:830,0,1378 -chr15 43112574 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.988;DP=53;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:343,0,2504 -chr15 43112575 . C G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=1.526;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:343,0,2504 -chr15 43127872 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:272,0,340 -chr15 43322037 . TCTACAACACAAAATATGATGTGAACAGTGTTGAAAAAGGTGTTCAATTGTGTAAAATCATAAAATTTTAC T 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.942;DP=17;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:510,0,1353 -chr15 43412105 . T C 371.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-1.738;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=28.56;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:397,0,1 -chr15 43696965 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.170;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:315,0,1297 -chr15 43704165 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.299;DP=55;FS=9.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:348,0,1579 -chr15 44192358 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-2.450;DP=20;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=14.64;ReadPosRankSum=-2.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:321,0,174 -chr15 44258315 . T A 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.567;DP=323;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.313;QD=5.15;ReadPosRankSum=2.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,82:323:99:1691,0,9116 -chr15 44268916 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.725;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=7.45;ReadPosRankSum=-2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,1472 -chr15 44268922 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=-1.174;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=12.94;ReadPosRankSum=-2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:99:274,0,1472 -chr15 44728909 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:351,0,526 -chr15 44808468 . C T 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=1.763;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,50:82:99:1631,0,1038 -chr15 44930161 . G T 2251.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2280,163,0 -chr15 45636735 . G C 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 -chr15 45636807 . A G 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-1.579;DP=40;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=26.37;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:1083,0,296 -chr15 45650805 . T A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=-1.287;DP=389;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,63:389:99:797,0,13136 -chr15 45660785 . G GCGGCAAGACCCAT 795.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,26:26:86:833,0,86 -chr15 45699553 . C G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 -chr15 45977705 . G T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr15 46006301 . G T 2690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.741;DP=96;FS=1.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.982;QD=28.03;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,65:95:99:2719,0,717 -chr15 46012136 . T C 6173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.269;DP=221;FS=23.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=27.94;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,166:221:99:6202,0,1267 -chr15 46020944 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:348,0,268 -chr15 46023465 . A T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr15 46024162 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:234,0,581 -chr15 46031497 . GCCTGAAGACAGCGAACATGATCATTTATACATTCAACACGCTCAATAAAACAGAAGACGTGTGTGAGATTCATA G 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=24;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:325,0,732 -chr15 46035075 . C G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.895;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:477,0,463 -chr15 46048721 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.151;DP=21;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=31.95;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:769,0,175 -chr15 46067076 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.062;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:344,0,692 -chr15 46071748 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=-0.520;DP=25;FS=17.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:411,0,521 -chr15 46071775 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=-1.285;DP=40;FS=12.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:526,0,803 -chr15 46072208 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.647;DP=54;FS=9.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:754,0,1055 -chr15 46091559 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:308,0,95 -chr15 46136182 . A T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.478;DP=49;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=19.44;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:981,0,919 -chr15 46140102 . G A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=1.449;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:582,0,487 -chr15 46145134 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.881;DP=37;FS=5.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:288,0,977 -chr15 46145162 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:534,0,561 -chr15 46150182 . A G 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.515;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=26.33;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1055,0,297 -chr15 46152305 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.345;DP=40;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:768,0,515 -chr15 46162131 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=1.267;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:461,0,313 -chr15 46162155 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.56;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,354 -chr15 46162641 . G T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-1.668;DP=48;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:402,0,1217 -chr15 46410558 . A G 201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:230,0,19 -chr15 46410621 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:273,0,357 -chr15 46466009 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.768;DP=185;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,27:185:99:244,0,5904 -chr15 46466079 . TCTGCACACACACACACACACACATTGACTACAGTGTTATGAATGTTGTGTGTGTGATGGTGTGTGTGTGTGTTGATGAAACGCTCGC T 7643.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.950;ClippingRankSum=1.440;DP=209;FS=10.924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=29.93;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,196:208:99:7681,495,0 -chr15 46486024 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.145;DP=89;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:344,0,2592 -chr15 46486395 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-1.478;DP=100;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:324,0,4210 -chr15 46507095 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=-0.667;DP=180;FS=3.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.141;QD=2.19;ReadPosRankSum=3.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,31:180:99:423,0,5668 -chr15 46511337 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.578;DP=126;FS=7.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,25:126:99:393,0,3778 -chr15 46515041 . A G 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=-0.289;DP=207;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,39:207:99:636,0,6360 -chr15 46532976 . TGGTTAGCTCCTCCTCCTCTGATTTCCTGTGCTATATTTGGTCACAGGGGCGTTAACCTGTTAAACTCCTCCCACA T 9704.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.052;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=33.82;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,227:230:99:9742,756,0 -chr15 46533117 . C T 2301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=-0.334;DP=170;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.929;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,75:169:99:2330,0,2982 -chr15 46533309 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.634;DP=183;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,34:182:99:482,0,5573 -chr15 46535997 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=-1.684;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,24:112:99:333,0,3083 -chr15 46566287 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.717;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:239,0,616 -chr15 46570568 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.945;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:315,0,285 -chr15 46573210 . G T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.250;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:791,0,1535 -chr15 46576794 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.722;DP=80;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=5.53;ReadPosRankSum=-1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:471,0,2258 -chr15 46576872 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.287;DP=77;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:565,0,2134 -chr15 46576956 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.264;DP=32;FS=6.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:278,0,793 -chr15 46587116 . A G 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=-0.138;DP=82;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=13.42;ReadPosRankSum=2.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,32:82:99:1129,0,1879 -chr15 46587296 . A G 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-0.665;DP=32;FS=8.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:634,0,513 -chr15 46587301 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.861;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:473,0,707 -chr15 46587939 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-1.144;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:333,0,1417 -chr15 46588029 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.188;DP=36;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:402,0,1163 -chr15 46588040 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-2.141;DP=44;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:251,0,1382 -chr15 46708882 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.748;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=4.23;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:333,0,1948 -chr15 46755211 . A G 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.778;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:36:758,0,36 -chr15 46774472 . A G 3570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;ClippingRankSum=5.157;DP=430;FS=18.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,140:430:99:3599,0,11069 -chr15 46774497 . T C 2521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=8.477;DP=469;FS=22.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:350,119:469:99:2550,0,12904 -chr15 46774557 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=1.842;DP=431;FS=2.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=1.15;ReadPosRankSum=8.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,64:431:99:522,0,13939 -chr15 46781681 . A G 3531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=-4.225;DP=454;FS=9.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,143:453:99:3560,0,11354 -chr15 46795402 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,216 -chr15 46837167 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-1.334;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:418,0,634 -chr15 46862123 . AG A 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.051;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:715,0,866 -chr15 46862783 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.980;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:381,0,2948 -chr15 46862784 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.840;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:381,0,2948 -chr15 46864538 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.805;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,14:82:99:245,0,5415 -chr15 46864541 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-1.693;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.939;QD=2.55;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,15:84:99:245,0,5415 -chr15 46866892 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=1.097;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:267,0,2525 -chr15 46867063 . G A 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.710;DP=87;FS=4.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:972,0,1941 -chr15 46867127 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.427;DP=60;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:282,0,1594 -chr15 46967677 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.21;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:76:395,0,76 -chr15 46969784 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.143;DP=115;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,30:115:99:627,0,3783 -chr15 46970035 . G A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-2.873;DP=118;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=6.81;ReadPosRankSum=3.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,34:118:99:832,0,3051 -chr15 46972546 . G GGT 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.193;DP=71;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:274,0,1065 -chr15 46981594 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.689;DP=110;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,29:109:99:630,0,2826 -chr15 46981689 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.331;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:367,0,5575 -chr15 47034385 . T G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-2.517;DP=53;FS=6.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:405,0,1507 -chr15 47080615 . C CT 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-2.126;DP=22;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:385,0,162 -chr15 47081368 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.372;DP=18;FS=5.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:537,0,109 -chr15 47082683 . C G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr15 47082684 . G T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr15 47082892 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=1.115;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=23.07;ReadPosRankSum=-1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:605,0,1376 -chr15 47082907 . A G 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=1.658;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:606,0,1376 -chr15 47086139 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.124;DP=48;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:802,0,770 -chr15 47086277 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.341;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:368,0,342 -chr15 47099482 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=1.031;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:293,0,663 -chr15 47314211 . T A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-1.508;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:686,0,490 -chr15 47314378 . G T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=-0.184;DP=34;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:840,0,331 -chr15 47407165 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=-0.731;DP=45;FS=3.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:285,0,1265 -chr15 47421370 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,264 -chr15 47422797 . A G 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.922;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:565,0,348 -chr16 38038 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=27.14;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,1:13:99:381,0,419 -chr16 127811 . TGTGTG T 794.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:67:832,67,0 -chr16 154286 . C A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr16 154294 . T C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr16 409600 . G C 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:439,30,0 -chr16 412675 . G A 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-1.866;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=25.25;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,38:54:99:1392,0,362 -chr16 1129399 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,382 -chr16 1213134 . A T 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=1.764;DP=93;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.653;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,62:93:99:2171,0,1015 -chr16 1215425 . C T 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=-2.434;DP=71;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=21.15;ReadPosRankSum=2.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:1530,0,862 -chr16 1225733 . A C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.177;DP=34;FS=5.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:445,0,742 -chr16 1226596 . G A 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-1.743;DP=38;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:976,0,355 -chr16 1227014 . A C 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.331;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:829,0,723 -chr16 1229051 . G C 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.942;DP=55;FS=5.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1057,0,857 -chr16 1229720 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.824;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:257,0,774 -chr16 1229875 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=-1.029;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:754,0,436 -chr16 1231888 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=-1.232;DP=44;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:915,0,560 -chr16 1232962 . C T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.736;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:823,0,509 -chr16 1291182 . G C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=2.908;DP=41;FS=5.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:301,0,1110 -chr16 1291207 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=2.210;DP=41;FS=4.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=13.60;ReadPosRankSum=-3.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:586,0,770 -chr16 1291236 . T G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.552;DP=55;FS=7.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=14.41;ReadPosRankSum=3.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:821,0,1041 -chr16 1303480 . C T 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.574;DP=58;FS=5.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:58:99:1218,0,799 -chr16 1345641 . G C 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:980,66,0 -chr16 1345642 . C A 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:980,66,0 -chr16 1345973 . C A 1195.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.076;DP=32;FS=4.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=30.37;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:1:1221,0,1 -chr16 1346330 . A T 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.133;DP=44;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=34.29;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:38:1537,0,38 -chr16 1346450 . A C 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-0.473;DP=66;FS=11.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,42:66:99:1714,0,840 -chr16 1347125 . G A 1721.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1750,126,0 -chr16 1347194 . T C 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=1.140;DP=69;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1249,0,1106 -chr16 1348496 . T A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=1.374;DP=42;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1015,0,357 -chr16 1348976 . A G 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=1.339;DP=22;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:99:744,0,106 -chr16 1349355 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.764;DP=25;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:558,0,315 -chr16 1353690 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-0.604;DP=35;FS=6.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:608,0,571 -chr16 1357310 . C T 2389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=2.386;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=31.86;ReadPosRankSum=1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,62:75:99:2418,0,197 -chr16 1367143 . G A 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr16 1367591 . C T 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr16 1367656 . G A 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 -chr16 1368048 . A G 686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53:758,53,0 -chr16 1385491 . AAGGTGCTCACGCTATCAATGACCACAATTACACTTACTTTGATAAACAGGACGCTTAGGTTACCCTTCATTTAATAATAAATCCCTTTCTTAAAGCATTGCATTATGTGCAGTTTCTCACAATGTGTTCGCGAAGCTAACATCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGC A 2205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=1.574;DP=81;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=27.23;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,63:68:99:2243,0,258 -chr16 1413202 . ACAGGTGAGAACGAGCGCTGCTGATGCCCATTAGTACTGGAGAAGCCCACGCTTACTGTTGTGCTGTTATTTACTCTTT A 4316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=1.698;DP=102;FS=3.054;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:4354,333,0 -chr16 1421898 . T TAC 696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-2.433;DP=60;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:734,0,864 -chr16 1423267 . A C 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=2.442;DP=48;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=13.27;ReadPosRankSum=-2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:665,0,950 -chr16 1423651 . G C 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-1.211;DP=90;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:1535,0,1546 -chr16 1424107 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.788;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:970,0,972 -chr16 1424121 . C A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.822;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:997,0,1095 -chr16 1424332 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=2.009;DP=54;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:472,0,3025 -chr16 1425487 . G T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.428;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:774,0,1244 -chr16 1425599 . A G 2290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.311;DP=116;FS=8.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.525;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:2319,0,1745 -chr16 1493734 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:247,0,323 -chr16 1494070 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,336 -chr16 1495174 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:242,0,52 -chr16 1497777 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=21.70;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:332,0,163 -chr16 1497917 . T G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:305,0,97 -chr16 1519486 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.733;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.17;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,288 -chr16 1930389 . A G 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 -chr16 1930607 . T G 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr16 2290710 . A T 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.052;DP=178;FS=12.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,46:178:99:1115,0,5137 -chr16 2297211 . A G 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.290;DP=135;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=8.40;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,42:134:99:1162,0,3585 -chr16 2297596 . A AT 1143.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-1.161;DP=98;FS=2.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1181,0,1122 -chr16 2503952 . A C 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=-0.584;DP=53;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=28.22;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1524,0,275 -chr16 2920251 . T C 277.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.88;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:306,0,14 -chr16 3076229 . TCA T 1331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.231;DP=127;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:1369,0,1289 -chr16 3076515 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:422,0,253 -chr16 3077929 . A C 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.858;DP=35;FS=9.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=27.02;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:974,0,1160 -chr16 3078171 . A AT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.349;DP=37;FS=25.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:451,0,453 -chr16 3101322 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,214 -chr16 3344600 . T C 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.217;DP=51;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:844,0,864 -chr16 3346995 . T A 9987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.270;ClippingRankSum=-1.920;DP=756;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,233:332:99:10016,0,2497 -chr16 3347052 . G A 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.855;DP=569;FS=20.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,72:318:99:935,0,14097 -chr16 3411255 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.590;DP=48;FS=4.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:924,0,609 -chr16 3411491 . G GT 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.220;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:436,0,746 -chr16 3429553 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=-1.232;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:362,0,344 -chr16 3474317 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=-1.032;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=31.11;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:40:526,0,40 -chr16 3474404 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:338,0,48 -chr16 3672476 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=32.75;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:50:445,0,50 -chr16 3686551 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.710;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:633,0,617 -chr16 3713350 . C CT 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.686;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:370,0,340 -chr16 3833749 . G GA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.740;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:56:244,0,56 -chr16 3932970 . C T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.182;DP=40;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.120;QD=26.69;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1096,0,285 -chr16 3950186 . G A 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.085;DP=69;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=24.13;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,46:68:99:1693,0,619 -chr16 3973039 . A G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=1.641;DP=55;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:526,0,1387 -chr16 3973424 . G T 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.236;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:997,0,638 -chr16 3973753 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:430,0,238 -chr16 3975059 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.921;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:610,0,446 -chr16 3976311 . C G 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.138;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:772,0,864 -chr16 4021033 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-3.170;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:416,0,210 -chr16 4037062 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.067;DP=23;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:477,0,674 -chr16 4041940 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:349,0,634 -chr16 4777867 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=1.098;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=13.81;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:401,0,498 -chr16 5101804 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.904;DP=75;FS=6.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:242,0,2340 -chr16 5113294 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-1.840;DP=64;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.069;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:251,0,1780 -chr16 5458904 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.133;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:423,0,3447 -chr16 5459216 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=2.198;DP=71;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:566,0,1970 -chr16 5485321 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=3.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=13.89;ReadPosRankSum=-3.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:306,0,685 -chr16 5485325 . A C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=23.15;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:99:306,0,685 -chr16 5485890 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:229,0,257 -chr16 5631624 . TA T 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.077;DP=27;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:373,0,328 -chr16 5631702 . CG C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-0.382;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:79:267,0,79 -chr16 5721677 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:291,0,361 -chr16 5777133 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.651;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,357 -chr16 5786922 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.970;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:724,0,724 -chr16 5792158 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.965;DP=45;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:910,0,1695 -chr16 5792167 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.564;DP=44;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:910,0,1695 -chr16 5819577 . GAGGTTCTCTATCCACTCAGGCCTGAATCACATCTGCTGCACCTGTCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATCCACATCTGTATCTCTCTTCATAC G 1679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.125;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,43:47:99:1717,0,437 -chr16 5824135 . C A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=1.981;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=14.08;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:845,0,1116 -chr16 5826655 . CAGGTGTGAAATCTACCCTTCCTAAACACTGAAACATGTCTGTGTAGAGCTGTTCATCTGTATACAGAGTGTTCACTGTGTTTAATCT C 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=2.894;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:557,0,2244 -chr16 5826656 . AGGT A 768.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-2.486;DP=47;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:806,0,2732 -chr16 5826664 . AATCTACCCTTCCTAAACACTGAAACATGTCTGTGTAGAGCTGTTCATCTGTATACAGAGTGTTCACTGTGTTTAATCTAGTGAG A 768.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=-1.777;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=15.69;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:806,0,2732 -chr16 5853356 . C A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.098;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:579,0,234 -chr16 5869291 . T G 491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:520,36,0 -chr16 5975246 . G A 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.205;DP=211;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=7.03;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,61:210:99:1511,0,5665 -chr16 6063995 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=-0.332;DP=43;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:772,0,517 -chr16 6067878 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.528;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:591,0,684 -chr16 6073983 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-2.468;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:308,0,307 -chr16 6373454 . GCCTGTGGTGAAACAGAGAAAAACTGATGATCATCTGTTCTCAATGAGCAAACATTTCTGTAAGAGGCAACTATAACTTAGGAACTATAGGTCAGCTTA G 3380.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=1.424;DP=82;FS=2.456;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3418,345,0 -chr16 6390581 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.900;DP=44;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:673,0,869 -chr16 6393408 . T C 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.478;DP=78;FS=4.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=19.71;ReadPosRankSum=-2.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,48:78:99:1566,0,1057 -chr16 6397355 . T C 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:551,45,0 -chr16 6400368 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.849;DP=61;FS=5.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:498,0,1550 -chr16 6400412 . T A 3933.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3962,283,0 -chr16 6400431 . T C 1265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=-0.822;DP=69;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1294,0,1240 -chr16 6400480 . C T 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.395;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1150,0,1375 -chr16 6400553 . T TA 2682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2720,200,0 -chr16 6400626 . G A 3204.83 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.325;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=24.12;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:3236,238,0 -chr16 6400725 . A C 6278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:6307,440,0 -chr16 6400797 . TA T 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=-3.010;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:1032,0,1614 -chr16 6400799 . A G 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-2.626;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:1032,0,1614 -chr16 6401490 . A AT 445.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:483,39,0 -chr16 6401572 . A T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr16 6403647 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr16 6403659 . T G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr16 6407209 . C T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 -chr16 6424935 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:239,0,131 -chr16 6424998 . T C 414.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=34.52;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:442,0,9 -chr16 6426482 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.850;DP=37;FS=7.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:528,0,678 -chr16 6426611 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.076;DP=30;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:376,0,660 -chr16 6429149 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.407;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:238,0,798 -chr16 6430572 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.471;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,564 -chr16 6479641 . C CA 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.658;DP=151;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=1.63;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,35:148:99:284,0,4042 -chr16 6483197 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.372;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:295,0,855 -chr16 6715611 . G T 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.042;DP=115;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,46:115:99:1523,0,2294 -chr16 6715670 . G A 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.478;DP=122;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:1464,0,2446 -chr16 6715745 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-0.721;DP=120;FS=14.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,32:120:99:706,0,3712 -chr16 6725876 . G A 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.260;DP=151;FS=6.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=7.22;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,44:151:99:1119,0,4058 -chr16 6725989 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.162;DP=126;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:612,0,3738 -chr16 6730501 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-1.180;DP=103;FS=5.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,30:103:99:784,0,2737 -chr16 6733764 . G T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-4.098;DP=51;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:920,0,795 -chr16 6741178 . A C 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-2.281;DP=130;FS=2.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,36:130:99:823,0,3621 -chr16 6741842 . A G 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.177;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,39:141:99:950,0,3883 -chr16 6744947 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.906;DP=153;FS=7.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,39:153:99:253,0,8322 -chr16 6745981 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.486;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,42:194:99:428,0,9009 -chr16 6746392 . C T 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-0.945;DP=192;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=6.73;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,55:192:99:1321,0,5201 -chr16 6749065 . CA C 1036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-0.468;DP=52;FS=9.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1074,0,135 -chr16 6749280 . T C 1823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-1.055;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,54:150:99:1852,0,5670 -chr16 6794159 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:236,0,64 -chr16 6795163 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.529;DP=58;FS=2.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:255,0,1652 -chr16 6800414 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.440;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:524,0,2128 -chr16 6811081 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=3.074;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.669;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:351,0,1926 -chr16 6814755 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.092;DP=72;FS=3.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,22:72:99:586,0,1938 -chr16 6819714 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.424;DP=70;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:586,0,1840 -chr16 6821517 . T G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.718;DP=118;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,27:118:99:497,0,3339 -chr16 6824476 . G T 2045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.202;DP=105;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=19.48;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,62:100:99:2074,0,1323 -chr16 6824512 . G A 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-0.607;DP=96;FS=1.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:1451,0,1874 -chr16 6827893 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.526;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:837,0,1360 -chr16 6829910 . AGTATGCTGGACATTAAAGGGATAGTTCACCCTAAAATAAACATTTGCTGTAATTTTTTTAGCCCTCAGGCAGTTAAAGATGACTTTTGTCTTCAGTAGAACACTAAAAAAAATTTATAGCTGAATCTGTGATCCTTGATGATTTTCGTGATGATGTTTGTGAACCACAG A 2264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.909;DP=87;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=26.03;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,63:84:99:2302,0,3422 -chr16 6829911 . GT G 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.137;DP=82;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:307,0,5567 -chr16 6829914 . TGCTGGACATTAAAGGGATAGTTCACCCTAAAATAAACATTTGCTGTAATTTTTTTAGCCCTCAGGCAGTTAAAGATGACTTTTGTCTTCAGTAGAACACTAAAAAAAATTTATAGCTGAATCTGTGATCCTTGATGATTTTCGTGATGATGTTTGTGAACCACAGGAG T 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.750;DP=87;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:297,0,5567 -chr16 6835752 . AGTGAGCTTTTTGAAGTATTCCCATATAGAAACCTGATAAATTGATATATACTAAAATTACATATACAGTATTTCCATGTAAAATATTTCAATATATGCATTGAGACGTTTGTTTTTATATGTGTTACTATTGGTAATATAAACTTTTGCTTGTTGACAG A 441.48 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=3.470;DP=86;FS=15.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=5.13;ReadPosRankSum=-2.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,73:81:99:3230,0,745 -chr16 6839694 . T A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=1.027;DP=49;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=20.20;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:1018,0,682 -chr16 6841349 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.921;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:486,0,543 -chr16 6842933 . T A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.533;DP=56;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:299,0,1663 -chr16 6843444 . C G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.196;DP=67;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:583,0,1740 -chr16 6843489 . G A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.588;DP=70;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:801,0,1666 -chr16 6844734 . GA G,GAA 338.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,6:13:99:413,165,243,285,0,627 -chr16 6857485 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=-1.809;DP=45;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:244,0,1287 -chr16 6878963 . T C 2023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.435;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=31.13;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,52:65:99:2052,0,227 -chr16 6892586 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-2.265;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:232,0,1029 -chr16 6892899 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:98:282,0,98 -chr16 6894524 . T G 2280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.083;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=34.04;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,58:67:53:2309,0,53 -chr16 6897547 . G GT 396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:434,42,0 -chr16 6913382 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:87:349,0,87 -chr16 6958791 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=-0.576;DP=65;FS=5.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:503,0,1513 -chr16 6963904 . T C 1775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.934;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=34.82;ReadPosRankSum=2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,46:51:34:1804,34,0 -chr16 6964018 . C T 2856.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2885,196,0 -chr16 6969249 . AT A 219 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:12:256,12,0 -chr16 6970411 . G A 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=1.160;DP=48;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=20.37;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:1006,0,1445 -chr16 6971713 . T A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-1.342;DP=19;FS=9.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=26.46;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:531,0,156 -chr16 6972925 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,326 -chr16 6972970 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,228 -chr16 7042937 . C T 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.472;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:972,0,234 -chr16 7043053 . G T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=1.513;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:376,0,248 -chr16 7043492 . C G 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-1.198;DP=34;FS=8.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:989,0,179 -chr16 7044107 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=1.531;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=29.78;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:475,0,329 -chr16 7044790 . C A 1089.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.294;DP=34;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=32.05;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:24:1118,0,24 -chr16 7044879 . G T 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.222;DP=56;FS=3.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=23.39;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,48:56:79:1338,0,79 -chr16 7045234 . C T 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.107;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,33:43:99:1217,0,215 -chr16 7435661 . T TAA 2108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-3.125;DP=289;FS=2.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,96:230:99:2791,0,4606 -chr16 7618603 . C G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.914;DP=71;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:504,0,2474 -chr16 7633043 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.057;DP=35;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:241,0,953 -chr16 7635187 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=-1.388;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:249,0,998 -chr16 7638365 . A C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.423;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:391,0,618 -chr16 7804223 . C A 204.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:233,0,19 -chr16 7862000 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.549;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1119 -chr16 7862001 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.484;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.937;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1111 -chr16 7862326 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.690;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:233,0,1051 -chr16 7867174 . T G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-2.272;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=14.99;ReadPosRankSum=2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:403,0,462 -chr16 7959371 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-1.584;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:248,0,775 -chr16 7978583 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.902;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:315,0,872 -chr16 8034140 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.401;DP=53;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:902,0,944 -chr16 8095141 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-1.010;DP=146;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=2.33;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,26:146:99:369,0,4561 -chr16 8137221 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=3.225;DP=123;FS=4.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=1.67;ReadPosRankSum=-2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,20:123:99:234,0,4090 -chr16 8145568 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-2.461;DP=151;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,25:151:99:324,0,4837 -chr16 8168644 . CT C 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-2.021;DP=72;FS=3.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:450,0,1355 -chr16 8169622 . T G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr16 8383066 . AGAACCCCCTGCAAGACCATACACACAATCCT A 3221.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.238;ClippingRankSum=0.425;DP=263;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.635;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,98:163:99:3259,0,10334 -chr16 8383070 . CCCCCTGCAAGACCAT C 1133.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.795;DP=249;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=4.55;ReadPosRankSum=3.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,51:166:99:1171,0,12395 -chr16 8383087 . CACACAATCCTGAACACCAGATGCAAAACTGAAGCAGTGTTTGAGAATAACGAGAACCAATGGCATTTATAAAGGGGTTGAGGCTCA C 1126.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=-0.351;DP=247;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=4.56;ReadPosRankSum=3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,51:165:99:1164,0,12395 -chr16 8383103 . CCAGATGCAAAACTGAAGCAGTGTTTGAGAATAACGAGAACCAATGGCATTTATAAAGGGGTTGAGGCTCA C 3221.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.096;DP=246;FS=0.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,98:164:99:3259,0,9909 -chr16 8651809 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-0.285;DP=84;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:660,0,2237 -chr16 8659374 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-1.647;DP=76;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:691,0,1948 -chr16 8849967 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,423 -chr16 8876229 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-2.468;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:266,0,530 -chr16 8935584 . C G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.757;DP=49;FS=9.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.462;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:621,0,1109 -chr16 8944955 . A T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.894;DP=56;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:604,0,1207 -chr16 8962272 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:36:269,0,36 -chr16 8963848 . C CA 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=-0.427;DP=156;FS=5.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,31:150:99:280,0,3285 -chr16 8966347 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-2.675;DP=96;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:612,0,2761 -chr16 9162192 . T A 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 -chr16 9350926 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=2.967;DP=39;FS=11.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=7.05;ReadPosRankSum=-3.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:303,0,1613 -chr16 9350927 . T C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-2.670;DP=39;FS=7.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=13.76;ReadPosRankSum=2.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:565,0,1107 -chr16 9558605 . T A 218.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:247,0,24 -chr16 9660276 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,285 -chr16 9666216 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,211 -chr16 9666995 . AT A 671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:51:709,51,0 -chr16 9667337 . A T 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr16 9667787 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.318;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=26.28;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:475,0,160 -chr16 9677757 . G GTTTT 340.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:378,26,0 -chr16 10069854 . T C 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.939;DP=88;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.254;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,31:88:99:1046,0,1961 -chr16 10070047 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-1.989;DP=84;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:359,0,2567 -chr16 10137311 . AACCTGAAAGGACATGAGGAAAAGAGCAGGAGACAGAAGGGAGAAAGAAGATGAGTTATAAAACATGGGCAAAATAAAAGGTAGCTGTGTACTTGAGTCATACTC A 2589.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=1.181;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:99:2627,185,0 -chr16 10166919 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.115;DP=67;FS=2.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.156;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:558,0,1746 -chr16 10728143 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:321,0,185 -chr16 10728245 . A T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr16 10736335 . G C 373.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:402,30,0 -chr16 10736402 . C A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr16 10761197 . T A 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr16 10761304 . C T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.128;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=30.90;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:708,0,174 -chr16 10774385 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr16 10974286 . T C 1074.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1103,78,0 -chr16 10993867 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=12.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,444 -chr16 10993926 . T G 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:564,39,0 -chr16 10994105 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:294,0,303 -chr16 11019956 . A T 367.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:396,30,0 -chr16 11020977 . T A 653.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.945;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=32.65;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:12:681,12,0 -chr16 11027869 . G A 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr16 11134385 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr16 11187662 . G C 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-2.342;DP=38;FS=15.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=31.94;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:98:1242,0,98 -chr16 11206135 . A T 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr16 11318862 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:311,0,280 -chr16 11352944 . TC T 477 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-1.309;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:12:514,12,0 -chr16 11355387 . A C 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=1.621;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=30.72;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:69:612,0,69 -chr16 11368279 . GAGGTCAGTCTTACTGTCATTTCCATTATTGTTTTTCTTACTCCTTTTTTCTGCCCTTTTGCAGTTTTGTTTACAGCAATGTTTTTCTTTGAGCAC G 11875.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=-0.300;DP=354;FS=3.052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=33.55;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,316:324:99:11913,877,0 -chr16 11429106 . G GAAAGAAAA 375.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:25:413,25,0 -chr16 11572177 . GT G 1374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.590;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=25.00;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,44:54:99:1412,0,127 -chr16 11574288 . GA G 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.583;DP=43;FS=11.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:629,0,173 -chr16 11801253 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.833;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=21.02;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:722,0,330 -chr16 11804660 . GCTGCATGAAGAACTAGACATTAATTTCAGCAATGTGAAAACCTAAAGCATTCACTTACATTCACTGTTATTCTTTGAAAATGTCTAC G 584.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.436;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=27.84;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:622,0,513 -chr16 11811271 . G A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=1.204;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=30.36;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1091,0,113 -chr16 11811349 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.564;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:638,0,398 -chr16 11811354 . C A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.428;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:638,0,364 -chr16 11814156 . A T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.855;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:299,0,175 -chr16 11819161 . T G 1258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1287,90,0 -chr16 11819525 . T C 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-1.555;DP=40;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1199,0,184 -chr16 11821338 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.023;DP=29;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:336,0,701 -chr16 11821566 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-1.720;DP=30;FS=9.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:252,0,804 -chr16 11821599 . A G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=1.190;DP=32;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=23.37;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:776,0,382 -chr16 11821778 . G A 1084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-2.011;DP=37;FS=3.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=29.32;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1113,0,183 -chr16 11822076 . G A 624.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:653,48,0 -chr16 11826628 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=-1.113;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:517,0,166 -chr16 11826639 . G C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-2.082;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.628;QD=21.17;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:494,0,277 -chr16 11826747 . G A 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=31.90;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:71:1049,0,71 -chr16 11826824 . G A 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.274;DP=32;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.869;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:808,0,160 -chr16 11827054 . G C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:372,0,474 -chr16 11827064 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=1.977;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=28.65;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:372,0,474 -chr16 11827111 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:270,0,190 -chr16 11942799 . C T 3333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=4.969;DP=195;FS=6.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,106:195:99:3362,0,3089 -chr16 12032646 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-2.731;DP=59;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=8.15;ReadPosRankSum=3.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:509,0,1535 -chr16 12036213 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.088;DP=59;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:357,0,1628 -chr16 12057103 . C T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-1.945;DP=145;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:1073,0,3960 -chr16 12064412 . T C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=1.514;DP=146;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,38:146:99:836,0,8250 -chr16 12084813 . G A 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.073;DP=177;FS=13.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,50:177:99:1269,0,4914 -chr16 12087038 . A C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.380;DP=16;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:243,0,681 -chr16 12087039 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,681 -chr16 12087350 . CA C 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.528;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,31:165:99:392,0,4532 -chr16 12087477 . G C 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-1.144;DP=170;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,45:170:99:1008,0,4736 -chr16 12118619 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.332;DP=105;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:523,0,3172 -chr16 12230318 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.603;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:388,0,1815 -chr16 12244905 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=1.344;DP=75;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:288,0,2241 -chr16 12340820 . G C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:78:474,0,78 -chr16 12341149 . C G 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:714,54,0 -chr16 12341251 . T G 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 -chr16 12386422 . GAGGTAAAGAACTAAAACCAAGTTTTAAAGCAAGTGTTTTGTGTTTCTAAAGATTATATTTCATGACTGACATTCTCTCTTCGTGAA G 2633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=3.937;DP=75;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=31.00;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,66:75:99:2671,0,2959 -chr16 12678817 . ACCTCCT A 208.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:246,0,13 -chr16 12692551 . G C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.881;DP=68;FS=20.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=8.76;ReadPosRankSum=-2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,23:68:99:624,0,3713 -chr16 12694199 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.707;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:346,0,1430 -chr16 12695265 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.146;DP=47;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:515,0,2740 -chr16 12695571 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=2.700;DP=13;FS=21.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=25.44;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:359,0,144 -chr16 12696738 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=1.420;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:249,0,1998 -chr16 12839450 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-1.731;DP=85;FS=13.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:499,0,2344 -chr16 12841467 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.186;DP=71;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:291,0,2026 -chr16 12842191 . C CT 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.444;DP=62;FS=4.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=3.30;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:242,0,921 -chr16 12842716 . A G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=1.107;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:422,0,1404 -chr16 12842722 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=-0.476;DP=47;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:300,0,1488 -chr16 12842962 . G A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=32.92;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:505,0,511 -chr16 12842965 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-2.359;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=23.26;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:505,0,511 -chr16 12843068 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,1:6:99:509,0,511 -chr16 12843257 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.234;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,1016 -chr16 12843454 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.694;DP=24;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:353,0,123 -chr16 12843495 . G C 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.586;DP=48;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:856,0,171 -chr16 12843576 . GA G 1240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.295;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:78:1278,0,78 -chr16 12843636 . G C 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,15:15:57:1278,0,57 -chr16 12843658 . T G 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.250;DP=30;FS=20.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=33.20;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:78:1278,0,78 -chr16 12919856 . C T 1816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=-0.717;DP=67;FS=18.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,53:67:99:1845,0,230 -chr16 13050790 . CA C 246.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:284,27,0 -chr16 13296488 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:419,0,134 -chr16 13304791 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:306,0,231 -chr16 13475951 . A C 2164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.514;DP=80;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,58:80:99:2193,0,514 -chr16 13495890 . C T 2626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.102;DP=86;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,71:86:99:2655,0,212 -chr16 13496071 . A C 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.336;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:543,0,557 -chr16 13498211 . C T 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-1.304;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=25.58;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,29:41:99:1077,0,308 -chr16 13498614 . C T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.811;DP=37;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:995,0,317 -chr16 13500807 . A T 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=2.498;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=24.56;ReadPosRankSum=-3.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1256,0,425 -chr16 13501179 . C T 1985.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.964;DP=54;FS=6.254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:22:2014,22,0 -chr16 13501480 . C G 1234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=2.714;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:1263,0,420 -chr16 13501547 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-1.399;DP=31;FS=8.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=21.90;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:707,0,432 -chr16 13501649 . C A 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=1.478;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=29.83;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:2659,193,0 -chr16 13524527 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.702;DP=84;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:587,0,2482 -chr16 13524567 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.264;DP=64;FS=3.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:506,0,1891 -chr16 13524642 . A T 1942.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-0.549;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=28.21;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1971,138,0 -chr16 13525221 . G A 3081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=1.025;DP=85;FS=4.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,71:85:99:3110,0,151 -chr16 13528664 . T A 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:244,0,25 -chr16 13715541 . T G 4347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.221;DP=148;FS=8.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,112:148:99:4376,0,842 -chr16 13715782 . AT A 1188.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.276;DP=69;FS=11.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,47:66:99:1226,0,217 -chr16 13716023 . T G 9294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.402;ClippingRankSum=-1.104;DP=306;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=30.38;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,241:306:99:9323,0,1124 -chr16 13718066 . T A 10070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;ClippingRankSum=-1.396;DP=352;FS=8.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,265:352:99:10099,0,1891 -chr16 13719617 . A G 9275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.539;DP=325;FS=4.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=28.54;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,243:325:99:9304,0,1871 -chr16 13719719 . TGA T 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:85:238,0,85 -chr16 13724453 . G C 9420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.717;DP=319;FS=5.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=29.53;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,250:319:99:9449,0,1327 -chr16 13725006 . G A 8944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.387;DP=322;FS=0.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=27.78;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,239:319:99:8973,0,1768 -chr16 13736101 . C T 9365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=-1.408;DP=326;FS=5.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,257:326:99:9394,0,1229 -chr16 13736197 . G C 6697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-2.457;DP=219;FS=3.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=30.58;ReadPosRankSum=2.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,181:218:99:6726,0,469 -chr16 13749827 . C T 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=1.030;DP=49;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,36:49:99:1331,0,321 -chr16 13756448 . A G 2510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.600;DP=80;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=31.38;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,67:80:99:2539,0,135 -chr16 13813916 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr16 13813971 . T G 289.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=18;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:318,0,19 -chr16 13814313 . T G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-1.376;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:650,0,232 -chr16 13815402 . C T 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.694;DP=42;FS=5.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=27.57;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1186,0,218 -chr16 13855538 . C T 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1004,69,0 -chr16 13868316 . G A 1572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.429;DP=57;FS=4.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,44:56:99:1601,0,242 -chr16 13876883 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=-2.605;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=17.58;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:415,0,362 -chr16 13876907 . G A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.758;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:719,0,455 -chr16 13892157 . G T 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=1.333;DP=59;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,48:59:99:1828,0,199 -chr16 13892214 . G A 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.619;DP=52;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,40:52:99:1517,0,283 -chr16 14004734 . G A 3579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=-8.607;DP=246;FS=19.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,102:246:99:3608,0,4868 -chr16 14007133 . C T 2071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=5.705;DP=121;FS=10.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:2100,0,2083 -chr16 14007192 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=3.396;DP=83;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:517,0,2299 -chr16 14007806 . A G 7984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.990;DP=271;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,207:271:99:8013,0,1418 -chr16 14008077 . T A 1917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-1.090;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,55:85:99:1946,0,1065 -chr16 14008208 . T C 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=5.023;DP=78;FS=17.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:1164,0,1628 -chr16 14008232 . A C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=4.557;DP=69;FS=7.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=5.87;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:433,0,1894 -chr16 14008527 . T C 2452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.293;DP=99;FS=15.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,69:99:99:2481,0,1447 -chr16 14009204 . A C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=6.041;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=5.30;ReadPosRankSum=-4.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:564,0,5501 -chr16 14009205 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=5.504;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=5.52;ReadPosRankSum=-4.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:564,0,5501 -chr16 14009499 . A T 5456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-0.831;DP=200;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=27.28;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,142:200:99:5485,0,1488 -chr16 14009703 . G T 6338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-0.840;DP=240;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,164:240:99:6367,0,2102 -chr16 14010268 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=5.282;DP=82;FS=12.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=3.55;ReadPosRankSum=-5.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:319,0,2543 -chr16 14010656 . G C 5465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.083;DP=210;FS=7.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=26.03;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,146:210:99:5494,0,1647 -chr16 14012768 . G GAGGCCGTGTT 5932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.101;DP=239;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,162:228:99:5970,0,1856 -chr16 14013067 . TCTGTTGAAAAGAAAAGAAAGCATTAGGAGATACTTAAATTACACGCTACATAATTCACATATTACGAGGACACATATGCGTAC T 7665.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-0.624;DP=172;FS=4.721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:7703,694,0 -chr16 14013293 . A G 4896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-1.650;DP=189;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=25.91;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,132:189:99:4925,0,1369 -chr16 14016104 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=1.482;DP=39;FS=5.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:319,0,1040 -chr16 14082324 . A G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 -chr16 14082654 . C T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr16 14083018 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:395,27,0 -chr16 14083020 . A T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr16 14114040 . G A 604.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:633,45,0 -chr16 14117110 . G A 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 -chr16 14376182 . CAGGTGAGACCGATGAGTTGCTCCACAGGTTTTTTAAAAAAACACTCTTCATTTCTCATGATCTCTTTCTTTTCA C 1273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=1.841;DP=38;FS=10.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=33.52;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:99:1311,0,787 -chr16 14463116 . A T 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:261,21,0 -chr16 14498247 . G GT 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.269;DP=19;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:36:299,0,36 -chr16 14543083 . T C 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr16 14617740 . G A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=1.385;DP=44;FS=1.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=30.90;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,36:44:99:1388,0,134 -chr16 14618294 . C G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.350;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=26.70;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:589,0,163 -chr16 14618425 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,226 -chr16 14618793 . G A 1158.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-1.455;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=33.71;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:43:1187,43,0 -chr16 14618857 . G A 964.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.069;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:993,72,0 -chr16 14619679 . T C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:467,36,0 -chr16 14620023 . G C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=2.106;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=19.20;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:393,0,289 -chr16 14620574 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=22.10;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:426,0,210 -chr16 14621583 . T G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.374;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=29.63;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:769,0,99 -chr16 14621676 . G T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.233;DP=30;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:894,0,131 -chr16 14623094 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr16 14623097 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr16 14623442 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.614;DP=20;FS=5.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:631,0,159 -chr16 14625205 . G C 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.308;DP=38;FS=18.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=22.94;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:900,0,467 -chr16 14625483 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=22.21;ReadPosRankSum=2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:317,0,174 -chr16 14634893 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:475,36,0 -chr16 14635052 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:282,0,102 -chr16 14921520 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.764;DP=15;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:38:516,0,38 -chr16 14925652 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr16 14929908 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:444,0,48 -chr16 15198899 . TGGTAAATGAGACGTTCTGCAATGCTTCATTACCATAATTAACCACAAGCTTTGATCAGTATACAGAAGAGAGGCCGTCATCTGTCTTAATTCTATGCAAATACACAGTTAAATGCGTAACAAATATTTGTGCGTGCA T 805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=2.237;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.55;ReadPosRankSum=-2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:32:843,0,32 -chr16 15256239 . T C 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.347;DP=26;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:810,0,142 -chr16 15320667 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-2.309;DP=37;FS=15.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.110;QD=7.70;ReadPosRankSum=-2.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:313,0,972 -chr16 15368143 . AT A 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-1.200;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:654,0,300 -chr16 15369593 . C G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.487;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:299,0,1179 -chr16 15375459 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.560;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:238,0,468 -chr16 15424599 . AG A 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.578;DP=61;FS=5.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:852,0,2687 -chr16 15424601 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.468;DP=60;FS=5.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:852,0,2653 -chr16 15424633 . CT C 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.544;DP=42;FS=5.528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:20:561,20,0 -chr16 15453020 . A G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.545;DP=72;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=7.22;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:548,0,1976 -chr16 15457784 . CCT C 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-2.369;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:882,0,785 -chr16 15623609 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.131;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:360,0,1029 -chr16 15623715 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=14.82;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:369,0,673 -chr16 15626112 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=2.614;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.47;ReadPosRankSum=-2.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:269,0,523 -chr16 15741347 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr16 15775782 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.498;DP=187;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,36:186:99:618,0,5835 -chr16 15821358 . T TA 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=1.395;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:239,0,301 -chr16 15822701 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,274 -chr16 15822757 . TA T 293.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:331,34,0 -chr16 15823048 . C G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.820;DP=27;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=20.21;ReadPosRankSum=-2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:574,0,2106 -chr16 15824011 . C CT 1559.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1597,147,0 -chr16 15953638 . A T 223.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:252,21,0 -chr16 15975948 . G A 1797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.229;DP=175;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,59:175:99:1826,0,3938 -chr16 15996916 . C A 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.360;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:1226,0,2124 -chr16 16023282 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.437;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,658 -chr16 16033408 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr16 16042430 . G GACAGTTGGGA 1576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.039;DP=52;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,37:47:99:1614,0,388 -chr16 16149067 . A C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-1.913;DP=75;FS=3.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:652,0,2068 -chr16 16149371 . G A 2150.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2179,154,0 -chr16 16150031 . AT A 1812.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.473;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=30.85;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1850,155,0 -chr16 16150072 . T G 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 -chr16 16678580 . CT C 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=1.961;DP=33;FS=3.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:563,0,279 -chr16 16678706 . C T 3788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=1.514;DP=111;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=34.13;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,96:111:99:3817,0,122 -chr16 16678727 . A C 4218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.133;DP=125;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=33.75;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,108:125:99:4247,0,121 -chr16 16678958 . A AC 1547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.236;DP=63;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=24.57;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,45:63:99:1585,0,440 -chr16 16679081 . T A 1630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1659,117,0 -chr16 16679180 . A T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=5.265;DP=65;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=14.75;ReadPosRankSum=-2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:987,0,1552 -chr16 16679414 . T G 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.570;DP=68;FS=18.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1133,0,2869 -chr16 16679419 . A G 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.794;DP=63;FS=19.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=17.54;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:1133,0,2874 -chr16 16679468 . C T 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=4.015;DP=92;FS=12.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:1582,0,1690 -chr16 16679630 . T G 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=2.719;DP=96;FS=5.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=23.58;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,65:96:99:2292,0,2538 -chr16 16679651 . T A 2252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=5.232;DP=82;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=27.47;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,45:81:99:2281,0,2538 -chr16 16679946 . T TA 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=-3.151;DP=81;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=8.01;ReadPosRankSum=4.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:686,0,1205 -chr16 16680154 . AC A 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.889;DP=112;FS=9.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:110:99:647,0,4069 -chr16 16680321 . T C 1832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.334;DP=92;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=19.92;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,55:92:99:1861,0,1340 -chr16 16691871 . T A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.575;ClippingRankSum=-0.676;DP=144;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,48:144:99:1654,0,3090 -chr16 16691932 . A T 6182.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:6211,439,0 -chr16 16692022 . T TC 3400.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:3827,314,0 -chr16 16692063 . G GC 1078.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:94:1116,94,0 -chr16 16711468 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.06;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,198 -chr16 16711549 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-0.943;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:459,0,605 -chr16 16711628 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.450;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:542,0,758 -chr16 16711651 . C T 1461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1490,111,0 -chr16 16711755 . T A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=-1.283;DP=36;FS=7.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:708,0,518 -chr16 16711905 . T G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-1.432;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:899,0,670 -chr16 16712032 . T A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.691;DP=41;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=29.17;ReadPosRankSum=2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1224,0,600 -chr16 16712034 . C G 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.408;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=31.47;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:1224,0,559 -chr16 16933495 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=1.248;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:375,0,378 -chr16 17268987 . A T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-1.209;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:583,0,629 -chr16 17342342 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:61:240,0,61 -chr16 17345324 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.535;DP=23;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:315,0,490 -chr16 17389540 . C A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.776;DP=143;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,29:143:99:495,0,4311 -chr16 17421338 . G T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.644;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,357 -chr16 17558164 . G T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.738;DP=33;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=22.21;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:761,0,310 -chr16 17558180 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.226;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=23.22;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:841,0,302 -chr16 17750745 . A G 468.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.248;DP=17;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=27.54;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:495,0,4 -chr16 18091486 . A G 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.418;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:663,0,1187 -chr16 18091641 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.311;DP=59;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:273,0,1892 -chr16 18092723 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.811;DP=65;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=6.17;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:429,0,1814 -chr16 18094219 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=1.975;DP=70;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:260,0,2045 -chr16 18108305 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=1.694;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,340 -chr16 18131986 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=1.302;DP=36;FS=5.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:234,0,1017 -chr16 18284284 . CAAAGTTCCGATCCTG C 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-2.621;DP=66;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:258,0,1124 -chr16 18284306 . C T 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.295;DP=49;FS=8.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1054,0,1322 -chr16 18285074 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.725;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.913;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:581,0,3843 -chr16 18320535 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=2.518;DP=91;FS=23.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:241,0,2894 -chr16 18323642 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-0.409;DP=90;FS=5.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:337,0,2829 -chr16 18595824 . G A 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.313;DP=116;FS=3.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:962,0,3104 -chr16 18720635 . T A 2545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=1.402;DP=95;FS=9.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=26.80;ReadPosRankSum=3.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,66:95:99:2574,0,798 -chr16 18721068 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.425;DP=15;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:33:503,0,33 -chr16 18724666 . GCTAAAACAGATTTTTGCACCCCAATCCCCCCCAAAAAAAGAGTAAGAAAAAAAAGGCAGAACTGTTGTACACCCGCAAAAAAATAACACAGCGATTAACATAAAAAAGTATGCCTGGACTTAC G 8619.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-1.166;DP=192;FS=1.816;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=26.15;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,187:192:99:8657,782,0 -chr16 18728424 . T C 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.379;DP=277;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,67:277:99:1564,0,14346 -chr16 18728425 . G T 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.701;DP=274;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,67:274:99:1559,0,14346 -chr16 18732585 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=32.77;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:487,0,123 -chr16 18745721 . T C 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.594;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=5.37;ReadPosRankSum=-1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,44:181:99:1000,0,5478 -chr16 18746281 . C T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-2.357;DP=151;FS=8.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=6.81;ReadPosRankSum=2.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,42:151:99:1057,0,4151 -chr16 18818780 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:269,0,384 -chr16 18977351 . G T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=-0.149;DP=62;FS=5.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:597,0,1351 -chr16 19001046 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.250;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=5.65;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:350,0,1643 -chr16 19001669 . G T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.473;DP=41;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:313,0,1115 -chr16 19002970 . G A 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=1.349;DP=57;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:976,0,1068 -chr16 19003047 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-2.137;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:415,0,1691 -chr16 19003094 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=2.841;DP=47;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:395,0,1530 -chr16 19004299 . C G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=2.233;DP=68;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=6.36;ReadPosRankSum=-2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:461,0,1908 -chr16 19004606 . C G 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=1.502;DP=51;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:651,0,1041 -chr16 19005048 . C A 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.856;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:959,0,665 -chr16 19006908 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.462;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:418,0,407 -chr16 19006961 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,375 -chr16 19025259 . G A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr16 19027116 . C T 566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:595,42,0 -chr16 19049805 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:245,0,55 -chr16 19105777 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:248,0,208 -chr16 19124134 . A C 1740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.275;DP=84;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:84:99:1769,0,1615 -chr16 19124800 . A T 1451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.694;DP=67;FS=3.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1480,0,886 -chr16 19180466 . C T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.424;DP=16;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:476,0,126 -chr16 19181607 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-2.879;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,386 -chr16 19181836 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.534;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:443,0,297 -chr16 19183490 . T G 619.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=34.40;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:10:647,10,0 -chr16 19183552 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.415;DP=17;FS=9.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:364,0,250 -chr16 19223439 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.197;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:453,0,551 -chr16 19223577 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.988;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:328,0,373 -chr16 19256528 . GCCTACCAGGAGAGCAAAATTTCAGTTACAGAAAAACAATTTTTGTTGCAGGCAGCTTATGTAACATCCATGATTACGTA G 15101.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.273;DP=346;FS=3.005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,344:346:99:15139,1203,0 -chr16 19258498 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:47:386,0,47 -chr16 19311182 . GACATCATCATCATCA G 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=1.815;DP=99;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:582,0,2584 -chr16 19311183 . ACATCATCATCATCAT A 2108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.507;DP=98;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,56:80:99:2146,0,616 -chr16 19311198 . T G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=2.018;DP=86;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:571,0,2584 -chr16 19312955 . G T 2001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-2.023;DP=66;FS=19.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=30.33;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,48:66:99:2030,0,1153 -chr16 19314474 . G T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.180;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:63:823,0,63 -chr16 19314861 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=1.880;DP=16;FS=15.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:90:474,0,90 -chr16 19343310 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:292,0,215 -chr16 19363104 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=4.249;DP=178;FS=17.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,28:178:99:270,0,10429 -chr16 19363154 . A T 4600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.467;DP=156;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,121:156:99:4629,0,735 -chr16 19363272 . G T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=4.763;DP=117;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:1209,0,8421 -chr16 19363308 . C T 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.442;DP=133;FS=12.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=16.42;ReadPosRankSum=2.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,44:133:99:2212,0,3005 -chr16 19364271 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-1.043;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,55:269:99:998,0,8337 -chr16 19367297 . C T 4603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=-1.731;DP=250;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,128:250:99:4632,0,4395 -chr16 19406966 . T C 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.412;DP=121;FS=2.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,34:121:99:834,0,3332 -chr16 19527677 . T A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:332,0,258 -chr16 19529366 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:290,0,158 -chr16 19529798 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.113;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:354,0,379 -chr16 19532324 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.683;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:308,0,306 -chr16 19532426 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,215 -chr16 19532881 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,220 -chr16 19533209 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=-1.727;DP=25;FS=6.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.066;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:322,0,564 -chr16 19536356 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:230,0,178 -chr16 19555728 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:244,0,326 -chr16 19610876 . G T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=1.564;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:250,0,450 -chr16 19611325 . T TTA 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:673,44,0 -chr16 19612277 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:379,0,359 -chr16 19612823 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:289,0,383 -chr16 19648374 . T C 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.367;DP=67;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1394,0,898 -chr16 19677127 . T A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.952;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:469,0,444 -chr16 19678217 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.309;DP=51;FS=4.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:243,0,1571 -chr16 19678254 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-1.031;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:910,0,597 -chr16 19678568 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.024;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:351,0,650 -chr16 19678742 . A T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=1.632;DP=27;FS=6.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:582,0,358 -chr16 19688210 . G A 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.231;DP=41;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:633,0,731 -chr16 19699420 . T A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.764;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:714,0,362 -chr16 19699622 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.336;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=21.85;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:487,0,233 -chr16 19699853 . TAA T,TA 256.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,5,10:15:99:455,273,260,151,0,108 -chr16 19704589 . C CTA 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.180;DP=67;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.218;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:663,0,1179 -chr16 19733000 . G T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=1.669;DP=22;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:460,0,309 -chr16 19733353 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=-0.408;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:439,0,422 -chr16 19737509 . GCCTATAAAATGACAGTTATGACCATAAGTATAATTCAAATCTTAATAGCAGCCAAAACTGCAAACACACA G 1425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.306;DP=41;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=34.77;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,34:37:99:1463,0,348 -chr16 19737633 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-1.410;DP=51;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=4.19;ReadPosRankSum=2.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:242,0,1479 -chr16 19744967 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.529;DP=39;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:277,0,912 -chr16 19752520 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.288;DP=18;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:353,0,269 -chr16 19762099 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:311,0,976 -chr16 19774935 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=1.350;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.985;QD=29.83;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:615,0,119 -chr16 19776517 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-2.000;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=30.17;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:72:692,0,72 -chr16 19804369 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr16 19813938 . A G 465.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:494,33,0 -chr16 19816292 . T C 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 -chr16 19816486 . T A 1581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-1.974;DP=48;FS=6.792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=32.95;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,41:45:51:1610,51,0 -chr16 19817467 . C T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 -chr16 19817514 . A G 2231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2260,160,0 -chr16 19886855 . A G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr16 20223252 . C T 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 -chr16 20225609 . G T 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:476,33,0 -chr16 20226982 . T A 509.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:538,39,0 -chr16 20527466 . C CA 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.654;DP=31;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=16.25;ReadPosRankSum=-2.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:39:606,0,39 -chr16 20565609 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:239,0,108 -chr16 20580787 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,106 -chr16 20607216 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.31;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:35:274,0,35 -chr16 20975613 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.08;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:299,0,50 -chr16 20986995 . T G 250.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:11:278,0,11 -chr16 21037581 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.959;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:401,0,296 -chr16 21108780 . C T 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=1.407;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=26.18;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:735,0,232 -chr16 21140406 . G T 581.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.351;DP=18;FS=7.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=32.32;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:22:610,0,22 -chr16 21140519 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:377,0,124 -chr16 21252196 . G T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr16 21264118 . T A 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr16 21291635 . T A 312.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:14:341,14,0 -chr16 21316481 . A C 329.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:4:356,0,4 -chr16 21330959 . C T 374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:403,30,0 -chr16 21495766 . A T 4537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=-0.866;DP=149;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=30.45;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,116:149:99:4566,0,603 -chr16 21495966 . A AT 1732.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-1.215;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.778;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,69:87:99:1770,0,157 -chr16 21496633 . A T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.303;DP=35;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:555,0,729 -chr16 21497988 . A T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.921;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:489,0,286 -chr16 21502070 . G A 2299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.857;DP=75;FS=1.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=30.66;ReadPosRankSum=1.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,63:75:99:2328,0,130 -chr16 21657721 . C A 220.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.55;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:249,0,18 -chr16 21661883 . T A 609.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.854;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=29.04;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:24:638,0,24 -chr16 21663502 . CAGGTGAGCCAAAACAACATACTTTTTATTAACTGCACAGAATGGGATCTTCATGGTCACAGCATTTGTCATCTCATTTTGTTTCGTTTAAT C 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.914;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:99:1032,0,727 -chr16 21663829 . T A 881.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.419;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=29.88;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:910,63,0 -chr16 21664219 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=1.480;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:43:431,0,43 -chr16 21763073 . G T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr16 21763090 . A T 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr16 21820377 . C T 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.737;DP=34;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:913,0,291 -chr16 21821451 . A T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:690,0,284 -chr16 21830015 . A G 215.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:244,0,21 -chr16 21830753 . C G 363.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=33.01;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:391,0,11 -chr16 21930039 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,260 -chr16 22214168 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=1.193;DP=101;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:1405,0,1982 -chr16 22355085 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=-1.387;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:452,0,419 -chr16 22355540 . G GT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.333;DP=28;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:289,0,196 -chr16 22378959 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.374;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:336,0,718 -chr16 22398756 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.271;DP=92;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:501,0,2577 -chr16 22475490 . C T 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr16 22475510 . A G 375.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 -chr16 22594431 . TAGGTACAGTGTCAGTGATTTTACTGTATATCTAAAGCAATGCTGGTGATCTTGTATTAATCTTTTTCATTTCCTCTGC T 5579.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.875;DP=146;FS=1.617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=27.23;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,138:144:99:5617,419,0 -chr16 22758348 . C T 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 -chr16 22782330 . C T 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr16 22877283 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-0.609;DP=40;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:769,0,558 -chr16 22885191 . A T 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-0.341;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:661,0,1405 -chr16 22885239 . C G 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.988;DP=36;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:822,0,454 -chr16 22885516 . A C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-0.731;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:577,0,422 -chr16 22886401 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.720;DP=30;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:245,0,794 -chr16 22887036 . TAG T 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.623;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=29.22;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:534,0,130 -chr16 22887452 . GA G 939.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.758;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:11:976,11,0 -chr16 22890603 . A C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DP=97;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:281,0,3021 -chr16 22898003 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.341;DP=290;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,55:290:99:839,0,9182 -chr16 22900141 . A G 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-2.300;DP=230;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=5.51;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,57:230:99:1296,0,6678 -chr16 22917663 . G A 1387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.912;DP=342;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,74:342:99:1416,0,10267 -chr16 22940120 . C T 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.862;DP=238;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,48:238:99:797,0,7198 -chr16 22958859 . G C 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.444;DP=302;FS=6.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,74:301:99:1597,0,8635 -chr16 22989349 . C A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-0.817;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:533,0,653 -chr16 23001385 . T A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.250;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:758,0,1523 -chr16 23013133 . G A 1410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.014;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:1439,0,1489 -chr16 23123354 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.406;DP=63;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:1165,0,1745 -chr16 23123642 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-2.082;DP=33;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:254,0,1393 -chr16 23123804 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.372;DP=40;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:318,0,1107 -chr16 23124242 . C T 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.615;DP=55;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.863;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:937,0,999 -chr16 23220138 . C T 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.875;DP=71;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:832,0,1276 -chr16 23428314 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-2.202;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.45;ReadPosRankSum=2.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,240 -chr16 23452665 . A G 233.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:262,0,22 -chr16 23509599 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr16 23509601 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr16 23514895 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.920;DP=31;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:715,0,345 -chr16 23525387 . TA T 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;ClippingRankSum=-0.280;DP=19;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=27.62;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:61:562,0,61 -chr16 23525860 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.523;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:402,0,388 -chr16 23527001 . A G 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.626;DP=36;FS=14.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=22.80;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:849,0,439 -chr16 23527200 . T TA 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.646;DP=24;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:281,0,657 -chr16 23527201 . T A 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.919;DP=23;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.167;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:390,0,697 -chr16 23527552 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.022;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:612,0,457 -chr16 23527755 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.06;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:269,0,288 -chr16 23528133 . G A 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.902;DP=23;FS=10.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=22.38;ReadPosRankSum=2.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:543,0,181 -chr16 23528264 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=-0.634;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:398,0,276 -chr16 23528322 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.778;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:513,0,398 -chr16 23528383 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:308,0,320 -chr16 23528523 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:241,0,66 -chr16 23529099 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.380;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=23.30;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:401,0,211 -chr16 23529549 . T C 720.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.180;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=34.32;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:20:749,20,0 -chr16 23529904 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=2.339;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=17.13;ReadPosRankSum=2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:268,0,249 -chr16 23529974 . G T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-1.550;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:536,0,985 -chr16 23529979 . T G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-1.060;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:536,0,985 -chr16 23530140 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.386;DP=27;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=23.66;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:667,0,314 -chr16 23530405 . TA T 879.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:91:917,91,0 -chr16 23565576 . C T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.292;DP=36;FS=1.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=26.49;ReadPosRankSum=-2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:982,0,246 -chr16 23585930 . C T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr16 23608416 . T C 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr16 23633776 . C T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=1.957;DP=47;FS=6.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=33.44;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,40:47:55:1600,0,55 -chr16 23634289 . C T 2990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.950;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,77:100:99:3019,0,481 -chr16 23635822 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.143;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:439,0,176 -chr16 23637445 . G A 2549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.020;DP=88;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,69:88:99:2578,0,370 -chr16 23642019 . C T 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=3.695;DP=41;FS=12.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=20.58;ReadPosRankSum=-2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:872,0,489 -chr16 23642046 . T C 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=2.762;DP=54;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=26.46;ReadPosRankSum=2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:54:99:1457,0,377 -chr16 23644602 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,238 -chr16 23645121 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,559 -chr16 23645122 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,559 -chr16 23645536 . A T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:360,0,139 -chr16 23646041 . G A 533.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.810;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:3:560,3,0 -chr16 23646405 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.246;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,165 -chr16 23646535 . G GA 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-0.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=30.45;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:494,0,169 -chr16 23646560 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.085;DP=14;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=33.27;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:494,0,169 -chr16 23646996 . C A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.240;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:419,0,128 -chr16 23647148 . C T 2342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.066;DP=79;FS=5.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,62:79:99:2371,0,374 -chr16 23662760 . G A 3530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-0.748;DP=96;FS=2.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=31.50;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,84:96:99:3559,0,459 -chr16 23664966 . G A 2219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.414;DP=77;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,60:76:99:2248,0,324 -chr16 23665219 . C T 2144.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.260;DP=51;FS=6.284;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=30.91;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,48:51:80:2173,80,0 -chr16 23665315 . A G 2375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.944;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=30.07;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,64:79:99:2404,0,237 -chr16 23735766 . T G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-1.685;DP=30;FS=15.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=30.59;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:946,0,124 -chr16 23817260 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=1.094;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:256,0,1230 -chr16 23924190 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-1.311;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:458,0,618 -chr16 24151770 . A G 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:48:681,48,0 -chr16 24168697 . A G 1185.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=1.036;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=28.21;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:22:1214,22,0 -chr16 24168706 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=1.220;DP=35;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:661,0,606 -chr16 24174500 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=2.712;DP=48;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=16.50;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:820,0,694 -chr16 24180550 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.741;DP=18;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:338,0,257 -chr16 24525911 . A C 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:649,48,0 -chr16 24525952 . TA T 253.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:291,22,0 -chr16 24525954 . A T 262.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:291,22,0 -chr16 24531902 . T C 1290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1319,93,0 -chr16 24534971 . A G 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr16 24783487 . CCA C 322.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.594;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:16:360,0,16 -chr16 24840199 . A G 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:72:1067,72,0 -chr16 24840208 . T G 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:72:1067,72,0 -chr16 24840388 . C A 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:599,45,0 -chr16 24840616 . G A 706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:735,54,0 -chr16 24840730 . T C 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:720,51,0 -chr16 24840796 . T G 372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 -chr16 24840844 . C T 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr16 24840916 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr16 24840975 . G T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:445,36,0 -chr16 24841024 . G A 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:821,60,0 -chr16 24841096 . T C 840.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:869,63,0 -chr16 24876973 . T A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr16 24963304 . A AT 366.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.070;DP=29;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:15:404,0,15 -chr16 24976473 . G A 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr16 25554718 . C CTT 370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:408,32,0 -chr16 25556968 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,174 -chr16 25730636 . GA G 586.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:61:624,61,0 -chr16 25744397 . TGTGAGTGCTGTGCCTTTTTTATGCCACAATTAAGTCTGATGTTATCCCCGGATAATTTCAGAATTATTTTCCTTTATTGTGTGTGTCAG T 2098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=1.663;DP=50;FS=3.372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=35.83;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2136,164,0 -chr16 26031962 . A G 2373.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.950;DP=31;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:18:2402,0,18 -chr16 26031963 . C T 2373.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.250;DP=31;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=29.57;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:22:2402,0,22 -chr16 26032050 . A G 2373.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.790;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=34.91;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,43:45:18:2402,0,18 -chr16 26039238 . T TA 2626.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2714,260,0 -chr16 26073209 . G A 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:607,45,0 -chr16 26112018 . TGA T 537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:575,39,0 -chr16 26114633 . G A 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:78:1142,78,0 -chr16 26140687 . C T 2276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2305,169,0 -chr16 26153402 . TGAAGG T 19371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=455;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,454:454:99:19409,1643,0 -chr16 26153409 . AATTTGAGCTTGACAGACTATGACTGAAATGTATTATGCATATAAACATGCACCGTTTAAGACATTTTAATGCAAATAATTAAAATCATTTTCTCTTTTT A 20008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=2.972;DP=458;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.840;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,454:457:99:20046,1691,0 -chr16 26154478 . G T 825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:854,66,0 -chr16 26154556 . G A 5339.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:5368,385,0 -chr16 26154958 . GT G 6556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-1.696;DP=371;FS=2.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,270:331:99:6594,0,317 -chr16 26161692 . G A 3969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=1.715;DP=101;FS=2.004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,97:101:99:3998,292,0 -chr16 26161974 . T C 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr16 26219132 . GGGTAAGGGATACCGTACAGTGAATATTCCATTAAAAAATCATTCAAGTTTTTTGTTCGTGTGAGTGTAAACTTGCTTATTTTGTGAACTTCTTCCA G 12487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.073;DP=322;FS=13.114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.137;QD=33.73;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,318:322:99:12525,928,0 -chr16 26228938 . A C 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 -chr16 26231929 . C T 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:341,24,0 -chr16 26232675 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr16 26261411 . G A 3095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3124,211,0 -chr16 26261420 . A G 3095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:3124,211,0 -chr16 26261537 . A C 1817.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1846,130,0 -chr16 26261576 . T TA 1694.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-0.280;DP=48;FS=4.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=22.15;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1732,132,0 -chr16 26261681 . G GA 849.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:86:901,86,0 -chr16 26261892 . T C 3271.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3300,240,0 -chr16 26262224 . T A 1684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1713,117,0 -chr16 26262229 . A T 1684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1713,117,0 -chr16 26262314 . C G 1971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2000,141,0 -chr16 26262358 . A G 1278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1307,93,0 -chr16 26262395 . A G 503.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.240;DP=25;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=20.14;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7:531,7,0 -chr16 26263956 . A T 2060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2089,147,0 -chr16 26264099 . G C 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr16 26264328 . A T 2221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2250,157,0 -chr16 26264640 . A G 2190.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2219,156,0 -chr16 26264948 . G A 2756.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2785,199,0 -chr16 26264977 . C T 2039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2068,150,0 -chr16 26265089 . G A 1469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1498,111,0 -chr16 26265111 . C T 1923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1952,144,0 -chr16 26265205 . C A 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr16 26265272 . C T 1209.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.116;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1238,87,0 -chr16 26265486 . G A 1383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1412,96,0 -chr16 26265516 . T A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr16 26265563 . C T 950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:979,69,0 -chr16 26265600 . T G 1930.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1959,138,0 -chr16 26265733 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr16 26265739 . A C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:257,18,0 -chr16 26265840 . G A 2626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2655,178,0 -chr16 26265841 . T A 2626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2655,178,0 -chr16 26265996 . G GT 365.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:403,26,0 -chr16 26266002 . C T 374.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:403,26,0 -chr16 26266084 . T C 1797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1826,126,0 -chr16 26266111 . T C 1902.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1931,132,0 -chr16 26266188 . T A 2003.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2032,138,0 -chr16 26266240 . G A 2247.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2276,157,0 -chr16 26266277 . A G 1872.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1901,138,0 -chr16 26266350 . A G 2565.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2594,184,0 -chr16 26266405 . C T 2780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2809,201,0 -chr16 26266451 . C G 3816.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3845,271,0 -chr16 26266534 . C T 4415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:4444,318,0 -chr16 26266551 . A C 4406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4435,316,0 -chr16 26266756 . G A 3669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:3698,262,0 -chr16 26267432 . G A 2769.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2798,199,0 -chr16 26286397 . G A 3673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3702,259,0 -chr16 26286411 . G A 2906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2935,205,0 -chr16 26286481 . G A 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 -chr16 26286495 . T C 250.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:279,0,20 -chr16 26286967 . A G 6031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:6060,436,0 -chr16 26289377 . A T 4335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:4364,334,0 -chr16 26289392 . C A 5001.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:5030,370,0 -chr16 26425005 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr16 26429789 . A G 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1260,93,0 -chr16 26429802 . AG A 878.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:916,85,0 -chr16 26429929 . C CAA 366.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 -chr16 26452758 . GT G 263.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:301,31,0 -chr16 26453019 . CT C 1009.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.503;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=32.57;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1047,100,0 -chr16 26762173 . A C 335.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 -chr16 26815404 . G A 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:697,51,0 -chr16 26817795 . CAGGTGAGAGAATCACACCACATGTTAATGATTCGATATCGCAAAAGCATGCATCTAAAAATACTGTGCTTTAAT C 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.754;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:445,0,3834 -chr16 26824482 . T C 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr16 26828764 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:250,18,0 -chr16 26830878 . G GGT 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr16 26840191 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr16 26840368 . T C 860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:65:889,65,0 -chr16 26847703 . A T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr16 26849552 . C CA 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:336,30,0 -chr16 26885493 . G A 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:688,48,0 -chr16 26895475 . T A 1686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1715,120,0 -chr16 26901608 . A G 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 -chr16 26980391 . T C 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:601,42,0 -chr16 27059046 . A AT 869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:907,69,0 -chr16 27059844 . T C 752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:781,54,0 -chr16 27059890 . A C 666.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:695,48,0 -chr16 27060522 . A T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr16 27071250 . T C 2012.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2041,150,0 -chr16 27228592 . TA T 329.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-1.748;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:25:367,0,25 -chr16 27228597 . T A 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:58:895,58,0 -chr16 27270091 . A G 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:743,51,0 -chr16 27270396 . G A 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr16 27272031 . A G 2482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2511,184,0 -chr16 27275752 . G C 4144.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4173,301,0 -chr16 27304278 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr16 27310469 . G A 2529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2558,181,0 -chr16 27318512 . C T 1234.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1263,90,0 -chr16 27319161 . T C 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr16 27335166 . T C 1947.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1976,138,0 -chr16 27336459 . C T 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 -chr16 27352355 . C T 2633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.646;DP=67;FS=3.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,66:67:99:2662,195,0 -chr16 27360932 . C T 829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:858,63,0 -chr16 27362214 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-1.480;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=30.91;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:430,0,44 -chr16 27363085 . C T 929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:958,66,0 -chr16 27385484 . G A 1360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1389,105,0 -chr16 27388079 . G T 1426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1455,102,0 -chr16 27388318 . G A 1079.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1108,78,0 -chr16 27388483 . C A 936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:965,69,0 -chr16 27388890 . G A 513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:542,39,0 -chr16 27401645 . GT G 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 -chr16 27401669 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 -chr16 27408598 . T A 4128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=-1.596;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=29.73;ReadPosRankSum=1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:4157,304,0 -chr16 27409143 . CT C 516.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-1.129;DP=27;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:10:553,0,10 -chr16 27409460 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr16 27409523 . CTA C 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:489,34,0 -chr16 27414237 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr16 27414287 . T A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr16 27414745 . GT G 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr16 27415647 . G A 1046.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1075,78,0 -chr16 27415821 . C G 1862.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1891,138,0 -chr16 27415852 . G A 1806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1835,129,0 -chr16 27415932 . G A 1453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1482,105,0 -chr16 27472662 . G C 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 -chr16 27535959 . A T 1366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:87:1395,87,0 -chr16 27535963 . G GGCGTTC 1357.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:87:1395,87,0 -chr16 27538420 . C T 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:417,30,0 -chr16 27539981 . A T 1657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1686,120,0 -chr16 27588751 . ACATAGTGAGTTTTGAAGAC A 1473.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1511,118,0 -chr16 27588774 . ATTTATTCTGGAAATATTGGCAAAATGTCTTTATTAGCAAAAATCGTATTTTTCATCTTCAG A 1428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.158;DP=33;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1466,115,0 -chr16 27600220 . T G 905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:63:934,63,0 -chr16 27613475 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:730,51,0 -chr16 27614901 . C T 1023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1438,102,0 -chr16 27615093 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:433,33,0 -chr16 27661722 . A T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr16 27685008 . A G 1994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=-0.627;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=34.12;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:2023,138,0 -chr16 27685014 . G T 1979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:2008,138,0 -chr16 27734901 . AAGGTGACTGACACTTTACCTCTCATTCAGCTGCTTTCAGAAGTGAGCTTTAGCCAGTCTTTCACACTCGGGTGCCGCGTTTGCTTTGC A 2360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=1.670;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=34.24;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2398,177,0 -chr16 27737775 . TGGTAAAGTACCACGGTAAAGCTCATTACACACGTGACGAGCCGAAGCAGGAGTTCTGAATGCTGTGTGTTCATCCACA T 2441.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=2.365;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:2479,200,0 -chr16 27741531 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.668;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:272,0,519 -chr16 27795936 . C T 893.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-0.788;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:922,63,0 -chr16 27796873 . GTT G 362.49 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.919;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:14:570,14,0 -chr16 27798137 . A T 968.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:997,72,0 -chr16 27799762 . A T 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 -chr16 27882829 . C CAT 3172.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3210,214,0 -chr16 27889777 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr16 27926596 . T G 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr16 27941201 . C T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr16 28266073 . G A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr16 28317553 . T C 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr16 28321840 . A C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr16 28321970 . C CT 218.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:256,27,0 -chr16 28393809 . TA T 1706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.393;DP=65;FS=1.920;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,57:61:99:1744,144,0 -chr16 28485759 . A T 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr16 28623226 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr16 28623385 . T G 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr16 28624239 . A G 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr16 28625360 . G A 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr16 28631565 . T A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr16 28631568 . C T 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:391,27,0 -chr16 28633408 . G A 1617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.953;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=29.72;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1646,117,0 -chr16 28647198 . C T 2068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2097,156,0 -chr16 28671303 . T TC 2342.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2380,174,0 -chr16 28682749 . T A 1863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1892,129,0 -chr16 28682752 . C T 1863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1892,129,0 -chr16 28686168 . G A 1501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1530,111,0 -chr16 28695194 . C CT,CTT 792.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,29,10:39:99:1181,262,146,796,0,758 -chr16 28696545 . C T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1868,129,0 -chr16 28697001 . G T 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:656,45,0 -chr16 28701044 . T C 1680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1709,120,0 -chr16 28708860 . G A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=1.183;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:1000,0,2000 -chr16 28710351 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=-0.227;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:600,0,539 -chr16 28719078 . G C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=7.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:731,0,565 -chr16 28719208 . CAGGTATACATGGTAACACACAACCAGTATTGTGCTCTTATGTAAAACATATAAGCATGATGGGTTGTTTTTGTTTT C 1433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.242;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1471,0,512 -chr16 28719631 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.543;DP=62;FS=7.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:815,0,1358 -chr16 28725776 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=2.043;DP=48;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:830,0,822 -chr16 28727380 . G A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.194;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:867,0,906 -chr16 28727501 . C T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.025;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:776,0,685 -chr16 28731999 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.540;DP=51;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:434,0,1014 -chr16 28760410 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:282,0,108 -chr16 28761286 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.119;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:320,0,287 -chr16 28767274 . C T 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.835;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:979,0,760 -chr16 28767558 . A G 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.838;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.779;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:712,0,781 -chr16 28776420 . G A 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.869;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=17.69;ReadPosRankSum=-2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:736,0,1371 -chr16 28781666 . T A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-1.676;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:529,0,1861 -chr16 28782553 . C T 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.147;DP=86;FS=7.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:1459,0,1473 -chr16 28825646 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=1.050;DP=33;FS=11.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:324,0,812 -chr16 28830675 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=-0.867;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:513,0,986 -chr16 28838848 . C A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.897;DP=51;FS=4.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:891,0,884 -chr16 28850504 . C T 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.959;DP=69;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:1102,0,1287 -chr16 28876554 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=-0.693;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:749,0,715 -chr16 28896596 . A T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=2.630;DP=49;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=18.04;ReadPosRankSum=-2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:912,0,895 -chr16 28897591 . TA T 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.538;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:565,0,654 -chr16 28905986 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr16 28912102 . G T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=1.934;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.798;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1003,0,1341 -chr16 28925781 . G A 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-0.176;DP=88;FS=10.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:1426,0,1523 -chr16 28927249 . G A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.387;DP=59;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1089,0,1055 -chr16 28927253 . G GA 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.160;DP=59;FS=5.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:595,0,652 -chr16 28927399 . T G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.155;DP=39;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=17.46;ReadPosRankSum=2.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:709,0,700 -chr16 28938709 . G A 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.067;DP=69;FS=3.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1508,0,2061 -chr16 28938712 . G A 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.251;DP=69;FS=3.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=21.45;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1508,0,2061 -chr16 28942373 . C T 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-1.075;DP=68;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,36:68:99:1202,0,1156 -chr16 28942730 . G T 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.949;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1980,0,2250 -chr16 28949274 . A G 1445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.872;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1474,0,1383 -chr16 28949343 . G A 1791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.528;DP=94;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,56:94:99:1820,0,1288 -chr16 28951336 . G A 1806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=-0.391;DP=103;FS=6.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1835,0,1459 -chr16 28961657 . C G 1647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=1.014;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=16.81;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1676,0,1577 -chr16 28961825 . C T 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.319;DP=105;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:1501,0,1745 -chr16 28968241 . C A 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.706;DP=67;FS=4.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:967,0,1354 -chr16 29035473 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-2.714;DP=65;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:247,0,2010 -chr16 29038910 . T A 1411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-0.586;DP=78;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:1440,0,1336 -chr16 29040606 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=2.754;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:278,0,1244 -chr16 29043985 . A C 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.133;DP=91;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1592,0,1638 -chr16 29044404 . A G 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.718;DP=109;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1849,0,2015 -chr16 29047455 . G A 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.676;DP=118;FS=2.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:2173,0,2056 -chr16 29052951 . C A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.953;DP=71;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1161,0,1330 -chr16 29053215 . A G 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.030;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1045,0,1006 -chr16 29066304 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=1.969;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:512,0,363 -chr16 29066934 . A T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-1.632;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=14.66;ReadPosRankSum=3.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:468,0,588 -chr16 29068502 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=1.138;DP=39;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:647,0,662 -chr16 29205767 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr16 29312710 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-1.533;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:924,0,1163 -chr16 29349221 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-2.135;DP=60;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:841,0,1189 -chr16 29350000 . TTA T 1072.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=-0.380;DP=49;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:1110,0,767 -chr16 29350560 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-1.166;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=16.28;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:533,0,538 -chr16 29377597 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:338,0,373 -chr16 29378698 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.136;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:419,0,442 -chr16 29387325 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.950;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:585,0,121 -chr16 29399532 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.598;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:475,0,290 -chr16 29399702 . G T 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.865;DP=36;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:897,0,275 -chr16 29428934 . T A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.594;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:328,0,680 -chr16 29429096 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.396;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:251,0,456 -chr16 29435246 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.536;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:440,0,310 -chr16 29444400 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-2.423;DP=56;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=16.71;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:964,0,1042 -chr16 29444447 . C A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.871;DP=42;FS=2.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=25.02;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1079,0,351 -chr16 29444543 . A G 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-0.528;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:952,0,1073 -chr16 29444848 . T G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.762;DP=61;FS=10.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:463,0,3700 -chr16 29444857 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.618;DP=59;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:465,0,3700 -chr16 29444977 . C T 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-1.340;DP=63;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:914,0,1198 -chr16 29445380 . G A 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.998;DP=57;FS=7.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1008,0,1050 -chr16 29451226 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.432;DP=46;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:551,0,1036 -chr16 29574173 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=12.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:246,0,253 -chr16 29596088 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.608;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:323,0,362 -chr16 29596346 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,380 -chr16 29621077 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,220 -chr16 29633160 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=1.313;DP=16;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,262 -chr16 29634513 . GAA G 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.566;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:90:297,0,90 -chr16 29634960 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,177 -chr16 29645959 . GA G 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-0.595;DP=175;FS=4.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:1390,0,1939 -chr16 29652867 . A G 3525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.122;DP=207;FS=6.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=17.03;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,107:207:99:3554,0,3381 -chr16 29656016 . TCTGAAAGAGATGAGGGGACATGAAGATGACACAGCAGGGGAAAACTCCACGTCATTCTTAGTGGTTGTACAGCTGTGTATTTTGTCATCGTGAAACACTCAC T 9888.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=1.866;DP=252;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,225:231:99:9926,683,0 -chr16 29713396 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:269,0,180 -chr16 29717288 . T C 286.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:315,0,13 -chr16 29719065 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:263,0,298 -chr16 29736744 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=4.238;DP=77;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=2.63;ReadPosRankSum=-3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:231,0,2408 -chr16 29742192 . C T 1594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.061;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:1623,0,3751 -chr16 29767256 . A G 2049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.919;DP=117;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:2078,0,2033 -chr16 29783124 . C T 2357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.695;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:2386,0,2621 -chr16 29783411 . G C 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=1.047;DP=111;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,40:111:99:1418,0,5294 -chr16 29784784 . C T 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=1.599;DP=159;FS=7.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,51:158:99:1346,0,3992 -chr16 29784841 . C T 1581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=1.638;DP=118;FS=10.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:1610,0,2504 -chr16 29790582 . C A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=1.198;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=25.17;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:582,0,196 -chr16 29790732 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:291,0,369 -chr16 29791174 . G C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.646;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:408,0,399 -chr16 29791537 . T A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.403;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=30.80;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:75:675,0,75 -chr16 29791568 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=1.189;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:521,0,129 -chr16 29791622 . G T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.62;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:310,0,98 -chr16 29791992 . T G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.317;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:343,0,363 -chr16 29796670 . T C 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.186;DP=39;FS=4.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:891,0,484 -chr16 29797074 . A T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-1.328;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:696,0,970 -chr16 29801692 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.435;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:868,0,614 -chr16 29801900 . C T 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.007;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=20.87;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:863,0,472 -chr16 29803521 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.063;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:657,0,615 -chr16 29835541 . A G 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.070;DP=79;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1530,0,1160 -chr16 29835657 . C G 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.728;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:644,0,549 -chr16 29835760 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.490;DP=45;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:827,0,775 -chr16 29836702 . A T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=-0.292;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:419,0,733 -chr16 29836748 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-1.624;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:280,0,1135 -chr16 29837253 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:329,0,304 -chr16 29845381 . G T 1976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=2.016;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:2005,0,5358 -chr16 29850151 . C T 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.925;DP=111;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:1503,0,2306 -chr16 29855086 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.694;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,131 -chr16 29860759 . A T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:427,0,203 -chr16 29895527 . T A 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.104;DP=57;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=16.73;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:982,0,842 -chr16 29904171 . A T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=1.907;DP=38;FS=8.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=17.84;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:706,0,1463 -chr16 30340975 . G A 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-0.573;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:73:99:1385,0,1099 -chr16 30473784 . G A 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.227;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1178,0,1362 -chr16 30476849 . C T 767.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.065;DP=60;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=12.80;ReadPosRankSum=2.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:805,0,1231 -chr16 30485114 . G T 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-0.295;DP=54;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:1122,0,1656 -chr16 30485120 . T G 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.950;DP=57;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1137,0,2019 -chr16 30492607 . T C 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-0.371;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1142,0,810 -chr16 30498819 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=1.262;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:392,0,394 -chr16 30498870 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.126;DP=39;FS=16.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:677,0,676 -chr16 30598611 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.465;DP=30;FS=8.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:467,0,589 -chr16 30691813 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.563;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:296,0,575 -chr16 30740982 . G T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.688;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.27;ReadPosRankSum=-3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:265,0,416 -chr16 30741271 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.487;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:417,0,657 -chr16 30741756 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:281,0,417 -chr16 30786128 . G A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.289;DP=92;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:1242,0,1795 -chr16 30786400 . T A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:526,0,387 -chr16 30786479 . A C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.673;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:439,0,330 -chr16 30787231 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:293,0,457 -chr16 30787408 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-2.000;DP=14;FS=16.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=23.41;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:356,0,170 -chr16 30790323 . A AT 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=-0.738;DP=36;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:397,0,399 -chr16 30792761 . G T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=1.068;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:453,0,275 -chr16 30793049 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-1.549;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:518,0,509 -chr16 30793167 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.724;DP=23;FS=7.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:316,0,501 -chr16 30794126 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-2.777;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:244,0,208 -chr16 30797306 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=2.646;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:346,0,634 -chr16 30797603 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=1.705;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:377,0,438 -chr16 30804715 . G A 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=1.456;DP=110;FS=4.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1717,0,2303 -chr16 30819095 . G C 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.735;DP=89;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=17.49;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:1585,0,1512 -chr16 30819533 . G A 1314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.166;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1343,0,1157 -chr16 30819646 . G A 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=0.873;DP=63;FS=2.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=17.73;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1145,0,1124 -chr16 30819835 . C T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.059;DP=77;FS=2.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:912,0,1701 -chr16 30820110 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.467;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:998,0,1000 -chr16 30820965 . A C 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=1.283;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:700,0,487 -chr16 30824864 . G A 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.339;DP=46;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:940,0,708 -chr16 30827194 . T A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-2.025;DP=40;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:895,0,1363 -chr16 30846830 . G A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.356;DP=47;FS=14.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=18.27;ReadPosRankSum=2.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:887,0,715 -chr16 30850560 . G A 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.540;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=25.93;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,42:60:99:1584,0,472 -chr16 30854877 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.771;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:908,0,533 -chr16 30855156 . CA C 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.544;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:561,0,437 -chr16 30891873 . T G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:646,0,97 -chr16 30891929 . T C 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.733;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:389,0,283 -chr16 30893209 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.556;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:285,0,304 -chr16 30965210 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-2.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:287,0,216 -chr16 30965240 . A C 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:523,36,0 -chr16 31003864 . C T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.394;DP=44;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:868,0,636 -chr16 31026723 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.181;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:448,0,286 -chr16 31030298 . G C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:430,0,327 -chr16 31064520 . T G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:466,0,830 -chr16 31068115 . G C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.094;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:499,0,338 -chr16 31068628 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=1.658;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=27.59;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:580,0,122 -chr16 31069059 . C T 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.013;DP=41;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:789,0,653 -chr16 31070195 . A AT 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-0.084;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:700,0,454 -chr16 31070311 . A T 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.781;DP=54;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1156,0,711 -chr16 31074636 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.710;DP=62;FS=5.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:966,0,951 -chr16 31089613 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.196;DP=48;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:853,0,890 -chr16 31093631 . T C 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.491;DP=46;FS=6.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.209;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:932,0,684 -chr16 31096858 . G C 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=1.890;DP=52;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,32:52:99:1085,0,676 -chr16 31097056 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-1.449;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=22.51;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:906,0,461 -chr16 31222964 . C A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.771;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:955,0,158 -chr16 31233335 . CGGTGAGAGGACTTAACACTAATAGGATGAAAGTTAAGCCCGTCACTCCTCACTCATTTTCTCTTCTTTTCTCCA C 3103.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=3.073;DP=86;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=26.97;ReadPosRankSum=-2.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,76:83:99:3141,0,1431 -chr16 31258240 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.683;DP=17;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:266,0,642 -chr16 31281942 . T C 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-2.943;DP=98;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,32:98:99:824,0,6469 -chr16 31281944 . A G 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-3.375;DP=98;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,32:98:99:824,0,6469 -chr16 31303783 . GAC G 1481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.780;DP=108;FS=6.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1519,0,1522 -chr16 31304458 . G T 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-2.669;DP=97;FS=6.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1284,0,1764 -chr16 31304659 . G A 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.130;DP=100;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1727,0,1659 -chr16 31319887 . T C 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.274;DP=94;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,56:94:99:1857,0,1280 -chr16 31453313 . C CT 985.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.140;DP=41;FS=3.641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=24.04;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1147,116,0 -chr16 31453502 . AAAAC A 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:99:259,0,1072 -chr16 31454389 . G GT 3618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.945;DP=185;FS=6.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.792;QD=19.56;ReadPosRankSum=3.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,131:172:99:3656,0,530 -chr16 31454653 . A AT 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=2.971;DP=34;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.76;ReadPosRankSum=-3.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:369,0,915 -chr16 31454776 . A T 3176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-1.027;DP=176;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:3205,0,6405 -chr16 31494541 . GA G 383.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.651;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:419,2,0 -chr16 31500957 . T A 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-1.250;DP=53;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:999,0,768 -chr16 31592210 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=1.268;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:357,0,87 -chr16 32920337 . C CA 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.083;DP=127;FS=16.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:99:302,0,2411 -chr16 33674458 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.18;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47:290,0,47 -chr16 33922346 . TCCTCCTCCTCCC T 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.794;DP=20;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:417,0,844 -chr16 34004752 . ACTGTGAGAGAGAAAGACGAATTATATCAATCAATATATACGGCTGTAAAGTTATCAATCTAGTATAGTAGTTTATTATAGTGTGTGAAATCTGTGTTTTGACTTAC A 12167.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.292;DP=243;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=32.72;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,242:243:99:12205,1133,0 -chr16 34037392 . TA T 1043.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.327;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:1081,0,1243 -chr16 34037984 . A AAT 832.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-1.177;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=4.27;ReadPosRankSum=3.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,53:178:99:870,0,5053 -chr16 34038663 . G GT 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-2.600;DP=326;FS=10.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,61:294:99:477,0,5678 -chr16 34081221 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-1.128;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:453,0,1555 -chr16 34081344 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=3.855;DP=43;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:328,0,2779 -chr16 34081353 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=3.782;DP=42;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:327,0,2779 -chr16 34273466 . G C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.728;DP=65;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:1207,0,1166 -chr16 34283589 . A G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.858;DP=60;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:912,0,1117 -chr16 34283820 . TTCACCTGAAATAGGTTAAAAAATAGGATATACAAAAATGTGAAACAAAGTTAAATTTGTTAATCATTGTGAAAAAATTCTAAAAAAAATACTAAAC T 2320.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=1.874;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=28.10;ReadPosRankSum=-2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2358,217,0 -chr16 34340939 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=1.368;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=15.29;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:334,0,387 -chr16 34424959 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=-0.415;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:540,0,514 -chr16 34431223 . C T 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=-0.678;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1962,0,1986 -chr16 34616025 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,419 -chr16 34876765 . CT C 3237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=-0.260;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:3275,317,0 -chr16 34876945 . A T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=-1.738;DP=36;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:724,0,1363 -chr16 34880860 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:363,0,344 -chr16 34897207 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,227 -chr16 34983961 . T C 1554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=1.094;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=27.67;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1583,114,0 -chr16 34983978 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.374;DP=30;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:289,0,937 -chr16 34984111 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=-0.193;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:703,0,1229 -chr16 34984112 . T C 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.465;DP=50;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=27.30;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,36:50:99:1393,0,369 -chr16 34984250 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.209;DP=42;FS=5.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:316,0,1185 -chr16 35001426 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,179 -chr16 35038682 . G GT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.833;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:249,0,516 -chr16 35064276 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-2.011;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=21.85;ReadPosRankSum=1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1230,0,1666 -chr16 35158060 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.276;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:254,0,254 -chr16 35167358 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.644;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:339,0,280 -chr16 35167379 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.306;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:346,0,167 -chr16 35170374 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.119;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:326,0,314 -chr16 35172684 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.740;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:357,0,257 -chr16 35172693 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.600;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:357,0,257 -chr16 35317736 . C T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.913;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:616,0,832 -chr16 35323558 . TCTACAAGACAGAAAGGCACAAGACAAGTCTGAGACAGATTTAATGAGCACAATAACCTTTTCAAACTCACTTAAACATTATGCCACACTTAC T 3647.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=3.352;DP=89;FS=1.939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.355;QD=28.50;ReadPosRankSum=-2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,81:85:99:3685,258,0 -chr16 35332099 . G T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.060;DP=24;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,810 -chr16 35346117 . TCTAAACACAAACAAGGAAATTATTAAGTCATGCAGTGAAATCAGACGACACGAAAACCACTTCAACATGACAAACTTCAAAAACTTGC T 1116.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-0.623;DP=49;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1154,0,735 -chr16 35346118 . CT C 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=-0.882;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:340,0,1641 -chr16 35346120 . AAACACAAACAAGGAAATTATTAAGTCATGCAGTGAAATCAGACGACACGAAAACCACTTCAACATGACAAACTTCAAAAACTTGCCT A 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.131;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:341,0,1596 -chr16 35416114 . C CT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-2.980;DP=290;FS=7.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=1.03;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,56:263:99:337,0,5118 -chr16 35463095 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=1.561;DP=36;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:240,0,975 -chr16 35477660 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.096;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,312 -chr16 35486479 . C T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-0.009;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:677,0,1259 -chr16 35891332 . T A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:294,0,99 -chr16 35891357 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=27.89;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:90:335,0,90 -chr16 35892745 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=2.359;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.06;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,132 -chr16 35909240 . C CA 920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=-0.382;DP=173;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,58:167:99:958,0,2859 -chr16 35959648 . C T 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.174;DP=75;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:705,0,1927 -chr16 35962217 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.605;DP=76;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:407,0,3507 -chr16 36207490 . T C 2584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=1.439;DP=101;FS=11.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=25.59;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,70:101:99:2613,0,795 -chr16 36209994 . A G 1759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.734;DP=137;FS=7.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=12.85;ReadPosRankSum=2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,52:137:99:1788,0,2911 -chr16 36210169 . C T 1848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.427;DP=125;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1877,0,2418 -chr16 36210332 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.861;DP=126;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,36:126:99:907,0,3464 -chr16 36233097 . AAC A 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.387;DP=39;FS=1.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:788,0,519 -chr16 36238513 . A C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr16 36245094 . GTT G 577.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.253;DP=60;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:704,0,1116 -chr16 36245429 . G C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.021;DP=31;FS=5.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,721 -chr16 36326385 . A T 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.011;DP=46;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:889,0,710 -chr16 36341684 . G A 651.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.193;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:16:680,16,0 -chr16 36349682 . A G 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.019;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1059,0,235 -chr16 36356551 . A G 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:537,39,0 -chr16 36396618 . G A 3289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-0.278;DP=196;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,103:195:99:3318,0,3238 -chr16 36398123 . T C 2388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.703;DP=136;FS=6.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:2417,0,6471 -chr16 36398129 . AAGGTATACTGAATGTTTGCTTAAGACATAAACTCACTTTTTTTTGTTTTGTGGTGTTATGGAAATTATGCAATGAACTGTGCTGTTTTGAGT A 5344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=1.598;DP=132;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=30.26;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,118:129:99:5382,0,2045 -chr16 36402015 . C CT 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.039;DP=44;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:320,0,679 -chr16 36402583 . C T 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.654;DP=127;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1923,0,2355 -chr16 36473760 . T TA 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-1.418;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.969;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:283,0,909 -chr16 36605710 . G A 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.573;DP=124;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:1658,0,2539 -chr16 36615946 . T TA 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.548;DP=39;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:476,0,478 -chr16 36616446 . AG A 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.993;DP=37;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:335,0,685 -chr16 36742943 . G C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-1.838;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=16.80;ReadPosRankSum=2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,259 -chr16 36757660 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:370,0,209 -chr16 36757746 . A C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:458,0,232 -chr16 36757869 . G T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.740;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:542,0,153 -chr16 36757887 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=1.362;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=24.70;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:547,0,157 -chr16 36759156 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=23.40;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:309,0,143 -chr16 36875521 . A C 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr16 36875769 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:331,0,333 -chr16 37000544 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.818;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:385,0,704 -chr16 37067502 . C T 2191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.031;DP=314;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,93:314:99:2220,0,14194 -chr16 37067917 . CT C 1559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=1.681;DP=281;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,1:271:99:1597,0,8575 -chr16 37622311 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:345,0,257 -chr16 37844343 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:232,0,391 -chr16 37977818 . A C 236.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:265,0,22 -chr16 37978382 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=20.18;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:230,0,67 -chr16 37979290 . AT A 315.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:353,24,0 -chr16 37979292 . G C 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 -chr16 38014467 . C T 517.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.347;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=34.49;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:1:543,1,0 -chr16 38075286 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.384;DP=124;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,26:124:99:506,0,3758 -chr16 38099965 . T G 2320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.756;DP=194;FS=5.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,71:192:99:2349,0,3992 -chr16 38101779 . G A 1682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=-0.418;DP=188;FS=20.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,62:187:99:1711,0,4693 -chr16 38101806 . C T 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.804;DP=201;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,56:200:99:1338,0,5511 -chr16 38111743 . C T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.082;DP=190;FS=3.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=5.26;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,46:190:99:1028,0,5490 -chr16 38124433 . T C 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.213;DP=149;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,38:149:99:950,0,8247 -chr16 38124434 . G T 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=1.821;DP=150;FS=4.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,38:150:99:950,0,8247 -chr16 38124799 . AT A 3426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=1.089;DP=135;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,84:126:99:3464,0,664 -chr16 38125603 . A AT 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-0.948;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:518,0,472 -chr16 38125747 . C A 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=0.917;DP=75;FS=7.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1284,0,1373 -chr16 38125775 . G GT 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.658;DP=72;FS=26.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:788,0,916 -chr16 38126242 . G C 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.681;DP=81;FS=3.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:1119,0,1681 -chr16 38127429 . TCCTGGTGAGTTTTAAAGACAGAAGAGAAGATCAGCTGAAAATGTAAGTGTAAAGAAACACACGAATCAGCTGAAATGAGCGTCAGA T 2267.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.470;DP=53;FS=6.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=27.16;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2305,192,0 -chr16 38220039 . AACCTGAAGAAAGACATGAAATAAGCTGTAAAAAGACAGTGAAAACCTCCCTCAAACTTTGTCACATTATTCTGCTTTTTATTTTTTTCTCTGTCTTGTCTGT A 1723.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=2.244;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1761,161,0 -chr16 38237963 . G T 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.405;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:862,0,951 -chr16 38885943 . TC T 248.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:286,24,0 -chr16 39184573 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.789;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:531,0,1854 -chr16 39184584 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.343;DP=57;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=4.24;ReadPosRankSum=2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:270,0,1671 -chr16 39235617 . A AT 976.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-2.122;DP=131;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1102,0,1302 -chr16 39324904 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:398,0,202 -chr16 39345079 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.267;DP=42;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:285,0,1544 -chr16 39349549 . T C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.838;DP=49;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:751,0,983 -chr16 39349632 . A G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.287;DP=46;FS=8.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:834,0,762 -chr16 39378496 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:304,0,460 -chr16 39384365 . T C 699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:728,51,0 -chr16 39508255 . G A 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-1.382;DP=127;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:1854,0,6227 -chr16 39508258 . T C 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=-1.129;DP=144;FS=5.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,52:144:99:1854,0,6288 -chr16 39577836 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:89:232,0,89 -chr16 39602257 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-0.996;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:256,0,413 -chr16 39603959 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-1.904;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=24.73;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:597,0,176 -chr16 39693333 . A G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=2.663;DP=81;FS=10.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:650,0,2092 -chr16 39698851 . A T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.643;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,23:69:99:588,0,1659 -chr16 39708925 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.729;DP=66;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:257,0,1943 -chr16 39876595 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.448;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.176;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,249 -chr16 39881067 . T A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.942;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:77:490,0,77 -chr16 39881248 . T A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-1.710;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:504,0,197 -chr16 39894943 . T C 1405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=-0.311;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:1434,0,2195 -chr16 39903340 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-1.052;DP=59;FS=6.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:280,0,1784 -chr16 39913936 . C T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.119;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:641,0,1341 -chr16 39913965 . CT C 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.565;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:428,0,649 -chr16 39916281 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:291,0,374 -chr16 39925110 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr16 39984876 . A C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr16 40051789 . C T 1877.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1906,138,0 -chr16 40066523 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=2.291;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:364,0,658 -chr16 40075445 . G A 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=1.293;DP=67;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1102,0,836 -chr16 40075529 . T C 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.193;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:1012,0,326 -chr16 40079128 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.599;DP=28;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:323,0,608 -chr16 40084753 . C A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,774 -chr16 40084754 . A C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:247,0,774 -chr16 40095740 . T TAA 315.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:353,30,0 -chr16 40144346 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=1.177;DP=28;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:413,0,402 -chr16 40144514 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=1.799;DP=19;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:335,0,252 -chr16 40216060 . G T 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.669;DP=94;FS=10.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,40:94:99:1381,0,1832 -chr16 40680827 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.330;DP=35;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:361,0,801 -chr16 40681000 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.927;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:372,0,432 -chr16 40681126 . A G 1939.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1968,138,0 -chr16 40681132 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.419;DP=46;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:746,0,851 -chr16 40681352 . A G 1311.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1340,96,0 -chr16 40681897 . GA G 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=1.318;DP=34;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:261,0,688 -chr16 40681928 . G A 757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:786,57,0 -chr16 40681939 . A C 770.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:799,57,0 -chr16 40681988 . A AG 264.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:302,27,0 -chr16 40682516 . A T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr16 40682624 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=1.347;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:307,0,592 -chr16 40682663 . A T 444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:473,33,0 -chr16 40682676 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr16 40683395 . TG T 233.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:271,18,0 -chr16 40730077 . C G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=1.399;DP=41;FS=12.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:607,0,699 -chr16 40790286 . TGTAAGTACATACTTTGTGAGGAGACTGTAAATGTGTTTGGTCACCTAAAAAACGAATCCCTTTCTCTCTTAG T 4984.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.336;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=29.02;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,118:122:99:5156,211,0 -chr16 40800695 . AG A 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-1.480;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:37:325,0,37 -chr16 40800785 . T C 705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:51:734,51,0 -chr16 40800790 . T A 705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:51:734,51,0 -chr16 40800836 . T TC 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:255,0,382 -chr16 40801530 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.861;DP=75;FS=7.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:411,0,2340 -chr16 40864010 . G GA 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.124;DP=88;FS=8.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:656,0,1986 -chr16 40864245 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-0.548;DP=77;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:350,0,2298 -chr16 40869654 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.116;DP=78;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:931,0,1836 -chr16 40877489 . G C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.319;DP=78;FS=4.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:608,0,2037 -chr16 40881549 . A T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.260;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:585,0,1743 -chr16 40885247 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.402;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:664,0,792 -chr16 40890496 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.355;DP=58;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:251,0,1771 -chr16 40903400 . G A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.053;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:1018,0,1714 -chr16 40931356 . T A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.155;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:572,0,633 -chr16 40965689 . A G 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 -chr16 40975174 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.198;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:714,0,587 -chr16 40975938 . G C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-1.480;DP=48;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:532,0,1743 -chr16 40976508 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:46:343,0,46 -chr16 40977077 . TAG T 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.467;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:467,0,384 -chr16 40977383 . A G 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.600;DP=66;FS=3.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:955,0,1341 -chr16 40978734 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.749;DP=112;FS=1.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=3.62;ReadPosRankSum=2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:434,0,3356 -chr16 41007712 . G A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.456;DP=40;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:534,0,800 -chr16 41012168 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=1.027;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:269,0,1794 -chr16 41015556 . CT C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:14:235,0,14 -chr16 41020426 . A G 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.588;DP=58;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:808,0,1240 -chr16 41021005 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:330,0,591 -chr16 41045588 . A T 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.658;DP=270;FS=5.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,55:270:99:1212,0,16767 -chr16 41045594 . T A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.720;DP=265;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,55:265:99:1214,0,16767 -chr16 41046811 . T A 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.424;ClippingRankSum=-1.754;DP=273;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,69:272:99:1544,0,7027 -chr16 41047700 . AAGGTAAATTCAAAGAAATAATATTTAGGAGCCAATTACATACAAAGATGTCACCAATGTCACCAAAATGAATTGAATTTTTGATTCTTTTTATATCAGTTACAATCAAATATATTTTTCTAACTCTCTC A 16779.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=1.695;DP=443;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,434:437:99:16817,1254,0 -chr16 41051013 . TGTGAGCAGAAATAAGAGATGATTAAAATCTTTTCCAGGCACTCTTACAGTACTTCAAATAAAGTGTGTATTTCATTGGATTCAG T 12860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=2.149;DP=286;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,284:286:99:12898,1088,0 -chr16 41219357 . A C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.288;DP=29;FS=8.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:427,0,615 -chr16 41610027 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.588;DP=195;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,42:195:99:859,0,6133 -chr16 41610048 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-1.960;DP=184;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.460;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,34:184:99:509,0,5732 -chr16 41851995 . C T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.294;DP=116;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,28:116:99:596,0,3482 -chr16 41852021 . G T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.221;DP=123;FS=3.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,30:123:99:651,0,3549 -chr16 41900921 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:85:238,0,85 -chr16 41912439 . T C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.352;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:525,0,652 -chr16 41914995 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:33:264,0,33 -chr16 41915614 . G A 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-0.289;DP=80;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=16.57;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:1354,0,1481 -chr16 42012996 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.232;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:389,0,449 -chr16 42038839 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=1.693;DP=48;FS=2.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:233,0,1409 -chr16 42039316 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-2.483;DP=74;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:474,0,4394 -chr16 42039322 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-2.429;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:468,0,4394 -chr16 42045310 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.225;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:526,0,2163 -chr16 42048801 . A C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-2.171;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:445,0,1406 -chr16 42048873 . A C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-0.153;DP=44;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:293,0,1612 -chr16 42052639 . GA G 290.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:28:328,28,0 -chr16 42052642 . G A 299.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:328,28,0 -chr16 42063873 . C T 2081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.691;DP=254;FS=0.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,81:254:99:2110,0,6611 -chr16 42102088 . C A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-1.079;DP=200;FS=4.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,52:200:99:1184,0,5461 -chr16 42296533 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr16 42304670 . CA C 738.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.720;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.348;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:15:776,15,0 -chr16 42305405 . T C 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.534;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:791,0,957 -chr16 42305457 . AC A 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.202;DP=45;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:534,0,585 -chr16 42305993 . A C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=1.340;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:290,0,471 -chr16 42307642 . T C 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.273;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:635,0,496 -chr16 42309079 . C CT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=1.754;DP=26;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:277,0,268 -chr16 42309450 . T TTC 634.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.639;DP=24;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:9:671,0,9 -chr16 42309833 . GT G,GTT 214.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.945;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,9,9:20:99:360,170,293,156,0,280 -chr16 42449816 . A T 801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:830,63,0 -chr16 42449900 . C T 381.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:410,30,0 -chr16 42496524 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-2.725;DP=79;FS=3.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=7.30;ReadPosRankSum=2.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:605,0,2061 -chr16 42567808 . C A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.731;ClippingRankSum=3.022;DP=57;FS=19.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:490,0,1359 -chr16 42567862 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=2.442;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=8.65;ReadPosRankSum=2.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:573,0,1583 -chr16 42696516 . G C 322.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=29.36;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:351,0,13 -chr16 42696529 . C G 245.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:12:273,0,12 -chr16 42698224 . C CA 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.345;DP=41;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:541,0,415 -chr16 42819712 . A G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.140;DP=42;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:640,0,830 -chr16 43007603 . GAGGTAACGTTAAAGGGTCTTAAACACCCTTTTTCTGTAACGTTAACGTGTTTGAGTGTGTATGGATAATTGGAACTCTTATATTTTC G 1401.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=1.516;DP=33;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1439,129,0 -chr16 43092808 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=2.537;DP=68;FS=15.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=5.95;ReadPosRankSum=-3.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:433,0,2891 -chr16 43092922 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.361;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:237,0,1391 -chr16 43234170 . T G 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-0.316;DP=196;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:1392,0,11201 -chr16 43234177 . C T 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.563;DP=191;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,53:191:99:1397,0,11201 -chr16 43235622 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.881;DP=116;FS=1.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,28:116:99:668,0,3547 -chr16 43236941 . A AT 1081.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.365;DP=142;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,50:138:99:1119,0,2099 -chr16 43272263 . G T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.844;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=17.39;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:637,0,764 -chr16 43299142 . A C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.071;DP=29;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:267,0,766 -chr16 43680823 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=1.845;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=7.58;ReadPosRankSum=-2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:551,0,1727 -chr16 43695811 . A G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.938;DP=90;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:286,0,2966 -chr16 43739365 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.560;DP=36;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=13.02;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:497,0,1644 -chr16 43747317 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.835;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=8.79;ReadPosRankSum=2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:327,0,2025 -chr16 43761379 . C G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=1.975;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:502,0,521 -chr16 43761611 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.961;DP=38;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,1077 -chr16 43771268 . T G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.632;DP=31;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,862 -chr16 43773850 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.387;DP=55;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:376,0,1539 -chr16 43778080 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.109;DP=52;FS=4.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:457,0,1386 -chr16 43778490 . A T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.251;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:647,0,3896 -chr16 43778491 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.373;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,22:72:99:647,0,3896 -chr16 43779273 . A T 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.487;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,40:109:99:1367,0,2382 -chr16 43779353 . GCTGTGGACATTTTTAAACAAAAGTTCTTTTGTATCAAATGAACAACAGCACAAGATTTTAAATATATCCAGGTGAACTATTAC G 2058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=3.627;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=23.66;ReadPosRankSum=-5.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,65:79:99:2096,0,3991 -chr16 43779545 . G A 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=-1.276;DP=73;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:1002,0,1567 -chr16 43779758 . CCCTTTTAAAAATAAATATGATTTTTTAATGAAAAATAGAACTTCTAATATGTTGGTATACTCTTATCATGTATAAAAAAAGTCCCTTA C 4831.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=2.492;DP=113;FS=1.878;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=27.03;ReadPosRankSum=-1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,108:113:99:4869,371,0 -chr16 43780032 . GCTGGGGATAAAAAGAAACATTGCACATTATTTGAAATTGCTTGAAAAGCCAACGAGATTGTAGAAATTACCAAAAAATCCATTAACATTAAACATTTAC G 2573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=1.883;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=33.43;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,64:77:99:2611,0,2093 -chr16 43781448 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.471;DP=168;FS=0.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,40:168:99:818,0,4910 -chr16 43786717 . T C 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=1.277;DP=67;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:537,0,1717 -chr16 43793117 . C T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.441;DP=83;FS=3.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:693,0,1834 -chr16 44079557 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-0.872;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.556;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,198 -chr16 44239554 . T C 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.363;DP=52;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:824,0,992 -chr16 44239569 . A G 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-1.538;DP=46;FS=6.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:824,0,907 -chr16 44239648 . T G 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.191;DP=54;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:943,0,913 -chr16 44241341 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.474;DP=57;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1066,0,905 -chr16 44242480 . C T 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.657;DP=73;FS=6.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1206,0,1283 -chr16 44256912 . C T 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.893;DP=100;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:1236,0,2095 -chr16 44256990 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.664;DP=82;FS=4.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:486,0,2203 -chr16 44257363 . T C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.371;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:836,0,801 -chr16 44304955 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-0.255;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:351,0,557 -chr16 44352537 . CA C 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.782;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:47:502,0,47 -chr16 44454889 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.074;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:483,0,986 -chr16 44455992 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.514;DP=48;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:424,0,1187 -chr16 44481996 . GAGTCCTAATAGAGCAGACAACACGCGTGCCA G 864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=1.260;DP=37;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=23.37;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:902,0,1102 -chr16 44481999 . TCCTAATAGAGCAGACAACACGCGTGCCATGTGACTATCTATTATGGTTTTGAAGTACCAAAAATAATAATGTCCTGGATTGAACTGGAGCTGTA T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.327;DP=34;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:243,0,1770 -chr16 44482030 . TGACTATCTATTATGGTTTTGAAGTACCAAAAATAATAATGTCCTGGATTGAACTGGAGCTGTA T 864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=1.077;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=25.43;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:902,0,285 -chr16 44496836 . C A 4044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.827;DP=147;FS=7.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,107:141:99:4073,0,736 -chr16 44504004 . GT G 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.289;DP=63;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:357,0,439 -chr16 44643043 . G C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.550;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:352,0,443 -chr16 44665821 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-1.274;DP=41;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:627,0,710 -chr16 44673890 . C A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.941;DP=82;FS=9.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:773,0,3388 -chr16 44673900 . C A 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.277;DP=84;FS=11.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:1360,0,3228 -chr16 44675091 . A G 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=2.280;DP=52;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:658,0,1148 -chr16 44675180 . T A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=2.017;DP=54;FS=4.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=7.61;ReadPosRankSum=2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:439,0,1406 -chr16 44694687 . G C 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.535;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1466,0,1591 -chr16 44702682 . A C 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=1.368;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=18.47;ReadPosRankSum=-2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1303,0,1001 -chr16 44730441 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.230;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:470,0,508 -chr16 44749814 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=32.97;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:325,0,134 -chr16 44750679 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,103 -chr16 44753692 . T TA 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=1.233;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:383,0,815 -chr16 44778808 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.599;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:387,0,590 -chr16 44780667 . T G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.021;DP=31;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:604,0,459 -chr16 44781270 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.539;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:611,0,1228 -chr16 44815419 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=-0.460;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,874 -chr16 44815420 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.328;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,874 -chr16 44815794 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=1.126;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:419,0,456 -chr16 44816046 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,164 -chr16 44841942 . GAA G 1100.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=-2.509;DP=143;FS=9.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:1237,0,2413 -chr16 44842043 . AT A 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-2.134;DP=105;FS=14.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:760,0,1322 -chr16 44842387 . CTA C 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=1.296;DP=134;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,22:131:99:340,0,4741 -chr16 44842546 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:391,0,366 -chr16 44852499 . G A 2514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.171;DP=159;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:2543,0,2915 -chr16 44934724 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.152;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,355 -chr16 44955482 . G A 3172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.153;ClippingRankSum=3.743;DP=172;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=18.45;ReadPosRankSum=-2.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,85:172:99:3201,0,3175 -chr16 44957909 . C T 248.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:277,0,21 -chr16 45056391 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.150;DP=33;FS=11.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:583,0,586 -chr16 45056599 . TGCGA T 228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:20:266,20,0 -chr16 45057860 . G A 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=1.629;DP=30;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=23.49;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:733,0,346 -chr16 45057895 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.620;DP=43;FS=6.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:815,0,764 -chr16 45067987 . C T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=1.274;DP=54;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:912,0,959 -chr16 45070350 . C T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.200;DP=42;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:945,0,472 -chr16 45070362 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.538;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:563,0,790 -chr16 45093113 . G C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:384,0,246 -chr16 45096105 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=-0.328;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=24.99;ReadPosRankSum=2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:478,0,197 -chr16 45097110 . A G 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-1.162;DP=35;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:756,0,476 -chr16 45097319 . T A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.986;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:361,0,702 -chr16 45098512 . T A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr16 45099543 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.168;DP=40;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:534,0,894 -chr16 45100337 . C G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:394,0,351 -chr16 45100397 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:284,0,521 -chr16 45100850 . T A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.758;ClippingRankSum=-2.573;DP=45;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=12.42;ReadPosRankSum=2.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:587,0,2105 -chr16 45100891 . C T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.641;DP=41;FS=6.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:695,0,693 -chr16 45101054 . G A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.671;DP=54;FS=2.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:949,0,959 -chr16 45101235 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-1.091;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:376,0,366 -chr16 45103478 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-0.118;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:249,0,777 -chr16 45103557 . G T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:264,0,537 -chr16 45103903 . T G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.307;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:498,0,592 -chr16 45103910 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=-0.375;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:256,0,1104 -chr16 45104033 . A T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-1.385;DP=26;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:488,0,468 -chr16 45105068 . G C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:644,45,0 -chr16 45105424 . A T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-0.312;DP=34;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:563,0,1477 -chr16 45105560 . T TC 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=19.73;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:274,0,147 -chr16 45105648 . A T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=2.462;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:469,0,447 -chr16 45105718 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:338,0,260 -chr16 45106750 . T A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=-1.724;DP=43;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:710,0,814 -chr16 45108772 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,327 -chr16 45108943 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.066;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:419,0,566 -chr16 45109221 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=-1.718;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,216 -chr16 45109253 . T G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,229 -chr16 45110909 . C G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=23.92;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,176 -chr16 45112115 . C A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr16 45145230 . G A 3152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.532;DP=246;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,103:246:99:3181,0,4692 -chr16 45145335 . G A 3511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.102;DP=229;FS=9.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,99:229:99:3540,0,4457 -chr16 45145449 . G A 3089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.902;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,90:195:99:3118,0,3435 -chr16 45161497 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.995;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:715,0,1250 -chr16 45194765 . G T 2254.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.446;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=31.43;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:2283,164,0 -chr16 45194831 . AATAT A,AAT 913.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=-0.669;DP=47;FS=4.238;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,10,27:39:99:1168,799,927,260,0,226 -chr16 45194920 . A G 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.515;DP=64;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:532,0,1631 -chr16 45195219 . TAC T 4951.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.358;DP=282;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,131:265:99:4989,0,5111 -chr16 45195348 . G A 5011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.674;DP=310;FS=0.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,159:310:99:5040,0,5316 -chr16 45195683 . TG T 3557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.753;DP=262;FS=9.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,127:259:99:3595,0,3646 -chr16 45195966 . G GGAGGA 575.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:16:613,16,0 -chr16 45212158 . T C 7198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-4.638;DP=282;FS=19.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=25.53;ReadPosRankSum=-2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,193:282:99:7227,0,2307 -chr16 45215124 . G A 7527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-2.500;DP=419;FS=0.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,231:419:99:7556,0,6617 -chr16 45225186 . G C 6474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.120;DP=401;FS=9.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=16.15;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,212:401:99:6503,0,6547 -chr16 45227855 . A G 7321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.493;DP=439;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,203:438:99:7350,0,8020 -chr16 45243571 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=27.44;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:385,0,95 -chr16 45243760 . C G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=25.48;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:91:334,0,91 -chr16 45258653 . G T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=-0.358;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=15.44;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:1387,0,1630 -chr16 45258728 . AGTGAGTACTTTAAATAAAAGCCCAGGCATTGATTAATAAAAGAGTAGTGTCATTCCATTAGCAGGTTTTTTTTTCATGCTGTTTTCTTCTTTTTAAG A 4612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=1.770;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=27.73;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,98:101:99:4650,402,0 -chr16 45259108 . C A 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.242;DP=87;FS=8.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1215,0,3705 -chr16 45261310 . G C 1347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-1.163;DP=83;FS=13.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1376,0,1398 -chr16 45265304 . C CT 578.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=1.025;DP=71;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:616,0,973 -chr16 45276715 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,190 -chr16 45278692 . T C 262.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.87;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:291,0,13 -chr16 45278796 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.580;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:280,0,1062 -chr16 45279009 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=2.340;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=16.11;ReadPosRankSum=-2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:447,0,459 -chr16 45280967 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-0.250;DP=25;FS=6.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:470,0,322 -chr16 45294613 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.155;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:326,0,396 -chr16 45447822 . C T 317.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.79;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:346,0,14 -chr16 45449953 . A G 624.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:653,48,0 -chr16 45457418 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-1.412;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:293,0,445 -chr16 45457562 . C A 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:489,36,0 -chr16 45457979 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,398 -chr16 45458147 . T C 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:897,63,0 -chr16 45459790 . C T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:469,33,0 -chr16 45463807 . A T 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 -chr16 45464090 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:338,24,0 -chr16 45464663 . CA C 225.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:263,24,0 -chr16 45464763 . A T 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 -chr16 45464800 . TA T 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 -chr16 45505794 . C A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-0.896;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=25.28;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:458,0,175 -chr16 45508399 . T C 290.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:319,24,0 -chr16 45509464 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:263,0,298 -chr16 45521865 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:290,0,63 -chr16 45521878 . T C 257.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:286,0,21 -chr16 45525043 . A T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=1.034;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:504,0,452 -chr16 45525094 . G T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:373,0,244 -chr16 45529509 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:364,0,246 -chr16 45529558 . T C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.362;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:92:855,0,92 -chr16 45530421 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=1.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:362,0,346 -chr16 45530436 . T A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=1.292;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:364,0,307 -chr16 45530833 . T A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:366,0,514 -chr16 45531000 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-1.209;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:561,0,388 -chr16 45546958 . G A 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1746,123,0 -chr16 45612595 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:250,0,250 -chr16 45614828 . GTCAGGTGAGTTTTGTATATATCATCTAATAAAAGAAAATATGTTTTAGACAACAATGCATTACGTTTTTACTCAAT G 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.269;DP=20;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:345,0,1565 -chr16 45619287 . C T 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 -chr16 45667885 . C A 1528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=1.053;DP=97;FS=5.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:1557,0,3256 -chr16 45674628 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:234,0,58 -chr16 45707389 . C T 1936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1965,144,0 -chr16 45707721 . GCTGCTTAATCAAAGAAAGAGACACAATTCTTGATATCAACTAGGGTTGAGGCTGTGTTCTGTCTGTATTTATACGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTAC G 2864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=2.784;DP=83;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=34.51;ReadPosRankSum=-2.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,69:78:99:2902,0,1370 -chr16 45710465 . T C 2113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2142,154,0 -chr16 45710487 . C T 1959.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1988,141,0 -chr16 45728317 . G T 1895.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1924,138,0 -chr16 45730523 . G A 564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:593,42,0 -chr16 45737202 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr16 45748994 . G A 4419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:4448,322,0 -chr16 45763496 . C T 2211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.670;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=28.12;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2240,163,0 -chr16 45803173 . G A 857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:886,63,0 -chr16 45826688 . T C 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:661,45,0 -chr16 45852856 . TA T 475.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.456;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:29:513,29,0 -chr16 45866194 . T G 2077.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2106,147,0 -chr16 45866293 . T A 1013.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:72:1042,72,0 -chr16 45866405 . G A 2824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2853,202,0 -chr16 45866505 . C T 10520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,235:235:99:10549,707,0 -chr16 45866598 . C T 12565.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=283;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,283:283:99:12594,852,0 -chr16 45867101 . C T 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:736,51,0 -chr16 45867107 . A C 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:51:736,51,0 -chr16 45868115 . G A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr16 45879339 . T G 1708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1737,135,0 -chr16 45891572 . G A 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:484,36,0 -chr16 45978678 . TCTGCAAAGAAAACCAACGTTTCATTATTTGGGTCCATTTAATGTCTGGTTTCAGAAATTTATTTAGACACTCAC T 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=33.65;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:542,0,260 -chr16 45992221 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.379;DP=63;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:319,0,1874 -chr16 46071098 . C A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=1.441;DP=31;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=29.83;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:953,0,178 -chr16 46071236 . C T 2485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2514,172,0 -chr16 46071406 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=1.024;DP=36;FS=11.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:374,0,935 -chr16 46072575 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-1.985;DP=50;FS=2.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:416,0,1345 -chr16 46072674 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-1.375;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,36:114:99:1009,0,3022 -chr16 46072843 . A T 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.850;DP=78;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:78:99:1174,0,1578 -chr16 46073092 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-2.604;DP=113;FS=2.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,38:113:99:885,0,6490 -chr16 46127547 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=1.626;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:367,0,1027 -chr16 46129127 . C G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-3.050;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=28.78;ReadPosRankSum=-2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:575,0,116 -chr16 46129762 . A AT 425.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:620,44,0 -chr16 46132200 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.791;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:348,0,2918 -chr16 46152762 . CACCTTCCGGAAAAAACAGATCTGTCCAACTGTGTTTCTGAATCCAGTTAGCATACAGCAGCATTAATGAAGCCTTTCCAA C 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.229;DP=48;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:531,0,1491 -chr16 46152767 . TCCGGAAAAAACAGA T 715.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.301;DP=46;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:753,0,1122 -chr16 46152785 . GTCCAACTGTGTTTCTGAATCCAGTTAGCATACAGCAGCATTAATGAAGCCTTTCCAAACCTTTCTA G 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-1.870;DP=53;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:758,0,1122 -chr16 46153643 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-2.436;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:524,0,1077 -chr16 46160752 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-2.152;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=4.73;ReadPosRankSum=-2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,8:45:99:241,0,4585 -chr16 46160761 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-2.039;DP=52;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:238,0,4585 -chr16 46188920 . T G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.138;DP=53;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:251,0,1589 -chr16 46202269 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.342;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:313,0,667 -chr16 46220827 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.628;DP=55;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:457,0,1319 -chr16 46237448 . G C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=1.785;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:525,0,914 -chr16 46237465 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=1.120;DP=44;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:287,0,1244 -chr16 46259627 . C T 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.862;DP=202;FS=2.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,51:202:99:1114,0,5798 -chr16 46259994 . T C 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.869;DP=238;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=4.44;ReadPosRankSum=2.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,53:238:99:1084,0,7174 -chr16 46262770 . T C 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=-0.696;DP=290;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,72:290:99:1653,0,8663 -chr16 46276754 . CAGGTATCATTGTTTTATTAGAAAATAAAAGGTGAAACTGATGCTTATTTTGTTTTTTTACATTATTAAAATAACTATGTCTTTTATTTTGA C 3720.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.337;DP=99;FS=2.199;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,96:99:99:3758,339,0 -chr16 46430456 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:492,0,122 -chr16 46667135 . C T 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 -chr16 46667137 . AT A 212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:12:234,12,0 -chr16 46669567 . G T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,916 -chr16 46669656 . GT G 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=30.97;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:347,0,267 -chr16 46669659 . A C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:347,0,267 -chr16 46669798 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.079;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=33.17;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:559,0,39 -chr16 46669892 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=29.16;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:44:349,0,44 -chr16 46670750 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.48;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,128 -chr16 47513524 . TGGCAC T 629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.351;DP=18;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:667,0,100 -chr16 47547620 . T A 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:536,36,0 -chr16 47619640 . T C 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:48:678,48,0 -chr16 48044281 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:256,0,139 -chr16 48063041 . AT A 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.566;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:74:284,0,74 -chr16 48063175 . G T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.677;ClippingRankSum=-1.165;DP=141;FS=10.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,28:141:99:523,0,4458 -chr16 48063233 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=1.826;DP=156;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,28:156:99:472,0,5194 -chr16 48065637 . C G 5084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.235;DP=288;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,139:288:99:5113,0,5091 -chr16 48065649 . A G 1319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.470;ClippingRankSum=0.498;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.087;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,57:227:99:1348,0,5223 -chr16 48273260 . A G 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.098;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=24.66;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:842,0,273 -chr16 48974060 . T A 7780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:7809,571,0 -chr16 48974065 . G C 7780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:7809,571,0 -chr16 49047747 . TA T 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.813;DP=17;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:244,0,121 -chr16 49150080 . C A 285.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:314,24,0 -chr16 49391103 . TA T 2977.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.059;DP=124;FS=1.475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=24.01;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,109:116:99:3023,280,0 -chr16 49391380 . T TG 653.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:49:691,49,0 -chr16 49569797 . CT C 295.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.70;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:10:332,10,0 -chr16 49684814 . G C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=2.975;DP=48;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=8.52;ReadPosRankSum=-2.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:437,0,1544 -chr16 49684828 . T C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=1.353;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=13.34;ReadPosRankSum=-4.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:682,0,1006 -chr16 49684840 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.078;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:243,0,1451 -chr16 49692552 . C A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=3.873;DP=51;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=7.51;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:411,0,2570 -chr16 49707973 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=3.153;DP=34;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:380,0,783 -chr16 49885980 . A T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=22.67;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:391,0,210 -chr16 49908407 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,463 -chr16 49909370 . TA T 506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:544,51,0 -chr16 49910347 . CTT C 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.419;DP=75;FS=19.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:589,0,2263 -chr16 49920341 . ATGTG A 483.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=1.488;DP=19;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:6:520,6,0 -chr16 49921970 . GA G 1403.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.705;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:99:1441,99,0 -chr16 49921972 . G T 2378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2407,170,0 -chr16 49924445 . T TG 532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.512;DP=36;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:33:570,0,33 -chr16 49925184 . T TA 1138.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:89:1176,89,0 -chr16 49927389 . C CT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-1.087;DP=80;FS=9.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:319,0,1270 -chr16 50488216 . G GT 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-2.308;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=4.52;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:286,0,938 -chr16 50493218 . ACTTCAGGGAAAGAAAAAAGTACAGTGCATTACATACTGCACAGTGATTTGATGAAAGTATGAGTGAACGGGTCTTAC A 2669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=2.563;DP=77;FS=2.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=34.67;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,65:77:99:2707,0,3187 -chr16 51609592 . G T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-2.511;DP=300;FS=4.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=5.24;ReadPosRankSum=2.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,72:300:99:1600,0,8847 -chr16 51609989 . C T 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-1.420;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=4.69;ReadPosRankSum=2.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,63:283:99:1356,0,19866 -chr16 51609992 . C A 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=-1.732;DP=276;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=4.79;ReadPosRankSum=2.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,61:276:99:1349,0,19866 -chr16 51609998 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-3.192;DP=272;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.255;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,71:272:99:1570,0,12624 -chr16 51610076 . G T 4339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-3.340;DP=159;FS=7.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=27.29;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,103:159:99:4368,0,3429 -chr16 51610079 . C T 3990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-2.617;DP=159;FS=10.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=25.10;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,102:159:99:4019,0,4111 -chr16 51613641 . A G 3093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.320;DP=81;FS=5.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=28.55;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:3122,232,0 -chr16 51617926 . G A 203.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:232,0,21 -chr16 51617983 . G A 3255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3284,238,0 -chr16 51624855 . C T 12224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.383;DP=406;FS=7.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=30.11;ReadPosRankSum=2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,323:406:99:12253,0,1441 -chr16 51743364 . G T 4166.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:4195,292,0 -chr16 51743367 . C T 4166.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:4195,292,0 -chr16 51749636 . C T 4698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=-0.226;DP=317;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,135:317:99:4727,0,6267 -chr16 51754894 . C T 5899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=1.294;DP=325;FS=12.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,180:314:99:5928,0,4615 -chr16 51795087 . A C 1195.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1224,87,0 -chr16 51901490 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.470;DP=49;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.91;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:906,0,861 -chr16 51907878 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=1.448;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:287,0,237 -chr16 51909652 . CT C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:246,0,117 -chr16 51912088 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.026;DP=26;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:459,0,554 -chr16 51950277 . G C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=4.233;DP=58;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:236,0,1612 -chr16 51950288 . C A 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=4.013;DP=75;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=11.74;ReadPosRankSum=-2.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:909,0,1499 -chr16 51950312 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=2.607;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:511,0,2499 -chr16 51950411 . A G 2962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.983;DP=196;FS=7.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,86:196:99:2991,0,3710 -chr16 51961056 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.527;DP=174;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,35:163:99:662,0,4936 -chr16 51975148 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=5.121;DP=55;FS=27.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:292,0,1551 -chr16 52537990 . G C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.668;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:68:432,0,68 -chr16 52541593 . A T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-2.265;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:41:922,0,41 -chr16 53065473 . A T 834.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.364;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:25:863,25,0 -chr16 53065840 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=3.073;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:448,0,437 -chr16 53065873 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=1.608;DP=38;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1063,0,274 -chr16 53066015 . C G 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.051;DP=35;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=21.14;ReadPosRankSum=-2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:768,0,450 -chr16 53066367 . C CT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-1.705;DP=64;FS=4.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=3.39;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:254,0,1039 -chr16 53067342 . G A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.733;DP=48;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1242,0,468 -chr16 53068209 . T C 1486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1515,111,0 -chr16 53069463 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.431;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:298,0,1109 -chr16 53069644 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.728;DP=25;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:645,0,191 -chr16 53070354 . CT C 298.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.496;DP=14;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:16:336,16,0 -chr16 53071164 . G A 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=-1.630;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:666,0,414 -chr16 53131509 . C G 370.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -chr16 53150429 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:314,0,720 -chr16 53527152 . G T 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.495;DP=183;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,55:183:99:1381,0,4869 -chr16 53596253 . CCACACACACA C 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=7.809;DP=154;FS=21.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=4.34;ReadPosRankSum=-5.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,31:128:99:706,0,9775 -chr16 53596632 . GT G 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=-0.041;DP=34;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:333,0,332 -chr16 53635144 . TA T 336.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:374,36,0 -chr16 54461635 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:394,0,157 -chr16 54469471 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr16 54546094 . AC A 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.315;DP=21;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:35:345,0,35 -chr16 54553225 . G T 1479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=1.369;DP=39;FS=3.099;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.942;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:73:1508,73,0 -chr16 54559481 . AG A 302.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:340,36,0 -chr16 54637302 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=1.563;DP=47;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:429,0,1256 -chr16 54637355 . T TC 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=1.412;DP=53;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:350,0,1351 -chr16 54638671 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.579;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:417,0,536 -chr16 54638699 . C A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.849;DP=28;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=16.17;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:481,0,425 -chr16 54638746 . A AC 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=13.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:297,0,871 -chr16 54639014 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:379,0,708 -chr16 54639408 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-2.282;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=33.55;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:65:498,0,65 -chr16 54640228 . T TA 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.570;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:365,0,608 -chr16 54641983 . C CAA 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=2.073;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:40:407,0,40 -chr16 54665534 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.320;DP=72;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:245,0,2087 -chr16 54737074 . A C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.148;DP=83;FS=6.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=6.08;ReadPosRankSum=-1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:533,0,2248 -chr16 54737117 . T C 1913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-3.085;DP=438;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:342,96:438:99:1942,0,13428 -chr16 54737607 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=1.223;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:378,0,588 -chr16 54738015 . G T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.927;DP=34;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:434,0,652 -chr16 54738214 . CGGTCGTTGTGGTATTATTAATGTTATTGTTATTAAATTACATTTTTTAGGCTTTTAAACAATTTTTAAAATTCTTTAACGGTTTTTATTTTTTGTTTTGTTCATTTA C 2581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=2.691;DP=22;FS=5.484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,6:22:99:2619,1019,0 -chr16 54739111 . AAGGTAACTTTCCTTAACATCCGATCATTTCGGTGCTGTTTATTATATTTGTAATAACATTTAATGTAATTGATTATAC A 23165.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=3.884;DP=594;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=30.76;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,565:575:99:23203,1674,0 -chr16 54739947 . TTC T 2206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-3.113;DP=420;FS=8.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,99:403:99:2244,0,12051 -chr16 54740171 . A T 406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.989;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:444,0,1759 -chr16 54766989 . A G 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:656,45,0 -chr16 54767074 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.354;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:266,0,789 -chr16 54767128 . T G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr16 54768711 . C T 1582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1611,108,0 -chr16 54768712 . A G 1582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1611,108,0 -chr16 54805127 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=1.775;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:362,0,620 -chr16 54877764 . T C 1665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.648;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1694,117,0 -chr16 54892568 . C T 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.372;DP=80;FS=7.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:1429,0,1311 -chr16 54892580 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.478;DP=67;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:330,0,1881 -chr16 54892649 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-2.337;DP=38;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=5.44;ReadPosRankSum=2.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:235,0,2233 -chr16 54892658 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-3.027;DP=37;FS=9.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=5.80;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:243,0,2233 -chr16 54898238 . G C 1249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1278,90,0 -chr16 54902139 . A T 582.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.648;DP=33;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=17.66;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:19:611,0,19 -chr16 54902270 . A C 761.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:790,54,0 -chr16 54902340 . G A 670.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:699,51,0 -chr16 54902423 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=1.470;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=32.84;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:99:488,0,158 -chr16 54902435 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.423;DP=12;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:488,0,158 -chr16 54902502 . T A 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-2.372;DP=29;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:1365,0,290 -chr16 54902626 . C G 1975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.426;DP=131;FS=6.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,46:69:99:2004,0,569 -chr16 54902669 . A G 1485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.457;DP=89;FS=17.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1514,0,1017 -chr16 54902685 . C T 1862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=1.551;DP=61;FS=35.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=30.54;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,37:51:99:1891,0,395 -chr16 54902750 . G A 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-2.731;DP=69;FS=18.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:1053,0,929 -chr16 54902765 . C A 2347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2376,166,0 -chr16 54902839 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-0.964;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.92;ReadPosRankSum=2.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:415,0,350 -chr16 54902852 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.039;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:378,0,768 -chr16 54903004 . A G 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,17:17:70:660,0,70 -chr16 54903143 . GT G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=3.163;DP=64;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=6.51;ReadPosRankSum=-4.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:454,0,2975 -chr16 54903312 . A C 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:44:533,44,0 -chr16 54903621 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=15.46;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:291,0,319 -chr16 54995467 . A C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.302;DP=37;FS=10.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:453,0,839 -chr16 55373721 . C T 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.330;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:988,0,343 -chr16 55373839 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.990;DP=36;FS=10.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:754,0,507 -chr16 55374648 . C T 1773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.200;DP=97;FS=7.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1802,0,1477 -chr16 55472964 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.501;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=11.47;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:315,0,300 -chr16 55507405 . AGTGAGTCTTTACGGTCACAGCATTACAGATCATCCATTCATTATTATATTATTTTTACTTTAAGGTTACTTGTGTGTTTCTGACTAATTTATTTGTGTTATTCAG A 1290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=1.832;DP=41;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,33:36:99:1328,0,712 -chr16 55515517 . C T 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=-1.144;DP=73;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:1441,0,2165 -chr16 55535441 . ACTGACACTACATAACATACATTTAAAAAGCCCACATGACTATAAAACACAGCTGAACGTCAGAGCTCATGCCTTACAGAACACCAAACTAATCTCAATTACCTAGATGTAAACAGTGCCTAAATACAAGTAGACCTGTTAGATGCATCATGCTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGTGCAAACTCAC A 2836.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=36.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,1:3:99:2874,1034,0 -chr16 55542134 . G A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 -chr16 55564278 . G T 1947.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-1.732;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=32.88;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1976,141,0 -chr16 55568018 . A T 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr16 55572502 . T C 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:24:315,24,0 -chr16 55572536 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,0:1:66:257,0,66 -chr16 55572562 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:270,0,58 -chr16 55572615 . T A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.882;DP=61;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=6.96;ReadPosRankSum=4.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:453,0,698 -chr16 55572638 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=1.204;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=4.41;ReadPosRankSum=2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:293,0,812 -chr16 55572891 . GA G 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:61:687,61,0 -chr16 55573115 . T C 1182.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.040;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.292;QD=28.36;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:46:1211,46,0 -chr16 55573164 . T G 692.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=34.60;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:720,11,0 -chr16 55573835 . A G 3883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3912,280,0 -chr16 55573883 . A G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=28.04;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:99:666,0,391 -chr16 55575058 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=1.583;DP=66;FS=35.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:913,0,1307 -chr16 55575063 . A T 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.347;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:466,0,2186 -chr16 55575336 . T A 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=-3.511;DP=83;FS=27.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=13.79;ReadPosRankSum=-3.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1173,0,2238 -chr16 55575577 . A G 647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:676,51,0 -chr16 55575934 . A T 2514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.344;DP=63;FS=2.748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=29.97;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,59:61:99:2543,178,0 -chr16 55575994 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-2.610;DP=57;FS=7.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,47:56:99:1901,0,134 -chr16 55595129 . C T 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.565;DP=104;FS=1.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1303,0,4658 -chr16 55603778 . GT G 1445.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.292;DP=79;FS=1.563;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,61:71:44:1523,44,0 -chr16 55604100 . T C 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.690;DP=49;FS=6.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:843,0,1151 -chr16 55604177 . AG A 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-1.777;DP=19;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:57:509,0,57 -chr16 55604588 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.854;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:392,0,432 -chr16 55604690 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.369;DP=42;FS=6.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:649,0,1099 -chr16 55604773 . T C 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=2.011;DP=100;FS=5.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,36:99:99:1158,0,2783 -chr16 55604879 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.921;DP=88;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=2.51;ReadPosRankSum=-2.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:99:249,0,2776 -chr16 55605187 . CTT C 224.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:398,31,0 -chr16 55605428 . A ATT 670.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:708,47,0 -chr16 55605713 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-1.648;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:282,0,1286 -chr16 55605728 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.215;DP=31;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:390,0,730 -chr16 55615317 . TG T 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.34;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:53:296,0,53 -chr16 55615320 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=33.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:53:296,0,53 -chr16 55818001 . C G 323.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.39;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:352,0,15 -chr16 55827735 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:276,0,145 -chr16 55827784 . C G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:397,0,138 -chr16 55829916 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,319 -chr16 55829917 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,319 -chr16 55830021 . G C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=24.60;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:348,0,130 -chr16 56024727 . G A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.397;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=31.75;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1076,0,119 -chr16 56024792 . A C 5331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=6.415;DP=285;FS=35.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=18.71;ReadPosRankSum=-3.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,153:230:99:5360,0,2626 -chr16 56024921 . G A 1780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=-0.361;DP=201;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1809,0,1907 -chr16 56024964 . C T 465.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=11.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=33.23;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:492,0,4 -chr16 56025482 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.753;DP=59;FS=8.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:328,0,1552 -chr16 56026425 . G A 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.320;ClippingRankSum=1.431;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=14.89;ReadPosRankSum=-3.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,50:82:99:1726,0,1207 -chr16 56026565 . G T 1912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-1.674;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=23.33;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1941,0,211 -chr16 56027134 . C T 1491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1520,108,0 -chr16 56028370 . A G 756.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.261;DP=24;FS=10.792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=31.53;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:23:785,23,0 -chr16 56029015 . G A 365.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.474;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=28.08;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:393,0,12 -chr16 56029120 . G A 3377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3406,253,0 -chr16 56058432 . G C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.165;DP=56;FS=7.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:887,0,1059 -chr16 56075795 . G A 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=1.455;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=31.60;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,37:43:57:1387,0,57 -chr16 56100965 . G A 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.272;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.101;QD=22.27;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1231,0,634 -chr16 56108581 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=1.151;DP=49;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:263,0,1461 -chr16 56125222 . GA G 948.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.423;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=22.59;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,32:40:86:986,0,86 -chr16 56125365 . A G 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.148;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:994,0,1062 -chr16 56129044 . C T 5820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.400;DP=215;FS=4.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=27.07;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,162:215:99:5849,0,1118 -chr16 56138410 . A G 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=2.130;DP=55;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1035,0,955 -chr16 56138871 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.372;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:316,0,421 -chr16 56140260 . A T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-1.451;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:600,0,1031 -chr16 56145781 . G C 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-2.676;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:756,0,6043 -chr16 56145784 . G T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-2.895;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,28:105:99:762,0,6043 -chr16 56148195 . CA C 1262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=2.144;DP=84;FS=6.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,43:81:99:1300,0,1250 -chr16 56154755 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr16 56161631 . T C 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.403;DP=259;FS=6.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,58:259:99:1120,0,7406 -chr16 56164952 . T A 1405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.854;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,58:195:99:1434,0,4997 -chr16 56164976 . G A 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.783;DP=203;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.66;ReadPosRankSum=-5.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,64:203:99:1584,0,5116 -chr16 56165105 . A G 3941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.661;DP=262;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,119:261:99:3970,0,4487 -chr16 56178591 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.954;DP=127;FS=11.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,25:126:99:375,0,5551 -chr16 56199832 . C T 2679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.962;DP=147;FS=4.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:2708,0,5509 -chr16 56221718 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-0.808;DP=218;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=2.59;ReadPosRankSum=3.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,41:216:99:592,0,6583 -chr16 56309950 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-4.664;DP=42;FS=6.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:600,0,862 -chr16 56311442 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:44:277,0,44 -chr16 56311512 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:260,0,93 -chr16 56311798 . C T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=2.605;DP=43;FS=6.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:806,0,641 -chr16 56312181 . C T 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.165;DP=46;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=16.69;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:796,0,757 -chr16 56322750 . C T 2170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.588;DP=114;FS=5.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:2199,0,4297 -chr16 56331627 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.974;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:609,0,1290 -chr16 56334524 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.137;DP=76;FS=3.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,31:76:99:1091,0,1568 -chr16 56334537 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.880;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:575,0,2167 -chr16 56340038 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.156;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:410,0,84 -chr16 56351925 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=-0.802;DP=92;FS=7.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=3.36;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:337,0,2911 -chr16 56355051 . C A 3015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-0.299;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=18.17;ReadPosRankSum=-2.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:3044,0,3082 -chr16 56355105 . C T 3088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-1.790;DP=191;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,90:191:99:3117,0,3113 -chr16 56370800 . C T 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.595;DP=122;FS=1.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,74:122:99:2318,0,1561 -chr16 56427435 . G A 398.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=33.21;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:7:426,0,7 -chr16 56442446 . G A 623.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.452;DP=23;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:15:652,0,15 -chr16 56452667 . T C 2152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.403;DP=93;FS=4.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,62:93:99:2181,0,1184 -chr16 56452668 . T C 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.943;DP=95;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.852;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1756,0,1928 -chr16 56478312 . T G 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr16 56480821 . T TA 418.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:456,45,0 -chr16 56497630 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.28;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:92:251,0,92 -chr16 56581362 . T G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:281,0,58 -chr16 56675479 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-1.283;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:328,0,1149 -chr16 56679421 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-0.063;DP=73;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:247,0,2221 -chr16 56726282 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=-1.639;DP=54;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:325,0,1582 -chr16 56808954 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.173;DP=55;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=3.87;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:241,0,1605 -chr16 56809093 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=-0.345;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:400,0,2719 -chr16 56819359 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.911;DP=61;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:230,0,1836 -chr16 56832454 . G A 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-1.174;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1232,0,2188 -chr16 56833951 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:266,0,476 -chr16 56838724 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:265,0,308 -chr16 56841352 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.084;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:551,0,468 -chr16 56841468 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.478;DP=30;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:510,0,547 -chr16 56842725 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.675;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=17.56;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:397,0,334 -chr16 56844496 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.002;DP=42;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:574,0,878 -chr16 56893678 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr16 56931574 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.194;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:247,0,507 -chr16 56981985 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.741;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:399,0,611 -chr16 57119428 . A G 224.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.02;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:252,0,10 -chr16 57315272 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-2.353;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:387,0,3608 -chr16 57441552 . C A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=-0.018;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:528,0,1950 -chr16 57442520 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-0.872;DP=81;FS=5.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:274,0,2431 -chr16 57446973 . TA T 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.678;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:378,0,171 -chr16 57564946 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.022;DP=29;FS=8.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:383,0,640 -chr16 57597939 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=28.14;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:394,0,92 -chr16 57692273 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.097;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:284,0,3346 -chr16 57693815 . G C 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.124;DP=72;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:567,0,1997 -chr16 57739052 . A T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=1.099;DP=121;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,27:121:99:521,0,3526 -chr16 57742461 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-3.196;DP=91;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:634,0,2571 -chr16 57835227 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=1.900;DP=57;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:313,0,1541 -chr16 57840679 . GGGTACGAGAGAAGACTAGTTTACCACGTTTTACTACTAACTCTGATCACTGACAGCTGTTTTTGTGCATTATAGAAAATAATATGTGCATTGTTTCTTGTGATGTGAA G 2081.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.722;DP=49;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:2119,202,0 -chr16 57920913 . G A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-1.095;DP=35;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:888,0,876 -chr16 57920914 . C T 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=-1.268;DP=35;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:888,0,876 -chr16 57945885 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=1.183;DP=87;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:86:99:517,0,2509 -chr16 57946168 . T TA 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=-0.369;DP=77;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:764,0,3134 -chr16 57946467 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-0.520;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=29.76;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:683,0,328 -chr16 57946987 . ACACACG A 406.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=-2.123;DP=16;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=25.43;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:17:444,0,17 -chr16 57947055 . A T 3278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=1.109;DP=84;FS=7.706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,75:81:99:3307,238,0 -chr16 57947163 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.218;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,27:130:99:516,0,3982 -chr16 57947317 . A G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.741;DP=30;FS=8.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:407,0,775 -chr16 57950980 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-1.528;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:488,0,2833 -chr16 57953396 . A G 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr16 57958035 . T C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:644,48,0 -chr16 57991267 . CGT C 253.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:291,26,0 -chr16 58024259 . T C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.814;DP=111;FS=12.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,29:110:99:632,0,3077 -chr16 58125300 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.337;DP=181;FS=6.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,31:180:99:365,0,5929 -chr16 58125672 . T C 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.165;DP=48;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.475;QD=30.45;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1490,0,179 -chr16 58126749 . C CA 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-3.612;DP=91;FS=23.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:413,0,2163 -chr16 58126803 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.509;DP=126;FS=5.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,26:126:99:502,0,3806 -chr16 58127003 . T C 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=-0.715;DP=58;FS=5.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=21.63;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:58:99:1283,0,1723 -chr16 58127004 . A G 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=-0.679;DP=56;FS=3.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=22.41;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,34:56:99:1283,0,1723 -chr16 58127136 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=-0.013;DP=103;FS=4.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,25:95:99:631,0,4479 -chr16 58127263 . G A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.462;DP=96;FS=7.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,30:96:99:801,0,2590 -chr16 58127791 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.988;DP=41;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:357,0,3533 -chr16 58129572 . T A 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.333;DP=119;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.975;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,38:119:99:1090,0,6680 -chr16 58129573 . T A 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.454;DP=117;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,37:117:99:1090,0,6680 -chr16 58129912 . CA C 1227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.229;DP=59;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.792;QD=20.81;ReadPosRankSum=2.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1265,0,1573 -chr16 58129916 . A G 1236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.515;ClippingRankSum=-0.493;DP=57;FS=2.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,33:57:99:1265,0,1573 -chr16 58130149 . T C 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:28:714,28,0 -chr16 58130219 . G A 1047.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1076,81,0 -chr16 58130537 . T C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.75;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:39:428,0,39 -chr16 58130946 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.264;DP=158;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,28:158:99:507,0,10503 -chr16 58136810 . G A 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.582;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,47:152:99:1172,0,3931 -chr16 58150632 . C T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.637;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=27.76;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:861,0,159 -chr16 58151268 . C T 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:857,66,0 -chr16 58151287 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-2.373;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:64:606,0,64 -chr16 58153057 . C T 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.276;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:65:939,0,65 -chr16 58155446 . C A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.780;DP=34;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=20.76;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:734,0,435 -chr16 58156785 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=46;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:324,0,265 -chr16 58159512 . T C 1863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.123;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,47:51:66:1892,66,0 -chr16 58191445 . A G 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr16 58194747 . T G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=25.84;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:390,0,117 -chr16 58233295 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.960;DP=43;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:773,0,1077 -chr16 58233563 . C A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-0.305;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:504,0,325 -chr16 58242098 . G A 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=1.040;DP=58;FS=3.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:920,0,1085 -chr16 58242184 . TCTGTAATAGAAAAAGAACATGAGTCAGCTGATTGACGGCTGTCAATCGTGTGCTGAAGGGGGCGTGTCAGAC T 2212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.035;DP=50;FS=4.114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:2250,204,0 -chr16 58245216 . C T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.895;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=19.87;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:843,0,530 -chr16 58247006 . C T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-0.786;DP=47;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1001,0,558 -chr16 58256415 . G T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=1.457;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:723,0,909 -chr16 58275485 . A T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.378;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:586,0,846 -chr16 58275578 . G T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.710;DP=32;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:416,0,930 -chr16 58276803 . A G 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.464;DP=53;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:693,0,1096 -chr16 58278391 . C CA 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-2.370;DP=42;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:643,0,781 -chr16 58279351 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-1.215;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:231,0,891 -chr16 58305094 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:686,0,635 -chr16 58305922 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-0.237;DP=162;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:567,0,4704 -chr16 58309935 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=4.145;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:597,0,1692 -chr16 58310307 . CAG C 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.984;DP=100;FS=8.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,33:91:99:984,0,1427 -chr16 58310954 . C T 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.744;DP=144;FS=12.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,51:144:99:1616,0,3048 -chr16 58311439 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.898;DP=142;FS=3.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,36:142:99:723,0,7330 -chr16 58311449 . C T 2677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=2.432;DP=153;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:2706,0,3824 -chr16 58311797 . C G 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:457,0,133 -chr16 58311940 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-1.052;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:317,0,1528 -chr16 58312097 . C T 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.597;DP=108;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:1410,0,2108 -chr16 58318503 . C T 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.450;DP=245;FS=4.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,71:245:99:1618,0,6120 -chr16 58319257 . C G 2138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=1.379;DP=134;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:2167,0,2159 -chr16 58319281 . G A 1973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-0.123;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:2002,0,2087 -chr16 58319332 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.748;DP=152;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,32:152:99:633,0,4589 -chr16 58319704 . C T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=-1.199;DP=179;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,37:179:99:672,0,5184 -chr16 58324580 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.614;DP=84;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:413,0,2530 -chr16 58331257 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-2.174;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:516,0,206 -chr16 58334322 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=2.150;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:258,0,460 -chr16 58353463 . TA T 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.577;DP=147;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,40:147:99:595,0,2420 -chr16 58353670 . A G 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-0.327;DP=325;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,66:325:99:1064,0,9702 -chr16 58357145 . G A 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.113;DP=367;FS=0.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=5.18;ReadPosRankSum=2.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,90:366:99:1930,0,10319 -chr16 58364979 . T C 2625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.446;DP=483;FS=0.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:362,121:483:99:2654,0,13652 -chr16 58399738 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=1.729;DP=69;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:852,0,1479 -chr16 58399887 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.757;DP=115;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,37:115:99:984,0,2868 -chr16 58401091 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.439;DP=109;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,33:109:99:882,0,2827 -chr16 58402420 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-1.840;DP=88;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=4.74;ReadPosRankSum=2.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:445,0,2515 -chr16 58402505 . C A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-1.004;DP=82;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:635,0,2241 -chr16 58403476 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-2.506;DP=70;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:400,0,2032 -chr16 58404088 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.398;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:266,0,661 -chr16 58455817 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:270,18,0 -chr16 58466497 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=1.158;DP=53;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:251,0,1441 -chr16 58473158 . G T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.322;DP=59;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:387,0,1659 -chr16 58473259 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=-0.376;DP=42;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:272,0,1105 -chr16 58480797 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.451;DP=50;FS=6.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:495,0,1114 -chr16 58531353 . A T 241.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:270,0,22 -chr16 58531741 . G A 2899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=-0.088;DP=376;FS=8.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,115:375:99:2928,0,9910 -chr16 58542949 . G A 2638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=1.707;DP=392;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,112:392:99:2667,0,10612 -chr16 58574323 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr16 58598863 . A G 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-0.561;DP=64;FS=5.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,47:63:99:1729,0,336 -chr16 58598877 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-0.560;DP=56;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:250,0,1659 -chr16 58598947 . A T 2127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:2156,159,0 -chr16 58599079 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.937;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:278,0,1230 -chr16 58599250 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.424;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:253,0,1007 -chr16 58599381 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-2.561;DP=30;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:396,0,641 -chr16 58599596 . T TAC 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.311;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:63:314,0,63 -chr16 58629757 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.982;DP=105;FS=4.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:500,0,3033 -chr16 58633762 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-1.960;DP=100;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=3.43;ReadPosRankSum=2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:371,0,3123 -chr16 58640693 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.729;DP=56;FS=4.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=4.25;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:266,0,1703 -chr16 58641673 . C T 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.102;DP=53;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=31.90;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,44:53:99:1719,0,145 -chr16 58647360 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.350;DP=109;FS=6.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:352,0,5819 -chr16 58648204 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.186;DP=124;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,23:124:99:343,0,3762 -chr16 58648282 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-2.324;DP=92;FS=5.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:265,0,2690 -chr16 58650301 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.512;DP=81;FS=6.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=3.31;ReadPosRankSum=2.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,12:81:99:296,0,5543 -chr16 58650310 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=2.124;DP=89;FS=9.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:297,0,5575 -chr16 58652924 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=1.239;DP=53;FS=10.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:232,0,1576 -chr16 58653026 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.598;DP=86;FS=2.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:410,0,2487 -chr16 58654290 . G A 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.263;DP=114;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1987,0,1939 -chr16 58659863 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.538;DP=100;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:551,0,2890 -chr16 58666182 . A C 480.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=34.34;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:506,0,0 -chr16 58667552 . TA T 252.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.158;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:1:287,1,0 -chr16 58670164 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.500;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:488,0,3056 -chr16 58759659 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=1.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=25.36;ReadPosRankSum=2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:434,0,150 -chr16 58776492 . G A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.575;ClippingRankSum=-0.819;DP=97;FS=6.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=5.22;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:535,0,2718 -chr17 1217 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-2.219;DP=66;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:304,0,1902 -chr17 1572 . C T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-2.118;DP=76;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:615,0,1857 -chr17 6502 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:229,0,196 -chr17 40733 . G T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=27.65;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:443,0,298 -chr17 40740 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;ClippingRankSum=-2.192;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=29.63;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:443,0,298 -chr17 57036 . T C 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-1.354;DP=68;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1319,0,887 -chr17 57101 . AGTGAGTGCTGATGCTGCTGCTGTGTCCTGCTCTGTTCCCTGTAGATCCTCACAGCTCTTCTCCTCCTCCTCAG A 5363.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.913;DP=143;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.052;QD=25.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,140:142:99:6094,459,0 -chr17 57721 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.775;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:335,0,417 -chr17 58451 . G A 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-1.788;DP=79;FS=6.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:975,0,1837 -chr17 58633 . T A 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:512,39,0 -chr17 142767 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=1.672;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:410,0,628 -chr17 156965 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-1.159;DP=28;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:399,0,626 -chr17 156983 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.830;DP=21;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:399,0,622 -chr17 156993 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:609,0,156 -chr17 157022 . T C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:609,0,134 -chr17 157023 . T A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:609,0,134 -chr17 158698 . C A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.039;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:602,0,757 -chr17 163505 . C T 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.149;DP=35;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:629,0,547 -chr17 177684 . G A 5854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=-0.829;DP=341;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,184:340:99:5883,0,5486 -chr17 180355 . C T 5738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=-1.562;DP=344;FS=7.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,170:344:99:5767,0,5836 -chr17 180645 . G A 5009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.868;DP=291;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,159:291:99:5038,0,4490 -chr17 185253 . G A 5714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.798;DP=328;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,179:328:99:5743,0,5233 -chr17 185931 . G A 4709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.322;DP=281;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=16.76;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,137:280:99:4738,0,4935 -chr17 208314 . G A 4125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.472;DP=259;FS=0.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,119:259:99:4154,0,4451 -chr17 212185 . T TCA 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.553;DP=19;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:385,0,189 -chr17 212214 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.161;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,524 -chr17 282213 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.617;DP=40;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:407,0,745 -chr17 285648 . ACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGTCAGAGGTCTGCACAGAGTCCAACCACACCTGTTCTC A 248.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=2.966;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,65:69:99:286,121,0 -chr17 386756 . TA T 243.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:281,27,0 -chr17 454500 . T C 444.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=34.41;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:25:473,0,25 -chr17 511764 . T G 3574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=4.173;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=12.63;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,97:282:99:3603,0,13329 -chr17 511767 . G A 3574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=3.433;DP=278;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=12.86;ReadPosRankSum=1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,93:277:99:3603,0,13319 -chr17 523465 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=6.930;DP=177;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=1.42;ReadPosRankSum=-4.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,29:177:99:279,0,5967 -chr17 523932 . A T 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=4.268;DP=38;FS=13.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=30.35;ReadPosRankSum=-5.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:1444,0,258 -chr17 524260 . T TA 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.290;DP=40;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:505,0,518 -chr17 586581 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,171 -chr17 713250 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=2.021;DP=15;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.021;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:380,0,172 -chr17 713714 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-1.280;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:610,0,113 -chr17 736033 . G T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.632;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.592;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:694,0,1861 -chr17 736331 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=2.373;DP=33;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:99:254,0,1894 -chr17 742812 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=1.129;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:531,0,952 -chr17 758993 . TGA T 2419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=-2.682;DP=147;FS=11.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:2457,0,2921 -chr17 761293 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.579;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,425 -chr17 762448 . TCTGCAGAGCACAATCACTGTTACACACACACTCCTGCTGAACGCATGACTGTAAGCTGAATATGAGTGTGAGAGCGCAC T 8503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:8541,632,0 -chr17 903370 . A T 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 -chr17 904274 . G A 1095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1124,78,0 -chr17 904700 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr17 904739 . T C 618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:647,45,0 -chr17 943268 . CTA C 397.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr17 950245 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=-0.721;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:288,0,2344 -chr17 976817 . G C 3778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-1.158;DP=219;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,105:218:99:3807,0,3664 -chr17 980431 . A G 2689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.996;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,60:92:99:2718,0,848 -chr17 980497 . A G 3731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-1.240;DP=106;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,89:106:99:3760,0,169 -chr17 980550 . A G 2834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.957;DP=90;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.168;QD=31.50;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:2863,0,1427 -chr17 980567 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.351;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:308,0,3648 -chr17 980927 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=2.430;DP=21;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=25.84;ReadPosRankSum=-2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:807,0,1006 -chr17 980942 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-2.264;DP=24;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=32.45;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:807,0,1006 -chr17 981191 . A G 2302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.990;DP=72;FS=4.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,60:72:99:2331,0,138 -chr17 981196 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-1.204;DP=70;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:546,0,2518 -chr17 981336 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=3.008;DP=47;FS=9.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:319,0,1593 -chr17 1067150 . G C 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr17 1072285 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.546;DP=17;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:474,0,311 -chr17 1083604 . T A 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:460,33,0 -chr17 1084096 . G A 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:401,27,0 -chr17 1152061 . G A 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-0.443;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1054,0,909 -chr17 1170220 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.060;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:474,0,1803 -chr17 1171253 . T A 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr17 1172603 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=2.890;DP=22;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:321,0,1135 -chr17 1182906 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.105;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:664,0,145 -chr17 1183352 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-2.051;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=26.63;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:401,0,127 -chr17 1221804 . A G 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:669,51,0 -chr17 1221906 . GC G 1268.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-1.652;DP=49;FS=4.574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1306,124,0 -chr17 1222029 . T C 1163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:90:1192,90,0 -chr17 1222033 . T C 1031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=1.494;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1060,84,0 -chr17 1222378 . T C 2997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3026,217,0 -chr17 1222704 . C T 2671.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2700,184,0 -chr17 1227747 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=1.545;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.75;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:298,0,183 -chr17 1228801 . A G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:40:521,40,0 -chr17 1232641 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.171;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:420,0,505 -chr17 1232882 . T G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.720;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:498,0,498 -chr17 1234695 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=1.505;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=19.51;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:555,0,364 -chr17 1247362 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=1.387;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=15.83;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:424,0,438 -chr17 1247726 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.257;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:537,0,552 -chr17 1311032 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=30.92;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:30:523,0,30 -chr17 1316271 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=23.72;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:384,0,163 -chr17 1317813 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.929;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:578,0,341 -chr17 1330519 . C T 2295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-2.735;DP=93;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,61:89:99:2324,0,756 -chr17 1351614 . C T 2279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-0.690;DP=98;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=23.26;ReadPosRankSum=2.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,64:98:99:2308,0,2401 -chr17 1430483 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr17 1430491 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr17 1502434 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.540;DP=53;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=15.81;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:866,0,911 -chr17 1526311 . G A 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.031;DP=84;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1355,0,1455 -chr17 1607105 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:299,0,170 -chr17 1612017 . C A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.64;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:60:295,0,60 -chr17 2210181 . A C 739.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:768,57,0 -chr17 2210477 . G T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr17 2210746 . A C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr17 2238126 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:260,0,299 -chr17 2284211 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.04;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:369,0,326 -chr17 2377674 . C T 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.336;DP=57;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,35:57:99:1230,0,754 -chr17 2377881 . G GA 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.417;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=11.62;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:409,0,347 -chr17 2379063 . G A 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=1.308;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=20.38;ReadPosRankSum=-2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:721,0,466 -chr17 2379954 . T A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.793;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:764,0,610 -chr17 2380978 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-1.469;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:457,0,329 -chr17 2381272 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:455,0,443 -chr17 2381616 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:292,21,0 -chr17 2381855 . G C 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=-1.462;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1183,0,214 -chr17 2382533 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:303,0,303 -chr17 2382574 . T C 249.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:278,0,20 -chr17 2382934 . T C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-1.155;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.214;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:730,0,534 -chr17 2383051 . G A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.925;DP=51;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:1076,0,653 -chr17 2383790 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-1.457;DP=34;FS=10.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:532,0,686 -chr17 2384167 . C G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.731;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:579,0,839 -chr17 2384573 . A T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.110;DP=43;FS=11.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:724,0,709 -chr17 2385364 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.534;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:554,0,1123 -chr17 2385752 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr17 2385755 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr17 2386250 . A C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=1.354;DP=29;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:342,0,661 -chr17 2386373 . A AT 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.477;DP=30;FS=6.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:257,0,473 -chr17 2386799 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:256,0,289 -chr17 2386803 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=32.84;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:99:256,0,289 -chr17 2387067 . G A 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 -chr17 2388122 . T G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:372,0,758 -chr17 2421548 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-0.802;DP=73;FS=7.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:1007,0,1384 -chr17 2433110 . A C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.193;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:525,0,718 -chr17 2476401 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.202;DP=47;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:335,0,1332 -chr17 2512586 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:255,0,664 -chr17 2512592 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,664 -chr17 3543211 . A G 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr17 3543298 . G A 904.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:63:933,63,0 -chr17 3544734 . C T 720.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.971;DP=22;FS=2.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.884;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:20:749,20,0 -chr17 3544816 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,274 -chr17 3545498 . T A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.032;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,425 -chr17 3746249 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.818;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:333,0,304 -chr17 3746768 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:277,0,61 -chr17 3844197 . T G 2042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=1.261;DP=186;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,62:186:99:2071,0,4250 -chr17 3866330 . C G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,136 -chr17 4071679 . A C 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr17 4072328 . G C 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr17 4076622 . G T 506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:535,42,0 -chr17 4171671 . T C 565.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:594,42,0 -chr17 4171981 . A T 241.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:270,0,20 -chr17 4181452 . G T 544.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:573,39,0 -chr17 4181708 . A T 2313.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:2342,175,0 -chr17 4181723 . TA T 1015.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.802;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1053,0,655 -chr17 4208820 . T C 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:297,21,0 -chr17 4627099 . GTT G 226.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr17 4864505 . T C 4462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.494;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,133:342:99:4491,0,6962 -chr17 4903000 . G C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.269;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:455,0,659 -chr17 5343964 . T C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr17 5344067 . C T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr17 5382371 . A C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.532;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=26.90;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:351,0,48 -chr17 5395617 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:306,0,51 -chr17 5395668 . T C 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:675,51,0 -chr17 5591141 . T C 218.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:247,21,0 -chr17 5646005 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr17 5646006 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr17 5689893 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=1.877;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:627,0,320 -chr17 5695372 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=-1.032;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:43:492,0,43 -chr17 5714414 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.162;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:300,0,589 -chr17 5714919 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,246 -chr17 5725639 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:384,0,614 -chr17 5779205 . C T 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:440,33,0 -chr17 5780026 . A C 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=1.164;DP=59;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1181,0,2112 -chr17 5780261 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-0.285;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:591,0,960 -chr17 5780269 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-0.302;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:591,0,960 -chr17 6047283 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,384 -chr17 6107816 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:297,0,240 -chr17 6134399 . C T 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.451;DP=198;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,58:198:99:1508,0,5247 -chr17 6202060 . C T 1792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-1.858;DP=67;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=26.76;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,46:67:99:1821,0,591 -chr17 6211062 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.693;DP=210;FS=5.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,33:210:99:319,0,9595 -chr17 6211185 . A T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=1.373;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,40:204:99:672,0,6339 -chr17 6211218 . T A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.374;DP=183;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,36:183:99:559,0,5207 -chr17 6242477 . AAGGTCTGAGTCCTGTTTTAGCAGAGTTTATTTATCATTTGAGCTTTGCTGTGACTGGATCTGATCTACCGC A 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:252,0,1349 -chr17 6262799 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.528;DP=30;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:347,0,698 -chr17 6267611 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.097;DP=40;FS=10.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:321,0,988 -chr17 6267776 . C T 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-0.437;DP=73;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:989,0,1533 -chr17 6477670 . G T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-1.426;DP=79;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:538,0,2241 -chr17 6477700 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.683;DP=92;FS=2.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:458,0,2618 -chr17 6478253 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=-0.227;DP=48;FS=5.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:328,0,1390 -chr17 6479268 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.390;DP=74;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:250,0,3183 -chr17 6479341 . A C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=3.050;DP=46;FS=4.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:622,0,1190 -chr17 6479898 . A AGT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-1.214;DP=116;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:248,0,2778 -chr17 6493948 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=-2.090;DP=125;FS=2.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=4.65;ReadPosRankSum=2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:609,0,3451 -chr17 6557371 . G T 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-0.503;DP=78;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,46:78:99:1524,0,1078 -chr17 6570385 . G A 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-2.787;DP=91;FS=3.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=5.61;ReadPosRankSum=2.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:539,0,3461 -chr17 6570479 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.393;DP=113;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,28:113:99:637,0,3320 -chr17 6570625 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.898;DP=105;FS=7.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:637,0,2976 -chr17 6572630 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.173;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:395,0,566 -chr17 6573529 . C A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=2.104;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.734;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:383,0,1194 -chr17 6573872 . A C 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.384;DP=76;FS=6.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=15.69;ReadPosRankSum=2.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1221,0,1439 -chr17 6573975 . A C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=1.202;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:566,0,2094 -chr17 6705493 . G T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr17 6708206 . G T 402.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=33.52;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:430,0,10 -chr17 6724332 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:349,24,0 -chr17 6732044 . G A 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:836,60,0 -chr17 6732323 . GT G 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 -chr17 6812940 . A T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr17 6819077 . A T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=2.752;DP=26;FS=21.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:457,0,420 -chr17 6849616 . C T 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr17 6849649 . C A 351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:380,30,0 -chr17 6849664 . A C 366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:395,30,0 -chr17 6849814 . G A 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:75:1096,75,0 -chr17 6849820 . T C 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:75:1096,75,0 -chr17 6856906 . A G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=40.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:484,36,0 -chr17 6856967 . TCTGATAACACAAGTTCACAAACAATCACGATGATTATCTGGTGGCCTTAGAAAAGCTCATCTTTGTGTTCACCTCAC T 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:292,0,722 -chr17 6857067 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:99:292,0,722 -chr17 6881394 . T C 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 -chr17 6881442 . G A 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 -chr17 7069355 . TA T 216.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.348;DP=11;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:251,0,1 -chr17 7110324 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:444,0,456 -chr17 7110342 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=1.162;DP=29;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:507,0,471 -chr17 7379987 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-0.142;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:326,0,557 -chr17 7463561 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:254,0,414 -chr17 7464433 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.091;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:342,0,1695 -chr17 7468437 . A AT 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.429;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:272,0,242 -chr17 7468589 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,378 -chr17 7644974 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.298;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:567,0,461 -chr17 7723021 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:275,0,281 -chr17 7725683 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.199;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:538,0,1111 -chr17 7735024 . T A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.798;DP=34;FS=5.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:520,0,649 -chr17 7735071 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.192;ClippingRankSum=1.121;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:591,0,585 -chr17 7747899 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-1.099;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:388,0,81 -chr17 7840097 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-1.794;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:236,0,287 -chr17 8042463 . TGGTAAGACTTTTCTGTGCAACTAAAACAAGAAATCATAGACACGTAAAGAATTTTTCTCAAGATGCATATGATTATTTCTA T 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:299,0,315 -chr17 8069767 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.514;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:352,0,387 -chr17 8163960 . T G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.177;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:460,0,633 -chr17 8270716 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-1.657;DP=43;FS=10.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:280,0,1146 -chr17 8324211 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.094;DP=31;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:343,0,708 -chr17 8786810 . C CT 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.035;DP=159;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=3.78;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,42:140:99:638,0,2664 -chr17 8797084 . C G 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.639;DP=73;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:874,0,1656 -chr17 8863602 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.109;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:244,0,782 -chr17 9002863 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.817;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=7.42;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:414,0,1397 -chr17 9873242 . G A 2435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-2.059;DP=140;FS=3.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:2464,0,2308 -chr17 9873270 . TG T 970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=-1.569;DP=86;FS=15.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,44:81:99:1008,0,914 -chr17 9912602 . C A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.505;DP=33;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:427,0,802 -chr17 9956186 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.050;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:507,0,696 -chr17 9958467 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=1.356;DP=39;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:599,0,1665 -chr17 10013125 . C A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.620;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:519,0,1646 -chr17 10013126 . A T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.802;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:519,0,1646 -chr17 10014028 . T G 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.748;DP=59;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:844,0,1220 -chr17 10015144 . G C 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-0.584;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,32:69:99:1161,0,1288 -chr17 10016582 . GCCTAAAAATAAAGAAGAAAACATAATAAGTCATATTTTCAGTGCAATTACAAGCATGATTTGTAGCAAAATCAACAAA G 2957.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.735;DP=69;FS=4.046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,65:66:99:2995,253,0 -chr17 10022087 . T C 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.937;DP=62;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:952,0,1111 -chr17 10022656 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.571;DP=43;FS=14.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=5.81;ReadPosRankSum=2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:278,0,1207 -chr17 10026431 . G A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=1.203;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:748,0,769 -chr17 10029323 . T A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=1.767;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:570,0,928 -chr17 10029980 . G T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=2.103;DP=42;FS=4.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:720,0,725 -chr17 10030091 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.287;DP=48;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:615,0,1045 -chr17 10030199 . T C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.759;DP=52;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:709,0,1159 -chr17 10357554 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.122;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:447,0,516 -chr17 10358141 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.513;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:760,0,923 -chr17 10457616 . T C 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.218;DP=111;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:749,0,3467 -chr17 10498155 . G A 2018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.082;DP=181;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,64:181:99:2047,0,3904 -chr17 10552235 . G GGCT 1293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.394;DP=112;FS=2.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:103:99:1331,0,2176 -chr17 10565462 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=2.637;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:249,0,2290 -chr17 10565669 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,403 -chr17 10569310 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.659;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:368,0,589 -chr17 10569616 . A G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:347,0,293 -chr17 10644742 . C T 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.225;DP=86;FS=2.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,31:86:99:1083,0,1946 -chr17 10645546 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=2.806;DP=78;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,14:78:99:241,0,2495 -chr17 10685707 . AG A 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.841;DP=128;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,41:120:99:963,0,1949 -chr17 10685845 . T G 2010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.637;DP=158;FS=8.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,57:157:99:2039,0,3482 -chr17 10866543 . C G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.182;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:449,0,123 -chr17 11023045 . C A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.880;DP=46;FS=6.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:825,0,807 -chr17 11131813 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:465,0,332 -chr17 11240008 . C T 2661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.690;DP=137;FS=7.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:2690,0,2025 -chr17 11240020 . C T 2692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.023;DP=139;FS=5.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:2721,0,2086 -chr17 11241925 . GA G 1361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-1.947;DP=120;FS=4.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1399,0,1359 -chr17 11242391 . ATC A 1279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.255;DP=88;FS=4.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:1317,0,1871 -chr17 11242937 . G T 2999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-2.672;DP=193;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,89:193:99:3028,0,3285 -chr17 11261848 . G A 2045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.881;DP=115;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:2074,0,1968 -chr17 11268326 . A C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,147 -chr17 11269470 . T A 2739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=-0.128;DP=178;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,76:178:99:2768,0,3465 -chr17 11277332 . T A 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.704;DP=109;FS=3.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:1468,0,1951 -chr17 11285572 . C T 204.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:233,0,25 -chr17 11287146 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.88;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:98:357,0,98 -chr17 11335942 . GA G 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.483;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:468,0,161 -chr17 11336190 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.861;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:307,0,2257 -chr17 11336339 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.319;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=11.71;ReadPosRankSum=2.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:356,0,679 -chr17 11336978 . C CA 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.078;DP=39;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:295,0,623 -chr17 11337093 . T C 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=2.416;DP=74;FS=9.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:537,0,2155 -chr17 11337338 . T TA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.759;DP=75;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=4.26;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,41:64:99:685,0,459 -chr17 11337461 . G T 2199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.451;DP=125;FS=2.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:2228,0,2189 -chr17 11340280 . C T 1821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.436;DP=132;FS=4.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1850,0,2468 -chr17 11471866 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:348,0,273 -chr17 11574828 . C G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=1.306;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:540,0,405 -chr17 11580114 . A G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.217;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:441,0,364 -chr17 11580543 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.553;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:346,0,1276 -chr17 11580559 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.716;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:346,0,1275 -chr17 11581217 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:69:240,0,69 -chr17 11581218 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:69:240,0,69 -chr17 11631839 . G C 358.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=32.55;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:386,0,12 -chr17 11644228 . G C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=26.65;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:348,0,95 -chr17 12013742 . C T 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr17 12085684 . G A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=2.881;DP=82;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:626,0,2186 -chr17 12086992 . TCCTGTGAGGAAAAAGACATCACAATGCATTAAGTGTGATCCAGAACAAACTAAATGTTTTGTTAAACTTTATAGGGTTGCTTA T 3961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=1.539;DP=132;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=30.01;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,105:128:99:3999,0,4015 -chr17 12088194 . G A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=1.206;DP=102;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=4.79;ReadPosRankSum=-2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,25:102:99:517,0,3230 -chr17 12088952 . C T 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=1.447;DP=75;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=18.10;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:1386,0,1389 -chr17 12090005 . GGATCACTATAGGAAGGACATTGCATAGCAATA G 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-2.158;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:704,0,4916 -chr17 12090042 . AGAGAATGGCATGGCGTGTGAAACTCACCTCAAGCAACACAACAGAAAGCATGATAGTCAATGTTAAGAAGTAC A 663.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-2.226;DP=99;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=6.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,27:97:99:701,0,4916 -chr17 12091339 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=4.721;DP=69;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:301,0,2098 -chr17 12097139 . G T 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.525;DP=56;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:972,0,994 -chr17 12099994 . TCTGAAAGAGAAAGAAATTAACTAAACAATAAATAAAAATTCAACACAATTTAGTACAGAATGGGCCAAAATCGAAC T 3503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=1.754;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,79:82:99:3541,293,0 -chr17 12103399 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.593;DP=60;FS=5.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:776,0,1241 -chr17 12103454 . C T 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=3.225;DP=67;FS=10.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=15.34;ReadPosRankSum=2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1056,0,1216 -chr17 12161886 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.642;DP=39;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:545,0,817 -chr17 12161987 . G GA 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=1.185;DP=48;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:526,0,651 -chr17 12305509 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.471;DP=101;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,32:101:99:820,0,2622 -chr17 12305653 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.711;DP=91;FS=1.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1565,0,1511 -chr17 12306015 . T A 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-1.972;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1581,0,1575 -chr17 12306031 . T A 1717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-1.773;DP=96;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1746,0,1582 -chr17 12306745 . T C 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.154;DP=75;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,35:75:99:1296,0,1338 -chr17 12306851 . A C 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.762;DP=80;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=11.52;ReadPosRankSum=2.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:950,0,1783 -chr17 12307113 . G C 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.227;DP=89;FS=4.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,50:89:99:1661,0,1400 -chr17 12307288 . G A 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-0.511;DP=70;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.274;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:1213,0,1252 -chr17 12361276 . C A 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.521;DP=59;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1202,0,754 -chr17 12604969 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.472;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:758,0,1653 -chr17 12606260 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.798;DP=66;FS=3.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:994,0,1229 -chr17 12610861 . G T 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.323;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1047,0,1244 -chr17 12610948 . G GA 660.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.522;DP=62;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:732,0,624 -chr17 12611364 . GT G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.086;DP=32;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:242,0,515 -chr17 12611851 . G T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.028;DP=52;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:791,0,1064 -chr17 12612653 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.156;DP=62;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=3.29;ReadPosRankSum=2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:232,0,1706 -chr17 12612923 . AAC A 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.241;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:683,0,891 -chr17 12630932 . C G 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.382;DP=39;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:374,0,993 -chr17 12660620 . G C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=1.898;DP=52;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:777,0,961 -chr17 12682502 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.530;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:309,0,307 -chr17 12683033 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.368;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:286,0,286 -chr17 12691191 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.035;DP=61;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.236;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1051,0,973 -chr17 12693109 . A G 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-0.410;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:835,0,1101 -chr17 12721477 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-1.249;DP=64;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:691,0,1340 -chr17 12721675 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=3.671;DP=47;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:538,0,1100 -chr17 12774397 . G A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.837;DP=61;FS=3.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:501,0,1465 -chr17 12788432 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-1.184;DP=33;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:444,0,636 -chr17 12789437 . G T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.816;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:393,0,390 -chr17 12789798 . T A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-2.127;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:516,0,789 -chr17 12809789 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=1.903;DP=129;FS=7.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=2.45;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,27:123:99:344,0,4451 -chr17 12826983 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=2.378;DP=366;FS=27.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.664;QD=0.55;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:318,48:366:99:230,0,12238 -chr17 12828911 . A G 2652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.101;DP=488;FS=2.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:365,123:488:99:2681,0,13603 -chr17 12882770 . C A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.156;DP=49;FS=2.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:626,0,1075 -chr17 12883459 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-2.189;DP=103;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:343,0,3299 -chr17 12883502 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-0.473;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:461,0,2771 -chr17 12886794 . G GT 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.451;DP=163;FS=5.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,31:147:99:323,0,3272 -chr17 12903538 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=1.632;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:242,0,797 -chr17 12909206 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.475;DP=53;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:451,0,1436 -chr17 12909547 . G T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-0.635;DP=110;FS=5.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,19:109:99:231,0,3290 -chr17 12910472 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.909;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:298,0,2320 -chr17 12915473 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.713;DP=66;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=6.10;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:431,0,1778 -chr17 12960661 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=-1.131;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:272,0,799 -chr17 14318877 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=1.130;DP=43;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:607,0,855 -chr17 14369396 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.477;DP=73;FS=5.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:377,0,1975 -chr17 14369426 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-1.486;DP=85;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:352,0,2390 -chr17 14369494 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.558;DP=79;FS=7.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:483,0,2802 -chr17 14455897 . G T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.551;DP=88;FS=12.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:550,0,2514 -chr17 14456160 . A T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-1.562;DP=78;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:487,0,2144 -chr17 14459944 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;ClippingRankSum=-1.234;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:352,0,2455 -chr17 14460265 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=1.060;DP=76;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.543;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:332,0,2175 -chr17 14461715 . T G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.600;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:492,0,925 -chr17 14542184 . GA G 1025.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.052;DP=155;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,49:153:99:1063,0,2490 -chr17 14578366 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.110;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:297,0,1338 -chr17 14588802 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.538;DP=99;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:308,0,3010 -chr17 14588837 . C A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=2.348;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:841,0,3537 -chr17 14596559 . G C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.481;DP=106;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,30:102:99:790,0,2823 -chr17 14599554 . G T 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.391;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:923,0,2848 -chr17 14625556 . G T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.938;DP=87;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:354,0,4421 -chr17 14635571 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.363;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=1.96;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,25:152:99:326,0,4860 -chr17 14638302 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=1.255;DP=70;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:500,0,1917 -chr17 14638343 . T G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-1.035;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:442,0,2655 -chr17 14638524 . T A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.149;DP=184;FS=5.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,38:184:99:662,0,5712 -chr17 14638557 . C T 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=-1.306;DP=215;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,44:215:99:817,0,6541 -chr17 14655174 . G T 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=-0.931;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1517,0,1698 -chr17 14658719 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.928;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:377,0,1707 -chr17 14658774 . T C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=2.587;DP=70;FS=9.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:626,0,1856 -chr17 14658830 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.917;DP=26;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=28.38;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:766,0,127 -chr17 14662042 . A T 5599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.205;DP=283;FS=11.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.112;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,170:280:99:5628,0,3714 -chr17 14662083 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=-2.665;DP=121;FS=10.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=3.44;ReadPosRankSum=-6.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:444,0,4721 -chr17 14690269 . T C 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.830;DP=226;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,52:226:99:1071,0,6860 -chr17 14700773 . G A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.522;DP=164;FS=12.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,35:164:99:636,0,5459 -chr17 14882860 . T TG 1324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.595;DP=58;FS=4.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,41:57:99:1362,0,356 -chr17 14919630 . G A 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=1.460;DP=69;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1019,0,1098 -chr17 14926020 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.575;DP=71;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:398,0,1856 -chr17 14942071 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.490;DP=72;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:460,0,1915 -chr17 14952931 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.168;DP=77;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:500,0,2155 -chr17 14953439 . A T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.911;DP=72;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:842,0,1675 -chr17 14953659 . C G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.470;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,18:95:99:304,0,2974 -chr17 14954002 . A C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.675;DP=44;FS=4.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:591,0,1004 -chr17 14963706 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:261,0,91 -chr17 14965318 . GA G 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:294,0,329 -chr17 14966086 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.950;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:244,0,813 -chr17 14967386 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,622 -chr17 14998968 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.013;DP=44;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.779;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:307,0,1676 -chr17 15001540 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.630;ClippingRankSum=-0.481;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:452,0,1735 -chr17 15027553 . A G 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.193;DP=72;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1036,0,1409 -chr17 15027622 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=-0.575;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:279,0,1996 -chr17 15057373 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=1.091;DP=46;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=7.39;ReadPosRankSum=-1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:368,0,1133 -chr17 15060754 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,174 -chr17 15061429 . C T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.745;DP=51;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:886,0,922 -chr17 15277055 . G T 841.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:57:870,57,0 -chr17 15286576 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.033;DP=53;FS=7.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:239,0,1700 -chr17 15286815 . A T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr17 15286816 . C T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr17 15287741 . C A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.651;DP=60;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:698,0,1417 -chr17 15288627 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=3.121;DP=59;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.42;ReadPosRankSum=-2.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,10:59:99:230,0,4778 -chr17 15289310 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=2.420;DP=32;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:256,0,1678 -chr17 15297383 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=3.590;DP=31;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,802 -chr17 15298624 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.351;DP=104;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:499,0,3044 -chr17 15301621 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.117;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:336,0,239 -chr17 15306555 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=2.024;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:459,0,1651 -chr17 15306943 . TCTATAAAAAGGTTTAAAATAGATTTATTCAAGTGAAAATGGAAGCAAATGCAGAAAAGGTGGTTGATATCCATAC T 2159.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=2.350;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=26.06;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2197,178,0 -chr17 15312662 . T C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.442;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:525,0,1670 -chr17 15316495 . C G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-0.152;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:458,0,1350 -chr17 15317772 . TCTGCAAATAGACATTAACATGTATTCCCGTTTAATTGAGACTTTATCAGAAGTTCGCTTATCAAGTTACATAC T 1959.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=2.633;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.90;ReadPosRankSum=2.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,52:82:99:1997,0,1031 -chr17 15317774 . TGCAAATAGACATTAACA T 988.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-2.691;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:1026,0,3268 -chr17 15317794 . TATTCCCGTTTAATTGAGACTTTATCAGAAGTTCGCTTATCAAGTTACATACCTTGC T 988.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-2.681;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=12.06;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:1026,0,3179 -chr17 15320961 . C T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=2.889;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,26:106:99:570,0,3026 -chr17 15328222 . T C 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.594;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:859,0,1934 -chr17 15329150 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=2.110;DP=48;FS=5.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:246,0,1412 -chr17 15329384 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.708;DP=85;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:313,0,2687 -chr17 15332256 . A T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=1.418;DP=102;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:588,0,2645 -chr17 15332307 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=1.631;DP=72;FS=3.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:392,0,2431 -chr17 15344381 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-2.491;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:423,0,1244 -chr17 15345187 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.575;DP=69;FS=6.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:252,0,2151 -chr17 15378676 . T C 1016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;ClippingRankSum=1.015;DP=148;FS=23.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=6.87;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1839,0,1656 -chr17 15379290 . A AT 2427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-1.095;DP=372;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,122:343:99:2465,0,5298 -chr17 15500343 . A AG 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.560;DP=22;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:325,0,372 -chr17 15568024 . T A 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 -chr17 15752687 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.450;DP=58;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:627,0,1193 -chr17 15752763 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.287;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:352,0,2758 -chr17 15759903 . C A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-0.864;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:858,0,881 -chr17 15774709 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.037;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:895,0,923 -chr17 15785351 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.265;DP=60;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:271,0,1769 -chr17 15786936 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.236;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:400,0,1939 -chr17 15805371 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.926;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:440,0,718 -chr17 15806676 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=35.66;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:46:430,0,46 -chr17 15923135 . A G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.614;DP=78;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,23:78:99:583,0,2080 -chr17 15938921 . T A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=2.476;DP=176;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,43:176:99:993,0,5141 -chr17 15940949 . A T 2135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.647;DP=186;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,67:186:99:2164,0,4092 -chr17 15941722 . GGGTAAGCATCACAAACATGACAATAACCTAACAGCAGTGTCTAACCAACACATTCTGGTAAACATTCACATGGGTTTGTTCTTGCA G 5779.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=2.275;DP=141;FS=3.012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=33.31;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,125:127:99:5817,519,0 -chr17 15944483 . C T 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.866;DP=173;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,50:173:99:1268,0,4593 -chr17 15948796 . G T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.773;DP=126;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,40:126:99:1090,0,3308 -chr17 15949340 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=3.951;DP=118;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.37;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,26:118:99:544,0,3742 -chr17 15950733 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:233,0,106 -chr17 16033942 . A T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=-0.278;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=15.07;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:601,0,680 -chr17 16034742 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.204;DP=38;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:354,0,973 -chr17 16034772 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.435;DP=34;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:281,0,926 -chr17 16097379 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.205;DP=58;FS=2.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:462,0,1511 -chr17 16106193 . GAGGTGAACCTTCTTTTCCACTGAACCATTTCGCTGGAGGATGTCTGAGTGTGGTTTGATGCACTGTAACATTTATATATTGTTTTTTCTTGT G 2523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=1.237;DP=56;FS=3.332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=33.90;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2561,222,0 -chr17 16115581 . CAAGGTAAGCTTCTATGGGGAAAAACAAGACACATGGTAGACCACAGGAAATAGGGAGTTAATAACACAGGAAATAACCTTTGATATTCAATTTGCTTATGG C 1782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.195;DP=42;FS=2.236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:99:1820,189,0 -chr17 16119565 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-2.036;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.780;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:396,0,1361 -chr17 16119834 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=2.631;DP=64;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:333,0,3084 -chr17 16119963 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.831;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:531,0,1250 -chr17 16122168 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.303;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:288,0,1233 -chr17 16123458 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.280;DP=49;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:663,0,2281 -chr17 16123464 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.321;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:663,0,2296 -chr17 16123707 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.359;DP=39;FS=8.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:305,0,1455 -chr17 16124607 . C CT 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.372;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:301,0,1784 -chr17 16124704 . TA T 819.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.094;DP=31;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:31:874,0,31 -chr17 16139652 . CCA C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,126 -chr17 16604241 . A G 642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:671,48,0 -chr17 16633533 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-2.159;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:275,0,2398 -chr17 16634011 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.186;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:576,0,904 -chr17 16645048 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.448;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:256,0,3584 -chr17 16645494 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-0.377;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:359,0,609 -chr17 16646467 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.887;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:235,0,1154 -chr17 16646605 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=1.822;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:297,0,894 -chr17 17271325 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.979;DP=27;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:333,0,577 -chr17 17272073 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=-0.178;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:508,0,603 -chr17 17730434 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:275,0,216 -chr17 17855688 . C A 644.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.542;DP=18;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=30.50;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14:673,14,0 -chr17 17859330 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:235,0,639 -chr17 17899485 . G T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.100;DP=56;FS=4.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:455,0,2981 -chr17 17899490 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.529;DP=50;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:455,0,2981 -chr17 17900844 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=1.445;DP=47;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:250,0,1367 -chr17 18009870 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.172;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:335,0,1002 -chr17 19254080 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.619;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:453,0,1863 -chr17 19311643 . C CA 1115.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.319;DP=249;FS=12.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,72:236:99:1153,0,4440 -chr17 19979848 . AACCTGAGATGAAAACATTGAATATGACAACCTTTTTTTAACAGATCATTATTGCAACTGGTGGATTGGTTTTCTAAAGACTAAAAGCATCTGATTT A 9345.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.187;DP=204;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,202:204:99:9383,803,0 -chr17 19983639 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,417 -chr17 19983648 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-2.148;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=30.58;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:334,0,417 -chr17 19984031 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-2.362;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:299,0,660 -chr17 19986994 . G A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=-0.443;DP=254;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=3.17;ReadPosRankSum=3.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,52:254:99:834,0,7624 -chr17 19987283 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=1.380;DP=221;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=1.78;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,36:221:99:422,0,7089 -chr17 20014463 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:245,0,63 -chr17 20062679 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.122;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:331,0,1248 -chr17 20073737 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=-1.961;DP=202;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=4.27;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,44:202:99:891,0,6329 -chr17 20352044 . T A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-1.659;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:448,0,450 -chr17 20504317 . T G 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.207;DP=111;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,28:111:99:618,0,3347 -chr17 20505008 . C G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.417;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:502,0,4814 -chr17 20545073 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-1.195;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.73;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:426,0,522 -chr17 20545493 . C A 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.892;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:416,0,442 -chr17 20545582 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-1.359;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:229,0,363 -chr17 20549220 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.214;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=4.16;ReadPosRankSum=2.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:303,0,2841 -chr17 20549401 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-0.662;DP=48;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:250,0,1419 -chr17 20550286 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-0.690;DP=69;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:453,0,1925 -chr17 20550613 . A T 1245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=-1.921;DP=100;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1274,0,2248 -chr17 20555284 . G C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.843;DP=63;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:753,0,1504 -chr17 20618151 . A T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.641;DP=111;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,29:111:99:710,0,3179 -chr17 20626145 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.144;DP=132;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=3.57;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,28:132:99:499,0,3914 -chr17 20626268 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.242;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,27:109:99:601,0,3139 -chr17 20759354 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.502;DP=229;FS=13.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,46:228:99:334,0,13977 -chr17 20819973 . ACTGACCCAAACACATACACACATAAAGATAAAGGCAGAAATAATCACTAATTTCTTGCTTAAAGTTTAGAAAGAATCTCTATAGTCTTAC A 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,1254 -chr17 20822704 . GCCTGAAAAATGTTCACACAGGACATTGTGAGTGAGATTTAGTCTGTGCAGAGTTGTGAGTACAGTGTTTGCACATGAGCATATAAA G 748.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=1.857;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=29.33;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:99:786,0,448 -chr17 21086860 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=-0.742;DP=34;FS=8.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:257,0,1849 -chr17 21086866 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=-0.317;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:257,0,1849 -chr17 21158106 . GCTGGAGGGGAAGGGTTGAAAAGTTAAACAAGTGATCTGACTCAGGGGACGAAGAAAATGTGCTCGAGTAAGTGCGCATGCGTGTGTGTGACTGAC G 659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.262;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=34.72;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:56:697,0,56 -chr17 21705704 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.036;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,140 -chr17 21705900 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr17 21735767 . A C 1839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.515;DP=78;FS=6.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=23.59;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,55:78:99:1868,0,544 -chr17 21741962 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=1.169;DP=99;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,31:98:99:648,0,2441 -chr17 21749703 . G A 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.058;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:1036,0,2144 -chr17 21782829 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.997;ClippingRankSum=-0.666;DP=98;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:304,0,2725 -chr17 21799645 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.248;DP=63;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:280,0,1931 -chr17 22376152 . G A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.493;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,48:158:99:1219,0,4046 -chr17 22377627 . T C 1300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;ClippingRankSum=-4.483;DP=186;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=6.99;ReadPosRankSum=2.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,49:186:99:1329,0,5221 -chr17 22377764 . C T 6345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.760;DP=294;FS=3.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=21.58;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,143:294:99:6374,0,10227 -chr17 22377798 . A G 6345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.280;DP=266;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,123:266:99:6374,0,10306 -chr17 22412353 . GAGGTATTTATTTGATCTCGTAAAGCATCAGACAACATATGATTTTTGAGTAGGTGTGCCCACATTTCAATTATTACATTTTTCCCCAAAT G 753.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=2.415;DP=158;FS=3.033;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:791,314,0 -chr17 22414862 . G A 2170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.549;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:2199,0,2402 -chr17 22417576 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-0.427;DP=53;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:706,0,1089 -chr17 22437520 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=2.824;DP=50;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:788,0,937 -chr17 22449152 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.571;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1066,0,893 -chr17 22449259 . T G 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.713;DP=66;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:812,0,2295 -chr17 22451490 . G A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.311;DP=70;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1238,0,1218 -chr17 22453045 . T A 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.707;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:950,0,1049 -chr17 22460365 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.565;DP=62;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:515,0,1732 -chr17 22479853 . C T 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-1.277;DP=95;FS=10.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,36:95:99:1203,0,1974 -chr17 22480656 . C A 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=1.552;DP=80;FS=11.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:1193,0,1453 -chr17 22482814 . T A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=-0.014;DP=85;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:931,0,1817 -chr17 22483506 . C T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.831;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:1073,0,2040 -chr17 22499075 . C T 2172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.596;DP=150;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:2201,0,2759 -chr17 22517423 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=2.443;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:327,0,1309 -chr17 22517424 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=2.749;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:282,0,1400 -chr17 22517744 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.175;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=17.24;ReadPosRankSum=2.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:597,0,542 -chr17 22559811 . G A 1674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.631;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1703,0,1723 -chr17 22612668 . G A 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.382;DP=45;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:1006,0,1469 -chr17 22634949 . A T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.859;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:679,0,772 -chr17 22635031 . G A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=-0.138;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:934,0,1011 -chr17 22787079 . G A 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.680;ClippingRankSum=0.206;DP=81;FS=7.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,47:81:99:1559,0,1065 -chr17 22882553 . G A 1293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-0.939;DP=73;FS=7.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:73:99:1322,0,1139 -chr17 22905123 . C T 1613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.324;DP=85;FS=5.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,48:85:99:1642,0,1326 -chr17 22933051 . T A 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.735;DP=70;FS=6.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=21.68;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:1546,0,842 -chr17 22946360 . G A 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-1.265;DP=68;FS=5.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,46:68:99:1700,0,572 -chr17 22947224 . CT C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.935;DP=16;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,477 -chr17 23022874 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=1.796;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:365,0,442 -chr17 23030336 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:324,0,384 -chr17 23032180 . C A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:255,0,300 -chr17 23034137 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:268,0,400 -chr17 23042638 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.298;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:294,0,661 -chr17 23050525 . T A 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=-1.195;DP=91;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:1652,0,1535 -chr17 23062438 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.939;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:327,0,659 -chr17 23295272 . TGTAAGAATGCAAGAAACTAATAAAGTGATGATGGCTTGATATTTTTCACATGATATAGCATCATGTCTTGTTTTTTTTTTAG T 1961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=1.657;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=28.57;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1999,173,0 -chr17 23296899 . AAGGTAGCACAGATGGCTGATGTGACTGTAACATCAGAGCTACAAGAACATCATCATGACTCTCTTTTTATTCCATAATTCTGAGATTCAATATGTTTATCACATATTCGT A 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=1.265;DP=29;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=28.09;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:852,0,2310 -chr17 23405580 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.489;DP=19;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:287,0,371 -chr17 23481367 . G A 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.391;DP=228;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,51:227:99:1046,0,6697 -chr17 23541309 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.860;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:255,0,817 -chr17 23757861 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=-0.138;DP=43;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:567,0,905 -chr17 23794682 . C CT 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.111;DP=175;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,32:152:99:304,0,3195 -chr17 23908532 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.684;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:313,0,360 -chr17 24150922 . C T 1454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.318;DP=95;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=15.31;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:1492,0,1725 -chr17 24151930 . G C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-0.888;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:230,0,599 -chr17 24272058 . G A 2146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.937;DP=157;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=13.67;ReadPosRankSum=2.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,61:156:99:2175,0,3329 -chr17 24274795 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=27.68;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:305,0,336 -chr17 24400858 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:280,0,297 -chr17 24428752 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.234;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:523,0,880 -chr17 24429427 . G A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=-2.029;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1089,0,1061 -chr17 24429928 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.027;DP=52;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:834,0,930 -chr17 24431289 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,222 -chr17 24436018 . T C 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=1.023;DP=117;FS=8.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1782,0,2184 -chr17 24436149 . T C 1737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.170;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=16.55;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1766,0,1848 -chr17 24440711 . A ATT 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=-0.199;DP=50;FS=10.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:513,0,772 -chr17 24445956 . T C 7045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-1.438;DP=472;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=14.93;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,200:470:99:7074,0,9144 -chr17 24459209 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:302,0,325 -chr17 24471601 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-0.214;DP=32;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:419,0,711 -chr17 24491233 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.669;DP=31;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:408,0,663 -chr17 24493147 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-1.588;DP=58;FS=4.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:485,0,1512 -chr17 24513002 . T A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=-0.448;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.355;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:717,0,1357 -chr17 24515821 . T G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-1.171;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,40:235:99:571,0,11159 -chr17 24518276 . C T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-1.145;DP=323;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,69:323:99:1248,0,9866 -chr17 24550706 . A G 2615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-1.221;DP=167;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:167:99:2644,0,3041 -chr17 24554742 . C T 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-3.098;DP=92;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:858,0,2372 -chr17 24645793 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=1.197;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:280,0,701 -chr17 24648201 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-2.646;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=13.60;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:545,0,895 -chr17 24663103 . C A 3094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=-2.438;DP=190;FS=1.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=16.29;ReadPosRankSum=2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,85:190:99:3123,0,3549 -chr17 24663315 . A T 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.536;DP=161;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,47:160:99:1088,0,4339 -chr17 24663479 . C A 2794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-1.392;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=17.69;ReadPosRankSum=2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:2823,0,2648 -chr17 24674293 . C CT 305.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:8:342,8,0 -chr17 24683970 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=1.077;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:479,0,1371 -chr17 24684245 . C G 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.659;DP=81;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:678,0,2352 -chr17 24715323 . T A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-1.561;DP=143;FS=6.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,35:143:99:780,0,4162 -chr17 24718942 . A T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=3.085;DP=56;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:966,0,845 -chr17 25015829 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.317;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,394 -chr17 25052705 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.492;DP=28;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:234,0,726 -chr17 25180525 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=2.276;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:291,0,978 -chr17 25182991 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.017;DP=37;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:310,0,970 -chr17 25185116 . G C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr17 25185117 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr17 25233704 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,149 -chr17 25236872 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.757;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:477,0,1809 -chr17 25236875 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.907;DP=37;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:477,0,1799 -chr17 25236970 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.564;DP=37;FS=21.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:657,0,593 -chr17 25270724 . CT C 599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-2.117;DP=81;FS=0.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:637,0,1081 -chr17 25271119 . CA C 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-0.024;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:268,0,843 -chr17 25271911 . C CT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-1.370;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:451,0,1139 -chr17 25277446 . A C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=3.692;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,31:205:99:264,0,6749 -chr17 25281483 . G GT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.417;DP=142;FS=19.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=1.41;ReadPosRankSum=-2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,15:138:99:238,0,3417 -chr17 25286310 . G A 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=-3.330;DP=282;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,64:281:99:1168,0,9630 -chr17 25286447 . A G 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.528;DP=408;FS=12.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,91:407:99:1729,0,11890 -chr17 25372389 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.678;DP=59;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:421,0,1639 -chr17 25391537 . A G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-1.387;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:536,0,1002 -chr17 25452585 . G T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=-0.087;DP=81;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:641,0,2137 -chr17 25463363 . AGCCTTTCAGTCAATCAGACATTTTATTAGAATAGATTTTAAACATTTCTAAAGTGTCTTTGTTAGCATGTGTGAGTGATTGACTT A 294.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=2.368;DP=63;FS=3.085;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=4.68;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:332,128,0 -chr17 25468998 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.062;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:306,0,4359 -chr17 25477857 . G A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.586;DP=223;FS=3.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,53:223:99:1064,0,9420 -chr17 25478015 . C A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.323;DP=268;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,61:268:99:758,0,15508 -chr17 25478369 . C T 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.163;DP=260;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,70:260:99:1662,0,7410 -chr17 25478530 . C A 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.470;DP=274;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,56:274:99:1050,0,8666 -chr17 25481119 . GACCTTGATGGACACGAGAGAGACATAAAAGTCAGAAAAAGAGAATGCAATAGTATTTTTTTGACCCAGTTGCTCCATTTTATCAGGCCACAAATCACTTCAATAAAACTATCCGTTGTTCATTCACTTGTTCTC G 14042.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.265;DP=364;FS=4.816;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,341:345:99:14080,1016,0 -chr17 25667524 . ACTGTAACACAAGAGCACAGAGAAAGATGAACAAGCCTGTGCCCATTTTGATTACTTTGCTTTTAAATTAAACTTAC A 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.935;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=24.58;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:518,0,317 -chr17 25715688 . G GGGCCC 1313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=1.267;DP=71;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:1351,0,1555 -chr17 25716124 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.115;DP=71;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:298,0,2020 -chr17 25728714 . GT G 916.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-1.062;DP=67;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,43:56:99:1039,0,235 -chr17 25729219 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.307;DP=41;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=12.65;ReadPosRankSum=-1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:547,0,926 -chr17 25729293 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-0.960;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:288,0,918 -chr17 26320453 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=1.074;DP=38;FS=7.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:456,0,840 -chr17 26323428 . A C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.833;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:837,0,440 -chr17 26343801 . T A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.071;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=21.11;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:746,0,433 -chr17 26346462 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:365,0,309 -chr17 26426825 . G T 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.704;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=14.88;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:951,0,1203 -chr17 26484462 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.989;DP=61;FS=7.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:377,0,1559 -chr17 26511773 . C A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=-0.472;DP=29;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:516,0,379 -chr17 26531315 . C T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.173;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:1110,0,1429 -chr17 26532268 . G A 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=1.331;DP=76;FS=6.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1178,0,1470 -chr17 26554824 . GA G 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.650;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.329;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:487,0,443 -chr17 26555002 . G A 4960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-2.760;DP=313;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,137:311:99:4989,0,5637 -chr17 26586131 . G A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.787;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:530,0,150 -chr17 26586195 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:288,0,217 -chr17 26623732 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.511;DP=145;FS=7.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,33:145:99:666,0,4256 -chr17 26632668 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.961;DP=193;FS=5.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,37:193:99:611,0,5987 -chr17 26632686 . A C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.131;DP=202;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,40:202:99:652,0,6208 -chr17 26654167 . CT C 1360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.510;ClippingRankSum=-1.046;DP=100;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,56:89:99:1398,0,552 -chr17 26655062 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.299;DP=58;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:325,0,1633 -chr17 26770747 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.662;DP=41;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:279,0,1236 -chr17 27193560 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.961;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:337,0,448 -chr17 27193821 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.857;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:315,0,346 -chr17 27194232 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.364;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:364,0,419 -chr17 27866565 . T C 250.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:5:278,0,5 -chr17 27866925 . G T 8715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=2.115;DP=235;FS=12.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=37.32;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,167:235:99:8744,0,1066 -chr17 27866991 . GTT G 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-1.867;DP=140;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=2.48;ReadPosRankSum=3.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:932,0,3431 -chr17 27867085 . G A 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.572;DP=55;FS=10.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=34.89;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1947,0,467 -chr17 27867114 . T TG 3036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,80:80:73:3074,0,73 -chr17 27867277 . C CA 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=-1.677;DP=179;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=2.01;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,40:167:99:397,0,3320 -chr17 27867773 . AC A 1451.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.952;ClippingRankSum=0.553;DP=243;FS=5.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,70:221:99:1489,0,10979 -chr17 27867796 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-1.766;DP=200;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,53:200:99:1503,0,10979 -chr17 27868024 . TA T 1413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-2.042;DP=162;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=8.73;ReadPosRankSum=-3.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,13:149:99:1451,0,6984 -chr17 27868102 . T G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.931;DP=239;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,57:239:99:524,0,10397 -chr17 27868126 . GA G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-1.691;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,66:266:99:271,0,8696 -chr17 27868235 . G GT 940.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=-0.323;DP=314;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,81:287:99:978,0,5053 -chr17 27868508 . C CTT 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.519;DP=263;FS=8.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,48:232:99:721,0,6739 -chr17 27868658 . T A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=1.347;DP=217;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,39:217:99:415,0,8089 -chr17 27868889 . C A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.255;DP=236;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,49:236:99:934,0,7377 -chr17 27869111 . G A 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-1.235;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,61:277:99:1167,0,8190 -chr17 27869609 . G GT 2055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;ClippingRankSum=-0.907;DP=268;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.226;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,76:258:99:2093,0,12603 -chr17 27869612 . A T 2049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.555;DP=266;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,77:266:99:2078,0,12603 -chr17 27870256 . A T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=1.051;DP=75;FS=13.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:642,0,1977 -chr17 27870364 . T C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-1.747;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,29:116:99:691,0,3409 -chr17 27871899 . A G 1384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1413,96,0 -chr17 27871995 . C T 1974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2003,138,0 -chr17 27872332 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=2.242;DP=84;FS=4.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=2.39;ReadPosRankSum=-2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,15:84:99:229,0,5288 -chr17 27872337 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=1.612;DP=82;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,13:82:99:236,0,5288 -chr17 28129815 . TTGTGTGTG T 387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:40:425,40,0 -chr17 28130417 . CT C 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.849;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:884,0,184 -chr17 28143861 . A AT 1139.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=-1.280;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1177,0,1182 -chr17 28157057 . C T 2056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=2.394;DP=393;FS=5.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,95:393:99:2085,0,11470 -chr17 28157777 . T TA 341.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:379,39,0 -chr17 28669124 . GCCTGCTGTCAAACAAATGATGGGGGACAAATAAAAAAAGTGGAAATATACTCATTTCTTTATATTGTGTCTTTTCTGAACACACATTA G 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=1.856;DP=33;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.20;ReadPosRankSum=-2.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:275,0,5429 -chr17 28669128 . GCTGTCAAACAAATGATGGGGGACAAATAAAAAAAGTGGAAATATACTCATTTCTTTATATTGTGTCTTTTCTGAACACACATTAC G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=2.399;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:271,0,5172 -chr17 28680437 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=1.513;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1387 -chr17 28680440 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=1.010;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:237,0,1387 -chr17 28681764 . TGGTATGAAAGTTACTGTGCTTTTCTGTGCCAAGTTGAAAAATAAAAGTGGATATGCATATATATTTTTTATGTATGTGGATCTCTTCAAAGAATCTCCCTGTGTTTTCAACA T 1435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=2.023;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=27.50;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:99:1473,130,0 -chr17 28694532 . GGGTAAGAAACTAGGCCAATATTTAGGTCTCCTTGGGTTGGATATTGAGTCTGGTGTATTAAATGTGTCCCATGTTTCTGTCA G 1520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=1.994;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=27.53;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,36:38:99:1558,0,664 -chr17 28727737 . C T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.326;DP=54;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:622,0,1195 -chr17 28734318 . G A 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.440;DP=205;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,55:205:99:1215,0,5840 -chr17 28748092 . C T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.729;DP=164;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,40:164:99:894,0,4820 -chr17 28797601 . AAGGTGAGCACTGTGCGTCTTGAGTATTATGCTAAATAAGGGTTTTTATTTTGTCAACTGATGTCTTCATTTTCCGTCTTTC A 7669.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=1.165;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:7707,686,0 -chr17 28797823 . G GCGCTATTCCTTT 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.042;DP=174;FS=5.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,36:162:99:537,0,8227 -chr17 28798005 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.114;DP=205;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,37:204:99:558,0,6512 -chr17 29336125 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.860;DP=30;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:249,0,763 -chr17 29426518 . CCAGGTTTGATTATTACTATGCAGAAAATTAGGAAAAGCAGTTTAGTTTCTCAGGCTAAAATAATGTTACCTGTTTG C 1373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=1.577;DP=41;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=33.51;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,38:41:99:1411,0,276 -chr17 29428224 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.546;DP=41;FS=7.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:331,0,1056 -chr17 29428299 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.566;DP=58;FS=4.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:243,0,1802 -chr17 29857032 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.656;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:322,0,535 -chr17 30470414 . TGGTGAGACCATCAAGACAATCGTGCAGTAAATTTAAGTTGAATGTTATGGTATACATTTAAGTAGCTAAGTATTATTAAAATCATCTTTACCTCTTTA T 1099.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.580;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:96:1137,96,0 -chr17 30525139 . AAGGTGAGACTATTCAAGACAAATGTCTGTGGCGATAGGGTACACTTGGCTTGACAAATGCAAAAATAAAAGTACCCAGTGTAAACTGCAAAATCTCTATC A 1254.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=1.255;DP=29;FS=3.832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:98:1292,98,0 -chr17 30765774 . C CT 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.300;DP=307;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,50:293:99:273,0,6760 -chr17 30785564 . TGGTAAGTGGGTAATAATTATTAGTCAGTCATTTGTAGAGCCTATTAAAAATAAATTAACTAAAAGTTTGTATGGTTTATCCA T 11649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.446;DP=241;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=34.43;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,238:241:99:11687,977,0 -chr17 30919537 . ACG A 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=19.52;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:252,0,145 -chr17 30960475 . GCTAAAAAAAAAAAGATAACATTGTTAACATTTGCAAGATATGAAAAACTTTTTTTTAAATAATCCTGGATTCCTCAAAACCTAC G 3170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=1.731;DP=78;FS=5.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=27.73;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,71:78:99:3208,284,0 -chr17 31038221 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-1.322;DP=57;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:298,0,1673 -chr17 31038575 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.774;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:450,0,1655 -chr17 31039470 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.202;DP=72;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:252,0,2284 -chr17 31080741 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.774;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:424,0,2091 -chr17 31080777 . G C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.992;DP=69;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:274,0,2116 -chr17 31117991 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=1.360;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:245,0,1276 -chr17 31691545 . AACCTGAAATTTCATTAAATACAATCGTTTGTAACTGTTAGCTACTCTCAATGTTTCAACACCTAAACGACAAAACAAATCAACTT A 1876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=1.955;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1914,177,0 -chr17 31777797 . AACCTGAATAAAAAACACACCGGTCATAAATGGACACAATATGTATTATTTAATATGTGATCTTATTATCTTTTCAAT A 790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.561;DP=23;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=34.38;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:64:828,64,0 -chr17 31855258 . C CT 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.908;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:397,0,386 -chr17 31865115 . T A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:460,0,455 -chr17 31865209 . C G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=-1.466;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=25.52;ReadPosRankSum=2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:360,0,124 -chr17 31865317 . A T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.179;DP=40;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:534,0,810 -chr17 31871525 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=1.823;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:378,0,322 -chr17 31890689 . T A 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:726,51,0 -chr17 32572039 . C CA 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=-0.473;DP=62;FS=3.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:383,0,2082 -chr17 32574146 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.023;DP=67;FS=4.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:265,0,2025 -chr17 32614359 . G T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.546;DP=86;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1012,0,1842 -chr17 32614434 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.665;DP=63;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:290,0,1832 -chr17 32706206 . A AT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=3.169;DP=59;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=3.50;ReadPosRankSum=-3.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:244,0,1094 -chr17 32725506 . G T 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.352;DP=399;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,105:397:99:2216,0,11278 -chr17 32730075 . G A 1959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-1.314;DP=353;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,96:352:99:1988,0,11552 -chr17 32737847 . G T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.278;DP=38;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:649,0,685 -chr17 32755229 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=1.289;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:272,0,760 -chr17 32928776 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.941;DP=49;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:365,0,1470 -chr17 32928864 . T G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.937;DP=91;FS=2.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:439,0,3619 -chr17 32938220 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.216;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:99:230,0,1405 -chr17 32939057 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=-1.591;DP=98;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.139;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:348,0,3054 -chr17 32942058 . T G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.650;DP=75;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:317,0,2288 -chr17 32943226 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=1.148;DP=76;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:264,0,2389 -chr17 32958893 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=0.229;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:499,0,4275 -chr17 32984977 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.581;DP=97;FS=10.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:464,0,2830 -chr17 33068102 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.115;DP=73;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:333,0,2261 -chr17 33071583 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.164;DP=74;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:434,0,2006 -chr17 33578841 . GA G 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-0.505;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:49:309,0,49 -chr17 33591864 . G C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.054;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:424,0,471 -chr17 33618587 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.269;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:398,0,1985 -chr17 33628301 . A G 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.897;DP=258;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,62:258:99:1323,0,7583 -chr17 33628342 . A ACAGAG 6396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.564;DP=242;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,175:236:99:6434,0,1539 -chr17 33628578 . T C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-1.531;DP=190;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,41:189:99:772,0,5495 -chr17 33635636 . C T 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.642;DP=224;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,55:224:99:1191,0,8501 -chr17 33660042 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.103;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:244,0,1354 -chr17 33661714 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-0.486;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:691,0,2146 -chr17 33667600 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.790;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:245,0,2019 -chr17 33672081 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=-0.473;DP=57;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:302,0,1744 -chr17 33672232 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=1.565;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:340,0,1169 -chr17 33672516 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.008;DP=65;FS=4.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:251,0,2067 -chr17 33690593 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=1.455;DP=21;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:235,0,500 -chr17 33917412 . CCCTAAAGAAACAAACAGCTTCATAAATGTTCATCTCTAAAGCAACGTGATTAAAGCTGCTATTAGACTCA C 1429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=1.135;DP=42;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=34.04;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,38:42:99:1467,0,635 -chr17 34080965 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.572;DP=94;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,18:94:99:312,0,2936 -chr17 34092601 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.404;DP=67;FS=2.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:521,0,1819 -chr17 34110951 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=1.370;DP=113;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,27:113:99:597,0,3319 -chr17 34111407 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.354;DP=103;FS=3.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:328,0,3257 -chr17 34394618 . C T 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.853;DP=79;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:940,0,1831 -chr17 34406412 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=1.298;DP=54;FS=6.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:448,0,1501 -chr17 34406799 . G T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.707;DP=33;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:343,0,841 -chr17 34406988 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.762;DP=31;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:260,0,845 -chr17 34409334 . A C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.167;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:603,0,480 -chr17 34413733 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=-0.607;DP=202;FS=4.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,35:202:99:506,0,6570 -chr17 34416069 . G C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-1.441;DP=192;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,36:191:99:566,0,6017 -chr17 34416081 . G C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-1.784;DP=176;FS=4.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,31:175:99:472,0,5610 -chr17 34974350 . GT G,GTT 3925.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.594;DP=311;FS=5.337;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:39,168,63:270:99:4449,165,1303,3872,0,6225 -chr17 34977835 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=1.646;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:389,0,585 -chr17 35014921 . A C 254.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:283,0,17 -chr17 35264238 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.284;DP=71;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:291,0,1976 -chr17 35264333 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.635;DP=60;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.125;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:433,0,1455 -chr17 35264388 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.097;DP=54;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:378,0,1450 -chr17 35362751 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.293;DP=71;FS=18.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:255,0,2205 -chr17 35391060 . A C 897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:66:926,66,0 -chr17 35411006 . GCAGGTAACATTTGAATACGCTGTGCAGTTTGGCTAGCGATTCATACTCCTCTGACATTTATGTTTGTTTATGTTT G 2646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.696;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=30.42;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,71:75:99:2684,0,551 -chr17 35413513 . G A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.747;DP=70;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:525,0,3108 -chr17 35415240 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=-1.099;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:451,0,678 -chr17 35415254 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-1.438;DP=37;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:476,0,970 -chr17 35415857 . C T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr17 35416038 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.922;DP=27;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:348,0,1113 -chr17 35417563 . G C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.998;DP=103;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:584,0,2924 -chr17 35425466 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.140;ClippingRankSum=0.589;DP=112;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,19:112:99:292,0,3593 -chr17 36056555 . A G 2027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=-1.332;DP=316;FS=1.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,85:316:99:2056,0,9061 -chr17 37035338 . TG T 400.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.651;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=23.58;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:19:438,19,0 -chr17 37073441 . G A 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.698;DP=169;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,40:168:99:836,0,4957 -chr17 37077416 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-2.025;DP=269;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,44:269:99:491,0,12277 -chr17 37078377 . T A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=-2.795;DP=186;FS=17.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,38:186:99:700,0,5515 -chr17 37078616 . G T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.493;DP=177;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,40:177:99:839,0,5239 -chr17 37107011 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.082;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:244,0,694 -chr17 37107491 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.753;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:392,0,448 -chr17 37119108 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.851;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:391,0,803 -chr17 37126552 . C A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=1.068;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:303,0,786 -chr17 37129697 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.477;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,472 -chr17 37138238 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.117;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:232,0,1488 -chr17 37232006 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr17 37254155 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:265,0,230 -chr17 37379672 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.528;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:675,0,490 -chr17 37399081 . C T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-1.494;DP=67;FS=10.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=14.31;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:987,0,2364 -chr17 37402050 . G T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=1.119;DP=132;FS=5.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,35:132:99:846,0,3807 -chr17 37409222 . A C 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-3.940;DP=105;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:1731,0,3954 -chr17 37409251 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-1.733;DP=160;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:1044,0,5252 -chr17 37453918 . A T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr17 37528691 . G A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=1.343;DP=82;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=13.38;ReadPosRankSum=-2.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:1125,0,1644 -chr17 37529816 . C G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.35;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:239,0,59 -chr17 37530024 . T C 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-1.511;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=25.81;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:596,0,150 -chr17 37530092 . T A 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:803,60,0 -chr17 37530997 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.206;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:423,0,296 -chr17 37738389 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=-1.547;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=5.34;ReadPosRankSum=3.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:498,0,2314 -chr17 37958574 . G A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-1.123;DP=299;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,63:299:99:1214,0,9227 -chr17 37959211 . TA T 745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.829;ClippingRankSum=-0.042;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:783,0,1648 -chr17 37961259 . T C 2029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=-0.655;DP=324;FS=0.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,90:324:99:2058,0,8112 -chr17 38115579 . A C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-0.209;DP=43;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:267,0,4046 -chr17 38115584 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.412;DP=46;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:267,0,4046 -chr17 38133482 . G C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=1.594;DP=59;FS=14.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=6.23;ReadPosRankSum=2.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:396,0,1571 -chr17 38136225 . T A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.364;DP=50;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:457,0,1313 -chr17 38137249 . AGTAAACGCAGCTCTTTTCCTGTTTTTGTTTTTTTTGCCATTTGTTCTTGCCCATCTTACTGTGTTTCTGTCAG A 1057.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=1.453;DP=32;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=33.05;ReadPosRankSum=-1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1095,0,857 -chr17 38138169 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.516;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:305,0,2217 -chr17 38171648 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-3.007;DP=54;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:248,0,2930 -chr17 38171649 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-3.016;DP=53;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:248,0,2930 -chr17 38178740 . AGTAGAGAATAATAATAACAGACATAATACATTTCAGTCTGTTTGTTCTGTGCTGCAGGATGATTAAAGCAATGATTTGTGTTCATCTACTGGTGCAG A 2590.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=1.641;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:2628,222,0 -chr17 38186977 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-0.298;DP=59;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,11:58:99:254,0,1748 -chr17 38189860 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=1.823;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,986 -chr17 38192974 . CT C 399.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=24.99;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:437,17,0 -chr17 38193645 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,535 -chr17 38400058 . AT A 216.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr17 38400061 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr17 38620388 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:70:292,0,70 -chr17 38627063 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=8.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:365,0,698 -chr17 38631575 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-1.214;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:263,0,137 -chr17 38638974 . G T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-1.270;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:722,0,350 -chr17 38682831 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-1.248;DP=22;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:370,0,371 -chr17 38690262 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,289 -chr17 38692564 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.739;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:296,0,209 -chr17 38700990 . A C 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:412,30,0 -chr17 38704914 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,373 -chr17 38713070 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-0.270;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=20.43;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:641,0,1047 -chr17 38721407 . T C 297.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.00;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:325,0,12 -chr17 38751217 . T A 2059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.139;DP=154;FS=6.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,60:154:99:2088,0,3326 -chr17 38752278 . G A 1809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.749;DP=120;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1838,0,2434 -chr17 38754257 . G A 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=1.939;DP=136;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,50:134:99:1297,0,2836 -chr17 38755141 . T C 1964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.595;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,57:142:99:1993,0,4213 -chr17 38756139 . T C 2385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.432;DP=139;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:2414,0,2497 -chr17 38758499 . T A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=1.031;DP=152;FS=6.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,34:151:99:719,0,4638 -chr17 38759539 . A ACTCTG 2609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=1.595;DP=123;FS=3.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:99:2647,174,0 -chr17 38762311 . C A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.763;DP=181;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,46:180:99:984,0,5138 -chr17 38766752 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=1.549;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=15.46;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:492,0,1317 -chr17 38767593 . A C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=-2.316;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:790,0,1259 -chr17 38768248 . T A 1410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=1.020;DP=69;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1439,0,1087 -chr17 38770513 . A C 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.709;DP=20;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=30.44;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:75:637,0,75 -chr17 38772772 . T C 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.239;DP=51;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1045,0,688 -chr17 38822151 . A G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DP=38;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:467,0,932 -chr17 38822202 . A C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.537;DP=46;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:342,0,1275 -chr17 38823666 . GGT G 1448.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=1.990;DP=66;FS=3.112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:41:1486,41,0 -chr17 38825703 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.991;DP=46;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:366,0,1178 -chr17 38827004 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.310;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:317,0,1057 -chr17 38827076 . G T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.253;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:970,0,770 -chr17 38829346 . G A 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.166;DP=43;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=21.92;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:971,0,519 -chr17 38829628 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=-0.235;DP=61;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:723,0,1389 -chr17 38829650 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.081;DP=61;FS=7.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:1007,0,2505 -chr17 38830274 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-0.908;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,3:33:99:1088,0,2013 -chr17 38845824 . A G 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-1.462;DP=57;FS=11.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:948,0,1004 -chr17 38852838 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=1.109;DP=68;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:294,0,2016 -chr17 38856289 . G T 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=1.239;DP=53;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:705,0,1203 -chr17 38880242 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.905;DP=98;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,23:98:99:496,0,2761 -chr17 38880386 . C A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=-0.634;DP=132;FS=1.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,35:132:99:821,0,3686 -chr17 38880953 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.057;DP=82;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:953,0,1944 -chr17 38881013 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=1.299;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:718,0,2775 -chr17 38881520 . G C 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-2.418;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1257,0,1511 -chr17 38908281 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:380,0,205 -chr17 38917214 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.801;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:319,0,430 -chr17 38924229 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-0.724;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:233,0,734 -chr17 38928207 . C T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-1.278;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:437,0,414 -chr17 39090846 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.919;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:269,0,763 -chr17 39095783 . G GA 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-1.509;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:501,0,166 -chr17 39106212 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-0.588;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:408,0,676 -chr17 39108832 . G A 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.154;DP=48;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:762,0,807 -chr17 39128981 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.829;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:470,0,506 -chr17 39352305 . T G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.543;DP=30;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,797 -chr17 39896190 . A T 5995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=2.120;DP=218;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=27.50;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,149:217:99:6024,0,1617 -chr17 39899902 . ACAGGTACACACTTCTTCATTTAATAAAAAGGAGCTTTAATATTAGCAGATTTCTTATGGTTGAGGTGTATTTGCTTTATT A 11833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.699;DP=304;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,254:257:99:11871,1099,0 -chr17 39976237 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=1.087;DP=34;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:564,0,618 -chr17 40275629 . C T 2229.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2258,160,0 -chr17 40275844 . T G 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr17 40275891 . C T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr17 40276022 . T A 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:855,60,0 -chr17 40276136 . A T 1743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1772,129,0 -chr17 40276189 . C T 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-1.888;DP=47;FS=5.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:99:1305,0,231 -chr17 40576296 . T C 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.101;DP=37;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:763,0,393 -chr17 40576315 . A G 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.336;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=14.17;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:765,0,393 -chr17 40576440 . T G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:397,0,381 -chr17 40576616 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.899;DP=108;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:352,0,5358 -chr17 40576618 . T TA 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-3.203;DP=114;FS=3.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:500,0,2424 -chr17 40576623 . A C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.027;DP=109;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:429,0,4746 -chr17 40576735 . AT A 2326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-1.048;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=20.77;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:99:2364,0,269 -chr17 40576805 . A C 2218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.921;DP=148;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:2247,0,2446 -chr17 40576880 . C T 769.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:63:798,63,0 -chr17 40580865 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=2.180;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:236,0,130 -chr17 40581087 . A G 1846.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1875,135,0 -chr17 40581455 . G A 2446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=1.553;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=32.96;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2475,172,0 -chr17 40583214 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.980;DP=67;FS=6.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:246,0,2256 -chr17 41035392 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.482;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:487,0,497 -chr17 41048074 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=-0.996;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:566,0,441 -chr17 41061818 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=27.85;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:446,0,306 -chr17 41061827 . T C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=29.84;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:446,0,306 -chr17 41091448 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:256,0,147 -chr17 41317974 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.500;DP=102;FS=6.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:870,0,2567 -chr17 41432203 . G A 2139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.372;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:2168,0,2077 -chr17 41439571 . G A 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.856;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=17.94;ReadPosRankSum=2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1248,0,1019 -chr17 41439707 . T TAC 2195.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.216;DP=110;FS=2.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=19.96;ReadPosRankSum=-2.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,68:100:99:2304,0,773 -chr17 41440497 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.218;DP=91;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:452,0,2727 -chr17 41441920 . G A 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.313;DP=122;FS=7.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:1083,0,6492 -chr17 41441921 . T A 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=-1.399;DP=125;FS=7.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,38:123:99:1083,0,6492 -chr17 41442220 . GA G 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.673;DP=127;FS=8.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,44:120:99:910,0,1186 -chr17 41442420 . A G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.453;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:486,0,1847 -chr17 41442733 . AAT A 2582.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=124;FS=4.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:2620,0,2014 -chr17 41443121 . TA T 440.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-1.149;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:23:478,0,23 -chr17 41581554 . A T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-0.276;DP=71;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:394,0,2043 -chr17 41591712 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.825;DP=50;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=17.54;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:905,0,897 -chr17 41592085 . G GC 1567.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1605,128,0 -chr17 41593038 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-1.394;DP=68;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:910,0,2407 -chr17 41618611 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=2.470;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:673,0,624 -chr17 41686985 . C A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.058;DP=45;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:894,0,640 -chr17 41699505 . T A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=1.401;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:685,0,1355 -chr17 41746793 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.802;DP=40;FS=6.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=15.34;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:642,0,1089 -chr17 41746820 . C T 841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=-0.379;DP=46;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=18.30;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:879,0,696 -chr17 41748759 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.456;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:768,0,718 -chr17 41759899 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-1.179;DP=43;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,9:43:99:296,0,2674 -chr17 41759902 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=-2.092;DP=45;FS=5.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=5.95;ReadPosRankSum=-2.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:296,0,2674 -chr17 41771535 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.122;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:422,0,656 -chr17 41775282 . A G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.381;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:625,0,663 -chr17 41782785 . G A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.098;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1242,0,460 -chr17 41782825 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.347;DP=42;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:998,0,477 -chr17 41785082 . A T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.177;DP=39;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:952,0,444 -chr17 41801400 . T A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=-0.751;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=26.81;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1503,0,403 -chr17 42120322 . A T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.613;DP=35;FS=10.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:577,0,649 -chr17 42134832 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=1.415;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:355,0,250 -chr17 42160856 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.025;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:397,0,811 -chr17 42161755 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,279 -chr17 42392214 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.337;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:328,0,586 -chr17 42623711 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.244;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:401,0,282 -chr17 42699053 . A G 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=-0.244;DP=29;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:588,0,471 -chr17 42699194 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:556,0,39 -chr17 42973078 . GA G 716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=-0.869;DP=71;FS=0.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,27:70:99:754,0,1199 -chr17 42973154 . C T 3011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.821;ClippingRankSum=0.132;DP=129;FS=2.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=23.35;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,81:116:99:3040,0,977 -chr17 42973799 . A G 808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:60:837,60,0 -chr17 42973806 . C T 764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.520;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:793,57,0 -chr17 42974715 . G T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.295;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:1520,0,1538 -chr17 42974786 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-1.631;DP=123;FS=6.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:661,0,2731 -chr17 42974932 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=4.367;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=13.81;ReadPosRankSum=-2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:401,0,525 -chr17 42974993 . A G 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.318;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=19.48;ReadPosRankSum=-2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:632,0,186 -chr17 42975054 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr17 42975326 . A T 2338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=1.795;DP=100;FS=20.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=23.39;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,62:79:99:2367,0,533 -chr17 42975359 . CA C 715.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-2.614;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=17.04;ReadPosRankSum=2.614 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:25:753,25,0 -chr17 42975466 . T A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr17 42976041 . TA T,TAA 831.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=-1.325;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,20,13:34:99:876,371,922,572,0,1559 -chr17 42976053 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=1.606;DP=42;FS=56.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.61;ReadPosRankSum=-3.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:474,0,1370 -chr17 42976096 . C G 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:454,33,0 -chr17 42976312 . G A,T 629.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,14,2:16:87:666,87,170,627,0,1294 -chr17 42976313 . A T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.315;DP=23;FS=12.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=23.95;ReadPosRankSum=2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:579,0,173 -chr17 42976396 . T TA 914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-1.733;DP=47;FS=5.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=19.46;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:87:952,87,0 -chr17 42976767 . A T 536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:565,39,0 -chr17 42977070 . A G 395.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:6:423,0,6 -chr17 42977444 . G T 3427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3456,241,0 -chr17 42977594 . C A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 -chr17 42977598 . A C 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 -chr17 42977758 . A G 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=2.743;DP=46;FS=8.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=25.76;ReadPosRankSum=-2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:30:1213,0,30 -chr17 42977926 . G T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.318;DP=37;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:686,0,539 -chr17 42977977 . C G 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.093;DP=62;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1394,0,427 -chr17 42977987 . CT C 2638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2676,197,0 -chr17 42978187 . T C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr17 42978188 . C T 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr17 42978230 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.238;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:238,0,454 -chr17 42978550 . T G 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=2.815;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=30.44;ReadPosRankSum=-2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:49:1459,0,49 -chr17 42978551 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=2.815;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.274;QD=30.44;ReadPosRankSum=-2.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:49:1459,0,49 -chr17 42978652 . C G 1492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1521,108,0 -chr17 42978667 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=-4.292;DP=39;FS=5.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.10;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:266,0,1085 -chr17 42979148 . C A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.171;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:58:925,0,58 -chr17 42979163 . C A 2370.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2399,169,0 -chr17 42980014 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-1.003;DP=35;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=8.65;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,144 -chr17 42980470 . T C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr17 43052737 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.785;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,488 -chr17 43057165 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.344;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:379,0,2493 -chr17 43066491 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=3.510;DP=18;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.82;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,398 -chr17 43075139 . T TA 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.488;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.138;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:394,0,614 -chr17 43075258 . C T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=-5.093;DP=257;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,56:257:99:1147,0,7870 -chr17 43076137 . GCCTGTAAGATGAAAGTGGAAATTATATACAAATATACAATTCAAGTAAAAAATAAATAAATTGAAATTGTTAAATATACAAACTTGATAAAAATAAAGACTTA G 5984.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-1.236;DP=383;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.984;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,174:371:99:6022,0,8628 -chr17 43076139 . CTGT C 6780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.936;DP=373;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,192:371:99:6818,0,8812 -chr17 43076143 . AAGATGAAAGTGGAAATTATATACAAATATACAATTCAAGTAAAAAATAAATAAATTGAAATTGTTAAATATACAAACTTGATAAAAATAAAGACTTACCG A 6780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.203;DP=379;FS=4.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.807;QD=17.89;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,193:377:99:6818,0,8812 -chr17 43338786 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.88;ReadPosRankSum=2.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:296,0,353 -chr17 43338991 . T TA 419.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:457,45,0 -chr17 43339761 . T G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=2.001;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=23.26;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:447,0,122 -chr17 43341716 . C T 2225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.375;DP=29;FS=4.210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=24.48;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:99:2254,160,0 -chr17 43342103 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.116;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:292,0,500 -chr17 43342324 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.531;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:316,0,355 -chr17 43342855 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=1.851;DP=50;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:248,0,1446 -chr17 43461293 . C A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.488;DP=62;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:856,0,1255 -chr17 43465868 . C T 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.862;DP=58;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=24.55;ReadPosRankSum=2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,39:58:99:1452,0,603 -chr17 43465940 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=2.317;DP=39;FS=5.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:230,0,2326 -chr17 43465943 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=2.444;DP=41;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:230,0,2326 -chr17 43467847 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.746;DP=89;FS=5.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,29:89:99:783,0,2245 -chr17 43475751 . G A 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.257;DP=36;FS=7.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.182;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:742,0,524 -chr17 43510953 . G C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:434,0,275 -chr17 43514302 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.452;DP=70;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:391,0,2042 -chr17 43521364 . C G 278.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.98;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:307,0,19 -chr17 43548969 . A G 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:492,36,0 -chr17 43549084 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:394,0,118 -chr17 43549306 . A G 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:237,0,24 -chr17 43550258 . T G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:257,0,351 -chr17 43550628 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.634;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,453 -chr17 43551656 . G GT 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.871;DP=35;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:301,0,870 -chr17 43552228 . T A 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 -chr17 43553926 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-2.289;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:305,0,301 -chr17 43554800 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:276,0,104 -chr17 43555892 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:377,0,166 -chr17 43555910 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-2.001;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:472,0,261 -chr17 43557726 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:327,0,373 -chr17 43565046 . T C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.115;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:687,0,939 -chr17 43569988 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-1.727;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=12.79;ReadPosRankSum=-3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:527,0,797 -chr17 43574224 . T C 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-0.643;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:788,0,393 -chr17 43574277 . C A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.174;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=27.59;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:911,0,222 -chr17 43606548 . TA T 568.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:606,57,0 -chr17 43607208 . C T 831.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:860,60,0 -chr17 43607326 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:86:372,0,86 -chr17 43610260 . A C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.095;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:595,0,607 -chr17 43620743 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,378 -chr17 43621115 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.377;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,646 -chr17 43621313 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=-0.596;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,505 -chr17 43645703 . TGTGAGCCCCGAACAATGTCGTTTATCAATACTCAATTGGTTTTCAAACATTGTGTAACTCATTTTCTCTAATAG T 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.550;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=29.46;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:597,0,1413 -chr17 43649533 . GAATAGGTATAAA G 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=19;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:99:719,0,625 -chr17 43649548 . TTTGGACTGATACTTGAAAACGTAAAGGCTTGCAATGTCAGCAAAACACAATGTATTTCTCCTGAAC T 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.953;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=34.09;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:719,0,625 -chr17 43655802 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:374,0,333 -chr17 43656429 . C CA 937.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:89:975,89,0 -chr17 43660325 . G A 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:536,39,0 -chr17 43662106 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.297;DP=50;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:741,0,994 -chr17 43662183 . ACTGACAGACCAATGGCAGAAGGTCAATAAGAAGCACTAGACCAGTCTATTATTAAAATCTGACTAGTTTGTGCTTAC A 2145.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=2.327;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,51:56:99:2183,0,605 -chr17 43662586 . G A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.419;DP=45;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:812,0,825 -chr17 43667749 . T G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.942;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:80:537,0,80 -chr17 43667815 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:345,0,121 -chr17 43705811 . C T 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-1.720;DP=100;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:594,0,2832 -chr17 43705873 . G T 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.064;DP=80;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:607,0,2349 -chr17 43706374 . C CT 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-1.205;DP=48;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:600,0,384 -chr17 43759447 . G C 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.687;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:527,0,793 -chr17 43760875 . C G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.755;DP=28;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:53:939,0,53 -chr17 43766064 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=1.109;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:356,0,136 -chr17 43766220 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=1.308;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=19.03;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:542,0,382 -chr17 43766261 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.692;DP=31;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:542,0,578 -chr17 43896468 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.097;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:285,0,1606 -chr17 43896686 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.207;DP=44;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:521,0,1002 -chr17 43896698 . T A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.168;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:533,0,872 -chr17 43896718 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.461;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:466,0,753 -chr17 43896791 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,171 -chr17 43897289 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-0.320;DP=42;FS=13.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:304,0,1849 -chr17 43897290 . C T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.617;DP=41;FS=11.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:642,0,1257 -chr17 43897303 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.257;DP=38;FS=13.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:502,0,882 -chr17 43897355 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.769;DP=57;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:360,0,1689 -chr17 43902785 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.012;DP=178;FS=6.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,40:178:99:883,0,10841 -chr17 43910097 . C A 3031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=3.782;DP=124;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=24.45;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,83:124:99:3060,0,1074 -chr17 43910140 . C A 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=2.085;DP=98;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1882,0,1366 -chr17 44052465 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr17 44053819 . G T 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=2.706;DP=24;FS=10.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=34.57;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:858,0,180 -chr17 44127272 . A C 1383.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.409;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=34.60;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,35:40:17:1412,0,17 -chr17 44237655 . CA C 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:243,18,0 -chr17 44237776 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:273,0,59 -chr17 44291521 . C CA 745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.329;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:783,0,1198 -chr17 44294261 . G C 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:528,36,0 -chr17 44487867 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=2.282;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:366,0,81 -chr17 44490820 . G T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=-0.087;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:499,0,114 -chr17 44510362 . T C 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.604;DP=32;FS=4.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=28.31;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:934,0,99 -chr17 44521080 . GT G 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.054;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:429,0,176 -chr17 44585823 . T A 606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:635,48,0 -chr17 44586102 . G A 323.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:352,0,13 -chr17 44586924 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:332,0,236 -chr17 45189487 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.155;DP=90;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:492,0,2627 -chr17 45259432 . C T 2070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.740;DP=306;FS=3.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=6.77;ReadPosRankSum=2.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,86:306:99:2099,0,8299 -chr17 45259831 . C T 2099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-7.287;DP=112;FS=17.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=18.75;ReadPosRankSum=4.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,75:112:99:2128,0,3710 -chr17 45259907 . G A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.955;DP=243;FS=2.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=2.65;ReadPosRankSum=4.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,45:243:99:671,0,7527 -chr17 45278100 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.912;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:342,0,1443 -chr17 45278291 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=1.288;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:404,0,1480 -chr17 45317465 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=2.176;DP=31;FS=4.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:289,0,816 -chr17 45516624 . A AG 675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-1.278;DP=54;FS=7.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:713,0,1081 -chr17 45518082 . TTC T 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-1.276;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:427,0,2255 -chr17 45518347 . TA T 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-3.325;DP=37;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:383,0,575 -chr17 45518419 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=-1.101;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:396,0,1670 -chr17 45526959 . C T 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.643;DP=80;FS=4.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:1257,0,1587 -chr17 45533337 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-0.040;DP=44;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:296,0,1223 -chr17 45534337 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.072;DP=79;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:537,0,2145 -chr17 45646539 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.580;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:281,0,465 -chr17 45727678 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.410;DP=40;FS=12.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:604,0,780 -chr17 45823964 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,366 -chr17 45823968 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,366 -chr17 45845324 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.866;DP=36;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:707,0,502 -chr17 45899781 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.552;DP=186;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,38:186:99:661,0,5700 -chr17 45900104 . G GA 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.862;DP=107;FS=4.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:452,0,3841 -chr17 45900794 . C T 1426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.834;DP=228;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,62:228:99:1455,0,6289 -chr17 45900999 . T A 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.889;DP=148;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,46:148:99:1272,0,4099 -chr17 45901334 . T A 1374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-3.200;DP=244;FS=5.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,63:244:99:1403,0,7767 -chr17 45905790 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.274;DP=64;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:354,0,1656 -chr17 45918931 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.699;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:266,0,911 -chr17 45976395 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.083;DP=24;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:361,0,699 -chr17 45976431 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=14.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:252,0,465 -chr17 46122595 . G T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=3.665;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:264,0,418 -chr17 46122637 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=2.900;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=14.51;ReadPosRankSum=-2.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:449,0,1161 -chr17 46122638 . G T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=2.681;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:449,0,1124 -chr17 46154591 . G A 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=1.723;DP=43;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:374,0,1409 -chr17 46155107 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-1.404;DP=35;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:315,0,1193 -chr17 47059378 . A G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr17 47699821 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,307 -chr17 48839810 . T G 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.907;DP=40;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=29.52;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1209,0,416 -chr17 48840218 . C T 2056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=-0.542;DP=67;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,58:67:59:2085,0,59 -chr17 49039628 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.530;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:327,0,216 -chr17 49056276 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=20.89;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,287 -chr17 49061809 . C T 468.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:495,2,0 -chr17 49061895 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.206;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:390,0,268 -chr17 49077816 . TA T 210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:248,21,0 -chr17 49078140 . T C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.311;DP=175;FS=5.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,40:175:99:806,0,7385 -chr17 49115579 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,233 -chr17 49115583 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,233 -chr17 49117515 . C G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:247,0,430 -chr17 49167171 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.199;DP=170;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,47:170:99:1091,0,4570 -chr17 49174994 . G A 1419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-1.025;DP=182;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,58:182:99:1448,0,4778 -chr17 49175913 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.398;DP=88;FS=1.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:597,0,2476 -chr17 49176165 . GA G 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.516;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:569,0,364 -chr17 49252393 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.096;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:437,0,962 -chr17 49258482 . G C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.703;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:269,0,3251 -chr17 49269953 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=1.675;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:341,0,1019 -chr17 49286628 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.437;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:249,0,1703 -chr17 49288034 . C A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=-0.516;DP=46;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:406,0,2021 -chr17 49288234 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=2.894;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:235,0,768 -chr17 49373047 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.549;DP=56;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:252,0,5011 -chr17 49373056 . C G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.717;DP=61;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,12:61:99:252,0,5011 -chr17 49373639 . G A 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-0.122;DP=59;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=25.37;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,40:59:99:1525,0,566 -chr17 49373842 . T TCA 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.159;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:428,0,104 -chr17 49455944 . G A 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr17 49471200 . G A 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.284;DP=87;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1158,0,1874 -chr17 49507667 . C A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr17 49515244 . G T 3464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=1.349;DP=166;FS=7.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=20.87;ReadPosRankSum=2.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,102:166:99:3493,0,2131 -chr17 49524834 . A T 3188.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.258;DP=160;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,94:160:99:3217,0,2341 -chr17 49530975 . G T 2653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=1.072;DP=145;FS=5.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=18.30;ReadPosRankSum=3.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:2682,0,5488 -chr17 49805936 . C A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr17 49806153 . T A 700.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:51:729,51,0 -chr17 49807088 . C A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr17 49807272 . A AC 762.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:800,60,0 -chr17 49807479 . G A 1450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1479,102,0 -chr17 49959969 . T C 929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:958,69,0 -chr17 50044508 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-0.942;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=18.19;ReadPosRankSum=2.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:865,0,710 -chr17 50048727 . AAGGTAAGATCAGATTTTCTAAATCAATGTCTCCGAGTGAAGAATTTCATATTGACAGAATGACCTCTTCTGTTC A 3142.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-0.120;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:3180,257,0 -chr17 50053214 . T C 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.423;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=20.99;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:805,0,498 -chr17 50143849 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,369 -chr17 50151738 . T A 310.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.09;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:339,0,15 -chr17 50156088 . A C 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=1.147;DP=29;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=27.58;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:828,0,169 -chr17 50300014 . C T 4449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=1.790;DP=293;FS=16.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=15.19;ReadPosRankSum=-1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,126:293:99:4478,0,5726 -chr17 50300348 . C T 4673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=1.614;DP=341;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,136:341:99:4702,0,6892 -chr17 50300537 . A G 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.439;DP=219;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,72:219:99:1943,0,5776 -chr17 50314074 . G A 2632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=-3.796;DP=366;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,117:365:99:2661,0,9093 -chr17 50318804 . T A 543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:572,42,0 -chr17 50348818 . A G 4481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=5.988;DP=570;FS=13.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=7.86;ReadPosRankSum=2.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:395,170:565:99:4510,0,15108 -chr17 50384484 . A G 5714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.120;DP=414;FS=4.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,173:391:99:5743,0,6714 -chr17 50389244 . C T 9058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.703;ClippingRankSum=3.957;DP=388;FS=28.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=23.35;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,249:360:99:9087,0,2740 -chr17 50400075 . T G 3108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-2.230;DP=375;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=8.29;ReadPosRankSum=3.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,120:375:99:3137,0,9535 -chr17 50445789 . A G 4994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.319;DP=304;FS=6.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,141:304:99:5023,0,5355 -chr17 50445812 . CT C 246.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:25:284,25,0 -chr17 50445817 . A T 255.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:25:284,25,0 -chr17 50449613 . G A 5372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.396;DP=357;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,157:357:99:5401,0,6509 -chr17 50467157 . C T 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;ClippingRankSum=5.374;DP=356;FS=30.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=5.38;ReadPosRankSum=2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,87:356:99:1944,0,10208 -chr17 50467184 . G A 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=6.178;DP=323;FS=5.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=5.05;ReadPosRankSum=-5.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,78:323:99:1658,0,9375 -chr17 50467577 . A G 4906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-2.504;DP=304;FS=6.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,139:304:99:4935,0,5533 -chr17 50470968 . C T 4666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.704;DP=284;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,131:283:99:4695,0,5074 -chr17 50471474 . C T 7026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;ClippingRankSum=1.707;DP=387;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,195:386:99:7055,0,6748 -chr17 50471557 . G A 4808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=-2.065;DP=322;FS=0.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,143:320:99:4837,0,5797 -chr17 50474486 . G A 4533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.399;DP=302;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.187;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,131:302:99:4562,0,5730 -chr17 50510746 . T TA 888.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-0.616;DP=79;FS=10.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:926,0,661 -chr17 50510986 . T C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.189;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:76:568,0,76 -chr17 50511101 . G C 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-1.650;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=27.70;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1164,0,120 -chr17 50511105 . A G 1697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1726,117,0 -chr17 50511275 . GA G 321.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:35:359,35,0 -chr17 50511316 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:32:433,32,0 -chr17 50511479 . G A 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-1.333;DP=35;FS=8.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:942,0,334 -chr17 50511767 . C CT 477.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=26.54;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:24:515,24,0 -chr17 50512214 . C G 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=3.361;DP=42;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=22.57;ReadPosRankSum=-2.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:976,0,1785 -chr17 50512236 . T C 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=1.617;DP=38;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=24.94;ReadPosRankSum=-1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:976,0,1751 -chr17 50512239 . T TA 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=2.757;DP=38;FS=7.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:272,0,556 -chr17 50512902 . T TA 2169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.947;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,54:81:99:2207,0,1519 -chr17 50512904 . G A 2178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-1.293;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,55:82:99:2207,0,1518 -chr17 50513208 . A G 2741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.413;DP=113;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=24.26;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,75:111:99:2770,0,956 -chr17 50547556 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:283,0,154 -chr17 50547560 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:283,0,154 -chr17 50547646 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.584;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:599,0,158 -chr17 50641092 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,346 -chr17 50641209 . C T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr17 50643054 . T C 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:661,45,0 -chr17 50643349 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=26.08;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:289,0,139 -chr17 50671862 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=2.654;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,259 -chr17 50671997 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.774;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=23.44;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:333,0,134 -chr17 50722781 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr17 50731579 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:393,0,262 -chr17 50815202 . CT C 1005.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.521;DP=132;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:1043,0,1343 -chr17 50817061 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=1.695;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=7.35;ReadPosRankSum=-2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:425,0,1506 -chr17 50817199 . G GT 1063.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=-3.064;DP=119;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=8.94;ReadPosRankSum=2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:1101,0,1632 -chr17 50819714 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.914;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:306,0,748 -chr17 50819716 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:306,0,748 -chr17 50821684 . C A 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:386,27,0 -chr17 50938182 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:305,0,54 -chr17 50956072 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.275;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:399,0,450 -chr17 50956230 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:343,0,520 -chr17 50956860 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:308,0,95 -chr17 50977073 . AC A 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=-1.791;DP=15;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:255,0,217 -chr17 50980273 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.411;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:355,0,487 -chr17 50991218 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:333,0,1012 -chr17 50991230 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.255;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=12.19;ReadPosRankSum=2.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:333,0,1041 -chr17 50996860 . G A 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:244,0,24 -chr17 51008759 . C T 1295.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:93:1324,93,0 -chr17 51013561 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.09;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:53:317,0,53 -chr17 51013576 . G C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:53:317,0,53 -chr17 51018165 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.363;DP=33;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:339,0,832 -chr17 51094218 . G C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-1.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:300,0,940 -chr17 51114199 . G T 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.366;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,33:56:99:1109,0,793 -chr17 51298090 . C T 1811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.043;DP=103;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1840,0,1795 -chr17 51317792 . GT G 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.338;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:513,0,209 -chr17 51318320 . C G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=-0.544;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:245,0,1473 -chr17 51320742 . A AC 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.951;DP=36;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:563,0,637 -chr17 51321112 . G C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.297;DP=67;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:770,0,1525 -chr17 51321790 . TAA T 355.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:58:681,58,0 -chr17 51322225 . A G 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.201;DP=78;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,44:77:99:1478,0,1172 -chr17 51322402 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=1.291;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:431,0,727 -chr17 51323834 . A G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.253;DP=35;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:484,0,915 -chr17 51323869 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:276,0,226 -chr17 51368749 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,221 -chr17 51368753 . G C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,221 -chr17 51482123 . C A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-1.559;DP=26;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=28.41;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:767,0,256 -chr17 51541999 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-1.920;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:566,0,444 -chr17 51542033 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.185;DP=18;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=28.26;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:70:537,0,70 -chr17 51546600 . CTTCTCCTCCTCTGTTGTCGCTGTGGTG C 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.182;DP=77;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:465,0,1777 -chr17 51546714 . GT G 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=-1.273;DP=48;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=29.85;ReadPosRankSum=-2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:99:1470,0,137 -chr17 51546717 . CTTCTCCTCCTCTGTTGTCGCTGTGGTGTT C 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=-1.335;DP=59;FS=10.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=24.28;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:99:1470,0,137 -chr17 51577401 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.914;DP=72;FS=10.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:325,0,2040 -chr17 51606323 . G A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-2.379;DP=140;FS=1.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,32:140:99:647,0,4149 -chr17 51611647 . C T 2566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-2.265;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=30.20;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,70:85:99:2595,0,243 -chr17 51715532 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=-1.250;DP=85;FS=2.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:353,0,2505 -chr17 51731275 . T C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-2.904;DP=109;FS=4.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:818,0,3142 -chr17 51731443 . T C 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=1.150;DP=144;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,34:143:99:742,0,4241 -chr17 51731990 . T C 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.926;DP=80;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1028,0,1582 -chr17 51741448 . G A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=1.894;DP=134;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,34:134:99:804,0,3810 -chr17 51801296 . C A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.645;DP=119;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,20:119:99:271,0,3794 -chr17 51832984 . T C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.243;DP=54;FS=5.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:903,0,994 -chr17 52041615 . T A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.747;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:404,0,424 -chr17 52138442 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.879;DP=27;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.682;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:351,0,594 -chr17 52139005 . G C 855.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:63:884,63,0 -chr17 52139293 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-3.171;DP=44;FS=5.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,9:44:99:374,0,3514 -chr17 52139305 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-1.141;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:374,0,3514 -chr17 52139314 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.002;DP=44;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:766,0,1611 -chr17 52140582 . GC G 1584.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.580;DP=79;FS=6.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1622,0,538 -chr17 52142190 . G T 2536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.609;DP=121;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,76:121:99:2565,0,1552 -chr17 52142457 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-3.032;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:359,0,1029 -chr17 52142490 . C CT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.397;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:243,0,985 -chr17 52142584 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=1.615;DP=40;FS=2.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:562,0,1198 -chr17 52143628 . C T 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.790;DP=68;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1580,0,830 -chr17 52143833 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-2.657;DP=40;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:361,0,1048 -chr17 52143897 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.676;DP=70;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1249,0,4023 -chr17 52246738 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=1.403;DP=32;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:299,0,907 -chr17 52283799 . GT G 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-1.587;DP=50;FS=7.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:458,0,552 -chr17 52348621 . CA C 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-2.113;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=13.86;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:55:259,0,55 -chr17 52458823 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-0.807;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:288,0,554 -chr17 52620420 . C A 1581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=0.186;DP=125;FS=3.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,47:125:99:1610,0,2783 -chr17 52642814 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.634;DP=21;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=23.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:528,0,205 -chr17 53052689 . C A 7362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.735;DP=591;FS=0.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=12.46;ReadPosRankSum=3.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:387,204:591:99:7391,0,26384 -chr17 53052690 . C T 7362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.490;DP=591;FS=0.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,201:582:99:7391,0,26470 -chr17 53081297 . G C 2793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.304;DP=289;FS=0.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,109:289:99:2822,0,14165 -chr17 53168910 . G T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.082;DP=111;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,33:109:99:774,0,2922 -chr17 53169482 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.873;DP=105;FS=1.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:1249,0,2023 -chr17 53169671 . G A 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-1.980;DP=99;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:1663,0,1685 -chr17 53179086 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-0.305;DP=69;FS=3.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:746,0,1106 -chr17 53397395 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:313,0,57 -chr17 53401264 . G C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,164 -chr17 53402134 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:347,0,290 -chr17 53424632 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:408,0,368 -chr17 53426943 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:254,0,342 -chr17 53429842 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.158;DP=36;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:620,0,638 -chr17 53430612 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=22.95;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:579,0,278 -chr17 53430782 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,362 -chr17 53432493 . CTT C 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.684;DP=220;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,37:207:99:704,0,5520 -chr17 53432715 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=2.887;DP=17;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=12.28;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:237,0,849 -chr17 53447370 . T A 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.102;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=33.16;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:40:592,40,0 -chr17 53682353 . G T 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 -chr17 53714313 . C A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.145;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:496,0,880 -chr17 53717261 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:329,0,582 -chr17 53717272 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=2.540;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,582 -chr17 53772751 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr17 53772752 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr17 53775173 . TGGTGTGTTTGAGTAACTGCGCCAATGTGCTTACACTCATCTGATGCTCATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCA T 3464.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.308;DP=82;FS=3.069;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=28.09;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:76:99:3502,302,0 -chr17 53775328 . T C 1425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.486;DP=79;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1454,0,1536 -chr17 53790882 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.584;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:311,0,972 -chr17 53792852 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=-0.784;DP=41;FS=12.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=10.51;ReadPosRankSum=3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:459,0,934 -chr17 53795252 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-1.234;DP=35;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.180;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:361,0,1146 -chr17 53815893 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-1.066;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:645,0,1179 -chr17 53817220 . C T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=-0.353;DP=61;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1071,0,992 -chr17 53829226 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.569;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:453,0,409 -chr17 53829341 . G A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.946;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:36:895,0,36 -chr17 53830687 . T C 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.250;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:668,0,200 -chr17 53851710 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=-0.046;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:360,0,973 -chr17 53893194 . C G 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.259;DP=79;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:1103,0,1582 -chr17 53893950 . T C 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 -chr17 53905533 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:267,0,63 -chr17 53905765 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,163 -chr17 53907075 . G A 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.016;DP=76;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1254,0,1343 -chr17 53908163 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-1.622;DP=36;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=10.49;ReadPosRankSum=2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:406,0,433 -chr17 53909725 . T C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.044;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:887,0,1024 -chr17 53922126 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.197;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:442,0,1462 -chr17 53922209 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.960;DP=43;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:794,0,740 -chr17 53927709 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.768;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1131,0,1147 -chr17 53928676 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.849;DP=62;FS=5.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:868,0,1166 -chr17 53929619 . A G 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-3.940;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=27.44;ReadPosRankSum=-3.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:632,0,922 -chr17 53974381 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-0.648;DP=18;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,217 -chr17 53977085 . C T 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.389;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:771,0,703 -chr18 9212 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.324;DP=97;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:99:385,0,2905 -chr18 15227 . AGTCAGTGACACACACACACACACACAGACGCATGTGTATGTGAGCACAGCTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGCAG A 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.207;ClippingRankSum=0.210;DP=70;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1264,0,5370 -chr18 15228 . GTCAGTGACACACACACACACACACAGACGCATGTGTATGTGAGCACAGCTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGCAGA G 976.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-2.186;DP=70;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:1014,0,5198 -chr18 16397 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.127;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=12.87;ReadPosRankSum=-2.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:453,0,701 -chr18 75089 . TA T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.404;DP=50;FS=9.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:347,0,706 -chr18 78019 . C A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.438;DP=105;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:821,0,2623 -chr18 115380 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-0.668;DP=61;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:247,0,1604 -chr18 117335 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.304;DP=100;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:391,0,2941 -chr18 119415 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=1.219;DP=88;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=5.65;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:525,0,2484 -chr18 129217 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.333;DP=57;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:282,0,1673 -chr18 134164 . AGTAACACGCTTTACACTACTACTGCAGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTCTGACTGTGGTGTTTCCTCAG A 2329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=1.715;DP=73;FS=1.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=31.91;ReadPosRankSum=-2.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,63:68:35:2367,0,35 -chr18 137858 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.377;DP=55;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:281,0,2832 -chr18 151108 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-0.038;DP=61;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:551,0,1530 -chr18 161139 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=1.813;DP=110;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:466,0,3133 -chr18 165020 . AGTGGTGGTGTGTGTGTGGTT A 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=4.368;DP=133;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=4.55;ReadPosRankSum=-3.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,25:133:99:643,0,15198 -chr18 165042 . CAGATGGAGCCAGT C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=3.874;DP=189;FS=9.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=1.09;ReadPosRankSum=-2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,23:139:99:243,0,17430 -chr18 167751 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=2.766;DP=115;FS=8.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,28:115:99:637,0,3225 -chr18 231046 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.939;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,285 -chr18 231106 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.099;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:388,0,341 -chr18 234820 . G T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.372;DP=39;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:340,0,1212 -chr18 266032 . T C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.379;DP=412;FS=5.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:339,73:412:99:842,0,17611 -chr18 266038 . G A 2628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-1.697;DP=404;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,113:403:99:2657,0,13754 -chr18 300916 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.765;DP=72;FS=5.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:323,0,2029 -chr18 320829 . G T 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.609;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.015;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:636,0,698 -chr18 329474 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-0.902;DP=42;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:648,0,790 -chr18 329523 . C T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.553;DP=95;FS=3.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:1258,0,1940 -chr18 346684 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.602;DP=94;FS=3.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:588,0,2456 -chr18 444411 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=-0.394;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:610,0,815 -chr18 449557 . T G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-2.976;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=21.84;ReadPosRankSum=-4.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:727,0,379 -chr18 683342 . A C 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:66:982,66,0 -chr18 683344 . A C 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:66:982,66,0 -chr18 683468 . A G 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:66:982,66,0 -chr18 749229 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=1.922;DP=118;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:463,0,2266 -chr18 1569005 . T G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.626;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:512,0,132 -chr18 1570952 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,313 -chr18 1677146 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.869;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:390,0,730 -chr18 1677155 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.531;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:390,0,730 -chr18 1677538 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,543 -chr18 1680667 . AT A 651.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.822;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=34.31;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:689,17,0 -chr18 1680760 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-4.438;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=11.09;ReadPosRankSum=3.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:372,0,1215 -chr18 1680773 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-4.028;DP=30;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=7.56;ReadPosRankSum=2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:255,0,827 -chr18 1684641 . C A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.168;DP=79;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:426,0,2390 -chr18 2376193 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.119;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:348,0,403 -chr18 2379329 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:260,0,384 -chr18 2449334 . G GA 656.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.207;DP=316;FS=7.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,70:265:99:694,0,4499 -chr18 2482981 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.712;DP=172;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,33:172:99:552,0,5393 -chr18 2485256 . AGTAAGACTCCGATCACATGACAAAACAATTAAAAGCCTTTTATCCTATCAGCTGTTGACTTCTCTGATTTCTCTACAG A 8123.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.916;DP=201;FS=1.667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=25.33;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,195:200:99:8161,588,0 -chr18 2549534 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-1.022;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:362,0,464 -chr18 2688907 . AT A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=-0.173;DP=48;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:248,0,732 -chr18 2715631 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:258,0,343 -chr18 4296331 . A T 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.187;DP=235;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,61:235:99:1495,0,6723 -chr18 4471891 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:394,0,268 -chr18 4474175 . AT A 227.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr18 4474178 . A C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr18 4488794 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.764;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:513,0,508 -chr18 4495769 . GTAACCATGTTCAGACACTTAAAGCAGAGTTTGATATGCATTTTTATTGCAGACTTTATTTGGGGAAGGAAAAATTGATAAAA G 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=6.103;DP=65;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:781,0,5153 -chr18 4508268 . AACCTGAAATGCAGACAATGTTGAAAACTAAAACAAATATTAACTAAAATCTGAATTAATTACTTAATTCATCTGCAGT A 1475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=-1.688;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,43:72:99:1513,0,1005 -chr18 4508271 . CTGAAATG C 958.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=1.561;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:996,0,1561 -chr18 4508279 . CAGACAATGTTGAAAACTAAAACAAATATTAACTAAAATCTGAATTAATTACTTAATTCATCTGCAGTACCT C 958.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.641;DP=74;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:996,0,1569 -chr18 4611101 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,100 -chr18 4647007 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=-0.674;DP=47;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:762,0,843 -chr18 4647079 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-2.561;DP=39;FS=3.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:274,0,971 -chr18 4659826 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=2.489;DP=22;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:246,0,360 -chr18 4660329 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.746;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:315,0,415 -chr18 4664325 . G C 1607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.578;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.390;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,61:187:99:1636,0,4791 -chr18 4664434 . ATG A 1576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-2.325;DP=343;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,7:254:99:1614,0,12513 -chr18 4664447 . T A 2915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-1.169;DP=337;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,111:336:99:2944,0,18465 -chr18 4668001 . C T 1762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.032;DP=384;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,88:383:99:1791,0,14733 -chr18 4668004 . T C 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.125;DP=386;FS=1.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:299,86:385:99:1662,0,14482 -chr18 4673320 . C T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-3.075;DP=283;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=2.94;ReadPosRankSum=2.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,54:283:99:861,0,8683 -chr18 4718873 . G T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.317;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:447,0,217 -chr18 4731872 . CGGTGAGAGAAGACACACACTACACACGTCAGTCACAATCTGTCACTCTCTGCTTCCTGCATTTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTA C 2703.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.766;DP=381;FS=2.028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,369:374:99:2741,926,0 -chr18 4759562 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=-1.702;DP=52;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:376,0,1430 -chr18 4773119 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.398;DP=27;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1099 -chr18 4773145 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.188;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:384,0,857 -chr18 4773295 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.992;DP=33;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:375,0,731 -chr18 4773306 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-1.286;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:485,0,529 -chr18 4773727 . T C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-0.653;DP=51;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:515,0,1782 -chr18 4773852 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.637;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:385,0,1496 -chr18 4790436 . C A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=1.309;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:489,0,476 -chr18 4920632 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=1.632;DP=64;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:249,0,3334 -chr18 4921317 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.669;DP=66;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:422,0,1715 -chr18 4949110 . C T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-3.408;DP=539;FS=29.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:456,83:539:99:726,0,16961 -chr18 5018398 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=23.86;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:243,0,59 -chr18 5020445 . C A 1099.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.201;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:50:1128,50,0 -chr18 5036498 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,293 -chr18 5052926 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.476;DP=75;FS=14.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:237,0,2321 -chr18 5056573 . T C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=-1.153;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=26.93;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:863,0,250 -chr18 5171013 . GT G 2449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.044;DP=142;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,90:118:99:2487,0,331 -chr18 5172969 . G A 3454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-3.465;DP=188;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=18.38;ReadPosRankSum=3.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,109:188:99:3483,0,2682 -chr18 5173066 . TCTATAATAACAAATAAATATGCATAAATATGTTTTTAAAAAGCATGGATTATAAAAAAATGTGAAGATTAAGTAAACTCATTTAAAAACAAAAAGTAGCCACATAC T 6467.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.861;DP=147;FS=6.231;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=34.57;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,145:147:99:6505,634,0 -chr18 5196418 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.618;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=2.95;ReadPosRankSum=2.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:329,0,5105 -chr18 5231207 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr18 5231245 . A AT 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.409;DP=50;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:696,0,649 -chr18 5231651 . A G 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.340;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1295,0,685 -chr18 5234624 . A C 1603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.743;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=31.84;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1632,120,0 -chr18 5234645 . T C 2462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2491,181,0 -chr18 5584808 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-1.661;DP=26;FS=13.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:494,0,352 -chr18 5587265 . TAA T 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.546;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,112 -chr18 5594830 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:248,0,242 -chr18 5619040 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,340 -chr18 5623600 . C T 3406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-2.446;DP=124;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=27.47;ReadPosRankSum=3.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,89:123:99:3435,0,815 -chr18 5636064 . A G 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.623;DP=227;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,56:226:99:1270,0,7075 -chr18 5777275 . T A 201.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.84;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:230,0,15 -chr18 5788565 . AACACACACACACACACACACACACACAT A 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-1.694;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=7.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:99:556,0,3462 -chr18 5825456 . A G 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=1.652;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:831,0,1416 -chr18 5916402 . C G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.553;DP=26;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:356,0,1154 -chr18 5948645 . G C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=-1.358;DP=430;FS=0.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:363,66:429:99:657,0,14287 -chr18 5986622 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.027;DP=15;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,235 -chr18 6003624 . G C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.418;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:304,0,776 -chr18 6003791 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.200;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:453,0,544 -chr18 6005974 . G C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.175;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:317,0,613 -chr18 6037666 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.282;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.974;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:276,0,954 -chr18 6141202 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-0.045;DP=52;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:244,0,1536 -chr18 6208682 . GA G 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-0.486;DP=60;FS=8.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:396,0,3379 -chr18 6213303 . G A 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-0.484;DP=92;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,36:92:99:1281,0,1873 -chr18 6213339 . C T 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.198;DP=93;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:1401,0,1736 -chr18 6217975 . TCCTGCAACACAAACAACTCAGTGTGAAGGCAGCCGGTCACATCACATCTGATTAAAGCACATCTCTGCTGA T 5065.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=1.134;DP=149;FS=2.253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=34.00;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,140:143:99:5103,405,0 -chr18 6366566 . G A 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:732,57,0 -chr18 6370842 . A C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=2.646;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=12.49;ReadPosRankSum=-3.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:403,0,578 -chr18 6370912 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.691;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:336,0,1577 -chr18 6371012 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.050;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:407,0,1575 -chr18 6371028 . A ACT 900.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-1.150;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:938,0,292 -chr18 6371084 . CT C 869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-1.674;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=25.58;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:62:907,62,0 -chr18 6371136 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.276;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:448,0,477 -chr18 6371191 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-2.647;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:77:388,0,77 -chr18 6371276 . T C 1918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1947,141,0 -chr18 6371463 . A G 1558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=1.510;DP=89;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:1587,0,2951 -chr18 6371472 . T C 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-2.651;DP=83;FS=2.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=15.80;ReadPosRankSum=2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1340,0,3397 -chr18 6371626 . G T 1758.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1787,129,0 -chr18 6411147 . A G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr18 6415161 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=23.38;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,170 -chr18 6417495 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-2.534;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.298;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:326,0,205 -chr18 6455525 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,104 -chr18 6457922 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.127;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:242,0,423 -chr18 6459124 . G A 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:356,24,0 -chr18 6459133 . C T 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:356,24,0 -chr18 6461802 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:339,0,288 -chr18 6462695 . T C 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:668,45,0 -chr18 6462704 . T G 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:668,45,0 -chr18 6620022 . G A 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:645,48,0 -chr18 6707427 . C T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr18 6712407 . T A 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.873;DP=99;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:74:1202,0,74 -chr18 6712445 . A G 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.181;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:85:1201,0,85 -chr18 6723146 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr18 6890884 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.617;DP=39;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:231,0,1167 -chr18 6941933 . T C 1485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.094;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1514,0,1608 -chr18 6942087 . T C 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.962;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=31.70;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1740,0,646 -chr18 7030878 . T TTTTTTAAAGAGG 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=417;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,27:27:50:699,0,50 -chr18 7103344 . AGTATGCTTCATGTGTTGCTAAACTGTTCATTTCTATCATTGGTAAGGTTATGTTTTGTTGAATACATTCTTTGATCATTTATTTGCAG A 1463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=2.457;DP=41;FS=5.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,36:40:99:1501,0,411 -chr18 7705618 . CAGGTGCTGAGAGATACATTCTGCATGCAGCTAAAATAAATTCTGTGGTTATGAATGCAGGACGTTGTGTTTGTATGCTTTCCCATCACTCAA C 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.908;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=23.03;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:590,0,3266 -chr18 7708691 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.119;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:344,0,738 -chr18 7709549 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.837;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:364,0,462 -chr18 7709847 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.566;DP=35;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:275,0,968 -chr18 7709884 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.032;DP=38;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:313,0,1218 -chr18 7714706 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-1.720;DP=48;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:294,0,1324 -chr18 7718868 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.797;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:291,0,608 -chr18 7719898 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=-1.005;DP=37;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:499,0,803 -chr18 7728986 . G T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.421;DP=40;FS=6.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:645,0,746 -chr18 7802785 . A T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-1.050;DP=58;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:781,0,1445 -chr18 7831998 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=1.244;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=13.23;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:306,0,407 -chr18 7960085 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.731;DP=76;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:304,0,2349 -chr18 7962459 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=-0.366;DP=95;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:519,0,2754 -chr18 7963519 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.601;DP=104;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:421,0,3200 -chr18 7976226 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.354;DP=109;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=7.71;ReadPosRankSum=-2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:869,0,2760 -chr18 9014448 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-1.699;DP=33;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:566,0,526 -chr18 9758911 . GCTGCGTTAAACACAGAGAGGGAAAGAGAGGGAGAGATGGGGGGGAGAAAAAGATGAGTGGAGAAGGGAAAAAGCTGACCTACAGAATAAATATGTTCAAATAGAAGGCACTTAC G 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=1.552;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=34.48;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:520,0,583 -chr18 10138606 . G GC 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.985;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:428,0,818 -chr18 10138607 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.919;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:428,0,818 -chr18 10151812 . ACTGAAATAAACATAAGAGTCAGCACAAAGATTCAGTTTACTAGTAATGATAAAAATTTAGATAAAAAGGAGGATTGTATAAC A 2630.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.188;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=28.91;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:2668,251,0 -chr18 11317532 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.659;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:510,0,419 -chr18 11358695 . AT A 279.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.134;DP=15;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:11:316,11,0 -chr18 11361524 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.320;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:234,0,671 -chr18 11362997 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:339,0,381 -chr18 11562822 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,145 -chr18 11587716 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=1.945;DP=15;FS=13.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=20.65;ReadPosRankSum=-2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:338,0,390 -chr18 11673403 . A G 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=1.288;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:888,0,1476 -chr18 11702983 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=1.047;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:256,0,2514 -chr18 11725786 . GC G 1268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.381;DP=182;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,64:162:99:1509,0,2018 -chr18 11905497 . GT G 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.253;DP=90;FS=3.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:425,0,1464 -chr18 11906466 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.225;DP=45;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:524,0,1152 -chr18 11908501 . C CT 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-1.444;DP=52;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:240,0,1421 -chr18 11908717 . CTT C 644.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=-0.436;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:783,0,753 -chr18 11909431 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.331;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:311,0,1253 -chr18 12312955 . G T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=13.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:393,0,300 -chr18 12313649 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:403,0,701 -chr18 12313979 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.088;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:363,0,574 -chr18 12320201 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.617;DP=35;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:504,0,650 -chr18 12365682 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.980;DP=27;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,685 -chr18 12516210 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=1.399;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:273,0,468 -chr18 12536631 . T A 206.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:235,0,25 -chr18 12537489 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=2.176;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,258 -chr18 12553348 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.819;DP=29;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:423,0,591 -chr18 12602336 . T C 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.495;DP=46;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:758,0,723 -chr18 12602663 . C T 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.537;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:845,0,843 -chr18 12692810 . C T 1791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=-2.341;DP=245;FS=3.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,73:245:99:1820,0,6609 -chr18 12714673 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.912;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:358,0,311 -chr18 12735222 . GAGGTACACACACTTACAGATAGTGTACCCTTAATCTGTAAAACAAATCATGTACTGGTTTCTTTTTCTCTTCTGT G 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=30.88;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:377,0,1149 -chr18 12802083 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-1.149;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:936,0,2851 -chr18 12803213 . A C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-0.942;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,30:132:99:609,0,4002 -chr18 12827675 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.047;DP=124;FS=2.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,36:124:99:906,0,3472 -chr18 12833084 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-1.251;DP=166;FS=6.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,48:163:99:978,0,7536 -chr18 13431237 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.704;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:255,0,565 -chr18 13930067 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=1.905;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,259 -chr18 14181668 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:329,0,495 -chr18 14196659 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-1.258;DP=50;FS=8.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:432,0,1234 -chr18 14258063 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.109;DP=60;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:425,0,2061 -chr18 14272542 . GAAGGTATGTGGTAAAACTGGTGTTAGGTTTACATAACAGCATCTCGTTTGTTGTTTTCACAGTCTTGACATAAACTTCTCTCTCCC G 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:310,0,953 -chr18 14277692 . G C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.126;DP=27;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:327,0,628 -chr18 14288405 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.201;DP=97;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:99:731,0,2549 -chr18 14291648 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-1.522;DP=34;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:252,0,980 -chr18 14317832 . C CTG 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.107;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:285,0,454 -chr18 14318139 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.557;DP=39;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:558,0,777 -chr18 14319735 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=3.232;DP=37;FS=8.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:274,0,1059 -chr18 14319910 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:277,0,668 -chr18 14357206 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.589;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.263;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:475,0,3929 -chr18 14358958 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.968;DP=152;FS=8.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:499,0,5013 -chr18 14359120 . C T 3815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-1.929;DP=110;FS=3.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=34.69;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,91:110:99:3844,0,162 -chr18 14364438 . T A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=2.326;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,31:113:99:745,0,3001 -chr18 14378187 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.073;ClippingRankSum=0.055;DP=104;FS=3.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,23:104:99:398,0,3196 -chr18 14422640 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.585;DP=111;FS=1.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:506,0,3227 -chr18 14431754 . C T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-0.987;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:927,0,1737 -chr18 14431769 . G T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.130;DP=71;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1124,0,1367 -chr18 14436547 . T C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-0.421;DP=95;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:1053,0,2069 -chr18 14436747 . C T 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.174;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,47:130:99:1579,0,2788 -chr18 14442429 . ACTGCAAACACAAAAAGATTTATGATGATATATTTGCATGAGTGCATTACTGAAGACTATTATTAATACTCAC A 4548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.644;DP=111;FS=2.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=31.28;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,101:105:99:4586,338,0 -chr18 14464544 . G C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.372;DP=52;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:324,0,1272 -chr18 14469803 . C A 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 -chr18 14470432 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-2.431;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:363,0,329 -chr18 14482899 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=1.281;DP=109;FS=4.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:421,0,2603 -chr18 14715198 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:385,0,643 -chr18 14722597 . AAGGTGAGACTCCTGATTCATCGTTTGTGACATTTATAGGTATTAACAAACACTGTACTTCATTTTATATCGTGACCATATTATTT A 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.898;DP=11;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:314,0,513 -chr18 14918285 . CA C 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.218;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:660,0,905 -chr18 14926295 . C T 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 -chr18 15055350 . A G 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.709;DP=50;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:909,0,904 -chr18 15160712 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=-1.769;DP=50;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:321,0,1401 -chr18 15162421 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-1.964;DP=46;FS=5.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:302,0,2745 -chr18 15162427 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-2.163;DP=46;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:302,0,2745 -chr18 15163070 . C T 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2255,160,0 -chr18 15163097 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=1.470;DP=59;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=5.08;ReadPosRankSum=-3.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:328,0,1748 -chr18 15163112 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=4.368;DP=59;FS=6.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:314,0,1646 -chr18 15169222 . G A 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=-0.990;DP=74;FS=7.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1279,0,1221 -chr18 15169814 . A G 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.182;DP=58;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:909,0,1121 -chr18 15169815 . C T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=-0.023;DP=60;FS=3.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:799,0,2500 -chr18 15185266 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.600;DP=111;FS=8.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1849,0,1996 -chr18 15191852 . C A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=1.119;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=17.98;ReadPosRankSum=3.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1125,0,1896 -chr18 15191853 . G A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=1.450;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1125,0,1880 -chr18 15193964 . C T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-2.193;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:656,0,4523 -chr18 15193970 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=-1.769;DP=80;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:659,0,4523 -chr18 15203445 . C T 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=4.370;DP=58;FS=9.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=17.96;ReadPosRankSum=-2.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1070,0,949 -chr18 15203457 . T G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=2.890;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:380,0,1135 -chr18 15246814 . T C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=34.41;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:60:855,60,0 -chr18 15246912 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.495;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:262,0,722 -chr18 15246952 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.746;DP=38;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:265,0,1075 -chr18 15248214 . T A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.634;DP=36;FS=6.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:597,0,641 -chr18 15471412 . CT C 1822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-1.185;DP=212;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=8.60;ReadPosRankSum=-2.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,79:195:99:1860,0,2632 -chr18 15471967 . CG C 2887.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.801;DP=268;FS=7.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,128:246:99:2925,0,3128 -chr18 15515742 . G A 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=-0.917;DP=98;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=14.07;ReadPosRankSum=2.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1407,0,3814 -chr18 15563954 . A G 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,532 -chr18 15564175 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.589;DP=23;FS=14.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,397 -chr18 15564286 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:289,0,290 -chr18 15767766 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.070;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.608;QD=23.81;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:552,0,198 -chr18 15768200 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,289 -chr18 15768442 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-1.557;DP=25;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:295,0,543 -chr18 15769238 . A AT 507.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=1.585;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:545,0,1047 -chr18 15770086 . A T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:394,0,211 -chr18 15805129 . T A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-1.747;DP=260;FS=8.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=3.30;ReadPosRankSum=-2.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,52:260:99:886,0,8585 -chr18 15808344 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.425;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,1105 -chr18 15827177 . G C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=1.015;DP=35;FS=9.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:229,0,959 -chr18 15829855 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:406,0,344 -chr18 15838334 . G T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.201;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:731,0,2313 -chr18 15838335 . T G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.399;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:731,0,2314 -chr18 16381515 . G A 3429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.134;DP=516;FS=7.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:368,148:516:99:3458,0,13722 -chr18 16381862 . TGCAGGTAACTTCCTTTTGCGAATTAATTTTTTTTTTCTCAATCAAAAGGTTTGTCGAGCTTTTCACTGTTAATTATATGTGCTTTTGTAA T 9187.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=2.644;DP=354;FS=2.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=25.95;ReadPosRankSum=-11.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,233:316:99:9439,0,3450 -chr18 16381864 . CAGGTAACTTCCTTTTGCGAATTAATTTTTTTTTTCTCAATCAAAAGGTTTGTCGAGCTTTTCACTGTTAATTATATGTGCTTTTGTA C 1690.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-2.573;DP=344;FS=4.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.133;QD=4.91;ReadPosRankSum=11.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,77:315:99:1728,0,13328 -chr18 16382703 . C T 4250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-1.970;DP=335;FS=8.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,124:335:99:4279,0,7359 -chr18 16384314 . T C 2516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.519;ClippingRankSum=-0.012;DP=308;FS=4.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,97:308:99:2545,0,7530 -chr18 16384358 . TC T 6252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.340;ClippingRankSum=-2.489;DP=282;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=22.17;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,10:271:99:6290,0,8166 -chr18 16459502 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:287,0,450 -chr18 16553703 . C A 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.620;DP=95;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:1404,0,1796 -chr18 16578546 . G A 1334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.198;DP=108;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,39:108:99:1363,0,2493 -chr18 16637921 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.637;DP=13;FS=26.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,311 -chr18 16637924 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-2.637;DP=13;FS=26.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,311 -chr18 16757730 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.894;DP=128;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.228;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,23:128:99:357,0,4020 -chr18 16790174 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.068;DP=204;FS=2.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,50:203:99:944,0,5313 -chr18 16798614 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=1.724;DP=86;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.10;ReadPosRankSum=-2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:295,0,2675 -chr18 17067856 . G T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.095;ClippingRankSum=3.933;DP=372;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=2.95;ReadPosRankSum=3.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,73:371:99:1127,0,13488 -chr18 17067868 . TCTGTACAAACCACATATAAATGATCAGTGTAACAAACAACAATATTGTTTCCAGCATCTGATGCAGCACTTAC T 15706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.808;DP=356;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=27.36;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,348:352:99:15744,1160,0 -chr18 17068013 . TCCTGTGTGCGATAAAGAGTCAGCAACCAAATCACCACTTCAGCACCATTTACACTTCATTTGCAGTTTCAACCCAATGAAACCTTAATGGCAGTTTAAAATTCTTAGATCTGCATA T 12813.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=1.674;DP=365;FS=1.035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=31.41;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,322:336:99:12851,974,0 -chr18 17070246 . T C 14441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=375;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,351:351:99:14470,1056,0 -chr18 17166286 . AC A 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.540;DP=60;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:312,0,990 -chr18 17263620 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-1.415;DP=72;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:331,0,2045 -chr18 17276024 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.820;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=7.67;ReadPosRankSum=3.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:473,0,1495 -chr18 17426065 . TA T 279.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:7:316,7,0 -chr18 17430333 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-2.968;DP=197;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=1.02;ReadPosRankSum=2.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,29:196:99:230,0,6268 -chr18 18129449 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.909;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,36:118:99:931,0,3056 -chr18 18160433 . T C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=-1.326;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=28.71;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:832,0,176 -chr18 18437922 . C T 1692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.524;DP=506;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=3.35;ReadPosRankSum=2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:404,101:505:99:1721,0,15335 -chr18 18439887 . T A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-1.937;DP=242;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,40:242:99:527,0,7905 -chr18 18474614 . A C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 -chr18 18497962 . A C 424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:453,33,0 -chr18 18600791 . A G 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.175;DP=32;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=30.46;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1003,0,130 -chr18 18613003 . A C 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr18 18613133 . AG A 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:338,0,303 -chr18 18613242 . G A 1224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1253,87,0 -chr18 18613243 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:362,0,604 -chr18 18613697 . T G 2731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2760,199,0 -chr18 18648310 . TGGTGAGACTCTTTGACTATTCATGAAGGAGGGAACATTTCTATAACAAGATTTATTCATCAAATCAGGTTTATAATCCCTTTTCTCTCTTGTA T 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.891;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=27.39;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:722,0,450 -chr18 18651066 . G GT 347.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.522;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=18.28;ReadPosRankSum=-2.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:9:384,0,9 -chr18 18652057 . A C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:322,0,159 -chr18 18681711 . T TA 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.666;DP=42;FS=15.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:397,0,584 -chr18 18682636 . CTT C 1346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.124;DP=75;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1384,0,1469 -chr18 18767078 . CCGAGGTAACGACATCATCATTTAATCAACATTATAGGAATT C 3112.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.017;DP=111;FS=4.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,82:108:99:3150,0,3050 -chr18 18767080 . GAGGTAACGACATCATCATTTAATCAACATTATAGGAATTTGCGAATATAAAATATTTGGCTGCTCAATGATGTGTTTGGTGAAAAAGCAGAAGTGCAGTTAGTTTGTGTTATCTATGGCCTGTCAGCTTCTTTAATGTGTCTTTATCAACATAAAAATGTCCAC G 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=1.250;DP=113;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,26:111:99:457,0,5686 -chr18 18767121 . GCGAATATAAAATATTTGGCTGCTCAATGATGTGTTTGGTGAAAAAGCAGAAGTGCAGTTAGTTTGTGTTATCTATGGCCTGTCAGCTTCTTTAATGTGTCTTTATCAACATAAAAATGTCCAC G 3112.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.131;DP=106;FS=5.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=29.37;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,78:104:99:3150,0,2410 -chr18 18770302 . CAGGTACATCTTTTTTCGCCTGGTGCTTTAATGACAGATTAAATTCACTTCATTAAACTAAATATAGTAAATATTGAATGTTTTCTTTTTAA C 3245.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.936;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3283,299,0 -chr18 18809687 . T G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 -chr18 18809776 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr18 18813713 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.992;DP=31;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:240,0,473 -chr18 18813865 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.626;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:454,0,455 -chr18 18813882 . T C 754.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:54:783,54,0 -chr18 18880157 . T TA 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr18 19200087 . C CT 719.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-1.009;DP=60;FS=2.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,41:57:99:934,0,318 -chr18 19227662 . CGGTCAGTATTTCCTTCTCAAATGGCTGTCATGTGGACTGTTTACAGAAATAAGGCTAATGGGCATTGCTTAATGTGTCTGGATCTGTTTTGTCTTCATTCATGCA C 3474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=2.044;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,89:92:99:3512,309,0 -chr18 19598230 . TCTGAAAGACAAATAAAAGGTGAATTGAAGGACACAAATAGTTAAATCGCAAACTGATTAACATGGCAATCACTCAC T 3173.72 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.477;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=30.68;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3211,268,0 -chr18 19808493 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-1.591;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:322,0,199 -chr18 20029383 . TGTGAGTGATGTTAACTTACATTAAAGATTTTGTAGCAAAATGCTCTGAATGCTAACTAGCTGACTTTCCATGTTTTCAG T 840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.988;DP=162;FS=1.783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=5.19;ReadPosRankSum=-2.969 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,157:162:99:878,331,0 -chr18 20249014 . AAGGTAACGTTGTGCATGATTGTAGTCGAACGGGTCATTATCTATATTTTGTTCTCACGAGTAATGCAATTGCTATATGACATGTCTTTGTTGACCCTTTCCAATC A 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:417,0,796 -chr18 20270679 . A G 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:24:335,24,0 -chr18 20314376 . AAGGTATACTTACTATAGAATGAGGTGGTAAGTCTGTTTATTTGGGTATGATTACATTTGTAATTGATTTATTTTCTGAAAC A 2707.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=1.448;DP=62;FS=3.382;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:2745,227,0 -chr18 20314550 . GAGGTATGAAAGTATCTTTGCAAAGTGGGATTTTTAAAAAATATAATTTGTTATATATTTCATAGGATTCTTTTCACAC G 2722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=1.679;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=25.26;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:2760,214,0 -chr18 20364764 . CA C 620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-0.483;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:658,0,199 -chr18 20365051 . C T 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-1.491;DP=26;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=30.34;ReadPosRankSum=2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:817,0,140 -chr18 20365340 . CA C 1188.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.825;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:1226,0,111 -chr18 20896581 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.540;DP=157;FS=1.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,31:157:99:586,0,4922 -chr18 21665358 . T A 3122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-1.392;DP=97;FS=3.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=32.19;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,82:97:99:3151,0,185 -chr18 21692933 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=1.294;DP=62;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:589,0,1643 -chr18 21693877 . T C 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.394;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,33:49:99:1228,0,451 -chr18 21717087 . C T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr18 21717139 . C A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr18 21717212 . T G 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr18 21717242 . G T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr18 21718446 . T C 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -chr18 21803104 . TA T 727.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:76:765,76,0 -chr18 21955324 . G C 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 -chr18 22073944 . CTT C,CT 527.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-1.348;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,19,7:27:99:875,182,150,559,0,489 -chr18 22172942 . A G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.320;DP=70;FS=9.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.294;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:554,0,1813 -chr18 22187653 . T TA 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.214;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:251,0,116 -chr18 22199066 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:99:262,0,322 -chr18 22432467 . A T 943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:972,69,0 -chr18 22432482 . A C 2475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2504,178,0 -chr18 22433160 . C CT 926.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=1.054;DP=312;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,58:195:99:964,0,3733 -chr18 22433225 . TCA T 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:28:297,28,0 -chr18 22433228 . TG T 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:28:297,28,0 -chr18 22433559 . A C 585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:614,42,0 -chr18 22433582 . A G 1061.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1090,75,0 -chr18 22433651 . A T 1161.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.619;DP=45;FS=6.690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1190,81,0 -chr18 22434601 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr18 22434974 . T TCA 519.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 -chr18 22435593 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=3.363;DP=46;FS=58.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=16.52;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:788,0,956 -chr18 22435603 . A G 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=5.094;DP=67;FS=56.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=25.77;ReadPosRankSum=-4.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:1755,0,239 -chr18 22435746 . CA C 5726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=1.201;DP=245;FS=4.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,183:203:99:5764,0,117 -chr18 22435903 . G T 1979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2008,141,0 -chr18 22437308 . A G 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=-1.267;DP=140;FS=4.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:983,0,5043 -chr18 22437477 . T C 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=3.638;DP=141;FS=62.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=7.84;ReadPosRankSum=-2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,30:134:99:1134,0,4073 -chr18 22437488 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.424;DP=166;FS=28.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=1.64;ReadPosRankSum=3.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,24:158:99:300,0,6125 -chr18 22437593 . C G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=4.036;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.92;ReadPosRankSum=-4.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:402,0,1617 -chr18 22437766 . C T 1944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=-1.660;DP=140;FS=8.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1973,0,2970 -chr18 22437853 . T A 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=-2.243;DP=110;FS=5.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=13.61;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:1525,0,1941 -chr18 22756558 . C CA 885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.179;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:944,0,507 -chr18 22756702 . C CT 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=1.285;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:893,0,963 -chr18 22756730 . T TA 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=1.395;DP=80;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:968,0,870 -chr18 23653040 . GA G 1920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-1.298;DP=125;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=15.37;ReadPosRankSum=2.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,81:119:99:1958,0,523 -chr18 24523981 . T G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr18 24718843 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=-0.027;DP=123;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,30:123:99:513,0,3407 -chr18 24727513 . TCTGAAAAACAAAGGTGGGATTGAATGTAAAGCTCAGGTGTAATGCTAACTCCTGGATTTGACTGTGTAAATGTGCAC T 4142.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=3.082;DP=111;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,99:111:99:4180,0,1480 -chr18 24730392 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=-0.848;DP=101;FS=8.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,20:101:99:333,0,3165 -chr18 24855374 . T C 609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:638,45,0 -chr18 24855832 . T C 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:350,24,0 -chr18 24855835 . T C 226.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:255,0,16 -chr18 25343914 . G T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=-2.371;DP=38;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=13.15;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:528,0,2102 -chr18 25562125 . C T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:445,30,0 -chr18 25563370 . T A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=3.187;DP=33;FS=10.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:470,0,724 -chr18 25564220 . T C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr18 25880326 . T A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=-2.825;DP=50;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:901,0,851 -chr18 25880920 . T A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-1.084;DP=52;FS=2.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:812,0,1067 -chr18 25881364 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:268,0,200 -chr18 25881497 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=30.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:305,0,56 -chr18 25881576 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-1.908;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=11.28;ReadPosRankSum=-2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:299,0,564 -chr18 25881662 . AT A 733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.016;DP=31;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:771,0,104 -chr18 25883230 . C G 9229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.866;DP=496;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,282:496:99:9258,0,7418 -chr18 26217825 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-1.985;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=16.11;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:431,0,441 -chr18 26222559 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.634;DP=36;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:647,0,601 -chr18 26231961 . A T 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=-0.494;DP=45;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:999,0,509 -chr18 26401052 . C CT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=1.164;DP=18;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:280,0,119 -chr18 26403079 . A G 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.307;DP=70;FS=3.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1089,0,1327 -chr18 26416387 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-0.983;DP=18;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=24.82;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:475,0,350 -chr18 26416390 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.196;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:475,0,350 -chr18 26620259 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:312,0,286 -chr18 26634205 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.341;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:428,0,354 -chr18 26652398 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,225 -chr18 26668438 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.341;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,465 -chr18 26680986 . T A 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr18 26681741 . C A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=1.835;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=27.40;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:357,0,474 -chr18 26696603 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.592;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:320,0,368 -chr18 26743888 . G T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.801;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=16.28;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:484,0,475 -chr18 26756528 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=-0.190;DP=34;FS=4.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:518,0,638 -chr18 26799063 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.011;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:829,0,867 -chr18 26824825 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.491;DP=49;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:794,0,805 -chr18 26863512 . C A 6789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-0.399;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.118;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,193:300:99:6818,0,3417 -chr18 26863794 . T C 3621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.201;DP=208;FS=2.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,113:208:99:3650,0,3296 -chr18 27012765 . TGGTGAGAAATAGCACAAGCTTCTGTCTTCAAGAAGACTCTAGTTTCCAAAATCTCATCTGTTCTTCTCCCTAAAACCA T 2670.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=2.047;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=28.22;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,58:63:99:2708,233,0 -chr18 27017254 . G A 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.305;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:868,0,286 -chr18 27025471 . A T 205.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:14:234,0,14 -chr18 27029815 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,188 -chr18 27030117 . T TAC 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:303,0,54 -chr18 27232845 . G T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.220;DP=31;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:610,0,457 -chr18 27243313 . G A 278.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:307,0,19 -chr18 27254103 . T TA 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.941;DP=31;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:436,0,483 -chr18 27254175 . G T 2408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=-0.340;DP=130;FS=5.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:2437,0,2139 -chr18 27301824 . A G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.693;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:483,0,339 -chr18 27303264 . A T 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:646,45,0 -chr18 27304026 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,389 -chr18 27304795 . G A 659.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.193;DP=18;FS=5.563;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:15:688,15,0 -chr18 27558749 . G T 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.430;DP=142;FS=7.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,52:142:99:1730,0,3146 -chr18 27573476 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.787;DP=29;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:378,0,634 -chr18 27573506 . C CA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.060;DP=32;FS=3.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:308,0,430 -chr18 27573651 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,451 -chr18 27573734 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.528;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:382,0,371 -chr18 27573891 . C A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.012;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:547,0,2226 -chr18 27574186 . CT C 409.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:447,43,0 -chr18 27575040 . T C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=2.558;DP=28;FS=14.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=23.67;ReadPosRankSum=-2.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:691,0,272 -chr18 27942900 . G A 2838.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2867,202,0 -chr18 27945920 . G A 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.803;DP=53;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1093,0,781 -chr18 27948594 . G A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.885;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:748,0,264 -chr18 27949750 . G T 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-1.135;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=22.73;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:892,0,496 -chr18 28090947 . A G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr18 28090996 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr18 28268567 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.848;DP=22;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:600,0,314 -chr18 28923663 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr18 29118834 . G A 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.289;DP=43;FS=4.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:937,0,540 -chr18 29123744 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,908 -chr18 29141148 . C G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.742;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:624,0,537 -chr18 29354319 . CTT C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:285,0,120 -chr18 29845207 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.267;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:317,0,440 -chr18 29847633 . C T 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=1.728;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:687,0,687 -chr18 29904346 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=21.32;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:348,0,719 -chr18 29904861 . C G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:357,0,327 -chr18 29915117 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.216;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:318,0,355 -chr18 29916516 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:349,0,211 -chr18 29916924 . T A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.86;ReadPosRankSum=2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:394,0,198 -chr18 29917340 . A G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:347,0,49 -chr18 29928800 . A T 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=-0.956;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=23.22;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:841,0,789 -chr18 29930281 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.765;DP=24;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=8.74;ReadPosRankSum=2.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:238,0,575 -chr18 29932702 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.725;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:618,0,314 -chr18 29949862 . T C 385.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.61;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:8:413,0,8 -chr18 29951006 . C A 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr18 29955209 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:277,0,409 -chr18 29961865 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=1.743;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:447,0,233 -chr18 29963841 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.217;DP=31;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:547,0,554 -chr18 29970283 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.495;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:640,0,236 -chr18 29978186 . A G 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr18 29979638 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.678;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:249,0,129 -chr18 30102106 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.625;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:299,0,203 -chr18 30314506 . G A 287.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:316,0,19 -chr18 30422595 . A AAC 1298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-1.048;DP=140;FS=9.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1336,0,1550 -chr18 30448035 . TCTGTAAAGATTTGTTAATATGTCAACATCACACAAACAGACTCGGGAAATCATGAAAAACATTTGAAGAAGCCTCAAGTTTAC T 3377.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=1.193;DP=79;FS=2.109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3415,260,0 -chr18 30453914 . TGTGTGTTATATGAGAATTGGAAAAAAAAAACGTTGTTTGAGTTTTTATTTCAATGTGCTAATTTCCGTTGTTTAATTTCAG T 14235.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=1.407;DP=332;FS=2.121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=28.30;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,320:323:99:14273,1108,0 -chr18 30454384 . G GCA 3591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-3.526;DP=386;FS=4.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.456;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,120:331:99:3629,0,6509 -chr18 30795022 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=24.24;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:416,0,165 -chr18 30795244 . C CT 242.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:280,27,0 -chr18 30964268 . G GT 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr18 30980693 . G A 254.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:283,0,21 -chr18 31095342 . GT G 298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:336,33,0 -chr18 31095475 . T TA 214.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:38:315,38,0 -chr18 31854734 . A T 230.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:259,21,0 -chr18 31957900 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-2.051;DP=28;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:316,0,358 -chr18 31979135 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr18 32210316 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.214;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.725;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:243,0,630 -chr18 32384631 . T C 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.780;DP=34;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:729,0,472 -chr18 32384895 . T A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr18 32388570 . G C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.423;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:765,0,744 -chr18 32393314 . G A 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-1.290;DP=57;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=18.80;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,31:57:99:1100,0,952 -chr18 32441147 . C CT 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=1.600;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.66;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:68:687,68,0 -chr18 32802349 . C T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.488;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,75:342:99:1519,0,10461 -chr18 32802414 . A C 19894.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.350;DP=614;FS=2.891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=32.40;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,604:606:99:19923,1778,0 -chr18 32943899 . G T 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=1.040;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=23.92;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1583,0,1971 -chr18 33327657 . C CAT 225.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr18 33486995 . T A 269.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:298,0,17 -chr18 33539968 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:258,0,296 -chr18 33540929 . T A 1228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1257,90,0 -chr18 33542888 . G A 579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:608,45,0 -chr18 33542904 . A G 466.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:1:492,0,1 -chr18 33582133 . A T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=-0.223;DP=41;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:659,0,617 -chr18 33596010 . G GT 419.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:457,45,0 -chr18 33596903 . A T 634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:663,45,0 -chr18 33749701 . T C 6047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.976;ClippingRankSum=1.613;DP=356;FS=8.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,189:356:99:6076,0,5358 -chr18 33775344 . CA C 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-1.194;DP=66;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:751,0,802 -chr18 33775465 . T TA 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.450;DP=49;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:706,0,529 -chr18 33776036 . A G 2551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=1.033;DP=124;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,76:123:99:2580,0,1536 -chr18 33787911 . TCCTACAGACAGACAAACAATTGAAATATTCAGACTCAAGTTCTGCTCCTCAATTATGCGATGAAGTGAGAACAAGTTTTCA T 4609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:4647,376,0 -chr18 33834337 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:281,0,210 -chr18 33834612 . TA T 1981.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.650;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.65;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:2019,175,0 -chr18 33835419 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.402;DP=84;FS=2.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=2.43;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,14:84:99:232,0,5820 -chr18 33841234 . GACCTGCACACAATGCATACATGTAATTATGACAGACATTCTGAGAAAAAAACCCTGCCATGAAACAAACGTTTTCCTC G 8431.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.946;DP=193;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,181:183:99:8469,733,0 -chr18 33864560 . G A 2524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.090;DP=140;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:2553,0,2479 -chr18 33885818 . A T 206.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:235,0,19 -chr18 33888941 . G A 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.357;DP=83;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,49:83:99:1588,0,1201 -chr18 33981856 . T A 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.654;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1255,0,1258 -chr18 33987223 . G A 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=-1.161;DP=92;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:1334,0,1842 -chr18 34147799 . GT G 2036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-1.064;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,55:142:99:2074,0,2190 -chr18 34179494 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.282;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.352;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:589,0,372 -chr18 34234346 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-1.555;DP=115;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=9.02;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,38:115:99:1066,0,2821 -chr18 34420452 . G T 3731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.432;DP=201;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,118:201:99:3760,0,2663 -chr18 34420845 . A C 1960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=1.097;DP=116;FS=4.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1989,0,2051 -chr18 34421184 . CA C 1682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-1.722;DP=75;FS=1.538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=22.44;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,66:74:71:1730,71,0 -chr18 34424624 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr18 34436482 . C A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.474;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:73:577,0,73 -chr18 34438950 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.168;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=31.88;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:77:634,0,77 -chr18 34987474 . GT G 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.999;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:388,0,386 -chr18 35144203 . GT G,GTT 226.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,5:12:99:307,139,156,199,0,236 -chr18 35207238 . A C 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr18 35285697 . T A 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr18 35541812 . C CAG 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=3.070;DP=20;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=11.34;ReadPosRankSum=-2.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:264,0,365 -chr18 35624248 . TA T 3850.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3888,346,0 -chr18 35624944 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.596;DP=120;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=3.81;ReadPosRankSum=2.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:485,0,3710 -chr18 36636825 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=-2.273;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.597;QD=11.32;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:594,0,1132 -chr18 36665733 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.069;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:866,0,1217 -chr18 37192969 . C T 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.153;DP=137;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,34:136:99:733,0,3693 -chr18 37198941 . CA C 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=-2.236;DP=81;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:406,0,1167 -chr18 37201001 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-2.533;DP=69;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.72;ReadPosRankSum=2.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:492,0,1727 -chr18 37202058 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=1.570;DP=46;FS=6.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:417,0,1123 -chr18 37202093 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=-0.712;DP=48;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:431,0,1276 -chr18 37202418 . C CT 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=-0.644;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:647,0,2517 -chr18 37202629 . T A 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-1.049;DP=59;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:350,0,1769 -chr18 37202638 . C CT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-1.124;DP=58;FS=4.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:265,0,979 -chr18 37212200 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.422;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.618;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:884,0,1572 -chr18 37270725 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.875;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:335,0,1147 -chr18 37271257 . G C 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.811;DP=49;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:629,0,1010 -chr18 37334529 . C CT 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.206;DP=193;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,47:164:99:650,0,3067 -chr18 37483715 . A G 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-1.890;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=22.54;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:772,0,413 -chr18 37483812 . A G 1315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.833;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1344,0,205 -chr18 37483913 . A G 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.206;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:849,0,839 -chr18 37821205 . A T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.811;DP=41;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:460,0,941 -chr18 37822179 . T C 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.181;DP=47;FS=6.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:814,0,786 -chr18 37825182 . GA G 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-1.960;DP=81;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:884,0,920 -chr18 37826414 . AT A 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-0.715;DP=69;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:462,0,859 -chr18 38596676 . T A 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr18 38682926 . A T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.966;DP=46;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=14.67;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:703,0,906 -chr18 38683557 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.043;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:318,0,691 -chr18 38683887 . CT C 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.976;DP=68;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:388,0,751 -chr18 38684521 . G A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.573;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1157,0,3380 -chr18 38684523 . T TA 1225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.235;DP=87;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,35:85:99:1263,0,1160 -chr18 38684621 . T C 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.676;DP=65;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:1185,0,1109 -chr18 39059136 . CA C 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=1.805;DP=42;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:265,0,519 -chr18 39153271 . T A 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.018;DP=219;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,57:219:99:1267,0,5930 -chr18 39176810 . C T 1663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.837;DP=318;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,79:315:99:1692,0,10930 -chr18 39210163 . ACTGGGAAGAGAGAGATAATGACATCAAAACAAACATCACATCAGAATCATACTTGCTCTCAGCACCAAACTCATTTCAACTCAC A 4857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=2.473;DP=113;FS=2.391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=27.04;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,106:109:99:4895,374,0 -chr18 39210346 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.244;DP=29;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:515,0,495 -chr18 39573064 . T A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.223;DP=31;FS=5.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:409,0,680 -chr18 39593540 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=1.134;DP=118;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,30:118:99:681,0,3276 -chr18 39646158 . C T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=1.361;DP=224;FS=0.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=6.66;ReadPosRankSum=-2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,64:224:99:1519,0,6137 -chr18 39650775 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.092;DP=124;FS=4.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:374,0,3862 -chr18 39858798 . C G 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.149;DP=45;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:855,0,696 -chr18 39860647 . TTCAGGTACTGAATCTTTCATCGCCTCTTTCTGTCTTCATTTATTGTCAAGATCTTGTGTTAATATCGGTCTGTTTC T 14138.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=2.435;DP=346;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=33.04;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,344:346:99:14176,1165,0 -chr18 39864680 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=2.221;DP=206;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,52:206:99:1090,0,12855 -chr18 39866118 . G A 4555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-2.085;DP=283;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,151:282:99:4584,0,4367 -chr18 39911979 . T A 1497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=2.860;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:1526,0,2337 -chr18 39912016 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=-0.641;DP=101;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:870,0,2612 -chr18 39920412 . G A 2743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.736;DP=151;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:2772,0,2281 -chr18 39923762 . C T 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=5.895;DP=97;FS=30.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:725,0,2552 -chr18 39924091 . C T 3742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.827;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,106:211:99:3771,0,3771 -chr18 39931409 . C A 2759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=1.069;DP=161;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:2788,0,2697 -chr18 39931573 . G C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.639;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,2:14:99:297,0,478 -chr18 39931930 . C CA 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.142;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:260,0,663 -chr18 39931939 . C G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.261;DP=45;FS=6.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:778,0,824 -chr18 39933295 . T TC 1163.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1207,123,0 -chr18 39933655 . A C 2379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2408,169,0 -chr18 39982616 . G C 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=-2.552;DP=142;FS=8.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,41:139:99:1101,0,6461 -chr18 39982617 . A G 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=-0.700;DP=138;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,31:136:99:645,0,11079 -chr18 39982620 . G A 3971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.039;DP=132;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,101:130:99:4000,0,1954 -chr18 39982656 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.162;DP=41;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=15.36;ReadPosRankSum=-3.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,9:40:99:658,0,11079 -chr18 39982752 . C G 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.365;DP=70;FS=10.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1207,0,1360 -chr18 39982776 . A G 2982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:3011,211,0 -chr18 39983026 . A T 3566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.804;DP=214;FS=1.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,99:214:99:3595,0,3935 -chr18 39983132 . A G 11540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=276;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,276:276:99:11569,831,0 -chr18 39983268 . G A 2939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.699;DP=194;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.462;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,86:194:99:2968,0,3563 -chr18 39983499 . A G 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-1.809;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,43:65:99:1463,0,715 -chr18 39983551 . A T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.192;DP=61;FS=6.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1078,0,1032 -chr18 39983779 . T C 2324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=1.363;DP=141;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:2353,0,2350 -chr18 39983914 . T A 1906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1935,129,0 -chr18 39983915 . T C 1906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1935,129,0 -chr18 39984570 . G GAA 545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:583,40,0 -chr18 41668413 . TA T 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=1.600;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:415,0,525 -chr18 41668726 . GA G 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.253;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.29;ReadPosRankSum=3.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:526,0,845 -chr18 42299289 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=2.172;DP=35;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:410,0,840 -chr18 42301550 . T A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.617;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:642,0,770 -chr18 42492644 . T A 1599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.504;DP=166;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,56:166:99:1628,0,3245 -chr18 42502057 . A C 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;ClippingRankSum=3.317;DP=238;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=3.20;ReadPosRankSum=2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,41:236:99:789,0,15131 -chr18 42502064 . A T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=2.695;DP=227;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,43:225:99:784,0,15131 -chr18 42502122 . G T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-1.555;DP=168;FS=19.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=3.87;ReadPosRankSum=3.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,36:167:99:678,0,12722 -chr18 42722292 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.137;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=14.23;ReadPosRankSum=2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:384,0,847 -chr18 42722745 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:311,0,348 -chr18 42723457 . TA T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.880;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:243,0,260 -chr18 42723505 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.853;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,490 -chr18 42764907 . T G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.148;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.259;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:780,0,809 -chr18 42781297 . C A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.138;DP=99;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:335,0,3024 -chr18 42782249 . T C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.332;DP=39;FS=7.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:552,0,1297 -chr18 42782428 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.519;DP=88;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,19:87:99:390,0,3722 -chr18 42782530 . T C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.216;DP=90;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:602,0,2838 -chr18 42782789 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-0.638;DP=48;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:678,0,1187 -chr18 42782810 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-1.770;DP=68;FS=10.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:500,0,1876 -chr18 42825502 . C T 4439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=1.474;DP=218;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,132:217:99:4468,0,2962 -chr18 42949594 . A G 2768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=-1.640;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,80:127:99:2797,0,1567 -chr18 42959880 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=2.017;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=6.87;ReadPosRankSum=-2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:399,0,3192 -chr18 42959893 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.783;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:394,0,3192 -chr18 42968647 . C T 2319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.268;DP=151;FS=14.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:2348,0,2792 -chr18 42974205 . G C 1910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.459;DP=132;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1939,0,2523 -chr18 42975075 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-2.339;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:470,0,1471 -chr18 42975076 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=-2.033;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:470,0,1473 -chr18 42976907 . C T 2959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-0.443;DP=165;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:2988,0,2744 -chr18 42980984 . C CT 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-0.978;DP=61;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:571,0,695 -chr18 42984007 . C A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.515;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=23.88;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:458,0,248 -chr18 42990918 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:377,0,279 -chr18 43014889 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.831;DP=33;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:556,0,579 -chr18 43022702 . GCTACATGAAGACAGAGAGGTGAGTCACTTGAAGGCCACATATGAGGGCGACTACCAAATTACCACAAATACACTGCAGGACTGTCGGGAACTTCAGCGCACTCAAAAACAGGCATGAACACACACGCACACACTCAC G 1523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=3.742;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=31.10;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,36:49:99:1561,0,6983 -chr18 43035295 . TCTACAAACAAAACACAAGACATGTAAATGACTCGGTAAAGACCAAATCTATTCAAGACAGTTAAATCATCAACACTGAGATAATTAGACCACAAATAAAACCCCTAC T 11285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.210;DP=281;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,263:276:99:11323,0,3968 -chr18 43049259 . C T 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-1.679;DP=61;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,33:60:99:1083,0,969 -chr18 43050042 . G A 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.429;DP=75;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.178;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:1367,0,1297 -chr18 43050297 . A G 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=-0.868;DP=73;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:1222,0,1505 -chr18 43054742 . G T 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=1.650;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.952;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:858,0,1214 -chr18 43061011 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-1.393;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:290,0,1220 -chr18 43062437 . G C 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.581;DP=55;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:944,0,1003 -chr18 43070185 . T C 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=1.238;DP=67;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1080,0,1260 -chr18 43070363 . G A 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.044;DP=74;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,31:74:99:1073,0,1436 -chr18 43070381 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.239;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:1106,0,1452 -chr18 43078419 . CAGGTTAGTGCAACCACCCGATTCCTTTTCTTGAGGTTAAAAAACTACTTGTTTGACAAAGTAATGCTTGACTTTCCTT C 3059.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=1.197;DP=74;FS=2.915;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:3097,291,0 -chr18 43079615 . C T 1660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-2.943;DP=87;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=19.09;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1689,0,2291 -chr18 43079699 . AT A 1486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.570;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1524,0,4443 -chr18 43112751 . C T 2578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.163;DP=157;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=16.43;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:2607,0,2671 -chr18 43125286 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-0.038;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:545,0,597 -chr18 43126945 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.817;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.381;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,395 -chr18 43187287 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.263;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:341,0,650 -chr18 43195671 . C T 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-1.516;DP=33;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:919,0,241 -chr18 43200426 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=-0.393;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=24.43;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:639,0,188 -chr18 43207973 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-0.170;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:474,0,488 -chr18 43218450 . G C 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.491;DP=49;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:853,0,809 -chr18 43226521 . C T 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=1.052;DP=69;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1332,0,954 -chr18 43236599 . CTACAAGGTTAGAACGGCT C 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=1.290;DP=60;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:305,0,9256 -chr18 43236603 . AAGGTTAGAACGGCTTTCATGTTGCATGCTAAAGGCCCTTGAATTTAGCATGACGACACTTTAAACTACTTCCTTCCTTCTTTCCTTC A 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=2.408;DP=67;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:311,0,11791 -chr18 43236621 . ATGTTGCATGCTAAAGGCCCTTGAATTTAGCATGACGACACTTTAAACTACTTCCTTCCTTCTTTCCTTC A 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=1.308;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=6.23;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:99:305,0,10865 -chr18 43237108 . C T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-0.429;DP=48;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:957,0,673 -chr18 43237936 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-1.902;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:587,0,193 -chr18 43239675 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.62;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:325,0,358 -chr18 43239799 . TA T 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.642;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:446,0,215 -chr18 43243758 . A G 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.434;ClippingRankSum=0.820;DP=135;FS=0.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,47:135:99:1468,0,3009 -chr18 43283798 . C T 2157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.752;ClippingRankSum=-1.625;DP=300;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=7.19;ReadPosRankSum=2.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,93:298:99:2186,0,7650 -chr18 43291524 . C T 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-0.116;DP=137;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:797,0,8397 -chr18 43293486 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-1.161;DP=142;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,31:142:99:584,0,8798 -chr18 43297095 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,344 -chr18 43308062 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.119;DP=32;FS=12.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:369,0,735 -chr18 43331021 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-1.416;DP=31;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:301,0,919 -chr18 43331304 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=1.296;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:282,0,929 -chr18 43645119 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-1.653;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:361,0,544 -chr18 43645150 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.665;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:604,0,490 -chr18 43645206 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-1.099;DP=33;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:540,0,539 -chr18 43664678 . G C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.119;DP=44;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:295,0,1207 -chr18 43671433 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.251;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:332,0,1175 -chr18 43674475 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.794;DP=44;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:359,0,1471 -chr18 43674921 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=1.693;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=12.62;ReadPosRankSum=-2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:268,0,420 -chr18 43675849 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.755;DP=26;FS=11.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:581,0,587 -chr18 43676504 . T G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.527;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:367,0,523 -chr18 43676635 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=1.584;DP=21;FS=14.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:359,0,367 -chr18 43676856 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.855;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=21.65;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:721,0,1123 -chr18 43985122 . A G 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=-2.763;DP=84;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1684,0,2970 -chr18 43985127 . G T 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-3.274;DP=82;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:1684,0,2970 -chr18 43988248 . C A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.959;DP=75;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:895,0,1678 -chr18 43992494 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.866;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:886,0,1681 -chr18 43992789 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.929;DP=96;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:661,0,2663 -chr18 43992949 . C T 1694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=1.611;DP=108;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1723,0,1930 -chr18 43994071 . T C 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-2.075;DP=93;FS=13.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=8.58;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,30:93:99:826,0,2403 -chr18 43995692 . C T 2270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.199;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=31.54;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,60:71:99:2299,0,175 -chr18 43996948 . C A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.748;DP=67;FS=8.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:1331,0,958 -chr18 43997020 . A C 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.323;DP=72;FS=10.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=20.26;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,44:72:99:1487,0,3602 -chr18 44006012 . T A 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=1.055;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=29.45;ReadPosRankSum=1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:1246,0,139 -chr18 44065023 . C T 3893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.239;DP=448;FS=17.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,147:448:99:3922,0,11203 -chr18 44065715 . G C 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.474;ClippingRankSum=-1.787;DP=308;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=3.84;ReadPosRankSum=5.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1212,0,927 -chr18 44088128 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=24.98;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:278,0,267 -chr18 44088129 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=2.383;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=22.71;ReadPosRankSum=-2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:278,0,267 -chr18 44088156 . A G 464.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=31.16;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:14:493,14,0 -chr18 44091546 . G T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=1.012;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:368,0,532 -chr18 44099455 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.375;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:461,0,291 -chr18 44100260 . T A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=1.826;DP=43;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:616,0,941 -chr18 44100569 . T A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-1.283;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:437,0,140 -chr18 44102034 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-0.528;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:762,0,552 -chr18 44112210 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:69:236,0,69 -chr18 44148990 . TCAGCATTACAGAACTCAAGTCTAGGCTTTATTGTCATTCTGCTACAAGAGAGAAACTAAATGTCGGTCTCAAAGGACCACAGAGCTACATATATAAACAGAAGCAGAAATATGAACA T 862.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=1.273;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=33.72;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,1:15:99:900,388,0 -chr18 44157123 . G C 2991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=1.902;DP=262;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=11.42;ReadPosRankSum=2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,91:261:99:3020,0,5910 -chr18 44159623 . A T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-0.051;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,48:198:99:1084,0,5773 -chr18 44173404 . A G 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.833;DP=240;FS=3.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,77:240:99:2049,0,6146 -chr18 44222040 . G T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-1.227;DP=224;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,51:224:99:995,0,6450 -chr18 44227578 . C A 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-0.729;DP=201;FS=7.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,42:201:99:924,0,10672 -chr18 44227579 . A T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.411;DP=204;FS=9.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.001;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,44:204:99:924,0,10672 -chr18 44228362 . T G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=3.610;DP=89;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:629,0,5386 -chr18 44228365 . T C 3395.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.537;DP=86;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=34.06;ReadPosRankSum=-1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,79:86:11:3423,0,11 -chr18 44228366 . T C 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-2.794;DP=84;FS=4.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,56:84:99:2171,0,2285 -chr18 44228726 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=2.282;DP=34;FS=9.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:290,0,871 -chr18 44228915 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=-0.015;DP=40;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:302,0,1330 -chr18 44229182 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=2.641;DP=54;FS=10.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=14.59;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:816,0,3471 -chr18 44229193 . C T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=2.241;DP=58;FS=9.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:785,0,2626 -chr18 44229441 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,146 -chr18 44229863 . C T 2306.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2335,166,0 -chr18 44229949 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=3.951;DP=28;FS=6.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=21.06;ReadPosRankSum=-3.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:618,0,852 -chr18 44229956 . G T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=3.750;DP=25;FS=10.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=23.59;ReadPosRankSum=-3.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:618,0,852 -chr18 44230356 . G A 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:63:882,63,0 -chr18 44230462 . A C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.385;DP=23;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:388,0,389 -chr18 44231567 . C T 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=1.265;DP=74;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:1015,0,1443 -chr18 44231620 . T A 2970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.867;DP=154;FS=2.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:2999,0,4457 -chr18 44231630 . T C 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=-0.168;DP=172;FS=4.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,44:171:99:972,0,8043 -chr18 44231992 . CTT C 3476.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-1.465;DP=55;FS=2.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.871;QD=30.62;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,36:41:99:3787,114,0 -chr18 44235606 . G T 2036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.253;DP=159;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,61:159:99:2065,0,3263 -chr18 44239372 . C T 3000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.371;DP=184;FS=0.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,95:184:99:3029,0,3117 -chr18 44239410 . G A 3545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.720;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.369;QD=16.49;ReadPosRankSum=2.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,107:215:99:3574,0,3707 -chr18 44255722 . C G 3027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.813;DP=210;FS=10.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,95:177:99:3056,0,3070 -chr18 44263669 . G T 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=-1.752;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,60:227:99:1436,0,6383 -chr18 44266727 . T C 5966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.093;DP=193;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=30.92;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,156:193:99:5995,0,570 -chr18 44293883 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-1.029;DP=33;FS=11.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.740;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:386,0,778 -chr18 44299715 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.712;DP=26;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:332,0,706 -chr18 44299718 . G C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.781;DP=26;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:91:813,0,91 -chr18 44299904 . A T 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=16.70;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:388,0,232 -chr18 44365626 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:250,0,804 -chr18 44366258 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr18 44366509 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=1.506;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:379,0,643 -chr18 44366846 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.465;DP=29;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:407,0,599 -chr18 44368692 . A C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:368,0,500 -chr18 44368958 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=17;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,411 -chr18 44369042 . T A 650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:679,48,0 -chr18 44371528 . T A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=1.641;DP=382;FS=2.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,78:382:99:1204,0,16457 -chr18 44372770 . G A 885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=1.107;DP=27;FS=9.556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=32.81;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:40:914,40,0 -chr18 44399552 . C T 2105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.313;DP=326;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,89:326:99:2134,0,8934 -chr18 44399701 . AC A 788.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.210;DP=87;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:826,0,543 -chr18 44400272 . A C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.496;DP=271;FS=7.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=2.31;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,48:271:99:654,0,8787 -chr18 44421651 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.246;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:368,0,470 -chr18 44421956 . T A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.671;DP=17;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=30.57;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:34:548,0,34 -chr18 44443533 . T G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.449;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:365,0,322 -chr18 44445188 . A T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.843;DP=37;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:447,0,870 -chr18 44453567 . A T 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-2.576;DP=81;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:913,0,1643 -chr18 44458911 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.575;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:323,0,1748 -chr18 44459062 . C A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.717;DP=60;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:1203,0,824 -chr18 44459155 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-1.167;DP=57;FS=3.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:449,0,1386 -chr18 44468022 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.539;DP=63;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=6.52;ReadPosRankSum=2.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:439,0,3537 -chr18 44468025 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.361;DP=61;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:439,0,3537 -chr18 44468046 . A C 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-1.011;DP=60;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:759,0,1178 -chr18 44475937 . C G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=-1.149;DP=68;FS=5.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:337,0,1966 -chr18 44525469 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.12;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:375,0,174 -chr18 44525784 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:395,0,398 -chr18 44556427 . A G 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=1.648;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:503,0,598 -chr18 44573271 . C G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.320;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:395,0,358 -chr18 44574259 . A G 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:63:903,63,0 -chr18 44579047 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.575;DP=25;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:99:230,0,1477 -chr18 44579763 . T C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=26.04;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:497,0,159 -chr18 44581117 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=21.62;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:266,0,99 -chr18 44581452 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-1.768;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=26.41;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:398,0,316 -chr18 44581469 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.664;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=30.90;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:399,0,273 -chr18 44583307 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.234;DP=33;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:476,0,414 -chr18 44583326 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.655;DP=31;FS=11.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:467,0,554 -chr18 44619504 . T C 1755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-3.006;DP=100;FS=16.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1784,0,1749 -chr18 44619512 . T A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.293;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:507,0,4572 -chr18 44619649 . A T 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.457;DP=80;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:1262,0,2026 -chr18 44619708 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=-1.348;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.215;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,23:101:99:436,0,3262 -chr18 44619937 . G A 1601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.166;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,48:133:99:1630,0,2885 -chr18 44622345 . C T 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.829;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:740,0,2030 -chr18 44623407 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-0.936;DP=79;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:369,0,2458 -chr18 44628004 . G C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=2.023;DP=66;FS=16.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:437,0,1923 -chr18 44629170 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.251;DP=68;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:314,0,2027 -chr18 44668041 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.580;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:277,0,493 -chr18 44668255 . T G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-0.159;DP=32;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:385,0,768 -chr18 44668809 . C T 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-0.319;DP=34;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:740,0,416 -chr18 44681563 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=1.817;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:524,0,715 -chr18 44759536 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,337 -chr18 44770109 . A AT 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.069;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:623,0,228 -chr18 44770285 . T TA 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=-3.005;DP=51;FS=6.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=7.88;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:439,0,694 -chr18 44770609 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-0.206;DP=55;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:503,0,1401 -chr18 44770980 . GT G 1571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.304;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1609,0,884 -chr18 44776342 . C T 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-0.789;DP=104;FS=4.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1867,0,1575 -chr18 44776705 . T A 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.916;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1612,0,1541 -chr18 44776729 . G A 1809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.380;DP=110;FS=4.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1838,0,1826 -chr18 45038571 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.311;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:379,0,1056 -chr18 45042083 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:90:334,0,90 -chr18 45042192 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=27.78;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:306,0,125 -chr18 45042455 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:240,0,157 -chr18 45042579 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.286;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:364,0,373 -chr18 45042785 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-1.317;DP=28;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:276,0,539 -chr18 45043950 . GT G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-0.013;DP=43;FS=3.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:405,0,2263 -chr18 45103912 . GA G 210.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:245,0,0 -chr18 45107378 . A G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr18 47048924 . CCAGGTAAAGCTGGAGCTCACGCACAACATTTTTAAAAGATATTTCATATTTACGCGTTTGGCAGGTGGCATGTTTTTATCCCTTTCTGGGAACTGCACTCGTGTCTCTGCTGGAGTTTCTTCACCTGTTCAGATGCTGGACCTCAAGTTTATATCATGACGTTTGTCTGCTGTCTGGTTCAAAGGTCAAATTCTGATTCTTTTCTCTCTTCTTT C 2216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=4.000;DP=72;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.915;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,59:65:99:2254,0,1684 -chr18 47056033 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,434 -chr18 47087618 . A G 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 -chr18 47247826 . T A 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.195;DP=139;FS=0.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,46:139:99:1301,0,3513 -chr18 47265713 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,220 -chr18 47303880 . T G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,431 -chr18 47334073 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-0.538;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:280,0,1313 -chr18 47351176 . AT A 2151.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-4.408;DP=178;FS=65.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=12.09;ReadPosRankSum=5.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:2189,0,2450 -chr18 47385795 . G GT 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=-1.059;DP=53;FS=8.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:542,0,563 -chr18 47502551 . A T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-1.399;DP=58;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=17.60;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1049,0,803 -chr18 47716475 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-1.079;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=21.03;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:617,0,328 -chr18 47716723 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-2.493;DP=23;FS=14.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=16.16;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:400,0,363 -chr18 47716734 . A C 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:75:1067,75,0 -chr18 47716795 . C A 2825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:2854,199,0 -chr18 47716850 . A G 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.101;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,29:50:99:993,0,746 -chr18 47717603 . T C 581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:610,45,0 -chr18 47779590 . C G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:317,0,628 -chr18 47779598 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,628 -chr18 47779729 . C T 2396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2425,175,0 -chr18 47784910 . T C 2482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2511,181,0 -chr18 47806650 . A T 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.274;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1210,0,1602 -chr18 47806656 . G A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.879;DP=55;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1214,0,1602 -chr18 47841268 . C G 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr18 47886388 . C T 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.030;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.267;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:947,0,302 -chr18 48077127 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.929;DP=96;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:256,0,2965 -chr18 48085144 . C T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.329;DP=111;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:99:886,0,2838 -chr18 48096296 . A T 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.716;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=18.15;ReadPosRankSum=3.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:1535,0,2046 -chr18 48097287 . T C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-1.004;DP=49;FS=6.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.617;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:860,0,853 -chr18 48097427 . C A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-1.859;DP=107;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:536,0,2355 -chr18 48097536 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.591;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.972;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:427,0,1689 -chr18 48097587 . T G 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-1.768;DP=78;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:606,0,1176 -chr18 48098683 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.22;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,1:8:99:246,0,554 -chr18 48099987 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.023;DP=29;FS=4.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:330,0,1094 -chr18 48116601 . C CT 452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.386;DP=52;FS=6.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:490,0,742 -chr18 48116616 . G A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.145;DP=55;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:774,0,1030 -chr18 48116716 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.778;DP=26;FS=7.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:377,0,514 -chr18 48164237 . C T 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;ClippingRankSum=-1.746;DP=136;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,46:136:99:1191,0,5185 -chr18 48164346 . T C 2210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.530;DP=285;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=7.76;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,86:285:99:2239,0,7657 -chr18 48168632 . T C 2297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.837;DP=282;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,92:282:99:2326,0,8644 -chr18 48272823 . T A 509.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:538,39,0 -chr18 48712816 . G T 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-2.251;DP=107;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:1435,0,2157 -chr18 48713389 . A T 2005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=-2.049;DP=125;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:2034,0,2121 -chr18 48813832 . A AGT 1966.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.920;DP=91;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=21.61;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,64:77:99:2004,0,497 -chr18 48981252 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:288,0,312 -chr18 48982506 . C A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.902;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:581,0,798 -chr18 48982554 . GA G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-0.512;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:267,0,888 -chr18 48982617 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.456;DP=35;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:266,0,1216 -chr18 49004210 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:249,0,450 -chr18 49297761 . C T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.714;DP=80;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:734,0,2156 -chr18 49297805 . A C 2077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.603;DP=185;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,65:185:99:2106,0,6940 -chr18 49298142 . C T 3227.04 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.149;DP=242;FS=0.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,94:241:99:3255,0,5067 -chr18 49298275 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.158;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:271,0,274 -chr18 49349742 . C T 4134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=1.208;DP=259;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,118:259:99:4163,0,4553 -chr18 49356656 . A C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.639;DP=337;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,51:337:99:490,0,11052 -chr18 49370772 . C T 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.322;DP=99;FS=3.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:1410,0,1889 -chr18 49378105 . G C 1920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.173;DP=142;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1949,0,2769 -chr18 49378220 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=1.455;DP=100;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:673,0,2725 -chr18 49382595 . TGGTGTGTTTAGAGCTCATTTCTGATGAGACATTCCTGAATTATATTCTGTCTGTGATGTGTTTCTGCATCTTTTA T 5332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=3.436;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=22.68;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,130:146:99:5370,0,3801 -chr18 49386650 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=-2.064;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:593,0,2177 -chr18 49391205 . ACT A 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.36;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,228 -chr18 49391847 . ATC A 225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:381,33,0 -chr18 49392895 . T C 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.596;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:520,0,309 -chr18 49393265 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=1.661;DP=37;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:702,0,1302 -chr18 49536504 . G A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.743;DP=104;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.867;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1734,0,1830 -chr18 49548753 . A G 1868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.034;DP=107;FS=4.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1897,0,1676 -chr18 49678857 . CAGAGCG C 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.308;ClippingRankSum=-3.413;DP=28;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:253,0,348 -chr18 49778090 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=1.010;DP=24;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:358,0,341 -chr18 49806089 . G GGT 1282.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.362;DP=69;FS=2.428;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:48:52:1320,52,0 -chr18 49806500 . GGT G 560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-0.863;DP=75;FS=3.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=7.48;ReadPosRankSum=2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:598,0,1693 -chr18 49846473 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=-0.967;DP=117;FS=9.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:479,0,3558 -chr18 49854694 . TCTGAAGATGATCACGCACACACACACACATCAGTGACAGAAGAGCAGCGGTACACACTCACACACGCTCACACTCAC T 1423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=1.420;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=34.73;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,34:40:99:1461,0,2035 -chr18 49856564 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-2.276;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:275,0,412 -chr18 49858014 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-1.740;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:262,0,497 -chr18 49861490 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-1.347;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:320,0,378 -chr18 49873668 . G A 4850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.518;DP=270;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,138:270:99:4879,0,4548 -chr19 8726 . TCCTACACAAACACACACACACACAAACACACACACACACACACACAGAGCAGTGTGAGCGGCTGCAGGACAGTGCCACCTGCAGGAGAGTCTGCTGCTCTTCA T 5064.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=1.467;DP=135;FS=3.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=32.68;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,120:135:99:5102,0,1028 -chr19 28653 . CGTAAGTGTGGCCATCCTTTGACAGACATTGAAGATGTTTTCAGATTGTGAGTCTCTAACCCTGACATGTGTCTCTCTGCAG C 1795.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=2.491;DP=46;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,43:46:61:1833,0,61 -chr19 41891 . AGTGTGTGTGCTGCAGCATCTGAACACGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGCGT A 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.540;DP=43;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=6.51;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,1:36:99:317,0,5415 -chr19 42077 . GCAGGTGCGCACACACACACACACACACTCTCTCTTTCACCTGTTCACCTGCTCACACCTGTGCTGCTCTA G 12059.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.035;DP=315;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,308:311:99:12097,1058,0 -chr19 61821 . A AGTGT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-0.246;DP=108;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=1.95;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:306,0,2253 -chr19 64303 . CCCTGAAACACACACGAGGGTTTAATGCTGTGTGTCAGCATCACCTGCACACTGATGTGTGTACGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAACGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTCTGTACTGAAAAACACATA C 4199.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=3.293;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=33.80;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,109:114:99:4237,326,0 -chr19 69051 . T C 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 -chr19 69067 . A G 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:709,51,0 -chr19 74378 . T G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.861;DP=73;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:589,0,1728 -chr19 74390 . T C 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.822;DP=61;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,41:61:99:1453,0,530 -chr19 76732 . G C 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=-1.237;DP=72;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:767,0,1571 -chr19 77116 . T G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr19 78043 . C T 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.621;DP=92;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=19.17;ReadPosRankSum=2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,55:92:99:1792,0,1233 -chr19 78275 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=23.05;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:397,0,155 -chr19 78579 . T C 1474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1503,111,0 -chr19 78657 . T C 983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1012,75,0 -chr19 79098 . A C 2117.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2146,154,0 -chr19 79164 . T C 2322.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2351,175,0 -chr19 79300 . C T 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.463;DP=79;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,50:79:99:1691,0,944 -chr19 79315 . A G 3501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:3530,268,0 -chr19 79645 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-1.702;DP=38;FS=7.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:497,0,753 -chr19 80737 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-1.496;DP=78;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=2.63;ReadPosRankSum=-1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:233,0,2323 -chr19 81587 . C T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-3.586;DP=42;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:738,0,603 -chr19 81628 . T C 2705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2734,208,0 -chr19 82127 . G A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.267;DP=120;FS=0.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,42:120:99:1388,0,2624 -chr19 131744 . AACAGTGTTAGTAGTGTTGTCATAGAGACAGTGTAAGTAGTGTTGTCATAGAG A 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,18:18:99:631,0,909 -chr19 328732 . G A 1785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.266;DP=156;FS=6.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,56:155:99:1814,0,3296 -chr19 341063 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr19 341114 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=1.066;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:697,0,103 -chr19 341151 . G C,T 877.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,5,22:27:99:1006,855,845,156,0,117 -chr19 381740 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.073;DP=24;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=21.07;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:534,0,320 -chr19 384747 . C G 3831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:3860,0,217 -chr19 384748 . A G 3831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:3860,0,219 -chr19 384828 . T C 3830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.025;DP=182;FS=7.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=21.05;ReadPosRankSum=-1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,80:96:99:3859,0,252 -chr19 384832 . G A 3831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.324;DP=190;FS=7.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,84:100:99:3860,0,174 -chr19 384923 . G C 2815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=-1.994;DP=212;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,46:128:99:2844,0,3742 -chr19 384981 . G A 2816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.878;DP=147;FS=14.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=19.16;ReadPosRankSum=2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:2845,0,3808 -chr19 385002 . A C 2817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=2.060;DP=130;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=21.68;ReadPosRankSum=-2.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,57:73:99:2846,0,3739 -chr19 385075 . C T 4555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-4.150;DP=327;FS=7.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,85:206:99:10457,0,6930 -chr19 385120 . T G 4142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-1.288;DP=352;FS=8.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,100:222:99:4171,0,7593 -chr19 385202 . T C 11471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.665;DP=272;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=30.37;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,206:207:99:11500,0,5101 -chr19 385284 . C G 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-3.360;DP=67;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=12.04;ReadPosRankSum=3.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:835,0,786 -chr19 385293 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=2.099;DP=67;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:586,0,1159 -chr19 385314 . GC G 485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:39:523,39,0 -chr19 385319 . T C 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:39:523,39,0 -chr19 426355 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.139;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:472,0,152 -chr19 435832 . G C 1599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.443;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=32.65;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,42:49:52:1628,0,52 -chr19 440697 . C G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-2.454;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,618 -chr19 444253 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.249;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,390 -chr19 486967 . G C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.410;DP=23;FS=9.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:93:675,0,93 -chr19 500087 . G T 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.610;DP=38;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:730,0,518 -chr19 540346 . G A 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-1.666;DP=67;FS=5.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=20.92;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1430,0,1703 -chr19 540350 . A G 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-1.489;DP=65;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,42:65:99:1644,0,656 -chr19 540604 . A C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,573 -chr19 540608 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-2.392;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=19.21;ReadPosRankSum=-2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:278,0,573 -chr19 542705 . CCAGGAGCTGCAGGAGGTCAAAGGTCGCGCAGCCTCCACACAT C 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=3.483;DP=50;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=13.97;ReadPosRankSum=-2.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:736,0,7498 -chr19 560716 . AAGGTGGACAGCGGCTAGCTCACCGCTCGGCTACAATACAAGATGTGTTATGTAAACGCAGCTAGCATCTCCGCTAACCCCTGCGTGTCTGTCTCCTC A 4182.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.636;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,89:91:99:4220,407,0 -chr19 560899 . G A 2934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-0.950;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,81:110:99:2963,0,642 -chr19 617001 . CGT C 891.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=-0.963;DP=45;FS=5.283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:80:929,80,0 -chr19 617104 . TTG T 214.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:252,22,0 -chr19 740134 . CGTGAGACTCCACACACACACACACACACACACACACACACACTCATGTGATGACAGTAAGTGTAGCTGATGCTGGTGTGTGCAG C 1868.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=1.410;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=31.54;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1906,150,0 -chr19 743581 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.490;DP=43;FS=7.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=23.37;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1033,0,340 -chr19 747120 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.278;DP=25;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:262,0,142 -chr19 754350 . TTC T 1061.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.427;DP=37;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=28.70;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1099,0,309 -chr19 754390 . A AAT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-0.308;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:280,0,1579 -chr19 771723 . A AACGCACAGC 231.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:269,17,0 -chr19 777655 . C CA 244.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:282,26,0 -chr19 845459 . C G 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.548;DP=34;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:934,0,173 -chr19 953742 . T A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-1.721;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:385,0,627 -chr19 991084 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:246,0,134 -chr19 1061565 . ACT A 495.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.302;DP=22;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=22.51;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:10:532,10,0 -chr19 1061890 . T A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=1.898;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=21.36;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:370,0,214 -chr19 1071093 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:240,0,115 -chr19 1247610 . CA C 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.345;DP=110;FS=7.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,58:83:99:1066,0,304 -chr19 1248313 . G GT 1530.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1568,152,0 -chr19 1423162 . G A 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr19 1483316 . G A 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 -chr19 1496516 . C CA 511.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:549,54,0 -chr19 1710891 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr19 1711094 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,274 -chr19 1714260 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:83:392,0,83 -chr19 1826154 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-1.256;DP=44;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:652,0,814 -chr19 1828769 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-2.442;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:590,0,925 -chr19 1831405 . C A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.369;DP=51;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:941,0,832 -chr19 1852716 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.983;ClippingRankSum=-1.826;DP=33;FS=11.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:549,0,580 -chr19 1859043 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.164;DP=33;FS=5.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:644,0,494 -chr19 1946185 . CTG C 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:23:246,23,0 -chr19 1950317 . C G 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=-1.162;DP=52;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:940,0,890 -chr19 1955362 . A C 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=-0.561;DP=53;FS=5.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:877,0,942 -chr19 1962354 . A G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=-1.635;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:404,0,486 -chr19 1963162 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.267;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.34;ReadPosRankSum=-2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:327,0,182 -chr19 1963321 . TA T 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=29.37;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:91:331,0,91 -chr19 1964282 . ACACACACACT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:251,0,287 -chr19 1965886 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,334 -chr19 1968052 . A T 2517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-1.313;DP=155;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.995;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:2546,0,2790 -chr19 1971429 . T TA 2131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-1.483;DP=156;FS=6.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:2169,0,3282 -chr19 1971690 . G A 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.454;DP=93;FS=5.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:1254,0,1975 -chr19 1971758 . T G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.374;DP=84;FS=7.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=5.95;ReadPosRankSum=2.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:528,0,1965 -chr19 1972552 . A C 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.828;DP=115;FS=12.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1961,0,1999 -chr19 1972943 . A AT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.164;DP=116;FS=4.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=2.64;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,25:106:99:344,0,2354 -chr19 1973502 . G A 1890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-1.229;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1919,0,1918 -chr19 1973661 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.258;DP=66;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:529,0,1907 -chr19 1974631 . A T 2603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.406;DP=144;FS=0.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:2632,0,2603 -chr19 1981615 . GCTGTGAAACAAATGATTTGATTTAAATTCACTCATGCATCAATAGTTATTTGAATATTCAGATGTCTTCACAGCACCTCAAACTTAAATAACAAAC G 488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=1.661;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,74:79:99:526,186,0 -chr19 1981748 . G A 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-2.034;DP=74;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1250,0,1361 -chr19 1981764 . ACACCTGATCACATCAGAAAAACAATCAACAATTAAATATCCATCATTACTATCTGTAAATCAATAAATCAATTATATAAGGCTGAAAATAGACCCT A 3171.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=2.349;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=33.38;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:99:3209,272,0 -chr19 2016977 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.555;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:258,0,1008 -chr19 2058502 . CACCTGGAGGAGGAGAAGAGGAGCTCAGTTCACAGACCACAGCGGATATATAGGAGTGTATTCATTATAGTGAAAGTCTCTCAA C 2344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=4.312;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=32.54;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,58:66:99:2382,0,2449 -chr19 2060545 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=1.009;DP=50;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:891,0,920 -chr19 2135550 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-1.077;DP=23;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:412,0,380 -chr19 2135663 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.361;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:518,0,658 -chr19 2135856 . C A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-1.480;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=22.51;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:546,0,575 -chr19 2135860 . T A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.194;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=23.53;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:546,0,575 -chr19 2136673 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.560;DP=22;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:409,0,378 -chr19 2136693 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.626;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:393,0,368 -chr19 2137369 . G T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.095;DP=40;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:727,0,1113 -chr19 2155090 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.072;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:311,0,611 -chr19 2158735 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.340;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:597,0,438 -chr19 2158771 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-1.106;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:416,0,465 -chr19 2160150 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-1.693;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:279,0,486 -chr19 2173291 . GTT G 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-1.399;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:417,0,252 -chr19 2185785 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:318,0,804 -chr19 2188203 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=2.355;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:238,0,437 -chr19 2189713 . AAC A 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-0.263;DP=22;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:257,0,255 -chr19 2190349 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,251 -chr19 2198593 . A T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-0.289;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:767,0,1303 -chr19 2198596 . A G 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.259;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:767,0,1303 -chr19 2205821 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=-0.567;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:510,0,375 -chr19 2206920 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.332;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:875,0,525 -chr19 2211936 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-0.207;DP=30;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:541,0,556 -chr19 2256570 . G T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.448;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:348,0,554 -chr19 2397441 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.692;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:329,0,402 -chr19 2397936 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.754;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:407,0,206 -chr19 2401892 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,414 -chr19 2402093 . C A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=22.11;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:382,0,200 -chr19 2442453 . G GCA 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.772;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:310,0,266 -chr19 2458542 . G A 2359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.461;DP=136;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:2388,0,2594 -chr19 2632360 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr19 2735769 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.007;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:361,0,2244 -chr19 2735832 . T A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.948;ClippingRankSum=-0.262;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,33:146:99:639,0,3764 -chr19 2761500 . G A 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:887,78,0 -chr19 2780204 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.634;DP=58;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=5.67;ReadPosRankSum=2.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:357,0,1629 -chr19 2780258 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.671;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:746,0,798 -chr19 2780393 . G C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr19 2780465 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.194;DP=55;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:965,0,2038 -chr19 2780466 . A G 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-0.161;DP=55;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:965,0,2076 -chr19 2786523 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-3.775;DP=23;FS=21.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=25.12;ReadPosRankSum=3.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:606,0,191 -chr19 2786547 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=1.479;DP=37;FS=8.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:457,0,791 -chr19 2786676 . C G 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr19 2786934 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=1.184;DP=49;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:309,0,1295 -chr19 2787108 . A G 788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:817,60,0 -chr19 2791005 . T C 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr19 2791074 . T A 1762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-0.055;DP=57;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=30.93;ReadPosRankSum=2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,48:57:99:1791,0,122 -chr19 2791365 . A G 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.044;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=32.96;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:45:984,0,45 -chr19 2791520 . A C 829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:858,60,0 -chr19 2801319 . T A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.063;DP=131;FS=2.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,48:131:99:1629,0,2796 -chr19 2801601 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.529;DP=136;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:237,0,4865 -chr19 2801624 . T G 4374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:4403,319,0 -chr19 2801743 . CCA C 3241.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3279,227,0 -chr19 2801886 . A C 7568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:7597,547,0 -chr19 2983604 . A G 2642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2671,195,0 -chr19 2983697 . T C 1688.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1717,123,0 -chr19 3081402 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:496,0,114 -chr19 3086852 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.658;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,31:42:99:1126,0,240 -chr19 3370852 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-0.414;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:549,0,577 -chr19 3373452 . G GT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.125;DP=107;FS=5.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=2.43;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:297,0,1884 -chr19 3564708 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.253;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:675,0,517 -chr19 3571939 . G T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=1.759;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:526,0,508 -chr19 3633401 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-2.069;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:837,0,2462 -chr19 3634361 . T A 1889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.720;DP=95;FS=3.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1918,0,1492 -chr19 3634400 . G T 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-1.357;DP=114;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:2145,0,1590 -chr19 3642316 . C T 1605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=-0.708;DP=74;FS=4.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,48:74:99:1634,0,885 -chr19 3646758 . AT A 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.921;DP=21;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:368,0,138 -chr19 3654183 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.394;DP=40;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:720,0,652 -chr19 3700997 . CA C 1110.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.462;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,44:66:99:1148,0,525 -chr19 3718413 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.897;DP=61;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:245,0,2734 -chr19 3829552 . G C 316.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:344,0,10 -chr19 3950822 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.197;DP=29;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:537,0,434 -chr19 3951976 . G A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.198;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.468;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:578,0,559 -chr19 3952804 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:349,0,332 -chr19 3954884 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=1.847;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:286,0,465 -chr19 3957440 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.077;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:450,0,417 -chr19 4251795 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.951;DP=31;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:270,0,788 -chr19 4268805 . A T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-3.058;DP=26;FS=4.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:94:793,0,94 -chr19 4268817 . G A 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1035,75,0 -chr19 4269039 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.528;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,685 -chr19 4269040 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:390,0,669 -chr19 4273176 . G A 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:686,54,0 -chr19 4273194 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:335,0,463 -chr19 4273665 . C T 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr19 4277662 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=30.34;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:362,0,50 -chr19 4277671 . T C 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:444,30,0 -chr19 4278343 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,298 -chr19 4288999 . A C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr19 4289009 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr19 4289110 . A T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.762;DP=22;FS=16.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:602,0,197 -chr19 4289152 . C T 1018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1047,75,0 -chr19 4421579 . T A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.048;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,291 -chr19 4421596 . T A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.952;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:403,0,604 -chr19 4661284 . CTT C 732.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=-2.833;DP=166;FS=5.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=4.41;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,7:147:99:770,0,16142 -chr19 4687974 . A C 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.770;DP=68;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:820,0,1373 -chr19 4708723 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.850;DP=37;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:685,0,524 -chr19 4721176 . A C 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.362;DP=33;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=28.54;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:970,0,120 -chr19 4721213 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=2.282;DP=36;FS=15.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:243,0,975 -chr19 4721306 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,356 -chr19 4721308 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,356 -chr19 4722974 . T G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=1.347;DP=26;FS=2.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:597,0,319 -chr19 4727209 . G C 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.164;DP=112;FS=4.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:573,0,3248 -chr19 4938160 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-1.164;DP=17;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:251,0,316 -chr19 5455313 . TCTGCGAAAGCGGAGGAAGAGAAGAGGACAGGAGGCATTTGATTTGTGTCTGTTAGACGCTCAGGAGGATCAGCACAGATGGATTGTGGGATTGTTTACTCAC T 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=1.992;DP=21;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:274,0,4188 -chr19 5575341 . C T 2229.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.119;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=33.42;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2258,169,0 -chr19 5582749 . A G 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:730,51,0 -chr19 5620784 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=1.232;DP=52;FS=6.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:408,0,1381 -chr19 5625197 . TAA T 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.864;DP=50;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=6.77;ReadPosRankSum=2.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:480,0,1344 -chr19 5625199 . A AT 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-3.010;DP=50;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:530,0,946 -chr19 5633571 . TCTGAGACGGTGAGTAAAGGTAGACCTTCACACTCTGATTGTGACTGAACGCATGTGTAAGACACCCAACATATGTGTGTGTGTGCACGGACTGCATTAAAAGATAC T 13298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.234;DP=300;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=27.99;ReadPosRankSum=2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,297:300:99:13336,1038,0 -chr19 5643900 . G C 6514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.755;DP=404;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,181:403:99:6543,0,7421 -chr19 5644517 . GCTGCAAGCAGACGACCATAATTGTGTTTAAAGAAAGTGTCTATTTGTTATTAAATTAAGTTTGATTTAGCTATGCTGATCTCAC G 16656.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=2.437;DP=387;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,385:387:99:16694,1351,0 -chr19 5652813 . G A 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=6.019;DP=218;FS=4.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=4.33;ReadPosRankSum=-2.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,49:217:99:973,0,6300 -chr19 5654265 . A G 7567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.479;DP=453;FS=5.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,213:453:99:7596,0,7897 -chr19 5682987 . A AT 1199.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=-0.955;DP=178;FS=5.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1451,0,1233 -chr19 5934481 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.843;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:308,0,1677 -chr19 5981346 . TCTGTGAGAGGAAATGCAACAGAAAAGCAGCTAGATAAGTCATCTGTTGGTTTTGATTTCCATCTTGCTATACAAATTTGACATGTTAAAACAGATTTTTAC T 10435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.601;DP=269;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,236:239:99:10473,769,0 -chr19 5987996 . ATACCTGCACATAAATAAAGTCAATATAAATGTTTTGGATCTATTATAGATTTTGTAAGCAATTTTTAAAGTCTTACAACGGTGGACT A 21506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=2.620;DP=488;FS=4.378;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,483:488:99:21544,1725,0 -chr19 5992357 . TCTGTGAGAGGAAATGCAACAGTAATGAAGCCAGATGAGTCGTGTTGATTTTGATTCTAATCTTTCTTTGTAAATATAACATGTTAAATATTTTAC T 14207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=1.122;DP=336;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=32.28;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,318:321:99:14245,1107,0 -chr19 5992855 . AACCTGCACAGACATTTAATCAATGTAAATGTTTTGAATCTTTTATAGATTTTGGAAGTGAATTTTTATAGTGCAAGTCTTACAACTGTGGACTT A 1996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=2.472;DP=274;FS=2.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.282;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,250:253:99:2034,699,0 -chr19 6044652 . AAGGTTGTCGCTGTTAAATAATTGACACTCTAAAGTGGTTTACGGTTACAAGTGTGGGCCATTTTTAACATCCTCATTTGCATCCAC A 1786.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.362;ClippingRankSum=5.575;DP=358;FS=11.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,322:333:99:1824,677,0 -chr19 6204967 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:274,0,351 -chr19 6242376 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.160;DP=46;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:590,0,911 -chr19 6243322 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.603;DP=59;FS=3.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:747,0,1260 -chr19 6309735 . G C 215.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:244,21,0 -chr19 6350090 . G A 1459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1488,111,0 -chr19 6351025 . T A 2660.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=41.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2689,193,0 -chr19 6353042 . T C 2341.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2370,172,0 -chr19 6353849 . C T 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.262;DP=85;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:1420,0,1654 -chr19 6353853 . A T 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.684;DP=85;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:804,0,3665 -chr19 6354092 . A T 8290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:8319,658,0 -chr19 6354435 . C A 4318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.221;DP=231;FS=6.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,129:231:99:4347,0,3611 -chr19 6388189 . T A 2260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.495;DP=131;FS=3.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=17.26;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:2289,0,2367 -chr19 6671861 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.457;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:388,0,129 -chr19 6672094 . A T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr19 6672618 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr19 6672789 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:268,0,303 -chr19 6673070 . G A 1064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1093,78,0 -chr19 6673113 . A C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:499,0,272 -chr19 6673168 . A C 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:636,48,0 -chr19 6681659 . A G 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr19 6682603 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,214 -chr19 6682815 . A G 506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:535,39,0 -chr19 6699107 . C A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.785;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:688,0,699 -chr19 6708735 . C G 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.274;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:763,0,573 -chr19 6709913 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=1.246;DP=16;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.80;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:425,0,174 -chr19 6710188 . G A 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.403;DP=48;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:787,0,865 -chr19 6713026 . T A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=2.149;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:424,0,445 -chr19 6733508 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=2.346;DP=40;FS=5.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:336,0,1865 -chr19 6733562 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=2.569;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:248,0,728 -chr19 6738932 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=-0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:574,0,527 -chr19 6746294 . T C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=1.778;DP=33;FS=11.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:765,0,428 -chr19 6748220 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=2.315;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:373,0,591 -chr19 6748235 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=1.342;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:384,0,648 -chr19 6748295 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-1.713;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:410,0,663 -chr19 6748340 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-1.815;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:398,0,704 -chr19 6748571 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=-0.687;DP=38;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:653,0,656 -chr19 6748919 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-1.851;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:673,0,356 -chr19 6749963 . C A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.560;DP=42;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:718,0,721 -chr19 6750141 . G T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.718;DP=44;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:373,0,1134 -chr19 6750710 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:312,0,473 -chr19 6839107 . GA G 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=2.562;DP=155;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=3.57;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,39:141:99:591,0,2742 -chr19 6925695 . T A 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-0.951;DP=99;FS=6.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=20.71;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,62:99:99:2079,0,1269 -chr19 6951060 . C T 3390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.107;DP=147;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,94:147:99:3419,0,1781 -chr19 6951201 . T C 3262.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-1.719;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,69:72:99:3291,225,0 -chr19 6951954 . C CGAGT 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-3.002;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:278,0,273 -chr19 6952466 . G A 6490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-1.340;DP=210;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=30.91;ReadPosRankSum=-2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,167:210:99:6519,0,1226 -chr19 6966972 . G A 3222.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.261;DP=161;FS=0.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,97:161:99:3251,0,2256 -chr19 6966987 . T C 3412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.414;DP=165;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,102:165:99:3441,0,2138 -chr19 6968764 . G A 3130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-1.263;DP=172;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,96:172:99:3159,0,2758 -chr19 6974883 . C A 3689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.370;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=20.50;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,112:180:99:3718,0,2265 -chr19 7063601 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,573 -chr19 7063602 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,573 -chr19 7063786 . T C 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 -chr19 7064500 . G GGA 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:336,26,0 -chr19 7065269 . C T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr19 7065597 . T A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=28.10;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:506,0,111 -chr19 7066196 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.695;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:478,0,560 -chr19 7066312 . T A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-0.055;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1071,0,593 -chr19 7067823 . A C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.867;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:295,0,160 -chr19 7067911 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,288 -chr19 7069694 . AT A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-2.855;DP=15;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:243,0,131 -chr19 7185946 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,329 -chr19 7530191 . A G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr19 7583871 . T A 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:353,25,0 -chr19 7583913 . G T 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:34:475,34,0 -chr19 7614009 . C A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=2.316;DP=80;FS=4.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1562,0,1181 -chr19 7614958 . C CTGCACAGAAAAAGA 5024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=1.696;DP=195;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,136:180:99:5062,0,1019 -chr19 7620280 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.753;ClippingRankSum=5.797;DP=112;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=2.50;ReadPosRankSum=-5.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:308,0,3370 -chr19 7620831 . CGTAAGCAGGATGCTAAGGTTTTACTGAATATCATGTTTTGGTACCGTGTTTGAGTGTGTAACTTCTTTATTTTTCTCCTGTGCAG C 9967.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=1.591;DP=224;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,221:223:99:10005,802,0 -chr19 7640721 . C A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=1.501;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:396,0,237 -chr19 7692308 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:256,0,62 -chr19 7802904 . A T 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:51:690,51,0 -chr19 7810710 . A T 9872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.287;DP=362;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,264:362:99:9901,0,2235 -chr19 7931712 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.579;DP=38;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:308,0,1018 -chr19 8078548 . TA T 822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.407;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,37:50:99:860,0,172 -chr19 8104872 . GA G 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.717;DP=50;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:543,0,511 -chr19 8108241 . AT A 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-1.061;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:527,0,888 -chr19 8112084 . T A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.307;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.792;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:643,0,685 -chr19 8150420 . TA T 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.248;DP=31;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:264,0,1681 -chr19 8189016 . GT G 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-0.888;DP=81;FS=8.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:286,0,1365 -chr19 8189094 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.252;DP=45;FS=10.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:347,0,740 -chr19 8189326 . AT A 1857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.108;DP=70;FS=3.438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=26.54;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:1895,189,0 -chr19 8220617 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=-0.137;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:444,0,438 -chr19 8252895 . T A 3167.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.572;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=26.82;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,70:81:5:3195,0,5 -chr19 8371620 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,226 -chr19 8371761 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:268,0,100 -chr19 8425276 . AAGGTAAATCGAGGTCTGCCAGTGAATATCTGCAGTCTCTCCATTCCAGCGTCTCATCTTATTGGCTTTCTTTCATTTC A 4925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.520;DP=128;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,114:116:99:4963,359,0 -chr19 8426266 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=-3.860;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=13.95;ReadPosRankSum=-3.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:377,0,496 -chr19 8443591 . C T 1627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DP=62;FS=2.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,45:62:99:1656,0,358 -chr19 8449567 . T G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.231;DP=69;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=3.29;ReadPosRankSum=3.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:255,0,2124 -chr19 8585476 . A C 201.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:230,0,22 -chr19 9156660 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-1.349;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:382,0,728 -chr19 9600721 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.119;DP=49;FS=7.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:498,0,1421 -chr19 9640458 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-0.185;DP=35;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:807,0,485 -chr19 9641053 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.327;DP=32;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:247,0,944 -chr19 9747598 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.189;DP=79;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:447,0,2343 -chr19 9763049 . ACGG A 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.893;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:273,0,3886 -chr19 9763053 . TCAGTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGTCTCTCTCTTCTTCTGCTTTTAGCATTCACTACATTTGCTCAGTCTGTAATTTGTGTCATCA T 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=1.427;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:268,0,3886 -chr19 9763489 . A T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=2.226;DP=57;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:757,0,2799 -chr19 9778509 . T G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.214;DP=62;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:345,0,1820 -chr19 9779127 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.292;DP=50;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:332,0,1484 -chr19 9779264 . GA G 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.427;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:330,0,2031 -chr19 9779796 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.861;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:233,0,2138 -chr19 9880254 . TGTAGGTGATGCCTCGAACAGTTTTGTGCTCAGAAATAATCTGCCGTGCTCTGTTGAGTTGTATTGTCTGTGTGCTGTACGTTTAG T 3352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.274;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,73:77:99:3390,283,0 -chr19 9897664 . ACT A 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=1.412;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:343,0,1063 -chr19 10082183 . T A 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-0.798;DP=323;FS=8.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,77:323:99:1666,0,9704 -chr19 10875500 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=1.404;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:491,0,948 -chr19 11096213 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr19 11096364 . T C 864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.083;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:893,60,0 -chr19 11096370 . C A 864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.347;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:60:893,60,0 -chr19 11096519 . A C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr19 11479432 . G GA 755.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=-2.638;DP=313;FS=5.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=2.41;ReadPosRankSum=2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,64:262:99:793,0,4024 -chr19 11479842 . G GA 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.555;ClippingRankSum=0.019;DP=361;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,74:339:99:428,0,7085 -chr19 11487520 . G GA 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.640;DP=371;FS=7.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,64:348:99:359,0,7545 -chr19 11504982 . G GA 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-0.049;DP=319;FS=7.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,56:282:99:391,0,5962 -chr19 11721691 . G GT 1224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-3.372;DP=344;FS=6.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,93:325:99:1262,0,6100 -chr19 11822262 . C CA 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.011;DP=139;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.091;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:99:298,0,2439 -chr19 12114656 . AT A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-1.371;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:54:348,0,54 -chr19 12255949 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,169 -chr19 12470023 . G T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.736;DP=34;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:312,0,1043 -chr19 12538644 . C T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.455;DP=107;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:612,0,2983 -chr19 12545331 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=3.000;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:425,0,2635 -chr19 12600976 . C T 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.422;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,44:143:99:1140,0,3721 -chr19 12618486 . A C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-1.461;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:313,0,1382 -chr19 12653138 . A G 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.758;DP=40;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:620,0,666 -chr19 12653427 . A C 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.729;DP=58;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:715,0,1210 -chr19 12653763 . G C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-1.286;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=6.63;ReadPosRankSum=2.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:446,0,1773 -chr19 12654413 . T TA 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.911;DP=53;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:957,0,168 -chr19 12654524 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-1.055;DP=48;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:249,0,3562 -chr19 12655013 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=1.324;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,24:114:99:485,0,3553 -chr19 12752215 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.144;DP=316;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,57:316:99:806,0,9787 -chr19 12756947 . C T 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.895;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,44:203:99:851,0,6169 -chr19 12767409 . G T 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-0.351;DP=193;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,42:193:99:809,0,5871 -chr19 12787227 . C T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-3.175;DP=205;FS=18.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,58:204:99:1450,0,5637 -chr19 12985094 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-0.535;DP=57;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:374,0,1637 -chr19 12985421 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-2.764;DP=96;FS=7.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:281,0,3107 -chr19 13028837 . T G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-0.969;DP=52;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:403,0,1444 -chr19 13035605 . C T 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.392;DP=168;FS=4.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=5.69;ReadPosRankSum=3.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,43:168:99:984,0,4724 -chr19 13242820 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.489;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:322,0,3369 -chr19 13245563 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.604;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,26:94:99:597,0,3121 -chr19 13246939 . A G 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:439,33,0 -chr19 13267493 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.283;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:341,0,1141 -chr19 13277720 . A C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.018;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,29:120:99:599,0,3508 -chr19 13548625 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-0.790;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,34:193:99:440,0,6142 -chr19 13560154 . T A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-1.069;DP=41;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:529,0,893 -chr19 13561778 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-2.149;DP=32;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:425,0,673 -chr19 13735477 . G C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr19 13740991 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,249 -chr19 13741296 . T C 2771.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2800,202,0 -chr19 13741334 . C T 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.961;DP=72;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.966;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1196,0,1348 -chr19 14575041 . T TA 335.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=22.39;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:17:373,0,17 -chr19 14840628 . T TA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.559;DP=46;FS=7.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:406,0,628 -chr19 14875618 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:459,0,657 -chr19 14901931 . GA G 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.674;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:346,0,578 -chr19 14902236 . CA C 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.027;DP=44;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.29;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:446,0,505 -chr19 14903526 . AGT A 729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-0.125;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:767,0,937 -chr19 15073948 . C T 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr19 15283231 . T C 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=1.704;DP=70;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=15.90;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:1141,0,1243 -chr19 15454705 . G A 2884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.094;DP=183;FS=4.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,83:183:99:2913,0,3303 -chr19 15468170 . TC T 586.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:624,43,0 -chr19 15468442 . G GT 341.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:379,36,0 -chr19 15508974 . A AGTATGAG 5029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:5067,363,0 -chr19 15518059 . T A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=1.508;DP=99;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:1199,0,1935 -chr19 15519495 . A T 1437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1466,102,0 -chr19 16016239 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.775;DP=30;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:361,0,607 -chr19 16086596 . T TC 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.271;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:379,0,212 -chr19 16255893 . C A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr19 16311926 . A T 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:551,39,0 -chr19 16311935 . A T 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:551,39,0 -chr19 16829510 . G GC 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=3.305;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=15.24;ReadPosRankSum=-3.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:403,0,681 -chr19 16829515 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=2.540;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=23.42;ReadPosRankSum=-3.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:403,0,681 -chr19 16829946 . TA T 389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:427,42,0 -chr19 17155205 . T TA 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.695;DP=189;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,40:170:99:267,0,2638 -chr19 17160313 . G GT 1336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.409;DP=164;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,87:149:99:1577,0,1176 -chr19 17160943 . T C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.492;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:180:99:671,0,5898 -chr19 17160945 . T C 1649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.056;ClippingRankSum=-3.283;DP=175;FS=3.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=9.43;ReadPosRankSum=2.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1678,0,4462 -chr19 17161636 . T TTG 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-1.519;DP=76;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:617,0,2166 -chr19 17178144 . A AT 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=2.033;DP=83;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:766,0,975 -chr19 17178267 . AT A 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.575;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:367,0,218 -chr19 17528662 . A G 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.745;DP=67;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:680,0,2141 -chr19 17528882 . T G 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.077;DP=36;FS=10.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:721,0,651 -chr19 17529958 . C T 2488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.339;DP=78;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=31.91;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,61:78:99:2517,0,293 -chr19 17530079 . A G 2698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-2.926;DP=97;FS=16.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,70:97:99:2727,0,654 -chr19 17530486 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=1.658;DP=17;FS=9.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=22.28;ReadPosRankSum=-1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:407,0,219 -chr19 17531399 . C A 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=2.276;DP=86;FS=4.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1556,0,2131 -chr19 17851154 . A G 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.033;DP=46;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:894,0,705 -chr19 17851924 . TA T 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.755;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:774,0,131 -chr19 17852480 . T C 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.959;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=33.07;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:888,0,181 -chr19 17852642 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=-0.530;DP=37;FS=1.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:276,0,1728 -chr19 17863350 . A C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=1.818;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:383,0,143 -chr19 17863550 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,731 -chr19 17863555 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,731 -chr19 17863699 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,324 -chr19 17864330 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:296,0,95 -chr19 17866258 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.146;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:389,0,309 -chr19 17866711 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,374 -chr19 18147123 . G T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=1.327;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:36:658,0,36 -chr19 18147131 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:36:658,0,36 -chr19 18155936 . A T 223.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:252,21,0 -chr19 18155968 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.600;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,144 -chr19 18156637 . T G 2211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=1.140;DP=69;FS=5.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=32.06;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,53:57:21:2240,21,0 -chr19 18156638 . A T 2211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=1.140;DP=69;FS=5.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=32.06;ReadPosRankSum=-1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,53:57:21:2240,21,0 -chr19 18160533 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.717;DP=29;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:515,0,294 -chr19 18318915 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.520;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=29.74;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:623,0,112 -chr19 18318916 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=1.845;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=31.30;ReadPosRankSum=-1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:623,0,115 -chr19 18321262 . CGGTGAGATGCAAGTTTTTCTACATATCTGCATTATTATCATTATGAATGAAATATTATCTTGTGTGTTTCTGTGTCTCA C 2185.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=1.515;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.467;QD=26.98;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,65:78:99:2223,0,3121 -chr19 18548127 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.797;DP=28;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:421,0,693 -chr19 18552195 . A C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.993;DP=15;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,475 -chr19 18556435 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,467 -chr19 18557676 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-0.472;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:282,0,1812 -chr19 18557682 . A T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.929;DP=35;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=17.74;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:728,0,662 -chr19 18559624 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.038;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:348,0,350 -chr19 18962861 . G A 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=-0.102;DP=69;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1189,0,1151 -chr19 18962979 . G A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.241;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1076,0,1048 -chr19 18963136 . C T 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.718;DP=79;FS=5.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:1072,0,1690 -chr19 18963161 . G A 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.108;DP=82;FS=4.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1167,0,1584 -chr19 19011058 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:98:340,0,98 -chr19 19245644 . GT G 729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.523;DP=56;FS=4.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:767,0,419 -chr19 19365474 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr19 19503970 . TA T 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.021;DP=40;FS=6.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:44:709,0,44 -chr19 20101495 . T C 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr19 20114717 . T TA 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.492;DP=103;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:841,0,965 -chr19 20157608 . CA C 593.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:631,43,0 -chr19 20157611 . A C 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:631,43,0 -chr19 20543747 . T C 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.301;DP=50;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:888,0,899 -chr19 20543867 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:237,0,59 -chr19 20544424 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-1.370;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:254,0,651 -chr19 20595823 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.439;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:447,0,337 -chr19 20656011 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:290,0,361 -chr19 20660286 . C CT 332.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.724;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:4:529,0,4 -chr19 20673027 . C CA 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=-1.170;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:368,0,772 -chr19 20673049 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-2.341;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:366,0,743 -chr19 20679234 . CA C 318.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:356,30,0 -chr19 20734048 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-1.077;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:410,0,358 -chr19 20775607 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-2.279;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:335,0,357 -chr19 20887005 . CA C 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=-0.792;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:480,0,241 -chr19 20908046 . ACTGCAAATGAAAATGGAAAAAATTTACACAAGTATACCGTGCAAGATAATGCAAAAAAATTGCAAAATATCTAAACACTACACAGGAAAAATGTAAAGTTTAATCTGAGTCTTCAGAC A 2239.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.229;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.172;QD=31.70;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,49:53:99:2277,195,0 -chr19 20935980 . TA T 212.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:9:249,0,9 -chr19 20963294 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.356;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:388,0,743 -chr19 21197059 . TA T 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=29.52;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:36:480,0,36 -chr19 21203617 . C CCA 4370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-1.589;DP=145;FS=1.899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=30.14;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,118:122:99:4408,351,0 -chr19 21203736 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.580;DP=126;FS=17.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,34:126:99:852,0,3596 -chr19 21217801 . ACAGGTGAATGTTAAAGGGTTTTTTTATATTTCGTTATGTGGGATAGCTATGTAAACAAACCTTTCTCTTTTCTGATTGGTG A 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=31.67;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:544,0,539 -chr19 22643130 . T A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.382;DP=29;FS=9.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:601,0,390 -chr19 22816453 . GT G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.076;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:243,0,204 -chr19 22849768 . C T 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.551;DP=17;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=20.75;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:390,0,177 -chr19 22858939 . T G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.463;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=16.20;ReadPosRankSum=3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:417,0,458 -chr19 22893670 . T G 2124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.321;DP=145;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:2153,0,2683 -chr19 22894553 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-2.320;DP=60;FS=3.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:516,0,1642 -chr19 22902875 . G A 2991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=-1.052;DP=136;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=22.00;ReadPosRankSum=-2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,89:136:99:3020,0,3811 -chr19 22930838 . G C 2111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=-0.668;DP=128;FS=3.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:2140,0,2256 -chr19 23401485 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.578;DP=39;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:620,0,684 -chr19 23620806 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-1.217;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=21.19;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:558,0,313 -chr19 23623065 . T G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.050;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.161;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,517 -chr19 24388723 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:358,0,200 -chr19 24401893 . C CTT 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.723;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,31:125:99:715,0,4193 -chr19 24406730 . G GT 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.156;DP=47;FS=11.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:500,0,1047 -chr19 24406947 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-1.168;DP=36;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:308,0,909 -chr19 24442409 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:299,0,216 -chr19 24457126 . C T 261.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:290,0,20 -chr19 24457127 . T C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 -chr19 24468240 . T G 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.540;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:896,0,906 -chr19 24490674 . C T 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 -chr19 24519609 . CT C 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.262;DP=63;FS=3.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:691,0,462 -chr19 24519780 . C T 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-0.836;DP=71;FS=2.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:498,0,1411 -chr19 24749424 . GA G 2724.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-1.490;DP=131;FS=12.196;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,102:120:9:2761,9,0 -chr19 24933423 . A T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr19 24975811 . TGGTGAGTGTCACTTTGGCATTGTTATAGTTGCATGACGTTGTGGCATCCACAAAGTAGGTGCTAAACAGTTTTCTTCTCTATCTACA T 8985.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.602;DP=291;FS=3.592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=30.88;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,278:281:99:9023,567,0 -chr19 24976405 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.731;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:251,0,734 -chr19 24976434 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.462;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:340,0,723 -chr19 24977443 . GTTTTT G 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,19:19:99:295,0,2156 -chr19 25388236 . GAGGTACTAAAGTAACCTGTATAGGTTTAATCTGTTTATAAGCTTGTTTAACACTGTACTAAATGAAGAGTACTGTAATAGTGAATCTTAAAATAAACATAAATATTTTGTTCTC G 3639.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=1.470;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=29.08;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:3677,354,0 -chr19 25575421 . G GA 1303.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.717;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=19.46;ReadPosRankSum=3.294 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,52:59:21:1381,21,0 -chr19 25575447 . AT A 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-1.323;DP=74;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:244,0,1046 -chr19 25838168 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:243,0,266 -chr19 26141184 . AG A 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.529;DP=20;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,311 -chr19 26141222 . A C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr19 26141879 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-1.161;DP=54;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:455,0,880 -chr19 26141914 . A C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=-0.586;DP=49;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:472,0,632 -chr19 26179294 . A T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=-0.326;DP=39;FS=7.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:592,0,727 -chr19 26186512 . TA T 349.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.873;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:13:387,0,13 -chr19 26861136 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=-0.620;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:521,0,497 -chr19 27109299 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:348,0,293 -chr19 27158670 . G A 2118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=-0.173;DP=124;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:2147,0,2210 -chr19 27188959 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.857;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:352,0,308 -chr19 27197062 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.783;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:423,0,627 -chr19 27213256 . AAGGTTGGTGAGGATTTTAATGCACTTGATTGATTTTATTTACAGTATCACTAAAAGCATGATGCCTCTGAAC A 1238.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.195;DP=32;FS=3.135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=34.49;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:99:1276,111,0 -chr19 27218214 . GCTCCAAGAGAAAACAGCACATCATGTCACAATACAATAACATCTTTCTTAAATGAAATGATTCAAAAAATTGAAAAGGAGATCATAC G 13549.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=3.612;DP=364;FS=7.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,344:363:99:13587,288,0 -chr19 27226675 . C CT 572.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.722;DP=36;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:38:642,38,0 -chr19 27227860 . G A 2560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-1.187;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:2589,0,2108 -chr19 27227972 . C CA 1177.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-2.041;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1215,0,1715 -chr19 27231914 . CCCTGAAACACAAAAGCCCTTATAGTTTCTGAATCGAAAGGCTGTCAATCTATTATTTACAGCTGATCTGAGTTAGTCACTAA C 7522.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=2.580;DP=208;FS=4.083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,185:190:99:7560,556,0 -chr19 27235535 . G A 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.603;DP=119;FS=3.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:2027,0,2054 -chr19 27294724 . G A 1510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.968;DP=67;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,45:67:99:1539,0,1221 -chr19 27339585 . T C 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr19 27339653 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr19 27340841 . GT G 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.354;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:287,0,54 -chr19 27342238 . T C 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.091;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:702,0,184 -chr19 27343326 . AT A 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.597;DP=17;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:297,0,153 -chr19 27343614 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-2.208;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=10.76;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:577,0,1185 -chr19 27393410 . C A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.077;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:645,0,444 -chr19 27393415 . C CCTTCACTAAACCT 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.509;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=20.96;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:645,0,444 -chr19 27399410 . C T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.419;DP=36;FS=7.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=22.22;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:828,0,388 -chr19 27422315 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.626;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:348,0,373 -chr19 27834556 . A G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:726,0,319 -chr19 27835712 . A G 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-0.906;DP=47;FS=4.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:1306,0,755 -chr19 27923459 . CCACCTTTACGTGTTAAATGGTGCGTTAGTTTATGAGACATGTGAGGTGTTGCTAGTGTTGATAAAATAAAGTTGTTCAGCGATG C 675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=2.646;DP=21;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=32.18;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:713,0,853 -chr19 27950930 . A ACCATTGGTCGCCTATTG 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=3.368;DP=23;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=12.38;ReadPosRankSum=-2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:322,0,2052 -chr19 28439711 . A C 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.791;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=30.18;ReadPosRankSum=3.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:776,0,290 -chr19 28441551 . T A 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.429;DP=94;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1704,0,1700 -chr19 28441757 . A T 1393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=-1.547;DP=91;FS=0.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1422,0,1568 -chr19 28442381 . C T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=-0.838;DP=81;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1399,0,1455 -chr19 28442417 . T C 1639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.761;DP=103;FS=4.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:1668,0,1899 -chr19 28452371 . G A 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.306;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,72:168:99:2494,0,3213 -chr19 28456522 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=1.715;DP=229;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.512;QD=2.96;ReadPosRankSum=3.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,43:229:99:707,0,7168 -chr19 28459738 . A AT 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=1.534;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:414,0,435 -chr19 28613458 . CA C 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.483;DP=40;FS=4.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:645,0,166 -chr19 28767016 . T G 3161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.774;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=17.96;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,90:176:99:3190,0,3040 -chr19 28769495 . G A 3668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=-2.079;DP=213;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,100:211:99:3697,0,3704 -chr19 28769512 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=-3.191;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=17.11;ReadPosRankSum=3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:2252,0,2225 -chr19 28819409 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:473,0,523 -chr19 28930776 . T G 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr19 28937912 . C G 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:438,33,0 -chr19 28938294 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:234,0,67 -chr19 29273511 . G T 5019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=1.837;DP=301;FS=12.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,137:301:99:5048,0,5223 -chr19 29274332 . G A 3417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=1.364;DP=277;FS=21.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.724;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,115:276:99:3446,0,4698 -chr19 29774069 . G A 1985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=-1.109;DP=118;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:2014,0,1972 -chr19 29780455 . T C 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.876;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:681,0,729 -chr19 29781540 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=-1.632;DP=30;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:557,0,472 -chr19 29781831 . C A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.453;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:709,0,675 -chr19 29788031 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.901;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:528,0,883 -chr19 29801884 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-1.083;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:504,0,832 -chr19 29802231 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=-0.638;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:452,0,346 -chr19 29816026 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=7.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:551,0,692 -chr19 29839590 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.256;DP=66;FS=3.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:820,0,1372 -chr19 29845296 . A G 289.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:8:317,0,8 -chr19 30356760 . C CT 980.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.418;DP=102;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:1018,0,1058 -chr19 30391775 . G T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.022;DP=70;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:284,0,2255 -chr19 30510730 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-2.097;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=7.73;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1504 -chr19 30510731 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-1.248;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1504 -chr19 30634341 . TA T 531.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.324;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:569,0,311 -chr19 30636714 . TCTGAAAAAAAAGAAAAGAAAAAATCAATATGGAAAGTGCTCAATTTATGCAACATTTTGAGGAAAGAGGCAAAAGACACATCTCAAACACTCAC T 1639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=2.575;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=32.15;ReadPosRankSum=-1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,47:51:99:1677,0,588 -chr19 30637108 . G A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.523;DP=65;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:997,0,1325 -chr19 30867540 . C G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-0.248;DP=139;FS=1.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,32:139:99:573,0,3850 -chr19 30867759 . A G 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.193;DP=158;FS=9.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,46:158:99:1152,0,4202 -chr19 30879008 . CGGTCAGTGCAACACATTTTTTTTAACTTTTTTGTACTGTAAACAGGTGTCTTTACTAAAATCTAAACTTTCACATATACA C 828.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.055;DP=158;FS=3.012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,154:156:99:866,329,0 -chr19 30883802 . CT C 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.513;DP=70;FS=4.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:850,0,2925 -chr19 31045305 . G A 5225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.450;DP=324;FS=12.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,136:324:99:5254,0,13654 -chr19 31045754 . C T 5158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=1.085;DP=287;FS=1.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,143:286:99:5187,0,5182 -chr19 31063652 . C CT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.980;DP=316;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,54:281:99:249,0,6184 -chr19 31082258 . C T 1656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-1.087;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1685,0,1817 -chr19 31082955 . C T 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.598;DP=96;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1719,0,1879 -chr19 31083118 . G A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=-1.405;DP=69;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.102;QD=15.30;ReadPosRankSum=2.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:1084,0,3248 -chr19 31083124 . G T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-2.957;DP=78;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=13.54;ReadPosRankSum=2.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:1084,0,3200 -chr19 31084710 . G T 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.896;DP=116;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1987,0,2080 -chr19 31098155 . C T 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.045;DP=84;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,49:84:99:1698,0,1286 -chr19 31101867 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.643;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:459,0,425 -chr19 31108875 . C A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=1.255;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:549,0,221 -chr19 31109366 . AGT A 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.973;DP=37;FS=7.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:446,0,757 -chr19 31109813 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.417;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:525,0,472 -chr19 31596778 . C CT 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.406;DP=297;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,44:260:99:413,0,5093 -chr19 31667438 . G C 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.063;ClippingRankSum=0.486;DP=34;FS=17.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=33.90;ReadPosRankSum=-3.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:99:1181,0,218 -chr19 31667440 . A G 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.467;DP=32;FS=16.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=30.88;ReadPosRankSum=-3.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1181,0,227 -chr19 31682289 . G A 2611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-1.617;DP=447;FS=4.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:333,114:447:99:2640,0,12770 -chr19 31714166 . A G 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-1.247;DP=17;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:388,0,222 -chr19 31921944 . T TCCGGAGTACCGGTG 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.564;DP=96;FS=7.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:696,0,2772 -chr19 32130412 . G A 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=1.838;DP=135;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.29;ReadPosRankSum=-5.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:1823,0,2679 -chr19 32325890 . G C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr19 32644359 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.037;DP=66;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:328,0,1836 -chr19 32825193 . GA G 2947.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.348;DP=307;FS=4.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,116:289:99:2985,0,4422 -chr19 32825773 . T TA 2111.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=-0.289;DP=199;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,90:177:99:2149,0,2204 -chr19 32828839 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=5.588;DP=212;FS=4.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=2.02;ReadPosRankSum=-2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,35:212:99:457,0,6856 -chr19 32829318 . T C 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=4.519;DP=225;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,54:225:99:1135,0,6457 -chr19 32836837 . CT C 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=1.139;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=22.61;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:399,0,443 -chr19 32837510 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:317,0,58 -chr19 32838628 . TA T 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.366;DP=30;FS=9.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:304,0,366 -chr19 32839161 . GA G 820.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.390;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:858,0,187 -chr19 32839201 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.830;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.89;ReadPosRankSum=2.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:505,0,805 -chr19 32839297 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.131;DP=33;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:428,0,752 -chr19 32839445 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.346;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1453,0,102 -chr19 32842131 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=1.024;DP=51;FS=6.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:362,0,1374 -chr19 32843359 . G T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.352;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:448,0,866 -chr19 32853991 . G A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-0.019;DP=52;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:738,0,1040 -chr19 32858499 . G T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.304;DP=66;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:838,0,1390 -chr19 32867289 . G T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=1.228;DP=32;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=13.24;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:452,0,620 -chr19 32989491 . T A 659.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.529;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=32.99;ReadPosRankSum=2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:23:688,0,23 -chr19 32989534 . G T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.074;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:550,0,408 -chr19 33035020 . T A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-1.243;DP=180;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,39:180:99:607,0,4800 -chr19 33044092 . C G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.029;DP=53;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:432,0,1400 -chr19 33044812 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.151;DP=36;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:408,0,876 -chr19 33044873 . CA C 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.781;DP=29;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:372,0,445 -chr19 33120975 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=1.206;DP=36;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:236,0,1085 -chr19 33122222 . A T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.549;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:728,0,762 -chr19 33123099 . T TA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.380;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:347,0,281 -chr19 33123146 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.527;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:345,0,578 -chr19 33123566 . A AT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.231;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:271,0,234 -chr19 33123896 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.557;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:555,0,899 -chr19 33136737 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-0.721;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=4.84;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:251,0,1321 -chr19 33176627 . G A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.557;DP=84;FS=5.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:1084,0,1750 -chr19 33183956 . AAT A 270.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:308,25,0 -chr19 33185539 . T C 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=1.011;DP=48;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:829,0,844 -chr19 33186070 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-0.148;DP=54;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1052,0,883 -chr19 33186095 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-2.503;DP=53;FS=18.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:841,0,1058 -chr19 33189055 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=1.200;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.644;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:264,0,341 -chr19 33189337 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:265,0,325 -chr19 33190290 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.634;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,969 -chr19 33190293 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,969 -chr19 33190542 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:264,0,183 -chr19 33191794 . T A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:250,0,482 -chr19 33193663 . C A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.217;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:458,0,365 -chr19 33196302 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:333,0,311 -chr19 33198602 . T C 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=34.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:25:236,0,25 -chr19 33199141 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=24.83;ReadPosRankSum=2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:351,0,126 -chr19 33200340 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:361,0,336 -chr19 33294056 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.465;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:412,0,464 -chr19 33296242 . G A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-1.717;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:1070,0,1714 -chr19 33296309 . A G 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=-0.180;DP=98;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:98:99:1443,0,1916 -chr19 33309431 . G T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=-0.376;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=14.58;ReadPosRankSum=3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:451,0,924 -chr19 33394868 . A C 2873.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:2902,217,0 -chr19 33409050 . G A 1659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.671;DP=87;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,51:79:99:1688,0,908 -chr19 33832551 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:230,0,373 -chr19 33847988 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.705;DP=71;FS=15.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:965,0,1534 -chr19 33849001 . A C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=-6.201;DP=99;FS=7.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,28:98:99:666,0,4167 -chr19 33849091 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=-2.735;DP=50;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=8.08;ReadPosRankSum=-3.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:432,0,2138 -chr19 33849501 . G A 1942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=-1.658;DP=104;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1971,0,1806 -chr19 33858300 . G A 204.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:233,0,25 -chr19 33862746 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:298,0,439 -chr19 33863838 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:425,0,336 -chr19 33869151 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=3.321;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:601,0,1162 -chr19 33871047 . T TA 1774.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.691;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,81:104:99:1988,0,250 -chr19 33871125 . C G 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=1.230;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.904;QD=14.24;ReadPosRankSum=-2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,69:158:99:2292,0,2875 -chr19 33874883 . G A 5116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.975;DP=296;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,142:295:99:5145,0,4713 -chr19 33881110 . A G 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.550;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.526;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:988,0,1107 -chr19 33885507 . C G 1314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.130;DP=76;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:1343,0,1250 -chr19 34013670 . G C 1907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.485;DP=168;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,60:168:99:1936,0,5543 -chr19 34190018 . G C 2181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.530;DP=149;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:2210,0,2941 -chr19 34194087 . AAAGGACATTTGTTTCTGTCTACGCAGCTG A 1054.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.332;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:1092,0,4831 -chr19 34194131 . C T 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=1.021;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,46:153:99:1142,0,4413 -chr19 34194614 . CT C 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.979;DP=67;FS=9.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:474,0,995 -chr19 34213857 . G A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=4.653;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.360;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:941,0,3443 -chr19 34213942 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=2.838;DP=43;FS=12.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=8.69;ReadPosRankSum=4.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:402,0,1084 -chr19 34230732 . T C 232.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:261,0,15 -chr19 34240711 . G GA 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-1.055;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:554,0,304 -chr19 34240875 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.137;DP=38;FS=5.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:245,0,1195 -chr19 34241704 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=1.682;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:292,0,245 -chr19 34241948 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.420;DP=30;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:385,0,904 -chr19 34271073 . CA C 1041.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-0.497;DP=146;FS=7.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1079,0,1482 -chr19 34271465 . G A 3069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.039;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,91:226:99:3098,0,8223 -chr19 34271477 . C CA 2616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.381;DP=228;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,87:217:99:2654,0,3102 -chr19 34271747 . G A 3616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.696;DP=218;FS=4.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,93:217:99:3645,0,4333 -chr19 34272225 . AT A 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-0.503;DP=227;FS=4.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,47:212:99:681,0,4484 -chr19 34274618 . A T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=-3.930;DP=237;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,51:232:99:910,0,6959 -chr19 34274808 . TCCTACAACCAGAAAAAAAATGCTTAGGGAGGTCTTGTCGATGTACCAAACAACAGTACATCTCCATTTAGAATTGATCATGAATTTGTTTTATA T 2067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-2.897;DP=330;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,88:324:99:2105,0,10710 -chr19 34274810 . CT C 8858.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=-3.674;DP=328;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,230:322:99:8896,0,3341 -chr19 34274814 . AACCAGAAAAAAAATGCTTAGGGAGGTCTTGTCGATGTACCAAACAACAGTACATCTCCATTTAGAATTGATCATGAATTTGTTTTATACCACG A 8858.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-4.377;DP=344;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,230:330:99:8896,0,3306 -chr19 34275003 . C A 5295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.386;DP=357;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=14.83;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,151:357:99:5324,0,6899 -chr19 34275091 . T A 300.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.11;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:329,0,19 -chr19 34275725 . A G 360.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.74;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:388,0,11 -chr19 34289384 . G A 4570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.592;DP=318;FS=4.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,149:317:99:4599,0,4862 -chr19 34302575 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.443;DP=138;FS=1.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,25:137:99:359,0,4206 -chr19 34306765 . T G 4838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-0.598;DP=265;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,133:264:99:4867,0,4709 -chr19 34310920 . C T 6836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.096;DP=395;FS=7.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,192:395:99:6865,0,6622 -chr19 34312875 . T G 16745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-9.554;DP=322;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=31.41;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,215:322:99:16774,0,2378 -chr19 34312927 . AACCTGCGGGGGGGGAAAAAAACACCACTTTCTTAAAAAGAGCAAAAAGCCACAGCGCATAATTGGGAAGTTGATCAGCAGACTT A 16736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-2.485;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=28.27;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,331:335:99:16774,0,1688 -chr19 34319473 . G A 5706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-0.832;DP=322;FS=11.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,157:322:99:5735,0,6073 -chr19 34326242 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.076;DP=87;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:433,0,2592 -chr19 34421077 . C G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.024;DP=60;FS=7.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:505,0,1464 -chr19 34446419 . T C 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=1.241;DP=50;FS=8.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:927,0,734 -chr19 34446580 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.264;DP=35;FS=18.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:294,0,2296 -chr19 34446903 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.736;DP=35;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:240,0,998 -chr19 34447000 . CA C 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.286;DP=60;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:672,0,919 -chr19 34500302 . T G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.737;DP=62;FS=2.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:649,0,1397 -chr19 34576457 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:278,0,107 -chr19 34638668 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.020;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1066,0,1120 -chr19 34875852 . G T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.521;DP=62;FS=5.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:768,0,2560 -chr19 34875853 . A G 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.554;DP=61;FS=5.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:768,0,2564 -chr19 34875907 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-1.607;DP=39;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:307,0,1537 -chr19 34875917 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=1.577;DP=38;FS=7.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:315,0,1501 -chr19 34876689 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:277,0,103 -chr19 34876990 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.25;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:306,0,139 -chr19 34877341 . C G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=17.16;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:320,0,305 -chr19 34877364 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.220;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:285,0,259 -chr19 34877583 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.151;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:460,0,243 -chr19 34877647 . A G 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=-1.194;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:719,0,218 -chr19 34878069 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-2.061;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:497,0,206 -chr19 34878594 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,340 -chr19 35066237 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,295 -chr19 35097095 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=1.001;DP=23;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=11.29;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:288,0,544 -chr19 35130298 . A G 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-0.047;DP=102;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:1565,0,1863 -chr19 35136909 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-1.594;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:811,0,3399 -chr19 35139181 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=3.365;DP=64;FS=7.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:328,0,1880 -chr19 35139211 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-2.929;DP=59;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,11:59:99:232,0,3855 -chr19 35140439 . T C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-1.124;DP=61;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:357,0,1750 -chr19 35149144 . CA C 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.531;DP=53;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:512,0,476 -chr19 35149703 . A T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.372;DP=67;FS=5.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:558,0,1779 -chr19 35150961 . C CT 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=2.409;DP=45;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.53;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:376,0,574 -chr19 35201714 . ACTAAAAGTATGAAGAAAAGAAATCAGAGAAATAGTCTATTGTAATATGCAACACTTTAATGTTTGTTGTTTGGATGAATCTAAATGATAAATCTTAC A 1642.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=1.540;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=25.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:99:1680,159,0 -chr19 35212609 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.856;DP=44;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:294,0,1224 -chr19 35253194 . A C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.471;ClippingRankSum=-0.425;DP=120;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:615,0,3610 -chr19 35268749 . T A 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:743,54,0 -chr19 35268764 . G A 621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:650,45,0 -chr19 35270920 . T C 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.633;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=28.49;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:712,0,132 -chr19 35270940 . T C 974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1003,72,0 -chr19 35271136 . A T 831.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:860,60,0 -chr19 35271242 . T C 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 -chr19 35271338 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=16.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=29.25;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:76:467,0,76 -chr19 35271405 . C T 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:950,66,0 -chr19 35271438 . A G 955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:984,69,0 -chr19 35273062 . T C 908.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:937,66,0 -chr19 35273290 . G A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=2.068;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=31.25;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:84:997,0,84 -chr19 35275401 . T A 955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:984,69,0 -chr19 35277659 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.344;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:403,0,132 -chr19 35277680 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:41:409,0,41 -chr19 35280053 . A T 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=1.327;DP=31;FS=6.463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=26.89;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:46:1142,46,0 -chr19 35281825 . T C 1189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1218,93,0 -chr19 35284228 . C T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.367;DP=24;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:685,0,117 -chr19 35287762 . T C 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.612;DP=27;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=28.66;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:802,0,168 -chr19 35288717 . G T 1313.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.618;DP=41;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=32.05;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:16:1342,0,16 -chr19 35290931 . A G 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:850,63,0 -chr19 35291234 . A G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr19 35303779 . A G 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1746,120,0 -chr19 35303788 . C A 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1746,120,0 -chr19 35303858 . CA C 537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:575,45,0 -chr19 35376110 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=-0.079;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:338,0,1039 -chr19 35506962 . C G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr19 35508111 . T A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:475,33,0 -chr19 35508114 . A C 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 -chr19 35630056 . G T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-2.423;DP=90;FS=4.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:547,0,2564 -chr19 35630108 . T G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.952;DP=68;FS=5.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:443,0,1946 -chr19 35645776 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.071;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=3.24;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:278,0,2402 -chr19 35728879 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.474;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:295,0,1170 -chr19 35728915 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.901;DP=36;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:266,0,844 -chr19 35765660 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-2.069;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,915 -chr19 35765739 . C A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-1.523;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:348,0,1016 -chr19 35766001 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-1.223;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:513,0,1847 -chr19 35768045 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.231;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:231,0,502 -chr19 35780421 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.724;DP=36;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:270,0,983 -chr19 36246687 . G A 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=1.297;DP=42;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:790,0,1766 -chr19 36281739 . A C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.307;DP=38;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:589,0,528 -chr19 36282062 . A G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.795;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:779,0,473 -chr19 36299935 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:346,0,354 -chr19 36553043 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.331;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:404,0,667 -chr19 36553585 . A T 1973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.793;DP=129;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:2002,0,5684 -chr19 36555602 . CCCTGTGGGATATCAAAGAAATGCTTGGCATTATAATGTGATCAAATACATAAACAGAAAATAAAATGGTTTTTATTTATTGTA C 13242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=2.223;DP=298;FS=2.060;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=28.23;ReadPosRankSum=-2.982 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,280:284:99:13280,1021,0 -chr19 36563477 . A G 255.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:284,0,18 -chr19 36588840 . C A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.350;DP=156;FS=13.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,41:156:99:1000,0,4468 -chr19 36589096 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-2.688;DP=123;FS=8.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=4.73;ReadPosRankSum=2.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,31:123:99:610,0,3569 -chr19 36589218 . C G 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=-0.167;DP=211;FS=7.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,65:211:99:1773,0,8311 -chr19 36595506 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:275,0,60 -chr19 36596091 . C A 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-0.701;DP=264;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,73:264:99:1684,0,6888 -chr19 36601372 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:282,0,181 -chr19 36605367 . C G 3427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=1.249;DP=226;FS=0.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,99:226:99:3456,0,4182 -chr19 36614194 . G A 3359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-1.625;DP=212;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,99:212:99:3388,0,3576 -chr19 36618172 . C T 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.011;DP=247;FS=4.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,57:246:99:1183,0,7389 -chr19 36618187 . G A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.532;ClippingRankSum=0.287;DP=212;FS=7.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=3.25;ReadPosRankSum=2.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,46:210:99:717,0,6284 -chr19 36618360 . T G 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=1.208;DP=243;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,54:243:99:1050,0,10008 -chr19 36630543 . C G 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-1.133;DP=118;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,42:118:99:1463,0,2604 -chr19 36630633 . C T 2077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-1.497;DP=134;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=15.51;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:2106,0,2528 -chr19 36630772 . T A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.766;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,25:142:99:342,0,4519 -chr19 36633666 . C A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-2.471;DP=258;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=1.64;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,40:257:99:451,0,8421 -chr19 36644093 . G T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.384;DP=109;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:482,0,3282 -chr19 36646695 . A G 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-0.666;DP=60;FS=2.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:729,0,1355 -chr19 36647782 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:373,0,323 -chr19 36647933 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-0.021;DP=30;FS=8.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:425,0,630 -chr19 36647957 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.758;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:511,0,774 -chr19 36667832 . A G 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.864;DP=111;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,31:110:99:745,0,3039 -chr19 36670140 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.494;DP=104;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,25:104:99:518,0,3037 -chr19 36676819 . T C 1200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-0.224;DP=76;FS=9.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1229,0,1281 -chr19 36676851 . G A 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.811;DP=79;FS=5.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,41:78:99:1276,0,1286 -chr19 36680219 . G T 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=-0.888;DP=82;FS=4.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:1350,0,1418 -chr19 36682510 . C T 1626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.908;DP=101;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1655,0,1652 -chr19 36690535 . A T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-1.483;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=14.34;ReadPosRankSum=2.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:444,0,614 -chr19 36690910 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=2.353;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=12.54;ReadPosRankSum=2.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:279,0,414 -chr19 36692467 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.811;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,414 -chr19 36703807 . C T 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-0.973;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1140,0,1180 -chr19 36703870 . T C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.383;DP=102;FS=4.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:454,0,2976 -chr19 36708186 . G T 1236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.240;DP=66;FS=4.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:1265,0,1013 -chr19 36742375 . G T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=-0.083;DP=73;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1249,0,1348 -chr19 36874103 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.015;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:234,0,944 -chr19 36874267 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.510;DP=27;FS=5.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:510,0,770 -chr19 36874428 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.934;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:292,0,579 -chr19 36874592 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-0.842;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:391,0,658 -chr19 36899372 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:295,0,381 -chr19 36922605 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.123;DP=28;FS=5.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:369,0,577 -chr19 36923019 . T C 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.111;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=31.99;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:59:828,0,59 -chr19 36924319 . T A 930.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.187;DP=21;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:68:959,68,0 -chr19 36925267 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.561;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:511,0,612 -chr19 36926000 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.814;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:500,0,749 -chr19 36926608 . A G 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.653;DP=43;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.340;QD=24.86;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1097,0,354 -chr19 36927519 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:432,0,726 -chr19 36927523 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.956;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,726 -chr19 36927899 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-1.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:334,0,324 -chr19 36928358 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.262;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=15.25;ReadPosRankSum=3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:379,0,382 -chr19 36928391 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:379,0,280 -chr19 36928430 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.523;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:376,0,380 -chr19 36928528 . T C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=-0.643;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:709,0,251 -chr19 36931946 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.836;DP=28;FS=10.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:230,0,684 -chr19 36948757 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-2.019;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:431,0,536 -chr19 36967182 . TC T 1214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-4.016;DP=126;FS=11.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=9.64;ReadPosRankSum=3.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,41:109:99:1301,0,3363 -chr19 36967575 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-1.549;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:392,0,675 -chr19 36967660 . A T 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.281;DP=76;FS=3.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:1365,0,2364 -chr19 36972705 . C A 2336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.178;DP=499;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,115:496:99:2365,0,14262 -chr19 36972863 . G T 2823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.441;DP=448;FS=0.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=6.30;ReadPosRankSum=2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,118:448:99:2852,0,12544 -chr19 36977095 . G A 7207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.456;ClippingRankSum=0.115;DP=543;FS=0.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=13.27;ReadPosRankSum=3.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,238:541:99:7236,0,9567 -chr19 36983371 . G A 3981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.675;DP=124;FS=6.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=32.11;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,104:123:99:4010,0,213 -chr19 36986761 . T C 3338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.288;DP=123;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,90:123:99:3367,0,763 -chr19 36994267 . TCCTAAAAGTAAAAAAAAAGCAAATACAAGTTACTCATCAAACACTTTAGGGTGTAAATAAAGAGTAGATGACAAGCTCCACTAA T 3516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=2.017;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=27.02;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,72:74:99:3554,370,0 -chr19 37007517 . T C 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.798;DP=259;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,67:259:99:1433,0,7550 -chr19 37008097 . G A 3852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-2.746;DP=208;FS=4.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,106:208:99:3881,0,3744 -chr19 37043183 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:34:383,0,34 -chr19 37271598 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=25.12;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:405,0,401 -chr19 37273959 . A G 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.317;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:2332,0,4414 -chr19 37273960 . G A 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=1.089;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:2332,0,4375 -chr19 37281702 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.374;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:499,0,2816 -chr19 37347763 . G C 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-1.435;DP=24;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:442,0,347 -chr19 37348197 . A G 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.294;DP=37;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:735,0,448 -chr19 37362517 . C T 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.937;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=26.58;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,41:55:99:1490,0,361 -chr19 37400881 . A C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.049;DP=36;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:773,0,437 -chr19 37663530 . G C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=28.73;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:373,0,53 -chr19 37739852 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.88;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:267,0,100 -chr19 39050690 . G A 2070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.576;DP=365;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,89:365:99:2099,0,27345 -chr19 39050692 . T G 2070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=1.051;DP=371;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,91:371:99:2099,0,27345 -chr19 39051685 . G A 2372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=1.259;DP=448;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,110:448:99:2401,0,12767 -chr19 39054705 . G A 3074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=1.148;DP=401;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,121:401:99:3103,0,10705 -chr19 39169725 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.152;DP=71;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:409,0,2017 -chr19 39250534 . A G 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.917;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1112,0,1083 -chr19 39335189 . C A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.278;DP=38;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:602,0,703 -chr19 39338735 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.654;DP=76;FS=2.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:362,0,2084 -chr19 39346341 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-1.729;DP=72;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:498,0,1969 -chr19 39348703 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.373;DP=55;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:480,0,1458 -chr19 39353629 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-0.084;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,15:87:99:232,0,2787 -chr19 39378360 . A C 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=-0.381;DP=73;FS=4.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1248,0,1235 -chr19 39384399 . A G 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=2.028;DP=52;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:903,0,2130 -chr19 39384405 . T C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=2.238;DP=52;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:903,0,2070 -chr19 39391033 . CAG C 1016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-1.545;DP=52;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,31:49:99:1054,0,906 -chr19 39391261 . G A 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.148;DP=64;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1104,0,1150 -chr19 39474963 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.040;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:360,0,708 -chr19 39475603 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,143 -chr19 39719964 . G A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.320;DP=52;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:871,0,892 -chr19 39720012 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=1.630;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:442,0,1414 -chr19 39793686 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.448;DP=80;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:529,0,2181 -chr19 39806783 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-1.320;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:281,0,1000 -chr19 39875885 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.272;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:236,0,846 -chr19 39875915 . G A 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-2.245;DP=26;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:311,0,512 -chr19 39876286 . A AT 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.024;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:318,0,319 -chr19 39929504 . G A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr19 39934808 . A T 290.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:318,0,12 -chr19 39934876 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:231,0,66 -chr19 39971109 . G A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.596;DP=284;FS=2.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,90:284:99:1743,0,23254 -chr19 39994543 . A C 208.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:237,0,18 -chr19 40005310 . A T 8000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=1.266;DP=475;FS=33.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,271:475:99:8029,0,6808 -chr19 40013486 . C T 5779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.335;DP=355;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.295;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,186:353:99:5808,0,5851 -chr19 40013505 . G T 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.095;DP=380;FS=4.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,88:379:99:1749,0,10980 -chr19 40015847 . C A 1847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=-3.335;DP=278;FS=2.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,75:277:99:1876,0,8045 -chr19 40016094 . T C 3195.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.735;DP=287;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,146:287:99:3224,0,21196 -chr19 40016298 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.898;DP=162;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:611,0,5184 -chr19 40016351 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.846;DP=150;FS=16.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,28:150:99:479,0,4872 -chr19 40022584 . TG T 2990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-0.645;DP=53;FS=6.662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=31.41;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:3028,262,0 -chr19 40022755 . G A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-1.006;DP=264;FS=5.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,43:264:99:602,0,18243 -chr19 40022757 . G A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-2.358;DP=268;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,43:268:99:595,0,18243 -chr19 40022798 . G T 5498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.678;DP=348;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,157:346:99:5527,0,7285 -chr19 40022913 . A T 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.362;DP=259;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,63:259:99:1436,0,7650 -chr19 40023197 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.300;DP=143;FS=3.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,28:143:99:363,0,5305 -chr19 40023260 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.753;DP=104;FS=1.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:723,0,4863 -chr19 40023265 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.235;DP=103;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:572,0,4390 -chr19 40023292 . A T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.208;DP=91;FS=9.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:652,0,3294 -chr19 40023431 . A C 1885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.572;DP=144;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,56:144:99:1914,0,2967 -chr19 40023475 . G T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.947;DP=149;FS=4.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,34:149:99:728,0,4616 -chr19 40023760 . T A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.131;DP=187;FS=4.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,40:186:99:329,0,6250 -chr19 40023979 . C A 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.247;DP=260;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,58:260:99:1109,0,7676 -chr19 40024159 . T G 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.832;ClippingRankSum=-0.274;DP=190;FS=3.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,61:190:99:1619,0,4444 -chr19 40024267 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=-0.105;DP=269;FS=7.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,62:269:99:1208,0,7872 -chr19 40024689 . C T 1911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=-1.012;DP=323;FS=0.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,88:323:99:1940,0,8554 -chr19 40026137 . G A 3361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-1.450;DP=230;FS=1.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,101:230:99:3390,0,4122 -chr19 40026169 . G T 3072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.836;DP=207;FS=0.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,89:207:99:3101,0,3848 -chr19 40040511 . G A 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.736;DP=197;FS=0.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,49:197:99:1080,0,8535 -chr19 40040515 . T C 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-0.860;DP=211;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=8.13;ReadPosRankSum=3.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,66:211:99:1744,0,7659 -chr19 40054668 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-1.006;DP=311;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=3.14;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,61:311:99:1005,0,9349 -chr19 40057220 . G C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=4.259;DP=206;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=1.03;ReadPosRankSum=-4.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,30:205:99:241,0,6544 -chr19 40066193 . A G 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.024;DP=199;FS=10.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.022;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:918,0,4930 -chr19 40071276 . G A 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.384;DP=208;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,50:208:99:1025,0,5755 -chr19 40102158 . G C 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.475;DP=310;FS=4.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=6.25;ReadPosRankSum=2.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,84:310:99:1965,0,8553 -chr19 40140160 . G A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=1.182;DP=260;FS=3.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=5.01;ReadPosRankSum=2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,63:260:99:1331,0,7432 -chr19 40143070 . C A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.501;DP=229;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,41:229:99:501,0,8124 -chr19 40143127 . C G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.813;DP=231;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,49:231:99:747,0,8512 -chr19 40145876 . A C 1661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=1.428;DP=309;FS=7.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=5.38;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,76:309:99:1690,0,8892 -chr19 40986792 . A T 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-2.105;DP=290;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,67:290:99:1228,0,8096 -chr19 40987103 . A G 3700.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.773;DP=385;FS=1.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.146;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,114:339:99:3738,0,14215 -chr19 40987106 . G A 4124.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-2.898;DP=371;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=11.12;ReadPosRankSum=2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,117:337:99:4162,0,7651 -chr19 40991352 . A C 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;ClippingRankSum=-1.450;DP=308;FS=31.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,36:126:99:1120,0,1072 -chr19 40994419 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.221;DP=41;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:252,0,1127 -chr19 40994455 . G A 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.483;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=28.28;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1131,0,234 -chr19 40994546 . C T 1289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-1.188;DP=46;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,34:46:99:1318,0,263 -chr19 40994898 . T C 240.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:269,0,20 -chr19 40996228 . G GT 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=1.175;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:60:435,0,60 -chr19 40996716 . G T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.581;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:562,0,1087 -chr19 40996777 . G GT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.498;DP=34;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:337,0,396 -chr19 40998017 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:370,0,373 -chr19 40998074 . T A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=17.71;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:347,0,287 -chr19 40998088 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:260,0,254 -chr19 40998379 . G T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-1.429;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=18.36;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:377,0,333 -chr19 40999120 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.827;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:348,0,218 -chr19 40999697 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=-0.698;DP=58;FS=4.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.225;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:232,0,1782 -chr19 40999945 . G A 4704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.129;DP=291;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,122:291:99:4733,0,12845 -chr19 40999948 . T A 4704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.732;DP=298;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,125:298:99:4733,0,12669 -chr19 41001062 . AT A 315.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.992;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:6:351,6,0 -chr19 41006137 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=1.177;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=22.60;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:435,0,255 -chr19 41006625 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.277;DP=44;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:254,0,1264 -chr19 41006719 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-0.647;DP=27;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:256,0,604 -chr19 41007410 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.769;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,108 -chr19 41007678 . A T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.483;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:698,0,1215 -chr19 41007685 . A G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.348;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:578,0,1435 -chr19 41007701 . T G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.178;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:612,0,799 -chr19 41007902 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:291,0,429 -chr19 41008427 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:299,0,385 -chr19 41008558 . A G 870.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.992;DP=24;FS=7.877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:30:899,30,0 -chr19 41008831 . A G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.784;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:494,0,977 -chr19 41009117 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.467;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:400,0,1792 -chr19 41009894 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=-0.175;DP=23;FS=11.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:310,0,1251 -chr19 41009903 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.129;DP=27;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:310,0,1251 -chr19 41011242 . T G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=2.298;DP=46;FS=9.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:570,0,1326 -chr19 41011255 . T A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=1.725;DP=48;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=13.22;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:663,0,1315 -chr19 41011555 . A C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.162;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:370,0,388 -chr19 41012421 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.335;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=14.76;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:471,0,603 -chr19 41012741 . A T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.613;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1648,0,1406 -chr19 41013033 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.690;DP=79;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=3.68;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:319,0,2453 -chr19 41013157 . GTA G 874.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-2.141;DP=52;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:912,0,759 -chr19 41015372 . A G 1597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=1.644;DP=101;FS=8.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:1626,0,1759 -chr19 41015425 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.784;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:616,0,108 -chr19 41030032 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:322,0,284 -chr19 41041094 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.397;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:591,0,667 -chr19 41042214 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.099;DP=36;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:422,0,802 -chr19 41062202 . T G 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=2.068;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=28.23;ReadPosRankSum=2.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:734,0,126 -chr19 41062733 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-1.997;DP=40;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:715,0,566 -chr19 41080352 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.660;DP=32;FS=14.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:579,0,610 -chr19 41080623 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.893;DP=36;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:313,0,954 -chr19 41081299 . C T 823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:60:852,60,0 -chr19 41081305 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=13.34;ReadPosRankSum=-2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:255,0,340 -chr19 41086983 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.042;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:305,0,1538 -chr19 41106230 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-1.835;DP=63;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:438,0,1743 -chr19 41108117 . A G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=-0.520;DP=92;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:978,0,2110 -chr19 41108163 . G A 3317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-1.053;DP=130;FS=4.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,88:130:99:3346,0,1140 -chr19 41115486 . C A 2320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-1.009;DP=81;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=28.65;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,62:81:99:2349,0,403 -chr19 41117473 . C T 2516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.842;DP=155;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=16.24;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:2545,0,2670 -chr19 41123302 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-2.386;DP=115;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=3.22;ReadPosRankSum=2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:398,0,3627 -chr19 41123443 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.412;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,28:147:99:448,0,4465 -chr19 41139983 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=21.49;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,200 -chr19 41140577 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=-0.038;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:436,0,680 -chr19 41142916 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.069;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,548 -chr19 41148179 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr19 41286007 . T G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=2.621;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:298,0,384 -chr19 41287033 . C T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=-1.866;DP=47;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:772,0,832 -chr19 41287201 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.395;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:457,0,895 -chr19 41287202 . C A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.718;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:457,0,874 -chr19 41287220 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.231;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=15.73;ReadPosRankSum=-2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:453,0,1233 -chr19 41287289 . TC T 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.723;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=9.72;ReadPosRankSum=3.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:329,0,280 -chr19 41287445 . T C,A 1135.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,17:21:99:1169,1067,2331,163,0,154 -chr19 41287468 . T C 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,25:25:99:1003,0,154 -chr19 41287919 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.936;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:247,0,838 -chr19 41288207 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=1.350;DP=19;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=29.41;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:587,0,112 -chr19 41289904 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.158;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:282,0,289 -chr19 41290008 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-0.609;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:450,0,206 -chr19 41290324 . C T 717.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=30.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:19:746,0,19 -chr19 41290387 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:248,0,465 -chr19 41291339 . C T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr19 41291515 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.113;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.154;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:340,0,346 -chr19 41292233 . GT G 521.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=1.279;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:559,0,111 -chr19 41292282 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,848 -chr19 41300616 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.560;DP=121;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:416,0,3365 -chr19 41308037 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.934;DP=124;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,32:124:99:752,0,10171 -chr19 41308042 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=-1.479;DP=123;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,34:123:99:740,0,10171 -chr19 41501468 . T C 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-0.982;DP=62;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:718,0,1380 -chr19 41512489 . C T 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.164;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=31.38;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:54:907,0,54 -chr19 41850380 . CGGTAAAACACACACAAATATTACAAAAAAAACTATTAAAAAAAATAACAACGTGCTAATGCTAAACACATCCGCA C 4533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=1.701;DP=112;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:4571,360,0 -chr19 41852972 . C T 1396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=-0.594;DP=95;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:1425,0,1638 -chr19 41856356 . G A 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=1.135;DP=83;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1405,0,1471 -chr19 41859566 . G GA 672.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-1.097;DP=41;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=16.41;ReadPosRankSum=-1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:710,0,224 -chr19 41860509 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr19 41954347 . AGTGAGTATCACAACCAACATCCTACAATGAATCTCTTAAGTCCACTTTGTAGCATATAAGTCCATCACCTTTCATTTTTTCAG A 2409.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=1.723;DP=401;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,393:395:99:17873,1333,0 -chr19 41954835 . A G 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=-5.277;DP=374;FS=62.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=4.23;ReadPosRankSum=-1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,175:223:99:1612,0,345 -chr19 41962160 . G GT 3144.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.323;DP=313;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,146:293:99:3182,0,3960 -chr19 41962516 . GT G 4739.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-1.510;DP=352;FS=10.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,178:346:99:4777,0,4989 -chr19 41962833 . T A 4844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-2.524;DP=281;FS=8.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,135:281:99:4873,0,4738 -chr19 41973741 . G C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.351;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:599,0,424 -chr19 41988355 . C T 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:234,0,25 -chr19 41994407 . C T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.770;DP=51;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:602,0,1113 -chr19 41994536 . C A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.878;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:926,0,1129 -chr19 41994926 . G A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-0.750;DP=35;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:699,0,509 -chr19 41995221 . C T 927.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.669;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=33.13;ReadPosRankSum=-2.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:6:955,0,6 -chr19 41995711 . T TC 931.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:969,72,0 -chr19 41999534 . C A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.493;DP=74;FS=9.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:506,0,2124 -chr19 41999613 . C A 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-1.266;DP=82;FS=7.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1290,0,1580 -chr19 42017693 . T C 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=1.878;DP=81;FS=3.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.53;ReadPosRankSum=-1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,54:81:99:1772,0,890 -chr19 42017705 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-0.900;DP=79;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:806,0,1630 -chr19 42040835 . C A 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:531,39,0 -chr19 42087943 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.032;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:274,0,517 -chr19 42120542 . A T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:445,33,0 -chr19 42120618 . C CA 203.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:31:300,31,0 -chr19 42121092 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.122;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=17.25;ReadPosRankSum=-2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:356,0,325 -chr19 42121507 . G GA 388.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:426,30,0 -chr19 42121511 . G A 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr19 42122918 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.977;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,175 -chr19 42123608 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.212;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:368,0,264 -chr19 42123722 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.872;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:275,0,247 -chr19 42124194 . T C 285.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.78;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:314,0,13 -chr19 42124724 . A C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr19 42125438 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:282,0,102 -chr19 42125999 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:284,0,406 -chr19 42126131 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=1.562;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,305 -chr19 42126665 . A C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-1.002;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:336,0,210 -chr19 42126774 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:262,0,108 -chr19 42128264 . C T 876.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:905,66,0 -chr19 42128451 . AT A 533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:571,39,0 -chr19 42138751 . G C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,186 -chr19 42138901 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:354,0,122 -chr19 42141307 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.488;DP=17;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:360,0,205 -chr19 42149194 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=1.861;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:232,0,727 -chr19 42149473 . G C 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr19 42149713 . T C 323.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=32.39;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:352,0,15 -chr19 42150209 . A G 1084.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:81:1113,81,0 -chr19 42151006 . T C 453.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=34.90;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:6:481,0,6 -chr19 42151161 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-1.960;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=23.63;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:430,0,203 -chr19 42151383 . G T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.595;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=15.89;ReadPosRankSum=-1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:616,0,597 -chr19 42178470 . A C 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.216;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:558,0,296 -chr19 42442284 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.244;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:237,0,1611 -chr19 42443198 . C CT 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-2.860;DP=145;FS=18.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,32:136:99:415,0,2851 -chr19 42472986 . A AC 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.803;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:266,0,951 -chr19 42473056 . CT C 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.322;DP=25;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:335,0,242 -chr19 42475901 . A AC 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.634;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:387,0,230 -chr19 42476202 . T G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.765;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:399,0,651 -chr19 42476410 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.442;DP=37;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:238,0,1015 -chr19 42476972 . G T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.857;DP=66;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:430,0,1822 -chr19 42484870 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.472;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:504,0,935 -chr19 42488197 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.925;DP=100;FS=5.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:681,0,2808 -chr19 42505645 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.014;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:299,0,1162 -chr19 42510796 . A G 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=1.048;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:539,0,555 -chr19 42540367 . T C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-1.767;DP=98;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,27:97:99:687,0,2718 -chr19 43242028 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=1.073;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:448,0,1417 -chr19 43252826 . G C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.687;DP=58;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:395,0,1536 -chr19 43260585 . GA G 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.231;DP=49;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:261,0,738 -chr19 43260705 . C A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=2.076;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:447,0,904 -chr19 43261179 . T G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.175;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:449,0,1228 -chr19 43261277 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.537;DP=24;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:322,0,821 -chr19 43262002 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:254,0,415 -chr19 43262160 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:410,0,626 -chr19 43263908 . TA T 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.236;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:431,0,834 -chr19 43263964 . G GA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-2.021;DP=50;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:443,0,579 -chr19 43264750 . T G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=1.033;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=7.46;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:237,0,756 -chr19 43265136 . GT G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.946;DP=52;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:278,0,311 -chr19 43338874 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=1.725;DP=127;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,25:127:99:522,0,8263 -chr19 43338876 . A C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=1.662;DP=130;FS=0.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,26:130:99:517,0,8263 -chr19 43366061 . T C 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.720;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=18.04;ReadPosRankSum=2.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:930,0,1713 -chr19 43366662 . C T 2982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=36.33;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,8:11:99:3011,218,0 -chr19 43367040 . A G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.321;DP=75;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:479,0,2754 -chr19 43368368 . C T 2626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-1.179;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=31.27;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,68:84:99:2655,0,402 -chr19 43369496 . CT C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.176;DP=25;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:246,0,244 -chr19 43369704 . T C 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:502,36,0 -chr19 43369922 . TTA T 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.212;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:265,0,848 -chr19 43370114 . AC A 530.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:25:568,25,0 -chr19 43374653 . C A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.860;DP=71;FS=7.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:330,0,2103 -chr19 43393641 . G T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.841;DP=48;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:531,0,966 -chr19 43399146 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=-1.380;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:278,0,1858 -chr19 43420733 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-0.143;DP=57;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:275,0,1698 -chr19 43450742 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.301;DP=70;FS=8.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:275,0,2110 -chr19 43583379 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:251,18,0 -chr19 43585606 . TA T 324.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:362,36,0 -chr19 43599241 . C A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-2.499;DP=149;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:644,0,10051 -chr19 43599302 . C A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=-0.226;DP=147;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:623,0,10050 -chr19 43628551 . C T 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.026;DP=197;FS=5.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,51:194:99:1163,0,5278 -chr19 43749709 . C G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.497;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:371,0,1672 -chr19 43756394 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-2.020;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:325,0,2025 -chr19 43784101 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:264,0,126 -chr19 43793836 . T G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.088;DP=30;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:578,0,479 -chr19 43849319 . T C 2288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.670;DP=609;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:481,127:608:99:2317,0,18205 -chr19 43859091 . CAGGTGATGTAGCTGCTGCTTTCTTTTTTTTTTCCTTTTGTTAAACTATGCATCTTATTAACACTCCATTCCTTTGATAAA C 17109.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.179;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,396:397:99:17147,1338,0 -chr19 43861269 . G C 1289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=-0.469;DP=224;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,60:224:99:1318,0,11497 -chr19 43861998 . TA T 2131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.482;DP=149;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,105:131:99:2169,0,2589 -chr19 43862457 . A T 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.043;DP=175;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,51:174:99:1257,0,4763 -chr19 43935956 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.959;DP=76;FS=3.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:364,0,2181 -chr19 43937346 . TTA T 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.502;DP=45;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:319,0,946 -chr19 43977821 . ACTGCAAAAAAACAAACAAACGATTAGTGGCTCAATAAAATAGAAGTGAATATTTGCAGATTCATTGTTTATTATTTCAGCTTAC A 17586.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=2.096;DP=409;FS=8.831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=29.60;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,406:409:99:17624,1494,0 -chr19 43980629 . T A 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=3.405;DP=384;FS=12.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=2.47;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,68:384:99:978,0,12491 -chr19 44019137 . C T 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=2.568;DP=89;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=18.55;ReadPosRankSum=2.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1679,0,2878 -chr19 44019139 . A C 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=2.568;DP=89;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1679,0,2878 -chr19 44157473 . T A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-2.135;DP=34;FS=14.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:322,0,857 -chr19 44163771 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=3.013;DP=46;FS=23.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:264,0,1314 -chr19 44165196 . TACCTGTATATAGAGAGCACCAATGAGGAAATCCTACATACAAACTACAAACATTCAATACTGTCTGAGTTGATGATCAACTAACTG T 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:260,0,1233 -chr19 44170606 . AT A 214.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:252,0,16 -chr19 44174144 . CACCTAAATAAAAGAGAGACACTTTAAAAACAAGCACTCTACTGGGATGTTCTGTGTAATAAGGCAGAAATGT C 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.068;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,2043 -chr19 44179879 . C CA 209.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:320,33,0 -chr19 44193977 . AT A 1068.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1106,112,0 -chr19 44208659 . AC A 349.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:29:387,29,0 -chr19 44208661 . ACAC A 349.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:387,29,0 -chr19 44210080 . C A 1157.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:84:1186,84,0 -chr19 44214563 . G GA 432.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:470,41,0 -chr19 44215263 . CACACACTCTTTTATGTCCTCTGTAGCGTAAGATAAAACACACTGTAATAACATGCTTGTTTTTTGCCTTTAGAT C 2360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.466;ClippingRankSum=0.250;DP=257;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,85:254:99:2398,0,6505 -chr19 44289111 . A T 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:241,0,25 -chr19 44369482 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.484;DP=61;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:368,0,1691 -chr19 44370945 . G GT 276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -chr19 44370950 . C T 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -chr19 44372363 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.740;DP=31;FS=8.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:263,0,908 -chr19 44374893 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,247 -chr19 44376373 . G A 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.310;DP=303;FS=12.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=3.03;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,60:303:99:945,0,9141 -chr19 44401308 . T A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.446;DP=306;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=3.59;ReadPosRankSum=2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,64:306:99:1126,0,9220 -chr19 44404789 . G A 1610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.191;DP=297;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,72:296:99:1639,0,8588 -chr19 44420284 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.542;DP=34;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:447,0,677 -chr19 44444394 . A C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.113;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:322,0,1197 -chr19 44445325 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-1.953;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:77:579,0,77 -chr19 44445771 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,289 -chr19 44446888 . AT A 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-1.087;DP=33;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:421,0,1262 -chr19 44447543 . TC T 632.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.390;DP=62;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:670,0,740 -chr19 44462566 . A G 238.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:267,0,20 -chr19 44489293 . G A 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.182;DP=122;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,36:122:99:918,0,3233 -chr19 44498933 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=1.803;DP=69;FS=19.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:401,0,3147 -chr19 44505088 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-0.408;DP=58;FS=6.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:410,0,1666 -chr19 44515315 . CCAGGTACTTTATATTTAAATTAGGAATGAGATGAGATGTGATGTCATATTGTATGTCTAATTGTAAGTCGATTCTGGCTTCTTCTGT C 4834.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.049;DP=115;FS=3.136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=31.13;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:4872,451,0 -chr19 44519439 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=1.622;DP=78;FS=9.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:534,0,2121 -chr19 44521571 . C T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr19 44521574 . T A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:351,24,0 -chr19 44522160 . A AT 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.135;DP=62;FS=7.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,33:56:99:634,0,481 -chr19 44528147 . CT C 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.979;DP=21;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:292,0,114 -chr19 44529054 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,182 -chr19 44586555 . CCT C 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=1.374;DP=112;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,39:111:99:1332,0,2232 -chr19 44610733 . T C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.479;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,35:160:99:689,0,4871 -chr19 44610808 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.484;DP=151;FS=2.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=1.97;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,25:150:99:326,0,4752 -chr19 44629623 . A G 2503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.294;DP=319;FS=5.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,99:318:99:2532,0,11724 -chr19 44633715 . CTG C 1551.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=-1.367;DP=109;FS=9.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:2:1587,0,2 -chr19 44692749 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.617;DP=266;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,58:266:99:1081,0,10037 -chr19 44693646 . A G 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-1.064;DP=280;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,64:280:99:1252,0,8069 -chr19 44781183 . G GA 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.916;DP=90;FS=4.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:358,0,1547 -chr19 44782050 . A G 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.065;DP=89;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:1044,0,2037 -chr19 44782807 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:90:392,0,90 -chr19 44782988 . AT A 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.693;DP=46;FS=6.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:474,0,1327 -chr19 44783110 . C CA 1609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:99:1647,144,0 -chr19 44783603 . AG A 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.277;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=8.43;ReadPosRankSum=2.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:366,0,806 -chr19 44783975 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.259;DP=29;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:271,0,1105 -chr19 44784923 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-1.535;DP=64;FS=10.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:429,0,1832 -chr19 44786611 . GT G 694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.358;DP=59;FS=4.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.78;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:732,0,757 -chr19 44786719 . T A 1029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-2.273;DP=79;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:1058,0,2016 -chr19 44787621 . G GTT 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=-0.138;DP=30;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:650,0,328 -chr19 44788261 . GTCCTAATATTTCAAATAATTGTAATGCATAAGTTTTTTTTTTTATAATAATGTTGTCAAAAAATAGGGGA G 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.126;DP=41;FS=3.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:530,0,8630 -chr19 44788338 . GGC G 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=-1.351;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=16.68;ReadPosRankSum=-1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:521,0,8630 -chr19 44789126 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.436;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:243,0,1969 -chr19 44820709 . TCTGAATGACAAAACCATATGAGTGAGATGCATAAAGCTGAATAATTTCATCAGAATATCCCGCCTGCCTCAC T 691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.066;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=30.53;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:729,0,490 -chr19 44850055 . TCTGCACAGAAACAGCACTGTTACGCTGCAGCCCAGTAGAGAAACAGTGGATTACTGCTGCTGGTGTGTAGTCTTAC T 1707.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.973;DP=92;FS=12.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:1745,0,4096 -chr19 44850057 . TGCACAG T 1837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.204;DP=91;FS=14.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:1875,0,4090 -chr19 44850065 . AACAGCACTGTTACGCTGCAGCCC A 1837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-1.284;DP=91;FS=14.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:1875,0,4090 -chr19 44850092 . AGAGAAACAGTGGATTACTGCTGCTGGTGTGTAGTCTTACCTAGAGTG A 1837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.924;DP=101;FS=9.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1875,0,4090 -chr19 44858277 . G A 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=-0.089;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1631,0,983 -chr19 44874462 . T C 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:307,24,0 -chr19 44889794 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=1.924;DP=46;FS=4.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:741,0,799 -chr19 44968441 . G A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-0.555;DP=40;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=17.92;ReadPosRankSum=2.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:745,0,754 -chr19 44972077 . TC T 374.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=28.27;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:23:412,23,0 -chr19 45040894 . T G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.802;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,30:131:99:661,0,3946 -chr19 45041354 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.014;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:414,0,2112 -chr19 45049874 . C T 2392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-2.044;DP=184;FS=2.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=13.00;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,68:166:99:2421,0,3313 -chr19 45088636 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=1.421;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:458,0,630 -chr19 45090630 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=10.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:326,0,231 -chr19 45092363 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.708;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,556 -chr19 45138375 . A T 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:665,45,0 -chr19 45138424 . T G 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:261,21,0 -chr19 45152760 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.760;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,460 -chr19 45153322 . C G 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.434;DP=35;FS=3.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:798,0,411 -chr19 45153343 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.567;DP=39;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:500,0,789 -chr19 45288697 . CAGGTATGTCTACAACTGTGATTTAAGAAACAAAGTTGGTCTAACTTGACTATAGTTGATTTTAAACCATCACTGTTCTCCTCCTCT C 5914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:5952,522,0 -chr19 45325872 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=1.777;DP=54;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:343,0,2654 -chr19 45326070 . CG C 834.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:872,85,0 -chr19 45326183 . T C 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:657,48,0 -chr19 45362352 . T A 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-1.505;DP=311;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.03;ReadPosRankSum=-2.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,68:311:99:1281,0,8999 -chr19 45397985 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=1.459;DP=322;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=1.04;ReadPosRankSum=2.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,46:318:99:362,0,10465 -chr19 45405364 . T G 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=3.116;DP=23;FS=13.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:676,0,140 -chr19 45405909 . A G 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.030;DP=22;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=27.76;ReadPosRankSum=-1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:62:639,0,62 -chr19 45406428 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.645;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:232,0,772 -chr19 45407163 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=2.475;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=19.48;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,294 -chr19 45407329 . AT A 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:25:297,25,0 -chr19 45408604 . T TG 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.922;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:668,0,1867 -chr19 45448836 . G T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.629;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:470,0,856 -chr19 45466549 . GA G 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.555;ClippingRankSum=0.967;DP=40;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:373,0,881 -chr19 45468147 . G T 284.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:313,21,0 -chr19 45470836 . T G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=13.68;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:388,0,428 -chr19 45470918 . AT A 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.350;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:64:401,0,64 -chr19 45471570 . TG T 408.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:446,36,0 -chr19 45471868 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:298,0,230 -chr19 45474573 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=24.67;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,177 -chr19 45477292 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.368;DP=71;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:419,0,1962 -chr19 45477376 . T C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.478;DP=64;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:842,0,1374 -chr19 45480339 . C T 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-2.142;DP=45;FS=3.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.44;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,36:45:99:1398,0,161 -chr19 45480420 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.420;DP=76;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:648,0,1898 -chr19 45482542 . A G 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr19 45482965 . T A 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-0.664;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:962,0,1478 -chr19 45560632 . G A 4514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=3.039;DP=718;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.29;ReadPosRankSum=5.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:525,193:718:99:4543,0,19912 -chr19 45566663 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.676;DP=38;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:311,0,1019 -chr19 45629442 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,105 -chr19 46885449 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.153;DP=220;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,37:220:99:414,0,6959 -chr19 46891402 . GAGGTAAAAGACAGTTTATACACACACAGACACGGGTTTGGTGGTCCGGCATGTGTGTGTGTGATGTGTGTGTGTGTCTTTGTGTAC G 5286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=-2.388;DP=202;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,141:190:99:5324,0,2828 -chr19 46914377 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=-0.022;DP=29;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:392,0,568 -chr19 46935457 . G C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=1.139;DP=112;FS=4.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:319,0,3360 -chr19 46953868 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-4.247;DP=51;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:344,0,3108 -chr19 46954283 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=1.129;DP=64;FS=6.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:287,0,1939 -chr19 47034131 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.792;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:419,0,2588 -chr19 47137543 . ATGTGTGTGCGTGTG A 297.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:29:335,29,0 -chr19 47138005 . C CA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.877;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:257,0,242 -chr19 47285674 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.550;DP=47;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:471,0,1049 -chr19 47285815 . T A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=-0.499;DP=42;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:469,0,907 -chr19 47456467 . C T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-0.012;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:717,0,793 -chr19 47472881 . A G 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=-0.900;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=24.07;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:991,0,304 -chr19 47473735 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.921;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:474,0,418 -chr19 47715308 . G A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=1.357;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:489,0,375 -chr19 47716211 . T C 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 -chr19 47716351 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:268,0,277 -chr19 47716360 . A C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=29.97;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:268,0,277 -chr19 47716524 . A T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=1.641;DP=67;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:824,0,1550 -chr19 47723441 . G T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.853;DP=95;FS=11.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.523;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:455,0,2752 -chr19 47723940 . T A 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 -chr19 47723941 . T C 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 -chr19 47777934 . C T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.074;DP=98;FS=10.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,35:98:99:1145,0,2199 -chr19 47778464 . C A 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.874;DP=92;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:1452,0,1679 -chr19 47778623 . C A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=1.854;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:522,0,851 -chr19 47778684 . CA C 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.758;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.907;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:349,0,349 -chr19 47779243 . A T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.940;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:421,0,2408 -chr19 47890497 . A T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.209;DP=155;FS=3.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,37:154:99:659,0,4322 -chr19 47900651 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-0.392;DP=156;FS=1.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,30:155:99:518,0,4601 -chr19 47905511 . C A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.471;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,33:130:99:776,0,3964 -chr19 47919620 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.596;DP=99;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:435,0,2984 -chr19 48053338 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=1.244;DP=47;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:331,0,1106 -chr19 48208266 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.345;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.46;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:489,0,490 -chr19 48210244 . A C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.975;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:371,0,337 -chr19 48210327 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.306;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:240,0,497 -chr19 48211628 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.596;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:313,0,584 -chr19 48212639 . A C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.552;DP=34;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:328,0,900 -chr19 48214351 . CT C 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.506;DP=28;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:270,0,384 -chr19 48269651 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.104;DP=39;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:384,0,937 -chr19 48271436 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,1:14:99:404,0,450 -chr19 48324743 . G GCA 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.680;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:469,0,532 -chr19 48325456 . GGACATTCTCCAGCACACACTCTCGCACACACACTCTCTTGTGCACACTCTCACTCTCACACACACTCTCAAGCA G 464.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.985;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=23.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:0:499,0,0 -chr19 48325787 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=23.04;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:443,0,200 -chr19 48325865 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-2.419;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:289,0,1043 -chr19 48326640 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-2.306;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:496,0,993 -chr19 48403502 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.377;DP=220;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,37:220:99:421,0,7183 -chr19 48524242 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr19 48680114 . C A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.416;DP=33;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:595,0,523 -chr19 49093447 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.034;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,18:93:99:314,0,2827 -chr19 49095680 . C T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-1.844;DP=227;FS=8.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,67:226:99:1567,0,9855 -chr19 49095855 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=-1.033;DP=146;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,27:146:99:449,0,7158 -chr19 49203355 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.293;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:257,0,895 -chr19 49503486 . T C 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=-2.269;DP=121;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=3.72;ReadPosRankSum=2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:478,0,3638 -chr19 49503769 . T A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.919;DP=67;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:352,0,1966 -chr19 49519707 . T G 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-1.407;DP=242;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,52:241:99:1009,0,7337 -chr19 49521100 . A AT 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.038;DP=133;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:411,0,1866 -chr19 49521731 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.237;DP=140;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,27:139:99:311,0,5496 -chr19 49528855 . G A 2063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-0.634;DP=218;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,70:218:99:2092,0,11300 -chr19 49528858 . G A 2063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.678;DP=210;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,70:210:99:2092,0,11300 -chr19 49530193 . G A 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.523;DP=244;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,56:244:99:1147,0,12478 -chr19 49532901 . G T 1452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.346;DP=265;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,67:262:99:1481,0,9828 -chr19 49533890 . GAC G 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:342,0,416 -chr19 49535081 . C A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.619;DP=29;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=23.10;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:698,0,342 -chr19 49720949 . A C 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.346;DP=311;FS=3.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,72:311:99:1500,0,9350 -chr19 49721193 . C T 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-1.974;DP=239;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,48:237:99:862,0,7249 -chr19 49723000 . TCTGAGACAGAAGAGGAGACTCAGTGTCAGCTATAATCAGTGTTCAGATCATCATGTGGTAATATCGGTCTCTCTGTAC T 17362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=-0.656;DP=372;FS=2.342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,356:359:99:17400,1405,0 -chr19 49723100 . G A 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=-1.808;DP=391;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=4.18;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,88:391:99:1663,0,13980 -chr19 49724928 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-1.174;DP=381;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,62:381:99:575,0,12443 -chr19 49725331 . TCCTGCACACCACAGAAGAAGAGCAGGTGAGAAAACACTTCCTGCAGAAAACACCTTCCAGCTTCATTGGTCGAGCGGCACGCA T 2108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-2.527;DP=391;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,125:372:99:2146,0,16668 -chr19 49725332 . CCTG C 8055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-0.946;DP=384;FS=0.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,234:369:99:8093,0,6388 -chr19 49725339 . ACCACAGAAGAAGAGCAGGTGAGAAAACACTTCCTGCAGAAAACACCTTCCAGCTTCATTGGTCGAGCGGCACGCACCACG A 8026.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.473;DP=403;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=19.92;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,247:389:99:8064,0,6389 -chr19 49742858 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-0.136;DP=295;FS=17.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,63:295:99:1288,0,9303 -chr19 49750785 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.393;DP=87;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:356,0,2710 -chr19 49750860 . A T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.779;DP=32;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.59;ReadPosRankSum=3.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:527,0,778 -chr19 49750863 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.742;DP=29;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.30;ReadPosRankSum=-2.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:356,0,1214 -chr19 49750872 . A T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=29.96;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:527,0,794 -chr19 49752723 . ACTGAAACACACACACACACACAGGGAGAGAGAGAGAGAGACTCTGAACACACTGCTGCGCACACACAGAGCATGATGGGATATGAAGTGAGGATTCAC A 7781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=1.367;DP=180;FS=6.812;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,175:180:99:7819,695,0 -chr19 49756564 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-1.323;DP=20;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:261,0,750 -chr19 49756576 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.875;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:99:251,0,750 -chr19 49764374 . TG T 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:272,0,743 -chr19 49764376 . TGTGTGTG T 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:272,0,743 -chr19 49768257 . ACGCG A 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=-2.993;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=34.76;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:663,0,453 -chr19 49768265 . ACACTCCTCTGCGGAGACGCG A 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.646;DP=24;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:424,0,655 -chr19 49775588 . C T 1767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.133;DP=466;FS=16.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,99:466:99:1796,0,14101 -chr19 49783816 . G T 2048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.365;DP=339;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=6.04;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,92:338:99:2077,0,8723 -chr19 49783939 . C T 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.144;DP=392;FS=4.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:323,69:392:99:879,0,12015 -chr19 49784688 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-0.215;DP=150;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,28:150:99:433,0,4710 -chr19 49800404 . A G 4460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.729;DP=294;FS=7.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,130:294:99:4489,0,5482 -chr19 49800454 . CACACACACACACACACACACAG C 347.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=32.98;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:83:385,83,0 -chr19 49801007 . G A 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.294;DP=406;FS=0.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=4.44;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:314,92:406:99:1829,0,11789 -chr19 49802601 . G A 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.523;DP=507;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:401,106:507:99:1930,0,15032 -chr19 49803381 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.484;DP=329;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=2.41;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,60:328:99:820,0,10424 -chr19 49803890 . TCTGAAGACAAAACATCCACCATCAGCAGATTTCCCACACTCCCCTTCCCCTTAAAGTGTCTGTAGACTTAC T 14114.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=2.363;DP=325;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,316:323:99:14152,1049,0 -chr19 49804751 . C G 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;ClippingRankSum=0.916;DP=287;FS=3.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,53:287:99:800,0,8731 -chr19 49810396 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-1.703;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,49:215:99:1009,0,5986 -chr19 49810407 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=-1.053;DP=243;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,38:241:99:300,0,7539 -chr19 49813107 . CCCTGAGGAAAGAAGACGAGCAGCGGTCAGTACAGCGCTTCCCCAGATCAGCACACACACACACACACACACACACACACACACTCCTCAGCACACAGAACACACA C 14507.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.451;DP=395;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=29.20;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,365:367:99:14545,1116,0 -chr19 49815177 . T TGA 1112.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:88:1379,88,0 -chr19 49819406 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,320 -chr19 49820069 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.047;DP=90;FS=12.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:231,0,2640 -chr19 49820264 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.731;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:269,0,2458 -chr19 49821042 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.492;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:273,0,2479 -chr19 49852588 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.511;DP=358;FS=5.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,70:356:99:860,0,14375 -chr19 49868466 . T TGATGAA 914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.472;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=26.14;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:40:952,40,0 -chr19 49871744 . A G 1409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1438,102,0 -chr19 49873721 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.481;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:385,0,3032 -chr19 49873753 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.432;DP=63;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:430,0,1779 -chr19 49877229 . A C 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-1.307;DP=166;FS=0.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,37:165:99:745,0,5315 -chr19 49877518 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:250,0,481 -chr19 49877531 . G T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,162 -chr19 49970049 . G C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.756;DP=124;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,28:124:99:577,0,3763 -chr19 49971253 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.014;DP=42;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:308,0,1159 -chr19 49972976 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.718;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:296,0,1159 -chr19 49973511 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.171;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=16.77;ReadPosRankSum=-2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:565,0,1401 -chr19 49973519 . G T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.111;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=16.27;ReadPosRankSum=-3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:565,0,1416 -chr19 49973574 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=1.109;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,441 -chr19 50054542 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.063;DP=47;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:292,0,1301 -chr19 50076582 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-1.517;DP=57;FS=2.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:284,0,3407 -chr19 50076583 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=-1.727;DP=56;FS=2.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:284,0,3407 -chr19 50089711 . A G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.119;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:356,0,1892 -chr19 50139670 . C G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-0.784;DP=86;FS=6.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:454,0,2479 -chr19 50140233 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.101;DP=101;FS=4.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,23:101:99:472,0,2915 -chr19 50177171 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.728;DP=95;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:445,0,2784 -chr19 50184622 . T C 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=-0.419;DP=133;FS=3.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,43:128:99:1412,0,2964 -chr19 50209222 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=-0.542;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:263,0,1709 -chr19 50211388 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-0.689;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:405,0,1153 -chr19 50211474 . C A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.760;DP=64;FS=3.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:514,0,1624 -chr19 50215773 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.372;DP=63;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1249,0,820 -chr19 50234798 . A ATT 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-2.654;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:272,0,278 -chr19 50238473 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=1.044;DP=43;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:271,0,1150 -chr19 50238948 . G T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-1.451;DP=57;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:694,0,1144 -chr19 50246714 . A AGT 210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:248,21,0 -chr19 50248274 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=1.186;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=18.62;ReadPosRankSum=-1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:233,0,226 -chr2 24255 . T TG 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=15;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:302,0,134 -chr2 24258 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=26.03;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:302,0,134 -chr2 334844 . A T 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.628;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1061,0,625 -chr2 334907 . G C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:279,0,548 -chr2 335054 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-1.558;DP=81;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:281,0,2483 -chr2 335961 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:369,0,430 -chr2 345601 . T C 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=-3.298;DP=51;FS=8.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:736,0,1140 -chr2 740216 . A G 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:447,30,0 -chr2 1106184 . T G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.256;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:304,0,170 -chr2 1128514 . TCTGAAAAAACAACAACACAGAAAACAGATTGCAAATCACAATCAGTGCAGTTTTACACACTGTTGTTTGAATAAAATAAATTAAATTAAGCGTAC T 950.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-0.429;DP=38;FS=9.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:989,0,4343 -chr2 1332741 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=1.246;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=23.49;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:404,0,177 -chr2 1409521 . T C 3856.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3885,280,0 -chr2 1529601 . T G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=1.830;DP=51;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:365,0,1287 -chr2 1565636 . A G 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-3.357;DP=69;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=16.62;ReadPosRankSum=2.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1175,0,1190 -chr2 1701941 . C A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr2 1755605 . A C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.915;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=6.53;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:348,0,516 -chr2 1801522 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-1.259;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:340,0,492 -chr2 1803769 . G T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.280;DP=43;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:766,0,703 -chr2 1805567 . T G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.043;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:655,0,339 -chr2 1805633 . T C 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.090;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:776,0,494 -chr2 1806027 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:521,0,518 -chr2 1806051 . G T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-1.364;DP=37;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:502,0,663 -chr2 1823672 . AT A 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.902;DP=44;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=6.31;ReadPosRankSum=-3.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:320,0,449 -chr2 1920895 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.715;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=27.91;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:419,0,265 -chr2 2084835 . CT C 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 -chr2 2335249 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.122;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:368,0,231 -chr2 2368809 . A T 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.687;DP=142;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,48:140:99:1668,0,8014 -chr2 2368925 . T C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=-3.261;DP=232;FS=15.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,45:232:99:770,0,7169 -chr2 2369572 . T G 5557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=-0.969;DP=335;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,174:323:99:5586,0,5032 -chr2 2376478 . TCCTAAAACACACACGGATGAGGCTTTCACATGATGAAGACTTTACATGATGTTTCATCAGCACAACAGAGTTCAGTGTA T 13201.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.490;DP=307;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,286:288:99:13239,1150,0 -chr2 2376581 . C T 4938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-3.912;DP=304;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,160:304:99:4967,0,4914 -chr2 2412623 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-1.858;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=19.20;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:393,0,253 -chr2 2414941 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:555,0,237 -chr2 2416128 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=20.63;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:317,0,210 -chr2 2416173 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,261 -chr2 2424411 . GA G 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.033;DP=23;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.473;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:298,0,265 -chr2 2424490 . C G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=1.517;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:269,0,448 -chr2 2424497 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,448 -chr2 2443102 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:272,0,139 -chr2 2472560 . T C 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=2.739;DP=27;FS=14.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=32.44;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:904,0,137 -chr2 2514302 . G GT 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=-2.157;DP=185;FS=8.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,37:176:99:393,0,3855 -chr2 2899792 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=5.154;DP=190;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,47:171:99:361,0,8682 -chr2 2934060 . AGTTGGTTCTTCCAGTTTTGTTTTTCATTCTTCATTTTTTGCTCCGCACATTGAACCGTTAACTCATGATGAATTTCTCATCTTTCTGCAG A 10939.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=1.445;DP=237;FS=1.962;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,233:237:99:10977,932,0 -chr2 2941314 . C T 2175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=6.281;DP=123;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=17.69;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:2204,0,2302 -chr2 2941350 . G A 2374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=-0.536;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=16.72;ReadPosRankSum=-4.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:2403,0,2068 -chr2 2941362 . G A 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-2.819;DP=127;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:2318,0,1994 -chr2 2941598 . G GTA 765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.952;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=26.40;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:803,0,213 -chr2 2941745 . A G 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.186;DP=60;FS=6.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,39:60:99:1443,0,1457 -chr2 2941746 . G A 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.683;DP=62;FS=8.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,39:61:99:1443,0,1457 -chr2 2970263 . T C 669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=-0.397;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,33:123:99:707,0,3431 -chr2 3008464 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-3.824;DP=108;FS=6.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:308,0,3271 -chr2 3024658 . C A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.256;DP=133;FS=6.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,36:133:99:882,0,3578 -chr2 3032557 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-1.090;DP=97;FS=4.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:501,0,2928 -chr2 3034249 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=1.721;DP=122;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:303,0,3814 -chr2 3051648 . GA G 1018.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-2.698;DP=94;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,52:82:99:1056,0,491 -chr2 3051886 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-1.393;DP=111;FS=8.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,23:111:99:461,0,3538 -chr2 3052732 . A T 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:408,29,0 -chr2 3067623 . AAGGTGAGAACGTTTGACTCATTTCCAGAGCTGGATTTGAGCCTCCAGATCTCCTGCTTTAGTTCTAACATTGTTTCTTTTGCCCTC A 4976.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.190;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=27.54;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,108:110:99:5014,418,0 -chr2 3385978 . AGTGAGTGCCCTCCTTTTCCACTTTTGCTTCATGCTTTCGTTTTTGTGTGTTGCTGGCTGATCGTGTGTAATGATGTGGGTGTGATGTGTGCTGTAG A 3739.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=3.382;DP=90;FS=4.280;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=31.69;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,85:90:99:3777,323,0 -chr2 3396506 . T C 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=4.878;DP=199;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,46:199:99:957,0,8336 -chr2 3426095 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:930,66,0 -chr2 3464937 . AT A 9094.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:9132,638,0 -chr2 3465190 . C T 1302.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1331,96,0 -chr2 3567173 . C CTT 1385.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1423,109,0 -chr2 3567352 . A AT 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.370;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=21.08;ReadPosRankSum=-1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:46:480,0,46 -chr2 3771174 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:276,0,103 -chr2 3880471 . T G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,203 -chr2 3881122 . TA T 576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.901;DP=66;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:614,0,309 -chr2 3881171 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-1.592;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:293,0,1123 -chr2 3882029 . T G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:412,0,252 -chr2 3882151 . TTC T 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.507;DP=36;FS=4.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:660,0,801 -chr2 3893339 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=-0.923;DP=26;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:451,0,465 -chr2 3895405 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=1.003;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:448,0,1125 -chr2 3895625 . T G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.724;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:484,0,313 -chr2 3911711 . A T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.904;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:746,0,1680 -chr2 3911714 . C T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.503;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:746,0,1683 -chr2 3913902 . G C 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.579;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:664,0,573 -chr2 3913950 . G A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.983;DP=35;FS=13.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:553,0,750 -chr2 4014021 . T C 226.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=32.32;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:4:253,4,0 -chr2 4014024 . G C 226.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:4:253,4,0 -chr2 4015478 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.583;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:230,0,230 -chr2 4058271 . C T 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.858;DP=67;FS=3.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1767,0,545 -chr2 4059991 . C T 2462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=-1.681;DP=98;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=25.13;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,67:98:99:2491,0,865 -chr2 4063720 . G A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-3.984;DP=55;FS=10.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:822,0,1147 -chr2 4064117 . A G 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=1.686;DP=60;FS=20.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1050,0,984 -chr2 4064658 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,106 -chr2 4096763 . T C 232.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:261,0,22 -chr2 4098288 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:355,0,398 -chr2 4120902 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.830;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:373,0,304 -chr2 4267584 . C A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.939;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:569,0,695 -chr2 4422373 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.015;DP=343;FS=1.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,56:343:99:669,0,11020 -chr2 4547812 . T G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.224;DP=65;FS=6.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:488,0,1784 -chr2 4624926 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.194;DP=26;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=7.91;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:234,0,689 -chr2 4732970 . G T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-1.234;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:372,0,1896 -chr2 4733178 . G C 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-1.224;DP=47;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:1149,0,1266 -chr2 4733317 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.089;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=3.79;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:324,0,3083 -chr2 4734044 . A G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.565;DP=41;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:762,0,653 -chr2 4734474 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.284;DP=50;FS=5.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:306,0,2653 -chr2 4734475 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.375;DP=50;FS=5.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:306,0,2653 -chr2 4734837 . GT G 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.581;DP=83;FS=4.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:511,0,2829 -chr2 4734843 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.168;DP=82;FS=15.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:598,0,3114 -chr2 4736861 . T A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.196;DP=67;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:462,0,3100 -chr2 4737301 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.283;DP=39;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.368;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:396,0,1044 -chr2 4738167 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.132;DP=76;FS=14.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:373,0,2533 -chr2 4738229 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.076;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:330,0,1629 -chr2 4738309 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-1.335;DP=51;FS=5.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:566,0,1462 -chr2 4738516 . A T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=-0.316;DP=79;FS=2.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:568,0,2307 -chr2 4740781 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.462;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=4.00;ReadPosRankSum=3.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,24:111:99:472,0,3376 -chr2 4754429 . G T 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.195;DP=132;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.110;QD=7.35;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,39:132:99:999,0,3527 -chr2 4789483 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:338,0,52 -chr2 4791968 . C CT 865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.839;DP=52;FS=3.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,39:49:99:970,0,99 -chr2 4803966 . C CT 243.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:281,27,0 -chr2 4823906 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.637;DP=63;FS=2.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:293,0,1835 -chr2 4932216 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-0.378;DP=38;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:540,0,1880 -chr2 4932220 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.015;DP=44;FS=2.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:540,0,1873 -chr2 5041188 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.510;DP=35;FS=6.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:244,0,957 -chr2 5049913 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-1.564;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.578;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,561 -chr2 5053077 . C T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.245;DP=70;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=12.00;ReadPosRankSum=2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:868,0,1597 -chr2 5053435 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-1.338;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,17:102:99:290,0,5806 -chr2 5053436 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=-0.082;DP=104;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,18:103:99:282,0,5806 -chr2 5053612 . T G 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.825;DP=158;FS=11.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,40:158:99:894,0,4507 -chr2 5065056 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.835;DP=152;FS=10.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,29:152:99:479,0,4680 -chr2 5065562 . TCTAGAATTACCGCAAAAATTGAGCATTAAGAATTCATATGTACTTCCACTAAAACGCTTTATAATGGTAAGAGCTCAGGGCAATACTAAC T 980.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=1.710;DP=158;FS=3.598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=6.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:1018,346,0 -chr2 5092656 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-3.016;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,246 -chr2 5099379 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.398;DP=64;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:297,0,1341 -chr2 5100368 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.372;DP=53;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:269,0,1576 -chr2 5178953 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,145 -chr2 5356598 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.123;DP=121;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,26:121:99:477,0,3552 -chr2 5448689 . GGGTAAGTCTGATAAGTCACATTTTTTTCAGTTCTGCTTTAAGTAAAGTGCATCATTTCTTATTTAAAATGACTTTTTAAATGAATTCCCATTGTTTTGCCA G 1077.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=1.609;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=33.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1115,0,1213 -chr2 5448868 . AAGGTCGGTAACTGTATTTCAAATTAAAAAGTGCATTGTTAATATGATTAATCGAGCATTGATTGTTTCCTTCAACCATTTCCAC A 1140.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.639;DP=34;FS=2.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=33.55;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,31:34:99:1178,0,576 -chr2 5452392 . CA C 284.43 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,125 -chr2 5452401 . T G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:280,0,212 -chr2 5455564 . CA C 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.206;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.268;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:317,0,103 -chr2 5543861 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-2.080;DP=43;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:659,0,813 -chr2 5551949 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-1.032;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:372,0,722 -chr2 5564051 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=-0.240;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=4.17;ReadPosRankSum=2.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:241,0,1532 -chr2 5566929 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:234,0,355 -chr2 5578632 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:255,18,0 -chr2 5672159 . T A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-1.479;DP=39;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:724,0,644 -chr2 5676264 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.734;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:508,0,1074 -chr2 5694626 . GT G 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.315;DP=98;FS=0.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:552,0,2338 -chr2 5694722 . TC T 547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.328;DP=77;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:585,0,2047 -chr2 5694804 . TCA T 1012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=2.532;DP=111;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=9.12;ReadPosRankSum=-3.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,36:105:99:1050,0,2126 -chr2 5709969 . C A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr2 5716664 . AAGGTAAAAACCAGTGTCAGAACTTAAAGGCACCTTTGATGAAAATCAACTTTTGTAAGCTGTTTGGAAAGAACTGTCTGTGTTTATAGCATGTTCACTGTCCTATTGGGGTGATATAAACACAAGTCTCTTTTTTTATTTCTTGATGTTAAAAT A 347.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=2.905;DP=82;FS=2.285;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=4.24;ReadPosRankSum=-2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,71:74:99:385,140,0 -chr2 5749230 . AC A 2841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=-0.064;DP=130;FS=3.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,87:130:99:2879,0,1008 -chr2 5773836 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.643;DP=40;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:559,0,1575 -chr2 5799236 . TCTGTGCAGAACATCAGTCTGAACTAATAACACTAATAATACAAACACTGAAAAAAAGAGTTTATCTCCATGTATGTTCTGTGGTTATTGTTTTTGTACTGTACTTAC T 531.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,21:22:99:744,0,676 -chr2 5885629 . G A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.670;ClippingRankSum=-1.546;DP=228;FS=3.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,44:228:99:792,0,7190 -chr2 5903563 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.354;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:314,0,478 -chr2 5903670 . AT A 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-1.351;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:336,0,401 -chr2 5976887 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.601;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:322,0,445 -chr2 5976967 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.888;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:240,0,631 -chr2 5981671 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=2.605;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:382,0,360 -chr2 5987118 . T G 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:895,66,0 -chr2 6659489 . A G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr2 6841501 . AAGGTTCTGCTCTTTTACGCTCAATTTTCTGTTTTGAAATGATCGCAGGTAAAGTTTGTATATAAAGTCCCTTCACGTTGTGC A 1523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=1.727;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=29.91;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,38:41:99:1561,0,216 -chr2 6858607 . T C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=22.03;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:535,0,434 -chr2 6858692 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-0.518;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:358,0,1088 -chr2 6859199 . T C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-0.665;DP=37;FS=3.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:528,0,810 -chr2 6862661 . TCCTTAAAGCAGGAAAACAGGTTGGATCAGCACACGCTCCTCATACGAGAATAAATAAATGCAGACGTTCATCCATAGCTCTTCAACTCA T 2184.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-0.214;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:99:2222,177,0 -chr2 6945788 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.268;DP=65;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:295,0,1890 -chr2 6951479 . TCTACATATGATAAAAATAAAGCAAACAAATGAAACTAACCACAAAAAACGCAAAAATAAGTAAAAAATAATACGCTAC T 2319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=7.737;DP=171;FS=12.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,66:171:99:2357,0,55661 -chr2 7404947 . C T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr2 7488265 . TCTAGAGGAAAACAAAACAATAAAACTGAAAAAACGCTAGTTAACTACATGAAAATGAAACTAAAAAAGGAAAGTGAACCCAACACATGC T 2010.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=2.139;DP=98;FS=8.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,65:98:99:2464,0,13265 -chr2 7550152 . CTTTAACAGCAGATGGCGCTCTTGGCTAGTT C 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.482;DP=18;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:268,0,1514 -chr2 7718564 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.825;DP=121;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:278,0,3621 -chr2 8098324 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.746;DP=27;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:249,0,757 -chr2 8437979 . T C 6592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=1.445;DP=564;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:379,185:564:99:6621,0,13549 -chr2 8438459 . T C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=1.243;DP=493;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.488;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:421,72:493:99:584,0,16105 -chr2 8444760 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.136;DP=270;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,37:270:99:231,0,9373 -chr2 8444907 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.435;DP=245;FS=4.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,50:244:99:891,0,7517 -chr2 8445937 . A T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;ClippingRankSum=-2.314;DP=300;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=2.76;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,55:299:99:856,0,9593 -chr2 8590772 . G C 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=-0.179;DP=71;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:1177,0,1159 -chr2 8591800 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-2.917;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=3.22;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:312,0,2616 -chr2 8598640 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.328;DP=99;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=2.25;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:251,0,3092 -chr2 8604550 . C G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.036;DP=94;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:99:237,0,2933 -chr2 8624140 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.096;DP=85;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:263,0,2644 -chr2 8624406 . CG C 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.951;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:316,0,159 -chr2 8624894 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.826;DP=30;FS=3.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:425,0,837 -chr2 9291929 . A T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.515;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:945,0,313 -chr2 9292347 . A T 472.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.248;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:499,0,4 -chr2 9292390 . C T 250.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:279,0,20 -chr2 9369630 . C T 378.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=31.57;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:2:405,0,2 -chr2 9371956 . G GT 796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:834,57,0 -chr2 9372074 . TTG T 365.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:403,29,0 -chr2 9473428 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,105 -chr2 9478687 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.048;DP=296;FS=3.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,53:296:99:815,0,9588 -chr2 9479669 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=-0.074;DP=196;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,33:196:99:488,0,6123 -chr2 9535626 . A G 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:234,0,25 -chr2 9620483 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.796;DP=56;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:499,0,2886 -chr2 9627148 . CCG C 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-0.412;DP=114;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,25:113:99:488,0,4772 -chr2 9627151 . TATGCTATACACCAACTACACCCACTGCTGCTTTACAAGAGCCGTTTGAGGCATTCTGTTTGAGTGTCTGGTTTCCCTTTTGTTGTCTTCGCATAG T 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.543;DP=114;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:491,0,4772 -chr2 9638913 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=29.28;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:321,0,128 -chr2 9646584 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr2 9653127 . ACCAGAAAAAATTTAGGAGCT A 401.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:35:439,35,0 -chr2 9653448 . G A 928.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:957,66,0 -chr2 9653449 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.956;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:380,0,420 -chr2 9656120 . G A 848.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-1.073;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=27.80;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:877,60,0 -chr2 9656495 . A AT 260 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:12:297,12,0 -chr2 9664155 . G A 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=-0.642;DP=47;FS=1.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=30.00;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,40:47:99:1438,0,322 -chr2 9743164 . A G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr2 9743254 . G T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.428;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:577,0,191 -chr2 9771299 . G A 870.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:899,63,0 -chr2 9838875 . G C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr2 9843923 . G T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr2 9856259 . C T 8299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-3.426;DP=303;FS=15.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=27.39;ReadPosRankSum=2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,221:301:99:8328,0,1761 -chr2 9865551 . C CAG 6133.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.914;DP=235;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,162:209:99:6171,0,974 -chr2 9880896 . CCACCTGAGAATGACAAAAGTAGAAGATGAAGTGCTTCGTTTACATAGACCCTCCCTGTATACAAGCACAGTCCGGCCGGTTGTTTT C 2886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=-1.321;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,68:73:99:2924,0,311 -chr2 9881115 . TCCTGTCAATGAAAGACTATGTAAAACGGCTCTATACAGGTATGGGGAAGGTTGCAACTCTGGATTTTTGTTTGTTTA T 7288.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=1.229;DP=166;FS=7.237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=23.66;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,163:165:99:7326,577,0 -chr2 9883037 . TCTAAACAAATAAATGAATGATGACAAATCATTTACTAGTTGAATGGTATTATTGCATTGGCAACCAAGGGCTTCACTACACTGAC T 6750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=1.615;DP=165;FS=2.073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,160:164:99:6788,456,0 -chr2 9883423 . G C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=4.464;DP=51;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=10.86;ReadPosRankSum=-4.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:582,0,1162 -chr2 9940340 . C CA 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.939;DP=292;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=1.59;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,57:268:99:503,0,5749 -chr2 9949761 . A G 658.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.653;DP=21;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:23:687,0,23 -chr2 9958068 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.462;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:415,0,395 -chr2 10133788 . C T 3436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.650;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=28.95;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:3465,244,0 -chr2 10134166 . GA G 8798.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-2.400;DP=302;FS=19.782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=29.13;ReadPosRankSum=2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,281:289:99:8836,853,0 -chr2 10259885 . T A 655.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:684,51,0 -chr2 10328413 . C T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 -chr2 10397024 . A G 2022.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2051,150,0 -chr2 10407471 . AACCTGAAAATAAAGACAGAAGCCGGTTATACTTATTACCAATCAATGGGCTTTAGTTTATTCAGATGATAAGGGAGCAGTACTTC A 1271.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.617;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.65;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:90:1309,90,0 -chr2 10662625 . CCCTAAAACACAATGTGACAGGTGAAGAGCTGATAGTTATTCAGACGGCATCGCATGCAACCAGTGTGAGAAGAGACAGAGCTAA C 1554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=2.820;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=32.55;ReadPosRankSum=-2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:99:1592,142,0 -chr2 10705817 . G A 2307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=-0.068;DP=177;FS=11.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,70:177:99:2336,0,3647 -chr2 10722992 . A T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.106;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:572,0,2975 -chr2 10909147 . A G 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=1.102;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:490,0,689 -chr2 10997262 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=10.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:460,0,129 -chr2 11122133 . A C 2415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.504;DP=140;FS=0.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:2444,0,2423 -chr2 11122651 . A G 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -chr2 11122737 . G T 1097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1126,81,0 -chr2 11126597 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:256,0,52 -chr2 11127946 . G A 2931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.143;DP=115;FS=3.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:2960,0,3192 -chr2 11128051 . G A 2979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.996;DP=106;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=28.11;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,83:106:99:3008,0,454 -chr2 11128270 . T C 945.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:974,69,0 -chr2 11128484 . T G 6918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:6947,498,0 -chr2 11274502 . T C 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.593;DP=84;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=17.96;ReadPosRankSum=-2.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1537,0,1271 -chr2 11420665 . A AT 445.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:483,42,0 -chr2 11421033 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.869;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:388,0,441 -chr2 11421340 . A C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-0.755;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:842,0,783 -chr2 11421480 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=1.774;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:321,0,1085 -chr2 11422351 . A G 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=1.966;DP=46;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=30.65;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,37:46:99:1438,0,449 -chr2 11422977 . A G 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.044;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.17;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:893,0,492 -chr2 11423172 . C T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.090;DP=39;FS=6.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:774,0,624 -chr2 11423486 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.104;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.099;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:560,0,514 -chr2 11423712 . C T 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:569,39,0 -chr2 11424156 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-1.466;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:379,0,286 -chr2 11424592 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.628;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:362,0,956 -chr2 11424736 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=1.330;DP=49;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:897,0,922 -chr2 11425086 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-1.510;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,20:119:99:282,0,3836 -chr2 11431355 . C A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.350;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,28:98:99:719,0,2570 -chr2 11434382 . C T 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.310;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:1512,0,1651 -chr2 11440003 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-2.345;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:530,0,304 -chr2 11445675 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:564,0,500 -chr2 11452539 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=24.71;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:300,0,92 -chr2 11586057 . A T 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.795;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:334,0,351 -chr2 11597152 . T G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.245;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:419,0,419 -chr2 11601590 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:853,0,314 -chr2 11622558 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.289;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:654,0,640 -chr2 11622726 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.263;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:397,0,389 -chr2 11717321 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.811;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:552,0,658 -chr2 11717566 . A G 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=2.910;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:643,0,672 -chr2 11717752 . C G 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.099;DP=53;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1060,0,768 -chr2 11721799 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=1.359;DP=32;FS=15.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:540,0,577 -chr2 11737169 . G C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.724;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:313,0,490 -chr2 11751776 . C T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.535;DP=72;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1261,0,1335 -chr2 11761504 . C T 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.178;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1829,0,1573 -chr2 11769601 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=10.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,565 -chr2 11769647 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=1.449;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,239 -chr2 11789342 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-0.460;DP=100;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:600,0,2689 -chr2 11793690 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-1.355;DP=50;FS=15.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:358,0,1329 -chr2 11794002 . A T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-1.835;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:619,0,384 -chr2 11794102 . A G 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-1.156;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:595,0,648 -chr2 12063723 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:333,0,456 -chr2 12063741 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.358;DP=24;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.20;ReadPosRankSum=2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,575 -chr2 12142811 . T C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr2 12144244 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr2 12148836 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr2 12590722 . A T 2139.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2168,150,0 -chr2 12592542 . T C 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr2 12592652 . T C 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 -chr2 12828941 . A T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.395;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:551,0,426 -chr2 12828968 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-1.602;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:435,0,519 -chr2 13046612 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.258;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:620,0,481 -chr2 13985493 . C CT 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-3.172;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:250,0,678 -chr2 13985498 . A G,T 233.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-2.331;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,7,7:17:99:403,165,432,153,0,545 -chr2 13985640 . A C 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 -chr2 13985847 . T G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.033;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=23.92;ReadPosRankSum=-1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:674,0,129 -chr2 14125561 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=1.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:332,0,438 -chr2 14331910 . TCCTTAAAATTTAACAAATGGACAAACATCATCACCGACCGCAGATGATTTTAAATGTAATTGTAGGAGTTTGACCCTTA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:99:535,0,176 -chr2 14389792 . A T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=1.313;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:409,0,386 -chr2 14797377 . A G 902.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:931,66,0 -chr2 15211614 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=3.537;DP=150;FS=6.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.107;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,31:150:99:490,0,9963 -chr2 15211771 . C CA 1069.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=-0.184;DP=191;FS=12.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.60;ReadPosRankSum=-2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,60:177:99:1107,0,7898 -chr2 15383447 . CT C 372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=2.360;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:410,0,594 -chr2 16348691 . A T 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:244,0,24 -chr2 16348733 . A C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr2 16348975 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,476 -chr2 16348976 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,476 -chr2 16349085 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:52:826,0,52 -chr2 16349109 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.556;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:286,0,432 -chr2 16349159 . C T 1187.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-2.410;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=33.94;ReadPosRankSum=2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,16:20:14:1216,14,0 -chr2 16535034 . C CA 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-1.543;DP=290;FS=16.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,52:280:99:356,0,6376 -chr2 16535477 . CT C 2171.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.473;DP=142;FS=6.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,90:120:99:2209,0,1113 -chr2 16535731 . C T 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-3.109;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=31.41;ReadPosRankSum=3.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1316,0,154 -chr2 16543714 . G A 7617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-1.500;DP=268;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=28.42;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,200:260:99:7646,0,1220 -chr2 16547270 . C T 9815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-2.151;DP=351;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=27.97;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,261:351:99:9844,0,2015 -chr2 16556240 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.195;DP=21;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=19.51;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:438,0,259 -chr2 16560655 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr2 16918215 . TA T 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.361;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:46:323,0,46 -chr2 16918584 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=1.656;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,228 -chr2 16933549 . T A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.344;DP=51;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:233,0,1523 -chr2 17087644 . A T 240.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:268,0,10 -chr2 17087651 . T A 240.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:10:268,0,10 -chr2 17272298 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.538;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:503,0,759 -chr2 17350611 . A C 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-2.399;DP=66;FS=7.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=13.16;ReadPosRankSum=2.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:897,0,2024 -chr2 17350706 . T G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.109;DP=138;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,28:138:99:518,0,9127 -chr2 17351480 . T C 5022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=1.141;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=30.26;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,133:166:99:5051,0,570 -chr2 17360244 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=1.144;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,46:168:99:1088,0,4466 -chr2 17367757 . C CCGTCCA 3400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=-0.733;DP=210;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=16.19;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,105:192:99:3438,0,3166 -chr2 17383219 . A C 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:564,39,0 -chr2 17383334 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=2.725;DP=26;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:229,0,644 -chr2 17383996 . G C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=1.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:495,0,110 -chr2 18214051 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.073;DP=38;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:648,0,641 -chr2 18275694 . TCTAGCAGAAAAATCAAACAGTGATGACTAGGAACAAACACATAAAACTGAGAAAACGCAAAGCATAAGGTTCTTAC T 12706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=-0.274;DP=305;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=32.08;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,293:299:99:12744,854,0 -chr2 18278549 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.393;DP=53;FS=4.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:371,0,1561 -chr2 18281092 . A C 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:477,33,0 -chr2 18282198 . C A 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:522,36,0 -chr2 18282208 . G A 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:522,36,0 -chr2 18282622 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-1.718;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,231 -chr2 18282744 . G T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=-0.192;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:362,0,2306 -chr2 18282753 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.612;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:357,0,2306 -chr2 18282900 . T G 4160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.146;DP=244;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,131:243:99:4189,0,3844 -chr2 18282951 . T C 2770.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=1.169;DP=211;FS=14.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,88:202:99:2924,0,3640 -chr2 18284297 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=22.40;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:297,0,139 -chr2 18473198 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.724;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=13.25;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:333,0,513 -chr2 18473218 . T TC 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.088;DP=24;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:335,0,457 -chr2 18940960 . C CA 237.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.611;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:26:275,0,26 -chr2 18986488 . T G 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.816;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:760,0,1238 -chr2 19215142 . ACTGCAGGGAAATAATGAATAATATTTTAGACCCAAACTAAGGCTAAGTAGCGACAAAGCTGTTGACAGTTCTGGTTAAAGGAAGTTTTGCTCAACGACAGTCACATGCGCCGTGAACACGTGGGCTGTGCTGACTCAC A 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=3.536;DP=23;FS=12.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=29.94;ReadPosRankSum=-2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:726,0,2977 -chr2 19218186 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=4.075;DP=65;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=3.93;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:284,0,1904 -chr2 19220032 . A T 2570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=-0.607;DP=157;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:2599,0,2667 -chr2 19229522 . AAGGTAAGAGAACAGCCTCACACTGGCTATACTGGTTATTTTAAAATGTTAAACTGATTTGTTCTCTCT A 8588.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=2.375;DP=215;FS=1.448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,208:215:99:8626,673,0 -chr2 19460678 . C A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.263;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:591,0,1070 -chr2 19460725 . A AAT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.515;ClippingRankSum=-2.696;DP=36;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=7.02;ReadPosRankSum=2.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:698,0,393 -chr2 19461355 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=1.794;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,268 -chr2 19462086 . G C 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-0.897;DP=264;FS=4.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,61:264:99:1279,0,7854 -chr2 19462210 . TCTGTGGTTAAAATTGGAGTAGCAATAAGTCTAAACAAACTTTGAACAATATTTATATATTTTCTCTACTTTTTACCCCCTCTCGAATGTAC T 10378.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=1.248;DP=241;FS=9.334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,235:241:99:10416,921,0 -chr2 19618715 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.170;DP=66;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:581,0,1622 -chr2 19717654 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=-0.979;DP=42;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:615,0,741 -chr2 19717768 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.924;DP=64;FS=8.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=4.18;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:296,0,1834 -chr2 19752010 . TA T 306.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-0.496;DP=15;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:14:344,14,0 -chr2 19753313 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-2.237;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:327,0,1130 -chr2 19753314 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-2.083;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:282,0,1208 -chr2 20287870 . T C 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=1.330;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:71:99:1568,0,818 -chr2 20295869 . TTG T 1097.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=1.684;DP=80;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1135,0,1391 -chr2 20347805 . T C 1386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-0.810;DP=55;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:1415,0,458 -chr2 20433306 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:324,0,97 -chr2 20471581 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.074;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:371,0,550 -chr2 20471605 . A C 910.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-1.065;DP=52;FS=8.049;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:18:939,18,0 -chr2 20471993 . G A 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -chr2 20533036 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=-1.071;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=26.46;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:82:478,0,82 -chr2 20537188 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.327;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:519,0,532 -chr2 20537203 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.620;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:623,0,446 -chr2 20538550 . A G 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.664;DP=27;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=25.70;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:722,0,209 -chr2 20542789 . C G 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.030;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:734,0,127 -chr2 20545830 . A T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.548;DP=22;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:96:668,0,96 -chr2 20584167 . A T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr2 20586844 . CCCTGAACACAGACACACACATTACACAACCACATGGAAGACACTCAACCACTCAAGAACAAATCATGAAACTGTAGTAAGTGCCCA C 3367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-0.510;DP=112;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,87:104:99:3405,0,1929 -chr2 20602920 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.286;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:499,0,1710 -chr2 20609665 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.722;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:352,0,293 -chr2 20610925 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.709;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:232,0,2026 -chr2 20622485 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.320;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:435,0,646 -chr2 20623999 . G A 2112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=1.284;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=35.29;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2141,153,0 -chr2 20626968 . C T 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-2.697;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:1255,0,1323 -chr2 20629115 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:323,0,174 -chr2 20629863 . A C 1133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=1.016;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=26.93;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1162,84,0 -chr2 20661044 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=1.640;DP=92;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:332,0,2819 -chr2 20664384 . CGTAAGAAAGCGAAACTAACCTGTATTTAAACATGTTAGGTCACAGAAACACACTTTCTTTCCTGACTGTTTTCTTTTACAG C 1420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.542;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,36:37:99:1520,0,174 -chr2 20712956 . C T 3212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=-0.088;DP=157;FS=7.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=20.46;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,96:157:99:3241,0,2092 -chr2 20718774 . CACCTAAAACACGACAGAATCTTTAGCATATGACCTGCAGTCTTGTATGCACTTTGAATCAGATGTAAATTTGAATGCCACTT C 5776.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.202;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,124:129:99:5814,495,0 -chr2 20752880 . GAGGTCAGGTCTACTCTTCAATCTCTGGCTTTCACCTGCAGTTTGTTTTTGCTCTTCATTCTACATGATTCTTTTGTTTTGC G 1673.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.266;DP=42;FS=3.107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=31.28;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1711,146,0 -chr2 20769390 . T TA 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=2.929;DP=52;FS=10.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:383,0,1699 -chr2 20769698 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.457;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,836 -chr2 20770576 . CT C 1154.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-2.887;DP=169;FS=6.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,55:163:99:1192,0,2658 -chr2 20770648 . GT G 1209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-0.101;DP=94;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,52:78:99:1247,0,528 -chr2 20851244 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=2.938;DP=31;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,866 -chr2 20857126 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=-0.307;DP=22;FS=14.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,481 -chr2 20857415 . CT C 571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.601;DP=36;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.561;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:47:610,0,47 -chr2 20867401 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.266;DP=59;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1081,0,958 -chr2 20872249 . AAGGTAGAGAAAATGTCTGCGCTGGTGAGTTGTGTGTGCTGGTTATGAGATTAAGTTTGTATTTCTTTATTTTTC A 2860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.017;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=30.09;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:2898,187,0 -chr2 21130933 . G A 1938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.543;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,50:71:99:1967,0,782 -chr2 21134145 . T A 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=-1.081;DP=356;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,88:354:99:1753,0,13348 -chr2 21139686 . G A 6718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=-2.476;DP=395;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=17.01;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,187:395:99:6747,0,6878 -chr2 21418386 . C T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=1.732;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:632,0,157 -chr2 21530308 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=28.57;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:67:571,0,67 -chr2 21563011 . CA C 683.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.523;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,49:190:99:721,0,4048 -chr2 21564144 . T A 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-2.010;DP=172;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,45:172:99:963,0,4354 -chr2 21564262 . C T 4714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.022;DP=270;FS=12.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,149:270:99:4743,0,4172 -chr2 21564745 . C T 5040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.021;DP=301;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,159:301:99:5069,0,4947 -chr2 21565343 . A T 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=-0.410;DP=265;FS=8.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,44:265:99:1583,0,10092 -chr2 21568628 . C T 5094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.175;DP=286;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=17.81;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,158:286:99:5123,0,7687 -chr2 21568737 . G A 5676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.144;DP=249;FS=4.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,166:248:99:5705,0,2034 -chr2 21569040 . TCCTGCCGACAAAGAAAATAATGTTATCTGATCTTTAACAAAAAAGGATACACTCAAGATAAATGCATTTTCAAACTTA T 10740.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.043;DP=256;FS=2.995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=28.19;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,254:256:99:10778,775,0 -chr2 21572222 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,104 -chr2 21603808 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=2.570;DP=131;FS=4.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:856,0,3594 -chr2 21627622 . GCCTGAAACACACACACACACACACACACACACAATGATTACACCACCAGAAAACATCCAGGTGCCAGCGGTTTCCACTCGATGCATTGCATTTTCACTCTGTGCGCAACCTATCTTCA G 1093.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.907;ClippingRankSum=11.503;DP=432;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=2.53;ReadPosRankSum=-5.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,343:398:99:1131,0,6301 -chr2 22003037 . T C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=1.034;DP=60;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:837,0,1189 -chr2 22003356 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=2.777;DP=38;FS=7.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=11.36;ReadPosRankSum=-2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:460,0,1128 -chr2 22060317 . GGGTAAATAAAAAACAAAAAAATTAACACTTGATTTCATAATATGTTTGGTTTGTTGTCAATATGGATGTCTTTATGGGTTCTA G 12073.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.172;DP=293;FS=2.223;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=25.69;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,259:262:99:12111,1103,0 -chr2 22065976 . T C 8909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=1.172;DP=497;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,277:497:99:8938,0,7640 -chr2 22075556 . T C 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.158;DP=129;FS=4.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,48:129:99:1507,0,4300 -chr2 22089133 . G A 3600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.162;DP=188;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,109:188:99:3629,0,2733 -chr2 22165478 . GAGGTAAGAGAAACTCAATTATAGTAACTTGCTTTCTTACTAATGAAACTGAAGTAACTGTTATTATTGTTGTTTTCTC G 318.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=1.688;DP=83;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,77:78:99:356,139,0 -chr2 22165711 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-0.243;DP=54;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:969,0,901 -chr2 22172247 . A G 1316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.992;DP=76;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:1345,0,1348 -chr2 22172262 . G A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.361;DP=65;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=16.53;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1103,0,1170 -chr2 22174440 . A T 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-1.802;DP=73;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=17.24;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,42:73:99:1287,0,1015 -chr2 22217527 . C A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=-0.460;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:466,0,734 -chr2 22219486 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-1.480;DP=55;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:530,0,1436 -chr2 22219529 . CT C 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.352;DP=55;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:603,0,821 -chr2 22419765 . C T 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-0.410;DP=60;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1087,0,835 -chr2 22428408 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.200;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:378,0,285 -chr2 22480372 . GAGGTATGTATAGTGCCTTCTTATACTCCTCTAAATCTCATCCAGCAAACATAAATAGCAGATTAATATTGGCGCACATGACCTTCATTGTGCTCTCTC G 932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=3.760;DP=33;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:970,0,2973 -chr2 22751613 . A C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-0.829;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:473,0,530 -chr2 22751751 . A AT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-0.429;DP=27;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:247,0,326 -chr2 22751961 . GA G 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.778;DP=15;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:53:307,0,53 -chr2 22752061 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,291 -chr2 22753806 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=22.11;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:382,0,198 -chr2 22757877 . GCTGATGAGAATAAAGAGATTCATGACAATATTTTATTTATTAGAATTATTTTATTATTAAGATCATGTTCAATTGCTGGTGAATATATTCTGAGGCCAAC G 1552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=-1.051;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,37:39:99:1590,0,163 -chr2 22811445 . T G 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:63:897,63,0 -chr2 22811451 . G A 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:897,63,0 -chr2 22811533 . C G 1438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1467,105,0 -chr2 23021854 . A C 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=-0.763;DP=54;FS=9.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1106,0,737 -chr2 23022064 . T A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-0.237;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:579,0,360 -chr2 23148844 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.670;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=18.27;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:412,0,333 -chr2 23163925 . G A 1598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.785;DP=86;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1627,0,1272 -chr2 23192012 . C A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-1.998;DP=154;FS=8.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,42:154:99:876,0,4829 -chr2 23192117 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=-0.407;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:240,0,1070 -chr2 23231582 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=1.249;DP=31;FS=7.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=25.57;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:821,0,151 -chr2 23599023 . A AGATAATGGTAAG 709.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:47:747,47,0 -chr2 24147344 . T C 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-2.211;DP=88;FS=2.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1652,0,1323 -chr2 24149403 . T A 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.255;DP=77;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:1377,0,1361 -chr2 24156572 . A T 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-0.142;DP=68;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:1254,0,2330 -chr2 24187025 . G A 330.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=33.09;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:359,0,14 -chr2 24220046 . A G 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.278;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:676,0,724 -chr2 24243519 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=2.781;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=14.16;ReadPosRankSum=-3.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:368,0,463 -chr2 24878351 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:245,0,515 -chr2 24878355 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.225;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:298,0,370 -chr2 24878356 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-1.004;DP=15;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=30.58;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:73:487,0,73 -chr2 24878485 . T C 2128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.594;DP=94;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,62:94:99:2157,0,1041 -chr2 24878506 . T C 2709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.306;DP=104;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,72:104:99:2738,0,858 -chr2 24881277 . GCCTGGAGTGAAGACACATACACACAGGGTTCAGCAAACAAGCCAGTAACAACCACACACACAACATCTTGTCTCTTA G 7746.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=3.419;DP=213;FS=4.467;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=32.91;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,207:213:32:8071,32,0 -chr2 24995447 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=-0.146;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:234,0,1000 -chr2 25690079 . GT G 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-1.805;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:341,0,101 -chr2 25691006 . G GT 348.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-1.735;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:30:478,30,0 -chr2 25756471 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=2.025;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:316,0,417 -chr2 25971442 . A G 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.328;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.263;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:699,0,255 -chr2 25992103 . G GT 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-0.659;DP=264;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,56:209:99:447,0,4786 -chr2 25992888 . CCT C 932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=-0.075;DP=284;FS=11.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=3.28;ReadPosRankSum=5.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,80:264:99:970,0,8476 -chr2 25992944 . C CT 991.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=2.619;DP=326;FS=4.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,90:310:99:1029,0,11116 -chr2 26205010 . G A 967.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.847;DP=32;FS=4.806;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:11:995,11,0 -chr2 26205127 . T A 1064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1093,78,0 -chr2 26344975 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.438;DP=167;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,44:167:99:998,0,4585 -chr2 26431243 . C CT 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=-2.559;DP=69;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=8.89;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:651,0,794 -chr2 26432032 . T TA 531.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:46:569,46,0 -chr2 26447362 . G T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-2.022;DP=67;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:345,0,2089 -chr2 26447393 . C CTA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.405;DP=58;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:268,0,1456 -chr2 26447687 . G GT 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.331;DP=131;FS=5.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:406,0,3440 -chr2 26448137 . CT C,CTT 929.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.134;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,21,36:64:99:1044,653,1042,388,0,606 -chr2 26448485 . C CT 1688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-1.693;DP=141;FS=5.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1726,0,1593 -chr2 26611768 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.911;DP=107;FS=5.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,18:107:99:231,0,3524 -chr2 26615301 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=2.422;DP=69;FS=14.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=3.76;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:288,0,2060 -chr2 26615320 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.619;DP=62;FS=20.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:386,0,1761 -chr2 26619131 . CACCTGACAAACATCAAAAGATTATTGATGAGACGCGGGATGAAGCAGACATCTGCACTTTATAAGCAATAACACTT C 8065.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.780;DP=196;FS=2.345;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=31.12;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,193:196:99:8103,609,0 -chr2 26637693 . AAGGTCATAAGCTTCTTACACACCCACATTAATTCGCAAATTTGCAATCAAATTAAACACGGTACCCTTATGTGCGATTTCCATCTTGT A 4420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=1.730;DP=116;FS=1.815;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=29.93;ReadPosRankSum=-2.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,109:114:99:4458,329,0 -chr2 26649164 . TGGTGAGTGCAAACGAGTGTATAGGTTTGTTTTATAGTCTTTCTGTGACGATAACTTTGTCCAGTTCTGCTACTGAAATATAAGTGATGCAGTTTAAGACTCTGAGGAAGGCTTGTAAATCATGTTAGTCCTAAAATATACACTGTCAGTTTCTAATTGTTGCATTTTAATTTGTCAATCCA T 8312.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-1.505;DP=262;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=31.73;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,242:246:99:8350,676,0 -chr2 26650005 . AAC A 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:255,0,335 -chr2 26747157 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:385,0,49 -chr2 26751490 . GCTGTTTGACACAGAAAGTCTATGATGATGTGTTTGGACAAAGGACATTTTTCACAGTGGTTTTCCACTGAC G 2016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=1.700;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=24.71;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,48:52:99:2054,0,677 -chr2 26772752 . TCCTGGTGGTAGAGTGAAACAGCAATGAACGCACTGAAAAATGTCTCAGTTTCACAGGGGAAATATTTGAGATCTCCTCTTA T 13397.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=3.144;DP=322;FS=3.174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=29.18;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,314:322:99:13435,1056,0 -chr2 26779446 . TCTGAGGGAGGACAGAAATGCAGATGTAAACAAAAGTTCCGCAATGCAAGCAAAAATCTATTAATGTTAATTCTGCAGCATAAGGGTGAC T 12461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=2.074;DP=281;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,279:281:99:12499,1024,0 -chr2 26783677 . A G 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.277;DP=49;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=13.87;ReadPosRankSum=-2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:708,0,1985 -chr2 26784632 . C T 923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:952,66,0 -chr2 26785217 . T A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=1.669;DP=65;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=15.81;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1056,0,1216 -chr2 26786864 . C CG 236.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:274,27,0 -chr2 26829763 . CTT C 4043.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:4081,280,0 -chr2 26829936 . C CT 4797.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=1.277;DP=173;FS=3.408;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=27.73;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:5039,486,0 -chr2 26845832 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.195;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:555,0,147 -chr2 26865801 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,466 -chr2 27478714 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.217;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:350,0,884 -chr2 27525829 . T C 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-2.066;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=12.60;ReadPosRankSum=2.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:633,0,944 -chr2 27526868 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=2.011;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,331 -chr2 27539024 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=8.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:425,0,236 -chr2 27548527 . AGTGAGTGACAACACCCTCAGAAAAAAAGTGTCATATTTATGAAATGCTTGCATGTGTTCACTTATTCTATCTCTCCTTTAG A 12737.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.935;DP=296;FS=1.499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=29.40;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,255:262:99:12775,1060,0 -chr2 27548655 . A T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=-1.809;DP=278;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=2.83;ReadPosRankSum=-1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,55:278:99:815,0,11399 -chr2 27548902 . GT G 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.397;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:26:336,0,26 -chr2 27680681 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.765;DP=248;FS=5.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,48:248:99:789,0,7492 -chr2 27682432 . CT C 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=-4.216;DP=203;FS=4.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=2.12;ReadPosRankSum=3.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,119:188:99:468,0,4012 -chr2 27687430 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.741;DP=11;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,148 -chr2 27688715 . C T 4317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.266;DP=262;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,137:262:99:4346,0,4341 -chr2 27689468 . A T 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.878;DP=126;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:607,0,6879 -chr2 27689925 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.327;DP=224;FS=3.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,49:224:99:848,0,8837 -chr2 27691360 . TC T 3557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.851;DP=188;FS=5.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,111:182:99:3595,0,2332 -chr2 27701424 . G C 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.993;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=33.59;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:1103,0,305 -chr2 27701576 . G C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.340;DP=20;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:353,0,598 -chr2 27701727 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:359,0,45 -chr2 27803580 . T G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-1.973;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:245,0,1031 -chr2 27813110 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=-0.293;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=26.37;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:872,0,256 -chr2 27814132 . G C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.333;DP=40;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:262,0,1112 -chr2 27817770 . A C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:323,0,416 -chr2 27969385 . C A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:373,0,242 -chr2 28049994 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.549;DP=38;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:232,0,1095 -chr2 28134551 . T A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-1.557;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=21.23;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:559,0,311 -chr2 28218003 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.587;DP=64;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:741,0,1471 -chr2 28218743 . T G 2487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=1.669;DP=136;FS=2.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,80:136:99:2516,0,1944 -chr2 28218851 . G A 3256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=-2.466;DP=129;FS=10.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,80:119:99:3285,0,874 -chr2 28239056 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.249;DP=102;FS=14.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:464,0,4180 -chr2 28239143 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.994;DP=115;FS=4.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,28:115:99:566,0,3210 -chr2 29192836 . A G 1706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.298;DP=281;FS=0.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,82:280:99:1735,0,10699 -chr2 29196758 . CGATCTGGTAAACAGAAGCAGACATTTTTTCTATTGTTTCATGTTTTTTTTTTATTT C 2903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=1.391;DP=394;FS=0.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:273,115:388:99:2941,0,16713 -chr2 29196761 . TCTGGTAAACAGAAGCAGACATTTTTTCTATTGTTTCATGTTTTTTTTTTATTTAATTTTTTTTTAATAATATCCTGAC T 9599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-0.458;DP=391;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,258:385:99:9637,0,8071 -chr2 29634872 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-2.294;DP=67;FS=1.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:309,0,2019 -chr2 29692001 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-1.672;DP=31;FS=16.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:357,0,707 -chr2 29827356 . A AT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.532;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:249,0,2042 -chr2 29960840 . T C 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=-1.140;DP=295;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,71:294:99:1433,0,15548 -chr2 29961083 . A C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=-0.257;DP=147;FS=7.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=4.66;ReadPosRankSum=-2.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,35:147:99:713,0,4539 -chr2 29961251 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=-0.557;DP=391;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,54:391:99:401,0,13481 -chr2 29966459 . CGGTAAATATACCACCTATAATGTAAAATACAACCAACCAATGACAAGTTATTGTCAGATCTCCAACTTAATTGTGCAAATCTGCTCTTTTGTTGAA C 2594.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=-0.150;DP=88;FS=2.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=29.48;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,58:63:68:2524,0,68 -chr2 29984303 . T A 1397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.149;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.65;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1426,102,0 -chr2 30005664 . G GAA 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.410;DP=33;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:385,0,426 -chr2 30005894 . C CA 5146.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:5184,359,0 -chr2 30006786 . A AT 563.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.529;DP=60;FS=10.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:604,0,509 -chr2 30034301 . C CT 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.666;DP=151;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,28:134:99:250,0,2871 -chr2 30219310 . TGTAAGTATTGCATTAGTTTCTTTAATAAATTGAGTGTTTTAATGTGATTGCAGACCTCTCTTCTTTTTTCAG T 4461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=1.050;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=31.54;ReadPosRankSum=1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,98:101:99:4499,347,0 -chr2 30269733 . A G 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-0.221;DP=46;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:754,0,821 -chr2 30561487 . T TTA 1452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.401;DP=104;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=13.97;ReadPosRankSum=3.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1490,0,1504 -chr2 30619332 . A G 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.621;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:911,0,1818 -chr2 30622660 . C CG 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-1.190;DP=76;FS=7.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:403,0,1603 -chr2 30622842 . G GA 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=-0.231;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:523,0,268 -chr2 30673983 . C CT 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=1.450;DP=80;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:461,0,874 -chr2 30675231 . GA G 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.495;DP=22;FS=11.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,602 -chr2 30675233 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.758;DP=22;FS=11.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,602 -chr2 30697022 . CGTAAGTGTGCACATTGATCTGCAGGGTTATATAAAAGTAACTCTGAAGTCAACTTAAACTGTCAGAGATTATGCAAATCAAATGTAGAGAGCTCATTCTTGAACTTTGTTCAAGGTCGGCTTGAGAGCTGAAGGACGCCTTTGTTTTGGCTTGGCTGTTTTATGCTCTGTCTCTCTGTTTGTGTGTAG C 3566.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=1.932;DP=87;FS=3.152;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,79:87:99:3604,344,0 -chr2 30700081 . T TA 816.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.265;DP=41;FS=2.483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:42:854,42,0 -chr2 30702155 . CCCTGCCGGAGAGGAAGAGCCACATGAGTGCGGTTTATCTCTTAGACTGGCTTCAGGAAATGGAGACTTTGCACTTA C 2457.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=2.016;DP=67;FS=2.344;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=29.69;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:99:2495,227,0 -chr2 31013774 . T TA 1089.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1127,110,0 -chr2 31014976 . A AT 571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:54:609,54,0 -chr2 31018290 . CT C 548.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=1.503;DP=41;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:586,0,126 -chr2 31143644 . C T 4186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.442;DP=160;FS=9.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=26.17;ReadPosRankSum=2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,110:159:99:4215,0,1286 -chr2 31151002 . A T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr2 31165006 . C A 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.190;DP=166;FS=6.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,43:165:99:995,0,4756 -chr2 31166452 . C T 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=3.533;DP=155;FS=4.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.229;QD=7.50;ReadPosRankSum=-3.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,47:155:99:1190,0,4111 -chr2 31167355 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.518;DP=74;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:243,0,2511 -chr2 31167800 . C T 2180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-1.074;DP=82;FS=8.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=26.59;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,57:80:99:2209,0,581 -chr2 31250975 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,222 -chr2 31334009 . C T 205.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:234,0,21 -chr2 31423897 . C G 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=1.149;DP=49;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=31.83;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,40:49:99:1588,0,165 -chr2 31430447 . G A 1032.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1061,78,0 -chr2 31430496 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr2 31480177 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.433;DP=95;FS=6.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:859,0,2481 -chr2 31480419 . GT G 897.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.877;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:935,0,212 -chr2 31480575 . G A 5483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.010;DP=202;FS=33.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,150:202:99:5512,0,1184 -chr2 31483629 . T C 642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:671,54,0 -chr2 31497971 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:81:518,0,81 -chr2 31499878 . T C 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.787;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:625,0,351 -chr2 31524795 . C T 2024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-0.838;DP=71;FS=6.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=28.52;ReadPosRankSum=2.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,56:71:99:2053,0,284 -chr2 31545263 . T TA 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.733;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:20:814,20,0 -chr2 31548667 . TCTGTAATTAAAGTACACATTGATATCCAGTTGGTTAACTTCATTTGCATAAATTCGGGCTCTAAAGAGAACAGCGAGAGCTTAC T 6486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=2.387;DP=148;FS=1.276;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=28.71;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,138:148:99:6524,548,0 -chr2 31548873 . ACTAAAATCGGATTGTTTCTTATATACATGTGGAAGCCTGAGAGAAATGAAAGTGTGTGCATTTATTATACTTAC A 6494.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.981;DP=154;FS=1.729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=26.81;ReadPosRankSum=-1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,147:152:99:6532,517,0 -chr2 31550831 . TCTGAGCACAAAGTGAAAGAAACAATATTATTGTGCCATCATCAGCTCATGTGTGTATTGATGATTTAAACTCTCACACACACAGACAGAC T 5852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=3.081;DP=152;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=29.29;ReadPosRankSum=-2.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,142:152:99:5890,0,681 -chr2 31569274 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=-0.825;DP=57;FS=4.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:360,0,1622 -chr2 31570330 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-0.631;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:261,0,882 -chr2 31609207 . G GT 315.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:24:353,24,0 -chr2 31983976 . T G 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.912;DP=56;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=21.85;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1252,0,810 -chr2 32091384 . TCTGCAGAGGAACAAAGATTCAGAAATTCAACAGTCTCCATTTTAATAGTATGAGTTTATTGTGACTTGTACTTAC T 6272.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.346;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=30.25;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,150:154:99:6310,451,0 -chr2 32133691 . G A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=1.263;DP=35;FS=5.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=20.36;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:741,0,500 -chr2 32133772 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-1.801;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:489,0,798 -chr2 32207605 . C CA 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=-0.178;DP=42;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:526,0,332 -chr2 32208606 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.090;DP=48;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:406,0,1292 -chr2 32208820 . TA T 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.528;DP=48;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:787,0,372 -chr2 32210147 . C T 580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:609,42,0 -chr2 32223590 . AAAAGAAAAAAAAATAAAAT A 405.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:43:443,43,0 -chr2 32249223 . GCTATAAGAGAAGACAGTCTGAGCTGCACCCACATTTTTCATGTCCTCACAGAAATCAAATCACATAC G 2099.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.906;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,56:61:99:2137,0,550 -chr2 32279934 . G A 2169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.906;DP=81;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,58:81:99:2198,0,589 -chr2 32287805 . G A 2700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=2.274;DP=98;FS=3.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=27.56;ReadPosRankSum=-2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,73:98:99:2729,0,579 -chr2 32302447 . ACTGAAACACAGACACGCAAACAGTTTCCTGGAGGTCATGCAGGTAATTTTAAGTCAATTCTTTTTATAGATTTACAGGTCGTTTTCTGACATCTCTTAC A 2388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=1.483;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:2426,196,0 -chr2 32308580 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=3.633;DP=19;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=14.51;ReadPosRankSum=-3.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:304,0,368 -chr2 32308862 . C A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr2 32308864 . A G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr2 32309950 . G T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.742;DP=41;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=25.43;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:1071,0,356 -chr2 32329347 . A G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr2 32371987 . CA C 1807.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=-1.743;DP=86;FS=7.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=21.02;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,66:86:99:1845,0,256 -chr2 32387826 . CA C 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=1.811;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=13.25;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:289,0,163 -chr2 32388112 . CAT C 271.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr2 32402287 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.493;DP=35;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:264,0,976 -chr2 32498332 . A T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.692;DP=27;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:699,0,165 -chr2 32499074 . A G 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.700;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:717,0,151 -chr2 32527442 . CG C 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=-1.851;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:566,0,565 -chr2 32935541 . A G 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.538;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:702,0,1117 -chr2 33126633 . C T 1492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.534;DP=205;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,60:205:99:1521,0,7386 -chr2 33128142 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.009;DP=106;FS=8.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:412,0,3371 -chr2 33134143 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.655;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:460,0,451 -chr2 33134264 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=1.228;DP=77;FS=11.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:295,0,2626 -chr2 33135710 . G T 1281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.983;DP=71;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1310,0,1381 -chr2 33135733 . T C 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.218;DP=64;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=19.68;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1288,0,1125 -chr2 33137274 . T TA 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.803;DP=75;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:386,0,1371 -chr2 33137605 . A G 880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:909,63,0 -chr2 33138850 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=-2.299;DP=141;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,31:140:99:575,0,4617 -chr2 33139029 . G A 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.315;DP=147;FS=4.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,42:147:99:1211,0,8144 -chr2 33139649 . A G 2396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-2.545;DP=110;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=21.79;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,70:110:99:2425,0,1402 -chr2 33140162 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:286,0,739 -chr2 33185526 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:237,0,189 -chr2 33192980 . CT C 271.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:309,30,0 -chr2 33398315 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-1.114;DP=187;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,30:187:99:268,0,6994 -chr2 33398370 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.711;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,24:139:99:356,0,4615 -chr2 33398414 . A T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.666;DP=144;FS=4.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,34:144:99:726,0,4900 -chr2 33399358 . A G 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.182;DP=148;FS=3.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,44:148:99:1101,0,3925 -chr2 33399576 . A T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.778;DP=140;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:336,0,4426 -chr2 33400196 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=1.144;DP=156;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=2.58;ReadPosRankSum=-2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,26:156:99:430,0,10377 -chr2 33400198 . T A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=1.475;DP=152;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=2.64;ReadPosRankSum=-2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,26:152:99:430,0,10377 -chr2 33403457 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.928;DP=203;FS=2.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,36:203:99:537,0,6566 -chr2 33662434 . TGGTAAGAGTGGACTGCTATGGGTGAATTTTGTTAAGGTTGGTTCAGAATCTTCAGTCTCCTTGTGCTTGTACCTTTTCCA T 498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=1.671;DP=90;FS=6.088;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,86:89:99:536,198,0 -chr2 33686169 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.306;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=3.40;ReadPosRankSum=2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:361,0,3124 -chr2 33686669 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.021;DP=118;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,37:117:99:1052,0,3125 -chr2 33693307 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.947;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,26:172:99:281,0,5719 -chr2 33789806 . C A 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.298;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1073,0,1684 -chr2 33843771 . C CA 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-1.558;DP=41;FS=17.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:256,0,684 -chr2 34645237 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=17.22;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:321,0,275 -chr2 34858525 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.625;DP=52;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:452,0,1384 -chr2 35331100 . CCTACAGGTGAGTCTCAAATCAGAAAAAAAAGCACTGGAAAAAGACCGTTTTATAAATCGAATTGTTTCCGAAACCTTAATTTTAAAACATTTCCTTTCTCTTTACA C 6572.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=3.806;DP=186;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=32.54;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,181:186:99:6610,569,0 -chr2 35331707 . C CT 1842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-0.038;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=37.27;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:75:1880,75,0 -chr2 35332001 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.937;DP=63;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:388,0,2080 -chr2 35582221 . CAGGTCAGTCCGGTGAAATGGTCATTTATTTTGTGCGTTGGCATACCACAAGGAGATCGCCTGTGTGACTTCCCTCTGCTGTTATTCCTCCTCCT C 9603.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=1.164;DP=214;FS=2.150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=27.04;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,211:214:99:9641,897,0 -chr2 35695420 . G A 2667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.176;DP=438;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:322,116:438:99:2696,0,12207 -chr2 35699808 . AT A 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-2.017;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,35:144:99:428,0,7508 -chr2 35699903 . AT A 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-0.333;DP=110;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:479,0,2262 -chr2 35700477 . T TA 1131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.712;ClippingRankSum=-0.275;DP=209;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,49:203:99:1169,0,10827 -chr2 35798328 . C CT 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-1.467;DP=104;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:400,0,1997 -chr2 36385735 . ACTGGGGGAGAACAGATCATTGATTTGGTTTTAAATGTTCCCTTGATGTGCATGAATAACAACAGCATCATGAAGAGAAGAGAACTTAC A 15207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.281;DP=367;FS=1.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=28.77;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,357:367:24:15210,24,0 -chr2 36391744 . CAA C 396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:35:434,35,0 -chr2 36660799 . G C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:310,0,138 -chr2 36661184 . TGTAAGTATTTTATTCATTTAAACATAACATTCAGCGCTTTGTACTTGACCAAGCTGTAAAAACCGAACTGAGCATTGAATTAACTGCGTTTGTCAACTTCTTCAG T 1374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.717;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:99:1412,106,0 -chr2 36662710 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:384,0,238 -chr2 36708990 . T C 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.830;DP=36;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=23.22;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:864,0,889 -chr2 36709932 . T C 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.526;DP=77;FS=5.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1360,0,1306 -chr2 36710381 . T TTA 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.214;DP=50;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:968,0,926 -chr2 36710780 . T G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-0.921;DP=30;FS=6.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:536,0,570 -chr2 36710883 . A T 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-2.132;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1036,0,868 -chr2 36711072 . C A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.418;DP=52;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:656,0,1157 -chr2 36713622 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-2.591;DP=28;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:373,0,571 -chr2 36845379 . GA G 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-1.373;DP=64;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:480,0,713 -chr2 36846662 . A G 6669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=2.565;DP=383;FS=7.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.41;ReadPosRankSum=-3.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,191:383:99:6698,0,7028 -chr2 36854254 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=-1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:336,0,84 -chr2 36859711 . A G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=-0.829;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:439,0,524 -chr2 36860077 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.617;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:561,0,357 -chr2 36866471 . A T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-0.043;DP=98;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:1505,0,1907 -chr2 36866653 . G C 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.602;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:1452,0,1516 -chr2 36866774 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.130;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:816,0,1661 -chr2 36866829 . G A 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.451;DP=76;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1215,0,1509 -chr2 36866959 . G A 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=2.293;DP=49;FS=5.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:793,0,989 -chr2 36866977 . G T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=2.902;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:644,0,1310 -chr2 36867100 . A T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.578;DP=62;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:386,0,3957 -chr2 36867109 . A T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=1.404;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:386,0,3957 -chr2 36867365 . A T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.290;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:540,0,541 -chr2 36899464 . G C 7591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.088;DP=452;FS=7.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,211:452:99:7620,0,8068 -chr2 36902832 . T C 6463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=-0.767;DP=435;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,197:431:99:6492,0,7472 -chr2 36902890 . A G 6032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=-2.900;DP=424;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,174:414:99:6061,0,7927 -chr2 36903890 . T G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=-1.427;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:273,0,716 -chr2 36905678 . C A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=1.269;DP=66;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=12.59;ReadPosRankSum=-1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:859,0,1390 -chr2 36906430 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=-0.760;DP=42;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:357,0,1262 -chr2 36910655 . A G 5694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=1.860;DP=329;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,164:329:99:5723,0,6007 -chr2 36915940 . G C 6817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=1.366;DP=427;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,195:426:99:6846,0,7489 -chr2 36922514 . A G 6092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.819;DP=343;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,175:343:99:6121,0,5865 -chr2 36922529 . C T 5738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.586;DP=356;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,182:355:99:5767,0,6147 -chr2 36924173 . GAGGTATGTGCTTTAGATAATCATCTGAAATATGCTGCACCTTATGGACCAAGTTAATATTTAGATCTCTTCTGTGTGTTTC G 13314.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=2.434;DP=311;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=35.80;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,309:311:99:13352,1015,0 -chr2 36926894 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.255;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:278,0,846 -chr2 36978902 . TGTACAACATCTGGCCGGATGGGGAACAAAATGAATAATGTGCAGGTCTTGATGCTTGCTTTTCTCTCTGTGTGTTTAG T 4122.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=1.931;DP=126;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,99:124:99:4160,0,8348 -chr2 36982042 . TAGGTAGGATCTCTTTTACAATTCTGTATTCTTTTGTCATCGACACCAGGATGGCTTCATATAATTCTGTGTGTTTGTGTTTAC T 2277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.479;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:2315,0,2661 -chr2 36982044 . GGTAGGATCTC G 2406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.739;DP=141;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:2444,0,2613 -chr2 36982056 . TTTACAATTCTGTATTCTTTTGTCATCGACACCAGGATGGCTTCATATAATTCTGTGTGTTTGTGTTTACAGTG T 2406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.859;DP=141;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:2444,0,2613 -chr2 36984773 . G A 3592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.446;DP=198;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,109:198:99:3621,0,3172 -chr2 36985962 . T C 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=2.565;DP=69;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1225,0,1243 -chr2 36986091 . C T 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.672;DP=100;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1793,0,1826 -chr2 36986491 . GT G 908.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.358;DP=89;FS=8.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:946,0,961 -chr2 37002541 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:264,0,62 -chr2 37023327 . G A 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-0.071;DP=39;FS=9.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:756,0,592 -chr2 37023884 . T TC 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=2.252;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=15.78;ReadPosRankSum=-2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:479,0,369 -chr2 37024585 . C T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.899;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1152,0,1084 -chr2 37026576 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:328,0,424 -chr2 37026866 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-1.910;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=15.45;ReadPosRankSum=-2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,320 -chr2 37026939 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-1.967;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:432,0,295 -chr2 37027249 . T G 464.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:5:492,0,5 -chr2 37027729 . T TA 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.079;DP=28;FS=3.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:414,0,234 -chr2 37029768 . G C 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr2 37033751 . G T 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-0.403;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,36:65:99:1182,0,995 -chr2 37072496 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.728;DP=46;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:735,0,852 -chr2 37072606 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=2.921;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:390,0,1575 -chr2 37072607 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=2.622;DP=32;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:354,0,1655 -chr2 37073121 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.652;DP=53;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:988,0,821 -chr2 37086592 . T G 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.199;DP=124;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=15.80;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1987,0,2088 -chr2 37086862 . AAC A 2150.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-2.266;DP=125;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:2188,0,2124 -chr2 37107054 . T C 2947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.305;DP=162;FS=7.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=18.20;ReadPosRankSum=3.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,89:157:99:2976,0,2425 -chr2 37176565 . C T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.096;DP=47;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:827,0,820 -chr2 37179526 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.211;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=18.64;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:755,0,664 -chr2 37179565 . A T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.743;DP=43;FS=19.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:719,0,695 -chr2 37180905 . C T 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=1.062;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1095,0,655 -chr2 37182583 . A G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.227;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.085;QD=22.51;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:726,0,360 -chr2 37188947 . CA C 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.454;DP=83;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:561,0,1090 -chr2 37192709 . GCTACGGAAGATATTGGAAATTTAAGACTTTTAATAAATGTTATCATAACTAAGAGCTAAACGCAGCTTAAAATCCTAC G 4842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=1.971;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=32.51;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,111:113:99:4880,335,0 -chr2 37208525 . T C 836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:63:865,63,0 -chr2 37208634 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.246;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:391,0,440 -chr2 37209417 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.515;DP=41;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:255,0,1158 -chr2 37209522 . C A 1239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1268,100,0 -chr2 37221626 . TAC T 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=32.21;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:55:456,0,55 -chr2 37222968 . A T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-1.057;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:729,0,621 -chr2 37225600 . C T 656.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:685,48,0 -chr2 37225974 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=-0.851;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:407,0,874 -chr2 37266838 . C G 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.178;DP=38;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=24.44;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:957,0,330 -chr2 37275644 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.476;DP=40;FS=12.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.862;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:720,0,642 -chr2 37335411 . T G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=1.753;DP=40;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:535,0,776 -chr2 37335501 . G A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.951;DP=36;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=16.02;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:605,0,619 -chr2 37335549 . T C 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.124;DP=48;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=16.54;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:822,0,845 -chr2 37377689 . T A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-1.495;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.939;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:965,0,1539 -chr2 37378760 . A G 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-0.464;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:663,0,948 -chr2 37390304 . G A 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.248;DP=64;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,39:64:99:1296,0,854 -chr2 37406212 . T G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.872;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:301,0,247 -chr2 37406713 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=21.62;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:266,0,125 -chr2 37407107 . C A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-1.303;DP=56;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1224,0,747 -chr2 37425943 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=2.246;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:388,0,383 -chr2 37426017 . G T 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.358;DP=49;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:1291,0,398 -chr2 37438308 . C T 2125.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2154,157,0 -chr2 37442185 . T C 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=16.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:520,0,416 -chr2 37475281 . A G 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=1.222;DP=50;FS=12.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:927,0,802 -chr2 37475544 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-0.390;DP=69;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1222,0,1188 -chr2 37476414 . C A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=-0.952;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:418,0,646 -chr2 37477111 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.332;DP=36;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:630,0,639 -chr2 37478672 . G A 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:732,51,0 -chr2 37479103 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-0.188;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.917;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:621,0,420 -chr2 37479447 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=1.517;DP=30;FS=9.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=16.29;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:517,0,564 -chr2 37479595 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.530;DP=40;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:707,0,623 -chr2 37499340 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:332,0,432 -chr2 37510834 . T A 1233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1262,90,0 -chr2 37510944 . A C 743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:772,57,0 -chr2 37517832 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.621;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:370,0,296 -chr2 37528402 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:256,0,294 -chr2 37532048 . GCAGGCAAGAATTTGTCATTCAGATCTTTCTGTGATAATCTATGCAATTACCTAAATGTGTGATTTTATTTTGTTACTGTTTTCTGGT G 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:341,0,846 -chr2 37535979 . GA G 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 -chr2 37542816 . A G 363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:392,30,0 -chr2 37552426 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:294,0,287 -chr2 37552455 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=-0.694;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=22.38;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:610,0,1165 -chr2 37552465 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.755;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:601,0,1165 -chr2 37552768 . T C 660.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:689,51,0 -chr2 37554836 . T G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:521,39,0 -chr2 37555693 . T C 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr2 37555726 . GACCTGTTGAAAGAAAAGACTTCAGTTTATTCAGTTTAATGTCATTTAAACAGATCATGAAATTCATGATAGCAGGCGAAGTT G 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:381,0,382 -chr2 37572126 . T C 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.082;DP=56;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:882,0,1068 -chr2 37572977 . CCCTACATATCAAATAAAAAGCATATAAAACACACTACTTTAGCATGTCAATTCAGAAAACATAATCTTTAATACTGAGGCTGGCAGATCATTGGTTCCTCA C 2194.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.996;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,44:46:99:2232,228,0 -chr2 37576553 . A G 2272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.801;DP=129;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:2301,0,2104 -chr2 37576570 . C G 1849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.361;DP=114;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1878,0,1947 -chr2 37576710 . A T 2149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.537;DP=107;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:2178,0,1468 -chr2 37576853 . A G 2552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.386;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,79:130:99:2581,0,1766 -chr2 37579779 . A G 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.078;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:1597,0,1656 -chr2 37581469 . G C 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr2 37581945 . G A 1953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.009;DP=111;FS=1.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1982,0,2027 -chr2 37605884 . CG C 563.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=1.486;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:4:599,4,0 -chr2 37606147 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=2.378;DP=41;FS=4.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:421,0,893 -chr2 37606870 . C T 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.588;DP=88;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1355,0,3428 -chr2 37618665 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=1.327;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=28.88;ReadPosRankSum=2.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:548,0,104 -chr2 37618744 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=1.780;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:333,0,282 -chr2 37621226 . C G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-1.410;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=28.76;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:661,0,109 -chr2 37621544 . A C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:260,0,685 -chr2 37621554 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=2.905;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=16.55;ReadPosRankSum=-2.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:260,0,685 -chr2 37651293 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,254 -chr2 37671507 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:44:375,0,44 -chr2 37673507 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.714;ClippingRankSum=0.343;DP=27;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:333,0,584 -chr2 37676411 . G A 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr2 37677076 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,187 -chr2 37683253 . A C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.282;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:511,0,196 -chr2 37692824 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,222 -chr2 37693273 . G C 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr2 37694974 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr2 37711260 . G C 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.034;DP=63;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1004,0,1139 -chr2 37717280 . A G 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.563;DP=62;FS=10.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=17.59;ReadPosRankSum=2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1119,0,1153 -chr2 37718174 . G A 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=1.089;DP=69;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:1255,0,1141 -chr2 37724465 . T G 621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.803;DP=31;FS=2.688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,23:26:34:650,34,0 -chr2 37725218 . T C 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.532;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:858,0,1263 -chr2 37729834 . A AT 3468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=-2.431;DP=344;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,136:333:99:3506,0,5066 -chr2 37731837 . T C 4554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=1.151;DP=378;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,141:377:99:4583,0,7603 -chr2 37736296 . G A 8679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=2.887;DP=319;FS=6.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=27.21;ReadPosRankSum=-2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,231:318:99:8708,0,2149 -chr2 37736329 . T C 8464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=-1.071;DP=382;FS=6.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.437;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,251:381:99:8493,0,4389 -chr2 37736764 . GT G 1233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=1.149;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,53:77:99:1271,0,344 -chr2 37742848 . G C 4192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.253;DP=238;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,129:238:99:4221,0,3939 -chr2 37768003 . G A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:751,0,578 -chr2 37768214 . A G 756.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.180;DP=21;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=30.02;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:20:785,0,20 -chr2 37768216 . G A 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.693;DP=20;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:28:785,0,28 -chr2 37770394 . A T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=1.476;DP=36;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.471;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:752,0,563 -chr2 37770809 . ATT A 297.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=27;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:15:507,15,0 -chr2 37775503 . A C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-1.673;DP=69;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:563,0,3787 -chr2 37775647 . G A 2766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-1.652;DP=136;FS=13.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,85:135:99:2795,0,1662 -chr2 37779634 . T G 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-0.964;DP=99;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:1520,0,1894 -chr2 37781183 . A G 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.621;DP=85;FS=6.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1492,0,1396 -chr2 37790619 . C T 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.919;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:1582,0,1782 -chr2 37790768 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=3.713;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:276,0,1757 -chr2 37804267 . G A 1775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=1.311;DP=110;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1804,0,2129 -chr2 37805096 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.296;DP=80;FS=10.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:368,0,5102 -chr2 37805101 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.095;DP=82;FS=9.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:375,0,5102 -chr2 37809400 . G A 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=-1.695;DP=93;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1731,0,1610 -chr2 37817715 . C T 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.851;DP=114;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1987,0,1871 -chr2 37818533 . A T 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.951;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1146,0,1042 -chr2 37850403 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=-2.039;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:574,0,488 -chr2 37850609 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,328 -chr2 37855037 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.362;DP=34;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:592,0,646 -chr2 37855589 . C T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=1.445;DP=63;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=13.84;ReadPosRankSum=-1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:900,0,1272 -chr2 37855901 . A C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.705;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:740,0,722 -chr2 37857576 . C T 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-1.109;DP=49;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:700,0,1011 -chr2 37857703 . C A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.146;DP=24;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:478,0,370 -chr2 37857904 . G A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=1.897;DP=33;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=21.05;ReadPosRankSum=-1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:723,0,472 -chr2 37858236 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.313;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:68:673,0,68 -chr2 37858771 . T C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=1.304;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=13.83;ReadPosRankSum=2.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:374,0,533 -chr2 37864307 . G A 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=-1.049;DP=120;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:2084,0,1880 -chr2 37876419 . G A 2479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=1.718;DP=193;FS=6.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,76:193:99:2508,0,3838 -chr2 37876494 . T C 7518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:7547,548,0 -chr2 37881216 . AGTCAGTAGCTTTGATGTCCCATAACATAAAGCACGAGCACAAAGAGAGCATAGATCTGAAACTGCTGCTTATCTTTCATCAG A 9941.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.362;DP=220;FS=2.113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,216:219:99:9979,837,0 -chr2 37883763 . G A 4314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=1.241;DP=240;FS=1.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,118:240:99:4343,0,4509 -chr2 37883874 . A G 11580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=285;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,284:284:99:11609,860,0 -chr2 37884191 . G A 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=-2.683;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=11.02;ReadPosRankSum=2.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1693,0,2500 -chr2 37884299 . C CT 1415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-2.097;DP=178;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,103:171:99:1889,0,1415 -chr2 37885223 . A AT 418.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:59:566,59,0 -chr2 37885290 . T A 1522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.140;DP=37;FS=3.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=29.98;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1551,108,0 -chr2 37885540 . G C 2312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-2.092;DP=121;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:2341,0,1820 -chr2 37885742 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-1.318;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:897,0,1825 -chr2 37885745 . C A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-0.901;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:897,0,1825 -chr2 37885849 . C T 2643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.663;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:2672,0,2471 -chr2 37900394 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr2 37901420 . T C 3503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.882;DP=240;FS=0.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,109:238:99:3532,0,4045 -chr2 37905114 . C T 7627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.708;DP=416;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,239:416:99:7656,0,6106 -chr2 37905770 . G A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.480;DP=55;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1011,0,995 -chr2 37906027 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=1.954;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,413 -chr2 37906376 . CT C 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.180;DP=70;FS=3.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:882,0,643 -chr2 37906622 . G T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.114;DP=54;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:773,0,1114 -chr2 37908760 . C T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-1.445;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:88:830,0,88 -chr2 37932697 . C G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.114;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:491,0,792 -chr2 37972056 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.285;DP=40;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:719,0,611 -chr2 37977174 . G C 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=1.680;DP=109;FS=1.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=10.90;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,37:109:99:1216,0,2433 -chr2 37978528 . GT G 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=1.379;DP=53;FS=4.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=14.03;ReadPosRankSum=-2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:781,0,438 -chr2 37978895 . C CA 558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-2.332;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:596,0,598 -chr2 37979083 . C T 1087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.464;DP=59;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1116,0,980 -chr2 37979185 . C T 841.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:870,60,0 -chr2 37992034 . G T 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.273;DP=127;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:2161,0,2280 -chr2 37992123 . G A 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.462;DP=133;FS=13.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,47:133:99:1622,0,2985 -chr2 38009465 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.558;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:555,0,539 -chr2 38045313 . G T 1649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1678,120,0 -chr2 38045666 . T C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.268;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:772,0,1100 -chr2 38059524 . G A 2506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=2.538;DP=165;FS=6.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:2535,0,3008 -chr2 38095193 . A G 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=3.485;DP=120;FS=7.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=8.17;ReadPosRankSum=-3.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,39:120:99:1009,0,3082 -chr2 38548429 . A C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-1.573;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:365,0,207 -chr2 38565574 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:240,0,235 -chr2 38587620 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.650;DP=15;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:71:458,0,71 -chr2 38593565 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:257,18,0 -chr2 38594466 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:76:290,0,76 -chr2 38681000 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,178 -chr2 38701644 . G T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.457;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=25.85;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:416,0,135 -chr2 38701659 . CA C 391.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=1.827;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:35:429,35,0 -chr2 38701728 . T C 1925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=1.827;DP=178;FS=14.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=10.82;ReadPosRankSum=-2.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,50:173:99:1954,0,10855 -chr2 38701742 . C G 1916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=2.020;DP=234;FS=16.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,73:227:99:1945,0,10855 -chr2 38702384 . GCTGTTCACAGTAACACACAACTCATTTTATTAGTTCATGCAATAAGTGACAACACATTAACACACATGAACGCACACACGCAC G 11963.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=1.887;DP=270;FS=2.057;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=28.40;ReadPosRankSum=2.496 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,254:258:99:12001,1158,0 -chr2 38704664 . C A 4030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=1.407;DP=299;FS=0.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,111:299:99:4059,0,13018 -chr2 38704667 . G A 4030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=1.501;DP=283;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,103:283:99:4059,0,12930 -chr2 38710054 . T A 5538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-1.441;DP=379;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,161:378:99:5567,0,7205 -chr2 39354160 . G A 2318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-1.240;DP=123;FS=11.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:2347,0,1701 -chr2 39354422 . C T 1542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.899;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=18.59;ReadPosRankSum=1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,48:83:99:1571,0,1143 -chr2 39379924 . C T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=1.237;DP=60;FS=2.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1003,0,956 -chr2 39379990 . GGA G 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.227;DP=41;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:440,0,648 -chr2 39436498 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-3.330;DP=22;FS=4.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=19.72;ReadPosRankSum=3.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:462,0,1289 -chr2 39436706 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-1.826;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=22.22;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:606,0,1517 -chr2 39436722 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.320;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:606,0,1517 -chr2 39436950 . C CT,CTT 660.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.893;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,24,8:33:99:891,207,121,651,0,757 -chr2 39437296 . A C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:74:465,0,74 -chr2 39437642 . G GTT 566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.436;DP=43;FS=2.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:604,0,1703 -chr2 39438447 . GT G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.263;DP=48;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:277,0,617 -chr2 39438676 . C CT 755.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.652;DP=66;FS=2.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:793,0,830 -chr2 39772212 . T TG 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.402;DP=64;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:466,0,957 -chr2 39772499 . G A 2134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=-0.452;DP=106;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=20.14;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:2163,0,2045 -chr2 39772680 . G C 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.209;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:1541,0,1516 -chr2 39774239 . G A 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.236;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1867,0,1925 -chr2 39898231 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,502 -chr2 39903894 . T A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=1.304;DP=32;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:419,0,665 -chr2 39979314 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:305,0,649 -chr2 39979763 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.001;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=22.90;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:555,0,677 -chr2 39979941 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,939 -chr2 39980011 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:262,0,185 -chr2 39982137 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=-0.259;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:247,0,780 -chr2 39984476 . T G 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:752,51,0 -chr2 39985157 . C T 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.268;DP=85;FS=5.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,32:85:99:1123,0,1900 -chr2 39985299 . T A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-0.976;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:508,0,1508 -chr2 40095161 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.120;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:415,0,1346 -chr2 40164530 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.894;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:681,0,716 -chr2 40266917 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.707;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:542,0,1062 -chr2 40267394 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=17.05;ReadPosRankSum=-2.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:318,0,311 -chr2 40268270 . T C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-2.058;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:555,0,484 -chr2 40268295 . TA T 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.569;DP=29;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:337,0,304 -chr2 40272699 . G GAC 260.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr2 40585769 . A G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.197;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=24.03;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:701,0,263 -chr2 40619509 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.034;DP=47;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:495,0,1062 -chr2 40631159 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-2.377;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:249,0,3290 -chr2 40631174 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=-2.268;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:254,0,3290 -chr2 40632139 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.257;DP=43;FS=10.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:288,0,1183 -chr2 40638408 . T C 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:950,69,0 -chr2 40638546 . G A 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 -chr2 41525159 . G GT 985.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.381;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1023,0,681 -chr2 41525847 . C A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.163;DP=347;FS=23.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,60:346:99:764,0,16751 -chr2 41526990 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.720;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:299,0,4890 -chr2 41527351 . C G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=1.777;DP=61;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:383,0,3893 -chr2 41527352 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=2.171;DP=58;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:389,0,3893 -chr2 41540838 . A C 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.409;DP=68;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:1183,0,1068 -chr2 41543969 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-1.172;DP=50;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:659,0,2370 -chr2 41543972 . A C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.130;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:704,0,2284 -chr2 41544191 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,320 -chr2 41564434 . T C 2470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.621;DP=140;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=17.65;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:2499,0,2554 -chr2 41565329 . G A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.761;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,34:103:99:944,0,2686 -chr2 41570259 . C T 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.201;DP=124;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,50:124:99:1644,0,2409 -chr2 41594680 . A T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr2 41594723 . C A 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr2 41594841 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.077;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=22.77;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:347,0,132 -chr2 41594872 . G A 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 -chr2 41702087 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.656;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:311,0,543 -chr2 41714138 . G A 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=-0.519;DP=55;FS=5.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:1042,0,723 -chr2 41727119 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.638;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:433,0,1975 -chr2 41943049 . A T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.159;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:493,0,110 -chr2 41977884 . G A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.887;DP=71;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:991,0,1204 -chr2 41983022 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=1.403;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:521,0,825 -chr2 42006284 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.713;DP=59;FS=2.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:868,0,1176 -chr2 42020885 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-1.952;DP=34;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:236,0,970 -chr2 42122876 . G C 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.226;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:596,0,360 -chr2 42152221 . A G 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 -chr2 42164423 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.312;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:991,0,962 -chr2 42167904 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=-0.601;DP=36;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:452,0,633 -chr2 42172404 . T A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=1.887;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=30.64;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:825,0,99 -chr2 42176163 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.995;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:464,0,462 -chr2 42182198 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:361,0,329 -chr2 42184691 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-3.008;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,374 -chr2 42185859 . T A 216.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:245,0,21 -chr2 42242676 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,177 -chr2 42253296 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=1.582;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:276,0,413 -chr2 42262232 . A G 2127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2156,160,0 -chr2 42265964 . C T 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-0.952;DP=74;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,44:74:99:1502,0,1019 -chr2 42272196 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.130;DP=72;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:829,0,1623 -chr2 42278282 . G A 236.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:265,0,18 -chr2 42292877 . C T 6688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-4.224;DP=322;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,209:322:99:6717,0,7780 -chr2 42308088 . G A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.320;DP=37;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:680,0,598 -chr2 42325627 . G A 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:384,27,0 -chr2 42325766 . G T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.541;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:527,0,911 -chr2 42325989 . G A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr2 42326000 . T G 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:414,30,0 -chr2 42326166 . A G 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.800;DP=28;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=33.46;ReadPosRankSum=3.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:78:965,0,78 -chr2 42326213 . A C 1131.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:87:1160,87,0 -chr2 42326233 . G T 684.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-2.293;DP=15;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=34.13;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:17:713,17,0 -chr2 42326567 . G C 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-1.076;DP=33;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=31.69;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,27:29:40:1074,0,40 -chr2 42326787 . G A 1024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:75:1053,75,0 -chr2 42326901 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.224;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:457,0,965 -chr2 42326911 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.652;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:538,0,1026 -chr2 42326952 . A T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=1.166;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:837,0,1135 -chr2 42327002 . C T 1230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.518;DP=61;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1259,0,706 -chr2 42327301 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=3.242;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=10.76;ReadPosRankSum=-2.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:265,0,513 -chr2 42327792 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=1.021;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:381,0,365 -chr2 42327885 . T A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.527;DP=36;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:480,0,1770 -chr2 42329967 . T C 3528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=-2.308;DP=223;FS=11.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,97:218:99:3557,0,4115 -chr2 42333660 . G A 5214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-1.546;DP=398;FS=1.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,151:397:99:5243,0,8541 -chr2 42455190 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=1.232;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:366,0,371 -chr2 42455315 . C CT 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.262;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:63:409,0,63 -chr2 42455641 . C A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:279,0,240 -chr2 42497591 . G C 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=-0.860;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:782,0,747 -chr2 42505161 . G A 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-0.533;DP=96;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1697,0,1539 -chr2 42516821 . G A 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.826;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:964,0,963 -chr2 42522707 . G GA 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-1.049;DP=42;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:577,0,359 -chr2 42523488 . C T 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.262;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1412,0,1264 -chr2 42526121 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=2.788;DP=27;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:233,0,799 -chr2 42526364 . C T 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.578;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:879,0,1589 -chr2 42534798 . T C 768.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:797,57,0 -chr2 42593004 . C A 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.448;DP=76;FS=1.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=16.40;ReadPosRankSum=2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,41:76:99:1275,0,1202 -chr2 42593020 . C A 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.017;DP=71;FS=3.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:1169,0,1135 -chr2 42593125 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.514;DP=47;FS=2.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:637,0,966 -chr2 42593595 . T A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.706;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:293,0,316 -chr2 42602873 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-1.418;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:377,0,601 -chr2 42618765 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=-0.750;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:540,0,690 -chr2 42621084 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.731;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:536,0,548 -chr2 42633549 . T C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.299;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:437,0,435 -chr2 42638626 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.705;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:587,0,198 -chr2 42644002 . C A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-1.615;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:368,0,357 -chr2 42650550 . G A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-2.103;DP=42;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:704,0,699 -chr2 42705909 . T G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr2 42706222 . T G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.518;DP=56;FS=11.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:405,0,1612 -chr2 42721208 . T A 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.485;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:870,0,974 -chr2 42724146 . T A 1579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.272;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:1608,0,1658 -chr2 42725957 . G A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.932;DP=60;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1136,0,917 -chr2 42774272 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.838;DP=48;FS=13.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=15.83;ReadPosRankSum=2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:788,0,861 -chr2 42774284 . G T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.118;DP=47;FS=8.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:900,0,698 -chr2 42806049 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-1.202;DP=22;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:300,0,439 -chr2 42825601 . G GA 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.723;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,38:174:99:488,0,4057 -chr2 42847648 . G T 10203.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,253:253:99:10232,768,0 -chr2 42848433 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.611;DP=37;FS=10.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:469,0,820 -chr2 42848466 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.158;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:313,0,99 -chr2 42849176 . T A 3707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=1.220;DP=208;FS=5.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,102:208:99:3736,0,4052 -chr2 42849433 . T TAC 3922.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-1.642;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,124:129:99:4431,365,0 -chr2 42918622 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,421 -chr2 43037714 . G A 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -chr2 43038165 . C T 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr2 43038374 . T G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr2 43038417 . T A 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 -chr2 43040327 . A C 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr2 43043909 . T C 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.628;DP=108;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:1568,0,2263 -chr2 43043957 . A T 2092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.117;DP=114;FS=3.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:2121,0,1915 -chr2 43044017 . C G 2109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.754;DP=133;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:2138,0,5466 -chr2 43044018 . T A 2109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.800;DP=133;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:2138,0,5422 -chr2 43044171 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=2.624;DP=104;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,21:103:99:337,0,3155 -chr2 43047177 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=2.585;DP=55;FS=9.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:294,0,1641 -chr2 43049846 . C T 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.489;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:1025,0,1250 -chr2 43049892 . G T 2537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2566,186,0 -chr2 43050533 . T C 1134.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:81:1163,81,0 -chr2 43050538 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:449,0,470 -chr2 43050714 . T G 3857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3886,280,0 -chr2 43050734 . C T 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.886;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1133,0,866 -chr2 43054450 . C T 1055.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1084,78,0 -chr2 43058255 . A T 2536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2565,187,0 -chr2 43061388 . G A 1540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.234;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1569,108,0 -chr2 43183726 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:240,0,321 -chr2 43191086 . A T 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr2 43256702 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.093;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:604,0,844 -chr2 43257358 . T C 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-3.125;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=23.30;ReadPosRankSum=3.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:867,0,1030 -chr2 43257769 . T C 967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.722;DP=26;FS=2.764;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=25.23;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:29:996,29,0 -chr2 43260005 . G GAC 1778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=1.012;DP=134;FS=3.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,50:130:99:1816,0,2907 -chr2 43260618 . G A 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=1.802;DP=59;FS=11.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=32.47;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,50:59:99:1944,0,749 -chr2 43380709 . A G 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=-1.289;DP=92;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1693,0,1572 -chr2 43391870 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.736;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=18.64;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1165,0,932 -chr2 43417654 . G A 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=1.065;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.071;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1020,0,947 -chr2 43417698 . A G 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.355;DP=70;FS=4.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1048,0,1265 -chr2 43490148 . GT G 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=2.250;DP=27;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:238,0,1287 -chr2 43490615 . C A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.891;DP=48;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=19.70;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:974,0,1613 -chr2 43491888 . G A 249.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:278,0,16 -chr2 43492013 . G A 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.049;DP=62;FS=4.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1020,0,1003 -chr2 43492295 . C A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.029;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:652,0,233 -chr2 43492860 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-0.539;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:316,0,610 -chr2 43492898 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=1.826;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:537,0,910 -chr2 43493834 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=8.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:326,0,368 -chr2 43494559 . C T 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=2.203;DP=43;FS=20.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=14.16;ReadPosRankSum=-2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:646,0,745 -chr2 43570506 . C A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-2.179;DP=43;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:951,0,475 -chr2 43644320 . C T 2308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.457;DP=143;FS=12.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:2337,0,2292 -chr2 43664730 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-0.173;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:629,0,553 -chr2 43665454 . C CT 1721.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.021;DP=67;FS=2.643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=25.70;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,59:61:99:17152,1215,0 -chr2 43666377 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=5.514;DP=200;FS=18.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=3.61;ReadPosRankSum=-2.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,41:200:99:750,0,6234 -chr2 43666623 . CT C 1220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.184;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=25.43;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,46:48:99:1258,0,305 -chr2 43666712 . G A 4912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-4.814;DP=166;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=29.59;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,128:166:99:4941,0,806 -chr2 43666997 . G A 3585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3614,253,0 -chr2 43667788 . C A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=2.201;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=23.04;ReadPosRankSum=-2.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:443,0,200 -chr2 43667918 . AG A 1386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=4.310;DP=130;FS=32.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:1424,0,1444 -chr2 43667923 . T A 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=5.530;DP=129;FS=52.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1424,0,1444 -chr2 43676284 . G A 439.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=33.84;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:467,0,5 -chr2 43676473 . C T 1251.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1280,90,0 -chr2 43680786 . A G 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-2.585;DP=22;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.272;QD=32.31;ReadPosRankSum=2.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:739,0,274 -chr2 43680793 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=-2.422;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=30.90;ReadPosRankSum=2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:739,0,274 -chr2 43680867 . C T 451.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=34.77;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:479,0,5 -chr2 43684082 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=21.98;ReadPosRankSum=-2.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:336,0,588 -chr2 43688463 . C T 1803.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;ClippingRankSum=-3.119;DP=53;FS=17.325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=34.03;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,48:53:19:1832,19,0 -chr2 43688578 . G A 2933.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-1.731;DP=94;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.779;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,82:93:17:2962,0,17 -chr2 43700135 . G A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-2.866;DP=95;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=13.18;ReadPosRankSum=2.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:1280,0,2189 -chr2 43700260 . GCAGGTCTGAGAAGCTGTCAGTCTCTCTCCTACATAAATGAAGACATGACAAACTTTCTGATTGACTGTTTTCTCTCTCATAT G 6032.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:6070,513,0 -chr2 43702931 . C T 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.584;DP=77;FS=3.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,45:77:99:1513,0,1113 -chr2 43703766 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-2.768;DP=61;FS=5.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:856,0,1280 -chr2 43704027 . G T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-3.001;DP=60;FS=8.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=17.06;ReadPosRankSum=3.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1052,0,1016 -chr2 43704341 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=1.194;DP=61;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=21.24;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1324,0,1835 -chr2 43704496 . A G 794.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:823,57,0 -chr2 43705260 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=3.795;DP=32;FS=8.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.52;ReadPosRankSum=-2.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:397,0,1575 -chr2 43705706 . C CT 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.344;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:467,0,484 -chr2 43707149 . AT A 632.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-1.432;DP=28;FS=4.075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:67:670,67,0 -chr2 43730669 . CACTCTGTATGTTGAACAAACTAAACATTAAAACATCCTAATATGCATGATTTGAAAGGGAA C 1287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=-0.495;DP=80;FS=1.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:1325,0,4005 -chr2 43730674 . TGTATGTTGAACAAACTAAACATTAAAACATCCTAATATGCATGATTTGAAAGGGAAATTCTGCCTATGCACGCAAGGCTGTAGATTGTTTGTAAATATTTCTCTCTCTTTTTCTCCAAG T 1038.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.345;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:1076,0,3611 -chr2 43730734 . CTGCCTA C 1287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.733;DP=78;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:1325,0,4048 -chr2 43730747 . CAAGGCTGTAGATTGTTTGTAAATATTTCTCTCTCTTTTTCTCCAAGGCACGT C 1287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.533;DP=80;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=16.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:1325,0,4097 -chr2 43736268 . GA G 479.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-0.627;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:517,0,762 -chr2 43736502 . TGTAA T 538.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:53:576,53,0 -chr2 43741142 . G A 658.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.193;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:686,8,0 -chr2 43741792 . G T 583.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.919;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=34.35;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:5:611,5,0 -chr2 43765630 . TA T 1529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-0.928;DP=133;FS=4.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1567,0,1417 -chr2 43765825 . CG C 1570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1608,131,0 -chr2 43766175 . G A 1840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=-0.131;DP=123;FS=7.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1869,0,2396 -chr2 43769086 . G A 4125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.941;DP=226;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=18.26;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,128:224:99:4154,0,3234 -chr2 43800881 . G A 2582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.289;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,75:189:99:2611,0,3855 -chr2 43800902 . G C 3672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-0.496;DP=192;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,115:192:99:3701,0,2580 -chr2 43812614 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-1.050;DP=33;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:621,0,432 -chr2 43863159 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.295;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:341,0,913 -chr2 43863962 . T A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=1.444;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,387 -chr2 43866207 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-2.077;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:571,0,532 -chr2 43868489 . AT A 711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=1.065;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=24.54;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:48:749,48,0 -chr2 43879094 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.133;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:466,0,582 -chr2 43971627 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.979;DP=59;FS=2.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1031,0,961 -chr2 44009711 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=2.422;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=30.61;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:82:518,0,82 -chr2 44016698 . A G 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:746,51,0 -chr2 44048818 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-1.569;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:381,0,389 -chr2 44105805 . G A 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.051;DP=49;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:1043,0,742 -chr2 44106868 . G A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr2 44108954 . AC A 253.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=1.283;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.875;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:3:289,0,3 -chr2 44110558 . CT C 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.615;DP=91;FS=6.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:520,0,1130 -chr2 44265061 . C T 3324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-1.460;DP=187;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,91:186:99:3353,0,3523 -chr2 44265264 . G GCACACA 473.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:30:511,30,0 -chr2 44302072 . A G 4506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=2.703;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=19.02;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,135:230:99:4535,0,3326 -chr2 44323477 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:256,0,318 -chr2 44324747 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.952;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:373,0,522 -chr2 44374202 . G A 2874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=-0.386;DP=186;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=15.46;ReadPosRankSum=2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,98:186:99:2903,0,3068 -chr2 44394897 . G A 2484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.672;DP=137;FS=1.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:2513,0,2215 -chr2 44423507 . TA T 300.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:338,33,0 -chr2 44438839 . C T 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:237,0,25 -chr2 44444851 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.155;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:713,0,685 -chr2 44460030 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.620;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:339,0,443 -chr2 44606676 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.724;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,788 -chr2 44668750 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-1.604;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:246,0,522 -chr2 44669242 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,421 -chr2 44756266 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-1.653;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:312,0,1512 -chr2 44813851 . GCCTGAAGGATATGGTATTGTGTAAAAGAGATTTATTTTATAATAATTCAATGCATGCATTTGAAAAAGTCGATTTTACCCCCCCGACGCAAACTCCTCA G 8235.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=2.424;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,188:190:99:8273,675,0 -chr2 44821275 . T TTCAGC 2387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=3.206;DP=84;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=28.43;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,62:71:99:2425,0,359 -chr2 44821488 . CCCTAACAGAACAAATCAGCCATCAGCGAACATGAACAGCAGTTTAATGTGACTGTGCAGAAAACAGGTAATCTCCTTCAA C 2371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.566;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=33.60;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:99:2409,156,0 -chr2 44830142 . T A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=-0.203;DP=202;FS=0.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=3.95;ReadPosRankSum=2.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,43:201:99:826,0,5866 -chr2 44838583 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.401;DP=180;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,40:180:99:760,0,5500 -chr2 45346759 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-1.102;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:297,0,467 -chr2 45409369 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.154;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:565,0,847 -chr2 45434231 . G C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=1.813;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:233,0,226 -chr2 45438782 . C G 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr2 45438793 . T A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr2 45462206 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.200;DP=53;FS=17.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:465,0,1336 -chr2 45475416 . T A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=-0.041;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:629,0,107 -chr2 45476513 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:255,0,52 -chr2 45487282 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.525;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=27.16;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:653,0,145 -chr2 45487382 . G A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.420;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:804,0,866 -chr2 45487722 . T C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.340;DP=67;FS=5.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:770,0,1417 -chr2 45487808 . C A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=-2.610;DP=37;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:328,0,945 -chr2 45495684 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.540;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,129 -chr2 45496939 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=2.003;DP=12;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=23.06;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:305,0,52 -chr2 45512523 . C T 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr2 45513075 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,154 -chr2 45546514 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.328;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:241,0,1198 -chr2 45546796 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-1.450;DP=68;FS=4.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:235,0,2183 -chr2 45549023 . G T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=-1.624;DP=129;FS=7.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,27:129:99:501,0,3995 -chr2 45565979 . C A 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.983;DP=50;FS=6.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:756,0,1019 -chr2 45711101 . C T 1516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-3.573;DP=134;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=11.32;ReadPosRankSum=3.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,46:134:99:1545,0,2986 -chr2 45711280 . G A 3513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.658;DP=208;FS=6.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,111:208:99:3542,0,3521 -chr2 45719195 . T A 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.521;DP=62;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1228,0,936 -chr2 46100971 . T C 1710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=6.499;DP=279;FS=5.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,72:279:99:1739,0,8048 -chr2 46428085 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=1.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:353,0,361 -chr2 46428258 . CA C 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.023;DP=34;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:537,0,146 -chr2 46430751 . CA C 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.349;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:90:367,0,90 -chr2 46430922 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.096;DP=83;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1399,0,1406 -chr2 46544999 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,526 -chr2 46807987 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:270,0,96 -chr2 46809038 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:357,0,366 -chr2 47498667 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=3.155;DP=114;FS=8.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,19:114:99:271,0,3933 -chr2 47498874 . GA G 484.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-1.703;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,37:150:99:522,0,3223 -chr2 47503091 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=1.345;DP=186;FS=9.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,39:186:99:711,0,5646 -chr2 47515841 . GCCTGAGAGATGGAGGATCATGCAGAGCAGGAATGAGAAAGTGCTTTCTGGTTGATTGTGTTATTGTGTGGGTTTTGTTTTTA G 7011.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.777;DP=161;FS=8.904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=29.39;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,157:161:99:7049,573,0 -chr2 47540247 . G T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.321;DP=167;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,40:167:99:780,0,4532 -chr2 47641636 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.084;DP=44;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:242,0,1487 -chr2 47641811 . A T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.800;DP=28;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:388,0,610 -chr2 47707182 . GT G 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=-0.041;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:391,0,534 -chr2 47710158 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.444;DP=20;FS=11.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:340,0,984 -chr2 47877269 . AT A 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.217;DP=27;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:250,0,282 -chr2 47877478 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.995;DP=44;FS=8.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:827,0,650 -chr2 47925626 . G T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.994;DP=64;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1028,0,1083 -chr2 47943679 . T TA 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.723;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:435,0,331 -chr2 47944177 . TA T 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.372;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:385,0,117 -chr2 47944255 . T A 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr2 47947493 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.828;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:498,0,992 -chr2 47975440 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.791;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:457,0,166 -chr2 48035380 . TCTGGAAATATATGAAGAATATGTAGAGCTATTATGACAGTGTTCTCTAGCTGAATGATTAACTATTTTCTATGCTTAC T 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.922;DP=18;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:395,0,2028 -chr2 48095104 . T A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 -chr2 48095216 . A T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr2 48095282 . C A 1421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1450,102,0 -chr2 48095372 . A G 1366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1395,93,0 -chr2 48095378 . C T 1366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1395,93,0 -chr2 48095585 . T A 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1142,84,0 -chr2 48095647 . C T 3292.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3321,232,0 -chr2 48095702 . A G 3001.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3030,217,0 -chr2 48096120 . C G 6764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6793,473,0 -chr2 48096201 . G T 2772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2801,199,0 -chr2 48096240 . G A 3088.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3117,219,0 -chr2 48096250 . C T 3088.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:3117,219,0 -chr2 48096529 . T G 3950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3979,279,0 -chr2 48096575 . G A 912.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:941,69,0 -chr2 48096612 . G A 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 -chr2 48096695 . G A 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr2 48097028 . A T 2380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2409,169,0 -chr2 48097403 . T C 1267.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1296,90,0 -chr2 48097448 . G A 1801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1830,126,0 -chr2 48097814 . T A 1305.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1334,93,0 -chr2 48097823 . G T 1305.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:93:1334,93,0 -chr2 48097856 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr2 48097858 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr2 48097952 . T C 3000.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:3029,208,0 -chr2 48097955 . C T 3000.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:3029,208,0 -chr2 48109006 . A G 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:496,36,0 -chr2 48109099 . G T 2432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2461,175,0 -chr2 48109873 . C A 940.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:969,66,0 -chr2 48109890 . T A 945.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:974,66,0 -chr2 48110316 . C T 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr2 48110380 . T C 743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:772,54,0 -chr2 48111183 . T C 491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:520,39,0 -chr2 48111203 . G A 547.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:576,39,0 -chr2 48111286 . G A 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 -chr2 48111295 . T C 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 -chr2 48112039 . G A 573.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:602,42,0 -chr2 48112075 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr2 48203421 . T G 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.650;DP=66;FS=15.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,33:56:99:1186,0,837 -chr2 48212433 . T G 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-1.968;DP=94;FS=1.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:1346,0,1871 -chr2 48213704 . A T 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.648;DP=60;FS=16.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1314,0,1921 -chr2 48213710 . T C 1279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.955;DP=58;FS=12.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1308,0,1921 -chr2 48215623 . C A 1961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.056;DP=92;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,57:92:99:1990,0,1232 -chr2 48219480 . C G 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=1.360;DP=85;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1451,0,1484 -chr2 48259343 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:350,0,136 -chr2 48268070 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.857;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:295,0,367 -chr2 48317794 . G A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=1.939;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.036;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1362,0,1492 -chr2 48331401 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=2.571;DP=45;FS=14.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=7.33;ReadPosRankSum=2.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:358,0,952 -chr2 48333526 . C T 2093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-0.017;DP=128;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:2122,0,2352 -chr2 48418779 . G GA 1716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.987;ClippingRankSum=-1.996;DP=136;FS=15.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,79:123:99:1754,0,969 -chr2 48437636 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=1.457;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:371,0,370 -chr2 48470721 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-2.585;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=12.84;ReadPosRankSum=2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,340 -chr2 48470814 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:347,0,58 -chr2 48470861 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:262,0,290 -chr2 48470938 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.993;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:271,0,249 -chr2 49255729 . AT A 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=2.024;DP=15;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:45:287,0,45 -chr2 49256051 . T C 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr2 49257133 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-0.228;DP=26;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:336,0,369 -chr2 49257179 . C A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.903;DP=44;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:464,0,711 -chr2 49311094 . G A 2441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=-0.233;DP=129;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:2470,0,1749 -chr2 49317114 . C T 2711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-1.247;DP=134;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.448;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,81:134:99:2740,0,1796 -chr2 49319211 . T G 2536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.084;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:2565,0,2104 -chr2 49333691 . T C 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=2.003;DP=100;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1726,0,1666 -chr2 49333784 . A G 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.733;DP=70;FS=4.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1324,0,1038 -chr2 49339991 . C T 2855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=1.292;DP=152;FS=8.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,87:152:99:2884,0,2296 -chr2 49352856 . G A 4198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.208;DP=262;FS=10.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,133:261:99:4227,0,4249 -chr2 49352936 . G A 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.967;DP=150;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,55:150:99:1815,0,3391 -chr2 49352972 . G T 1636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=-0.124;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=13.09;ReadPosRankSum=-3.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,49:125:99:1665,0,2566 -chr2 49364926 . G C 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.836;DP=46;FS=16.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:782,0,751 -chr2 49368328 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-1.950;DP=19;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:537,0,114 -chr2 49384869 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.463;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:385,0,442 -chr2 49385125 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.252;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:307,0,527 -chr2 49385840 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-2.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:264,0,252 -chr2 49401306 . A C 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.126;DP=45;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.873;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:899,0,709 -chr2 49505096 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.555;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:264,0,209 -chr2 49508737 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr2 49518557 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:293,0,329 -chr2 49570253 . C A 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.038;DP=47;FS=10.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=5.48;ReadPosRankSum=-2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:295,0,1700 -chr2 49571046 . CAT C 3217.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:3255,128,0 -chr2 49571127 . A G 3238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.490;DP=183;FS=16.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,92:183:99:3267,0,3374 -chr2 49571156 . C CA 1480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-1.229;DP=256;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,72:256:99:1518,0,6678 -chr2 49571356 . A G 4971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.178;DP=258;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,154:258:99:5000,0,3642 -chr2 49573965 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=2.473;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:396,0,345 -chr2 49593920 . T G 5545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.008;DP=194;FS=4.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=28.59;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,144:184:99:5574,0,547 -chr2 49594167 . G T 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=-3.828;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:897,0,1679 -chr2 49601648 . T A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-1.734;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:396,0,1708 -chr2 49607161 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-3.964;DP=53;FS=15.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=5.92;ReadPosRankSum=-4.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:342,0,2314 -chr2 49607423 . G T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.742;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:612,0,535 -chr2 49607535 . A G 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.638;DP=69;FS=13.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1452,0,874 -chr2 49627687 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:412,0,364 -chr2 49627818 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-2.081;DP=33;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:414,0,790 -chr2 49628928 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=1.369;DP=40;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:512,0,845 -chr2 49630086 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.876;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:537,0,1289 -chr2 49630484 . A G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.472;DP=31;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:625,0,358 -chr2 49631627 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-0.722;DP=22;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:360,0,413 -chr2 49634428 . A AC 810.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.157;DP=24;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.932;QD=33.78;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:29:848,29,0 -chr2 49847809 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.087;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,385 -chr2 49912126 . T A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.873;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:558,0,103 -chr2 49913020 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.212;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:829,0,177 -chr2 49913950 . GA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.101;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:273,0,464 -chr2 49913953 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,464 -chr2 49915341 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.531;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=22.40;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:297,0,139 -chr2 49916744 . C G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr2 49919862 . T A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.178;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:414,0,313 -chr2 49920189 . C A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.600;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:318,0,470 -chr2 49921675 . A T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:355,0,188 -chr2 50011805 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.218;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:483,0,418 -chr2 50020056 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:448,0,487 -chr2 50020080 . A C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:279,0,417 -chr2 50020207 . G C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,387 -chr2 50021484 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=27.58;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:442,0,346 -chr2 50130258 . C T 1639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.509;DP=86;FS=4.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1668,0,1294 -chr2 50139500 . T A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.725;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=21.65;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:418,0,240 -chr2 50154422 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-1.241;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:411,0,657 -chr2 50166913 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=1.137;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:352,0,516 -chr2 50179229 . GAT G 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.929;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:373,0,679 -chr2 50179440 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.285;DP=75;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:236,0,2652 -chr2 50179947 . G A 2450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=1.317;DP=126;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:2479,0,1716 -chr2 50185944 . G T 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.214;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1619,0,1034 -chr2 50192465 . C T 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.386;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1726,0,1803 -chr2 50206529 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:260,0,99 -chr2 50380183 . A T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.558;DP=33;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:591,0,592 -chr2 50394271 . A G 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=1.156;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.249;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:832,0,799 -chr2 50406503 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.139;DP=18;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:346,0,197 -chr2 50413580 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:385,0,584 -chr2 50414440 . T C 231.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:260,0,18 -chr2 50415125 . C T 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-1.804;DP=46;FS=9.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:1161,0,407 -chr2 50417588 . T C 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.844;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:526,0,626 -chr2 50422236 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.893;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:815,0,488 -chr2 50431229 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:363,0,277 -chr2 50434546 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:368,0,986 -chr2 50434549 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:368,0,989 -chr2 50453589 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.537;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,378 -chr2 50453721 . A AT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.86;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,207 -chr2 50482752 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-1.041;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=24.23;ReadPosRankSum=-1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:755,0,228 -chr2 50501769 . C A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,324 -chr2 50536101 . C T 682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:711,54,0 -chr2 50647405 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.329;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:749,0,676 -chr2 50659285 . A G 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=1.119;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:955,0,363 -chr2 50661394 . CGGTACCCAAACACATACCGGCACTGACTTTCCATTAATATGAGATGACGCATGCAAAAACAGATTTCAGGCAGTTGCTGTGTGCTCTGTGCTTATGTACTCACGGCTGCAGTACTGCTGTGCTGTTTTTTTCA C 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.561;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:99:1308,0,1301 -chr2 50665304 . A T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=-1.225;DP=34;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:523,0,612 -chr2 50670606 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,257 -chr2 50670626 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:395,0,436 -chr2 50670742 . G T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:418,0,304 -chr2 50671858 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:345,0,52 -chr2 50689273 . C T 2167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-0.481;DP=108;FS=4.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,67:108:99:2196,0,1355 -chr2 50799965 . CA C 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.454;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:481,0,108 -chr2 50800091 . G A 2366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.590;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:2395,0,2364 -chr2 50844693 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.544;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:241,0,636 -chr2 50844969 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=-0.102;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:707,0,695 -chr2 50844990 . C T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.863;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:785,0,825 -chr2 50845067 . C A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.445;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:764,0,611 -chr2 50847540 . TG T 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-1.871;DP=53;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:278,0,2372 -chr2 50847807 . T C 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.729;DP=27;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=28.44;ReadPosRankSum=1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:796,0,197 -chr2 50847935 . TA T 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=1.036;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:423,0,117 -chr2 50864503 . C T 215.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:244,0,20 -chr2 50966718 . A C 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1086,75,0 -chr2 50966757 . T C 2252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2281,166,0 -chr2 50968774 . G A 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-0.195;DP=57;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,43:57:99:1652,0,878 -chr2 50968780 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.271;DP=64;FS=4.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:343,0,3532 -chr2 50973279 . T A 2972.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3001,219,0 -chr2 50982316 . T C 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=-0.005;DP=77;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1551,0,1102 -chr2 50982451 . T C 2762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-0.346;DP=70;FS=3.136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=23.75;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:2791,205,0 -chr2 50982454 . T C 3119.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3148,211,0 -chr2 50985324 . A G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.426;DP=55;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1084,0,866 -chr2 50985369 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=1.309;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:759,0,366 -chr2 50987940 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.780;DP=62;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:333,0,1628 -chr2 50988881 . A G 2866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:2895,211,0 -chr2 51004374 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.783;DP=45;FS=6.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:767,0,815 -chr2 51006501 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.652;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:846,0,872 -chr2 51018548 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=19.98;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,186 -chr2 51020525 . G A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr2 51024373 . A C 1287.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1316,96,0 -chr2 51024525 . T A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr2 51347270 . T C 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-1.674;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:464,0,402 -chr2 51541126 . TA T 536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.376;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:574,0,829 -chr2 51541695 . A G 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.059;DP=112;FS=7.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1976,0,1721 -chr2 51582896 . A G 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.283;DP=71;FS=8.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1153,0,1353 -chr2 51609512 . A G 2981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=2.593;DP=137;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=21.76;ReadPosRankSum=2.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,88:137:99:3010,0,1648 -chr2 51663339 . A T 470.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:36:499,36,0 -chr2 51722544 . C T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=1.052;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:585,0,507 -chr2 51737596 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-0.664;DP=55;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:634,0,1183 -chr2 51737677 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-0.817;DP=47;FS=7.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=4.74;ReadPosRankSum=3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:251,0,1337 -chr2 51737999 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.441;DP=36;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=7.30;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:291,0,2325 -chr2 51753898 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:318,0,304 -chr2 51754440 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=-2.119;DP=33;FS=8.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:440,0,713 -chr2 51754987 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.692;DP=31;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:529,0,538 -chr2 51755050 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.528;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:521,0,461 -chr2 51765148 . T A 2471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=-5.583;DP=305;FS=0.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,92:305:99:2500,0,17723 -chr2 52213098 . A G 222.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:251,0,14 -chr2 52217393 . G C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,155 -chr2 52217394 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,155 -chr2 52218831 . C A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.550;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=28.88;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:577,0,120 -chr2 52218861 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:309,0,355 -chr2 52219158 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.150;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:618,0,265 -chr2 52219161 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:618,0,265 -chr2 52319171 . T A 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.751;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,46:79:99:1719,0,2591 -chr2 52319178 . A T 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.490;DP=79;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,45:79:99:1719,0,2591 -chr2 52319328 . A G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.190;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=28.03;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:785,0,316 -chr2 52319498 . A G 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr2 52326999 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.043;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:66:686,0,66 -chr2 52331237 . G A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.153;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1064,0,913 -chr2 52339324 . G A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=1.476;DP=55;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1087,0,809 -chr2 52349478 . T C 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.185;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1065,0,937 -chr2 52352026 . GA G 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.137;DP=29;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:319,0,247 -chr2 52386773 . T G 433.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=33.32;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:4:460,0,4 -chr2 52389641 . G A 2211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=-6.956;DP=295;FS=19.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,90:294:99:2240,0,10035 -chr2 52408726 . G A 8377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.751;DP=485;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,260:485:99:8406,0,7933 -chr2 52411516 . A G 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.910;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1857,0,1623 -chr2 52411680 . T C 2588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-2.739;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,74:113:99:2617,0,1296 -chr2 52518447 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:304,0,256 -chr2 52518687 . A T 577.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.102;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=33.97;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:8:605,8,0 -chr2 52519140 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:45:464,0,45 -chr2 52519236 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=2.758;DP=14;FS=10.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=25.48;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:385,0,132 -chr2 52524731 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=1.562;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:266,0,575 -chr2 52524741 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=1.485;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:266,0,575 -chr2 52525932 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.682;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:290,0,242 -chr2 52526341 . T A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.570;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:749,0,263 -chr2 52670187 . G T 320.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:349,0,14 -chr2 52670304 . G A 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:524,39,0 -chr2 52670338 . G A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr2 52677812 . G A 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 -chr2 52680653 . C T 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 -chr2 52704326 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr2 52704390 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:322,0,49 -chr2 52704405 . A G 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr2 52705183 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-1.565;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=32.10;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:38:574,0,38 -chr2 52705260 . G A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-1.752;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:670,0,105 -chr2 52706176 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:273,0,101 -chr2 52706292 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.594;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=32.58;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:45:517,0,45 -chr2 52707637 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.170;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:507,0,129 -chr2 52708359 . G A 305.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:10:333,0,10 -chr2 52708361 . G A 305.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.91;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:10:333,0,10 -chr2 52709032 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,139 -chr2 52709083 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:337,0,93 -chr2 52709104 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=1.268;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=26.67;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:77:375,0,77 -chr2 52711826 . G T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:313,0,403 -chr2 52712279 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:450,0,248 -chr2 52712443 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:253,18,0 -chr2 52712837 . C T 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:743,51,0 -chr2 52713944 . A T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.401;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:322,0,506 -chr2 52714624 . C A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,244 -chr2 52714811 . T A 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:298,30,0 -chr2 52714992 . G A 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:51:722,51,0 -chr2 52715129 . T A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.233;DP=30;FS=5.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:624,0,900 -chr2 52715220 . C T 1171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.690;DP=28;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:1200,0,134 -chr2 52715367 . C T 1312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.732;DP=31;FS=4.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=33.60;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:97:1341,0,97 -chr2 52715820 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=2.281;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:259,0,220 -chr2 52716228 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:347,0,141 -chr2 52760377 . C T 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:417,30,0 -chr2 52839032 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,135 -chr2 52839324 . G A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr2 52840453 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:276,0,56 -chr2 52842353 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:282,0,64 -chr2 52919144 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.486;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:520,0,648 -chr2 52926643 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.481;DP=36;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:528,0,698 -chr2 52935728 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.234;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:675,0,706 -chr2 52938194 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-0.462;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:428,0,444 -chr2 52938608 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:379,0,258 -chr2 52939951 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:319,0,55 -chr2 52940337 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:342,0,126 -chr2 52942481 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.369;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:477,0,160 -chr2 52942484 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:287,0,541 -chr2 52942752 . A G 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:302,21,0 -chr2 52942824 . A G 697.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=25.68;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:15:726,15,0 -chr2 52943394 . C CA 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.227;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:304,0,99 -chr2 52955103 . G T 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.798;DP=41;FS=5.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:1009,0,319 -chr2 53014401 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,332 -chr2 53014403 . C A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.566;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,332 -chr2 53028586 . C T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-0.268;DP=29;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=27.03;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:812,0,211 -chr2 53029034 . C CA 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.916;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:440,0,190 -chr2 53029509 . C CA 1131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.209;DP=62;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.244;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,39:62:99:1169,0,685 -chr2 53029686 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=-1.892;DP=23;FS=26.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:446,0,371 -chr2 53030008 . C A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.812;DP=37;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:603,0,1664 -chr2 53030161 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.408;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:285,0,2591 -chr2 53030610 . G C 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.790;DP=48;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=18.72;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:927,0,783 -chr2 53030859 . G T 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.101;DP=81;FS=9.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,49:81:99:1710,0,1144 -chr2 53030962 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=1.778;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:266,0,2137 -chr2 53031315 . G A 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-2.350;DP=45;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=18.22;ReadPosRankSum=3.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:848,0,1836 -chr2 53031320 . A T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-2.373;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=18.63;ReadPosRankSum=3.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:848,0,1836 -chr2 53031651 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.079;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:345,0,574 -chr2 53032462 . C T 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:502,36,0 -chr2 53034586 . T A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.198;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=18.55;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1160,0,946 -chr2 53035331 . T TA 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.513;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:420,0,378 -chr2 53035421 . G A 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-0.995;DP=51;FS=4.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1181,0,610 -chr2 53091335 . T A 1776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.071;DP=66;FS=5.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,47:66:99:1805,0,493 -chr2 53091371 . C A 1639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.023;DP=62;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,44:62:99:1668,0,468 -chr2 53091819 . T G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=1.716;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:462,0,397 -chr2 53092810 . T G 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.134;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=16.02;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:797,0,884 -chr2 53093143 . C G 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=1.056;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=22.07;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1198,0,1584 -chr2 53093399 . G A 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.196;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:762,0,716 -chr2 53093542 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-1.133;DP=36;FS=5.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:308,0,950 -chr2 53093632 . T A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.320;DP=37;FS=10.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:693,0,621 -chr2 53094382 . TG T 763.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.573;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:801,0,795 -chr2 53094712 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=2.477;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:783,0,698 -chr2 53094759 . A G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=2.227;DP=44;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:840,0,680 -chr2 53095298 . A T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=-0.404;DP=53;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=19.30;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:1051,0,803 -chr2 53095808 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.461;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:470,0,707 -chr2 53097358 . A T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.758;DP=35;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:504,0,746 -chr2 53098407 . A G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=3.014;DP=21;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=18.85;ReadPosRankSum=-1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:424,0,1280 -chr2 53098758 . T A 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=1.144;DP=71;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,43:66:99:1053,0,769 -chr2 53099070 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.308;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:857,0,776 -chr2 53104431 . C A 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=-1.707;DP=74;FS=7.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=18.48;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:1396,0,1114 -chr2 53178869 . G T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=3.180;DP=35;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=23.59;ReadPosRankSum=-2.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:854,0,295 -chr2 53368759 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:229,0,211 -chr2 53408909 . CAA C,CAAAA 242.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,5:9:99:327,191,267,163,0,217 -chr2 53408954 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=26.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:370,0,92 -chr2 53409134 . G C 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.334;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=28.96;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1042,0,189 -chr2 53410793 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=25.91;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:89:391,0,89 -chr2 53436901 . A C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-1.681;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=21.24;ReadPosRankSum=-1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:368,0,606 -chr2 53437996 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=-0.265;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:383,0,742 -chr2 53806299 . GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT G 289.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:44:327,44,0 -chr2 54261740 . TC T 478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:516,51,0 -chr2 54261821 . GT G 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.522;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:452,0,450 -chr2 54402991 . ACT A 501.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:537,0,2 -chr2 54665595 . A T 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:855,60,0 -chr2 54824994 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-1.133;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:415,0,166 -chr2 54827094 . A C 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:804,57,0 -chr2 55022926 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.416;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:566,0,503 -chr2 55128810 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-1.393;DP=36;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:370,0,917 -chr2 55129336 . T C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr2 55388801 . A AC 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=-2.199;DP=108;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,34:103:99:493,0,2312 -chr2 55429093 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.481;DP=25;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.727;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:234,0,1130 -chr2 55429160 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.268;DP=20;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:255,0,513 -chr2 55430429 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:419,0,210 -chr2 55430463 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:244,0,228 -chr2 55804474 . C A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.320;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:385,0,394 -chr2 55804602 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.313;DP=22;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=28.81;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:662,0,100 -chr2 55842081 . C T 4162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=4.443;DP=245;FS=9.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,115:245:99:4191,0,4285 -chr2 55844121 . C T 5618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.654;DP=325;FS=7.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,175:325:99:5647,0,5164 -chr2 55849590 . G A 2057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=1.176;DP=438;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,103:438:99:2086,0,12928 -chr2 55852212 . A C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=-0.885;DP=182;FS=4.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,46:181:99:433,0,8233 -chr2 55852530 . C T 2285.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-1.052;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=31.58;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2314,163,0 -chr2 55852572 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=2.431;DP=72;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:374,0,4195 -chr2 55852895 . CA C 1307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-2.344;DP=149;FS=6.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1345,0,1145 -chr2 55881535 . A G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=1.540;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:554,0,115 -chr2 55883798 . C A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.783;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:638,0,104 -chr2 55909460 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:250,0,123 -chr2 55912669 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:296,0,130 -chr2 55912832 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,344 -chr2 55913559 . GA G 241.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:23:277,23,0 -chr2 55917129 . G C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:321,0,63 -chr2 55964840 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.620;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:522,0,533 -chr2 55966245 . T C 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.632;ClippingRankSum=-0.312;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:944,0,614 -chr2 55967096 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-1.544;DP=75;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1095,0,1489 -chr2 55967629 . T G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=34.12;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:540,0,121 -chr2 55967748 . G A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-0.846;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:1000,0,799 -chr2 55967884 . C G 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-0.293;DP=46;FS=7.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1075,0,794 -chr2 55968064 . A G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.207;DP=43;FS=9.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:774,0,731 -chr2 55968113 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.132;DP=37;FS=6.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:282,0,1041 -chr2 55968951 . C G 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-1.392;DP=64;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,34:64:99:1152,0,1090 -chr2 55969329 . T A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.509;DP=57;FS=6.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:859,0,1131 -chr2 55969356 . G A 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.270;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1383,0,2538 -chr2 55969497 . G T 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=1.024;DP=98;FS=6.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1654,0,1770 -chr2 55993561 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.060;DP=46;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:387,0,1223 -chr2 55996272 . CGG C 229.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:267,22,0 -chr2 55997073 . T A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr2 55997643 . GA G 548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:586,51,0 -chr2 56009795 . G T 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.980;DP=70;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,48:70:99:1829,0,593 -chr2 56012562 . A G 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=-0.062;DP=55;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1210,0,626 -chr2 56051800 . G T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-1.480;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:72:502,0,72 -chr2 56196773 . A T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.019;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:520,0,2015 -chr2 56197332 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=-1.488;DP=46;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=6.21;ReadPosRankSum=2.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:314,0,1285 -chr2 56197472 . T A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-0.376;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:755,0,1599 -chr2 56200730 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:305,0,56 -chr2 56225288 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:274,0,264 -chr2 56254515 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:385,0,294 -chr2 56307219 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:339,0,159 -chr2 56307244 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:231,0,256 -chr2 56339999 . GA G 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr2 56340548 . G GT 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-1.195;DP=22;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:422,0,265 -chr2 56340949 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:296,0,140 -chr2 56341542 . G A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=1.522;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=27.82;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:974,0,238 -chr2 56342131 . C CT 745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.952;DP=25;FS=7.368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:36:783,36,0 -chr2 56342532 . TA T 386.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-2.404;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=19.34;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:29:424,0,29 -chr2 56342720 . A G 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.595;DP=36;FS=4.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=33.13;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:44:1221,0,44 -chr2 56342968 . T G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.012;DP=49;FS=4.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:774,0,819 -chr2 56343018 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.104;DP=54;FS=8.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:400,0,1344 -chr2 56343408 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=1.222;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:238,0,787 -chr2 56343558 . G T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-0.296;DP=61;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:942,0,964 -chr2 56371292 . A G 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.559;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=29.47;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:706,0,107 -chr2 56372360 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:232,0,59 -chr2 56372462 . A G 659.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.306;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=25.79;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:16:688,16,0 -chr2 56372503 . T A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.489;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:368,0,350 -chr2 56372991 . C G 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=1.299;DP=46;FS=5.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=28.30;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,34:43:99:1330,0,165 -chr2 56375011 . C G 1327.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.343;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=34.94;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:36:39:1356,39,0 -chr2 56375023 . A T 1214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=33.75;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:18:1243,18,0 -chr2 56394692 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.973;DP=187;FS=10.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=3.74;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,42:187:99:728,0,5096 -chr2 56405064 . A T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.050;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=24.65;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:472,0,426 -chr2 56405271 . A T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.321;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:574,0,397 -chr2 56405440 . TA T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.896;DP=18;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:324,0,105 -chr2 56405519 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:259,0,229 -chr2 56405693 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:256,0,361 -chr2 56418741 . C T 3455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-0.950;DP=188;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,104:187:99:3484,0,3012 -chr2 56426210 . G A 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-0.800;DP=104;FS=6.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:2018,0,1600 -chr2 56426791 . T C 2282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=1.427;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:2311,0,2213 -chr2 56429811 . T C 2839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-1.042;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,89:163:99:2868,0,2572 -chr2 56431772 . A G 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=2.351;DP=172;FS=12.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,55:172:99:1479,0,4475 -chr2 56446340 . C T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.134;DP=156;FS=1.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,42:156:99:929,0,4084 -chr2 56446923 . A G 2150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.794;DP=122;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:2179,0,2128 -chr2 56447373 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.214;DP=119;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:617,0,4165 -chr2 56447601 . CT C 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.304;DP=82;FS=3.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:290,0,2300 -chr2 56447757 . A T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.266;ClippingRankSum=-0.575;DP=131;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,34:131:99:860,0,3850 -chr2 56447787 . C T 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-2.167;DP=183;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:1118,0,5255 -chr2 56448010 . AG A 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.110;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,45:66:99:1158,0,416 -chr2 56565958 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=20.11;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:350,0,239 -chr2 56588037 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-0.921;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:465,0,193 -chr2 56639888 . C A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=-0.980;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=28.53;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:827,0,138 -chr2 56639986 . C A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.903;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:576,0,248 -chr2 56639988 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:576,0,248 -chr2 56674090 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.876;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:268,0,304 -chr2 56687834 . C A 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=1.346;DP=37;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:909,0,348 -chr2 56743348 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-2.488;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,282 -chr2 56750604 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr2 56765179 . T G 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr2 56779981 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=30.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:271,0,135 -chr2 56779984 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=30.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:271,0,135 -chr2 56791814 . T C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr2 56873674 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:464,0,242 -chr2 56873950 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,429 -chr2 56874215 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:485,0,316 -chr2 56874333 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,412 -chr2 56875000 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 -chr2 56875771 . G C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:242,0,119 -chr2 56887152 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.892;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:744,0,490 -chr2 56912160 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:467,0,425 -chr2 56918538 . A G 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:575,39,0 -chr2 56918539 . C T 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:575,39,0 -chr2 56919799 . A T 244.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:273,0,22 -chr2 56920824 . G A 497.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:50:701,50,0 -chr2 56921836 . AT A 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.227;DP=17;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:42:316,0,42 -chr2 56928315 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-0.156;DP=52;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:844,0,876 -chr2 57005783 . A AT 294.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:332,27,0 -chr2 57026883 . TCTGAGGAGAAACAAGATCTGCATATTTCTGGAAAGTGTAACGCATGCGTGCCGAAAAGGAAATAAGATGTCATAC T 3174.72 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=1.153;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=26.73;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,75:85:99:3212,0,2487 -chr2 57154073 . T C 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:660,45,0 -chr2 57190117 . A G 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:669,45,0 -chr2 57190118 . C T 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:669,45,0 -chr2 57199331 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.870;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:326,0,657 -chr2 57201244 . C T 1151.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DP=30;FS=4.357;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.31;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1180,87,0 -chr2 57203508 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:38:393,0,38 -chr2 57371640 . GCTGTGGGAATAAAGCAGTATAGAAGAGAATCAGTGCATTAAACTAGAGGACAAGTGATAACTGAGAATAGAGAAAGCATTGACTGAC G 19305.24 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.661;DP=508;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,497:508:99:21016,0,1304 -chr2 57371805 . G A 7044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=1.095;DP=392;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,216:391:99:7073,0,13880 -chr2 57526940 . AT A 444.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.383;DP=23;FS=2.643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=19.33;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,19:22:7:481,7,0 -chr2 57527274 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=2.419;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:244,0,627 -chr2 57530684 . AT A 218.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 -chr2 57530810 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=24.05;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:413,0,141 -chr2 57531439 . G GA 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.499;DP=40;FS=4.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:498,0,409 -chr2 57533039 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.921;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:456,0,592 -chr2 57536645 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:380,0,423 -chr2 57557560 . C A 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.431;DP=54;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:1074,0,760 -chr2 57557634 . C A 2554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.877;DP=145;FS=1.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:2583,0,2256 -chr2 57619224 . T G 3215.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.807;DP=127;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,84:127:99:3244,0,3127 -chr2 57630296 . T A 1084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.468;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.574;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1113,0,1244 -chr2 57630480 . G A 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=5.068;DP=51;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.323;QD=31.13;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,38:51:99:1616,0,599 -chr2 57639484 . T C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr2 57645323 . G C 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=4.717;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=12.86;ReadPosRankSum=-4.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:993,0,1556 -chr2 57689417 . C T 3497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.641;DP=192;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=18.22;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,105:191:99:3526,0,3043 -chr2 57698550 . C T 3392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=1.996;DP=166;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,102:166:99:3421,0,2202 -chr2 57701969 . G T 3003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.508;DP=161;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=18.66;ReadPosRankSum=3.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,86:160:99:3032,0,5583 -chr2 57701970 . G T 3003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.332;DP=161;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=18.66;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:3032,0,5583 -chr2 57702518 . A T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.914;DP=77;FS=3.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1068,0,1715 -chr2 57702816 . C A 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.041;DP=82;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,56:82:99:2173,0,727 -chr2 57702990 . C G 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=3.963;DP=74;FS=17.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:1306,0,1329 -chr2 57703389 . G A 1673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.088;DP=57;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=29.36;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1702,0,2147 -chr2 57703408 . G A 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=1.246;DP=77;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=21.69;ReadPosRankSum=-3.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:1698,0,2147 -chr2 57703536 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-3.010;DP=70;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=4.18;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,5:70:99:321,0,7359 -chr2 57703721 . G T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=3.377;DP=19;FS=17.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:563,0,239 -chr2 57704312 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:302,0,92 -chr2 57704786 . TG T 2051.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-1.732;DP=56;FS=3.786;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=29.26;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,54:55:99:2089,155,0 -chr2 57705280 . T A 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1453,102,0 -chr2 57705512 . A G 1647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1676,115,0 -chr2 57705522 . A T 763.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.904;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:53:792,53,0 -chr2 57705679 . GA G,GAA 212.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,4:11:99:297,115,124,210,0,247 -chr2 57705846 . A C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.516;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:747,0,377 -chr2 57706576 . C CCACACA 666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:48:704,48,0 -chr2 57707169 . T C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.310;DP=71;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:1032,0,1485 -chr2 57707188 . C CT 708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.025;DP=76;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:746,0,864 -chr2 57707341 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=1.393;DP=50;FS=10.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:321,0,1445 -chr2 57733275 . G T 6248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.716;DP=365;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,193:364:99:6277,0,6156 -chr2 57745781 . T C 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -chr2 57745802 . C A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr2 57762303 . A AT 2878.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-1.336;DP=119;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=24.19;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,86:113:99:2916,0,408 -chr2 57809831 . T C 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr2 57888898 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr2 57888903 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr2 58048519 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=29.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:241,0,105 -chr2 58048540 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:241,0,105 -chr2 58049497 . A AT 215.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:253,27,0 -chr2 58057354 . AT A 334.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:372,39,0 -chr2 58100787 . G A 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 -chr2 58179150 . A C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr2 58187095 . C G 237.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:266,0,18 -chr2 58187131 . T C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:403,0,52 -chr2 58187239 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=34.68;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:51:375,0,51 -chr2 58187240 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=34.68;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:51:375,0,51 -chr2 58187292 . G A 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:454,36,0 -chr2 58187679 . T A 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.321;DP=27;FS=3.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=26.03;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1096,78,0 -chr2 58188225 . T C 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 -chr2 58189485 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.118;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=31.76;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:80:600,0,80 -chr2 58190337 . T A 345.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=34.59;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:374,0,15 -chr2 58190600 . C CT 345.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:383,13,0 -chr2 58190724 . A T 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-1.576;DP=22;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=34.02;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:887,63,0 -chr2 58190805 . T C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr2 58190915 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=30.13;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:89:450,0,89 -chr2 58190955 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:320,0,102 -chr2 58305593 . G T 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:471,36,0 -chr2 58316278 . T C 811.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:840,60,0 -chr2 58341279 . G A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr2 58343207 . G C 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 -chr2 58343522 . G A 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 -chr2 58414302 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=1.708;DP=81;FS=4.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,15:81:99:244,0,2588 -chr2 58416360 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:444,33,0 -chr2 58416370 . A G 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr2 58417771 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.756;DP=117;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,19:113:99:267,0,3553 -chr2 58418001 . C T 4647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:4676,331,0 -chr2 58418023 . C T 4861.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:4890,352,0 -chr2 58431744 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=23.90;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:315,0,89 -chr2 58431776 . C G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:424,33,0 -chr2 58431886 . T C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr2 58431893 . T C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr2 58433063 . A C 257.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:286,0,16 -chr2 58433072 . A T 257.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:16:286,0,16 -chr2 58436240 . C T 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:439,30,0 -chr2 58687175 . C CA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.379;DP=48;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:247,0,891 -chr2 58688876 . A G 905.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.050;DP=25;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=29.39;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:27:934,27,0 -chr2 58688931 . T C 1202.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=1.856;DP=35;FS=2.483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=34.37;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:20:1231,20,0 -chr2 58688980 . C T 1731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=2.282;DP=44;FS=8.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=32.28;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1760,126,0 -chr2 58689148 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=16.29;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:240,0,208 -chr2 58689208 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=1.670;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,499 -chr2 58689213 . T A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:273,0,499 -chr2 58689734 . T A 1446.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=2.556;DP=39;FS=10.492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:25:1475,25,0 -chr2 58689938 . TTG T 882.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.600;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:76:920,76,0 -chr2 58698407 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=20.20;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:311,0,130 -chr2 58710222 . T A 775.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=-1.135;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:16:804,0,16 -chr2 58710269 . G A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr2 58712164 . A T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.805;DP=23;FS=7.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:646,0,228 -chr2 58712372 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,137 -chr2 58712758 . C G 234.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:263,0,21 -chr2 58719104 . C T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.371;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:754,0,115 -chr2 58719124 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-1.036;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=27.17;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:789,0,118 -chr2 58732729 . A G 412.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=34.36;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:438,0,1 -chr2 58732762 . G T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:672,51,0 -chr2 58735190 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,296 -chr2 58741356 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:349,0,128 -chr2 58759753 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:89:268,0,89 -chr2 59216728 . C T 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.156;DP=48;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:1231,0,383 -chr2 59216749 . G C 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.292;DP=42;FS=2.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1114,0,294 -chr2 59239674 . C A 1360.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.208;DP=43;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:1:1386,0,1 -chr2 59282875 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr2 59493866 . A G 16839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.888;ClippingRankSum=0.498;DP=541;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=31.13;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,461:540:99:16868,0,2510 -chr2 59493872 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=-1.983;DP=507;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=0.45;ReadPosRankSum=3.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:438,69:507:99:255,0,34642 -chr2 59522052 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.363;DP=32;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=33.71;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1107,0,198 -chr2 59522196 . C G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=3.609;DP=33;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=14.81;ReadPosRankSum=-4.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:517,0,699 -chr2 59522367 . A C 2407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.390;DP=84;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=28.66;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,70:84:99:2436,0,158 -chr2 59550418 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr2 59550434 . C G 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -chr2 59603113 . G T 7437.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-1.719;DP=258;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,225:258:25:7466,0,25 -chr2 59611517 . C T 226.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:255,0,18 -chr2 59619846 . C T 4051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.959;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,119:149:99:4080,0,519 -chr2 59619914 . G GCCATAATGATTTCGTGGCC 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,18:105:99:409,0,3520 -chr2 59623042 . AAGGTGCGTCTCACACACACCTGCAGAAAACCTGAGTGATGTCACTTCCTGTTTCTGAATGCTGTTTCTGTGTC A 3255.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.420;DP=86;FS=2.104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=25.00;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,82:86:99:3293,246,0 -chr2 59623744 . T G 2260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.267;DP=80;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,60:78:99:2289,0,350 -chr2 59630567 . TCTGTGGAGCAAAGTAGAGGGTTAGCGTGCGCAGACACACACACACACACACACACACAGGCACACACAGGGCTGCAGTACAGTAC T 5191.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-0.142;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.71;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,113:117:99:5229,444,0 -chr2 59639593 . G T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-1.863;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=29.15;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:33:553,0,33 -chr2 59660985 . G C 1056.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1085,78,0 -chr2 59661020 . G A 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1095,78,0 -chr2 59677686 . C G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:365,0,275 -chr2 59681378 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr2 59681379 . G C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr2 59699050 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.365;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:232,0,986 -chr2 59699061 . G A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.242;DP=40;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1066,0,284 -chr2 59700677 . AT A 1544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.301;DP=66;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,49:58:77:1582,0,77 -chr2 59709500 . T C 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.092;DP=209;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,50:209:99:1007,0,5888 -chr2 59878210 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.333;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:340,0,182 -chr2 59977427 . T C 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-2.264;DP=42;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.30;ReadPosRankSum=2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:755,0,896 -chr2 60049852 . C T 684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:713,51,0 -chr2 60055448 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr2 60205353 . A C 757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:786,54,0 -chr2 60205658 . C G 1146.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-2.058;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=33.73;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:24:1175,0,24 -chr2 60221215 . T A 288.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:317,24,0 -chr20 30994 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:307,0,376 -chr20 31355 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:257,0,104 -chr20 31732 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,300 -chr20 135340 . GTGTGTGTGTGTT G 935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:78:973,78,0 -chr20 143880 . ACG A 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-3.460;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=16.81;ReadPosRankSum=3.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:676,0,449 -chr20 144795 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.568;DP=33;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:279,0,836 -chr20 172538 . G T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-2.242;DP=45;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:749,0,380 -chr20 172550 . G A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.251;DP=58;FS=7.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1087,0,873 -chr20 173021 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.027;DP=94;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,18:86:99:283,0,2525 -chr20 173887 . TCCTGTGAGAAACACACACACACAGTCATGAACACACACACACACACACACTCTGCTGAAGAAGAGCACTAGTGTCTGGCTCTTATTATCCCGTCCACACA T 5471.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.545;DP=128;FS=3.550;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,121:128:99:5509,456,0 -chr20 180397 . A AAC 457.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:495,42,0 -chr20 201612 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.790;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:462,0,359 -chr20 218747 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.527;DP=118;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,20:118:99:271,0,3703 -chr20 219560 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-1.048;DP=90;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:382,0,2540 -chr20 239845 . G C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:609,0,351 -chr20 239919 . A G 1935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.111;DP=108;FS=5.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1964,0,1877 -chr20 239984 . T C 4874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-1.077;DP=191;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=25.52;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,133:191:99:4903,0,1496 -chr20 250399 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.244;DP=180;FS=7.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,35:173:99:613,0,5304 -chr20 250543 . G GGCTCT 5031.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.166;DP=137;FS=14.502;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=29.12;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,105:117:99:5069,128,0 -chr20 253876 . A T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.525;DP=128;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,42:127:99:1135,0,5062 -chr20 253937 . T C 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=-2.645;DP=69;FS=4.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=14.66;ReadPosRankSum=3.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1040,0,1245 -chr20 253963 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=3.095;DP=94;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:245,0,1911 -chr20 258204 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.272;DP=203;FS=4.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,40:203:99:673,0,6128 -chr20 264492 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.294;DP=221;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,41:215:99:690,0,6799 -chr20 268418 . G C 2795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=1.919;DP=165;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:2824,0,2720 -chr20 298244 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.992;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,419 -chr20 299785 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:279,0,136 -chr20 420139 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=1.199;DP=32;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:290,0,836 -chr20 453662 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.948;DP=83;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:471,0,3036 -chr20 461659 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.471;DP=29;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:281,0,1134 -chr20 463156 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.878;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,579 -chr20 556909 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.447;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:752,0,939 -chr20 572562 . A T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=-0.149;DP=50;FS=4.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:754,0,2764 -chr20 572567 . A T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=-0.544;DP=49;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:754,0,2727 -chr20 574410 . G T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=-0.345;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:589,0,721 -chr20 595183 . G T 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.251;DP=241;FS=10.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,56:241:99:1186,0,7154 -chr20 605917 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=3.838;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=21.51;ReadPosRankSum=-2.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:480,0,669 -chr20 705073 . TGGTGAGTTCTCTGTGTGAGTTTGATTAGCCTCAATCTCTGCAGTTTTACGAATATTTCGTCTTCACTTATTTTGCTGCTGTTTTCA T 1093.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=2.291;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=27.34;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:1131,0,3411 -chr20 735297 . C T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.528;DP=129;FS=0.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,29:129:99:603,0,3813 -chr20 779067 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.340;DP=79;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:302,0,3103 -chr20 799234 . G T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=1.241;DP=102;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:644,0,2796 -chr20 875387 . TCTGTTAAGCAAACGAGAGGAAAAATGAGCCGGGTGACGGTGTTTCTGGAGGTCAGTATGAAAGGGTGAGGGTTTGAAC T 3305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.396;DP=100;FS=2.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=33.06;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,89:92:99:3343,274,0 -chr20 898594 . A G 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-1.986;DP=83;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:457,0,2299 -chr20 906415 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-0.948;DP=90;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:268,0,2820 -chr20 907718 . CGTCCACCTACAAGCAAACGTAATCAGATAATAA C 755.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.105;DP=106;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:793,0,4408 -chr20 907722 . CACCTACAAGCAAACGTAATCAGATAATAAATCCACAGGAAGCATTACGAAGCATGTATCAGAACTGAAGTGTGTTTGT C 2062.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.578;DP=102;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,63:100:99:2100,0,3129 -chr20 907755 . CACAGGAAGCATTACGAAGCATGTATCAGAACTGAAGTGTGTTTGT C 762.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.177;DP=96;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:800,0,4408 -chr20 923779 . A C 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 -chr20 926079 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:233,0,292 -chr20 932800 . A G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.121;DP=37;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:625,0,1108 -chr20 932905 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=-1.442;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,10:45:99:267,0,2352 -chr20 932906 . T C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.082;DP=85;FS=4.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:817,0,1421 -chr20 954949 . C A 388.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:416,0,11 -chr20 954987 . C T 362.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.96;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:390,0,7 -chr20 967131 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.224;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:392,0,671 -chr20 1143264 . A G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=-0.636;DP=49;FS=6.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:728,0,1999 -chr20 1143270 . G T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.463;ClippingRankSum=1.051;DP=51;FS=7.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:991,0,1606 -chr20 1150329 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=34.56;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:443,0,454 -chr20 1150338 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=26.24;ReadPosRankSum=2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:435,0,454 -chr20 1200079 . A C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.866;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,149 -chr20 1213598 . T C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.352;DP=51;FS=2.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=14.17;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:751,0,969 -chr20 1222188 . C G 1292.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:93:1321,93,0 -chr20 1227442 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=-0.581;DP=30;FS=11.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:303,0,714 -chr20 1265432 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:310,0,221 -chr20 1267694 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-2.691;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=5.32;ReadPosRankSum=2.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:390,0,2396 -chr20 1280370 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-1.648;DP=41;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:303,0,1718 -chr20 1280760 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-1.031;DP=45;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:547,0,974 -chr20 1310942 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,452 -chr20 1311402 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.103;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:296,0,919 -chr20 1313740 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.550;DP=21;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:378,0,365 -chr20 1318939 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.354;DP=22;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:317,0,393 -chr20 1319038 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:338,24,0 -chr20 1340081 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.112;DP=37;FS=6.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:475,0,826 -chr20 1343402 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-0.755;DP=77;FS=5.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:347,0,4791 -chr20 1343408 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.231;DP=81;FS=6.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:347,0,4791 -chr20 1348166 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=-0.805;DP=93;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:268,0,2889 -chr20 1362087 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=1.221;DP=68;FS=4.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:268,0,2102 -chr20 1373171 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=1.617;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:268,0,1086 -chr20 1377544 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.286;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:334,0,376 -chr20 1393468 . C G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:301,0,491 -chr20 1393471 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,491 -chr20 1393623 . C T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-0.817;DP=21;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=24.51;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:543,0,106 -chr20 1465135 . C CCT 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.099;DP=35;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:461,0,548 -chr20 1465239 . CA C 1050.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.886;DP=58;FS=1.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,39:49:65:1088,0,65 -chr20 1465777 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-1.650;DP=45;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:422,0,1391 -chr20 1465850 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=1.754;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:512,0,908 -chr20 1490532 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.321;DP=74;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:353,0,2135 -chr20 1492755 . A C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,188 -chr20 1500081 . C T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.367;DP=69;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:1209,0,1143 -chr20 1541654 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.470;DP=102;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:586,0,2847 -chr20 1547408 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.125;DP=59;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:276,0,1669 -chr20 1583938 . C A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.878;DP=72;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:702,0,1594 -chr20 1907502 . G GC 212.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:250,17,0 -chr20 1907507 . A G 221.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:17:250,17,0 -chr20 1949116 . G A 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=1.660;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1210,0,1943 -chr20 2018834 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=-1.163;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,27:139:99:448,0,4295 -chr20 2044022 . G A 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:303,21,0 -chr20 2101994 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=1.259;DP=31;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,656 -chr20 2306289 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.380;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:439,0,1515 -chr20 2309479 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.050;DP=106;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:448,0,3068 -chr20 2312272 . C A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.105;DP=281;FS=10.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,50:281:99:734,0,8805 -chr20 2314873 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=1.586;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=25.49;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:436,0,164 -chr20 2323400 . C G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:70:235,0,70 -chr20 2341434 . TCTGCACATGCCGTCAGAGATAAAAGATTGAGATTACATCAAAACACATCCTGCTAAACCTCAGAATTAAACATGATTACAGATGCAAGCTTGGAAGGTTTGCAGAC T 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=2.567;DP=34;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:518,0,8930 -chr20 2509003 . T TAC 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=-2.219;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=3.75;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:99:562,0,3271 -chr20 2509951 . C CAT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:244,0,486 -chr20 2528646 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-1.872;DP=80;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:430,0,2888 -chr20 2528648 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.612;DP=80;FS=2.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:384,0,3071 -chr20 2534738 . G T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-1.136;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:369,0,2621 -chr20 2544460 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=1.671;DP=112;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:643,0,2898 -chr20 2544556 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-1.743;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:99:371,0,2961 -chr20 2585257 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=2.654;DP=77;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:503,0,2128 -chr20 2585269 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=1.195;DP=71;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:515,0,1918 -chr20 2645045 . C T 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.878;DP=155;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,47:155:99:1198,0,3945 -chr20 2653172 . G A 1385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-0.025;DP=121;FS=3.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,42:121:99:1414,0,2766 -chr20 2675523 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.984;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,285 -chr20 2699559 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.116;DP=77;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:413,0,2014 -chr20 2699598 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.455;DP=91;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:457,0,2596 -chr20 2709191 . C A 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 -chr20 2709446 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=-0.746;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:276,0,656 -chr20 2747810 . C T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.250;DP=303;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,48:280:99:595,0,8760 -chr20 2748033 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=-0.462;DP=282;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,49:278:99:532,0,8317 -chr20 2752425 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:229,0,58 -chr20 2766702 . G A 7002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.004;DP=422;FS=6.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,219:421:99:7031,0,7237 -chr20 2767787 . C T 7753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-1.088;DP=454;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,239:454:99:7782,0,7723 -chr20 2768232 . C T 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.153;DP=338;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,76:338:99:1400,0,9511 -chr20 2771547 . GAA G 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=-1.253;DP=153;FS=5.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,29:96:99:792,0,1735 -chr20 2771906 . TTA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.015;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:367,0,890 -chr20 2772630 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.494;DP=36;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:464,0,941 -chr20 2773447 . A T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.011;DP=228;FS=11.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,50:227:99:1001,0,7017 -chr20 2773926 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.059;DP=150;FS=4.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,24:150:99:277,0,4867 -chr20 2774112 . C A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.918;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,34:166:99:710,0,5095 -chr20 2774398 . TAA T 1179.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.896;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:1217,0,1945 -chr20 3003417 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=-0.385;DP=72;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:353,0,2098 -chr20 3004013 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=1.902;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,746 -chr20 3004016 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=3.269;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=13.52;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,746 -chr20 3008569 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-1.224;DP=279;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,48:279:99:547,0,8494 -chr20 3009023 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.850;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:449,0,419 -chr20 3009113 . G T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=1.085;DP=112;FS=5.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=4.89;ReadPosRankSum=3.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,26:112:99:576,0,3401 -chr20 3010424 . T TG 2676.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=-0.388;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,11:133:99:2714,0,7119 -chr20 3010426 . T A 2685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=-0.779;DP=137;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,12:136:99:2714,0,7000 -chr20 3010493 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.020;DP=163;FS=1.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,37:163:99:418,0,13022 -chr20 3010839 . A G 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=2.943;DP=73;FS=25.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:691,0,2213 -chr20 3010914 . A G 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.797;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:636,0,273 -chr20 3011225 . T C 3045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.454;DP=231;FS=6.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,89:230:99:3074,0,4715 -chr20 3011255 . A G 3372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=1.281;DP=237;FS=9.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=14.23;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,99:236:99:3401,0,4427 -chr20 3016147 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:54:402,0,54 -chr20 3029919 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=1.164;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:411,0,2703 -chr20 3067886 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.589;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:254,0,783 -chr20 3073914 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.704;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=15.78;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:470,0,474 -chr20 3146713 . G C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.253;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:293,0,442 -chr20 3146759 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:305,0,393 -chr20 3155237 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,390 -chr20 3165187 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,425 -chr20 3179281 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:279,0,428 -chr20 3248200 . T A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-1.811;DP=75;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,29:75:99:1024,0,1627 -chr20 3254020 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=-1.520;DP=163;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=2.89;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,31:163:99:499,0,5066 -chr20 3258143 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-2.309;DP=144;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:614,0,4388 -chr20 3264340 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.311;DP=155;FS=11.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,24:154:99:253,0,4928 -chr20 3284544 . A T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=-0.401;DP=58;FS=2.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:667,0,1433 -chr20 3288630 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.090;DP=55;FS=4.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:243,0,1630 -chr20 3288771 . A C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.627;DP=61;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:836,0,1277 -chr20 3288791 . T C 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=-0.435;DP=50;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1112,0,634 -chr20 3309361 . C G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.121;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:338,0,1624 -chr20 3321060 . GAGGTACGGATCCATCAAATGGATGTAATGAGACGGATTATTTTAGTTTGTTGTAACAAAATTCAGTTTTCTTTGAC G 1643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.755;DP=46;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=31.54;ReadPosRankSum=-2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,40:44:99:1681,0,175 -chr20 3331697 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.347;DP=84;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:393,0,2560 -chr20 3333868 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-1.391;DP=88;FS=8.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=6.24;ReadPosRankSum=2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:577,0,2443 -chr20 3336887 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.355;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:637,0,3113 -chr20 3337207 . GCTGAAAGAAAGAGCATGACATCAGAGAAAAGATCTTGGGCAGAATGAGAATATTGGAAATATCATGTGTCTTGGTAC G 2390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.760;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=30.65;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,63:74:99:2428,0,925 -chr20 3337336 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.416;DP=71;FS=4.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:300,0,2130 -chr20 3339569 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.901;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:302,0,1046 -chr20 3351798 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.324;DP=35;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.22;ReadPosRankSum=-3.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:386,0,1133 -chr20 3351842 . T C 1588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.021;DP=90;FS=4.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.974;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:1617,0,1673 -chr20 3351882 . C G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-1.875;DP=122;FS=3.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:421,0,3974 -chr20 3352785 . C T 2507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.361;DP=81;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=30.96;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,58:81:99:2536,0,888 -chr20 3352798 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.023;DP=76;FS=6.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:399,0,3036 -chr20 3352812 . C T 2294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.467;DP=74;FS=6.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=31.01;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,52:74:99:2323,0,922 -chr20 3353261 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.769;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:435,0,497 -chr20 3353953 . T C 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.712;DP=114;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1377,0,2173 -chr20 3354173 . C G 613.35 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:678,48,0 -chr20 3354207 . T C 934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:963,69,0 -chr20 3354783 . G A 623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:652,48,0 -chr20 3355501 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-3.168;DP=237;FS=6.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,45:237:99:501,0,18091 -chr20 3355502 . A T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-5.630;DP=241;FS=4.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,46:241:99:501,0,18091 -chr20 3355697 . C A 3832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=-0.070;DP=258;FS=8.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,116:258:99:3861,0,9164 -chr20 3355826 . C T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=6.845;DP=169;FS=9.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,43:169:99:968,0,4876 -chr20 3356009 . T C 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-3.911;DP=80;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=12.17;ReadPosRankSum=-2.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1002,0,1700 -chr20 3358400 . TA T 3465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.191;DP=275;FS=4.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,131:251:99:3503,0,5517 -chr20 3382890 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,181 -chr20 3385630 . T G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=-0.602;DP=35;FS=5.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:292,0,950 -chr20 3395869 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.465;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.758;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:230,0,926 -chr20 3479763 . T A 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1682,117,0 -chr20 3633725 . T C 375.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=1.448;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=28.88;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:403,0,8 -chr20 3903958 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.543;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:324,0,1135 -chr20 3930451 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.348;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:238,0,1176 -chr20 3952761 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:263,0,761 -chr20 4034987 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=-0.903;DP=37;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=5.89;ReadPosRankSum=2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:246,0,1120 -chr20 4035343 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.321;DP=48;FS=13.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:264,0,1541 -chr20 4035392 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=1.503;DP=47;FS=4.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:766,0,841 -chr20 4051398 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.193;DP=24;FS=6.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:309,0,495 -chr20 4051516 . A C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:279,0,1269 -chr20 4051517 . C G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:279,0,1269 -chr20 4052118 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.387;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,812 -chr20 4052119 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,804 -chr20 4052283 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.637;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,430 -chr20 4052955 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=1.147;DP=39;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:391,0,1262 -chr20 4053165 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,215 -chr20 4063906 . T TG 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-0.644;DP=65;FS=20.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:401,0,1155 -chr20 4064178 . T A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.410;DP=56;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.013;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:396,0,2367 -chr20 4065966 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.229;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:438,0,2015 -chr20 4066530 . GT G 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=-1.129;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:248,0,603 -chr20 4078878 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-0.436;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=15.43;ReadPosRankSum=-2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:491,0,544 -chr20 4079329 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-1.902;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,415 -chr20 4114096 . T TAAAAGATGTTCTCCCTCAGAAC 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=-0.145;DP=50;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:256,0,1130 -chr20 4162773 . G C 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-1.176;DP=113;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,32:113:99:820,0,3053 -chr20 4164312 . A T 837.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=1.306;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=28.89;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:27:866,27,0 -chr20 4164772 . C G 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-1.050;DP=78;FS=3.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:688,0,2313 -chr20 4165748 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-0.914;DP=52;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:514,0,2348 -chr20 4165766 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-1.560;DP=65;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:377,0,4409 -chr20 4165789 . C T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=-1.115;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:615,0,3807 -chr20 4165859 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-0.803;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:261,0,5220 -chr20 4169344 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;ClippingRankSum=2.303;DP=107;FS=5.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,19:107:99:317,0,7045 -chr20 4169346 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=2.413;DP=108;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:317,0,7045 -chr20 4254566 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-0.249;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:302,0,998 -chr20 4372885 . GAGGTAAAACATGAGCCTCAACTGACATGTGTATCATGATATATTATCAACTGACATCTCAAGAATAAATGTGATGTACATGGTTTATTTCATTCTCTCATTGC G 3038.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.372;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,61:63:99:3076,322,0 -chr20 4373040 . A C 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.525;DP=89;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:1187,0,1827 -chr20 4373091 . A G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=1.009;DP=74;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:900,0,1685 -chr20 4378616 . C A 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.620;DP=114;FS=2.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,41:114:99:1366,0,2522 -chr20 4381011 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:257,0,611 -chr20 4381543 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-0.223;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=9.96;ReadPosRankSum=2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:337,0,667 -chr20 4381719 . C T 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-0.592;DP=64;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,39:64:99:1279,0,892 -chr20 4381914 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.139;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:259,0,2617 -chr20 4381986 . C G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.424;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:353,0,2874 -chr20 4489212 . C A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.385;DP=36;FS=5.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:515,0,752 -chr20 4712948 . AT A 240.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=24.05;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:3:276,0,3 -chr20 4754723 . CA C 1250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=-4.891;DP=130;FS=14.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=9.62;ReadPosRankSum=5.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,30:123:99:1288,0,2038 -chr20 4759318 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=-1.330;DP=261;FS=7.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,50:261:99:816,0,8349 -chr20 4801384 . TCTGAAAGAAAAAAAAACATCAGGTTTGTCTAATATGCTAAGGTATGTTATTAATGTAAAGAAATGTGGTTCTGATTTAAGGCTGATCATTAC T 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-0.303;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:505,0,684 -chr20 4947337 . GCCTGTAAACATCAAATAACGGTTGCCATAGCTCTGCTTCTTTCTTATGAACTGAATGAAATCAACGTGCGTCCTGGCTTA G 2295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=2.872;DP=55;FS=2.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=29.53;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2333,183,0 -chr20 4949077 . T G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr20 4949099 . A C 302.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr20 5093040 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=-1.394;DP=47;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=4.29;ReadPosRankSum=2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:230,0,1215 -chr20 5130870 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-0.813;DP=73;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:425,0,2017 -chr20 5133725 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=29.58;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:324,0,127 -chr20 5133870 . G A 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 -chr20 5135927 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.647;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:286,0,1454 -chr20 5298843 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:247,0,107 -chr20 5371668 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-1.778;DP=68;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:265,0,2120 -chr20 6018009 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:311,0,175 -chr20 6119683 . C T 340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:369,30,0 -chr20 6134677 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.949;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:485,0,1013 -chr20 6135789 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=3.614;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:255,0,1722 -chr20 6137375 . T A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-2.920;DP=18;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:514,0,107 -chr20 6137825 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=2.148;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=16.89;ReadPosRankSum=2.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:383,0,369 -chr20 6137983 . T A 239.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:268,24,0 -chr20 6138038 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:334,0,185 -chr20 6138214 . G T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.221;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:283,0,872 -chr20 6138433 . C A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-2.757;DP=33;FS=9.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=14.42;ReadPosRankSum=2.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:504,0,883 -chr20 6138834 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-2.851;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=3.69;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:246,0,1811 -chr20 6139382 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-2.089;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:346,0,5369 -chr20 6215517 . CA C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=1.044;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:81:246,0,81 -chr20 6516241 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr20 6593271 . T C 416.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:3:443,0,3 -chr20 6593329 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.65;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:39:485,0,39 -chr20 6593393 . T C 4599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.092;DP=119;FS=3.106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:4628,331,0 -chr20 6593736 . T C 375.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 -chr20 6593765 . A C 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 -chr20 6686829 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr20 6688424 . T A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 -chr20 6768405 . A AGCATGTAACGTGTG 1058.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.569;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:58:1096,58,0 -chr20 6771366 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.231;DP=92;FS=9.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:246,0,2885 -chr20 7029738 . T A 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.257;DP=244;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,45:244:99:539,0,7645 -chr20 7032604 . G A 3162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.226;DP=147;FS=5.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,86:147:99:3191,0,2248 -chr20 7032946 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-2.098;DP=283;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,46:281:99:556,0,9454 -chr20 7033402 . TA T 603.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=-0.295;DP=41;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:4:639,0,4 -chr20 7039592 . C A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=-2.362;DP=94;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:616,0,2519 -chr20 7066876 . C T 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=1.547;DP=90;FS=2.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=14.03;ReadPosRankSum=-2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1291,0,1554 -chr20 7067020 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.213;DP=60;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:376,0,1508 -chr20 7067109 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.629;DP=68;FS=7.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:319,0,1952 -chr20 7067127 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.235;DP=65;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:520,0,1707 -chr20 7067223 . T C 2155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2184,160,0 -chr20 7337887 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.244;DP=22;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:376,0,283 -chr20 7456785 . T A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=2.077;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=7.62;ReadPosRankSum=-2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,28:95:99:752,0,2537 -chr20 7462489 . TCCTAAAGAGAACATAGAGAAACATCTCTCATGCTGCTGATCTATGGTAGATCGTTTAGAGTTGCCAGGTTGTAGGCAGGTTGTAGTTTTA T 3534.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=2.391;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,81:83:99:3572,308,0 -chr20 7468290 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.910;DP=110;FS=5.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,31:110:99:747,0,2857 -chr20 7510113 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.021;DP=118;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:336,0,3723 -chr20 7526506 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-1.369;DP=78;FS=8.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:278,0,2481 -chr20 7614323 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=1.083;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:506,0,192 -chr20 7616767 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.377;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,200 -chr20 7617305 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,524 -chr20 7625207 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.951;DP=59;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:233,0,1811 -chr20 8144671 . C T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.312;DP=123;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,30:122:99:688,0,5073 -chr20 8144743 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-0.842;DP=163;FS=3.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,36:163:99:729,0,4883 -chr20 8233434 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=1.259;DP=41;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:494,0,856 -chr20 8252583 . GT G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.318;DP=25;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:454,0,904 -chr20 8252589 . T A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.046;DP=28;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:499,0,863 -chr20 8252719 . G T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-1.050;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:653,0,116 -chr20 8252815 . A C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:382,0,265 -chr20 8252847 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:392,0,215 -chr20 8254308 . T TA 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:318,0,441 -chr20 8255271 . G T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.076;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:566,0,535 -chr20 8259453 . T C 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:749,54,0 -chr20 8259973 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-1.624;DP=39;FS=2.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:415,0,997 -chr20 8268166 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.997;DP=69;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:758,0,1497 -chr20 8268171 . C CTACATGTGCAGTT 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.699;DP=69;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:758,0,1489 -chr20 8272596 . A G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.394;DP=42;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:821,0,596 -chr20 8296021 . T G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:237,0,64 -chr20 9283415 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:290,0,254 -chr20 9296789 . T G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.410;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:449,0,444 -chr20 9296807 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.267;DP=23;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:328,0,462 -chr20 9311287 . G T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-1.796;DP=23;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:369,0,366 -chr20 9348899 . C A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr20 9350758 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=26.43;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:319,0,56 -chr20 9351656 . C T 3067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-2.120;DP=190;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,90:190:99:3096,0,3176 -chr20 9356286 . TC T 238.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:276,24,0 -chr20 9356924 . AT A 298.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:4:334,0,4 -chr20 9368067 . T G 1867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.680;DP=110;FS=7.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1896,0,1820 -chr20 9415598 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.75;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:337,0,119 -chr20 9456237 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.981;DP=31;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=14.38;ReadPosRankSum=-2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:474,0,650 -chr20 9469071 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=2.301;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:236,0,658 -chr20 9600654 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=1.209;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:405,0,478 -chr20 9756388 . T A 2175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.028;DP=136;FS=2.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:2204,0,2597 -chr20 9757211 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.539;DP=46;FS=9.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.364;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:795,0,820 -chr20 9757354 . G T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.815;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:520,0,3715 -chr20 9757355 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=-0.457;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=7.69;ReadPosRankSum=2.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:513,0,3715 -chr20 9932697 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:303,0,96 -chr20 9946800 . C T 3201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.622;DP=594;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:448,146:594:99:3230,0,17096 -chr20 10154834 . G A 5914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.627;DP=382;FS=5.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,144:382:99:5943,0,17346 -chr20 10157613 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:258,0,344 -chr20 10728063 . TA T 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=1.016;DP=28;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=7.60;ReadPosRankSum=-2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:250,0,247 -chr20 11284802 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,221 -chr20 11917150 . T TAC 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 12389243 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.136;DP=58;FS=13.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:387,0,1687 -chr20 12389776 . G T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.669;ClippingRankSum=-2.556;DP=66;FS=7.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:99:409,0,16706 -chr20 12389779 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=-2.558;DP=72;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,7:62:99:344,0,16706 -chr20 12389853 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.463;DP=195;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,19:175:99:374,0,16706 -chr20 12389854 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.536;DP=191;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,18:171:99:354,0,16706 -chr20 12389893 . T C 5335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.394;DP=106;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,74:102:99:5364,0,497 -chr20 12389932 . A T 3713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.385;DP=83;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=31.95;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:3774,0,1856 -chr20 12389957 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=2.890;DP=112;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:377,0,5122 -chr20 12390040 . T C 3516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.487;DP=231;FS=14.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,107:204:99:3545,0,3574 -chr20 12390137 . G A 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=3.428;DP=99;FS=11.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,62:96:99:2212,0,1243 -chr20 12390182 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.415;DP=47;FS=10.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=8.63;ReadPosRankSum=-4.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:434,0,1183 -chr20 12390415 . T C 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.215;DP=66;FS=17.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=20.12;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1356,0,486 -chr20 12390467 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-3.042;DP=55;FS=28.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=9.69;ReadPosRankSum=-2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:561,0,1147 -chr20 12461566 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-3.037;DP=93;FS=5.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=4.83;ReadPosRankSum=3.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:477,0,2851 -chr20 12464391 . C T 980.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.297;DP=28;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=35.16;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:7:1008,0,7 -chr20 12464529 . T C 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=3.058;DP=84;FS=12.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:681,0,1471 -chr20 12464544 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=1.031;DP=69;FS=10.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=7.08;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:517,0,1863 -chr20 12466859 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.021;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:346,0,2073 -chr20 12553855 . G A 327.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.393;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=25.22;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:356,0,16 -chr20 12844133 . A C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=28.14;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:394,0,92 -chr20 13482950 . G GA 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.326;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:460,0,2083 -chr20 13483145 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.644;DP=105;FS=3.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=2.85;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:328,0,5129 -chr20 13483209 . GT G 998.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.050;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:1036,0,1329 -chr20 13787538 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.333;DP=75;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:239,0,2294 -chr20 13930299 . CA C 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.628;DP=200;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,34:175:99:274,0,9475 -chr20 13943243 . AACCTGTGCCAAAGAACTCAATAGGCTAAGACATAAGGCTCATGACCTGGTCAAATGTGGAAAAAAAATAATATCAAGAGATCAGTAAGACCC A 8382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=1.156;DP=225;FS=1.712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=28.40;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,206:212:99:8981,707,0 -chr20 14550410 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=1.704;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:571,0,1078 -chr20 14574573 . T G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-2.711;DP=46;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:778,0,830 -chr20 14574619 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.723;DP=62;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1065,0,970 -chr20 14574699 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=3.894;DP=46;FS=36.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:347,0,1267 -chr20 14574912 . CAT C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.332;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:525,0,515 -chr20 14575002 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,428 -chr20 14575012 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=20.65;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:276,0,428 -chr20 14575137 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.111;DP=47;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:495,0,1502 -chr20 14575372 . C G 2204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.593;DP=85;FS=3.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,58:76:99:2233,0,875 -chr20 14575389 . C T 5725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.674;DP=132;FS=10.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,84:119:99:5754,0,922 -chr20 14575414 . A G 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=-0.487;DP=179;FS=7.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,50:170:99:1275,0,6322 -chr20 14575467 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.100;DP=236;FS=10.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,45:210:99:354,0,8329 -chr20 14575581 . T C 2550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-0.754;DP=112;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=22.77;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,68:96:99:2579,0,1317 -chr20 14575593 . A G 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-1.759;DP=76;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.21;ReadPosRankSum=-3.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,43:64:99:1488,0,762 -chr20 14586175 . A G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.774;DP=22;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:607,0,137 -chr20 14588057 . T A 1557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=-0.152;DP=50;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1586,0,132 -chr20 14600786 . A G 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.545;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:1476,0,1615 -chr20 14600818 . TA T 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-1.148;DP=95;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:590,0,1120 -chr20 14864006 . G T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-4.640;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=7.79;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:332,0,1033 -chr20 14864043 . T A 1984.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2013,144,0 -chr20 14864121 . G A 1904.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1933,137,0 -chr20 14891939 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-2.063;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:250,0,927 -chr20 14891971 . A G 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1317,96,0 -chr20 14909435 . TGTAAGTCTGCAGTTGTGCATAATCACTCTTGAATTGGAATAATAACAGATCTTCTCCATTAATTATTGTTTGCGTCCAGCTTTTGATTTGTCCAGCTTTTTCTTTTTTGATGTTTTTTTTAAAG T 2751.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=1.550;DP=72;FS=5.716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=27.02;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,69:72:99:2789,204,0 -chr20 15030175 . CT C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-1.866;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:243,0,272 -chr20 15031077 . G GA 585.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-1.441;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:623,0,1041 -chr20 15043509 . ATGTTGG A 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=5.766;DP=137;FS=11.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:530,0,8300 -chr20 15560212 . CT C 1829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.155;ClippingRankSum=4.252;DP=176;FS=33.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=10.40;ReadPosRankSum=-3.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1867,0,3154 -chr20 15952656 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.931;DP=76;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:235,0,2276 -chr20 16680475 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.749;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=2.33;ReadPosRankSum=-1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:312,0,3840 -chr20 16704637 . G C 595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:624,48,0 -chr20 16896358 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:306,0,49 -chr20 16896373 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=30.15;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:390,0,51 -chr20 16896496 . G A 663.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:692,48,0 -chr20 16896649 . G A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:333,27,0 -chr20 16897289 . A G 349.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:378,30,0 -chr20 16897816 . G A 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:555,39,0 -chr20 16898084 . C T 240.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:269,0,21 -chr20 16898187 . G A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:480,33,0 -chr20 16898193 . T C 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:480,33,0 -chr20 16898362 . G C 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr20 16898472 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr20 16898475 . A G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 -chr20 16899351 . G A 355.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:383,0,9 -chr20 16899396 . T C 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:275,21,0 -chr20 16899449 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr20 16899648 . A G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr20 16899675 . A G 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:528,39,0 -chr20 16899996 . C A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr20 16900011 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr20 16900188 . A G 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 -chr20 16900754 . G A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 -chr20 16987998 . CT C 1198.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.983;DP=40;FS=1.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1236,0,493 -chr20 17864197 . CT C 1894.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.712;DP=244;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,99:239:99:1932,0,2424 -chr20 18234849 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,133 -chr20 18352394 . C T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-2.415;DP=379;FS=2.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:309,69:378:99:967,0,12516 -chr20 18396926 . G T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr20 18438420 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr20 18438426 . G C 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr20 18439726 . C G 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-1.264;DP=40;FS=6.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:654,0,719 -chr20 18464162 . A T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.664;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:99:598,0,2815 -chr20 18464856 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.097;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,33:151:99:656,0,4767 -chr20 18465288 . G A 2552.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-2.887;DP=75;FS=8.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=34.04;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,65:73:0:2578,0,0 -chr20 18465360 . G GAC 517.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.714;DP=28;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:554,9,0 -chr20 18468306 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.437;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,31:169:99:444,0,5297 -chr20 18479107 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.776;DP=151;FS=1.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.229;QD=4.01;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,32:151:99:634,0,4480 -chr20 18486568 . ACTGAAAAACATCATGGGAGATTGGATTTATAATGGAAATAAAAATAAATAAAAAGATAAGAACTGAGCGAGGAATGTACAGTATTCATAC A 5325.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=1.705;DP=138;FS=3.078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:5916,429,0 -chr20 18489946 . C T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.397;DP=137;FS=2.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,35:137:99:778,0,3841 -chr20 18750626 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-0.154;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:480,0,457 -chr20 18792002 . CT C 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.094;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:341,0,215 -chr20 18792936 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,303 -chr20 18846488 . T TA 206.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:244,24,0 -chr20 18855025 . C A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=-1.075;DP=47;FS=6.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:833,0,524 -chr20 19056499 . A G 579.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.452;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=25.18;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:12:607,0,12 -chr20 19067152 . TGTTAAGGTAAGCACTTCACAGTACCGTACAGTAAGCATGCTCAG T 5356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.277;DP=355;FS=1.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,161:333:99:5394,0,6941 -chr20 19067156 . AAGGTAAGCACTTCACAGTACCGTACAGTAAGCATGCTCAGTTTATGCATTTATAAACTTAATTCTTTCAATTTCAGGTTTAACAAAAAATTTGTTTTAT A 5181.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.552;DP=349;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,164:330:99:5219,0,7466 -chr20 19067200 . ATGCATTTATAAACTTAATTCTTTCAATTTCAGGTTTAACAAAAAATTTGTTTTAT A 5356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.176;DP=331;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.618;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,151:312:99:5394,0,6928 -chr20 19070047 . G GA 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-0.070;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:34:427,0,34 -chr20 19147417 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.391;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:419,0,512 -chr20 19150169 . AC A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.979;DP=17;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=24.10;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:447,0,343 -chr20 19347794 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:239,0,64 -chr20 19348726 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=2.047;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.047;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:232,0,223 -chr20 19395815 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=10;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=21.48;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:243,0,63 -chr20 19395894 . C G 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 -chr20 19396051 . C T 482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:511,36,0 -chr20 19502914 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.321;DP=65;FS=3.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:350,0,4100 -chr20 19503034 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-0.931;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:326,0,1917 -chr20 19585462 . TGTACGTACTTTTATCATCATGGTATGAGCGTCACTCGATGTTTTAATAAACGGAATAGCAAACTGTCTTTGTTTTACAG T 1031.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=2.115;DP=30;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=34.39;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1069,0,1387 -chr20 19587815 . GACAGGTGAGACCCCTGGACAGTCATCCCAAACAGGTTAGTCATTGCTTCTGTATTTTAACATGTTTATTGTTACTTCTTATGCTTT G 959.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=3.292;DP=42;FS=11.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=22.85;ReadPosRankSum=-3.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:997,0,3246 -chr20 19604155 . T A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.717;ClippingRankSum=0.635;DP=114;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:515,0,3311 -chr20 19904508 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.966;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:446,0,2315 -chr20 20295124 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.540;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:263,0,99 -chr20 20297379 . G A 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr20 20299112 . T A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-2.303;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:453,0,523 -chr20 20304359 . A T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=1.383;DP=117;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,30:117:99:694,0,4596 -chr20 20304852 . G C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.179;DP=99;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:628,0,2837 -chr20 20399504 . C CT 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.635;DP=191;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=3.93;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,64:170:99:862,0,2213 -chr20 20557182 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,444 -chr20 20557663 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.135;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:312,0,1382 -chr20 20682954 . C G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.851;DP=63;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:265,0,1833 -chr20 20682972 . ACTAAAAAGCAGCCACAATACACATCAATCGATAGCTAGCCAATTAGCCAGCCAACTAACGTCAAACGTGCCAGAGACCGACTGCGTAAATAAAACAACAACAATAACAAACGTAC A 1805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=1.264;DP=93;FS=8.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1843,0,20897 -chr20 20685581 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.085;DP=78;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:382,0,2328 -chr20 20685726 . G A 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:481,39,0 -chr20 20765636 . T C 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=2.054;DP=249;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,55:249:99:1104,0,7739 -chr20 20767071 . A AG 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-1.942;DP=229;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,39:204:99:416,0,5273 -chr20 20767154 . GCACACACACACACACACACACA G 205.24 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=2.556;DP=95;FS=8.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=2.16;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:816,0,711 -chr20 20767222 . C T 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.236;DP=144;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:892,0,7699 -chr20 20889671 . T C 1683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.035;DP=364;FS=6.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,84:364:99:1712,0,11006 -chr20 20973244 . GCCTAAACATTGAAATAACGTTTAACACGAAGATAAATAAACTGTAACGCACTCTCTCAGCAATGTATCGCAATAAGGGATTGTTTATCAA G 712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=1.085;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:99:750,0,778 -chr20 21417638 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.861;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:432,0,877 -chr20 21417726 . TC T 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=2.388;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=15.85;ReadPosRankSum=-2.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:275,0,655 -chr20 21418448 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.322;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:402,0,518 -chr20 21420143 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=-1.835;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:243,0,665 -chr20 21509999 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.199;DP=55;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:606,0,1198 -chr20 21545963 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-0.240;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:488,0,1676 -chr20 21546684 . G GT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.819;DP=50;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:324,0,669 -chr20 21714964 . C T 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-2.177;DP=63;FS=3.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:765,0,1261 -chr20 21719818 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-2.397;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:506,0,747 -chr20 21725320 . C G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-0.500;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:477,0,1643 -chr20 21736074 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-1.856;DP=48;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:331,0,1300 -chr20 21887601 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.282;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:414,0,2563 -chr20 21887865 . G T 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.665;DP=127;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:1420,0,2802 -chr20 21888094 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.031;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:354,0,1643 -chr20 21888159 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=-1.883;DP=57;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=16.45;ReadPosRankSum=3.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:966,0,1025 -chr20 21891174 . T C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=1.442;DP=153;FS=8.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,39:153:99:836,0,4233 -chr20 21905540 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=-0.898;DP=139;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,39:139:99:994,0,3833 -chr20 21944915 . C T 1332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.686;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,41:120:99:1361,0,2735 -chr20 22160564 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:324,0,279 -chr20 22230537 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.709;DP=20;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=30.59;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:65:640,0,65 -chr20 22238630 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=20.71;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:256,0,126 -chr20 22261574 . G C 2853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.124;DP=162;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.523;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:2882,0,2849 -chr20 22263644 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.971;DP=156;FS=5.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,25:156:99:304,0,5112 -chr20 22450069 . G A 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.133;DP=92;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,34:92:99:1339,0,4180 -chr20 22451983 . G C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.902;DP=65;FS=8.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:274,0,2371 -chr20 22454434 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.547;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:572,0,2219 -chr20 22708652 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=1.141;DP=31;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:436,0,563 -chr20 22708664 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.441;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:421,0,531 -chr20 22720435 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-0.404;DP=44;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:236,0,966 -chr20 22724500 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.822;DP=35;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:269,0,950 -chr20 23010824 . A AT 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=-0.364;DP=44;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=14.52;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:676,0,721 -chr20 23102461 . T C 211.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:240,0,23 -chr20 23104998 . A ATG 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,287 -chr20 23170363 . C T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.278;DP=42;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:699,0,733 -chr20 23170559 . G GT 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.111;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:552,0,303 -chr20 23171538 . TA T 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.234;DP=50;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:372,0,393 -chr20 23192248 . T TA 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.675;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:395,0,305 -chr20 23233379 . T A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.713;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:630,0,2871 -chr20 23365981 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=1.238;DP=96;FS=3.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:257,0,2992 -chr20 23382889 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.916;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.363;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:357,0,2411 -chr20 23435394 . GACCTGTGAAAAAAAACACACACTAAGTATGTAGGGGGGGTCACTATTTGTTTGCATTGAGTTGTGAGAACCTGAGAGT G 1394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=2.313;DP=49;FS=2.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1432,0,4308 -chr20 23609232 . C T 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.164;DP=255;FS=14.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,71:255:99:1516,0,8209 -chr20 23635054 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-1.209;DP=278;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,58:278:99:1063,0,8332 -chr20 23635182 . C T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.573;DP=192;FS=6.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,45:192:99:928,0,5454 -chr20 23643790 . TCTGAAATTAAATGTATACTCCTGAATTAAACAAACACCTATTAAAGGACTCTTGGACATTTTAAAAGATTCAC T 717.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.979;DP=23;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=31.21;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:755,0,952 -chr20 23653494 . G A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-0.551;DP=50;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:320,0,1183 -chr20 23673114 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.954;DP=35;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:278,0,1243 -chr20 23778664 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-0.534;DP=91;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:540,0,2650 -chr20 23809054 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-0.083;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:337,0,2357 -chr20 23811260 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=-0.580;DP=57;FS=6.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:253,0,2264 -chr20 23817327 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-1.075;DP=85;FS=7.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:467,0,2416 -chr20 23817465 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.726;DP=45;FS=1.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.888;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:244,0,1998 -chr20 23818636 . C CT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.066;DP=24;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:318,0,233 -chr20 23835603 . C T 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:626,45,0 -chr20 23835985 . T G 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:675,48,0 -chr20 23839313 . G C 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.469;DP=155;FS=2.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,30:155:99:537,0,4834 -chr20 23839658 . G A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-1.157;DP=145;FS=0.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=6.46;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:965,0,3927 -chr20 23839691 . C T 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-2.057;DP=156;FS=3.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=6.18;ReadPosRankSum=2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,41:156:99:992,0,4467 -chr20 23859850 . C CT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.655;DP=40;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:303,0,500 -chr20 23860252 . TTG T 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.754;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:499,0,733 -chr20 23862002 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.218;DP=43;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.687;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:321,0,2362 -chr20 23868024 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-1.957;DP=65;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.957;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:437,0,1841 -chr20 23868457 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=-3.133;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:290,0,1691 -chr20 23872577 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=-0.809;DP=63;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:514,0,1583 -chr20 23872588 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-0.592;DP=63;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=6.77;ReadPosRankSum=2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:455,0,1673 -chr20 23937425 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.021;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:293,0,698 -chr20 23938655 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-2.137;DP=35;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:387,0,844 -chr20 23956149 . A AT 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=1.657;DP=65;FS=4.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:263,0,1065 -chr20 23979168 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.017;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:423,0,2224 -chr20 24134396 . AG A 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=1.949;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=2.59;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:239,0,1707 -chr20 24310009 . TGTACGTGCATCTCCACTGTTTTTCCGCAGTTCTTGTCTCCGGCTGCTGCAGATCTCTGACCGCTTTGTTGTTGTTTTTCTGTGTGCAG T 3975.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.051;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,96:99:99:4013,288,0 -chr20 24314631 . A G 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-1.551;DP=131;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,43:131:99:1197,0,3350 -chr20 24316610 . G T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.735;DP=89;FS=8.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:493,0,3475 -chr20 24316785 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-1.788;DP=79;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:334,0,3873 -chr20 24848341 . G C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.781;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:451,0,621 -chr20 24848460 . G T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=1.195;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:482,0,769 -chr20 24882291 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-1.460;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:354,0,683 -chr20 25333047 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr20 25371741 . G A 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-0.487;DP=333;FS=0.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,75:333:99:1407,0,9874 -chr20 25478044 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=-0.647;DP=89;FS=5.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,30:89:99:1039,0,1990 -chr20 25481565 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.706;DP=81;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:506,0,2217 -chr20 25489225 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.145;DP=55;FS=3.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:802,0,1074 -chr20 25500109 . G A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=1.193;DP=121;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:99:625,0,3457 -chr20 25500353 . G T 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.896;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,57:149:99:1931,0,3104 -chr20 25501469 . A C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-1.448;DP=127;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,33:126:99:770,0,4426 -chr20 25501629 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-1.415;DP=93;FS=4.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:450,0,3213 -chr20 25502198 . G GT 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.612;DP=27;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.126;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:382,0,203 -chr20 25502717 . AG A 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:314,0,867 -chr20 25579950 . G A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.368;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:781,0,612 -chr20 25581197 . G C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.024;DP=29;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:265,0,809 -chr20 25581717 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.694;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:252,0,698 -chr20 25584416 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.044;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.891;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:298,0,1230 -chr20 25629890 . G T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr20 25653150 . C T 2562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=1.408;DP=339;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,103:338:99:2591,0,8709 -chr20 25655617 . GAC G 2238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.836;DP=253;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,78:232:99:2276,0,6450 -chr20 25658924 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=1.026;DP=46;FS=4.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:531,0,1059 -chr20 25659863 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.160;DP=38;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:509,0,739 -chr20 25660568 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=1.569;DP=51;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=4.27;ReadPosRankSum=-1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:246,0,3169 -chr20 25660569 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=1.882;DP=52;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:249,0,3169 -chr20 25672408 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=1.716;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:446,0,1741 -chr20 25673905 . TCTACAAAATAAAGGATAAAGAGATTAAACGTAAAATGGCATTATTGTCAAAACAGCTTATTTAAATGACCCAATATACAAAAAAAAAAAAAGGTTTCTTAC T 1671.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=3.990;DP=50;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=33.43;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1709,0,2640 -chr20 25674027 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.751;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:297,0,1220 -chr20 25674298 . GACCTATAAGAATGTACCATACAAAATGAGTCACATAAATTAGCACAACAGTAAAAGCATCAGTTACTAGTTTCAACATTTTCGCCT G 1549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=2.374;DP=49;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=31.63;ReadPosRankSum=-2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:99:1587,0,2474 -chr20 25928826 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:482,0,454 -chr20 25936954 . G C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-1.043;DP=128;FS=5.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,23:128:99:344,0,4089 -chr20 25939453 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.354;DP=75;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:320,0,3190 -chr20 25939746 . AT A 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.295;DP=78;FS=5.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:298,0,3724 -chr20 25946611 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.502;DP=61;FS=4.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:243,0,1843 -chr20 25947111 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=-0.016;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:266,0,1081 -chr20 25948646 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.410;DP=42;FS=1.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:229,0,1173 -chr20 25953369 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=1.201;DP=40;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:541,0,803 -chr20 25957705 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,573 -chr20 25990268 . A T 1179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:84:1208,84,0 -chr20 25990339 . A G 950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:69:979,69,0 -chr20 25990630 . T A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:635,0,372 -chr20 25990794 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.471;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:267,0,400 -chr20 26013923 . TCCTGCAAGAAGCAATATGGTTGCAGTAATTGTGTTAAGTATATGTGATAAGTTTAAAATGAATTTCATATTAGCACTCA T 10713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=1.718;DP=252;FS=3.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=27.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,250:251:99:10751,817,0 -chr20 26032577 . A G 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.066;DP=103;FS=6.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,24:103:99:513,0,2995 -chr20 26053436 . T G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.543;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:405,0,1440 -chr20 26053998 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.429;DP=104;FS=9.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,28:104:99:677,0,2943 -chr20 26054194 . AT A 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-2.009;DP=59;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=5.94;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:388,0,1086 -chr20 26089535 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:322,0,59 -chr20 26374837 . C T 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=1.175;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,43:119:99:1436,0,2680 -chr20 26383502 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.253;DP=122;FS=8.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=4.64;ReadPosRankSum=-2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:594,0,3532 -chr20 26388350 . G A 1667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-1.441;DP=97;FS=11.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1696,0,1681 -chr20 26388432 . G A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.457;DP=105;FS=5.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:1331,0,2396 -chr20 26424107 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-0.301;DP=31;FS=6.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:360,0,622 -chr20 26434086 . C T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-1.624;DP=92;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:1258,0,1767 -chr20 26435092 . A T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.092;DP=49;FS=2.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:684,0,1558 -chr20 26436698 . T C 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.967;DP=52;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:895,0,942 -chr20 26438979 . T G 2647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=2.471;DP=192;FS=4.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,76:192:99:2676,0,3929 -chr20 26508961 . T A 2685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-2.090;DP=84;FS=11.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=31.97;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,71:84:99:2714,0,572 -chr20 26509300 . C A 3863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.054;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=35.37;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:3892,288,0 -chr20 26540875 . C G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=1.092;DP=215;FS=5.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,40:215:99:607,0,6573 -chr20 26552592 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.845;DP=243;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,43:243:99:588,0,7491 -chr20 26561237 . G A 4347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.549;DP=257;FS=6.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,135:257:99:4376,0,7415 -chr20 26563886 . T G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:308,21,0 -chr20 26570493 . T C 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.426;DP=24;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:758,0,108 -chr20 26602143 . G A 595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:624,45,0 -chr20 26714322 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:317,0,49 -chr20 26732389 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-1.110;DP=73;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:73:99:1565,0,2438 -chr20 26732398 . C A 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.127;DP=73;FS=1.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:1500,0,2508 -chr20 26732782 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-2.041;DP=66;FS=2.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:1012,0,1071 -chr20 26733708 . T C 1314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=-0.155;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=22.67;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,38:58:99:1343,0,639 -chr20 26738728 . A G 211.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:240,0,20 -chr20 26836992 . G A 3912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-2.158;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,110:222:99:3941,0,4056 -chr20 26854300 . G C 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr20 26856117 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-1.967;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:377,0,274 -chr20 26856150 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=-2.224;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.99;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:380,0,179 -chr20 26914085 . C G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.678;DP=85;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:554,0,2373 -chr20 26937413 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.090;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,860 -chr20 26937506 . AGTAAGTGTGTGAAATGCATTACACTCTTTGTTTGTTATGGAATATTCTCTGTTAATTTTTATTTTCCTGATAG A 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.493;DP=27;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:485,0,188 -chr20 26946258 . C T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=1.756;DP=18;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:35:619,0,35 -chr20 26946277 . A T 810.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=1.203;DP=26;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:10:838,0,10 -chr20 26946365 . T C 255.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:284,0,16 -chr20 26970614 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.402;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:417,0,3610 -chr20 26971664 . CT C 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.937;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:536,0,167 -chr20 26972770 . T C 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-1.753;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,34:153:99:692,0,4609 -chr20 26972849 . T TC 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-2.520;DP=141;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,36:135:99:681,0,3197 -chr20 26974683 . A AT 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.542;ClippingRankSum=2.794;DP=69;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:617,0,850 -chr20 26977822 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.494;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.352;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:519,0,467 -chr20 26989179 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:475,0,493 -chr20 26989827 . C A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.972;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:625,0,733 -chr20 26990956 . CT C 615.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:22:653,0,22 -chr20 27032385 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.103;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:315,0,1254 -chr20 27032815 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.743;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:354,0,707 -chr20 27051200 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.485;DP=40;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:269,0,1124 -chr20 27069066 . G A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.986;DP=58;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:765,0,1299 -chr20 27118829 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.430;DP=64;FS=8.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:285,0,1975 -chr20 27119159 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=-1.182;DP=23;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:395,0,395 -chr20 27119884 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-1.951;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:478,0,627 -chr20 27131947 . C T 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.261;DP=144;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,41:144:99:985,0,3886 -chr20 27138490 . G GTA 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr20 27142747 . T TTG 328.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr20 27311540 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:233,0,56 -chr20 27327947 . TA T 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-2.025;DP=27;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=8.06;ReadPosRankSum=2.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:255,0,384 -chr20 27328311 . T G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=26.65;ReadPosRankSum=2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:428,0,117 -chr20 27373037 . G A 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:550,42,0 -chr20 27401176 . T G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=24.15;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:463,0,198 -chr20 27423594 . AGTAGGCAACACGCATATCATAATGATGATTAAAATCACAATATAACGCTTTGTGAATTGTTCTTTTTTTGTCCCCCTTTTTTGCAG A 1504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.854;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=32.89;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,37:42:85:1542,0,85 -chr20 27435656 . A ACT 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:336,30,0 -chr20 27570284 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-1.738;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:429,0,406 -chr20 27579960 . GA G 279.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:317,30,0 -chr20 27693664 . T A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.038;DP=42;FS=9.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:738,0,730 -chr20 27693895 . A T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.803;DP=43;FS=7.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:466,0,955 -chr20 27700975 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.810;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:594,0,559 -chr20 27702671 . A T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.134;DP=43;FS=4.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:701,0,778 -chr20 27712171 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=1.897;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:718,0,469 -chr20 28279519 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.188;DP=37;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:264,0,999 -chr20 28296703 . CT C 3017.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.307;DP=368;FS=2.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,124:356:99:3055,0,5955 -chr20 28300384 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.555;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:360,0,1500 -chr20 28346483 . G T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.653;DP=49;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:358,0,1344 -chr20 28350169 . G T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr20 28384007 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:99:262,0,562 -chr20 28384031 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:262,0,562 -chr20 28390654 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.080;DP=39;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:263,0,1888 -chr20 28397000 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.956;DP=51;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:553,0,1142 -chr20 28431477 . A T 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:574,39,0 -chr20 28452706 . G GT 794.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.681;DP=39;FS=5.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:38:832,0,38 -chr20 28530061 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:454,0,613 -chr20 28667783 . G T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=-2.394;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:404,0,644 -chr20 28676300 . AG A 216.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:254,22,0 -chr20 28677429 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.275;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:427,0,593 -chr20 28723666 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-0.160;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:295,0,888 -chr20 28809937 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.192;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:422,0,657 -chr20 28829951 . G C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.794;DP=70;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:390,0,2003 -chr20 28843540 . ACAGGTTTCATGTTTGCTTTGTATTATCACCTGTTTACCTCCAGGTGTTGCGTTGATCATATTGCCTCAACAGCTCGTTTTGTTTGT A 4934.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-2.217;DP=112;FS=9.633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=30.75;ReadPosRankSum=2.573 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,109:112:99:4972,423,0 -chr20 28843647 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.090;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:419,0,2824 -chr20 28853467 . TG T 1317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-2.399;DP=111;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:1355,0,2196 -chr20 28859253 . GTT G 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=3.571;DP=182;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=1.60;ReadPosRankSum=-3.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,21:148:99:328,0,5294 -chr20 28859707 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.311;DP=289;FS=9.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,52:289:99:720,0,11212 -chr20 28860370 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-1.580;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:487,0,1348 -chr20 28861739 . T C 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.666;DP=427;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,102:382:99:2251,0,10492 -chr20 28896247 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.089;DP=245;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,38:244:99:425,0,8160 -chr20 28896979 . T C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=1.757;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:627,0,8246 -chr20 28897196 . T C 6129.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.144;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=33.52;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:99:6158,439,0 -chr20 28897201 . T C 6124.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.628;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:99:6153,439,0 -chr20 28897224 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.348;DP=43;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=5.51;ReadPosRankSum=-2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:265,0,1295 -chr20 28897308 . T C 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.331;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,37:196:99:562,0,7066 -chr20 28897317 . T C 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=2.368;DP=233;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=6.35;ReadPosRankSum=-2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,62:233:99:1507,0,7110 -chr20 28897756 . G T 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=-0.645;DP=392;FS=11.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:315,77:392:99:1097,0,20768 -chr20 28902848 . A AT 294.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=1.273;DP=21;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:26:395,26,0 -chr20 28912449 . A T 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=1.548;DP=35;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:382,0,1338 -chr20 28913418 . T A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.476;DP=47;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:283,0,1316 -chr20 28913641 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.476;DP=87;FS=5.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:293,0,3738 -chr20 28913650 . G GA 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DP=77;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:457,0,1536 -chr20 28915106 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.900;DP=76;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:450,0,2110 -chr20 28915271 . G A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=2.939;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=24.74;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:894,0,269 -chr20 28915410 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.786;DP=69;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:515,0,3772 -chr20 28916909 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=1.058;DP=89;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:628,0,2297 -chr20 28916965 . A G 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.752;DP=102;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:1194,0,2079 -chr20 28923112 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.381;DP=94;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:532,0,2715 -chr20 28963944 . C CA 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-1.680;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.829;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:324,0,606 -chr20 29063633 . C G 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.146;DP=141;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,37:141:99:855,0,4043 -chr20 29071681 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-2.852;DP=283;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,42:282:99:347,0,9002 -chr20 29250792 . A AAT 632.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.196;DP=45;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:670,0,670 -chr20 29289811 . ATCAGGTCTACAACTTCACACACCATTATATCTATAAACGTTGATTATAAACAGTCCTTTTGTTAAATCTGTTCTCATGTTTGATTTGTGATTTCT A 1290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.448;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=20.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,51:54:99:2052,0,828 -chr20 29295043 . T C 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=1.653;DP=39;FS=8.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=25.43;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:1020,0,416 -chr20 29295441 . GT G 1098.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.536;DP=73;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:71:99:1136,0,607 -chr20 29317383 . T A 3906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=1.954;DP=223;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,107:220:99:3935,0,3747 -chr20 29368098 . C A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.268;DP=194;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,48:194:99:1056,0,5487 -chr20 29379413 . AACCTAAATGCAAAGTGATGCCAATGATAGAATCCAACTCAGATGATCAAAAATATTTTTTCCAAAATGCCCTAAAATGTGATAAACTGT A 5058.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.996;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,108:110:99:5096,472,0 -chr20 29415229 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=-1.337;DP=107;FS=6.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=2.90;ReadPosRankSum=-2.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:339,0,3350 -chr20 29503727 . ATACCTGTGAGGTACAACGTCCCACACTGCGTTAGCATATTTCACAAGCTCTTGAGATGTAAGAACAGCAACGCAAGGTGATCTGACCAGGCCAAACCATAACT A 17197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=1.632;DP=385;FS=6.904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,376:378:99:17235,1472,0 -chr20 29518562 . C T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-0.483;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,37:112:99:1078,0,4824 -chr20 29518563 . A G 2168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=1.135;DP=109;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:2197,0,1702 -chr20 29518754 . AT A 4010.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.520;DP=220;FS=6.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,128:210:99:4048,0,2692 -chr20 29518882 . T C 2878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=1.237;DP=186;FS=5.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:2907,0,2875 -chr20 29558714 . CCCTGGAGAAACAGCACCGCAGCTCACAGAGTATAACGAATTTCCACATAACACTGCAGACTGACAAAATACACACTAGAGATACTTA C 742.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=31.93;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:60:780,60,0 -chr20 29610953 . C CA 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-1.546;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,42:178:99:472,0,2860 -chr20 29646217 . TCTGAACACAAACACATGAGAATTACAAGACTTCCCTTTTTGTAAAACCTCAAGATGTACAATTGATAGTTTGACGCTTAC T 8035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=1.595;DP=182;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=27.99;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,179:181:99:8073,689,0 -chr20 29646523 . C A 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=1.588;DP=154;FS=3.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,32:154:99:632,0,4784 -chr20 29649403 . A G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.647;DP=173;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,34:173:99:564,0,5334 -chr20 29694818 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-1.389;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:421,0,2531 -chr20 29696433 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-1.011;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:403,0,2292 -chr20 29699962 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-0.963;DP=97;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=3.28;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:346,0,4406 -chr20 29700184 . T A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-1.282;DP=93;FS=8.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:435,0,2864 -chr20 29700511 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.871;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:381,0,2445 -chr20 29701050 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.342;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:345,0,1271 -chr20 29704732 . GGTACATGAGGGGTTAAGGCCAAAACAACGCAAAGAAGTACTAGAGCAATAGTATATCACAAAATAATGCTAGAAATATGAGTGGATAT G 1199.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=1.251;DP=62;FS=4.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=19.35;ReadPosRankSum=-2.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1237,0,4676 -chr20 29706340 . GCTGCAATATGAAAAGAAGAAAGACTATTGAGGAAAGCTTTTTACATTTTGGTGTTCAAACTGAATTAATTTAAAAGCTTATAATCGACAC G 591.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=1.692;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:629,218,0 -chr20 29778799 . G C 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=1.526;DP=177;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,48:177:99:1152,0,4873 -chr20 29781798 . A C 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.648;ClippingRankSum=-1.116;DP=218;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,48:218:99:950,0,5987 -chr20 29786629 . C T 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.010;DP=274;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,60:273:99:1160,0,8124 -chr20 29795937 . C T 4747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=-0.357;DP=257;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,68:250:99:4776,0,5320 -chr20 29804219 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:245,0,495 -chr20 29808355 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=-0.089;DP=227;FS=1.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,53:226:99:649,0,10540 -chr20 29861556 . C G 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr20 29863058 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.233;DP=45;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:389,0,1199 -chr20 29865260 . G T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.700;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.86;ReadPosRankSum=2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:247,0,1315 -chr20 30057564 . CT C 1393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.176;DP=75;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,59:72:58:1431,0,58 -chr20 30057880 . G C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.590;DP=101;FS=8.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:269,0,3207 -chr20 30059091 . CT C,CTT 4202.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.411;DP=254;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:14,157,42:213:99:4130,535,831,3779,0,5638 -chr20 30059218 . GA G 1102.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-0.319;DP=350;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,69:319:99:1140,0,5946 -chr20 30059941 . CT C 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-1.694;DP=274;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,67:260:99:963,0,5287 -chr20 30903268 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.424;DP=83;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:479,0,2366 -chr20 30915477 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.444;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,33:126:99:736,0,3515 -chr20 30915990 . C CT 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-1.014;DP=92;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,29:88:99:495,0,1621 -chr20 30916776 . G C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.440;DP=67;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:235,0,1969 -chr20 30919457 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.803;DP=33;FS=11.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:268,0,891 -chr20 30943317 . A C 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:234,0,25 -chr20 31003033 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,147 -chr20 31003626 . T C 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.172;DP=46;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,38:45:66:1782,0,66 -chr20 31003685 . TAGGTAACAGCACATCCTTTGTGAAAAATAATTTATTTTTGTGCCATCATTACAAGACAAAATACATTTCAACTGATTTCAGTTGGTTATATTTTTC T,TAGTTGGTTATATTTTTC 1778.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.191;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,40,15:59:99:2012,385,2346,1505,0,7213 -chr20 31007291 . G C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.652;DP=89;FS=8.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,25:87:99:628,0,3135 -chr20 31007435 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=-1.806;DP=27;FS=21.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:269,0,521 -chr20 31008034 . A G 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.091;DP=20;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=32.19;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:29:672,0,29 -chr20 31008235 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=1.415;DP=225;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,36:186:99:649,0,6624 -chr20 31008325 . T G 4878.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-1.324;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=34.82;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,107:112:99:4907,340,0 -chr20 31008362 . G A 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=-0.937;DP=90;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:1234,0,2192 -chr20 31244068 . G C 3320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-1.737;DP=299;FS=15.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=11.11;ReadPosRankSum=5.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,100:299:99:3349,0,6916 -chr20 31253370 . A G 4126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.372;DP=369;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,124:369:99:4155,0,8417 -chr20 31256438 . T G 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=1.664;DP=205;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,41:205:99:725,0,6228 -chr20 31259284 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=1.159;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:289,0,1365 -chr20 31263283 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=-1.110;DP=60;FS=4.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:253,0,1814 -chr20 31296575 . A C 5974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=6.111;DP=721;FS=2.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:492,229:721:99:6003,0,18737 -chr20 31297898 . AGTGAGTTCATTGACAACTATGTGAGTTTGTACTTTTTGCCTGGCTGTTTCTTTTATCACTCTGCTAATTAATTTTGATTATCAACAG A 13538.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.435;DP=401;FS=2.056;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=33.76;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,363:367:99:13576,1127,0 -chr20 31298548 . G A 3181.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-3.142;DP=363;FS=3.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,128:363:99:3210,0,14625 -chr20 31300315 . C T 3652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=2.016;DP=331;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,111:328:99:3681,0,7616 -chr20 31300446 . TGGTATGGATCAGCCTTTTATTTTAACCAAGCTTTTTTTCCAGGCTAGAACTGGTTACTTAAGCTAATTCTTGGTCTATTTACACA T 12200.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.220;DP=307;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=27.46;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,301:305:99:12238,917,0 -chr20 31302182 . GAGGTAAATGTAAAATAAATCCTTATTTCCCCAAACCCATGAACTTATACAGACTTTTTAAAAATATAATATTTTTTCCATAATCATCT G 7902.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-5.572;DP=523;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=15.11;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,207:312:99:7940,0,5937 -chr20 31302185 . GTAAATGTAAAATAAAT G 2234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=4.173;DP=314;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,83:302:99:2272,0,20296 -chr20 31302203 . CTTATTTCCCCAAACCCATGAACTTATACAGACTTTTTAAAAATATAATATTTTTTCCATAATCATCTAGGCT C 2236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=5.060;DP=327;FS=3.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=6.84;ReadPosRankSum=5.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,83:315:99:2274,0,20296 -chr20 31302556 . C T 2726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.977;DP=324;FS=7.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,105:324:99:2755,0,8469 -chr20 31305797 . T A 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-2.895;DP=119;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=8.34;ReadPosRankSum=3.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,37:118:99:1021,0,3162 -chr20 31306082 . C G 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=1.510;DP=206;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,57:206:99:1358,0,5837 -chr20 31306415 . G A 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-2.101;DP=227;FS=17.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,64:227:99:1644,0,6532 -chr20 31307678 . C T 1950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-2.430;DP=239;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,80:239:99:1979,0,8591 -chr20 31307778 . A C 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-1.903;DP=221;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,60:221:99:1394,0,6272 -chr20 31308735 . C T 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=3.791;DP=239;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=7.65;ReadPosRankSum=-2.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,72:238:99:1857,0,6583 -chr20 31455472 . T A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=1.128;DP=76;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:686,0,1928 -chr20 31455635 . C A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-0.012;DP=46;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:567,0,1130 -chr20 31461992 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=-0.034;DP=83;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,27:83:99:709,0,2221 -chr20 31462391 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.902;DP=99;FS=7.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:742,0,2622 -chr20 31462598 . G C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.177;DP=99;FS=8.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.803;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:265,0,3941 -chr20 31462657 . G C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.749;DP=91;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:450,0,3636 -chr20 31469872 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=1.984;DP=79;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:258,0,2543 -chr20 31748726 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.743;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,455 -chr20 31748797 . T C 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.350;DP=79;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.90;ReadPosRankSum=3.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:968,0,3591 -chr20 31748800 . A AG 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=1.357;DP=84;FS=2.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=11.08;ReadPosRankSum=2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:968,0,3633 -chr20 31748863 . G T 4572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.810;DP=121;FS=3.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=32.80;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:4601,322,0 -chr20 31748967 . G A 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.189;DP=106;FS=3.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,42:104:99:1495,0,2148 -chr20 31749129 . T A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.021;DP=156;FS=41.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,36:129:99:676,0,6782 -chr20 31749170 . C T 2956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.641;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:2985,0,2651 -chr20 31749212 . G A 10284.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:10313,731,0 -chr20 31749273 . AT A 2718.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.748;DP=106;FS=4.667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,85:97:53:2756,53,0 -chr20 31749321 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.217;DP=25;FS=9.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:434,0,487 -chr20 32049173 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.529;DP=53;FS=4.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:637,0,1203 -chr20 32083667 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.022;DP=68;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:324,0,1986 -chr20 32083827 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-1.542;DP=31;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:288,0,755 -chr20 32083849 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:278,0,345 -chr20 32157502 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=-0.312;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:313,0,1588 -chr20 32176113 . G A 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.077;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,50:157:99:1397,0,4153 -chr20 32176600 . G A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-2.839;DP=161;FS=1.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=6.05;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,44:161:99:1003,0,4447 -chr20 32184722 . A T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.357;DP=46;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:682,0,921 -chr20 32267809 . G GA 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.167;DP=108;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:427,0,1375 -chr20 32268130 . A T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.468;DP=139;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,33:139:99:709,0,4236 -chr20 32269286 . C A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-1.537;DP=41;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:558,0,847 -chr20 32269350 . A G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.493;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:785,0,791 -chr20 32329883 . G A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.672;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,46:170:99:1066,0,4635 -chr20 32477500 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.363;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:359,0,2387 -chr20 32537274 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-0.869;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=16.24;ReadPosRankSum=2.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:548,0,567 -chr20 32552868 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.735;DP=110;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=4.32;ReadPosRankSum=3.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:503,0,3364 -chr20 32554849 . C T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.080;DP=144;FS=3.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=5.85;ReadPosRankSum=2.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:871,0,4036 -chr20 32559344 . G GA 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.819;ClippingRankSum=-2.092;DP=77;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=2.65;ReadPosRankSum=2.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:242,0,1206 -chr20 32559785 . GT G 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.260;DP=55;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:276,0,934 -chr20 33216069 . A T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.841;DP=88;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:676,0,2265 -chr20 33217201 . AGTACGATATAACAGAGGCATTTTATTTGACTCAAATTTTAGTACGTTGATAATGATTTAATTTTACCCCCTCAG A 4878.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=1.532;DP=114;FS=5.111;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.533;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,110:114:99:4916,419,0 -chr20 33333384 . A T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=-0.433;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.808;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:602,0,2838 -chr20 33334573 . T A 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=-0.051;DP=240;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,59:239:99:1319,0,6487 -chr20 33506295 . A T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.924;DP=75;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:442,0,3992 -chr20 33506296 . G A 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=-0.710;DP=76;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:443,0,3991 -chr20 33506707 . G GA 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-2.123;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,37:175:99:337,0,3798 -chr20 33507088 . T G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.300;DP=195;FS=7.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=1.87;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,32:195:99:393,0,6139 -chr20 33507386 . G A 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.533;DP=229;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,59:229:99:1321,0,6344 -chr20 33510023 . A G 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.123;DP=172;FS=16.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,47:171:99:940,0,9415 -chr20 33514701 . G A 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=1.676;DP=228;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,56:228:99:1256,0,6556 -chr20 33515151 . AC A 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:358,0,45 -chr20 33568499 . AGTCAGTGCAACTGCAAGTTCAAACTTCGATATTTCAACTCTCATGCATATTCCCTAAAATATATATCATGTTATTTTGTGTCCAG A 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:254,0,1286 -chr20 33568737 . AGTAAGTCAACTGAGTTGGACTTAATCAATAGAAAATAAGGTAAACTGTTTCTCAATGATGCTTTCTCCTCAG A 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:343,0,803 -chr20 33617838 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:296,0,93 -chr20 33674325 . A G 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.133;DP=52;FS=6.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:652,0,1044 -chr20 33677648 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.684;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,774 -chr20 33687796 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.372;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:424,0,2174 -chr20 33693478 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.650;DP=59;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:255,0,1722 -chr20 33708375 . A G 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=2.494;DP=59;FS=9.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:963,0,1073 -chr20 33741278 . GAGGTAAACCATTGAATTCCTCTTCCTCAGCTCTCATACATACTTATAACAGCATTACTTCTGTTTAAGAGTGTTCTATGGGTTGAT G 239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:277,21,0 -chr20 33774076 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-2.186;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:292,0,649 -chr20 33774136 . TA T 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.202;DP=33;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:253,0,434 -chr20 33776974 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.141;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:290,0,1238 -chr20 33777127 . A T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-0.660;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:617,0,1134 -chr20 33777515 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=1.186;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:594,0,1836 -chr20 33783707 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.981;DP=51;FS=6.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:392,0,2617 -chr20 33783708 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.741;DP=49;FS=9.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:392,0,2617 -chr20 33814573 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.272;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:540,0,2075 -chr20 33814579 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.070;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:540,0,2055 -chr20 33834442 . G A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.030;DP=80;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:983,0,1686 -chr20 33835197 . A T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-1.007;DP=32;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:509,0,1157 -chr20 33835439 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.245;DP=66;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:317,0,2043 -chr20 33835687 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-2.909;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=5.37;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:259,0,1304 -chr20 33836197 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.306;DP=85;FS=3.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=5.53;ReadPosRankSum=-2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:498,0,2332 -chr20 33884477 . C T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.061;DP=88;FS=2.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,31:88:99:1001,0,1822 -chr20 33887349 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.841;DP=84;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:650,0,2202 -chr20 33934376 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.783;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:386,0,571 -chr20 33940161 . AACAGGTCAGCTTTTACACTTTCAGACAGTCAACCGGACAAGCTGTATTTTCTATTACATGTACTGTGCATTCACTTTGTGCGTGTGTTTGTGTG A 632.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=19;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=33.30;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:58:670,58,0 -chr20 34021325 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.173;DP=42;FS=4.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:384,0,1079 -chr20 34021356 . T A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.092;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:438,0,946 -chr20 34029610 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.726;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:229,0,1045 -chr20 34030583 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-0.218;DP=60;FS=4.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:288,0,1613 -chr20 34032187 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=-0.031;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:456,0,932 -chr20 34048577 . T A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=2.629;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:378,0,622 -chr20 34053486 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.239;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:314,0,516 -chr20 34063746 . G A 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:271,0,22 -chr20 34064106 . C T 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=1.288;DP=137;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,46:137:99:1223,0,6318 -chr20 34064343 . TCTGAAAGAGAAAAGCGAGACACATAGTTAGTGAAACAGAAATAAGAGATTGCATGTGGTTTGTCTAATATTATTGTGTTTGTAC T 5657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=3.106;DP=162;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=34.92;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,151:161:99:5695,0,819 -chr20 34075843 . T C 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.692;DP=129;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,47:129:99:1607,0,2874 -chr20 34076268 . T G 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-0.355;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,44:119:99:1431,0,2556 -chr20 34078937 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.590;DP=164;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,33:160:99:465,0,5464 -chr20 34087833 . C T 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.536;DP=102;FS=8.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:1270,0,2291 -chr20 34088058 . C T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.682;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,44:169:99:1023,0,4709 -chr20 34088164 . C T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.136;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:775,0,8925 -chr20 34092889 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.378;DP=102;FS=7.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:839,0,5885 -chr20 34092895 . C A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.012;DP=99;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:839,0,5885 -chr20 34094478 . G GT 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.745;DP=97;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:334,0,1799 -chr20 34198783 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=-2.435;DP=55;FS=4.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:281,0,1632 -chr20 34205762 . ACTGCAGAAAAAATGCAATAAAGCTATCTTAAAATGCTCACACATAAGCGGGGTCACAATATTTTCCCAGGCAAAGACATTGCTGGTCAC A 1383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=1.454;DP=41;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=33.75;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:99:1421,0,938 -chr20 34363507 . GCAGGTTTGTGTGCATCACATTAATCCAAAAAATTTTGAATGTCTCTTGCTTTTGCTAAGCAACTCTTGTCTTGCTCTT G 12914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.061;DP=330;FS=1.715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,316:321:99:12952,898,0 -chr20 34365099 . A AT 1465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=-0.560;DP=145;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1503,0,1967 -chr20 34365448 . AT A 646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-3.868;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=2.91;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,16:214:99:684,0,6225 -chr20 34403075 . A C 292.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:321,0,13 -chr20 34438107 . CAGGTACTGTACCCTTAAAGTACTAAACCAATACAAATCTGTTTTAAGATTAATTCTGGTCCTAAATGCGTCAATTGTGTGATAACTGT C 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=1.041;DP=27;FS=8.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:751,0,1189 -chr20 34638257 . CAA C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.769;DP=65;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=3.78;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:283,0,1828 -chr20 34638261 . GGTGAGTTTGGCTGGATCTGATGCTACTGTAGCTACTATGTTTTTTTACTGCAGTGTTTCATGTATGCTTGTGTTTT G 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.008;DP=65;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:284,0,1828 -chr20 34638263 . TGAGTTTGGCTGGATCTGATGCTACTGTAGCTACTATGTTTTTTTACTGCAGTGTTTCATGTATGCTTGTGTTTTAGGG T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.321;DP=65;FS=7.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:340,0,3175 -chr20 34672280 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:349,0,157 -chr20 34672438 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.326;DP=26;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:465,0,326 -chr20 34686106 . A G 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.793;DP=49;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:1022,0,1811 -chr20 34803434 . C CA 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.021;DP=322;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=1.05;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,56:277:99:374,0,5800 -chr20 35084366 . GA G 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-1.730;DP=64;FS=4.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:272,0,1909 -chr20 35091429 . G A 2809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.037;DP=370;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,117:370:99:2838,0,9103 -chr20 35093320 . GAA G 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=-0.894;DP=172;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,3:121:99:1031,0,2898 -chr20 35167464 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.925;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:267,0,1010 -chr20 35184108 . C A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.902;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:388,0,1409 -chr20 35268329 . T C 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=-0.720;DP=86;FS=4.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1471,0,1411 -chr20 35319816 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.771;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:581,0,2583 -chr20 35321588 . T C 1575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=1.446;DP=81;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1604,0,1233 -chr20 35321820 . T G 2154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.644;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,63:99:99:2183,0,1265 -chr20 35322025 . T G 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.664;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,46:76:99:1600,0,1043 -chr20 35322301 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.966;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:412,0,3597 -chr20 35322307 . A G 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.396;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:926,0,1655 -chr20 35370771 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 35370772 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 35453194 . GT G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-1.067;DP=44;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:302,0,529 -chr20 35487211 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-1.055;DP=56;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:404,0,1621 -chr20 35615913 . A C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=2.135;DP=29;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=11.51;ReadPosRankSum=-3.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:362,0,660 -chr20 35616171 . T C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.076;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:855,0,1854 -chr20 35618265 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.157;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:297,0,645 -chr20 35619909 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.171;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:267,0,512 -chr20 35620257 . A G 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=2.025;DP=40;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.642;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:746,0,622 -chr20 35626620 . T A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.122;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,462 -chr20 35707834 . A C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=1.142;DP=27;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:339,0,741 -chr20 35708023 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.725;DP=33;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:296,0,886 -chr20 35719307 . A C 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:422,33,0 -chr20 35967614 . T C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=1.935;DP=134;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=4.43;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,30:133:99:622,0,3902 -chr20 35985528 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=-0.083;DP=108;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,26:108:99:617,0,5543 -chr20 35985529 . T A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=-0.367;DP=105;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,26:105:99:617,0,5543 -chr20 36003966 . C CT 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=0.202;DP=91;FS=9.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:361,0,1247 -chr20 36004507 . G T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=1.090;DP=81;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:452,0,2448 -chr20 36420548 . A AT 2693.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.567;DP=235;FS=9.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,123:224:99:2731,0,2463 -chr20 36420654 . A G 2188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=-0.689;DP=275;FS=0.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,83:274:99:2217,0,7620 -chr20 36420704 . A T 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=-0.473;DP=234;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=8.44;ReadPosRankSum=2.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,71:234:99:2003,0,6496 -chr20 36421021 . T TA 716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-2.055;DP=207;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,56:185:99:754,0,3453 -chr20 36441485 . A C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-0.274;DP=120;FS=2.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:1030,0,3088 -chr20 36445321 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.279;DP=100;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:439,0,3017 -chr20 36445412 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-1.249;DP=83;FS=13.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=2.50;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,15:83:99:236,0,2642 -chr20 36445956 . C CA 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.576;DP=45;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:331,0,249 -chr20 36446365 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.967;DP=82;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:277,0,2515 -chr20 36599985 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.326;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:323,0,355 -chr20 36801962 . A C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-1.537;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:325,0,569 -chr20 36817708 . G GCT 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.025;DP=32;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:348,0,503 -chr20 36824542 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.047;DP=46;FS=3.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:560,0,952 -chr20 36854026 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.333;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:474,0,717 -chr20 36872253 . G C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.989;DP=45;FS=2.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:338,0,1309 -chr20 36941503 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.573;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:445,0,1684 -chr20 36941672 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.578;DP=40;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:342,0,1023 -chr20 37025431 . A C 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1544,105,0 -chr20 37025453 . A G 937.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:966,66,0 -chr20 37322281 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.326;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,830 -chr20 37407764 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.631;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,779 -chr20 37464317 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-2.005;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:400,0,749 -chr20 37493981 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.500;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=9.74;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:262,0,570 -chr20 37543524 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.503;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:356,0,651 -chr20 37546308 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.355;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:267,0,543 -chr20 37760585 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:372,0,421 -chr20 37780055 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.373;DP=36;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:487,0,790 -chr20 37793320 . A C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.160;DP=42;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:283,0,1085 -chr20 37825180 . C T 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=-0.624;DP=88;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1301,0,1841 -chr20 38267435 . T G 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-1.079;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:768,0,179 -chr20 38271153 . GAA G 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.819;DP=22;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:57:518,0,57 -chr20 38407514 . C T 5579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.467;DP=398;FS=1.016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=14.02;ReadPosRankSum=-1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,121:139:99:5608,289,0 -chr20 38407521 . G GT 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.908;DP=512;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,27:166:99:284,0,3938 -chr20 38407617 . A T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=2.730;DP=466;FS=13.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:644,0,5288 -chr20 38407624 . G T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=4.980;DP=349;FS=9.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=1.78;ReadPosRankSum=-3.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:650,0,5288 -chr20 38407672 . C G 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.405;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=27.68;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,35:42:31:2659,31,0 -chr20 38428857 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,313 -chr20 38498513 . C G 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.955;DP=74;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1142,0,1458 -chr20 38506716 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.835;DP=70;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1208,0,1123 -chr20 38612557 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=1.564;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=22.94;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:464,0,244 -chr20 38613365 . T C 310.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=31.02;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:338,0,10 -chr20 38614173 . T C 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:275,0,22 -chr20 38618089 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-1.317;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:261,0,723 -chr20 38618099 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:299,0,641 -chr20 38619998 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:308,0,395 -chr20 38620008 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:308,0,395 -chr20 38628105 . C T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.752;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=30.09;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:931,0,134 -chr20 38694733 . A AT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.445;DP=31;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:287,0,431 -chr20 38837232 . A G 3581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.347;DP=142;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,96:142:99:3610,0,1212 -chr20 38924932 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=-1.110;DP=34;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:553,0,689 -chr20 38929741 . G A 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.872;DP=73;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,44:72:99:1491,0,973 -chr20 38929994 . C T 4196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.719;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,123:194:99:4225,0,2437 -chr20 39281049 . TC T 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.927;DP=68;FS=15.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:613,0,966 -chr20 39281834 . GGA G 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.297;DP=37;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:525,0,742 -chr20 40493365 . G GATTCCAGGCTTTT 3110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:99:3148,157,0 -chr20 40498636 . TGGTATTGATCATGAACGATTTTCTAAATCTTCTCACAAATATTTACTTGTTCATAAAATGGTCTAAAACTAAAAATGTATATATTTTTTTATCCAAA T 2151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.866;DP=357;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=6.03;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,312:313:99:2189,810,0 -chr20 40498934 . ACT A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:248,0,57 -chr20 40507603 . G A 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-0.166;DP=52;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:881,0,2010 -chr20 40507896 . C T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.604;DP=66;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1110,0,1041 -chr20 40511958 . G T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=1.424;DP=62;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:856,0,1325 -chr20 42253748 . CT C 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-1.864;DP=33;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:502,0,1036 -chr20 42254025 . CTA C 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.351;DP=78;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:673,0,2454 -chr20 42301332 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.368;DP=36;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:295,0,812 -chr20 42372897 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.294;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:584,0,643 -chr20 42655820 . G A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.677;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:914,0,430 -chr20 42695621 . G GT 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.132;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:306,0,173 -chr20 42697521 . TA T 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.399;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=11.11;ReadPosRankSum=-2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:304,0,144 -chr20 42720514 . T G 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.201;DP=53;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:1079,0,2055 -chr20 43153413 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=2.489;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:314,0,495 -chr20 43154302 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,178 -chr20 43154483 . T TA 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-2.982;DP=72;FS=5.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=3.47;ReadPosRankSum=2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:287,0,1026 -chr20 43181364 . G C 3780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.363;DP=210;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,107:209:99:3809,0,3645 -chr20 43181436 . C T 2208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.431;DP=131;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=16.86;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:2237,0,2232 -chr20 43183363 . T C 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.572;DP=100;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1736,0,1743 -chr20 43183381 . C T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.667;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1520,0,1451 -chr20 43534421 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr20 43746462 . T G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.885;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:939,0,931 -chr20 43746846 . G GAC 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:295,0,48 -chr20 43974128 . T C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr20 43974246 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.978;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,159 -chr20 44001439 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr20 44028385 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:300,0,232 -chr20 44155183 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=20.41;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:416,0,267 -chr20 44155358 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.041;DP=15;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,171 -chr20 44513872 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr20 44592330 . G T 1643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=-0.801;DP=95;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:1672,0,3541 -chr20 44746612 . T G 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr20 44780696 . CACCTGAAGGCTCATGAAGGCAGCAAAGTGTGATTCCTTTTACATTACTCCAATGCTAAATATACAATAATGGAAGAAATGACACACTCATGATACAATTTCCAGGCACAGAGCTGCGAACGGCGGCCTT C 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=2.822;DP=24;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:386,0,5380 -chr20 44878096 . C A 1653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.828;ClippingRankSum=-0.979;DP=123;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1682,0,2397 -chr20 44991477 . GA G 452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=1.011;DP=60;FS=4.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:506,0,478 -chr20 44991864 . GT G 817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.465;DP=74;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,35:72:99:871,0,687 -chr20 45817513 . T A 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:670,48,0 -chr20 45838962 . G T 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr20 45848046 . GCTGCAACAAAGAAATGCCATGAATGATCTATGTTTGTTCTCCATATTAATCTCTGCATCCTGAAGTGCAGATTGAGAACTGAC G 3306.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=1.453;DP=76;FS=2.347;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=31.96;ReadPosRankSum=-1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,71:74:99:3344,281,0 -chr20 45870027 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.363;DP=26;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:400,0,516 -chr20 45870095 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.456;DP=35;FS=10.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:273,0,1054 -chr20 46426729 . GA G 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-1.088;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:399,0,311 -chr20 46427140 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.687;DP=78;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:342,0,2098 -chr20 46427341 . T A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.873;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:425,0,2154 -chr20 46608334 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.860;DP=55;FS=8.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:348,0,2261 -chr20 46686240 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.176;DP=89;FS=4.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:621,0,2418 -chr20 46743302 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.080;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:369,0,2386 -chr20 46768283 . C G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.338;DP=91;FS=6.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:650,0,2430 -chr20 46845249 . A G 2584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2613,189,0 -chr20 46845332 . C T 1753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1782,126,0 -chr20 46845376 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:326,0,301 -chr20 46982387 . G T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.582;DP=24;FS=16.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=20.66;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:524,0,315 -chr20 46982441 . G A 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:485,36,0 -chr20 46984081 . GT G 751.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.740;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:41:789,41,0 -chr20 46984433 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.270;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:254,0,1460 -chr20 47101759 . A G 751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:780,57,0 -chr20 47133926 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.474;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:445,0,158 -chr20 47232927 . TA T 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=-2.266;DP=47;FS=12.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:313,0,373 -chr20 47237316 . A AG 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:319,0,561 -chr20 47288936 . C A 384.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=32.02;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:412,0,9 -chr20 47326487 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.276;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:266,0,399 -chr20 47525584 . A G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr20 47602286 . G T 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 -chr20 47604694 . G A 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 -chr20 47604822 . G A 780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:809,63,0 -chr20 47662911 . A G 1208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.416;DP=47;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,34:47:99:1237,0,269 -chr20 47669644 . G A 3281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.948;DP=117;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=28.05;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,86:117:99:3310,0,762 -chr20 47669827 . C T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=2.420;DP=77;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:1023,0,3645 -chr20 47669831 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=2.409;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:1023,0,3651 -chr20 47670232 . T C 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=4.172;DP=82;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=15.11;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1267,0,1540 -chr20 47670259 . A G 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=6.097;DP=83;FS=13.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=26.33;ReadPosRankSum=-4.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:2214,0,2787 -chr20 47670266 . A T 2172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=4.967;DP=93;FS=15.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:2201,0,2787 -chr20 47670498 . T A 4117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-0.673;DP=195;FS=22.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=21.12;ReadPosRankSum=2.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,121:194:99:4146,0,2471 -chr20 47670691 . A G 4599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.051;DP=177;FS=15.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,124:175:99:4628,0,1313 -chr20 47726562 . ACAAC A,AAAC 1464.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.039;DP=94;FS=1.699;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=15.58;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:9,13,57:79:99:1556,1414,3374,163,0,172 -chr20 47726943 . AAGAGAGAGAG A 753.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=1.569;DP=68;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:758,0,1402 -chr20 47822351 . A G 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr20 47823075 . GA G 369.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.671;DP=20;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:9:406,0,9 -chr20 47835467 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 47844988 . G A 1514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;ClippingRankSum=0.137;DP=91;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:1543,0,1436 -chr20 47850581 . T C 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-1.349;DP=101;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1700,0,1731 -chr20 47860858 . T C 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.670;DP=68;FS=13.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1179,0,2761 -chr20 47860861 . G T 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-0.662;DP=70;FS=12.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1179,0,2713 -chr20 47880327 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:240,0,236 -chr20 48015178 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-0.650;DP=48;FS=13.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:317,0,1971 -chr20 48016492 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=3.458;DP=24;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:305,0,1042 -chr20 48018108 . AT A 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=1.863;DP=50;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:491,0,534 -chr20 48018144 . T TTA 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.855;DP=42;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:458,0,642 -chr20 48038123 . A G 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.897;DP=79;FS=6.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=22.01;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,51:79:99:1767,0,936 -chr20 48111290 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=1.243;DP=57;FS=6.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:256,0,1679 -chr20 48139600 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-1.722;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:268,0,722 -chr20 48175993 . T G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.696;DP=37;FS=7.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:526,0,782 -chr20 48210466 . T TCA 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,16:16:56:527,0,56 -chr20 48211363 . T A 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=3.363;DP=35;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:770,0,470 -chr20 48211629 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:262,18,0 -chr20 48211631 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr20 48213394 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.824;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:392,0,345 -chr20 48213479 . C A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr20 48213480 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr20 48213670 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.193;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=14.91;ReadPosRankSum=2.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:565,0,739 -chr20 48213790 . T TA 535.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-2.037;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:573,0,154 -chr20 48213818 . G C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=28.71;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:57:344,0,57 -chr20 48213970 . G T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:290,0,67 -chr20 48215067 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:61:305,0,61 -chr20 48215490 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.041;DP=48;FS=2.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:827,0,839 -chr20 48216088 . C A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.661;DP=49;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:725,0,1017 -chr20 48217218 . G A 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.540;DP=56;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1281,0,703 -chr20 48217440 . C G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=2.077;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=14.63;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:350,0,403 -chr20 48218276 . G GT 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:331,0,569 -chr20 48218575 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.168;DP=38;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:708,0,711 -chr20 48220006 . TAA T 379.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.134;DP=15;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:1:414,1,0 -chr20 48222148 . G A 754.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:783,54,0 -chr20 48368075 . C CA 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.430;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:265,0,851 -chr20 48368828 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=3.227;DP=43;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:409,0,1136 -chr20 48379292 . T C 1591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.651;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1620,0,1829 -chr20 48379313 . C T 2046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.085;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:2075,0,2070 -chr20 48621781 . T C 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-1.030;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:1328,0,405 -chr20 48659062 . G C 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.372;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=27.65;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:526,0,119 -chr20 48659212 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=29.07;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:348,0,51 -chr20 48659870 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr20 48664849 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,298 -chr20 48665665 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.023;DP=29;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:630,0,303 -chr20 48680704 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:317,0,340 -chr20 48707122 . T C 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.524;DP=43;FS=6.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:728,0,999 -chr20 48707545 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-0.170;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:479,0,454 -chr20 48707951 . A G 1561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.531;DP=87;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:1590,0,1531 -chr20 48709772 . G GT 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-1.160;DP=106;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:736,0,1476 -chr20 48713614 . G A 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.011;DP=90;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=15.04;ReadPosRankSum=-2.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1382,0,1660 -chr20 48723914 . T C 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.804;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=15.91;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1333,0,1422 -chr20 48786755 . GAC G 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-1.504;DP=227;FS=9.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,49:210:99:927,0,5637 -chr20 48786930 . TA T 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-1.646;DP=242;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,63:229:99:927,0,4349 -chr20 48997230 . T A 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:527,39,0 -chr20 49073102 . C CT 483.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.886;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:78:533,0,78 -chr20 49766091 . AT A 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-1.338;DP=151;FS=4.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:487,0,1612 -chr20 49767290 . C G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-0.482;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:486,0,170 -chr20 49782226 . G T 8057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.433;ClippingRankSum=0.563;DP=463;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,266:462:99:8086,0,6855 -chr20 49876311 . T C 7593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.902;DP=452;FS=8.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,237:451:99:7622,0,7730 -chr20 49971800 . T A 5269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.710;DP=276;FS=0.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,157:276:99:5298,0,4271 -chr20 49972473 . G A 3928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-2.963;DP=239;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,109:239:99:3957,0,4396 -chr20 49972575 . G A 4800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=1.409;DP=285;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,137:283:99:4829,0,4754 -chr20 49993590 . T C 5774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.084;DP=321;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,176:321:99:5803,0,5146 -chr20 49993625 . A T 5643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-1.558;DP=310;FS=0.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=18.21;ReadPosRankSum=3.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,157:310:99:5672,0,5597 -chr20 50009261 . G A 2363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.214;DP=163;FS=14.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.460;QD=14.50;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,67:163:99:2392,0,3251 -chr20 50079995 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.551;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:340,0,637 -chr20 50107033 . A T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=1.049;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:642,0,828 -chr20 50118492 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-2.685;DP=34;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:378,0,791 -chr20 50119922 . AT A 863.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:61:901,61,0 -chr20 50121390 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.402;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:706,0,801 -chr20 50121920 . T A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.849;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=15.30;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:426,0,1065 -chr20 50122566 . G T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.452;DP=33;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:565,0,1241 -chr20 50122570 . T A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=-0.220;DP=31;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:565,0,1241 -chr20 50142853 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-2.266;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=17.88;ReadPosRankSum=2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:350,0,268 -chr20 50240199 . A C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr20 50249998 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:460,0,115 -chr20 50250253 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=22.52;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:276,0,138 -chr20 50253035 . C CAG 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.395;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:297,0,262 -chr20 50335910 . A C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=-0.471;DP=63;FS=8.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:871,0,1208 -chr20 50342649 . G A 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.330;DP=61;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,36:61:99:1201,0,850 -chr20 50354677 . A C 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.597;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:825,0,937 -chr20 51333455 . C CG 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.894;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=24.45;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:722,0,745 -chr20 51424344 . T C 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.689;DP=89;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:618,0,2556 -chr20 51424359 . T C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.053;DP=96;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,21:96:99:437,0,3167 -chr20 51424476 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.537;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:254,0,2780 -chr20 51430387 . T C 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.014;DP=303;FS=10.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,64:297:99:1297,0,9123 -chr20 51492253 . AT A 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 -chr20 51492644 . T C 251.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:280,0,17 -chr20 51495775 . A AT 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=-0.245;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:75:411,0,75 -chr20 51748056 . A G 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr20 52039688 . A C 1094.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1123,78,0 -chr20 52039854 . A G 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-0.128;DP=22;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:74:717,0,74 -chr20 52041787 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:364,0,441 -chr20 52087695 . A G 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr20 52087770 . A C 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 -chr20 52092600 . A C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:290,0,423 -chr20 52092645 . C G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:329,0,366 -chr20 52098419 . G A 1516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=-0.788;DP=99;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1545,0,1563 -chr20 52102024 . G A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.054;DP=112;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,34:112:99:864,0,2800 -chr20 52102105 . G T 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-2.087;DP=122;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:1629,0,2202 -chr20 52102926 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:341,0,93 -chr20 52103101 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:259,0,58 -chr20 52132902 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.441;DP=129;FS=3.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,34:129:99:718,0,3540 -chr20 52137938 . TCTGCAACAACAGAAAGAGAGCATTAGAAATATGCTGAATAAGCTGTAATAAGTGTGATTGGAGTGGGCGTAC T 4383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=1.698;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:4421,331,0 -chr20 52161037 . C T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.833;DP=38;FS=6.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:688,0,659 -chr20 52161090 . C T 269.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:297,0,12 -chr20 52274747 . T C 259.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:288,0,17 -chr20 52535620 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.281;DP=73;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:364,0,2551 -chr20 52535671 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.319;DP=79;FS=3.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:272,0,2416 -chr20 52623962 . TCCTGAAAAACACACACATACACACAGGTCAAACACACTGTCCTCCTGCGGTTACTGGTGATTTGAGCTGATCTTA T 7268.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-0.504;DP=162;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=33.74;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,154:158:99:7306,661,0 -chr20 52627628 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.051;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,32:190:99:440,0,6125 -chr20 52757310 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.377;DP=31;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:506,0,592 -chr20 52761316 . G T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.348;DP=24;FS=11.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:394,0,435 -chr20 52829494 . T TC 738.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.853;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:35:776,0,35 -chr20 52830071 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:308,0,367 -chr20 52830126 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:343,0,428 -chr20 52863959 . A G 1896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.602;DP=110;FS=3.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1925,0,1954 -chr20 52864142 . A G 1839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=-1.350;DP=102;FS=3.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:1868,0,1666 -chr20 52865086 . C A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=1.147;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:798,0,398 -chr20 52865538 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=2.994;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:425,0,844 -chr20 52867041 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=2.208;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:378,0,456 -chr20 52884121 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr20 52885381 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:231,0,299 -chr20 52895759 . G A 3127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-3.516;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,94:176:99:3156,0,2902 -chr20 52895820 . C T 3744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.776;DP=236;FS=3.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,122:235:99:3773,0,4066 -chr20 52899789 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:238,0,65 -chr20 52904752 . C A 17944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=-1.882;DP=618;FS=4.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=29.04;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,478:617:99:17973,0,2627 -chr20 52940090 . G A 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:537,39,0 -chr20 53065660 . T C 265.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:294,0,18 -chr20 53116224 . G GGT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=-1.194;DP=25;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:247,0,486 -chr20 53167144 . T TAC 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:246,0,252 -chr20 53181927 . C T 1338.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1367,96,0 -chr20 53215134 . C A 2301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.535;DP=132;FS=5.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:2330,0,2229 -chr20 53236865 . T C 1785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=1.570;DP=110;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1814,0,1969 -chr20 53281367 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.555;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:402,0,1879 -chr20 53283259 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.578;DP=41;FS=7.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:321,0,1525 -chr20 53319674 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.348;DP=38;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:263,0,1021 -chr20 53373779 . G T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-0.378;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:284,0,824 -chr20 53395522 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.239;DP=38;FS=7.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:526,0,833 -chr20 53406579 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.793;DP=32;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:517,0,570 -chr20 53745964 . G A 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.299;DP=113;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=12.77;ReadPosRankSum=2.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:1471,0,2394 -chr20 53815828 . A G 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.957;DP=78;FS=5.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.819;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:1277,0,1542 -chr20 53834192 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-2.434;DP=35;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:279,0,864 -chr20 53949575 . T C 247.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:276,0,18 -chr20 54162805 . C CA 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.976;DP=50;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:266,0,889 -chr20 54163190 . C CA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.733;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:443,0,414 -chr20 54165016 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=3.183;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=15.72;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,739 -chr20 54165077 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=-1.511;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:376,0,309 -chr20 54253669 . C A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=1.007;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1734,0,1443 -chr20 54253721 . C T 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-0.643;DP=94;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1731,0,1503 -chr20 54254024 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:251,0,114 -chr20 54254088 . AC A 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.505;DP=25;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:424,0,914 -chr20 54254672 . AAG A 1814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.667;DP=87;FS=2.133;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,56:60:99:1852,143,0 -chr20 54255621 . G T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr20 54255886 . G T 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 -chr20 54256028 . A C 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.358;DP=94;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1775,0,1581 -chr20 54256959 . A T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr20 54257119 . C T 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:36:508,36,0 -chr20 54257122 . A G 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 -chr20 54503700 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.869;DP=33;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:242,0,915 -chr20 54504770 . AC A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.058;DP=26;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:283,0,903 -chr20 54505508 . GA G 432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.794;DP=89;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,22:89:99:470,0,2527 -chr20 54544127 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.825;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=7.68;ReadPosRankSum=-3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:251,0,826 -chr20 54544445 . CT C 710.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-1.019;DP=133;FS=4.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:748,0,3242 -chr20 54595390 . C G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr20 54609641 . G A 11211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.454;DP=392;FS=6.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=28.60;ReadPosRankSum=-1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,307:392:99:11240,0,1575 -chr20 54618468 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-0.752;DP=101;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,19:101:99:303,0,5723 -chr20 54678995 . C T 1523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1552,117,0 -chr20 54680531 . G A 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr20 54680731 . T A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=1.133;DP=36;FS=8.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=24.83;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:922,0,323 -chr20 54699557 . C CA 789.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=1.140;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.761;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:32:937,32,0 -chr20 54737389 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.971;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:331,0,314 -chr20 54741397 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,203 -chr20 54746086 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=-0.843;DP=37;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:623,0,544 -chr20 54746225 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.265;DP=32;FS=8.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:408,0,697 -chr20 54778014 . TCCTGTTAATGACAGCATGTTTAAAGCAGCACAAACACACAGCAGACAGAGTGTGTGAACGGGAAGATCATCGTTA T 5550.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.174;DP=175;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=31.72;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,161:173:99:5588,0,1184 -chr20 54803646 . A G 5655.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:5684,418,0 -chr20 54806020 . A T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=-0.577;DP=27;FS=7.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:550,0,358 -chr20 54808861 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.768;DP=93;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1460,0,1233 -chr20 54888759 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-0.071;DP=40;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:475,0,926 -chr20 54892302 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.122;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:330,0,1284 -chr20 54938474 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=-1.350;DP=49;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:825,0,973 -chr20 54949814 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.507;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:599,0,583 -chr20 54965555 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.156;DP=40;FS=4.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:398,0,2217 -chr20 54985625 . C CT 261.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:299,24,0 -chr20 55054909 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:268,0,256 -chr20 55063831 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.527;DP=25;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:336,0,444 -chr20 55068458 . AGTAAGTGCTTCTGTTATTGTTGAAGATGTTGGATGGTTGATGCTGAAGTGTGTGACTCCGTTTGCTCGTTTGGTTTCCGCAG A 781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=1.552;DP=19;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:58:819,58,0 -chr20 55094077 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,125 -chr20 55109830 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-2.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:235,0,423 -chr20 55126667 . C T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr20 55236388 . C T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr20 55236694 . G A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:387,27,0 -chr20 55236911 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr20 55449301 . A C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.038;DP=270;FS=11.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,53:207:99:1461,0,5922 -chr20 55449810 . G A 3317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.371;ClippingRankSum=-2.021;DP=252;FS=5.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,109:250:99:3346,0,4544 -chr20 55638971 . C A 610.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:639,45,0 -chr20 55639688 . C CT 1744.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=-0.334;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:1782,168,0 -chr20 55640562 . C A 1941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1970,138,0 -chr20 55641154 . GT G 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-2.151;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:518,0,284 -chr20 55641378 . A T 1413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1442,102,0 -chr20 55641453 . C CT 361.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-1.736;DP=20;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:399,13,0 -chr20 55641695 . C T 1232.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1261,87,0 -chr20 55643326 . A G 677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:706,48,0 -chr20 55786635 . T C 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=-1.225;DP=251;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,64:235:99:1468,0,6366 -chr20 55786662 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.717;DP=264;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,49:263:99:684,0,7978 -chr21 19443 . ACT A 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:312,0,55 -chr21 24937 . CG C 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:67:294,0,67 -chr21 30806 . G C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.783;DP=23;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:652,0,105 -chr21 30877 . G A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=1.327;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=25.80;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:828,0,244 -chr21 64785 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=-0.955;DP=67;FS=3.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:555,0,1708 -chr21 71633 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.924;DP=89;FS=5.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:713,0,2338 -chr21 122090 . ACTGGGGAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCTCAGTGATGTGCAGCTGTGGACAGCGTCTGGAACACTGCTGCACTCCTGAACTCAC A 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=33.84;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:511,0,524 -chr21 142164 . GAGGTGCAGATATTCTGTAGGACTGGCCAGTTATAGTTCATCGTGTGGCATTAGTGTTCAGATCTGTAGGTCTGTATTTCTGATTGTGTGTTTGTGTTCATGC G 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=2.072;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:250,0,1871 -chr21 154966 . T TGC 222.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:10:259,0,10 -chr21 186905 . C CA 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.244;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:297,0,162 -chr21 187862 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 -chr21 188632 . C G 332.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:361,27,0 -chr21 190048 . T A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.205;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:491,0,491 -chr21 195789 . T A,G 4110.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,43,77:120:99:4506,2801,2682,1720,0,1513 -chr21 195846 . G C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=1.947;DP=39;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=17.30;ReadPosRankSum=-2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:703,0,547 -chr21 212030 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.292;DP=36;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=5.77;ReadPosRankSum=-2.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:236,0,2096 -chr21 212035 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.200;DP=36;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=5.88;ReadPosRankSum=-3.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:240,0,2096 -chr21 212058 . TCTGAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGACGTCACGCACTGCTCCACACACTAGCATTAGCTCACCGCGGCGTGTCAGAC T 1955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=1.518;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,41:46:99:1993,204,0 -chr21 212530 . C A 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.119;DP=87;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:1144,0,1735 -chr21 225793 . A AG 366.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 -chr21 225795 . T A 375.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 -chr21 231728 . G GGT 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.525;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:539,0,116 -chr21 232722 . G C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.936;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:268,0,900 -chr21 249227 . C A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-1.023;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.127;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:1028,0,5699 -chr21 254135 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=27.41;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:92:412,0,92 -chr21 255431 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:69:324,0,69 -chr21 290202 . CT C 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-2.003;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:390,0,736 -chr21 300762 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-1.545;DP=302;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,84:302:99:1849,0,7922 -chr21 325547 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.350;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:359,0,2132 -chr21 328337 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-1.638;DP=37;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:358,0,860 -chr21 339448 . GCTCTCTCT G,GCTCT 288.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,3:9:99:383,134,196,267,0,275 -chr21 367248 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.283;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:518,0,1786 -chr21 369134 . G T 4430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.571;DP=376;FS=6.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,137:376:99:4459,0,7667 -chr21 389147 . G A 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 -chr21 420996 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-0.297;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.891;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:316,0,1201 -chr21 462245 . A AGGACGG 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.171;DP=37;FS=5.855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:21:670,21,0 -chr21 465002 . G C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-1.483;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:429,0,564 -chr21 480034 . G C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-1.058;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:468,0,274 -chr21 480093 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,363 -chr21 481161 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.209;ClippingRankSum=4.601;DP=73;FS=6.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:335,0,2242 -chr21 484986 . C T 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=3.470;DP=375;FS=8.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.389;QD=3.19;ReadPosRankSum=3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,92:364:99:1223,0,11231 -chr21 538428 . G A 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.503;DP=100;FS=3.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:669,0,2666 -chr21 540400 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=-0.687;DP=85;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:537,0,2302 -chr21 541858 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.027;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:417,0,2399 -chr21 541971 . T A 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-1.540;DP=102;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:2084,0,5502 -chr21 541975 . A G 2517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.532;DP=101;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=24.93;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,75:101:99:2546,0,3136 -chr21 542034 . T A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.295;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:573,0,3260 -chr21 542118 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-1.266;DP=97;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:416,0,3298 -chr21 542568 . T C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-1.254;DP=83;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:525,0,2323 -chr21 543325 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.552;DP=95;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:516,0,2743 -chr21 555342 . T C 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-1.550;DP=103;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=7.42;ReadPosRankSum=2.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:792,0,2621 -chr21 555906 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=1.855;DP=86;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:698,0,2146 -chr21 561217 . C A 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=1.002;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,33:142:99:635,0,4110 -chr21 561334 . T C 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.180;DP=114;FS=4.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:99:596,0,3290 -chr21 561861 . TAG T 1171.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1209,99,0 -chr21 561984 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.316;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:317,0,2373 -chr21 562690 . G A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr21 563398 . A T 1168.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1197,87,0 -chr21 564080 . AG A 1215.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-1.016;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=31.38;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:85:1253,85,0 -chr21 564193 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:266,0,340 -chr21 564218 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,340 -chr21 564286 . TAA T 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.588;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=30.01;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:2299,0,172 -chr21 564484 . G T 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-4.143;DP=42;FS=7.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=17.54;ReadPosRankSum=4.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:765,0,1076 -chr21 565049 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.966;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:237,0,728 -chr21 565147 . C A 650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:679,48,0 -chr21 565670 . T G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.255;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:388,0,2486 -chr21 566205 . AC A 1255.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:1293,104,0 -chr21 567392 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.941;DP=29;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:324,0,1304 -chr21 568225 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-2.133;DP=66;FS=6.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,31:66:99:1092,0,2452 -chr21 568617 . TA T 1796.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=1.111;DP=87;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,66:83:99:1834,0,304 -chr21 568623 . AAG A 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-1.685;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:253,0,2721 -chr21 598967 . GAGGTCTGACACTCGCACACAGACCCCATAATACCAGCTCTGTCAGGGCTCACACAGTAGCCACTCAGTCTAATTGCATTACTGTTTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT G 15861.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.777;DP=382;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=32.61;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,379:382:99:15899,1419,0 -chr21 602146 . A G 3965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,127:139:99:4598,0,185 -chr21 734139 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:248,0,418 -chr21 758098 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-0.455;DP=46;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:571,0,1044 -chr21 774409 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-2.183;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:510,0,651 -chr21 774501 . T G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.310;DP=33;FS=5.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:607,0,461 -chr21 775037 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.364;DP=54;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=4.24;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:257,0,1557 -chr21 821354 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.693;ClippingRankSum=-3.693;DP=23;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=38.00;ReadPosRankSum=-3.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:1298,0,342 -chr21 822418 . C T 2218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=1.568;DP=431;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=5.15;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,105:431:99:2247,0,12523 -chr21 827354 . G C 2266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.268;DP=357;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,96:357:99:2295,0,10084 -chr21 868309 . GCA G 2909.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.187;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.490;QD=21.55;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,89:100:61:2947,61,0 -chr21 868490 . C A 1403.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=2.250;DP=19;FS=11.491;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=35.13;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,15:19:9:1431,9,0 -chr21 868955 . CAA C 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:47:279,0,47 -chr21 941182 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr21 941496 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.868;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:332,0,817 -chr21 941513 . T C 2253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2282,163,0 -chr21 943972 . G A 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-2.489;DP=155;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=1.71;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,24:139:99:302,0,7087 -chr21 943976 . G A 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-1.031;DP=146;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.760;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,33:145:99:618,0,7991 -chr21 1027742 . G T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr21 1071957 . C T 2025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2054,161,0 -chr21 1072170 . TG T 1200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.164;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=31.60;ReadPosRankSum=-2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,30:38:99:1238,0,889 -chr21 1072172 . T A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.772;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=31.84;ReadPosRankSum=-2.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,30:38:99:1238,0,800 -chr21 1077345 . G A 2119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.852;DP=279;FS=6.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,84:278:99:2148,0,7534 -chr21 1089593 . T A 2357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-1.659;DP=409;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=5.76;ReadPosRankSum=4.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,104:406:99:2386,0,11558 -chr21 1107772 . T C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=1.168;DP=127;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,26:127:99:510,0,4003 -chr21 1301743 . A T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,240 -chr21 1391248 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-1.706;DP=38;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=6.97;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:293,0,982 -chr21 1395188 . CA C 206.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr21 1722733 . C T 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=-1.687;DP=88;FS=1.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,59:88:99:2036,0,771 -chr21 1724745 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.156;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:243,0,1579 -chr21 1727542 . C T 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=1.426;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=29.33;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:908,0,111 -chr21 1807927 . C CA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.023;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,12:65:99:274,0,3910 -chr21 1809007 . C A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:332,0,240 -chr21 1906090 . T C 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:27:245,0,27 -chr21 1940089 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:399,0,543 -chr21 2008861 . A AAG 570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:608,47,0 -chr21 2010038 . G GT 605.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:77:711,77,0 -chr21 2015373 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,367 -chr21 2015377 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:366,0,275 -chr21 2100405 . C T 785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:814,57,0 -chr21 2360303 . C CA 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.860;DP=99;FS=2.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.405;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:345,0,1835 -chr21 2573728 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:270,0,97 -chr21 2595401 . GT G 221.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr21 2595404 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr21 2631086 . C A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr21 2631753 . T C 999.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1028,72,0 -chr21 2631814 . GA G 503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:541,52,0 -chr21 2638673 . G T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=-2.770;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:344,0,224 -chr21 2650389 . G A 907.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:63:936,63,0 -chr21 2677695 . C T 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr21 2733771 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr21 2760539 . C T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr21 2762893 . A T 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 -chr21 2768368 . C G 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr21 2904894 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:239,0,332 -chr21 2911459 . GA G 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.974;DP=37;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:437,0,523 -chr21 2912228 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=4.989;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:251,0,3270 -chr21 2912229 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=4.968;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:251,0,3270 -chr21 2991438 . C T 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1682,120,0 -chr21 3111963 . T C 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr21 3112783 . T G 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:307,24,0 -chr21 3249179 . C T 210.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:2:237,0,2 -chr21 3311928 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-0.961;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:640,0,225 -chr21 3313743 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.460;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:374,0,398 -chr21 3321177 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=1.925;DP=31;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:563,0,469 -chr21 3488302 . C G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=1.285;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:650,0,369 -chr21 3867584 . A G 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.211;DP=46;FS=8.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.382;QD=18.56;ReadPosRankSum=1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:882,0,721 -chr21 3964689 . TTATAAGGGTTTAGAATTTAGCATCATGTTC T 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=1.892;DP=38;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:435,0,4740 -chr21 4021933 . G T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,864 -chr21 4058884 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.731;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:290,0,1227 -chr21 4069724 . C G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:270,0,288 -chr21 4260492 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.340;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:340,0,1984 -chr21 4260810 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=2.259;DP=38;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=8.60;ReadPosRankSum=-3.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,4:38:99:355,0,2412 -chr21 4260814 . TTG T 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=2.268;DP=37;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:402,0,650 -chr21 4315951 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.670;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,240 -chr21 4564097 . AT A 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.098;DP=37;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:546,0,357 -chr21 4774170 . AAGGTACAGTTTTCCACCCTGCAGGCTTATAAATAATGTTAAAAACTCTGATCTTAGTAACAATATATCTCATGTCTGTTCCATCAAAC A 3856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=2.396;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,90:92:99:3894,294,0 -chr21 5025110 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:240,0,447 -chr21 5026160 . A G 1474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1503,111,0 -chr21 5033409 . G A 3090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.499;DP=151;FS=3.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=20.47;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,95:151:99:3119,0,1821 -chr21 5034394 . G C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=1.744;DP=193;FS=3.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,29:193:99:251,0,6084 -chr21 5066983 . C T 3323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.815;DP=201;FS=9.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,107:201:99:3352,0,3358 -chr21 5066998 . C T 3602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=-0.008;DP=205;FS=6.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,114:205:99:3631,0,3140 -chr21 5082638 . C T 12712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.230;DP=187;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,118:186:99:12741,0,1241 -chr21 5082692 . T C 3271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-3.510;DP=162;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=20.20;ReadPosRankSum=2.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,105:160:99:3300,0,3682 -chr21 5082743 . C T 5472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-2.123;DP=220;FS=2.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,166:219:99:5501,0,3719 -chr21 5082774 . T C 4149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=1.488;DP=232;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.252;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,123:232:99:4178,0,6003 -chr21 5082926 . A G 8094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.161;DP=258;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=31.38;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,182:256:99:8123,0,1550 -chr21 5083133 . T C 7629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=1.801;DP=289;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,207:289:99:7658,0,1935 -chr21 5083367 . C T 3300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=-1.743;DP=195;FS=18.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=16.93;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,100:195:99:3329,0,3501 -chr21 5083520 . C T 4576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-1.312;DP=238;FS=0.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,139:238:99:4605,0,3319 -chr21 5083553 . C T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=1.331;DP=276;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,52:275:99:784,0,8586 -chr21 5083652 . C T 5629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=2.063;DP=282;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=19.96;ReadPosRankSum=-2.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,150:282:99:5658,0,8590 -chr21 5083658 . A G 5611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;ClippingRankSum=2.999;DP=270;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=20.78;ReadPosRankSum=-2.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,144:270:99:5640,0,8590 -chr21 5083775 . A G 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=3.506;DP=104;FS=15.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=15.24;ReadPosRankSum=-2.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:1613,0,1885 -chr21 5083822 . T A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=2.415;DP=46;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:332,0,1243 -chr21 5204608 . C CT 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-2.453;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:369,0,490 -chr21 5205604 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DP=68;FS=16.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:964,0,1429 -chr21 5206399 . A C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-2.059;DP=50;FS=10.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:691,0,1119 -chr21 5207338 . G A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-2.541;DP=67;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:939,0,1437 -chr21 5207864 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.149;DP=118;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,22:118:99:392,0,3789 -chr21 5208429 . G GTT 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.259;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:241,0,1316 -chr21 5209097 . T C 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.283;DP=57;FS=7.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:826,0,1187 -chr21 5209861 . T TA 793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.914;DP=51;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:831,0,273 -chr21 5210852 . T C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-1.230;DP=27;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:575,0,590 -chr21 5211741 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=1.129;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:282,0,1090 -chr21 5240799 . AT A 1107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.898;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:1145,0,854 -chr21 5241239 . T G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=1.964;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=7.42;ReadPosRankSum=-2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,2:61:99:488,0,4490 -chr21 5241942 . GT G 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.393;DP=62;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=26.30;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,44:60:99:1668,0,204 -chr21 5242115 . T C 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=-0.030;DP=53;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=29.45;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,39:53:99:1589,0,420 -chr21 5242336 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=2.224;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=20.22;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,228 -chr21 5242814 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.859;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:266,0,1429 -chr21 5242891 . T C 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=1.183;DP=51;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:935,0,776 -chr21 5243086 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=32.70;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:281,0,137 -chr21 5243560 . T C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:510,0,377 -chr21 5244062 . C T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=1.080;DP=42;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:842,0,1525 -chr21 5249743 . A T 483.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=34.52;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:510,0,4 -chr21 5250071 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,226 -chr21 5254550 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,231 -chr21 5254584 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=1.670;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:246,0,260 -chr21 5255463 . A AT 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.452;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:310,0,129 -chr21 5258098 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-0.655;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:78:829,0,78 -chr21 5258463 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.118;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=30.99;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:63:586,0,63 -chr21 5258623 . TA T 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.460;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:512,0,138 -chr21 5259241 . T TA 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:374,0,213 -chr21 5274960 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=25.93;ReadPosRankSum=-1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:495,0,166 -chr21 5275780 . A ACT 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:98:363,0,98 -chr21 5277226 . T A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.189;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:583,0,554 -chr21 5279337 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.716;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:584,0,984 -chr21 5280134 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:343,0,288 -chr21 5310873 . G A 1206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=-1.336;DP=39;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=30.94;ReadPosRankSum=2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,32:39:99:1235,0,121 -chr21 5314875 . C A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.026;DP=66;FS=3.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:505,0,1740 -chr21 5369004 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=1.999;DP=34;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.40;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,2:33:99:246,0,1168 -chr21 5399592 . AAGGTTGATCAGCTGAATTTCAAGATATGCAATCTTTTCGTTCGTGAGAAAGTCTTGCATGGGATTAACAGAACTCTAACTCTCGTTCTC A 1285.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=1.372;DP=247;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,232:235:99:1323,442,0 -chr21 5444917 . A G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-2.355;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=21.08;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:492,0,256 -chr21 5466011 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:421,0,424 -chr21 5466322 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,360 -chr21 5469505 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=2.262;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:296,0,173 -chr21 5469570 . T G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:250,0,286 -chr21 5476428 . G A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.592;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:1031,0,1534 -chr21 5479550 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=-0.414;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=14.32;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:558,0,695 -chr21 5480229 . A G 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.162;DP=28;FS=1.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:580,0,427 -chr21 5480824 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=2.227;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:396,0,744 -chr21 5481434 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=-3.132;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:470,0,1060 -chr21 5482901 . A G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:21:292,21,0 -chr21 5483011 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:359,0,48 -chr21 5614079 . G A 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=1.386;DP=68;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:1124,0,1182 -chr21 5632254 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.332;DP=52;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:432,0,1290 -chr21 5776655 . GA G 554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:592,57,0 -chr21 5837973 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 6835.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:6983,824,0 -chr21 5838094 . G A 5912.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:5941,365,0 -chr21 5904131 . G A 2480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.193;DP=122;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,76:122:99:2509,0,1504 -chr21 5907674 . A G 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-1.827;DP=70;FS=2.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=7.10;ReadPosRankSum=1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:525,0,2060 -chr21 5910081 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.156;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:242,0,1634 -chr21 5910715 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.061;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:244,0,999 -chr21 5910722 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.387;DP=30;FS=8.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:365,0,836 -chr21 6054442 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,477 -chr21 6054443 . A G 658.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:9:686,9,0 -chr21 6164045 . A G 742.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:771,54,0 -chr21 6285715 . A G 1479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1508,108,0 -chr21 6343142 . T C 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 -chr21 6346398 . A AAC 648.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:686,50,0 -chr21 6346657 . GT G 284.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:322,27,0 -chr21 6568287 . T TTCATCATCA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-2.302;DP=72;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.97;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:323,0,246 -chr21 6680645 . T TA 978.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.834;DP=174;FS=16.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,60:153:99:1016,0,2153 -chr21 6770164 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.253;DP=21;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:269,0,447 -chr21 6770935 . A AT 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.145;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:340,0,380 -chr21 6772127 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.517;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:380,0,630 -chr21 6772195 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=1.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,354 -chr21 6773994 . G GA 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.194;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:334,0,228 -chr21 6774866 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.079;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,461 -chr21 6774924 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.084;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:233,0,912 -chr21 6776075 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,259 -chr21 6776670 . T G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:420,0,306 -chr21 6777132 . A T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.887;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.045;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:405,0,284 -chr21 6777535 . T TA 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:298,0,140 -chr21 6777829 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=1.080;DP=28;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=30.81;ReadPosRankSum=2.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:73:891,0,73 -chr21 7304463 . C T 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-1.513;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=25.88;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,42:62:99:1633,0,548 -chr21 7304580 . A C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.406;DP=55;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:408,0,1534 -chr21 7304728 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-2.086;DP=47;FS=17.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=5.31;ReadPosRankSum=2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:278,0,1385 -chr21 7306426 . C G 1309.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1338,96,0 -chr21 7349317 . T A 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:658,45,0 -chr21 7349745 . C A 331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:360,30,0 -chr21 7351366 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:730,51,0 -chr21 7551449 . A AGT 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:336,27,0 -chr21 7554420 . AG A 388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:34:426,34,0 -chr21 7844061 . AGTGAGTATAAACTCACGTCATGCATGCTTGTAGTTTTTGATCCCTGACATCAAATGACACTGCATGTTTTTCTGATTTGTTGCATAG A 15239.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=1.656;DP=330;FS=1.723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=27.50;ReadPosRankSum=-1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,325:330:99:15430,1376,0 -chr21 7847166 . C T 9357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=4.558;DP=573;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,263:573:99:9386,0,9894 -chr21 7849046 . A G 209.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:238,0,19 -chr21 7849710 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:308,0,187 -chr21 7850196 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=1.558;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=21.28;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:390,0,199 -chr21 7851581 . T G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.849;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:479,0,400 -chr21 7856098 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:397,0,128 -chr21 7857127 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=1.466;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:349,0,132 -chr21 7862831 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=1.946;DP=31;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=26.19;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:840,0,216 -chr21 7926964 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.80;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:301,0,98 -chr21 7927011 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-1.131;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:540,0,498 -chr21 7947593 . C T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.267;DP=61;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1028,0,1034 -chr21 7954724 . G A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-1.568;DP=57;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:876,0,1137 -chr21 7962026 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:308,0,168 -chr21 7962796 . CT C 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:242,0,210 -chr21 7963115 . G C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr21 7963183 . A C 266.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:295,0,18 -chr21 7963256 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.296;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:338,0,49 -chr21 7963799 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.766;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:332,0,175 -chr21 7964419 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:241,0,461 -chr21 7968580 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,133 -chr21 7970543 . G T 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.214;DP=50;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:902,0,863 -chr21 7972598 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:375,0,55 -chr21 7972729 . A G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.445;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:597,0,751 -chr21 7976299 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.139;DP=33;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:439,0,990 -chr21 7978803 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=-0.476;DP=45;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=12.31;ReadPosRankSum=2.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:582,0,970 -chr21 7981534 . T G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.343;DP=36;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:312,0,926 -chr21 7983852 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.638;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:608,0,563 -chr21 7985277 . A G 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.057;DP=45;FS=6.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=17.64;ReadPosRankSum=-1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:822,0,728 -chr21 8132543 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,364 -chr21 8132600 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.152;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:325,0,375 -chr21 8195920 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:346,0,426 -chr21 8225649 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:425,0,158 -chr21 8225692 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.369;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=25.16;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:456,0,157 -chr21 8578223 . T A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr21 8580186 . T C 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:541,39,0 -chr21 8580649 . G GA 448.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:486,33,0 -chr21 8815852 . C A 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=2.277;DP=71;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:1017,0,1377 -chr21 8830789 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.694;DP=56;FS=3.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1208,0,739 -chr21 8855023 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr21 8856572 . T G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:390,0,92 -chr21 9410994 . GGGTAAAAACTCCAGATTACTATAAACATCACGACTTTAACATTAACATTACTCGCACATTGTGACAATAACAATGAACTGGGTTATATAGAAAGGTGTAGATTTAAAACCAAGGAGTGGTGTATAATCCTTTCTCTTTTTTTCA G 2895.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=1.679;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:2933,224,0 -chr21 9415248 . AT A 274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:312,31,0 -chr21 9425002 . GATTCAC G 1578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1616,116,0 -chr21 9426014 . A T 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 -chr21 9435506 . ACTGTACAGAGTCACAAAAGGATATTGTTAATAAAACATAATGTATACCATTTGTAGGGTTTTGCATATGGAGCAAGAGAAACAAACACTCAC A 4588.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=2.403;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,103:105:99:4626,352,0 -chr21 9515031 . C G 2423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2452,180,0 -chr21 9516564 . G A 2301.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2330,166,0 -chr21 9753957 . A AAC 545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:583,45,0 -chr21 9780685 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=2.942;DP=30;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=12.73;ReadPosRankSum=-2.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:410,0,917 -chr21 9780689 . TCTAAAACACAGACAAAATAAATTAAACATATGACACTTTGGATTAAGAGGTATTTTGTGTTTGACTTCTGAC T 1386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=1.300;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=35.66;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1424,114,0 -chr21 9806770 . TGGTAAAACACAAACAAAAACACAGTGCATTGCTGAATATTAAATGCAAAATAAAGCACAAGGCTTTGTCTTTGCA T 998.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.207;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.489;QD=33.29;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:99:1036,0,615 -chr21 9916666 . AAGGTGTTGACAAACTTTGTTTCTGATGATGTTCAAATTAAATCAGTTGACATTTGACACATATTTGACTACTTGCATGTTGTCT A 3125.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=4.789;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.052;QD=32.56;ReadPosRankSum=-5.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,79:96:99:3163,0,4897 -chr21 9918545 . A G 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.379;DP=85;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,28:85:99:757,0,2197 -chr21 9925984 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.572;DP=54;FS=2.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:260,0,1561 -chr21 9926152 . A G 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.633;DP=56;FS=7.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:937,0,1037 -chr21 9990163 . G T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:38:322,0,38 -chr21 9990165 . T A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=32.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:38:322,0,38 -chr21 9990518 . C CT 2453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-2.114;DP=239;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,119:211:99:2491,0,2009 -chr21 9990627 . CTACAG C 223.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:261,27,0 -chr21 9995172 . GCCTGTAAACAGACGAAGATGCTGTTATTTGTGTGAAGAAATTAGAGGAACATTGTTGCAGGTTTGTTTGCGGTA G 16371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=1.723;DP=388;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=26.48;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,366:367:99:16409,1262,0 -chr21 9999646 . ACTTTGACAAACAGCAGAAATGAAAGTCAGTATCGAAGAAAAGTGCGAATGTGTATAGATGTCAATAGAGAAGAAATTCAC A 11431.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.304;DP=248;FS=2.201;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=34.83;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,235:238:99:11469,1147,0 -chr21 10001598 . G GC 770.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.900;DP=606;FS=12.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:434,106:540:99:808,0,12152 -chr21 10029727 . TCTGCTCAAAGAAAGAGAGACATGTTTAGTTTTGATGTTAATGCAGATGTTTTTGTCGATGTGTTTTAAAATGTTGTTAC T 11218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=-2.087;DP=350;FS=9.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=32.05;ReadPosRankSum=-5.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,272:327:99:11256,0,1893 -chr21 10029730 . GC G 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-1.819;DP=347;FS=11.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=0.79;ReadPosRankSum=5.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,52:347:99:312,0,25246 -chr21 10029732 . TCAAAGAAAGAGAGACATGTTTAGTTTTGATGTTAATGCAGATGTTTTTGTCGATGTGTTTTAAAATGTTGTTACCTGC T 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=-2.310;DP=372;FS=11.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=0.75;ReadPosRankSum=5.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:320,52:372:99:315,0,25246 -chr21 10196987 . G GA 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.455;DP=51;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:472,0,657 -chr21 10200510 . A G 6898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-2.364;DP=173;FS=6.302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=25.83;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,171:173:99:6927,503,0 -chr21 10201477 . G C 4193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.805;DP=130;FS=13.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=32.26;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,111:129:99:4222,0,114 -chr21 10205851 . T TA 1952.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-1.230;DP=192;FS=3.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,82:173:99:1990,0,6953 -chr21 10205852 . T A 2736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.098;DP=192;FS=7.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=14.25;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,89:182:99:3104,0,6248 -chr21 10223703 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:294,0,181 -chr21 10263761 . CT C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-0.093;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:240,0,344 -chr21 10267720 . C T 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.217;DP=45;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:851,0,733 -chr21 10268766 . GT G 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=1.028;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:389,0,1834 -chr21 10269119 . C CT 236.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:274,27,0 -chr21 10305625 . TTG T 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.742;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.447;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:621,0,1070 -chr21 10309582 . A G 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.563;DP=68;FS=18.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1331,0,845 -chr21 10321009 . G A 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.550;DP=72;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,40:72:99:1284,0,1128 -chr21 10382841 . G A 1780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=2.076;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=13.39;ReadPosRankSum=-2.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:1809,0,6027 -chr21 10387487 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-1.309;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:561,0,492 -chr21 10454278 . TCTGGAGAACAAAAAGAAAAAAACAGCTGATGTACACATGCTGTACTCTCGTCAGATCTCTGATTCGAAATTATGCACAGTGATACAAAAGTACCTCCATAC T 639.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:62:677,62,0 -chr21 10501087 . CT C 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.183;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:346,0,889 -chr21 10502741 . G GAT 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=-1.380;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:385,0,259 -chr21 10503895 . C CT 357.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:56:494,56,0 -chr21 11249224 . C CA 304.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.935;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:7:341,7,0 -chr21 11249369 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.983;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:350,0,641 -chr21 11250941 . C A 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.731;DP=71;FS=3.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,48:71:99:1882,0,673 -chr21 11251081 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.885;DP=53;FS=7.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:988,0,897 -chr21 11253039 . G T 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-0.630;DP=72;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:923,0,1547 -chr21 11289186 . G A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.960;DP=37;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:625,0,744 -chr21 11289577 . TAA T 336.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr21 11289950 . A G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr21 11290986 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.184;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:487,0,1246 -chr21 11290994 . C A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.741;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:487,0,1254 -chr21 11291300 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.542;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:282,0,813 -chr21 11291855 . C G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:389,0,203 -chr21 11292459 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,799 -chr21 11292888 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.450;DP=34;FS=11.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:388,0,804 -chr21 11293116 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.615;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:475,0,478 -chr21 11294965 . CA C 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=1.920;DP=20;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:307,0,163 -chr21 11295380 . C T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.352;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:726,0,1077 -chr21 11338747 . AAGGTAAAGTATTTTGTCTAAATTTGTCTGAACACTTACCTGAATTTAAGCCTTATTGTTACTCAATGCAAC A 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=1.805;DP=26;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:580,0,3002 -chr21 11348769 . T G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr21 11352645 . GA G 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=1.190;DP=153;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,36:151:99:416,0,4872 -chr21 11352654 . C CA 1081.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.498;DP=193;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,54:192:99:1119,0,5735 -chr21 11370068 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=1.135;DP=399;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=1.76;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,65:399:99:729,0,13143 -chr21 11390562 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.241;DP=323;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,47:323:99:401,0,10888 -chr21 11407713 . AAGGTATGAAGAACGCAAATGTACCTGAAAGAAAACTATTTATTTGGTTTGCCTTCAACTCTTGTTCTCCATTC A 15521.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=372;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,358:358:99:15559,1227,0 -chr21 11412704 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.118;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:763,0,846 -chr21 11416701 . C T 9128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.112;DP=344;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=26.54;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,239:343:99:9157,0,2657 -chr21 11418367 . AGTAAGCAGCCCACTTATTATTTCACAATACACTGCTCAACTGAAAGTGCTAACTGAAAACGTGATGCGAATGTTTGCTTCAG A 1401.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=4.082;DP=446;FS=0.922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,383:401:99:1439,568,0 -chr21 11428278 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,136 -chr21 11428765 . G GT 2407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2578,253,0 -chr21 11429425 . C CT 4159.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.617;DP=220;FS=5.811;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,175:189:99:4767,390,0 -chr21 11429528 . TCCTGCAAAAAGAAAACATGTTAGATTTACACTTAAACTACAGTATCTGCAAATATCAGATTGAAGTCTAAGCTTGTATAAACTCTCACCTCA T,TCCTCA 13777.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.151;DP=364;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=31.11;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,54,278:333:99:12994,12324,21737,1565,0,1624 -chr21 11448352 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.764;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:507,0,1086 -chr21 11448385 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-0.850;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:481,0,505 -chr21 11448490 . T C 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=1.465;DP=41;FS=8.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,32:41:99:1584,0,450 -chr21 11448514 . C G 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=1.244;DP=41;FS=8.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=28.42;ReadPosRankSum=-1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,32:41:99:1584,0,495 -chr21 11814329 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.268;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:374,0,1293 -chr21 11815749 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,99 -chr21 11820290 . T C 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.281;DP=70;FS=2.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:799,0,1483 -chr21 11857482 . GAACCCTAAAAAGGATTAACAAGCAACATTTTATCA G 2039.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.292;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,58:78:99:2077,0,2657 -chr21 11857485 . CCCTAAAAAGGATTAACAAGCAACATTTTATCAGACTAAAAAACATAATGTGGTCTGTATGCAGTTGGGCTGTGATCGAGCGAGTCAGAGGTGTGCAA C 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.021;DP=88;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=3.66;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:359,0,4995 -chr21 11857520 . CTAAAAAACATAATGTGGTCTGTATGCAGTTGGGCTGTGATCGAGCGAGTCAGAGGTGTGCAA C 2039.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=-1.249;DP=87;FS=4.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:99:2077,0,3028 -chr21 11961495 . AT A 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=-1.362;DP=26;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:527,0,107 -chr21 11962699 . CT C 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=1.012;DP=33;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:258,0,427 -chr21 11963626 . G GT 613.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:651,63,0 -chr21 11964322 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:346,0,255 -chr21 11964399 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-1.033;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:382,0,1269 -chr21 11970349 . CACCTAAAAAGGATTGTGTTTAAAAAGTTGATGTGCCCTGCAATCAGAAGTGGCCGTACGCTTGCTT C 2396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=1.366;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=34.24;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,57:59:99:2687,229,0 -chr21 11977588 . G A 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.264;DP=70;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:1162,0,1039 -chr21 12002537 . T TA 235.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:23:273,23,0 -chr21 12003201 . GA G 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.170;DP=34;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:393,0,401 -chr21 12111069 . C T 1614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.164;DP=284;FS=4.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,71:279:99:1643,0,7978 -chr21 12121962 . T A 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.727;DP=242;FS=16.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,47:242:99:769,0,7498 -chr21 12122246 . G A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.533;DP=182;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,39:181:99:680,0,5437 -chr21 12122962 . C CT 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-1.491;DP=192;FS=2.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,36:175:99:273,0,3850 -chr21 12285248 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:44:334,0,44 -chr21 12468341 . CCCTTCATCAAGAGAAAAACAGTACTATTACTCCTTCAGAAGACAGTGAGATAGATGGTGTTTGAAACGGATGACTTCAGCAGAAATTGTGCCGACATCAAGAAGTTAATTTACACA C 1150.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=2.037;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=26.67;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:99:1188,106,0 -chr21 12579391 . AT A 269.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:307,30,0 -chr21 12846611 . GA G 775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.309;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:813,0,116 -chr21 12846758 . C A 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.188;ClippingRankSum=-1.439;DP=87;FS=5.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:1645,0,1484 -chr21 12847342 . C T 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.912;DP=78;FS=7.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,34:78:99:1192,0,1500 -chr21 12899077 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-2.652;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=21.12;ReadPosRankSum=2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:345,0,214 -chr21 12900594 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-1.323;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=28.54;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:75:542,0,75 -chr21 12901442 . A T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-0.686;DP=30;FS=5.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:505,0,528 -chr21 12908732 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:352,0,557 -chr21 13014799 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-1.681;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:420,0,353 -chr21 13032496 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.804;DP=49;FS=9.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:310,0,1405 -chr21 13040822 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.111;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:434,0,601 -chr21 13041271 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=1.244;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:492,0,751 -chr21 13048124 . C A 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=-1.225;DP=55;FS=5.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:929,0,1017 -chr21 13048535 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=2.045;DP=56;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:923,0,982 -chr21 13048551 . GCTGTGGTGGAGCACCAAAAGGGTTCAGGGGTCAGAGAAATCCAAATGAATCAGAACTGGAGAGGAATAAATGAACTAAC G 1027.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=-1.100;DP=54;FS=7.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,32:53:99:1065,0,909 -chr21 13048552 . CTGTGGTGG C 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.853;DP=53;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:736,0,1246 -chr21 13048561 . AGCACCAAAAGGGTTCAGGGGTCAGAGAAATCCAAATGAATCAGAACTGGAGAGGAATAAATGAACTAACCG A 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-0.745;DP=54;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:736,0,1230 -chr21 13048704 . T C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-1.407;DP=46;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:697,0,835 -chr21 13838647 . T A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=35.02;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:86:562,0,86 -chr21 13914684 . A AT 876.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-1.061;DP=178;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,48:177:99:914,0,4137 -chr21 14300837 . GCCTGTCCATAAAAAGAGAAGTTTATGAGAGAGGTTGCAGAAATCATACACGCTAAAGTCTATAGCAACACTGTGCCTCA G 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:369,0,398 -chr21 15518197 . G GTT 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:241,0,93 -chr21 15519547 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.653;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:424,0,221 -chr21 15519799 . GAGGTTGACTTTTTGTTCCTATTTTTTGTTTGATTAAAGTTGTTGATGCACTCTTTTAATCCTCTACATTCTTCGCAATGAC G 10124.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-1.069;DP=269;FS=2.995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=31.20;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,254:256:99:10162,959,0 -chr21 15538916 . AAGGTAATGAAAGATTCATACTCTAATAGGTAATGCTTCATACATATCTAACCTTTAATAATATGAATGCTTTAC A 26472.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.666;DP=260;FS=1.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=22.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,254:259:99:26510,1937,0 -chr21 15542278 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,222 -chr21 15543761 . T TA 1485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=1.092;DP=119;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1523,0,1136 -chr21 15543946 . TA T 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=1.425;DP=64;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=13.23;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,37:61:99:884,0,567 -chr21 15596988 . C T 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=3.559;DP=132;FS=10.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,42:132:99:1082,0,3294 -chr21 15607286 . C G 3772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-1.072;DP=218;FS=7.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,116:217:99:3801,0,3588 -chr21 15609772 . G A 4209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.250;DP=244;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=17.25;ReadPosRankSum=2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,130:243:99:4238,0,4021 -chr21 15617403 . A C 5105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.686;DP=279;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,141:279:99:5134,0,4932 -chr21 15617684 . G GT 686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.126;DP=55;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:724,0,723 -chr21 15618491 . A G 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-3.133;DP=63;FS=11.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:997,0,1187 -chr21 15619439 . C T 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-0.761;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:1603,0,1846 -chr21 15623193 . G A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.186;DP=72;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1204,0,2667 -chr21 15754357 . A G 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.127;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1220,0,1364 -chr21 15770754 . A AT 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-0.106;DP=52;FS=13.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:474,0,757 -chr21 15770926 . C T 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.134;DP=53;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:1064,0,866 -chr21 15772044 . G A 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=-0.430;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1101,0,947 -chr21 15785593 . C G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:237,0,60 -chr21 15786120 . T G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr21 15831195 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=15.82;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:392,0,369 -chr21 15834025 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.633;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.640;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:493,0,521 -chr21 15834287 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.302;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:547,0,669 -chr21 15838866 . C G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.439;DP=27;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=14.40;ReadPosRankSum=3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:417,0,484 -chr21 15847177 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=2.468;DP=39;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:532,0,1423 -chr21 15849453 . C A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.458;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=27.76;ReadPosRankSum=2.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:861,0,1145 -chr21 15849688 . C A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-2.091;DP=44;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:737,0,978 -chr21 15850748 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:368,0,368 -chr21 15925345 . A C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:450,0,201 -chr21 16080991 . C CA 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-0.221;DP=87;FS=8.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:484,0,1198 -chr21 16081553 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.317;DP=96;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,29:96:99:818,0,2621 -chr21 16082447 . T TA 776.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.617;DP=55;FS=4.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:814,0,398 -chr21 16082497 . G A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-0.222;DP=39;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:779,0,596 -chr21 16082566 . C CA 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=1.194;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:590,0,530 -chr21 16082595 . G C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.290;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:902,0,876 -chr21 16082659 . G T 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.717;DP=44;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=23.95;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:1082,0,463 -chr21 16082711 . T C 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=1.012;DP=49;FS=20.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:857,0,777 -chr21 16083090 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=1.523;DP=46;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:419,0,1321 -chr21 16083114 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.576;DP=40;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:298,0,1457 -chr21 16083285 . T C 1689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=-0.005;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:84:99:1718,0,1942 -chr21 16083451 . AATCC A 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=-0.158;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.93;ReadPosRankSum=-2.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,466 -chr21 16083601 . G A 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-1.096;DP=41;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.149;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:631,0,711 -chr21 16084168 . G GA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:406,0,126 -chr21 16084633 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.288;DP=175;FS=11.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,40:175:99:829,0,5046 -chr21 16096746 . A T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.295;DP=83;FS=4.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:1145,0,1771 -chr21 16099331 . C T 4708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=1.356;DP=200;FS=24.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=23.54;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,113:195:99:4737,0,5106 -chr21 16101864 . TCCTTTAAAAACAGCCAGAGCAAACGAGATTATTTTGGAGATTTGGACCTTTTTAGATCTCTTTCACAGCCTTTACACATTATACACA T 12356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.829;DP=332;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.618;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,299:307:99:12394,899,0 -chr21 16104110 . G T 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-4.002;DP=188;FS=13.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,61:188:99:1752,0,12036 -chr21 16104113 . T A 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=-4.491;DP=188;FS=14.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,57:188:99:1756,0,12036 -chr21 16457955 . GA G 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=19.92;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:44:357,0,44 -chr21 16463372 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=2.262;DP=23;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:253,0,329 -chr21 16503217 . T G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr21 16773674 . TA T 262.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:300,30,0 -chr21 16872058 . A AT 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=1.301;DP=131;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=1.64;ReadPosRankSum=-1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:252,0,2424 -chr21 16896035 . GA G 10291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-10.075;DP=193;FS=11.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=30.52;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,99:180:99:10329,0,803 -chr21 16974677 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.003;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:434,0,302 -chr21 16990726 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:272,0,58 -chr21 17234836 . C T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr21 17731388 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:237,0,155 -chr21 17735542 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr21 17739104 . T C 1561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.225;DP=44;FS=2.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,40:44:37:1590,37,0 -chr21 17740757 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:306,0,218 -chr21 17740771 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=15.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,250 -chr21 17744517 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.262;DP=20;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=28.94;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:607,0,122 -chr21 17749338 . G T 3695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.059;DP=133;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.79;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,98:133:99:3724,0,828 -chr21 17749642 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:233,0,65 -chr21 17753494 . GGCCTGA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=3.694;DP=31;FS=7.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=7.12;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:258,0,1484 -chr21 17772225 . CT C 3696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.694;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,129:162:99:3734,0,365 -chr21 17772995 . AT A 1110.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=-0.082;DP=65;FS=2.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,44:60:99:1148,0,211 -chr21 17773064 . G GT 637.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-1.002;DP=34;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:675,0,195 -chr21 18117030 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=22.67;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:459,0,235 -chr21 18117426 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.489;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:613,0,532 -chr21 18125256 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr21 18132067 . CA C 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=1.273;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.199;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:415,0,660 -chr21 18144884 . G T 1610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=2.324;DP=92;FS=2.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1639,0,1531 -chr21 18169273 . C G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr21 18169835 . T G 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.102;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=29.75;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:53:772,0,53 -chr21 18209018 . A AT 247.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:285,24,0 -chr21 18430359 . A G 1676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.142;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=27.04;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,45:62:99:1705,0,470 -chr21 18434892 . C CA 815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-2.096;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:82:946,82,0 -chr21 18436242 . G A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=-0.458;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=29.79;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:892,0,131 -chr21 18591802 . AC A 8173.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.164;DP=291;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,224:286:99:8211,0,1106 -chr21 18696546 . A T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=-2.179;DP=29;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:403,0,1423 -chr21 18696706 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=1.820;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:474,0,464 -chr21 18696808 . TG T 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.830;DP=26;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:267,0,360 -chr21 18696876 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.684;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.74;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:323,0,360 -chr21 18731699 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-1.137;DP=34;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:707,0,496 -chr21 18732205 . T A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-1.090;DP=40;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:515,0,855 -chr21 18734281 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.461;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:463,0,510 -chr21 18736019 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.742;DP=57;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:986,0,953 -chr21 18738909 . G A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.548;DP=43;FS=4.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:739,0,770 -chr21 18743713 . G C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.965;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:290,0,227 -chr21 18862886 . C T 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.144;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,38:64:99:1292,0,943 -chr21 18929373 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.351;DP=39;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:669,0,673 -chr21 18936396 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=1.638;DP=39;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1051,0,711 -chr21 18937858 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.024;DP=28;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:344,0,643 -chr21 18937909 . T C 210.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:239,0,16 -chr21 18938202 . G T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.086;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:690,0,1087 -chr21 18938210 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.353;DP=35;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:305,0,1073 -chr21 18940535 . TA T 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-0.495;DP=24;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:255,0,378 -chr21 18941229 . TA T 542.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.040;DP=51;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:580,0,560 -chr21 18941659 . T A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=1.083;DP=26;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:718,0,232 -chr21 18942143 . G A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.344;DP=56;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:970,0,982 -chr21 18945523 . A T 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.250;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:887,0,871 -chr21 19142129 . C T 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.183;DP=100;FS=5.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.867;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1697,0,1645 -chr21 19222592 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:361,0,283 -chr21 19538889 . TCTGTTTAAACAGAGCAGGCGGAAATTAAAACCAAATTTTGGGACGAATGAACATACCTCTGCACTTTTAACATGTTATATGCATTTTGTAAGCATTCTCAC T 5370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=-1.080;DP=125;FS=1.629;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.512 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,119:125:99:5408,438,0 -chr21 19543287 . T C 5613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.130;DP=336;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,160:336:99:5642,0,5780 -chr21 19543504 . T C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.214;DP=348;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:817,0,682 -chr21 19543682 . C T 5031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.779;DP=352;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,143:352:99:5060,0,7170 -chr21 19548914 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,363 -chr21 19549803 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:254,0,421 -chr21 19549842 . GT G,GTT 338.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.347;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,9,10:20:99:426,224,316,226,0,291 -chr21 19550277 . C A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=-1.276;DP=34;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:968,0,991 -chr21 19550284 . C G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.318;DP=40;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=23.27;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:959,0,991 -chr21 19560353 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,212 -chr21 19561062 . C G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:311,0,182 -chr21 19571676 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.312;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,398 -chr21 19571938 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.531;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=20.21;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:291,0,173 -chr21 19592991 . C T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.021;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:781,0,302 -chr21 19599940 . T C 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=2.344;DP=86;FS=7.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,33:86:99:1191,0,1850 -chr21 19600030 . A T 4237.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:4266,307,0 -chr21 19606191 . G A 2378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.508;DP=146;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:2407,0,2482 -chr21 19609776 . C T 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=2.084;DP=76;FS=10.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:919,0,1770 -chr21 19623582 . A G 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:736,51,0 -chr21 19647418 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 -chr21 19647442 . C G 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 -chr21 19655475 . G T 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr21 19660139 . CCCTGCAACAATACATGTACTTACATCACAACATTAAGCTTTACACATCAGATAAATGCTCAATAATTGTTA C 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.635;DP=19;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=12.30;ReadPosRankSum=2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,167 -chr21 19660222 . A T 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=3.702;DP=40;FS=13.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,32:40:99:1170,0,148 -chr21 19660331 . G A 1640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-3.781;DP=105;FS=11.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:1669,0,1956 -chr21 19660366 . C A 2509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=2.155;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=31.77;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,64:77:99:2538,0,182 -chr21 19662895 . C T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr21 19667577 . C T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr21 19724186 . C G 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr21 19724221 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=2.178;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:31:624,0,31 -chr21 19752849 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:324,0,218 -chr21 19755095 . C T 2705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-2.104;DP=238;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,82:236:99:2734,0,5194 -chr21 19757372 . A T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=5.908;DP=192;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,47:189:99:955,0,5463 -chr21 19757481 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.843;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,39:130:99:1052,0,3556 -chr21 19759441 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:76:356,0,76 -chr21 19848219 . CACCTTATTGAAGCAGAAGAACAAAACAATTCAGCTCTAATTTTCAGCAGGTAAATGTATTCTGTTGTCAGCGGTTCAGTATCAAGTTACTTTTGTAGAATTGTTT C 7799.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=1.167;DP=237;FS=2.025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=32.91;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,215:219:99:7837,589,0 -chr21 20002655 . TCTAAAAAACAAACAACAAAAAAACAATAGTTATTTAATATTTTTAACATAATCTCATCTTCCATCTTTTTCTGAAATGTGACTTAC T 213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=1.662;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:97:251,97,0 -chr21 20126091 . TA T 400.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:43:438,43,0 -chr21 20175126 . GT G 770.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.449;DP=69;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:808,0,806 -chr21 20211127 . G A 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.065;DP=155;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,37:155:99:813,0,4442 -chr21 20775732 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=1.705;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:349,0,405 -chr21 21025348 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=2.618;DP=37;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=13.35;ReadPosRankSum=-3.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:522,0,550 -chr21 21028237 . AT A 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.983;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:318,0,132 -chr21 21030480 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.092;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:434,0,716 -chr21 21054801 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.463;DP=48;FS=4.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:377,0,2193 -chr21 21265205 . TCTGAGAGAGAGAGCAAAACCACAGGTTTGAACAAGTGATAGATATTATTTCTAAGTGGTGTGTCGTTTAC T 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.960;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=26.94;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:603,0,1273 -chr21 21306109 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.079;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:462,0,1377 -chr21 21406323 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=-0.970;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:419,0,880 -chr21 21406338 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=-0.976;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:469,0,827 -chr21 21518130 . T C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:323,0,365 -chr21 21527081 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=1.262;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:395,0,403 -chr21 21529050 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.189;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=28.05;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:79:505,0,79 -chr21 21529081 . G C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-1.714;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=33.75;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:38:602,0,38 -chr21 21530155 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=3.377;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:436,0,422 -chr21 21556589 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=-0.575;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:342,0,473 -chr21 21678303 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-0.086;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:297,0,1672 -chr21 21680123 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=10.99;ReadPosRankSum=2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:248,0,417 -chr21 21906230 . G A 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-1.398;DP=108;FS=1.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:899,0,2683 -chr21 21910880 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.092;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,398 -chr21 21962283 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-0.090;DP=98;FS=9.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:434,0,6387 -chr21 21993950 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.889;DP=156;FS=4.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,34:155:99:661,0,4520 -chr21 21994715 . G C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.343;DP=52;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:416,0,1526 -chr21 21996459 . G C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.448;DP=99;FS=11.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:595,0,2773 -chr21 21997120 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=-0.746;DP=122;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,23:122:99:394,0,3844 -chr21 21999343 . T C 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.352;DP=128;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,37:128:99:947,0,3554 -chr21 21999394 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.436;DP=139;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,28:139:99:515,0,4290 -chr21 22000065 . G T 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.253;DP=148;FS=4.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,35:148:99:735,0,4258 -chr21 22000078 . TGTAAGTACTGCCTCACTTATAAAAGTTGCAGAGTGTTTTGTATTGTTGTTTTCTAAAACAGACATTTAAAATTATATTTCAG T 4729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=2.665;DP=135;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=30.86;ReadPosRankSum=-4.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,121:134:99:5240,0,1988 -chr21 22001408 . AAGGTGAGAAACACACTAATGAACAGAAAAACCCTTATTGATTTTTCTATATGATAGTATCTTAAATCTGCTTACATTCTGTTTTCTCTGCTTTTTTT A 6876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=1.330;DP=180;FS=6.438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=32.23;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,147:153:99:6914,606,0 -chr21 22002793 . C CT 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=-1.319;DP=149;FS=11.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=1.73;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,29:138:99:295,0,3049 -chr21 22003512 . C T 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.102;DP=80;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:1226,0,1583 -chr21 22004910 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.383;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:475,0,2099 -chr21 22006603 . TCCTAAAAGAAAAATACATCTCTAAACACTTAAGTGCACTATATAGATAGCGTACAGTATCCGCCGATCAACTCTTA T 2204.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-1.053;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:2242,199,0 -chr21 22039960 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.317;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:295,0,774 -chr21 22082088 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=2.200;DP=95;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:325,0,2867 -chr21 22088610 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.303;DP=96;FS=10.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,21:96:99:359,0,3792 -chr21 22134639 . TC T 1220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.777;DP=114;FS=4.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:1258,0,6716 -chr21 22136056 . G A 1460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=-0.611;DP=228;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,64:228:99:1489,0,6236 -chr21 22155651 . CCCTAAGTCATAAAAAAAAAAAAAAATAGCACAACGGTTAAAAAAACTATAAACTGTAATACAACTATCAAAAAAAGAGAGACCAACTTA C 2555.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=2.373;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:64:99:2593,205,0 -chr21 22450315 . T TCA 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.709;DP=72;FS=15.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:405,0,1406 -chr21 22452320 . T C 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-0.875;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:699,0,2803 -chr21 22452409 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=-1.038;DP=84;FS=5.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:262,0,2712 -chr21 22520980 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.044;DP=74;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:564,0,1814 -chr21 22582740 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=-0.316;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:484,0,2234 -chr21 22612886 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.514;DP=142;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=4.11;ReadPosRankSum=2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,31:142:99:612,0,4203 -chr21 22613026 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=-0.427;DP=156;FS=9.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,34:156:99:701,0,4726 -chr21 22613965 . T G 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.014;DP=157;FS=5.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,47:157:99:1250,0,4215 -chr21 22614725 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.372;DP=119;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:345,0,4002 -chr21 22615260 . G GT 1682.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-0.677;DP=178;FS=2.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,70:166:99:1720,0,2450 -chr21 22615436 . C T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.588;DP=216;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,56:216:99:1312,0,6281 -chr21 22697084 . G T 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.335;DP=244;FS=18.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=4.20;ReadPosRankSum=2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,54:244:99:1053,0,7223 -chr21 22700144 . A G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-0.105;DP=205;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,38:205:99:570,0,6430 -chr21 23693193 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-1.294;DP=54;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:523,0,1453 -chr21 23816071 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.388;DP=56;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:313,0,1706 -chr21 23866719 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.798;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:298,0,1378 -chr21 24314678 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.506;DP=172;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,40:172:99:852,0,5133 -chr21 24322377 . A T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.655;DP=199;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,46:199:99:1096,0,12402 -chr21 24322519 . C CA 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.373;DP=130;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,39:123:99:532,0,2057 -chr21 24323036 . A G 2330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-0.469;DP=83;FS=6.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,61:83:99:2359,0,492 -chr21 24343858 . AT A 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=31.84;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:21:483,21,0 -chr21 24921531 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=-0.512;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:256,0,990 -chr21 24922769 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,416 -chr21 24923342 . C A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.516;DP=30;FS=9.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:395,0,1370 -chr21 24923344 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-0.069;DP=29;FS=13.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:395,0,1380 -chr21 24941446 . C A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-0.620;DP=57;FS=8.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:739,0,1273 -chr21 24941497 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.051;DP=92;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:1288,0,1882 -chr21 24941833 . T C 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=1.044;DP=119;FS=13.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,36:119:99:953,0,2799 -chr21 25081537 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,743 -chr21 25081538 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.694;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,743 -chr21 25083824 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=28.07;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:337,0,58 -chr21 25134633 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-2.428;DP=39;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:413,0,991 -chr21 25187633 . C A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-1.165;DP=69;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:784,0,1602 -chr21 25191321 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.012;DP=74;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:550,0,2078 -chr21 25197601 . A G 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:48:657,48,0 -chr21 25415243 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.181;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:260,0,1142 -chr21 25415657 . A AT 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.214;DP=48;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.62;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:403,0,2035 -chr21 25415660 . A T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.038;DP=44;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:403,0,2035 -chr21 25416479 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=-0.713;DP=57;FS=6.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:284,0,1802 -chr21 25416696 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=1.515;DP=81;FS=2.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:515,0,2054 -chr21 25451808 . AT A 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.824;DP=123;FS=6.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,29:122:99:518,0,3116 -chr21 25451843 . C CT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.846;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:305,0,1800 -chr21 25455011 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-2.278;DP=36;FS=7.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=14.33;ReadPosRankSum=2.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:544,0,731 -chr21 25785425 . C CT 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.718;DP=131;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,34:125:99:499,0,2429 -chr21 25809438 . C A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.897;DP=255;FS=15.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,53:255:99:949,0,7756 -chr21 25883577 . T TA 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=-0.510;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:650,0,988 -chr21 25886880 . GA G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.939;DP=45;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:255,0,590 -chr21 26027529 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=-1.433;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:486,0,792 -chr21 26065188 . T TA 758.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.093;DP=103;FS=1.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:796,0,998 -chr21 26071228 . T TA 1012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-2.045;DP=181;FS=5.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,57:164:99:1050,0,6285 -chr21 26122718 . TGGTGAGGAAGCTCTTCCATATATAATGCCATAATCATGTTGTGGAGTGTTTCTAAATCTGTCATCTTTCTACTCCTTCCTCA T 16013.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=348;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,338:338:99:16051,1413,0 -chr21 26124393 . GT G 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.882;DP=251;FS=17.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,46:227:99:678,0,3838 -chr21 26125155 . A G 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.181;DP=333;FS=5.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,71:333:99:1338,0,10381 -chr21 26125412 . C A 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=-1.491;DP=332;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,60:332:99:785,0,11585 -chr21 26386253 . TGTATGTGTTTGACTGCTCTCACCAAAGTATTATTTATGCCAGAAATGTCTTGTGTTACCGTTTTGTTTTTATCTGCAG T 15868.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=2.436;DP=358;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=27.38;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,355:357:99:15906,1214,0 -chr21 26593094 . T C 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-2.381;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=33.18;ReadPosRankSum=2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:891,0,112 -chr21 26593095 . T C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=3.402;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=31.51;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:879,0,126 -chr21 26593777 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.270;DP=67;FS=3.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:480,0,1366 -chr21 26593873 . G C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=-1.481;DP=212;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,37:212:99:434,0,6470 -chr21 26594619 . G T 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.825;DP=325;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,76:325:99:1554,0,9500 -chr21 26611139 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.824;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,38:117:99:1005,0,2858 -chr21 26668041 . T A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.013;DP=99;FS=2.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:99:517,0,5460 -chr21 26668042 . G T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-0.035;DP=96;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,21:96:99:517,0,5460 -chr21 26679474 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-1.240;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:302,0,587 -chr21 26699428 . C T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.591;DP=200;FS=7.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,45:200:99:928,0,5973 -chr21 26700561 . G A 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=1.322;DP=252;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,54:252:99:1062,0,7469 -chr21 26709080 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.280;DP=212;FS=15.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,48:212:99:1005,0,6237 -chr21 26718973 . GA G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.884;DP=184;FS=4.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,83:181:99:3270,0,5965 -chr21 26773041 . T TA 1171.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.583;DP=93;FS=0.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:1209,0,1735 -chr21 26774364 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=1.175;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:354,0,662 -chr21 26774665 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.565;DP=55;FS=6.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:240,0,2146 -chr21 26795445 . A T 1816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.326;DP=320;FS=5.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,83:319:99:1845,0,11341 -chr21 26803126 . TCTAGAAGTTAAAAAGGATGTAAATTAAAGTGTTTTGAAAAGCATACATTATTAGCTAGACATTTTGTATGGACTCAC T 3383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.393;DP=85;FS=2.385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=28.32;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,82:85:99:3421,248,0 -chr21 26803559 . TCTGTAGCAACAAAAAGAACCAACATTGTGTCTTTGCTGCACTTTCTGTAATGTGTCCAAAAATGAGAAATGTGTCATAC T 3627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=3.272;DP=123;FS=3.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=29.49;ReadPosRankSum=-1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,87:121:99:3665,0,11379 -chr21 26803675 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=-0.852;DP=119;FS=2.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,26:119:99:571,0,3584 -chr21 26811278 . T G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.931;DP=297;FS=4.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,46:296:99:621,0,19931 -chr21 26821262 . CGGTTAATCTACGCACAGAAATTTACTTAATTTAGAATAAGTGTTGTTTAAACTGCTGATTGTTATGTGTATCTCTGTACA C 12805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=1.889;DP=342;FS=5.384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.26;ReadPosRankSum=-1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,328:342:99:12843,1100,0 -chr21 26823785 . C T 3326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.739;DP=424;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,133:422:99:3355,0,11118 -chr21 26825810 . T A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.914;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:752,0,1253 -chr21 26876889 . TCTGGTGGAATAAATAAGACATTACAGTTTGACATCTACTTTAAAAGTATTCATAAATAAGATTGTGCTTTCTGCTTTGCACACTTAC T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,1296 -chr21 27030724 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=-0.981;DP=43;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:472,0,948 -chr21 27031787 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-1.928;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=16.64;ReadPosRankSum=2.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:361,0,374 -chr21 27032402 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.264;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:258,0,796 -chr21 27274800 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.559;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:49:600,0,49 -chr21 27275057 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-1.610;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:276,0,430 -chr21 27275720 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:257,0,327 -chr21 27851009 . A T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-5.730;DP=344;FS=24.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,54:344:99:463,0,24741 -chr21 27873309 . T TTC 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-2.543;DP=41;FS=10.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:418,0,973 -chr21 27882501 . A T 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.638;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=13.01;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:1199,0,1889 -chr21 27887382 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.700;DP=88;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:676,0,2243 -chr21 27890801 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=5.419;DP=616;FS=0.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=0.47;ReadPosRankSum=5.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:527,89:616:99:316,0,18848 -chr21 27907194 . G A 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=-1.210;DP=318;FS=0.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,74:318:99:1349,0,12045 -chr21 28123639 . A AAG 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.954;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:279,0,504 -chr21 28187504 . G A 1084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-0.687;DP=248;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,56:248:99:1113,0,7231 -chr21 28257649 . G GT 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.973;DP=54;FS=4.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.089;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:253,0,703 -chr21 28294523 . C T 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.755;DP=169;FS=0.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,42:169:99:954,0,4737 -chr21 28401893 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=1.814;DP=72;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:421,0,2061 -chr21 28433560 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.230;DP=70;FS=4.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=14.68;ReadPosRankSum=2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1056,0,1314 -chr21 28708173 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-1.932;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,134 -chr21 28708196 . G C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=-2.293;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:329,0,295 -chr21 28709657 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-1.408;DP=16;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:331,0,153 -chr21 28720690 . T C 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 -chr21 28738419 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr21 28742731 . A G 681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:710,51,0 -chr21 28759504 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=1.341;DP=65;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:436,0,1757 -chr21 28763554 . T A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.416;DP=46;FS=4.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:627,0,945 -chr21 28768093 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=1.578;DP=77;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:342,0,2264 -chr21 28768196 . T C 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=1.484;DP=71;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:1028,0,1300 -chr21 28768540 . A G 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-2.184;DP=56;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=8.87;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:525,0,1814 -chr21 28768702 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=-1.088;DP=56;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:357,0,1674 -chr21 28770721 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.736;DP=105;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:816,0,2587 -chr21 28775377 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-1.364;DP=76;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:913,0,2544 -chr21 28776048 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.732;DP=86;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=5.22;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:477,0,2266 -chr21 28799079 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.496;DP=59;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:333,0,1739 -chr21 28801402 . C CT 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.092;DP=73;FS=11.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:368,0,1218 -chr21 28802113 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.404;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=3.38;ReadPosRankSum=2.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,25:125:99:451,0,3792 -chr21 28802395 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=1.494;DP=149;FS=2.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,28:149:99:358,0,4373 -chr21 28804791 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,147 -chr21 28806287 . C G 1342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.814;DP=97;FS=6.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.916;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,40:97:99:1371,0,1960 -chr21 28821557 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.280;DP=100;FS=5.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=5.23;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:551,0,2683 -chr21 28860520 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.245;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:331,0,2031 -chr21 28914068 . A G 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.708;DP=342;FS=5.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,89:342:99:2011,0,9439 -chr21 28918611 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.356;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:308,0,1330 -chr21 28918833 . G C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.120;DP=42;FS=7.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:405,0,1092 -chr21 28919399 . C G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=1.799;DP=30;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:379,0,811 -chr21 28984396 . G GA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.539;DP=50;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:352,0,761 -chr21 28990667 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.555;DP=64;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:318,0,1802 -chr21 28994439 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-0.275;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:416,0,1305 -chr21 28994526 . T G 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-1.533;DP=62;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:902,0,1103 -chr21 29004714 . CA C 334.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=1.293;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,42:56:99:747,0,178 -chr21 29005022 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.767;DP=89;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:258,0,2630 -chr21 29005114 . G C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=2.000;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:552,0,2739 -chr21 29013509 . C A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.324;DP=90;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:444,0,2629 -chr21 29013967 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.728;DP=46;FS=9.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:331,0,1140 -chr21 29222041 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.892;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:528,0,942 -chr21 29228567 . G A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.317;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.659;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,40:184:99:781,0,7624 -chr21 29279890 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=-0.544;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:492,0,2325 -chr21 29335303 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.416;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:594,0,480 -chr21 29374928 . GCCTGAAGGAGACAAACACTGTAGTATGCACATGTAAAGTGAATGTGAACATCCAGTTTGTGTGTGTATTTA G 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:287,0,1611 -chr21 29539057 . TCTGTGAAAACACATCAGCAACAATTAGAGCTTTATAAAGCACACCTAGCATCAGTCATCTATACAATACTCCCAACTTAC T 16307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=2.981;DP=377;FS=2.305;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=31.31;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,369:372:99:16345,1254,0 -chr21 29539219 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.367;DP=280;FS=4.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,77:280:99:1849,0,7836 -chr21 29651266 . T G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.004;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=27.36;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:40:466,0,40 -chr21 29759367 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.353;DP=86;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:338,0,3679 -chr21 29773418 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=1.524;DP=30;FS=13.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:238,0,1865 -chr21 29773424 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=1.641;DP=32;FS=27.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:238,0,1865 -chr21 29781475 . T C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.352;DP=22;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:30:669,0,30 -chr21 29781743 . A C 2989.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:3018,220,0 -chr21 30000544 . G T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=1.384;DP=67;FS=9.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:479,0,1861 -chr21 30001342 . C CA 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.564;DP=49;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:430,0,2581 -chr21 30029513 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.109;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:229,0,827 -chr21 30773586 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:79:255,0,79 -chr21 30864189 . CCCTATGCGCAACAAGCAGAATTTTAGTGCTCCAGATTTTTTAATAGGTTTCTGCTTATCATTTTGCAGCAAAACTTA C 1404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=2.317;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=29.00;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:99:1442,134,0 -chr21 30865021 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.858;DP=30;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:290,0,746 -chr21 31050849 . TCTGCCAGCAAAGATCAACATTTTGCGATTTAAAAAAAAAACAATCATATTCAGGTAATTTACACAGAAGTATAAATAATAGTAAAATAATGCAC T 6425.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=3.266;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=33.37;ReadPosRankSum=-2.247 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,136:145:99:6463,604,0 -chr21 31113659 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-1.121;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:265,0,1120 -chr21 31155541 . TA T 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.853;DP=24;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:54:523,0,54 -chr21 31155757 . T C 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.102;DP=23;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:290,0,576 -chr21 31156747 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.028;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,580 -chr21 31225363 . G T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.577;DP=74;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:501,0,2011 -chr21 31230127 . T C 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=2.237;DP=204;FS=2.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,41:204:99:637,0,6266 -chr21 31243219 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.646;DP=23;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:275,0,537 -chr21 31523691 . A T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-1.510;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:426,0,3109 -chr21 31525790 . C T 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-1.856;DP=206;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,41:206:99:1410,0,7916 -chr21 31526801 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-1.210;DP=163;FS=0.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,30:163:99:370,0,5240 -chr21 31526850 . C CT 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=-1.239;DP=157;FS=2.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.566;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:317,0,3066 -chr21 31981951 . T A 1206.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.116;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=29.17;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1235,87,0 -chr21 32296712 . T A 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.459;DP=130;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,39:129:99:1004,0,3440 -chr21 32375357 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.440;DP=99;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:389,0,5755 -chr21 32375359 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.431;DP=99;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.986;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:384,0,5755 -chr21 32393814 . A T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.130;DP=77;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:560,0,2044 -chr21 32394951 . C CT 235.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:18:359,0,18 -chr21 32525136 . C T 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr21 32968399 . G T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.472;DP=85;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:690,0,4756 -chr21 33330845 . GA G 707.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.776;DP=56;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:745,0,513 -chr21 33690773 . C T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=-0.031;DP=48;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=16.87;ReadPosRankSum=-2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:838,0,846 -chr21 33758713 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.321;DP=65;FS=1.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:399,0,1744 -chr21 33800109 . C G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.358;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:308,0,1655 -chr21 33800112 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.331;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:308,0,1655 -chr21 33801839 . AT A 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 -chr21 33802820 . CCCTGTAATGAAATTTCAGTCAAATCAAGATACAAAAACGTGTATGAATGTAGAAGTATACGCTATATATTTCTCACTCA C 2948.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=-0.287;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,67:71:99:2986,109,0 -chr21 33815351 . A G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.127;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:540,0,1072 -chr21 33817716 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=-0.657;DP=46;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:343,0,1237 -chr21 33853088 . A G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.497;DP=127;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,29:127:99:579,0,4904 -chr21 33881128 . G A 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=1.176;DP=97;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,36:97:99:1244,0,2121 -chr21 33881139 . C G 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.091;DP=96;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:1214,0,2122 -chr21 33883986 . CCCTGTTCAATCACAGCAACACCAATTCTCTTACCGTAACCTTTCCAACCTTACAGAAATATAATGCGCCAAAATCCAAAATGCATTAAGCAGCCACCTTA C 2545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=1.323;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,56:63:99:2583,284,0 -chr21 33887482 . C A 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-4.169;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=21.17;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1108,0,842 -chr21 33891817 . C A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.972;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:598,0,2361 -chr21 34008733 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.829;DP=33;FS=9.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:249,0,903 -chr21 34245691 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.190;DP=86;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:515,0,2218 -chr21 34246205 . T A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.401;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:718,0,3942 -chr21 34246206 . A T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.309;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:718,0,3992 -chr21 34246299 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.533;DP=65;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:259,0,2052 -chr21 34246755 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-2.043;DP=64;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:745,0,1458 -chr21 34285148 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.940;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:427,0,1359 -chr21 34290858 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=27.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:94:412,0,94 -chr21 34321863 . G A 2071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.378;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:2100,0,2083 -chr21 34604457 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-1.594;DP=79;FS=5.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:268,0,2586 -chr21 34605199 . T A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.633;DP=46;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:370,0,1899 -chr21 34605347 . A T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=1.252;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:390,0,5013 -chr21 34607262 . CT C 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=-0.211;DP=87;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:644,0,1064 -chr21 34607589 . G GT 1070.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=-0.247;DP=62;FS=7.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,47:58:99:1160,0,104 -chr21 34607686 . A T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=-0.441;DP=67;FS=8.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:968,0,1360 -chr21 34607769 . A C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.213;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:366,0,1974 -chr21 34607962 . G T 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.388;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1188,0,1123 -chr21 34608395 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=1.091;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:767,0,552 -chr21 34609145 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.470;DP=67;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:273,0,2752 -chr21 34609305 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-1.636;DP=76;FS=13.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:271,0,2423 -chr21 34611821 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-1.044;DP=145;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,26:145:99:392,0,4473 -chr21 34636066 . C A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.502;DP=161;FS=0.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,42:161:99:951,0,4474 -chr21 35312092 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr21 35389320 . C T 3716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-1.789;DP=190;FS=10.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:3745,0,3211 -chr21 35389341 . T C 3703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-2.415;DP=142;FS=11.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:3732,0,3213 -chr21 35389436 . T A 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=-1.315;DP=169;FS=4.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1195,0,5213 -chr21 35389519 . T C 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.225;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=22.16;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:1624,0,7748 -chr21 35389588 . TCG T 1586.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.043;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=31.11;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:1624,0,7887 -chr21 35389642 . A G 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=0.145;DP=55;FS=13.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=29.01;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:1624,0,7673 -chr21 35389688 . G A 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.206;DP=115;FS=16.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:1624,0,7799 -chr21 35389719 . T A 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=-1.073;DP=126;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,9:65:99:1624,0,7758 -chr21 35389720 . C A 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=-2.226;DP=129;FS=5.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,9:68:99:1624,0,7712 -chr21 35389848 . T A 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=2.054;DP=57;FS=6.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1115,0,2200 -chr21 35389888 . A G 2140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=-0.342;DP=87;FS=5.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=24.61;ReadPosRankSum=3.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,52:87:99:2169,0,1187 -chr21 35390021 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.583;DP=53;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:277,0,1641 -chr21 35390270 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=4.329;DP=33;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=12.93;ReadPosRankSum=-3.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:455,0,664 -chr21 35390620 . C G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.030;DP=51;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=8.64;ReadPosRankSum=-3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:469,0,1293 -chr21 35390669 . G A 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=2.923;DP=72;FS=4.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=18.79;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:1381,0,1056 -chr21 35390907 . A G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=1.455;DP=50;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.536;QD=18.06;ReadPosRankSum=2.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:931,0,1553 -chr21 35390913 . A G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=1.226;DP=51;FS=4.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=17.70;ReadPosRankSum=3.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:931,0,1553 -chr21 35708590 . A G 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;ClippingRankSum=-0.885;DP=77;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:603,0,1798 -chr21 35720780 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.387;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:366,0,675 -chr21 35729114 . A T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.194;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:351,0,993 -chr21 35732654 . A G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=-0.657;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:573,0,656 -chr21 35746648 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.326;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:249,0,802 -chr21 35752451 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.213;DP=34;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:385,0,907 -chr21 35757382 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-0.353;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:491,0,873 -chr21 35770999 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.734;DP=172;FS=6.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,35:172:99:650,0,5244 -chr21 35777767 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-1.466;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:310,0,671 -chr21 35778449 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-0.819;DP=39;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:445,0,951 -chr21 35782123 . G C 579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:608,42,0 -chr21 35782995 . TG T 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.979;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:389,0,112 -chr21 35784376 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:252,0,244 -chr21 35784659 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.847;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:287,0,497 -chr21 35787542 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=-0.583;DP=36;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:247,0,990 -chr21 35790003 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=1.523;DP=38;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:308,0,951 -chr21 35867585 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-1.047;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,572 -chr21 35892923 . C CA 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.423;DP=15;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:55:271,0,55 -chr21 35937687 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.206;DP=88;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:472,0,2639 -chr21 35941108 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=2.196;DP=81;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:434,0,5180 -chr21 35941144 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.072;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:304,0,1071 -chr21 36009355 . G T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr21 36009413 . C T 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 -chr21 36059441 . GT G 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:260,0,155 -chr21 36062553 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:375,0,127 -chr21 36118726 . T TA 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-0.190;DP=59;FS=14.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,32:53:99:521,0,517 -chr21 36120467 . C T 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.501;DP=105;FS=5.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,26:105:99:1030,0,4465 -chr21 36120665 . T C 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=-0.228;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:540,0,1954 -chr21 36121040 . TAC T 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=-3.762;DP=132;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=6.11;ReadPosRankSum=2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,33:131:99:844,0,4259 -chr21 36123117 . GT G 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.294;DP=172;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,32:158:99:289,0,4746 -chr21 36129938 . G A 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=-0.734;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,53:155:99:1407,0,5127 -chr21 36130064 . G A 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.548;DP=101;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,62:101:99:1995,0,1310 -chr21 36130250 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.932;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,40:164:99:829,0,4527 -chr21 36149993 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:377,0,285 -chr21 36312895 . CACCTGCAGGCAATAAGGACAATGATTCTGAATTACACTACAGAGTTCACAGCTATCACTTTCATTCCTTTATGATGGATTACAGCTTACTCAGCAGGACCAAGTAACGGATCAGCAAGACAAACTT C 3219.64 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=1.531;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=27.26;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,79:82:99:3257,238,0 -chr21 36384367 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=2.249;DP=60;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:729,0,1284 -chr21 36409988 . A G 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=1.248;DP=62;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=22.66;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,36:53:99:1433,0,490 -chr21 36410092 . A T 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.139;DP=74;FS=6.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,47:59:99:1792,0,261 -chr21 36433562 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-2.112;DP=204;FS=9.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=1.53;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,32:204:99:341,0,6731 -chr21 36433607 . G A 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.281;DP=214;FS=2.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=1.70;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,34:214:99:401,0,7190 -chr21 36433756 . G GT 549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.755;DP=222;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,49:217:99:587,0,4663 -chr21 36509894 . A G 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.931;DP=195;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,38:195:99:688,0,6178 -chr21 36510405 . C CT 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=-2.460;DP=150;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,28:143:99:298,0,3546 -chr21 36513506 . A G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.030;DP=249;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,41:249:99:512,0,8147 -chr21 36742988 . A G 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr21 36751504 . G A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=3.116;DP=79;FS=3.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:934,0,1870 -chr21 37473122 . T C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:467,33,0 -chr21 37607653 . G C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.274;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,1:19:99:235,0,1814 -chr21 37619730 . GT G 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-1.466;DP=39;FS=15.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:259,0,510 -chr21 37688498 . C T 4461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=1.228;DP=270;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,142:270:99:4490,0,4541 -chr21 37699364 . C G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=2.436;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:269,0,417 -chr21 37699979 . T TA 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.614;DP=22;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:33:408,0,33 -chr21 37755292 . G T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=0.634;DP=37;FS=5.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:837,0,1158 -chr21 37902650 . G GT,GTT 3869.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.046;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,151,37:189:99:4836,746,247,3814,0,3734 -chr21 37904686 . T C 344.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:373,30,0 -chr21 37952762 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:533,36,0 -chr21 37952768 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:533,36,0 -chr21 37953089 . G C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=1.604;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:271,0,1209 -chr21 37956476 . AT A 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.119;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:374,0,271 -chr21 37956838 . G GT 933.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:95:971,95,0 -chr21 38029044 . G A 5622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.271;DP=313;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,157:312:99:5651,0,5494 -chr21 38029175 . G A 6512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-0.527;DP=267;FS=0.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=24.39;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,129:267:99:6541,0,9613 -chr21 38029366 . C T 6537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-3.229;DP=424;FS=4.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,197:423:99:6566,0,7426 -chr21 38029539 . G A 1810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-1.356;DP=144;FS=5.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,54:144:99:1839,0,3090 -chr21 38029567 . G T 3093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-2.369;DP=131;FS=0.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:3122,0,3891 -chr21 38029689 . C T 2649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.332;DP=125;FS=3.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=21.20;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,77:125:99:2678,0,3618 -chr21 38029847 . G T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.075;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=30.25;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:966,0,115 -chr21 38136062 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.004;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=30.63;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:44:457,0,44 -chr21 38287987 . C T 2666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.250;DP=229;FS=3.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,80:229:99:2695,0,5182 -chr21 38307241 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-1.778;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:637,0,184 -chr21 38343547 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=1.474;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:458,0,445 -chr21 38343919 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.489;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:286,0,336 -chr21 38345465 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.177;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:333,0,336 -chr21 38347493 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,332 -chr21 38362305 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.370;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:265,0,1112 -chr21 38392446 . CA C 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.657;DP=41;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:428,0,553 -chr21 38404493 . G T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.806;DP=104;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,37:104:99:1261,0,2367 -chr21 38404848 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.768;DP=164;FS=5.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,26:164:99:277,0,5270 -chr21 38405812 . C A 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.774;DP=220;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,59:220:99:1234,0,5718 -chr21 38432940 . C T 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:686,51,0 -chr21 38438840 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.350;DP=67;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:773,0,1512 -chr21 38453276 . AACCTGGTGATACATAGGATAGGTGATAGTACAGATAATCGACCAATAATAACACATCTAATTGAAATGATGTGATTTGAGTTTACTTTTTTTAAAGT A 12513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=282;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,282:282:99:12551,1124,0 -chr21 38715471 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-0.499;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:257,0,1654 -chr21 38724245 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.762;DP=65;FS=5.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=19.53;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1298,0,870 -chr21 38725405 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.408;DP=106;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:327,0,5850 -chr21 38806389 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.039;DP=34;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:242,0,938 -chr21 38809741 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=1.240;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:300,0,833 -chr21 38881947 . T G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=0.007;DP=157;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,32:156:99:592,0,4401 -chr21 38885085 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.224;DP=130;FS=5.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,31:130:99:692,0,3821 -chr21 38944856 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.170;DP=81;FS=3.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:398,0,2260 -chr21 38997181 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-0.969;DP=23;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=23.51;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:569,0,192 -chr21 39001418 . T G 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.727;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.292;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:67:600,0,67 -chr21 39001758 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-1.244;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:334,0,406 -chr21 39004433 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=-1.414;DP=31;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:259,0,799 -chr21 39191445 . A C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.465;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:454,0,351 -chr21 39191879 . A C 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.883;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:841,0,1543 -chr21 39191921 . G T 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.359;DP=73;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1215,0,1344 -chr21 39192092 . A T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.096;DP=43;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.934;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:718,0,1377 -chr21 39201738 . G T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=2.910;DP=99;FS=6.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.389;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:722,0,3781 -chr21 39205373 . C T 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.140;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1773,0,1488 -chr21 39209430 . G T 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.529;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:1453,0,3437 -chr21 39209431 . G T 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-1.279;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:1453,0,3431 -chr21 39311125 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.489;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:247,0,1481 -chr21 39312985 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-1.630;DP=27;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:252,0,415 -chr21 39339636 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.815;DP=74;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:511,0,1967 -chr21 39352485 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.38;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:252,0,98 -chr21 39353316 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,104 -chr21 39353397 . T A 218.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:247,0,24 -chr21 39359531 . T TA 1129.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.236;DP=53;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:1344,102,0 -chr21 39359798 . A T 1403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1432,102,0 -chr21 39360865 . T A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr21 39360872 . C A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:383,27,0 -chr21 39360938 . A T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=34.68;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:54:375,0,54 -chr21 39361240 . AT A 573.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.578;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:611,60,0 -chr21 39361292 . T TG 1644.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-1.734;DP=27;FS=5.836;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=32.47;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:99:1682,116,0 -chr21 39453335 . CT C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.031;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:264,0,253 -chr21 39457181 . TTTACCTGCGAGTAAAAGCTCTCAATTAAAACAGTTATTCCAAATGTGTAAGCATTTTAGTGCGTTCATAGGGC T 828.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=2.558;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=23.02;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:866,0,2453 -chr21 39579378 . C T 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=1.652;DP=166;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,44:166:99:1026,0,4569 -chr21 39583194 . T C 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.244;DP=145;FS=4.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:966,0,3845 -chr21 39608910 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr21 39670519 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.377;DP=61;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:314,0,1666 -chr21 39673037 . G C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.286;DP=52;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:238,0,1537 -chr21 39677316 . G A 2149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-1.716;DP=96;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=22.39;ReadPosRankSum=1.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,62:95:99:2178,0,1078 -chr21 39677500 . C T 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-3.672;DP=74;FS=17.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.576;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1320,0,1261 -chr21 39677779 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.580;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:450,0,1235 -chr21 39677826 . CA C 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=-1.689;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:99:476,0,125 -chr21 39695136 . T G 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-0.527;DP=118;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1828,0,2260 -chr21 39951193 . AT A 398.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:29:436,29,0 -chr21 39972055 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:248,0,529 -chr21 40170673 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-0.919;DP=176;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,35:176:99:649,0,5461 -chr21 40225992 . G GA 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.102;DP=44;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:338,0,494 -chr21 40234007 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=1.923;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:303,0,973 -chr21 40235490 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:256,0,424 -chr21 40246896 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.110;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:340,0,1936 -chr21 40250382 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.546;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:303,0,1017 -chr21 40251038 . C G 4194.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:4223,301,0 -chr21 40252100 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.192;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:599,0,808 -chr21 40252222 . A G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr21 40335055 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-2.242;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:333,0,1357 -chr21 40460577 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr21 40467510 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:280,0,339 -chr21 40467513 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:280,0,339 -chr21 40470168 . G A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr21 40474317 . T C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.855;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=16.61;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:510,0,494 -chr21 40474497 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=-0.094;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:450,0,304 -chr21 40475153 . T C 1237.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1266,93,0 -chr21 40477023 . G T 3447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3476,253,0 -chr21 40477107 . G A 2910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2939,214,0 -chr21 40493514 . G T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-1.185;DP=85;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=8.01;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:709,0,2162 -chr21 40522515 . C T 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.437;DP=426;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:333,93:426:99:1785,0,12907 -chr21 40559206 . C CT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-1.967;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:238,0,1338 -chr21 40738669 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=29.65;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:384,0,52 -chr21 40863747 . A C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr21 41377030 . T C 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-1.158;DP=187;FS=4.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,37:187:99:527,0,6684 -chr21 41377035 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-1.334;DP=180;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,30:180:99:337,0,5982 -chr21 41379547 . G GT 993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.178;DP=222;FS=3.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,66:196:99:1031,0,3175 -chr21 41436138 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:375,0,412 -chr21 41436164 . C G 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.576;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:588,0,521 -chr21 41436245 . T G 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.057;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:796,0,2284 -chr21 41436341 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.776;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:357,0,374 -chr21 41438199 . T A 246.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:275,0,19 -chr21 41438601 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.899;DP=23;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:435,0,324 -chr21 41439013 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-1.014;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:766,0,752 -chr21 41439165 . T G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.636;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=27.47;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:770,0,141 -chr21 41445929 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.801;DP=54;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:1033,0,1517 -chr21 41503438 . A G 1807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-2.886;DP=67;FS=5.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=26.98;ReadPosRankSum=-2.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,48:67:99:1836,0,491 -chr21 41503520 . T C 4197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:4226,307,0 -chr21 41505761 . G A 2095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=1.181;DP=126;FS=9.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:2124,0,2203 -chr21 41506539 . A T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr21 41506695 . A T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr21 41507104 . C T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr21 41507122 . A T 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr21 41509406 . G T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr21 41509424 . G GA 245.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr21 41511978 . T G 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:39:548,39,0 -chr21 41517385 . A T 3118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.549;DP=167;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,96:167:99:3147,0,2381 -chr21 41519566 . C T 5138.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:5167,375,0 -chr21 41520970 . C A 2650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.056;DP=148;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=17.91;ReadPosRankSum=2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:2679,0,2714 -chr21 41548695 . C T 2808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-1.276;DP=208;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.325;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,81:208:99:2837,0,4349 -chr21 41619789 . G C 1455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.228;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1484,0,1451 -chr21 41628376 . AGTAAGCGTCGTTTATTACCATGTTAAGTACTAAGTGCCTCTTCAGTCGTGTAGTAGTGGTGCAGGTTAATATGGCCATCCATTTTCTCCTTTTTCAG A 2009.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.782;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,80:87:99:2102,0,725 -chr21 41632949 . A T 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.117;DP=86;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1314,0,1403 -chr21 41655281 . G C 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=2.679;DP=67;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=17.82;ReadPosRankSum=-1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,37:67:99:1222,0,1116 -chr21 41656664 . C A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.526;DP=65;FS=4.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:984,0,1359 -chr21 41782986 . CT C 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,402 -chr21 41826401 . T C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.436;DP=77;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:887,0,1884 -chr21 41826631 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=2.257;DP=81;FS=6.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:528,0,2459 -chr21 41829194 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr21 41842501 . G A 1342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.830;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=15.26;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:1371,0,1679 -chr21 41883636 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=-0.812;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:325,0,1642 -chr21 41891094 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.147;DP=23;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:360,0,445 -chr21 41913228 . CACACACACACACACACACACACACACACACACAT C 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:18:249,18,0 -chr21 41920078 . T C 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:661,48,0 -chr21 41920348 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,279 -chr21 41920905 . G A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr21 41930845 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.660;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:571,0,555 -chr21 41931207 . T C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.892;DP=36;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:777,0,476 -chr21 41931756 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.579;DP=24;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:357,0,410 -chr21 41932518 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=-0.473;DP=30;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:680,0,320 -chr21 41937806 . A C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:290,21,0 -chr21 41938612 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:259,18,0 -chr21 41938973 . C T 358.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.869;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:439,0,162 -chr21 41984471 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,243 -chr21 42001162 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-1.613;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:299,0,548 -chr21 42101470 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:658,0,245 -chr21 42101992 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.914;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:339,0,302 -chr21 42102290 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,129 -chr21 42103802 . A AT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.096;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:258,0,259 -chr21 42104096 . T C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.665;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:647,0,348 -chr21 42104241 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=26.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:326,0,330 -chr21 42115521 . T C 3681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.045;DP=218;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,115:218:99:3710,0,3851 -chr21 42122173 . CT C 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=1.896;DP=70;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.04;ReadPosRankSum=-2.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,34:68:99:740,0,698 -chr21 42343546 . G T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=-1.105;DP=71;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:1024,0,1366 -chr21 42353645 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=2.301;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:234,0,648 -chr21 42359777 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=3.250;DP=58;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:362,0,1554 -chr21 42585201 . G C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=4.563;DP=103;FS=21.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,27:103:99:628,0,2904 -chr21 42665761 . A C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.518;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:544,0,383 -chr21 42809234 . T A 423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:452,33,0 -chr21 42809263 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.936;DP=22;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:243,0,518 -chr21 42809267 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.289;DP=23;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:230,0,580 -chr21 43069461 . A G 358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:387,30,0 -chr21 43171339 . T G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr21 43237572 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=1.052;DP=31;FS=5.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:504,0,1281 -chr21 43237573 . G A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.250;DP=31;FS=5.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:596,0,1107 -chr21 43240507 . A AT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.348;ClippingRankSum=0.337;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:337,0,3630 -chr21 43241248 . AT A 9088.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:9126,624,0 -chr21 43242626 . G GA 1361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.652;DP=118;FS=11.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1399,0,1410 -chr21 43243392 . A AT 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=2.012;DP=130;FS=6.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1158,0,1227 -chr21 43243942 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=2.131;DP=41;FS=4.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:365,0,1224 -chr21 43244317 . CT C 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-1.028;DP=139;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,28:137:99:576,0,3262 -chr21 43245104 . C T 6004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=-1.574;DP=321;FS=18.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,155:321:99:6033,0,11240 -chr21 43273943 . T C 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-1.994;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=21.76;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1334,0,891 -chr21 43275165 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=1.675;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:293,0,1080 -chr21 43275169 . T C 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=1.244;DP=29;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=27.79;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:834,0,339 -chr21 43289724 . T C 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.271;DP=100;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1823,0,1543 -chr21 43302380 . T A 2239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.369;DP=102;FS=27.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,65:102:99:2268,0,1294 -chr21 43305317 . G C 2087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.359;DP=118;FS=2.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:2116,0,1884 -chr21 43308824 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.642;DP=32;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:568,0,558 -chr21 43525089 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,389 -chr21 43525096 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:232,0,389 -chr21 43594568 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,308 -chr21 43603558 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-1.388;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:718,0,1159 -chr21 43620672 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-2.104;DP=41;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:768,0,582 -chr21 43621905 . C A 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr21 43621952 . G C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=-1.506;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:450,0,254 -chr21 43624293 . C G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.739;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:24:346,24,0 -chr21 43651063 . A C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.578;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:307,0,616 -chr21 43654465 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-0.142;DP=31;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:423,0,649 -chr21 43658185 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=1.148;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:269,0,952 -chr21 43658731 . G C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.669;DP=44;FS=7.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:338,0,1130 -chr21 43660498 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.476;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:374,0,748 -chr21 43660561 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=2.900;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:428,0,647 -chr21 43886046 . T C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr21 43886573 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.235;DP=28;FS=9.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:584,0,397 -chr21 43887141 . C T 1028.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-1.476;DP=27;FS=4.314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=27.39;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1057,78,0 -chr21 43888549 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr21 43889238 . A G 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.903;DP=85;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:1309,0,3565 -chr21 43889489 . G C 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.242;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,53:83:99:1899,0,1039 -chr21 43893430 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=25.63;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:77:387,0,77 -chr21 43893913 . CTTGGGCTCGGTTTCCAGCTGA C 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=1.141;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.36;ReadPosRankSum=-2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,814 -chr21 43897800 . GCA G 3606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=-3.163;DP=156;FS=1.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=23.12;ReadPosRankSum=6.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,99:120:99:3644,0,303 -chr21 44022157 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.092;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.680;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:273,0,160 -chr21 44022214 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.253;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:434,0,278 -chr21 44022569 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:417,0,616 -chr21 44022574 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.193;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:417,0,616 -chr21 44022821 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:386,0,272 -chr21 44023602 . T G 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:384,27,0 -chr21 44023997 . A AGT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.528;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.63;ReadPosRankSum=-2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:337,0,348 -chr21 44024042 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.061;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:420,0,687 -chr21 44024225 . CA C 299.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:337,33,0 -chr21 44027101 . A C 3494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.878;DP=304;FS=6.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=11.50;ReadPosRankSum=-2.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,104:304:99:3523,0,6975 -chr21 44030291 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.680;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=23.80;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:409,0,165 -chr21 44036836 . A G 201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-2.054;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=20.18;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:19:230,0,19 -chr21 44037242 . T A 1754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-2.512;DP=122;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=14.38;ReadPosRankSum=2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1783,0,2337 -chr21 44037289 . G A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:306,21,0 -chr21 44037399 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=1.119;DP=351;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,58:347:99:306,0,14851 -chr21 44037507 . C T 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=7.128;DP=300;FS=16.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,65:300:99:787,0,10727 -chr21 44040885 . C T 5493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.618;ClippingRankSum=0.025;DP=438;FS=16.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,179:438:99:5522,0,8636 -chr21 44041319 . G A 4896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.736;DP=311;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,145:311:99:4925,0,5275 -chr21 44059066 . A C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-1.872;DP=40;FS=16.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=11.32;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:481,0,874 -chr21 44059249 . C G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=2.262;DP=14;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.77;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:403,0,215 -chr21 44059250 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=2.166;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:403,0,215 -chr21 44059377 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.648;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:344,0,221 -chr21 44059402 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.212;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,127 -chr21 44061963 . A T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=2.976;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=30.89;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:79:646,0,79 -chr21 44062715 . CA C 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=2.289;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=12.87;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:256,0,428 -chr21 44067109 . G A 2165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.651;DP=170;FS=11.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,69:170:99:2194,0,3082 -chr21 44148671 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:264,0,564 -chr21 44160465 . T C 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr21 44160467 . G A 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:396,27,0 -chr21 44161869 . C T 2665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.331;DP=170;FS=0.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:2694,0,2721 -chr21 44162600 . C T 3326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.890;DP=226;FS=7.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,100:226:99:3355,0,3907 -chr21 44176515 . GCA G 397.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-1.488;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:8:434,8,0 -chr21 44176746 . A C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-2.041;DP=13;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=28.37;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:43:397,0,43 -chr21 44176763 . C T 337.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.696;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=30.66;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9:365,0,9 -chr21 44183706 . C CCAT 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:50:269,0,50 -chr21 44186752 . G A 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-1.073;DP=167;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,54:167:99:1393,0,4130 -chr21 44203424 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,261 -chr21 44203944 . A T 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=1.582;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,39:72:99:1333,0,1192 -chr21 44206401 . C T 3323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=2.322;DP=317;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=10.49;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,107:316:99:3352,0,7035 -chr21 44210575 . G A 2270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.196;DP=147;FS=3.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:2299,0,2524 -chr21 44314638 . A ATC 376.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:29:414,29,0 -chr21 44314933 . C T 1588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.105;DP=132;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1626,0,3043 -chr21 44317332 . C G 5533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-1.284;DP=411;FS=9.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,162:410:99:5562,0,8367 -chr21 44325735 . T C 2029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.065;DP=147;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,59:147:99:2058,0,2954 -chr21 44326448 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-1.753;DP=58;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:340,0,1592 -chr21 44326469 . G T 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-1.310;DP=81;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:482,0,2120 -chr21 44328848 . A C 5797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.082;DP=147;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=31.98;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:5826,430,0 -chr21 44330299 . C G 1784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.121;DP=104;FS=4.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1813,0,3278 -chr21 44336196 . C T 3603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=1.078;DP=202;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,101:202:99:3632,0,3577 -chr21 44336920 . G A 3530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.539;DP=218;FS=1.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,104:218:99:3559,0,3587 -chr21 44345282 . G C 2099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-4.074;DP=108;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:2128,0,3417 -chr21 44349975 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.790;DP=70;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:337,0,2094 -chr21 44350153 . ACACACACACACACACACACACTCT A 646.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:77:684,77,0 -chr21 44356182 . C T 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:72:990,72,0 -chr21 44361942 . G T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=3.873;DP=28;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.706;QD=25.96;ReadPosRankSum=2.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:755,0,147 -chr21 44364225 . G A 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:752,54,0 -chr21 44364298 . T C 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 -chr21 44369578 . G GGGT 3339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.003;DP=171;FS=16.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,96:157:99:3377,0,2418 -chr21 44370611 . G A 3537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=2.043;DP=286;FS=0.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=12.37;ReadPosRankSum=-2.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,109:286:99:3566,0,5872 -chr21 44370837 . G C 3922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.224;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,89:229:99:3951,0,9769 -chr21 44371737 . G A 5301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.004;DP=368;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=14.41;ReadPosRankSum=2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,156:367:99:5330,0,6815 -chr21 44376935 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.235;DP=44;FS=7.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:317,0,1088 -chr21 44378435 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.186;DP=52;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:690,0,941 -chr21 44379348 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-1.644;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,370 -chr21 44380234 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.907;DP=37;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:440,0,893 -chr21 44380536 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:284,0,113 -chr21 44381257 . TACACACACACAC T 571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:55:609,55,0 -chr21 44399276 . C G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:417,0,177 -chr21 44439003 . A T 7075.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:7104,503,0 -chr21 44455033 . A G 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:354,24,0 -chr21 44495007 . C A 3761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=-1.075;DP=305;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=12.33;ReadPosRankSum=2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,109:305:99:3790,0,6836 -chr21 44496639 . G A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr22 121756 . CGTGTGTGT C 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:27:694,27,0 -chr22 228682 . ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-0.196;DP=82;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=2.61;ReadPosRankSum=3.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:251,0,1683 -chr22 310211 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr22 310244 . C G 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr22 389982 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,166 -chr22 443420 . T C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-0.158;DP=103;FS=7.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:481,0,3150 -chr22 565576 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=3.089;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:432,0,434 -chr22 566272 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=2.192;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:396,0,118 -chr22 598039 . A C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-2.354;DP=80;FS=7.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:413,0,2288 -chr22 626712 . G A 4352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=3.129;DP=152;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=28.64;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,116:151:99:4381,0,724 -chr22 709987 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.665;DP=29;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:345,0,676 -chr22 724790 . A G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:436,0,348 -chr22 734168 . T C 3127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-3.645;DP=177;FS=6.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,97:177:99:3156,0,2668 -chr22 734892 . G A 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.860;DP=158;FS=8.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,43:155:99:1040,0,4136 -chr22 736930 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.686;DP=188;FS=3.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,37:188:99:615,0,5831 -chr22 756887 . A G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.530;DP=359;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,61:358:99:570,0,10579 -chr22 776891 . G A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.458;DP=68;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:826,0,1481 -chr22 779518 . AAGGTGCGGCACTGCTGGAAAATCATTCCTATGTTGTTTATTTTCTTGTATTGTAACGCATACCAAATTTGCTATGTACCCATGATGCCGTGCTGTGTTTTTTGCGC A 291.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=1.370;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:64:99:329,117,0 -chr22 793145 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.728;DP=52;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:286,0,1561 -chr22 793157 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.331;DP=62;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:325,0,1893 -chr22 802809 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.042;DP=99;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:750,0,2567 -chr22 805335 . G A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.026;DP=102;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:579,0,2736 -chr22 807473 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.567;DP=110;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=4.14;ReadPosRankSum=2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:484,0,3114 -chr22 808764 . C T 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.515;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,34:120:99:739,0,3122 -chr22 811495 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-3.757;DP=84;FS=17.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:620,0,2245 -chr22 811625 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.700;DP=70;FS=5.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:459,0,1997 -chr22 811651 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.231;DP=79;FS=9.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:421,0,2234 -chr22 814140 . A G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.782;DP=63;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:359,0,1792 -chr22 837307 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-0.675;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:417,0,342 -chr22 840429 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-1.270;DP=84;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=2.78;ReadPosRankSum=2.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,16:84:99:262,0,3892 -chr22 843509 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.186;DP=63;FS=8.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:316,0,1776 -chr22 872847 . TGGTCAGTGATTTTTCATTTTTATTTAAAATTCTTGCAAACAGGAAGTGATGCGTTACGTTGTTCTGCCTCTTCCA T 2192.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=2.868;DP=53;FS=6.234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=22.95;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:2230,177,0 -chr22 875791 . C T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.044;DP=61;FS=5.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:773,0,1328 -chr22 879961 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.545;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:230,0,241 -chr22 899447 . GCTGTTAAAGAGGAGAACAGAGAGAGAAATGAGATGACTCTGCTTTTCTCCATCACTCCATCATCTCTGATCTGCACCCAC G 4626.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=1.862;DP=104;FS=2.464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,99:102:99:4664,416,0 -chr22 915226 . G A 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.351;DP=98;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,31:98:99:875,0,2565 -chr22 915315 . CCCTGAGAGCGTCACCAAAGCACAGGAGAATGATTTGGAGACTTTAACATTGTGGAGTGAAAGAATAAATACAATGAACGTTTAACCATA C 3562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=2.455;DP=96;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=31.46;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,85:91:99:3600,0,925 -chr22 915717 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.037;DP=81;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:523,0,2185 -chr22 918283 . TCTACAAGAGACGGAGTACTCAACAACTCGCAGAACACAAAGGCTAGCTACGCAGAACACACACCAAACACACCATCCCCAC T 5234.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.471;DP=121;FS=2.003;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=28.60;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,117:121:99:5272,424,0 -chr22 929231 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=2.776;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:436,0,2035 -chr22 936273 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.422;DP=74;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:430,0,2227 -chr22 1002221 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr22 1191497 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-1.856;DP=41;FS=16.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:388,0,1701 -chr22 1215453 . G T 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=-3.229;DP=228;FS=16.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,68:227:99:1269,0,5214 -chr22 1233051 . A C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.851;DP=79;FS=11.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=5.91;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:495,0,2095 -chr22 1237173 . T A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr22 1240943 . T C 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.543;DP=104;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,36:104:99:1172,0,2447 -chr22 1255536 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-1.097;DP=76;FS=3.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:558,0,2048 -chr22 1260820 . G C 1385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=1.207;DP=99;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:1414,0,1918 -chr22 1349330 . A G 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.583;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=15.25;ReadPosRankSum=2.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:562,0,710 -chr22 1349339 . A C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-2.733;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=6.58;ReadPosRankSum=3.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:252,0,1835 -chr22 1349694 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:291,0,338 -chr22 1407655 . A G 249.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.36;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:278,0,21 -chr22 1408340 . A G 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.554;DP=29;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:799,0,129 -chr22 1437317 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.12;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:375,0,451 -chr22 1437523 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,533 -chr22 1438012 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=2.637;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:296,0,132 -chr22 1585085 . AT A 726.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.346;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:26:764,26,0 -chr22 1585720 . C T 674.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.552;DP=19;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=23.57;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:21:703,0,21 -chr22 1687776 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-2.040;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=18.12;ReadPosRankSum=3.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,352 -chr22 1693426 . A C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr22 1693511 . T C 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 -chr22 1695499 . C G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -chr22 1727079 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=1.165;DP=23;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:453,0,310 -chr22 1763114 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:52:291,0,52 -chr22 1886944 . C T 250.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:279,24,0 -chr22 2000310 . C G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-2.282;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=32.34;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:35:481,0,35 -chr22 2012619 . A C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=2.293;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:378,0,244 -chr22 2018071 . A C 479.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=34.27;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:505,0,0 -chr22 2052110 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=1.042;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:260,0,393 -chr22 2060401 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.31;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:96:229,0,96 -chr22 2074164 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.104;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:299,0,549 -chr22 2114083 . A G 206.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=9;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:235,0,25 -chr22 2115445 . A C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.655;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=14.75;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:338,0,371 -chr22 2143666 . C T 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.577;DP=201;FS=4.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,62:201:99:1581,0,5258 -chr22 2155603 . C T 2663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.650;ClippingRankSum=2.171;DP=235;FS=14.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.34;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,85:234:99:2692,0,5148 -chr22 2162145 . C T 5351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=1.208;DP=312;FS=8.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,153:311:99:5380,0,5743 -chr22 2165466 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:310,0,96 -chr22 2179917 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=2.083;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:256,0,883 -chr22 2179927 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=1.658;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:256,0,883 -chr22 2180370 . T G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.265;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.474;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:367,0,357 -chr22 2384543 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.337;DP=71;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:421,0,1867 -chr22 2421866 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:268,0,179 -chr22 2459784 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.694;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:415,0,841 -chr22 2542839 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=1.447;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:237,0,299 -chr22 2596590 . G T 262.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:291,0,19 -chr22 2597218 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:271,0,226 -chr22 2636990 . A G 435.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:1:461,0,1 -chr22 2637020 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:274,0,63 -chr22 2776996 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.289;DP=20;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:290,0,420 -chr22 2823969 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.550;DP=39;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:240,0,1136 -chr22 2826366 . G T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.389;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:680,0,785 -chr22 2899142 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:258,0,95 -chr22 2924232 . G C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=-1.881;DP=59;FS=15.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:272,0,1627 -chr22 2970625 . C T 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.586;ClippingRankSum=-3.566;DP=729;FS=13.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=1.18;ReadPosRankSum=5.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:558,101:659:99:891,0,21942 -chr22 2981665 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.90;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,305 -chr22 2981666 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,305 -chr22 2982031 . A G 358.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=29.85;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:385,0,4 -chr22 2995466 . G T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr22 3023349 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,139 -chr22 3070802 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.009;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=25.09;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:505,0,151 -chr22 3071579 . A C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:383,0,364 -chr22 3074843 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:263,0,58 -chr22 3078352 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,179 -chr22 3107502 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.623;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:240,0,985 -chr22 3108790 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,285 -chr22 3118614 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:282,0,95 -chr22 3159792 . G T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=7.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.890;QD=26.45;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:716,0,183 -chr22 3258369 . T C 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.107;DP=78;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,46:78:99:1505,0,1823 -chr22 3370981 . GA G 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.204;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:514,0,1479 -chr22 3372739 . G A 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.519;DP=158;FS=9.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,47:157:99:1231,0,4079 -chr22 3373110 . AC A 979.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=-0.853;DP=139;FS=0.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:1017,0,3592 -chr22 3373187 . CAA C 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.757;DP=102;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:601,0,1803 -chr22 3397291 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.416;DP=121;FS=15.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,33:121:99:867,0,7052 -chr22 3431682 . G A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.280;DP=106;FS=3.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,33:106:99:867,0,2825 -chr22 3431715 . A T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.240;DP=114;FS=3.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:856,0,2956 -chr22 3433010 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=1.347;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:362,0,2555 -chr22 3449833 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-0.855;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:540,0,1977 -chr22 3470116 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.152;DP=123;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,25:122:99:426,0,3637 -chr22 3888581 . A G 4311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=-0.745;DP=146;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=29.53;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,114:145:99:4340,0,566 -chr22 3946049 . G A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=-0.306;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,46:169:99:1127,0,4564 -chr22 4007851 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.455;DP=221;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=2.94;ReadPosRankSum=-5.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,43:221:99:678,0,6697 -chr22 4007881 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=5.595;DP=204;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=2.21;ReadPosRankSum=2.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,36:204:99:480,0,6258 -chr22 4017724 . C T 4260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=-1.871;DP=324;FS=1.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=13.15;ReadPosRankSum=3.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,124:324:99:4289,0,6601 -chr22 4023598 . C A 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.027;DP=314;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,77:314:99:1736,0,9292 -chr22 4024125 . T C 1661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-2.679;DP=357;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,81:346:99:1690,0,9997 -chr22 4027034 . T C 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=-0.617;DP=364;FS=5.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,84:364:99:1714,0,10466 -chr22 4039967 . C A 3644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.605;DP=268;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=13.60;ReadPosRankSum=3.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,94:268:99:3673,0,13506 -chr22 4039975 . T G 3644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.046;DP=287;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,100:287:99:3673,0,13534 -chr22 4188671 . C CG 509.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:547,40,0 -chr22 4188673 . C T 518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:547,40,0 -chr22 4288626 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr22 4324644 . C T 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=2.029;DP=31;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:493,0,564 -chr22 4324674 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.026;DP=27;FS=9.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.40;ReadPosRankSum=-2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:255,0,678 -chr22 4332468 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,227 -chr22 4339569 . T TGC 5903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.512;DP=327;FS=0.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,153:321:99:5941,0,10314 -chr22 4339937 . G A 10338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=2.291;DP=575;FS=15.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,289:575:99:10367,0,16825 -chr22 4343594 . G A 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-1.319;DP=319;FS=7.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,94:319:99:2398,0,8641 -chr22 4343646 . TCCTATAATGCAGGGATTTAAAGTCTTAATACACCACTGGACTCATATCTTAAGTATAACTTTTTGAAATATCACAACATG T 14176.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.149;DP=365;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,351:355:99:14214,1043,0 -chr22 4358463 . T C 400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:429,30,0 -chr22 4410235 . C G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=1.416;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=33.46;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:35:597,0,35 -chr22 4602718 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.888;DP=15;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=27.38;ReadPosRankSum=-1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:439,0,52 -chr22 4602719 . G T 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:575,39,0 -chr22 4603563 . TA T 241.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:279,27,0 -chr22 4603677 . C CT 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-1.523;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:311,0,549 -chr22 4603770 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=20.34;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:252,0,134 -chr22 4603846 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=3.451;DP=67;FS=13.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=5.13;ReadPosRankSum=-3.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:372,0,2033 -chr22 4610166 . A G 2267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-4.198;DP=106;FS=6.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=21.39;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,67:105:99:2296,0,1833 -chr22 4611984 . T C 4699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-1.160;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=27.65;ReadPosRankSum=2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,129:169:99:4728,0,822 -chr22 4614191 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.244;DP=90;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:978,0,1823 -chr22 4616447 . T A 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.963;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:2200,0,2101 -chr22 4618317 . G A 3382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-0.315;DP=246;FS=5.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,100:246:99:3411,0,7701 -chr22 4641648 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.311;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:303,0,642 -chr22 4643485 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.524;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:562,0,755 -chr22 4643512 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=1.022;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:658,0,691 -chr22 4647081 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.131;DP=22;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:391,0,410 -chr22 4698700 . T A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.129;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=21.69;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:679,0,374 -chr22 4698715 . T A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-1.615;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.026;QD=18.76;ReadPosRankSum=2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:741,0,577 -chr22 4703668 . G A 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.403;DP=82;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1359,0,1241 -chr22 4748143 . T G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.366;DP=61;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:497,0,1598 -chr22 4750771 . T A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=2.024;DP=41;FS=9.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:644,0,789 -chr22 4756847 . A G 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.186;DP=63;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,32:63:99:1149,0,1121 -chr22 4756897 . A G 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-2.659;DP=72;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:530,0,2011 -chr22 4756949 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.663;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:500,0,2012 -chr22 4756950 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=-0.240;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:555,0,1967 -chr22 4757119 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=1.528;DP=31;FS=8.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:591,0,513 -chr22 4757193 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.184;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:506,0,919 -chr22 4757209 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.070;DP=46;FS=2.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:407,0,1166 -chr22 4757578 . T C 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.608;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:791,0,1035 -chr22 4757642 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-1.877;DP=56;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,11:56:99:234,0,1794 -chr22 4760858 . A G 786.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-1.598;DP=23;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=34.21;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:23:815,0,23 -chr22 4760966 . GCT G 903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-1.497;DP=68;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:941,0,1342 -chr22 4761383 . C T 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:353,27,0 -chr22 4776452 . T A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.998;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:727,0,698 -chr22 4782138 . C T 251.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:280,0,17 -chr22 4785741 . G T 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=-0.466;DP=104;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1452,0,2170 -chr22 4785777 . G C 2873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.761;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,85:145:99:2902,0,2192 -chr22 4785850 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-2.405;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,43:137:99:652,0,4741 -chr22 4785888 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=3.877;DP=160;FS=8.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:510,0,6433 -chr22 4785961 . T A 3822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-1.119;DP=184;FS=2.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,114:184:99:3851,0,2450 -chr22 4785986 . G A 1952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-1.080;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,58:170:99:1981,0,3965 -chr22 4786093 . T G 2592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=1.097;DP=151;FS=6.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:2621,0,2714 -chr22 4786192 . T C 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.604;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=16.11;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,92:203:99:3315,0,3865 -chr22 4786320 . C A 2325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-1.561;DP=116;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,69:115:99:2354,0,1565 -chr22 4786410 . C G 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=1.710;DP=58;FS=5.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:707,0,1464 -chr22 4786541 . C T 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.449;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:66:1381,66,0 -chr22 4786607 . T C 575.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:6:603,6,0 -chr22 4814683 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.426;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.19;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:232,0,441 -chr22 4857944 . CA C 323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:361,36,0 -chr22 4858068 . CA C 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:238,0,121 -chr22 4875579 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.143;DP=37;FS=10.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:486,0,811 -chr22 4935173 . T A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:305,0,94 -chr22 4935218 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.62;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:321,0,96 -chr22 4935642 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.702;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=23.60;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:453,0,275 -chr22 4938005 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-1.918;DP=53;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:684,0,1617 -chr22 4938299 . T C 3667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-0.272;DP=135;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=27.17;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,97:135:99:3696,0,977 -chr22 4938373 . G GA 624.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.083;DP=119;FS=5.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,33:115:99:662,0,2716 -chr22 5063126 . C T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.631;DP=60;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:757,0,1217 -chr22 5546054 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.666;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:373,0,527 -chr22 5546308 . G C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=1.270;DP=28;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:556,0,380 -chr22 5581166 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.559;DP=40;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:825,0,475 -chr22 5581257 . T C 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.014;DP=62;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:1119,0,1022 -chr22 5584767 . T C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-0.284;DP=45;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:794,0,807 -chr22 5591399 . TA T 1004.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-0.345;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:1042,0,1682 -chr22 5591683 . T G 2343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.259;ClippingRankSum=1.377;DP=156;FS=4.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:2372,0,2865 -chr22 5593299 . G A 3262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.600;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,103:181:99:3291,0,2680 -chr22 5600870 . C A 4903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.861;ClippingRankSum=-1.238;DP=251;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,145:251:99:4932,0,3589 -chr22 5626783 . G C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr22 5626785 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr22 5626874 . T C 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr22 5627175 . A G 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 -chr22 5627363 . T C 580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:609,42,0 -chr22 5628166 . A C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:339,0,89 -chr22 5628911 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.517;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:437,0,362 -chr22 5628964 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=2.462;DP=31;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:464,0,654 -chr22 5634068 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.842;DP=33;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:425,0,774 -chr22 5634204 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-0.096;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:544,0,749 -chr22 5634257 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.560;DP=36;FS=7.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:434,0,795 -chr22 5634425 . A G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-1.425;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.18;ReadPosRankSum=2.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:514,0,627 -chr22 5662281 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.923;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:456,0,434 -chr22 5680153 . G A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-1.396;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:1203,0,1430 -chr22 5680404 . C T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.327;DP=41;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:734,0,707 -chr22 5682252 . G GA,GAA 654.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,12,23:35:99:1153,623,525,314,0,241 -chr22 5682765 . C T 1728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.667;DP=120;FS=18.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1757,0,2253 -chr22 5686184 . C T 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=-0.120;DP=103;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:1342,0,2017 -chr22 5687933 . G A 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.057;DP=143;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,50:143:99:1637,0,3153 -chr22 5687968 . A G 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.079;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,52:138:99:1755,0,2926 -chr22 5697569 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=-0.978;DP=105;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1816,0,1789 -chr22 5779873 . C G 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 -chr22 5839952 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:356,0,348 -chr22 5852460 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,251 -chr22 5998686 . C G 292.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.55;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:321,0,14 -chr22 5998830 . T A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr22 6110898 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=35;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:46:443,0,46 -chr22 6226547 . C T 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr22 6226659 . C T 359.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=32.64;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:387,0,12 -chr22 6238704 . C T 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr22 6247145 . G C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:231,0,99 -chr22 6254219 . C G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,167 -chr22 6254537 . A T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=1.228;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:297,0,494 -chr22 6254657 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.527;DP=27;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,617 -chr22 6259037 . A G 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr22 6265912 . T A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr22 6265983 . G T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr22 6266633 . G A 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 -chr22 6449990 . T C 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 -chr22 6450332 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr22 6471954 . A T 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 -chr22 6514490 . A G 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr22 6525987 . T C 673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:702,48,0 -chr22 6557329 . G T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr22 6558522 . C T 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 -chr22 6575353 . A G 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr22 6599165 . AAC A 528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:566,40,0 -chr22 6599287 . C T 700.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:729,57,0 -chr22 6703387 . T C 219.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:248,0,25 -chr22 6906440 . C A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr22 6906441 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr22 6908622 . T A 529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:558,42,0 -chr22 6909747 . A C 819.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:848,60,0 -chr22 6934906 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.311;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:480,0,615 -chr22 6945897 . TCTACAACACAAACACATCGATGAAACACAGATAGAAGATTCAAGAATAATGCTTAAAAGGATTGTTGTATTAC T 4078.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=1.802;DP=150;FS=5.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,108:150:99:4116,0,1549 -chr22 6945899 . TACAACACAAACACATCGATGAAACACAGA T 885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-6.172;DP=148;FS=4.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,39:148:99:923,0,4944 -chr22 6945930 . AGAAGATTCAAGAATAATGCTTAAAAGGATTGTTGTATTACCTTT A 887.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-5.833;DP=155;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,39:155:99:925,0,4944 -chr22 6955962 . GA G 1751.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.406;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,72:109:99:1789,0,828 -chr22 6956121 . C G 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-2.373;DP=277;FS=0.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,82:277:99:2161,0,7729 -chr22 6956350 . A C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.427;DP=100;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:484,0,2937 -chr22 6956449 . G A 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-1.375;DP=94;FS=7.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,29:94:99:807,0,2441 -chr22 6956748 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=1.214;DP=151;FS=3.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:306,0,5015 -chr22 6956987 . A T 4642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=-1.080;DP=292;FS=0.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,131:292:99:4671,0,8276 -chr22 6957046 . GACCTGAGAGATCACAAGAGATTATGTGAGAAACTATAATTAAAATGGATGCAGTGTTAACAGGAAACAAGAACTGTAAAGTATAAAGCATC G 1502.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=2.432;DP=309;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,272:274:99:1540,527,0 -chr22 7530082 . C G 271.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:300,0,14 -chr22 7530257 . G GC 842.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.915;DP=61;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:884,0,555 -chr22 7555237 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-1.688;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:470,0,538 -chr22 7555674 . A T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.52;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:331,0,58 -chr22 7557718 . G T 413.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:441,0,8 -chr22 7557777 . C G 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:952,0,116 -chr22 7557801 . C T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.390;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=32.79;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:91:1012,0,91 -chr22 7558874 . A G 290.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.32;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:319,0,15 -chr22 7558913 . T C 626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:655,48,0 -chr22 7559178 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.064;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:316,0,368 -chr22 7559331 . G GA 665.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-0.866;DP=34;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:703,0,99 -chr22 7560063 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:348,0,171 -chr22 7560396 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,104 -chr22 7580507 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=27.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:383,0,95 -chr22 7596850 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.067;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:876,0,551 -chr22 7601452 . T C 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.037;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.027;QD=27.40;ReadPosRankSum=2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:631,0,148 -chr22 7602480 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.625;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,210 -chr22 7605464 . C G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.619;DP=21;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:599,0,107 -chr22 7605518 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=1.083;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=28.18;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:91:451,0,91 -chr22 7652774 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.415;DP=78;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:353,0,1623 -chr22 7652822 . C T 1004.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1033,72,0 -chr22 7652877 . G A 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:81:1203,81,0 -chr22 7652943 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.109;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:256,0,929 -chr22 7655813 . A C 353.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 -chr22 7832140 . C T 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 -chr22 7832230 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.093;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:230,0,260 -chr22 7832536 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:395,24,0 -chr22 8179275 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.527;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:356,0,527 -chr22 8212306 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-2.357;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:362,0,525 -chr22 8212323 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.902;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:233,0,452 -chr22 8324041 . GA G 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:262,0,278 -chr22 8346302 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,360 -chr22 8352018 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.934;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:303,0,548 -chr22 8362289 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.346;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:489,0,654 -chr22 8608192 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:238,0,815 -chr22 8608194 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.792;DP=21;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:246,0,723 -chr22 8610717 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-1.280;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=23.60;ReadPosRankSum=1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:84:807,0,84 -chr22 8612761 . A C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-1.314;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=5.86;ReadPosRankSum=2.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:251,0,961 -chr22 8777869 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=2.329;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,328 -chr22 8777934 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=2.327;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:365,0,314 -chr22 8930974 . C T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.304;DP=37;FS=7.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:538,0,366 -chr22 8931009 . A G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.366;DP=54;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:726,0,806 -chr22 8931961 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:97:450,0,97 -chr22 8931962 . T G 473.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-0.134;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=26.31;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:501,0,7 -chr22 8932600 . T G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.495;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:422,0,119 -chr22 8932626 . G C 320.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:7:348,0,7 -chr22 8932638 . C T 209.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.19;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:238,0,23 -chr22 9422535 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr22 9431472 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,361 -chr22 9447946 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr22 9462860 . A G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=1.345;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=29.99;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:83:508,0,83 -chr22 9476879 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,303 -chr22 9476882 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,303 -chr22 9477021 . A G 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.679;DP=82;FS=11.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,53:82:99:1793,0,985 -chr22 9477071 . G A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-2.565;DP=52;FS=7.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:774,0,991 -chr22 9477233 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-2.115;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.24;ReadPosRankSum=3.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:384,0,212 -chr22 9837853 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr22 9983531 . T G 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-0.130;DP=51;FS=4.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:1196,0,574 -chr22 10002781 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:280,0,699 -chr22 10003225 . G A 214.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:243,0,22 -chr22 10009843 . T A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:328,0,435 -chr22 10022630 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:92:436,0,92 -chr22 10022729 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,217 -chr22 10037465 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,172 -chr22 10150407 . C G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:365,0,246 -chr22 10179101 . T A 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 -chr22 10182816 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:239,0,52 -chr22 10203680 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.382;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:502,0,882 -chr22 10203682 . A G 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.595;DP=34;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=23.40;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:824,0,509 -chr22 10203796 . A G 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-1.273;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:651,0,1204 -chr22 10203799 . A G 1708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-1.267;DP=53;FS=7.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=32.24;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,44:53:99:1737,0,150 -chr22 10234005 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.181;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:235,0,771 -chr22 10245990 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.019;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:495,0,624 -chr22 10258110 . GCCTTCAGAAACGAACAGACTTTATAGTCACCATCATGTGCACTTTAAAACTAGATGTTAACAAAATGCGAACAAACTTTGCGTTCA G 695.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.060;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:99:733,0,625 -chr22 10274485 . C A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=-0.069;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:471,0,963 -chr22 10300951 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=1.331;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,455 -chr22 10307129 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:455,0,429 -chr22 10315908 . AAGGTCAGATAGACACATTTATTCAAACATTTTTCTGATTAATGACATTTTAAACATGTTTTTTGTAATTTGCTTGTATTGGGTTGC A 15295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=345;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,345:345:99:15333,1447,0 -chr22 10322567 . T A 1344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-2.233;DP=186;FS=5.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,53:186:99:1373,0,5352 -chr22 10328691 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.093;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:510,0,763 -chr22 10370978 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=-0.495;DP=113;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=4.13;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,24:113:99:495,0,3494 -chr22 10371990 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.663;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,20:118:99:285,0,3970 -chr22 10372055 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.595;DP=109;FS=10.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:295,0,4841 -chr22 10372446 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.125;DP=78;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:385,0,2278 -chr22 10485835 . CAAAAATGGACCAATGATGACTTGTTTTTGTTGGAACGTCAATATTAATGAATTCATTGTGCTATAACACAAACCGACCTGT C 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.211;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:673,0,1233 -chr22 10591243 . GCCTGTAGAGTTAGAGTTAGCGTTAGGCTGTTCTGTTTTTTTAATCCGCAAGGGGTTGTTGGTTTACCTTA G 3617.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=2.851;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=29.30;ReadPosRankSum=-1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,92:96:99:3655,306,0 -chr22 10625705 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr22 10627537 . TCTGTGAATGTAAAGAAATCACAATTAAACTGACAGCAAATGTCGAGGCAGGTCAGCCAGGAGATGATATTAAAAAGTGCGAGCTAACTTAC T 2620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=2.138;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=31.14;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,63:68:99:2658,0,507 -chr22 10702234 . A C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=-1.111;DP=59;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:817,0,1231 -chr22 10704182 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.930;DP=52;FS=7.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:310,0,1544 -chr22 10707911 . T C 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-1.129;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:502,0,926 -chr22 10712794 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.106;DP=67;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.044;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:452,0,1913 -chr22 10736868 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.723;DP=120;FS=2.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:547,0,3645 -chr22 10739355 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.534;DP=103;FS=3.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,18:103:99:262,0,3503 -chr22 10747313 . T C 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.460;DP=142;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,40:142:99:953,0,3652 -chr22 10747787 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.636;DP=82;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:233,0,4452 -chr22 10766561 . C A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-0.838;DP=119;FS=10.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,19:119:99:247,0,3844 -chr22 10770972 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.639;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,26:135:99:414,0,4020 -chr22 10788878 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-1.225;DP=94;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:395,0,4004 -chr22 10801067 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.094;DP=38;FS=1.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:317,0,1010 -chr22 10811488 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.613;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:294,0,509 -chr22 10821258 . C G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.320;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:319,0,403 -chr22 10827422 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-3.049;DP=79;FS=4.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:234,0,2488 -chr22 10863050 . AAGGTGAGGGAGTTGCTTTATGAAATTAATTATGAATTTAAATGTTTCACATTATGATATTTAAATGAATTGTGGTAAATTTGACACTAGTGTTTCCTATTTTC A 15396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=1.256;DP=361;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=27.95;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,357:360:99:15434,1219,0 -chr22 10865579 . G C 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-1.210;DP=359;FS=1.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,81:359:99:1576,0,10925 -chr22 10866016 . T C 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-0.497;DP=246;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,52:246:99:973,0,7554 -chr22 10880632 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.844;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=12.78;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,574 -chr22 10880647 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=1.256;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=22.46;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:410,0,197 -chr22 10881448 . CA C 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.743;DP=190;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,40:183:99:476,0,3845 -chr22 10881981 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-2.184;DP=135;FS=5.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,28:135:99:522,0,4191 -chr22 10882264 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=-0.193;DP=180;FS=3.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,31:174:99:486,0,5527 -chr22 10894992 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.702;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:458,0,3636 -chr22 10904720 . G C 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=1.289;DP=108;FS=5.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:761,0,2869 -chr22 10904857 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-0.729;DP=109;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,22:109:99:396,0,3577 -chr22 10976048 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=1.648;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=10.62;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,459 -chr22 11033430 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=1.271;DP=89;FS=0.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=6.17;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:577,0,2531 -chr22 11033945 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.257;DP=77;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:540,0,2198 -chr22 11034849 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.526;DP=91;FS=4.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,27:91:99:708,0,2321 -chr22 11035007 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-0.259;DP=77;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:391,0,2289 -chr22 11035983 . A T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.945;DP=69;FS=2.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:574,0,1860 -chr22 11036695 . T TCC 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.917;DP=49;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:264,0,1487 -chr22 11037016 . A G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.889;DP=37;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:405,0,960 -chr22 11045862 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.463;DP=123;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:311,0,3700 -chr22 11050596 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.365;DP=114;FS=8.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,19:113:99:257,0,3568 -chr22 11063663 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=1.752;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:302,0,1578 -chr22 11114678 . G T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-1.064;DP=91;FS=3.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=5.63;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:541,0,2535 -chr22 11182076 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.731;DP=74;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:537,0,2012 -chr22 11182088 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.109;DP=77;FS=3.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:512,0,2129 -chr22 11233771 . A T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.521;DP=125;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,27:124:99:584,0,7437 -chr22 11234012 . C CA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-2.686;DP=182;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,41:150:99:393,0,2405 -chr22 11552912 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.428;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=2.93;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,26:141:99:441,0,8826 -chr22 11552913 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.682;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,24:135:99:434,0,8826 -chr22 11615605 . CACCTGCACACACACACACACGTACTGACATTATAACATCTGCATCCTTATCAACATCAACGCCATCATAAAGTGTGAGTTTT C 1347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=1.593;DP=38;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=31.97;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:99:1385,0,394 -chr22 11631396 . CACAGGTAACCAGCAAATATAAGTCTGTTTTAAGTCTAAACTGATGGACTGCGCTGAACTTTCTTCCTGATCA C 1080.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-2.125;DP=37;FS=13.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.672;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,31:34:3:1116,0,3 -chr22 11708309 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.855;DP=66;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:398,0,4450 -chr22 11708315 . G T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.209;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:395,0,4450 -chr22 11709269 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.592;DP=96;FS=4.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:547,0,2841 -chr22 11755052 . GCTGTTAAAGAGACAGTCGTCATTAAACATTTAGAGGACAGCATCAGATTATTAATGATTGATTAAGCATCAAAGCATTTTATTGATTAC G 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:449,0,693 -chr22 11829732 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.590;DP=32;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:291,0,849 -chr22 11868932 . CGTAAGTATTTTTGCAAACTTTACAAACACCAAAATAGAATTTATAAATATTACACATAAATTAACTTACTTTTTTTTCCCTCTCCAG C 15984.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=2.271;DP=391;FS=4.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=34.78;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,378:388:99:16017,0,1927 -chr22 11889204 . C T 1736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-4.616;DP=131;FS=69.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,49:131:99:1765,0,2903 -chr22 11983421 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-1.498;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:244,0,1041 -chr22 11983438 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-1.717;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,1109 -chr22 12199921 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.402;DP=53;FS=6.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:348,0,1546 -chr22 12578809 . AT A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.517;DP=94;FS=7.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:283,0,1877 -chr22 12919173 . AGTAAGTCCTAAAGCATAAAATATCTGAATATGTGTTAATGAAATATTGTCAGAGTTTTTCTGATTGATGTCTAACAGGAGAACTCTGTCTAACTGGTTGATTTTGAGTCTAG A 2526.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=1.095;DP=83;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=30.44;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,70:82:99:2564,0,3910 -chr22 12952671 . GAGGTTAGAAAATCCTTTAAAAGAACCAAATTTAAAATAATTCCCACCAAATCATAAACTTTAGATTTGTTATTTTCTCTTTCTTTCTTC G 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-0.133;DP=28;FS=4.607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:99:1189,108,0 -chr22 12960686 . A ATGAGGATCCACAGATT 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=1.547;DP=40;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:618,0,672 -chr22 12960688 . G GCTCC 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:618,0,672 -chr22 13118879 . C CAA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,178 -chr22 13185731 . C CA 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.268;DP=53;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:645,0,408 -chr22 13185911 . C CT 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.843;DP=56;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:482,0,653 -chr22 13187116 . G T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-1.861;DP=64;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:1003,0,1236 -chr22 13241073 . T C 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr22 13695104 . G A 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr22 13855694 . C CA 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.982;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:256,0,815 -chr22 13855752 . G C 1089.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1118,78,0 -chr22 13855861 . A G 745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:774,54,0 -chr22 13856399 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.595;DP=108;FS=2.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=1.96;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:240,0,3662 -chr22 13857577 . C A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.437;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=24.95;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:602,0,186 -chr22 13859527 . G C 3513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.887;DP=93;FS=1.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.728;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,80:85:99:3542,215,0 -chr22 13859550 . GACCTGAAAAATATAACCAACTGAAATCAGTTGAAATGTATTTGGTCTTGTGATGATGACACAAAAATAAATTATTTTTCACAAAGGATGTGCTGTT G 1391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=-0.263;DP=139;FS=17.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.01;ReadPosRankSum=-5.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:1429,0,11049 -chr22 13859569 . ACTGAAATCAGTTGAAATGTATTTGGTCTTGTGATGATGACACAAAAATAAATTATTTTTCACAAAGGATGTGCTGTTAC A 1520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=2.502;DP=125;FS=16.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=12.17;ReadPosRankSum=-2.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:1558,0,4735 -chr22 13859796 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.673;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:424,0,617 -chr22 13860167 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=2.312;DP=188;FS=7.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,32:162:99:522,0,5262 -chr22 14062607 . A T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.483;DP=69;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:685,0,3856 -chr22 14062616 . T G 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.439;DP=73;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,22:73:99:690,0,3856 -chr22 14064033 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.415;DP=69;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:284,0,2121 -chr22 14084278 . G T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-1.145;DP=95;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:776,0,4183 -chr22 14084279 . T G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-1.782;DP=95;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:776,0,4183 -chr22 14087369 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-0.921;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:296,0,920 -chr22 14121881 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,223 -chr22 14148313 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=10;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:57:274,0,57 -chr22 14231968 . AACCTGCAAAAACACATATTTACAAACTGCATGGTGACTGATTTTCCAAAAAAATGTTAGTTTTATGGATAAAAAATGTCAGGTATTTTTCAGGTATATTATTCAGAAACAGTTGGCTTTACAACTCGCTGACATAAAAATCATACGT A 2607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=2.654;DP=88;FS=2.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=29.63;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,70:81:99:2645,0,2376 -chr22 14232985 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=1.317;DP=65;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:295,0,2500 -chr22 14232997 . CAATCTAGTTTGAAGATTAGGATGAATGTAATTTTAATGTTCATTTAACGT C 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.582;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:686,0,2334 -chr22 14233000 . TCTAGTTTGAAGATTAGGATGAATGTAATTTTAATGTTCATTTAACGTTATTTGGATGCAATGTTTGGCATTAAGTCTCAATGCAC T 1573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.011;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=20.71;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,47:74:99:1611,0,1066 -chr22 14233050 . TTTGGATGCAATGTTTGGCATTAAGTCTCAATGCAC T 644.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.905;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.939;QD=8.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:682,0,2334 -chr22 14235409 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.292;DP=71;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:482,0,2033 -chr22 14236096 . A G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.045;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,32:106:99:755,0,2633 -chr22 14236751 . A T 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-2.188;DP=128;FS=3.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,46:128:99:1544,0,2828 -chr22 14238509 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.880;DP=338;FS=5.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,59:338:99:694,0,10477 -chr22 14242603 . A C 3730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=3.479;DP=279;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=13.37;ReadPosRankSum=-3.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,109:279:99:3759,0,6023 -chr22 14242645 . C T 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=2.925;DP=255;FS=18.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,65:255:99:1513,0,7394 -chr22 14250566 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-4.598;DP=65;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:511,0,1733 -chr22 14252739 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.220;DP=73;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:333,0,2279 -chr22 14252771 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.817;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:465,0,2088 -chr22 14268613 . TGTACGTTTTACTTAAGTAGTTTAAAAACACTAATAGCTTAAAAACTTGACTGTTTTTATTGACTCTGGAGGTTTAATTGATTTCTTTCTCTCCACAG T 12900.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.461;DP=319;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=30.53;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,311:315:99:12938,954,0 -chr22 14269396 . GGGTAAGTTTTTAATCACATCCCCTCAGATTTTGTAAAAATGGATTTGATAGTTAAAGTTTCCATGTGTTATCTTTCA G 10373.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.165;DP=283;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=34.44;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,256:263:99:10411,390,0 -chr22 14270143 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.358;DP=24;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:312,0,555 -chr22 14290006 . A T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=-1.077;DP=45;FS=4.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:500,0,912 -chr22 14377843 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.663;DP=41;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:510,0,875 -chr22 14400004 . C A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.043;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:349,0,647 -chr22 14404733 . A G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.307;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:463,0,882 -chr22 14406470 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.267;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:321,0,986 -chr22 14910440 . C CA 246.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:284,27,0 -chr22 15490947 . T A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=1.734;DP=38;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:433,0,861 -chr22 15774639 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.127;DP=112;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,26:112:99:447,0,2945 -chr22 16055104 . CACACACACAT C 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=2.404;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:316,0,258 -chr22 16166871 . TA T 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.216;DP=30;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:399,0,293 -chr22 16174053 . CT C 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.128;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:699,0,133 -chr22 16243981 . C T 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.886;DP=33;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=23.48;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:803,0,1167 -chr22 16243991 . G T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=1.523;DP=38;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:807,0,1167 -chr22 16245044 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.051;DP=60;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:348,0,3751 -chr22 16245049 . C G 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-0.999;DP=64;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:351,0,3751 -chr22 16251198 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.894;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:68:696,0,68 -chr22 16251213 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.98;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:350,0,161 -chr22 16336389 . C A 647.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=34.09;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:23:676,0,23 -chr22 16338351 . T A 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=0.770;DP=77;FS=7.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=16.33;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:1286,0,1356 -chr22 16338545 . T G 3149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-1.286;DP=124;FS=4.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,85:124:99:3178,0,988 -chr22 16338619 . CTT C 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=1.015;DP=89;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1316,0,876 -chr22 16339039 . A G 4402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.097;DP=167;FS=6.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,119:167:99:4431,0,1184 -chr22 16407722 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.504;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,559 -chr22 16502473 . TCTGTTTTTAACAACAACAAAAATTAGCTTTCAGTTTTAACAATTACAATCAAATCCAATTAAAATAAAACAAAAATCCTCTTTAAATAC T 8278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.780;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,179:181:99:8316,748,0 -chr22 16524530 . TTTGAATGAGCTTCTAGGGGTTTAGTAATTTTCTCTTGTGCAATTATAATTAACAGGTAAAC T 1137.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=3.336;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1175,0,1637 -chr22 16524948 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-3.226;DP=49;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=14.93;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:760,0,878 -chr22 16525426 . GAGGTTATGCCATTCTCAATATGTACTGTGTGCAAAGCTGCTAACAGAAATGTTATTATTAAATCATTGCATAAATAAAATGTAGCTAAAATTAAAATCTTAAGAGAATTAATGACCATCTCTTGTGTTATATGTCCATTGC G 1274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.257;DP=63;FS=9.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,36:63:99:1312,0,7448 -chr22 16564934 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:368,0,420 -chr22 16695756 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.021;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:352,0,357 -chr22 16707564 . T TA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.356;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.748;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:352,0,560 -chr22 16759826 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.610;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:391,0,488 -chr22 16766158 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=1.414;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:344,0,526 -chr22 16819595 . G A 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.069;DP=34;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:592,0,595 -chr22 17058783 . G GA 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.639;DP=52;FS=2.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:401,0,661 -chr22 17060419 . A G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.926;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:483,0,746 -chr22 17342813 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:243,0,296 -chr22 17409598 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.629;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=13.41;ReadPosRankSum=2.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:444,0,667 -chr22 17750263 . AT A 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.348;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:421,0,484 -chr22 17755146 . AT A 2300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.576;DP=217;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,72:216:99:2338,0,3586 -chr22 17759549 . C CG 496.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.349;DP=676;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:29:534,0,29 -chr22 17764897 . TGGTGAGATGTCTTTCCAGTCCTACTAAACCCAGACTTCTATTCTGTCAACATTTGTAATGTATTTTCTGTGTGTTTTTCCGTCCA T 17803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=3.218;DP=414;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=27.85;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,406:413:99:17841,1399,0 -chr22 17813988 . CACCTGAAATTATATTTAAAGACAGTTACTTACATGATGATATAGTTCATGACTTTAAACAGATGTAGATATAATTAAAGATGAGAAGAGAATGAGAAGCGT C 6943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=1.928;DP=424;FS=0.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,229:407:99:6981,0,9225 -chr22 17813990 . CCT C 6472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=-1.505;DP=409;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,171:403:99:6510,0,9034 -chr22 17815799 . G A 6133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;ClippingRankSum=-0.428;DP=427;FS=8.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,174:427:99:6162,0,8437 -chr22 17921319 . AGTTAAAAGTACCACACCACCAGAAGAAGCTCTGCTTACCCAG A 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=1.276;DP=107;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,32:107:99:816,0,4649 -chr22 18087541 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,173 -chr22 18087838 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:480,0,136 -chr22 18457313 . AG A 756.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-0.456;DP=43;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:794,0,1573 -chr22 18766258 . CCCTGAGAAAAAAACAAAAAAAAACAAACACTATTTAGTACCACATTGGCCATAAGTTTCATAAAGACTACACTAAATACATA C 15398.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.953;ClippingRankSum=4.513;DP=374;FS=4.494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,341:374:99:15436,1338,0 -chr22 19322296 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.610;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=30.96;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1081,0,111 -chr22 19322354 . A C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-0.890;DP=30;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:81:951,0,81 -chr22 19964009 . T A 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.116;DP=224;FS=6.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,65:224:99:1619,0,9835 -chr22 20306603 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=2.198;DP=31;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:232,0,785 -chr22 20455072 . A G 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.277;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=14.84;ReadPosRankSum=-2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:711,0,926 -chr22 20455107 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-2.290;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=14.44;ReadPosRankSum=2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:577,0,655 -chr22 20460018 . GCAGGTATAAAAGTAGCATTAAAACTCCTGCTCATTGATCTTTTAATGCCAATGGTATTTGATGCCAATCTCTAATTGTACCACATTTGTTATCTGCCTA G 1514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.168;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,40:49:99:1552,0,1135 -chr22 20464753 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:304,0,94 -chr22 20469951 . C T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:436,33,0 -chr22 20470520 . G T 1044.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=1.076;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=33.47;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:42:1073,42,0 -chr22 20477793 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.601;DP=57;FS=5.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:549,0,1438 -chr22 20477944 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-1.871;DP=57;FS=2.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:549,0,1471 -chr22 20478031 . A T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.584;DP=63;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:767,0,1407 -chr22 20478393 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=1.126;DP=77;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:652,0,1878 -chr22 20480169 . G T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.621;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,32:67:99:1110,0,1138 -chr22 20482616 . G C 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.627;DP=79;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.304;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:1226,0,1472 -chr22 20482730 . G A 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=1.343;DP=80;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:881,0,1694 -chr22 20494926 . C T 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.199;DP=131;FS=8.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,43:131:99:1204,0,3409 -chr22 20513872 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,264 -chr22 20560165 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=1.202;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:427,0,319 -chr22 20560791 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.676;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:429,0,202 -chr22 20562346 . T G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:307,0,420 -chr22 20610972 . TAA T 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.320;DP=177;FS=2.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,34:177:99:664,0,8335 -chr22 20611393 . C CT 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.114;DP=78;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:705,0,651 -chr22 20611491 . G T 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.379;DP=103;FS=2.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:1641,0,3704 -chr22 20611601 . T C 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.358;DP=124;FS=9.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,36:120:99:1056,0,7131 -chr22 20622157 . T G 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.099;DP=367;FS=0.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:299,68:367:99:1020,0,11618 -chr22 20632575 . TA T 11302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-3.228;DP=131;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=28.14;ReadPosRankSum=-3.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,15:97:99:11340,0,2127 -chr22 20632676 . C CA 4467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-0.550;DP=168;FS=17.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.165;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,131:157:99:4505,0,4277 -chr22 20638259 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.301;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:393,0,702 -chr22 20640006 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,361 -chr22 20646140 . C T 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.188;DP=257;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=7.74;ReadPosRankSum=2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,79:256:99:2018,0,6632 -chr22 20660573 . T TA 813.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.414;DP=218;FS=5.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,59:209:99:851,0,4067 -chr22 20660664 . G T 3247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=-0.271;DP=254;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,97:254:99:3276,0,5387 -chr22 20726880 . T G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.418;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:308,0,1031 -chr22 20727119 . C CA 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.813;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:277,0,1403 -chr22 20727451 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-0.725;DP=108;FS=7.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:520,0,3331 -chr22 20727679 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-1.421;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:325,0,2479 -chr22 20728854 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=1.297;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:468,0,1580 -chr22 20729034 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.660;DP=126;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,28:126:99:384,0,5214 -chr22 20734020 . GCTTCAAAAAAACAAAACAATAAAAACACCACAGTCAGCAACAGCGCAAGCATCTAAACACAAATGTGAATAATCAACACATCTTCATAC G 6298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.067;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=28.81;ReadPosRankSum=-1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,147:150:99:6336,538,0 -chr22 20738108 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=-1.085;DP=164;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,35:163:99:589,0,4773 -chr22 20782600 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.557;DP=50;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:267,0,1419 -chr22 20794592 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-1.740;DP=43;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:258,0,1227 -chr22 20798048 . AC A 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-0.896;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:431,0,212 -chr22 20798050 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.664;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:431,0,212 -chr22 21098502 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-1.468;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:239,0,1416 -chr22 21099359 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.639;DP=51;FS=2.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:261,0,2808 -chr22 21099360 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.349;ClippingRankSum=-1.148;DP=51;FS=2.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:261,0,2808 -chr22 21099683 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.205;DP=63;FS=5.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:454,0,1790 -chr22 21101298 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-2.349;DP=36;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:278,0,1013 -chr22 21103402 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.410;DP=61;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:320,0,1625 -chr22 21109425 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.538;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:347,0,2100 -chr22 21112448 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.326;DP=66;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:461,0,1634 -chr22 21112499 . G T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=2.172;DP=62;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:624,0,1339 -chr22 21271865 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.960;DP=73;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:267,0,2697 -chr22 21272250 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.088;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:310,0,1321 -chr22 21272277 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=-0.647;DP=45;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:262,0,1354 -chr22 21280268 . ACTGCAGAAACACACAGCCTTTTAGTTCCATACCAAAAAAAAGTATATTACCAGGAGGACTGTAAAAAGTAATCGAATTAC A 12333.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=1.380;DP=272;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,269:272:99:12371,955,0 -chr22 21280391 . G A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.519;DP=227;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,61:227:99:1406,0,6198 -chr22 21282236 . CCCTGCGAGATGAGCATGAAAATGATTACTCACAAAGCACAGAGCGAGACGGTCAGATATAATCTTGATCGTGACACTCA C 13937.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.461;DP=327;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,325:327:99:13975,1090,0 -chr22 21285199 . T C 2163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=1.219;DP=486;FS=6.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:371,113:484:99:2192,0,13333 -chr22 21465621 . G A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-1.029;DP=194;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,58:194:99:1477,0,5140 -chr22 21472169 . C CT 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-1.655;DP=150;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,45:140:99:758,0,2568 -chr22 21477216 . AGTGAGATTTTGACCGCACACTGACACCTGTTTTGGAAGAGTAACTTTTTACATGCAGCTTTACTGTTTTCTAG A 619.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=2.627;DP=21;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.292;QD=29.51;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:657,0,129 -chr22 21495273 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.242;DP=40;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:268,0,1077 -chr22 21589510 . T G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.466;DP=46;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:380,0,1130 -chr22 21593881 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=1.017;DP=53;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:398,0,1470 -chr22 21600218 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.784;DP=68;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:293,0,3560 -chr22 21614368 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.951;DP=58;FS=2.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:284,0,1734 -chr22 21625604 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.031;DP=25;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:232,0,640 -chr22 21625765 . T A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:283,0,406 -chr22 21636525 . G T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-2.708;DP=67;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=13.27;ReadPosRankSum=2.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:917,0,1401 -chr22 21674441 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,371 -chr22 21686668 . CACCTAAATGGGAGACTTCTCAAAGTAAAATACAGCTTGTTTTTCAGACGTGAGGTTTTAACAAGAAGGACAGCACACAG C 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.19;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:291,0,555 -chr22 21721128 . C G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.124;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=5.02;ReadPosRankSum=2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:395,0,2126 -chr22 21721622 . C T 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=2.215;DP=86;FS=6.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:711,0,2271 -chr22 21740758 . C T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-1.064;DP=95;FS=11.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:602,0,2557 -chr22 21866643 . C G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.391;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:512,0,561 -chr22 21866920 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.890;DP=28;FS=10.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:232,0,754 -chr22 21867087 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:249,0,379 -chr22 21976893 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.830;DP=26;FS=9.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:384,0,511 -chr22 21977503 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-0.036;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,43:191:99:859,0,5392 -chr22 21983256 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.975;ClippingRankSum=5.692;DP=91;FS=8.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=4.22;ReadPosRankSum=-5.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,14:91:99:412,0,2934 -chr22 21983385 . A G 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.144;DP=124;FS=11.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,35:124:99:831,0,3359 -chr22 21989189 . T TTA 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-1.329;DP=122;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,29:114:99:344,0,3693 -chr22 21997667 . A G 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:544,42,0 -chr22 22114165 . GT G 417.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.397;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:19:455,0,19 -chr22 22390770 . A T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.391;DP=41;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.85;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:514,0,854 -chr22 22578301 . G A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-0.445;DP=119;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=7.65;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,37:119:99:939,0,3113 -chr22 22597331 . TA T 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.505;DP=16;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:42:317,0,42 -chr22 22638224 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.14;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,638 -chr22 22672622 . CGGTAAGCAGATCCTTGTTTTGAGGGGAGGAATGTTAGCGTTTTCACTTCTGATTGAATGGGTTTTGTCTTTTCA C 8722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=3.113;DP=219;FS=1.158;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=30.79;ReadPosRankSum=-1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,208:219:99:8760,726,0 -chr22 22838745 . GGGTAAAGTATTTTACATTGCCGTATTCATACACCAAACCCTTCACAGTTACAGCAAATATGACATTAGTTCACTTTATTGATGTACATTACA G 2117.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=1.136;DP=58;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=29.82;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,52:58:99:2155,0,553 -chr22 23262764 . T TA 211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:249,20,0 -chr22 23262803 . A G 1124.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-1.255;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=25.37;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1153,84,0 -chr22 23418756 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.445;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,25:124:99:358,0,4502 -chr22 23418870 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.086;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:332,0,2069 -chr22 23731739 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.070;DP=65;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:350,0,1798 -chr22 23741043 . C G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.099;DP=63;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:451,0,1672 -chr22 23741357 . C G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.864;DP=38;FS=11.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:341,0,907 -chr22 24151066 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=1.983;DP=46;FS=8.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:239,0,1395 -chr22 24151782 . A T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-1.789;DP=79;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=9.19;ReadPosRankSum=3.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:754,0,1953 -chr22 24152774 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;ClippingRankSum=-4.687;DP=73;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:278,0,2201 -chr22 24161349 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-2.182;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:393,0,1540 -chr22 24194390 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:290,0,233 -chr22 24194511 . A C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,129 -chr22 24231332 . G A 1778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.796;DP=277;FS=11.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,74:276:99:1807,0,7741 -chr22 24234396 . A C 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.538;DP=201;FS=20.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,53:201:99:1228,0,8262 -chr22 24243277 . A T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.569;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,40:203:99:672,0,6526 -chr22 24243294 . A G 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.393;DP=208;FS=5.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,40:208:99:634,0,6570 -chr22 24274352 . G T 1672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-1.441;DP=352;FS=0.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,81:351:99:1701,0,10331 -chr22 24274657 . C T 4324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.881;DP=499;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,162:499:99:4353,0,13008 -chr22 24278157 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=-0.743;DP=28;FS=5.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:317,0,655 -chr22 24278466 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:282,0,377 -chr22 24281407 . A T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=1.390;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,58:299:99:927,0,9345 -chr22 24282330 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=5.067;DP=364;FS=38.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=0.94;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,51:364:99:369,0,12229 -chr22 24288504 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=2.134;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:304,0,807 -chr22 24292958 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.403;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:429,0,769 -chr22 24292981 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.567;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:366,0,656 -chr22 24303362 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,485 -chr22 24303545 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:242,0,421 -chr22 24303707 . A T 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 -chr22 24316844 . G C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.540;DP=68;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:355,0,2039 -chr22 24316955 . T G 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.588;DP=83;FS=4.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,27:83:99:734,0,2134 -chr22 24329406 . T A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.970;DP=134;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,25:133:99:346,0,4783 -chr22 24330677 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=1.540;DP=94;FS=3.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,16:92:99:240,0,2981 -chr22 24332186 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=-0.161;DP=112;FS=9.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:546,0,3370 -chr22 24332789 . C T 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.822;DP=134;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,38:134:99:933,0,3674 -chr22 24332999 . C T 1322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.506;DP=101;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:1351,0,2155 -chr22 24333404 . T C 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-0.628;DP=120;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,39:120:99:940,0,4214 -chr22 24334988 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.318;DP=103;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,22:103:99:445,0,3235 -chr22 24343039 . C A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-0.416;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,27:119:99:583,0,3503 -chr22 24343249 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=-0.300;DP=122;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,31:122:99:671,0,3492 -chr22 24346360 . A G 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.252;DP=78;FS=3.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:861,0,1787 -chr22 24348996 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-1.092;DP=111;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:747,0,3057 -chr22 24349556 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.629;DP=83;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:326,0,2500 -chr22 24352193 . C T 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.744;DP=103;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:1218,0,2326 -chr22 24352329 . G A 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.350;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:592,0,1251 -chr22 24373297 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.032;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,422 -chr22 24383883 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.991;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:297,0,517 -chr22 24386856 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-1.837;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:316,0,368 -chr22 24387024 . A C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.965;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:284,0,212 -chr22 24406493 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:312,0,98 -chr22 24832748 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-1.490;DP=40;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:309,0,1079 -chr22 24954938 . G T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=1.250;DP=95;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.158;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,27:95:99:693,0,2619 -chr22 24969598 . C CT 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-1.448;DP=27;FS=6.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:278,0,261 -chr22 24970610 . C CT 448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.042;DP=61;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:486,0,848 -chr22 24970786 . GA G 1027.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.778;ClippingRankSum=1.143;DP=168;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,54:157:99:1065,0,2200 -chr22 24971129 . AG A 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=1.424;DP=44;FS=4.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:513,0,539 -chr22 24971185 . G A 1945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-1.685;DP=108;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1974,0,1814 -chr22 25196553 . AGTGAGTAGAGGCATGATTTCACCCGTAAGTCCACTCAGAGCAAGAGAATGAGAAGTTTATGTTTACAG A 1130.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.605;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=30.82;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:54:1158,54,0 -chr22 25505327 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:488,0,708 -chr22 25562135 . C T 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-5.259;DP=95;FS=35.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:888,0,2561 -chr22 25567456 . G A 3075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=2.262;DP=217;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,90:216:99:3104,0,4367 -chr22 25581463 . G A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=2.375;DP=192;FS=10.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,35:192:99:716,0,13191 -chr22 25581578 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr22 25582088 . A G 14012.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=1.261;DP=236;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=35.33;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,227:228:99:14041,997,0 -chr22 25582132 . CT C 8693.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.340;DP=234;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.71;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,218:219:99:8731,658,0 -chr22 25609352 . C T 755.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:784,57,0 -chr22 25881189 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:288,21,0 -chr22 25881411 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.238;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:441,0,367 -chr22 25881424 . G C 786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:57:815,57,0 -chr22 25882367 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=-1.060;DP=39;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:419,0,849 -chr22 25882374 . T A 1350.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1379,99,0 -chr22 26046962 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=1.828;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:245,0,515 -chr22 26067419 . C G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.956;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:402,0,387 -chr22 26155264 . T G 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 -chr22 26155293 . G C 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 -chr22 26155313 . T G 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 -chr22 26155439 . G A 995.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1024,75,0 -chr22 26155453 . G C 908.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:937,66,0 -chr22 26155674 . G A 1197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1226,87,0 -chr22 26155726 . G A 1096.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1125,84,0 -chr22 26392553 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.171;DP=67;FS=2.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:516,0,1823 -chr22 26392583 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.476;DP=76;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:548,0,2132 -chr22 26393537 . T A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-0.297;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:502,0,1815 -chr22 26393643 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.006;DP=75;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:556,0,2112 -chr22 26393786 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.624;DP=58;FS=2.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.01;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:261,0,1764 -chr22 26394237 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-2.062;DP=88;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=7.45;ReadPosRankSum=2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:684,0,2430 -chr22 26395015 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.683;DP=77;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:969,0,1741 -chr22 26395177 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-2.017;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:429,0,2702 -chr22 26489078 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,296 -chr22 26518048 . G C 834.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:863,60,0 -chr22 26518148 . A G 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr22 26685909 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.329;DP=65;FS=12.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:527,0,1779 -chr22 26721137 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,376 -chr22 26722045 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=29.64;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:398,0,161 -chr22 26722051 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:398,0,161 -chr22 26725826 . A C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.113;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:364,0,522 -chr22 26738065 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:393,0,620 -chr22 26738067 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=18.24;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:393,0,620 -chr22 26788569 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.129;DP=44;FS=4.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:329,0,1144 -chr22 26812288 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.336;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:261,0,965 -chr22 26836002 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=-1.347;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.20;ReadPosRankSum=2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:409,0,745 -chr22 26855893 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:269,0,526 -chr22 26868601 . TA T 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-1.844;DP=70;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.227;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:686,0,664 -chr22 26871859 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=1.378;DP=47;FS=14.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=5.59;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:291,0,1389 -chr22 26880677 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-0.938;DP=70;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:449,0,1947 -chr22 26889890 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=-1.287;DP=45;FS=9.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:401,0,2959 -chr22 26889893 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=-1.183;DP=44;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:401,0,2959 -chr22 26889990 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.152;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:384,0,1670 -chr22 26890025 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.459;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:260,0,1685 -chr22 26903054 . T C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.930;DP=70;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:533,0,1944 -chr22 26903646 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-0.424;DP=51;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.19;ReadPosRankSum=2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:599,0,1141 -chr22 26914940 . C G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.285;DP=50;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:878,0,825 -chr22 26923764 . C T 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=1.841;DP=203;FS=3.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=6.89;ReadPosRankSum=4.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,57:203:99:1426,0,5573 -chr22 26925912 . C T 1380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-0.681;DP=209;FS=4.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,58:209:99:1409,0,5623 -chr22 26933069 . T A 1281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.391;DP=268;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,62:265:99:1310,0,7854 -chr22 26937775 . T A 2206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=1.603;DP=196;FS=10.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,67:196:99:2235,0,4628 -chr22 26940639 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,457 -chr22 27063891 . T C 3274.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3303,246,0 -chr22 27078661 . G A 3845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3874,285,0 -chr22 27091311 . C G 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:715,51,0 -chr22 27178728 . C A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.156;DP=48;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:519,0,2672 -chr22 27200574 . G A 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-2.789;DP=178;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,55:178:99:1389,0,4614 -chr22 27208430 . G A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=2.723;DP=123;FS=1.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=6.48;ReadPosRankSum=-2.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,38:123:99:825,0,2996 -chr22 27226053 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=1.458;DP=57;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:256,0,1685 -chr22 27254634 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.176;DP=44;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:735,0,739 -chr22 27254815 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.796;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:243,0,889 -chr22 27255326 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.283;DP=27;FS=8.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:238,0,681 -chr22 27256405 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:240,0,325 -chr22 27257299 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:418,0,517 -chr22 27322869 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-2.030;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:515,0,934 -chr22 27324201 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=-2.164;DP=28;FS=6.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:252,0,783 -chr22 27326474 . T G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.481;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:329,0,1102 -chr22 27361316 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-0.700;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:339,0,1637 -chr22 27361359 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-2.260;DP=61;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=6.11;ReadPosRankSum=1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:401,0,1643 -chr22 27361575 . G A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.385;DP=74;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:933,0,1577 -chr22 27381981 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.871;DP=67;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:265,0,2001 -chr22 27393576 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:346,0,267 -chr22 27396275 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-1.109;DP=66;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:601,0,1558 -chr22 27398709 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.901;DP=71;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:589,0,1850 -chr22 27398742 . T A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.072;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:443,0,2058 -chr22 27398922 . C T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=-0.872;DP=74;FS=6.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:626,0,1836 -chr22 27408074 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=-1.253;DP=59;FS=12.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:263,0,1748 -chr22 27409687 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.761;DP=71;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:366,0,2028 -chr22 27410512 . T C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.484;DP=57;FS=7.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:731,0,1154 -chr22 27410977 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=2.450;DP=88;FS=4.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=7.99;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:731,0,2172 -chr22 27461532 . C CT 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-1.283;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:429,0,773 -chr22 27461551 . C A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.283;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:560,0,985 -chr22 27461818 . T C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-1.034;DP=30;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:272,0,790 -chr22 27461964 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.960;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:240,0,1567 -chr22 27474146 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-1.622;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:284,0,1259 -chr22 27480118 . T C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.073;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:530,0,445 -chr22 27480169 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:345,0,376 -chr22 27483154 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=1.234;DP=55;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:326,0,1594 -chr22 27552277 . T G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=2.192;DP=54;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:624,0,1253 -chr22 27553508 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=1.127;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:456,0,1331 -chr22 27553924 . TGC T 832.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.687;DP=69;FS=2.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:870,0,1776 -chr22 27554061 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=-0.297;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,14:77:99:250,0,3265 -chr22 27804224 . G C 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 -chr22 27804567 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:265,18,0 -chr22 27804572 . A G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr22 27804725 . G C 846.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:875,63,0 -chr22 27804835 . G A 928.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:957,69,0 -chr22 27805014 . TA T 272.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:310,27,0 -chr22 27805082 . A G 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr22 27805096 . T G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr22 27805158 . A G 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr22 27806045 . A C 557.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:586,42,0 -chr22 27806104 . T TG 343.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:381,36,0 -chr22 27806380 . T G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:521,39,0 -chr22 27806464 . AGG A 503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:541,37,0 -chr22 27806920 . G A 408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:437,30,0 -chr22 28094449 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr22 28444980 . T G 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:244,0,25 -chr22 28444997 . T A 210.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:239,0,25 -chr22 28725288 . G C 331.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=27.59;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:359,0,12 -chr22 28725306 . A G 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 -chr22 29191005 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,159 -chr22 29934673 . AT A 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.967;DP=46;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:244,0,861 -chr22 30096607 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.037;DP=64;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:454,0,1688 -chr22 30130434 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.821;ClippingRankSum=-0.701;DP=37;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=6.89;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:283,0,948 -chr22 30190452 . C T 2099.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.90;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:99:2128,154,0 -chr22 30190479 . A G 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:57:507,57,0 -chr22 30190741 . G GT 1170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=1.050;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,54:59:61:1362,61,0 -chr22 30191172 . GT G 563.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:601,49,0 -chr22 30191322 . T A 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.920;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1144,0,1541 -chr22 30191324 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-1.627;DP=63;FS=8.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:336,0,3213 -chr22 30191380 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.410;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:236,0,3919 -chr22 30191882 . T A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr22 30191892 . C A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr22 30192303 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.709;DP=51;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:320,0,909 -chr22 30192304 . A C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=1.102;DP=55;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:320,0,909 -chr22 30192898 . A T 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr22 30192972 . G GT 461.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=11.139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=29.93;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:3:497,3,0 -chr22 30192979 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.386;DP=30;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:469,0,434 -chr22 30193101 . T TA 1763.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.056;DP=62;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.45;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,44:48:99:1801,0,99 -chr22 30193102 . T A 1903.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.563;DP=63;FS=2.585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=30.22;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,46:49:22:1932,22,0 -chr22 30193222 . G T 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -chr22 30193449 . A G 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:678,48,0 -chr22 30194107 . T C 3093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.691;DP=64;FS=11.946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=28.54;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:3122,232,0 -chr22 30194172 . T A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=2.885;DP=97;FS=52.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=14.20;ReadPosRankSum=-3.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1406,0,1095 -chr22 30194175 . G GT 679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-3.174;DP=100;FS=46.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=6.80;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:717,0,1011 -chr22 30194514 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=1.156;DP=111;FS=34.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,25:99:99:571,0,5367 -chr22 30194518 . C CA 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=1.724;DP=110;FS=22.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,29:98:99:582,0,2156 -chr22 30194623 . T A 5563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:99:5592,389,0 -chr22 30194632 . C T 5563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:5592,389,0 -chr22 30194679 . G T 1315.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:94:1344,94,0 -chr22 30194754 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-1.699;DP=107;FS=6.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:915,0,1914 -chr22 30194945 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.235;DP=66;FS=5.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:396,0,2013 -chr22 30195034 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-1.874;DP=163;FS=8.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,29:148:99:293,0,8111 -chr22 30195154 . C T 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=1.262;DP=60;FS=31.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=27.81;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,10:53:99:1697,0,1601 -chr22 30195173 . A T 3620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=6.005;DP=89;FS=52.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=28.47;ReadPosRankSum=-3.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,53:73:99:3649,0,235 -chr22 30195359 . C G 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=1.433;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:69:1544,69,0 -chr22 30195402 . C T 480.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.744;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=34.35;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:507,2,0 -chr22 30195560 . A T 1393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-1.103;DP=81;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:1422,0,1402 -chr22 30195638 . A G 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.417;DP=58;FS=7.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:1115,0,808 -chr22 30195778 . A C 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2353,160,0 -chr22 30195784 . T C 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2353,160,0 -chr22 30195851 . G A 328.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:357,30,0 -chr22 30196149 . T A 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 -chr22 30196151 . T C 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 -chr22 30196827 . A G 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:463,33,0 -chr22 30197093 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.126;DP=50;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:418,0,807 -chr22 30197112 . G A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:510,36,0 -chr22 30197409 . G A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.252;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:704,0,1826 -chr22 30197738 . T C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.442;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:600,0,3303 -chr22 30197917 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-2.708;DP=149;FS=15.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:312,0,4194 -chr22 30198006 . AT A 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-0.402;DP=82;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:461,0,643 -chr22 30198189 . G GAA 1782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1881,125,0 -chr22 30198276 . GTC G 2108.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.517;DP=98;FS=2.434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=21.52;ReadPosRankSum=3.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,51:56:13:2146,13,0 -chr22 30362932 . T A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.078;DP=50;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:801,0,870 -chr22 30395146 . T G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.334;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:453,0,321 -chr22 30405242 . G C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.774;DP=42;FS=16.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:552,0,899 -chr22 30420138 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.486;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:281,0,1072 -chr22 30420200 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.642;DP=32;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:420,0,1066 -chr22 30420201 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-1.839;DP=33;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:258,0,1419 -chr22 30950055 . C T 608.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.123;DP=18;FS=5.315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=33.79;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:636,9,0 -chr22 31065757 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.731;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:274,0,107 -chr22 31087893 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.967;DP=14;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:409,0,53 -chr22 31400267 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=-0.877;DP=42;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:569,0,761 -chr22 31404648 . A C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=-1.008;DP=45;FS=8.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:571,0,979 -chr22 31412618 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=1.028;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:231,0,664 -chr22 31413340 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.506;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:356,0,637 -chr22 31649776 . C A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-1.975;DP=92;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:531,0,2627 -chr22 31649996 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.874;DP=92;FS=11.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=8.55;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:815,0,2472 -chr22 31650765 . T G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=-1.562;DP=24;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.91;ReadPosRankSum=2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:242,0,596 -chr22 31650864 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.378;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.235;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:231,0,602 -chr22 31664057 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-1.092;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:447,0,1760 -chr22 31668097 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.062;DP=44;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:600,0,894 -chr22 31685757 . A C 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.971;DP=77;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:1017,0,1669 -chr22 31881295 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.407;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:246,0,820 -chr22 32004214 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-2.163;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:298,0,175 -chr22 32004378 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.500;DP=24;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:678,0,135 -chr22 32004716 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:371,0,398 -chr22 32349312 . G A 2666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.265;DP=138;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:2695,0,2025 -chr22 32353188 . G A 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr22 32366932 . G A 2882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-0.586;DP=151;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:2911,0,2251 -chr22 32380681 . GAC G 341.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:379,31,0 -chr22 32381247 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,177 -chr22 32390307 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-0.065;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:505,0,464 -chr22 32393435 . G A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=0.916;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:530,0,320 -chr22 32558977 . TCTAAAAACGAGAAACTTAATGAAGACCACCAAGACTAAGGCTTTCTTTTTAGGAAAAAATGAGTTGATTATGCAC T 12225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.088;DP=271;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,264:266:99:12263,1082,0 -chr22 32596338 . CA C 3215.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.355;DP=215;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,133:200:99:3253,0,1504 -chr22 32718875 . AGTGAGAATTATGTTTAAAATACTAAAACTAATGTGCCTTAATGCATCCATTAATTAGTTAGTTGTTTTTTTCTTCAATCAAATGAGAGAAATGTGATGTTTTATTTAG A 1528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.540;DP=31;FS=2.980;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:99:1566,183,0 -chr22 33049345 . T G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,16:16:99:263,0,3703 -chr22 33049407 . T C 1645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:99:1674,119,0 -chr22 33049458 . T C 1645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:1674,119,0 -chr22 33137869 . A G 625.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:654,45,0 -chr22 33197050 . G A 2589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-0.816;DP=92;FS=3.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,67:92:99:2618,0,638 -chr22 33200822 . A G 1443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=1.430;DP=56;FS=4.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=25.78;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,38:56:99:1472,0,540 -chr22 33200958 . G A 1973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.367;DP=80;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,52:80:99:2002,0,2171 -chr22 33200961 . A C 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-1.160;DP=82;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,52:82:99:2011,0,2171 -chr22 33201574 . G A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.876;DP=32;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:694,0,407 -chr22 33201653 . C G 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.126;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:581,0,466 -chr22 33201702 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.122;DP=27;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:521,0,399 -chr22 33201723 . G T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=-0.290;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:463,0,401 -chr22 33217621 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr22 33217624 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr22 33234485 . C T 2160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=-2.560;DP=64;FS=7.762;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=33.76;ReadPosRankSum=3.560 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,56:62:41:2189,41,0 -chr22 33235330 . G A 702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:731,51,0 -chr22 33246660 . T A 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:566,39,0 -chr22 33247417 . G C 1221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=-1.040;DP=30;FS=3.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1250,87,0 -chr22 33247507 . T C 372.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=33.91;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:401,0,13 -chr22 33501233 . T G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.617;DP=58;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:762,0,1305 -chr22 33501409 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.295;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:325,0,1256 -chr22 33738490 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=-0.471;DP=47;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:628,0,1025 -chr22 33744381 . G T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-1.457;DP=52;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:402,0,1359 -chr22 33772572 . C A 2444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.425;ClippingRankSum=0.160;DP=300;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,95:300:99:2473,0,7935 -chr22 33772648 . C T 1399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.075;DP=182;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,54:182:99:1428,0,5182 -chr22 33772665 . T G 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.108;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:1096,0,4004 -chr22 35040751 . TTA T 272.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:310,23,0 -chr22 35044682 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:252,0,293 -chr22 35095477 . G A 2317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.857;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,63:83:99:2346,0,439 -chr22 35095621 . C T 2387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.827;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=22.32;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,71:107:99:2416,0,1200 -chr22 35095913 . A G 2161.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2190,157,0 -chr22 35096266 . A T 2793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2822,204,0 -chr22 35096339 . A C 2494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2523,186,0 -chr22 35096523 . A AT 1030.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:89:1068,89,0 -chr22 35096572 . AC A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.962;DP=70;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:248,0,2049 -chr22 35096830 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=3.776;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.719;QD=11.93;ReadPosRankSum=-3.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:410,0,1634 -chr22 35096839 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=2.606;DP=37;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:422,0,1634 -chr22 35096983 . A T 3476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3505,261,0 -chr22 35097025 . C A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.135;DP=73;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:668,0,1888 -chr22 35097115 . A T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=3.181;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=11.16;ReadPosRankSum=-2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:285,0,462 -chr22 35097129 . ATT A 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:50:687,50,0 -chr22 35097247 . G A 1185.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1214,87,0 -chr22 35097513 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-2.106;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:298,0,640 -chr22 35097524 . GTA G 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.684;DP=33;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:298,0,711 -chr22 35097663 . C T 2757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.576;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=26.77;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,74:103:99:2786,0,704 -chr22 35097871 . G A 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-0.849;DP=60;FS=2.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:262,0,1557 -chr22 35097874 . A G 2119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2157,138,0 -chr22 35097883 . G A 1449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=1.467;DP=54;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,39:53:99:1487,0,329 -chr22 35097934 . A G 1790.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1819,138,0 -chr22 36012228 . CT C 2036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.602;DP=230;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,86:210:99:2074,0,2900 -chr22 36055505 . G A 3577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.656;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,96:254:99:3606,0,10894 -chr22 36055507 . G A 3577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.440;DP=251;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,96:249:99:3606,0,10882 -chr22 36074120 . A T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.714;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=4.57;ReadPosRankSum=2.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:444,0,5936 -chr22 36074122 . A C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.396;ClippingRankSum=-1.113;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=4.58;ReadPosRankSum=2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:440,0,5936 -chr22 36074258 . GA G 1407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.836;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,56:85:99:1445,0,466 -chr22 36074813 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.540;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:441,0,707 -chr22 36075334 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,400 -chr22 36075597 . A C 267.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:296,0,18 -chr22 36075636 . A T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-1.669;DP=23;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=20.99;ReadPosRankSum=3.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:511,0,333 -chr22 36077736 . C G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-2.613;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=6.24;ReadPosRankSum=2.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:359,0,1507 -chr22 36078284 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=2.657;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:331,0,1536 -chr22 36251715 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,249 -chr22 36363699 . G C 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr22 37201921 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:270,0,374 -chr22 37287459 . G GGA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.831;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,217 -chr22 37287646 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.398;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:261,0,132 -chr22 37591026 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.103;DP=38;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:548,0,765 -chr22 37631336 . T C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.030;DP=50;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:595,0,1073 -chr22 37635646 . G A 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.376;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:957,0,825 -chr22 37636492 . C A 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.392;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1198,0,1439 -chr22 37636815 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-0.394;DP=46;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:373,0,1201 -chr22 37636837 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.303;DP=40;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:516,0,840 -chr22 37637335 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=4.101;DP=66;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=7.15;ReadPosRankSum=-2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:500,0,4113 -chr22 37637736 . A T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.766;DP=40;FS=4.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:585,0,803 -chr22 37637988 . T A 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.078;DP=66;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:916,0,1264 -chr22 37639924 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.537;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:327,0,508 -chr22 37640625 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:316,0,140 -chr22 37640994 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:292,0,146 -chr22 37642310 . AT A 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.347;DP=49;FS=6.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=6.99;ReadPosRankSum=2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:380,0,1915 -chr22 37642378 . CA C 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.384;DP=36;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:295,0,475 -chr22 37642508 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-1.442;DP=36;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:320,0,1015 -chr22 37642996 . T C 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=-0.750;DP=49;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:785,0,887 -chr22 37643694 . GT G 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-2.693;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:269,0,520 -chr22 37643706 . T G 712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.335;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:750,0,165 -chr22 37644317 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=1.627;DP=32;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:368,0,771 -chr22 37644514 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,793 -chr22 37645099 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.028;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:304,0,579 -chr22 37645369 . C T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.786;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:570,0,104 -chr22 37648823 . G C 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.896;DP=51;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:878,0,892 -chr22 37649182 . C G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.806;DP=45;FS=4.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:630,0,817 -chr22 37660346 . G T 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.317;DP=34;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:721,0,386 -chr22 37660614 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.283;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:238,0,831 -chr22 37796903 . TCA T 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:23:246,23,0 -chr22 37799461 . A T 675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:48:704,48,0 -chr22 37799631 . AT A 334.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:394,30,0 -chr22 37809133 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=2.516;DP=72;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=4.90;ReadPosRankSum=3.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:381,0,2073 -chr22 37855553 . C G 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-0.372;DP=68;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1045,0,1930 -chr22 37880873 . T G 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=-1.421;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:1242,0,1351 -chr22 37882237 . G A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.017;DP=73;FS=6.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:804,0,2551 -chr22 37885127 . A G 1218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.489;DP=58;FS=3.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=21.01;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,36:58:99:1247,0,753 -chr22 37885147 . A T 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.186;DP=58;FS=5.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1211,0,690 -chr22 37888434 . A G 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.574;DP=80;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1399,0,1406 -chr22 37897970 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.68;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:305,0,52 -chr22 37953879 . T C 952.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:981,72,0 -chr22 37964479 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=1.622;DP=24;FS=9.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:398,0,448 -chr22 37969268 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr22 37987040 . C A 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-1.378;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=27.67;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:1218,0,465 -chr22 38002271 . G C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.753;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:359,0,417 -chr22 38010594 . T A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.400;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=16.34;ReadPosRankSum=2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:404,0,391 -chr22 38011440 . A C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:324,0,296 -chr22 38011967 . A T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:409,0,244 -chr22 38012785 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:392,0,245 -chr22 38013387 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=3.281;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=14.74;ReadPosRankSum=-2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:264,0,679 -chr22 38013392 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=2.540;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:264,0,679 -chr22 38035796 . G C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.757;DP=53;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:871,0,856 -chr22 38059726 . G A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.570;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1024,0,1076 -chr22 38062209 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.104;DP=30;FS=11.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:519,0,545 -chr22 38062252 . C CT 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.284;DP=32;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:322,0,337 -chr22 38066549 . G GT 2277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-0.671;DP=301;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,113:271:99:2315,0,3588 -chr22 38067872 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:431,0,273 -chr22 38070025 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.533;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:324,0,410 -chr22 38147397 . G A 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=-0.505;DP=93;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1471,0,1487 -chr22 38148591 . A G 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.000;DP=57;FS=22.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,34:57:99:1184,0,798 -chr22 38174122 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=22.27;ReadPosRankSum=2.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:340,0,148 -chr22 38198083 . A C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=22.09;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:448,0,234 -chr22 38404413 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr22 38404475 . G A 271.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:300,24,0 -chr22 38784650 . C G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.569;DP=46;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:571,0,1509 -chr22 38867900 . A C 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-2.024;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:991,0,956 -chr22 38868411 . C A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-1.464;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1362,0,1348 -chr22 38868506 . A G 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=-0.577;DP=38;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:914,0,914 -chr22 38869690 . T C 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.039;DP=58;FS=14.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:901,0,1050 -chr22 38869692 . A G 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.281;DP=59;FS=9.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:936,0,1022 -chr22 38871196 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.198;DP=47;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:631,0,923 -chr22 39065342 . C G 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:749,51,0 -chr22 39378384 . AG A 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:88:353,0,88 -chr22 39405520 . A C 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:275,0,22 -chr22 39408494 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.425;DP=32;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:255,0,1061 -chr22 39408705 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.445;DP=82;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:701,0,4478 -chr22 39432091 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:313,0,358 -chr22 39477096 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.406;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:430,0,404 -chr22 39542161 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:295,0,513 -chr22 39543942 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.895;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:450,0,422 -chr22 39543955 . C A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-1.043;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:479,0,453 -chr22 39556286 . C CA 1225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-3.258;DP=361;FS=3.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,88:334:99:1263,0,6777 -chr22 39563646 . TCTGGAAAAACAAAACCTCTAATCAAACTGGTTCAAAACAAGACATTGAACACTTTAGAAGCGTCAGAGTTTCCTCTTAC T 1391.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=354;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,339:339:99:1429,618,0 -chr22 39569659 . C T 6456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.959;ClippingRankSum=1.286;DP=411;FS=21.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,221:411:99:6485,0,6827 -chr22 39572909 . T A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=2.025;DP=314;FS=17.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,72:314:99:1562,0,9666 -chr22 39639396 . A C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=2.183;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:266,0,1582 -chr22 39661877 . A G 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:32:423,32,0 -chr22 39721887 . A G 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.029;DP=158;FS=15.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,44:158:99:1069,0,4238 -chr22 39760106 . G T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.972;DP=140;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,33:140:99:663,0,4019 -chr22 39782103 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=1.059;DP=36;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=5.72;ReadPosRankSum=-2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:234,0,1096 -chr22 39782120 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.877;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=6.22;ReadPosRankSum=2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:252,0,1073 -chr22 39853760 . A G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=2.569;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:637,0,644 -chr22 39858116 . C T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.460;DP=29;FS=8.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:585,0,451 -chr22 39895811 . A G 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:434,36,0 -chr22 40017766 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.485;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:281,0,2714 -chr22 40333886 . TA T 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.393;DP=92;FS=1.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:686,0,1356 -chr22 40334091 . A AT 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.752;DP=32;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:338,0,383 -chr22 40335105 . C T 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.109;DP=270;FS=13.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,77:270:99:1755,0,7084 -chr22 40335477 . C T 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.084;DP=226;FS=1.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,56:226:99:999,0,5992 -chr22 40523150 . TGCAAGTTATATTTTCAGATCGTGCAATGCAGAGTTGGCCTCTGTAAACTCGCTAATAACTTTGTTTTGCTTGTGTTTTGTGCGACAG T 1691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.429;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,52:90:99:1729,0,1859 -chr22 40523152 . CAA C 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-0.312;DP=97;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:90:99:1332,0,2233 -chr22 40523155 . GTTATATTTTCAGATCGTGCAATGCAGAGTTGGCCTCTGTAAACTCGCTAATAACTTTGTTTTGCTTGTGTTTTGTGCGACAGGCA G 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.111;DP=99;FS=1.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:1332,0,2238 -chr22 40526100 . GAGGTCAGTCCTTCTCCTGGCTTAATGCAACATAAGAAATCATTCAGCCTATAAAGTGCTCAGTGTCGTGTTTTATTGAC G 3970.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=2.825;DP=98;FS=4.797;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=31.13;ReadPosRankSum=-2.947 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,93:98:99:4008,314,0 -chr22 40538577 . TCCTGCACATGCACACACAGACACACACACATATGAGCATCTCCACAATGCTTCTAAAGAGTCTGTGAAGAGTTGCTAAACACTCA T 8424.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=-2.104;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,173:179:99:8462,762,0 -chr22 40540913 . A AT 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=-1.032;DP=136;FS=15.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=4.44;ReadPosRankSum=7.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,89:116:99:641,0,362 -chr22 40575438 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-1.074;DP=41;FS=5.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:235,0,2464 -chr22 40576192 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-1.647;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:296,0,882 -chr22 40576631 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=1.106;DP=68;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:331,0,3311 -chr22 40577346 . G GT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-2.454;DP=93;FS=19.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:326,0,1635 -chr22 40577877 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr22 40581542 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-1.091;DP=28;FS=12.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1834 -chr22 40624328 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=2.642;DP=335;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=2.50;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,69:333:99:867,0,14862 -chr22 40684597 . G A 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-3.279;DP=418;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,74:418:99:1048,0,13543 -chr22 40697611 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.397;DP=290;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,51:290:99:675,0,8977 -chr22 40736786 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=-0.221;DP=63;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:433,0,1725 -chr22 40787760 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:278,0,214 -chr22 40789912 . TA T 343.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:381,34,0 -chr22 40789975 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.230;DP=53;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:234,0,1618 -chr22 40790054 . G C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.315;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=6.50;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:392,0,1609 -chr22 40790274 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.616;DP=75;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=3.49;ReadPosRankSum=-2.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:290,0,2194 -chr22 40790406 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.443;DP=96;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:576,0,2398 -chr22 40956474 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,210 -chr22 40957690 . T C 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:60:882,60,0 -chr22 40982466 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:89:231,0,89 -chr22 40996232 . A G 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.450;DP=119;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,30:119:99:736,0,3456 -chr22 40998622 . T G 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.592;DP=142;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,30:142:99:562,0,3804 -chr22 41007919 . A AT 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.437;DP=111;FS=2.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,39:106:99:646,0,1600 -chr22 41052861 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.675;DP=115;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=4.03;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,25:115:99:492,0,3356 -chr22 41067336 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=1.131;DP=92;FS=7.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:332,0,2806 -chr22 41073160 . G A 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.836;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:1036,0,2052 -chr22 41073166 . G A 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.874;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:1036,0,2052 -chr22 41076974 . GT G 660.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-0.496;DP=40;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:698,0,168 -chr22 41078240 . A G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.216;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:718,0,1934 -chr22 41123992 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=1.166;DP=86;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=4.46;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:412,0,2470 -chr22 41127220 . C CA 388.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.480;DP=65;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:426,0,4521 -chr22 41128386 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:267,0,50 -chr22 41150350 . G A 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.320;DP=209;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,50:209:99:1061,0,6091 -chr22 41157114 . C T 2315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.335;DP=191;FS=3.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,70:191:99:2344,0,4111 -chr22 41160873 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.528;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:297,0,859 -chr22 41161045 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.331;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.134;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:364,0,609 -chr22 41161098 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.041;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:375,0,351 -chr22 41161123 . T A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.678;DP=21;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:379,0,323 -chr22 41161225 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.041;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:333,0,265 -chr22 41161461 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=1.610;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,383 -chr22 41162053 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.015;DP=41;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:270,0,1188 -chr22 41191610 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.902;DP=65;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:233,0,4148 -chr22 41195821 . A G 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.132;DP=82;FS=1.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:926,0,2108 -chr22 41195867 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.395;DP=109;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:307,0,3791 -chr22 41196079 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.725;DP=94;FS=3.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:380,0,2922 -chr22 41196101 . G A 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.844;DP=83;FS=23.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=16.42;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1391,0,1438 -chr22 41196260 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-2.481;DP=65;FS=11.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.03;ReadPosRankSum=2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:810,0,1898 -chr22 41197605 . A T 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 -chr22 41197803 . T C 309.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=30.92;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:337,0,10 -chr22 41197840 . A T 653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-0.539;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=31.13;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:35:682,35,0 -chr22 41198227 . T C 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.484;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=34.05;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1288,0,285 -chr22 41198473 . A T 1883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-1.644;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1912,138,0 -chr22 41199007 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=1.189;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:485,0,903 -chr22 41255337 . G A 486.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=34.73;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:513,0,4 -chr22 41255577 . C T 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr22 41256336 . T A 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr22 41257603 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=9.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.25;ReadPosRankSum=2.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:439,0,652 -chr22 41265724 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:69:240,0,69 -chr22 41289221 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.112;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:358,0,670 -chr22 41293725 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.639;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:271,0,884 -chr22 41302422 . TA T 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-1.917;DP=61;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:867,0,675 -chr22 41303392 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.171;DP=53;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:370,0,3225 -chr22 41303395 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=-0.423;DP=52;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:381,0,3225 -chr22 41303825 . CT C 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.682;DP=78;FS=6.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:263,0,3972 -chr22 41317673 . A G 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=1.171;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:2118,0,2413 -chr22 41330347 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-1.384;DP=134;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,27:133:99:508,0,4070 -chr22 41338601 . T G 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=2.192;DP=99;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,24:99:99:641,0,6602 -chr22 41338602 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=2.496;DP=105;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:630,0,6602 -chr22 41376087 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.742;DP=26;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,539 -chr22 41376767 . T A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-1.358;DP=98;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=4.84;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,23:98:99:503,0,2820 -chr22 41377258 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.160;DP=60;FS=6.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:281,0,3111 -chr22 41377312 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-0.275;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:337,0,2209 -chr22 41377516 . A T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.373;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:485,0,614 -chr22 41379437 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.523;DP=66;FS=5.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:473,0,5039 -chr22 41395893 . A G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr22 41395946 . A T 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:475,36,0 -chr22 41396367 . A C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:42:508,0,42 -chr22 41396372 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:45:450,0,45 -chr22 41397235 . A G 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 -chr22 41397584 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr22 41398202 . A C 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 -chr22 41398254 . G A 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 -chr22 41398456 . A G 318.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=31.81;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:11:346,0,11 -chr22 41398731 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.954;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,449 -chr22 41398905 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,573 -chr22 41398906 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,573 -chr22 41401028 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr22 41410636 . A G 1261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.733;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=27.56;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1290,93,0 -chr22 41430985 . A G 368.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:397,30,0 -chr22 41431339 . T C 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr22 41432717 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.804;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:354,0,544 -chr22 41434704 . T C 605.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:634,45,0 -chr22 41440755 . A T 579.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.106;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=28.99;ReadPosRankSum=-2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:26:608,0,26 -chr22 41453161 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=1.711;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:381,0,938 -chr22 41453171 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=3.191;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=17.64;ReadPosRankSum=-3.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:381,0,932 -chr22 41453296 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:282,0,167 -chr22 41453702 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=2.406;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:330,0,1254 -chr22 41453705 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=1.779;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:330,0,1254 -chr22 41454260 . T A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.278;DP=72;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:544,0,2777 -chr22 41457237 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=2.066;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:363,0,654 -chr22 41457272 . A G 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=3.311;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:753,0,595 -chr22 41464791 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=1.394;DP=41;FS=7.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:462,0,832 -chr22 41470785 . A G 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=2.336;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:745,0,532 -chr22 41470818 . C T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.884;DP=55;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:931,0,935 -chr22 41471478 . T C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.741;DP=79;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:632,0,2107 -chr22 41485923 . G T 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr22 41486102 . A AC 1125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.733;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=37.43;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:75:1163,75,0 -chr22 41486105 . A C 1174.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:80:1212,80,0 -chr22 41486245 . G C 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=2.631;DP=25;FS=17.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:49:767,0,49 -chr22 41489544 . T TA 210.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:248,24,0 -chr22 41489712 . G C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:379,0,493 -chr22 41489812 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-0.410;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=22.04;ReadPosRankSum=-2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:491,0,249 -chr22 41491287 . A G 1192.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1221,90,0 -chr22 41673862 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.89;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,128 -chr22 41681885 . A G 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 -chr22 41681963 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:298,0,321 -chr22 41739167 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=1.422;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:746,0,101 -chr22 41776775 . G A 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.477;DP=61;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:868,0,1091 -chr22 41778275 . C A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-1.145;DP=43;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:636,0,871 -chr22 41844880 . C CT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-1.495;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:244,0,1635 -chr22 41926833 . G A 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.664;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1085,0,1981 -chr22 41926835 . G A 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-1.115;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:1085,0,1937 -chr22 41947656 . A C 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-0.515;DP=86;FS=4.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1579,0,1187 -chr22 41947687 . G A 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-1.024;DP=93;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:1244,0,1836 -chr22 41951059 . C G 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.252;DP=77;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:598,0,1962 -chr22 41951893 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.727;DP=94;FS=3.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:669,0,5097 -chr22 41958413 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-3.354;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:366,0,1428 -chr22 41974515 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=1.439;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:430,0,592 -chr22 41975194 . T C,G 4135.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.762;DP=167;FS=4.068;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,47,60:113:99:4379,2146,2095,2138,0,2125 -chr22 41975325 . A G 13883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=480;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,292:292:99:13912,981,0 -chr22 42053428 . AAGGTACATCGGCAGTCTAATGTTTTCACCTGAACACTGCGTTGCTCTTGAGTCTGAGATGGTTTGGTTTTCTGTACGTC A 2528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=1.678;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:2566,185,0 -chr22 42069143 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.825;DP=74;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.955;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:356,0,2131 -chr22 42073922 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.495;DP=90;FS=3.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:267,0,2776 -chr22 42091260 . GCTGCACATTCCAGCATGATCTCAGAAATATCATTAATATAAAGGTTTATGCCATACAGCAATGTCTGAATCCTAC G 1264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=3.530;DP=40;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=31.62;ReadPosRankSum=-2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1302,0,2865 -chr22 42091897 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.363;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:239,0,1214 -chr22 42096535 . TCTACAAGCAAGATTAACAGTAGTGTTGTCCTTATTGTGGATGAAGATATGTCTAACATTGATCATTATACTGTACACGCTCAC T 1553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=2.265;DP=40;FS=6.591;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=25.40;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:99:1591,113,0 -chr22 42126291 . T G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.819;DP=29;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:414,0,652 -chr22 42127071 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:65:240,0,65 -chr22 42133278 . A G 1721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=-1.371;DP=254;FS=3.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,74:254:99:1750,0,6675 -chr22 42133803 . T C 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.726;DP=201;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,62:201:99:1572,0,5689 -chr22 42133827 . C T 1601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.393;DP=208;FS=0.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,64:208:99:1630,0,5816 -chr22 42134820 . C A 1499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.173;DP=235;FS=2.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,67:235:99:1528,0,6183 -chr22 42224303 . C A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr22 42259716 . GGGTAGGAGAACAGCACTTGAACATTGCATCTGTGTTTATTTTGTATGTGTTATGTAAGGTTGTCTTTCA G 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=1.195;DP=48;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.414;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:982,0,2843 -chr22 42260623 . T G 1070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-1.326;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1099,0,553 -chr22 42260625 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-1.092;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:675,0,1508 -chr23 95764 . C T 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.337;DP=60;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,46:60:99:1736,0,295 -chr23 109179 . A T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.380;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:487,0,157 -chr23 109344 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=26.21;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:500,0,156 -chr23 144830 . A T 825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.908;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=31.76;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:854,60,0 -chr23 252809 . C A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr23 261059 . C G 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=1.807;DP=36;FS=3.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=27.44;ReadPosRankSum=-1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1016,0,185 -chr23 263213 . A G 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:333,24,0 -chr23 263263 . A G 989.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=1.495;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:5:1017,0,5 -chr23 263584 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:311,0,147 -chr23 268277 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.476;DP=40;FS=4.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:516,0,982 -chr23 268799 . A C 2958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.104;DP=84;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=32.58;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,66:84:99:2987,0,990 -chr23 268806 . C A 2958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.233;DP=92;FS=4.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,71:92:99:2987,0,1028 -chr23 269099 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:299,0,816 -chr23 269632 . TC T 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.290;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:303,0,406 -chr23 275090 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=1.826;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=30.98;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:44:400,0,44 -chr23 278909 . G A 350.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.82;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:378,0,12 -chr23 331922 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.189;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=30.57;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:548,0,219 -chr23 332743 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.284;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:59:611,0,59 -chr23 334645 . C T 262.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:16:291,0,16 -chr23 334646 . G T 262.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:291,0,16 -chr23 344798 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=1.910;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,304 -chr23 344999 . G T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.613;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:516,0,273 -chr23 523613 . CCCTACAATTAGGCAACACAACAGCATTATTATCAGACATAAATGTAATATTTTGAATAATGATAAGCTGTAAATATGTTCCTCA C 17521.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.595;DP=439;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=33.45;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,429:431:99:17559,1264,0 -chr23 607869 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-2.293;DP=17;FS=13.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=23.10;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:421,0,251 -chr23 607967 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.482;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:394,0,347 -chr23 608895 . T C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.987;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=21.76;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:507,0,329 -chr23 608908 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-1.286;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=19.18;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:316,0,161 -chr23 611789 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=1.055;DP=48;FS=5.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:381,0,1303 -chr23 612318 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=1.120;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:276,0,869 -chr23 612564 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=3.472;DP=22;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:314,0,453 -chr23 614083 . ACTGATGGAGACACACAGCAGGTCAGACTCATGCACGTTCAGGAGGAACACAGTAAATAAAACAGGTCTTAC A 4291.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=3.590;DP=100;FS=1.890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=25.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,95:100:99:4329,327,0 -chr23 965276 . C A 1090.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1119,81,0 -chr23 965627 . T A 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:308,24,0 -chr23 965674 . T C 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=-0.133;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:803,0,1181 -chr23 965675 . G A 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.102;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:930,0,565 -chr23 965716 . C T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=-0.598;DP=171;FS=21.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=3.36;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:602,0,1754 -chr23 965795 . T C 3802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:3832,262,0 -chr23 965800 . A T 3935.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:3964,271,0 -chr23 965905 . T A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=3.556;DP=42;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=8.16;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:371,0,527 -chr23 966062 . C T 8661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.355;DP=253;FS=14.930;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=34.24;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,220:248:50:8690,50,0 -chr23 966096 . G A 4195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-1.019;DP=124;FS=18.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=33.84;ReadPosRankSum=-2.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,105:119:99:4742,0,222 -chr23 966649 . G A 252.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:281,0,22 -chr23 967880 . C T 2041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2070,138,0 -chr23 967881 . T C 2041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2070,138,0 -chr23 968325 . A T 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=-1.283;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:1366,0,2770 -chr23 968336 . A C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.534;DP=155;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,29:111:99:623,0,7650 -chr23 968346 . C A 2208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=-1.421;DP=210;FS=3.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.514;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:2237,0,4019 -chr23 968424 . TCA T 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=4.501;DP=198;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:740,0,2063 -chr23 969102 . C G 1339.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.628;DP=41;FS=8.195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=32.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:96:1368,96,0 -chr23 969309 . A C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.414;DP=28;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:482,0,450 -chr23 986852 . G GT 256.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:294,24,0 -chr23 987465 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.278;DP=26;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=9.22;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,141 -chr23 987487 . T C 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:709,48,0 -chr23 1582380 . A G 439.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.032;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:12:467,0,12 -chr23 1697740 . A C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=1.199;DP=118;FS=1.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,22:118:99:382,0,3595 -chr23 1736454 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=1.325;DP=84;FS=12.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:321,0,2518 -chr23 1947142 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.456;DP=42;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,478 -chr23 1948767 . T C 203.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:232,0,23 -chr23 2009980 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,364 -chr23 2176355 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.265;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:312,0,2188 -chr23 2233315 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.376;DP=43;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:245,0,1207 -chr23 2273401 . G C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-1.719;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:381,0,1365 -chr23 2442989 . G A 2138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.127;DP=523;FS=5.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.410;QD=4.09;ReadPosRankSum=3.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:408,114:522:99:2167,0,15276 -chr23 2560812 . T A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.387;DP=32;FS=15.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:484,0,648 -chr23 2561554 . G GT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.120;DP=59;FS=6.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=3.76;ReadPosRankSum=-2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:259,0,1303 -chr23 2562208 . C CTT 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=-1.527;DP=130;FS=16.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1778,0,1950 -chr23 2598934 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.953;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:415,0,617 -chr23 2684795 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.318;DP=44;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:722,0,800 -chr23 3421987 . AAC A 1001.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.173;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=22.77;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1039,0,498 -chr23 3516809 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:292,0,374 -chr23 3516810 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=33.42;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:563,0,35 -chr23 3572596 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=1.269;DP=43;FS=8.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:562,0,1535 -chr23 3572615 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.020;DP=85;FS=12.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,15:85:99:230,0,2945 -chr23 3572932 . A G 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.352;DP=158;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,42:158:99:975,0,4454 -chr23 3574607 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.477;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:346,0,579 -chr23 3588961 . A G 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.650;DP=112;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1961,0,5718 -chr23 3588962 . T C 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.846;DP=120;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1961,0,5601 -chr23 3589008 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=2.032;DP=153;FS=5.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,27:153:99:281,0,9620 -chr23 3642990 . G C 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.749;DP=530;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=2.18;ReadPosRankSum=3.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:440,89:529:99:1182,0,17347 -chr23 3643314 . T C 9236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-2.724;DP=345;FS=16.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=26.77;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,243:345:99:9265,0,2849 -chr23 3726749 . GCTTTAAAAGTAACATGTTTACTCATTTTACTTTAAAAGAGTCAACTAATCA G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.536;DP=65;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=3.53;ReadPosRankSum=2.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:267,0,14838 -chr23 4317120 . G GA 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.525;DP=42;FS=8.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:257,0,542 -chr23 4317348 . TA T 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.896;DP=19;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:330,0,210 -chr23 4318027 . AT A 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.293;DP=31;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=14.64;ReadPosRankSum=-2.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:491,0,1554 -chr23 4397306 . T G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.744;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:38:543,0,38 -chr23 4534682 . G GT 1572.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-1.622;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,48:63:99:1610,0,271 -chr23 4754010 . C CA,CAA 899.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-1.175;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:22,50,32:104:99:1640,388,543,623,0,1107 -chr23 4812513 . GTACCTGCAGAATGACGCATTATGCTTAGTCACGTTTGAAGCATATTTATTATGCATTAAAGTGTGCTTGTGGCT G 3305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.400;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.873;QD=35.34;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,75:77:99:3343,259,0 -chr23 4906488 . GACCTGTGATGGAGAGAGCTGTTTAGCAGCTAGATCCGGTTTCTTTGATCGCATATTAAAGTATCAACATGTAAAATC G 949.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.252;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:99:987,0,594 -chr23 4955662 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-0.500;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=17.02;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:556,0,1034 -chr23 4955674 . G C 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-3.225;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=22.90;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:807,0,848 -chr23 4956124 . C CTG 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.496;DP=15;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=32.25;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:521,0,115 -chr23 4956527 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=2.173;DP=35;FS=5.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:270,0,879 -chr23 4956779 . A AT 491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.402;DP=34;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:529,0,299 -chr23 4972875 . C A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-0.113;DP=67;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:603,0,1682 -chr23 4972901 . GCTACACAAAAGGAAAGGACACTCAGTGTAAAACCATTCTGTCAAGTGTGACAATGACAACAACAACATAAAAGTGTATTAAC G 2309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=1.764;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=35.00;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,55:60:99:2347,0,499 -chr23 4974367 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.230;DP=42;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:516,0,908 -chr23 4979716 . TCCTGATATCAGAGCATACAAAAACAGCATGACTGCATTTATAGTTTCTACTGTAAAGCCTGTGGCCTCAATTGTGTTAAAAGTGATTGTTGTTGTTGTTGTTGGAGAAATTGCTTGTTACTCAAACACATGCACCTGAGGCTCCGCCTA T 2328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=2.595;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,64:90:99:2366,0,8903 -chr23 5257725 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr23 5626084 . A G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:617,0,1234 -chr23 5626086 . T G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.594;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:617,0,1234 -chr23 5626200 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.162;DP=54;FS=16.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:303,0,1558 -chr23 5815660 . A G 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=14;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=31.70;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:43:472,0,43 -chr23 5815843 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.482;DP=19;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:326,0,243 -chr23 5815849 . G A 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:54:757,54,0 -chr23 5815953 . A G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-1.887;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:718,0,980 -chr23 5816103 . T G 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.032;DP=59;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=15.91;ReadPosRankSum=2.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:967,0,1533 -chr23 5816140 . G C 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.605;DP=51;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:787,0,1127 -chr23 5816179 . A G 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.419;DP=47;FS=4.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=19.51;ReadPosRankSum=2.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:945,0,968 -chr23 5816222 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=2.167;DP=44;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:427,0,2016 -chr23 5816284 . C CA 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.494;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.036;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:590,0,511 -chr23 5816528 . TA T 387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:425,39,0 -chr23 6077973 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.410;DP=57;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:493,0,3141 -chr23 6096993 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.743;DP=55;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=5.00;ReadPosRankSum=2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:303,0,1624 -chr23 6108834 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-1.058;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:233,0,2080 -chr23 6119840 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:338,0,208 -chr23 6119970 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=1.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:247,0,577 -chr23 6364637 . T G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.987;DP=29;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:443,0,526 -chr23 6368573 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.308;DP=36;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:488,0,764 -chr23 6374800 . T G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=2.744;DP=30;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:244,0,1710 -chr23 6374809 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=2.016;DP=28;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=7.71;ReadPosRankSum=-2.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:244,0,1710 -chr23 6472516 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.599;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:317,0,647 -chr23 6681405 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=-0.791;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:340,0,1383 -chr23 6691675 . C CT 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.617;DP=48;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:448,0,453 -chr23 6691796 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-2.734;DP=129;FS=5.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,43:128:99:1435,0,3882 -chr23 6724400 . CA C 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-0.881;DP=64;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:391,0,1778 -chr23 6725758 . A T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-0.684;DP=72;FS=2.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:323,0,2288 -chr23 6744596 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-1.115;DP=107;FS=2.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:568,0,3009 -chr23 6744677 . T A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=-1.380;DP=88;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=21.33;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,57:88:99:1905,0,2138 -chr23 6744830 . A C 1714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1743,126,0 -chr23 6744865 . T C 2149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2178,160,0 -chr23 6744881 . A G 2710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2739,199,0 -chr23 6744970 . G T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.004;DP=146;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,41:146:99:983,0,3822 -chr23 6745067 . C G 2128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.446;DP=150;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:2157,0,2951 -chr23 6745087 . C T 2560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.128;DP=150;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:2589,0,2389 -chr23 6747974 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=1.406;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.41;ReadPosRankSum=-1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:244,0,427 -chr23 6747980 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:474,0,111 -chr23 6751091 . A G 2606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2635,196,0 -chr23 6753851 . G A 3518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.268;DP=121;FS=4.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,95:121:99:3547,0,487 -chr23 6755246 . T G 3612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3641,259,0 -chr23 6755273 . A C 2307.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=1.314;DP=58;FS=3.321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=29.11;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2336,168,0 -chr23 6755333 . A G 3186.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3215,228,0 -chr23 6755354 . C A 3629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3658,259,0 -chr23 6757356 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=3.325;DP=91;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:342,0,2678 -chr23 6757386 . T C 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.485;DP=82;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1541,0,2823 -chr23 6757392 . T C 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-1.154;DP=73;FS=6.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=20.79;ReadPosRankSum=2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:1546,0,2823 -chr23 6761390 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.446;DP=130;FS=3.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,38:130:99:969,0,3391 -chr23 6761414 . C T 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-1.791;DP=120;FS=4.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.960;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:979,0,2973 -chr23 6761489 . G C 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-0.215;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:2048,0,2080 -chr23 6761939 . C A 1981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.160;DP=120;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:2010,0,1974 -chr23 6764688 . G C 2481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.706;DP=136;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:2510,0,4012 -chr23 6764788 . C T 4042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-1.624;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=29.73;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,106:136:99:4071,0,650 -chr23 6766086 . A G 1995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.058;DP=87;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,57:87:99:2024,0,1024 -chr23 6766365 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=4.062;DP=51;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.74;ReadPosRankSum=-3.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:627,0,1123 -chr23 6766382 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=2.079;DP=44;FS=9.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=12.20;ReadPosRankSum=-3.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:565,0,2292 -chr23 6766385 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=2.179;DP=46;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:565,0,2286 -chr23 6766476 . T G 2284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-1.098;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=26.57;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,61:85:99:2313,0,622 -chr23 6766511 . T C 3184.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.496;DP=122;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,85:121:99:3213,0,923 -chr23 6766646 . T A 2225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-1.613;DP=101;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,65:101:99:2254,0,1255 -chr23 6766776 . A C 1661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.734;DP=121;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1690,0,2419 -chr23 6766800 . T G 1848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=1.172;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1877,0,2282 -chr23 6767065 . A G 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.210;DP=129;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:2222,0,2390 -chr23 6767118 . C A 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.265;DP=153;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,62:153:99:2212,0,3170 -chr23 6767330 . A G 2730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.225;DP=166;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:2759,0,2913 -chr23 6767425 . G T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.124;DP=116;FS=7.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,34:116:99:917,0,3112 -chr23 6767504 . C G 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.432;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:99:1295,0,139 -chr23 6772260 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.215;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:794,0,1419 -chr23 6777735 . C T 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.033;DP=72;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:994,0,1433 -chr23 6785993 . T C 2588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.272;DP=115;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=22.51;ReadPosRankSum=-2.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:2617,0,1416 -chr23 6786035 . G A 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.747;DP=102;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:1537,0,5055 -chr23 6786133 . C G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.230;DP=133;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,36:133:99:944,0,9264 -chr23 6786144 . T A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.937;DP=134;FS=9.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=6.83;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:944,0,9264 -chr23 6786304 . T C 2140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=-0.952;DP=106;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:2169,0,1635 -chr23 6786318 . A G 4241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:4270,298,0 -chr23 6786380 . G T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=-0.775;DP=57;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.24;ReadPosRankSum=2.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1068,0,981 -chr23 6786451 . A AT,ATT 985.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=-1.126;DP=51;FS=5.756;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.214;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,28,9:42:99:1372,170,105,992,0,1062 -chr23 6786589 . G A 1817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=-0.681;DP=121;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1846,0,2117 -chr23 6786598 . T TA 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=-1.293;DP=146;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,38:142:99:554,0,2832 -chr23 6786612 . T C 2428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-2.255;DP=146;FS=6.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:2457,0,2610 -chr23 6786706 . CA C 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.263;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.869;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,37:175:99:383,0,4316 -chr23 6786731 . T C 8884.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-1.621;DP=218;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,217:218:99:8913,641,0 -chr23 6805854 . C G 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 -chr23 6806469 . T C 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.985;DP=90;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,31:90:99:989,0,2049 -chr23 6806564 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.861;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:383,0,1581 -chr23 6812087 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.211;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:620,0,721 -chr23 6812117 . C A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=2.500;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:364,0,354 -chr23 6814590 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:378,0,165 -chr23 6907396 . C A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-1.036;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:442,0,897 -chr23 6949101 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=2.295;DP=108;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,29:108:99:715,0,2974 -chr23 6984175 . G C 918.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.339;DP=101;FS=5.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:956,0,390 -chr23 7575878 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.475;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.42;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,438 -chr23 7576396 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-0.472;DP=61;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:288,0,1235 -chr23 7615431 . T C 979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.509;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:42:1008,42,0 -chr23 7615563 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:235,0,59 -chr23 7782868 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=-1.423;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:260,0,1626 -chr23 7831239 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.326;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:439,0,126 -chr23 7846730 . TTC T 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-1.509;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:715,0,2240 -chr23 7850265 . C CA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-1.479;DP=42;FS=7.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:269,0,538 -chr23 7850360 . C A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.125;DP=88;FS=5.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,19:87:99:403,0,2692 -chr23 7857637 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.145;DP=181;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,40:181:99:706,0,5319 -chr23 7860354 . CACCTGCATAGGACAAAGCAAAAGCCTGACTGAGTGAAACTATTGCATTTTGCTGAATATCAATATGTGCACAGAAGTGCATCCGAACTT C 10137.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=1.956;DP=236;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.925;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,229:235:99:10175,880,0 -chr23 8807113 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:288,0,313 -chr23 8811171 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=28.10;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:534,0,156 -chr23 9327627 . AGTAAATTAATGAAGTTTAAATTGTAAATACACAAGTATGTGTCTACATAGAGCTAATTTAAATACAATTTGACCGGTTTCTCTGTTTACCGCAG A 3116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=32.38;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:99:3154,1092,0 -chr23 9335415 . G A 3128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=2.685;DP=558;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=5.61;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:420,138:558:99:3157,0,16290 -chr23 9335451 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.560;ClippingRankSum=4.455;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=4.70;ReadPosRankSum=-4.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:362,0,1779 -chr23 9389422 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.933;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=3.54;ReadPosRankSum=3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:453,0,3613 -chr23 9391227 . G A 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr23 9395141 . A AT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.356;DP=52;FS=2.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:266,0,890 -chr23 9504276 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-3.229;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=7.92;ReadPosRankSum=2.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:258,0,904 -chr23 9504400 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.434;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:534,0,2087 -chr23 9506723 . G A 2823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.269;DP=79;FS=2.883;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=31.44;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:2852,227,0 -chr23 9506747 . A T 7014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:7043,490,0 -chr23 9506841 . G A 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-2.391;DP=68;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,37:65:99:1251,0,1002 -chr23 9509453 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.355;DP=83;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:314,0,2536 -chr23 9509647 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=1.310;DP=91;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:566,0,2563 -chr23 9529012 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=-0.652;DP=72;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:588,0,1870 -chr23 9656411 . C CA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.271;DP=95;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:250,0,1807 -chr23 9681617 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=-0.524;DP=119;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.20;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:290,0,3996 -chr23 9681624 . TCTAAAGAGCAGAGACACAGTGAACAAAGAGTTTGTGTATCACAAAGTTCCTGCTGAGAGTATGATAATAGGATTAAAATGGCTGAC T 4687.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=1.685;DP=119;FS=2.936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=34.21;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,117:119:99:4725,414,0 -chr23 9699735 . C T 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.674;DP=137;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,33:137:99:725,0,3835 -chr23 9715129 . C T 1845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=-0.027;DP=109;FS=9.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1874,0,1907 -chr23 9747567 . A C 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=-1.382;DP=99;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1772,0,1614 -chr23 9774963 . G A 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.196;DP=105;FS=6.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1847,0,1694 -chr23 9813172 . G A 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.995;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1192,0,1258 -chr23 9813813 . C T 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.773;DP=105;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1773,0,1732 -chr23 9901643 . C CA 2232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=-0.540;DP=176;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,99:175:99:2270,0,1823 -chr23 9916752 . A G 4623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.938;DP=176;FS=11.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,121:176:99:4652,0,1561 -chr23 9918106 . C A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=24.58;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:397,0,92 -chr23 9918290 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:233,0,67 -chr23 9921552 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,174 -chr23 9923607 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:322,0,99 -chr23 9930110 . T C 3973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=-0.807;DP=248;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=16.02;ReadPosRankSum=3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,109:224:99:4002,0,3760 -chr23 9935523 . C A 2788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=1.503;DP=169;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,88:169:99:2817,0,2852 -chr23 9935651 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=4.392;DP=143;FS=4.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,31:143:99:577,0,8466 -chr23 9935654 . C G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=3.312;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,23:132:99:599,0,8466 -chr23 9935727 . T C 3139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=2.071;DP=189;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,89:189:99:3168,0,3233 -chr23 9943667 . G A 3433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=-2.209;DP=167;FS=10.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=20.56;ReadPosRankSum=2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,100:166:99:3462,0,2236 -chr23 10021348 . A T 221.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:250,0,22 -chr23 10139231 . T C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.641;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:686,0,674 -chr23 10139299 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.684;DP=25;FS=11.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:397,0,337 -chr23 10149684 . T C 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=1.713;DP=50;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:834,0,870 -chr23 10152817 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.972;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:702,0,968 -chr23 10244097 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.581;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:531,0,275 -chr23 10269513 . C T 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:534,36,0 -chr23 10281083 . TCTGATGAAGTAAAATATAAATGAATGTCAATAGGGAACAGATTTCAAGACATTATATTCATAGCTTAATTTGAGAAGCAAGGTGACTGAC T 15375.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.836;DP=339;FS=3.322;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,337:339:99:15413,1238,0 -chr23 10356585 . G A 7206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.869;DP=374;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,218:374:99:7235,0,12201 -chr23 10457102 . TGGTGAGTTTGCTTTCTTGTACTCATCGTAGACATTCGGAATTGAAAATTCAATCCTTAACTCTTGGGTTATGATTGTTGCGATTTTCA T 10949.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-1.260;DP=241;FS=6.923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,227:232:99:10987,1043,0 -chr23 10457412 . AGTAAGTTTACCTCTGAAGAAGAAAGTGCATGCACATTTGAGTAGATTTATTTTGTATGGTTTGTAACAAATATCCTCTCTCCTGCAG A 14213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-0.907;DP=341;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,318:319:99:14251,1096,0 -chr23 10457796 . TA T 3392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-0.868;DP=382;FS=8.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.197;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,145:361:99:3430,0,4927 -chr23 10523730 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-1.191;DP=56;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:1024,0,953 -chr23 10674727 . C T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=1.650;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:533,0,737 -chr23 10674793 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.979;DP=42;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:631,0,797 -chr23 10674839 . G C 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=1.122;DP=40;FS=9.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:762,0,587 -chr23 10677284 . G T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-0.207;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:489,0,523 -chr23 10696992 . T C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr23 10696994 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr23 10697616 . C CGT 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.625;DP=50;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:340,0,1103 -chr23 10802751 . A G 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.108;DP=84;FS=1.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:1347,0,1592 -chr23 10932032 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.472;DP=154;FS=3.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,33:153:99:608,0,4671 -chr23 10932655 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=1.410;DP=95;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:394,0,2902 -chr23 10936057 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,115 -chr23 11102507 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:238,0,62 -chr23 11487459 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:314,0,463 -chr23 11555289 . G T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.921;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=13.37;ReadPosRankSum=2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:456,0,656 -chr23 11878538 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:400,0,314 -chr23 11972314 . G A 1881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.930;DP=98;FS=2.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1910,0,1513 -chr23 12026933 . G A 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=-0.302;DP=82;FS=5.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1367,0,2143 -chr23 12257832 . C T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-1.397;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:696,0,461 -chr23 12257833 . G T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-1.461;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:696,0,461 -chr23 12259155 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-1.154;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,310 -chr23 12259412 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,477 -chr23 12259416 . C G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,477 -chr23 12260944 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.933;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:474,0,547 -chr23 12261307 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:329,0,271 -chr23 12261526 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:337,0,280 -chr23 12524903 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:350,0,261 -chr23 12526358 . C T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=-0.127;DP=36;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:677,0,606 -chr23 12593559 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.859;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:542,0,407 -chr23 12632382 . GA G 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr23 12632392 . A T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:249,18,0 -chr23 12632530 . G A 627.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.735;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:8:655,8,0 -chr23 12632598 . A T 1915.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-0.111;DP=80;FS=3.499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=23.95;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:1944,135,0 -chr23 12632647 . C A 641.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.156;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:669,8,0 -chr23 12632923 . G A 1615.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:29:1640,29,0 -chr23 12632932 . C T 1582.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=-1.753;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,34:37:15:1611,0,15 -chr23 12633060 . AT A 767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:64:805,64,0 -chr23 12633168 . A G 3936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3965,277,0 -chr23 12633199 . A G 3078.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:3107,214,0 -chr23 12633269 . A G 365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:394,30,0 -chr23 12633587 . C T 623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:652,45,0 -chr23 12633668 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.672;DP=42;FS=19.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:398,0,707 -chr23 12641131 . A G 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 -chr23 12641553 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-0.589;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:372,0,189 -chr23 12641554 . A T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.589;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:372,0,189 -chr23 12641699 . A G 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 -chr23 12980935 . C CA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-2.420;DP=311;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,51:285:99:268,0,6578 -chr23 13018211 . C A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-0.193;DP=88;FS=12.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:551,0,858 -chr23 13047462 . G A 16646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.363;DP=300;FS=5.638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=28.59;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,259:282:99:16675,1131,0 -chr23 13047527 . G A 5648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.033;DP=306;FS=22.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,170:293:99:5677,0,5277 -chr23 13047626 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-1.141;DP=293;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,44:274:99:551,0,8866 -chr23 13047737 . G T 4146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=1.324;DP=182;FS=0.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,112:165:99:4175,0,1327 -chr23 13047978 . C A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=-1.066;DP=118;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:1287,0,2740 -chr23 13047985 . G A 4445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.116;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=28.75;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,100:106:99:4474,281,0 -chr23 13048102 . G A 5366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-2.266;DP=231;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=23.23;ReadPosRankSum=-5.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,53:221:99:5395,0,8372 -chr23 13048174 . C CAA 5358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.928;DP=218;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.990;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,137:214:99:5396,0,8301 -chr23 13048315 . G T 5981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-2.443;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,47:187:99:6010,0,10643 -chr23 13048393 . G A 5981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=-1.420;DP=269;FS=11.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,47:219:99:6010,0,10571 -chr23 13048503 . C T 5981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-1.092;DP=118;FS=3.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=29.42;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,106:112:99:6010,0,10461 -chr23 13048721 . A C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.087;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=31.68;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:1032,0,451 -chr23 13048745 . A C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.098;DP=38;FS=6.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:1032,0,409 -chr23 13048849 . A G 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=1.021;DP=73;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1424,0,313 -chr23 13048950 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.196;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:594,0,231 -chr23 13048987 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.134;DP=13;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=20.83;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:299,0,130 -chr23 13049334 . C T 4141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-1.583;DP=103;FS=1.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=28.88;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,85:95:99:4170,113,0 -chr23 13049382 . A C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=1.799;DP=106;FS=25.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=4.13;ReadPosRankSum=3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:466,0,3510 -chr23 13049484 . G GA 751.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.451;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:988,0,254 -chr23 13049558 . T C 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.186;DP=91;FS=2.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1285,0,1261 -chr23 13049594 . T C 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.837;DP=60;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=23.08;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,36:44:99:1413,0,112 -chr23 13049878 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.544;DP=52;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:483,0,559 -chr23 13049955 . G A 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.573;DP=65;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1335,0,954 -chr23 13049968 . C G 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-3.139;DP=69;FS=8.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=13.90;ReadPosRankSum=2.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:987,0,1064 -chr23 13670701 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.732;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:360,0,626 -chr23 13698016 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:307,0,383 -chr23 13710084 . C T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.330;DP=46;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:744,0,733 -chr23 13733347 . G C 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr23 13733357 . T G 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:393,27,0 -chr23 13737427 . C A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=32.05;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:477,0,46 -chr23 13834406 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,222 -chr23 13918848 . G C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-1.484;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=25.09;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:530,0,277 -chr23 13920893 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,318 -chr23 13945366 . T A 5917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=-0.064;DP=385;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=15.37;ReadPosRankSum=2.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,168:385:99:5946,0,7227 -chr23 13957104 . A C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.069;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:514,0,811 -chr23 13957237 . G T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-0.153;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:474,0,656 -chr23 13958472 . G T 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.621;DP=40;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=20.42;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:845,0,594 -chr23 13958530 . C A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.705;DP=38;FS=2.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.47;ReadPosRankSum=2.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:730,0,1328 -chr23 14053265 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-1.732;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:467,0,298 -chr23 14060983 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:299,0,691 -chr23 14168669 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.177;DP=40;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:708,0,654 -chr23 14169006 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=6.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:429,0,671 -chr23 14295126 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=27.34;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:43:329,0,43 -chr23 14310127 . G A 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.045;DP=130;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,41:130:99:1050,0,3392 -chr23 14342933 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:279,0,104 -chr23 14369683 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,348 -chr23 14371247 . A T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.692;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:349,0,672 -chr23 14373892 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=1.347;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:383,0,303 -chr23 14374254 . T A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.883;DP=51;FS=4.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:445,0,1775 -chr23 14375229 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.223;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:330,0,587 -chr23 14375657 . G T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.044;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:318,0,1940 -chr23 14376844 . T C 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.976;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.212;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:1234,0,1102 -chr23 14846543 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=2.180;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=23.73;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:313,0,113 -chr23 14884102 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.912;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:396,0,1987 -chr23 14892633 . C T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=1.444;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=11.48;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:878,0,1694 -chr23 14900105 . G A 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=-0.244;DP=73;FS=4.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:1008,0,1506 -chr23 14907688 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.423;DP=84;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=4.83;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:434,0,2515 -chr23 14911509 . G T 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-2.102;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,31:101:99:805,0,2700 -chr23 14911609 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-0.352;DP=88;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:590,0,2388 -chr23 14944769 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.624;DP=83;FS=3.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:521,0,2777 -chr23 14945195 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.540;DP=120;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,27:120:99:554,0,3723 -chr23 14958769 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.918;DP=117;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,19:116:99:253,0,3748 -chr23 15104026 . CA C 569.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-0.348;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:607,0,325 -chr23 15110061 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.256;DP=38;FS=3.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:259,0,999 -chr23 15151662 . A C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.182;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:470,0,127 -chr23 15151812 . T C 361.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=32.83;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:389,0,11 -chr23 15152213 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.292;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:314,0,644 -chr23 15152818 . T A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.103;DP=36;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:286,0,892 -chr23 15153513 . A T 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:525,36,0 -chr23 15153946 . T C 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:52:739,52,0 -chr23 15154176 . A G 443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:472,33,0 -chr23 15154903 . T G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.660;DP=21;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:30:701,0,30 -chr23 15155445 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.646;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:393,0,389 -chr23 15155727 . GT G 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.057;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:38:274,0,38 -chr23 15156091 . A G 911.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.819;DP=23;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=32.60;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:2:938,0,2 -chr23 15156123 . A G 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.167;DP=33;FS=8.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=31.39;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:1064,0,159 -chr23 15156173 . C G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-1.397;DP=63;FS=1.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:410,0,1768 -chr23 15156958 . AT A 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-1.051;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:327,0,384 -chr23 15157443 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=1.093;DP=51;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:561,0,935 -chr23 15157492 . A C 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.613;DP=34;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:569,0,348 -chr23 15198098 . T G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=-0.970;DP=37;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:446,0,824 -chr23 15315595 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.232;DP=82;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:449,0,2402 -chr23 15316189 . G T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-1.719;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,27:124:99:567,0,3748 -chr23 15330910 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=3.355;DP=148;FS=10.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,22:148:99:313,0,10124 -chr23 15330912 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=3.219;DP=151;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:313,0,10124 -chr23 15403646 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr23 16443898 . C T 5569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.894;DP=507;FS=17.809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=10.99;ReadPosRankSum=-2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,139:168:99:5598,286,0 -chr23 16443939 . T A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.188;ClippingRankSum=-1.367;DP=563;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=0.66;ReadPosRankSum=1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,44:217:99:398,0,5963 -chr23 16443978 . C CTT,CGT 4186.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.774;DP=188;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,91,22:116:99:5126,736,387,4058,0,3911 -chr23 16444064 . A G 1964.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-1.372;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1993,138,0 -chr23 16445269 . T G 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr23 16445340 . T G 1475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1504,111,0 -chr23 16445391 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.119;DP=27;FS=4.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:312,0,511 -chr23 16445630 . T G 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 -chr23 16445641 . T A 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:523,36,0 -chr23 16446361 . G T 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.046;DP=59;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:782,0,540 -chr23 16446390 . A G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:426,33,0 -chr23 16447612 . T G 458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:487,33,0 -chr23 16447688 . A C 1008.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:72:1037,72,0 -chr23 16447809 . G GA 2955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.484;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,40:48:99:2993,110,0 -chr23 16448100 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=3.665;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=9.99;ReadPosRankSum=-3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:258,0,514 -chr23 16448123 . A G 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:625,42,0 -chr23 16448374 . T C 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:446,30,0 -chr23 16448461 . T A 2246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-1.732;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2275,157,0 -chr23 16448561 . T G 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr23 16448563 . T C 255.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:284,0,17 -chr23 16448913 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:99:236,0,337 -chr23 16448979 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.024;DP=50;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:519,0,404 -chr23 16449005 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.363;DP=56;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:259,0,731 -chr23 16449220 . G GA 796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.383;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=28.45;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:44:834,44,0 -chr23 16449681 . A C 7738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-1.404;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:99:7767,548,0 -chr23 16449740 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.300;DP=43;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:255,0,1571 -chr23 16449748 . TA T 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,0:37:99:260,0,8941 -chr23 16449809 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-0.764;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,1:93:99:283,0,5561 -chr23 16449860 . A G 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-0.084;DP=243;FS=20.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,39:166:99:948,0,4817 -chr23 16449986 . C T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-4.957;DP=260;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=4.81;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,49:160:99:1280,0,5737 -chr23 16450032 . T C 4363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=1.778;DP=136;FS=11.397;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=32.09;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,34:44:99:4392,260,0 -chr23 16450051 . A T 5373.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:5402,406,0 -chr23 16450066 . A C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.262;DP=96;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:580,0,881 -chr23 16450108 . TG T 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.778;DP=231;FS=7.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:433,0,2209 -chr23 16450143 . TA T 2544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=-1.031;DP=263;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,65:89:99:2582,0,340 -chr23 16450226 . C T 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 -chr23 16450479 . T C 918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:947,66,0 -chr23 16450629 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.391;DP=33;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:60:611,0,60 -chr23 16451269 . A C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr23 16451700 . T A 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:27:389,27,0 -chr23 16451722 . G T 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr23 16451768 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-0.562;DP=120;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=3.23;ReadPosRankSum=-2.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:416,0,2526 -chr23 16451804 . A G 2981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=-4.361;DP=240;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,93:160:99:3010,0,2396 -chr23 16451826 . G A 3493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=2.965;DP=283;FS=10.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=12.35;ReadPosRankSum=3.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,97:205:99:3522,0,3429 -chr23 16452091 . A T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=2.037;DP=28;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:612,0,550 -chr23 16452261 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-0.409;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:471,0,2878 -chr23 16452305 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-2.219;DP=13;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:80:258,0,80 -chr23 16452326 . C T 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:271,0,22 -chr23 16452466 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.098;DP=49;FS=6.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:418,0,1310 -chr23 16820320 . TA T 1473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=-0.542;DP=326;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,77:297:99:1511,0,5283 -chr23 16825166 . G A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=-1.936;DP=333;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,70:333:99:1331,0,10029 -chr23 16856816 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=-0.222;DP=52;FS=8.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:374,0,1826 -chr23 16857229 . C A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.141;DP=52;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:886,0,2088 -chr23 16857429 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=-1.790;DP=58;FS=6.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=4.13;ReadPosRankSum=2.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:268,0,1856 -chr23 16857442 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-2.029;DP=63;FS=8.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:278,0,2323 -chr23 16859128 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-1.244;DP=69;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:363,0,2115 -chr23 16859616 . T C 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.434;DP=188;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,43:188:99:870,0,5546 -chr23 16928246 . G T 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.041;DP=40;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:733,0,716 -chr23 17004596 . TCACTGGTAAGTCTGATATTAAACGGTTCTTCATTTGAACGATCAAACTTAAAATAAATGCAATAAAA T 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.741;DP=11;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=31.07;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:99:379,0,747 -chr23 17004667 . TTTTTTTTTATTAAGTTGAACTAGAAAATGCCTTCTTTGTGATCTATAATTGATGTCCTCA T 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:379,0,747 -chr23 17044838 . A AT 1692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-2.492;DP=344;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,101:306:99:1730,0,5625 -chr23 17054238 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.869;DP=38;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:309,0,1032 -chr23 17054356 . TG T 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-2.556;DP=28;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:279,0,461 -chr23 17108424 . A C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=4.305;DP=66;FS=2.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:237,0,2124 -chr23 17108444 . T C 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr23 17125080 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.214;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:236,0,609 -chr23 17127797 . TCTGGAACAAAGAAAAAAATAATAAATGCAACTCAATTTAAATTCAACATATCATCAAACTAAAACTCAC T 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=1.755;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=15.74;ReadPosRankSum=-3.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:352,0,4615 -chr23 17132656 . ACTGCAAAATAGGACATGGTTTCAGAACTTAATATTAAACGTACTTATCTTAACAAATGACTGCATATCTTTAGTAGGAAGCTCATGACAAAC A 1299.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1337,101,0 -chr23 17138192 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.126;DP=30;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:470,0,596 -chr23 17142809 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.024;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:311,0,627 -chr23 17149573 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.326;DP=22;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:259,0,957 -chr23 17150112 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.307;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:307,0,753 -chr23 17168811 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.027;DP=28;FS=10.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:256,0,714 -chr23 17281307 . TAGGTATGAGTTTTCAAGTTTAATTCTTTTTCCATGTAGTTAATATTTAACAATATGATAAACTCTTAC T 3926.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=2.077;DP=109;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=29.24;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,93:99:99:3964,0,913 -chr23 17606972 . T C 281.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:309,0,11 -chr23 17628532 . TCTATAAAAGAGATAAAAGTGTCATGTTTGACATTCAAAATATAGATAAATAGACAGATACAGTGGATGCCACTAAGGAGGCAAAAAAGATGATTATAC T 2642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=5.361;DP=79;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=33.45;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,63:79:99:2680,0,5358 -chr23 17629049 . GCCTGTGAGAAGTGAAATGAGTGAACTGTTCTGACTGCTACAAAGATGTTAAATAATAGCACAAATGCTTTCATA G 2829.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=1.569;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=35.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:2867,245,0 -chr23 17955676 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.046;DP=68;FS=9.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:326,0,1983 -chr23 18113474 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=11.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:233,0,542 -chr23 18117726 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.308;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=17.84;ReadPosRankSum=2.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:492,0,633 -chr23 18117739 . T A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.437;DP=26;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=15.91;ReadPosRankSum=2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:442,0,660 -chr23 18153495 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,309 -chr23 18206334 . C G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=2.708;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=14.73;ReadPosRankSum=-1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:426,0,514 -chr23 18289801 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.361;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,38:190:99:677,0,5670 -chr23 18545419 . G T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.461;DP=160;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,32:160:99:543,0,4927 -chr23 18550529 . T A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-1.009;DP=192;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,48:191:99:1079,0,5471 -chr23 18731709 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-0.864;DP=83;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:496,0,2350 -chr23 18733254 . T TG 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=4.215;DP=50;FS=10.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=7.57;ReadPosRankSum=-3.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:435,0,2644 -chr23 18733439 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-0.523;DP=160;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,34:160:99:564,0,5026 -chr23 18743265 . T A 3092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=1.880;DP=728;FS=9.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=4.25;ReadPosRankSum=2.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:570,157:727:99:3121,0,33290 -chr23 18764242 . ATACCTGCATGACAAAACAACAACAAAAAAGGGATGTCAATTTAAATTCAATGAATAGAGAACTTTTTAAAGTTCCGACTCAAAAAAAAATAAAATC A 2380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.472;ClippingRankSum=-0.500;DP=75;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=31.74;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,56:71:99:2418,0,4819 -chr23 18897824 . T C 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.275;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:698,0,669 -chr23 18924421 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.390;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:316,0,670 -chr23 18924433 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=1.074;DP=38;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:461,0,821 -chr23 18927457 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.395;DP=26;FS=7.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:354,0,574 -chr23 18927575 . A G 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=-2.603;DP=42;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=26.54;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1143,0,278 -chr23 18927701 . G C 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-1.270;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=26.82;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:672,0,192 -chr23 18927735 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,304 -chr23 18931093 . T C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.299;DP=49;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:379,0,1358 -chr23 18931549 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-1.184;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,337 -chr23 18933673 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=-0.129;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=14.34;ReadPosRankSum=-2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:401,0,481 -chr23 18934031 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.545;DP=64;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:463,0,1792 -chr23 18934095 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.281;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1107,0,1007 -chr23 18935524 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-1.498;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:521,0,1203 -chr23 18936965 . T C 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.326;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1073,0,367 -chr23 18937866 . T C 2221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-1.715;DP=79;FS=2.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,60:72:99:2250,0,179 -chr23 18939723 . T G 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.441;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=17.86;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,45:64:99:1207,0,438 -chr23 18939749 . A G 2098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.261;DP=71;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,56:71:99:2127,0,307 -chr23 18941564 . T C 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.421;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:97:1319,0,97 -chr23 18944837 . T C 2494.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.763;DP=70;FS=3.889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,63:70:26:2523,26,0 -chr23 18944840 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-1.482;DP=68;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:349,0,2335 -chr23 18948617 . G C 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=1.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=32.25;ReadPosRankSum=-1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1028,0,280 -chr23 18948626 . C A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.460;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:664,0,1050 -chr23 18965784 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.551;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:360,0,2360 -chr23 18965880 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.935;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=4.13;ReadPosRankSum=2.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:276,0,1816 -chr23 19274082 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.107;DP=53;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:421,0,1914 -chr23 19316089 . GACCTACACCACAACAACAGTGTATTACACCAGTGGGGTTCTGATGTTATGGGAGATTAAGACAAATCCCAGTGTTGTCTT G 3880.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.317;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:3918,339,0 -chr23 19770810 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.265;DP=102;FS=4.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=4.86;ReadPosRankSum=3.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,25:102:99:524,0,2940 -chr23 19783036 . TCTATGAAAGAGACAAACAGAGAAATGTCTAAGAATGAAGTCAAGGACAAACCTGTCAGTGGTGTGTCACTCAC T 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.777;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:1057,0,3340 -chr23 19903699 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.107;DP=83;FS=3.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:365,0,1702 -chr23 19916385 . A T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.306;DP=74;FS=4.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:695,0,1934 -chr23 19916402 . T A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=1.256;DP=82;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:1038,0,1806 -chr23 19940477 . TGGTATGAATTATCAGTCTATTAAAGAATTGTTTAGGAGATATTGGACTGTATACTTTCTTTCTCAGGCTATAATTCTTCTTGTGCGCCGGCA T 4581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-2.279;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,99:103:99:4619,378,0 -chr23 20001330 . TCTAAAGAGAAAGAAACCCAACATCAGCGACCGCTTGACAATTACAACTTAGTTTTCATTTGTGTTGCATTAC T 9579.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:9617,954,0 -chr23 20087286 . GGGTATAGATCCTCACCTCTGTATTTGGCTTTAATAATCAATTAAGCTTTTAATTATCTATTATTGGACCCTCTTTGTGCTGTGGTTTTAGAGATCAAACATAAACATCTGCTGTTGTATGTTTATTA G 16701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-0.262;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=30.12;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,395:398:99:16739,1427,0 -chr23 20089217 . CCAGGTATTTGCTGCTGGTTGCCAGTTTTAGATTAAATCTGGTGTATAACTTCCATACTTTATTCAATATCTTCACTCCTA C 13075.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.632;DP=333;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=25.59;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,321:324:99:13113,937,0 -chr23 20089422 . TGGTAAGACTTGCTCTTAATGATCATGCTAATGTTTATTTTGTACTGTAATGCATCTATGTCTGTTGCCCTGTGCACTGCA T 16677.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=-1.043;DP=380;FS=4.466;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=29.67;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,368:379:99:16715,1324,0 -chr23 20104220 . CCGT C 651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.899;DP=100;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:689,0,3187 -chr23 20104224 . AAGTTAAATGAGCTAGTATTAAAAAGTAACTCTTGAGCCAGTGATGTTTTTTATTGAGCTCATGTTTATCATTTTCAG A 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.318;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:448,0,3838 -chr23 20116214 . ACTGAGGGACACAGAGAGGATCACGTCATTACAGAAAAAACACACATGACCTCAAGATTTGAAATGTAGTTCCAC A 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.998;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=34.70;ReadPosRankSum=-1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,39:44:99:1668,0,499 -chr23 20289173 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=1.422;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:564,0,1412 -chr23 20289176 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.921;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:564,0,1396 -chr23 20303647 . TAACACAGGGTTAAAGAGATAGTTTACTTGAAAAAAGAC T 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=27.60;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:534,0,1603 -chr23 20472112 . TCTAAAACAGACGATAAATTTTAGTACACAAATACTCTCTGGAAACAAACATATGAGCTCCACTAAC T 9362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=1.923;DP=222;FS=1.572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=33.92;ReadPosRankSum=-1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,216:222:99:9400,664,0 -chr23 20552983 . T C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-0.307;DP=50;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:531,0,1167 -chr23 20713964 . AGTAAGTCATTCGATATCTTCTCATGTGCATCTGTTTGTGAACGTCACTCAAGCTCACTACATCAAACGCAACACTGTGAATCTGCAG A 26355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.095;DP=444;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,437:438:99:26393,2082,0 -chr23 20718094 . TCTTGAAATTAAAAACAGTACGCTGGTTAGAAATGGGTATGAATATGCAAATGTCGGGTATTTTATATTATAAGAGAACAGTGCTTGTGTATGGCTTAC T 4484.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.622;DP=106;FS=16.833;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,95:106:99:4522,458,0 -chr23 20762848 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.386;DP=38;FS=5.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:303,0,1073 -chr23 20794614 . T TG 1172.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.822;DP=71;FS=3.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.52;ReadPosRankSum=2.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1210,0,1178 -chr23 20796406 . C A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.060;DP=55;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:792,0,1092 -chr23 20805906 . T TG 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.937;DP=60;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:324,0,1472 -chr23 20816288 . AT A 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.417;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:576,0,1176 -chr23 20816290 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.302;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:576,0,1179 -chr23 20944384 . G A 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.229;DP=332;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,88:331:99:1447,0,13245 -chr23 20944692 . C T 2008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.996;DP=388;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,95:386:99:2037,0,10881 -chr23 21131956 . GA G 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=1.684;DP=31;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:371,0,213 -chr23 21559609 . A G 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-0.650;DP=187;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=3.59;ReadPosRankSum=2.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,39:187:99:700,0,12774 -chr23 21559617 . C T 3209.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.608;DP=198;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,89:198:99:3238,0,3617 -chr23 21563585 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-1.262;DP=138;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,32:131:99:704,0,3896 -chr23 21567484 . TG T 5119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.053;DP=191;FS=3.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=26.80;ReadPosRankSum=-2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,136:178:99:5157,0,1231 -chr23 21567488 . A T 5128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:5157,0,1105 -chr23 21567491 . C G 5128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:5157,0,1101 -chr23 21570301 . TGGTAGGAGTCACGGACTTCAATTGATCTCTTAACATCCATGCAGTTGTTATCACATGTAGTCACACTAAATAACTTCAATTTCACCTTCTA T 8486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.537;DP=203;FS=4.709;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,199:203:99:8524,784,0 -chr23 21571080 . TGATTG T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-0.945;DP=31;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:536,0,1461 -chr23 21579052 . T A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=1.832;DP=100;FS=5.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:644,0,2779 -chr23 21600203 . G T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-1.563;DP=114;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:623,0,4490 -chr23 21603278 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.974;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,23:100:99:473,0,2958 -chr23 21607230 . C T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.052;DP=96;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:527,0,2790 -chr23 21611761 . T C 1561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=1.442;DP=101;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.46;ReadPosRankSum=-1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:1590,0,1729 -chr23 21623310 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.326;DP=94;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:474,0,3427 -chr23 21632943 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-1.880;DP=72;FS=3.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:509,0,1984 -chr23 21637803 . A G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-0.150;DP=127;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,37:126:99:912,0,3449 -chr23 21647979 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.261;DP=104;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:297,0,3292 -chr23 21657181 . C A 1927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.196;DP=151;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,56:150:99:1956,0,3236 -chr23 21671048 . GT G 2350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-1.407;DP=151;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,3:146:99:2388,0,4028 -chr23 21739126 . TA T 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-2.570;DP=23;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:253,0,249 -chr23 21739247 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.869;DP=81;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:349,0,4054 -chr23 21749318 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.189;DP=65;FS=4.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:229,0,2026 -chr23 21749980 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-0.214;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:238,0,642 -chr23 21750212 . G A 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 -chr23 21750690 . G T 1754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=0.047;DP=71;FS=4.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.779;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1783,0,1392 -chr23 21754664 . T A 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr23 21755134 . GT G 513.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.132;DP=47;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:551,0,645 -chr23 21756357 . A AAC 537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:575,41,0 -chr23 21756614 . C T 547.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:576,39,0 -chr23 21756630 . T A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=5.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=31.22;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:29:510,29,0 -chr23 21756788 . C CT 1271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.203;DP=56;FS=3.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:73:1309,0,73 -chr23 21756812 . T G 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.664;DP=40;FS=8.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:1040,0,328 -chr23 21756995 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.812;DP=211;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,33:198:99:414,0,6539 -chr23 21757416 . C T 2447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2476,178,0 -chr23 21763696 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.215;DP=77;FS=3.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:470,0,5359 -chr23 21763697 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.029;DP=77;FS=3.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:470,0,5359 -chr23 21763847 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.562;DP=107;FS=5.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=1.91;ReadPosRankSum=-2.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,18:107:99:233,0,4560 -chr23 21764557 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.753;DP=52;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=5.92;ReadPosRankSum=-2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:336,0,1346 -chr23 21764586 . T C 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.677;DP=41;FS=37.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:674,0,665 -chr23 21764609 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.072;DP=29;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=22.61;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:684,0,708 -chr23 21764611 . T G 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.952;DP=28;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:684,0,708 -chr23 21768276 . CT C 2924.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-2.631;DP=278;FS=6.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,132:263:99:2962,0,2972 -chr23 21795182 . GCTAAAAAAAGAATCATTGAACTGTTAACTTTGATATAACAACACAACTAGAGTGAAGCGCTTACCGAGTAAAATAGTGTTTAC G 449.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.46;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:45:487,45,0 -chr23 21795317 . TCTAGGAACAAAAATGATGACATTTCGAATCCGATTGTACCTCTTTCTAATGTTGATTGAAAGCACTGGGATCTCAC T 530.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.39;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:568,0,693 -chr23 21816103 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.299;DP=252;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,54:251:99:1012,0,12685 -chr23 21816202 . T G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-0.288;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:527,0,3287 -chr23 21816483 . A T 3517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-1.211;DP=298;FS=4.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,103:298:99:3546,0,6674 -chr23 21924569 . ACAGGTGAGACGCAATTCAAACAAACAAGCCATTACATCTAATCCTCCTTCATATTGACAAACACAACCCCTCCCTCTTTCCCCAT A 1667.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=1.485;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=27.48;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1705,148,0 -chr23 21927071 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.341;DP=23;FS=7.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=14.08;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:352,0,458 -chr23 21928338 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.171;DP=33;FS=5.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:539,0,711 -chr23 21928440 . A C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=-0.107;DP=37;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:622,0,685 -chr23 21966608 . GAGGTAATGAGCTGCTGCTGGTATCAATAACCATTAAGATCTAGACTGAATCTATCAATCAATCAATTATTTCCGAACTCATCTTTT G 1098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-1.561;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=27.67;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:96:1136,96,0 -chr23 21999460 . G C 829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:858,60,0 -chr23 22000473 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.296;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=23.23;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:34:307,0,34 -chr23 22000524 . C T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr23 22031562 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.283;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:295,0,615 -chr23 22042578 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=1.030;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:308,0,416 -chr23 22097943 . T C 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr23 22098973 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:43:419,0,43 -chr23 22100272 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:250,0,168 -chr23 22272758 . T A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-1.843;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:716,0,724 -chr23 22324336 . T A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.504;DP=101;FS=2.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:254,0,3171 -chr23 22324542 . G A 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.683;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:1438,0,1309 -chr23 22328615 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.861;DP=65;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:240,0,1961 -chr23 22348703 . TGGTAAGCGGAAACACTGAAATCAATCATTTTTTTGCCATTTGTAAATATGGTAGAATCGATTGTATGTTTTCTGTATGCA T 3212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.017;DP=91;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,76:86:99:3250,0,1701 -chr23 22351598 . G T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-1.759;DP=105;FS=13.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.324;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,30:102:99:767,0,2736 -chr23 22357922 . T TA 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-1.688;DP=144;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,52:138:99:790,0,2182 -chr23 22358503 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.319;DP=184;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,45:184:99:984,0,8472 -chr23 22486657 . T C 1085.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1114,81,0 -chr23 22486777 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 -chr23 22486798 . C T 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:567,39,0 -chr23 22721420 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:355,0,282 -chr23 22722020 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,1028 -chr23 22790838 . C G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=1.098;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:345,0,1262 -chr23 22791124 . TC T 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.837;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:301,0,301 -chr23 22791692 . A G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-1.242;DP=41;FS=4.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:681,0,727 -chr23 22929178 . T A 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.637;DP=89;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:1147,0,3278 -chr23 22929426 . G A 2148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-1.240;DP=248;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,81:247:99:2177,0,6346 -chr23 22929935 . GCCTTGAGAAGGAAAGATCATGTTAGAACAGTCATTACTCAGTAAAATAATGTCAGTATAAATGAATCTCAGTGGTGTTGTGGTATAATTAAATGTCTACTGTATTAGTCTATAGTTGCAGCCACTCCATAAATTACTCA G 914.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=7.114;DP=227;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,141:201:99:952,0,11932 -chr23 22932817 . C CT 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.360;DP=194;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,42:164:99:453,0,3323 -chr23 22937684 . G A 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=-0.485;DP=226;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=8.47;ReadPosRankSum=3.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,74:226:99:1943,0,5802 -chr23 22944719 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.401;DP=31;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:271,0,808 -chr23 22968846 . C T 3089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.897;DP=175;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:3118,0,3082 -chr23 22969037 . CGTGAGTCATTCTGCTGTGGACAGATTTCTATACAAGAGCGCAACTTGCCTGTGTTTGTGATGCACTGTTGCTTTTATCTGCCTTCATTCAG C 16547.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.722;DP=372;FS=3.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,359:360:99:16585,1486,0 -chr23 23079430 . C CA 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.540;DP=64;FS=5.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:561,0,835 -chr23 23079538 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.919;DP=64;FS=4.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:299,0,1826 -chr23 23168575 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.429;DP=67;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:279,0,2012 -chr23 23182936 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-1.526;DP=79;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:576,0,2168 -chr23 23183143 . G A 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-0.625;DP=103;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:1169,0,2105 -chr23 23214025 . T C 3469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.034;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,95:118:99:3498,0,401 -chr23 23217340 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-1.929;DP=187;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,40:187:99:517,0,7769 -chr23 23217679 . C T 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.170;DP=133;FS=3.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,40:133:99:1013,0,3389 -chr23 23220783 . C CT 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.193;DP=117;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=4.66;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,39:110:99:583,0,1709 -chr23 23221359 . CT C 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-3.125;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=3.09;ReadPosRankSum=2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:638,0,730 -chr23 23221689 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.595;DP=47;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:551,0,1236 -chr23 23222080 . G A 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.162;DP=119;FS=3.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,34:119:99:757,0,3264 -chr23 23383193 . GCAGGTACAGAGCCAGGCGTCGAGGGGTTTAGGGGCCATCTGACCGCATCTGAACCCCCCCCTAACCTCTTTTTTTTTCCA G 519.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:99:557,123,0 -chr23 23390637 . A G 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.808;DP=83;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1248,0,1504 -chr23 23412795 . A T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.286;DP=81;FS=3.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:463,0,2161 -chr23 23412957 . C T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.042;DP=133;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,33:132:99:696,0,3643 -chr23 23417288 . G T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.410;DP=86;FS=6.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:597,0,2444 -chr23 23432090 . C A 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.514;DP=82;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:952,0,1803 -chr23 23442228 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-0.049;DP=66;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:522,0,1703 -chr23 23468201 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.533;DP=98;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,24:98:99:559,0,2809 -chr23 23484293 . T A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.172;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:323,0,856 -chr23 23506707 . G C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.606;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:317,0,504 -chr23 23694556 . GCTGGTAAACAAAGATAAAACGTATTTAGATTGTGTATTCAGGAAATTAAATTGCGTTTTTAAAAGCACGTTAAAAGTTTATCATCTTGAGGAATCTGACTTGCAACTTAC G 8123.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=4.646;DP=188;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=31.89;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,179:188:99:8161,697,0 -chr23 23781833 . A C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.360;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:417,0,2742 -chr23 23781960 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=1.000;DP=58;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:502,0,1481 -chr23 23953035 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.231;DP=58;FS=6.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:367,0,1718 -chr23 24041298 . C T 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-1.267;DP=231;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,60:231:99:1225,0,6204 -chr23 24112324 . A C 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=1.619;DP=177;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.254;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,47:177:99:1125,0,4904 -chr23 24112355 . G A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-0.828;DP=152;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,42:151:99:1028,0,4140 -chr23 24117868 . C G 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=-0.787;DP=135;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,41:130:99:1066,0,3404 -chr23 24146964 . C CA 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.006;DP=98;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:259,0,1755 -chr23 24150448 . T C 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.270;DP=172;FS=2.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=3.14;ReadPosRankSum=2.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,32:172:99:569,0,11126 -chr23 24150451 . G T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.623;DP=175;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,32:175:99:569,0,11126 -chr23 24150589 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.724;DP=152;FS=6.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,43:152:99:1056,0,3962 -chr23 24163971 . A G 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.557;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=5.83;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,44:169:99:1014,0,4828 -chr23 24200123 . G T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=1.659;DP=61;FS=2.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:829,0,1342 -chr23 24200708 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-1.291;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:569,0,2603 -chr23 24200906 . CT C 1265.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.184;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:95:1303,95,0 -chr23 24399907 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-2.452;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:326,0,687 -chr23 24425743 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,684 -chr23 24487710 . TA T 243.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:2:279,2,0 -chr23 24489741 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:355,0,505 -chr23 24495059 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=1.184;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:353,0,309 -chr23 24501297 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.335;DP=39;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:258,0,1077 -chr23 24514263 . A G 1835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.987;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:1864,0,2860 -chr23 24514341 . T C 1768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.204;DP=240;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=7.37;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,70:240:99:1797,0,6835 -chr23 24514548 . CT C 1238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-2.099;DP=291;FS=8.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,78:264:99:1276,0,8364 -chr23 24514556 . C A 2105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.714;DP=280;FS=2.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,83:280:99:2134,0,10219 -chr23 24518378 . ACTGAGGAAGAGAGGCAACTTGTAAAGATTATTTTTTACAAAAACTACACATGCCAGGCTATCAAGAGACCACTTAC A 16495.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=1.147;DP=320;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,313:314:99:16533,1293,0 -chr23 24635938 . C CG 335.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:373,30,0 -chr23 24636439 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=4.626;DP=37;FS=8.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:727,0,1272 -chr23 24636444 . C T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=4.600;DP=37;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:727,0,1312 -chr23 24637356 . A C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.095;DP=69;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:313,0,2072 -chr23 24637494 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.317;DP=88;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:287,0,2706 -chr23 24648001 . C G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.343;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:368,0,1642 -chr23 24657405 . G T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-1.567;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.636;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:633,0,1787 -chr23 24726815 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.289;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:374,0,1180 -chr23 24727736 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.582;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:270,0,1145 -chr23 24730948 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.145;DP=48;FS=1.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:364,0,1313 -chr23 24775842 . GCCTATGAAAGTGAGAAGTTGTTTAATGTGCCAACGATTTTGTTCACATACTTGTCAAATTGGTCCCATAAACACACAAAATAAATCGTCAAAATGAAAAACATCAATATCACTGA G 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:263,0,890 -chr23 24791728 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.130;DP=119;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,27:119:99:521,0,3523 -chr23 24803944 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=2.442;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:249,0,962 -chr23 24855857 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.735;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:313,0,501 -chr23 24858094 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,379 -chr23 24879044 . C G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.601;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:310,0,437 -chr23 24882826 . GAGGTCAGGCTCAGTTCTTATTAGTTTTTTAACTGATTTAAGTTCAGTTTAGAGTCATATACTGTGTGTTTTATCCCGC G 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.711;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=31.54;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:605,0,730 -chr23 24940397 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.437;DP=70;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:448,0,1959 -chr23 24951063 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,427 -chr23 24952081 . CA C 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.611;DP=54;FS=5.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:519,0,544 -chr23 24952446 . A AT 560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.433;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:598,0,849 -chr23 24952479 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.330;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:740,0,1363 -chr23 24952839 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-1.239;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:367,0,595 -chr23 24952879 . C A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.992;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,412 -chr23 24956970 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-1.394;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,32:173:99:313,0,8429 -chr23 24959694 . ACTAGCACAGCCGTGGGTTACTACACAACTCTAGAATGCTAGCCAACAAGCATCTAATGAGGGCTTTCTACTCTTATTTTCTACAGGAATGTTATGTTTCCATAC A 6996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=2.742;DP=244;FS=10.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=28.68;ReadPosRankSum=1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,173:233:99:7034,0,19027 -chr23 24982012 . TCCTGTGGAGCCGAGCAGAGACAATATCAGATATCCATTCAAATGGGATGTGATAAAAGTGTGGTTAATGGTTAAACCAA T 6326.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.116;DP=177;FS=1.339;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=32.32;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,145:154:99:6364,109,0 -chr23 24992795 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=2.035;DP=50;FS=2.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:323,0,1330 -chr23 25022666 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.616;DP=50;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:365,0,1317 -chr23 25035330 . C A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-1.166;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:316,0,707 -chr23 25213837 . G T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=1.482;DP=72;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:457,0,1935 -chr23 25213858 . CGGTAAGTAGAAAAGCGTACGAAACAGCTTATGTATAAAGGTAAAATGTGACGCTTCTCGTGTTGTTTTTCTCAACA C 2883.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.605;ClippingRankSum=0.519;DP=82;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=35.75;ReadPosRankSum=-2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,73:82:99:2921,0,1232 -chr23 25257928 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.212;DP=63;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:247,0,2726 -chr23 25264387 . G T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.481;DP=36;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:302,0,912 -chr23 25264399 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=-0.338;DP=35;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:259,0,894 -chr23 25381708 . A C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr23 25381847 . G A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr23 25432722 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:229,0,64 -chr23 25437116 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.400;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:681,0,2469 -chr23 25460068 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.785;DP=75;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:530,0,2018 -chr23 25486987 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.395;DP=89;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:377,0,2725 -chr23 25491651 . A G 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.918;DP=121;FS=5.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,35:121:99:841,0,4348 -chr23 25491915 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=1.027;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:249,0,1997 -chr23 25493310 . G A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-1.135;DP=90;FS=8.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:625,0,2509 -chr23 25493994 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=1.382;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:574,0,2371 -chr23 25494488 . C T 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.829;DP=126;FS=6.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,38:125:99:1010,0,3460 -chr23 25497318 . C A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-0.308;DP=72;FS=14.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.144;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:538,0,2036 -chr23 25497973 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.174;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:418,0,2330 -chr23 25498380 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.552;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:348,0,2168 -chr23 25498668 . G T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-1.405;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=4.67;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:528,0,2852 -chr23 25498774 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.100;DP=119;FS=5.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,25:118:99:475,0,3529 -chr23 25503602 . A T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:263,0,102 -chr23 25506138 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.107;DP=82;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:546,0,2461 -chr23 25507884 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.431;DP=119;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:794,0,3307 -chr23 25508537 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-0.014;DP=88;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:524,0,2478 -chr23 25509553 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-1.866;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:401,0,3123 -chr23 25509724 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=-0.073;DP=133;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,46:133:99:1459,0,2861 -chr23 25509917 . G T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.076;DP=117;FS=10.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:924,0,6682 -chr23 25509924 . A T 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.614;DP=119;FS=5.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,33:119:99:907,0,6682 -chr23 25510326 . CAA C 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=-1.088;DP=71;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:385,0,2198 -chr23 25511088 . C CA 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.919;DP=18;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:49:371,0,49 -chr23 25511555 . A G 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=1.006;DP=37;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:818,0,543 -chr23 25511712 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.571;DP=74;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:264,0,3344 -chr23 25511780 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.145;DP=70;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:452,0,2031 -chr23 25512001 . A G 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=-0.154;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:752,0,869 -chr23 25548732 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,338 -chr23 25555991 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.231;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:375,0,379 -chr23 25581114 . C T 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.788;ClippingRankSum=0.781;DP=453;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:356,96:452:99:1613,0,13990 -chr23 25583327 . C T 3028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=1.041;DP=539;FS=4.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:403,136:539:99:3057,0,15377 -chr23 25593779 . C G 3215.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-0.450;DP=486;FS=20.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:351,135:486:99:3244,0,22721 -chr23 25634393 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,680 -chr23 25635360 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,147 -chr23 25711295 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=1.122;DP=63;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:327,0,1908 -chr23 25717670 . GAGGTGATGTTGAGCATGATTTACGTTATTTTGAGAGTGTCCTTCATTAAGCTCTCCACTCAGATTATGTGCTTTTGTTTTGACATAC G 917.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.679;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:99:955,0,536 -chr23 25721994 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.362;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:445,0,770 -chr23 25735403 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.123;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:377,0,546 -chr23 25739111 . C T 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=-0.568;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,43:132:99:1061,0,3088 -chr23 25758230 . G A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.515;DP=116;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,38:116:99:1064,0,2978 -chr23 25777224 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.154;DP=111;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:348,0,3466 -chr23 25801843 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=-0.540;DP=79;FS=1.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=10.29;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:841,0,1554 -chr23 25801969 . C A 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-1.982;DP=93;FS=7.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.33;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:1268,0,1863 -chr23 25802041 . G A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.374;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:1564,0,2132 -chr23 25802116 . TCCTGTACATCATATCAAATCAATTTAAACTAAACTATTTTTTGAGTTTTAGAGACAAGTTTGGGAAGATACACA T 4008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=1.696;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:4046,341,0 -chr23 25806204 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-1.162;DP=85;FS=6.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:537,0,2357 -chr23 25829576 . A C 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.598;DP=68;FS=4.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:819,0,1311 -chr23 25838287 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.975;DP=71;FS=5.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:340,0,2066 -chr23 26022292 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-0.790;DP=112;FS=9.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:648,0,3140 -chr23 26044043 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.484;DP=96;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:482,0,2716 -chr23 26044242 . CAGGTACTGTATATGGGTAAAGAAGACTGTGTAATTAATTATCATTATAACAGATAAATAATGACGACTGACATGTTTGTCA C 4079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.620;DP=129;FS=2.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.597;QD=31.63;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,100:116:99:4117,0,2194 -chr23 26055166 . CT C 340.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-1.391;DP=106;FS=6.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:829,0,807 -chr23 26055311 . GCACACACACACACACACA G 382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:48:420,48,0 -chr23 26058446 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.280;DP=90;FS=2.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:310,0,2649 -chr23 26061666 . GCTGACAAAGAAATGACAGCATGAATGGGCTGGTCACAGAAAAACAATGTGTCCTTTAAAAATAAAAACTGAC G 4805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.258;DP=116;FS=4.276;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=31.12;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,111:116:99:4843,355,0 -chr23 26062084 . GCTGAAGAAAGTGAAAGAACACATCAACCCCAACCTTTGAGACTGGATTACATTACAAGCATTAAAAAGCAGAATAAATGAGCCACAC G 4843.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.675;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=38.80;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,91:93:99:4881,394,0 -chr23 26062425 . G C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.629;DP=90;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:274,0,2763 -chr23 26084167 . CA C 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=1.030;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:307,0,156 -chr23 26084570 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-0.839;DP=64;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:853,0,1408 -chr23 26085335 . T C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.154;DP=45;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:530,0,972 -chr23 26148865 . CAGGTACATTAATCATCCTTAAAATGAGATAAGAAGAGCAGAATGTCAAGACTTTTTTTCCTAATGTGATGTTTTTTCTCAACTACTAT C 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.228;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:369,0,420 -chr23 26148867 . GGTAC G 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-1.042;DP=22;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:290,0,547 -chr23 26148873 . TTAATCATCCTTAAAATGAGATAAGAAGAGCAGAATGTCAAGACTTTTTTTCCTAATGTGATGTTTTTTCTCAACTACTATAGAC T 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.050;DP=22;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:290,0,535 -chr23 26152742 . A C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,254 -chr23 26350593 . G GT 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=-1.943;DP=84;FS=4.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:328,0,1513 -chr23 26351883 . T C 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.685;DP=134;FS=3.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=5.79;ReadPosRankSum=-2.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,36:134:99:804,0,4049 -chr23 26362865 . C T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-1.945;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,42:197:99:800,0,5848 -chr23 26380671 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=2.317;DP=40;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=6.82;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:301,0,1068 -chr23 26380711 . CAA C 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=-0.629;DP=33;FS=4.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=6.78;ReadPosRankSum=-2.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,983 -chr23 26382070 . T G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.239;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:685,0,2227 -chr23 26382200 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=1.095;DP=69;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:495,0,2086 -chr23 26387250 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.631;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=17.06;ReadPosRankSum=-1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:506,0,534 -chr23 26398516 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr23 26399845 . A T 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.155;DP=143;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,44:143:99:1170,0,3896 -chr23 26451367 . TATCCCATCAGCTTCGTAGAGGAACTGAAGCCGAATAAAGAGC T 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.689;DP=13;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:289,0,1777 -chr23 26465770 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.209;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:354,0,2343 -chr23 26465971 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.505;DP=40;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:566,0,1068 -chr23 26466203 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.476;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:340,0,1026 -chr23 26466394 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-0.391;DP=77;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:401,0,2241 -chr23 26466424 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=-0.485;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:379,0,2060 -chr23 26485891 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.616;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:268,0,1411 -chr23 26526202 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-0.145;DP=44;FS=4.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:333,0,1051 -chr23 26767725 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr23 26781276 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=2.604;DP=86;FS=4.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:458,0,2525 -chr23 26781906 . C CT 771.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-1.687;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:809,0,655 -chr23 26782031 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.817;DP=44;FS=6.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:563,0,998 -chr23 26782572 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.307;DP=55;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:309,0,1586 -chr23 26784298 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.649;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:439,0,2690 -chr23 26800783 . C A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.653;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:522,0,2536 -chr23 26805887 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.124;DP=76;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:487,0,2177 -chr23 26833807 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:255,0,432 -chr23 26834764 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=1.072;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:577,0,279 -chr23 26835092 . AT A 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.019;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:247,0,475 -chr23 26840032 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-1.035;DP=92;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,16:92:99:249,0,2942 -chr23 26865722 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.271;DP=94;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:361,0,2841 -chr23 26983722 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=-0.400;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:302,0,1451 -chr23 27292760 . C A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.464;DP=241;FS=2.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=3.43;ReadPosRankSum=4.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,45:241:99:856,0,15216 -chr23 27292762 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.473;DP=242;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=3.45;ReadPosRankSum=3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,48:242:99:864,0,15216 -chr23 27297530 . AAGGTCAGAACGGGTCTTGGTAATAAGTTTAATAATGTTAAACATGTCTTCTATGTTAAATTATGTCTCTTATTATACTTTGTGC A 9618.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=1.335;DP=244;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=31.72;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,233:237:99:9656,692,0 -chr23 27309337 . T C 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=1.107;DP=136;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=4.70;ReadPosRankSum=-2.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,33:136:99:668,0,5726 -chr23 27309839 . G T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-1.346;DP=122;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,38:122:99:983,0,3072 -chr23 27312188 . C CT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=-1.676;DP=88;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:303,0,2228 -chr23 27312801 . GT G 1715.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.192;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:1753,170,0 -chr23 27315089 . G GT 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.365;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:617,0,2051 -chr23 27315481 . T TC 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.174;DP=24;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:334,0,310 -chr23 27318825 . G GA 358.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:396,39,0 -chr23 27319341 . CA C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-1.950;DP=60;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:267,0,1169 -chr23 27373959 . G A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.229;DP=170;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,41:170:99:948,0,5119 -chr23 27490367 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:281,0,598 -chr23 27685208 . C CA 612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:65:650,65,0 -chr23 27687331 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:266,0,599 -chr23 27688443 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=6.64;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:360,0,1264 -chr23 27695732 . C G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.440;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:878,0,474 -chr23 27739898 . C T 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.758;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:1207,0,1285 -chr23 27749911 . AT A 1018.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.901;DP=44;FS=2.092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,37:41:60:1056,60,0 -chr23 27749983 . G A 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-0.821;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:1187,0,281 -chr23 27752001 . T A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.944;DP=99;FS=12.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:334,0,2641 -chr23 27752029 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.552;DP=92;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:681,0,2474 -chr23 27759133 . G A 1961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.641;DP=119;FS=3.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1990,0,2048 -chr23 27801616 . ATAGTCTGCATAAACAGGGGAAAAACACTATTACAG A 9788.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=236;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,230:232:99:9826,0,218 -chr23 27801655 . TGTAAATGATGATACAGAAAATGTAGGAGTGATCAGTAC T 10437.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=1.134;DP=232;FS=2.075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=32.18;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,229:232:99:10475,852,0 -chr23 27817181 . GCTGTGGAAACACATTTAAATGGTTAAAAGTATTCTGGAGGTGTAAAATGTCAGCTTGTGGAATGTTTGAAAACTGCATTGGCTCTGAACAC G 1872.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.161;DP=74;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,48:72:99:1910,0,5495 -chr23 27817559 . AACCTGCATATAGAAAGGAAGATGTGAGGTCACTTCTAAGCCATCAAAAAATGACTAGTATTGCATACATTTGTGCTTTACAATCAT A 3402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=2.586;DP=91;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=27.34;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,83:91:99:3440,0,1254 -chr23 27832148 . A G 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:656,45,0 -chr23 27833202 . G A 1399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.364;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:1428,0,1114 -chr23 27838382 . T A 1663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=-0.962;DP=98;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1692,0,1463 -chr23 27847518 . G T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.279;DP=66;FS=5.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:599,0,2956 -chr23 27847519 . G T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.921;DP=64;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:928,0,2715 -chr23 27862734 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-1.635;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,406 -chr23 27870695 . C G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,193 -chr23 27896450 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=-2.312;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:393,0,438 -chr23 27899109 . A G 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:247,0,23 -chr23 27968845 . T A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-1.286;DP=19;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=31.30;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:76:623,0,76 -chr23 28020559 . GACAGGTGAAGTAGACACCAAGTATACAGTATACATATACAGTTTTGTGTACAATGAGGCAGATTTTAATATTACTGTTTGTTTTTTATACA G 680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.347;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=11.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:99:718,0,593 -chr23 28034587 . G A 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=-0.399;DP=71;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:1375,0,1109 -chr23 28048057 . CCCTGCAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAAATCAGCACACAGGCAAAACACTTTTCAGACATGCAGGAGAAGGATAAACATGCAACTTA C 10702.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=1.348;DP=251;FS=2.403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.356;QD=29.06;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,248:251:99:10740,954,0 -chr23 28249061 . G C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-0.083;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:616,0,610 -chr23 28260544 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr23 28261354 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.843;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:729,0,1213 -chr23 28312857 . T TA 389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:427,36,0 -chr23 28352399 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-1.501;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:317,0,331 -chr23 28423393 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:325,0,307 -chr23 28424771 . C A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.415;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:361,0,250 -chr23 28425027 . A G 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr23 28427688 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-2.007;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:369,0,450 -chr23 28428929 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:272,0,747 -chr23 28443871 . G A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=1.259;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:533,0,539 -chr23 28588303 . G A 5032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.338;DP=333;FS=4.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,143:333:99:5061,0,6360 -chr23 28589744 . G GAA 893.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-7.141;DP=232;FS=8.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=3.85;ReadPosRankSum=-5.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,51:223:99:931,0,6318 -chr23 28620357 . GA G 8745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=2.008;DP=703;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=12.44;ReadPosRankSum=-2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:368,312:680:99:8783,0,9286 -chr23 28623604 . A G 220.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:18:249,0,18 -chr23 28626818 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=2.076;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:280,0,1486 -chr23 28751193 . A G 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=-0.241;DP=161;FS=0.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,60:160:99:1980,0,3365 -chr23 28758582 . G A 2035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.564;DP=117;FS=7.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=17.40;ReadPosRankSum=2.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:2064,0,2033 -chr23 28770989 . T C 3366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-1.846;DP=189;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,94:188:99:3395,0,3431 -chr23 28781428 . G A 3754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.321;DP=251;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,112:251:99:3783,0,4395 -chr23 28784434 . T G 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=1.357;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=8.11;ReadPosRankSum=2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:1001,0,3043 -chr23 28784815 . G T 3674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.201;DP=243;FS=0.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,107:243:99:3703,0,4439 -chr23 28811191 . G A 4121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.324;DP=231;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,116:231:99:4150,0,4229 -chr23 28904287 . A G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.489;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:424,0,2328 -chr23 28926530 . G GT 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=-1.261;DP=90;FS=0.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:692,0,1048 -chr23 29046242 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.887;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,404 -chr23 29201855 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=-0.600;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:436,0,910 -chr23 29605625 . G GT 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.555;DP=88;FS=3.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:423,0,1499 -chr23 30100206 . TA T 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.016;DP=44;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:269,0,534 -chr23 30964957 . G A 778.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:807,57,0 -chr23 30987416 . GGGTATGTTAGACATGTTATCTTCTCAGATTAGTCTTTTGTAAAACTTATTGTAGTTATAGAAAGCAACCTTCCTATGTCTAAGTCTTGTTTCATGTGTGTTTCTCTTCTGCCCACTCCACTA G 6456.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.306;DP=171;FS=4.422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=30.01;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,164:169:99:6494,585,0 -chr23 31005822 . AT A 2718.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=-0.324;DP=241;FS=13.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,149:218:99:2756,0,972 -chr23 31014961 . GCCTGTACAAAAAAAAAAGTGTTTACTCATCAAGCTTTTTTGTCTGTGTAACAGACAGGGATCTAGCTAGGATATTGAAAACACTCA G 7818.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.352;DP=283;FS=1.749;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,250:255:99:7856,759,0 -chr23 31157811 . CA C 1707.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1745,148,0 -chr23 31157857 . G A 1127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1156,81,0 -chr23 31160511 . C T 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 -chr23 31160576 . G T 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 -chr23 31167907 . G A 1206.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1235,87,0 -chr23 31174212 . CA C 449.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:487,48,0 -chr23 31261641 . G T 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr23 31347775 . C A 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr23 31347832 . G T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:469,41,0 -chr23 31350115 . G A 1494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1523,111,0 -chr23 31357292 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr23 31484076 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.603;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:759,0,798 -chr23 31484077 . T A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.516;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=23.57;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:759,0,798 -chr23 31511728 . AT A 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.574;DP=29;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:352,0,330 -chr23 31512579 . TA T 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.373;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:247,0,694 -chr23 31513573 . T C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.436;DP=44;FS=4.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:925,0,1655 -chr23 31514771 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.786;DP=50;FS=10.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:965,0,1975 -chr23 31519470 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.331;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.976;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:759,0,1828 -chr23 31596994 . A G 5518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=-2.858;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=31.47;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,117:120:99:5547,415,0 -chr23 31597249 . T TA 704.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-1.174;DP=205;FS=12.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,54:189:99:742,0,3741 -chr23 31619947 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr23 31623265 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,171 -chr23 31660789 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:439,0,148 -chr23 31700397 . T C 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=-0.889;DP=83;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=13.19;ReadPosRankSum=-1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1123,0,1713 -chr23 31700840 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=1.300;DP=24;FS=7.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:589,0,130 -chr23 31702360 . G T 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=-1.543;DP=64;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=19.31;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1264,0,795 -chr23 31843756 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.329;DP=36;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.338;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:429,0,801 -chr23 31881441 . G C 2728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-4.477;DP=167;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=16.34;ReadPosRankSum=3.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,77:167:99:2757,0,2876 -chr23 32001370 . C A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.913;DP=32;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:357,0,748 -chr23 32006577 . G T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.105;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:558,0,850 -chr23 32006730 . AT A 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.646;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:241,0,443 -chr23 32006781 . A C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=1.018;DP=34;FS=7.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=15.20;ReadPosRankSum=-2.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:545,0,639 -chr23 32048697 . G C 1979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.891;DP=144;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:2008,0,2271 -chr23 32140338 . T A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.054;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:672,0,698 -chr23 32151115 . T A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-2.742;DP=54;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:914,0,2085 -chr23 32151118 . T A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-2.262;DP=51;FS=4.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=17.37;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:914,0,2042 -chr23 32151340 . CTG C 1052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=-0.185;DP=69;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.002;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1090,0,891 -chr23 32153906 . GAGGTATTACTTTTTTTTTTTAAAGGGAGGAGTTAAATAAGCACAGATGTGGTATTGCGATATGCATGAAAATTGTAAAAGCAAATGTGTTTATTTTTTTCT G 4701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=1.270;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,121:123:99:4739,396,0 -chr23 32172253 . C G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.035;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:382,0,593 -chr23 32181477 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-1.047;DP=25;FS=10.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:328,0,578 -chr23 32191985 . GT G 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-1.142;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:361,0,267 -chr23 32192032 . G T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.322;DP=24;FS=14.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:369,0,491 -chr23 32201304 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.398;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=9.95;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:267,0,559 -chr23 32201563 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=20.84;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,163 -chr23 32232227 . A C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.815;DP=34;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:476,0,1636 -chr23 32232229 . A T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=-0.842;DP=33;FS=5.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:476,0,1620 -chr23 32257882 . T A 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=-1.596;DP=99;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:1118,0,1781 -chr23 32265674 . CAT C 446.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:484,33,0 -chr23 32272767 . TGGTTTGTATCAGTTGTTTCAACCTTCTTGATGTATTAAGGTTTTGAGTCCCCTTTTTTATGATTGTCATGTTCATCTTAATACTTGCA T 10173.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.922;DP=233;FS=4.813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=29.49;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,209:219:99:10211,941,0 -chr23 32390235 . A C 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr23 32390248 . A C 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr23 32390439 . G T 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-1.080;DP=42;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:786,0,649 -chr23 32394142 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.138;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:541,0,539 -chr23 32438857 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:272,0,311 -chr23 32478177 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=-1.971;DP=58;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:382,0,1710 -chr23 32478197 . T A 1841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.333;DP=69;FS=3.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=26.69;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,48:69:99:1870,0,579 -chr23 32478608 . C CA 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-0.084;DP=62;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:605,0,892 -chr23 32478683 . T C 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.076;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:850,0,2436 -chr23 32478684 . GT G 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.874;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:850,0,2387 -chr23 32478814 . G C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-2.211;DP=51;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1064,0,1564 -chr23 32488765 . TCTGTTTGGAGAAGAGAAGACTGTGCTTTAGTTTCACTCTCATCATTCCGTGTGTGGATGCAGTTGTAGAGATATATCAGAGTCCTAC T 3508.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.231;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=31.59;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:3546,301,0 -chr23 32501299 . A G 1207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.547;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1245,0,1318 -chr23 32548238 . C A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.423;DP=48;FS=14.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:887,0,882 -chr23 32548288 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.152;DP=50;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:644,0,1157 -chr23 32548558 . TA T 220.04 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.510;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:312,0,134 -chr23 32548625 . T TA 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-2.219;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:94:399,0,94 -chr23 32549360 . T C 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:488,33,0 -chr23 32549361 . T G 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:488,33,0 -chr23 32549987 . T A 1133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:84:1162,84,0 -chr23 32593326 . T TA 624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:48:662,48,0 -chr23 32595860 . T TC 924.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.821;DP=49;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,40:43:44:1424,44,0 -chr23 32598067 . G GA 840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:997,100,0 -chr23 32599001 . C CA,CAA 677.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.922;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.976;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,24,12:39:99:987,278,229,560,0,595 -chr23 32599432 . C T 1031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1060,84,0 -chr23 32639132 . G A 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.636;DP=77;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:960,0,1703 -chr23 32639196 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=1.129;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:364,0,2068 -chr23 32639275 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=3.563;DP=52;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:230,0,1637 -chr23 32745827 . C T 5160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-0.682;DP=293;FS=13.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,141:292:99:5189,0,5026 -chr23 32746200 . A T 2610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.289;DP=179;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,74:179:99:2639,0,3595 -chr23 32746634 . TA T 1654.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.765;DP=180;FS=1.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,66:174:99:1692,0,2593 -chr23 32747225 . CA C 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=2.123;DP=147;FS=18.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.414;QD=4.32;ReadPosRankSum=-3.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,39:137:99:673,0,1907 -chr23 32747807 . C A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.583;DP=155;FS=7.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=2.70;ReadPosRankSum=-2.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,16:154:99:447,0,11533 -chr23 32747816 . T A 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=4.316;DP=170;FS=25.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=2.49;ReadPosRankSum=-3.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:461,0,11495 -chr23 32788689 . T A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.872;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:615,0,1238 -chr23 32791920 . A T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.931;DP=44;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:818,0,682 -chr23 32792601 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.935;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:740,0,995 -chr23 32850102 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=1.474;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:720,0,918 -chr23 32858979 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.655;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:516,0,1419 -chr23 33105307 . C G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=-0.054;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:419,0,800 -chr23 33105627 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=1.579;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:236,0,1133 -chr23 33551823 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-1.457;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=23.10;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:421,0,193 -chr23 33571625 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=1.528;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:503,0,589 -chr23 33661758 . CA C 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.435;DP=54;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:416,0,788 -chr23 33840960 . AC A 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.420;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:451,0,324 -chr23 33871146 . C T 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.624;DP=87;FS=12.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:1518,0,1497 -chr23 33934968 . G T 5162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.698;DP=292;FS=0.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,163:292:99:5191,0,4523 -chr23 33942431 . CT C 1556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.952;DP=204;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,79:184:99:1594,0,2044 -chr23 33973653 . T C 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:54:757,54,0 -chr23 33973768 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr23 34148616 . T A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:438,0,607 -chr23 34148618 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:438,0,607 -chr23 34157896 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=1.347;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:345,0,301 -chr23 34157958 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=1.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:350,0,347 -chr23 34161636 . C G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:419,0,125 -chr23 34161665 . T A 1086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1115,81,0 -chr23 34165401 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.154;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=22.66;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:708,0,326 -chr23 34165562 . A G 1657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1686,120,0 -chr23 34165580 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.441;DP=41;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:846,0,552 -chr23 34165809 . A G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=1.402;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:422,0,311 -chr23 34165895 . C T 867.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:896,72,0 -chr23 34166009 . C G 1255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1284,90,0 -chr23 34166087 . A G 1289.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1318,96,0 -chr23 34166183 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=2.003;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=15.34;ReadPosRankSum=-2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:565,0,640 -chr23 34166455 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.207;DP=28;FS=5.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:516,0,503 -chr23 34169139 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr23 34169151 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr23 34286725 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-1.106;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:516,0,462 -chr23 34286726 . A G 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-2.060;DP=28;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=26.28;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:764,0,206 -chr23 34287044 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.246;DP=45;FS=8.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:592,0,965 -chr23 34319834 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:490,0,433 -chr23 34326191 . TGGTGAGTGTTGATGTTTACGTGTTTTTGTTGTCTGTGGCACGTTTTCATTATATACAGTATGTGTTCATTCATGTATGTCCTGTCAATCATTATA T 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=3.485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:96:1248,96,0 -chr23 34354814 . G A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.493;DP=229;FS=18.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.853;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,49:228:99:949,0,6919 -chr23 34616738 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.467;DP=26;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:385,0,510 -chr23 34618927 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=22.70;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:346,0,523 -chr23 34620577 . GT G 479.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.959;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:1:514,0,1 -chr23 35026706 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-1.984;DP=32;FS=12.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:371,0,661 -chr23 35026850 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.090;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,867 -chr23 35187217 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-1.075;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:422,0,609 -chr23 35188963 . A C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=1.110;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:417,0,1055 -chr23 35188964 . AT A 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=1.110;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:417,0,1093 -chr23 35434489 . G A 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.351;DP=63;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1077,0,1122 -chr23 35437939 . C G 1620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1649,114,0 -chr23 35520573 . T C 236.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:265,0,18 -chr23 35520901 . C A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.415;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:565,0,576 -chr23 35520958 . T A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.850;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:695,0,1681 -chr23 35534123 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.774;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:572,0,592 -chr23 35556353 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=1.205;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:707,0,702 -chr23 35570765 . A T 3863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-0.505;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,106:210:99:3892,0,3741 -chr23 35588495 . CCCAA C 578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:48:616,48,0 -chr23 35588976 . C T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.859;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:868,0,875 -chr23 35589053 . C A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=1.216;DP=99;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:379,0,3078 -chr23 35693669 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.872;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:267,0,819 -chr23 35711339 . G GACGAGCTCACTC 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.311;DP=54;FS=12.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:882,0,1005 -chr23 35711342 . G GA 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:882,0,1005 -chr23 35712924 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.342;DP=44;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:679,0,905 -chr23 35713041 . C A 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.414;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=33.28;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1293,0,193 -chr23 35714589 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=2.253;DP=49;FS=6.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:744,0,932 -chr23 35715415 . T TTG 547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-0.104;DP=41;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:585,0,477 -chr23 35716034 . TA T 248.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:15:286,15,0 -chr23 35716217 . GT G 644.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.050;DP=29;FS=3.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:42:682,42,0 -chr23 35743512 . T G 3701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.759;DP=144;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=25.71;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,99:144:99:3730,0,1204 -chr23 35743533 . G A 2087.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2116,150,0 -chr23 35743618 . TCTGCACAGATGGGTCATGAAGACATGTTATCAAACTAATCACACAAATTAATAAATTACTAATAAAATAACACAAAATCATCCATTTTAAAATTTAACCACGTGATCTCAC T 5600.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-1.329;DP=136;FS=8.075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,134:136:99:5638,404,0 -chr23 35743803 . G A 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=3.307;DP=331;FS=67.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=1.82;ReadPosRankSum=4.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,54:330:99:632,0,10464 -chr23 35743824 . A T 15477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=392;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,392:392:99:15506,1174,0 -chr23 35761401 . C T 3859.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3888,280,0 -chr23 35762740 . G A 6830.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-2.292;DP=173;FS=15.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=34.54;ReadPosRankSum=2.364 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,170:172:99:6860,512,0 -chr23 35766427 . T C 13848.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,331:331:99:13877,1005,0 -chr23 35766520 . T C 3312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=-5.740;DP=297;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=11.15;ReadPosRankSum=-5.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,101:295:99:3341,0,5755 -chr23 35766538 . C T 5194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.664;DP=342;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=15.19;ReadPosRankSum=3.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,148:342:99:5223,0,6529 -chr23 35767345 . T C 6272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-2.998;DP=291;FS=214.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,181:291:99:6301,0,3951 -chr23 35767567 . C T 4799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:4828,346,0 -chr23 35831056 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.830;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:244,0,364 -chr23 35835678 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:86:310,0,86 -chr23 35839872 . G A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-1.146;DP=40;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:699,0,499 -chr23 35840438 . G T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=-0.988;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:574,0,626 -chr23 36015082 . T TA 1313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-1.160;DP=176;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,72:169:99:1378,0,1953 -chr23 36016055 . G GCA 509.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:34:547,34,0 -chr23 36033372 . T A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.679;DP=31;FS=9.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=34.15;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:99:1087,0,104 -chr23 36046878 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-1.122;DP=66;FS=5.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:707,0,1555 -chr23 36107742 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.164;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:316,0,2158 -chr23 36138017 . GT G 500.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.022;DP=40;FS=7.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:538,0,372 -chr23 36172649 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:361,0,177 -chr23 36184372 . G GT,GTT 624.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,12,22:34:99:1101,588,493,311,0,243 -chr23 36234117 . T A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr23 36237594 . G T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.394;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:413,0,408 -chr23 36242014 . CT C,CTT 224.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,6:12:99:305,166,194,170,0,196 -chr23 36349015 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.160;DP=47;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:783,0,896 -chr23 36349164 . G GT 1817.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.717;DP=71;FS=2.432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:1900,198,0 -chr23 36349864 . T A 3223.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=-0.800;DP=316;FS=0.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,143:315:99:3252,0,6273 -chr23 36359327 . AGTAAGTGCTGTGTTTCACGGTCAATCTAGTAGTCTTGGAACTTAAAGAAATGAGGTGCTAACAAATGTATTTTCTCCTTTAG A 16170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-0.482;DP=383;FS=2.586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=37.56;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,362:364:99:16208,1276,0 -chr23 36359699 . GAGGTATGTGCCTGACTGGATTCTGAAGATTTTAATGTTATTTCTTTGTAACTTAGTAGTTTTACTGTTATTTT G 1086.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=2.724;DP=229;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,221:229:99:1124,434,0 -chr23 36361151 . G GT 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-0.717;DP=45;FS=4.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:520,0,494 -chr23 36361286 . TA T 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=1.552;DP=40;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:335,0,1408 -chr23 36361748 . G GA 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.623;DP=128;FS=4.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,31:119:99:427,0,2349 -chr23 36361803 . AAGGTAGTTGCTGATTTTAATGTGGCACTCTAGTTTGTTTACAATTTTCCTCCATCTCAAACTTCTTTCTCTCTTCT A 2301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.183;ClippingRankSum=3.415;DP=86;FS=8.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=26.76;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,55:80:99:2339,0,11029 -chr23 36450404 . A G 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr23 36469558 . ATT A,AT 233.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.251;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,11,7:22:99:501,106,218,239,0,266 -chr23 36476976 . C T 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.466;DP=59;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:1143,0,949 -chr23 36533416 . GA G 2731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.950;ClippingRankSum=-0.315;DP=227;FS=4.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,123:204:99:2769,0,3416 -chr23 36691061 . A AT 1367.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1518,146,0 -chr23 36845485 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.227;DP=50;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=6.28;ReadPosRankSum=-3.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:342,0,1459 -chr23 36846236 . C CT 249.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:287,26,0 -chr23 36846950 . CA C 452.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:490,49,0 -chr23 36867747 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-1.091;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:338,0,327 -chr23 36894003 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:307,0,276 -chr23 36980939 . T A 4595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.191;DP=175;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=26.26;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:4624,0,1423 -chr23 36980996 . GA G 3385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.687;DP=275;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=12.31;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,145:226:99:3423,0,3115 -chr23 36981114 . A G 26743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:26772,1884,0 -chr23 36981125 . G T 26735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.640;DP=233;FS=6.168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=33.18;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,207:209:99:26764,1884,0 -chr23 36981208 . A G 3023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.516;DP=370;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,79:333:99:3052,0,9535 -chr23 36981244 . T C 26705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=409;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,382:382:99:26734,1884,0 -chr23 36981421 . T C 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-1.965;DP=236;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=5.77;ReadPosRankSum=2.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,59:219:99:1391,0,8018 -chr23 36981482 . AT A 322.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:32:360,32,0 -chr23 36981486 . A G 331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:32:360,32,0 -chr23 36984272 . C CA 1197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1235,99,0 -chr23 37174602 . G T 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-1.268;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1867,0,1856 -chr23 37183590 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:384,0,216 -chr23 37187997 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.271;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:291,0,421 -chr23 37384826 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=-0.739;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:386,0,487 -chr23 37386655 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=2.053;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:290,0,1757 -chr23 37580963 . TA T 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.648;DP=16;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:274,0,169 -chr23 37583658 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=2.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=15.89;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:346,0,367 -chr23 37583697 . GGGTGAGAACTACACAGATATTAAAGTTTTCAGTCTTTTCTTAATATGCATACGCTGAATCTCCTTTTCCACTCATCTTGGATTTCTA G 815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=1.071;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=29.06;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:80:853,80,0 -chr23 37588759 . A C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr23 37590199 . G C 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr23 37753285 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.012;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:376,0,518 -chr23 37797754 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.240;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:701,0,223 -chr23 37813389 . A T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr23 37831868 . A T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=1.217;DP=35;FS=7.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:693,0,516 -chr23 37854253 . T C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=2.290;DP=38;FS=13.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:741,0,1869 -chr23 37854256 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=2.627;DP=40;FS=18.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=17.82;ReadPosRankSum=2.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:741,0,1869 -chr23 37915964 . C T 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr23 38186783 . T C 1283.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.340;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:53:1312,53,0 -chr23 38186925 . G A 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 -chr23 38187091 . G A 436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:465,33,0 -chr23 38187591 . T G 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 -chr23 38244656 . T A 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=-0.078;DP=70;FS=15.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,36:69:99:1173,0,1210 -chr23 38244746 . T A 3548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.081;DP=279;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,104:279:99:3577,0,12964 -chr23 38244807 . A C 4032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.108;DP=271;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=14.88;ReadPosRankSum=2.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,114:271:99:4061,0,5352 -chr23 38355557 . GT G 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.852;DP=47;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:705,0,137 -chr23 38356445 . AT A 679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:717,70,0 -chr23 38920228 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:380,0,360 -chr23 38920595 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.351;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,703 -chr23 38921439 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:296,0,260 -chr23 39049411 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-1.135;DP=86;FS=6.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:703,0,2317 -chr23 39051422 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=3.527;DP=107;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:396,0,3288 -chr23 39051446 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=4.714;DP=96;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,20:96:99:377,0,2941 -chr23 39051464 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=4.140;DP=93;FS=3.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:264,0,2990 -chr23 39051843 . C T 2268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.135;DP=148;FS=3.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:2297,0,2720 -chr23 39052020 . A T 2229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-1.311;DP=141;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:2258,0,2555 -chr23 39052866 . T TTC 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=5.057;DP=63;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=4.92;ReadPosRankSum=-3.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:347,0,1653 -chr23 39052983 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.910;DP=103;FS=12.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,31:103:99:837,0,2749 -chr23 39053029 . A ACT 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=1.354;DP=82;FS=8.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:261,0,2850 -chr23 39053192 . AC A 1202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;ClippingRankSum=-0.778;DP=105;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1240,0,1854 -chr23 39053553 . G T 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-2.893;DP=38;FS=12.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=34.20;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:57:1328,0,57 -chr23 39053708 . G T 1653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=1.121;DP=95;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=17.41;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1682,0,1647 -chr23 39053842 . CA C 1042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.302;DP=95;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:1080,0,1286 -chr23 39404094 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=29.83;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:416,0,52 -chr23 39596687 . A C 314.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:28:343,28,0 -chr23 39598116 . T A 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=-0.442;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=33.70;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:47:1073,0,47 -chr23 39598701 . C CT 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.767;DP=26;FS=8.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:510,0,178 -chr23 39599298 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-1.617;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=28.52;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1055,0,192 -chr23 39600125 . GAC G 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:70:241,0,70 -chr23 39673553 . G A 613.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-1.123;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:641,9,0 -chr23 39676496 . A G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr23 39676649 . C T 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr23 39676711 . A G 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 -chr23 39676959 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr23 39677776 . T TA 285.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr23 39678451 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr23 39781483 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=1.902;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:247,0,392 -chr23 39890463 . C CA 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.337;DP=197;FS=4.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,46:167:99:591,0,3004 -chr23 39894774 . G A 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.126;DP=105;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1976,0,1682 -chr23 39896650 . G T 4191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-3.137;DP=152;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=27.58;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,109:151:99:4220,0,1036 -chr23 39902913 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.151;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:408,0,211 -chr23 39903032 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=3.524;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=24.71;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:646,0,218 -chr23 39906436 . T G 1649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.463;DP=58;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=28.44;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1678,0,312 -chr23 39906449 . A G 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-1.034;DP=58;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=20.10;ReadPosRankSum=2.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1194,0,784 -chr23 39911515 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.050;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:1007,0,1349 -chr23 39911585 . A AAC 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.766;DP=49;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:513,0,530 -chr23 39914354 . G C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:398,0,138 -chr23 39946540 . T A 728.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.659;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=34.71;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:16:757,16,0 -chr23 39948206 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr23 39948449 . A T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-0.085;DP=58;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:474,0,1541 -chr23 39948680 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.137;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:423,0,902 -chr23 39948681 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.416;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:378,0,1105 -chr23 39949276 . A C 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:407,36,0 -chr23 39949677 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,235 -chr23 40053403 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:373,0,476 -chr23 40105220 . C A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=-0.059;DP=52;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:451,0,1338 -chr23 40106056 . C G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.312;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:537,0,668 -chr23 40108367 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=8.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,431 -chr23 40108378 . C G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.305;DP=25;FS=6.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:367,0,523 -chr23 40200163 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,209 -chr23 40237742 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:259,0,135 -chr23 40340899 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.42;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:95:230,0,95 -chr23 40342220 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=1.056;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:379,0,797 -chr23 40342236 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.550;DP=30;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:285,0,908 -chr23 40800867 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.689;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:262,0,729 -chr23 40802331 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=1.426;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.947;QD=14.53;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:566,0,728 -chr23 40803698 . G T 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.079;DP=83;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1094,0,1633 -chr23 42656239 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:319,0,131 -chr23 42887690 . AC A 692.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=29.50;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:26:730,0,26 -chr23 42887955 . TG T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,185 -chr23 42887957 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,185 -chr23 43010859 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=3.320;DP=27;FS=29.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.66;ReadPosRankSum=-3.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:478,0,211 -chr23 43062503 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=1.450;DP=35;FS=3.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:529,0,1563 -chr23 43078337 . T G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.816;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:837,0,2742 -chr23 43099629 . C A 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.983;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:712,0,172 -chr23 43099716 . G T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.065;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:703,0,648 -chr23 43099847 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.170;DP=31;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:493,0,1024 -chr23 43099854 . A C 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.694;DP=30;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:493,0,1031 -chr23 43207502 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-0.799;DP=79;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:266,0,2310 -chr23 43207616 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.989;DP=86;FS=7.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:381,0,2478 -chr23 43586275 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=-1.077;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:244,0,1668 -chr23 43626407 . T G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-4.497;DP=118;FS=4.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,23:118:99:415,0,3713 -chr23 43882037 . C G 1803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.712;DP=338;FS=3.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,84:338:99:1832,0,9532 -chr23 43953501 . C CA 532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.714;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=31.34;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:87:570,0,87 -chr23 44159402 . A AT 1033.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:81:1071,81,0 -chr23 44217575 . G GT 364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:56:529,56,0 -chr23 44306280 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.645;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:435,0,676 -chr23 44476474 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.290;DP=85;FS=2.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:420,0,2373 -chr23 44512907 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-0.398;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:839,0,3648 -chr23 44520582 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=1.259;DP=139;FS=2.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,25:139:99:395,0,4091 -chr23 44524425 . C G 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.156;DP=116;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,31:116:99:723,0,3156 -chr23 44524509 . G T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-1.323;DP=127;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,28:127:99:563,0,3585 -chr23 44573752 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.642;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:499,0,683 -chr23 44627533 . G A 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-1.038;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=24.53;ReadPosRankSum=-2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,32:47:99:1181,0,397 -chr23 44631259 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-1.802;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:236,0,829 -chr23 44631766 . T A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=-3.496;DP=55;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:680,0,1125 -chr23 44632441 . A T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.120;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:323,0,616 -chr23 44633022 . GA G 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-1.759;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=20.63;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:388,0,185 -chr23 44633124 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr23 44633130 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr23 44634642 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-1.408;DP=56;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:479,0,1435 -chr23 44635412 . T G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.677;DP=74;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:621,0,1921 -chr23 44635743 . AT A 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=34.12;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:99:242,0,138 -chr23 44635746 . CCCACTTTTGTTTGAATTTCCACTGGATATT C 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:242,0,138 -chr23 44636096 . AGTTTGAATTTCCACTGGATATTCCCGCTTTT A 330.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:35:368,35,0 -chr23 44731810 . C T 12552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;ClippingRankSum=-3.082;DP=689;FS=82.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=18.22;ReadPosRankSum=-3.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,381:686:99:12581,0,11347 -chr23 44755101 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.913;DP=36;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:230,0,953 -chr23 44791587 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.708;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:483,0,1743 -chr23 44855199 . T C 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.148;DP=31;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=20.41;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:661,0,422 -chr23 44871033 . C T 1834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.732;DP=301;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,84:301:99:1863,0,7761 -chr23 44872203 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr23 44884623 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.344;DP=51;FS=4.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:250,0,1418 -chr23 44907881 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-1.271;DP=28;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:347,0,669 -chr23 44908132 . G A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.722;DP=62;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,50:61:99:1905,0,486 -chr23 44908294 . C G 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.588;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1406,0,1480 -chr23 44908403 . T C 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.929;DP=78;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.542;QD=13.74;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:1100,0,1581 -chr23 44908561 . C T 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr23 44908575 . A T 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 -chr23 44908587 . T C 559.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:10:587,10,0 -chr23 44912249 . A G 3713.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:3742,274,0 -chr23 44917738 . G A 2264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.354;DP=100;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,65:100:99:2293,0,1216 -chr23 44921943 . T G 3499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.484;DP=126;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=27.78;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,93:125:99:3528,0,763 -chr23 44922004 . G A 3121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=-1.306;DP=126;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=24.78;ReadPosRankSum=2.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,89:125:99:3150,0,841 -chr23 44922490 . G T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=3.158;DP=55;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:685,0,1211 -chr23 44922545 . A G 1216.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:87:1245,87,0 -chr23 44922635 . T G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=3.283;DP=35;FS=11.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:751,0,507 -chr23 44922647 . T A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=1.550;DP=34;FS=17.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:627,0,799 -chr23 44923483 . T G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr23 44923697 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=6.391;DP=87;FS=0.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:518,0,2355 -chr23 44923780 . T C 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:529,39,0 -chr23 44923936 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr23 44924181 . C T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.127;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=28.89;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:866,0,453 -chr23 44924319 . G T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-2.770;DP=76;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:619,0,2005 -chr23 44924365 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.878;DP=63;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:854,0,2668 -chr23 44924377 . G A 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.248;ClippingRankSum=-0.583;DP=56;FS=3.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:854,0,2740 -chr23 44938564 . A G 1597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1626,117,0 -chr23 44941258 . G T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.500;DP=24;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:651,0,136 -chr23 44941291 . T G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:329,0,310 -chr23 44942921 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.019;DP=33;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:329,0,819 -chr23 44942993 . T C 1116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1145,84,0 -chr23 44945193 . C T 1133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1162,87,0 -chr23 44945214 . A C 1152.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1181,84,0 -chr23 44948011 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.536;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:303,0,788 -chr23 44948020 . A C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:528,0,289 -chr23 44950228 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.066;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=13.16;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:410,0,580 -chr23 44951315 . C T 567.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:596,42,0 -chr23 44952535 . G C 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.227;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1021,0,800 -chr23 44952916 . A T 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:804,57,0 -chr23 44954509 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.172;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:646,0,368 -chr23 44954700 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.089;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:422,0,1311 -chr23 44954763 . G A 1629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1658,120,0 -chr23 44958588 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.336;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:509,0,518 -chr23 44958615 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.094;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:306,0,487 -chr23 44958629 . G T 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1064,78,0 -chr23 44958698 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.937;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:444,0,297 -chr23 44958767 . T A 1063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1092,78,0 -chr23 44960928 . T C 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1095,78,0 -chr23 44964129 . T C 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:746,54,0 -chr23 44964173 . G C 501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:530,39,0 -chr23 44965393 . A G 1443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1472,108,0 -chr23 44965420 . A G 1372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1401,105,0 -chr23 45028418 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=2.445;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:305,0,537 -chr23 45029927 . T G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-0.971;DP=25;FS=4.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:355,0,505 -chr23 45048636 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-1.169;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:727,0,613 -chr23 45061958 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:258,0,424 -chr23 45076447 . G A 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-1.716;DP=59;FS=7.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,37:59:99:1269,0,700 -chr23 45077106 . AC A 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.384;DP=47;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:553,0,993 -chr23 45143938 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-0.605;DP=40;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:284,0,1004 -chr23 45163187 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.519;DP=94;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:470,0,3310 -chr23 45164602 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=1.098;DP=39;FS=2.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:491,0,989 -chr23 45188645 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.595;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:339,0,500 -chr23 45197658 . A G 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 -chr23 45197724 . G A 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 -chr23 45205164 . G T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr23 45205978 . C A 214.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:243,0,19 -chr23 45328132 . C A 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-1.046;DP=69;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:847,0,1529 -chr23 45330450 . C T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.692;DP=58;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:896,0,1073 -chr23 45332427 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-2.158;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:673,0,1142 -chr23 45332600 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-1.414;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:378,0,1324 -chr23 45332615 . G T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=-0.847;DP=60;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:469,0,1551 -chr23 45344117 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.155;DP=47;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:325,0,1239 -chr23 45348726 . C G 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.482;DP=53;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:720,0,1132 -chr23 45356920 . G C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.597;DP=60;FS=4.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:403,0,3321 -chr23 45356929 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.821;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:414,0,3321 -chr23 45365203 . G C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.376;DP=78;FS=3.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.390;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,26:78:99:560,0,2076 -chr23 45382058 . TA T 1043.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.389;DP=277;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,73:257:99:1081,0,5117 -chr23 45474128 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:354,0,258 -chr23 45476133 . T C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=-2.880;DP=74;FS=31.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.60;ReadPosRankSum=-5.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:813,0,1700 -chr23 45479704 . C T 1451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=1.741;DP=69;FS=3.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,44:69:99:1480,0,834 -chr23 45493828 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-1.700;DP=54;FS=13.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=4.87;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:291,0,1535 -chr23 45493843 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=-1.572;DP=65;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:237,0,1916 -chr23 45576366 . G GT 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.829;DP=174;FS=6.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,38:155:99:363,0,2872 -chr23 45585651 . G T 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=-1.314;DP=388;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,89:387:99:1812,0,10959 -chr23 45635676 . T C 731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:760,57,0 -chr23 45635729 . C A 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.299;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,51:86:99:1662,0,1208 -chr23 45651033 . G A 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.185;DP=78;FS=7.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:1384,0,1276 -chr23 45683818 . T C 2039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2068,147,0 -chr23 45756011 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.519;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:311,0,339 -chr23 45756026 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:346,0,384 -chr23 45849352 . T A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.951;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:667,0,640 -chr23 45870325 . C T 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.532;DP=92;FS=7.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1714,0,1457 -chr23 45874616 . G T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=4.316;DP=71;FS=18.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:398,0,3937 -chr23 45884210 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=2.021;DP=44;FS=11.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:675,0,660 -chr23 45885546 . G C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-1.984;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:581,0,576 -chr23 45888567 . A AAG 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.027;DP=27;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:357,0,434 -chr23 45997859 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.156;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:238,0,923 -chr23 46022706 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-1.617;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:309,0,621 -chr23 46048947 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=-0.246;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:399,0,448 -chr23 46105701 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:382,0,282 -chr23 46149578 . C A 2261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=-0.155;DP=149;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:2290,0,2730 -chr23 46161573 . TCTGTTAGCATTAGCAGATAATGTTAATTATCACTATGATCTGATATAATACTGCAGACGTGAGCTAAAGCTGTAC T 7876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.832;DP=176;FS=4.411;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=28.41;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,171:175:99:7914,694,0 -chr23 46185354 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.547;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:984,0,251 -chr23 46191715 . G A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.231;DP=48;FS=18.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=18.00;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:892,0,792 -chr23 46193639 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.668;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:415,0,310 -chr23 46197071 . A C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.455;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:585,0,1186 -chr23 46197788 . A AT 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-1.030;DP=21;FS=10.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,557 -chr23 46200661 . C CTG 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-1.418;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,387 -chr23 46201432 . C T 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-2.873;DP=52;FS=9.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=18.53;ReadPosRankSum=3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:992,0,1551 -chr23 46201433 . T C 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-2.845;DP=50;FS=7.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=19.14;ReadPosRankSum=3.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:985,0,1551 -chr23 46278849 . G T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.103;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1280,0,714 -chr23 46374214 . C T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.464;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:773,0,1438 -chr24 1668 . A G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.783;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,38:146:99:878,0,4063 -chr24 55098 . C G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.242;DP=75;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:389,0,2038 -chr24 218093 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.727;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:377,0,450 -chr24 225123 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.913;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=12.95;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:326,0,503 -chr24 225361 . C G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.195;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:234,0,754 -chr24 284366 . G C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.972;DP=22;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,465 -chr24 353378 . C T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.620;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:588,0,577 -chr24 425614 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.701;DP=277;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,62:277:99:1249,0,8254 -chr24 426498 . G A 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.143;DP=230;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,46:229:99:824,0,7224 -chr24 478460 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.502;DP=141;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,26:141:99:398,0,4380 -chr24 481805 . C T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.681;DP=144;FS=9.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,36:144:99:847,0,4295 -chr24 482069 . T A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=-3.599;DP=161;FS=6.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=2.10;ReadPosRankSum=2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,27:161:99:367,0,9990 -chr24 482071 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-3.956;DP=168;FS=8.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.220;QD=2.02;ReadPosRankSum=2.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,27:168:99:367,0,9990 -chr24 483584 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=1.202;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:392,0,2014 -chr24 483585 . A G 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.431;DP=68;FS=4.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1076,0,1246 -chr24 483589 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.037;DP=66;FS=6.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:353,0,2187 -chr24 483720 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=-0.161;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:256,0,3536 -chr24 485502 . AAC A 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.892;DP=85;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:279,0,712 -chr24 485742 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-1.161;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,32:157:99:620,0,4999 -chr24 486578 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=-0.152;DP=119;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:400,0,4863 -chr24 487537 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=-0.061;DP=126;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=1.83;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,22:126:99:259,0,4497 -chr24 489849 . C CT 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-2.585;DP=89;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.210;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:469,0,1419 -chr24 518384 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.276;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:229,0,630 -chr24 521785 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.998;DP=72;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:308,0,2258 -chr24 521814 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.264;DP=82;FS=4.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:252,0,2624 -chr24 534980 . G GCA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.006;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:319,0,1897 -chr24 942469 . G C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:268,0,565 -chr24 948359 . G T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=1.545;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:254,0,819 -chr24 957629 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-0.868;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:367,0,1081 -chr24 958931 . T C 370.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.34;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:6:398,0,6 -chr24 982131 . G A 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-0.005;DP=79;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=20.41;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,48:79:99:1641,0,1085 -chr24 987747 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.040;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:237,0,3140 -chr24 988707 . GCCTGCAAACAACAACAACAGCAGTTCAGATTCTGCCATGCATCAACATCGGTCTCTGCAAGAAGAACAGCGCACACA G 3532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=2.836;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=34.98;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,84:101:99:3570,0,2605 -chr24 997898 . T G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-2.009;DP=53;FS=7.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:625,0,1092 -chr24 1022999 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.662;DP=91;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:588,0,2376 -chr24 1027955 . C T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.043;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:920,0,3760 -chr24 1033856 . T G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-0.352;DP=44;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:915,0,1525 -chr24 1033862 . A G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.108;DP=44;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:915,0,1525 -chr24 1033942 . G A 2814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.539;DP=111;FS=4.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=25.36;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,74:97:99:2843,0,499 -chr24 1033974 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.507;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,26:112:99:494,0,3293 -chr24 1035602 . G A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.508;DP=111;FS=3.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:690,0,2875 -chr24 1035660 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=1.352;DP=66;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1007,0,1092 -chr24 1122615 . C A 1440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.209;DP=88;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:1469,0,1524 -chr24 1123482 . A T 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=-0.780;DP=218;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,54:218:99:1123,0,6504 -chr24 1133229 . G T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=-2.228;DP=261;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.353;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,46:261:99:691,0,17009 -chr24 1133232 . G T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=-2.213;DP=275;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,47:275:99:709,0,17009 -chr24 1133376 . C T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.994;DP=262;FS=5.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=2.35;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,53:262:99:644,0,7799 -chr24 1140616 . G A 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=-1.629;DP=192;FS=0.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,51:191:99:1131,0,7027 -chr24 1163954 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.769;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:230,0,1334 -chr24 1175011 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=-0.287;DP=80;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:533,0,2166 -chr24 1181853 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.127;DP=148;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=5.94;ReadPosRankSum=2.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,40:148:99:908,0,3995 -chr24 1316532 . A G 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-2.201;DP=167;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,36:167:99:678,0,4746 -chr24 1425693 . T TA 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:37:312,0,37 -chr24 1425702 . A T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:31:386,0,31 -chr24 1425932 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=1.837;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:303,0,581 -chr24 1459313 . G C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:295,21,0 -chr24 1459324 . G A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr24 2228990 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.599;DP=42;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:305,0,1132 -chr24 2229003 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.013;DP=47;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=4.61;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:245,0,1325 -chr24 2375966 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:460,0,120 -chr24 2559551 . G A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=1.050;DP=114;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,26:114:99:569,0,3504 -chr24 2559567 . G T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=1.049;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:465,0,3060 -chr24 2754058 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,317 -chr24 3136201 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.677;DP=146;FS=3.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,38:145:99:621,0,4034 -chr24 3240864 . T A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-5.547;DP=132;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,30:132:99:649,0,8284 -chr24 3240871 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-5.555;DP=127;FS=7.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=4.89;ReadPosRankSum=4.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,25:124:99:649,0,8284 -chr24 3241056 . A C 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-1.418;DP=106;FS=0.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:1424,0,2334 -chr24 3241131 . CAA C 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-0.445;DP=60;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:516,0,1564 -chr24 3241621 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.229;DP=64;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:378,0,1808 -chr24 3416602 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,655 -chr24 3491751 . C CAT 989.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.076;DP=56;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1027,0,1277 -chr24 3547578 . C A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=-1.316;DP=128;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,24:128:99:397,0,4162 -chr24 3547982 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=2.663;DP=47;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,9:47:99:419,0,2470 -chr24 3556690 . ATC A 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:399,0,448 -chr24 3556785 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.253;DP=69;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:433,0,2028 -chr24 3604348 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.170;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:277,0,2102 -chr24 4080942 . C G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.611;DP=48;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:687,0,1063 -chr24 4080998 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=3.324;DP=23;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:231,0,625 -chr24 4219640 . TA T 1311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.059;DP=214;FS=0.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,67:203:99:1349,0,2727 -chr24 4501552 . AACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC A 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=3.665;DP=33;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=10.02;ReadPosRankSum=-2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:368,0,1328 -chr24 4505637 . T G 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.026;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:435,0,738 -chr24 4527731 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.794;DP=81;FS=6.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:448,0,2253 -chr24 5061483 . A T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.143;DP=37;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:443,0,897 -chr24 5369475 . T C 1788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=1.448;DP=93;FS=1.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,56:93:99:1817,0,1307 -chr24 5393608 . TG T 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.969;DP=105;FS=3.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1332,0,1611 -chr24 5562550 . G A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr24 5562583 . G T 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -chr24 5735081 . GT G 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.449;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:247,0,216 -chr24 5924256 . G T 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr24 5978622 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-2.159;DP=28;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=32.71;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:99:944,0,265 -chr24 5983571 . T G 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-2.323;DP=57;FS=15.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1037,0,1085 -chr24 5999856 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:454,0,278 -chr24 6013734 . T A 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.276;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:511,0,465 -chr24 6199810 . T A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.921;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:481,0,193 -chr24 6200241 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:382,0,242 -chr24 6200467 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.264;DP=18;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=20.99;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:406,0,184 -chr24 6200692 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.191;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=25.59;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:668,0,184 -chr24 6200834 . A T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=23.60;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:453,0,190 -chr24 6200902 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,224 -chr24 6201518 . C A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:279,0,229 -chr24 6202326 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr24 6202365 . A G 554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:583,45,0 -chr24 6203632 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:311,0,143 -chr24 6216740 . C A 1781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-0.452;DP=81;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=22.00;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:1810,0,936 -chr24 6217443 . C T 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.522;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1477,0,332 -chr24 6218054 . T A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.309;DP=51;FS=3.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,42:51:99:1629,0,153 -chr24 6219308 . T TTA 1278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1316,100,0 -chr24 6219483 . TA T 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-2.404;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=28.41;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:577,0,146 -chr24 6219485 . T G 577.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-1.897;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=30.41;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:644,0,146 -chr24 6219719 . A T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-2.510;DP=32;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=19.34;ReadPosRankSum=2.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:647,0,923 -chr24 6219732 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.481;DP=27;FS=6.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=22.92;ReadPosRankSum=2.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:647,0,923 -chr24 6219887 . A T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.348;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=17.07;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:438,0,406 -chr24 6219921 . A T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.423;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:557,0,458 -chr24 6220110 . A T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-1.468;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:744,0,1407 -chr24 6220752 . C CT 549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-2.096;DP=52;FS=11.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:587,0,561 -chr24 6236515 . C T 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.621;DP=63;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.134;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,40:63:99:1333,0,773 -chr24 6297623 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.431;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:319,0,579 -chr24 6303243 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=-1.620;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=25.21;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:356,0,101 -chr24 6378261 . C T 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:460,36,0 -chr24 6427928 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.441;DP=47;FS=4.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:837,0,699 -chr24 6445528 . T TA 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-0.248;DP=43;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:461,0,495 -chr24 6445550 . CAT C 1446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.772;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1484,0,1351 -chr24 6445945 . A AT 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;ClippingRankSum=1.070;DP=93;FS=8.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:255,0,1910 -chr24 6446368 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=-4.929;DP=96;FS=14.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=3.79;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:392,0,5330 -chr24 6446369 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-4.559;DP=97;FS=12.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,19:97:99:392,0,5330 -chr24 6446404 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=6.129;DP=132;FS=0.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:931,0,7708 -chr24 6583785 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,167 -chr24 6594655 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:278,0,64 -chr24 6594794 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:39:367,0,39 -chr24 6596091 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.116;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:274,0,418 -chr24 6677075 . G C 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-1.183;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:722,0,623 -chr24 6677243 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.175;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:767,0,1044 -chr24 6677293 . G C 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.433;DP=56;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=13.73;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:797,0,1137 -chr24 6677350 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=1.770;DP=57;FS=7.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,31:57:99:1066,0,929 -chr24 6677429 . C T 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.443;DP=45;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:863,0,839 -chr24 6677442 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.707;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:758,0,914 -chr24 6677504 . T C 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.142;DP=34;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:733,0,446 -chr24 6677621 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:990,70,0 -chr24 6677879 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=2.674;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:346,0,627 -chr24 6677966 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.149;DP=45;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:846,0,617 -chr24 6678022 . A G 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.121;DP=44;FS=4.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:567,0,940 -chr24 6678323 . T C 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 -chr24 6678383 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.644;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:457,0,527 -chr24 6678454 . G A 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1080,78,0 -chr24 6678557 . A G 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:57:821,57,0 -chr24 6678559 . A T 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:57:821,57,0 -chr24 6678628 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-0.310;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:499,0,605 -chr24 6678665 . T C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.018;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:582,0,628 -chr24 6685697 . G A 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:569,39,0 -chr24 6785653 . A G 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:456,33,0 -chr24 6795492 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:229,0,57 -chr24 6804334 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.440;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:652,0,646 -chr24 6841642 . GCCTGAAAGACACACTCAAGCATATCACATTATCATCTCCAGCGCCATCCTCATATTTACAGTCGTTCACAGTCTTTA G 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:518,0,1021 -chr24 7468018 . G A 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 -chr24 7662080 . GA G 535.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.460;DP=28;FS=2.269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:15:573,15,0 -chr24 7783042 . G A 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 -chr24 7975140 . C G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.893;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:299,0,300 -chr24 8023833 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=2.067;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:267,0,622 -chr24 8052905 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:317,0,214 -chr24 8052914 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=32.09;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:317,0,214 -chr24 8053960 . A T 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:282,0,22 -chr24 8055505 . A T 7071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.542;DP=264;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=26.79;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,185:264:99:7100,0,2017 -chr24 8056141 . T C 1526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.076;DP=229;FS=6.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,65:226:99:1555,0,7342 -chr24 8056657 . A G 9388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.232;DP=334;FS=0.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=28.11;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,244:334:99:9417,0,2340 -chr24 8060710 . A G 15309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.077;DP=533;FS=8.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=28.72;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,406:533:99:15338,0,2705 -chr24 8521543 . T TA 4215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.021;DP=240;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=17.57;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,177:239:99:4344,0,852 -chr24 8540132 . G A 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr24 8540939 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.198;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:315,0,569 -chr24 9373637 . A G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.844;DP=115;FS=3.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,25:115:99:467,0,3241 -chr24 9467397 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=20.78;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,141 -chr24 9467566 . C A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr24 9467575 . A T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:264,18,0 -chr24 9476946 . GCCTTCGGGGGGGAAAAAAAAACATCACCACATTTAGTCTTTACACATTCTTGTTTTATGAATGAGGAAATATTAGTGTTAAGTGTGAGATGCCAA G 4947.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.099;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,110:112:99:4985,404,0 -chr24 9479244 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=2.110;DP=106;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,19:105:99:286,0,3324 -chr24 9490157 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=1.749;DP=55;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:324,0,1620 -chr24 10119622 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=1.767;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:348,0,660 -chr24 10120464 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-1.056;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,627 -chr24 10149169 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=13.19;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:292,0,404 -chr24 10215953 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.019;DP=235;FS=8.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,58:233:99:1222,0,6544 -chr24 10216613 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.519;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:247,0,1015 -chr24 10832174 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.684;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:249,0,758 -chr24 10834159 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.152;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:300,0,364 -chr24 10842560 . CT C 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.792;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:583,0,622 -chr24 10848332 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.255;DP=25;FS=6.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:301,0,552 -chr24 11129071 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.763;DP=31;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:270,0,1662 -chr24 11129072 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-2.720;DP=31;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:270,0,1662 -chr24 11225170 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:349,0,214 -chr24 11229385 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,426 -chr24 11239519 . G C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:257,0,136 -chr24 11256063 . C T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=-1.605;DP=142;FS=11.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.092;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:800,0,4102 -chr24 11303080 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-1.368;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:315,0,370 -chr24 11369762 . C G 442.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.668;DP=25;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:1:468,0,1 -chr24 11726970 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr24 11920421 . T G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.942;DP=30;FS=14.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=28.49;ReadPosRankSum=-2.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:883,0,132 -chr24 11920479 . G A 6380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=2.066;DP=167;FS=5.255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,155:165:99:6409,381,0 -chr24 11921643 . C A 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr24 11923998 . C T 1523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-1.300;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=31.61;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1552,111,0 -chr24 11924039 . G A 7038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.930;DP=203;FS=7.566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=34.67;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,164:174:99:7067,413,0 -chr24 11924159 . C T 2854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=4.224;DP=76;FS=134.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=33.40;ReadPosRankSum=2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,64:76:99:2883,0,100 -chr24 11924343 . T A 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:413,30,0 -chr24 11925211 . A T 2396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=-1.466;DP=84;FS=43.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=28.53;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,61:73:99:2426,0,166 -chr24 11950267 . T C 559.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:588,41,0 -chr24 11950272 . T C 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:47:688,47,0 -chr24 11951275 . G T 802.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.237;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=34.87;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:11:830,0,11 -chr24 11951384 . A C 757.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-0.180;DP=22;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=34.44;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:25:786,0,25 -chr24 11951423 . T C 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-0.946;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:87:1260,87,0 -chr24 11951478 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.091;DP=21;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,465 -chr24 12871114 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.828;DP=106;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:385,0,3031 -chr24 12871181 . GCTGCAGGATAACAAAATAACAAAACAGGTGCTATAAAAATAAAAAGGTTGATAATAAAGCAGGATATTCTGGTTGTGCTGACAGAC G 4237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=2.054;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=22.79;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,92:95:99:4275,377,0 -chr24 12874947 . A T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.375;DP=86;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.165;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:379,0,2531 -chr24 12927187 . C T 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-1.186;DP=364;FS=6.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,81:364:99:1551,0,10750 -chr24 13143178 . A T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-2.247;DP=168;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=2.50;ReadPosRankSum=2.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,30:166:99:449,0,7674 -chr24 13159533 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.201;DP=134;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,33:134:99:719,0,3855 -chr24 13917820 . TA T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.520;DP=63;FS=2.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:249,0,1139 -chr24 14138488 . A G 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.753;DP=200;FS=2.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,49:200:99:1091,0,6006 -chr24 14289538 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.031;DP=78;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:306,0,2331 -chr24 14320098 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-1.381;DP=97;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,17:97:99:265,0,3156 -chr24 14446640 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-1.025;DP=71;FS=12.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:340,0,3174 -chr24 14464684 . GC G 2189.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.636;DP=153;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:2227,0,2276 -chr24 14469270 . A AT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-1.225;DP=45;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:243,0,537 -chr24 14481384 . C CGA 610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-2.772;DP=363;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,57:307:99:648,0,8539 -chr24 14524907 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:229,0,431 -chr24 14524908 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:271,0,404 -chr24 14526023 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-1.620;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:423,0,634 -chr24 15123600 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:234,0,350 -chr24 15135684 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,267 -chr24 15978946 . G C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.985;DP=171;FS=1.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:340,0,3658 -chr24 15979022 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.035;DP=117;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:649,0,3500 -chr24 15979025 . A G 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=1.355;DP=116;FS=12.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:582,0,3471 -chr24 16079362 . T G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr24 16369341 . T G 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.344;DP=174;FS=6.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,46:172:99:1088,0,4735 -chr24 16370039 . A G 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.024;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=30.93;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1018,0,113 -chr24 16370077 . A T 2867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=3.564;DP=150;FS=23.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=19.12;ReadPosRankSum=-3.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:2896,0,5317 -chr24 16370078 . G C 2867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=3.978;DP=164;FS=12.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=17.49;ReadPosRankSum=-3.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:2896,0,5317 -chr24 16370359 . T G 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr24 16370666 . G GA 2619.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.785;DP=153;FS=3.445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,115:122:99:3109,312,0 -chr24 16371617 . TA T 2797.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=-2.261;DP=578;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:363,180:543:99:2835,0,8888 -chr24 16371961 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.632;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:33:611,0,33 -chr24 16372184 . T G 374.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:403,27,0 -chr24 16372224 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr24 16372919 . T A 5569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:5598,385,0 -chr24 16372977 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=4.521;DP=31;FS=79.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=9.25;ReadPosRankSum=-2.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:315,0,911 -chr24 16373147 . G T 1324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.249;DP=40;FS=3.871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=33.12;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:61:1353,61,0 -chr24 16407972 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.256;DP=16;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,241 -chr24 16407989 . T TA 239.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.791;DP=16;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:4:275,4,0 -chr24 16409659 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.380;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,521 -chr24 16412352 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=29.20;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:43:437,0,43 -chr24 16747859 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.702;DP=47;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:341,0,1320 -chr24 16748238 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-1.080;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,52:150:99:1405,0,6685 -chr24 16749823 . A T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=-0.227;DP=97;FS=6.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=3.92;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:408,0,3803 -chr24 16754697 . G T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:320,0,417 -chr24 17463805 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.910;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:349,0,2067 -chr24 17547996 . CT C 207.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=38.08;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:0:242,0,0 -chr24 17727197 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-1.431;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:314,0,880 -chr24 17727605 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:279,0,180 -chr24 17728543 . A G 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:629,45,0 -chr24 17763869 . C T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=2.885;DP=164;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=3.93;ReadPosRankSum=-2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,39:156:99:672,0,6811 -chr24 17764326 . C CT 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.895;DP=218;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=1.83;ReadPosRankSum=-2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,46:208:99:436,0,4394 -chr24 17764949 . C CT 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.024;DP=191;FS=0.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,39:176:99:460,0,3249 -chr24 17913886 . CA C 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=1.775;DP=19;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:321,0,212 -chr24 18994925 . T C 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.659;ClippingRankSum=-2.647;DP=497;FS=5.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.050;QD=1.26;ReadPosRankSum=3.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:420,76:496:99:656,0,16237 -chr24 18995640 . G A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.475;DP=411;FS=4.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=1.50;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:348,63:411:99:646,0,25370 -chr24 18995650 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=-6.013;DP=305;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=2.02;ReadPosRankSum=5.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,31:305:99:645,0,25370 -chr24 19106631 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=-0.701;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:322,0,1250 -chr24 19303704 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.811;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:346,0,1753 -chr24 19325619 . T A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.145;DP=72;FS=5.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:638,0,1842 -chr24 19340367 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.503;DP=59;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:295,0,1827 -chr24 20255805 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.859;DP=48;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:261,0,2635 -chr24 20256965 . T TA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.388;DP=70;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:238,0,1294 -chr24 20258354 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.646;DP=135;FS=21.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,29:135:99:567,0,4035 -chr24 20258775 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.082;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:99:513,0,3400 -chr24 20809012 . TCTGTGATAAAAGAAGAACATTAAAAGAACAATCCTCTCTCTTTGTTTTCGTCGGTATTATAAAAGAAGACTTATAAGCCTCAC T 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=2.404;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=27.31;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:365,0,2038 -chr24 20937448 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.107;DP=72;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:231,0,2914 -chr24 21019976 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-1.104;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:455,0,2098 -chr24 21146006 . C A 1769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.904;DP=434;FS=6.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:331,91:422:99:1798,0,12891 -chr24 21147753 . A T 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=1.775;DP=325;FS=5.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,64:324:99:1036,0,9296 -chr24 21157894 . G A 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.391;DP=349;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,92:349:99:2171,0,9983 -chr24 21160708 . TGGTAAGAGACCCAATCTAAGCTTACATGAAGACTACAACAAAATATGACATTAATGAACATGTCCTGCTCCACA T 10767.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-1.275;DP=329;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,291:301:99:10805,0,902 -chr24 21160830 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.694;DP=319;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,56:318:99:730,0,10438 -chr24 21161218 . G A 2047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.959;DP=356;FS=9.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,90:356:99:2076,0,10156 -chr24 21163075 . A G 1511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=-0.306;DP=264;FS=1.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,70:264:99:1540,0,7324 -chr24 21174763 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-0.413;DP=102;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=2.00;ReadPosRankSum=2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:232,0,3147 -chr24 21174811 . C A 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.980;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,30:109:99:711,0,3503 -chr24 21179345 . C A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-1.880;DP=163;FS=1.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,39:162:99:811,0,4701 -chr24 21179897 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.114;DP=61;FS=7.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:264,0,1872 -chr24 21184707 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.584;DP=37;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.142;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:234,0,1060 -chr24 21253216 . TCCTGAATTAAAAAAAATATATATGCAAACACTTAAAAAAAAGGTGTACAGAATTAACATATAGATATTAAAAACAATGTCTTCTAAAATCAA T 4965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=2.687;DP=135;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=26.44;ReadPosRankSum=-4.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,120:130:99:5003,0,310 -chr24 21254466 . G A 1315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.454;DP=174;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,51:173:99:1344,0,4791 -chr24 21254916 . T A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.411;DP=171;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,41:171:99:932,0,5031 -chr24 21259143 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.454;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:288,0,3416 -chr24 21501843 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=1.420;DP=77;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,14:77:99:252,0,2452 -chr24 21506231 . G GT 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-0.414;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:255,0,2033 -chr24 21506511 . CACCTGTTCAAAAGAAAAAAATGTAAGAACAAAAAAATTTCGATTTAGGAATGAGGAATTCGTTTAGGAATGAGTTT C 2967.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=2.344;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=27.01;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:3005,271,0 -chr24 21506674 . C G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.335;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,25:109:99:521,0,4478 -chr24 21512117 . C A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.815;DP=66;FS=4.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:363,0,1919 -chr24 21525550 . T C 3149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.505;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=31.50;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,83:100:99:3178,0,257 -chr24 21561681 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.487;DP=133;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,33:133:99:746,0,3925 -chr24 21599812 . G A 633.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.205;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:11:661,11,0 -chr24 21602815 . C A 549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:578,42,0 -chr24 21614357 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:231,0,111 -chr24 21763171 . G A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.499;DP=141;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:842,0,4023 -chr24 21769875 . C T 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=2.090;DP=150;FS=9.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,43:150:99:1042,0,3946 -chr24 21783430 . G C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-1.361;DP=176;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,39:176:99:747,0,5225 -chr24 21790273 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.578;DP=170;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=4.08;ReadPosRankSum=2.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:721,0,5166 -chr24 21791372 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.089;DP=150;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,33:149:99:658,0,4628 -chr24 21807418 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.098;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:258,0,706 -chr24 21814930 . G GT 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-1.045;DP=100;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:707,0,1029 -chr24 21819120 . C A 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-2.033;DP=217;FS=5.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,60:216:99:1392,0,5852 -chr24 21819191 . G A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-1.237;DP=218;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,44:218:99:765,0,6696 -chr24 21820791 . G A 1930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=1.857;DP=263;FS=0.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,77:263:99:1959,0,7377 -chr24 21825824 . GCTGCGGACACAAAAATGATGATCAATGACAGAACAAAACACCAGCAAACCACACACATTCACTAACACACCACACACACTTACTGTCATCATCCTTCATTTAGGAGTGTAAAAGATCAAGAGAACAGTAGTGTTAGCGTCACTTGTCAAGTACGTAATCTTATAGTTCCAAAATACTTGTTATTGTGTATTGCAAGTATAAATAAATGCAGTATAGTCCTTTTGTTGTCATTAAAGGAGGGATTGTATACTCAC G 10752.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=3.516;DP=266;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,258:265:99:10790,797,0 -chr24 21829205 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.727;DP=158;FS=42.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:509,0,4957 -chr24 21831050 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.662;DP=206;FS=7.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,41:206:99:701,0,6265 -chr24 21837368 . C A 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=-1.711;DP=230;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,53:229:99:1122,0,6676 -chr24 21837379 . G T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-1.810;DP=234;FS=3.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,52:233:99:1063,0,6871 -chr24 21867305 . CT C 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.110;DP=215;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,38:212:99:494,0,8161 -chr24 21971334 . TA T 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:49:294,0,49 -chr24 21972653 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:251,0,441 -chr24 21979380 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.062;DP=102;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,30:102:99:752,0,2742 -chr24 21979781 . A T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.691;DP=57;FS=11.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:770,0,1997 -chr24 22058345 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.897;DP=51;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:374,0,1413 -chr24 22110357 . C G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.952;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:542,0,516 -chr24 22110492 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.354;DP=38;FS=8.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:314,0,1018 -chr24 22146576 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.705;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,24:128:99:388,0,4038 -chr24 22147152 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-0.016;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:573,0,3301 -chr24 22183496 . C T 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.315;DP=183;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,50:183:99:1142,0,4793 -chr24 22185436 . T C 1298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.304;DP=135;FS=4.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1327,0,4589 -chr24 22186015 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.230;DP=37;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:230,0,1097 -chr24 22209039 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.600;DP=61;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=7.91;ReadPosRankSum=2.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:511,0,1596 -chr24 22229646 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.534;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:318,0,956 -chr24 22289137 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.168;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:340,0,785 -chr24 22328268 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-2.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=18.78;ReadPosRankSum=2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:310,0,223 -chr24 22328412 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.802;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:466,0,1787 -chr24 22328682 . T C 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.187;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:719,0,973 -chr24 22338393 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.731;DP=70;FS=5.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:409,0,2025 -chr24 22346722 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.017;DP=104;FS=2.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:263,0,3277 -chr24 22407585 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:340,0,134 -chr24 22407624 . C A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=25.34;ReadPosRankSum=2.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,131 -chr24 22572023 . ACTGGAAGACACAAATACAGTCATGTGGAGAAATCAAGACTTCTTTACAGTAAATATTCAAAAGACCGTAACAGAAATCTCTTAC A 2407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.205;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=29.79;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2445,198,0 -chr24 22575763 . ACTGACAAATGTAAAGACCACTAGTATTACTTTAAATGCTTCAAATGAAAGTGACTTCAAACAAACCAAATTGCTGCTCAC A 2343.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.211;DP=58;FS=2.269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,55:58:1:2378,1,0 -chr24 22575910 . CCCTGGATAAACAGTAGACGCTCCTTGCATTCGTTTACATACACAAATCATACACATATTGATCATATCAACAGGCTTTA C 1992.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=2.643;DP=87;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=22.90;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,67:79:99:2030,0,4045 -chr24 22679597 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.274;ClippingRankSum=0.058;DP=276;FS=1.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,54:276:99:494,0,10685 -chr24 23349479 . G C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-0.148;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:418,0,2384 -chr24 23352476 . CCCTGTGAAAACACGAATGATGTTGGTGTAAAAGGGTGGAGAAAGTGTTGGGATTCAGGATTGGTGAGGGATTGTCTTA C 5624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-0.932;DP=129;FS=1.965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,123:127:99:5662,431,0 -chr24 23357178 . AT A 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.898;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.34;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:31:272,0,31 -chr24 23851636 . C A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.456;DP=159;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,34:159:99:661,0,4788 -chr24 23851999 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.262;DP=112;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:511,0,5585 -chr24 23852293 . GA G,GAA 471.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.673;DP=62;FS=1.833;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,24,14:45:99:633,194,418,389,0,668 -chr24 23853077 . C CT 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=-1.028;DP=144;FS=4.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:398,0,2079 -chr24 23854095 . C G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.128;DP=150;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,35:149:99:705,0,4366 -chr24 23855880 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.142;DP=104;FS=6.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:953,0,2815 -chr24 23859867 . C A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.932;DP=119;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,32:119:99:749,0,3294 -chr24 23860943 . A T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.329;DP=80;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:454,0,2112 -chr24 23910845 . G C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.476;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:697,0,2555 -chr24 23910953 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=-0.682;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:448,0,3337 -chr24 23911196 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.630;DP=116;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,31:116:99:760,0,3236 -chr24 24298784 . AACCTGAAAGAGAATTTAACAGCATAAAATAAAACAGTAGCCCCAACAAAACTTTATGTTCAGTAAGTGCCAT A 944.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=1.589;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=26.36;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:79:982,79,0 -chr24 24367563 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.375;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:271,0,473 -chr24 24367627 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.026;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:289,0,664 -chr24 24415928 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.488;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:284,0,1152 -chr24 24424087 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.927;DP=38;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:233,0,1145 -chr24 24425380 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=-2.187;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:709,0,1012 -chr24 24425455 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-1.928;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=11.99;ReadPosRankSum=-2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:508,0,1163 -chr24 24446417 . C A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.708;DP=76;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:456,0,2881 -chr24 24447086 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-0.184;DP=156;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,26:155:99:257,0,6121 -chr24 24447161 . C T 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.093;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,47:139:99:1581,0,3299 -chr24 24451050 . G C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.664;DP=65;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:394,0,2533 -chr24 24459331 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-1.804;DP=87;FS=2.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:329,0,2623 -chr24 24459491 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.450;DP=77;FS=7.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:399,0,2193 -chr24 24463812 . G A 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.873;DP=111;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,35:111:99:927,0,2951 -chr24 24465879 . C G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.633;DP=113;FS=7.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,25:113:99:531,0,3344 -chr24 24490756 . A C 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.504;DP=98;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:1123,0,2297 -chr24 24503593 . C T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.061;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=12.25;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:812,0,1332 -chr24 24539906 . C CT 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.412;DP=78;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:540,0,1198 -chr24 24540017 . C G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-2.399;DP=110;FS=12.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=4.30;ReadPosRankSum=2.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:501,0,3408 -chr24 24540145 . CCA C 725.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.646;DP=101;FS=1.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:763,0,1678 -chr24 24544154 . GT G 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.717;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:683,0,202 -chr24 24627880 . A C 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=-0.654;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:617,0,631 -chr24 24636015 . T G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.144;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:362,0,2036 -chr24 24656139 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.404;DP=16;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=30.80;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:82:521,0,82 -chr24 24656434 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,431 -chr24 24656461 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.485;DP=21;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:237,0,494 -chr24 24658900 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.034;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:274,0,498 -chr24 24660707 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.603;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:414,0,720 -chr24 24668185 . TCTGAGGAAAAACAAAACAAAATTAAAACACAGAAGAGAGAAATGTAGAGATGCAGTAAACCTCTTAATCATTTTCTGCATGCATTTGTCCTTACTTAC T 1247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.350;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,30:32:99:1285,0,222 -chr24 24668416 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.029;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:310,0,449 -chr24 24710338 . CACCTGCAGGTAAAAAAATGGACTTGGCATTAATTTAGTTCTTCAAAATAACTGAACAAACATATAATTAAACACACTCACTA C 6706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.983;DP=192;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=34.93;ReadPosRankSum=-1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,164:168:99:6744,480,0 -chr24 24716601 . T C 3642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.663;DP=223;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,103:223:99:3671,0,3726 -chr24 24718725 . T G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=-5.707;DP=90;FS=9.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=7.75;ReadPosRankSum=-6.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,29:90:99:726,0,2298 -chr24 24719087 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.317;DP=170;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=2.47;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,30:170:99:448,0,5448 -chr24 24720714 . A C 1505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=1.529;DP=66;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=22.81;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,40:66:99:1534,0,1847 -chr24 24720715 . G A 1505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=1.531;DP=69;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=21.82;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,42:69:99:1534,0,1847 -chr24 24729629 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-2.690;DP=85;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:577,0,2830 -chr24 24733669 . A G 2591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-2.231;DP=117;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,76:117:99:2620,0,1401 -chr24 24734866 . G C 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.322;DP=119;FS=9.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,38:119:99:1024,0,3024 -chr24 24737676 . C T 1511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.993;DP=118;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,44:118:99:1540,0,2559 -chr24 24772443 . TAA T 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=1.408;DP=148;FS=2.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1751,0,1554 -chr24 24773019 . G A 3091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=-1.384;DP=537;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:396,140:536:99:3120,0,14887 -chr24 24783770 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:327,0,138 -chr24 24895745 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.902;DP=49;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:620,0,1176 -chr24 24896318 . G A 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.465;DP=76;FS=7.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1183,0,1396 -chr24 25069750 . C G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.648;DP=121;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,31:120:99:685,0,3325 -chr24 25071168 . C G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-0.844;DP=59;FS=1.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:418,0,1659 -chr24 25308656 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-1.527;DP=45;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:311,0,1258 -chr24 25310451 . GGA G 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=-1.619;DP=77;FS=8.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:795,0,1505 -chr24 25310812 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.232;DP=68;FS=3.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:456,0,1864 -chr24 25336855 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.645;DP=41;FS=7.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:320,0,2272 -chr24 25339374 . TGGTAGGTGAAGTCACTTTTAAAAATCGTATCTGATGTATATTGTCTTATTGCAGTATAATTATCTTTTGCA T 1094.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=2.308;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:99:1132,0,1086 -chr24 25340004 . C CT 532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:60:607,60,0 -chr24 25341400 . GTT G 787.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-1.019;DP=44;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:36:1048,0,36 -chr24 25341507 . CA C,CAA 1663.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-2.685;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:11,48,36:95:99:2105,643,973,1132,0,1604 -chr24 25342028 . G GGA 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=-2.740;DP=75;FS=18.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.90;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:730,0,1321 -chr24 25404903 . C A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=1.349;DP=63;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:681,0,1418 -chr24 25538870 . GAGGTACAGACACATTTCAACATACTATACACAATACCATGAATCGTGTGGTCCTCAACTGATATGACATATGTACATATATGTTA G 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=2.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:537,0,1639 -chr24 25548293 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.582;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:234,0,636 -chr24 25595678 . GT G 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.430;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:246,0,554 -chr24 25595710 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.120;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:250,0,1041 -chr24 25636184 . C CTGAGGCAGGTGTACTCAAG 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,23:23:99:544,0,2160 -chr24 25660814 . AGTGAGTAAACAAACAGTCATGTCCTTCTCATCTCAAAGCCTTTCATTCATTTGAGTATGATTGCAG A 3264.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=1.368;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=30.54;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:3302,251,0 -chr24 25841013 . TACAGGTGAGGAAAAAGTTTACGCATCAGTGGAATAAAATAGCTGATATTTTGTTTTATCTTTTTTCTTGTTCAGTTTTATTTAATTTTCACTCCAAAGTGTGCTGCTGTACTAA T 2539.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.164;DP=62;FS=3.874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:2577,211,0 -chr24 25845960 . TCTGAATAATATAAACATCAAAGAAAATAGTTTTAAAGGATTTCTGACAACACCACACACAATATGCTGTAAGCCGTCCACTCCAAAACATTTAC T 1911.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=2.282;DP=49;FS=2.204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=26.13;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,45:49:23:1949,23,0 -chr24 25976930 . ATT A,AT 214.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.331;DP=22;FS=2.430;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,10,6:20:99:422,107,305,219,0,791 -chr24 26209993 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.753;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:442,0,402 -chr24 26246988 . AAGGTGTGTAGCCGTGAATTTGAATACACAGCATGACTGAAACTGAACTCCTTTCTCATTATTGTCTAAATCTAACATC A 2990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=1.279;DP=82;FS=1.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,77:82:99:3028,263,0 -chr24 26431908 . A T 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.523;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=34.38;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:30:1197,0,30 -chr24 26436695 . A G 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.617;DP=48;FS=26.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=17.87;ReadPosRankSum=-2.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:886,0,678 -chr24 26446711 . T G 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.727;DP=37;FS=31.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1065,0,272 -chr24 26446802 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=2.527;DP=33;FS=28.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=7.45;ReadPosRankSum=-2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,870 -chr24 26739920 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:383,0,238 -chr24 26745939 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=1.302;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=24.93;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:452,0,104 -chr24 26783064 . CCA C 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.824;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:387,0,429 -chr24 26783165 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:238,0,151 -chr24 26783193 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,137 -chr24 26783234 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:273,0,53 -chr24 26783345 . A AT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:276,0,146 -chr24 26784773 . T G 289.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:318,0,19 -chr24 26784788 . G C 285.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:314,0,19 -chr24 26785135 . T C 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr24 26785230 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:85:304,0,85 -chr24 26825573 . A C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr24 26828564 . T C 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.069;DP=29;FS=8.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=22.51;ReadPosRankSum=-1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:681,0,361 -chr24 26828703 . T G 2228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=-1.609;DP=74;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=30.12;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,58:74:99:2257,0,285 -chr24 26846132 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.07;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,147 -chr24 26848684 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:353,0,162 -chr24 26850944 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.64;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,110 -chr24 26852165 . G GT 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=27.61;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:99:338,0,202 -chr24 26852198 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.922;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:338,0,202 -chr24 26852599 . C G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.09;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:281,0,49 -chr24 26853090 . A G 209.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:238,0,21 -chr24 26853163 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.08;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:269,0,93 -chr24 26853310 . T C 247.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:276,0,17 -chr24 27076444 . CA C 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=-1.640;DP=192;FS=0.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,73:181:99:1668,0,2305 -chr24 27173115 . TCCTGTTCACAAGCACCACAGTGAGAACCAGTCTAAGCTGCTGCCACAGATATTATTTGTGTTCTGTTTTAATCTAGAGAGGGAAAAAA T 1436.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=32.19;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1474,130,0 -chr24 27221003 . CAGGTTTGTCTATGCTCTGTAAACGGTGTCTGTTTTTAAGATCTGGGTTCATTATTAACTCTACTTACTAACTTTTT C 1108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=3.162;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=34.65;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1146,0,1104 -chr24 27236373 . A G 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.126;DP=31;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:600,0,483 -chr24 27236448 . A T 376.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.158;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=28.93;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:404,0,12 -chr24 27236673 . G A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.193;DP=38;FS=5.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:965,0,283 -chr24 27278898 . G GA 2104.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.648;ClippingRankSum=-1.593;DP=237;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,111:213:99:2224,0,2168 -chr24 27280579 . AACCTACAAAGAGAGACCGGCATAATAAACACCCACAATCTGACATTAAAACCTGCCATGCAAAAAACCCTATCCAAACATT A 2001.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.426;DP=419;FS=9.488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,404:407:99:2039,725,0 -chr24 27438879 . T A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr24 27547219 . TA T,TAA 419.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.413;DP=26;FS=3.358;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,8,12:21:99:501,338,533,193,0,244 -chr24 27560446 . G A 1588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=-2.031;DP=86;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=18.47;ReadPosRankSum=3.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,51:86:99:1617,0,1198 -chr24 27596651 . C A 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.120;DP=80;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1381,0,1414 -chr24 27608699 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.932;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:370,0,2238 -chr24 27608735 . G A 2428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-3.619;DP=72;FS=3.865;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=33.73;ReadPosRankSum=3.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,64:70:82:2457,82,0 -chr24 27807319 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.223;DP=53;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:407,0,1384 -chr24 27812667 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.196;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:471,0,2373 -chr24 27815705 . GT G 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=2.088;DP=46;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:450,0,271 -chr24 27819543 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-1.127;DP=95;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:414,0,2917 -chr24 27841183 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.816;DP=117;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:99:494,0,5620 -chr24 27878993 . AAGGTATACTGCTGCAAAAGTGACATCACATTTTTGACTGTTGCAGTTTCAGATATTGTGTTGTCGCATAATATTTTTGGTTTGATTAT A 2155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=1.630;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,51:75:99:2193,0,8126 -chr24 27891114 . AT A 1164.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1202,118,0 -chr24 28052934 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=-0.442;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:408,0,1721 -chr24 28063397 . A G 1670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.978;DP=55;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=30.38;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1699,0,228 -chr24 28065170 . T A 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=1.288;DP=51;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1483,0,215 -chr24 28066631 . T C 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=1.162;DP=52;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=27.09;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1437,0,315 -chr24 28068645 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-2.033;DP=50;FS=13.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:292,0,1463 -chr24 28070994 . T C 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.217;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:698,0,824 -chr24 28093378 . C CA 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.062;DP=46;FS=2.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:452,0,588 -chr24 28109256 . TCTGTAGAGGAAAATAAACATAAGAACATGCCAAAACCGCTGGGAGATCTTTATTTTTTAATTCGTTTTTAC T 7904.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=2.856;DP=185;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,181:185:99:7942,652,0 -chr24 28114763 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-1.723;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:247,0,757 -chr24 28115718 . C CT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.858;DP=58;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=3.62;ReadPosRankSum=-2.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,3:50:99:247,0,5197 -chr24 30360913 . T G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr24 30524086 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.408;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:369,0,1453 -chr24 30524087 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.408;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:369,0,1518 -chr24 30524434 . A G 1069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1098,78,0 -chr24 30524549 . A G 366.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=33.36;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:395,0,13 -chr24 30578878 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=2.437;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:563,0,436 -chr24 30599607 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=1.305;DP=36;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:309,0,930 -chr24 30600070 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-1.187;DP=32;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:406,0,857 -chr24 31139047 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 -chr24 31140274 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.832;DP=104;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:388,0,4029 -chr24 31147037 . GCTGAAACAAAGAGAGGTGAAGTCAGAGACGCATCAAGCATGGGTGGATCATTGTGCGTTTGACCTCAATCTTAC G 5963.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=134;FS=4.418;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=31.52;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:6001,523,0 -chr24 31165371 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=1.614;DP=91;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:272,0,2826 -chr24 31198439 . CTT C,CT 1786.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.436;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,63,18:82:99:2718,359,197,1883,0,1701 -chr24 31203996 . T A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=-1.938;DP=185;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,37:185:99:587,0,5541 -chr24 31204028 . GCTGCTGAGGGAGAAAAGCATCCAAAATATTACCGAAATACAAGTTTGGTGCTATTTGTGCTCCATAATTTCCAGGTATATGATTTGGCTTAC G 1518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=-0.654;DP=209;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,56:196:99:1556,0,8535 -chr24 31204031 . GCTGAGGGAGAAAAGCATCCAAAATATTACCGAAATACAAGTTTGGTGCTATTTGTGCTCCATAATTTCCAGGTATATGATTTGGCTTAC G 5289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=-3.299;DP=204;FS=1.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=25.93;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,131:193:99:5327,0,3924 -chr24 31225276 . GGTAAAA G 1089.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=2.232;DP=85;FS=17.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:99:1127,0,2286 -chr24 31225487 . AAGGTGAGCTTCTGACACTTCTAAAATCTAAAATAATGCTATGTAGTTGATCTTTTTAATAGTTCGTTTGTATTTTTGGTGATC A 4740.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.672;DP=99;FS=3.100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:4778,402,0 -chr24 31252024 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.853;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:271,0,485 -chr24 31252156 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-0.148;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:250,0,796 -chr24 31252355 . AT A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.634;DP=22;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:348,0,157 -chr24 31252414 . A C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:377,0,607 -chr24 31263745 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-1.067;DP=33;FS=7.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:548,0,617 -chr24 31344392 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.58;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:314,0,143 -chr24 31404694 . T A 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=-0.779;DP=50;FS=8.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=21.64;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1110,0,701 -chr24 31428116 . A G 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=1.304;DP=44;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:1262,0,289 -chr24 31432353 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-2.011;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:327,0,230 -chr24 31435957 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:262,0,344 -chr24 31437257 . GAA G 331.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:13:358,13,0 -chr24 31449569 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:470,0,124 -chr24 31678947 . AT A 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=-0.792;DP=34;FS=4.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:411,0,437 -chr24 31685431 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-2.387;DP=78;FS=5.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,45:78:99:1453,0,1104 -chr24 31695881 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:239,0,59 -chr24 31699524 . A AG 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.255;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=27.85;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:35:455,0,35 -chr24 31700726 . G GTA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.101;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:238,0,197 -chr24 31703426 . CGTGAGTAAAAGCTGCATTCGCCATTTGTCAGTCTGTGTGTCAGTCGTCGGTGAGCCGCCTCATTTTTCTGTCATGTTTTGAAG C 6627.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.733;DP=156;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=28.40;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:6665,572,0 -chr24 31705946 . TA T 238.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:276,28,0 -chr24 31706002 . T A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=-1.637;DP=23;FS=5.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=24.42;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:590,0,171 -chr24 31706759 . AT A 574.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.648;DP=33;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,27:31:22:737,22,0 -chr24 32799078 . C A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=1.531;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=21.85;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:356,0,175 -chr24 32799504 . T G 284.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:313,0,19 -chr24 32803145 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=-0.838;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.274;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:269,0,967 -chr24 32803232 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.929;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:395,0,779 -chr24 32803247 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-3.366;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:410,0,934 -chr24 32871425 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.848;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:263,0,1103 -chr24 32875008 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.131;DP=46;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:376,0,1239 -chr24 33109359 . GCCTGCAGATCATTAAAACAACACACTCTGAAAGAGACAGACAAAATATATGTTCTTTATACAGGAGTCTAGTGTACTCA G 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=2.307;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:504,0,6958 -chr24 33153406 . TA T 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:477,0,1092 -chr24 33153703 . T C 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=-0.697;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,35:153:99:714,0,6215 -chr24 33154568 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=2.533;DP=54;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:498,0,1410 -chr24 33155057 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.603;DP=53;FS=7.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:280,0,1676 -chr24 33155205 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.672;DP=54;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=4.31;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:261,0,2183 -chr24 33155409 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.830;DP=49;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:560,0,1148 -chr24 33155745 . C CT 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.233;DP=26;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:260,0,2156 -chr24 33155904 . T TA 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-0.852;DP=32;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:641,0,320 -chr24 33230710 . C A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.341;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,35:141:99:796,0,4011 -chr24 33279176 . ACTGCAAAGACTCAAGAATTAAATCAGGACCCCCAAAAGTGTTTACTTTAAAGCCAAAGTTCTTCTTTCCTAC A 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-1.246;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=21.80;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:386,0,294 -chr24 33322422 . TCTACAAGAGAACGGAAGAAGGGTTTAAAATCAAAACAAAACCTACCAAATGACTGCAGGGGCAGGAAAGCTCCTCAC T 254.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:33:292,33,0 -chr24 33381955 . T C 7574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-4.277;DP=286;FS=0.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=26.49;ReadPosRankSum=3.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,208:286:99:7603,0,1756 -chr24 33395909 . T A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-1.115;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:416,0,412 -chr24 33723570 . ACC A 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.552;DP=29;FS=19.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:275,0,426 -chr24 33723679 . G GC 10119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.570;DP=495;FS=2.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=20.44;ReadPosRankSum=-1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,376:459:99:10157,0,507 -chr24 33741518 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr24 33753741 . C T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr24 33852522 . C T 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.670;DP=88;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,64:88:99:2512,0,609 -chr24 33852681 . A C 3952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=1.206;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,120:227:99:3981,0,3818 -chr24 33852958 . T C 2819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.788;DP=126;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=22.38;ReadPosRankSum=-2.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,82:122:99:2848,0,791 -chr24 33854504 . A T 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.346;DP=110;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,32:110:99:833,0,3838 -chr24 33855360 . G GA 1045.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:77:1083,77,0 -chr24 33855627 . G A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.494;DP=248;FS=6.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,54:248:99:983,0,7282 -chr24 33855660 . T C 3197.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=-1.271;DP=288;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,99:288:99:3226,0,6493 -chr24 33864088 . GCTAAAGTTGAAAGTAAAACAAGCATTAATATTTCATTTTCAAAAGAAACTCTCTGGCGTCTCCATTGTGTCAGTACTGGGAGCGATTCAGAC G 8171.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=1.505;DP=333;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,214:288:99:8209,0,2973 -chr24 33864090 . TAAAGTTGAAAGTAAAACAAGCATTAATATTTCATTTTCAAAAGAAACTCTCTGG T 1691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-1.051;DP=313;FS=0.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,71:287:99:1729,0,10058 -chr24 33864146 . GTCTCCATTGTGTCAGTACTGGGAGCGATTCAGACCTCA G 1697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.953;DP=334;FS=0.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,77:308:99:1735,0,10058 -chr24 34532844 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-2.014;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=27.30;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:71:547,0,71 -chr24 34568827 . T C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:24:346,24,0 -chr24 34568961 . G A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.861;DP=49;FS=2.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:596,0,1019 -chr24 34662013 . TA T 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=-0.913;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:389,0,263 -chr24 34662330 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.28;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:85:261,0,85 -chr24 34714578 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:417,0,259 -chr24 34716482 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr24 34716509 . T C 239.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 -chr24 34928906 . C A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr24 34959960 . A C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.416;DP=47;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=12.44;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:613,0,991 -chr24 34960441 . CA C 882.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-0.630;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,49:84:99:954,0,536 -chr24 34960860 . G T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.834;DP=249;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.389;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,44:249:99:625,0,9134 -chr24 34965414 . A G 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.486;DP=276;FS=2.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,54:276:99:936,0,8424 -chr24 34965686 . G A 932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.364;DP=291;FS=5.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,60:291:99:961,0,8891 -chr24 35028675 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.534;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:338,0,1399 -chr24 35099594 . A G 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.428;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=28.12;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:1031,0,212 -chr24 35099739 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=2.355;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:230,0,430 -chr24 35099772 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:238,0,389 -chr24 35100292 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.398;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:239,0,734 -chr24 35185676 . A C 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr24 35413026 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.205;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:356,0,481 -chr24 35414163 . G A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:421,36,0 -chr24 35414936 . A G 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:559,39,0 -chr24 35414980 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.683;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:300,0,287 -chr24 35415047 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr24 35415049 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr24 35415592 . CA C 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.156;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:50:295,0,50 -chr24 35416208 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=29.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:99:278,0,234 -chr24 35417072 . A T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-2.751;DP=25;FS=2.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:792,0,298 -chr24 35417079 . A T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-2.608;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:792,0,288 -chr24 35418745 . C A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.411;DP=41;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:478,0,971 -chr24 35419122 . AT A 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.869;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:311,0,266 -chr24 35832569 . A AT 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.087;DP=77;FS=2.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:308,0,1072 -chr24 35875486 . G C 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr24 36010811 . A C 4121.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.271;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=34.64;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,108:119:85:4150,85,0 -chr24 36017104 . T C 4537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.827;DP=265;FS=9.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=17.12;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,139:264:99:4566,0,4461 -chr24 36017227 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=2.080;DP=150;FS=16.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.25;ReadPosRankSum=2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,37:150:99:815,0,4317 -chr24 36022135 . G A 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.417;DP=155;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=9.09;ReadPosRankSum=4.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,51:155:99:1437,0,3930 -chr24 36022231 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=3.431;DP=143;FS=31.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=1.49;ReadPosRankSum=-2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,22:142:99:242,0,4592 -chr24 36071197 . G A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.500;DP=168;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=5.93;ReadPosRankSum=2.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,44:168:99:1024,0,4691 -chr24 36102434 . C CAA 230.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr24 36102607 . ATT A 209.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr24 36162574 . A G 1404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1433,102,0 -chr24 36168666 . G A 1692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1721,120,0 -chr24 36168819 . C T 1034.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1063,75,0 -chr24 36477290 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=1.000;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:886,0,1747 -chr24 36498967 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.785;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:731,0,1955 -chr24 36498977 . T C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.311;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:686,0,2014 -chr24 36657102 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.643;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:1503,0,2448 -chr24 36657116 . C G 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-1.480;DP=102;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.45;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,35:102:99:1094,0,2128 -chr24 36657438 . T A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.099;DP=36;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:456,0,833 -chr24 36658031 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.696;DP=78;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:708,0,2045 -chr24 36658094 . C T 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.396;DP=74;FS=9.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1254,0,1309 -chr24 36658273 . T A 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.854;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1828,0,1825 -chr24 36658389 . T A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.632;DP=48;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:660,0,1034 -chr24 36711682 . C A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.881;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:617,0,1133 -chr24 36885704 . C A 2313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-1.697;DP=162;FS=5.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,67:162:99:2342,0,3133 -chr24 36887356 . A G 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-1.620;DP=97;FS=6.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1715,0,4009 -chr24 36887441 . A C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:373,0,692 -chr24 36887641 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=1.944;DP=50;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:246,0,1537 -chr24 37018358 . G GTA 4775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.972;DP=228;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=20.95;ReadPosRankSum=2.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,48:211:99:4813,0,4971 -chr24 37018422 . T A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=1.004;DP=237;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=2.69;ReadPosRankSum=2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,59:236:99:665,0,13957 -chr24 37053758 . C A 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.289;DP=148;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,54:148:99:1857,0,2811 -chr24 37118756 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.444;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:259,0,433 -chr24 37175577 . GT G 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.534;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:394,0,445 -chr24 37175708 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.076;DP=93;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:556,0,2725 -chr24 37177777 . T C 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.571;DP=90;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:659,0,2974 -chr24 37216975 . C T 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.144;DP=75;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:1098,0,1364 -chr24 37232314 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-0.946;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:453,0,1326 -chr24 37524882 . G GA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:254,0,238 -chr24 37525726 . G GT 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.838;DP=94;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:342,0,1426 -chr24 37750400 . G GA 804.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.807;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.41;ReadPosRankSum=2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:1:839,1,0 -chr24 37750456 . AAAT A 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:366,0,113 -chr24 37801155 . A T 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr24 37895774 . TCCCCCC T 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=1.813;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:272,0,249 -chr24 37895864 . A G 4379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=-3.057;DP=256;FS=6.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,126:256:99:4408,0,4304 -chr24 37922670 . TGGTATGAAGACAACAATACAGTTTACATTTGATTTCAAGCACAGATCATCAGCTAGCCGTGTTTAATTGTGCCTTTTTCTCCA T 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:597,0,410 -chr24 38016474 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr24 38137609 . T C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 -chr24 38138575 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr24 38138595 . C G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:259,18,0 -chr24 38214318 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.533;DP=24;FS=11.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:371,0,406 -chr24 38216633 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.154;DP=136;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:609,0,850 -chr24 38216765 . A G 360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:389,30,0 -chr24 38217441 . A AC 437.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 -chr24 38301327 . A T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:277,0,58 -chr24 38312177 . C T 727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:756,51,0 -chr24 38312432 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr24 38313501 . T A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.217;DP=40;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:720,0,707 -chr24 38314002 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:423,0,1030 -chr24 38315341 . A G 445.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=34.30;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:2:472,2,0 -chr24 38364588 . C G 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.365;DP=91;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:1182,0,1958 -chr24 38364600 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.445;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1055,0,1891 -chr24 38375619 . T C 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=1.765;DP=70;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=21.97;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:1566,0,852 -chr24 38378654 . A AC 1057.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.226;DP=40;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:1095,0,370 -chr24 38379070 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr24 38379213 . T G 1453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-1.102;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,38:50:99:1482,0,281 -chr24 38379491 . GA G 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=1.751;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=20.09;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:680,0,248 -chr24 38379835 . T G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr24 38380010 . T A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr24 38380229 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:395,0,690 -chr24 38381458 . A G 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 -chr24 38382083 . A T 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 -chr24 38382089 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 -chr24 38382404 . T A 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.967;DP=50;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:817,0,993 -chr24 38382439 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-0.462;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:391,0,448 -chr24 38466835 . G T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr24 38466907 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.361;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:78:458,0,78 -chr24 38563214 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr24 38716641 . T C 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.475;DP=69;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,32:69:99:1084,0,1219 -chr24 38770783 . TGC T 5417.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:5455,478,0 -chr24 38789701 . A G 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=1.180;DP=33;FS=4.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:74:1068,0,74 -chr24 38789947 . G T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.818;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:376,0,699 -chr24 38807909 . A G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=1.217;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:621,0,641 -chr24 38815073 . T A 370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:31:408,31,0 -chr24 38853908 . A T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.526;DP=50;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:942,0,843 -chr24 38857208 . A T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-0.372;DP=69;FS=2.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:920,0,1293 -chr24 38860820 . A C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.623;DP=42;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:818,0,671 -chr24 38888222 . C T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.549;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:828,0,273 -chr24 38889420 . AG A 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:268,0,126 -chr24 38923929 . T A 3860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.945;DP=204;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,117:204:99:3889,0,3110 -chr24 38923971 . G A 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.353;DP=194;FS=12.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,102:194:99:3315,0,3340 -chr24 38924145 . G C 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-0.208;DP=128;FS=35.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=5.42;ReadPosRankSum=-3.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,32:127:99:722,0,3711 -chr24 38935164 . T C 2699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.220;DP=197;FS=6.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,110:182:99:2728,0,2471 -chr24 38941043 . A T 3453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=3.566;DP=218;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=15.84;ReadPosRankSum=4.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,95:211:99:3482,0,3919 -chr24 38941213 . T C 9720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:231:99:9749,695,0 -chr24 38942244 . CTAGTTTTTAACAGTGGATGGCGCTCTAGAA C 363.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:58:401,58,0 -chr24 38943048 . A T 2843.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2872,202,0 -chr24 38943277 . T C 783.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:52:812,52,0 -chr24 38944155 . C A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=4.697;DP=92;FS=23.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,28:92:99:746,0,7736 -chr24 38944156 . T A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=4.722;DP=92;FS=23.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,28:92:99:746,0,7736 -chr24 38944649 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:448,0,426 -chr24 38945096 . G C 655.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:48:684,48,0 -chr24 38945562 . AAT A 1327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=1.094;DP=42;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,1:38:99:1365,0,1404 -chr24 38945583 . T TA 2684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=1.141;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=29.51;ReadPosRankSum=-2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:99:2722,209,0 -chr24 38946053 . T C 436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:465,33,0 -chr24 38946656 . T C 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:621,42,0 -chr24 38946709 . A C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr24 38946745 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr24 38948126 . A T 3179.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-2.658;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,95:160:99:3208,0,2318 -chr24 38963805 . C A 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr24 38964177 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr24 38997413 . C A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:79:421,0,79 -chr24 38998250 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:277,0,450 -chr24 39009574 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-2.018;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:83:501,0,83 -chr24 39034626 . C A 1282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1311,96,0 -chr24 39058234 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=1.776;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:422,0,546 -chr24 39072555 . A T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.444;DP=35;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:945,0,322 -chr24 39073233 . T C 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.207;DP=21;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=26.75;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:590,0,164 -chr24 39108148 . ACAGGTACAGCACCGATGCTTGTTGATGACTTTTATTTCATATGTGAGGGTCAAAATTGTGTCTGTGTGTTT A 750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=27.75;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:61:788,61,0 -chr24 39113617 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:43:271,0,43 -chr24 39118176 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=1.902;DP=18;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=20.82;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:403,0,237 -chr24 39128570 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:270,0,57 -chr24 39132534 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:297,0,52 -chr24 39134546 . G C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,101 -chr24 39174137 . G T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-2.268;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=29.57;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:1004,0,167 -chr24 39180584 . T A 386.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=29.75;ReadPosRankSum=-2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:26:415,0,26 -chr24 39182852 . C G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:398,0,160 -chr24 39182897 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.857;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:685,0,101 -chr24 39190878 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.270;DP=30;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:548,0,498 -chr24 39191818 . C T 15321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.074;DP=820;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.133;QD=18.69;ReadPosRankSum=3.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:388,430:818:99:15350,0,31757 -chr24 39193702 . C A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.07;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:315,0,91 -chr24 39194711 . G A 251.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:280,0,20 -chr24 39194809 . GTA G 215.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr24 39394185 . A AGGATCTGTATAAGCG 915.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:953,66,0 -chr24 39445514 . T TTA 880.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:918,60,0 -chr24 39445544 . GA G 269.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=16;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:9:306,9,0 -chr24 39445982 . T G 1935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.403;DP=88;FS=5.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,56:88:99:1964,0,1137 -chr24 39446165 . T A 1732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.295;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=23.10;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,49:75:99:1761,0,910 -chr24 39446356 . T TA 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-1.551;DP=28;FS=6.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:526,0,585 -chr24 39446391 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=-1.886;DP=59;FS=5.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:991,0,939 -chr24 39446561 . T G 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.527;DP=100;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1793,0,1716 -chr24 39602528 . CCCTGCAAGACAAAACCAAACTCAACCTCAGAAAATATACAATCCATAAACACAGAAATATTAATAAAATATA C 4512.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.632;ClippingRankSum=-0.223;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=20.81;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,98:103:99:4550,364,0 -chr24 39797688 . G A 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:241,0,25 -chr24 39798473 . G A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr24 39798533 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:233,0,476 -chr24 39799927 . C G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=-1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=21.41;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:328,0,179 -chr24 39805556 . A C 11623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.062;DP=616;FS=0.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=18.87;ReadPosRankSum=2.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,359:615:99:11652,0,9005 -chr24 39858338 . G T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr24 39862331 . G A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.670;DP=50;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:833,0,864 -chr24 39878029 . A T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-1.010;DP=53;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=25.54;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,37:52:99:1382,0,369 -chr24 39878042 . AACCTATCAAATCAAATCAAACAGCAGCAATCACAACCAAACCATTATCCGACAATTCCACAGCGTTTCAAATCGGGCATCTGCTCAAATATGCACTGT A 1719.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.139;DP=53;FS=3.372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=32.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1757,139,0 -chr24 39890624 . A AT 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.011;DP=50;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:385,0,1115 -chr24 40064232 . G C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-1.838;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,390 -chr24 40064345 . A T 1955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=-0.828;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:1984,108,0 -chr24 40064410 . C T 2216.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:2245,160,0 -chr24 40064539 . C T 692.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:16:721,16,0 -chr24 40064698 . T C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-1.212;DP=19;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:481,0,204 -chr24 40064723 . A T 280.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:309,0,19 -chr24 40065241 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:236,0,586 -chr24 40065916 . GAC G 910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=1.536;DP=28;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:59:948,0,59 -chr24 40066330 . T G 1215.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:83:1244,83,0 -chr24 40066336 . A G 1215.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:83:1244,83,0 -chr24 40066447 . A T 1215.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:83:1244,83,0 -chr24 40066530 . T C 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.925;DP=13;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=33.53;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:32:726,0,32 -chr24 40066721 . T C 3717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.740;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.56;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,9:12:99:3746,225,0 -chr24 40066842 . T C 3723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-1.217;DP=102;FS=7.986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=20.36;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:3752,231,0 -chr24 40066968 . G C 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=-0.557;DP=62;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:1252,0,2643 -chr24 40067035 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=1.372;DP=73;FS=9.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:488,0,5331 -chr24 40067037 . A C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=1.103;DP=74;FS=11.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:485,0,5331 -chr24 40067347 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=13;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:260,0,97 -chr24 40131911 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.452;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:285,0,531 -chr24 40328306 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=21.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:330,0,154 -chr24 40328795 . CT C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.833;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:250,0,527 -chr24 40329652 . G A 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.587;DP=75;FS=7.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:1258,0,1093 -chr24 40330192 . G GCT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-1.155;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:276,0,849 -chr24 40403272 . A C 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:801,54,0 -chr24 40403276 . T A 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:801,54,0 -chr24 40413954 . A C 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-3.501;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:83:1142,0,83 -chr24 40414009 . T C 1400.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.219;DP=67;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:12:1428,0,12 -chr24 40414053 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=-1.203;DP=19;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=15.72;ReadPosRankSum=-3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,302 -chr24 40514473 . G C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.567;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:69:463,0,69 -chr24 40523852 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,322 -chr24 40534747 . C G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:245,0,323 -chr24 40535293 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:313,0,164 -chr24 40607402 . C G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=0.769;DP=23;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:424,0,387 -chr24 40613915 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,160 -chr24 40644779 . G C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-3.191;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:318,0,343 -chr24 40645848 . C G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-3.213;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:325,0,364 -chr24 40655582 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.042;DP=48;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:897,0,764 -chr24 40666178 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-0.836;DP=35;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:456,0,1664 -chr24 40666726 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,261 -chr24 40678478 . C A 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.252;DP=36;FS=5.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=22.08;ReadPosRankSum=1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:823,0,766 -chr24 40681164 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:365,0,51 -chr24 40684585 . C T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=2.414;DP=61;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1060,0,836 -chr24 40689608 . T C 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.117;DP=36;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=23.13;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:861,0,415 -chr24 40726689 . T C 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.318;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:541,0,385 -chr24 40727205 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,206 -chr24 40727206 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,206 -chr24 40727299 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,174 -chr24 40727799 . A C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=2.017;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:832,0,103 -chr24 40728570 . GT G 337.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:11:374,11,0 -chr24 40728950 . A G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:87:427,0,87 -chr24 40729835 . A T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr24 40730308 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=1.102;DP=19;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:326,0,379 -chr24 40730772 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.506;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,450 -chr24 40750913 . C G 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=3.475;DP=111;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=14.02;ReadPosRankSum=-2.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:1585,0,4142 -chr24 40751507 . T C 4491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=1.160;DP=145;FS=27.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,114:145:99:4520,0,651 -chr24 40775658 . G A 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-1.280;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1111,0,1246 -chr24 40776085 . G A 2035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.184;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:2064,0,1649 -chr24 40781021 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.987;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:603,0,204 -chr24 40783581 . GGTC G 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-1.588;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,320 -chr24 40849537 . T G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.490;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:561,0,936 -chr24 40934289 . A T 2036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.550;DP=93;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=21.90;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,60:93:99:2065,0,1122 -chr24 40936983 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=27.20;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:92:409,0,92 -chr24 40939623 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,134 -chr24 40940123 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:259,0,256 -chr24 40940173 . C G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.251;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=22.87;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,201 -chr24 40958603 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=2.154;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=19.09;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:410,0,778 -chr24 40958981 . A AAT 1416.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:97:1454,97,0 -chr24 41107242 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=25.23;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:331,0,530 -chr24 41107265 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:421,0,379 -chr24 41129312 . CGGTGGACATTCATTTACAGCACTTCTGCCACAATCATGTGTATAATTGATGCATGAATAAGATGAAGGGACACAATATCATGTATGTCTGCATGTTTTTAA C 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=1.362;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:98:1248,98,0 -chr24 41138286 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr24 41188645 . C CTG 769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.127;DP=29;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:807,0,164 -chr24 41212018 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.604;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:298,0,376 -chr24 41212722 . C CA 221.43 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:68:362,0,68 -chr24 41224352 . GAGGTTTGTCGGTAGACTGTGCATATACGCCATTGCAAAGAGATTTATTATAAAATAAAGGTTTTATGCAAATATAAGGTTGTCTGTTTCTTCTTTTTAT G 432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=29.16;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:99:470,0,3474 -chr24 41224571 . A T 2337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=5.865;DP=294;FS=9.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.508;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,96:294:99:2366,0,7144 -chr24 41236294 . G A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.546;ClippingRankSum=0.350;DP=114;FS=3.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,34:114:99:922,0,2957 -chr24 41240431 . C T 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr24 41307981 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:303,0,54 -chr24 41360504 . C T 277.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.89;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:306,0,13 -chr24 41364146 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.129;DP=213;FS=1.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=1.25;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,32:213:99:295,0,6762 -chr24 41366068 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=1.724;DP=182;FS=0.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,32:182:99:415,0,5704 -chr24 41431510 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.442;DP=120;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:381,0,3881 -chr24 41526380 . T C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr24 41690568 . A C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:242,0,61 -chr24 41712821 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:345,0,122 -chr24 41712914 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:279,0,63 -chr24 41720487 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:284,0,221 -chr24 41740391 . A T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=1.709;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:315,0,214 -chr24 42050494 . C T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr24 42195931 . G A 1319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.246;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,38:46:89:1348,0,89 -chr24 42230050 . T A 214.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:243,0,23 -chr24 42232384 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-1.783;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:684,0,519 -chr24 42232850 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.282;DP=22;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=25.67;ReadPosRankSum=-1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:593,0,186 -chr24 42233324 . A C 282.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.43;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:311,0,18 -chr24 42235009 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.496;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:277,0,1045 -chr24 42235365 . A T 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:690,48,0 -chr24 42241361 . CCTCCTGAAAAACACAGGGACAAACAAAACATCATGAGGAAATCATG C 8434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-7.421;DP=304;FS=21.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=27.75;ReadPosRankSum=2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,216:290:99:8472,0,2601 -chr24 42241363 . TCCTGAAAAACACAGGGACAAACAAAACATCATGAGGAAATCATGTTTCAAATGCAATGCTTTAATGTCTGAGTCCTATCGTTTACTTA T 1298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=-0.143;DP=297;FS=23.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,64:284:99:1336,0,9645 -chr24 42241409 . TTCAAATGCAATGCTTTAATGTCTGAGTCCTATCGTTTACTTA T 8434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-3.777;DP=292;FS=24.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=28.89;ReadPosRankSum=-2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,216:283:99:8472,0,1863 -chr24 42241747 . CACCTAACGAAACAAAATTAAATGATGTGAACTACTCTTTAATCTTTGCAAAATGTGTGAAGAGAAAATGCCTGATTTTCAGTAGCTT C 15980.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.598;DP=448;FS=2.843;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,391:393:99:16018,1192,0 -chr24 42242815 . CCCTTTAAGTATGAAGGAAAGCATTTTAAGTCATTAGTCTTAAATTAATCTAATGTAAATAACATAATAGGAAATGATCATTCACGGTTA C 16189.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.624;DP=365;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,349:350:99:16227,1433,0 -chr24 42244005 . A G 3308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=9.106;DP=361;FS=100.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=9.17;ReadPosRankSum=-6.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,120:361:99:3337,0,9349 -chr24 42244628 . G T 6171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.324;DP=193;FS=5.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,156:193:99:6200,0,607 -chr24 42246087 . C T 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-2.688;DP=257;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=4.28;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,55:257:99:1129,0,7950 -chr24 42246720 . C T 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=-3.288;DP=55;FS=45.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=16.45;ReadPosRankSum=3.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:933,0,1003 -chr24 42247548 . C T 8224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=6.222;DP=350;FS=12.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=23.50;ReadPosRankSum=-4.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,232:350:99:8253,0,4073 -chr24 42247593 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=5.339;DP=74;FS=26.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:794,0,3817 -chr24 42267000 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.412;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:314,0,2939 -chr24 42267108 . A T 3590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3619,265,0 -chr24 42267114 . C A 3530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:3559,262,0 -chr24 42270533 . C T 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.335;DP=77;FS=31.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=14.63;ReadPosRankSum=-4.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:1155,0,1466 -chr24 42270784 . A G 215.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:22:244,22,0 -chr24 42271629 . G A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.358;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:871,0,977 -chr24 42271692 . C T 4451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.051;ClippingRankSum=-8.309;DP=254;FS=5.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=17.53;ReadPosRankSum=7.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,123:254:99:4480,0,4018 -chr24 42304780 . G A 3156.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3185,214,0 -chr24 42304783 . G A 3156.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:3185,214,0 -chr24 42305994 . C G 229.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:258,0,22 -chr24 42321052 . A G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:739,54,0 -chr24 42321085 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-3.230;DP=20;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=27.94;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:587,0,107 -chr24 42349963 . G T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-2.494;DP=28;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=26.56;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:772,0,170 -chr24 42376882 . A G 582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:611,45,0 -chr24 42379592 . G C 276.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:305,24,0 -chr24 42380125 . T C 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:309,21,0 -chr24 42380130 . G A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr24 42380283 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr24 42381294 . G C 765.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.042;DP=25;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=30.61;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:10:793,0,10 -chr24 42386963 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr24 42428781 . T G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr24 42461277 . A G 2116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2145,154,0 -chr24 42461310 . G A 1814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1843,126,0 -chr24 42505238 . CCTCCTGAACAACACAAGG C 3107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-1.722;DP=92;FS=2.611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3145,231,0 -chr24 42505258 . TATTGACAAAAACAGTATGCAAAATAGAATATATAGTGCATGGATGTGCCAGAAAAGCACTCA T 3107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.747;DP=92;FS=2.611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=33.78;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3145,231,0 -chr24 42505532 . A G 3532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3561,241,0 -chr24 42505534 . T C 3532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3561,241,0 -chr24 42509706 . G T 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.351;DP=25;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=32.31;ReadPosRankSum=2.053 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:30:836,30,0 -chr24 42530400 . A T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=28.37;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:94:397,0,94 -chr24 42531447 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:274,0,120 -chr24 42531545 . C G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,105 -chr24 42531618 . C G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:338,0,164 -chr24 42532963 . G T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-1.440;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=27.13;ReadPosRankSum=-3.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:598,0,154 -chr24 42537103 . G T 363.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=33.00;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:391,0,12 -chr24 42540533 . G C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.826;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:488,0,35 -chr24 42618626 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:348,0,90 -chr24 42618679 . C G 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-0.211;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=23.94;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:555,0,199 -chr24 42623097 . G C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.896;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,299 -chr24 42623104 . ACTACACACAGACACACAAACATTAATCCTGATACATCATCTATGATCATCATATTCAGACTGTGCTCAC AACACACAGACACACAAACATTAATCCTGATACATCATCTATGATCATCATATTCAGACTGTGCTCAC,A 429.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,4:11:99:513,203,299,338,0,547 -chr24 42623107 . ACACACAGACACACAAACATTAATCCTGATACATCATCTATGATCATCATATTCAGACTGTGCTCACG A 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.246;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,299 -chr24 42623813 . A C 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=-0.085;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:569,0,324 -chr24 42639382 . A G 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr24 42864855 . AAC A 350.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:388,36,0 -chr24 43484128 . G A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.652;DP=80;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=20.57;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,49:79:99:1674,0,993 -chr24 43507002 . T C 1561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.034;DP=81;FS=6.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,48:81:99:1590,0,1165 -chr24 43508003 . G A 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-1.124;DP=98;FS=6.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1911,0,2337 -chr24 43525775 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=2.813;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=13.62;ReadPosRankSum=-2.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:682,0,955 -chr24 43546130 . C T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=-0.226;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:554,0,347 -chr24 43551803 . TA T 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.870;DP=42;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:453,0,451 -chr24 43551844 . TA T 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.298;DP=30;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:477,0,1259 -chr24 43551853 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=1.750;DP=33;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=13.60;ReadPosRankSum=-1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:477,0,1259 -chr24 43552118 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-1.125;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:783,0,830 -chr24 43563441 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.889;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=15.96;ReadPosRankSum=2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:475,0,534 -chr24 43604028 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-1.753;DP=21;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:495,0,233 -chr24 43617113 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.427;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:277,0,811 -chr24 43620180 . C T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.048;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:837,0,448 -chr24 43671163 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-1.670;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:238,0,223 -chr24 43680312 . C T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr24 43688608 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:240,0,226 -chr24 43762975 . T A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-1.447;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:504,0,209 -chr24 43763869 . TATACAC T 496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:534,45,0 -chr24 43764024 . G A 1486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.769;DP=52;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:1515,0,1042 -chr24 43774276 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=1.055;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:425,0,212 -chr24 43808942 . G A 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-1.510;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1207,0,727 -chr24 43809874 . A T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.041;DP=34;FS=14.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:674,0,527 -chr24 43811193 . C G 2068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.532;DP=78;FS=5.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,58:78:99:2097,0,504 -chr24 43828452 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:384,0,383 -chr24 43829675 . G T 1098.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1127,81,0 -chr24 43837112 . T G 2710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=-0.701;DP=151;FS=4.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=17.95;ReadPosRankSum=2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:2739,0,2243 -chr24 43837184 . C A 5278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.218;DP=292;FS=5.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,163:291:99:5307,0,4451 -chr24 43838338 . G T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr24 43838339 . T G 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:295,21,0 -chr24 43848320 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.574;DP=29;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:513,0,506 -chr24 43848753 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.752;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:616,0,1153 -chr24 43858649 . G T 7992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=2.178;DP=609;FS=26.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=13.12;ReadPosRankSum=-9.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,241:608:99:8021,0,11755 -chr24 43862465 . G A 282.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:10:310,0,10 -chr24 43868146 . T A 204.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:11:232,11,0 -chr24 43875433 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.181;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:410,0,269 -chr24 43890371 . TGGTGAGCGACCCACTGATCCCTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTTTGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTAATGCCTCTGTGTTCTTCA T 3276.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=2.393;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=32.64;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,84:86:99:3314,297,0 -chr24 43907428 . CGGTCAGACACACACACACACACACACACACACACACGCTCCCTTATGGATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCA C 7131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=3.370;DP=220;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=32.42;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,202:220:99:7169,0,370 -chr24 43909097 . G A 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.804;DP=62;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:981,0,949 -chr24 43909347 . A AAC 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.669;DP=106;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:735,0,1271 -chr24 43922038 . G A 2901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=-0.815;DP=157;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,97:157:99:2930,0,1934 -chr24 43926149 . G A 2981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=1.103;DP=177;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,105:177:99:3010,0,2337 -chr25 2100 . TGGCAAGTGTCTCTCTGAGTGTGTGTGCGCATGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCA T 10359.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-2.173;DP=233;FS=1.380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=32.84;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,223:232:99:10397,843,0 -chr25 4843 . T TTG 510.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.531;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=30.05;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:16:548,16,0 -chr25 115369 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr25 171263 . C T 2167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2196,160,0 -chr25 253553 . AGAGTGT A 481.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:44:519,44,0 -chr25 254113 . T G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:484,39,0 -chr25 267872 . AGGAGGT A 235.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:273,22,0 -chr25 269738 . G A 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 -chr25 275991 . C T 741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:770,57,0 -chr25 291380 . AACACACACACACACACACATAGTCAGATTAGTTTCTGTCTCTCTGCTCTGACCACAGGTGTATGGGCAGACTGAGGGACACACACAGATGCTTCTGTCATCATGAATATAAAGCTCTACTGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTTTGTACTACACACACACACACACAC A 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=1.552;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,1:19:99:419,0,7100 -chr25 298484 . T G 7241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:7270,491,0 -chr25 298485 . A T 7241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:7270,491,0 -chr25 299308 . G A 6212.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:6241,469,0 -chr25 303895 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:360,0,53 -chr25 306520 . AGT A 1058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=2.341;DP=51;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=20.76;ReadPosRankSum=-2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:48:1096,0,48 -chr25 467441 . GT G 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-0.348;DP=31;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:268,0,296 -chr25 470643 . G GA 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-1.187;DP=16;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:21:332,0,21 -chr25 502229 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=44;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:59:370,0,59 -chr25 1139311 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=1.922;DP=44;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:866,0,605 -chr25 1141768 . A G 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.516;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1362,0,1149 -chr25 1146066 . C A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.080;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:719,0,777 -chr25 1150042 . G T 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-3.135;DP=42;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:714,0,658 -chr25 1150779 . G A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=1.933;DP=36;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=15.94;ReadPosRankSum=2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:602,0,653 -chr25 1150859 . G A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.138;DP=38;FS=10.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:553,0,765 -chr25 1151323 . G A 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:726,51,0 -chr25 1151325 . CCAGCAGCAGCTG C 600.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:46:638,46,0 -chr25 1151450 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=1.200;DP=29;FS=15.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:514,0,500 -chr25 1153237 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=-0.711;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:624,0,965 -chr25 1153281 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.457;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:299,0,360 -chr25 1153300 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.872;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:282,0,248 -chr25 1153603 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-1.514;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.51;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:375,0,341 -chr25 1153690 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.455;DP=33;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:623,0,451 -chr25 1155408 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.074;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:384,0,546 -chr25 1162223 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=22.60;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:322,0,134 -chr25 1207971 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=2.000;DP=24;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.37;ReadPosRankSum=-2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:397,0,379 -chr25 1207989 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=2.025;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=13.92;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,285 -chr25 1208105 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.231;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:826,0,1103 -chr25 1208320 . C T 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:527,36,0 -chr25 1372597 . TCA T 422.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:36:459,36,0 -chr25 1483361 . G T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.290;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:689,0,662 -chr25 1483366 . A T 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.730;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=27.80;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1624,114,0 -chr25 1571124 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr25 1759222 . T A 301.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:27:330,0,27 -chr25 2591698 . GAGGTGAGAATGGCTATATTTGTGATTATTTAGGTTGTTAGATACCATTTTTACTTTTTCCTTTCTACTTTTTCTGTTGCTCATTT G 1293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=1.593;DP=38;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=34.05;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:99:1331,0,1099 -chr25 2646557 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.276;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:270,0,485 -chr25 2866811 . G C 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.423;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:726,0,861 -chr25 2866883 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.232;DP=43;FS=6.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:651,0,739 -chr25 2866934 . T C 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=1.436;DP=62;FS=4.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1070,0,1019 -chr25 2964346 . G A 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.551;DP=64;FS=5.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1143,0,1006 -chr25 2973855 . C A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.785;DP=39;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:525,0,785 -chr25 2982344 . T TA 935.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=1.285;DP=75;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=12.48;ReadPosRankSum=-3.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:973,0,758 -chr25 3013722 . T G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.718;DP=42;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:741,0,698 -chr25 3014759 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=1.937;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:899,0,577 -chr25 3017119 . TA T 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 -chr25 3028402 . C T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.038;DP=62;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:534,0,1537 -chr25 3165197 . CACCTGTATGAGAGAAAAAGCAGATAAACATGCTGCAGTAAAATAACAAAAACACAACTCAAATAGTTTGATTCAATTTCTTG C 1734.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=3.153;DP=64;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=27.11;ReadPosRankSum=-2.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,52:59:99:1772,0,1141 -chr25 3176988 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=28.07;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:337,0,55 -chr25 3186785 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr25 3186964 . C A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-1.323;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=27.81;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:74:501,0,74 -chr25 3261780 . T C 1298.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1327,102,0 -chr25 3269699 . C G 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 -chr25 3272133 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr25 3284857 . G A 2119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.980;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,63:95:99:2148,0,1054 -chr25 3284875 . A G 2240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.100;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=25.46;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,61:88:99:2269,0,720 -chr25 3301603 . T C 2491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.143;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,65:93:99:2520,0,728 -chr25 3301963 . T A 6566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-1.523;DP=245;FS=6.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,173:245:99:6595,0,1858 -chr25 3302150 . C T 8434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.336;DP=298;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,204:298:99:8463,0,6214 -chr25 3302155 . C G 8442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-0.400;DP=302;FS=1.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,206:302:99:8471,0,6092 -chr25 3302301 . A C 4228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4257,298,0 -chr25 3354882 . T C 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.226;DP=283;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,70:282:99:1502,0,8103 -chr25 3357297 . C T 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=-1.123;DP=242;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,67:241:99:1466,0,6414 -chr25 3357719 . G T 2744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=2.827;DP=191;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,35:191:99:2773,0,11233 -chr25 3357791 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.688;DP=236;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,48:236:99:249,0,19532 -chr25 3358110 . T C 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.211;DP=130;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,36:130:99:876,0,4777 -chr25 3360369 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-0.425;DP=25;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:300,0,567 -chr25 3361025 . G A 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DP=204;FS=0.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,61:204:99:1349,0,5280 -chr25 3370171 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=1.097;DP=322;FS=11.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,51:322:99:497,0,16969 -chr25 3406974 . AGTGAGTATCCTTCATTTCCTGCCCTGAGAACCGATCTTATAGATGTTTATAACCTCTCATTTTCATCACAG A 4420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=1.699;DP=104;FS=4.372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:4458,340,0 -chr25 3413089 . T A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-0.727;DP=88;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=6.33;ReadPosRankSum=-1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:585,0,2399 -chr25 3522073 . C T 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.018;DP=84;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:1637,0,1367 -chr25 3527961 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.098;DP=50;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:721,0,970 -chr25 3529240 . G A 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=34.47;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:752,60,0 -chr25 3530650 . T TG 830.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:60:868,60,0 -chr25 3533849 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.048;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:568,0,706 -chr25 3533926 . ACTAAAAGAGAGTGGATTTTCTGGTAAATGGGTGATTTATTGATTTATTAGGATGTACAATGAGTAGAATTGTGCTTGTGAACCAC A 687.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.824;DP=32;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=21.49;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:99:725,0,729 -chr25 3556088 . G A 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=-2.084;DP=133;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=7.25;ReadPosRankSum=2.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,38:133:99:992,0,3662 -chr25 3563741 . GCTTAGAGAAAAACAAGAGCTTTATGAAGAATCCAAATCAAGTGGAGTGCATGGGTCTACATTGAGTCTAAAGATCTTCAGCACTGAC G 12726.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.336;DP=283;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,275:278:99:12764,1126,0 -chr25 3563952 . C CTTTTT 513.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:18:551,18,0 -chr25 3633782 . G T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-0.403;DP=52;FS=19.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:965,0,1949 -chr25 3633785 . T C 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-1.093;DP=54;FS=15.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:965,0,1890 -chr25 3644697 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.356;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:442,0,368 -chr25 3673741 . TCCTGTCATCACATTATATATGAACTCAAGCGTTTATTCTATTACACAGACAAGACGACTGGTCATCTCAAAAATAGATGAAGGATAAAAAGTAAGTACTGCAATTTAGTCAGTCTTTAGTTTTTGAAACTAAACATTAAATCATTTCAATCAAA T 2456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=4.307;DP=70;FS=9.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=34.99;ReadPosRankSum=-2.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,63:70:99:2494,0,1884 -chr25 3739006 . A C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=-0.493;DP=128;FS=5.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,31:126:99:694,0,3764 -chr25 3739995 . GT G 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.003;DP=127;FS=7.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,39:117:99:510,0,5420 -chr25 3740316 . T G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=3.566;DP=95;FS=6.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:357,0,3928 -chr25 3740683 . T C 1162.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:84:1191,84,0 -chr25 3767348 . G A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-1.147;DP=110;FS=5.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1856,0,1696 -chr25 3767368 . TCTGCAATGCACAAGACACTACAGTTATTCCTGATTTAATATAAATATCCCCTCAAGTCTCCAATGGTGGTCTGTACTCAC T 4807.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.067;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,103:105:99:4845,451,0 -chr25 3773940 . A AT 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-0.231;DP=108;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,26:101:99:342,0,2071 -chr25 3781068 . C A 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.575;ClippingRankSum=-0.161;DP=106;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:789,0,2585 -chr25 3781386 . C G 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=-0.058;DP=123;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=6.76;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,36:123:99:860,0,3203 -chr25 3811533 . TCCTGAAACATCAGTCAATCAGTGTGCAGGGTGTTTTTTGTTTATTTCAGATATGATTTGAGATATTGTTAGCATCTCA T 1959.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.872;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=28.08;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,48:52:13:1997,13,0 -chr25 3835509 . G A 1988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=-1.634;DP=139;FS=18.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,56:139:99:2017,0,2829 -chr25 3851216 . G GCACTGGTCAGCCGGGC 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.213;DP=47;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:505,0,1658 -chr25 3853104 . A C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=1.015;DP=34;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,881 -chr25 3938448 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=1.032;DP=16;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=31.05;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:97:525,0,97 -chr25 3938459 . C CA 531.91 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:15:552,0,15 -chr25 3938850 . T G 359.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:388,30,0 -chr25 3940456 . T G 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:523,36,0 -chr25 3943807 . A AT 1863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=6.387;DP=213;FS=9.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=8.75;ReadPosRankSum=-6.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,66:212:99:1901,0,10874 -chr25 4434313 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:318,0,427 -chr25 4469141 . G A 401.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:429,0,6 -chr25 4469213 . C T 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 -chr25 4676370 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.535;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:486,0,325 -chr25 4850329 . TA T 564.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.628;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:32:602,32,0 -chr25 4863356 . G T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-0.197;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:599,0,765 -chr25 4863695 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:99:248,0,103 -chr25 4863715 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,14:14:82:519,0,82 -chr25 4864117 . C G 695.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:724,51,0 -chr25 4872370 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.462;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:387,0,408 -chr25 4872391 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.517;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:445,0,441 -chr25 4877830 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.155;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:254,0,750 -chr25 4996334 . T A 2478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2507,187,0 -chr25 5020863 . TGGTAAGTGTGGTTTCCTCAAACCTTTAGATGCTTTCTACTGTGTAATGTACATTTTATTGATTTATTTTTTCACTCTTTCCA T 1331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.716;DP=220;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,210:211:99:1369,497,0 -chr25 5029832 . TTTGAGGTTAGCCA T 9963.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=1.170;DP=286;FS=2.288;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=34.84;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,263:266:99:10001,737,0 -chr25 5029848 . GATTTCATGTCCTGGAATTTTAGATTGTGTGTACTGTGGTGTACAAACCTGGCCAGCACTGCAGACTGCAGTTTAAAGGTCATTTGTTTTTTTCC G 11844.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=1.145;DP=264;FS=1.964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=31.70;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,260:264:99:11882,1119,0 -chr25 5038560 . G GT 2478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.590;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2606,273,0 -chr25 5043845 . GCCTTAAGAAAGTGACAGTGTGTGTCTGATTTAACTAACTGCTCGTTTTTGGGTGAACAATCATTTCTACATGATTTCAAATAAAGTAATAAATCTGCTGAAGTCATTTAAGGTCTTA G 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:438,0,1199 -chr25 5068128 . C CA 255.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:293,27,0 -chr25 5068285 . C T 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:454,33,0 -chr25 5068807 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr25 5069127 . A G 290.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:319,24,0 -chr25 5070144 . CT C 1961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1999,137,0 -chr25 5235895 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.441;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:308,0,941 -chr25 5253671 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.913;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:238,0,1017 -chr25 5315897 . G A 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 -chr25 5316086 . G C 663.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:692,48,0 -chr25 5316240 . A G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:739,54,0 -chr25 5316297 . A G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr25 5316650 . T C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr25 5327713 . T G 833.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=30.02;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:862,60,0 -chr25 5327847 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr25 5349829 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:353,0,272 -chr25 5356697 . AAGGCAAATATAACTTTAACCTGCGGTGCATGGCGATTTTGATCAATCATTCTCACTAGAAACAGAATGTCAATCTTTTACCCCATGCTTTCAGTGCTGTGCTTGTTTTCTGC A 1160.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.156;ClippingRankSum=0.470;DP=40;FS=6.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=29.02;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:99:1198,0,3495 -chr25 5361478 . GAGGTGAGGAAGTGAAAACACCGATCTGCTGGGGATTTTTTGTGTGCGTGTAGTGTTTGCTAACAGACTGTAACTCTTTATC G 1135.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=3.774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:94:1173,94,0 -chr25 5386587 . C T 3042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.592;DP=200;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,79:199:99:3071,0,8456 -chr25 5386590 . C G 3042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.406;DP=196;FS=2.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,80:195:99:3071,0,8402 -chr25 5389707 . AG A,ATATGATGATCGGAAGG 534.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=3.789;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,143,0:148:99:6214,231,1478,850,0,415 -chr25 5389709 . TAAGAAGCTTCAGTATGGCCATCTAGTGGCGAATGACGGTTAAAGCACAATAAATATGTGTTGTCGTGTGTGACCTGATGCTGACTTTGTATTTACTGCTCCAACAGA T 638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=5.017;DP=150;FS=1.303;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,141:150:99:676,256,0 -chr25 5423680 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:288,0,124 -chr25 5600997 . CCT C 251.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:289,0,22 -chr25 6225803 . C G 2248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.147;DP=119;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:2277,0,1818 -chr25 6226179 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=1.992;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,418 -chr25 6226273 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-1.614;DP=66;FS=16.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,26:65:99:669,0,2248 -chr25 6226275 . T C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-1.181;DP=71;FS=15.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:669,0,2288 -chr25 6226393 . G A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.493;DP=87;FS=16.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:1125,0,2369 -chr25 6226395 . G A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=-1.482;DP=83;FS=14.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:798,0,4371 -chr25 6226538 . T G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=5.044;DP=74;FS=3.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=7.20;ReadPosRankSum=-3.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:561,0,2109 -chr25 6226641 . A G 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.069;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,38:83:99:1347,0,1528 -chr25 6226808 . T G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=4.061;DP=49;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=5.75;ReadPosRankSum=-2.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:310,0,1688 -chr25 6226862 . G A 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.700;DP=71;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=14.11;ReadPosRankSum=4.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:1030,0,1459 -chr25 6227096 . G C 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=-0.277;DP=64;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1111,0,982 -chr25 6227129 . A G 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-1.266;DP=59;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1031,0,1092 -chr25 6227420 . AG A 342 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.496;DP=17;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:12:379,12,0 -chr25 6227774 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=2.205;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=30.69;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:68:550,0,68 -chr25 6228197 . T G 875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:904,66,0 -chr25 6228226 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=1.965;DP=31;FS=5.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=20.93;ReadPosRankSum=-2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:677,0,1384 -chr25 6228236 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=2.628;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.930;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:685,0,1384 -chr25 6228369 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=8.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:312,0,237 -chr25 6228454 . G T 635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:664,48,0 -chr25 6228467 . T C 1036.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1065,78,0 -chr25 6228568 . C T 2159.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2188,157,0 -chr25 6228751 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-1.138;DP=74;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:370,0,3280 -chr25 6228804 . G A 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.638;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1389,0,1309 -chr25 6228805 . A G 3706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3735,260,0 -chr25 6228944 . C T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:694,51,0 -chr25 6228953 . TC T 376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:38:414,38,0 -chr25 6228971 . C T 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1203,87,0 -chr25 6229078 . A C 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.711;DP=98;FS=4.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1729,0,1729 -chr25 6229124 . C T 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.535;DP=86;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:1368,0,1575 -chr25 6229177 . T A 2725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2754,207,0 -chr25 6229241 . G GT 751.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=1.502;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=20.32;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:96:877,96,0 -chr25 6229250 . A T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.652;DP=47;FS=6.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:649,0,719 -chr25 6252650 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=18.62;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,189 -chr25 6265550 . A G 4374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.184;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.83;ReadPosRankSum=2.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,118:210:99:4403,0,6923 -chr25 6265554 . C T 4395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=-1.269;DP=219;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=20.07;ReadPosRankSum=3.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,123:219:99:4424,0,6923 -chr25 6271944 . T G 3727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3756,280,0 -chr25 6279296 . T A 6816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-2.467;DP=402;FS=9.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=16.96;ReadPosRankSum=2.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,208:393:99:6845,0,6646 -chr25 6281871 . G A 4649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=1.411;DP=342;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,133:329:99:4678,0,6817 -chr25 6285784 . C T 5775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-0.343;DP=353;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,165:353:99:5804,0,6209 -chr25 6297113 . AACAGGTACTGAACGCATTGGAAATCATTTCACTCGGTCGTGTTACAACTTACACAAACATGGATGACAGTTTACTCTCTTTCCCC A 13597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.414;DP=356;FS=1.596;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,350:356:99:13635,1116,0 -chr25 6322401 . C T 240.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:269,0,15 -chr25 6375474 . AT A 1842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1880,182,0 -chr25 6403212 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:645,0,28 -chr25 6408353 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.091;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:504,0,631 -chr25 6409816 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.215;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:615,0,1411 -chr25 6409817 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.207;DP=36;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:615,0,1424 -chr25 6410033 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.363;DP=26;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:460,0,366 -chr25 6411168 . G T 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr25 6411226 . C G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr25 6440073 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-1.681;DP=45;FS=4.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:288,0,1201 -chr25 6441714 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=1.415;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:436,0,1069 -chr25 6441738 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=1.781;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=12.48;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:415,0,774 -chr25 6441739 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=1.501;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:587,0,653 -chr25 6441826 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-1.774;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:260,0,395 -chr25 6441861 . T C 472.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=33.74;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:1:498,0,1 -chr25 6441862 . T C 503.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.496;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=29.20;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:4:530,4,0 -chr25 6556908 . AT A 2030.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2068,203,0 -chr25 6645443 . C G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:334,27,0 -chr25 6718582 . GCTAGAAGAGCATTAGCAAGACATTCATCACAAAAGCAAAATCACAACAGCAGCAGGTGGAGAGCGTAAACAGTGCAAGAGTGTGGAGACTGAC G 2280.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=2.352;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=29.10;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2318,220,0 -chr25 6753223 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=-1.835;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=7.92;ReadPosRankSum=2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:361,0,1115 -chr25 6754153 . AT A 724.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.493;DP=42;FS=5.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:19:762,0,19 -chr25 7639241 . G A 1601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.673;DP=78;FS=3.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,48:78:99:1630,0,1005 -chr25 7639388 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;ClippingRankSum=-1.570;DP=85;FS=8.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:370,0,2292 -chr25 7652365 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=1.893;DP=37;FS=11.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:450,0,862 -chr25 7705299 . A G 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.534;DP=51;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:863,0,1658 -chr25 7718350 . G T 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.142;DP=73;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,40:72:99:1272,0,1122 -chr25 7719232 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.998;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:671,0,460 -chr25 7719282 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=1.109;DP=35;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:669,0,550 -chr25 7723001 . A T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.059;DP=33;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=26.93;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:917,0,282 -chr25 7723344 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=2.901;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:314,0,585 -chr25 7723585 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-1.388;DP=21;FS=9.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:657,0,198 -chr25 7723615 . TA T 822.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=1.346;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=29.38;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:27:860,0,27 -chr25 7724564 . G A 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.483;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1164,0,228 -chr25 7724667 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=-1.270;DP=40;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:1184,0,235 -chr25 7725023 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-1.300;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:623,0,966 -chr25 7725910 . A AGT 523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:561,44,0 -chr25 7733183 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,130 -chr25 7743908 . T C 335.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 -chr25 7747974 . C T 1665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.683;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1694,0,1734 -chr25 7755154 . G A 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.904;DP=83;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1483,0,1308 -chr25 7802459 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.969;DP=56;FS=6.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:600,0,1239 -chr25 7811662 . C CA 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.906;DP=86;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:290,0,1752 -chr25 7815663 . T A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.129;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:445,0,493 -chr25 7816397 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=22.41;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:342,0,397 -chr25 7816407 . T A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.41;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:342,0,397 -chr25 7823589 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.719;QD=23.24;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:400,0,159 -chr25 7826999 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=23.99;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:412,0,163 -chr25 7843426 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:233,0,403 -chr25 7877933 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.423;DP=17;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:466,0,148 -chr25 7877963 . T C 464.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:493,36,0 -chr25 7878601 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.527;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:582,0,312 -chr25 7888171 . TCCTACACACACACACACCAAACAACATCCATCATACTCCACTACAAAACACACGATGACTGCTCTTCAGAACTGA T 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=34.98;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:562,0,129 -chr25 7890947 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:262,0,102 -chr25 7891430 . T C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr25 7894287 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,242 -chr25 7913096 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=1.129;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:555,0,141 -chr25 7917851 . A T 3335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.704;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,99:173:99:3364,0,2655 -chr25 7937440 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=1.530;DP=24;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:435,0,474 -chr25 7939895 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-1.898;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:376,0,162 -chr25 7940088 . C A 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr25 7940742 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,146 -chr25 7941900 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,137 -chr25 7979153 . GAAA G 213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:20:251,20,0 -chr25 7980552 . AT A 301.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.401;DP=16;FS=11.139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:11:338,11,0 -chr25 7980961 . TA T 590.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.459;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:628,0,706 -chr25 7987034 . CTGGTGG C 224.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:262,22,0 -chr25 8128531 . A C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr25 8142384 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=21.21;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:304,0,173 -chr25 8153756 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=1.936;DP=14;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=16.70;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,301 -chr25 8155562 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,226 -chr25 8155567 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:257,0,422 -chr25 8156052 . A C 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=-2.079;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=18.76;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1060,0,790 -chr25 8170185 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-2.432;DP=52;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:868,0,1060 -chr25 8178920 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.103;DP=44;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:332,0,1203 -chr25 8182508 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,323 -chr25 8246599 . C T 2356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.445;DP=156;FS=5.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:2385,0,2929 -chr25 8251890 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-0.572;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:392,0,2036 -chr25 8251900 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-1.606;DP=52;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:321,0,1725 -chr25 8296071 . T C 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.392;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:804,0,2135 -chr25 8309071 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=2.089;DP=67;FS=7.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:581,0,1641 -chr25 8309097 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.224;DP=65;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:421,0,1599 -chr25 8309152 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=2.187;DP=58;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=9.00;ReadPosRankSum=2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:550,0,1452 -chr25 8311098 . T C 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-1.582;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:1185,0,1510 -chr25 8318436 . T C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=1.013;DP=52;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:871,0,2088 -chr25 8318514 . T G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=1.758;DP=48;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:332,0,1265 -chr25 8444426 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.200;DP=42;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:252,0,1169 -chr25 8457053 . GCCTGACGCACAGGCATGCGCGCGCACACACAGAGACATTAATTAGACAAACATGATCATTCAGATAAATACATTTAGTAAAGAATCACGAGTTCTGA G 1436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.900;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=28.17;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,42:49:99:1474,0,791 -chr25 8585213 . A C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr25 8590211 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=-2.201;DP=18;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=24.49;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:469,0,215 -chr25 8590327 . A G 1652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.217;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=26.23;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,44:63:99:1681,0,507 -chr25 8590420 . A G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=2.598;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:939,0,1467 -chr25 8590773 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-3.123;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=25.05;ReadPosRankSum=2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:404,0,160 -chr25 8590774 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-2.488;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,368 -chr25 8625388 . G C 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr25 8631453 . A C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.425;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:301,0,526 -chr25 8631580 . T C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr25 8659822 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.331;DP=20;FS=9.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=28.54;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:599,0,267 -chr25 8659870 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.760;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:445,0,299 -chr25 8660252 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:381,0,407 -chr25 8670485 . AGTCAAACTAATGTGTGCTGTATATGAATAGCTATGAAAGTCCAGGTCTTGTGTGTTCCTCCAGGCT A 685.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.066;DP=19;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=32.83;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:723,0,514 -chr25 8676730 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.876;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:294,0,716 -chr25 8709105 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:368,0,340 -chr25 8709123 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:281,0,311 -chr25 8734924 . C A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=1.545;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=26.65;ReadPosRankSum=-2.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:508,0,288 -chr25 8736561 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.332;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=29.03;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:667,0,113 -chr25 8739184 . G T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr25 8739311 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:306,0,54 -chr25 8740565 . T C 847.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:876,63,0 -chr25 8740832 . G A 539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:568,39,0 -chr25 8741738 . G A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr25 8746266 . G C 211.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:240,0,21 -chr25 8751902 . TC T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:286,0,248 -chr25 8752804 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.467;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:319,0,445 -chr25 8826687 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=1.022;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:366,0,382 -chr25 8855882 . A T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr25 8855905 . G A 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 -chr25 8860379 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=1.323;DP=47;FS=8.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:683,0,947 -chr25 8867507 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-0.465;DP=53;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=5.43;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:316,0,1555 -chr25 8870197 . ACTGCAATCAAAACAAAAACACGAGTTTAAGGAGCCGAGGAGGATTAGCATAATAAGCGGACGTTTATCTCCAAAACTGCAGAAAAAGCGAAAC A 1659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=3.898;DP=46;FS=1.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:99:1697,0,2571 -chr25 8885590 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-1.076;DP=53;FS=1.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:415,0,1383 -chr25 8890446 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=-0.529;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:459,0,786 -chr25 8893561 . G A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.892;DP=70;FS=5.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:605,0,1871 -chr25 8893845 . CA C 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.585;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:252,0,498 -chr25 8901022 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=1.106;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:462,0,506 -chr25 8914881 . G T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-1.134;DP=47;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:511,0,1115 -chr25 8920008 . G A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=-0.762;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1038,0,967 -chr25 8967622 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.852;DP=40;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:708,0,686 -chr25 8970681 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.214;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:422,0,866 -chr25 9033951 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=1.234;DP=77;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:384,0,2049 -chr25 9136686 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.045;DP=57;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:393,0,1632 -chr25 9149822 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=-0.410;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:436,0,492 -chr25 9149913 . C T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.790;DP=43;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:746,0,794 -chr25 9163638 . T C 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.821;DP=40;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:605,0,782 -chr25 9175035 . AAGGTGAGGCTTTAACATTACTGAATCAGCTCTTTTGCATCAGCTTTCTGCATCCGGTCACTGTGTTTTCTGT A 1333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-0.025;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=33.34;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:99:1371,0,1603 -chr25 9177127 . T A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.933;DP=56;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:781,0,1127 -chr25 10540684 . C T 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 -chr25 10608593 . A C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-1.004;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:42:418,0,42 -chr25 10705212 . C T 9904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.480;DP=578;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:293,277:570:99:9933,0,9509 -chr25 10813879 . C T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.519;DP=57;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.038;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:987,0,1047 -chr25 10814171 . CAA C 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.748;DP=67;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:627,0,563 -chr25 10856804 . A G 2639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:2668,196,0 -chr25 10876890 . T C 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=2.755;DP=69;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:921,0,1447 -chr25 10881319 . G T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=0.380;DP=101;FS=6.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:1147,0,2055 -chr25 10887193 . G A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-1.823;DP=88;FS=0.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:533,0,2516 -chr25 10887373 . C G 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-1.360;DP=82;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1218,0,2909 -chr25 10889242 . G A 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.960;DP=105;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,40:105:99:1366,0,2149 -chr25 10953061 . C T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.302;DP=87;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1145,0,1774 -chr25 10991789 . A T 2063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2092,153,0 -chr25 10992022 . A T 2702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2731,205,0 -chr25 11008397 . G GT 1312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.088;DP=122;FS=9.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,32:35:34:1350,0,34 -chr25 11016212 . A G 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.467;DP=108;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1771,0,1969 -chr25 11071475 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,309 -chr25 11156080 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr25 11156081 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:308,21,0 -chr25 11156624 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr25 11615045 . C G 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 -chr25 11674283 . G GA 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.677;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:279,0,834 -chr25 12139322 . G A 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=30.50;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:32:548,32,0 -chr25 12598855 . TCGCGGTTAGTACATCTCCTCCTTTTACTTTACTATATTAGTTTATATTATTAATTATTTACATTTAA T 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.386;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=3.95;ReadPosRankSum=2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:515,0,4528 -chr25 12600714 . CAGGTAAACATTCACCGCCTAATTAATCTGCATAAAATGATAGAAAATGCATTAAGAGAATAAAAGTGCTTATTTCAAAATGTTTTCCCTCTT C 6294.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.329;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=31.07;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,153:156:99:6332,572,0 -chr25 12604241 . C T 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=1.256;DP=117;FS=7.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,40:117:99:1154,0,6060 -chr25 12604416 . T G 2530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.839;DP=112;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=22.60;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,74:112:99:2559,0,1231 -chr25 12610784 . G A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-2.159;DP=81;FS=6.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:1066,0,1706 -chr25 12613754 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=1.991;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=31.75;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:441,0,1408 -chr25 12613828 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.135;DP=54;FS=6.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:277,0,3144 -chr25 12613863 . GT G 1501.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-1.313;DP=64;FS=1.954;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,50:58:7:1538,7,0 -chr25 12614184 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.911;DP=41;FS=11.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=7.58;ReadPosRankSum=-2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:339,0,1046 -chr25 12615067 . A G 1524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-0.300;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,42:74:99:1553,0,2488 -chr25 12615943 . C A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-3.639;DP=63;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:328,0,1902 -chr25 12617854 . G T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-2.655;DP=74;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:871,0,1710 -chr25 13097261 . T A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-0.404;DP=68;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:797,0,1564 -chr25 13097273 . G A 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.567;DP=57;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:975,0,1075 -chr25 13097448 . A AT 1968.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2006,134,0 -chr25 13097670 . CT C 656.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.319;DP=67;FS=5.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,28:62:99:694,0,764 -chr25 13131627 . AAGGTGTCAGCTTTGTCACAAACCTCACCTTACGTTAGTCTTTACTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTGAAAGTAATTTATATATTTCCTTGC A 1891.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=292;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,282:282:99:1929,681,0 -chr25 13131821 . TGGTGGGTATTTTGTTCTTACATGGCTATCAACAGTTATTTAAACAAATGTAATTGTATGTTAAAAAATGCATATTAAGTAAGTCTTTTTAAAAGCA T,TGCA 704.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.116;DP=77;FS=2.125;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,31,34:69:99:1441,409,1572,407,0,1789 -chr25 13132065 . AAGGTGAGATTTAAACAGCTTTTTTTCATAAGCTAACAGTATATACCAGTTTGGCTATCAGTCAAAATGTCTATATACCTAACCAAAATATGAGAGGTGCAGTTGTCGTTTTTAATGTGAATAAAACATTTAGATGTTTTTTTATGTGTGCTGCTGTTTTC A 3942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.377;DP=291;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,117:288:99:3980,0,7753 -chr25 13132066 . AGGTG A 5552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-2.389;DP=286;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.960;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,166:283:99:5590,0,6388 -chr25 13132071 . AGATTTAAACAGCTTTTTTTCATAAGCTAACAGTATATACCAGTTTGGCTATCAGTCAAAATGTCTATATACCTAACCAAAATATGAGAGGTGCAGTTGTCGTTTTTAATGTGAATAAAACATTTAGATGTTTTTTTATGTGTGCTGCTGTTTTCAG A 5563.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-1.939;DP=286;FS=5.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,164:285:99:5601,0,6388 -chr25 13139616 . CT C 230.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=18;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:10:267,10,0 -chr25 13141808 . CT C 1192.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.088;DP=88;FS=4.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,52:83:99:1230,0,720 -chr25 13153751 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-2.228;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.80;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,384 -chr25 13155192 . C A 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=-0.363;DP=103;FS=16.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:978,0,5445 -chr25 13203130 . T A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=1.002;DP=33;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:646,0,484 -chr25 13203172 . AT A 685.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.415;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:723,0,739 -chr25 13203173 . T TC 585.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-0.704;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:623,0,1182 -chr25 13206729 . G GT 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.876;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:531,0,533 -chr25 13541412 . A T 564.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.66;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:24:593,0,24 -chr25 13959122 . GT G 486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.371;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:524,0,99 -chr25 13959494 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr25 13959651 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:288,21,0 -chr25 13960757 . G A 1033.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1062,75,0 -chr25 13960821 . C T 623.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:51:865,51,0 -chr25 13963958 . G A 2045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2074,150,0 -chr25 13991658 . T C 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 -chr25 13994714 . CA C 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.031;DP=24;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:271,0,270 -chr25 14080786 . GCTGCATCAAACACACACACACACACACACAAACATGACAATGCAAATTGACATCTGAAACACCACCTCACTTCCAAACAGAAACCGGTACTCTCATGCCCTCTGCTGGTGAGTAAGCGCAATAAATCCAGAATTAACATTGAAGGAATCTTTTTTTACTCAAAATCTCTCTGAAATGTACTCTAATGTCCTAAATCCAGTTCAGAGTTGAAAAAGATCCAAAACCACAACATTAC G 6045.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.808;ClippingRankSum=4.694;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=32.33;ReadPosRankSum=1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,165:185:99:6083,0,6724 -chr25 14090931 . TAGAGAG T 288.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:39:326,39,0 -chr25 14100593 . T TA 203.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:29:241,0,29 -chr25 14100600 . C A 536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:565,39,0 -chr25 14101669 . T C 2507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2536,184,0 -chr25 14102291 . GTT G 326.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:364,30,0 -chr25 14103814 . TG T 805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.124;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:83:843,83,0 -chr25 14106335 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,1:2:52:283,0,52 -chr25 14121411 . AT A 218.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:15:256,0,15 -chr25 14122097 . G A 1931.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1960,150,0 -chr25 14664637 . ACGTGGTGCGTTCTAAACCAGTGACAT A 6045.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.646;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:6083,504,0 -chr25 14664666 . TCAGTCTTGTGTCTTTTATCTGTAACCCACACCATCATTCTGCTCTTCACTTTGCA T 6045.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.011;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=29.44;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,133:135:99:6083,504,0 -chr25 14676195 . GAATCTACAAGAATACACGCAAACAGCTCC G 1400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=1.899;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1438,0,743 -chr25 14676227 . TTAAAAAATCATCATCAGTAAAGCTCACAAATAAAACAGTTCATGAAGAAGTCTAACTCAC T 1400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=1.899;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1438,0,743 -chr25 14676420 . CTCACT C 2063.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=1.663;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.594;QD=30.69;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2101,186,0 -chr25 14676428 . AAAGACAGAATGTCAAAAATATATTAAGGTTTTCCTCAGAGAATGTGTCAATTCTGGTTCATTTTTAAGACACACTGAAGAGCATCTGTAC A 2153.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.728;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:2191,192,0 -chr25 14682483 . ACACCTGCGTGCCATTCACATACTGGTCTTATTATTTCATCTTATCTTATATTATGAATCAATACTGTATATATGAGCAGGAATGAG A 230.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=2.333;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=4.81;ReadPosRankSum=-2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:97:268,97,0 -chr25 14691004 . GCTTAAAGAACACATTTGAATGTACAAGACTGCTTTTTTACAAGTAAGAAAAAATTAGATATAACTTTAGGATGTACTTAC G 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=2.255;DP=37;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:452,0,10562 -chr25 14771852 . A AT 899.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:98:1025,98,0 -chr25 14772874 . C CT 264.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:43:395,43,0 -chr25 14999083 . TTA T 810.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:58:848,58,0 -chr25 15305898 . T A 1158.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1187,93,0 -chr25 15571211 . C CT 366.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:404,39,0 -chr25 15642035 . T A 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 -chr25 15705296 . A AT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-0.050;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:55:344,0,55 -chr25 15705603 . A AT 332.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-0.510;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:24:370,24,0 -chr25 16004835 . CT C 833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:871,75,0 -chr25 16669563 . G GA 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-0.604;DP=106;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:472,0,1811 -chr25 17032878 . T TCTG 952.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 -chr25 17038300 . G GACCCC 3352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3390,236,0 -chr25 17044304 . G A 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 -chr25 17044343 . CT C 369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:407,40,0 -chr25 17310457 . GT G 359.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=23.99;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:15:397,15,0 -chr25 17328626 . CA C 935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-1.243;DP=43;FS=3.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=21.76;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:81:973,81,0 -chr25 17664238 . C T 3958.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:3987,295,0 -chr25 17666029 . A AT 397.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:435,36,0 -chr25 17666846 . TTG T 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:74:1034,74,0 -chr25 17690214 . CAGGTGGGTGAATTTGACATTGGCGGGAAGTTGTTATTGCATCACTGTGTACTGATATGTGCCTGGGTCACGTTTCT C 12514.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.925;DP=299;FS=4.735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.584;QD=30.24;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,289:299:99:12552,1075,0 -chr25 17693470 . C T 10014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,241:241:99:10043,725,0 -chr25 17696376 . C CA 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.898;DP=325;FS=8.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,62:315:99:510,0,6956 -chr25 17697242 . CGTTAGTTACTCACTCTACCAACCAATTCATTACCCCTTTTCAAATAGCGTTAATTAAGACACTAACAATTTTTACCTTAACGTTTATAG C 16578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=1.313;DP=379;FS=2.022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=33.71;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,374:378:99:16616,1258,0 -chr25 17697724 . G A 11740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.720;DP=284;FS=3.041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=31.47;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,283:284:99:11769,852,0 -chr25 17710154 . TCCTAAAGACATGAGCTGTGAGAGATCGAAGCATCCACCACAATAAACAAACACAAAGATAGAAAATAATAATA T 1024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.946;DP=30;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=34.16;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1062,0,1542 -chr25 17712402 . A T 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.385;DP=23;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:671,0,139 -chr25 17712452 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.440;DP=37;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:660,0,663 -chr25 17713769 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-1.517;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.047;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:298,0,462 -chr25 17731454 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=3.736;DP=46;FS=5.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.184;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:369,0,1229 -chr25 17734459 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.687;DP=44;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:682,0,842 -chr25 17735179 . G A 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.628;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:851,0,715 -chr25 17735391 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=2.996;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:233,0,1074 -chr25 17765837 . C T 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-0.951;DP=91;FS=3.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1464,0,1624 -chr25 17771027 . C T 3299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.922;ClippingRankSum=2.910;DP=120;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=27.50;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,89:119:99:3328,0,755 -chr25 17773634 . C T 6765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:6794,525,0 -chr25 17774735 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.052;DP=64;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:491,0,3157 -chr25 17775875 . TG T 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-0.024;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:319,0,316 -chr25 17775960 . G A 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=-0.987;DP=67;FS=8.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1049,0,1170 -chr25 17780460 . T G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-0.767;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:571,0,489 -chr25 17801716 . C A 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=2.825;DP=31;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=29.06;ReadPosRankSum=2.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:929,0,103 -chr25 17801922 . C T 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-1.361;DP=67;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1202,0,1230 -chr25 17831353 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.452;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:534,0,623 -chr25 17831691 . A T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.284;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:509,0,507 -chr25 17831777 . G T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.659;DP=26;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:579,0,358 -chr25 17831808 . T C 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.875;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:631,0,601 -chr25 17832640 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-1.259;DP=40;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:755,0,590 -chr25 17832733 . A AT 489.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:527,50,0 -chr25 17833085 . G C 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.454;DP=39;FS=4.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:478,0,940 -chr25 17834544 . C G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.109;DP=55;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=6.18;ReadPosRankSum=-3.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:368,0,3304 -chr25 17834780 . C A 268.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:297,0,15 -chr25 17834856 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-2.565;DP=28;FS=17.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:359,0,627 -chr25 17835175 . C G 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.086;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:914,0,824 -chr25 17853182 . TCTGCAGTGAAGAAAACACACGACAATTTAAACACATTTAAAAGTGAATTATTCTAATTCAAACTAACGTTAAAATTCTAATTAATGTCTGTATAAAAAAAAGAAAAAC T 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=2.162;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:99:635,0,901 -chr25 17918219 . T A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.797;DP=48;FS=10.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:795,0,885 -chr25 17922357 . G C 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.444;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:1624,0,1205 -chr25 17932172 . C CTA 1163.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=3.316;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1201,0,451 -chr25 17933123 . A T 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=1.392;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:1346,0,1198 -chr25 17953321 . T C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.260;DP=53;FS=9.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:790,0,2165 -chr25 17955109 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=1.323;DP=33;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=12.30;ReadPosRankSum=-1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:99:434,0,1777 -chr25 17955115 . G GGACATC 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=1.048;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:434,0,1860 -chr25 17963369 . G A 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=1.191;DP=56;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:987,0,930 -chr25 17968142 . TGTGAGTCGCATTCCCCCACCACATCAATAATTCTGGTTTTCAACTCTCCACACTGACATTGGTTCTCTTGGCAG T 2266.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.452;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=34.10;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:99:2304,191,0 -chr25 18236606 . T C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr25 18379117 . C T 3903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-0.757;DP=63;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,41:63:99:3932,0,516 -chr25 18379132 . A G 3903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=-0.106;DP=64;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,50:64:99:3932,0,458 -chr25 18379447 . A G 2890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=1.340;DP=165;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,88:164:99:2919,0,2779 -chr25 18379643 . T TA 269.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=24.50;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:306,0,7 -chr25 18379749 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=1.417;DP=48;FS=4.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=15.97;ReadPosRankSum=2.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:795,0,876 -chr25 18381447 . G A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.375;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:825,0,776 -chr25 18388431 . GCCTGTTGAAATCATACAGTGGTTAAGGAGAGAGAAAGAGCCGGAGGAGAAAGTGCTGGAAACCAATCTCA G 2262.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.903;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=34.28;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,58:62:99:2300,132,0 -chr25 18391238 . G T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.132;DP=64;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1416,0,2018 -chr25 18411311 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.973;DP=38;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:650,0,682 -chr25 18412861 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=1.160;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:514,0,346 -chr25 18421207 . AAGGTAAAGATCACTCTTTTGTTGCACGTTTTCTAAATCTTTCACAATTTCTCCATATTAAATCATATTGAATCTCGTTCTCC A 1094.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.129;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=32.12;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,27:29:99:1132,0,416 -chr25 18423952 . C G 294.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:323,0,17 -chr25 18427369 . T A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.199;DP=56;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:648,0,1134 -chr25 18431025 . C T 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.852;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:941,0,748 -chr25 18431135 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.287;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.907;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:675,0,848 -chr25 18442156 . AGCT A 1194.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.479;DP=65;FS=15.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1232,0,2317 -chr25 18442157 . GCTGATACAAGGAAAGCGAATAGGATTAGATTTAAGTTTGCTCTATATATAATGTCAAAAAGTGTTTCAATGCAATACTGAC G 1148.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.296;DP=65;FS=15.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1186,0,2397 -chr25 18442161 . ATACAAGGAAAGCGAATAGGATTAGATTTAAGTTTGCTCTATATATAATGTCAAAAAGTGTTTCAATGCAATACTGACG A 1194.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.283;DP=65;FS=13.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:1232,0,2317 -chr25 18443343 . C T 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.933;DP=51;FS=3.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:796,0,866 -chr25 18443481 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.592;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:702,0,1098 -chr25 18449622 . T C 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=-0.063;DP=54;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1145,0,694 -chr25 18450056 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-2.253;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:496,0,2180 -chr25 18454792 . A G 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.970;DP=51;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:907,0,939 -chr25 18457196 . G T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.394;DP=40;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:828,0,574 -chr25 18457258 . G A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-2.108;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1197,0,660 -chr25 18457281 . C T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.429;DP=53;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,36:53:99:1340,0,483 -chr25 18465048 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.264;DP=32;FS=5.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:544,0,588 -chr25 18472938 . T C 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=2.229;DP=62;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.527;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1177,0,972 -chr25 18478063 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.843;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:745,0,584 -chr25 18540201 . G T 1244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-1.794;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.801;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1273,0,2127 -chr25 18541190 . G T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.472;DP=56;FS=12.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:781,0,934 -chr25 18947625 . CATGCTAAAGGAACAATACAGAATTCAGGTCAAATGATGATAGATAAATAAATATTCAGTA C 365.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:31:403,31,0 -chr25 18983330 . T C 4796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:4825,349,0 -chr25 19048241 . G A 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr25 19048258 . A G 593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:622,42,0 -chr25 19048293 . G GA 269.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:349,35,0 -chr25 19062084 . T A 1553.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1582,108,0 -chr25 19062549 . TTG T 1072.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1110,87,0 -chr25 19062580 . T C 2322.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2351,169,0 -chr25 19062795 . G GA 4640.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.420;DP=201;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,171:173:99:4678,463,0 -chr25 19063080 . C T 10593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,242:242:99:10622,748,0 -chr25 19063972 . A C 3798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3827,271,0 -chr25 19063983 . T C 3798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3827,271,0 -chr25 19064221 . A G 3988.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:4017,290,0 -chr25 19064255 . G GT 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.589;DP=85;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,54:68:99:961,0,141 -chr25 19064404 . G T 11239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=267;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,267:267:99:11268,807,0 -chr25 19064691 . G A 6294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:6323,436,0 -chr25 19071089 . C T 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:564,39,0 -chr25 19071095 . G T 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:564,39,0 -chr25 19125353 . T C 1880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1909,129,0 -chr25 19178180 . T TA 272.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:380,41,0 -chr25 19178543 . A G 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1081,78,0 -chr25 19179532 . A G 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr25 19180361 . G A 882.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-1.576;DP=22;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:911,63,0 -chr25 19202634 . G A 1042.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1071,75,0 -chr25 19210591 . C T 733.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:762,54,0 -chr25 19377829 . A AT 311.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:349,33,0 -chr25 19386940 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr25 19398336 . A G 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:683,48,0 -chr25 19412010 . A G 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr25 19416435 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr25 19417279 . T A 787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:816,60,0 -chr25 19425587 . G A 738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:767,54,0 -chr25 19425605 . G A 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 -chr25 19451590 . G A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr25 19451977 . C A 1014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1043,72,0 -chr25 19452493 . C A 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:60:850,60,0 -chr25 19452755 . C T 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr25 19452823 . C T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr25 19452873 . C T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:351,24,0 -chr25 19453475 . T TA 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr25 19453766 . T C 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 -chr25 19453797 . GT G 226.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:10:263,10,0 -chr25 19454903 . T TA 1638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1676,158,0 -chr25 19457914 . A G 1095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1124,84,0 -chr25 19463236 . TGTAAGTGTTTGATCACAGCTACAGATGAATAGATAGTTGCCACTTATGCAAAGACCTGAACTTAATGAATACTTCTTATTTTTTTCAG T 10174.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=2.429;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=26.06;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,243:245:99:10212,839,0 -chr25 19467101 . T A 2297.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2326,166,0 -chr25 19467953 . G T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1868,132,0 -chr25 19478689 . C A 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:574,39,0 -chr25 19478697 . A G 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:574,39,0 -chr25 19506472 . C T 4892.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:4958,408,0 -chr25 19506493 . A G 5789.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:5818,420,0 -chr25 19508919 . AAGGTGAATGACTCTGACTCTCAGCACTGAAGTTCAGCATCTCGGTGTCACTGACTAAACTGTGTGTTTGTTGAC A 5173.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-1.523;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=32.61;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:5211,479,0 -chr25 19511740 . C G 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr25 19669153 . C A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:510,36,0 -chr25 19695141 . G A 1869.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1898,135,0 -chr25 19695506 . G A 1002.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1031,72,0 -chr25 19703251 . C G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr25 19704324 . G A 881.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:910,66,0 -chr25 19706605 . C T 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr25 19708540 . G A 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 -chr25 19854066 . G C 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:739,54,0 -chr25 19864769 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr25 20021926 . G A 534.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:563,39,0 -chr25 20037974 . C T 1612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1641,117,0 -chr25 20046827 . A G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.188;DP=39;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:504,0,852 -chr25 20052704 . GCCTGATAAAGCAATATTACACATGAGGAAACATGGTTTTACGGAAAGTCTTGTGATTAGTGTGCATCAGCATATCTCAGA G 2480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=1.604;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=31.40;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,70:77:99:2518,0,971 -chr25 20075665 . G GA 741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:779,75,0 -chr25 20078425 . GCCTTTAAAACACACATTAATACAAACTCAAGGAGAAGAAGCGTCAAACGATCTTCTTATTCAAATGGTAGAGAGCTTA G 2527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.921;DP=71;FS=2.508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=29.39;ReadPosRankSum=-1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,61:64:99:2565,184,0 -chr25 20090074 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr25 20157674 . G C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=6.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:368,0,451 -chr25 20157741 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.436;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,386 -chr25 20233628 . A T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.423;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=22.55;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:592,0,207 -chr25 20233631 . A AGCTCAACTT 554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.282;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=22.19;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:592,0,210 -chr25 20245798 . T G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=1.581;DP=35;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:303,0,3352 -chr25 20245804 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.968;DP=35;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:297,0,3352 -chr25 20247644 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.682;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.187;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:472,0,676 -chr25 20308505 . T C 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=2.555;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:786,0,883 -chr25 20314721 . A C 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.944;DP=65;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,26:65:99:895,0,1338 -chr25 20328665 . G A 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-1.659;DP=80;FS=11.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,49:80:99:1622,0,1003 -chr25 20328737 . A G 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.471;DP=75;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,53:75:99:1917,0,544 -chr25 20335917 . C A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.515;DP=59;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:679,0,1324 -chr25 20338202 . T TCTCTGCTCTTCGAGTGGC 2308.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2346,168,0 -chr25 20339479 . A G 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.074;DP=56;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.243;QD=15.50;ReadPosRankSum=2.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:896,0,1011 -chr25 20348051 . G A 1238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1267,90,0 -chr25 20355434 . G C 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=1.290;DP=68;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1360,0,1016 -chr25 20355584 . T G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.343;DP=49;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:368,0,1354 -chr25 20395362 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=1.070;DP=32;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:383,0,688 -chr25 20421639 . T G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.069;DP=28;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:518,0,489 -chr25 20421751 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.354;DP=42;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.819;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:668,0,740 -chr25 20423299 . GA G 604.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-1.103;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=26.29;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:64:642,64,0 -chr25 20424080 . T A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.805;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=15.40;ReadPosRankSum=-2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:444,0,554 -chr25 20425509 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:400,0,802 -chr25 20425733 . A C 664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:693,51,0 -chr25 20425957 . C T 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 -chr25 20426499 . A C 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=20.62;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:523,0,373 -chr25 20449340 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:252,0,390 -chr25 20519040 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-0.282;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:577,0,185 -chr25 20526905 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:361,0,345 -chr25 20539605 . C A 844.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:873,60,0 -chr25 20581654 . A G 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.405;DP=186;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,91:169:99:3051,0,2919 -chr25 20587845 . G C 8702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=1.452;DP=458;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=19.00;ReadPosRankSum=2.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,258:458:99:8731,0,7223 -chr25 20703735 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=16;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.24;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:33:384,0,33 -chr25 20723322 . GCTGTAGACACACCGAGACAGCATCGGCACTCTGCTTAAAACACCAAAACCAAAAACTCTTTGACATGGTTTTCTACGTAC G 6315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-1.111;DP=153;FS=5.483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,145:153:99:6353,536,0 -chr25 21021445 . G C 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:526,36,0 -chr25 21238705 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr25 21238955 . G A 732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:761,54,0 -chr25 21373701 . T TA 278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:316,35,0 -chr25 21668372 . CA C 281.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:13:319,0,13 -chr25 21762104 . C A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.676;DP=40;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:794,0,552 -chr25 21781192 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=1.733;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:718,0,439 -chr25 21785943 . CT C 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-0.892;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:573,0,164 -chr25 21786254 . C A 2048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-2.007;DP=157;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.039;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,60:157:99:2077,0,3306 -chr25 21796183 . ATACCTGTTAAATGTAGAGAGTGTGAAATATAAATGATGCGAGTGAATTAAATGTAAAAACATCACTGTCAGGTGTACACT A 6482.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=1.267;DP=150;FS=3.281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:6520,563,0 -chr25 21809869 . CT C 392.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:430,45,0 -chr25 21824112 . A G 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=1.367;DP=79;FS=6.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:1165,0,1609 -chr25 21824888 . G T 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=-0.073;DP=80;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:1089,0,1521 -chr25 21883592 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-1.340;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.426;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:279,0,422 -chr25 21926968 . A T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=1.186;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:331,0,566 -chr25 21947020 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:337,0,512 -chr25 22182606 . G GA 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.701;DP=33;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:465,0,330 -chr25 22779043 . A G 598.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:627,45,0 -chr25 22822103 . CT C 212.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:250,21,0 -chr25 22881375 . G C 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=-1.090;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=5.49;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,7:107:99:923,0,1520 -chr25 22948006 . G C 1290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1319,96,0 -chr25 23214688 . G T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr25 23359432 . GA G 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=4.134;DP=172;FS=8.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=2.40;ReadPosRankSum=-2.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,39:169:99:450,0,3104 -chr25 23577590 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.137;DP=45;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:580,0,890 -chr25 23583470 . TA T 1212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.915;DP=71;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,46:65:99:1251,0,242 -chr25 23700316 . CAT C 2011.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=-1.879;DP=230;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,72:230:99:2049,0,6771 -chr25 23701042 . A ATGTATATG 493.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:31:531,31,0 -chr25 23701397 . T C 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=5.528;DP=42;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=16.52;ReadPosRankSum=2.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:722,0,739 -chr25 23701563 . G A 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=7.654;DP=88;FS=105.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:1043,0,2081 -chr25 23703335 . C G 2682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.809;DP=191;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,81:191:99:2711,0,3561 -chr25 23703436 . G GTA 3472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-1.150;DP=257;FS=0.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,96:253:99:3510,0,5732 -chr25 23705817 . G T 5017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.553;ClippingRankSum=-0.252;DP=320;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,125:319:99:5046,0,13546 -chr25 24174290 . T TA 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.311;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:42:253,0,42 -chr25 24248300 . CT C 1037.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-1.166;DP=92;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:1075,0,178 -chr25 24294272 . G A 4153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=2.195;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=15.44;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,115:269:99:4182,0,5273 -chr25 24315431 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.414;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:594,0,2469 -chr25 24341491 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:338,0,165 -chr25 24359393 . C T 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=2.261;DP=141;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=6.12;ReadPosRankSum=2.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,37:141:99:891,0,3993 -chr25 24359405 . C T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=2.523;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=4.05;ReadPosRankSum=2.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:612,0,4386 -chr25 24764288 . CT C 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.940;DP=62;FS=5.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:506,0,630 -chr25 25756823 . ACTGTGGAGACACACAGAATCTCGTGAATCAATTTACTTTTAGGTAAAAGCACTTTAGGAGACCATGTCTGTTTTAATTATTTCTATCAAATTGCCATTTTTAAAGCTTTGACTGTTCAATTAC A 1771.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=2.433;DP=307;FS=7.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,304:306:99:1809,686,0 -chr25 26125050 . T C 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.854;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=26.92;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:809,0,212 -chr25 26182435 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.981;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.457;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:461,0,258 -chr25 26353266 . G A 543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:572,42,0 -chr25 26411371 . A AT 497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.471;DP=39;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:535,0,323 -chr25 26680732 . T C 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1020,75,0 -chr25 26692223 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:379,0,194 -chr25 26692281 . T G 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 -chr25 26692331 . C T 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr25 26699600 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,99 -chr25 26773066 . C T 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 -chr25 26773072 . A G 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:431,30,0 -chr25 27097417 . T C 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:564,39,0 -chr25 27097428 . A T 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:564,39,0 -chr25 27279793 . C A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=1.799;DP=24;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:30:685,0,30 -chr25 27301952 . C T 493.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.488;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:520,0,4 -chr25 27302050 . T C 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr25 27687531 . TAGGTACTTTCCCCAGACAAAACATTGTTCATATGACCTTAGTTTAGGTCAACAGCAAAGATAATTGCTACTTGTCCAATGACTGTGCAAGATTATATTAAAGTACAGTTAGGCTCATTGAACCACATACTCCATTATCGTCCCCACCTGTTTCCAC T 1449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=4.684;DP=51;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=28.43;ReadPosRankSum=-3.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1487,0,5075 -chr25 27687954 . CAGGTTAGTCATAAGGTAAAACCTCCAAACAGAGTGCTTCATAAGCTTGTAGAGTACTTGGTGCTAGCAAACAATTTATGCTCTTTTA C 1198.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=2.889;DP=42;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=28.54;ReadPosRankSum=-1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1236,0,3538 -chr25 27689762 . CAGGTTTGTACATCCTGAATCTAGAAATTATATACAGTATAATCAATTCCCAGACAACTCTGAACAACATCAGTGTGTATGTAA C 1615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.262;DP=55;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,46:55:99:1653,0,2970 -chr25 27690175 . AGTGAGTCCACAATGCATACTTTTGTTCTGTTATAACGTTGCCAAAAACACTAATTCATAACTTACTGTCTTTTCAG A 1687.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=-0.146;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,41:48:99:1725,0,1639 -chr25 27695975 . TCTAAAGTGAAGCAGATGTCATTGAATGTTCTTGTATCCTTCAGGAACCCAATTATTATAAAATGTAACAGCCTTTCAC T 1454.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.121;DP=34;FS=2.285;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:99:1492,124,0 -chr25 27709148 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=1.129;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:350,0,1823 -chr25 27709177 . ACTAAAAATAGACAATTATATATTAATTGAACAATTATGCATTTAGTAGAATTTTATTTTGTCATAACTGCTGTATCGAGTGCTATCTTAC A 2943.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=1.681;DP=67;FS=3.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,66:67:99:2981,251,0 -chr25 27709269 . T G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-2.125;DP=67;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:328,0,1966 -chr25 27744556 . GA G 2807.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.401;DP=244;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,111:234:99:2845,0,2996 -chr25 28367772 . G A 1769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.384;DP=47;FS=6.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:1798,0,235 -chr25 28367825 . G A 1691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=-0.281;DP=66;FS=14.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=25.63;ReadPosRankSum=-1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:1720,0,420 -chr25 28367943 . A T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.314;DP=48;FS=4.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:519,0,813 -chr25 28368104 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.588;DP=47;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:263,0,1006 -chr25 28368151 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-2.472;DP=19;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:318,0,341 -chr25 28368362 . G T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr25 28369536 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:264,0,98 -chr25 28582127 . A T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.313;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=30.49;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:699,0,292 -chr25 28583083 . T TTTGTTATTTGA 1060.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:73:1098,73,0 -chr25 28678524 . A AT 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.087;DP=73;FS=15.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:764,0,950 -chr25 28678956 . GA G 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.630;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:348,0,483 -chr25 28679219 . C CA 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.895;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:638,0,728 -chr25 29139649 . GA G 386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:424,39,0 -chr25 29140436 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.382;DP=38;FS=4.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:593,0,686 -chr25 29140483 . C G 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.154;DP=42;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:555,0,813 -chr25 29140689 . AAGGTGAGACGAACGAAATCTATTTTTTTCTTTTAGCACGCACCGCATGTCTTCTCTCTTTCTCCCATTCTTTAACACAATTTGCAATTTC A 1128.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=2.593;DP=32;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=35.33;ReadPosRankSum=-2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1166,0,871 -chr25 29146482 . C CA 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=-1.126;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:382,0,1022 -chr25 29146485 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.052;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:382,0,1024 -chr25 29199631 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=-0.772;DP=43;FS=10.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:311,0,1335 -chr25 29199983 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:251,0,310 -chr25 29202448 . G A 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.541;DP=99;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:1347,0,2064 -chr25 29226146 . ACTGCAATCACAAGGTCATTCCCATGTAGAAGTTATAATATTGACTTCCATCTGTGTTCTTCAGTAACTGAGTGTGCTTAC A 2634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.962;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=32.41;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,68:70:99:2878,0,834 -chr25 29251503 . G A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.105;DP=60;FS=5.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:469,0,1652 -chr25 29251569 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.895;DP=40;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:370,0,1074 -chr25 29251932 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=3.151;DP=47;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:344,0,1317 -chr25 29257181 . G A 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.168;DP=57;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:989,0,941 -chr25 29266423 . C T 1029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.068;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1058,0,1145 -chr25 29284561 . T A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.990;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:715,0,628 -chr25 29457201 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=9.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:356,0,540 -chr25 29457340 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.377;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:346,0,625 -chr25 29507700 . TA T 1196.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=-0.873;DP=162;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,59:150:99:1234,0,1763 -chr25 29507826 . GTA G 965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.061;DP=167;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=5.78;ReadPosRankSum=2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,42:149:99:1003,0,5364 -chr25 29528055 . G A 3469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=-1.144;DP=290;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,115:290:99:3498,0,5597 -chr25 29582063 . C CTG 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,486 -chr25 29625700 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=-1.432;DP=34;FS=5.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:604,0,1281 -chr25 29643604 . GCAGGTAAATGTATGGGGGATGAAGATTTTGGGGGCTGGATTTGAAATATAATTGTAAATACTTGTTTTTTGTTTTGGTCAAT G 1724.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=1.652;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1762,151,0 -chr25 29656894 . G C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.558;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:476,0,498 -chr25 29855851 . GT G 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.696;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,40:189:99:346,0,4712 -chr25 29938702 . T C 7027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.763;DP=262;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=26.82;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,188:262:99:7056,0,1826 -chr25 29938723 . A G 8360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.031;DP=311;FS=0.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=26.88;ReadPosRankSum=-1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,221:311:99:8389,0,2293 -chr25 29938828 . G A 8191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.432;DP=290;FS=2.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,221:290:99:8220,0,1399 -chr25 29938984 . G C 7408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=-0.348;DP=266;FS=3.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=27.85;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,198:266:99:7437,0,1507 -chr25 29939263 . T G 6074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=1.917;DP=226;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=26.88;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,163:225:99:6103,0,1488 -chr25 29946816 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:328,0,150 -chr25 30652292 . C G 1810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.592;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1839,0,2262 -chr25 30683838 . C T 1847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.368;DP=103;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1876,0,1610 -chr25 30687333 . T C 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-1.288;DP=88;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=21.61;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,56:88:99:1930,0,1105 -chr25 30687438 . C T 1611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.181;DP=93;FS=3.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1640,0,1602 -chr25 30692442 . G A 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.597;DP=37;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=31.53;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:99:1195,0,112 -chr25 30692577 . T G 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 -chr25 30696241 . T A 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:694,54,0 -chr25 30700743 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.564;DP=31;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:283,0,368 -chr25 30701619 . CT C 701.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=-2.675;DP=79;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:739,0,1026 -chr25 31134846 . G A 5733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.376;DP=383;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,181:382:99:6273,0,6652 -chr25 31211048 . C A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=1.194;DP=170;FS=5.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,44:170:99:1011,0,4858 -chr25 31289064 . A T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-0.292;DP=30;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:409,0,672 -chr25 31317045 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.198;DP=36;FS=5.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:446,0,828 -chr25 31317972 . TGTACGTTATCAGTGATTTAGAAATATTCATTCAAAATCGAATTGTCTTTAAAGTATGATTCATAAAATCCATGATTTGATACCTTTCAG T 1752.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1790,168,0 -chr25 31320375 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-2.012;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:286,0,842 -chr25 31321525 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.313;DP=40;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:653,0,949 -chr25 31333723 . C A 5114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=1.792;DP=384;FS=3.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,147:383:99:5143,0,8150 -chr25 31335700 . A G 4961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-0.608;DP=346;FS=5.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,151:346:99:4990,0,6420 -chr25 31362481 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-0.966;DP=24;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:334,0,582 -chr25 31373206 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.903;DP=25;FS=10.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:231,0,660 -chr25 31380768 . A C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.535;DP=32;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:682,0,539 -chr25 31381193 . G A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=1.677;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:585,0,859 -chr25 31968736 . C CCT 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-0.474;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:78:613,0,78 -chr25 32088593 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=26.05;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:393,0,137 -chr25 32090372 . T C 1225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:84:1254,84,0 -chr25 32090382 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=1.308;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:414,0,726 -chr25 32090555 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.788;DP=31;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:443,0,154 -chr25 32090676 . A G 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-2.538;DP=36;FS=9.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=27.66;ReadPosRankSum=-2.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:1024,0,1560 -chr25 32090718 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=-3.895;DP=93;FS=16.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=10.71;ReadPosRankSum=4.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:1024,0,1532 -chr25 32090797 . C T 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.516;DP=251;FS=38.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,36:167:99:977,0,10290 -chr25 32090805 . C T 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.422;DP=240;FS=55.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,33:155:99:921,0,10293 -chr25 32090955 . A G 2228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:2257,158,0 -chr25 32091058 . A T 391.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.579;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=28.00;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:13:420,0,13 -chr25 32120782 . T A 5308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=1.000;DP=888;FS=4.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=5.98;ReadPosRankSum=2.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:660,225:885:99:5346,0,26399 -chr25 32124985 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 -chr25 32129048 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=1.061;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:239,0,766 -chr25 32167334 . A T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=-1.179;DP=330;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,61:330:99:904,0,10576 -chr25 32229373 . T C 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=1.424;DP=150;FS=1.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,33:149:99:670,0,4231 -chr25 32232576 . G T 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.025;DP=217;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,48:217:99:959,0,6436 -chr25 32233814 . C T 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.791;DP=169;FS=5.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,53:169:99:1435,0,5062 -chr25 32233825 . G A 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=1.114;DP=173;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,56:173:99:1465,0,5013 -chr25 32233950 . G T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.468;DP=212;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,41:212:99:699,0,6492 -chr25 32233969 . G C 2294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.206;DP=203;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,91:161:99:3375,0,2467 -chr25 32234463 . T A 1429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-0.692;DP=142;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,53:142:99:1458,0,7431 -chr25 32235031 . A T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=-0.182;DP=145;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:973,0,4380 -chr25 32236312 . A C 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-0.036;DP=44;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:630,0,855 -chr25 32236944 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.566;DP=205;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,40:205:99:679,0,6403 -chr25 32237099 . T C 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.649;DP=281;FS=2.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,70:281:99:1501,0,7959 -chr25 32237326 . C T 1335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.782;DP=215;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,64:215:99:1373,0,10499 -chr25 32237456 . A T 2346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=-3.399;DP=208;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,72:208:99:2375,0,4507 -chr25 32237544 . G T 1455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=1.577;DP=175;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,55:175:99:1484,0,5455 -chr25 32237599 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.383;DP=80;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:297,0,4329 -chr25 32256909 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=2.409;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:444,0,1125 -chr25 32256928 . C G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.425;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=16.63;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:444,0,1130 -chr25 32258067 . A G 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.271;DP=77;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:1328,0,1439 -chr25 32258255 . T A 2469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.332;ClippingRankSum=-1.049;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=28.72;ReadPosRankSum=-3.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,56:84:99:2498,0,491 -chr25 32258312 . A T 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.290;DP=61;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1377,0,1158 -chr25 32258684 . G T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=1.974;DP=80;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:1335,0,1514 -chr25 32258711 . C T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.183;DP=53;FS=4.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:641,0,1267 -chr25 32258898 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-2.743;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:274,0,519 -chr25 32259033 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.717;DP=23;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:508,0,555 -chr25 32260073 . GAGGTGAGTTTTACTGCTGATAAAGTAGCTAGGTAAACTATCAGGAAAGGTCTTATGTCTTTGTGTCATCAACTTC G 11263.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-1.791;DP=303;FS=1.932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=29.05;ReadPosRankSum=2.572 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,262:266:99:11301,821,0 -chr25 32261678 . T C 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.924;DP=141;FS=4.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:1406,0,3788 -chr25 32262679 . T C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-1.277;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:433,0,503 -chr25 32262728 . C A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.197;DP=30;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:538,0,468 -chr25 32265399 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.531;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:322,0,2367 -chr25 32398770 . T G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=2.407;DP=39;FS=6.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:602,0,752 -chr25 32401927 . GT G 239.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:277,26,0 -chr25 32452002 . T C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=-0.655;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:621,0,1088 -chr25 32457677 . C T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=1.068;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:685,0,1545 -chr25 32468004 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=20.20;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:311,0,154 -chr25 32470353 . T A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.767;DP=93;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:427,0,2745 -chr25 32474081 . CCCTGACGAAAACAAAATGAGCATACATTTATTATTACAGCTAAATTATGCATCAAAACAATTTCCAAACTTGATCATGAGGTGATCTA C 3432.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=1.688;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=36.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:3470,248,0 -chr25 32475800 . T C 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=1.667;DP=77;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1036,0,1564 -chr25 32475818 . TCTGCATAATAAGACGTGATGCATTATGAGAGTTTCTGTTTTGATAACAAAGGGAGACTGCAGTAACTTTTAGTCAGTTTTTACGTGAACGTTAATTAC T 2471.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=1.361;DP=59;FS=3.496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,57:59:99:2509,233,0 -chr25 32487319 . A T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.265;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,28:37:99:1073,0,229 -chr25 32499566 . A G 432.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=33.27;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:3:459,3,0 -chr25 32549943 . G T 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.556;DP=279;FS=4.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,72:279:99:1641,0,8040 -chr25 32556200 . CGTAAGACGCACTCAGAAAATATCCTTGAGATCAGTTGTTTGGGTGATCACTTTTTTAAACTCTTCCTTAATGTGGCTCTCCAG C 11861.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=3.206;DP=320;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=31.36;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,298:319:99:12800,0,5182 -chr25 32556438 . C T 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=-0.069;DP=301;FS=7.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=4.03;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,72:301:99:1241,0,8564 -chr25 32607003 . A G 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.255;DP=180;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,55:180:99:1395,0,4886 -chr25 32611961 . A C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.577;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:484,0,1273 -chr25 32633323 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.983;DP=81;FS=5.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:360,0,4764 -chr25 32725594 . CCCTACAGACGATCAAACAGGCTCAACATCCAACACTGTAAATGCACTAAACCTTTATAAAAAGAGCGGTAAATCATCACAGA C 572.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=1.509;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=26.03;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:610,0,1108 -chr25 32808684 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-0.512;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=14.77;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:427,0,556 -chr25 32810359 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=-2.976;DP=115;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:425,0,6749 -chr25 32810360 . T A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.753;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:434,0,6794 -chr25 32879113 . A G 3690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.415;DP=188;FS=12.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,110:188:99:3719,0,2742 -chr25 32882593 . ACTGCAAAACCAATTCAAAATGTCAGCAAAATACATGATTTACAATGAGAATGACGGAACAGTCAGCTGAAATGAAGCATACTCAC A 10239.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-1.573;DP=232;FS=6.617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=31.17;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,220:226:99:10277,731,0 -chr25 33217861 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.158;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:405,0,1407 -chr25 33219428 . T A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.109;DP=83;FS=7.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:472,0,2213 -chr25 33220591 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-2.269;DP=72;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:337,0,2156 -chr25 33231203 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=-0.584;DP=61;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:470,0,1562 -chr25 33233476 . C T 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.584;DP=77;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1085,0,1583 -chr25 33240884 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=1.682;DP=63;FS=11.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1184,0,810 -chr25 33254610 . G A 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-1.475;DP=68;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,22:68:99:611,0,1713 -chr25 33261964 . GCTGTGGGAAAACAGCAGCAGTCAACCTGACTTTGCTCCCTCATATCGTTTAAGCATTACGTAATCATCTCTCATAC G 5876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=1.901;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=30.24;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,137:139:99:5914,490,0 -chr25 33294398 . C A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.586;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:279,0,919 -chr25 33300004 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.195;DP=37;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:229,0,2319 -chr25 33300014 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.240;DP=38;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:229,0,2319 -chr25 33305177 . C G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.413;DP=31;FS=9.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,837 -chr25 33345110 . C CT 1793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=1.105;DP=172;FS=4.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=10.43;ReadPosRankSum=-2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1831,0,1842 -chr25 33345307 . G T 1739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-1.456;DP=268;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,76:268:99:1768,0,7118 -chr25 33347710 . TCTAAAGAGAAAGCAAAAACACATGTACTTTCTGACTCCACACATGCACTTTTCTGACTTATTTGAGTTTTGAATGAGATTATTGAGAAGTGTGTGTCCATTTCAGGCACCCGTACTGAC T 8160.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=3.491;DP=198;FS=1.627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,192:198:99:8198,590,0 -chr25 33356132 . G A 200.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:229,0,22 -chr25 33371965 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.028;DP=26;FS=6.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:260,0,2043 -chr25 33372013 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=1.173;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:294,0,1032 -chr25 33373077 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.371;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:516,0,470 -chr25 33373089 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.614;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:540,0,372 -chr25 33377685 . T G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.952;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.28;ReadPosRankSum=-2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:461,0,432 -chr25 33497378 . A AAC 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=-0.782;DP=94;FS=6.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:348,0,3491 -chr25 33497426 . A AT 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-1.989;DP=105;FS=4.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:332,0,1808 -chr25 33497971 . C CT 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.879;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:603,0,492 -chr25 33498584 . C CT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.899;DP=32;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:320,0,372 -chr25 33583197 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr25 33721965 . CT C 293.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.639;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:19:331,0,19 -chr25 33739733 . T G 779.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.030;DP=152;FS=30.137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,90:99:99:808,172,0 -chr25 33739734 . G GA 762.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.189;DP=159;FS=30.137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,90:99:99:800,165,0 -chr25 34062433 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:402,0,201 -chr25 34094525 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:291,0,392 -chr25 34465846 . G T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr25 34827066 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-2.353;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:753,0,633 -chr25 35034592 . G C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,415 -chr25 35065347 . C T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=0.214;DP=441;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:360,79:439:99:957,0,14232 -chr25 35067177 . TGTGAGTATGGCAGTGTTTAAATGCACTTATTAAGGGGTTTGTACCTGAGATATAACCGTGTGTTTCATCACAG T 16384.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.175;DP=389;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,387:388:99:16422,1174,0 -chr25 35201306 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-1.682;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:296,0,255 -chr25 35201488 . G A 947.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:976,69,0 -chr25 35202800 . G GT 679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:717,66,0 -chr25 35328652 . C T 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=-0.136;DP=74;FS=14.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1056,0,1448 -chr25 35331839 . T C 2851.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=0.817;DP=71;FS=6.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:2880,208,0 -chr25 35331845 . G A 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.994;DP=76;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=20.08;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:1554,0,1081 -chr25 35334538 . T C 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.059;DP=55;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:958,0,991 -chr25 35335055 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.149;DP=89;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:247,0,2784 -chr25 35335100 . C G 2277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.140;DP=84;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=27.12;ReadPosRankSum=1.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,61:84:99:2306,0,580 -chr25 35335247 . T C 3537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3566,256,0 -chr25 35343609 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:387,0,197 -chr25 35458930 . GT G 223.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:261,29,0 -chr25 35462597 . G A 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.180;DP=127;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.957;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,39:127:99:1012,0,3328 -chr25 35465382 . C T 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.699;DP=176;FS=14.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,44:176:99:875,0,10475 -chr25 35466954 . C T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-0.422;DP=130;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,31:129:99:650,0,3515 -chr25 35470141 . G A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-2.111;DP=132;FS=5.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=4.88;ReadPosRankSum=2.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,32:132:99:672,0,3683 -chr25 35471661 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-3.090;DP=140;FS=4.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=2.28;ReadPosRankSum=2.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:348,0,4103 -chr25 35471879 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-2.893;DP=105;FS=3.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:405,0,6746 -chr25 35499435 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=1.290;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:499,0,495 -chr25 35499746 . C A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.537;DP=74;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:595,0,1843 -chr25 35511812 . A G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.007;DP=110;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,27:110:99:614,0,3087 -chr25 35520340 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-0.652;DP=84;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:359,0,2334 -chr25 35544194 . T A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr25 35662984 . A T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.624;DP=58;FS=7.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:834,0,1363 -chr25 35663194 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.860;DP=45;FS=3.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:285,0,1610 -chr25 35663320 . T C 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.112;DP=53;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:937,0,935 -chr25 35665247 . A G 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-1.376;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.968;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:913,0,1392 -chr25 35669038 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:396,0,392 -chr25 35669419 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.840;DP=64;FS=14.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:318,0,3305 -chr25 35669516 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-2.177;DP=75;FS=5.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:343,0,3431 -chr25 35671421 . TA T 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.020;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:283,0,395 -chr25 35671902 . G GA 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.383;DP=43;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:458,0,344 -chr25 35672452 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-0.561;DP=46;FS=6.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:387,0,1242 -chr25 35694920 . T C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.019;DP=88;FS=12.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:606,0,2296 -chr25 35695386 . A G 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.407;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:975,0,2445 -chr25 35764075 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.429;DP=125;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,28:125:99:542,0,3567 -chr25 35765559 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.008;DP=62;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:279,0,1803 -chr25 35765775 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-2.003;DP=106;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:628,0,2964 -chr25 35773803 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=-1.680;DP=167;FS=2.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,32:153:99:643,0,4621 -chr25 35782282 . G C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.394;DP=125;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:615,0,3543 -chr25 35798261 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=2.698;DP=33;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:367,0,789 -chr25 35815217 . C T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.757;DP=145;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,36:145:99:791,0,4139 -chr25 35839308 . G T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=1.720;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:504,0,1002 -chr25 35857983 . C T 1699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.200;ClippingRankSum=-0.153;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,72:269:99:1728,0,7348 -chr25 35860651 . G T 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.651;DP=286;FS=3.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,70:286:99:1420,0,8202 -chr25 35865294 . C T 2155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-2.034;DP=270;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=7.98;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,84:270:99:2184,0,7254 -chr25 35865426 . AAT A 669.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.211;DP=19;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=28.19;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:27:707,27,0 -chr25 35865627 . A AT 458.08 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.456;DP=30;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:0:455,0,0 -chr25 35865747 . C A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.961;DP=80;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:599,0,2101 -chr25 35865782 . C A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.695;DP=53;FS=7.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:801,0,1111 -chr25 35990888 . C A 1511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=-3.005;DP=57;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=26.52;ReadPosRankSum=2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1540,0,251 -chr25 35995188 . C T 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-1.179;DP=63;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1067,0,962 -chr25 35997687 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:282,0,258 -chr25 35998042 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=2.574;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:464,0,1193 -chr25 35998134 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.985;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:403,0,452 -chr25 35999036 . T C 202.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:11:230,0,11 -chr25 35999494 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.952;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:445,0,540 -chr25 36000140 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=2.324;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:244,0,454 -chr25 36000255 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=3.127;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,333 -chr25 36001095 . A AC 1315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:99:1353,99,0 -chr25 36001115 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=-1.266;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:455,0,696 -chr25 36001455 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=3.367;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:380,0,489 -chr25 36001636 . C T 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.622;DP=48;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=28.41;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,34:48:99:1392,0,840 -chr25 36001637 . C T 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.919;DP=48;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=28.41;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,34:48:99:1392,0,840 -chr25 36001749 . CT C 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.540;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:278,0,159 -chr25 36003865 . AGTGAGTCTGAGTGTTTTCTCAGCGTCTGCAGGTGCCGCAGTGAATGAAGGATGTTCTTCTCTCCCACAG A 1059.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=5.138;DP=59;FS=14.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=17.96;ReadPosRankSum=-4.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1097,0,12755 -chr25 36014853 . C CT 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-1.262;DP=26;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:283,0,274 -chr25 36017373 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.296;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,543 -chr25 36087026 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=1.540;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=31.82;ReadPosRankSum=2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:51:601,0,51 -chr25 36092295 . C A 1211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-0.666;DP=69;FS=4.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.602;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1240,0,1240 -chr25 36092655 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=3.200;DP=61;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:524,0,3499 -chr25 36095529 . T C 2096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.180;DP=83;FS=6.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=25.26;ReadPosRankSum=-2.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:99:2125,0,756 -chr25 36099567 . ATAGGTAAAGTAGGATGGATATTT A 3982.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.615;DP=93;FS=3.153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=28.89;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:4020,343,0 -chr25 36099591 . CCTAACTAATTAATCAGTATTATGTCTCAAATGCTGTAGTTTAACTTTCTGTCTCTTACTCT C 3886.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=-1.466;DP=89;FS=2.217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,86:89:99:3924,335,0 -chr25 36135386 . T G 1993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.818;DP=112;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:2022,0,1814 -chr25 36135441 . CCCTGCACAGAAAACCATTTAAAATGTCAAGATATACTTTCTGAATGTGTAGAAAGTGAACAGAGAAACTCA C 4820.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=1.667;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:4858,401,0 -chr25 36137933 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.738;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:994,0,1263 -chr25 36153640 . ACTGAAAAACAAATGCACGATTACCCTCACTGTAGCATTACCAGTGCTGTAAGACATCTGCCAGAAGCCACACATAAACTCAC A 3204.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.685;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:3242,251,0 -chr25 36279243 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.591;DP=26;FS=12.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:402,0,473 -chr25 36305529 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-0.936;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,509 -chr25 36309437 . C A 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=31.11;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:32:492,32,0 -chr25 36315997 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=1.735;DP=45;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:241,0,1257 -chr25 36332717 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:377,0,362 -chr25 36333649 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.222;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:292,0,222 -chr25 36334991 . GT G 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-1.799;DP=39;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:484,0,392 -chr25 36335326 . G A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-1.613;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=30.78;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:44:490,0,44 -chr25 36335817 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.427;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:365,0,628 -chr25 36394992 . AC A 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:250,0,298 -chr25 36397020 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=-0.482;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:508,0,513 -chr25 36433165 . C A 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 -chr25 36661031 . TTC T 485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:523,37,0 -chr25 36661077 . T TTA 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:489,32,0 -chr25 36661870 . T G 491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:520,36,0 -chr25 36661999 . T C 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=2.063;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.42;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:562,0,152 -chr25 36662374 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.646;DP=33;FS=3.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:265,0,1101 -chr25 36662450 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:299,0,529 -chr25 36668232 . G A 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.146;DP=78;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,44:78:99:1451,0,1176 -chr25 36707990 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=1.111;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:284,0,375 -chr25 36724583 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.134;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:297,0,446 -chr25 36745701 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.905;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:275,0,447 -chr25 36749758 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.077;DP=27;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:480,0,490 -chr25 36754456 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.733;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=18.88;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:368,0,273 -chr25 36757758 . T G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.047;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:545,0,339 -chr25 36819992 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:300,0,276 -chr25 36990712 . T C 1300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.921;DP=77;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1329,0,1236 -chr25 36990878 . C T 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:51:739,51,0 -chr25 36990953 . G C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=1.010;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:675,0,763 -chr25 36993291 . G A 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.337;DP=86;FS=5.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:1476,0,1524 -chr25 36994262 . GT G 323.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:361,24,0 -chr25 36998135 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:42:429,0,42 -chr25 37041916 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-0.777;DP=50;FS=4.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,28:29:99:1654,0,1214 -chr25 37041957 . C T 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-3.738;DP=53;FS=14.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=30.66;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:1653,0,1214 -chr25 37041991 . A T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=-2.601;DP=84;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:1648,0,1214 -chr25 37042064 . A T 4361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.246;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,13:100:99:4390,0,2650 -chr25 37042126 . A AC 4320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-0.637;DP=122;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=28.30;ReadPosRankSum=3.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,60:79:99:4358,0,2650 -chr25 37042241 . G T 4347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=1.457;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=28.29;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,62:63:99:4376,0,2650 -chr25 37102880 . GCTGTTGGATGAAGTCATGATGCTTTTTAGTGAATCTGAACCTAAACAAGTTTTTTTACAGTAAAGATTTGCTCTTAC G 727.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=2.462;DP=21;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=34.65;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:765,0,615 -chr25 37106364 . ACACCTGAGATAGGAGTGTCGTCTCCATTAATAAAACAATCTCATCAGCATCTTTAATACTGCTTTACACACAGACTGAAACT A 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.474;DP=18;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=24.54;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:479,0,1069 -chr25 37116351 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:298,0,388 -chr25 37116367 . CGCCTGTGAAACAGACACATCCACTCATAAGCATGACTCCATTTCCCGTGTATTCATTTGGTAATGTTTGCACGT C 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.933;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=27.47;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:99:669,0,1189 -chr25 37128029 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,213 -chr25 37171218 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.313;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:241,0,173 -chr25 37235551 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=1.522;DP=42;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:514,0,1134 -chr25 37236079 . T C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=1.398;DP=60;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.748;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:497,0,2553 -chr25 37256098 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=20.84;ReadPosRankSum=-1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,153 -chr25 37262578 . C A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:310,0,178 -chr25 37278742 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:278,0,207 -chr25 37279045 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.380;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.102;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:545,0,983 -chr25 37286608 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.950;DP=30;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:825,0,240 -chr25 37289969 . G C 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.639;DP=61;FS=7.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:783,0,1238 -chr25 37290065 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.518;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:751,0,984 -chr25 37321769 . G A 651.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.953;DP=20;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=32.59;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:26:680,0,26 -chr25 37322887 . TA T 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.493;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:454,0,138 -chr25 37323081 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-1.600;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=20.77;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:319,0,169 -chr25 37323098 . T A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.56;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:311,0,137 -chr25 37454390 . C T 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.022;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:902,0,657 -chr25 37456134 . A G 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.770;DP=54;FS=7.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:901,0,930 -chr25 37465188 . A C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.961;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:424,0,351 -chr25 37494916 . C T 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:39:561,39,0 -chr25 37540091 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr25 37558639 . T C 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr25 37575317 . T C 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.958;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1023,0,872 -chr25 38223106 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr25 38256906 . A G 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-1.804;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:581,0,1061 -chr25 38259510 . AGTGAGTGTGTGCATGCATCAATGCTCCACTTATGTGTGGTGTTTTCTTCATCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTCAG A 2385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=2.409;DP=103;FS=11.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=23.16;ReadPosRankSum=-3.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:2423,0,11374 -chr25 38259638 . C G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-0.255;DP=100;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=7.74;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,32:100:99:802,0,3007 -chr25 38262513 . C A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.452;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=7.20;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,36:122:99:907,0,3314 -chr25 38263673 . C G 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.759;DP=72;FS=7.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.658;QD=9.39;ReadPosRankSum=2.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:704,0,1868 -chr25 38329479 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.348;DP=43;FS=14.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:240,0,1196 -chr25 38333113 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.828;DP=59;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:531,0,1464 -chr25 38357515 . C T 1979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=1.579;DP=310;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,87:310:99:2008,0,8278 -chr25 38357550 . GGGTACGCTCACACACACACACACACATATCAGTGAACATCAATACTGTCAAACACACTCCGCTCACCTCAGGCTTCCTGAATGTA G 1695.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=4.008;DP=295;FS=1.612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=5.75;ReadPosRankSum=-2.207 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,261:267:99:1733,496,0 -chr25 38363562 . C T 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-4.663;DP=245;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=6.43;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,70:245:99:1603,0,12780 -chr25 38363606 . GGGTGAGGAGAGCTTCAGAAACGGCAGCATCTTCATCATCATCATCATCACCCTCATCATTATTGTACTTCTCCATCCTCA G 18240.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-1.196;DP=291;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,290:291:99:18278,1422,0 -chr25 38364752 . AAGGTAAAATCTGATCCAGGGTCAGCTCTGAGTGTGTCTGCAGTGTGTAGCAGTGGCATCTTTGAGCCTGTGTGTGTCTGTGTGTGC A 14243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=2.716;DP=339;FS=13.507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=33.29;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,325:329:99:14281,986,0 -chr25 38364856 . C T 2075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.030;DP=345;FS=1.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,92:345:99:2104,0,9630 -chr25 38366898 . AGTGTGT A 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-1.926;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:386,0,270 -chr25 38368024 . CT C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.103;DP=143;FS=11.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,36:133:99:541,0,2313 -chr25 38368582 . CT C 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.040;DP=100;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:540,0,1682 -chr25 38404844 . C T 2826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-3.527;DP=382;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,113:382:99:2855,0,10366 -chr25 38412812 . G C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.465;DP=43;FS=12.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=11.41;ReadPosRankSum=3.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:519,0,689 -chr25 38413068 . C T 1520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=-1.513;DP=339;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,76:339:99:1549,0,10328 -chr25 38414858 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-1.857;DP=305;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,82:303:99:1901,0,8505 -chr25 38435823 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=-0.304;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:325,0,1148 -chr25 38435891 . C G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.346;DP=86;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:542,0,2355 -chr25 38435947 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=-0.360;DP=91;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:610,0,2460 -chr25 38436127 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=-0.414;DP=136;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,39:136:99:986,0,3553 -chr25 38438689 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=1.010;DP=115;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,21:115:99:302,0,3696 -chr25 38439879 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.182;DP=146;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,25:146:99:342,0,4506 -chr25 38440815 . TCTGACCAACACAAACACACCGGTCAGCTACACTAATGCACACACACACACACACACACACACACAGACACACACACACACTCATCAAACACACTCGCACAGACATCAGACAC T 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=3.253;DP=56;FS=4.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=9.30;ReadPosRankSum=-3.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,49:54:99:558,0,703 -chr25 38447143 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=2.411;DP=268;FS=0.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=1.18;ReadPosRankSum=-5.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,39:268:99:345,0,8831 -chr25 38448918 . C T 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 -chr25 38448984 . CGTGCGTGTATGTGTGTTTGCACACATATTTTTGCGAGTATGTATGTGT C 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=3.330;DP=24;FS=10.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=11.95;ReadPosRankSum=-2.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:324,0,1801 -chr25 38449244 . T A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=1.135;DP=38;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:485,0,1223 -chr25 38450863 . G A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-1.291;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,27:95:99:665,0,2441 -chr25 38450977 . A G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.847;DP=79;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:604,0,2119 -chr25 38462582 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:300,0,498 -chr25 38475369 . GACCTGCAGGAAACACATTCAGACGCTGTAACAGGTCGCTTGACTAACACAGGGTAAATATGGGATAGAGACGTGTACAC G 1402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=1.920;DP=37;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=23.53;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,34:37:99:1440,0,413 -chr25 38477081 . TCTAGAAGAGCACAGGATAATCAGAAGGAAACCCACAGACTCAGAGCTGCAGAAACACAGAGATGTTCTTAC T 1840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.652;DP=43;FS=4.293;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=33.37;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1878,136,0 -chr25 38489918 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.91;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:339,0,133 -chr3 47350 . C T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr3 379746 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.920;DP=72;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:446,0,2384 -chr3 380424 . A AT 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.791;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:595,0,596 -chr3 382978 . C G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.301;DP=41;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:272,0,1190 -chr3 393433 . A AT 2070.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=-0.666;DP=249;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,72:234:99:2108,0,11620 -chr3 393741 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=2.431;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:477,0,1225 -chr3 399913 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=5.256;DP=144;FS=31.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.43;ReadPosRankSum=-3.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,13:144:99:810,0,4917 -chr3 405604 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.234;DP=39;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:271,0,1022 -chr3 420824 . C T 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.247;DP=309;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,64:309:99:1031,0,9230 -chr3 423363 . C T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.744;DP=180;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=2.92;ReadPosRankSum=3.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,34:180:99:554,0,5815 -chr3 426983 . G T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=-0.558;DP=113;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=2.61;ReadPosRankSum=2.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,24:113:99:323,0,5849 -chr3 566388 . A G 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr3 566499 . C G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=2.246;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:306,0,1303 -chr3 566790 . A G 699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:728,51,0 -chr3 567050 . T C 623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:45:652,45,0 -chr3 716780 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.680;DP=25;FS=10.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:456,0,937 -chr3 716789 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.263;DP=22;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:456,0,937 -chr3 719597 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.482;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:686,0,346 -chr3 719693 . C G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.776;DP=80;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:564,0,2568 -chr3 719948 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=2.601;DP=106;FS=14.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,24:106:99:481,0,3047 -chr3 891205 . A T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr3 968817 . G A 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr3 1019584 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=1.953;DP=25;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:312,0,577 -chr3 1020356 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=2.532;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,375 -chr3 1778687 . C G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr3 1800095 . A G 239.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:268,0,22 -chr3 1903403 . ACACACACACACACACACACACACACACACACACAC A 781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:95:895,95,0 -chr3 1965111 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr3 2097342 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=3.422;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=20.45;ReadPosRankSum=-3.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:560,0,565 -chr3 2097627 . TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACACACACACACACACACACACACACACA T 544.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:99:683,139,0 -chr3 2309799 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,136 -chr3 2991660 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr3 2991757 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,229 -chr3 2991809 . C T 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:318,24,0 -chr3 2992033 . A G 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 -chr3 3154926 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.436;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,24:158:99:252,0,5466 -chr3 3155590 . C A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=2.976;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=14.19;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:312,0,586 -chr3 3156606 . TA T 782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-1.625;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:820,93,0 -chr3 3156634 . T C 1542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=1.511;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=32.14;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:1571,134,0 -chr3 3157166 . T A 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr3 3157436 . T A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr3 3157465 . T C 574.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:603,42,0 -chr3 3158589 . C A 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=-0.544;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,47:190:99:1143,0,5728 -chr3 3159071 . G A 1083.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.896;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=26.29;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1112,84,0 -chr3 3159273 . T C 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=1.349;DP=44;FS=13.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:793,0,464 -chr3 3159282 . T A 1417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1446,102,0 -chr3 3175524 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr3 3188448 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr3 3189704 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.718;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=15.64;ReadPosRankSum=-2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:341,0,809 -chr3 3189724 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-1.780;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:341,0,809 -chr3 3189823 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=-0.811;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:482,0,549 -chr3 3189958 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.421;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,261 -chr3 3191206 . G A 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.673;DP=30;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:357,0,780 -chr3 3333660 . G T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr3 3533967 . G A 3296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=1.853;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=30.81;ReadPosRankSum=-2.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,85:100:99:3325,0,130 -chr3 3534069 . C T 1723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1752,123,0 -chr3 3535918 . G GA 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.427;DP=34;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:20:954,0,20 -chr3 3628181 . C G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr3 3630489 . A T 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr3 3661586 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=26.17;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,330 -chr3 3661587 . A G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,330 -chr3 3734784 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr3 3843477 . T A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr3 3845854 . T C 214.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:243,0,19 -chr3 3845901 . A T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr3 3852211 . T A 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:490,36,0 -chr3 3868878 . C A 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-1.039;DP=69;FS=3.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.92;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,36:69:99:1196,0,1190 -chr3 3868897 . G T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=1.223;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:474,0,2006 -chr3 3869526 . A T 664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:693,48,0 -chr3 3870150 . T C 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 -chr3 3870161 . T A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 -chr3 3870306 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr3 3870362 . A T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr3 3871820 . A T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:83:238,0,83 -chr3 3871948 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:268,0,59 -chr3 3872046 . G T 996.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-1.456;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=32.45;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1025,72,0 -chr3 3872390 . A C 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:420,30,0 -chr3 3872571 . A G 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:367,27,0 -chr3 3872674 . AT A 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.894;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:384,0,235 -chr3 3872739 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=1.130;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:235,0,1629 -chr3 3872743 . T TA 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.112;DP=23;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.350;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:367,0,802 -chr3 3872749 . T G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.231;DP=21;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:235,0,1629 -chr3 3872983 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.290;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:283,0,109 -chr3 3873216 . A C,T 1705.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,29,23:52:99:1939,874,791,1066,0,999 -chr3 3873380 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:266,0,53 -chr3 3873542 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.741;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,141 -chr3 3873581 . G A 1126.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1155,84,0 -chr3 3873735 . A T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.777;DP=60;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:280,0,1555 -chr3 3881418 . A G 265.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:294,0,16 -chr3 3891079 . TCTGAGAAAAAACAAATCAAGGTGTTACATAGGACTCAAGTCTGAAATCTGCAGCTATGATTGTCTCCCGGCACAC T 2472.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.152;DP=57;FS=4.135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=21.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2510,210,0 -chr3 4170612 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:99:303,0,457 -chr3 4522635 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:230,0,61 -chr3 4641279 . A C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 -chr3 4641289 . T C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:357,24,0 -chr3 4655299 . A C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=1.250;DP=20;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=25.24;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:533,0,248 -chr3 4655492 . A G 1776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=1.828;DP=74;FS=10.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=24.01;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,47:54:48:1805,0,48 -chr3 4657208 . T A 367.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:396,0,13 -chr3 4923529 . G A 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 -chr3 5074717 . G A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.382;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:702,0,3074 -chr3 5089445 . CGGTGAGATTATGCAAACCTCCATCTGACATGATGAAGGATCTGAGTGTGACGTTTGTCTGATATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTA C 4658.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.742;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=26.53;ReadPosRankSum=-2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:4696,349,0 -chr3 5103543 . C G 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr3 5732310 . G A 6691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.759;DP=322;FS=3.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,206:322:99:6720,0,5909 -chr3 5739223 . C T 5406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.582;DP=331;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,180:329:99:5435,0,5380 -chr3 5743779 . GCTGAAATCAACAACATTCACACACTCATACGGTCACATCACACAGGAGGAATAGGAGTACAGTACTGGTCAGACTCTCTCAC G 14937.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-1.777;DP=392;FS=5.537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=27.40;ReadPosRankSum=2.310 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,321:324:99:14975,1437,0 -chr3 5791627 . C T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.967;DP=120;FS=16.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=6.36;ReadPosRankSum=3.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:791,0,7758 -chr3 5791699 . T C 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.649;ClippingRankSum=-3.143;DP=347;FS=29.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,100:331:99:1710,0,13217 -chr3 5864043 . C T 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-0.460;DP=200;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,57:200:99:1286,0,5195 -chr3 5865487 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.009;DP=183;FS=8.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,37:183:99:599,0,5367 -chr3 5921178 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr3 5977484 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr3 6142240 . C A 3097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.441;DP=446;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.104;QD=6.95;ReadPosRankSum=2.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,128:445:99:3126,0,11885 -chr3 6508726 . TCCTAAAAAGTAAACAATTAGACAGATATTTAAAAGGGAACATAAATGGTAGGTATATCCTGGATGTTATGGAACCCAGCCTA T 4487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=1.697;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=26.93;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:4525,366,0 -chr3 6518963 . G T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.565;DP=110;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,33:110:99:799,0,4032 -chr3 6575296 . G GA 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=-0.701;DP=203;FS=4.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,40:172:99:266,0,3449 -chr3 6575648 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=1.040;DP=265;FS=0.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=3.13;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,51:265:99:857,0,8279 -chr3 6733172 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.31;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:62:328,0,62 -chr3 6737790 . T A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr3 6764846 . T A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr3 6771931 . T A 3649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3678,253,0 -chr3 7006870 . C CA 1852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-4.175;DP=300;FS=12.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,103:264:99:1928,0,5021 -chr3 7007605 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=-1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,227 -chr3 7013155 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=21.80;ReadPosRankSum=-1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,138 -chr3 7300046 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.142;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:319,0,574 -chr3 7414210 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.772;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,252 -chr3 7491751 . T C 251.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:280,0,22 -chr3 7496607 . A C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.878;DP=57;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:735,0,1305 -chr3 7499291 . T C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr3 7500149 . A T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr3 7501151 . T C 559.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:3:586,3,0 -chr3 7503440 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:235,0,129 -chr3 7510431 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:67:237,0,67 -chr3 7510528 . G A 387.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:414,0,4 -chr3 7514042 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:302,0,344 -chr3 7514289 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.964;DP=20;FS=12.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:404,0,295 -chr3 7514523 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=-2.131;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:998,0,883 -chr3 7514967 . G T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.821;DP=31;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:465,0,629 -chr3 7602097 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.065;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:327,0,708 -chr3 7602109 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.888;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:327,0,755 -chr3 7602178 . T A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-1.094;DP=35;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=20.36;ReadPosRankSum=4.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:741,0,635 -chr3 7735653 . T C 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=2.940;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:831,0,613 -chr3 8218027 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.275;DP=30;FS=7.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:648,0,447 -chr3 8256500 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.036;DP=28;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,433 -chr3 8256591 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=2.439;DP=30;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:505,0,375 -chr3 8266464 . G GT 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:313,0,339 -chr3 8267863 . T A 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.907;DP=221;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,44:220:99:736,0,6750 -chr3 8277739 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=2.031;DP=36;FS=11.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:297,0,1715 -chr3 8277740 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=1.830;DP=37;FS=11.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:297,0,1715 -chr3 8434992 . C A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.611;DP=170;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,34:170:99:643,0,5526 -chr3 8436047 . A G 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-0.081;DP=297;FS=1.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,55:297:99:743,0,9012 -chr3 8436489 . G C 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.067;DP=270;FS=3.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,67:270:99:1470,0,7956 -chr3 8436577 . G GT 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.540;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:264,0,1606 -chr3 8451419 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,228 -chr3 8580920 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.398;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:365,0,407 -chr3 8580977 . T A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.920;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:941,0,327 -chr3 8581068 . A G 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.228;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=28.72;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:976,0,164 -chr3 8581142 . A G 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.080;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:1135,0,269 -chr3 8595568 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.390;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:696,0,351 -chr3 8595608 . T G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=-0.771;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:545,0,571 -chr3 8666793 . C T 377.07 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:375,0,16 -chr3 8716334 . T C 518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:547,39,0 -chr3 8716688 . A G 724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:753,54,0 -chr3 8716729 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-1.604;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:234,0,468 -chr3 9822352 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.706;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:371,0,606 -chr3 9822388 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-1.014;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:472,0,297 -chr3 9822390 . C T 1025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1054,72,0 -chr3 9851812 . C T 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.165;DP=65;FS=10.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1027,0,1176 -chr3 9852215 . G T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.612;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:362,0,352 -chr3 9852498 . T C 820.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:849,60,0 -chr3 9867528 . C T 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.415;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=28.18;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:789,0,172 -chr3 9870822 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=20.44;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:478,0,270 -chr3 9870849 . A G 1705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1734,126,0 -chr3 9876360 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=-0.698;DP=37;FS=3.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:388,0,827 -chr3 9876468 . T C 1127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1156,84,0 -chr3 9877442 . G C 1557.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1716,127,0 -chr3 10018345 . T G 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-1.460;DP=127;FS=0.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,35:127:99:871,0,3450 -chr3 10035315 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.655;DP=114;FS=13.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:613,0,2966 -chr3 10035336 . C T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.926;DP=127;FS=3.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,33:127:99:616,0,3212 -chr3 10035441 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=-0.897;DP=111;FS=10.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,27:111:99:558,0,3182 -chr3 10046001 . T C 2921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2950,213,0 -chr3 10046019 . G A 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-0.869;DP=56;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:977,0,964 -chr3 10054039 . C T 1609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1638,120,0 -chr3 10057290 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.729;DP=54;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:415,0,1453 -chr3 10059475 . T C 731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:760,54,0 -chr3 10062915 . A G 794.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:823,60,0 -chr3 10063008 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.922;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:265,0,139 -chr3 10063605 . T C 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr3 10063942 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.517;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:747,0,138 -chr3 10064760 . G GTT 1077.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.516;DP=88;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1343,0,1373 -chr3 10064880 . AT A 866.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.192;DP=167;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,44:156:99:904,0,2718 -chr3 10065100 . C T 3742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-0.743;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=31.19;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,100:120:99:3771,0,204 -chr3 10077974 . G T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=2.037;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.52;ReadPosRankSum=-2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:254,0,143 -chr3 10078033 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-1.078;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=28.63;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:744,0,718 -chr3 10078036 . A C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=-0.547;DP=31;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:426,0,1265 -chr3 10078255 . G GGT 1441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.925;DP=60;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=24.03;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1479,0,474 -chr3 10087573 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:317,0,227 -chr3 10088228 . G A 637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:666,48,0 -chr3 10093571 . T C 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1086,78,0 -chr3 10095316 . G C 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.901;DP=25;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1000,72,0 -chr3 10109805 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.230;DP=29;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:403,0,529 -chr3 10133921 . C G 551.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:580,45,0 -chr3 10133934 . C A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:354,27,0 -chr3 10225158 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-1.953;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:271,0,1080 -chr3 10243636 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.377;DP=272;FS=5.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,42:272:99:448,0,10978 -chr3 10243778 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.082;DP=199;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,36:199:99:494,0,6219 -chr3 10535653 . AAGGTAACCAAACATCCACTCAATACACAGCGCGATCCGAATGCGTGCGCGATCCTCAACGCCTGTTTGATTTCCAC A 3825.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=1.617;DP=109;FS=7.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=27.02;ReadPosRankSum=-3.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,93:104:99:3863,0,2458 -chr3 10829643 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,137 -chr3 10995075 . T TA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.217;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:352,0,1115 -chr3 10995333 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.563;DP=67;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:251,0,2021 -chr3 10995975 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.596;DP=23;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=14.42;ReadPosRankSum=2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:360,0,127 -chr3 10997723 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=-1.511;DP=77;FS=4.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=3.45;ReadPosRankSum=2.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:294,0,2165 -chr3 11065527 . C G 2348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=1.742;DP=329;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,97:327:99:2377,0,8649 -chr3 11264445 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:401,0,253 -chr3 11475799 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-1.198;DP=49;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:368,0,1245 -chr3 11477348 . A T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.420;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:428,0,639 -chr3 11477951 . A C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=-0.535;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:292,0,524 -chr3 11491538 . C A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-3.712;DP=48;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.81;ReadPosRankSum=2.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:691,0,926 -chr3 11493922 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.083;DP=39;FS=9.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:238,0,1440 -chr3 11535932 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.300;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:499,0,831 -chr3 11539120 . TGGTCTGGCTTCACTTTTATCAGACATCACAGAGATTTCTGCTTCTCTGATATTGCCTTGTGTTTATTTCTGCTCTGAATAATGTATGTGCGGTCTGATATTGTCTTGTGTTTATCTCTGCTTTA T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=34.59;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:314,0,844 -chr3 11645020 . T G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.370;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:76:347,0,76 -chr3 11645182 . A G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.471;DP=23;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=17.73;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:436,0,283 -chr3 11646953 . A T 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 -chr3 11648042 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr3 11648532 . T G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=1.001;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:467,0,166 -chr3 11648586 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.659;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:377,0,568 -chr3 11827310 . A T 1433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-1.218;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=26.55;ReadPosRankSum=3.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1462,0,339 -chr3 11829618 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-1.704;DP=73;FS=2.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:623,0,1932 -chr3 11831407 . G A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=-1.018;DP=67;FS=2.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=12.89;ReadPosRankSum=2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:892,0,1814 -chr3 11838620 . A T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-2.434;DP=49;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:807,0,881 -chr3 11838857 . T C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.195;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:621,0,802 -chr3 11897654 . A T 240.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:269,17,0 -chr3 11897656 . A T 231.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:269,17,0 -chr3 11969007 . C T 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=1.505;DP=178;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,47:178:99:1101,0,5005 -chr3 11975517 . CA C,CAA 251.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-0.066;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,10,7:19:99:363,133,204,230,0,334 -chr3 12383963 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:233,0,2837 -chr3 12384100 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.506;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:233,0,2837 -chr3 12384109 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.013;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,8:51:99:233,0,2837 -chr3 12494957 . TCCTGATCAAATAGTACAATTCGAGAGGTATAGAGGTAAAAAAAAAATCAAGAGCTGCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTA T 621.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:53:659,53,0 -chr3 12595339 . C T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-1.411;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,27:82:99:708,0,2071 -chr3 12679183 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.829;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:268,0,1491 -chr3 12782068 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,129 -chr3 12791654 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-2.549;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=17.57;ReadPosRankSum=2.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:450,0,928 -chr3 12796246 . C T 1008.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1037,78,0 -chr3 12796361 . A T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.895;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=16.26;ReadPosRankSum=2.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:516,0,491 -chr3 12798400 . T C 1430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1459,105,0 -chr3 12804181 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr3 12805630 . G A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:440,33,0 -chr3 12806890 . A C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr3 12864255 . C T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr3 12964870 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=-0.981;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:254,0,1932 -chr3 12974442 . A G 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=1.434;DP=30;FS=4.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=34.06;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:40:1050,0,40 -chr3 12982856 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-2.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=16.62;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:344,0,674 -chr3 12983015 . G T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=2.656;DP=58;FS=9.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:450,0,915 -chr3 12983016 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=2.251;DP=58;FS=9.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:416,0,1279 -chr3 12983070 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.546;DP=23;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=15.56;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:386,0,117 -chr3 12983357 . T G 1860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.603;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:1889,0,910 -chr3 12983668 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=2.815;DP=62;FS=1.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=3.38;ReadPosRankSum=-2.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:238,0,1261 -chr3 12983792 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:316,0,267 -chr3 13227200 . T G 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 -chr3 13229234 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=2.958;DP=26;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:390,0,491 -chr3 13229301 . G A 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:668,48,0 -chr3 13233689 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.078;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:615,0,99 -chr3 13237368 . C T 2635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2664,193,0 -chr3 13237396 . A G 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.372;DP=56;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=32.91;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,49:56:49:1871,0,49 -chr3 13238432 . A G 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.619;DP=53;FS=6.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=23.77;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,36:53:99:1288,0,458 -chr3 13238506 . T C 1593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1622,123,0 -chr3 13258875 . C T 215.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.84;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:244,0,15 -chr3 13279070 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.539;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.964;QD=21.48;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:780,0,400 -chr3 13283777 . A G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=-1.143;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:577,0,178 -chr3 13283812 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:930,66,0 -chr3 13287862 . A T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr3 13287909 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr3 13304291 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:79:339,0,79 -chr3 13361801 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.256;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,175 -chr3 13361812 . G C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,266 -chr3 13362677 . C A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.028;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:541,0,366 -chr3 13363891 . G C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.634;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:455,0,281 -chr3 13364022 . C A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.065;DP=34;FS=18.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:525,0,495 -chr3 13364074 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.815;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,404 -chr3 13365157 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.533;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:413,0,328 -chr3 13365248 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,346 -chr3 13365535 . A T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:451,0,370 -chr3 13366095 . A T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-0.586;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:570,0,465 -chr3 13366247 . T G 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:646,48,0 -chr3 13366427 . C A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=1.187;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=29.55;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:43:442,0,43 -chr3 13449133 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.911;DP=114;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,23:114:99:452,0,3640 -chr3 13473037 . CACCTGTAAGCCAACATTGATGATCATCATGTGTACTATCAGAAAAGCTCAGAAAACACAAACTAGTAAAGAGTGGAGAAAAGTTAAATTGGGATGAATATCA C 4167.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=1.800;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,110:133:99:4205,0,2484 -chr3 13607247 . A C 3707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-1.331;DP=261;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,107:261:99:3736,0,5206 -chr3 13607474 . A G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.543;DP=99;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:441,0,3664 -chr3 13607643 . A G 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=2.847;DP=40;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.116;QD=33.04;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:1350,0,392 -chr3 13607993 . G A 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-0.523;DP=142;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,44:142:99:1173,0,3778 -chr3 13875500 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-2.195;DP=95;FS=2.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:411,0,3018 -chr3 13875726 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.283;DP=73;FS=12.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:478,0,2013 -chr3 13876870 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.376;DP=68;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:331,0,2108 -chr3 13952351 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr3 13979645 . G C 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr3 13980206 . T A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=-0.506;DP=21;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:631,0,197 -chr3 13980573 . G A 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:810,57,0 -chr3 13980605 . A C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-0.822;DP=19;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=27.04;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:34:731,0,34 -chr3 13980784 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-2.282;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:605,0,509 -chr3 13991981 . A G 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:244,0,25 -chr3 14158662 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=1.202;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:305,0,401 -chr3 14158826 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:331,0,294 -chr3 14160045 . A G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr3 14165894 . G C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr3 14238302 . TGGTGAGTTTTTGCATGTGATATTTTCCACTCTTTATGCATACTGATGGAAATAGCCATGGCTCTTCTTTTGTGTATTTCA T 3946.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=3.185;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=30.62;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,87:91:99:3984,302,0 -chr3 14292197 . A G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.139;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=31.83;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:633,0,107 -chr3 14292398 . A C 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.848;DP=34;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=32.05;ReadPosRankSum=2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:66:1118,0,66 -chr3 14292657 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr3 14296759 . T C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.800;ClippingRankSum=0.827;DP=79;FS=2.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:671,0,1667 -chr3 14296807 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-2.192;DP=130;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,29:130:99:579,0,3808 -chr3 14299324 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.812;DP=182;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,31:182:99:407,0,5780 -chr3 14690515 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-0.008;DP=62;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:375,0,1302 -chr3 14694183 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.158;DP=105;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:770,0,2770 -chr3 14700681 . A G 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-1.149;DP=105;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,28:105:99:623,0,2858 -chr3 14708859 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.660;DP=60;FS=4.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:380,0,1684 -chr3 14719690 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.147;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:324,0,2068 -chr3 14719772 . G A 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-1.172;DP=73;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:981,0,1417 -chr3 14719832 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.198;DP=68;FS=3.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:319,0,1891 -chr3 14731822 . CTT C 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr3 14741693 . G A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-1.159;DP=63;FS=18.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:535,0,1543 -chr3 14784851 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-1.153;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:550,0,793 -chr3 14793257 . T A 410.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=34.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:438,0,10 -chr3 14798215 . AAC A 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.215;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=24.45;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:893,0,254 -chr3 14807808 . C T 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=-0.414;DP=91;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:1435,0,3908 -chr3 14808118 . C A 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-2.071;DP=63;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1063,0,1096 -chr3 14818984 . A G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-0.227;DP=51;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:326,0,1491 -chr3 14819343 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=1.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:229,0,438 -chr3 14820219 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=1.411;DP=64;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:374,0,1728 -chr3 14820241 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.131;DP=71;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:338,0,2076 -chr3 14854053 . G T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=1.536;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:609,0,713 -chr3 14860528 . C T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.281;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:557,0,865 -chr3 14937347 . C A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.287;DP=183;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,47:177:99:944,0,6183 -chr3 14937659 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-2.573;DP=308;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=2.19;ReadPosRankSum=3.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,53:308:99:703,0,9628 -chr3 14965312 . C A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.013;DP=91;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:628,0,3323 -chr3 14966067 . A G 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.213;DP=100;FS=5.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,33:100:99:892,0,2430 -chr3 14967217 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-1.042;DP=98;FS=3.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:353,0,3123 -chr3 14977022 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.416;DP=109;FS=5.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,26:109:99:537,0,3051 -chr3 14977065 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=-1.263;DP=116;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,21:115:99:338,0,3401 -chr3 14996170 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.573;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:234,0,1240 -chr3 14996203 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=2.438;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:235,0,1318 -chr3 14996496 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.021;DP=48;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:676,0,1014 -chr3 15007911 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.927;DP=105;FS=8.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:411,0,6001 -chr3 15007912 . A T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.976;DP=104;FS=8.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:419,0,6001 -chr3 15010610 . T C 1666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-0.337;DP=189;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,63:189:99:1695,0,4570 -chr3 15012711 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=-1.555;DP=141;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,26:141:99:337,0,3613 -chr3 15012777 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=-0.268;DP=112;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:328,0,3515 -chr3 15018793 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=-0.628;DP=99;FS=4.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=7.49;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:770,0,2499 -chr3 15021239 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-0.955;DP=104;FS=3.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:236,0,2809 -chr3 15073400 . GCTGAGAGAACATTTAGCACTCTTAAAACACACTCTTCACAACCTGAAATATAAATCAAGCCTCTGTGTATTCAAAAGCATGGGATTTTATGTGGGACTTAC G 13316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.983;DP=295;FS=2.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=33.91;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,292:295:99:13354,1119,0 -chr3 15075440 . G C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=-0.062;DP=31;FS=38.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=19.15;ReadPosRankSum=-3.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:622,0,356 -chr3 15090752 . T C 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.540;DP=72;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:1009,0,1556 -chr3 15090835 . AAGCTCTCAAAGACTTTACCTTAAACAGCCAAGAAATTCCCACCTTGTTG A 1338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=2.470;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,48:80:99:1376,0,2060 -chr3 15094659 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-1.191;DP=65;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:281,0,1837 -chr3 15224780 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:259,0,366 -chr3 15226213 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,325 -chr3 15227053 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.354;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:250,0,741 -chr3 15227560 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.016;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:432,0,852 -chr3 15242362 . GCTGTCGATAAATAAAAGTTAATTGCAATTCTCTTATCCAAATTAAGCTCCTTTGTTAAAATCTCTAC G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.53;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:258,0,493 -chr3 15254108 . GCTAAAAGAAACACAAAATGTTCGACCTTAAAAAGAAACATGATTTGAAAAGATCCAGACTAAATAGTGCTTCGTGTGAACGGGTAC G 2533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.070;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=28.58;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2571,216,0 -chr3 15264372 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=1.298;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:684,0,1396 -chr3 15275471 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:290,0,212 -chr3 15292021 . C A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:346,0,835 -chr3 15295275 . C G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=1.550;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=17.24;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:373,0,348 -chr3 15317280 . G A 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.111;DP=418;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:324,94:418:99:1822,0,12212 -chr3 15401121 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=-3.215;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=25.69;ReadPosRankSum=3.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:465,0,160 -chr3 15423666 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=-1.974;DP=90;FS=9.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:690,0,2358 -chr3 15425836 . C T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.511;DP=93;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:642,0,2497 -chr3 15426471 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.959;DP=87;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:319,0,2593 -chr3 15427419 . A T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.012;DP=43;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:614,0,949 -chr3 15428490 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=3.540;DP=68;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:254,0,4379 -chr3 15439777 . C T 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-1.569;DP=191;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,63:191:99:1624,0,4540 -chr3 15440287 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-2.058;DP=255;FS=9.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,63:255:99:1022,0,9625 -chr3 15466922 . C CA 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.153;DP=32;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:360,0,340 -chr3 15473106 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.237;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:432,0,1899 -chr3 15483386 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.134;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:299,0,3194 -chr3 15483613 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.614;DP=45;FS=2.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:309,0,1182 -chr3 15486764 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DP=56;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:458,0,3843 -chr3 15493157 . G C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=-1.981;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:367,0,2285 -chr3 15493193 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.815;DP=74;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:268,0,2106 -chr3 15505100 . G GCCCCGGTGGCCAAGCCCA 7063.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=280;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,195:269:99:7101,0,2350 -chr3 15505335 . CAG C 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.010;DP=139;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,2:129:99:867,0,5450 -chr3 15505886 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=2.586;DP=239;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,39:239:99:455,0,12486 -chr3 15505934 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.084;DP=222;FS=18.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,39:221:99:591,0,6965 -chr3 15506149 . C A 3897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.339;DP=242;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,108:242:99:3926,0,4538 -chr3 15558168 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-1.252;DP=64;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:240,0,1909 -chr3 15578598 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-2.104;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:267,0,1124 -chr3 15585327 . T C 1648.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1677,120,0 -chr3 15588839 . C G 1508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1537,114,0 -chr3 15588911 . G A 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.493;DP=39;FS=2.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:743,0,653 -chr3 15588932 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:261,0,1315 -chr3 15588944 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.691;DP=49;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:320,0,1353 -chr3 15592066 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-1.011;DP=58;FS=7.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:500,0,1430 -chr3 15592163 . C T 1801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1830,123,0 -chr3 15592168 . T C 1801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1830,123,0 -chr3 15592255 . T G 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.672;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=21.19;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:1342,0,848 -chr3 15592351 . C CT 818.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.285;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:856,0,1548 -chr3 15592493 . A G 4001.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:4030,307,0 -chr3 15592531 . A G 1715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1744,129,0 -chr3 15592728 . G C 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.915;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:726,0,619 -chr3 15592825 . CA C 940.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:97:978,97,0 -chr3 15592916 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.042;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,418 -chr3 15592970 . GT G 575.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:43:613,43,0 -chr3 15592975 . T C 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:613,43,0 -chr3 15593057 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.144;DP=40;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:419,0,3959 -chr3 15593063 . G A 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.122;DP=49;FS=6.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=26.14;ReadPosRankSum=-2.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1309,0,1325 -chr3 15593086 . A G 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-2.050;DP=49;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:859,0,925 -chr3 15593122 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=1.104;DP=48;FS=3.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:250,0,1413 -chr3 15595205 . G C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.488;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:565,0,660 -chr3 15595317 . GT G 336 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:12:373,12,0 -chr3 15595424 . A T 1589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-3.253;DP=37;FS=5.282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=31.44;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:49:1618,49,0 -chr3 15595462 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.316;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:530,0,3253 -chr3 15595572 . T C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr3 15595576 . A G 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr3 15607646 . T A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-1.721;DP=18;FS=11.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:409,0,232 -chr3 15607699 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.543;DP=30;FS=13.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:253,0,864 -chr3 15610913 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=3.413;DP=60;FS=3.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:768,0,1417 -chr3 15623478 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-2.077;DP=199;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=5.34;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:1090,0,5372 -chr3 15624187 . G A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.504;DP=150;FS=10.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,40:150:99:814,0,5212 -chr3 15639146 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:243,0,1185 -chr3 15639250 . A C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:352,0,329 -chr3 15642057 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.463;DP=43;FS=7.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.02;ReadPosRankSum=-2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:330,0,1119 -chr3 15642090 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-1.279;DP=44;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:718,0,760 -chr3 15648154 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=27.43;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:330,0,125 -chr3 15650182 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=2.259;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:389,0,1607 -chr3 15652904 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.736;DP=49;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:700,0,2215 -chr3 15652907 . C A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.660;DP=50;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:700,0,2215 -chr3 15664054 . GA G 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-1.408;DP=16;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:274,0,114 -chr3 15665121 . C CT 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=-1.446;DP=261;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,61:251:99:424,0,8099 -chr3 15665316 . GCA G 10133.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=4.036;DP=141;FS=9.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=31.10;ReadPosRankSum=-3.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,7:133:99:10171,0,3037 -chr3 15688092 . C G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.119;DP=45;FS=6.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:250,0,1909 -chr3 15693576 . G A 1924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-2.395;DP=242;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,74:242:99:1953,0,8554 -chr3 15693822 . C A 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=-1.895;DP=281;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,58:280:99:1006,0,8572 -chr3 15729764 . A T 2950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=1.097;DP=386;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=7.64;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,116:386:99:2979,0,10202 -chr3 15754562 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=1.362;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:284,0,858 -chr3 15774047 . A G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.107;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:1598,0,2483 -chr3 15774048 . C A 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.412;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=20.13;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1598,0,2483 -chr3 15774676 . C CA 731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.164;DP=69;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:769,0,759 -chr3 15774727 . G A 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-1.525;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:1585,0,1539 -chr3 15776052 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-1.349;DP=53;FS=7.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:968,0,857 -chr3 15776157 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.174;DP=82;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:343,0,4316 -chr3 15776309 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.329;DP=43;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:706,0,771 -chr3 15779000 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.792;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,587 -chr3 15779188 . C A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.396;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=17.65;ReadPosRankSum=-2.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:593,0,594 -chr3 15779290 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.734;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:813,0,849 -chr3 15779512 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-1.139;DP=26;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:230,0,712 -chr3 15779604 . A T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=-1.614;DP=16;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=27.74;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:472,0,363 -chr3 15780301 . T A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=1.355;DP=44;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:727,0,708 -chr3 15780942 . C T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.304;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:748,0,721 -chr3 15781541 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.436;DP=29;FS=9.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:327,0,660 -chr3 15847523 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,139 -chr3 15847528 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=31.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:278,0,139 -chr3 15851640 . C T 6767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.784;DP=403;FS=7.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,211:403:99:6796,0,6842 -chr3 15851652 . C T 7019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=-0.612;DP=418;FS=3.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,218:418:99:7048,0,7083 -chr3 15852674 . G A 916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-1.734;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=29.63;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:69:945,69,0 -chr3 15853101 . G A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.820;DP=51;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:925,0,2041 -chr3 15861272 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.230;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:451,0,1258 -chr3 15861867 . G A 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.733;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:1607,0,2145 -chr3 15865490 . C T 1374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.088;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.883;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1403,0,2106 -chr3 15895746 . C T 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=1.851;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1176,0,1428 -chr3 15901422 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.259;DP=80;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=3.57;ReadPosRankSum=2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:314,0,2731 -chr3 15901464 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.065;DP=77;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:431,0,2203 -chr3 15901857 . T G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.356;DP=56;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:444,0,1444 -chr3 15901972 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.280;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:322,0,1072 -chr3 15902736 . A G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=1.117;DP=47;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:834,0,865 -chr3 15902851 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=-0.267;DP=35;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:307,0,1012 -chr3 15903296 . T C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.032;DP=76;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:379,0,2226 -chr3 15903426 . T A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.910;DP=47;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:583,0,968 -chr3 15903555 . AT A 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:345,0,284 -chr3 15903561 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:345,0,284 -chr3 15904456 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,410 -chr3 15905054 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.234;DP=80;FS=7.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:571,0,2148 -chr3 15939596 . T G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr3 15939669 . C G 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:492,36,0 -chr3 15939760 . T C 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr3 16009063 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.078;DP=58;FS=3.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:436,0,1646 -chr3 16009387 . CCCTGGAGGACGAGATGGAAAGATGATGATTATGTAGGATGCATATTCCAGCTAAACATGCTGATTGACAGTGGAGAGATGTCAAACGGGTCTTA C 9207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=2.765;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=29.84;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,230:236:99:9245,690,0 -chr3 16028030 . TCTATCAAAAAGCAAAAAAAAAAACTTTAAATAACATCACTGAGAGAGAAATGTTTAATCAATATCCTATTTCAGTTTAC T 7699.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=2.515;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=29.14;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,194:197:99:7737,563,0 -chr3 16031145 . T A 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.634;DP=195;FS=10.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,58:195:99:1470,0,8343 -chr3 16078173 . AG A 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=2.372;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,275 -chr3 16092925 . TCTGAAAAGCAAAACAAAGAGCGTGAGATTGTTTACATTTCTAGAGCATCAGGAATCTCAGCATTTAGTATAGCAACTGCACAGATGACTCCCAC T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:340,0,294 -chr3 16135983 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=2.435;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=7.17;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:315,0,1069 -chr3 16160402 . T A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr3 16212139 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:244,0,294 -chr3 16284457 . T C 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=2.154;DP=120;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,42:120:99:1384,0,2686 -chr3 16299092 . G GT 619.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-0.328;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:657,0,774 -chr3 16299409 . A T 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=2.107;DP=84;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:1419,0,1492 -chr3 16299782 . C A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=-0.007;DP=104;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,39:104:99:1398,0,3458 -chr3 16299909 . A AC 582.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-1.015;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:620,0,137 -chr3 16319584 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=1.602;DP=109;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:724,0,2945 -chr3 16325573 . T C 1837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.343;DP=130;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1866,0,2505 -chr3 16325766 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.490;DP=110;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,32:110:99:834,0,3019 -chr3 16332158 . G A 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.756;DP=93;FS=15.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.628;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,31:93:99:1037,0,2116 -chr3 16337942 . C A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=-1.581;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,22:73:99:485,0,1819 -chr3 16349082 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.328;DP=145;FS=6.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:415,0,4444 -chr3 16358838 . T A 3769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.028;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,100:147:99:3798,0,1275 -chr3 16366320 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.717;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:471,0,285 -chr3 16367210 . A G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.025;DP=56;FS=1.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:1084,0,1964 -chr3 16389720 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,144 -chr3 16489158 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.268;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:488,0,894 -chr3 16491447 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.694;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:307,0,640 -chr3 16542273 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.132;DP=44;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:338,0,1186 -chr3 16581376 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.452;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,31:93:99:825,0,2352 -chr3 16592627 . T C 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-2.023;DP=26;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=27.26;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:737,0,166 -chr3 16596883 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.922;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:669,0,1329 -chr3 16596957 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.752;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:670,0,1265 -chr3 16597008 . A C 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.282;DP=56;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:618,0,1332 -chr3 16631354 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.262;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:545,0,1415 -chr3 16631899 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.775;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:693,0,1503 -chr3 16633048 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,264 -chr3 16633652 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:334,27,0 -chr3 16634103 . G C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.736;DP=20;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:476,0,642 -chr3 16634476 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.892;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:441,0,698 -chr3 16635241 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:412,0,408 -chr3 16635930 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,343 -chr3 16692884 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.411;DP=181;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,50:181:99:1243,0,5143 -chr3 16702545 . A C 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.716;DP=207;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,54:207:99:1264,0,5873 -chr3 16727196 . TA T 691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.385;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=23.06;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:99:729,0,312 -chr3 16727207 . A T 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:818,0,333 -chr3 16727696 . G A 255.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:284,22,0 -chr3 16727701 . AG A 246.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:284,22,0 -chr3 16728823 . T A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.390;DP=95;FS=11.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:478,0,2976 -chr3 16729261 . T A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.478;DP=174;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,49:174:99:1271,0,4941 -chr3 16913261 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-1.025;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:236,0,373 -chr3 16942292 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.787;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:304,0,462 -chr3 16978075 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-2.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:236,0,253 -chr3 16979548 . T C 246.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:275,0,14 -chr3 17168070 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:319,0,229 -chr3 17168071 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:319,0,229 -chr3 17169065 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,467 -chr3 17291857 . T C 2827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=-0.112;DP=397;FS=0.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,117:397:99:2856,0,10476 -chr3 17294598 . TA T 1178.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.753;DP=214;FS=14.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,60:186:99:1216,0,4226 -chr3 17304069 . TTTAAGGTAAAGGCGTTTTTCTCGTTTTTGAAGAACTTAAGCTTTATCTG T 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.088;DP=48;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:244,0,1910 -chr3 17304072 . AAGGTAAAGGCGTTTTTCTCGTTTTTGAAGAACTTAAGCTTTATCTGTCAGCTGAATATTGAAAAAGGTTCATCTCTGTTGTTGTGTTGCTTTTCTT A 1095.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.040;DP=47;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1133,0,867 -chr3 17304121 . AGCTGAATATTGAAAAAGGTTCATCTCTGTTGTTGTGTTGCTTTTCTT A 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.654;DP=43;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=4.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:247,0,1910 -chr3 17323949 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:428,30,0 -chr3 17324348 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=1.610;DP=18;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,456 -chr3 17324453 . G T 647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:49:676,49,0 -chr3 17324981 . A AT 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.326;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:306,0,184 -chr3 17376965 . T C 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.577;DP=137;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=16.02;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:2223,0,2597 -chr3 17377044 . T C 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-0.321;DP=58;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1075,0,952 -chr3 17377091 . T C 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=1.215;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:645,0,1031 -chr3 17377437 . T A 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.319;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1153,0,2290 -chr3 17377442 . A G 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-2.952;DP=59;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1093,0,2342 -chr3 17378023 . G GA 530.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:568,0,147 -chr3 17378036 . A C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.927;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:402,0,653 -chr3 17378094 . C T 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.119;DP=130;FS=7.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,49:129:99:1594,0,2673 -chr3 17378456 . A G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.743;DP=158;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:509,0,4953 -chr3 17380977 . C T 2798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.321;DP=203;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,85:203:99:2827,0,4919 -chr3 17381006 . G A 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=-0.796;DP=83;FS=11.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1025,0,1712 -chr3 17381053 . C G 343.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:372,30,0 -chr3 17381078 . T G 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.399;DP=64;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,39:64:99:1356,0,836 -chr3 17412956 . T C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.184;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:639,0,157 -chr3 17412999 . A G 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.236;DP=65;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:1829,0,353 -chr3 17413203 . A G 1252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1281,96,0 -chr3 17413409 . G GA 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.706;DP=87;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1058,0,733 -chr3 17413484 . A G 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 -chr3 17419796 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:409,0,283 -chr3 17452474 . A T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,170 -chr3 17467787 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=1.080;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:338,0,568 -chr3 17598983 . T A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=1.231;DP=21;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=23.27;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:517,0,199 -chr3 17599623 . T C 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr3 17599629 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:385,27,0 -chr3 17618013 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=1.493;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:243,0,226 -chr3 17626422 . A T 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr3 17626494 . G A 2705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.586;DP=187;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,80:187:99:2734,0,3511 -chr3 17627317 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=1.294;DP=62;FS=6.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:698,0,1863 -chr3 17627347 . A G 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:855,0,815 -chr3 17627695 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=18.29;ReadPosRankSum=-2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,220 -chr3 17630839 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:356,0,220 -chr3 17637082 . T C 1939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-1.947;DP=136;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=14.26;ReadPosRankSum=4.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1968,0,2736 -chr3 17637107 . C T 2333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-0.695;DP=146;FS=7.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:2362,0,2572 -chr3 17637255 . G GT 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=1.560;DP=145;FS=15.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,40:127:99:668,0,2301 -chr3 17637303 . T A 2236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=3.766;DP=159;FS=12.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=14.07;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,66:159:99:2265,0,2902 -chr3 17637423 . T G 3100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.314;DP=149;FS=24.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,95:149:99:3129,0,1776 -chr3 17638171 . A C 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.113;DP=48;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:946,0,592 -chr3 17638567 . GAA G,GAAA 247.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,11:14:99:373,295,508,117,0,107 -chr3 17662185 . G A 2792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.782;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,85:227:99:2821,0,4594 -chr3 17668866 . T C 1482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1511,120,0 -chr3 17668884 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-1.401;DP=48;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:288,0,2629 -chr3 17668928 . A C 4180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=1.775;DP=142;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=29.44;ReadPosRankSum=-1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,107:142:99:4209,0,715 -chr3 17669000 . C T 3328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.804;DP=177;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,103:177:99:3357,0,2571 -chr3 17669029 . G A 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-0.159;DP=99;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1871,0,1418 -chr3 17669080 . A G 422.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:451,33,0 -chr3 17672720 . C CA 342.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.302;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:20:415,20,0 -chr3 17672939 . A G 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.157;DP=72;FS=3.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=24.91;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1822,0,607 -chr3 17672986 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,190 -chr3 17700220 . C T 1833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.189;DP=122;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1862,0,3175 -chr3 17716959 . T C 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-2.168;DP=209;FS=4.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=8.26;ReadPosRankSum=2.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,67:209:99:1755,0,5313 -chr3 17731983 . C T 1696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.626;DP=202;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,66:201:99:1725,0,5137 -chr3 17736675 . C T 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.797;DP=186;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,55:186:99:1347,0,4891 -chr3 17737263 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.397;DP=32;FS=5.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:399,0,782 -chr3 17759673 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-0.703;DP=34;FS=4.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:240,0,915 -chr3 17788645 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.218;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=4.03;ReadPosRankSum=2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:234,0,1482 -chr3 17789618 . T A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.864;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:379,0,554 -chr3 17790965 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:326,0,232 -chr3 17798559 . A G 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.702;DP=110;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,27:110:99:632,0,3135 -chr3 17798965 . C T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-0.062;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:927,0,1830 -chr3 17808560 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=1.284;DP=55;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:429,0,1481 -chr3 17809650 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:271,0,227 -chr3 17826829 . A AT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-0.467;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:337,0,1587 -chr3 17832965 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.127;DP=57;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:240,0,1709 -chr3 17834503 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.669;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:367,0,359 -chr3 17834541 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.999;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=25.27;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:660,0,181 -chr3 17834629 . CCT C 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.134;DP=13;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:325,0,165 -chr3 17835060 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.478;DP=37;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:240,0,1161 -chr3 17915241 . T A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-2.189;DP=119;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=5.26;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,31:119:99:654,0,3372 -chr3 17915436 . TC T 1119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-3.833;DP=242;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,69:233:99:1157,0,4597 -chr3 17915931 . C A 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-1.538;DP=224;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,67:224:99:1516,0,5464 -chr3 18030822 . C T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.779;DP=39;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:784,0,632 -chr3 18031410 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,105 -chr3 18105404 . T C 1929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=1.841;DP=115;FS=4.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1958,0,2070 -chr3 18105673 . CT C 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=-0.061;DP=138;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:682,0,1279 -chr3 18106240 . GA G 15555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.420;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=37.29;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,93:133:99:15593,0,185 -chr3 18128304 . C T 2348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-1.123;DP=274;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,86:273:99:2377,0,6699 -chr3 18129792 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=2.242;DP=268;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=1.50;ReadPosRankSum=3.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,37:267:99:429,0,19697 -chr3 18129801 . A G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=1.513;DP=300;FS=8.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,43:299:99:427,0,19697 -chr3 18134167 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.698;DP=72;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:524,0,2085 -chr3 18134190 . C T 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.201;DP=108;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:921,0,2844 -chr3 18215146 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-1.034;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:335,0,725 -chr3 18292111 . G A 326.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:355,0,15 -chr3 18298754 . G T 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:379,27,0 -chr3 18298796 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:312,0,130 -chr3 18298836 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=32.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46:390,0,46 -chr3 18299181 . T A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.10;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:55:443,0,55 -chr3 18299193 . T G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:55:443,0,55 -chr3 18299588 . C A 221.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:250,0,22 -chr3 18299972 . A G 554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:583,42,0 -chr3 18300167 . G A 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-1.398;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=31.09;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:70:619,0,70 -chr3 18302912 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr3 18302936 . C T 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 -chr3 18304756 . C G 666.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:695,51,0 -chr3 18308992 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.428;DP=43;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:381,0,1169 -chr3 18309034 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.099;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:376,0,1894 -chr3 18334453 . C A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr3 18342238 . G A 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr3 18360767 . T TG 671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:709,54,0 -chr3 18385041 . G T 333.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=33.39;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:362,0,14 -chr3 18395360 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.077;DP=51;FS=13.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:269,0,1490 -chr3 18395408 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-1.363;DP=44;FS=12.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:339,0,1199 -chr3 18436899 . A C 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=-0.017;DP=72;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:1158,0,3265 -chr3 18436901 . C G 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.011;DP=76;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,31:76:99:1158,0,3283 -chr3 18462939 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.020;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,27:161:99:297,0,4811 -chr3 18462960 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.411;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,22:127:99:277,0,3809 -chr3 18473356 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,427 -chr3 18539424 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-1.417;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:276,0,924 -chr3 18539445 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-1.404;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:318,0,909 -chr3 18542408 . CATTCTGAAACAGGACAGAAATGATTTTAAGATAATAACATATAAACCTTTGGACA C 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.171;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:788,0,343 -chr3 18542466 . TTCAGCATATTAACCTCAC T 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.684;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:788,0,445 -chr3 18550403 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=2.208;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:480,0,495 -chr3 18572675 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,398 -chr3 18574837 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-1.478;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:396,0,742 -chr3 18582350 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.829;DP=34;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:245,0,924 -chr3 18596455 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:345,0,99 -chr3 18596555 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-1.147;DP=88;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:603,0,2254 -chr3 18597036 . CCCTAAGAAGATATGGAAATTAACTTCTGAATAATTGTGCTTTTGCTATAAATGAAACATACTGTATGTAAAAAAAACTAATAGTTTGTGCATGTGTGTCTCATGTCCTGTTATGGTTAATGAAATTATGAGTGTATAAAAGCGTAGTGGTAAGGACCATCACAAA C 721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.121;ClippingRankSum=1.463;DP=167;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,29:166:99:759,0,81443 -chr3 18600918 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.534;DP=115;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,36:115:99:913,0,2916 -chr3 18609870 . GCTTCAAAACAAAGACACAGGTTCAGTGCATGTTCATGACCAACAATTTCACTTTTTTTGTGGAAAACGTCCATGTAGTTTACAATAACTATGGTTTAAAC G 508.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=2.389;DP=123;FS=3.040;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=4.14;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:546,222,0 -chr3 18618352 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:428,0,214 -chr3 18624793 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:290,0,401 -chr3 18625465 . T A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.267;DP=27;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:468,0,451 -chr3 18625521 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:260,0,734 -chr3 18627079 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-1.368;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:337,0,359 -chr3 18658060 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-1.704;DP=150;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,25:150:99:336,0,8100 -chr3 18658485 . T C 1892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.861;DP=152;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,56:152:99:1921,0,3564 -chr3 18658690 . T A 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.666;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1581,0,1603 -chr3 18658775 . A C 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.201;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:99:761,0,3389 -chr3 18659042 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-1.301;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:230,0,1464 -chr3 18660457 . T A 2389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.395;DP=126;FS=9.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:2418,0,1919 -chr3 18660776 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.558;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=26.21;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:736,0,232 -chr3 18660917 . T G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=-1.021;DP=52;FS=7.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:384,0,1484 -chr3 19056794 . A AAT 225.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:9:262,9,0 -chr3 19062834 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=-0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,389 -chr3 19063823 . T C 1155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:88:1184,88,0 -chr3 19067769 . G C 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.131;DP=188;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,44:188:99:952,0,5692 -chr3 19077765 . A T 2176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-1.959;DP=345;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,104:342:99:2205,0,10871 -chr3 19082257 . C T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.673;DP=400;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,80:399:99:1430,0,12048 -chr3 19086691 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=-0.742;DP=109;FS=4.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,34:109:99:584,0,4227 -chr3 19088863 . C T 1665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=-0.130;DP=393;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=4.24;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,88:393:99:1694,0,11354 -chr3 19089216 . C T 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.154;DP=489;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=3.24;ReadPosRankSum=3.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:400,89:489:99:1613,0,32087 -chr3 19089225 . G A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-0.172;DP=484;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:395,89:484:99:1629,0,32087 -chr3 19089617 . GGGTGAGCAGAACTACTTCTCTTATAATAAGAACACCTTTGTATTTTATTTGCATCTCATCATGTCTTCTGGTGTTTTACA G 12132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=-0.302;DP=306;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=33.75;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,297:298:99:12170,934,0 -chr3 19089861 . A G 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-1.758;DP=346;FS=0.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=3.95;ReadPosRankSum=3.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,72:324:99:1395,0,9725 -chr3 19161505 . G T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.164;DP=50;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:583,0,1179 -chr3 19176769 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.398;DP=64;FS=9.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=3.59;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:258,0,1934 -chr3 19176800 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.007;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:238,0,2205 -chr3 19185643 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.092;DP=77;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:244,0,2314 -chr3 19190263 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.475;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:245,0,822 -chr3 19514458 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.068;DP=78;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:324,0,2448 -chr3 19527808 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.373;DP=54;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:395,0,1428 -chr3 19536652 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=1.170;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:629,0,943 -chr3 19537776 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=1.131;DP=31;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,817 -chr3 19537997 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=1.193;DP=50;FS=4.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:292,0,2760 -chr3 19538050 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.762;DP=31;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:253,0,897 -chr3 19538447 . A C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=2.278;DP=36;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:292,0,1039 -chr3 19540305 . T A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-1.388;DP=47;FS=4.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:725,0,935 -chr3 19540726 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-1.068;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:491,0,382 -chr3 19540743 . T G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.396;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=21.59;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:460,0,247 -chr3 19569627 . G A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.074;DP=106;FS=3.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,25:106:99:517,0,4302 -chr3 19573196 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=1.402;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:282,0,1099 -chr3 19578041 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=1.104;DP=94;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=3.90;ReadPosRankSum=3.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,20:94:99:395,0,2831 -chr3 19584969 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-1.037;DP=119;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:337,0,3659 -chr3 19589752 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=1.155;DP=115;FS=8.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:385,0,3502 -chr3 19597330 . C T 2114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.388;DP=123;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:2143,0,2198 -chr3 19604153 . G GC 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=-0.649;DP=67;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:764,0,812 -chr3 19604630 . G C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-1.459;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.106;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:282,0,1772 -chr3 19604754 . CT C 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.094;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:382,0,173 -chr3 19644029 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.170;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:276,0,887 -chr3 19644161 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=-0.363;DP=33;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:333,0,784 -chr3 19683732 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.449;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:307,0,1005 -chr3 19701292 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=-1.457;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=15.29;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:380,0,682 -chr3 19705181 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:369,0,271 -chr3 19706122 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:328,0,264 -chr3 19841747 . T C 4251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.982;ClippingRankSum=0.470;DP=262;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,135:262:99:4280,0,4836 -chr3 19849629 . C G 1962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.619;DP=286;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,81:286:99:1991,0,7768 -chr3 19856491 . C T 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.416;DP=274;FS=6.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,62:272:99:1201,0,8068 -chr3 19857013 . C A 3123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.549;ClippingRankSum=-3.919;DP=190;FS=4.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,92:188:99:3152,0,3565 -chr3 19857941 . C T 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.004;DP=232;FS=9.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,53:231:99:1098,0,6984 -chr3 19858174 . G T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=-0.465;DP=273;FS=8.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,57:273:99:1065,0,8383 -chr3 19859058 . C A 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.863;DP=265;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,56:265:99:1016,0,10517 -chr3 19859735 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.712;ClippingRankSum=-1.924;DP=187;FS=13.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=1.85;ReadPosRankSum=3.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,30:187:99:375,0,5873 -chr3 19859845 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=-1.133;DP=122;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,30:122:99:586,0,3443 -chr3 19859944 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=1.126;DP=67;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=12.49;ReadPosRankSum=-2.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:865,0,1551 -chr3 19860489 . A AG 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.803;DP=165;FS=23.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,32:164:99:398,0,4889 -chr3 19860519 . A C 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=1.069;DP=181;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,41:181:99:660,0,6888 -chr3 19893346 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-0.283;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:492,0,124 -chr3 19902683 . G T 1503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.663;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,47:75:99:1532,0,944 -chr3 19908514 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=1.140;DP=55;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:407,0,1432 -chr3 19916249 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.209;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:290,0,678 -chr3 19931955 . TACACACACACACACACACACACACACACAC T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.751;DP=52;FS=8.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:925,0,4706 -chr3 19931996 . A G 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-0.898;DP=40;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=24.07;ReadPosRankSum=-4.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:991,0,4533 -chr3 19932309 . A G 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=-1.316;DP=168;FS=3.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,43:168:99:903,0,7595 -chr3 19932707 . G A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.395;DP=243;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,56:243:99:1157,0,7178 -chr3 19932905 . T C 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.639;DP=204;FS=0.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,56:204:99:1365,0,5771 -chr3 19940575 . G A 3687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-2.101;DP=209;FS=0.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,114:205:99:3716,0,3237 -chr3 19964109 . C T 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-0.404;DP=301;FS=2.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,58:300:99:938,0,9254 -chr3 19971116 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.605;DP=422;FS=5.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:357,64:421:99:534,0,13311 -chr3 19973102 . G C 2157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=-1.188;DP=421;FS=7.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,104:421:99:2186,0,12090 -chr3 19998247 . T C 1545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.490;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=31.34;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:71:1574,71,0 -chr3 19998248 . T C 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.717;DP=39;FS=9.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=28.53;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1141,0,343 -chr3 19998399 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.542;DP=80;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:238,0,2512 -chr3 20003461 . CCCTGGAACAGGAAAGGGTGGATGATGCACTTATTCAAAGAATTTTTTTGCATAGATGGAAATAAATCTACCACGTA C 17165.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=2.615;DP=520;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=33.01;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,508:518:99:17203,0,1395 -chr3 20059624 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:281,0,309 -chr3 20115149 . C CT 210.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:248,24,0 -chr3 20644566 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.298;DP=40;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:708,0,709 -chr3 20644798 . G A 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.687;DP=84;FS=5.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,33:84:99:1176,0,1812 -chr3 20644879 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.936;DP=93;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:471,0,3295 -chr3 20645081 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.060;DP=98;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:298,0,3115 -chr3 20663604 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-0.575;DP=89;FS=2.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:422,0,2537 -chr3 20663679 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.098;DP=97;FS=4.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:495,0,2750 -chr3 20876489 . T C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr3 20889769 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:390,0,226 -chr3 20908072 . A T 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:500,39,0 -chr3 21043102 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,331 -chr3 21074434 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.762;DP=24;FS=6.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:259,0,1296 -chr3 21076561 . A G 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=1.259;DP=51;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:934,0,768 -chr3 21076573 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-1.497;DP=55;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=5.12;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:310,0,1472 -chr3 21091679 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=1.259;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:348,0,1262 -chr3 21101318 . T G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-1.259;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:437,0,1398 -chr3 21110743 . A AGTGATTT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:96:297,0,96 -chr3 21113522 . TCTGCAATGCAAACATACACTTATGGTTTAAAATGACTTGAAAATGCTAAAGACTCTAAAACCAGTTTGATTGACCATGTAGATTTGTGAC T 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=33.39;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:438,0,714 -chr3 21165124 . A C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=-1.833;DP=181;FS=1.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,45:180:99:871,0,4879 -chr3 21166748 . G A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.275;DP=231;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,56:231:99:1204,0,6580 -chr3 21176687 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=-0.804;DP=162;FS=5.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=5.44;ReadPosRankSum=2.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,43:161:99:910,0,4389 -chr3 21209836 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr3 21338629 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.406;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:361,0,984 -chr3 21338787 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.566;DP=72;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:434,0,2135 -chr3 21338871 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.280;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=5.78;ReadPosRankSum=2.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:346,0,1596 -chr3 21339129 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.971;DP=99;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:419,0,2935 -chr3 21345050 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr3 21353802 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.106;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:299,0,91 -chr3 21354331 . A T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-1.046;DP=64;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:332,0,2697 -chr3 21354521 . T G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.591;DP=62;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,11:61:99:535,0,2177 -chr3 21354841 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:339,0,2707 -chr3 21354857 . A G 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.597;DP=42;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:783,0,1879 -chr3 21354957 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-2.745;DP=67;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:383,0,3508 -chr3 21360488 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.959;DP=78;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:311,0,2313 -chr3 21371531 . A G 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.404;DP=67;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:515,0,1765 -chr3 21377620 . AGCT A 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=-0.560;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:433,0,3189 -chr3 21377624 . AACAGGAGATACAGACACATTAACACACGTCAGACAAACACGTCGCTCACAGACTAATGTGTAGACACTTAC A 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.304;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=5.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:452,0,3189 -chr3 21455464 . CT C 529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.242;DP=245;FS=4.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,49:225:99:567,0,4773 -chr3 21462771 . G C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.050;DP=36;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:369,0,1084 -chr3 21465734 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.636;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:265,0,796 -chr3 21471869 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.455;DP=72;FS=4.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:259,0,2149 -chr3 21472458 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=-1.049;DP=127;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,23:127:99:309,0,4030 -chr3 21494995 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.900;DP=61;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:303,0,1831 -chr3 21495015 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.366;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=5.05;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:291,0,1560 -chr3 21495932 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.605;DP=113;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,22:113:99:387,0,3478 -chr3 21496552 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.137;DP=132;FS=3.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=1.73;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,22:132:99:256,0,4217 -chr3 21500688 . G C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.645;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:273,0,2740 -chr3 21561265 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=-0.352;DP=83;FS=5.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:402,0,2321 -chr3 22267574 . T TTC 1052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=-2.426;DP=124;FS=9.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,43:121:99:1090,0,3194 -chr3 22272269 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-0.774;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:279,0,1324 -chr3 22293080 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.093;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:444,0,2262 -chr3 22357189 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=1.603;DP=63;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:382,0,1822 -chr3 22359698 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=2.196;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:323,0,2323 -chr3 22365827 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.598;DP=86;FS=5.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:399,0,2397 -chr3 22367634 . C G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.482;DP=58;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:342,0,1771 -chr3 22368157 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.092;DP=53;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:679,0,1134 -chr3 22371783 . C CT 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.547;DP=70;FS=7.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:261,0,1556 -chr3 22371829 . T G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-1.282;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:718,0,2045 -chr3 22372326 . CT C 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.215;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.18;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:260,0,675 -chr3 22373820 . GA G 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.678;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:263,0,645 -chr3 22743514 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,246 -chr3 22747388 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:256,0,269 -chr3 22747961 . C A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:501,0,158 -chr3 22747996 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.817;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:691,0,187 -chr3 22751858 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,417 -chr3 22755319 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:376,0,125 -chr3 22760243 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.406;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:382,0,401 -chr3 22760573 . T G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=2.416;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=20.58;ReadPosRankSum=-2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,208 -chr3 22761964 . A C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.296;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:555,0,713 -chr3 22761989 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-1.848;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,515 -chr3 22791766 . A T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.775;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.504;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:523,0,311 -chr3 22791778 . G C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:406,0,277 -chr3 23081491 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.647;DP=56;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=5.51;ReadPosRankSum=-1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:337,0,1606 -chr3 23085802 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-1.065;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:382,0,1297 -chr3 23103343 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.464;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:261,0,2741 -chr3 23105275 . CT C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:357,0,132 -chr3 23105623 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=1.827;DP=56;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:259,0,1692 -chr3 23253384 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.880;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:267,0,1803 -chr3 23517177 . CAGGTGCGTTTTAACAAAAAGATAACATGAAAATAATCAAATATACTAATAGAAAATATAGGCACACGGTTATAGGACACACAAAGGATAAATGGGTGTAAAATGCATCTTTCCTTTCTCTTTTTATCA C 20547.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=2.115;DP=542;FS=1.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,528:541:99:20585,1904,0 -chr3 23517361 . AGTGAGTTTGCTAGTTTGAGGAAATGGTCATTTGACAGATATAAATCTGTTTTCACATATTAAATCTACTCCAATCTTCTGTACTTTAG A 15990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=4.044;DP=432;FS=2.718;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=34.48;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,417:427:99:16028,512,0 -chr3 23519670 . CGTAAGTGCACAGATCTTCTCGGATTCCACTACATTTTTTTTTAAACAAAATGTGAATAATTTTACACAATTACTTCTTACAATTTTTAG C 16795.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=1.192;DP=397;FS=14.002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,394:396:99:17885,1308,0 -chr3 23525324 . T C 1991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=3.115;DP=467;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:361,105:466:99:2020,0,12836 -chr3 23528761 . GT G 4809.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=-0.272;DP=384;FS=9.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,209:341:99:4847,0,2201 -chr3 23622916 . G GA 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-0.815;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:418,0,570 -chr3 23734803 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=1.330;DP=130;FS=4.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,26:129:99:416,0,3870 -chr3 23753035 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.189;DP=84;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=2.91;ReadPosRankSum=-2.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:273,0,2522 -chr3 23753082 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.840;DP=76;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=4.88;ReadPosRankSum=2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:399,0,1942 -chr3 23811034 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.503;DP=131;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=2.03;ReadPosRankSum=1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,29:130:99:294,0,6933 -chr3 23811105 . T C 2597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-1.455;DP=125;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:2626,0,2539 -chr3 23814128 . GA G 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.206;ClippingRankSum=0.788;DP=190;FS=0.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,48:179:99:726,0,3196 -chr3 23865884 . C T 1208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.276;DP=251;FS=4.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,59:251:99:1237,0,7405 -chr3 23972476 . C A 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.677;DP=33;FS=18.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:985,0,108 -chr3 23972867 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-1.055;DP=62;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:249,0,1922 -chr3 23996824 . CT C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=2.042;DP=46;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.075;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:251,0,582 -chr3 24033864 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=11.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:404,0,279 -chr3 24037716 . G T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;ClippingRankSum=1.292;DP=201;FS=1.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,49:201:99:830,0,5865 -chr3 24038776 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;ClippingRankSum=-1.942;DP=236;FS=6.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,47:235:99:652,0,7021 -chr3 24045137 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.164;DP=60;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:405,0,1692 -chr3 24401456 . AT A 757.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:79:796,79,0 -chr3 24401923 . TGCGTGC T 574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:612,45,0 -chr3 24505775 . G T 16607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,398:398:99:16636,1198,0 -chr3 24507303 . CAGGCACTGCTCTCACCGTTTAATGTGAAAATGTCACTTTAGGATCTTGTCTCAACTTTTGATTTTGTGTGCATTT C 11205.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.547;DP=305;FS=2.841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,268:278:99:11243,837,0 -chr3 25074703 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=1.879;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:413,0,575 -chr3 25074809 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,127 -chr3 25098203 . T TA 345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.519;DP=18;FS=9.031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:23:443,23,0 -chr3 25371502 . TA T 863.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.509;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=23.34;ReadPosRankSum=-1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:94:901,94,0 -chr3 25372075 . GACCTGGAAGAAAAAACTAGAGTCAAGCTGGGATTGGCAAATAGATCTGGACCAGAGCCATACCCTTTAGAGGGGCTTGTAAAAAAGGACAGAACTTGTGGCAGTTAAACCACAGCTCATGTATCTCACCAATTGGATTT G 11592.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=3.271;DP=346;FS=7.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=33.51;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,283:336:99:11630,0,7132 -chr3 25374203 . CACCTGAATTGGCAGAAAAAAAAACAAATTAGCCAGAGTACACCATTAAAAGCATTTCAAAAGTAAATAAGGTTTGATCCCACTCCT C 12216.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.188;DP=287;FS=3.376;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,284:285:99:12254,1076,0 -chr3 25374433 . ACTAAAAAAAAAAAATAAACAAGACAATTAAACATGTTCATTGTAAGAAACTGATTCGGATATGCTTCACTTTACTGAACTTAC A 14477.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=336;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,334:336:99:14515,412,0 -chr3 25382422 . AT A 873.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=-0.259;DP=54;FS=1.952;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,42:47:4:927,4,0 -chr3 25538105 . G GT 320.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:358,23,0 -chr3 26671220 . AACCTGCGGAGATCAATCAACGAGCAACTTGTTTGACAATAACGCTTCAAAATAACAGAATTCTTCAAATATACAAAACTAAATGTGTAACTC A 2436.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=433;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,393:393:99:2474,902,0 -chr3 26792555 . G GT 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-1.144;DP=102;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:380,0,1377 -chr3 26877417 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,516 -chr3 26877418 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=-0.791;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=26.69;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:482,0,151 -chr3 26877551 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:313,0,139 -chr3 27983771 . C CT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.946;DP=54;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:238,0,720 -chr3 28137189 . A AT 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.432;DP=101;FS=1.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:359,0,1490 -chr3 30102289 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-1.532;DP=65;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:262,0,4496 -chr3 30102457 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.647;DP=104;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=3.24;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:365,0,3541 -chr3 30102469 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.629;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=1.97;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:241,0,3424 -chr3 30291881 . CT C 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.841;DP=56;FS=5.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:617,0,778 -chr3 30347850 . CAGGTATATTGGCTTTGTTCTCTCAGAAGGAGATGTGGTTTGGCATTGCTGAAGGTCATCCAAATTCAATTGTGTTTCTT C 1832.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=1.714;DP=211;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:189:99:1870,379,0 -chr3 30354139 . C CA 746.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-2.357;DP=66;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:784,0,697 -chr3 30399115 . ACTAACAGACAGATAAAGTAACTGACATTCAATCATATTCATCTGATTAACGTTAGACAGCAGTCTAGCATGCTAACAAGCTCCCTGTGCAAGTCATCTGCAATGCCATGTAAAATACAGATTTTGTGACTGCGAGGTGTATCAGACACAATCATCTTAC A 9856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=2.797;DP=233;FS=5.459;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=24.83;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,224:233:99:9894,801,0 -chr3 30654014 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,140 -chr3 30662130 . TGA T 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-1.555;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:595,0,460 -chr3 30849339 . CA C 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.153;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:386,0,321 -chr3 30855927 . A G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-0.321;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:531,0,389 -chr3 31041592 . TA T 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.789;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:519,0,740 -chr3 31080713 . CCCTGCCAGACCATTTACACTAGTTAAAACATGCAACTTCTTAAACTAAAAACACTTAAACAACTTGTGTTCGGTTCTTG C 1680.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.873;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=29.27;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1718,149,0 -chr3 31098403 . TGA T 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-1.288;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:298,0,380 -chr3 31195172 . T C 258.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:287,0,21 -chr3 31195295 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.651;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:304,0,602 -chr3 31220565 . CT C 2153.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=-1.412;DP=247;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,111:210:99:2191,0,2351 -chr3 31220721 . G GA 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.170;DP=72;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:333,0,995 -chr3 31277702 . T A 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-1.453;DP=104;FS=1.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1421,0,2220 -chr3 31279613 . G C 2032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.769;DP=156;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,62:155:99:2061,0,3059 -chr3 31863136 . TA T 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.474;DP=316;FS=6.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,60:291:99:636,0,6498 -chr3 31863453 . AT A 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.787;DP=73;FS=7.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:543,0,943 -chr3 31936420 . TCCTAGAATCAAAATCAACTTCCATCACTGCAGTGCGCTTACTTATGCATACTATATATGCATGAAGGAGAGCTCCTTA T 16229.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.758;DP=366;FS=3.283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,344:345:99:16267,1368,0 -chr3 31941244 . C A 1679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=-4.307;DP=356;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=4.72;ReadPosRankSum=2.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,83:354:99:1708,0,9741 -chr3 31952135 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,324 -chr3 31959863 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.024;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:334,0,692 -chr3 31985939 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-0.014;DP=42;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:328,0,1129 -chr3 32016937 . T TA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.296;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:336,0,701 -chr3 32017188 . G GA 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-1.504;DP=79;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:498,0,1363 -chr3 32054176 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.411;DP=58;FS=7.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:264,0,1797 -chr3 32062115 . CA C 976.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.154;DP=296;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,73:296:99:1014,0,7461 -chr3 32194566 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-0.287;DP=58;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:400,0,1526 -chr3 32195617 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=1.068;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:235,0,1369 -chr3 32195685 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-0.035;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:258,0,1410 -chr3 32237263 . G GAAAC 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.179;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:99:652,0,5932 -chr3 32243020 . T G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.615;DP=41;FS=15.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:537,0,834 -chr3 32243291 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,404 -chr3 32257092 . T C 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.487;DP=50;FS=35.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1311,0,721 -chr3 32257121 . T G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=-2.773;DP=44;FS=24.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=15.56;ReadPosRankSum=-4.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:713,0,757 -chr3 32272656 . G T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr3 32272670 . T G 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr3 32365182 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:378,0,389 -chr3 32431807 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=-1.797;DP=123;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.26;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,24:123:99:306,0,3750 -chr3 32447663 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.537;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:845,0,1347 -chr3 32494596 . G GA 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.845;DP=276;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,58:249:99:491,0,5452 -chr3 32524399 . T C 2334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.804;DP=318;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=7.34;ReadPosRankSum=-2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,95:318:99:2363,0,8127 -chr3 32537450 . GA G 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.450;DP=121;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,32:95:99:632,0,1179 -chr3 32540907 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.185;DP=85;FS=5.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:362,0,2451 -chr3 32541254 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-0.962;DP=94;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:367,0,2728 -chr3 32552704 . G T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.038;DP=124;FS=3.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:573,0,4912 -chr3 32560609 . GCAGGTAAGTGCATGCTATCATTACCACTGTATGTGATGTGTCTTTTATGTGGCAATCTCCCTCTAATGGATGCTGCATCTCCA G 1516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.022;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:99:1554,166,0 -chr3 32572061 . C T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.007;DP=135;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,37:135:99:866,0,3485 -chr3 32572154 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.643;DP=107;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:499,0,2883 -chr3 32573689 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-0.607;DP=142;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,44:142:99:1174,0,3667 -chr3 32594776 . G GT 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-1.324;DP=83;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:353,0,1491 -chr3 32621349 . T A 2257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.861;DP=315;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,93:315:99:2286,0,8088 -chr3 32621542 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.132;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,38:179:99:685,0,5458 -chr3 32622693 . C T 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.202;DP=149;FS=18.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,41:149:99:1044,0,4040 -chr3 32649283 . ACAGGTATAATCAATCACACTTCTGTTTACACTCATTTGTTCAGTTGCTGAAGTTTGATCTCTCTGTTT A 1668.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=1.372;DP=60;FS=3.388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1706,143,0 -chr3 32667501 . AGTAAGACAATGCTATCCTCAGAATAAACCTAAAATGTCACTTGTTGATATAATAATCATATAATGATTCTTCTTTTCTCTTATCCAG A 15458.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.448;DP=405;FS=4.318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=30.50;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,394:405:99:15496,1156,0 -chr3 32674981 . CCCTACAGTCAGAAGGAACACCTGCATTTATTTTCAACATTTGGCCACAAAACATCAGATATAACTTAGGATTTCTTCCTTTCCAGGTAAATGTGTAGATTTATATA C 9115.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-1.931;DP=217;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,210:216:99:9153,774,0 -chr3 32677281 . TCTGCATGGGGAATATATAAAAAAAATACAAAAGTAAGACACATGATGATTTAGTTTTCTCCTATTACTGCATTATTCTAACTTTTTTTTAGTGTAC T 10532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.506;DP=242;FS=2.237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,239:242:99:10570,884,0 -chr3 32724203 . CT C 982.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=1.174;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1020,0,131 -chr3 32733062 . T G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-0.024;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:366,0,1791 -chr3 32766399 . C A 626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:655,45,0 -chr3 32790720 . T A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.625;DP=96;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,28:96:99:667,0,2549 -chr3 32794829 . G GGATTT 1400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-1.428;DP=95;FS=1.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:1438,0,1536 -chr3 32794835 . G T 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=-1.337;DP=93;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=15.16;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:1438,0,1536 -chr3 32961781 . T C 265.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:294,0,15 -chr3 32961786 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,101 -chr3 32987332 . TCAGGTGCGTATATATAGAGAAGATACATTTTTCATTTGTCCCTAGCTCATGTGCATCTGTAAAAAAAAAAGTGTTTCTTGTTTGTGCTCTA T 3615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=1.692;DP=90;FS=3.267;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=27.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:3653,277,0 -chr3 33002945 . CATTGTGAGTTCCACCCAGATATTCCAGTAA C 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-0.966;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:478,0,966 -chr3 33002978 . TCTGTAAATGAATGGATACTGGACCGACTTGTGCTCTTTCATGCAG T 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.094;DP=24;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:478,0,966 -chr3 33078491 . GGGTAACTCGTAAACTTGAATAAATCTCAGTGTTGATTGTATGTATTTCAATCTTTTCTGATTTTGTCCCGCCATTTTTCTCTCTGTAAACGTATA G 2942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=2.299;DP=80;FS=7.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=30.11;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,71:80:99:2980,0,1719 -chr3 33098515 . C CTG 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.352;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:344,0,172 -chr3 33202795 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.593;DP=120;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,34:120:99:829,0,3259 -chr3 33586100 . GGGTGAGAGATATGCTCACCCTTGATAACTGTTGAATGCAAATATGTGAGATTTATTTAGATTTTTTCCATTTCTCTCCCTTCCCATA G 1029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-0.040;DP=202;FS=6.223;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,190:196:99:1067,372,0 -chr3 34016472 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.166;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:339,0,3043 -chr3 34257377 . C CA 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.660;DP=176;FS=11.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,44:169:99:758,0,4524 -chr3 34265415 . CA C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.010;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:276,0,2448 -chr3 34265421 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.393;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:278,0,2448 -chr3 34265428 . ACTGTAAATTACAAATAATTTAATCACACGACAGCTGTTACCACTGAAATCTGAACAGATTTAGACTTGACTCACTCAC A 1510.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-3.354;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=30.83;ReadPosRankSum=3.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,39:47:99:1548,0,1071 -chr3 34267214 . A T 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-0.443;DP=79;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:777,0,5165 -chr3 34322626 . TGGTAGCATATTTCATTTTCTTTTCTTTGTTTATTTTTTACTGCCAAAGAGAACCCTTTAGTAACAATTGTTTACATTTTTTTTTACTTTTTGGCAACA T 8847.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-0.011;DP=259;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=34.16;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,239:246:99:8885,687,0 -chr3 34364005 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.495;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:334,0,1732 -chr3 34540882 . TA T 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.265;DP=162;FS=9.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,39:159:99:546,0,3349 -chr3 34889963 . ACCTGTACAAAACAAGACATTTTTTTAAATTTCATGCTATGTGGTTGTGAGATAAAAATGTTAGTCAGTGAGTGCAGCACAAAATCAGGGCTTG A 7927.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.927;ClippingRankSum=1.378;DP=203;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=33.67;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,182:197:99:7965,0,2355 -chr3 35411114 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.768;DP=20;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:357,0,119 -chr3 35500440 . TGTAAGTGTCTATATCAACAAATGTCAAAAAGGTAAAGTGTTTTTGACCTTGGAAAGCTAAAACTGTATTGTGACCACAG T 435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=1.139;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=5.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,77:79:99:473,180,0 -chr3 35502378 . GAGGTAAAAATTAAATTGACAGATTGACCCACCAAACTGTCAATTTTGTTAAATGATGTCTGGCATCAACTAAATTTTCAATTACATTTTTTCC G 2925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=2.489;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=33.63;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,82:85:99:2963,288,0 -chr3 35503531 . G GA 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-1.317;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:266,0,2010 -chr3 35615486 . C CA 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-0.036;DP=85;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:309,0,1383 -chr3 35616031 . AT A 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.904;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:816,0,695 -chr3 35616313 . CT C 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-1.057;DP=151;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:254,0,2576 -chr3 35885788 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,183 -chr3 35935288 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.920;DP=44;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:384,0,1130 -chr3 35943183 . GCTGCAACAAATAATCAGAAATTCTTTTCAGTCAAGTATTGCACATAAATATCCTCAAATGTTTCATACCTGAATGATTTTAAATGATCTTAC G 1922.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=1.459;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=35.00;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,47:52:99:1960,0,1256 -chr3 36124199 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.043;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:278,0,1111 -chr3 36173281 . A G 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=2.529;DP=283;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,57:283:99:917,0,8989 -chr3 36173441 . G A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-3.139;DP=257;FS=5.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,58:257:99:1204,0,7677 -chr3 36209371 . A C 1416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-3.033;DP=261;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,68:261:99:1445,0,8795 -chr3 36248146 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.835;DP=72;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:392,0,2180 -chr3 36248321 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-1.687;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:300,0,826 -chr3 36283067 . C CT 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.911;DP=88;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,23:78:99:341,0,1207 -chr3 36322515 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.267;DP=42;FS=7.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=6.68;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:309,0,1131 -chr3 36348272 . G C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.660;DP=98;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:588,0,2773 -chr3 36445575 . T A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 -chr3 36448282 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,515 -chr3 36448284 . G GGTGT 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=2.475;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:379,0,169 -chr3 36448487 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-1.078;DP=25;FS=13.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:233,0,647 -chr3 36461283 . TCTGAAAGTGGAGCATGTGTGATGGTGACATGTCTATCTATTGGAGATCTATTATGATTTATTGGAGTAATGCAAATGGAATGAGCTTAC T 1773.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=1.655;DP=47;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=28.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:2060,149,0 -chr3 36597945 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.844;DP=60;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:340,0,1718 -chr3 37130556 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-0.010;DP=53;FS=4.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.912;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:308,0,1527 -chr3 37578721 . T A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.465;DP=48;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:382,0,1340 -chr3 37578732 . C G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=-0.068;DP=53;FS=6.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:428,0,1456 -chr3 37662896 . G A 2047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.860;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,85:300:99:2076,0,8575 -chr3 37663736 . G GT 1270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.601;DP=404;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,98:366:99:1308,0,7348 -chr3 37681974 . C CGA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.520;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:254,0,3294 -chr3 37683501 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.462;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:354,0,1081 -chr3 37746290 . A G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.283;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=28.41;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:426,0,44 -chr3 37746388 . G T 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr3 37752287 . A T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr3 37753881 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.715;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:288,0,193 -chr3 37772368 . G A 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=1.090;DP=153;FS=3.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,36:153:99:777,0,9816 -chr3 37783948 . C T 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=1.280;DP=220;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,67:218:99:1762,0,5952 -chr3 38645130 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.845;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:239,0,997 -chr3 38651020 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=-0.308;DP=67;FS=8.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:332,0,1973 -chr3 38665541 . T C 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:247,0,23 -chr3 38675839 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.195;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:511,0,2053 -chr3 38759478 . G C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.219;DP=111;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,20:111:99:289,0,3433 -chr3 38908099 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:375,0,282 -chr3 38909489 . C T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:304,21,0 -chr3 39110129 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.425;DP=54;FS=12.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:279,0,1512 -chr3 39179021 . TCTACAAACAGAGAGATGGAGAAAAACAAAGAGAAAACAAGATAAGTGCATGAAATATTTGCAATTTAGAGTTAAAATTCCAGTTTGGAGAATTTATAC T 2328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=2.055;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=33.75;ReadPosRankSum=-1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,63:69:99:2366,0,876 -chr3 39179202 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.721;DP=51;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.141;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:243,0,1591 -chr3 39232992 . T C 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=1.018;DP=121;FS=4.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,36:121:99:938,0,3350 -chr3 39233769 . GA G 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-0.949;DP=272;FS=8.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,66:240:99:1058,0,4835 -chr3 39234102 . C A 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.300;DP=302;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,83:302:99:1947,0,8182 -chr3 39308851 . C A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=1.544;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:478,0,2006 -chr3 39309749 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.049;DP=81;FS=5.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.119;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:467,0,2448 -chr3 39553884 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-2.296;DP=24;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:279,0,542 -chr3 39563683 . T C 2238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=1.317;DP=463;FS=2.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=4.84;ReadPosRankSum=2.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,107:441:99:2267,0,12941 -chr3 39565569 . G C 2719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.536;DP=392;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,111:392:99:2748,0,11044 -chr3 39607873 . C G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.848;DP=84;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,27:84:99:710,0,2194 -chr3 39651376 . CCA C 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-1.228;DP=80;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:456,0,2316 -chr3 39659212 . G A 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.882;DP=144;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,43:144:99:1026,0,3639 -chr3 39673061 . A C 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=1.051;DP=111;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=7.15;ReadPosRankSum=2.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:822,0,3048 -chr3 39677561 . G A 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-0.567;DP=114;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:1202,0,2540 -chr3 39680480 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.416;DP=98;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:436,0,2837 -chr3 39682727 . T G 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=-0.317;DP=43;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=7.51;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:360,0,713 -chr3 39683507 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=4.747;DP=74;FS=25.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=3.90;ReadPosRankSum=-3.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:317,0,2167 -chr3 39959980 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-1.453;DP=43;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:604,0,892 -chr3 39966837 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.833;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:257,0,1593 -chr3 39988171 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.087;DP=92;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:395,0,5512 -chr3 39988177 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.169;DP=89;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:395,0,5512 -chr3 40201892 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-0.199;DP=51;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:310,0,1513 -chr3 40201934 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-0.350;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=32.37;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:708,0,201 -chr3 40202030 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,275 -chr3 40202084 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.782;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:480,0,956 -chr3 40213509 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=1.073;DP=125;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,21:125:99:292,0,4053 -chr3 40223829 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=1.849;DP=131;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,26:131:99:471,0,4047 -chr3 40251155 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.817;DP=26;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.451;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:321,0,563 -chr3 40262967 . TCCTGAAAAACGAGAGACAGCGAGTTGTTACAGTATCTTTGACCTTGATTCAGTTTTACAAAATCAAACCAAACTCA T 11701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-1.023;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=35.79;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,214:215:99:11739,989,0 -chr3 40285001 . TGGTTAGTATTGTAATATCCATCCATCCATCTATATTTTGTTTGTTAATAATGCTAATACAATGTTTGTATTGTTTTGCA T 3101.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.871;DP=90;FS=4.498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=34.46;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,84:88:99:3139,277,0 -chr3 40289665 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.601;DP=41;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:551,0,883 -chr3 40439124 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.234;DP=100;FS=2.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,29:99:99:772,0,2569 -chr3 40474518 . A T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.772;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=12.02;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:437,0,720 -chr3 40481076 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=1.041;DP=35;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:463,0,799 -chr3 40522892 . CCCTGTAATGCAAGGACACAAGCGTTACATTTTGTGAACTACTTGAGAAAGTTCTCAGTTTGGGTCAGAATCAAACTAATCGGTCTTCTCA C 13938.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=2.239;DP=316;FS=2.824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,312:314:99:13976,1207,0 -chr3 40576214 . C T 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=-0.654;DP=344;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,75:343:99:1473,0,10541 -chr3 40803930 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=1.573;DP=156;FS=4.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,24:153:99:263,0,4689 -chr3 40812174 . TGTGAGTATTGCCTATCAAATCACTGACCACTAAAACTCAAAAATACTCAATTATTCTTTTCATCTCACCAG T 5407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=1.812;DP=122;FS=4.500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=26.87;ReadPosRankSum=-2.958 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,115:120:99:5445,495,0 -chr3 40812494 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.509;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,30:149:99:536,0,4590 -chr3 40821489 . G T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.089;DP=108;FS=1.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,33:106:99:876,0,2714 -chr3 40877780 . TCTGTAACAGCATGATGACAACTCAAATCACAATCACTTCACAGATAAAAAGCTGATCTGCACACAGTGAAGGGATGTAC T 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=-0.945;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:600,0,1051 -chr3 40894640 . A C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.895;DP=40;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:335,0,1051 -chr3 40894733 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.074;DP=34;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:337,0,889 -chr3 40895033 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr3 40922438 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.053;DP=89;FS=13.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:443,0,2585 -chr3 41642728 . G C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=2.527;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:445,0,1447 -chr3 41699915 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.854;DP=58;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:262,0,1753 -chr3 41716701 . GAGGTCTGTTTACAATATATACTTTGCTGTATTGATGTTTCAGGTTTTAGATAGTTTTTTTTAACTTGTGCTTTTCTTTTGTTTCACTCAAT G 4902.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=1.259;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,138:145:99:4940,625,0 -chr3 41912514 . GA G 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=2.144;DP=325;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.777;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,2:321:99:943,0,11736 -chr3 41917407 . G GA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=2.351;DP=374;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:406,0,182 -chr3 41917661 . TGGTAAGTATACCAAAACATTTTTACATATATTGGTATTAAAACTGAAAAGGATCATTGAGAATAGAAACTAATGGTTTTTGTTTCTTCATTGCA T 14206.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=1.647;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=27.89;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,325:331:99:14244,1227,0 -chr3 41918689 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.585;DP=50;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.459;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:239,0,1500 -chr3 41919070 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=-0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:329,0,789 -chr3 41919071 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.409;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:329,0,747 -chr3 41921277 . G C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=1.197;DP=314;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,54:314:99:727,0,10447 -chr3 42016985 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.558;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:377,0,2694 -chr3 42053006 . G A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.535;DP=77;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1079,0,1579 -chr3 42081407 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-1.100;DP=83;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:292,0,2409 -chr3 42106524 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:288,0,333 -chr3 42828475 . GCTGTTAGGAAATAAAGAAACAGAAAGAATGTCAAAATGTATCATTTTGAACACGCATACAGAAACAAACACACACAGCCAGCAATTTAC G 2986.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=1.683;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=34.75;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:3024,233,0 -chr3 43559707 . ACTGAAACACAGAGAGCGAGAGAACAGAGTGAGTCTCTGTTGTTGTTCCTCAGTCTCCTGTGGTTTGAGTTCCTAC A 2805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=2.107;DP=91;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=30.83;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,82:91:99:2843,0,975 -chr3 43655259 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:271,0,254 -chr3 43655376 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:411,0,128 -chr3 44041085 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=33.93;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:35:700,0,35 -chr3 44041091 . T C 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=34.17;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:35:700,0,35 -chr3 44043050 . G A 555.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=34.74;ReadPosRankSum=-1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:27:584,0,27 -chr3 44043195 . G T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:242,18,0 -chr3 44043329 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-1.999;DP=18;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:269,0,372 -chr3 44043545 . T C 658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:51:687,51,0 -chr3 44043576 . C T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr3 44315631 . C CA 435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:35:473,35,0 -chr3 44317194 . A G 3477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.180;DP=275;FS=16.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,55:243:99:3506,0,6405 -chr3 44317386 . G A 3477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-1.636;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=21.26;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,35:36:99:3506,0,6425 -chr3 44317732 . A T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.121;DP=57;FS=62.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=5.21;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:325,0,1687 -chr3 44317844 . C G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.982;DP=143;FS=51.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.988;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,25:134:99:407,0,4523 -chr3 45411241 . C CT 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-0.478;DP=230;FS=5.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,51:207:99:531,0,3655 -chr3 46837457 . G GT 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.166;DP=135;FS=8.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:329,0,902 -chr3 46838302 . G GT 566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=-2.052;DP=235;FS=13.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,58:188:99:604,0,3118 -chr3 46839575 . G GT 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.844;DP=278;FS=12.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=2.09;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,61:239:99:618,0,4299 -chr3 46844127 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,385 -chr3 46844141 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=-1.523;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:265,0,303 -chr3 46844574 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,228 -chr3 47005230 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr3 47021149 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-1.032;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=30.63;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:37:549,0,37 -chr3 47344747 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-2.282;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:49:448,0,49 -chr3 47344751 . A G 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:577,39,0 -chr3 47498540 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-0.625;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:243,0,929 -chr3 47973365 . GT G 430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:468,45,0 -chr3 48060975 . CGTGAGTATCATCTTTGACATTGCTATTTGACATTTTTTTTATTGGTTTGTGTGTAGAGGTAATCACTAGGCTGTTCTTTTAAACTCAATAG C 1561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.755;ClippingRankSum=5.468;DP=423;FS=5.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=3.69;ReadPosRankSum=-4.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,391:423:99:1599,0,2299 -chr3 48061970 . TA T 4879.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.019;DP=211;FS=5.127;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=23.13;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,180:195:99:4972,444,0 -chr3 49744905 . AT A 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:301,0,203 -chr3 49753914 . T C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.058;DP=38;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:662,0,699 -chr3 50031876 . T TA 750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:788,54,0 -chr3 50279892 . GT G 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.629;DP=41;FS=8.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:674,0,138 -chr3 50281163 . T A 1556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1585,108,0 -chr3 50282784 . C T 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:99:2353,163,0 -chr3 50282797 . C G 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:2353,163,0 -chr3 50282865 . A C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.600;DP=61;FS=7.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:378,0,1363 -chr3 50311103 . TG T 1074.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:1112,85,0 -chr3 50719622 . G A 1524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1553,108,0 -chr3 50719738 . C T 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:825,57,0 -chr3 50719950 . G A 3807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3836,271,0 -chr3 50719980 . C T 1905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1934,135,0 -chr3 50834272 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr3 50835060 . A C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr3 50839046 . G A 1253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1282,90,0 -chr3 50868021 . C A 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:592,42,0 -chr3 51709849 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr3 52748385 . G GC 210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:248,21,0 -chr3 52941605 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:316,0,58 -chr3 53196418 . G A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.475;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:1014,0,215 -chr3 53196520 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-0.917;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=24.57;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:839,0,883 -chr3 53196523 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.842;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=24.27;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:829,0,883 -chr3 53201528 . G T 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.083;DP=45;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:974,0,559 -chr3 53241073 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,123 -chr3 53241209 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.606;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:392,0,96 -chr3 53282367 . C T 313.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=31.39;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:342,0,14 -chr3 53286100 . G T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.709;DP=35;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=29.71;ReadPosRankSum=3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1068,0,170 -chr3 53298460 . A G 1866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-1.252;DP=57;FS=12.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=32.75;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:84:1895,0,84 -chr3 53298472 . GCTAGAGAAAAGAAATTCAAAGTTGTGGTCATCTGACAGCTTTTAGAGTTTCAAATAGTGCAAGACCAAC G 2520.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.152;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=33.00;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2558,205,0 -chr3 53309183 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr3 53312039 . T TA 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.949;DP=43;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:289,0,642 -chr3 53335393 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:237,0,350 -chr3 53337427 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.896;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:460,0,170 -chr3 53369441 . G C 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.294;DP=34;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=30.38;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1061,0,116 -chr3 53685932 . T C 10647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,252:252:99:10676,773,0 -chr3 53686012 . G A 11437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.550;DP=285;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=33.56;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,284:285:99:11466,858,0 -chr3 53690932 . T C 12331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=-1.380;DP=316;FS=3.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=30.78;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,304:305:99:12360,902,0 -chr3 53691078 . G C 10012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;ClippingRankSum=-0.009;DP=386;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,275:374:99:10041,0,2033 -chr3 53691117 . C T 14636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=361;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,356:356:99:14665,1074,0 -chr3 53712931 . C CA 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.265;DP=95;FS=5.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,57:77:99:930,0,1708 -chr3 53969935 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.963;DP=95;FS=3.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:391,0,2932 -chr3 54085982 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:304,0,1092 -chr3 54088432 . CT C 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:296,0,168 -chr3 54160694 . A G 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:282,0,22 -chr3 54167438 . A C 5058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=-2.573;DP=298;FS=1.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,144:298:99:5087,0,5256 -chr3 54170514 . C T 5637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.358;DP=291;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,165:291:99:5666,0,4683 -chr3 54171522 . CACCTAAAAAAGGATTGGTAATTGATCATTTCCATGTGGGAACAACGGGACCTATGCAAGGCAACAGTAAACCAGATATAATTGTTGATACTT C 9843.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.014;DP=226;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=28.66;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,210:213:99:9881,961,0 -chr3 54175239 . A G 6326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=-1.015;DP=377;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,195:377:99:6355,0,6534 -chr3 54175350 . GCCTATGTGAGAGAGTATGTGGACCGTTGACAAGAAGATCACAGAGAAACTGTTTAAACAATCACATGCCATTTTATATA G 824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-2.539;DP=289;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,55:272:99:862,0,10960 -chr3 54175353 . TATGTGAGAGAGTATGTGGACCGTTGACAAGAAGATCACAGAGAAACTGTTTAAACAATCACATGCCATTTTATATAC T 7645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-0.060;DP=280;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,209:270:99:7683,0,2765 -chr3 54175433 . CTT C 7645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=-1.222;DP=290;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,209:271:99:7683,0,2761 -chr3 54176241 . TCTGGCAAAATGTAAGAACAACATAAGACCACTGCAACTGTATTATCTTTGAAAGCTGTATATGCATGACCCACATTAAAAGCTTGGTTTGTTTTAAATCAGACTCAC T,TTTATCTTTGAAAGCTGTATATGCATGACCCACATTAAAAGCTTGGTTTGTTTTAAATCAGACTCAC 3462.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.628;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,79,115:197:99:5972,2396,4012,1178,0,2771 -chr3 54176284 . TATCTTTGAAAGCTGTATATGCATGACCCACATTAAAAGCTTGGTTTGTTTTAAATCAGACTCACTA T 3950.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.218;DP=205;FS=7.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,119:202:99:3988,0,4811 -chr3 54178134 . C T 11435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=1.073;DP=412;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,303:412:99:11464,0,2566 -chr3 54178357 . A G 5778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-5.560;DP=263;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.001;QD=21.97;ReadPosRankSum=3.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,169:261:99:5807,0,3126 -chr3 54326021 . A C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.131;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:416,0,375 -chr3 54467556 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.102;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,315 -chr3 54467574 . C G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=1.240;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:399,0,122 -chr3 54467772 . T G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-2.062;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:358,0,432 -chr3 54468774 . T A 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:514,36,0 -chr3 54468801 . T C 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:697,51,0 -chr3 54468891 . TG T 659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-1.304;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=26.39;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:697,0,127 -chr3 54468943 . A G 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.397;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1005,0,115 -chr3 54468997 . A G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-1.434;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:548,0,121 -chr3 54469086 . G C 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr3 54469165 . C T 1121.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-1.034;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=32.55;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:31:1150,31,0 -chr3 54483902 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:276,0,345 -chr3 54483938 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.463;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:404,0,441 -chr3 54483958 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.723;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:459,0,416 -chr3 54484123 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:239,0,67 -chr3 54521064 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=1.526;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=23.59;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:500,0,150 -chr3 54533343 . A G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:476,0,164 -chr3 54533476 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=25.70;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:388,0,131 -chr3 54541411 . C T 642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:671,48,0 -chr3 54725474 . G A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr3 54746660 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:325,0,356 -chr3 54747781 . G T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.417;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:499,0,259 -chr3 54751390 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.913;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:468,0,308 -chr3 54751495 . C G 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr3 55285989 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:345,0,676 -chr3 55286694 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.626;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:1243,0,360 -chr3 55290199 . T G 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.173;DP=54;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:918,0,861 -chr3 55393336 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=2.533;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,160 -chr3 55413017 . G A 1796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.101;DP=101;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1825,0,1653 -chr3 55419013 . AAGGTACGGCTTCGTAAACAATATTTTAGAAACTCTTTTGGTGTAATTCAATTAATTTTGCCCCTCAACTCCATTTC A 3409.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.425;DP=90;FS=4.575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=33.12;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,81:85:99:3447,251,0 -chr3 55419123 . C T 1741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-0.313;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,50:87:99:1770,0,1291 -chr3 55437797 . T C 5452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-1.663;DP=347;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,172:326:99:5481,0,5495 -chr3 55441448 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.946;DP=228;FS=10.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,39:228:99:582,0,7590 -chr3 55443125 . C T 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.821;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,34:57:99:1184,0,804 -chr3 55443322 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=2.470;DP=144;FS=29.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,23:144:99:270,0,4838 -chr3 55450369 . G T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.337;DP=134;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=3.65;ReadPosRankSum=-4.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,28:134:99:517,0,4033 -chr3 55453460 . G T 1312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-3.518;DP=86;FS=10.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:1341,0,1600 -chr3 55454531 . T C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.047;DP=182;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,38:182:99:694,0,5743 -chr3 55455550 . TCCTGAAAAGAAGCTCAAGTCAGACCACTTGTTTTCTAGAAGGGAGCTCTGAAAAGGCAAAGTAACTCA T 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.787;DP=131;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,41:130:99:1058,0,10879 -chr3 55455552 . CTGAAAAGAAGCTCAAGTCAGACCACTTGTTTTCTAGAAGGGAGCTCTGAAAAGGCAAAGTAACTCACT C 3221.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-0.215;DP=132;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=24.41;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,88:132:99:3259,0,4589 -chr3 55466276 . AG A 505.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=1.761;DP=33;FS=8.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:30:543,0,30 -chr3 55466423 . C A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=1.566;DP=39;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=24.87;ReadPosRankSum=-2.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:998,0,510 -chr3 55467029 . T C 1132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1161,78,0 -chr3 55467034 . C T 1132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:78:1161,78,0 -chr3 55467184 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:275,0,545 -chr3 55467344 . G A 2213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:52:2242,52,0 -chr3 55467553 . C G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=1.115;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=26.60;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:507,0,108 -chr3 55468123 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:305,0,1519 -chr3 55468214 . C A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.098;DP=37;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:557,0,839 -chr3 55468248 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=1.060;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:329,0,326 -chr3 55468413 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.895;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:324,0,667 -chr3 55469448 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=3.026;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:923,0,1738 -chr3 55469484 . A T 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=2.856;DP=75;FS=8.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=11.60;ReadPosRankSum=-2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:898,0,1778 -chr3 55469502 . C T 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=3.842;DP=69;FS=8.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,27:69:99:956,0,1488 -chr3 55520710 . TAA T,TA 1024.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,36,11:52:99:1600,277,251,1060,0,960 -chr3 55602613 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.78;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:296,0,57 -chr3 55602618 . C T 581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:610,42,0 -chr3 55635946 . T A 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr3 55636302 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:373,0,84 -chr3 55645446 . A C 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:237,0,24 -chr3 55651094 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=3.295;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:275,0,461 -chr3 55687282 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.246;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:419,0,943 -chr3 55687432 . T C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.008;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:443,0,3510 -chr3 55688469 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.053;DP=37;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:278,0,991 -chr3 55688490 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.835;DP=36;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:326,0,943 -chr3 55706125 . C T 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.405;DP=68;FS=4.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,35:68:99:1100,0,1219 -chr3 55708373 . T TCCCATTTCGAGCTCTTCTCCA 1538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.230;DP=94;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:1576,0,1362 -chr3 55717958 . GAGGTCAGTAGAACAACATGTGTGACATAACACACATGCACACAGCCTTCTGATTGGTTTGCACCTTTCATATGCTTTTTATGTTCTC G 3901.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=1.516;DP=96;FS=2.124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=29.44;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,93:96:99:3939,327,0 -chr3 55724120 . A G 1541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1570,111,0 -chr3 55965814 . A G 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=1.094;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.900;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:435,0,1884 -chr3 55965882 . T A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=-2.500;DP=444;FS=33.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=1.17;ReadPosRankSum=2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:377,66:443:99:549,0,18996 -chr3 55965888 . C T 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-2.290;DP=478;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:399,79:478:99:943,0,19067 -chr3 55972190 . A G 4209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.751;ClippingRankSum=-10.689;DP=507;FS=130.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,160:504:99:4238,0,12874 -chr3 55972240 . TCTGCAGGAAATACAACAAACCAAATTAGTTTATAGCCACTATGAAAGTATCAAACTTGAGAACAACTGTTGATAGCGCTCAC T 16047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=4.955;DP=381;FS=8.211;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=28.09;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,370:381:99:16085,1259,0 -chr3 55974794 . C T 4514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=-0.543;DP=269;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,124:269:99:4543,0,4989 -chr3 55979333 . A G 2786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-3.975;DP=304;FS=41.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.103;QD=9.17;ReadPosRankSum=3.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,102:303:99:2815,0,8098 -chr3 55979422 . TCTGCAGGAAACACAACAAACCAAATTAGTTTACAGCCACTACGAAAGTATCAAACTTGAGAACAACTGTTGATAGCGCTCAC T 9677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=3.339;DP=312;FS=32.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=31.02;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,233:262:99:9715,0,5856 -chr3 55983317 . A G 19294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.914;ClippingRankSum=-1.556;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=25.77;ReadPosRankSum=3.129 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,46:50:99:19323,1484,0 -chr3 55983320 . T C 19294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.410;DP=71;FS=2.187;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=30.33;ReadPosRankSum=3.246 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,52:59:99:19323,1484,0 -chr3 55983386 . C T 1730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=1.343;DP=304;FS=18.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,73:304:99:1759,0,9063 -chr3 55983421 . GGGTAAGCTGACATAGATTACAGATGTTTTTAAGAAAGTCTTTAGGTATCCATGCTGTGTGTCGATATAACCCTACTCTTGTGTCCTCTCACA G 18499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.674;ClippingRankSum=-0.864;DP=415;FS=4.688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.006;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,382:392:99:18537,1445,0 -chr3 55999424 . G GT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.818;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:238,0,510 -chr3 56094275 . C CTGTTTTGACAATGACCTCCAGTGTGT 1121.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.063;DP=71;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1159,0,1223 -chr3 56349895 . T C 511.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.508;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=31.99;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:26:540,0,26 -chr3 56350479 . C T 1046.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1075,75,0 -chr3 56353133 . G T 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-2.141;DP=50;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:841,0,920 -chr3 56459851 . T C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.090;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:555,0,568 -chr3 56628909 . G A 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=3.239;DP=106;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:905,0,2603 -chr3 56628963 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=1.991;DP=95;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:396,0,2470 -chr3 56636543 . A T 2002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.583;DP=118;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:2031,0,1739 -chr3 56819350 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.850;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:303,0,483 -chr3 56820317 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.538;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:679,0,749 -chr3 56821160 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.729;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=20.43;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:682,0,452 -chr3 56902635 . A G 4311.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.328;DP=106;FS=7.608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=33.42;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,101:106:99:4340,304,0 -chr3 56903996 . C T 4032.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:4061,286,0 -chr3 56904140 . T C 1393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:84:1422,84,0 -chr3 56904246 . T A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-0.047;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=11.22;ReadPosRankSum=2.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:623,0,1225 -chr3 56904343 . C T 687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:716,51,0 -chr3 56904439 . T A 2897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2926,205,0 -chr3 56904560 . T A 1335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:96:1364,96,0 -chr3 56904575 . G A 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:81:1095,81,0 -chr3 56904802 . A G 2027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.693;DP=132;FS=2.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:2056,0,2412 -chr3 56904859 . C CT 2116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2283,214,0 -chr3 56905097 . C CTT 2237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2275,164,0 -chr3 56905217 . A C 3228.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.865;DP=166;FS=9.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,96:166:99:3256,0,2475 -chr3 56905266 . C T 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-0.406;DP=156;FS=8.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:2398,0,3060 -chr3 56905503 . G T 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:527,39,0 -chr3 56905635 . A T 4379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4408,313,0 -chr3 56905930 . T C 3277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3306,238,0 -chr3 56906262 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-1.077;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:394,0,382 -chr3 56906334 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-0.573;DP=31;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:562,0,1097 -chr3 56906781 . G A 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 -chr3 56906851 . G T 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:574,42,0 -chr3 56910246 . T C 470.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:499,36,0 -chr3 56910342 . T A 786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.743;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=30.99;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:815,60,0 -chr3 56910447 . G T 2091.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:2120,144,0 -chr3 56963971 . T C 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 -chr3 56984915 . GA G 2684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.175;DP=94;FS=5.344;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:2722,260,0 -chr3 56993864 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.264;DP=53;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:766,0,1077 -chr3 57047189 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr3 57083374 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr3 57162710 . G A 5506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:5535,388,0 -chr3 57162718 . A G 5506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:5535,388,0 -chr3 57162760 . T C 4252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4281,301,0 -chr3 57162849 . A T 2855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.253;DP=168;FS=5.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:2884,0,3025 -chr3 57162874 . C A 2690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=-1.380;DP=164;FS=10.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:2719,0,2999 -chr3 57162944 . C T 2594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=-0.558;DP=162;FS=5.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:2623,0,2977 -chr3 57162971 . T C 7049.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:7078,508,0 -chr3 57163035 . A G 3056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.299;ClippingRankSum=0.592;DP=113;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=27.05;ReadPosRankSum=5.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,81:112:99:3085,0,702 -chr3 57163077 . G T 4263.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:4292,319,0 -chr3 57163116 . T A 4458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4487,325,0 -chr3 57163276 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.343;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:334,0,571 -chr3 57163302 . G T 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:737,51,0 -chr3 57163357 . C T 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 -chr3 57163462 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=2.786;DP=107;FS=11.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=6.04;ReadPosRankSum=3.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:674,0,3101 -chr3 57163566 . A T 4113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4142,301,0 -chr3 57163734 . G A 2335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2364,166,0 -chr3 57163767 . G A 765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:794,63,0 -chr3 57163826 . C G 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1544,108,0 -chr3 57163848 . G A 2438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2467,178,0 -chr3 57163953 . C T 3117.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3146,217,0 -chr3 57164003 . A G 365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:394,30,0 -chr3 57164295 . C A 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,19:19:34:647,0,34 -chr3 57164312 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:324,0,1087 -chr3 57164416 . G C 3837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3866,285,0 -chr3 57164458 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.733;DP=20;FS=15.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:239,0,400 -chr3 57164698 . A G 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 -chr3 57164705 . G A 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 -chr3 57164899 . C A 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:825,57,0 -chr3 57164904 . C G 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:825,57,0 -chr3 57165039 . A G 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2659,187,0 -chr3 57165337 . T C 822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:851,60,0 -chr3 57165396 . A T 709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:738,54,0 -chr3 57165477 . A C 954.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:983,69,0 -chr3 57165524 . T C 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1203,84,0 -chr3 57166038 . A C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-1.206;DP=61;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1064,0,1072 -chr3 57166149 . T C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=-0.407;DP=83;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:704,0,4525 -chr3 57166156 . A G 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=-0.252;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:708,0,4525 -chr3 57166267 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.858;DP=30;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:313,0,1638 -chr3 57166271 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.549;DP=32;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:313,0,1638 -chr3 57166368 . T C 964.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:74:993,74,0 -chr3 57166439 . T TAG 1777.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1815,120,0 -chr3 57166525 . G A 2747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=-1.033;DP=179;FS=4.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,79:179:99:2776,0,3473 -chr3 57166588 . A G 5891.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:5920,426,0 -chr3 57166621 . T C 1640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.441;ClippingRankSum=3.641;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.80;ReadPosRankSum=-3.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,52:139:99:1669,0,2983 -chr3 57166634 . T C 6564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:6593,478,0 -chr3 57166735 . G A 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-1.124;DP=86;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:995,0,2020 -chr3 57166745 . C T 2780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2809,195,0 -chr3 57220441 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.286;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,376 -chr3 57220675 . T C 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:694,51,0 -chr3 57220693 . T C 633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:662,48,0 -chr3 57230887 . C A 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr3 57231073 . T C 810.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:839,63,0 -chr3 57231927 . T C 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr3 57234467 . C G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:374,0,229 -chr3 57234518 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:378,0,123 -chr3 57234689 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:378,0,135 -chr3 57267270 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr3 57267278 . C A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:310,21,0 -chr3 57268716 . G C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr3 57280801 . A G 587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:616,42,0 -chr3 57281459 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,185 -chr3 57282049 . T A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr3 57282101 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:229,0,66 -chr3 57303510 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr3 57303516 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr3 57303712 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,141 -chr3 57303761 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:233,0,62 -chr3 57303970 . T C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:644,45,0 -chr3 57306138 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=23.20;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:469,0,231 -chr3 57318362 . A T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr3 57319940 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:406,0,127 -chr3 57320122 . T C 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr3 57320339 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=23.49;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:404,0,161 -chr3 57320352 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.67;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:375,0,196 -chr3 57321322 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:290,0,298 -chr3 57323574 . T C 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:720,51,0 -chr3 57328534 . G A 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:559,42,0 -chr3 57375264 . C G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr3 57375277 . A C 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr3 57517697 . C G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.619;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.186;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:526,0,164 -chr3 57522872 . A G 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr3 57564716 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:354,0,206 -chr3 57566102 . G C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=10;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.78;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:246,0,65 -chr3 57566128 . A G 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:39:551,39,0 -chr3 57566184 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:265,0,130 -chr3 57616745 . T A 773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:802,57,0 -chr3 57766739 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.660;DP=39;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:691,0,707 -chr3 57773235 . T C 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.409;DP=69;FS=3.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1218,0,994 -chr3 57773777 . GAT G 1634.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1672,123,0 -chr3 57853793 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.872;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:450,0,1320 -chr3 57853795 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.995;DP=30;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:450,0,1316 -chr3 57857883 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:466,0,286 -chr3 57929746 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.468;DP=32;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:795,0,278 -chr3 57941577 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:516,0,257 -chr3 57949694 . G T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.708;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=14.77;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:427,0,531 -chr3 57950259 . T C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=2.778;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:619,0,578 -chr3 57950298 . C A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.879;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=19.36;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:609,0,450 -chr3 57951206 . C G 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.239;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:704,0,563 -chr3 57992013 . T A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.974;DP=43;FS=15.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=13.44;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:606,0,1672 -chr3 57992015 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=2.084;DP=43;FS=15.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=13.44;ReadPosRankSum=2.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:606,0,1661 -chr3 57993054 . C A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-2.088;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=22.72;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:687,0,371 -chr3 57994167 . A T 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr3 57994241 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr3 57995711 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-2.721;DP=42;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:356,0,1068 -chr3 57996074 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.318;DP=24;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.969;QD=23.45;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:591,0,177 -chr3 57996410 . C T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.770;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=24.92;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:701,0,202 -chr3 57996511 . A G 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-1.346;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1347,0,740 -chr3 57996596 . T A 1023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:78:1052,78,0 -chr3 57997385 . T G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.639;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:655,0,764 -chr3 57997566 . C A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.797;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:494,0,415 -chr3 58237373 . A C 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=2.732;DP=119;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,34:119:99:1021,0,6884 -chr3 58237377 . C T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=2.866;DP=121;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=8.20;ReadPosRankSum=-2.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,37:121:99:1021,0,6884 -chr3 58237421 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.090;DP=77;FS=3.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:445,0,2339 -chr3 58237436 . T A 1912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.126;ClippingRankSum=-1.082;DP=70;FS=3.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=27.33;ReadPosRankSum=-5.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,52:70:99:1941,0,480 -chr3 58237455 . AC A 1601.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=1.423;DP=64;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=25.03;ReadPosRankSum=-2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,45:63:99:1639,0,424 -chr3 58237616 . C A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.141;DP=52;FS=9.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:404,0,1408 -chr3 58237637 . T TA 1213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.578;DP=52;FS=7.965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,44:49:48:1251,48,0 -chr3 58237797 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=-1.388;DP=108;FS=42.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=2.20;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:266,0,3579 -chr3 58276850 . T C 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=1.138;DP=94;FS=3.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:625,0,2816 -chr3 58279853 . G T 2821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-1.493;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,84:126:99:2850,0,1380 -chr3 58459878 . T A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=2.463;DP=54;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=12.01;ReadPosRankSum=-2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:677,0,1164 -chr3 58580735 . CT C 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 -chr3 58582446 . T C 903.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:932,66,0 -chr3 59005342 . C T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=1.120;DP=25;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:665,0,423 -chr3 59013769 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=12.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,334 -chr3 59013796 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:399,0,277 -chr3 59013881 . C A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.165;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:437,0,310 -chr3 59026329 . A C 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr3 59026627 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.230;DP=66;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:332,0,1933 -chr3 59027641 . G A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=-0.366;DP=101;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:1564,0,1885 -chr3 59027728 . C T 1843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.051;DP=102;FS=3.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1872,0,1541 -chr3 59038120 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=6.409;DP=266;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,47:266:99:742,0,17534 -chr3 59038123 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=6.150;DP=269;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=2.65;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,44:269:99:742,0,17534 -chr3 59163677 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:319,0,275 -chr3 59374009 . C T 769.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:798,57,0 -chr3 59452841 . A T 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:234,0,23 -chr3 59504075 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=14.76;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:294,0,379 -chr3 59568124 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.277;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:417,0,683 -chr3 59674167 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-1.029;DP=75;FS=12.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,19:75:99:460,0,3714 -chr3 59675604 . A T 1252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.915;DP=93;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=13.47;ReadPosRankSum=-1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:1383,0,1512 -chr3 59948299 . A AT 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.704;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:367,0,197 -chr3 59948383 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.440;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:412,0,662 -chr3 60283241 . A AT 387.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-0.771;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:25:425,25,0 -chr3 60288287 . G GA 627.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:68:689,68,0 -chr3 60347974 . C T 12244.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:12273,877,0 -chr3 60352511 . GA G 1562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=3.458;DP=78;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=20.04;ReadPosRankSum=-2.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,55:67:99:1600,0,1224 -chr3 60352534 . A T 2888.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.562;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:2917,149,0 -chr3 60449445 . A T 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr3 60467800 . GT G 420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:458,45,0 -chr3 60476528 . A G 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:612,42,0 -chr3 60479725 . GACATATGATGATCCACACTGGAGAGAAACCACACACATGTACACAGTGTGGAAAGAGTTTCACACAGTCATCATCGCTTAATAA G 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-2.203;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=11.24;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:262,0,1688 -chr3 60480142 . G T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=1.951;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:883,0,858 -chr3 60480206 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.475;DP=46;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:503,0,807 -chr3 60480332 . T A 949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:978,69,0 -chr3 60512272 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=1.317;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.57;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,380 -chr3 60528642 . T G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr3 60529523 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:87:285,0,87 -chr3 60530243 . G C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr3 60530595 . T G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr3 60534550 . G C 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=30.74;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:32:520,0,32 -chr3 60536483 . T C 203.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:232,21,0 -chr3 60536642 . A G 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:534,42,0 -chr3 60541883 . T C 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:385,27,0 -chr3 60541891 . A G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:255,18,0 -chr3 60555428 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.49;ReadPosRankSum=-2.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:235,0,397 -chr3 60584289 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:630,48,0 -chr3 60590661 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:18:255,18,0 -chr3 60590670 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr3 60616129 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=2.173;DP=24;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:313,0,448 -chr3 60633583 . A T 1121.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1150,84,0 -chr3 60633752 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.304;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:624,0,398 -chr3 60633764 . A G 1336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:93:1365,93,0 -chr3 60636433 . T G 400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:429,30,0 -chr3 60637228 . A G 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:510,39,0 -chr3 60637305 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.867;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.09;ReadPosRankSum=2.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:277,0,388 -chr3 60637621 . AT A 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr3 60637627 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr3 60642174 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:321,0,552 -chr3 60663966 . C T 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 -chr3 60917030 . T G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr3 61137534 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.244;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.391;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:239,0,370 -chr3 61159334 . G A 2463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=-0.826;DP=131;FS=2.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:2492,0,4423 -chr3 61159563 . ATGCTGGGACAGGCTCTTTTACAGGTGCTAGTACAGGGACAGACTCCTTCACAGTTTCTGG A 5372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.842;DP=186;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:5410,621,0 -chr3 61187012 . G T 5760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=-0.239;DP=360;FS=3.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,164:360:99:5789,0,6425 -chr3 61187080 . C CCTG 845.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,25:25:58:883,0,58 -chr3 61194638 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=28.40;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:511,0,121 -chr3 61195464 . CA C 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.381;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:408,0,469 -chr3 61206041 . A G 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.091;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:708,0,746 -chr3 61210630 . C A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=-0.820;DP=48;FS=4.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=23.08;ReadPosRankSum=2.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1136,0,623 -chr3 61211717 . T G 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:720,51,0 -chr3 61215982 . C A 3664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=-1.601;DP=149;FS=9.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=24.60;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,105:148:99:3693,0,1036 -chr3 61217855 . A T 1238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.733;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1267,109,0 -chr3 61223200 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:318,0,275 -chr3 61223224 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.683;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,282 -chr3 61239901 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr3 61239908 . G T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 -chr3 61241030 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.749;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,189 -chr3 61243672 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:318,0,246 -chr3 61243747 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:304,0,250 -chr3 61264618 . CT C 574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:612,66,0 -chr3 61264736 . C T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.277;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:952,0,906 -chr3 61273487 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.102;DP=39;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:606,0,633 -chr3 61311132 . C T 1965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=-0.619;DP=112;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1994,0,1549 -chr3 61311338 . CG C 556.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,28:28:44:857,0,44 -chr3 61311867 . AT A 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-1.290;DP=49;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:584,0,613 -chr3 61312934 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=-1.984;DP=39;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:506,0,840 -chr3 61314651 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.438;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:315,0,2603 -chr3 61314903 . G GT 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-2.155;DP=40;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:390,0,445 -chr3 61314911 . A T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.307;ClippingRankSum=-0.259;DP=37;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:496,0,715 -chr3 61380348 . CCAGGTAAGGATCATGTGATTACTCTCATTTGCGTGTATGAACTTTTATGACGTTGTGTTAAATTAGTATAGATTTCTTTTTGAAACTGTTACCTAATATTTGTGTACGGTTCTCAATTAAAGTCATCTATCACA C 1277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=1.314;DP=47;FS=11.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=27.19;ReadPosRankSum=-2.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1315,0,1411 -chr3 61390978 . T A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-1.155;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=30.27;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:83:997,0,83 -chr3 61431003 . AG A 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr3 61440158 . GT G 925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:94:963,94,0 -chr3 61440237 . C CT 770.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:808,78,0 -chr3 61440618 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:279,0,51 -chr3 61452372 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=25.61;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:438,0,164 -chr3 61617670 . CT C 517.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.444;DP=38;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:25:555,0,25 -chr3 61622222 . TCTGACACACAAAACAACACAGAAGACAACAAGATCTGTTCACCATCAGACTTTTCATTTTTGGGTGAACGATCCCTTAAACATGACATTTTTTCCTAACAAAATTAAAAGGAAGCCCGGGAGGAGGCGTACTGCGCTCCAAGTTCACCAATTAGGATGACTTTCAGCGTTCATTGTTATCAAGGACTAAGGAAAGAATCTATATACACACACAAAC T 7476.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=2.861;DP=165;FS=1.533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=29.29;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,157:165:99:7514,648,0 -chr3 61792945 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:306,0,138 -chr3 61802955 . T TA 2009.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=-2.776;DP=294;FS=11.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,119:275:99:2157,0,2943 -chr3 61888811 . C A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=-0.411;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:516,0,1869 -chr3 61889268 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.248;DP=50;FS=2.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:337,0,1366 -chr3 61889859 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.222;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:272,0,2311 -chr3 61894285 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=-0.039;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:429,0,2771 -chr3 61894626 . CT C 624.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.189;DP=22;FS=2.831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:29:662,29,0 -chr3 61896045 . A T 245.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:274,0,20 -chr3 61896119 . C T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr3 61896546 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=1.522;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:281,0,1077 -chr3 61899226 . G A 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:476,36,0 -chr3 61899600 . A C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:265,0,102 -chr3 61967794 . A G 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr3 61968466 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.231;DP=21;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:255,0,1003 -chr3 61973540 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.352;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:400,0,217 -chr3 61975137 . G T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=34.80;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:585,0,111 -chr3 61980230 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr3 61981418 . T C 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:509,36,0 -chr3 61981425 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:290,0,133 -chr3 62005862 . A AAC 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=1.727;DP=95;FS=12.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=2.40;ReadPosRankSum=-2.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:265,0,1976 -chr3 62006353 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.030;DP=51;FS=7.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:450,0,1387 -chr3 62006760 . T C 1219.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:87:1248,87,0 -chr3 62007300 . T A 359.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:7:387,0,7 -chr3 62007696 . T C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.142;DP=108;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,27:108:99:622,0,3180 -chr3 62085003 . T G 722.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:751,54,0 -chr3 62085082 . G A 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:626,45,0 -chr3 62166246 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:267,0,64 -chr3 62327784 . A C 323.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:351,0,12 -chr3 62717995 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=4.038;DP=45;FS=9.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=14.86;ReadPosRankSum=-3.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:697,0,1880 -chr3 62719965 . A AGT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.155;DP=61;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:256,0,249 -chr3 62901424 . C G 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:368,24,0 -chr3 62901988 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-1.504;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:411,0,262 -chr3 62902171 . T A 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr3 62950663 . G C 2189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=1.237;DP=56;FS=9.780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=36.57;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:2218,117,0 -chr3 62986999 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.158;DP=20;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:233,0,442 -chr3 63052613 . CATCTAGCATGCAACAAACACCATCA C 6668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=3.915;DP=166;FS=4.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=29.34;ReadPosRankSum=-4.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,157:166:99:6706,0,2590 -chr3 63052640 . TGCGCACACAACACACGTCAGCCTACTACAGCGTATATCTATATGACATATATTCATGCATTCAAAAACAAATAAGCTCTTAAAACCGGGGAGATCCGTCACACATCTTCATTATCTGCAACATTTACAACTCAC T 6668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=2.543;DP=173;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,155:173:99:6706,0,2476 -chr3 63132241 . C G 1132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1161,84,0 -chr3 63132290 . G A 1154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1183,84,0 -chr3 63178186 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.098;DP=142;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:574,0,6993 -chr3 63178928 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr3 63178930 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:262,18,0 -chr3 63180137 . C T 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-2.200;DP=207;FS=12.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,58:207:99:1137,0,7308 -chr3 63180281 . G A 1889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-1.161;DP=163;FS=11.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=11.59;ReadPosRankSum=-2.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,60:163:99:1918,0,4001 -chr3 63184374 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.871;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:299,0,1635 -chr4 11804 . G C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.900;DP=40;FS=18.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:316,0,1086 -chr4 11853 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.288;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:348,0,1212 -chr4 27719 . AT A 3202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.625;DP=292;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,155:251:99:3240,0,2691 -chr4 40020 . G T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.124;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:99:718,0,8001 -chr4 41790 . A G 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.334;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:763,0,1063 -chr4 99492 . ACTGCAGGAGAAACAGCAGATGATCAGCACACTAACCTCAGCAGATACTGCACAGCCCCACTACAGGTTTCTCAC A 1023.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=1.101;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=33.02;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:99:1061,0,426 -chr4 360316 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.161;DP=193;FS=5.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,40:193:99:728,0,5916 -chr4 367309 . T C 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=-0.841;DP=185;FS=11.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,57:184:99:1456,0,4582 -chr4 369361 . G C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.595;DP=139;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,25:139:99:367,0,4440 -chr4 373815 . A G 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.079;DP=161;FS=4.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,44:161:99:987,0,4512 -chr4 376582 . A G 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.485;DP=189;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,46:189:99:906,0,5633 -chr4 378012 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-1.348;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,28:196:99:251,0,6578 -chr4 379134 . G C 2495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.593;DP=163;FS=3.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:2524,0,2803 -chr4 381521 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;ClippingRankSum=-0.048;DP=196;FS=4.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,37:196:99:345,0,5647 -chr4 443138 . A G 2211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.394;DP=109;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,66:109:99:2240,0,1935 -chr4 444105 . G GGT 4149.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-2.078;DP=342;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=12.13;ReadPosRankSum=-2.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,153:277:99:4187,0,3306 -chr4 453871 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:289,0,124 -chr4 458009 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:244,0,203 -chr4 458242 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-0.905;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1230,0,2721 -chr4 458249 . C T 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.361;DP=67;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1230,0,2671 -chr4 471090 . CA C 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.740;DP=141;FS=5.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1472,0,1228 -chr4 473271 . G A 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=4.770;DP=96;FS=22.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=14.61;ReadPosRankSum=-3.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:1431,0,1887 -chr4 553932 . AGT A 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-1.971;DP=59;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:261,0,1610 -chr4 558225 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=1.407;DP=49;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:257,0,1438 -chr4 568440 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.943;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:475,0,576 -chr4 568644 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-1.235;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:333,0,1218 -chr4 577057 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-1.030;DP=67;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:394,0,1945 -chr4 581862 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=-0.618;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:751,0,1105 -chr4 587275 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:327,0,372 -chr4 613056 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=1.163;DP=126;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:361,0,3302 -chr4 613181 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.391;DP=191;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,25:188:99:291,0,12911 -chr4 613183 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.116;DP=194;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,28:191:99:285,0,12911 -chr4 630492 . T A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.664;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:444,0,451 -chr4 630645 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.237;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:297,0,1134 -chr4 647411 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.236;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:300,0,959 -chr4 648306 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.807;DP=47;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=11.12;ReadPosRankSum=2.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:551,0,1090 -chr4 649488 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.650;DP=49;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:436,0,1254 -chr4 650783 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.011;DP=47;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:319,0,1561 -chr4 652703 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=1.538;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:405,0,724 -chr4 653088 . T A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.381;DP=38;FS=2.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:688,0,780 -chr4 653204 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.544;DP=42;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:342,0,1045 -chr4 757157 . C A 2262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.230;DP=132;FS=2.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:2291,0,2194 -chr4 812585 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.242;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:515,0,984 -chr4 814198 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.413;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:242,0,957 -chr4 814669 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.817;DP=51;FS=6.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:361,0,1338 -chr4 816212 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=2.086;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:325,0,1395 -chr4 869402 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=-0.324;DP=161;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,34:158:99:452,0,4815 -chr4 872498 . A G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-0.862;DP=96;FS=1.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:621,0,3132 -chr4 872675 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.992;DP=142;FS=2.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,28:142:99:331,0,5446 -chr4 873528 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.187;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,28:121:99:556,0,3435 -chr4 873565 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.964;DP=112;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:501,0,3372 -chr4 919862 . C CAG 970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=-0.782;DP=114;FS=4.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,42:63:99:1008,0,460 -chr4 920248 . GATAAA G 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=2.823;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=3.15;ReadPosRankSum=-2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,3:131:99:453,0,24666 -chr4 920254 . GAGAGAGAGAGA G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.635;ClippingRankSum=7.287;DP=164;FS=14.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=2.54;ReadPosRankSum=-4.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,28:164:99:454,0,24666 -chr4 1406416 . A G 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.618;DP=121;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=6.04;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,31:121:99:759,0,9135 -chr4 1406417 . A G 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-1.743;DP=121;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=6.04;ReadPosRankSum=2.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,31:121:99:759,0,9135 -chr4 1423736 . AT A 1422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.758;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,53:67:99:1460,0,605 -chr4 1424167 . A T 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.767;ClippingRankSum=-1.137;DP=44;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:875,0,557 -chr4 1484449 . CGTACGTCCTGTTTACCTGTGTTTGTGCATGCTCATTCTGCTGTTCGTCTGATTGTTCATTAGTTATGTGTGTTTTACAG C 3813.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.401;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=30.44;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,81:83:99:3851,316,0 -chr4 1486815 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=-2.274;DP=102;FS=20.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:490,0,3045 -chr4 1496939 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-1.150;DP=96;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:305,0,2917 -chr4 1507374 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-1.670;DP=105;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1849,0,1848 -chr4 1515093 . T C 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=-0.675;DP=129;FS=3.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,35:129:99:865,0,3551 -chr4 1543280 . C A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=-1.041;DP=99;FS=17.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,24:99:99:530,0,2653 -chr4 1587720 . T G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=1.450;DP=94;FS=7.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:355,0,3049 -chr4 1593875 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.010;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:234,0,1739 -chr4 1606908 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-1.566;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:407,0,1424 -chr4 1616373 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.941;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:335,0,1325 -chr4 1635357 . A G 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.736;DP=77;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1060,0,1654 -chr4 1638562 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.106;DP=115;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:2252,0,1385 -chr4 1645083 . T TG 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-1.326;DP=29;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:360,0,604 -chr4 1647622 . T G 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.640;DP=37;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:717,0,581 -chr4 1647909 . G A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.233;DP=46;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:734,0,933 -chr4 1682387 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.895;DP=24;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:431,0,413 -chr4 1682643 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-2.176;DP=109;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:499,0,3217 -chr4 1737041 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:291,0,100 -chr4 1741765 . G A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.326;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=25.70;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:825,0,254 -chr4 1906673 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-0.332;DP=59;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:422,0,1611 -chr4 1909814 . C G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.158;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=21.29;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:454,0,225 -chr4 1915999 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=2.406;DP=279;FS=1.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=2.62;ReadPosRankSum=2.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,61:274:99:760,0,8163 -chr4 1916047 . C A 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-1.854;DP=236;FS=12.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,60:235:99:919,0,6173 -chr4 1916245 . G A 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.464;DP=294;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,67:294:99:1146,0,8180 -chr4 1917008 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.361;DP=320;FS=5.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,60:318:99:897,0,9129 -chr4 1962311 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=-2.507;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:339,0,334 -chr4 1964481 . T G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:354,0,93 -chr4 2211314 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:302,0,203 -chr4 2380696 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=13;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:362,0,124 -chr4 2382280 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.839;DP=41;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:260,0,1121 -chr4 2405877 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.933;DP=58;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:519,0,1558 -chr4 2478961 . T A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.674;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:480,0,932 -chr4 2526476 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.299;DP=25;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:421,0,420 -chr4 2540044 . T G 279.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:5:307,0,5 -chr4 2542961 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.090;DP=33;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:548,0,629 -chr4 2618581 . G GA 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.137;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:478,0,480 -chr4 2618652 . T A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.439;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:618,0,773 -chr4 2618906 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=2.725;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:257,0,586 -chr4 2619030 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.934;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:521,0,381 -chr4 2620043 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-1.234;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:407,0,810 -chr4 2620823 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-1.444;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:270,0,1296 -chr4 2620827 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-2.257;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:279,0,1296 -chr4 2620969 . T G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-1.546;DP=35;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:319,0,925 -chr4 2621071 . A AT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.244;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:451,0,867 -chr4 2621335 . A AT 840.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-1.222;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:878,0,881 -chr4 2621612 . A T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-1.510;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:458,0,873 -chr4 2621617 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:458,0,873 -chr4 2622173 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=1.364;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:386,0,585 -chr4 2622482 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.521;DP=39;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=16.58;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:675,0,615 -chr4 2622801 . A G 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-0.032;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:733,0,1298 -chr4 2623228 . T A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.179;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:864,0,902 -chr4 2624465 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.586;DP=64;FS=4.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:306,0,1846 -chr4 2633073 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.156;DP=35;FS=8.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:383,0,758 -chr4 2638516 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.290;DP=37;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:576,0,693 -chr4 2645007 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.054;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:634,0,1166 -chr4 2645111 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=1.013;DP=52;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:964,0,804 -chr4 2658841 . G A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.194;DP=45;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:667,0,801 -chr4 2658904 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-0.243;DP=46;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:763,0,619 -chr4 2737731 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-2.060;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:233,0,1902 -chr4 2737740 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.634;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:631,0,1006 -chr4 2798336 . A AAC 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-2.409;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:260,0,798 -chr4 2798556 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.203;DP=55;FS=11.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:361,0,1535 -chr4 2799022 . G GA 316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.913;DP=37;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=8.56;ReadPosRankSum=-2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:354,0,254 -chr4 2816222 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-1.368;DP=131;FS=4.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,25:131:99:361,0,3694 -chr4 2819265 . C A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.645;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:737,0,1030 -chr4 2828103 . G A 2891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-1.021;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=29.81;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,77:97:99:2920,0,401 -chr4 2852983 . C T 2578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.105;DP=86;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,70:86:99:2607,0,287 -chr4 2860386 . T C 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.603;DP=61;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1320,0,753 -chr4 2860474 . G A 2392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=-0.940;DP=85;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,68:84:99:2421,0,271 -chr4 3870836 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.954;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=13.60;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:341,0,346 -chr4 3873680 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=29.80;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:356,0,49 -chr4 3978810 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.529;DP=48;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:403,0,877 -chr4 3983909 . G GT 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.771;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:394,0,365 -chr4 4107528 . T C 1925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=2.534;DP=152;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,55:152:99:1954,0,3532 -chr4 4110696 . G A 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-2.618;DP=272;FS=17.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,63:272:99:1412,0,15473 -chr4 4230900 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-2.003;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:43:341,0,43 -chr4 4230979 . G A 1063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.226;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=22.63;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:75:1092,75,0 -chr4 4231015 . T A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:510,36,0 -chr4 4413381 . ACTGTTGAGCGAGAGGAAGGTTTAGTGTGATTGTATGGTGATTTAGAATTCAGGCGGAGATAGTTAAAGGTCAATTCTCAC A 3734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=1.691;DP=85;FS=4.523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:3772,285,0 -chr4 4413504 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.398;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:579,0,2193 -chr4 4585606 . C CA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.810;DP=31;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:336,0,340 -chr4 4585742 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.261;DP=52;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:759,0,1171 -chr4 4587331 . A G 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 -chr4 4587346 . T G 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:618,42,0 -chr4 4625088 . G A 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-1.069;DP=57;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.340;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:850,0,1055 -chr4 4626280 . G A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-2.235;DP=60;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:857,0,2785 -chr4 4626529 . GACCTGTAAATGTAAGATTCTAGATTTAAAGCAGTATTTTTTAAAACCCTATTAAATGACTTTAAAAGCAAATAAAGAACAC G 2816.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.976;DP=91;FS=4.432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=30.95;ReadPosRankSum=-1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,82:87:99:2854,211,0 -chr4 4626636 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=1.578;DP=108;FS=8.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:899,0,2771 -chr4 4686632 . C T 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.676;DP=112;FS=6.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.331;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,41:112:99:1398,0,2438 -chr4 4696009 . G A 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-2.025;DP=148;FS=2.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,60:148:99:2069,0,3054 -chr4 4696057 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.984;DP=147;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:2252,0,2796 -chr4 4723147 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.112;DP=82;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:915,0,1830 -chr4 4794995 . C T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.698;DP=125;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,40:124:99:1068,0,3096 -chr4 4803712 . GT G 1418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.900;DP=120;FS=14.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,45:120:99:1456,0,2477 -chr4 4839550 . A AT 202.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr4 4899071 . T TA 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=1.172;DP=68;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:332,0,1193 -chr4 4899277 . AT A 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=2.082;DP=27;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=18.14;ReadPosRankSum=-2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:38:527,0,38 -chr4 4915838 . AACCTGCCATAGAGCACACACAGCAGCACATCAGGACAGAAGAGTGTAAGGTAACACGATGACAATGAGAATACAAAAGGGGGAAATATTT A 7598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.564;DP=175;FS=4.720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,171:175:99:7636,662,0 -chr4 5129731 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.155;DP=70;FS=9.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:406,0,1956 -chr4 5129908 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=-0.772;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:572,0,2189 -chr4 5142909 . C G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.810;DP=71;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:287,0,2987 -chr4 5175376 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=1.237;DP=67;FS=5.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:528,0,1666 -chr4 5195708 . G A 1858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.427;DP=273;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,79:273:99:1887,0,7254 -chr4 5198354 . C T 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-1.826;DP=56;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:944,0,905 -chr4 5198481 . TC T 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.473;DP=49;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:338,0,1006 -chr4 5203628 . TCTGTAAATATCAAAATTAGCAGTAAATTCTTAAAATAACACAATCTTACAGAAACGGAGCTTGTATTTAGCTTCCTAAATGCTGAC T 4635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=3.249;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=35.06;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,111:116:99:4673,337,0 -chr4 5212370 . CTTTT C 236.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:28:274,28,0 -chr4 5212375 . T A 245.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:28:274,28,0 -chr4 5212973 . G A 1789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=-0.098;DP=192;FS=4.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,58:192:99:1818,0,11195 -chr4 5221318 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.494;DP=59;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:760,0,1272 -chr4 5324782 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.417;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:267,0,459 -chr4 5324863 . A T 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.400;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:322,0,136 -chr4 5464305 . TAG T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=25.36;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:367,0,143 -chr4 5516929 . TGTAAGTGTTAACACTTCTGACGATTCTTAGTTTTAACAATGTTTCATATCTCAAAACTTCTCTCACTCTAAATGTGATGCAG T 6783.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.338;DP=152;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=36.15;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,146:151:99:6821,564,0 -chr4 5617072 . C CA 426.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:464,44,0 -chr4 5621161 . G T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,203 -chr4 5638886 . T A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.872;DP=114;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:745,0,3245 -chr4 5638972 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-2.025;DP=78;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=5.51;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:458,0,2203 -chr4 5641581 . G A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=-0.807;DP=133;FS=1.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,34:133:99:842,0,3791 -chr4 5651220 . T C 5073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-9.219;DP=193;FS=34.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=26.29;ReadPosRankSum=7.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,139:193:99:5102,0,1314 -chr4 5651997 . C T 2339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.621;DP=456;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,109:455:99:2368,0,13193 -chr4 5653887 . C T 2328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=-1.142;DP=400;FS=2.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,102:398:99:2357,0,11178 -chr4 5654418 . G A 3142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.164;DP=506;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:369,136:505:99:3171,0,14168 -chr4 5667604 . C A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=1.922;DP=40;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:424,0,914 -chr4 5681955 . G A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.988;DP=36;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:456,0,810 -chr4 5698750 . TCTGAGAGCAAAAAGACCATCAGAAAACAGTCTCACACCATAACACTCTGTGATTTGACCAAACACTCAC T 2061.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=2.961;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=34.94;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,47:51:99:2099,0,920 -chr4 5699298 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.334;DP=95;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:541,0,2642 -chr4 5708991 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=2.010;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:236,0,664 -chr4 5711697 . G C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.197;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,716 -chr4 5762053 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=1.248;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:405,0,408 -chr4 5762400 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.301;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:455,0,351 -chr4 5809866 . A AT 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.701;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:338,0,340 -chr4 5810361 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=1.870;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:285,0,466 -chr4 5811490 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.029;DP=74;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:638,0,1890 -chr4 6028532 . G C 1849.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=3.554;DP=47;FS=10.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=31.27;ReadPosRankSum=2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,41:47:9:1877,0,9 -chr4 6032380 . CT C 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:67:411,0,67 -chr4 6036213 . C CA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.095;DP=34;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:415,0,343 -chr4 6126107 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=2.785;DP=32;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:506,0,1615 -chr4 6541420 . G A 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-2.184;DP=138;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:2251,0,2423 -chr4 6541436 . A G 2391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-1.536;DP=146;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:2420,0,2629 -chr4 6549398 . C T 3622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.247;DP=209;FS=0.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=17.33;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,116:207:99:3651,0,3059 -chr4 6573598 . GA G 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.134;DP=56;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:460,0,563 -chr4 6574207 . CT C 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.396;DP=86;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:305,0,1282 -chr4 6587675 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr4 6605542 . C T 6380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.768;DP=405;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.500;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,180:405:99:6409,0,7569 -chr4 6609714 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-2.435;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=21.80;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:377,0,437 -chr4 6611680 . ACCTCTACACTGATTGCTCAGAAGGCCCTACGATGCTCTGATTGGTCACGTACCTCTACACTGATTGGTCAGATGGCTCTACTATGCTCTGATAGGTCACATG A 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=-1.576;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=33.00;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:1297,0,3244 -chr4 6613516 . A C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:359,0,116 -chr4 6837691 . A G 1345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1374,107,0 -chr4 6837727 . G A 1002.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1031,75,0 -chr4 6906218 . C T 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:522,36,0 -chr4 6906510 . T C 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:479,33,0 -chr4 6906538 . T C 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 -chr4 7014803 . T C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-1.101;DP=29;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:628,0,384 -chr4 7040519 . ACTACAAGACGTAACACTTGATTAGAAACCATAAACACATGTATAAAACATCATATAGGTGGAAAGAGAGTTTAC A 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.199;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:726,0,767 -chr4 7194574 . T C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.656;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:403,0,270 -chr4 7199259 . C A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.256;DP=44;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:535,0,980 -chr4 7206802 . G C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.072;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:319,0,1065 -chr4 7206854 . G T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.915;DP=45;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:642,0,941 -chr4 7226004 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.953;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:922,0,1006 -chr4 7226151 . G C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=1.372;DP=48;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=15.06;ReadPosRankSum=-2.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:751,0,1865 -chr4 7226155 . C CT 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-0.866;DP=48;FS=7.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:350,0,891 -chr4 7226403 . G GT 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.350;DP=69;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.432;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:438,0,619 -chr4 7228318 . T TA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.623;DP=70;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:415,0,918 -chr4 7229356 . T C 1721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=1.036;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1750,0,1683 -chr4 7247907 . T G 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.770;DP=87;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1456,0,1369 -chr4 7254646 . G T 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.377;DP=110;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:1487,0,2039 -chr4 7257254 . GTACACCTGAGAGAT G 1034.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-2.451;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1072,0,1827 -chr4 7257260 . CT C 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=2.150;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:67:99:982,0,4198 -chr4 7257262 . GAGAGATAACATTAAAGTAAGACTTCGGTCATGACGCATCATTTGCAAAGGACATAAACTTCTATTACATACTGAGATTGTAAGTTCTACCA G 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=1.406;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:982,0,4289 -chr4 7257271 . CATTAAAGTAAGACTTCGGTCATGACGCATCATTTGCAAAGGACATAAACTTCTATTACATACTGAGATTGTAAGTTCT C 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=-1.679;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:650,0,4147 -chr4 7284827 . C T 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.779;DP=77;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.226;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:77:99:1347,0,1385 -chr4 7451537 . A G 2259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=1.457;DP=175;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,67:175:99:2288,0,3786 -chr4 7455969 . G A 2290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=4.952;DP=146;FS=6.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=15.69;ReadPosRankSum=-2.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:2319,0,5693 -chr4 7478756 . G A 2805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=-1.520;DP=208;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=13.49;ReadPosRankSum=2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,84:208:99:2834,0,4016 -chr4 7478830 . G A 2220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.319;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:2249,0,2863 -chr4 7496180 . C A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:562,0,211 -chr4 7497450 . G A 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=-1.178;DP=43;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:793,0,686 -chr4 7497543 . G A 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.056;DP=62;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1090,0,1099 -chr4 7520881 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:278,0,56 -chr4 7548072 . TA T 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=3.065;DP=48;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=8.14;ReadPosRankSum=-2.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:428,0,892 -chr4 7638639 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.176;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:359,0,668 -chr4 7638866 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:326,0,412 -chr4 7640640 . A AT 235.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:19:273,19,0 -chr4 7643566 . T C 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:613,45,0 -chr4 7975098 . T TTG 229.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:267,21,0 -chr4 8536043 . T G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=11.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:293,0,397 -chr4 8669014 . TCCTGTGCAAAACCAACACATCTGTGATCTACATCCACACTGACTCATTCACAACTACACACAAAAACCCAGCAAA T 718.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=3.062;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=23.18;ReadPosRankSum=-2.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:756,0,4202 -chr4 9062115 . C CT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=-2.434;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:249,0,662 -chr4 9711403 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.050;DP=35;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:537,0,681 -chr4 9763814 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:269,0,394 -chr4 9809041 . TGGTATCATACAAACACACTAATATGCATAGCCTTATTTAATATTATGCAGTATAGCATCTCATTCTTGCATCATGTATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCTA T 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=-0.574;DP=28;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:532,0,5032 -chr4 9814630 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.734;DP=35;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:429,0,828 -chr4 9818816 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-1.002;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:998,0,959 -chr4 9822365 . TGTAAGCAAGACATTCATATTTAATATAATGCAAATTCTGGGTCCATAAAGCGTATGTAATGTGTTTTGTGTTCCAG T 2410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=1.174;DP=65;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,58:65:99:2448,0,228 -chr4 10263837 . TA T 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.709;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:335,0,153 -chr4 10423019 . A ACAACAGC 3272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.282;DP=164;FS=6.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,93:150:99:3310,0,2197 -chr4 10545190 . GAGGTGAAACATGCAAGGTTTGTATCAACACTGTTTTTATACTTTATTTATTTTCATCAAGAGTGCATCTCTGTGC G 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:266,0,992 -chr4 10640838 . TCTGGAGACAAAGAACGAAGGCAATATTAAAACCGAATGTCCCCAAAACAAGTGTATCTGAAGGCCTGCAGTTGTTAGATCGGTGCTTGCTCTTAC T 1423.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=1.691;DP=291;FS=2.058;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,253:257:99:1461,561,0 -chr4 10797983 . GT G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.099;DP=16;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=16.36;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:21:299,0,21 -chr4 10801549 . TCCTACAAAGAAAACAAAAGGTGTTTTTAATGCACAGACTTCTTTGGAAATTGCAAGCGCTACTGTTAAATCTGCTTA T 5610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=1.647;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=33.00;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,158:169:99:5648,0,347 -chr4 10802347 . GCTGCAAAAGACAAAATAAGATCACAAACGATATCAGGATTATGAATGTAATGATGATATGTAAGAAAGACATGAATGAGAGATTTAC G 8269.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=1.081;DP=186;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=30.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,183:186:99:8307,639,0 -chr4 10869759 . GT G 920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-0.110;DP=67;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,39:66:99:958,0,676 -chr4 10874653 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=2.460;DP=58;FS=5.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:538,0,3266 -chr4 11011646 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=-0.249;DP=27;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:387,0,242 -chr4 11097705 . CT C 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=3.090;DP=117;FS=17.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:521,0,2113 -chr4 11098640 . T C 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.353;DP=47;FS=13.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=18.91;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:917,0,771 -chr4 11384529 . TCTAAATTTGAATAAGCACTTATAAGTTCAAGAGCATTCATTAAACATATCATTACTCCATTAATGAGGTTAGTCAAACTCACATAC T 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:99:501,0,470 -chr4 11780516 . GAA G 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:321,0,484 -chr4 11780789 . A G 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.083;DP=59;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1032,0,994 -chr4 11782831 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.467;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:524,0,386 -chr4 11819158 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=24.37;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:345,0,534 -chr4 11819731 . C A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.062;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:477,0,585 -chr4 11843912 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,216 -chr4 11878296 . T A 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:670,48,0 -chr4 11878304 . T C 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:48:670,48,0 -chr4 11878427 . T TA 569.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.619;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:70:742,70,0 -chr4 11879766 . T TAC 1060.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-1.907;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,48:55:99:1098,0,122 -chr4 11883370 . C CT 932.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:67:970,67,0 -chr4 11965340 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=2.264;DP=54;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:630,0,1193 -chr4 11980975 . G A 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.624;DP=116;FS=1.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=17.23;ReadPosRankSum=2.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:2027,0,2103 -chr4 11981056 . AT A 546.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.917;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.119;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:5:583,5,0 -chr4 11981805 . G C 1654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-0.258;DP=131;FS=6.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,50:131:99:1683,0,2800 -chr4 11981884 . GA G 1620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-2.626;DP=126;FS=7.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1658,0,1225 -chr4 11982157 . G A 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.712;DP=200;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,87:200:99:3315,0,7837 -chr4 11982160 . A G 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.136;DP=196;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,84:196:99:3315,0,7803 -chr4 11989026 . TCCTGTAGATCCAATGCAAATACATATTTACAGACTATTCATCCATTTTTCAATGCAAGATTAAAACACAGGACAGATACTTA T 4541.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=2.474;DP=113;FS=2.525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=28.04;ReadPosRankSum=-2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,110:113:99:4579,332,0 -chr4 11993671 . C T 2625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.508;DP=163;FS=5.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,76:162:99:2654,0,2787 -chr4 11994210 . C T 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-1.400;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1511,0,1334 -chr4 12001862 . T C 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.218;DP=147;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:2214,0,2903 -chr4 12002262 . A T 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-1.136;DP=160;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.382;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:2951,0,2913 -chr4 12008602 . C A 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:307,24,0 -chr4 12011501 . G A 3839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.483;DP=228;FS=3.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,107:228:99:3868,0,4016 -chr4 12017966 . C T 2734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.149;DP=170;FS=0.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,78:170:99:2763,0,2983 -chr4 12020770 . G A 3368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=-0.161;DP=243;FS=0.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,110:242:99:3397,0,4210 -chr4 12021067 . CA C 1170.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-1.022;DP=72;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=16.26;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,35:70:99:1208,0,1190 -chr4 12021727 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.932;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,133 -chr4 12032438 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-1.297;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:449,0,585 -chr4 12033221 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,322 -chr4 12036024 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=-3.360;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=16.41;ReadPosRankSum=4.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:422,0,420 -chr4 12036098 . T G 1164.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:81:1193,81,0 -chr4 12036103 . C A 1164.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1193,81,0 -chr4 12036258 . G C 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=4.969;DP=102;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.146;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,31:102:99:815,0,2773 -chr4 12036418 . A C 2843.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2872,202,0 -chr4 12041286 . G A 3345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=-0.677;DP=195;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,102:194:99:3374,0,3469 -chr4 12041510 . G A 2873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=-0.422;DP=164;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,87:164:99:2902,0,2741 -chr4 12098570 . G A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=1.056;DP=46;FS=7.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=29.95;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1406,0,1046 -chr4 12098911 . A AT 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.844;DP=42;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:454,0,374 -chr4 12099146 . CT C 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.851;DP=35;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:324,0,615 -chr4 12099842 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-1.067;DP=40;FS=9.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:825,0,1319 -chr4 12100293 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.253;DP=42;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:753,0,1371 -chr4 12120899 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=2.037;DP=46;FS=8.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:640,0,948 -chr4 12120935 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=2.325;DP=39;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:313,0,1056 -chr4 12121852 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.814;DP=42;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:376,0,1033 -chr4 12127521 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.736;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:439,0,741 -chr4 12143866 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.869;ClippingRankSum=1.670;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:506,0,923 -chr4 12147422 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.837;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:658,0,819 -chr4 12166988 . C T 1692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.965;DP=87;FS=9.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.238;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,52:87:99:1721,0,1177 -chr4 12197349 . G A 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.582;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1296,0,718 -chr4 12481340 . C A 2584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.534;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=13.19;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,76:196:99:2613,0,4087 -chr4 12482869 . T C 4148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.115;DP=243;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,114:243:99:4177,0,4324 -chr4 12484767 . C T 2572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.663;DP=154;FS=8.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:2601,0,2741 -chr4 12489178 . C CA 3921.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:4307,426,0 -chr4 12489330 . AT A 1024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-1.754;DP=51;FS=7.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=20.09;ReadPosRankSum=2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,43:49:99:1062,0,167 -chr4 12522189 . C T 1768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.291;DP=102;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1797,0,1900 -chr4 12523692 . C T 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-1.780;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1502,0,1338 -chr4 12524009 . C G 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.987;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:1499,0,1957 -chr4 12525440 . AT A 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=-1.796;DP=101;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=3.51;ReadPosRankSum=4.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:392,0,1994 -chr4 12525513 . T G 1245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=-1.755;DP=93;FS=22.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:1274,0,1969 -chr4 12636265 . C T 2324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=2.776;DP=286;FS=3.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=8.13;ReadPosRankSum=-5.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,91:285:99:2353,0,7643 -chr4 12636298 . T C 2489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.765;ClippingRankSum=5.721;DP=299;FS=2.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,93:299:99:2518,0,7997 -chr4 12656281 . G A 2215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.614;DP=153;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,63:153:99:2244,0,3038 -chr4 12657803 . C G 1684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=1.059;DP=115;FS=6.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:1713,0,2342 -chr4 12660275 . G A 1875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.236;DP=103;FS=6.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1904,0,1553 -chr4 12660624 . T C 2452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.338;DP=158;FS=2.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:2481,0,2686 -chr4 12662369 . A G 2611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=1.223;DP=136;FS=14.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:2640,0,4934 -chr4 12664226 . CGTAAGTGACCTAAAAACCTGTTCATGCCTGTTCATTCGCTGCACCACATAACCGATGCTCTCCTCTTTCAG C 8223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=4.481;DP=188;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,181:188:99:8261,636,0 -chr4 12666054 . G A 2780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.265;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,82:193:99:2809,0,3629 -chr4 12692706 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-1.153;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:421,0,691 -chr4 12693107 . G A 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=-0.801;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:696,0,627 -chr4 12696470 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.278;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:755,0,656 -chr4 12696542 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.168;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:330,0,617 -chr4 12705450 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-2.919;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:706,0,1080 -chr4 12767180 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=2.313;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:484,0,364 -chr4 12772305 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.390;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:459,0,725 -chr4 12775116 . T TTGTTCCTGATC 941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-1.037;DP=54;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:979,0,874 -chr4 12793929 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,303 -chr4 12794119 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.147;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:453,0,374 -chr4 12794179 . C G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-1.721;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:254,0,413 -chr4 12794604 . C G 213.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:242,0,18 -chr4 12795006 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=1.299;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:251,0,874 -chr4 12795327 . C A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=1.493;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=19.00;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:997,0,773 -chr4 12817916 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.932;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:299,0,127 -chr4 12970335 . T C 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-1.528;DP=43;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:780,0,677 -chr4 12970533 . A T 1546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-2.298;DP=75;FS=12.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=20.62;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:1575,0,2112 -chr4 12970621 . T A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-0.742;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:750,0,879 -chr4 12970711 . T A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-2.827;DP=48;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:866,0,860 -chr4 12970836 . C T 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.490;DP=101;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=14.28;ReadPosRankSum=2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:1471,0,2010 -chr4 12971195 . T A 2101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.040;DP=109;FS=3.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:2130,0,1672 -chr4 12985565 . T C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.123;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:860,0,486 -chr4 13008492 . C T 3468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-1.586;DP=212;FS=3.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,100:210:99:3497,0,3521 -chr4 13008653 . T A 2763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.923;DP=175;FS=5.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,84:174:99:2792,0,2862 -chr4 13027776 . AT A 572.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=2.273;DP=46;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:610,0,404 -chr4 13029371 . C T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=2.154;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:686,0,1914 -chr4 13313683 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.481;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:455,0,981 -chr4 13314806 . G A 400.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-2.282;DP=14;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=28.58;ReadPosRankSum=2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:10:428,0,10 -chr4 13315610 . G A 3589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3618,250,0 -chr4 13425841 . G C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.478;DP=30;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:498,0,464 -chr4 13439605 . T C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=2.071;DP=58;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:547,0,1494 -chr4 13515187 . T C 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.238;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=31.19;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:808,0,103 -chr4 13515257 . TAA T 317.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:44:544,44,0 -chr4 13515493 . C T 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.000;DP=50;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:735,0,1087 -chr4 13521981 . G A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=1.556;DP=94;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:1562,0,1715 -chr4 13536185 . A G 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.841;DP=96;FS=10.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,33:96:99:998,0,2013 -chr4 13551144 . A G 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.768;DP=65;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1170,0,1251 -chr4 13551393 . G A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:27:365,27,0 -chr4 13551402 . A G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:365,27,0 -chr4 13551471 . T A,C 1883.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,24,30:54:99:2050,1091,1022,972,0,946 -chr4 13552030 . T A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=3.548;DP=44;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=14.06;ReadPosRankSum=-3.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:647,0,751 -chr4 13711525 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:461,0,205 -chr4 13711532 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.650;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=28.85;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:461,0,205 -chr4 13777569 . C T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr4 13801884 . G GC 361.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:399,29,0 -chr4 13801886 . T A 370.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:29:399,29,0 -chr4 13965462 . T A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.278;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:828,0,615 -chr4 13978486 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:384,0,396 -chr4 13982166 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-1.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,1408 -chr4 13982172 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.132;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:249,0,1401 -chr4 13982741 . G T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:309,0,310 -chr4 13982767 . A AT 327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:365,35,0 -chr4 13983220 . T G 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-1.693;DP=61;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:684,0,1295 -chr4 13983370 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-2.132;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:233,0,1031 -chr4 13986155 . A G 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=1.995;DP=66;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1164,0,1118 -chr4 13988430 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.409;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:713,0,720 -chr4 13988553 . C G 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.842;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=13.53;ReadPosRankSum=-2.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:556,0,740 -chr4 13991228 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.184;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:481,0,795 -chr4 13994329 . G A 4950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=-0.062;DP=385;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=12.86;ReadPosRankSum=3.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,143:385:99:4979,0,8346 -chr4 13994559 . TGTGAGTCATGCATGCATGCATTCAAATGTACCTTCTAATTATACACAGCGGGCATTACATGTCTATGGACATCAGTTCAAAAATAATCTCTTTTAATTTCAG T 11805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=2.637;DP=301;FS=7.036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=28.57;ReadPosRankSum=-2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,289:294:99:11843,852,0 -chr4 13994824 . GAGGTAGGTGCCTTTTCTCTTCTGCATGAAGCTGTAATTAAAAAAAAAAGTGATTTAAGTGCAAGACAAATATGAATAAACACCATGTTTTGTGACTAACCT G 10382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.353;DP=310;FS=2.034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=33.49;ReadPosRankSum=-2.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,280:284:99:10420,816,0 -chr4 14001604 . A G 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.795;DP=117;FS=10.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1816,0,2006 -chr4 14003141 . G T 2218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=-0.676;DP=118;FS=3.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:2247,0,2113 -chr4 14008319 . G A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-1.581;DP=68;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=17.22;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1199,0,1221 -chr4 14013542 . C T 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.623;DP=79;FS=3.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1424,0,1363 -chr4 14014158 . T C 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.428;DP=75;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1214,0,1372 -chr4 14022904 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=1.583;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:540,0,696 -chr4 14029420 . A G 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-0.120;DP=57;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1067,0,1003 -chr4 14031574 . ACAGGTCAGGGTTAATTATATAATTATATATGCTTATAGTGCATCATAAAGTTCTGTATGATTTTACTTTTTTTTTTTGGCTTATGTGAT A 1739.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=1.480;DP=56;FS=6.646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=31.07;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:1777,147,0 -chr4 14033500 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.780;DP=43;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:366,0,1171 -chr4 14037508 . C T 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-0.709;DP=139;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,44:139:99:1782,0,3213 -chr4 14037532 . T A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.007;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.808;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,42:133:99:944,0,7177 -chr4 14038571 . G T 2433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.436;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:2462,0,2458 -chr4 14040692 . C T 2634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.310;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:2663,0,3004 -chr4 14040736 . C T 3007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=-1.111;DP=181;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,100:181:99:3036,0,2862 -chr4 14041939 . C T 3554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=1.353;DP=206;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,111:206:99:3583,0,3389 -chr4 14042037 . T C 8459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:8488,608,0 -chr4 14042355 . T C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=4.387;DP=76;FS=8.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=15.51;ReadPosRankSum=-3.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:1207,0,1503 -chr4 14042391 . C T 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-1.911;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=33.10;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:988,0,246 -chr4 14042501 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.200;DP=59;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:661,0,1408 -chr4 14042692 . C A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.083;DP=35;FS=10.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:652,0,579 -chr4 14043360 . C A 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=1.235;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:874,0,817 -chr4 14044382 . CT C 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.354;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:292,0,321 -chr4 14044621 . T C 1020.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:75:1049,75,0 -chr4 14044930 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=1.283;DP=41;FS=9.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:638,0,1794 -chr4 14044978 . T A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.761;DP=53;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:617,0,1325 -chr4 14048252 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=-1.063;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:484,0,872 -chr4 14054896 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.157;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,693 -chr4 14056957 . A AT 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-1.132;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:329,0,1105 -chr4 14057473 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.684;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:312,0,410 -chr4 14058325 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.682;DP=34;FS=29.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:531,0,1374 -chr4 14058326 . T G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.087;DP=34;FS=29.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:531,0,1374 -chr4 14058530 . C CA 657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.653;DP=66;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:702,0,792 -chr4 14060685 . G T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=1.042;DP=55;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:624,0,1133 -chr4 14069153 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.665;DP=38;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:752,0,527 -chr4 14071770 . C A 2096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.209;DP=141;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=14.87;ReadPosRankSum=3.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:2125,0,2478 -chr4 14072821 . C CT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.245;DP=119;FS=9.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=2.01;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:276,0,2336 -chr4 14074635 . C T 2282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.510;DP=148;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.622;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:2311,0,2427 -chr4 14075949 . A G 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-2.209;DP=93;FS=0.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:1441,0,1749 -chr4 14076049 . C CT 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.365;DP=62;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:281,0,2295 -chr4 14123386 . G GT 1577.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-1.430;DP=218;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,95:216:99:1615,0,9880 -chr4 14123398 . C T 5634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=-1.871;DP=222;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=25.38;ReadPosRankSum=2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,120:222:99:5663,0,6114 -chr4 14123469 . GT G 1852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.660;DP=214;FS=10.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,82:197:99:1890,0,2541 -chr4 14123704 . T C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=4.572;DP=144;FS=4.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,37:144:99:855,0,4215 -chr4 14123740 . A C 4218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-3.484;DP=132;FS=6.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=31.96;ReadPosRankSum=3.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,103:132:99:4247,0,1873 -chr4 14123749 . C T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=4.481;DP=143;FS=5.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:1001,0,8275 -chr4 14123903 . T A 2839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=-1.197;DP=167;FS=0.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,80:167:99:2868,0,2746 -chr4 14124053 . CAA C,CA 322.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.274;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,11,7:19:99:518,164,165,288,0,273 -chr4 14124393 . T G 3385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-1.103;DP=186;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,92:184:99:3414,0,3398 -chr4 14125512 . C CA 2131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=-2.158;DP=160;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:2530,0,2226 -chr4 14146949 . C T 2073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.790;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:2102,0,2263 -chr4 14147270 . TA T 1983.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-1.392;DP=131;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:2021,0,2281 -chr4 14147418 . C T 4013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=0.401;DP=94;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=27.19;ReadPosRankSum=-2.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,64:94:99:4042,0,313 -chr4 14147669 . A G 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.611;DP=88;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1715,0,1407 -chr4 14147965 . C CA 1286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-1.672;DP=114;FS=19.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1324,0,1719 -chr4 14162019 . A G 3287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.467;DP=202;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,99:201:99:3316,0,3373 -chr4 14164832 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.171;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.67;ReadPosRankSum=-2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:309,0,3205 -chr4 14166884 . G A 2716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.520;DP=175;FS=4.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,79:174:99:2745,0,3086 -chr4 14168279 . TA T 342.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.873;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:13:380,0,13 -chr4 14200882 . A G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr4 14283551 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=1.277;DP=51;FS=6.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:355,0,1436 -chr4 14284540 . C CT 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.502;DP=45;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:669,0,218 -chr4 14285756 . TTG T 1220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.594;DP=42;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=29.07;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,31:41:99:1258,0,219 -chr4 14285968 . G GT 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=-1.189;DP=67;FS=5.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:504,0,772 -chr4 14286171 . C CT 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.827;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:718,0,733 -chr4 14485872 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=-0.740;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=15.55;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:1008,0,1121 -chr4 14555855 . G T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.769;DP=84;FS=3.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1021,0,1850 -chr4 14555978 . C G 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=-0.550;DP=106;FS=1.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,37:106:99:1178,0,2362 -chr4 14556076 . A C 1824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.721;DP=128;FS=1.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1853,0,2355 -chr4 14721467 . C T 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-0.147;DP=74;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,42:74:99:1407,0,1192 -chr4 14882622 . G GA 546.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:584,39,0 -chr4 14997019 . T A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.334;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:699,0,930 -chr4 15005161 . AGTGAGTGTGGAACATTGATAGCATTTTGAACACAGTCAATGTAACCTTACACTTTTGAGGCATTTGGATGCAAAGACTTTTTAGTTACATGCACGCTTCTGTCTTTATAG A 1636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.933;DP=47;FS=2.559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=34.82;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:88:1674,88,0 -chr4 15050151 . G GGGTGAGC 13307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,300:300:99:13345,942,0 -chr4 15063535 . ACTGAGGAAGAGACAAATAATAGTTGGCAATGGTTATGATTAGCACTGCAGATACAATGGAGACATTTGCTCAC A 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=2.807;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=28.92;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:471,0,1906 -chr4 15388405 . G A 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.208;DP=94;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.459;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:1644,0,3314 -chr4 15388589 . A G 2114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.938;DP=155;FS=13.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,60:155:99:2143,0,3350 -chr4 15388771 . T TA 1207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.031;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1245,0,3344 -chr4 15407336 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.940;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:440,0,696 -chr4 15407347 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-1.177;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:378,0,714 -chr4 15437161 . G A 2846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.382;DP=190;FS=6.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,82:190:99:2875,0,3590 -chr4 15437217 . T A 2581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-1.138;DP=187;FS=4.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,81:187:99:2610,0,3094 -chr4 15437745 . T TG 1219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-1.311;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:1257,0,2117 -chr4 15437760 . T A 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-2.058;DP=134;FS=2.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=12.55;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1710,0,3127 -chr4 15604530 . C CG 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.566;DP=125;FS=24.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:530,0,1427 -chr4 15789762 . TGGTGAGCCACCAACATACTATCAGTAACAGCCCATGACACTGTCAGTATAAAAATAAAATTAAAAAATTTCTACA T 1326.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.462;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:99:1364,117,0 -chr4 15962539 . CAAAACACGATTTAAAATTACACAAATCCAATTCGTAACTTT C 1122.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.284;DP=95;FS=2.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1160,0,3918 -chr4 15962854 . TCCA T 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=3.138;DP=49;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=8.85;ReadPosRankSum=-2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,10:49:99:471,0,6654 -chr4 15962858 . TTTCATAACTTCAAAACACGATTCAAAAATACACAAATC T 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=4.103;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=7.00;ReadPosRankSum=-2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:471,0,6654 -chr4 16693598 . G A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr4 16729455 . CT C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-1.271;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:276,0,227 -chr4 16776255 . A T 3125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.856;DP=185;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,88:185:99:3154,0,3341 -chr4 16984031 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.056;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:874,0,1033 -chr4 17067304 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=-0.794;DP=32;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:724,0,391 -chr4 17187720 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:274,0,473 -chr4 17202368 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:247,0,390 -chr4 17269724 . C G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.908;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:451,0,334 -chr4 17269822 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:422,0,399 -chr4 17303566 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.985;DP=41;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=15.26;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:654,0,766 -chr4 17317303 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.497;DP=43;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:552,0,1857 -chr4 17349162 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.283;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:282,0,906 -chr4 17484646 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,160 -chr4 17496341 . TC T 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:271,0,418 -chr4 17498363 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.220;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.28;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:373,0,260 -chr4 17498699 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:236,0,97 -chr4 17499487 . AG A 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-0.765;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:309,0,1139 -chr4 17499890 . A T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=-0.464;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:457,0,528 -chr4 17500547 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.403;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:371,0,448 -chr4 17510235 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.117;DP=49;FS=5.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:606,0,2491 -chr4 17510241 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=1.345;DP=48;FS=5.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:606,0,2437 -chr4 17517095 . TGGTATGAGAGCTTACCACTCAATTACACTAGAAAAATGTCATGATTTGGACAGTGCAAGTTTATTCACTGTGATTCCTCTCTATGTA T 2589.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.670;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.060;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2627,238,0 -chr4 17560477 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:70:241,0,70 -chr4 17568283 . A C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.651;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:453,0,363 -chr4 17569528 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=1.181;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=30.29;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:79:634,0,79 -chr4 17571577 . G C 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1007,75,0 -chr4 17573743 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=-0.551;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:608,0,359 -chr4 17574119 . G C 1349.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:96:1378,96,0 -chr4 17574129 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.158;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=26.83;ReadPosRankSum=-1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:860,0,206 -chr4 17575380 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.348;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:545,0,651 -chr4 17578662 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.250;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:491,0,687 -chr4 17661100 . T A 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-0.311;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:898,0,960 -chr4 17661148 . GT G 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.472;DP=70;FS=5.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:760,0,717 -chr4 17662158 . T TA 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-1.613;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=27.24;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:21:473,0,21 -chr4 17662173 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:28:369,0,28 -chr4 17662958 . TCTATTGGGAGAACGTAGATGGTGTTAGAAAAGGTCGCTTTCGCGAACGGAGAGACGTCCGAGCCGCGAAACATTTAC T 2640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.998;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=31.82;ReadPosRankSum=2.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,62:81:99:2678,0,7854 -chr4 17663055 . T C 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=-1.561;DP=78;FS=9.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:1206,0,1138 -chr4 17663104 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-1.892;DP=95;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:1503,0,1637 -chr4 17663367 . C G 2066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.886;DP=133;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:2095,0,2292 -chr4 17685123 . C G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-2.546;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:337,0,138 -chr4 17789131 . G T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.417;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=12.82;ReadPosRankSum=2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:323,0,506 -chr4 17810044 . C G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.493;DP=30;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:563,0,549 -chr4 17827482 . C T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:694,51,0 -chr4 17834799 . G T 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr4 17841083 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,171 -chr4 17907935 . AACCTTTTGAGAGAAACAGTGATCAGAAAGCGAGCCGGGCAACATAACACATCAAAATGTTCGTGATAATATGAGGACTGTTTTACACCCACATT A 2596.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.678;DP=65;FS=3.148;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=33.79;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:2634,208,0 -chr4 17921138 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,155 -chr4 17922491 . GA G 2363.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.425;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:2401,242,0 -chr4 18056252 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=-0.668;DP=22;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.471;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:450,0,276 -chr4 18056268 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-1.082;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=23.04;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:512,0,199 -chr4 18199136 . C T 201.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:230,0,21 -chr4 18331688 . C CAT 2220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.363;DP=156;FS=10.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:2258,0,2208 -chr4 18470176 . TTG T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.181;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,447 -chr4 18701746 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.162;DP=34;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:393,0,789 -chr4 18701794 . G C 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.656;DP=44;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:907,0,652 -chr4 18983576 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.146;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:381,0,1067 -chr4 18983597 . CT C 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.640;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:494,0,606 -chr4 18983938 . G A 1767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=3.303;DP=120;FS=5.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=14.73;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:1796,0,2384 -chr4 18985903 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.386;DP=60;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:1043,0,2215 -chr4 18985906 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.565;DP=60;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:1043,0,2189 -chr4 19004161 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.103;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:637,0,587 -chr4 19011312 . CACCTGCAGAGAAAATCAGATTTCAGATATCTTTGATGCAAAAACCTATTAATCAGGAGTGATGTAAGAACTAGAAACAATT C 1327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.584;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=26.96;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:99:1365,113,0 -chr4 19033355 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=-0.803;DP=23;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:55:417,0,55 -chr4 19033634 . AT A 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.026;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:336,0,769 -chr4 19033679 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.929;DP=34;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:493,0,554 -chr4 19034161 . G GT 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-0.998;DP=30;FS=8.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:300,0,396 -chr4 19034628 . G GT 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.610;DP=34;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:331,0,490 -chr4 19036655 . CA C 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.784;DP=64;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:681,0,712 -chr4 19085666 . C G 2017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-2.170;DP=147;FS=6.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=13.73;ReadPosRankSum=2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,60:147:99:2046,0,2867 -chr4 19201691 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.249;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:382,0,332 -chr4 19202761 . A AC 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.047;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:324,0,205 -chr4 19203617 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:355,0,219 -chr4 19238955 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.626;DP=34;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=24.61;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:865,0,336 -chr4 19239074 . G GA 428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:466,32,0 -chr4 19408230 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:358,0,333 -chr4 19413057 . G GCT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-1.445;DP=21;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:256,0,378 -chr4 19413758 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.754;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:444,0,411 -chr4 19414892 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:292,0,221 -chr4 19441730 . T TA 277.08 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:20:327,0,20 -chr4 19442601 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.304;DP=31;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:440,0,686 -chr4 19838480 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.572;DP=30;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:408,0,633 -chr4 19838546 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.734;DP=35;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=11.82;ReadPosRankSum=2.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:442,0,725 -chr4 19838945 . C T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=2.918;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:748,0,718 -chr4 19839082 . G A 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.172;DP=43;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=30.11;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1680,0,354 -chr4 19923301 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:295,0,249 -chr4 19923662 . G GA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-1.680;DP=47;FS=4.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:395,0,534 -chr4 19924220 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-1.557;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=21.04;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:470,0,283 -chr4 19924565 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=1.200;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=23.55;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:923,0,478 -chr4 20225520 . G GTT 392.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:620,48,0 -chr4 20247876 . G A 1350.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1379,96,0 -chr4 20248030 . T TA 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=1.133;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,38:44:43:789,0,43 -chr4 20259374 . G GATA 249.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:19:287,19,0 -chr4 20425254 . G C 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:649,51,0 -chr4 20658034 . A C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,306 -chr4 20688724 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=-1.513;DP=38;FS=7.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:325,0,1054 -chr4 20894509 . T C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.401;DP=48;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:669,0,1005 -chr4 20898429 . A C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:87:400,0,87 -chr4 20919211 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:232,0,141 -chr4 20920706 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:274,0,56 -chr4 20969094 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=1.844;DP=37;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:613,0,669 -chr4 20976495 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.525;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:681,0,538 -chr4 21172266 . C T 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr4 21235150 . C T 2415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.474;DP=148;FS=2.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:2444,0,2623 -chr4 21249046 . T A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=2.669;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=14.99;ReadPosRankSum=-2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:448,0,538 -chr4 21249264 . T G 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.393;DP=81;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,44:81:99:1457,0,1327 -chr4 21249283 . A G 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.989;DP=83;FS=7.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1421,0,1451 -chr4 21249452 . A G 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-1.363;DP=40;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.77;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1139,0,273 -chr4 21251718 . GCTGAGATACACGGAAGTACATAATTGATATGATGCAAATAAATTAGATAGAATCAAATCCCCTACATTTTAGATTTATTAACAGCATAC G 4142.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.224;DP=123;FS=8.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,110:117:99:4180,0,485 -chr4 21254937 . T A 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.030;DP=78;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1560,0,2523 -chr4 21254938 . C T 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.334;DP=80;FS=4.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:1560,0,2523 -chr4 21255745 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=1.366;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:978,0,836 -chr4 21256970 . T A 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.809;DP=62;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1217,0,998 -chr4 21263347 . A T 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.275;DP=62;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1061,0,1067 -chr4 21263793 . C A 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-0.450;DP=59;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1172,0,870 -chr4 21270800 . T C 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=2.588;DP=58;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1143,0,1826 -chr4 21270803 . C T 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=3.445;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1143,0,1826 -chr4 21289034 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:266,0,62 -chr4 21290004 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.161;DP=38;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:326,0,1084 -chr4 21291613 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=1.859;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:389,0,784 -chr4 21295094 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.964;DP=44;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:897,0,588 -chr4 21299796 . T G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.875;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:511,0,440 -chr4 21301209 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.854;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=23.40;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:426,0,186 -chr4 21354719 . C A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-0.450;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:709,0,761 -chr4 21361486 . T A 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.509;DP=119;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:99:1300,0,2621 -chr4 21376020 . G A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.159;DP=107;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1743,0,1828 -chr4 21413817 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.676;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:505,0,507 -chr4 21415982 . G A 7554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.309;DP=407;FS=2.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=18.56;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,240:407:99:7583,0,5480 -chr4 21418487 . T TC 1243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.423;DP=57;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=21.82;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1281,0,1401 -chr4 21419017 . AT A 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-1.346;DP=49;FS=6.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:462,0,500 -chr4 21419377 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-0.825;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:776,0,509 -chr4 21419633 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=-2.454;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:281,0,338 -chr4 21419861 . A AT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.871;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:383,0,152 -chr4 21420366 . A T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.292;DP=49;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:890,0,897 -chr4 21420815 . G A 2250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=1.093;DP=109;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,67:109:99:2279,0,1438 -chr4 21421056 . G A 1806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-1.147;DP=66;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,47:66:99:1835,0,494 -chr4 21567362 . T C 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.365;DP=42;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:718,0,706 -chr4 21577290 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=-0.477;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:642,0,758 -chr4 21588927 . T G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.345;DP=32;FS=5.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:458,0,631 -chr4 21590390 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=-1.664;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:254,0,424 -chr4 21590816 . T A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,365 -chr4 21590941 . CTG C 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.631;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=16.07;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:423,0,454 -chr4 21644837 . C T 3366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.803;DP=199;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=16.92;ReadPosRankSum=4.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,93:199:99:3395,0,3581 -chr4 21649386 . A G 2823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=2.199;DP=144;FS=15.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,83:144:99:2852,0,2201 -chr4 21670088 . G A 2101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.920;DP=135;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:2130,0,2363 -chr4 21674602 . T A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-3.383;DP=102;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:1007,0,4624 -chr4 21674603 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-3.531;DP=104;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:1007,0,4624 -chr4 21690208 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:259,0,61 -chr4 21722027 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.899;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:318,0,354 -chr4 21808999 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=2.174;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:232,0,389 -chr4 22708729 . G A 343.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=28.60;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:371,0,10 -chr4 22710522 . G T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.402;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:686,0,487 -chr4 22817853 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=3.602;DP=91;FS=5.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:245,0,3110 -chr4 22819150 . G GT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-2.015;DP=109;FS=11.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=1.84;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:238,0,1990 -chr4 22820757 . A ATG 2515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-1.858;DP=304;FS=36.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,89:242:99:2553,0,4629 -chr4 22848925 . G A 4427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=-2.450;DP=291;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,141:290:99:4456,0,4564 -chr4 24147518 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,273 -chr4 24171470 . GT G 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.800;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:244,0,500 -chr4 24177151 . C T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.884;DP=97;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.458;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1450,0,1561 -chr4 24192811 . C A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=2.072;DP=59;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:353,0,1567 -chr4 24192836 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=2.947;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:349,0,1418 -chr4 24193158 . G T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.077;DP=90;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:1519,0,1576 -chr4 24337168 . TCA T 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.574;DP=31;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:323,0,637 -chr4 24339249 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-2.887;DP=57;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:257,0,1726 -chr4 24516444 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:533,42,0 -chr4 24694865 . T A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.119;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=16.57;ReadPosRankSum=1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:890,0,934 -chr4 24720326 . A T 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 -chr4 24725099 . G A 1886.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1915,129,0 -chr4 24734513 . G A 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.399;DP=68;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,34:68:99:1178,0,1230 -chr4 24774544 . CGTAAGTTTGACTTCAGCATGTTTTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTTGTAATTATCAGTTCCGTTTTCAG C 5034.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=1.202;DP=136;FS=3.007;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,132:136:99:5072,387,0 -chr4 24777251 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.036;DP=45;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:391,0,1161 -chr4 24791720 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,254 -chr4 24814906 . G T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-1.141;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=22.57;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:773,0,409 -chr4 24818341 . A G 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-2.678;DP=53;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=16.58;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:907,0,950 -chr4 24821557 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.078;DP=37;FS=5.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:512,0,1592 -chr4 24821632 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.964;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:480,0,906 -chr4 24821735 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-2.046;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:297,0,754 -chr4 24826857 . A G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=2.195;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:770,0,584 -chr4 24829851 . G A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.174;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:931,0,956 -chr4 24838567 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.18;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47:310,0,47 -chr4 24842334 . G GA 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.594;DP=51;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:629,0,752 -chr4 24937299 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr4 24948671 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-1.309;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,187 -chr4 24948932 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:405,0,96 -chr4 24949202 . T A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.224;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:442,0,441 -chr4 24995365 . A T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-0.668;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:289,0,423 -chr4 25020752 . T A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-0.124;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=25.59;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:540,0,147 -chr4 25033556 . A C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.847;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:561,0,561 -chr4 25033942 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.376;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:353,0,485 -chr4 25033969 . G T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=-0.361;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:512,0,584 -chr4 25039594 . C T 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.191;DP=36;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:782,0,392 -chr4 25099494 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.206;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:542,0,447 -chr4 25103731 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=32.67;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:453,0,525 -chr4 25106702 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,620 -chr4 25106703 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,620 -chr4 25107224 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,291 -chr4 25115850 . G A 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.746;DP=74;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=17.21;ReadPosRankSum=2.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1302,0,1274 -chr4 25116203 . G T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=1.544;DP=59;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,37:59:99:1261,0,766 -chr4 25119854 . C T 1576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.918;DP=88;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:1605,0,1492 -chr4 25126768 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:387,0,777 -chr4 25130991 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.136;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:715,0,415 -chr4 25131039 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.319;DP=40;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:710,0,603 -chr4 25136577 . T A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-2.023;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=21.36;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:669,0,378 -chr4 25136690 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:272,0,139 -chr4 25137663 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-2.140;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=21.39;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,299 -chr4 25137957 . A T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=1.890;DP=20;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:435,0,300 -chr4 25152377 . T G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=1.093;DP=46;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:633,0,904 -chr4 25154540 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.126;DP=42;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:728,0,731 -chr4 25162632 . C A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=1.568;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:606,0,602 -chr4 25162754 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=1.429;DP=39;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:399,0,1188 -chr4 25162817 . GGGTGAGTGCATCTTAGCCATTGAATACATTTTGGGATTGCTCGGTTTTGCTGATGGAGGTCAGAGGGTTGTTGACATCAGAGCTGTTGTTTGTGGTGTGTTTA G 1112.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=1.280;DP=35;FS=8.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=31.79;ReadPosRankSum=-1.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:99:1150,0,754 -chr4 25166880 . G T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:295,0,340 -chr4 25167371 . T A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-1.219;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:612,0,895 -chr4 25167646 . A T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.013;DP=33;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:430,0,695 -chr4 25168146 . T TA 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=-0.331;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:446,0,1329 -chr4 25168148 . T A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.214;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:446,0,1330 -chr4 25456668 . TC T 825.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.044;DP=62;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:863,0,825 -chr4 25456711 . G T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-0.392;DP=54;FS=3.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:763,0,1145 -chr4 25457200 . T G 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.441;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:894,0,985 -chr4 25457403 . CA C 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.437;DP=46;FS=2.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:430,0,522 -chr4 25457662 . C T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-0.499;DP=53;FS=5.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:732,0,836 -chr4 25457987 . T A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=-0.327;DP=74;FS=15.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:861,0,1469 -chr4 25458049 . T A 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.330;DP=54;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:912,0,871 -chr4 25458399 . A T 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=2.647;DP=69;FS=8.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,34:69:99:1208,0,1261 -chr4 25458680 . G A 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.369;DP=86;FS=10.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1527,0,1574 -chr4 25475467 . G A 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.631;DP=78;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=21.00;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,49:78:99:1666,0,1016 -chr4 25476896 . A C 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.279;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:936,0,912 -chr4 25476962 . T C 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.555;DP=70;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1335,0,993 -chr4 25517549 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:230,0,441 -chr4 25643602 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=1.139;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=20.30;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:353,0,203 -chr4 25643649 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:301,0,346 -chr4 25768669 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:259,0,372 -chr4 26118697 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr4 26227380 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.623;DP=14;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:79:382,0,79 -chr4 26227448 . C T 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr4 26401634 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-0.316;DP=37;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:318,0,1014 -chr4 26410158 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.362;DP=81;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:1460,0,1449 -chr4 26410395 . A G 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.712;DP=79;FS=5.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1398,0,1342 -chr4 26411638 . C G 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=1.310;DP=79;FS=4.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1366,0,1355 -chr4 26445463 . C T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.191;DP=46;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:1004,0,647 -chr4 26548913 . C A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:304,0,259 -chr4 26597643 . T G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,250 -chr4 26924043 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=1.361;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=27.24;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:573,0,389 -chr4 26924045 . T C 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=1.526;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=27.24;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:573,0,389 -chr4 26924944 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-1.087;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:412,0,248 -chr4 27242718 . A T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=22.49;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:568,0,255 -chr4 27251376 . C A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=30.72;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:612,0,106 -chr4 27252533 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.237;DP=26;FS=9.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:324,0,570 -chr4 27253619 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=-2.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,259 -chr4 27502329 . C G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.826;DP=42;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:646,0,825 -chr4 27505909 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.094;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=13.82;ReadPosRankSum=2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:512,0,737 -chr4 27520967 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-1.610;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:504,0,899 -chr4 27526168 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=2.123;DP=38;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:438,0,869 -chr4 27527592 . G A 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.462;DP=51;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:884,0,951 -chr4 27528806 . G A 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.251;DP=54;FS=3.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:863,0,886 -chr4 27543139 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=1.021;DP=52;FS=11.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:443,0,1329 -chr4 27589181 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=3.522;DP=39;FS=15.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:273,0,1086 -chr4 27645228 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-1.082;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:361,0,521 -chr4 27670325 . C A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.142;DP=71;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1079,0,1365 -chr4 27676371 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=1.740;DP=38;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:256,0,1133 -chr4 27677519 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-2.434;DP=43;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=11.20;ReadPosRankSum=3.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:510,0,941 -chr4 27689408 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.593;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=21.91;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:598,0,299 -chr4 27689779 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-1.141;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:451,0,625 -chr4 27690567 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=2.083;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=24.21;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:343,0,128 -chr4 27730139 . A C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.31;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,188 -chr4 27734138 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:280,0,281 -chr4 27753295 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.484;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:272,0,529 -chr4 27762115 . CTG C 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.466;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:334,0,123 -chr4 27780200 . G A 335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:364,30,0 -chr4 27939324 . T C 529.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=1.504;DP=15;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=32.25;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:3:556,3,0 -chr4 27942581 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.936;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,536 -chr4 28027506 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=34.75;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:98:341,0,98 -chr4 28027510 . A C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-0.348;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=26.06;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:98:341,0,98 -chr4 28027659 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr4 28028050 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr4 28028553 . TA T 377.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-0.248;DP=15;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:8:414,8,0 -chr4 28028834 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=1.086;DP=18;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:436,0,44 -chr4 28032870 . A T 849.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:878,63,0 -chr4 28032906 . A C 403.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=28.79;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:12:431,12,0 -chr4 28128995 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.28;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:33:301,0,33 -chr4 28143939 . T G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr4 28146265 . C T 905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:934,66,0 -chr4 28146345 . T C 725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:754,54,0 -chr4 28160246 . G A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr4 28175885 . T C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:75:443,0,75 -chr4 28282928 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,149 -chr4 28473803 . C T 524.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.810;DP=15;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=34.95;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:550,0,1 -chr4 28474012 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:259,0,346 -chr4 28485702 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:508,0,396 -chr4 28486977 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=1.113;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:517,0,518 -chr4 28487595 . G C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,526 -chr4 28995415 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.798;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:503,0,1504 -chr4 28996677 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.988;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:339,0,388 -chr4 29159276 . T C 557.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:586,42,0 -chr4 29173877 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=12;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:91:232,0,91 -chr4 29174201 . A G 317.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.696;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=26.49;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:346,0,16 -chr4 29174207 . A G 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr4 29174372 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.637;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:267,0,144 -chr4 29174762 . T G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:263,0,61 -chr4 29282332 . T G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.133;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:528,0,149 -chr4 29282561 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,100 -chr4 29282761 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=1.791;DP=15;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,217 -chr4 29282800 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=16.34;ReadPosRankSum=-2.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,267 -chr4 29282959 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=17.91;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,170 -chr4 29531989 . G A 359.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:2:386,0,2 -chr4 29569351 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.365;DP=11;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,297 -chr4 29569356 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=11;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,217 -chr4 29641701 . C T 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.048;DP=113;FS=5.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1930,0,2009 -chr4 29661273 . C T 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.174;DP=112;FS=8.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:1631,0,2239 -chr4 29661370 . G A 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-1.688;DP=150;FS=5.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,56:150:99:1962,0,3295 -chr4 29997872 . G A 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 -chr4 30124757 . C CT 410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:448,36,0 -chr4 30125751 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr4 30212342 . A G 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:446,30,0 -chr4 30305339 . T C 287.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:316,0,18 -chr4 30771641 . G C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,277 -chr4 31149038 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:354,0,254 -chr4 31302036 . C A 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr4 31324135 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.503;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=31.30;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:623,0,127 -chr4 31337196 . T C 246 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr4 31337210 . C T 294.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:323,0,15 -chr4 31391125 . A G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr4 31499846 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.179;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:273,0,53 -chr4 31582258 . T A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:440,33,0 -chr4 31582463 . G T 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 -chr4 31647605 . G T 2473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=-1.732;DP=59;FS=9.258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=34.05;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:2502,176,0 -chr4 31778318 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.467;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:434,0,90 -chr4 31805658 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:269,0,61 -chr4 32116679 . A G 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr4 32116695 . A T 225.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:254,21,0 -chr4 32118928 . C T 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:631,48,0 -chr4 32119030 . G A 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr4 32233492 . T C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr4 32747485 . C A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr4 33040509 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:229,0,61 -chr4 33145652 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.98;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:268,0,100 -chr4 33148427 . T G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.808;DP=57;FS=8.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:385,0,2003 -chr4 34154328 . A G 344.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=31.36;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:373,0,13 -chr4 34154358 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:318,0,51 -chr4 34188865 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:70:241,0,70 -chr4 34249126 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:303,0,132 -chr4 34249154 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=25.91;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:391,0,124 -chr4 34459168 . T G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr4 34460686 . T A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 34470699 . C T 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr4 34470842 . C A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr4 34474399 . A T 376.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=34.18;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:404,0,12 -chr4 34621361 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:298,0,96 -chr4 34622491 . A T 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.771;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=23.37;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:99:1418,0,4115 -chr4 34622535 . A G 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-2.884;DP=59;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=23.56;ReadPosRankSum=-2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:1418,0,4202 -chr4 34622567 . C T 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=1.726;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:1418,0,4299 -chr4 34622573 . C T 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.088;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=19.04;ReadPosRankSum=3.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:1418,0,4222 -chr4 34622681 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.285;DP=72;FS=4.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:251,0,5936 -chr4 34622782 . T A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.263;DP=39;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:372,0,651 -chr4 34682598 . G T 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr4 34837889 . T C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 -chr4 34837912 . A G 422.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:448,0,1 -chr4 34838088 . G A 887.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=2.154;DP=25;FS=10.969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=28.14;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:27:916,27,0 -chr4 34838193 . T A 4689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:4718,328,0 -chr4 34838265 . AG A 1602.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=1.032;DP=56;FS=12.497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,48:54:9:1639,9,0 -chr4 34838636 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr4 34838729 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.898;DP=33;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,478 -chr4 34839082 . C T 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-1.734;DP=26;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=33.64;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:903,66,0 -chr4 34839121 . C T 3522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3551,247,0 -chr4 34841139 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.894;DP=25;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=28.03;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:60:729,0,60 -chr4 34841676 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:345,0,213 -chr4 34841824 . C A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.907;DP=46;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:609,0,1103 -chr4 34841890 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.733;ClippingRankSum=-0.350;DP=79;FS=64.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:577,0,2244 -chr4 34841955 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=2.221;DP=249;FS=32.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,41:246:99:510,0,9136 -chr4 34857573 . T G 230.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:259,0,18 -chr4 34899394 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:341,0,271 -chr4 34899547 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:391,0,136 -chr4 34900212 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,194 -chr4 35086118 . T A 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 -chr4 35086159 . T A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr4 35088296 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:34:319,0,34 -chr4 35088404 . G A 665.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.197;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:15:694,15,0 -chr4 35088736 . A T 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:720,48,0 -chr4 35088737 . A T 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:720,48,0 -chr4 35094912 . C T 3190.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:3219,226,0 -chr4 35095007 . A C 4623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:4652,328,0 -chr4 35279109 . C G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:303,0,57 -chr4 35644126 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,130 -chr4 35644330 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=1.448;DP=18;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:259,0,246 -chr4 35644641 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.722;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,317 -chr4 35644857 . C A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.903;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:510,0,437 -chr4 36115254 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.211;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,713 -chr4 36291173 . C A 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 -chr4 36292322 . G T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.483;DP=42;FS=7.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:575,0,789 -chr4 36292418 . T TA 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.445;DP=23;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=10.38;ReadPosRankSum=2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:276,0,576 -chr4 36292710 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:252,0,371 -chr4 36293956 . CT C 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=1.200;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:315,0,237 -chr4 36346612 . G T 299.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:328,0,13 -chr4 36346698 . A G 244.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:273,0,15 -chr4 36346947 . G T 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 -chr4 36347488 . C T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr4 36409956 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:233,0,52 -chr4 36570613 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr4 36578395 . A G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr4 36646651 . T G 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:28:434,28,0 -chr4 36646729 . A G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.441;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=29.94;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:68:597,0,68 -chr4 36646840 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-2.509;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:648,0,934 -chr4 36647018 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=29.30;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:96:314,0,96 -chr4 36647121 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-1.639;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.014;QD=24.10;ReadPosRankSum=2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:462,0,168 -chr4 36647333 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.761;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:90:384,0,90 -chr4 36647406 . G C,T 224.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,3:9:97:335,115,97,222,0,213 -chr4 36647884 . A T 364.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:393,0,13 -chr4 36648102 . C T 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 -chr4 36714264 . C G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr4 36857898 . T G 280.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:309,24,0 -chr4 37243326 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,233 -chr4 37501022 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.915;DP=48;FS=18.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:303,0,1189 -chr4 37501073 . A G 2508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2537,181,0 -chr4 37502046 . G T 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr4 37502869 . A G 1041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:78:1070,78,0 -chr4 37502881 . G A 357.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,1:2:20:386,20,0 -chr4 37504614 . T C 210.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=21;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:239,0,23 -chr4 37504661 . A T 251.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:280,0,16 -chr4 37572382 . C T 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 -chr4 37572452 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 -chr4 37574216 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr4 37576534 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr4 37649553 . C G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.370;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:356,0,95 -chr4 37693469 . A C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.087;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:592,0,115 -chr4 37881461 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.783;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:527,0,621 -chr4 37881527 . A G 570.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=26.61;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:597,2,0 -chr4 38079623 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:232,0,58 -chr4 38079936 . A G 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr4 38104838 . C T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr4 38578678 . C T 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 -chr4 38616927 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,334 -chr4 38796781 . C G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 38946923 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr4 38946984 . G C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:855,60,0 -chr4 38949069 . T C 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:999,75,0 -chr4 38949143 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr4 38952172 . T C 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:681,51,0 -chr4 38952277 . G T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:243,18,0 -chr4 38953011 . A T 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:466,33,0 -chr4 39122459 . G C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.320;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:309,0,447 -chr4 39122747 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.479;DP=20;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,444 -chr4 39122839 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.194;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:275,0,496 -chr4 39461221 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:256,0,685 -chr4 39574003 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.741;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,376 -chr4 39574265 . A G 704.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:733,51,0 -chr4 39574616 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.819;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:425,0,571 -chr4 39574654 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.913;DP=32;FS=11.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:955,0,183 -chr4 39574875 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-1.318;DP=34;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:376,0,804 -chr4 39575070 . A G 449.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:1:475,0,1 -chr4 39575084 . A T 523.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:6:551,6,0 -chr4 39575127 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.467;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=21.30;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:433,0,162 -chr4 39575457 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=1.385;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:473,0,470 -chr4 39575535 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.694;DP=28;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,699 -chr4 39575737 . T A 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:613,42,0 -chr4 39575754 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.212;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:231,0,512 -chr4 39575855 . C A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.283;DP=29;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:748,0,831 -chr4 39575879 . G A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-0.921;DP=34;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=21.26;ReadPosRankSum=2.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:751,0,831 -chr4 39575989 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=-0.056;DP=35;FS=5.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:415,0,864 -chr4 39576010 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.754;DP=39;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:544,0,743 -chr4 39576178 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-0.310;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:677,0,510 -chr4 39576474 . A G 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.898;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:68:688,0,68 -chr4 39576665 . A T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.255;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1162 -chr4 39576666 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.534;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1159 -chr4 39576861 . T C 973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1002,69,0 -chr4 39576891 . A G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.381;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:674,0,195 -chr4 39576998 . G T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=2.684;DP=20;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=13.09;ReadPosRankSum=-2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:290,0,410 -chr4 39577261 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:467,0,473 -chr4 39577320 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=-1.082;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:363,0,502 -chr4 39577551 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:255,0,168 -chr4 39577779 . GTC G 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-0.960;DP=40;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:647,0,1042 -chr4 39577941 . T G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.314;DP=34;FS=9.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:915,0,246 -chr4 39578156 . G T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.591;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,823 -chr4 39578157 . G T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.091;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:429,0,823 -chr4 39578298 . A T 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -chr4 39669221 . C T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 39669328 . T C 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.383;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=32.80;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:39:1045,0,39 -chr4 39669353 . A T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:80:528,0,80 -chr4 39669559 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=-1.186;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:363,0,838 -chr4 39669761 . C A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-1.900;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:700,0,237 -chr4 39669812 . T A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-2.074;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:804,0,214 -chr4 39669958 . C T 1000.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.074;DP=29;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=34.50;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:3:1027,0,3 -chr4 39670047 . A G 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=2.025;DP=31;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=31.99;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1020,0,127 -chr4 39670058 . C A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.652;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:639,0,478 -chr4 39670129 . C A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=2.550;DP=43;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=29.27;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:99:1287,0,103 -chr4 39670683 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.126;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,912 -chr4 39671101 . T C 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=1.602;DP=44;FS=13.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:896,0,591 -chr4 39671682 . T TA 513.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.788;DP=31;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.58;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:40:626,40,0 -chr4 39672590 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:31:308,0,31 -chr4 39998462 . C T 7476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.491;DP=467;FS=59.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=16.01;ReadPosRankSum=3.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,201:411:99:7505,0,7758 -chr4 39998635 . T A 2339.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:99:2368,167,0 -chr4 39998650 . G C 2294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:2323,164,0 -chr4 39998716 . CA C 3092.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:99:3130,226,0 -chr4 39998735 . AG A 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.242;DP=55;FS=18.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:892,0,1698 -chr4 39998737 . T A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=1.102;DP=60;FS=13.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:892,0,1698 -chr4 39998814 . G A 16287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.419;ClippingRankSum=-3.250;DP=488;FS=14.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=33.38;ReadPosRankSum=5.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,224:433:99:16316,0,13713 -chr4 39998844 . A G 16254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-2.614;DP=525;FS=43.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=30.96;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,271:472:99:16283,0,13715 -chr4 39998937 . A G 5073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;ClippingRankSum=1.702;DP=185;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=27.43;ReadPosRankSum=3.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,149:154:99:5102,0,13394 -chr4 39998970 . A G 2422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,50:50:99:2451,0,14741 -chr4 39999066 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.401;DP=66;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:467,0,333 -chr4 40294750 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.933;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:291,0,389 -chr4 40317796 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-2.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,177 -chr4 40317828 . G GT 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-2.003;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:251,0,252 -chr4 40441267 . G C 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:488,33,0 -chr4 40521716 . G A 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr4 40666277 . A T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.047;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:584,0,390 -chr4 40804556 . C T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr4 40836686 . A G 712.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:741,51,0 -chr4 40836713 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:415,0,627 -chr4 40836715 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=1.196;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,906 -chr4 40910433 . C A 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 -chr4 40910452 . G A 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr4 40911359 . A G 375.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:404,30,0 -chr4 41053820 . C T 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 -chr4 41159408 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-1.445;DP=20;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:292,0,425 -chr4 41175720 . A G 948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.250;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=28.75;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:34:977,34,0 -chr4 41175780 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=-1.743;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.10;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:43:669,0,43 -chr4 41175820 . T TC 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-1.086;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:94:358,0,94 -chr4 41274525 . A G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.426;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:703,0,106 -chr4 41275006 . C T 259.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:288,0,21 -chr4 41493704 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:349,0,137 -chr4 41888817 . T C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr4 41969851 . A G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr4 42341932 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr4 42342169 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:243,0,65 -chr4 42343175 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:277,0,63 -chr4 42842558 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.000;DP=13;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:274,0,176 -chr4 43337710 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=1.910;DP=23;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,328 -chr4 43475292 . C T 211.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:240,0,25 -chr4 43853469 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr4 43854378 . C A 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr4 44112699 . A T 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 -chr4 44234036 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,334 -chr4 44293294 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=-0.060;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=19.51;ReadPosRankSum=-2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:516,0,327 -chr4 44578861 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:92:257,0,92 -chr4 44578940 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:300,0,123 -chr4 44755773 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=13;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:275,0,58 -chr4 44756145 . C A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:392,0,758 -chr4 44756187 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-2.416;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=22.74;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:392,0,758 -chr4 44756513 . C T 780.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-1.313;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=33.95;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:21:809,21,0 -chr4 44804953 . T C 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr4 44994519 . C A 1009.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.156;DP=24;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=35.60;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:82:1038,82,0 -chr4 45056999 . T G 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:517,39,0 -chr4 45057002 . T C 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:517,39,0 -chr4 45058454 . C CTA 988.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1026,69,0 -chr4 45374991 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr4 45388688 . A C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr4 45627126 . C G 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.373;DP=59;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:1264,0,919 -chr4 45628495 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.543;DP=21;FS=17.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:300,0,876 -chr4 45628496 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=17.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:300,0,880 -chr4 45632518 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.581;DP=46;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:389,0,964 -chr4 46509453 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:46:333,0,46 -chr4 46509454 . A C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:46:333,0,46 -chr4 46718670 . G A 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr4 46732436 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.340;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:381,0,377 -chr4 47517748 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.573;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:521,0,539 -chr4 47517784 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-2.601;DP=24;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=10.07;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:270,0,421 -chr4 47517995 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.454;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:500,0,1041 -chr4 48074699 . G A 793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:822,60,0 -chr4 48074790 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.760;DP=92;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:546,0,1694 -chr4 48076773 . A T 1905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.498;DP=69;FS=5.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=27.62;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,46:60:99:1934,0,1743 -chr4 48076779 . A G 5060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:5089,359,0 -chr4 48076902 . A C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.957;DP=61;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:647,0,826 -chr4 48076914 . GT G 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.537;DP=30;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=14.79;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:481,0,169 -chr4 48077049 . G T 822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:851,60,0 -chr4 48080069 . G T 2906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:99:2935,211,0 -chr4 48080083 . G A 2862.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.79;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:99:2891,208,0 -chr4 48080124 . A T 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=1.194;DP=189;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=5.37;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,44:163:99:1043,0,5371 -chr4 48080150 . T C 2105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.534;DP=319;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,80:261:99:2134,0,7176 -chr4 48080251 . A G 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-5.025;DP=169;FS=71.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=8.30;ReadPosRankSum=-4.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,51:155:99:1431,0,4025 -chr4 48080347 . T G 956.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:985,69,0 -chr4 48081338 . CT C 342.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=28;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7:379,7,0 -chr4 48081362 . A G 593.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=33;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:7:621,7,0 -chr4 48081869 . T C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr4 48081870 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr4 48082567 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.250;DP=188;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,32:155:99:606,0,4834 -chr4 48082605 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.783;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:549,0,178 -chr4 48082606 . C G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=1.021;DP=24;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:325,0,487 -chr4 48082851 . A T 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr4 48083296 . C G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=33.58;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:61:364,0,61 -chr4 48083422 . T A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.934;DP=34;FS=10.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:590,0,585 -chr4 48083781 . C T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.856;DP=145;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:801,0,4128 -chr4 48083933 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=1.471;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:876,0,1133 -chr4 48084118 . T C 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:804,60,0 -chr4 48084414 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.368;DP=25;FS=22.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=28.51;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:741,0,139 -chr4 48084626 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=-1.442;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:591,0,4369 -chr4 48355619 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,443 -chr4 48493937 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr4 48494244 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr4 48631269 . G T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:238,0,65 -chr4 48631307 . A G 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr4 49158603 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=1.296;DP=13;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:333,0,58 -chr4 49280007 . G C 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr4 49683807 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.479;DP=34;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=9.43;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:349,0,126 -chr4 49694700 . T C 2949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2978,208,0 -chr4 49694724 . T C 1800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1829,126,0 -chr4 49695216 . T G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.448;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:49:450,0,49 -chr4 49695219 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.423;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:49:450,0,49 -chr4 49695655 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr4 49695656 . A G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:252,18,0 -chr4 49995925 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr4 50141625 . AC A 252.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.044;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:7:289,0,7 -chr4 50141685 . T A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:81:444,0,81 -chr4 50141742 . A G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr4 50141805 . T C 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-2.916;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:523,0,160 -chr4 50141858 . T A 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:645,45,0 -chr4 50549064 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=25.07;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:304,0,57 -chr4 50598036 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=1.413;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:288,0,1631 -chr4 50598116 . T A 1941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1970,142,0 -chr4 50706127 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:287,0,62 -chr4 50802025 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-3.018;DP=48;FS=6.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=4.54;ReadPosRankSum=3.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,2091 -chr4 50802029 . A G 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=3.383;DP=65;FS=8.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=17.23;ReadPosRankSum=-3.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1148,0,597 -chr4 50802033 . C A 2054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2083,141,0 -chr4 50843874 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr4 50843959 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=16.77;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:263,0,51 -chr4 50844416 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:277,0,49 -chr4 50887047 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:304,0,176 -chr4 50887581 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.984;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,308 -chr4 50918319 . G A 648.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=34.13;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:676,8,0 -chr4 50918440 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.866;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:322,0,814 -chr4 50936952 . A C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-0.099;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:535,0,552 -chr4 50937141 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=1.588;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=27.03;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:623,0,103 -chr4 50937396 . A G 685.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-1.187;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:12:713,12,0 -chr4 50937934 . G A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 51179219 . G C 370.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=33.73;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:399,0,13 -chr4 51179255 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:267,0,49 -chr4 51179960 . G A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr4 51179998 . A G 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:500,36,0 -chr4 51180060 . C T 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 -chr4 51180559 . A G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr4 51181001 . G A 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr4 51181077 . T A 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr4 51364675 . T G 1029.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.320;DP=26;FS=9.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=25.69;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:26:1058,0,26 -chr4 51364794 . A C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=1.010;DP=36;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:608,0,1400 -chr4 51364797 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.983;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:608,0,1449 -chr4 51364862 . T C 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=1.364;DP=38;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:801,0,465 -chr4 51364929 . A T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.123;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:549,0,345 -chr4 51365081 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=1.681;DP=28;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:345,0,503 -chr4 51365147 . C G 569.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.792;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:607,0,801 -chr4 51365468 . A G 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.363;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:1224,0,293 -chr4 51365857 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-2.224;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:553,0,606 -chr4 51366086 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.419;DP=28;FS=16.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:549,0,396 -chr4 51366119 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.689;DP=31;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:252,0,1389 -chr4 51366140 . C G 1839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.738;DP=44;FS=3.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=32.00;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:1868,0,215 -chr4 51366228 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-1.095;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:439,0,2417 -chr4 51366414 . A C 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-2.130;DP=28;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:761,0,182 -chr4 51366544 . G T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.045;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:66:766,0,66 -chr4 51366667 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.029;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:367,0,983 -chr4 51366673 . TA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=-1.431;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:367,0,989 -chr4 51366761 . GT G 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-1.286;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:651,0,292 -chr4 51367192 . AC A 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.300;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=6.10;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:275,0,388 -chr4 51367230 . T A 2658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=1.977;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:78:2687,0,78 -chr4 51367271 . T G 2664.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.873;DP=31;FS=2.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=29.52;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,15:20:6:2692,6,0 -chr4 51367308 . C T 1801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=1.482;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:99:1830,0,257 -chr4 51367379 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-2.176;DP=144;FS=13.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:485,0,2353 -chr4 51367423 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-1.702;DP=37;FS=6.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=7.18;ReadPosRankSum=-3.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:294,0,593 -chr4 51367532 . A C 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-0.076;DP=33;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=32.27;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:1228,0,490 -chr4 51367539 . C T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=1.210;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:731,0,1132 -chr4 51367549 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=2.343;DP=63;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=3.28;ReadPosRankSum=-3.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:235,0,2573 -chr4 51367692 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=2.478;DP=109;FS=14.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1107,0,947 -chr4 51367924 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.666;DP=21;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,366 -chr4 51380692 . G A 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 -chr4 51387368 . C T 816.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:845,66,0 -chr4 51390541 . C T 1358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1387,99,0 -chr4 51391471 . C T 1086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1117,81,0 -chr4 51395903 . T G 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 -chr4 51414600 . C G 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr4 51536522 . A T 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr4 51537010 . C G 244.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:273,0,16 -chr4 51537029 . A G 283.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:4:310,0,4 -chr4 51537197 . G T 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr4 51664494 . C A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr4 51664495 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr4 51855588 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.850;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=32.25;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:97:641,0,97 -chr4 51856490 . G C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,134 -chr4 51972912 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=2.993;DP=29;FS=6.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:763,0,262 -chr4 51975410 . T G 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:425,33,0 -chr4 52078304 . A G 527.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=1.504;DP=19;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:553,0,1 -chr4 52138121 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=14.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.68;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:265,0,101 -chr4 52182760 . T G 588.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:617,45,0 -chr4 52436067 . A T 311.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=31.14;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:8:339,0,8 -chr4 52436172 . G A 1112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.706;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1141,78,0 -chr4 53050351 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,154 -chr4 53050354 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.62;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,154 -chr4 53183865 . T C 487.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:1:513,0,1 -chr4 53188772 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.133;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,182 -chr4 53285565 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-2.239;DP=15;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=22.18;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:361,0,49 -chr4 53286833 . C T 6991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:7020,470,0 -chr4 53286834 . C T 6991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:7020,470,0 -chr4 53617435 . T G 205.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:234,0,19 -chr4 53798387 . T C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=29.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=31.30;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:70:623,0,70 -chr4 53940864 . T C 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr4 53940893 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:55:241,0,55 -chr4 54044023 . C T 1044.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1073,75,0 -chr4 54061755 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=-0.034;DP=24;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.70;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,456 -chr4 54061767 . A T 845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:874,63,0 -chr4 54341682 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:344,0,182 -chr4 54341775 . G A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr4 54481387 . A G 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 -chr4 54618161 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr4 54690568 . C T 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:238,0,25 -chr4 54691538 . T C 292.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:321,0,14 -chr4 54784719 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,139 -chr4 54839033 . G A 363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:392,33,0 -chr4 54890979 . A G 1428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1457,102,0 -chr4 54891056 . T C 1258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1287,93,0 -chr4 54891339 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.739;DP=45;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:321,0,1282 -chr4 54906079 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr4 54968940 . A T 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr4 54982220 . G A 3410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=3.076;DP=101;FS=24.177;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.292;QD=33.77;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,83:91:85:3439,85,0 -chr4 54982266 . T G 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=3.583;DP=45;FS=32.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.422;QD=27.57;ReadPosRankSum=-3.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:99:1269,0,322 -chr4 54982398 . T G 377.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=31.46;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:7:405,0,7 -chr4 55039610 . A G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:484,36,0 -chr4 55039638 . G A 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:484,36,0 -chr4 55039756 . C T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:395,27,0 -chr4 55235899 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-2.339;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,258 -chr4 55236177 . G C 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 -chr4 55236278 . G A 1360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1389,99,0 -chr4 55236326 . A T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=2.179;DP=33;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:847,0,245 -chr4 55350900 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.566;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:435,0,282 -chr4 55350907 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=23.93;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:435,0,282 -chr4 55566711 . T C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.091;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:411,0,645 -chr4 55567501 . A T 321.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.19;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:350,0,14 -chr4 55582976 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.398;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:275,0,138 -chr4 55639146 . T G 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 -chr4 55782410 . G A 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:678,51,0 -chr4 55782436 . A G 2221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2250,157,0 -chr4 56370518 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr4 56437006 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:409,0,745 -chr4 56477707 . C T 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr4 56479897 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:256,18,0 -chr4 56479902 . A C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr4 56530626 . C G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:329,0,169 -chr4 56707623 . C G 3722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-2.384;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,101:139:99:3751,0,929 -chr4 56707770 . C A 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-2.089;DP=69;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=23.61;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:43:99:1657,0,103 -chr4 56707837 . A G 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.714;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:1657,0,119 -chr4 56707921 . T C 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:70:1657,0,70 -chr4 56708350 . C A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-2.753;DP=106;FS=8.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=2.54;ReadPosRankSum=3.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,9:60:99:298,0,3482 -chr4 56733985 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.092;DP=35;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:517,0,620 -chr4 56734107 . A T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=2.583;DP=27;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=21.40;ReadPosRankSum=-2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:606,0,1315 -chr4 56734117 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=2.335;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=25.67;ReadPosRankSum=-2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:99:593,0,1315 -chr4 56734136 . G C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-2.415;DP=24;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=23.45;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:591,0,1315 -chr4 56734146 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-2.391;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:591,0,1315 -chr4 56734327 . C T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.764;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.73;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,2:15:99:1060,0,351 -chr4 56734407 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.056;DP=70;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:235,0,2745 -chr4 56734570 . T C 2083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.642;DP=47;FS=4.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:42:2112,0,42 -chr4 56734620 . A C 2083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=-0.444;DP=26;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=26.51;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:50:2112,0,50 -chr4 56734819 . A T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.255;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:32:681,0,32 -chr4 56734836 . A C 331.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.89;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:16:360,0,16 -chr4 56734944 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=31.76;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:345,0,263 -chr4 56734965 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-2.404;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:345,0,263 -chr4 56735130 . C A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.218;DP=61;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:428,0,2336 -chr4 56735133 . C A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.471;DP=63;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:428,0,2336 -chr4 56735324 . C T 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.283;DP=27;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=34.60;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:1087,0,245 -chr4 56735331 . T G 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.001;DP=28;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=31.16;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:1087,0,247 -chr4 56735643 . G T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.206;DP=21;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:593,0,155 -chr4 56735817 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.434;DP=24;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=24.45;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:72:615,0,72 -chr4 56736015 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-2.074;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=16.63;ReadPosRankSum=2.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,212 -chr4 56736086 . T C 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.427;DP=30;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=30.39;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:49:940,0,49 -chr4 56736162 . T C 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-1.949;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=26.14;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:891,0,529 -chr4 56736267 . G C 2868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2897,201,0 -chr4 56736351 . G T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.054;DP=37;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:350,0,1329 -chr4 56736426 . T C 1200.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.237;DP=19;FS=6.107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,15:18:15:1229,15,0 -chr4 56736785 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.691;DP=14;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.875;QD=28.91;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:433,0,50 -chr4 56736906 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=1.106;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:306,0,99 -chr4 56737064 . G C 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.608;DP=38;FS=14.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:1106,0,329 -chr4 56737119 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.039;DP=26;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:551,0,686 -chr4 56737339 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.467;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:99:246,0,557 -chr4 56737411 . A G 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-1.469;DP=40;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,28:37:99:1117,0,415 -chr4 56737657 . G A 1354.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.437;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=33.87;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:62:1383,62,0 -chr4 57053142 . T A 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.552;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1065,0,211 -chr4 57053229 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=16.30;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,287 -chr4 57144615 . T C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr4 57302492 . A C 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:475,33,0 -chr4 57704608 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.731;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:277,0,97 -chr4 58001057 . A G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr4 58001856 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:373,0,164 -chr4 58088299 . A C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr4 58088727 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=1.480;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:31:436,0,31 -chr4 58088759 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.48;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:303,0,51 -chr4 58088979 . G A 704.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.020;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.66;ReadPosRankSum=2.981 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,19:31:19:733,19,0 -chr4 58089427 . G C 554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:583,42,0 -chr4 58089481 . T G 284.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:313,0,15 -chr4 58089511 . C T 372.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=33.91;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:401,0,13 -chr4 58089903 . T C 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:821,57,0 -chr4 58089975 . T A 905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:934,66,0 -chr4 58090096 . C T 913.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:942,66,0 -chr4 58090256 . G T 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:46:581,46,0 -chr4 58090756 . A C 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:566,42,0 -chr4 58090820 . A C 504.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.116;DP=15;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=33.65;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:0:530,0,0 -chr4 58091403 . A C 757.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.141;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:20:786,0,20 -chr4 58091411 . C A 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=34.77;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:980,66,0 -chr4 58091831 . G C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:418,0,331 -chr4 58091875 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-2.435;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:234,0,335 -chr4 58092432 . A C 530.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.060;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=20.42;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:14:592,14,0 -chr4 58092433 . A C 942.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:81:1149,81,0 -chr4 58093307 . T C 489.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=34.94;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:516,0,4 -chr4 58096080 . G A 619.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.731;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=32.62;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:24:648,0,24 -chr4 58099247 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-1.701;DP=20;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=25.54;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:62:539,0,62 -chr4 58103108 . A C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr4 58198796 . G C 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:241,0,25 -chr4 58204818 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:259,0,58 -chr4 58204919 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:334,0,52 -chr4 58248863 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr4 58258977 . C CT 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:508,50,0 -chr4 58260516 . C T 561.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:618,45,0 -chr4 58269653 . G A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr4 58270201 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr4 58270856 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr4 58271391 . G A 354.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:383,0,13 -chr4 58271487 . C G 228.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:257,0,18 -chr4 58271669 . C A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr4 58468029 . T C 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:529,36,0 -chr4 58468054 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:308,0,101 -chr4 58469842 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,160 -chr4 58469845 . A G 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:350,24,0 -chr4 58507202 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.875;QD=31.21;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:434,0,50 -chr4 58507592 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-3.473;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:714,0,1002 -chr4 58543091 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-1.057;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=23.90;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:554,0,183 -chr4 58577184 . AC A 884.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=-2.000;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=30.06;ReadPosRankSum=2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:922,0,673 -chr4 58577186 . TCTCCTCTTTAATCCTCAGATCTTCAC T 884.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.216;DP=26;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=34.03;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:922,0,678 -chr4 58582741 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:229,0,377 -chr4 58623305 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=-1.264;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:420,0,201 -chr4 58623621 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.475;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:445,0,234 -chr4 58809773 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=-1.467;DP=27;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:464,0,166 -chr4 58874647 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.910;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,248 -chr4 59286625 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=-2.409;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:341,0,363 -chr4 59292417 . G A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=-0.110;DP=29;FS=8.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:525,0,457 -chr4 60109136 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=1.555;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:264,0,379 -chr4 60109552 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;ClippingRankSum=-3.323;DP=57;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=8.08;ReadPosRankSum=3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:489,0,3442 -chr4 60109560 . T G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-3.142;DP=63;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=7.31;ReadPosRankSum=3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:489,0,3442 -chr4 60109813 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-2.644;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:302,0,898 -chr4 60112547 . A AT 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=1.108;DP=101;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:281,0,2498 -chr4 60128518 . GC G 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=1.636;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:246,0,758 -chr4 60182886 . CCT C 2473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=-1.732;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,65:66:99:2511,0,188 -chr4 60182889 . GCAGTGGAAAGTGTTGTTAGAAACAAAACTTGCCTGAAATAATGCTAGAGAATGCTTTTAGAGTTCAACTCACA G 2473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-1.732;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,64:65:99:2511,0,188 -chr4 60250172 . GAGGTAAAACCCTTCCTGCATCCCAGCAGGCGCCCAGTTGTTTATTTAAAGCGATTATAGTTCACATCAATACTGCTGTTTTGTCGC G 13317.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=1.601;DP=310;FS=2.108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,306:309:99:13355,1109,0 -chr4 60270978 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,344 -chr4 60273355 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.657;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:385,0,383 -chr4 60588469 . T C 400.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=33.40;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:428,0,6 -chr4 60630373 . A T 2721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-2.330;DP=196;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,79:195:99:2750,0,4420 -chr4 60640145 . G T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr4 60665058 . A G 4750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=8.922;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=20.93;ReadPosRankSum=-3.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,144:226:99:4779,0,2743 -chr4 60666753 . G C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=1.516;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=25.74;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:440,0,122 -chr4 60667272 . G A 1810.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=-0.356;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=28.72;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,45:50:13:1839,13,0 -chr4 60669463 . T C 200.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:229,0,25 -chr4 60688132 . G A 2045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2074,144,0 -chr4 60688153 . G T 1384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1413,99,0 -chr4 60688972 . A G 667.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:696,48,0 -chr4 60688984 . G T 658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:687,48,0 -chr4 60689364 . C T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:357,27,0 -chr4 60689893 . G A 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-2.361;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:36:990,36,0 -chr4 60690275 . C A 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:659,45,0 -chr4 60690281 . A C 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:659,45,0 -chr4 60690531 . A G 1991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-1.905;DP=53;FS=2.603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=35.34;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:2020,114,0 -chr4 60691774 . C T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr4 60691874 . TC T 200.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr4 60694125 . G A 201.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:16:230,0,16 -chr4 60694687 . A C 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr4 60695674 . G GT 219.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:257,27,0 -chr4 60696000 . A G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:415,30,0 -chr4 60696008 . G A 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -chr4 60704183 . T G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-2.270;DP=14;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=28.91;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:43:433,0,43 -chr4 60704235 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-0.267;DP=23;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=12.34;ReadPosRankSum=-3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:312,0,438 -chr4 60704253 . T G 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.140;DP=32;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=18.74;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:628,0,448 -chr4 60717322 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=2.764;DP=22;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:487,0,292 -chr4 60717416 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.585;DP=31;FS=20.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=8.22;ReadPosRankSum=3.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:283,0,783 -chr4 60737926 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=2.148;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=18.54;ReadPosRankSum=-2.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:566,0,614 -chr4 60741342 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=32.07;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:56:417,0,56 -chr4 60741343 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:56:417,0,56 -chr4 60743028 . G C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.05;ReadPosRankSum=-2.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:295,0,154 -chr4 60743220 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.264;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:481,0,239 -chr4 60753442 . T C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.260;ClippingRankSum=-3.289;DP=90;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,26:90:99:691,0,2274 -chr4 60759455 . C T 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=-3.025;DP=97;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=15.99;ReadPosRankSum=4.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1579,0,1841 -chr4 60760087 . A C 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-2.643;DP=114;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.759;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,69:114:99:2332,0,1444 -chr4 60760185 . T G 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=4.124;DP=86;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:1466,0,1491 -chr4 60760356 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=2.720;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:588,0,601 -chr4 60760558 . G A 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.280;DP=42;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1046,0,363 -chr4 60760893 . C T 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=2.789;DP=84;FS=4.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=20.08;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:1715,0,3050 -chr4 60760990 . G A 2225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=1.945;DP=81;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=27.48;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,59:79:99:2254,0,403 -chr4 60779362 . A T 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:536,39,0 -chr4 60793119 . T C 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 -chr4 60797448 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-3.065;DP=17;FS=10.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=23.22;ReadPosRankSum=2.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:423,0,196 -chr4 60800771 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=1.727;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=10.87;ReadPosRankSum=-2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:300,0,570 -chr4 60803636 . T G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-1.809;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:290,0,854 -chr4 60819767 . G T 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.243;DP=36;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=22.80;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:849,0,476 -chr4 60819769 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.080;DP=37;FS=3.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:466,0,1416 -chr4 60821116 . A G 361.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.90;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:2:388,0,2 -chr4 60850564 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=16.77;ReadPosRankSum=3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:263,0,301 -chr4 60850576 . GA G 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.875;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:33:364,0,33 -chr4 60931507 . T G 336.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:365,0,13 -chr4 60931586 . TA T 392.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:430,42,0 -chr4 60931788 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:291,0,66 -chr4 60931789 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:291,0,66 -chr4 60931879 . C T 262.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:291,0,22 -chr4 60931952 . T G 1081.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.963;DP=64;FS=4.314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1110,78,0 -chr4 60932050 . T C 1412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=1.863;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:66:1441,66,0 -chr4 60932351 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=2.268;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=34.38;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:915,0,107 -chr4 60932373 . A C 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=3.489;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=24.25;ReadPosRankSum=-2.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:780,0,9267 -chr4 60932378 . GACCTGTCAACAATTCAAAACGTGTAAAACTCATTGTTTTATTCAGTGATGATTTAATACCCATACATTCAATTGGTAAGGCCTTT G 742.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=4.933;DP=53;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.309;QD=14.01;ReadPosRankSum=-3.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:780,0,9621 -chr4 60933153 . A T 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr4 60933434 . G A 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 -chr4 60943120 . C G 298.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:327,0,19 -chr4 60944850 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=28.43;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:98:341,0,98 -chr4 60946640 . A T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=1.085;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=27.43;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:55:522,0,55 -chr4 60993240 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:86:458,0,86 -chr4 60993423 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.667;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=26.74;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:456,0,165 -chr4 60993922 . A T 291.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.43;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:320,0,16 -chr4 60999849 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=32.37;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:514,0,163 -chr4 60999876 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=27.53;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:514,0,163 -chr4 61058962 . T C 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr4 61059223 . G A 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr4 61158042 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=1.909;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:350,0,136 -chr4 61166762 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=30.91;ReadPosRankSum=-1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:430,0,50 -chr4 61166793 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:84:317,0,84 -chr4 61241385 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,339 -chr4 61251157 . TC T 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.036;DP=23;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:349,0,276 -chr4 61252031 . TCTGGAGGAAAGCAGGGCTTTAAAATCAGGTAAATCATTTACATTAGCTATGTATAGCCGCAGATGCTAGCTCAC T 1155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.681;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:99:1193,0,908 -chr4 61263183 . A C 458.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=29.05;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:2:485,2,0 -chr4 61264476 . T TCC 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.79;ReadPosRankSum=-1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:473,0,297 -chr4 61297762 . T A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-1.585;DP=75;FS=9.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1288,0,851 -chr4 61370300 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr4 61370818 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.469;DP=36;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:392,0,856 -chr4 61370842 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.596;DP=37;FS=16.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:386,0,838 -chr4 61435731 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=1.496;DP=34;FS=8.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:418,0,744 -chr4 61438088 . G T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.129;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:434,0,444 -chr4 61438263 . A G 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:586,0,287 -chr4 61439378 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.298;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:515,0,598 -chr4 61439480 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=-3.159;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:273,0,1238 -chr4 61439651 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.018;DP=37;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:462,0,672 -chr4 61442102 . A G 2038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2067,144,0 -chr4 61442231 . C T 1869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.364;DP=73;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,51:71:99:1898,0,503 -chr4 61442336 . A G 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=-0.017;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,53:75:99:2027,0,547 -chr4 61442591 . C G 2412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2441,175,0 -chr4 61442627 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.876;DP=74;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:297,0,1782 -chr4 61442711 . T TC 292.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:330,23,0 -chr4 61442719 . C T 301.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:23:330,23,0 -chr4 61443706 . A G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 61830460 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=1.412;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:409,0,280 -chr4 61832762 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.307;DP=42;FS=7.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.896;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:820,0,555 -chr4 61840511 . G T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.671;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=24.74;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:820,0,295 -chr4 61854079 . C A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr4 61856380 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-2.266;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=22.30;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:385,0,155 -chr4 61857144 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.931;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:320,0,97 -chr4 61932560 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.32;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:378,0,170 -chr4 61933094 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,167 -chr4 61940149 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=19.18;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:316,0,203 -chr4 61949882 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:273,0,58 -chr4 61951192 . T G 591.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:25:620,0,25 -chr4 62015582 . TGTACGTCTCACACACACACACACACACACACACACACACTACAGACAGTGAGCGTGAGTGTGTGTGTTTCTGTCTGCAG T 1790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.173;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1828,152,0 -chr4 62032762 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=-0.077;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,45:215:99:901,0,6564 -chr4 62035311 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=3.230;DP=73;FS=13.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=4.60;ReadPosRankSum=-2.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:364,0,2107 -chr4 62037500 . T C 2403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.236;DP=89;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,65:89:99:2432,0,573 -chr4 62037551 . C T 3621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.374;DP=138;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=26.24;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,97:138:99:3650,0,1099 -chr4 62038628 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.570;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=24.36;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:491,0,192 -chr4 62043516 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-1.467;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:476,0,250 -chr4 62044117 . T C 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-2.074;DP=36;FS=3.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1000,0,164 -chr4 62044153 . AGTGAGTGTCCTCTTCATCTTCATCTTCATCTTCATCATCAGCTGTGTCCTGCAGAGCTGCTGTTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAG A 1322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=1.355;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,44:51:99:1360,0,2134 -chr4 62044391 . ACAGGTGACGGAGAGTGTGTCCATGTGTGTGAGTGTGTGCGCGTGTTTTCATGTGTGTGTGAGTGTGTGTGCGCATGTATTCATGTGTGTGTGTGTGTGTG A 1012.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=1.583;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=30.39;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:99:1050,105,0 -chr4 62047193 . G A 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=-0.032;DP=44;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=30.95;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:91:1390,0,91 -chr4 62047841 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-2.194;DP=21;FS=12.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=29.51;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:65:648,0,65 -chr4 62048768 . C G 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.903;DP=33;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:941,0,205 -chr4 62048780 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.018;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:281,0,873 -chr4 62049312 . G T 1308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.196;DP=48;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=27.27;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:1337,0,292 -chr4 62050300 . C A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-0.317;DP=54;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=34.75;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,48:54:99:1905,0,307 -chr4 62050405 . A G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.397;DP=88;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:563,0,2225 -chr4 62050507 . G T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.190;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:635,0,870 -chr4 62051716 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-1.237;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:341,0,411 -chr4 62052152 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr4 62052187 . A G 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:500,36,0 -chr4 62052188 . G C 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:500,36,0 -chr4 62052462 . C T 938.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:967,69,0 -chr4 62052849 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=-1.135;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=28.89;ReadPosRankSum=2.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:606,0,114 -chr4 62055877 . C A 1520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.030;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=30.68;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1549,120,0 -chr4 62057416 . A T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr4 62057594 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-4.588;DP=66;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:280,0,2049 -chr4 62057696 . TGAACATCTGGAGAACCACAGACAAAAA T 934.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:80:972,80,0 -chr4 62057800 . A T 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:447,33,0 -chr4 62058504 . A G 1255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1284,96,0 -chr4 62058623 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=2.268;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:568,0,330 -chr4 62058624 . T G 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=2.268;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=26.99;ReadPosRankSum=-2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:568,0,330 -chr4 62059754 . G A 10956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-1.242;DP=362;FS=5.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,284:362:99:10985,0,1478 -chr4 62060103 . T G 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.444;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=18.58;ReadPosRankSum=5.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1812,0,3159 -chr4 62060104 . G T 1791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=-2.771;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=18.10;ReadPosRankSum=4.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1820,0,3159 -chr4 62060703 . C T 6889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=-0.350;DP=277;FS=12.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,204:277:99:6918,0,1645 -chr4 62060810 . G A 5759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-1.107;DP=236;FS=9.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=24.41;ReadPosRankSum=4.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,160:236:99:5788,0,1939 -chr4 62060889 . C T 1387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;ClippingRankSum=0.775;DP=159;FS=12.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=8.73;ReadPosRankSum=-3.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,39:159:99:1416,0,4114 -chr4 62060921 . G A 2935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=7.727;DP=193;FS=16.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,86:193:99:2964,0,3168 -chr4 62063598 . C T 2435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.019;DP=110;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,73:110:99:2464,0,1144 -chr4 62065887 . G A 3285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=2.428;DP=73;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,50:73:99:3314,0,423 -chr4 62068833 . G A 3395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.903;DP=130;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=26.12;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,92:130:99:3424,0,942 -chr4 62080135 . G A 4025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.861;DP=126;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.95;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,108:126:99:4054,0,115 -chr4 62080203 . C A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=2.170;DP=123;FS=16.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,23:123:99:335,0,3800 -chr4 62083285 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr4 62083420 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.034;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=20.70;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:670,0,414 -chr4 62085985 . G T 366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:395,30,0 -chr4 62086698 . G T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-4.176;DP=44;FS=3.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=19.02;ReadPosRankSum=3.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:865,0,202 -chr4 62093954 . GT G 2546.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=2.333;DP=106;FS=7.380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=24.03;ReadPosRankSum=-2.411 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,61:63:99:2584,192,0 -chr4 62093957 . C G 2555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=31.74;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:99:2584,192,0 -chr5 82133 . T A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=2.192;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,2:19:99:391,0,228 -chr5 177666 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.016;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:390,0,365 -chr5 245644 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.757;DP=30;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:354,0,691 -chr5 250623 . GAGGTATGTGCCCGCTGCGACTCCTGTCTTTGGCTGATTGTGTCTGTAATTTAATCGAGCGTTCTGTGTTCGTGTCTGCTTTGTTGTGATTTTTCCGTC G 573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=4.023;DP=30;FS=18.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=19.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:611,0,6334 -chr5 250865 . T C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=-0.274;DP=163;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:565,0,4752 -chr5 250939 . G T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=-0.840;DP=160;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,36:160:99:688,0,4685 -chr5 278301 . T C 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.813;ClippingRankSum=-0.698;DP=196;FS=0.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,42:196:99:787,0,5395 -chr5 279784 . TGTGAGTATCAGCAGAACACACTGAGCATTGATTATTGATTATTGATCAGGAGTGACCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCAG T 10104.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-3.180;DP=275;FS=4.984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=30.45;ReadPosRankSum=1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,216:223:99:10142,671,0 -chr5 279880 . G A 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.045;DP=268;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,58:268:99:1101,0,8959 -chr5 282935 . AACACACACACACACACACAC A 200.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:54:364,54,0 -chr5 284271 . ACTCT A 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-1.083;DP=18;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:499,0,151 -chr5 298566 . G C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-1.047;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:281,0,971 -chr5 307970 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.543;DP=56;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:269,0,1585 -chr5 336190 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr5 472631 . GT G 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=-0.417;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:798,0,1637 -chr5 513731 . A T 3168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.606;DP=173;FS=5.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=18.32;ReadPosRankSum=2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:3197,0,3111 -chr5 544125 . G T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.932;DP=74;FS=12.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=6.71;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:525,0,1907 -chr5 601901 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.976;DP=61;FS=2.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:356,0,1693 -chr5 610693 . A G 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.850;DP=41;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:672,0,691 -chr5 632096 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.342;DP=35;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:400,0,791 -chr5 633891 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-1.288;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:272,0,426 -chr5 675330 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.509;ClippingRankSum=-0.931;DP=213;FS=8.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,38:210:99:541,0,6109 -chr5 823983 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=25.13;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,125 -chr5 826166 . C T 3749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3778,256,0 -chr5 826171 . G T 3360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.742;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=30.46;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:3389,244,0 -chr5 861029 . TAGGTCAGTGTGGCTCTGTGGTGTCTGCAGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGATGGGATCTGCTGTGTATGGC T 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=24.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:336,0,1244 -chr5 1225049 . C T 1644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.909;DP=225;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,68:225:99:1673,0,5853 -chr5 1253491 . TA T,TAA 205.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,4:10:99:503,151,117,231,0,200 -chr5 1253662 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-0.097;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=13.04;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:550,0,813 -chr5 1284038 . CT C 2630.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=1.055;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=25.30;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,88:92:99:2668,265,0 -chr5 1357811 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.81;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:302,0,133 -chr5 1357847 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=24.58;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:397,0,131 -chr5 1400739 . C A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr5 1401519 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.034;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:345,0,93 -chr5 1401593 . C T 342.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=31.09;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:370,0,12 -chr5 1410306 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.041;DP=20;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:521,0,146 -chr5 1410336 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.754;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,186 -chr5 1424538 . T C 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-4.147;DP=83;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=16.48;ReadPosRankSum=-2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1396,0,1434 -chr5 1429170 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=2.437;DP=38;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=15.07;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:601,0,742 -chr5 1436828 . T C 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=1.296;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=32.39;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:75:1162,0,75 -chr5 1436879 . G A 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.072;DP=68;FS=5.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=29.72;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,56:68:99:2049,0,151 -chr5 1485720 . C G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-1.227;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=29.78;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:68:475,0,68 -chr5 1547571 . A AT 884.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:922,87,0 -chr5 1548877 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr5 1552128 . G A 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 -chr5 1557705 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr5 1567020 . T A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.354;DP=92;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:800,0,2277 -chr5 1567031 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.046;DP=92;FS=5.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,30:91:99:770,0,2251 -chr5 1770887 . GCTGCAAACATGAGGCAGATCCATCATCTTTCTGTCTGAACAGTGACATGCTGAACAGTGTGTGCGCGTGTGTGTTGTAC G 3089.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=2.384;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=26.98;ReadPosRankSum=-2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3127,236,0 -chr5 1971668 . G A 1112.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.829;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:21:1141,0,21 -chr5 2098860 . G A 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:433,33,0 -chr5 2102043 . G GA 272.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:310,30,0 -chr5 2107165 . T TAC 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:405,0,192 -chr5 2156460 . A C 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:76:1046,76,0 -chr5 2156494 . TGA T 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.330;DP=30;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:650,0,301 -chr5 2156605 . C CT 832.91 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-1.647;DP=90;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,55:87:99:1060,0,951 -chr5 2156700 . G T 3434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3463,250,0 -chr5 2157010 . CT C 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.650;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.050;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:60:395,0,60 -chr5 2176764 . G T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr5 2176766 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr5 2190818 . G A 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 -chr5 2194804 . C G 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 -chr5 2194960 . C G 945.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:974,69,0 -chr5 2243460 . C A 372.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=31.02;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:400,0,10 -chr5 2243518 . A G 390.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:417,0,4 -chr5 2260723 . C T 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.959;DP=26;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=32.45;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:46:872,0,46 -chr5 2260776 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-1.102;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:369,0,240 -chr5 2261380 . C A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.420;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:509,0,261 -chr5 2262625 . ATG A 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.159;DP=37;FS=7.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=13.97;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:63:554,0,63 -chr5 2370057 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.752;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:548,0,127 -chr5 2432071 . A G 299.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:328,0,17 -chr5 2524016 . G T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-1.029;DP=52;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:378,0,1568 -chr5 2564923 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=1.218;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,683 -chr5 2581522 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-0.013;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:263,0,1932 -chr5 2707459 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.742;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:481,0,229 -chr5 3069855 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr5 3171268 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:352,0,345 -chr5 3560850 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-1.133;DP=51;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:583,0,1070 -chr5 3562889 . GT G 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.546;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:63:303,0,63 -chr5 3590450 . C T 1899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.448;DP=297;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=6.40;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,84:297:99:1928,0,7697 -chr5 3626534 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=3.440;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:276,0,681 -chr5 3626554 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=3.112;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=9.84;ReadPosRankSum=-2.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:294,0,683 -chr5 3673804 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.065;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:397,0,115 -chr5 3931937 . C T 3656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-1.975;DP=308;FS=8.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,109:308:99:3685,0,6800 -chr5 3931970 . G A 4300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.067;DP=360;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,130:360:99:4329,0,10096 -chr5 3944793 . G A 3599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.365;DP=262;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,112:262:99:3628,0,6625 -chr5 3944895 . A G 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=-3.634;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,36:152:99:765,0,4447 -chr5 3954573 . CGG C 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=1.501;DP=20;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:495,0,1436 -chr5 3954576 . TATGAAAGCGCACACACTCTCTTCACTCCCTCTGTTTTTGGGGAAGCAGTTTCACAGGTGGTTTTGTCTGTGCAG T 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=1.859;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=19.04;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:399,0,1547 -chr5 3959961 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,103 -chr5 4017182 . C T 302.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=30.23;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9:330,0,9 -chr5 4032093 . G T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=1.085;DP=96;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:441,0,2714 -chr5 4058974 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.024;DP=124;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,29:124:99:577,0,3657 -chr5 4130708 . A T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=2.037;DP=18;FS=9.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=31.43;ReadPosRankSum=-1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:36:594,0,36 -chr5 4130790 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.047;DP=71;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:857,0,3141 -chr5 4130796 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=-1.086;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:488,0,3825 -chr5 4130824 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-0.955;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:295,0,1433 -chr5 4131120 . T A 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=4.379;DP=48;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=27.93;ReadPosRankSum=-4.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,37:45:99:1369,0,135 -chr5 4131130 . G A 2316.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2345,160,0 -chr5 4131220 . G C 5010.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-2.312;DP=201;FS=1.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,127:140:58:5039,58,0 -chr5 4131292 . T G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr5 4131706 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-3.267;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:551,0,2138 -chr5 4131707 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-3.267;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:585,0,1076 -chr5 4131745 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.226;DP=48;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=15.52;ReadPosRankSum=2.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:773,0,804 -chr5 4131758 . G A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.522;DP=49;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:803,0,778 -chr5 4261411 . T TA 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.216;DP=148;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,81:138:99:1605,0,1212 -chr5 4301271 . T C 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.591;DP=192;FS=9.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,41:191:99:899,0,10738 -chr5 4301274 . C A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.316;DP=197;FS=12.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,43:196:99:891,0,10738 -chr5 4351504 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.009;DP=68;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:272,0,2767 -chr5 4351505 . C A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-1.349;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:397,0,2471 -chr5 4351611 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.874;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:303,0,884 -chr5 4446449 . C A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.139;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.726;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,38:203:99:504,0,10631 -chr5 4447446 . C T 3911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.415;DP=309;FS=26.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,112:309:99:3940,0,7431 -chr5 4456586 . G T 2860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-3.868;DP=169;FS=7.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:2889,0,2898 -chr5 4743370 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=1.092;DP=46;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:549,0,988 -chr5 4743511 . T A 1380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-1.435;DP=72;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.079;QD=19.18;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,39:72:99:1409,0,2364 -chr5 4743514 . C G 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.753;DP=73;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:1374,0,2365 -chr5 4743661 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.417;DP=68;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:275,0,2104 -chr5 4743676 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.536;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:358,0,2273 -chr5 4754103 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.415;DP=90;FS=8.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1106,0,1946 -chr5 4754136 . C T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.761;DP=105;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:1567,0,1987 -chr5 4765400 . G A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr5 4765569 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr5 4765958 . C T 2278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2307,163,0 -chr5 4767856 . AC A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:267,0,918 -chr5 4769054 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,174 -chr5 4772981 . ATT A,ATTT 380.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.863;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,11,6:19:99:496,113,257,379,0,488 -chr5 4883494 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:421,0,85 -chr5 4893973 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=28.83;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:403,0,50 -chr5 5025879 . G T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-0.554;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:567,0,401 -chr5 5151591 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,147 -chr5 5572952 . AT A 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.467;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:58:337,0,58 -chr5 5576376 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,208 -chr5 5676756 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.494;DP=80;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:292,0,3270 -chr5 5685994 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr5 5699374 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr5 5699415 . G A 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:320,24,0 -chr5 6292649 . GT G 907.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:70:945,70,0 -chr5 6512503 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-0.025;DP=120;FS=8.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.391;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,20:120:99:249,0,3996 -chr5 6811798 . CA C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.272;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:239,0,560 -chr5 6811810 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:440,0,346 -chr5 6831388 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=-1.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,443 -chr5 6930663 . G A 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.440;DP=61;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1040,0,1037 -chr5 6937454 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.796;DP=18;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:458,0,202 -chr5 6945567 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.966;DP=50;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:546,0,1142 -chr5 6961647 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-1.506;DP=29;FS=6.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:359,0,598 -chr5 6961666 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-1.914;DP=30;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:338,0,750 -chr5 6962470 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=1.452;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:280,0,516 -chr5 6962692 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,233 -chr5 6963739 . A T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.087;DP=55;FS=4.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:906,0,909 -chr5 6964350 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:263,0,62 -chr5 7013688 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-1.594;DP=44;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:270,0,1156 -chr5 7025790 . T A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr5 7030951 . C T 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.243;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1286,0,1303 -chr5 7031655 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.021;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:375,0,863 -chr5 7031897 . T A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.521;DP=44;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:687,0,843 -chr5 7032040 . A T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.292;DP=29;FS=8.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:411,0,1303 -chr5 7032043 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.706;DP=28;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:411,0,1296 -chr5 7033149 . G A 2894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-1.445;DP=149;FS=5.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:2923,0,2470 -chr5 7033156 . G A 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=-0.324;DP=156;FS=2.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,38:156:99:791,0,7384 -chr5 7033260 . G T 2365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.117;DP=166;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=14.25;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,68:166:99:2394,0,3146 -chr5 7033296 . T G 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-3.341;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,38:126:99:948,0,3348 -chr5 7049666 . C G 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=-0.821;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:712,0,1294 -chr5 7148833 . C A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=-0.270;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:508,0,2849 -chr5 7150320 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.234;DP=93;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:274,0,2951 -chr5 7182787 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-2.176;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:269,0,485 -chr5 7183834 . CT C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=14.17;ReadPosRankSum=-2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:264,0,138 -chr5 7241060 . T A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr5 7851141 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.043;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:442,0,885 -chr5 7875302 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=2.416;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=20.25;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:332,0,206 -chr5 7889436 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:324,0,548 -chr5 7889523 . C A 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr5 7889798 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.307;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:253,0,457 -chr5 7890029 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:253,0,344 -chr5 7890398 . T A 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 -chr5 7891611 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:314,0,875 -chr5 8066685 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=2.281;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.08;ReadPosRankSum=-2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:282,0,446 -chr5 8139246 . A G 7239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:7268,530,0 -chr5 8139284 . G A 4087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.322;DP=152;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,115:152:99:4116,0,783 -chr5 8178227 . C T 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 -chr5 8304411 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.831;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:329,0,6787 -chr5 8304414 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.248;DP=103;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,17:103:99:364,0,6786 -chr5 8311366 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.890;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=2.96;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:244,0,2266 -chr5 8311444 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.356;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:537,0,2445 -chr5 8340850 . T G 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr5 8340851 . G C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr5 8345282 . A T 235.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:19:264,19,0 -chr5 8351747 . G A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr5 8671127 . AC A 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.849;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:64:323,0,64 -chr5 8671553 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr5 8671650 . GA G 239.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:275,3,0 -chr5 8672621 . G C 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr5 8672807 . A G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.112;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.052;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:489,0,230 -chr5 8672939 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.068;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:301,0,241 -chr5 9038253 . CT C 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=-0.868;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:8:356,0,8 -chr5 9129034 . G A 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=1.133;DP=41;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1150,0,279 -chr5 9129061 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.198;DP=59;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:773,0,2891 -chr5 9129064 . C G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.182;DP=62;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:773,0,2884 -chr5 9137985 . C T 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=-0.941;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.205;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:1307,0,1529 -chr5 9138013 . C G 4664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4693,340,0 -chr5 9334361 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=1.016;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:387,0,396 -chr5 9350019 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:339,0,260 -chr5 9364306 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.232;DP=96;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:403,0,2704 -chr5 9390224 . A G 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.686;DP=139;FS=2.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.19;ReadPosRankSum=3.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,33:139:99:749,0,4010 -chr5 9415636 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=2.362;DP=98;FS=5.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=2.92;ReadPosRankSum=3.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:314,0,2939 -chr5 9416984 . ACAGGTAACACAAACAACCACAATAACACACAACGGCATAATGCACTGGATGATGTCCTAATTCTCCTTTGTGTTGATTTC A 3867.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=2.399;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=28.20;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,95:97:99:3905,317,0 -chr5 9442940 . G T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.975;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:352,0,565 -chr5 9539032 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.221;DP=47;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:258,0,1389 -chr5 9556850 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:252,0,96 -chr5 9815763 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=1.465;DP=20;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.44;ReadPosRankSum=2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:78:597,0,78 -chr5 9815820 . G A 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-2.719;DP=41;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:743,0,606 -chr5 9845507 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,377 -chr5 9845510 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,377 -chr5 9918242 . T TTG 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.176;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:986,0,748 -chr5 9918815 . G GC 410.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:448,29,0 -chr5 9995562 . AC A 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.953;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:310,0,813 -chr5 10011702 . A G 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.065;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:999,0,1718 -chr5 10011764 . C T 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=-1.122;DP=78;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:901,0,1546 -chr5 10014462 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.047;DP=88;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:331,0,2292 -chr5 10018493 . C T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.289;DP=81;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1335,0,1397 -chr5 10029980 . G T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.296;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1357,0,1123 -chr5 10031198 . G A 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.529;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,32:63:99:1096,0,1115 -chr5 10050386 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.132;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:348,0,2349 -chr5 10050440 . T C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-1.202;DP=72;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:939,0,1692 -chr5 10052612 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=3.753;DP=69;FS=10.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:563,0,4129 -chr5 10052615 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=4.076;DP=73;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:563,0,4129 -chr5 10090497 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-0.705;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:274,0,2167 -chr5 10101120 . T C 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr5 10114027 . T C 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 -chr5 10229537 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr5 10425691 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-0.333;DP=25;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=26.59;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:693,0,181 -chr5 10434529 . A G 2273.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2302,165,0 -chr5 10434536 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.665;DP=55;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1007,0,911 -chr5 10434674 . A G 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.201;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,37:62:99:1213,0,832 -chr5 10607128 . C G 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.403;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:795,0,666 -chr5 10607278 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.041;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:715,0,512 -chr5 10607349 . C T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.047;DP=51;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:903,0,824 -chr5 10607469 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.158;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=26.93;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:486,0,302 -chr5 10607478 . G T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.065;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:486,0,293 -chr5 10953316 . C CT 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=3.538;DP=42;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:641,0,1403 -chr5 10961626 . A G 280.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.20;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:309,0,19 -chr5 11404827 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.396;DP=20;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:386,0,48 -chr5 12379353 . A T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.460;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:442,0,555 -chr5 12449408 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.215;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=12.53;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:617,0,979 -chr5 12450070 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=-0.478;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:498,0,566 -chr5 12628873 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.071;DP=43;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:463,0,761 -chr5 12629082 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.054;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:711,0,896 -chr5 12926390 . GA G 307.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=1.240;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=18.11;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:15:345,15,0 -chr5 13218866 . G A 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.721;DP=78;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:1257,0,1443 -chr5 13451600 . T C 822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:851,63,0 -chr5 13717881 . A C 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr5 13732838 . C T 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=1.554;DP=153;FS=2.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=8.90;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,51:153:99:1390,0,3799 -chr5 13769766 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=1.732;DP=24;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:506,0,312 -chr5 13820797 . G A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=2.450;DP=35;FS=5.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=22.79;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:826,0,402 -chr5 13820870 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.255;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:322,0,579 -chr5 13823101 . G T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-1.155;DP=40;FS=6.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:646,0,727 -chr5 13828864 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,141 -chr5 13829569 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.540;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,135 -chr5 13830440 . T A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.187;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=24.42;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:541,0,188 -chr5 13874587 . T C 1337.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1366,99,0 -chr5 13874637 . G T 2143.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2172,160,0 -chr5 13926570 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.686;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:550,0,508 -chr5 13926851 . C A 1094.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:78:1123,78,0 -chr5 13926864 . G C 1094.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1123,78,0 -chr5 14067457 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=-0.704;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:538,0,1828 -chr5 14067480 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.909;DP=93;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:336,0,4366 -chr5 14177643 . G A 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.086;DP=118;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:2036,0,2109 -chr5 14182235 . C T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=-0.117;DP=38;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.956;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:701,0,703 -chr5 14235910 . CTT C,CT 241.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,8:15:99:466,207,187,209,0,166 -chr5 14237255 . T C 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 -chr5 14239549 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=-0.236;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:347,0,962 -chr5 14240069 . A G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.325;DP=40;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:649,0,724 -chr5 14303605 . CA C 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-1.844;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:599,0,453 -chr5 14305313 . C CT 208.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:246,20,0 -chr5 14305317 . C A 217.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:20:246,20,0 -chr5 14306418 . G A 1869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=1.635;DP=83;FS=2.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=22.53;ReadPosRankSum=-0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,53:83:99:1898,0,1086 -chr5 14306557 . C T 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.058;DP=84;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=17.96;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,46:84:99:1537,0,1438 -chr5 14306653 . T A 1344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.122;DP=75;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:1373,0,1336 -chr5 14315325 . G A 1749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=2.203;DP=94;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1778,0,1471 -chr5 14372047 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.579;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:265,0,398 -chr5 14372612 . TA T 238.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:276,27,0 -chr5 14377327 . AC A 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:292,0,479 -chr5 14396487 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,290 -chr5 14397541 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-0.277;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:429,0,897 -chr5 14416983 . C G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-1.439;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:396,0,511 -chr5 14495553 . T TA 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr5 14511124 . A C 1640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-0.091;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=28.56;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:99:1669,117,0 -chr5 14511332 . C CA 1210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.315;DP=81;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1248,0,875 -chr5 14511561 . C T 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-2.372;DP=115;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:2223,0,1859 -chr5 14517836 . G C 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.277;DP=128;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:2200,0,2119 -chr5 14537769 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.513;DP=36;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:489,0,732 -chr5 14538649 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.637;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:394,0,453 -chr5 14538760 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:281,0,140 -chr5 14615437 . T A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=31.84;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:32:665,0,32 -chr5 14674625 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.035;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:358,0,370 -chr5 14749238 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:356,0,355 -chr5 14749559 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=2.637;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.48;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,146 -chr5 14750815 . G C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:350,0,172 -chr5 14760692 . A T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.091;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:513,0,682 -chr5 14763464 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.798;DP=66;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:548,0,1659 -chr5 14768411 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:338,0,99 -chr5 14849640 . C CT 1045.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.776;DP=91;FS=4.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,58:64:99:1328,110,0 -chr5 14849749 . G A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.145;DP=51;FS=7.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:974,0,854 -chr5 14858343 . TCC T 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.567;DP=54;FS=10.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:599,0,1022 -chr5 14890351 . A G 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.175;DP=55;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1055,0,805 -chr5 14890454 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-1.214;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=23.09;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:998,0,364 -chr5 14907207 . A AT 842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:86:880,86,0 -chr5 14910917 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,367 -chr5 14989275 . C A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.708;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:520,0,942 -chr5 14997762 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=1.847;DP=21;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=19.80;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:444,0,258 -chr5 15043378 . A G 1676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1705,120,0 -chr5 15043424 . G C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=22.37;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:498,0,232 -chr5 15271361 . G C 906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:935,66,0 -chr5 15271409 . A G 2174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2203,160,0 -chr5 15280100 . C T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=1.050;DP=65;FS=11.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,23:65:99:775,0,1502 -chr5 15280168 . A G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=1.019;DP=60;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:840,0,1199 -chr5 15761167 . G A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr5 15764348 . A G 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:355,24,0 -chr5 15764356 . T C 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr5 16010601 . G GTT 1684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=-1.196;DP=235;FS=4.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,73:186:99:2136,0,3659 -chr5 16011848 . A AT 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-0.774;DP=182;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1545,0,1645 -chr5 16013413 . TA T 2506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.836;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=27.55;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2544,243,0 -chr5 16097567 . GT G 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.377;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:430,0,817 -chr5 16099345 . G A 2930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.214;DP=178;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,84:178:99:2959,0,3012 -chr5 16099612 . G A 2283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.715;DP=150;FS=13.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:2312,0,2664 -chr5 16100791 . C T 2041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.695;DP=149;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,60:149:99:2070,0,3009 -chr5 16102043 . GCCTGTTGTTGTT G 202.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:240,27,0 -chr5 16102057 . T C 211.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:240,27,0 -chr5 16182226 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-0.454;DP=111;FS=9.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,37:111:99:1052,0,2763 -chr5 16232555 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:39:249,0,39 -chr5 16232556 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:39:249,0,39 -chr5 16232865 . T TA 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.574;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:322,0,337 -chr5 16233136 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=-2.059;DP=57;FS=2.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=14.15;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:835,0,1062 -chr5 16351894 . T C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-2.599;DP=36;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:592,0,532 -chr5 17158613 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=2.446;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:379,0,555 -chr5 17269075 . C T 2341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.136;DP=143;FS=8.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:2370,0,2517 -chr5 17582943 . C T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.248;DP=38;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:699,0,638 -chr5 17584448 . C A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.604;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:419,0,317 -chr5 17585962 . C A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=1.056;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:654,0,1024 -chr5 17588145 . TC T 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.454;DP=24;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:294,0,195 -chr5 17612558 . A G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 -chr5 17613732 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=-3.620;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=19.93;ReadPosRankSum=3.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:387,0,310 -chr5 17638396 . G A 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 -chr5 17696086 . A T 257.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:286,0,22 -chr5 17720367 . TCTGTGGAAAACAGCAAAATTATATTTTCATAAATTATCTAAACATTATTATTATTTTATTTCATCATTTATAATTACATTTGTCTTCTGAACTACAAAGATCCTTGTACATCAAATAGAAAAAAAGCAAAACAATGGTCAAAGTAC T 19689.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.685;DP=423;FS=2.218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,420:423:99:19727,1747,0 -chr5 17720562 . C CT 1042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-2.187;DP=435;FS=25.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:314,94:408:99:1080,0,8828 -chr5 17927651 . G GT 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.414;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:384,0,255 -chr5 18040208 . A C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.804;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,511 -chr5 18047031 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.985;DP=22;FS=6.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:392,0,393 -chr5 18047051 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.006;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:428,0,493 -chr5 18112016 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,385 -chr5 18112018 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,385 -chr5 18140944 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-1.092;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,178 -chr5 19530007 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.668;DP=127;FS=2.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,33:127:99:767,0,3574 -chr5 19530451 . A G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-1.425;DP=228;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,46:224:99:602,0,9216 -chr5 19531057 . A G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.035;DP=172;FS=4.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,35:172:99:612,0,5313 -chr5 19531514 . G GT 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-0.379;DP=50;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:454,0,554 -chr5 19580106 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.758;DP=160;FS=4.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,40:158:99:905,0,4569 -chr5 19591461 . G C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-3.815;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:621,0,1677 -chr5 19592003 . G GT 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.474;DP=74;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:479,0,1264 -chr5 19592016 . A T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.453;DP=66;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:540,0,2219 -chr5 19593691 . T A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.901;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:488,0,646 -chr5 19596507 . G GA 458.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-0.055;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:30:604,30,0 -chr5 19597269 . AG A 208.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:246,18,0 -chr5 19598319 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.870;DP=26;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.451;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:348,0,552 -chr5 19599314 . AT A 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-1.280;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:87:393,0,87 -chr5 19651238 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.682;DP=117;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:731,0,5461 -chr5 19652186 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=-1.341;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:460,0,2893 -chr5 19671196 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:328,0,255 -chr5 19673482 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=2.047;DP=45;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:353,0,1167 -chr5 19688154 . TCTGGGGCAAAAATTGAAATGATAAGTTTCAAATATGTAAACACTGTAATAAATATGAGTTATTTAAAAAGAATAATAAGGTATTTATGTATTTCTCTGTTGTTTTTTTAAAAATGTACTGTGATATTAACAGATTTTGTGTAC T 1723.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.644;DP=39;FS=3.869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1761,134,0 -chr5 19827276 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:406,0,227 -chr5 20607781 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:94:235,0,94 -chr5 20611344 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-1.755;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:377,0,336 -chr5 20719186 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=1.812;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:347,0,1224 -chr5 20719204 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=2.351;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=15.94;ReadPosRankSum=-2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:347,0,1224 -chr5 20726323 . T C 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:36:699,0,36 -chr5 20726342 . A G 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=36.51;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:36:699,0,36 -chr5 20726356 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=29.40;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:381,0,375 -chr5 20726469 . T C 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=33.30;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:661,0,425 -chr5 20727444 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.261;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:370,0,745 -chr5 20731953 . GCCTAGAAGCCCACATTTTGATCACTCACAGACACAGAATTGT G 1860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.578;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1898,165,0 -chr5 20732000 . ATGTCCCATTACATAAATAATATACTTATAAATTCTACATTAAACTTACTTTG A 1817.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1855,163,0 -chr5 20791426 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-2.004;DP=84;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:306,0,2570 -chr5 20805768 . A C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-1.080;DP=39;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:340,0,1021 -chr5 20821973 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.266;DP=61;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:280,0,1760 -chr5 21079760 . C CTA 276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -chr5 21110609 . C A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-1.120;DP=44;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:315,0,1240 -chr5 21143207 . AAGGTGGTTCAGCAGCATGTATTTTCTTCACATTTTAACACATTATTCTAATTTGATGGTCTGACAGTAAGAAATCCTGTATTTGC A 1735.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-0.885;DP=48;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,41:44:72:1773,0,72 -chr5 21150166 . AAGGTTAGATTTAATAACAAAACAACTGCAATTGCTCATGAGCTGTAGCGGTCAGAGGTTTTTTTCTACTAC A 2225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.074;DP=52;FS=7.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=30.95;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2263,203,0 -chr5 21169109 . A AT 1223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-1.517;DP=60;FS=1.677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.169;QD=20.40;ReadPosRankSum=2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,45:51:95:1947,95,0 -chr5 21220475 . AT A 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:551,55,0 -chr5 21221412 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=6.043;DP=58;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=17.88;ReadPosRankSum=-2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1065,0,874 -chr5 21221889 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=1.064;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:335,0,384 -chr5 21234776 . GGGTTCGTATCACATGTAATCGGAGATAGTGATTTACAGGTTAAAATGCATAGAGCCTACTTGAATTTCTTGTCTTTCTTTTCTGAA G 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=1.309;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=31.43;ReadPosRankSum=-2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:823,0,506 -chr5 21275666 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.541;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:253,0,822 -chr5 21577887 . TA T 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.155;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:540,0,163 -chr5 21583958 . GCTGGTGCACAGAACACAGAATGCAAAATAGATCATTATGAATAAACATTTTAGAAGATATTAAACAAGAGTGATGATTCTTATTGGAATAC G 1980.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.167;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,40:43:99:2018,0,258 -chr5 21672437 . A C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.510;DP=52;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:263,0,1506 -chr5 21685781 . AT A 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.604;DP=27;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:77:443,0,77 -chr5 21736524 . CT C 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.852;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:398,0,370 -chr5 21899839 . ACTGTAAAAGGAATGAGAAAGTAAGATAATGGATCAGAGATCTTAAACAGTGGAACAGATGTTTTTATACTGAC A 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=2.706;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=31.69;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:893,0,126 -chr5 21972135 . G GT 1011.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-1.237;DP=134;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,47:129:99:1049,0,2135 -chr5 22184850 . G A 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.614;DP=261;FS=6.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,62:261:99:1231,0,7510 -chr5 22200737 . T C 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.334;DP=184;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,50:184:99:1136,0,5077 -chr5 22201435 . T TA 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.931;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:502,0,918 -chr5 22227480 . G GA 673.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=-0.108;DP=144;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,42:134:99:711,0,2426 -chr5 22263294 . C CA 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.532;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:296,0,512 -chr5 22263475 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-2.645;DP=51;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:230,0,1792 -chr5 22645522 . GT G 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.840;DP=145;FS=9.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.938;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,32:131:99:416,0,2513 -chr5 22646443 . G GA 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=-1.340;DP=120;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,30:104:99:494,0,1704 -chr5 22724300 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.257;DP=43;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:287,0,1090 -chr5 22949525 . TGGTAAGATGATGCCTGCTGCACACCTCGGTCAAACCCCCAATATAACCCCTTTGACCCATATGTCATTTCTGAACATTGGATACAGTATGGTTGTTTAATCTTTTATAAGAGGATCTGTTTGTGTGCGCA T 4728.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=1.115;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,111:114:99:4766,460,0 -chr5 23657534 . TCCTGCATACCCAGAAACACAAAAACTACATGAAAAAAAATCCATTCAACAGCTGGCGGAGAAGGAAAAACACACAGTGTTCA T 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=24.27;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:377,0,1868 -chr5 23667568 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:343,0,97 -chr5 23795604 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.986;DP=46;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:731,0,885 -chr5 23795717 . C G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.300;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:459,0,626 -chr5 23795978 . GT G 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.102;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:434,0,465 -chr5 23796233 . G T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.851;DP=30;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:521,0,524 -chr5 23796293 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.271;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:404,0,578 -chr5 23796578 . A G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=2.079;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:523,0,638 -chr5 23796671 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=2.957;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:327,0,1289 -chr5 23796680 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=2.746;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:282,0,1371 -chr5 23816220 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=2.208;DP=18;FS=12.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:333,0,328 -chr5 23816244 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:235,0,447 -chr5 23816268 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:329,0,357 -chr5 23828523 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.853;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:291,0,484 -chr5 23853078 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=1.470;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,539 -chr5 23880654 . T C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.241;DP=42;FS=2.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:813,0,645 -chr5 23893936 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.723;DP=45;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:397,0,1201 -chr5 23897951 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.53;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,107 -chr5 23955888 . G GT 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=1.006;DP=206;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,47:176:99:566,0,3352 -chr5 23955930 . AC A 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=4.835;DP=169;FS=18.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=1.77;ReadPosRankSum=-2.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,30:165:99:336,0,8585 -chr5 23955933 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=5.642;DP=171;FS=31.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=1.81;ReadPosRankSum=-2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,36:169:99:338,0,8585 -chr5 23956432 . T TG 2209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=-1.554;DP=157;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.198;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,67:156:99:2247,0,2883 -chr5 23956888 . GT G 1196.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.432;DP=165;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1234,0,1766 -chr5 23957021 . T A 5026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-1.657;DP=274;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,130:274:99:5055,0,10843 -chr5 23957171 . A G 4566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=1.115;DP=286;FS=6.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,126:286:99:4595,0,5521 -chr5 24248198 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,100 -chr5 24248927 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=1.792;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,254 -chr5 24258676 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:326,0,165 -chr5 24267394 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-1.408;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:371,0,158 -chr5 24298311 . A T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=-1.261;DP=37;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=17.02;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:658,0,604 -chr5 24335547 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.966;DP=212;FS=10.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,46:212:99:923,0,6401 -chr5 24348321 . A G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.038;DP=149;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,36:147:99:802,0,4298 -chr5 24356881 . T A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.047;DP=142;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,27:142:99:439,0,4251 -chr5 24377108 . T A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=-0.959;DP=285;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,44:284:99:496,0,9571 -chr5 24377128 . C G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.079;DP=339;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,57:338:99:728,0,11205 -chr5 24377348 . T A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.744;DP=224;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,41:224:99:554,0,7710 -chr5 24377555 . A G 1322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=2.156;DP=446;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:358,88:446:99:1351,0,12694 -chr5 24380431 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.169;DP=359;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,58:359:99:624,0,11643 -chr5 24382218 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.365;DP=363;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:312,51:363:99:351,0,11849 -chr5 24632650 . CCAGGTTCTTCCAGACTGCTCTGTTTACATCCTCCATCTCTGCTTAATAACACACGAGTCACTGAAGTATGTGTGTTTTGTTTGTTTCTG C 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=1.751;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:680,0,2648 -chr5 25031528 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.286;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=15.46;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:322,0,339 -chr5 25066156 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.753;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:395,0,568 -chr5 25182590 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.789;DP=50;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:362,0,1375 -chr5 25188236 . T G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.990;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:370,0,926 -chr5 25283277 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.415;DP=77;FS=9.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:401,0,2270 -chr5 25284818 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.520;DP=112;FS=7.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:356,0,3513 -chr5 25284860 . G A 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-3.854;DP=108;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,29:108:99:689,0,3119 -chr5 25303738 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=-1.789;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,26:118:99:573,0,3567 -chr5 25305032 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.959;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=15.41;ReadPosRankSum=2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:660,0,816 -chr5 25311099 . C G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.964;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:289,0,900 -chr5 25321744 . T C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=-0.698;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:951,0,252 -chr5 25331152 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-1.172;DP=46;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:389,0,1113 -chr5 25331185 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=-1.561;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:341,0,1334 -chr5 25338876 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-1.577;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:821,0,869 -chr5 25346774 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.749;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:289,0,2224 -chr5 25358810 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=2.000;DP=125;FS=5.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:703,0,3514 -chr5 25363912 . G C 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=-0.432;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,41:142:99:966,0,3951 -chr5 25458341 . A G 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.095;DP=81;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:754,0,2036 -chr5 25458611 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=-0.676;DP=72;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:382,0,2125 -chr5 25461676 . A T 1765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.479;DP=86;FS=6.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,51:77:99:1794,0,886 -chr5 25461679 . T TCCCA 1765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.229;DP=83;FS=6.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=21.27;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,46:72:99:1803,0,886 -chr5 25464000 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=1.189;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=3.36;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:233,0,1813 -chr5 25557530 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,305 -chr5 25563138 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.029;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:370,0,475 -chr5 25571656 . T C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=23.61;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:406,0,160 -chr5 25571713 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-2.236;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:497,0,177 -chr5 25572178 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:383,0,313 -chr5 25575213 . T C 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.496;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=21.38;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:755,0,515 -chr5 25592746 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.403;DP=54;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:643,0,1876 -chr5 25592749 . G T 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.363;DP=56;FS=5.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=23.76;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,37:56:99:1359,0,609 -chr5 25593102 . T G 2323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-0.216;DP=71;FS=3.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,62:71:58:2352,0,58 -chr5 25595318 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.059;DP=36;FS=3.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:536,0,1339 -chr5 25626627 . A C 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.881;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=21.59;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,31:49:99:1086,0,617 -chr5 25627050 . G T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.388;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:558,0,805 -chr5 25627410 . AAC A 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=-0.795;DP=42;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:424,0,650 -chr5 25627500 . GT G 2244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.413;DP=70;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=32.07;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,54:70:99:2282,0,140 -chr5 25627591 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=1.531;DP=48;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:393,0,1359 -chr5 25627670 . C T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=1.852;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:785,0,666 -chr5 25630323 . A T 1879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-2.050;DP=60;FS=5.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=31.33;ReadPosRankSum=-1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,51:60:73:1908,0,73 -chr5 25630368 . T C 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.885;DP=30;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=33.06;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:48:1020,0,48 -chr5 25630486 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.317;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:254,0,371 -chr5 25630793 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=30.07;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:359,0,54 -chr5 25630815 . T G 364.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=33.12;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:392,0,9 -chr5 25631365 . AT A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.387;DP=26;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:243,0,252 -chr5 25631518 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=1.077;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:283,0,954 -chr5 25632595 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:320,0,574 -chr5 25634148 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-0.702;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.038;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:618,0,191 -chr5 25634413 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.124;DP=58;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:313,0,2100 -chr5 25634587 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=-0.041;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:686,0,1739 -chr5 25634596 . C T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=1.483;DP=41;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:686,0,1737 -chr5 25634820 . G T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-1.083;DP=61;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.717;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:242,0,1846 -chr5 25634882 . G A 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-1.814;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:937,0,3443 -chr5 25634889 . T G 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-2.149;DP=74;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:937,0,3354 -chr5 25637974 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.053;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:275,0,1565 -chr5 25640622 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.030;DP=40;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.363;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:273,0,1116 -chr5 25643191 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.505;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,15:81:99:243,0,2614 -chr5 25663002 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-1.110;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=19.40;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:552,0,374 -chr5 25668478 . C G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.083;DP=32;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.18;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:578,0,480 -chr5 25668483 . A AC 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=1.451;DP=29;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=10.37;ReadPosRankSum=-2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:338,0,276 -chr5 25668603 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.997;DP=44;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:723,0,727 -chr5 25668655 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.479;DP=37;FS=3.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=13.29;ReadPosRankSum=2.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:520,0,706 -chr5 25677897 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-1.860;DP=109;FS=4.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=3.70;ReadPosRankSum=3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:432,0,3325 -chr5 25679229 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-1.170;DP=51;FS=7.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:800,0,1046 -chr5 25679314 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=2.088;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:311,0,2143 -chr5 25679592 . G T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=3.145;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=17.68;ReadPosRankSum=-3.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:824,0,1520 -chr5 25679596 . T G 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=2.758;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=18.60;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:828,0,1595 -chr5 25679815 . T A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.034;DP=45;FS=18.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:643,0,1850 -chr5 25681621 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.116;DP=98;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.184;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:487,0,2868 -chr5 25684619 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=1.761;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:310,0,3081 -chr5 25700482 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.111;DP=263;FS=10.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.94;ReadPosRankSum=-2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,57:263:99:1065,0,11067 -chr5 25700487 . A G 1426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-4.697;DP=264;FS=38.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=5.40;ReadPosRankSum=3.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,66:264:99:1455,0,10030 -chr5 25701169 . G A 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-2.576;DP=275;FS=13.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,82:274:99:2036,0,12885 -chr5 25709367 . T C 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.471;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,73:341:99:1296,0,9995 -chr5 25725333 . C G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.246;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:397,0,817 -chr5 25728821 . G GA 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.351;DP=285;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,50:245:99:636,0,5353 -chr5 25729425 . A T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr5 25730234 . A G 3587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.560;DP=199;FS=4.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.798;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,108:199:99:3616,0,3335 -chr5 25730376 . A AG 4438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-1.766;DP=181;FS=2.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.901;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,127:176:99:4476,0,1151 -chr5 25730476 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=4.393;DP=99;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=4.21;ReadPosRankSum=-3.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:445,0,3214 -chr5 25730607 . G A 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.372;DP=54;FS=2.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:960,0,917 -chr5 25730663 . GT G 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=1.917;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=36.59;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:1057,0,400 -chr5 25732001 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.358;DP=24;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:518,0,279 -chr5 25732052 . C T 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-1.855;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1006,0,984 -chr5 25732106 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.116;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.045;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:246,0,399 -chr5 25732763 . G A 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr5 25742834 . G A 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.258;DP=52;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=27.84;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:1476,0,351 -chr5 25743165 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=1.083;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:663,0,1169 -chr5 25743256 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=2.123;DP=61;FS=4.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:386,0,1865 -chr5 25756505 . A G 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.357;DP=219;FS=7.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,50:219:99:1004,0,6473 -chr5 25758381 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.646;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:371,0,657 -chr5 25759338 . G C 3101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-1.273;DP=189;FS=9.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,94:189:99:3130,0,3322 -chr5 25759356 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-1.464;DP=186;FS=4.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,34:186:99:451,0,5632 -chr5 25760198 . A G 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.501;DP=197;FS=6.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,43:197:99:885,0,5984 -chr5 25760938 . TTA T 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.667;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:363,0,197 -chr5 25766156 . AT A 1795.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.336;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,79:119:99:1833,0,1788 -chr5 25766203 . A G 3974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-2.134;DP=97;FS=4.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,70:95:99:4003,0,361 -chr5 25798057 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=2.446;DP=118;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:1565,0,2421 -chr5 25798185 . G T 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.970;DP=75;FS=7.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:1338,0,1352 -chr5 25798223 . G T 1388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.638;DP=88;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1417,0,1629 -chr5 25798997 . G GA 2064.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.057;DP=165;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,95:161:99:2170,0,1593 -chr5 25800921 . TGA T 1350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.026;DP=123;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1388,0,1767 -chr5 25802066 . C T 2420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.140;DP=137;FS=6.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:2449,0,2410 -chr5 25802651 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.494;DP=142;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,27:142:99:447,0,4677 -chr5 25802772 . A G 2606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=-3.932;DP=222;FS=2.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=11.74;ReadPosRankSum=3.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,78:222:99:2635,0,4941 -chr5 25803073 . G A 3227.04 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-0.139;DP=292;FS=11.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,98:292:99:3255,0,6818 -chr5 25803097 . G A 3490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-2.390;DP=298;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,105:298:99:3519,0,6751 -chr5 25803396 . C T 4904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.785;DP=292;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,140:292:99:4933,0,5121 -chr5 25804221 . GT G 2153.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.646;DP=151;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,91:145:99:2191,0,1265 -chr5 25804296 . G T 6257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-0.915;DP=216;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,156:216:99:6286,0,1420 -chr5 25804304 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.040;DP=225;FS=4.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,32:224:99:250,0,10105 -chr5 25804475 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.549;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:494,0,476 -chr5 25807668 . A T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.565;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:720,0,2478 -chr5 25807676 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.954;DP=55;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:720,0,2429 -chr5 25808821 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.55;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:61:310,0,61 -chr5 25817366 . C T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.344;DP=79;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,26:78:99:752,0,2025 -chr5 25819428 . A G 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.465;DP=90;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1583,0,1480 -chr5 25822342 . T G 2134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-2.161;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=15.03;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:2163,0,3893 -chr5 25822370 . A C 1824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.781;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1853,0,3493 -chr5 25822445 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=1.744;DP=66;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1022,0,1247 -chr5 25848715 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-1.085;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:357,0,455 -chr5 25850617 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=18.04;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:389,0,266 -chr5 25850630 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:360,0,281 -chr5 25852867 . A T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.207;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:581,0,579 -chr5 25852928 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.311;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:390,0,577 -chr5 25853075 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-3.204;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=24.20;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:367,0,391 -chr5 25853455 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.785;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:294,0,1069 -chr5 25853458 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:294,0,1071 -chr5 25854106 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:229,0,359 -chr5 25854248 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=-1.418;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:301,0,529 -chr5 25854253 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:466,0,190 -chr5 25868294 . CT C 2803.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.513;DP=121;FS=1.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,71:116:99:2841,0,3086 -chr5 25868396 . CT C 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=-1.405;DP=110;FS=6.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=7.77;ReadPosRankSum=3.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:892,0,2200 -chr5 25868577 . G A 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-1.848;DP=359;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,90:359:99:2079,0,10437 -chr5 25868732 . T G 1606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-2.189;DP=225;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,64:225:99:1635,0,6452 -chr5 25868791 . C T 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-1.559;DP=231;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,66:231:99:1633,0,6250 -chr5 25869143 . G A 5791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.811;DP=225;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=25.74;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,158:224:99:5820,0,1570 -chr5 25877452 . A T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.158;ClippingRankSum=0.642;DP=282;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,43:282:99:441,0,10673 -chr5 25877716 . G C 5480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-1.160;DP=295;FS=1.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,149:295:99:5509,0,8332 -chr5 25877719 . T G 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.635;DP=305;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.423;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,69:305:99:1352,0,15811 -chr5 25877886 . C T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.769;DP=258;FS=8.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,65:258:99:1505,0,7588 -chr5 25877937 . T C 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-1.422;DP=271;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,65:271:99:1413,0,8024 -chr5 25878250 . T A 4222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-1.437;DP=257;FS=31.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,120:257:99:4251,0,6947 -chr5 25878259 . C T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.718;DP=275;FS=16.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,67:275:99:1369,0,12813 -chr5 25878478 . TCCTGCAATGAGCACAGACCATCCGTGTGTTTAGATGTAAATAATGAAGTCGCATTGAAAATGACAGTTTAGCTAAAGTCAAACACAAA T 1594.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.127;DP=401;FS=1.903;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,373:377:99:1632,614,0 -chr5 25879372 . A T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.934;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=27.77;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:82:417,0,82 -chr5 25881911 . A G 5891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=-0.131;DP=397;FS=32.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,168:397:99:5920,0,7808 -chr5 25886895 . A T 5083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-1.527;DP=349;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,153:349:99:5112,0,6806 -chr5 25889177 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=1.054;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:283,0,331 -chr5 25889483 . CT C 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.182;DP=46;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:399,0,421 -chr5 25890294 . G C 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.643;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:756,0,1212 -chr5 25909527 . G A 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.027;DP=52;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=34.63;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,45:52:52:1829,0,52 -chr5 25910187 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.667;DP=66;FS=6.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:277,0,2032 -chr5 25913808 . T A 1500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-1.307;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=28.32;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1529,0,275 -chr5 25914446 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr5 25914482 . C A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr5 25918355 . C T 9658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=1.296;DP=346;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,257:345:99:9687,0,1966 -chr5 25928524 . AC A 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.507;ClippingRankSum=-0.824;DP=201;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,94:186:99:2299,0,2829 -chr5 25956938 . T C 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 -chr5 25957228 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,258 -chr5 25999426 . GAA G 1012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.059;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:1331,0,756 -chr5 25999569 . G A 2091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.656;DP=113;FS=1.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:2120,0,1880 -chr5 26000014 . C A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.498;DP=200;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,55:200:99:1287,0,5524 -chr5 26000245 . G A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.474;DP=185;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,32:185:99:679,0,12285 -chr5 26000254 . G A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=1.341;DP=193;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=3.23;ReadPosRankSum=-2.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,36:193:99:651,0,12285 -chr5 26000659 . G C 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.536;DP=174;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,47:172:99:1078,0,4865 -chr5 26000696 . G A 2968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-2.979;DP=183;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,85:183:99:2997,0,3201 -chr5 26000716 . A G 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.502;DP=182;FS=9.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,47:182:99:1079,0,5258 -chr5 26001082 . G A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.405;DP=170;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:517,0,5297 -chr5 26002159 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=-0.416;DP=138;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:99:677,0,4013 -chr5 26002434 . G T 2287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.077;DP=132;FS=5.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:2316,0,2410 -chr5 26179692 . G GA 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.238;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:700,0,604 -chr5 26180683 . G A 4184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.941;DP=239;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,124:239:99:4213,0,4392 -chr5 26180883 . G GA 4073.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.115;DP=268;FS=0.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,167:249:99:4115,0,1875 -chr5 26181141 . A G 7070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.984;ClippingRankSum=-1.994;DP=274;FS=10.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,189:274:99:7099,0,2057 -chr5 26181254 . GCTGTGGAATAGAGAAAACAGACAGTCATCCGAGTTTGCAATACTTCATAAGAATGGCACTTTACTACACAAGTCACGGCTAAAAGGGTAC G 12342.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-1.001;DP=301;FS=2.862;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=31.89;ReadPosRankSum=2.716 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,292:301:99:12380,849,0 -chr5 26181393 . G A 10118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=0.173;DP=402;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,278:400:99:10147,0,3116 -chr5 26183377 . TCTGCAATATTGTTTTGAAGTTACTTAGGCATCTCATAAGCATGATTGTAATTGTGTACAATGAAGTTATGCATTATTTTTTTAGATCTTATAAATGTATGATTTGCTTAAGGGCACTTAC T 18091.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=3.406;DP=404;FS=1.435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=30.90;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,396:403:99:18129,1497,0 -chr5 26190857 . C T 1833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.102;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.430;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1862,0,1931 -chr5 26191094 . C T 2238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=1.795;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:2267,0,1739 -chr5 26191141 . A T 2095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-2.280;DP=120;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:2124,0,2018 -chr5 26193892 . A C 1562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.124;DP=87;FS=2.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,49:87:99:1591,0,1364 -chr5 26200473 . T G 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=1.145;DP=70;FS=6.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,41:70:99:1432,0,1055 -chr5 26200736 . C CT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.870;DP=29;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:258,0,552 -chr5 26201427 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-1.473;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:341,0,220 -chr5 26204428 . TCTGGGTTGACAGAAATGAAGAAATATATTTAGATTTTAGTTGACCTGCACCCTAGTTATCAGAGATTTCCGGGATCTTAC T 1212.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=1.284;DP=33;FS=2.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=34.48;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,30:33:10:1249,0,10 -chr5 26211050 . A G 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.374;DP=34;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=28.02;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:981,0,151 -chr5 26212868 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.415;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:848,0,817 -chr5 26213230 . G C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.875;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:454,0,505 -chr5 26236395 . C A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.331;DP=50;FS=4.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:564,0,1261 -chr5 26244686 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr5 26257632 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.486;DP=42;FS=7.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:250,0,1154 -chr5 26265156 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:261,0,513 -chr5 26425769 . T TA 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=1.811;DP=36;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:349,0,524 -chr5 26425843 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.247;DP=66;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:301,0,1941 -chr5 26426343 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.218;DP=81;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:749,0,3799 -chr5 26426429 . A C 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=1.293;DP=71;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=17.05;ReadPosRankSum=2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1239,0,2924 -chr5 26426432 . C A 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=1.581;DP=72;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=16.82;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1239,0,2959 -chr5 26426496 . A T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-3.112;DP=72;FS=12.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.288;QD=8.71;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:655,0,1832 -chr5 26426546 . GT G 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.999;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:99:332,0,5749 -chr5 26426790 . T C 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.066;DP=98;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,30:97:99:638,0,2985 -chr5 26426911 . G A 3158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.420;DP=80;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,51:80:99:3187,0,692 -chr5 26426948 . C T 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.444;DP=123;FS=5.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1847,0,3353 -chr5 26447179 . A G 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=1.088;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,32:129:99:740,0,3850 -chr5 26462985 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=-1.060;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,29:127:99:491,0,3752 -chr5 26464314 . A G 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 -chr5 26486132 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-1.810;DP=30;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:308,0,1749 -chr5 26486609 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,382 -chr5 26488845 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.791;DP=28;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:631,0,324 -chr5 26537939 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.480;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:260,0,839 -chr5 26537972 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-0.206;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:338,0,656 -chr5 26542524 . AT A 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.891;DP=62;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:823,0,338 -chr5 26542678 . TA T 1082.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=1.974;DP=257;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,74:240:99:1120,0,4010 -chr5 26543315 . ACTAAAAAAAAAAAAAAAAATTAATTTAGATTTATGCATATTTACCAGCCAAAACAATTCATCTAGTACGATGGATCTCTCAC A 15098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=1.738;DP=384;FS=7.422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=23.63;ReadPosRankSum=1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,375:384:99:15136,1100,0 -chr5 26544483 . CA C 3505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.139;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=36.77;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,42:63:42:3543,0,42 -chr5 26544520 . G T 2001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-2.087;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.318;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,58:86:99:2030,0,1510 -chr5 26544710 . G GT 973.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.444;DP=85;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,49:77:99:1011,0,541 -chr5 26545246 . C T 3616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=-1.266;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,38:170:99:3645,0,3953 -chr5 26545314 . TA T 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.089;DP=131;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=5.20;ReadPosRankSum=4.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:719,0,6192 -chr5 26545991 . G A 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=2.002;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,36:153:99:793,0,5595 -chr5 26546515 . T G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.128;DP=159;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,26:159:99:327,0,5214 -chr5 26546583 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.861;DP=147;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,28:147:99:465,0,4583 -chr5 26555877 . C G 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.735;DP=61;FS=7.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:782,0,1330 -chr5 26556275 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.508;DP=67;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=6.55;ReadPosRankSum=2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:467,0,1828 -chr5 26556305 . T TA 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-1.918;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:679,0,743 -chr5 26556858 . A AT 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-0.909;DP=128;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,42:119:99:664,0,2016 -chr5 26565122 . A T 301.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:10:329,0,10 -chr5 26565130 . G A 301.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:329,0,10 -chr5 26570832 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-0.411;DP=72;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:333,0,2044 -chr5 26578096 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.772;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:415,0,1827 -chr5 26584148 . C A 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:496,36,0 -chr5 26681382 . C A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-1.063;DP=59;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:408,0,2743 -chr5 26681391 . T A 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.240;DP=62;FS=6.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:1134,0,1013 -chr5 26681510 . T C 1911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-2.262;DP=69;FS=3.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.152;QD=27.71;ReadPosRankSum=2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,51:69:99:1940,0,413 -chr5 26715052 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:337,0,295 -chr5 26715194 . T C 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.717;DP=39;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:923,0,490 -chr5 26715343 . TAA T 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.872;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:452,0,707 -chr5 26715466 . TCCTGTTTAAAAGTTAAAAAACCATAAGTATTGTGATTAACCATAATACAATTTACAAACACACACACACATATTTCCATTTATCTTA T 2256.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=2.885;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=32.71;ReadPosRankSum=-2.918 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,58:61:99:2294,190,0 -chr5 26717533 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.015;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:388,0,886 -chr5 26719269 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-0.689;DP=28;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:727,0,243 -chr5 26724408 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-1.905;DP=43;FS=2.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:388,0,1095 -chr5 26726783 . A T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.110;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=22.10;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:846,0,507 -chr5 26726796 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=1.088;DP=42;FS=10.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:325,0,1074 -chr5 26726957 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.857;DP=53;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=15.39;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:844,0,1064 -chr5 26727076 . ACTGTGGAGATCATCATCAATGTGGGGAAAATACAAAGCACAAGCGCATACAAATGTTTCACAAACACTCAC A 1776.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=1.473;DP=44;FS=3.716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=33.36;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1814,165,0 -chr5 26727203 . G A 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.686;DP=45;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=24.93;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1150,0,417 -chr5 26731957 . T C 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.055;DP=68;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,33:68:99:1178,0,1105 -chr5 26733708 . C G 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-1.373;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1006,0,1238 -chr5 26737401 . T A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=-0.921;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:471,0,574 -chr5 26744606 . A G 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -chr5 26746476 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.699;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:322,0,2382 -chr5 26746727 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-1.970;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:479,0,1355 -chr5 27000626 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:499,0,279 -chr5 27000651 . A G 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.574;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:679,0,345 -chr5 27002581 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,900 -chr5 27005131 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.407;DP=56;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:350,0,1642 -chr5 27006863 . C T 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.289;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.365;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1167,0,1266 -chr5 27006951 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.356;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.724;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:410,0,496 -chr5 27007007 . A T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-1.246;DP=32;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:557,0,606 -chr5 27007165 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-1.546;DP=49;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:251,0,1488 -chr5 27007479 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.921;DP=101;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,30:100:99:705,0,2596 -chr5 27008210 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.913;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:366,0,2789 -chr5 27008853 . A G 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=2.019;DP=99;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=11.76;ReadPosRankSum=-2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:1192,0,2380 -chr5 27009444 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.643;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:354,0,349 -chr5 27009504 . T G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:401,0,673 -chr5 27009538 . G C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.543;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:401,0,254 -chr5 27010055 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.647;DP=58;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:706,0,1995 -chr5 27010179 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.820;DP=47;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:347,0,1309 -chr5 27010711 . T TC 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=-0.209;DP=56;FS=6.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:297,0,1179 -chr5 27010766 . C CA 1610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.555;DP=66;FS=6.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=24.41;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:1648,0,162 -chr5 27010819 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-2.055;DP=62;FS=3.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=7.67;ReadPosRankSum=-2.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:504,0,1687 -chr5 27010864 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.036;DP=63;FS=3.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:845,0,2675 -chr5 27011152 . A T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.441;DP=94;FS=1.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,26:94:99:649,0,3577 -chr5 27020025 . C T 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.582;DP=141;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1556,0,2869 -chr5 27225049 . C T 13008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=2.008;DP=631;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=20.62;ReadPosRankSum=3.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,381:631:99:13037,0,8940 -chr5 27226805 . G T 9849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=1.068;DP=478;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,285:477:99:9878,0,6782 -chr5 27252016 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.623;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:231,0,598 -chr5 27257777 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.287;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:397,0,476 -chr5 27263864 . G A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-1.119;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:796,0,791 -chr5 27338262 . TC T 2265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-2.855;DP=140;FS=0.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=16.18;ReadPosRankSum=3.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,88:129:99:2303,0,1863 -chr5 27371171 . C T 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:247,0,22 -chr5 27371884 . T C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=32.45;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:42:515,0,42 -chr5 27372897 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.610;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=21.07;ReadPosRankSum=2.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:534,0,315 -chr5 27378533 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.541;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:406,0,2409 -chr5 27397932 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.508;DP=38;FS=8.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:529,0,822 -chr5 27399441 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.054;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=21.49;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,202 -chr5 27404845 . A T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.168;DP=52;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1002,0,581 -chr5 27410310 . G A 1420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.950;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:1449,0,1530 -chr5 27414350 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-0.157;DP=45;FS=11.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:416,0,2051 -chr5 27415019 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.749;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:537,0,2024 -chr5 27424870 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.582;DP=74;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:444,0,3496 -chr5 27434964 . A T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.684;DP=79;FS=9.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:411,0,2327 -chr5 27435063 . T A 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.429;DP=75;FS=14.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:1319,0,1296 -chr5 27435075 . C T 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-0.043;DP=69;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:911,0,1511 -chr5 27435093 . C T 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.518;DP=64;FS=8.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,34:64:99:1144,0,1092 -chr5 27440474 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.918;DP=76;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.87;ReadPosRankSum=1.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:550,0,2175 -chr5 27453190 . G A 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.699;DP=123;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1828,0,2174 -chr5 27455276 . C A 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-2.143;DP=63;FS=3.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:920,0,1240 -chr5 27455306 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.033;DP=65;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:1056,0,1147 -chr5 27456675 . AAGGTACAGTACTTTTACAACATGGAAAAATTCATTTAAATGTCAGCTTTACCTAGTCTGATTCCCATAACCATCTCTTTAC A 3376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=1.130;DP=86;FS=2.194;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=33.86;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,83:86:99:3414,273,0 -chr5 27457100 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.939;DP=80;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:376,0,2535 -chr5 27457186 . C CA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.844;DP=48;FS=1.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:431,0,594 -chr5 27457197 . T A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=1.312;DP=46;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:299,0,1796 -chr5 27458005 . A AT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-2.469;DP=33;FS=11.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=8.54;ReadPosRankSum=2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:319,0,413 -chr5 27708081 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,146 -chr5 27711001 . C T 255.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:284,0,19 -chr5 27720094 . C G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:471,0,500 -chr5 27722285 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.893;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:488,0,637 -chr5 27722311 . A T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-1.971;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=13.27;ReadPosRankSum=2.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:466,0,697 -chr5 27724459 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:272,0,186 -chr5 27725545 . G C 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-1.815;DP=38;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=26.02;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:1017,0,359 -chr5 27725628 . T C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.888;DP=29;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:860,0,129 -chr5 27725725 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=3.123;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:331,0,198 -chr5 27726820 . A C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.177;DP=50;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:414,0,1318 -chr5 27748111 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.959;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:404,0,318 -chr5 27779537 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:91:334,0,91 -chr5 27785041 . C T 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.448;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1468,0,1541 -chr5 27807269 . T A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-1.331;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:499,0,494 -chr5 27839381 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-0.363;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:340,0,850 -chr5 27839411 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.091;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,706 -chr5 27844223 . A T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.049;DP=64;FS=7.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:896,0,1249 -chr5 27845228 . T G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.795;ClippingRankSum=0.151;DP=86;FS=2.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:432,0,2340 -chr5 27847285 . C T 2440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.525;DP=96;FS=15.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=25.42;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,65:96:99:2469,0,896 -chr5 27847357 . A G 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-4.492;DP=52;FS=8.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:788,0,1048 -chr5 27847650 . G T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:283,0,228 -chr5 27851213 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.813;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:273,0,885 -chr5 27855642 . T A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-1.693;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:406,0,402 -chr5 27862712 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.799;DP=77;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:366,0,2330 -chr5 27862770 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.993;DP=68;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:272,0,2146 -chr5 27877339 . A T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.775;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:642,0,757 -chr5 27907732 . A AT 434.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:46:493,46,0 -chr5 27908645 . G A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=1.414;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:857,0,1223 -chr5 27908666 . G T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.720;DP=50;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:404,0,1379 -chr5 27909260 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.154;DP=37;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:289,0,1091 -chr5 27909537 . CA C 1779.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.220;DP=104;FS=9.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,69:99:99:1817,0,1344 -chr5 27909547 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-1.436;DP=113;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,24:113:99:465,0,5359 -chr5 27909851 . GA G 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:673,67,0 -chr5 27919810 . T A 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.750;DP=46;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=17.30;ReadPosRankSum=-1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:824,0,708 -chr5 27928745 . G A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-2.534;DP=80;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:865,0,1718 -chr5 27933791 . C T 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.312;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,56:191:99:1315,0,5010 -chr5 28000549 . G C 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=2.327;DP=118;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:1511,0,2425 -chr5 28013880 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.843;DP=144;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,32:144:99:634,0,4371 -chr5 28013970 . C T 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=-2.216;DP=138;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,34:138:99:712,0,3967 -chr5 28110625 . CCT C 2368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.096;DP=90;FS=5.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,69:85:99:2406,0,216 -chr5 28110739 . C T 1710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-1.717;DP=84;FS=6.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,53:82:99:1739,0,1209 -chr5 28331953 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=2.985;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:385,0,546 -chr5 28341969 . A G 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.008;DP=59;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1288,0,765 -chr5 28366186 . GT G 1128.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1166,112,0 -chr5 28366416 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.849;DP=17;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.763;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:78:283,0,78 -chr5 28366515 . T G 1009.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.138;DP=30;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.728;QD=33.67;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:5:1037,0,5 -chr5 28380808 . T C 1214.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1243,87,0 -chr5 28395838 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:99:230,0,99 -chr5 28397158 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.063;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:76:521,0,76 -chr5 28398333 . A T 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr5 28398950 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:291,0,66 -chr5 28399443 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:404,0,290 -chr5 28399482 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.515;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=23.32;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:448,0,211 -chr5 28399586 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=23.73;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:92:313,0,92 -chr5 28400209 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.856;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:555,0,159 -chr5 28400887 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=2.430;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,414 -chr5 28401466 . C A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-1.237;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:485,0,479 -chr5 28428275 . A T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr5 28434834 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-1.472;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:240,0,1340 -chr5 28434835 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-0.528;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:240,0,1340 -chr5 28438122 . G C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.853;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:489,0,261 -chr5 28443762 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-3.365;DP=69;FS=1.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=3.26;ReadPosRankSum=-2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:253,0,2058 -chr5 28443783 . A C 1514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=3.348;DP=78;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=19.42;ReadPosRankSum=-3.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:1543,0,4366 -chr5 28449798 . C T 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.325;DP=236;FS=1.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.692;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,53:235:99:1107,0,7072 -chr5 28450264 . AAT A 2097.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=-1.474;DP=100;FS=2.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=20.98;ReadPosRankSum=3.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:99:99:2135,0,1657 -chr5 28451671 . A C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.345;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:939,0,203 -chr5 28453770 . C T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=1.466;DP=52;FS=7.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=28.67;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,40:52:99:1519,0,288 -chr5 28461368 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.533;DP=57;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:691,0,2581 -chr5 28461372 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.726;DP=55;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:691,0,2570 -chr5 28461493 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.897;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:549,0,2887 -chr5 28465551 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.006;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=5.34;ReadPosRankSum=3.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:429,0,2232 -chr5 28469714 . T A 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 -chr5 28471022 . T A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr5 28473007 . GA G 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.501;DP=22;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:275,0,174 -chr5 28473517 . TA T 527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:565,55,0 -chr5 28500821 . C T 1334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=1.576;DP=43;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.388;QD=31.04;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1363,0,138 -chr5 28502602 . G A 1884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-0.949;DP=66;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,51:66:99:1913,0,282 -chr5 28502635 . C T 1596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.069;DP=57;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=28.01;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1625,0,203 -chr5 28503684 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.181;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:253,0,2479 -chr5 28503958 . C A 1912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.641;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=28.55;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,50:67:99:1941,0,418 -chr5 28509753 . A T 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.423;DP=20;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=32.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:683,0,28 -chr5 28509806 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.855;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.67;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,159 -chr5 28510128 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=-0.514;DP=38;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:279,0,1132 -chr5 28510221 . T C 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=1.682;DP=34;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:65:1048,0,65 -chr5 28529319 . C T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr5 28529594 . CAT C 1313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.834;DP=45;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=29.19;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,33:45:99:1351,0,343 -chr5 28530387 . T A 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.859;DP=65;FS=5.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,38:65:99:1295,0,971 -chr5 28565866 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.270;DP=49;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:830,0,919 -chr5 28571639 . G GGA 221.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:259,17,0 -chr5 29042858 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:270,0,60 -chr5 29044041 . C T 259.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:288,0,16 -chr5 29044189 . T G 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr5 29054415 . GCAGGTAAGTCACACATTTTTAAAACTTTCTTTAGATTATTCCAGACATTTCTTCTAACTACACCTTTTTTTGCGTCACAAAATGTTTTTCAACTC G 2068.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.289;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:2106,161,0 -chr5 29054699 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.275;DP=46;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:354,0,1194 -chr5 29131521 . G A 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.185;DP=60;FS=5.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1060,0,1002 -chr5 29183091 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.516;DP=52;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:970,0,819 -chr5 29183570 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=1.399;DP=34;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:345,0,902 -chr5 29184265 . G A 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=1.048;DP=82;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.69;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,44:81:99:1479,0,1359 -chr5 29184403 . A G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.281;DP=36;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:631,0,675 -chr5 29185166 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.315;DP=49;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:706,0,2034 -chr5 29185290 . G T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.026;DP=55;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.847;QD=13.63;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:778,0,1147 -chr5 29388693 . C G 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr5 29511251 . GA G 356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:394,40,0 -chr5 29511524 . C G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-1.570;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:576,0,167 -chr5 29512098 . T C 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=1.795;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,39:61:99:1430,0,1619 -chr5 29512107 . G T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=1.975;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=25.03;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,36:56:99:1430,0,1619 -chr5 29548929 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=1.626;DP=22;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=30.13;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:29:691,0,29 -chr5 29567410 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.215;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:844,0,281 -chr5 29567601 . T A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:510,0,164 -chr5 29567940 . A C 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.481;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:578,0,316 -chr5 29569298 . G GT 251.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.058;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:540,0,100 -chr5 29596027 . G A 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.999;DP=46;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=29.84;ReadPosRankSum=2.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1401,0,206 -chr5 29639106 . G A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-1.692;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=28.47;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:94:797,0,94 -chr5 29642842 . T C 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.180;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:1486,0,532 -chr5 29642858 . C T 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.585;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=25.07;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1332,0,456 -chr5 29642932 . G GT 1075.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1197,119,0 -chr5 29643176 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.250;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:564,0,267 -chr5 29687197 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=30.89;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:57:368,0,57 -chr5 29687281 . GGCAGGTGAGCTGCTGCTTTACACGTGTTCCAATTTATTAATAAGAAGGAAAAATCACATGCTAACTAATTCTGTTTACTGAAAATTTC G 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=1.552;DP=16;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=28.48;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:493,0,601 -chr5 29777215 . T G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=19.70;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:304,0,219 -chr5 29777860 . T TA 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-3.244;DP=33;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=8.02;ReadPosRankSum=2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:302,0,411 -chr5 29778497 . A G 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.718;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=26.77;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:858,0,611 -chr5 29923517 . T C 2399.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-1.153;DP=65;FS=8.860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,58:65:19:2428,19,0 -chr5 29923632 . C T 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.960;DP=57;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,46:57:99:1792,0,225 -chr5 29923807 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.182;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:475,0,130 -chr5 29936213 . G GT 782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:820,69,0 -chr5 29936229 . C T 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:805,54,0 -chr5 29936453 . A G 577.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:606,42,0 -chr5 29936494 . A T 738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:767,54,0 -chr5 29936614 . C T 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1369,99,0 -chr5 29936755 . A C 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr5 29937325 . ACT A 406.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:444,31,0 -chr5 29937952 . G T 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:749,51,0 -chr5 29938077 . G T 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:645,45,0 -chr5 29938103 . G A 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 -chr5 29939086 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr5 29951151 . AT A 1758.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=1.548;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=21.71;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,65:81:99:1796,0,139 -chr5 29951313 . G A 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=3.314;DP=56;FS=13.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1402,0,477 -chr5 29951634 . T C 1737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1766,126,0 -chr5 29951755 . T A 2332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.383;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=33.81;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,60:69:59:2361,0,59 -chr5 30000157 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr5 30000158 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr5 30021964 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:261,0,97 -chr5 30078063 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=25.18;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:406,0,123 -chr5 30134825 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:301,0,136 -chr5 30134877 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,141 -chr5 30135058 . C G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.454;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:394,0,280 -chr5 30135575 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.196;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=26.72;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:429,0,131 -chr5 30137167 . T G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.283;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:419,0,138 -chr5 30137358 . G T 239.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:268,0,22 -chr5 30149819 . C T 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 -chr5 30150726 . G C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr5 30163943 . A T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr5 30167413 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,136 -chr5 30199269 . C CT 3182.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-1.866;DP=295;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,189:256:99:4198,0,784 -chr5 30209110 . ACTGACAAACAACAAAACACACAACTGAGACTCACTGCTTCCTTCTGTTCCGCAAGAATAATGACTGACAGTCTGAGTTAC A 14351.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.714;DP=339;FS=3.232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=34.56;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,320:339:99:14389,1127,0 -chr5 30214070 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-2.231;DP=42;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=19.45;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:845,0,466 -chr5 30215361 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.866;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:550,0,156 -chr5 30215703 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:473,0,691 -chr5 30216051 . T A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.071;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:80:551,0,80 -chr5 30217407 . C T 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.833;DP=45;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1304,0,190 -chr5 30219278 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.260;DP=26;FS=5.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:67:694,0,67 -chr5 30220723 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:47:391,0,47 -chr5 30220847 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.417;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=26.94;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:540,0,165 -chr5 30221067 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=-0.637;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:684,0,490 -chr5 30221167 . A G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.555;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:904,0,791 -chr5 30221172 . A T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.186;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=28.25;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:904,0,791 -chr5 30221288 . A C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.024;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:622,0,670 -chr5 30221321 . A T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-0.042;DP=32;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=27.24;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:900,0,254 -chr5 30221546 . T C 11883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=-2.870;DP=318;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=27.49;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,272:315:99:11912,179,0 -chr5 30221680 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr5 30222003 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,323 -chr5 30222068 . T A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=24.20;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:367,0,133 -chr5 30222521 . G T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,213 -chr5 30222848 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,206 -chr5 30230445 . G C 10720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.202;DP=339;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=31.62;ReadPosRankSum=2.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,280:339:99:10749,0,833 -chr5 30241805 . A T 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=8.398;DP=215;FS=54.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=3.35;ReadPosRankSum=-6.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,41:215:99:749,0,13926 -chr5 30241808 . T A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=8.105;DP=211;FS=46.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.33;ReadPosRankSum=-7.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,37:211:99:731,0,13926 -chr5 30263431 . C T 4474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=6.225;DP=252;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=17.76;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,123:251:99:4503,0,4661 -chr5 30263502 . C T 2705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.413;DP=172;FS=9.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,80:171:99:2734,0,2969 -chr5 30391670 . C A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr5 30393099 . G GA 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-1.896;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:412,0,124 -chr5 30397373 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:76:279,0,76 -chr5 30397478 . G A 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.109;DP=32;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:899,0,203 -chr5 30411974 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=1.714;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=31.93;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:29:571,0,29 -chr5 30421425 . T C 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-1.543;DP=47;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,39:47:99:1612,0,278 -chr5 30421426 . C T 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=-1.065;DP=48;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=33.00;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1612,0,278 -chr5 30508888 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=27.40;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:357,0,84 -chr5 30508899 . A G 323.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.39;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:352,0,16 -chr5 30510230 . G T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.066;DP=19;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=34.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:32:681,0,32 -chr5 30511217 . C T 770.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.685;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:12:798,0,12 -chr5 30554844 . T C 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.064;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=26.62;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:667,0,194 -chr5 30556176 . A G 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=2.959;DP=57;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=34.91;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,35:57:99:2018,0,1335 -chr5 30556190 . G A 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=4.551;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=33.72;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:2018,0,1317 -chr5 30565914 . C T 1480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-0.696;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1509,0,1649 -chr5 30583905 . G A 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.214;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1251,0,183 -chr5 30583959 . A G 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.871;DP=48;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1491,0,122 -chr5 30587184 . C T 1937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-2.711;DP=57;FS=1.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=34.00;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,50:57:44:1966,0,44 -chr5 30607630 . T G 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:457,33,0 -chr5 30607648 . A C 372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 -chr5 30634620 . C T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr5 30768901 . T C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:303,21,0 -chr5 30769132 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:292,21,0 -chr5 30987380 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:80:403,0,80 -chr5 30987468 . C A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.084;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=27.32;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:520,0,327 -chr5 31010283 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-1.667;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=32.11;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:542,0,35 -chr5 31436848 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:305,0,305 -chr5 31437395 . T C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.765;ClippingRankSum=-0.269;DP=40;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:484,0,845 -chr5 31437443 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.127;DP=46;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:615,0,928 -chr5 31728965 . CAGGTAGGAAACGCGCCAGGATCACTCTGTAACGTTACGTGCTGTCACTCGACTTAAAGTTTTCAAGCAGGTTGGTGTGTTAACCTTGTTTAAACACCTTGTTGTT C 8595.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.070;DP=193;FS=6.272;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=34.82;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,191:193:99:8633,753,0 -chr5 31848201 . GA G 1955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.209;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,68:75:93:1993,93,0 -chr5 32065050 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.500;DP=64;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:589,0,1796 -chr5 32065345 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=2.555;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:290,0,1943 -chr5 32065375 . T C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-0.436;DP=48;FS=14.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:884,0,785 -chr5 32147022 . G GT 824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-0.654;DP=172;FS=13.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,49:154:99:862,0,2839 -chr5 32276284 . T G 694.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:723,54,0 -chr5 32568242 . A G 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 -chr5 32568263 . G A 405.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,14:14:26:434,0,26 -chr5 32568967 . A G 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.618;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:1615,0,522 -chr5 32568974 . T C 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.144;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=30.15;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:1615,0,523 -chr5 32569088 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-3.424;DP=165;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:475,0,4005 -chr5 32569180 . C A,G 5008.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.590;DP=210;FS=2.562;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:13,34,109:156:99:5465,4054,4281,1122,0,1039 -chr5 32569267 . G A 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.304;DP=76;FS=4.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.679;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,35:60:99:1193,0,927 -chr5 32904635 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=1.150;DP=37;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:252,0,1926 -chr5 32905418 . T TG 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.783;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:515,0,529 -chr5 32905618 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.924;DP=53;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:474,0,1345 -chr5 33228008 . A C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.123;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:423,0,830 -chr5 33228449 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.320;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:329,0,408 -chr5 33228557 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=2.060;DP=42;FS=7.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:252,0,1226 -chr5 33358885 . A G 1324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1353,96,0 -chr5 33360214 . TA T 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:41:253,0,41 -chr5 33374136 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr5 33451018 . AAGGTGAAAATGCCCTGTTTATGGGCTTGACTAAATCCCATATATTTTTATGATTGTGTTGTTTTGGGGTGGTTAGCCATGTTTACCTTGATTCTGGTC A 1686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=1.891;DP=46;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=32.69;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,42:46:99:1724,0,435 -chr5 33468454 . GCTGCCATTAACAGCGATAGAGAGTCAGACTGAATTTAATTTGCTTACTTCATTGAGAAGGATGAGCTGTTAC G 1477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=2.307;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=28.98;ReadPosRankSum=-2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,40:44:99:1515,0,119 -chr5 33521136 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=4.027;DP=175;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,29:175:99:355,0,5746 -chr5 33533344 . TCCTGCGATCGTCAATGCCAGTCAGAAATGTGAAGCTTAAGACCCTCAACATAATCCTGCTAAGTCTTCACTTA T 10682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=1.668;DP=272;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=33.06;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,267:271:99:10720,871,0 -chr5 33539011 . T A 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=2.059;DP=203;FS=6.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,51:203:99:1143,0,5827 -chr5 33690265 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr5 33690859 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:235,0,453 -chr5 33691081 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr5 33698742 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:244,0,374 -chr5 33717540 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=-0.122;DP=59;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:250,0,1872 -chr5 33819681 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.157;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:319,0,456 -chr5 33846779 . T C 27383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=634;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,633:633:99:27412,1902,0 -chr5 33847145 . C T 17664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.401;DP=436;FS=68.477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=32.08;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,420:436:99:17693,1264,0 -chr5 33847314 . T C 5492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.248;DP=134;FS=2.964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=29.08;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,132:134:99:5521,387,0 -chr5 33853337 . A G 3860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3889,281,0 -chr5 33854003 . TGTGAGCAACAGAAGATGACAAATATACCACCGAGGAATGGTACACTTATAAAATATGAATCTATTAAGTTTCTGTATATGCTTACAAAAG T 15926.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=1.123;DP=371;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=31.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,367:370:99:16696,1274,0 -chr5 33854168 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.106;ClippingRankSum=-0.557;DP=380;FS=99.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=0.64;ReadPosRankSum=3.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,50:377:99:273,0,13145 -chr5 33855101 . A G 8764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=1.006;DP=506;FS=12.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,265:504:99:8793,0,8946 -chr5 33862089 . T C 24149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.710;DP=602;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=28.91;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,599:600:99:24178,1757,0 -chr5 33862400 . C T 10342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-0.995;DP=271;FS=6.433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,268:270:99:10371,777,0 -chr5 33867439 . T C 301.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=30.19;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:330,0,14 -chr5 33870740 . G A 14621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=7.759;DP=392;FS=32.004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,363:392:99:14650,709,0 -chr5 33870752 . A G 11594.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=5.189;DP=347;FS=59.940;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=33.41;ReadPosRankSum=-4.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:36,310:346:99:11623,235,0 -chr5 33887112 . A T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr5 33903699 . C T 7811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=-10.326;DP=453;FS=1.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=17.24;ReadPosRankSum=4.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,233:450:99:7840,0,8094 -chr5 33905839 . TCCTGTGTGTAAAATGGGAAAATATTATGTATGATTTGAAACCAAATTAACAATCACTCTTATATAGAAATTACAAAGAATCCCTA T 18479.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=407;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,407:407:99:18517,1493,0 -chr5 33907311 . A T 2894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=3.352;DP=228;FS=34.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,88:228:99:2923,0,4764 -chr5 33910022 . C T 4937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=1.446;DP=643;FS=0.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:452,188:640:99:4966,0,17944 -chr5 33920343 . A G 17406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=409;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,409:409:99:17435,1234,0 -chr5 33920355 . C A 6457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=-3.616;DP=393;FS=137.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,177:393:99:6486,0,7386 -chr5 33921552 . TCTGTAGAAAGAAAAAATATTATCTGTATCATATCATAAAGACGGTTATTCATCAGGTTTTATTATTTTTTGATTCTTAC T 15905.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.185;DP=397;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=26.96;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,387:390:99:15943,1147,0 -chr5 33923727 . T A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-2.720;DP=369;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,29:367:99:925,0,13347 -chr5 33923738 . A G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.477;ClippingRankSum=5.742;DP=437;FS=42.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=1.94;ReadPosRankSum=-4.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:361,74:435:99:877,0,14425 -chr5 33924504 . T C 731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=13.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=34.85;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:69:760,69,0 -chr5 33924509 . CCTGTTA C 722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=9.031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:69:760,69,0 -chr5 33924683 . A T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:363,0,45 -chr5 33925185 . A T 7549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-3.996;DP=180;FS=20.507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,174:180:99:7578,523,0 -chr5 33937142 . G A 2724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=-3.607;DP=370;FS=28.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,109:370:99:2753,0,10180 -chr5 33937242 . GCCTTTTACATGAACACAAATCTCCATTAGACTCTTTTTTTTTAATACACTTTGAAACTGTTGTTCTGTTGCTCA G 9027.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=2.107;DP=204;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=24.64;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,194:204:99:9065,939,0 -chr5 33937443 . TCTACAACATGGAAGCAACAAGATAAATGTATTGGAAGATGCTTTCAACTATATTAATGACATTGCGCAACAGAAAGCAAAAAACGAAGCCATTATGCTTTTAC T 27500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=1.591;DP=678;FS=2.993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,663:665:99:27538,1956,0 -chr5 33937640 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.052;ClippingRankSum=6.834;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=3.96;ReadPosRankSum=-6.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:511,0,7289 -chr5 33937646 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=3.902;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=5.25;ReadPosRankSum=-3.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,7:92:99:511,0,7289 -chr5 33938882 . C T 2720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-2.860;DP=162;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=16.79;ReadPosRankSum=4.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:2749,0,2849 -chr5 33964572 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-0.453;DP=32;FS=15.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:517,0,580 -chr5 33971988 . G GTTTTTTCTCCTTTCCTTCC 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=2.043;DP=37;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:285,0,730 -chr5 33992074 . A C 6550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.105;DP=331;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,193:331:99:6579,0,4895 -chr5 33992095 . A G 5963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.366;DP=324;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,180:324:99:5992,0,5167 -chr5 33998412 . TA T 866.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.593;DP=28;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=30.95;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:904,0,219 -chr5 33999313 . C G 839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:61:868,61,0 -chr5 33999375 . CT C 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.522;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=20.04;ReadPosRankSum=-2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:57:438,0,57 -chr5 33999397 . T A 982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.144;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=33.90;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:70:1011,70,0 -chr5 34017795 . A AC 540.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-1.931;DP=57;FS=3.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:578,0,792 -chr5 34018407 . G T 1475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.991;DP=55;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1504,0,421 -chr5 34018524 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.804;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:362,0,517 -chr5 34018770 . T C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-2.255;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:1076,0,1074 -chr5 34018834 . A T 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.034;DP=79;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:1464,0,1513 -chr5 34018932 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=1.312;DP=45;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=13.71;ReadPosRankSum=-2.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:645,0,2280 -chr5 34114014 . C G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=1.816;DP=49;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:713,0,2255 -chr5 34116099 . A G 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.316;DP=71;FS=6.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:1319,0,1222 -chr5 34116572 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.165;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,331 -chr5 34117687 . T G 284.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:313,20,0 -chr5 34117944 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.040;DP=78;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:528,0,2285 -chr5 34120722 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=1.639;DP=119;FS=12.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,23:119:99:402,0,3542 -chr5 34409831 . C T 6840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-0.532;DP=354;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,207:352:99:6869,0,4887 -chr5 34410292 . G GTT 922.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=-1.176;DP=219;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,49:218:99:960,0,6385 -chr5 34416071 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-1.036;DP=48;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:309,0,2821 -chr5 34416076 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-1.138;DP=44;FS=3.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:302,0,2821 -chr5 34416293 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=-0.903;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:438,0,722 -chr5 34416336 . A AAT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=1.670;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:282,0,485 -chr5 34419871 . A T 3130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.828;DP=121;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,86:119:99:3159,0,838 -chr5 34424509 . A G 1817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-1.680;DP=78;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=23.30;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,52:78:99:1846,0,860 -chr5 34425471 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=1.052;DP=95;FS=10.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=6.09;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,25:95:99:607,0,2605 -chr5 34434099 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.202;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:315,0,451 -chr5 34436291 . C T 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.120;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=17.35;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1017,0,982 -chr5 34446351 . T C 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=1.276;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:698,0,793 -chr5 34448645 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-2.281;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,366 -chr5 34453221 . TAGGTATGTGGTACAATGGCAGTCATGTAGCCTTTTTTGGCACAGTTTATTGTGCTTTTAGCATTAACATGTAATGTTTTTAATGTTTTTTAA T 591.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.496;DP=14;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:58:629,58,0 -chr5 34476349 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.027;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:392,0,478 -chr5 34480954 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:454,0,347 -chr5 34483046 . C G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:394,0,445 -chr5 34485305 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.947;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:374,0,959 -chr5 34486400 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.577;DP=39;FS=8.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:321,0,1078 -chr5 34500859 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=1.818;DP=49;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:257,0,1325 -chr5 34504775 . T C 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.551;DP=221;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,61:220:99:1473,0,6253 -chr5 34506569 . C T 4448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=-2.453;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,131:237:99:4477,0,3844 -chr5 34508302 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=-0.324;DP=168;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:795,0,4982 -chr5 34508381 . T A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=2.203;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,29:129:99:554,0,7003 -chr5 34550284 . G T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.849;DP=49;FS=9.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=27.73;ReadPosRankSum=2.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1387,0,274 -chr5 34637685 . C T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.924;DP=187;FS=7.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,45:187:99:982,0,5473 -chr5 34637703 . G A 3248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.551;DP=187;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,99:187:99:3277,0,3260 -chr5 34639886 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.199;ClippingRankSum=0.410;DP=46;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:673,0,909 -chr5 34856769 . G T 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.360;DP=42;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=22.26;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:963,0,969 -chr5 34857127 . T TA 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-3.013;DP=34;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=15.20;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:554,0,296 -chr5 34857538 . A T 344.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=31.30;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:372,0,9 -chr5 34887410 . GCTGAAAAAAGGAAAGTTCTGCTCATTTAAAAGTCCACAAAACTGTCATTGGAGTTACTTGCAGAGTTCTGCTTTTAC G 1574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.014;DP=55;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1612,0,3981 -chr5 34895801 . G C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=3.462;DP=42;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:230,0,1887 -chr5 34901308 . G T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.205;DP=53;FS=15.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:967,0,851 -chr5 34909767 . C T 277.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:306,0,13 -chr5 34910786 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.372;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:366,0,280 -chr5 34913375 . C A 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 -chr5 34915723 . GCTGGACAAACAGAATGGAAAATAGCATTTATTATTCTCACTTTAATTACACAATGAAAAGAAAGAAAAATGTAAACACCACCAACAGTAACAACCACAAAGCAGCTCATGACCAAC G 3328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=1.921;DP=97;FS=1.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=34.32;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,88:97:99:3366,0,1531 -chr5 34920346 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=2.371;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:368,0,449 -chr5 34925666 . G A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.831;DP=32;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:602,0,705 -chr5 34934021 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:259,0,501 -chr5 34965212 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.622;DP=78;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=6.39;ReadPosRankSum=2.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:527,0,2173 -chr5 34965551 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.726;ClippingRankSum=-0.524;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:324,0,2505 -chr5 34965782 . C G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:441,0,433 -chr5 34966086 . TA T 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.770;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:362,0,589 -chr5 34966115 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.783;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:685,0,470 -chr5 34967166 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.832;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:648,0,1412 -chr5 34967171 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=-1.268;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:648,0,1441 -chr5 34967331 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-4.155;DP=49;FS=16.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:328,0,2109 -chr5 34967341 . G C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-0.444;DP=47;FS=4.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:658,0,1469 -chr5 34971481 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=1.398;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:366,0,362 -chr5 34971928 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.448;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:254,0,782 -chr5 34972418 . T C 229.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:258,0,22 -chr5 34973356 . C G 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.124;DP=35;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:930,0,325 -chr5 34978590 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.921;DP=39;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:293,0,971 -chr5 35152189 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.477;DP=27;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,606 -chr5 35152971 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=3.354;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=7.68;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:274,0,816 -chr5 35153288 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:388,0,167 -chr5 35153775 . C G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.612;DP=21;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:315,0,610 -chr5 35155137 . G A 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.011;DP=47;FS=6.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:786,0,1309 -chr5 35179680 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.566;DP=76;FS=7.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,43:76:99:1453,0,1119 -chr5 35224529 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-0.391;DP=53;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:442,0,1323 -chr5 35286545 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=36.34;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:54:417,0,54 -chr5 35286548 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:54:417,0,54 -chr5 35291583 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:483,0,250 -chr5 35351369 . T G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.167;DP=31;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:575,0,459 -chr5 36025696 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-1.933;DP=27;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.234;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:540,0,360 -chr5 36034072 . C G 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.549;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:872,0,664 -chr5 36069194 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=-1.211;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:487,0,588 -chr5 36069225 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-1.964;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:603,0,582 -chr5 36084416 . T A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.660;DP=50;FS=11.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=20.86;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1071,0,631 -chr5 36137211 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.478;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:815,0,526 -chr5 36147384 . G A 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-1.343;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:611,0,596 -chr5 36150423 . C A 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.286;DP=55;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=21.27;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1198,0,758 -chr5 36150524 . T C 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.215;DP=35;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:684,0,600 -chr5 36160379 . AG A 788.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:82:826,82,0 -chr5 36160404 . C CG 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=3.293;DP=40;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=6.17;ReadPosRankSum=-1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:284,0,1011 -chr5 36191911 . GAA G 1813.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,70:75:48:2301,48,0 -chr5 36192022 . A T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-1.015;DP=81;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,46:81:99:1567,0,1285 -chr5 36193216 . G GT 566.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.139;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:57:704,57,0 -chr5 36196429 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:54:266,0,54 -chr5 36226939 . G A 4746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.305;DP=243;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,141:242:99:4775,0,3499 -chr5 36231973 . C T 3663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.692;DP=188;FS=3.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,110:188:99:3692,0,2737 -chr5 36233946 . C T 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.184;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1354,0,755 -chr5 36234339 . C A 2910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-1.861;DP=136;FS=14.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.461;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:2939,0,3748 -chr5 36234340 . T A 2804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-2.808;DP=134;FS=14.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,80:133:99:2929,0,4027 -chr5 36240385 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.517;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:251,0,625 -chr5 36240469 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-2.475;DP=40;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:666,0,653 -chr5 36240527 . A G 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.055;DP=33;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:639,0,480 -chr5 36242106 . G A 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-0.157;DP=63;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,44:63:99:1470,0,468 -chr5 36251839 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.964;DP=52;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:854,0,953 -chr5 36252117 . A C 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-1.346;DP=60;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:1008,0,1078 -chr5 36252148 . G A 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.763;DP=68;FS=3.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1123,0,1311 -chr5 36253348 . G C 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.158;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:30:1710,0,30 -chr5 36253908 . A G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.217;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:877,0,913 -chr5 36254649 . G A 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-1.024;DP=53;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:1193,0,608 -chr5 36255175 . C T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.330;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:822,0,415 -chr5 36255206 . T C 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.216;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=22.45;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:769,0,419 -chr5 36255883 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-2.172;DP=36;FS=7.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:265,0,946 -chr5 36255900 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.016;DP=38;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=8.15;ReadPosRankSum=-2.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:338,0,2044 -chr5 36255926 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=2.928;DP=41;FS=4.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:479,0,963 -chr5 36448226 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-0.769;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:500,0,542 -chr5 36505056 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-1.341;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:392,0,455 -chr5 36610436 . A C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:365,0,349 -chr5 36616101 . A G 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=1.425;DP=90;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1596,0,1464 -chr5 36616116 . G A 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.885;DP=101;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1793,0,1603 -chr5 36616459 . C T 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.378;DP=80;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,48:80:99:1559,0,1101 -chr5 36742377 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=11.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:398,0,324 -chr5 36742757 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.281;DP=59;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1092,0,997 -chr5 36743321 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=1.077;DP=45;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=14.48;ReadPosRankSum=-3.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:680,0,2012 -chr5 36743568 . C CA 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-1.785;DP=39;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:423,0,645 -chr5 36753585 . G A 2037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.560;DP=80;FS=10.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,54:80:99:2066,0,724 -chr5 36804194 . G A 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-0.079;DP=84;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=21.24;ReadPosRankSum=2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,54:84:99:1812,0,992 -chr5 36820774 . A T 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=1.206;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=22.35;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:855,0,498 -chr5 36820989 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.607;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:392,0,657 -chr5 36821384 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.769;DP=34;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:646,0,859 -chr5 36822147 . C G 1585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.937;DP=75;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,47:75:99:1614,0,1006 -chr5 36822823 . TG T 824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-1.178;DP=72;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:862,0,868 -chr5 36829491 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.158;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:239,0,464 -chr5 36829705 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,492 -chr5 36830031 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-2.406;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=21.27;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:560,0,314 -chr5 36870847 . CGGT C 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=3.528;DP=33;FS=2.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=8.63;ReadPosRankSum=-3.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:322,0,666 -chr5 36871545 . G T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:383,27,0 -chr5 36874785 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,175 -chr5 36876642 . AACCTGAAAAGAGAGCGCTTACACTTTTAGTATGCAAACTCTTTTTGTCAAGACTGAAGATTTACATATAAGCCACACTT A 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=2.452;DP=22;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=26.90;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:629,0,2753 -chr5 36889272 . G T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.871;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:531,0,571 -chr5 36889857 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=1.175;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:345,0,628 -chr5 36891928 . C G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-0.427;DP=42;FS=1.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:554,0,967 -chr5 36892249 . A G 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-0.078;DP=52;FS=8.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1356,0,486 -chr5 36893069 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-0.087;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:403,0,817 -chr5 36893483 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.453;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:561,0,524 -chr5 36893579 . T C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.281;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:623,0,624 -chr5 36895069 . T G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-2.166;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:363,0,1044 -chr5 36895258 . G T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.110;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:471,0,812 -chr5 36895344 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.269;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:289,0,608 -chr5 36896041 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.917;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=7.05;ReadPosRankSum=2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:275,0,971 -chr5 36897429 . C G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=-0.027;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:339,0,1164 -chr5 36898274 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-0.364;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:477,0,497 -chr5 36919713 . G A 355.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=29.65;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:383,0,6 -chr5 37019599 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.582;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:264,0,566 -chr5 37019789 . G C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.86;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,149 -chr5 37019790 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,149 -chr5 37022189 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.807;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,553 -chr5 37022268 . T G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:346,0,258 -chr5 37081703 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr5 37102769 . A G 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-1.793;DP=64;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=26.75;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,45:64:99:1740,0,509 -chr5 37102955 . T A 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.118;DP=56;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=20.50;ReadPosRankSum=-1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1176,0,711 -chr5 37103049 . G A 1719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.638;DP=70;FS=5.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=24.57;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,47:70:99:1748,0,837 -chr5 37103223 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.650;DP=19;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=28.57;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:571,0,114 -chr5 37104593 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.029;DP=24;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:354,0,462 -chr5 37180235 . A C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=24.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:42:248,0,42 -chr5 37180317 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:302,0,53 -chr5 37233072 . C T 302.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:6:330,0,6 -chr5 37299873 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=27.24;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:464,0,129 -chr5 37301272 . G T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=2.301;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=24.91;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:651,0,262 -chr5 37301634 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=24.06;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:57:317,0,57 -chr5 37331755 . C T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.231;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=26.45;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:716,0,165 -chr5 37372243 . T A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.311;DP=51;FS=4.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:716,0,497 -chr5 37573432 . G T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.468;DP=38;FS=4.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=22.10;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:868,0,445 -chr5 37573561 . T A 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.783;DP=111;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1698,0,1780 -chr5 37582828 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=1.031;DP=81;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:390,0,2348 -chr5 37585188 . CTG C 543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-1.129;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:581,0,359 -chr5 37868089 . C CT 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.998;DP=31;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:263,0,457 -chr5 37868415 . C T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.851;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,26:97:99:650,0,2690 -chr5 37868956 . T A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.835;DP=73;FS=5.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:495,0,2063 -chr5 37869313 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-1.392;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:589,0,472 -chr5 37929192 . G T 1170.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=1.053;DP=62;FS=6.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.476;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1208,0,1702 -chr5 37929193 . T A 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=1.125;DP=62;FS=5.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=19.01;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1207,0,1743 -chr5 37929362 . GT G 740.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-2.586;DP=56;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:43:778,0,43 -chr5 38016760 . C G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:273,0,420 -chr5 38022585 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:247,0,233 -chr5 38136545 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.063;DP=111;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,20:111:99:320,0,3475 -chr5 38158449 . G A 1906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=2.036;DP=103;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1935,0,1502 -chr5 38170437 . C T 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=1.175;DP=134;FS=7.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:816,0,3760 -chr5 38177652 . A G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.868;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:545,0,2694 -chr5 38186921 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.272;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:301,0,2098 -chr5 38197498 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.327;DP=100;FS=6.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:514,0,2928 -chr5 38206351 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.103;DP=52;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:700,0,1107 -chr5 38226795 . A T 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=1.199;DP=154;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:2216,0,2404 -chr5 38227176 . G A 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.104;DP=152;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,44:151:99:1162,0,4091 -chr5 38227315 . A G 2545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=-1.025;DP=147;FS=2.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:2574,0,2669 -chr5 38227327 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.853;DP=122;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:2252,0,2247 -chr5 38227493 . T A 1772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.074;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1801,0,1770 -chr5 38228206 . A C 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.678;DP=210;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,45:210:99:876,0,6523 -chr5 38228808 . CG C 1058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.498;DP=203;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,50:199:99:1096,0,5437 -chr5 38229788 . C T 11833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-1.256;DP=179;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=32.93;ReadPosRankSum=-2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,108:177:99:11862,0,275 -chr5 38229918 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=-2.291;DP=143;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=4.63;ReadPosRankSum=2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,40:143:99:690,0,5851 -chr5 38231055 . C T 2529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=-0.389;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,77:120:99:2558,0,1385 -chr5 38231677 . C A 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-3.465;DP=274;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,84:273:99:1519,0,7315 -chr5 38255805 . A C 3222.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=1.838;DP=501;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:364,137:501:99:3251,0,14069 -chr5 38264250 . G T 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=1.538;DP=440;FS=10.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:350,90:440:99:1558,0,13602 -chr5 38294268 . C T 2155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=-0.768;DP=346;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=6.23;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,91:346:99:2184,0,9834 -chr5 38300273 . CA C 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:350,0,150 -chr5 38300539 . A G 2206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-1.675;DP=297;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=7.43;ReadPosRankSum=2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,73:297:99:2235,0,24989 -chr5 38300551 . T C 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.089;DP=299;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=7.34;ReadPosRankSum=3.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,69:297:99:2222,0,24989 -chr5 38300874 . AG A 1251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-3.986;DP=314;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,101:299:99:1289,0,5631 -chr5 38300984 . A G 1265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-1.854;DP=233;FS=6.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,59:233:99:1294,0,7214 -chr5 38301111 . T A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.353;DP=248;FS=2.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,43:248:99:608,0,8151 -chr5 38401973 . A AGATTGTGTC 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.232;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:317,0,368 -chr5 38495836 . CGGTGAGAGCTGTGTTTGAGTTTAATGCGTGCGCTTGTATTCATTTTGATGTATTAGCTATTATCATAGTTGTATGTGCTTGTATACACTA C 3027.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.447;ClippingRankSum=13.379;DP=375;FS=67.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=8.07;ReadPosRankSum=-11.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,153:348:99:3065,0,103887 -chr5 38498966 . C CT 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=-1.277;DP=165;FS=14.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,54:151:99:670,0,1780 -chr5 38500396 . C CA 2582.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-0.537;DP=638;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:445,186:631:99:2620,0,12057 -chr5 38511638 . AGTAAGTACTTGCATGAATCTTAACACTACTACAATGGCAACTGCATATTTTTTTATACGTTTGGACTCAACCGTAAATCACAATCTTCCTTTTTTCTCCACAG A 16063.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=1.074;DP=391;FS=9.577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=32.59;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,388:391:99:16101,1171,0 -chr5 38524301 . ACTTTATTGCAAGAGAAGAGAAATATTATTTCGTTGCACAGCTAAAACAGAAGGTTTTGGACGCGCACGAACAGTCTGTCAC A 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-1.323;DP=20;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:787,0,739 -chr5 38897003 . G T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=-1.358;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:477,0,190 -chr5 38897833 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:305,0,97 -chr5 38899063 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:423,0,407 -chr5 38912844 . C A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.101;DP=42;FS=4.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=15.57;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:682,0,760 -chr5 38917117 . A G 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.852;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:2251,0,2057 -chr5 38919502 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:278,0,100 -chr5 38921682 . C T 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.730;DP=101;FS=7.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1729,0,1687 -chr5 38980864 . T G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-0.257;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:727,0,531 -chr5 39006608 . G A 1695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.523;DP=92;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1724,0,1698 -chr5 39014009 . C T 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.999;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:1386,0,1467 -chr5 39023461 . G A 1504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-0.260;DP=86;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1533,0,1337 -chr5 39118047 . TGTAAGAATTTCAAAAGCCTTGTAAAAATGTGCCAAACGGCCTCGACGCGGATAATCTGTGTTTTTTATCCACAG T 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=3.069;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.85;ReadPosRankSum=-2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:353,0,16364 -chr5 39309907 . TA T,TAA 2373.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.403;DP=158;FS=6.888;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,79,47:133:99:2617,723,1020,2042,0,2678 -chr5 39358539 . GT G 702.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-1.317;DP=30;FS=3.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:67:740,67,0 -chr5 40298004 . G A 1296.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.434;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=29.26;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:94:1325,94,0 -chr5 40298178 . A C 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.788;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:1009,0,730 -chr5 40298358 . A G 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.346;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1145,0,343 -chr5 40298475 . AG A 408.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.302;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:446,17,0 -chr5 40298513 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:238,0,101 -chr5 40299985 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:428,0,123 -chr5 40302312 . A G 253.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.75;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:282,0,13 -chr5 40306231 . C T 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 -chr5 40414718 . GCTTGGGAACACAGACATTTTATGTTTGCTTCACAATTGCTAAATCAGAAAAAAAAGTTGCTGACAGGATACTAGCAGGTAC G 4249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=1.752;DP=99;FS=5.892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,91:99:99:4287,372,0 -chr5 40696405 . T G 250.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:279,0,18 -chr5 41114342 . AT A 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:246,0,177 -chr5 41279928 . C CA 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.326;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:311,0,189 -chr5 41632668 . T C 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.080;DP=37;FS=5.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=15.07;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:586,0,728 -chr5 41665188 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.305;DP=32;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:303,0,1757 -chr5 41687526 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.482;DP=37;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:309,0,1892 -chr5 41694486 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=1.435;DP=53;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:240,0,1567 -chr5 41694871 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.161;DP=54;FS=4.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:443,0,1422 -chr5 41854963 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-1.683;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:410,0,688 -chr5 41916209 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.338;DP=99;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:425,0,3021 -chr5 41916869 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.058;DP=120;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:586,0,3500 -chr5 41917019 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.646;ClippingRankSum=-0.419;DP=117;FS=5.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,27:115:99:513,0,3315 -chr5 41917241 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.106;DP=109;FS=13.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:316,0,3418 -chr5 41917565 . C G 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-2.005;DP=123;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,29:123:99:584,0,3532 -chr5 42126165 . G A 1959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.764;DP=342;FS=0.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,89:342:99:1988,0,9348 -chr5 42130553 . C CT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=1.023;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=3.33;ReadPosRankSum=-1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:372,0,675 -chr5 42132630 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.175;DP=61;FS=2.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:697,0,1317 -chr5 42469581 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.733;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:241,0,401 -chr5 42555211 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.163;DP=45;FS=4.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:348,0,1232 -chr5 42583459 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.222;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:546,0,1560 -chr5 42583462 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.665;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:546,0,1556 -chr5 42723975 . T TA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=-0.320;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:240,0,1138 -chr5 42727914 . G A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.378;DP=59;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.291;QD=14.17;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:864,0,1196 -chr5 42748106 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.445;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:434,0,658 -chr5 42748958 . TA T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-0.734;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:342,0,331 -chr5 42749316 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.479;DP=34;FS=5.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:328,0,941 -chr5 42879290 . C CA 792.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.493;DP=47;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:830,0,1526 -chr5 43067498 . G A 1834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.338;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1863,0,1829 -chr5 43070284 . CT C 1056.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=2.539;DP=127;FS=7.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,42:127:99:1094,0,3064 -chr5 43117307 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,286 -chr5 43134913 . TGGTGAGACCACTTTGTTCCATAAAGAGACTTGAACATTTACATTGACATTAACAGTTGCTGTTCAATCAATTTGAGTGAATAACCGCAAAAATTTTGATTTTCTTGATTTCA T 18309.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=1.033;DP=409;FS=2.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=22.13;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,404:408:99:18347,1485,0 -chr5 43225583 . G A 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr5 43225651 . A T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:357,27,0 -chr5 43260360 . C T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-1.127;DP=88;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,31:88:99:1060,0,2063 -chr5 43413813 . C T 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=-0.297;DP=358;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,74:358:99:1406,0,10800 -chr5 43448586 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.426;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:366,0,2145 -chr5 43453080 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.296;DP=71;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:264,0,2189 -chr5 43453571 . C A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=1.029;DP=33;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:392,0,786 -chr5 43454458 . T C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.954;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:433,0,743 -chr5 43454459 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=1.430;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:271,0,1645 -chr5 43454791 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=1.719;DP=31;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:276,0,2026 -chr5 43454809 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.453;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:276,0,2026 -chr5 43456734 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.283;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:238,0,845 -chr5 43458462 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.484;DP=44;FS=8.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:231,0,1123 -chr5 43458904 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.570;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:295,0,791 -chr5 43460237 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.223;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:402,0,997 -chr5 43461560 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=-0.277;DP=46;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:427,0,1098 -chr5 43496973 . G GA 558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.399;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:596,0,424 -chr5 43497385 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.745;DP=82;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:360,0,2482 -chr5 43504149 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.494;DP=158;FS=5.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:497,0,4818 -chr5 43504322 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.454;DP=187;FS=7.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,32:187:99:397,0,12256 -chr5 43506705 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.822;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,22:123:99:285,0,7561 -chr5 43521571 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.468;DP=113;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,27:113:99:599,0,3338 -chr5 43647584 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:236,0,420 -chr5 43685588 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=1.581;DP=318;FS=2.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,47:318:99:399,0,10127 -chr5 43685726 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-2.385;DP=258;FS=19.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,40:258:99:311,0,9383 -chr5 43686683 . A T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.333;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=4.19;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,44:184:99:929,0,5198 -chr5 43713274 . C T 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.450;ClippingRankSum=8.848;DP=318;FS=11.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=2.11;ReadPosRankSum=-6.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,56:317:99:700,0,10059 -chr5 43713946 . G A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-3.036;DP=330;FS=6.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,62:330:99:955,0,10148 -chr5 43741960 . G A 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.720;DP=277;FS=3.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,60:277:99:877,0,7652 -chr5 43742114 . GCTGAGAGACAAAAACAGAAGAGCATTGAAACATCGACCATCACATAAAGCCGTGAGTTCAGTTTAAATCTCCTCCGCTTAC G 13663.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=1.599;DP=303;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=32.92;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,290:299:99:13701,1158,0 -chr5 43742205 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=-2.187;DP=312;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,54:312:99:705,0,9377 -chr5 43781658 . G GA 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.427;DP=94;FS=10.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:273,0,1907 -chr5 43782282 . CT C 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.568;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:495,0,1529 -chr5 43782495 . G GT 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=-3.561;DP=97;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=6.14;ReadPosRankSum=2.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:633,0,986 -chr5 43783474 . C A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-1.293;DP=125;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,27:125:99:516,0,3606 -chr5 43909445 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,410 -chr5 43952153 . G T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.029;DP=30;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:437,0,525 -chr5 43952234 . T C 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:45:630,45,0 -chr5 44151957 . T G 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=1.230;DP=25;FS=12.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.348;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:721,0,162 -chr5 44151971 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.950;DP=23;FS=13.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=26.95;ReadPosRankSum=-1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:648,0,209 -chr5 44153231 . A G 651.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.964;DP=20;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=32.57;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:679,8,0 -chr5 44154566 . A G 293.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:322,0,18 -chr5 44453572 . TA T 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-2.248;DP=305;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,60:294:99:788,0,7685 -chr5 45481646 . G C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-1.581;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:316,0,1555 -chr5 46759651 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=-1.830;DP=23;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=17.86;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:439,0,621 -chr5 46801927 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:356,0,350 -chr5 46901628 . G T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,212 -chr5 46941469 . G GT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.933;DP=20;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:254,0,393 -chr5 47073457 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=2.664;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:469,0,162 -chr5 47158393 . T C 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.120;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:69:664,0,69 -chr5 47160321 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.78;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:316,0,59 -chr5 47358506 . AT A 396.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-1.335;DP=20;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:22:434,0,22 -chr5 47359446 . T G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.142;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:631,0,625 -chr5 47397484 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.330;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:478,0,725 -chr5 47402145 . G GA 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.055;DP=48;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:366,0,709 -chr5 47430103 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=2.111;DP=42;FS=4.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=11.42;ReadPosRankSum=2.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:508,0,874 -chr5 47513034 . CAGGTATGTTGTATCCTAGTCAAGCATTACTCATTAGTCATAATAACTCCTGTGTTTGTCTAATGTGTGAATCTGTCTTAA C 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=29.36;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:419,0,787 -chr5 47514106 . GGGTGAGGGAGGGATTTCTTTTAAACTTAAAAGTGTATTATACTGGAGGTATGAAATGCTAAATTATCATCCTCTGTTGTA G 653.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:53:691,53,0 -chr5 47549951 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.775;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:414,0,903 -chr5 47549953 . A C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-0.348;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:414,0,922 -chr5 47677862 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:275,0,93 -chr5 47722167 . T C 1154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1183,81,0 -chr5 47745394 . G C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=-1.555;DP=28;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:369,0,552 -chr5 47757965 . C T 2237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=1.323;DP=98;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=22.83;ReadPosRankSum=-2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,69:98:99:2266,0,1874 -chr5 47809889 . TA T 355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:393,37,0 -chr5 47810288 . GT G 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-0.988;DP=33;FS=9.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:256,0,540 -chr5 47810294 . T A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-1.291;DP=30;FS=9.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:355,0,635 -chr5 47811974 . G T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr5 47812314 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:322,0,57 -chr5 47862727 . A G 276.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:305,0,19 -chr5 47889325 . G C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.950;DP=87;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:686,0,2266 -chr5 47905148 . A G 232.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:261,0,21 -chr5 47908667 . C T 218.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:1:244,1,0 -chr5 47918520 . G C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=26.48;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:293,0,51 -chr5 48066974 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr5 48102316 . C A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-0.053;DP=61;FS=25.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=11.77;ReadPosRankSum=-6.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:746,0,1482 -chr5 48102641 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=-5.538;DP=74;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=7.12;ReadPosRankSum=3.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:555,0,2012 -chr5 48102723 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=-2.709;DP=181;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,32:181:99:509,0,6008 -chr5 48102814 . CA C 4889.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.054;DP=17;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=22.23;ReadPosRankSum=2.549 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,10:16:99:4927,356,0 -chr5 48103697 . A G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-0.482;DP=250;FS=6.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,58:246:99:747,0,10223 -chr5 48104109 . T A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-1.320;DP=55;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=34.12;ReadPosRankSum=4.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,45:55:99:1905,0,345 -chr5 48104110 . G A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.070;DP=54;FS=5.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=34.75;ReadPosRankSum=4.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,45:54:99:1905,0,404 -chr5 48104267 . A AG 859.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-0.057;DP=45;FS=14.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.191;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:897,0,1586 -chr5 48104272 . A G 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.499;DP=43;FS=11.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:897,0,1586 -chr5 48104720 . G A 1617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.640;DP=221;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,67:221:99:1646,0,6742 -chr5 48104960 . G A 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=1.365;DP=264;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=4.73;ReadPosRankSum=4.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,61:264:99:1277,0,7636 -chr5 48105352 . C T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=2.072;DP=254;FS=3.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,62:253:99:1096,0,16450 -chr5 48105374 . T A 3920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-1.534;DP=263;FS=20.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,92:260:99:3949,0,11443 -chr5 48105897 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.926;DP=209;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,54:209:99:844,0,8991 -chr5 48106085 . G C 4999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.925;DP=318;FS=0.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,143:317:99:5028,0,5692 -chr5 48696848 . G A 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=-2.256;DP=263;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,81:262:99:2118,0,6766 -chr5 49645981 . G C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-0.711;DP=73;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:430,0,2461 -chr5 49696827 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.158;DP=81;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:654,0,2095 -chr5 49707130 . G C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-0.613;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,26:94:99:639,0,2681 -chr5 49732780 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-1.343;DP=102;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:629,0,5301 -chr5 49733653 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.695;DP=129;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,34:126:99:820,0,3492 -chr5 49736512 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-1.285;DP=156;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,29:156:99:466,0,4755 -chr5 49751761 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.436;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:266,0,1611 -chr5 49759519 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.309;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:233,0,1112 -chr5 49759538 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.265;DP=39;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:317,0,1091 -chr5 49812523 . C T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=1.759;DP=38;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:543,0,788 -chr5 49833301 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=2.063;DP=35;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:270,0,929 -chr5 49833354 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.663;DP=34;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:288,0,817 -chr5 49891440 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.177;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=20.58;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,222 -chr5 49893122 . G A 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-1.616;DP=316;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,80:316:99:1782,0,8926 -chr5 49903874 . C T 3188.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=3.050;DP=282;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=11.31;ReadPosRankSum=3.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,96:282:99:3217,0,6499 -chr5 49937227 . G A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=1.100;DP=267;FS=10.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,58:267:99:1160,0,8104 -chr5 49937247 . T A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.543;DP=252;FS=22.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,57:252:99:1184,0,7574 -chr5 49943867 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.264;DP=50;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:794,0,969 -chr5 49945392 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,129 -chr5 49947266 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.299;DP=67;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:460,0,1772 -chr5 49947477 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.921;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:461,0,926 -chr5 49949631 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.464;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:263,0,2470 -chr5 49950562 . A C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.074;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:433,0,1191 -chr5 49952583 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=-2.192;DP=66;FS=8.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:285,0,1849 -chr5 49957794 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=1.226;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:447,0,1495 -chr5 49957795 . A T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.954;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:447,0,1494 -chr5 49966001 . A AT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.359;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:280,0,695 -chr5 49988736 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=-1.356;DP=99;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:308,0,3065 -chr5 49991330 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.580;DP=70;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.386;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:244,0,2177 -chr5 50025401 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-1.051;DP=109;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:413,0,3267 -chr5 50455531 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.117;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=4.02;ReadPosRankSum=2.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:229,0,2164 -chr5 50514755 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.335;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:257,0,865 -chr5 50583460 . T A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=-0.349;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:284,0,994 -chr5 50585818 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.946;DP=70;FS=7.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:510,0,1872 -chr5 50585845 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=1.602;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:654,0,1278 -chr5 50593997 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=1.442;DP=35;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:282,0,1028 -chr5 50605622 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.681;DP=51;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:279,0,1460 -chr5 50608047 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.355;DP=51;FS=8.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:399,0,1319 -chr5 50618285 . G A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=-0.557;DP=69;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:469,0,1974 -chr5 50621399 . A G 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.767;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1300,0,1170 -chr5 50621432 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-2.128;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:323,0,2023 -chr5 50624720 . T C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-0.529;DP=36;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:740,0,445 -chr5 50624750 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=-0.522;DP=34;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:575,0,797 -chr5 50629138 . T C 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=1.743;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:999,0,3117 -chr5 50629144 . A G 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=1.344;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=13.87;ReadPosRankSum=3.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:999,0,3108 -chr5 50682515 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=-0.390;DP=69;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:468,0,1904 -chr5 50768939 . C CA 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-1.319;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,35:127:99:459,0,3692 -chr5 50769990 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.427;DP=110;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,19:110:99:253,0,3433 -chr5 50770430 . C CA 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.128;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,24:98:99:315,0,2287 -chr5 50775258 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.594;DP=154;FS=5.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:400,0,4999 -chr5 50777124 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.045;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:268,0,1315 -chr5 50777475 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.952;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=7.06;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:339,0,1193 -chr5 50778428 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-0.914;DP=141;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=2.84;ReadPosRankSum=-2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,27:141:99:429,0,4323 -chr5 50802991 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=-0.749;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:271,0,850 -chr5 50803012 . G C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.294;DP=41;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:334,0,1035 -chr5 50810615 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-2.300;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:234,0,1104 -chr5 50811498 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.767;DP=63;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:299,0,1771 -chr5 51527921 . T A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-2.004;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,35:149:99:1014,0,4299 -chr5 51529643 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.689;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:256,0,987 -chr5 51940166 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.037;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:240,0,479 -chr5 52507286 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.239;DP=47;FS=7.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:252,0,1378 -chr5 52538111 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.121;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:264,0,1105 -chr5 52561092 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-0.506;DP=75;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,19:75:99:435,0,2972 -chr5 52565375 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.153;DP=76;FS=3.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:621,0,1993 -chr5 52565716 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.473;DP=77;FS=5.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:364,0,2336 -chr5 52579257 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=1.345;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:763,0,1063 -chr5 52581755 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.904;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:895,0,1292 -chr5 52582110 . GGGTTTGTGTGGCTTTCAATTCACTGTTTGCTCAGTGCTGTCACATTTTTTAGATACAAAATTCAATCCGATCAATCGTGTACCAATTATTAATTTCTATTTTTAA G 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=1.242;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=34.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,52:55:99:2299,0,234 -chr5 52583796 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.657;DP=46;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:380,0,1185 -chr5 52767695 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr5 52857307 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,1:14:99:259,0,2328 -chr5 52857322 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.531;DP=18;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,1:17:99:259,0,2171 -chr5 52857491 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:254,0,1295 -chr5 52860905 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.794;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:366,0,357 -chr5 52886720 . GCCTGTAAACACACACAACACATTCAGTAAAATAAGGTATCAGTTTGAATTAATCACCTTCGGTAACTCTGAAATGACTGTAATGTCATAGTTAACCATA G 1243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=2.432;DP=34;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=29.86;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:99:1281,0,1111 -chr5 52886908 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.315;DP=49;FS=5.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:714,0,1009 -chr5 52898021 . C T 332.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:361,0,15 -chr5 52902238 . G A 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 -chr5 52902634 . A G 406.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=33.90;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:434,0,6 -chr5 52902816 . T C 662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:691,54,0 -chr5 52902919 . T C 2284.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.183;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,58:61:99:2313,175,0 -chr5 52913222 . T A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.228;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:908,0,1506 -chr5 52913252 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.373;DP=58;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:333,0,1685 -chr5 52917112 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.666;DP=66;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:349,0,1855 -chr5 52922685 . A T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.727;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=13.05;ReadPosRankSum=2.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:511,0,761 -chr5 52926564 . T G 1349.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:97:1378,97,0 -chr5 52926625 . G C 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:455,33,0 -chr5 52926714 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-2.964;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=19.99;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:348,0,251 -chr5 52926890 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-1.183;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.455;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:270,0,998 -chr5 52926922 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.601;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:495,0,590 -chr5 52927147 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.749;DP=51;FS=2.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:328,0,2063 -chr5 52927234 . A G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-1.505;DP=45;FS=2.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:426,0,1217 -chr5 52927294 . T A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.702;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=26.87;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1076,0,322 -chr5 52927377 . C T 1240.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:1269,101,0 -chr5 52927532 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-1.904;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:552,0,290 -chr5 52927540 . G A 1039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1068,72,0 -chr5 52927626 . G A 1467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1496,102,0 -chr5 52927655 . T A 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.739;DP=26;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:500,0,449 -chr5 52928260 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.634;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:231,0,442 -chr5 52928832 . T A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.981;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,842 -chr5 52929093 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=-2.945;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=16.41;ReadPosRankSum=2.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:537,0,489 -chr5 52929182 . G A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-0.201;DP=68;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:911,0,1401 -chr5 52929225 . A AG 1679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.122;DP=64;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,47:64:99:1717,0,384 -chr5 52929317 . A G 2880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2909,202,0 -chr5 52929368 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.172;DP=80;FS=3.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:450,0,2317 -chr5 52929426 . C T 1433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.227;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:1462,0,1522 -chr5 52929454 . C A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.239;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:894,0,1666 -chr5 52929517 . G T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-1.447;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=17.60;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:521,0,798 -chr5 52929852 . TAA T 236.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:678,52,0 -chr5 52929917 . C T 997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1026,72,0 -chr5 52929949 . G T 1702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1731,123,0 -chr5 52935200 . A C 203.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:232,0,20 -chr5 53118054 . C T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr5 53118642 . C CT 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 -chr5 53120718 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-0.444;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=11.35;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:278,0,485 -chr5 53247507 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr5 53451325 . C T 2624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-2.194;DP=326;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,102:326:99:2653,0,8792 -chr5 53592799 . A C 679.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:708,48,0 -chr5 53592871 . A G 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:579,39,0 -chr5 53592880 . G A 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:579,39,0 -chr5 53592940 . A G 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:534,36,0 -chr5 53592999 . G T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=1.315;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:415,0,330 -chr5 53593218 . C T 1635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1664,117,0 -chr5 53593569 . T C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.370;DP=35;FS=4.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:951,0,201 -chr5 53596945 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr5 53600629 . T G 4726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4755,340,0 -chr5 53600688 . C T 3546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.732;DP=115;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,93:114:99:3575,0,354 -chr5 53600736 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.797;DP=121;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,24:120:99:412,0,3758 -chr5 53607783 . C G 1999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-1.962;DP=63;FS=5.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,50:63:99:2028,0,1065 -chr5 53607784 . A C 1999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=-0.696;DP=61;FS=3.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=32.78;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,48:61:99:2028,0,998 -chr5 53607838 . G A 1150.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1179,81,0 -chr5 53626895 . A C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:393,0,495 -chr5 53627399 . G T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=-0.916;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:318,0,591 -chr5 53716161 . T A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.083;DP=48;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:294,0,1442 -chr5 53717461 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.667;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:253,0,935 -chr5 53739575 . A T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.352;DP=38;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:363,0,910 -chr5 53744159 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.579;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:459,0,796 -chr5 53853165 . A T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr5 53926811 . C T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr5 54728674 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:417,0,114 -chr5 54728744 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,238 -chr5 54730799 . A G 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr5 54739607 . A G 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:488,36,0 -chr5 54756945 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,266 -chr5 54760788 . C G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr5 54766010 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=-1.562;DP=106;FS=3.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:371,0,3358 -chr5 54786397 . A G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.681;DP=101;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:561,0,3070 -chr5 54820984 . T G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=1.226;DP=67;FS=7.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:507,0,1828 -chr5 54940513 . C G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.110;DP=44;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:552,0,962 -chr5 54941964 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.014;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:234,0,1246 -chr5 54950822 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.669;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=4.51;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:267,0,2548 -chr5 54952931 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.651;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:474,0,817 -chr5 54952932 . T A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.589;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:474,0,817 -chr5 54953823 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.315;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:329,0,422 -chr5 54954514 . TA T 511.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:549,48,0 -chr5 54954991 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.879;DP=52;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:280,0,1581 -chr5 54955336 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.181;DP=28;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:262,0,704 -chr5 55149968 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-2.251;DP=186;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,35:186:99:591,0,7657 -chr5 55150066 . C T 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.266;DP=328;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,69:327:99:1331,0,10270 -chr5 55150516 . A C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.149;DP=336;FS=3.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=0.99;ReadPosRankSum=2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,47:336:99:361,0,11272 -chr5 55150612 . CACCTGCAATATAAATGATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACTTCAACAAAGCTTTAAAATGGCTTAAATGACTT C 9190.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=1.211;DP=232;FS=1.619;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=29.72;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,219:225:99:9228,661,0 -chr5 55153129 . T A 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.644;DP=136;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,32:136:99:696,0,3959 -chr5 55163195 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=1.567;DP=94;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:450,0,2678 -chr5 55164902 . A T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.461;DP=60;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:496,0,1580 -chr5 55207008 . T TA 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.702;DP=88;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:691,0,1341 -chr5 55208353 . A G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.196;DP=211;FS=8.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,47:211:99:946,0,6335 -chr5 55208371 . C T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.203;DP=230;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,52:230:99:1045,0,6793 -chr5 55208827 . G A 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.025;DP=207;FS=6.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,56:207:99:1394,0,5807 -chr5 55216572 . G C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.451;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,23:107:99:450,0,3246 -chr5 55216693 . G C 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.850;DP=118;FS=9.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,25:118:99:512,0,3726 -chr5 55228883 . A C 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.228;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,41:124:99:1111,0,3114 -chr5 55228970 . T C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.042;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,33:104:99:902,0,2755 -chr5 55230529 . G C 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.539;DP=125;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,41:125:99:1115,0,3120 -chr5 55230624 . TA T 882.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-1.951;DP=84;FS=1.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:920,0,764 -chr5 55377454 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:268,0,388 -chr5 55516516 . T C 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=-0.783;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=29.35;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:674,0,111 -chr5 55519179 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=13.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:300,0,638 -chr5 55519497 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.257;DP=57;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:308,0,1728 -chr5 55519765 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=-0.139;DP=48;FS=6.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=6.31;ReadPosRankSum=2.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:331,0,1338 -chr5 55521764 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.063;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:292,0,1251 -chr5 55522460 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.176;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=15.72;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:374,0,360 -chr5 55534847 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.219;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:250,0,1329 -chr5 55538371 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.842;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=12.83;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:580,0,937 -chr5 55540843 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.298;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:464,0,840 -chr5 55545564 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.763;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:299,0,1317 -chr5 55549846 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.250;DP=44;FS=7.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:288,0,1206 -chr5 55753066 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.073;DP=50;FS=4.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:427,0,1841 -chr5 55760671 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=-0.421;DP=50;FS=4.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:331,0,1346 -chr5 56068014 . A C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=10.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,139 -chr5 56068945 . C CA 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-1.426;DP=23;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:306,0,156 -chr5 56069506 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:348,0,660 -chr5 56070954 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.864;DP=38;FS=7.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:332,0,972 -chr5 56075203 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.227;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:483,0,890 -chr5 56078595 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.412;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:295,0,902 -chr5 56501140 . C G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.503;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:256,0,890 -chr5 56516870 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:249,0,453 -chr5 56607641 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=1.031;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:328,0,610 -chr5 56622814 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.847;DP=34;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:311,0,827 -chr5 56698392 . T C 1298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=-0.671;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=27.63;ReadPosRankSum=2.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:1327,0,273 -chr5 56698540 . T G 1282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1311,93,0 -chr5 56719348 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-2.047;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:230,0,204 -chr5 56733608 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=1.034;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:286,0,727 -chr5 56869509 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.106;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:309,0,95 -chr5 56981200 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.290;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:245,0,1792 -chr5 57132739 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.637;DP=60;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:447,0,1464 -chr5 57276109 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=-0.562;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:363,0,646 -chr5 57282872 . G T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=1.342;DP=72;FS=2.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:459,0,2048 -chr5 57282896 . C A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.451;DP=71;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:382,0,2073 -chr5 57299485 . GCTGTACACAAACAAAATAACTCCATTGAAATCAGAATTGACATTTCTTTCACTCCTGATATTAAGTATGGTAACTCAC G 3420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.688;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=26.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:3458,262,0 -chr5 57330519 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.066;DP=45;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:257,0,1341 -chr5 57342239 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=1.630;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.66;ReadPosRankSum=-1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:368,0,1664 -chr5 57360994 . G T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-2.241;DP=39;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:589,0,834 -chr5 57367866 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=1.030;DP=20;FS=11.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:251,0,442 -chr5 57677680 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.277;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:390,0,394 -chr5 57682921 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-0.195;DP=57;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:346,0,1643 -chr5 57683186 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.126;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:362,0,609 -chr5 57722391 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=1.332;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:386,0,1623 -chr5 57794319 . A T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-1.743;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:354,0,946 -chr5 57916920 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=1.512;DP=120;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,24:120:99:375,0,3355 -chr5 57917245 . A G 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=1.548;DP=71;FS=9.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=7.46;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:558,0,1807 -chr5 57918136 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-0.192;DP=89;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:404,0,2731 -chr5 57921546 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.048;DP=64;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:309,0,1854 -chr5 57922683 . A C 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.406;DP=37;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:281,0,1062 -chr5 58324207 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-0.439;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:331,0,2369 -chr5 58361479 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.051;DP=341;FS=2.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,58:341:99:607,0,20835 -chr5 58367697 . C T 1892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-1.156;DP=370;FS=11.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,90:361:99:1921,0,10252 -chr5 58411687 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=-0.652;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:271,0,247 -chr5 58414287 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.228;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:245,0,133 -chr5 58493490 . G T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.781;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=28.39;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:96:738,0,96 -chr5 58515837 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:248,0,446 -chr5 58603244 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.901;DP=31;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:611,0,442 -chr5 58611377 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.444;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.22;ReadPosRankSum=-2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:275,0,478 -chr5 58667820 . C G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,336 -chr5 58681615 . C CT 328.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:408,44,0 -chr5 58685057 . C CT 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.387;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:251,0,252 -chr5 58688392 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-0.489;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:247,0,1265 -chr5 58715291 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,332 -chr5 58762559 . C T 772.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-3.017;DP=243;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,46:236:99:810,0,6983 -chr5 58762598 . G A 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.760;DP=391;FS=4.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,78:391:99:1243,0,11882 -chr5 58793282 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=2.312;DP=74;FS=3.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:618,0,1879 -chr5 58795627 . TA T 1109.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:94:1147,94,0 -chr5 58796283 . C A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.334;DP=22;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:328,0,666 -chr5 58796305 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.380;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:470,0,745 -chr5 58796370 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.950;DP=36;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:233,0,1105 -chr5 58926115 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,416 -chr5 58984752 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-1.465;DP=45;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:331,0,1249 -chr5 59008694 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:268,0,91 -chr5 59065015 . T C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.266;DP=141;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,31:141:99:622,0,4300 -chr5 59065280 . T C 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.324;DP=167;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,43:167:99:1000,0,4857 -chr5 59075535 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,141 -chr5 59087189 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.122;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:291,0,748 -chr5 59093792 . C T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.163;DP=64;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:917,0,1255 -chr5 59099109 . A T 203.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:232,0,25 -chr5 59100787 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.230;DP=42;FS=2.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:513,0,911 -chr5 59111579 . G T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=-2.588;DP=84;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:350,0,3365 -chr5 59111590 . A T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-1.735;DP=91;FS=3.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:550,0,3208 -chr5 59127017 . C G 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.125;DP=442;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:341,101:442:99:2049,0,13121 -chr5 59139694 . G A 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=-0.579;DP=418;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:325,93:418:99:1911,0,12631 -chr5 59146196 . A C 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.827;DP=317;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,59:317:99:936,0,16509 -chr5 59245284 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:283,0,61 -chr5 59566425 . T C 443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:472,33,0 -chr5 59836832 . C T 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr5 59836863 . A G 844.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:873,63,0 -chr5 59895770 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=1.694;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,342 -chr5 59910674 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.760;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:269,0,456 -chr5 59921863 . C T 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-1.255;DP=161;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,46:161:99:1020,0,5185 -chr5 59921882 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=2.509;DP=146;FS=11.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,23:146:99:296,0,9675 -chr5 59921883 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=2.244;DP=148;FS=11.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,23:148:99:296,0,9675 -chr5 59922196 . C CT 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.056;DP=113;FS=4.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:267,0,2146 -chr5 59926091 . A C 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.027;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.488;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,41:184:99:808,0,5455 -chr5 60001983 . TAC T 296.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:27:329,27,0 -chr5 60159294 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,275 -chr5 60160421 . A G 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.347;DP=60;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=15.81;ReadPosRankSum=2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:977,0,2558 -chr5 60160487 . CCAGGTGATCAGTTTAACACTTTATACAGGCAACAGCTATTGAGTAGATTCATAAACAAAGATAAGCATCATTTTTGTTTGGTGTCTGTTTG C 2626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.887;DP=78;FS=5.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=33.68;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,62:72:99:2664,0,897 -chr5 60165085 . A C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-0.356;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:375,0,2894 -chr5 60165513 . G A 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.782;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1965,0,1184 -chr5 60165674 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.516;DP=46;FS=7.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:395,0,2482 -chr5 60165680 . A C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.261;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:335,0,2882 -chr5 60165976 . G A 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 -chr5 60168561 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.791;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:663,0,3954 -chr5 60228399 . G A 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=2.433;DP=61;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1163,0,713 -chr5 60228458 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=2.054;DP=32;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=18.56;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:622,0,1082 -chr5 60228462 . C A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=2.362;DP=31;FS=11.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:622,0,1082 -chr5 60299946 . TG T 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=25.52;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:318,0,303 -chr5 60299951 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=24.15;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:318,0,303 -chr5 60300000 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr5 60315627 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.279;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:363,0,455 -chr5 60316422 . A T 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:531,36,0 -chr5 60316427 . A G 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:531,36,0 -chr5 60316592 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.906;DP=35;FS=3.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:330,0,927 -chr5 60316868 . T A,C 1353.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,27,13:40:99:1539,437,357,1109,0,1081 -chr5 60316884 . T C 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.981;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:522,0,1060 -chr5 60318041 . G A 1517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1546,111,0 -chr5 60328158 . C A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.249;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:484,0,932 -chr5 60332141 . C T 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.422;DP=86;FS=9.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=17.71;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1551,0,1288 -chr5 60332452 . T C 2894.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2923,208,0 -chr5 60334463 . G A 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1682,120,0 -chr5 60344469 . G C 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.442;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:823,0,809 -chr5 60529303 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.623;DP=49;FS=1.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:325,0,1355 -chr5 60548820 . A C 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.450;DP=58;FS=3.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:841,0,1171 -chr5 60548953 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=-0.177;DP=67;FS=10.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:451,0,1865 -chr5 60548978 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-1.935;DP=51;FS=8.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:238,0,1555 -chr5 60549710 . T TA 570.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.169;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:608,0,754 -chr5 60549939 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-1.322;DP=45;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.528;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:311,0,2718 -chr5 60549945 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-1.897;DP=44;FS=7.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:311,0,2718 -chr5 60550120 . A T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=1.450;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:906,0,1413 -chr5 60550198 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-1.080;DP=38;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=6.49;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:275,0,2268 -chr5 60550208 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-2.991;DP=38;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=6.57;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:278,0,2268 -chr5 60550722 . A C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.105;DP=78;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:440,0,2416 -chr5 60550761 . T G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.506;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:424,0,1710 -chr5 60550793 . A C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.392;DP=49;FS=3.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:784,0,1057 -chr5 60550868 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-1.511;DP=53;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.598;QD=15.22;ReadPosRankSum=2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:835,0,1016 -chr5 60559918 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-1.799;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:246,0,897 -chr5 60573037 . C G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.916;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=17.51;ReadPosRankSum=2.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:939,0,897 -chr5 60574198 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:287,0,328 -chr5 60691554 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.351;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:275,0,2774 -chr5 60736970 . A T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr5 60778214 . C T 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.329;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:1253,0,307 -chr5 60778327 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.245;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:519,0,552 -chr5 60779966 . C A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.257;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=14.41;ReadPosRankSum=2.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:547,0,748 -chr5 60780083 . A T 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-1.685;DP=35;FS=3.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=23.74;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:859,0,857 -chr5 60790692 . CACCTGACAACACATTAACAGCACATTAACATGCGTCCGCGCAGCTCGTAGCAACAAAGGTGCGCGTGCTGCAAAAATAAACTAAGATCCACCATAGAACGG C 5601.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=2.950;DP=139;FS=2.190;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=29.07;ReadPosRankSum=-2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,136:139:99:5639,493,0 -chr5 60799893 . GCCTGAACACACACGCAAACACACATTCAGCATCTCTTACCGTGCATCAGCTGATTTATGGCTGAATTGTGGATGTCTTA G 3746.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=4.623;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=33.16;ReadPosRankSum=-2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,91:113:99:3784,0,5651 -chr5 60809926 . C A 2152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=1.562;DP=105;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.702;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,66:105:99:2181,0,1321 -chr5 60897137 . C A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-1.032;DP=51;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:784,0,915 -chr5 60900041 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.431;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:731,0,699 -chr5 60900305 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:287,0,115 -chr5 60959688 . G A 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 -chr5 61078952 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=1.244;DP=30;FS=9.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=18.73;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:590,0,1154 -chr5 61078961 . A G 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.781;DP=31;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=18.12;ReadPosRankSum=2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:590,0,1157 -chr5 61095779 . T G 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.405;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:825,0,336 -chr5 61118194 . C T 2159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=-1.844;DP=109;FS=4.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=19.81;ReadPosRankSum=2.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:2188,0,1394 -chr5 61142789 . G A 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.384;DP=101;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1987,0,1379 -chr5 61148009 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.051;DP=51;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:1044,0,667 -chr5 61178150 . G A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.868;DP=83;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:1219,0,1558 -chr5 61178165 . C T 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.981;DP=84;FS=4.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1242,0,1600 -chr5 61178725 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,129 -chr5 61179761 . C T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-2.283;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=31.48;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:99:1004,0,324 -chr5 61181596 . G C 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr5 61231911 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:233,0,66 -chr5 61235035 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.610;ClippingRankSum=-0.316;DP=45;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.048;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:603,0,1835 -chr5 61242479 . T C 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:456,33,0 -chr5 61248021 . T A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.370;DP=50;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:830,0,1022 -chr5 62036963 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.107;DP=59;FS=7.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:496,0,1521 -chr5 62037059 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.577;DP=45;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:297,0,1247 -chr5 62343658 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.202;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:229,0,1765 -chr5 62528217 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.076;DP=85;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:480,0,2517 -chr5 62553134 . G GT 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=1.050;DP=46;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:598,0,324 -chr5 62553177 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-0.209;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:421,0,659 -chr5 62557554 . TCTGAGGCAAAGTCAAGAATTACAAAAAAACACTCATCAATAGTCTTTCATATAAAACTGAACCTTCCTAC T 443.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=31.00;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:43:481,43,0 -chr5 62678571 . G GT 312.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:350,33,0 -chr5 62678603 . C A 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:413,33,0 -chr5 62762077 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=-0.660;DP=84;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:547,0,2285 -chr5 62762131 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.580;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:282,0,495 -chr5 62828590 . G C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=1.372;DP=54;FS=11.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:351,0,1560 -chr5 62828621 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.363;DP=62;FS=6.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:252,0,1920 -chr5 62861921 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-0.093;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:603,0,1431 -chr5 62861951 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.615;DP=61;FS=3.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:463,0,1733 -chr5 62874910 . A T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.272;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:692,0,954 -chr5 62949393 . A T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-1.955;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:633,0,399 -chr5 62949406 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=1.244;DP=27;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:439,0,516 -chr5 62954696 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=-2.362;DP=128;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,25:128:99:448,0,4000 -chr5 62954930 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.841;DP=127;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,34:127:99:818,0,3615 -chr5 62954972 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.770;DP=134;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:683,0,4021 -chr5 62965219 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.706;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:321,0,332 -chr5 62987398 . A T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.718;DP=63;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:342,0,1901 -chr5 62987447 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.874;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:356,0,1429 -chr5 63105250 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.581;DP=35;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:328,0,926 -chr5 63105634 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-1.438;DP=63;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:435,0,1705 -chr5 63109702 . GT G 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=1.232;DP=55;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:318,0,662 -chr5 63110118 . TTC T 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.164;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:288,0,877 -chr5 63166880 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-1.365;DP=42;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:502,0,927 -chr5 63565911 . T C 257.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:286,0,20 -chr5 63584007 . A G 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:528,36,0 -chr5 63688278 . T A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=1.281;DP=91;FS=6.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,27:91:99:713,0,2469 -chr5 63713213 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.451;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:499,0,2258 -chr5 63818285 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.973;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:291,0,2056 -chr5 63842497 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.809;DP=89;FS=6.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:597,0,2517 -chr5 63852090 . A G 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.431;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,34:131:99:794,0,3775 -chr5 63883470 . C G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.593;DP=39;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:626,0,665 -chr5 64401685 . T G 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr5 64401702 . A C 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 -chr5 64452302 . C T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=-1.034;DP=116;FS=2.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,25:116:99:476,0,3178 -chr5 64455338 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-1.156;DP=150;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,38:150:99:795,0,4166 -chr5 64465640 . CT C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.890;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:285,0,113 -chr5 64522121 . T C 2087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=1.788;DP=103;FS=4.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,76:103:99:2116,0,706 -chr5 64534937 . C T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-0.266;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:596,0,1038 -chr5 64535076 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.869;DP=44;FS=6.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:709,0,707 -chr5 64562239 . C CAGAAGAGAAA 754.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:55:792,55,0 -chr5 64567108 . G T 910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.241;DP=26;FS=3.160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=33.42;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:32:939,32,0 -chr5 64571024 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.702;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:292,0,1069 -chr5 64615343 . G T 3539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3568,265,0 -chr5 64615978 . AT A 1303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=2.187;DP=68;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,49:68:99:1341,0,312 -chr5 64629297 . G C 885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:914,69,0 -chr5 64634684 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:245,0,166 -chr5 64646763 . G C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:394,0,329 -chr5 64646798 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=-1.142;DP=27;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=7.73;ReadPosRankSum=2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1380 -chr5 64694005 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr5 64727834 . G A 6979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=-0.517;DP=260;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,193:260:99:7008,0,1372 -chr5 64742620 . C A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.471;DP=206;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=3.00;ReadPosRankSum=2.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,39:206:99:647,0,6490 -chr5 64745244 . G C 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.366;DP=164;FS=10.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,51:164:99:1335,0,4306 -chr5 64745340 . C T 6045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=1.406;DP=203;FS=6.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,144:202:99:6074,0,3422 -chr5 64764504 . A G 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-0.468;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,49:196:99:1155,0,5704 -chr5 64764570 . T C 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.141;DP=172;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,43:171:99:963,0,5022 -chr5 64785646 . C T 1749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-2.222;DP=249;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,73:249:99:1778,0,6662 -chr5 64785680 . G A 6041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-1.757;DP=239;FS=9.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,160:239:99:6070,0,2171 -chr5 64786372 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=4.258;DP=149;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,25:148:99:337,0,5035 -chr5 64786533 . T C 2038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=2.423;DP=94;FS=5.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=21.69;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,58:94:99:2067,0,1251 -chr5 64864522 . AAGGTCAGTTCTGTGTGCTTGGGACTACTTTTTTGTGTTGCTCAATCTGACTGTTCCTTTGGTTGTTAT A 11098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=2.453;DP=315;FS=14.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=31.67;ReadPosRankSum=3.235 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,266:275:99:11136,843,0 -chr5 64870177 . GT G,GTT 1653.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.095;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,15,69:87:99:1832,1619,2368,333,0,338 -chr5 64871569 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=28.10;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:48:253,0,48 -chr5 64872321 . CT C 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=2.420;DP=30;FS=6.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=17.59;ReadPosRankSum=-2.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:565,0,204 -chr5 64872556 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=4.188;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:381,0,474 -chr5 64872924 . C T 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=-3.998;DP=40;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=27.27;ReadPosRankSum=3.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1119,0,334 -chr5 64872994 . TC T 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=-0.419;DP=52;FS=13.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=9.51;ReadPosRankSum=3.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:532,0,892 -chr5 64874005 . C T 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.407;ClippingRankSum=-3.876;DP=34;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=30.46;ReadPosRankSum=3.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:99:1064,0,120 -chr5 64874492 . G T 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=-2.620;DP=59;FS=3.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1276,0,745 -chr5 64875996 . C A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-1.150;DP=99;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,20:98:99:389,0,3115 -chr5 64876646 . C A 15786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=287;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,286:286:99:15815,1089,0 -chr5 64876649 . A C 15786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=290;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,289:289:99:15815,1089,0 -chr5 64933133 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.971;DP=149;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,29:149:99:487,0,4437 -chr5 64937478 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.577;DP=157;FS=5.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,29:157:99:473,0,4808 -chr5 64939873 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-0.533;DP=115;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,24:115:99:424,0,3363 -chr5 64946027 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.402;DP=168;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.014;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,32:168:99:419,0,5173 -chr5 64946317 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.432;DP=195;FS=8.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,33:194:99:433,0,6076 -chr5 64993818 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-1.672;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:264,0,753 -chr5 64993896 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:254,0,142 -chr5 64993897 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:344,0,54 -chr5 64994768 . CCTTACCTATTTTATAAAGAAAATGATTAAACCCATAATATTGGTTGAGCAGGATCAGATATCTGAAACAATATGTTAATAGTA C 948.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.931;DP=28;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.525;QD=33.88;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:99:986,0,910 -chr5 65352355 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.678;DP=15;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,291 -chr5 65533163 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-1.684;DP=91;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,30:91:99:844,0,2289 -chr5 65553630 . A T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.074;DP=71;FS=3.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:390,0,2053 -chr5 65566304 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-1.441;DP=81;FS=3.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:269,0,2380 -chr5 65634631 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr5 65634632 . T G 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:349,24,0 -chr5 65763359 . G A 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr5 65768192 . C T 934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:963,72,0 -chr5 65770992 . G A 444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:473,33,0 -chr5 65771817 . T C 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 -chr5 65771949 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr5 65950017 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.586;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:460,0,605 -chr5 66051497 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.993;DP=77;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:408,0,2153 -chr5 66058726 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=-1.452;DP=48;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:309,0,1368 -chr5 66059104 . A AT 430 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.070;DP=19;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:12:467,0,12 -chr5 66059467 . CA C 540.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.315;DP=25;FS=9.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:17:567,0,17 -chr5 66062874 . G C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.829;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:260,0,1392 -chr5 66069859 . CTGATGT C 277.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:315,26,0 -chr5 66495973 . TCTGTGTAGAAATCATAATTTTTAAAAAAAAGTGTTCAATGAATATATGAAAACACTCCCCTGACAATGACTGCAGGCCCAC T 14098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.934;ClippingRankSum=0.834;DP=353;FS=5.025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=27.39;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,334:343:99:14136,1117,0 -chr5 66894936 . C G 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:409,30,0 -chr5 66895826 . AT A 210.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:245,0,0 -chr5 66937144 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=-0.041;DP=61;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:337,0,1715 -chr5 67004540 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,131 -chr5 67005376 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,211 -chr5 67473240 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-1.387;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:676,0,687 -chr5 67473386 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.164;DP=30;FS=7.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=29.03;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:899,0,499 -chr5 67474028 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=1.383;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:481,0,538 -chr5 67474149 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=1.889;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=18.17;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:537,0,1029 -chr5 67474467 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:261,0,277 -chr5 67474520 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-2.147;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=19.49;ReadPosRankSum=2.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:496,0,299 -chr5 67474575 . G C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:245,0,204 -chr5 67478544 . G A 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-1.160;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1094,0,745 -chr5 67530488 . G GA 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-3.840;DP=387;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=0.80;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,61:356:99:346,0,8343 -chr5 67571503 . AT A 558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.894;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:596,0,902 -chr5 67620931 . T C 208.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:237,0,22 -chr5 67844850 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.868;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:455,0,331 -chr5 67877341 . G A 1558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.749;DP=94;FS=2.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:1587,0,1607 -chr5 67877974 . C A 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.771;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:854,0,1171 -chr5 67878735 . A T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.393;DP=33;FS=3.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:431,0,750 -chr5 67878950 . G T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.879;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:420,0,367 -chr5 67878961 . CT C 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-1.970;DP=23;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:275,0,274 -chr5 67880700 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.801;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:468,0,732 -chr5 67936271 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:233,0,65 -chr5 67937706 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-1.280;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:262,0,358 -chr5 67989594 . TA T 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.191;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:415,0,1698 -chr5 68354388 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:265,0,450 -chr5 68396587 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-1.499;DP=61;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:351,0,1699 -chr5 68396624 . CCCTGTGAACAGAGAGACACAATGACTTACAGACGCGTCATCACTCAACCCCGGTGGACACAAAATACAGAGGGAGGTCTGGCTTTCATTACACA C 221.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=2.368;DP=64;FS=2.962;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=3.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:259,111,0 -chr5 68433061 . AGTAAGCATTTTGATAGTGATTTATAATAGAAGATAATAGTTATTTGAGTATTAAACTGTTATAATTATACTAGTGGTAATGATTTATAACACAAACTCATCTTTCATTACAG A 1844.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=2.741;DP=43;FS=2.578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=32.23;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,40:43:99:1882,162,0 -chr5 68602746 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.377;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,882 -chr5 68659589 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-1.001;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=21.09;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:450,0,245 -chr5 68665365 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.322;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=3.19;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:382,0,3498 -chr5 68667991 . T TA 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.229;DP=94;FS=2.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:356,0,1432 -chr5 68668567 . A T 2219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=1.200;DP=206;FS=6.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,70:204:99:2248,0,4643 -chr5 68668690 . G A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.275;DP=228;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,63:228:99:1398,0,5933 -chr5 68669117 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.199;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,26:124:99:338,0,4645 -chr5 68669134 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.030;DP=108;FS=17.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=2.57;ReadPosRankSum=-2.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:306,0,4240 -chr5 68674525 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-1.414;DP=125;FS=7.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=11.40;ReadPosRankSum=2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,44:125:99:1453,0,2738 -chr5 68679988 . C T 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-0.065;DP=145;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=11.15;ReadPosRankSum=3.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,49:145:99:1645,0,3319 -chr5 68684891 . C T 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.650;DP=127;FS=3.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:1478,0,2559 -chr5 68684954 . A G 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.814;DP=135;FS=4.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1585,0,3037 -chr5 68688468 . A T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.561;DP=84;FS=4.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=8.09;ReadPosRankSum=2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,28:84:99:708,0,2062 -chr5 69009847 . G T 2778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-2.729;DP=165;FS=6.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,88:165:99:2807,0,2855 -chr5 69010218 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=3.289;DP=64;FS=25.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:598,0,1603 -chr5 69010795 . A G 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=-0.556;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=16.34;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:1744,0,1958 -chr5 69010987 . G A 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.147;DP=93;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:942,0,5131 -chr5 69011113 . A G 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.071;DP=73;FS=13.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,43:73:99:1466,0,1104 -chr5 69014531 . GT G 2750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.467;DP=168;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,104:161:99:2788,0,2768 -chr5 69166985 . AAGGCAAGATGGAGAACTCCTGTTTATGCTCGTGTTTAGAGAGAATTGTGGTGATTCTGATTTGATTGTTGTGGTTGTAAT A 2932.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2970,244,0 -chr5 69260366 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=1.061;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:373,0,131 -chr5 69329032 . A G 2785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=-1.033;DP=134;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=20.79;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,63:75:93:2814,0,93 -chr5 69351957 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.895;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:515,0,471 -chr5 69353568 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.789;DP=18;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:482,0,159 -chr5 69372483 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.808;DP=45;FS=4.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:806,0,752 -chr5 69436777 . C A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.527;DP=36;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:446,0,780 -chr5 69449921 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.143;DP=46;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:795,0,769 -chr5 69462399 . G T 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.733;DP=58;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1133,0,2046 -chr5 69462401 . A C 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.116;DP=59;FS=2.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1133,0,2046 -chr5 69462505 . C T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=-1.802;DP=59;FS=2.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=14.83;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:903,0,1125 -chr5 69476337 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.741;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:546,0,1129 -chr5 69476983 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=1.166;DP=56;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:710,0,1145 -chr5 69487364 . G A 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.046;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:726,0,962 -chr5 69672175 . CA C 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-2.362;DP=92;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:683,0,1154 -chr5 69801775 . C CA 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-2.753;DP=160;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,35:141:99:454,0,2197 -chr5 69805938 . G A 6374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.784;DP=345;FS=1.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,192:345:99:6403,0,5494 -chr5 70183196 . CA C 679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:717,63,0 -chr5 70183263 . CA C 349.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr5 70183265 . A T 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr5 70232455 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.923;DP=32;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:572,0,568 -chr5 70262153 . GCCTACAAATAACAAAAAAGCAAACAAAGACACATTATTAATGCGTGCTGATTTTAAACCACTTCAACAAATCTCTTGAAATAAACGATGTA G 3740.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=1.863;DP=91;FS=3.807;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=32.48;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,85:91:99:3778,138,0 -chr5 70266571 . G T 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 -chr5 70266642 . T C 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr5 70282627 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.053;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:296,0,305 -chr5 70283502 . T TA 591.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=1.281;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:31:629,31,0 -chr5 70283559 . C A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr5 70284885 . AT A 894.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=1.316;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:37:932,37,0 -chr5 70311497 . A G 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:523,39,0 -chr5 70318442 . GCTGCAGCAGACAGAGAATAGAGTCTAAATATACAGCTTCACGTGTAGACGTCTGACTTTATGAAGCAGAAGGTTTTAC G 1924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-0.697;DP=48;FS=6.887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1962,138,0 -chr5 70456127 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:92:516,0,92 -chr5 70459539 . T C 6803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=-2.931;DP=301;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,188:296:99:6832,0,3571 -chr5 70478139 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:259,18,0 -chr5 70478145 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr5 70521662 . G GTA 233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr5 70729970 . C G 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 -chr5 70810221 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.161;DP=54;FS=6.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:350,0,2977 -chr5 70813949 . C T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-0.501;DP=70;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:967,0,1335 -chr5 70855746 . CT C 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=1.035;DP=81;FS=3.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:487,0,998 -chr5 70856214 . CAT C 1679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1717,123,0 -chr5 70856518 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.058;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,534 -chr5 70876720 . C T 651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:680,48,0 -chr5 70876735 . TC T 225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:263,21,0 -chr5 70876812 . T C 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:526,36,0 -chr5 70877222 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr5 70877381 . C A 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:836,63,0 -chr5 70877760 . T C 1044.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1073,75,0 -chr5 70878292 . T C 1698.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1727,129,0 -chr5 70919491 . A G 7638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7667,532,0 -chr5 71058719 . C T 1151.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1180,87,0 -chr5 71083661 . C A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr5 71083662 . A T 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr5 71084239 . TC T 491.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:529,36,0 -chr5 71228843 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:257,18,0 -chr5 71288864 . G A 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 -chr5 71293437 . C A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr5 71304678 . TA T 269.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.48;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:306,6,0 -chr5 71304814 . A T 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:630,45,0 -chr5 71357649 . ACTTCAAACGAGAGAGAGAAAAAACAACTTTCAAAATGAGGAGACGCGAACTCTTCGGATAAATTTACACTATTGTGAATGATAAGAAGACTTCTGTATAGTATTTATGGCAGTGACAGATCTTAC A 610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.593;DP=26;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:648,0,2622 -chr5 71460155 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,134 -chr5 71671349 . A C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.230;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:448,0,684 -chr5 71673654 . C T 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.710;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=25.59;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1103,0,297 -chr5 71673723 . T C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.893;DP=37;FS=4.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:766,0,472 -chr5 71683033 . G T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=2.810;DP=49;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:635,0,1029 -chr5 71683774 . G T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=1.371;DP=39;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:847,0,577 -chr5 71684300 . T G 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.256;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:994,0,1309 -chr5 71719049 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:542,0,917 -chr5 71719057 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.174;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:542,0,917 -chr5 71719348 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr5 71721847 . G C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=2.528;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:52:902,0,52 -chr5 71738060 . G C 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.885;DP=65;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,42:65:99:1441,0,765 -chr5 71752846 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:231,0,185 -chr5 71798528 . CA C 283.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:321,30,0 -chr5 71800744 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.935;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:406,0,328 -chr5 71803278 . A C 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.399;DP=33;FS=6.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:973,0,208 -chr5 71803390 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=2.609;DP=29;FS=20.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:544,0,846 -chr5 71803391 . C A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=1.822;DP=25;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=21.07;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:555,0,846 -chr5 71803591 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=1.318;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:470,0,169 -chr5 71803629 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-1.610;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.098;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:369,0,241 -chr5 71803833 . G GA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.106;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:254,0,194 -chr5 71804390 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:471,0,312 -chr5 71805591 . T A 2319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.875;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,63:93:99:2348,0,802 -chr5 71808092 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-3.091;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:424,0,340 -chr5 71810478 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.861;DP=26;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=26.95;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:729,0,564 -chr5 71810485 . A T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.539;DP=26;FS=6.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=25.22;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:684,0,654 -chr5 71811037 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=3.225;DP=19;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:348,0,753 -chr5 71811039 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=3.091;DP=18;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:348,0,753 -chr5 71811133 . AT A 325.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.736;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:14:363,14,0 -chr5 71811168 . A T 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:752,54,0 -chr5 71811749 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=1.081;DP=49;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:264,0,1428 -chr5 71816683 . G A 6719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.085;DP=361;FS=13.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=18.61;ReadPosRankSum=-1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,203:361:99:6748,0,5713 -chr5 71821208 . T C 3463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.425;ClippingRankSum=1.318;DP=271;FS=12.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=12.78;ReadPosRankSum=2.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,101:271:99:3492,0,5588 -chr5 71880849 . G A 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=-1.417;DP=56;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1152,0,2307 -chr5 71880856 . G C 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.812;DP=59;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1152,0,2307 -chr5 71881578 . C A 1300.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=1.083;DP=33;FS=5.509;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=29.70;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1329,93,0 -chr5 71881655 . C CT 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.715;DP=14;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:242,0,173 -chr5 71881794 . A G 993.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1022,72,0 -chr5 71881814 . G A 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1000,72,0 -chr5 71881868 . AT A 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.817;DP=31;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:256,0,204 -chr5 71882027 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.225;DP=36;FS=5.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:494,0,1141 -chr5 71882171 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=1.555;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:277,0,376 -chr5 71882589 . C A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.309;DP=41;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=27.53;ReadPosRankSum=2.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1157,0,260 -chr5 71883032 . G GTGTA 369.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:407,29,0 -chr5 71883461 . G A 238.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:267,0,16 -chr5 71883799 . A C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-1.217;DP=24;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:447,0,398 -chr5 71884861 . C T 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=1.141;DP=93;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.682;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:1325,0,1692 -chr5 71891322 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:268,0,642 -chr5 71891433 . T A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.094;DP=35;FS=6.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:1009,0,236 -chr5 71903401 . C A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.345;DP=98;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1566,0,1749 -chr5 71998235 . A AC 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.483;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.08;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:635,0,481 -chr5 71998911 . T A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=3.434;DP=28;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:613,0,743 -chr5 71999940 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr5 72000434 . AT A 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=1.441;DP=26;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:299,0,309 -chr5 72000827 . G A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=1.488;DP=57;FS=9.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1103,0,861 -chr5 72020943 . C T 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.941;ClippingRankSum=0.800;DP=77;FS=1.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:1211,0,1342 -chr5 72032447 . C A 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.843;DP=70;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:1117,0,1230 -chr5 72057314 . GA G 2434.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:2472,218,0 -chr5 72080058 . T A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr5 72085760 . T C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr5 72119449 . G A 200.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:229,21,0 -chr5 72147260 . G T 5436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.694;DP=255;FS=3.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,165:255:99:5465,0,2978 -chr5 72147279 . G A 7091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=1.388;DP=292;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=24.29;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,196:292:99:7120,0,2550 -chr5 72150735 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=1.184;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:373,0,328 -chr5 72151950 . AGGCTAGTTTTTAACAGCAGATGGCACTCTAGGGTAGTGTTTAACAGCAGATGCCGCTCTAGGCTAGTGTTTAACAGCAGATGGTGCTCTAGGCTAGTGATTAAAAGCAGATGGCGCTCTG A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=19.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:248,0,1287 -chr5 72153013 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:258,0,105 -chr5 72165146 . G T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=1.676;DP=41;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=25.75;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,29:41:99:1084,0,293 -chr5 72167489 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.457;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:280,0,376 -chr5 72172525 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.976;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=19.60;ReadPosRankSum=-2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:479,0,323 -chr5 72176231 . C T 974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1003,72,0 -chr5 72217177 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:318,0,361 -chr5 72222044 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:238,0,409 -chr5 72228789 . T G 749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:778,57,0 -chr5 72228818 . C T 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:721,51,0 -chr5 72362219 . TCTAGATGTGGTGTTAAAGAGAAATAAACATTACAAAAAATATATGTGCATCTCACAAATGTTTATTCCGAGTCTGGGGTTTCTTAC T 18257.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.295;DP=412;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,408:411:99:18295,1484,0 -chr5 72452833 . T C 2025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2054,157,0 -chr5 72454773 . A G 5263.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:5292,374,0 -chr5 72463432 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr5 72473479 . G A 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1381,99,0 -chr5 72474396 . T C 810.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:839,66,0 -chr5 72478769 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.801;DP=48;FS=10.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:389,0,1257 -chr5 72486701 . T C 364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:393,30,0 -chr5 72509756 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=17.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:294,0,51 -chr5 72510323 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr5 72514546 . A C 1018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1047,72,0 -chr5 72535703 . C T 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr5 72535779 . G T 2939.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2968,208,0 -chr5 72535827 . C T 4269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:4298,310,0 -chr5 72537317 . A G 577.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:606,45,0 -chr5 72584636 . G A 3208.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3237,237,0 -chr5 72585138 . G A 3515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3544,256,0 -chr5 72589408 . G C 702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:731,54,0 -chr5 72592510 . A G 4052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4081,301,0 -chr5 72601395 . G T 1079.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1108,75,0 -chr5 72649278 . T A 948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:977,72,0 -chr5 72649516 . T TA 2071.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2424,246,0 -chr5 72657454 . G A 827.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:856,60,0 -chr5 72657560 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:352,27,0 -chr5 72664938 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=-0.878;DP=53;FS=7.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:357,0,1470 -chr5 72664950 . A C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.808;DP=67;FS=5.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:600,0,1698 -chr5 72666617 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-2.022;DP=111;FS=39.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,20:111:99:308,0,3390 -chr5 72673200 . A G 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr5 72673300 . A T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.829;DP=21;FS=19.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=27.80;ReadPosRankSum=2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:612,0,426 -chr5 72673305 . C A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-3.031;DP=22;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=26.53;ReadPosRankSum=2.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:612,0,473 -chr5 72687824 . A AT 245.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:316,32,0 -chr5 72721160 . G A 2146.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2175,163,0 -chr5 72746124 . T C 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:528,36,0 -chr5 72746126 . G A 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:528,36,0 -chr5 72751107 . A G 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=2.550;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1127,0,1159 -chr5 72755145 . C A 432.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=33.27;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:3:459,3,0 -chr5 72761698 . A T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=3.191;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:378,0,338 -chr5 72762527 . A T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.277;DP=47;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1071,0,617 -chr5 72771206 . C T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=1.225;DP=54;FS=5.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1068,0,811 -chr5 72776046 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=1.449;DP=26;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:333,0,580 -chr5 72801461 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr5 72815950 . T G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=-0.588;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:899,0,900 -chr5 72817913 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-3.674;DP=69;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:512,0,4194 -chr5 72817919 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=-3.305;DP=71;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=6.81;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:512,0,4194 -chr5 72820173 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=2.547;DP=74;FS=8.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:970,0,1607 -chr5 72823038 . C T 2319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-1.592;DP=142;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:2348,0,2389 -chr5 72918167 . G A 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:445,33,0 -chr5 72918249 . A C 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -chr5 72923961 . CA C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.930;DP=20;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:31:266,0,31 -chr5 72923982 . G GT 453.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=1.214;DP=25;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:64:601,64,0 -chr5 72936201 . T A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr5 72957221 . G T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr5 72957387 . TACCTGATTGGGGAAGAATGATGAATGTTAAAGCGGATGCTTGTTTTCTCTGGCGGCAGGATTAAAGTGGCAGAACTC T 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.290;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=34.29;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:483,0,738 -chr5 72957676 . T C 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:485,33,0 -chr5 72957849 . AACCTGTGCAAATACATGGATGAGCAACTTATTAGTGATTGTTCTTGAGCACTGAGCACACTGAGTGATTTACAC A 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=2.606;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=32.99;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:631,0,862 -chr5 72990564 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:289,0,488 -chr5 73379495 . GTC G 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.138;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:457,0,476 -chr5 73583547 . TA T 216.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:20:249,20,0 -chr5 73587207 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr5 74752100 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.859;ClippingRankSum=2.169;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.99;ReadPosRankSum=-2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:478,0,474 -chr5 74756101 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,214 -chr5 74756187 . AT A 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:81:328,0,81 -chr5 74854492 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.969;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=14.08;ReadPosRankSum=2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:690,0,857 -chr5 74854937 . A T 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.729;DP=82;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1194,0,1574 -chr5 74854955 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.090;DP=66;FS=6.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1008,0,1190 -chr5 74932827 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.462;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:705,0,567 -chr5 74933243 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=1.421;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:426,0,758 -chr5 74935592 . T A 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr5 74982120 . G C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:335,0,125 -chr5 74983116 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,619 -chr5 74986930 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=1.093;DP=56;FS=3.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:848,0,925 -chr5 75025912 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,124 -chr5 75057879 . C T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.458;DP=73;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=15.33;ReadPosRankSum=2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1147,0,1307 -chr5 75060302 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.379;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:829,0,659 -chr5 75072955 . TTCATCA T 406.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:44:444,44,0 -chr5 75078593 . C T 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-1.447;DP=75;FS=6.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1031,0,1498 -chr5 75097368 . T A 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 -chr5 75124007 . GAAGTCAATGGTTACTGGTTTACAATACTATAA G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:43:255,0,43 -chr5 75130582 . TA T 465.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:503,43,0 -chr5 75130969 . A T 411.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=33.38;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:3:438,0,3 -chr5 75138109 . C T 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=-1.177;DP=178;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.763;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,58:169:99:1707,0,3247 -chr5 75153161 . C T 2534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.944;DP=150;FS=7.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:2563,0,2551 -chr5 75158030 . G A 2878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=-1.112;DP=200;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,99:199:99:2907,0,3387 -chr5 75158576 . G A 2686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-1.857;DP=137;FS=0.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=19.61;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,83:137:99:2715,0,1776 -chr5 75172741 . T C 3407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.749;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.111;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,95:190:99:3436,0,3558 -chr5 75179380 . T A 609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:638,45,0 -chr5 75180839 . G T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr5 75181156 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.168;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:390,0,696 -chr5 75182332 . G A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.117;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:727,0,745 -chr5 75182943 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-1.491;DP=24;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.66;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:308,0,518 -chr5 75245744 . A G 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 -chr5 75245835 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:240,0,130 -chr5 75245884 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-0.667;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:466,0,486 -chr5 75245971 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.016;DP=36;FS=7.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:567,0,689 -chr5 75257589 . C A 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:275,21,0 -chr5 75259154 . G T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-1.250;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:556,0,99 -chr5 75259442 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:412,0,552 -chr5 75259697 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.113;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:492,0,473 -chr5 75266926 . T A 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-1.156;DP=73;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1092,0,954 -chr5 75267158 . A T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=-2.376;DP=78;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:608,0,2097 -chr5 75267208 . C A 991.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.620;DP=77;FS=13.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:1226,0,1227 -chr5 75272224 . C T 2323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.979;DP=81;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=28.69;ReadPosRankSum=1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,65:81:99:2352,0,243 -chr5 75272253 . A G 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.713;ClippingRankSum=0.418;DP=88;FS=8.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:558,0,2200 -chr5 75278028 . C T 2862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.955;DP=167;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,83:167:99:2891,0,2926 -chr5 75281384 . G A 1658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.120;DP=120;FS=10.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:1687,0,2335 -chr5 75281555 . A G 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=-4.469;DP=90;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:90:99:1169,0,1626 -chr5 75283194 . GT G 1830.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-1.259;DP=130;FS=3.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1868,0,1946 -chr5 75284311 . G A 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=-0.068;DP=120;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1899,0,3274 -chr5 75284791 . C G 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.467;DP=56;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1025,0,1028 -chr5 75286281 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-1.071;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.190;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:715,0,1075 -chr5 75286703 . T A 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-2.809;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=26.26;ReadPosRankSum=2.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:99:954,0,202 -chr5 75288013 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=2.834;DP=85;FS=2.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=3.89;ReadPosRankSum=2.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:359,0,2584 -chr5 75288247 . G A 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-1.067;DP=109;FS=8.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1753,0,1863 -chr5 75288745 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:229,0,156 -chr5 75308910 . C T 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.104;DP=51;FS=5.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:841,0,961 -chr5 75310572 . G A 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.088;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1567,0,1543 -chr5 75311302 . G A 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.519;DP=83;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1479,0,1219 -chr5 75316352 . C T 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-1.486;DP=123;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1756,0,2318 -chr5 75316755 . G A 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=1.088;DP=95;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:1527,0,1740 -chr5 75317666 . G A 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=1.561;DP=76;FS=4.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,29:75:99:990,0,1551 -chr5 75318712 . C T 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.596;DP=101;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:1201,0,2265 -chr5 75320362 . T C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=-0.711;DP=81;FS=6.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:626,0,2479 -chr5 75320588 . T G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-0.046;DP=37;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=14.64;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:570,0,772 -chr5 75369967 . C CT 219.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:257,27,0 -chr5 75418393 . G T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=-0.170;DP=69;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:815,0,1554 -chr5 75420873 . C T 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=-0.659;DP=66;FS=11.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=25.30;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,43:66:99:1698,0,1700 -chr5 75420875 . C T 1677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.259;DP=68;FS=8.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,45:68:99:1706,0,1700 -chr5 75421025 . C T 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=1.107;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=15.67;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:1266,0,1450 -chr5 75422779 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.305;DP=73;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1131,0,1238 -chr5 75469594 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.074;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:546,0,383 -chr5 75474532 . A C 633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:662,48,0 -chr5 75476287 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:292,0,244 -chr5 75476341 . C T 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:529,39,0 -chr5 75476429 . T C 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:675,51,0 -chr5 75476716 . T C 721.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:750,54,0 -chr5 75476795 . A C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr5 75563678 . G T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr5 75573232 . T G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.312;ClippingRankSum=5.257;DP=139;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=11.29;ReadPosRankSum=-2.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:1598,0,2261 -chr5 75573292 . C T 3008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=4.800;DP=161;FS=13.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,62:160:99:3037,0,7475 -chr6 1742 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.134;DP=77;FS=2.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:467,0,2031 -chr6 2686 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.329;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:241,0,1016 -chr6 11735 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-1.045;DP=69;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:381,0,3773 -chr6 11740 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.282;DP=63;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:381,0,3773 -chr6 12789 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.153;DP=42;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:324,0,2191 -chr6 12795 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.456;DP=41;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:314,0,2191 -chr6 12906 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.041;DP=68;FS=3.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:457,0,1832 -chr6 17588 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-1.182;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:821,0,1243 -chr6 18017 . T C 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.154;DP=72;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:811,0,1605 -chr6 22809 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-0.345;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:556,0,1125 -chr6 22980 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.088;DP=42;FS=5.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:335,0,1066 -chr6 38985 . G C 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.056;DP=97;FS=1.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:1305,0,1899 -chr6 39001 . G A 1926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=1.603;DP=96;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,59:96:99:1955,0,1258 -chr6 39276 . G A 2753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=-0.526;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=25.74;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,74:106:99:2782,0,808 -chr6 39357 . A C 2418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.142;DP=119;FS=7.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,77:119:99:2447,0,1311 -chr6 39829 . A G 4850.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:4879,352,0 -chr6 40105 . A G 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=-0.524;DP=141;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,41:141:99:1034,0,3692 -chr6 40599 . C T 3864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:3893,283,0 -chr6 41027 . G T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.477;DP=131;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,40:130:99:1001,0,3236 -chr6 41294 . T C 5112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:5141,387,0 -chr6 42277 . A G 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.387;DP=138;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,51:137:99:1730,0,2853 -chr6 43451 . C T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.118;DP=123;FS=5.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:1600,0,2463 -chr6 44172 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.734;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:271,0,1077 -chr6 44331 . TGC T 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.065;DP=17;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:378,0,108 -chr6 50852 . GAGGTGAGAGACGCGGTTATCACTCGTAAACACTGCGGTCATTCATCCAGCCTGTGTTTGAACCTGTGTGTGTGTGTGTGTTC G 3007.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=1.902;DP=72;FS=2.801;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=38.22;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:3045,274,0 -chr6 51067 . AGTAAGAGCCGCCCCCCTCCACTGGACCCTCAGGTGTGCTCGGGTATGCTCAGGTGTGTGTTCTGCTTCTCCACAG A 2157.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=2.303;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=34.80;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,51:62:99:2195,0,2564 -chr6 51152 . A G 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=1.813;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=14.62;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:847,0,6406 -chr6 55238 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.380;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:497,0,567 -chr6 56009 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:300,0,1054 -chr6 67545 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.502;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:455,0,565 -chr6 69535 . C G 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.111;DP=100;FS=0.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1179,0,2060 -chr6 71958 . CA C 441.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.740;DP=14;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=31.53;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:8:478,0,8 -chr6 71961 . ACACACACG A 441.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:8:478,0,8 -chr6 87095 . GAGGTAAAGACACTCCTGCAGCACATGCTCTGAGTGTGTGGTGTTACTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC G 1583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=1.100;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=25.54;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,53:61:99:1621,0,1488 -chr6 110716 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.897;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:351,0,1518 -chr6 152319 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.830;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:564,0,1071 -chr6 153543 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=1.424;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:247,0,990 -chr6 156381 . G T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.654;DP=57;FS=8.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:445,0,1511 -chr6 158731 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=-0.391;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:449,0,1767 -chr6 158772 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-2.703;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:232,0,1122 -chr6 217839 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.009;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=24.20;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:488,0,200 -chr6 223434 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.255;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:302,0,509 -chr6 313383 . T C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.270;DP=37;FS=7.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:453,0,858 -chr6 444204 . CGGTACGGGAGTGTTTAATACTCTGAACACCGCACTGATGATTACTGCATGATGACTGACACACTGTCTGACCAATCACA C 4713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=1.791;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=30.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,110:112:99:4751,401,0 -chr6 451459 . T TG 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.158;DP=17;FS=9.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:308,0,129 -chr6 910471 . GA G 381.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:26:419,0,26 -chr6 912173 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-2.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:378,0,126 -chr6 912246 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=-0.957;DP=22;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:28:718,0,28 -chr6 927190 . G C 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.190;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=29.50;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1444,0,190 -chr6 935764 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-0.589;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=31.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:59:1126,0,59 -chr6 1262026 . C T 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.681;DP=64;FS=6.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,50:64:99:1911,0,276 -chr6 1269463 . C T 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.339;DP=53;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,37:53:99:1412,0,442 -chr6 1269799 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.452;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:442,0,365 -chr6 1271077 . A T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.416;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=14.59;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:320,0,398 -chr6 1272615 . GC G 1029.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.323;DP=32;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=32.18;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,29:32:31:1067,0,31 -chr6 1274517 . G A 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.297;DP=28;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=33.92;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:86:978,0,86 -chr6 1274554 . C A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=31.05;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:35:526,0,35 -chr6 1274758 . T C 686.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-0.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=34.34;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:18:715,18,0 -chr6 1275406 . C G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-0.263;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:466,0,367 -chr6 1275556 . T TA 420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:458,45,0 -chr6 1443576 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.712;DP=53;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:262,0,1526 -chr6 1533040 . G T 2406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.962;DP=89;FS=4.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=27.04;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,63:88:99:2435,0,609 -chr6 1533101 . T G 1950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-0.877;DP=71;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,52:71:99:1979,0,417 -chr6 1533188 . A C 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.685;DP=52;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=31.84;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,42:52:99:1684,0,199 -chr6 1601720 . A G 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-1.740;DP=66;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,42:66:99:1452,0,798 -chr6 1614551 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-4.506;DP=58;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.06;ReadPosRankSum=-4.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:496,0,1357 -chr6 1616180 . TGAAACATCAAGAACACACACAGTCAATCTTCAGCTTTAATGCTGGATCATGGAAGAGGAGCAGAAGCGCTTCATACCC T 4076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:4114,389,0 -chr6 1635298 . A G 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1086,78,0 -chr6 1635594 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:78:416,0,78 -chr6 1635738 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=1.096;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:270,0,281 -chr6 1636644 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:245,0,66 -chr6 1637102 . A C 370.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:399,27,0 -chr6 1644542 . T C 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=1.907;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=31.76;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,48:55:99:1775,0,259 -chr6 1652504 . A T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.023;DP=45;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:886,0,648 -chr6 1652516 . C A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.496;DP=48;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.156;QD=21.70;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,31:48:99:1070,0,566 -chr6 1659544 . G A 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:743,51,0 -chr6 1659554 . T C 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:743,51,0 -chr6 1671620 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,394 -chr6 1672065 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,472 -chr6 1672068 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=22.12;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,472 -chr6 1690166 . G A 1073.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1102,78,0 -chr6 1690184 . T C 1105.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.299;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1134,84,0 -chr6 1707866 . C T 3655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-4.991;DP=154;FS=5.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=23.74;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,103:154:99:3684,0,3665 -chr6 1707968 . G A 16661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-2.654;DP=464;FS=38.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=32.15;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,395:459:99:16690,0,134 -chr6 1710812 . C A 791.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:820,57,0 -chr6 1711078 . C A 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:42:601,42,0 -chr6 1711085 . T C 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:601,42,0 -chr6 1711177 . G T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.517;DP=38;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:766,0,1248 -chr6 1711184 . T C 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.958;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=26.24;ReadPosRankSum=2.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:894,0,531 -chr6 1711264 . A T 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=2.078;DP=76;FS=10.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,44:76:99:1552,0,1137 -chr6 1711445 . C A 4837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-2.026;DP=152;FS=6.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=31.83;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,123:152:99:4866,0,496 -chr6 1711462 . T A 10563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:10592,731,0 -chr6 1711539 . T C 4026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.880;ClippingRankSum=-1.413;DP=172;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=23.41;ReadPosRankSum=4.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,113:172:99:4055,0,4224 -chr6 1711548 . C T 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.126;DP=159;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,53:159:99:1457,0,9023 -chr6 1715389 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=23.73;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:313,0,141 -chr6 1720238 . GT G 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.537;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:399,0,110 -chr6 1721747 . C T 649.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.251;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:27:678,0,27 -chr6 1721848 . T C 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.644;DP=28;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:69:800,0,69 -chr6 1738136 . G A 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.063;DP=33;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.499;QD=27.63;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:940,0,180 -chr6 1739142 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.350;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=29.94;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:597,0,113 -chr6 1739243 . T C 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr6 1739986 . A G 200.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:229,0,19 -chr6 1740122 . A T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:272,0,264 -chr6 1741731 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=28.21;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:395,0,84 -chr6 1741791 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.240;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=30.05;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:479,0,314 -chr6 1741803 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:479,0,314 -chr6 1743647 . G T 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.402;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:926,0,160 -chr6 1750973 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.919;DP=17;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=30.80;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:37:669,0,37 -chr6 1750976 . G T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.919;DP=17;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:37:669,0,37 -chr6 1755877 . C T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=1.236;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=23.73;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:574,0,177 -chr6 1865333 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.139;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:358,0,201 -chr6 1865417 . G T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.312;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:680,0,540 -chr6 1904340 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=1.806;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:246,0,883 -chr6 1904421 . C T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-2.913;DP=52;FS=7.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,41:52:99:1600,0,196 -chr6 1905212 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.933;DP=42;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:301,0,1157 -chr6 1954487 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-0.722;DP=84;FS=4.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:857,0,1666 -chr6 1959246 . G A 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.526;DP=89;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:1030,0,2023 -chr6 1962650 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-2.309;DP=57;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:523,0,1448 -chr6 1967914 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.087;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:230,0,677 -chr6 1968482 . A G 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.239;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:500,0,289 -chr6 1970418 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.215;DP=49;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:489,0,2792 -chr6 1970928 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.174;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,1928 -chr6 1970933 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-1.425;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,1928 -chr6 1975339 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.253;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:286,0,464 -chr6 1975584 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-1.129;DP=82;FS=5.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:275,0,3020 -chr6 1975744 . T A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=-2.814;DP=82;FS=3.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:343,0,4486 -chr6 1977486 . G GT 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.425;DP=113;FS=10.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,30:110:99:375,0,2262 -chr6 2168178 . A T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.126;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=11.85;ReadPosRankSum=-2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:431,0,509 -chr6 2181048 . C T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.631;DP=47;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:689,0,722 -chr6 2192906 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=30.34;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:362,0,148 -chr6 2193485 . A G 624.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=26.01;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:23:653,23,0 -chr6 2193490 . A G 590.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=1.897;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=32.82;ReadPosRankSum=-1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:22:619,0,22 -chr6 2193968 . T TA 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:369,0,185 -chr6 2194961 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.230;DP=41;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:231,0,1225 -chr6 2198195 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.027;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:675,0,1152 -chr6 2198367 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.308;DP=70;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:509,0,1853 -chr6 2240226 . A G 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.312;DP=88;FS=2.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:1035,0,2053 -chr6 2280626 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-1.789;DP=24;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=11.78;ReadPosRankSum=-2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:311,0,521 -chr6 2313354 . T C 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-1.609;DP=26;FS=12.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:522,0,358 -chr6 2351386 . G T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.055;DP=33;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:599,0,1423 -chr6 2356156 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.603;DP=30;FS=6.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:360,0,1261 -chr6 2356194 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.542;DP=29;FS=6.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:260,0,1189 -chr6 2361099 . GCAGGTGCACCTCTGAATGTTAAAGCTTTGGTCTGTCTCCAGTGTTTCAGGGTTTGCTCAAAGCGCTGAGCTGTTTTCTGTGTGTCTC G 1418.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=1.623;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1456,124,0 -chr6 2407640 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:342,0,377 -chr6 2420210 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.220;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:376,0,254 -chr6 2422209 . C A 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr6 2424458 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:407,0,404 -chr6 2428975 . C T 1871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.341;DP=61;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=30.68;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,51:61:90:1900,0,90 -chr6 2949446 . A C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.307;DP=56;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:524,0,1460 -chr6 2949875 . A T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=1.313;DP=49;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:710,0,2308 -chr6 2950147 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.988;DP=45;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:274,0,1284 -chr6 2951645 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.135;DP=51;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:299,0,1431 -chr6 3000762 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=3.303;DP=40;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:473,0,828 -chr6 3004070 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.951;DP=66;FS=6.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:230,0,1989 -chr6 3030143 . G A 1000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.052;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:1029,0,1720 -chr6 3062856 . G A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.334;DP=58;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=13.24;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:796,0,1218 -chr6 3062895 . T C 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.033;DP=56;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:904,0,1008 -chr6 3080639 . A T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-1.601;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=17.12;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:559,0,552 -chr6 3081301 . G A 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-0.559;DP=52;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:1069,0,747 -chr6 3101823 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.213;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:297,0,1293 -chr6 3102042 . T A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.129;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:642,0,375 -chr6 3102315 . C T 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-1.511;DP=57;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:851,0,1206 -chr6 3102659 . T A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.913;DP=64;FS=8.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1197,0,1140 -chr6 3126372 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.656;DP=20;FS=13.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.99;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,687 -chr6 3126942 . C G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.700;DP=35;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:473,0,1635 -chr6 3127440 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.488;DP=47;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:345,0,1308 -chr6 3128263 . C A 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-0.279;DP=48;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:802,0,889 -chr6 3199927 . A T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr6 3205888 . A G 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.451;DP=67;FS=3.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:806,0,1444 -chr6 3211889 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.203;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:453,0,1997 -chr6 3212332 . T G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.607;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:249,0,1532 -chr6 3276807 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:235,0,60 -chr6 3281211 . A C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-1.503;DP=23;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:552,0,576 -chr6 3289422 . ACAGGTGAACACGGGAGGGGGGAAACACTCTATACAGCATTTAGATCTGTTATTGATATATTTGTTTTTGTTTTGTT A 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=2.143;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=31.99;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:613,0,370 -chr6 3294661 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.441;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,24:84:99:594,0,2275 -chr6 3298447 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.225;DP=50;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.212;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:557,0,1108 -chr6 3316381 . T A 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-1.669;DP=104;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=14.71;ReadPosRankSum=2.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:1558,0,2025 -chr6 3316554 . A T 6732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=-1.489;DP=417;FS=7.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,190:417:99:6761,0,16580 -chr6 3319208 . A G 5606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.526;DP=365;FS=0.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,162:365:99:5635,0,6726 -chr6 3321800 . C A 2798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.444;DP=454;FS=1.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,118:453:99:2827,0,13122 -chr6 3348140 . C T 2824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.244;DP=31;FS=2.817;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=30.37;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,7:12:92:2853,92,0 -chr6 3348183 . T C 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.861;DP=128;FS=11.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:1326,0,981 -chr6 3348189 . C T 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-0.053;DP=139;FS=12.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:1140,0,2053 -chr6 3348276 . A C 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=-0.816;DP=123;FS=9.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=10.08;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:1268,0,965 -chr6 3348307 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=-1.996;DP=67;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=7.34;ReadPosRankSum=-3.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:520,0,963 -chr6 3348611 . A C 1011.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:73:1040,73,0 -chr6 3349309 . C A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr6 3349419 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=31.81;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:42:410,0,42 -chr6 3349660 . T G 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:99:1453,102,0 -chr6 3349704 . C T 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:1453,102,0 -chr6 3349774 . A T 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:99:1453,102,0 -chr6 3349912 . A G 587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:42:616,42,0 -chr6 3351876 . A G 1446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1475,110,0 -chr6 3352040 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:41:491,0,41 -chr6 3367667 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:241,0,116 -chr6 3367675 . G T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.84;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:99:241,0,116 -chr6 3368911 . C T 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr6 3492519 . C G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=-1.038;DP=209;FS=9.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,37:209:99:522,0,6884 -chr6 3497292 . AGTATGAGTTCATCTTTGATTGTGCTGTTTACCCATGAATGTGGGATACGGGAGTAATGTTTCATTGTCATTGCAG A 10951.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.495;DP=320;FS=2.221;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=34.22;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,289:292:99:10989,1036,0 -chr6 3498976 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=3.407;DP=190;FS=26.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,39:190:99:704,0,11535 -chr6 3498982 . T G 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=3.292;DP=180;FS=42.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=4.62;ReadPosRankSum=-4.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:180:99:859,0,5388 -chr6 3502845 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr6 3507990 . T A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=1.010;DP=68;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=15.26;ReadPosRankSum=2.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1066,0,1209 -chr6 3519563 . T A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=3.185;DP=127;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,38:125:99:664,0,2701 -chr6 3519586 . G C 3070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=1.758;DP=144;FS=4.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,95:144:99:3099,0,1623 -chr6 3519626 . G A 3464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=2.841;DP=142;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,97:142:99:3493,0,981 -chr6 3519921 . TC T 1906.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=1.118;DP=141;FS=6.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1944,0,1899 -chr6 3523475 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.465;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:255,0,918 -chr6 3525187 . T C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.034;DP=33;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:686,0,506 -chr6 3525224 . A T 917.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:66:946,66,0 -chr6 3525869 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,481 -chr6 3527507 . G A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr6 3529346 . G T 5084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=-1.409;DP=184;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=27.63;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,132:184:99:5113,0,1263 -chr6 3539508 . T A 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.418;DP=185;FS=5.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,41:185:99:805,0,5655 -chr6 3653224 . G C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.798;DP=79;FS=4.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:1076,0,1662 -chr6 3668041 . T C 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.189;DP=84;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:1219,0,1605 -chr6 3673731 . CAGGTTTGTATCTGGAACATACACATTTATTGATTCGAAGAAGTGCTTAGCTAATACTGCTGCTAATGGGTTTTTTATTGCTTTCCTCTGCTCTCCAT C 2706.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=3.237;DP=77;FS=2.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,65:77:99:2744,0,3723 -chr6 3679833 . C CT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=1.128;DP=228;FS=4.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=0.92;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,38:210:99:247,0,4740 -chr6 3682418 . A T 4459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=-0.474;DP=259;FS=0.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,122:259:99:4488,0,4586 -chr6 3689488 . CAG C 495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-1.466;DP=202;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,33:189:99:533,0,6350 -chr6 3689726 . C CT 900.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.951;DP=128;FS=4.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1234,0,2213 -chr6 3693215 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=-1.581;DP=79;FS=8.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:296,0,2547 -chr6 3693526 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.491;DP=44;FS=4.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=24.52;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,30:44:99:1107,0,384 -chr6 3694007 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.811;DP=76;FS=4.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:252,0,2399 -chr6 3694154 . C T 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-1.522;DP=89;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:1187,0,1583 -chr6 3694190 . C G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.996;DP=76;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:429,0,2147 -chr6 3694211 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.989;DP=77;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=5.66;ReadPosRankSum=-2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:464,0,2070 -chr6 3694243 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=1.873;DP=82;FS=6.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=5.11;ReadPosRankSum=3.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:447,0,2346 -chr6 3695962 . GCTACAGAAACACACCAAACATTCAACGCAGCTTCATCGTAAAATGCACTGCACATCAATAGCCGTGTGTGGCTTTTAGCTATTAGTTTAAAGTGTTTAC G 6778.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-1.033;DP=160;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,156:160:99:6816,540,0 -chr6 3710318 . A T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=4.957;DP=83;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:604,0,2104 -chr6 3710336 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=1.038;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=5.25;ReadPosRankSum=-2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:522,0,2650 -chr6 3713304 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.675;DP=100;FS=9.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:529,0,2923 -chr6 3726207 . A C 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr6 3749712 . G A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.228;DP=71;FS=6.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:1015,0,1410 -chr6 3759394 . G T 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.702;DP=73;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1199,0,1247 -chr6 3761793 . G A 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=-2.184;DP=67;FS=7.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1597,0,523 -chr6 3763953 . T C 2344.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2373,175,0 -chr6 3763974 . T C 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.367;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1054,0,927 -chr6 3764230 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.213;DP=47;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:501,0,1063 -chr6 3764242 . C T 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.115;DP=59;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:1079,0,886 -chr6 3764269 . T C 1880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.540;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,54:76:99:1909,0,520 -chr6 3764354 . G A 2239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2268,166,0 -chr6 3772115 . T C 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:458,33,0 -chr6 3772568 . T C 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr6 3772609 . C T 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:554,39,0 -chr6 3773243 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:364,0,353 -chr6 3775093 . T TC 320.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:34:358,34,0 -chr6 3775408 . C T 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr6 3776057 . G A 1493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.914;DP=103;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=14.50;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:1522,0,1886 -chr6 3776117 . T A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.137;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:428,0,390 -chr6 3827540 . C A 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.148;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1192,0,629 -chr6 3828370 . C G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr6 3829330 . C G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=21.91;ReadPosRankSum=2.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:335,0,177 -chr6 3831696 . A C 741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:770,57,0 -chr6 3832258 . A G 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 -chr6 3833933 . G A 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.662;DP=50;FS=6.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:870,0,810 -chr6 3834132 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-1.654;DP=84;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:441,0,2504 -chr6 3834159 . T C 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.370;DP=86;FS=1.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1572,0,1243 -chr6 3837402 . A T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.308;DP=112;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,35:112:99:931,0,2881 -chr6 3855218 . G A 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=2.124;DP=91;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,32:91:99:1082,0,2016 -chr6 3856813 . A C 280.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:309,0,17 -chr6 3971249 . C A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr6 3979179 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=-1.765;DP=40;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.14;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:234,0,1384 -chr6 3984595 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.129;DP=33;FS=5.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=19.69;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:678,0,435 -chr6 3998232 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.366;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:366,0,1306 -chr6 3998235 . A T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-1.846;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:366,0,1304 -chr6 4012288 . CAGGTCAGTTCAGTTCAGCTCAGCTTAGTTCCCTCTTTACATTCATTTCTGATTCACAAACACTCATCCTGTTTTTAACTCT C 1633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-1.377;DP=41;FS=6.986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:89:1671,89,0 -chr6 4015769 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=1.737;DP=43;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:706,0,883 -chr6 4019593 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=-1.275;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,446 -chr6 4035688 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:259,0,129 -chr6 4048605 . CA C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.394;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:240,0,1093 -chr6 4051249 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=1.768;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:362,0,961 -chr6 4051259 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.122;DP=35;FS=10.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:410,0,1226 -chr6 4051366 . C A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=1.140;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:442,0,890 -chr6 4052584 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.674;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:759,0,539 -chr6 4053502 . AG A 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-0.668;DP=50;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:706,0,972 -chr6 4054839 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.174;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,21:102:99:385,0,3017 -chr6 4057897 . G T 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=1.010;DP=73;FS=3.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1320,0,1315 -chr6 4064842 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.687;DP=61;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:246,0,1827 -chr6 4087157 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=1.065;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:390,0,1320 -chr6 4113988 . ACAGGTGAGGACACGGTGGCTGGTTTACAGAGCCGTGAATCTGAATCCAGGTTCAGACCGTTTCCTGTTTGTCCTG A 1356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.116;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:99:1394,134,0 -chr6 4118481 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.266;DP=42;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:902,0,307 -chr6 4118719 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:379,0,282 -chr6 4121443 . C CT 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.180;DP=26;FS=7.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:373,0,412 -chr6 4173595 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.247;DP=20;FS=16.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:337,0,353 -chr6 4180540 . G T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:381,0,87 -chr6 4181793 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:460,0,656 -chr6 4194189 . G T 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-1.422;DP=25;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:845,0,296 -chr6 4194552 . C A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.684;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:683,0,568 -chr6 4194690 . G T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.669;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:649,0,380 -chr6 4196566 . C G 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.993;DP=38;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:663,0,663 -chr6 4199414 . A T 801.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.482;DP=27;FS=6.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=29.70;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:5:829,0,5 -chr6 4209490 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=1.532;DP=45;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:365,0,1153 -chr6 4222295 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.991;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:576,0,560 -chr6 4222367 . T C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-0.218;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:466,0,478 -chr6 4226902 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.648;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=13.53;ReadPosRankSum=2.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:583,0,854 -chr6 4232335 . C A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.013;DP=43;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:939,0,523 -chr6 4233008 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.634;DP=30;FS=9.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:252,0,795 -chr6 4240214 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,301 -chr6 4240754 . C CAA 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-0.412;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.534;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:357,0,538 -chr6 4241128 . GT G 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.994;DP=35;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:472,0,280 -chr6 4275053 . G GT 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-1.383;DP=35;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:469,0,1364 -chr6 4275054 . G T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.560;DP=36;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:469,0,1363 -chr6 4429423 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:356,0,54 -chr6 4430605 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:259,0,63 -chr6 4433167 . CCACCAT C 493.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:44:531,44,0 -chr6 4434535 . G T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=1.875;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=30.22;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:965,0,115 -chr6 4435098 . A C 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-1.453;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:932,0,226 -chr6 4768055 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:310,0,345 -chr6 4768407 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.185;DP=35;FS=13.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:496,0,760 -chr6 4769757 . G C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=-0.204;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:370,0,948 -chr6 4770429 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=1.152;DP=36;FS=3.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=12.88;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:492,0,798 -chr6 4771882 . C A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.374;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:839,0,742 -chr6 4772239 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,367 -chr6 4775869 . A C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:452,0,246 -chr6 4776583 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.290;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:400,0,489 -chr6 4777400 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.551;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=21.28;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:624,0,336 -chr6 4778098 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.408;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:339,0,611 -chr6 4780052 . AT A 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:38:452,0,38 -chr6 5311249 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:475,0,146 -chr6 6148540 . C T 4954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.656;DP=328;FS=10.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.188;QD=15.11;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,141:327:99:4983,0,6253 -chr6 6190256 . C T 13623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-1.090;DP=281;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=27.19;ReadPosRankSum=3.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,171:281:99:13652,0,2365 -chr6 6192800 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-0.677;DP=35;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:575,0,597 -chr6 6198024 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.197;DP=41;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:652,0,781 -chr6 6415575 . C T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.548;DP=123;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:123:99:1567,0,2608 -chr6 6456796 . C G 3780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.131;DP=231;FS=4.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,110:231:99:3809,0,3862 -chr6 6456953 . C T 4146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=1.488;DP=232;FS=0.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,118:232:99:4175,0,4142 -chr6 6458730 . G A 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-1.099;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:2494,0,2589 -chr6 6704066 . T C 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=-0.460;DP=159;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,63:159:99:2222,0,3183 -chr6 6708101 . C T 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=1.389;DP=264;FS=0.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,68:264:99:1527,0,7524 -chr6 6712199 . GA G 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=-0.274;DP=123;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=1.76;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,24:115:99:254,0,2344 -chr6 6712220 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.668;DP=117;FS=8.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,30:116:99:669,0,3603 -chr6 6712492 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-2.378;DP=131;FS=11.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,26:130:99:261,0,8819 -chr6 6712507 . CT C 1541.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.360;DP=122;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1579,0,2443 -chr6 6719753 . G A 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.027;DP=74;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1311,0,1236 -chr6 6719798 . C A 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-0.419;DP=86;FS=7.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:1580,0,1464 -chr6 6722155 . TGGTATCCAGCATTTATTTGACTATATCGATGCCTTTCCATCATCTTCGAGAGCATTATGAAATTTCTTGATTGTTCTTAATACAGCATAAATTGTTTTGGGACATAGAACAGTTTGGCTGTTGTTCTTTCTTCATTTCTCA T 5251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=2.738;DP=149;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,123:149:99:5289,0,7568 -chr6 6750137 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:434,0,50 -chr6 6852938 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.374;DP=78;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.939;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:396,0,2277 -chr6 6883474 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.039;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:565,0,161 -chr6 6883617 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:261,0,99 -chr6 6884165 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.903;DP=37;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:241,0,1121 -chr6 6890135 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.419;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:388,0,569 -chr6 6890153 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:433,0,743 -chr6 6906698 . G A 2464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.697;ClippingRankSum=1.921;DP=125;FS=0.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=19.72;ReadPosRankSum=9.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:2493,0,1934 -chr6 6914178 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.677;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:347,0,1659 -chr6 6916632 . CT C 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.079;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:336,0,837 -chr6 6916813 . T G 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=-2.382;DP=102;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,33:102:99:845,0,3024 -chr6 6930288 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.758;DP=117;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:763,0,2927 -chr6 7024570 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=-0.066;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:300,0,745 -chr6 7046464 . G T 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.268;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:959,0,527 -chr6 7050455 . A T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-1.967;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:614,0,713 -chr6 7166494 . A G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.431;DP=34;FS=4.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:602,0,562 -chr6 7189724 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=-1.312;DP=49;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:649,0,998 -chr6 7190267 . G A 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.312;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:736,0,1425 -chr6 7193063 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=1.007;DP=36;FS=12.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:275,0,972 -chr6 7274921 . G T 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.281;DP=61;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:1016,0,1088 -chr6 7285160 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=1.110;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:453,0,1562 -chr6 7292077 . C T 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.970;DP=86;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:1408,0,1507 -chr6 7301341 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.217;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:646,0,1224 -chr6 7307728 . A T 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-0.595;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:735,0,493 -chr6 7331262 . AG A 971.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.412;DP=39;FS=1.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=24.92;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,30:38:99:1009,0,150 -chr6 7331680 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=-0.808;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:755,0,1244 -chr6 7331732 . G A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.172;DP=78;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:534,0,1975 -chr6 7370011 . C A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.163;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=31.29;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:94:1674,0,94 -chr6 7370053 . C T 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.065;DP=31;FS=12.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=29.96;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:1158,0,181 -chr6 7370808 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=2.174;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.43;ReadPosRankSum=-2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,437 -chr6 7371123 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=-0.218;DP=27;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=27.32;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:766,0,456 -chr6 7371317 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.269;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:334,0,589 -chr6 7371549 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-1.321;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:243,0,2455 -chr6 7374064 . C A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.628;DP=61;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1157,0,1057 -chr6 7374261 . A T 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=-0.403;DP=54;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1050,0,687 -chr6 7374717 . A T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,551 -chr6 7374729 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:287,0,551 -chr6 7375815 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=3.165;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=20.27;ReadPosRankSum=-3.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,535 -chr6 7376918 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.112;DP=29;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=23.03;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:696,0,435 -chr6 7376955 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:405,0,511 -chr6 7377330 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.784;DP=65;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:352,0,1866 -chr6 7377428 . T C 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.297;DP=66;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:1256,0,1050 -chr6 7383461 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.087;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:808,0,318 -chr6 7416153 . A T 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.840;DP=51;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:985,0,1418 -chr6 7419564 . A G 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.418;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:887,0,629 -chr6 7422513 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-2.020;DP=37;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:498,0,829 -chr6 7426152 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.745;DP=62;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:578,0,3282 -chr6 7426155 . A G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.718;DP=62;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:578,0,3282 -chr6 7445552 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.447;DP=80;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:709,0,2058 -chr6 7546956 . C T 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.649;DP=263;FS=0.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=6.38;ReadPosRankSum=3.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,72:262:99:1707,0,7385 -chr6 7550246 . T G 1575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.898;DP=256;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,67:255:99:1604,0,7277 -chr6 7565039 . A G 11540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=286;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,286:286:99:11569,858,0 -chr6 7573892 . A AACACAC 439.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:11:476,11,0 -chr6 7588856 . TCCTGAGAAAAAAACAACACATGCACACATTAATGGAAAAACAGATTTAAAGGGCAAACCTCGCTATTCTTGCCGTTTGAAATGAGGCAGATGTTTAA T 2391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.175;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=33.69;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,62:66:99:2429,0,676 -chr6 7614181 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.057;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:249,0,1006 -chr6 7630306 . TCTGTTGAAGACAATGACACATTCAGTCATGAATGACAGCCAGTTTCACACGACTTTTGTGCAGTTCATGTTGCTACACTCTTACTACATCGCAGAACGTCAGAAAATGTTGCTTAC T 19912.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.066;DP=462;FS=2.874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=23.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,459:461:99:19950,1596,0 -chr6 7630451 . G T 3929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;ClippingRankSum=-0.208;DP=477;FS=0.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:311,147:458:99:3958,0,11159 -chr6 7643187 . TCTGAGAAAGAGATAATGGATTATTAATTAATGAAACATCAACAGATTACATCACATTGATAACCCATCAGAAGCTCAC T 814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=2.097;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=32.59;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:87:852,87,0 -chr6 7666836 . C A 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.993;DP=400;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:300,99:399:99:2215,0,11593 -chr6 7669399 . C T 1713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=1.956;DP=364;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,87:364:99:1742,0,10609 -chr6 7678158 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.128;DP=239;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,47:238:99:826,0,7341 -chr6 7803609 . C G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr6 7865892 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-0.364;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:638,0,663 -chr6 7866053 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.821;DP=33;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:320,0,1111 -chr6 7866457 . A G 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-0.681;DP=32;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=32.68;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:1296,0,598 -chr6 7866697 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-1.262;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:392,0,746 -chr6 7866763 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-1.395;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:425,0,567 -chr6 7866900 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=34.47;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:304,0,251 -chr6 7868407 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=1.032;DP=56;FS=5.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:729,0,1276 -chr6 7875744 . A G 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.356;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:587,0,1220 -chr6 7880036 . G A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.229;DP=67;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:780,0,1373 -chr6 7882328 . ACTGCACACAAACACATTAACATATAGGTTCTCCATCTAAAATCATAACGTAACAAAAAATTTGAGTACGCCTCACAGATCAACAATGCTCTTAC A 1722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=1.477;DP=41;FS=2.175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=34.63;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:99:1760,155,0 -chr6 7892021 . C T 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.124;DP=44;FS=10.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,29:44:99:993,0,463 -chr6 7907116 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=-1.376;DP=36;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:617,0,635 -chr6 7907129 . G A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-1.535;DP=35;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:626,0,625 -chr6 7927149 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.606;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:448,0,432 -chr6 7927261 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-1.137;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:397,0,746 -chr6 7927654 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=-0.304;DP=27;FS=10.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:698,0,179 -chr6 7980801 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-1.142;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:326,0,479 -chr6 7980819 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=1.304;DP=25;FS=11.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:234,0,1439 -chr6 7980827 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=2.361;DP=26;FS=14.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:231,0,1439 -chr6 8019121 . G A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-1.760;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,47:128:99:1566,0,2778 -chr6 8022863 . A T 223.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:252,0,18 -chr6 8022942 . TC T 244.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:282,28,0 -chr6 8024292 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr6 8024311 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr6 8024556 . G C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr6 8038270 . G T 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.498;DP=159;FS=12.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,49:159:99:1301,0,4909 -chr6 8038465 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=-4.912;DP=111;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=7.07;ReadPosRankSum=4.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,26:111:99:813,0,3349 -chr6 8038734 . C T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.329;DP=111;FS=4.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:752,0,5336 -chr6 8038955 . C A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.446;DP=214;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,51:214:99:1005,0,6213 -chr6 8048022 . C T 3724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=-0.438;DP=351;FS=4.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,140:340:99:3753,0,6927 -chr6 8053677 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.360;DP=287;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,72:287:99:1435,0,8187 -chr6 8055339 . TGTAAGAAACATCTTTATTTACATACTATTAATTAGTATAAGTTGGCCTTTTTTTATAGATGAAGTTTTTTAATGAAATGGACACTTCACTTTTTCACCTGCAG T 5164.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=2.436;DP=402;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=12.85;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,375:377:99:16249,1333,0 -chr6 8055534 . C A 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.274;DP=391;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:315,75:390:99:1241,0,12266 -chr6 8057971 . G A 3981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=3.374;DP=291;FS=6.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=13.68;ReadPosRankSum=-2.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,120:291:99:4010,0,5534 -chr6 8060852 . AAGGTGAACATCCATACGACATAACACCGCAGATACTGACACGCGTTACATTCAGATAAAGATTAAATGAATTTTTATCAC A 11984.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=-0.588;DP=308;FS=18.538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=37.95;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,301:307:99:12022,1093,0 -chr6 8062278 . TA T 1213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.321;DP=83;FS=6.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,46:64:99:1251,0,281 -chr6 8084588 . A G 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.383;DP=120;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:2223,0,2090 -chr6 8087565 . C CA 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-0.199;DP=94;FS=3.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.085;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:442,0,1562 -chr6 8095485 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-0.223;DP=54;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:315,0,1704 -chr6 8095517 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.081;DP=52;FS=9.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:351,0,1447 -chr6 8099412 . TGGTAAGACTGAATCTTCTGGACTGATGAAGCAGTTTCAACAGAAGCCATTCAGAGCGTTCCTGTCTCATCATCTGTTTCACTCTTGCA T 2876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=1.682;DP=69;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,68:69:99:2914,235,0 -chr6 8103153 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=3.984;DP=57;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=4.98;ReadPosRankSum=-3.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:312,0,4256 -chr6 8103156 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=3.930;DP=60;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:306,0,4256 -chr6 8103159 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-3.277;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:409,0,2596 -chr6 8131144 . T G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-0.517;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:444,0,431 -chr6 8149604 . G A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=-0.212;DP=39;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:761,0,614 -chr6 8178611 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:376,0,235 -chr6 8178737 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,206 -chr6 8183052 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=1.313;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,289 -chr6 8183980 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=1.376;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:362,0,492 -chr6 8193776 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:476,0,240 -chr6 8205702 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:98:283,0,98 -chr6 8241931 . T A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr6 8255234 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.377;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,594 -chr6 8258199 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,254 -chr6 8271479 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.199;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:623,0,527 -chr6 8360414 . T G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.162;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=19.03;ReadPosRankSum=-2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:561,0,934 -chr6 8360415 . A G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.209;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:561,0,934 -chr6 8360508 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.321;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:350,0,559 -chr6 8368808 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.546;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:462,0,502 -chr6 8382308 . C A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.455;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:537,0,526 -chr6 8382353 . G T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.384;DP=32;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:463,0,661 -chr6 8459698 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,179 -chr6 8463627 . G A 450.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=34.66;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:478,0,7 -chr6 8463783 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:293,0,49 -chr6 8487890 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:381,0,122 -chr6 8487944 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-1.076;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=27.92;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:76:475,0,76 -chr6 8542546 . C A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=33.25;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:394,0,229 -chr6 8542551 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.775;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=28.14;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:394,0,229 -chr6 8545377 . G C 578.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=32.49;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:23:607,23,0 -chr6 8550614 . C G 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr6 8550629 . G A 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr6 8562140 . A C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=1.530;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:444,0,392 -chr6 8566359 . T C 1724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1753,126,0 -chr6 8566393 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.157;ClippingRankSum=0.595;DP=53;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:294,0,1793 -chr6 8566410 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.081;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.238;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:293,0,1676 -chr6 8568690 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-0.533;DP=53;FS=6.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:445,0,1811 -chr6 8569608 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.536;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:432,0,323 -chr6 8598926 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,301 -chr6 8606864 . CCCTGAAAGACAAAATACTTTTGACTATAACATGCATCTAAAAAAAGACAAAATAACAGTACATGTGTGCGGTATTCTTA C 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=2.606;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=30.37;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:584,0,1943 -chr6 8628213 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:301,0,54 -chr6 8628507 . G A 208.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:237,0,19 -chr6 8628680 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr6 8631482 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.283;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:235,0,1020 -chr6 8659436 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.209;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:336,0,2790 -chr6 8664777 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.420;DP=23;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:250,0,544 -chr6 8665218 . GA G 244.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.303;DP=24;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:328,0,200 -chr6 8665736 . T C 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.186;DP=82;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:1390,0,1312 -chr6 8672740 . G A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.168;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1098,0,1364 -chr6 8672785 . G A 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=-0.049;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:945,0,1289 -chr6 8682858 . G C 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.878;DP=77;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:1006,0,1657 -chr6 8688573 . CG C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=1.078;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:243,0,1224 -chr6 8688575 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.553;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:243,0,1224 -chr6 9085953 . T C 2601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.119;DP=200;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.251;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,78:200:99:2630,0,4182 -chr6 9087198 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.184;DP=113;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,18:113:99:260,0,6888 -chr6 9087199 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=-0.514;DP=113;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,18:113:99:260,0,6888 -chr6 9088001 . C T 2379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-0.700;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,67:154:99:2408,0,3022 -chr6 9114539 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.482;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:758,0,1784 -chr6 9114541 . A G 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-1.230;DP=47;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:758,0,1806 -chr6 9127824 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=1.346;DP=64;FS=2.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:902,0,1278 -chr6 9133013 . T C 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.976;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:841,0,934 -chr6 9143387 . T G 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.913;DP=88;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=20.67;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,55:88:99:1847,0,1102 -chr6 9143541 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=-2.391;DP=54;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:661,0,1158 -chr6 9143687 . G A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.121;DP=44;FS=7.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=20.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:926,0,548 -chr6 9187208 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.907;DP=65;FS=6.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:330,0,1938 -chr6 9187560 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=3.280;DP=97;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,18:97:99:301,0,2902 -chr6 9187713 . A G 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-0.943;DP=110;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,32:105:99:793,0,2741 -chr6 9194216 . G A 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=2.108;DP=155;FS=4.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,61:155:99:2068,0,3153 -chr6 9198819 . C T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.242;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=28.77;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:64:920,0,64 -chr6 9279549 . G A 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr6 9332742 . A T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=-0.436;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:483,0,570 -chr6 9335434 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.122;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:293,0,1221 -chr6 9342688 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.262;DP=40;FS=2.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:910,0,485 -chr6 9415956 . G GA 316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-1.026;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:386,0,206 -chr6 9416263 . AG A 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.086;DP=37;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:421,0,365 -chr6 9438392 . G A 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.350;DP=426;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=4.58;ReadPosRankSum=3.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,96:426:99:1980,0,12888 -chr6 9500627 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.946;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:407,0,2471 -chr6 9512739 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.360;DP=92;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:374,0,2835 -chr6 9554171 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,201 -chr6 9563900 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.312;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:309,0,512 -chr6 9571256 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.682;DP=43;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:255,0,1205 -chr6 9582156 . A C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=2.329;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,571 -chr6 9616254 . A ATT 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.452;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:512,0,486 -chr6 9617014 . A G 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.020;DP=121;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,33:121:99:786,0,3399 -chr6 9617230 . A T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.042;DP=179;FS=10.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,43:179:99:995,0,5532 -chr6 9618148 . C T 1747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-1.270;DP=142;FS=5.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,54:141:99:1776,0,2856 -chr6 9618523 . G A 2815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-0.069;DP=194;FS=3.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,82:194:99:2844,0,3754 -chr6 9619255 . A G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.910;DP=139;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,35:139:99:770,0,4093 -chr6 9619736 . G GT 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.892;DP=143;FS=2.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,36:118:99:543,0,2165 -chr6 9656557 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:243,0,300 -chr6 9662437 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:260,0,415 -chr6 9662495 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:390,0,236 -chr6 9866333 . T C 2443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.490;DP=151;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:2472,0,2639 -chr6 9879768 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=-1.325;DP=114;FS=3.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:333,0,3574 -chr6 9879844 . C T 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.937;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,61:156:99:2084,0,3251 -chr6 9891860 . A C 2112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.991;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:2141,0,2790 -chr6 9908576 . GTC G 211.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:249,0,25 -chr6 9908833 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:231,0,135 -chr6 9909463 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,145 -chr6 9909956 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:266,0,138 -chr6 9910002 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:369,0,131 -chr6 9911565 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=12;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:237,0,93 -chr6 9921544 . AT A 2501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.753;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.200;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,106:175:99:2539,0,1384 -chr6 9926277 . AT A 2801.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.055;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=27.47;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2849,259,0 -chr6 9926402 . T C 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-1.814;DP=83;FS=7.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:911,0,2810 -chr6 9966955 . G A 4439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=-1.180;DP=245;FS=17.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,125:245:99:4468,0,4478 -chr6 9967091 . C T 5352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-1.627;DP=132;FS=3.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=33.14;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:5381,388,0 -chr6 9967412 . C T 4452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.299;DP=194;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,127:194:99:4481,0,2336 -chr6 9967546 . GA G 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-2.532;DP=146;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,32:141:99:453,0,3709 -chr6 10081940 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:93:373,0,93 -chr6 10082240 . C A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-2.798;DP=59;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:768,0,1327 -chr6 10083365 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-0.052;DP=136;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=5.15;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,37:135:99:729,0,5213 -chr6 10087965 . C T 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=-0.866;DP=83;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:1356,0,1528 -chr6 10088529 . A T 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.217;DP=88;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:1476,0,2351 -chr6 10088541 . A T 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.538;DP=93;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:1488,0,2491 -chr6 10088640 . T A 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.412;DP=85;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:1523,0,1498 -chr6 10088793 . C T 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-0.945;DP=83;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:1231,0,1532 -chr6 10089054 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.056;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:311,0,2742 -chr6 10093104 . T C 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-1.062;DP=66;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:1181,0,2231 -chr6 10093734 . C T 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.276;DP=64;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1083,0,1059 -chr6 10094178 . G A 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.768;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=21.61;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1433,0,846 -chr6 10095021 . C T 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.106;DP=62;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1126,0,1068 -chr6 10156250 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.871;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:351,0,749 -chr6 10159763 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=-2.035;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:285,0,2094 -chr6 10159772 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=-2.319;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:285,0,2094 -chr6 10202313 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=20.81;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:382,0,252 -chr6 10210481 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:359,0,261 -chr6 10309761 . A T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.550;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.822;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:438,0,411 -chr6 10312284 . T G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,137 -chr6 10360729 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,217 -chr6 10458455 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:277,0,198 -chr6 10492619 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-1.620;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=23.21;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:330,0,138 -chr6 10493139 . T TA 571.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=1.055;DP=21;FS=6.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:15:609,0,15 -chr6 10502044 . G A 3292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=-3.254;DP=174;FS=9.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,56:79:99:3321,0,336 -chr6 10502071 . A G 3291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.696;DP=166;FS=9.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,76:83:99:3320,0,350 -chr6 10502127 . C T 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-3.044;DP=190;FS=5.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=6.84;ReadPosRankSum=2.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:1328,0,2929 -chr6 10502190 . T C 3516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.179;DP=85;FS=7.610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=36.28;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,41:45:99:3545,244,0 -chr6 10502231 . C T 3516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.639;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=31.27;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,12:14:99:3545,244,0 -chr6 10502359 . G GA 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.385;DP=39;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:253,0,441 -chr6 10502384 . CA C 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.462;DP=36;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:275,0,287 -chr6 10625361 . T A 457.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:486,33,0 -chr6 10632129 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.376;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:372,0,589 -chr6 10632408 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=3.542;DP=63;FS=8.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=4.63;ReadPosRankSum=-2.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:320,0,1906 -chr6 10633386 . TCCTGAAATTAAAAGGAAAAGGGTGTCAAACTACAACTTGAATGATCAGGCTGGATCCAAGTGAGATAGAATTCTGATATAA T 5666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=1.910;DP=136;FS=3.011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,121:123:99:5704,540,0 -chr6 10633512 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=5.015;DP=107;FS=11.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=4.60;ReadPosRankSum=-3.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:520,0,2798 -chr6 10633524 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=4.876;DP=99;FS=11.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=3.07;ReadPosRankSum=-2.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:332,0,2936 -chr6 10639051 . G T 473.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=33.85;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:500,2,0 -chr6 10639106 . A T 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:439,33,0 -chr6 10652361 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=1.415;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:261,0,402 -chr6 10652983 . C T 5821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=-0.462;DP=326;FS=3.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=17.86;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,161:326:99:5850,0,6128 -chr6 10653187 . G A 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.686;DP=356;FS=0.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=2.43;ReadPosRankSum=2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,63:355:99:893,0,11113 -chr6 10662154 . C T 5967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.343;DP=349;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,182:348:99:5996,0,5953 -chr6 10663679 . T C 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=-1.931;DP=391;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=4.03;ReadPosRankSum=3.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,86:390:99:1603,0,10938 -chr6 10666882 . C A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.20;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:237,0,152 -chr6 10693483 . T G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=-0.711;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:466,0,619 -chr6 10694559 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.910;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,298 -chr6 10723733 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.186;DP=93;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:614,0,2585 -chr6 10729198 . G A 3244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=-0.353;DP=191;FS=1.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,101:191:99:3273,0,3270 -chr6 10741903 . G A 5586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.452;DP=318;FS=4.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,156:318:99:5615,0,5974 -chr6 10764848 . C G 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.282;DP=81;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:1210,0,1573 -chr6 10782983 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.099;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:482,0,143 -chr6 10801097 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,147 -chr6 10801099 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,147 -chr6 10801446 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:296,0,131 -chr6 10821732 . A T 5611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=1.143;DP=319;FS=2.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,156:318:99:5640,0,5822 -chr6 10821860 . A G 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.835;DP=305;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,90:305:99:2292,0,8400 -chr6 10822178 . GCCTGTGCAAAATAATAAGATTTGTTAAGCGAGTCCATCTCATCGTAAGAAAATGCGTATTCGCCAAATCAGCCTTA G 14548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.847;DP=379;FS=2.406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=27.60;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,371:374:99:14586,1061,0 -chr6 10874532 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.430;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:373,0,673 -chr6 10897078 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-0.009;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:702,0,1902 -chr6 10897081 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.540;DP=54;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:443,0,2319 -chr6 10981251 . CAACAA C 418.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.26;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:27:456,0,27 -chr6 10981903 . A C 3590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=1.403;DP=301;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,108:301:99:3619,0,6762 -chr6 10988393 . G T 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.121;DP=44;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=13.15;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:607,0,933 -chr6 10989077 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.105;DP=47;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:376,0,1277 -chr6 10989589 . A G 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:571,42,0 -chr6 11002065 . C T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=1.401;DP=95;FS=4.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:828,0,5302 -chr6 11009620 . C T 225.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:254,0,22 -chr6 11027011 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:268,0,366 -chr6 11039914 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=1.870;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:302,0,432 -chr6 11058427 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,333 -chr6 11138033 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:348,0,315 -chr6 11164936 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,230 -chr6 11165377 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.674;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:431,0,660 -chr6 11168735 . C T 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.137;DP=32;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=28.43;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:938,0,157 -chr6 11173027 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-0.606;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:706,0,560 -chr6 11175205 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:248,0,364 -chr6 11176452 . A T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:284,0,168 -chr6 11177111 . T C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=-1.286;DP=22;FS=15.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:409,0,556 -chr6 11177307 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.549;DP=19;FS=7.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:253,0,480 -chr6 11187774 . T A 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.031;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1020,0,858 -chr6 11187859 . A G 1386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.260;DP=55;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,37:55:99:1415,0,521 -chr6 11192920 . G A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.938;DP=44;FS=11.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1271,0,210 -chr6 11193219 . G C 1416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=2.197;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=27.25;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:1445,0,376 -chr6 11193656 . G A 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.241;DP=78;FS=4.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1419,0,1221 -chr6 11196321 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.611;DP=59;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=10.98;ReadPosRankSum=2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:676,0,2898 -chr6 11196406 . C G 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.471;DP=70;FS=3.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=19.33;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,39:69:99:1381,0,2188 -chr6 11196530 . C T 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-1.373;DP=80;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:1293,0,1316 -chr6 11196782 . G A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.755;DP=53;FS=3.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:798,0,967 -chr6 11203034 . G T 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=-0.324;DP=64;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1157,0,1008 -chr6 11206299 . C T 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.660;DP=63;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,36:63:99:1119,0,940 -chr6 11206382 . G T 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.688;DP=51;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:932,0,1140 -chr6 11210721 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-1.003;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:282,0,1421 -chr6 11210908 . C A 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.154;DP=47;FS=4.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:836,0,1844 -chr6 11210910 . C T 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.088;DP=47;FS=8.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:836,0,1823 -chr6 11223431 . C G 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.034;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:782,0,712 -chr6 11233734 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.860;DP=66;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:376,0,3882 -chr6 11241663 . C T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.980;DP=41;FS=6.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:920,0,1540 -chr6 11246010 . G A 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.511;DP=54;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=15.14;ReadPosRankSum=-1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:846,0,953 -chr6 11254898 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.338;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.723;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:335,0,2058 -chr6 11254998 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.204;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:908,0,691 -chr6 11325087 . C T 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.901;DP=82;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1437,0,1386 -chr6 11325910 . C A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.023;DP=60;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:760,0,1322 -chr6 11325926 . G T 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.335;DP=63;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:777,0,2012 -chr6 11326136 . AT A 744.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.338;DP=64;FS=3.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:782,0,1356 -chr6 11415377 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:60:404,0,60 -chr6 11423772 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,206 -chr6 11618607 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,251 -chr6 11676005 . G GT 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=-0.572;DP=125;FS=21.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=2.15;ReadPosRankSum=-2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,20:115:99:306,0,6784 -chr6 11676734 . G A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=1.947;DP=230;FS=0.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,48:230:99:803,0,6972 -chr6 11677118 . A T 1440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-2.042;DP=204;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,60:204:99:1469,0,5352 -chr6 11702501 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-0.867;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,23:120:99:377,0,3652 -chr6 11702925 . T G 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.497;DP=197;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=3.96;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,42:197:99:808,0,5827 -chr6 11708862 . C G 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.391;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,45:164:99:1078,0,4601 -chr6 11892590 . G A 1930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.702;DP=281;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,80:281:99:1959,0,7768 -chr6 11893010 . G A 1658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=1.144;DP=214;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,70:213:99:1687,0,7297 -chr6 11893202 . G A 2533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-4.554;DP=343;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=7.39;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,103:342:99:2562,0,8701 -chr6 11912372 . T C 2417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.175;DP=300;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,98:300:99:2446,0,12754 -chr6 11913841 . C T 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=1.220;DP=301;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,73:301:99:1563,0,8655 -chr6 11914474 . A ACT 877.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-1.458;DP=163;FS=5.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,51:160:99:1347,0,4843 -chr6 11921871 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.475;DP=32;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.032;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:610,0,770 -chr6 11944641 . C G 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-0.806;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=25.53;ReadPosRankSum=2.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:692,0,207 -chr6 11948609 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.587;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:255,0,897 -chr6 11948701 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=1.617;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:315,0,929 -chr6 11949603 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:403,0,240 -chr6 11964839 . TCTGCAAATACGTAAAAGAGATGAGTGACGTCAATGTAAAATTGGACTTTTTTTTAAACGTGTAATAAAGGGTCATAC T 967.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.530;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=24.81;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1005,0,764 -chr6 11984640 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.056;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:339,0,706 -chr6 12001954 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.591;ClippingRankSum=1.609;DP=37;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:486,0,746 -chr6 12104638 . T C 374.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:403,27,0 -chr6 12104644 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,107 -chr6 12113305 . C G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.430;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:280,0,885 -chr6 12124758 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.952;DP=39;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:281,0,991 -chr6 12375266 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.04;ReadPosRankSum=-2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:302,0,395 -chr6 12377017 . ACAGGTAGGCTAAGTATCATTGGAATTTAGATGGATCTACATTTTTAAAAGACATAATATAATAACTTTTCAATTTTCTCAC A 1326.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.271;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:99:1364,119,0 -chr6 12415843 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.510;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=8.33;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:870,0,2519 -chr6 12463104 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.628;DP=80;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:343,0,3060 -chr6 12578291 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:269,0,505 -chr6 12705092 . A AT 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.235;DP=69;FS=7.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:370,0,1589 -chr6 12707144 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.979;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,1171 -chr6 12707572 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:233,0,59 -chr6 12710348 . A C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-1.807;DP=34;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:446,0,731 -chr6 12710399 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.708;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:517,0,1026 -chr6 12715496 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-0.693;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:565,0,1511 -chr6 12715854 . C A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.876;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:694,0,1906 -chr6 12715898 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.704;DP=78;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:458,0,2173 -chr6 12763617 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.012;DP=47;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:292,0,1355 -chr6 12779936 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-0.709;DP=95;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,16:94:99:258,0,2989 -chr6 12785279 . G C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.535;DP=37;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:358,0,935 -chr6 12789237 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=-0.116;DP=54;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:336,0,1479 -chr6 12881614 . T A 2528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=-4.443;DP=126;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.07;ReadPosRankSum=2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:2557,0,1746 -chr6 12887735 . C T 6801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.355;DP=230;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=29.57;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,182:230:99:6830,0,877 -chr6 12896569 . G A 7373.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.655;DP=212;FS=5.628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=34.78;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,188:212:2:7400,2,0 -chr6 12896863 . GA G 1096.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.277;DP=82;FS=5.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=13.37;ReadPosRankSum=2.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,45:71:99:1134,0,1278 -chr6 12901949 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.230;DP=47;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=30.46;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,38:47:99:1460,0,151 -chr6 12905829 . G T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:464,0,708 -chr6 12907446 . AT A 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=2.762;DP=43;FS=8.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=8.11;ReadPosRankSum=-2.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:386,0,2426 -chr6 12907463 . T A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-0.024;DP=28;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=22.38;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:655,0,737 -chr6 12907939 . T A 2251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.673;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,59:72:99:2280,0,191 -chr6 12910874 . G A 2411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.068;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=32.57;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,57:60:99:2440,172,0 -chr6 12934945 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr6 12936436 . C T 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:57:850,57,0 -chr6 12940000 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.943;DP=38;FS=4.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=31.97;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:48:1243,0,48 -chr6 12946254 . C T 3172.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-1.148;DP=81;FS=1.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,76:81:99:3201,186,0 -chr6 12949276 . C T 1823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.091;DP=41;FS=7.291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:99:1852,126,0 -chr6 12949286 . C T 1823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=-0.096;DP=39;FS=8.486;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=33.13;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:99:1852,126,0 -chr6 12949500 . C A 1550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-2.464;DP=43;FS=2.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=32.54;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,38:42:40:1579,40,0 -chr6 12949932 . A G 1541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.230;DP=44;FS=2.020;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,39:43:32:1570,32,0 -chr6 12957860 . C T 292.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:321,0,17 -chr6 12959563 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.775;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:563,0,194 -chr6 12995523 . C T 1191.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=1.849;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:53:1220,53,0 -chr6 13003021 . A T 609.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=36.41;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:16:638,0,16 -chr6 13014059 . A G 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:554,39,0 -chr6 13019933 . CA C 562.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:600,49,0 -chr6 13020084 . T TA 597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-1.619;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=23.91;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:38:635,38,0 -chr6 13020507 . G GA 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=2.208;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:74:350,0,74 -chr6 13020608 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:338,0,52 -chr6 13020798 . G A 845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-1.252;DP=25;FS=3.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:28:874,28,0 -chr6 13021040 . T C 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:683,48,0 -chr6 13021518 . C G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=1.713;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:93:422,0,93 -chr6 13024533 . T A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-2.464;DP=27;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:514,0,450 -chr6 13046171 . C T 1750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.499;DP=54;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,46:54:87:1779,0,87 -chr6 13046294 . G GT 357.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-0.567;DP=26;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:0:410,0,0 -chr6 13046398 . G GT 932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.633;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:970,0,405 -chr6 13046401 . A G 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=-0.152;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=29.43;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:970,0,402 -chr6 13046637 . T TA 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.651;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:68:547,0,68 -chr6 13046948 . G A 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.498;DP=46;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,37:46:99:1394,0,293 -chr6 13047133 . C A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-2.137;DP=46;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1224,0,232 -chr6 13047490 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=31.56;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:407,0,54 -chr6 13047588 . G A 290.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:319,0,13 -chr6 13047745 . C T 773.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.857;DP=22;FS=2.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:20:802,20,0 -chr6 13047855 . A C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=32.14;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:671,0,28 -chr6 13049596 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=25.28;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:281,0,105 -chr6 13049729 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=27.45;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:440,0,135 -chr6 13049796 . G A 334.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:363,0,16 -chr6 13052157 . C G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:309,21,0 -chr6 13052158 . T C 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:309,21,0 -chr6 13053997 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.142;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=28.54;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:599,0,183 -chr6 13054943 . CA C 529.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.375;DP=30;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:4:565,0,4 -chr6 13056156 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=-0.897;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=30.48;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1095,0,116 -chr6 13100968 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.564;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:384,0,696 -chr6 13101628 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=1.262;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:304,0,674 -chr6 13102032 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-1.060;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:329,0,323 -chr6 13111368 . G A 3168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=1.122;DP=472;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:340,132:472:99:3197,0,12902 -chr6 13114559 . G A 13237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=1.692;DP=696;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,399:694:99:13266,0,10107 -chr6 13131449 . C T 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-1.584;DP=310;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,63:309:99:1103,0,9886 -chr6 13141732 . A T 1944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-3.435;DP=308;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,87:308:99:1973,0,8097 -chr6 13148895 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.038;DP=44;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.684;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:374,0,1213 -chr6 13149517 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.242;DP=49;FS=6.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:524,0,1120 -chr6 13150886 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.422;DP=40;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:231,0,1129 -chr6 13162953 . G C 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.178;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=29.17;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1516,0,180 -chr6 13163386 . T C 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.108;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:579,0,1013 -chr6 13163449 . A G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.195;DP=54;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:626,0,1233 -chr6 13255515 . C A 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr6 13257109 . G A 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 -chr6 13284956 . G A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.969;DP=35;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=29.79;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1071,0,145 -chr6 13300889 . T TA 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-0.269;DP=54;FS=6.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=7.40;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:645,0,546 -chr6 13301241 . G T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.154;DP=81;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=11.36;ReadPosRankSum=2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:948,0,4923 -chr6 13315739 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-1.379;DP=157;FS=1.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,25:157:99:270,0,5099 -chr6 13315905 . AACCTGTGGGAAATGAAAGAAACTGGTGATATCGCTACTCAATAAGCCAACCCCAAAACCAAACCAAAACCTGAAGCTATTTGCTTGTAAAGGCTAATGGGGAACTC A 7995.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=2.961;DP=178;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=32.17;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,175:178:99:8033,685,0 -chr6 13693506 . G T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=-0.583;DP=453;FS=33.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:379,74:453:99:839,0,14878 -chr6 13878113 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-1.446;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:311,0,392 -chr6 13921065 . TA T 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.373;DP=231;FS=7.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,38:220:99:394,0,4861 -chr6 13942817 . G GA 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-0.018;DP=110;FS=0.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.226;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,28:109:99:506,0,2583 -chr6 13944175 . AACCTATTTAAAACATGTGTTAATAGTGCTTGCTGGCTCAAAAAAGGGAATATAAAGAGTTTTGCTTCTATAACATACTG A 5029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=1.702;DP=117;FS=4.517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=25.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:5067,430,0 -chr6 13945508 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=2.447;DP=58;FS=9.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1090,0,873 -chr6 13997874 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.743;DP=89;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:255,0,2854 -chr6 13998835 . C G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=1.318;DP=111;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:697,0,3001 -chr6 13998955 . G GT 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.362;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1424,0,1665 -chr6 14007324 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.881;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:261,0,2821 -chr6 14150827 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=28.38;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:312,0,53 -chr6 14962203 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.899;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:460,0,531 -chr6 15030812 . T A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.093;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:364,0,476 -chr6 15110107 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.017;DP=38;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:262,0,1056 -chr6 15157231 . A C 8272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=2.294;DP=489;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,244:478:99:8301,0,8056 -chr6 15200920 . T A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,0:6:99:670,0,320 -chr6 15200987 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=17;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:411,0,677 -chr6 15201115 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.823;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:234,0,431 -chr6 15203660 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.796;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:376,0,297 -chr6 15204467 . C T 1566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1595,108,0 -chr6 15204556 . A G 1105.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:78:1134,78,0 -chr6 15204582 . A G 343.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.474;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:3:370,0,3 -chr6 15506275 . GCCTGAAAGTAAATGTTCACAAATATATAGTGAGTTGCAAATCTGGAAGAAAGCAGATTTAAATGTAATTTTTTTAACTAATTATTTGAACGGTTCA G 573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=2.854;DP=26;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=22.07;ReadPosRankSum=-2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:611,0,5578 -chr6 15949516 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=-0.541;DP=25;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:710,0,154 -chr6 15951653 . C A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-1.152;DP=37;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:948,0,344 -chr6 15963265 . G C 1643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=1.061;DP=93;FS=10.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1672,0,1518 -chr6 15963514 . C T 1497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-1.357;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1526,0,1625 -chr6 15963848 . A AT 926.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-1.473;DP=44;FS=11.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:964,0,1528 -chr6 15964074 . G T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=1.635;DP=50;FS=10.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:834,0,948 -chr6 16053768 . C T 1706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.230;DP=81;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,51:81:99:1735,0,1021 -chr6 16080796 . G A 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.781;DP=78;FS=5.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,44:78:99:1420,0,1204 -chr6 16087443 . G A 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=1.916;DP=80;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1603,0,1135 -chr6 16199620 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.015;DP=38;FS=2.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:454,0,849 -chr6 16199775 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=1.283;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:675,0,594 -chr6 16396001 . GT G 5910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=2.372;DP=317;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=18.65;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,238:307:99:5948,0,1131 -chr6 17371565 . G T 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 -chr6 17371597 . T A 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:484,33,0 -chr6 17569537 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.749;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:362,0,516 -chr6 17653895 . A G 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:477,36,0 -chr6 17653972 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.275;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:709,0,1330 -chr6 17654116 . A C 1039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=2.198;DP=32;FS=22.184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=32.49;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:36:1068,36,0 -chr6 17654446 . A T 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 -chr6 17655666 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.245;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:357,0,1597 -chr6 17655744 . C A 7078.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:7107,496,0 -chr6 17655825 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:296,0,509 -chr6 17656447 . T C 2578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.192;DP=103;FS=7.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=25.04;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,66:76:99:2607,0,574 -chr6 17656463 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=2.470;DP=78;FS=11.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:250,0,4100 -chr6 17656465 . A T 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-3.977;DP=77;FS=17.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,48:64:99:1911,0,775 -chr6 17753298 . G C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr6 17851223 . C G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr6 17853326 . C CAT 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.283;DP=23;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=20.90;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:518,0,397 -chr6 17855956 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.666;DP=16;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:255,0,64 -chr6 17999369 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.906;DP=63;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:484,0,1613 -chr6 18210051 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-0.725;DP=36;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:459,0,801 -chr6 18540192 . T G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.394;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:415,0,560 -chr6 18655548 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.197;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:406,0,283 -chr6 18656343 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:272,0,308 -chr6 18672530 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-2.565;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:462,0,812 -chr6 18684625 . T A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.192;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:491,0,405 -chr6 18684700 . TA T 1022.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1060,103,0 -chr6 18684818 . T G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.608;DP=33;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:446,0,715 -chr6 18733323 . C G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-1.246;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=23.05;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,227 -chr6 19062117 . C T 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:1086,0,1841 -chr6 19062122 . C CT 1079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.743;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1117,0,670 -chr6 19062624 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.420;DP=50;FS=2.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=12.94;ReadPosRankSum=2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:675,0,1439 -chr6 19062995 . A C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.493;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:582,0,274 -chr6 19063416 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-1.762;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:670,0,1275 -chr6 19171024 . C T 1520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.248;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1549,0,1312 -chr6 19171255 . G A 2494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.937;DP=116;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,75:115:99:2523,0,1340 -chr6 19171459 . G A 2595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=-0.599;DP=115;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:2624,0,1480 -chr6 19172004 . T A 2666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.216;DP=142;FS=2.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=18.78;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:2695,0,2525 -chr6 19172131 . G A 2239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=-0.733;DP=135;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:2268,0,2276 -chr6 19172344 . T A 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.799;DP=116;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,44:116:99:1530,0,2429 -chr6 19172576 . C A 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=-1.442;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,39:111:99:1336,0,2495 -chr6 19172601 . A G 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.220;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,38:129:99:909,0,3460 -chr6 19172966 . T C 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.017;DP=177;FS=0.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,60:177:99:1976,0,4307 -chr6 19173948 . T C 5697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=-0.027;DP=181;FS=6.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,151:180:99:5726,0,252 -chr6 19173995 . T G 2057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=-1.111;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,63:175:99:2086,0,3724 -chr6 19174014 . C G 3013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.830;DP=166;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,92:166:99:3042,0,2609 -chr6 19176953 . G T 6153.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:6182,451,0 -chr6 19179019 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.481;DP=108;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,32:108:99:808,0,2858 -chr6 19179080 . C G 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-0.642;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,45:152:99:1102,0,3950 -chr6 19181642 . T C 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.560;DP=160;FS=5.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:1203,0,4186 -chr6 19183877 . G A 2397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.192;DP=151;FS=2.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:2426,0,2542 -chr6 19184527 . A T 5032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=2.693;DP=162;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=31.07;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,131:160:99:5066,0,440 -chr6 19185176 . T C 4582.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.946;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=34.20;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,119:134:5:4610,5,0 -chr6 19185212 . G A 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.200;DP=139;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,45:139:99:1227,0,3578 -chr6 19185233 . T C 2758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=1.017;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,82:137:99:2787,0,1818 -chr6 19185993 . A T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.805;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,42:126:99:1127,0,3202 -chr6 19189309 . A G 4661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=1.204;DP=151;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,123:151:99:4690,0,478 -chr6 19189348 . A C 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.766;DP=147;FS=9.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=4.61;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,35:147:99:706,0,4099 -chr6 19189387 . T C 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.830;DP=188;FS=2.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,50:188:99:1171,0,5196 -chr6 19191444 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-1.034;DP=155;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,35:155:99:721,0,4463 -chr6 19191562 . T A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=1.187;DP=171;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,38:171:99:739,0,5000 -chr6 19191922 . C T 2685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.848;DP=92;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=29.19;ReadPosRankSum=1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,69:91:99:2714,0,448 -chr6 19192176 . G T 6645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6674,473,0 -chr6 19192474 . A G 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.048;DP=112;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:833,0,3130 -chr6 19192522 . A G 5067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-2.703;DP=144;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=31.31;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,126:144:59:5096,0,59 -chr6 19192725 . G GT 776.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.046;DP=182;FS=6.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1125,0,2147 -chr6 19192834 . T A 2935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.173;DP=150;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=19.57;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:2964,0,2314 -chr6 19193169 . TA T 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=1.376;DP=71;FS=7.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,26:66:99:498,0,934 -chr6 19193257 . T C 5185.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:5214,373,0 -chr6 19193598 . G A 2893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-1.164;DP=131;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=22.09;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,85:131:99:2922,0,1589 -chr6 19193757 . CT C 1494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.589;DP=170;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,66:153:99:1532,0,2168 -chr6 19193797 . A G 4141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=-0.321;DP=154;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,99:154:99:4170,0,1524 -chr6 19194166 . C T 4716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-0.087;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=27.91;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,124:169:99:4745,0,1073 -chr6 19194214 . C T 3000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.790;DP=156;FS=3.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:3029,0,2453 -chr6 19194323 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.219;DP=160;FS=21.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,24:159:99:235,0,4957 -chr6 19194431 . T G 6154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:6183,421,0 -chr6 19194440 . T A 6154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:6183,421,0 -chr6 19194542 . T C 8018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:8047,583,0 -chr6 19194696 . T C 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-1.294;DP=188;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,56:188:99:1421,0,4981 -chr6 19194868 . T C 2163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.401;DP=129;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:2192,0,2267 -chr6 19195049 . A T 3651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3680,262,0 -chr6 19195099 . A G 1545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=-0.542;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:1574,0,1705 -chr6 19195318 . T C 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.543;DP=154;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,61:154:99:2146,0,3279 -chr6 19195438 . TA T 4641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=1.234;DP=159;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=29.19;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4679,454,0 -chr6 19195498 . A G 3589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=-0.019;DP=196;FS=5.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,100:196:99:3618,0,3371 -chr6 19195518 . A T 2913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.497;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,81:171:99:2942,0,3022 -chr6 19195563 . T G 2919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=-2.509;DP=168;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,83:168:99:2948,0,3137 -chr6 19195681 . A C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=4.799;DP=76;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=4.44;ReadPosRankSum=-3.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:366,0,2363 -chr6 19195690 . T C 3249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3278,233,0 -chr6 19195816 . A C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=-0.835;DP=99;FS=10.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:428,0,3096 -chr6 19195952 . T C 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-1.552;DP=19;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=31.23;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:31:694,31,0 -chr6 19196044 . A T 4426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:4455,314,0 -chr6 19196050 . T C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-2.108;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,28:107:99:613,0,3039 -chr6 19212499 . GA G 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.621;DP=56;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:299,0,1108 -chr6 19212518 . A T 2210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2239,157,0 -chr6 19212666 . A G 2169.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2198,157,0 -chr6 19251124 . T C 2173.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2202,157,0 -chr6 19256078 . A T 2542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.852;DP=63;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,62:63:99:2571,184,0 -chr6 19285863 . G A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=1.200;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:501,0,356 -chr6 19286145 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:292,0,473 -chr6 19286230 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:311,0,524 -chr6 19298129 . C A 4729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.648;ClippingRankSum=-0.820;DP=276;FS=17.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,143:268:99:4758,0,4004 -chr6 19298163 . CAGGTGGGTATGCCAGTATTTTGCTGAGTGCAGCTTAAATAAAAAAAGTGTACCTTAACGCATCGTGTGTGTTTTTAA C 8495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-1.022;DP=271;FS=17.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,222:245:99:8533,0,289 -chr6 19303241 . C T 1647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.401;DP=228;FS=6.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,68:228:99:1676,0,5893 -chr6 19304162 . C A 1642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=-0.298;DP=264;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,75:264:99:1671,0,7088 -chr6 19355812 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.385;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,540 -chr6 19356376 . C A 292.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:321,0,19 -chr6 19357313 . A T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.808;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:330,0,1267 -chr6 19357314 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.444;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:330,0,1269 -chr6 19357639 . T C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:272,0,418 -chr6 19363844 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:325,0,283 -chr6 19364098 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:317,0,172 -chr6 19366091 . A T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.249;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,27:84:99:746,0,2192 -chr6 19366597 . A G 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.492;DP=84;FS=5.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:1603,0,1552 -chr6 19367139 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-0.672;DP=94;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:587,0,2876 -chr6 19367151 . C T 1803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.347;DP=89;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.111;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,53:89:99:1832,0,1269 -chr6 19368089 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.986;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,473 -chr6 19368842 . A AT 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:245,0,180 -chr6 19368870 . CA C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:266,0,192 -chr6 19368887 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,180 -chr6 19369481 . A G 2929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.412;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,74:81:99:2958,101,0 -chr6 19371846 . G A 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.678;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=16.50;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1249,0,1403 -chr6 19378380 . G A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-1.528;DP=27;FS=4.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:728,0,208 -chr6 19379366 . ACAGGTCAGTATTAACAAATAGCTTTTTGCACTTTAATGTAAGAAATCAGCACATTATGACCTTGTTTTTTTATCCTTGTAAAAT A 3446.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.165;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=31.39;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:3484,286,0 -chr6 19381244 . C A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.800;DP=65;FS=5.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:500,0,1781 -chr6 19383638 . C A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.230;DP=77;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:931,0,1830 -chr6 19385147 . G A 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.907;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:1282,0,1242 -chr6 19385753 . A T 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.799;DP=91;FS=3.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:1527,0,1709 -chr6 19545849 . T A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.243;DP=259;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,46:258:99:728,0,8565 -chr6 19548948 . G C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-0.635;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:229,0,1204 -chr6 19570187 . A T 634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:663,48,0 -chr6 19651195 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr6 19705972 . T C 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-2.275;DP=187;FS=4.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.900;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,67:187:99:2173,0,4550 -chr6 19706013 . C CT 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.876;DP=170;FS=5.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:386,0,2392 -chr6 19706338 . C CT 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=-3.859;DP=91;FS=21.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=4.06;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:407,0,1767 -chr6 19781669 . G T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-1.193;DP=57;FS=3.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:570,0,1419 -chr6 19953443 . T C 326.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.69;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:355,0,14 -chr6 19953817 . T C 1665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=1.623;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=32.66;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,45:51:30:1694,0,30 -chr6 20031661 . T A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.140;DP=62;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:465,0,1577 -chr6 20031910 . C A 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.445;DP=117;FS=19.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,40:117:99:1355,0,2806 -chr6 20032284 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=3.408;DP=93;FS=4.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:473,0,2566 -chr6 20033205 . T G 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=1.336;DP=81;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:924,0,1896 -chr6 20044829 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.034;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:471,0,493 -chr6 20082281 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.625;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:232,0,1659 -chr6 20198975 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.554;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:237,0,3126 -chr6 20199195 . T A 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=-0.990;DP=103;FS=6.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1767,0,1872 -chr6 20199236 . G A 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.566;DP=82;FS=23.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1413,0,1462 -chr6 20199318 . G T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.621;DP=36;FS=7.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:294,0,691 -chr6 20199332 . C CA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=4.007;DP=48;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=4.81;ReadPosRankSum=-3.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:268,0,1193 -chr6 20199771 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.285;DP=99;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:599,0,2761 -chr6 20209748 . G A 233.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:262,0,16 -chr6 20210027 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-2.829;DP=56;FS=8.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:322,0,1576 -chr6 20238062 . C T 1973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.440;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=23.87;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2002,141,0 -chr6 20246973 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.172;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:377,0,637 -chr6 20252718 . TA T 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.109;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:357,0,368 -chr6 20252736 . G T 983.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-0.378;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=25.89;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,32:37:21:1012,0,21 -chr6 20261131 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=19.98;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:288,0,122 -chr6 20261452 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.179;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:551,0,806 -chr6 20261731 . T C 1438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1467,105,0 -chr6 20296129 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=-0.485;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:241,0,599 -chr6 20365944 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-1.402;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=14.84;ReadPosRankSum=2.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:518,0,645 -chr6 20367623 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=1.341;DP=68;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:810,0,1581 -chr6 20367725 . T G 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.102;ClippingRankSum=-0.588;DP=75;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:529,0,2371 -chr6 20369413 . T C 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=-0.023;DP=61;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:729,0,1321 -chr6 20388289 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.221;DP=40;FS=7.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:302,0,1103 -chr6 20402855 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.119;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:369,0,654 -chr6 20452134 . G A 749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:778,54,0 -chr6 20577573 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.764;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:288,0,882 -chr6 20604663 . CTT C 780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.092;DP=41;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:818,0,680 -chr6 20772152 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.423;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:372,0,514 -chr6 20772207 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.534;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:306,0,449 -chr6 20811839 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.622;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=17.24;ReadPosRankSum=-1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:580,0,603 -chr6 20815619 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr6 20895247 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.424;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,220 -chr6 20903304 . AGTACGATATCTGCCCTTCCAATATGTTCGAAATCAAACAGAATCGTCAGCTTTCCATCGATGATAATTACATTGTTTGTTTTACAG A 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=30.27;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:340,0,1170 -chr6 20904771 . A G 2165.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.080;DP=57;FS=18.069;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,52:56:75:2194,75,0 -chr6 20904877 . T A 4308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4337,298,0 -chr6 20905505 . G GT 204.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:242,23,0 -chr6 20905546 . T C 1447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1476,105,0 -chr6 20905606 . C T 2342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.386;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=34.45;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,58:63:99:2371,105,0 -chr6 20905681 . A G 2892.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2921,205,0 -chr6 20905930 . A G 3336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.084;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=33.04;ReadPosRankSum=-1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:3365,238,0 -chr6 20905970 . T C 2658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-1.349;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=32.50;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,63:65:99:2687,190,0 -chr6 20906329 . C T 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.821;DP=71;FS=15.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:99:1289,0,239 -chr6 20906336 . T TA 1175.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.473;DP=85;FS=7.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:6:1212,0,6 -chr6 20906441 . A G 1060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=2.275;DP=50;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:36:1089,36,0 -chr6 20906450 . C G 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=2.105;DP=39;FS=4.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=18.87;ReadPosRankSum=-2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:99:764,0,118 -chr6 20906612 . T A 3315.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3344,237,0 -chr6 20906632 . T A 2967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2996,208,0 -chr6 20906695 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr6 20906702 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr6 20908298 . C G 1617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1646,114,0 -chr6 20908724 . G T 4690.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.281;DP=163;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,119:122:99:4719,349,0 -chr6 20908755 . G A 2817.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2846,205,0 -chr6 20908834 . T A 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 -chr6 20908956 . T C 3411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3440,249,0 -chr6 20909027 . C T 1071.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1100,78,0 -chr6 20909165 . G C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=16.60;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:244,0,180 -chr6 20909218 . T G 3353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:3382,232,0 -chr6 20909280 . T C 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.363;DP=86;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=22.31;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,48:56:88:1947,0,88 -chr6 20909592 . C T 1291.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1320,96,0 -chr6 20909616 . A C 2027.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2056,141,0 -chr6 20909739 . T G 5493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5522,379,0 -chr6 20909775 . T C 4296.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.799;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=33.83;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:4325,304,0 -chr6 21030537 . C A 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.012;DP=70;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1267,0,1232 -chr6 21033833 . TAA T 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.300;DP=32;FS=7.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:498,0,346 -chr6 21386556 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,183 -chr6 21404268 . C T 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.692;DP=68;FS=2.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1350,0,991 -chr6 21478442 . A T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.470;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:681,0,116 -chr6 21560403 . T A 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr6 21560415 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:52:270,0,52 -chr6 21566558 . T C 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.759;DP=105;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:1271,0,2230 -chr6 21578190 . TCTGAAACACACAATTTATCAGAACTGATTCATAGGTTCTCTTCATGCACTGATAGAAAATAAAAATAAGCAGATTTAAAAAGACAGAAC T 4552.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=2.405;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=26.32;ReadPosRankSum=-2.428 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,109:111:99:4590,337,0 -chr6 21639957 . A G 3536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=30.22;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:99:3565,262,0 -chr6 21639978 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:294,0,439 -chr6 21640764 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=1.030;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=21.42;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:371,0,366 -chr6 21640780 . A G 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.896;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=26.68;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:99:736,0,1339 -chr6 21640781 . A G 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.189;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.079;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:99:730,0,1339 -chr6 21645091 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-0.152;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:237,0,862 -chr6 21662752 . GAGGTGATACCAGTAACATGAGTGTTCATATCATCCATGTAATCTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAAGTAAAAATCAAGTGACTTAATATCAACTGGTCTTTATTCTATTTGTAC G 2974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=1.682;DP=76;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,68:69:99:3012,228,0 -chr6 21663480 . T A 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.122;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:838,0,1291 -chr6 21667213 . A G 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-0.997;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:830,0,2404 -chr6 21724151 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-1.889;DP=26;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:495,0,390 -chr6 21724163 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-1.505;DP=25;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=17.43;ReadPosRankSum=-2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:464,0,387 -chr6 22452229 . TA T 211.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-0.967;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=13.23;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:22:249,0,22 -chr6 22455667 . CCCTGTAAATGAACCCATACACACAAAGGACATGTTACAGTGTACAAACACGCTGATGAGTGGAAGGCTAGTTTCAATAGGTTCTAATTTACAGTAAAATACACATCATTTTATTA C 2705.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=2.106;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,58:62:99:2743,227,0 -chr6 22458147 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.385;DP=64;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:251,0,1958 -chr6 22827748 . GC G 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.318;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:682,0,1086 -chr6 22827750 . AGGTCAAATGCCGTTTCTTAGAGCATTCCTTCAGTTTATTGATTGTATTTTAATCTGACAGGTCTGTAATGTCTTTGTTCAC A 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.761;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=26.94;ReadPosRankSum=-1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:603,0,905 -chr6 23156400 . CT C 1474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.345;DP=72;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,56:69:99:1512,0,224 -chr6 23210696 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=3.539;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=5.78;ReadPosRankSum=-3.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:317,0,2357 -chr6 23211115 . G A 3947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.387;DP=356;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=11.09;ReadPosRankSum=3.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,120:354:99:3976,0,8236 -chr6 23216759 . T C 3339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.954;ClippingRankSum=0.116;DP=404;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=8.27;ReadPosRankSum=2.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,128:404:99:3368,0,10167 -chr6 23221006 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:456,0,266 -chr6 23256589 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,525 -chr6 23256590 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,525 -chr6 23256804 . TA T 263.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:301,30,0 -chr6 23267403 . G T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.880;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:339,0,326 -chr6 23267485 . C A 1235.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1264,90,0 -chr6 23267713 . T G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:82:462,0,82 -chr6 23267901 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:339,0,297 -chr6 23267917 . A C 544.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.810;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:2:571,2,0 -chr6 23268473 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.345;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:85:502,0,85 -chr6 23268662 . C T 494.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=30.43;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7:522,7,0 -chr6 23268758 . T C 445.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=34.27;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:473,0,7 -chr6 23268947 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.286;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=22.52;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:366,0,171 -chr6 23269220 . A T 626.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.731;DP=19;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:27:655,0,27 -chr6 23280829 . ACTAAGATAACATATACCATAAATAACAAGAGTGTGAACCAGTTCACGTTATTAATGATTAGTATCTTAATGTTTAATGTGTATTAAAAACAAAAAC A 2671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=2.368;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=30.98;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2709,226,0 -chr6 23282702 . T G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.247;DP=59;FS=2.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:489,0,3339 -chr6 23286861 . T A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=1.523;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:730,0,1244 -chr6 23377876 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-0.148;DP=171;FS=5.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,28:171:99:360,0,5622 -chr6 23377921 . G T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.300;DP=187;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=7.17;ReadPosRankSum=3.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,54:187:99:1369,0,5061 -chr6 23378956 . C A 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.204;DP=113;FS=2.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:1511,0,2729 -chr6 23400527 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.762;DP=51;FS=2.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=6.41;ReadPosRankSum=-2.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:355,0,1503 -chr6 23491772 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.048;DP=37;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:414,0,847 -chr6 23540455 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.025;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:350,0,595 -chr6 23541426 . GT G 306.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=1.203;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:8:343,8,0 -chr6 23545858 . T G 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-1.167;DP=116;FS=4.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,41:116:99:1404,0,4252 -chr6 23546620 . G A 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.247;DP=146;FS=10.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,35:146:99:787,0,4326 -chr6 23546792 . A G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-1.961;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=3.62;ReadPosRankSum=2.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,29:143:99:550,0,4440 -chr6 23560023 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.467;DP=60;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:253,0,1947 -chr6 23560073 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.722;DP=59;FS=11.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:328,0,1755 -chr6 23561243 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=-2.838;DP=30;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:349,0,697 -chr6 23614547 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=1.837;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=13.52;ReadPosRankSum=2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:488,0,688 -chr6 23680790 . G A 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-1.671;DP=53;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:940,0,2025 -chr6 23702723 . C A 384.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:2:411,0,2 -chr6 23702894 . A T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 -chr6 23726989 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.369;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:265,0,3715 -chr6 23727028 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=1.212;DP=40;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:257,0,1114 -chr6 23727042 . T A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.242;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:593,0,687 -chr6 23727339 . A AT 1168.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1206,102,0 -chr6 23727385 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.222;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:580,0,400 -chr6 23727418 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:433,0,280 -chr6 23778015 . T G 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=2.346;DP=58;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=21.34;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1266,0,1676 -chr6 23786293 . T TA 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.567;DP=34;FS=14.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:297,0,513 -chr6 23789532 . CTT C 3324.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:4531,340,0 -chr6 23804406 . C T 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-0.775;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:993,0,2881 -chr6 23805209 . A G 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.290;DP=40;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:555,0,820 -chr6 23867918 . G A 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:632,48,0 -chr6 23868248 . T C 922.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:951,66,0 -chr6 23868803 . A G 2963.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:2992,218,0 -chr6 23868881 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=1.527;DP=106;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:335,0,3083 -chr6 23869050 . T G 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=1.041;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=22.38;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:99:1304,0,142 -chr6 23988542 . T A 544.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:582,60,0 -chr6 23988614 . G A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DP=21;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:489,0,157 -chr6 23989082 . G A 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;ClippingRankSum=-4.472;DP=33;FS=42.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=23.05;ReadPosRankSum=3.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:789,0,399 -chr6 23989125 . G C 1531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.061;DP=44;FS=2.157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=34.81;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,40:44:41:1560,41,0 -chr6 23989314 . A G 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.017;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,55:88:99:1871,0,1128 -chr6 23989438 . G T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr6 23989439 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr6 23989732 . G A 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr6 23989842 . G T 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr6 23990297 . G T 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 -chr6 23990308 . T TA 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-0.826;DP=34;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:450,0,117 -chr6 23990490 . G T 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.134;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:1037,0,1449 -chr6 23990493 . G A 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.105;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:1037,0,1449 -chr6 23990847 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=-0.895;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1065,0,1339 -chr6 23990932 . G T 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:51:715,51,0 -chr6 23990957 . G A 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:479,36,0 -chr6 23991030 . G A 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.397;DP=72;FS=23.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:851,0,1500 -chr6 23991117 . A C 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-3.071;DP=120;FS=10.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.144;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1944,0,1379 -chr6 23992023 . C A 678.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=-0.258;DP=63;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:734,0,797 -chr6 23992097 . A C 1909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=1.645;DP=161;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:1938,0,1529 -chr6 23992153 . G T 1325.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:97:1354,97,0 -chr6 23992613 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 -chr6 23992677 . T A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.948;ClippingRankSum=0.578;DP=36;FS=10.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=20.66;ReadPosRankSum=3.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:772,0,184 -chr6 23992715 . G C 764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:793,57,0 -chr6 23992863 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:317,0,387 -chr6 23992876 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.536;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:317,0,387 -chr6 23992954 . A T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.219;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:479,0,987 -chr6 23992976 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.264;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=15.54;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:479,0,987 -chr6 23993624 . G T 610.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:709,54,0 -chr6 23993636 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:99:399,0,238 -chr6 23994011 . A G 5482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:5511,391,0 -chr6 23994130 . A G 2479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.282;ClippingRankSum=1.535;DP=75;FS=45.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=33.06;ReadPosRankSum=-1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,63:74:99:2508,0,113 -chr6 23994161 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.578;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=13.16;ReadPosRankSum=-2.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:252,0,278 -chr6 24014732 . A T 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;ClippingRankSum=0.905;DP=181;FS=3.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,44:181:99:949,0,5069 -chr6 24032649 . TGGTGCGTTACAGAATTGAAACCACATAAGTGTGGTTTAGGTTCTTTCATTTAATCATTTATTATTCAGTAATCATAAGTGTTGATGTTTCTGTATCACA T 14796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=3.178;DP=352;FS=3.829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,326:332:99:14834,1198,0 -chr6 24039377 . ACTGTAAAGTACGACAACCAAAAATGTAAGAAAAAGAACCCATTACAAGAATGAGAATAAACAACATCAACAAAAAAACATAC A 1388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=1.597;DP=33;FS=2.210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:99:1426,126,0 -chr6 24048072 . A T 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.365;DP=41;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:535,0,898 -chr6 24158587 . T C 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:524,36,0 -chr6 24158689 . C G 333.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:362,27,0 -chr6 24159598 . T C 779.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:808,57,0 -chr6 24159702 . G C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr6 24159988 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr6 24160058 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr6 24169740 . T A 1084.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.207;DP=31;FS=2.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=34.98;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:1:1110,0,1 -chr6 24169797 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.820;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=24.32;ReadPosRankSum=-1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:28:466,0,28 -chr6 24171280 . T C 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:835,57,0 -chr6 24171288 . T A 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:835,57,0 -chr6 24171850 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=-4.196;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=17.62;ReadPosRankSum=4.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:874,0,818 -chr6 24172817 . C G 4968.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:4997,358,0 -chr6 24173831 . T A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr6 24173957 . T A 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr6 24175148 . G T 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.438;DP=82;FS=11.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1252,0,1652 -chr6 24176083 . T G 1171.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1200,84,0 -chr6 24750219 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.462;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:304,0,750 -chr6 25473324 . T A 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr6 25473408 . G A 213.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr6 26266608 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.677;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:663,0,1317 -chr6 26266609 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=-0.512;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:663,0,1317 -chr6 26268048 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-1.657;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:559,0,859 -chr6 26583768 . CA C 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=4.827;DP=215;FS=0.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=3.45;ReadPosRankSum=-3.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,54:202:99:779,0,4056 -chr6 26583800 . CT C 719.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=3.280;DP=215;FS=7.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=3.35;ReadPosRankSum=-2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:757,0,3883 -chr6 26596679 . ACTTGATGAGGTAAAGAAAAAAAAACATAATCGACTTAAAGGTTTACAAAACATCTGCTATAAACATCAAAAATTGCTTTATACTAAC A 13544.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=0.418;DP=383;FS=4.669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,377:381:99:13582,1095,0 -chr6 26741244 . A C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.554;DP=29;FS=6.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:444,0,1149 -chr6 26814783 . A C 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-2.840;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.964;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:1087,0,1260 -chr6 26919670 . T C 1748.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1777,126,0 -chr6 26919712 . A G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.633;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:604,0,853 -chr6 26921177 . G A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.610;DP=53;FS=4.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:1203,0,597 -chr6 26942672 . A G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.767;DP=53;FS=2.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:780,0,839 -chr6 27217868 . ATAGGTAGGAATCATTTCTGTGGATAAACAATGGACATAATATTGCTGTCACATATTGAATGTTGTTTTCTTTTTCTGTTT A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=2.424;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:283,0,3337 -chr6 27323438 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.569;DP=35;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:634,0,613 -chr6 27323470 . A C 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.424;DP=53;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:974,0,880 -chr6 27323589 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-1.680;DP=24;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:410,0,482 -chr6 27355047 . TGGTAGTTATTGAATATTACAGCATTCATTCTAAAATGTAAAGAGTGACAAGATTGATAATGATGATTTCTGTTGTACGTTGCA T 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.683;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:254,0,1394 -chr6 27524503 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=1.892;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:449,0,359 -chr6 27583584 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=2.004;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=29.31;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:761,0,105 -chr6 27584135 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:356,0,53 -chr6 27584333 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=20.36;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:415,0,277 -chr6 27584347 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.109;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:452,0,287 -chr6 27593238 . GA G 1714.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-1.467;DP=101;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1752,0,1205 -chr6 27615092 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.460;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,793 -chr6 27615093 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-1.116;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,793 -chr6 27623419 . C T 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.256;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=25.33;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,38:54:99:1396,0,434 -chr6 27626667 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.906;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:601,0,1278 -chr6 27631129 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.760;DP=52;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,33:52:99:1131,0,660 -chr6 27705890 . C A 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-3.816;DP=206;FS=11.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,47:206:99:906,0,6179 -chr6 27706078 . GAGGTGAGTAAAAGCACAAGTGGTAGAGATGCCATAGTCAAAAAATAGTACTCTTTTTAATTTATTGCTCAACTCTTGCAACAACCATAATTCTCTTTCC G 12561.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.718;DP=301;FS=1.644;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=28.94;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,295:301:99:12599,1102,0 -chr6 27745365 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-2.066;DP=62;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,37:62:99:1174,0,798 -chr6 28142276 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.162;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:389,0,890 -chr6 28219350 . G T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.611;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:815,0,622 -chr6 28275715 . A C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.605;DP=52;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:450,0,1282 -chr6 28275767 . A T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=-0.265;DP=46;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:522,0,947 -chr6 28275962 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.225;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:572,0,606 -chr6 28323160 . G A 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.389;DP=43;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:917,0,521 -chr6 28400159 . A G 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-1.441;DP=52;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.597;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:832,0,968 -chr6 28401447 . A G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=3.343;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:436,0,609 -chr6 28931269 . A G 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.368;ClippingRankSum=4.140;DP=89;FS=5.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=5.83;ReadPosRankSum=-4.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:547,0,2404 -chr6 28936576 . C T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=6.161;DP=170;FS=15.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=4.29;ReadPosRankSum=-4.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:757,0,11498 -chr6 28940878 . C G 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=3.256;DP=151;FS=20.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,52:151:99:1246,0,5447 -chr6 28996318 . C A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.519;DP=58;FS=11.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1003,0,955 -chr6 29003488 . A G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.839;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=30.51;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:58:608,0,58 -chr6 29006765 . C A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=1.247;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:383,0,216 -chr6 29014592 . GTACCTTGAACATCAGAGAAAACGCATGAAAAAAAAGCGTACTTTTTAGATCTCATATCTAGTTCCAATATGTTTA G 694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=2.729;DP=26;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:99:732,0,1446 -chr6 29034427 . T G 2776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=-1.487;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,83:129:99:2805,0,1621 -chr6 29049774 . GCTGAAGAAGAAAAAAATTATTAAACAATAACTAAGACAACAACTTATCCAAGAAAATTAATGCAGAAAGGTGGCGTAC G 4846.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=2.114;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,109:111:99:5012,412,0 -chr6 29105410 . TGTAAGTTATCAAAGCTATCATTAATGGAGATATGTGAAGAAAATCTTAAATGTTGCAATTTGTGATTTCAG T 10223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.938;DP=226;FS=6.782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=34.50;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,214:225:99:10261,927,0 -chr6 29108103 . TGTAAGTGGCACATCAGTTCGGATCTCTTAAGTGCTTTTTTTTAATGGCAATGTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCTCTGCAG T 17340.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=1.723;DP=396;FS=3.123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=32.97;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,394:395:99:17951,1365,0 -chr6 29116848 . G T 3406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.357;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,93:193:99:3435,0,3490 -chr6 29180581 . T A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.534;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:549,0,591 -chr6 29180764 . G T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.250;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=23.45;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:638,0,612 -chr6 29180789 . T A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.028;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:525,0,354 -chr6 29180955 . G C 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.172;DP=55;FS=2.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1094,0,829 -chr6 29181440 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=1.051;DP=56;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:815,0,1082 -chr6 29181842 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.238;DP=32;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=10.49;ReadPosRankSum=-2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:364,0,757 -chr6 29181992 . T G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.950;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:420,0,1919 -chr6 29181994 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-1.534;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:420,0,1919 -chr6 29426121 . T C 334.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=33.49;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:363,0,16 -chr6 29506476 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,450 -chr6 29506478 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,450 -chr6 29507489 . AATAATTACTTCACAACATAAAGTTTTCAGTGCTAAAAGACCTCGAGTATGACCATTAATAACCCATAATGCTATTATTTTAGGAG A 1480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.634;DP=309;FS=0.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,73:307:99:1518,0,14291 -chr6 29507657 . AAGGTATATTTATTTAATGAAAGTAAAAAAAAAAAGCTTTTAAAACATCCGCTGTGGGTTGAAACAATTGACAACCAAAATGTGTAAATAAAGATGAATTACTAAGGTATTACCACATTAC A 27666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.684;DP=432;FS=4.169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,409:410:99:27704,1873,0 -chr6 29507799 . T G 9754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=-0.649;DP=382;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,261:382:99:9783,0,3277 -chr6 29508353 . T TA 3323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-6.649;DP=333;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,141:332:99:3361,0,8230 -chr6 29508967 . T G 599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:628,45,0 -chr6 29578044 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=-0.298;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:378,0,1117 -chr6 29795178 . C A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:323,0,330 -chr6 29796543 . A AT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.905;DP=30;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:259,0,575 -chr6 29796557 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.551;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=14.24;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:484,0,741 -chr6 29828081 . T C 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.380;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:598,0,618 -chr6 29829208 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.582;ClippingRankSum=0.301;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:352,0,683 -chr6 29833667 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,137 -chr6 29833948 . T G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=26.56;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:347,0,99 -chr6 29847848 . C T 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:480,36,0 -chr6 29862539 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:286,0,136 -chr6 29865404 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,103 -chr6 30122166 . C T 2254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-1.808;DP=118;FS=3.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:2283,0,1901 -chr6 30129953 . G A 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=-2.782;DP=79;FS=1.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=17.29;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1394,0,2616 -chr6 30132564 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:95:236,0,95 -chr6 30139209 . G A 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-2.875;DP=82;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.075;QD=14.14;ReadPosRankSum=2.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1188,0,1596 -chr6 30143496 . G A 1919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-1.331;DP=111;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1948,0,1992 -chr6 30183824 . C T 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:855,0,311 -chr6 30269050 . C T 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.728;DP=41;FS=9.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:790,0,599 -chr6 30284625 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-1.032;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:658,0,336 -chr6 30284762 . T TA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.113;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:244,0,455 -chr6 30318528 . T A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=1.610;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:297,0,819 -chr6 30318537 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=1.377;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:297,0,819 -chr6 30319106 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.919;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:257,0,117 -chr6 30319283 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=1.902;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:466,0,240 -chr6 30319976 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.537;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:587,0,99 -chr6 30321348 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:57:331,0,57 -chr6 30321771 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:411,0,295 -chr6 30323242 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:384,0,203 -chr6 30360474 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,181 -chr6 30361639 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:349,0,317 -chr6 30364405 . C A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.706;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:330,0,336 -chr6 30367149 . A G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-1.767;DP=29;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:650,0,337 -chr6 30367221 . T A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.93;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:441,0,145 -chr6 30367733 . C G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-1.352;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:360,0,398 -chr6 30367900 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:349,0,169 -chr6 30370286 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.198;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:424,0,1534 -chr6 30370450 . C A 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-1.598;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:666,0,1133 -chr6 30374507 . T A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.960;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1097,0,610 -chr6 30375643 . T G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=-0.079;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:637,0,672 -chr6 30380122 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.727;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:347,0,459 -chr6 30380142 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=1.275;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:350,0,415 -chr6 30411518 . G C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.888;DP=21;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:319,0,425 -chr6 30411561 . A T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=2.362;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:310,0,480 -chr6 30413567 . G A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.417;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:664,0,226 -chr6 30545223 . T A 2333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-2.633;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:2362,0,1923 -chr6 30761918 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,157 -chr6 30878058 . T TA 540.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:59:578,59,0 -chr6 30974164 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:388,0,201 -chr6 31028326 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.178;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:349,0,914 -chr6 31044606 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=22.42;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:387,0,208 -chr6 31109837 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.184;DP=225;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,50:225:99:1008,0,6818 -chr6 31120096 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.003;ClippingRankSum=1.502;DP=40;FS=13.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:298,0,1069 -chr6 31120187 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-0.078;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:363,0,1579 -chr6 31120290 . A G 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=1.116;DP=47;FS=7.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,33:45:99:1901,0,162 -chr6 31120313 . A G 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=1.278;DP=63;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:586,0,2367 -chr6 31120399 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.895;ClippingRankSum=-3.564;DP=83;FS=5.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:371,0,2317 -chr6 31120553 . C T 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.022;DP=110;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:110:99:1014,0,2846 -chr6 31120618 . T A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.842;DP=42;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:565,0,1106 -chr6 31120940 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.313;DP=88;FS=5.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:509,0,5517 -chr6 31123377 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:59:249,0,59 -chr6 31123378 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:59:249,0,59 -chr6 31283072 . GAA G 848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.922;DP=43;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.756;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:99:1115,0,115 -chr6 31283990 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.597;DP=91;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:416,0,2576 -chr6 31284011 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-2.038;DP=83;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:246,0,4565 -chr6 31303834 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.520;DP=85;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:675,0,2246 -chr6 31314723 . T A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.175;DP=89;FS=3.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,22:89:99:473,0,2370 -chr6 31316277 . T C 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=-0.298;DP=65;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:910,0,1200 -chr6 31464384 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=1.068;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,461 -chr6 31497200 . A T 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 -chr6 31777111 . TCTGAACATGACGTTAAAGACTAGACAAGTGCTGTTCTTGACATGATTGCGAATAGATGAAATTAAATACAAAAAATGTCGATGAAAACACACAGGTAAAGGATAC T 2270.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=1.666;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.88;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:2308,173,0 -chr6 31785023 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-1.588;DP=89;FS=7.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:314,0,2570 -chr6 32078342 . A T 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.151;DP=154;FS=3.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=7.54;ReadPosRankSum=2.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,45:154:99:1190,0,4122 -chr6 32095306 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,340 -chr6 32398709 . CA C 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=1.767;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:476,0,99 -chr6 33243665 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:275,0,98 -chr6 33244338 . T G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:367,0,164 -chr6 33247598 . ACAGGTAAGCCTCTTAGAACATCGCTATTTGATCGATAGACATCCAACCTCTTAACTCCAGCCCCAAACGCAATGTGTATACAAACAATTCATTTGATTGCGAGAAGCCCATTAACCAAGTCTGTGAAGAGGCGCGTTCCTTTGAGGTTGCATCACATCCATTGATTTATCTTTCCTTTGATTG A 8548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=2.425;DP=207;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,204:206:99:9155,775,0 -chr6 33256068 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.332;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:599,0,438 -chr6 33361121 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-1.205;DP=31;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:317,0,675 -chr6 33361302 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.562;DP=29;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.090;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:384,0,674 -chr6 33363811 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=-0.951;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:298,0,2170 -chr6 33363947 . C A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-1.647;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:651,0,3531 -chr6 33540618 . T G 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr6 33572567 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:79:249,0,79 -chr6 33579257 . G GA 363.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:25:401,25,0 -chr6 33579260 . G T 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:25:401,25,0 -chr6 33609908 . TCTAGGGGAGAAAGAAGAGAGATTTAATACGGAAAAGCACACTTTGGCAGGGGTCACTTTAATAAAGCATTAACACAC T 1048.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=2.498;DP=402;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=2.61;ReadPosRankSum=-3.924 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,365:373:99:1086,451,0 -chr6 33618610 . T C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.152;DP=76;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:454,0,2148 -chr6 33624782 . ACTAGAACACAAAGAGACAAAGCATGAAGCAAAAGTAAAAGCACTGAAGACTGGCTAGGAATAAAGATGTCATTTATAATAATTTAGCTTATATGAATATCAC A 5440.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=2.094;DP=123;FS=2.106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,118:123:99:5478,453,0 -chr6 33642958 . A G 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.499;DP=46;FS=4.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:698,0,872 -chr6 33645350 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,341 -chr6 33733699 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.790;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:365,0,208 -chr6 33762215 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.695;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:572,0,1020 -chr6 33773155 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-0.905;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:433,0,589 -chr6 34380617 . G A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=-1.831;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=4.49;ReadPosRankSum=2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,38:156:99:728,0,5378 -chr6 34381144 . TTA T 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.393;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,1:92:99:331,0,3154 -chr6 34437524 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.377;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:354,0,291 -chr6 34612476 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,127 -chr6 34641020 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,446 -chr6 34644647 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=1.280;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,612 -chr6 34644661 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-0.167;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:451,0,614 -chr6 34681974 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.496;DP=37;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:256,0,1007 -chr6 34682504 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-1.952;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:232,0,669 -chr6 34682707 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.847;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:401,0,780 -chr6 34682853 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.575;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:581,0,906 -chr6 34683321 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.952;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:382,0,825 -chr6 34684257 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.489;DP=50;FS=8.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.485;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:448,0,1291 -chr6 34684401 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.738;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:275,0,771 -chr6 34823724 . T A 2081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=-0.326;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,61:149:99:2110,0,3163 -chr6 34825010 . T C 2609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=1.569;DP=151;FS=9.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=17.28;ReadPosRankSum=-2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:2638,0,2669 -chr6 34880855 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:396,0,95 -chr6 34880918 . A C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:254,0,261 -chr6 34881087 . T A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:395,0,262 -chr6 34890041 . G A 1673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.492;DP=576;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:460,113:573:99:1702,0,16590 -chr6 34976954 . CT C 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.182;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.850;QD=16.17;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:66:296,0,66 -chr6 34998473 . C A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.332;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:527,0,1478 -chr6 35015774 . G C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:560,0,603 -chr6 35015878 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-1.453;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:460,0,910 -chr6 35016470 . A C 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-2.074;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=28.28;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:802,0,150 -chr6 35016921 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-1.091;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:365,0,576 -chr6 35016939 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.684;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,332 -chr6 35017927 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-1.856;DP=44;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:597,0,980 -chr6 35018455 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.304;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:314,0,442 -chr6 35019571 . A C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:418,0,117 -chr6 35023547 . T C 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-0.257;DP=43;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:664,0,764 -chr6 35037344 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-0.487;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:300,0,1207 -chr6 36329946 . G GT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=-1.418;DP=67;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:488,0,824 -chr6 36330487 . GCTGTTGGGTAAACGAGAAAATAGATTAAGTTCAACTTAAATTATTTTAGCTCCTTAAACGTCTTTATTTTATTGCATTAGTTACATAAAGAGAATGCAAGGTGCATTTTCTGAAAGGTTTTAACTCTGGCGACTTAC G 11348.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=4.068;DP=275;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=32.56;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,256:275:99:11386,556,0 -chr6 36667364 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-1.582;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:289,0,417 -chr6 36731689 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=1.171;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:563,0,367 -chr6 36731698 . T A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=1.623;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:563,0,357 -chr6 36737583 . A G 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=1.620;DP=27;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=25.77;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:724,0,223 -chr6 36821563 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=1.446;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:464,0,1801 -chr6 36825062 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,454 -chr6 37255425 . G GA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.933;DP=175;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=1.35;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,37:163:99:274,0,3062 -chr6 37367839 . A T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.962;DP=93;FS=3.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:581,0,2185 -chr6 37400254 . CT C 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.399;DP=31;FS=10.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:844,0,423 -chr6 37400256 . GCGCAATAGAAATATGCTGATTAGAGATCTGATAGGTTTTTTCAATAACGGTCAACTAAAAGCTTCTCTCACCA G 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.457;DP=32;FS=13.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:844,0,735 -chr6 37427362 . C CAACA 257.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:20:295,20,0 -chr6 37651111 . AGTACGCACGACAACTCTTCATTGTGCTCATGTATTTATTTCTGTTTATTAATGCCACCCTTGAGGCCACTCGTCTTGTTTTGTCCTTTTTCTCTTGCAG A 10614.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=1.023;DP=234;FS=7.950;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=32.50;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,232:234:99:10652,874,0 -chr6 37678882 . AT A 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=2.450;DP=58;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:584,0,648 -chr6 38436545 . G T 211.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:240,0,19 -chr6 38584551 . G A 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr6 38789542 . G GT 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.172;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:691,0,1105 -chr6 38789772 . T A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.290;DP=48;FS=1.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:415,0,2608 -chr6 38827256 . CCAGGTCAAACGCGCGGATTCCCCACAACAACTATTTTTAGCATCTGGATAGTTCTTTGTTGTTTGAAGAGTATTTTCCTTGTTCATT C 2810.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=3.147;DP=93;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,78:92:99:2848,0,4470 -chr6 38833193 . C CT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=-0.348;DP=27;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:305,0,258 -chr6 38883971 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,222 -chr6 38885424 . A AT 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.599;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=21.13;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:312,0,336 -chr6 38886103 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=1.449;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:478,0,576 -chr6 38908242 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.186;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:447,0,885 -chr6 38951884 . TCTGAAAGACAAACACAGCCAGATAGCTATCTTACTATCATTAAACGTGGAAGCACTGCCGTGTGTTTAAGTGTCTGTAAGAC T 1552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.303;DP=72;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1590,0,12623 -chr6 39119318 . T A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.573;DP=31;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:563,0,574 -chr6 39121031 . GT G 500.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=1.169;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=11.64;ReadPosRankSum=-2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:538,0,1832 -chr6 39240398 . CTGCAACAAGAAATAATAACAAATCAGACACTTATCTAACACGAGCTG C 5170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:5208,625,0 -chr6 39240449 . TTACGAGATTTCGAGACAGAGATTGATTTATCTGAATATTTACCAGAG T 5170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:5208,625,0 -chr6 39295457 . TGGTAAAGTGCTCTTACACACCATAGTTTTAGATCATCATCAAGTTTGTTGAATCGATCTGAAATCTTTTCTTTTTTTCTA T 14009.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=0.653;DP=361;FS=7.648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.69;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,353:361:99:14047,1204,0 -chr6 39295759 . AGTAAAGAGGAAAAGTTTAATTCTTGTATTTCATAGGGCATTAAATACAGTCACTGATTCTAATTCCTCTATATTTAG A 5633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.253;DP=188;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,146:182:99:5671,0,9086 -chr6 39296294 . GA G,GAA 1021.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,32,10:42:99:1069,221,182,951,0,1165 -chr6 39309018 . GT G 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.155;DP=37;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:434,0,415 -chr6 39309152 . C CA 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=2.691;DP=61;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.91;ReadPosRankSum=-2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:467,0,896 -chr6 39309420 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-1.783;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:719,0,612 -chr6 39323244 . G GT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.348;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:290,0,385 -chr6 39441175 . G GA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.744;DP=139;FS=17.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,29:133:99:329,0,2896 -chr6 39448949 . CCCTAATATGAAGAAATAAGTGAAACATGTCACTAAATCTAATTCAAGTGTAACATCATATTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTA C 11102.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.303;DP=264;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,258:262:99:11140,884,0 -chr6 39462350 . AG A 592.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-2.068;DP=20;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=29.64;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:63:630,0,63 -chr6 39471862 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.204;DP=46;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:597,0,1855 -chr6 39508493 . C A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.314;DP=48;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:901,0,843 -chr6 39544717 . T A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-1.082;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:99:1197,0,111 -chr6 39544827 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=1.713;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:412,0,988 -chr6 39552623 . TCCTGCAAGAGCGAGTAACATGATAATGCTGCAATGCCAAAACTACTGTAATCCAACTTGTGGCATATTCAAATTTA T 3281.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=1.048;DP=76;FS=3.367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:3319,287,0 -chr6 39564426 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.158;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=21.49;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:458,0,252 -chr6 39564434 . G GA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.515;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=14.09;ReadPosRankSum=-1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:319,0,133 -chr6 39565727 . C CA 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.056;DP=21;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=20.32;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:41:464,0,41 -chr6 39567512 . T TA 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.312;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=14.55;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:85:241,0,85 -chr6 39567629 . CA C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:79:264,0,79 -chr6 39570648 . GCTAAAATGTGTAAAAACAACAATTGAGATTCTCTGCAAATAAGCCAATCTAATTTCACAGAGAACACTGGTTCAAGAAGGCTCTTAC G 1323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=2.116;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.030;QD=33.94;ReadPosRankSum=-2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:99:1361,0,1643 -chr6 39589815 . G A 272.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:301,24,0 -chr6 39592506 . T A 3055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=1.286;DP=108;FS=7.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,78:108:99:3084,0,774 -chr6 39592607 . T C 10332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=1.931;DP=347;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=29.78;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,264:347:99:10361,0,1885 -chr6 39600270 . C T 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-1.094;DP=61;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1278,0,786 -chr6 39603117 . C T 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.794;DP=63;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1277,0,817 -chr6 39613286 . A G 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-0.089;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:1044,0,737 -chr6 39614237 . C T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=1.721;DP=45;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:738,0,1951 -chr6 39627414 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DP=34;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:437,0,708 -chr6 39629563 . C T 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.611;DP=65;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1108,0,1119 -chr6 39631096 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.816;DP=42;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:876,0,518 -chr6 39631378 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-2.931;DP=19;FS=12.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:263,0,416 -chr6 39670691 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=2.914;DP=29;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:313,0,685 -chr6 39670857 . GGTGT G 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=4.049;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:333,0,1126 -chr6 39762599 . T G 310.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:339,0,16 -chr6 39790450 . G A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.154;DP=45;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:970,0,493 -chr6 39796356 . A C 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.877;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1014,0,901 -chr6 39796669 . T C 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.213;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=17.70;ReadPosRankSum=2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:807,0,643 -chr6 39831384 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=-1.155;DP=81;FS=5.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:445,0,2275 -chr6 39848481 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=1.367;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:864,0,768 -chr6 39892367 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,153 -chr6 39906916 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=23.57;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:429,0,212 -chr6 39928111 . T A 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.358;DP=90;FS=1.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.178;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:1444,0,3929 -chr6 39937574 . G A 2871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.428;DP=94;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,76:94:99:2900,0,334 -chr6 39975406 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=2.286;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:255,0,478 -chr6 39975505 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-1.905;DP=20;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=30.54;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:47:639,0,47 -chr6 39976027 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,901 -chr6 39976035 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:249,0,901 -chr6 39980055 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-1.531;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:258,0,1421 -chr6 39989434 . TCCTGTATTTAGCAATATAAACAACTCAAAATAGCAGATATATATATGAAAACAATGTATCTTTGTGAGCTGAATATTATACTTA T 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:668,0,137 -chr6 39996231 . T C 8302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=2.014;DP=434;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,247:434:99:8331,0,6862 -chr6 39996347 . A T 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=-0.259;DP=87;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1451,0,1476 -chr6 40020992 . AGT A 2060.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.685;DP=112;FS=3.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:2098,0,2218 -chr6 40021134 . C T 1631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.707;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,47:74:99:1660,0,1672 -chr6 40147270 . GC G 216.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:19:254,19,0 -chr6 40151138 . T C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.207;DP=43;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.077;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:806,0,1664 -chr6 40188823 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-1.291;DP=30;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=19.83;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:623,0,425 -chr6 40192661 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.709;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:63:566,0,63 -chr6 40210627 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-0.607;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:376,0,593 -chr6 40356288 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:253,0,103 -chr6 40360770 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-1.132;DP=32;FS=14.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:252,0,904 -chr6 40361991 . C T 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-0.465;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,43:73:99:1453,0,1067 -chr6 40365053 . G A 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-0.710;DP=72;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,47:72:99:1661,0,827 -chr6 40385937 . G A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr6 40392692 . ACTGTAAAAAGGCAAGAAATATATATAAATAAAACATTATTACACTTCTAGACAACACTAATAAACAAAGGCAATGATACACATACACAC A 1107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:90:1145,90,0 -chr6 40474500 . GA G 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=2.439;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:342,0,290 -chr6 40502355 . AAGGTACAAAATATCTTGAGTTCTTTTTTATGCCTCTGTCAAATTTGTAGACATATTTTTCTTTTTTTCAAT A 2165.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=2.140;DP=70;FS=6.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=30.94;ReadPosRankSum=-3.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,52:65:99:2203,0,4255 -chr6 40503783 . TCCTGTAACAACAGCAGACACTTAAAACAGCACATGTAAATCAGATTTTGAGTAACGTTGGTACGTTACATTCGTCGTTTCGAGCCTTCGTAAATTTATAAACCGTGACTAA T 8540.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.653;DP=226;FS=4.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,204:225:99:8578,0,1893 -chr6 40509120 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.818;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:289,0,343 -chr6 40509269 . TA T 1583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-1.231;DP=138;FS=3.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1621,0,1321 -chr6 40535076 . G A 206.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:235,0,21 -chr6 40536989 . T C 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr6 40559994 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.322;DP=38;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:290,0,1011 -chr6 40560118 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.461;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:301,0,1249 -chr6 40578688 . T A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=-2.849;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:428,0,256 -chr6 40582689 . T A 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=2.372;DP=130;FS=3.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,39:123:99:770,0,2761 -chr6 40585662 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:236,0,65 -chr6 40594641 . G C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=26.37;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:582,0,158 -chr6 40597050 . A T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=-0.283;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:281,0,872 -chr6 40599555 . G T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.368;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:320,0,544 -chr6 40619743 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.899;DP=23;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:443,0,367 -chr6 40620197 . T A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.378;DP=32;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:551,0,621 -chr6 40620398 . TC T 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.629;DP=40;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:503,0,522 -chr6 40621506 . CAG C 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=22.67;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:400,0,138 -chr6 40624455 . T C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-0.037;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:724,0,110 -chr6 40625573 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.482;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:297,0,116 -chr6 40638401 . G GA 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-0.182;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:282,0,469 -chr6 40638828 . CTG C 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.111;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:450,0,620 -chr6 40639034 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=27.83;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:98:390,0,98 -chr6 40639097 . T TA 214.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:252,24,0 -chr6 40648020 . T G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-2.460;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:904,0,232 -chr6 40648402 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=2.499;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:333,0,1019 -chr6 40650672 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.069;DP=38;FS=5.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:234,0,1063 -chr6 40652042 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.612;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:374,0,578 -chr6 40693752 . TA T 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=3.672;DP=102;FS=7.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=2.60;ReadPosRankSum=-2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,24:98:99:302,0,4836 -chr6 40693776 . A T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-1.099;DP=69;FS=7.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=4.37;ReadPosRankSum=-3.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,5:69:99:330,0,4836 -chr6 40693851 . G A 2781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=-0.593;DP=167;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,76:167:99:2810,0,2954 -chr6 40694286 . T C 6969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.549;DP=392;FS=0.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,211:391:99:6998,0,6697 -chr6 40697242 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.08;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:259,0,97 -chr6 40701246 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,174 -chr6 40701329 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.500;DP=44;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=11.93;ReadPosRankSum=-2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:553,0,1040 -chr6 40755514 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=1.357;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:424,0,430 -chr6 40755622 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-0.673;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:537,0,606 -chr6 40758256 . C T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.317;DP=37;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:580,0,628 -chr6 40763596 . G T 1411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=2.837;DP=93;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.493;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:1440,0,1685 -chr6 40768479 . ACAGGTATGAGCCCACAAACATTATGCTATTTCTAATGAATCTCCGTAAATCTAATCATTTGGTGTCTTT A 5803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=2.882;DP=216;FS=5.388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.516;QD=26.87;ReadPosRankSum=2.484 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,136:144:99:5841,423,0 -chr6 40769977 . C T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=1.086;DP=88;FS=7.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:1073,0,1986 -chr6 40771526 . G A 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-2.096;DP=202;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=5.87;ReadPosRankSum=2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,52:200:99:1213,0,5567 -chr6 40771676 . C T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.760;DP=61;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:574,0,1495 -chr6 40833739 . AACCTAAAGCTCAGACAAATGATAAGTGGAAGTGTTGCTTAAGAAAAACTCACTTCATATTATACAAGTATTATATGCTTTTTT A 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=1.371;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=26.87;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:521,0,1799 -chr6 40835748 . CCCTAGATCACCACGTATAGTAAGTTATAATATGTATGTTTACAGTTGGTATGTGCACAACTGGAGAAACAAAGTATTGGAATTTGACATAAGTTTTGTGAGTGTACCAGA C 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.727;DP=19;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:679,0,674 -chr6 40877777 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.705;DP=84;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1022,0,1933 -chr6 40898701 . AT A 563.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.743;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:601,60,0 -chr6 40954761 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-2.412;DP=75;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:301,0,2227 -chr6 40959182 . GCTTCAAATACAGATTAATCATTAATCATAATCACATCCCTCCATAATTTACCACAGCTACAAACTGTCGTTATCTACAATAATTTACTGTACACATGACGCAAACACTAC G 2409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.725;DP=64;FS=4.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,59:64:99:2447,0,1888 -chr6 41011043 . TA TAA,T 848.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.788;DP=80;FS=2.884;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,52,15:69:99:1825,272,224,1675,0,2319 -chr6 41011608 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.347;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:467,0,778 -chr6 41013204 . A T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=-0.036;DP=238;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,50:238:99:964,0,7144 -chr6 41013481 . A AG 437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-0.565;DP=52;FS=8.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:475,0,596 -chr6 41013691 . A T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-3.567;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=27.93;ReadPosRankSum=2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:894,0,531 -chr6 41014673 . G A 436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:465,33,0 -chr6 41015138 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr6 41015221 . C G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr6 41015689 . T A 1315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=2.293;DP=354;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,76:354:99:1344,0,10544 -chr6 41046443 . GA G 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.433;DP=69;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:419,0,1146 -chr6 41046689 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.510;DP=75;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:232,0,2370 -chr6 41288704 . G A 1432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-0.901;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1461,0,891 -chr6 41366801 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=6.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:463,0,325 -chr6 41372537 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:357,0,297 -chr6 41377830 . G C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:430,0,258 -chr6 41382264 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=33.25;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:51:261,0,51 -chr6 41391371 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.678;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:639,0,6553 -chr6 41391377 . A C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.341;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:86:99:494,0,7499 -chr6 41391628 . TA T 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=1.768;DP=15;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:79:262,0,79 -chr6 41428515 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:290,0,98 -chr6 41429855 . A C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:289,0,136 -chr6 41429869 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:288,0,215 -chr6 41432305 . T C 882.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.261;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=31.93;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:27:911,27,0 -chr6 41432435 . GA G 1127.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.213;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1165,115,0 -chr6 41433215 . A C 1776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.469;DP=82;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=21.67;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,51:82:99:1805,0,1500 -chr6 41433377 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.993;ClippingRankSum=-0.430;DP=73;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:321,0,2241 -chr6 41435213 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.309;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.785;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:373,0,743 -chr6 41437223 . C A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.415;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:540,0,546 -chr6 41441436 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.223;DP=31;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:399,0,684 -chr6 41446017 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-0.344;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.51;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:243,0,895 -chr6 41467062 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:317,0,335 -chr6 41486608 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.580;DP=83;FS=5.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:421,0,2419 -chr6 41534992 . C T 1712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.184;DP=106;FS=0.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.421;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1741,0,1850 -chr6 41651502 . G T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.453;DP=68;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:390,0,1932 -chr6 41659469 . T A 1585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.133;DP=79;FS=16.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1614,0,1074 -chr6 41686356 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=3.916;DP=58;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=5.74;ReadPosRankSum=-3.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:361,0,3471 -chr6 41686359 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=3.927;DP=57;FS=4.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=5.84;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:361,0,3471 -chr6 41686754 . T A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.477;DP=51;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:660,0,1089 -chr6 41687608 . CT C 856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.236;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:894,0,479 -chr6 41687841 . T A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-0.883;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:529,0,721 -chr6 41687893 . C G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.316;DP=44;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:774,0,773 -chr6 41689498 . T TA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.435;DP=34;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:363,0,838 -chr6 41689805 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.839;DP=105;FS=9.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,22:105:99:416,0,3271 -chr6 41690930 . C A 271.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:300,24,0 -chr6 41690999 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=1.173;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=18.27;ReadPosRankSum=-2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:412,0,342 -chr6 41691155 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.109;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=17.55;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:660,0,615 -chr6 41692751 . C A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.695;DP=63;FS=3.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:867,0,1313 -chr6 41693056 . G GT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.091;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:300,0,371 -chr6 41693112 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=-0.576;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:462,0,591 -chr6 41693875 . T G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=2.147;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:237,0,984 -chr6 41694067 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=1.034;DP=49;FS=22.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=8.71;ReadPosRankSum=-2.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:455,0,2290 -chr6 41754670 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.996;DP=36;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:303,0,932 -chr6 41766449 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.540;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,734 -chr6 41766497 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-1.517;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,522 -chr6 41766527 . C G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.934;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:385,0,522 -chr6 41767275 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-1.323;DP=28;FS=8.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:431,0,539 -chr6 41927048 . T G 5477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.668;DP=320;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,169:319:99:5506,0,5323 -chr6 41927324 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.028;DP=282;FS=3.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=2.09;ReadPosRankSum=2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,48:282:99:617,0,8959 -chr6 41963783 . G A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr6 41969696 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.594;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:316,0,597 -chr6 41969894 . C T 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.892;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:798,0,616 -chr6 41974165 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.677;DP=40;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:700,0,702 -chr6 41974219 . C T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.155;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:701,0,705 -chr6 41986049 . G C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:260,0,158 -chr6 42221493 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:257,0,401 -chr6 42223099 . T C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr6 42234192 . GCTGGGGGAAATGATAGAATCCAAAATTATTATAATATACAGAGCTATCCAAAATTTTATAATATACAGAGCTACCATTATTATGCTGCATTTAGTATAGGAAACATAC G 1945.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1983,164,0 -chr6 42286798 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.229;DP=149;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,27:149:99:405,0,4514 -chr6 42287287 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.504;DP=154;FS=1.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.57;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,24:153:99:270,0,4646 -chr6 42301674 . CATTT C 938.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.504;ClippingRankSum=4.297;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=13.04;ReadPosRankSum=-3.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:976,0,1996 -chr6 42302132 . T C 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.454;DP=171;FS=4.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,54:171:99:1465,0,4966 -chr6 42306046 . C G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=2.421;DP=246;FS=9.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,41:246:99:470,0,7623 -chr6 42306171 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.638;DP=201;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,30:201:99:249,0,6556 -chr6 42341604 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-1.611;DP=129;FS=6.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,21:129:99:249,0,6449 -chr6 42341607 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-1.047;DP=127;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,18:127:99:249,0,6449 -chr6 42341976 . G A 3952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.103;DP=219;FS=11.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,110:219:99:3981,0,3901 -chr6 42342006 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-2.521;DP=224;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=1.50;ReadPosRankSum=2.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,35:224:99:364,0,7337 -chr6 42348005 . T C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=1.224;DP=47;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:453,0,2026 -chr6 42348011 . C CA 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.275;DP=49;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:696,0,628 -chr6 42348523 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.508;DP=51;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:325,0,1493 -chr6 42348561 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.406;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=4.59;ReadPosRankSum=2.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:276,0,1627 -chr6 42348702 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.817;DP=53;FS=9.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:324,0,1538 -chr6 42410468 . A C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,326 -chr6 42425866 . T A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.591;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:445,0,408 -chr6 42435926 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.769;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:400,0,376 -chr6 42529737 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:312,0,97 -chr6 42604947 . G A 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.482;DP=129;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,46:129:99:1558,0,2853 -chr6 42621390 . ATTTTCTGAACTTTAATACTTTCAATTCCAATGTTCATTAATATGCAAATCCTCAGATCTAAATTATGACATCTTGCAGG A 1839.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.722;DP=156;FS=19.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,57:155:99:1877,0,6798 -chr6 42622014 . GTC G 1534.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1572,125,0 -chr6 42845470 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=10.96;ReadPosRankSum=2.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:335,0,669 -chr6 42846022 . GAA G,GAAA 284.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-1.366;DP=36;FS=5.315;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.472;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,8,14:27:99:461,223,706,173,0,327 -chr6 42846837 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:274,0,421 -chr6 42864433 . C A 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=1.995;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=16.23;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1132,0,1214 -chr6 42864881 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.744;DP=51;FS=7.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:229,0,1540 -chr6 42865566 . A C 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-0.080;DP=70;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:865,0,3080 -chr6 42865567 . C A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=1.175;DP=70;FS=3.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:865,0,3033 -chr6 42883408 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:372,0,375 -chr6 42947536 . C T 1871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=1.896;DP=109;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=17.17;ReadPosRankSum=-2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1900,0,1908 -chr6 42951538 . C A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.297;DP=44;FS=2.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:459,0,994 -chr6 42951610 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.453;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:335,0,897 -chr6 42956688 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.217;DP=50;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:442,0,1329 -chr6 43008126 . C T 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.062;DP=229;FS=4.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=5.13;ReadPosRankSum=2.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,54:229:99:1204,0,6946 -chr6 43009422 . C A 6036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.187;DP=342;FS=5.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,185:342:99:6065,0,5644 -chr6 43023281 . A T 4308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=-2.467;DP=319;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,73:315:99:4337,0,8130 -chr6 43163804 . C G 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=1.193;DP=62;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1120,0,956 -chr6 43169524 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.193;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:718,0,1012 -chr6 43182807 . G GA 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.168;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=26.30;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:37:537,0,37 -chr6 43185432 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.635;DP=27;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:412,0,495 -chr6 43193797 . G A 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.340;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:947,0,1219 -chr6 43196338 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.324;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:303,0,2207 -chr6 43196379 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-2.198;DP=67;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:255,0,1962 -chr6 43200338 . A G 1109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.415;DP=69;FS=6.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,32:69:99:1138,0,1254 -chr6 43217406 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.895;DP=45;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:342,0,1196 -chr6 43364101 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:339,0,370 -chr6 43405723 . C CT 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.780;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:432,0,550 -chr6 43531284 . C A 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=-1.159;DP=43;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:959,0,1068 -chr6 43531909 . G A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.266;DP=52;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:694,0,1152 -chr6 43556307 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-1.010;DP=69;FS=8.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:297,0,1984 -chr6 43587019 . C T 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=2.007;DP=85;FS=3.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:1252,0,1423 -chr6 43835638 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,356 -chr6 43837739 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:333,0,309 -chr6 43938628 . A C 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:412,0,525 -chr6 43938696 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-1.078;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:237,0,686 -chr6 44095173 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-1.373;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:247,0,1147 -chr6 44118548 . A G 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=1.720;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:1106,0,1041 -chr6 44125843 . CT C 709.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.755;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=26.29;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:747,0,129 -chr6 44126615 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.280;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:293,0,430 -chr6 44126746 . C CA 364.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=-0.950;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,17:20:1:435,1,0 -chr6 44176180 . A T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-2.325;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:982,0,988 -chr6 44176218 . A G 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-1.137;DP=54;FS=5.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:547,0,2488 -chr6 44176333 . A AG 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:415,0,732 -chr6 44178052 . C T 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.008;DP=58;FS=3.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:1027,0,1599 -chr6 44178079 . A C 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.475;DP=58;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,28:58:99:997,0,1016 -chr6 44211239 . C A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.513;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:636,0,537 -chr6 44858588 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=1.029;DP=117;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:377,0,3705 -chr6 44860910 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-0.811;DP=96;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=2.09;ReadPosRankSum=2.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,16:96:99:229,0,3035 -chr6 44862573 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.150;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:371,0,3497 -chr6 44887663 . C T 3171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.884;DP=182;FS=3.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,91:182:99:3200,0,3310 -chr6 44914548 . CA C 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=2.180;DP=54;FS=11.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:466,0,655 -chr6 44915877 . T G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.115;DP=68;FS=5.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.048;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:563,0,1763 -chr6 44916008 . C T 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-1.357;DP=100;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,34:100:99:1153,0,2223 -chr6 45129624 . T G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.423;DP=17;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:342,0,245 -chr6 45308450 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=31.75;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:83:314,0,83 -chr6 45781953 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:315,0,232 -chr6 45799878 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.058;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:456,0,925 -chr6 45824976 . G A 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.276;ClippingRankSum=1.257;DP=166;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,45:165:99:952,0,7422 -chr6 45824977 . C T 2437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=-1.790;DP=167;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=14.60;ReadPosRankSum=2.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,74:167:99:2466,0,4618 -chr6 45837745 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.032;DP=134;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,29:134:99:572,0,3745 -chr6 45837757 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.443;DP=135;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,27:135:99:485,0,4085 -chr6 45837841 . C A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.074;DP=139;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,28:139:99:502,0,4098 -chr6 45838003 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=2.174;DP=185;FS=8.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,34:184:99:481,0,5609 -chr6 45870157 . TGGTAAGTCAAATATTATAAGACTGAATATTCAAGTCAATTTTAGATTAAAGTGCACATATATTTTTTTTCTTTTGCTTTAAA T 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.47;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:257,0,1609 -chr6 45874149 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.758;DP=79;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:392,0,2454 -chr6 45874377 . A AT 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.327;DP=44;FS=7.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:340,0,345 -chr6 45876107 . C CT 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.202;DP=284;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,60:244:99:693,0,4910 -chr6 45876503 . C T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.785;DP=363;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,80:359:99:1002,0,11737 -chr6 45879174 . A T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr6 45886191 . C T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-1.550;DP=257;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,60:257:99:1258,0,12865 -chr6 45889792 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.094;DP=34;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:271,0,907 -chr6 45908014 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.774;DP=28;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:258,0,681 -chr6 45944423 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.079;DP=26;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:344,0,741 -chr6 46180744 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.532;DP=108;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=2.60;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:309,0,52 -chr6 46180787 . T C 311.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:340,0,16 -chr6 46180897 . A AT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1091 -chr6 46180905 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.259;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1094 -chr6 46182091 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.788;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=9.18;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:276,0,229 -chr6 46182622 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-1.637;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:473,0,125 -chr6 46183900 . GT G 1935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.008;DP=103;FS=1.527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,74:83:99:1980,115,0 -chr6 46184059 . G A 977.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1006,69,0 -chr6 46184084 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr6 46184646 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.348;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=31.58;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:35:990,35,0 -chr6 46258039 . AAGGTAAAGTAATGCTTTTCTTTTAACTTGTATTCTTTTTTTGAGATTTATGTGTATAATGTGCACATATTGACTGTTTTCC A 599.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=27.25;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:47:637,47,0 -chr6 46333616 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr6 46333617 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr6 46333743 . T G 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 -chr6 46348344 . TGGTAAGACCCAAGCGTGTGCACTTGATTCAAATCAGACTAATTTGTTACTTTCATAAAACCTAGTTTAGGTTGGATTTTTAGTGATAAATGTTGTTTATTTTCATTGATTAATTTTTCTTTTGTTTGTTTCA T 9369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.588;DP=246;FS=2.456;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,243:246:99:9407,865,0 -chr6 46351296 . G GA 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.391;DP=213;FS=12.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,41:204:99:325,0,4417 -chr6 46353199 . C T 3433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-0.652;DP=236;FS=0.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,104:236:99:3462,0,4317 -chr6 46353790 . G C 3056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.001;DP=239;FS=0.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,90:239:99:3085,0,5212 -chr6 46354727 . C T 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-3.023;DP=266;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,70:266:99:1570,0,11480 -chr6 46357739 . C T 4701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-1.235;DP=344;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,136:343:99:4730,0,7044 -chr6 46360220 . C T 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.741;DP=259;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,63:256:99:1342,0,7412 -chr6 46364645 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.682;DP=42;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:283,0,1378 -chr6 46371410 . C A 2361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=1.300;DP=298;FS=6.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=7.93;ReadPosRankSum=2.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,92:298:99:2390,0,7750 -chr6 46827526 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-1.109;DP=360;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,64:360:99:867,0,11520 -chr6 46830944 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.104;DP=234;FS=3.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,40:234:99:383,0,8345 -chr6 46831016 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.152;DP=238;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,41:238:99:575,0,7589 -chr6 46831058 . A C 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=1.605;DP=210;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,45:210:99:805,0,6701 -chr6 46831189 . A G 3852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.443;DP=234;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,120:234:99:3881,0,4096 -chr6 46831549 . C T 3884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-1.047;DP=216;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,117:216:99:3913,0,3661 -chr6 46840361 . C A 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-0.601;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:1615,0,2515 -chr6 46857830 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:393,0,399 -chr6 46971414 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:350,0,363 -chr6 47397985 . G T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-1.546;DP=105;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,35:105:99:1049,0,5474 -chr6 47397986 . A C 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-1.275;DP=105;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,35:105:99:1049,0,5474 -chr6 47398967 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=1.219;DP=47;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:245,0,3343 -chr6 47398974 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.332;DP=46;FS=8.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,9:46:99:254,0,3343 -chr6 47399172 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.512;DP=59;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:484,0,1628 -chr6 47433593 . T TC 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:90:357,0,90 -chr6 47750721 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=1.061;DP=75;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:403,0,3658 -chr6 47751950 . G A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr6 47756995 . G C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.311;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,19:105:99:249,0,3102 -chr6 47757303 . C A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.978;DP=106;FS=5.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:640,0,6057 -chr6 47760369 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-0.494;DP=116;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:435,0,3403 -chr6 47776188 . G A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.776;DP=64;FS=2.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1103,0,1102 -chr6 47781292 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=2.326;DP=58;FS=4.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:384,0,1640 -chr6 47796855 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=-0.056;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,30:145:99:510,0,4372 -chr6 47806039 . A T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-1.523;DP=156;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=4.18;ReadPosRankSum=2.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,33:156:99:680,0,5004 -chr6 47806193 . CA C 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=1.077;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:617,0,212 -chr6 47806473 . T A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.230;DP=33;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:466,0,889 -chr6 47826134 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:83:341,0,83 -chr6 47832126 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,221 -chr6 47992943 . A ACC 282.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:23:320,23,0 -chr6 47999131 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=1.359;DP=25;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:336,0,534 -chr6 48005612 . CA C 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.913;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:375,0,242 -chr6 48005695 . A C 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.970;DP=52;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:692,0,1100 -chr6 48005745 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.164;DP=82;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:252,0,3286 -chr6 48006393 . G C 1438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.597;DP=113;FS=6.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,42:113:99:1467,0,2538 -chr6 48006678 . G T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.775;DP=106;FS=11.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=7.34;ReadPosRankSum=2.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:806,0,8172 -chr6 48006684 . C T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.520;DP=101;FS=11.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,29:101:99:806,0,8172 -chr6 48007461 . T C 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 -chr6 48007990 . G T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.578;DP=54;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:438,0,1514 -chr6 48008589 . G A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.227;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:727,0,385 -chr6 48009440 . G A 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=2.736;DP=129;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,46:129:99:1568,0,2815 -chr6 48010555 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-2.922;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,30:122:99:649,0,7567 -chr6 48012721 . G A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-2.059;DP=93;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=5.64;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:553,0,2607 -chr6 48104327 . G T 2127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=-0.872;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=17.16;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:2156,0,2012 -chr6 48109042 . G A 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.588;DP=91;FS=5.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,55:91:99:1854,0,1260 -chr6 48133828 . AAGGTAGGAGATTCAACACTAAATCTAATGCTTTAATAATTTGCTCATTCAGTTAACATCAAAATGCAAACCAGTAGTATATTGATGTGTTTTGCAGTCGTTTTAATCAGTATGATCTCTTAATC A 756.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=1.619;DP=143;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,140:142:99:794,326,0 -chr6 48139621 . T TA 221.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:259,26,0 -chr6 48139785 . GT G 925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:97:963,97,0 -chr6 48178966 . G A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-0.543;DP=54;FS=4.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:687,0,1761 -chr6 48181978 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=1.543;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:292,0,470 -chr6 48182640 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.848;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:231,0,606 -chr6 48230897 . T C 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.404;DP=27;FS=2.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=28.84;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:71:807,0,71 -chr6 48238786 . C A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.734;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:462,0,576 -chr6 48253246 . A T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.172;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:673,0,375 -chr6 48254457 . G A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.728;DP=34;FS=7.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:636,0,1205 -chr6 48293411 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-1.892;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:370,0,1354 -chr6 48301120 . GCAGGTATATGGATTCAAGAGCACTGTTTTATTGCAGTCTTAAACTGCCATGTTATGACTTTTGTGTATGT G 2222.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=1.670;DP=56;FS=3.332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=34.07;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2260,176,0 -chr6 48301337 . T A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-1.122;DP=40;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:765,0,599 -chr6 48303612 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.488;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:583,0,471 -chr6 48319110 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-2.031;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:316,0,337 -chr6 48320559 . TA T 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-2.620;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:56:297,0,56 -chr6 48320864 . T A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=-1.155;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:932,0,309 -chr6 48321227 . A C 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:384,27,0 -chr6 48324067 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-0.173;DP=56;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:701,0,1353 -chr6 48324089 . G T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.432;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:579,0,1082 -chr6 48324258 . G GA 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.287;DP=80;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:453,0,1311 -chr6 48324492 . T G 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-2.428;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1370,0,1485 -chr6 48325096 . G A 1889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.107;DP=75;FS=6.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,50:75:99:1918,0,696 -chr6 48365061 . A G 333.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=33.39;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:362,0,14 -chr6 49001416 . G T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.068;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:486,0,415 -chr6 49001826 . C T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.629;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:843,0,777 -chr6 49036307 . C T 8304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.261;ClippingRankSum=0.790;DP=439;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=18.92;ReadPosRankSum=3.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,241:439:99:8333,0,7428 -chr6 49041847 . A G 1576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.680;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1605,0,1090 -chr6 49042625 . CT C 639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.686;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=6.33;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:87:99:677,0,1978 -chr6 49042636 . T A 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.237;DP=109;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1184,0,2026 -chr6 49042918 . G A 3005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.035;DP=223;FS=12.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,84:223:99:3034,0,4935 -chr6 49043301 . G C 3967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.431;DP=179;FS=4.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,100:179:99:3996,0,2869 -chr6 49043358 . T C 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=31.81;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:55:892,0,55 -chr6 49043716 . GGGTACGTTTGCTTCTACTGCGTTTGGTGAAGCATTAAAAGGGCTGCAGAACATCTAAATCTTCATTTTGCTGTTTTACA G 15869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=1.517;DP=364;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=34.83;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,360:364:99:15907,1305,0 -chr6 49047001 . G C 7368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.779;DP=316;FS=23.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.203;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,206:316:99:7397,0,13069 -chr6 49047124 . G A 20859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.059;DP=261;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,110:261:99:20888,0,2954 -chr6 49047899 . TA T 1496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1534,124,0 -chr6 49048081 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr6 49048204 . T C 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=1.379;DP=41;FS=15.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:672,0,844 -chr6 49048739 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=2.976;DP=20;FS=5.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:79:645,0,79 -chr6 49049295 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.153;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:502,0,537 -chr6 49049637 . T A 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:658,45,0 -chr6 49049820 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:56:249,0,56 -chr6 49050117 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=1.101;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:682,0,1431 -chr6 49055770 . TCTATAAACACACGAGTGAGGATCAGTTAACTTCATAGTTATGCTCAATGAACCGAGAAATACAATGTGTTAAATAC T 942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.653;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=30.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:99:980,0,598 -chr6 49056701 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=-0.931;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:719,0,1062 -chr6 49261459 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:89:387,0,89 -chr6 49308829 . T C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.990;DP=36;FS=10.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=21.94;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:818,0,414 -chr6 49309322 . T G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.158;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:426,0,235 -chr6 49310262 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.68;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:295,0,50 -chr6 49310938 . C A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr6 49311151 . G A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:239,18,0 -chr6 49311762 . C T 204.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:233,0,21 -chr6 49313343 . A T 907.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:936,63,0 -chr6 49313352 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,303 -chr6 49313902 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:349,0,305 -chr6 49317452 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-1.625;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:307,0,216 -chr6 49331758 . C A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.128;DP=40;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:461,0,882 -chr6 49333078 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.794;DP=15;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:80:477,0,80 -chr6 49333114 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.67;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:310,0,172 -chr6 49333167 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:301,0,825 -chr6 49333175 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:301,0,825 -chr6 49455183 . A G 2585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=1.392;DP=417;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,110:417:99:2614,0,12094 -chr6 49457923 . A G 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.853;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:480,0,568 -chr6 49466890 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:471,33,0 -chr6 49468882 . A G 5508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.525;DP=378;FS=21.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,160:378:99:5537,0,7003 -chr6 49469081 . G T 6212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.045;DP=426;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,181:425:99:6241,0,8122 -chr6 49469123 . C T 6138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=-5.372;DP=442;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,181:442:99:6167,0,8389 -chr6 49473492 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-1.087;DP=39;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:416,0,948 -chr6 49473554 . C A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-2.323;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:585,0,576 -chr6 49473697 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.640;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:471,0,1511 -chr6 49473710 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=-0.234;DP=50;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:250,0,1441 -chr6 49473919 . G A 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.956;DP=59;FS=10.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:810,0,1280 -chr6 49474598 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,504 -chr6 49475237 . C A 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.209;DP=136;FS=12.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,41:136:99:1077,0,3710 -chr6 49475337 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=1.115;DP=91;FS=9.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:263,0,6213 -chr6 49475616 . T C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-0.769;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:741,0,909 -chr6 49475730 . G A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.868;DP=117;FS=3.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1743,0,2170 -chr6 49484437 . G A 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.133;ClippingRankSum=-1.540;DP=86;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.008;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,59:85:99:1976,0,700 -chr6 49486998 . T G 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-0.935;DP=106;FS=6.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.654;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1858,0,1527 -chr6 49506359 . A C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=2.659;DP=35;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=21.45;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:779,0,418 -chr6 49529115 . G C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr6 49529268 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr6 49530134 . G C 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:397,27,0 -chr6 49530144 . G A 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:397,27,0 -chr6 49588448 . C G 2124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=1.368;DP=179;FS=10.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,64:179:99:2153,0,3974 -chr6 49588553 . A T 1814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.518;ClippingRankSum=-1.001;DP=133;FS=3.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:1843,0,5187 -chr6 49588554 . C A 1814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-1.598;DP=137;FS=4.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,50:137:99:1843,0,5249 -chr6 49589177 . G A 11901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:11930,825,0 -chr6 49589392 . C T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-1.745;DP=58;FS=9.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,36:57:99:1248,0,720 -chr6 49589597 . G GT 2435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.377;DP=186;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,112:183:99:2494,0,1643 -chr6 49589925 . C T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.761;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,34:140:99:779,0,10687 -chr6 49602728 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:508,0,237 -chr6 49604498 . G A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.198;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:764,0,346 -chr6 49607077 . T G 1759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1788,129,0 -chr6 49607455 . A G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.575;DP=44;FS=9.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:780,0,639 -chr6 49674735 . G A 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.472;DP=56;FS=7.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1041,0,1572 -chr6 49677800 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:232,0,61 -chr6 49678074 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.408;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,183 -chr6 49688906 . T C 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.423;DP=48;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:882,0,863 -chr6 49688954 . T A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=1.345;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:780,0,620 -chr6 49689900 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr6 49690253 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=34.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:54:394,0,54 -chr6 49690748 . G A 2054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=-0.306;DP=63;FS=6.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.108;QD=32.62;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,49:63:99:2083,0,624 -chr6 49691282 . A T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-2.185;DP=38;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:448,0,928 -chr6 49691398 . C T 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.542;DP=54;FS=5.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:803,0,1103 -chr6 49691613 . C G 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.043;DP=55;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:1145,0,789 -chr6 49692154 . CG C 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.977;DP=33;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:369,0,380 -chr6 49696025 . T C 9328.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:9357,700,0 -chr6 49701353 . G T 3823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=1.571;DP=288;FS=20.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,114:288:99:3852,0,5882 -chr6 49712341 . A G 2471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.128;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=28.41;ReadPosRankSum=3.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,63:87:99:2500,0,614 -chr6 49730477 . C T 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=-3.494;DP=153;FS=15.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=6.19;ReadPosRankSum=2.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,40:153:99:975,0,4194 -chr6 49732698 . A AT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.813;DP=74;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:265,0,1400 -chr6 49743670 . TCTAGAAATGAAAGACATTTTACAAAGAATTAAGTGCTTTGAGAGCTGTTTCATTAAGCAGTACATGCAGTAGAGTGTATTTAAAACATAC T 526.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.798;DP=99;FS=2.088;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,92:96:99:564,198,0 -chr6 49748256 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,101 -chr6 49751627 . G A 1807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=-0.021;DP=88;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,54:88:99:1836,0,1290 -chr6 49762394 . AG A,AGG 785.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.229;DP=56;FS=1.951;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,22,21:49:99:891,470,706,427,0,729 -chr6 49763472 . C A 1913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-0.878;DP=104;FS=4.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=18.40;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1942,0,1837 -chr6 49813628 . C T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.515;DP=76;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,46:76:99:1505,0,1014 -chr6 49841042 . A T 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:510,39,0 -chr6 49957728 . C CT 3188.01 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-6.334;DP=646;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:452,168:620:99:3225,0,11170 -chr6 50010570 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-1.196;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:385,0,990 -chr6 50340716 . C A 2708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=4.654;DP=412;FS=11.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,114:412:99:2737,0,11151 -chr6 50351924 . G T 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 -chr6 50353597 . G A 4214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;ClippingRankSum=0.420;DP=370;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,139:370:99:4243,0,7645 -chr6 50359803 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,162 -chr6 50364872 . G C 2179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.227;DP=138;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:2208,0,2492 -chr6 50404185 . G T 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=1.006;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:1311,0,1730 -chr6 50404395 . T C 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.070;DP=83;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1150,0,1661 -chr6 50404422 . C T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.809;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:948,0,1693 -chr6 50405135 . A C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.401;DP=95;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,25:95:99:568,0,2583 -chr6 50405226 . G A 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.198;DP=115;FS=0.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:1576,0,2295 -chr6 50636649 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-0.984;DP=28;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:259,0,729 -chr6 50683324 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-1.379;DP=63;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:915,0,1214 -chr6 50684140 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=2.085;DP=49;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:676,0,855 -chr6 50686538 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-1.013;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:394,0,460 -chr6 50687826 . A G 424.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.869;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=32.65;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8:452,8,0 -chr6 50687880 . G T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=1.692;DP=47;FS=5.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:307,0,1173 -chr6 50702727 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.165;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:337,0,294 -chr6 50958618 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:93:239,0,93 -chr6 51481839 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.266;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:483,0,816 -chr6 51499396 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=1.467;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:425,0,168 -chr6 51500023 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.331;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:282,0,501 -chr6 51500068 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.471;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.177;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:282,0,206 -chr6 51502883 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=1.230;DP=43;FS=10.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:591,0,1301 -chr6 51502892 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.684;DP=52;FS=4.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:271,0,2201 -chr6 51513727 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=-1.340;DP=64;FS=4.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:258,0,1948 -chr6 51518921 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-1.059;DP=50;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:403,0,1337 -chr6 51521798 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.623;DP=43;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:618,0,790 -chr6 51528674 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-1.131;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:276,0,1386 -chr6 51529807 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-0.542;DP=53;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:272,0,1605 -chr6 51530530 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.279;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=6.43;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:414,0,1682 -chr6 51530916 . T A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-2.595;DP=51;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=13.29;ReadPosRankSum=2.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:706,0,1071 -chr6 51534624 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.551;DP=42;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:329,0,1102 -chr6 51543722 . G A 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.373;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=25.45;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:919,0,332 -chr6 51545454 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.481;DP=41;FS=7.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:490,0,950 -chr6 51546068 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=-0.071;DP=58;FS=8.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:317,0,2419 -chr6 51581874 . G T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.238;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=13.01;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:731,0,1022 -chr6 51720649 . GCA G 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.863;DP=103;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:330,0,3080 -chr6 51721159 . C T 5775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=1.380;DP=283;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=20.41;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,172:283:99:5804,0,3949 -chr6 51759653 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.164;DP=44;FS=6.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:401,0,1189 -chr6 52022958 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=2.013;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:235,0,1246 -chr6 52022967 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=2.667;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:235,0,1246 -chr6 52175272 . A G 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.226;ClippingRankSum=-0.500;DP=125;FS=14.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=4.57;ReadPosRankSum=-2.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,29:125:99:600,0,3937 -chr6 52175963 . C CA 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=-0.215;DP=264;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,52:220:99:390,0,4030 -chr6 52292957 . G T 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.349;DP=238;FS=8.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,46:237:99:790,0,7442 -chr6 52293026 . T G 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-1.494;DP=283;FS=1.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,58:283:99:1028,0,8717 -chr6 52426593 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:352,27,0 -chr6 52472120 . GA G 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.439;DP=69;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:599,0,1358 -chr6 52615946 . C T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-1.960;DP=174;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,39:174:99:842,0,5326 -chr6 52742651 . T A 8141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-4.727;DP=456;FS=6.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,245:456:99:8170,0,9339 -chr6 52773823 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:381,0,257 -chr6 53177730 . A C 6645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:6674,497,0 -chr6 53177798 . T C 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:500,39,0 -chr6 53205561 . G GT 3602.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:3640,342,0 -chr6 53205642 . A C 6426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.606;DP=292;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=22.01;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,234:264:99:6455,284,0 -chr6 53205778 . T A 19672.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:19701,1362,0 -chr6 53205802 . C CG 19663.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:19701,1362,0 -chr6 53205844 . G C 3461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3490,261,0 -chr6 53205902 . G GA 4861.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.132;DP=191;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=25.45;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,168:170:99:4899,502,0 -chr6 53205924 . A G 10516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:10545,757,0 -chr6 53206065 . C CT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.926;DP=289;FS=3.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,47:263:99:276,0,6027 -chr6 53206227 . G GT 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DP=275;FS=8.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,58:257:99:513,0,5287 -chr6 53206367 . GA G 9767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=294;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,283:283:99:9805,857,0 -chr6 53206568 . C CT 1223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1423,133,0 -chr6 53226669 . C T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr6 53294294 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:277,0,310 -chr6 53435368 . C CT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-0.514;DP=265;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,49:245:99:344,0,4239 -chr6 53435632 . C CT 811.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-2.596;DP=280;FS=13.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,70:243:99:849,0,4133 -chr6 53435952 . C CA 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.206;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:379,0,404 -chr6 53436223 . G GA 935.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=1.717;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=6.93;ReadPosRankSum=-2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1197,0,1644 -chr6 53482778 . G A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr6 53482801 . G A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr6 53940011 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:360,0,530 -chr6 53942402 . A C 1785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:99:1814,130,0 -chr6 53942503 . T C 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.216;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:985,0,990 -chr6 53942560 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:230,0,133 -chr6 53942979 . T A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.690;DP=26;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=23.30;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:634,0,225 -chr6 53943153 . T C 2230.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.635;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=33.80;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,36:42:49:2259,49,0 -chr6 53943373 . T A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.474;DP=25;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=27.06;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:35:914,0,35 -chr6 53943745 . A T 1073.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:79:1102,79,0 -chr6 53953691 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:294,0,218 -chr6 54045265 . T G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr6 54045294 . G T 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 -chr6 54045466 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.322;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=29.67;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:414,0,136 -chr6 54045469 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.537;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:414,0,136 -chr6 54048344 . AT A 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr6 54048362 . T C 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 -chr6 54048725 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:92:335,0,92 -chr6 54062323 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.845;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=24.16;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:439,0,166 -chr6 54072537 . G A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.656;DP=56;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:939,0,927 -chr6 54106729 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.782;DP=64;FS=5.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:744,0,1440 -chr6 54107370 . G C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.594;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,569 -chr6 54120001 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.560;DP=38;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:464,0,834 -chr6 54121352 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:346,0,129 -chr6 54122928 . C T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.386;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:249,0,240 -chr6 54123636 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.867;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:274,0,418 -chr6 54123921 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.487;DP=30;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:392,0,1682 -chr6 54132636 . A G 3389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=1.843;DP=463;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.423;QD=7.32;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,135:462:99:3418,0,12429 -chr6 54203859 . A T 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=-0.402;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,36:98:99:1193,0,2175 -chr6 54219149 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.514;DP=130;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,48:130:99:1565,0,2876 -chr6 54279680 . T A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.289;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:617,0,285 -chr6 54279872 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-1.080;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:241,0,1071 -chr6 54280006 . T C 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.793;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=14.87;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:876,0,1110 -chr6 54281611 . CTT C 834.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:62:872,62,0 -chr6 54630992 . A C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.136;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:832,0,2572 -chr6 54631014 . G T 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-0.460;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:892,0,2407 -chr6 54631015 . T A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-0.743;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:892,0,2407 -chr6 54653477 . TGTGAGTAACCTGAAGTCTTGTAACGAGGGAAATTTTGCAATGTTTACGTTATTATTCATGACGTCGTCTGTATGTTATTATTACCAG T 956.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=1.375;DP=31;FS=3.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=30.86;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,29:31:99:1198,0,543 -chr6 54992694 . CCATCTGATTCTCAATATTGTAGTTCAGACTT C 295.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:333,25,0 -chr6 54993096 . TCCA T 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,0:9:99:292,0,2163 -chr6 54993100 . TCAAATTCTCAATATTGTAGTCCAGACTCCATTAGATTCTCAATATTGTAGTCCAGACTCCATCAGATTCTCAATATTGTAGTCCAGACTC T 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=3.665;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=12.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:292,0,1990 -chr6 55005510 . GCCGGCA G 1076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1114,122,0 -chr6 55182603 . GA G 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.099;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:91:337,0,91 -chr6 55268217 . TCTGCATAACCACACAAAGCAATGGAATGAACTACAGTCAGAAATTTCCACCAAATAGAAAAGGATGTATATAAAGGCCTTAC T 8067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.490;DP=381;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,236:372:99:8105,0,6866 -chr6 55268218 . CTGCATAACCACACAAAGCAATGGAATGAACTACAGTCAGAA C 4272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.257;DP=381;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,129:370:99:4310,0,10518 -chr6 55268262 . TTCCACCAAATAGAAAAGGATGTATATAAAGGCCTTACCATC T 4645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.138;DP=387;FS=4.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=12.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,137:378:99:4683,0,10465 -chr6 55273636 . GCCTGAGGAGACAAGCGGTTTAAGAAGATGATCAGGATTTGATATTTCAGGCTTATTGAATCCTGTATTAAAACAAACAGACATTGTGCTCA G 5035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=4.109;DP=117;FS=1.603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=29.84;ReadPosRankSum=-1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,111:117:99:5073,398,0 -chr6 55298068 . GACCTACAGAGGAAGGAAAGAGAAGAAAATGACCTGTAGGAATGTGACTGAATATGTACGAGAAAGCGTTAGTAAAACAGTTCAGCTT G 5537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=2.411;DP=128;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=29.22;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:5575,419,0 -chr6 55694892 . AGTGAGTTTACACTCCAACACAAATAAACCACACAGTTTTATACAAAGACATGCATTAAAAAGCTTGTTTCTCTTGCTATTTTAG A 5015.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.955;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:5053,432,0 -chr6 55695067 . CGGTAAAATGACCTAATTATTAGTTCAAACGGCTTCTCTGATAAACAAACTCAAAGCAGATAAGCCTTATCTCTAATGCAGCTGTGTTTACCAGAGATGCAAAGATACGAGGAGTGTTTTGTTCTTCTCTGTTTCA C 6035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=1.823;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=36.21;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,139:146:99:6073,539,0 -chr6 56148979 . G C 1648.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=33.39;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:99:1677,117,0 -chr6 56148981 . G T 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.39;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:99:1682,117,0 -chr6 56149044 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.668;DP=23;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:83:494,0,83 -chr6 56149100 . T A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:43:454,0,43 -chr6 56149167 . A C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=1.588;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:48:931,0,48 -chr6 56149234 . C T 3049.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:3078,220,0 -chr6 56149283 . G A 2628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.531;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=33.70;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:2657,227,0 -chr6 56149610 . G T 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 -chr6 56149793 . T TA 1119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1157,119,0 -chr6 56150944 . GAA G 733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=1.103;DP=64;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:898,0,953 -chr6 56815169 . C A 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr6 57454645 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,328 -chr6 57454666 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=22.25;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:451,0,233 -chr6 57570262 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.119;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:319,0,336 -chr6 57572612 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:432,0,278 -chr6 57572759 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:345,0,294 -chr6 57581191 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=1.263;DP=73;FS=19.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1324,0,1274 -chr6 57581233 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-2.923;DP=48;FS=9.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:312,0,1326 -chr6 57581713 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=2.276;DP=52;FS=4.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:285,0,1481 -chr6 57582226 . A C 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=2.725;DP=63;FS=6.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,39:63:99:1333,0,798 -chr6 57582466 . TAC T 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.259;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:400,0,781 -chr6 57582641 . G A 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.767;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:850,0,1031 -chr6 57583460 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.492;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:249,0,996 -chr6 57583513 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.630;DP=33;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:477,0,1608 -chr6 57583874 . G T 2254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=1.227;DP=124;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:2283,0,1949 -chr6 57584269 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-0.246;DP=26;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:336,0,354 -chr6 57590533 . C A 2106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.138;DP=112;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:2135,0,1678 -chr6 57605001 . G A 3029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-0.089;DP=162;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=18.70;ReadPosRankSum=3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,97:162:99:3058,0,2130 -chr6 57670601 . C T 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=1.148;DP=53;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:954,0,1924 -chr6 57670634 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=1.906;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=19.01;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1055,0,848 -chr6 57683543 . T A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.213;DP=26;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=27.53;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:97:744,0,97 -chr6 57738322 . G C 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=2.016;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:557,0,533 -chr6 57738368 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=2.822;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:448,0,383 -chr6 57738389 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=2.654;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=17.20;ReadPosRankSum=2.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:269,0,265 -chr6 57740599 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=2.959;DP=29;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=9.03;ReadPosRankSum=-2.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:290,0,1580 -chr6 57740684 . A G 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.550;DP=55;FS=2.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1151,0,747 -chr6 57740751 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=-2.760;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:350,0,452 -chr6 57740972 . C A 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-1.023;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1112,0,435 -chr6 57795157 . T A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.088;DP=24;FS=11.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=21.82;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:552,0,824 -chr6 57796880 . A G 885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:914,66,0 -chr6 57805105 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.350;DP=62;FS=2.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,42:61:99:1298,0,465 -chr6 58258000 . C T 1799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1828,129,0 -chr6 58822195 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.683;DP=49;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:297,0,2995 -chr6 58822196 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.693;DP=50;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:297,0,2995 -chr6 58858825 . G A 1481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.428;DP=124;FS=4.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:1510,0,2545 -chr6 58864707 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.718;DP=140;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,43:139:99:1024,0,3484 -chr6 59094223 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-3.544;DP=40;FS=12.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.09;ReadPosRankSum=3.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:392,0,2057 -chr6 59094226 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-1.749;DP=43;FS=19.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:400,0,2057 -chr6 59148537 . G A 2994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=1.451;DP=135;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=22.18;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,89:135:99:3023,0,1460 -chr6 59148573 . C T 2494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.962;DP=120;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,73:120:99:2523,0,1621 -chr6 59148806 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=2.393;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:552,0,388 -chr6 59148910 . A C 2226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.598;DP=77;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,49:77:99:2255,0,1554 -chr6 59148983 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.330;DP=67;FS=3.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:592,0,1822 -chr6 59149221 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.105;ClippingRankSum=0.830;DP=50;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=6.36;ReadPosRankSum=-4.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:346,0,2988 -chr6 59149223 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.916;ClippingRankSum=0.305;DP=47;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.76;ReadPosRankSum=-3.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:346,0,2988 -chr6 59149244 . T A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=4.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=18.18;ReadPosRankSum=-5.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:828,0,1804 -chr6 59149248 . G A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.602;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=17.77;ReadPosRankSum=-4.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:828,0,1816 -chr6 59149349 . T C 3056.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.464;DP=71;FS=3.741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:3085,218,0 -chr6 59149388 . C T 4097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:4126,287,0 -chr6 59150040 . T TA 2169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.383;DP=77;FS=4.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=28.18;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,65:77:99:2207,0,116 -chr6 59150105 . G A 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.947;DP=107;FS=25.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=16.08;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:1749,0,4331 -chr6 59150142 . G T 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.934;DP=85;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:1282,0,1668 -chr6 59150177 . A AGT 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=3.396;DP=87;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=5.40;ReadPosRankSum=-3.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:507,0,1779 -chr6 59219925 . AT A 248.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:286,24,0 -chr6 59354172 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,388 -chr6 59354363 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:59:489,59,0 -chr6 59354423 . T C 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:59:489,59,0 -chr6 59354625 . G T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:395,27,0 -chr6 59354627 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr6 59355027 . C T 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-1.146;DP=66;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,42:65:99:1400,0,786 -chr6 59375098 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:285,0,173 -chr6 59375484 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:309,0,102 -chr6 59375909 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:318,0,137 -chr6 59376120 . A T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.330;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:519,0,602 -chr6 59376438 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.983;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:447,0,195 -chr6 59376712 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:293,0,103 -chr6 59382557 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:303,0,50 -chr6 59539068 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.98;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:51:303,0,51 -chr6 59648335 . T C 3461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-2.847;DP=161;FS=0.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=21.50;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,104:161:99:3490,0,1659 -chr6 59658966 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=2.826;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:341,0,289 -chr6 59737182 . G C 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.068;DP=55;FS=8.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=31.94;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1785,0,343 -chr6 59737287 . T C 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.993;DP=33;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:695,0,415 -chr7 101313 . C G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.986;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:318,0,379 -chr7 605659 . C A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr7 636002 . C CTA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-2.228;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:240,0,121 -chr7 644640 . C CT 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.17;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:239,0,260 -chr7 645887 . AT A 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=12.61;ReadPosRankSum=2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:239,0,159 -chr7 645995 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:397,0,164 -chr7 646143 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-1.733;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:312,0,511 -chr7 646144 . GT G 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.324;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:312,0,511 -chr7 661959 . A C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr7 700429 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=1.533;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:281,0,1629 -chr7 718578 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=1.273;DP=20;FS=8.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,469 -chr7 729370 . A G 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.708;DP=260;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,61:260:99:1264,0,12391 -chr7 739421 . A G 7844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.497;DP=220;FS=7.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,31:219:99:7873,0,9601 -chr7 739823 . G GT 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.625;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:272,0,2515 -chr7 746873 . T C 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr7 859489 . CCCTGCAGAGCACAGATGAAGTTGAGTGTAAAGTTTTCTGCTCACACTGGTGTAATGGTCACAGTGCTGTGCTGATGACTTA C 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:257,0,805 -chr7 1023148 . A G 208.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.84;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:237,0,15 -chr7 1023395 . T TTG 226.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:264,17,0 -chr7 1506170 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:360,0,355 -chr7 1525072 . G C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.322;DP=25;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:353,0,481 -chr7 1525728 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.038;DP=44;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:366,0,1197 -chr7 1568756 . G A 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr7 1602061 . C CT 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-1.055;DP=45;FS=12.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:319,0,548 -chr7 1648585 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.349;DP=111;FS=1.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1654,0,1680 -chr7 1654725 . T A 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=1.046;DP=38;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:59:757,0,59 -chr7 1654777 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-0.381;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:653,0,178 -chr7 1661959 . A G 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:742,57,0 -chr7 1670202 . A G 1234.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1263,90,0 -chr7 1670252 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.738;DP=42;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:306,0,1201 -chr7 1671514 . A T 1409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1438,102,0 -chr7 1684190 . GCGCGTA G 289.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:327,26,0 -chr7 1704759 . GCA G 228.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr7 1708434 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-2.057;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:231,0,1584 -chr7 1711022 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.058;DP=32;FS=3.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:420,0,724 -chr7 1725348 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.789;DP=160;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,25:160:99:241,0,5066 -chr7 1725426 . C T 8784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-1.618;DP=290;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,233:290:99:8813,0,919 -chr7 1726465 . A C 8174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.205;DP=271;FS=4.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=30.17;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,220:271:99:8203,0,697 -chr7 1733109 . G A 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.823;DP=391;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=1.53;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,59:385:99:635,0,12788 -chr7 1733136 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.591;DP=401;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,63:401:99:682,0,13092 -chr7 1747368 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.159;DP=272;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,47:272:99:645,0,8611 -chr7 2637184 . T TTGA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:268,0,114 -chr7 2651151 . GATGTAGTTGTGTTTGATGATGTAGTTGTGTTTGATGATGTAGTTGTGTTTGATGATGTAGTTGTGTTTGATA G 6706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=5.022;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,44:56:99:6744,406,0 -chr7 2654406 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,0:84:99:541,0,11457 -chr7 2754156 . TCTGCATAAACAGAGGAGAAAACTATTCAAATGCAGTTCAGAAATATACAGTGATTCTAGGAGCATAACCAGATCTTAC T 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.783;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:99:943,0,378 -chr7 3596019 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr7 3596117 . C T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr7 4104429 . A AT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.634;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:256,0,361 -chr7 4104742 . C G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.526;DP=120;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=3.79;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:483,0,4637 -chr7 4106037 . T G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.389;DP=43;FS=6.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:510,0,1532 -chr7 4106218 . C T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:469,33,0 -chr7 4106230 . A G 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:514,36,0 -chr7 4107313 . TC T 823.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.436;DP=44;FS=9.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=18.72;ReadPosRankSum=3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:861,0,269 -chr7 4110338 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=-1.059;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:677,0,2471 -chr7 4110520 . C T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.935;DP=137;FS=4.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:878,0,3522 -chr7 4209797 . T TTC 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.857;DP=30;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:278,0,651 -chr7 4262342 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-1.358;DP=140;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,26:139:99:460,0,4515 -chr7 4280804 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=-0.582;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:558,0,5145 -chr7 4432503 . G T 223.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:252,21,0 -chr7 4442768 . A T 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr7 4442782 . C T 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:669,48,0 -chr7 4651241 . T C 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:715,48,0 -chr7 5955903 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=38.00;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:65:246,0,65 -chr7 5955911 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:65:246,0,65 -chr7 6225894 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-2.840;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=16.41;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,255 -chr7 6245019 . G A 1603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.550;DP=58;FS=8.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.060;QD=27.65;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,43:58:99:1632,0,390 -chr7 6249271 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=2.011;DP=17;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:231,0,342 -chr7 6360488 . CAGAATCAAGTATTCCAGAGAGCAGTTTAATGATGGTAAAAAAAACATACCTTGAAATGTCATAACTGACCAATA C 975.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.491;ClippingRankSum=-3.345;DP=58;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:1013,0,6018 -chr7 6361024 . AACATACCTTGGAATGTTGCGACTGACCAATCAGAATCAAGTACTCCAAGGAGCCGTGTAATAATGGCGAATT A 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=2.736;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:468,0,7708 -chr7 6363224 . G C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.849;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=21.21;ReadPosRankSum=-2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:410,0,116 -chr7 6364747 . A AC 297.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.159;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=21.23;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:1:332,1,0 -chr7 6536948 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:309,0,215 -chr7 6664421 . ACTGAAAAAAAATGACAGTAATAGTAACACAATTTTTCATGACTACATGTAATATTAATAAGAATTTCCTCAC A 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.071;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:391,0,1244 -chr7 6664558 . C T 284.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:22:313,22,0 -chr7 7029610 . T A 340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:369,30,0 -chr7 7463153 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-2.079;DP=146;FS=3.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,23:146:99:246,0,4687 -chr7 7472064 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.641;DP=53;FS=4.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:338,0,1418 -chr7 7489623 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-2.302;DP=51;FS=10.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:238,0,3276 -chr7 7502384 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.300;DP=64;FS=4.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:271,0,1780 -chr7 7564759 . ATGCAGAG A 1107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1145,109,0 -chr7 7574271 . C T 1672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.027;DP=313;FS=11.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,77:313:99:1701,0,8907 -chr7 7578260 . C G 2787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=1.740;DP=373;FS=0.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,111:373:99:2816,0,10262 -chr7 7712090 . AT A 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.226;DP=85;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=13.19;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,48:81:99:1158,0,814 -chr7 7712132 . A AT 1547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.382;DP=84;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=18.43;ReadPosRankSum=-2.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:1585,0,1906 -chr7 7735996 . C T 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.003;DP=120;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=16.39;ReadPosRankSum=2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1995,0,1695 -chr7 7742012 . A C 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.510;DP=84;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:1473,0,1502 -chr7 7750534 . C A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.585;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=25.74;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:749,0,165 -chr7 7750555 . A C 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.817;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:523,0,159 -chr7 7752845 . A AT 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.793;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:286,0,105 -chr7 7753971 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.037;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,141 -chr7 7852963 . AT A 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-3.387;DP=93;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:280,0,1739 -chr7 7853700 . T TA 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.975;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:447,0,561 -chr7 7854846 . A T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-1.607;DP=85;FS=6.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:477,0,2438 -chr7 7855022 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.234;DP=98;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:429,0,2979 -chr7 7916010 . G A 3951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.363;DP=469;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,151:468:99:3980,0,11802 -chr7 7936394 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:406,0,244 -chr7 7936738 . G A 752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:781,57,0 -chr7 7936808 . T C 448.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.736;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:474,0,0 -chr7 7936832 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.196;DP=24;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:395,0,390 -chr7 7937072 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.722;DP=56;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=5.01;ReadPosRankSum=-2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:309,0,357 -chr7 7937243 . T C 1144.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-1.409;DP=58;FS=2.638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.098;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:12:1172,12,0 -chr7 7939549 . C A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.379;DP=47;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:979,0,738 -chr7 7940153 . T C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.867;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:855,57,0 -chr7 7940156 . T C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.867;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:855,57,0 -chr7 7940222 . A G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.536;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:504,0,109 -chr7 7940300 . GTT G,GT 1566.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=-2.821;DP=153;FS=11.529;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=10.24;ReadPosRankSum=3.011 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:10,26,57:93:99:2065,1287,1629,391,0,404 -chr7 7940514 . C A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.659;DP=45;FS=11.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:1142,0,1222 -chr7 8305797 . T TC 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=1.475;DP=98;FS=3.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=2.54;ReadPosRankSum=-2.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,16:98:99:286,0,6668 -chr7 8419363 . A C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.839;DP=83;FS=3.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:556,0,2176 -chr7 8425107 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-1.514;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:338,0,2758 -chr7 8439806 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.228;DP=81;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:472,0,2277 -chr7 8440004 . C G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-0.764;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,18:95:99:285,0,2847 -chr7 8452078 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=3.178;DP=70;FS=3.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:584,0,4040 -chr7 8452084 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=3.967;DP=72;FS=5.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:584,0,4040 -chr7 8452130 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=1.814;DP=76;FS=6.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:239,0,3150 -chr7 8452141 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.478;DP=80;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:321,0,3359 -chr7 8851400 . G A 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:574,45,0 -chr7 9027766 . T C 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 -chr7 9179839 . AT A 2017.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.991;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,3:107:99:2055,0,2693 -chr7 9179912 . C T 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=-0.304;DP=111;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=10.78;ReadPosRankSum=2.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1225,0,5160 -chr7 9180727 . C T 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=-1.237;DP=191;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,61:191:99:1618,0,4936 -chr7 9181213 . G A 2241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=2.313;DP=386;FS=0.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,98:386:99:2270,0,11364 -chr7 9186929 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=1.729;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=20.66;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:524,0,324 -chr7 9187546 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.376;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:414,0,1178 -chr7 9187548 . T A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-0.894;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:414,0,1185 -chr7 9222924 . C T 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=4.156;DP=39;FS=19.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=30.46;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:99:1216,0,189 -chr7 9222956 . T A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=2.950;DP=19;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=27.51;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:551,0,117 -chr7 9264130 . C T 735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:764,51,0 -chr7 9264131 . T G 735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:764,51,0 -chr7 9296376 . A T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=1.194;DP=18;FS=3.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=32.65;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:29:616,0,29 -chr7 9296663 . T C 990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1019,72,0 -chr7 9320976 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-1.093;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:248,0,940 -chr7 9321609 . C T 1507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.754;DP=71;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:1536,0,2878 -chr7 9321618 . G A 1507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-2.407;DP=79;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:1536,0,2878 -chr7 9321828 . A C 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.367;DP=88;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,35:88:99:1432,0,3797 -chr7 9321834 . T A 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=1.031;DP=88;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1432,0,3809 -chr7 9405830 . C G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=3.442;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=20.38;ReadPosRankSum=-2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:395,0,246 -chr7 9500658 . A C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:88:232,0,88 -chr7 9501751 . C CT 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.180;DP=85;FS=9.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:441,0,1033 -chr7 9501868 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.126;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=2.41;ReadPosRankSum=3.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:264,0,3204 -chr7 9697926 . T A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.460;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=16.49;ReadPosRankSum=-2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:391,0,542 -chr7 10080325 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.255;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:300,0,1698 -chr7 10086021 . G C 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=2.338;DP=236;FS=9.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,57:235:99:1139,0,8003 -chr7 10100818 . C G 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=1.370;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:654,0,607 -chr7 10100851 . AT A 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=-0.938;DP=39;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:377,0,634 -chr7 10100985 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.134;DP=83;FS=4.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=6.46;ReadPosRankSum=2.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:564,0,3603 -chr7 10101062 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.727;DP=79;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:594,0,5902 -chr7 10101071 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=1.376;DP=74;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:590,0,5902 -chr7 10101472 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:294,0,477 -chr7 10101529 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=1.087;DP=35;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:553,0,467 -chr7 10101629 . A G 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=25.77;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:99:929,0,165 -chr7 10101633 . A G 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:929,0,161 -chr7 10106921 . G T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-2.630;DP=64;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:395,0,1714 -chr7 10291365 . G GT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.250;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:248,0,887 -chr7 10665290 . TG T 248.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:286,30,0 -chr7 10680637 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-2.213;DP=39;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:558,0,774 -chr7 10680808 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.581;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:376,0,753 -chr7 11500130 . A G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=1.381;DP=63;FS=7.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:441,0,1610 -chr7 11584540 . T C 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-1.082;DP=110;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:1408,0,2405 -chr7 11618697 . G A 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.245;DP=117;FS=1.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:1563,0,2178 -chr7 11672756 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.630;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=17.19;ReadPosRankSum=2.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1816,0,1500 -chr7 11692769 . A T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.964;DP=67;FS=4.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=15.24;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1049,0,2983 -chr7 11693497 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.092;DP=64;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:594,0,2280 -chr7 11694057 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=2.720;DP=31;FS=9.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,2308 -chr7 11729572 . A G 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=-0.422;DP=86;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1486,0,1353 -chr7 11729618 . C A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-2.235;DP=104;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1734,0,1805 -chr7 11729942 . C G 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=1.910;DP=70;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=16.84;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1207,0,1098 -chr7 11822296 . A AAC 680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-2.106;DP=138;FS=0.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:718,0,2677 -chr7 11822893 . T C 1990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-0.584;DP=114;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.108;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:2019,0,2098 -chr7 12029115 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-1.347;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,312 -chr7 12196514 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.245;DP=131;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,23:131:99:351,0,4223 -chr7 12196598 . T G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.941;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,35:215:99:441,0,11834 -chr7 12208233 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.997;DP=61;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:308,0,1760 -chr7 12210651 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.588;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,847 -chr7 12212231 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.993;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:334,0,1845 -chr7 12212233 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.022;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:342,0,1845 -chr7 12391386 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.546;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:68:261,0,68 -chr7 12404552 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=24.09;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:245,0,56 -chr7 12405846 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,452 -chr7 12407699 . T C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr7 12409835 . TG T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:324,0,204 -chr7 12409971 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:86:230,0,86 -chr7 12882714 . G A 1545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.305;DP=125;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,46:125:99:1574,0,2856 -chr7 12961514 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=1.791;DP=27;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:267,0,238 -chr7 13665965 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=27.80;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:334,0,410 -chr7 13666525 . A AT 326.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 -chr7 13667655 . A AG 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=27.57;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:892,0,102 -chr7 13670159 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.559;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:389,0,785 -chr7 13670794 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-0.123;DP=56;FS=4.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:286,0,1581 -chr7 13670824 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=1.546;DP=52;FS=7.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:234,0,1430 -chr7 14180913 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.238;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:450,0,216 -chr7 14280791 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:387,0,249 -chr7 14311836 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.884;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:290,0,866 -chr7 14453263 . C G 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.168;DP=57;FS=3.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.754;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:976,0,1453 -chr7 14453494 . C A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=1.445;DP=50;FS=2.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:457,0,1308 -chr7 14453537 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.863;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:310,0,1837 -chr7 14453586 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=1.009;DP=53;FS=10.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:251,0,1631 -chr7 14453623 . A C 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.205;DP=45;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1035,0,496 -chr7 14462060 . A T 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=1.338;DP=52;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,36:52:99:1394,0,442 -chr7 14479049 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr7 14509406 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.757;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:322,0,2225 -chr7 14509415 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.874;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:322,0,2225 -chr7 14535286 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.567;DP=44;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.594;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:278,0,1228 -chr7 14542327 . T C 1774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.702;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=29.98;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1803,128,0 -chr7 14542335 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.716;DP=37;FS=7.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:436,0,937 -chr7 14542463 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.117;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:243,0,1051 -chr7 14869307 . C G 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=-0.185;DP=36;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:851,0,359 -chr7 15080399 . G A 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-0.893;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.376;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:848,0,719 -chr7 15081111 . C G 1916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.055;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=25.76;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1945,0,138 -chr7 15081246 . A G 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=-0.610;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1270,0,369 -chr7 15081668 . G T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.724;DP=22;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=30.58;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:66:701,0,66 -chr7 15081783 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.344;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:561,0,347 -chr7 15081990 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=1.633;DP=24;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=27.99;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:700,0,151 -chr7 15082086 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.802;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:779,0,182 -chr7 15233197 . G A 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-2.402;DP=79;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1446,0,1369 -chr7 15236215 . T G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.009;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=28.88;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:577,0,127 -chr7 15236277 . G T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.076;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=28.45;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:1024,0,254 -chr7 15236324 . C A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.692;DP=33;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=20.57;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:707,0,535 -chr7 15236471 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.888;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:259,0,925 -chr7 15236529 . C A 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.575;DP=81;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:1232,0,1490 -chr7 15236966 . TA T 594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=1.243;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:632,0,141 -chr7 15237084 . CA C 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.272;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:94:407,0,94 -chr7 15238821 . G T 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.337;DP=42;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.666;QD=30.64;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:91:1315,0,91 -chr7 15238838 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.766;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=6.06;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:319,0,1205 -chr7 15238976 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.352;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:303,0,1530 -chr7 15240427 . A T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=1.707;DP=49;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:742,0,932 -chr7 15241415 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:88:376,0,88 -chr7 15243787 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.447;DP=43;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=26.88;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1184,0,299 -chr7 15243976 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.066;DP=41;FS=6.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:820,0,625 -chr7 15243988 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.334;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:848,0,562 -chr7 15245422 . T G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:322,0,310 -chr7 15245474 . A G 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.488;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:641,0,545 -chr7 15245677 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-1.992;DP=21;FS=7.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,674 -chr7 15245678 . T C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.705;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.53;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:568,0,186 -chr7 15246265 . A AT 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=1.473;DP=17;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:357,0,466 -chr7 15246270 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=1.591;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=21.92;ReadPosRankSum=-1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:357,0,466 -chr7 15246969 . G A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.055;DP=46;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:822,0,787 -chr7 15248410 . T A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=1.154;DP=22;FS=22.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:499,0,706 -chr7 15248415 . T G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=1.606;DP=23;FS=21.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:499,0,706 -chr7 15248764 . C G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.135;DP=43;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:848,0,832 -chr7 15250271 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=2.203;DP=33;FS=13.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:241,0,1399 -chr7 15250335 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:544,0,629 -chr7 15250423 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.146;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:355,0,497 -chr7 15251778 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.155;DP=434;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:356,75:431:99:867,0,14602 -chr7 15300869 . T G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.715;DP=64;FS=5.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1043,0,1375 -chr7 15300924 . C A 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-0.050;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:890,0,1346 -chr7 15416864 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=1.089;DP=63;FS=8.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:332,0,1812 -chr7 15692337 . C G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr7 15929625 . A C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=24.05;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:365,0,84 -chr7 15936264 . T G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:328,0,138 -chr7 16372727 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:294,0,630 -chr7 16423544 . G A 207.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:236,0,18 -chr7 16424908 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.549;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,477 -chr7 16588688 . C CA 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.431;DP=83;FS=2.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:504,0,1390 -chr7 16647403 . C A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.293;DP=90;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:621,0,2181 -chr7 16665004 . G GA 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.915;DP=43;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:538,0,154 -chr7 16955190 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-0.359;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:304,0,852 -chr7 17357079 . TCTAATGGGAACAAGAACAATTAGTCAAAGGTCTGTCTCATGATCTCAGCAAGATGCATACATATGTGTGGTGTTCTTCCTAC T 5287.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.062;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=32.62;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:5325,481,0 -chr7 17364621 . TCTGTTAAACAAACAAATATACAAAGTCAACACAAGCTTTAAAATAAACATTCAAGTCTGAATAGGATTATGAACAGGTCAGATTTCATGTGAAACATGCTTTAATGCTTAC T 601.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=2.387;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=7.52;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:639,213,0 -chr7 17733315 . G T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.885;DP=68;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:544,0,1764 -chr7 17781803 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.292;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:586,0,2079 -chr7 17784620 . CGGTACACACATTAGCATCCATTAGACTGAACAGAGTGTTCCCGGCATTCCTAATGCGAGTCTTGTGCTTCTCTGAACA C 3294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=3.350;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=29.46;ReadPosRankSum=-3.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,85:91:99:3332,0,491 -chr7 17803054 . G A 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.605;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,42:156:99:1032,0,4382 -chr7 18013534 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.577;DP=38;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:551,0,756 -chr7 18016524 . C T 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:632,45,0 -chr7 18022853 . T TG 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=1.614;DP=20;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:62:340,0,62 -chr7 18022955 . T A 1335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1364,96,0 -chr7 18023023 . T A 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:709,54,0 -chr7 18023220 . T C 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 -chr7 18024017 . T C 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 -chr7 18025141 . G GT 680.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:718,63,0 -chr7 18025978 . AAC A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=1.351;DP=29;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:447,0,625 -chr7 18026472 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=-1.323;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:82:541,0,82 -chr7 18316705 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 18316708 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 18678912 . A G 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr7 18679773 . G A 612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:641,45,0 -chr7 18680344 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr7 18680438 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,180 -chr7 18680533 . A T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.67;ReadPosRankSum=-1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,170 -chr7 18680727 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:234,0,338 -chr7 18680863 . C G 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:351,24,0 -chr7 18680984 . CT C 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.276;DP=25;FS=7.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:380,0,163 -chr7 18681394 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr7 18682039 . A T 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 -chr7 18687802 . A G 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:857,60,0 -chr7 18720502 . A T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr7 18732967 . A G 480.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=34.34;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:506,0,0 -chr7 18735739 . A G 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr7 18735757 . T C 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 -chr7 18735847 . G C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.092;DP=31;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:497,0,580 -chr7 18737345 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.066;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:341,0,316 -chr7 18741322 . A T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-1.006;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=16.85;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:601,0,553 -chr7 18741406 . A G 1145.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1174,87,0 -chr7 18743092 . T C 431.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:458,0,3 -chr7 18747268 . T C 207.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:236,0,17 -chr7 18751774 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr7 18751858 . G T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr7 18753096 . GA G 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.036;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:37:510,0,37 -chr7 18754336 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr7 18817393 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.216;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=15.39;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:336,0,375 -chr7 18817426 . A T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=1.148;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:327,0,330 -chr7 18900414 . T C 396.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=33.03;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:424,0,8 -chr7 18902889 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,110 -chr7 18941481 . T C 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.066;DP=32;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=27.40;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:905,0,197 -chr7 18943724 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=1.523;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:305,0,281 -chr7 18951421 . A G 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:532,0,375 -chr7 19001380 . C G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.228;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:469,0,326 -chr7 19001681 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,294 -chr7 19001783 . C A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:392,0,160 -chr7 19003754 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=26.40;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:58:345,0,58 -chr7 19003765 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=26.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:242,0,67 -chr7 19009381 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:351,0,52 -chr7 19035274 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-1.660;DP=26;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:342,0,559 -chr7 19036010 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,169 -chr7 19040499 . G A 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr7 19189362 . A G 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=1.567;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:746,0,850 -chr7 19189534 . GT G 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.740;DP=178;FS=7.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,38:175:99:434,0,8352 -chr7 19189772 . GC G 2014.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:2052,169,0 -chr7 19190474 . G GT 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.190;DP=89;FS=7.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:241,0,1590 -chr7 19216159 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.264;DP=28;FS=10.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:342,0,1069 -chr7 19216181 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.596;DP=24;FS=16.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:325,0,557 -chr7 19277111 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.635;DP=40;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:293,0,1039 -chr7 19317342 . CA C 430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:468,45,0 -chr7 19353535 . C T 2707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-0.739;DP=316;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,102:316:99:2736,0,8188 -chr7 19361807 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=1.886;DP=178;FS=35.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,43:178:99:324,0,10270 -chr7 19362433 . C T 4254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=1.014;DP=316;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,115:316:99:4283,0,7023 -chr7 19379739 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.556;DP=62;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:243,0,1902 -chr7 19381547 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.735;DP=42;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:497,0,957 -chr7 19381924 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.131;DP=50;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:481,0,961 -chr7 19382047 . T C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.488;DP=45;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:747,0,958 -chr7 19677863 . TA T 262.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:300,30,0 -chr7 19678772 . CA C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=1.139;DP=18;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:250,0,134 -chr7 19694530 . CT C 318.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:356,24,0 -chr7 19696867 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-2.119;DP=102;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,22:102:99:296,0,2874 -chr7 19773593 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=-0.615;DP=60;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:333,0,1704 -chr7 19773686 . TA T 704.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.014;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:34:742,0,34 -chr7 19773900 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.754;DP=69;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:254,0,4829 -chr7 19773975 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.606;DP=40;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:333,0,1680 -chr7 19809468 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.900;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:558,0,1506 -chr7 19833475 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-2.591;DP=76;FS=5.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:455,0,2349 -chr7 19834134 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.229;DP=45;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:419,0,1110 -chr7 19834233 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-2.648;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:386,0,2567 -chr7 19834256 . T C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-1.707;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=12.08;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:584,0,1018 -chr7 19835301 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.833;DP=122;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,20:122:99:234,0,3801 -chr7 19920369 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=-1.186;DP=26;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:349,0,925 -chr7 20134602 . T G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=1.758;DP=45;FS=10.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.066;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:292,0,1250 -chr7 20175480 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.083;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:255,0,1096 -chr7 20282936 . T C 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.752;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=23.34;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:775,0,326 -chr7 20282997 . T C 320.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=32.02;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:348,0,10 -chr7 20283708 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=3.002;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:316,0,386 -chr7 20571264 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:249,0,342 -chr7 20643681 . C CA 1115.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.251;DP=183;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,62:177:99:1153,0,3097 -chr7 20653620 . AGTAAGACATGTAATATGTAACGAGTGTGTAAAAATGAGTATGTGTACCAGTCGAAAGTGACCCAGAGACTTGTGTTGATGCTTGAAAGCAG A 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=33.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:309,0,852 -chr7 20653778 . G C 923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:952,69,0 -chr7 20657600 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-1.809;DP=50;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:524,0,2640 -chr7 20657615 . G C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.330;DP=48;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:508,0,3199 -chr7 20657623 . A T 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-1.190;DP=60;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1117,0,1859 -chr7 20657655 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-1.230;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:462,0,1524 -chr7 20677807 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=34.62;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:409,0,48 -chr7 20684254 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.124;DP=20;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:533,0,149 -chr7 20710261 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.022;DP=99;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:351,0,2845 -chr7 20712462 . A G 3081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.131;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=15.11;ReadPosRankSum=2.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,88:204:99:3110,0,3772 -chr7 20712486 . G A 2709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=-0.992;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=13.62;ReadPosRankSum=2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,83:199:99:2738,0,3872 -chr7 20712717 . A T 2376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.602;DP=148;FS=0.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:2405,0,2632 -chr7 20713068 . T C 3119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-1.059;DP=231;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,89:231:99:3148,0,4978 -chr7 20713111 . C T 3083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=-0.759;DP=209;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,90:209:99:3112,0,4053 -chr7 20713260 . A T 3146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.006;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,90:203:99:3175,0,3695 -chr7 20715694 . C CT 742.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-1.724;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:780,0,740 -chr7 20735506 . T C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.420;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=18.64;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:606,0,466 -chr7 20787750 . TCCTGAAAAGAAAAAACATTATCATTGCCTGTCTTTAGTTATTAAACTGAAACATGTTAAACCTTAACATTTA T 6635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.143;DP=157;FS=3.094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:6673,516,0 -chr7 20792813 . G C 1716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.317;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:1745,0,2532 -chr7 20794722 . G A 3504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-0.597;DP=200;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,100:200:99:3533,0,3639 -chr7 20848368 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:285,0,407 -chr7 20916774 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:287,0,216 -chr7 20976040 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-1.148;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:317,0,327 -chr7 20984321 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 20984322 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 21001580 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=1.418;DP=30;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:603,0,417 -chr7 21004457 . C T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.446;DP=44;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:748,0,754 -chr7 21015456 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-2.278;DP=39;FS=6.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:288,0,2566 -chr7 21015465 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=-2.279;DP=45;FS=5.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:293,0,2540 -chr7 21035428 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.156;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:78:421,0,78 -chr7 21136510 . CTT C 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=2.003;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:336,0,527 -chr7 21146111 . T C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-3.480;DP=56;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=13.17;ReadPosRankSum=3.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:766,0,2632 -chr7 21146117 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-2.291;DP=57;FS=7.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=12.94;ReadPosRankSum=2.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:766,0,2665 -chr7 21184166 . T G 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.523;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.752;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,29:46:99:1006,0,601 -chr7 21436283 . G A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.250;DP=75;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:1214,0,1411 -chr7 21451398 . T TA 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=-1.962;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:353,0,596 -chr7 21460539 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=4.283;DP=220;FS=16.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=3.84;ReadPosRankSum=-3.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,33:220:99:872,0,15003 -chr7 21460548 . A G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=5.179;DP=233;FS=2.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=3.54;ReadPosRankSum=-3.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,49:233:99:854,0,15003 -chr7 21808871 . A G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr7 21950628 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-1.023;DP=41;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:358,0,1090 -chr7 22079818 . A C 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr7 22258705 . G GT 381.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=1.759;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:12:511,12,0 -chr7 22261003 . A G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=-1.066;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:713,0,935 -chr7 22261162 . C CT 849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.983;DP=26;FS=10.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=32.68;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:887,0,428 -chr7 22931315 . G A 4052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.747;DP=244;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=16.61;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,112:244:99:4081,0,4510 -chr7 22939716 . A G 3504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.359;DP=252;FS=1.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,104:251:99:3533,0,4966 -chr7 22940292 . G A 3853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=1.131;DP=278;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=13.86;ReadPosRankSum=2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,112:278:99:3882,0,5607 -chr7 22946501 . AT A 721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=-1.735;DP=159;FS=27.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,46:152:99:759,0,2837 -chr7 23112800 . A C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:71:258,0,71 -chr7 23489336 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.935;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:325,0,453 -chr7 23490840 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-2.359;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=23.81;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:314,0,137 -chr7 23491418 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=1.589;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:332,0,341 -chr7 23614549 . A G 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:621,45,0 -chr7 23745378 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-1.222;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:251,0,823 -chr7 23745681 . C A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=-0.495;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:765,0,446 -chr7 23746359 . T A 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.531;DP=54;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1190,0,1899 -chr7 23746368 . G C 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.448;DP=55;FS=7.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:1191,0,1899 -chr7 23793582 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.082;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=23.08;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:513,0,176 -chr7 23799253 . T A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-1.101;DP=52;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.055;QD=21.42;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:1142,0,641 -chr7 23842620 . TTACGGTAAGAACTG T 4122.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=1.047;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:4160,359,0 -chr7 23842637 . CTCAATGGGTTTCATAACAAGAGCTAATACCTTTTCATTACATGCATTTTTCACTTTTTCTAAGCATTATTTAATTTGTGTTAACA C 4079.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=1.729;DP=93;FS=6.219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=32.13;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,90:93:99:4117,357,0 -chr7 23842839 . TGTGAGTACTTTTCATGCCTTCACGTAACATTAGTGAGGCTCAATAGTGTGTATGTAATTGTTTTTTGTGAATGTGTGGTGACTGATTTACGTGATCTTGTGCGGCAG T 8856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.488;DP=193;FS=1.400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=31.98;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,185:193:99:8894,825,0 -chr7 23850807 . C CA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=1.613;DP=21;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:58:339,0,58 -chr7 23862093 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.701;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:519,0,148 -chr7 23926792 . CA C 3849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-0.293;DP=259;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,175:229:99:3887,0,716 -chr7 23926937 . C G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=4.671;DP=155;FS=9.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,25:149:99:508,0,4868 -chr7 23926983 . A AT 3825.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=-4.724;DP=173;FS=1.317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=22.11;ReadPosRankSum=4.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,142:151:99:4124,369,0 -chr7 23927163 . A G 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.585;DP=191;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,55:181:99:1383,0,4763 -chr7 23927561 . C T 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-2.564;DP=203;FS=7.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,53:180:99:1380,0,5023 -chr7 23927589 . C T 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-2.625;DP=214;FS=10.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.483;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,45:183:99:1032,0,5366 -chr7 23956089 . T C 1942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-0.548;DP=109;FS=7.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1971,0,2022 -chr7 23956504 . C A 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.324;DP=168;FS=6.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,67:168:99:2318,0,3353 -chr7 23971708 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-2.473;DP=36;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:321,0,876 -chr7 23972019 . A T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.655;DP=41;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:568,0,903 -chr7 23973353 . AT A 264.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.639;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:15:302,0,15 -chr7 23979951 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-0.860;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:373,0,909 -chr7 23979978 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=-0.968;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:444,0,881 -chr7 23981443 . A G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-1.668;DP=51;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:494,0,2329 -chr7 23981446 . A AT 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=-2.069;DP=48;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.247;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:494,0,2329 -chr7 23981621 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.147;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:320,0,1348 -chr7 23983255 . AGTATGGCTACTAGAAGTCTTTTTTTTGTGTGTGTAAACCTCTTTAGCTCTGTCGTGTCAGGTAGTTTAATTGTTTTTCTTATTTCTCAG A 10155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.971;DP=327;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,313:320:99:10204,0,1125 -chr7 23987066 . A T 4492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.055;ClippingRankSum=-0.099;DP=373;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,140:373:99:4521,0,6776 -chr7 23987795 . C G 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.025;DP=166;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,70:166:99:2512,0,3301 -chr7 24017582 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=-2.293;DP=48;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=7.93;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:409,0,1896 -chr7 24017718 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-1.188;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:271,0,1764 -chr7 24017721 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.727;DP=53;FS=10.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:475,0,1697 -chr7 24018034 . T G 1773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.221;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1802,0,1478 -chr7 24018224 . C T 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.136;DP=97;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1755,0,1565 -chr7 24041046 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:357,0,659 -chr7 24059003 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,254 -chr7 24063486 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:349,0,161 -chr7 24063632 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.418;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:390,0,361 -chr7 24065775 . C G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:248,0,640 -chr7 24151579 . A AAATCTAT 752.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,22:22:99:790,0,978 -chr7 24171576 . TA T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.680;DP=37;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:323,0,344 -chr7 24708845 . A G 327.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.79;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:356,0,14 -chr7 24917163 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,131 -chr7 24917532 . T C 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:281,21,0 -chr7 24918891 . C CA 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-1.723;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:349,0,280 -chr7 24920424 . TA T 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.529;DP=42;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:364,0,1237 -chr7 24920480 . C CA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=1.424;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:339,0,820 -chr7 24923729 . TA T 1598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.182;DP=69;FS=3.445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,61:68:82:1636,82,0 -chr7 25054712 . A AGC 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.095;DP=33;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=25.90;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:892,0,380 -chr7 25137585 . G GT 223.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:261,24,0 -chr7 25178367 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=4.476;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:261,0,1449 -chr7 25180811 . T A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.104;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=22.58;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1067,0,559 -chr7 25234216 . T TAA 272.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:310,20,0 -chr7 25234625 . CT C 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.247;DP=91;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:779,0,868 -chr7 25234742 . AAT A 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.456;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=21.78;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:865,0,134 -chr7 25235844 . A AT 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-2.829;DP=93;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:779,0,1060 -chr7 25258201 . AAGGTGACTATTCGTCCACATTTTCAGAAATCGCTTGCTAGATTTGCAGAAATCAACTTTCTTTTTTTTGTC A 10095.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=3.857;DP=289;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=34.93;ReadPosRankSum=-3.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,263:278:99:10133,144,0 -chr7 25264001 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=1.971;DP=65;FS=1.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:563,0,1577 -chr7 25267862 . TCCTGGAGCAGAAGAGAGCACGTGTTATCTCCAGAACAAGCAAATGGTGAACCAAACCGCTTTCTAGGACACTCA T 5108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=5.090;DP=170;FS=3.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=30.05;ReadPosRankSum=-2.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,149:163:99:5146,0,1203 -chr7 25273322 . TCTGACAAACACACATAAACACAGAACTGTGAAGACAAGAGCTTTATAGGCGTCAAACACTGACACTGTGCTTACACTGAC T 6888.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-1.172;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,148:150:99:6926,631,0 -chr7 25378004 . T C 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.493;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,40:63:99:1421,0,822 -chr7 25378991 . A C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=1.140;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:343,0,327 -chr7 25402767 . TAG T 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-1.012;DP=48;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=5.79;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:315,0,1659 -chr7 25524634 . AACCTGCAAAACAAGTAAATCACAGTCAGTTACAGGACAATAGGCGATAACAATTCAGTTTAACTGCCAAATAATAGCTAACTTAAGAAACCATGGCAGGGTGATTTACAGT A 16367.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.085;DP=367;FS=2.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,364:367:99:16405,1456,0 -chr7 25529798 . G A 11009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.644;DP=548;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.562;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,336:548:99:11038,0,6792 -chr7 25562888 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.231;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:340,0,957 -chr7 25627206 . T TA 830.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.877;DP=107;FS=4.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:868,0,2092 -chr7 25638776 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.527;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:366,0,544 -chr7 25638916 . T C 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-1.318;DP=34;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=18.46;ReadPosRankSum=2.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:656,0,1039 -chr7 25639995 . GA G 1490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.971;ClippingRankSum=-0.911;DP=171;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=8.72;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:1528,0,3520 -chr7 25783472 . G C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.889;DP=51;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.934;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:710,0,970 -chr7 25788466 . C A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.216;DP=45;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=17.48;ReadPosRankSum=2.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:815,0,816 -chr7 25810994 . A G 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-1.435;DP=52;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:1103,0,1652 -chr7 25811525 . G C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.973;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:676,0,703 -chr7 25839889 . C A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:342,0,214 -chr7 25840074 . CT C 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.958;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:306,0,361 -chr7 25883017 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.268;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:405,0,1542 -chr7 25883018 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.186;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:405,0,1541 -chr7 26123372 . G A 215.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:244,0,21 -chr7 26132988 . TA T 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:263,0,114 -chr7 26170533 . G GA 1937.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=-4.004;DP=252;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=7.69;ReadPosRankSum=2.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,87:234:99:1975,0,3464 -chr7 26171506 . C T 2586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2615,187,0 -chr7 26203646 . G A 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.898;DP=84;FS=9.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:1218,0,1719 -chr7 26226929 . C A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-1.862;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:821,0,746 -chr7 26226947 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-2.563;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:758,0,721 -chr7 26459412 . G T 1881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.015;DP=94;FS=16.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,57:94:99:1910,0,1294 -chr7 26459871 . C CT 706.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.970;DP=53;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,34:48:99:854,0,238 -chr7 26513817 . A T 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=3.684;DP=72;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1137,0,1216 -chr7 26513844 . G A 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-3.122;DP=68;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=16.79;ReadPosRankSum=3.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1170,0,1808 -chr7 26725704 . A AT 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.778;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:660,0,1352 -chr7 26726031 . T C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=2.277;DP=43;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:790,0,746 -chr7 26726309 . C A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.550;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:1324,0,1093 -chr7 26726443 . C T 372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 -chr7 26823362 . TCCTGCGCACAGAGGAGAACTCATGTTATGCAGTTACAGAGGGTGTTTAATGATGCATATGTCCCTTCTAAAGATAAGATGGTACTCA T 5458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=1.469;DP=152;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,141:152:99:5496,0,596 -chr7 27004717 . T C 3210.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.128;DP=281;FS=5.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,95:281:99:3239,0,6552 -chr7 27007258 . AAC A 4173.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-1.377;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,117:233:99:4211,0,4107 -chr7 27007802 . T G 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=2.369;DP=62;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=16.35;ReadPosRankSum=2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,2:61:99:1042,0,2021 -chr7 27042942 . AAGGCATGTCTCCATACTTCCATCCTCCATGCAGCATATTAAAAATGGCAGCAAATTTTAACAATATTTGCATTTTCATGC A 13055.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.605;DP=312;FS=2.225;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,309:312:99:13093,1086,0 -chr7 27043969 . T G 15146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.786;DP=299;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=31.15;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,147:299:99:15175,0,3455 -chr7 27137538 . G GT 2491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.429;DP=161;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:2529,0,2705 -chr7 27152317 . CT C 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.317;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:474,0,512 -chr7 27168033 . G A 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.054;DP=146;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,44:145:99:1118,0,3873 -chr7 27172511 . C CA 1870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1908,173,0 -chr7 27173215 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.386;DP=26;FS=17.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:399,0,490 -chr7 27202399 . G C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=1.488;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:474,0,437 -chr7 27268604 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=2.209;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:265,0,422 -chr7 27269211 . A G 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=1.832;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:622,0,324 -chr7 27272861 . C T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.649;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:819,0,1561 -chr7 27389021 . C T 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-2.345;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1048,0,1068 -chr7 27392554 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr7 27394447 . C T 4022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=1.506;DP=273;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,118:272:99:4051,0,5010 -chr7 27492552 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.846;DP=42;FS=6.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:852,0,599 -chr7 27492755 . CA C 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.307;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:316,0,245 -chr7 27493948 . T A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.198;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:588,0,570 -chr7 27494201 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,269 -chr7 27504092 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:368,0,279 -chr7 27504305 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.065;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,839 -chr7 27515129 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:325,0,102 -chr7 27515219 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-0.295;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:339,0,164 -chr7 27515237 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=1.678;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.65;ReadPosRankSum=2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:328,0,316 -chr7 27515354 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-0.444;DP=31;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:260,0,785 -chr7 27520659 . A G 1343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-1.666;DP=67;FS=6.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1372,0,908 -chr7 27522038 . G A 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-0.163;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.148;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:969,0,1287 -chr7 27522871 . T G 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.486;DP=29;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=33.47;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:999,0,298 -chr7 27523111 . G A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.933;DP=36;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:667,0,649 -chr7 27523409 . G A 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-1.530;DP=68;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1148,0,1210 -chr7 27524027 . A T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.830;DP=61;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1022,0,1071 -chr7 27524219 . A G 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-1.259;DP=54;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:810,0,1069 -chr7 27534208 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.657;DP=55;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:678,0,1112 -chr7 27558751 . C A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,895 -chr7 27559260 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr7 27560449 . A T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=1.051;DP=154;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,49:148:99:1399,0,3855 -chr7 27584119 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:315,0,131 -chr7 27586147 . G A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.635;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.74;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:670,0,174 -chr7 27586295 . A T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.537;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:412,0,314 -chr7 27588368 . C A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=9.94;ReadPosRankSum=2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:237,0,484 -chr7 27595688 . G A 1244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.056;DP=82;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1273,0,3163 -chr7 27598266 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=1.491;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:808,0,1628 -chr7 27636548 . C CA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.978;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=5.61;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:357,0,947 -chr7 27636978 . G GA 5069.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.003;DP=406;FS=0.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,220:383:99:5107,0,4047 -chr7 27637118 . CAA C 2760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-2.388;DP=343;FS=44.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=8.05;ReadPosRankSum=3.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,102:342:99:2798,0,11050 -chr7 27637734 . GA G 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-2.386;DP=52;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=5.76;ReadPosRankSum=-2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:337,0,375 -chr7 27643342 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,171 -chr7 27707707 . C A 2506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=-0.518;DP=194;FS=3.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,72:193:99:2535,0,4163 -chr7 27707819 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;ClippingRankSum=3.018;DP=129;FS=16.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,32:123:99:531,0,4303 -chr7 27710748 . G A 4513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.176;DP=286;FS=7.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,127:286:99:4542,0,11105 -chr7 27742693 . A C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-1.289;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:709,0,518 -chr7 27830080 . T TA 709.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:747,57,0 -chr7 27832075 . A AAC 729.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:767,54,0 -chr7 27855330 . G A 7796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.295;DP=453;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=17.21;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,240:452:99:7825,0,7684 -chr7 27862233 . C T 5401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=-0.223;DP=352;FS=0.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,151:352:99:5430,0,6752 -chr7 27863376 . A T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:436,30,0 -chr7 27863681 . G A 2069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.502;DP=95;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,59:95:99:2098,0,1265 -chr7 27954011 . C T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.014;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:612,0,699 -chr7 27991174 . A T 2239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.671;DP=116;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,67:116:99:2268,0,1758 -chr7 28017689 . A AT 1509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.975;DP=159;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1547,0,1623 -chr7 28017730 . C A 2101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-2.456;DP=125;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:2130,0,2176 -chr7 28018279 . T G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.018;DP=33;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:655,0,569 -chr7 28020189 . CA C 628.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:666,45,0 -chr7 28032889 . G A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.633;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:490,0,499 -chr7 28136219 . TCAGGTAAGATGCACCTCATTTGTCAATGAAAGTTTGGAATTGGAAGCAACCCTTGGCCCAATTGTGTTTATTTTTGAGTTCACCATGTGATTTC T 994.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=2.421;DP=181;FS=7.360;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,170:172:99:1032,382,0 -chr7 28136493 . CATGCAGGTAAACTGGAGAATTTGTTCATTCATCAGACTTCAGTTGTATCAGTGAAGTTTTCCAACTCATGTTTAATGCA C 8115.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=2.170;DP=254;FS=1.922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=31.95;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,219:223:99:8153,613,0 -chr7 28143883 . GTTTT G 844.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=1.004;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=32.10;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,19:20:8:1195,0,8 -chr7 28144032 . G A 1510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-0.562;DP=84;FS=7.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,46:84:99:1539,0,1369 -chr7 28144239 . GT G,AT 6547.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.742;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=30.88;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,110,92:203:99:6132,3600,5650,3059,0,6863 -chr7 28169339 . AAGGTATCAAATCAACCATTCATAATAGATTGTGTTTTATTTTAGGAGATTTCTGGGAAAATGAGATCAGTACACTGCAGC A 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=410;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,1:5:99:633,0,307 -chr7 28326112 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:349,0,261 -chr7 28344061 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=-1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:270,0,522 -chr7 28344062 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,522 -chr7 28446574 . G A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.677;DP=76;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:955,0,1442 -chr7 28575472 . CT C 708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.859;DP=47;FS=5.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:746,0,114 -chr7 28576641 . C G 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.607;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1282,0,1401 -chr7 28580318 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.381;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:594,0,1230 -chr7 28580319 . C A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:594,0,1230 -chr7 28826404 . T TC 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:325,0,318 -chr7 28827896 . T TA 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.190;DP=33;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:276,0,286 -chr7 29012376 . A T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.212;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:667,0,1597 -chr7 29326150 . T A 2806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2835,190,0 -chr7 29342733 . G A 3884.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3913,286,0 -chr7 29344203 . T C 678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:707,51,0 -chr7 29344254 . G T 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=34.20;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:32:507,32,0 -chr7 29344272 . T C 1155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1184,90,0 -chr7 29355808 . T C 2640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2669,202,0 -chr7 29446135 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.049;DP=46;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:335,0,1198 -chr7 29743262 . AT A 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:551,54,0 -chr7 29744605 . C G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:436,0,115 -chr7 29766312 . TCTGAGGAACACCAAGATGATGGAGGTTAGTTTCGGTGCGAAAACACACAGGGGCATATGTGAATAAAAAGAGTGAGTGACTTAC T 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:252,0,498 -chr7 29905983 . AAT A 323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:361,31,0 -chr7 29907862 . G A 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.368;DP=94;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1301,0,1263 -chr7 29933442 . C T 1394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.069;DP=86;FS=0.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:86:99:1423,0,1627 -chr7 29933487 . C T 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.012;DP=81;FS=5.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:1253,0,1415 -chr7 29936246 . A G 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=-0.319;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:954,0,1010 -chr7 29941167 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.295;ClippingRankSum=0.936;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=17.08;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:609,0,554 -chr7 29959542 . TA T 231.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.474;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:5:268,5,0 -chr7 29961904 . TA T 233.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:271,27,0 -chr7 30011826 . AACCTGAAAATGGAAAGAAAAACAAATCTGTTAATTATCGTGTCTCAATTTAGTTCATTTGAATAAGCTTACCAAAACTTGCCACTT A 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:631,0,579 -chr7 30012699 . TCTAGGGAGAAACACATTAGAAGAACAATTAGTAATTGTGCTGATGCCTAATGCTGACTGATGATGTGCATGAACATGACGACGGGAGCAGAC T 3404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=2.813;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=32.26;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,78:81:99:3442,293,0 -chr7 30015356 . A G 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-3.343;DP=59;FS=3.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1057,0,1109 -chr7 30110381 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.230;DP=49;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:723,0,1769 -chr7 30110460 . C T 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.719;DP=71;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,34:71:99:1139,0,1180 -chr7 30173223 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,205 -chr7 30370772 . G A 1446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.906;DP=79;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.144;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,45:79:99:1475,0,1150 -chr7 30378453 . A G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.765;DP=56;FS=5.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:612,0,1295 -chr7 30379075 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.097;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=15.65;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,28:58:99:936,0,953 -chr7 30395164 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:257,18,0 -chr7 30398167 . T A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr7 30432813 . C CA 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.210;DP=44;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:282,0,843 -chr7 30446303 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,328 -chr7 30474541 . T A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=2.036;DP=60;FS=5.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:932,0,1002 -chr7 30490155 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:329,0,101 -chr7 30522961 . A C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=2.108;DP=33;FS=35.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=13.33;ReadPosRankSum=-2.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:468,0,1194 -chr7 30526184 . G A 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-2.223;DP=91;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=21.36;ReadPosRankSum=4.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,60:91:99:1972,0,1013 -chr7 30566043 . G A 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.367;DP=53;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=17.75;ReadPosRankSum=2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:969,0,832 -chr7 30566132 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-2.459;DP=66;FS=7.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=3.66;ReadPosRankSum=2.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:270,0,2480 -chr7 30567952 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.922;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:908,0,1022 -chr7 30568186 . G A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.528;DP=68;FS=3.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,35:68:99:1137,0,1241 -chr7 30618197 . G A 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:234,0,24 -chr7 30646938 . T C 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.446;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:1115,0,2146 -chr7 30688177 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.095;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:332,0,821 -chr7 30889787 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.814;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:308,0,1186 -chr7 31032374 . A G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-2.425;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=21.80;ReadPosRankSum=2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:486,0,227 -chr7 31293487 . AAGGTGTGAACGGTCATCTGCGTGTGTTGGTTGTGTGTTTGTGGACAGCTTTTTAATCCTGTCTTCTGTCTTTCACGCACAC A 5072.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.699;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:5110,528,0 -chr7 31297213 . C T 805.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:834,60,0 -chr7 31297218 . C T 805.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:60:834,60,0 -chr7 31305406 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.180;DP=31;FS=11.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:627,0,459 -chr7 31305516 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:45:413,0,45 -chr7 31305550 . A G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,155 -chr7 31417146 . ACTGCAGAAAATAATCAGATGAGAAAAATCAGGACAGATTCGGTATTCAAAATCATTAAGGCTGTACGTGTGAAAGTAAAAAGGTGTCAGTTTGTTGTTTAC A 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.589;DP=25;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=31.12;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:84:1034,84,0 -chr7 31512767 . T C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.546;DP=105;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:777,0,6134 -chr7 31513160 . TCTGCATGATTTATTCAGAGATTCATATCAAATGCATTTATGCAGCGCATATGCTTGTGAGTGAATGCTGCTTGAGTTTCTCAC T 9047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.768;DP=212;FS=3.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.716;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,211:212:99:9085,786,0 -chr7 31548038 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.900;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:417,0,2632 -chr7 31550180 . A G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-1.679;DP=98;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,28:98:99:713,0,2589 -chr7 31606480 . A AAT 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr7 31607320 . CCCTGTCAATGTACACCAGAAAGACCAGCGTCACAATAACACTCCATTTTCATTAAGTGCTGCCTACAGTTGCAGTTTTTACTGTA C 1119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=-0.424;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:99:1157,106,0 -chr7 31667022 . TCTACAAAAAAAGTAGTTGTTTTAGTTAACCATTTGAATTTAGATTGATTATTTAGAGATGAAAAAAAATAAATCAGAC T 9870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.163;DP=206;FS=2.118;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,200:203:99:9908,926,0 -chr7 31746047 . T A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.458;DP=47;FS=4.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:796,0,819 -chr7 31828442 . G A 2126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.172;DP=187;FS=7.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,65:187:99:2155,0,4369 -chr7 31830310 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.936;DP=44;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:251,0,1146 -chr7 31869807 . G T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=0.640;DP=53;FS=8.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:626,0,1234 -chr7 31879829 . TCCTGTACATAAAGAAAAGAAAAACCTTTAGGAGACCAGTAACACCTCAATTATAACTGTACAATGAAATAGTTCACACA T 8941.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.377;DP=246;FS=6.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=32.48;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,229:231:99:8979,675,0 -chr7 31880033 . TCCTTCACATACACAATTTCAGCACATCAAACAAACACACAAGACATGCCAACTCTGAATTTCCATGAGCAGGGATATATCGTAGTCGCA T 13191.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=1.352;DP=306;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=31.45;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,291:293:99:13229,1191,0 -chr7 31889500 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.510;DP=94;FS=8.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:513,0,2703 -chr7 31891226 . T A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.958;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:365,0,952 -chr7 31892695 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:236,0,144 -chr7 31893499 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr7 31895895 . TCCTGGTAAGGCATAATAAAGGTATACAGTAAGTTTACGAAAACCAAACGTGAAGTAAATGAGTTTAGTTCAGAGAATAAAGATTTA T 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.101;DP=268;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,250:252:99:766,0,139 -chr7 31899335 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.027;DP=57;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:435,0,1579 -chr7 31915326 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=-1.156;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,30:115:99:742,0,3217 -chr7 31963365 . AAGGTTCGTGTCTTTTATTTGGCACCAAGCAGCTTATGAACGTAAACAACAACGTGCTGCCACACACTCCTTTGTTTCCTTTTTAC A 1512.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.623;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.314;QD=31.21;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1550,135,0 -chr7 31966319 . TGTAAGTGCTGATTTTTGTGATCCCTGATGGAATTTGTGTGATCTTCAGAAGATAACGCTTGCCTTTTTTCCATCTGATTTCTAG T 1896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.648;DP=44;FS=3.112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1934,142,0 -chr7 31975722 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=1.233;DP=93;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:496,0,2648 -chr7 31977725 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=-0.161;DP=59;FS=2.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:420,0,1478 -chr7 31988877 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-1.125;DP=62;FS=2.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:739,0,2472 -chr7 32008488 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.477;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:746,0,1229 -chr7 32258148 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-1.557;DP=92;FS=7.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:403,0,2615 -chr7 32258402 . GCCTACAAACAAACACCCATCAGTGACACATAAAAATATCCAGACATCAAGGTACAGTGAAGCCAGTATGATTTCATAAAGTAAATAAACCAA G 3859.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=1.753;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=30.30;ReadPosRankSum=-2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,84:88:99:3897,314,0 -chr7 32260164 . TCTGCAATAACAATAATAAATATACTGAAGTATTCCTTTTATTGCAATGCATTCGGTAATATTTCTTTGTGACATAAATAC T 4243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.184;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=31.52;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:4281,362,0 -chr7 32442562 . T G 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=1.335;DP=190;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,54:189:99:1279,0,5016 -chr7 32673645 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.862;DP=56;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:423,0,1444 -chr7 32702287 . C G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=-0.350;DP=60;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:491,0,1592 -chr7 32721303 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=1.354;DP=75;FS=12.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:461,0,4347 -chr7 32721306 . A T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=1.424;DP=73;FS=12.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:461,0,4347 -chr7 32726111 . G T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.356;DP=81;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:415,0,2327 -chr7 32727196 . GA G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.106;DP=26;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:243,0,272 -chr7 32765843 . A G 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.803;DP=147;FS=4.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,43:147:99:1109,0,4140 -chr7 32766017 . T C 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.888;DP=59;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:278,0,2556 -chr7 32766967 . TAA T 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.097;DP=61;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:642,0,1069 -chr7 32767455 . C T 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-1.171;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,53:192:99:1290,0,5526 -chr7 32768015 . G C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-3.163;DP=188;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,36:188:99:602,0,5958 -chr7 32768574 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.927;DP=144;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=2.30;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,26:144:99:360,0,4664 -chr7 32774100 . GCCTAATGAGGAAATGAAAGCAGCTCAAGTTTTTTCAAGTTTGAAAAATATGTTCATTTACTTCAATGATGGGTGTAACTTGCTTTTGATGTGGTAATGAAAATAAAGTATATTGCGCGTTAATCAAGGCTAATTATCATGAGCCCTGCTAATGACTAATGCTTTCATGTGATTTCTCCCTCTCCAGATTATTGCTTAACACTTGATTCTTA G 937.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.525;ClippingRankSum=7.335;DP=179;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=5.24;ReadPosRankSum=-4.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,142:169:99:975,0,8289 -chr7 32775304 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.62;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:310,0,92 -chr7 32830512 . A C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.894;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:411,0,610 -chr7 32833125 . CTT C 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-2.421;DP=56;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:469,0,1706 -chr7 32835859 . TA T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.474;DP=61;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:241,0,1162 -chr7 32838903 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=-1.928;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:654,0,2785 -chr7 32838992 . T A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.653;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:524,0,1818 -chr7 32937839 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.355;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=3.92;ReadPosRankSum=3.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:275,0,1872 -chr7 32960200 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.943;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:284,0,283 -chr7 33242657 . C T 2251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.254;DP=134;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:2280,0,2169 -chr7 33791910 . A T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.197;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:472,0,596 -chr7 33792365 . C CT 597 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:71:718,71,0 -chr7 33792646 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.674;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:313,0,1773 -chr7 33792664 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-1.317;DP=68;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:368,0,1938 -chr7 33793636 . G T 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.646;DP=51;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:712,0,1104 -chr7 34049142 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-1.506;DP=39;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:1126,0,310 -chr7 34049837 . A C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,442 -chr7 34050128 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=1.087;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:408,0,788 -chr7 34057171 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.176;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,873 -chr7 34076694 . C T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.417;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:570,0,453 -chr7 34076715 . C G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-0.059;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:510,0,507 -chr7 34078281 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr7 34079680 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.228;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:324,0,451 -chr7 34080351 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,517 -chr7 34082453 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:471,0,202 -chr7 34147096 . T A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.083;DP=52;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:648,0,1174 -chr7 34147977 . C CT 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.617;DP=33;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:408,0,393 -chr7 34148142 . CT C 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.249;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:281,0,228 -chr7 34167665 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.840;DP=23;FS=10.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,539 -chr7 34170363 . C A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-2.167;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:549,0,600 -chr7 34178327 . T G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.466;DP=52;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:450,0,1389 -chr7 34195005 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.840;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:284,0,937 -chr7 34195006 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-2.098;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:284,0,937 -chr7 34243555 . C A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.545;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:535,0,584 -chr7 34255298 . A T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-1.479;DP=39;FS=9.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=16.35;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:666,0,730 -chr7 34255536 . C A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=1.553;DP=36;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:625,0,667 -chr7 34258296 . TG T 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=1.350;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=27.42;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:33:476,0,33 -chr7 34319520 . A AT 4620.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-1.426;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=30.98;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:4658,320,0 -chr7 34422403 . G GA 580.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:77:723,77,0 -chr7 34427482 . T A 534.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:563,39,0 -chr7 34509508 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,251 -chr7 34535344 . TCTGACAGAGACAAAAATGAATAAAATAGCACCACCATGCCTTATTAATCACTCAAATTAATTACTATTGGGCACAATGGGCACTCATGTGGTAC T 1233.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=1.609;DP=29;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:99:1271,102,0 -chr7 34583218 . A ATG 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:80:306,0,80 -chr7 34611507 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr7 34652718 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-0.081;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:244,0,1282 -chr7 34652832 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.010;DP=53;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:356,0,1334 -chr7 34678972 . TA T 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 -chr7 34680595 . GT G 8012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-7.812;DP=131;FS=25.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=31.94;ReadPosRankSum=5.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,36:114:99:8050,0,893 -chr7 34680708 . T TG 839.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-1.274;DP=289;FS=4.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,67:285:99:877,0,10858 -chr7 34777775 . GT G 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.083;DP=32;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:378,0,376 -chr7 35007142 . C CA 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.717;DP=134;FS=4.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,40:124:99:660,0,2260 -chr7 35450025 . GT G 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.525;DP=50;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:583,0,300 -chr7 35450561 . TA T 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.226;DP=40;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:449,0,202 -chr7 35576353 . G T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.268;DP=95;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,30:95:99:795,0,2403 -chr7 35580541 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.764;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:353,0,3080 -chr7 35584372 . AT A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.967;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:21:250,0,21 -chr7 35600348 . C CT 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.188;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:301,0,775 -chr7 35660514 . T TA 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.741;DP=31;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:297,0,581 -chr7 35660594 . T TCA 864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-2.727;DP=81;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,30:74:99:933,0,1464 -chr7 35684486 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.019;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:470,0,537 -chr7 35684567 . A G 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=-1.139;DP=44;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:682,0,631 -chr7 35756777 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-1.904;DP=35;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:573,0,679 -chr7 35756856 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:486,0,364 -chr7 35756980 . TCA T 717.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:62:756,62,0 -chr7 35757154 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.427;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:289,0,1404 -chr7 35757213 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=1.012;DP=63;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:451,0,1784 -chr7 35812009 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.563;DP=58;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:560,0,1490 -chr7 35943054 . A C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-1.514;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:315,0,1944 -chr7 36231128 . TC T 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=1.771;DP=83;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:338,0,2007 -chr7 36250479 . A T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=-0.423;DP=70;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:567,0,1829 -chr7 36264083 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=1.286;DP=102;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:246,0,3216 -chr7 36276335 . GT G 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.137;DP=38;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:503,0,1123 -chr7 36276345 . T C 486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-1.767;DP=36;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:524,0,1206 -chr7 36281657 . TA T 360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:398,39,0 -chr7 36282636 . G GT 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,680 -chr7 36546084 . C T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.076;DP=230;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,57:230:99:1312,0,6750 -chr7 36549423 . CAT C 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.723;DP=118;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,25:113:99:577,0,3898 -chr7 36652328 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.354;DP=38;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:324,0,1055 -chr7 36666360 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:301,0,337 -chr7 36738473 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=2.171;DP=38;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:261,0,1095 -chr7 37802573 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-1.268;DP=141;FS=1.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=3.45;ReadPosRankSum=2.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,29:141:99:514,0,4367 -chr7 37803848 . T C 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=-0.387;DP=180;FS=4.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,38:180:99:716,0,5237 -chr7 37945553 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.078;DP=116;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:445,0,3469 -chr7 37945681 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=1.056;DP=50;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:267,0,1479 -chr7 37947642 . T TG 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.180;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,30:61:99:651,0,1280 -chr7 38342867 . C T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.948;DP=81;FS=3.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:896,0,1813 -chr7 38353950 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=-0.127;DP=112;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:352,0,3318 -chr7 38359664 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=1.537;DP=67;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:268,0,1767 -chr7 38782325 . GA G 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.375;DP=96;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:385,0,1744 -chr7 38782468 . A C 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-0.300;DP=86;FS=1.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.170;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:781,0,2176 -chr7 38913058 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-1.575;DP=38;FS=8.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:269,0,1100 -chr7 38926070 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.885;DP=78;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:349,0,2199 -chr7 38978389 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.170;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.200;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,35:146:99:707,0,4132 -chr7 39156288 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.533;DP=16;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:409,0,173 -chr7 39156495 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.412;DP=18;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:331,0,220 -chr7 39156663 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=2.362;DP=40;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:559,0,776 -chr7 39159181 . A C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.322;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=26.05;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:393,0,49 -chr7 39254589 . GA G 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.997;DP=37;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:327,0,487 -chr7 39254713 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.335;DP=46;FS=2.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:682,0,1062 -chr7 39260477 . G A 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.975;DP=60;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,35:60:99:1196,0,870 -chr7 39290569 . A G 306.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=30.69;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:335,0,16 -chr7 39486492 . C T 1844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-1.158;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,54:140:99:1873,0,2959 -chr7 39655560 . TATCCTTTTCAGTGTAGCAGTGTGCATTATTCAGTCAATCTATTTTCAAAGCTGCAGATTGTAAGTAACTTCCAGATTCTCCTTAACCACTTGCAGA T 921.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.653;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:959,0,4569 -chr7 39656359 . GA G 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.149;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:663,0,1252 -chr7 39659528 . G A 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=-0.581;DP=88;FS=0.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1500,0,1555 -chr7 39784575 . C A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.256;DP=35;FS=5.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:461,0,772 -chr7 39928343 . T TA 1448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.577;DP=123;FS=4.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.772;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1486,0,1453 -chr7 39928799 . A G 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=1.779;DP=121;FS=33.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=5.39;ReadPosRankSum=-2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,28:121:99:680,0,6661 -chr7 39928805 . A T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=3.760;DP=107;FS=33.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=6.04;ReadPosRankSum=-2.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:674,0,6661 -chr7 39933541 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:236,0,55 -chr7 39974368 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.176;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:359,0,362 -chr7 39984154 . C G 8143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.082;DP=447;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,227:447:99:8172,0,8155 -chr7 40096165 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.206;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:424,0,287 -chr7 40101513 . TACCTGAATAAACATAAGGATGGCAACTTTGTCATATGTTTCTGTGATTTCAGATGCTTGCATAAATTACTAAGTAAAAACAGAAGGAAA T 1861.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=1.664;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=30.85;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:1899,163,0 -chr7 40147941 . G GACT 5453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-0.190;DP=341;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,132:277:99:5491,0,5687 -chr7 40149123 . C T 1382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=3.822;DP=222;FS=28.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,60:222:99:1411,0,6126 -chr7 40152068 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=1.873;DP=38;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=5.55;ReadPosRankSum=-2.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:239,0,1096 -chr7 40165178 . GCAGGTGAGATGTATAAGCATAAAGCATGACATCATCAGCTGCCTGTTGTATTGGTTCTGAAACCTTTTAATCTGTCTCCTTTA G 5167.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.713;DP=136;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:5205,434,0 -chr7 40169163 . C T 1925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=2.020;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1954,0,2063 -chr7 40175708 . C CA 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=1.178;DP=139;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=1.70;ReadPosRankSum=-1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,29:125:99:273,0,2589 -chr7 40176047 . G A 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-2.707;DP=79;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1297,0,1333 -chr7 40176517 . A G 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.251;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=29.49;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:972,0,208 -chr7 40176541 . A G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=1.957;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:528,0,548 -chr7 40176670 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.366;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:428,0,574 -chr7 40176678 . A G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-1.561;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:553,0,531 -chr7 40177201 . TA T 1009.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.102;DP=80;FS=2.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:1047,0,634 -chr7 40186061 . T TA 997.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.032;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,45:71:99:1055,0,591 -chr7 40196512 . GCCTGAAGAGAGGATAAAAAACATGAACAAATAAACAGCTGGCTATAAAACAGCCAAATGTCCTTTATTAGTATTCTGGAGAAAATGCCTCGTGTTTTTA G 4170.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=2.555;DP=118;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=33.00;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,108:112:99:4208,0,313 -chr7 40744852 . G C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,336 -chr7 40785329 . G A 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.277;DP=214;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.989;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,59:214:99:1426,0,5942 -chr7 40821699 . C T 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=-0.315;DP=267;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,55:267:99:909,0,8188 -chr7 40842483 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.230;DP=126;FS=3.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,20:126:99:237,0,4048 -chr7 40845068 . C A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-2.110;DP=40;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=6.79;ReadPosRankSum=2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:300,0,1101 -chr7 40850701 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.298;DP=116;FS=6.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,19:116:99:270,0,3834 -chr7 41070157 . A T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=1.416;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:99:645,0,2874 -chr7 41070942 . T A 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=1.410;DP=126;FS=8.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=2.63;ReadPosRankSum=-1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,23:126:99:369,0,3988 -chr7 41137538 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.273;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:860,0,944 -chr7 41137576 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:301,0,377 -chr7 41137817 . T C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.340;DP=150;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,36:150:99:794,0,4334 -chr7 41435999 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:291,0,758 -chr7 41436005 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:291,0,808 -chr7 41446769 . G GT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-1.516;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:44:303,0,44 -chr7 41474539 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-2.032;DP=55;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=25.03;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1405,0,354 -chr7 41483422 . G A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.290;DP=136;FS=11.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,32:136:99:635,0,7395 -chr7 41486950 . G C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.555;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,449 -chr7 41490341 . C A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-2.091;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:454,0,734 -chr7 41497056 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:256,0,61 -chr7 41533161 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=-0.215;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:259,0,902 -chr7 41556009 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,254 -chr7 41891751 . T C 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.392;DP=63;FS=7.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1136,0,1211 -chr7 41971303 . A AT 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-0.679;DP=51;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:621,0,881 -chr7 41978321 . GT G 769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.497;DP=57;FS=3.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:807,0,2357 -chr7 41978326 . G A 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.216;DP=58;FS=5.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:807,0,2326 -chr7 41995016 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.873;DP=56;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:305,0,1671 -chr7 42048715 . AT A 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=1.220;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:243,0,294 -chr7 42105865 . C CA 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.235;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,33:50:99:632,0,327 -chr7 43539901 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:341,0,588 -chr7 43661385 . G C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.503;DP=88;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:454,0,2399 -chr7 44157480 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=1.858;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:386,0,1402 -chr7 44630512 . A G 1043.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=1.065;DP=27;FS=3.023;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=37.18;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:73:1072,73,0 -chr7 44630564 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.029;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:232,0,786 -chr7 44633724 . T A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.217;DP=34;FS=7.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=28.08;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:983,0,717 -chr7 45457785 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-2.219;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=26.73;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:349,0,84 -chr7 45592316 . T C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.826;DP=35;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:468,0,815 -chr7 45612115 . GA G 311.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=1.614;DP=17;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:23:349,0,23 -chr7 45613053 . GT G 387.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.347;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:425,13,0 -chr7 45614255 . T G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.097;DP=32;FS=19.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:413,0,1020 -chr7 45616840 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.992;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:287,0,1744 -chr7 45663902 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.185;DP=155;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,26:155:99:376,0,5188 -chr7 45664568 . A AAT 325.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=1.107;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=21.68;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:362,0,9 -chr7 45665758 . T TG 570.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=1.393;DP=45;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=12.68;ReadPosRankSum=3.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:608,0,271 -chr7 45703635 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-1.275;DP=362;FS=6.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,55:362:99:461,0,12254 -chr7 45703988 . A G 2943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.218;DP=230;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,86:230:99:2972,0,4979 -chr7 45762089 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=-0.180;DP=105;FS=1.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:324,0,3227 -chr7 45779784 . C A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.843;DP=105;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:503,0,3084 -chr7 45779927 . GCTGCAGAAAATATTAAAGAATGCAATCAGGCATAATTATCAATTTATCATATTATATTTCCAAAAAAGATATACATCATCACGCCAACACATTTAC G 2132.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=1.261;DP=103;FS=2.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,79:100:99:2170,0,1253 -chr7 45954713 . T TA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.530;DP=38;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:323,0,606 -chr7 45954868 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=2.629;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=17.54;ReadPosRankSum=-2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:572,0,577 -chr7 46455716 . G C 16602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.270;DP=420;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=24.05;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,419:420:99:16631,1230,0 -chr7 46582433 . C A 1159.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.619;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1188,81,0 -chr7 46776859 . C T 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=1.704;DP=35;FS=14.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:99:1014,0,163 -chr7 47573309 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr7 47585530 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.560;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:246,0,1638 -chr7 48040862 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=1.364;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:378,0,589 -chr7 48338854 . C CT 576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.014;DP=59;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:759,0,281 -chr7 48340720 . A C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=-0.726;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:461,0,1168 -chr7 48720903 . AG A 328.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:366,30,0 -chr7 48767430 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.129;DP=63;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:448,0,1685 -chr7 48870179 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=-1.726;DP=76;FS=5.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:281,0,2271 -chr7 48870884 . A G 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.055;DP=46;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.496;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:781,0,830 -chr7 48871973 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:285,0,61 -chr7 49492205 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.460;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:439,0,406 -chr7 49493958 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.508;DP=38;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:501,0,821 -chr7 49496043 . TA T 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.948;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:39:373,0,39 -chr7 49496512 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-0.668;DP=33;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:315,0,1060 -chr7 49500840 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:246,0,186 -chr7 49710268 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-0.348;DP=73;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:307,0,2328 -chr7 49710349 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.423;DP=70;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,13:70:99:230,0,2159 -chr7 49717861 . T TTA 313.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr7 49760589 . G GT 1063.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1363,139,0 -chr7 49810137 . G GA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-1.776;DP=18;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.511;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:317,0,100 -chr7 49835093 . C G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.852;DP=169;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,29:168:99:377,0,5345 -chr7 49835291 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.452;DP=136;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:271,0,4120 -chr7 49840524 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.883;DP=82;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:253,0,6561 -chr7 49840799 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-1.899;DP=80;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=4.61;ReadPosRankSum=2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:397,0,2231 -chr7 49940372 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-0.472;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:230,0,693 -chr7 50178611 . G GT 210.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:15:278,0,15 -chr7 50179826 . A C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:318,0,763 -chr7 50190613 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-1.695;DP=41;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:339,0,1001 -chr7 50250298 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.325;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:308,0,827 -chr7 50277883 . GGGTAGGCCGTCCTATCTTTGAACTTCGGAAGCACACGATATTGTGAAATATGCCACCTTCTTGCTACATATTTATTTTTTATTGTACA G 2295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=2.188;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=31.28;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,51:55:99:2333,206,0 -chr7 50333066 . T TAC 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.261;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:595,0,737 -chr7 50511833 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,864 -chr7 50783199 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:281,0,373 -chr7 51078732 . G C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.540;DP=54;FS=6.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:480,0,1439 -chr7 51078764 . G T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=-0.317;DP=58;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:389,0,1628 -chr7 51091170 . C G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.302;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:318,0,902 -chr7 51096689 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-1.701;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:293,0,1046 -chr7 51685155 . G GA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.657;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:347,0,1632 -chr7 51685839 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.858;DP=21;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:252,0,498 -chr7 51729686 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.386;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:340,0,1453 -chr7 51753395 . A T 288.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.02;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:4:315,4,0 -chr7 51761710 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.486;DP=53;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:277,0,3167 -chr7 51761719 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.538;DP=51;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:251,0,3167 -chr7 51775576 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.203;DP=43;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:291,0,1119 -chr7 51805431 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.939;DP=44;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:325,0,2350 -chr7 51814585 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.026;DP=88;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:99:335,0,2713 -chr7 51817028 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.416;DP=119;FS=2.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,20:119:99:242,0,3706 -chr7 51833215 . T A 214.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:243,0,23 -chr7 51857426 . T C 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.323;DP=144;FS=1.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,43:144:99:1050,0,4908 -chr7 51857441 . AAGGTAAATCATATCCATCTTATTCGTCTGTAGTAAATACATGATGTTCTTTTGCTAGAGGTCCATGGGTCTTAATGCGCTGGGTGCTTATTCCCCCAC A 7257.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.262;DP=164;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=34.74;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,162:164:99:7295,596,0 -chr7 51864931 . G T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.980;DP=290;FS=2.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,42:290:99:343,0,9680 -chr7 51932912 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.436;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:374,0,779 -chr7 51934172 . T G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=1.992;DP=21;FS=12.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.89;ReadPosRankSum=2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:257,0,429 -chr7 51934350 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.264;DP=67;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:587,0,1798 -chr7 51938414 . G T 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.936;DP=94;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:1336,0,1823 -chr7 52002637 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:450,0,280 -chr7 52005021 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=-0.172;DP=38;FS=8.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:237,0,1014 -chr7 52101264 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.184;DP=86;FS=10.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,15:86:99:269,0,5914 -chr7 52101272 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=-1.001;DP=88;FS=10.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:269,0,5914 -chr7 52101550 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.783;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:312,0,5323 -chr7 52110238 . TCTCACCTGTGAAAGAGCAACAGTTCATCACACGGACTCTGCAAGACTTCAATATCACATCGTCTAAGCATTTTCATAGG T 4435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.042;DP=129;FS=1.734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=34.39;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,107:112:99:4473,324,0 -chr7 52110333 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-0.238;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:327,0,3425 -chr7 52111236 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.528;DP=128;FS=0.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,33:128:99:695,0,3573 -chr7 52111548 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-2.107;DP=85;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:653,0,4304 -chr7 52113658 . G A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=1.473;DP=114;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.086;QD=4.98;ReadPosRankSum=2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:99:596,0,3304 -chr7 52166145 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.366;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,29:123:99:612,0,3602 -chr7 52221398 . T A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.200;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:334,0,1579 -chr7 52375817 . T C 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.183;DP=45;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:605,0,825 -chr7 52376240 . C A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.346;DP=89;FS=6.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,29:89:99:799,0,2259 -chr7 52376667 . T G 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.615;DP=95;FS=6.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1339,0,1994 -chr7 52378367 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;ClippingRankSum=-2.277;DP=217;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,38:217:99:348,0,15252 -chr7 52381298 . C A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=1.199;DP=206;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,41:205:99:682,0,6228 -chr7 52382286 . TACCTGAGAAGACAATAGGCAGAAGTCAATGTATCATGACTGTCCAGGAATTGAATTATTCTTGTTTAGATTTTTGATTTGAATTCATAAACTACTG T 8153.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=1.652;DP=175;FS=3.404;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:8276,731,0 -chr7 52431395 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-2.152;DP=161;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=1.77;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,27:161:99:314,0,5019 -chr7 52623749 . T C 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=1.049;DP=406;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:320,86:406:99:1588,0,12947 -chr7 52626087 . C A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=-1.855;DP=273;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,61:271:99:1280,0,8183 -chr7 52648414 . C T 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.616;DP=316;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,69:316:99:1302,0,9586 -chr7 52648625 . A AT 458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.604;DP=251;FS=4.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,51:225:99:496,0,4740 -chr7 52648633 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=-2.293;DP=248;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,44:238:99:519,0,7392 -chr7 52649141 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-1.846;DP=77;FS=17.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=3.43;ReadPosRankSum=2.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:292,0,2368 -chr7 52649398 . C T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.413;DP=259;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,48:259:99:708,0,8430 -chr7 52701235 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.112;DP=66;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:343,0,1892 -chr7 52703039 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.489;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=6.61;ReadPosRankSum=-2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:319,0,1229 -chr7 52703747 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=1.361;DP=66;FS=7.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:444,0,1820 -chr7 52923222 . C T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr7 52929174 . C A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:296,0,296 -chr7 52930291 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=-0.328;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:417,0,388 -chr7 52930379 . G C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.706;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:587,0,380 -chr7 53098132 . G C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.702;DP=52;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:621,0,1236 -chr7 53098240 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=1.039;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:464,0,909 -chr7 53098262 . C A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=1.062;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:509,0,862 -chr7 53099091 . G A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.822;DP=83;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,26:82:99:628,0,2013 -chr7 53135399 . A G 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr7 53139675 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr7 53140064 . TG T 402.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 -chr7 53140069 . G T 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:440,30,0 -chr7 53142018 . G C 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 -chr7 53164974 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.123;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:347,0,1272 -chr7 53168859 . A G 405.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:23:434,23,0 -chr7 53186634 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.474;DP=62;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:544,0,1666 -chr7 53204579 . TCCTGCAGTAAACAAACATGGGCATGAACAAGCGGAGTCAAGCTGGACGAATCTGAAACCAAGTTGTCAAACGGCTGCATGGTGCGCTGCGTGACCAAACACTGTAAACTACTGTCACCAGTGTTCACAAAACCTGCTTCGACTAAAAGTTCCCCTGAATAAAAACAAA T 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=2.048;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=15.86;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,3987 -chr7 53212206 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.850;DP=23;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:505,0,385 -chr7 53248920 . C G 1965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.154;DP=266;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=7.39;ReadPosRankSum=-2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,80:266:99:1994,0,14499 -chr7 53268944 . G A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.780;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=27.04;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1137,0,253 -chr7 53269770 . A AC 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-1.453;DP=32;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=29.09;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:65:968,0,65 -chr7 53277584 . C G 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.038;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:653,0,1973 -chr7 53462446 . C T 672.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:701,51,0 -chr7 53462516 . G T 1633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1662,120,0 -chr7 53462579 . T C 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 -chr7 53609661 . C CA 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.680;DP=92;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:540,0,1499 -chr7 53630394 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.170;DP=85;FS=9.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:299,0,2606 -chr7 53740129 . AAC A 1535.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-4.461;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=16.88;ReadPosRankSum=2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,51:59:15:1573,0,15 -chr7 53744087 . T A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr7 53887281 . T C 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.562;DP=91;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:1168,0,2038 -chr7 53972284 . GTTT G,GTTTT 226.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=1.504;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,5,9:15:99:337,192,464,149,0,149 -chr7 53972310 . AT A 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=3.924;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=13.33;ReadPosRankSum=-3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:477,0,279 -chr7 53973287 . C CA 1197.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.739;DP=187;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,47:178:99:1235,0,8740 -chr7 53973291 . T A 1206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-1.495;DP=178;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,47:178:99:1235,0,8740 -chr7 54044171 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.674;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:321,0,1093 -chr7 54195158 . T C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=1.362;DP=97;FS=10.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:446,0,2950 -chr7 54198239 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.495;DP=137;FS=4.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:1007,0,3702 -chr7 54202842 . CAGGTATAACACTCGGTGCCAACACGCTGTACAAATACCGCTATTCTTTTGGGCATGTCTGATTGTCTGACTTGCATTTTATTTTATTTTTTTTCTTTAA C 5768.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=1.706;DP=134;FS=3.571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=26.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:5806,426,0 -chr7 54206310 . GT G 1365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-1.183;DP=88;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,58:82:99:1403,0,275 -chr7 54224360 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.138;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:515,0,547 -chr7 54224465 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.112;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:241,0,498 -chr7 54229167 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-0.085;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:268,0,546 -chr7 54240466 . AAGGTATGAGGATTGTTGATAGGAAAATTTGTTGGGTTGAAATCGTGTTGTGCATGATGGTACTGCTGTGTGTTC A 840.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.648;DP=31;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:878,0,528 -chr7 54277640 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:317,0,233 -chr7 54285543 . GA G 502.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:540,54,0 -chr7 54290728 . A T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.416;DP=42;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=15.95;ReadPosRankSum=-2.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:698,0,783 -chr7 54290793 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=-1.310;DP=48;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=12.33;ReadPosRankSum=-1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:620,0,1081 -chr7 54292612 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.179;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:261,0,1860 -chr7 54293504 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-0.710;DP=55;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:313,0,1439 -chr7 54296845 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.626;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:256,0,1226 -chr7 54355873 . A T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.002;DP=142;FS=5.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.106;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,37:141:99:831,0,3959 -chr7 54356565 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=1.478;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:448,0,2661 -chr7 54365137 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.149;DP=83;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:464,0,2249 -chr7 54372894 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.459;DP=92;FS=3.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:515,0,5154 -chr7 54382706 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.076;DP=89;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:598,0,2182 -chr7 54391853 . G A 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=-0.572;DP=159;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,43:159:99:1060,0,4538 -chr7 54422283 . G T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.406;DP=65;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:743,0,1356 -chr7 54582586 . G GA 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=2.099;DP=203;FS=9.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=2.54;ReadPosRankSum=-2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,52:188:99:553,0,3931 -chr7 54583170 . G GA 629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-3.097;DP=293;FS=6.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=2.15;ReadPosRankSum=2.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,64:273:99:667,0,5752 -chr7 54583470 . CAA C 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-1.231;DP=182;FS=4.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,56:146:99:1811,0,2490 -chr7 54583749 . AT A 1397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.691;DP=165;FS=3.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,85:130:99:1625,0,554 -chr7 54646164 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:232,0,435 -chr7 55000191 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:89:347,0,89 -chr7 55005233 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=1.531;DP=27;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,596 -chr7 55016764 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.476;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:452,0,2772 -chr7 55220161 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-1.642;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:232,0,990 -chr7 55220994 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.317;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:270,0,775 -chr7 55221033 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.199;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:284,0,834 -chr7 55221559 . A AT 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.773;DP=60;FS=3.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:654,0,976 -chr7 55222099 . TC T 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.623;DP=43;FS=7.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:321,0,481 -chr7 55235290 . C CT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-1.103;DP=71;FS=4.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:254,0,1057 -chr7 55236415 . G T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.112;DP=115;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,36:115:99:935,0,2909 -chr7 55265772 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.972;DP=152;FS=9.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,35:152:99:754,0,4539 -chr7 55265850 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=-0.862;DP=146;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,26:146:99:399,0,4441 -chr7 55282615 . C G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=2.959;DP=149;FS=5.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,27:148:99:407,0,4499 -chr7 55284618 . C T 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=-2.719;DP=101;FS=4.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,32:101:99:1081,0,5769 -chr7 55294193 . G A 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.307;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,44:157:99:1021,0,4168 -chr7 55294241 . A G 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-1.273;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,34:120:99:783,0,3047 -chr7 55377437 . G A 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.092;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=8.04;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,41:128:99:1057,0,3209 -chr7 55444910 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.732;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:821,0,3677 -chr7 55789653 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.329;DP=113;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,28:113:99:650,0,3174 -chr7 55790002 . C A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.320;DP=168;FS=0.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:750,0,4832 -chr7 55790934 . T C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-2.478;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:639,0,1054 -chr7 55794529 . G T 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=-0.090;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:1189,0,2270 -chr7 55795432 . A G 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.023;DP=176;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,51:176:99:1330,0,4888 -chr7 55795804 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.324;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:614,0,2446 -chr7 55796986 . T C 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.129;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,43:154:99:1034,0,3959 -chr7 55797049 . T C 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.366;DP=169;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=5.96;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,44:168:99:1035,0,4768 -chr7 55892170 . A C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.275;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:705,0,4531 -chr7 55892171 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.624;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:705,0,4531 -chr7 56068488 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.148;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:420,0,598 -chr7 56207281 . C G 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=5.803;DP=68;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=13.95;ReadPosRankSum=-4.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:977,0,1325 -chr7 56220954 . AGTAAGCTGATAAGATTATTGTTGTAATTATAGTTATATACGAGTATAAAAATAGCAATAAACATCTCGGGTATGTCCTGTCATCCCCCTATTATGTTTTTAG A 11335.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.433;DP=279;FS=3.438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,262:279:99:11373,1035,0 -chr7 56222549 . T C 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 -chr7 56222551 . GATTAAAAC G 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 -chr7 56222562 . T C 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 -chr7 56222564 . ATAC A 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 -chr7 56222568 . T G 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 -chr7 56222571 . AT A 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 -chr7 56222574 . TTTCTTTGCTTTAG T 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,0:5:99:1189,489,0 -chr7 56227698 . C CT 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=1.349;DP=53;FS=10.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.52;ReadPosRankSum=-3.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:893,0,632 -chr7 56280625 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr7 56281072 . G C 610.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.735;DP=42;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:13:639,13,0 -chr7 56281143 . A T 906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:935,66,0 -chr7 56590799 . A AT 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.153;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:284,0,1125 -chr7 56785265 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.673;DP=47;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:402,0,1126 -chr7 56839090 . T A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.033;DP=68;FS=13.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,22:68:99:623,0,1752 -chr7 56919303 . G T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=-1.117;DP=112;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,27:111:99:508,0,4316 -chr7 56919429 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.058;DP=107;FS=4.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:314,0,3999 -chr7 56920010 . T A 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.408;DP=119;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,40:119:99:1320,0,2825 -chr7 56923008 . A G 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=-1.049;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:823,0,2252 -chr7 56970266 . G GA 832.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=-0.356;DP=61;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,40:61:99:913,0,469 -chr7 57383048 . A C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.286;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:373,0,335 -chr7 57396554 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=-2.474;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:230,0,1206 -chr7 57411966 . AT A 383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:421,42,0 -chr7 57415618 . C CA 389.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.868;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:427,17,0 -chr7 57425692 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.284;DP=86;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:656,0,2342 -chr7 57425703 . CACCTGGAAAAAACACAACGATGTACAAATAGTATTGTGGCAGCCAGAACATGGTATTAATGGATTACAGGATTACGTCAAACTCTCACTT C 3412.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.953;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=34.75;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:3450,298,0 -chr7 57427996 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.560;DP=82;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:401,0,2453 -chr7 57430714 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=-0.096;DP=77;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:261,0,2312 -chr7 57659501 . C T 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-0.525;DP=85;FS=2.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,46:85:99:1523,0,1418 -chr7 57661374 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.455;DP=94;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,20:94:99:422,0,2819 -chr7 57661468 . A G 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-1.248;DP=101;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:1413,0,2147 -chr7 57661656 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=2.919;DP=64;FS=12.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=6.43;ReadPosRankSum=-3.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:440,0,1750 -chr7 57661674 . C T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=-0.956;DP=59;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:793,0,1352 -chr7 57662061 . G A 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.509;DP=63;FS=12.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:810,0,3177 -chr7 57662067 . A T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.524;DP=61;FS=14.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:810,0,3138 -chr7 57662706 . A G 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.687;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,33:102:99:860,0,2596 -chr7 57662838 . C A 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.995;DP=93;FS=2.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:1146,0,2277 -chr7 57662875 . T G 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-1.147;DP=71;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,38:71:99:1304,0,1175 -chr7 57662952 . C A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=1.743;DP=80;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=6.83;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:575,0,2239 -chr7 57663093 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.668;DP=113;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:326,0,3466 -chr7 57663583 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-2.339;DP=107;FS=4.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:820,0,2979 -chr7 57663959 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.018;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:365,0,3467 -chr7 57664287 . G A 1344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.806;DP=88;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1373,0,1660 -chr7 57664455 . C T 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.831;DP=89;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1525,0,1701 -chr7 57664530 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.772;DP=95;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:365,0,2965 -chr7 57664578 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.773;DP=117;FS=1.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:750,0,3175 -chr7 57664746 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-1.925;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:512,0,3541 -chr7 57664771 . A C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=-0.739;DP=125;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,28:123:99:597,0,3507 -chr7 57665799 . T C 2229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.198;DP=122;FS=3.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.28;ReadPosRankSum=3.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:2258,0,2246 -chr7 57668877 . A C 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-1.073;DP=54;FS=10.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:984,0,1002 -chr7 57669051 . T G 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.344;DP=93;FS=5.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:1385,0,1645 -chr7 57669516 . G A 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-2.735;DP=90;FS=26.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=11.84;ReadPosRankSum=3.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,32:90:99:1094,0,1951 -chr7 57669794 . GA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.851;DP=61;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:350,0,569 -chr7 57670560 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.172;DP=64;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:461,0,1748 -chr7 57671348 . T A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.893;DP=64;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:474,0,1637 -chr7 57672149 . A T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.693;DP=63;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:553,0,1619 -chr7 57672618 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=1.222;DP=62;FS=3.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:447,0,2221 -chr7 57672743 . AT A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.237;DP=72;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:320,0,2050 -chr7 57690425 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-0.549;DP=74;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:814,0,1738 -chr7 57690593 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.123;DP=70;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:397,0,2894 -chr7 57723812 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.059;DP=88;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:443,0,2567 -chr7 57730428 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.097;DP=111;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,24:111:99:456,0,3184 -chr7 57730612 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=2.881;DP=51;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:262,0,2323 -chr7 57730839 . C T 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=2.052;DP=76;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:1306,0,1391 -chr7 57730998 . G C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=-0.346;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:309,0,1373 -chr7 57731139 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.032;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:546,0,280 -chr7 57731208 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=1.336;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:322,0,430 -chr7 57731575 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=-0.444;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:327,0,1540 -chr7 57731804 . T G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.323;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:370,0,4414 -chr7 57736779 . C G 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.758;DP=340;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,63:340:99:886,0,10241 -chr7 57737103 . A C 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=1.844;DP=206;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,65:201:99:2079,0,11166 -chr7 57740625 . C G 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.456;DP=276;FS=0.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,77:276:99:1816,0,8060 -chr7 57743452 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=-0.139;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:478,0,608 -chr7 57744383 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=1.850;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:292,0,912 -chr7 57744733 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:297,0,886 -chr7 57744734 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:297,0,884 -chr7 57747067 . C T 2540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=1.202;DP=174;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=14.60;ReadPosRankSum=-1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,72:174:99:2569,0,3654 -chr7 57747123 . G T 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=2.256;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=17.78;ReadPosRankSum=2.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:3051,0,2948 -chr7 57747840 . T G 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.428;DP=235;FS=4.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,54:235:99:1180,0,7182 -chr7 57747950 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.031;ClippingRankSum=0.042;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,46:164:99:966,0,4485 -chr7 57791782 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.214;DP=47;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:257,0,1421 -chr7 57792194 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.540;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:270,0,685 -chr7 57792505 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.715;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:327,0,1061 -chr7 57847468 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:321,0,54 -chr7 58027854 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.436;DP=98;FS=11.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=2.95;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:317,0,3127 -chr7 58028296 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.178;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=3.07;ReadPosRankSum=3.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:369,0,3498 -chr7 58029968 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.516;DP=71;FS=5.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:333,0,2177 -chr7 58030141 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=3.478;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:571,0,1694 -chr7 58032316 . A G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.849;DP=49;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=7.18;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:380,0,3185 -chr7 58032992 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.639;DP=49;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:289,0,1503 -chr7 58033183 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.183;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:262,0,1205 -chr7 58033351 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.518;DP=59;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:261,0,1853 -chr7 58034317 . C A 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.411;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1211,0,1578 -chr7 58034494 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=-0.025;DP=62;FS=4.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:351,0,1673 -chr7 58041651 . A C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.068;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:676,0,1151 -chr7 58041788 . T G 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=1.686;DP=37;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:529,0,782 -chr7 58056829 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.402;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:374,0,973 -chr7 58276901 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.202;DP=52;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:412,0,1435 -chr7 58289409 . T C 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.175;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:700,0,533 -chr7 58311309 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.116;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:316,0,989 -chr7 58312718 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.559;DP=47;FS=7.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:321,0,1254 -chr7 58328471 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.442;DP=48;FS=2.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:242,0,1389 -chr7 58369223 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:301,0,326 -chr7 58463640 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=10.67;ReadPosRankSum=-2.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:231,0,442 -chr7 58501300 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:269,0,409 -chr7 58874440 . C CA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.105;DP=81;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:347,0,1536 -chr7 58934057 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,182 -chr7 58970803 . T G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.132;DP=26;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:390,0,398 -chr7 59030845 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.858;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:318,0,1549 -chr7 59123694 . G T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=1.116;DP=33;FS=6.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:287,0,890 -chr7 59124664 . GA G 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.015;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:331,0,972 -chr7 59131272 . TA T 1219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-2.018;DP=145;FS=6.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,53:138:99:1257,0,2158 -chr7 59131958 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.050;DP=223;FS=13.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,54:223:99:756,0,11662 -chr7 59132039 . TC T 696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=1.290;DP=201;FS=5.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,46:200:99:734,0,14834 -chr7 59132041 . A T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.558;DP=202;FS=5.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,47:202:99:728,0,14834 -chr7 59154989 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.370;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:252,0,915 -chr7 59157965 . G T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.746;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:431,0,477 -chr7 59164069 . A G 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=1.108;DP=171;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=4.12;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,37:171:99:732,0,5275 -chr7 59167582 . T G 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=-0.725;DP=159;FS=10.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,35:159:99:641,0,4856 -chr7 59172978 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,171 -chr7 59178679 . G A 3308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-1.791;DP=184;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,92:182:99:3337,0,3318 -chr7 59181122 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.525;DP=186;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,37:186:99:642,0,5732 -chr7 59206877 . C A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-1.129;DP=176;FS=1.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,29:176:99:420,0,11845 -chr7 59208271 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.174;DP=124;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:394,0,3879 -chr7 59208283 . A T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.305;DP=116;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,23:116:99:415,0,3563 -chr7 59459342 . C G 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.488;DP=93;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:1662,0,1620 -chr7 59459772 . A AT 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=1.175;DP=81;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:332,0,1855 -chr7 59459899 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.525;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:365,0,2031 -chr7 59460361 . AT A 845.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.165;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,36:54:99:883,0,392 -chr7 59460400 . C T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=1.298;DP=56;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:476,0,2401 -chr7 59461085 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=1.399;DP=65;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=22.01;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1459,0,1154 -chr7 59462279 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-2.306;DP=75;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:524,0,2140 -chr7 59463346 . T C 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.177;DP=54;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:643,0,1215 -chr7 59464066 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=14;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:398,0,212 -chr7 59964472 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-0.173;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:388,0,567 -chr7 59965891 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-1.618;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:675,0,2259 -chr7 59973017 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.989;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:272,0,2424 -chr7 60030577 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.084;DP=88;FS=2.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:503,0,2458 -chr7 60052364 . T G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.129;ClippingRankSum=-0.224;DP=73;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:446,0,2053 -chr7 60096090 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=2.166;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:265,0,102 -chr7 60096120 . A C 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 -chr7 60125782 . A T 1985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.723;DP=468;FS=6.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:364,104:468:99:2014,0,13903 -chr7 60140545 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=3.196;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:429,0,512 -chr7 60619344 . AGTACGTCTTACTCACTGAGGGGGTTATTTGCTAAAACATGTGTTAAAAAGTTTGTTTTAACTTTGTGTAATGTTTTGGTCAG A 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=1.540;DP=20;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.496;QD=27.79;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:593,0,818 -chr7 60621598 . T C 1486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.733;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=30.42;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:99:1515,105,0 -chr7 60621609 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.377;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:341,0,708 -chr7 60627070 . T A 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=1.247;DP=438;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:332,103:435:99:1943,0,12747 -chr7 60733663 . CT C 554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.436;DP=51;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:592,0,560 -chr7 60734918 . T G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.298;DP=46;FS=15.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:394,0,1247 -chr7 60734974 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-2.155;DP=50;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:244,0,1488 -chr7 60871981 . A AT 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.772;DP=46;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:680,0,768 -chr7 60880206 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=1.422;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:249,0,724 -chr7 60892772 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.382;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:395,0,578 -chr7 60892865 . T G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=9.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:402,0,1069 -chr7 60892867 . A C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-1.669;DP=23;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:402,0,1081 -chr7 60933819 . G T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.420;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:453,0,2881 -chr7 60934183 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-1.959;DP=51;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:465,0,1571 -chr7 60934254 . G T 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-1.322;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=17.10;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:661,0,1208 -chr7 60934877 . T G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.081;DP=92;FS=3.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:511,0,3716 -chr7 61062555 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,386 -chr7 61125827 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.720;DP=100;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,32:100:99:856,0,2595 -chr7 61281327 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.704;DP=96;FS=6.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:547,0,2779 -chr7 61295400 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.734;DP=93;FS=5.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:386,0,2840 -chr7 61406033 . T G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr7 61630924 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=12.93;ReadPosRankSum=2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:248,0,375 -chr7 61639704 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,262 -chr7 61643592 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:298,0,394 -chr7 61753139 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.630;DP=54;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:431,0,1426 -chr7 61753346 . C A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.522;DP=89;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:723,0,2545 -chr7 61756145 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.286;DP=104;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:287,0,3283 -chr7 61960244 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-2.192;DP=50;FS=4.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:274,0,1500 -chr7 61966554 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=1.519;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:592,0,1944 -chr7 61970418 . A C 2536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2565,184,0 -chr7 61989708 . A C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.756;DP=66;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:399,0,1790 -chr7 62036085 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=2.321;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:446,0,1867 -chr7 62057276 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.216;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:259,0,1393 -chr7 62059460 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.610;DP=73;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=3.00;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:247,0,3638 -chr7 62059463 . A G 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.337;DP=73;FS=4.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:1286,0,1149 -chr7 62059490 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-0.811;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:281,0,2015 -chr7 62070672 . A G 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=1.309;DP=51;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:748,0,920 -chr7 62123409 . A T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.116;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:529,0,1039 -chr7 62337426 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.818;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,327 -chr7 62361869 . A C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr7 62361917 . G T 298.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.21;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:17:327,17,0 -chr7 62363232 . C T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:445,30,0 -chr7 62363239 . C A 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:445,30,0 -chr7 62425681 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:310,0,287 -chr7 62620142 . G A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-2.476;DP=122;FS=2.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,30:121:99:767,0,3397 -chr7 62620238 . G A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=1.196;DP=117;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,33:117:99:761,0,3108 -chr7 62630498 . C T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.114;DP=127;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,32:127:99:717,0,3617 -chr7 62630534 . C T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-3.513;DP=132;FS=7.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:890,0,3645 -chr7 62631731 . G A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-0.161;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,37:140:99:647,0,4006 -chr7 62638195 . T C 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.412;DP=126;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,38:126:99:953,0,3103 -chr7 62643432 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=-0.002;DP=148;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,48:148:99:1208,0,3752 -chr7 62646341 . A G 2347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.995;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:2376,0,3642 -chr7 62646347 . C A 2353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.193;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:2382,0,3642 -chr7 62649939 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.072;DP=72;FS=5.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:642,0,1880 -chr7 62652271 . A T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=1.348;DP=44;FS=2.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:371,0,1500 -chr7 62845511 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.081;DP=46;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:542,0,1070 -chr7 62847668 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-1.085;DP=44;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:540,0,929 -chr7 62848302 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DP=56;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:304,0,1639 -chr7 62849562 . AC A 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.899;DP=30;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:481,0,416 -chr7 62849807 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-2.356;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,542 -chr7 62850593 . A C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=-0.127;DP=19;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,484 -chr7 62852620 . G T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=1.575;DP=37;FS=7.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:437,0,897 -chr7 62854297 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=24.86;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:426,0,167 -chr7 62855107 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,152 -chr7 63058058 . C T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:336,24,0 -chr7 64015046 . A G 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:527,39,0 -chr7 64100775 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.850;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:519,0,597 -chr7 64100967 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:286,0,562 -chr7 65356929 . G T 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-1.486;DP=143;FS=8.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,48:141:99:1598,0,3188 -chr7 65446491 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.669;DP=31;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:398,0,666 -chr7 65555930 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:249,18,0 -chr7 65586048 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=1.492;DP=58;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1088,0,901 -chr7 65603058 . G T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.494;DP=53;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:448,0,1409 -chr7 65623892 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=1.438;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.482;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:302,0,1391 -chr7 65624545 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.776;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:340,0,1036 -chr7 65625345 . T G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.903;DP=33;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=13.02;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:458,0,712 -chr7 65632630 . C G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.265;DP=37;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:231,0,1048 -chr7 65632722 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-0.234;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:440,0,922 -chr7 65632785 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-1.257;DP=32;FS=6.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:241,0,855 -chr7 65674316 . TCTGTAAATAACGTGTTTTGATGTATTGTCACGCAAACAAGATCTTTTCTGAAGTTTTACCATCTAAAAAAAACAAGATAAAGTTGTACCATAC T 1609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=2.625;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,44:47:99:1862,0,480 -chr7 65674939 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.474;DP=67;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=6.15;ReadPosRankSum=-2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:440,0,1955 -chr7 65675803 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-1.009;DP=65;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:233,0,1919 -chr7 65681076 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.159;DP=53;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:278,0,1611 -chr7 65691940 . G GT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=0.958;DP=277;FS=4.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=0.82;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,56:257:99:265,0,6664 -chr7 65692106 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.357;DP=79;FS=8.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:673,0,2159 -chr7 65718760 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.629;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:241,0,882 -chr7 65726130 . CCCTTTAACACAAAATGTAGACAACGTCAGAGCAACCTGGTGAACATCAAAACGTGTTGAGTATGACTGACTGTGTATTGCCTCA C 1751.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.133;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=33.28;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1789,155,0 -chr7 65850439 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:230,0,428 -chr7 66011132 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.976;DP=34;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:245,0,965 -chr7 66014380 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=0.230;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:252,0,2929 -chr7 66016916 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=-0.347;DP=55;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:307,0,1661 -chr7 66019664 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-0.663;DP=22;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,268 -chr7 66020739 . T C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:243,18,0 -chr7 66020771 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:285,0,299 -chr7 66020774 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:243,0,428 -chr7 66396841 . T TG 220.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 -chr7 66653815 . T A 693.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.154;DP=40;FS=8.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:731,0,284 -chr7 66821232 . A AT 620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-1.040;DP=235;FS=5.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,60:208:99:658,0,8152 -chr7 66821918 . C CT 1640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.034;DP=248;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,86:224:99:1678,0,2889 -chr7 66822045 . G GA 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-1.913;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:468,0,4923 -chr7 66834880 . T A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.191;DP=35;FS=12.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:409,0,819 -chr7 66835740 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.309;DP=78;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:566,0,1872 -chr7 66856290 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.354;DP=64;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:841,0,1394 -chr7 66954049 . G A 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.422;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:689,0,1190 -chr7 66961458 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=-3.153;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,264 -chr7 66965237 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.499;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:271,0,1110 -chr7 66965826 . C A 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.808;DP=45;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:592,0,1337 -chr7 67000028 . A G 2988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.569;DP=406;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,120:406:99:3017,0,10740 -chr7 67015322 . C T 3777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.615;DP=319;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,111:319:99:3806,0,7293 -chr7 67030383 . C T 3975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=1.377;DP=338;FS=0.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,125:337:99:4004,0,6932 -chr7 67033902 . C CA 1327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.246;DP=145;FS=6.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1365,0,1407 -chr7 67095269 . C A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr7 67096828 . GA G 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.270;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:276,0,494 -chr7 67112887 . G C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:372,0,353 -chr7 67113498 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.205;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:487,0,359 -chr7 67114473 . T C 239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 -chr7 67114508 . A T 392.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:459,34,0 -chr7 67114749 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.471;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:363,0,1076 -chr7 67114756 . G T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.092;DP=28;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:488,0,892 -chr7 67114772 . T A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.231;DP=26;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=17.99;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:496,0,446 -chr7 67114827 . A AT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.909;DP=16;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:78:248,0,78 -chr7 67116156 . T A 216.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr7 67116235 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 67288444 . A T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-1.409;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:474,0,4164 -chr7 67288449 . C A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.345;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:487,0,4164 -chr7 67305465 . AAGGTGCTTCACTTCATCCATCATGCGTTGTCGGAATTTATTTTCTGTGTTATTCATTTACTCTCTTATTGTGTTTATTTATTTTGC A 4200.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.897;DP=96;FS=2.132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=26.79;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,85:88:99:4238,448,0 -chr7 67321515 . GAAGGTAACATGCAATATGGAGGATATGGATAATATGCAACTTGAATGATGAGAGTCCTAATGTGTTTTTTTTTTTCTTTTGAACTC G 6144.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-3.254;DP=164;FS=11.069;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=27.43;ReadPosRankSum=2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,134:143:99:6182,501,0 -chr7 67325991 . C T 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.110;DP=128;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,45:128:99:1424,0,2610 -chr7 67328564 . GA G 3411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.375;DP=192;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,129:176:99:3449,0,849 -chr7 67328610 . TA T 1544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=2.485;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1582,0,1475 -chr7 67329002 . AAG A 3204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=2.357;DP=278;FS=58.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.794;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,91:271:99:3242,0,6700 -chr7 67332553 . GCTGGGAGAATTGAGAGGTTAAACCAACTGTACACCAACTAAACTTTAACAAACGCCTTCAATAGAAACAGTCAGCCATAC G 10726.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=1.745;DP=352;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,334:340:99:10764,947,0 -chr7 67410910 . C A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr7 67478515 . A G 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:439,33,0 -chr7 67938300 . C CA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-1.552;DP=48;FS=8.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:362,0,574 -chr7 67938398 . GT G 1197.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-2.118;DP=112;FS=5.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1235,0,1203 -chr7 67947621 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:270,0,62 -chr7 67978302 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.702;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:295,0,1110 -chr7 67978354 . C G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.071;DP=39;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:572,0,831 -chr7 68111117 . C T 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=1.201;DP=24;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=33.09;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:51:881,51,0 -chr7 68111693 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-3.224;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:270,0,316 -chr7 68111776 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=1.033;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:620,0,374 -chr7 68111835 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-3.065;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,329 -chr7 68131008 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:230,0,90 -chr7 68131738 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-2.653;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:477,0,893 -chr7 68543764 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,303 -chr7 68773905 . G T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.606;DP=56;FS=6.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:491,0,1490 -chr7 69123099 . GCCTGTTAAAAAAAAAAATAATAATCACAGAATTTTTCATTTAGCACATAAACTGTTTTTATATTACTGTACGAGTCTGGACAGGGCCTGAAAGTGTAGATCCAAA G 2833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=2.481;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,67:72:99:2871,254,0 -chr7 69217941 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.231;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:521,0,151 -chr7 69219167 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:372,0,206 -chr7 69220152 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,300 -chr7 69220575 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:317,0,181 -chr7 69220711 . T G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.519;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:428,0,447 -chr7 69220785 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.943;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:332,0,324 -chr7 69220871 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:327,0,260 -chr7 69493760 . T C 1641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=7.823;DP=331;FS=9.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=4.96;ReadPosRankSum=3.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,79:331:99:1670,0,10036 -chr7 69516628 . CTT C 264.44 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.118;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:313,0,132 -chr7 69530355 . T C 8149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.834;DP=490;FS=5.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,248:490:99:8178,0,8084 -chr7 69798894 . T TAA 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.065;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:537,0,108 -chr7 69800321 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=2.298;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:422,0,525 -chr7 69800328 . G T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:427,0,525 -chr7 69833044 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.723;DP=59;FS=9.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1091,0,966 -chr7 69849690 . GT G 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.180;DP=25;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=19.15;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:516,0,123 -chr7 69850286 . CA C 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:255,0,102 -chr7 69896668 . GCTGGAACACACAGTTAGCCGCTCATGGTTGTCTGCAGTTCTTCATATGTTACATGTTATAGTGGAGAGTTTAC G 691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.235;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:729,0,1822 -chr7 69896769 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:386,0,370 -chr7 69912507 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:351,0,489 -chr7 70371093 . G T 3567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=-1.926;DP=145;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=24.61;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,97:145:99:3596,0,1203 -chr7 70376551 . A G 3483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-0.507;DP=209;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.401;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,107:209:99:3512,0,3612 -chr7 70377045 . AAT A 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.157;DP=97;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:302,0,3131 -chr7 70377357 . G A 2394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=-1.461;DP=146;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:2423,0,2690 -chr7 70377971 . A T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:485,0,615 -chr7 70378139 . C G 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-0.175;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=30.69;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:642,0,106 -chr7 70379094 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:328,0,351 -chr7 70379355 . T G 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:534,39,0 -chr7 70380348 . G T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=1.164;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:364,0,344 -chr7 70381102 . C A 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.212;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:712,0,1028 -chr7 70400010 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.343;DP=39;FS=10.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:438,0,995 -chr7 70494198 . A G 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.233;DP=102;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:1486,0,1909 -chr7 70496904 . A C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=1.337;DP=91;FS=5.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:396,0,2627 -chr7 70648257 . GT G 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=1.736;DP=105;FS=3.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,33:95:99:617,0,954 -chr7 70648380 . CT C 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.788;DP=95;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:329,0,1786 -chr7 70648996 . GTT G 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-1.359;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:316,0,189 -chr7 70649443 . T TA 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.280;DP=68;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=7.01;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,43:61:99:759,0,299 -chr7 70649707 . G C 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.277;DP=178;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,49:178:99:1173,0,4901 -chr7 71196830 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.065;DP=33;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:483,0,493 -chr7 71201402 . T C 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr7 71313480 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr7 72102446 . T A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-2.834;DP=65;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:273,0,1079 -chr7 72306434 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:39:496,0,39 -chr7 72306569 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:33:444,33,0 -chr7 72552173 . A C 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.185;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:2069,0,2074 -chr7 72645962 . C CA 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.328;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,35:125:99:539,0,2444 -chr7 72657996 . TTACAAATGTAAA T 236.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:31:274,31,0 -chr7 72818680 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-1.159;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:499,0,812 -chr7 72818764 . A AT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.049;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:247,0,609 -chr7 73844410 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-0.638;DP=25;FS=18.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:331,0,675 -chr7 73844517 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=1.248;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:521,0,318 -chr7 73846986 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:230,0,63 -chr7 73847006 . T C 330.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=33.09;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:359,0,14 -chr7 73976022 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:277,0,59 -chr7 73982722 . ACTGAGACACAGAAAGAGCAGGTTGAGAATGAAGAACGAATCTCATGATTAAGGAGCAGATTGAAGTGTGTGTGCTCTTAC A 3567.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.953;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=29.60;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:3605,259,0 -chr7 73983327 . G A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-1.333;DP=71;FS=8.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,41:71:99:1388,0,1111 -chr7 73992857 . G A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.204;DP=108;FS=3.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:1564,0,2136 -chr7 74357162 . T C 2688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=1.943;DP=298;FS=7.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,97:282:99:2717,0,8424 -chr7 74357187 . T C 2033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=1.140;DP=303;FS=3.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,95:294:99:2062,0,10350 -chr7 74357367 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=2.670;DP=94;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=6.07;ReadPosRankSum=-2.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:599,0,3881 -chr7 74357380 . T C 2552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=-0.831;DP=102;FS=10.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=25.03;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,63:101:99:2581,0,1529 -chr7 74357383 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-2.677;DP=111;FS=5.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:495,0,4282 -chr7 74580693 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=-1.044;DP=50;FS=8.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:638,0,2527 -chr7 74580696 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-1.808;DP=51;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:638,0,2548 -chr7 74594680 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.240;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:267,0,2418 -chr7 74610041 . A G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=1.165;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:703,0,1427 -chr7 74644812 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.629;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=22.32;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:720,0,899 -chr7 74668842 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr7 74736264 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:311,0,380 -chr7 74753440 . A G 308.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:337,0,13 -chr7 74756832 . TG T 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.181;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:368,0,225 -chr7 74839940 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:371,0,125 -chr7 75007006 . G C 4078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=1.252;DP=163;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=25.02;ReadPosRankSum=3.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,111:163:99:4107,0,1359 -chr7 75007018 . C T 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.249;DP=162;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,64:162:99:2146,0,3271 -chr7 75014541 . G C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-1.569;DP=171;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,48:171:99:855,0,7243 -chr7 75014674 . G T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-2.631;DP=94;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:1261,0,3402 -chr7 75015371 . A AT 923.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=-2.278;DP=167;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,51:167:99:961,0,3582 -chr7 75015898 . G GA 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.917;DP=93;FS=11.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:669,0,872 -chr7 75111942 . T C 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:592,42,0 -chr7 75111966 . G A 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:598,42,0 -chr7 75112125 . T C 610.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:639,45,0 -chr7 75112230 . A G 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:766,54,0 -chr7 75364108 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.549;DP=32;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:280,0,788 -chr7 75420310 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-1.351;DP=33;FS=10.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:541,0,562 -chr7 75455348 . C G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.210;DP=49;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:372,0,1347 -chr7 75457909 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.586;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:318,0,932 -chr7 75463158 . T A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-1.469;DP=94;FS=5.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:401,0,5852 -chr7 75463159 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-1.384;DP=94;FS=5.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:401,0,5852 -chr7 75468831 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=-0.814;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,19:112:99:262,0,3641 -chr7 75484261 . C CT 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.165;DP=166;FS=3.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=3.25;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,48:153:99:732,0,2390 -chr7 75555942 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.537;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:365,0,1356 -chr7 75555954 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=-1.734;DP=53;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:624,0,1330 -chr7 75708140 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-0.142;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:601,0,356 -chr7 75723667 . G A 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=0.558;DP=99;FS=15.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:1451,0,1910 -chr7 75733564 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:387,0,126 -chr7 75737187 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:315,0,328 -chr7 75750265 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-0.381;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:458,0,356 -chr7 76059246 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=2.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=16.48;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:259,0,250 -chr7 76406353 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:273,0,60 -chr7 76575445 . A G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr7 76619784 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.322;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:342,0,1078 -chr7 76654234 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.031;DP=111;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,28:111:99:667,0,3216 -chr7 76654395 . GC G 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-0.716;DP=120;FS=7.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,29:117:99:557,0,2988 -chr7 76654975 . T TA 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-3.947;DP=87;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,28:83:99:413,0,1490 -chr7 76686670 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.826;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:346,0,1399 -chr7 76692630 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.290;DP=56;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:240,0,1640 -chr7 76693281 . G T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.843;DP=52;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:479,0,2813 -chr7 76696308 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.306;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:378,0,1175 -chr7 76724075 . TCTGAAGAGAAAACAACAACGTTCAGTCATTTTGAGCATGGAAAAGTCAGTCTGAGTGTCAAACATGGCAGTTGCTGTTCTCAGATCAGTGTTTAC T 16211.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.812;DP=362;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=28.58;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,359:362:99:16249,1423,0 -chr7 76784928 . GC G 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.764;DP=56;FS=9.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:247,0,1615 -chr7 76787622 . G C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.199;DP=67;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:290,0,2136 -chr7 76788778 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.981;DP=80;FS=6.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,14:80:99:253,0,4446 -chr7 76823327 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=-1.140;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:301,0,352 -chr7 76834215 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=2.264;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,393 -chr7 76834227 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:288,0,400 -chr7 76839843 . G C 2356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-0.603;DP=84;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,57:84:99:2385,0,2151 -chr7 76849380 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:243,0,169 -chr7 76859954 . A T 381.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.159;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:441,0,10 -chr7 76860059 . G C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=1.286;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:351,0,379 -chr7 76960758 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.022;DP=30;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:284,0,721 -chr7 76961237 . CT C 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.566;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:280,0,104 -chr7 76964423 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=1.827;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=20.78;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:340,0,210 -chr7 76965022 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:372,0,397 -chr7 76971870 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.152;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,364 -chr7 76972595 . A T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.728;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,26:98:99:702,0,5652 -chr7 76988267 . C T 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.838;DP=141;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:1592,0,2920 -chr7 76990660 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.512;DP=120;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,22:120:99:314,0,3763 -chr7 77013256 . A G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=-3.108;DP=204;FS=10.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,35:203:99:508,0,12575 -chr7 77013263 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-3.373;DP=192;FS=6.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,28:191:99:512,0,12575 -chr7 77018329 . C A 3297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.139;DP=187;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,94:187:99:3326,0,4250 -chr7 77018831 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.055;DP=148;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,24:147:99:277,0,4678 -chr7 77022187 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.777;DP=200;FS=0.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:1230,0,5794 -chr7 77026104 . A G 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.235;DP=116;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,31:113:99:1270,0,6986 -chr7 77029841 . A AGT 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-2.028;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=2.33;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,32:140:99:477,0,3304 -chr7 77047809 . GCAGGTCAGAGTGTGTTTCTGTCTGCCTGTGTGTTATCATTCAGCGTGTGTGTTATTATAGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGCA G 5126.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.128;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=31.52;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,104:106:99:5164,417,0 -chr7 77095292 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.545;DP=271;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,70:270:99:1570,0,7484 -chr7 77096472 . G A 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.316;DP=273;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,64:273:99:1217,0,7518 -chr7 77097509 . C T 1905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.666;ClippingRankSum=-1.603;DP=310;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,91:308:99:1934,0,7856 -chr7 77098437 . CTG C 2810.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,1:8:99:2848,164,0 -chr8 102807 . A T 1528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.831;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=23.52;ReadPosRankSum=2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,45:65:99:1557,0,486 -chr8 136269 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.556;DP=35;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:668,0,458 -chr8 145499 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,104 -chr8 250727 . C G 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.762;DP=113;FS=3.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,32:113:99:813,0,3040 -chr8 267722 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=-0.383;DP=91;FS=7.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:690,0,2304 -chr8 268540 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=1.850;DP=76;FS=3.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:565,0,2029 -chr8 268561 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.672;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:685,0,4416 -chr8 268622 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-1.115;DP=88;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.20;ReadPosRankSum=2.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:750,0,2203 -chr8 271307 . A C 2892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-2.472;DP=104;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,79:104:99:2921,0,495 -chr8 289573 . G T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.547;DP=154;FS=0.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,38:154:99:677,0,4183 -chr8 289716 . G A 2304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.382;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:2333,0,2359 -chr8 289833 . C T 1068.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.349;DP=74;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1106,0,1369 -chr8 290142 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=3.706;DP=91;FS=4.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=6.05;ReadPosRankSum=-2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:579,0,2454 -chr8 290172 . C T 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=-1.899;DP=121;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,48:121:99:1594,0,2463 -chr8 290328 . C G 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.711;DP=138;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1972,0,2470 -chr8 290973 . C T 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-1.024;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1473,0,1514 -chr8 291054 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.447;DP=108;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:374,0,7049 -chr8 291063 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-0.634;DP=106;FS=3.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:99:375,0,7049 -chr8 292110 . TC T 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.279;DP=81;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:348,0,1924 -chr8 313118 . G T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=1.013;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:314,0,948 -chr8 316178 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.905;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:233,0,291 -chr8 318741 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,799 -chr8 319110 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.280;DP=40;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:247,0,1040 -chr8 319319 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=-0.011;DP=51;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:308,0,1395 -chr8 333183 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:294,0,204 -chr8 333617 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.467;DP=39;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:564,0,727 -chr8 333753 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=1.194;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:467,0,266 -chr8 340612 . C G 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=1.599;DP=42;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:675,0,702 -chr8 356409 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.222;DP=37;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:232,0,1010 -chr8 367569 . T C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.585;DP=44;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:602,0,841 -chr8 367652 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.415;DP=50;FS=2.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:332,0,1893 -chr8 377559 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.739;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:378,0,454 -chr8 387096 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=1.204;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:268,0,1751 -chr8 393152 . G A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.381;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:780,0,1295 -chr8 393197 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.345;DP=54;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:323,0,1498 -chr8 397802 . A T 348.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=31.69;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:376,0,7 -chr8 398157 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.743;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:289,0,1374 -chr8 398158 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.487;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:401,0,1199 -chr8 413046 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.125;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:625,0,3885 -chr8 413894 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=-1.246;DP=79;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.597;QD=10.53;ReadPosRankSum=2.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:860,0,1821 -chr8 442437 . T C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.215;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:411,0,394 -chr8 446440 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,158 -chr8 446444 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,158 -chr8 447332 . C T 7848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.485;DP=311;FS=27.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,223:311:99:7877,0,1990 -chr8 447520 . C A 636.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=31.26;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:21:665,21,0 -chr8 448343 . G A 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.808;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,46:56:99:1691,0,165 -chr8 452203 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.979;DP=15;FS=12.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:325,0,103 -chr8 458493 . G A 2815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-1.197;DP=204;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=13.80;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,86:204:99:2844,0,3721 -chr8 461067 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.435;DP=66;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:230,0,1976 -chr8 461367 . C T 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-3.438;DP=94;FS=3.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.273;QD=16.28;ReadPosRankSum=2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:1559,0,1587 -chr8 461570 . A G 259.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:18:288,0,18 -chr8 461675 . G T 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.078;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,42:70:99:1383,0,936 -chr8 467713 . GGCAGGTAACGTCTGCATGACTGCTCTCCCCCGCCGCATGCCCGCGCTCACTCTGCTTCTGCTCT G 6873.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=3.392;DP=236;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=29.13;ReadPosRankSum=-4.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,200:236:99:7556,0,8212 -chr8 471222 . C A 255.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:284,0,16 -chr8 471645 . C G 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.417;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,55:256:99:997,0,7305 -chr8 473187 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.805;DP=27;FS=9.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:407,0,454 -chr8 473296 . ACACAC A 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.077;DP=36;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:363,0,554 -chr8 479247 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.266;DP=45;FS=11.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.074;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:633,0,908 -chr8 485305 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:303,0,358 -chr8 489970 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.042;DP=56;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:802,0,999 -chr8 494600 . T TAC 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:71:259,0,71 -chr8 498254 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-2.364;DP=85;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1131,0,1728 -chr8 499800 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=4.299;DP=29;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=15.16;ReadPosRankSum=-3.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:468,0,400 -chr8 500040 . C T 2651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-1.834;DP=95;FS=10.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=27.91;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,74:95:99:2680,0,427 -chr8 505542 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.206;DP=97;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:415,0,3021 -chr8 505599 . T G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=1.270;DP=155;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,33:155:99:612,0,4475 -chr8 539841 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:82:244,0,82 -chr8 542302 . TGA T 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr8 579893 . TA T 214.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:30:252,0,30 -chr8 579975 . C T 997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.187;DP=19;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:72:1026,72,0 -chr8 581030 . G C 1383.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-2.533;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=30.08;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:2:1410,0,2 -chr8 581123 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=-0.423;DP=49;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:307,0,978 -chr8 581127 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.047;DP=47;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:594,0,541 -chr8 581471 . G C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr8 581687 . T C 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:310,21,0 -chr8 581804 . G T 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:21:310,21,0 -chr8 581897 . G T 280.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:25:309,25,0 -chr8 581925 . TA T 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=34.10;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:85:276,0,85 -chr8 581964 . A G 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:55:757,55,0 -chr8 582024 . C T 2112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2141,150,0 -chr8 582140 . T C 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=1.516;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=28.15;ReadPosRankSum=-1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:41:1098,0,41 -chr8 582243 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:256,0,271 -chr8 582620 . G A 1241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:92:1270,92,0 -chr8 582664 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.141;DP=33;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:381,0,750 -chr8 583040 . A C 1983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:90:2012,90,0 -chr8 583166 . C T 1980.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.087;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:87:2009,87,0 -chr8 583265 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.521;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,444 -chr8 583422 . C G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:260,18,0 -chr8 583436 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:260,18,0 -chr8 584401 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-1.224;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:326,0,1062 -chr8 584429 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=-0.787;DP=42;FS=12.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:530,0,896 -chr8 585924 . C T 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.601;DP=53;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:994,0,751 -chr8 595174 . A G 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.050;DP=36;FS=7.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:735,0,858 -chr8 644610 . G T 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr8 657570 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:278,0,55 -chr8 661134 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:363,0,54 -chr8 661773 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-2.069;DP=19;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,283 -chr8 661809 . T G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.076;DP=16;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:85:486,0,85 -chr8 662335 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=1.027;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,272 -chr8 662849 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:293,0,96 -chr8 697695 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=22.08;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:249,0,220 -chr8 733761 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=1.248;DP=22;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:403,0,406 -chr8 773416 . ATG A 836.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.295;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:874,0,995 -chr8 773989 . T C 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:555,39,0 -chr8 775005 . T G 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:63:881,63,0 -chr8 776002 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-1.101;DP=24;FS=7.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:415,0,835 -chr8 776003 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:415,0,835 -chr8 776249 . C CTT 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-1.395;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:406,0,566 -chr8 777745 . TA T 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.753;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:267,0,403 -chr8 986373 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=-2.346;DP=100;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,32:100:99:740,0,2502 -chr8 992951 . C T 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.355;DP=106;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:1607,0,1958 -chr8 993255 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:318,0,57 -chr8 1120115 . C G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:273,0,395 -chr8 1134211 . C T 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.115;DP=66;FS=8.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:1149,0,1203 -chr8 1135185 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.118;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:907,0,1140 -chr8 1139451 . A AT 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.208;DP=28;FS=12.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:275,0,586 -chr8 1139532 . T A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.155;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:433,0,623 -chr8 1182018 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:280,0,184 -chr8 1182436 . C T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:244,18,0 -chr8 1198853 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.416;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:343,0,540 -chr8 1202411 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.195;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=27.40;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:768,0,562 -chr8 1279972 . T A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-2.620;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=28.67;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:401,0,209 -chr8 1280005 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:401,0,209 -chr8 1280624 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.98;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,109 -chr8 1281868 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=1.746;DP=44;FS=8.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:883,0,530 -chr8 1283091 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.343;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:669,0,1298 -chr8 1288166 . G A 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=-1.618;DP=58;FS=7.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:924,0,747 -chr8 1291617 . C T 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 -chr8 1292938 . A C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:95:233,0,95 -chr8 1295924 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.943;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.24;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:288,0,287 -chr8 1298850 . TA T 303.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:341,36,0 -chr8 1327746 . G A 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-5.118;DP=226;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=6.44;ReadPosRankSum=4.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,62:226:99:1483,0,6083 -chr8 1333305 . C T 4016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-1.931;DP=256;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,113:256:99:4045,0,4861 -chr8 1335743 . T A 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=1.181;DP=84;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:1226,0,1439 -chr8 1335822 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.366;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=15.11;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:678,0,1487 -chr8 1335826 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.960;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=17.56;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:678,0,1517 -chr8 1343122 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,172 -chr8 1358634 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-1.273;DP=47;FS=6.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:551,0,1003 -chr8 1908294 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-2.007;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:362,0,351 -chr8 1964663 . A G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:18:267,18,0 -chr8 1964883 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:99:577,0,121 -chr8 1964887 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:99:577,0,121 -chr8 1964939 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=1.951;DP=49;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:577,0,121 -chr8 1965460 . G C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=1.556;DP=63;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:264,0,1001 -chr8 1965477 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.328;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:270,0,957 -chr8 2145973 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:281,0,265 -chr8 2435295 . G C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-2.501;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:351,0,684 -chr8 2504107 . A G 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.306;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=27.29;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:1120,0,309 -chr8 2534579 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=21.21;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:516,0,278 -chr8 2591801 . G A 5025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=1.889;DP=402;FS=3.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=12.50;ReadPosRankSum=2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,148:402:99:5054,0,8514 -chr8 2603069 . C G 2382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.987;DP=316;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,95:289:99:2411,0,7225 -chr8 2655997 . C T 271.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.696;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:300,0,16 -chr8 2656757 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:274,0,103 -chr8 2656774 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.98;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:268,0,101 -chr8 2662376 . C T 4665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.585;ClippingRankSum=0.759;DP=559;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:386,172:558:99:4694,0,15043 -chr8 2666492 . C CT 651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;ClippingRankSum=0.352;DP=113;FS=5.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,34:99:99:689,0,1495 -chr8 2673912 . T C 5604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.486;DP=657;FS=10.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=8.53;ReadPosRankSum=3.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:443,213:656:99:5633,0,16548 -chr8 2684861 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-0.329;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,23:103:99:500,0,3232 -chr8 2685208 . T A 2322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.243;DP=143;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:2351,0,2519 -chr8 2693210 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=-0.738;DP=235;FS=10.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,42:235:99:642,0,7354 -chr8 2710512 . G T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.823;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:447,0,3314 -chr8 2724133 . A G 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.381;DP=50;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:927,0,804 -chr8 2724163 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.040;DP=75;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:254,0,2337 -chr8 2724781 . A C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.099;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:429,0,1685 -chr8 2729991 . G A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-1.905;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:560,0,1085 -chr8 2735856 . G T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.206;DP=79;FS=6.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:710,0,2104 -chr8 2749750 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-1.768;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:276,0,1516 -chr8 2760858 . G T 4944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.513;DP=257;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,147:257:99:4973,0,3870 -chr8 2763708 . ACTGAAACACAAGAGAGATGGGGAGTTATTGAAATGCTAAGATTCTGACTTGCATAAATGAAATGAAAACTTCTACCACTTAC A 12316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=2.433;DP=322;FS=6.743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=21.42;ReadPosRankSum=-2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,293:295:99:12354,1061,0 -chr8 2766633 . G A 3551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=1.551;DP=288;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=12.33;ReadPosRankSum=2.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,106:286:99:3580,0,6143 -chr8 2772071 . T A 1016.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1045,72,0 -chr8 2772115 . T A 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:681,48,0 -chr8 2772570 . A G 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 -chr8 2772583 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr8 2772637 . A G 1720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1749,117,0 -chr8 2777546 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.477;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:325,0,522 -chr8 2782448 . C G 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-2.854;DP=80;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=12.18;ReadPosRankSum=-2.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1003,0,1600 -chr8 2782474 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=4.661;DP=66;FS=7.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=5.51;ReadPosRankSum=-1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:392,0,3956 -chr8 2782477 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=4.451;DP=72;FS=7.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:392,0,3956 -chr8 2895306 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.037;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:465,0,231 -chr8 2915626 . A AG 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.334;DP=61;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:452,0,447 -chr8 2955080 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,263 -chr8 2964853 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.402;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:260,0,390 -chr8 2968253 . A G 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.987;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:556,0,516 -chr8 2968372 . A G 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.95;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:99:706,0,130 -chr8 2968374 . A G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=19;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:705,0,156 -chr8 2968483 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,14:14:99:705,0,156 -chr8 2968578 . C G 1188.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:90:1217,90,0 -chr8 2968632 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.347;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:283,0,901 -chr8 2968718 . G GC 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.482;DP=56;FS=10.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:424,0,211 -chr8 2969051 . A G 1082.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.208;DP=38;FS=5.528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:75:1111,75,0 -chr8 2969074 . T C 1661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.908;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1690,123,0 -chr8 2969492 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,287 -chr8 2970246 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.975;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:321,0,359 -chr8 2970258 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=2.245;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:311,0,379 -chr8 3072360 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=15.98;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:236,0,209 -chr8 3072697 . GA G 261.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-1.086;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:23:299,0,23 -chr8 3077351 . TA T 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:256,0,420 -chr8 3254203 . G T 1730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.544;DP=142;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,54:142:99:1759,0,2811 -chr8 3258917 . A T 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=1.054;DP=133;FS=17.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,46:131:99:1477,0,2847 -chr8 3266816 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.250;DP=57;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:331,0,1815 -chr8 3267074 . T A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=1.511;DP=47;FS=9.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:494,0,3405 -chr8 3269808 . T TG 781.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.157;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:819,0,1503 -chr8 3696259 . T C 1349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-0.290;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=17.09;ReadPosRankSum=3.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:1378,0,2925 -chr8 3696262 . A C 1349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.057;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1378,0,2958 -chr8 3713794 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=2.612;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:330,0,2200 -chr8 3713994 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.907;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:660,0,1875 -chr8 3716142 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.549;DP=48;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=8.64;ReadPosRankSum=-2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:443,0,1004 -chr8 3716161 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=1.381;DP=40;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:460,0,741 -chr8 3716262 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.646;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:396,0,404 -chr8 3716287 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.585;DP=34;FS=9.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:320,0,832 -chr8 3717970 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=-0.008;DP=57;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=13.54;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:800,0,1168 -chr8 3718017 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=-0.382;DP=44;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:297,0,1359 -chr8 3718232 . G C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.824;DP=47;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:753,0,904 -chr8 3719623 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=34.47;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:304,0,191 -chr8 3733629 . A G 2002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.502;DP=185;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,62:185:99:2031,0,4176 -chr8 3733659 . A T 2401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.726;DP=195;FS=0.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,71:195:99:2430,0,4287 -chr8 3758487 . C T 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.410;DP=160;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,58:160:99:1972,0,3581 -chr8 3761606 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=4.149;DP=120;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=3.96;ReadPosRankSum=-2.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:503,0,7327 -chr8 3761609 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=3.768;DP=122;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,25:122:99:503,0,7327 -chr8 3764640 . A G 2703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.370;DP=179;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,80:179:99:2732,0,3241 -chr8 4149821 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-2.272;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:400,0,434 -chr8 4245320 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:86:330,0,86 -chr8 4300602 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,173 -chr8 4568903 . T A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.251;DP=43;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1091,0,327 -chr8 4599151 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.961;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:348,0,407 -chr8 4599272 . G T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=1.080;DP=30;FS=3.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:620,0,402 -chr8 4599328 . G T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.384;DP=32;FS=5.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:492,0,1288 -chr8 4599597 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=3.098;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,263 -chr8 4600332 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:473,0,353 -chr8 4600383 . G A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.296;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:814,0,465 -chr8 4601075 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.129;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:411,0,469 -chr8 4642926 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:930,66,0 -chr8 4643113 . T A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-1.363;DP=36;FS=7.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:652,0,599 -chr8 4646477 . A G 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=1.550;DP=117;FS=20.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=8.49;ReadPosRankSum=-2.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,37:117:99:1022,0,2931 -chr8 4646529 . C A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.928;DP=72;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=5.09;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:395,0,2124 -chr8 4649201 . G T 2438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.909;DP=153;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=15.94;ReadPosRankSum=4.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:2467,0,2674 -chr8 4649820 . G A 4105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.068;DP=196;FS=3.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=20.95;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,120:196:99:4134,0,2659 -chr8 4656118 . A G 2880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.593;DP=176;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,83:175:99:2909,0,2894 -chr8 4672524 . G C 3098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-1.202;DP=178;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,91:178:99:3127,0,2941 -chr8 4687198 . C A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-1.571;DP=103;FS=6.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:1238,0,2332 -chr8 4687219 . G A 2866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.321;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,85:135:99:2895,0,1665 -chr8 4693435 . C A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.781;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=6.13;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:844,0,3429 -chr8 4694488 . C T 3686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.464;DP=183;FS=0.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,111:182:99:3715,0,2377 -chr8 4719430 . C T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.379;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:776,0,1452 -chr8 4719435 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.118;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.131;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:776,0,1452 -chr8 4726523 . T A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=1.844;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:806,0,520 -chr8 4735514 . A G 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.356;DP=40;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1173,0,175 -chr8 4778318 . A T 215.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:244,21,0 -chr8 4789394 . A C 1485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.085;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=28.57;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1514,0,316 -chr8 4789565 . CAT C 1459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.904;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=22.46;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1497,0,1021 -chr8 4822407 . T A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-3.293;DP=71;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:886,0,1588 -chr8 4822834 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=-0.667;DP=55;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:327,0,1603 -chr8 4831046 . G A 4895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.005;DP=182;FS=13.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=26.90;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,128:181:99:4924,0,1320 -chr8 4882722 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-1.504;DP=122;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,20:121:99:400,0,8112 -chr8 4888463 . T A 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.946;DP=138;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=5.32;ReadPosRankSum=2.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,34:138:99:762,0,3849 -chr8 4907059 . G A 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=-1.138;DP=146;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,52:146:99:1693,0,2965 -chr8 4907576 . G C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-1.351;DP=79;FS=3.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:724,0,2027 -chr8 4907671 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.620;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:735,0,1360 -chr8 4907721 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=1.407;DP=47;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:398,0,1263 -chr8 4907833 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-3.016;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,229 -chr8 4907976 . C A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.155;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:657,0,2143 -chr8 4908266 . AT A 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-1.517;DP=73;FS=2.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:501,0,4089 -chr8 4908268 . A C 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-1.251;DP=73;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:501,0,4089 -chr8 4908564 . G T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=1.066;DP=121;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:460,0,5528 -chr8 4908707 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-1.238;DP=80;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:647,0,2861 -chr8 4909582 . C T 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=1.125;DP=84;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,48:84:99:1666,0,1324 -chr8 4910166 . A AT 3488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3526,236,0 -chr8 4910709 . G C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=-0.304;DP=79;FS=7.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=3.54;ReadPosRankSum=2.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:308,0,5655 -chr8 4911034 . G A 3416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.221;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,68:101:99:3445,0,1636 -chr8 4911174 . C T 2635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.878;DP=143;FS=2.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:2664,0,3731 -chr8 4942688 . T C 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-1.463;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=30.35;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:99:787,0,188 -chr8 4942863 . T A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=-0.178;DP=48;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:718,0,960 -chr8 4950117 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=1.707;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=5.68;ReadPosRankSum=2.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:335,0,1530 -chr8 4957812 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-1.122;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:393,0,459 -chr8 4958121 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.568;DP=66;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:308,0,1891 -chr8 4962098 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=1.364;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:329,0,1830 -chr8 4962223 . G T 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=1.489;DP=69;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:1039,0,1340 -chr8 4962382 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=2.187;DP=51;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:240,0,1515 -chr8 4971179 . A G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.509;DP=176;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=18.37;ReadPosRankSum=-2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,100:176:99:3261,0,2545 -chr8 4971470 . G A 2309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.208;DP=206;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,73:206:99:2338,0,6435 -chr8 4971479 . C T 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=-0.174;DP=206;FS=6.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,54:206:99:1100,0,8633 -chr8 4977979 . AAGGTGATATTATGTCTGTTCTTCAGTATAATGATCAATTTAGCAGAAACCATGCTGAAACCATGCAGTGCTAACCAGATATTCTTGTCTTCC A 8139.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=1.713;DP=196;FS=3.156;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=28.32;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,181:182:99:8177,621,0 -chr8 4980211 . AGTAAATCACTTCTACCTTAATCTTCCTAACAAACTGTTAATAAAGCTTGTCCGCTCCGTAATTTTGTTGTCTTTCTGTTTTGTTTTTTTCCACAG A 8787.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=2.088;DP=229;FS=1.259;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=23.55;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,211:221:99:8825,635,0 -chr8 4988397 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:253,0,450 -chr8 4988738 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.731;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:318,0,2377 -chr8 4989019 . G A 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-1.579;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.114;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1323,0,2223 -chr8 4991444 . T G 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.547;DP=109;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:798,0,2966 -chr8 4994455 . G T 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.821;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,41:114:99:1389,0,2483 -chr8 4997498 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=1.484;DP=20;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.269;QD=27.44;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:577,0,117 -chr8 5012554 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-0.597;DP=62;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:401,0,1939 -chr8 5015357 . G C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-0.981;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:356,0,1848 -chr8 5021813 . T A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.368;DP=63;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:710,0,1439 -chr8 5022086 . TA T 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.313;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:461,0,912 -chr8 5022379 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.207;DP=68;FS=5.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.923;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:317,0,2090 -chr8 5022827 . T C 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.793;DP=53;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:853,0,793 -chr8 5022930 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=-2.051;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:968,0,2032 -chr8 5024174 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.251;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:610,0,819 -chr8 5024603 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=-2.523;DP=96;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,31:96:99:788,0,3935 -chr8 5025278 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.832;DP=50;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:515,0,2729 -chr8 5025289 . T A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.683;DP=49;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:509,0,2729 -chr8 5025451 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.144;DP=38;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:277,0,1153 -chr8 5025576 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.437;DP=54;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=13.92;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:780,0,1092 -chr8 5025965 . C A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.343;DP=64;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=16.72;ReadPosRankSum=-2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1098,0,1211 -chr8 5026039 . C G 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.972;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:927,0,876 -chr8 5026165 . A G 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-1.636;DP=61;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,41:61:99:1613,0,562 -chr8 5026177 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.426;DP=61;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:420,0,1783 -chr8 5026433 . G T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-0.232;DP=57;FS=11.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1063,0,1004 -chr8 5062739 . T A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.520;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=30.14;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:631,0,356 -chr8 5063158 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=2.374;DP=47;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=4.53;ReadPosRankSum=-2.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:241,0,1368 -chr8 5063437 . C A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.270;DP=51;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=10.54;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:566,0,1197 -chr8 5063801 . T A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.053;DP=49;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:594,0,1432 -chr8 5064042 . T G 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.210;DP=103;FS=1.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:1551,0,1998 -chr8 5066546 . T A 2798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2827,208,0 -chr8 5066574 . C T 1867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.111;DP=62;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=30.13;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,51:62:99:1896,0,129 -chr8 5066701 . C A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.468;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,33:97:99:1095,0,2186 -chr8 5066807 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-0.389;DP=105;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:369,0,3216 -chr8 5067589 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-2.557;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:338,0,1106 -chr8 5067611 . T C 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-3.230;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=27.26;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,36:50:99:1391,0,373 -chr8 5068958 . C A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=1.838;DP=70;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:509,0,4141 -chr8 5068960 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=2.078;DP=69;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:497,0,4141 -chr8 5069009 . A C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.028;DP=56;FS=11.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:379,0,1480 -chr8 5069435 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-1.510;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:624,0,1972 -chr8 5069535 . G C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.142;DP=85;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:1030,0,1829 -chr8 5069615 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;ClippingRankSum=0.264;DP=69;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=7.78;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:565,0,1821 -chr8 5072513 . T C 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.242;DP=78;FS=9.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:681,0,1995 -chr8 5072592 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=1.206;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:531,0,1449 -chr8 5072616 . G A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=2.059;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:755,0,1237 -chr8 5077271 . C A 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=2.594;DP=59;FS=3.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=12.83;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:785,0,1308 -chr8 5077445 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=2.025;DP=57;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:323,0,4676 -chr8 5077446 . G C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=1.778;DP=57;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:323,0,4676 -chr8 5077455 . C T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-0.311;DP=60;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1028,0,1823 -chr8 5079609 . G A 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=1.961;DP=71;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1262,0,1304 -chr8 5091609 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=1.169;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:369,0,1626 -chr8 5095815 . G A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-1.679;DP=64;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:862,0,1384 -chr8 5175492 . C G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=1.072;DP=42;FS=3.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:300,0,1164 -chr8 5175638 . C G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.436;DP=29;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:256,0,1154 -chr8 5175657 . A T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.646;DP=41;FS=3.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:449,0,1201 -chr8 5179808 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.276;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:261,0,545 -chr8 5180051 . G A 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.746;DP=55;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1447,0,366 -chr8 5265866 . C T 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr8 5266291 . C T 314.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=31.42;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:342,0,10 -chr8 5299933 . C A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr8 5302952 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=23.18;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:260,0,100 -chr8 5330590 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.773;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:419,0,413 -chr8 5331476 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=1.216;DP=62;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:278,0,1777 -chr8 5335563 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.342;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:336,0,998 -chr8 5335650 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-1.845;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:366,0,756 -chr8 5342714 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.827;DP=69;FS=5.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:500,0,1798 -chr8 5358386 . G A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=2.108;DP=73;FS=6.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:737,0,1604 -chr8 5366121 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-2.017;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:254,0,801 -chr8 5402968 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=1.037;DP=59;FS=3.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:681,0,2218 -chr8 5418712 . A G 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=2.320;DP=53;FS=12.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:784,0,1121 -chr8 5419182 . C T 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.714;DP=74;FS=10.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=17.98;ReadPosRankSum=2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1359,0,1349 -chr8 5419761 . A C 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=-0.797;DP=83;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:1456,0,1406 -chr8 5429860 . C A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=4.728;DP=69;FS=3.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=6.84;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:500,0,1737 -chr8 5444919 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.636;DP=57;FS=4.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=3.89;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:250,0,2007 -chr8 5445552 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.098;DP=46;FS=2.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:342,0,1320 -chr8 5447164 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.950;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:250,0,1039 -chr8 5447753 . CTGTGTGTGTGTGTG C 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=33;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:99:272,0,1853 -chr8 5448845 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.440;DP=35;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:654,0,579 -chr8 5463275 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.310;DP=68;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:988,0,1336 -chr8 5472069 . A G 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.275;DP=79;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:622,0,2098 -chr8 7464193 . T A 800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:57:829,57,0 -chr8 7472163 . G A 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr8 7472166 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:283,21,0 -chr8 7557514 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.246;DP=21;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:364,0,418 -chr8 7558387 . T A 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.442;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=24.77;ReadPosRankSum=2.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1217,0,380 -chr8 7592088 . G A 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:585,45,0 -chr8 7592261 . T C 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=-3.322;DP=114;FS=9.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,11:63:99:1208,0,3397 -chr8 7592279 . T C 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-3.803;DP=97;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:1208,0,3317 -chr8 7592345 . A T 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.034;DP=52;FS=8.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:1208,0,3262 -chr8 7592458 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.194;DP=46;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:319,0,711 -chr8 7592898 . T C 214.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:243,0,18 -chr8 7593022 . T A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr8 7867710 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr8 7885198 . CT C 1881.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1919,131,0 -chr8 7972959 . T C 3183.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3212,232,0 -chr8 8029179 . AC A 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 8044340 . GT G 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.314;DP=50;FS=8.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,35:41:26:758,0,26 -chr8 8045221 . C T 8017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:8046,577,0 -chr8 8053048 . TCTGTAAATAAAAGCAGTTGGTTGAGGAACAGGTATTGAATGCAGTAATCATAAAGCATCATCTATGAACTCAC T 11505.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-1.460;DP=238;FS=2.201;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=32.84;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,235:238:99:11543,907,0 -chr8 8063281 . G A 1563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1592,123,0 -chr8 8063364 . G A 5404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:5433,391,0 -chr8 8080865 . C T 1407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1436,105,0 -chr8 8102551 . T C 1985.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2014,144,0 -chr8 8106465 . C A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr8 8106540 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr8 8211268 . CAT C 323.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:361,25,0 -chr8 8256438 . T A 2163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.732;DP=49;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:2192,150,0 -chr8 8312635 . A C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr8 8312834 . A T 733.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:762,54,0 -chr8 8317015 . A AT 562.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.980;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:68:649,68,0 -chr8 8317710 . T A 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 -chr8 8319039 . C CT 280.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:318,33,0 -chr8 8349672 . C T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 -chr8 8351341 . C T 944.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:973,69,0 -chr8 8354401 . A T 814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:57:843,57,0 -chr8 8388236 . T C 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:757,60,0 -chr8 8428144 . A T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr8 8428752 . A T 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 -chr8 8429587 . AT A 770.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:79:808,79,0 -chr8 8827238 . C T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.281;DP=43;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:772,0,702 -chr8 8829092 . G A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:351,27,0 -chr8 8829458 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,834 -chr8 8830026 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-1.030;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:435,0,1044 -chr8 8831022 . C CT 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=20.56;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:70:284,0,70 -chr8 8831389 . T A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.611;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=27.14;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:571,0,245 -chr8 8831602 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=1.838;DP=34;FS=7.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.081;QD=15.17;ReadPosRankSum=-2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:544,0,691 -chr8 8831698 . C T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.538;DP=39;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=20.58;ReadPosRankSum=-2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:831,0,1196 -chr8 8831699 . C T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.109;DP=41;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:831,0,1196 -chr8 8832824 . A T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.498;DP=38;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:480,0,896 -chr8 8881348 . C T 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.370;DP=67;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:1188,0,1194 -chr8 8898433 . G GA 654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:60:692,60,0 -chr8 8971250 . T G 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.640;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1336,0,834 -chr8 9231390 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-1.773;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:401,0,449 -chr8 9396575 . G T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=-1.010;DP=35;FS=1.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:692,0,565 -chr8 9474575 . GAGGTGAAAATTCATGACAGATTTCTCACATTTTTTTAATGGTAACAGTGAGTCAAAATACTGATGAAAAGTGTCTTTTC G 3795.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.118;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=31.98;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,92:94:99:3833,301,0 -chr8 9574461 . G GT 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.493;DP=61;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:298,0,1983 -chr8 9589032 . G A 1487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1516,111,0 -chr8 9589059 . CT C 1944.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1982,150,0 -chr8 9589152 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=5.497;DP=53;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=5.64;ReadPosRankSum=-3.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:327,0,1508 -chr8 9591785 . A AAC 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=-0.041;DP=24;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=30.70;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:68:774,0,68 -chr8 9592798 . TA T 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.932;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=7.18;ReadPosRankSum=2.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:260,0,685 -chr8 9593097 . C G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=2.492;DP=45;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:331,0,1276 -chr8 9594250 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.204;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:229,0,624 -chr8 9596292 . C T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr8 9596303 . A G 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr8 10339124 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,336 -chr8 10339302 . A G 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr8 10966818 . AT A 452.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.945;DP=21;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:29:490,29,0 -chr8 10967468 . G T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr8 10972575 . C CAA 233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr8 10976676 . GT G 220.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:258,27,0 -chr8 11368321 . TA T 234.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:272,27,0 -chr8 11479070 . G A 2613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-1.377;DP=69;FS=1.896;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=30.89;ReadPosRankSum=2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,64:69:99:2642,115,0 -chr8 11479216 . A G 3333.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=1.690;DP=75;FS=2.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=28.58;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,72:75:99:3362,229,0 -chr8 11479225 . T C 3333.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.400;DP=73;FS=3.072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=26.94;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:3362,229,0 -chr8 11497291 . C T 3201.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=2.263;DP=81;FS=2.172;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=34.84;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,78:81:99:3230,234,0 -chr8 11501937 . GT G 899.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.744;DP=57;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,40:54:99:937,0,141 -chr8 11502086 . GT G 1629.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-1.732;DP=59;FS=3.090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=27.62;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:1667,164,0 -chr8 11502296 . T C 4730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.719;DP=118;FS=2.806;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,116:118:99:4759,343,0 -chr8 11502483 . A T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=27.80;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:575,0,253 -chr8 11504964 . C A 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:732,54,0 -chr8 11521458 . A G 733.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:762,54,0 -chr8 11522937 . A T 2317.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2346,166,0 -chr8 11536802 . C G 454.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:483,36,0 -chr8 11545589 . T C 582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:611,45,0 -chr8 11545877 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:357,0,53 -chr8 11555349 . G A 234.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:263,0,21 -chr8 11590698 . AT A 280.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:318,22,0 -chr8 11591226 . AT A 2132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=1.418;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:2170,202,0 -chr8 11595345 . G A 985.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1014,72,0 -chr8 11595633 . TA T 315.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:353,24,0 -chr8 11595639 . C T 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 -chr8 11596532 . A AAC 203.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:4:369,0,4 -chr8 11598193 . CAT C 359.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.393;DP=12;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=29.98;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:21:397,21,0 -chr8 11599602 . T G 811.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-1.514;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=33.82;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:25:840,25,0 -chr8 11640445 . T A 1715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.222;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=31.22;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,43:46:93:1744,93,0 -chr8 11650835 . C T 566.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=37.38;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:593,2,0 -chr8 11663256 . C T 1554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=2.142;DP=44;FS=2.444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=30.10;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:83:1583,83,0 -chr8 11697473 . AGTCAGTACTGCATTATGTTCAACTCGTTCCAGAAAATGTCGTAGTCAGTTCGTTGACTCACATATTTCTGCTCGTGTTTTCACAG A 9835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.989;DP=258;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=31.69;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,247:258:99:9872,0,377 -chr8 11702232 . C A 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=1.856;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=31.02;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:40:990,0,40 -chr8 11702280 . G A 1638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=1.264;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=34.14;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:64:1667,64,0 -chr8 11702345 . G T 1587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1616,103,0 -chr8 11728797 . GCAA G 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,22:22:99:691,0,111 -chr8 11746847 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=29.52;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:47:353,0,47 -chr8 11748775 . G A 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr8 11748988 . C CT 523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:561,42,0 -chr8 11810155 . C T 215.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:11:243,11,0 -chr8 11810825 . G A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr8 12085294 . A T 577.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.868;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=34.66;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:6:605,6,0 -chr8 12086587 . T A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr8 12086602 . G T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:309,21,0 -chr8 12092149 . G GA 402.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=20.14;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:26:476,26,0 -chr8 12095453 . C A 571.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=33.41;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:4:598,4,0 -chr8 12106485 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr8 12199475 . C G 759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:788,54,0 -chr8 12200749 . A G 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:550,39,0 -chr8 12234725 . T C 2304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=-0.185;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2333,174,0 -chr8 12262914 . AT A 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.372;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:62:428,0,62 -chr8 12263809 . C T 420.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=35.19;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:448,0,6 -chr8 12264235 . T G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=24.23;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:319,0,131 -chr8 12264291 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=1.323;DP=17;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:649,0,196 -chr8 12647147 . C A 740.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-1.085;DP=22;FS=8.073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=33.67;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:21:769,21,0 -chr8 12649461 . A T 575.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=30.34;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:602,2,0 -chr8 12667652 . A G 2149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2178,160,0 -chr8 13452645 . T TACCATG 4212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4250,297,0 -chr8 13464513 . T TA 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 13464514 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 13610994 . A G 5381.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-2.106;DP=134;FS=5.884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=35.30;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,131:134:99:5410,385,0 -chr8 13638446 . AAGGTAACACTTGCTGCCTCTGTACAACTCTTCTCCAGTTCCGTGTGTTCATTTCATATCTTACACTTCTGCTTACTTTATTTTC A 2516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=1.583;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=32.38;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2554,217,0 -chr8 13676147 . TA T 1339.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-1.708;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:1377,145,0 -chr8 13676224 . GT G 2296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:2334,217,0 -chr8 13705325 . T TG 247.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:285,24,0 -chr8 13706820 . C T 318.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.89;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:347,0,15 -chr8 13852690 . G A 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 -chr8 13868979 . TA T 4265.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-1.711;DP=167;FS=8.048;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,141:146:99:4303,426,0 -chr8 13872930 . C T 8240.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:8269,593,0 -chr8 13881819 . T C 1493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1522,114,0 -chr8 14052067 . G T 335.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=33.59;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:364,0,16 -chr8 14114213 . T C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr8 14114232 . A G 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 -chr8 14115166 . C T 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr8 14148211 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=2.027;DP=24;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:305,0,528 -chr8 14519742 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-1.694;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:334,0,484 -chr8 14661255 . C T 969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:998,72,0 -chr8 14688140 . CT C 1619.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=70;FS=3.865;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=23.14;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:1657,166,0 -chr8 14688184 . CA C 1374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1412,101,0 -chr8 14688188 . A T 1383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1412,101,0 -chr8 14688633 . AT A 8114.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-1.061;DP=297;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=27.32;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,273:279:99:8152,803,0 -chr8 14729256 . CA C 711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:74:749,74,0 -chr8 14892518 . T A 3124.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3153,223,0 -chr8 14956754 . C T 1177.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1206,84,0 -chr8 14957154 . A T 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr8 14970981 . CT C 592.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-0.651;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.354;QD=22.80;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:44:630,44,0 -chr8 15020567 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=3.416;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:348,0,272 -chr8 15078068 . C A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 -chr8 15105065 . C T 687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:716,51,0 -chr8 15108636 . G A 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:442,30,0 -chr8 15108642 . G T 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:442,30,0 -chr8 15124179 . G T 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 -chr8 15315120 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr8 15372050 . A C 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 -chr8 15394844 . AAGGTAATTGCCATTCTGACTTTAAAAAAAAAGAAAAGTTTCCTACTGCAGTTTAATGACATTCACCAC A 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=2.606;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=26.61;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:463,0,1469 -chr8 15484960 . G A 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1624,117,0 -chr8 15487271 . T G 996.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1025,69,0 -chr8 15498119 . G A 1023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1052,72,0 -chr8 15595713 . T A 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:632,45,0 -chr8 15597835 . AC A 3315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-1.480;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=28.58;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:3353,323,0 -chr8 15793691 . T G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr8 15803036 . T TA 228.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:266,29,0 -chr8 16016103 . C CT 215.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:253,24,0 -chr8 16019595 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.517;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,218 -chr8 16523887 . CT C 1858.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-2.336;DP=67;FS=7.728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=27.74;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:1896,165,0 -chr8 16573633 . C T 9894.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-1.021;DP=255;FS=1.604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,248:254:99:9923,727,0 -chr8 16632415 . C A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-0.468;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:50:529,0,50 -chr8 16633679 . A T 7365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-2.422;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=33.33;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,178:189:99:7394,470,0 -chr8 16634408 . GA G 2912.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.420;DP=199;FS=8.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,127:178:99:2950,0,874 -chr8 16635083 . GA G 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-1.806;DP=61;FS=9.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:479,0,389 -chr8 16901609 . C T 3290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.276;DP=77;FS=7.874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:76:99:3319,223,0 -chr8 16908193 . A T 2618.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-1.952;DP=79;FS=10.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=33.15;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,70:79:17:2647,0,17 -chr8 16944877 . T TTG 1409.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.526;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,41:47:24:1447,0,24 -chr8 16952851 . C T 1009.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1038,72,0 -chr8 16952871 . G T 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:835,57,0 -chr8 17001518 . G A 1321.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1350,93,0 -chr8 17001538 . G A 1159.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.658;DP=33;FS=5.465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.661;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:8:1187,8,0 -chr8 17038096 . C CA 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.04;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:53:285,0,53 -chr8 17040610 . T C 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr8 17107576 . GGACCTGAAAGAGATAAGATGGCATTATGGGTGCCCAAATAAATTGATGCATGTTTCAGATGTAAGATGTCTATAGACGGATTAAGTACT G 8841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.768;DP=244;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=32.33;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,208:228:99:8879,0,4727 -chr8 17116494 . C T 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:457,33,0 -chr8 17116702 . C CT 599.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:637,54,0 -chr8 17129283 . G GA 296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:334,33,0 -chr8 17135436 . T TA 948.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.545;DP=42;FS=3.641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:82:1024,82,0 -chr8 17199981 . AGTAAGCCTGACTCTCATACATTTAGATTTACACTATATATGTTTTTAAATCAGAAAACCGGTCTTTCATCAG A 1181.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.040;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=31.29;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,29:31:99:1219,0,229 -chr8 17202256 . C G 1533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.416;DP=42;FS=2.356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=24.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:75:1562,75,0 -chr8 17206912 . C G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=2.132;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=30.49;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:81:577,0,81 -chr8 17211368 . T A 240.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:269,0,22 -chr8 17213116 . A T 2435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.329;DP=69;FS=2.235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=31.62;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,65:68:99:2464,197,0 -chr8 17223457 . T A 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:737,51,0 -chr8 17223758 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:309,0,50 -chr8 17232834 . G GA,GAA 526.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.523;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=14.62;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,21,8:31:99:785,191,134,504,0,514 -chr8 17241343 . TCTACGGAGGGAGAAAAATAAGATATTATTCACGATGTGAAAATATGACTATCACCACTATGTTTTTACACAGAGATGACACACATCTGGCCTAC T 1429.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.523;DP=33;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1467,125,0 -chr8 17249156 . C CT 7849.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.999;DP=217;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=30.21;ReadPosRankSum=2.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,211:217:99:7887,631,0 -chr8 17288784 . CTT C,CT 664.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.900;DP=42;FS=2.623;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,15,23:40:99:1032,537,492,393,0,284 -chr8 17575117 . C A 3228.29 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.179;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:3257,258,0 -chr8 17575201 . C G 2728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2757,205,0 -chr8 17583215 . C T 1647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.384;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=34.12;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1676,120,0 -chr8 17676815 . CT C 554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:32:592,32,0 -chr8 17678602 . TCA T 499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:38:537,38,0 -chr8 17694453 . TCCTGAGAAAGAATAGCAAATTATTTCAGACACTTTAAGATGTCTTCCTTTTTGACATATATAAATGTAAATATAAAAATAAATGCGTATAAATATGCTAACATTTTATTCTGAAACGTGACTGATTTA T 2943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=3.285;DP=91;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,78:89:99:2981,0,3856 -chr8 17697273 . ACTGAAATAAAGACGGTTCGTTATGAAGGGTTTAATGTGAACACTCAGCAGGGATCTTGTTGATGAATGTCCAGCATTCCTAC A 3884.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.593;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,84:87:99:3922,352,0 -chr8 17712030 . A AT 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:499,42,0 -chr8 17916123 . CT C 1404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1442,139,0 -chr8 17921708 . C T 2861.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.916;DP=79;FS=1.800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,74:79:99:2890,142,0 -chr8 17926540 . C A 1967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=1.843;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=28.14;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:33:1996,33,0 -chr8 17926547 . C T 1967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=1.022;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=26.22;ReadPosRankSum=-2.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,46:49:33:1996,33,0 -chr8 18054896 . CCTGGGAACAAAATCTGGAGCAAGTAGATCTGGATTAGTA C 388.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:4:424,0,4 -chr8 18302003 . TGTAAGTAACTACATAATATTTGAAAAAATGTATTAATTTGTCTCTTCTTTTACTGGCAATTGTTATGTTTACATTACAG T 2233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=3.292;DP=61;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=31.38;ReadPosRankSum=-2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,54:61:99:2271,0,1372 -chr8 18307023 . C A 1925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-1.109;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=31.11;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1954,138,0 -chr8 18307119 . A G 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.173;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=27.92;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:804,57,0 -chr8 18307168 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:383,27,0 -chr8 18307176 . A T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:383,27,0 -chr8 18307609 . AGTTCTAATAAACCGAAAATATAAGT A 1252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=1.317;DP=43;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=29.13;ReadPosRankSum=-2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,39:43:99:1290,0,2068 -chr8 18307637 . TATTTAACGGTTTGATCCTAAAATGTTTCAATTGTTGTGCATTTTAGAAGAACTTAC T 1252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=3.742;DP=46;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1290,0,2068 -chr8 18309756 . AC A 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr8 18407333 . T C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-1.427;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=29.51;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:884,0,108 -chr8 18419422 . T C 1507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.140;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=27.93;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1536,108,0 -chr8 18436410 . G T 662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:691,51,0 -chr8 18436601 . G A 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:831,60,0 -chr8 18437389 . C T 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:690,48,0 -chr8 18437777 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=1.870;DP=22;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:317,0,468 -chr8 18503149 . T C 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:726,51,0 -chr8 18503824 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.863;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:30:575,0,30 -chr8 18506863 . G T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr8 18526498 . T C 640.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=35.14;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:668,8,0 -chr8 18545328 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr8 18550257 . C T 11086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.351;DP=292;FS=4.636;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,273:292:99:11115,614,0 -chr8 18551390 . C A 13623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.303;DP=353;FS=0.976;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=29.11;ReadPosRankSum=3.619 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,327:343:99:13652,984,0 -chr8 18554549 . GAC G 9069.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.414;DP=256;FS=0.881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=29.14;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,216:241:99:9107,130,0 -chr8 18555540 . G GT 4567.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-1.569;DP=177;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=25.81;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,151:171:18:4605,0,18 -chr8 18555649 . A T 15837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.439;DP=178;FS=5.256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=27.21;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,169:173:99:15866,1122,0 -chr8 18718159 . G A 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr8 18726582 . A T 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:591,45,0 -chr8 18726865 . C T 677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:706,54,0 -chr8 18730947 . C T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr8 18764462 . C T 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr8 18775480 . TCTGAGATCATTTGCTGAGGAAACATTTCTTCTTATTACATATGCTTGAATGAAAAAAACAGACACATGCATTTTGCTTGTGCCATTCCGACAGCATACTGTAAAAAGGATAC T 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=1.444;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:520,0,281 -chr8 18875784 . C G 3955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.712;DP=101;FS=8.131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=32.03;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,96:101:99:3984,290,0 -chr8 18883598 . A C 3487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-0.981;DP=99;FS=2.968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,89:99:67:3516,67,0 -chr8 18886544 . G T 3193.69 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.405;DP=80;FS=2.619;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=31.39;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3222,232,0 -chr8 18887061 . G A 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -chr8 18914425 . T G 345.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:374,0,13 -chr8 18939865 . T A 284.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:313,0,15 -chr8 18972852 . C A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr8 19031486 . CCCTAATGAAACAATCCCAAACGACCACATGATGACACAAATGTTTGCACACCAAAACCAAAGTAAATCTGGAATTCAGTA C 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.077;DP=14;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:381,0,1635 -chr8 19037526 . CA C 1076.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.171;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,70:86:99:1184,0,165 -chr8 19065081 . C T 1425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-1.612;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=32.40;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:82:1454,82,0 -chr8 19074225 . T C 2617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2646,178,0 -chr8 19074786 . C T 2192.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.361;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2221,163,0 -chr8 19087571 . G GA 2404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:2442,167,0 -chr8 19109179 . C T 3585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3614,264,0 -chr8 19115459 . A AT 857 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.511;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:12:894,0,12 -chr8 19118586 . G T 1141.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.388;DP=32;FS=2.455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=31.72;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:6:1169,6,0 -chr8 19121362 . G GTA 1750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.021;DP=59;FS=7.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=29.67;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:1788,0,231 -chr8 19121652 . C T 1726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=1.041;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=33.40;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,45:49:55:1755,55,0 -chr8 19135561 . A G 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.348;DP=46;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=30.23;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,38:46:99:1419,0,116 -chr8 19161278 . A T 1797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=1.955;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=34.07;ReadPosRankSum=-2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1826,129,0 -chr8 19167191 . T C 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr8 19171498 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:355,24,0 -chr8 19171505 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr8 19171610 . G A 2401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.314;DP=59;FS=6.247;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=26.44;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,57:59:99:2430,172,0 -chr8 19172251 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-2.637;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:259,0,120 -chr8 19172268 . G A 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:414,30,0 -chr8 19362067 . T C 2921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.723;DP=77;FS=1.909;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,73:77:99:2950,178,0 -chr8 19365902 . T C 687.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.055;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=32.75;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:23:716,0,23 -chr8 19367222 . CT C 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,31:41:99:758,0,107 -chr8 19409134 . GA G 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.929;DP=33;FS=9.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:49:672,0,49 -chr8 19459262 . T C 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr8 19460335 . T TAC 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.667;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:31:491,0,31 -chr8 19573237 . G A 1047.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-0.969;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=33.79;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:7:1075,7,0 -chr8 19722213 . C A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:38:443,0,38 -chr8 19722485 . CA C 209.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:244,0,0 -chr8 19754348 . T G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=27.91;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:391,0,87 -chr8 19754364 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:285,0,57 -chr8 19776075 . CA C 758.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-1.538;DP=31;FS=5.082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:30:796,30,0 -chr8 19808985 . ACAAACACATATACACACACACACACACACACG A 3511.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-1.643;DP=169;FS=10.218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,111:121:99:3549,196,0 -chr8 19881067 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr8 19887938 . G T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.254;DP=18;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:352,0,84 -chr8 19940606 . G A 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:275,21,0 -chr8 20154408 . A G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=1.888;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=34.03;ReadPosRankSum=-1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,83:95:21:3263,0,21 -chr8 20154522 . T C 4197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.292;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.206;QD=30.74;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,102:109:99:4226,248,0 -chr8 20155830 . TA T 350.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.556;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.302;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:14:388,0,14 -chr8 20156232 . C CA 455.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-0.293;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=15.19;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:27:607,27,0 -chr8 20156563 . T TA 1249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-0.807;DP=39;FS=2.191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=32.04;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:33:1287,33,0 -chr8 20524999 . A G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr8 20608142 . C T 473.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.744;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.80;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:4:500,4,0 -chr8 20611896 . GT G 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=2.991;DP=30;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=23.29;ReadPosRankSum=-2.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:736,0,125 -chr8 20733419 . AT A 312.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:350,33,0 -chr8 20734231 . AC A 205.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:7:242,0,7 -chr8 20835018 . A AT 266.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:1:301,0,1 -chr8 20835123 . C CT 727.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 -chr8 20882907 . C T 329.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=29.96;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:357,0,7 -chr8 20909808 . G C 568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:597,45,0 -chr8 20909940 . G T 571.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:600,42,0 -chr8 20964397 . AT A 625.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-1.253;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:3:661,3,0 -chr8 20986336 . GCCAGGTACATCACACACCCTTGTCTTTTTATGCTAACCACTGTCATAAACCTACGTCAGAAGTATCATTCATGGGCTGCTCTATGAATAAAACTCATCTCCTGTTACTC G 7063.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=2.347;DP=225;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=31.39;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,203:213:99:7101,0,652 -chr8 20988399 . CAA C 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=3.464;DP=27;FS=8.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=12.40;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:531,0,190 -chr8 20988652 . AT A 4548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.816;DP=184;FS=3.512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,162:179:99:4586,316,0 -chr8 20989982 . C CAA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.608;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:363,0,338 -chr8 20990043 . TA T 894.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.798;DP=46;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:932,0,122 -chr8 20990116 . G GA 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.967;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:38:332,0,38 -chr8 21009230 . T TC 683.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:49:957,49,0 -chr8 21097133 . T TA 841.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-2.006;DP=50;FS=6.368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.878;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,44:46:89:1001,89,0 -chr8 21097392 . CA C 2197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=-0.267;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=32.46;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:2235,151,0 -chr8 21097635 . AT A 1371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=1.127;DP=89;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,58:75:99:1411,0,161 -chr8 21097878 . A AAG 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=1.667;DP=16;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=30.48;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:34:525,0,34 -chr8 21411134 . T C 3211.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-1.244;DP=83;FS=4.959;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,79:83:99:3240,238,0 -chr8 21411229 . TGGTGCGCTCATTCTGAATAGTCTGGATGAGGATTACATACATGTATTATATTTACATGCACAACGTCTTACATGATCCAATGTCTGTCTTCTGCA T 4058.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=1.803;DP=88;FS=2.583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=27.89;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,84:87:99:4096,410,0 -chr8 21414257 . A ATCT 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=2.577;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:656,0,169 -chr8 21606389 . T C 1461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1490,105,0 -chr8 21677938 . T C 414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:443,30,0 -chr8 21679187 . GCTGCAATGTAAAAAGAAGGAAATTAATTAACAAAGTTGGACTTACTGTACATTTACTTATTTATCCATGTACATCTCCCAC G 1479.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=2.314;DP=36;FS=2.653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=24.00;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1517,111,0 -chr8 21679536 . C T 1342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=-1.628;DP=33;FS=3.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:96:1371,96,0 -chr8 21744055 . AAGGTAAAATGGCTGAAATCTGCATCAGCACTGTTTTGTGAATATGGAAACCGATTTTCAAATATAAAAATAATCATTGCTAATGCGATGTGATGTTCAATCCTGC A 16796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=419;FS=3.105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=34.04;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,418:419:99:16834,1484,0 -chr8 21747743 . AGTAAGTGCTATAAAGACAGCAACTGTCAGCAAATTGCTTGCTTTTTATAGCTGATCAAAAGTAATGATCTTTCTGTCTTTTTTTGCCAG A 20819.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.430;DP=455;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=27.71;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,454:455:99:20857,1741,0 -chr8 21751819 . CGTGAGTCTTTGACAAGTCTTAATTTCTTACAGACTGTGTAAAGTAAAAATATGAAATATGTTAACATTTTTGTGTCTTCTCAATAAAG C 2289.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=1.722;DP=355;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=6.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,343:344:99:2327,803,0 -chr8 21751961 . AGTGAGTGTCCACAATTTGGTGGTAACACAGTTTGAAATCTCAGTACTTAAATGGTTTGGTTAACCATTGTTATTTATAATAG A 15574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-2.023;DP=431;FS=2.312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.702;QD=33.00;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,409:412:99:15781,1208,0 -chr8 21783458 . C CT 6410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.374;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=28.93;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:6448,430,0 -chr8 21783835 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.416;DP=103;FS=5.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.632;QD=1.95;ReadPosRankSum=2.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,15:103:99:229,0,6503 -chr8 21783890 . A G 6609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-1.719;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=30.79;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,22:31:54:6638,54,0 -chr8 21783900 . A G 6574.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=-0.680;DP=47;FS=1.648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,29:36:21:6603,21,0 -chr8 21783916 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=1.149;DP=65;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,9:65:99:256,0,6503 -chr8 21783993 . A G 6550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=1.950;DP=106;FS=2.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=27.70;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,78:97:80:6579,0,80 -chr8 21784125 . A G 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.624;DP=68;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1067,0,2512 -chr8 21784169 . A G 2840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-0.165;DP=111;FS=17.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,76:110:99:2869,0,1102 -chr8 21784171 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=5.184;DP=112;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=2.81;ReadPosRankSum=-4.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:343,0,3421 -chr8 21784393 . A G 2460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=2.464;DP=77;FS=8.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=31.96;ReadPosRankSum=-2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,49:76:99:2489,0,716 -chr8 21784438 . A G 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.874;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:902,0,921 -chr8 21784467 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.244;DP=88;FS=4.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:271,0,3088 -chr8 21787346 . TCAA T 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=2.491;DP=140;FS=15.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=2.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:361,0,167 -chr8 21788554 . G GT 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.174;DP=197;FS=3.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,51:172:99:501,0,2425 -chr8 21789784 . C T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.633;ClippingRankSum=3.966;DP=25;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=31.95;ReadPosRankSum=-4.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:827,0,1143 -chr8 21862382 . AGTGAGTCGCTTTTGTGTCACTTTTGACTTTTCTCATTTTGCTTTCGGCACACATGTCTTAGTCAAAAAAAAGCAAAGCGATTATGTGTGACTTCATGTTTTTCTCCTTTTGCTCTGAGCAG A 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=2.162;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=26.81;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:99:635,0,757 -chr8 21906381 . G T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=2.895;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=33.67;ReadPosRankSum=-2.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:870,0,259 -chr8 21906382 . A T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=3.004;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=31.18;ReadPosRankSum=-3.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:870,0,271 -chr8 21933569 . GGGTGAGCAAGCTTAAGACAGGGGAAAAAGTCAGGTAAAATAACTCCTGTATCTATTTTGATAACCTATATGAAATTTCTTTAAA G 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:250,0,825 -chr8 22890928 . TA T 603.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:641,63,0 -chr8 22892148 . G A 633.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:13:662,13,0 -chr8 22894841 . C T 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr8 22900786 . A T 658.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=24.11;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:16:687,16,0 -chr8 22937263 . T C 2233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2262,160,0 -chr8 22943032 . T A 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1067,75,0 -chr8 22945984 . C T 284.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:313,21,0 -chr8 22946868 . A G 790.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:819,57,0 -chr8 22947333 . G A 424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:453,33,0 -chr8 22947358 . T C 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 -chr8 22949259 . C T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:672,45,0 -chr8 22949268 . G T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:672,45,0 -chr8 22949425 . T A 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:629,45,0 -chr8 22949546 . T C 1766.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1795,126,0 -chr8 22949596 . A C 2584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2613,184,0 -chr8 22949872 . A G 2757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2786,199,0 -chr8 22950026 . T A 1045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1074,75,0 -chr8 22952995 . C CT 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.961;DP=28;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:456,0,145 -chr8 22953043 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.868;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:432,0,311 -chr8 22954087 . C T 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:831,63,0 -chr8 22963525 . A G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=1.686;DP=25;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=26.91;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:701,0,143 -chr8 22965624 . T G 2516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2545,178,0 -chr8 22967481 . A T 2496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.188;DP=68;FS=8.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=34.96;ReadPosRankSum=-1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,63:68:99:2525,104,0 -chr8 22967489 . A G 3252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3281,223,0 -chr8 22970012 . A C 2195.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2224,156,0 -chr8 22970108 . G A 1203.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1232,87,0 -chr8 22970162 . A G 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 -chr8 22970194 . C A 220.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:249,0,24 -chr8 22970218 . A G 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:566,42,0 -chr8 22970414 . T A 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 -chr8 22970419 . T C 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:525,36,0 -chr8 23107632 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr8 23111124 . A G 1148.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1177,87,0 -chr8 23111244 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr8 23111823 . T A 1548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1577,111,0 -chr8 23111856 . A C 843.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:872,63,0 -chr8 23111914 . C G 837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:60:866,60,0 -chr8 23111922 . A C 837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:866,60,0 -chr8 23112036 . A G 762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:791,57,0 -chr8 23115634 . G C 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:721,51,0 -chr8 23115648 . C T 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr8 23119437 . G A 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:398,27,0 -chr8 23129916 . C CA 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.381;DP=293;FS=11.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,54:284:99:346,0,6264 -chr8 23130319 . A C 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1369,108,0 -chr8 23130498 . T A 2028.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2057,159,0 -chr8 23130723 . A T 4406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:4435,325,0 -chr8 23133400 . ACTGGACACAGTTTAGAATACATCATTACTAAATCACAAAAACACCACCACACAAGTCAAAATCAAGCAGGAGAGTTTCACAC A 13684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=1.957;DP=349;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=29.71;ReadPosRankSum=-1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,329:333:99:13722,1002,0 -chr8 23133635 . T C 4171.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=1.373;DP=106;FS=3.721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:4200,310,0 -chr8 23139928 . G T 4615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-0.389;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=30.52;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,111:117:99:4644,298,0 -chr8 23146225 . A G 11280.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=268;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,268:268:99:11309,817,0 -chr8 23152221 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr8 23161987 . C T 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:887,63,0 -chr8 23215424 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.206;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:618,0,117 -chr8 23216863 . A T 1811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-1.827;DP=51;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=29.44;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,45:51:32:1840,0,32 -chr8 23217074 . A AC 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=2.783;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:274,0,271 -chr8 23240986 . A G 842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:871,60,0 -chr8 23248830 . T A 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 -chr8 23347143 . C A 747.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-1.531;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=33.99;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:20:776,0,20 -chr8 23347344 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,105 -chr8 23347838 . AT A 275.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:313,31,0 -chr8 23347883 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=1.902;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:454,0,239 -chr8 23348899 . CA C 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=1.371;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:59:294,0,59 -chr8 23350474 . A T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr8 23350574 . CGTAAGAAGCTTTCCTTTTTGTCTATGTATGCAGGGGACATGAAGTTATAATACATGACTAATACATGTAATTGTTTGTTTGCAG C 2491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=7.710;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=23.73;ReadPosRankSum=-3.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,66:105:99:2529,0,16522 -chr8 23351889 . C T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:534,0,367 -chr8 23352217 . A AT 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:489,35,0 -chr8 23356447 . C G 976.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=34.88;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,25:28:3:1003,3,0 -chr8 23356513 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:349,0,223 -chr8 23356574 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-1.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:252,0,260 -chr8 23356637 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=19.05;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:314,0,207 -chr8 23356781 . C G 1059.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.069;DP=30;FS=5.999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:3:1086,3,0 -chr8 23357219 . T A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=1.845;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:440,0,156 -chr8 23357405 . A T 360.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.81;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:388,0,5 -chr8 23364464 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.368;DP=25;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=28.75;ReadPosRankSum=2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:747,0,135 -chr8 23364801 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:385,0,81 -chr8 23365521 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,103 -chr8 23374936 . A C 7280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=4.001;DP=222;FS=15.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=32.80;ReadPosRankSum=-3.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,162:221:99:7309,0,1078 -chr8 23378181 . T C 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=1.942;DP=139;FS=19.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=11.26;ReadPosRankSum=-3.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,50:139:99:1594,0,3075 -chr8 23378559 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=-1.854;DP=87;FS=14.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:266,0,2599 -chr8 23384135 . A G 4215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.014;DP=168;FS=20.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=25.09;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,115:168:99:4244,0,1454 -chr8 23396837 . C T 409.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=34.15;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:0:435,0,0 -chr8 23434398 . G A 210.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:239,0,19 -chr8 23434443 . G A 425.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=32.73;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:452,0,3 -chr8 23434490 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.085;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=32.72;ReadPosRankSum=1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:33:519,0,33 -chr8 23456972 . T C 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:444,33,0 -chr8 23466977 . C CG 430 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-1.475;DP=21;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:12:467,0,12 -chr8 23472290 . A ATTGGGTGGATGCATAGCGGGAGGATGGATG 390.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=20;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:16:428,0,16 -chr8 23592511 . G T 393.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=32.77;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:420,0,4 -chr8 23607730 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr8 23859137 . CA C 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.287;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:36:499,0,36 -chr8 23893418 . A AT 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:40:383,0,40 -chr8 23893497 . T TA 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.085;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:50:325,0,50 -chr8 23952919 . GA G 210.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:248,24,0 -chr8 23954223 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 23954674 . T A 1141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1170,78,0 -chr8 23955318 . C CA 286.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:394,41,0 -chr8 23956057 . A AT 1734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1782,173,0 -chr8 23962422 . G A 3968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.557;DP=130;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=30.53;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,109:130:99:3997,0,645 -chr8 23962833 . T C 5135.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5164,379,0 -chr8 23971524 . ATT A 2778.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,71:78:99:2816,126,0 -chr8 23972641 . CA C 2190.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-1.185;DP=100;FS=1.297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,82:95:30:2228,30,0 -chr8 23972795 . T TA 1641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-0.583;DP=73;FS=1.736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=22.49;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,59:66:66:1679,66,0 -chr8 24032779 . T TTA 325.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.616;DP=21;FS=2.762;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=15.50;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:7:362,7,0 -chr8 24034491 . A AT 914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.208;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=28.59;ReadPosRankSum=-2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:52:952,52,0 -chr8 24035437 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr8 24035730 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=24.05;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:413,0,166 -chr8 24047252 . TC T 2470.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2508,245,0 -chr8 24048340 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.756;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:285,0,4910 -chr8 24057031 . AT A 367.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:405,39,0 -chr8 24064206 . CT C 1099.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.147;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:24:1137,0,24 -chr8 24068244 . CCAGGTACAAACAAAGCATCACATCAGTACCACAATGACTGCATTACAAATACACACAATACAGTCAGCTCTCACTGTGCCAAAAGCTCAAGGTGTTCTTGCACGG C 11110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.152;DP=270;FS=2.215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=31.89;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,266:270:99:11148,947,0 -chr8 24068586 . C T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.006;DP=68;FS=8.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.089;QD=19.29;ReadPosRankSum=5.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,42:68:99:1340,0,1205 -chr8 24068733 . CT C 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.483;DP=48;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:321,0,459 -chr8 24068761 . CT C 712.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.435;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:48:750,48,0 -chr8 24068858 . C CAA 622.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:51:660,51,0 -chr8 24105338 . G A 1494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1523,103,0 -chr8 24113809 . G A 1323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-1.516;DP=38;FS=2.258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=34.84;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:35:1352,35,0 -chr8 24233104 . AT A 2703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=-0.744;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,103:120:99:2741,0,365 -chr8 24233674 . TTA T 4182.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=1.053;DP=123;FS=16.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=34.01;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,104:123:99:4220,0,260 -chr8 24400809 . G A 2203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.124;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,60:77:99:2232,0,342 -chr8 24406662 . T C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=1.986;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=17.37;ReadPosRankSum=-2.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:532,0,537 -chr8 24406925 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=1.631;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:402,0,375 -chr8 24407420 . T TA 506.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-1.135;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:16:563,0,16 -chr8 24407543 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=2.749;DP=33;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:560,0,288 -chr8 24407883 . TC T 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=2.525;DP=42;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:485,0,469 -chr8 24407897 . A C 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=2.304;DP=33;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=14.08;ReadPosRankSum=-3.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:493,0,660 -chr8 24408427 . C T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=-0.721;DP=36;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:903,0,401 -chr8 24410097 . GA G 865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=1.951;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:54:903,0,54 -chr8 24433794 . T TTC 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.452;DP=38;FS=9.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:740,0,116 -chr8 24493045 . T C 7424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=1.730;DP=221;FS=4.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=33.60;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,177:221:99:7453,0,2176 -chr8 24500332 . T A 12490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.320;DP=355;FS=8.406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.653;QD=33.73;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:35,320:355:99:12519,286,0 -chr8 24527783 . CGA C 620.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:658,51,0 -chr8 24528074 . A T 341.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:4:368,4,0 -chr8 24528269 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr8 24528282 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr8 24534636 . T C 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:439,30,0 -chr8 24536865 . C T 2015.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2044,147,0 -chr8 24536920 . G T 2310.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2339,166,0 -chr8 24543671 . T A 966.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:995,72,0 -chr8 24543695 . G A 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-0.867;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:803,57,0 -chr8 24543873 . C T 789.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.441;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=29.58;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:15:818,0,15 -chr8 24543932 . C G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:270,0,64 -chr8 24544576 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:361,0,144 -chr8 24544595 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:361,0,144 -chr8 24544765 . G T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:79:434,0,79 -chr8 24544777 . C T 322.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:351,0,15 -chr8 24545387 . T C 255.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:284,0,22 -chr8 24552126 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=-0.397;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:470,0,39 -chr8 24559414 . TA T 275.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:313,30,0 -chr8 25639445 . A T 761.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.867;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=33.12;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:17:790,0,17 -chr8 25640687 . CT C 490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.124;DP=43;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:528,0,224 -chr8 25742173 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:273,0,60 -chr8 25743048 . G GT 281.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=23.43;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:4:317,4,0 -chr8 25745369 . G A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr8 25791290 . C T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr8 25825382 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.986;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=28.22;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:1044,0,236 -chr8 25880686 . G A 2427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=1.871;DP=73;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=33.26;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,64:73:51:2456,0,51 -chr8 25895492 . G GA 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.217;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:90:288,0,90 -chr8 25895719 . C A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.791;DP=43;FS=7.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=31.02;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,33:43:99:1362,0,563 -chr8 25896464 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=4.116;DP=38;FS=20.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=16.55;ReadPosRankSum=-3.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:657,0,669 -chr8 25900636 . G C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=2.646;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:306,0,296 -chr8 25938474 . G A 3066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.589;DP=104;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=29.49;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,86:104:99:3095,0,271 -chr8 25943116 . C A 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-0.323;DP=49;FS=5.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:1447,0,239 -chr8 25969465 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:311,0,98 -chr8 25969502 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,126 -chr8 26043205 . G A 461.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=32.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:488,0,4 -chr8 26070664 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.237;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:553,0,316 -chr8 26074182 . A T 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr8 26074312 . T C 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 -chr8 26133792 . C T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.881;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,36:42:57:1382,0,57 -chr8 26144421 . A T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.318;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=32.34;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:675,0,28 -chr8 26145435 . A T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:46:570,0,46 -chr8 26145551 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:88:413,0,88 -chr8 26146007 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.191;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=33.04;ReadPosRankSum=-1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:28:755,0,28 -chr8 26146127 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=1.501;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=31.42;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:65:751,0,65 -chr8 26149913 . TGTAATGTGTACTACAATGTTGGTGGATTTTTTCATAATGTGATACAAGTCATTAATAATAAGTTCAATTAATTTACCTGCAG T 7422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.994;DP=171;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=29.80;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,165:171:99:7460,596,0 -chr8 26150608 . T TA 2121.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.513;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,75:92:99:2159,0,175 -chr8 26150807 . A G 2279.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.460;DP=61;FS=2.366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=29.51;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,56:61:87:2308,87,0 -chr8 26153454 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:424,0,85 -chr8 26154128 . T C 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 -chr8 26156752 . A T 2084.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=2.020;DP=55;FS=2.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2113,108,0 -chr8 26164027 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:260,18,0 -chr8 26176445 . C T 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr8 26183008 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.933;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:348,0,177 -chr8 26183124 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=28.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:315,0,55 -chr8 26205474 . G C 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.710;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.236;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:502,0,197 -chr8 26207495 . C T 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-1.236;DP=37;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1149,0,203 -chr8 26221394 . A G 268.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:297,24,0 -chr8 26252868 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr8 26277601 . G A 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.107;DP=26;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=32.11;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:46:863,0,46 -chr8 26305032 . G A 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.780;DP=28;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:87:889,0,87 -chr8 26419162 . G GA 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.667;DP=18;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:75:318,0,75 -chr8 26443005 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.337;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:576,0,235 -chr8 26446911 . G A 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.957;DP=67;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,35:63:99:1147,0,997 -chr8 26666709 . TCTGAAGCACAGACAGTTTGTTAGCAGTACAACTCATAAAATATCATTAATAACCAAAGAATAAACTACAAATCACAAAAGGGAGCTCAC T 9701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-1.357;DP=223;FS=2.164;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,207:223:99:9739,815,0 -chr8 27075795 . ACTATAAGAGAGAAAGAAAGACTCAATTAATCTTCTCGCCTGTATAATTGCACAGTTGACAGCTGGGAAGAGTGGTAGTATTTCATTCGCTTAGGAAGATGACATGACTATTAATTAC A 679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.598;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=35.88;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:717,0,787 -chr8 27221334 . GA G 2140.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.568;DP=126;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,84:113:99:2178,0,411 -chr8 27279768 . G GT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.596;DP=87;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:314,0,1513 -chr8 27919232 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr8 28058320 . C T 3133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=1.224;DP=79;FS=6.012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=30.75;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,74:77:99:3162,223,0 -chr8 28058487 . C T 4481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=2.104;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,53:61:99:4510,111,0 -chr8 28058488 . C A 4434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=2.026;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,54:62:64:4463,64,0 -chr8 28058559 . C T 1784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.049;DP=71;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=25.14;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1813,0,971 -chr8 28058783 . A AT 797.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.449;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:38:835,38,0 -chr8 28058820 . G A 1911.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.706;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:99:1940,145,0 -chr8 29120996 . G GA 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-2.040;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=1.37;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,35:161:99:269,0,3310 -chr8 29316751 . GA G 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.315;DP=49;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:626,0,347 -chr8 29318280 . G GT 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.586;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:38:665,0,38 -chr8 29380932 . TA T 1537.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=1.665;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,63:92:99:1575,0,408 -chr8 29558196 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=1.358;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:439,0,209 -chr8 30436479 . C T 288.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:317,0,19 -chr8 30443363 . T TA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-0.739;DP=25;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:250,0,252 -chr8 30613134 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=3.415;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=15.99;ReadPosRankSum=-2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:364,0,374 -chr8 30621169 . T A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.343;DP=64;FS=3.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,43:64:99:1477,0,568 -chr8 30621423 . CT C 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.263;DP=36;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:629,0,151 -chr8 30622667 . A AAT 621.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.019;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:659,0,387 -chr8 30667473 . G A 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-1.448;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,52:71:99:1867,0,461 -chr8 30750946 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=21.44;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,136 -chr8 30755456 . C A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr8 30773740 . C T 508.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.085;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:8:536,8,0 -chr8 30918060 . GA G 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-1.563;DP=51;FS=13.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:64:893,0,64 -chr8 30918136 . GA G 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=-0.802;DP=33;FS=16.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:457,0,156 -chr8 31007462 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:267,0,53 -chr8 31169947 . GT G 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.866;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:246,0,262 -chr8 31172847 . C G 381.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=34.73;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:410,0,13 -chr8 31207929 . G T 577.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-0.913;DP=18;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=32.10;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:25:606,0,25 -chr8 31226093 . G C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.146;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,249 -chr8 31272183 . G A 361.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:24:390,0,24 -chr8 31418616 . AAGGTGGATGAGATCATCAGAAATGCTCTTCTACTGCCAAAAAAATCAGCTTTTTGTTGACTGTTTTCAATCTGGTCTCTCTGTGTGTTC A 1118.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=2.627;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=32.42;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:99:1156,0,1590 -chr8 31442585 . A T 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=-1.881;DP=35;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:962,0,262 -chr8 31442693 . T C 944.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.352;DP=25;FS=3.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:37:973,37,0 -chr8 31442953 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,325 -chr8 31442954 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,325 -chr8 31479228 . GGGTACCTCACTATTATCAAACTGTGATCTACATTAACCTTTACTGTGTTAAAAAGTTGATTTGCTCTGTTCTGGTGTGGCCACA G 794.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=2.342;DP=56;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=14.19;ReadPosRankSum=-3.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:832,0,11088 -chr8 31578479 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.006;DP=23;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:693,0,102 -chr8 31579833 . T A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=4.282;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:561,0,700 -chr8 31592510 . G A 4446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-1.422;DP=149;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=29.84;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,116:147:99:4475,0,598 -chr8 31675106 . G GA 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-0.766;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:31:756,0,31 -chr8 31795094 . G GA 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=-0.783;DP=31;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:436,0,107 -chr8 31993816 . AAC A 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.454;DP=31;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:364,0,244 -chr8 32216395 . GCTTTGGGAAGAAAAGAAGAAGCAATATTAATACCCCGTGCAAATGTAGGTGTTGATAAGAGTGTGGTGAAGAGGAGGTGATCTACTCAC G 3175.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.942;DP=80;FS=1.904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=30.08;ReadPosRankSum=-2.934 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,72:76:99:3213,250,0 -chr8 32223282 . T TA 1794.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1950,192,0 -chr8 32224357 . G T 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=1.037;DP=271;FS=8.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,59:270:99:1000,0,7874 -chr8 32229836 . G A 5621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.571;DP=195;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.584;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,149:195:99:5650,0,2529 -chr8 32234474 . A AG 283.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 -chr8 32236214 . G A 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 -chr8 32254806 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=3.462;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=13.85;ReadPosRankSum=-3.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:333,0,832 -chr8 32254815 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=23.44;ReadPosRankSum=-2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:99:333,0,831 -chr8 32290220 . A T 11003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.400;ClippingRankSum=0.246;DP=349;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=31.53;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,283:348:99:11032,0,851 -chr8 32290839 . G T 5495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=-0.639;DP=204;FS=6.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=26.94;ReadPosRankSum=4.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,139:203:99:5524,0,1625 -chr8 32291110 . T G 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=4.205;DP=76;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=9.27;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:733,0,2327 -chr8 32304850 . TA T 242.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:280,27,0 -chr8 32698967 . C T 604.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=24.19;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:6:632,6,0 -chr8 32699297 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.506;DP=21;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:565,0,150 -chr8 32743682 . A G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr8 32747817 . T A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr8 32748464 . C T 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.655;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:99:1899,0,100 -chr8 32790141 . C T 221.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:250,21,0 -chr8 32878219 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.385;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,440 -chr8 32878579 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.042;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=29.47;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:34:559,0,34 -chr8 33229590 . C T 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.622;DP=69;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=23.01;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,45:68:99:1616,0,794 -chr8 33260189 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=1.139;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.877;QD=16.73;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:413,0,392 -chr8 33260202 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=1.602;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:537,0,444 -chr8 33273484 . G A 370.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=33.73;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:399,0,13 -chr8 33650180 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-0.337;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:527,0,276 -chr8 33884282 . G T 6754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DP=221;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,175:220:99:6783,0,785 -chr8 34779124 . G T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=-1.335;DP=162;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:579,0,4974 -chr8 35223846 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-1.912;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:256,0,1777 -chr8 35226379 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-2.019;DP=80;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:301,0,2510 -chr8 35232024 . G A 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.581;DP=88;FS=1.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:632,0,2305 -chr8 35791191 . A G 366.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=33.29;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:10:394,0,10 -chr8 38611988 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.507;DP=58;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,11:58:99:230,0,1851 -chr8 38913868 . G A 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:980,72,0 -chr8 38932290 . A G 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr8 38932292 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr8 38932411 . A T 1291.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1320,90,0 -chr8 38932434 . C T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.237;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=34.71;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,36:39:44:1382,0,44 -chr8 38932602 . A G 1596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1625,114,0 -chr8 38932716 . C A 2157.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2186,154,0 -chr8 38932979 . C T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr8 38933210 . T C 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr8 38933233 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=2.115;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:367,0,199 -chr8 38934079 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=2.045;DP=41;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=6.51;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,774 -chr8 38934080 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-3.364;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.26;ReadPosRankSum=3.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:367,0,662 -chr8 39738386 . ACACG A 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=1.803;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:463,0,370 -chr8 39925353 . C T 1915.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1944,141,0 -chr8 39926606 . T G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.826;ClippingRankSum=-0.615;DP=143;FS=29.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=4.22;ReadPosRankSum=-3.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,29:130:99:631,0,4184 -chr8 39926691 . G C 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.344;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:1087,0,2176 -chr8 39926731 . C A 638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:667,48,0 -chr8 39928202 . C T 1900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1929,132,0 -chr8 39928795 . A T 3312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:3341,229,0 -chr8 39928799 . T G 3312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3341,229,0 -chr8 39929543 . A T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.118;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:620,0,165 -chr8 39929594 . G T 227.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=10;FS=8.451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:11:255,11,0 -chr8 40114323 . A C 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:234,18,0 -chr8 40141206 . A G 1193.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=1.625;DP=62;FS=9.031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=19.26;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:5:1221,5,0 -chr8 40141215 . T C 1199.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=2.192;DP=33;FS=12.330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:13:1228,13,0 -chr8 40141306 . C A 15086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=2.098;DP=493;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.473;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,334:337:99:15115,1098,0 -chr8 40141426 . C T 3990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=1.595;DP=160;FS=7.542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=24.94;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,96:98:99:4019,283,0 -chr8 40141431 . A G 4211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.540;DP=145;FS=7.767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=29.05;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,90:92:99:4240,286,0 -chr8 40141455 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=2.262;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:71:291,0,71 -chr8 40148703 . G GTC 1465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=4.675;DP=106;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=13.83;ReadPosRankSum=-3.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1503,0,1024 -chr8 40199646 . C T 233.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:262,0,19 -chr8 41013701 . A G 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr8 41478086 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=1.344;DP=14;FS=11.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=25.20;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:381,0,124 -chr8 41802500 . GA G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.876;DP=19;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:243,0,210 -chr8 41803044 . TA T 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.453;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:278,0,166 -chr8 41819982 . C CA 901.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=-0.794;DP=60;FS=2.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,43:57:99:1079,0,203 -chr8 41821862 . AC A 1345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.627;DP=53;FS=19.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=25.39;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1383,0,220 -chr8 42034364 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.931;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:304,0,94 -chr8 42060805 . A G 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr8 42063634 . G A 476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:505,36,0 -chr8 42063876 . C G 1114.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-0.042;DP=50;FS=3.289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:42:1143,42,0 -chr8 42191347 . C G 3340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.196;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=28.55;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,91:117:99:3369,0,562 -chr8 42191616 . T TAA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.420;DP=43;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:538,0,312 -chr8 42191711 . GT G 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=-0.151;DP=41;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=7.63;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:350,0,325 -chr8 42191858 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-2.246;DP=35;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:273,0,952 -chr8 42192423 . G T 2984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.589;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.989;QD=26.89;ReadPosRankSum=1.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,79:111:99:3013,0,839 -chr8 42525785 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:389,0,341 -chr8 42525826 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=2.141;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:561,0,148 -chr8 42526925 . G A 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.546;DP=55;FS=10.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1122,0,701 -chr8 42620237 . GA G 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=1.327;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:20:468,20,0 -chr8 42620436 . A G 897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:926,63,0 -chr8 42620758 . T A 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr8 42621111 . A T 1086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1115,78,0 -chr8 42621283 . A G 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1096,81,0 -chr8 42621386 . G T 612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:641,45,0 -chr8 42621425 . C CT 231.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:269,24,0 -chr8 42621660 . A C 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 -chr8 42621710 . A T 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:850,60,0 -chr8 42621859 . A C 949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:978,70,0 -chr8 42621954 . AT A 374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:412,33,0 -chr8 42622342 . T C 1533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1562,111,0 -chr8 42622527 . A C 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=-1.204;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=29.11;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:50:1080,50,0 -chr8 42622588 . A G 1004.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1033,75,0 -chr8 42622688 . G A 580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:609,42,0 -chr8 42622784 . T C 1255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1284,93,0 -chr8 42623222 . A G 3178.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3207,229,0 -chr8 42623975 . A T 2645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2674,204,0 -chr8 42627246 . T C 2419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2448,178,0 -chr8 42627321 . A C 1880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1909,135,0 -chr8 42627480 . T C 1695.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1724,123,0 -chr8 42785179 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr8 42785231 . C T 336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:365,30,0 -chr8 43500645 . AAGGTCAGTCTTGGAAGAGGTCTGATTCTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCATTTAAAACATTTATCTCTCTTTTTGTCTTCATATTCTCACTC A 6356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=1.491;DP=151;FS=3.452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=32.91;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,144:151:99:6394,473,0 -chr8 43501255 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,253 -chr8 43501256 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=23.68;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:265,0,98 -chr8 43501292 . A G 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=2.250;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=31.04;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:77:618,0,77 -chr8 43501401 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-2.849;DP=37;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:585,0,824 -chr8 44070728 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:278,0,138 -chr8 44131478 . T C 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr8 44939390 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:293,0,99 -chr8 44947853 . A ATC 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:255,0,95 -chr8 44948032 . G A 230.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:259,0,13 -chr8 45027460 . A G 246.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:275,0,16 -chr8 45030235 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.86;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:63:333,0,63 -chr8 45137459 . T C 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.633;QD=26.03;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:653,0,138 -chr8 45194740 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,182 -chr8 45421280 . G GA 1214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=1.802;DP=50;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=24.29;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1339,0,706 -chr8 45422264 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=3.684;DP=45;FS=11.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=6.24;ReadPosRankSum=-3.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:309,0,2383 -chr8 45439640 . G A 2502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.650;DP=93;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,79:93:78:2531,0,78 -chr8 45522987 . G A 2616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-1.938;DP=100;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=26.17;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,72:100:99:2645,0,639 -chr8 45794509 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=1.152;DP=28;FS=9.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:475,0,526 -chr8 45794530 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-0.437;DP=47;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:820,0,794 -chr8 45794633 . C T 258.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:287,0,19 -chr8 45794893 . A C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.209;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:275,0,242 -chr8 45795167 . T C 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.245;DP=97;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:1368,0,1812 -chr8 45795288 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:300,0,384 -chr8 45795896 . G A 5616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.301;DP=171;FS=3.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:5645,0,1108 -chr8 45795943 . T C 2940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.434;DP=259;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,85:196:99:2969,0,6224 -chr8 45838192 . ATG A 849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=3.444;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=12.68;ReadPosRankSum=-2.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:887,0,911 -chr8 45838375 . A AT 816.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=-0.913;DP=51;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,34:46:99:854,0,170 -chr8 45913260 . C G 1167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1196,81,0 -chr8 45913261 . A C 1167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1196,81,0 -chr8 46171488 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:331,0,45 -chr8 46310613 . T A 286.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:315,0,19 -chr8 46321436 . AT A 500.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.185;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=33.38;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:36:538,0,36 -chr8 46321658 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.752;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=28.21;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:41:395,0,41 -chr8 46321758 . A G 909.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.324;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:7:937,0,7 -chr8 46321997 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.749;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,281 -chr8 46321999 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.118;DP=14;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:372,0,55 -chr8 46396937 . A G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.334;DP=25;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=30.95;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:43:802,0,43 -chr8 46459446 . TGTGAGTCCTGACTGATTGTTATTATTACATTTAGTTTTTTTCCCCAACTAAATTCTGCCACTCTTTTTTTGCTTGTGTATTAAATGTCGGTTGTCCTGACAG T 4221.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.844;DP=123;FS=2.168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=34.32;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,120:123:99:4259,384,0 -chr8 46490950 . C G 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr8 46504228 . G A 973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.317;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1002,72,0 -chr8 46529582 . A T 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-0.080;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=31.40;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:1190,0,425 -chr8 46529585 . T A 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-1.093;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=32.27;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1190,0,407 -chr8 46529693 . T A 1638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1667,117,0 -chr8 46530213 . G A 1937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.631;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=29.81;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,52:65:99:1966,0,220 -chr8 46530941 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-0.347;DP=49;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:241,0,1482 -chr8 46531565 . G A 1356.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1385,99,0 -chr8 46533171 . A G 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.271;DP=63;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.127;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,51:63:99:1962,0,188 -chr8 46533216 . A G 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.169;DP=62;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=29.45;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,50:62:99:1854,0,199 -chr8 46534060 . T G 1149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.299;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1178,84,0 -chr8 46534090 . A T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.675;DP=33;FS=11.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:74:1068,0,74 -chr8 46535036 . C T 613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:642,45,0 -chr8 46535045 . T A 613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:45:642,45,0 -chr8 46604935 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr8 46604942 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:259,18,0 -chr8 46799410 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:86:324,0,86 -chr8 46799924 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:429,0,214 -chr8 46835195 . TCTAAGAGACGGAAAGCAACAAATGCAATTTGTATTAATATTATTACAGTAATATTAGTGTTCACCAGGGTCACAATAAGCTATATAAAGCAAAATATGCCATGACGTAC T 1056.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.285;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:1094,0,236 -chr8 47138006 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:246,0,373 -chr8 47485632 . GCCTGACAAAACAGAAGACTTGTAATATCAAATAGACATTCAAGAAATAGGTAGAATTTTTACAGAATTCATTA G 2228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.670;DP=66;FS=5.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=33.77;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,56:61:99:2266,0,564 -chr8 47511150 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr8 47918125 . T C 4110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.262;DP=93;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:4139,0,6679 -chr8 47918216 . T C 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=1.414;DP=73;FS=7.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,54:73:99:674,0,8654 -chr8 47918341 . T C 3516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.655;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=31.76;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,65:69:99:3545,254,0 -chr8 47918404 . T C 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.770;DP=68;FS=7.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:562,0,2015 -chr8 47918408 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.689;DP=69;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:401,0,2070 -chr8 47921660 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:63:274,0,63 -chr8 47928750 . CCCTATAAAGGAACAATATGAAAAATCAACTCATTCACAGCCAGCTCACACAAATGAGCGGAGAGTCCAAAGTAGAGCATA C 1441.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=3.414;DP=267;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.223;QD=5.40;ReadPosRankSum=-3.434 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,252:259:99:1479,574,0 -chr8 48373619 . T A 9637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.658;DP=372;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=25.91;ReadPosRankSum=3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,255:372:99:9666,0,3037 -chr8 48418956 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.430;DP=79;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:229,0,2491 -chr8 48467072 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.654;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:293,0,2092 -chr8 48482197 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.021;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:402,0,604 -chr8 48534036 . G T 4837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=1.105;DP=166;FS=3.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=29.14;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,125:166:99:4866,0,931 -chr8 48914636 . A AT 281.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:319,30,0 -chr8 49053014 . A G 1480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-0.558;DP=57;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:1509,0,577 -chr8 49053291 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.762;DP=78;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:338,0,4627 -chr8 49081929 . GCCTACGAATTAAAGTGATTTCAAAGATTAGCATATTGTTCAGACACTGACATAAACTTGGATTTATTAGTATTGTATGTATTGCCAAAGAAACAAAGTTAAGATACTTA G 1189.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=2.598;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1227,0,1630 -chr8 49300176 . C CA 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.427;ClippingRankSum=-1.280;DP=463;FS=10.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:321,89:410:99:594,0,7726 -chr8 49300296 . T G 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=-6.409;DP=59;FS=18.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,33:57:99:1122,0,1184 -chr8 49300297 . C T 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=-6.489;DP=59;FS=25.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.099;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1115,0,1184 -chr8 49300791 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=2.496;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:241,0,1105 -chr8 49300991 . T G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=-1.006;DP=386;FS=30.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,58:384:99:528,0,12136 -chr8 49303205 . CCCTAAAATTCAAGAAAAGCATCCATCAGTCAAAAAAGCAGCTTCCAATTTAATTTACTGACTGATGCTCAGGCATCACCAAAAGCATA C 4428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:4466,438,0 -chr8 49303586 . C T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-2.498;DP=411;FS=14.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=2.28;ReadPosRankSum=3.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:339,72:411:99:966,0,12738 -chr8 49388926 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.633;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:520,0,1360 -chr8 49734538 . T G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr8 49815650 . A T 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.220;DP=314;FS=20.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,68:314:99:1304,0,9414 -chr8 49864558 . C CA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.659;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,34:149:99:393,0,3137 -chr8 49880644 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.576;DP=190;FS=15.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,39:189:99:714,0,5489 -chr8 49914835 . T TA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=1.282;DP=40;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:250,0,709 -chr8 50023782 . C A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=1.542;DP=146;FS=4.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,23:146:99:332,0,9558 -chr8 50023786 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=1.442;DP=141;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=2.20;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,23:141:99:338,0,9558 -chr8 50076335 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.295;DP=72;FS=5.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:487,0,2003 -chr8 50106541 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:300,0,493 -chr8 50706354 . T TA 323.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:37:368,37,0 -chr8 50768532 . AAGGTAAGACTTAAAAATCTTAATATTCATCAAAAAGCGAAGTGAATGATTACTAATAAATCACATGCGACCTCTTTC A 1505.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-0.510;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=24.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1543,127,0 -chr8 50775561 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:533,36,0 -chr8 50821111 . A T 1329.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1358,96,0 -chr8 51058695 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr8 51058738 . G T 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 -chr8 51061686 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr8 51061695 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr8 51064963 . C T 689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:718,51,0 -chr8 51069832 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr8 51072846 . G A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr8 51074438 . C A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr8 51074990 . C A 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr8 51075020 . G A 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:477,33,0 -chr8 51352985 . AG A 374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:31:412,31,0 -chr8 51352988 . T A 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:31:412,31,0 -chr8 51465212 . A G 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr8 51465369 . C A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr8 51466994 . G A 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 -chr8 51467822 . G A 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 -chr8 51467931 . T C 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr8 51467947 . T A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr8 51467981 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr8 51468116 . C A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr8 51479693 . A C 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr8 51479719 . C CA 277.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:315,30,0 -chr8 51480668 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:260,18,0 -chr8 51480699 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.380;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,182 -chr8 51480787 . T C 1441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:99:1470,99,0 -chr8 51480797 . C T 856.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.908;DP=24;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=35.81;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:885,60,0 -chr8 51480917 . A T 618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:49:647,49,0 -chr8 51480998 . GA G 407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:36:445,36,0 -chr8 51481431 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=13.28;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:254,0,141 -chr8 51482251 . C T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr8 51482494 . T C 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:470,33,0 -chr8 51485091 . C G 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:630,48,0 -chr8 51569542 . A G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 -chr8 51569549 . A G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 -chr8 51569771 . CAT C 299.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:337,30,0 -chr8 51571502 . TA T 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.633;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:430,0,144 -chr8 51576285 . G A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr8 51581619 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr8 51664985 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr8 51665275 . TG T 1700.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1738,130,0 -chr8 51706158 . G A 1276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1305,96,0 -chr8 51706182 . C T 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr8 51996330 . G T 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1086,78,0 -chr8 52006706 . A AC 9025.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.738;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=26.69;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,207:209:99:9198,616,0 -chr8 52006712 . G A 9934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,223:223:99:9963,680,0 -chr8 52006988 . CA C 6310.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.040;DP=225;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,204:214:99:6348,618,0 -chr8 52007029 . T TG 717.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.360;DP=101;FS=2.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,38:56:99:755,0,358 -chr8 52010217 . CA C 822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.268;DP=42;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=19.59;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,32:40:67:860,0,67 -chr8 52010957 . T TTG 343.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.738;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=24.54;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3:379,0,3 -chr8 52012425 . G A 1319.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1348,93,0 -chr8 52012702 . G A 581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:610,42,0 -chr8 52016559 . C T 14528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=359;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,359:359:99:14557,1092,0 -chr8 52020619 . A G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:343,24,0 -chr8 52020887 . CT C 548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:586,52,0 -chr8 52021291 . A G 726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:755,54,0 -chr8 52021335 . A T 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr8 52022566 . C A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr8 52024956 . C A 3860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3889,276,0 -chr8 52027310 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr8 52047542 . A C 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1020,72,0 -chr8 52080766 . T A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr8 52081019 . CT C 257.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:295,27,0 -chr8 52081047 . T C 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 -chr8 52082247 . A G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:651,48,0 -chr8 52082521 . A C 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr8 52115239 . A T 939.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:968,75,0 -chr8 52127140 . G T 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:656,45,0 -chr8 52127369 . G A 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:435,33,0 -chr8 52127632 . T G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 -chr8 52127903 . G A 520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:549,39,0 -chr8 52127986 . A T 653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:682,48,0 -chr8 52128790 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr8 52128904 . A T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:338,24,0 -chr8 52128918 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:290,21,0 -chr8 52129075 . G T 637.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-1.335;DP=19;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=33.57;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:23:666,0,23 -chr8 52129093 . C G 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:903,66,0 -chr8 52129237 . T G 513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:542,39,0 -chr8 52129266 . C T 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:524,39,0 -chr8 52129293 . C T 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:658,48,0 -chr8 52145269 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.394;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.771;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:266,0,736 -chr8 52281249 . C A 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 -chr8 52432017 . G A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr8 52569141 . A T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr8 52573362 . T A 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr8 52575180 . C A 279.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:308,0,17 -chr8 52575455 . A T 249.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:278,0,22 -chr8 52576204 . T G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.58;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:264,0,106 -chr8 52577067 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:280,0,66 -chr8 52613152 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr8 52613435 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=1.545;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:616,0,406 -chr8 52613869 . C T 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr8 52614153 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:344,0,288 -chr8 52615209 . GA G 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.673;DP=28;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:376,0,285 -chr8 52615336 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-2.670;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=32.25;ReadPosRankSum=2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:66:512,0,66 -chr8 52624363 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.990;DP=110;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,29:110:99:691,0,3115 -chr8 52632606 . T A 1921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.425;DP=68;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,51:68:99:1950,0,413 -chr8 52644356 . T A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:408,0,202 -chr8 52647703 . C G 3308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3337,237,0 -chr8 52647722 . C T 4408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4437,316,0 -chr8 52756176 . G GA 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.334;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:319,0,420 -chr8 53216141 . A G 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.311;DP=58;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:1082,0,1056 -chr8 53216272 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.691;DP=37;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:616,0,706 -chr8 53216427 . T C 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=-0.550;DP=62;FS=1.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,43:62:99:1644,0,526 -chr8 53216614 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=2.488;DP=23;FS=7.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:476,0,728 -chr8 53216641 . A T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=2.233;DP=22;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:399,0,822 -chr8 53217978 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=2.065;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=21.56;ReadPosRankSum=-2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:783,0,468 -chr8 53218308 . G T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=1.426;DP=37;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=21.48;ReadPosRankSum=2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:823,0,1155 -chr8 53218309 . AG A 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.163;DP=38;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=20.68;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:823,0,1155 -chr8 53218370 . G T 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=2.117;DP=42;FS=10.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=27.26;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,31:42:99:1173,0,265 -chr8 53218673 . C T 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.621;DP=31;FS=4.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=30.09;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:93:1381,93,0 -chr8 53218905 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,326 -chr8 53222270 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:434,0,239 -chr8 53228889 . C T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=4.455;DP=47;FS=23.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=19.29;ReadPosRankSum=-3.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:935,0,2171 -chr8 53231260 . T A 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=-0.941;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=27.85;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,44:61:99:1727,0,421 -chr8 53231605 . T G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-1.926;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.894;QD=15.22;ReadPosRankSum=2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:576,0,678 -chr8 53232021 . C A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr8 53232955 . A G 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.570;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=28.22;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1016,0,184 -chr8 53233095 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.331;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=30.24;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:875,0,489 -chr8 53235298 . C G 1235.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:99:1264,99,0 -chr8 53235395 . CA C 1226.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=30.89;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:99:1264,99,0 -chr8 53235540 . A T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.091;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:552,0,1351 -chr8 53235573 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=1.018;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:552,0,1315 -chr8 53235833 . A AC 370.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:408,30,0 -chr8 53236228 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=-1.501;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:322,0,335 -chr8 53236715 . T C 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=-1.878;DP=58;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,36:57:99:1250,0,659 -chr8 53236811 . T C 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-1.050;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1060,0,361 -chr8 53431404 . T G 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:882,63,0 -chr8 53433636 . A G 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:657,48,0 -chr8 53593319 . G GAC 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:251,0,53 -chr8 53598659 . C T 6450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=1.536;DP=185;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=34.87;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,169:185:99:6479,231,0 -chr8 53606452 . CACCTGTGTGCAAAAACAGGCCTCTGTGAGTTCATCTGTTTACAGCCAAACACAGACAACTAATCAAAGAATTAATCATTTTAATTAATGCAAGACTT C 8031.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=1.243;DP=177;FS=3.237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,176:177:99:8069,708,0 -chr8 53608888 . T C 6024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.869;DP=167;FS=1.079;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=27.84;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,153:167:99:6053,231,0 -chr8 53636792 . GCACCTAGGTTTTAAACACATGCATCAGATGCAGTACCATCATAATTACCCATCATGCCACGATAACCGGATGAAAAGTCT G 3035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:3073,251,0 -chr8 53653517 . T G 233.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:262,0,22 -chr8 53709853 . T C 1379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1408,102,0 -chr8 53711256 . CA C 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=30.16;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:369,0,148 -chr8 53711422 . T G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr8 53719478 . T C 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.227;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=23.99;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:412,0,316 -chr8 53719484 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=32.94;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:412,0,316 -chr8 53719828 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-2.855;DP=13;FS=12.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:321,0,124 -chr8 53724045 . G A 1584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.633;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=31.12;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1613,129,0 -chr8 53735129 . C T 335.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 -chr8 54000265 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=1.317;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:392,0,992 -chr8 54000269 . A G 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.526;DP=36;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:825,0,181 -chr8 54055436 . C T 205.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:234,0,21 -chr8 54055633 . T C 785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.387;DP=20;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=25.69;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:814,57,0 -chr8 54200065 . T A 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr8 54203657 . G A 557.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-0.373;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=32.81;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:25:586,0,25 -chr8 54203914 . C T 696.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:725,51,0 -chr8 54213525 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr8 54219504 . A C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.774;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:326,0,128 -chr8 54228241 . T C 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:445,33,0 -chr8 54229991 . T C 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 -chr8 54290849 . T A 2786.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=1.357;DP=79;FS=5.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,71:79:15:2815,15,0 -chr8 54293824 . G T 3545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.315;DP=90;FS=2.130;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,87:90:99:3574,262,0 -chr8 54294153 . G A 2481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.465;DP=69;FS=1.647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=29.05;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,62:68:69:2510,69,0 -chr8 54294213 . T C 2188.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=1.161;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=28.03;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:2217,120,0 -chr8 54294240 . G A 2242.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=1.670;DP=57;FS=2.788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=28.45;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2271,166,0 -chr8 54304909 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=3.269;DP=17;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=11.87;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:230,0,381 -chr8 54307961 . T C 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.671;DP=58;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=30.81;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,45:58:99:1815,0,718 -chr8 54307964 . G A 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-1.234;DP=54;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=33.09;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1815,0,707 -chr8 54308228 . G A 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=2.080;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=30.49;ReadPosRankSum=-2.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:99:1148,0,103 -chr8 54315942 . C A 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=1.396;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,67:72:99:2659,123,0 -chr8 54320318 . G A 1236.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.277;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1265,109,0 -chr8 54321231 . T A 2449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=-0.493;DP=81;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=30.24;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,67:81:99:2478,0,200 -chr8 54323697 . C T 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=-0.607;DP=104;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,87:104:99:3264,0,180 -chr8 54346123 . G T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=2.848;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,510 -chr8 54346130 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=2.524;DP=14;FS=8.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=18.98;ReadPosRankSum=-2.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:294,0,510 -chr8 54348453 . T C 2190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.486;DP=66;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=33.19;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,57:66:63:2219,0,63 -chr8 54349056 . G T 1920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.435;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.67;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,53:66:99:1949,0,259 -chr8 54359603 . G T 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.247;DP=43;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=30.16;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:43:83:1325,0,83 -chr8 54361218 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=2.342;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:806,0,102 -chr8 54361376 . T C 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=2.509;DP=30;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:838,0,177 -chr8 54364169 . G A 1856.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.364;DP=56;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=33.16;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:0:1882,0,0 -chr8 54386485 . T C 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:349,27,0 -chr8 54386984 . T C 1256.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1285,90,0 -chr8 54387082 . G A 2237.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.490;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=30.43;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,47:50:81:2266,81,0 -chr8 54387092 . C T 2227.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.389;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:71:2256,71,0 -chr8 54387455 . A T 1439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1468,101,0 -chr8 54421198 . A G 1878.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.066;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=33.54;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:8:1906,0,8 -chr8 54626021 . A G 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.112;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:378,0,824 -chr8 54626036 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.049;DP=29;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:305,0,1083 -chr8 54626471 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.655;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:434,0,1118 -chr8 54730437 . G T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr8 54976904 . GTGCAACAGCTTGACATTTTATGATGTTTCACAAATGATATTATAATTTTCTTTTATTGTTTGCTA G 12048.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-1.227;DP=255;FS=3.185;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=32.82;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,254:255:99:12130,1136,0 -chr8 54976973 . CAAACCATTTTAACCCTGTATTTGTAATCTTTTAGGAGGT C 11055.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.094;DP=275;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,273:275:99:11093,1129,0 -chr8 55062885 . A C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.926;DP=18;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:419,0,163 -chr8 55062945 . T C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=2.708;DP=32;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:490,0,740 -chr8 55063063 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.074;DP=62;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:507,0,1068 -chr8 55063164 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.305;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:381,0,488 -chr8 55118753 . G GATCTTTAGAGTCTTTTGCGGGATCTTTAGAGTCTTTTGCGGGATC 1037.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=-0.324;DP=42;FS=9.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=24.71;ReadPosRankSum=-3.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:1075,0,566 -chr8 55130760 . GT G 210.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-0.348;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:245,0,0 -chr8 55176223 . TC T 1650.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-2.123;DP=126;FS=11.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=13.10;ReadPosRankSum=2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,74:96:99:1688,0,221 -chr8 55176248 . GT G 4101.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.229;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=34.03;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:4139,399,0 -chr8 55176250 . GTGTGTGTGTGT G 2215.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=1.361;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,94:96:99:3988,301,0 -chr8 55179607 . C T 14377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=359;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,359:359:99:14406,1078,0 -chr8 55236398 . C T 11037.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=286;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,285:285:99:11066,841,0 -chr8 55236482 . T A 8942.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:228:99:8971,685,0 -chr8 55248353 . T C 590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:619,42,0 -chr8 55248362 . G A 590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:619,42,0 -chr8 55265202 . G A 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:449,36,0 -chr8 55282021 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:245,18,0 -chr8 55282022 . T A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:245,18,0 -chr8 55282073 . C T 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr8 55301635 . C T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr8 55314571 . G A 213.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.56;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:242,0,15 -chr8 55321100 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:315,0,49 -chr8 55326895 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-1.197;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=31.40;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:77:562,0,77 -chr8 55348137 . A G 612.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.714;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=32.44;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:16:641,16,0 -chr8 55350739 . AGTAAGCCCTCAACCACAGCTATAATGCTCAATATCCATCTGTTCGCTTGTTTAATGGTTAGTTTCCTCTGTGTTTGTGTGTGCAG A 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=34.22;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:927,0,1155 -chr8 55354810 . CCAATATCAGTCTCTCAGAGCAAACAAAGCAGAAGATCCTTCACTCAGAGCAAACAAAACT C 1055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,1:4:99:1093,0,125 -chr8 55355867 . G A 559.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:588,45,0 -chr8 55356119 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr8 55357777 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:29:309,0,29 -chr8 55359795 . G A 925.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=1.280;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=33.04;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:12:953,0,12 -chr8 55359860 . G GT 787.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DP=47;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:825,0,240 -chr8 55359928 . G A 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=5.364;DP=49;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=18.14;ReadPosRankSum=-5.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:917,0,715 -chr8 55364751 . A AAT 292.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:330,27,0 -chr8 55364957 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:287,0,55 -chr8 55365554 . G A 450.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=32.18;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:3:477,3,0 -chr8 55366005 . CA C 576.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=-0.125;DP=29;FS=2.269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:13:614,13,0 -chr8 55366014 . A T 870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.952;DP=30;FS=6.576;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=29.02;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:43:1062,43,0 -chr8 55382143 . A T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:303,21,0 -chr8 55396617 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.830;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:248,0,379 -chr8 55397579 . GA G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:277,0,54 -chr8 55398427 . G A 557.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=34.87;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:584,2,0 -chr8 55403048 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.093;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,544 -chr8 55405558 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -chr8 55405611 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr8 55408219 . T A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 -chr8 55408343 . T C 3297.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-1.142;DP=91;FS=1.649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.87;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,83:91:93:3326,93,0 -chr8 55545621 . G A 1879.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.083;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=34.81;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,50:54:80:1908,80,0 -chr8 55550189 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.405;DP=42;FS=3.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:86:1324,0,86 -chr8 55550398 . A T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr8 55556010 . CGT C 939.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=1.648;DP=122;FS=22.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:977,0,1735 -chr8 55556112 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=-1.092;DP=83;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:245,0,3108 -chr8 55556212 . T G 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=16;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:99:1283,0,2237 -chr8 55556222 . T C 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=26.02;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:1283,0,2222 -chr8 55556280 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=-1.839;DP=135;FS=15.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:1283,0,2237 -chr8 55557098 . A T 797.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=1.552;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:13:826,0,13 -chr8 55557107 . A T 822.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=-0.057;DP=23;FS=3.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=27.41;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:24:851,24,0 -chr8 55558047 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=24.57;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:495,0,193 -chr8 55558398 . T C 1169.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-1.096;DP=34;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=34.41;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:27:1198,0,27 -chr8 55558696 . C A 1403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.714;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=27.15;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1432,99,0 -chr8 55558835 . T C 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:489,36,0 -chr8 55559010 . A G 1342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-1.733;DP=32;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=25.76;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1371,93,0 -chr8 55559084 . T G 946.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=31.25;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:975,66,0 -chr8 55667158 . CG C 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=17;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=15.57;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:55:355,0,55 -chr8 55764021 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=2.850;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=25.49;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:436,0,119 -chr8 55785604 . A G 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr8 55785651 . G A 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:413,30,0 -chr8 55789692 . A T 1456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.964;DP=42;FS=1.969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=34.68;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,38:42:39:1485,39,0 -chr8 55805646 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.481;DP=38;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:304,0,1003 -chr8 55856476 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=23.81;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:314,0,401 -chr8 56081058 . TATGAAGATG T 487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=1.504;DP=20;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=24.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:38:525,38,0 -chr8 56085422 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,1:3:47:244,0,47 -chr8 56085427 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,1:3:47:244,0,47 -chr8 56085674 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=3.179;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=14.94;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:312,0,1206 -chr8 56085679 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=3.096;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=14.94;ReadPosRankSum=-3.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:312,0,1200 -chr8 56085933 . A G 876.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:63:905,63,0 -chr8 56151694 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=20.71;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:256,0,709 -chr9 30926 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=2.331;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:291,0,905 -chr9 50485 . G A 1782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=2.327;DP=40;FS=10.726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=26.90;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:99:1811,123,0 -chr9 54872 . A G 2052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.096;DP=489;FS=3.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:382,107:489:99:2081,0,19544 -chr9 152372 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=2.571;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:433,0,930 -chr9 165331 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=2.410;DP=46;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=7.52;ReadPosRankSum=-2.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,10:46:99:374,0,3500 -chr9 165335 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=2.915;DP=53;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=6.39;ReadPosRankSum=-2.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:367,0,3500 -chr9 166158 . G T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.892;ClippingRankSum=0.086;DP=83;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:470,0,3854 -chr9 167211 . A C 2420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=-1.417;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=14.24;ReadPosRankSum=2.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,70:170:99:2449,0,3310 -chr9 181244 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=1.261;DP=58;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.183;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:442,0,1632 -chr9 184612 . TGGTAATCACACACTCGACTCTTCTAACATGTATTTGCTGGATCTTAATATAACTTTAATCTGACTTTGTGATCCACTCA T 3991.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.930;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=25.68;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,92:94:99:4029,295,0 -chr9 210140 . C T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.701;DP=146;FS=5.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,39:145:99:894,0,3987 -chr9 210772 . CGTACGTCTCCTCATACACCCAGATCCTGAAGCAGACATCTTAATGCTGTGAATCTGTTATTAACGTCTGTCAGTTTCCTCTTCAG C 6381.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=1.543;DP=168;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=31.05;ReadPosRankSum=-0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,166:168:99:6419,528,0 -chr9 217346 . G A 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=1.126;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:868,0,1634 -chr9 227908 . GA G 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:252,0,251 -chr9 229593 . C T 4912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-0.492;DP=370;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,142:369:99:4941,0,7752 -chr9 230878 . C T 2135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=-1.733;DP=276;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,86:276:99:2164,0,7150 -chr9 230895 . T A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.526;DP=242;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,64:242:99:1453,0,6757 -chr9 231203 . TAG T 2145.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2183,189,0 -chr9 247146 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.778;DP=16;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:241,0,788 -chr9 251022 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.177;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:325,0,201 -chr9 251118 . G T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:71:458,0,71 -chr9 251130 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=28.81;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:43:374,0,43 -chr9 271716 . A C 1425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=-1.049;DP=77;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,45:77:99:1454,0,972 -chr9 271740 . G A 1754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.779;DP=114;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=15.39;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1783,0,1798 -chr9 289511 . C CGTG 261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:20:299,20,0 -chr9 326494 . C A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.517;DP=74;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:512,0,2143 -chr9 327394 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=1.799;DP=33;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:252,0,926 -chr9 332604 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.240;DP=122;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,27:121:99:391,0,3122 -chr9 381661 . G T 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.202;DP=51;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1502,0,177 -chr9 381732 . ACAGGTCATCATCCCTGCAGTCATACACCGACACACACACGCTCGTGCGCAGAACATCTTCACTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG A 2974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=2.381;DP=71;FS=3.030;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=26.12;ReadPosRankSum=-2.414 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:3012,230,0 -chr9 400744 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=-1.804;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,20:112:99:322,0,3572 -chr9 402879 . C T 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.306;DP=95;FS=2.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:787,0,2435 -chr9 404637 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=-0.888;DP=90;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:309,0,2621 -chr9 412926 . A C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-2.558;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=6.41;ReadPosRankSum=-4.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:259,0,1085 -chr9 413010 . G A 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:48:678,48,0 -chr9 418830 . C A 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.907;DP=171;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,46:171:99:1040,0,4613 -chr9 422863 . C T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.979;DP=169;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,39:169:99:792,0,4868 -chr9 423420 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.154;DP=96;FS=2.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=4.66;ReadPosRankSum=2.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:476,0,2672 -chr9 427380 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-2.213;DP=213;FS=0.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,50:211:99:905,0,5631 -chr9 427659 . AACTCACCTGCACACACACCATTCACTGGTTCATCATCCTCCTCCTCTGCTCCTCCTTCATCATCGTCTGCTCT A 7661.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.902;DP=184;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,156:160:99:7699,695,0 -chr9 429900 . G GAC 221.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:13:259,13,0 -chr9 431792 . ACT A 402.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 -chr9 444024 . G T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.615;DP=138;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,35:138:99:781,0,3719 -chr9 453791 . GGGTAGGGCGCGCTCGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGACCTGAATGTGTGTGTGTGTTCTCTCCACA G 18310.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.238;ClippingRankSum=1.244;DP=435;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=35.07;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,421:435:99:18348,1543,0 -chr9 457372 . C A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.046;ClippingRankSum=0.930;DP=318;FS=17.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=3.01;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,93:305:99:984,0,10855 -chr9 458857 . A G 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.326;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:973,0,210 -chr9 458908 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-2.815;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:389,0,1307 -chr9 458958 . A G 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.483;DP=61;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,30:61:99:1062,0,1113 -chr9 459840 . C T 1745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.413;DP=255;FS=2.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.953;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,77:254:99:1774,0,5650 -chr9 459935 . AGCCGCAGGTAGGCC A 6034.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.491;DP=252;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.547;QD=23.95;ReadPosRankSum=-3.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,171:243:99:6072,0,2903 -chr9 459938 . CGCAGGTAGGCCACCGCACGGCATGCTGGGAGTCAGCTGTACGTACCAAAGAGTGTTAAACTCTGCTTCACTGTCTGCCCCG C 1375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-0.923;DP=258;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=5.33;ReadPosRankSum=3.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,67:237:99:1413,0,7371 -chr9 459952 . CGCACGGCATGCTGGGAGTCAGCTGTACGTACCAAAGAGTGTTAAACTCTGCTTCACTGTCTGCCCCG C 6034.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.731;DP=249;FS=7.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,161:230:99:6072,0,2887 -chr9 461593 . TA T 584.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-0.020;DP=34;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:622,0,183 -chr9 462355 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.535;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:300,0,491 -chr9 464286 . T TTACAGTAATGATACTCG 946.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,1:2:99:9012,568,0 -chr9 468315 . TACACACACACACACACACGCACACACACACACACACAC T,TACACAC 355.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,6:13:99:799,355,749,444,0,332 -chr9 489989 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.365;DP=15;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,302 -chr9 489997 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.365;DP=15;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,302 -chr9 494709 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.964;DP=32;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:236,0,823 -chr9 495679 . G T 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=1.681;DP=71;FS=8.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1176,0,1358 -chr9 495709 . C T 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=-2.529;DP=64;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:873,0,1257 -chr9 513172 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.535;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:367,0,1570 -chr9 524718 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:309,0,56 -chr9 526588 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=2.298;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:282,0,205 -chr9 568744 . T C 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.935;DP=67;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,32:67:99:1201,0,1267 -chr9 568998 . G A 682.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=38.34;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:18:711,18,0 -chr9 569016 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=4.042;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=7.91;ReadPosRankSum=-3.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:234,0,756 -chr9 569244 . T C 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.649;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.693;QD=14.13;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:1568,0,2058 -chr9 575141 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.115;DP=73;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:400,0,1914 -chr9 583795 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=2.502;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:452,0,2947 -chr9 586209 . C G 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.941;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:1479,0,1828 -chr9 588682 . C T 1926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.542;DP=139;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1955,0,2719 -chr9 597095 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.233;DP=68;FS=6.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=12.23;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:860,0,2364 -chr9 610067 . G A 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-1.168;DP=87;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:1513,0,1471 -chr9 697597 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=1.359;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:495,0,1405 -chr9 697619 . C A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.568;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:388,0,1289 -chr9 701001 . A AAC 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=-0.951;DP=68;FS=2.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:281,0,1414 -chr9 707445 . C G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.349;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:572,0,2009 -chr9 717679 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=-0.427;DP=70;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:282,0,4226 -chr9 726631 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-0.575;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:244,0,2566 -chr9 743920 . TA T 504.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:542,52,0 -chr9 882130 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:329,0,275 -chr9 901053 . T G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=1.726;DP=54;FS=4.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:303,0,1481 -chr9 956707 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:455,0,671 -chr9 1011400 . T A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.830;DP=62;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=6.50;ReadPosRankSum=2.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:431,0,2731 -chr9 1167647 . C G 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=-0.705;DP=44;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:775,0,1038 -chr9 1167669 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.919;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:398,0,384 -chr9 1181119 . G C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.110;DP=70;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:266,0,2170 -chr9 1186156 . A T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.354;DP=47;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:408,0,1207 -chr9 1192690 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.278;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:241,0,1700 -chr9 1197662 . A G 281.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:310,0,19 -chr9 1197670 . A G 315.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=31.59;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:344,0,16 -chr9 1197770 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=-1.226;DP=48;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:260,0,1418 -chr9 1252306 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-2.606;DP=68;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:562,0,1627 -chr9 1256419 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=-0.607;DP=63;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:767,0,1362 -chr9 1256488 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-1.912;DP=68;FS=4.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:395,0,1745 -chr9 1263753 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.499;DP=77;FS=5.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:369,0,2258 -chr9 1363789 . C A 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=32.54;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:1279,0,287 -chr9 1363853 . C T 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.543;DP=54;FS=8.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1279,0,329 -chr9 1363985 . A G 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.593;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.091;QD=33.14;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:1155,0,244 -chr9 1364012 . C A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.365;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=30.90;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:99:1155,0,244 -chr9 1364161 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=29.34;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:90:351,0,90 -chr9 1575703 . C CTA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=1.461;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:244,0,168 -chr9 1576331 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:269,0,52 -chr9 1587797 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.864;DP=48;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:653,0,993 -chr9 1662948 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-1.159;DP=75;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:265,0,2383 -chr9 1668898 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.530;DP=94;FS=12.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:269,0,2992 -chr9 1670597 . T TC 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.466;DP=32;FS=3.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:279,0,565 -chr9 1671344 . T G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.810;DP=47;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:412,0,1276 -chr9 1929575 . T C 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-4.378;DP=54;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:857,0,1003 -chr9 1929898 . T G 1638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.307;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:1667,0,2172 -chr9 1932993 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:256,0,399 -chr9 1939608 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.220;DP=24;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:326,0,611 -chr9 1939895 . CA C 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:57:245,0,57 -chr9 1939943 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=2.747;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:388,0,234 -chr9 1958777 . T A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.091;DP=33;FS=5.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:518,0,678 -chr9 1996545 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,348 -chr9 2021478 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.038;DP=106;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:459,0,3194 -chr9 2023186 . A G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-0.011;DP=114;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,30:103:99:762,0,2861 -chr9 2336164 . A T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=-1.791;DP=97;FS=6.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,30:97:99:776,0,2414 -chr9 2342700 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.55;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:81:414,0,81 -chr9 2378752 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,207 -chr9 2378850 . C G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:396,0,517 -chr9 2379962 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=1.129;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:457,0,1022 -chr9 2381970 . T G 850.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.158;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=26.62;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:879,63,0 -chr9 2382798 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:287,0,56 -chr9 2383974 . C T 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr9 2389822 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.839;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,567 -chr9 2389856 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.290;DP=23;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:257,0,495 -chr9 2400983 . A C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.416;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:359,0,528 -chr9 2418748 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.125;DP=48;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:345,0,1288 -chr9 2424812 . A G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.373;DP=21;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:356,0,440 -chr9 2454387 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:246,0,460 -chr9 2478490 . C T 475.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=33.99;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:502,2,0 -chr9 2479850 . CA C 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 -chr9 2480704 . T A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=-0.092;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:419,0,388 -chr9 2480862 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.119;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:550,0,327 -chr9 2493650 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.762;DP=31;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:253,0,809 -chr9 2510051 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=19.32;ReadPosRankSum=2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:434,0,249 -chr9 2552322 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.387;DP=71;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:270,0,2090 -chr9 2552628 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,322 -chr9 2775139 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.797;DP=41;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:606,0,715 -chr9 2776564 . T TA 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:267,0,501 -chr9 2777813 . C T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr9 3123605 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=1.992;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=17.61;ReadPosRankSum=-2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:398,0,278 -chr9 3123949 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=1.378;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:269,0,336 -chr9 3131427 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,785 -chr9 3131429 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,785 -chr9 3306938 . G A 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.029;DP=178;FS=9.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,57:178:99:1552,0,4663 -chr9 3394197 . G C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-1.188;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:294,0,2504 -chr9 3445218 . T C 1890.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1919,144,0 -chr9 3459683 . G T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.333;DP=53;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:466,0,1371 -chr9 3471366 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-0.844;DP=57;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:350,0,1651 -chr9 3471511 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.364;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:250,0,1369 -chr9 3473391 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-0.312;DP=54;FS=23.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:895,0,921 -chr9 3534393 . A T 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:238,0,25 -chr9 3534716 . A G 763.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:792,57,0 -chr9 3535118 . T C 663.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:692,48,0 -chr9 3535186 . G A 670.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=26.80;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:698,8,0 -chr9 3535268 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -chr9 3535683 . A T 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:522,36,0 -chr9 3536110 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr9 3536478 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr9 3602102 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.878;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:762,0,3073 -chr9 3605913 . T A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-2.148;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:365,0,359 -chr9 3616260 . T C 204.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=34.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:233,0,23 -chr9 3911372 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-1.140;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:456,0,448 -chr9 3911386 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.264;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:349,0,616 -chr9 3911520 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-2.023;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=11.59;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:376,0,667 -chr9 3912703 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=1.169;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:447,0,688 -chr9 3915470 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.166;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:773,0,887 -chr9 3915489 . C G 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.273;DP=54;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:767,0,1076 -chr9 4385461 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.091;DP=66;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:526,0,1684 -chr9 4385761 . A G 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.042;DP=69;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=17.53;ReadPosRankSum=-2.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1238,0,1134 -chr9 4397366 . T G 1959.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1988,141,0 -chr9 4397386 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=-0.767;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:322,0,1435 -chr9 4737324 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.541;DP=100;FS=3.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:495,0,1533 -chr9 4737366 . T C 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-1.905;DP=41;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=25.73;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1083,0,186 -chr9 4737807 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-1.140;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,451 -chr9 4737980 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,222 -chr9 4739075 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.007;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:378,0,376 -chr9 4739452 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.372;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:268,0,873 -chr9 4775448 . A T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr9 5048234 . GT G 583.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-0.248;DP=21;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=27.80;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:61:621,61,0 -chr9 5050389 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-2.535;DP=47;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:548,0,1021 -chr9 5350994 . G A 271.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:300,0,18 -chr9 6164530 . C CT 670.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.601;DP=112;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,35:102:99:708,0,1590 -chr9 6166105 . GA G 822.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:860,85,0 -chr9 6579921 . A G 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 -chr9 6700263 . CT C 840.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.931;DP=84;FS=8.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:878,0,906 -chr9 6955510 . G A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:746,51,0 -chr9 6955511 . T A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:746,51,0 -chr9 6956439 . T G 793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:822,60,0 -chr9 7122294 . G A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.552;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:871,0,311 -chr9 7122306 . A G 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.207;DP=37;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:858,0,423 -chr9 7130699 . C A 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=1.083;DP=90;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.962;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:1404,0,1649 -chr9 7134606 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=2.315;DP=29;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:389,0,648 -chr9 7263305 . A G 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:24:336,24,0 -chr9 7280014 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=1.675;DP=37;FS=10.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:519,0,1637 -chr9 7280018 . C A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=1.074;DP=38;FS=9.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:519,0,1626 -chr9 7446897 . G GA 331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:369,36,0 -chr9 7447286 . G A 245.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:274,0,22 -chr9 7452144 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.790;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:341,0,480 -chr9 7497946 . GA G 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-1.265;DP=95;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.56;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,32:85:99:850,0,2223 -chr9 7542786 . A AT 209.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:247,23,0 -chr9 7543732 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.774;ClippingRankSum=3.566;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,875 -chr9 7544842 . G T 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-1.984;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=31.63;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1072,0,127 -chr9 7545313 . A G 292.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:11:320,0,11 -chr9 7559723 . G A 244.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:273,0,16 -chr9 7559739 . A C 237.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:11:265,0,11 -chr9 7559836 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-0.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:382,0,85 -chr9 7563999 . TCCTGAAATCAACAGAAATAACAATATGAAATGTGCAGTATTAAATCAGTTCATAAACATTACAAGAGCCCTTTCTCTCTTA T 17193.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.710;DP=393;FS=3.016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=29.58;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,390:392:99:17231,1367,0 -chr9 7571087 . A C 206.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:235,0,19 -chr9 7611186 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.429;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.143;QD=16.72;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:396,0,359 -chr9 7616938 . T A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:531,0,310 -chr9 7616953 . G T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.145;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:686,0,365 -chr9 7629504 . C T 1682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-0.543;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,45:59:99:1711,0,338 -chr9 7642466 . T A 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.860;DP=65;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:1823,0,331 -chr9 7646040 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.447;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,291 -chr9 7655665 . A G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:289,21,0 -chr9 7655741 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=25.68;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,210 -chr9 7656211 . C T 202.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:231,0,22 -chr9 7656297 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:264,0,64 -chr9 7658503 . T A 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr9 7660693 . A AAT 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.996;DP=21;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:21:563,0,21 -chr9 7662643 . T C 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:882,66,0 -chr9 7662709 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:441,0,85 -chr9 7662898 . T G 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr9 7662961 . T A 201.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:230,0,23 -chr9 7663086 . G C 382.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=31.86;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:410,0,9 -chr9 7663109 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:41:250,0,41 -chr9 7672221 . G A 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 -chr9 7672533 . A C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.196;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:401,0,124 -chr9 7675080 . T TG 395.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:433,33,0 -chr9 7704428 . C T 8058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-3.271;DP=281;FS=5.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,210:281:99:8087,0,1590 -chr9 7704695 . G A 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=2.821;DP=178;FS=27.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,54:178:99:1293,0,4543 -chr9 7705006 . A G 1558.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1587,114,0 -chr9 7719968 . A G 1175.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.777;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=27.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1204,84,0 -chr9 7720076 . G A 9440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-1.076;DP=227;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,226:227:99:9469,680,0 -chr9 7720160 . T C 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr9 7720193 . G T 13642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.198;DP=330;FS=5.879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,326:329:99:13671,966,0 -chr9 7720589 . G A 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-1.733;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=32.58;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:999,72,0 -chr9 7720592 . C G 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=29.10;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:72:999,72,0 -chr9 7766992 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=25.78;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:44:286,0,44 -chr9 7769654 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=25.80;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:312,0,92 -chr9 7770124 . C A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:346,0,133 -chr9 7770510 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:277,0,141 -chr9 8023608 . G A 689.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.063;DP=20;FS=7.225;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=34.45;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:12:717,12,0 -chr9 8065897 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-2.899;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=25.70;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:388,0,118 -chr9 8106222 . C A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:363,0,165 -chr9 8110017 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.495;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:720,0,255 -chr9 8110317 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.803;DP=20;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:69:594,0,69 -chr9 8204920 . T TA 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-2.101;DP=26;FS=8.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:90:424,0,90 -chr9 8473423 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=-1.113;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=13.52;ReadPosRankSum=2.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:461,0,653 -chr9 8473461 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.878;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:290,0,544 -chr9 8473599 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.714;DP=67;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:305,0,2065 -chr9 8474274 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.351;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:420,0,1131 -chr9 8474589 . T TC 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=-0.022;DP=29;FS=18.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=12.99;ReadPosRankSum=3.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:414,0,463 -chr9 8474654 . A C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.144;DP=67;FS=3.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1207,0,1179 -chr9 8474823 . G A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=1.726;DP=70;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:798,0,1544 -chr9 8492930 . A G 1475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.618;DP=95;FS=6.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:1504,0,2590 -chr9 8492935 . C T 2920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=1.471;DP=99;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.324;QD=29.50;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,76:99:99:2949,0,525 -chr9 8493213 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.050;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:480,0,3034 -chr9 8494454 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-1.422;DP=73;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:243,0,2341 -chr9 8494846 . G T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.448;DP=66;FS=2.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=14.09;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:958,0,1169 -chr9 8501713 . T G 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr9 8674607 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=2.451;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=15.38;ReadPosRankSum=-2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:459,0,468 -chr9 8675341 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=1.446;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:443,0,844 -chr9 8675478 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.450;DP=62;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1055,0,1022 -chr9 8676485 . GA G 305.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=23.52;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:28:343,28,0 -chr9 8676532 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-1.249;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:252,0,1669 -chr9 8689188 . T A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=1.416;DP=76;FS=3.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,31:76:99:1024,0,1575 -chr9 8705909 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.489;DP=78;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:295,0,2366 -chr9 8902211 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.670;DP=63;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:261,0,1832 -chr9 8907084 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-1.511;DP=82;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:646,0,2101 -chr9 8928612 . C CAGGATTTGT 831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=1.520;DP=36;FS=8.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=23.10;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:869,0,165 -chr9 8934018 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-1.591;DP=66;FS=5.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:290,0,1949 -chr9 8939184 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.133;DP=40;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:312,0,1061 -chr9 8955190 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=1.019;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:271,0,1856 -chr9 8959720 . T A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-0.139;DP=105;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:453,0,5035 -chr9 8974940 . G C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.711;DP=99;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:99:421,0,2870 -chr9 9028626 . TA T 863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.778;DP=61;FS=1.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:46:901,0,46 -chr9 9029961 . A T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-1.072;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:330,0,2357 -chr9 9178079 . A AT 870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:98:946,98,0 -chr9 9305983 . G T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:307,21,0 -chr9 9305990 . C T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr9 9325665 . T A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr9 9405435 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.215;DP=233;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,43:227:99:697,0,7083 -chr9 9799288 . G GA 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.273;DP=59;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:543,0,756 -chr9 9799509 . GT G 1088.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=-0.905;DP=166;FS=9.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,54:149:99:1126,0,1903 -chr9 9800362 . TCA T 533.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=-2.397;DP=124;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=4.30;ReadPosRankSum=2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:571,0,2053 -chr9 9805771 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=20.62;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,131 -chr9 9892218 . A T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=-2.009;DP=177;FS=4.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,34:177:99:569,0,9424 -chr9 9938808 . A AT 1103.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.119;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1141,0,1686 -chr9 9953183 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.229;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:293,0,3929 -chr9 9953395 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.308;DP=88;FS=3.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:710,0,2402 -chr9 9957080 . A G 3844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-0.411;DP=202;FS=5.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,114:202:99:3873,0,3248 -chr9 9957905 . T C 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.153;DP=297;FS=18.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.282;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,73:297:99:1600,0,8793 -chr9 9958771 . AT A 692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.876;DP=332;FS=2.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=2.09;ReadPosRankSum=-2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,63:325:99:730,0,9318 -chr9 9959251 . G A 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=-0.468;DP=283;FS=1.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,66:283:99:1420,0,8744 -chr9 9964198 . C T 9254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=-0.622;DP=508;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,288:507:99:9283,0,7367 -chr9 10063296 . G A 2980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.631;DP=566;FS=5.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:423,142:565:99:3009,0,15647 -chr9 10174749 . A T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.887;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=25.82;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:493,0,147 -chr9 10181977 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:260,0,249 -chr9 10463836 . T A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-1.606;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=27.60;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:387,0,81 -chr9 10978442 . G A 6141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=-0.174;DP=337;FS=12.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,189:337:99:6170,0,5114 -chr9 10980237 . G A 11331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.732;DP=286;FS=3.574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=29.92;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,270:271:99:11360,808,0 -chr9 10984732 . A G 872.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=2.568;DP=26;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=33.54;ReadPosRankSum=-2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:11:900,0,11 -chr9 10998165 . C T 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.421;DP=71;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:1168,0,1272 -chr9 11003232 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.471;DP=74;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:240,0,4124 -chr9 11003550 . TAGGTAATTGTGTGGGAGGTCATCATGAATGTATTATGTATTCGAAAGCGATTCATCTAATGTGATTTTCTCTCTC T 3266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=1.514;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=31.72;ReadPosRankSum=-2.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,83:88:99:3304,0,436 -chr9 11003979 . ATT A 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.645;DP=30;FS=9.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:450,0,491 -chr9 11004056 . G T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.072;DP=28;FS=6.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:632,0,302 -chr9 11004145 . A G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr9 11521270 . T TA 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.289;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:285,0,193 -chr9 11522028 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-1.822;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:442,0,421 -chr9 11522217 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.778;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:242,0,761 -chr9 11523183 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=2.409;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:365,0,334 -chr9 11523282 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.124;DP=33;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:468,0,682 -chr9 11689723 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=13;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,175 -chr9 11689728 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:243,0,175 -chr9 11855968 . A C 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=1.176;DP=45;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=16.51;ReadPosRankSum=3.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:771,0,1579 -chr9 11855969 . C A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=1.131;DP=45;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=16.51;ReadPosRankSum=3.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:771,0,1582 -chr9 11858763 . T C 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=1.984;DP=40;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:861,0,531 -chr9 11858968 . G A 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=1.586;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=27.02;ReadPosRankSum=2.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1352,0,926 -chr9 11859034 . G A 2094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=2.915;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,55:77:99:2123,0,516 -chr9 11888711 . A G 5536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.093;DP=345;FS=7.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,178:345:99:5565,0,5994 -chr9 11892483 . ACGGAGATCATCTCCAGCTCACACCGACTGATAATACACTGGAATTTAGGGCTCAGATGAACCTCTGACTCACCTCACC A 1476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=-0.400;DP=302;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,70:286:99:1514,0,11996 -chr9 11902755 . C A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.013;DP=245;FS=5.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,47:245:99:792,0,7754 -chr9 11908646 . C G 4551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.316;DP=243;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,137:243:99:4580,0,3871 -chr9 11928866 . T A 3626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.319;DP=220;FS=10.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,102:209:99:3655,0,3883 -chr9 11931017 . C A 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.221;DP=90;FS=29.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.168;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:90:99:1140,0,2896 -chr9 11931048 . C G 5268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.491;DP=138;FS=14.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:5297,0,1733 -chr9 11931102 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=3.011;DP=186;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,43:186:99:818,0,5409 -chr9 11941930 . T G 932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=-1.103;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,46:187:99:961,0,5516 -chr9 11947857 . T A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.760;DP=190;FS=12.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,37:190:99:651,0,6045 -chr9 11951697 . TCTAGCAAAGAAAAAAAAACACATAATAAATTTTAGGACACTGCCCTAAAATCTAAAACTAAAAAAAGTCCATCACAAACAAAAATCATTAC T 8422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.715;DP=216;FS=3.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=26.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,202:203:99:8460,712,0 -chr9 11952679 . C T 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-1.189;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.947;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1221,0,953 -chr9 12539560 . C A 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=-1.045;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=20.50;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,57:95:99:1976,0,1363 -chr9 12539577 . A G 1674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.305;DP=93;FS=1.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.026;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1703,0,1486 -chr9 12541933 . G A 1596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.195;DP=91;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1625,0,1513 -chr9 12542040 . TCTTGGAATGAAAAAAAATATACATTTATGGACCATAAATCATAAATAAACCAGAATGCAATGATGCAACCTGACCTGTACTTAC T 4036.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.726;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=30.02;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,87:91:99:4074,350,0 -chr9 12717446 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.965;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:293,0,440 -chr9 12728317 . G A 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 -chr9 12731275 . A G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.419;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:677,0,727 -chr9 12739587 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.993;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:721,0,491 -chr9 12739730 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.676;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:500,0,510 -chr9 12740382 . C A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=2.236;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:300,0,961 -chr9 12741199 . CTG C 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.817;DP=22;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:346,0,460 -chr9 12767746 . C A 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-0.134;DP=53;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:889,0,950 -chr9 12867625 . T TG 799.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DP=33;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=24.23;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:837,0,741 -chr9 12868489 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.025;DP=21;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,378 -chr9 12868904 . T G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.102;DP=23;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:405,0,1067 -chr9 12868914 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.830;DP=27;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=13.95;ReadPosRankSum=-2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:405,0,1071 -chr9 12870504 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=1.463;DP=40;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:690,0,707 -chr9 12874427 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.595;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:623,0,824 -chr9 12879133 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.295;DP=35;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.137;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:763,0,378 -chr9 12896613 . A G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-0.902;DP=41;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:705,0,758 -chr9 12925021 . G A 3019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=1.537;DP=165;FS=0.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:3048,0,6397 -chr9 12929091 . G T 4644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.437;DP=259;FS=2.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,131:259:99:4673,0,4587 -chr9 12938288 . T A 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.591;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:873,0,850 -chr9 12967183 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=-0.760;DP=61;FS=3.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:899,0,2598 -chr9 12967186 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=-0.903;DP=62;FS=3.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:899,0,2568 -chr9 12969595 . C T 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.484;DP=73;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1238,0,1157 -chr9 12969606 . G A 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.331;DP=74;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1234,0,1133 -chr9 12969690 . C T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.317;DP=61;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:822,0,1236 -chr9 12973319 . A G 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.303;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1085,0,735 -chr9 13141036 . T A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=1.170;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:684,0,318 -chr9 13388423 . AT A 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.778;DP=17;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:74:258,0,74 -chr9 14313844 . TGGTGAGTTTATGTAATTAAGCAACAGACCGACATTCTACAAAAAAAGTTGTTTATGATCTGTATTTCTGTTTTTA T 1881.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=1.093;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=32.39;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1919,175,0 -chr9 14314673 . C CT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.569;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:453,0,160 -chr9 14367652 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-1.153;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:263,0,1732 -chr9 14367655 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.805;DP=29;FS=6.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:263,0,1732 -chr9 14644007 . C T 2843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.582;DP=100;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=28.44;ReadPosRankSum=2.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,80:100:99:2872,0,300 -chr9 14644740 . T TA 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-1.055;DP=33;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=25.66;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:884,0,424 -chr9 14651119 . C CA 335.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:373,36,0 -chr9 14719365 . G T 1678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1707,120,0 -chr9 14719461 . G A 653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:682,51,0 -chr9 14719479 . T A 1343.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1372,99,0 -chr9 15076783 . C T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr9 15251846 . C T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr9 15643397 . ACTGAAGCATATGAGGGGTCAGAAACATGTAAACTACTGAAACATGAGAACAAATCATTTTAAAGGGAAATTTAC A 15374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-0.153;DP=374;FS=3.609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=32.07;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,355:362:99:15412,1027,0 -chr9 15645095 . G T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr9 15650115 . TG T 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;ClippingRankSum=5.167;DP=290;FS=12.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=1.38;ReadPosRankSum=6.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,153:224:99:438,0,1360 -chr9 15805499 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.094;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:252,0,458 -chr9 15922317 . G A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr9 15923875 . T A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.801;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:997,0,1297 -chr9 15923906 . CT C 218.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=15;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:5:255,0,5 -chr9 15924006 . C T 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-1.722;DP=77;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:1375,0,1392 -chr9 15924772 . C T 1136.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.487;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=38.45;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:7:1164,7,0 -chr9 15924800 . T G 3541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3570,249,0 -chr9 15925003 . ACC A 241.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:279,22,0 -chr9 15925009 . T C 250.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:22:279,22,0 -chr9 15926411 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.797;DP=34;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:274,0,726 -chr9 15926444 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.331;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:498,0,280 -chr9 15961369 . A C 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr9 15961392 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr9 15962209 . C T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 -chr9 16185593 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:235,0,819 -chr9 16448655 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.827;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=29.05;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:65:522,0,65 -chr9 16451420 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:260,0,118 -chr9 16459659 . A G 3566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.547;DP=112;FS=3.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,97:112:68:3595,0,68 -chr9 16688569 . C G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.592;DP=19;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:393,0,91 -chr9 16688686 . T C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.369;DP=20;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=20.99;ReadPosRankSum=-1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:448,0,206 -chr9 16915659 . C CT 242.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:280,27,0 -chr9 16915726 . AT A 218.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=19.90;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:5:255,5,0 -chr9 16916528 . A C 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr9 16916780 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.857;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=29.60;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:709,0,106 -chr9 17115752 . C T 361.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.91;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:389,0,5 -chr9 17128227 . T C 698.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1253,84,0 -chr9 17128230 . T C 1269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1298,87,0 -chr9 17156143 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.417;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=27.57;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:552,0,159 -chr9 17156695 . C A 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-0.238;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1144,0,113 -chr9 17156769 . G A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.789;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1370,0,322 -chr9 17156803 . A G 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.515;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=25.56;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:923,0,325 -chr9 17156878 . C T 1803.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1832,126,0 -chr9 17156879 . G A 1803.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1832,126,0 -chr9 17157031 . G T 777.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:78:806,78,0 -chr9 17157226 . T A 340.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.00;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:369,0,13 -chr9 17157238 . T C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr9 17157549 . C T 1367.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.020;DP=41;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=33.35;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:10:1395,0,10 -chr9 17157640 . G A 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 -chr9 17158060 . A G 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.921;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=29.35;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:938,0,178 -chr9 17158300 . T A 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1007,72,0 -chr9 17158367 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=1.217;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:452,0,898 -chr9 17158376 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-1.200;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:441,0,911 -chr9 17158424 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=23.06;ReadPosRankSum=2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,128 -chr9 17158623 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr9 17158691 . C A 669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:698,48,0 -chr9 17158697 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=2.720;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:257,0,304 -chr9 17158988 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.534;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:554,0,981 -chr9 17158995 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.364;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:475,0,1111 -chr9 17159116 . G T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:301,21,0 -chr9 17159430 . GT G 360.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:398,27,0 -chr9 17159440 . C T 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 -chr9 17159999 . G A 726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:755,57,0 -chr9 17160262 . A G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.544;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:854,0,287 -chr9 17160586 . A G 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.078;DP=30;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=32.26;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:996,0,340 -chr9 17160595 . G A 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-0.692;DP=27;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:996,0,342 -chr9 17160679 . T C 797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=1.404;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.33;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:826,60,0 -chr9 17289278 . C T 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:480,36,0 -chr9 17294495 . T G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.07;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,128 -chr9 17305272 . C CT 313.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:351,36,0 -chr9 17562199 . C CT 627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=42;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:737,0,127 -chr9 17599799 . G T 3798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.712;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=30.88;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,99:123:99:3827,0,427 -chr9 17677542 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.700;DP=109;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.435;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,26:109:99:553,0,3098 -chr9 17679792 . G A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=1.389;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,32:128:99:723,0,3686 -chr9 17701646 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=1.221;DP=102;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:578,0,2829 -chr9 17709680 . G A 2582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.983;DP=92;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,68:92:99:2611,0,569 -chr9 17776286 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.137;DP=91;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:462,0,2694 -chr9 17835662 . C T 2367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.925;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=26.60;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,63:89:99:2396,0,693 -chr9 17847429 . GAGGTGACGTAAAATTCCAACTACACTCCCTAAAATATTTTCAGTCACTGTAAAACAAAGAGCATCACTAAATGTCTCTCCAC G 4498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=1.699;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=34.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:4536,330,0 -chr9 17847848 . CAGGTAGGAAAATGTTTATTATTCAAGCTTCTTTTGCTAAAAAGTAATTTATTGTACTCTTATATATCTTTTTTTGAATAAAT C 4815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=2.818;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,122:126:99:5249,399,0 -chr9 17850557 . T C 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.131;DP=48;FS=4.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=29.14;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,36:48:99:1427,0,287 -chr9 17850988 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-1.030;DP=23;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:342,0,416 -chr9 17851266 . C A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 -chr9 17851517 . T G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=2.486;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:482,0,130 -chr9 17865073 . C A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:272,0,253 -chr9 17865195 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,255 -chr9 17894494 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.311;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:89:434,0,89 -chr9 17940755 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-1.031;DP=16;FS=9.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:450,0,126 -chr9 17940932 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:468,0,121 -chr9 17941038 . A T 413.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:441,0,8 -chr9 17942063 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:486,0,234 -chr9 17943670 . G T 301.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=30.19;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:330,0,16 -chr9 17944303 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:268,0,64 -chr9 17947566 . C T 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.336;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=30.39;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:77:940,0,77 -chr9 17949987 . T G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr9 17962584 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:331,0,50 -chr9 17964594 . GA G 583.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:621,54,0 -chr9 17965559 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-2.451;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.871;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:566,0,356 -chr9 17965814 . T TAA 284.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:23:322,23,0 -chr9 18054993 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:240,0,63 -chr9 18079297 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-0.306;DP=26;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=25.53;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:692,0,221 -chr9 18116789 . C T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.061;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=26.88;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:942,0,187 -chr9 18184632 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,137 -chr9 18204510 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=1.030;DP=30;FS=3.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=28.56;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:885,0,173 -chr9 18205593 . G C 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=-1.115;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:912,0,134 -chr9 18237771 . C T 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=1.682;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=28.89;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:1126,0,242 -chr9 18298212 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-0.903;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:666,0,198 -chr9 18425026 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:437,0,238 -chr9 18471809 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:386,0,127 -chr9 18471891 . A G 269.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.90;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:297,0,11 -chr9 18520225 . C CT 241.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:22:279,0,22 -chr9 18521389 . A T 660.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:688,8,0 -chr9 18560760 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,102 -chr9 18990645 . T A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr9 19113805 . A C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.089;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:703,0,202 -chr9 19338985 . CTCAGGTTTGTCATTTTTTTACATTTCTATTTCAACCAATAAGCTTTTTTAGCCTGAGTAATAATAACCCTCTGAATATGCATT C 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=2.205;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:683,0,506 -chr9 19350902 . G A 2951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.162;DP=164;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,91:164:99:2980,0,4869 -chr9 19430646 . G A 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.157;DP=68;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1108,0,1097 -chr9 19430924 . C T 1464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.112;DP=86;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:1493,0,1534 -chr9 19431063 . T G 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.294;DP=53;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=15.92;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:872,0,840 -chr9 19431438 . C A 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.708;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1239,0,1242 -chr9 19431898 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.989;DP=45;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:318,0,1225 -chr9 19431920 . A G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=1.612;DP=50;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:710,0,1107 -chr9 19432832 . A T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-1.826;DP=68;FS=3.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1312,0,959 -chr9 19433070 . T C 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-0.566;DP=55;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:881,0,978 -chr9 19433631 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.863;DP=43;FS=9.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:760,0,830 -chr9 19722267 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr9 20102530 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr9 20102531 . C A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr9 20196373 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.159;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:234,0,346 -chr9 20196382 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,346 -chr9 20196496 . G T 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.674;DP=42;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=29.90;ReadPosRankSum=-1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1284,0,140 -chr9 20197018 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-2.313;DP=17;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:317,0,166 -chr9 20197212 . A G 1401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=1.337;DP=39;FS=4.649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1430,102,0 -chr9 20197558 . G T 1231.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.668;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:16:1260,16,0 -chr9 20198005 . G A 1187.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.005;DP=32;FS=2.982;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=32.38;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:45:1216,45,0 -chr9 20337882 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=1.279;DP=36;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:252,0,2081 -chr9 20337883 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.761;DP=37;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:252,0,2081 -chr9 20338228 . T TA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.263;DP=25;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:308,0,232 -chr9 20348475 . TCTGATCACAACCAAGCAGATGCAGATGTTGAGGTCAAATTAAAGGCTATAAAGTGTGTTTACAGCCATTTTGACATCTCTTAC T 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=2.178;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=31.47;ReadPosRankSum=-2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:669,0,981 -chr9 20383288 . CAGCACTG C 1265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-1.782;DP=87;FS=7.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:1303,0,2162 -chr9 20383292 . ACTGAGAAAACAACACAAAGTCATTATAAGCCTGATTATATTGCACAGTTAATCAAACCATGAGAGGATGATAGTGAAACACCATGTAC A 1182.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.173;DP=87;FS=6.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:1220,0,2389 -chr9 20383299 . AAACAACACAAAGTCATTATAAGCCTGATTATATTGCACAGTTAATCAAACCATGAGAGGATGATAGTGAAACACCATGTAC A 1266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-1.330;DP=79;FS=4.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:1304,0,2144 -chr9 20383413 . G A 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=-0.790;DP=79;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=17.33;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1397,0,1372 -chr9 20391191 . A G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.359;DP=74;FS=12.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:978,0,1475 -chr9 20391262 . T C 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.126;DP=97;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=16.54;ReadPosRankSum=3.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1633,0,1694 -chr9 20391738 . G T 2051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.959;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=33.09;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,53:62:82:2080,0,82 -chr9 20392334 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,291 -chr9 20393763 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,100 -chr9 20395008 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:87:346,0,87 -chr9 20396374 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.48;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:303,0,59 -chr9 20396527 . T A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.31;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:344,0,101 -chr9 20396547 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=26.29;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:94:370,0,94 -chr9 20396619 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:68:640,0,68 -chr9 20396785 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,168 -chr9 20398315 . G T 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:247,0,22 -chr9 20408578 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,102 -chr9 20427889 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:233,0,61 -chr9 20483026 . G T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=28.73;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:373,0,55 -chr9 20514389 . C G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.25;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:306,0,96 -chr9 20514455 . G T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr9 20514464 . C T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:261,18,0 -chr9 20533146 . T A 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:801,54,0 -chr9 20533149 . C T 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:801,54,0 -chr9 20533390 . A G 763.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:792,57,0 -chr9 20541016 . T C 4383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=2.534;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=28.65;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,98:153:99:4412,0,1424 -chr9 20541025 . T C 2982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.011;DP=183;FS=7.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,86:183:99:3011,0,5169 -chr9 20546616 . C T 3900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.147;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:3929,280,0 -chr9 20560445 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.888;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:243,0,595 -chr9 20560544 . C A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=34.76;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:654,0,114 -chr9 20560551 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-0.632;DP=18;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=34.76;ReadPosRankSum=-1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:654,0,114 -chr9 20584600 . G A 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr9 20585411 . C A 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr9 20585565 . A G 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr9 20621373 . T C 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr9 20621421 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr9 20694805 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr9 20697294 . C T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr9 20698975 . T A 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr9 20699156 . GTC G 224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:262,21,0 -chr9 20708595 . G A 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 -chr9 20780430 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.041;DP=22;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:415,0,304 -chr9 20780558 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.627;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:263,0,229 -chr9 20805430 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=10;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:275,0,56 -chr9 20811374 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr9 20829417 . C G 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-2.544;DP=91;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:1069,0,1700 -chr9 20829474 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-1.426;DP=113;FS=14.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:521,0,3614 -chr9 20829534 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=3.807;DP=65;FS=13.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:719,0,1351 -chr9 20874190 . T G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr9 21107848 . T G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-1.938;DP=38;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:727,0,605 -chr9 21111379 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.063;DP=62;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:401,0,1723 -chr9 21174692 . A T 1718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-1.095;DP=66;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.04;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1747,0,513 -chr9 21193891 . C T 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.685;DP=54;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:936,0,939 -chr9 21518534 . G T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:381,0,912 -chr9 21518535 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.029;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:381,0,910 -chr9 21528944 . T C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=4.238;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=16.74;ReadPosRankSum=-2.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:497,0,496 -chr9 21529511 . TGGTGAGTAAAGTTTAATGAGAGTCAGAGTTGACTGTGATTGTGTGTATCAGTGTATTTGTCCTGTCTTCA T 3512.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.523;DP=90;FS=1.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,82:88:22:3900,0,22 -chr9 21529714 . T C 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=-0.436;DP=80;FS=3.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=27.43;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,57:80:99:2223,0,553 -chr9 21533257 . G A 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.197;DP=74;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.243;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,31:74:99:1092,0,1510 -chr9 21560041 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.914;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:549,0,613 -chr9 21563801 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:313,0,866 -chr9 21567123 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-2.011;DP=39;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:420,0,955 -chr9 21591247 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.801;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:445,0,1223 -chr9 21796909 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=1.727;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.18;ReadPosRankSum=-2.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:808,0,1299 -chr9 21796930 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.664;DP=63;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:802,0,1393 -chr9 21840287 . C T 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-2.489;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=34.20;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:849,0,818 -chr9 21857659 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.348;DP=52;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:363,0,1397 -chr9 21889455 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.599;DP=121;FS=4.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:264,0,3829 -chr9 21893180 . T A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.267;DP=59;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:933,0,1134 -chr9 21893550 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=1.056;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,20:116:99:254,0,3870 -chr9 21905791 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.487;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:267,0,2244 -chr9 22069251 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:264,0,255 -chr9 22069500 . A G 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.722;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=28.63;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:48:860,0,48 -chr9 22075165 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr9 22197717 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.837;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:231,0,1598 -chr9 22200191 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:418,0,243 -chr9 22253167 . C T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.366;DP=37;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:437,0,840 -chr9 22258016 . A C 893.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:922,66,0 -chr9 22293903 . G T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.371;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:467,0,2121 -chr9 22293934 . AAGGTATATCTACATTCAATCATGACGTTCTGTAATTTCAGTTTGCTTTAATGTTTGTACTACATATATCTTGCACTAAATCATTTGC A 3307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=1.596;DP=78;FS=6.541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=33.45;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:3345,265,0 -chr9 22300507 . CCCTGCAATAAAGCCAGTGGAGTTATAAAAAATCCATAACAAATCTTAACACAGTATTAAGAACTGTGTATTCATTA C 14259.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.819;DP=335;FS=3.992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=34.29;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,310:315:99:14297,980,0 -chr9 22301858 . G A 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.553;DP=216;FS=3.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,65:216:99:1641,0,7667 -chr9 22303163 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:89:302,0,89 -chr9 22329219 . T A 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=1.930;DP=53;FS=22.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:960,0,1000 -chr9 22329360 . T A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.093;DP=58;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:1081,0,1055 -chr9 22333075 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.605;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:255,0,2179 -chr9 22378743 . A G 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:559,42,0 -chr9 22380579 . G A 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-1.087;DP=74;FS=10.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1158,0,1386 -chr9 22382617 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.611;DP=93;FS=4.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:600,0,2570 -chr9 22384897 . C T 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.378;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=22.46;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:949,0,302 -chr9 22390508 . A G 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.038;DP=80;FS=8.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:440,0,3842 -chr9 22390625 . GA G 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-0.541;DP=53;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:390,0,464 -chr9 22395009 . G A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.494;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.295;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:662,0,1585 -chr9 22406180 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-2.776;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:328,0,674 -chr9 22412317 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.026;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.07;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:273,0,708 -chr9 22422438 . G C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.757;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:406,0,1845 -chr9 22430862 . C G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-1.799;DP=55;FS=5.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:230,0,1788 -chr9 22437020 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.756;DP=102;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,19:102:99:278,0,3159 -chr9 22437163 . G T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.854;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,23:120:99:793,0,5168 -chr9 22437398 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.617;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:406,0,2616 -chr9 22437797 . C T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-1.920;DP=77;FS=13.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:644,0,2037 -chr9 22438031 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.195;DP=71;FS=12.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:590,0,1993 -chr9 22438048 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.312;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:318,0,2573 -chr9 22463503 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.775;DP=110;FS=7.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,18:109:99:248,0,3596 -chr9 22463592 . A AG 1224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-1.976;DP=148;FS=4.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:1262,0,2462 -chr9 22464017 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.375;DP=102;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:506,0,3050 -chr9 22470383 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=2.658;DP=100;FS=8.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:360,0,3169 -chr9 22486970 . T A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.591;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,40:133:99:910,0,3161 -chr9 22487241 . C T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.202;DP=88;FS=5.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:774,0,2351 -chr9 22505066 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-1.187;DP=111;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=3.34;ReadPosRankSum=2.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:399,0,3440 -chr9 22509652 . T G 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=-0.491;DP=63;FS=5.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,35:63:99:1139,0,1386 -chr9 22512226 . C A,T 1596.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-2.436;DP=133;FS=5.336;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:17,39,77:133:99:2940,1488,2704,193,0,1313 -chr9 22512553 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=4.137;DP=76;FS=4.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=3.31;ReadPosRankSum=-2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:280,0,2347 -chr9 22524599 . G C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=1.779;DP=49;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:286,0,1434 -chr9 22531161 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-1.186;DP=49;FS=10.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:293,0,1437 -chr9 22569441 . T G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.836;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:235,0,704 -chr9 22592174 . TC T 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:294,0,51 -chr9 22598410 . C CT 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.129;DP=44;FS=4.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:550,0,554 -chr9 22598891 . A G 331.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.10;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:359,0,12 -chr9 22600159 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.191;DP=35;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:392,0,852 -chr9 22844211 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.391;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:493,0,498 -chr9 22844244 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.230;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:494,0,471 -chr9 22844356 . CAGGTTTTGAAGTATACAAGTTACAGTCGTTAATGATTTTGTTTGACCTGTTGTCTTCCTCAGTCTGTTGGCTTCCCTCATTAGTTTTTCATGCTCTGCT C 739.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=4.302;DP=40;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=18.49;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:777,0,7266 -chr9 22850001 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=-1.403;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,846 -chr9 22853995 . A G 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.676;DP=421;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=4.02;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:329,91:420:99:1719,0,12580 -chr9 22857541 . A C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.028;DP=114;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=5.36;ReadPosRankSum=2.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,32:114:99:639,0,4250 -chr9 22858007 . A T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:381,0,373 -chr9 22858305 . TCCTGCAGTTATAGAGATTGTTTAAATGGCCATGTTTATTGTCAACAGTTTTCAAAGTGTCAAGAATTGCAAAATTCTAACGTA T 7555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.680;ClippingRankSum=5.969;DP=283;FS=47.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=26.70;ReadPosRankSum=-4.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,199:281:99:7593,0,27580 -chr9 22858434 . G A 1766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.457;DP=278;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,75:277:99:1795,0,7668 -chr9 22858463 . ACTGGTGATGAAAATCAATAAAGAATTTATAAAATTATAATGTTTCGAAAACTGTAATCCTTTTCAAACAAATGAAGATAGCGTCCCAC A 9616.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.749;DP=258;FS=4.250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=32.01;ReadPosRankSum=3.525 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,236:248:99:9654,722,0 -chr9 22858597 . C T 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-0.890;DP=253;FS=1.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=5.01;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,62:252:99:1297,0,7156 -chr9 22858834 . T G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.286;DP=171;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:458,0,5375 -chr9 22860238 . G A 5050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-1.783;DP=288;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,171:288:99:5079,0,4595 -chr9 22864795 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.258;DP=214;FS=2.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,42:213:99:662,0,8784 -chr9 22933077 . C A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.443;DP=101;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:507,0,2840 -chr9 22938320 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.094;DP=117;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,33:117:99:841,0,6150 -chr9 22952370 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.968;DP=63;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:249,0,1858 -chr9 22964589 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.118;DP=32;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:293,0,822 -chr9 23004795 . AT A 1062.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.770;DP=44;FS=6.160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=24.15;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:85:1100,85,0 -chr9 23009244 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.516;DP=166;FS=5.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,29:165:99:392,0,4983 -chr9 23009909 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=-1.882;DP=84;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:400,0,2605 -chr9 23124746 . C A 1739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.758;DP=433;FS=8.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:340,93:433:99:1768,0,13202 -chr9 23150193 . A G 2338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.869;ClippingRankSum=7.278;DP=339;FS=4.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=6.90;ReadPosRankSum=-8.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,99:339:99:2367,0,9579 -chr9 23150366 . T C 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=-0.509;DP=404;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=1.92;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,69:404:99:805,0,12817 -chr9 23150529 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.624;DP=268;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,47:268:99:496,0,8562 -chr9 23155292 . T C 4780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.519;ClippingRankSum=5.457;DP=307;FS=10.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=15.57;ReadPosRankSum=-5.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,141:295:99:4809,0,5406 -chr9 23155651 . A G 11351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.702;DP=374;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,300:371:99:11380,0,927 -chr9 23190770 . GT G 474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:53:512,53,0 -chr9 23191043 . T G 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.600;ClippingRankSum=2.365;DP=182;FS=19.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,62:182:99:2027,0,4320 -chr9 23191570 . G A 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.230;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,55:169:99:1497,0,4453 -chr9 23195202 . G A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr9 23215569 . GACCTGAAAATAATTATTTTTTAGTGATTTATTTTTTCCCCATCTCCATTTTATTTTGGTTTAATTTTTAAGAATGTTAATTGAAATTTTAGTTTT G 10666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=2.532;DP=255;FS=7.541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=32.34;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,250:255:99:10704,800,0 -chr9 23220204 . T A 834.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:863,60,0 -chr9 23220767 . G A 1204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.880;DP=341;FS=8.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,69:341:99:1233,0,10745 -chr9 23238222 . G A 1810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=-2.811;DP=363;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,86:362:99:1839,0,10819 -chr9 23238425 . GCTGTAGTGGAAGAAAAGCCAGTACTGTGATTTAGCATTACAGATTCAAATAAAGTATATATTTTTAGTTTTGTATGTTGTATTGAGCTCAC G 14193.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=2.318;DP=369;FS=1.525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=31.79;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,346:353:99:14231,1023,0 -chr9 23245939 . C T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.194;DP=306;FS=4.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,70:305:99:1399,0,8969 -chr9 23246402 . G A 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.548;DP=283;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,56:282:99:950,0,8728 -chr9 23265361 . A G 2694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;ClippingRankSum=3.812;DP=173;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=15.58;ReadPosRankSum=-4.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:2723,0,2998 -chr9 23265624 . ACTGAAGTGCAACATGAGTCTGTTACTTTCAAGTTTATCAGACAACAACATTTTAACAGTCAAAAAATTATTATCTTATAATCCTCAAAATTTAAATTAC A 2249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.114;DP=39;FS=4.289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=30.49;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:99:2287,413,0 -chr9 23265853 . G A 29721.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-1.230;DP=725;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=31.28;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,718:724:99:29750,2162,0 -chr9 23272581 . G A 1425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.182;DP=193;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=7.39;ReadPosRankSum=-2.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,57:193:99:1454,0,5166 -chr9 23273061 . G A 4877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.885;ClippingRankSum=-0.413;DP=317;FS=5.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=15.39;ReadPosRankSum=2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,165:316:99:4906,0,5330 -chr9 23331904 . A C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-1.635;DP=267;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=2.09;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,47:267:99:585,0,12753 -chr9 23332128 . GCTGTAGTGAAAAAGAAGTCTGTTATTTTCAAGTTTATTAAGCAGAAAACTTCACGCTCAAAACTGCATTAATCTGTATCTTATATAAGCTTAACATTGGGCTCAC G 7811.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.451;DP=445;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,232:424:99:7849,0,9684 -chr9 23332129 . CTGTAGTGAAAAAGAAGTCTGTTATTTTCAAGTTTATTAAGCAGAAAACTTCACGCTCAAAACTGCATTAATCTGTATCTT C 6558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=1.469;DP=440;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,187:424:99:6596,0,11867 -chr9 23332212 . ATAAGCTTAACATTGGGCTCACCATG A 6556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.360;DP=447;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,187:430:99:6594,0,12340 -chr9 23343448 . G A 7445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.227;DP=404;FS=3.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,205:404:99:7474,0,7268 -chr9 23351569 . T C 3331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=4.281;DP=299;FS=19.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=11.14;ReadPosRankSum=-3.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,103:299:99:3360,0,6417 -chr9 23670333 . C T 2419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.567;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=30.25;ReadPosRankSum=-1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,65:80:99:2448,0,237 -chr9 23670376 . C G 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-2.039;DP=75;FS=1.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1199,0,1204 -chr9 23672083 . C G 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=-0.393;DP=103;FS=0.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1772,0,1752 -chr9 23681303 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.024;DP=63;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:333,0,1925 -chr9 23780902 . A G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.093;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:608,0,822 -chr9 23780989 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.270;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:387,0,623 -chr9 23831017 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.411;DP=69;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:381,0,1987 -chr9 23834688 . ACAGGTAATGTGCCAGTCTTCTTAACATTGACTTATATTGTGGAAGATCGTTCTCACACCTCACATTTGGTCATG A 4440.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.393;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=34.19;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,95:97:99:4478,392,0 -chr9 23834789 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.452;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:445,0,3050 -chr9 23835091 . A G 1732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=-0.257;DP=108;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:1761,0,2024 -chr9 23838760 . G A 2478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.829;DP=252;FS=15.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,94:251:99:2507,0,14349 -chr9 23838812 . AG A 2930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-4.218;DP=283;FS=15.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=10.36;ReadPosRankSum=4.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,104:283:99:2968,0,17915 -chr9 23838817 . C T 2941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.752;ClippingRankSum=-4.878;DP=278;FS=15.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=10.58;ReadPosRankSum=3.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,103:278:99:2970,0,17915 -chr9 23839259 . G A 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.950;DP=412;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:309,103:412:99:2251,0,11742 -chr9 23839487 . C T 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.324;DP=390;FS=11.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,89:390:99:1767,0,11325 -chr9 23842278 . ACTGAACAACGGGACAAACATGTTAAAATGATCTCCTTATTGAGAGATGCCTTCTGCTGAGGAAGTGTTTGTAGTGTATCAATCTAGCAGACGTTAAACAGATATCTGAATGCAGAATGTTGCAGTAACCCAATTAAACTCAAGCAGTGCAGACAGATGATTACCAAGACCTTACACAGCTGTTGTGTGAGTTGTGAGCCTAC A 14924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=2.496;DP=401;FS=1.182;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=26.83;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,361:372:99:14962,1125,0 -chr9 23868507 . A T 6742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.891;DP=365;FS=6.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=18.47;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,185:365:99:6771,0,6540 -chr9 23885273 . A G 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.027;DP=323;FS=0.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.508;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,65:323:99:1178,0,10116 -chr9 23887290 . G A 2095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.783;DP=489;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,108:489:99:2124,0,15004 -chr9 23889105 . G T 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.317;DP=297;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,76:297:99:1771,0,8192 -chr9 23889120 . T C 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.095;DP=293;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,73:293:99:1644,0,8506 -chr9 23889836 . G A 1654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.038;DP=403;FS=11.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,87:403:99:1683,0,12312 -chr9 23890858 . C T 1204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=-0.467;DP=259;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,60:259:99:1233,0,7693 -chr9 23891286 . A G 2037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=-2.341;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=7.52;ReadPosRankSum=2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,78:271:99:2066,0,7572 -chr9 23894781 . T TAGTC 11485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.027;DP=280;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=31.33;ReadPosRankSum=1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,257:258:99:11523,802,0 -chr9 23898034 . G T 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=1.026;DP=219;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,58:219:99:1419,0,6458 -chr9 23898857 . A T 1806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.670;DP=344;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,83:344:99:1835,0,10325 -chr9 23898893 . G A 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.519;DP=346;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=4.92;ReadPosRankSum=3.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,82:346:99:1731,0,10216 -chr9 23901739 . G A 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.064;DP=246;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,63:246:99:1466,0,7028 -chr9 23906999 . G A 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-0.163;DP=291;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,67:291:99:1421,0,8908 -chr9 23914119 . C G 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.249;DP=270;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,58:269:99:1109,0,7993 -chr9 23936615 . A T 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-1.932;DP=56;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,40:56:99:1366,0,427 -chr9 23939631 . TCCTAATAATAAGAAATAAGGAAGTGAAATCAAATGTTGTCTGAGCAGACAAGAAAAAAAAAACATACTAATGCCTTTGACATATACTGG T 2883.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.349;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=27.62;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:99:2921,271,0 -chr9 23939805 . ACTGCACACAAGAGACACATGTTAAGGAGACATTCCCTTCACCCTTTCAGAGAGATCTCAGGACATCTAC A 3112.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.812;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=27.11;ReadPosRankSum=-2.411 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,67:70:99:3150,273,0 -chr9 23971197 . G A 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-0.959;DP=48;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:813,0,843 -chr9 23972182 . TG T 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-1.484;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:349,0,309 -chr9 24037329 . AGTAGGTTTCATAACCTTACATTCTGAAGTGTACGTAAAATGAATGATTCTTGAGTCTTTTTCTCTCCAATCAACCCTTTCAG A 5421.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.173;DP=124;FS=1.556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,117:124:99:5459,462,0 -chr9 24066697 . TCTGTGACAGAAAGATCAAGTTTAACTAAACACTGTTTACGAAACACACACACAACAACAACAACAACAATAAAAGCTGAATTAACGTTCATAATTGTGACATTTTCTTCCACAAAC T 4378.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=1.475;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=30.84;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,97:100:99:4416,360,0 -chr9 24174575 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-2.817;DP=27;FS=16.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:418,0,308 -chr9 24174791 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.968;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:238,0,336 -chr9 24174847 . T G 1277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:95:1306,95,0 -chr9 24175009 . A G 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:569,42,0 -chr9 24268058 . C CA 1423.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1461,142,0 -chr9 24273243 . AAT A 472.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:510,37,0 -chr9 24776010 . AACCTGCAAAAGCAGAATAGAGAAATAAGTCACATTTGCCTGCCTCAGGTGCTAAATACACAGACTGGATCATT A 1947.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=4.467;DP=359;FS=1.495;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=5.43;ReadPosRankSum=-3.839 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,317:324:99:1985,781,0 -chr9 24814799 . G T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr9 24817241 . A T 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:649,48,0 -chr9 24849813 . TCTAAGACACAGAACAGACATGCTCAAGCTATCTGAACAGACACATGTAACATAAATGGCACACATTCTGTTGTTAGTCCGCTTTGTGCTAAACGCTTCATTCATCACTAGGATTCTCTCAC T 1837.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=2.097;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=35.09;ReadPosRankSum=-1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1875,168,0 -chr9 24862188 . C CT 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.310;DP=41;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:394,0,538 -chr9 25226307 . GT G 479.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.659;DP=41;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:529,0,323 -chr9 25234865 . CTT C 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.457;DP=63;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:542,0,1893 -chr9 25235141 . A AAC 1083.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-2.358;DP=85;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1121,0,993 -chr9 25250804 . G A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-0.221;DP=112;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:99:702,0,2537 -chr9 25420798 . T C 958.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=28.47;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:987,69,0 -chr9 25982808 . C CT 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.585;DP=25;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:268,0,270 -chr9 25983669 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.595;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:341,0,336 -chr9 26200517 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-2.513;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=14.88;ReadPosRankSum=2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:430,0,477 -chr9 26200973 . G T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:504,0,136 -chr9 26201039 . C A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr9 26205562 . T C 2480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.233;DP=141;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:2509,0,2711 -chr9 26214334 . GCTGTAAATAAAGTTTAAGTTAAGCTCTTTAACGTTAATGTGAATATTTCGACCAGGGCTATTAATGAAAGAGTCTCTCAC G 10924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,245:245:99:10962,956,0 -chr9 26379472 . T C 1779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.587;DP=92;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1808,0,1112 -chr9 26379479 . GT G 586.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-1.470;DP=111;FS=6.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:624,0,1762 -chr9 26379492 . G A 2361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=-1.376;DP=122;FS=7.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:2390,0,1555 -chr9 26381339 . G GA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=-0.710;DP=38;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:431,0,412 -chr9 26415867 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.139;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:545,0,828 -chr9 26415973 . A T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.738;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:945,0,1774 -chr9 26416246 . G A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.791;DP=61;FS=5.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1098,0,980 -chr9 26420633 . C T 1956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-1.127;DP=97;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,59:97:99:1985,0,1295 -chr9 26859160 . T A 3795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.446;ClippingRankSum=-0.665;DP=209;FS=4.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.169;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,113:200:99:3824,0,2920 -chr9 26861408 . A C 3649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-1.335;DP=221;FS=4.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,105:221:99:3678,0,3753 -chr9 26864302 . T C 3776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.034;DP=218;FS=1.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,109:218:99:3805,0,3851 -chr9 26870163 . C CT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=-0.589;DP=111;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,28:105:99:282,0,2063 -chr9 26870954 . C CT 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.122;DP=47;FS=5.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=5.95;ReadPosRankSum=-2.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:317,0,605 -chr9 27119807 . A C 4380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.693;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.761;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,128:277:99:4409,0,4818 -chr9 27124824 . G A 5364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-1.771;DP=306;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,148:305:99:5393,0,5032 -chr9 27129188 . AT A 6033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=4.156;DP=218;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,70:212:99:6071,0,21377 -chr9 27129192 . CTCTTCTCTTCTCTTCTCTT C 6033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=4.749;DP=222;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,70:222:99:6071,0,21979 -chr9 27129297 . T C 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-0.541;DP=175;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,75:175:99:1615,0,28308 -chr9 27145151 . A G 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.164;DP=109;FS=11.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:1490,0,2302 -chr9 27157440 . C CT 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-1.358;DP=87;FS=4.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:321,0,1548 -chr9 27158109 . C CA 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.741;DP=118;FS=9.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=1.96;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:269,0,2972 -chr9 27158220 . G C 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.953;DP=106;FS=5.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.882;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,32:106:99:783,0,2970 -chr9 27158689 . GTT G 2218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.161;DP=121;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:2256,0,2277 -chr9 27158990 . G GA 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.147;DP=109;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,38:95:99:824,0,1689 -chr9 27995380 . C T 267.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=17;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:296,0,19 -chr9 28440996 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.502;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:768,0,1278 -chr9 28774795 . A C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.830;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,814 -chr9 28781093 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.585;DP=39;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:815,0,558 -chr9 28795827 . G C 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.309;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1441,0,1426 -chr9 28795936 . C A 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-0.289;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1175,0,1284 -chr9 28795953 . C G 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-1.186;DP=65;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:1016,0,1347 -chr9 28796079 . C A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=-0.054;DP=71;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=11.02;ReadPosRankSum=-2.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:811,0,1647 -chr9 28796148 . G A 1638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.119;DP=101;FS=3.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:1667,0,1818 -chr9 28796242 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.010;DP=50;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:779,0,925 -chr9 28796664 . T A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.825;DP=40;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.44;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:886,0,1727 -chr9 28796669 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.186;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:875,0,1727 -chr9 28796745 . A T 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.425;DP=45;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:914,0,696 -chr9 28796786 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=-2.123;DP=25;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,589 -chr9 28829566 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr9 28829614 . G A 705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:734,54,0 -chr9 28894172 . G C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-1.558;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:753,0,776 -chr9 28894242 . C A 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.453;DP=87;FS=1.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1105,0,1917 -chr9 28895600 . TA T 269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:307,21,0 -chr9 28917790 . T C 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.318;DP=50;FS=11.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1286,0,363 -chr9 29193617 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:309,0,362 -chr9 29265495 . T C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.249;DP=37;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:323,0,1000 -chr9 29266248 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-1.989;DP=89;FS=10.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:675,0,2454 -chr9 29268204 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.117;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=8.04;ReadPosRankSum=-2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:374,0,1072 -chr9 29296675 . C T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.401;DP=108;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:554,0,3217 -chr9 29301847 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.554;DP=135;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:682,0,3911 -chr9 29374900 . A AT 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.683;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:53:805,0,53 -chr9 29374989 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.815;DP=70;FS=17.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:272,0,2170 -chr9 29378876 . C CA 1247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-2.033;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,52:71:99:1285,0,274 -chr9 29639680 . A T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.595;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:359,0,768 -chr9 29639783 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.940;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:313,0,594 -chr9 29646478 . T G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.588;DP=30;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:438,0,632 -chr9 29649504 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=1.387;DP=43;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:628,0,532 -chr9 29649584 . GCCTGGGAGCACATGAAAGACAAATAGATTACATGGAAGTAATGTGTTAGATAAATAATATTTTTTAAACAATCCTA G 780.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=1.561;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:72:818,72,0 -chr9 29904242 . A T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=1.006;DP=75;FS=3.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:773,0,3557 -chr9 29904243 . T G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.815;DP=75;FS=3.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:773,0,3557 -chr9 29971087 . T G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=1.186;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:340,0,2790 -chr9 29971174 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=1.110;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:524,0,1965 -chr9 30528752 . T G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.158;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:391,0,3292 -chr9 30528761 . T G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-0.741;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:386,0,3292 -chr9 31038307 . T C 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 -chr9 31040464 . A G 784.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.087;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:13:813,0,13 -chr9 31040492 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.813;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:758,0,134 -chr9 31045177 . A AT 1099.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=2.292;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=18.33;ReadPosRankSum=-2.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1164,0,123 -chr9 31045786 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=2.477;DP=81;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=4.02;ReadPosRankSum=-2.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,8:81:99:354,0,5879 -chr9 31046164 . G A 2695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=-1.541;DP=107;FS=2.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,75:107:99:2724,0,1405 -chr9 31047477 . C T 4149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=1.302;DP=135;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,112:135:99:4178,0,284 -chr9 31145846 . A T 1896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.094;DP=266;FS=13.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=7.13;ReadPosRankSum=6.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,75:266:99:1925,0,7346 -chr9 31279034 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=1.034;DP=64;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=5.86;ReadPosRankSum=-2.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:403,0,3950 -chr9 31408984 . C T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.325;DP=37;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:543,0,753 -chr9 31662030 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=2.965;DP=44;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:281,0,1234 -chr9 31818482 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:328,0,321 -chr9 32024039 . T C 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-0.143;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1256,0,1153 -chr9 32319041 . C CT 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-2.123;DP=124;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:875,0,1650 -chr9 32620180 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:249,18,0 -chr9 32730120 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.752;DP=29;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=16.99;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:521,0,110 -chr9 32730157 . A T 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:482,33,0 -chr9 32730242 . A T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.738;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:42:462,0,42 -chr9 33129639 . C CA 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=-1.274;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,31:126:99:430,0,2591 -chr9 33133190 . AGTAAACCTAACCTAACTATCTAAGAAATACTAGCTGCTAACAAATACTATTCAGAAATTGCTCTATGAGATAGAATTGCTTATGAGATTAAATATTTCGGGATCTCTTTTGCAG A 3927.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.315;ClippingRankSum=0.694;DP=111;FS=2.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,95:106:99:3965,0,2111 -chr9 33320780 . GT G 835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-2.120;DP=199;FS=10.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,54:169:99:873,0,3060 -chr9 33322442 . ATACCTTCAAGAGATCGAAGAAAACAAAGGTCAGTTTTGGGAAAATCAACAGGACGCATCTGGAGGACGGAGGAGTCCAATTCT A 11683.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.016;DP=328;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=28.92;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,312:315:99:11721,902,0 -chr9 33349690 . TCCTAAAACACAAACCCATTAGCGACATCATCAAAATGAGTTTAACACCATGCTAGATAATGACAGCTTCCACACATTCAATCACA T 900.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-0.976;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=34.64;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:938,0,2132 -chr9 33684970 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=1.412;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:295,0,650 -chr9 33785965 . C A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.920;DP=117;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:729,0,3251 -chr9 33926115 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-1.102;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:436,0,1711 -chr9 33926456 . TG T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.173;DP=42;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:240,0,1119 -chr9 33926530 . A T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=-0.525;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:544,0,976 -chr9 34014681 . G GA 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.370;DP=134;FS=0.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,44:129:99:1470,0,2371 -chr9 34280712 . A G 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:356,24,0 -chr9 34324193 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-1.709;DP=242;FS=16.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,42:241:99:563,0,8186 -chr9 34385679 . TA T 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=-1.388;DP=182;FS=10.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,41:167:99:691,0,2778 -chr9 34741859 . ACTGTAGAACAAAATGTAGGTTAAGCGAAGTGTCATAACAGCTAATAGATAGTATATGAAATTATGACAAGCATATGAAAGTATACCCAC A 10413.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=1.901;DP=237;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=36.24;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,233:237:99:10451,755,0 -chr9 34819142 . AGTAAGTCTTGAACCCCTAACGTTCACCTGAATCTTTTTATGACTAATGGTCTCAGGTAACAAAAACTGATCACAATTAATACGTTTCTGTTCTCTCTCTCCACAG A 3891.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.447;ClippingRankSum=4.117;DP=132;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=29.48;ReadPosRankSum=-2.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,95:131:99:3929,0,12411 -chr9 35060302 . T C 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:850,60,0 -chr9 35061977 . G A 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.417;DP=55;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:989,0,235 -chr9 35073750 . C CA 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-1.265;DP=124;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=2.47;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:343,0,2473 -chr9 35078835 . C T 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.533;DP=96;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,55:96:99:1880,0,1474 -chr9 35083971 . G A 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr9 35084240 . A T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.711;DP=61;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1078,0,1066 -chr9 35085060 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,133 -chr9 35088678 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=1.536;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:450,0,337 -chr9 35091779 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-1.091;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:425,0,568 -chr9 35110488 . T G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.696;DP=37;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:543,0,773 -chr9 35111116 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:391,0,253 -chr9 35112204 . C A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.463;DP=24;FS=10.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,892 -chr9 35119186 . C A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-1.493;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:361,0,469 -chr9 35125669 . T G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-0.094;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:546,0,542 -chr9 35128693 . C G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.556;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:338,0,480 -chr9 35135482 . G T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr9 35136077 . G C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,234 -chr9 35141460 . G C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=1.510;DP=64;FS=3.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:863,0,1669 -chr9 35160709 . G A 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=1.179;DP=72;FS=6.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:1189,0,1267 -chr9 35210018 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-1.076;DP=35;FS=7.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:581,0,675 -chr9 35213637 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=1.359;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.264;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:405,0,396 -chr9 35218455 . T C 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.367;DP=55;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=20.41;ReadPosRankSum=3.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1151,0,1546 -chr9 35229410 . C T 2326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-1.967;DP=143;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=16.27;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:2355,0,4075 -chr9 35229775 . TCTGCAGAATTATGAGCAGGAATGGGATTTGAGTCTGTGCTTCTGATTTCAGGATCATGCACTTAATGATTTAAGCAACGTCTGTTTAC T 6624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.658;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=30.31;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:8609,687,0 -chr9 35248671 . C T 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.905;DP=74;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:1197,0,1263 -chr9 35248866 . A T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-2.442;DP=60;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1057,0,847 -chr9 35255076 . G A 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-0.964;DP=64;FS=2.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:880,0,1296 -chr9 35267598 . A G 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.113;DP=61;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=13.49;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:851,0,1196 -chr9 35317666 . A G 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.898;DP=72;FS=2.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1005,0,1189 -chr9 35321671 . G A 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-1.031;DP=82;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1177,0,2812 -chr9 35322212 . T TTG 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-1.743;DP=41;FS=5.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:314,0,1496 -chr9 35323061 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.413;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:332,0,1999 -chr9 35323227 . T G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.181;DP=82;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:550,0,2487 -chr9 35323547 . A AAC 792.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-2.042;DP=61;FS=5.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,37:56:99:830,0,886 -chr9 35324057 . A C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.748;DP=54;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:770,0,1130 -chr9 35324209 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr9 35324877 . C T 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.598;DP=88;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:1043,0,2053 -chr9 35326367 . TA T 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.971;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:350,0,858 -chr9 35344180 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.594;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:398,0,1580 -chr9 35344237 . A C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.757;DP=34;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:354,0,877 -chr9 35345480 . C G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-1.319;DP=94;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:289,0,2645 -chr9 35351780 . T A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.209;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:556,0,1761 -chr9 35356272 . G A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.846;DP=106;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=8.18;ReadPosRankSum=2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,33:106:99:895,0,2771 -chr9 35356740 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.691;DP=104;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,33:104:99:864,0,2801 -chr9 35360041 . G T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-2.505;DP=52;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:389,0,1813 -chr9 35360305 . C T 810.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-2.361;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=31.54;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:20:839,0,20 -chr9 35360621 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.758;ClippingRankSum=3.936;DP=29;FS=13.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=7.41;ReadPosRankSum=-3.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:243,0,792 -chr9 35371254 . T A 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-1.166;DP=68;FS=8.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1401,0,945 -chr9 35379210 . T G 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=3.116;DP=107;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1693,0,1969 -chr9 35380871 . G A 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.212;DP=106;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:1420,0,2323 -chr9 35381484 . C A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.117;DP=90;FS=5.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1125,0,1974 -chr9 35394701 . C A 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.132;DP=112;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:1452,0,2278 -chr9 35394719 . T A 1674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.364;DP=124;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1703,0,2619 -chr9 35399416 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,265 -chr9 35399444 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:320,0,324 -chr9 35409213 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.456;DP=41;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:256,0,1792 -chr9 35409897 . C T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.345;DP=32;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=18.68;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:626,0,451 -chr9 35409938 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:473,0,289 -chr9 35410138 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.224;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,204 -chr9 35620451 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.510;DP=27;FS=11.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=16.73;ReadPosRankSum=-2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:480,0,496 -chr9 35837562 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:235,0,57 -chr9 35848378 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=-2.203;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:247,0,1177 -chr9 35848619 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.860;DP=45;FS=7.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:288,0,1244 -chr9 35851927 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-0.757;DP=49;FS=9.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:467,0,1248 -chr9 35851938 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-0.707;DP=47;FS=2.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:568,0,1070 -chr9 35873783 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,419 -chr9 35873930 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.631;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:257,0,1755 -chr9 35874022 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-2.177;DP=20;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:256,0,358 -chr9 35874033 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,128 -chr9 35874098 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.927;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:377,0,449 -chr9 35874600 . A C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-1.128;DP=40;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=16.64;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:694,0,615 -chr9 35883930 . A T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.455;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=15.14;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:664,0,786 -chr9 35891700 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.352;DP=62;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1208,0,2447 -chr9 35902777 . T A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.190;DP=59;FS=5.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1064,0,1086 -chr9 35909944 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=-1.552;DP=72;FS=18.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,13:72:99:238,0,2362 -chr9 35910208 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=-1.167;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,35:118:99:844,0,3113 -chr9 35910253 . C G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-2.615;DP=119;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:626,0,3465 -chr9 35915822 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.341;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:359,0,761 -chr9 35915828 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:359,0,813 -chr9 35933788 . CGGTGAGCCTTCCCCTGCGGCCAGACATTGATTCAGAGCATTTCTCGTTGAGTGCAGAAGTGAAGCTTTTAAAACCAATTAAAGACTTGCTTCTTAACATATATAACATGATAAATAAACCAACGCTTTTGGTTTCTGCTTTTTTCA C 4712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=2.432;DP=123;FS=3.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=33.82;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,112:118:99:4750,0,511 -chr9 35934270 . ACAGGTCAGAAATTAGTCTTTTGTTTTGTAAGAATTATTTTATGTTGATGAACTTGACTAACACACTGTTTTAATTG A 5375.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.956;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,134:139:99:5413,398,0 -chr9 35936415 . C T 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=-1.170;DP=113;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1679,0,1895 -chr9 35938758 . G A 2300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.072;DP=141;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:2329,0,3647 -chr9 35939169 . C T 2648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-0.431;DP=162;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:162:99:2677,0,2704 -chr9 35939535 . C T 2541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=1.037;DP=144;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:2570,0,2393 -chr9 35939558 . C T 2280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.010;DP=128;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:2309,0,2447 -chr9 35971272 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=2.123;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:386,0,410 -chr9 35986071 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,336 -chr9 35989020 . G A 2964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=1.277;DP=182;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=16.29;ReadPosRankSum=3.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,94:182:99:2993,0,3065 -chr9 35991164 . G A 2270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.059;DP=142;FS=8.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:2299,0,2481 -chr9 35991320 . T C 3638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.966;DP=146;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.085;QD=24.92;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,101:146:99:3667,0,1136 -chr9 35993402 . C T 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.485;DP=120;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:2214,0,1958 -chr9 35993475 . TGTACGCTTCATAAACAAAAACACTCAGTTGTATGTATTGTGTGTATTTTATTTTCAGCCTGTTTTCAATCTTTCTAATGCTCTGTGCAG T 5675.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=1.697;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=33.96;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:5713,537,0 -chr9 35998436 . C A 3538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=1.479;DP=218;FS=8.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=16.23;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,100:218:99:3567,0,3979 -chr9 35998560 . T A 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=2.202;DP=142;FS=7.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,36:142:99:880,0,9315 -chr9 35998561 . C T 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=2.163;DP=142;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,35:142:99:880,0,9315 -chr9 35999011 . AT A 2241.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.947;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=26.37;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:2279,223,0 -chr9 35999574 . G A 5333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.191;DP=260;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=20.51;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,159:260:99:5362,0,4203 -chr9 36023034 . A G 5097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.400;ClippingRankSum=-1.116;DP=328;FS=5.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,149:326:99:5126,0,5329 -chr9 36040950 . G T 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-0.012;DP=339;FS=3.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,79:339:99:1637,0,9612 -chr9 36140726 . CA C 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 -chr9 36141762 . G T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:92:340,0,92 -chr9 36182241 . G A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.700;DP=24;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=26.49;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:664,0,143 -chr9 36186307 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:260,0,1086 -chr9 36204676 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,249 -chr9 36852173 . C A 243.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:272,0,22 -chr9 36891397 . A T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=-1.932;DP=141;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,21:140:99:285,0,9638 -chr9 36926418 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:372,0,215 -chr9 36965499 . GGGTAAAAAAAAGCATTTGCTATGGTAGAGATCATCTAAGCACATGGTGTTCTGATCATTCACATTGTCTTCTCTCACA G 12382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.577;DP=289;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=29.24;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,270:273:99:12420,1039,0 -chr9 37579831 . A C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:68:239,0,68 -chr9 37591641 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:343,0,96 -chr9 37712038 . G T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:276,0,284 -chr9 37797972 . T TA 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=28.82;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,1:5:99:476,0,671 -chr9 37797995 . T C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=1.184;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:507,0,670 -chr9 37798163 . T C 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:825,60,0 -chr9 37798217 . T A 2797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=2.185;DP=60;FS=1.431;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.794;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,52:60:61:2826,61,0 -chr9 37798437 . T TA 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.137;DP=107;FS=3.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,32:104:99:663,0,2429 -chr9 37798900 . T C 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.070;DP=289;FS=4.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=3.04;ReadPosRankSum=2.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,55:279:99:906,0,10073 -chr9 37798945 . T C 6426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.404;ClippingRankSum=0.586;DP=233;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=27.58;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,162:226:99:6455,0,1591 -chr9 37799097 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.503;DP=66;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:287,0,2075 -chr9 37799117 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.589;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:324,0,434 -chr9 37946386 . GA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=-0.592;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:53:273,0,53 -chr9 37948076 . A AG 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=1.630;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:257,0,977 -chr9 37948077 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=1.359;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:257,0,1014 -chr9 37948912 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.712;DP=36;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:655,0,651 -chr9 37998708 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,523 -chr9 38001215 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=-0.353;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:713,0,711 -chr9 38012256 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=25.49;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:436,0,366 -chr9 38012857 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=8;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:95:471,0,95 -chr9 38012858 . A G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=32.23;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:426,0,135 -chr9 38012898 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.546;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:273,0,96 -chr9 38013047 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=30.93;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:99:502,0,219 -chr9 38013063 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:383,0,424 -chr9 38013540 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=1.728;DP=32;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:283,0,799 -chr9 38019755 . T C 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=1.036;DP=153;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,46:153:99:1160,0,4065 -chr9 38026351 . A C 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.018;DP=162;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.978;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,47:162:99:1150,0,4313 -chr9 38026479 . G A 1230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.876;DP=150;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,48:150:99:1259,0,3823 -chr9 38070115 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr9 38298836 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=-0.075;DP=47;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:756,0,850 -chr9 38324762 . C G 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.052;DP=71;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1202,0,1186 -chr9 38324948 . C A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.867;DP=34;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:647,0,502 -chr9 38327511 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-1.426;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:368,0,898 -chr9 38343863 . A G 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.443;DP=51;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:1006,0,2008 -chr9 38343869 . C T 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=1.203;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:1006,0,2008 -chr9 38346271 . C T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-1.550;DP=57;FS=6.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=28.42;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,44:57:99:1648,0,307 -chr9 38346404 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.056;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=22.15;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:449,0,238 -chr9 38390504 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:231,0,57 -chr9 38419381 . AT A 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.046;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:558,0,376 -chr9 38439539 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=-0.673;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:316,0,1043 -chr9 38484244 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.444;DP=62;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:465,0,1531 -chr9 38504532 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.602;DP=70;FS=7.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:567,0,1897 -chr9 38504704 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.129;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:521,0,941 -chr9 38505259 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.221;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:576,0,1127 -chr9 38530105 . A C 2507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=1.412;DP=88;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=28.50;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,66:88:99:2536,0,541 -chr9 38533212 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=1.990;DP=61;FS=5.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:523,0,1540 -chr9 38533467 . A C 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=1.060;DP=76;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:1302,0,2208 -chr9 38533646 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-2.376;DP=84;FS=15.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:508,0,2926 -chr9 38558787 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:273,0,99 -chr9 38559690 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.368;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:307,0,298 -chr9 38571911 . T A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-1.012;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:501,0,2040 -chr9 38615736 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.588;DP=64;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:472,0,1680 -chr9 38802133 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.476;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:329,0,1913 -chr9 38891236 . C A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.676;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:484,0,3232 -chr9 38891633 . TAA T 744.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.539;DP=40;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:782,0,329 -chr9 38892436 . T A 1988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.610;DP=111;FS=4.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:2017,0,1910 -chr9 38892723 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-1.698;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:901,0,1033 -chr9 38892743 . G A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.207;DP=59;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1031,0,1087 -chr9 38908850 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-1.858;DP=65;FS=5.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:371,0,1804 -chr9 38909648 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-1.564;DP=60;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:293,0,1743 -chr9 38924613 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:369,0,54 -chr9 39082046 . ACT A 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.469;DP=162;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,36:160:99:787,0,5133 -chr9 39082723 . GT G 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-1.129;DP=83;FS=9.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=10.18;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,33:81:99:882,0,1981 -chr9 39082812 . C T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=1.019;DP=104;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1430,0,2296 -chr9 39095061 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=-1.106;DP=175;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,44:175:99:953,0,4899 -chr9 39113637 . ACAGGTTTGTTGAAATCAAAACTTCCCCCAAAACGTCCAGTCTCTGCATTTGTGAAGAAAAAAAACATCTTCTGTAACTCCTG A 3555.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.179;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=31.96;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,80:84:99:3593,240,0 -chr9 39116474 . A T 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.607;DP=89;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,33:89:99:1150,0,2116 -chr9 39176651 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,409 -chr9 39210961 . AC A 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.058;DP=66;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:513,0,3640 -chr9 39210963 . G T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=1.175;DP=68;FS=5.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:525,0,3640 -chr9 39211435 . G A 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.495;DP=162;FS=11.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,40:162:99:916,0,4785 -chr9 39213375 . TGTAAGTACTACAGTCAGAGTATGTTTTAGTTGGGACTTTTAAGATGTTATCATTAATTTGATCATGTTTTTTTGTTTGCAG T 4987.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.449;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=31.81;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,116:119:99:5025,418,0 -chr9 39257810 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=-2.468;DP=39;FS=16.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=12.05;ReadPosRankSum=-4.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:498,0,862 -chr9 39257825 . C A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-2.839;DP=49;FS=20.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:738,0,949 -chr9 39259840 . A G 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.094;DP=71;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:560,0,1920 -chr9 39293000 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=-1.010;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:311,0,3740 -chr9 39342557 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.502;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:341,0,2320 -chr9 39342723 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.027;DP=59;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:496,0,1567 -chr9 39343086 . G T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-1.451;DP=98;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:520,0,2844 -chr9 39370502 . AAGGTGAGTGCTATCCATCAACGAACACCTCCAACATTTGTTTGTTTGTCAGATTAAAGCTTGTGTGCTGTTCTTTTCATT A 1185.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.657;DP=193;FS=7.534;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,183:185:99:7707,551,0 -chr9 39404686 . AT A 741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.267;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=28.53;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:779,75,0 -chr9 39428292 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=1.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=27.62;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:691,0,145 -chr9 39434437 . A T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.645;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:697,0,251 -chr9 39434446 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.362;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:697,0,253 -chr9 39438876 . A C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-2.756;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,164 -chr9 39441228 . A G 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.937;DP=33;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=29.84;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1013,0,233 -chr9 39459269 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-1.391;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:277,0,1913 -chr9 39569519 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.368;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:316,0,578 -chr9 39608781 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,253 -chr9 39672419 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-1.183;DP=78;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:561,0,2196 -chr9 39673162 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.656;DP=93;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:767,0,5178 -chr9 39673163 . C A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.605;DP=93;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:767,0,5178 -chr9 40043456 . TA T 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.134;DP=89;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:255,0,1614 -chr9 40044496 . G A 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.456;DP=32;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=29.46;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:971,0,411 -chr9 40044955 . A ATC 291.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:53:779,53,0 -chr9 40045037 . T A 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.098;DP=71;FS=4.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1131,0,1255 -chr9 40045168 . G T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.284;DP=95;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:354,0,2999 -chr9 40046864 . GA G 1540.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.803;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=30.21;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1578,154,0 -chr9 40047744 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:253,18,0 -chr9 40085440 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=1.455;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:288,0,487 -chr9 41785258 . A G 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.728;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=6.71;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,38:137:99:947,0,3810 -chr9 41808034 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=-1.056;DP=96;FS=9.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:269,0,2884 -chr9 41813768 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.063;DP=106;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,21:106:99:381,0,3252 -chr9 41818403 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.414;DP=61;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:243,0,1838 -chr9 41824363 . T A 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.133;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1002,0,1700 -chr9 41854917 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=4.586;DP=55;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:279,0,1603 -chr9 41865847 . T C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-2.557;DP=64;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1064,0,1146 -chr9 41898656 . A G 8224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.721;DP=208;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=33.95;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,197:208:99:8253,556,0 -chr9 41898822 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=1.073;DP=24;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=19.66;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:500,0,304 -chr9 41923371 . A T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.018;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=18.39;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:635,0,520 -chr9 42155679 . TGTGCGTTTTCTTTTGCTTGTATGATAAAGGCATTTCAGTACTGTTTGGCTTTCCTAGGGTTCATATCCTCGATGTGTTTTTCTTGTTTCAG T 1575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=1.858;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:99:1614,0,2401 -chr9 42155837 . AAGGTACAGTTGATCTAGAGTCAATATCTATAATTACTTTAAAATGTTACTTTTTTAATGCAACATTTCCCCATAC A 1278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.407;DP=34;FS=5.828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:99:1316,113,0 -chr9 42160949 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=1.342;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:301,0,753 -chr9 42176306 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.225;DP=112;FS=1.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:639,0,3180 -chr9 42369397 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.119;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:339,0,2539 -chr9 42454865 . G T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-0.053;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=23.99;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:436,0,134 -chr9 42536369 . C G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.607;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:443,0,894 -chr9 42681597 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=-1.315;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:343,0,421 -chr9 42699837 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-0.879;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:475,0,594 -chr9 42732316 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.144;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:913,0,1312 -chr9 42732643 . A C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.711;DP=80;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1053,0,1654 -chr9 42734668 . G A 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-1.489;DP=83;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:1185,0,1604 -chr9 42814007 . T C 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.678;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:800,0,1403 -chr9 42818200 . TA T 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.134;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:69:455,0,69 -chr9 42825060 . GCTGTGTAACAAAACAAAAAAACAAACAAACATGGCACAGACAAGTCATGATCAGATATTCATTTAAATATTCACTGAGGTTTCCATTATGAAAGAGAGCAAAGTTTAGCAACAGAATAAC G 1382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=1.712;DP=52;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=26.59;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1420,0,4652 -chr9 42850840 . ACTAAAAACATGGAATATTAAATTTGTTAGTGTTTTCTTGACATGTATTGAATGGTCAACCTCATTAAGAAACATAC A 1315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=1.625;DP=33;FS=3.291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1353,108,0 -chr9 43029563 . G A 4307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=1.410;DP=243;FS=9.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,122:243:99:4336,0,4273 -chr9 43032331 . T C 5399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=2.256;DP=341;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=15.84;ReadPosRankSum=-2.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,158:341:99:5428,0,5594 -chr9 43046338 . T C 3754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.929;DP=234;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=16.05;ReadPosRankSum=3.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,108:234:99:3783,0,4012 -chr9 43172884 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:309,0,532 -chr9 43201759 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,297 -chr9 43301175 . A G 219.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:248,0,25 -chr9 43430718 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,318 -chr9 43431067 . G T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:311,0,171 -chr9 43431782 . T A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:485,0,353 -chr9 43433936 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=-0.677;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:578,0,923 -chr9 43494004 . A T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=4.941;DP=56;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=13.50;ReadPosRankSum=-3.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:784,0,1180 -chr9 43494087 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=3.292;DP=43;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:324,0,1095 -chr9 43494972 . G T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=-0.281;DP=103;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:527,0,3030 -chr9 43689197 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=1.197;DP=54;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:304,0,1410 -chr9 43731284 . CCCTAAGCATGAGAACAGGGTGAACGTGAAAAAAAAAATGAGTGGGCAAAGTTTTAATGTTATTTGAGCTATTTGGAAACAAGTAACTTG C 14413.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-1.050;DP=338;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,312:317:99:14451,1309,0 -chr9 43732357 . A G 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-1.223;DP=485;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:409,75:484:99:745,0,15683 -chr9 43733965 . CCCTGTCAAAACACTACATTTGAATTATGTGGTCTTTAAAAGAAAAGTTTTGCAAGAAAAATTGACAATGACGTAACCCTATA C 17410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.503;DP=569;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,565:569:99:17448,1578,0 -chr9 43734064 . G T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.254;DP=471;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=1.79;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:394,76:470:99:871,0,14811 -chr9 43737215 . A T 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=-0.033;DP=543;FS=7.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=2.09;ReadPosRankSum=4.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:449,94:543:99:1164,0,16762 -chr9 43737456 . CCCTGAAAAGCATTTAAGGTAGTGCTGAAGTTTAGCTGACCTATTACAATAGATTAAAATATTTATGTAGATGTACAGATTTGCTTAGCATCACCCA C 16595.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=1.561;DP=448;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=31.57;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,413:417:99:16633,1212,0 -chr9 43743093 . C CCTGGTGACCCATTCGA 21520.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=553;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,519:519:99:21558,1498,0 -chr9 43769321 . A T 1087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.014;DP=448;FS=18.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:368,80:448:99:1116,0,14574 -chr9 43801909 . C A 4495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.593;DP=226;FS=0.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=19.89;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,135:226:99:4524,0,3109 -chr9 43803271 . ACTGGAGAATGAAAAAGAACAACTTTAAAGTTACTTAAATGCAAACGAAACGACTTTTTTCATCTGTTAGCCTAAGTTACGCAACTACTGCTAGAATCATCTTTATAACGTTGCCTGGAGCAAATTAATATCAGCTGAATTATATATTAAACCCAACAAAACATGTTTAC A 7879.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=3.112;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=32.56;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,201:210:99:7917,587,0 -chr9 43807283 . G A 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.404;DP=424;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,85:423:99:1381,0,13192 -chr9 43808835 . C A 2387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.083;DP=312;FS=7.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,92:312:99:2416,0,8230 -chr9 43812683 . T G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.352;DP=285;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,50:281:99:696,0,8604 -chr9 43848514 . G T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=1.162;DP=69;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:433,0,1929 -chr9 43848673 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-1.593;DP=49;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:236,0,1518 -chr9 43980752 . C T 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-2.018;DP=344;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,86:344:99:1917,0,9996 -chr9 43988162 . C T 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=-2.153;DP=263;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,77:263:99:1962,0,7015 -chr9 44013843 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.273;DP=40;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:268,0,1127 -chr9 44017143 . A T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.479;DP=42;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:554,0,901 -chr9 44106220 . AT A 421.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:459,45,0 -chr9 44106738 . A C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.152;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,378 -chr9 44109484 . A C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=1.121;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:495,0,563 -chr9 44111231 . T C 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.381;DP=50;FS=13.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:764,0,1521 -chr9 44113479 . A G 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.023;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:796,0,808 -chr9 44120339 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.033;DP=49;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:364,0,1357 -chr9 44128627 . G T 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=1.430;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=22.76;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:711,0,340 -chr9 44146947 . CT C 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.517;DP=27;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:319,0,316 -chr9 44223674 . C CTG 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=4.225;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=3.79;ReadPosRankSum=-3.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:390,0,3174 -chr9 44223860 . C T 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.354;DP=77;FS=6.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1383,0,1174 -chr9 44226330 . C T 2613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=-0.620;DP=133;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,81:133:99:2642,0,1767 -chr9 44685525 . T G 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-0.375;DP=107;FS=10.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:2069,0,1519 -chr9 44873070 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=1.218;DP=333;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=3.81;ReadPosRankSum=5.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,71:329:99:1298,0,9985 -chr9 44950156 . T G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:58:249,0,58 -chr9 45115332 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.809;DP=40;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:338,0,1047 -chr9 45148630 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.048;DP=37;FS=7.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:453,0,886 -chr9 45154085 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=-0.250;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:255,0,1173 -chr9 45155873 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=1.591;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:352,0,469 -chr9 45155875 . G C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=23.13;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:352,0,469 -chr9 45157232 . CT C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=2.333;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:80:264,0,80 -chr9 45158753 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.31;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,104 -chr9 45357895 . T TA 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=2.229;DP=99;FS=3.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,28:96:99:551,0,2133 -chr9 45357929 . CT C 1189.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=-0.910;DP=104;FS=12.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1227,0,1003 -chr9 45359068 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-0.045;DP=292;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.365;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,45:291:99:432,0,9102 -chr9 45423184 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=20.71;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:401,0,233 -chr9 45457896 . T C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.502;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:580,0,467 -chr9 45554822 . G C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.247;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:364,0,389 -chr9 45556068 . CTG C 204.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=9;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:242,0,24 -chr9 45789649 . GA G 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=1.135;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:816,0,126 -chr9 45789772 . C T 3452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.384;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=17.18;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,100:201:99:3481,0,3548 -chr9 45831055 . A G 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=-0.518;DP=291;FS=5.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,70:290:99:1432,0,8489 -chr9 45937952 . C A 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=1.222;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:927,0,920 -chr9 45938120 . A T 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.047;DP=70;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1208,0,1861 -chr9 45960888 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.461;DP=54;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=13.16;ReadPosRankSum=2.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:739,0,1123 -chr9 45968979 . G T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=30.48;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:394,0,49 -chr9 47606386 . TA T 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.291;DP=46;FS=3.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:514,0,445 -chr9 47855835 . A G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr9 47873742 . C CA 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.430;DP=81;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:641,0,686 -chr9 47873961 . GTT G 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.308;DP=112;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1088,0,990 -chr9 47890593 . T A 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=-2.267;DP=98;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1726,0,1542 -chr9 48510019 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.462;DP=30;FS=6.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:307,0,784 -chr9 48511426 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.712;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:353,0,1091 -chr9 48511427 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.694;DP=26;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:465,0,500 -chr9 48514389 . A T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.471;DP=32;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:578,0,615 -chr9 48514412 . G T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-1.759;DP=38;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=13.78;ReadPosRankSum=2.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:552,0,809 -chr9 48514965 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=22.14;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:316,0,210 -chr9 48515737 . G C 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.938;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,22:72:99:583,0,1792 -chr9 48564863 . TCTGGAAAAAGAAAAACAAGTGGAGACGTATCCATTTGCACACACACATGCTAATTCTGAGATTGGTTTTAGGGATAATTGATGTGTAC T 2597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=1.672;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2635,239,0 -chr9 48583591 . T C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=-0.460;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:469,0,617 -chr9 48849117 . T A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.495;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:803,0,833 -chr9 49027255 . C T 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.321;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:1773,0,4209 -chr9 49027262 . T C 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.482;DP=106;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:1773,0,4284 -chr9 49027309 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.915;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:907,0,681 -chr9 49064513 . T C 3913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.768;DP=231;FS=14.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,120:231:99:3942,0,4150 -chr9 49115580 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-1.136;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:316,0,1102 -chr9 49120056 . T TG 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:91:345,0,91 -chr9 49153883 . C T 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 -chr9 49182935 . C T 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.441;DP=448;FS=3.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=3.19;ReadPosRankSum=3.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:362,86:448:99:1456,0,14311 -chr9 49242641 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.863;DP=29;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:404,0,582 -chr9 49249763 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,492 -chr9 49275018 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.613;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:260,0,531 -chr9 49285131 . A T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=1.063;DP=46;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:280,0,1337 -chr9 49292890 . A G 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=1.127;DP=266;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,69:266:99:1576,0,7553 -chr9 49293352 . C A 3307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.577;DP=228;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,96:228:99:3336,0,4382 -chr9 49297492 . C A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=-2.908;DP=236;FS=16.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,46:224:99:894,0,13074 -chr9 49300689 . G A 2602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.753;DP=219;FS=9.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,81:218:99:2631,0,4528 -chr9 49347499 . A T 5022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-0.910;DP=276;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,153:276:99:5051,0,4444 -chr9 49347847 . G T 3999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.676;DP=227;FS=0.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,112:227:99:4028,0,4103 -chr9 49526663 . C A 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1203,84,0 -chr9 49616866 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.293;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=17.69;ReadPosRankSum=-1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:559,0,445 -chr9 49616920 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.370;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:362,0,532 -chr9 49617034 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.128;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:257,0,950 -chr9 49621098 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.599;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:373,0,368 -chr9 49621122 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.070;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:423,0,550 -chr9 49627394 . C T 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:943,72,0 -chr9 49627460 . G A 651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:680,51,0 -chr9 49627583 . C T 999.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1028,72,0 -chr9 49627601 . A T 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1007,72,0 -chr9 49627739 . C T 1326.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1355,105,0 -chr9 49627922 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.999;DP=25;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=25.91;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:676,0,161 -chr9 49630211 . C T 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.150;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=30.56;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:34:943,34,0 -chr9 49630760 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.506;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:564,0,156 -chr9 49716852 . G T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr9 49717505 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-2.219;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=25.73;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:337,0,348 -chr9 49928437 . G A 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr9 50506873 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,256 -chr9 50511445 . CT C 234.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.283;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:16:272,0,16 -chr9 50511768 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.799;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:373,0,1573 -chr9 50521530 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-1.100;DP=52;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:377,0,2389 -chr9 50524233 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-2.137;DP=37;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:277,0,1010 -chr9 50526081 . C G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.256;DP=47;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:284,0,1380 -chr9 50526765 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.869;DP=34;FS=8.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:242,0,927 -chr9 50527227 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.091;DP=40;FS=5.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:271,0,1392 -chr9 50527332 . G C 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.667;DP=45;FS=4.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:583,0,961 -chr9 50811969 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.676;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:465,0,495 -chr9 50819478 . A C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.589;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:409,0,818 -chr9 50826388 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr9 50830254 . G A 208.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:237,0,18 -chr9 50847660 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,123 -chr9 51061694 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=-0.398;DP=50;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:248,0,1450 -chr9 51344151 . G C 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.941;DP=50;FS=5.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:701,0,1052 -chr9 51348158 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.722;DP=57;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:369,0,1860 -chr9 51482635 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.690;DP=76;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:416,0,2237 -chr9 51491524 . G A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.577;DP=94;FS=8.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:569,0,2693 -chr9 51498646 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.296;DP=68;FS=4.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:267,0,2077 -chr9 51502802 . T A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr9 51509377 . T A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.914;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,330 -chr9 52577463 . A AGCAATGGC 599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.181;DP=58;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:637,0,1352 -chr9 52597133 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.983;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:753,0,1313 -chr9 52597207 . A ACGGACCAGGACTTCCGC 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=1.787;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:715,0,1296 -chr9 52604903 . C CA 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.909;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:338,0,1106 -chr9 52607336 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:345,0,1289 -chr9 53195449 . TCA T 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:247,0,159 -chr9 53478134 . G A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-1.559;DP=84;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1271,0,1623 -chr9 53481334 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.959;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,323 -chr9 53481734 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.060;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:615,0,458 -chr9 53481763 . C G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.079;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:468,0,376 -chr9 53530429 . C T 3228.29 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.671;DP=24;FS=3.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=29.45;ReadPosRankSum=-1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,15:17:99:3256,232,0 -chr9 53530585 . G A 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-3.169;DP=123;FS=7.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:1495,0,2181 -chr9 53531277 . A G 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr9 53531310 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:276,0,189 -chr9 53532100 . C G 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.396;DP=49;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:1081,0,540 -chr9 53532162 . C G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-1.221;DP=34;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:523,0,674 -chr9 53532274 . G C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.401;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=22.99;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:396,0,422 -chr9 53532505 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=-3.728;DP=130;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:566,0,1252 -chr9 53532547 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.177;DP=69;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:312,0,1630 -chr9 53532717 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:310,0,104 -chr9 53839692 . C G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=1.902;DP=18;FS=23.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,422 -chr9 53861677 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=2.803;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:258,0,643 -chr9 54032656 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=34.70;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:74:524,0,74 -chr9 54032665 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:74:524,0,74 -chr9 54036707 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:373,0,373 -chr9 54130278 . G A 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.279;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:921,0,1613 -chr9 54171619 . AT A 911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.102;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=34.67;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:949,0,219 -chr9 54171624 . T C 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.837;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:99:949,0,219 -chr9 54171762 . CA C 1871.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-0.670;DP=76;FS=1.521;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,66:74:59:1909,59,0 -chr9 54186316 . C G 974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1003,72,0 -chr9 54192643 . C T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.261;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=25.03;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:604,0,481 -chr9 54198077 . G A 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.248;DP=41;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.282;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:732,0,744 -chr9 54200041 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.149;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:674,0,893 -chr9 54200098 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-2.058;DP=49;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:283,0,1417 -chr9 54211921 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=2.060;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=13.19;ReadPosRankSum=-2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:292,0,1007 -chr9 54211927 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=2.013;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:292,0,1007 -chr9 54222569 . T A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:408,0,205 -chr9 54245399 . T TTC 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,201 -chr9 54322574 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:260,0,409 -chr9 54505595 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-1.581;DP=26;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:253,0,619 -chr9 55102818 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.717;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:548,0,1546 -chr9 55332437 . A G 2299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.079;DP=284;FS=6.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,89:284:99:2328,0,13601 -chr9 55336128 . AAC A 1633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=-3.568;DP=243;FS=8.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=6.72;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,58:173:99:1671,0,3352 -chr9 55336221 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=-1.319;DP=47;FS=7.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:261,0,1436 -chr9 55336480 . A G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=-1.465;DP=61;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:713,0,1562 -chr9 55337893 . T TCA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-1.238;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:339,0,1615 -chr9 55338831 . A C 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=-0.744;DP=62;FS=5.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=16.27;ReadPosRankSum=2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1037,0,1456 -chr9 55364148 . G A 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 -chr9 55750458 . T C 5577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.169;DP=222;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.064;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,153:222:99:5606,0,1798 -chr9 55767170 . G A 9591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.449;DP=341;FS=20.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,257:341:99:9620,0,1778 -chr9 55769303 . A T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr9 55906930 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:415,0,170 -chr9 55931758 . T G 238.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:267,21,0 -chr9 55931806 . A C 864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:893,69,0 -chr9 55946687 . G C 211.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:240,0,25 -chr9 56284099 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=2.115;DP=223;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,34:223:99:321,0,7002 -chr9 56300064 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.030;DP=90;FS=5.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,32:90:99:1095,0,2052 -chr9 56323568 . A G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,276 -chr9 56326041 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.462;DP=25;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:430,0,461 -chr9 56333820 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.929;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:585,0,1073 -chr9 56333822 . T C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=1.369;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:585,0,1064 -chr9 56351096 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-1.075;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:484,0,671 -chr9 56355752 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.795;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:334,0,335 -chr9 56366577 . T TC 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=2.245;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:343,0,299 -chr9 56367025 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.109;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,469 -chr9 56429029 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.542;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:239,0,775 -chr9 56434083 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-1.154;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:350,0,423 -chr9 56435269 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.194;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:286,0,952 -chr9 56435270 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.613;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:286,0,947 -chr9 56680087 . AAC A 525.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.735;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:22:563,22,0 -chr9 56710395 . T A 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:446,30,0 -chr9 56710644 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:57:481,0,57 -chr9 56710711 . C G 764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:58:793,58,0 -chr9 56710869 . G A 1761.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:99:1790,134,0 -chr9 56710886 . A C 1752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:99:1781,131,0 -chr9 56711068 . A C 492.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:625,22,0 -chr9 56713058 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-1.670;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:373,0,466 -chr9 56714036 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.264;DP=51;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:296,0,1859 -chr9 56714117 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=1.805;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:232,0,468 -chr9 56715251 . A G 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr9 56747766 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:297,0,224 -chr9 56748866 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.779;DP=37;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:506,0,972 -chr9 56748867 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.391;DP=37;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:505,0,878 -chr9 56749042 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=27.06;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:353,0,130 -chr9 56750347 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=-3.383;DP=59;FS=5.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:483,0,1549 -chr9 56750664 . AT A 1643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.050;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1681,0,1675 -chr9 56750843 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.281;DP=163;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,31:162:99:463,0,5136 -chr9 56751142 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=4.348;DP=61;FS=5.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=14.24;ReadPosRankSum=-2.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:897,0,2646 -chr9 56751583 . T TA 1446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.506;DP=122;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1484,0,849 -chr9 56753930 . T C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=4.088;DP=49;FS=13.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=14.42;ReadPosRankSum=-2.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:735,0,3510 -chr9 56754341 . CA C 2553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=1.476;DP=128;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:2591,0,1202 -chr9 56763246 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.032;DP=24;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:237,0,417 -chr9 56766478 . T G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.548;DP=36;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.338;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:509,0,872 -chr9 57062167 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.049;DP=37;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:348,0,1038 -chr9 57160475 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.115;DP=29;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:299,0,656 -chr9 57198624 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.384;DP=38;FS=3.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:307,0,989 -chr9 57198660 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.693;DP=49;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:445,0,1224 -chr9 57211901 . G T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.810;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:519,0,834 -chr9 57211961 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-1.485;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:436,0,1158 -chr9 57240993 . A G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=-0.027;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:383,0,497 -chr9 57360024 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.190;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:414,0,1514 -chr9 57517769 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.813;ClippingRankSum=-1.415;DP=50;FS=9.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:651,0,974 -chr9 57816294 . G GCA 2045.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-2.584;DP=204;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,69:177:99:2083,0,3431 -chr9 57929159 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-1.801;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:365,0,537 -chr9 57945530 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-1.280;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:399,0,276 -chr9 57971471 . T C 3153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.141;DP=116;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,83:116:99:3182,0,939 -chr9 57971654 . T A 1856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.502;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,49:67:99:1885,0,409 -chr9 57977778 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:513,0,795 -chr9 57977881 . ACT A 1102.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=-0.790;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1140,0,396 -chr9 57981942 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.600;DP=36;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=27.33;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:1012,0,144 -chr9 57982148 . C T 1575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.260;DP=54;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=29.18;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,42:54:99:1604,0,271 -chr9 57982673 . T TC 1529.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1567,126,0 -chr9 57984903 . C T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-0.830;DP=40;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=23.82;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:981,0,280 -chr9 57985290 . A G 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-1.405;DP=33;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:65:699,0,65 -chr9 58106954 . TGA T 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-2.717;DP=174;FS=2.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=1.53;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,36:169:99:304,0,4876 -chr9 58149372 . GAC G 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.112;DP=95;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:253,0,1264 -chr9 58175149 . G A 2008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.961;ClippingRankSum=-1.492;DP=528;FS=9.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:425,103:528:99:2037,0,32633 -chrM 2285 . G A 10814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,259:259:99:10843,779,0 -chrM 2421 . C T 10759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=254;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,254:254:99:10788,765,0 -chrM 3938 . A G 3701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:3730,268,0 -chrM 3962 . T C 4258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:4287,307,0 -chrM 4530 . A T 15504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=376;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,369:369:99:15533,1110,0 -chrM 4666 . C T 13592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=321;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,321:321:99:13621,969,0 -chrM 7986 . G A 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1081,78,0 -chrM 8059 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chrM 9081 . G A 591.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:620,45,0 -chrM 9816 . T A 4563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:4592,319,0 -chrM 10677 . T C 10335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,244:244:99:10364,734,0 -chrM 10770 . G A 16050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=-1.699;DP=311;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=28.11;ReadPosRankSum=1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,310:311:99:16079,1108,0 -chrM 10780 . C T 15654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=346;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,346:346:99:15683,1081,0 -chrM 10963 . C T 982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1011,75,0 -chrM 11617 . A T 6460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:6489,467,0 -chrM 12975 . T C 12134.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=279;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,279:279:99:12163,850,0 -chrM 14534 . G A 8207.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:8236,600,0
--- a/CloudMapzebrafishhomozygositymapping/test-data/CloudMapzebrafishhomozygositymapping_test1_output.html Mon Oct 13 08:26:32 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,274 +0,0 @@ -<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> - <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en"> - <head> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" /> - <meta name="generator" content="Galaxy rgToolFactory.py tool output - see http://g2.trac.bx.psu.edu/" /> - <title></title> - <link rel="stylesheet" href="/static/style/base.css" type="text/css" /> - </head> - <body> - <div class="toolFormBody"> - -<div class="infomessage">Galaxy Tool "CloudMapzebrafishhomozygositymapping" run at 13/10/2014 13:24:02</div><br/> -<div class="toolFormTitle">CloudMapzebrafishhomozygositymapping log output</div> - -<pre> - -Loading required package: methods - -Loading required package: grid - -Loading required package: lattice - -Loading required package: survival - -Loading required package: splines - -Loading required package: Formula - -Attaching package: 'Hmisc' - -The following object(s) are masked from 'package:base': - - format.pval, round.POSIXt, trunc.POSIXt, units - - -</pre> - -<div class="toolFormTitle">Other images and outputs</div> -(Click on a thumbnail image to download the corresponding original PDF image)<br/> -<div><table class="simple" cellpadding="2" cellspacing="2"> -<tr> -<td><a href="allchrs.pdf"><img src="allchrs.png" title="Click to download a PDF of allchrs.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called allchrs.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr1.pdf"><img src="chr1.png" title="Click to download a PDF of chr1.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr1.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr10.pdf"><img src="chr10.png" title="Click to download a PDF of chr10.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr10.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr11.pdf"><img src="chr11.png" title="Click to download a PDF of chr11.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr11.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr12.pdf"><img src="chr12.png" title="Click to download a PDF of chr12.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr12.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr13.pdf"><img src="chr13.png" title="Click to download a PDF of chr13.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr13.pdf"/></a></td> -</tr> -<tr> -<td><a href="chr14.pdf"><img src="chr14.png" title="Click to download a PDF of chr14.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr14.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr15.pdf"><img src="chr15.png" title="Click to download a PDF of chr15.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr15.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr16.pdf"><img src="chr16.png" title="Click to download a PDF of chr16.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr16.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr17.pdf"><img src="chr17.png" title="Click to download a PDF of chr17.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr17.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr18.pdf"><img src="chr18.png" title="Click to download a PDF of chr18.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr18.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr19.pdf"><img src="chr19.png" title="Click to download a PDF of chr19.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr19.pdf"/></a></td> -</tr> -<tr> -<td><a href="chr2.pdf"><img src="chr2.png" title="Click to download a PDF of chr2.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr2.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr20.pdf"><img src="chr20.png" title="Click to download a PDF of chr20.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr20.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr21.pdf"><img src="chr21.png" title="Click to download a PDF of chr21.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr21.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr22.pdf"><img src="chr22.png" title="Click to download a PDF of chr22.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr22.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr23.pdf"><img src="chr23.png" title="Click to download a PDF of chr23.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr23.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr24.pdf"><img src="chr24.png" title="Click to download a PDF of chr24.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr24.pdf"/></a></td> -</tr> -<tr> -<td><a href="chr25.pdf"><img src="chr25.png" title="Click to download a PDF of chr25.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr25.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr3.pdf"><img src="chr3.png" title="Click to download a PDF of chr3.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr3.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr4.pdf"><img src="chr4.png" title="Click to download a PDF of chr4.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr4.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr5.pdf"><img src="chr5.png" title="Click to download a PDF of chr5.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr5.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr6.pdf"><img src="chr6.png" title="Click to download a PDF of chr6.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr6.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr7.pdf"><img src="chr7.png" title="Click to download a PDF of chr7.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr7.pdf"/></a></td> -</tr> -<tr> -<td><a href="chr8.pdf"><img src="chr8.png" title="Click to download a PDF of chr8.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr8.pdf"/></a></td> - -<td><a href="chr9.pdf"><img src="chr9.png" title="Click to download a PDF of chr9.pdf" hspace="5" width="200" - alt="Image called chr9.pdf"/></a></td> - -<td> </td><td> </td><td> </td><td> </td> -</tr></table></div> - -<div class="toolFormTitle">Other log output</div> - -<pre> - -## Toolfactory generated command line = Rscript - /Volumes/ngs/database/files/012/dataset_12474.dat None - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - -null device - - 1 - - -</pre> - -<div class="toolFormTitle">All output files available for downloading</div> - -<div><table class="colored" cellpadding="3" cellspacing="3"><tr><th>Output File Name (click to view)</th><th>Size</th></tr> - -<tr><td><a href="CloudMapzebrafishhomozygositymapping.Rscript">CloudMapzebrafishhomozygositymapping.Rscript</a></td><td>27.8 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="CloudMapzebrafishhomozygositymapping_error.log">CloudMapzebrafishhomozygositymapping_error.log</a></td><td>340 B</td></tr> -<tr><td><a href="CloudMapzebrafishhomozygositymapping_runner.log">CloudMapzebrafishhomozygositymapping_runner.log</a></td><td>781 B</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="allchrs.pdf">allchrs.pdf</a></td><td>87.1 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr1.pdf">chr1.pdf</a></td><td>7.8 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr10.pdf">chr10.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr11.pdf">chr11.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr12.pdf">chr12.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr13.pdf">chr13.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr14.pdf">chr14.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr15.pdf">chr15.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr16.pdf">chr16.pdf</a></td><td>8.1 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr17.pdf">chr17.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr18.pdf">chr18.pdf</a></td><td>7.6 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr19.pdf">chr19.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr2.pdf">chr2.pdf</a></td><td>7.8 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr20.pdf">chr20.pdf</a></td><td>7.6 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr21.pdf">chr21.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr22.pdf">chr22.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr23.pdf">chr23.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr24.pdf">chr24.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr25.pdf">chr25.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr3.pdf">chr3.pdf</a></td><td>7.8 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr4.pdf">chr4.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr5.pdf">chr5.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr6.pdf">chr6.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr7.pdf">chr7.pdf</a></td><td>7.6 KB</td></tr> -<tr class="odd_row"><td><a href="chr8.pdf">chr8.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> -<tr><td><a href="chr9.pdf">chr9.pdf</a></td><td>7.9 KB</td></tr> -</table></div><br/> -</div></body></html> -
--- a/CloudMapzebrafishhomozygositymapping/test-data/test1_out.log Mon Oct 13 08:26:32 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,53 +0,0 @@ -## Toolfactory generated command line = Rscript - /Volumes/ngs/database/files/012/dataset_12474.dat None -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1
--- a/CloudMapzebrafishhomozygositymapping/tool_dependencies.xml Mon Oct 13 08:26:32 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,18 +0,0 @@ -<?xml version="1.0"?> -<tool_dependency> - <package name="ghostscript" version="9.10"> - <repository changeset_revision="9345d2740f0c" name="package_ghostscript_9_10" owner="devteam" prior_installation_required="True" toolshed="https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu" /> - </package> - <package name="graphicsmagick" version="1.3.18"> - <repository changeset_revision="2fd4eb971ba5" name="package_graphicsmagick_1_3" owner="iuc" prior_installation_required="True" toolshed="https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu" /> - </package> - <readme> - -**What it Does** - -This tool is part of an update to the CloudMap pipeline (Minevich et al. 2012) to incorporate homozygosity mapping in zebrafish. This tool facilitates the mapping of zebrafish mutants from WGS or RNA-Seq data using bulk segregant homozygosity mapping. As input it takes a VCF list of variants (usually quality filtered for Q200 with WT SNPs/indels removed). This file is produced when running the CloudMap zebrafish pipeline. It plots an adjusted homozygosity ratio such that a high ratio indicates mapping region. It outputs an HTML file with combined and individual chromosome plots as PDFs. The adjusted homozygosity ratio is calculated as described in: - -IN SUBMISSION - - </readme> -</tool_dependency>
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.py Mon Oct 13 08:42:19 2014 -0400 @@ -0,0 +1,742 @@ +# cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.py - a self annotated version of rgToolFactory.py generated by running rgToolFactory.py +# to make a new Galaxy tool called cloudmap_zf_hom_mapping +# User r.poole@ucl.ac.uk at 13/10/2014 13:41:11 +# rgToolFactory.py +# see https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/wiki/Home +# +# copyright ross lazarus (ross stop lazarus at gmail stop com) May 2012 +# +# all rights reserved +# Licensed under the LGPL +# suggestions for improvement and bug fixes welcome at https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/wiki/Home +# +# August 2014 +# merged John Chilton's citation addition and ideas from Marius van den Beek to enable arbitrary +# data types for input and output - thanks! +# +# march 2014 +# had to remove dependencies because cross toolshed dependencies are not possible - can't pre-specify a toolshed url for graphicsmagick and ghostscript +# grrrrr - night before a demo +# added dependencies to a tool_dependencies.xml if html page generated so generated tool is properly portable +# +# added ghostscript and graphicsmagick as dependencies +# fixed a wierd problem where gs was trying to use the new_files_path from universe (database/tmp) as ./database/tmp +# errors ensued +# +# august 2013 +# found a problem with GS if $TMP or $TEMP missing - now inject /tmp and warn +# +# july 2013 +# added ability to combine images and individual log files into html output +# just make sure there's a log file foo.log and it will be output +# together with all images named like "foo_*.pdf +# otherwise old format for html +# +# January 2013 +# problem pointed out by Carlos Borroto +# added escaping for <>$ - thought I did that ages ago... +# +# August 11 2012 +# changed to use shell=False and cl as a sequence + +# This is a Galaxy tool factory for simple scripts in python, R or whatever ails ye. +# It also serves as the wrapper for the new tool. +# +# you paste and run your script +# Only works for simple scripts that read one input from the history. +# Optionally can write one new history dataset, +# and optionally collect any number of outputs into links on an autogenerated HTML page. + +# DO NOT install on a public or important site - please. + +# installed generated tools are fine if the script is safe. +# They just run normally and their user cannot do anything unusually insecure +# but please, practice safe toolshed. +# Read the fucking code before you install any tool +# especially this one + +# After you get the script working on some test data, you can +# optionally generate a toolshed compatible gzip file +# containing your script safely wrapped as an ordinary Galaxy script in your local toolshed for +# safe and largely automated installation in a production Galaxy. + +# If you opt for an HTML output, you get all the script outputs arranged +# as a single Html history item - all output files are linked, thumbnails for all the pdfs. +# Ugly but really inexpensive. +# +# Patches appreciated please. +# +# +# long route to June 2012 product +# Behold the awesome power of Galaxy and the toolshed with the tool factory to bind them +# derived from an integrated script model +# called rgBaseScriptWrapper.py +# Note to the unwary: +# This tool allows arbitrary scripting on your Galaxy as the Galaxy user +# There is nothing stopping a malicious user doing whatever they choose +# Extremely dangerous!! +# Totally insecure. So, trusted users only +# +# preferred model is a developer using their throw away workstation instance - ie a private site. +# no real risk. The universe_wsgi.ini admin_users string is checked - only admin users are permitted to run this tool. +# + +import sys +import shutil +import subprocess +import os +import time +import tempfile +import optparse +import tarfile +import re +import shutil +import math + +progname = os.path.split(sys.argv[0])[1] +myversion = 'V001.1 March 2014' +verbose = False +debug = False +toolFactoryURL = 'https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory' + +# if we do html we need these dependencies specified in a tool_dependencies.xml file and referred to in the generated +# tool xml +toolhtmldepskel = """<?xml version="1.0"?> +<tool_dependency> + <package name="ghostscript" version="9.10"> + <repository name="package_ghostscript_9_10" owner="devteam" prior_installation_required="True" /> + </package> + <package name="graphicsmagick" version="1.3.18"> + <repository name="package_graphicsmagick_1_3" owner="iuc" prior_installation_required="True" /> + </package> + <readme> + %s + </readme> +</tool_dependency> +""" + +protorequirements = """<requirements> + <requirement type="package" version="9.10">ghostscript</requirement> + <requirement type="package" version="1.3.18">graphicsmagick</requirement> + </requirements>""" + +def timenow(): + """return current time as a string + """ + return time.strftime('%d/%m/%Y %H:%M:%S', time.localtime(time.time())) + +html_escape_table = { + "&": "&", + ">": ">", + "<": "<", + "$": "\$" + } + +def html_escape(text): + """Produce entities within text.""" + return "".join(html_escape_table.get(c,c) for c in text) + +def cmd_exists(cmd): + return subprocess.call("type " + cmd, shell=True, + stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE) == 0 + + +def parse_citations(citations_text): + """ + """ + citations = [c for c in citations_text.split("**ENTRY**") if c.strip()] + citation_tuples = [] + for citation in citations: + if citation.startswith("doi"): + citation_tuples.append( ("doi", citation[len("doi"):].strip() ) ) + else: + citation_tuples.append( ("bibtex", citation[len("bibtex"):].strip() ) ) + return citation_tuples + + +class ScriptRunner: + """class is a wrapper for an arbitrary script + """ + + def __init__(self,opts=None,treatbashSpecial=True): + """ + cleanup inputs, setup some outputs + + """ + self.useGM = cmd_exists('gm') + self.useIM = cmd_exists('convert') + self.useGS = cmd_exists('gs') + self.temp_warned = False # we want only one warning if $TMP not set + self.treatbashSpecial = treatbashSpecial + if opts.output_dir: # simplify for the tool tarball + os.chdir(opts.output_dir) + self.thumbformat = 'png' + self.opts = opts + self.toolname = re.sub('[^a-zA-Z0-9_]+', '', opts.tool_name) # a sanitizer now does this but.. + self.toolid = self.toolname + self.myname = sys.argv[0] # get our name because we write ourselves out as a tool later + self.pyfile = self.myname # crude but efficient - the cruft won't hurt much + self.xmlfile = '%s.xml' % self.toolname + s = open(self.opts.script_path,'r').readlines() + s = [x.rstrip() for x in s] # remove pesky dos line endings if needed + self.script = '\n'.join(s) + fhandle,self.sfile = tempfile.mkstemp(prefix=self.toolname,suffix=".%s" % (opts.interpreter)) + tscript = open(self.sfile,'w') # use self.sfile as script source for Popen + tscript.write(self.script) + tscript.close() + self.indentedScript = '\n'.join([' %s' % html_escape(x) for x in s]) # for restructured text in help + self.escapedScript = '\n'.join([html_escape(x) for x in s]) + self.elog = os.path.join(self.opts.output_dir,"%s_error.log" % self.toolname) + if opts.output_dir: # may not want these complexities + self.tlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"%s_runner.log" % self.toolname) + art = '%s.%s' % (self.toolname,opts.interpreter) + artpath = os.path.join(self.opts.output_dir,art) # need full path + artifact = open(artpath,'w') # use self.sfile as script source for Popen + artifact.write(self.script) + artifact.close() + self.cl = [] + self.html = [] + a = self.cl.append + a(opts.interpreter) + if self.treatbashSpecial and opts.interpreter in ['bash','sh']: + a(self.sfile) + else: + a('-') # stdin + a(opts.input_tab) + a(opts.output_tab) + self.outputFormat = self.opts.output_format + self.inputFormats = self.opts.input_formats + self.test1Input = '%s_test1_input.xls' % self.toolname + self.test1Output = '%s_test1_output.xls' % self.toolname + self.test1HTML = '%s_test1_output.html' % self.toolname + + def makeXML(self): + """ + Create a Galaxy xml tool wrapper for the new script as a string to write out + fixme - use templating or something less fugly than this example of what we produce + + <tool id="reverse" name="reverse" version="0.01"> + <description>a tabular file</description> + <command interpreter="python"> + reverse.py --script_path "$runMe" --interpreter "python" + --tool_name "reverse" --input_tab "$input1" --output_tab "$tab_file" + </command> + <inputs> + <param name="input1" type="data" format="tabular" label="Select a suitable input file from your history"/><param name="job_name" type="text" label="Supply a name for the outputs to remind you what they contain" value="reverse"/> + + </inputs> + <outputs> + <data format="tabular" name="tab_file" label="${job_name}"/> + + </outputs> + <help> + +**What it Does** + +Reverse the columns in a tabular file + + </help> + <configfiles> + <configfile name="runMe"> + +# reverse order of columns in a tabular file +import sys +inp = sys.argv[1] +outp = sys.argv[2] +i = open(inp,'r') +o = open(outp,'w') +for row in i: + rs = row.rstrip().split('\t') + rs.reverse() + o.write('\t'.join(rs)) + o.write('\n') +i.close() +o.close() + + + </configfile> + </configfiles> + </tool> + + """ + newXML="""<tool id="%(toolid)s" name="%(toolname)s" version="%(tool_version)s"> +%(tooldesc)s +%(requirements)s +<command interpreter="python"> +%(command)s +</command> +<inputs> +%(inputs)s +</inputs> +<outputs> +%(outputs)s +</outputs> +<configfiles> +<configfile name="runMe"> +%(script)s +</configfile> +</configfiles> + +%(tooltests)s + +<help> + +%(help)s + +</help> +<citations> + %(citations)s + <citation type="doi">10.1093/bioinformatics/bts573</citation> +</citations> +</tool>""" # needs a dict with toolname, toolid, interpreter, scriptname, command, inputs as a multi line string ready to write, outputs ditto, help ditto + + newCommand=""" + %(toolname)s.py --script_path "$runMe" --interpreter "%(interpreter)s" + --tool_name "%(toolname)s" %(command_inputs)s %(command_outputs)s """ + # may NOT be an input or htmlout - appended later + tooltestsTabOnly = """ + <tests> + <test> + <param name="input1" value="%(test1Input)s" ftype="%(inputFormats)s"/> + <param name="job_name" value="test1"/> + <param name="runMe" value="$runMe"/> + <output name="tab_file" file="%(test1Output)s" ftype="%(outputFormat)s"/> + </test> + </tests> + """ + tooltestsHTMLOnly = """ + <tests> + <test> + <param name="input1" value="%(test1Input)s" ftype="%(inputFormats)s"/> + <param name="job_name" value="test1"/> + <param name="runMe" value="$runMe"/> + <output name="html_file" file="%(test1HTML)s" ftype="html" lines_diff="5"/> + </test> + </tests> + """ + tooltestsBoth = """<tests> + <test> + <param name="input1" value="%(test1Input)s" ftype="%(inputFormats)s"/> + <param name="job_name" value="test1"/> + <param name="runMe" value="$runMe"/> + <output name="tab_file" file="%(test1Output)s" ftype="%(outputFormat)s" /> + <output name="html_file" file="%(test1HTML)s" ftype="html" lines_diff="10"/> + </test> + </tests> + """ + xdict = {} + xdict['outputFormat'] = self.outputFormat + xdict['inputFormats'] = self.inputFormats + xdict['requirements'] = '' + if self.opts.make_HTML: + if self.opts.include_dependencies == "yes": + xdict['requirements'] = protorequirements + xdict['tool_version'] = self.opts.tool_version + xdict['test1Input'] = self.test1Input + xdict['test1HTML'] = self.test1HTML + xdict['test1Output'] = self.test1Output + if self.opts.make_HTML and self.opts.output_tab <> 'None': + xdict['tooltests'] = tooltestsBoth % xdict + elif self.opts.make_HTML: + xdict['tooltests'] = tooltestsHTMLOnly % xdict + else: + xdict['tooltests'] = tooltestsTabOnly % xdict + xdict['script'] = self.escapedScript + # configfile is least painful way to embed script to avoid external dependencies + # but requires escaping of <, > and $ to avoid Mako parsing + if self.opts.help_text: + helptext = open(self.opts.help_text,'r').readlines() + helptext = [html_escape(x) for x in helptext] # must html escape here too - thanks to Marius van den Beek + xdict['help'] = ''.join([x for x in helptext]) + else: + xdict['help'] = 'Please ask the tool author (%s) for help as none was supplied at tool generation\n' % (self.opts.user_email) + if self.opts.citations: + citationstext = open(self.opts.citations,'r').read() + citation_tuples = parse_citations(citationstext) + citations_xml = "" + for citation_type, citation_content in citation_tuples: + citation_xml = """<citation type="%s">%s</citation>""" % (citation_type, html_escape(citation_content)) + citations_xml += citation_xml + xdict['citations'] = citations_xml + else: + xdict['citations'] = "" + coda = ['**Script**','Pressing execute will run the following code over your input file and generate some outputs in your history::'] + coda.append('\n') + coda.append(self.indentedScript) + coda.append('\n**Attribution**\nThis Galaxy tool was created by %s at %s\nusing the Galaxy Tool Factory.\n' % (self.opts.user_email,timenow())) + coda.append('See %s for details of that project' % (toolFactoryURL)) + coda.append('Please cite: Creating re-usable tools from scripts: The Galaxy Tool Factory. Ross Lazarus; Antony Kaspi; Mark Ziemann; The Galaxy Team. ') + coda.append('Bioinformatics 2012; doi: 10.1093/bioinformatics/bts573\n') + xdict['help'] = '%s\n%s' % (xdict['help'],'\n'.join(coda)) + if self.opts.tool_desc: + xdict['tooldesc'] = '<description>%s</description>' % self.opts.tool_desc + else: + xdict['tooldesc'] = '' + xdict['command_outputs'] = '' + xdict['outputs'] = '' + if self.opts.input_tab <> 'None': + xdict['command_inputs'] = '--input_tab "$input1" ' # the space may matter a lot if we append something + xdict['inputs'] = '<param name="input1" type="data" format="%s" label="Select a suitable input file from your history"/> \n' % self.inputFormats + else: + xdict['command_inputs'] = '' # assume no input - eg a random data generator + xdict['inputs'] = '' + xdict['inputs'] += '<param name="job_name" type="text" label="Supply a name for the outputs to remind you what they contain" value="%s"/> \n' % self.toolname + xdict['toolname'] = self.toolname + xdict['toolid'] = self.toolid + xdict['interpreter'] = self.opts.interpreter + xdict['scriptname'] = self.sfile + if self.opts.make_HTML: + xdict['command_outputs'] += ' --output_dir "$html_file.files_path" --output_html "$html_file" --make_HTML "yes"' + xdict['outputs'] += ' <data format="html" name="html_file" label="${job_name}.html"/>\n' + else: + xdict['command_outputs'] += ' --output_dir "./"' + if self.opts.output_tab <> 'None': + xdict['command_outputs'] += ' --output_tab "$tab_file"' + xdict['outputs'] += ' <data format="%s" name="tab_file" label="${job_name}"/>\n' % self.outputFormat + xdict['command'] = newCommand % xdict + xmls = newXML % xdict + xf = open(self.xmlfile,'w') + xf.write(xmls) + xf.write('\n') + xf.close() + # ready for the tarball + + + def makeTooltar(self): + """ + a tool is a gz tarball with eg + /toolname/tool.xml /toolname/tool.py /toolname/test-data/test1_in.foo ... + """ + retval = self.run() + if retval: + print >> sys.stderr,'## Run failed. Cannot build yet. Please fix and retry' + sys.exit(1) + tdir = self.toolname + os.mkdir(tdir) + self.makeXML() + if self.opts.make_HTML: + if self.opts.help_text: + hlp = open(self.opts.help_text,'r').read() + else: + hlp = 'Please ask the tool author for help as none was supplied at tool generation\n' + if self.opts.include_dependencies: + tooldepcontent = toolhtmldepskel % hlp + depf = open(os.path.join(tdir,'tool_dependencies.xml'),'w') + depf.write(tooldepcontent) + depf.write('\n') + depf.close() + if self.opts.input_tab <> 'None': # no reproducible test otherwise? TODO: maybe.. + testdir = os.path.join(tdir,'test-data') + os.mkdir(testdir) # make tests directory + shutil.copyfile(self.opts.input_tab,os.path.join(testdir,self.test1Input)) + if self.opts.output_tab <> 'None': + shutil.copyfile(self.opts.output_tab,os.path.join(testdir,self.test1Output)) + if self.opts.make_HTML: + shutil.copyfile(self.opts.output_html,os.path.join(testdir,self.test1HTML)) + if self.opts.output_dir: + shutil.copyfile(self.tlog,os.path.join(testdir,'test1_out.log')) + outpif = '%s.py' % self.toolname # new name + outpiname = os.path.join(tdir,outpif) # path for the tool tarball + pyin = os.path.basename(self.pyfile) # our name - we rewrite ourselves (TM) + notes = ['# %s - a self annotated version of %s generated by running %s\n' % (outpiname,pyin,pyin),] + notes.append('# to make a new Galaxy tool called %s\n' % self.toolname) + notes.append('# User %s at %s\n' % (self.opts.user_email,timenow())) + pi = open(self.pyfile,'r').readlines() # our code becomes new tool wrapper (!) - first Galaxy worm + notes += pi + outpi = open(outpiname,'w') + outpi.write(''.join(notes)) + outpi.write('\n') + outpi.close() + stname = os.path.join(tdir,self.sfile) + if not os.path.exists(stname): + shutil.copyfile(self.sfile, stname) + xtname = os.path.join(tdir,self.xmlfile) + if not os.path.exists(xtname): + shutil.copyfile(self.xmlfile,xtname) + tarpath = "%s.gz" % self.toolname + tar = tarfile.open(tarpath, "w:gz") + tar.add(tdir,arcname=self.toolname) + tar.close() + shutil.copyfile(tarpath,self.opts.new_tool) + shutil.rmtree(tdir) + ## TODO: replace with optional direct upload to local toolshed? + return retval + + + def compressPDF(self,inpdf=None,thumbformat='png'): + """need absolute path to pdf + note that GS gets confoozled if no $TMP or $TEMP + so we set it + """ + assert os.path.isfile(inpdf), "## Input %s supplied to %s compressPDF not found" % (inpdf,self.myName) + hlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"compress_%s.txt" % os.path.basename(inpdf)) + sto = open(hlog,'a') + our_env = os.environ.copy() + our_tmp = our_env.get('TMP',None) + if not our_tmp: + our_tmp = our_env.get('TEMP',None) + if not (our_tmp and os.path.exists(our_tmp)): + newtmp = os.path.join(self.opts.output_dir,'tmp') + try: + os.mkdir(newtmp) + except: + sto.write('## WARNING - cannot make %s - it may exist or permissions need fixing\n' % newtmp) + our_env['TEMP'] = newtmp + if not self.temp_warned: + sto.write('## WARNING - no $TMP or $TEMP!!! Please fix - using %s temporarily\n' % newtmp) + self.temp_warned = True + outpdf = '%s_compressed' % inpdf + cl = ["gs", "-sDEVICE=pdfwrite", "-dNOPAUSE", "-dUseCIEColor", "-dBATCH","-dPDFSETTINGS=/printer", "-sOutputFile=%s" % outpdf,inpdf] + x = subprocess.Popen(cl,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir,env=our_env) + retval1 = x.wait() + sto.close() + if retval1 == 0: + os.unlink(inpdf) + shutil.move(outpdf,inpdf) + os.unlink(hlog) + hlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"thumbnail_%s.txt" % os.path.basename(inpdf)) + sto = open(hlog,'w') + outpng = '%s.%s' % (os.path.splitext(inpdf)[0],thumbformat) + if self.useGM: + cl2 = ['gm', 'convert', inpdf, outpng] + else: # assume imagemagick + cl2 = ['convert', inpdf, outpng] + x = subprocess.Popen(cl2,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir,env=our_env) + retval2 = x.wait() + sto.close() + if retval2 == 0: + os.unlink(hlog) + retval = retval1 or retval2 + return retval + + + def getfSize(self,fpath,outpath): + """ + format a nice file size string + """ + size = '' + fp = os.path.join(outpath,fpath) + if os.path.isfile(fp): + size = '0 B' + n = float(os.path.getsize(fp)) + if n > 2**20: + size = '%1.1f MB' % (n/2**20) + elif n > 2**10: + size = '%1.1f KB' % (n/2**10) + elif n > 0: + size = '%d B' % (int(n)) + return size + + def makeHtml(self): + """ Create an HTML file content to list all the artifacts found in the output_dir + """ + + galhtmlprefix = """<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> + <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en"> + <head> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" /> + <meta name="generator" content="Galaxy %s tool output - see http://g2.trac.bx.psu.edu/" /> + <title></title> + <link rel="stylesheet" href="/static/style/base.css" type="text/css" /> + </head> + <body> + <div class="toolFormBody"> + """ + galhtmlattr = """<hr/><div class="infomessage">This tool (%s) was generated by the <a href="https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/overview">Galaxy Tool Factory</a></div><br/>""" + galhtmlpostfix = """</div></body></html>\n""" + + flist = os.listdir(self.opts.output_dir) + flist = [x for x in flist if x <> 'Rplots.pdf'] + flist.sort() + html = [] + html.append(galhtmlprefix % progname) + html.append('<div class="infomessage">Galaxy Tool "%s" run at %s</div><br/>' % (self.toolname,timenow())) + fhtml = [] + if len(flist) > 0: + logfiles = [x for x in flist if x.lower().endswith('.log')] # log file names determine sections + logfiles.sort() + logfiles = [x for x in logfiles if os.path.abspath(x) <> os.path.abspath(self.tlog)] + logfiles.append(os.path.abspath(self.tlog)) # make it the last one + pdflist = [] + npdf = len([x for x in flist if os.path.splitext(x)[-1].lower() == '.pdf']) + for rownum,fname in enumerate(flist): + dname,e = os.path.splitext(fname) + sfsize = self.getfSize(fname,self.opts.output_dir) + if e.lower() == '.pdf' : # compress and make a thumbnail + thumb = '%s.%s' % (dname,self.thumbformat) + pdff = os.path.join(self.opts.output_dir,fname) + retval = self.compressPDF(inpdf=pdff,thumbformat=self.thumbformat) + if retval == 0: + pdflist.append((fname,thumb)) + else: + pdflist.append((fname,fname)) + if (rownum+1) % 2 == 0: + fhtml.append('<tr class="odd_row"><td><a href="%s">%s</a></td><td>%s</td></tr>' % (fname,fname,sfsize)) + else: + fhtml.append('<tr><td><a href="%s">%s</a></td><td>%s</td></tr>' % (fname,fname,sfsize)) + for logfname in logfiles: # expect at least tlog - if more + if os.path.abspath(logfname) == os.path.abspath(self.tlog): # handled later + sectionname = 'All tool run' + if (len(logfiles) > 1): + sectionname = 'Other' + ourpdfs = pdflist + else: + realname = os.path.basename(logfname) + sectionname = os.path.splitext(realname)[0].split('_')[0] # break in case _ added to log + ourpdfs = [x for x in pdflist if os.path.basename(x[0]).split('_')[0] == sectionname] + pdflist = [x for x in pdflist if os.path.basename(x[0]).split('_')[0] <> sectionname] # remove + nacross = 1 + npdf = len(ourpdfs) + + if npdf > 0: + nacross = math.sqrt(npdf) ## int(round(math.log(npdf,2))) + if int(nacross)**2 != npdf: + nacross += 1 + nacross = int(nacross) + width = min(400,int(1200/nacross)) + html.append('<div class="toolFormTitle">%s images and outputs</div>' % sectionname) + html.append('(Click on a thumbnail image to download the corresponding original PDF image)<br/>') + ntogo = nacross # counter for table row padding with empty cells + html.append('<div><table class="simple" cellpadding="2" cellspacing="2">\n<tr>') + for i,paths in enumerate(ourpdfs): + fname,thumb = paths + s= """<td><a href="%s"><img src="%s" title="Click to download a PDF of %s" hspace="5" width="%d" + alt="Image called %s"/></a></td>\n""" % (fname,thumb,fname,width,fname) + if ((i+1) % nacross == 0): + s += '</tr>\n' + ntogo = 0 + if i < (npdf - 1): # more to come + s += '<tr>' + ntogo = nacross + else: + ntogo -= 1 + html.append(s) + if html[-1].strip().endswith('</tr>'): + html.append('</table></div>\n') + else: + if ntogo > 0: # pad + html.append('<td> </td>'*ntogo) + html.append('</tr></table></div>\n') + logt = open(logfname,'r').readlines() + logtext = [x for x in logt if x.strip() > ''] + html.append('<div class="toolFormTitle">%s log output</div>' % sectionname) + if len(logtext) > 1: + html.append('\n<pre>\n') + html += logtext + html.append('\n</pre>\n') + else: + html.append('%s is empty<br/>' % logfname) + if len(fhtml) > 0: + fhtml.insert(0,'<div><table class="colored" cellpadding="3" cellspacing="3"><tr><th>Output File Name (click to view)</th><th>Size</th></tr>\n') + fhtml.append('</table></div><br/>') + html.append('<div class="toolFormTitle">All output files available for downloading</div>\n') + html += fhtml # add all non-pdf files to the end of the display + else: + html.append('<div class="warningmessagelarge">### Error - %s returned no files - please confirm that parameters are sane</div>' % self.opts.interpreter) + html.append(galhtmlpostfix) + htmlf = file(self.opts.output_html,'w') + htmlf.write('\n'.join(html)) + htmlf.write('\n') + htmlf.close() + self.html = html + + + def run(self): + """ + scripts must be small enough not to fill the pipe! + """ + if self.treatbashSpecial and self.opts.interpreter in ['bash','sh']: + retval = self.runBash() + else: + if self.opts.output_dir: + ste = open(self.elog,'w') + sto = open(self.tlog,'w') + sto.write('## Toolfactory generated command line = %s\n' % ' '.join(self.cl)) + sto.flush() + p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdout=sto,stderr=ste,stdin=subprocess.PIPE,cwd=self.opts.output_dir) + else: + p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdin=subprocess.PIPE) + p.stdin.write(self.script) + p.stdin.close() + retval = p.wait() + if self.opts.output_dir: + sto.close() + ste.close() + err = open(self.elog,'r').readlines() + if retval <> 0 and err: # problem + print >> sys.stderr,err + if self.opts.make_HTML: + self.makeHtml() + return retval + + def runBash(self): + """ + cannot use - for bash so use self.sfile + """ + if self.opts.output_dir: + s = '## Toolfactory generated command line = %s\n' % ' '.join(self.cl) + sto = open(self.tlog,'w') + sto.write(s) + sto.flush() + p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir) + else: + p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False) + retval = p.wait() + if self.opts.output_dir: + sto.close() + if self.opts.make_HTML: + self.makeHtml() + return retval + + +def main(): + u = """ + This is a Galaxy wrapper. It expects to be called by a special purpose tool.xml as: + <command interpreter="python">rgBaseScriptWrapper.py --script_path "$scriptPath" --tool_name "foo" --interpreter "Rscript" + </command> + """ + op = optparse.OptionParser() + a = op.add_option + a('--script_path',default=None) + a('--tool_name',default=None) + a('--interpreter',default=None) + a('--output_dir',default='./') + a('--output_html',default=None) + a('--input_tab',default="None") + a('--input_formats',default="tabular,text") + a('--output_tab',default="None") + a('--output_format',default="tabular") + a('--user_email',default='Unknown') + a('--bad_user',default=None) + a('--make_Tool',default=None) + a('--make_HTML',default=None) + a('--help_text',default=None) + a('--citations',default=None) + a('--tool_desc',default=None) + a('--new_tool',default=None) + a('--tool_version',default=None) + a('--include_dependencies',default=None) + opts, args = op.parse_args() + assert not opts.bad_user,'UNAUTHORISED: %s is NOT authorized to use this tool until Galaxy admin adds %s to admin_users in universe_wsgi.ini' % (opts.bad_user,opts.bad_user) + assert opts.tool_name,'## Tool Factory expects a tool name - eg --tool_name=DESeq' + assert opts.interpreter,'## Tool Factory wrapper expects an interpreter - eg --interpreter=Rscript' + assert os.path.isfile(opts.script_path),'## Tool Factory wrapper expects a script path - eg --script_path=foo.R' + if opts.output_dir: + try: + os.makedirs(opts.output_dir) + except: + pass + r = ScriptRunner(opts) + if opts.make_Tool: + retcode = r.makeTooltar() + else: + retcode = r.run() + os.unlink(r.sfile) + if retcode: + sys.exit(retcode) # indicate failure to job runner + + +if __name__ == "__main__": + main() + + +
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.xml Mon Oct 13 08:42:19 2014 -0400 @@ -0,0 +1,1301 @@ +<tool id="cloudmap_zf_hom_mapping" name="cloudmap_zf_hom_mapping" version="0.01"> +<description>Map a zebrafish mutant using bulk sergeant homozygosity mapping</description> +<requirements> + <requirement type="package" version="9.10">ghostscript</requirement> + <requirement type="package" version="1.3.18">graphicsmagick</requirement> + </requirements> +<command interpreter="python"> + + cloudmap_zf_hom_mapping.py --script_path "$runMe" --interpreter "Rscript" + --tool_name "cloudmap_zf_hom_mapping" --input_tab "$input1" --output_dir "$html_file.files_path" --output_html "$html_file" --make_HTML "yes" +</command> +<inputs> +<param name="input1" type="data" format="vcf" label="Select a suitable input file from your history"/> +<param name="job_name" type="text" label="Supply a name for the outputs to remind you what they contain" value="cloudmap_zf_hom_mapping"/> + +</inputs> +<outputs> + <data format="html" name="html_file" label="${job_name}.html"/> + +</outputs> +<configfiles> +<configfile name="runMe"> +#homozygosity-mapping script +#input file: Q200 variants no wildtype +ourargs = commandArgs(TRUE) +inf = ourargs[1] +outf = ourargs[2] +Q200var = read.table(inf) + + +het <- Q200var[grep("AF=0.5",Q200var\$V8), ] +hom <- Q200var[grep("AF=1.0",Q200var\$V8), ] + +get_hom1 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr1") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr1") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom2 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr2") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr2") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom3 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr3") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr3") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom4 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr4") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr4") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom5 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr5") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr5") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom6 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr6") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr6") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom7 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr7") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr7") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom8 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr8") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr8") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom9 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr9") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr9") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom10 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr10") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr10") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom11 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr11") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr11") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom12 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr12") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr12") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom13 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr13") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr13") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom14 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr14") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr14") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom15 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr15") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr15") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom16 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr16") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr16") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom17 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr17") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr17") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom18 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr18") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr18") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom19 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr19") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr19") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom20 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr20") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr20") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom21 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr21") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr21") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom22 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr22") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr22") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom23 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr23") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr23") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom24 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr24") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr24") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +get_hom25 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr25") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr25") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) +} + +h1 <- get_hom1(hom,het) +h2 <- get_hom2(hom,het) +h3 <- get_hom3(hom,het) +h4 <- get_hom4(hom,het) +h5 <- get_hom5(hom,het) +h6 <- get_hom6(hom,het) +h7 <- get_hom7(hom,het) +h8 <- get_hom8(hom,het) +h9 <- get_hom9(hom,het) +h10 <- get_hom10(hom,het) +h11 <- get_hom11(hom,het) +h12 <- get_hom12(hom,het) +h13 <- get_hom13(hom,het) +h14 <- get_hom14(hom,het) +h15 <- get_hom15(hom,het) +h16 <- get_hom16(hom,het) +h17 <- get_hom17(hom,het) +h18 <- get_hom18(hom,het) +h19 <- get_hom19(hom,het) +h20 <- get_hom20(hom,het) +h21 <- get_hom21(hom,het) +h22 <- get_hom22(hom,het) +h23 <- get_hom23(hom,het) +h24 <- get_hom24(hom,het) +h25 <- get_hom25(hom,het) + + + +#Extracting maxima (homozygosity-mapping) + +zero_crossings_maxima <- function(x,y){ + + dy <- diff(y) + xn <- x[2:length(x)] + + n <- length(dy) + t1 <- dy[1:n-1]; + t2 <- dy[2:n]; + tt <- t1*t2 + ind <- which(tt < 0) + + # print out the maxima + d2y <- diff(dy) + vind <- c() + vy <- c() + vxn <- c() + + xnn <- x[3:length(x)] + for(i in 1:length(ind)){ + ### cat( ind[i], d2y[ind[i]], '\n') + if( d2y[ind[i]] < 0 ){ + ### cat(ind[i], y[ind[i]], xn[ind[i]], "\n" ) + vind <- c(vind, ind[i]) + vy <- c(vy, y[ind[i]]) + vxn <- c(vxn, xn[ind[i]]) + } + } + + maxima <- data.frame(ind=vind, y=vy, x=vxn) + maxima <- maxima[order(maxima\$y),] + + #print( maxima ) + + results <- list() + results\$dy <- dy + results\$xn <- xn + results\$maxima <- maxima[ order(maxima\$y, decreasing=T), ] + + return(results) +} + +res1 <- zero_crossings_maxima(h1\$x,h1\$ratio) +res2 <- zero_crossings_maxima(h2\$x,h2\$ratio) +res3 <- zero_crossings_maxima(h3\$x,h3\$ratio) +res4 <- zero_crossings_maxima(h4\$x,h4\$ratio) +res5 <- zero_crossings_maxima(h5\$x,h5\$ratio) +res6 <- zero_crossings_maxima(h6\$x,h6\$ratio) +res7 <- zero_crossings_maxima(h7\$x,h7\$ratio) +res8 <- zero_crossings_maxima(h8\$x,h8\$ratio) +res9 <- zero_crossings_maxima(h9\$x,h9\$ratio) +res10 <- zero_crossings_maxima(h10\$x,h10\$ratio) +res11 <- zero_crossings_maxima(h11\$x,h11\$ratio) +res12 <- zero_crossings_maxima(h12\$x,h12\$ratio) +res13 <- zero_crossings_maxima(h13\$x,h13\$ratio) +res14 <- zero_crossings_maxima(h14\$x,h14\$ratio) +res15 <- zero_crossings_maxima(h15\$x,h15\$ratio) +res16 <- zero_crossings_maxima(h16\$x,h16\$ratio) +res17 <- zero_crossings_maxima(h17\$x,h17\$ratio) +res18 <- zero_crossings_maxima(h18\$x,h18\$ratio) +res19 <- zero_crossings_maxima(h19\$x,h19\$ratio) +res20 <- zero_crossings_maxima(h20\$x,h20\$ratio) +res21 <- zero_crossings_maxima(h21\$x,h21\$ratio) +res22 <- zero_crossings_maxima(h22\$x,h22\$ratio) +res23 <- zero_crossings_maxima(h23\$x,h23\$ratio) +res24 <- zero_crossings_maxima(h24\$x,h24\$ratio) +res25 <- zero_crossings_maxima(h25\$x,h25\$ratio) + + +#plotting (including maxima and adjusting to max ratio) +# all on one plot +pdf("allchrs.pdf",height=10, width=20) +library(Hmisc) +ymax <- 1.05*max( c(h1\$ratio,h2\$ratio,h3\$ratio,h4\$ratio,h5\$ratio,h6\$ratio,h7\$ratio,h8\$ratio,h9\$ratio,h10\$ratio,h11\$ratio,h12\$ratio,h13\$ratio,h14\$ratio,h15\$ratio,h16\$ratio,h17\$ratio,h18\$ratio,h19\$ratio,h20\$ratio,h21\$ratio,h22\$ratio,h23\$ratio,h24\$ratio,h25\$ratio)) +par(mfrow=c(5,5)) +plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") +points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") +points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") +points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") +points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") +points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") +points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") +points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") +points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") +points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") +points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") +points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") +points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") +points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") +points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") +points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") +points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") +points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") +points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") +points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") +points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") +points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") +points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") +points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") +points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") +points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(10) +dev.off() + +# seperate plots +pdf("chr1.pdf",height=5, width=10) +plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") +points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr2.pdf",height=5, width=10) +plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") +points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr3.pdf",height=5, width=10) +plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") +points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr4.pdf",height=5, width=10) +plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") +points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr5.pdf",height=5, width=10) +plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") +points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr6.pdf",height=5, width=10) +plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") +points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr7.pdf",height=5, width=10) +plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") +points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr8.pdf",height=5, width=10) +plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") +points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr9.pdf",height=5, width=10) +plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") +points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr10.pdf",height=5, width=10) +plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") +points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr11.pdf",height=5, width=10) +plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") +points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr12.pdf",height=5, width=10) +plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") +points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr13.pdf",height=5, width=10) +plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") +points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr14.pdf",height=5, width=10) +plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") +points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr15.pdf",height=5, width=10) +plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") +points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr16.pdf",height=5, width=10) +plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") +points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr17.pdf",height=5, width=10) +plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") +points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr18.pdf",height=5, width=10) +plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") +points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr19.pdf",height=5, width=10) +plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") +points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr20.pdf",height=5, width=10) +plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") +points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr21.pdf",height=5, width=10) +plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") +points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr22.pdf",height=5, width=10) +plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") +points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr23.pdf",height=5, width=10) +plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") +points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr24.pdf",height=5, width=10) +plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") +points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(nx=10) +dev.off() +pdf("chr25.pdf",height=5, width=10) +plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") +points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) +abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) +legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) +minor.tick(10) +dev.off() +</configfile> +</configfiles> + + + <tests> + <test> + <param name="input1" value="cloudmap_zf_hom_mapping_test1_input.xls" ftype="vcf"/> + <param name="job_name" value="test1"/> + <param name="runMe" value="$runMe"/> + <output name="html_file" file="cloudmap_zf_hom_mapping_test1_output.html" ftype="html" lines_diff="5"/> + </test> + </tests> + + +<help> + + +**What it Does** + +This tool is part of an update to the CloudMap pipeline (Minevich et al. 2012) to incorporate homozygosity mapping in zebrafish. This tool facilitates the mapping of zebrafish mutants from WGS or RNA-Seq data using bulk segregant homozygosity mapping. As input it takes a VCF list of variants (usually quality filtered for Q200 with WT SNPs/indels removed). This file is produced when running the CloudMap zebrafish pipeline. It plots an adjusted homozygosity ratio such that a high ratio indicates mapping region. It outputs an HTML file with combined and individual chromosome plots as PDFs. The adjusted homozygosity ratio is calculated as described in: + +IN SUBMISSION + +**Script** +Pressing execute will run the following code over your input file and generate some outputs in your history:: + + + #homozygosity-mapping script + #input file: Q200 variants no wildtype + ourargs = commandArgs(TRUE) + inf = ourargs[1] + outf = ourargs[2] + Q200var = read.table(inf) + + + het <- Q200var[grep("AF=0.5",Q200var\$V8), ] + hom <- Q200var[grep("AF=1.0",Q200var\$V8), ] + + get_hom1 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr1") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr1") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom2 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr2") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr2") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom3 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr3") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr3") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom4 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr4") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr4") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom5 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr5") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr5") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom6 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr6") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr6") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom7 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr7") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr7") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom8 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr8") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr8") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom9 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr9") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr9") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom10 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr10") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr10") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom11 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr11") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr11") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom12 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr12") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr12") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom13 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr13") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr13") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom14 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr14") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr14") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom15 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr15") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr15") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom16 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr16") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr16") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom17 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr17") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr17") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom18 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr18") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr18") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom19 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr19") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr19") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom20 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr20") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr20") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom21 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr21") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr21") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom22 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr22") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr22") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom23 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr23") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr23") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom24 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr24") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr24") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + get_hom25 <- function(x1,x2){ + hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr25") + het <- subset(x2,x2\$V1=="chr25") + d1 <- density(hom\$V2) + d2 <- density(het\$V2) + return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) + } + + h1 <- get_hom1(hom,het) + h2 <- get_hom2(hom,het) + h3 <- get_hom3(hom,het) + h4 <- get_hom4(hom,het) + h5 <- get_hom5(hom,het) + h6 <- get_hom6(hom,het) + h7 <- get_hom7(hom,het) + h8 <- get_hom8(hom,het) + h9 <- get_hom9(hom,het) + h10 <- get_hom10(hom,het) + h11 <- get_hom11(hom,het) + h12 <- get_hom12(hom,het) + h13 <- get_hom13(hom,het) + h14 <- get_hom14(hom,het) + h15 <- get_hom15(hom,het) + h16 <- get_hom16(hom,het) + h17 <- get_hom17(hom,het) + h18 <- get_hom18(hom,het) + h19 <- get_hom19(hom,het) + h20 <- get_hom20(hom,het) + h21 <- get_hom21(hom,het) + h22 <- get_hom22(hom,het) + h23 <- get_hom23(hom,het) + h24 <- get_hom24(hom,het) + h25 <- get_hom25(hom,het) + + + + #Extracting maxima (homozygosity-mapping) + + zero_crossings_maxima <- function(x,y){ + + dy <- diff(y) + xn <- x[2:length(x)] + + n <- length(dy) + t1 <- dy[1:n-1]; + t2 <- dy[2:n]; + tt <- t1*t2 + ind <- which(tt < 0) + + # print out the maxima + d2y <- diff(dy) + vind <- c() + vy <- c() + vxn <- c() + + xnn <- x[3:length(x)] + for(i in 1:length(ind)){ + ### cat( ind[i], d2y[ind[i]], '\n') + if( d2y[ind[i]] < 0 ){ + ### cat(ind[i], y[ind[i]], xn[ind[i]], "\n" ) + vind <- c(vind, ind[i]) + vy <- c(vy, y[ind[i]]) + vxn <- c(vxn, xn[ind[i]]) + } + } + + maxima <- data.frame(ind=vind, y=vy, x=vxn) + maxima <- maxima[order(maxima\$y),] + + #print( maxima ) + + results <- list() + results\$dy <- dy + results\$xn <- xn + results\$maxima <- maxima[ order(maxima\$y, decreasing=T), ] + + return(results) + } + + res1 <- zero_crossings_maxima(h1\$x,h1\$ratio) + res2 <- zero_crossings_maxima(h2\$x,h2\$ratio) + res3 <- zero_crossings_maxima(h3\$x,h3\$ratio) + res4 <- zero_crossings_maxima(h4\$x,h4\$ratio) + res5 <- zero_crossings_maxima(h5\$x,h5\$ratio) + res6 <- zero_crossings_maxima(h6\$x,h6\$ratio) + res7 <- zero_crossings_maxima(h7\$x,h7\$ratio) + res8 <- zero_crossings_maxima(h8\$x,h8\$ratio) + res9 <- zero_crossings_maxima(h9\$x,h9\$ratio) + res10 <- zero_crossings_maxima(h10\$x,h10\$ratio) + res11 <- zero_crossings_maxima(h11\$x,h11\$ratio) + res12 <- zero_crossings_maxima(h12\$x,h12\$ratio) + res13 <- zero_crossings_maxima(h13\$x,h13\$ratio) + res14 <- zero_crossings_maxima(h14\$x,h14\$ratio) + res15 <- zero_crossings_maxima(h15\$x,h15\$ratio) + res16 <- zero_crossings_maxima(h16\$x,h16\$ratio) + res17 <- zero_crossings_maxima(h17\$x,h17\$ratio) + res18 <- zero_crossings_maxima(h18\$x,h18\$ratio) + res19 <- zero_crossings_maxima(h19\$x,h19\$ratio) + res20 <- zero_crossings_maxima(h20\$x,h20\$ratio) + res21 <- zero_crossings_maxima(h21\$x,h21\$ratio) + res22 <- zero_crossings_maxima(h22\$x,h22\$ratio) + res23 <- zero_crossings_maxima(h23\$x,h23\$ratio) + res24 <- zero_crossings_maxima(h24\$x,h24\$ratio) + res25 <- zero_crossings_maxima(h25\$x,h25\$ratio) + + + #plotting (including maxima and adjusting to max ratio) + # all on one plot + pdf("allchrs.pdf",height=10, width=20) + library(Hmisc) + ymax <- 1.05*max( c(h1\$ratio,h2\$ratio,h3\$ratio,h4\$ratio,h5\$ratio,h6\$ratio,h7\$ratio,h8\$ratio,h9\$ratio,h10\$ratio,h11\$ratio,h12\$ratio,h13\$ratio,h14\$ratio,h15\$ratio,h16\$ratio,h17\$ratio,h18\$ratio,h19\$ratio,h20\$ratio,h21\$ratio,h22\$ratio,h23\$ratio,h24\$ratio,h25\$ratio)) + par(mfrow=c(5,5)) + plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") + points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") + points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") + points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") + points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") + points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") + points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") + points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") + points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") + points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") + points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") + points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") + points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") + points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") + points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") + points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") + points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") + points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") + points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") + points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") + points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") + points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") + points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") + points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") + points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") + points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(10) + dev.off() + + # seperate plots + pdf("chr1.pdf",height=5, width=10) + plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") + points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr2.pdf",height=5, width=10) + plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") + points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], 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ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") + points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr10.pdf",height=5, width=10) + plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") + points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr11.pdf",height=5, width=10) + plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") + points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], 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res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr21.pdf",height=5, width=10) + plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") + points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr22.pdf",height=5, width=10) + plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") + points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr23.pdf",height=5, width=10) + plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") + points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr24.pdf",height=5, width=10) + plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") + points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(nx=10) + dev.off() + pdf("chr25.pdf",height=5, width=10) + plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") + points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) + abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) + legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) + minor.tick(10) + dev.off() + +**Attribution** +This Galaxy tool was created by r.poole@ucl.ac.uk at 13/10/2014 13:41:11 +using the Galaxy Tool Factory. + +See https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory for details of that project +Please cite: Creating re-usable tools from scripts: The Galaxy Tool Factory. Ross Lazarus; Antony Kaspi; Mark Ziemann; The Galaxy Team. +Bioinformatics 2012; doi: 10.1093/bioinformatics/bts573 + + +</help> +<citations> + <citation type="doi">10.1534/genetics.112.144204</citation> + <citation type="doi">10.1093/bioinformatics/bts573</citation> +</citations> +</tool>
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/cloudmap_zf_hom_mapping_test1_input.xls Mon Oct 13 08:42:19 2014 -0400 @@ -0,0 +1,35467 @@ +##fileformat=VCFv4.1 +##FILTER=<ID=LowQual,Description="Low quality"> +##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed"> +##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)"> +##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality"> +##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype"> +##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification"> +##GATKCommandLine=<ID=HaplotypeCaller,Version=nightly-2014-01-31-gc6765ad,Date="Thu Oct 09 18:33:16 BST 2014",Epoch=1412875996785,CommandLineOptions="analysis_type=HaplotypeCaller 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sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=/Users/galaxy/galaxy-dist/database/tmp/tmp-gatk-DvBGms/input_variant.vcf) discordance=(RodBinding name=discordance source=/Volumes/ngs/database/files/002/dataset_2093.dat) concordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub 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+##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency (not necessarily the same as the AF), for each ALT allele, in the same order as listed"> +##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality"> +##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads"> +##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities"> +##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth"> +##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias"> +##contig=<ID=Zv9_scaffold3453,length=203829> +##contig=<ID=Zv9_scaffold3454,length=91011> +##contig=<ID=Zv9_scaffold3455,length=543129> +##contig=<ID=Zv9_scaffold3456,length=253302> +##contig=<ID=Zv9_scaffold3457,length=101278> +##contig=<ID=Zv9_scaffold3458,length=223119> 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.912;DP=132;FS=2.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,25:132:99:307,0,3552 +Zv9_scaffold3455 148081 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=-0.584;DP=172;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,32:172:99:341,0,4752 +Zv9_scaffold3455 152119 . T G 2160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=1.087;DP=164;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:2189,0,2216 +Zv9_scaffold3455 157545 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.715;DP=141;FS=8.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,27:141:99:400,0,3421 +Zv9_scaffold3455 157578 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.277;DP=154;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:306,0,4108 +Zv9_scaffold3455 167332 . T C 1969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.356;DP=136;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1998,0,2100 +Zv9_scaffold3455 339404 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.921;DP=33;FS=11.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:265,0,875 +Zv9_scaffold3455 339823 . T C 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-0.888;DP=46;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:536,0,863 +Zv9_scaffold3455 347685 . G GT 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.843;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:342,0,1233 +Zv9_scaffold3455 348721 . A AT 406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.714;DP=47;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:499,0,390 +Zv9_scaffold3455 349421 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.002;DP=190;FS=4.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,39:189:99:358,0,4455 +Zv9_scaffold3455 349519 . T A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.239;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,35:169:99:456,0,3957 +Zv9_scaffold3455 371724 . A G 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=1.258;DP=92;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,32:92:99:870,0,1648 +Zv9_scaffold3455 371760 . A T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=-0.794;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,27:87:99:622,0,1821 +Zv9_scaffold3455 422810 . G GT 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.647;DP=76;FS=3.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:358,0,1040 +Zv9_scaffold3456 26353 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +Zv9_scaffold3459 217553 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,196 +Zv9_scaffold3459 218425 . AG A 628.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.183;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:666,0,483 +Zv9_scaffold3459 269495 . C A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +Zv9_scaffold3460 55143 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.267;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:236,0,337 +Zv9_scaffold3463 654984 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.416;DP=55;FS=3.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:795,0,582 +Zv9_scaffold3465 207470 . A G 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=-1.191;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=33.36;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:562,0,117 +Zv9_scaffold3465 207475 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-1.237;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:378,0,378 +Zv9_scaffold3465 422655 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:239,0,105 +Zv9_scaffold3465 426185 . T C 211.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:239,0,11 +Zv9_scaffold3469 60188 . G A 304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:333,33,0 +Zv9_scaffold3469 60253 . A G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +Zv9_scaffold3471 94534 . A T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=1.891;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:387,0,487 +Zv9_scaffold3471 95384 . G C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.236;DP=49;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:582,0,806 +Zv9_scaffold3471 95783 . TCCTGAGGGAAGATGGATACAAGTGTGGTAAGGATTTTAATAATGACATGTGAATGTTCTGTAGAAGAAAAAAACGATGTAAAACAGATGGCCTA T 2423.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.284;DP=54;FS=6.377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:99:2461,224,0 +Zv9_scaffold3471 124444 . T C 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=-0.219;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:987,0,734 +Zv9_scaffold3471 139711 . T C 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.227;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:907,0,658 +Zv9_scaffold3471 139876 . T C 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-0.045;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:990,0,909 +Zv9_scaffold3471 139944 . A G 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-1.125;DP=56;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:787,0,873 +Zv9_scaffold3471 164627 . G T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-1.056;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:321,0,524 +Zv9_scaffold3474 45049 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,338 +Zv9_scaffold3476 136818 . G A 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:461,36,0 +Zv9_scaffold3476 136900 . G A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.361;DP=62;FS=11.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=16.75;ReadPosRankSum=-2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1067,0,574 +Zv9_scaffold3476 136915 . T A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.188;DP=53;FS=9.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=4.18;ReadPosRankSum=2.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:250,0,887 +Zv9_scaffold3476 136927 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.162;DP=42;FS=23.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=14.52;ReadPosRankSum=-2.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:638,0,354 +Zv9_scaffold3476 137166 . A G 586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:615,48,0 +Zv9_scaffold3476 137208 . G A 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.082;DP=65;FS=12.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:80:971,0,80 +Zv9_scaffold3476 137266 . T C 770.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=21.41;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:60:799,60,0 +Zv9_scaffold3484 55665 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.014;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:572,0,588 +Zv9_scaffold3484 71430 . G A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.734;DP=49;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:741,0,688 +Zv9_scaffold3484 71897 . C T 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-0.352;DP=67;FS=8.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,40:67:99:1148,0,736 +Zv9_scaffold3484 82283 . G A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.217;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:635,0,1095 +Zv9_scaffold3484 96372 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=1.477;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=24.19;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:899,0,294 +Zv9_scaffold3484 96403 . A C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.462;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=14.67;ReadPosRankSum=-2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:395,0,427 +Zv9_scaffold3484 96480 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.903;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:638,0,315 +Zv9_scaffold3484 96522 . A G 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.181;DP=57;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=24.00;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,44:57:99:1396,0,230 +Zv9_scaffold3484 103897 . G A 1967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.203;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.108;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,58:76:99:1996,0,320 +Zv9_scaffold3484 104476 . TC T 623.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.575;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:55:661,0,55 +Zv9_scaffold3484 105015 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.482;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:278,0,802 +Zv9_scaffold3484 105257 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=1.833;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:541,0,234 +Zv9_scaffold3484 105616 . T TA 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=31.46;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:48:325,0,48 +Zv9_scaffold3484 105652 . A G 225.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:16:254,0,16 +Zv9_scaffold3484 106037 . G C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=24.45;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:395,0,145 +Zv9_scaffold3485 225332 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-0.502;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:299,0,1661 +Zv9_scaffold3485 227018 . C T 2158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-0.183;DP=88;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=24.53;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,69:87:99:2187,0,252 +Zv9_scaffold3485 243810 . G C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=-1.156;DP=86;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:424,0,1933 +Zv9_scaffold3485 253644 . AAGGTAGTGAAGTCTTTAAGTGTCAGACTGACTTGAGTTTTGGATGTCATGTTGCAGTCCCCTTAGATCCCATTGCTGTGTTTCTCCAAC A 2988.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.739;DP=66;FS=6.359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:3026,261,0 +Zv9_scaffold3485 256563 . CT C,CTT 563.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-0.567;DP=44;FS=14.880;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,19,19:43:99:724,347,570,365,0,541 +Zv9_scaffold3485 257154 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:57:249,0,57 +Zv9_scaffold3485 299291 . A G 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:540,39,0 +Zv9_scaffold3485 299308 . G A 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 +Zv9_scaffold3487 176875 . A T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +Zv9_scaffold3491 3018 . G A 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 +Zv9_scaffold3493 21401 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:315,27,0 +Zv9_scaffold3493 21495 . A C 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:732,66,0 +Zv9_scaffold3493 159055 . AG A 262.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:300,24,0 +Zv9_scaffold3494 18966 . A T 334.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:363,33,0 +Zv9_scaffold3494 208033 . T C 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 +Zv9_scaffold3497 29349 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:60:244,0,60 +Zv9_scaffold3497 29430 . G T 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +Zv9_scaffold3497 32983 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:335,0,179 +Zv9_scaffold3497 74469 . G C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +Zv9_scaffold3497 93556 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.214;DP=59;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:586,0,999 +Zv9_scaffold3497 93610 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=2.022;DP=67;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.24;ReadPosRankSum=-2.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:67:99:379,0,3774 +Zv9_scaffold3497 93618 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=3.451;DP=68;FS=17.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:371,0,3774 +Zv9_scaffold3503 25644 . G A 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:688,63,0 +Zv9_scaffold3503 25670 . G A 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:427,33,0 +Zv9_scaffold3503 26296 . T C 1176.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=-0.045;DP=28;FS=3.033;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:41:1205,41,0 +Zv9_scaffold3503 26298 . G T 1176.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.201;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=35.22;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:41:1205,41,0 +Zv9_scaffold3503 26997 . T G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.032;DP=42;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:78:840,0,78 +Zv9_scaffold3504 21360 . G A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 +Zv9_scaffold3510 20897 . G T 329.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:358,30,0 +Zv9_scaffold3510 21562 . GT G 336.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:374,36,0 +Zv9_scaffold3510 21601 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +Zv9_scaffold3510 22370 . C A 323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:352,30,0 +Zv9_scaffold3510 23778 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +Zv9_scaffold3510 93460 . G C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +Zv9_scaffold3510 93558 . T C 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:518,45,0 +Zv9_scaffold3510 93908 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:267,0,101 +Zv9_scaffold3510 101776 . T G 254.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:283,0,22 +Zv9_scaffold3510 220471 . T A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +Zv9_scaffold3511 28019 . C T 4479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-2.263;DP=240;FS=0.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=18.67;ReadPosRankSum=2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,124:240:99:4508,0,8426 +Zv9_scaffold3511 28022 . G A 4479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.330;DP=241;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=18.59;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,128:241:99:4508,0,8426 +Zv9_scaffold3512 28701 . A T 1034.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1063,84,0 +Zv9_scaffold3512 35163 . T C 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:554,45,0 +Zv9_scaffold3512 64942 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:267,0,318 +Zv9_scaffold3512 82244 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-1.531;DP=13;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:60:258,0,60 +Zv9_scaffold3514 175450 . A T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=-0.848;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:61:482,0,61 +Zv9_scaffold3514 203934 . C T 788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:817,87,0 +Zv9_scaffold3514 204766 . T G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 +Zv9_scaffold3514 204808 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=27.64;ReadPosRankSum=2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:80:581,0,80 +Zv9_scaffold3514 204952 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.551;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:307,0,100 +Zv9_scaffold3515 10008 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:60:246,0,60 +Zv9_scaffold3516 746 . T C 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=1.259;DP=51;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:683,0,971 +Zv9_scaffold3516 974 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.379;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:232,0,653 +Zv9_scaffold3516 1133 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-0.949;DP=51;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:327,0,1674 +Zv9_scaffold3516 2662 . T A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.326;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:407,0,1032 +Zv9_scaffold3516 3375 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.258;DP=23;FS=7.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:495,0,146 +Zv9_scaffold3516 5285 . G C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=21.30;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:369,0,173 +Zv9_scaffold3516 6275 . A T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.456;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:45:476,0,45 +Zv9_scaffold3516 6788 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-1.382;DP=28;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:567,0,1063 +Zv9_scaffold3516 7577 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-0.734;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:402,0,1269 +Zv9_scaffold3516 9700 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.855;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:385,0,540 +Zv9_scaffold3516 10433 . A C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.754;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:334,0,673 +Zv9_scaffold3516 11655 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=1.362;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:413,0,1089 +Zv9_scaffold3516 12145 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-2.407;DP=55;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:263,0,1425 +Zv9_scaffold3516 12580 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.370;DP=73;FS=8.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:509,0,1552 +Zv9_scaffold3516 12814 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-1.166;DP=71;FS=3.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:267,0,1940 +Zv9_scaffold3516 74225 . C G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=3.704;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:563,0,2247 +Zv9_scaffold3516 95322 . G T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-0.063;DP=93;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:622,0,2056 +Zv9_scaffold3516 100014 . TA T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:84:314,0,84 +Zv9_scaffold3518 12016 . T TA 275.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:313,24,0 +Zv9_scaffold3519 148855 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:234,0,138 +Zv9_scaffold3519 149428 . A G 236.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:9:264,0,9 +Zv9_scaffold3519 149479 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:293,0,134 +Zv9_scaffold3519 180370 . C T 259.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:19:288,0,19 +Zv9_scaffold3519 186060 . G A 204.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:233,0,22 +Zv9_scaffold3519 187130 . T A 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:831,69,0 +Zv9_scaffold3522 20503 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.844;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:311,0,438 +Zv9_scaffold3522 20525 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.954;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:329,0,343 +Zv9_scaffold3522 65856 . C T 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.282;DP=233;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,72:232:99:1365,0,4776 +Zv9_scaffold3522 66417 . T G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.207;DP=168;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:246,0,3778 +Zv9_scaffold3524 37411 . C A 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:408,36,0 +Zv9_scaffold3524 37932 . G T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=-1.115;DP=239;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,48:203:99:1049,0,7892 +Zv9_scaffold3524 37949 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-0.270;DP=226;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,44:192:99:1040,0,11575 +Zv9_scaffold3524 37958 . C T 3112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=-1.038;DP=212;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,133:189:99:3141,0,2085 +Zv9_scaffold3524 38774 . C A 241.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=24.14;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:8:269,0,8 +Zv9_scaffold3524 53286 . G C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=1.219;DP=51;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:553,0,612 +Zv9_scaffold3524 104134 . G C 231.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:260,0,22 +Zv9_scaffold3524 104795 . T C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.122;DP=143;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:741,0,187 +Zv9_scaffold3524 104838 . A C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.988;DP=48;FS=13.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:515,0,418 +Zv9_scaffold3524 104852 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.689;DP=15;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:230,0,249 +Zv9_scaffold3524 104856 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=28.82;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:230,0,249 +Zv9_scaffold3524 104964 . CA C 1480.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1518,124,0 +Zv9_scaffold3524 105053 . C G 1859.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1888,159,0 +Zv9_scaffold3525 62325 . A G 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.777;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:601,0,2260 +Zv9_scaffold3525 76423 . A C 288.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:317,27,0 +Zv9_scaffold3530 931810 . T C 270.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:299,27,0 +Zv9_scaffold3530 1454599 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.146;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:392,0,373 +Zv9_scaffold3530 1454725 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.421;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:376,0,175 +Zv9_scaffold3533 120804 . C A 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:66:943,66,0 +Zv9_scaffold3533 120808 . G A 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:943,66,0 +Zv9_scaffold3533 120914 . A G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:484,33,0 +Zv9_scaffold3533 120920 . T G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:484,33,0 +Zv9_scaffold3533 191438 . G C 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +Zv9_scaffold3533 191443 . G A 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:238,0,24 +Zv9_scaffold3533 191906 . C A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +Zv9_scaffold3534 74643 . C T 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.513;DP=72;FS=6.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.982;QD=16.97;ReadPosRankSum=2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1250,0,932 +Zv9_scaffold3534 74719 . T A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-1.430;DP=56;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:488,0,2414 +Zv9_scaffold3534 74720 . A G 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=1.352;DP=56;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:943,0,1459 +Zv9_scaffold3534 74923 . C T 2302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-4.590;DP=73;FS=3.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=31.54;ReadPosRankSum=2.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,50:72:99:2331,0,1113 +Zv9_scaffold3534 74933 . A G 2106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-2.352;DP=76;FS=8.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,52:76:99:2135,0,1213 +Zv9_scaffold3536 347863 . G A 285.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:314,27,0 +Zv9_scaffold3536 349440 . G A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 +Zv9_scaffold3536 349694 . A G 237.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:266,21,0 +Zv9_scaffold3537 3162 . A AGT 1018.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-2.098;DP=86;FS=7.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:80:99:1056,0,1362 +Zv9_scaffold3537 20805 . GAGGTGAGTTCAGCTCAGTGTGTGAATCTGCAGATCCTGAATGCTGTTACTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTC G 4190.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.711;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=31.30;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,94:99:99:4228,161,0 +Zv9_scaffold3537 20915 . G C 2099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-1.729;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:2128,0,1998 +Zv9_scaffold3537 20948 . C T 2624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-2.639;DP=168;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:2653,0,2387 +Zv9_scaffold3537 21023 . C T 2670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-1.044;DP=177;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,100:176:99:2699,0,2396 +Zv9_scaffold3537 25153 . C G 2611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-1.835;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,93:169:99:2640,0,2427 +Zv9_scaffold3537 25507 . A T 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=-1.804;DP=85;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:1306,0,1358 +Zv9_scaffold3537 25568 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.211;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:368,0,875 +Zv9_scaffold3539 2551 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-1.179;DP=48;FS=7.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:234,0,1104 +Zv9_scaffold3539 22364 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.777;DP=18;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=24.65;ReadPosRankSum=2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:53:472,0,53 +Zv9_scaffold3539 22710 . A C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.162;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:308,0,742 +Zv9_scaffold3539 22906 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.694;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:314,0,941 +Zv9_scaffold3539 34125 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.614;DP=46;FS=9.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:277,0,1088 +Zv9_scaffold3539 39902 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.610;DP=40;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:499,0,796 +Zv9_scaffold3539 44188 . G A 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-0.865;DP=187;FS=1.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,56:186:99:1117,0,4058 +Zv9_scaffold3539 180648 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.456;DP=21;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.127;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:321,0,269 +Zv9_scaffold3539 181335 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=23.78;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,105 +Zv9_scaffold3540 135029 . T C 218.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:247,30,0 +Zv9_scaffold3540 163826 . A C 299.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.00;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:328,0,13 +Zv9_scaffold3540 221469 . A AAG 1731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-2.829;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,76:91:99:1769,0,155 +Zv9_scaffold3540 221616 . G GT 978.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=-1.777;DP=90;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,55:74:99:1167,0,529 +Zv9_scaffold3544 24791 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.968;DP=27;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:658,0,118 +Zv9_scaffold3545 107767 . C T 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.202;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=19.19;ReadPosRankSum=-1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:796,0,267 +Zv9_scaffold3545 107809 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.951;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:631,0,155 +Zv9_scaffold3545 110583 . G T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=1.162;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:456,0,668 +Zv9_scaffold3545 110981 . C G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-2.282;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=33.83;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:468,0,139 +Zv9_scaffold3545 110984 . A C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.516;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=29.32;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:468,0,139 +Zv9_scaffold3545 111078 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=2.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:275,0,226 +Zv9_scaffold3545 111522 . AGT A 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.755;DP=20;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:306,0,237 +Zv9_scaffold3545 141382 . T TA 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=2.143;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=20.25;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:21:422,0,21 +Zv9_scaffold3545 141507 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=2.592;DP=49;FS=55.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=7.14;ReadPosRankSum=-4.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:378,0,3315 +Zv9_scaffold3545 141510 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=2.788;DP=53;FS=55.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=6.60;ReadPosRankSum=-3.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:378,0,3315 +Zv9_scaffold3545 141517 . T A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-3.410;DP=62;FS=46.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:832,0,1675 +Zv9_scaffold3545 141710 . T A 1233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.612;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1262,99,0 +Zv9_scaffold3546 15860 . G T 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 +Zv9_scaffold3546 142177 . T A 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:490,39,0 +Zv9_scaffold3546 142263 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:232,0,128 +Zv9_scaffold3546 142267 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=33.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:232,0,128 +Zv9_scaffold3546 143475 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.952;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:360,0,535 +Zv9_scaffold3546 144485 . G A 212.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:241,0,15 +Zv9_scaffold3546 145599 . G T 243.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:272,0,22 +Zv9_scaffold3546 145622 . C A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.228;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,142 +Zv9_scaffold3546 147265 . G T 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.42;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:22:275,0,22 +Zv9_scaffold3546 148730 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:298,0,326 +Zv9_scaffold3546 148866 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=24.92;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:402,0,660 +Zv9_scaffold3546 149048 . A T 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:644,48,0 +Zv9_scaffold3546 149128 . G C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.552;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:31:403,0,31 +Zv9_scaffold3546 149176 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:288,0,296 +Zv9_scaffold3546 149369 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.520;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:393,0,571 +Zv9_scaffold3546 149417 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-1.013;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:395,0,508 +Zv9_scaffold3546 149520 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:414,0,731 +Zv9_scaffold3546 149524 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-0.077;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:249,0,1008 +Zv9_scaffold3548 3677 . C T 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1624,140,0 +Zv9_scaffold3548 3787 . G C 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.465;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=22.07;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1220,0,249 +Zv9_scaffold3548 23459 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:279,0,541 +Zv9_scaffold3548 40426 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:83:351,0,83 +Zv9_scaffold3548 233743 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.375;DP=23;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:232,0,372 +Zv9_scaffold3548 299313 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.594;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:482,0,556 +Zv9_scaffold3548 299758 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.058;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:413,0,361 +Zv9_scaffold3548 299845 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-1.385;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:454,0,411 +Zv9_scaffold3553 102886 . G T 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:482,33,0 +Zv9_scaffold3553 103098 . G GT 252.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:290,32,0 +Zv9_scaffold3553 103269 . G A 236.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:265,24,0 +Zv9_scaffold3553 104450 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=1.214;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:449,0,374 +Zv9_scaffold3553 104479 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.032;DP=25;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:242,0,390 +Zv9_scaffold3556 48960 . AATATCCTTTTCTGTGGTCAATTCTGACACATTTACATATGCAAATGTTTGTATGCATTGTTCAAATGTCATAAGATGTGTTTTTATCCTTTACAATGCATCAC A 2080.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=2.345;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=31.70;ReadPosRankSum=-2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:99:2118,172,0 +Zv9_scaffold3557 7787 . CAT C 793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.354;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=20.35;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:831,0,690 +Zv9_scaffold3557 21995 . T A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-1.515;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:407,0,727 +Zv9_scaffold3557 40148 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-1.207;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:513,0,524 +Zv9_scaffold3557 61824 . C A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.517;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:310,0,535 +Zv9_scaffold3557 72142 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=1.741;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:282,0,386 +Zv9_scaffold3561 94943 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=3.223;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:471,0,333 +Zv9_scaffold3561 148257 . A T 513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:542,48,0 +Zv9_scaffold3561 150309 . T C 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:419,42,0 +Zv9_scaffold3561 150330 . C A 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +Zv9_scaffold3562 11589 . C T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-1.211;DP=36;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:595,0,530 +Zv9_scaffold3563 42444 . A G 1771.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1800,156,0 +Zv9_scaffold3563 48075 . C T 553.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:582,54,0 +Zv9_scaffold3563 48097 . G A 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:519,45,0 +Zv9_scaffold3563 49240 . C A 315.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:344,0,14 +Zv9_scaffold3563 49390 . T A 1785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1814,135,0 +Zv9_scaffold3563 49411 . G C 401.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=33.45;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:429,0,8 +Zv9_scaffold3563 61647 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=32.98;ReadPosRankSum=2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:490,0,122 +Zv9_scaffold3563 61686 . C T 491.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.361;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.937;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,24:28:7:519,7,0 +Zv9_scaffold3563 61711 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=13.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=27.61;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:89:470,0,89 +Zv9_scaffold3563 61871 . G C 1046.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1075,90,0 +Zv9_scaffold3563 62005 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-1.369;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:30:335,0,30 +Zv9_scaffold3563 102654 . G C 362.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:391,45,0 +Zv9_scaffold3563 174406 . A G 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.377;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:678,0,725 +Zv9_scaffold3563 181574 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.290;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:264,0,499 +Zv9_scaffold3563 189663 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:257,0,251 +Zv9_scaffold3563 190821 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.835;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:250,0,400 +Zv9_scaffold3563 208093 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.268;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:491,0,419 +Zv9_scaffold3563 240971 . C A 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.679;DP=117;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1700,0,1670 +Zv9_scaffold3563 252255 . A T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.930;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:417,0,2927 +Zv9_scaffold3563 252670 . TGTACGGTTTTCGTTTCCTTTCATTCCTCTTTAAATATTTTCAGAATTTAAAAATAGTTTGAACCTATAATGGGTGCTTTTAATGTTGATCTAGGAACTATCAAAAACTTTTTACCATATTAACTCAAACAATGTGTTTTAG T 5856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=2.771;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=25.36;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,142:146:99:5886,0,206 +Zv9_NA654 4127 . C CAA 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.513;DP=47;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=5.31;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:302,0,1215 +Zv9_NA772 1232 . A G 1179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1208,117,0 +Zv9_NA237 11110 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:422,0,173 +Zv9_NA237 11637 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=4.583;DP=116;FS=44.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=7.20;ReadPosRankSum=-4.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,33:116:99:864,0,3151 +Zv9_NA237 14926 . A C 3379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=1.023;DP=204;FS=5.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,96:203:99:3408,0,3411 +Zv9_NA237 17277 . G T 4397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.210;DP=230;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,134:229:99:4426,0,3293 +Zv9_NA237 17329 . CCACCTTTTGGACCAAAGAAAATAACTTTAAGTCTTGCAGAAAAGTAATTAAGAGTACAGATGACGTTCTGACCCTCATTAAAGTGTGAAGAACG C 10685.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.806;DP=240;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=34.46;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,228:230:99:10723,994,0 +Zv9_NA237 18076 . C T 2874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=-2.922;DP=263;FS=9.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,88:251:99:2903,0,5688 +Zv9_NA237 24605 . G A 3442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=0.541;DP=191;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=18.02;ReadPosRankSum=-1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,97:189:99:3471,0,3338 +Zv9_NA237 26707 . G A 3292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.225;DP=174;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,98:173:99:3321,0,2661 +Zv9_NA834 10039 . A G 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 +Zv9_NA834 10071 . T A 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 +Zv9_NA834 13536 . A C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +Zv9_NA834 15387 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 +Zv9_NA540 796 . G C 3601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=-0.992;DP=303;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,101:257:99:3630,0,5526 +Zv9_NA540 5742 . TCTGCGAGACCACACACACATTCACACACAGTCAGTTTGATAAACACTATGAATATGCCAGAAAGCTGTTGTTGACAGAAAGTGTGTGTAC T 11659.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.522;DP=298;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=31.50;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,293:296:99:11697,861,0 +Zv9_NA945 638 . ATC A 928.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-2.773;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:966,0,1465 +Zv9_NA945 906 . C G 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-0.443;DP=66;FS=6.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=15.94;ReadPosRankSum=-2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:1080,0,1185 +Zv9_NA760 3928 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.436;DP=34;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:310,0,684 +Zv9_NA426 11914 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.376;DP=28;FS=8.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:494,0,344 +Zv9_NA426 12595 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,179 +Zv9_NA426 12865 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.363;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:380,0,346 +Zv9_NA303 22316 . GA G 319.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:357,30,0 +Zv9_NA303 69305 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:283,0,325 +Zv9_NA303 69410 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:341,0,1055 +Zv9_NA303 69413 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:341,0,1055 +Zv9_NA692 6351 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.296;DP=100;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=2.29;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,18:100:99:257,0,3059 +Zv9_NA692 6363 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=-0.734;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:407,0,2759 +Zv9_NA333 563 . A T 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 +Zv9_NA333 1318 . C A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,177 +Zv9_NA333 12174 . T A 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +Zv9_NA333 17390 . AT A 283.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:321,33,0 +Zv9_NA530 4249 . A C 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.866;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1377,0,1023 +Zv9_NA530 4438 . T G 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.536;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:1097,0,2863 +Zv9_NA530 4818 . A G 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.351;DP=70;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,35:70:99:1320,0,1626 +Zv9_NA530 5385 . C A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-2.332;DP=62;FS=21.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:766,0,1376 +Zv9_NA530 5902 . T G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.182;DP=78;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:978,0,1735 +Zv9_NA530 5983 . C T 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.519;DP=65;FS=6.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1130,0,1104 +Zv9_NA530 6601 . C T 1585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.482;DP=101;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:1614,0,1895 +Zv9_NA530 6640 . A T 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.016;DP=90;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=15.14;ReadPosRankSum=2.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:1391,0,1744 +Zv9_NA530 7185 . A C 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=-0.501;DP=75;FS=2.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:567,0,1997 +Zv9_NA530 7309 . A G 2790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.258;DP=103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=27.09;ReadPosRankSum=-1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,73:103:99:2819,0,829 +Zv9_NA530 8572 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.826;DP=122;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,35:122:99:869,0,3396 +Zv9_NA530 9090 . C T 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-0.403;DP=62;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1132,0,977 +Zv9_NA530 9245 . G GA 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.634;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:539,0,448 +Zv9_NA530 10283 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=1.694;DP=61;FS=3.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:893,0,1204 +Zv9_NA530 10410 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=-0.053;DP=138;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:99:611,0,6651 +Zv9_NA235 6054 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.083;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:542,0,709 +Zv9_NA235 8746 . C T 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-1.080;DP=73;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1554,0,907 +Zv9_NA235 9178 . C G 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=2.396;DP=72;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:923,0,1555 +Zv9_NA235 9189 . C A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=3.692;DP=73;FS=1.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:965,0,1470 +Zv9_NA235 11306 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=-0.814;DP=56;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=5.94;ReadPosRankSum=-2.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:361,0,1580 +Zv9_NA500 8166 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.525;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=26.03;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:627,0,155 +Zv9_NA500 8307 . C A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.046;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:530,0,159 +Zv9_NA500 8931 . G T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-1.181;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:615,0,455 +Zv9_NA500 9462 . A G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=1.386;DP=21;FS=9.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:380,0,265 +Zv9_NA86 62060 . T C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-1.106;DP=62;FS=2.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,30:62:99:1053,0,994 +Zv9_NA86 77716 . A G 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.655;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=16.66;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1078,0,1016 +Zv9_NA357 29517 . TA T 825.19 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:478,33,0 +Zv9_NA892 104174 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:380,0,48 +Zv9_NA910 8005 . GAAGAACACAAAA G 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:43:397,0,43 +Zv9_NA433 4010 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +Zv9_NA433 4043 . T G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 +Zv9_NA941 1117 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.225;DP=15;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:306,0,398 +Zv9_NA928 35405 . GT G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.202;DP=26;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:271,0,178 +Zv9_NA747 1202 . A C 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 +Zv9_NA747 12862 . G T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:345,24,0 +Zv9_NA266 33019 . A C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.931;DP=41;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:288,0,1075 +Zv9_NA266 33343 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-0.453;DP=54;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:639,0,1234 +Zv9_NA407 34924 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=1.909;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=22.11;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:382,0,127 +Zv9_NA407 40880 . G A 1721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.058;DP=71;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,47:69:99:1750,0,592 +Zv9_NA985 810 . C T 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-0.485;DP=362;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,78:353:99:1490,0,10376 +Zv9_NA327 7647 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-0.896;DP=89;FS=5.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:378,0,2601 +Zv9_NA771 53487 . T A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:316,0,136 +Zv9_NA169 779 . G C 404.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:432,0,8 +Zv9_NA169 7892 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:352,0,89 +Zv9_NA169 7914 . T G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=32.05;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:49:477,0,49 +Zv9_NA169 8109 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.393;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:431,0,755 +Zv9_NA169 8288 . T C 785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:814,60,0 +Zv9_NA169 8317 . G A 593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:622,45,0 +Zv9_NA169 8686 . T C 206.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:235,0,21 +Zv9_NA169 8920 . T A 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:646,45,0 +Zv9_NA661 4549 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-0.729;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:319,0,1849 +Zv9_NA661 9779 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.167;DP=30;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:467,0,838 +Zv9_NA27 23784 . A T 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +Zv9_NA573 1935 . G A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.938;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:636,0,1245 +Zv9_NA573 5116 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.042;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:643,0,685 +Zv9_NA573 5225 . G A 1236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.510;DP=63;FS=13.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1265,0,841 +Zv9_NA573 22002 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.594;DP=50;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:586,0,1159 +Zv9_NA631 7792 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.399;DP=105;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,18:100:99:253,0,3258 +Zv9_NA683 609 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.110;DP=33;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:994,0,152 +Zv9_NA683 637 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.140;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.348;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1460,0,177 +Zv9_NA683 4528 . GGGTACATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTAATGATGATCTTGATTTTGTGTGTGCA G 3012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=1.489;DP=99;FS=5.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=30.43;ReadPosRankSum=-2.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,72:99:99:3050,0,4169 +Zv9_NA683 4711 . G A 2478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.091;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,70:87:99:2507,0,275 +Zv9_NA683 4815 . CGGTCAGGGGAACACACACACACACACACAGATACGCAGACACAAACAGTTTGTAACTCCTCCTCCTGTCCAGCA C 3233.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-0.883;DP=85;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,75:84:99:3329,131,0 +Zv9_NA683 5499 . C T 3793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3822,277,0 +Zv9_NA683 6813 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=1.981;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=16.61;ReadPosRankSum=-2.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:676,0,1482 +Zv9_NA683 6852 . C T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=2.390;DP=66;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,39:65:99:1335,0,1855 +Zv9_NA683 7462 . C G 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.688;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=26.07;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1436,0,281 +Zv9_NA683 8330 . T C 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +Zv9_NA683 13447 . T G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.126;DP=34;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:350,0,728 +Zv9_NA683 17029 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=29.56;ReadPosRankSum=-1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:383,0,217 +Zv9_NA683 17775 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +Zv9_NA683 20420 . A C,T 2214.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,55,11:66:99:2451,316,153,2146,0,2163 +Zv9_NA683 25414 . T A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-1.177;DP=25;FS=7.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.768;QD=28.39;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:738,0,140 +Zv9_NA683 25810 . CGGT C 2198.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2236,167,0 +Zv9_NA683 26533 . G A 3636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.724;ClippingRankSum=-0.176;DP=138;FS=1.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,105:137:99:3665,0,700 +Zv9_NA683 27074 . G A 2586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.097;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=22.49;ReadPosRankSum=2.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,76:115:99:2615,0,1234 +Zv9_NA683 29058 . C CTG 710.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=2.272;DP=41;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.578;QD=17.33;ReadPosRankSum=-2.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:748,0,259 +Zv9_NA683 29420 . T G 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:54:782,54,0 +Zv9_NA683 29635 . C T 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.551;DP=46;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:919,0,599 +Zv9_NA683 29681 . C T 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.122;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=20.03;ReadPosRankSum=2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:629,0,416 +Zv9_NA683 41920 . G A 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +Zv9_NA683 119596 . G A 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:612,42,0 +Zv9_NA918 211 . TTG T 730.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.539;DP=24;FS=7.659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=30.45;ReadPosRankSum=-2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:17:768,17,0 +Zv9_NA918 2964 . A C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:359,0,488 +Zv9_NA918 5329 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=3.016;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,227 +Zv9_NA918 5753 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.218;DP=36;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:360,0,1184 +Zv9_NA918 5819 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-0.954;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,420 +Zv9_NA918 18866 . A C 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-3.331;DP=82;FS=7.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=18.70;ReadPosRankSum=3.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1562,0,1371 +Zv9_NA918 19288 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=1.354;DP=39;FS=3.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:319,0,1016 +Zv9_NA918 42355 . T G 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=-1.586;DP=116;FS=9.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:721,0,3336 +Zv9_NA918 43757 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=-1.736;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:375,0,1382 +Zv9_NA918 43758 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=15.08;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:375,0,1335 +Zv9_NA918 45423 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-0.294;DP=33;FS=8.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:287,0,872 +Zv9_NA918 45465 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.986;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:333,0,688 +Zv9_NA918 46683 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=-0.921;DP=28;FS=5.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:440,0,527 +Zv9_NA918 46973 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-1.536;DP=22;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:331,0,462 +Zv9_NA918 47076 . T C 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=1.992;DP=42;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:1071,0,290 +Zv9_NA130 80180 . G A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +Zv9_NA544 6911 . G A 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +Zv9_NA899 4444 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.791;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,206 +Zv9_NA899 40944 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.710;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:478,0,192 +Zv9_NA899 41446 . C G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.530;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:314,0,311 +Zv9_NA899 45361 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:278,0,58 +Zv9_NA899 45841 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +Zv9_NA899 46308 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +Zv9_NA899 81086 . G C 203.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.14;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:13:232,0,13 +Zv9_NA689 5425 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,335 +Zv9_NA689 5811 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=1.032;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:264,0,453 +Zv9_NA689 8192 . C T 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +Zv9_NA689 30828 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.088;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:360,0,408 +Zv9_NA807 23494 . G T 14125.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.615;DP=341;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=29.05;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,340:341:99:14154,1002,0 +Zv9_NA807 23668 . G A 3695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-4.437;DP=292;FS=11.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,101:292:99:3724,0,12503 +Zv9_NA807 23669 . A T 3695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.811;ClippingRankSum=-4.316;DP=289;FS=12.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,102:289:99:3724,0,12480 +Zv9_NA807 25435 . AACAGGTGCACTATCAGTTTTAATAAGCGGTTTCATTGAAGAACTGTTAGAAGTCCATTTCAGAACCATTTCTCAGTATCGGCTTACTTTATGATAATCTCTGTTATTGTTTTCATCT A 14650.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-1.570;DP=426;FS=7.150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=34.39;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,400:405:99:14688,1092,0 +Zv9_NA807 25708 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=3.645;DP=39;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=11.87;ReadPosRankSum=-3.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:491,0,1774 +Zv9_NA807 25709 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=3.145;DP=35;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=13.22;ReadPosRankSum=-3.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:491,0,1774 +Zv9_NA807 25742 . A G 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 +Zv9_NA363 2866 . C T 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=-1.645;DP=144;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,55:144:99:2003,0,3119 +Zv9_NA363 21511 . G A 2563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=-2.375;DP=174;FS=18.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,76:173:99:2592,0,3189 +Zv9_NA787 59063 . G A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +Zv9_NA787 59082 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +Zv9_NA787 70959 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:317,0,54 +Zv9_NA787 78151 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,416 +Zv9_NA883 35418 . TCCTGAAAGAAAACACGATTTTAGTAAAACATATTTTTTCTTTAAAACATGCAAGGAGTGATGACTCCAGAAATAATGATGGTA T 4877.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=2.224;DP=165;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=29.56;ReadPosRankSum=-1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,133:141:99:4915,0,380 +Zv9_NA883 35598 . CACCTGCAATACACAACAATTAGCCATTGATTAAAAAGTGTTGAATTATGGTAACATCAGCAACATCAAATGTTGCACCT C 15499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=2.873;DP=373;FS=5.065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=32.41;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,360:371:99:15537,1347,0 +Zv9_NA984 1695 . G A 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +Zv9_NA732 64984 . A C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-0.561;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:531,0,493 +Zv9_NA732 84612 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.736;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=11.17;ReadPosRankSum=-2.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:274,0,469 +Zv9_NA732 84870 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.293;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:498,0,1236 +Zv9_NA732 84872 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:498,0,1230 +Zv9_NA732 84982 . G GT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.027;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:276,0,643 +Zv9_NA732 85085 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.438;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:648,0,1720 +Zv9_NA732 85086 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.463;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:648,0,1684 +Zv9_NA732 87320 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-1.073;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:292,0,524 +Zv9_NA732 96197 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.367;DP=39;FS=5.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:263,0,1109 +Zv9_NA732 113593 . A C 4335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.928;DP=202;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,124:202:99:4364,0,2692 +Zv9_NA732 113883 . T A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.215;DP=35;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:555,0,1293 +Zv9_NA732 113890 . T A 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-1.413;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:810,0,1214 +Zv9_NA732 124844 . G C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 +Zv9_NA732 124882 . A C 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 +Zv9_NA732 125341 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.613;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:241,0,1058 +Zv9_NA542 17408 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +Zv9_NA542 17410 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +Zv9_NA994 41139 . T TTA 405.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.248;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:10:442,10,0 +Zv9_NA437 8694 . G A 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.029;DP=88;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.767;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1520,0,1517 +Zv9_NA437 23409 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-0.414;DP=37;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:483,0,660 +Zv9_NA437 35145 . A G 836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:63:865,63,0 +Zv9_NA437 35154 . T G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-1.398;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:354,0,331 +Zv9_NA437 35481 . T G 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +Zv9_NA224 2901 . C A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.725;DP=36;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:449,0,844 +Zv9_NA224 4761 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=-0.633;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:511,0,511 +Zv9_NA947 3643 . G C 490.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:685,48,0 +Zv9_NA947 62719 . G A 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:598,42,0 +Zv9_NA947 62907 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.228;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:328,0,370 +Zv9_NA947 63440 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,291 +Zv9_NA947 65774 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=2.217;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:412,0,482 +Zv9_NA947 67346 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.829;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=20.27;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:697,0,471 +Zv9_NA947 67440 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=2.499;DP=41;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:556,0,848 +Zv9_NA947 67591 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.468;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:271,0,822 +Zv9_NA947 67697 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.864;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:589,0,769 +Zv9_NA947 76103 . G T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=-1.782;DP=30;FS=9.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:271,0,721 +Zv9_NA947 96138 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=2.180;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=20.81;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:278,0,124 +Zv9_NA947 182124 . C A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-1.330;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=16.32;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:779,0,760 +Zv9_NA947 188484 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +Zv9_NA735 120394 . TA T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.595;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:261,0,1478 +Zv9_NA735 120609 . C T 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=-1.828;DP=31;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=27.38;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:877,0,189 +Zv9_NA735 120969 . C T 1394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.579;DP=83;FS=5.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:1423,0,1367 +Zv9_NA735 121558 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=33.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:95:230,0,95 +Zv9_NA735 122793 . G A 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-2.330;DP=75;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,32:75:99:1171,0,1462 +Zv9_NA735 134539 . G A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=0.630;DP=101;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:1280,0,1899 +Zv9_NA735 134587 . G A 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=-0.770;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:1386,0,1340 +Zv9_NA735 135927 . T A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-1.010;DP=52;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:634,0,1222 +Zv9_NA735 135942 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.699;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:623,0,1273 +Zv9_NA735 137138 . G A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.076;DP=72;FS=8.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.69;ReadPosRankSum=2.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:1014,0,1403 +Zv9_NA735 146157 . C T 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.433;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1443,0,2463 +Zv9_NA735 146466 . G A 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=-1.831;DP=81;FS=7.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=15.70;ReadPosRankSum=3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1300,0,1238 +Zv9_NA735 146579 . C T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-1.292;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1084,0,596 +Zv9_NA735 146667 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=1.177;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:780,0,362 +Zv9_NA735 146788 . T A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.143;DP=76;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:99:1003,0,1550 +Zv9_NA735 148333 . T C 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.406;DP=75;FS=6.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1302,0,1251 +Zv9_NA900 4747 . T A 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.059;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:869,0,287 +Zv9_NA900 6976 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,323 +Zv9_NA900 17661 . C T 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=-0.111;DP=142;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,40:142:99:1009,0,3855 +Zv9_NA694 37685 . C T 1244.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1273,87,0 +Zv9_NA694 37836 . A C 7334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.386;DP=264;FS=12.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,188:229:99:7363,0,630 +Zv9_NA694 37942 . G A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.521;ClippingRankSum=-1.482;DP=88;FS=24.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=13.35;ReadPosRankSum=-3.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1203,0,1777 +Zv9_NA694 37962 . T C 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:47:625,47,0 +Zv9_NA694 39254 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.101;DP=24;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:229,0,579 +Zv9_NA694 39260 . A T 234.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-1.296;DP=167;FS=3.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,64:166:99:2042,0,3274 +Zv9_NA992 3785 . T G 2421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.202;DP=158;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=15.33;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:2450,0,2627 +Zv9_NA992 10030 . A T 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.446;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:990,0,680 +Zv9_NA265 12057 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.272;DP=30;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,830 +Zv9_NA276 16291 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-1.041;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:483,0,709 +Zv9_NA276 58875 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=1.448;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:233,0,2099 +Zv9_NA276 66792 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.457;DP=63;FS=3.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:830,0,1204 +Zv9_NA276 68260 . T G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=1.110;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.92;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:402,0,167 +Zv9_NA276 68595 . C A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.830;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=27.66;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:1024,0,295 +Zv9_NA276 68724 . A G 681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:710,48,0 +Zv9_NA276 68866 . T A 684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:713,51,0 +Zv9_NA276 69235 . A C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.655;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:498,0,580 +Zv9_NA276 69247 . G C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.132;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:363,0,561 +Zv9_NA276 69634 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:310,0,580 +Zv9_NA276 69768 . T A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-2.353;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=29.23;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:642,0,117 +Zv9_NA276 70010 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=-2.134;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:482,0,1132 +Zv9_NA276 71918 . T A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +Zv9_NA276 74812 . A G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.990;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:769,0,514 +Zv9_NA276 75747 . G A 1414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.733;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:99:1443,105,0 +Zv9_NA276 75843 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-2.701;DP=38;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:604,0,722 +Zv9_NA276 75858 . A T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.466;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:620,0,637 +Zv9_NA276 76188 . T C 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.422;DP=32;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:679,0,474 +Zv9_NA276 76233 . A T 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:414,30,0 +Zv9_NA276 76298 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=2.048;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:279,0,288 +Zv9_NA276 77368 . C T 1627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-1.588;DP=62;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,43:62:99:1656,0,510 +Zv9_NA276 77457 . G T 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-1.453;DP=82;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1241,0,1589 +Zv9_NA276 77574 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.808;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:634,0,328 +Zv9_NA276 77596 . C T 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:857,63,0 +Zv9_NA276 79268 . C G 1446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.783;DP=84;FS=2.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1475,0,1455 +Zv9_NA276 80264 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.601;DP=51;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:659,0,2436 +Zv9_NA276 80266 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.490;DP=52;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:659,0,2438 +Zv9_NA276 80793 . C A 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1624,117,0 +Zv9_NA276 80982 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-1.360;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:244,0,1331 +Zv9_NA276 81065 . G A 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.307;DP=78;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:943,0,1701 +Zv9_NA276 81102 . G A 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.460;DP=79;FS=6.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=21.55;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,50:79:99:1731,0,992 +Zv9_NA276 81767 . TCCTGCTAAGAGAAGAGATTTCACCGTGAGAGACCTGAAGACCTCAGGTGCTTCAAACTGGCAGGCAGTGATTTA T 652.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=-0.025;DP=71;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=9.19;ReadPosRankSum=-2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:690,0,4614 +Zv9_NA276 81771 . GCTAAGAGAAGAGATTTCACCGTGAGAGACCTGAAGACCTCAGGTGCTTCAAACTGGCAGGCAGTGATTTAC G 1476.73 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.513;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:624,0,548 +Zv9_NA561 71152 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-2.472;DP=26;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:628,0,202 +Zv9_NA561 72253 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.131;DP=30;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:243,0,770 +Zv9_NA561 81424 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-1.030;DP=49;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:403,0,1285 +Zv9_NA561 81640 . C A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.061;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:774,0,159 +Zv9_NA561 96179 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.205;DP=30;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:421,0,1354 +Zv9_NA561 104377 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=1.116;DP=41;FS=9.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:647,0,730 +Zv9_NA409 23416 . G C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.137;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:413,0,530 +Zv9_NA904 2064 . A C 2578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-1.283;DP=75;FS=1.520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.145;QD=34.38;ReadPosRankSum=-1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,66:73:45:2607,45,0 +Zv9_NA904 8840 . AG A 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.67;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:53:324,0,53 +Zv9_NA904 8842 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.95;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:53:324,0,53 +Zv9_NA15 647 . C T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-0.586;DP=45;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:674,0,839 +Zv9_NA15 3127 . T C 411.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=34.32;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:2:438,2,0 +Zv9_NA15 6541 . T C 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.368;DP=67;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=29.07;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,55:67:99:1976,0,146 +Zv9_NA15 16672 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=19.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:307,0,291 +Zv9_NA981 726 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=3.489;DP=102;FS=11.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:312,0,7032 +Zv9_NA157 1245 . A T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.895;DP=82;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,42:82:99:1520,0,1456 +Zv9_NA257 74002 . C A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +Zv9_NA257 111345 . C T 281.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:310,0,19 +Zv9_NA851 23391 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +Zv9_NA851 23394 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +Zv9_NA851 24581 . G A 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 +Zv9_NA851 24967 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.324;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:293,0,526 +Zv9_NA851 25665 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-1.216;DP=34;FS=1.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=23.02;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:49:811,0,49 +Zv9_NA806 9036 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:241,0,218 +Zv9_NA203 44910 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.263;DP=54;FS=4.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:315,0,1626 +Zv9_NA470 77408 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.409;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:287,0,1609 +Zv9_NA466 5833 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-1.405;DP=231;FS=10.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,35:231:99:306,0,7381 +Zv9_NA466 17339 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=1.898;DP=183;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,30:182:99:378,0,5940 +Zv9_NA466 20543 . T A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.695;DP=284;FS=0.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,50:284:99:710,0,8972 +Zv9_NA466 27347 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-0.195;DP=89;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:382,0,2773 +Zv9_NA466 27905 . G A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.728;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1370,0,753 +Zv9_NA466 29805 . T A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.258;DP=71;FS=8.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:311,0,2152 +Zv9_NA466 29923 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-1.769;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:236,0,257 +Zv9_NA466 30333 . A G 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.245;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:853,0,1134 +Zv9_NA466 30516 . G T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.361;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=18.71;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:627,0,500 +Zv9_NA466 32502 . C T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.117;DP=50;FS=12.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:761,0,864 +Zv9_NA466 32514 . C T 530.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=-0.245;DP=72;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:519,0,1938 +Zv9_NA466 67239 . G C 1582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=-0.772;DP=93;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1611,0,1630 +Zv9_NA466 72715 . T A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 +Zv9_NA466 93961 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.395;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:281,0,2108 +Zv9_NA466 101268 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-1.606;DP=33;FS=4.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:260,0,778 +Zv9_NA466 101559 . T C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=-2.039;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:555,0,442 +Zv9_NA466 101640 . C T 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.111;DP=80;FS=7.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=17.12;ReadPosRankSum=2.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:1398,0,1263 +Zv9_NA466 143510 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.516;DP=69;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:285,0,2049 +Zv9_NA466 155844 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-2.981;DP=31;FS=9.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:231,0,820 +Zv9_NA908 63587 . A G 281.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.32;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:310,0,18 +Zv9_NA908 73827 . C T 274.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:303,0,17 +Zv9_NA908 84862 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.495;DP=77;FS=6.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1324,0,1315 +Zv9_NA908 87271 . A T 1995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.032;DP=100;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,61:100:99:2024,0,1317 +Zv9_NA908 87337 . G T 1893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-1.204;DP=94;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,59:94:99:1922,0,1163 +Zv9_NA908 87514 . A G 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.330;DP=45;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:766,0,730 +Zv9_NA908 90175 . TGGTAAGGGATCGTCTTGTCAACCGATGCATTCGGATGCAAGCTGCTCGATACTCAGGTGTGTTTATCTGCGCA T 4392.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=2.341;DP=101;FS=1.893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=27.68;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,96:101:99:4430,355,0 +Zv9_NA908 91436 . C G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +Zv9_NA908 91716 . G A 2073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.246;DP=81;FS=4.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,57:81:99:2102,0,586 +Zv9_NA908 91851 . A G 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=1.096;DP=63;FS=2.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1289,0,2484 +Zv9_NA908 92617 . C A 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.021;DP=87;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:1592,0,1362 +Zv9_NA908 92657 . T C 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=-0.892;DP=94;FS=1.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=18.50;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1767,0,1585 +Zv9_NA908 92793 . T TA 1599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.950;DP=71;FS=3.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,47:70:99:1637,0,566 +Zv9_NA908 93093 . T C 2859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.009;DP=114;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=25.09;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,78:114:99:2888,0,997 +Zv9_NA908 93434 . CTT C 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.396;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.256;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:40:365,0,40 +Zv9_NA908 104721 . G A 4992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.493;DP=193;FS=5.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,130:193:99:5021,0,1698 +Zv9_NA908 105799 . T C 1782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.276;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,48:68:99:1811,0,527 +Zv9_NA908 105994 . T G 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.435;ClippingRankSum=0.205;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1091,0,1440 +Zv9_NA908 106379 . A G 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-1.043;DP=68;FS=11.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:890,0,1551 +Zv9_NA908 106663 . C A 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.694;DP=36;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:1010,0,234 +Zv9_NA908 106683 . G T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.417;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:503,0,148 +Zv9_NA908 129311 . G T 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 +Zv9_NA908 129314 . A G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:400,30,0 +Zv9_NA55 2137 . A T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-1.501;DP=85;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:367,0,2578 +Zv9_NA55 9082 . G A 1972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.350;DP=69;FS=11.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=28.59;ReadPosRankSum=4.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,55:69:99:2001,0,239 +Zv9_NA55 9247 . C T 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.227;DP=163;FS=4.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,37:162:99:670,0,4538 +Zv9_NA55 13435 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-2.843;DP=168;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,41:168:99:857,0,7593 +Zv9_NA55 13507 . G C 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.747;DP=173;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,49:172:99:1170,0,4615 +Zv9_NA55 14454 . G C 205.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +Zv9_NA820 1819 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=-0.257;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:240,0,1166 +Zv9_NA972 18803 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:234,0,708 +Zv9_NA972 18926 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.175;DP=65;FS=13.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:359,0,1851 +Zv9_NA972 18961 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.299;DP=68;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:435,0,1950 +Zv9_NA129 6149 . C A 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.927;DP=168;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:899,0,8975 +Zv9_NA129 6150 . A G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.823;DP=169;FS=4.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,39:169:99:899,0,8975 +Zv9_NA129 7218 . G A 2397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.101;DP=207;FS=6.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,73:207:99:2426,0,4560 +Zv9_NA786 94780 . G A 353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:382,30,0 +Zv9_NA784 9794 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +Zv9_NA784 9795 . T A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +Zv9_NA784 10505 . A G 709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:51:738,51,0 +Zv9_NA681 82985 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=14;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,110 +Zv9_NA866 11258 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=1.423;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:344,0,2517 +Zv9_NA48 75642 . C T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.616;DP=51;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:778,0,949 +Zv9_NA925 4479 . CGTGAGTACAGCAGCGATACACACACACACACACACACACACACAGATAACCACACTGCTCCCCAAGGCGTCACACAGTGATTGCGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGTGCGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGACACAG C 3228.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.885;ClippingRankSum=1.934;DP=105;FS=3.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,76:89:99:3265,0,3023 +Zv9_NA925 4861 . C T 4157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.107;DP=175;FS=5.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=23.76;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,120:168:99:4186,0,1167 +Zv9_NA925 4921 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=1.893;DP=159;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,34:158:99:637,0,4680 +Zv9_NA925 5443 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.570;DP=140;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,36:140:99:763,0,3867 +Zv9_NA925 6141 . C G 2414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.287;DP=146;FS=0.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:2443,0,2546 +Zv9_NA5 3294 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.340;DP=26;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,225 +Zv9_NA5 6155 . T C 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +Zv9_NA5 6506 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.589;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=5.54;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:344,0,135 +Zv9_NA5 6512 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=41;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:344,0,135 +Zv9_NA345 119070 . C G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +Zv9_NA345 119327 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,230 +Zv9_NA345 122976 . A T 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 +Zv9_NA345 126525 . C T 329.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.92;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:357,0,10 +Zv9_NA888 4115 . C G 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 +Zv9_NA888 4141 . A AT 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:551,51,0 +Zv9_NA974 440 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,166 +Zv9_NA701 1459 . A C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DP=21;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:50:565,0,50 +Zv9_NA701 1499 . A C 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=-1.299;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=27.92;ReadPosRankSum=2.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1145,0,139 +Zv9_NA701 11136 . A G 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.717;DP=42;FS=1.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=25.80;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1112,0,221 +Zv9_NA18 2011 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.580;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:472,0,1493 +Zv9_NA279 2083 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-1.379;DP=140;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,28:139:99:457,0,4184 +Zv9_NA89 17457 . C T 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.795;DP=65;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.630;QD=20.43;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1356,0,785 +Zv9_NA89 19119 . C A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.378;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:578,0,619 +Zv9_NA89 19137 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.104;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:624,0,537 +Zv9_NA89 19283 . A G 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=-2.044;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:493,0,534 +Zv9_NA89 19298 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.919;DP=36;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:588,0,1016 +Zv9_NA89 22633 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.472;DP=54;FS=9.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=19.63;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1088,0,822 +Zv9_NA89 31454 . ACAGCAG A 297.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:28:335,28,0 +Zv9_NA89 31543 . C A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-1.742;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:585,0,606 +Zv9_NA89 33952 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.585;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=11.33;ReadPosRankSum=3.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:402,0,644 +Zv9_NA89 34622 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,316 +Zv9_NA89 34711 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.380;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:540,0,610 +Zv9_NA89 35003 . T A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:355,0,52 +Zv9_NA89 73562 . C T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.416;DP=116;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,42:116:99:1387,0,2582 +Zv9_NA89 85732 . GAGGTGAGATCAGACGGCGTGTGTTTTCCACACCACTGGAATATAACGCTGTATATACCGCTGCTTCTCTGAGCTCTTCTGTCCTCTTCTGTCCAC G 5272.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=1.769;DP=122;FS=2.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=30.60;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,119:122:99:5310,440,0 +Zv9_NA190 8433 . C T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +Zv9_NA190 8445 . G C 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +Zv9_NA684 2983 . G A 2549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2578,193,0 +Zv9_NA603 2616 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:340,0,159 +Zv9_NA603 3671 . T C 206.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:235,0,23 +Zv9_NA90 9600 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=25.34;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:99:410,0,540 +Zv9_NA231 1242 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-1.082;DP=47;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:339,0,1308 +Zv9_NA231 2624 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-1.790;DP=54;FS=4.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:440,0,1492 +Zv9_NA231 2814 . A T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-0.773;DP=92;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:477,0,2518 +Zv9_NA231 3518 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-1.508;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:323,0,1028 +Zv9_NA231 4123 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-1.050;DP=63;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:368,0,1804 +Zv9_NA163 18062 . G T 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-0.010;DP=107;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:1470,0,2312 +Zv9_NA163 19282 . G C 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.438;DP=105;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,34:99:99:1150,0,2259 +Zv9_NA163 24177 . GCCTGCAGAAAGAAAAGACGTTACACCTCGCACACAGACCGCCATTATTCAAGTTAGCTCCGACTAAAAACACGCTTAATAGTCAAACTTA G 3241.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.775;DP=83;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,78:83:5:3278,0,5 +Zv9_NA927 4969 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:347,0,215 +Zv9_NA927 5597 . T G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-0.113;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:418,0,153 +Zv9_NA927 5659 . C G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.962;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:484,0,110 +Zv9_NA927 5683 . A C 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.331;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=30.29;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:634,0,200 +Zv9_NA927 7346 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +Zv9_NA907 10637 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-1.925;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=31.15;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:92:1399,0,92 +Zv9_NA907 23094 . G A 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.022;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=30.42;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,47:56:99:1762,0,124 +Zv9_NA907 25202 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.250;DP=23;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=21.82;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:530,0,111 +Zv9_NA623 15865 . T C 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 +Zv9_NA698 37394 . A G 1030.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1059,75,0 +Zv9_NA698 37486 . T A 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:536,39,0 +Zv9_NA698 38408 . T C 605.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:45:634,45,0 +Zv9_NA698 38839 . GT G 1866.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1904,154,0 +Zv9_NA698 40148 . C T 1183.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=39.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1212,93,0 +Zv9_NA698 41073 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +Zv9_NA698 43191 . T A 1443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1472,108,0 +Zv9_NA698 56365 . C A 5765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:5794,427,0 +Zv9_NA698 57431 . G A 325.78 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +Zv9_NA698 59090 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +Zv9_NA698 59143 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:990,69,0 +Zv9_NA698 60372 . T C 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 +Zv9_NA698 60414 . C T 809.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.734;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=32.60;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:838,57,0 +Zv9_NA698 60608 . T C 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:49:714,49,0 +Zv9_NA698 60609 . G A 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:49:714,49,0 +Zv9_NA698 61037 . G A 3495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3524,241,0 +Zv9_NA698 61592 . G A 1647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-0.565;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=29.62;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,42:46:84:1676,84,0 +Zv9_NA698 62122 . C T 1357.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1386,96,0 +Zv9_NA698 62898 . T C 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:803,54,0 +Zv9_NA698 62962 . CT C 1371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1409,106,0 +Zv9_NA698 62985 . C T 1539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1568,108,0 +Zv9_NA698 63078 . G T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +Zv9_NA698 63085 . A T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:300,21,0 +Zv9_NA698 63786 . G GGA 901.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.069;DP=28;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=32.20;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:939,72,0 +Zv9_NA698 63965 . T G 1814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1843,129,0 +Zv9_NA698 64064 . A G 1487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1516,105,0 +Zv9_NA698 64112 . C T 1575.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1604,117,0 +Zv9_NA698 64181 . T A 3328.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3357,239,0 +Zv9_NA698 75201 . C A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +Zv9_NA698 86884 . G A 3157.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3186,223,0 +Zv9_NA708 11590 . C CAT 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=1.861;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=7.76;ReadPosRankSum=-2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:239,0,768 +Zv9_NA493 4990 . CGATAAGCGGCG C 946.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:93:984,93,0 +Zv9_NA493 7082 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-1.386;DP=30;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=12.93;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:416,0,300 +Zv9_NA92 3024 . C A 898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:927,66,0 +Zv9_NA92 15829 . G A 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:645,48,0 +Zv9_NA92 19005 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:315,0,165 +Zv9_NA92 19035 . A C 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:555,39,0 +Zv9_NA92 19908 . G A 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +Zv9_NA92 21741 . C A 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 +Zv9_NA92 43917 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.655;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:459,0,469 +Zv9_NA946 1272 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.443;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:573,0,887 +Zv9_NA962 1252 . T C 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 +Zv9_NA382 1275 . A G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-2.033;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:709,0,145 +Zv9_NA382 19643 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:366,0,152 +Zv9_NA382 58301 . T TTG 373.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.594;DP=20;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:26:411,0,26 +Zv9_NA382 58928 . G GA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:83:246,0,83 +Zv9_NA382 58930 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:83:246,0,83 +Zv9_NA590 4471 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +Zv9_NA590 4938 . C T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +Zv9_NA590 4980 . A T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +Zv9_NA463 28109 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=2.062;DP=23;FS=19.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.42;ReadPosRankSum=2.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:429,0,864 +Zv9_NA463 28110 . G A 400.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=2.738;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:333,0,931 +Zv9_NA463 30385 . C G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.246;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:248,0,967 +Zv9_NA463 30470 . C T 1476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:99:1505,108,0 +Zv9_NA463 30557 . T A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +Zv9_NA995 5186 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.704;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:460,0,477 +Zv9_NA995 21779 . G C 239.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:268,0,19 +Zv9_NA995 21905 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:323,0,247 +Zv9_NA585 446 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=1.867;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:637,0,1224 +Zv9_NA585 3351 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-0.783;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:313,0,1804 +Zv9_NA255 4975 . A G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +Zv9_NA255 11286 . T C 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 +Zv9_NA255 12126 . G T 813.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:842,60,0 +Zv9_NA255 12351 . C T 681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:710,51,0 +Zv9_NA132 15530 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.636;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=22.49;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:703,0,177 +Zv9_NA132 36067 . T G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=2.377;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:428,0,247 +Zv9_NA331 44183 . G A 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.690;ClippingRankSum=1.914;DP=150;FS=3.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,36:149:99:855,0,9645 +Zv9_NA331 44262 . C G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=1.517;DP=150;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,26:150:99:346,0,4643 +Zv9_NA383 10534 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.557;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:423,0,85 +Zv9_NA428 92030 . G C 245.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:274,21,0 +Zv9_NA428 92102 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +Zv9_NA913 14416 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=1.449;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:233,0,420 +Zv9_NA913 14825 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=3.087;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:426,0,1119 +Zv9_NA913 15233 . C T 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +Zv9_NA913 15256 . G A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:30:432,30,0 +Zv9_NA913 16754 . TGA T 487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:37:525,37,0 +Zv9_NA933 1013 . A T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:352,24,0 +Zv9_NA337 64885 . T TC 1407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.702;DP=190;FS=12.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.818;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1445,0,2219 +Zv9_NA337 65534 . G A 3733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-1.790;DP=183;FS=6.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,109:183:99:3762,0,2545 +Zv9_NA337 66344 . T G 3811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.420;DP=97;FS=13.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=25.31;ReadPosRankSum=-4.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,67:95:99:3840,0,635 +Zv9_NA337 66359 . GT G 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=-1.743;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,38:50:99:403,0,2973 +Zv9_NA337 66395 . A G 2359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.294;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=28.15;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:2388,0,1945 +Zv9_NA337 66513 . T A 1068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1097,81,0 +Zv9_NA337 66688 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-1.335;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:336,0,952 +Zv9_NA337 67542 . C T 8420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=-1.248;DP=446;FS=11.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=18.88;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,279:444:99:8449,0,5158 +Zv9_NA337 67667 . CACACACACACACACAT C 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=-2.403;DP=42;FS=1.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=12.04;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:543,0,922 +Zv9_NA337 67690 . A G 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,0:6:99:1595,0,622 +Zv9_NA337 67692 . A G 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=29.83;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:99:1595,0,669 +Zv9_NA337 68005 . C T 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.045;DP=94;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1622,0,1647 +Zv9_NA337 68697 . C G 4722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.447;DP=233;FS=0.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,131:226:99:4751,0,3012 +Zv9_NA337 68737 . C T 5440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.261;DP=258;FS=0.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.375;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,150:258:99:5469,0,3526 +Zv9_NA337 68904 . G A 4774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-1.760;DP=259;FS=5.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,150:259:99:4803,0,5787 +Zv9_NA337 69090 . C G 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.511;DP=278;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.250;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,67:278:99:1356,0,7744 +Zv9_NA337 69261 . T A 6909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-1.011;DP=286;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,191:286:99:6938,0,2510 +Zv9_NA135 17499 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,125 +Zv9_NA905 13646 . T A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:311,0,244 +Zv9_NA905 46236 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-1.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:366,0,403 +Zv9_NA905 46349 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:362,0,131 +Zv9_NA905 46383 . A G 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.364;DP=22;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:606,0,153 +Zv9_NA905 47150 . G C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.136;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.094;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:420,0,360 +Zv9_NA905 49020 . A C 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 +Zv9_NA905 49204 . T A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.517;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:609,0,400 +Zv9_NA905 49380 . T G 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 +Zv9_NA905 50128 . A G 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:350,24,0 +Zv9_NA905 50515 . ATC A 274.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:312,22,0 +Zv9_NA783 18454 . G A 666.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.091;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:695,17,0 +Zv9_NA783 26626 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,246 +Zv9_NA783 26631 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:236,0,246 +Zv9_NA783 27004 . C A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +Zv9_NA783 27089 . G T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:311,0,98 +Zv9_NA783 27256 . C G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:255,0,126 +Zv9_NA62 7575 . T C 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:234,0,23 +Zv9_NA880 22869 . GAGCGTT G 658.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-1.378;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.097;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:34:696,34,0 +Zv9_NA399 22115 . T G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.162;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:573,0,273 +Zv9_NA675 159231 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.401;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:307,0,424 +Zv9_NA478 119 . TAC T 494.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.711;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:13:534,0,13 +Zv9_NA478 823 . T C 2035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2064,151,0 +Zv9_NA478 951 . T C 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:804,63,0 +Zv9_NA566 3327 . AAGGTCAGTGCACAGCTTCAGTGATGTGTGTTTAATATCCCGAGGTGCTACTGAATCTGTATGATCTGTGTCCTCCAC A 7633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.784;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=27.08;ReadPosRankSum=-2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,174:183:99:7671,585,0 +Zv9_NA398 30768 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.871;DP=23;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:263,0,477 +Zv9_NA429 5878 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.412;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:409,0,266 +Zv9_NA429 10040 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:276,0,158 +Zv9_NA429 10045 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=27.53;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:276,0,158 +Zv9_NA429 10448 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:335,0,372 +Zv9_NA429 15241 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,143 +Zv9_NA429 17230 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +Zv9_NA429 18431 . A T 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 +Zv9_NA429 19549 . G A 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 +Zv9_NA429 19606 . T TTC 360.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 +Zv9_NA429 57571 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.460;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:558,0,451 +Zv9_NA429 63160 . C G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 +Zv9_NA429 63161 . A G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 +Zv9_NA813 6170 . G C 550.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.932;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:289,0,120 +Zv9_NA824 46974 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +Zv9_NA824 87812 . C G 221.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:250,0,15 +Zv9_NA824 87979 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:36:292,0,36 +Zv9_NA534 8903 . G C 618.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=1.942;DP=50;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:289,0,1377 +Zv9_NA534 13752 . TCCTGCAACACACACACACACACACGCACAGGTCAGTCAGTCAGTGTCACAGATCAGCTAGGGGTCAGATGTCACACACACACTCA T 2576.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=1.673;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2614,191,0 +Zv9_NA534 17182 . G A 1840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.003;DP=107;FS=7.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1869,0,1824 +Zv9_NA534 17339 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.484;DP=82;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=6.84;ReadPosRankSum=2.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:589,0,2137 +Zv9_NA501 72474 . T C 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 +Zv9_NA831 5075 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +Zv9_NA403 43537 . G C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:315,0,131 +Zv9_NA403 83797 . G C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-1.376;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:332,0,180 +Zv9_NA911 12938 . T A 2232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-1.935;DP=86;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,59:86:99:2261,0,722 +Zv9_NA911 14008 . A T 3027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-0.942;DP=178;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.029;QD=17.01;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,83:178:99:3056,0,3375 +Zv9_NA911 14089 . G A 3920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.562;DP=215;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=18.24;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,109:215:99:3949,0,3802 +Zv9_NA911 15107 . A C 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 +Zv9_NA192 18252 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.266;DP=74;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:571,0,1942 +Zv9_NA166 1488 . C T 863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:892,60,0 +Zv9_NA166 1489 . C T 863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:892,60,0 +Zv9_NA166 2575 . CA C 248.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:286,27,0 +Zv9_NA166 4146 . A C 302.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.66;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:331,0,15 +Zv9_NA166 4357 . T G 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:803,57,0 +Zv9_NA166 7556 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.478;DP=23;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:541,0,201 +Zv9_NA166 7638 . A T 249.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.158;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:278,0,13 +Zv9_NA408 10522 . A C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.978;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:308,0,219 +Zv9_NA291 1005 . C T 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-1.761;DP=48;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,42:48:60:1577,0,60 +Zv9_NA167 1911 . G C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=1.370;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=23.25;ReadPosRankSum=2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:563,0,184 +Zv9_NA167 1962 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=2.196;DP=28;FS=3.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:565,0,383 +Zv9_NA189 19987 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +Zv9_NA395 34200 . A G 2423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.385;DP=73;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=33.20;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,56:73:99:2452,0,874 +Zv9_NA662 4397 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.209;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1194 +Zv9_NA662 4398 . T A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.162;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1183 +Zv9_NA662 4661 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.315;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:247,0,1119 +Zv9_NA662 6648 . T G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +Zv9_NA662 8457 . A T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.271;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.10;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:390,0,203 +Zv9_NA662 11435 . A C 344.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:238,0,134 +Zv9_NA563 5776 . A T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +Zv9_NA563 6049 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +Zv9_NA563 6057 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=32.67;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:51:320,0,51 +Zv9_NA563 6619 . C T 358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:387,30,0 +Zv9_NA384 16845 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:365,0,323 +Zv9_NA384 18806 . C T 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.114;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:739,0,478 +Zv9_NA384 57994 . GGGTAAAAAACACTGAGCATCATCATATCCGTCTGTCACTGAAGCGCTTGTGTTTCTCATCTCTCTTATTTCTGCA G 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=26.43;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:328,0,1650 +Zv9_NA384 60933 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-1.678;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.85;ReadPosRankSum=-2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,305 +Zv9_NA832 7811 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-1.356;DP=39;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:387,0,1013 +Zv9_NA706 2677 . C T 3429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.493;DP=198;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,96:198:99:3458,0,3390 +Zv9_NA706 11048 . C T 4674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.793;DP=254;FS=1.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,139:254:99:4703,0,4239 +Zv9_NA533 2457 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-1.447;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:237,0,282 +Zv9_NA119 1316 . A G 1843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=-2.047;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,56:96:99:1872,0,1405 +Zv9_NA119 1685 . G A 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-3.796;DP=64;FS=6.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:956,0,1167 +Zv9_NA119 2010 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=-1.905;DP=53;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:462,0,3030 +Zv9_NA119 2013 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-1.984;DP=53;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:459,0,3030 +Zv9_NA119 3111 . G A 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.482;DP=89;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:1284,0,1448 +Zv9_NA988 923 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=14.44;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:317,0,866 +Zv9_NA988 1985 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.550;QD=16.99;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:317,0,290 +Zv9_NA991 7116 . T A 1739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.534;DP=85;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,51:85:99:1768,0,1218 +Zv9_NA991 7206 . C T 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.076;DP=84;FS=9.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1466,0,1478 +Zv9_NA160 1397 . C G 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=-0.188;DP=75;FS=14.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1096,0,1525 +Zv9_NA160 1573 . G T 801.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=2.215;DP=72;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:990,0,1358 +Zv9_NA160 1951 . T A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.409;DP=50;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:1089,0,2237 +Zv9_NA160 2423 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=1.265;DP=51;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:800,0,1006 +Zv9_NA160 4788 . G T 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.091;DP=69;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1330,0,1020 +Zv9_NA897 16147 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.589;DP=26;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:459,0,725 +Zv9_NA897 16250 . ATG A 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=-1.858;DP=67;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:334,0,1222 +Zv9_NA600 8570 . G C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.639;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=26.40;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:477,0,46 +Zv9_NA107 55236 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.343;DP=151;FS=4.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:531,0,4590 +Zv9_NA378 7811 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=-0.272;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:590,0,212 +Zv9_NA378 7931 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.945;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=17.58;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:415,0,375 +Zv9_NA378 8098 . A C 294.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=29.48;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:20:323,0,20 +Zv9_NA378 10380 . T G 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 +Zv9_NA923 2011 . A C 1722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.209;DP=107;FS=2.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1751,0,1760 +Zv9_NA923 4151 . C T 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.095;DP=82;FS=17.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,27:82:99:740,0,2134 +Zv9_NA923 10069 . A T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.168;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:78:641,0,78 +Zv9_NA963 4639 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.910;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:257,0,771 +Zv9_NA963 4657 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:99:257,0,771 +Zv9_NA963 11261 . G A 1642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.595;DP=328;FS=3.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,79:326:99:1671,0,9357 +Zv9_NA154 28377 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.531;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:285,0,91 +Zv9_NA154 28668 . C A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +Zv9_NA154 31606 . A T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.334;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:528,0,721 +Zv9_NA290 24423 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.88;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:257,0,97 +Zv9_NA290 24537 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,105 +Zv9_NA932 1073 . T A 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.293;DP=57;FS=4.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1253,0,1348 +Zv9_NA417 5626 . C T 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 +Zv9_NA261 5696 . A C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=-1.004;DP=71;FS=6.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:372,0,1847 +Zv9_NA261 10207 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.269;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:555,0,603 +chr1 20361 . G A 1994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2023,153,0 +chr1 37556 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=-2.391;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,344 +chr1 37616 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=28.34;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:340,0,52 +chr1 47585 . G T 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:591,42,0 +chr1 77838 . A G 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:694,54,0 +chr1 93242 . C T 551.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:580,42,0 +chr1 96385 . A G 1037.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1066,78,0 +chr1 98791 . G A 1031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1060,75,0 +chr1 144561 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=5.353;DP=70;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=3.57;ReadPosRankSum=-4.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:278,0,2107 +chr1 149197 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-1.151;DP=79;FS=5.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:373,0,2375 +chr1 152315 . C T 2162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-2.289;DP=89;FS=4.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=24.30;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,60:89:99:2191,0,740 +chr1 153011 . G C 1735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.209;DP=68;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,48:68:99:1764,0,509 +chr1 193439 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.219;DP=85;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:448,0,2338 +chr1 204800 . C T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-1.310;DP=78;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:957,0,1581 +chr1 232428 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.303;DP=57;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:255,0,1601 +chr1 232569 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.818;DP=72;FS=2.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:306,0,2161 +chr1 236381 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.294;DP=62;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:246,0,2411 +chr1 317603 . T G 310.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:6:338,0,6 +chr1 342286 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:99:1019,109,0 +chr1 345263 . GCCTGGAGAGAGACAGATGATGTTAACTCAAACTAGTCCTGCTGTTCTGAGTGTAAATGATGTAACACACACACAGACACACA G 2566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.121;DP=91;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=28.21;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,80:86:99:2604,0,128 +chr1 358970 . TCTGCAGACACAAAAACACTCAAGACCATCACTGTTAAACACTGTACAACATTCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAC T 974.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.757;DP=29;FS=7.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=33.61;ReadPosRankSum=-2.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:99:1012,0,441 +chr1 364000 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.665;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:771,0,729 +chr1 371646 . G C 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=-2.171;DP=65;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,36:65:99:1194,0,917 +chr1 424766 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.488;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:381,0,217 +chr1 430212 . CA C 225.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr1 430217 . C G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 +chr1 463223 . C T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=2.234;DP=78;FS=2.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:916,0,3477 +chr1 485990 . C A 14321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.501;DP=451;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.874;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,334:449:99:14350,0,6091 +chr1 485999 . A C 14321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.078;ClippingRankSum=0.487;DP=446;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=32.11;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,329:444:99:14350,0,5848 +chr1 500423 . G A 8167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.094;DP=320;FS=2.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,228:318:99:8196,0,2086 +chr1 546238 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.052;DP=53;FS=5.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:618,0,626 +chr1 548510 . G A 6507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=-2.312;DP=215;FS=2.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,176:215:99:6536,0,562 +chr1 560468 . CTCTGCAGGTGAGCGTACTGTAGTCAAACACCCTGCTGTGACCCTGCTCCTCCTATAACACACACCTGATGT C 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:472,0,112 +chr1 568504 . C T 3052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.756;DP=99;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=30.84;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,83:99:99:3081,0,216 +chr1 571487 . G T 2899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.687;DP=88;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,76:88:74:2928,0,74 +chr1 572567 . C T 2164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=3.493;DP=77;FS=21.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=28.11;ReadPosRankSum=1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,63:77:99:2193,0,202 +chr1 572661 . G A 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=3.828;DP=67;FS=8.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1326,0,788 +chr1 573969 . C T 5971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.507;DP=216;FS=3.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,166:216:99:6000,0,1043 +chr1 593614 . TCCTGCAGCACACAGAGGGTTACACAGACTCACACACACACACACACACACACACACACTCTACTGTAGAAACTGA T 1851.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=1.300;DP=56;FS=8.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=33.07;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,48:56:99:1889,0,1009 +chr1 624970 . C T 3182.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3211,238,0 +chr1 634046 . CACAGGTGAGTTCATAATTTGGATATTCATGAGCAGCGGCGCGGTGCTGATGCTGCAGCTGATATTGTGTGTTTACCTGATTCACGGTCAGGTTCATCTGTAAAGCGCCTCTTAACTGAATCTGTGTGAAACTGATCTGTCTTCATGTGTTCTGG C 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=2.074;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=31.21;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:443,0,1071 +chr1 638526 . C T 1097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1126,87,0 +chr1 638559 . T A 2207.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2236,166,0 +chr1 640869 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:567,42,0 +chr1 655201 . GAGGTCAGTGTGTGTTTGGGTGGGCAGCAGTTTGAAGCTGTGCTGCGTGTTTGTGGGTAATGATGTGGACACACACAGCTCTGACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTC G 3829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=3.539;DP=128;FS=3.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=29.92;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,114:128:99:3867,0,459 +chr1 658695 . TCA T 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.140;DP=60;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:394,0,745 +chr1 680891 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.200;DP=28;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,543 +chr1 681486 . A C 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-1.164;DP=44;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.021;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:755,0,268 +chr1 681493 . T G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.890;DP=49;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:755,0,258 +chr1 681613 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=1.991;DP=33;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:276,0,536 +chr1 684100 . A G 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.624;DP=74;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1169,0,1300 +chr1 684880 . A G 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.455;DP=67;FS=13.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1141,0,1103 +chr1 697201 . T C 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 +chr1 697546 . G A 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 +chr1 766124 . A G 882.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:911,69,0 +chr1 779691 . TATATGTGTAGTGTGTGTGTATGTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGC T 1711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1749,155,0 +chr1 779928 . TG T 224.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.448;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=6.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:270,0,4 +chr1 779930 . TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG T 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.493;DP=36;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:41:242,0,41 +chr1 986525 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-3.379;DP=54;FS=6.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:296,0,1604 +chr1 997045 . C A 2840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.225;DP=175;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,87:175:99:2869,0,2903 +chr1 997622 . TCTACACACACACACACAAAAACACACACACACACAAAAACACACACACACCATGATGATGGTGATGAAACGGTCACTGCAGTGTATGAAAAGTTCACGATAC T 9459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=2.651;DP=247;FS=1.624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=29.64;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,239:245:99:9497,696,0 +chr1 997815 . A C 4657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.856;ClippingRankSum=-0.845;DP=264;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,133:264:99:4686,0,4317 +chr1 1001796 . C T 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-0.760;DP=169;FS=11.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,56:169:99:1537,0,4166 +chr1 1013803 . C T 3305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-2.341;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,96:195:99:3334,0,3369 +chr1 1021349 . T C 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.029;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:594,0,718 +chr1 1027049 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=1.847;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:430,0,259 +chr1 1029207 . C A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:403,0,640 +chr1 1075728 . C A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=-1.631;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:347,0,395 +chr1 1076359 . T A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.958;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:414,0,1677 +chr1 1078818 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.575;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:401,0,487 +chr1 1093026 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=1.012;DP=44;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:1031,0,1218 +chr1 1093029 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.901;DP=45;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:1031,0,1218 +chr1 1446910 . TGGTGCGAAATCAATGCATTTAACATAATTTCCATTATTTAAATCAACAGTGTTGGCTATGTAGTAAGATTCAATGGTGTTTTTCTTTATGCA T 7970.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.058;DP=195;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,190:192:99:8008,722,0 +chr1 1456143 . T C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.096;DP=167;FS=8.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=3.94;ReadPosRankSum=-3.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,37:167:99:687,0,5347 +chr1 1459974 . C T 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.723;DP=178;FS=3.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,48:178:99:1185,0,4989 +chr1 1460987 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.785;DP=160;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,25:160:99:263,0,5268 +chr1 1475023 . C T 3500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=-0.629;DP=394;FS=17.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.096;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,129:394:99:3529,0,17466 +chr1 1475932 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=-0.401;DP=351;FS=13.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,68:346:99:274,0,12396 +chr1 1478468 . GGGTGAGTACTGGCATTGCTATACTACGCATTTCCATGCGACGCGTTCCTTCAACGTGTTGTTTCTCCACA G 14559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.759;DP=343;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=30.58;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,318:321:99:14597,0,8255 +chr1 1478841 . G T 1332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.714;ClippingRankSum=-1.919;DP=405;FS=2.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=3.29;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,87:404:99:1361,0,12381 +chr1 1479426 . G A 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.808;DP=427;FS=1.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,89:427:99:1572,0,12914 +chr1 1480288 . C T 2721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.659;DP=373;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,111:373:99:2750,0,27579 +chr1 1480293 . TGGTAAGCACTGCATTTGATTGGTTCTATTTAATAGCTGGTTGGTGAGGTTAATAAATGATATTGTCCTGTTATCGTCAA T 2720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-3.090;DP=383;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,116:382:99:2758,0,27579 +chr1 1489002 . G GTC 907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-0.748;DP=86;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:945,0,1906 +chr1 1491996 . T C 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.702;DP=49;FS=16.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:714,0,1027 +chr1 1492139 . G A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.760;DP=78;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:725,0,2071 +chr1 1492176 . C G 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.551;DP=88;FS=4.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:1123,0,1969 +chr1 1492274 . G C 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=1.269;DP=51;FS=25.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.17;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1618,0,186 +chr1 1492695 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=-0.059;DP=72;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:439,0,2081 +chr1 1550022 . T C 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=-0.585;DP=218;FS=0.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=6.30;ReadPosRankSum=2.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,59:218:99:1401,0,6346 +chr1 1550217 . A T 1353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:1382,102,0 +chr1 1551848 . C T 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=-0.376;DP=246;FS=1.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=5.31;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,60:245:99:1334,0,7095 +chr1 1564574 . AAGGTAAACAACAAACAAACAAAGACTTAAAAGTTGGCTTATTGTTGATCTCATGAAAACATCCCTGGCTTGCTCATCTCTCC A 1542.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=1.019;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1580,148,0 +chr1 1565130 . T C 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=4.685;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:848,0,1225 +chr1 1568574 . A G 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr1 1568962 . C T 741.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=2.216;DP=21;FS=10.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=29.14;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:18:770,18,0 +chr1 1602563 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,102 +chr1 1602587 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.396;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:50:394,0,50 +chr1 1603093 . GT G 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=2.637;DP=15;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:248,0,416 +chr1 1603095 . ATGTCATATTTTGGGAACTTCCTTGACTGAATAATTCTGAAGACTCACATCTCAAACATATCTTCCACTTCAGGC A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=1.109;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:248,0,418 +chr1 1603300 . G T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=21.38;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:242,0,98 +chr1 1607338 . A AC 347.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr1 1607342 . G T 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:385,27,0 +chr1 1608081 . G A 980.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1009,69,0 +chr1 1608839 . G A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr1 1608844 . A T 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr1 1609029 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr1 1610407 . A T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr1 1610612 . G T 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 +chr1 1612582 . GA G 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:499,48,0 +chr1 1631288 . A C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=12;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=26.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:30:632,0,30 +chr1 1631310 . A T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=-0.592;DP=19;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=31.78;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:30:632,0,30 +chr1 1714191 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr1 1858564 . G C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.217;DP=51;FS=4.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:397,0,1361 +chr1 1886267 . A T 1393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.184;DP=72;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,43:72:99:1422,0,1011 +chr1 1942956 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.181;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:67:99:251,0,4028 +chr1 1942960 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.739;DP=63;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:251,0,4028 +chr1 1970068 . A G 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr1 1971185 . TA T 503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=1.561;DP=23;FS=13.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=21.90;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:58:541,58,0 +chr1 1971665 . C CA 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.508;DP=52;FS=4.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,35:51:99:1409,0,267 +chr1 1971675 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.437;DP=60;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,28:60:99:968,0,1503 +chr1 1972655 . T A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.759;DP=75;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:1370,0,1320 +chr1 1973879 . C CA 470.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:72:644,72,0 +chr1 1974194 . TTA T 1872.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1910,150,0 +chr1 2043750 . C T 2104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-1.309;DP=345;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,90:345:99:2133,0,9857 +chr1 2055852 . C CGT 3029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=-1.124;DP=122;FS=1.847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,85:91:99:3067,173,0 +chr1 2055960 . C T 2568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.314;DP=201;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,79:201:99:2597,0,4040 +chr1 2056045 . G A 1128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1157,81,0 +chr1 2056272 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-0.919;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:427,0,2407 +chr1 2058904 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.026;DP=44;FS=4.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:319,0,1148 +chr1 2166805 . T G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr1 2167092 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr1 2171812 . G A 201.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:230,0,25 +chr1 2183228 . T C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=1.283;DP=91;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:535,0,3769 +chr1 2200860 . G A 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-1.277;DP=68;FS=4.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1309,0,1020 +chr1 2201365 . TG T 534.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.175;DP=36;FS=2.593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:8:571,8,0 +chr1 2207217 . C A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr1 2703271 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr1 2704750 . G C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.288;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:373,0,295 +chr1 2704764 . A T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.102;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:322,0,385 +chr1 2705161 . A T 320.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:349,23,0 +chr1 2705218 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr1 2705990 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:250,0,388 +chr1 2706074 . A G 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:564,42,0 +chr1 2706107 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:346,24,0 +chr1 4173577 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-1.230;DP=156;FS=4.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.328;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,36:156:99:561,0,7546 +chr1 4244528 . C A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;ClippingRankSum=2.307;DP=85;FS=7.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:319,0,2640 +chr1 4244594 . A ATG 747.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-2.455;DP=93;FS=4.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:785,0,940 +chr1 4247866 . A T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.348;DP=104;FS=5.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:728,0,2985 +chr1 4254940 . A C 1087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-0.709;DP=118;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,39:118:99:1116,0,2998 +chr1 4264473 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.867;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.997;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:322,0,3490 +chr1 4283814 . A G 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.360;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1295,0,410 +chr1 4291807 . C CA 451.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.356;DP=364;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=1.24;ReadPosRankSum=3.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,68:360:99:489,0,8063 +chr1 4307806 . GT G 19856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-5.039;DP=273;FS=18.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=32.66;ReadPosRankSum=-5.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,23:258:99:19894,0,4763 +chr1 4320168 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.912;DP=56;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:297,0,1688 +chr1 4325117 . A G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:261,18,0 +chr1 4381489 . T C 1477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.911;DP=379;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.357;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:294,83:377:99:1506,0,11322 +chr1 4384476 . CACA C 5033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.543;DP=302;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.972;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,131:299:99:5071,0,15027 +chr1 4384477 . ACAGGTAAATATGGCCACACATCAGAGAGCTATTCAACCATGAATGCCATATTAATTTGAATGTTTGTTT A 5670.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-2.663;DP=299;FS=8.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,161:295:99:5708,0,9974 +chr1 4384480 . GGTAAATATGGCCACACATCAGAGAGCTATTCAACCATGAATGCCATATTAATTTGAATGTTTGTTT G 5033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.440;DP=284;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,120:284:99:5071,0,14810 +chr1 4384563 . T G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.164;DP=259;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=1.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,43:259:99:511,0,28027 +chr1 4392693 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.801;DP=168;FS=18.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=1.61;ReadPosRankSum=-3.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,30:165:99:299,0,6664 +chr1 4393877 . T TG 4085.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-1.732;DP=133;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=30.72;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:4123,390,0 +chr1 4395605 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=21.82;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:421,0,248 +chr1 4396687 . G A 7024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.385;DP=419;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,207:418:99:7053,0,7554 +chr1 4398403 . ACTGTTGGGTTGAAGGGAACAATGTCGGCATCAGATATGTATGCATATTAAGCTTTCATCAAAGCTTGAATTTCCTTTTTTAC A 15771.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=356;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,356:356:99:15809,1290,0 +chr1 4400679 . GTGCTGTAATTGCATAGAGTGAAAATAAAAGTTTAA G 9329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.157;DP=413;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,260:381:99:9367,0,3146 +chr1 4400716 . GTCATAGCGAGCAATGTCAGTCAATTAAATTTGAGAATTCACCTCAAATCAGCACTATTTAGGTAAAGCTACTTTGTAC G 9329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.378;DP=398;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=23.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,250:370:99:9367,0,3113 +chr1 4400882 . AACCTGATGTATGGAATACAGTTATTTCAATTATTGGCAATACCCCAACATCATAAAAAAAAACAAAAGTTTGTAATAAATTGAAGAAACTTCATACATTTTAGACACTAAAACAATAATAACCACAGTATACTTTAAATGAAGTGTCTTTGCATCCAATATTTTAAGTTTATAATCCCTGGGTTAGTTTATCCAGTGGTTGACAATTTTTTGGGCATTATGTATAGTTGCTT A 14367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.554;ClippingRankSum=6.843;DP=376;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,339:375:99:14405,0,1847 +chr1 4402783 . GCCTGAAAGTGAAGAAAAGCCATAAAAAAACATTAATAGTCAGAAAGCCCTGATACAAATGCCTTTAGCATGTGTGCTTA G 13390.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.207;DP=330;FS=3.024;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=27.33;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,326:330:99:13428,1090,0 +chr1 4405477 . TAATACAAAAGTAAAATACAAACAATATGATAACCCTCCTAGTGGAAGTTATCATAGTGCATTCCTCAAGAATGCA T 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,1:10:99:390,0,3506 +chr1 4407769 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=1.281;DP=61;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:288,0,1930 +chr1 4408926 . GCTAACGTGAAAAAGCAAAGAGGAATGAAGTCTAGTATTATTCTTGAACAGCAGTTCCTTTCATATCTTGTAATAGAGCTTATCCCTGGATCTACTAGACCTCAGTCTTTGTAGCAAGAAATAAACTACCTTTAGATTCAGGCAAAAGTAGGACTGGTTTAAATTAGTCTCATAGTAGCTTAC G 16333.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=-1.573;DP=358;FS=3.695;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=28.14;ReadPosRankSum=2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,352:358:99:16371,1398,0 +chr1 4425292 . G A 2965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=-2.034;DP=267;FS=8.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=11.11;ReadPosRankSum=4.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,92:267:99:2994,0,17790 +chr1 4425401 . ACTGAAAATCAAATCAGTCAAAAAAAACAAAAACAAATGGTAAGCACTTGATCCACTAATTCACACCCTATCGAAAAGACCAAGAAACTGATTTATTTTGGTATACCGTTACGATATTTTCTTGGTCAAAAGAGGCTCTGAGATGCACTTAC A 17356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=376;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,375:375:99:17394,1491,0 +chr1 4495682 . C CT 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-0.712;DP=200;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=2.14;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,42:181:99:465,0,3707 +chr1 4495925 . A G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=-2.578;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=11.87;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:883,0,1650 +chr1 4496394 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=-0.038;DP=98;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:379,0,3077 +chr1 4496776 . A G 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-2.371;DP=101;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:686,0,2766 +chr1 4497072 . A T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.376;DP=127;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,35:126:99:847,0,3083 +chr1 4497199 . T G 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.507;DP=144;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,32:144:99:643,0,4380 +chr1 4520097 . C T 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.216;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=22.06;ReadPosRankSum=3.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,39:59:99:1330,0,677 +chr1 4565543 . A G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-1.913;DP=89;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:728,0,2173 +chr1 4673240 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,259 +chr1 4673591 . T C 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:236,0,25 +chr1 5015547 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:230,0,471 +chr1 5038797 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.951;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,553 +chr1 5130430 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.176;DP=60;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:322,0,1628 +chr1 5221815 . TAC T 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr1 5231216 . TC T 462.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:500,48,0 +chr1 5383384 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr1 5522273 . G A 1070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-2.367;DP=138;FS=7.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:1099,0,3888 +chr1 5526478 . G GA 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-1.110;DP=85;FS=14.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:758,0,849 +chr1 6764393 . AT A 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=-3.387;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:331,0,517 +chr1 6771074 . G T,GT 2506.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,15,97:112:99:2953,2892,7351,343,0,107 +chr1 6885498 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr1 6885499 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr1 6890425 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.437;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:450,0,489 +chr1 6890575 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:261,0,250 +chr1 6890580 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:261,0,250 +chr1 7051796 . T G 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:43:632,43,0 +chr1 7051848 . T C 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:618,45,0 +chr1 7053516 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-0.382;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:375,0,638 +chr1 7053576 . A T 835.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:864,63,0 +chr1 7053840 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:361,0,370 +chr1 7055117 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-0.331;DP=34;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:692,0,398 +chr1 7055128 . G A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-1.283;DP=38;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:690,0,504 +chr1 7055270 . G T 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:598,42,0 +chr1 7055461 . C T 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 +chr1 7664325 . A G 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-1.027;DP=81;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:711,0,2102 +chr1 8056540 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=-2.489;DP=18;FS=12.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=16.71;ReadPosRankSum=-2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:329,0,242 +chr1 8056656 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=-0.437;DP=29;FS=8.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:240,0,690 +chr1 8056659 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=1.711;DP=27;FS=9.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:245,0,594 +chr1 8183191 . ACTGATGAAGATACCATCAGAAAATCAATCAAAAATCTGGTTCTCTCGATAATTTTTTTATGCTAAAACACTGTGAATTGAGAATAGGCTAGTGAAGCTCTTTAC A 1500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=1.628;DP=34;FS=4.046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=27.81;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1538,140,0 +chr1 8204120 . ACTGAAATTATAAGACGAATGAAACATGAGCGAGTGATGGATAGTTTTAGTTCAGGTGTTTAAAATACACATGATGGTTTGTTAC A 1076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-1.317;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:88:1114,88,0 +chr1 8588441 . AATACCTGCAGCAGACAAAACCCTCTCTTACTCGGGAGGAAAAACAATCCAACATTGCATTCATAGTGTAAATCTCCACACACTG A 1817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=1.074;DP=54;FS=7.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=33.66;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,49:54:99:1855,0,550 +chr1 8719419 . T C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 +chr1 9618296 . CGGTGAGACGCACTCTGACACACACACACACAAACACACATTCAGACCGATAGTCTTTCAGCAGGCTTTGTCAGCTGTCGCTGTCTGTTAACACA C 1077.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=-1.041;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1115,0,1328 +chr1 9872946 . ATG A 819.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:58:857,58,0 +chr1 9915080 . G GCC 468.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:36:506,36,0 +chr1 10962718 . G GA 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.313;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:327,0,524 +chr1 10963760 . G GT 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.773;DP=139;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1264,0,1213 +chr1 10964003 . CA C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.042;DP=148;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=3.30;ReadPosRankSum=-1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,34:128:99:525,0,2564 +chr1 10964690 . T C 1898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.379;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:1927,0,204 +chr1 10964703 . T C 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.176;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=20.62;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:1018,0,1660 +chr1 10964850 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.674;DP=78;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:274,0,2841 +chr1 10965691 . T C 1336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:96:1365,96,0 +chr1 10965692 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=1.345;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:99:330,0,811 +chr1 11043691 . TCCTGTGCAGATGTGCAAAAGAACAAAGCAGGTCATTTAATAAGCTACATTTATTGCAAATGTACAGTATGTGTTGATGGGGTTGCACCGA T 1049.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.036;DP=29;FS=10.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=35.55;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:99:1087,0,368 +chr1 11079903 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.914;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:340,0,1277 +chr1 11080071 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.282;DP=38;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:274,0,1075 +chr1 11080483 . TA T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.876;DP=30;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:347,0,602 +chr1 11080694 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.190;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:405,0,2428 +chr1 11080702 . G C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-0.251;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:405,0,2428 +chr1 11081082 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.023;DP=46;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:422,0,1219 +chr1 11081180 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=1.213;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.164;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:297,0,1294 +chr1 11081246 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.326;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:304,0,1815 +chr1 11081377 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.192;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:459,0,1659 +chr1 11082124 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=-0.036;DP=60;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=3.90;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:262,0,1805 +chr1 11082403 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-2.272;DP=50;FS=7.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:240,0,1530 +chr1 11082487 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.438;DP=55;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:266,0,1626 +chr1 11082733 . T G 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.263;DP=74;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:743,0,1680 +chr1 11083244 . T C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.887;DP=73;FS=8.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:694,0,1924 +chr1 11149230 . C G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=2.035;DP=47;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=7.34;ReadPosRankSum=-2.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:373,0,1263 +chr1 11170170 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.827;DP=58;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:346,0,1725 +chr1 11258855 . CCCTGGAATATAGCACATTTCTTAATAAATCTTTAAGAATAAAATATGTGAGTGTGTGTGTGCGTGTATTTGCACATTA C 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:299,0,684 +chr1 11290610 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr1 11290617 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr1 11290876 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr1 11292327 . A T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr1 11292462 . T C 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 +chr1 11293630 . C T 746.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:775,54,0 +chr1 11383599 . G A 365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:394,35,0 +chr1 11651184 . CGGTAAACGCAAACCTGACCCCTGGATGCTTTTATATAGATGCATTTAAAGTTTGAAGTTCATTTAGGGTTGACGAATGTTTCTCTTCA C 16149.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.707;DP=421;FS=6.013;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=28.06;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,418:421:99:16187,1354,0 +chr1 11691389 . CGTAGGTTTAGTCTATACAGTGTATTTCAGACATCAAGAAGAGATTTTCATTGCTAACATGCAACTTGTTATAATATTAATATTACAG C 1697.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.976;DP=40;FS=2.246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:99:1735,145,0 +chr1 12097463 . G GC 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.788;DP=50;FS=9.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:421,0,1546 +chr1 12125137 . C T 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.201;DP=76;FS=15.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:535,0,1805 +chr1 12147108 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.849;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:542,0,1647 +chr1 12153364 . T G 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-0.930;DP=68;FS=5.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:811,0,1560 +chr1 12153602 . A T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.175;DP=74;FS=6.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:344,0,4820 +chr1 12153610 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.666;DP=78;FS=3.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:344,0,4820 +chr1 12155248 . G A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.594;DP=86;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:728,0,2186 +chr1 12842288 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.096;DP=67;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:544,0,3558 +chr1 12842293 . T G 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.873;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.056;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,30:61:99:1145,0,1958 +chr1 12842401 . CAA C 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.479;DP=57;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:760,0,1256 +chr1 12842949 . C T 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.273;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:872,0,1154 +chr1 12843062 . C T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-1.735;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:693,0,2264 +chr1 12843335 . G T 1812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-2.871;DP=65;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=27.89;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:1841,0,716 +chr1 12843597 . C T 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.618;DP=91;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,37:91:99:1141,0,1731 +chr1 12873905 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.102;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:271,0,1460 +chr1 12900731 . A T 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:571,42,0 +chr1 12981871 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.606;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:326,0,1268 +chr1 13078316 . C G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;ClippingRankSum=-1.370;DP=101;FS=10.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:391,0,3034 +chr1 13296109 . AAGGTATGTACAAGATTAAATGATCAAATATTGTTAGTGTTTTTTAATTTTCTGCTAATTTTGCTCTCTGGTCGTTT A 3316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=1.371;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=29.44;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:3354,254,0 +chr1 13348182 . AG A 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.927;DP=46;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:314,0,1196 +chr1 13384347 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.309;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=24.06;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:341,0,248 +chr1 13384356 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=2.069;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=13.09;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:277,0,627 +chr1 13384484 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.025;DP=73;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:245,0,1947 +chr1 13384538 . A G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.162;DP=64;FS=5.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:640,0,1340 +chr1 13411867 . G A 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=2.246;DP=85;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.512;QD=11.04;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:967,0,1584 +chr1 13412027 . T A 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=3.925;DP=54;FS=10.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:962,0,1837 +chr1 13412037 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=2.743;DP=50;FS=20.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=17.74;ReadPosRankSum=-2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:915,0,2189 +chr1 13412078 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=2.336;DP=64;FS=10.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:483,0,1719 +chr1 13412121 . G A 1564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-0.173;DP=96;FS=2.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:1593,0,1731 +chr1 13412331 . G A 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.552;DP=74;FS=5.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:840,0,1539 +chr1 13412362 . T A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.437;DP=65;FS=8.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:346,0,4081 +chr1 13412460 . T C 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.330;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:912,0,907 +chr1 13412613 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.166;DP=90;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,33:89:99:1126,0,1955 +chr1 13412628 . C G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.852;DP=91;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:438,0,2724 +chr1 13412654 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.677;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:408,0,2434 +chr1 13412785 . T C 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.581;DP=67;FS=0.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:631,0,1751 +chr1 13412821 . G A 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=2.202;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1583,0,1150 +chr1 13412847 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.453;DP=88;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:440,0,2766 +chr1 13413123 . A G 1382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.827;DP=69;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1411,0,2093 +chr1 13972848 . C A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=1.968;DP=76;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:1023,0,1620 +chr1 14018044 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-0.639;DP=58;FS=4.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:409,0,3195 +chr1 14321274 . G T 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 +chr1 15202170 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.887;DP=21;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:423,0,269 +chr1 15375524 . C T 1895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.807;DP=83;FS=9.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,54:83:99:1924,0,1002 +chr1 15376406 . TCAGGTTTAGAATGTCATGTCATTCAATATCACATCAGTGTTTGTTTTAAAGGATATTGCTGAATTTTGCAGCTCGGTGTATTTGATCACTGCTTTGTCACTCAATG T 2301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.540;DP=71;FS=12.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=32.42;ReadPosRankSum=2.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,58:66:99:2339,0,535 +chr1 16187936 . A G 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-2.157;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,41:140:99:1031,0,3731 +chr1 16224475 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=3.098;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,18:104:99:246,0,3388 +chr1 16226744 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=1.045;DP=123;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,35:123:99:884,0,3469 +chr1 16226790 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.466;DP=136;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,40:136:99:1039,0,3679 +chr1 16238241 . A T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.014;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.193;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:653,0,3823 +chr1 16249567 . A C 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.970;DP=120;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:910,0,3018 +chr1 16251562 . C T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.143;DP=122;FS=8.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,32:122:99:727,0,3255 +chr1 16264530 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-3.332;DP=159;FS=6.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,33:159:99:516,0,8490 +chr1 16264773 . A AT 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-2.198;DP=130;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,37:122:99:458,0,2218 +chr1 16265065 . A G 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.450;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:1002,0,772 +chr1 16265365 . A G 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-2.004;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:1180,0,637 +chr1 16265996 . GT G 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-2.796;DP=97;FS=2.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=2.94;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:322,0,1770 +chr1 16266348 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.811;DP=36;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:332,0,1141 +chr1 16266359 . C CA 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.620;DP=47;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:735,0,483 +chr1 16277402 . C CA 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=-0.149;DP=100;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:289,0,2090 +chr1 16277503 . G A 1920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.108;DP=122;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1949,0,2405 +chr1 16277683 . A G 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=1.212;DP=50;FS=4.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=20.68;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:1062,0,1030 +chr1 16280059 . A G 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.577;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:864,0,1004 +chr1 16431374 . C G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=1.569;DP=34;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:297,0,926 +chr1 16437442 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:82:304,0,82 +chr1 16437754 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-1.630;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=8.12;ReadPosRankSum=2.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:548,0,1538 +chr1 16440195 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=1.545;DP=38;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:306,0,1100 +chr1 16440279 . C A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.190;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:708,0,691 +chr1 16440896 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.107;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=8.31;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:369,0,1415 +chr1 16483827 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,254 +chr1 16484054 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,338 +chr1 16487402 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.156;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:519,0,430 +chr1 16487424 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=-1.844;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=27.71;ReadPosRankSum=2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:915,0,236 +chr1 16491514 . GCTATATTAAACATTTAATAACATTTTAGTAATAGAACATCATTAGTGAATAGTCAAAATTAAAGTGCTAAAAAATACTTAC G 2173.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=1.667;DP=53;FS=3.263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=31.82;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2211,168,0 +chr1 16503503 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.589;DP=34;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:312,0,890 +chr1 16504400 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-0.607;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:488,0,463 +chr1 17318012 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.338;DP=44;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:232,0,1097 +chr1 17320170 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.256;DP=76;FS=5.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=6.26;ReadPosRankSum=2.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:504,0,2171 +chr1 17322213 . A T 727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:756,54,0 +chr1 17322373 . C T 360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:389,30,0 +chr1 17329260 . C G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.305;ClippingRankSum=0.039;DP=100;FS=5.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:371,0,3027 +chr1 17336220 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:356,0,246 +chr1 17337263 . T C 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-2.491;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=16.66;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:778,0,829 +chr1 17337942 . G A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.893;DP=49;FS=5.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:687,0,1434 +chr1 17400040 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.395;DP=91;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:359,0,2687 +chr1 17459809 . T G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=1.113;DP=67;FS=3.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=12.32;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:854,0,1419 +chr1 17468337 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-1.430;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:287,0,1799 +chr1 17468463 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-1.996;DP=79;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:240,0,2472 +chr1 17530422 . ACTACAGAGAATTACAGTCGTTTATAATCTGACATGCTGAATGAAAAGCAACACAAAATGCTAAACAACACTGAC A 3673.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=2.390;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=34.15;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:3711,288,0 +chr1 17539332 . G T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.159;DP=99;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:645,0,4274 +chr1 17609817 . G A 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-1.908;DP=265;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=5.03;ReadPosRankSum=2.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,65:265:99:1360,0,7243 +chr1 17666228 . T A 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.464;DP=341;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,78:339:99:1524,0,9594 +chr1 17674994 . A AAC 865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-1.069;DP=235;FS=7.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,50:207:99:903,0,5332 +chr1 17676006 . T TA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.700;DP=80;FS=2.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=3.73;ReadPosRankSum=-2.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:336,0,775 +chr1 17676291 . C A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.721;DP=122;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:583,0,3772 +chr1 17677148 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.148;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:406,0,2706 +chr1 17677198 . G GT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.516;DP=136;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,26:135:99:280,0,3408 +chr1 17677809 . A T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-2.310;DP=161;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,40:161:99:890,0,5082 +chr1 17677983 . A AT 797.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-0.041;DP=136;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:835,0,3500 +chr1 17678113 . T A 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-1.514;DP=211;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,59:211:99:1456,0,5879 +chr1 17678735 . GTT G 910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.226;DP=172;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,42:122:99:1263,0,2274 +chr1 17743863 . A T 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.109;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:939,0,1771 +chr1 17744269 . T G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.410;DP=61;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:326,0,1685 +chr1 17767235 . G T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-0.663;DP=42;FS=4.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:508,0,880 +chr1 17769991 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=1.637;DP=59;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:293,0,1786 +chr1 17776385 . CGTGAGTCACACTGAACACACCCACACGCAGACACGCTTAACAGGCTCATATGCATGCCTGTGTACATTTTCTGGCTTCTGTGCGTAG C 2535.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=1.674;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=29.19;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:2573,188,0 +chr1 17789668 . G T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.963;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:344,0,1957 +chr1 17809070 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.111;DP=36;FS=9.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:576,0,665 +chr1 17809390 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.791;DP=49;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:788,0,798 +chr1 17809912 . G A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=-0.689;DP=56;FS=9.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:933,0,983 +chr1 17847486 . G A 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.682;DP=80;FS=7.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:843,0,1827 +chr1 17847624 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;ClippingRankSum=0.584;DP=75;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:501,0,2076 +chr1 17874842 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:293,0,247 +chr1 17905833 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.594;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,579 +chr1 18097844 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-1.274;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:400,0,3034 +chr1 18097869 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.319;DP=41;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:405,0,3034 +chr1 18209941 . TA T 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.429;DP=24;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:275,0,227 +chr1 18305321 . CTG C 1079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.582;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:1117,0,1649 +chr1 18502573 . TA T 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.274;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=23.17;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:73:477,0,73 +chr1 18563974 . A C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr1 18564859 . T C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 +chr1 18565557 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:229,0,67 +chr1 18566420 . G T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr1 18567086 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:93:242,0,93 +chr1 18567390 . A C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:46:413,0,46 +chr1 18568887 . T C 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr1 18573423 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,170 +chr1 18577377 . C A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 +chr1 18583347 . ACTAAACACAACAATAAAACTCAGTGCATGATTAACAAGCAAATGTATGCGAATATTAATAGTTGGTTTAAATAC A 9399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=1.560;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=30.22;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,229:250:99:9437,0,877 +chr1 18608104 . CAGGTATAAACAAACCCAGACTTCATCATGTTCAGTAATGTATCAAACTGGCGTATCTAACTGTGTGTGTGCGCATTT C 1545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.384;DP=44;FS=3.107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1583,133,0 +chr1 18627752 . CGT C 1575.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1613,115,0 +chr1 18628531 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.884;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:249,0,470 +chr1 18628901 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:273,0,222 +chr1 18628913 . T G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:273,0,222 +chr1 18629245 . TA T 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.973;DP=32;FS=3.081;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=31.15;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:58:1034,58,0 +chr1 18701222 . GAGGTATGATCCATTTGAGGCCACATGATTAAGAAAATAATACGTTTTATCCACATTGACCAATCACTTTTTCTGTATCT G 2654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=1.083;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:3023,286,0 +chr1 18734847 . AT A 1272.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.698;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=28.28;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:89:1310,89,0 +chr1 18739020 . C T 1304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1333,93,0 +chr1 18850746 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=16.17;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,263 +chr1 18884930 . A T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr1 18950387 . G A 2167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2196,160,0 +chr1 18950510 . G A 2265.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2294,163,0 +chr1 18959646 . G A 1965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1994,138,0 +chr1 19650368 . T A 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 +chr1 19650670 . A C 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.365;DP=31;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:1917,0,527 +chr1 19650699 . G A 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.382;DP=36;FS=16.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.26;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:99:1917,0,431 +chr1 19650733 . C A 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=2.000;DP=32;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.000;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:1916,0,602 +chr1 19650747 . A C 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-1.660;DP=37;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=28.42;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:1916,0,601 +chr1 19650785 . T G 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.980;DP=37;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=29.62;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,22:23:99:1916,0,554 +chr1 19650849 . A G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.639;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=31.25;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:99:747,0,778 +chr1 19650856 . AG A 710.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,21:21:99:748,0,778 +chr1 19651010 . T C 6682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6711,491,0 +chr1 19651102 . A C,T 2624.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,16,63:79:99:2845,2368,2436,489,0,341 +chr1 19651342 . T G 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-1.609;DP=76;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1011,0,1041 +chr1 19651359 . T A 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=1.674;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=28.27;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,39:49:99:1583,0,248 +chr1 19719505 . C T 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr1 19719602 . G T 2122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=-0.483;DP=83;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=25.58;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,55:74:99:2151,0,844 +chr1 19936586 . TACCTTAAGAAAAAGTAGCAGACAAAATTAAAAGAAATTGTCTAAATTGTCTATTTGACTTCTTAAATTCAGCTTAAGACCAA T 1549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=1.657;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,48:49:99:1807,0,557 +chr1 20124223 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=-1.135;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:473,0,1757 +chr1 20127711 . T C 1564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.044;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=29.45;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1593,114,0 +chr1 20431293 . G A 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 +chr1 20556735 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=1.160;DP=30;FS=7.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:584,0,402 +chr1 20787051 . C T 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 +chr1 21422059 . G GA 1069.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1107,102,0 +chr1 21451240 . T TAA 570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:608,47,0 +chr1 21451519 . A AC 244.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr1 21468906 . G GTTTGAGTTTGAGTGT 598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:44:636,44,0 +chr1 21579539 . G T 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:570,39,0 +chr1 21579547 . A C 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:39:570,39,0 +chr1 21580957 . T TA 862.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:900,63,0 +chr1 21619665 . GCCTAGAATGCAGGAAATACATCAAAGCTTTATCCACACACACATGCAAACACACACACTGCAGATGCTCTCAAATAAACATACTCA G 1244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=2.301;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=32.76;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,32:37:99:1310,0,818 +chr1 21619836 . TCTAAAAGCAATAATTATCAGTCATATTGTAAAACTTAATGATTTGACATAAATGAGTAAACAGTATAAATGTATTTCTTAC T 2500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=2.365;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=31.84;ReadPosRankSum=-2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:2538,194,0 +chr1 22097688 . AAG A 1062.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1100,105,0 +chr1 22111692 . AACCTGAGGCATGGAAAGAAAAAAATTGCGCACATGGTATTTAAAAGTCTTTTTTAAAAATAAAAACTACTACATTTGCAATTGCAAACATT A 7911.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.229;DP=198;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=34.22;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,196:198:99:7949,754,0 +chr1 22272537 . TGGTAAGTAAAATTATTAACAAAAAAGGTTATGCAATTCTGTCTTGATATTTACTGTCCGTTAATGTTTGTACA T 2372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=1.992;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:2410,195,0 +chr1 22639007 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.499;DP=82;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:456,0,2210 +chr1 22720543 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.439;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:840,0,867 +chr1 22988682 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=1.202;DP=48;FS=3.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:253,0,1444 +chr1 23028024 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-1.249;DP=40;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:345,0,961 +chr1 23029114 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=2.097;DP=36;FS=5.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:374,0,906 +chr1 23031022 . T A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.071;DP=34;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:494,0,1404 +chr1 23031032 . A T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.562;DP=29;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:494,0,1451 +chr1 23038438 . G T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.753;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:396,0,869 +chr1 23369072 . T G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=30.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:94:275,0,94 +chr1 23383056 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.640;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:494,0,626 +chr1 23764834 . C A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-1.096;DP=82;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=6.67;ReadPosRankSum=2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:575,0,2146 +chr1 24140619 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.168;DP=53;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:402,0,1451 +chr1 24300178 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.405;DP=54;FS=4.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:368,0,1573 +chr1 24347374 . A AT 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.547;DP=191;FS=2.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,43:174:99:458,0,3396 +chr1 24348302 . T A 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.668;DP=142;FS=1.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.772;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,42:142:99:1120,0,3911 +chr1 24348922 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-2.144;DP=199;FS=5.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,45:199:99:953,0,6145 +chr1 24353037 . C G 1617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.233;DP=304;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,76:304:99:1646,0,8712 +chr1 24479101 . T C 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:413,30,0 +chr1 24508449 . C A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-0.295;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,36:122:99:871,0,3134 +chr1 24513528 . G A 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.235;DP=134;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,46:134:99:1518,0,3049 +chr1 24535683 . G A 3181.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.141;DP=351;FS=23.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,116:351:99:3210,0,8941 +chr1 24536715 . G C 3197.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3226,248,0 +chr1 24536716 . TG T 3188.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3226,248,0 +chr1 24710128 . A AAC 314.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr1 24733957 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.489;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,629 +chr1 24815708 . A G 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 +chr1 24815733 . G A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr1 24928973 . A T 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=-0.223;DP=144;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,49:144:99:1704,0,3434 +chr1 24929534 . C G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.105;DP=183;FS=13.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,42:183:99:883,0,5560 +chr1 24982292 . T C 2801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.394;ClippingRankSum=-1.155;DP=433;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,119:432:99:2830,0,11385 +chr1 24989889 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.637;DP=33;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:464,0,648 +chr1 25175009 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=2.328;DP=69;FS=8.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:840,0,1522 +chr1 25266758 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.945;DP=81;FS=9.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:472,0,2287 +chr1 25266799 . A G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=-0.059;DP=67;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:778,0,1588 +chr1 25268661 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.095;DP=65;FS=3.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:417,0,1915 +chr1 25269083 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-0.410;DP=66;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:466,0,1892 +chr1 25274358 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:393,0,385 +chr1 25277050 . TACCTGTTAATGACGCACCATTTGAGACTACAGTCATAAATGAAGACAATACCTAGAGTATATATAACCCGTTAAAAATGACCC T 1808.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=2.377;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=34.06;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,43:50:99:1846,0,1000 +chr1 25327633 . A C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.520;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:294,0,1375 +chr1 25346140 . A G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.215;DP=132;FS=6.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,33:132:99:779,0,3966 +chr1 25346406 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.464;DP=78;FS=4.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:322,0,2434 +chr1 25347030 . A G 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.533;DP=104;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:793,0,2842 +chr1 25347620 . GA G 694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.683;DP=129;FS=1.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:732,0,4941 +chr1 25347806 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.557;ClippingRankSum=0.717;DP=145;FS=6.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,29:144:99:500,0,4511 +chr1 25350541 . A C 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=1.133;DP=137;FS=0.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=6.90;ReadPosRankSum=2.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,39:137:99:973,0,3675 +chr1 25358893 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-0.078;DP=81;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:609,0,2254 +chr1 25359108 . T C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-0.253;DP=86;FS=4.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:697,0,2216 +chr1 25359141 . T A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=1.704;DP=88;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1031,0,1876 +chr1 25389854 . TA T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=1.573;DP=75;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:342,0,1129 +chr1 25417785 . C T 1054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=30.19;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1083,84,0 +chr1 25424978 . C T 1054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1083,75,0 +chr1 25439222 . T G 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1317,99,0 +chr1 25481781 . A C 1172.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1201,84,0 +chr1 25592973 . C T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=1.280;DP=135;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,37:135:99:848,0,3640 +chr1 25627205 . TCCTGTCATCAACAAGGCGTTGGAATTAAATCCGACTTTAACCCTTCAAATACACAAAACACAAAATTGAACTTGTA T 16580.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=4.041;DP=389;FS=1.149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=29.50;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,378:389:99:16618,1310,0 +chr1 25645866 . T G 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.446;DP=55;FS=5.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:725,0,1273 +chr1 25646354 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.132;DP=80;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:885,0,1873 +chr1 25651759 . C G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.927;DP=82;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:637,0,2133 +chr1 25653905 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-0.247;DP=93;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:614,0,2481 +chr1 25666024 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.214;DP=71;FS=3.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:470,0,1923 +chr1 26262846 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-2.700;DP=29;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:276,0,721 +chr1 26262895 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.414;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:566,0,760 +chr1 26455743 . G A 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr1 26692622 . C A 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 +chr1 26816934 . A T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr1 27831184 . T A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-1.044;DP=79;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:361,0,2335 +chr1 27891168 . T TA 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.137;DP=60;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:410,0,493 +chr1 27892556 . T C 342.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:371,18,0 +chr1 27892560 . T C 342.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:371,18,0 +chr1 27895675 . G C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.057;DP=80;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:388,0,2320 +chr1 27991735 . ACTAGTAAAGGAAGAAAACAACACTGCGATGAAACATGTAAGTTCGACGAGTTTTTTCTTACAACAATACATTTAACAACCAAAATACAGCGATATATTTGACAACGAAAAACTTAATCCACTTCTCAC A 1180.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.667;DP=67;FS=15.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1218,0,17704 +chr1 28030736 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-1.359;DP=168;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=4.09;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:715,0,4945 +chr1 28030833 . G T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=1.421;DP=104;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:784,0,2751 +chr1 28031379 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=1.935;DP=67;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.642;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:230,0,1999 +chr1 28094135 . A T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.858;DP=52;FS=8.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:490,0,1338 +chr1 28109552 . T C 669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:698,48,0 +chr1 28109599 . AAGGTATTGAACAAATGAATAGCACAATAGCAAAACGCAATGTAAAGCACACAATATACGCACACACACTCAGCTTCTTAGGGAGATTTGAGATTGTTTGAGGGGTTGAGGGTGAAAAAGATTCAAATGTGCAAATGCCTGTGAAAC A 919.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=2.266;DP=40;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:957,0,8183 +chr1 28109874 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.211;DP=18;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=32.60;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:31:615,0,31 +chr1 28109904 . A G 507.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.579;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:533,0,1 +chr1 28257387 . A G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.273;DP=17;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:48:553,0,48 +chr1 28257428 . G T 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 +chr1 28257451 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.079;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:37:563,0,37 +chr1 28438398 . G T 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:438,30,0 +chr1 28485525 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr1 28664128 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.523;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:330,0,1227 +chr1 28685405 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-1.437;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:384,0,2592 +chr1 28685406 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-2.253;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:384,0,2592 +chr1 28685521 . A C 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=1.634;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:538,0,2711 +chr1 28686859 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=-1.596;DP=61;FS=6.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=5.54;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:366,0,1667 +chr1 28702455 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-1.193;DP=44;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:246,0,1242 +chr1 28706360 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=2.228;DP=40;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:320,0,1140 +chr1 28706377 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=2.283;DP=35;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:234,0,1059 +chr1 28708999 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.253;DP=39;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:448,0,972 +chr1 28712003 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.957;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:422,0,1713 +chr1 28724489 . C T 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.992;DP=157;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,42:156:99:1018,0,4505 +chr1 28726741 . G A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.283;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,49:193:99:1097,0,5342 +chr1 28729043 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.545;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:432,0,997 +chr1 28732148 . A G 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=-0.434;DP=116;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,42:116:99:1314,0,2545 +chr1 28732526 . G A 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=-0.722;DP=137;FS=2.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:880,0,4454 +chr1 28732589 . C A 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.175;DP=143;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,46:142:99:1145,0,3553 +chr1 28743025 . T C 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.475;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:641,0,901 +chr1 28769312 . T C 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-6.620;DP=306;FS=7.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=4.59;ReadPosRankSum=2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,69:306:99:1432,0,15687 +chr1 28837153 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=1.439;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,35:143:99:788,0,3999 +chr1 28845932 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=1.309;DP=105;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:609,0,3012 +chr1 29020160 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr1 29064095 . T G 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=1.151;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=28.32;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:906,0,222 +chr1 29064156 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:384,0,819 +chr1 29064162 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:384,0,819 +chr1 29064444 . A T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.862;DP=80;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:655,0,2484 +chr1 29064501 . A G 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-1.628;DP=69;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.105;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1130,0,1190 +chr1 29066296 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.637;DP=63;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:291,0,1945 +chr1 29066791 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.221;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:336,0,1461 +chr1 29071086 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.90;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:291,0,141 +chr1 29071110 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=4.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.196;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:482,0,352 +chr1 29076879 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=1.262;DP=40;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:494,0,907 +chr1 29087779 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.349;DP=56;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:263,0,1435 +chr1 29115774 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.779;DP=46;FS=2.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:362,0,1182 +chr1 29163265 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-1.230;DP=60;FS=3.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:854,0,1194 +chr1 29332820 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:248,0,387 +chr1 29333141 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-1.528;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:327,0,392 +chr1 29334156 . G C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=-0.962;DP=36;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:315,0,843 +chr1 29335146 . A G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-0.483;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:512,0,767 +chr1 29427001 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.332;DP=68;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:280,0,2113 +chr1 29427273 . A T 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.976;DP=63;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:789,0,1398 +chr1 29429634 . G A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.020;DP=99;FS=4.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,27:99:99:672,0,2738 +chr1 29595156 . C G 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +chr1 29595276 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.226;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:593,0,340 +chr1 29595480 . G C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.041;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:377,0,389 +chr1 29605843 . T A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:347,0,351 +chr1 29818275 . A C 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.130;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:883,0,1726 +chr1 29885893 . T A 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr1 29910263 . A G 1249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1278,90,0 +chr1 29910418 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=1.180;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:279,0,1090 +chr1 29910479 . T A 1514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1543,111,0 +chr1 29910835 . A C 1745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-1.814;DP=54;FS=1.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=32.33;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,46:54:99:1774,0,108 +chr1 29911022 . T G 2025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=1.026;DP=69;FS=4.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=29.36;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,54:69:99:2054,0,287 +chr1 29911207 . T C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.337;DP=54;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:740,0,1181 +chr1 29911300 . T C 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.266;DP=35;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1078,0,121 +chr1 29911390 . T C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr1 29911782 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,101 +chr1 29911802 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:298,0,166 +chr1 30120456 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.993;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:864,0,924 +chr1 30476916 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:92:248,0,92 +chr1 30741817 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:451,0,237 +chr1 30962889 . TA T 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.845;DP=32;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:438,0,131 +chr1 30963401 . GCAGC G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.340;DP=72;FS=11.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:258,0,3043 +chr1 30963404 . GCCTGAAAATCCAAATCCAATAGTCATATAAAGCAGAGAGTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAATCAAATCCAATATTGTCTGACCTGATGGCACTTA G 837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.074;DP=73;FS=3.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:875,0,2480 +chr1 30963408 . GAAAATCCAAATCCAATAGTCATATAAAGCAGAGAGTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAATCAAATCCAATATTGTCTGACCTGATGGCACTTA G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.238;DP=70;FS=10.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:255,0,3506 +chr1 30966141 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-2.049;DP=60;FS=11.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:346,0,1754 +chr1 30986520 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.254;DP=41;FS=4.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:552,0,927 +chr1 30987754 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.888;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:396,0,1472 +chr1 31050272 . C G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.431;DP=78;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:536,0,2158 +chr1 31051981 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.401;DP=89;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:474,0,2601 +chr1 31108431 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.134;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:284,0,1345 +chr1 31111873 . GGGTACTGATGGCATGTTTTCAGCTGTATATGTTTATAGACTGTTTATTTTTATATTCTGTTGCCTACTGATCGCAGTCATTTTCTCATCA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=2.202;DP=14;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,3871 +chr1 31114082 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.267;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:369,0,982 +chr1 31153567 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=-2.773;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:627,0,421 +chr1 31263534 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-1.642;DP=166;FS=0.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,39:166:99:848,0,4971 +chr1 31319272 . G A 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=-0.826;DP=188;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,51:188:99:1194,0,5234 +chr1 31416275 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.822;DP=65;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:247,0,1875 +chr1 31432169 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.469;DP=80;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:484,0,2160 +chr1 31433244 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.179;DP=44;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.423;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:649,0,879 +chr1 31433422 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.132;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:346,0,1035 +chr1 31433706 . GA G 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.116;DP=44;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.271;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:678,0,161 +chr1 31471585 . C T 618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:647,45,0 +chr1 31471678 . G T 560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:589,42,0 +chr1 31926459 . C T 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 +chr1 32016908 . T C 674.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:703,48,0 +chr1 32052178 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr1 32052197 . A C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +chr1 32052280 . G T 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr1 32997892 . G A 1751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1780,129,0 +chr1 32998361 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:433,33,0 +chr1 33020913 . AT A 1990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=1.470;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=28.44;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,65:66:99:2028,193,0 +chr1 33021500 . C CA 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:246,23,0 +chr1 33024192 . AT A 216.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:254,24,0 +chr1 33024205 . A G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr1 33028405 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.888;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:285,0,930 +chr1 33029043 . T C 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=1.319;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=32.15;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:1025,0,134 +chr1 33029284 . T C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.889;DP=24;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:730,0,178 +chr1 33201395 . A AT 1233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=1.145;DP=82;FS=21.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=15.05;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,50:72:99:1292,0,375 +chr1 33201657 . G T 4148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=1.138;DP=91;FS=7.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,59:90:99:4177,0,1521 +chr1 33330278 . G A 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 +chr1 33331008 . C A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.548;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:93:654,0,93 +chr1 33882732 . C G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,213 +chr1 34009064 . G C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.140;DP=28;FS=7.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:837,0,128 +chr1 34045797 . T A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.962;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.321;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:501,0,210 +chr1 34046447 . A C 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.020;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=27.45;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:989,0,192 +chr1 34046964 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:232,0,61 +chr1 34226983 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.281;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:509,0,160 +chr1 34227681 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,123 +chr1 34309646 . G A 777.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.460;DP=25;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=31.08;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:12:805,0,12 +chr1 34328084 . A T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.167;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:664,0,146 +chr1 34328865 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:94:262,0,94 +chr1 34331233 . T C 217.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:246,0,24 +chr1 34332432 . A T 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 +chr1 34339237 . A AT 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.597;DP=34;FS=5.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:463,0,542 +chr1 34340639 . T C 3725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=-0.205;DP=115;FS=27.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,94:114:99:3754,0,373 +chr1 34343965 . A T 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:236,0,24 +chr1 34888395 . T A 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 +chr1 35120671 . T A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=-1.496;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:263,0,1434 +chr1 35133331 . T C 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 +chr1 35133338 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:251,0,53 +chr1 35190239 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr1 35190245 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:258,18,0 +chr1 35316726 . A AG 313.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:351,29,0 +chr1 35321558 . T A 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:805,54,0 +chr1 35322087 . CT C 278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:316,21,0 +chr1 35361886 . GA G 262.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:300,30,0 +chr1 35520030 . T TG 2141.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2179,150,0 +chr1 35605250 . GA G 572.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.413;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:610,60,0 +chr1 35605801 . G C 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-2.387;DP=89;FS=4.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=33.96;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,76:89:99:3051,0,128 +chr1 35606084 . A G 3619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=1.072;DP=110;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=32.91;ReadPosRankSum=-1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,96:110:59:3648,0,59 +chr1 35623643 . G A 3023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.811;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=27.49;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,81:110:99:3052,0,697 +chr1 35726818 . CA C 460.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:35:498,35,0 +chr1 35728200 . TC T 337.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=-0.913;DP=19;FS=3.039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:2:373,2,0 +chr1 35728243 . G A 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.350;DP=37;FS=1.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=28.86;ReadPosRankSum=3.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1096,0,193 +chr1 35729360 . G A 1883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.113;DP=73;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=25.81;ReadPosRankSum=2.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,50:73:99:1912,0,646 +chr1 35730903 . C CT 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.646;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:520,0,231 +chr1 35734858 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-1.064;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:384,0,335 +chr1 35740437 . T C 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.575;DP=84;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=24.29;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,57:84:99:2069,0,700 +chr1 35826708 . T C 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.077;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1762,0,537 +chr1 35827161 . G A 2392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=1.126;DP=78;FS=10.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.129;QD=30.68;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,64:78:99:2421,0,229 +chr1 35827520 . G A 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.054;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,40:52:99:1492,0,261 +chr1 35827584 . T C 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-1.201;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=27.11;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,53:69:99:1899,0,277 +chr1 35827717 . A G 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.467;DP=55;FS=19.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1068,0,800 +chr1 35854289 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr1 35854496 . A G 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:591,42,0 +chr1 35856404 . G A 755.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:784,57,0 +chr1 36056873 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.888;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=29.27;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:438,0,52 +chr1 36057015 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.271;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:360,0,839 +chr1 36057269 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.831;DP=14;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=17.63;ReadPosRankSum=2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:275,0,174 +chr1 36145018 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.022;DP=35;FS=1.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:991,0,105 +chr1 36146954 . A AC 1044.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.192;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.259;QD=24.87;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1082,0,180 +chr1 36147131 . T A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.457;DP=31;FS=9.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=26.22;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:841,0,261 +chr1 36147588 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.879;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:564,0,336 +chr1 36410062 . C CA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.489;DP=27;FS=12.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.66;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:352,0,386 +chr1 36410114 . C T 1288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.911;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1317,0,452 +chr1 36410719 . C A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-1.302;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:499,0,109 +chr1 36411386 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,264 +chr1 36458002 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.567;DP=21;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.746;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:67:654,0,67 +chr1 36463337 . G T 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.829;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:31:881,31,0 +chr1 36471462 . C A 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:658,48,0 +chr1 36620282 . C T 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-0.571;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:1882,0,330 +chr1 36620737 . G A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.016;DP=37;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:858,0,441 +chr1 36620840 . C CA 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=29.36;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:86:507,0,86 +chr1 36643924 . C A 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 +chr1 37046132 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:533,39,0 +chr1 37062205 . C T 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:592,42,0 +chr1 37062235 . G A 1358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1387,102,0 +chr1 37209120 . A G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.813;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:631,0,982 +chr1 37422173 . GGGTGAGGAAATTCTTATTAATATTACATGTAGTCATGAAAAATTGTAAGTGTTACTATTATTGTCATTTTTTCAGTA G 601.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.868;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:639,0,351 +chr1 37422443 . C T 1540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.150;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,41:55:99:1569,0,643 +chr1 37422501 . C T 815.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.927;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=31.38;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:22:844,22,0 +chr1 37429154 . G A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 +chr1 37429163 . G A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:529,36,0 +chr1 37484906 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=1.534;DP=56;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:477,0,1382 +chr1 37484939 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.285;DP=53;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:353,0,1385 +chr1 37535055 . A C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 +chr1 37586600 . G A 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +chr1 37602403 . G T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.237;DP=21;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=27.85;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:645,0,103 +chr1 37828196 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.286;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:335,0,368 +chr1 38579694 . TCTAGAAGAGAGAGAGAAAATTAAAATAAAAAACTAAGAAAAATAGTCACACAAGACTTCAGAAGCACATTTGCACGCTACTCAC T 12651.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-0.743;DP=293;FS=4.301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=24.95;ReadPosRankSum=-2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,288:293:99:12689,947,0 +chr1 38827438 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,293 +chr1 39003945 . GA G 2643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.622;DP=195;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,113:180:99:2681,0,1443 +chr1 39020253 . G A 5862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-0.546;DP=416;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,168:416:99:5891,0,8239 +chr1 39063802 . G T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=24.29;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:344,0,139 +chr1 39159748 . A G 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.964;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:549,0,581 +chr1 39160022 . C T 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=-1.573;DP=44;FS=5.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=23.90;ReadPosRankSum=-1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1080,0,387 +chr1 40063026 . T C 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.765;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1112,0,1262 +chr1 40134753 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.543;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:647,0,1846 +chr1 40136753 . C T 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.736;DP=88;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:1433,0,1618 +chr1 40137419 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-1.387;DP=75;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,29:75:99:991,0,1537 +chr1 40137659 . C T 1752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.440;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1781,0,1821 +chr1 40140364 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.367;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:655,0,763 +chr1 40140503 . A T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.517;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:534,0,727 +chr1 40140905 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=1.950;DP=49;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:759,0,2036 +chr1 40140910 . T C 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.917;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:759,0,2050 +chr1 40141189 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.099;DP=44;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:549,0,2113 +chr1 40141191 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.548;DP=43;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:549,0,2122 +chr1 40141493 . TA T 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.264;DP=55;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:693,0,1008 +chr1 40175983 . G C 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.461;DP=36;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:442,0,804 +chr1 40232634 . G GT 703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.034;DP=43;FS=9.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:754,0,127 +chr1 40233064 . T A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-1.370;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=30.44;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:64:637,0,64 +chr1 40234391 . T A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr1 40234478 . A T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr1 40242508 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.432;DP=28;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:767,0,216 +chr1 40243335 . AG A 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,575 +chr1 40244399 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=20.83;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:62:299,0,62 +chr1 40244683 . A G 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.349;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:89:749,0,89 +chr1 40247893 . C A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.116;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=27.11;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:41:571,0,41 +chr1 40248513 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:399,0,193 +chr1 40248658 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr1 40248789 . G A 746.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:775,54,0 +chr1 40248990 . G A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr1 40249239 . G T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr1 40249357 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:307,0,55 +chr1 40249882 . CT C 243.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:281,27,0 +chr1 40250124 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.52;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:58:386,0,58 +chr1 40250158 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=30.52;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:30:425,0,30 +chr1 40250245 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=24.06;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,129 +chr1 40250496 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:391,0,173 +chr1 40251424 . CACCTGAGAACAATCCACACGCAATAAATAATGAGAAATGGAACAAATATCACATGATTTAAATGAAGGCGACCTGAGAGATTTAATTAACTTCAGCTTAAAAATCTCATGCTGAAGTTTATGAATAGAGTTTGTT C 4648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=2.909;DP=137;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=33.93;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,120:137:99:4686,0,2101 +chr1 40252063 . G A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr1 40252490 . T C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 +chr1 40262191 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.104;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:401,0,498 +chr1 40262584 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.160;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.139;QD=20.48;ReadPosRankSum=-2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1052,0,677 +chr1 40263278 . C T 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.414;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=28.02;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1093,0,275 +chr1 40264186 . A AT 553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:51:591,51,0 +chr1 40264257 . T C 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.893;DP=32;FS=4.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:909,0,118 +chr1 40269819 . A C 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=1.667;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:838,0,154 +chr1 40270139 . C T 763.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.698;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:1:789,0,1 +chr1 40339454 . C T 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:835,63,0 +chr1 40339519 . T A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.690;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=25.10;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:480,0,112 +chr1 40339646 . G C 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:626,48,0 +chr1 40344322 . A G 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.220;DP=66;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,49:66:99:1857,0,406 +chr1 40346153 . T C 214.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:243,0,25 +chr1 40372054 . T C 2886.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2915,205,0 +chr1 40372164 . A T 551.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:580,39,0 +chr1 40372199 . C A 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 +chr1 40389291 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.065;DP=31;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:884,0,256 +chr1 40395083 . T A 7100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.178;DP=254;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=27.96;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,191:254:99:7129,0,1388 +chr1 40395103 . A C 7333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=-0.999;DP=251;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=29.22;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,189:251:99:7362,0,1428 +chr1 40395343 . A G 5916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=1.365;DP=225;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=26.30;ReadPosRankSum=-1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,162:225:99:5945,0,1529 +chr1 40395378 . G C 5523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.439;DP=209;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,147:209:99:5552,0,1555 +chr1 40401076 . C T 7165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=1.357;DP=230;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=31.16;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,174:230:99:7194,0,3164 +chr1 40401077 . A G 7165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=1.248;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,170:226:99:7194,0,3155 +chr1 40401398 . T A 5962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.384;DP=203;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,155:203:99:5991,0,1039 +chr1 40401553 . A G 4515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-1.003;DP=138;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=32.72;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,114:138:99:4544,0,383 +chr1 40401681 . C CTA 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=2.704;DP=48;FS=9.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=10.60;ReadPosRankSum=-3.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:546,0,1060 +chr1 40401695 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-1.466;DP=28;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=7.81;ReadPosRankSum=-2.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:247,0,712 +chr1 40401769 . AT A 904.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=-0.705;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:942,0,271 +chr1 40407783 . C T 3208.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=6.088;DP=169;FS=13.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,99:162:99:3237,0,2075 +chr1 40417400 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.092;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=20.06;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:289,0,242 +chr1 40420082 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=23.29;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,124 +chr1 40420726 . C A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=2.729;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=26.49;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:452,0,122 +chr1 40421131 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.820;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=33.57;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:36:599,0,36 +chr1 40421681 . T C 243.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:8:271,0,8 +chr1 40437080 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.718;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:407,0,131 +chr1 40447768 . CAG C 1592.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-1.509;DP=57;FS=8.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,40:57:99:1630,0,571 +chr1 40448658 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.792;QD=14.91;ReadPosRankSum=-2.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:237,0,262 +chr1 40453378 . T C 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=1.070;DP=70;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=28.21;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,54:70:99:2003,0,331 +chr1 40453687 . G A 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.193;DP=76;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.959;QD=30.31;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,63:76:99:2332,0,195 +chr1 40453803 . C T 1942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=-1.816;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=32.38;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,52:60:41:1971,0,41 +chr1 40455111 . T G 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.981;DP=59;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,40:59:99:1508,0,558 +chr1 40458817 . G A 2166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.799;DP=68;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=31.86;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,57:68:99:2195,0,153 +chr1 40500393 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.733;DP=48;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:459,0,1152 +chr1 40504789 . C A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.339;DP=40;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:830,0,565 +chr1 40505231 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=22.99;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:488,0,332 +chr1 40505340 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.358;DP=35;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:358,0,1829 +chr1 40509341 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.610;DP=36;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.310;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:736,0,500 +chr1 40509407 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.159;DP=47;FS=8.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:289,0,1356 +chr1 40509695 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.564;DP=112;FS=10.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,24:112:99:455,0,3378 +chr1 40509863 . G A 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.854;DP=125;FS=0.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:2114,0,2219 +chr1 40510310 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=-1.552;DP=84;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:1008,0,1334 +chr1 40512735 . GCTGCAGGAGAGAATGATTATGTGAATGTATCTGGTCTAACTTCAAGAGTCAGTGAAGGAAACACTAGTTTAGGTTTAC G 3805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=3.361;DP=93;FS=2.048;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=30.07;ReadPosRankSum=-2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,89:93:99:3843,320,0 +chr1 40516482 . C T 1983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.266;DP=130;FS=8.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:2012,0,2473 +chr1 40517990 . A T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr1 40524868 . A G 3029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.389;DP=110;FS=8.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=27.54;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,87:109:99:3058,0,354 +chr1 40525203 . C CA 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.105;DP=66;FS=5.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:645,0,904 +chr1 40602179 . C CA 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-1.156;DP=22;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:385,0,131 +chr1 40602660 . T A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,144 +chr1 40602800 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=2.180;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:427,0,84 +chr1 40603383 . G T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=-1.172;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:382,0,344 +chr1 40603566 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=1.085;DP=29;FS=8.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:409,0,572 +chr1 40603983 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.276;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.174;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:517,0,269 +chr1 40604493 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.042;DP=50;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:387,0,1358 +chr1 40604602 . C A 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.118;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:836,0,1486 +chr1 40604823 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-0.671;DP=52;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:719,0,1035 +chr1 40619547 . T G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-2.062;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.222;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:604,0,454 +chr1 40633950 . G T 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 +chr1 40659150 . A AG 1023.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=421;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:67:1061,67,0 +chr1 40727026 . C CAA 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=-0.271;DP=35;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:528,0,360 +chr1 40727161 . C G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.632;DP=46;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:718,0,861 +chr1 40727502 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.115;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:480,0,923 +chr1 40728215 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=-2.075;DP=36;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=12.10;ReadPosRankSum=2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:464,0,1372 +chr1 40728480 . GCA G 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.247;DP=53;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:419,0,1326 +chr1 40728684 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-0.940;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=32.85;ReadPosRankSum=2.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:61:718,0,61 +chr1 40728752 . C G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=-1.043;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:452,0,687 +chr1 40728827 . GA G 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-0.070;DP=24;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.66;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:605,0,483 +chr1 40729097 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.224;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:608,0,554 +chr1 40729982 . C A 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.371;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:72:99:982,0,1351 +chr1 40733116 . C T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=1.746;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:1045,0,694 +chr1 40803570 . G A 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=1.747;DP=54;FS=4.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.734;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,40:54:99:1523,0,324 +chr1 40960281 . C T 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=1.286;DP=56;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1075,0,930 +chr1 40962124 . A AT 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.735;DP=49;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:521,0,917 +chr1 40963770 . G T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:263,0,391 +chr1 40965968 . G A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=1.144;DP=109;FS=8.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,36:109:99:1071,0,5572 +chr1 40978183 . C A 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:430,36,0 +chr1 40983712 . G A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.204;DP=145;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,36:145:99:761,0,4198 +chr1 40994065 . G A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.252;DP=147;FS=0.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:1142,0,6481 +chr1 40994113 . G C 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.887;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,34:130:99:819,0,3742 +chr1 41024730 . A G 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.547;DP=128;FS=5.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1847,0,2511 +chr1 41073574 . T G 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.671;ClippingRankSum=-0.177;DP=107;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,40:107:99:1399,0,2124 +chr1 41077996 . A G 6303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.361;DP=181;FS=6.009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=34.83;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,160:181:26:6332,26,0 +chr1 41078153 . A G 3864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.548;DP=117;FS=3.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=33.03;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,99:117:99:3893,0,214 +chr1 41078195 . G T 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=2.167;DP=125;FS=3.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,36:125:99:909,0,3411 +chr1 41078369 . C G 1852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=1.000;DP=63;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=29.41;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,49:63:99:1881,0,271 +chr1 41078381 . T C 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.149;DP=47;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=30.82;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,38:47:99:1477,0,158 +chr1 41194246 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=2.078;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:348,0,447 +chr1 41513217 . T A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-1.603;DP=83;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:431,0,2439 +chr1 41513229 . A T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-1.045;DP=99;FS=7.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,31:99:99:866,0,2536 +chr1 41521646 . C T 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-1.757;DP=66;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:1187,0,1073 +chr1 41523302 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr1 41595809 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.215;DP=30;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:390,0,683 +chr1 41676359 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:287,0,250 +chr1 41678467 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.434;DP=54;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:336,0,1465 +chr1 41697137 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-1.019;DP=75;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:1459,0,1141 +chr1 41701572 . G C 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.938;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1143,0,1124 +chr1 41711539 . G A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.494;DP=55;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1197,0,715 +chr1 41711566 . G C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.296;DP=68;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:278,0,2004 +chr1 41714475 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-1.279;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:425,0,802 +chr1 41736314 . T C 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.255;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:718,0,1985 +chr1 41736323 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.775;DP=43;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:718,0,1993 +chr1 41862187 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.28;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,214 +chr1 41913737 . G A 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:393,27,0 +chr1 41916635 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.693;DP=45;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:800,0,1363 +chr1 41916714 . C T 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.551;DP=74;FS=7.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1155,0,1485 +chr1 41916841 . T A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.822;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:675,0,4936 +chr1 41982868 . GAGGTAGAAATCTGCTTTCCTCAATCTCTGAGCTCATTCTAAAACTAATAATGTATCCAGAATCCTGACTGTGTTTTGCTTTGAATC G 934.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=1.043;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=31.76;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:92:972,0,92 +chr1 41994722 . T C 3676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3705,265,0 +chr1 41994743 . G C 3403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3432,246,0 +chr1 42073492 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:234,0,163 +chr1 42153232 . GA G 249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:287,31,0 +chr1 42354514 . A T 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:401,27,0 +chr1 42354522 . T A 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:401,27,0 +chr1 42773614 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.705;DP=47;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:657,0,916 +chr1 42857344 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-0.513;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:299,0,1791 +chr1 42857425 . C T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=-0.108;DP=95;FS=4.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,30:95:99:716,0,2337 +chr1 43364646 . T C 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.693;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:978,0,1793 +chr1 43373848 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.050;DP=91;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:422,0,2633 +chr1 43417536 . G C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.812;DP=128;FS=1.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,33:128:99:751,0,3462 +chr1 43418003 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:428,0,828 +chr1 43418081 . AT A 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=-0.330;DP=37;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:242,0,830 +chr1 44073932 . C A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.651;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:576,0,893 +chr1 44074129 . T G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.322;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:504,0,1701 +chr1 44077097 . T C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr1 44380783 . C T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.518;DP=38;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:677,0,685 +chr1 44403802 . T C 429.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:4:456,4,0 +chr1 44404311 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.052;DP=26;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:375,0,518 +chr1 44404430 . G GT 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.099;DP=35;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:380,0,402 +chr1 44404567 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.469;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.29;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:630,0,864 +chr1 44404579 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.244;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:630,0,864 +chr1 44424166 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-1.160;DP=46;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:720,0,1749 +chr1 44424169 . T A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-0.782;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:720,0,1743 +chr1 44428730 . G A 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.759;DP=62;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:1278,0,845 +chr1 44621859 . G T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=-0.679;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:916,0,1249 +chr1 44622082 . C T 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.268;DP=86;FS=2.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:1438,0,1521 +chr1 44622356 . CT C 2834.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.487;DP=187;FS=6.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,101:186:99:2872,0,4857 +chr1 44622368 . G A 1176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.081;DP=195;FS=8.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,53:195:99:1205,0,9216 +chr1 44622523 . A G 3351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-2.613;DP=186;FS=6.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,93:185:99:3380,0,3389 +chr1 44622557 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.557;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,43:199:99:815,0,6351 +chr1 44622575 . A G 3412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-0.439;DP=197;FS=9.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=17.32;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:197:99:3441,0,3427 +chr1 44622731 . T C 3337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.446;DP=192;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,94:192:99:3366,0,3557 +chr1 44622888 . T A 1806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.678;DP=134;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:2482,0,2236 +chr1 44623000 . A G 3272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=1.793;DP=91;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=29.00;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,62:91:99:3301,0,597 +chr1 44623048 . C A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.660;DP=59;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.59;ReadPosRankSum=-4.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1007,0,1136 +chr1 44623103 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=2.978;DP=74;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:433,0,2943 +chr1 44623263 . T C 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-1.409;DP=65;FS=5.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1391,0,910 +chr1 44623320 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=1.095;DP=132;FS=8.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,20:132:99:237,0,4528 +chr1 44623506 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.495;DP=167;FS=2.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,37:167:99:746,0,6200 +chr1 44623514 . A C 5912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.266;DP=173;FS=11.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=34.18;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,148:173:99:5941,0,256 +chr1 44623691 . C G 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.915;DP=201;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,39:201:99:634,0,6197 +chr1 44645259 . C T 3025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.609;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,97:170:99:3054,0,2476 +chr1 44766683 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr1 44769284 . C T 920.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:949,66,0 +chr1 44776753 . G A 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1020,72,0 +chr1 44787639 . T TAA 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.290;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:359,0,113 +chr1 44846052 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-0.015;DP=80;FS=0.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1033,0,1653 +chr1 44878145 . G A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-1.734;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:505,0,780 +chr1 44996202 . C T 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.961;DP=56;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:889,0,1000 +chr1 45000167 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.551;DP=52;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:856,0,1317 +chr1 45002644 . C T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=1.697;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1135,0,890 +chr1 45014456 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-0.134;DP=43;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:752,0,678 +chr1 45015187 . C T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.653;DP=54;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:800,0,969 +chr1 45021299 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.270;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:545,0,507 +chr1 45026248 . T C 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-1.919;DP=87;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:1328,0,1742 +chr1 45027162 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=2.641;DP=76;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1184,0,1473 +chr1 45027217 . C T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.144;DP=79;FS=6.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:976,0,1728 +chr1 45030920 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=4.674;DP=76;FS=5.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=3.08;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:262,0,3079 +chr1 45030971 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=4.365;DP=86;FS=3.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:640,0,2302 +chr1 45037892 . C A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.133;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:603,0,518 +chr1 45040175 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-1.538;DP=64;FS=2.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1033,0,1087 +chr1 45040416 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.303;DP=65;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:872,0,1378 +chr1 45047767 . T A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:397,0,447 +chr1 45059434 . C A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.714;DP=48;FS=2.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:774,0,875 +chr1 45059614 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.611;DP=27;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1516 +chr1 45059617 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.583;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:237,0,1516 +chr1 45107817 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-1.931;DP=68;FS=7.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:453,0,1777 +chr1 45108507 . C A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=1.018;DP=54;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:842,0,1077 +chr1 45108720 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=1.606;DP=32;FS=6.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:267,0,866 +chr1 45109191 . C T 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=1.105;DP=97;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:1309,0,1968 +chr1 45133763 . G C 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=1.146;DP=77;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1386,0,1378 +chr1 45165097 . TCTGAGCAGTAATAACAGGTTATAAATGCATTACATGGTTGCATGTGCCTCTAAAGCATTTGCACACTTTAGGACCATAGTGATATGGAATGATTTCTGCTTAAAGATGCATGTTAACACACAGAACAAAATACTATCTGAC T 2364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.229;DP=224;FS=7.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,85:213:99:2402,0,12478 +chr1 45165100 . GA G 3458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.905;DP=210;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,110:203:99:3496,0,12272 +chr1 45165102 . GCAGTAATAACAGGTTATAAATGCATTACATGGTTGCATGTGCCTCTAAAGCATTTGCACACTTTAGGACCATAGTGATATGGAATGATTTCTGCTTAAAGATGCATGTTAACACACAGAACAAAATACTATCTGACCTGC G 3856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.974;DP=225;FS=7.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,112:219:99:3894,0,12277 +chr1 45165264 . G T 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=-0.249;DP=198;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,102:198:99:3315,0,3293 +chr1 45167248 . C CGGA 577.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:615,51,0 +chr1 45256140 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=27.25;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:328,0,51 +chr1 45256367 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=23.71;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:83:289,0,83 +chr1 45257811 . G T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:90:362,0,90 +chr1 45278144 . G T 2985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=-0.560;DP=130;FS=6.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,82:129:99:3014,0,1667 +chr1 45278390 . G T 7342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.732;DP=266;FS=5.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=27.60;ReadPosRankSum=-1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,191:265:99:7371,0,1861 +chr1 45292056 . A T 351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:380,30,0 +chr1 45308313 . C T 1564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.864;DP=96;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:1593,0,2825 +chr1 45321657 . T A 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=1.196;DP=78;FS=1.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:1270,0,1419 +chr1 45458553 . G T 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-0.507;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1120,0,925 +chr1 45605706 . C A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr1 45797991 . AAGGTAGGACAAATAATTCCAGGAGTATGTTTGTTTAGATGTGTGTGTTTTACTAATGTAATCCTATTCTCCT A 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=10;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.27;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:300,0,1410 +chr1 46040937 . T TA 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=3.629;DP=120;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=6.90;ReadPosRankSum=-4.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:865,0,974 +chr1 46121436 . A ATG 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.610;DP=51;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:643,0,770 +chr1 46134953 . G A 2802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.584;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:2831,0,2830 +chr1 46168618 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,650 +chr1 46169412 . G T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.053;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:304,0,292 +chr1 46169475 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:379,0,615 +chr1 46170195 . GA G 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-0.392;DP=45;FS=6.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:612,0,347 +chr1 46214904 . TA T 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.568;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:411,0,380 +chr1 46305238 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=2.599;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:243,0,846 +chr1 46306148 . A T 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.250;DP=61;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:725,0,1456 +chr1 46327601 . C CA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.635;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.904;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:247,0,529 +chr1 46330096 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:250,0,489 +chr1 46339228 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=2.887;DP=55;FS=14.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1031,0,998 +chr1 46346276 . AAC A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.769;DP=42;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:267,0,983 +chr1 46348061 . T TA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=1.099;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:247,0,463 +chr1 46348354 . AAT A 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=1.354;DP=35;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:256,0,992 +chr1 46349986 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:313,0,139 +chr1 46363162 . C G 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-1.398;DP=42;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=16.04;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:702,0,708 +chr1 46423860 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-4.204;DP=94;FS=5.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:286,0,2960 +chr1 46507012 . TGGTGAGTTTTCCAGACAGTTGTTTTTTATTTGATGTGAGCTATTATTGCTAGACGTTGATGTGCTTCAGCTATAATAATTATATTTGTGCA T 5089.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.422;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:5127,441,0 +chr1 46920483 . T A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-0.761;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:441,0,1317 +chr1 47113791 . T C 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=2.098;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=24.06;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1183,0,699 +chr1 47113970 . C T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.658;DP=78;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=18.93;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,44:78:99:1505,0,2045 +chr1 47151192 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:32:448,0,32 +chr1 47151352 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.919;DP=17;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:377,0,177 +chr1 47151582 . G C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.867;DP=21;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:343,0,176 +chr1 47207824 . GTT G 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.276;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:484,0,794 +chr1 47354358 . TCA T 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.279;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=2.00;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,28:135:99:388,0,4672 +chr1 47354362 . A ACG 995.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=1.121;DP=155;FS=4.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,46:139:99:1033,0,4207 +chr1 47494340 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.913;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:306,0,369 +chr1 47504228 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-1.295;DP=61;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:392,0,1696 +chr1 47513746 . TG T 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=-1.116;DP=44;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:381,0,708 +chr1 47522389 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-3.439;DP=57;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:336,0,1610 +chr1 47631720 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.388;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:291,0,552 +chr1 47631743 . A C 716.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-2.009;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=32.58;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:22:745,0,22 +chr1 47653331 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.320;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:409,0,334 +chr1 47657760 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.461;DP=34;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:462,0,766 +chr1 47658965 . C G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=2.735;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:681,0,652 +chr1 47977140 . G A 2078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=-0.603;DP=177;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,60:169:99:2107,0,3832 +chr1 48180022 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.883;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:229,0,303 +chr1 49801609 . T TA 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.270;DP=33;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:536,0,423 +chr1 50419748 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=2.858;DP=347;FS=20.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=2.11;ReadPosRankSum=3.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,59:346:99:760,0,11203 +chr1 50419797 . TCCTGAGAAGAAATAAATAATAATACTAAGTGATAAATAACACTAAAGTGTGCACACATGGATTACACAATACTTA T 13103.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.925;DP=341;FS=4.115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=34.11;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,327:332:99:13141,958,0 +chr1 50422314 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-1.290;DP=211;FS=7.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,34:211:99:404,0,6834 +chr1 50422681 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.902;DP=250;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,41:250:99:508,0,8033 +chr1 50692298 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=1.220;DP=22;FS=5.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,370 +chr1 50695445 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:346,0,408 +chr1 50696471 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-1.002;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:324,0,367 +chr1 50696472 . T A 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.766;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:395,0,361 +chr1 50696675 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=1.765;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:471,0,536 +chr1 50777351 . A G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.024;DP=44;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:836,0,678 +chr1 50811072 . G A 1997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=1.741;DP=300;FS=12.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=6.66;ReadPosRankSum=2.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,84:300:99:2026,0,8065 +chr1 50824734 . T A 3107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=-1.213;DP=387;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,130:387:99:3136,0,12217 +chr1 51010355 . T C 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.442;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:774,0,3032 +chr1 51010371 . C T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.039;DP=117;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,30:117:99:713,0,3365 +chr1 51023264 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.745;DP=88;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:586,0,2422 +chr1 51028924 . C G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=1.716;DP=98;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=4.58;ReadPosRankSum=-2.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:477,0,2917 +chr1 51034953 . T A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.417;DP=61;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:713,0,1411 +chr1 51053389 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.164;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:747,0,738 +chr1 51064595 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.246;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:416,0,488 +chr1 51065278 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.109;DP=33;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:257,0,994 +chr1 51065287 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.230;DP=29;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:482,0,533 +chr1 51102937 . G A 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.252;DP=82;FS=1.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:1256,0,1506 +chr1 51102952 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.556;DP=82;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1208,0,1571 +chr1 51115657 . C A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=1.767;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:312,0,1888 +chr1 51154005 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,330 +chr1 51199066 . G T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:263,0,158 +chr1 51207367 . ATC A 1360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.931;DP=166;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,52:161:99:1398,0,7807 +chr1 51207368 . TCTAGAAAGAATGGCAGAAATACCTCAGCCTGTGTAGTTAATCATTTCTAGGCCTCCATGAAGTGAATTTACTTATTTGCATACTTAC T 3574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=1.525;DP=167;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=21.41;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,104:163:99:3612,0,5497 +chr1 51207371 . AGAAAGAATGGCAGAAATACCTCAGCCTGTGTAGTTAATCATTTCTAGGCCTCCATGAAGTGAATTTACTTATTTGCATACTTACG A 1337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-1.044;DP=165;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,52:164:99:1375,0,7807 +chr1 51209957 . ACTGCATGGGGAGCATGATTAATTATACTCTTTTAAAGTACATTGTATTTCATAGACCTCACGAGGGATTGTTGTTTTAC A 4979.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.538;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=30.31;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,115:120:99:5017,331,0 +chr1 51434106 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-1.771;DP=39;FS=3.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:469,0,893 +chr1 51438459 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=1.018;DP=64;FS=8.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:324,0,1765 +chr1 51489289 . G C 2851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.995;DP=326;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,100:307:99:2880,0,12532 +chr1 51522532 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.786;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:315,0,947 +chr1 51525693 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.897;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:336,0,814 +chr1 51526095 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.817;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:321,0,1531 +chr1 51531177 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=-0.361;DP=70;FS=2.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:482,0,1685 +chr1 51533364 . GCCTTAAACAAATAAATAAATAAAACACACACAATCACATGTAAAAGCCCAGTGAATACACACACTGGACACAGCAGAATGGGTTTTA G 2100.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=2.354;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=26.27;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:2138,179,0 +chr1 51557439 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.518;DP=27;FS=5.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:394,0,563 +chr1 51562678 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.092;DP=67;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:378,0,1756 +chr1 51563293 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-1.616;DP=101;FS=4.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:342,0,2904 +chr1 51565440 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.472;DP=71;FS=5.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:305,0,2145 +chr1 51566049 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.933;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:351,0,2857 +chr1 51567468 . A C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.101;DP=96;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:346,0,2844 +chr1 51616491 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:327,0,335 +chr1 51617740 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.478;DP=60;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,11:60:99:328,0,3641 +chr1 51644689 . A T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.350;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:239,0,1513 +chr1 51650059 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.039;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:546,0,858 +chr1 51650438 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.559;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:307,0,1065 +chr1 51651441 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.313;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:392,0,1201 +chr1 51666042 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=-0.048;DP=44;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:683,0,1973 +chr1 51706654 . G C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=1.465;DP=30;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:443,0,553 +chr1 51708499 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.330;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:292,0,756 +chr1 51717469 . G A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.033;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:812,0,1715 +chr1 51731402 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.261;DP=80;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:433,0,1971 +chr1 51734550 . A G 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.189;DP=72;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:806,0,1476 +chr1 51737856 . G T 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-1.317;DP=74;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:634,0,1763 +chr1 51739910 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=1.733;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:381,0,354 +chr1 51756358 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=1.218;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:318,0,677 +chr1 51774937 . G A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.460;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:535,0,478 +chr1 51884761 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.91;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,222 +chr1 51886915 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.154;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,237 +chr1 51916414 . C CA 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.745;DP=198;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,55:191:99:781,0,3668 +chr1 51925812 . G A 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.795;DP=246;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,69:245:99:1637,0,6626 +chr1 51933991 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.756;DP=140;FS=4.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,41:140:99:1023,0,3826 +chr1 51935102 . CT C 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.985;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:735,0,400 +chr1 51935361 . G T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.145;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:644,0,1329 +chr1 51935695 . T TA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.152;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:323,0,1229 +chr1 51936492 . GT G 2961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=-1.954;DP=166;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.84;ReadPosRankSum=2.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,121:159:99:2999,0,408 +chr1 51936862 . T TG 372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.645;DP=34;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=10.96;ReadPosRankSum=-2.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:410,0,651 +chr1 51958403 . A C 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-2.266;DP=55;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1051,0,790 +chr1 51958498 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.061;DP=79;FS=2.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:523,0,2219 +chr1 51958627 . G A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=2.279;DP=68;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=15.32;ReadPosRankSum=-2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1070,0,1241 +chr1 51968133 . C T 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=-0.515;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=22.15;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,40:57:99:1313,0,471 +chr1 51991561 . C CT 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-3.485;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=5.26;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,39:125:99:700,0,2294 +chr1 52033416 . C A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.107;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,28:103:99:642,0,3040 +chr1 52052606 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:351,0,563 +chr1 52066985 . C G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-1.172;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,33:119:99:687,0,4397 +chr1 52067129 . A G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.391;DP=76;FS=1.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:931,0,1765 +chr1 52067543 . G A 2377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.830;DP=195;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,72:195:99:2406,0,4148 +chr1 52068219 . G A 1598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.747;DP=125;FS=5.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,47:124:99:1627,0,2712 +chr1 52068274 . C CA 448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=2.071;DP=101;FS=13.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,29:94:99:486,0,1716 +chr1 52115210 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.479;DP=95;FS=10.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:369,0,2793 +chr1 52127656 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.144;DP=24;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:432,0,395 +chr1 52127687 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:347,0,395 +chr1 52206871 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 +chr1 52207408 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.563;DP=137;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,28:137:99:548,0,4158 +chr1 52209801 . G A 250.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:279,0,20 +chr1 52210482 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.854;DP=156;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,32:156:99:598,0,4887 +chr1 52215884 . A C 3867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.363;DP=590;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:430,160:590:99:3896,0,17086 +chr1 52601058 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.419;DP=66;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:240,0,3563 +chr1 52601182 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.206;DP=44;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:349,0,1180 +chr1 52601529 . T C 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:316,24,0 +chr1 52601965 . G A 316.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=31.69;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:345,0,15 +chr1 52604287 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.290;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:666,0,703 +chr1 52604560 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.776;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:270,0,1821 +chr1 52606205 . C CT 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.921;DP=110;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:339,0,2603 +chr1 52606210 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=-1.013;DP=103;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:332,0,2603 +chr1 52610737 . C A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.144;DP=101;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:719,0,2630 +chr1 52619130 . G A 2061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.355;DP=171;FS=9.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,62:171:99:2090,0,5239 +chr1 52629878 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.136;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:236,0,756 +chr1 52631449 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.235;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:387,0,593 +chr1 52645118 . C G 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.154;DP=69;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,50:69:99:1944,0,486 +chr1 52645360 . A G 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.066;DP=46;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:775,0,926 +chr1 52645608 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=1.394;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:489,0,3116 +chr1 52645909 . G T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.138;DP=64;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:294,0,1971 +chr1 52693150 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.962;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:317,0,943 +chr1 52859163 . A C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr1 52861633 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,307 +chr1 52861635 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,307 +chr1 52863384 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:62:234,0,62 +chr1 52863399 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:62:234,0,62 +chr1 52863895 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:265,0,288 +chr1 52863926 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=26.31;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:265,0,288 +chr1 52869050 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.132;DP=39;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:492,0,856 +chr1 52872781 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.754;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:375,0,730 +chr1 52873034 . T A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=-1.762;DP=44;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:781,0,814 +chr1 52873209 . T A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-1.272;DP=42;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:745,0,1554 +chr1 52873213 . A C 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.930;DP=40;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:745,0,1578 +chr1 52873832 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-1.445;DP=39;FS=7.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:433,0,962 +chr1 52890943 . A T 3118.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:3147,242,0 +chr1 52891110 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,539 +chr1 52891114 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=1.002;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=21.72;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:354,0,539 +chr1 52893078 . GT G 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.214;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=33.82;ReadPosRankSum=2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:99:1390,0,954 +chr1 52893080 . GCAGTGTCCTCAGCATCTACAGCTTCTACAAGTGCAGTGTCATCACCATCCTCCGCTCCTACAAGTGCAGTGTCCTCAGCATCTACAGCTCCTACAAGT G 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.087;ClippingRankSum=-1.134;DP=50;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=27.05;ReadPosRankSum=2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:1390,0,861 +chr1 52946885 . GAC G 2495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.909;DP=99;FS=2.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,67:98:99:2533,0,989 +chr1 52950665 . G A 3515.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.068;DP=103;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=34.14;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,89:101:13:3544,0,13 +chr1 52955719 . C G 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.205;DP=74;FS=3.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1213,0,1202 +chr1 52973147 . ATTGTTTATATTGTGCAACAAATTTTGTTCGT A 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=23.73;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:417,0,1422 +chr1 52976005 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:250,0,285 +chr1 52977748 . G C 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.664;DP=119;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,30:119:99:707,0,3407 +chr1 52981572 . G A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.297;DP=46;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=17.26;ReadPosRankSum=2.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:822,0,763 +chr1 52982107 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.492;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:265,0,759 +chr1 52982373 . TC T 1387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.442;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=31.54;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:1425,0,1365 +chr1 52982746 . T TTG 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-1.227;DP=35;FS=3.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:242,0,1219 +chr1 52987432 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.861;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:279,0,1540 +chr1 53055275 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.746;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:438,0,1057 +chr1 53089823 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=-0.048;DP=57;FS=12.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:265,0,1656 +chr1 53093176 . C A 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.752;DP=67;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:823,0,1813 +chr1 53093783 . T C 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.776;DP=68;FS=5.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:793,0,1516 +chr1 53109694 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.522;DP=69;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=7.14;ReadPosRankSum=2.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:521,0,1844 +chr1 53111099 . G A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.219;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,33:103:99:833,0,2588 +chr1 53112231 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.539;DP=141;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=2.23;ReadPosRankSum=3.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:343,0,4309 +chr1 53116205 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=1.373;DP=89;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:663,0,5343 +chr1 53116208 . C T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.856;DP=94;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:674,0,5343 +chr1 53118301 . C T 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.587;DP=65;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1011,0,1110 +chr1 53118342 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.202;DP=81;FS=9.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:361,0,2347 +chr1 53118357 . C A 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=1.264;DP=91;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,41:90:99:1427,0,1522 +chr1 53122389 . A G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=-1.115;DP=63;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.824;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:523,0,1652 +chr1 53132346 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.141;DP=46;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:389,0,1168 +chr1 53132439 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=-0.448;DP=53;FS=2.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:479,0,1395 +chr1 53146917 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=1.298;DP=58;FS=10.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:394,0,1682 +chr1 53147117 . C T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-0.777;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:744,0,1481 +chr1 53147123 . T C 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.271;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:744,0,1481 +chr1 53171068 . A G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.175;DP=70;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:621,0,1755 +chr1 53183054 . CGGTAAACTCTCATTTTATTATCATTCTCCTCGTCTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTTCTGCGTTCACTCCTGTGTGTGTATCTCTGTCTTTCCCTCAA C 1721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=2.609;DP=93;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=18.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,81:90:99:1759,0,1261 +chr1 53195999 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.556;DP=24;FS=9.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:361,0,787 +chr1 53255494 . C G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=20.58;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,106 +chr1 53260212 . C T 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.094;DP=149;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,52:149:99:1730,0,3426 +chr1 53290562 . C T 2877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=1.019;DP=361;FS=3.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,113:361:99:2906,0,9354 +chr1 53310395 . T A 3151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=-3.728;DP=377;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,125:377:99:3180,0,9479 +chr1 53316250 . A G 4554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.516;ClippingRankSum=-2.437;DP=310;FS=0.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=14.69;ReadPosRankSum=2.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,132:310:99:4583,0,5333 +chr1 53769219 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=1.921;DP=149;FS=7.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=6.78;ReadPosRankSum=-2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:1039,0,4049 +chr1 53771865 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.893;DP=103;FS=1.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:419,0,3018 +chr1 53838863 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.682;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:350,0,589 +chr1 53849142 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-1.377;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:269,0,721 +chr1 53855985 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-1.997;DP=36;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:336,0,849 +chr1 53858690 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.281;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:414,0,779 +chr1 53858823 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:282,0,470 +chr1 53860407 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,181 +chr1 53860639 . C A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.472;DP=26;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:235,0,717 +chr1 53874242 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=-0.335;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:266,0,1776 +chr1 53874245 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-0.922;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:266,0,1776 +chr1 53874419 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.793;DP=47;FS=7.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:278,0,1297 +chr1 53890055 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=-2.762;DP=70;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=4.90;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:371,0,2052 +chr1 53890457 . G GA 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.455;DP=103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,31:100:99:519,0,2106 +chr1 53891316 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=1.639;DP=92;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:490,0,2797 +chr1 53891470 . A G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.816;DP=128;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,28:128:99:479,0,4422 +chr1 53897485 . T C 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.291;DP=115;FS=8.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,34:115:99:880,0,3080 +chr1 54245144 . G C 4252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.543;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,48:167:99:4281,0,3029 +chr1 54263746 . G T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.287;ClippingRankSum=-5.242;DP=498;FS=43.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=0.67;ReadPosRankSum=4.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:427,71:498:99:363,0,16172 +chr1 54265082 . A G 4796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=1.883;DP=393;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,141:374:99:4825,0,7894 +chr1 54317275 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=1.732;DP=46;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:292,0,1275 +chr1 54448873 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.043;DP=140;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.988;QD=3.93;ReadPosRankSum=-2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,30:140:99:579,0,4325 +chr1 54462212 . T C 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-0.206;DP=225;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,50:225:99:899,0,6938 +chr1 54486099 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=2.150;DP=82;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=3.41;ReadPosRankSum=-2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:308,0,2211 +chr1 54504177 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-1.147;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,26:122:99:508,0,3737 +chr1 54506358 . C T 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.811;DP=162;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,35:162:99:671,0,4849 +chr1 54520030 . G T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-1.563;DP=134;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,39:134:99:287,0,11319 +chr1 54525017 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.805;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:241,0,380 +chr1 54530311 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=17.91;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,209 +chr1 54549996 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.862;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:301,0,594 +chr1 54588888 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=6.865;DP=205;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=1.37;ReadPosRankSum=-3.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,43:204:99:309,0,18264 +chr1 54588891 . C T 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=6.393;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=3.69;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,37:209:99:804,0,9088 +chr1 54592727 . G GT 1817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-2.228;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1855,0,1941 +chr1 54629517 . ACTGAAGAAAGAAAAGGACAACAAACATTGAAAGCTTCATTTACACTGTAAAGCACCAGATGAATTATTTATATTGAATTTAC A 7913.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.441;DP=171;FS=3.017;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,168:171:99:7951,790,0 +chr1 54647115 . T G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-1.569;DP=54;FS=9.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:333,0,1861 +chr1 54651202 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.102;DP=50;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:275,0,1868 +chr1 54658957 . ACTGAAACAACAAACCCAAAGTTAGATTACTGTGTGACAGCATATCTGACAGTGTGCATCTGTGTGTAC A 2118.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=2.106;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=33.35;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:99:2156,0,1339 +chr1 54665045 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.609;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:656,0,1817 +chr1 54667549 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.188;DP=62;FS=3.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:531,0,1623 +chr1 54673760 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.166;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:293,0,2467 +chr1 54674000 . C A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=1.177;DP=40;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:430,0,908 +chr1 54683283 . T G 1695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=-0.862;DP=158;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,53:158:99:1724,0,3612 +chr1 54734421 . C A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.309;DP=83;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:682,0,3785 +chr1 54734430 . A G 1388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.370;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:1417,0,2534 +chr1 54734999 . A G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=-1.644;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=12.89;ReadPosRankSum=2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:505,0,1177 +chr1 54741276 . C A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-0.452;DP=204;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,47:203:99:1011,0,6052 +chr1 54745445 . A T 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=1.588;DP=160;FS=0.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:1212,0,4215 +chr1 54746085 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=1.277;DP=61;FS=9.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=3.47;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:240,0,1861 +chr1 54760558 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.437;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:476,0,624 +chr1 54795544 . G C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=1.991;DP=52;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:740,0,1028 +chr1 54812362 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.681;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:566,0,1033 +chr1 54812410 . CAAGGTTACACAGAGACGCAGTCTGCTTTACTCTGTGTTTATTACTTACTGAAGCGTTTGTGTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT C 847.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.514;DP=30;FS=8.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:44:885,0,44 +chr1 54818912 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.011;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:472,0,1432 +chr1 54821476 . A C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.154;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:563,0,2064 +chr1 54821591 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.110;DP=66;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:571,0,1834 +chr1 54822399 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:99:295,0,340 +chr1 54829396 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:259,0,381 +chr1 54858271 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:346,0,307 +chr1 54882607 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.849;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:235,0,816 +chr1 54903369 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.276;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:488,0,796 +chr1 54905538 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:267,0,394 +chr1 54914222 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.525;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:274,0,1340 +chr1 55030792 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:238,0,148 +chr1 55227111 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:391,0,301 +chr1 55233363 . C A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.403;DP=44;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:588,0,1015 +chr1 55239895 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.201;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:300,0,6256 +chr1 55240641 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=2.237;DP=183;FS=5.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=1.91;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,35:183:99:378,0,16499 +chr1 55240655 . TCTGACAGCCGAGGTCAAGGGTCATGAACAACACAACCGAGTCTACAACAGCAGAAACTGCTCATACAGTGTAAAGGATAC T 9545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=1.560;DP=182;FS=7.256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=26.79;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,169:178:99:9583,689,0 +chr1 55248869 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.197;DP=127;FS=4.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=4.33;ReadPosRankSum=2.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,27:127:99:578,0,7737 +chr1 55254569 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.031;DP=106;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:432,0,5622 +chr1 55258155 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=-2.539;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,34:140:99:663,0,3822 +chr1 55258223 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-0.050;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:363,0,1449 +chr1 55297055 . A T 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr1 55312427 . C T 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 +chr1 55324298 . T C 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr1 55410699 . C G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:236,0,62 +chr1 55432675 . G C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.746;DP=51;FS=10.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.305;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:689,0,1058 +chr1 55437899 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.167;DP=51;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:267,0,1443 +chr1 55442578 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,404 +chr1 55470400 . A T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-2.624;DP=44;FS=9.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:530,0,1061 +chr1 55493376 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.910;DP=50;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:406,0,1330 +chr1 55495834 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.479;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:241,0,2412 +chr1 55499973 . T TAA 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-0.756;DP=29;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=16.40;ReadPosRankSum=3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:581,0,384 +chr1 55501819 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-2.528;DP=183;FS=15.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,31:183:99:335,0,5636 +chr1 55502724 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.093;DP=188;FS=7.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,34:187:99:425,0,5392 +chr1 55505243 . AACCTGTCCAATCAGAACAAGACAATGTCACACTGCAGCATGTTAGCCAATTGATAATGATTGACCAATTAAATACAC A 521.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.133;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:559,0,567 +chr1 55520410 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.638;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:57:676,0,57 +chr1 55523582 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.349;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:624,0,622 +chr1 55527686 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.510;DP=35;FS=6.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:329,0,1832 +chr1 55536964 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.688;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:259,0,417 +chr1 55548158 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.434;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:815,0,3582 +chr1 55549282 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:408,0,351 +chr1 55552760 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-1.116;DP=53;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:260,0,1538 +chr1 55576940 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.680;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:573,0,524 +chr1 55576955 . T G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.315;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:453,0,473 +chr1 55638467 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.040;DP=54;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:279,0,1592 +chr1 55639553 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.465;DP=51;FS=2.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:406,0,1353 +chr1 55652877 . C G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=-0.449;DP=75;FS=1.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:355,0,2164 +chr1 55681167 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-2.515;DP=52;FS=6.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:310,0,1481 +chr1 55705805 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.233;DP=45;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:329,0,1114 +chr1 55751531 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-1.440;DP=31;FS=16.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:417,0,873 +chr1 55753026 . TAA T,TAAA 312.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,5,8:13:99:387,224,349,200,0,213 +chr1 55759977 . TCTGCAGAAATAACTCATGAAACACTGTATCTGCTCAGATAGAGTCAGTAACCCATGAATAATCCTGACACACAC T 3619.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.014;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:3657,299,0 +chr1 55769611 . C CTCG 273.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:22:311,22,0 +chr1 55826612 . T G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr1 55826623 . C G 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 +chr1 55838796 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.912;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=4.30;ReadPosRankSum=-2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:282,0,549 +chr1 55838846 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.115;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:520,0,576 +chr1 56286183 . GCT G 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:251,0,56 +chr1 56289525 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-2.039;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:330,0,3057 +chr1 56316430 . T C 6803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.375;DP=249;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=27.32;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,109:248:99:6832,0,4709 +chr1 56317311 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-3.031;DP=49;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:246,0,1476 +chr1 56318335 . AG A 457.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:26:495,0,26 +chr1 56318670 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.030;DP=40;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:277,0,1121 +chr1 56460439 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.838;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:499,0,2631 +chr1 56460964 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.659;DP=104;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,32:104:99:839,0,2786 +chr1 56494806 . T C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.869;DP=68;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,23:68:99:779,0,1570 +chr1 56579709 . C T 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=2.117;DP=118;FS=10.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,70:115:99:2398,0,1579 +chr1 56586292 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.659;DP=135;FS=9.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,24:134:99:367,0,4231 +chr1 56586432 . A G 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=1.922;DP=110;FS=1.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.715;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:1503,0,2232 +chr1 56588189 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.910;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:537,0,5692 +chr1 56590481 . C G 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.053;DP=81;FS=7.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:1073,0,1614 +chr1 56593633 . C A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=-0.444;DP=150;FS=5.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,44:150:99:1127,0,4017 +chr1 56600538 . C T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.343;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,38:135:99:904,0,3715 +chr1 56612438 . G C 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.864;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,36:106:99:1079,0,2428 +chr1 56614602 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.532;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:546,0,2340 +chr1 56618903 . A T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-0.491;DP=85;FS=6.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:668,0,2512 +chr1 56626747 . G A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-0.592;DP=62;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:941,0,1249 +chr1 56643885 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=4.965;DP=59;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=4.13;ReadPosRankSum=-4.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:272,0,2384 +chr1 56643892 . TCTAGCATTGACAAAGAGACTGACGTGAGCTCCTGACAGACGCCTCATACTGCTGATGGAGAAAAACACACTCTTAC T 2430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.577;DP=51;FS=3.096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=31.96;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:2468,175,0 +chr1 56643976 . T G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.140;DP=40;FS=9.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:552,0,2457 +chr1 56643980 . G T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-0.834;DP=39;FS=10.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:552,0,2444 +chr1 56677070 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.852;ClippingRankSum=4.300;DP=124;FS=10.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=3.27;ReadPosRankSum=-6.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,26:124:99:434,0,4275 +chr1 56677241 . G T 1620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.305;DP=509;FS=3.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=3.18;ReadPosRankSum=5.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:409,98:507:99:1649,0,16140 +chr1 56694466 . C T 5375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.375;DP=380;FS=0.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,152:380:99:5404,0,9221 +chr1 56714226 . G C 5585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.930;DP=416;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,162:414:99:5614,0,8562 +chr1 56764304 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.178;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:364,0,1838 +chr1 56764744 . A C 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.534;DP=199;FS=5.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:1110,0,5591 +chr1 56764912 . A G 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.084;DP=216;FS=6.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,66:216:99:1513,0,8443 +chr1 56764960 . C T 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=-0.310;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,70:194:99:1822,0,7182 +chr1 56807862 . T C 303.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=30.30;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:331,0,12 +chr1 56810322 . A C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=-3.470;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=16.15;ReadPosRankSum=-4.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:658,0,696 +chr1 56810700 . C A 5520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:5549,394,0 +chr1 56810761 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=2.498;DP=156;FS=5.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,25:155:99:326,0,5102 +chr1 56813218 . C T 1107.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1136,81,0 +chr1 56823856 . A AGAGATCC 4977.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.007;DP=172;FS=5.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=28.94;ReadPosRankSum=2.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,134:161:99:5015,0,769 +chr1 56823858 . A G 4984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=1.025;DP=178;FS=5.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,133:160:99:5013,0,811 +chr1 56834833 . AAGGTGAACGGTCTTTGGACATCATAGTGAAAACACTTGATGACTATTCCTGACCAAAAATGTATGGTTTTCCTCCCTCT A 7094.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=1.711;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=31.31;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:7132,596,0 +chr1 56846900 . TGGTACGTCTGATGCAGTTTCAGGACTTAATATGATAGATCTTTCTCATATGTTTCAATAGATCAAGTAGAGTTCCACTGATAGTTAACATGCTCTCTTTCTTTCA T 5485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=1.312;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=28.98;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,123:126:99:5523,471,0 +chr1 56865178 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=1.203;DP=54;FS=6.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:440,0,1449 +chr1 56891200 . T G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,104 +chr1 56970419 . TAA T 2024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=1.421;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=24.39;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,1:78:99:2062,0,2885 +chr1 56970552 . T C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.971;DP=64;FS=2.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:484,0,4648 +chr1 56971904 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.990;DP=71;FS=6.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:239,0,2065 +chr1 57107493 . A T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=5.110;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=16.63;ReadPosRankSum=-4.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:627,0,679 +chr1 57108186 . T C 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.377;DP=58;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=20.82;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,36:58:99:1236,0,1589 +chr1 57108325 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=3.303;DP=31;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=13.67;ReadPosRankSum=-2.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:452,0,655 +chr1 57109624 . C A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=-0.847;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=4.53;ReadPosRankSum=-4.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:386,0,4869 +chr1 57109627 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.026;ClippingRankSum=-0.996;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=4.59;ReadPosRankSum=-4.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:386,0,4869 +chr1 57110260 . AT A 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.892;DP=39;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:577,0,128 +chr1 57111868 . T A 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.217;DP=74;FS=9.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1316,0,1344 +chr1 57112429 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,106 +chr1 57116802 . T A 11088.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.358;DP=231;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=37.29;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,228:230:99:11117,783,0 +chr1 57117778 . C T 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=-0.902;DP=114;FS=7.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.458;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,42:114:99:1366,0,2528 +chr1 57150010 . A T 366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:395,30,0 +chr1 57150107 . T A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.206;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=25.34;ReadPosRankSum=-2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:535,0,380 +chr1 57150742 . A G 797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:826,57,0 +chr1 57150743 . A T 797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:826,57,0 +chr1 57151057 . T A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr1 57151058 . A G 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr1 57151588 . T A 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:414,33,0 +chr1 57455963 . G A 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 +chr1 58375010 . A C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.047;DP=40;FS=9.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:777,0,1220 +chr1 58375012 . C A 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=-0.183;DP=39;FS=12.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:777,0,1220 +chr1 58375120 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=2.270;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=12.53;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:313,0,217 +chr1 58375252 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=3.460;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=8.27;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:293,0,1935 +chr1 58375524 . G A 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.547;DP=60;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,37:60:99:1291,0,798 +chr1 58375589 . C CGA 1422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.706;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=26.35;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,36:54:99:1460,0,637 +chr1 58375718 . GTT G 1393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-1.437;DP=53;FS=14.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=26.30;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,36:51:99:1431,0,411 +chr1 58375990 . TAA T 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.767;DP=35;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:779,0,508 +chr1 58377690 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=2.049;DP=31;FS=26.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:232,0,813 +chr1 58649785 . T C 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr1 58716552 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:294,0,93 +chr1 58722837 . G T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.054;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:578,0,589 +chr1 58961108 . C G 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:683,48,0 +chr1 58963740 . T A 1264.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1293,90,0 +chr1 58963934 . A G 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:489,36,0 +chr1 58964198 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.134;DP=21;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=31.08;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:67:681,0,67 +chr1 58964279 . G A 1575.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-0.194;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,44:50:15:1604,0,15 +chr1 58964371 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr1 58964379 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:258,18,0 +chr1 58964592 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 +chr1 58964601 . C T 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:471,33,0 +chr1 59184753 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=2.363;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=14.11;ReadPosRankSum=-2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:254,0,286 +chr1 59439734 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.486;DP=53;FS=2.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:299,0,1608 +chr1 59447806 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.330;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:497,0,659 +chr1 59498888 . A T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.787;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:263,0,1162 +chr1 59500427 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=1.545;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:395,0,558 +chr1 59500673 . A G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.062;DP=31;FS=5.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=28.61;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:915,0,353 +chr1 59500687 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-1.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:259,0,901 +chr1 59514583 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,251 +chr1 59543637 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.139;DP=26;FS=6.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:240,0,1429 +chr1 59625655 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.209;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:299,0,342 +chr1 59668533 . T C 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=2.402;DP=100;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:846,0,2516 +chr1 59669431 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.867;DP=52;FS=2.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:358,0,1450 +chr1 59670264 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.468;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:407,0,1819 +chr1 59670296 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-1.253;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:247,0,1779 +chr1 59697444 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=1.907;DP=56;FS=4.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=3.92;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:248,0,1577 +chr1 59697480 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=2.284;DP=63;FS=9.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=3.50;ReadPosRankSum=-2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:249,0,3621 +chr1 59701374 . TCCTGGAAACACGAGCGCAGGTGTGATTTCATCAGTCACACACACACACACACGCTCGCTCACACACACACA T 1023.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.788;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:99:1061,138,0 +chr1 59772209 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=-1.315;DP=34;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:387,0,808 +chr1 59799397 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.779;DP=49;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:351,0,1221 +chr1 59799712 . C G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.842;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:434,0,1654 +chr1 59846637 . T G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.377;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:293,0,598 +chr1 59916860 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=-0.148;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:270,0,724 +chr1 59916896 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.688;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:445,0,925 +chr1 59918651 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=15.87;ReadPosRankSum=-2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:298,0,281 +chr1 59964557 . C T 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.842;DP=353;FS=5.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,94:353:99:2146,0,9511 +chr1 60013928 . TCCTGAAGCACATGAGAGGGTGAGACTGGAAGACCCTTAGTGTGGCAGAGCTCAGAGATGCTTTGAGATGTCGTTGGCGTTA T 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=26.13;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:377,0,1409 +chr1 60027548 . CA C 1274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1312,105,0 +chr1 60058880 . G C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.991;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:429,0,3443 +chr1 60181545 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.780;DP=77;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:429,0,2191 +chr1 60187996 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.891;DP=56;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:458,0,1412 +chr1 60231730 . C T 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.109;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,86:282:99:2114,0,7128 +chr1 60232580 . C T 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.481;ClippingRankSum=0.039;DP=337;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,84:337:99:1517,0,9491 +chr1 60250086 . C T 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.052;DP=337;FS=0.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.190;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,77:336:99:1511,0,9395 +chr1 60254445 . G A 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=-0.217;DP=295;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=6.17;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,79:295:99:1847,0,8077 +chr1 60254813 . C T 3439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.984;DP=334;FS=19.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=10.30;ReadPosRankSum=3.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,111:331:99:3468,0,7290 +chr1 60286102 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.194;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:325,0,926 +chr1 60297374 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.897;DP=155;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,34:155:99:646,0,4421 +chr1 60300103 . C CGT 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-0.755;DP=109;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:536,0,190 +chr1 60311476 . CGTATGTCGAAGATCTGATTGTTCACTCTCACACACTCGACACCGATTGGACTCATTTTATTATATGAATCTTCACAACACCCTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCAG C 875.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.476;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:913,0,1866 +chr1 60325015 . G C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=4.037;DP=54;FS=9.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:358,0,2519 +chr1 60325016 . C A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=3.855;DP=55;FS=9.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:364,0,2519 +chr1 60326170 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.027;DP=58;FS=6.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:338,0,1598 +chr1 60326171 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.118;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:316,0,1670 +chr1 60326340 . A G 563.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.070;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=31.32;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:21:592,0,21 +chr1 60331960 . G GGTA 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=2.606;DP=22;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=17.03;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:412,0,145 +chr1 60345775 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.010;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:316,0,1522 +chr10 28122 . A G 1200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.234;DP=107;FS=3.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,38:106:99:1229,0,2132 +chr10 29072 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.728;DP=106;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:407,0,3810 +chr10 56068 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-0.664;DP=92;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:474,0,2660 +chr10 58095 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.660;DP=98;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:571,0,2637 +chr10 59132 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.015;DP=68;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:310,0,2665 +chr10 59795 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.164;DP=50;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:598,0,1164 +chr10 60094 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:288,0,60 +chr10 61479 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=2.463;DP=33;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:328,0,846 +chr10 100919 . CGTGAGTTTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTCTGACCTCTGCTGTTTTCAG C 4376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=2.533;DP=106;FS=11.804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,101:106:99:4414,345,0 +chr10 101255 . GCAGGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGCGTGCGTGCGCATGTGTGTGTGTGTTTGTGTGAACGCCTCTCTCTGTCTGTGTTT G 4620.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=2.272;DP=119;FS=1.839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=36.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,114:119:99:4658,372,0 +chr10 103464 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=1.052;DP=49;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:407,0,1250 +chr10 107237 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.496;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:341,0,3440 +chr10 168139 . CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=46;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:275,0,3078 +chr10 188766 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-1.029;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:381,0,2238 +chr10 188805 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-1.285;DP=74;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:342,0,2118 +chr10 194974 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-1.050;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,14:77:99:245,0,2395 +chr10 195514 . C G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.623;DP=65;FS=3.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:427,0,1785 +chr10 201488 . A AAC 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.906;DP=60;FS=8.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:404,0,555 +chr10 219234 . C T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.189;DP=123;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,44:122:99:1084,0,2441 +chr10 219623 . G A 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-1.277;DP=99;FS=15.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:1241,0,2005 +chr10 220520 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.211;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,34:210:99:338,0,7873 +chr10 222259 . T A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=1.537;DP=115;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,39:113:99:1242,0,3036 +chr10 225141 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=-0.492;DP=33;FS=8.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:429,0,596 +chr10 227297 . A C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.214;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:438,0,1454 +chr10 252928 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.577;DP=27;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,655 +chr10 261775 . G A 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=-0.683;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:611,0,968 +chr10 289572 . A G 1855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.362;DP=105;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1884,0,2057 +chr10 289864 . A G 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-2.054;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,29:120:99:643,0,4382 +chr10 290053 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-0.280;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,36:170:99:706,0,5337 +chr10 290233 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=1.678;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=11.41;ReadPosRankSum=-2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:245,0,1000 +chr10 290236 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=2.550;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:278,0,1005 +chr10 290566 . AAC A 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-1.159;DP=107;FS=5.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,35:103:99:1264,0,2543 +chr10 348079 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.307;DP=73;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:357,0,2169 +chr10 357760 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.640;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:406,0,1213 +chr10 359218 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.297;DP=92;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:397,0,2570 +chr10 359788 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=-0.756;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:331,0,3594 +chr10 360175 . A G 1660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=1.145;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,51:78:99:1689,0,735 +chr10 361722 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-0.473;DP=94;FS=3.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:634,0,2339 +chr10 419246 . T C 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.083;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=25.22;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:684,0,232 +chr10 419414 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=-1.272;DP=39;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:708,0,901 +chr10 419558 . G C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=1.377;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=7.96;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:251,0,735 +chr10 420173 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=16.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,207 +chr10 420517 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.873;DP=33;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:319,0,1363 +chr10 420980 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.712;DP=26;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:713,0,722 +chr10 421024 . A G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=2.799;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=36.92;ReadPosRankSum=-3.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:714,0,722 +chr10 422376 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:337,0,206 +chr10 430203 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:283,0,167 +chr10 437714 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=4.048;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=11.11;ReadPosRankSum=-3.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:306,0,563 +chr10 437813 . T A 2607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.031;DP=119;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,50:85:99:2636,0,928 +chr10 437981 . A T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:99:656,0,1191 +chr10 438177 . T G 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.080;DP=56;FS=7.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:99:1541,0,2560 +chr10 438217 . C T 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=-3.742;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=23.27;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:1541,0,2580 +chr10 438589 . A G 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-2.554;DP=32;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=25.34;ReadPosRankSum=-2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:839,0,741 +chr10 438622 . G T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.128;DP=50;FS=8.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:827,0,741 +chr10 438769 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-1.330;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:826,0,169 +chr10 439390 . T G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.282;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:559,0,197 +chr10 582621 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=1.667;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,28:125:99:573,0,8780 +chr10 590018 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=1.241;DP=66;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=3.51;ReadPosRankSum=-1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:260,0,4058 +chr10 590019 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=1.757;DP=66;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:260,0,4058 +chr10 595365 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=1.383;DP=68;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:418,0,1912 +chr10 1011635 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.010;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:357,0,1509 +chr10 1014303 . GAAAACAGGAAGAGGAAGAGAACGGGAAAAAGAAAAGGAAGAAAACAGGAAGAGGAAGAGAACGGGAAAAAGAAAAGGAAGA G 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=1.631;DP=41;FS=10.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:402,0,1666 +chr10 1014821 . G A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-1.140;DP=53;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:1015,0,837 +chr10 1119473 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.637;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=11.29;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:559,0,955 +chr10 1119614 . C T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=2.164;DP=61;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=15.14;ReadPosRankSum=-2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:952,0,980 +chr10 1194825 . C G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,176 +chr10 1195140 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:478,0,489 +chr10 1195203 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=1.225;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:638,0,607 +chr10 1195977 . A C 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.869;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:460,0,427 +chr10 1196855 . T C 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.921;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=32.77;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:52:913,0,52 +chr10 1197593 . TAGAGCGCCATCTGCTGTTAAACACTAGTCA T 243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:31:281,31,0 +chr10 1201181 . G A 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.296;DP=126;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,39:126:99:976,0,3202 +chr10 1207502 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:320,0,1604 +chr10 1207525 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-0.356;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=5.14;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:388,0,1886 +chr10 1207546 . A C 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=2.340;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,45:66:99:1644,0,558 +chr10 1455649 . G T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:721,0,167 +chr10 1521991 . C G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.442;DP=99;FS=4.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,33:99:99:939,0,2493 +chr10 1525748 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=4.202;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=18.09;ReadPosRankSum=4.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:607,0,556 +chr10 1577349 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=19.78;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:325,0,205 +chr10 1586872 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:79:258,0,79 +chr10 1609781 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.032;DP=23;FS=11.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:278,0,520 +chr10 1624202 . TCTGCAAGACACCGTGGTGAGACACAGGTAAAAGCACTGGGAGATGTGATGGTGGTGATGATGGTGTGGTGGTGCTAAC T 6167.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.342;DP=140;FS=2.953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=27.88;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:6205,506,0 +chr10 1631315 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.842;DP=113;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=7.67;ReadPosRankSum=2.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:895,0,2951 +chr10 1632526 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.562;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,26:130:99:431,0,4931 +chr10 1647175 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.458;DP=114;FS=4.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:251,0,4170 +chr10 1714149 . G C 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=-2.021;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,36:156:99:685,0,4079 +chr10 1740253 . C T 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=2.552;DP=468;FS=12.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=3.31;ReadPosRankSum=2.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:370,96:466:99:1577,0,13810 +chr10 1785108 . G C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.774;DP=58;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=6.25;ReadPosRankSum=-1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:391,0,1543 +chr10 1790473 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=1.813;DP=56;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:758,0,1062 +chr10 1790563 . C T 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.628;DP=61;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1070,0,1076 +chr10 1802855 . G A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-1.365;DP=57;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1038,0,997 +chr10 1854304 . A AT 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-1.342;DP=32;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:300,0,565 +chr10 1897689 . G A 3875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-1.537;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,106:131:99:3904,0,510 +chr10 1905664 . T A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr10 1909007 . G A 2364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-1.123;DP=89;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=26.57;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,65:89:99:2393,0,1378 +chr10 1912708 . T G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.319;DP=130;FS=3.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,22:130:99:310,0,4078 +chr10 1914536 . G A 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=-0.682;DP=158;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.481;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,45:158:99:1171,0,4323 +chr10 1916117 . C A 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.465;DP=148;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,48:148:99:1313,0,6940 +chr10 1920083 . G C 3123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.637;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,99:181:99:3152,0,2964 +chr10 1920732 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=2.979;DP=60;FS=6.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=3.50;ReadPosRankSum=-3.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:238,0,3218 +chr10 1921000 . A T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-2.414;DP=114;FS=3.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:896,0,3159 +chr10 1921023 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-1.800;DP=124;FS=14.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.173;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:668,0,4497 +chr10 2016443 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-1.310;DP=60;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:262,0,1761 +chr10 2016531 . A C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=2.666;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:379,0,941 +chr10 2016976 . C G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr10 2017005 . A T 656.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:685,51,0 +chr10 2017128 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:571,0,511 +chr10 2017192 . G C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:240,18,0 +chr10 2018756 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:317,0,136 +chr10 2526960 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-0.585;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:408,0,377 +chr10 2528138 . C T 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=-0.617;DP=38;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:749,0,603 +chr10 2528214 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.713;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:237,0,873 +chr10 2529496 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:303,0,254 +chr10 2529625 . G C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-2.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:432,0,225 +chr10 2530606 . T C 923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:952,69,0 +chr10 2530658 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.564;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:924,0,425 +chr10 2530756 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.489;DP=27;FS=6.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:229,0,664 +chr10 2532681 . G A 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.227;DP=35;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=29.11;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1047,0,157 +chr10 2541987 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=1.610;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:336,0,232 +chr10 2543746 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,468 +chr10 2543797 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.516;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:363,0,653 +chr10 2588719 . AC A 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr10 2595431 . G A 2253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-1.338;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:2282,0,1573 +chr10 2602607 . A AT 767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.743;DP=42;FS=3.332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:86:862,86,0 +chr10 2602847 . T A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-1.010;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:628,0,212 +chr10 2603051 . C A 2203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.571;DP=71;FS=6.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,57:71:99:2232,0,277 +chr10 2603220 . T TCA 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.182;DP=28;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:345,0,366 +chr10 2603740 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-2.329;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=31.39;ReadPosRankSum=2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:656,0,113 +chr10 2603994 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.868;DP=30;FS=12.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:631,0,419 +chr10 2604045 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:531,0,458 +chr10 2604556 . GT G 1443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.505;DP=58;FS=5.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,36:58:99:1481,0,1439 +chr10 2605263 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.274;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:251,0,1283 +chr10 2605557 . A T 1845.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-2.294;DP=48;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=29.55;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,44:48:13:1874,0,13 +chr10 2605558 . C A 1845.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-2.173;DP=49;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=28.79;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,45:49:13:1874,0,13 +chr10 2606384 . C T 2906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.555;DP=104;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,79:104:99:2935,0,1089 +chr10 2606456 . C A 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.694;DP=102;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=21.44;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,69:102:99:2215,0,878 +chr10 2606858 . GA G 1052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.510;DP=89;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,49:80:99:1090,0,598 +chr10 2607123 . G T 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-1.034;DP=80;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1576,0,1096 +chr10 2621785 . A C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.315;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=27.93;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:71:531,0,71 +chr10 2622092 . C T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.891;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=30.37;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:60:757,0,60 +chr10 2628449 . C G 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=-0.139;DP=49;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=24.04;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,33:49:99:1206,0,442 +chr10 2641183 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr10 2641216 . C A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +chr10 2664780 . T C 1540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.863;DP=54;FS=2.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,42:54:99:1569,0,257 +chr10 2667194 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:425,0,764 +chr10 2674747 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.902;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:462,0,236 +chr10 2695711 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-3.308;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,469 +chr10 2695712 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-3.308;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=23.36;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,469 +chr10 2703836 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,282 +chr10 2703837 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,282 +chr10 2705238 . T C 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=-1.162;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:558,0,450 +chr10 2705469 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-2.862;DP=24;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:527,0,293 +chr10 2705873 . TAC T 279.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:317,22,0 +chr10 2706085 . G A 878.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:907,66,0 +chr10 2706137 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:260,0,91 +chr10 2707169 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr10 2707173 . C A 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 +chr10 2707230 . A G 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr10 2708859 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-2.522;DP=29;FS=8.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=24.72;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:745,0,255 +chr10 2709407 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:514,0,433 +chr10 2709425 . C A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=-0.568;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:573,0,141 +chr10 2722835 . C G 242.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:271,0,20 +chr10 2723947 . CG C 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.036;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:482,0,815 +chr10 2758994 . G A 239.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:268,0,22 +chr10 2776816 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:82:360,0,82 +chr10 2786260 . G C 3928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-0.132;DP=111;FS=3.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=29.34;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,93:111:99:3957,0,213 +chr10 2786489 . G C 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=1.497;DP=98;FS=3.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=17.33;ReadPosRankSum=4.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:1727,0,5398 +chr10 2786491 . C A 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=2.333;DP=101;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=16.82;ReadPosRankSum=4.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:1727,0,5226 +chr10 2813253 . T C 5091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-1.067;DP=198;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.751;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,140:198:99:5120,0,1358 +chr10 2859387 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.862;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:84:614,0,84 +chr10 2864714 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-2.533;DP=20;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=11.69;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:262,0,223 +chr10 2865096 . T C 656.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=30.38;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14:685,14,0 +chr10 2868518 . T A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=2.204;DP=33;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:668,0,1076 +chr10 2868539 . A T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=2.900;DP=33;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=21.17;ReadPosRankSum=-2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:727,0,400 +chr10 2868556 . G A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=2.937;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:738,0,478 +chr10 2879551 . AT A 682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:720,67,0 +chr10 2879887 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=2.443;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:278,0,376 +chr10 2880004 . T C 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.689;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=31.64;ReadPosRankSum=3.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:56:756,0,56 +chr10 2880202 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=24.81;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:98:326,0,98 +chr10 2881484 . A T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=29.12;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:465,0,113 +chr10 2881869 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.635;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,344 +chr10 2886484 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-1.157;DP=43;FS=6.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:813,0,1626 +chr10 2886488 . C G 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-1.057;DP=43;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:813,0,1626 +chr10 2888868 . C T 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.087;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1149,0,710 +chr10 2896951 . C T 2045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2074,147,0 +chr10 2903254 . T TA 615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:653,63,0 +chr10 2903710 . G A 1987.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2016,147,0 +chr10 2963319 . T C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 +chr10 2965444 . A G 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:709,51,0 +chr10 2974735 . A G 921.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.491;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=32.90;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:4:948,4,0 +chr10 3036766 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr10 3054334 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.077;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:269,0,706 +chr10 3054680 . C A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 +chr10 3056369 . A T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-1.803;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:469,0,321 +chr10 3056617 . G A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.074;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=28.67;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:1003,0,769 +chr10 3056623 . A T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-1.119;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:1003,0,769 +chr10 3103250 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr10 3145163 . A G 997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:72:1026,72,0 +chr10 3145517 . G GT 426.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:464,36,0 +chr10 3147716 . G C 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:678,48,0 +chr10 3147805 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.249;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:317,0,415 +chr10 3148339 . T G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr10 3149146 . A ATG 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.003;DP=15;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:318,0,264 +chr10 3150104 . AG A 228.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:266,18,0 +chr10 3150112 . G A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr10 3150189 . T A 292.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 +chr10 3150910 . C A 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 +chr10 3151182 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.096;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:589,0,189 +chr10 3193180 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=28.60;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:89:400,0,89 +chr10 3193215 . G C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.039;DP=21;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:259,0,1919 +chr10 3193223 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:259,0,1919 +chr10 3193248 . G C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-1.043;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:447,0,1019 +chr10 3193571 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.794;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:504,0,226 +chr10 3194609 . A G 842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:871,63,0 +chr10 3201761 . C T 1187.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.214;DP=38;FS=2.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:12:1215,0,12 +chr10 3205208 . C T 1419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.255;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,40:50:99:1448,0,188 +chr10 3214345 . G A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.401;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,31:42:99:1067,0,245 +chr10 3274731 . C T 3021.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.808;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=32.75;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:3050,219,0 +chr10 3274762 . C T 3804.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.638;DP=95;FS=3.343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=33.16;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:3833,277,0 +chr10 3275132 . C T 284.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:9:312,0,9 +chr10 3275195 . C T 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:688,51,0 +chr10 3276516 . T C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.177;DP=35;FS=6.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1076,0,288 +chr10 3276518 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.310;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:265,0,1279 +chr10 3276641 . T C 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.009;DP=56;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:464,0,1961 +chr10 3276855 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=-2.044;DP=69;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:548,0,2031 +chr10 3277218 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-1.864;DP=113;FS=4.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=2.82;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:347,0,3498 +chr10 3281491 . T A 787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:57:816,57,0 +chr10 3325469 . A T 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:478,36,0 +chr10 3325860 . G T 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 +chr10 3326083 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:277,0,62 +chr10 3328653 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,367 +chr10 3328840 . A C 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:646,45,0 +chr10 3330310 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr10 3332282 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.152;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:445,0,117 +chr10 3332681 . G A 606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:635,48,0 +chr10 3332708 . A T 300.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:8:328,0,8 +chr10 3367956 . G GT 252.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:290,30,0 +chr10 3373224 . A AC 301.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:339,23,0 +chr10 3373232 . A G 310.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:23:339,23,0 +chr10 3373668 . C T 1620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1649,111,0 +chr10 3375353 . C T 4540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4569,340,0 +chr10 3407862 . G A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.323;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=28.81;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:979,0,535 +chr10 3415798 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.654;DP=43;FS=1.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=26.44;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1165,0,319 +chr10 3420097 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=2.165;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,291 +chr10 3427909 . C CA 1468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.952;DP=95;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,64:95:99:1602,0,717 +chr10 3459738 . T G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.109;DP=14;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=18.05;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:281,0,202 +chr10 3459816 . T C 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.686;DP=64;FS=5.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,42:64:99:1491,0,768 +chr10 3501588 . C A 1099.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.619;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=31.31;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1128,81,0 +chr10 3511760 . GGTAA G 818.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:64:856,64,0 +chr10 3518456 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=22.87;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,206 +chr10 3522476 . G T 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:470,33,0 +chr10 3557408 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.944;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=26.91;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:56:378,0,56 +chr10 4095505 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,418 +chr10 4095622 . A G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-1.076;DP=17;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.28;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:509,0,109 +chr10 5096542 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.572;DP=54;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:279,0,1709 +chr10 5097521 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.608;DP=88;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=3.82;ReadPosRankSum=-2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:364,0,3084 +chr10 5113932 . CCCTGAACACAACACAAACACAAACACACTCTGGTATCGGCCACAGGACCACAAATAATGGACCTGCGCGTGTGCTATTCAGCTGTGCGTGAGTGTATATCGTA C 3264.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=1.549;DP=91;FS=2.169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=30.01;ReadPosRankSum=-2.891 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,80:83:99:3302,241,0 +chr10 6212746 . G C 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 +chr10 6245179 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.019;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:277,0,1074 +chr10 6246893 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.244;DP=41;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:329,0,1140 +chr10 6250150 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.612;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:382,0,375 +chr10 6269565 . CTG C 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=-1.034;DP=111;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,25:110:99:582,0,4260 +chr10 6271084 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=32.98;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:58:358,0,58 +chr10 6271086 . A C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=33.62;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:58:358,0,58 +chr10 6377152 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:271,0,57 +chr10 6690024 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.224;DP=34;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:608,0,641 +chr10 6694296 . TCTGAAAGGATCAGATTGGCTCATTTGCAATTCAAACACAGATTTAATGTTTAGCAGTGCAGGACGTTTGGACGTTTCCTCAC T 3021.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=2.077;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=33.95;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,80:86:99:3059,0,696 +chr10 6742236 . T C 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-2.036;DP=113;FS=3.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.935;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:844,0,3055 +chr10 6749917 . G A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-0.680;DP=90;FS=2.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,30:90:99:858,0,2287 +chr10 6751064 . GA G 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.460;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:262,0,520 +chr10 6837890 . AAT A 1427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.295;DP=241;FS=3.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,58:218:99:1465,0,6260 +chr10 6937547 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:332,0,45 +chr10 7004983 . CACCTGAATCACATAGGATTCATTAAATATTAGCAATGCAAACACTTTAAGCGCCTATAAGAGCTTTACATGAATATAAAAAGTA C 8355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.105;DP=382;FS=9.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.480;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,248:352:99:8393,0,2800 +chr10 7004988 . GAATCACATAGGATTCATTAAATATTA G 2390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.625;DP=370;FS=9.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,101:356:99:2428,0,9916 +chr10 7005016 . CAATGCAAACACTTTAAGCGCCTATAAGAGCTTTACATGAATATAAAAAGTAACCTGGA C 2435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.604;DP=391;FS=10.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,107:376:99:2473,0,9915 +chr10 7005390 . TCCTGGAGAGAGAGACGATTTATATTGAAACTGCTGTGAAATTAAATGGCTGCATCTGAAACATGAATGCAGCAGAGTA T 14447.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=4.255;DP=340;FS=2.333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.402;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,327:340:99:14485,1170,0 +chr10 7005588 . TCCTAAAGAACAAACATTCATGTTGAGGGCTCATTTCATTCCTTTGAGGACTGATTTTGGTTCAGATCAACGCA T 13708.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=2.720;DP=323;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.961;QD=25.42;ReadPosRankSum=-1.998 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,317:323:99:13746,1129,0 +chr10 7009462 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.731;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.192;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:237,0,1017 +chr10 7009708 . G A 1687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=-0.375;DP=83;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=20.33;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,49:83:99:1716,0,1193 +chr10 7009847 . G T 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.743;DP=182;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,53:182:99:1389,0,8214 +chr10 7009848 . T A 2727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.521;DP=182;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,75:182:99:2756,0,5838 +chr10 7009924 . C A 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=-2.565;DP=163;FS=4.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,60:163:99:2068,0,3585 +chr10 7010116 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.370;DP=40;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:246,0,2181 +chr10 7010121 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.406;DP=36;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:246,0,2218 +chr10 7011427 . G GA 532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=1.699;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=6.34;ReadPosRankSum=-3.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:570,0,3023 +chr10 7011436 . G T 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.472;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=14.85;ReadPosRankSum=2.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1927,0,1118 +chr10 7012208 . C G 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=-1.841;DP=165;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,55:165:99:1580,0,4255 +chr10 7017951 . G A 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.205;DP=99;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:1286,0,2123 +chr10 7020765 . TCTGAAACAGAGGTAACACATACAATGAATTCACAAATACTACAGTAAAAAAAGATGTGTGGTACAGTGATTCCATGTGTTTTTCGTATGTATAATCAAACACTCAC T 4356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.616;DP=100;FS=8.479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,92:100:99:4394,402,0 +chr10 7038373 . C T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.918;DP=59;FS=9.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:827,0,1201 +chr10 7038457 . G T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=-2.732;DP=62;FS=11.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=14.74;ReadPosRankSum=2.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:942,0,1188 +chr10 7061836 . G A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=-0.612;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:911,0,1063 +chr10 7066075 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:380,0,219 +chr10 7066166 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.961;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:353,0,458 +chr10 7066357 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-1.053;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:377,0,726 +chr10 7074429 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:45:258,0,45 +chr10 7074549 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr10 7074564 . A G 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 +chr10 7074741 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr10 7080616 . A T 482.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.504;DP=15;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=32.19;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:2:509,2,0 +chr10 7087869 . C T 5206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.711;DP=179;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,136:178:99:5235,0,961 +chr10 7157166 . T C 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:482,33,0 +chr10 7181363 . T A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.226;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:297,0,1491 +chr10 7184024 . G A 845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:874,66,0 +chr10 7193158 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.759;DP=36;FS=8.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:273,0,985 +chr10 7198231 . A T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.842;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:558,0,844 +chr10 7207664 . G C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-0.087;DP=40;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:356,0,989 +chr10 7211855 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=1.025;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:389,0,820 +chr10 7213477 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.279;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:254,0,712 +chr10 7220065 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-2.922;DP=24;FS=6.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=20.70;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:525,0,303 +chr10 7221007 . T C 1874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.127;DP=119;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1903,0,1977 +chr10 7236822 . G A 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.718;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:1560,0,1598 +chr10 7251254 . T C 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=-0.157;DP=117;FS=4.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1715,0,2332 +chr10 7267083 . G A 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.595;DP=105;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1823,0,1739 +chr10 7275221 . A G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=-0.438;DP=99;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:1598,0,1820 +chr10 7289133 . TA T 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-1.172;DP=31;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:311,0,400 +chr10 7289208 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.660;DP=51;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:503,0,1170 +chr10 7292436 . GCTTTGACAAAGAGAAAGGTGTTAATGCACATGATCATCACCATTGTAGTATATTCACGTTTTTCCGGTTCCCGTTCTACCAAGCATTGCTGATTAAGCAGTGCCTCATTTATTATTCTAGCTAACTCAACTCTAAAATTCTGGCATGACGCATCAAATCTGAGTCAACCACACCACCTAC G 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=3.171;DP=153;FS=4.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=4.50;ReadPosRankSum=-3.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,138:148:99:771,0,3629 +chr10 7381624 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:286,0,248 +chr10 7489800 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-2.409;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:297,0,754 +chr10 7490776 . G GA 1375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.769;DP=59;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1413,0,253 +chr10 7491431 . A C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-2.318;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:246,0,1274 +chr10 7492895 . T G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.899;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=14.82;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:369,0,461 +chr10 7492912 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.457;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:373,0,451 +chr10 7494064 . A C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-1.695;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:456,0,1315 +chr10 7557982 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.151;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:393,0,183 +chr10 8360001 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=2.964;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=16.11;ReadPosRankSum=-2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:431,0,473 +chr10 8360329 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,580 +chr10 8416829 . T A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr10 8720294 . C T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.226;DP=54;FS=8.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:904,0,1033 +chr10 8720754 . A G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=1.531;DP=53;FS=9.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:626,0,1267 +chr10 8720825 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.668;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:773,0,800 +chr10 8721048 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=1.037;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:404,0,592 +chr10 8749764 . GA G 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=1.866;DP=83;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:519,0,1764 +chr10 8750914 . C T 2434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.104;DP=109;FS=9.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=22.34;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,70:109:99:2463,0,1344 +chr10 8751159 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.562;DP=42;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:659,0,703 +chr10 8751352 . G A 2325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-1.353;DP=138;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:2354,0,2315 +chr10 8760958 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:405,0,51 +chr10 8761345 . GT G 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:261,0,187 +chr10 8762833 . T G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:298,0,219 +chr10 8880800 . C A 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1064,72,0 +chr10 8880809 . G T 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:72:1064,72,0 +chr10 8890883 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.165;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:455,0,823 +chr10 8893026 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.019;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:382,0,788 +chr10 8893125 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.261;DP=58;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:502,0,1516 +chr10 8897813 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.122;DP=47;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:583,0,1049 +chr10 8900287 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.195;DP=46;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:405,0,2650 +chr10 8900288 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.477;DP=47;FS=2.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:398,0,2650 +chr10 8903228 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-1.535;DP=38;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=17.10;ReadPosRankSum=2.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:678,0,682 +chr10 8919659 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.528;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:523,0,848 +chr10 8920456 . A T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-0.161;DP=43;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:618,0,930 +chr10 8925511 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.687;DP=43;FS=5.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:268,0,1200 +chr10 8928594 . AGTACACTTTTCTACATGATTGTGTTCTTTTACAGTTCTGCCACGTGTGATCTGTTAGTAATGCACATTTTCTTATCTAAAAAAATATTCCTCTATAG A 1273.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=2.286;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=36.74;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:99:1311,145,0 +chr10 8931892 . A T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.708;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:627,0,1124 +chr10 8933396 . T C 628.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.327;DP=17;FS=4.523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=29.42;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:11:656,11,0 +chr10 8949505 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,449 +chr10 8949593 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=24.98;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:303,0,93 +chr10 9010465 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=2.239;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:306,0,540 +chr10 9012644 . T C 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.414;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:702,0,144 +chr10 9012797 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.919;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:298,0,367 +chr10 9023746 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,288 +chr10 9033744 . G C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,645 +chr10 9034794 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=24.80;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:301,0,100 +chr10 9036129 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=2.013;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:287,0,474 +chr10 9065189 . C G 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.147;DP=70;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:1174,0,1106 +chr10 9065917 . T A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=1.002;DP=52;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,44:52:99:1674,0,115 +chr10 9066047 . C A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-1.382;DP=68;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1160,0,1904 +chr10 9066091 . T C 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-1.948;DP=64;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=16.26;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1069,0,1106 +chr10 9179853 . A AT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.100;DP=47;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:289,0,452 +chr10 9184219 . G T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:271,0,301 +chr10 9249874 . G A 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.891;DP=78;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,41:78:99:1384,0,1350 +chr10 9249995 . A G 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.109;DP=128;FS=4.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:2118,0,2154 +chr10 9265046 . A T 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=1.941;DP=117;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.885;QD=13.41;ReadPosRankSum=2.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,45:117:99:1597,0,2599 +chr10 9267679 . C T 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-2.139;DP=101;FS=9.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:1512,0,1995 +chr10 9325534 . A G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.667;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=33.92;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:571,0,114 +chr10 9351192 . C T 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.766;DP=163;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,48:163:99:1213,0,4226 +chr10 9367021 . A T 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 +chr10 9367050 . A G 586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:615,47,0 +chr10 9367134 . G A 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:527,36,0 +chr10 9367400 . A C 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr10 9375510 . A C 2600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2629,186,0 +chr10 9375591 . T C 2560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2589,187,0 +chr10 9398542 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-0.422;DP=47;FS=9.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:413,0,1214 +chr10 9485515 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.684;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,739 +chr10 9729495 . GAGGTTTAAATTTATATTGCATGTTGTGATTTTTGAATGTTTTTCTTCAGCTTTTAGAATGATTCATGTTCTCCTCTGTTTTC G 853.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=2.246;DP=26;FS=7.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=32.84;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:99:891,0,351 +chr10 9798379 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-2.117;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:235,0,330 +chr10 10150327 . A T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr10 10668047 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,110 +chr10 10724467 . C G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.137;DP=36;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:290,0,935 +chr10 10967197 . AT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:251,0,1072 +chr10 11480088 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:233,0,446 +chr10 11923468 . A C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr10 11974584 . A C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-1.447;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:234,0,283 +chr10 11974879 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=2.431;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=16.58;ReadPosRankSum=-2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,267 +chr10 11977301 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-1.087;DP=35;FS=11.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:549,0,603 +chr10 11979677 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=-1.791;DP=50;FS=10.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:517,0,2280 +chr10 11979704 . T C 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=1.128;DP=142;FS=35.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=9.92;ReadPosRankSum=4.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:1437,0,3560 +chr10 11979718 . T G 2454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.523;ClippingRankSum=-7.098;DP=171;FS=110.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=14.36;ReadPosRankSum=-5.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:2483,0,3465 +chr10 11979811 . C A 9498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=-0.040;DP=262;FS=6.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=26.95;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,104:122:88:9527,0,88 +chr10 11979869 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=4.308;DP=33;FS=32.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:367,0,1961 +chr10 12576481 . A T 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:543,42,0 +chr10 12577187 . C G 583.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-1.335;DP=27;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=21.62;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:24:612,0,24 +chr10 12734573 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,326 +chr10 12950945 . T A 599.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.123;DP=19;FS=3.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=31.55;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:8:627,8,0 +chr10 12950947 . T C 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 +chr10 14571818 . C CA 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.657;DP=163;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,40:158:99:539,0,2332 +chr10 14949561 . G GT 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-1.044;DP=126;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:261,0,1604 +chr10 15090641 . G C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 +chr10 15090648 . A T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr10 15627054 . A G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.073;DP=75;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:347,0,2584 +chr10 16031375 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.210;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:330,0,806 +chr10 16031402 . A G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=-0.782;DP=37;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:577,0,704 +chr10 16090459 . T C 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.850;DP=31;FS=11.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:543,0,689 +chr10 16517421 . A G 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 +chr10 16517452 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.775;DP=20;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=12.14;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:271,0,409 +chr10 16608562 . C T 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr10 18937166 . G GT 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-0.929;DP=102;FS=7.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:402,0,1688 +chr10 19024715 . C CCA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-2.154;DP=16;FS=6.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=17.86;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:86:323,0,86 +chr10 19549573 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:237,0,65 +chr10 19550366 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.454;DP=20;FS=16.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=19.04;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:409,0,293 +chr10 19576422 . CGTAAGTCAAGCGCATAAACACACTCCTCCGCTCATCACACCAGTTATCCTTCATTATCCTTTTTTTCTGAATCATCCACAG C 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:416,0,496 +chr10 19622763 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:260,0,290 +chr10 19622765 . A C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 +chr10 20117904 . AAGGTAAGCTCAACACATCTTGTCTTTCTTGATTCACAATTGTGACACAACATTTATGTGATGTGTGTGTGTTTTTC A 5427.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=1.716;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,122:124:99:5465,476,0 +chr10 20134983 . G GT 848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.925;DP=159;FS=5.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,49:140:99:886,0,2299 +chr10 20181127 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.348;DP=58;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:564,0,1510 +chr10 20269991 . TA T 822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.196;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,31:107:99:860,0,6079 +chr10 20290797 . G GA 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.186;DP=47;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:427,0,533 +chr10 20405291 . A AT 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=-2.474;DP=162;FS=1.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:655,0,2781 +chr10 20405892 . G A 1696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.056;DP=235;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,68:235:99:1725,0,6593 +chr10 20429360 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:237,0,506 +chr10 20429397 . CGGTAATGCTTCCAGACATAATGCCATGTTACACACTAACACAAACACACACTCTGACATTTTTAATGTGGTGCA C 1135.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.133;DP=26;FS=4.607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:96:1173,96,0 +chr10 20433262 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.910;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=15.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,292 +chr10 20439681 . T C 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=1.524;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:1156,0,1779 +chr10 20440068 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-2.149;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:366,0,1141 +chr10 20440702 . G GA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.380;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:339,0,414 +chr10 20441034 . A G 2191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-1.431;DP=87;FS=11.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,59:87:99:2220,0,768 +chr10 20441137 . A C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.515;DP=34;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:328,0,888 +chr10 20441393 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=-0.338;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:253,0,1180 +chr10 20441540 . T C 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.315;DP=57;FS=5.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:844,0,1166 +chr10 20444248 . A T 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.315;DP=75;FS=14.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:1173,0,1437 +chr10 20468172 . G T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.113;DP=87;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:751,0,2066 +chr10 20482670 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=13.52;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,368 +chr10 20482999 . G C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.403;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:363,0,445 +chr10 20487686 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=2.010;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=3.67;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:278,0,2126 +chr10 20487754 . A T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.533;DP=26;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=31.99;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:62:860,0,62 +chr10 20487885 . T TA 219.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:254,0,1 +chr10 20488040 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,466 +chr10 20488418 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.466;DP=18;FS=14.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:277,0,360 +chr10 20488543 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.427;DP=28;FS=13.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:255,0,1208 +chr10 20488551 . T C 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.373;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:518,0,398 +chr10 20488777 . A C 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=-2.961;DP=80;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:1152,0,1647 +chr10 20488846 . A T 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=-1.710;DP=110;FS=9.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:110:99:1000,0,2964 +chr10 20488942 . A C 2700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.899;DP=86;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,71:86:99:2729,0,236 +chr10 20489038 . C A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:96:865,0,96 +chr10 20491615 . A T 2203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.324;DP=76;FS=3.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=29.00;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,57:76:99:2232,0,440 +chr10 20525140 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=4.980;DP=117;FS=8.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=6.35;ReadPosRankSum=-2.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:771,0,3265 +chr10 20526578 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.397;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=2.36;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:358,0,4487 +chr10 20540448 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.136;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:237,0,1377 +chr10 20544112 . TCTGAGAAGAGACCAGCAGAATTATCAGTACATGATCATTTATGTATCCAGCATTCTGAACATTAAAGAGAATATTTGAC T 1785.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=1.528;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=30.37;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1823,164,0 +chr10 20554461 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.954;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:230,0,2133 +chr10 20598790 . T A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.151;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:471,0,939 +chr10 20621758 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.411;DP=33;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,1036 +chr10 20621917 . T C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=1.545;DP=18;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=37.22;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:753,0,130 +chr10 20622207 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.160;DP=27;FS=10.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:389,0,612 +chr10 20622286 . A G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.502;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:531,0,1178 +chr10 20622330 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.494;DP=53;FS=2.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:423,0,1419 +chr10 20624440 . A C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.147;DP=65;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:577,0,1656 +chr10 20624499 . T C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-0.757;DP=84;FS=3.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,24:84:99:595,0,2270 +chr10 20624541 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-1.655;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:541,0,2636 +chr10 20630338 . C T 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 +chr10 20639111 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-1.275;DP=68;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=5.50;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:402,0,1889 +chr10 20679550 . C G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.858;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,31:139:99:548,0,4115 +chr10 20999749 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,136 +chr10 21124729 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=-0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=15.55;ReadPosRankSum=-2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:277,0,292 +chr10 21523717 . G T 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.135;DP=320;FS=15.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,71:319:99:1393,0,9477 +chr10 21524827 . G GT 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=-0.851;DP=165;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,36:150:99:546,0,3970 +chr10 21551139 . C T 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.563;DP=163;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,56:161:99:1680,0,3696 +chr10 21551732 . G GA 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.215;DP=26;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:253,0,264 +chr10 21613905 . T C 212.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:21:241,0,21 +chr10 21614037 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:280,0,108 +chr10 21647055 . C T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr10 21659474 . A G 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:275,0,22 +chr10 21659906 . T A 271.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:300,0,19 +chr10 21696452 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-2.026;DP=69;FS=2.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.625;QD=5.19;ReadPosRankSum=3.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:386,0,2001 +chr10 21728706 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.391;DP=58;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:250,0,2611 +chr10 21729391 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-2.916;DP=66;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:447,0,1792 +chr10 21729438 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.617;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:404,0,2243 +chr10 21729712 . TA T,TAA 671.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.099;DP=100;FS=5.993;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:21,42,28:91:99:1080,244,909,539,0,1266 +chr10 21738604 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:318,0,59 +chr10 21738684 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr10 21739223 . T G 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr10 21739494 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.380;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:514,0,161 +chr10 21739556 . T C 1010.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.040;DP=25;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1039,72,0 +chr10 21739892 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.283;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:480,0,491 +chr10 21739894 . C G 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.392;DP=22;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=31.53;ReadPosRankSum=1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:83:722,0,83 +chr10 21740184 . C A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.069;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:499,0,510 +chr10 21750054 . C T 500.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.594;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=33.39;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:27:529,0,27 +chr10 21750276 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr10 21753668 . T C 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +chr10 21757793 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,137 +chr10 21757851 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:36:340,0,36 +chr10 21764195 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:327,0,93 +chr10 21768065 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-2.258;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:298,0,288 +chr10 21768532 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr10 21792362 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:264,0,56 +chr10 21792630 . G A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr10 21798695 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,266 +chr10 21798698 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,266 +chr10 21799583 . G A 227.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=22.71;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:11:255,11,0 +chr10 21805873 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.217;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=31.12;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:495,0,199 +chr10 21805876 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.361;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=31.12;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:495,0,199 +chr10 21806778 . T C 342.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.18;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:371,0,13 +chr10 21814612 . G GT 219.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:257,21,0 +chr10 21814742 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr10 21816524 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.099;DP=24;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:370,0,447 +chr10 21835014 . C G 247.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:276,0,13 +chr10 21852056 . A T 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.639;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:730,0,247 +chr10 21852443 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=30.77;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:39:459,0,39 +chr10 21852801 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.170;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:437,0,488 +chr10 21852879 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.157;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=10.08;ReadPosRankSum=2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:260,0,1420 +chr10 21852889 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.087;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:260,0,1420 +chr10 21853107 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:280,0,419 +chr10 21853123 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:282,0,411 +chr10 21853796 . A T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.504;DP=29;FS=8.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:563,0,459 +chr10 21853910 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr10 21854072 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.109;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=16.92;ReadPosRankSum=-2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:519,0,521 +chr10 21862530 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:414,0,251 +chr10 21862693 . T C 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 +chr10 21862942 . A G 789.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:22:818,22,0 +chr10 21863057 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,136 +chr10 21863130 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,171 +chr10 21863268 . G A 437.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=33.66;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:464,0,3 +chr10 21863688 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-1.999;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:401,0,541 +chr10 21863996 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:314,0,133 +chr10 21864433 . A T 245.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:274,0,15 +chr10 22004030 . A C 730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:759,54,0 +chr10 22004504 . A G 2061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-1.297;DP=90;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,60:90:99:2090,0,968 +chr10 22019737 . C T 2252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2281,163,0 +chr10 22020547 . G A 2274.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2303,166,0 +chr10 22020559 . C T 2145.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2174,160,0 +chr10 22020988 . G A 2351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2380,178,0 +chr10 22021037 . G A 2768.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2797,205,0 +chr10 22021198 . T C 2015.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2044,141,0 +chr10 22021284 . G A 2050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2079,144,0 +chr10 22021318 . T C 1933.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1962,141,0 +chr10 22021344 . C A 1762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1791,126,0 +chr10 22021405 . A G 2664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2693,190,0 +chr10 22021786 . T G 2171.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2200,154,0 +chr10 22022086 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-2.647;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:331,0,2210 +chr10 22026061 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:314,0,249 +chr10 22028252 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,334 +chr10 22582586 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,248 +chr10 22710594 . A T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.553;DP=40;FS=4.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:473,0,918 +chr10 22716974 . T TGAC 2416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=1.168;DP=86;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.822;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,66:83:99:2454,0,373 +chr10 22733193 . TA T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:342,0,329 +chr10 22807463 . T C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=1.695;DP=45;FS=11.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=9.77;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:468,0,2180 +chr10 22945811 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.995;DP=180;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,36:179:99:590,0,5640 +chr10 22947531 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.896;DP=185;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,37:185:99:559,0,5579 +chr10 22949285 . A G 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.324;DP=135;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,42:134:99:1126,0,3653 +chr10 22953731 . C T 1899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=1.579;DP=170;FS=2.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.099;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,58:170:99:1928,0,3895 +chr10 22954282 . T C 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.570;DP=120;FS=3.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=7.74;ReadPosRankSum=2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,36:120:99:957,0,3246 +chr10 22958324 . AGTGAGTGCAGTGTTGAGGTATTCAAGTTTTCGACACCTATTTTACTGTACTATGGCATTCCAGCTCCTCCTCCTCATCTTCTCTTTCAG A 9028.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=1.302;DP=208;FS=5.444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=28.56;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,199:208:99:9066,666,0 +chr10 22958540 . TGTGAGGAACATTAAGTATACTGAAGGCATATGATATTGTGTAATGATTCGTTTTATGTGAGTGTGCATATGTGCATATGTGTATGTGTGTTGAACAG T 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=5.584;DP=213;FS=4.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=2.90;ReadPosRankSum=-4.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,189:212:99:656,0,5856 +chr10 22961837 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=1.072;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:473,0,1212 +chr10 22961862 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.714;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:299,0,807 +chr10 22962939 . A AT 564.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.473;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=24.55;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:65:649,65,0 +chr10 22963096 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-0.133;DP=40;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:303,0,1642 +chr10 22976309 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=-1.611;DP=51;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:682,0,979 +chr10 23037731 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.714;DP=67;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:426,0,1805 +chr10 23037745 . T C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.146;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:730,0,1390 +chr10 23041986 . GACCTGAGAAACAGTGAAGGTGACAATTGGTAAACTGTCACACGTCAGTTTTGAAGATGCACTTAACATTGAAGGAAGACACAGAGATGGGGTTCACTC G 3372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=1.885;DP=79;FS=12.026;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=32.14;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3410,292,0 +chr10 23050762 . G C 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.310;DP=47;FS=9.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:738,0,888 +chr10 23055942 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.076;DP=38;FS=9.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:473,0,900 +chr10 23097096 . C A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-0.842;DP=77;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:932,0,2119 +chr10 23097294 . T C 1387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.287;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:1416,0,1423 +chr10 23097523 . C A 2523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.468;DP=84;FS=5.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=30.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,67:84:99:2552,0,299 +chr10 23106748 . C T 2161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=1.267;DP=86;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=25.14;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,58:86:99:2190,0,792 +chr10 23107022 . A T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.978;DP=76;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:695,0,2031 +chr10 23107097 . T C 2080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.352;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=28.50;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,55:73:99:2109,0,433 +chr10 23107158 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.486;DP=71;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:321,0,2267 +chr10 23107498 . C G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.186;DP=58;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:677,0,1326 +chr10 23107555 . TA T 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.698;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:514,0,697 +chr10 23107644 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.98;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,133 +chr10 23110526 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.083;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:360,0,492 +chr10 23112404 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr10 23112597 . G T 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 +chr10 23112854 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.136;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:248,0,792 +chr10 23112861 . C T 1238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1267,90,0 +chr10 23118754 . C T 1122.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1151,81,0 +chr10 23118778 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-2.434;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:314,0,782 +chr10 23126436 . A T 1938.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1967,138,0 +chr10 23126507 . A T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.227;DP=38;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:496,0,893 +chr10 23126708 . A C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.631;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:410,0,827 +chr10 23126751 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=-0.083;DP=37;FS=3.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:316,0,902 +chr10 23146747 . A G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr10 23285550 . TA T 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.340;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:97:283,0,97 +chr10 23331139 . G C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.408;DP=37;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:284,0,955 +chr10 23338083 . TCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAATATTTCACAATACAGCATTTTAGATCTAGCAGACTATACATAGAAATCTCAGACTTGCAATCAATACTGCATATGCTCAC T 1923.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.829;DP=46;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1961,176,0 +chr10 23366899 . A G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.013;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:512,0,880 +chr10 24753019 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=1.271;DP=30;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:347,0,704 +chr10 24822444 . GT G 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:68:314,0,68 +chr10 24822731 . A T 3676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:99:3705,287,0 +chr10 24822888 . C G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.792;ClippingRankSum=7.492;DP=188;FS=21.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=1.83;ReadPosRankSum=-7.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,34:188:99:373,0,5933 +chr10 24822990 . T A 1520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=1.054;DP=86;FS=13.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,49:85:99:1549,0,1354 +chr10 24823710 . CT C 368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:406,39,0 +chr10 24825010 . A T 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 +chr10 24837625 . G A 1107.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1136,81,0 +chr10 24856453 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-0.219;DP=154;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:360,0,4843 +chr10 24873592 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.975;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=8.57;ReadPosRankSum=2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:414,0,1604 +chr10 24995243 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.495;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:449,0,1649 +chr10 24995547 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.055;DP=61;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:424,0,1635 +chr10 24996335 . A T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-2.029;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=5.52;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:332,0,3310 +chr10 25004999 . G T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.309;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:748,0,882 +chr10 25031366 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.364;DP=79;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:604,0,1983 +chr10 25052730 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.824;DP=82;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:302,0,3242 +chr10 25054308 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.424;DP=59;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:249,0,2318 +chr10 25054574 . A G 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.503;DP=37;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:598,0,702 +chr10 25055615 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.969;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:255,0,1053 +chr10 25081170 . C CA 962.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.516;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,57:68:50:1293,0,50 +chr10 25081643 . C T 2498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.011;DP=118;FS=1.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:2527,0,1689 +chr10 25081710 . T TA 629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.088;DP=68;FS=5.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:667,0,618 +chr10 25081776 . T TA 1080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=-0.924;DP=90;FS=5.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:1118,0,989 +chr10 25085161 . T C 1422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.176;DP=117;FS=9.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=12.16;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,43:116:99:1460,0,2564 +chr10 25087676 . CCCTTAAAAGTCCCAATAAAATCCACAATGAATTCAAAAGATTTACATCTGGCAATATGTTTTTAAACATTTATATAGTAAATCAGCTCA C 7111.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-0.419;DP=191;FS=5.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,181:189:99:7149,533,0 +chr10 25090181 . GACCTGAAGAAGCACATTAAATGGGTAAACACATGCAAAACACTGCAGAATTAGTTACACAATTTCAACAC G 5676.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=1.577;DP=145;FS=2.149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=24.59;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,142:145:99:5714,460,0 +chr10 25090726 . T A 3375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-3.303;DP=128;FS=17.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=26.37;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,88:128:99:3404,0,1152 +chr10 25123645 . AGTAAGTAAGCTAATAAATTGCTGACACAATGACGCATTGGCATTGTTATTATTCTTGCATGTCATTCTGATTTGTTTTGCAG A 7175.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.008;DP=187;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=31.02;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,183:187:99:7213,530,0 +chr10 25127004 . A ATCAGAGAGGTCG 5233.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5271,364,0 +chr10 25140388 . A T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.176;DP=48;FS=4.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:871,0,788 +chr10 25140932 . C CA 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.227;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:390,0,1051 +chr10 25140941 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.665;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:497,0,1417 +chr10 25150646 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.758;DP=61;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1043,0,1072 +chr10 25155274 . G T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.733;DP=50;FS=4.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:750,0,912 +chr10 25155289 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.123;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:527,0,1094 +chr10 25155405 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.936;DP=33;FS=5.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:313,0,875 +chr10 25155477 . T G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:357,0,734 +chr10 25157628 . T TC 2542.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-1.189;DP=162;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:2580,0,2470 +chr10 25157796 . T A 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-4.153;DP=51;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=14.78;ReadPosRankSum=3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:782,0,1469 +chr10 25164000 . A G 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.359;DP=180;FS=3.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,94:180:99:3051,0,3049 +chr10 25947633 . T TA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-1.363;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:393,0,412 +chr10 25947676 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.813;DP=44;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:818,0,722 +chr10 25953479 . AACCTGAAAAGATAAACAGGTGAGATGAGGACCTCTAATAAGATGTTAAATTCATCTGTTCAAATCACAATTT A 1991.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.604;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:2029,181,0 +chr10 25959635 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-2.036;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:624,0,1213 +chr10 25959641 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-2.092;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:624,0,1213 +chr10 25972390 . G A 2674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=1.377;DP=418;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=6.40;ReadPosRankSum=3.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,112:417:99:2703,0,11731 +chr10 25972654 . ACTGTAAAAAAAGATATATATTATTACAAACAAAATAAAAAGGATCTTTGTGACAGTACAGTAAAGCAATCACGCATTAC A 7292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-2.471;DP=274;FS=5.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=26.62;ReadPosRankSum=-2.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,157:273:99:7330,0,8653 +chr10 25972655 . CTGT C 4107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.139;DP=272;FS=5.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=15.10;ReadPosRankSum=2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,114:271:99:4145,0,8372 +chr10 25972659 . AAAAAAAGATATATATTATTACAAACAAAATAAAAAGGATCTTTGTGACAGTACAGTAAAGCAATCACGCATTACCG A 4107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.446;DP=284;FS=4.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=14.46;ReadPosRankSum=2.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,114:282:99:4145,0,8397 +chr10 26016133 . C T 673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:702,51,0 +chr10 26017493 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.465;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:395,0,482 +chr10 26017886 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=21.86;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:378,0,205 +chr10 26208779 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.568;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:296,0,1793 +chr10 26291701 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.183;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:254,0,1927 +chr10 26335971 . G A 4102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=-1.176;DP=234;FS=10.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,121:233:99:4131,0,3885 +chr10 26336505 . A G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-0.547;DP=192;FS=3.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,48:192:99:978,0,5376 +chr10 26342776 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.000;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:424,0,576 +chr10 26345348 . C T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-1.637;DP=175;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=3.91;ReadPosRankSum=2.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,37:174:99:713,0,5145 +chr10 26396969 . C CT 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.826;DP=25;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:429,0,115 +chr10 26400029 . TCTGAGAAGAAAATAATAATCAATTAAAACTTTAATATCTGATTCTTCCTCATATCAATACGAGTTATGAAGCCACAAAC T 1242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=3.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:99:1280,106,0 +chr10 26405102 . C G 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:766,54,0 +chr10 26409127 . A T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.032;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:759,0,145 +chr10 26417908 . C T 811.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:840,60,0 +chr10 26595308 . T TA 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-1.669;DP=106;FS=4.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:473,0,4346 +chr10 26595498 . G C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.298;DP=44;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:276,0,3004 +chr10 26595503 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.932;DP=43;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:276,0,3004 +chr10 26595540 . T A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-1.147;DP=33;FS=10.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:493,0,659 +chr10 26596103 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.709;DP=21;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:241,0,484 +chr10 26619552 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-1.281;DP=29;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:646,0,385 +chr10 26619951 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.437;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:268,0,657 +chr10 26727262 . A T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=1.338;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=30.47;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:56:729,0,56 +chr10 26737699 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:364,0,176 +chr10 26744992 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.105;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=26.16;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:630,0,141 +chr10 26747829 . G A 419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:448,33,0 +chr10 26748836 . A ATT 697.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=30.34;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:22:735,22,0 +chr10 26766449 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.473;DP=55;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:234,0,1754 +chr10 26775605 . A T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.981;DP=79;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:922,0,1604 +chr10 26778472 . G A 1848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-0.598;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,50:67:99:1877,0,372 +chr10 26778685 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-3.001;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=21.32;ReadPosRankSum=2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:348,0,150 +chr10 26903931 . T TTC 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:448,0,147 +chr10 27175575 . G A 1644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.242;DP=58;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,45:58:99:1673,0,313 +chr10 27468822 . GT G 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.07;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:368,0,120 +chr10 27559152 . GGGTAAGTCTCTGATTCACAAATTGAGAACACAACCTTACAATTCATATGCACTGAATGTCTTTTGTATATGCA G 1074.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.847;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:99:1112,0,401 +chr10 27562234 . A G 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-1.180;DP=62;FS=8.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:791,0,1373 +chr10 27604713 . TACAGGTATCCCATATCTGTTATATTTAGGATAAATCAAACTCTAAATGCATATAATCATGCTGCTGTTTTCTTTTTAA T 2307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=1.019;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:2345,175,0 +chr10 27796702 . G T 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=1.147;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=19.13;ReadPosRankSum=-2.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:889,0,660 +chr10 27796896 . T G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.225;DP=73;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:840,0,1662 +chr10 28659555 . C T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.575;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:665,0,1331 +chr10 28712182 . GT G 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.213;DP=75;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:602,0,1114 +chr10 28739031 . C T 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.963;DP=86;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1192,0,1385 +chr10 28852619 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.875;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:445,0,880 +chr10 28853884 . CA C 278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:316,21,0 +chr10 28853891 . A C 287.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:316,21,0 +chr10 28860793 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=1.266;DP=71;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:637,0,1874 +chr10 28872747 . ACTGCTCCAAAACATTCAAACAGAGATATTTAATTGTGGATAAGAGATACAAAGGATATAATTTAGTTTGTCCACTTTGACATACTCAC A 3387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=2.320;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=29.06;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:76:99:3425,284,0 +chr10 28880446 . AC A 1766.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.118;ClippingRankSum=1.862;DP=188;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:1804,0,3427 +chr10 28880471 . C T 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=1.531;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1214,0,2236 +chr10 28993399 . AC A 4993.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:5031,488,0 +chr10 29050478 . A ATGG 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.135;DP=58;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:73:412,0,73 +chr10 29107357 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 +chr10 29109459 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 +chr10 29125445 . T A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr10 29125457 . A C 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr10 29144857 . C T 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:670,48,0 +chr10 29145727 . T A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr10 29165221 . G T 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1007,72,0 +chr10 29372691 . G A 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.701;DP=42;FS=11.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=32.07;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,36:42:52:1375,0,52 +chr10 29377650 . T A 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=-0.654;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,55:71:99:1965,0,414 +chr10 29965392 . A AT 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=-0.757;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:805,0,396 +chr10 29993819 . G T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr10 30005040 . A G 257.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:286,0,21 +chr10 30005063 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr10 30008493 . T TA 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-1.431;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:330,0,189 +chr10 30012721 . TCTGTTGGGTTTTAAACGGGAAACGTTCATATACAGCATTAGAGACCAAACTTGCGTTGTAATATATTTGCATATAAAAAGCGAACTTGC T 2295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.355;ClippingRankSum=1.209;DP=75;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=30.61;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,55:65:99:2333,0,3093 +chr10 30593359 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=30.37;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:423,0,48 +chr10 30598731 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-1.504;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,425 +chr10 30633922 . ACTGAAACACACATTGCCATTAAAACCACATAGAAAGTAGGTGAAAATAATAGGTGTAAATAAGTGACAAACAGTCTCAC A 4074.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=1.695;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=32.40;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:4112,331,0 +chr10 30652661 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=-0.475;DP=62;FS=6.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:365,0,1674 +chr10 30725034 . TTTTA T 927.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=1.600;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=23.79;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:99:965,103,0 +chr10 30760556 . GGGTAAGCACGTCACTCCCTAAATATTTAAATGAATTTACATCAGTCATTTCAGAAGTTAACTTAAGATGCATTTCA G 6371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:6409,584,0 +chr10 32518314 . T TG 1574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1612,113,0 +chr10 32687620 . G T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr10 33454878 . AT A 221.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:259,28,0 +chr10 33455699 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=2.963;DP=72;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=4.69;ReadPosRankSum=-3.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:366,0,592 +chr10 33455700 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=3.416;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=4.90;ReadPosRankSum=-3.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:366,0,592 +chr10 33455961 . C CT 268.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:38:381,38,0 +chr10 33456060 . C T 718.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:747,51,0 +chr10 33459978 . A T 3312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3341,241,0 +chr10 33536456 . T TCA 636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:674,45,0 +chr10 33538020 . G C 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 +chr10 33544767 . TG T 367.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr10 33545735 . T G 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 +chr10 33627182 . GA G 375.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:2:411,0,2 +chr10 33790025 . ACTTAAAGCAACGAGAAAGAAACAATTCCAGTCACGCAAGAGAACTAATGCACCATTTATGAAATAAATTAATAAGAAAGACAAATGGAGAGACGCTAC A 2042.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=2.067;DP=47;FS=10.224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=30.69;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:99:2080,178,0 +chr10 33813207 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=3.056;DP=32;FS=13.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=21.27;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:709,0,406 +chr10 33855967 . GA G 2000.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=1.098;DP=92;FS=5.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=21.75;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,74:84:85:2039,85,0 +chr10 34128868 . GAGGTCAGCTTTTTCCACCATTCACAAACTTCAACATCTGATTTTCTAGTATTATTTTGAGACTTACATCTGAAAACCTGATTGCTTTCTT G 17525.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.308;DP=456;FS=2.361;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,439:442:99:17563,1298,0 +chr10 34134145 . AGTAAGTCAATTTATGTAAATATGAACTTGTTTCAGCACATTTAAATGAACAACTTTTAATTTCTCCTTTTAATGTCTTATTTTCTCCTTATAG A 2809.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=1.723;DP=411;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=6.84;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,373:374:99:2847,950,0 +chr10 34134553 . C T 18505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=-0.761;DP=460;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,457:459:99:18534,1349,0 +chr10 34138928 . T C 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 +chr10 34156567 . C A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr10 34199395 . G A 1498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1527,108,0 +chr10 34202818 . C T 2191.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2220,163,0 +chr10 34209220 . A G 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.193;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=31.64;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:33:660,33,0 +chr10 34218188 . G A 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:419,29,0 +chr10 34218232 . G A 2472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2501,181,0 +chr10 34221348 . T C 4213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:4242,310,0 +chr10 34221660 . T A 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:442,30,0 +chr10 34221661 . T A 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:442,30,0 +chr10 34221704 . A T 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 +chr10 34222783 . T TA 223.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:261,24,0 +chr10 34224008 . G GT 231.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:269,24,0 +chr10 34227077 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr10 34249093 . G T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr10 34249478 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr10 34253042 . C T 560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:589,42,0 +chr10 34257673 . G C 651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:680,48,0 +chr10 34257890 . T G 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:930,63,0 +chr10 34257900 . G A 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:930,63,0 +chr10 34257955 . A G 983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1012,72,0 +chr10 34257970 . A G 1069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1098,75,0 +chr10 34258510 . G A 911.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:940,66,0 +chr10 34258529 . C CA 654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:65:692,65,0 +chr10 34258557 . C T 911.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:940,69,0 +chr10 34258845 . C A 2838.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2867,202,0 +chr10 34258877 . T C 2092.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.556;DP=53;FS=4.690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=29.14;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2121,154,0 +chr10 34258931 . T G 2190.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2219,157,0 +chr10 34259180 . A T 897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:926,66,0 +chr10 34259306 . C A 2014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2043,141,0 +chr10 34259512 . G A 1456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1485,102,0 +chr10 34259519 . A G 1456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:1485,102,0 +chr10 34259794 . G T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:430,30,0 +chr10 34259828 . G A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:32:440,32,0 +chr10 34259949 . T A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:26:344,26,0 +chr10 34260098 . A G 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:665,48,0 +chr10 34260178 . C G 2404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2433,172,0 +chr10 34260316 . T A 918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:947,66,0 +chr10 34260317 . A G 918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:66:947,66,0 +chr10 34260500 . T C 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:672,45,0 +chr10 34260587 . G A 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 +chr10 34260692 . A T 1011.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1040,72,0 +chr10 34260752 . C G 1644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1673,117,0 +chr10 34261128 . A G 2494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2523,171,0 +chr10 34261190 . T C 1871.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1900,132,0 +chr10 34261373 . G A 1345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1374,99,0 +chr10 34261435 . C A 1440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1469,99,0 +chr10 34261437 . G T 1440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1469,99,0 +chr10 34261581 . C A 1866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1895,132,0 +chr10 34261661 . G C 2497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2526,178,0 +chr10 34262094 . G A 1751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1780,129,0 +chr10 34262118 . G C 1563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1592,120,0 +chr10 34262149 . G A 1910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1939,138,0 +chr10 34262313 . C G 3978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:4007,295,0 +chr10 34270605 . T C 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 +chr10 34283330 . C G 1141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1170,87,0 +chr10 34286997 . C T 950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:979,69,0 +chr10 34288851 . G A 2309.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2338,169,0 +chr10 34288935 . A G 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 +chr10 34293693 . C T 688.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:717,54,0 +chr10 34303149 . C T 485.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=34.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:512,2,0 +chr10 34319220 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr10 34321428 . A G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr10 34330205 . G A 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1046,72,0 +chr10 34332328 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr10 34332340 . A C 591.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:620,45,0 +chr10 34333201 . G A 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:782,57,0 +chr10 34333263 . C A 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:999,69,0 +chr10 34346675 . T C 2459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2488,182,0 +chr10 34355490 . A C 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.476;DP=64;FS=11.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,41:64:99:1354,0,776 +chr10 34428536 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +chr10 34428899 . C A 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr10 34431109 . T A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr10 34435140 . A G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 +chr10 34475997 . A T 1535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1564,114,0 +chr10 34479564 . A T 1422.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1451,102,0 +chr10 34496403 . C T 1453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1482,108,0 +chr10 34506295 . C T 783.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:812,57,0 +chr10 34564736 . G T 1931.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1960,138,0 +chr10 34568158 . A T 1934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.873;DP=82;FS=3.029;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=23.59;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:99:1963,102,0 +chr10 34568292 . T C 2329.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:2367,164,0 +chr10 34568301 . C A 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.440;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:905,0,851 +chr10 34568464 . A G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:651,48,0 +chr10 34617220 . A G 2179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2208,160,0 +chr10 34621775 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr10 34643283 . T C 5623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:5652,406,0 +chr10 34645488 . C CA 204.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +chr10 34930488 . A G 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:50:645,50,0 +chr10 34974468 . G T 2377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2406,169,0 +chr10 34984945 . A C 1361.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1390,105,0 +chr10 34985843 . C T 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 +chr10 34989075 . C T 851.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:880,63,0 +chr10 34989111 . C A 1149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1178,84,0 +chr10 34989414 . T A 2768.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2797,199,0 +chr10 35014422 . G A 3240.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3269,223,0 +chr10 35025303 . A T 2787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2816,208,0 +chr10 35039444 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr10 35055592 . G T 6280.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:6309,466,0 +chr10 35238587 . G T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 +chr10 35246848 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr10 35246919 . A T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.043;DP=22;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=30.17;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:69:692,0,69 +chr10 35405863 . C T 1330.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1359,99,0 +chr10 35406586 . C T 1189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1218,90,0 +chr10 35408549 . T C 633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:662,48,0 +chr10 35423931 . G C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=33.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,1:7:99:263,0,192 +chr10 35430993 . T A 275.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:304,24,0 +chr10 35431152 . C T 1117.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=1.609;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1146,81,0 +chr10 35431267 . T A 1497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1526,108,0 +chr10 35431575 . A T 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 +chr10 35432493 . A G 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:645,48,0 +chr10 36461374 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,134 +chr10 36623762 . G A 3936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3965,286,0 +chr10 36626913 . T G 1782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1811,129,0 +chr10 36627131 . C T 1850.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1879,135,0 +chr10 36630866 . G A 1783.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1812,141,0 +chr10 36631635 . C G 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2255,157,0 +chr10 36631638 . T C 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2255,157,0 +chr10 36633886 . C T 1379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1408,102,0 +chr10 36634371 . T G 2836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2865,205,0 +chr10 36634518 . G A 1800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1829,132,0 +chr10 36634557 . A C 1833.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1862,138,0 +chr10 36634842 . T A 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1544,117,0 +chr10 36635205 . C G 1020.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:548,39,0 +chr10 36635579 . C T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +chr10 36635612 . T G 1431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1460,105,0 +chr10 36635751 . C T 1599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1628,111,0 +chr10 36635752 . A G 1599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1628,111,0 +chr10 36635821 . T C 1787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1816,132,0 +chr10 36636174 . A T 1842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1871,135,0 +chr10 36636228 . A C 1253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1282,93,0 +chr10 36673059 . A T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:309,21,0 +chr10 36673060 . A G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr10 37242466 . T TTA 14703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.803;DP=322;FS=6.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=32.63;ReadPosRankSum=-3.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,140:303:99:14741,0,4037 +chr10 37242592 . CA C 1742.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.461;DP=259;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,110:245:99:1780,0,9706 +chr10 37243788 . TCTGAGGAAGAAAAGAAGAAAAAAAAAAGTTGGGATAGGAGGGGAAAATGGCTTTAACACGATGTAAATGAGAGGTGTGACTGAC T 14687.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=1.435;DP=437;FS=4.541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=33.61;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,392:411:99:14725,1208,0 +chr10 37543912 . AT A 1553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-1.214;DP=56;FS=2.935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:1591,158,0 +chr10 37544696 . TG T 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.592;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=26.82;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:681,0,743 +chr10 37586198 . T G 910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:939,63,0 +chr10 37586205 . T A 910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:63:939,63,0 +chr10 37586309 . G A 1260.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1289,96,0 +chr10 37687569 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=1.852;DP=67;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.457;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:406,0,1994 +chr10 37698853 . G T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=2.571;DP=70;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:745,0,1866 +chr10 37699795 . A G 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.409;DP=88;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:1661,0,1610 +chr10 37738540 . TCCTGCATATCCAAGAAGAAGAATATTCAAGTGACCGACAGTCTGAGAAATCACAGATCAGTGCAAACAGTCAGACTTTACTCA T 4050.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.842;DP=99;FS=1.893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,87:91:99:4088,356,0 +chr10 37800264 . GA G,GAAA 361.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=1.542;DP=22;FS=3.680;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=16.42;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,11,6:18:99:451,187,224,286,0,471 +chr10 37802059 . C CT 675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=1.599;DP=41;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:76:713,0,76 +chr10 37815679 . G A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr10 37816009 . G A 4675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=2.418;DP=257;FS=3.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,130:257:99:4704,0,4545 +chr10 37828628 . A G 3861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.844;ClippingRankSum=1.763;DP=225;FS=19.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,110:225:99:3890,0,3751 +chr10 37856481 . GA G 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-1.080;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,36:45:50:831,0,50 +chr10 37856541 . T C 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=-2.660;DP=60;FS=9.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,33:60:99:1085,0,988 +chr10 37856845 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=3.852;DP=71;FS=5.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:476,0,3062 +chr10 37857242 . A T 2329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=-2.438;DP=86;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,65:84:99:2358,0,955 +chr10 37857245 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=1.013;DP=83;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:348,0,4825 +chr10 37859988 . C A 2487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=-0.877;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,86:155:99:2516,0,2350 +chr10 37898332 . C G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-2.178;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=20.93;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:656,0,323 +chr10 37911010 . C A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:306,21,0 +chr10 37912200 . C T 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 +chr10 37912844 . CGTAAGTTTATAAAACTTTTTATATATATACTCCTTCACCCTTTAGGACTATTCAATGGATGGGTTTTCTTTTTTAG C 15156.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=336;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,332:333:99:15194,1023,0 +chr10 37917333 . A C 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=-0.828;DP=46;FS=20.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1086,0,455 +chr10 37929976 . TCTAAACACACAACACCAATAAATCGATCACACACAACAGGACACATTATATCACGACATATCAAAATTGCACACTTTTGCATTTACTCCAC T 3184.65 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.884;DP=82;FS=1.991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=33.10;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,78:82:99:3222,311,0 +chr10 37946100 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,167 +chr10 37946160 . C A 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:625,45,0 +chr10 37948966 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr10 37952480 . A G 1922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=1.022;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.585;QD=22.10;ReadPosRankSum=2.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,57:87:99:1951,0,933 +chr10 37952492 . G A 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.542;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,44:120:99:1507,0,2583 +chr10 37952532 . C T 2034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-1.575;DP=158;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=12.88;ReadPosRankSum=3.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,62:157:99:2063,0,3151 +chr10 37952637 . T C 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:264,21,0 +chr10 37952714 . A C 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:569,42,0 +chr10 37954282 . C G 227.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:19:256,19,0 +chr10 37954373 . G A 569.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.21;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:4:596,4,0 +chr10 37954637 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=-0.157;DP=143;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,53:143:99:1654,0,4815 +chr10 37954638 . A C 2884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=1.084;DP=142;FS=3.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:2913,0,2075 +chr10 37954678 . C T 2431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-2.179;DP=171;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,70:171:99:2460,0,3462 +chr10 37954796 . GT G 1464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.815;DP=184;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1502,0,1805 +chr10 37954950 . G A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=-0.633;DP=151;FS=5.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,43:151:99:1097,0,4103 +chr10 37954972 . G T 4281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=-1.008;DP=167;FS=7.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,116:166:99:4310,0,1326 +chr10 37955115 . T TA 1229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.582;DP=169;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,58:161:99:1267,0,2442 +chr10 37955170 . A C 5943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:5972,438,0 +chr10 37955303 . A T 6622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6651,473,0 +chr10 37955408 . T A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-1.332;DP=100;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:606,0,2906 +chr10 38133733 . G T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=-0.055;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:467,0,1991 +chr10 38148335 . TCTGAAGGAGGAGAAAATGATTGAAATTACTCTAAAGAGATCACACCATTTTTTTTCTCTTAAATGTTTAAAATGGCATAC T 2116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=1.663;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=30.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2154,180,0 +chr10 38148663 . GAGCTGAAAATAGACAATAATTCATCATAAAC G 1921.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.060;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=22.61;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,56:85:99:1959,0,1047 +chr10 38148665 . GCTGAAAATAGACAATAATTCATCATAAACGGATGTGAACACAAACTTCTGTAAGAGGTTTTGAGTAATATTTCATAC G 663.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.930;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:701,0,3046 +chr10 38148696 . GATGTGAACACAAACTTCTGTAAGAGGTTTTGAGTAATATTTCATAC G 1923.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.564;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,55:84:99:1961,0,1047 +chr10 38302737 . T C 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-0.160;DP=74;FS=10.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,30:74:99:1290,0,3105 +chr10 38302746 . A G 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.376;DP=73;FS=8.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.293;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:1290,0,3132 +chr10 38374605 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=1.821;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=13.51;ReadPosRankSum=-2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:447,0,624 +chr10 38403277 . T C 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.510;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:504,0,430 +chr10 38457208 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:288,0,64 +chr10 38460793 . C G 1438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-1.459;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=28.97;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1467,102,0 +chr10 38462707 . A G 3094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-2.138;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=20.10;ReadPosRankSum=2.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,88:154:99:3123,0,2976 +chr10 38462718 . A G 6294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.799;DP=154;FS=2.603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.322;QD=29.73;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,142:154:99:6323,285,0 +chr10 38718415 . GGGTATGTAAAGTGCTGCATGTAGACTTTGTAGATGTACAGTAGTTGGTTTTAATGTTCTGGAACTTTTTTTA G 1145.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.847;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.918;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:44:1183,44,0 +chr10 38730063 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.601;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:313,0,535 +chr10 38730181 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=2.684;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.87;ReadPosRankSum=-2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,747 +chr10 39097700 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=-0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:354,0,344 +chr10 39116768 . T TTA 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:245,0,52 +chr10 39623585 . GA G 447.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.658;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=17.91;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:30:485,0,30 +chr10 39624284 . CG C 511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-1.344;DP=51;FS=2.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:549,0,1071 +chr10 39881757 . A T 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.664;DP=92;FS=9.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.45;ReadPosRankSum=-3.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:714,0,2423 +chr10 39882051 . A T 5903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.219;DP=236;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=25.02;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,160:235:99:5932,0,2021 +chr10 39885130 . C T 5716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.703;DP=220;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,156:220:99:5745,0,1571 +chr10 39885142 . GCAGGTACGAACCAATTTAAGTAAACATTAGTTATAACCTCATCTGTGAATTCAGTTGCTGATATAGCCTCACTTTTCCTTA G 8162.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.661;DP=228;FS=3.186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=30.29;ReadPosRankSum=2.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,206:215:99:8200,542,0 +chr10 39886113 . G A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-1.068;DP=34;FS=2.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:890,0,333 +chr10 39886196 . T TC 753.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=1.507;DP=48;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:791,0,793 +chr10 39886210 . T C 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.239;DP=45;FS=8.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=17.04;ReadPosRankSum=-2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:795,0,768 +chr10 39886455 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-1.301;DP=63;FS=10.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:464,0,1677 +chr10 39887819 . C T 2724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=-0.836;DP=119;FS=2.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,77:117:99:2753,0,1855 +chr10 39960057 . C T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=-0.778;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=29.30;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:80:995,0,80 +chr10 39964924 . TGGTAATGTTTATTAAATATTAGCATTTGTGATGCTGCAAAACAACCTGAAACGTGCACACCTAATCATTGACTTTAACCAAACA T 4280.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:4318,332,0 +chr10 39965136 . ACAGGTAAACATAGACTGAAAAGGTTTTTTAAAGTAAATATGTGCTGTGACAAGACTGATCTGACCTGTGGCGCTCTTTATTTG A 4145.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.683;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,98:103:99:4183,346,0 +chr10 39977558 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.678;DP=20;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,121 +chr10 39979605 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=2.431;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.05;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,251 +chr10 39994094 . A G 288.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.02;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:4:315,0,4 +chr10 40011579 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:296,0,214 +chr10 40027510 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.509;DP=66;FS=12.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:1222,0,1110 +chr10 40027759 . T C 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=-0.565;DP=82;FS=14.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1563,0,1243 +chr10 40027811 . A G 2581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-1.472;DP=125;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,79:125:99:2610,0,1584 +chr10 40036608 . A G 4665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.098;DP=182;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,129:179:99:4694,0,1229 +chr10 40059580 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:240,0,434 +chr10 40116394 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=18.47;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:490,0,306 +chr10 40116423 . T A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.936;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:495,0,250 +chr10 40427430 . ACG A 28678.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=640;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,640:640:99:28716,2142,0 +chr10 40427433 . TGAGTATACTTTTTAAATGTATATAATTCACATATATTCAACAGCTATAGGAAGTATTCCCAGTTGTTTACATATTAATTGATGTGTTATTACTCTCTTCGTTTTCAG T 28594.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=2.543;DP=640;FS=8.926;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,636:640:99:28632,2138,0 +chr10 40450307 . TGTAAATGTTGCATTTTTTCATTTGCTTTACAAATTTAAACATGATTTCCTAATTTATTAGTTTTTTTTCACTTGTCAG T 2705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.049;DP=84;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=32.21;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,77:84:99:2955,0,1026 +chr10 40477449 . G A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr10 40563493 . G A 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=-1.279;DP=280;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,94:279:99:3260,0,6664 +chr10 40574605 . C T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr10 40575050 . T A 588.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:617,42,0 +chr10 40586121 . G A 4181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.156;DP=366;FS=9.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,127:365:99:4210,0,8020 +chr10 40592160 . G A 5640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.688;DP=466;FS=10.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,165:466:99:5669,0,10374 +chr10 40595304 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.252;DP=364;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=1.24;ReadPosRankSum=-6.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:309,55:364:99:478,0,11876 +chr10 40608522 . CT C 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-1.547;DP=80;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:296,0,1757 +chr10 40609853 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-0.635;DP=40;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:312,0,1083 +chr10 40610283 . C CA 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.479;DP=45;FS=6.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:543,0,1851 +chr10 40610460 . C A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-2.327;DP=75;FS=5.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:588,0,1755 +chr10 40610570 . T C 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.260;DP=69;FS=13.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=12.87;ReadPosRankSum=-2.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,27:69:99:916,0,1398 +chr10 40612307 . CCCTAAAAAAATGGCTTGCATTAATAGCATGTTTAAAAAAAAGGAGATACACGATAGAGATGTAAAGATTTGCA C 3132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=2.266;DP=90;FS=2.364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=34.81;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,81:84:99:3170,233,0 +chr10 40648015 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,247 +chr10 40650842 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.072;DP=48;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:874,0,791 +chr10 40652890 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=-1.649;DP=38;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:356,0,1197 +chr10 40657280 . G T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr10 40658056 . A T 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 +chr10 40658225 . A G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr10 40972476 . G A 363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:392,30,0 +chr10 41479699 . G T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.387;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=20.99;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:553,0,308 +chr10 41644412 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.034;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:344,0,84 +chr10 41644803 . GT G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,147 +chr10 41644812 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:243,0,147 +chr10 41663001 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.485;DP=48;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:876,0,857 +chr10 42441253 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-0.035;DP=21;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:368,0,362 +chr10 42567344 . C A 4717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-3.910;DP=187;FS=6.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,141:187:99:4746,0,4040 +chr10 42567396 . C T 6440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=2.747;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=30.49;ReadPosRankSum=-2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,133:160:99:6469,0,142 +chr10 42654867 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.817;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:319,0,370 +chr10 42655085 . C T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:672,48,0 +chr10 42657371 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:254,0,348 +chr10 42681923 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=22.23;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,109 +chr10 43202429 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.954;DP=93;FS=2.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:488,0,2691 +chr10 43205948 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.782;DP=90;FS=3.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:299,0,2729 +chr10 43227126 . A T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:485,0,158 +chr10 43230939 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=-1.589;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:305,0,330 +chr10 43286973 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.580;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:277,0,475 +chr10 43289286 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:283,0,354 +chr10 43290492 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.134;DP=21;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=31.32;ReadPosRankSum=2.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:686,0,111 +chr10 43291112 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.359;DP=56;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:500,0,505 +chr10 43296685 . C A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:367,0,402 +chr10 43319577 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:331,0,181 +chr10 43324625 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-1.154;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,258 +chr10 43324853 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:274,0,115 +chr10 43324854 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.72;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:274,0,115 +chr10 43325139 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.53;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:94:231,0,94 +chr10 43327387 . A T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +chr10 43348607 . A C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.383;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:472,0,703 +chr10 43360377 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.440;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:259,0,1258 +chr10 43361115 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.183;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:267,0,782 +chr10 43385690 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-0.747;DP=46;FS=10.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:262,0,1367 +chr10 43455026 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.537;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:275,0,577 +chr10 43469407 . A C 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.463;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:612,0,1133 +chr10 43473009 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.662;DP=47;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:545,0,1190 +chr10 43477020 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.866;DP=42;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:498,0,1101 +chr10 43477352 . G T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=-3.246;DP=71;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:976,0,1632 +chr10 43484935 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.093;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:252,0,3190 +chr10 43500464 . G C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,326 +chr10 43500833 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr10 43502032 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=2.064;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:290,0,457 +chr10 43527724 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=1.503;DP=29;FS=10.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=27.89;ReadPosRankSum=-1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:837,0,175 +chr10 43528018 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.949;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:232,0,638 +chr10 43528480 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.42;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:230,0,108 +chr10 43560970 . G GA 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-2.009;DP=43;FS=5.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:634,0,292 +chr10 43561077 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=1.126;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:310,0,353 +chr10 43561079 . A T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.318;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:310,0,353 +chr10 43561105 . C A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.139;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,491 +chr10 43561469 . C T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=1.127;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:622,0,2675 +chr10 43561649 . A G 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=1.253;DP=104;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=13.05;ReadPosRankSum=-2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:1385,0,1739 +chr10 43565106 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.433;DP=75;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:680,0,1858 +chr10 43662625 . G GA 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-1.308;DP=84;FS=6.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:650,0,1161 +chr10 43726093 . A AGGGGTGCACAC 2008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.540;DP=70;FS=4.236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.70;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:2046,172,0 +chr10 43866192 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.093;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:669,0,2155 +chr10 43878757 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:260,0,67 +chr10 43891338 . C T 3118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.117;DP=387;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,122:386:99:3147,0,9779 +chr10 43904755 . C T 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.363;DP=283;FS=7.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,71:282:99:1151,0,9273 +chr10 43904895 . C CA 1273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-1.175;DP=248;FS=15.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,84:223:99:1311,0,3247 +chr10 43905842 . T TC 1069.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-1.604;DP=68;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=15.73;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1107,0,836 +chr10 43905851 . A G 1018.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=-1.418;DP=68;FS=6.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:1056,0,2113 +chr10 43921424 . T C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 +chr10 44026792 . G C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-1.503;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:503,0,1598 +chr10 44028881 . C A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.302;DP=28;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:339,0,789 +chr10 44106744 . G T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.423;DP=99;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:388,0,3104 +chr10 44110376 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.126;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:587,0,4498 +chr10 44293610 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.919;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:354,0,342 +chr10 44417111 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.469;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:314,0,424 +chr10 44672846 . G T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-0.002;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,34:168:99:558,0,8493 +chr10 44703256 . A G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;ClippingRankSum=-0.238;DP=214;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=3.70;ReadPosRankSum=2.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,45:213:99:821,0,6124 +chr10 44703604 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-1.231;DP=141;FS=6.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,34:141:99:700,0,4067 +chr10 44827980 . T G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 +chr10 44928257 . T A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-1.581;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:403,0,911 +chr10 44928264 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.102;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:403,0,911 +chr10 45020950 . A G 333.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:362,27,0 +chr10 45028348 . C G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:334,0,160 +chr10 45035181 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr10 45067804 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=2.369;DP=46;FS=7.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:257,0,1362 +chr10 45067815 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=2.087;DP=44;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:245,0,1233 +chr10 45078274 . G A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.955;DP=152;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,42:152:99:979,0,4793 +chr10 45083355 . C T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=1.210;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:1280,0,4419 +chr10 45088334 . G A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-0.622;DP=160;FS=0.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,42:160:99:991,0,4500 +chr10 45163961 . G GA 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-3.207;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:484,0,809 +chr10 45213259 . C G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.023;DP=104;FS=5.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,25:104:99:543,0,2999 +chr10 45218110 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-1.123;DP=107;FS=1.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,25:107:99:562,0,3247 +chr10 45263682 . AT A 743.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:79:781,79,0 +chr10 45264750 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-0.069;DP=98;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:265,0,4803 +chr10 45270767 . G A 1759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-3.257;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,54:159:99:1788,0,3541 +chr10 45301886 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.971;DP=42;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:444,0,752 +chr10 45302048 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-0.581;DP=73;FS=15.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:385,0,2692 +chr10 45305146 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:91:249,0,91 +chr10 45305148 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:91:249,0,91 +chr10 45334226 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr10 45437101 . T G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.724;DP=43;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:608,0,822 +chr10 45437214 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=1.566;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:503,0,415 +chr10 45501872 . TGGCCTTCATAATCAAACACAATAC T 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.229;DP=83;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,31:81:99:1057,0,1796 +chr10 45501874 . GCCTTCATAATCAAACACAATACTGATTTTAGTTCACCTATGACCTATAAATATATACATTAAGAATGTTCACGATGCCCTA G 1539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.485;DP=83;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,48:81:99:1577,0,1175 +chr10 45501898 . GATTTTAGTTCACCTATGACCTATAAATATATACATTAAGAATGTTCACGATGCCCTA G 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-1.168;DP=82;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1057,0,1786 +chr10 45513279 . A T 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=1.158;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1513,0,1687 +chr10 45517770 . G A 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-2.724;DP=87;FS=2.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1001,0,1865 +chr10 45552553 . G T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=4.416;DP=31;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=24.93;ReadPosRankSum=-4.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:801,0,684 +chr10 45552554 . A T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.663;ClippingRankSum=4.190;DP=26;FS=12.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=29.72;ReadPosRankSum=-4.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:801,0,688 +chr10 45554111 . C CG 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=3.075;DP=26;FS=7.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=17.53;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:493,0,456 +chr10 45554114 . G C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=33.52;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:490,0,456 +chr10 45559936 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=-0.359;DP=59;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=6.37;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:404,0,1512 +chr10 45560315 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.406;DP=50;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:698,0,1038 +chr10 45573930 . C G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.594;DP=25;FS=9.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,923 +chr10 45575089 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:421,0,48 +chr10 45584626 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.921;DP=30;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:444,0,575 +chr10 45584643 . T A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.213;DP=34;FS=7.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:441,0,691 +chr10 45608941 . G T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-2.001;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:497,0,809 +chr10 45619715 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.283;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=24.88;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:874,0,267 +chr10 45619731 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.556;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:270,0,1032 +chr10 45619810 . C G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.301;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:629,0,1079 +chr10 45621070 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-1.604;DP=22;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:293,0,491 +chr10 45621094 . G C 673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:702,51,0 +chr10 45653142 . C T 2178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.206;DP=309;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,89:309:99:2207,0,8319 +chr10 45658672 . CGGTAAGTCATCCTGTGTTTGATATTGGACTATTGTTCAGAAACGCTGGACAGCACTTGCGTTTACCTGTCCTGCA C 10309.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=3.565;DP=329;FS=7.364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.815;QD=31.34;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,295:311:99:10347,765,0 +chr10 45659747 . CGGTAAAGCTGCTGTTTCCTATATTTTCCTCTTCTTCGCTGTCCTTCATGAAATCTCATCATTATTATTCTGTGTTTTCTGCCTCA C 13900.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=302;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,302:302:99:13938,1144,0 +chr10 45661557 . CCA C 1894.32 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-1.223;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,63:73:54:1940,54,0 +chr10 45689592 . G C 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=1.451;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:460,0,374 +chr10 45692274 . T G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.346;DP=33;FS=5.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:481,0,654 +chr10 45709263 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-0.395;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:422,0,765 +chr10 45712688 . CG C 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:58:297,0,58 +chr10 45718779 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=1.151;DP=47;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=4.42;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:236,0,1101 +chr10 45719943 . C T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-0.839;DP=59;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:779,0,1294 +chr10 45726034 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-1.529;DP=37;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:402,0,663 +chr10 45865693 . C T 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-1.060;DP=77;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1033,0,1574 +chr10 45922566 . TCA T 1194.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1232,103,0 +chr10 45922779 . GA G 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-1.905;DP=71;FS=7.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:468,0,1059 +chr10 45923864 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=-0.989;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:351,0,1417 +chr10 45924275 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.526;ClippingRankSum=-0.338;DP=74;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:274,0,2387 +chr10 45924667 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=1.500;DP=75;FS=4.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:651,0,3863 +chr10 45926038 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.628;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:288,0,294 +chr10 45926494 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.523;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:364,0,2234 +chr10 45978985 . G A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=1.383;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:463,0,459 +chr10 45988367 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.455;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:473,0,731 +chr10 46005470 . A C 3070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.168;DP=183;FS=18.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,84:182:99:3099,0,3258 +chr10 46007764 . C T 5529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.007;DP=519;FS=5.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,175:519:99:5558,0,11258 +chr10 46012631 . C CT 536.20 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-1.364;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:38:735,38,0 +chr10 46014994 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.549;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,1613 +chr10 46015103 . GT G 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.419;DP=35;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:326,0,418 +chr10 46015797 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.300;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.781;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:475,0,666 +chr10 46015865 . A G 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=-2.130;DP=50;FS=6.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=11.70;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:613,0,1202 +chr10 46016151 . T G 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.125;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:756,0,916 +chr10 46016168 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.621;DP=43;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:718,0,773 +chr10 46016425 . G C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=2.702;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:279,0,1027 +chr10 46017571 . T A 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.363;DP=74;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1336,0,1226 +chr10 46024754 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.239;DP=75;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1283,0,1108 +chr10 46032058 . G A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.474;DP=77;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1398,0,1363 +chr10 46032386 . C T 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.818;DP=81;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:1334,0,1361 +chr10 46046266 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=-0.121;DP=54;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:251,0,1586 +chr10 46152011 . T A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.202;DP=66;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:486,0,1828 +chr10 46152957 . T C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.544;DP=39;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=19.38;ReadPosRankSum=-1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:784,0,614 +chr10 46153832 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=-0.485;DP=40;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:285,0,2307 +chr10 46153842 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.512;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:285,0,2307 +chr10 46154043 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=9.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:335,0,672 +chr10 46154136 . T C 2514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=1.402;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=27.69;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,22:29:63:2543,63,0 +chr10 46154143 . T C 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.680;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=33.59;ReadPosRankSum=-1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:1566,0,275 +chr10 46156637 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=1.006;DP=92;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:475,0,2500 +chr10 46178105 . C T 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.916;DP=103;FS=13.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:1499,0,2418 +chr10 46181248 . A C 1322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.385;DP=78;FS=7.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:1351,0,1303 +chr10 46205227 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=1.927;DP=66;FS=4.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:232,0,2001 +chr10 46292868 . G A 1962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.753;DP=186;FS=6.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,62:186:99:1991,0,4219 +chr10 46298864 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=1.312;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:666,0,2924 +chr10 46311792 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=-2.081;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:248,0,1242 +chr10 46312657 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-1.256;DP=42;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:554,0,818 +chr10 46320825 . G T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.644;DP=46;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:562,0,946 +chr10 46323656 . C T 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-1.188;DP=57;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:737,0,1080 +chr10 46337719 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.451;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=31.10;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:35:930,35,0 +chr10 46337769 . C T 662.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.964;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.96;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:13:691,13,0 +chr10 46362875 . C CA 1773.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.640;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,75:217:99:1811,0,3687 +chr10 46366771 . G A 2775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-1.318;DP=446;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=6.22;ReadPosRankSum=2.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,120:446:99:2804,0,12310 +chr10 46376775 . G A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.092;DP=64;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:662,0,1378 +chr10 46377297 . G A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.256;DP=108;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:925,0,2632 +chr10 46377974 . CT C 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.879;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:373,0,184 +chr10 46378095 . T A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=1.284;DP=38;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:521,0,807 +chr10 46379222 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.217;DP=77;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:453,0,6009 +chr10 46379503 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-0.242;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=3.28;ReadPosRankSum=2.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:258,0,2256 +chr10 46379715 . A T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-3.032;DP=53;FS=15.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:669,0,1195 +chr10 46380741 . T A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.939;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:463,0,3211 +chr10 46380952 . G T 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.987;DP=50;FS=5.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:859,0,2680 +chr10 46380982 . G A 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=-1.005;DP=51;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:789,0,3561 +chr10 46381830 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.092;DP=55;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:264,0,1758 +chr10 46382252 . T C 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=1.100;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:604,0,2249 +chr10 46411827 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.254;DP=16;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:351,0,81 +chr10 46432351 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=13.42;ReadPosRankSum=-2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,325 +chr10 46443028 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.138;DP=46;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:244,0,1260 +chr10 46451793 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=2.923;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.08;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:398,0,360 +chr10 46452131 . C G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-1.295;DP=62;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:369,0,2149 +chr10 46460290 . T A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=1.282;DP=101;FS=8.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,30:101:99:678,0,2647 +chr10 46466272 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=-1.607;DP=88;FS=8.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:586,0,2355 +chr10 46466353 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.359;DP=96;FS=5.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:330,0,2901 +chr10 46467079 . T C 1747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=-0.512;DP=103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.803;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1776,0,1668 +chr10 46470358 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:283,0,194 +chr10 46475603 . G T 2351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.464;DP=106;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=22.19;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,70:106:99:2380,0,1198 +chr10 46480341 . A T 3974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.495;DP=243;FS=0.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,113:242:99:4003,0,4136 +chr10 46490176 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.807;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:463,0,485 +chr10 46495885 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.898;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=23.18;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:376,0,155 +chr10 46503240 . G T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.585;DP=44;FS=8.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:621,0,847 +chr10 46524941 . GC G 610.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:648,49,0 +chr10 46530841 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.380;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:563,0,2188 +chr10 46530862 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-2.617;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=4.71;ReadPosRankSum=2.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:372,0,2451 +chr10 46530940 . G A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=1.095;DP=47;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:668,0,918 +chr10 46533037 . C T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=1.117;DP=93;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:626,0,2424 +chr10 46534384 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.600;DP=50;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:610,0,1056 +chr10 46537559 . G T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.373;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=11.14;ReadPosRankSum=3.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:864,0,1652 +chr10 46549693 . TGC T 792.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-1.881;DP=35;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=22.65;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:830,0,244 +chr10 46557339 . G GGA 1357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-1.784;DP=105;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.278;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:1395,0,1774 +chr10 46557371 . G A 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-0.839;DP=97;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,31:97:99:850,0,2420 +chr10 46557601 . T A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=4.043;DP=28;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:562,0,766 +chr10 46557639 . C T 1761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=1.514;DP=69;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=25.53;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,49:69:99:1790,0,449 +chr10 46572044 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.512;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:269,0,1469 +chr10 46572228 . CA C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.607;DP=135;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=2.37;ReadPosRankSum=-2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:357,0,2947 +chr11 22474 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.107;DP=56;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:902,0,845 +chr11 35120 . G C 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.316;DP=70;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:788,0,1557 +chr11 36610 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=-0.924;DP=58;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:784,0,1273 +chr11 40649 . C G 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=-0.151;DP=25;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:675,0,175 +chr11 45099 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=-0.199;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:524,0,742 +chr11 74779 . AACCTGCACAGCACAGCACAGAACACACTCTCAGCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGTGTGTATATATGTGTGTGTCTT A 9488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.269;DP=229;FS=8.402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,221:229:99:9526,765,0 +chr11 80772 . ACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGCTTTACTGCAGATCT A 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=2.061;DP=118;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:492,0,23923 +chr11 110517 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:250,0,212 +chr11 111242 . CCCTGCAGAACACAGACGACTTGTCAGCCGGATGCTGTTCAGTAAAGATAGAGCTCAGTAATCCTCAATGCCTCA C 16404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=2.156;DP=388;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=35.85;ReadPosRankSum=-2.987 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,383:386:99:16442,1317,0 +chr11 136221 . ACTGCACACACACACACACACACACACACACACATGAGAGCGCGCATCAGCAGTGACGATCAGCTGTGATCTGATTGGTCGTCAGCACTGAC A 9231.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=2.327;DP=210;FS=10.754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=35.97;ReadPosRankSum=-1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,201:210:99:9269,746,0 +chr11 141177 . A T 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.820;DP=56;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:855,0,982 +chr11 150216 . G GTT 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-1.334;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:501,0,517 +chr11 183783 . T C 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.444;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=33.43;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,39:44:99:1499,0,198 +chr11 183945 . T C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-1.099;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:609,0,1272 +chr11 183952 . T C 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=1.275;DP=49;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:655,0,1131 +chr11 184228 . T C 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.830;DP=32;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=31.71;ReadPosRankSum=-2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1043,0,149 +chr11 207559 . AAGGTCAAACACTCTCGCGGGCACTAACTGAACACGGCTAGCATGAGGCTAACATGATGATGATGATGATGCTGTTATTGTGTTTGTCCTGT A 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:292,0,583 +chr11 212438 . TCCTGAGGAGCAGAAGAACAGTCAGAAACACACACTAACACACACACTCAAGCAGCAAGGGTGTGTGTGTGTGTGTA T 16988.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.997;DP=394;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,378:381:99:17026,1209,0 +chr11 212971 . C T 7766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=-0.968;DP=377;FS=0.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,241:376:99:7795,0,4428 +chr11 268851 . G C 7252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7281,538,0 +chr11 283826 . AGT A 611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:649,49,0 +chr11 439958 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.108;DP=29;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:253,0,1232 +chr11 439963 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=1.257;DP=32;FS=6.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:242,0,1146 +chr11 440086 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.801;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:351,0,969 +chr11 440890 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-1.244;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:331,0,457 +chr11 441528 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,378 +chr11 441576 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr11 463566 . GCTGGTTTACATGTCAAGCAATCAGAGAAGTGATCAGAGATATGCCATTACAGAGATCAGACATTGCTGGCTTCGAGAGACGCTCAC G 4798.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=1.700;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=31.84;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:4836,396,0 +chr11 558371 . T G 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-1.059;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1108,0,1027 +chr11 667677 . G A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=-1.548;DP=33;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:688,0,464 +chr11 667771 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-1.267;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:433,0,245 +chr11 795226 . C T 3362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.999;DP=188;FS=12.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,106:187:99:3391,0,2802 +chr11 799302 . C T 2731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-2.306;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=18.33;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:2760,0,2303 +chr11 800294 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=3.271;DP=30;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=20.86;ReadPosRankSum=-3.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:654,0,381 +chr11 1053298 . G A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 +chr11 1053374 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr11 1053378 . C T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr11 1174009 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.542;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:590,0,808 +chr11 1204361 . A T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr11 1300767 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:231,0,380 +chr11 1301842 . T A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:250,0,475 +chr11 1302517 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=1.083;DP=59;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:434,0,1766 +chr11 1495769 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=4.328;DP=228;FS=10.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=1.24;ReadPosRankSum=-3.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,34:228:99:311,0,7655 +chr11 1539179 . A G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.141;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=24.35;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:710,0,456 +chr11 2232494 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.394;DP=23;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:388,0,402 +chr11 2589619 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,121 +chr11 2589705 . A G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr11 2596481 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-2.249;DP=76;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:508,0,2082 +chr11 2660802 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=1.430;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:238,0,1069 +chr11 2807082 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=1.009;DP=54;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:305,0,1759 +chr11 2953901 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=1.682;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:309,0,261 +chr11 3252081 . C CT 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-0.203;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:99:322,0,2515 +chr11 3252186 . C CT 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=1.400;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:382,0,500 +chr11 3367460 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.141;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:372,0,540 +chr11 3367499 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.412;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:467,0,444 +chr11 3656003 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.031;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,487 +chr11 3666945 . GCTGCAAAGCAAAAGGAGCAGAATACAGTTTGTGTTGAGACAATGACAGACTAGTTGAACAATTAATTTAATAAACGCTCAC G 1172.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=1.362;DP=32;FS=6.743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=23.12;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:71:1210,71,0 +chr11 3955490 . T TA 3245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-1.708;DP=364;FS=3.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,167:349:99:3283,0,4501 +chr11 4011963 . A G 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 +chr11 5556765 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.731;DP=29;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:409,0,599 +chr11 5765020 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:394,0,558 +chr11 5765024 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:319,0,617 +chr11 5765071 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:376,0,242 +chr11 5846046 . G GT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.717;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:296,0,163 +chr11 5847993 . C G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-1.480;DP=27;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:483,0,711 +chr11 5848025 . C T 836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:865,66,0 +chr11 5990947 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.028;DP=25;FS=6.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,514 +chr11 5998302 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,377 +chr11 5998642 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=2.127;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=15.89;ReadPosRankSum=-2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:346,0,404 +chr11 6151604 . TGGTAAGCTTCGGAGGTCTTCAGAGTGCTGTTAAACGTGTTTTTTTCCCCCTCAGACTCTGACTTCTTCGGCTTACTGTCTGCA T 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-3.930;DP=96;FS=14.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=6.49;ReadPosRankSum=-4.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:660,0,19129 +chr11 6466464 . C A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.248;DP=53;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:693,0,1154 +chr11 6466724 . T C 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.960;ClippingRankSum=-0.251;DP=74;FS=3.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:783,0,1719 +chr11 6475600 . G A 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=1.277;DP=68;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:950,0,1329 +chr11 6475684 . A G 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-2.966;DP=78;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:691,0,1951 +chr11 6482860 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.839;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:645,0,874 +chr11 6487900 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-0.781;DP=31;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:458,0,644 +chr11 7065646 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=17.80;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:313,0,242 +chr11 7128195 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,325 +chr11 8128028 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=23.21;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:330,0,261 +chr11 8766299 . A G 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-3.210;DP=61;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:658,0,1420 +chr11 8768140 . A G 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.935;DP=62;FS=1.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=28.11;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,47:61:99:1771,0,279 +chr11 10602372 . A T 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:559,39,0 +chr11 10612185 . GA G 877.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=1.065;DP=93;FS=1.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:915,0,1042 +chr11 10613584 . T G 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.051;DP=84;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1094,0,1759 +chr11 10614080 . T C 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.548;DP=66;FS=3.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,39:66:99:1380,0,991 +chr11 10614162 . TA T 826.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:864,70,0 +chr11 10631938 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.484;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:259,0,526 +chr11 10648209 . G A 566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:595,42,0 +chr11 10666690 . GCTGAAGATGAACAACACAAACAGACATTACATGCTGAAAAACATTTTTTTAAATACCTCTAAACCATACAGCAATAAAAGAGGATTCAC G 654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.302;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=32.89;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:57:692,57,0 +chr11 10733703 . T G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.127;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.25;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:501,0,549 +chr11 10733927 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.988;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:500,0,514 +chr11 10735246 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:423,0,90 +chr11 10735388 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-2.253;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:262,0,1208 +chr11 10735630 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-0.935;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:266,0,728 +chr11 10735817 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,307 +chr11 10777557 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.399;DP=47;FS=11.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:414,0,1147 +chr11 10875211 . A G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 +chr11 10875795 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,170 +chr11 10875866 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:234,0,55 +chr11 10876064 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:415,0,769 +chr11 11285409 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:250,0,139 +chr11 11298602 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.795;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=15.82;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:313,0,335 +chr11 11313454 . G C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:338,0,301 +chr11 11331300 . G A 5480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.263;DP=387;FS=1.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,160:387:99:5509,0,7576 +chr11 11352051 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:239,0,104 +chr11 11395929 . GA G 2972.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-0.663;DP=312;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,127:282:99:3010,0,3272 +chr11 11590187 . CCACCTGAAAGCAGAGAGAGACAGGATTCAGCAATGCACCGTAGTTCACAGTAGTACCTAAAACAGTTCATCCCACAACATGTGTGTGTAAAGAGAAATGTTCAT C 10386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=2.430;DP=278;FS=1.154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=29.76;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,267:278:99:10424,801,0 +chr11 11591121 . ACTAAAAATAAGACAGAAACACACATTATAAGTAAGAGCATTTCTCATCTTTCAGCTTAAATTTACAGCTTCTTAC A 13037.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=3.574;DP=317;FS=4.917;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=30.31;ReadPosRankSum=-1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,306:315:99:13075,928,0 +chr11 12028250 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=2.062;DP=15;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,207 +chr11 12068550 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=14.57;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:305,0,368 +chr11 12069044 . T G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:518,0,238 +chr11 12123225 . G T 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:457,33,0 +chr11 12311095 . C T 2522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=2.534;DP=177;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=14.25;ReadPosRankSum=2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,73:177:99:2551,0,3585 +chr11 12326558 . TGGTAATAACAACTGTTGTCCTGGCAATACAAGATTTAATCAGAGCTGAAATAATTGGTTTTGATTTTTTTTTCCTCCCCTCTA T 464.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:99:502,187,0 +chr11 12488076 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.415;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:501,0,448 +chr11 12488169 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=0.589;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:430,0,375 +chr11 12488325 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,408 +chr11 12840502 . C CA 581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:74:694,74,0 +chr11 12872714 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.978;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:269,0,436 +chr11 12916730 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.336;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:230,0,542 +chr11 12918832 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.659;DP=54;FS=26.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:280,0,1093 +chr11 13113571 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr11 13280744 . AT A 1368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.577;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1406,115,0 +chr11 13368243 . GAGGTATCGTTCATCATTGTAGCTGAGTAATACAAAAATGCTTATTCCACCTTTTTTTTCTAAATATTTTCTTTTGTCCTCCT G 2129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=1.258;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=33.28;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:99:2167,0,1144 +chr11 13375088 . A T 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-0.696;DP=48;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:980,0,696 +chr11 13396083 . G T 3537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=1.268;DP=282;FS=5.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,104:264:99:3566,0,5255 +chr11 13396146 . C A 5235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.858;DP=399;FS=4.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,147:356:99:5264,0,7276 +chr11 13396243 . AAGGTGACTTAAAGATCTTCTCAGATCCACTCGTAGAGAAGTAAAGCTAAAAGGTTTATGCTTGTAAACTTTAGAACTGCATTAAATTACAAGGTCCTCTTGATTGTT A 14393.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=1.282;DP=340;FS=3.020;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,328:330:99:14431,1108,0 +chr11 13397683 . C T 4277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.615;DP=217;FS=12.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,120:216:99:4306,0,7681 +chr11 13397879 . CAGGTGAGCACAGGTTTCATTTCAGCACTACATCTGATATTTTACCTTTATTCTTGACCTGGTTTCTTGCTCTTCTCTTCAT C 12718.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-0.401;DP=276;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,270:272:99:12756,1097,0 +chr11 13398417 . C CA 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=-0.698;DP=294;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=1.35;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,53:273:99:434,0,5920 +chr11 13468288 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=1.084;DP=18;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=26.82;ReadPosRankSum=-1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:511,0,165 +chr11 13514981 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:36:444,0,36 +chr11 13609889 . C G 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.376;DP=55;FS=6.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1216,0,676 +chr11 13631532 . C T 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.400;DP=77;FS=12.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1076,0,1559 +chr11 13690263 . A G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.940;DP=48;FS=4.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:834,0,845 +chr11 13690628 . TA T 857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.169;DP=33;FS=3.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:60:895,60,0 +chr11 13715820 . ACTCCAGGTAACAGCGGAAACCCGAAATAACATTTAAGTTTTTGATCTCACTGGAGATGTTCTAACATGCCTTGACTTCCT A 3581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.830;DP=106;FS=2.196;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=33.79;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,98:101:99:3619,272,0 +chr11 13719153 . A T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.358;DP=66;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:571,0,1743 +chr11 13974728 . T C 1774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.975;DP=101;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1803,0,1795 +chr11 13974886 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.804;DP=25;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:335,0,539 +chr11 14268017 . G A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr11 14268695 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr11 14315881 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.373;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.162;QD=31.57;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:31:565,0,31 +chr11 14316248 . G A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=-2.203;DP=43;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.53;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:739,0,636 +chr11 14319847 . G A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=17.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=18.27;ReadPosRankSum=1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:832,0,676 +chr11 14333483 . C T 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-0.161;DP=59;FS=2.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,34:59:99:1179,0,902 +chr11 14342463 . C T 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.710;DP=67;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:1331,0,1157 +chr11 14360807 . C A 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=1.428;DP=64;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1201,0,1014 +chr11 14507682 . T G 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.837;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:1426,0,1396 +chr11 14530638 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.554;DP=29;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=24.20;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:730,0,819 +chr11 14532073 . GAGGTAAGATGAGGTTTTCAATGTCTTGTGCGTTCTGTTGATCCAGTTTGATCATGTTGTGTAACTGTGGTTTCTCTGC G 1267.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=2.306;DP=34;FS=6.698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=27.49;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:99:1305,105,0 +chr11 14553780 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=1.796;DP=31;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:382,0,766 +chr11 14576538 . G A 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.276;DP=134;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=21.81;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:2951,0,5006 +chr11 14576547 . T C 2910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.972;DP=140;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:2939,0,5006 +chr11 14581759 . G A 3580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.120;DP=183;FS=0.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,105:183:99:3609,0,2844 +chr11 14582128 . G A 3753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.166;DP=200;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,112:200:99:3782,0,3215 +chr11 14582352 . A G 3113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.144;DP=176;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,88:176:99:3142,0,3207 +chr11 14583127 . G A 3538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3567,259,0 +chr11 14583465 . C CT 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=-0.405;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:441,0,1351 +chr11 14584826 . C T 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-1.228;DP=49;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1300,0,371 +chr11 16120138 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=3.136;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=11.76;ReadPosRankSum=-3.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:334,0,596 +chr11 16121889 . C G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.463;DP=47;FS=19.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:899,0,716 +chr11 16300000 . T G 2710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2739,193,0 +chr11 16391342 . G GT 389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:427,42,0 +chr11 16488640 . TCTGTAACACTTTAAGTGATGGAAAGTATTTTAGGTAATATATCCCAATACCCCACCAAGTACAAAATACAAACATTTCTTAAGAAGATCTTAACAGTGGTAACATTGATATCTGAGAAAAGGATAC T 2422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=2.580;DP=77;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=31.46;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,64:76:99:2707,0,5288 +chr11 16550495 . C T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.026;DP=26;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:564,0,631 +chr11 16564808 . G A 998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:76:1027,76,0 +chr11 16564810 . G A 998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:76:1027,76,0 +chr11 16599623 . G T 3432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.142;DP=178;FS=6.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,102:178:99:3461,0,5690 +chr11 16695527 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=26.75;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:78:376,0,78 +chr11 16708998 . G A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.033;DP=56;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1028,0,889 +chr11 16714754 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-1.083;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=25.92;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:71:443,0,71 +chr11 16715615 . A G 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:903,63,0 +chr11 16716572 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=3.135;DP=49;FS=19.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:419,0,1285 +chr11 16716781 . TA T 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.112;DP=24;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:48:431,0,48 +chr11 16717184 . AAC A 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-2.179;DP=33;FS=13.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:262,0,933 +chr11 16730469 . C T 1594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.211;DP=78;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,48:78:99:1623,0,1020 +chr11 16741273 . C T 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.402;DP=74;FS=4.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,44:74:99:1535,0,1178 +chr11 16969102 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:322,0,265 +chr11 17888540 . G A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr11 17888619 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:475,39,0 +chr11 17888640 . C T 364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:393,30,0 +chr11 18223721 . T A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=15.36;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:320,0,369 +chr11 18226620 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=20.59;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:646,0,369 +chr11 18234309 . AACCTGTGAACAACACAAAATTTCGATTAGACAGAAGTTTGCTGTAAGTGTAGAGTAAAGTGGAGCAGAAATTGTTT A 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=2.205;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=25.18;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:566,0,333 +chr11 18257719 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.401;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:671,0,678 +chr11 18274449 . G A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.158;DP=63;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:1089,0,1108 +chr11 18282155 . C G 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.326;DP=72;FS=6.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1429,0,1033 +chr11 18288646 . TCCTTCAAATACAACATGGACAACATTTCAGCTGTATCCACATTCAAACATTTATAGCATTTAGCATATGCTGTTCAAGTTACTAA T 6236.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.072;DP=154;FS=2.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,152:154:99:6274,550,0 +chr11 18476586 . G C 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.324;DP=39;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=23.30;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:937,0,315 +chr11 18493792 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=21.10;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:408,0,257 +chr11 18497057 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.184;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=12.61;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:356,0,552 +chr11 18510124 . G T 2473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-2.728;DP=143;FS=0.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:2502,0,1966 +chr11 18517307 . TG T 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-2.644;DP=63;FS=2.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:448,0,1181 +chr11 18577726 . GCTAATATGAAAAGGAAGAAAATAGTTAAACGGTTGAAAAAACAAACAATACAAGTGAACACTGGGTTAC G 2059.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=2.271;DP=66;FS=13.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,55:66:99:2097,0,2417 +chr11 18579175 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.442;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=16.26;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:321,0,321 +chr11 18586176 . C T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 +chr11 18588223 . G C 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=2.163;DP=42;FS=12.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:799,0,551 +chr11 18593406 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:233,0,66 +chr11 18680903 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.105;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.95;ReadPosRankSum=-2.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:488,0,942 +chr11 18681547 . A T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=2.160;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:486,0,503 +chr11 18698646 . G T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-0.822;DP=36;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:866,0,418 +chr11 18767377 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.546;DP=28;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:413,0,112 +chr11 18818785 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=14.88;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:311,0,259 +chr11 18819144 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:249,0,342 +chr11 18956233 . C CCCGG 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=1.312;DP=40;FS=12.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:414,0,1310 +chr11 18956453 . ATCGAACTCCTTGCCCCGT A 274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:36:312,36,0 +chr11 18959636 . A T 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.039;DP=87;FS=16.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:1332,0,1719 +chr11 19098323 . A G 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.505;DP=87;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.983;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1457,0,1425 +chr11 19101408 . C T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=-2.809;DP=56;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:688,0,1218 +chr11 19118045 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=4.366;DP=69;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=5.74;ReadPosRankSum=-2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:424,0,1846 +chr11 19118166 . A G 1643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.093;DP=100;FS=9.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1672,0,1743 +chr11 19118418 . GT G,GTT 1114.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-1.716;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,25,33:64:99:1274,657,982,569,0,829 +chr11 19119109 . TTA T 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.119;DP=39;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:238,0,614 +chr11 19119164 . G GT 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.136;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:308,0,310 +chr11 19124980 . C T 7607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-4.712;DP=216;FS=3.153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=30.10;ReadPosRankSum=2.898 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,196:216:99:7636,218,0 +chr11 19223248 . G T 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.062;DP=73;FS=8.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1161,0,1362 +chr11 19226460 . G A 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.879;DP=83;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1156,0,1711 +chr11 19293952 . A T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-2.082;DP=33;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=19.57;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:674,0,441 +chr11 19294101 . G A 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.437;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:790,0,589 +chr11 19433839 . C A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.795;ClippingRankSum=-0.991;DP=109;FS=4.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1856,0,1576 +chr11 19505307 . G GA 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=-1.285;DP=75;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:587,0,777 +chr11 19505623 . C CT 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.241;DP=94;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:327,0,1860 +chr11 19505936 . G A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-0.015;DP=79;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:1081,0,1824 +chr11 19507944 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,133 +chr11 19509520 . C A 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.990;DP=82;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:1321,0,1337 +chr11 19509577 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-1.548;DP=73;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,27:73:99:905,0,1606 +chr11 19510051 . C T 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-2.438;DP=92;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1684,0,1389 +chr11 19888311 . A G 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=-0.657;DP=50;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1047,0,613 +chr11 19888386 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-1.156;DP=39;FS=7.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:449,0,856 +chr11 19924258 . G A 1864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-5.296;DP=210;FS=78.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,70:210:99:1893,0,5294 +chr11 19933976 . A C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,415 +chr11 19934987 . T A 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 +chr11 19935939 . C T 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 +chr11 19943953 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.818;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,320 +chr11 19944692 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=1.708;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:298,0,101 +chr11 20031626 . T A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.910;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:738,0,1401 +chr11 20149637 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-1.484;DP=60;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:959,0,1184 +chr11 20153462 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=1.791;DP=80;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:885,0,1830 +chr11 20163431 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-3.464;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:324,0,1256 +chr11 20163473 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=2.257;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:255,0,1581 +chr11 20443224 . A G 212.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.42;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:14:241,0,14 +chr11 20536093 . T C 3762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=1.652;DP=313;FS=0.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,112:312:99:3791,0,6863 +chr11 20536219 . T C 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=7.163;DP=272;FS=37.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=4.40;ReadPosRankSum=-3.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,50:252:99:1226,0,13796 +chr11 20536221 . TG T 1192.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=7.635;DP=272;FS=30.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=4.39;ReadPosRankSum=-4.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,47:252:99:1230,0,13796 +chr11 20536591 . C A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.162;DP=193;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:507,0,5087 +chr11 20540602 . A AT 2933.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.697;DP=242;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,27:211:99:2971,0,4456 +chr11 20541196 . C T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.520;DP=308;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=2.32;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,55:288:99:743,0,12360 +chr11 20541232 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=-1.607;DP=340;FS=4.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=0.80;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,47:318:99:301,0,14348 +chr11 20542699 . A C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-0.336;DP=203;FS=8.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,47:196:99:1053,0,6012 +chr11 20542733 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.067;DP=234;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,57:230:99:1283,0,7823 +chr11 21273290 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.532;DP=88;FS=6.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=5.77;ReadPosRankSum=3.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:536,0,2386 +chr11 21280140 . C A 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.676;DP=97;FS=5.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:1567,0,1689 +chr11 21286798 . C T 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=-0.258;DP=70;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:986,0,1385 +chr11 21287038 . C A 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.801;DP=68;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:877,0,1430 +chr11 21356637 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-2.684;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:235,0,412 +chr11 21534077 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-1.056;DP=39;FS=10.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:645,0,684 +chr11 21538463 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.255;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:284,0,3318 +chr11 21538470 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.188;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:284,0,3318 +chr11 21558898 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-0.639;DP=28;FS=13.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:255,0,723 +chr11 21577830 . G A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-0.143;DP=382;FS=14.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,94:381:99:931,0,27567 +chr11 21578190 . G A 18282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=2.515;DP=124;FS=4.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,86:113:99:18311,0,2550 +chr11 21578445 . C T 3001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=-0.368;DP=219;FS=3.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,86:219:99:3030,0,7138 +chr11 21792131 . GCCTGACAACAAACAGGACAACAGCTATCAGCTCTGGTAAAGTAGTACACAATTTGGTCGAACAGAATGTAAAAGTCTCA G 1287.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=2.301;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=27.29;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:99:1325,111,0 +chr11 21863095 . G A 4571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.557;DP=311;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,133:309:99:4600,0,18847 +chr11 21988235 . TA T 1254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.624;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1292,0,901 +chr11 22095142 . T A 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-1.137;DP=128;FS=4.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1858,0,2495 +chr11 22100581 . C A 2260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.450;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:2289,0,1635 +chr11 22137326 . A C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,217 +chr11 22240274 . C A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=3.665;DP=51;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=17.09;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:900,0,983 +chr11 22240592 . A AAC 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-1.784;DP=44;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:583,0,602 +chr11 22241044 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.109;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.39;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,624 +chr11 22241063 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=1.628;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:279,0,381 +chr11 22241242 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.739;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.950;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:417,0,161 +chr11 22241456 . C CA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.106;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:319,0,530 +chr11 22241482 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.930;DP=40;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:583,0,764 +chr11 22242301 . G GT 460.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:498,41,0 +chr11 22243119 . G GA 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.098;DP=64;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:735,0,604 +chr11 22243210 . A G 1528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.189;DP=73;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1557,0,2131 +chr11 22243300 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=-0.994;DP=77;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:99:1063,0,1601 +chr11 22247130 . C T 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.035;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1323,0,1438 +chr11 22418317 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:385,0,384 +chr11 22426970 . G GA 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=-2.347;DP=45;FS=8.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:636,0,394 +chr11 22428004 . C T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.154;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:731,0,341 +chr11 22428816 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.038;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:362,0,377 +chr11 22430024 . GA G 245.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=22.35;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:2:281,2,0 +chr11 22430462 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.634;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,458 +chr11 22430943 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=2.549;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:351,0,277 +chr11 22868865 . C T 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.645;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,52:140:99:1752,0,3005 +chr11 22923477 . TG T 352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:390,37,0 +chr11 22926574 . GA G 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.564;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:432,0,997 +chr11 23804431 . T G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr11 23806034 . C G 567.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:596,42,0 +chr11 23806448 . A G 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 +chr11 23825969 . G GT 1859.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=-3.454;DP=89;FS=18.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,58:81:99:2126,0,1482 +chr11 24514422 . G GT 475.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:59:584,59,0 +chr11 24764851 . G T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.674;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:598,0,476 +chr11 24768095 . G T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-1.532;DP=56;FS=5.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:751,0,1121 +chr11 24802966 . GA G 647.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:685,67,0 +chr11 24806485 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,175 +chr11 24891859 . C G 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=1.719;DP=91;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=17.96;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:1663,0,1651 +chr11 24996115 . C A 4035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=-1.708;DP=215;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,128:214:99:4064,0,6818 +chr11 25001032 . C G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.480;DP=35;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:912,0,336 +chr11 25006975 . C T 1863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.901;DP=84;FS=7.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,54:84:99:1892,0,1010 +chr11 25018065 . GCTAGAAAACAAATTAACAGCTCTGTGAACACACTTCCTTGGAACAAAAACCATTTCAAGACTGTTCAATGATTGTGTCCGACTTAC G 13686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=1.722;DP=363;FS=3.208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.82;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,336:337:99:13724,1191,0 +chr11 25018341 . C T 4002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-0.879;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,125:227:99:4031,0,3586 +chr11 25019182 . TCTGCAGCACAAAATTAAAGAAAAATAAACTGTTTGATTCTACCAACAACAACAACAACAACATTTTTGTACCACTAGTACGAAC T 10595.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.237;DP=233;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=31.83;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,226:232:99:10633,907,0 +chr11 25022118 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.130;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:568,0,453 +chr11 25124013 . G A 2970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=1.928;DP=196;FS=9.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=15.16;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,85:195:99:2999,0,3511 +chr11 25124088 . A C 3211.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;ClippingRankSum=4.672;DP=178;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.04;ReadPosRankSum=2.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,88:177:99:3240,0,3140 +chr11 25274547 . T TA 1637.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.147;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=25.20;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:1755,150,0 +chr11 25278061 . AGTATGAAGCCTTAAGCTATGCCATTTAATTACTGTCATTAACGTGAAGTTTGTGTTTAATTTGTTATTCTTAACTCTCTCATCAG A 11700.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.714;DP=267;FS=9.435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=32.88;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,261:265:99:11738,464,0 +chr11 25278542 . T G 10583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=252;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,252:252:99:10612,773,0 +chr11 25278601 . T TA 5734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.421;DP=216;FS=2.039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,208:212:99:6025,616,0 +chr11 25292177 . CTT C 272.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:310,22,0 +chr11 25293209 . CT C 239.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:277,28,0 +chr11 25312943 . G A 1877.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1906,147,0 +chr11 25316106 . C T 1636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1665,123,0 +chr11 25365147 . AT A 410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:448,39,0 +chr11 25399090 . A T 476.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:1:502,1,0 +chr11 25399091 . C T 476.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:1:502,1,0 +chr11 25399157 . A C 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:766,54,0 +chr11 25399181 . A C 920.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:949,66,0 +chr11 25399265 . GA G 822.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-1.738;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=23.51;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:45:860,45,0 +chr11 25715964 . TGGTGCAGATCCCTCCTTGTGCTTCTAGAGAAATTGTAAGTATTTTCAACAGATTGTGAATAAGTATTCGCCCCCTATTAACA T 1539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.555;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=31.96;ReadPosRankSum=2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,36:39:99:1577,0,425 +chr11 25716187 . CCAGGTCAGATTTTCTACTTTATTTAAAATTAATTCAGGTAAATGATCGACTGACTTTTACCTAAAAAATGAATGCTTG C 2928.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=71;FS=2.925;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=30.97;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:2966,212,0 +chr11 25747170 . T TA 1211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:1771,119,0 +chr11 25747918 . TA T 1125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1163,121,0 +chr11 25776778 . C T 7385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:7414,560,0 +chr11 25781852 . TGGTGAGTCGGTGACCTCTGATGTTTTAATAAATCTCACAGAGTGCTTGTAAACGTCTGGATGTGAACAGCTGGGAACCTGTGGTGTGTTCTA T 7197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=1.391;DP=180;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=30.13;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,164:174:99:7328,269,0 +chr11 25809994 . A AT 369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:407,42,0 +chr11 25820415 . C A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr11 25820418 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:349,24,0 +chr11 25820799 . GT G 390.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:428,42,0 +chr11 25839085 . G T 750.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:779,57,0 +chr11 25964921 . C T 4163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:4192,324,0 +chr11 25970576 . C T 4173.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4202,301,0 +chr11 25986683 . TCAGGTTTGACTATTTAACCGTAAAACATGTGAGTACTGTACTTGTGCAATATTATTGCTTTATTATTTATCTCTCTTTTC T 1959.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.855;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=26.62;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,46:49:99:1997,0,252 +chr11 25987035 . CGTGAGTAAAGATCTATACTAAGCACATTTACACAGTCATGAATGATCTTGAATTAGTGATGACTGAATTGACTTCTCACAG C 1940.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=2.341;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=35.66;ReadPosRankSum=-2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1978,151,0 +chr11 25996406 . G C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr11 25996415 . C T 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:387,27,0 +chr11 26130104 . ACTAAAACAAAGGCATTATAGTGGATTACTGATTCCTGACTCATTCTAGACCCATTAACAGTCCTGTTACTATTTATCCAGCAAATGAACATAC A 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=25.63;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:473,0,1982 +chr11 26140867 . TCTGAAATGCACAAAGCAAGATTATGAGGTCAATGATTTTTGGTTAATAACAGGTCAATCTAATATTTTGTTGTTACACATTTACAGTGTTCATCATAC T 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=1.575;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=32.69;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:593,0,1060 +chr11 26236268 . C CA 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.678;DP=500;FS=11.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=1.23;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:386,92:478:99:652,0,10888 +chr11 26244636 . T C 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=2.479;DP=32;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:644,0,140 +chr11 26262230 . G A 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:636,48,0 +chr11 26262283 . C T 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 +chr11 26269965 . A AT 402.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:440,30,0 +chr11 26339332 . G A 7434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7463,536,0 +chr11 26348649 . C G 1312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1341,99,0 +chr11 26348761 . A G 839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:868,63,0 +chr11 26371300 . A G 6812.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:6841,489,0 +chr11 26377237 . C T 1443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-1.733;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1472,114,0 +chr11 26419433 . AGTGAGTAACTTATCTCTCACACTTTCTATTTAAAGCGAGCGTTAAAAAGATCTGTTGACACAAGTGATTTTACTTATTAATATACGTTCACTATGTTACAG A 1267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=2.301;DP=33;FS=4.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=30.08;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,31:33:99:1305,0,776 +chr11 26424582 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr11 26431994 . G T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr11 26434146 . C T 4023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:4052,295,0 +chr11 26453707 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,176 +chr11 26453896 . C A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 +chr11 26456177 . G A 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:675,48,0 +chr11 26457084 . CAT C 298.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 +chr11 26475958 . G A 3233.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3260,235,0 +chr11 26535254 . C A 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:895,63,0 +chr11 26546278 . A G 1176.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1205,90,0 +chr11 26546374 . C T 976.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1005,72,0 +chr11 26551091 . A AT 310.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:348,33,0 +chr11 26560069 . C A 1570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1599,120,0 +chr11 26563594 . GAGGTGTGTTTTGACCATTTCATCTGCAGATATCAGAAATCTTGAATTTGCCGCTAAATCCTTCTGTCTCTCCTTTTCTGTCTACTTTCTTCAC G 1775.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.648;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=29.01;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1813,143,0 +chr11 26563950 . G A 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 +chr11 26615368 . C G 4948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:4977,373,0 +chr11 26616442 . G A 4700.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4729,340,0 +chr11 26627362 . TG T 646.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:684,51,0 +chr11 26629319 . G A 1299.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1328,96,0 +chr11 26646803 . A G 604.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:633,45,0 +chr11 26647379 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:367,0,325 +chr11 26651613 . C T 1225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1254,87,0 +chr11 26664022 . A C 423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:452,36,0 +chr11 26716279 . CT C 831.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.331;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,33:39:4:867,4,0 +chr11 26812930 . C CA 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1034,69,0 +chr11 26816526 . CACACACACACACACACACACACACACACACAT C 233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr11 26821073 . G A 1689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1718,129,0 +chr11 27164124 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=2.976;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,369 +chr11 27166185 . T G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:338,0,288 +chr11 27166199 . TA T 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.048;DP=20;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:282,0,268 +chr11 27167071 . GA G 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.633;DP=29;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:439,0,149 +chr11 27167083 . A T 847.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.502;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:11:974,0,11 +chr11 27245331 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.939;DP=42;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:760,0,581 +chr11 27314659 . C T 1704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=-0.501;DP=146;FS=3.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,55:146:99:1733,0,3222 +chr11 27314704 . C T 1713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.928;DP=146;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.081;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,51:146:99:1742,0,3406 +chr11 27314872 . T A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.578;DP=133;FS=4.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:1674,0,2991 +chr11 27325892 . A T 7446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=1.449;DP=345;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,215:337:99:7475,0,4315 +chr11 27326237 . GAGGTTTTTGGTCACTTTTATTCACTTAGAAAACTAATGTTGGTTTGCACATGCAGATTTTGCTGACTTTCTTTTACCAACCACTCACTGT G 1756.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.064;ClippingRankSum=0.365;DP=273;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=6.43;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,258:264:99:1794,622,0 +chr11 27329660 . AAGGTTTGAACAACCTTTCTGTAATGTTAAAAAAACATTTGATTGCAGAATAGTTTTACAGTAATCATAATAAATCCCCACACTGTCTTTC A 13773.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.290;DP=299;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.141;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,281:284:99:13811,1148,0 +chr11 27331061 . G A 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 +chr11 27334206 . C T 1706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=-0.905;DP=89;FS=4.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,50:89:99:1735,0,1391 +chr11 27496251 . A AGT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-1.733;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=20.07;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:40:258,0,40 +chr11 27496417 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.983;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:311,0,756 +chr11 27496828 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,256 +chr11 27497022 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=-0.822;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:531,0,1456 +chr11 27498051 . A AT 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-1.927;DP=37;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:454,0,690 +chr11 27499346 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.092;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:922,0,1058 +chr11 27499510 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,342 +chr11 27500056 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=-1.656;DP=35;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:457,0,755 +chr11 27501816 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,404 +chr11 27501976 . CTT C 596.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.297;DP=47;FS=4.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:634,0,1143 +chr11 27502361 . A C 4100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=-0.923;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=31.32;ReadPosRankSum=-1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,82:112:99:4129,0,1758 +chr11 27541888 . AT A 5527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.376;DP=233;FS=0.977;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=23.72;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,204:221:99:5616,462,0 +chr11 27548675 . TA T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.293;DP=67;FS=2.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:249,0,1065 +chr11 27550641 . A G 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-3.295;DP=40;FS=11.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=27.94;ReadPosRankSum=3.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1146,0,387 +chr11 27550841 . AT A 907.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:91:945,91,0 +chr11 27550917 . C G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=1.547;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:275,0,930 +chr11 27553008 . T C 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.657;DP=60;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=20.96;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,37:60:99:1286,0,822 +chr11 27616332 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:231,0,64 +chr11 27616915 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:366,0,293 +chr11 27618934 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.633;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,150 +chr11 27619008 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-2.069;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,291 +chr11 27619078 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:275,0,227 +chr11 27619454 . C A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-2.237;DP=15;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=29.18;ReadPosRankSum=2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:466,0,185 +chr11 27619564 . G GT 335.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:473,50,0 +chr11 27619604 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=2.177;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:373,0,247 +chr11 27619908 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-0.329;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:839,0,808 +chr11 27620275 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.953;DP=42;FS=8.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:631,0,801 +chr11 27630009 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-1.130;DP=43;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:599,0,883 +chr11 27638187 . A G 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.091;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:1402,0,1164 +chr11 27639346 . A G 1813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=1.111;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,54:91:99:1842,0,1333 +chr11 27640720 . G A 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=2.576;DP=91;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:809,0,4781 +chr11 27640925 . C A 2034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=2.982;DP=128;FS=4.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:2063,0,2023 +chr11 27641222 . C T 1922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=-1.020;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1951,0,1665 +chr11 27641252 . T C 1977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.437;DP=113;FS=8.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=17.50;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:2006,0,1829 +chr11 27641507 . T A 318.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=31.89;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:347,0,16 +chr11 27644298 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:254,0,290 +chr11 27644399 . A C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:272,0,199 +chr11 27645809 . C T 275.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:304,0,17 +chr11 27647071 . AG A 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:74:253,0,74 +chr11 27663939 . G A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.045;DP=78;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:1362,0,1362 +chr11 27673580 . T C 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.145;DP=67;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:1153,0,1099 +chr11 27673781 . C T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.226;DP=85;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:1520,0,1449 +chr11 27673970 . C T 1626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.573;DP=89;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:1655,0,1466 +chr11 27675355 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-1.071;DP=87;FS=4.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:639,0,2293 +chr11 27675427 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.549;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:417,0,2015 +chr11 27675505 . A G 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.448;DP=65;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,45:65:99:1645,0,466 +chr11 28777823 . C CA 260.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:298,20,0 +chr11 28777828 . G A 269.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:20:298,20,0 +chr11 29300811 . CTCTT C 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=2.292;DP=20;FS=19.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:555,0,220 +chr11 29315290 . T A 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:782,54,0 +chr11 29490922 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-1.844;DP=55;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:397,0,1360 +chr11 30633924 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:414,0,90 +chr11 30638893 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-0.301;DP=23;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.704;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:616,0,206 +chr11 30670936 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-3.725;DP=70;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=7.45;ReadPosRankSum=2.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:550,0,1954 +chr11 30794910 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.741;DP=31;FS=5.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:424,0,616 +chr11 30795043 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=2.430;DP=20;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,380 +chr11 30795044 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:331,0,358 +chr11 30964837 . A G 284.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.60;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:8:312,0,8 +chr11 30982718 . C T 2917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=1.428;DP=171;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,80:170:99:2946,0,3040 +chr11 31107416 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:304,0,215 +chr11 31162260 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,275 +chr11 31198929 . T C 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.088;DP=93;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1583,0,1715 +chr11 31207398 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:274,0,98 +chr11 31268030 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=16.36;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,296 +chr11 31575601 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:56:249,0,56 +chr11 31575611 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:56:249,0,56 +chr11 31620600 . AAGGTGACCACATCTACTGTTTTTACTGTCAATACTGCTTTTTACTTCATGCGTTTCTTGTTGTTTATGACTAAAACATGAGTAGATTGGTCTCTAGCTATTTAAATTGTGTTGAATTTGTGTTTTGC A 13784.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=1.839;DP=312;FS=7.275;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=29.31;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,307:312:99:13822,1194,0 +chr11 31902956 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,133 +chr11 31903023 . A C 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-1.057;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:586,0,200 +chr11 31907392 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=2.472;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:344,0,335 +chr11 32025352 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=1.399;DP=22;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:496,0,287 +chr11 32025582 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=1.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:242,0,660 +chr11 32026063 . CT C 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-0.033;DP=52;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:787,0,391 +chr11 32576550 . GTA G 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=11;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,112 +chr11 34436877 . A C 2234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-0.466;DP=141;FS=3.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:2263,0,2470 +chr11 34439031 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,293 +chr11 34493276 . G A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-1.743;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,252 +chr11 34576127 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:288,0,539 +chr11 34591329 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:316,0,344 +chr11 34608702 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.370;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:388,0,519 +chr11 34608749 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.669;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:414,0,661 +chr11 34609562 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:313,0,396 +chr11 34609565 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=23.73;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:313,0,396 +chr11 34610121 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,299 +chr11 34611299 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.916;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.903;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:577,0,191 +chr11 34697743 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:229,0,302 +chr11 34698200 . C A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,155 +chr11 34707980 . T A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=1.018;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:658,0,663 +chr11 34708550 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.286;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:282,0,341 +chr11 34711952 . G A 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-0.375;DP=66;FS=8.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=15.06;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1022,0,1280 +chr11 34712150 . A T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.408;DP=66;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:1261,0,973 +chr11 34712234 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-1.749;DP=51;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:901,0,755 +chr11 34736697 . G C 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-1.439;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:981,0,977 +chr11 34758197 . A G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=1.586;DP=149;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:550,0,14245 +chr11 34759521 . C T 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=3.047;DP=108;FS=6.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,36:108:99:1025,0,2691 +chr11 34770760 . G T 4442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=-2.346;DP=250;FS=6.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,125:248:99:4471,0,4195 +chr11 34770841 . G A 4820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.388;DP=267;FS=11.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,134:266:99:4849,0,4790 +chr11 34773199 . T A 6572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=-0.967;DP=353;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=18.62;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,199:348:99:6601,0,5123 +chr11 34782170 . A G 8302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.488;DP=463;FS=4.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=17.93;ReadPosRankSum=3.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,256:463:99:8331,0,7252 +chr11 34786471 . C A 4807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=-0.448;DP=278;FS=0.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,150:277:99:4836,0,4615 +chr11 34834844 . GA G 2946.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-1.173;DP=322;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,134:293:99:2984,0,3191 +chr11 34846478 . A T 10305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=2.194;DP=540;FS=1.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,313:537:99:10334,0,7781 +chr11 34952796 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:389,0,51 +chr11 35024624 . C CA 509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.794;DP=45;FS=6.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:547,0,401 +chr11 35025254 . C T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.618;DP=51;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:935,0,806 +chr11 35025662 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=2.640;DP=47;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:399,0,2638 +chr11 35033422 . G A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=2.560;DP=75;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=17.89;ReadPosRankSum=-2.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1370,0,1241 +chr11 35035788 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=3.265;DP=33;FS=11.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=8.51;ReadPosRankSum=-3.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:309,0,753 +chr11 35036428 . G A 1231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-1.032;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:1260,0,1124 +chr11 35103053 . T A 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.596;DP=30;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=29.86;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:924,0,123 +chr11 35236432 . G A 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 +chr11 35237345 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:259,0,366 +chr11 35240298 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-1.115;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:384,0,268 +chr11 35302672 . A C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=2.034;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:351,0,93 +chr11 35325027 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=1.377;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:253,0,739 +chr11 35329703 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.819;DP=47;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:537,0,1025 +chr11 35329817 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.531;DP=39;FS=5.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=6.05;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:264,0,1109 +chr11 35330138 . T C 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.684;DP=55;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1147,0,733 +chr11 35330177 . C T 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-1.908;DP=65;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,39:65:99:1311,0,895 +chr11 35335978 . C T 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.935;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1483,0,1000 +chr11 35355090 . C G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=2.009;DP=31;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:430,0,560 +chr11 35357644 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.197;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:506,0,162 +chr11 35389053 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=1.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:367,0,491 +chr11 35392400 . A T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-0.171;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:410,0,506 +chr11 35397458 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.730;DP=37;FS=1.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:354,0,941 +chr11 35407151 . C T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=-1.219;DP=43;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:557,0,817 +chr11 35428319 . C G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=1.157;DP=75;FS=5.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:331,0,2310 +chr11 35635677 . A T 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-2.726;DP=133;FS=10.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=8.21;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,41:133:99:1120,0,3424 +chr11 35767020 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=2.067;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,247 +chr11 35787029 . A C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.629;DP=32;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:230,0,866 +chr11 35820794 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-1.917;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:252,0,954 +chr11 35905415 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.002;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:650,0,685 +chr11 35913257 . A T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.461;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:484,0,458 +chr11 36004306 . ACTGGTGCACATGTTAAGCAAATATCATAAACAAAAAGAATGAACAAAAATGATTTACAAGTATAATGGTAATAAACGGCATATTTATGTGATAAGGATAC A 1486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=2.142;DP=37;FS=2.334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:80:1524,80,0 +chr11 36289624 . C T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-0.537;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:746,0,953 +chr11 36289678 . G GA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.449;DP=38;FS=7.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:352,0,548 +chr11 36289805 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-1.540;DP=37;FS=5.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:284,0,2188 +chr11 36289812 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-1.243;DP=38;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:291,0,2188 +chr11 36305771 . G C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,376 +chr11 36336086 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.436;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:366,0,729 +chr11 36600984 . A C 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-1.284;DP=150;FS=6.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,52:149:99:1717,0,3381 +chr11 36601106 . A T 1499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.259;DP=122;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,44:122:99:1528,0,2739 +chr11 36883162 . T A 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.973;DP=199;FS=11.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,56:198:99:1457,0,5474 +chr11 36883819 . GACCTTAAAACATCAAGCAGTAGTTAAAATGAGGGTTATTTAAAACAAAATAAACCTGAAAATGTATTTATGAAATCCATGAAAACAT G 13710.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.496;DP=355;FS=13.552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=32.50;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,345:355:99:15702,1283,0 +chr11 36999354 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:302,0,91 +chr11 36999508 . C A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.740;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:273,0,485 +chr11 37046954 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=2.292;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:283,0,539 +chr11 37049066 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=-0.467;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:327,0,435 +chr11 37055978 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,261 +chr11 37056637 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,334 +chr11 37060420 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.694;DP=73;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:245,0,2210 +chr11 37070869 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=-0.766;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:291,0,1518 +chr11 37099047 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.530;ClippingRankSum=-1.635;DP=220;FS=5.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,43:220:99:449,0,6381 +chr11 37099644 . C T 3031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;ClippingRankSum=0.006;DP=199;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,107:199:99:3060,0,3152 +chr11 37124380 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=1.317;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:366,0,459 +chr11 37126259 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-0.140;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:402,0,614 +chr11 37127775 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.629;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:239,0,886 +chr11 37128638 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=1.341;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:460,0,644 +chr11 37134670 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-1.344;DP=26;FS=1.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:349,0,535 +chr11 37214293 . C G 2965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:2994,217,0 +chr11 37215235 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=5.085;DP=97;FS=3.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=4.34;ReadPosRankSum=-2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:449,0,2904 +chr11 37215592 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=-1.263;DP=58;FS=6.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=4.44;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:286,0,2350 +chr11 37215869 . C T 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.949;DP=107;FS=2.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1658,0,1929 +chr11 37215955 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-1.227;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:571,0,813 +chr11 37216254 . A C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.253;DP=82;FS=9.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:411,0,2517 +chr11 37216310 . A C 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-1.387;DP=77;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:717,0,2065 +chr11 37216340 . T C 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.062;DP=83;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:1057,0,1948 +chr11 37216558 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.533;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:261,0,2944 +chr11 37239256 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.688;DP=46;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:293,0,1243 +chr11 37239485 . C A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.069;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:534,0,652 +chr11 37270964 . TTACCTGCAAACATACAATTTCAGACACGTTGCCATTATATTTATTTCCACTTAAAAGCCTGAAATTTTAAAACAGCAGTGCAAGCATGG T 1440.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=1.798;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=29.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:99:1478,119,0 +chr11 37281468 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.033;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:339,0,406 +chr11 37293637 . A G 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.878;DP=75;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:930,0,1710 +chr11 37296700 . TCTGTGGAGGCAATCATTTGAAATGATGTTGCAAAACAGAATTTAAAAAAAATAAAGAAACATTTCATCATGGTCAGAC T 3961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.190;DP=104;FS=1.890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=30.34;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,95:100:99:3999,290,0 +chr11 37303626 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-0.442;DP=66;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:441,0,1677 +chr11 37325625 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.025;DP=72;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.515;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:558,0,1981 +chr11 37325703 . TGGTACAGTATTGCTTTTAAACGGGCATTTTCACCTGGAGTTAGTTTCGGAATCATCTTGTTTTTGTGTATTTCA T 344.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=3.257;DP=84;FS=2.011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,68:72:99:382,149,0 +chr11 37325831 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.069;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:697,0,2055 +chr11 37329958 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=1.873;DP=79;FS=8.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=3.86;ReadPosRankSum=2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:333,0,2359 +chr11 37583563 . G A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.090;DP=38;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:834,0,529 +chr11 37632864 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:300,0,368 +chr11 37632911 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:316,0,134 +chr11 37647085 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,306 +chr11 37656960 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.766;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:285,0,302 +chr11 37658657 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:341,0,180 +chr11 37659609 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,359 +chr11 37889515 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-0.860;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:339,0,959 +chr11 37889699 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.518;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:347,0,1529 +chr11 37910206 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.702;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:306,0,1147 +chr11 37932750 . C T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=-1.282;DP=71;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.824;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:743,0,1893 +chr11 37932784 . A C 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=-2.389;DP=72;FS=3.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:815,0,2734 +chr11 37933237 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.515;DP=47;FS=2.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:233,0,1395 +chr11 37940072 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.425;DP=26;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:287,0,594 +chr11 37940338 . T C 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=1.424;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=22.73;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:733,0,382 +chr11 37941261 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.930;DP=40;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=19.17;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:795,0,868 +chr11 37962685 . G T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr11 37983991 . T TC 498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:44:536,44,0 +chr11 38018086 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,147 +chr11 38049058 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=1.701;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:372,0,367 +chr11 38050538 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.445;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:263,0,372 +chr11 38118003 . G T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=-0.413;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:619,0,564 +chr11 38118044 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=1.414;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:413,0,475 +chr11 38118494 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:257,0,335 +chr11 38120129 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.066;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:422,0,580 +chr11 38124543 . C T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-1.059;DP=50;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:627,0,1012 +chr11 38193496 . C G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr11 38194038 . A T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +chr11 38216092 . A C 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 +chr11 38220136 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.954;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:333,0,443 +chr11 38220389 . A C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.531;DP=15;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=22.58;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:367,0,175 +chr11 38220860 . T C 220.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:249,21,0 +chr11 38221263 . A T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=-1.469;DP=37;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:547,0,863 +chr11 38221438 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.207;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:584,0,1207 +chr11 38221547 . G A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr11 38221885 . C A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:85:357,0,85 +chr11 38224640 . T TA 407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:445,42,0 +chr11 38225365 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:313,0,107 +chr11 38331867 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.029;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:373,0,342 +chr11 38366970 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=23.10;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:421,0,103 +chr11 38367533 . C G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=-1.265;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=21.87;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:728,0,405 +chr11 38368551 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-2.450;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=29.62;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:85:591,0,85 +chr11 38371837 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.034;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:271,0,509 +chr11 38437494 . C G 2390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2419,181,0 +chr11 38514215 . T A 1097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1126,78,0 +chr11 38515202 . A AG 851.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1052,110,0 +chr11 38515470 . C T 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 +chr11 38581963 . C T 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 +chr11 38586012 . A G 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 +chr11 38586021 . T C 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:398,27,0 +chr11 38600403 . T A 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 +chr11 38622628 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.434;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=29.60;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:561,0,119 +chr11 38623457 . C CA 216.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:254,26,0 +chr11 38779353 . G A 4555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=-1.345;DP=434;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,146:434:99:4584,0,16196 +chr11 38794244 . G A 9170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=-1.237;DP=273;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.706;QD=33.59;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,93:270:99:9199,0,5754 +chr11 38874699 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=1.240;DP=31;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:261,0,872 +chr11 39011200 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,100 +chr11 39014465 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,191 +chr11 39089184 . CGGTAAGATCAGCCCTTCTGTCTTTAGTTTTGTGCTGTTTTACTTCAGCTAAATCTGTCTTTTGTGCTCTGTCA C 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.972;DP=39;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=32.30;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:99:1297,0,1651 +chr11 39098211 . A G 495.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=32.25;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:522,3,0 +chr11 39216738 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=1.266;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=14.83;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:310,0,340 +chr11 39316514 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:311,0,404 +chr11 39316778 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-0.429;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:351,0,402 +chr11 39317043 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.667;DP=33;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:229,0,853 +chr11 39317146 . T G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-1.779;DP=49;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:283,0,1446 +chr11 39319875 . A C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.162;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=11.38;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:324,0,612 +chr11 39320604 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.607;DP=29;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:392,0,598 +chr11 39321769 . A C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr11 39323565 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=-0.444;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:279,0,810 +chr11 39327056 . C CT 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,291 +chr11 39329820 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.573;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:380,0,214 +chr11 39330499 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-1.723;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:483,0,412 +chr11 39774806 . AT A 2260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-1.708;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,79:132:99:2298,0,1569 +chr11 39774923 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-0.084;DP=231;FS=9.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,41:231:99:578,0,13741 +chr11 39775010 . A AAT 3034.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=-0.561;DP=148;FS=3.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,116:132:99:3072,107,0 +chr11 39775957 . TAG T 1062.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-0.517;DP=151;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=7.04;ReadPosRankSum=4.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,43:143:99:1100,0,3837 +chr11 39776332 . A AT 1275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-3.064;DP=220;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,67:196:99:1313,0,3227 +chr11 39776411 . A T 4432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-2.246;DP=204;FS=7.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,129:204:99:4461,0,2705 +chr11 39777202 . C CT 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-1.211;DP=353;FS=6.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,61:326:99:418,0,7377 +chr11 40240961 . T A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-2.179;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:352,0,1018 +chr11 40309838 . T C 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:36:508,36,0 +chr11 40313525 . ACTAAGAAGCAAACAGAATGTATCAGTTAAAACATTTTGAAACAAATGACCATAAAGCTGTACAGGTTTAAAACGGCAAAC A 6071.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.810;DP=140;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,130:135:99:6109,521,0 +chr11 40347579 . A T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=2.060;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:435,0,247 +chr11 40381741 . GT G 948.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.481;DP=139;FS=3.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,44:125:99:986,0,1907 +chr11 41480515 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-2.358;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=14.52;ReadPosRankSum=2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:275,0,313 +chr11 41493549 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.991;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:280,0,170 +chr11 41524576 . AGTCAGTATAATCGTTCCCTTCCTGTAATTTGGCTCATCCGTCCTTATTCAACTGGGTTTAAATAGAGCTGATCTTTCTCTTCGCAG A 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.817;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=23.44;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,33:35:99:1419,0,196 +chr11 41549122 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.386;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:430,0,563 +chr11 41609769 . A C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=3.021;DP=32;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:427,0,692 +chr11 41609885 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-1.085;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=12.99;ReadPosRankSum=2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:405,0,565 +chr11 41610158 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.165;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:365,0,412 +chr11 41613210 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=1.079;DP=69;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:350,0,2008 +chr11 41636974 . CAGGTAATCACAGCACACTGACTACAGCTGATCTGGTTTTTAGTCATGACTAACCACTGAATCATGAGTGTGTTTT C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,1243 +chr11 42093223 . G T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.49;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,146 +chr11 42095964 . A T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=19.24;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:336,0,241 +chr11 42097219 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.718;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,451 +chr11 42142334 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:300,0,147 +chr11 42143218 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.22;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:278,0,67 +chr11 42145173 . C T 277.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:306,0,17 +chr11 42154007 . AG A 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=-0.662;DP=175;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,50:162:99:823,0,3857 +chr11 42154746 . GCTGTTGAAATCAAACAGGTATTTTTTTAAATTAAAAGATCATGACAATAAATGTTTTGCTTTTATAAATGGTACTATCAAAAATAAAATGCAAAGTCAAACTCAC G 17059.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.104;DP=413;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,403:413:99:17097,573,0 +chr11 42319504 . G T 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=2.307;DP=64;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=16.53;ReadPosRankSum=-2.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:1086,0,1210 +chr11 42320284 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=-1.950;DP=87;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1095,0,1859 +chr11 42410756 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=23.55;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:405,0,493 +chr11 42411519 . C A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.623;DP=60;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:812,0,1269 +chr11 42558689 . G T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.945;DP=136;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:861,0,3877 +chr11 42658363 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.65;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:264,0,167 +chr11 42783396 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-2.209;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:443,0,262 +chr11 42793060 . C A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.630;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:375,0,812 +chr11 42797411 . C CA 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:375,0,610 +chr11 42799490 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:332,0,330 +chr11 42799582 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:344,0,180 +chr11 42800741 . T A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:429,0,997 +chr11 42800742 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:429,0,997 +chr11 42804498 . T A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.753;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:472,0,571 +chr11 42806570 . G A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr11 42806864 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.465;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:350,0,446 +chr11 42844299 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-2.044;DP=28;FS=4.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:830,0,381 +chr11 42853407 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.042;DP=42;FS=2.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=6.59;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:305,0,1151 +chr11 42858968 . G A 624.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=-1.327;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=27.16;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:42:653,42,0 +chr11 42931059 . C A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.902;DP=43;FS=4.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:615,0,799 +chr11 42949430 . ACAGGTACAATCATCTCAGAATTTAACACTGAGGAGTCATTTTAGACCTAAAAAGTTGCATATTATAACTGTACCGTTATTAAAGCTGATCAATGGTATGACATGTT A 3039.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.744;DP=68;FS=6.086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:99:3077,281,0 +chr11 42951385 . C A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.118;DP=108;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:922,0,2962 +chr11 42964745 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:351,0,668 +chr11 43037017 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:324,0,282 +chr11 43037453 . T A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.038;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:514,0,1346 +chr11 43037569 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:273,0,59 +chr11 43040158 . C G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.678;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,541 +chr11 43065404 . C T 1676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-1.088;DP=151;FS=6.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,51:151:99:1705,0,3505 +chr11 43067578 . A G 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.075;DP=151;FS=6.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,53:150:99:1772,0,3163 +chr11 43068629 . C A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.249;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.09;ReadPosRankSum=-2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:541,0,561 +chr11 43068979 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:235,0,52 +chr11 43069123 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:235,0,57 +chr11 43069847 . AG A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:267,0,406 +chr11 43074080 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.305;DP=60;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:487,0,1561 +chr11 43090742 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.888;DP=55;FS=6.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:513,0,1379 +chr11 43090949 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.572;DP=57;FS=20.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=4.61;ReadPosRankSum=-3.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:291,0,1660 +chr11 43091220 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.172;DP=66;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:375,0,1964 +chr11 43102203 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:89:311,0,89 +chr11 43102204 . T A 416.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=34.69;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:1:442,1,0 +chr11 43102513 . G A 2588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.554;DP=219;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,75:219:99:2617,0,5164 +chr11 43103561 . T G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=-2.293;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=31.98;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:32:508,0,32 +chr11 43121556 . G GAT 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=2.123;DP=319;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=1.53;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:70:526,0,70 +chr11 43125151 . G GA 1028.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.210;DP=104;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,50:87:99:1066,0,798 +chr11 43132402 . T C 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=3.359;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=25.88;ReadPosRankSum=-3.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,48:67:99:1762,0,495 +chr11 43132550 . T C 1216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.272;DP=54;FS=4.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=22.53;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1245,0,646 +chr11 43143217 . T C 1653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-3.716;DP=86;FS=18.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=19.23;ReadPosRankSum=-2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1682,0,1316 +chr11 43150486 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.641;DP=114;FS=10.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.722;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:323,0,3246 +chr11 43150713 . A G 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=1.034;DP=133;FS=4.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,46:132:99:1622,0,3248 +chr11 43161208 . T C 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-2.996;DP=253;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,88:248:99:2398,0,5535 +chr11 43165444 . A T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-0.912;DP=59;FS=10.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=6.66;ReadPosRankSum=-3.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:421,0,1670 +chr11 43166156 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.941;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:318,0,2430 +chr11 43176273 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=2.257;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,298 +chr11 43176376 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-1.125;DP=59;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:271,0,1726 +chr11 43176808 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.905;DP=120;FS=44.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,20:120:99:252,0,3992 +chr11 43289535 . TG T 883.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:73:921,73,0 +chr11 43289540 . A T 892.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:73:921,73,0 +chr11 43455639 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=1.278;DP=154;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=1.63;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,24:154:99:280,0,10307 +chr11 43608589 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,450 +chr11 43608596 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:231,0,450 +chr11 43611983 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,328 +chr11 43640172 . A G 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=1.826;DP=251;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=7.58;ReadPosRankSum=-3.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,75:251:99:1931,0,6560 +chr11 43684790 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.094;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:281,0,1648 +chr11 43690745 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.034;DP=49;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:365,0,2992 +chr11 43811333 . GAGGTGAGATGAAGCATGTGTGTGTGTGTTTTATGACCGTATATATGTCATACTGATACACTCAGATGACTCTCTCTGCCTTTTCTTCCCAC G 602.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:47:640,47,0 +chr11 43889637 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.205;DP=75;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:420,0,2185 +chr11 43890159 . G A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-1.007;DP=53;FS=5.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:861,0,890 +chr11 44022152 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.137;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:874,0,280 +chr11 44028884 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.636;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:242,0,1769 +chr11 44056799 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-1.765;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=14.34;ReadPosRankSum=2.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:401,0,542 +chr11 44105301 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=-1.091;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:694,0,519 +chr11 44113872 . AAG A 4345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.903;DP=293;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,145:221:99:4383,0,2114 +chr11 44120331 . C T 2232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.042;DP=329;FS=0.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=6.79;ReadPosRankSum=2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,92:327:99:2261,0,8882 +chr11 44139712 . C T 4238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.987;DP=136;FS=8.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=31.17;ReadPosRankSum=5.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,105:136:99:4267,0,1976 +chr11 44140458 . C G 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.397;DP=297;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,64:297:99:1124,0,8525 +chr11 44165912 . C T 8681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.844;DP=312;FS=0.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=27.83;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,233:312:99:8710,0,1801 +chr11 44488447 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=-2.447;DP=170;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=5.16;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,51:169:99:906,0,4046 +chr11 44578665 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr11 44583134 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:376,0,126 +chr11 44692106 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.330;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:282,0,2802 +chr11 44693442 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.656;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,27:103:99:614,0,3054 +chr11 44693456 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.013;DP=97;FS=3.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:548,0,2926 +chr11 44707617 . TA T 636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:42:674,42,0 +chr11 44713270 . C CT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.450;DP=35;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:266,0,542 +chr11 44715256 . A AC 841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-2.055;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:879,0,252 +chr11 45101375 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.409;DP=46;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:325,0,940 +chr11 45172695 . A G 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr11 45248361 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.016;DP=37;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:427,0,755 +chr11 45248862 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.745;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:343,0,739 +chr11 45358514 . C CT 746.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:62:784,62,0 +chr11 45358814 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:250,0,60 +chr11 45358968 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.471;DP=88;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:266,0,2858 +chr11 45368959 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.628;DP=91;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:403,0,2658 +chr11 45438103 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.662;DP=161;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,28:161:99:343,0,4868 +chr11 45443794 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=1.500;DP=150;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,37:150:99:818,0,4342 +chr11 45447681 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.892;DP=63;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:374,0,1839 +chr11 45447712 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=1.614;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=6.85;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:275,0,944 +chr11 45449279 . G GT 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.964;DP=54;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:288,0,947 +chr11 45453082 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.295;DP=45;FS=5.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:262,0,1277 +chr11 45465486 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.375;DP=50;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:231,0,1531 +chr11 45467343 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.682;DP=43;FS=5.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:267,0,1214 +chr11 45471007 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.113;DP=75;FS=5.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:293,0,2349 +chr11 45474683 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.520;DP=79;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:398,0,2144 +chr11 45478309 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-0.993;DP=68;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:285,0,2066 +chr11 45483855 . T G 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=-0.989;DP=360;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,68:358:99:1073,0,10640 +chr11 45656500 . AGTAAGAGCGCCTGATACACTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATGTGTAACTATACACATCCTGTTTGTGACGCAG A 754.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.102;DP=25;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=30.19;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:792,0,1384 +chr11 45705736 . G GT 200.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:6:237,0,6 +chr11 45714557 . T A 2830.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2859,229,0 +chr11 45718144 . A C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:521,39,0 +chr11 45718203 . A C 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:943,66,0 +chr11 45718427 . A G 913.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:942,66,0 +chr11 45718889 . A G 2725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2754,190,0 +chr11 45719189 . TTG T,TTGTG 1627.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.771;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,25,24:51:99:1663,835,1125,904,0,1265 +chr11 45719286 . TGA T 459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:497,37,0 +chr11 45724186 . G T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.211;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=33.54;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:30:632,0,30 +chr11 45724204 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:500,0,118 +chr11 45728179 . A G 2402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2431,178,0 +chr11 45728765 . A C 214.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:243,0,24 +chr11 45728796 . A C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr11 45728969 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr11 45736674 . C G 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-2.241;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:809,0,241 +chr11 45736768 . G C 2290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.202;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,49:55:53:2319,53,0 +chr11 45737018 . G T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=1.296;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=33.21;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,29:33:38:1124,0,38 +chr11 45737087 . T G 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.427;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=32.31;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:39:1062,0,39 +chr11 45751119 . G T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:42:491,0,42 +chr11 45752267 . AACCTGGCGGAGAAACAGGAGTGAGTGCAGGGGTCCAGTTCATTAACGGAGCACACTATCTAGCATTCTC A 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.34;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:393,0,411 +chr11 45752385 . G C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.594;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=31.85;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:45:506,0,45 +chr11 45753169 . A T 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 +chr11 45769156 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr11 45871983 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.996;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:235,0,417 +chr11 45903722 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.975;DP=52;FS=8.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:488,0,1323 +chr11 45977110 . GCAGGTCAGTGTGTGTCTCTGTGTGCATGTGTGTGTGCGCGCGAGCATTTGTGTGTGACTCGGTGTGTTCTCTGCT G 3047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-1.491;DP=72;FS=3.068;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:3085,249,0 +chr11 45979410 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.057;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:485,0,925 +chr11 46094988 . G A 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=1.425;DP=207;FS=7.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,52:202:99:1223,0,5653 +chr11 46099104 . AAC A 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=1.737;DP=73;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:479,0,346 +chr11 46167380 . TCTGACACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGATTATTTATCACAGAAAACAAAACAGCTGAGGAGGAAAATAATGCTTTTATCTATCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAC T 2829.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-1.728;DP=69;FS=3.052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.298;QD=35.95;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,67:69:99:3128,302,0 +chr11 46194187 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:321,0,615 +chr11 46197127 . G GCT 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.740;DP=201;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,43:143:99:852,0,3048 +chr11 46197527 . A T 2182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.658;DP=285;FS=11.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,86:285:99:2211,0,7751 +chr11 46219439 . T C 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=-1.393;DP=61;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1232,0,1462 +chr11 46219442 . C T 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.586;DP=54;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1242,0,1462 +chr11 46225334 . C T 1995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=1.837;DP=120;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:2024,0,2110 +chr11 46259426 . C T 1349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.808;DP=91;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=14.83;ReadPosRankSum=2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:1378,0,1767 +chr11 46263342 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=34.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:305,0,64 +chr11 46263729 . GTTTTATTTCTCAGATTTGTGAGGAAAAAGTA G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=1.922;DP=65;FS=3.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:454,0,11640 +chr11 46291093 . G A 2136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-2.799;DP=189;FS=11.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=11.31;ReadPosRankSum=2.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,69:189:99:2165,0,3459 +chr11 46294057 . A G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=1.417;DP=37;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:626,0,813 +chr11 46294150 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.260;DP=40;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:264,0,1773 +chr11 46296774 . A G 325.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=32.59;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:354,0,16 +chr11 46368804 . C A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.565;DP=45;FS=2.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:304,0,1074 +chr11 46407589 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=2.177;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:289,0,199 +chr11 46442510 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=11.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:370,0,284 +chr11 46461825 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.090;DP=110;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:412,0,3166 +chr12 2278 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:378,0,240 +chr12 15061 . G A 1969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-1.710;DP=154;FS=7.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,58:154:99:1998,0,3280 +chr12 19438 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.039;DP=53;FS=4.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:367,0,1739 +chr12 62915 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.408;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:450,0,436 +chr12 277946 . C T 4131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.702;DP=250;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,118:250:99:4160,0,4244 +chr12 278070 . G C 3083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.058;DP=181;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:181:99:3112,0,3187 +chr12 278247 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-1.136;DP=160;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,34:159:99:613,0,4569 +chr12 281907 . C T 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.714;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,98:195:99:3263,0,3188 +chr12 281988 . C T 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.261;DP=169;FS=0.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,47:169:99:1173,0,4658 +chr12 285105 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.691;DP=127;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,48:126:99:1816,0,5233 +chr12 285111 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.694;DP=122;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:1816,0,5201 +chr12 285177 . G A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=-1.165;DP=160;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,38:160:99:767,0,4449 +chr12 285517 . C T 3078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.172;DP=178;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,95:177:99:3107,0,2944 +chr12 286180 . G T 2586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.254;DP=187;FS=10.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,91:173:99:2615,0,2758 +chr12 291354 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-1.837;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:346,0,558 +chr12 295784 . T C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 +chr12 295794 . A G 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:400,27,0 +chr12 297818 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-1.389;DP=64;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=15.29;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1007,0,1147 +chr12 426094 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=26.37;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:94:371,0,94 +chr12 467564 . A C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-2.329;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=18.74;ReadPosRankSum=2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,230 +chr12 467676 . T A 3526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-0.812;DP=131;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=26.92;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,89:130:99:3555,0,1160 +chr12 508498 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-1.179;DP=145;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,33:144:99:684,0,4093 +chr12 509075 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.005;DP=87;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,19:87:99:361,0,2550 +chr12 509345 . G A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.486;DP=95;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1562,0,1565 +chr12 511729 . C T 1908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.313;DP=77;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,53:77:99:1937,0,631 +chr12 515322 . A G 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.517;DP=44;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,30:44:99:1108,0,337 +chr12 520167 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:437,0,269 +chr12 520324 . G A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=1.161;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1035,0,453 +chr12 520344 . C A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.326;DP=53;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=25.66;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1388,0,399 +chr12 520406 . G A 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=2.594;DP=54;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,44:54:99:1657,0,233 +chr12 520539 . T C 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.502;DP=63;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,39:63:99:1279,0,828 +chr12 520596 . T G 2076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.045;DP=66;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=31.47;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,56:66:99:2105,0,109 +chr12 520737 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-2.517;DP=66;FS=4.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=3.42;ReadPosRankSum=2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:254,0,2338 +chr12 520770 . G C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-2.773;DP=75;FS=7.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:340,0,2571 +chr12 521424 . G A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.125;DP=58;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1014,0,930 +chr12 521441 . G T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.218;DP=58;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1012,0,965 +chr12 539259 . C G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-1.193;DP=45;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=13.79;ReadPosRankSum=3.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:649,0,892 +chr12 539276 . A C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-0.809;DP=49;FS=2.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=11.34;ReadPosRankSum=2.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:584,0,1134 +chr12 545481 . T C 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.585;DP=35;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=27.39;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:987,0,224 +chr12 545531 . C T 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.660;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=25.76;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:930,0,214 +chr12 545621 . G A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.491;DP=29;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:76:900,0,76 +chr12 545657 . A G 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-0.161;DP=39;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=21.74;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:876,0,431 +chr12 545844 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.907;DP=36;FS=10.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:550,0,697 +chr12 545868 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.380;DP=36;FS=13.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:548,0,737 +chr12 545936 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.206;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:386,0,746 +chr12 545964 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.101;DP=33;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=6.63;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:247,0,879 +chr12 546281 . T C 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=1.870;DP=42;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.115;QD=26.73;ReadPosRankSum=-1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,33:42:99:1151,0,159 +chr12 546411 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.618;DP=36;FS=4.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:276,0,987 +chr12 546631 . T C 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.444;DP=41;FS=3.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=30.29;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1270,0,113 +chr12 546651 . A T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.902;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:654,0,668 +chr12 546801 . T C 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=-0.202;DP=29;FS=6.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:638,0,343 +chr12 547209 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=-0.750;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=22.61;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:616,0,221 +chr12 547298 . T C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.807;DP=36;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:652,0,656 +chr12 550616 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.689;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:695,0,402 +chr12 552250 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,267 +chr12 552522 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:303,0,218 +chr12 553734 . T C 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.646;DP=33;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=25.39;ReadPosRankSum=-2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:866,0,288 +chr12 553887 . T G 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=3.100;DP=34;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:623,0,634 +chr12 554228 . T G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=1.293;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:441,0,466 +chr12 554991 . AG A 1047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.733;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=34.92;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1085,87,0 +chr12 555069 . A G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.727;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:543,0,503 +chr12 555104 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.756;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:493,0,433 +chr12 556227 . G A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=21.67;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:505,0,285 +chr12 556341 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.985;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=17.74;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:454,0,396 +chr12 556381 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.469;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:391,0,565 +chr12 556476 . A C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.504;DP=29;FS=8.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:533,0,442 +chr12 556670 . G C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=-1.349;DP=32;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:705,0,1131 +chr12 556673 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-1.179;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:705,0,1131 +chr12 558384 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.566;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:609,0,549 +chr12 558784 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.713;DP=33;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:447,0,717 +chr12 559842 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,218 +chr12 559843 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,218 +chr12 559980 . T A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.262;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:658,0,231 +chr12 560085 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:43:521,0,43 +chr12 560239 . C A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=1.142;DP=32;FS=13.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:74:1084,0,74 +chr12 560343 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:246,0,379 +chr12 560826 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-0.579;DP=24;FS=14.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:455,0,387 +chr12 560890 . A G 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.260;DP=26;FS=1.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=29.84;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:95:804,0,95 +chr12 561197 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.929;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=24.60;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:348,0,138 +chr12 563801 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.376;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:251,0,338 +chr12 566084 . T C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=1.085;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:409,0,594 +chr12 572549 . T G 1410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.746;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=27.44;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:1439,0,169 +chr12 572834 . A T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-1.355;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=21.65;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:353,0,222 +chr12 576524 . G T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.579;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=19.67;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:756,0,469 +chr12 577445 . C G 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=1.392;DP=33;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:586,0,497 +chr12 580762 . A C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.087;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:686,0,480 +chr12 583681 . C T 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.370;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.937;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:753,0,502 +chr12 583747 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-1.554;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:362,0,574 +chr12 583807 . T C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-1.134;DP=34;FS=8.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:446,0,740 +chr12 584727 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.215;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:614,0,615 +chr12 586601 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-2.007;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:321,0,345 +chr12 586703 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=-0.371;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:474,0,490 +chr12 588155 . C T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.245;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:619,0,147 +chr12 594523 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:234,0,372 +chr12 594590 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.277;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:388,0,389 +chr12 594660 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.835;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:506,0,303 +chr12 598965 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-2.524;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=20.37;ReadPosRankSum=-1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:293,0,148 +chr12 601557 . T C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=1.906;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:65:709,0,65 +chr12 602561 . A T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=-0.309;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:983,0,223 +chr12 606113 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-0.482;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=31.15;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:51:807,0,51 +chr12 611268 . T C 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-0.113;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=26.02;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:835,0,203 +chr12 616233 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.527;DP=24;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=26.87;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:65:673,0,65 +chr12 616312 . G A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=-0.375;DP=28;FS=5.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=30.28;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:50:876,0,50 +chr12 618570 . T C 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.094;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:98:853,0,98 +chr12 618582 . A C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.640;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:704,0,103 +chr12 619276 . C A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:409,0,120 +chr12 620630 . A T 682.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-0.063;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=34.15;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:15:711,15,0 +chr12 621214 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.983;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:391,0,190 +chr12 623134 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,238 +chr12 658832 . C G 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-3.802;DP=58;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.56;ReadPosRankSum=-2.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:525,0,1795 +chr12 665309 . A G 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.329;DP=54;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1224,0,646 +chr12 684147 . C G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.137;DP=36;FS=12.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:304,0,905 +chr12 698602 . T C 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 +chr12 698653 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.88;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:84:297,0,84 +chr12 700808 . T A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr12 706801 . A T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:694,48,0 +chr12 706807 . C T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:48:694,48,0 +chr12 707167 . A G 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:550,39,0 +chr12 707772 . GAC G 363.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:401,27,0 +chr12 749902 . A G 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:350,27,0 +chr12 788134 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr12 790746 . C T 2132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:2161,147,0 +chr12 816242 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=23.71;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:289,0,58 +chr12 818119 . T C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=9.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:50:832,0,50 +chr12 823999 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.531;DP=27;FS=4.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:91:860,0,91 +chr12 824059 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:267,0,63 +chr12 827347 . A G 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.228;DP=44;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,36:44:99:1418,0,132 +chr12 827380 . T A 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-0.463;DP=58;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=29.15;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1719,0,336 +chr12 827430 . G A 2956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.484;DP=103;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,76:103:99:2985,0,677 +chr12 827524 . C T 1789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.147;DP=72;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=24.86;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1818,0,1879 +chr12 827530 . C T 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.058;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=26.77;ReadPosRankSum=-2.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1822,0,1879 +chr12 1045061 . AGTGTGT A 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:51:326,0,51 +chr12 1118985 . G A 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.326;DP=93;FS=2.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:1216,0,1835 +chr12 1153579 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.902;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:457,0,1940 +chr12 1153643 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.348;DP=74;FS=10.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:271,0,1793 +chr12 1173484 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.982;DP=85;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=5.07;ReadPosRankSum=2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:459,0,2405 +chr12 1190457 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.214;DP=54;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:295,0,1497 +chr12 1228910 . TCTAACAGAAGAAAGAGAGCAGAAAGGATGAAGACAGACGCCTAACTCTGCAGTGTGACGATCATGTTTACATTTAC T 3189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=1.585;DP=77;FS=2.856;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=33.23;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,75:77:99:3227,286,0 +chr12 1238025 . TCTGTTAATGAACGAAACACAAATTTATCTTCGATTTTTATATTTGTGCTTCAAAAAAGCTAAAGCTAATTGTGTTCAGTAATAATGTGTATTGTGAC T 302.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:32:340,32,0 +chr12 1702738 . CCA C 287.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 +chr12 1723569 . G C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:382,0,54 +chr12 1724245 . G T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:352,0,48 +chr12 1787035 . GT G 269.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:307,23,0 +chr12 2646191 . C A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.022;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:476,0,763 +chr12 2655349 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:299,0,385 +chr12 2758393 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr12 2759524 . G T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr12 2759753 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.925;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:74:311,0,74 +chr12 2759798 . A T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:350,27,0 +chr12 2766471 . G GA 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-3.185;DP=101;FS=8.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:686,0,1243 +chr12 2767414 . G T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:402,0,639 +chr12 2769574 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.211;DP=52;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:309,0,2681 +chr12 2770479 . C G 2801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:2830,202,0 +chr12 2770865 . CG C 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.100;DP=79;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=3.57;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:319,0,2039 +chr12 2772024 . T C 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=1.454;DP=70;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:816,0,1679 +chr12 2776865 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=1.000;DP=50;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:706,0,1081 +chr12 3354190 . CT C 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.244;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:299,0,177 +chr12 3459142 . TAAAGCTTTCAGTATGCTCATGTGAAATCATACCATGTTATCAACACATCAATTTACCCACATTTTTTTTCTCCCCCCAGGC T 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.614;DP=47;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:280,0,1520 +chr12 3473706 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-1.272;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:236,0,452 +chr12 3473868 . T A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.066;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:459,0,918 +chr12 3476062 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.811;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,217 +chr12 3477908 . G T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.170;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:468,0,521 +chr12 3479597 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,315 +chr12 3479607 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,315 +chr12 3479915 . A T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.154;DP=22;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:410,0,447 +chr12 3487569 . A T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr12 3487631 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=23.52;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:381,0,172 +chr12 3487763 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=21.16;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:261,0,144 +chr12 3488947 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.822;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=27.92;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:475,0,46 +chr12 3489430 . C G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.088;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:329,0,405 +chr12 3490345 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,618 +chr12 3491544 . C CA 354.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 +chr12 3491546 . G A 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 +chr12 3497683 . A G 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:307,21,0 +chr12 3512091 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=22.48;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:343,0,206 +chr12 3633571 . T TA 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.240;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:718,0,144 +chr12 3644136 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.591;DP=27;FS=6.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:253,0,712 +chr12 3648622 . T C 413.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=34.44;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:440,0,4 +chr12 3654699 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=24.49;ReadPosRankSum=-2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:420,0,418 +chr12 3660487 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=-1.457;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:403,0,1327 +chr12 3660518 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=1.834;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:425,0,1368 +chr12 3684483 . C A 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.740;DP=67;FS=6.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=12.76;ReadPosRankSum=2.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:883,0,2242 +chr12 3687913 . C CA 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.941;DP=235;FS=15.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,61:218:99:893,0,4208 +chr12 3688068 . CA C 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=1.790;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,39:182:99:463,0,4160 +chr12 3688291 . C CG 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.513;DP=270;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,60:244:99:572,0,11024 +chr12 3688600 . T C 1923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=1.289;DP=369;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,91:369:99:1952,0,10492 +chr12 3701592 . CCCTGCAGATTTGAAGGCATAAGAAATATTATTCATTTGGAACAGCATTTGGTTATTTCATAAAATCACCAATAAAGTTTGCTGA C 18005.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.559;DP=427;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,377:379:99:18043,1500,0 +chr12 3701710 . G A 2641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.084;DP=432;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,119:429:99:2670,0,20460 +chr12 3709017 . A G 3700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=3.055;DP=742;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=4.99;ReadPosRankSum=6.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:542,176:718:99:3729,0,19941 +chr12 3709035 . A C 3240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.733;ClippingRankSum=0.625;DP=685;FS=6.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.033;QD=4.73;ReadPosRankSum=3.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:523,161:684:99:3269,0,19029 +chr12 3714858 . CCCTACAAAAGAGAACGATAACTATTACTAAAACAGCAGAGGTTTTAGTAGGAATGATTTGTGTTTTAAAGATACCTA C 15428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.030;DP=420;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=30.29;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,395:398:99:15466,1170,0 +chr12 3716172 . A G 8634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-1.719;DP=495;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,274:492:99:8663,0,7379 +chr12 3717778 . A G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=-0.571;DP=733;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:563,169:732:99:3263,0,20409 +chr12 3721363 . G A 7927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=-5.316;DP=446;FS=34.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=17.78;ReadPosRankSum=5.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,249:446:99:7956,0,6517 +chr12 3805135 . C CT,CTT 2302.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.846;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=11.23;ReadPosRankSum=-2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:31,103,40:174:99:3399,463,634,1951,0,2618 +chr12 3881106 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-2.011;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:239,0,471 +chr12 3881576 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=17.90;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:243,0,335 +chr12 3882225 . AT A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.854;DP=45;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:447,0,538 +chr12 3897940 . A G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.589;DP=35;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:492,0,708 +chr12 3898132 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:410,0,473 +chr12 3903663 . T A 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:438,30,0 +chr12 3907942 . CT C 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,997 +chr12 3907945 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.976;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,1001 +chr12 4168222 . G C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.184;DP=133;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,31:133:99:682,0,3823 +chr12 4305559 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-1.883;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=2.32;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,19:111:99:286,0,3750 +chr12 4356747 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:275,0,411 +chr12 4357004 . T A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.042;DP=30;FS=12.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:463,0,605 +chr12 4357086 . A T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.475;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:619,0,2747 +chr12 4357111 . T A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=1.291;DP=47;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:614,0,2747 +chr12 4361076 . G T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.214;ClippingRankSum=-0.716;DP=88;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:970,0,1883 +chr12 4368394 . C T 1712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-0.622;DP=95;FS=3.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.133;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1741,0,1701 +chr12 4368419 . A T 1443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=-1.779;DP=91;FS=7.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.934;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1472,0,1465 +chr12 4368701 . T C 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.068;DP=69;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:846,0,1534 +chr12 4484748 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:260,18,0 +chr12 4484753 . T A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr12 4487820 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:547,0,426 +chr12 4488024 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.590;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:292,0,847 +chr12 4488054 . A G 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.018;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:676,0,484 +chr12 4488108 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.510;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=16.47;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:473,0,460 +chr12 4488117 . A G 1292.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1321,93,0 +chr12 4488342 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.882;DP=37;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:425,0,772 +chr12 4490972 . A G 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:356,27,0 +chr12 4556240 . T C 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.098;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=28.34;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1020,0,202 +chr12 4625099 . TCTATAGCAGTGACAGAGAACAGAAAAACAATAATGTTGAGCTCCAGGAGTGACTCGTGTAAGATTTACTGCTCAAGGAAGAACAAGAGTGTGAGGAAGAGATGGTGGAAGGGCTTTGTATATTGGTAAATGGCCACCAAATTCATTGGTGAAGGCAGAAAAGAGTGAAGGGTGTGAAAGTAAAGTGGATGAAGAGTAAGAGAGAGGAGTGAATGATTAAACATTTAATAAC T 14963.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.770;ClippingRankSum=6.358;DP=485;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=30.85;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,402:423:99:15001,0,782 +chr12 4637381 . C CCA 4375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-2.267;DP=403;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.461;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,124:372:99:4413,0,9146 +chr12 4645750 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=-1.095;DP=244;FS=15.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=2.20;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,43:244:99:565,0,7363 +chr12 4653800 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.423;DP=218;FS=5.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,39:218:99:604,0,6852 +chr12 4729877 . GT G 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-1.490;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=4.27;ReadPosRankSum=2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:362,0,1710 +chr12 4729889 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=-0.567;DP=68;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:419,0,1964 +chr12 4737560 . C G 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-1.712;DP=234;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,51:234:99:965,0,6965 +chr12 4897969 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.400;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:341,0,2215 +chr12 4912397 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=-0.839;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:242,0,1253 +chr12 5001095 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.603;DP=45;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:293,0,1268 +chr12 5001292 . C A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.977;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:405,0,1984 +chr12 5001311 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.778;ClippingRankSum=1.370;DP=76;FS=4.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=3.23;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:274,0,2205 +chr12 5058526 . A C 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=-2.459;DP=246;FS=9.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,59:245:99:1285,0,7003 +chr12 5229509 . A G 227.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:256,0,22 +chr12 5230561 . A G 348.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:376,0,9 +chr12 5245390 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.693;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:316,0,1713 +chr12 5245876 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.072;DP=140;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,22:140:99:267,0,8241 +chr12 5245878 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.124;DP=139;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,22:139:99:267,0,8241 +chr12 5247546 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-0.635;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.89;ReadPosRankSum=2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:769,0,1378 +chr12 5288770 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.086;DP=133;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,28:133:99:538,0,3770 +chr12 5358183 . A C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.664;DP=134;FS=6.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:860,0,3969 +chr12 5363947 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=-0.645;DP=249;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,38:249:99:301,0,8358 +chr12 5477685 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.528;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:322,0,659 +chr12 5494657 . A G 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:736,51,0 +chr12 5494785 . A G 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 +chr12 5651576 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=1.442;DP=38;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:275,0,1064 +chr12 5653136 . T C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=-1.265;DP=49;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:689,0,1178 +chr12 5760165 . T C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:29:552,0,29 +chr12 5760541 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.369;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:467,0,165 +chr12 5760763 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:354,0,101 +chr12 5760767 . T C 650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:48:679,48,0 +chr12 6077413 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.116;DP=134;FS=7.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,26:133:99:504,0,8447 +chr12 6077414 . T A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.163;DP=133;FS=5.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,25:132:99:497,0,8447 +chr12 6290862 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.572;DP=61;FS=3.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:482,0,1482 +chr12 6344220 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.390;DP=29;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:314,0,622 +chr12 6387230 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.684;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,414 +chr12 6387330 . T C 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-0.593;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=29.81;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:91:833,0,91 +chr12 6731381 . A G 1819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-2.220;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,30:113:99:1848,0,2724 +chr12 6734301 . TCCTGCCCAAACACAGTAATTAATACAAAAGCATAAATATTGGCATTCTGTGGATATTATACTGAAACACTGGACGTTGTCAAATCAATGAATTAAATTGGTGGCCCA T 3132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.253;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:99:3170,255,0 +chr12 6848718 . TCTGCAAAAACCCAGGCAAAATGGTCCTTGGAGAAATATTCTCTAATCACCAATAGATGTTTTCGCTGAGGGTATGAGTGTAC T 3209.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=1.759;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=28.79;ReadPosRankSum=-2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3247,271,0 +chr12 7935463 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.149;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,23:135:99:285,0,4321 +chr12 7935688 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.464;DP=43;FS=1.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:396,0,1147 +chr12 8271818 . T C 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=1.350;DP=19;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=31.67;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:41:630,0,41 +chr12 8272825 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.158;DP=55;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:354,0,1386 +chr12 8301607 . G GT 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-2.488;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:296,0,3026 +chr12 8311974 . GTA G 708.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:746,52,0 +chr12 8313997 . G A 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.258;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,39:194:99:689,0,6227 +chr12 8317682 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr12 8822511 . T C 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.107;DP=62;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1232,0,925 +chr12 8830646 . G A 1795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.281;DP=81;FS=14.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,52:81:99:1824,0,984 +chr12 8841821 . A G 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-3.360;DP=56;FS=12.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:919,0,1055 +chr12 8850752 . G T 2103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.505;DP=107;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=19.66;ReadPosRankSum=-1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:2132,0,1568 +chr12 8868806 . G T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;ClippingRankSum=-0.342;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:504,0,577 +chr12 8868844 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.889;DP=31;FS=11.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:521,0,509 +chr12 8944324 . T C 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr12 9136951 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.597;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:545,0,613 +chr12 9229283 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-0.339;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,24:103:99:494,0,2916 +chr12 9229685 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.860;DP=144;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,24:144:99:269,0,4526 +chr12 9230461 . T TG 1058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=1.602;DP=56;FS=7.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=18.91;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,34:56:99:1096,0,658 +chr12 9362447 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.459;DP=90;FS=3.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:302,0,2743 +chr12 9369446 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=1.078;DP=98;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:360,0,3056 +chr12 9376894 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=1.658;DP=136;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=1.95;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:294,0,4420 +chr12 9381440 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.406;DP=117;FS=3.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:507,0,3621 +chr12 9954514 . G T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-1.296;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:726,0,484 +chr12 10060138 . T G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.922;DP=37;FS=6.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:438,0,848 +chr12 10060224 . A C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.070;DP=48;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:413,0,1128 +chr12 10060235 . G T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.573;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:565,0,1155 +chr12 10069642 . T C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.735;DP=52;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:613,0,1123 +chr12 10069860 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.637;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:593,0,1016 +chr12 10112042 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-0.132;DP=54;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=14.50;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:811,0,2266 +chr12 10113027 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:417,0,286 +chr12 10113077 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:436,0,444 +chr12 10113796 . G T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=1.173;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:525,0,776 +chr12 10114049 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.473;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:394,0,767 +chr12 10114456 . G A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=-1.230;DP=57;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=15.87;ReadPosRankSum=2.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:933,0,1216 +chr12 10128232 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.763;DP=53;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:802,0,1038 +chr12 10143742 . T G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=-1.424;DP=48;FS=3.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:836,0,788 +chr12 10152469 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.818;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:542,0,994 +chr12 10158046 . T G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-1.003;DP=68;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:900,0,1415 +chr12 10158091 . T C 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.089;DP=82;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1293,0,1591 +chr12 10168579 . T C 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.765;DP=43;FS=4.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=24.79;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1094,0,344 +chr12 10198386 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=-0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:297,0,407 +chr12 10200020 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.794;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:373,0,390 +chr12 10200704 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.626;DP=22;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:374,0,408 +chr12 10204076 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-1.268;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:413,0,815 +chr12 10222851 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=23.64;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:241,0,98 +chr12 10264361 . A C 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.196;DP=123;FS=4.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1693,0,2525 +chr12 10314159 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.800;DP=39;FS=10.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:440,0,905 +chr12 10336413 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.607;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:283,0,917 +chr12 10336489 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:300,0,433 +chr12 10336712 . A G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.226;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.743;QD=25.49;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:640,0,229 +chr12 10368088 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:266,0,129 +chr12 10406989 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:232,0,305 +chr12 10423119 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,328 +chr12 10428857 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.414;DP=26;FS=13.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:431,0,485 +chr12 10538325 . T A 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr12 10555928 . A G 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr12 10562551 . T C 267.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:296,24,0 +chr12 10565672 . C T 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 +chr12 10609866 . C T 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:950,69,0 +chr12 10611212 . A G 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 +chr12 10624438 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.598;DP=40;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:506,0,702 +chr12 10632904 . C T 967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:996,72,0 +chr12 10662333 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.42;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:257,0,60 +chr12 10662559 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr12 10747892 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=1.354;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:461,0,327 +chr12 10751783 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:296,0,382 +chr12 10756406 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.267;DP=30;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,767 +chr12 10757796 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=1.110;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:242,0,1875 +chr12 10757867 . T G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=1.505;DP=40;FS=7.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:510,0,853 +chr12 10758297 . C T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.408;DP=39;FS=12.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:774,0,1324 +chr12 10758300 . A G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.169;DP=37;FS=13.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:774,0,1324 +chr12 10764046 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,335 +chr12 10799247 . T C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.066;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:647,0,792 +chr12 10799542 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.840;DP=48;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:236,0,1407 +chr12 10814681 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.809;DP=51;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:481,0,1291 +chr12 10815021 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.822;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:278,0,978 +chr12 10855493 . GA G 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=1.719;DP=78;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:798,0,1022 +chr12 10858187 . G A 5946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=-1.857;DP=337;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,179:333:99:5975,0,5618 +chr12 10858405 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:461,0,1918 +chr12 10858415 . A G 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.748;DP=40;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:798,0,1116 +chr12 10858428 . A G 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-1.630;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:771,0,1930 +chr12 10858645 . TA T 993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.194;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,2:209:99:1031,0,12994 +chr12 10858680 . G A 2813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.035;DP=163;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=17.26;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:2842,0,8363 +chr12 10921392 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr12 10923989 . G C 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 +chr12 11144729 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:378,0,273 +chr12 11145131 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:296,0,210 +chr12 11148076 . C A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:86:449,0,86 +chr12 11150636 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,338 +chr12 11159392 . TGTGAGTATGTCTCTCTCTTTCTGACATGCGTACAGTGTCATTGCTGTTTACCGCACACACTATGCAAAAACCATGCTTTTCCTTGCTCTAG T 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:339,0,566 +chr12 11177585 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=1.914;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:327,0,514 +chr12 11195059 . A G 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-1.265;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:844,0,950 +chr12 11195121 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.910;DP=60;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:760,0,1302 +chr12 11203864 . A T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-2.070;DP=71;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:611,0,1811 +chr12 11204028 . G C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-1.824;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,32:77:99:1076,0,1632 +chr12 11204475 . A G 1967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.917;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=32.13;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,49:56:39:1996,0,39 +chr12 11204659 . A G 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=-1.319;DP=91;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,36:91:99:1316,0,2018 +chr12 11204790 . A C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.307;DP=55;FS=6.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:286,0,1680 +chr12 11205668 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.854;DP=61;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:254,0,1882 +chr12 11205783 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-1.453;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:598,0,2061 +chr12 11205806 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.598;DP=76;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:618,0,1829 +chr12 11206898 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.272;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:287,0,493 +chr12 11207932 . C A 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=1.532;DP=116;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,43:116:99:1633,0,4887 +chr12 11207933 . A T 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=2.158;DP=117;FS=0.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:1633,0,4883 +chr12 11208146 . G C 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-0.313;DP=85;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,28:85:99:776,0,2167 +chr12 11208504 . AT A 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-1.649;DP=59;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:560,0,620 +chr12 11222490 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=1.908;DP=40;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:257,0,1061 +chr12 11230261 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.173;DP=34;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=13.32;ReadPosRankSum=2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:481,0,647 +chr12 11236266 . C T 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-2.100;DP=69;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1036,0,1315 +chr12 11239804 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:349,0,704 +chr12 11246394 . T C 4760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-1.413;DP=344;FS=9.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,135:344:99:4789,0,7184 +chr12 11246413 . AAGGTTTGACAGACATTTATTTCCTGATATACAAATCAAGGGTGAGACTGCAGTGCTGTTTTTCAATTGTATATTTATTCTTGTTTTT A 12277.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=-0.153;DP=330;FS=1.615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,296:302:99:12315,883,0 +chr12 11251079 . A T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-3.119;DP=290;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,100:282:99:1152,0,9898 +chr12 11251127 . T C 7301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-1.430;DP=319;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=22.89;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,123:318:99:7330,0,6596 +chr12 11253841 . C A 5196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=-0.625;DP=417;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,181:414:99:5225,0,7546 +chr12 11278650 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.749;DP=25;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:326,0,485 +chr12 11288481 . A C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=1.411;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:382,0,618 +chr12 11296782 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:271,0,133 +chr12 11299152 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=4.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:392,0,286 +chr12 11314940 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.217;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:322,0,495 +chr12 11316127 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:367,0,358 +chr12 11418000 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.179;DP=38;FS=2.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:494,0,839 +chr12 11423650 . G C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.148;DP=50;FS=2.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:401,0,1269 +chr12 11426444 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.232;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:328,0,1282 +chr12 11433862 . A G 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.533;DP=132;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.397;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:1719,0,2795 +chr12 11435375 . A G 2196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;ClippingRankSum=-3.392;DP=147;FS=7.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=14.94;ReadPosRankSum=3.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,56:147:99:2225,0,6389 +chr12 11437186 . C T 1909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.257;DP=181;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,60:178:99:1938,0,4136 +chr12 11437553 . C T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-0.750;DP=158;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=6.76;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,43:158:99:1096,0,4358 +chr12 11447180 . AT A 5477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=-2.983;DP=232;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=23.61;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,85:218:99:5515,0,3382 +chr12 11447352 . C A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-3.174;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,62:212:99:596,0,20021 +chr12 11447417 . C T 4747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=3.180;DP=392;FS=1.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,139:392:99:4776,0,8799 +chr12 11448133 . G A 2841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.427;DP=344;FS=11.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=8.26;ReadPosRankSum=2.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,97:342:99:2870,0,20037 +chr12 11450483 . C T 4247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.231;DP=294;FS=5.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,121:294:99:4276,0,5979 +chr12 11450575 . G A 3297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.542;DP=279;FS=1.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,98:279:99:3326,0,6397 +chr12 11452170 . T C 3577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.727;DP=385;FS=23.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,128:385:99:3606,0,9979 +chr12 11452203 . A C 4289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.035;ClippingRankSum=-0.001;DP=362;FS=17.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,129:362:99:4318,0,8328 +chr12 11453733 . C T 5121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.251;DP=352;FS=18.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,148:352:99:5150,0,6697 +chr12 11454917 . G A 4777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-0.897;DP=286;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,132:286:99:4806,0,5105 +chr12 11461120 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.059;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:509,0,1375 +chr12 11461144 . A T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.701;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:586,0,1672 +chr12 11477906 . A G 4448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.573;DP=331;FS=3.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,130:331:99:4477,0,6868 +chr12 11503827 . C G 1812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.401;ClippingRankSum=-2.279;DP=105;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=17.26;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1841,0,2333 +chr12 11504527 . A G 5837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=1.093;DP=335;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,163:334:99:5866,0,6389 +chr12 11504716 . A T 8056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-1.557;DP=515;FS=9.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=15.64;ReadPosRankSum=4.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,226:514:99:8085,0,9767 +chr12 11518705 . C A 7911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.034;DP=538;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,227:532:99:7949,0,10302 +chr12 11544515 . C A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=-0.508;DP=253;FS=6.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=2.19;ReadPosRankSum=2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,50:251:99:583,0,8740 +chr12 11555302 . C A 1208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.048;DP=313;FS=2.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,68:310:99:1246,0,9075 +chr12 11596718 . G A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr12 11614420 . TCTGGAATTTAAACCAATGCAGTTTCAGATATAATAGAAGCCTTGTCACATTTATTATAAACAAAGGAAAACTGCTAGAACAC T 2434.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.385;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:2472,186,0 +chr12 11702300 . T C 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.206;DP=72;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,43:72:99:1438,0,1058 +chr12 11702593 . G A 7093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-1.292;DP=339;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,209:339:99:7122,0,4411 +chr12 11702742 . TGGTAAAGTTAAACCTGTATGATATTTATCACATATATAGAGCTTTTCCTATTAATGATATTGATCCAAACCAGCCTTCATTAACATTGCACTCTGAATATATACA T 1961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.720;DP=278;FS=3.042;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,275:276:99:1999,671,0 +chr12 11713930 . TGTGAGACACCACTTCCTTTTCACTTCACAGAGATGACGTGCTCTCCATATTGACTTCTAAAACTCTCCTTCCTCCTTTCAG T 7080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=3.181;DP=297;FS=6.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=23.84;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,253:273:99:7118,0,1074 +chr12 12274527 . C T 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=2.440;DP=74;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=21.66;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1631,0,941 +chr12 12290100 . ACAGGTTAGCCAGAAACATACAGTAGATATTAAAAAGATAATATGACATTGATGTTGTCAGAGCACTTCATTGCTCTTCTTTTGTTTCTTTC A 455.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=1.685;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:493,169,0 +chr12 14238279 . T C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.527;DP=312;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,55:312:99:779,0,9998 +chr12 14246563 . G GACTGTGGACCC 1464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.441;DP=400;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,78:361:99:1502,0,11883 +chr12 14295066 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.816;DP=70;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:314,0,2672 +chr12 14295179 . T C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.592;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:1030,0,1825 +chr12 14418344 . TCTATTGAAAAGAAATGTCATTTAAAAACTGCACTGTAGCATTATCATCAACGCATTGTTTGACGTTTCCTTAC T 5597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=2.412;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,128:130:99:5635,418,0 +chr12 15339482 . C T 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=-0.057;DP=25;FS=10.414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:40:980,40,0 +chr12 15339636 . T C 900.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=1.043;DP=42;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=21.45;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:15:929,0,15 +chr12 15339641 . A T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.423;DP=37;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:558,0,338 +chr12 15339793 . T C 993.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=-1.734;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:1022,69,0 +chr12 15341590 . G A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr12 15342283 . G A 1560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=1.024;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=33.93;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,39:43:32:1589,32,0 +chr12 15342612 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=1.386;DP=24;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,99 +chr12 15543862 . C A 427.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=32.89;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:455,0,7 +chr12 15543873 . C T 541.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.116;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:567,0,1 +chr12 15544010 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.62;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,142 +chr12 15544018 . G T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,142 +chr12 15734721 . G T 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:749,51,0 +chr12 16658628 . C T 277.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:306,24,0 +chr12 16670013 . AT A 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-1.486;DP=59;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:511,0,1084 +chr12 17401212 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-2.524;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:259,0,262 +chr12 17402270 . G GT 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.728;DP=30;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:459,0,266 +chr12 17402342 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:477,0,458 +chr12 17479274 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr12 17515838 . AAGGTACAAAATTTGTAGTTTGACAGGCAATCAGGTTTAATAATGTATCTGATAAGTCTGACACACTGGCCATCCTC A 2462.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=1.257;DP=60;FS=1.912;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=30.67;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,55:60:99:2500,212,0 +chr12 17518234 . A G 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.755;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:590,0,534 +chr12 17524594 . C A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.188;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:827,0,1333 +chr12 17543464 . C A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.754;DP=39;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:553,0,762 +chr12 17543524 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.909;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,758 +chr12 17550537 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=3.285;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:519,0,871 +chr12 17552333 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr12 17552482 . C T 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:478,33,0 +chr12 17552486 . C G 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:478,33,0 +chr12 17585286 . C T 1607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.800;DP=252;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,69:252:99:1636,0,7037 +chr12 17585818 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.638;DP=100;FS=4.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,33:100:99:875,0,2658 +chr12 17660198 . A G 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.231;DP=32;FS=10.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=31.81;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1046,0,131 +chr12 17684168 . C CA 637.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.215;DP=38;FS=8.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:675,0,316 +chr12 17684223 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=-1.632;DP=31;FS=6.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:231,0,819 +chr12 17684877 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-0.601;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=19.71;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,56:95:99:1901,0,1259 +chr12 17703580 . G T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 +chr12 17703581 . A T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:42:585,42,0 +chr12 17811793 . G T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=-1.948;DP=57;FS=16.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=6.45;ReadPosRankSum=-3.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:396,0,1542 +chr12 17828186 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:290,0,502 +chr12 17943533 . G A 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-4.944;DP=169;FS=23.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,52:169:99:1389,0,4458 +chr12 17943854 . T A 2648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.265;DP=153;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:2677,0,2773 +chr12 17986548 . A C 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-1.285;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=29.71;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1276,0,234 +chr12 18016652 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:333,0,414 +chr12 18018091 . T A 3222.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.169;DP=126;FS=22.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=25.58;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,87:126:99:3251,0,999 +chr12 18026140 . C T 1500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-1.301;DP=126;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,46:124:99:1529,0,2563 +chr12 18037041 . A T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-1.110;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:432,0,775 +chr12 18043144 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=-0.349;DP=36;FS=13.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:584,0,650 +chr12 18053731 . TA T 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.104;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:370,0,490 +chr12 18053785 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:293,0,581 +chr12 18053795 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:293,0,581 +chr12 18223742 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.158;DP=31;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:262,0,1815 +chr12 18229228 . C T 3608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.834;ClippingRankSum=0.280;DP=247;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=14.61;ReadPosRankSum=3.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,101:247:99:3637,0,4888 +chr12 18271607 . A G 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.750;DP=58;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=13.65;ReadPosRankSum=2.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:820,0,1130 +chr12 18278818 . A T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.415;DP=75;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:599,0,1812 +chr12 18390552 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=3.442;DP=29;FS=6.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:450,0,535 +chr12 18390607 . T G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=1.606;DP=37;FS=8.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:384,0,2046 +chr12 18466667 . CT C 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.099;DP=74;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:481,0,768 +chr12 18475462 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:277,0,107 +chr12 18509684 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.729;DP=75;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:549,0,2072 +chr12 18514102 . A G 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.981;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.978;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,34:56:99:1142,0,740 +chr12 18523624 . TA T 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=-1.659;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:655,0,1122 +chr12 18530189 . C T 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.528;DP=101;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:101:99:1278,0,4513 +chr12 18536118 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.435;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.059;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,29:88:99:759,0,2226 +chr12 18536145 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.360;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:678,0,1979 +chr12 18540430 . C T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.555;DP=102;FS=7.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:1450,0,2045 +chr12 18590150 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.867;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.023;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:276,0,383 +chr12 18638223 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.483;DP=83;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:324,0,2555 +chr12 18638801 . TCTTTAAAGAAACAAGATCATTTTCATACAAATCTTTAAACAACAAATAATATTAATCAAAAAGACTTTTTTCATAC T 2604.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=1.177;DP=84;FS=6.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=31.01;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,64:81:99:2642,0,5012 +chr12 18700856 . AAGGTCTATATAGTTCATTTCCCTGATTTCAAGCAAAAAAAGTAATGTTATAATTTACAAGATGATTTATTTC A 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=1.058;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=23.99;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:565,0,1468 +chr12 18706200 . C T 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-1.277;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,62:222:99:1432,0,5945 +chr12 18736709 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=1.302;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:564,0,2893 +chr12 18959833 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.243;DP=85;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,20:85:99:431,0,2459 +chr12 18991696 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.898;DP=107;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:358,0,3278 +chr12 19015031 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.500;DP=70;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:603,0,1636 +chr12 19075576 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.046;DP=128;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=3.69;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,27:127:99:501,0,3858 +chr12 19363407 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.950;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:245,0,880 +chr12 19365068 . GGGTAAGATGATTTCAGAGTGTTCCTAAAAATAAAAACTGAAGCAAAATGTTTTTTATAACTTTTTATATCAATTTATATATCCATAAA G 863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=2.237;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=29.33;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:99:901,0,432 +chr12 19403122 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.943;DP=89;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:99:319,0,6434 +chr12 19403204 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.315;DP=91;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:497,0,2635 +chr12 19403905 . T A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-2.343;DP=104;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,25:104:99:545,0,3188 +chr12 19404389 . A AG 526.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=-1.528;DP=117;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:564,0,2279 +chr12 19406914 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=-0.531;DP=79;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=4.45;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:380,0,2395 +chr12 19407722 . A C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.273;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:490,0,1383 +chr12 19433036 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-0.403;DP=92;FS=7.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:554,0,2432 +chr12 19557778 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.728;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:229,0,665 +chr12 19571105 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-1.285;DP=54;FS=16.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:476,0,1429 +chr12 19576411 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.204;DP=71;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:293,0,2169 +chr12 19600738 . CCCTTTAAAAACAAAATCAAACCGAATGCACTAGAATTTGAGGTCTTGTTTTGTTTTACTGAAAATGAGAGAAGTCTTCATTTTCTTA C 2856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=2.446;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,68:72:99:2894,239,0 +chr12 19806614 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=-1.027;DP=118;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:282,0,3631 +chr12 19806740 . AGTAAAAAAAAAAACAGTGACCACTTAATTCTTCTGGCAATTTTGGAACCAGATTATGTATTTTTTTTGAGTGAGTTATAAGAGAAATTGATTAATTTTTCAAATTGACTTTATTTCACCTCTAG A 4079.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=1.034;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,85:87:99:4117,384,0 +chr12 19808604 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.536;ClippingRankSum=2.017;DP=87;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:361,0,2512 +chr12 19809397 . C A 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.294;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:114:99:853,0,3086 +chr12 19811035 . AGTATGGCCTTTACTTGTGCTCATTCTTTCTTTCGCCTTTATTCTTTCACCTTCTGCTTCTGTTTTTATTTAATTATTGTGTCATTAATTATATTCTCTGTTTTTAG A 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=3.466;DP=42;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.241;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1297,0,4742 +chr12 19812250 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.353;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:413,0,3226 +chr12 19812560 . A G 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-1.131;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,26:111:99:595,0,3291 +chr12 19812621 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.519;DP=93;FS=3.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:342,0,6317 +chr12 19812633 . G T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.747;DP=100;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=3.14;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:342,0,6317 +chr12 19925471 . A C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.561;DP=44;FS=1.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:624,0,916 +chr12 19925513 . G A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=-1.816;DP=64;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:710,0,1499 +chr12 19928014 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:264,0,265 +chr12 19930164 . A G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.598;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:714,0,1212 +chr12 19938607 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.599;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:375,0,736 +chr12 19938822 . TAC T 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.431;DP=65;FS=7.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:766,0,834 +chr12 19953815 . TA T 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-1.789;DP=54;FS=5.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.153;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:523,0,741 +chr12 19954023 . T A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-2.232;DP=70;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:401,0,2081 +chr12 19954106 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=1.087;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:478,0,1770 +chr12 19954402 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.821;DP=42;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:283,0,1148 +chr12 19954775 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.231;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:254,0,687 +chr12 19955140 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.516;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:389,0,4014 +chr12 19955142 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=-0.726;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:389,0,4014 +chr12 19957294 . T C 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=2.575;DP=64;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:738,0,1269 +chr12 19957352 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.500;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:244,0,2010 +chr12 19957374 . G T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=1.666;DP=63;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:367,0,1775 +chr12 19969422 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.031;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:449,0,1688 +chr12 20083522 . CAGGTAGATACAATGCCTTTTTTTTTTCGTATATGCACTCCAAAATTTGGTTGTTCATGTTGCATTCTGCTCTTTGT C 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.638;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=12.99;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:766,0,3875 +chr12 20104526 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.306;DP=57;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:352,0,1715 +chr12 20121712 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-0.864;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:476,0,2943 +chr12 20160160 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.116;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:298,0,1613 +chr12 20204071 . T C 2360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.687;DP=382;FS=7.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,104:382:99:2389,0,14004 +chr12 20206720 . C A 1673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.265;DP=415;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,88:415:99:1702,0,12966 +chr12 20208379 . T C 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.668;DP=327;FS=8.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,68:327:99:1198,0,9959 +chr12 20212665 . G A 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.699;DP=326;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=2.19;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,57:326:99:742,0,10073 +chr12 20212755 . T G 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.626;ClippingRankSum=-2.592;DP=339;FS=16.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.698;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,69:339:99:1167,0,9576 +chr12 20212809 . A G 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.088;DP=349;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,65:349:99:1018,0,11056 +chr12 20241482 . A C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.718;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:256,0,1878 +chr12 20241534 . GA G 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.365;DP=52;FS=4.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:521,0,504 +chr12 20241635 . G A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.109;DP=50;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:679,0,1111 +chr12 20241661 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.426;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:390,0,1689 +chr12 20252579 . AT A 388.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=1.641;DP=119;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=3.27;ReadPosRankSum=-1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:426,0,6412 +chr12 20252583 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.475;DP=116;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,22:116:99:422,0,6473 +chr12 20253877 . A C 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-1.041;DP=145;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,37:145:99:791,0,4952 +chr12 20254610 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.663;DP=180;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,39:180:99:722,0,5486 +chr12 20254714 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.951;DP=53;FS=10.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:330,0,2050 +chr12 20254731 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-2.097;DP=30;FS=10.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:348,0,2050 +chr12 20254870 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:237,0,427 +chr12 20254871 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.172;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:329,0,571 +chr12 20255468 . T C 1831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DP=124;FS=5.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1860,0,2435 +chr12 20263551 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.975;DP=101;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:622,0,2906 +chr12 20263569 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-1.027;DP=158;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,28:158:99:356,0,5192 +chr12 20265705 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.597;DP=288;FS=0.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,72:288:99:1565,0,8248 +chr12 20267005 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.233;DP=136;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,33:135:99:706,0,6821 +chr12 20267266 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.566;DP=168;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:756,0,5018 +chr12 20286387 . G C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.949;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:613,0,1093 +chr12 20287193 . T A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=18.73;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,306 +chr12 20296215 . A G 1993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.640;DP=402;FS=20.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,97:395:99:2031,0,11494 +chr12 20299592 . C T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.603;ClippingRankSum=-0.483;DP=263;FS=5.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,55:263:99:1057,0,8087 +chr12 20397865 . C T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.212;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,30:148:99:538,0,4626 +chr12 20406228 . TGTATGCTCTTTAAACAATGCATTATTTAAAGCAGCGCAGTTCAAATCTGCATTCGTTTGCTCACGTTGTGGCTTTTTTGTATCTGTGTCAG T 498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.826;DP=92;FS=2.837;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,86:88:99:536,213,0 +chr12 20406463 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=-1.326;DP=94;FS=3.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=2.41;ReadPosRankSum=3.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:255,0,5081 +chr12 20429823 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-1.333;DP=97;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:99:399,0,3061 +chr12 20429847 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.257;DP=110;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,23:110:99:465,0,3414 +chr12 20434541 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.223;DP=61;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:546,0,1556 +chr12 20434996 . C CA 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.629;DP=56;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:349,0,863 +chr12 20437532 . CA C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.791;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:276,0,1952 +chr12 20438046 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.416;DP=109;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,22:108:99:390,0,2668 +chr12 20469478 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-0.102;DP=77;FS=5.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:402,0,2239 +chr12 20509132 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.329;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:373,0,609 +chr12 21028525 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.358;DP=70;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:304,0,2208 +chr12 21218880 . GAGGTTTGTATAAACCAGTCTGTTTTTTTCCGAAACGCCAAAACGTAGAATCAGAAGTTTATTCCTTTTGTTTGC G 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=4.410;DP=50;FS=18.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:740,0,11942 +chr12 21380598 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 +chr12 21380630 . G A 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 +chr12 21381619 . T A 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:649,48,0 +chr12 21404885 . T A 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:500,36,0 +chr12 21431847 . A G 582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:611,45,0 +chr12 21688786 . C A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.080;DP=64;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:294,0,1940 +chr12 21691937 . T C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.748;DP=79;FS=7.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.39;ReadPosRankSum=-1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:533,0,2253 +chr12 21692053 . C G 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.447;DP=526;FS=4.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:434,91:525:99:1187,0,16479 +chr12 21702556 . GCTGAAACAGAGGAAAACAAACGGAACAGGTGAGTCTCAGACAAACAGGTATGTAAAATTGTGTTTACTGTACTGTAATGTTTGCTCAC G 15554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=-2.799;DP=410;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=29.47;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,368:397:99:15592,0,1469 +chr12 21702866 . CCCTGTAAAATACAACAAATGCATAATTTAAAATGATAATAGGCCTAATGTATTTTTACTATATAAATTATGATATTGGGAATACATA C 13762.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=1.886;DP=362;FS=5.338;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=32.84;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,340:348:99:13800,1001,0 +chr12 21705902 . C A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=1.081;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:616,0,1113 +chr12 21723305 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=1.675;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:304,0,2135 +chr12 21723375 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.571;DP=42;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.76;ReadPosRankSum=2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:312,0,1154 +chr12 21724300 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.690;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:599,0,1091 +chr12 21830860 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.192;DP=72;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:255,0,2116 +chr12 21916882 . A T 253.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 +chr12 22129390 . G A 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:470,33,0 +chr12 22129560 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr12 22129561 . G C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr12 22129723 . T A 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr12 22129843 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr12 22129899 . G T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr12 22129909 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr12 22130020 . A G 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:554,39,0 +chr12 22130053 . C T 662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:691,51,0 +chr12 22130236 . A C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr12 22133516 . C T 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 +chr12 22139076 . G GA 399.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:437,39,0 +chr12 22139132 . A G 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:607,45,0 +chr12 22140244 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr12 23036031 . GACCTACGGGGGAGAGACAGCTAATCAATACTAATCCATTCAGCAAATGCACCTTAATACCTCATGCCAGTGCTTTTTAACAACTCGGGAAAAGTATCAAAAGCGCACAGAGCACTGAAAGCAACAGTGACAGCAGAGATGAGCACTGCAGGCAAACACTGCCACCT G 1494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=3.801;DP=49;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=30.50;ReadPosRankSum=-2.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1532,0,4479 +chr12 23036443 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-1.079;DP=50;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:289,0,1460 +chr12 23452745 . C T 450.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=34.66;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:478,0,7 +chr12 23728539 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.939;DP=67;FS=2.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:473,0,1794 +chr12 23779595 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.516;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:277,0,2462 +chr12 23786885 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.376;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:311,0,2295 +chr12 23790761 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.444;DP=52;FS=10.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:302,0,1475 +chr12 23799675 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=-0.115;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:387,0,1582 +chr12 23800567 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.636;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:256,0,782 +chr12 23924150 . G A 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=2.479;DP=266;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,44:266:99:511,0,8775 +chr12 23924659 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.082;DP=164;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,25:164:99:266,0,5249 +chr12 23927397 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=-1.194;DP=161;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,29:161:99:593,0,10004 +chr12 23927400 . G T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.402;DP=150;FS=2.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,33:150:99:593,0,10004 +chr12 23959422 . C T 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.253;DP=183;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:1178,0,5241 +chr12 23986401 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.605;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,22:113:99:347,0,3312 +chr12 23988229 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.342;DP=105;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:893,0,2796 +chr12 24095000 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.050;DP=39;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:233,0,1110 +chr12 24117666 . G C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.227;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:236,0,1022 +chr12 24233602 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.626;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:473,0,2031 +chr12 24233778 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.964;DP=70;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:448,0,1972 +chr12 24256978 . C T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.065;DP=90;FS=4.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:529,0,2618 +chr12 24527307 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.426;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,451 +chr12 24676263 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:67:279,0,67 +chr12 24795431 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.147;DP=207;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=1.40;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,33:207:99:318,0,6856 +chr12 24825559 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.107;DP=235;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,37:235:99:433,0,7733 +chr12 24846844 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.458;DP=195;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,39:195:99:706,0,6423 +chr12 25334842 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.111;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=2.78;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:329,0,3430 +chr12 25342837 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-1.834;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,31:116:99:718,0,3015 +chr12 25345412 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.466;DP=106;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:772,0,2937 +chr12 25345466 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.969;DP=100;FS=13.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:350,0,3097 +chr12 25532970 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.230;DP=103;FS=6.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:331,0,3178 +chr12 25540568 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=2.025;DP=121;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,28:121:99:561,0,3567 +chr12 25551379 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-1.257;DP=130;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,22:130:99:290,0,4170 +chr12 25562755 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.211;DP=134;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:676,0,4040 +chr12 25753084 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr12 25753093 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr12 25855194 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.817;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:362,0,563 +chr12 25971905 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.193;DP=38;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:292,0,967 +chr12 26142900 . CT C 382.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.672;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:23:420,0,23 +chr12 26349101 . CA C 325.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=1.826;DP=19;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:7:382,0,7 +chr12 26411272 . G GT 296.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:403,40,0 +chr12 26424395 . CCCTAAGGCACAGATCAACAAATGAAAAAAAAGAAAGATGCAAGAAGATTAATATCGAAATGCTTAAACAGGAATCTAAACTAGGTTCAGTTA C 2378.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=-0.689;DP=57;FS=3.871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=30.37;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,51:57:99:2416,223,0 +chr12 26797214 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:237,0,248 +chr12 26905453 . C CT 704.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=-0.612;DP=131;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,40:109:99:742,0,1399 +chr12 26907518 . G GA 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;ClippingRankSum=-1.739;DP=154;FS=7.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,44:138:99:679,0,2212 +chr12 27394123 . A T 5675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=-0.795;DP=283;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,170:282:99:5704,0,3995 +chr12 27394195 . G A 8091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-2.758;DP=398;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,240:398:99:8120,0,5470 +chr12 27408906 . A C 5350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.160;DP=251;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,155:251:99:5379,0,3474 +chr12 27413823 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,232 +chr12 27468231 . AT A 730.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-0.501;DP=43;FS=13.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:768,0,203 +chr12 27479485 . ACTGTATGGGGCCGCATTATAGAGAGTGAATGCAAACACTTTGCAAATTGTGCTGTGTACAGCATCGCATGATTATTTCTCAC A 7689.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=1.712;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=29.86;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:7727,629,0 +chr12 27526984 . AATACCTACACAGAAAGAAAAGGACATTTAAATAAATGACAGACATAATCATGCTTTGAAAGGTGCCAACGTTGTCACAACCTAAAATACACTATAACGTAAAAC A 2849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=2.107;DP=93;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=30.64;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,79:92:99:2887,0,3009 +chr12 28118526 . AATCTGGAAAATGAGGTCATGAATCGACACTATAAATGGGGAAAGCCTCAGAATTGATCAGAATATTAAGATCTATCAGGATTCTC A 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.485;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=27.55;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:423,0,1719 +chr12 28466536 . G C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.735;DP=24;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,453 +chr12 28466567 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=1.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:309,0,263 +chr12 28467144 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.245;DP=28;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:646,0,143 +chr12 28600734 . TCCTACAGGAGAAAGAATATTGCTTGTAAATGAATGTAAAAAAGTCAACCAAATATCAAATGACACCTCATTA T 9563.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=1.699;DP=250;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=27.47;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,238:248:99:9601,704,0 +chr12 28791463 . ACAGGTATGCGTTATCAGATGCGAAGGACAACATTTACTTATTCTATGACTGAATAATGTCCAAAGTCTTGTTGTTGTC A 2072.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=1.143;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=33.98;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,54:61:99:2110,0,253 +chr12 28800160 . A G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.072;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:524,0,1907 +chr12 29141694 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=1.067;DP=40;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:313,0,497 +chr12 29514274 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:320,0,243 +chr12 29899195 . GA G 1733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.689;DP=115;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=15.08;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,69:100:99:1771,0,443 +chr12 29899237 . GCACACACA G 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=4.383;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:463,0,1869 +chr12 29917851 . C T 2824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.166;DP=162;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:2853,0,2839 +chr12 29920819 . A AC 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.637;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:664,0,1889 +chr12 30321460 . T G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr12 30340150 . TCTGTAAGAAAGCATAACGTTAGAATCACAATGCGACAAGTGCCAGCAGAAAATGACATTGAACACCAGTTTTTCCAATAC T 1526.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=1.529;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1564,140,0 +chr12 30375758 . AGTGAGCTATGATGGTCATTTATTGTAACATAATGGCTTTTACACATACTAACAAATAACATTTGTGTTTCACAG A 258.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.964;DP=85;FS=3.041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:296,116,0 +chr12 30392480 . GCTGTAGGAAGAAGTGGAATGTGAAGATTGGATTCGTGCAGTTCAATACAACAAAACAAGTAACAAAAACAAACAATATTAAC G 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=1.710;DP=184;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,164:165:99:621,0,155 +chr12 30418780 . AT A 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.207;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:736,0,737 +chr12 30460742 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-1.938;DP=163;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,40:163:99:763,0,4213 +chr12 30493183 . G C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=1.359;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:545,0,713 +chr12 30493880 . T C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.124;DP=34;FS=8.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:454,0,715 +chr12 30493904 . GC G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.865;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:267,0,181 +chr12 30493913 . A T 399.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:0:425,0,0 +chr12 30771850 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.536;DP=41;FS=20.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:486,0,1885 +chr12 30772008 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.528;DP=33;FS=8.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:681,0,499 +chr12 30772082 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=-0.148;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:270,0,875 +chr12 30776212 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-1.112;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:408,0,1236 +chr12 30792327 . CCAGGTACGTCAGAGACCCTTTATTTAACAGACTTATCATTGAAGAGAACTGTATATTGTCTGAACAGTGAATCTTG C 242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.386;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,68:71:99:280,120,0 +chr12 30792490 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-1.239;DP=65;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:506,0,3739 +chr12 30792493 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-1.067;DP=65;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:511,0,3739 +chr12 31392153 . A AAAAACGTGCTGCATTTTCTCACAACGCAAACAATTTACG 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.227;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:420,0,274 +chr12 31415865 . T TA 594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.080;DP=36;FS=13.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:632,0,1339 +chr12 31522920 . C A 1887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.207;DP=72;FS=3.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.458;QD=26.22;ReadPosRankSum=-2.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,52:72:99:1916,0,517 +chr12 31552691 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.555;DP=55;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=25.90;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:1453,0,476 +chr12 31795251 . T TA 870.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-1.727;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:908,0,392 +chr12 31868030 . G A 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=-1.039;DP=48;FS=9.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1227,0,422 +chr12 31874828 . C T 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=-2.016;DP=53;FS=1.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=29.13;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,40:53:99:1572,0,301 +chr12 31969261 . T TA 289.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.736;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:18:388,18,0 +chr12 31972202 . A T 734.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:763,54,0 +chr12 31990315 . A G 2464.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2493,181,0 +chr12 31994268 . C G 1762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1791,129,0 +chr12 31994672 . C A 1273.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1302,96,0 +chr12 31994889 . C A 1447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.359;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=28.78;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:79:1476,79,0 +chr12 31995006 . T C 2059.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2088,153,0 +chr12 32034326 . C G 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=-1.853;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:753,0,435 +chr12 32034345 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=-1.137;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:707,0,112 +chr12 32034990 . T C 2185.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2214,162,0 +chr12 32035005 . G A 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2255,160,0 +chr12 32035258 . T A 1069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1098,78,0 +chr12 32035438 . G GA 769.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:807,72,0 +chr12 32035957 . T A 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:24:321,24,0 +chr12 32035967 . A G 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:321,24,0 +chr12 32036194 . A G 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.135;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:94:1395,0,94 +chr12 32036218 . G A 1758.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1787,132,0 +chr12 32036338 . A C 1587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-1.644;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=34.25;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1616,114,0 +chr12 32036558 . A C 1346.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1375,96,0 +chr12 32036612 . G T 847.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:876,60,0 +chr12 32036654 . T C 842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:871,63,0 +chr12 32036671 . A T 875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:904,63,0 +chr12 32063428 . C T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1868,126,0 +chr12 32063431 . C T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1868,126,0 +chr12 32214955 . TCTGTTTCATCAAGAACAAAAAGAGTGAAAATATTAGTGTCTGTTTGTGTGTGTATGTTTGCACTATGTTTCTTTTTTCTATACTTTTTTTTTAC T 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.714;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=20.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:99:704,0,447 +chr12 32256969 . T TTC 3562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-1.538;DP=124;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=28.73;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,94:120:99:3600,0,501 +chr12 32278912 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.099;DP=141;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,29:141:99:513,0,4219 +chr12 32281916 . A G 1462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:99:1491,104,0 +chr12 32281921 . A G 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.190;DP=37;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:618,0,690 +chr12 32282049 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-0.252;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:313,0,1026 +chr12 32345958 . TA T 1455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=-0.883;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:1493,0,1016 +chr12 32348696 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.580;DP=168;FS=6.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,32:167:99:438,0,5990 +chr12 32471031 . ACG A 683.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:721,48,0 +chr12 32471128 . T A 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 +chr12 32471143 . C T 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 +chr12 32471263 . A G 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:537,39,0 +chr12 32471382 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:313,0,407 +chr12 32480208 . C T 1925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1954,141,0 +chr12 32483407 . C T 2994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3023,211,0 +chr12 32494093 . TGA T 910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.388;DP=47;FS=6.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:948,0,779 +chr12 32494191 . T C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=1.156;DP=33;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:939,0,596 +chr12 32494195 . A G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.842;DP=33;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:939,0,647 +chr12 32494431 . T A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=2.267;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:494,0,158 +chr12 32494462 . C A 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=3.000;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=28.04;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:849,0,221 +chr12 32494470 . T C 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=2.124;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:849,0,221 +chr12 32494559 . C T 2630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.259;DP=84;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.120;QD=31.32;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,66:84:99:2659,0,354 +chr12 32494612 . A T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-1.857;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:632,0,980 +chr12 32494861 . G GT 803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:841,75,0 +chr12 32494924 . A C 604.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:633,45,0 +chr12 32495195 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:332,0,917 +chr12 32495216 . T C 1916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1945,141,0 +chr12 32495251 . T A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;ClippingRankSum=-1.391;DP=44;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=14.77;ReadPosRankSum=5.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:678,0,822 +chr12 32495632 . G C 2015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.040;DP=76;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,52:75:99:2044,0,651 +chr12 32495662 . T C 3388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3417,244,0 +chr12 32495828 . A T 3364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3393,241,0 +chr12 32495913 . A G 2079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=1.113;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=30.14;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,56:69:99:2108,0,236 +chr12 32525347 . C A 4046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.007;ClippingRankSum=-2.832;DP=131;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=30.89;ReadPosRankSum=1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,103:131:99:4075,0,538 +chr12 32525521 . C T 6906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.892;ClippingRankSum=0.417;DP=266;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,199:266:99:6935,0,1452 +chr12 32525786 . G A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.671;DP=247;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,57:247:99:1137,0,7051 +chr12 32525807 . G A 8340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:8369,608,0 +chr12 32564804 . C T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +chr12 32565558 . A C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 +chr12 32570113 . A C 2310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=1.537;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,60:87:99:2339,0,1643 +chr12 32570114 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-1.522;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:591,0,4995 +chr12 32571519 . T A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr12 32571972 . A G 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=1.233;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=29.96;ReadPosRankSum=-1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,39:43:31:1556,0,31 +chr12 32572179 . A T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +chr12 32572326 . A G 1186.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:90:1215,90,0 +chr12 32572451 . A G 2024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-2.011;DP=58;FS=6.002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=34.91;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,51:56:46:2053,46,0 +chr12 32572657 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:266,0,368 +chr12 32572767 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=2.424;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=15.48;ReadPosRankSum=-2.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:245,0,217 +chr12 32668580 . GA G 916.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.595;DP=63;FS=4.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:954,0,272 +chr12 32668896 . G A 6296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.865;DP=227;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,175:227:99:6325,0,1058 +chr12 32673103 . C CA 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.200;DP=26;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:345,0,204 +chr12 32673553 . G A 3894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-2.542;DP=135;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.323;QD=28.85;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,106:134:99:3923,0,480 +chr12 32847499 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.373;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:361,0,976 +chr12 32848471 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.826;DP=47;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:340,0,1181 +chr12 33217713 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.566;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:233,0,961 +chr12 33279829 . T C 793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:822,60,0 +chr12 33282983 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.610;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:506,0,438 +chr12 33285449 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:265,0,58 +chr12 33316550 . CGGTAAGTGTTGTTCTATGTCAAAAGCTGAGTTTGTCTGATGTCCATACTTGAACTCATTATTTTATGTGTCTGATGTGCTCTCA C 871.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.912;DP=268;FS=2.403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,236:239:99:909,355,0 +chr12 33388275 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.230;DP=71;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:586,0,1777 +chr12 33389413 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=1.611;DP=65;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:312,0,1962 +chr12 33395720 . T A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:284,0,58 +chr12 33409169 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.639;DP=155;FS=3.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,32:154:99:617,0,4741 +chr12 33451495 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.203;DP=43;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:277,0,1069 +chr12 33453930 . C CT 1085.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,38:44:87:1101,87,0 +chr12 33873711 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.720;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=14.89;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:460,0,504 +chr12 34076888 . T C 682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:711,54,0 +chr12 34076968 . T A 663.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=-1.018;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:16:692,16,0 +chr12 34077774 . T C 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +chr12 34489843 . C T 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=-0.188;DP=49;FS=2.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1278,0,337 +chr12 34489858 . A T 1961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1990,147,0 +chr12 34517718 . A G 2408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2437,178,0 +chr12 34787494 . T C 725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:754,54,0 +chr12 34787873 . G A 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 +chr12 34788072 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr12 34820720 . TGGTATGAGTCAAAATAAAGAATTATTTAGCCTTCAGTACACTGGGTTTGGTTTTATAATCCTCTTTTTGTTTTTTATATAACCTTGCATACATTA T 13422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=1.017;DP=303;FS=2.143;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=30.90;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,300:303:99:13460,1043,0 +chr12 34831111 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.652;DP=72;FS=9.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:454,0,2004 +chr12 34845953 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.872;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:424,0,561 +chr12 34846065 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:258,0,371 +chr12 34846081 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,359 +chr12 34857233 . C T 454.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:483,33,0 +chr12 34863692 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr12 34867035 . G A 1554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1583,114,0 +chr12 34871452 . A G 1596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1625,114,0 +chr12 34873902 . G A 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:477,36,0 +chr12 34873910 . A T 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:477,36,0 +chr12 34873933 . G A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:434,33,0 +chr12 34876639 . C T 800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:68:829,68,0 +chr12 34881357 . C T 900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:929,66,0 +chr12 34923842 . A G 782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:811,57,0 +chr12 34943595 . A T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr12 34943783 . A C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr12 34944237 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr12 34944277 . C A 566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:595,42,0 +chr12 34944410 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 +chr12 34944939 . C G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 +chr12 34944954 . G A 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:502,39,0 +chr12 34944985 . T C 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 +chr12 34947947 . T TTC 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr12 34948642 . T A 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 +chr12 34951367 . A T 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:492,39,0 +chr12 34951441 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 +chr12 34951442 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 +chr12 34967056 . A T 1681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1710,117,0 +chr12 34968554 . T C 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:980,72,0 +chr12 34968586 . A C 1932.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1961,138,0 +chr12 34979396 . T C 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 +chr12 34979435 . T G 1879.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1908,141,0 +chr12 35033729 . T TC 465.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53:503,53,0 +chr12 35034482 . C G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:285,0,171 +chr12 35035193 . CT C 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=1.276;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:49:505,0,49 +chr12 35036299 . G A 583.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=34.30;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:12:611,12,0 +chr12 35049290 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.238;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:370,0,3411 +chr12 35099272 . C A 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=-1.094;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=27.05;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:921,0,104 +chr12 35100317 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:267,0,54 +chr12 35256970 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.618;DP=105;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=6.15;ReadPosRankSum=2.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:674,0,2743 +chr12 35464308 . T TA 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.645;DP=50;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:455,0,863 +chr12 35480710 . GTGTGTTGTAAGTGATTTTGCTT G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.235;ClippingRankSum=-0.754;DP=125;FS=11.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=1.87;ReadPosRankSum=-4.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:271,0,4396 +chr12 35484797 . A AT 1536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.153;DP=114;FS=14.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1574,0,1000 +chr12 35688723 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.157;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=29.40;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:675,0,109 +chr12 35688784 . G A 1104.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=2.105;DP=31;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:1:1130,0,1 +chr12 35754597 . T C 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=-3.020;DP=59;FS=3.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:971,0,1084 +chr12 35763331 . CAAGGTAAAAGCATAAATTTAGGCTTCATTTAAGAACAAAATGGTTTTATTCCATTATATTATGCTTTTTATCAATATGAATCTCTTTA C 5402.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.686;DP=138;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=33.47;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,135:138:99:5440,480,0 +chr12 35775739 . A G 1858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=2.024;DP=102;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=18.22;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1887,0,1531 +chr12 35779028 . C G 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-2.495;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1537,0,928 +chr12 35938423 . T TA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:250,0,213 +chr12 35941229 . A G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.563;DP=79;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:878,0,1780 +chr12 35944279 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-1.903;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:372,0,238 +chr12 35997152 . TACTAACCTACTCAAAAAGAGACATTTGTCATATTGCAGAATTACTGTAGGCGTCGACTGCATTTGAGTTAGGAGTTTTCTGTGGGTGTGAG T 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=31.67;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:544,0,241 +chr12 36219778 . C G 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:472,0,278 +chr12 36271589 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:282,0,54 +chr12 36272551 . CCACCTGAATGGAGATTGCCATTAAAATAAAATTCTCAACAACATAAAATCTTTAATAGCCACTATTATTAGCATTTAGGTCATTGTGTCTTGCT C 6922.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=4.462;DP=180;FS=1.079;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=29.64;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,165:179:99:6960,228,0 +chr12 36299359 . G C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,284 +chr12 36300715 . C CA 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-1.156;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:71:525,0,71 +chr12 36302816 . TA T 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr12 36303254 . A T 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +chr12 36305058 . T G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.822;DP=69;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:327,0,2237 +chr12 36306051 . TA T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=10;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=23.57;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:273,0,155 +chr12 36306421 . A G 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-1.360;DP=82;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=26.48;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,57:82:99:2200,0,659 +chr12 36440143 . CAGGTGAATAAATTGGTTTATTTTATTGCTACTTGTTTGCTTCTGAATAGTTGTTGTTTAGTCTTCTCTAAATTTTATTTCAATTTCTA C 1759.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=2.840;DP=47;FS=5.381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=24.26;ReadPosRankSum=-2.840 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:99:1797,148,0 +chr12 36492674 . TCTGAAATCATGACAGTCAAGGTCCACTGATGGCAAAGCATTCATTATTCTGCCGTACTCAGTTCTCTTCCGCAATGCCACAAAAAGGATAC T 848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=1.047;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:886,0,162 +chr12 36498372 . A G 202.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:11:230,0,11 +chr12 36502011 . TA T 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.216;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:416,0,131 +chr12 36749157 . G GCCCT 206.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:10:243,10,0 +chr12 37048810 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:281,0,501 +chr12 37186324 . TA T 216.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.741;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:251,0,1 +chr12 37186595 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:481,0,147 +chr12 37400265 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,417 +chr12 37501827 . T G 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=-0.420;DP=102;FS=1.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,39:102:99:1015,0,6496 +chr12 37507934 . T A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.326;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:553,0,3383 +chr12 37628362 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:360,0,554 +chr12 37665082 . A T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.626;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,359 +chr12 37670464 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:233,0,58 +chr12 37679181 . GT G 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 +chr12 37689530 . C T 2523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.734;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:2552,0,2190 +chr12 37693111 . C A 1884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=1.240;DP=102;FS=4.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1913,0,1613 +chr12 37693240 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=3.281;DP=16;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:229,0,369 +chr12 37696188 . G C 2320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.843;DP=136;FS=2.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:2349,0,2394 +chr12 37784432 . T C 762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:791,57,0 +chr12 37786990 . A G 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.578;DP=48;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:856,0,837 +chr12 37791936 . T C 670.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:699,48,0 +chr12 37813535 . G T 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.792;DP=58;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=26.17;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,42:58:99:1546,0,412 +chr12 37813550 . A G 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.829;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=26.39;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1242,0,333 +chr12 37820459 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.297;DP=22;FS=13.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,394 +chr12 37821456 . T A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=3.911;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:621,0,1816 +chr12 37821467 . G T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=3.677;DP=36;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:621,0,1858 +chr12 37822069 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:43:316,0,43 +chr12 37822072 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.78;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:43:316,0,43 +chr12 37822297 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.964;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:254,0,416 +chr12 37822311 . A T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 +chr12 37823297 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=3.181;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:309,0,492 +chr12 37894660 . C T 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 +chr12 37925479 . A G 2340.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-2.368;DP=67;FS=5.875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=34.94;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,60:67:14:2369,14,0 +chr12 37925549 . A G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.763;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=17.79;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:633,0,462 +chr12 37925648 . G T 2064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:2093,141,0 +chr12 37925657 . T C 2064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2093,141,0 +chr12 37925858 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=2.773;DP=72;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:306,0,2255 +chr12 37925887 . A G 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=2.961;DP=57;FS=5.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:500,0,1460 +chr12 37925923 . A G 1139.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.362;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=32.98;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1168,81,0 +chr12 37925984 . T A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=-3.464;DP=17;FS=12.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=18.93;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:350,0,287 +chr12 37925996 . T A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +chr12 37926619 . G C 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:438,33,0 +chr12 37926991 . G A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +chr12 37927218 . A T 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:354,24,0 +chr12 37928186 . C T 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 +chr12 37928205 . G A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr12 37928559 . G T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.633;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:526,0,505 +chr12 37928612 . C A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.597;DP=33;FS=10.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:551,0,649 +chr12 37928665 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr12 37928668 . A T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:236,18,0 +chr12 37928757 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.643;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:386,0,377 +chr12 37929091 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:391,0,97 +chr12 37929358 . A C 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:490,36,0 +chr12 37929481 . G C 1412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1441,102,0 +chr12 37929920 . C G 919.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:948,66,0 +chr12 37929994 . T C 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 +chr12 37934331 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.230;DP=27;FS=8.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:332,0,580 +chr12 37936877 . C G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.093;DP=62;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:290,0,1828 +chr12 37936893 . C A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.883;DP=65;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:844,0,1346 +chr12 37936993 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-2.082;DP=42;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:229,0,1246 +chr12 37952024 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-1.473;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:758,0,707 +chr12 37961577 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.889;DP=61;FS=6.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:244,0,1882 +chr12 37961886 . A G 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.298;DP=62;FS=8.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=27.66;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,46:62:99:1743,0,382 +chr12 37961994 . C T 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.772;DP=43;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=31.13;ReadPosRankSum=1.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1367,0,299 +chr12 37962089 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=-0.269;DP=45;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:313,0,1230 +chr12 37962313 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-1.067;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:656,0,550 +chr12 38070546 . C A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.886;DP=58;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:778,0,1178 +chr12 38071046 . T C 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-1.222;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=30.79;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:644,0,114 +chr12 38208853 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr12 38497392 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.247;DP=80;FS=2.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.616;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:246,0,2390 +chr12 38497539 . G T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.953;DP=87;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:415,0,2520 +chr12 38497715 . GA G 825.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-1.855;DP=58;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:863,0,244 +chr12 38542019 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.391;DP=30;FS=13.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.06;ReadPosRankSum=-3.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:420,0,435 +chr12 38542491 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.678;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:410,0,1627 +chr12 38543040 . A C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.796;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:308,0,1816 +chr12 38813795 . T C 4090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.961;DP=193;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,118:193:99:4119,0,2930 +chr12 38813801 . T C 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.948;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=9.42;ReadPosRankSum=2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,65:194:99:1856,0,5750 +chr12 38813890 . G A 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-1.113;DP=238;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,60:238:99:1336,0,7046 +chr12 38815197 . A AT 3369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=-1.065;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,90:102:99:3407,165,0 +chr12 38815382 . G GA 1292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.834;DP=84;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,55:69:99:1372,0,168 +chr12 38815511 . T C 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-0.090;DP=252;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.862;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,60:252:99:1518,0,7429 +chr12 38815869 . T A 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-1.363;DP=323;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,73:323:99:1492,0,9374 +chr12 38928097 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr12 38946534 . T C 1370.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=2.480;DP=25;FS=5.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=33.43;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:16:1399,0,16 +chr12 38946751 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.070;DP=28;FS=1.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:425,0,804 +chr12 38947123 . G C 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=-1.099;DP=101;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,32:101:99:795,0,5644 +chr12 40090268 . T C 2481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.533;DP=96;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,65:86:99:2510,0,800 +chr12 40090513 . T A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr12 40091433 . T G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.072;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:80:476,0,80 +chr12 40099818 . A G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.872;DP=38;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:573,0,803 +chr12 40099835 . G T 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.538;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1162,0,1390 +chr12 40100299 . T G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:301,0,240 +chr12 40106360 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-1.415;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,422 +chr12 40194549 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=74;FS=5.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:354,0,2122 +chr12 40231287 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=14.35;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:344,0,416 +chr12 40231697 . A AT 486.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:545,54,0 +chr12 40232143 . T A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=2.885;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:784,0,454 +chr12 40232801 . AT A,ATT 364.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-1.175;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,19,10:36:99:525,117,301,359,0,611 +chr12 40233566 . AT A 621.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.337;DP=26;FS=2.944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=23.91;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:47:659,47,0 +chr12 40234531 . G A 1795.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1824,132,0 +chr12 40234596 . T C 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:69:1000,69,0 +chr12 40234640 . T G 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr12 40341737 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-2.426;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,207 +chr12 40343491 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-1.248;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:339,0,386 +chr12 40394645 . C T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-0.977;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:603,0,784 +chr12 40402202 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.109;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=16.85;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:517,0,522 +chr12 40403818 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-1.799;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=19.67;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:343,0,285 +chr12 40513112 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:379,0,412 +chr12 40595384 . TGGTTGGATTCATTTTACTACAACATTAAAAAATATATTCATTCTTGATTTTATTTTGGTTCCTGGTCATCGCTGACATTCTCTTGGATGCGTTCTCTCTCA T 1598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.850;DP=34;FS=6.978;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=33.40;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:99:1636,168,0 +chr12 43009036 . G A 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-0.662;DP=45;FS=8.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1122,0,413 +chr12 43009084 . G T 3315.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3344,257,0 +chr12 43165682 . G A 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=1.251;DP=79;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1326,0,1349 +chr12 43166282 . CT C,CTT 1541.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.766;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=33.50;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,29,14:44:99:1541,373,898,1285,0,2162 +chr12 43166754 . AT A 327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:365,36,0 +chr12 43167386 . A G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.584;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:559,0,315 +chr12 43168194 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-2.800;DP=14;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=23.63;ReadPosRankSum=2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:359,0,162 +chr12 43230223 . ATG A 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.847;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:372,0,263 +chr12 43230712 . C CT 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=1.046;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:293,0,872 +chr12 43230777 . T A 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=1.117;DP=52;FS=3.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:1334,0,2305 +chr12 43230784 . T G 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.399;DP=60;FS=5.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1362,0,2304 +chr12 43230902 . GA G 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:673,67,0 +chr12 43239753 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.521;DP=171;FS=2.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,49:171:99:1249,0,4611 +chr12 43250256 . G A 2154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.468;DP=171;FS=2.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=12.60;ReadPosRankSum=3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,64:171:99:2183,0,3707 +chr12 43261077 . A G 1985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.139;DP=120;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:2014,0,2125 +chr12 43267836 . G A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=-1.676;DP=89;FS=3.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,34:89:99:1070,0,1903 +chr12 43280318 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=1.170;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:305,0,2010 +chr12 43281233 . CA C 758.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.231;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=22.32;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:34:796,34,0 +chr12 43282903 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:257,0,724 +chr12 43291300 . G C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.736;DP=59;FS=2.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:666,0,1356 +chr12 43291538 . G A 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.004;DP=88;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1241,0,1764 +chr12 43305689 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=1.884;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:342,0,1616 +chr12 43310534 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.531;DP=84;FS=2.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:537,0,2519 +chr12 43312946 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.059;DP=21;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:301,0,234 +chr12 44140688 . C CT,CTT 689.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=1.723;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,31,10:45:99:1386,223,112,704,0,689 +chr12 44140951 . A T 1577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-2.408;DP=161;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,69:160:99:1606,0,6972 +chr12 44141559 . CT C 803.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=1.447;DP=274;FS=2.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,63:251:99:841,0,4997 +chr12 44313164 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.388;QD=23.52;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:381,0,310 +chr12 44340764 . AACAGGTAAAGACAGATACATGCAGACTCGCTTCTGTACGGCTGGACGCGTTTAAACATTCTCTCTTCTG A 12770.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=2.995;DP=313;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=29.06;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,307:313:99:12808,1006,0 +chr12 45094840 . G A 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:626,48,0 +chr12 45629355 . T C 1803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.283;DP=57;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,47:57:99:1832,0,179 +chr12 45990748 . C CT 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-2.652;DP=164;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,41:154:99:572,0,3077 +chr12 46103875 . TCTGTTGACAGATGTTAAAAAAAAATATTAGTAGATTTACAATATTTGCTAAATTATAAACACATATCGCATGCAGTAC T 964.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=1.967;DP=27;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=28.06;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:99:1002,0,751 +chr12 46994872 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=1.877;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:323,0,1026 +chr12 46995967 . T G 234.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:53:264,53,0 +chr12 46996651 . G A 2554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-3.028;DP=114;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=22.41;ReadPosRankSum=2.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,75:114:99:2583,0,929 +chr12 47270056 . T C 393.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=32.77;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:421,0,9 +chr12 47284038 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr12 47284050 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr12 47288228 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr12 47429173 . A C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:232,0,67 +chr12 47704471 . C G 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 +chr12 47704528 . A G 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=-0.260;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,34:50:99:1323,0,437 +chr12 47704629 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.396;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:85:385,0,85 +chr12 47717249 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.489;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=15.49;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:431,0,412 +chr12 47770984 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:99:318,0,133 +chr12 47773247 . G T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.081;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=14.77;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:560,0,1513 +chr12 47773250 . T A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=1.067;DP=34;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:560,0,1523 +chr12 47796552 . T A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.423;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,39:136:99:979,0,3703 +chr12 47798807 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.065;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=3.46;ReadPosRankSum=2.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:444,0,3701 +chr12 47798934 . C T 1613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.773;DP=131;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,49:131:99:1642,0,2826 +chr12 47798969 . G A 1823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.043;DP=124;FS=0.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1852,0,2178 +chr12 47808194 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.110;DP=147;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,36:147:99:783,0,4280 +chr12 47902269 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.539;DP=158;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,33:158:99:605,0,4701 +chr12 47902298 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=1.433;DP=149;FS=6.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,33:148:99:607,0,6374 +chr12 47905483 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.540;DP=131;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,30:131:99:643,0,3804 +chr12 47905579 . A G 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-0.980;DP=172;FS=5.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,50:172:99:1149,0,4202 +chr12 47910404 . T C 1677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-0.638;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,71:227:99:1706,0,5674 +chr12 47912678 . GCAGGTCAGATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCGATCTATCTATTATGTTTGTTTCTCCTGTAAATCTGTGCTGTTGCTGTCCCT G 6444.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=1.121;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=33.92;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,185:190:99:6482,617,0 +chr12 47913691 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=-1.076;DP=35;FS=22.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:519,0,819 +chr12 47913702 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.156;DP=26;FS=18.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:372,0,693 +chr12 47914638 . T A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=-2.619;DP=32;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:413,0,1498 +chr12 47914644 . T A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=-2.698;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:413,0,1542 +chr12 47914733 . T TA 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.602;DP=28;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=22.10;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:56:656,0,56 +chr12 47915266 . A C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.209;DP=76;FS=7.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:406,0,5460 +chr12 47915316 . AC A 3535.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.869;DP=88;FS=3.624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=35.23;ReadPosRankSum=-2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,79:86:99:3573,216,0 +chr12 47915438 . C A 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.350;DP=86;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1525,0,1653 +chr12 47915859 . TA T 229.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=25.50;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:7:266,7,0 +chr12 47916158 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.149;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:255,0,2245 +chr12 47944758 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=-0.885;DP=28;FS=8.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:267,0,721 +chr12 47945280 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:335,0,970 +chr12 47968447 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.348;DP=38;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:458,0,793 +chr12 47968570 . C T 1520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1549,114,0 +chr12 47968831 . G A 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 +chr12 48038710 . G C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.202;DP=164;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,31:164:99:440,0,10342 +chr12 48038950 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=2.277;DP=159;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,28:159:99:368,0,9817 +chr12 48052313 . A C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.941;DP=69;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.58;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:482,0,1917 +chr12 48058193 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:284,0,162 +chr12 48074222 . C T 1796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-1.436;DP=95;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=18.91;ReadPosRankSum=1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1825,0,1940 +chr12 48076795 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.243;DP=67;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:233,0,1772 +chr12 48077267 . C T 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-1.051;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,47:71:99:1629,0,1378 +chr12 48077276 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.793;DP=69;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:273,0,4163 +chr12 48077321 . A G 3005.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3034,228,0 +chr12 48079453 . A G 2786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.886;DP=96;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=29.03;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,75:96:99:2815,0,482 +chr12 48079483 . C T 2467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.573;DP=100;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,68:100:99:2496,0,832 +chr12 48088212 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=1.812;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=16.85;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:382,0,317 +chr12 48155210 . G A 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-1.695;DP=46;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:721,0,872 +chr12 48161494 . G A 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:53:644,53,0 +chr12 48161861 . T C 2114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.419;DP=106;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,67:106:99:2143,0,1236 +chr12 48183416 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-1.309;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:312,0,3977 +chr12 48206345 . G A 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.159;DP=45;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=25.19;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:1162,0,375 +chr12 48210767 . C T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.854;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:948,0,584 +chr12 48486592 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,186 +chr12 48614108 . C A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:320,0,921 +chr12 48614293 . T G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=1.383;DP=37;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=16.29;ReadPosRankSum=-2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:631,0,1592 +chr12 48614510 . C G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.005;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:356,0,2282 +chr12 48614576 . A G 2308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2337,169,0 +chr12 48614692 . G A 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=-1.694;DP=85;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,28:84:99:956,0,1848 +chr12 48674368 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.132;DP=51;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:444,0,1365 +chr12 48674597 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.212;DP=57;FS=4.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.938;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:488,0,1394 +chr12 48745116 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=23.52;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:84:287,0,84 +chr12 48745487 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-2.548;DP=53;FS=8.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:445,0,1378 +chr12 48745577 . G A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.296;DP=70;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1031,0,1321 +chr12 48745697 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.539;DP=77;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:649,0,3965 +chr12 48745706 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-1.343;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:652,0,3965 +chr12 48773518 . G T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr12 48853950 . G C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=-0.405;DP=52;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:671,0,993 +chr12 48854015 . G A 2515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-3.184;DP=179;FS=8.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,72:179:99:2544,0,3567 +chr12 48854109 . C G 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=7.652;DP=180;FS=25.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=6.29;ReadPosRankSum=-6.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,26:180:99:1161,0,12618 +chr12 48854115 . C T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=7.143;DP=186;FS=4.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.00;ReadPosRankSum=-6.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,23:185:99:1145,0,12618 +chr12 48857050 . G A 13774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=340;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,340:340:99:13803,1021,0 +chr12 48857167 . C T 14274.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=345;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,345:345:99:14303,1038,0 +chr12 48858475 . T C 4977.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:5006,352,0 +chr12 48858485 . T A 4977.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:5006,352,0 +chr12 48858571 . T C 12870.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=269;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,269:269:99:12899,890,0 +chr12 48858577 . G A 7116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-4.103;DP=303;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=23.49;ReadPosRankSum=4.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,198:302:99:7145,0,7409 +chr12 48858580 . G A 3641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-0.566;DP=312;FS=3.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,105:312:99:3670,0,14063 +chr12 48859770 . C T 3340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.801;DP=423;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,136:423:99:3369,0,10600 +chr12 48860306 . G A 11918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.953;DP=353;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=33.76;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,337:338:99:11947,1014,0 +chr12 48882182 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=-1.060;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:673,0,1296 +chr12 48935792 . T C 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 +chr12 48991200 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:231,0,67 +chr12 49060253 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=-0.473;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:353,0,526 +chr12 49060701 . C G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.724;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:491,0,472 +chr12 49084811 . G T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-0.168;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:337,0,640 +chr12 49095016 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.794;DP=26;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:470,0,396 +chr12 49161837 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.220;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:353,0,498 +chr12 49222638 . C A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.293;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:435,0,597 +chr12 49247636 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=26.92;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:432,0,111 +chr12 49339304 . TA T 1067.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1105,109,0 +chr12 49379118 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=-1.389;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=25.57;ReadPosRankSum=4.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1051,0,376 +chr12 49442854 . T A 2100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-2.920;DP=285;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,86:269:99:2129,0,6640 +chr12 49571763 . C T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr12 49635290 . GT G 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=-1.462;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=6.90;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:458,0,1049 +chr12 49709268 . G T 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:42:621,42,0 +chr12 49709367 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=1.663;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=22.43;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:275,0,136 +chr12 49709429 . A T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=-1.273;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:389,0,296 +chr12 49710397 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=3.220;DP=24;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:312,0,536 +chr12 49710654 . GA G 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.468;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:600,0,266 +chr12 49711930 . A G 616.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:7:644,7,0 +chr12 49712904 . C CA 610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-1.178;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:648,0,220 +chr12 49718115 . G C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:306,0,143 +chr12 49734109 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=-0.113;DP=46;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:281,0,1226 +chr12 49768635 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr12 49841960 . T C 266.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:294,0,12 +chr12 49845552 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr12 49898774 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=-0.579;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,391 +chr12 49915444 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:321,0,142 +chr12 49939128 . C T 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 +chr12 49947781 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=1.045;DP=48;FS=4.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:763,0,815 +chr12 50216519 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=23.31;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:238,0,66 +chr12 50217719 . C T 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +chr12 50230159 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:451,0,434 +chr12 50243645 . C T 4658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.718;DP=250;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,143:250:99:4687,0,3731 +chr12 50259933 . G A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=1.819;DP=239;FS=7.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=4.74;ReadPosRankSum=2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,59:239:99:1161,0,6038 +chr12 50261738 . G A 4701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=-0.943;DP=303;FS=19.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,135:303:99:4730,0,5414 +chr12 50261768 . C T 4566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.971;ClippingRankSum=-0.347;DP=330;FS=15.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,154:329:99:4595,0,5531 +chr12 50266219 . C T 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-1.043;DP=280;FS=16.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,79:279:99:1947,0,7500 +chr12 50312870 . C G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=-1.867;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:489,0,533 +chr12 50316951 . G A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.052;DP=60;FS=5.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1071,0,1090 +chr12 50324305 . A G 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=-0.569;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:956,0,1060 +chr12 50324469 . G T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.533;DP=82;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:649,0,1936 +chr12 50422994 . G T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=1.048;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:596,0,583 +chr12 50425126 . T A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 +chr12 50434225 . T G 1809.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1838,129,0 +chr12 50434452 . G C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.576;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=2.13;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:231,0,3769 +chr12 50434476 . G C 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.121;DP=118;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:586,0,2753 +chr12 50444527 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-1.985;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:600,0,501 +chr12 50445150 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=22.25;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,138 +chr12 50541894 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-2.236;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,858 +chr12 50544851 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.676;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:288,0,970 +chr12 50548166 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.755;DP=47;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:841,0,826 +chr12 50661756 . ACAGGTCACACACACACACTCAGCGCACGCACCGCTCACACCGCAACCCTAGAGTCAACACAACATAATGTTATAAATGACGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT A 10811.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.625;ClippingRankSum=1.943;DP=262;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=28.94;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,242:261:99:10849,957,0 +chr12 50683830 . T C 2857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2886,208,0 +chr12 50687292 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.953;DP=41;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:230,0,1153 +chr12 50692175 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.352;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:353,0,548 +chr12 50692293 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.521;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=17.20;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:441,0,402 +chr12 50693181 . G A 982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.733;DP=25;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=29.08;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1011,72,0 +chr13 1013 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=1.681;DP=34;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:533,0,597 +chr13 1063 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.469;DP=75;FS=1.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:345,0,1946 +chr13 4203 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=2.014;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:587,0,939 +chr13 5246 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.184;DP=47;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:659,0,957 +chr13 5621 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.184;DP=50;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=6.14;ReadPosRankSum=-2.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:335,0,1330 +chr13 5636 . G A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=3.396;DP=46;FS=13.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=6.76;ReadPosRankSum=-2.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:348,0,889 +chr13 5642 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=3.411;DP=44;FS=10.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=6.52;ReadPosRankSum=-2.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:315,0,1861 +chr13 23557 . C A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:292,0,166 +chr13 42295 . G A 2478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.618;DP=144;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:2507,0,2228 +chr13 46784 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.270;DP=54;FS=5.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:755,0,930 +chr13 54422 . CGGTCTGATCCCCTGCCCTGACGCTCTGTGTGTGTGTGTGTTGAGATTGTGCACACTCACCCTGTTTCCCCTCA C 5075.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=3.388;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=33.60;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,121:125:99:5113,403,0 +chr13 54899 . G A 2242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-1.083;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:2271,0,1582 +chr13 59225 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-2.644;DP=80;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:375,0,2355 +chr13 61089 . G C 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-1.119;DP=92;FS=7.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1544,0,1481 +chr13 61131 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=-0.593;DP=80;FS=12.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:308,0,2047 +chr13 62196 . C T 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.299;DP=79;FS=7.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,40:79:99:1196,0,1121 +chr13 62621 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=0.221;DP=60;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:649,0,917 +chr13 63991 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.269;DP=23;FS=12.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:439,0,307 +chr13 64544 . T C 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.754;DP=85;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=29.01;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,66:85:99:2494,0,396 +chr13 64585 . A T 1986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.887;DP=61;FS=3.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=32.57;ReadPosRankSum=1.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,53:61:47:2015,0,47 +chr13 65211 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 454.20 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.434;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:99:479,0,327 +chr13 69741 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-2.454;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,19:111:99:261,0,3568 +chr13 73075 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.349;DP=131;FS=8.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,36:129:99:901,0,3542 +chr13 74312 . T A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.971;DP=87;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:1331,0,1605 +chr13 76114 . C A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.049;DP=129;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,22:129:99:303,0,4051 +chr13 76306 . G A 3830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-1.095;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,122:226:99:3859,0,3579 +chr13 78183 . C T 3024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.005;DP=172;FS=3.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,96:172:99:3053,0,2544 +chr13 78374 . T A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.689;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:636,0,4757 +chr13 80230 . A AGCACACACACAC 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=-4.979;DP=51;FS=11.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=4.27;ReadPosRankSum=4.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:255,0,393 +chr13 91777 . C G 821.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.262;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=34.21;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:12:849,0,12 +chr13 94306 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.470;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=27.29;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:656,0,103 +chr13 94497 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=2.797;DP=16;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:306,0,190 +chr13 98581 . CACCTTAGAAAGCAAAGAGAGAGAGGGGTGAAGCAGGATGGAGGAGTGGAGGACAGATAAAGGATGGAGCAGTGATGGAGGCCCGAGGGTGGAGGCTGT C 1497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=1.280;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=34.04;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1535,0,2159 +chr13 100049 . G A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=1.172;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:463,0,583 +chr13 102595 . G A 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=-0.454;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1266,0,1672 +chr13 104611 . G A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-1.296;DP=177;FS=5.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,45:175:99:1028,0,4830 +chr13 112891 . AGTGTGTGTGTGTGT A 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.749;DP=65;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:601,0,849 +chr13 163060 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=5.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,995 +chr13 179064 . T C 5691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.651;DP=283;FS=0.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,170:282:99:5720,0,3876 +chr13 181983 . G A 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-2.818;DP=56;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:1017,0,911 +chr13 182389 . CTGTA C 751.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.450;DP=337;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,58:337:99:789,0,11522 +chr13 182394 . CGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCTGAGGTGTAAAGAGCCCGTATTATGTGTGTTTGATAATGACTATGAATGTGTGACTGGGCTCTAAGTGGATGAAAACGTCCTGATGAGGGGTAAATCTGAAAGTTGTGTGTTCCTCAG C 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.384;DP=337;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,58:337:99:774,0,11522 +chr13 184407 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=2.246;DP=326;FS=15.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=1.94;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,57:326:99:660,0,10737 +chr13 224621 . C T 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-0.164;DP=80;FS=6.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.609;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,50:80:99:1523,0,981 +chr13 225020 . C A 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.070;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:945,0,1324 +chr13 233277 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=1.067;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:263,0,2389 +chr13 242953 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-0.443;DP=60;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:322,0,3978 +chr13 246524 . C G 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=1.062;DP=135;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,42:135:99:1019,0,4272 +chr13 247321 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.081;DP=124;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,28:124:99:512,0,3666 +chr13 257946 . TCCTTAACATGTGAAGCAGATGAAAAAACATCCAACAGATCAGAAAGCAAGAGCTGATGCCTGCAGCTGCTACTGAATGAAGACTGAACTGAATGAAGGATTGCTGAA T 3544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=3.112;DP=113;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=31.37;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,96:103:99:3582,0,928 +chr13 258638 . GCTTCAGACAGATGTTATGGTTAGAGTTTGAGCTTTTCACTACTGAGAGAAGAGGTGAGAAAGGTGGAGATGATCTAAGCAGGACGTAC G 3954.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=4.678;DP=104;FS=3.316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=33.64;ReadPosRankSum=-1.643 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,96:104:99:3992,113,0 +chr13 310672 . G T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.012;DP=70;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:509,0,1725 +chr13 311416 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=1.157;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:330,0,135 +chr13 335027 . C G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=-0.505;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:235,0,940 +chr13 335172 . TCTGACCAACACACAGCAATCAGTTATATTGCGTGTGTGTTTGTGTGTGCATGTTGTACTAGTGGTGCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGTAC T 1810.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=3.140;DP=59;FS=6.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=30.69;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,52:58:99:2165,0,1619 +chr13 337070 . GTTACCTGAAGAGAAAACCAGCTGAGGAAAATGCTTTCAAAACTAAGCAGAAGAGATCTAACCAAACAGACAGTTTAATTCAGCTGGTGGAGATGTGTCAGGGCTGGTCGT G 1010.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=1.758;DP=33;FS=3.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:1048,0,2263 +chr13 350787 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=1.076;DP=30;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:345,0,650 +chr13 383142 . A G 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.604;DP=216;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,53:215:99:1161,0,6121 +chr13 395249 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.051;DP=81;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:345,0,3576 +chr13 395587 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-1.199;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:291,0,1560 +chr13 418237 . T C 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.083;DP=83;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:848,0,4497 +chr13 418242 . A T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.572;DP=82;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:839,0,4497 +chr13 419421 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=1.500;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:291,0,1256 +chr13 420187 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-1.067;DP=88;FS=3.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:467,0,2522 +chr13 426052 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-1.055;DP=41;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,9:41:99:500,0,1312 +chr13 426546 . T C 1347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.715;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1376,0,2214 +chr13 427615 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.414;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=16.93;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:587,0,743 +chr13 427673 . G A 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.101;DP=33;FS=13.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:903,0,325 +chr13 433442 . C T 2027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.107;DP=165;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,60:165:99:2056,0,3508 +chr13 444453 . A G 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.274;DP=64;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=27.29;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,47:64:99:1775,0,403 +chr13 449340 . G A 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-2.455;DP=119;FS=2.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=15.92;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1923,0,1943 +chr13 458009 . C A 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.667;DP=110;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1947,0,2005 +chr13 464116 . G T 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=1.622;DP=83;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1525,0,1276 +chr13 464144 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=2.158;DP=85;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=18.14;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,48:85:99:1570,0,1286 +chr13 464199 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.777;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,33:70:99:1165,0,1265 +chr13 464637 . A G 2110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-2.926;DP=125;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:2139,0,2147 +chr13 524138 . C T 2732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=1.617;DP=167;FS=7.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=16.36;ReadPosRankSum=3.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:2761,0,2821 +chr13 525871 . G A 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=1.132;DP=170;FS=8.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,63:170:99:2079,0,3672 +chr13 526511 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=1.468;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:418,0,8877 +chr13 526519 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=1.186;DP=109;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:412,0,8877 +chr13 529202 . A G 1869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.106;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1898,0,2681 +chr13 530167 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=1.148;DP=187;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,28:186:99:247,0,5807 +chr13 530367 . G A 2713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.416;DP=152;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:2742,0,2234 +chr13 530412 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-3.494;DP=139;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,22:139:99:273,0,4450 +chr13 530494 . G A 2137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.444;DP=137;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:2166,0,2274 +chr13 530649 . G A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=-0.948;DP=123;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,38:122:99:970,0,3105 +chr13 530719 . C T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-3.014;DP=146;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,37:146:99:801,0,4129 +chr13 532035 . GAGGAAAGACTCTTTTCACTGTTTAAACTTCAGTGTCAGAGTGTGTGTGTGAGTGGATATTAGTATGTCATAGACACTAACGACACTGTTCTGATGTTTGTTTGCTTGAAC G 4981.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=0.985;DP=175;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.161;QD=28.47;ReadPosRankSum=-2.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,129:175:99:5019,0,14035 +chr13 534453 . G A 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=0.326;DP=57;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=22.05;ReadPosRankSum=2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1285,0,600 +chr13 535577 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.728;DP=44;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:656,0,983 +chr13 550378 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,379 +chr13 554194 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.262;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:330,0,1212 +chr13 580025 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.059;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,33:60:99:1092,0,934 +chr13 592285 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.259;DP=60;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:390,0,1602 +chr13 681704 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=24.77;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:375,0,122 +chr13 685919 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.442;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:261,0,2098 +chr13 686386 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.132;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:582,0,708 +chr13 687535 . C T 932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=-1.704;DP=40;FS=5.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:961,0,345 +chr13 694394 . G A 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-0.047;DP=51;FS=3.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:956,0,788 +chr13 701400 . A C 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-4.221;DP=192;FS=6.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,41:192:99:825,0,6825 +chr13 701445 . G A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=2.844;DP=130;FS=7.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,39:126:99:1018,0,5600 +chr13 702391 . TGTACACATCAGCTATACAACTGATCAATAATCATTAGTTTGTTCAGCCGTCATCATTGACTGATGTACTTTTGTTCCTGAAG T 3671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=2.920;DP=88;FS=2.191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=21.01;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,85:88:99:3709,299,0 +chr13 702540 . T G 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1317,102,0 +chr13 702546 . C A 1249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:99:1278,99,0 +chr13 703773 . A C 6760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.229;DP=201;FS=3.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=33.64;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,163:199:99:6789,0,404 +chr13 710858 . TGTACACCTCAGCTATACAACTGATCAATAATCATTAGTTTGTTCAGCCGTCATCATTGACTGATGTACTTTTGTTCCTGAAG T 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=32.90;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:465,0,1037 +chr13 711699 . T C 1788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1817,135,0 +chr13 715880 . G C 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.678;DP=35;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.269;QD=34.79;ReadPosRankSum=-1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,32:35:32:1246,0,32 +chr13 720821 . T A 4392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-1.101;DP=235;FS=10.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=18.69;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,135:235:99:4421,0,3195 +chr13 723865 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=4.145;DP=93;FS=13.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.711;QD=5.40;ReadPosRankSum=2.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:530,0,2629 +chr13 728173 . ACTGCACACAATCAGAAGCAGAATTCAGAAACAATAACACAAACACACACACTGCTGTCAGCACAGCGCACTTTACACACTGCACACACAAGCAGAAAGCTGCTTTAC A 3781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.693;DP=88;FS=4.821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=26.57;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:3819,295,0 +chr13 732326 . GCATCAGTGCTGGATGTTATCGTCATGGTAACAGCCTCAGTGCTGCTGGTCCAGCACTGTTAGGAGGGCATCAGTGTTGGATGTTGTTGCCATGGTAACTGCCTCCGTGCAGCTGGTCCAGTGCTGTGAGGAAGC G 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.204;DP=26;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=19.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:534,0,258 +chr13 732918 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=5.217;DP=60;FS=10.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:363,0,3589 +chr13 784030 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.599;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:598,0,316 +chr13 849469 . C A 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.435;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:272,0,890 +chr13 851194 . A AC 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-2.180;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:385,0,405 +chr13 855892 . T C 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.582;DP=36;FS=7.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=18.44;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:692,0,298 +chr13 857122 . C T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=-2.346;DP=37;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1045,0,145 +chr13 857955 . A G 1938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.048;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1967,0,1771 +chr13 986983 . G A 4186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.991;DP=259;FS=4.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,119:259:99:4215,0,4673 +chr13 992464 . GTA G,GTATA 1192.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.400;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,16,22:39:99:1237,731,1123,573,0,810 +chr13 993362 . T G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-2.297;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:576,0,398 +chr13 995107 . G T 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=-0.869;DP=90;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,54:90:99:2036,0,1911 +chr13 995189 . T G 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.247;DP=97;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,33:97:99:1125,0,2338 +chr13 995245 . G A 2300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-1.168;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:2329,0,1888 +chr13 995484 . T C 5347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.232;DP=117;FS=1.531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=29.59;ReadPosRankSum=-4.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,106:113:99:5376,387,0 +chr13 995947 . G T 2898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2927,215,0 +chr13 995981 . T C 3414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3443,249,0 +chr13 997118 . T A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=1.842;DP=74;FS=8.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:934,0,1549 +chr13 998811 . ACTGCAAAAGCACACACAGAAGTCAGCGTATAAAATAGAGTACTCATACAAAATAGCTCAGATTTCAGACTGACTTAC A 15633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=2.166;DP=363;FS=8.720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,345:349:99:15671,1241,0 +chr13 998938 . C T 6017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-1.961;DP=315;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,183:314:99:6046,0,4599 +chr13 1007768 . G A 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.812;DP=50;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.340;QD=29.92;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,40:50:99:1524,0,195 +chr13 1011809 . A C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.464;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:323,0,1197 +chr13 1012930 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=1.479;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:229,0,451 +chr13 1014503 . C G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-1.588;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:345,0,287 +chr13 1040246 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-2.971;DP=111;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=5.12;ReadPosRankSum=3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:597,0,9197 +chr13 1040908 . A AT 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=4.478;DP=144;FS=1.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=4.42;ReadPosRankSum=-3.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,40:139:99:674,0,2874 +chr13 1041097 . A T 1731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-1.091;DP=135;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=12.83;ReadPosRankSum=-6.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:1760,0,2996 +chr13 1041127 . A G 1930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=3.424;DP=145;FS=23.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,58:145:99:1959,0,4019 +chr13 1041501 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr13 1041879 . G GT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,187 +chr13 1041883 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.818;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,187 +chr13 1041961 . C G 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.262;DP=73;FS=9.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,48:73:99:1710,0,865 +chr13 1080945 . A T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.642;DP=30;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:424,0,584 +chr13 1083124 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.16;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:305,0,102 +chr13 1084483 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:274,0,182 +chr13 1086996 . A G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.099;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:614,0,723 +chr13 1087286 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.884;DP=39;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:273,0,1102 +chr13 1177421 . A T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.367;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:491,0,684 +chr13 1178878 . T TA 390.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53:508,53,0 +chr13 1179134 . A G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.572;DP=42;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:776,0,607 +chr13 1179269 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.509;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:358,0,757 +chr13 1179710 . C A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.390;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=7.97;ReadPosRankSum=-2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:650,0,1994 +chr13 1179954 . CT C 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.126;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:390,0,894 +chr13 1269310 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:265,0,109 +chr13 1288026 . C A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-2.423;DP=67;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:584,0,1667 +chr13 1397358 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.866;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:456,0,889 +chr13 1412032 . GAGGTCTGCTCTTCCCCAGATTCGTTTTTTTTTTTTATGCCTAAAAAGCGTTTAAATGTTGTAAACCTGACCCTTGATGTGCAATCTAGATCCTAAAACAGAAAGTTTTGTATTATAGTAATGATCTGACCTCTCGTTCTGATGCATGC G 2641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=2.272;DP=76;FS=2.261;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=34.76;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,68:71:99:2679,198,0 +chr13 1465952 . A G 2045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.360;DP=80;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,58:75:99:2074,0,304 +chr13 1508933 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-0.355;DP=95;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:518,0,2627 +chr13 1523854 . C T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=3.142;DP=182;FS=11.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,41:182:99:819,0,5338 +chr13 1555280 . C G 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-2.444;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1110,0,1294 +chr13 1563195 . A T 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.621;DP=143;FS=5.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,41:142:99:925,0,3811 +chr13 1565723 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=1.010;DP=116;FS=5.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=5.99;ReadPosRankSum=3.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,26:116:99:723,0,7480 +chr13 1565729 . C T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=1.269;DP=124;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:722,0,7441 +chr13 1574261 . G C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,439 +chr13 1657148 . TA T 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.314;DP=81;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1390,0,435 +chr13 1657321 . GT G 353.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:391,39,0 +chr13 1951697 . C A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.475;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:431,0,247 +chr13 1969875 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:247,0,97 +chr13 1971384 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=-0.533;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:395,0,322 +chr13 2034193 . TA T 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.889;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:583,0,269 +chr13 2034500 . TA T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.565;DP=63;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:273,0,1221 +chr13 2087967 . T C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.034;DP=60;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:813,0,1177 +chr13 2088062 . GT G 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.280;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=7.23;ReadPosRankSum=-3.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:507,0,918 +chr13 2088101 . C T 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.028;DP=73;FS=8.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=17.28;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1290,0,1294 +chr13 2127233 . T A 6055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-1.482;DP=337;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,175:337:99:6084,0,8147 +chr13 2127860 . T A 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.116;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:343,0,1277 +chr13 2128582 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=5.292;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=4.68;ReadPosRankSum=-4.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:281,0,12929 +chr13 2128583 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=5.292;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.68;ReadPosRankSum=-4.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:281,0,12929 +chr13 2128600 . TTTTGAAAA T 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.386;ClippingRankSum=5.403;DP=58;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:281,0,12929 +chr13 2128610 . TACTAA T 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=5.403;DP=58;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=4.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:281,0,12929 +chr13 2128782 . C T 5080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.260;DP=121;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,93:119:99:5109,0,355 +chr13 2129955 . AT A 2295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.047;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=27.01;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:2333,230,0 +chr13 2130804 . A G 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=1.188;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1388,0,742 +chr13 2131886 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.613;DP=39;FS=15.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:266,0,1120 +chr13 2132702 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=-0.149;DP=59;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:759,0,2144 +chr13 2171923 . G T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-0.570;DP=38;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:430,0,1014 +chr13 2201684 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.493;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.464;QD=26.93;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:513,0,159 +chr13 2207453 . GT G,GTT 508.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.619;DP=42;FS=3.757;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,9,23:33:99:684,512,676,229,0,258 +chr13 2209029 . C A 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.774;DP=114;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1980,0,1572 +chr13 2209115 . TCTGCTGGGAGAACACAAGCAGACCACTGAGAGAGGAGCAGTAAACACACACACAAAACACAGCACTGGCTGAGGAATGTGGGATGAAGTCATACAGGCAAACAGAC T 4417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=3.105;DP=125;FS=6.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,107:125:99:4455,0,5534 +chr13 2251809 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=23.63;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:359,0,116 +chr13 2373784 . G GATCTTTCGAGGCTTTTTTAAGA 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-0.929;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=12.69;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:380,0,405 +chr13 2374041 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.55;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:330,0,162 +chr13 2374720 . C A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.330;DP=112;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,30:112:99:667,0,3773 +chr13 2374738 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-3.578;DP=93;FS=10.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:603,0,2835 +chr13 2398786 . G T 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.451;DP=77;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:661,0,1976 +chr13 2424816 . TC T 745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:783,55,0 +chr13 2541907 . G C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=1.031;DP=33;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:238,0,939 +chr13 2796533 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.535;DP=36;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:492,0,780 +chr13 2796832 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:266,0,388 +chr13 2798072 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-1.867;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=22.13;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:338,0,165 +chr13 2798092 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.680;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=25.24;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:432,0,165 +chr13 2975666 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-0.478;DP=107;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=5.54;ReadPosRankSum=2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,28:107:99:621,0,2911 +chr13 3481551 . A T 759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:788,54,0 +chr13 3482195 . T G 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:336,24,0 +chr13 3482449 . G T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=3.056;DP=36;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=8.13;ReadPosRankSum=-2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:321,0,1958 +chr13 3482659 . G T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=1.309;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:505,0,927 +chr13 3483340 . G C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=3.031;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=14.52;ReadPosRankSum=-2.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:275,0,327 +chr13 3484226 . T G 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr13 3486099 . T C 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 +chr13 3486285 . C G 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:434,33,0 +chr13 3486668 . C T 989.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:69:1018,69,0 +chr13 3490088 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:99:254,0,379 +chr13 3490779 . C A 1961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=-1.733;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=33.20;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1990,136,0 +chr13 3491838 . C T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.220;DP=61;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,40:61:99:1369,0,700 +chr13 3492262 . C A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=3.987;DP=63;FS=5.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:761,0,1460 +chr13 3492286 . A T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=3.620;DP=66;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.66;ReadPosRankSum=-3.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:732,0,1559 +chr13 3492509 . T A 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.111;DP=75;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:1404,0,2538 +chr13 3492512 . G GA 1335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.905;DP=78;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:1373,0,2538 +chr13 3492636 . GA G 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=1.191;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:472,0,358 +chr13 3525657 . T C 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.707;DP=45;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:633,0,942 +chr13 3525979 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-2.435;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:260,0,355 +chr13 3528689 . T C 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-1.712;DP=34;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:781,0,332 +chr13 3528876 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.219;DP=36;FS=5.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:581,0,391 +chr13 3529193 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=-1.354;DP=45;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:637,0,1224 +chr13 3571914 . T A 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:241,0,24 +chr13 3573991 . G T 2496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.235;DP=185;FS=5.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=13.50;ReadPosRankSum=-6.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,65:185:99:2525,0,6193 +chr13 3574027 . C T 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-0.642;DP=141;FS=10.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,42:141:99:1048,0,3973 +chr13 3575124 . A T 6016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.656;DP=298;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,182:296:99:6054,0,3756 +chr13 3580746 . T A 2335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=-4.830;DP=181;FS=18.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=12.90;ReadPosRankSum=3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,65:181:99:2364,0,8867 +chr13 3605296 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.894;DP=54;FS=5.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:565,0,3141 +chr13 3611370 . A C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=29.29;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:409,0,52 +chr13 3619508 . C A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=1.866;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,134 +chr13 3619578 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:363,0,56 +chr13 3634817 . G GA 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.262;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:49:389,0,49 +chr13 3635631 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,301 +chr13 3635694 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:314,0,248 +chr13 3635732 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,482 +chr13 3635858 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:237,0,378 +chr13 3636591 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-3.486;DP=30;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=12.36;ReadPosRankSum=2.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:399,0,680 +chr13 3886236 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-1.517;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:268,0,1423 +chr13 3886340 . A G 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.274;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=17.19;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:905,0,872 +chr13 3886453 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=1.717;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:309,0,1178 +chr13 3965548 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-2.241;DP=101;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=2.59;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:290,0,3181 +chr13 3972391 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.554;DP=85;FS=5.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:400,0,2511 +chr13 3993569 . G GA 200.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:43:348,43,0 +chr13 3999029 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-1.291;DP=115;FS=6.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:401,0,3579 +chr13 4053655 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.703;DP=69;FS=5.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:394,0,2409 +chr13 4053795 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.410;DP=62;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=3.45;ReadPosRankSum=-1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:242,0,2685 +chr13 4053994 . A T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.093;DP=48;FS=8.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:801,0,1291 +chr13 4054475 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=3.927;DP=43;FS=7.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:374,0,1075 +chr13 4054525 . C A 1179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1208,87,0 +chr13 4061521 . T A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-0.576;DP=50;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:634,0,1157 +chr13 4265594 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.367;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:342,0,808 +chr13 4326644 . A T 4272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-2.885;DP=360;FS=0.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,129:357:99:4301,0,9328 +chr13 4337208 . G C 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,15:15:99:831,0,439 +chr13 4337908 . T G 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr13 4369370 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.386;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:276,0,1501 +chr13 4370080 . CT C 615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:64:653,64,0 +chr13 4370619 . G T 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 +chr13 4372214 . G GA 391.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:428,0,7 +chr13 4375260 . GT G 306.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-1.737;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:8:343,8,0 +chr13 4375376 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=33.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:231,0,325 +chr13 4645995 . A G 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.531;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=28.79;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:1167,0,113 +chr13 4645996 . A G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.063;DP=17;FS=7.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=30.53;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:714,0,259 +chr13 4655331 . AGTAGCGGGTGGTGTTTTCGTAGCGGGTGGTGTTTTC A 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.124;DP=44;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=10.83;ReadPosRankSum=-3.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:514,0,1633 +chr13 4655923 . T G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-1.517;DP=23;FS=15.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:430,0,632 +chr13 4662997 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.976;DP=83;FS=3.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:305,0,6576 +chr13 4677176 . TA T 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.382;DP=116;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:300,0,2792 +chr13 4702599 . CGTAAGTGCCCATGTTTGTTCCTCTTCTTGCTCTGTT C 808.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=373;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:99:846,369,0 +chr13 4705565 . TA T 996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=1.032;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:1034,0,1051 +chr13 4706549 . A G 216.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:245,0,18 +chr13 4753551 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-1.146;DP=44;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.34;ReadPosRankSum=2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:307,0,2229 +chr13 4921853 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,143 +chr13 5141405 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,455 +chr13 5167380 . CT C 966.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-1.519;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,62:214:99:1004,0,4106 +chr13 5167604 . TA T 3484.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=2.096;DP=266;FS=9.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=13.10;ReadPosRankSum=-2.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,139:249:99:3522,0,1973 +chr13 5168069 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:245,0,107 +chr13 5170129 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:266,0,350 +chr13 5170227 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.215;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:403,0,408 +chr13 5227848 . T C 1775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-0.963;DP=434;FS=1.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:336,97:433:99:1804,0,12127 +chr13 5227860 . G A 1778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.268;DP=421;FS=1.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:328,93:421:99:1807,0,12396 +chr13 5248866 . C CT 394.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:432,42,0 +chr13 5542099 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:42:413,0,42 +chr13 5543048 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-0.573;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=17.12;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:559,0,537 +chr13 5543878 . G C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=1.085;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:361,0,460 +chr13 5544389 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.181;DP=45;FS=5.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:423,0,1164 +chr13 5545441 . A T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.010;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:597,0,1213 +chr13 5548253 . T TA 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.424;DP=21;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:278,0,277 +chr13 5548371 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-1.372;DP=51;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:772,0,1684 +chr13 5549284 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.094;DP=63;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:663,0,1346 +chr13 5549521 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.592;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:478,0,2832 +chr13 5613912 . C CT 978.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.004;DP=98;FS=2.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1016,0,1004 +chr13 5624002 . A T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-0.514;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:775,0,1107 +chr13 5627390 . T A 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.740;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:310,0,212 +chr13 5667934 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.81;ReadPosRankSum=-1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:230,0,429 +chr13 5753183 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.827;DP=93;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:450,0,2661 +chr13 5754260 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-1.119;DP=308;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,47:308:99:425,0,9773 +chr13 5754284 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.219;DP=299;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,49:299:99:608,0,9528 +chr13 5754446 . G T 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.786;DP=251;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,66:248:99:1300,0,8501 +chr13 5754449 . G T 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.173;DP=250;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,49:248:99:797,0,9901 +chr13 5754749 . G A 1464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.655;DP=250;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,66:249:99:1493,0,6752 +chr13 5755278 . G T 3190.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.949;DP=264;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,85:264:99:3219,0,13112 +chr13 5755281 . A C 3190.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=1.151;DP=268;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=11.91;ReadPosRankSum=-2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,90:268:99:3219,0,13121 +chr13 5755393 . TCCTGCCAAATCCAATGAACGAGCGAGTTAGAACATTAATAATAAAGTCAACTCATACGACACCTAAATTGCTTATCATATTTATTAAACAGAACAAAAACTTA T 12684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.830;DP=283;FS=1.817;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,277:282:99:12722,1111,0 +chr13 5755522 . C A 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-1.454;DP=238;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,53:237:99:1026,0,9898 +chr13 5757860 . TCTGTGAACAGTTTGACGTTAGAGTTGCATCACTGCATCATAAGAATAAGCTGGTCTGAATTGCACTCCCATTTAACGTTAC T 12249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=1.951;DP=317;FS=4.254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=28.72;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,271:276:99:12287,971,0 +chr13 5801573 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,334 +chr13 5802070 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:330,0,356 +chr13 5872359 . C T 9529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.381;DP=204;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=24.37;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,70:204:99:9558,0,4886 +chr13 5872570 . A T 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.108;DP=246;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,89:245:99:1663,0,11746 +chr13 5876773 . C T 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-3.418;DP=208;FS=23.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,53:207:99:1220,0,5695 +chr13 5877101 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=1.671;DP=340;FS=0.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,65:340:99:1063,0,10579 +chr13 5882358 . A C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.269;DP=195;FS=10.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,44:195:99:879,0,5893 +chr13 5914359 . G A 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.438;DP=92;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:1017,0,2160 +chr13 5915790 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.112;DP=163;FS=4.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:579,0,4794 +chr13 5915891 . C T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=0.438;DP=139;FS=5.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,30:139:99:584,0,7344 +chr13 5916048 . T C 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=1.023;DP=104;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:1488,0,1977 +chr13 5916190 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-2.563;DP=112;FS=7.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:563,0,3758 +chr13 5917047 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=9.95;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:267,0,727 +chr13 5917154 . GA G 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.189;DP=23;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:244,0,254 +chr13 5918799 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-2.262;DP=14;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:302,0,97 +chr13 6278840 . A G 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.492;DP=30;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=27.89;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:865,0,217 +chr13 6278860 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.586;DP=36;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:282,0,1051 +chr13 6279156 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=32.91;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:456,0,117 +chr13 6279170 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:352,0,310 +chr13 6279937 . CT C 896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.984;DP=51;FS=7.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:934,0,307 +chr13 6321956 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=1.208;DP=32;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:522,0,523 +chr13 6323536 . G C 217.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:246,0,20 +chr13 6324889 . C G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=-0.312;DP=48;FS=5.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:780,0,983 +chr13 6326005 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,226 +chr13 6330869 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=1.598;DP=192;FS=69.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,39:192:99:694,0,5767 +chr13 6331094 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=-1.047;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.236;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:331,0,529 +chr13 6341186 . A G 6259.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:6288,471,0 +chr13 6341241 . GCTACAAAAACATCAATGCAGCGCATCACAAATCTCTCAAAACGACAATAATGGGCAGACCGTTACGCTGCGGGTGTGCTTTCTGGATTCCTAC G 6422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=1.366;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=30.52;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:6460,569,0 +chr13 6471047 . G A 1630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.118;DP=127;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:1659,0,2491 +chr13 6471100 . G A 3838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=-0.127;DP=286;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,111:285:99:3867,0,5775 +chr13 6471380 . G T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 +chr13 6473945 . CAGGTAGGAATCCAGAAAGCACACCCGCAGCGTAACGCTCTGCCCATTATTGTCATTTTGAGAGATTTGTGATGCGCTGCATTGATGTTTTTGT C 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=2.123;DP=16;FS=5.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=31.42;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:540,0,1267 +chr13 6474090 . A G 1233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1262,96,0 +chr13 6478477 . G T 1795.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1824,138,0 +chr13 6482117 . T G 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.405;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:934,0,1172 +chr13 6484296 . T C 1825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1854,132,0 +chr13 6484412 . CAG C 2907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.409;DP=168;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:2945,0,2490 +chr13 6487520 . A T 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 +chr13 6490534 . C A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:746,51,0 +chr13 6490945 . C T 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:415,33,0 +chr13 6491099 . G C 912.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.427;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=33.80;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:3:939,0,3 +chr13 6491184 . C A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=2.188;DP=19;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=23.20;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:469,0,566 +chr13 6491190 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=2.110;DP=23;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=19.16;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:469,0,566 +chr13 6494437 . A G 706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:735,57,0 +chr13 6517566 . T C 1576.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1605,117,0 +chr13 6525227 . C A 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.897;DP=47;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=28.63;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,37:47:99:1374,0,187 +chr13 6540032 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.558;DP=56;FS=12.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:338,0,1614 +chr13 6547151 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-1.252;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:322,0,1917 +chr13 7093503 . G T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:238,0,59 +chr13 7139832 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-2.353;DP=25;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:280,0,680 +chr13 7270815 . G C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-0.121;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:602,0,896 +chr13 7457340 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,445 +chr13 7458311 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=-0.298;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,502 +chr13 7462272 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.338;DP=35;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:309,0,1970 +chr13 7464905 . A G 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.553;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:549,0,359 +chr13 7465091 . A C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.401;DP=22;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:324,0,673 +chr13 7465435 . G T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.298;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:723,0,335 +chr13 7466096 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.601;DP=23;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:455,0,326 +chr13 7466149 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-1.132;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:319,0,974 +chr13 7532709 . T G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.311;DP=14;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:427,0,90 +chr13 7533937 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:313,0,598 +chr13 7533971 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-1.034;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:412,0,801 +chr13 7534274 . T C 254.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:283,0,14 +chr13 7534440 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=29.89;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:357,0,48 +chr13 7574532 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:404,0,404 +chr13 7593219 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.212;DP=25;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=25.91;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:676,0,190 +chr13 7623608 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-2.044;DP=82;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:415,0,2461 +chr13 7633562 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=-0.646;DP=93;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:613,0,2576 +chr13 7648955 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.683;DP=80;FS=3.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:443,0,2242 +chr13 7670149 . T A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=1.763;DP=31;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:900,0,600 +chr13 7670153 . G A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=1.153;DP=33;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:900,0,594 +chr13 7678813 . G T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.880;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:772,0,792 +chr13 7684347 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=-0.010;DP=55;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:271,0,1623 +chr13 7687531 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr13 7703506 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.507;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:491,0,716 +chr13 7703824 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.210;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:276,0,2149 +chr13 7703833 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.557;DP=39;FS=3.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:265,0,2149 +chr13 7711618 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-1.273;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:686,0,1050 +chr13 7711698 . A T 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=-1.525;DP=53;FS=5.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1148,0,756 +chr13 7739943 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-1.269;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:309,0,431 +chr13 7741009 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:372,0,51 +chr13 7765675 . AACCTGACAGAACAACCATTATCTTATGAGTTACACCAGATCTGACTTCAGGTTAGCACTTATTTTAAAGGAGAAGTTATTG A 1002.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-0.052;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:88:1040,88,0 +chr13 7985839 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.434;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=26.16;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:630,0,197 +chr13 8049072 . G GT 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.072;DP=88;FS=5.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:345,0,3175 +chr13 8143139 . C T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.246;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:588,0,694 +chr13 8143470 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.586;DP=35;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:317,0,920 +chr13 8146269 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,127 +chr13 8208491 . ACAGGTTTGTTCTTCCTTCAGAGTTTATAAGGTCTCGTTTTCCAAACGCAACTTCTAATTTAACATGTCCTTCTATTG A 15076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-2.249;DP=416;FS=2.859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=29.29;ReadPosRankSum=2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,379:385:99:15114,147,0 +chr13 8274370 . G T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=1.571;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:555,0,121 +chr13 8291697 . A T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.913;DP=18;FS=7.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=31.93;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:32:603,0,32 +chr13 8307799 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:347,0,176 +chr13 8327384 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=1.727;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:499,0,759 +chr13 8327394 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=1.741;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=22.42;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:499,0,759 +chr13 8334931 . C A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.099;DP=21;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:515,0,151 +chr13 8346329 . T A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:411,0,312 +chr13 8347926 . T A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.763;DP=36;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:803,0,750 +chr13 8347993 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:316,0,334 +chr13 8347996 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:316,0,334 +chr13 8348444 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,272 +chr13 8348693 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,178 +chr13 8665238 . C G 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.490;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1124,0,1340 +chr13 8665476 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.698;DP=78;FS=9.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:447,0,2361 +chr13 8665561 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-0.305;DP=32;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=8.02;ReadPosRankSum=-3.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:285,0,847 +chr13 8683803 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:350,0,124 +chr13 8705755 . A C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-1.317;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:766,0,731 +chr13 8705937 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=-0.490;DP=42;FS=9.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:365,0,1103 +chr13 8710267 . CACTGTTTTACAGAGACAAATAGTTTTCAATAGCTTAAAATGAGTTCAAATCACACCAATGGTTGGAAGAACACTTTTAGAAAACCAAGCAGGTCACTTA C 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.040;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:385,0,3335 +chr13 8710442 . TCTGTTTAGGGGTGAAAGAGACATTAAGACTGAGGTGTTTTTGGGGTAAATGGTTATGTACCATGATTGCTGGGATATGTGTGTGCGCCTTAC T 4773.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.723;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=32.17;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,103:105:99:4811,431,0 +chr13 8723761 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-1.748;DP=62;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1243,0,918 +chr13 8739816 . G A 1425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.139;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=32.79;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1454,102,0 +chr13 8741402 . A G 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.903;DP=23;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.115;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:549,0,237 +chr13 8750353 . T A 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.373;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=16.46;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:802,0,1046 +chr13 8750661 . A T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-1.615;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:806,0,698 +chr13 8760073 . A G 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=-1.293;DP=51;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=25.03;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1305,0,203 +chr13 8760967 . A T 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=3.464;DP=38;FS=12.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=29.89;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:1164,0,2139 +chr13 8768760 . G GT 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr13 8802647 . A G 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr13 8835767 . G T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr13 8920040 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=-0.711;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:419,0,577 +chr13 8920974 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.53;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,105 +chr13 8921218 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=11.04;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,444 +chr13 8946938 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:262,0,131 +chr13 8947022 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,242 +chr13 8988774 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.983;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:291,0,2172 +chr13 8988784 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.257;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:291,0,2172 +chr13 9011782 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=2.716;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:230,0,433 +chr13 9021570 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=1.361;DP=39;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:490,0,874 +chr13 9120331 . C A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 +chr13 9120395 . T A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 +chr13 9213335 . T C 10895.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,259:259:99:10924,780,0 +chr13 9221082 . GT G,GTT 869.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.023;DP=51;FS=6.532;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,18,26:47:99:938,557,782,424,0,561 +chr13 9221941 . A C 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.182;DP=61;FS=3.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,27:61:99:986,0,1932 +chr13 9221961 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-0.636;DP=38;FS=8.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:986,0,1922 +chr13 9244402 . TCTGAGTTAGAAAATAAACGCATCATTTATGGTTGACTTAAAAATAAACAATATACTGTAAATTAATCTTCCAAAC T 1213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-0.271;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=30.34;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:99:1517,0,226 +chr13 9798167 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-0.673;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:349,0,472 +chr13 9824136 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-0.199;DP=67;FS=3.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:522,0,1813 +chr13 10249054 . T TC 459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.899;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:497,0,749 +chr13 10249144 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-1.047;DP=41;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:246,0,2673 +chr13 10249158 . T G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-2.388;DP=44;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:248,0,2673 +chr13 10258037 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-1.255;DP=49;FS=6.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:577,0,1097 +chr13 10375338 . C T 1504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=-0.685;DP=174;FS=11.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1533,0,4197 +chr13 10460946 . A G 885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.315;DP=107;FS=0.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,34:107:99:923,0,2771 +chr13 10547935 . A T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:577,39,0 +chr13 10547937 . A C 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:577,39,0 +chr13 10548645 . A T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-1.721;DP=51;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:281,0,1450 +chr13 10552699 . TTTCCTAAATG T 1652.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.679;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:1690,0,5017 +chr13 10552701 . TCCTAAATGGTACAGAGTAATTAGGAAAATGTACAAGTCAAAAATATTCACAATAAGGCATTCATCATTAATGAACTCA T 1734.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.895;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1772,0,5510 +chr13 10552711 . TACAGAGTAATTAGGAAAATGTACAAGTCAAAAATATTCACAATAAGGCATTCATCATTAATGAACTCA T 1652.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.700;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:1690,0,5563 +chr13 10567431 . G A 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.439;DP=85;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:732,0,4418 +chr13 10567455 . T C 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=1.999;DP=87;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:991,0,1735 +chr13 10567833 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.210;DP=125;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:377,0,3793 +chr13 10568220 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.626;DP=154;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:451,0,4767 +chr13 10568299 . T G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.835;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,25:145:99:356,0,4571 +chr13 10572299 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.485;DP=120;FS=4.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:459,0,3658 +chr13 10585726 . A T 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.639;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:926,0,1206 +chr13 10594757 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=-1.668;DP=97;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,24:97:99:551,0,2798 +chr13 10606307 . C T 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.645;DP=94;FS=2.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,30:94:99:836,0,2454 +chr13 10950926 . C G 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr13 11157775 . T C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.327;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,31:115:99:773,0,3248 +chr13 11158027 . T A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-1.592;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:719,0,618 +chr13 11158660 . G GA 765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.012;DP=160;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,46:136:99:803,0,2317 +chr13 11158799 . T C 2407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-0.699;DP=107;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=22.50;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:2436,0,2300 +chr13 11158897 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.148;DP=124;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,31:124:99:288,0,6217 +chr13 11159296 . G GTT 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=-1.502;DP=95;FS=3.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:1003,0,1840 +chr13 11159618 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.802;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:910,0,3985 +chr13 11160285 . T TA 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=-1.312;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:492,0,1125 +chr13 11203583 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.098;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=18.21;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:520,0,421 +chr13 11203996 . C A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.191;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:419,0,684 +chr13 11204199 . A T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.454;DP=79;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:531,0,1981 +chr13 11204254 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.277;DP=66;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:376,0,1993 +chr13 11205180 . G T 385.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:414,13,0 +chr13 11206112 . G GA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.190;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:415,0,3540 +chr13 11206115 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.426;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:415,0,3540 +chr13 11299778 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.234;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:381,0,814 +chr13 11304119 . T C 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-2.527;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:550,0,800 +chr13 11304198 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.355;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=10.64;ReadPosRankSum=-2.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:273,0,523 +chr13 11325850 . T C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-0.336;DP=60;FS=14.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:879,0,1139 +chr13 11330069 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.693;DP=35;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:339,0,1906 +chr13 11391128 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.767;DP=29;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.039;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:517,0,494 +chr13 11482846 . TA T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,240 +chr13 11482979 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.629;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:254,0,1005 +chr13 11624439 . GA G 301.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-1.240;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:15:339,15,0 +chr13 11625308 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.531;DP=69;FS=7.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:450,0,1860 +chr13 11730134 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=3.505;DP=81;FS=5.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=3.70;ReadPosRankSum=-3.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:328,0,6094 +chr13 11730140 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=3.351;DP=87;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:338,0,6094 +chr13 11739505 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.520;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:396,0,1044 +chr13 11739753 . C T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr13 11743268 . G A 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.206;DP=156;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,53:156:99:1815,0,3653 +chr13 11743938 . C CT 1478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-1.801;DP=159;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1516,0,1959 +chr13 11744050 . C A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=-1.761;DP=187;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=7.37;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,64:187:99:1406,0,6045 +chr13 11744585 . G GT 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=-0.050;DP=228;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,47:162:99:557,0,2815 +chr13 11744714 . A C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=2.482;DP=229;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,45:225:99:438,0,10530 +chr13 11745862 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:254,0,90 +chr13 11752075 . A AT 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.707;DP=38;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:449,0,984 +chr13 11756912 . C T 1171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=1.304;DP=206;FS=0.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,52:206:99:1200,0,6033 +chr13 11765269 . C A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.449;DP=75;FS=5.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:472,0,2029 +chr13 11770160 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=-0.149;DP=60;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:561,0,1425 +chr13 11770456 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.544;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:338,0,1091 +chr13 11772313 . T A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=1.179;DP=49;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:460,0,1235 +chr13 11841545 . C T 1875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.224;DP=158;FS=6.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,57:158:99:1904,0,3411 +chr13 11842249 . A G 2505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.117;DP=162;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:2534,0,3651 +chr13 11842321 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.923;DP=145;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,37:145:99:789,0,4870 +chr13 11842350 . G A 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.987;DP=160;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,40:160:99:898,0,5027 +chr13 11842397 . T C 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.309;DP=148;FS=1.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,39:148:99:830,0,4554 +chr13 11842518 . T A 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.587;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,45:153:99:1151,0,4255 +chr13 11842669 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.785;DP=134;FS=5.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,26:134:99:415,0,4380 +chr13 11842789 . T C 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.190;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:620,0,585 +chr13 12501570 . TG T 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-1.695;DP=251;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,65:217:99:1032,0,3768 +chr13 12502305 . A T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.420;DP=115;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=7.13;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,34:115:99:848,0,3393 +chr13 12502355 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.391;DP=47;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:337,0,1319 +chr13 12502632 . GCTGTAAGATAGGGGAAAAAATGTTATGATCTGACAGGATTAACTAAAAATATAACCAAAAAAACTTGATAAATGTAC G 11774.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-1.301;DP=281;FS=10.736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=39.26;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,267:270:99:11812,837,0 +chr13 12504846 . TCTGAGGTGAAAAACATTCACGTTCAGCATTTAAATGAGTATAGAAATGCAGTGTATGCGTGCGTGTTAGTTAGGGCTTAC T 7144.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.189;ClippingRankSum=0.921;DP=313;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=22.83;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,258:272:99:9877,0,1697 +chr13 12504848 . TGAGGTGAAAAACATTCACGTTCAGCATTTAAATGAGTATAGAAATGCAGTGTATGCGTGCGTGTTAGTTAGGGCTTACC T 1030.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=2.455;DP=305;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,63:304:99:1068,0,12004 +chr13 12550543 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=-2.386;DP=65;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=4.30;ReadPosRankSum=4.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:308,0,2009 +chr13 12721195 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.216;DP=53;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:600,0,1241 +chr13 12735310 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.772;DP=44;FS=3.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:319,0,1080 +chr13 12752776 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-2.077;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:419,0,747 +chr13 12763378 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.327;DP=67;FS=5.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:452,0,1814 +chr13 12763423 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.238;DP=67;FS=5.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:376,0,1881 +chr13 12774369 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.661;DP=43;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:364,0,1069 +chr13 12780415 . A ACTCCG 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.825;DP=63;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:273,0,1892 +chr13 12824516 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=-2.230;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:440,0,1298 +chr13 12832220 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.249;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:368,0,2251 +chr13 12849637 . G T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.154;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1004,0,1675 +chr13 12854422 . TAA T 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.895;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:305,0,1058 +chr13 12854693 . G C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.577;DP=49;FS=2.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:318,0,2719 +chr13 12877862 . G T 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-0.560;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:1207,0,2262 +chr13 12885829 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.817;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.106;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:99:648,0,2936 +chr13 12895709 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.792;DP=87;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:314,0,4408 +chr13 12896599 . T C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=1.461;DP=120;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:591,0,3253 +chr13 12899829 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.951;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:469,0,2859 +chr13 12944406 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.044;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:751,0,1038 +chr13 12971068 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.197;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:402,0,405 +chr13 13083431 . A T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.365;DP=61;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:772,0,1774 +chr13 13083563 . AGC A 869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.073;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:64:907,64,0 +chr13 13083940 . T A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.407;DP=89;FS=1.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,29:89:99:1005,0,2187 +chr13 13084788 . G T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.619;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:521,0,1416 +chr13 13086826 . C T 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.703;DP=36;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:733,0,599 +chr13 13086950 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-1.665;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,25:87:99:616,0,2630 +chr13 13086963 . G T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.879;DP=90;FS=3.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:748,0,2589 +chr13 13087852 . G GT 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1262,134,0 +chr13 13097922 . A G 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-1.336;DP=101;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,31:101:99:831,0,2639 +chr13 13104601 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.709;DP=89;FS=7.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:692,0,2322 +chr13 13108639 . A G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.177;DP=61;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:536,0,1564 +chr13 13125022 . C G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=1.406;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:666,0,2773 +chr13 13561409 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.684;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:244,0,2625 +chr13 13565038 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.511;DP=131;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,30:130:99:638,0,3811 +chr13 13569474 . CGTGAGTTTCTCTACACTAACATGCAACTTCATTGCACGTTTTTCATTATCTTTTAATTGCTTTATTTCATTTTTTCACAATTTCCTTACGCAG C 2871.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.022;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=28.93;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,69:74:99:2909,0,674 +chr13 13592709 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=-2.671;DP=35;FS=10.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=13.68;ReadPosRankSum=-1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:507,0,1379 +chr13 13593484 . G T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 +chr13 13594133 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.857;DP=41;FS=10.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:380,0,1355 +chr13 13598456 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=3.731;DP=54;FS=16.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=11.13;ReadPosRankSum=-3.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:629,0,2414 +chr13 13599652 . T A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.156;DP=80;FS=17.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:380,0,2464 +chr13 13600214 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=-2.132;DP=117;FS=1.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=4.55;ReadPosRankSum=2.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:561,0,3387 +chr13 13803474 . G GTT 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=-1.315;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:882,0,1340 +chr13 13804022 . TAA T 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.055;DP=49;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:598,0,562 +chr13 13846373 . A G 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.136;DP=123;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,35:122:99:906,0,3293 +chr13 13849633 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.575;DP=120;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:749,0,3411 +chr13 13864155 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.734;ClippingRankSum=1.426;DP=79;FS=13.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:511,0,2341 +chr13 13867456 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.976;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:320,0,1186 +chr13 13928290 . C G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.100;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:366,0,1298 +chr13 13950016 . G C 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.900;DP=86;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:922,0,1930 +chr13 13963158 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-0.337;DP=52;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:563,0,1196 +chr13 14042752 . C T 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-2.037;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.52;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,321 +chr13 14043028 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.463;DP=43;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:347,0,1119 +chr13 15144995 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,414 +chr13 15291751 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:298,0,432 +chr13 15292176 . G C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:316,0,249 +chr13 15301194 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,177 +chr13 15380881 . C A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=1.158;DP=163;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,33:163:99:622,0,5262 +chr13 15382372 . G A 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=-3.630;DP=110;FS=80.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=14.25;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:1596,0,2020 +chr13 15382553 . A AT 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-1.866;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:454,0,743 +chr13 15383218 . A C 2556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=1.612;DP=109;FS=108.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=23.46;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,75:109:99:2585,0,915 +chr13 15383546 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.913;ClippingRankSum=6.180;DP=116;FS=14.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=2.66;ReadPosRankSum=-6.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,20:116:99:337,0,7549 +chr13 15383547 . A AT 1348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-3.568;DP=116;FS=7.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.63;ReadPosRankSum=3.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,67:104:99:1539,0,1543 +chr13 15383632 . A G 3056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.104;DP=166;FS=16.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,87:162:99:3085,0,2775 +chr13 15384564 . ATT A 3286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.642;ClippingRankSum=-1.237;DP=255;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,121:223:99:4041,0,2332 +chr13 15384885 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-1.257;DP=127;FS=30.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,21:126:99:281,0,4316 +chr13 15384991 . C T 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=-0.798;DP=213;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,52:213:99:1234,0,6819 +chr13 15548982 . T G 1758.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1787,126,0 +chr13 15549098 . G A 1263.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-1.570;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:17:1292,17,0 +chr13 15549389 . G T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.694;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:247,0,407 +chr13 15549454 . A G 4253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:4282,304,0 +chr13 15549515 . T C 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-0.366;DP=54;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:1384,0,977 +chr13 15549529 . C T 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.530;DP=58;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:1156,0,1986 +chr13 15549616 . C T 1718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-1.624;DP=50;FS=2.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=34.38;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1747,0,305 +chr13 15549680 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.953;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=32.63;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:99:746,0,1109 +chr13 15549733 . G T 2633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-2.341;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=27.50;ReadPosRankSum=2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:2662,0,125 +chr13 15549770 . G A 2633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=1.467;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=34.19;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,25:26:85:2662,0,85 +chr13 15549836 . A C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-3.303;DP=35;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:627,0,1594 +chr13 15549864 . G C 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,31:31:99:1577,0,239 +chr13 15549992 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.330;DP=34;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:320,0,948 +chr13 15550034 . A G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.842;DP=40;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:802,0,384 +chr13 15550136 . C T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=1.899;DP=52;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1124,0,819 +chr13 15550274 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.436;DP=56;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=29.03;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,42:55:99:1654,0,361 +chr13 15550345 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-1.115;DP=19;FS=18.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,789 +chr13 15550346 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=14.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.161;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:287,0,817 +chr13 15550403 . C T 478.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:3:505,3,0 +chr13 15550440 . A G 3638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.733;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=22.58;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:3667,259,0 +chr13 15550612 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=1.402;DP=51;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:731,0,954 +chr13 15717676 . C G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.646;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:277,0,822 +chr13 15796554 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-0.592;DP=153;FS=8.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,40:153:99:859,0,4128 +chr13 15860318 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=2.561;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:314,0,315 +chr13 15869185 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.890;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:282,0,426 +chr13 15869645 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.286;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:489,0,1249 +chr13 15869655 . T A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-0.769;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:489,0,1161 +chr13 15872450 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.716;DP=38;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:446,0,859 +chr13 16459088 . G A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.727;DP=69;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,28:69:99:983,0,1425 +chr13 16471874 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.710;DP=54;FS=8.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:425,0,1420 +chr13 16497476 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=-0.205;DP=58;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=7.63;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:471,0,3160 +chr13 16497484 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.715;DP=54;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:475,0,3160 +chr13 16544766 . C A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-1.143;DP=75;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:620,0,1887 +chr13 16920785 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=1.112;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:231,0,897 +chr13 16934868 . C T 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.296;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1085,0,961 +chr13 16937372 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-1.663;DP=60;FS=20.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=6.03;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:390,0,1880 +chr13 17147674 . T C 3430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3459,250,0 +chr13 17148299 . C CT 581.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.468;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:40:771,40,0 +chr13 17513895 . A T 327.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.71;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:11:355,0,11 +chr13 17730068 . T C 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.040;DP=96;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1691,0,1732 +chr13 17823843 . A C 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:751,54,0 +chr13 18082443 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.217;DP=44;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:472,0,731 +chr13 18095183 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.766;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:261,0,1833 +chr13 18102366 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=1.058;DP=48;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:391,0,2451 +chr13 18113337 . T G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.401;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:282,0,830 +chr13 18126033 . G A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.368;DP=51;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:864,0,822 +chr13 18132364 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.589;DP=69;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:233,0,2042 +chr13 18282484 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:249,0,50 +chr13 18284206 . A G 655.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.156;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=29.81;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:20:684,0,20 +chr13 18289769 . A G 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr13 18344523 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.725;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:229,0,386 +chr13 18347980 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=26.92;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:432,0,117 +chr13 18348617 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,429 +chr13 18389463 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,213 +chr13 18405866 . TAAGGTACTGTTTATATATAATATATGCTGCTAGAAATAACAGTTTTACTTGTTAGTCTATTACAGAGCTGCATTTGAATTCGTGAATTGTTCTTTATTA T 2553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.817;DP=81;FS=2.087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=31.53;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,77:81:99:2591,274,0 +chr13 18420216 . G A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-1.821;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,34:68:99:1097,0,1139 +chr13 18420267 . C G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.639;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:459,0,1956 +chr13 18552948 . TTGAAAATGGCTTCATTATTTTTTTTATTTGA T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:286,0,436 +chr13 18556576 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,303 +chr13 18556688 . A C 3755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=5.417;DP=224;FS=33.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,95:173:99:3784,0,668 +chr13 18558874 . C T 5896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-0.490;DP=292;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,158:291:99:5925,0,9009 +chr13 18673152 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:346,0,517 +chr13 18723098 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=-1.747;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=16.54;ReadPosRankSum=-2.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:359,0,339 +chr13 18729000 . G A 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.434;DP=68;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1328,0,1028 +chr13 18848594 . A C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.128;DP=51;FS=14.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:662,0,2233 +chr13 18848595 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-1.173;DP=51;FS=14.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:662,0,2237 +chr13 19351723 . C G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-0.078;DP=191;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,37:191:99:439,0,5048 +chr13 19362017 . A AT 2359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=-0.101;DP=278;FS=9.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,125:253:99:2397,0,2881 +chr13 19755610 . A G 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.317;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=22.45;ReadPosRankSum=-1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:567,0,272 +chr13 19757771 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.593;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:293,0,571 +chr13 19757813 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=1.045;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:415,0,540 +chr13 20350842 . C A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,175 +chr13 21777135 . GT G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.716;DP=63;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:242,0,1203 +chr13 21807961 . T TA 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.765;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:427,0,149 +chr13 21835404 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:433,30,0 +chr13 21915763 . T A 2474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=-1.069;DP=152;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:2503,0,2810 +chr13 21950865 . C G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=1.488;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:497,0,484 +chr13 21958063 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:233,0,237 +chr13 21961476 . A C 284.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:313,0,15 +chr13 21961592 . CA C 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.591;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:368,0,109 +chr13 21977414 . T C 1757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.863;DP=105;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.74;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1786,0,1687 +chr13 22006650 . C A 1737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.830;DP=112;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1766,0,1955 +chr13 22025705 . GA G 481.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:519,52,0 +chr13 22204890 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.775;DP=67;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:318,0,1958 +chr13 22347215 . C T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.126;DP=188;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,40:188:99:761,0,5622 +chr13 22381510 . GT G 2042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.710;DP=165;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,88:157:99:2080,0,1701 +chr13 22381795 . G GT 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.102;DP=162;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,54:161:99:1297,0,2755 +chr13 22382409 . G C 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.450;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,50:171:99:1232,0,7816 +chr13 22382511 . C G 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.873;DP=152;FS=0.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,36:152:99:809,0,4643 +chr13 22383423 . A C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-1.693;DP=119;FS=6.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:682,0,3516 +chr13 22397051 . G A 1216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.088;DP=86;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:1245,0,1724 +chr13 22401170 . G A 2620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-1.050;DP=137;FS=5.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=19.13;ReadPosRankSum=3.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:2649,0,1984 +chr13 22403536 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-1.015;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:365,0,2332 +chr13 22415075 . G A 4098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-1.849;DP=234;FS=11.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,119:234:99:4127,0,4181 +chr13 22415138 . G C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.213;DP=228;FS=6.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,47:226:99:784,0,6933 +chr13 22417409 . G A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.207;DP=191;FS=3.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.467;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,50:191:99:1142,0,5502 +chr13 22417526 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.586;DP=222;FS=0.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,52:222:99:1106,0,6530 +chr13 22417726 . C T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=1.151;DP=220;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,49:220:99:916,0,6614 +chr13 22457253 . C CT 711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.494;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:88:835,88,0 +chr13 22457278 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.273;DP=33;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:238,0,851 +chr13 22498065 . G T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.766;DP=72;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1209,0,1240 +chr13 22501930 . A C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=3.205;DP=66;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:317,0,1737 +chr13 22505567 . G A 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.010;DP=56;FS=9.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:938,0,1019 +chr13 22513379 . G C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.026;DP=55;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:794,0,1161 +chr13 22513485 . G A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.992;DP=49;FS=8.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:842,0,868 +chr13 22513604 . T A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.566;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:355,0,2194 +chr13 22514192 . G T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.690;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:559,0,126 +chr13 22620840 . GGGTGGGCCTAAATTCATTACTTTACGCTGGTTATCTTGACCTGCTTGGCCTGGAGATTTTTTAATTTTCGTGTTGGAGAGGTGTGAGTGTTACCTGCATTTTACACATTTTTTTCTTCTTCTTTTTTCA G 1924.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-3.641;DP=302;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=6.37;ReadPosRankSum=-6.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,76:285:99:1962,0,68488 +chr13 22621057 . C CT 621.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-1.279;DP=324;FS=6.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,63:299:99:659,0,6557 +chr13 22676427 . C G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:281,0,124 +chr13 22676446 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:242,0,173 +chr13 22682723 . GCTCATGCAGCAGCCTCCA G 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.950;ClippingRankSum=2.059;DP=166;FS=9.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=1.93;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,19:97:99:358,0,10017 +chr13 22683283 . C T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.221;DP=178;FS=14.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,49:178:99:1147,0,4662 +chr13 22685586 . C A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.213;DP=150;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,32:150:99:601,0,4634 +chr13 22691932 . T TA 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.658;DP=61;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:537,0,393 +chr13 22758663 . C CT 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.688;DP=68;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:459,0,813 +chr13 22759369 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=1.007;DP=135;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,26:135:99:477,0,4406 +chr13 22759766 . A T 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.679;DP=97;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1554,0,1829 +chr13 22760673 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.037;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:526,0,1216 +chr13 22761976 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.217;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:542,0,543 +chr13 22807314 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=-2.325;DP=85;FS=25.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=4.99;ReadPosRankSum=-6.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:452,0,2355 +chr13 22812684 . G A 5378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.282;DP=182;FS=2.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=29.55;ReadPosRankSum=2.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,140:182:99:5407,0,1709 +chr13 22816130 . C CT 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=-2.767;DP=541;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:427,105:532:99:553,0,11263 +chr13 22818062 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=-0.079;DP=451;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:383,68:451:99:430,0,16144 +chr13 22819440 . TAA T 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=-1.122;DP=44;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:583,0,889 +chr13 22827077 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.020;DP=236;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=1.71;ReadPosRankSum=3.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,37:236:99:432,0,7643 +chr13 22839135 . T TA 682.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.444;DP=186;FS=9.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,50:181:99:720,0,3585 +chr13 22873238 . C T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-0.440;DP=62;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=15.00;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:958,0,1163 +chr13 22880086 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr13 22884622 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.284;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:704,0,100 +chr13 22969600 . G T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.419;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,884 +chr13 22971309 . A G 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=-0.375;DP=63;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:749,0,1333 +chr13 22973931 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.435;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:291,0,971 +chr13 22980175 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.033;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:368,0,404 +chr13 22986582 . TCCTGCAAGTAAAAAAAGCACAAAACTCAGTGAATTCAGACCAAAACCAACATACTGTACAGTATTAGTTTTGTGTCTACAAGATGTGTTTTTGTCATA T 2317.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=2.212;DP=59;FS=2.490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,55:58:99:2355,206,0 +chr13 22997286 . GCCTGACAATGCAAAATACTGAGAACAGCATCAACAAAAAATAACTCAACTGTTGTCATGCTTAAACTTGGCAGGTA G 1148.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=1.481;DP=33;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=34.81;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:99:1186,0,1303 +chr13 22997390 . GTTCCTGGAA G 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=32.15;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:52:560,0,52 +chr13 22997401 . TAAATCAGCATGTTCAGACCAAAGCTGGCTACTTAGTTTTGAGAAACCGTATTAGTTTTATGTCTACAAGATGTATATTTGTCATA T 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=34.85;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:52:560,0,52 +chr13 23008734 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=-0.186;DP=48;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:432,0,1198 +chr13 23008764 . TGTAAGAAATTTGTTCAATTAAAAATGAAGCTGTAATTGCTGTTGTGTAAGTGTTTTTGGTTTGTCTTTTTCAG T 1406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-0.630;DP=44;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=31.97;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1444,0,3072 +chr13 23012162 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.142;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:259,0,1922 +chr13 23027963 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.134;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:391,0,1283 +chr13 23038323 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.492;DP=83;FS=7.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:355,0,2555 +chr13 23040852 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-2.087;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:495,0,2406 +chr13 23043174 . T G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=1.954;DP=54;FS=7.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:235,0,1566 +chr13 23065546 . TA T 641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:57:679,57,0 +chr13 23066077 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.103;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:331,0,1235 +chr13 23082107 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-0.283;DP=39;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:395,0,988 +chr13 23114137 . A T 2501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.252;DP=146;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:2530,0,2494 +chr13 23116264 . C A 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=-3.568;DP=144;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,35:144:99:790,0,4091 +chr13 23116441 . ACTAGAGGGAGGAAACACATTTTAGCCCGCGAACCTAACATATTCCTGACAGGATATTTTGGCTTTCAATGTGTCTGTTTTGCGAGATGAAAATGCTTCAATAC A 8961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=2.426;DP=217;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=28.35;ReadPosRankSum=-2.438 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,205:207:99:8999,661,0 +chr13 23118469 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.538;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,25:137:99:418,0,4249 +chr13 23123450 . C T 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.271;DP=190;FS=4.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,51:190:99:1223,0,5412 +chr13 23126008 . C G 3166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.556;DP=183;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,99:183:99:3195,0,3026 +chr13 23178071 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.692;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:351,0,407 +chr13 23182641 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.828;DP=27;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:546,0,311 +chr13 23199613 . G A 2693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.819;DP=119;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,78:119:99:2722,0,1351 +chr13 23202504 . T TATTTGG 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=-0.005;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:566,0,2104 +chr13 23397595 . A T 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 +chr13 23420117 . C T 2182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=-0.744;DP=75;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,59:75:99:2211,0,342 +chr13 23429908 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:324,0,240 +chr13 23444465 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-1.729;DP=129;FS=5.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,29:129:99:601,0,3857 +chr13 23855448 . CT C 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.746;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:353,0,197 +chr13 23856699 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=-1.271;DP=28;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=10.67;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:327,0,664 +chr13 23857417 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=1.943;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:293,0,366 +chr13 23858382 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.197;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:269,0,739 +chr13 23873979 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=-0.740;DP=38;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:265,0,1022 +chr13 23889161 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:345,0,373 +chr13 24121935 . T G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=4.327;DP=174;FS=20.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=2.00;ReadPosRankSum=-3.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,28:174:99:377,0,5862 +chr13 24220325 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-2.050;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:309,0,1596 +chr13 24294620 . C T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.716;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:595,0,1096 +chr13 24320327 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.524;DP=80;FS=5.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:330,0,2307 +chr13 24492353 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.788;DP=39;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:253,0,1103 +chr13 24508782 . A T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.602;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:427,0,559 +chr13 24514175 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.836;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:268,0,746 +chr13 24516799 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.283;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:246,0,958 +chr13 24517768 . TA T 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.119;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=11.49;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:359,0,205 +chr13 24593981 . T G 765.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:20:794,0,20 +chr13 24595788 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,600 +chr13 24596893 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.048;DP=58;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:302,0,1693 +chr13 24602723 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.310;DP=42;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:240,0,2425 +chr13 24602724 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.605;DP=42;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:240,0,2425 +chr13 24602787 . A C 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.485;DP=40;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.241;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1089,0,261 +chr13 24610140 . ACTGTGGCAGAAAGTTCACACAAGAAAGGTAAACTCACATACTGCCGTTTGTTCACCAAGAATGTAGAAAGACACAACAGCAAGTGTGCAGGTGACATTCATAC A 4793.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=1.261;DP=114;FS=6.101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=33.43;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,109:112:99:4831,386,0 +chr13 24659044 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.358;DP=283;FS=5.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=3.13;ReadPosRankSum=-1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,57:283:99:915,0,8695 +chr13 24659953 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=-2.086;DP=208;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=3.57;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,44:208:99:770,0,10063 +chr13 24743801 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.954;DP=24;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:452,0,969 +chr13 24743811 . G T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.684;DP=21;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:461,0,969 +chr13 24744391 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.312;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:419,0,1265 +chr13 24772038 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=1.545;DP=40;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:252,0,1114 +chr13 24779017 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 +chr13 24784391 . AT A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.306;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=24.81;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:21:459,21,0 +chr13 24805248 . T C 3614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=2.498;DP=205;FS=3.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=17.63;ReadPosRankSum=4.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,108:205:99:3643,0,11669 +chr13 24805391 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=1.330;DP=181;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,30:181:99:373,0,5814 +chr13 24805409 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=1.416;DP=198;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=2.42;ReadPosRankSum=3.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,34:198:99:507,0,6237 +chr13 24887515 . C A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.701;DP=48;FS=6.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:901,0,868 +chr13 24888028 . C CT 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.933;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:345,0,770 +chr13 24888376 . A AT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=1.330;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:326,0,510 +chr13 24925883 . G T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.040;DP=177;FS=7.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,32:177:99:332,0,7109 +chr13 24927383 . CA C 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.149;DP=65;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:343,0,928 +chr13 24927968 . C T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-1.028;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,46:219:99:848,0,6727 +chr13 24928265 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=1.044;DP=194;FS=2.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,29:194:99:272,0,6307 +chr13 24935668 . GCCTGCAAATGTTAACACAGAATTAAATAAATCAAAACTAAAACCTTATTAAAAAATAGCAATATAAAAAAAAATGATA G 7344.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=1.713;DP=180;FS=3.415;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:7382,613,0 +chr13 24936086 . A T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=-0.803;DP=161;FS=4.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,32:161:99:565,0,5063 +chr13 25095375 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.469;DP=106;FS=5.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:624,0,2815 +chr13 25109397 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=1.322;DP=43;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:263,0,1235 +chr13 25129671 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.139;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:263,0,1566 +chr13 25142704 . T A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.173;DP=136;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,34:136:99:812,0,4005 +chr13 25143888 . C CT 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=1.942;DP=115;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,22:114:99:349,0,3463 +chr13 25434347 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-0.152;DP=31;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:245,0,1634 +chr13 25436565 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-1.916;DP=143;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=1.73;ReadPosRankSum=2.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,23:143:99:276,0,4765 +chr13 25445194 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.236;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,20:120:99:238,0,3795 +chr13 25448820 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.761;DP=140;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,27:140:99:405,0,4427 +chr13 25628705 . G C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=1.584;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:381,0,349 +chr13 25674195 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=1.018;DP=96;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,16:96:99:241,0,3175 +chr13 25696059 . CA C 2866.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2904,277,0 +chr13 25696202 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-2.025;DP=213;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,40:213:99:678,0,6804 +chr13 25696302 . CA C 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=-0.889;DP=174;FS=2.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,42:142:99:759,0,1569 +chr13 25699640 . TCTGTTTAAAGAGAAAAGCATGAGTCACATGAGCGAGCATCGACACTAACAGTGTGAAAAGCCCAGTGCAGATGTAAAATGTAC T 16732.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.773;DP=357;FS=2.665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=29.95;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,333:344:99:16770,1183,0 +chr13 25701590 . C CT 919.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.937;DP=82;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:957,0,597 +chr13 25702713 . TA T 969.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=1.062;DP=83;FS=9.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.401;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1007,0,1028 +chr13 25795224 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.815;DP=61;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:294,0,1789 +chr13 25827753 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=1.227;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:229,0,978 +chr13 26060641 . G GA 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.303;DP=222;FS=2.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,38:195:99:321,0,4241 +chr13 27266674 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-0.362;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:258,0,851 +chr13 27266895 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=1.795;DP=34;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:296,0,1012 +chr13 27266935 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=3.261;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:426,0,1191 +chr13 27434727 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:328,0,306 +chr13 27477988 . A T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.261;DP=21;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:480,0,279 +chr13 27501241 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=3.038;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:464,0,361 +chr13 27512992 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:492,0,246 +chr13 27513131 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.205;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:470,0,478 +chr13 27536956 . G T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:454,0,370 +chr13 27537126 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-1.939;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:393,0,347 +chr13 27537200 . T A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=2.478;DP=45;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:714,0,871 +chr13 27537917 . A T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.956;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,853 +chr13 27538094 . T A 1768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.444;DP=42;FS=1.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,29:41:99:1797,0,273 +chr13 27545161 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-1.222;DP=30;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:243,0,775 +chr13 27857796 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:244,0,468 +chr13 27995497 . T G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.972;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:741,0,620 +chr13 28006370 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,333 +chr13 28175429 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,260 +chr13 28175485 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=1.399;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:481,0,225 +chr13 28233785 . G A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.255;DP=113;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.888;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:1734,0,2004 +chr13 28632675 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.085;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:396,0,91 +chr13 28648899 . C T 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.056;DP=77;FS=5.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:1219,0,1407 +chr13 28655807 . C A 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=2.003;DP=73;FS=1.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1304,0,1331 +chr13 28666352 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.964;DP=32;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:267,0,1761 +chr13 28666353 . A C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=1.197;DP=31;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:267,0,1761 +chr13 28736638 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.257;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:341,0,1888 +chr13 28819764 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-2.805;DP=67;FS=4.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:277,0,2470 +chr13 28819895 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.188;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:272,0,1947 +chr13 28820261 . C T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.627;DP=46;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=15.69;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:750,0,782 +chr13 28820744 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.190;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:664,0,617 +chr13 28822699 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:337,0,407 +chr13 28825934 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-0.425;DP=31;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=29.90;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:955,0,106 +chr13 28834143 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.577;DP=42;FS=2.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=22.28;ReadPosRankSum=2.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:964,0,508 +chr13 28873450 . A C 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.625;DP=54;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:774,0,1121 +chr13 28874346 . T TA 646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=-1.183;DP=64;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:684,0,2139 +chr13 28956038 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=27.44;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:82:385,0,82 +chr13 28956562 . T G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:88:436,0,88 +chr13 28967663 . C A 5328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-1.334;DP=292;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,157:292:99:5357,0,5005 +chr13 28968292 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-6.857;DP=211;FS=22.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,36:211:99:500,0,6981 +chr13 28968377 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=7.240;DP=200;FS=38.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,36:198:99:572,0,6494 +chr13 28968790 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.127;DP=299;FS=3.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,48:299:99:573,0,10200 +chr13 28968953 . A G 5363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=2.016;DP=176;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=30.48;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,145:176:99:5392,0,434 +chr13 28969082 . A G 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.023;DP=209;FS=2.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=3.95;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,45:209:99:853,0,7087 +chr13 28969090 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=1.197;DP=226;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,34:225:99:295,0,8168 +chr13 28969403 . T G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.222;DP=35;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:609,0,1285 +chr13 28969536 . C A 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.625;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=25.59;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,36:52:99:1359,0,439 +chr13 28969635 . G A 1546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-0.530;DP=61;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,41:61:99:1575,0,541 +chr13 28969951 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,141 +chr13 28978147 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.590;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:299,0,832 +chr13 28978160 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.810;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:332,0,966 +chr13 29043939 . G T 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-2.093;DP=39;FS=6.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:687,0,804 +chr13 29090015 . A T 3765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.774;DP=129;FS=10.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,83:128:99:3794,0,990 +chr13 29090673 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.604;DP=124;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:384,0,3633 +chr13 29448415 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-1.135;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:591,0,577 +chr13 29449157 . G A 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.939;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1188,0,328 +chr13 29450117 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=1.405;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:241,0,963 +chr13 29452887 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.898;DP=78;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=3.77;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:322,0,2399 +chr13 29453353 . T G 679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.535;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:717,0,826 +chr13 29478439 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:419,0,550 +chr13 29632841 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:392,0,180 +chr13 29641566 . TCTGCAGGAAAACATCCGTTTTTACTATAATAGAACTTGATATGAACATAAAATATAACATAAAGTATTACCTTAC T 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.764;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=34.52;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:33:555,0,33 +chr13 29645803 . TC T 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=-0.236;DP=49;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:391,0,918 +chr13 29646019 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-1.774;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=10.61;ReadPosRankSum=-2.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:251,0,433 +chr13 29994639 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=2.092;DP=85;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=3.66;ReadPosRankSum=-2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:339,0,2506 +chr13 29994925 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-1.875;DP=73;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:391,0,2103 +chr13 30026413 . GTT G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.584;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:420,0,130 +chr13 30176949 . C T 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=-2.911;DP=87;FS=28.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:1070,0,1937 +chr13 30203489 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=1.131;DP=156;FS=7.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=4.07;ReadPosRankSum=2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,34:156:99:663,0,4673 +chr13 30262660 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=1.797;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:99:456,0,2961 +chr13 30267046 . AGTGAGTCGATGCTTTTACTTTTCTTCTCTAAATGTACAGTTGTTTATTTTCTGCTTTCTTTTCTCTGAGCAAACACTTTGGTTTACCGTTTCAG A 4833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.191;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,103:106:99:4871,449,0 +chr13 30357109 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-1.867;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:260,0,1701 +chr13 30391580 . G A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-1.814;DP=291;FS=0.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,55:291:99:862,0,9207 +chr13 30391767 . C T 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=-0.249;DP=291;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,59:291:99:1119,0,9120 +chr13 30392276 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.501;DP=214;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,41:210:99:282,0,6979 +chr13 30782668 . A C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.786;DP=115;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,20:115:99:293,0,3538 +chr13 30785322 . C A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-0.273;DP=200;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,42:199:99:804,0,5751 +chr13 30788759 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-2.031;DP=120;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,22:120:99:280,0,3621 +chr13 30794017 . GA G 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.037;DP=108;FS=2.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,21:100:99:293,0,1921 +chr13 30805069 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=2.512;DP=39;FS=3.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:311,0,1112 +chr13 31102244 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-2.321;DP=55;FS=4.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:415,0,1450 +chr13 31124110 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-0.339;DP=50;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:383,0,1320 +chr13 31234256 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=1.981;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:251,0,460 +chr13 31369462 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=25.63;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:387,0,449 +chr13 31371675 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.461;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:245,0,1772 +chr13 31512736 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=1.225;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:308,0,2689 +chr13 31513375 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-0.170;DP=56;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:262,0,1735 +chr13 31575648 . G T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.019;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,34:159:99:678,0,4743 +chr13 31603844 . A G 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.934;DP=140;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:99:679,0,5416 +chr13 31603851 . T A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=1.146;DP=132;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:398,0,5271 +chr13 31603854 . T A 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=123;FS=2.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1596,0,3621 +chr13 31603889 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.315;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:381,0,6288 +chr13 31604010 . T A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.602;DP=57;FS=9.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=32.07;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1856,0,853 +chr13 31604018 . A T 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.626;DP=58;FS=14.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,40:56:99:1856,0,868 +chr13 31604150 . C A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-1.678;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:332,0,337 +chr13 31652855 . GACCTGATAAGAGAAAGCCATGAGAGTGGAAGGATCTACAAAATCTGGAATCTACAAATAGAAAAGACGCTGGACTA G 14510.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=2.437;DP=358;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=32.57;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,344:354:99:14548,1132,0 +chr13 31679232 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.896;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,36:205:99:484,0,6584 +chr13 31679259 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-1.466;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.001;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,36:219:99:452,0,6986 +chr13 31679442 . T G 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=-0.023;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,45:226:99:759,0,7185 +chr13 31747963 . T C 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.754;DP=64;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:431,0,1763 +chr13 31759424 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.822;DP=51;FS=4.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:432,0,1634 +chr13 31787838 . T TA 607.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=1.334;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=15.59;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:49:840,49,0 +chr13 32031011 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,232 +chr13 32853843 . C G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-1.768;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:488,0,1552 +chr13 32859331 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.026;DP=44;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:334,0,1519 +chr13 32862279 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.080;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:309,0,1698 +chr13 32864748 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=1.292;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:439,0,930 +chr13 32866566 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.220;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:321,0,482 +chr13 32866770 . C G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.897;DP=33;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:317,0,819 +chr13 32903641 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.619;DP=44;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:265,0,1229 +chr13 32949593 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.472;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:240,0,1470 +chr13 33028089 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=1.436;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:299,0,893 +chr13 33028112 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=1.473;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:319,0,888 +chr13 33028503 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.032;DP=49;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:440,0,1237 +chr13 33028902 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=2.453;DP=48;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=4.56;ReadPosRankSum=-2.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:247,0,1436 +chr13 33039918 . A T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.014;DP=129;FS=5.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,28:129:99:559,0,4019 +chr13 33053857 . G T 2350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.387;DP=145;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:2379,0,2514 +chr13 33228288 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.677;DP=31;FS=7.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:31:99:339,0,1994 +chr13 33228304 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=3.306;DP=37;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:339,0,1994 +chr13 33237639 . C CTTGTGTGTGTGTTTGTGT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:74:270,0,74 +chr13 33243656 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.197;DP=38;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:487,0,849 +chr13 33317326 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:375,0,409 +chr13 33349873 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=-0.168;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:316,0,636 +chr13 33420043 . A C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.019;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:549,0,1968 +chr13 33434999 . T A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-1.065;DP=57;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:831,0,1173 +chr13 33441683 . ACTGCAGAAAACCCACAAAACCCATGAGCCTTCGATTACTTGGGGTGGAAAATAGGTTACATAGAGTAAAGATAAAGAGAACGACAC A 4108.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.258;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,91:94:99:4146,349,0 +chr13 33461654 . A T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=1.463;DP=286;FS=6.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.136;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,41:286:99:332,0,9533 +chr13 33471953 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-3.024;DP=90;FS=23.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:251,0,2944 +chr13 33475767 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.778;ClippingRankSum=-2.661;DP=253;FS=6.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,45:253:99:711,0,16222 +chr13 33486684 . T G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-0.212;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:376,0,1560 +chr13 33488426 . G GT 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-2.254;DP=185;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:363,0,3448 +chr13 33492359 . A T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.314;DP=55;FS=3.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:525,0,1420 +chr13 33494895 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.021;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:426,0,2090 +chr13 33496537 . GAGGTAGTGTACATCATCTGCTTTTCTCTGAATGCTTTTAAAAAGGATTGAGTGGTGCAACATTTCTTTTTCTTTGTTCCGA G 1231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=1.050;DP=43;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=28.64;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,38:42:99:1269,0,431 +chr13 33501554 . CTT C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,147 +chr13 33504740 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.015;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:397,0,1915 +chr13 33536668 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,289 +chr13 33538723 . CCCTGCATTAATAGAGACAGTGAGTAAAAAAAACTGCATGGCTAGAAAAAAAGAAATGTTATTAATGCGAAAAGCTACTTA C 1609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=2.059;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=26.22;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:99:1647,130,0 +chr13 33857819 . G A 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=-2.523;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=15.91;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:1444,0,1491 +chr13 33860509 . A G 2926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-0.095;DP=259;FS=5.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,89:259:99:2955,0,5710 +chr13 33861488 . C T 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-2.767;DP=185;FS=13.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,61:185:99:1653,0,4777 +chr13 33870124 . A T 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.114;DP=127;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,35:126:99:887,0,3632 +chr13 33870367 . C T 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.096;DP=72;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1187,0,1434 +chr13 33870699 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.615;DP=109;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:395,0,4255 +chr13 33906697 . AAT A 2052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=3.630;DP=166;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=12.37;ReadPosRankSum=-3.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:2090,0,1627 +chr13 33907248 . GACCTAAAAGTAAATAAAGATATATTTTATGAAAAACAGAGGAATGTACAGGGATAACCTCCTAAATGTAAATAAGATTTGTGTTATGT G 1565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=372;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,1:3:99:1603,0,311 +chr13 34045526 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.346;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,20:114:99:314,0,3534 +chr13 35026372 . A G 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:234,0,23 +chr13 35592938 . AGTAAGTTCAAGTATAGATTTTTTGCAAAACGTTTTTCTCTTTTTTGTGCTTCATTGAGCTCATTTTCTTGATCTTTTCTCCTCGTTTTTAG A 1656.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=1.639;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1694,134,0 +chr13 35732834 . TA T 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.723;DP=85;FS=7.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,28:85:99:617,0,1420 +chr13 35841700 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr13 36148311 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:438,0,271 +chr13 36148956 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=1.531;DP=27;FS=9.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:332,0,601 +chr13 36149046 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.785;DP=40;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:684,0,666 +chr13 36149100 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.413;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:646,0,664 +chr13 36149226 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.060;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=18.93;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:615,0,460 +chr13 36190574 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.501;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:357,0,627 +chr13 36441962 . T TA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.354;DP=138;FS=14.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,33:116:99:443,0,2087 +chr13 36447025 . ACTGAGACATTAAGAGTAAACACACCCAAATTAAACACACAGTGTTATTGAAATCACAGAAGCATGTGTGTGAAGAAAAAAAACCCTCAC A 13474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=1.721;DP=308;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,306:307:99:13512,1086,0 +chr13 36540000 . GCTGACACACACATCAACATAGACATATATTAATGTTCAAACTGATAAAAAAAAAGAGAGAGAAGGTTTTAAGGATATGAACGCAC G 4697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.826;ClippingRankSum=2.342;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=33.13;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,111:122:99:4735,0,2351 +chr13 36595730 . T C 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr13 36722955 . T TA 941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-2.200;DP=294;FS=9.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,68:253:99:979,0,4932 +chr13 36723458 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-1.406;DP=280;FS=19.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,49:166:99:1005,0,3955 +chr13 36723572 . T A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=-3.625;DP=225;FS=76.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=2.41;ReadPosRankSum=3.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,35:169:99:570,0,5148 +chr13 36845044 . C T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr13 36883689 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.933;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=22.51;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:501,0,243 +chr13 36936257 . GTT G 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=2.319;DP=190;FS=5.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=11.90;ReadPosRankSum=-7.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:2647,0,2925 +chr13 36974553 . AACCTGAGAAAGGAGAAGTGTGTTTTGACAAAGAGAGTGGGACATGTAGAAGTCATGCTAGGGTTGGTTACATTAGTGTCTGTGTTTTT A 7929.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=2.424;DP=205;FS=3.032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=31.90;ReadPosRankSum=-2.437 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,191:193:99:7967,702,0 +chr13 37046224 . GCCTGCATATATACAATAAAATAAAAAACGGTGTGATTATTTGTCATTTCAATTCAGAGTCACAATTAGAGAGCAGTTAACAGTCAGGTCA G 2093.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=0.213;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=30.79;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,56:64:99:2131,0,379 +chr13 37474189 . TG T 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=1.728;DP=81;FS=6.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:461,0,2006 +chr13 37937191 . T G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.111;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:427,0,641 +chr13 37937334 . A T 472.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=24.85;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:4:499,0,4 +chr13 38031334 . T G 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr13 38031440 . A T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.761;DP=30;FS=7.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=24.89;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:775,0,132 +chr13 38031762 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.261;DP=120;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:294,0,2036 +chr13 38069157 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.779;DP=61;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:361,0,1669 +chr13 38991237 . G GT 315.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.810;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:389,17,0 +chr13 39019330 . GA G 497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=-2.275;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:535,0,1709 +chr13 39114893 . C T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.222;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,32:64:99:1152,0,1169 +chr13 39687541 . G T 3622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=0.384;DP=680;FS=5.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.175;QD=5.33;ReadPosRankSum=2.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:511,169:680:99:3651,0,19251 +chr13 39706325 . T C 8736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-0.853;DP=536;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=16.30;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,253:534:99:8765,0,8885 +chr13 39711022 . A T 1953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-1.766;DP=608;FS=7.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=3.21;ReadPosRankSum=3.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:473,117:590:99:1982,0,18222 +chr13 39742339 . A C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=1.329;DP=51;FS=6.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:283,0,1435 +chr13 39761882 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.960;DP=69;FS=10.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:354,0,2032 +chr13 39778577 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=-0.096;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:505,0,2188 +chr13 39820535 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.865;DP=66;FS=2.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:454,0,1829 +chr13 39831827 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:452,0,417 +chr13 39832997 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:245,0,66 +chr13 39833083 . T G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,224 +chr13 39837747 . C T 292.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:320,0,12 +chr13 39837906 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,100 +chr13 39851154 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=1.468;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:287,0,134 +chr13 39857234 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:243,0,172 +chr13 40050936 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-1.150;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:349,0,3855 +chr13 40595494 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.206;DP=36;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:328,0,970 +chr13 40597345 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:418,0,730 +chr13 40602178 . ACTGGCAAACATC A 311.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:27:349,27,0 +chr13 40607208 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.458;DP=44;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:610,0,936 +chr13 40612579 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.246;DP=37;FS=10.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:289,0,910 +chr13 40612792 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.541;DP=45;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.06;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:256,0,1216 +chr13 40757780 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=22.80;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:393,0,149 +chr13 40785267 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.726;DP=62;FS=7.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:372,0,1811 +chr13 40785390 . C T 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-0.933;DP=291;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,69:291:99:1460,0,8504 +chr13 41057645 . A C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.437;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:511,0,531 +chr13 41057859 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.287;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:856,0,1028 +chr13 41058063 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=2.335;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=5.44;ReadPosRankSum=-2.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:235,0,1115 +chr13 41568353 . TTA T 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-1.395;DP=20;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:259,0,532 +chr13 42777596 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.220;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:359,0,399 +chr13 42777610 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.087;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:309,0,509 +chr13 42796366 . G A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-1.533;DP=45;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:605,0,1008 +chr13 43004912 . A AT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-2.047;DP=27;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:305,0,189 +chr13 43013268 . GT G 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.887;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:304,0,146 +chr13 43125143 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.824;DP=31;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:269,0,805 +chr13 43125220 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,310 +chr13 43130008 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=29.58;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:61:324,0,61 +chr13 43169896 . C G 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=1.617;DP=104;FS=5.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,38:104:99:1282,0,2252 +chr13 43172638 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=-0.524;DP=103;FS=3.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,17:99:99:243,0,3260 +chr13 43216441 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.857;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:367,0,337 +chr13 43218109 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=1.045;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:410,0,567 +chr13 43220150 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.684;DP=29;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:229,0,785 +chr13 43220183 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.586;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:284,0,1080 +chr13 43221821 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=1.317;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:328,0,1243 +chr13 43222196 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-2.039;DP=46;FS=5.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:302,0,1272 +chr13 43334495 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.113;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:370,0,1116 +chr13 43334736 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=2.769;DP=56;FS=4.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:657,0,1388 +chr13 43345982 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.847;DP=98;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:449,0,2858 +chr13 43350882 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr13 43381464 . A AT 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.154;DP=149;FS=7.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,18:139:99:369,0,3419 +chr13 43387008 . C T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=1.115;DP=158;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,40:153:99:799,0,8496 +chr13 43892996 . G T 2067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-2.892;DP=372;FS=11.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=5.56;ReadPosRankSum=2.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,93:372:99:2096,0,10958 +chr13 43895139 . A G 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=1.307;DP=386;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,84:386:99:1516,0,11342 +chr13 43896333 . G T 3804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.654;DP=631;FS=11.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:464,165:629:99:3833,0,17773 +chr13 43922106 . C A 1880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.827;ClippingRankSum=-0.291;DP=440;FS=6.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:339,101:440:99:1909,0,12878 +chr13 43922121 . T C 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=-1.085;DP=352;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,66:352:99:1040,0,11079 +chr13 43947904 . A T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.143;DP=43;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:389,0,1101 +chr13 43953574 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.398;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:302,0,1772 +chr13 44034477 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.153;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:296,0,1421 +chr13 44034607 . A T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=1.133;DP=53;FS=2.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:512,0,2897 +chr13 44034617 . G T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=1.782;DP=50;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:515,0,2897 +chr13 44035451 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.760;DP=48;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:235,0,1390 +chr13 44137752 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.142;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:476,0,347 +chr13 44138242 . C G 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-0.061;DP=43;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:692,0,794 +chr13 44139489 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:291,0,63 +chr13 44139491 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:291,0,63 +chr13 44149513 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=1.762;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:350,0,1936 +chr13 44175597 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.913;DP=45;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=11.91;ReadPosRankSum=3.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:564,0,1038 +chr13 44181565 . C A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.369;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:983,0,977 +chr13 44235313 . G C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=1.310;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:508,0,517 +chr13 44243461 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.547;DP=38;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:288,0,975 +chr13 44254484 . T G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-1.445;DP=37;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:314,0,1307 +chr13 44279697 . A C 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.259;DP=82;FS=1.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:635,0,4062 +chr13 44284113 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:276,0,49 +chr13 44288092 . T A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.609;DP=114;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:641,0,3357 +chr13 44288173 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.834;DP=76;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:347,0,2207 +chr13 44288512 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.557;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:384,0,743 +chr13 45322713 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=-0.409;DP=270;FS=8.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=3.36;ReadPosRankSum=2.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,59:270:99:936,0,16950 +chr13 45322718 . GA G 951.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=1.112;DP=279;FS=10.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,56:279:99:989,0,16358 +chr13 45385893 . T TA 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr13 45387377 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=1.888;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:542,0,612 +chr13 45394830 . T C 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:420,30,0 +chr13 45394853 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 +chr13 45428214 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;ClippingRankSum=-2.607;DP=171;FS=7.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=2.02;ReadPosRankSum=2.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,28:170:99:374,0,5551 +chr13 45455478 . G C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,107 +chr13 45683143 . T C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-2.526;DP=100;FS=4.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,33:98:99:1064,0,2223 +chr13 45683208 . T C 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-0.778;DP=56;FS=3.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:696,0,1223 +chr13 46063485 . G A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 +chr13 46101980 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-1.110;DP=163;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,30:162:99:434,0,5267 +chr13 46127388 . C G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=23.71;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:289,0,96 +chr13 46185598 . AGTGAGACTCCCATTCTTCACCATAACATATAACCCAATGCAGTGCTCTAGCTGTGTTAATGCGAATTCTTTGTGTGCACGTTCAG A 4867.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.544;DP=137;FS=6.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=30.94;ReadPosRankSum=-1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,132:137:99:4905,0,216 +chr13 46534705 . C CT 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.049;DP=62;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:263,0,1060 +chr13 46747290 . C T 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=6.563;DP=127;FS=4.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=16.67;ReadPosRankSum=-5.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:2145,0,5131 +chr13 46747508 . CT C 15141.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.322;DP=373;FS=0.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=32.26;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,201:373:99:15179,0,6227 +chr13 46748029 . G GTT 3398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.410;ClippingRankSum=0.723;DP=261;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=13.02;ReadPosRankSum=-2.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,147:218:99:4966,0,1760 +chr13 46909836 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.058;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:1503,0,1501 +chr13 46910968 . A G 2752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.205;DP=196;FS=7.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,79:196:99:2781,0,4081 +chr13 46911581 . GA G 2247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-1.976;DP=180;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=12.49;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:2285,0,2183 +chr13 46911699 . A G 2633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.458;DP=144;FS=3.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.120;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:2662,0,2423 +chr13 46911783 . C T 2488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.593;DP=186;FS=11.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=13.38;ReadPosRankSum=2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,72:185:99:2517,0,3890 +chr13 46930977 . A T 3013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.451;DP=195;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=15.46;ReadPosRankSum=2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,87:195:99:3042,0,3627 +chr13 46955508 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:42:270,0,42 +chr13 46979844 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-1.120;DP=178;FS=2.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,40:178:99:794,0,5098 +chr13 47040291 . C CT 776.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=-0.879;DP=218;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,55:190:99:814,0,3583 +chr13 47219996 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.421;ClippingRankSum=3.287;DP=29;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=8.58;ReadPosRankSum=-3.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:277,0,1534 +chr13 47256454 . T A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.790;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.903;QD=24.91;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:626,0,1110 +chr13 47336074 . A G 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=1.362;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,33:68:99:1181,0,1086 +chr13 47731877 . T G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:230,0,66 +chr13 47882121 . CA C 337.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 +chr13 47884192 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=1.247;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:368,0,190 +chr13 48006885 . GCCCTGTGTAAAACACACACATACAGATTAGAAAAGTCAAAGGTTATACAAAGCAAGGCTATATTGCAAAATAATGTTACTGTATTGCAGT G 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=1.670;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:301,0,2533 +chr13 48148606 . C CT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:276,0,274 +chr13 48185168 . A G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.141;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=27.81;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:946,0,252 +chr13 48193758 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=1.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:255,0,186 +chr13 48193812 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,424 +chr13 48194067 . GA G 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.724;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:350,0,220 +chr13 48409252 . G A 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 +chr13 48727553 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:326,0,95 +chr13 48808162 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.548;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:285,0,917 +chr13 48812243 . C G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.243;DP=39;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:538,0,795 +chr13 48819758 . AT A 270.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=22.56;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:307,6,0 +chr13 48836628 . A AC 443.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:38:532,38,0 +chr13 48861307 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.173;DP=21;FS=10.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:296,0,808 +chr13 48978553 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,452 +chr13 49357161 . AATGGACATCTTGTAATCTGTCGAGACTTTACCTGCAGTTGATTTGATTTTCAACTTTCGCTGCTTCTCTTTTCATCCAGTC A 6296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=3.201;DP=143;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,139:143:99:6334,528,0 +chr13 49359151 . C T 3204.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=-0.355;DP=166;FS=4.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=19.31;ReadPosRankSum=2.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,96:166:99:3232,0,2428 +chr13 49364390 . ATG A 6896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.654;DP=165;FS=3.401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=35.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:6934,580,0 +chr13 49364395 . CAGGTAATCTGAACACACTCCTGCATTATAAACCTTCAGATGAGCAGCTGAAGAATCACTCGTCTCTCTGTTCCCTCT C 6896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.157;DP=163;FS=2.283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=31.19;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,151:154:99:6934,580,0 +chr13 49372253 . TTCAGGTAATATTTCCATCGCTGTCGCTGGACGTTTTGATAACAAGTCTGATATTCAGATAAACAAGCGTGGTGTGAATCTGTCC T 6364.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=1.350;DP=161;FS=1.875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,156:161:99:6402,525,0 +chr13 49375760 . ACAGGTAACGCTCCTTTTCCCAGCATGCATCTGTGATCTGGTGTGATCCTCAGCGTGGATGCTCAGCACTTTTCTTCTTCTTCTGTG A 6403.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=2.786;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,145:155:99:6441,509,0 +chr13 49525058 . C CTCTGTG 278.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:316,24,0 +chr13 49686694 . GAGGTACATGACCAACAGCTAAAAAGTGGGTCCAATTCACCCATTGTGAAATTATTTTTGTTTTTGTCATTTCCTTGGAGGGTATTGAAACTACCCTTTCGGTGATCACTGTGAGAAGACGTGTGTAGATCAGTTAGATTAGAGCAGGGGTGCCTTATTTCTCTGTTTTCTTTT G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=3.352;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=3.43;ReadPosRankSum=-2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,57:67:99:267,0,4727 +chr13 49695899 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=1.271;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:336,0,760 +chr13 49696555 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:254,0,684 +chr13 49696608 . AT A 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.567;DP=36;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:305,0,481 +chr13 49697061 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:295,0,1046 +chr13 49698125 . A G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-0.601;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:703,0,525 +chr13 49846239 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=2.715;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,782 +chr13 49864969 . C T 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.838;DP=51;FS=8.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:950,0,892 +chr13 49930717 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-1.560;DP=51;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:729,0,1004 +chr13 49979010 . G T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=1.595;DP=34;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:468,0,615 +chr13 50311529 . A C 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 +chr13 50420784 . C CA 1729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-0.593;DP=189;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1767,0,1501 +chr13 50542263 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.154;DP=44;FS=5.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:341,0,1221 +chr13 50582814 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=2.654;DP=149;FS=16.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,41:149:99:1009,0,3870 +chr13 50590926 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.540;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,803 +chr13 50592446 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,140 +chr13 50725082 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.294;DP=62;FS=9.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,12:62:99:246,0,4031 +chr13 50842157 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-2.504;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.49;ReadPosRankSum=2.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:304,0,481 +chr13 50842540 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.265;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:348,0,1218 +chr13 50866449 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.103;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=11.19;ReadPosRankSum=3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:375,0,707 +chr13 50956094 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.764;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:320,0,556 +chr13 51106767 . G A 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-2.374;DP=220;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,66:219:99:1736,0,5876 +chr13 51207561 . AACCTGAGTAGCAGAGAATTTGCATTAATAAAGAGCATTTCTGCCTTAAACATGATCATGTATGTGTGTAAATGTCTTGAATACTG A 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.496;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=34.18;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:550,0,824 +chr13 51214006 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-0.172;DP=70;FS=3.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:482,0,1963 +chr13 51214042 . T G 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.683;DP=64;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:963,0,1201 +chr13 51228891 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=-0.258;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:356,0,683 +chr13 51230360 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,191 +chr13 51239915 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.740;DP=38;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:296,0,1021 +chr13 51264191 . TCTGAAAAGAAAAGCACATGGAAGAAATGTAAGACGAAATGCATTTGAGGGAACTAGAAAAAACTTCAGATTTAGTACATTTTCACAC T 1358.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:99:1396,111,0 +chr13 51329735 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-1.388;DP=122;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:405,0,3714 +chr13 51340439 . T C 1092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.341;DP=105;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:101:99:1121,0,2280 +chr13 51360399 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.992;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:384,0,753 +chr13 51362967 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-1.726;DP=44;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:376,0,1183 +chr13 51381261 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=-0.995;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:338,0,1073 +chr13 51399849 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-0.382;DP=37;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=7.89;ReadPosRankSum=2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:320,0,960 +chr13 51399927 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-1.138;DP=41;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:360,0,935 +chr13 52197512 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=-1.557;DP=29;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:341,0,518 +chr13 52203402 . A G 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-2.041;DP=39;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:786,0,612 +chr13 52203453 . C T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-1.676;DP=40;FS=6.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:838,0,501 +chr13 52203956 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=-0.584;DP=86;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:374,0,4431 +chr13 52203957 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=-0.730;DP=89;FS=4.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:374,0,4431 +chr13 52204490 . GT G 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=-2.347;DP=41;FS=19.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:252,0,919 +chr13 52204538 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=1.031;DP=32;FS=6.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:251,0,1594 +chr13 52204666 . A AT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=1.378;DP=21;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:314,0,740 +chr13 52204824 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-1.528;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.32;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:448,0,122 +chr13 52205169 . T A 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.235;DP=76;FS=0.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:1104,0,1710 +chr13 52205178 . T C 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.616;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1160,0,1816 +chr13 52205735 . G C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.540;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:621,0,492 +chr13 52205857 . A G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-1.931;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:630,0,606 +chr13 52262523 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,217 +chr13 52262671 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,253 +chr13 52329159 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,203 +chr13 52330622 . A G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.013;DP=41;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:575,0,1470 +chr13 52331176 . T TA 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.942;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:311,0,620 +chr13 52988501 . C A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-0.508;DP=56;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:970,0,906 +chr13 52990970 . T G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=1.164;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:385,0,167 +chr13 52991769 . C CT 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-1.214;DP=43;FS=5.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:307,0,670 +chr13 52991781 . G T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-1.002;DP=37;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:446,0,885 +chr13 52994727 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,302 +chr13 52998129 . T G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.255;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:88:456,0,88 +chr13 52998623 . C G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.323;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:308,0,641 +chr13 52998918 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:282,0,402 +chr13 52999359 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=1.191;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:309,0,1015 +chr13 53000605 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-3.756;DP=34;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.35;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:856,0,1440 +chr13 53160790 . G A 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=-2.538;DP=118;FS=1.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,42:118:99:1330,0,2614 +chr13 53630031 . A AAC 307.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.668;DP=25;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:5:344,5,0 +chr13 53784662 . A T 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1282,87,0 +chr13 53851567 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.613;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:296,0,1374 +chr13 53876092 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.916;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:435,0,2505 +chr13 53881101 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=1.424;DP=45;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:261,0,1158 +chr13 53889546 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=-1.593;DP=46;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:598,0,990 +chr13 53899600 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=1.004;DP=88;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:287,0,2678 +chr13 53907852 . C T 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=4.287;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=23.96;ReadPosRankSum=3.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:771,0,212 +chr13 53910717 . T A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.39;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:24:379,24,0 +chr13 53979133 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:54:730,54,0 +chr13 53984117 . GGACCTGACCAACACACACAGACACACACACACACACACATCAGCGTCAGTCACACACACACACACACACAGGCAGGCAGAGGGGTGTAGACGCT G 9210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.137;DP=247;FS=1.340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,218:227:99:9248,569,0 +chr13 54022671 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:407,0,242 +chr14 952 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,407 +chr14 1456 . C A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=1.458;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:414,0,1277 +chr14 6725 . G C 5927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.069;DP=327;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,166:327:99:5956,0,5956 +chr14 9996 . C G 1502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.111;DP=87;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:1531,0,1407 +chr14 19069 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=2.008;DP=54;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:267,0,3143 +chr14 39008 . GGA G 1560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.222;DP=82;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:1598,0,1321 +chr14 104819 . C A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.411;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:709,0,239 +chr14 122764 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,241 +chr14 144119 . GTA G 803.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.818;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=29.77;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:26:841,26,0 +chr14 155762 . C G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.904;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:374,0,680 +chr14 192169 . A G 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.449;DP=119;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1995,0,1805 +chr14 196745 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-2.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.55;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:414,0,558 +chr14 197410 . A T 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:18:238,18,0 +chr14 223715 . ACACCTACAGCACAGAGCAGACAGTGTGTGTGTGTGTGTGATCAGCAGCAGTGTTCATCATCTCAGGTACG A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=17.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:243,0,1861 +chr14 226737 . TGGTGAGCAGCTTTACCAACACTGACGTCTCTGAAGAGTGTGTAGAAATGAAGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA T 3790.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.707;DP=151;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,114:137:99:3828,0,6526 +chr14 240244 . T C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 +chr14 246363 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,174 +chr14 274518 . C CA 344.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.741;DP=702;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=0.49;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:16:382,16,0 +chr14 274521 . T C 353.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:16:382,16,0 +chr14 470142 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-0.014;DP=43;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:256,0,1493 +chr14 478208 . G T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-1.099;DP=59;FS=7.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1021,0,1077 +chr14 535731 . C T 1572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1601,122,0 +chr14 536081 . C T 1115.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1144,84,0 +chr14 566782 . TG T 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:62:687,62,0 +chr14 568209 . G T 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 +chr14 569977 . G A 518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:547,39,0 +chr14 585072 . A G 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 +chr14 600001 . T C 1235.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:90:1264,90,0 +chr14 659036 . AAGGTGAGCGGGTCTGCAGATCAGCCACTTCATTCGCTGCCTCATCATGGCTCGTCATCTCTGTGTGTGCTGGTGTGTTTC A 574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=1.379;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=4.63;ReadPosRankSum=-2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,120:124:99:612,236,0 +chr14 937507 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=2.113;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=25.44;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:359,0,170 +chr14 938980 . T TA 388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:426,35,0 +chr14 1000301 . GT G 402.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:440,43,0 +chr14 1033204 . T C 915.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:944,66,0 +chr14 1039680 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:278,0,60 +chr14 1086354 . C G 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 +chr14 1147769 . TCA T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=2.453;DP=38;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,8:38:99:240,0,4014 +chr14 1203629 . C T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=1.252;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1152,0,1341 +chr14 1210114 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=1.988;DP=28;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=28.78;ReadPosRankSum=3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:834,0,119 +chr14 1240249 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-1.813;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:232,0,224 +chr14 1297260 . C G 5822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-1.767;DP=169;FS=3.250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,140:150:99:5851,298,0 +chr14 1297512 . C T 6411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=-1.680;DP=235;FS=7.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=27.28;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,152:185:99:6440,0,1286 +chr14 1297513 . A G 6411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=-0.603;DP=234;FS=9.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=27.40;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,155:186:99:6440,0,1238 +chr14 1297680 . G A 7682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-1.149;DP=220;FS=2.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=34.92;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,190:208:99:7711,282,0 +chr14 1297839 . G C 6732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.220;DP=185;FS=4.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,159:164:99:6761,482,0 +chr14 1767757 . C A 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.046;DP=53;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:711,0,1051 +chr14 1783550 . CA C 790.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=-0.673;DP=193;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,53:173:99:828,0,3128 +chr14 1783780 . T C 3323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.794;DP=297;FS=4.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,101:297:99:3352,0,6808 +chr14 1783796 . G A 3525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=1.581;DP=288;FS=8.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,103:288:99:3554,0,6543 +chr14 1784391 . G T 4075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=1.323;DP=304;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,121:303:99:4104,0,6544 +chr14 1784403 . A T 4067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.888;DP=304;FS=5.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,119:304:99:4096,0,6529 +chr14 1785612 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=-0.590;DP=314;FS=16.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,58:314:99:472,0,10044 +chr14 1785643 . G T 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.109;DP=322;FS=5.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,60:321:99:975,0,10445 +chr14 1786943 . C T 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.363;DP=331;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,78:330:99:1717,0,20039 +chr14 2065292 . A AC 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.345;DP=31;FS=5.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:394,0,637 +chr14 2065934 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-1.793;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:256,0,1035 +chr14 2066026 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.503;DP=33;FS=8.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:253,0,874 +chr14 2229308 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;ClippingRankSum=-1.418;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:321,0,351 +chr14 2229702 . G C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.310;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=10.32;ReadPosRankSum=2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:348,0,681 +chr14 2249210 . C T 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 +chr14 2249217 . G T 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:42:607,42,0 +chr14 2318029 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.454;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:381,0,248 +chr14 2330006 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:366,0,310 +chr14 2330015 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:366,0,310 +chr14 2347264 . T C 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:636,45,0 +chr14 2347285 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:730,54,0 +chr14 2347549 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,213 +chr14 2347688 . C T 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 +chr14 2347813 . T C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr14 2347819 . A C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 +chr14 2348371 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr14 2348788 . G C 2051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.482;DP=112;FS=1.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=18.32;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:2094,0,1539 +chr14 2349382 . A C,G 886.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.220;DP=51;FS=7.384;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:8,30,13:51:99:1243,117,325,854,0,1122 +chr14 2380174 . C T 855.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:884,60,0 +chr14 2380514 . A G 767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:796,54,0 +chr14 2380516 . A C 767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:796,54,0 +chr14 2380727 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr14 2380772 . A T 834.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:863,60,0 +chr14 2382245 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:368,0,593 +chr14 2425874 . A T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr14 2426831 . G A 480.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.496;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=34.32;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:3:507,0,3 +chr14 2554955 . A T 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 +chr14 2563955 . G A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr14 2595607 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.333;DP=33;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.978;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:277,0,863 +chr14 2596183 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.749;DP=63;FS=5.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:776,0,1336 +chr14 2596802 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.515;DP=43;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:576,0,965 +chr14 2741777 . T G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.752;DP=50;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:325,0,1572 +chr14 2741798 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.100;DP=58;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:303,0,1755 +chr14 2741810 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.833;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:400,0,1580 +chr14 2765784 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.603;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:396,0,657 +chr14 2766174 . C A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.056;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:740,0,391 +chr14 2766597 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-2.364;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=16.49;ReadPosRankSum=2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:391,0,406 +chr14 2766756 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.010;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:633,0,558 +chr14 2766927 . A T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.155;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:571,0,600 +chr14 2767144 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.086;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:616,0,558 +chr14 2767163 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=1.366;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:666,0,485 +chr14 2767383 . A C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-1.054;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:456,0,433 +chr14 2767401 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.845;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:601,0,222 +chr14 2805812 . C CA 883.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=-0.050;DP=148;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,49:136:99:921,0,1988 +chr14 2809283 . CAA C 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=1.212;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:609,0,2126 +chr14 2872698 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 +chr14 2879103 . T C 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 +chr14 2955326 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.454;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:522,0,783 +chr14 2955330 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-0.858;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=23.51;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:522,0,783 +chr14 2969716 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:385,0,92 +chr14 2971300 . T A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr14 2971531 . A G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr14 2989788 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.392;DP=41;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:481,0,979 +chr14 2989818 . C T 3066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3095,220,0 +chr14 2999363 . G A 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr14 3007775 . T C 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr14 3027409 . G T 2816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=-2.640;DP=234;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,84:234:99:2845,0,5350 +chr14 3069264 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.253;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:276,0,441 +chr14 3110535 . C T 653.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=27.56;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:17:682,17,0 +chr14 3110740 . C G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 +chr14 3110935 . C G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr14 3110994 . C A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr14 3111803 . G A 2130.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:2159,147,0 +chr14 3111813 . T C 2130.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2159,147,0 +chr14 3111966 . G C 1713.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1742,126,0 +chr14 3112070 . T TTA 259.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:297,20,0 +chr14 3166021 . C G 1388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1417,99,0 +chr14 3171606 . C T 1261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1290,90,0 +chr14 3178211 . TGGTGAGTGTTTTAGAGCCGTAAACATCGCACTCAGCACCCATCCGTAAATATTTCTCAATATTTTTCTCTCTCCTGCA T 1570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=1.639;DP=37;FS=3.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=29.56;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1608,126,0 +chr14 3179613 . T C 1112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1141,81,0 +chr14 3179690 . A G 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1020,69,0 +chr14 3179691 . G A 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1020,69,0 +chr14 3183196 . G A 988.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1017,72,0 +chr14 3183866 . CA C 478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:516,42,0 +chr14 3184495 . T C 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 +chr14 3184763 . G C 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:726,54,0 +chr14 3184826 . GT G 583.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:621,57,0 +chr14 3185019 . CA C 1124.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:94:1162,94,0 +chr14 3185218 . A G 938.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:967,69,0 +chr14 3185305 . A AAT 742.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.073;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=28.82;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:59:780,59,0 +chr14 3209141 . C G 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:665,48,0 +chr14 3209184 . C T 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:681,51,0 +chr14 3217402 . C T 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 +chr14 3217423 . A G 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:686,48,0 +chr14 3476338 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=2.386;DP=33;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:452,0,710 +chr14 3481466 . A C 1396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.866;DP=44;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:78:1425,0,78 +chr14 3481507 . C T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.778;DP=32;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=29.52;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:973,0,240 +chr14 3585124 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:293,0,54 +chr14 3585352 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.722;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:357,0,387 +chr14 3589211 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:262,0,61 +chr14 3590251 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=1.194;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:471,0,279 +chr14 3590278 . GT G 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.694;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:268,0,234 +chr14 3590417 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.091;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:652,0,210 +chr14 3591580 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:298,0,188 +chr14 3748855 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.158;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:275,0,256 +chr14 3895106 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.570;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:493,0,202 +chr14 4054986 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-1.926;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:97:614,0,97 +chr14 4120003 . C A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:358,0,366 +chr14 4151408 . G T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.353;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:720,0,495 +chr14 4186661 . C A 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.550;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,31:49:99:1075,0,611 +chr14 4222035 . G A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.604;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:585,0,592 +chr14 4222411 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:654,0,662 +chr14 4263417 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.772;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,229 +chr14 4304675 . G T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.849;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:622,0,670 +chr14 4307785 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=19.28;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:356,0,268 +chr14 4308049 . G T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr14 4312728 . ATGCTGAGGGAGGAAAAATGCAGG A 213.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:251,27,0 +chr14 4312753 . GTTTCTGACTGATTGTTTACATAAATAAAACCTGATGACTATAAAATAACGCAC G 213.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:251,27,0 +chr14 4342496 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=1.813;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:417,0,911 +chr14 4342500 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=2.473;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:417,0,911 +chr14 4368894 . T A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=1.051;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:569,0,165 +chr14 4369764 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 +chr14 4369782 . C T 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 +chr14 4370917 . T G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:327,0,162 +chr14 4371522 . T A 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 +chr14 4371536 . T A 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 +chr14 4472257 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=1.835;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:256,0,134 +chr14 4480003 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.613;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:534,0,536 +chr14 4497524 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.830;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=17.34;ReadPosRankSum=2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:479,0,1352 +chr14 4497525 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-0.830;DP=26;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:531,0,1168 +chr14 4501435 . T G 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=2.562;DP=72;FS=7.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:693,0,1859 +chr14 4501657 . C G 2736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-0.752;DP=56;FS=4.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=39.71;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2765,231,0 +chr14 4503000 . A T 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.617;DP=65;FS=6.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:984,0,1328 +chr14 4503221 . T A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.910;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:532,0,792 +chr14 4504247 . G GT 1872.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-2.299;DP=49;FS=6.295;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=30.26;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:44:1910,44,0 +chr14 4511836 . G A 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=-2.502;DP=123;FS=3.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=13.62;ReadPosRankSum=2.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:1704,0,2461 +chr14 4550822 . C G 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=1.068;DP=58;FS=14.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:867,0,1105 +chr14 4574595 . A C 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=-0.326;DP=41;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:732,0,735 +chr14 4596846 . C A 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.541;DP=52;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:757,0,1064 +chr14 4596851 . T A 2250.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2279,160,0 +chr14 4597008 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.062;DP=64;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,38:64:99:1288,0,924 +chr14 4597147 . G A 2545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=1.173;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=27.33;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,61:62:99:2574,183,0 +chr14 4597200 . A C 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.799;DP=59;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1122,0,983 +chr14 4597410 . C T 2501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2530,195,0 +chr14 4597739 . G A 1518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.806;DP=73;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:1547,0,1032 +chr14 4598429 . C T 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.319;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1358,0,1614 +chr14 4598516 . T C 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.326;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1368,0,920 +chr14 4598994 . G C 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.366;DP=62;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1093,0,1085 +chr14 4599030 . A C 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.535;ClippingRankSum=-0.562;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1039,0,897 +chr14 4599099 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-1.211;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:576,0,492 +chr14 4599173 . G T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.517;DP=38;FS=7.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:774,0,572 +chr14 4599192 . C A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=-0.451;DP=46;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:845,0,1813 +chr14 4599198 . T G 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-0.066;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:845,0,1823 +chr14 4599282 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-1.008;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:556,0,580 +chr14 4599372 . ATT A 281.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:465,37,0 +chr14 4599499 . G A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.055;DP=56;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:894,0,1090 +chr14 4599585 . C A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.044;DP=69;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:837,0,1571 +chr14 4599673 . A T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.505;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:537,0,869 +chr14 4599784 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-1.604;DP=45;FS=4.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:271,0,1230 +chr14 4599939 . T A 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1096,78,0 +chr14 4600059 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.197;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:422,0,295 +chr14 4600139 . T C 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 +chr14 4600183 . C T 912.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:941,66,0 +chr14 4600298 . A G 718.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:747,54,0 +chr14 4600336 . T A 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:661,48,0 +chr14 4600493 . T C 1228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1257,87,0 +chr14 4600542 . T C 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:850,60,0 +chr14 4600604 . A C 888.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-1.410;DP=24;FS=7.877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:38:917,38,0 +chr14 4600633 . T G 791.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:820,57,0 +chr14 4600776 . G T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=2.441;DP=35;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=21.11;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:767,0,467 +chr14 4600811 . C A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.503;DP=36;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:753,0,477 +chr14 4600832 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.419;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:245,0,860 +chr14 4601125 . T A 1702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1731,123,0 +chr14 4601258 . G A 678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:707,51,0 +chr14 4601292 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr14 4601531 . T C 2266.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2295,166,0 +chr14 4601634 . A T 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.864;DP=48;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=20.64;ReadPosRankSum=2.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1019,0,680 +chr14 4601719 . T C 799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.569;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=29.85;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:828,60,0 +chr14 4601754 . G A 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:804,60,0 +chr14 4601791 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.102;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=19.26;ReadPosRankSum=2.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:452,0,284 +chr14 4602019 . A G 1404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1433,99,0 +chr14 4602053 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-0.192;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:447,0,700 +chr14 4602170 . A G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-1.477;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=23.11;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:837,0,411 +chr14 4602320 . T C 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.420;DP=40;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=24.04;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:64:990,0,64 +chr14 4602509 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-2.023;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:331,0,1142 +chr14 4602568 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.773;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:708,0,707 +chr14 4619065 . G T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-1.791;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,234 +chr14 4619309 . A C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.604;DP=45;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:564,0,968 +chr14 4621101 . G A 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:882,66,0 +chr14 4808800 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=1.096;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:366,0,367 +chr14 4821279 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.902;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,443 +chr14 4821610 . A C 1395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1424,102,0 +chr14 4822933 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:243,0,409 +chr14 5130463 . CA C 571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.515;DP=72;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:609,0,1009 +chr14 5131687 . A AT 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.343;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:643,0,661 +chr14 5394694 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.702;DP=61;FS=9.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:493,0,1659 +chr14 5394845 . CT C,CTT 633.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=-1.444;DP=40;FS=2.750;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=15.83;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,14,18:35:99:737,405,574,340,0,471 +chr14 5394945 . TA T 716.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=2.195;DP=31;FS=11.614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=23.12;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:30:754,30,0 +chr14 5594257 . C T 818.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=2.227;DP=22;FS=3.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=37.23;ReadPosRankSum=-1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:25:847,25,0 +chr14 5594995 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-1.311;DP=49;FS=2.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:456,0,1318 +chr14 5596140 . T TA 218.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:256,27,0 +chr14 5596437 . TA T 323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:361,34,0 +chr14 5841372 . G A 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=2.712;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:942,0,1348 +chr14 5841374 . C T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=2.304;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=20.77;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:942,0,1348 +chr14 5861019 . A G 2347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-1.092;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=16.53;ReadPosRankSum=3.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:2376,0,2436 +chr14 5866243 . A T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.432;DP=71;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:970,0,1646 +chr14 5868850 . CAGGTGAGAGTCTAATTACTTTACTAATATTTTTCCTTTTTTTTATTTTTTTATTTATTTAATTTTTATGTATTTTTTTTATTAAATCTTTATTGTGAACCCTGAAATTCTGGAATTTGTATTTTTTCTTT C,CGGTGAGAGTCTAATTACTTTACTAATATTTTTCCTTTTTTTTATTTTTTTATTTATTTAATTTTTATGTATTTTTTTTATTAAATCTTTATTGTGAACCCTGAAATTCTGGAATTTGTATTTTTTCTTT 12043.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-2.194;DP=354;FS=7.063;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=34.02;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,167,176:348:99:14102,6776,6077,6722,0,6078 +chr14 5868852 . GGTGAGAGTCTAATTACTTTACTAATATTTTTCCTTTTTTTTATTTTTTTATTTATTTAATTTTTATGTATTTTTTTTATTAAATCTTTATTGTGAACCCTGAAATTCTGGAATTTGTATTTTTTCTTTA G 5956.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-2.235;DP=347;FS=4.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,173:343:99:5994,0,6815 +chr14 6255114 . GCCTGTGAACACATTTGAGAAACTGAAACATTTTAGCGGTGTGCAGGGTTTCTGCATTCGTGTTCGTGGTGATGTCACTCA G 1175.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=2.281;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=28.62;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:99:1213,110,0 +chr14 6338176 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=-1.105;DP=38;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:495,0,838 +chr14 6348249 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,174 +chr14 6455685 . G GACGGA 2432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.597;DP=169;FS=4.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:2470,0,2873 +chr14 6460010 . G A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=4.464;DP=133;FS=11.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,34:133:99:765,0,3674 +chr14 6484203 . G A 2335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=-1.538;DP=140;FS=4.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:2364,0,2321 +chr14 6484395 . G A 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.775;DP=69;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,36:69:99:1210,0,1229 +chr14 6505985 . AAGGTAAGTCGCAGCTGGCAAAAACAAATTATGTTATCTCTTTAATACCATTGATCATTAATCATTCAAACTCTTTCCTTC A 1123.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=1.561;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:91:1161,91,0 +chr14 6512630 . A C 773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:802,54,0 +chr14 6512635 . T C 773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:802,54,0 +chr14 6546538 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.948;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:755,0,1036 +chr14 6571569 . C G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=1.483;DP=64;FS=5.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:779,0,1484 +chr14 6574366 . A G 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:356,26,0 +chr14 6579336 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,347 +chr14 6579807 . C CA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.57;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:40:363,0,40 +chr14 6579809 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.48;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:40:363,0,40 +chr14 6589631 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.163;DP=52;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=4.44;ReadPosRankSum=-3.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:259,0,1553 +chr14 6590507 . A G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.480;DP=81;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:468,0,2390 +chr14 6591407 . G C 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=2.901;DP=96;FS=19.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1410,0,1972 +chr14 6591685 . T TA 1543.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.866;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1581,139,0 +chr14 6595809 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,128 +chr14 6596027 . A AT 430.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=21.54;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:28:468,28,0 +chr14 6598524 . T C 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:479,33,0 +chr14 6598542 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,264 +chr14 6598602 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +chr14 6599387 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,249 +chr14 6599404 . A G 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:438,33,0 +chr14 6599592 . T C 568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:597,42,0 +chr14 6599618 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:273,0,536 +chr14 6600292 . T A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:373,0,91 +chr14 6601443 . T A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:242,0,276 +chr14 6900324 . GCTGCAAGAAACAATGATTCATCTTGTGAGTAATGATTTAAAAGTTGTGTTTTGAGATGACTAAAGAAGTTAACTCCAATAAAGGACAAACTCAC G 10960.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=4.645;DP=361;FS=8.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=30.36;ReadPosRankSum=-6.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,305:328:99:10998,0,3353 +chr14 6900505 . A T 6117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=1.372;DP=429;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,176:400:99:6146,0,7176 +chr14 6901483 . TCTAAAATAAAAATAATTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGCATGTCTAAAATGTCAAATAACTGAACAACAACCGAAACTCAAAAGACAATGAC T 2349.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=1.011;DP=369;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=6.37;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,348:360:99:2387,899,0 +chr14 6902058 . ACTGAACCGGCAAAGAAAAAAAGCGCAAGATTAAATCTGTGTTTCATCCAAACGCGCAGAGGAAAAAGATGCAATTGAACAAGATCCGTGACTCAC A 17360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.006;DP=309;FS=3.760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,308:309:99:17398,1365,0 +chr14 6903601 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:259,0,217 +chr14 6906922 . G A 5987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.668;DP=349;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,169:349:99:6016,0,5713 +chr14 6919558 . G GACTCTGTTTGCTGGCTACAC 3864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=3.487;DP=130;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,106:119:99:4326,0,794 +chr14 6925695 . TGTGAGTAAATATAATGAGATTAATTAATTGAAAGCATGTAAAAAAAAAATCTGATTATTATTTTGTATAACTATCTGTTTCAG T 897.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=2.519;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=32.06;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:99:935,0,1981 +chr14 6925894 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,250 +chr14 6929648 . C T 4675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.425;DP=310;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,132:308:99:4704,0,6009 +chr14 6969169 . C G 2487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2516,190,0 +chr14 6980342 . C T 2025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2054,147,0 +chr14 6980473 . C T 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 +chr14 6983780 . T A 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:507,39,0 +chr14 6983810 . G A 571.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:600,42,0 +chr14 7017478 . T A 904.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:933,69,0 +chr14 7076586 . G T 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1081,75,0 +chr14 7076734 . ATG A 271.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:309,22,0 +chr14 7109718 . G A 4557.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:4586,334,0 +chr14 7120024 . A G 5637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:5666,409,0 +chr14 7121516 . C T 1347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1376,93,0 +chr14 7124936 . A C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 +chr14 7128947 . G T 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 +chr14 7129228 . C T 3348.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3377,250,0 +chr14 7129774 . C CT 790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.506;DP=35;FS=2.993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:65:828,65,0 +chr14 7134988 . T TC 438.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:476,36,0 +chr14 7135266 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr14 7135394 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:301,0,173 +chr14 7137166 . AGG A 368.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:406,28,0 +chr14 7141844 . CCG C 8157.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:8195,558,0 +chr14 7141942 . T C 7455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:7484,515,0 +chr14 7142098 . G A 6336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:6365,445,0 +chr14 7142229 . C T 1767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1796,123,0 +chr14 7142439 . C T 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:515,39,0 +chr14 7142547 . A T 2583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2612,184,0 +chr14 7142578 . A T 2002.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2031,144,0 +chr14 7142630 . A AGT 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.264;DP=26;FS=18.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=14.26;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:408,0,141 +chr14 7142693 . A T 3351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3380,247,0 +chr14 7149463 . C G 5781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:5810,418,0 +chr14 7168346 . C T 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 +chr14 7170898 . C T 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1142,84,0 +chr14 7171329 . C T 1372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1401,99,0 +chr14 7171430 . G A 2278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2307,165,0 +chr14 7175934 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr14 7178813 . A G 2564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2593,184,0 +chr14 7179723 . A G 2398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2427,172,0 +chr14 7183229 . A G 1785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1814,126,0 +chr14 7183673 . A C 2053.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2082,147,0 +chr14 7183730 . C A 2300.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2329,169,0 +chr14 7183763 . G A 2473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2502,191,0 +chr14 7184261 . C T 2731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2760,193,0 +chr14 7184632 . C A 3068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3097,223,0 +chr14 7184723 . G A 2676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2705,184,0 +chr14 7184726 . C G 2676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2705,184,0 +chr14 7185187 . G A 1041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1070,75,0 +chr14 7289126 . A AT 328.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:366,36,0 +chr14 7289336 . G A 1371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.733;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=32.37;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1400,113,0 +chr14 7358284 . C T 9984.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=1.445;DP=259;FS=6.558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=28.90;ReadPosRankSum=2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,257:259:99:10013,766,0 +chr14 7487960 . C T 1868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1897,135,0 +chr14 7488800 . C CGA 1450.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1488,103,0 +chr14 7489345 . C T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 +chr14 7489498 . G C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr14 7490273 . C T 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 +chr14 7490318 . A T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr14 7490389 . A C 675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:704,51,0 +chr14 7491035 . T A 573.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:602,42,0 +chr14 7491704 . G T 699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:728,51,0 +chr14 7492117 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr14 7493624 . C T 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 +chr14 7496065 . A C 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 +chr14 7496066 . C T 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 +chr14 7496310 . G A 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:550,39,0 +chr14 7498217 . A T 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 +chr14 7498862 . C A 683.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:712,51,0 +chr14 7499193 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr14 7499282 . C T 594.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:623,48,0 +chr14 7500415 . G T 1474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1503,105,0 +chr14 7500806 . C T 980.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1009,72,0 +chr14 7673280 . ACAGGTAAATCTACACCTCGTAAGTTCTTTTCCCTCTTACGGTGTATTTCTGTCACACACACATAATACATTTGCTCTGTTCATT A 6758.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=-0.061;DP=198;FS=1.635;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=34.14;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,192:198:99:6796,682,0 +chr14 7679437 . T C 9750.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:9779,698,0 +chr14 7685851 . G A 7090.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7119,532,0 +chr14 7685971 . G A 6425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:6454,464,0 +chr14 7686030 . A T 8937.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:226:99:8966,678,0 +chr14 7693871 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr14 7694412 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr14 7694909 . T A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr14 7695729 . C T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr14 7698069 . T A 634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:663,48,0 +chr14 7698557 . A T 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:455,33,0 +chr14 7702319 . GTT G 306.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:344,27,0 +chr14 7702493 . CAG C 218.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr14 7703410 . C T 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:618,42,0 +chr14 7703895 . AT A 305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:343,33,0 +chr14 7707841 . C T 1773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1802,126,0 +chr14 7707883 . T TA 2749.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2787,263,0 +chr14 7707922 . G A 4488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4517,316,0 +chr14 7708508 . GCA G 808.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:58:846,58,0 +chr14 7709333 . G T 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:502,36,0 +chr14 7709426 . A T 1678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1707,120,0 +chr14 7763043 . A C 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 +chr14 7763824 . C T 13563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.128;DP=412;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,397:399:99:13592,1159,0 +chr14 7767528 . C T 752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:781,57,0 +chr14 7823276 . C T 1550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1579,120,0 +chr14 7868438 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr14 7869085 . A T 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:559,39,0 +chr14 7869107 . T G 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 +chr14 7869648 . C T 727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:756,63,0 +chr14 7870145 . C A 734.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:763,54,0 +chr14 7871201 . GTTTTA G 638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.456;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:57:676,57,0 +chr14 7909575 . T C 5697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=1.005;DP=143;FS=3.293;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=26.28;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:5726,418,0 +chr14 7910164 . G A 1875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1904,135,0 +chr14 7935546 . C G 2678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2707,193,0 +chr14 7935711 . C T 3288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3317,243,0 +chr14 7935874 . G A 2472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2501,178,0 +chr14 7936824 . T C 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1189,81,0 +chr14 8044863 . C T 3792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3821,277,0 +chr14 8126483 . G C 1510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1539,111,0 +chr14 8145036 . C T 1200.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.108;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=28.77;ReadPosRankSum=-1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1229,93,0 +chr14 8179096 . T G 2405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2434,178,0 +chr14 8218388 . AT A 372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:410,40,0 +chr14 8233005 . G A 464.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:493,36,0 +chr14 8233949 . G A 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:629,45,0 +chr14 8234102 . GT G 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 +chr14 8234573 . C T 667.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:696,51,0 +chr14 8235323 . A G 716.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:745,54,0 +chr14 8235442 . G A 1311.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1340,96,0 +chr14 8236019 . A T 605.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:634,45,0 +chr14 8236401 . A G 1064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1093,81,0 +chr14 8236510 . G GT 430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:468,42,0 +chr14 8238350 . GT G 243.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.448;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:10:280,10,0 +chr14 8238503 . A C 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:672,45,0 +chr14 8240943 . G A 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:803,57,0 +chr14 8442378 . A C 1330.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:93:1359,93,0 +chr14 8466926 . T A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 +chr14 8574263 . C T 5208.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=1.168;DP=130;FS=3.782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:5237,376,0 +chr14 8585830 . GA G 324.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:13:362,13,0 +chr14 8788084 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,266 +chr14 8788411 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr14 8789236 . CA C 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:499,48,0 +chr14 9036968 . A T 800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:829,63,0 +chr14 9037001 . C A 1969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1998,141,0 +chr14 9040612 . A G 3455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3484,250,0 +chr14 9123287 . G A 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:659,48,0 +chr14 9167093 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:49:282,0,49 +chr14 9232238 . C T 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +chr14 9232259 . T G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr14 9232456 . C T 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 +chr14 9232509 . T C 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 +chr14 9232585 . G C 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1046,75,0 +chr14 9232654 . A C 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:805,57,0 +chr14 9232683 . C T 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:514,36,0 +chr14 9232779 . C T 374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:403,30,0 +chr14 9233204 . T C 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:721,51,0 +chr14 9234162 . A G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr14 9657329 . CAGGTAAATTGTAGACCCAAGGTTAATGTCTTTTTTTCTTAATGCTAATGTTTTAATTGAAGTAACTTATCCTTTTTTCCCT C 3550.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.563;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=30.00;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:3588,316,0 +chr14 10537221 . CAA C 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.821;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:333,0,573 +chr14 10537474 . T TA 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.944;DP=41;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:442,0,495 +chr14 10538315 . T C 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:280,21,0 +chr14 10538338 . T C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=33.87;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:863,0,317 +chr14 10538358 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.916;DP=26;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:257,0,1081 +chr14 10539131 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=6.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:362,0,636 +chr14 10581928 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=1.039;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:471,0,861 +chr14 10583158 . C T 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.466;DP=47;FS=2.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:683,0,1569 +chr14 10815411 . A C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.033;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:380,0,404 +chr14 10815423 . C G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-0.058;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:465,0,403 +chr14 10816288 . T C 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.496;DP=32;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:554,0,471 +chr14 10816523 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:307,0,104 +chr14 10830533 . G T 3145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-1.371;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.840;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,101:184:99:3174,0,2883 +chr14 10847225 . C A 4274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-1.332;DP=254;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,118:231:99:4303,0,4142 +chr14 10854556 . C CTGTTTTACTTCAG 3606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.297;DP=240;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=15.03;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,106:226:99:3644,0,4037 +chr14 10854766 . TTC T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=1.359;DP=47;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:249,0,1258 +chr14 10881424 . T C 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.060;ClippingRankSum=6.107;DP=238;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,62:228:99:634,0,8055 +chr14 10881484 . G T 3328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=1.861;DP=268;FS=2.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=12.42;ReadPosRankSum=3.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,99:267:99:3357,0,5804 +chr14 10903339 . C T 6161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.166;DP=352;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,176:352:99:6190,0,6201 +chr14 10907927 . T A 6257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.917;DP=354;FS=6.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=17.68;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,177:354:99:6286,0,6454 +chr14 10910737 . A T 5004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.924;DP=283;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=17.68;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,141:282:99:5033,0,5123 +chr14 10935396 . GT G 1886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.311;DP=203;FS=4.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,81:183:99:1924,0,5283 +chr14 10935400 . GT G 2117.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.449;DP=211;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,89:202:99:2155,0,5894 +chr14 10935853 . C T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 +chr14 11112425 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr14 11112453 . C G 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr14 11172096 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-1.334;DP=31;FS=9.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:610,0,415 +chr14 11180404 . A T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-0.777;DP=59;FS=5.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,39:59:99:1399,0,717 +chr14 11244944 . C A 1824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.471;DP=106;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1853,0,1786 +chr14 11249294 . C T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.059;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:1312,0,1085 +chr14 11268362 . G C 1804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-2.363;DP=97;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=18.61;ReadPosRankSum=2.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1833,0,1446 +chr14 11633298 . AGTACATACTTGTCGGTTTTCCTAATAATTGAATACGTATTAGCCCTTTGCCAACCGACTTATTGATTTCTGTCTTTGCTAG A 1893.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=1.125;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=30.84;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1931,158,0 +chr14 11659043 . C CA 2259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-2.219;DP=385;FS=12.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,128:357:99:2297,0,5959 +chr14 12484184 . T C 2105.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.558;DP=53;FS=2.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:2134,113,0 +chr14 12813025 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-1.197;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:247,0,365 +chr14 13304391 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:269,0,149 +chr14 13752663 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.633;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,176 +chr14 13782314 . T A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,0:5:99:528,0,276 +chr14 13782316 . C A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,0:5:99:528,0,282 +chr14 13783349 . C CT 746.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.288;DP=225;FS=6.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,60:204:99:784,0,3407 +chr14 13914182 . G C 1193.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1222,87,0 +chr14 13934750 . G C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.682;DP=36;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.040;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:309,0,266 +chr14 13935484 . C T 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1317,93,0 +chr14 13935565 . T C 4165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=-0.093;DP=292;FS=3.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,121:202:99:4194,0,3414 +chr14 13935612 . A G 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-1.390;DP=190;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,85:149:99:2951,0,2616 +chr14 13936375 . T A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr14 13937661 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr14 13937668 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:262,18,0 +chr14 13937756 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=13;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=17.06;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:250,0,115 +chr14 13937877 . CT C 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-0.030;DP=70;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:377,0,2692 +chr14 13943345 . T A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr14 13943424 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:270,0,145 +chr14 13943432 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:288,0,57 +chr14 14460292 . G GT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.123;DP=46;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:282,0,652 +chr14 14460401 . CT C 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-0.748;DP=47;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:392,0,1000 +chr14 14857441 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:412,0,294 +chr14 14857470 . A T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.538;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:88:503,0,88 +chr14 14858446 . T TA 224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:262,21,0 +chr14 14858461 . T A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-2.282;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:77:386,0,77 +chr14 14858849 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:328,0,216 +chr14 15427095 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:347,0,114 +chr14 16052820 . G A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr14 17471505 . T G 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.225;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,57:145:99:1972,0,6128 +chr14 17471532 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr14 17501833 . A AGT 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=1.434;DP=44;FS=18.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:510,0,552 +chr14 17503398 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-2.017;DP=37;FS=32.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:541,0,715 +chr14 17504328 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.961;DP=38;FS=10.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=5.57;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:240,0,713 +chr14 17504868 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=-0.135;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:854,0,1637 +chr14 17505005 . T A 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=2.589;DP=72;FS=40.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=23.43;ReadPosRankSum=-3.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1715,0,360 +chr14 17505395 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-0.267;DP=23;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:410,0,901 +chr14 17505396 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.277;DP=24;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:410,0,893 +chr14 17506038 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=24;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:96:235,0,96 +chr14 17510695 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.883;DP=38;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=24.10;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:62:944,0,62 +chr14 17510707 . G GA 899.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=2.404;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:57:937,0,57 +chr14 17510805 . A AG 690.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.187;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:728,0,2503 +chr14 17510859 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.361;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1052,0,1695 +chr14 17511431 . G T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-2.461;DP=114;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:383,0,2327 +chr14 17511497 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-2.709;DP=41;FS=26.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=7.21;ReadPosRankSum=-3.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:324,0,920 +chr14 17879260 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr14 17882467 . G A 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:612,42,0 +chr14 17882529 . G C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:644,48,0 +chr14 18494338 . CTG C 893.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.772;DP=236;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,47:229:99:931,0,8232 +chr14 18494662 . A AT 1688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=-0.618;DP=49;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=34.46;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,41:45:99:1726,0,1032 +chr14 18494789 . A G 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.390;DP=52;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=33.53;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:1772,0,1032 +chr14 18494985 . A G 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=1.236;DP=88;FS=2.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:1420,0,1778 +chr14 18600504 . TG T 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-1.857;DP=175;FS=6.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,33:156:99:398,0,3478 +chr14 18601353 . T C 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-1.412;DP=163;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=4.50;ReadPosRankSum=3.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,37:163:99:762,0,4700 +chr14 18622657 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:364,0,581 +chr14 18623435 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=-2.538;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:324,0,407 +chr14 18623440 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,203 +chr14 18624765 . C T 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=1.407;DP=329;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,72:328:99:1401,0,10501 +chr14 18625126 . G GA 1597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=-0.801;DP=257;FS=9.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,90:231:99:1635,0,2894 +chr14 18625519 . GCTGTGCAGAATGAACAACATGTTTCATAGTGTACTTCGCAAACATTTTAGAGTGGAAATTGACTAAAAGAACTTAC G 14178.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.978;DP=320;FS=6.061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,317:320:99:14216,1099,0 +chr14 18628297 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.471;DP=294;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,60:292:99:1065,0,8862 +chr14 18630338 . G T 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.664;DP=452;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:358,94:452:99:1749,0,13856 +chr14 18638905 . G GA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.339;DP=195;FS=4.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=1.08;ReadPosRankSum=-2.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,37:181:99:247,0,3914 +chr14 18639519 . T C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.465;DP=190;FS=5.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,42:189:99:842,0,5817 +chr14 18641848 . T TA 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=-2.212;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,45:161:99:591,0,3062 +chr14 19297488 . A T 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:517,36,0 +chr14 19298111 . GA G 238.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:276,24,0 +chr14 19298174 . T C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr14 19714532 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=2.151;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:239,0,1616 +chr14 19985396 . G A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-1.850;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:699,0,550 +chr14 19986596 . T A 1265.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1294,96,0 +chr14 19986892 . G A 664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:693,48,0 +chr14 20059792 . C T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.555;DP=96;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:580,0,2581 +chr14 20156516 . G GT 1271.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1309,105,0 +chr14 20156550 . C T 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:999,69,0 +chr14 20157070 . C T 286.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:315,0,18 +chr14 20158398 . A G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 +chr14 20158578 . T A 1440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1469,109,0 +chr14 20158834 . T G 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.429;DP=42;FS=21.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=23.14;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:1000,0,566 +chr14 21071447 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr14 21707401 . G T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.656;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:250,0,193 +chr14 21881200 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:240,0,321 +chr14 21967733 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.050;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:317,0,1035 +chr14 21989467 . C T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=2.090;DP=57;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:791,0,1769 +chr14 22001729 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,373 +chr14 22026583 . G C 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 +chr14 22054142 . T C 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=-0.708;DP=134;FS=4.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1595,0,2909 +chr14 22054268 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-1.982;DP=212;FS=4.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,39:212:99:539,0,6246 +chr14 22054324 . G C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=1.455;DP=187;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,42:187:99:855,0,5603 +chr14 22054382 . C G 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=1.278;DP=232;FS=5.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=5.87;ReadPosRankSum=6.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,59:232:99:1390,0,6548 +chr14 22064936 . T TA 1114.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.902;DP=106;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=10.52;ReadPosRankSum=2.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:1152,0,1244 +chr14 22112835 . CAGGTGTGTCTAACAGAATGTTCTTAGTCCATGTGAGTTTTTTTTTCTCATTTAACAACTTAACACCCTTTTTTCTGATGAACTCTTTCTTGTTCCTAT C 788.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=397;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,0:2:99:826,177,0 +chr14 22130561 . G A 1890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.139;DP=115;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1919,0,2054 +chr14 22168947 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-1.639;DP=36;FS=6.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.358;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:230,0,2256 +chr14 22168974 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=1.210;DP=49;FS=7.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:242,0,1458 +chr14 22200296 . G GT 701.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.222;DP=75;FS=6.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:739,0,741 +chr14 22213641 . A G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.195;DP=26;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=27.41;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:94:741,0,94 +chr14 22234505 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-1.551;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=24.22;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:561,0,313 +chr14 22242937 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=1.684;DP=69;FS=3.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:984,0,1270 +chr14 22335524 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.702;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:779,0,795 +chr14 22335659 . G T 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=2.174;DP=60;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:993,0,2320 +chr14 22335661 . G A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=2.129;DP=60;FS=5.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:993,0,2374 +chr14 22624782 . GA G 3729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=1.440;DP=212;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,96:206:99:3767,0,7241 +chr14 22624787 . G T 3738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.527;DP=209;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,96:209:99:3767,0,7182 +chr14 22632257 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.966;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:494,0,365 +chr14 22632381 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-3.512;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=18.10;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,306 +chr14 22633762 . TA T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:83:347,0,83 +chr14 22647243 . G A 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=2.422;DP=246;FS=4.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,66:243:99:1619,0,6849 +chr14 22652750 . G A 3372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.244;DP=227;FS=2.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,97:227:99:3401,0,4408 +chr14 22690862 . GGGTATGAAACTCTTCAGTTTATATGCTTTGCTCATGGGGCGACTGTGGATTAACATGTGTTTCTGTTTTTCTA G 13242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.140;DP=311;FS=8.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,309:311:99:13280,1053,0 +chr14 22700589 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,324 +chr14 22773468 . G T 2288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-1.167;DP=140;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:2317,0,2401 +chr14 22780378 . CAG C 1141.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=32;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,1:9:99:1179,0,222 +chr14 22781439 . T A 4136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.338;DP=77;FS=2.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=29.01;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,60:77:99:4165,0,326 +chr14 22832285 . G A 3263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.324;DP=199;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,93:199:99:3292,0,3459 +chr14 22840475 . G A 6939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=1.053;DP=359;FS=4.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,216:359:99:6968,0,4916 +chr14 22848577 . TTG T 1036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=1.558;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,51:229:99:1074,0,7185 +chr14 22849285 . CA C 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=-0.721;DP=110;FS=5.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,33:94:99:674,0,1377 +chr14 22901311 . T C 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-2.867;DP=59;FS=2.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1107,0,676 +chr14 22902000 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=28.85;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:79:461,0,79 +chr14 22902474 . G T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.574;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.950;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:345,0,696 +chr14 22902500 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=1.910;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=14.18;ReadPosRankSum=-2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,299 +chr14 22903054 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=1.080;DP=37;FS=8.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=5.97;ReadPosRankSum=2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:249,0,1090 +chr14 22904217 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=28.06;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:393,0,179 +chr14 22946028 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:309,0,99 +chr14 22983914 . C CA 1128.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.688;DP=95;FS=2.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,54:90:99:1166,0,777 +chr14 22990091 . G A 6210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-2.512;DP=340;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,189:340:99:6239,0,5376 +chr14 23007486 . TCTGAGAGGAAGAGAAGACACAGATGCAGTTAGCAAAGCCAACAGCGCTTTACATCTGACAGACTGAGAAACTGCAGTGTACTCAC T 12476.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.720;DP=296;FS=3.774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,278:279:99:12514,936,0 +chr14 23007616 . C G 5272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.735;DP=326;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,149:325:99:5301,0,5880 +chr14 23010650 . C A 4201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=-0.802;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,127:215:99:4230,0,4857 +chr14 23100185 . C T 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.919;DP=93;FS=0.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,57:93:99:1931,0,1205 +chr14 23100343 . T TG 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-2.869;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:347,0,658 +chr14 23100356 . T G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-2.451;DP=33;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=23.45;ReadPosRankSum=2.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:802,0,646 +chr14 23100719 . T A 1524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.213;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:1553,0,1292 +chr14 23108177 . A G 3471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.259;DP=190;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,97:190:99:3500,0,3302 +chr14 23108213 . G A 3789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.154;DP=211;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,105:205:99:3818,0,3771 +chr14 23108217 . TCTGCACAGGGAAAAGGAAGTTAACATGCATGTGGTGCACAGAGGAAATAAAATGTGAAAATCCATGAGCTTTTGAAGTGAC T 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=206;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=1.83;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:99:414,0,1314 +chr14 23109650 . A G 4432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.911;DP=230;FS=5.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,133:230:99:4461,0,3365 +chr14 23114210 . T A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.470;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1155,0,1706 +chr14 23135430 . CT C 6192.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.265;DP=358;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,237:357:99:6230,0,2079 +chr14 23139650 . C T 8975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-1.281;DP=515;FS=5.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,269:515:99:9004,0,9108 +chr14 23142594 . C T 3389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.835;DP=230;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,102:230:99:3418,0,4016 +chr14 23143025 . CA C,CAA 4027.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.305;DP=373;FS=3.483;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:97,124,120:341:99:5797,3005,6130,1134,0,9235 +chr14 23148599 . T C 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=-1.551;DP=75;FS=6.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:886,0,1698 +chr14 23148611 . C T 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-1.587;DP=78;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:1030,0,1677 +chr14 23154899 . G A 1833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=-1.500;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,55:65:99:1862,0,108 +chr14 23400505 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.176;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:352,0,358 +chr14 23442030 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.850;DP=54;FS=9.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:959,0,850 +chr14 23444468 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.783;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:697,0,559 +chr14 23444693 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=2.280;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:439,0,887 +chr14 23472866 . C A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.046;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=17.07;ReadPosRankSum=2.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:660,0,877 +chr14 23473175 . C A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.182;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:626,0,905 +chr14 23483651 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.682;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,237 +chr14 23484674 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:281,0,137 +chr14 23485097 . T C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.311;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=26.84;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:404,0,90 +chr14 23526702 . T A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.811;DP=25;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:448,0,406 +chr14 24130205 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr14 24503712 . T C 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 +chr14 24651578 . T TA 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.544;DP=85;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:434,0,1390 +chr14 24903233 . G C 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=-3.372;DP=88;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:910,0,2892 +chr14 24903317 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-1.501;DP=102;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:597,0,2984 +chr14 24903343 . A G 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.265;DP=108;FS=7.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,28:108:99:659,0,3263 +chr14 24903456 . A G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.466;DP=75;FS=5.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:505,0,2061 +chr14 24903470 . G C 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.603;DP=85;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:576,0,2238 +chr14 24903591 . AAT A 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=-1.030;DP=29;FS=7.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:277,0,258 +chr14 25096866 . AT A 240.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:276,3,0 +chr14 25278864 . CTA C 3884.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:3922,326,0 +chr14 25280829 . G GTCTGGC 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=1.159;DP=209;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:69:584,0,69 +chr14 25317824 . T G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=1.631;DP=111;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:398,0,3556 +chr14 25848366 . G A 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 +chr14 25848486 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-1.246;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:397,0,517 +chr14 25873597 . A T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr14 25873615 . T G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 +chr14 26072715 . AGTGGGTTTCATTTTTGTCTACTTGCCTGACTTGATGATGAGTGGGAGAGCGGACTCCTGATGTTTCCATGTGTTTGTTTAG A 970.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=1.583;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=31.10;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:90:1008,90,0 +chr14 26078164 . G GA 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.746;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:64:692,0,64 +chr14 26078533 . T TA 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:56:242,0,56 +chr14 26078548 . A T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr14 26154638 . G GA 222.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr14 26158030 . TA T 2549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.888;DP=122;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,94:119:99:2587,0,277 +chr14 26171829 . CCTAAGAAGAAATCATTTTTAAAACTCTTTTCTAATCATAT C 266.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:99:304,142,0 +chr14 26172651 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=3.127;DP=131;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:865,0,3581 +chr14 26180134 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=20.81;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:278,0,139 +chr14 26186216 . C G 277.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:306,0,18 +chr14 26448278 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-0.206;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:253,0,435 +chr14 26448862 . GA G 268.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.290;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:305,6,0 +chr14 26508829 . G GT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.950;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:437,0,229 +chr14 26520284 . T TA 1046.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-1.546;DP=60;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,47:58:99:1119,0,164 +chr14 26546130 . G C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr14 26548487 . A G 1545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.899;DP=53;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,40:53:99:1574,0,324 +chr14 26600735 . C T 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:378,27,0 +chr14 26915052 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:357,0,488 +chr14 26948555 . T A 549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-1.900;DP=114;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:114:99:587,0,4178 +chr14 26948556 . A T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-2.269;DP=112;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=4.19;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:497,0,4183 +chr14 26950916 . AACCTGATGAAATGTATAGAATATATGTAAATGAAACTTATAGAATAATAGGATGAAACTAGCTAAAATAGTTGTAAAAATGAGACAGCAT A 15077.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-1.396;DP=381;FS=2.084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,364:367:99:15115,1099,0 +chr14 26992601 . G T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-1.073;DP=70;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:1003,0,1434 +chr14 27116358 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-0.659;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:495,0,407 +chr14 27242941 . G T 5450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.870;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=30.19;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,129:140:99:5558,257,0 +chr14 27243354 . C T 1715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-2.650;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=20.67;ReadPosRankSum=2.726 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:58:1744,58,0 +chr14 27243360 . C T 2390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2419,166,0 +chr14 27243512 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=2.122;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=9.30;ReadPosRankSum=-2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:270,0,392 +chr14 27243566 . C G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr14 27243775 . C G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-2.037;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:98:666,0,98 +chr14 27243787 . T G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-2.037;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:98:666,0,98 +chr14 27243872 . T G 537.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.868;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=25.58;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:9:565,9,0 +chr14 27243914 . G A 925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:954,66,0 +chr14 27244023 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.980;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=28.54;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:43:970,0,43 +chr14 27244107 . A T 3050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.190;DP=120;FS=2.109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=25.42;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,75:79:99:3079,141,0 +chr14 27244143 . A C 1896.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-1.221;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.861 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,48:51:61:1925,61,0 +chr14 27244206 . G C 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr14 27244391 . G C 482.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=1.488;DP=28;FS=11.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:509,0,4 +chr14 27245137 . A G 683.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:712,48,0 +chr14 27245187 . T C 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 +chr14 27246059 . T C 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:715,51,0 +chr14 27246161 . C T 2752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.197;DP=76;FS=5.697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=33.86;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:99:2781,193,0 +chr14 27246198 . G A 979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:72:1008,72,0 +chr14 27246242 . C G 213.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:21:242,0,21 +chr14 27246251 . A T 213.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:242,0,21 +chr14 27246413 . G C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.456;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:90:469,0,90 +chr14 27246422 . T C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.20;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:90:469,0,90 +chr14 27246558 . TA T 347.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:386,36,0 +chr14 27271684 . GAGGTTTGTTTTTGGAATGGTGCACTGTTAATTAAGTAGGTTTCAGATATTCACATGCCTCTATGTTTTCGTTTC G 1081.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.678;DP=33;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=32.78;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,27:29:99:1119,0,612 +chr14 27394167 . G A 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.837;DP=60;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:1201,0,856 +chr14 27422753 . TA T 3501.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.263;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=31.27;ReadPosRankSum=-1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,106:110:99:3539,342,0 +chr14 27423406 . TCTGTTTTGCATGAGAAACGACAAGATAAAGCATCAACACAAATCTGCCAATGACCTGAATATGTCAGCCATTTTAC T 11381.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=-0.308;DP=262;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=32.31;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,256:262:99:11419,991,0 +chr14 27434279 . C T 2913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=1.618;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,77:219:99:2942,0,10184 +chr14 27434283 . C A 2913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=1.849;DP=223;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,79:222:99:2942,0,10226 +chr14 27436984 . TCTGTGAAATTAAATGTTCACGCGTGAAATCCCCAGTGATGCCTGAATTTAAAAAGCAAAATGCCCAGAGCATGCTAAACTCAC T 2208.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.379;DP=49;FS=6.673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2246,192,0 +chr14 27443160 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.532;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:457,0,595 +chr14 27444276 . G T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.664;DP=53;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=13.32;ReadPosRankSum=3.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:734,0,1121 +chr14 27461977 . G GA 1103.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.786;DP=74;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:1141,0,2606 +chr14 27478070 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.173;DP=149;FS=6.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,28:149:99:452,0,4831 +chr14 27520520 . CA C 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-0.967;DP=328;FS=32.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=1.85;ReadPosRankSum=2.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,106:322:99:644,0,20586 +chr14 27520937 . G GA 928.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.579;DP=300;FS=6.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,71:271:99:966,0,5411 +chr14 27595337 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.315;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:365,0,468 +chr14 27712565 . TA T 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=-0.597;DP=84;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:442,0,1401 +chr14 27725237 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.225;DP=245;FS=5.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=1.25;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,37:245:99:334,0,8827 +chr14 27726712 . TGTAGGTTTTCATGGTAAAATATATTCGTGTATTGGTAAAAGACATGTGTAATTGTCTTAAATCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTGTGTGTGAATCTAG T 9244.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.803;ClippingRankSum=1.424;DP=238;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=26.49;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,225:238:99:9651,0,958 +chr14 27727173 . GGGTATATGTTTTCTACGATTTAAGCTTGAAACTATACTTATTAAATTGATAACAGAACGTTTTAATTAAGTCTTCTTTAAATAATTTCTGGTGATGATATCAAGCTTTTGTCTGAACATGTCTCTTATTCTTCTA G 10200.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=4.368;DP=268;FS=9.889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,261:268:99:10238,809,0 +chr14 27732056 . CAGGTTCGCATTGAATGCCTGTTAATACAATGGCTTTTGCTGTCTGCAGCTGCATTGAAAGCTTTGTGAGACTGTACTCTGTCTGCATGT C 13735.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.314;DP=389;FS=3.471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,333:339:99:13773,999,0 +chr14 27789042 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.406;DP=180;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,36:180:99:640,0,5835 +chr14 27789064 . C T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.224;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,47:195:99:1078,0,5975 +chr14 27791136 . G T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-1.015;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,26:144:99:416,0,6619 +chr14 27792176 . G A 3837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:3866,273,0 +chr14 27792449 . T C 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.023;ClippingRankSum=10.558;DP=224;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=6.47;ReadPosRankSum=-8.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,64:224:99:1478,0,6235 +chr14 27792547 . T C 1955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1984,141,0 +chr14 27792575 . T A 899.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=29.81;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:928,69,0 +chr14 27793536 . G C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.613;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:735,0,931 +chr14 27793776 . C G 3994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:4023,292,0 +chr14 27796919 . A G 2640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.216;DP=47;FS=4.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=29.94;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:2669,198,0 +chr14 27796925 . A G 2634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2663,198,0 +chr14 27797733 . T C 7756.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:7785,551,0 +chr14 27797816 . A G 5634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:5663,403,0 +chr14 27797826 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.348;DP=135;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,31:135:99:644,0,4121 +chr14 27797954 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=-1.788;DP=321;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=2.22;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,55:321:99:742,0,10601 +chr14 27798263 . C T 4680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=-1.133;DP=288;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,136:288:99:4709,0,4923 +chr14 27798389 . T G 7389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:7418,530,0 +chr14 27799070 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=-1.642;DP=273;FS=45.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=1.49;ReadPosRankSum=4.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,50:267:99:434,0,8883 +chr14 27799163 . A G 7586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-1.525;DP=184;FS=3.354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=31.08;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,183:184:99:7615,555,0 +chr14 27804615 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=1.154;DP=244;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,46:244:99:741,0,7853 +chr14 28109950 . A T 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 +chr14 28109954 . T C 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 +chr14 29048782 . G T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.603;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:510,0,4664 +chr14 29048785 . T A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.750;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:510,0,4664 +chr14 29048825 . C CA 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=1.079;DP=110;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:674,0,1249 +chr14 29049187 . C T 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.214;DP=134;FS=10.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=7.56;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,43:134:99:1041,0,4076 +chr14 29063802 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=-0.141;DP=46;FS=3.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:721,0,775 +chr14 29064055 . T G 1451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1480,108,0 +chr14 29064292 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=2.826;DP=33;FS=9.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=6.72;ReadPosRankSum=-2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:250,0,2932 +chr14 29064299 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.605;ClippingRankSum=-2.221;DP=33;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=25.87;ReadPosRankSum=2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:882,0,952 +chr14 29064301 . A G 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.693;DP=32;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:882,0,952 +chr14 29064307 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=2.115;DP=33;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=6.72;ReadPosRankSum=-2.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:99:250,0,2767 +chr14 29064740 . A G 738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:767,63,0 +chr14 29064834 . A C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.890;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:454,0,394 +chr14 29064839 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-1.120;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=22.41;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:454,0,394 +chr14 29371861 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.182;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=22.42;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:813,0,1240 +chr14 29474750 . G A 2699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=1.878;DP=139;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:2728,0,2261 +chr14 29478813 . AT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=1.827;DP=47;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=4.55;ReadPosRankSum=-2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:251,0,777 +chr14 29483776 . ACTAAAAAACATGGAGTGAAAAAACGGACGAATGTAACGTTAACGTTAGGAGCCAAATGAAACCAATGGTGCGACTTAAAATAACTGTATTTAATAATAAAACAGTAAATTATAATTTATATACACATTGAATGAAATTATAATTTATGTAGCAATAATAGACTCGTACTATCTCAC A 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.065;DP=31;FS=6.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:867,0,3397 +chr14 29485638 . C T 1607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=-0.720;DP=92;FS=6.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1636,0,1526 +chr14 29524727 . AAGGTCTGACCCTGTGACCCATCACCAGATCATACAGCATTGACTTTGACTTGTTCCAAAGGGAGCGAGATATTAATTACCTCTGCATGTGTCTTCC A 9561.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.557;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,229:230:99:9599,891,0 +chr14 29534290 . AGCAGGTCAGTGGTTATAAGGTTTTGTGTCCTCTGTCAAAGTGAGTTTTGCTTGCTGGTTTTGACATCTTTTTTTTCTGACTCTGATGTGT A 8844.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=1.154;DP=208;FS=2.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=36.00;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,186:189:99:8882,811,0 +chr14 29535853 . TGTAAGCAAACATTTGTTTATCTTAGATTTGTGTTCATATTACATTTGAGGATCGTTCATTGGCTGTCAGATGTTAAGTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTCTGTTTCCTCTTAG T 9121.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.791;DP=238;FS=2.747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.147;QD=33.35;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,228:238:99:9159,844,0 +chr14 29545572 . A AAT 764.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.094;DP=62;FS=7.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:802,0,1047 +chr14 29546740 . T G 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=6.158;DP=82;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=10.42;ReadPosRankSum=-5.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,26:82:99:892,0,3909 +chr14 29546747 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=5.258;DP=78;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=8.78;ReadPosRankSum=-4.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:713,0,4156 +chr14 29547380 . C CTT 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=-0.186;DP=97;FS=3.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:73:99:1203,0,1070 +chr14 29548384 . G A 255.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:284,0,22 +chr14 29551257 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,335 +chr14 29565405 . AT A 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.625;DP=60;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:515,0,1002 +chr14 29575128 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-3.691;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:630,0,1532 +chr14 30468852 . T C 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 +chr14 30539860 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr14 30651332 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:83:384,0,83 +chr14 30651636 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.348;DP=38;FS=8.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:497,0,868 +chr14 30669554 . T C 2052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.509;DP=135;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:2081,0,2436 +chr14 30676878 . A T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=-1.370;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:658,0,1155 +chr14 30678029 . C CA 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=1.665;DP=48;FS=8.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:443,0,547 +chr14 30678188 . A C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-0.334;DP=42;FS=7.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=10.66;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:476,0,1186 +chr14 30678268 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.046;DP=55;FS=6.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:368,0,1954 +chr14 30681313 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:274,0,56 +chr14 30684358 . C T 211.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:240,0,19 +chr14 30684559 . G A 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.211;DP=73;FS=8.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,46:73:99:1497,0,818 +chr14 30687392 . A G 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=1.436;DP=72;FS=2.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=25.40;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,50:72:99:1857,0,596 +chr14 30687692 . G A 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.139;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1478,0,1520 +chr14 30687877 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:84:491,0,84 +chr14 30688191 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-2.050;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:468,0,1047 +chr14 30688201 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-1.681;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:468,0,1047 +chr14 30688410 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.109;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:303,0,212 +chr14 30688842 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.89;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:280,0,141 +chr14 30695693 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.372;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:295,0,400 +chr14 30715237 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.910;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,626 +chr14 31268856 . GGGTAAGTTCTTGCCTGCCGTACCACAATATTTTCCTTTTTTCACTAAACATTTGTTCTGTTTTTTAAATGTTCAGTTTTAAGTACTAAAATGGTATATTTGTTTTTCTCA G 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:495,0,335 +chr14 31293982 . TA T 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.623;DP=15;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:51:300,0,51 +chr14 31354273 . TCCTTTTAAAAGAATGTGAGAGTGAGATTTTCTGAAATCAGAAGTAGATAATTAACAATTTAACCAAATATACAAGTTGTTATCAAA T 1579.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=1.641;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=26.30;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1617,124,0 +chr14 31583440 . TA T 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-1.006;DP=32;FS=4.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:612,0,150 +chr14 31603368 . G A 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.941;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,37:96:99:1192,0,1971 +chr14 31670287 . CA C 4661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.418;DP=383;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,192:348:99:4699,0,2991 +chr14 31860132 . CT C 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.053;DP=21;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:62:367,0,62 +chr14 31862375 . A T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.335;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=29.07;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:784,0,120 +chr14 31961812 . AAC A 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.075;DP=114;FS=3.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,16:94:99:247,0,3057 +chr14 32371039 . TGGTGAACTTTTCACAGTCCTAATACCGTCTAGAATTACAAACTGTATTGCTGATGTAGAAAAGTTTGTAACCTTTTTTTGTTCGTCTCA T 1538.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=1.592;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:1576,145,0 +chr14 32390216 . GA G 355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:393,40,0 +chr14 32410654 . AAGGTATCGCTTTCTTTTCCTTAATAAATGTTTTATTATTGTTATGCAAGCTTTTGTGCTTTTTATTTATTTCTCTCCTTTGTATGAGT A 2079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=3.369;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=29.71;ReadPosRankSum=-2.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,53:70:99:2117,0,5144 +chr14 32411010 . GGGT G 2087.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=2.007;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,81:87:99:3055,0,2122 +chr14 32411014 . AAGATGGCACACTTGACACTTTTTAATAATGTAGTGGCTTTTTGTAATGTGTTTACACCTGTGAGATGCCGATACATGTTTCTGTGTATGCTCAG A 2529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.697;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,70:95:99:2567,0,1927 +chr14 32486271 . TCCTGTTACAACAAAAGAGATACAAGTGAGGTCGATATCATCAGCAGATTTCTGATTCAGCCAGGAGTTCCTAGGGAAATAAATGTGCATGTACTTA T 9245.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=2.967;DP=225;FS=2.066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=27.49;ReadPosRankSum=-2.977 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,212:215:99:9283,725,0 +chr14 32538253 . GA G 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:57:245,0,57 +chr14 33377223 . TCACAAACACACACACA T 237 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:274,0,12 +chr14 33717228 . ACTGTGACAAGTGAAAAGCATGTTAATAAGCTGAATAATGGCCTAGTTTCTTTTATGGTATCATCAAAACGTATTCCTGTATTGAGCGTATAC A 7845.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DP=179;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=32.43;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:7883,768,0 +chr14 33753690 . C T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr14 33862286 . ACTGAGGGGAACACACTCTTGTCAATGTTATTTTTAGCATGTCAAATCACTGCTGAAATGAACAGGAGGCGTCACTGCTTAC A 2091.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.006;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=29.12;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:2129,164,0 +chr14 34045580 . G GA 459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:497,48,0 +chr14 34196010 . CA C 1105.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=1.239;DP=53;FS=7.169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:48:55:1143,55,0 +chr14 34229154 . TTTTTTGACCTGAATTAACTCAC T 225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:62:263,62,0 +chr14 34240134 . C T 2600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=1.669;DP=161;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:2629,0,2993 +chr14 34276923 . GA G 485.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-2.205;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=23.13;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:27:524,27,0 +chr14 34277288 . A AT 2510.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2586,262,0 +chr14 34289103 . G A 5272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.234;DP=333;FS=8.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,148:332:99:5301,0,6216 +chr14 34314370 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.648;DP=22;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,505 +chr14 34389037 . AAGGTAGACGAAGATTTTTATTATGATTGAAGAATATTACGTTAAATAGACTACTGCAACAGTTTCTTTGTGTTTATACGCTTTTATTTC A 8907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.837;ClippingRankSum=-0.321;DP=310;FS=78.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=28.73;ReadPosRankSum=3.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,207:304:99:8945,0,39474 +chr14 34389238 . AAGGTGAGCGATGATGAACAAGATGTTTAGATTGACTCTGGTTATTGAGACATGTTTTTTAGGAGTAAAGGGTTATATTTGAAACGTATATCTGTGTATATGTCCACTGCAGCATTTAGCACTGCTCTTTTAAACTTT A 13930.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.408;DP=440;FS=1.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=31.66;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,407:417:99:13968,1040,0 +chr14 34417740 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.239;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:455,0,278 +chr14 34448090 . GA G 837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.706;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:875,0,184 +chr14 34448481 . CA C 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.441;DP=47;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:676,0,874 +chr14 34449046 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=2.801;DP=38;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:256,0,1108 +chr14 34449907 . C CA 756.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-2.405;DP=74;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:794,0,900 +chr14 34450271 . CAG C 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=-3.282;DP=122;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:431,0,4173 +chr14 34450447 . C CA 1085.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=-0.590;DP=124;FS=9.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:1123,0,1760 +chr14 34454278 . T C 1576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=3.654;DP=175;FS=29.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1605,0,4267 +chr14 34480002 . C CA 1680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.544;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=16.16;ReadPosRankSum=-3.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,33:91:99:1718,0,1427 +chr14 34491060 . G A 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.358;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:847,0,958 +chr14 34491880 . G C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.489;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:356,0,266 +chr14 34491928 . T A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.172;DP=37;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:799,0,476 +chr14 34541610 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.751;DP=46;FS=8.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:246,0,1269 +chr14 34729349 . C T 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=1.015;DP=60;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1069,0,1523 +chr14 34765308 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,290 +chr14 34770735 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=4.498;DP=40;FS=9.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=11.49;ReadPosRankSum=-2.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:488,0,962 +chr14 34783302 . G A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.831;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:719,0,1391 +chr14 34802519 . G C 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr14 34802558 . CT C 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.212;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:258,0,255 +chr14 34802666 . C A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 +chr14 34803853 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:381,0,281 +chr14 34821764 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.055;DP=34;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:478,0,671 +chr14 34847628 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.317;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:452,0,233 +chr14 34856996 . A C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.478;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:925,0,120 +chr14 34945272 . A C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=1.019;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:606,0,233 +chr14 34956960 . A G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr14 35016380 . A G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr14 35070903 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-1.942;DP=28;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=21.78;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:638,0,314 +chr14 35071200 . C CTT 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.724;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1053,0,881 +chr14 35074028 . A G 6690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-1.507;DP=223;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=30.00;ReadPosRankSum=-0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,177:223:99:6719,0,801 +chr14 35076228 . G A 4431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=-0.150;DP=171;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=25.92;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,130:171:99:4460,0,847 +chr14 35076345 . A T 4480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=-0.102;DP=163;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=27.49;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,123:163:99:4509,0,744 +chr14 35078432 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-2.154;DP=164;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,30:164:99:464,0,5158 +chr14 35078447 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-1.711;DP=165;FS=5.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=1.83;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,27:165:99:330,0,5318 +chr14 35081703 . A G 4423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.690;DP=161;FS=2.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,118:161:99:4452,0,979 +chr14 35084254 . G A 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=1.021;DP=131;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,34:131:99:802,0,3610 +chr14 35084509 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.812;DP=153;FS=11.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.199;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:464,0,4838 +chr14 35084521 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=-0.338;DP=156;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,25:156:99:266,0,4753 +chr14 35084726 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-1.115;DP=180;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,39:180:99:753,0,5401 +chr14 35092082 . G A 2237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.738;DP=141;FS=10.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:2266,0,2444 +chr14 35099593 . CCACCTGAAGCTGCAAAGGGAAACATACAGCCATTACAAAAACCCAAAAATGAAAACGGTCCTAATGAGAACCGGGTAGTTTGGTTT C 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=1.553;DP=159;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,28:146:99:543,0,11877 +chr14 35099602 . GCTGCAAAGGGAAACATACAGCCATTACAAAAACCCAAAAATGAAAACGGTCCTAATGAGAACCGGGTAGTTTGGTTTCAC G 4237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.694;DP=144;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,108:144:99:4275,0,4522 +chr14 35177559 . C CAT 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:277,0,103 +chr14 35178227 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:358,0,322 +chr14 35178286 . A AT 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.222;DP=19;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:264,0,201 +chr14 35214633 . GT G 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=1.115;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:60:347,0,60 +chr14 35219325 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.334;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:302,0,442 +chr14 35678232 . T C 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 +chr14 35691101 . C T 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 +chr14 35693070 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-2.304;DP=35;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=22.36;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:811,0,888 +chr14 35693071 . G C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=2.304;DP=35;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:434,0,1466 +chr14 35700424 . G A 635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:664,51,0 +chr14 35703171 . T C 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 +chr14 35736053 . G T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 +chr14 35765562 . G C 543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:572,39,0 +chr14 35765756 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.220;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:496,0,321 +chr14 35788548 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,134 +chr14 35926691 . A G 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:646,48,0 +chr14 35948343 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.024;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:452,0,486 +chr14 36182586 . C CT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.151;DP=44;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:488,0,605 +chr14 36406399 . T TGG 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.671;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:264,0,785 +chr14 36406897 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=33.42;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:563,0,296 +chr14 36407289 . G A 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr14 36408008 . A T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=-1.067;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=20.52;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:726,0,505 +chr14 36544832 . T C 2259.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2288,166,0 +chr14 36544899 . T C 756.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:785,57,0 +chr14 36545263 . T TA 1454.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1492,145,0 +chr14 36545282 . A T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-0.383;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:684,0,470 +chr14 36545376 . G A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=-1.512;DP=67;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:858,0,1515 +chr14 36562999 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=20.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:83:277,0,83 +chr14 36563026 . C A 259.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:288,0,13 +chr14 36563072 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=2.858;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=13.05;ReadPosRankSum=-2.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,347 +chr14 36563121 . A C 913.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:942,69,0 +chr14 36563214 . G A 1116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1145,81,0 +chr14 36564238 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.28;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:301,0,48 +chr14 36567392 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.611;DP=39;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:440,0,983 +chr14 36571715 . C T 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 +chr14 36706405 . G A 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:990,72,0 +chr14 36708362 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.900;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:436,0,481 +chr14 36708377 . A G 1087.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1116,81,0 +chr14 36708532 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.701;DP=26;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:299,0,582 +chr14 36708729 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:359,0,316 +chr14 36712868 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-1.444;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:364,0,329 +chr14 36713230 . T A 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 +chr14 36713345 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr14 36713414 . A T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=25.65;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:413,0,128 +chr14 36713428 . T C 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:626,45,0 +chr14 36714432 . C G 284.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:313,21,0 +chr14 36714642 . T C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr14 36715813 . A T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr14 36715923 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr14 36716586 . C CTT 221.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:259,17,0 +chr14 36783983 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr14 36785695 . A C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.429;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:348,0,336 +chr14 36785931 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,434 +chr14 37014114 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-0.104;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:539,0,501 +chr14 37020440 . T C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-2.498;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:806,0,555 +chr14 37020650 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.548;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:441,0,399 +chr14 37094654 . GA G 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 +chr14 37094662 . T G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr14 37095111 . G GA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:329,0,291 +chr14 37097204 . G GA 427.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:465,47,0 +chr14 37102505 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.495;DP=50;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:577,0,1194 +chr14 37102529 . C G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.710;DP=42;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:298,0,1097 +chr14 37116319 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=2.350;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:232,0,464 +chr14 37446989 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-1.070;DP=52;FS=9.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:413,0,1351 +chr14 37447008 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-1.217;DP=62;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=7.01;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:463,0,1638 +chr14 37449748 . A G 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.671;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:1002,0,1279 +chr14 37488041 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=4.398;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=5.28;ReadPosRankSum=-3.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:361,0,1888 +chr14 37508480 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:400,0,319 +chr14 37569788 . GT G 805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=-1.415;DP=129;FS=13.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:843,0,1188 +chr14 37569809 . AT A 857.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.050;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.688;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:895,0,879 +chr14 37635620 . G C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.892;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:486,0,687 +chr14 37649052 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:398,0,405 +chr14 37865342 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.82;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:55:237,0,55 +chr14 37906185 . C T 2304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.048;DP=505;FS=6.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:387,117:504:99:2333,0,14629 +chr14 37906850 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-2.615;DP=463;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=1.90;ReadPosRankSum=4.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:383,78:461:99:910,0,14226 +chr14 37907092 . C T 19132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=2.402;DP=653;FS=5.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,502:653:99:19161,0,2880 +chr14 37999196 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:289,0,189 +chr14 37999272 . A G 880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:64:909,64,0 +chr14 38033946 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.42;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:275,0,56 +chr14 38042786 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:243,0,249 +chr14 38141038 . G A 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=2.245;DP=61;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=21.06;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,39:61:99:1313,0,731 +chr14 38184262 . A T 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.049;DP=76;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1221,0,1294 +chr14 38207531 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.933;DP=90;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:650,0,4070 +chr14 38207532 . T G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-1.258;DP=90;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:650,0,4070 +chr14 38820612 . A AT 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=1.102;DP=73;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:726,0,1067 +chr14 40133584 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 +chr14 40152072 . C T 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:412,36,0 +chr14 40152146 . C T 2638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2667,193,0 +chr14 40155275 . A C 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +chr14 40182714 . T TC 2843.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.929;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:2881,246,0 +chr14 40182916 . A T 12741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=297;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,297:297:99:12770,893,0 +chr14 40183014 . A T 23182.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-2.445;DP=546;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=28.90;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,544:546:99:23211,1603,0 +chr14 40202553 . A G 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 +chr14 40202690 . G A 1187.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1216,87,0 +chr14 40206488 . T C 1644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1673,120,0 +chr14 40206620 . G C 1184.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1213,84,0 +chr14 40206699 . T G 2069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2098,144,0 +chr14 40258404 . A C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr14 40259309 . C T 976.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1005,75,0 +chr14 40259838 . A G 9684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=1.634;DP=296;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,293:296:99:9713,855,0 +chr14 40264721 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr14 40279618 . A T 10914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=260;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,260:260:99:10943,784,0 +chr14 40287807 . A G 2808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2837,199,0 +chr14 40287901 . T A 2193.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2300,160,0 +chr14 40287916 . G GT 664.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=1.250;DP=35;FS=3.123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=19.00;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:14:702,14,0 +chr14 40288247 . G A 201.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:230,0,23 +chr14 40305671 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr14 40314836 . TCTAAAACAGCAGACGCAAGAAATAATTTAAATCGACATACATAATACTGAAATTCATGGGAAAAAAATGAAATAAAATGTAC T 2611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.857;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=30.03;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,60:62:99:2649,204,0 +chr14 40327630 . AC A 286.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 +chr14 40381051 . CAA C 227.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 +chr14 40381540 . C A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 +chr14 40835714 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=11.43;ReadPosRankSum=2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:371,0,701 +chr14 40847665 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.205;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:429,0,333 +chr14 42067526 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-2.010;DP=52;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=11.65;ReadPosRankSum=2.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:634,0,1218 +chr14 42081058 . T C 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.224;DP=88;FS=1.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:960,0,1937 +chr14 42096344 . C CT 570.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.110;DP=60;FS=7.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:608,0,710 +chr14 42195455 . A C 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-1.487;DP=45;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:969,0,659 +chr14 42719748 . T C 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-0.450;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:641,0,1437 +chr14 42720272 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.765;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:375,0,550 +chr14 42744098 . ACTGAGTAGGGGAAAACAAGCAGAAGAACAACAGAATAACATCCTGTAATACTGCAGCGTTCGCATACATTTAAAAATTAATTAACCACATAATTAACAACTCAC A 3253.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=2.265;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:3291,297,0 +chr14 42753159 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.988;DP=151;FS=2.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,26:151:99:364,0,12658 +chr14 42754586 . T C 1778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-0.071;DP=121;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1807,0,2562 +chr14 42754587 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.900;DP=121;FS=7.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:365,0,4027 +chr14 42754699 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.959;DP=83;FS=3.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:599,0,2401 +chr14 42754715 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-1.869;DP=72;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:500,0,2186 +chr14 42754720 . T C 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-3.087;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:685,0,1293 +chr14 42834471 . C CTG 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,107 +chr14 42863189 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=1.809;DP=44;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:761,0,770 +chr14 42895533 . A T 531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:560,42,0 +chr14 42900316 . G A 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:531,36,0 +chr14 43047016 . C G 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 +chr14 43047018 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:34:260,0,34 +chr14 43463956 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.090;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=16.51;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:573,0,587 +chr14 43464618 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:273,0,313 +chr14 43496252 . T A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=1.115;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:427,0,426 +chr14 43496271 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.464;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:413,0,485 +chr14 43705429 . G A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-1.004;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:778,0,723 +chr14 43705454 . G T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.486;DP=48;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:843,0,789 +chr14 45848502 . CTG C 604.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.468;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,1:148:99:642,0,9301 +chr14 47218056 . A C 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 +chr14 47303847 . T A 1334.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.249;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:62:1363,62,0 +chr14 47568339 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.054;DP=54;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:608,0,1176 +chr14 47569082 . GT G 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.545;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.121;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:275,0,1056 +chr14 47606774 . ACC A 5495.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:5533,417,0 +chr14 47621857 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=2.843;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,417 +chr14 47621859 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=2.843;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,417 +chr14 47656105 . A T 200.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:37:229,37,0 +chr14 47668280 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.683;DP=315;FS=3.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=5.95;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,80:315:99:1901,0,9221 +chr14 47673719 . C G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=1.039;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:446,0,2919 +chr14 47673965 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.459;DP=63;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:674,0,1362 +chr14 47690272 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,141 +chr14 47690471 . C T 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 +chr14 47691875 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=1.249;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:259,0,777 +chr14 47692511 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.876;DP=17;FS=18.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,340 +chr14 47692549 . A C 286.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:315,0,19 +chr14 47692975 . A T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.878;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:672,0,186 +chr14 47692998 . G GA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=1.366;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:347,0,516 +chr14 47693714 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:310,0,49 +chr14 47694336 . T TA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.986;DP=27;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:274,0,365 +chr14 47694819 . C A 1078.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=29.82;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:59:1107,59,0 +chr14 47694823 . C G 1058.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.42;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:39:1087,39,0 +chr14 47695054 . G T 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=1.223;DP=155;FS=0.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,50:155:99:1359,0,4016 +chr14 47707582 . C T 1641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.020;DP=208;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,65:208:99:1670,0,5338 +chr14 47728318 . T TA 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.134;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:37:736,0,37 +chr14 47732837 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=1.287;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=15.96;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:491,0,514 +chr14 47732864 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.235;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:396,0,607 +chr14 47733316 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.193;DP=15;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,349 +chr14 47733370 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:347,0,49 +chr14 47733642 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:425,0,204 +chr14 47735702 . C CA 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.202;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:58:386,0,58 +chr14 47738547 . CT C 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.460;DP=37;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:292,0,423 +chr14 47744128 . A G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.592;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:75:579,0,75 +chr14 47795261 . G T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr14 48235324 . A G 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 +chr14 48281677 . T A 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-1.200;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,30:100:99:769,0,2753 +chr14 48282020 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=1.913;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:414,0,2559 +chr14 48282185 . T A 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=1.422;DP=99;FS=9.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,31:99:99:756,0,2889 +chr14 48282198 . C CT 837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.738;DP=98;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:881,0,884 +chr14 48375093 . T C 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.686;DP=39;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:651,0,480 +chr14 48375402 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.211;DP=88;FS=3.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:255,0,2878 +chr14 48379817 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.069;DP=146;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,35:146:99:767,0,4312 +chr14 48394042 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-1.485;DP=172;FS=4.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,33:172:99:563,0,5407 +chr14 48394082 . C T 2436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.079;DP=208;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,72:208:99:2465,0,4762 +chr14 48417588 . G A 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=1.002;DP=217;FS=5.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,62:217:99:1524,0,5876 +chr14 48422116 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.512;DP=177;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,33:176:99:529,0,5296 +chr14 48438352 . A G 261.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.73;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:290,0,21 +chr14 48444435 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:266,0,60 +chr14 48460096 . C A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.356;DP=240;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,49:238:99:895,0,7255 +chr14 48460153 . A G 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=-0.149;DP=243;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,51:242:99:945,0,7028 +chr14 48460266 . T G 3060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.201;ClippingRankSum=0.143;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=14.44;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,92:210:99:3089,0,4105 +chr14 48465714 . T C 3584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=1.178;DP=210;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,101:209:99:3613,0,3480 +chr14 48469092 . T G 3952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=-0.013;DP=235;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=16.82;ReadPosRankSum=2.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,112:232:99:3981,0,4061 +chr14 48469203 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.976;DP=241;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,42:235:99:599,0,7789 +chr14 48469227 . A G 3341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.402;DP=229;FS=4.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,97:224:99:3370,0,4249 +chr14 48469311 . C T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=2.109;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,51:213:99:1023,0,11017 +chr14 48472141 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-1.551;DP=222;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=2.51;ReadPosRankSum=2.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,39:216:99:586,0,6882 +chr14 48478521 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.917;DP=149;FS=2.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:415,0,4663 +chr14 48480221 . A G 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-1.030;DP=221;FS=3.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,52:204:99:1201,0,5896 +chr14 48488516 . A T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=-1.671;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:577,0,888 +chr14 48488670 . G A 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.766;DP=59;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1047,0,1080 +chr14 48488759 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-1.203;DP=43;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:333,0,1113 +chr14 48488826 . G C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.355;DP=45;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:863,0,652 +chr14 48489333 . A C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.207;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:544,0,592 +chr14 48489622 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.563;DP=35;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:450,0,793 +chr14 48489669 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.177;DP=50;FS=4.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:308,0,1413 +chr14 48489704 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=1.128;DP=47;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:341,0,1279 +chr14 48510272 . G C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.059;DP=47;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:323,0,2821 +chr14 48517442 . C A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=-0.895;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:370,0,1087 +chr14 48519127 . T C 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.250;DP=101;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:1535,0,1947 +chr14 48519355 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=-0.032;DP=66;FS=12.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:286,0,4211 +chr14 48519361 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.100;DP=63;FS=10.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,11:63:99:278,0,4211 +chr14 48521286 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.429;DP=64;FS=7.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:554,0,1713 +chr14 48524180 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.105;DP=76;FS=8.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:518,0,2058 +chr14 48527509 . A G 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=3.469;DP=81;FS=6.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:723,0,2012 +chr14 48527572 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=2.206;DP=75;FS=3.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:458,0,1952 +chr14 48529841 . G C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=2.170;DP=64;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.968;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:650,0,1405 +chr14 48531798 . A T 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.823;DP=92;FS=4.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:1546,0,1446 +chr14 48539441 . C T 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-1.121;DP=132;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,42:132:99:1097,0,3269 +chr14 48572330 . GT G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=-0.946;DP=316;FS=16.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,55:263:99:405,0,3614 +chr14 48572503 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.549;DP=171;FS=22.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=4.60;ReadPosRankSum=5.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,29:171:99:815,0,5358 +chr14 48572569 . C CT 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-3.047;DP=154;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=1.57;ReadPosRankSum=2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,29:132:99:279,0,2177 +chr14 49010064 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=1.323;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:420,0,2956 +chr14 49010463 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.520;DP=56;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:302,0,2123 +chr14 49010803 . C CA 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-1.603;DP=111;FS=2.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,28:103:99:403,0,1693 +chr14 49012085 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=-0.309;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:256,0,1351 +chr14 49024725 . T C 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.507;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1072,0,1525 +chr14 49025121 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:240,0,425 +chr14 49025133 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:37:372,0,37 +chr14 49025330 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:285,0,95 +chr14 49025464 . T C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-1.218;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=23.93;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:794,0,426 +chr14 49025465 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.487;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:414,0,793 +chr14 49051718 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:65:255,0,65 +chr14 49051720 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:65:255,0,65 +chr14 49154769 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.391;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:403,0,773 +chr14 49155041 . TA T 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.718;DP=43;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:626,0,661 +chr14 49156604 . GAA G 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=3.307;DP=24;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=12.32;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:333,0,503 +chr14 49157057 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.365;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,222 +chr14 49157342 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=21.68;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:245,0,172 +chr14 49241945 . TCCTTCAGCAAAAAACAAATTTATAACAAATGCATTTTCCTAACACAATCTAAAAGTACTACAGGAATCGTCTGCACA T 17587.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=1.032;DP=411;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=30.03;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,406:410:99:17625,1368,0 +chr14 49250456 . CGTGAGTTACTCTGGAGTGTGCTCATGCCATTTCCGTCTTGTTTTGTGGAGTGTGTGTGTGTGCCTGACTGGATGTTGTGTTTTTGCAG C 1223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=2.124;DP=376;FS=5.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,330:336:99:1261,0,379 +chr14 49292334 . T A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=1.978;DP=188;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,35:183:99:463,0,5663 +chr14 49322516 . AACCTAGTAAAAATGGAAACTCAATTTTCCCAACTGAAGCGTGACAGAGTTTAATTTGAGACAAAATTATTATTTTTTCTATGCATCTGTTTTCAGTTATTTGTTGCACTC A 1339.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.998;DP=33;FS=3.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=24.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1377,118,0 +chr14 49799359 . A C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-1.858;DP=28;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:372,0,535 +chr14 50718080 . T A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-1.302;DP=98;FS=7.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:693,0,4094 +chr14 50720928 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:256,0,289 +chr14 50723079 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,302 +chr14 50736442 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.105;DP=110;FS=8.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,20:110:99:286,0,3437 +chr14 50737177 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.082;DP=123;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,27:123:99:478,0,3430 +chr14 51119941 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.376;DP=130;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,22:130:99:289,0,4065 +chr14 51144802 . TAC T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.328;DP=40;FS=8.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:249,0,1288 +chr14 51150913 . T C 2877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.263;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,84:210:99:2906,0,4233 +chr14 51150950 . A T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.728;DP=204;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=3.97;ReadPosRankSum=-3.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,44:202:99:839,0,6149 +chr14 51150986 . T A 2608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.255;DP=218;FS=5.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,80:213:99:2637,0,4336 +chr14 51180120 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.103;DP=92;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:252,0,5016 +chr14 51193041 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-1.337;DP=116;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:287,0,3277 +chr14 51224317 . C T 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-1.392;DP=122;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,37:122:99:980,0,3182 +chr14 51290488 . A T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DP=91;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:659,0,1637 +chr14 51290511 . C T 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.650;DP=69;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=22.97;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1613,0,341 +chr14 51328888 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-0.512;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:279,0,493 +chr14 51331875 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.613;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.066;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:319,0,567 +chr14 51345548 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.794;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:462,0,364 +chr14 51376021 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.594;DP=173;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,33:173:99:576,0,5613 +chr14 51378667 . T A 7210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=-0.564;DP=197;FS=5.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=29.77;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,40:195:99:7239,0,4566 +chr14 51384120 . G C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.045;DP=145;FS=3.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,32:145:99:584,0,4349 +chr14 51413562 . A T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.702;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:362,0,1401 +chr14 51451963 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.148;DP=81;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:409,0,2143 +chr14 51452008 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.869;ClippingRankSum=0.072;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=4.12;ReadPosRankSum=-2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:333,0,1944 +chr14 51470360 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=-0.239;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:322,0,728 +chr14 51470891 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:423,0,337 +chr14 51470990 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.835;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:385,0,662 +chr14 51471537 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,143 +chr14 51471538 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,143 +chr14 51690177 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.139;DP=61;FS=10.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:357,0,1928 +chr14 51691784 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.271;DP=45;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:237,0,1984 +chr14 51950247 . T TC 362.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 +chr14 52551115 . C A 692.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.632;DP=45;FS=3.039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:15:721,15,0 +chr14 53213545 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=3.709;DP=137;FS=6.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,35:137:99:816,0,3799 +chr14 53213724 . T A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-2.540;DP=135;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,31:135:99:695,0,4141 +chr14 53214568 . AGT A 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.234;DP=128;FS=8.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=2.56;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,23:126:99:365,0,4001 +chr14 53214764 . G C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=4.457;DP=135;FS=24.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=5.01;ReadPosRankSum=-3.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,33:135:99:705,0,4032 +chr14 53214791 . CTG C,CTGTG 1857.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.385;DP=90;FS=3.188;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,37,24:64:99:1868,745,1167,1224,0,1764 +chr14 53214862 . T C 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.905;DP=97;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,35:97:99:1220,0,2267 +chr14 53215001 . GTA G 459.24 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:52:556,52,0 +chr14 53216020 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=2.126;DP=103;FS=6.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,23:103:99:454,0,3037 +chr14 53217314 . C G 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:237,0,25 +chr14 53217631 . G A 2030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.480;DP=133;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:2059,0,2139 +chr14 53290773 . T A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-0.689;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:725,0,344 +chr14 53293449 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.935;DP=106;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:463,0,4309 +chr14 53293513 . A T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.502;DP=74;FS=3.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:637,0,2134 +chr14 53293582 . A G 1036.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:42:1065,42,0 +chr14 53317781 . T C 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.952;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:926,0,925 +chr14 53317881 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=2.582;DP=53;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:262,0,1538 +chr14 53318300 . GTTGGTCAGTTTGGAGCTCCTCTGATTGGTCAGTTTGGAGCTCCTCTGA G 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=-0.134;DP=42;FS=11.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:314,0,1565 +chr14 53318348 . A G 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.665;DP=33;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=17.48;ReadPosRankSum=3.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:605,0,808 +chr14 53318424 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.425;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=28.49;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:655,0,171 +chr14 53319225 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.380;DP=67;FS=3.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:922,0,1311 +chr14 53319638 . A G 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=1.081;DP=43;FS=5.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:913,0,549 +chr14 53351225 . A G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.496;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:476,0,3397 +chr14 53351967 . A G 2882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.327;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=16.57;ReadPosRankSum=2.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,82:174:99:2911,0,2954 +chr14 53352052 . C T 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.405;DP=132;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:2145,0,2393 +chr14 53357456 . AGCAGGTGAGACCGTGTGATGTGTGTGTGTTGTGTGTGTATTCTGTGTGTGTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 931.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=2.098;DP=44;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:969,0,5361 +chr14 53360922 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-2.337;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:336,0,1052 +chr14 53362181 . T C 1386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-2.590;DP=97;FS=21.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:1424,0,3351 +chr14 53362256 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-2.553;DP=154;FS=2.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,24:154:99:241,0,4945 +chr14 53363105 . G C 255.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:284,0,21 +chr14 53363691 . C G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:298,0,97 +chr14 53390145 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.739;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=29.65;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:90:384,0,90 +chr14 53406691 . C G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr14 53409849 . C T 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.740;DP=55;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=26.12;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1465,0,287 +chr14 53412386 . C T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.367;DP=58;FS=5.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1071,0,928 +chr14 53412408 . A C 2453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2484,184,0 +chr14 53412521 . C T 1539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1568,105,0 +chr14 53412523 . A G 1539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1568,105,0 +chr14 53412874 . G A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-0.354;DP=31;FS=4.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:926,0,153 +chr14 53413043 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.032;DP=36;FS=10.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:627,0,659 +chr14 53413109 . C T 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:903,66,0 +chr14 53413131 . C T 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 +chr14 53413219 . C A 1227.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:90:1256,90,0 +chr14 53413292 . T C 1521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=-0.950;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=31.15;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1550,108,0 +chr14 53413320 . C T 1711.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1740,120,0 +chr14 53413372 . A T 1863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.711;DP=72;FS=3.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=25.89;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,48:72:99:1892,0,688 +chr14 53413494 . T C 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 +chr14 53413676 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr14 53413864 . G T 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:537,39,0 +chr14 53414412 . A T 1206.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:87:1235,87,0 +chr14 53414528 . G A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-2.301;DP=59;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,42:59:99:1566,0,643 +chr14 53414566 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.511;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:316,0,1494 +chr14 53414958 . A G 1458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1487,102,0 +chr14 53415105 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr14 53415106 . C G 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr14 53415126 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr14 53420448 . TGA T 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:68:372,0,68 +chr14 53456046 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr14 53461492 . G A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=6.327;DP=146;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,41:146:99:890,0,4796 +chr14 53461580 . TA T 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=1.076;DP=127;FS=6.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,38:124:99:973,0,2583 +chr14 53466860 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=1.551;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,27:150:99:394,0,4537 +chr14 53501334 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=-1.835;DP=96;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:334,0,2645 +chr14 53561554 . C G 4947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=-0.773;DP=289;FS=8.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,112:176:99:4976,0,2509 +chr14 53561617 . A T 4908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=1.453;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=36.69;ReadPosRankSum=-2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,55:73:99:4937,0,2509 +chr14 53561747 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=1.850;DP=96;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:870,0,994 +chr14 53569659 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-0.524;DP=57;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:296,0,1607 +chr14 53570154 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.156;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:229,0,954 +chr14 53570376 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.020;DP=33;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:345,0,1709 +chr14 53570382 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.508;DP=33;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:339,0,1709 +chr14 53570464 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.994;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:419,0,699 +chr14 53570501 . G T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-0.673;DP=42;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:303,0,1068 +chr14 53573678 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=-1.518;DP=192;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,36:191:99:544,0,5889 +chr14 53573729 . T A 2838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.374;ClippingRankSum=-1.665;DP=170;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:2867,0,2933 +chr14 53576681 . A G 3905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.802;DP=257;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,113:257:99:3934,0,4749 +chr14 53581153 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=1.192;DP=178;FS=6.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,41:178:99:814,0,5214 +chr14 53582138 . G A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.409;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,49:276:99:690,0,8274 +chr14 53591497 . C T 4752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=2.385;DP=280;FS=8.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,134:280:99:4781,0,4749 +chr14 53592945 . C T 5272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=1.299;DP=303;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,152:303:99:5301,0,5332 +chr14 53597197 . C T 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-0.472;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:1352,0,1644 +chr14 53729937 . C G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=1.787;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:236,0,1600 +chr14 53733426 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:340,0,438 +chr15 19280 . A AACACAC 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=2.140;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:244,0,767 +chr15 22442 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.607;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:472,0,441 +chr15 23131 . CACAAACAA C 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.333;DP=35;FS=26.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=24.19;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:896,0,684 +chr15 24246 . T A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-1.031;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:407,0,1086 +chr15 25675 . G T 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.935;DP=89;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,56:87:99:1847,0,1019 +chr15 25745 . G A 1843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-2.999;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1872,0,2938 +chr15 65644 . T C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.669;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:628,0,536 +chr15 65674 . T C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.174;DP=53;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:697,0,1403 +chr15 113355 . C T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.924;DP=73;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1357,0,2703 +chr15 113362 . C T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=1.065;DP=75;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1357,0,2665 +chr15 124685 . G A 2086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.628;DP=119;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:2115,0,1858 +chr15 125454 . G A 2444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.293;DP=115;FS=17.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=21.26;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,73:114:99:2473,0,1323 +chr15 132040 . C T 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=-1.430;DP=75;FS=6.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:1086,0,1111 +chr15 291789 . AC A 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,0:10:99:240,0,1306 +chr15 291791 . ACACGCACACACACACAC A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=2.353;DP=24;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=8.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:243,0,1270 +chr15 296104 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=22.44;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:85:320,0,85 +chr15 471002 . C A 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-3.595;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:1100,0,2861 +chr15 471043 . G C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=3.992;DP=66;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:597,0,1661 +chr15 471377 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=-0.771;DP=31;FS=7.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:517,0,555 +chr15 474469 . C A 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-1.166;DP=53;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:840,0,856 +chr15 477687 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,140 +chr15 481787 . TGTAAGCCTTCGTATTCCTGTAGACACAAACATCAGGATTGAATGGTGCTTTAAACATGCTACCGTTTCCAG T 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:356,0,3707 +chr15 533500 . G A 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.256;DP=78;FS=1.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:1390,0,1234 +chr15 540444 . G A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.861;DP=32;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:651,0,341 +chr15 622061 . A G 1302.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1331,93,0 +chr15 741456 . C T 236.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 +chr15 764475 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.049;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:246,0,387 +chr15 783472 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,115 +chr15 846982 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.251;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=24.46;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:444,0,416 +chr15 846997 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.355;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:238,0,518 +chr15 859621 . G T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:295,0,334 +chr15 861778 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr15 861779 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr15 869705 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,449 +chr15 869806 . A G 253.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=32.07;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:282,0,18 +chr15 877163 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,190 +chr15 890998 . C G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=2.011;DP=30;FS=9.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:423,0,650 +chr15 891061 . A C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.503;DP=29;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:423,0,884 +chr15 891211 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=1.019;DP=39;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:603,0,937 +chr15 900885 . C G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:310,0,130 +chr15 901447 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:337,0,336 +chr15 987317 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:277,0,466 +chr15 988197 . T C 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=1.491;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:542,0,304 +chr15 988214 . T A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.047;ClippingRankSum=1.032;DP=33;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.48;ReadPosRankSum=3.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:341,0,1024 +chr15 988245 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-4.255;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:374,0,1447 +chr15 1041136 . T A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DP=21;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=24.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:79:538,0,79 +chr15 1041237 . G GA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:238,0,179 +chr15 1042658 . T A 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-2.938;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:633,0,1414 +chr15 1043367 . A G 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr15 1159813 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-1.778;DP=91;FS=6.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:387,0,2675 +chr15 1214228 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.566;DP=35;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:289,0,989 +chr15 1550118 . T C 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-1.689;DP=57;FS=9.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=12.89;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,7:52:99:763,0,3294 +chr15 1557577 . A G 236.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:265,0,16 +chr15 1592216 . GTT G 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=3.054;DP=63;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:541,0,852 +chr15 1626734 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.478;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=26.32;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:502,0,109 +chr15 1656938 . T C 2201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.787;DP=85;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,59:85:99:2230,0,694 +chr15 1663197 . A G 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.877;DP=97;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1618,0,1649 +chr15 1667256 . G A 1635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=1.721;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:1664,0,4692 +chr15 1667266 . G A 1765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=2.502;DP=104;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.061;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1794,0,2158 +chr15 1667336 . C T 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-3.950;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=14.69;ReadPosRankSum=3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:1380,0,1797 +chr15 1667580 . A G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.381;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:637,0,803 +chr15 1725635 . AACCTGGAAGAAACACACACACAGCAGCTGAGCACGGGAGACTGACACACATTCAGAAGATCGATCCTCCAGAGTCTG A 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=33.98;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:411,0,620 +chr15 1781528 . CT C 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=3.205;DP=44;FS=7.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:255,0,672 +chr15 1782047 . T C 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.662;DP=52;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:378,0,1296 +chr15 1791703 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=1.466;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:381,0,403 +chr15 1791711 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:336,0,583 +chr15 1791757 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=3.305;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:404,0,427 +chr15 1792125 . A G 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=-0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=30.03;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:51:719,0,51 +chr15 1793507 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:364,0,45 +chr15 1814601 . T TCA 4902.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-2.582;DP=386;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,157:347:99:4940,0,5604 +chr15 1814728 . T C 2112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=-2.116;DP=285;FS=26.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=7.41;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,84:285:99:2141,0,7593 +chr15 1814870 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-1.089;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:497,0,997 +chr15 1817694 . C T 7530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=-0.898;DP=436;FS=4.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,251:436:99:7559,0,6225 +chr15 1818616 . A G 5287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=1.344;DP=282;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=18.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,160:281:99:5316,0,6774 +chr15 1818670 . G A 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.724;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=12.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:879,0,1190 +chr15 1830634 . T C 10520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=1.847;DP=579;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=18.17;ReadPosRankSum=2.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,317:577:99:10549,0,9135 +chr15 1939724 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:293,0,165 +chr15 2188709 . C T 1666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.151;DP=66;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=25.25;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,45:66:99:1695,0,538 +chr15 2188738 . A G 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.357;DP=71;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,42:71:99:1392,0,996 +chr15 2346130 . C G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=2.603;DP=65;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:451,0,1707 +chr15 2403813 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=2.443;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:292,0,393 +chr15 2493690 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.810;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:355,0,342 +chr15 2494412 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53:229,0,53 +chr15 2518175 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.667;DP=92;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:518,0,2643 +chr15 2525848 . GCAGGTAAACAGTAGTGGGGGGTGATTGGTGTGTAATTGAACACACTGATGTTGATCTGATGTGGTGGTCTGCTA G 2910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=2.843;DP=82;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=29.31;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,69:74:99:2948,0,189 +chr15 2529023 . TGGTGAGTGCAGATCAGCGCAGATCACACCACTGAAACCGACTACTGTTGATCAGAGCAAATGAGTGATGTTGTTGCTGGTGTCCGTCA T 3571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.559;DP=88;FS=1.763;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=23.21;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,83:88:99:3609,320,0 +chr15 2551854 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.371;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:304,0,996 +chr15 2572120 . C T 2000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-2.908;DP=57;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:2029,0,172 +chr15 2582084 . T A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=1.701;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:520,0,546 +chr15 2582283 . C CG 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.510;DP=31;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:345,0,316 +chr15 2584342 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=1.560;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:388,0,437 +chr15 2631829 . C T 5379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=-0.026;DP=338;FS=4.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,166:338:99:5408,0,6083 +chr15 2665497 . A C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr15 2698714 . C A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr15 2721558 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.334;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:513,0,520 +chr15 2738147 . T C 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.298;DP=83;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,64:83:99:2512,0,409 +chr15 2769280 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=1.236;DP=36;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:316,0,953 +chr15 2795843 . CT C 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:99:297,0,113 +chr15 2795888 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=31.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:99:297,0,113 +chr15 2797800 . C CG 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=24.87;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:286,0,51 +chr15 2812330 . CTG C 718.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:756,52,0 +chr15 2841515 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=29.31;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:46:380,0,46 +chr15 2964800 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:287,0,54 +chr15 2964832 . T C 277.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.78;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:305,0,12 +chr15 3024419 . C T 239.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:268,0,15 +chr15 3027566 . G C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.997;DP=79;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:290,0,2340 +chr15 3102525 . A C 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.248;ClippingRankSum=-0.850;DP=64;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1136,0,856 +chr15 3113973 . G A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-1.568;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1238,0,1245 +chr15 3195719 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.696;DP=45;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,10:45:99:250,0,2671 +chr15 3195726 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.854;DP=44;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:256,0,2671 +chr15 3268272 . G GT 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.729;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=28.55;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:62:509,0,62 +chr15 3269144 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:449,0,318 +chr15 3269226 . A C 1096.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:78:1125,78,0 +chr15 3336749 . T A 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:631,45,0 +chr15 3391357 . C G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:294,0,612 +chr15 3508873 . A C 1948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:1977,135,0 +chr15 3508933 . A G 1948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:99:1977,135,0 +chr15 3508987 . T C 1165.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:84:1194,84,0 +chr15 3509084 . T C 220.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:19:249,19,0 +chr15 3590269 . TCCTGCACACATCAATAAAACAGGCTGATTGACTACAGGTCAGGTTTGAATGAAAATGAGAAGAGCTTTAAGCAAACGTGTA T 308.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=34.30;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:35:346,35,0 +chr15 4858002 . C T 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=-1.415;DP=282;FS=6.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,73:282:99:1155,0,18293 +chr15 4858711 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.309;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:260,0,1718 +chr15 4858897 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.042;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:238,0,428 +chr15 4859108 . C CT 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.351;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:492,0,1876 +chr15 4975238 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:252,0,511 +chr15 5259435 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:341,0,205 +chr15 5262181 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:234,0,343 +chr15 5477997 . C T 1507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-0.274;DP=55;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=27.41;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1536,0,350 +chr15 5531042 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=-1.755;DP=49;FS=2.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:285,0,1376 +chr15 5616846 . T C 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-1.078;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:542,0,700 +chr15 5617268 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-1.303;DP=57;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:99:390,0,864 +chr15 5688169 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:289,0,371 +chr15 5723749 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.422;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:288,0,1938 +chr15 5724074 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=-0.478;DP=120;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,32:120:99:723,0,3195 +chr15 5765829 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.989;DP=61;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:519,0,1636 +chr15 5773331 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.023;DP=71;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:271,0,1918 +chr15 5781534 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-1.809;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:296,0,2171 +chr15 5792668 . A G 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.662;DP=254;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.242;QD=5.98;ReadPosRankSum=2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,66:252:99:1546,0,7175 +chr15 5793654 . TCTGGAAAAAAGAACCATGCATTAGCCAGGCACATGATAAAATTGTAAACAACAATGAAATTAGCGAGTCTGACAAAACCAACTTAC T 22903.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=6.807;DP=534;FS=2.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=30.64;ReadPosRankSum=-2.836 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,517:534:99:22941,1753,0 +chr15 5793770 . GCTGTTTATGTGGAGAAAACAAGAAATTAAGAAAACAAGACAAACTTGTAACAGTTGTGTTCAAGAATGTGTTAAATGCCACAGTAAAAGAGGCAAACTTAC G 24985.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=7.247;DP=618;FS=1.737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,593:615:99:27152,2035,0 +chr15 5860823 . C CT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.490;DP=194;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:320,0,2716 +chr15 5861011 . G GT 937.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.962;DP=195;FS=9.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1089,0,2009 +chr15 5861354 . C T 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.090;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,45:61:99:1707,0,380 +chr15 5861380 . G C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=-1.076;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:252,0,962 +chr15 5861981 . T A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.014;DP=200;FS=5.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,42:199:99:778,0,5980 +chr15 5864472 . G C 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-2.937;DP=59;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:894,0,1326 +chr15 6013409 . C T 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.254;DP=63;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1125,0,1176 +chr15 6013475 . T C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.639;DP=54;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:710,0,1183 +chr15 6013508 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:441,0,826 +chr15 6034054 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.139;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:237,0,1345 +chr15 6034057 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:237,0,1345 +chr15 6349000 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.814;DP=52;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:286,0,2668 +chr15 6349001 . G T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.398;DP=50;FS=7.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:286,0,2668 +chr15 6400173 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-1.002;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:323,0,195 +chr15 6438221 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:309,0,190 +chr15 6452439 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-2.234;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:357,0,608 +chr15 6498255 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-2.628;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,493 +chr15 6544430 . A C 1826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-1.501;DP=322;FS=2.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,81:309:99:1855,0,8783 +chr15 6692649 . T TA 862.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=-1.881;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=17.25;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:900,0,797 +chr15 6728828 . T A 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:943,66,0 +chr15 6728991 . GT G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-1.520;DP=48;FS=11.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:267,0,2712 +chr15 6728996 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-1.325;DP=49;FS=10.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:267,0,2712 +chr15 6833661 . C G 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-1.965;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=29.61;ReadPosRankSum=2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:887,0,355 +chr15 6866200 . G A 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.624;DP=58;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:881,0,1556 +chr15 6868954 . T G 3549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3578,253,0 +chr15 6868985 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.197;ClippingRankSum=0.270;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:572,0,2033 +chr15 6873696 . T A 1871.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=-0.527;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1900,135,0 +chr15 6873759 . T A 1428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1457,105,0 +chr15 6873811 . T TA 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-1.644;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:370,0,585 +chr15 6873838 . G GA 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.137;DP=45;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.223;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:441,0,621 +chr15 7078483 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.145;DP=55;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=5.87;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:351,0,1592 +chr15 7105907 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=1.319;DP=40;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=8.22;ReadPosRankSum=-2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:357,0,2436 +chr15 7117007 . T C 2443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=-1.885;DP=186;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=13.14;ReadPosRankSum=3.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,70:186:99:2472,0,4048 +chr15 7117635 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-0.621;DP=67;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:491,0,1756 +chr15 7117709 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=1.411;DP=60;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=7.16;ReadPosRankSum=4.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:458,0,3443 +chr15 7117715 . T A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.510;DP=59;FS=2.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=7.28;ReadPosRankSum=4.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:458,0,3443 +chr15 7117985 . A AC 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-1.185;DP=60;FS=8.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:668,0,1270 +chr15 7118045 . C T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-1.607;DP=105;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,34:97:99:1135,0,2312 +chr15 7118479 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-0.844;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:578,0,641 +chr15 7118584 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=-0.816;DP=42;FS=4.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:561,0,1083 +chr15 7118724 . C A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=3.191;DP=96;FS=9.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,34:96:99:1137,0,2187 +chr15 7228840 . G GA 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-2.017;DP=51;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:387,0,561 +chr15 7471044 . A G 611.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:640,48,0 +chr15 7471077 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.787;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=24.94;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:502,0,153 +chr15 7478306 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr15 8260537 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.589;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:330,0,1324 +chr15 8275713 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-1.180;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:353,0,1547 +chr15 8458600 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.224;DP=32;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:289,0,867 +chr15 8460008 . TA T 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.249;DP=41;FS=11.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:680,0,231 +chr15 8461299 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:443,0,246 +chr15 8461716 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr15 8740164 . TA T 305.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:7:330,0,7 +chr15 8934381 . A G 2598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-2.690;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,75:184:99:2627,0,3591 +chr15 8934461 . T A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.745;DP=125;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:760,0,3768 +chr15 9128817 . A G 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-1.437;DP=78;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:1024,0,1756 +chr15 9143502 . AT A 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.742;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:536,0,876 +chr15 9143671 . T C 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=3.681;DP=71;FS=19.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:1275,0,1148 +chr15 9144258 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=1.963;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=7.82;ReadPosRankSum=2.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:638,0,1919 +chr15 9144505 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-1.323;DP=24;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,522 +chr15 9145889 . A T 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=1.307;DP=74;FS=7.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=27.29;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,53:74:99:2048,0,548 +chr15 9146064 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=2.821;DP=37;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=6.70;ReadPosRankSum=-2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:276,0,1061 +chr15 9376338 . G A 3018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-3.682;DP=228;FS=1.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,89:228:99:3047,0,6775 +chr15 9445388 . G A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.750;DP=72;FS=3.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1224,0,1541 +chr15 9468797 . G C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:233,0,283 +chr15 9468810 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:303,0,296 +chr15 9488361 . T A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.190;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:528,0,1939 +chr15 9489038 . AAC A 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=2.387;DP=70;FS=8.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=3.62;ReadPosRankSum=-3.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:291,0,1589 +chr15 9489187 . A T 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=1.560;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=15.92;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1350,0,1325 +chr15 9489401 . G A 3679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-2.460;DP=149;FS=11.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.70;ReadPosRankSum=3.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,96:145:99:3708,0,1336 +chr15 9489471 . T G 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=1.426;DP=75;FS=4.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1400,0,1338 +chr15 9489510 . A C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.255;ClippingRankSum=-0.525;DP=44;FS=9.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.18;ReadPosRankSum=-4.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:476,0,1075 +chr15 9489670 . A G 3752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.368;DP=122;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,91:120:99:3781,0,1536 +chr15 9489671 . T C 3752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.644;DP=122;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,91:120:99:3781,0,1585 +chr15 9489814 . G C 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=3.132;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=13.28;ReadPosRankSum=-2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:732,0,2281 +chr15 9489815 . G T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=3.491;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=14.66;ReadPosRankSum=-3.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:732,0,2283 +chr15 9490397 . T G 2831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-2.221;DP=98;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,62:93:99:2860,0,733 +chr15 9490650 . T A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-1.485;DP=99;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1564,0,1764 +chr15 9491039 . A G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.498;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:439,0,2447 +chr15 9492012 . T C 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=-0.383;DP=94;FS=6.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,57:82:99:2145,0,696 +chr15 9492214 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=-0.865;DP=79;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:384,0,1943 +chr15 9492647 . C T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.532;DP=108;FS=3.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:958,0,2873 +chr15 9495064 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.575;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:391,0,477 +chr15 9495303 . T TA 696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.846;DP=88;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:734,0,1446 +chr15 9495426 . G C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.419;DP=76;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:1044,0,925 +chr15 9495462 . T C 1513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.941;DP=68;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=22.26;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,43:68:99:1542,0,894 +chr15 10384872 . T C 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 +chr15 10810478 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-1.341;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:245,0,874 +chr15 11118631 . A T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr15 11118675 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr15 11120971 . G A 385.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.290;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:413,0,9 +chr15 11845494 . A G 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.411;ClippingRankSum=0.795;DP=97;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:1410,0,1429 +chr15 11859456 . A G 2612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.636;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:2641,0,2642 +chr15 11859570 . G T 2642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=2.025;DP=129;FS=4.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,81:129:99:2671,0,1588 +chr15 11864665 . T C 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.715;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:610,0,394 +chr15 11942367 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.659;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:417,0,1377 +chr15 11942404 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.677;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:392,0,1692 +chr15 12146960 . C T 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 +chr15 12231960 . TA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-0.126;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:367,0,707 +chr15 12367679 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=2.163;DP=71;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:390,0,2143 +chr15 12368006 . T G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-1.843;DP=75;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:343,0,2336 +chr15 12994996 . A T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.291;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:468,0,313 +chr15 12998236 . A AT 267.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:305,30,0 +chr15 13003350 . TA T 288 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:388,45,0 +chr15 13135770 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=18.21;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,219 +chr15 13385231 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=24.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:576,0,169 +chr15 13388196 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=28.74;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:89:488,0,89 +chr15 13388367 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.424;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=24.92;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:427,0,112 +chr15 13392204 . CT C 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.200;DP=26;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:265,0,285 +chr15 13392750 . CT C 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-1.194;DP=23;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:399,0,222 +chr15 13392763 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:394,0,124 +chr15 13394961 . C G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:343,0,204 +chr15 13564528 . C CA 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=-0.370;DP=81;FS=9.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:421,0,1328 +chr15 13780216 . A C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.813;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:401,0,350 +chr15 13894454 . A AT 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=-1.902;DP=20;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=21.69;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:471,0,447 +chr15 13954301 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:295,0,96 +chr15 13988329 . CGTAAGTCCAGGAGACATATTTAAATATTTCCCACTGATCCTTTTTTTTTTAAATCAAAACCAACATTTGACTAATTGTGTTTATTTGCTTCTTTTCAG C 3438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=2.730;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=34.73;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,82:98:99:3475,0,2326 +chr15 13989595 . GGCAGGTGATCTAAAAATTTTGTCATTTGTCATGTTAGATAAAGTCCTGATGCTCATAGAACTTTGAGAACTTTATTTACATAAGGAGACACTCTAT G 3552.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.840;DP=85;FS=4.944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=31.39;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,81:85:99:3590,288,0 +chr15 14009632 . G A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.590;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:931,0,1974 +chr15 14009641 . T G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=1.518;DP=50;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:931,0,1976 +chr15 14115239 . TCCTGAAGAAAGCAAATCCCAGTATGAATGACACAAGTAAACAAGACAACATGACATAATTATTAAAGAAAAGAAAACATGGTA T 439.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=1.691;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:477,177,0 +chr15 14368501 . AT A 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.981;DP=78;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:433,0,855 +chr15 14368985 . A AT 1450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.395;DP=146;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1488,0,1562 +chr15 14426319 . AGTAAGCATTAATCAATAGAGATAAGATGTGTTTGTTGACATGGTTTGATATCAGCTGCTATAAAACGTCTATGTGGAAACACAATTGAATTATTTCATTTTTTTCCCTTCTTTATCTCCAG A 1125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=1.250;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=29.82;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:97:1163,97,0 +chr15 14482513 . TCTACAAAACAGACTGTTTTCATTCTGACTGCTCTGGTGTAGTTATAAAACATTCATCTGTGAACTGACGCTTTGCTCAC T 233.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=1.657;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:271,108,0 +chr15 14606108 . C T 1446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=1.756;DP=87;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1475,0,1454 +chr15 14606132 . C T 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.833;DP=80;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:1354,0,1334 +chr15 14611656 . C G 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.469;DP=66;FS=2.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=15.77;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1069,0,1066 +chr15 14611799 . C A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.866;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:704,0,532 +chr15 14805270 . CTG C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=1.562;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,303 +chr15 15095246 . TCCTGCTGAACAGAGAAACAAACAACGCTTTTCGAGTCTGATAAACAACGGCTATTTGTGTGCCTCGCGAAATACGGTAAATAAACCGCAACCAACATTAGATTTAAAACAAAGAGACTTA T 1292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.233;ClippingRankSum=-0.791;DP=230;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,60:230:99:1330,0,13521 +chr15 15095250 . GCTGAACAGAGAAACAAACAACGCTTTTCGAGTCTGATAAACAACGGCTATTTGTGTGCCTCGCGAAATACGGTAAATAAACCGCAACCAACATTAGATTTAAAACAAAGAGACTTAC G 6078.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.543;DP=223;FS=1.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=27.26;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,150:219:99:6116,0,5217 +chr15 15174789 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.173;DP=34;FS=8.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:657,0,538 +chr15 15197988 . A C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=1.220;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:378,0,593 +chr15 15197997 . G C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:378,0,593 +chr15 15213187 . T A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=1.381;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:535,0,480 +chr15 15342572 . C A 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.467;DP=91;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1595,0,1271 +chr15 15400063 . G T 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.027;DP=77;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,43:76:99:1446,0,1130 +chr15 15425402 . CT C 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-0.717;DP=45;FS=16.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=6.15;ReadPosRankSum=2.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:314,0,575 +chr15 15425451 . A AC 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.072;DP=47;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:635,0,590 +chr15 15756781 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:270,0,62 +chr15 15758372 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.281;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.410;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:577,0,805 +chr15 15794923 . A G 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.245;DP=67;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1156,0,1236 +chr15 15880633 . G T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=2.320;DP=59;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1068,0,978 +chr15 15890374 . A G 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-1.947;DP=50;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:819,0,917 +chr15 15890406 . A G 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.100;DP=63;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:964,0,1175 +chr15 15891580 . T G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.205;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=28.51;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:912,0,171 +chr15 15893225 . A G 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.166;DP=39;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:636,0,645 +chr15 15893388 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.498;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:523,0,474 +chr15 15908228 . C T 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=-0.004;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,55:91:99:1943,0,1275 +chr15 15912542 . CT C 1232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.096;DP=97;FS=8.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:1270,0,1351 +chr15 15913142 . AT A 863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.881;DP=76;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:901,0,929 +chr15 15933426 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:247,0,114 +chr15 15935037 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.47;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:240,0,56 +chr15 15935974 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr15 15939391 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.07;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:337,0,45 +chr15 15954882 . C T 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-1.339;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1108,0,1028 +chr15 15955353 . C CT 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.183;DP=34;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:589,0,188 +chr15 15955738 . CA C 2436.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:2474,186,0 +chr15 15956194 . T C 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=2.384;DP=67;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:965,0,2156 +chr15 15956343 . T C 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-1.574;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:1198,0,851 +chr15 15956677 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.134;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=18.49;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:435,0,321 +chr15 15958603 . G A 1722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.631;DP=88;FS=7.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=19.58;ReadPosRankSum=2.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,53:88:99:1751,0,1172 +chr15 15965548 . A G 1611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.471;DP=83;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,50:82:99:1640,0,1068 +chr15 16062664 . AGTAGGTTGATCTTTAGATGAACTCACAGAGGTATACAGTAATGTAATCAAATTTCTAGCAAGTCATTTTATTGCTTTTGTTTTTAG A 857.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-1.753;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=34.31;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:99:895,0,119 +chr15 16067274 . T C 1266.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-2.086;DP=34;FS=7.899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=29.29;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:56:1295,56,0 +chr15 16068164 . AT A 599.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:637,60,0 +chr15 16142206 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:478,0,501 +chr15 16142208 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.395;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:478,0,501 +chr15 16164544 . ACACG A 339.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.28;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8:376,8,0 +chr15 16164679 . C T 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.791;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1134,0,1144 +chr15 16171366 . G A 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.336;DP=58;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1109,0,942 +chr15 16287082 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.090;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:568,0,579 +chr15 16299803 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:253,0,504 +chr15 16336023 . T A 4788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.489;DP=275;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,133:275:99:4817,0,4695 +chr15 16336104 . T A 4037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=1.649;DP=230;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=17.56;ReadPosRankSum=2.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,112:230:99:4066,0,3787 +chr15 16339866 . T C 3434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.209;DP=203;FS=9.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,107:203:99:3463,0,3480 +chr15 16358093 . C T 4173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-0.917;DP=243;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,134:243:99:4202,0,3837 +chr15 16358386 . C CT 1200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.115;DP=200;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,93:182:99:1754,0,1771 +chr15 16391734 . A AT 1055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-1.859;DP=145;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:1093,0,7694 +chr15 16391807 . CAT C 2012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-1.435;DP=134;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=15.02;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:2050,0,2670 +chr15 16421064 . CCCTGTACACAGCGGATAAACACAACTGAATAAGTGTCATTTCAGTGAATTGACTGTCTGTTATTGATGAAAAATTAGTCATTTGTA C 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=1.397;DP=24;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.45;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:816,0,236 +chr15 16442630 . CTCAGGTAATGGTGTTTTCTTTTTTAGACTTCTACATTTGACCAATAATAAATGGAGCAATTCCAATTTGACCTCAGCGTCTCCTACCTT C 7766.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.952;DP=187;FS=7.298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,185:187:99:7804,620,0 +chr15 16443735 . GT G 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.050;DP=21;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:291,0,135 +chr15 16462692 . T C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.584;DP=18;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:97:530,0,97 +chr15 16506888 . T TAA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:250,0,256 +chr15 16839764 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:317,0,355 +chr15 16842536 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-1.455;DP=21;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:248,0,919 +chr15 16844670 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=21.72;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:354,0,166 +chr15 16846092 . C T 370.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:399,27,0 +chr15 16857865 . C T 1646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-1.024;DP=95;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1675,0,1710 +chr15 16858979 . A T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:441,0,457 +chr15 16889839 . G C 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=-0.609;DP=50;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,29:50:99:980,0,759 +chr15 16891064 . T C 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-0.394;DP=49;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:940,0,713 +chr15 16892002 . C A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-2.247;DP=48;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1091,0,632 +chr15 16910264 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.887;DP=55;FS=5.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:882,0,993 +chr15 16964344 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.283;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:627,0,844 +chr15 16964467 . C T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.340;DP=44;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:784,0,755 +chr15 17092281 . G T 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=1.290;DP=77;FS=3.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:1597,0,2950 +chr15 17092301 . TGGTGAGTCGTGTCATTTTCATTTATTTGAAATAGTTTTCCCTCAGTCTGTGTGATGTTATTTGACTCTGTGTTTGTCA T 2067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.725;ClippingRankSum=3.333;DP=97;FS=3.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=21.32;ReadPosRankSum=-4.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,64:82:99:2105,0,6278 +chr15 17099468 . AT A 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.470;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:655,0,1417 +chr15 17099473 . C T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.675;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=16.07;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:655,0,1417 +chr15 17201502 . GA G 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:489,48,0 +chr15 17332320 . C A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr15 17379539 . T G 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.967;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:865,0,613 +chr15 18032487 . G A 1319.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1350,96,0 +chr15 18033575 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.190;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:455,0,442 +chr15 18033862 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=1.463;DP=46;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:542,0,963 +chr15 18036556 . ACATATCTAAAGACAGCAGAG A 1532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1570,135,0 +chr15 18036581 . TTAGACACAGCTACAGAACAGATTTGTACATTTTAAGAAGACGATGTGAGTTTTGTCTGTGCATGCAAACGTCCGTGCCACTGTTGACCATGTAATAATGAAACTTAC T 1532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=1.386;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:99:1570,135,0 +chr15 18036871 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=17.04;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:369,0,282 +chr15 18037040 . T TA 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.437;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.861;QD=15.74;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:478,0,483 +chr15 18075521 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.623;DP=37;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:637,0,603 +chr15 18216939 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.165;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:412,0,360 +chr15 18217038 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-1.457;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:399,0,208 +chr15 18217272 . A T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.425;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:370,0,1199 +chr15 18217274 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:370,0,1200 +chr15 18217328 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=2.358;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:271,0,341 +chr15 18225344 . TA T 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-2.725;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:546,0,527 +chr15 18231368 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:271,0,202 +chr15 18232235 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.080;DP=45;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:660,0,842 +chr15 18232495 . TCTGTAAAAATGATTCATAAACTGATTCTCATTATCTGCTTCTTAAGCGCTCAGTATATTGACTCCTCAC T 996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.061;DP=36;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:1034,0,2544 +chr15 18236226 . G T 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=-0.552;DP=85;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:1178,0,1717 +chr15 18237316 . G A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=-1.145;DP=61;FS=3.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:845,0,1149 +chr15 18239485 . C A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr15 18248399 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=2.414;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:293,0,2806 +chr15 18248410 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.918;DP=41;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:293,0,2806 +chr15 18248601 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.674;DP=30;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=7.53;ReadPosRankSum=2.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:254,0,864 +chr15 18632794 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:412,0,423 +chr15 18644097 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.80;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,141 +chr15 18869391 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.893;DP=37;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:481,0,838 +chr15 18889199 . T C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.245;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:676,0,142 +chr15 18889698 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:277,0,52 +chr15 18890894 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.932;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:312,0,137 +chr15 18892639 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,246 +chr15 18953955 . AGGTC A 1385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=1.209;DP=36;FS=6.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1423,0,328 +chr15 18953960 . AGTATTGAGAATTACATACAAAATACATCTGTTTGAGATCAACATAAACATTACATAACAAGCTTGTCTGAAATTCTGCACCATCAG A 1385.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=1.052;DP=37;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=32.41;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:14:1423,0,14 +chr15 18969962 . C T 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.714;DP=69;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1268,0,1260 +chr15 18973696 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-0.492;DP=60;FS=12.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.928;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:432,0,1538 +chr15 19035969 . C T 1987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.774;DP=99;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,59:99:99:2016,0,1441 +chr15 19038364 . G A 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=-0.771;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1156,0,1092 +chr15 19042945 . G T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=2.238;DP=73;FS=8.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:822,0,1618 +chr15 19043510 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=-0.009;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:783,0,995 +chr15 19049007 . G A 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.577;DP=79;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=19.63;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,48:79:99:1579,0,1054 +chr15 19086289 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.330;DP=52;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:866,0,887 +chr15 19166461 . G A 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.206;DP=72;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,43:71:99:1512,0,983 +chr15 19166603 . A T 1178.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=-0.990;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=24.82;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1207,81,0 +chr15 19300265 . TGTAAGTCACCATCATTTGTCATCTGATTTCGTACTGTTCTTTTAATGTCTACAAATAAACATTTCTCTTTCAGGATTTAGACAATGCAGGCTAATGTTTTTTCTCTCTTGTGTTTGTTTTAAG T 1456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.448;DP=39;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=30.72;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:99:1494,0,545 +chr15 19307023 . A G 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.541;DP=86;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:1460,0,1544 +chr15 19307105 . G A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.198;DP=51;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:857,0,914 +chr15 19308583 . G A 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-2.968;DP=57;FS=2.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:805,0,1146 +chr15 19308629 . T C 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.634;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:872,0,2605 +chr15 19309205 . A T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=-2.149;DP=51;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:1007,0,1818 +chr15 19309206 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-2.122;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:1022,0,1818 +chr15 19310139 . G T 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.783;DP=40;FS=3.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=28.14;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1154,0,375 +chr15 19310473 . C T 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-1.388;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=19.46;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1585,0,1195 +chr15 19310653 . C T 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.641;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,66:102:99:2292,0,1238 +chr15 19310878 . A T 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.133;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1262,0,662 +chr15 19311006 . G T 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-1.084;DP=52;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:787,0,993 +chr15 19311562 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:235,0,343 +chr15 19312068 . A C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-1.101;DP=24;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:406,0,440 +chr15 19326308 . A T 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=-2.115;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,58:97:99:2215,0,3118 +chr15 19326309 . C T 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-2.202;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,60:99:99:2215,0,3118 +chr15 19332664 . C A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr15 19336025 . G A 3767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=-0.715;DP=205;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,115:205:99:3796,0,3172 +chr15 19345561 . C T 4027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.707;DP=228;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,113:228:99:4056,0,4135 +chr15 19345609 . G T 3958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-2.027;DP=224;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,124:224:99:3987,0,3465 +chr15 19346074 . TGTGAGGATCGTTCGGATGCTCGGATACTTTTCTTTTTTCTGTATTGAGATTATATTAAAGTGAGTGTGTTTTTGCACCATAG T 5960.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.220;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=25.92;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:5998,580,0 +chr15 19356496 . T TA 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=2.007;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=15.98;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:293,0,164 +chr15 19372984 . T A 478.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=34.21;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:505,0,2 +chr15 19373799 . A G 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:636,45,0 +chr15 19425257 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:380,0,457 +chr15 19429845 . T TA 1519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.210;DP=115;FS=4.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,65:100:99:1585,0,802 +chr15 19490030 . G A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.265;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:993,0,215 +chr15 19492318 . G T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.835;DP=83;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:1335,0,1338 +chr15 19502151 . G A 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=1.694;DP=51;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:943,0,730 +chr15 19605428 . G C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:325,0,292 +chr15 19605500 . G T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:396,0,370 +chr15 19605687 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.634;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.40;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:426,0,156 +chr15 19605737 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:334,0,374 +chr15 19607215 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.935;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:313,0,445 +chr15 19609480 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,331 +chr15 19609625 . G T 291.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.42;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:320,0,19 +chr15 19610047 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,206 +chr15 19610546 . AG A 585.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:43:623,43,0 +chr15 19614859 . CTG C 1831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.139;DP=158;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1869,0,1967 +chr15 19671051 . T C 3618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-1.649;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,107:161:99:3647,0,1815 +chr15 19671567 . G A 2443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.639;DP=145;FS=6.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:2472,0,2474 +chr15 19693045 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:243,0,222 +chr15 19797632 . G A 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.681;DP=69;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,46:69:99:1744,0,619 +chr15 19799778 . TCTACAAAAACACAGACATTACGTTCAACCCAGTTAATCATCCAAACAGAATATGCAGAGCTGGCAATTTTGATTCAC T 1315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=2.297;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=29.16;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:99:1353,106,0 +chr15 19805088 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=19.28;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:356,0,235 +chr15 19805748 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.304;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:367,0,310 +chr15 19847817 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=-0.503;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:345,0,610 +chr15 19855551 . G GT 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=1.083;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:49:328,0,49 +chr15 19868015 . G A 2120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=-1.028;DP=108;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=19.64;ReadPosRankSum=2.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:2149,0,1630 +chr15 19870291 . G T 3289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-0.139;DP=171;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,100:171:99:3318,0,2381 +chr15 19903198 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:273,0,228 +chr15 19904146 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.248;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:415,0,406 +chr15 19956806 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:362,0,140 +chr15 19966391 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-2.002;DP=31;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=21.99;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:710,0,383 +chr15 19973459 . TCTACAAATATTTGCATACAACAAGGTCAACACTGATAACACTGCAGAGATAAAATAATTAAAAATTAGAAAAATGTTACTCAC T 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=2.807;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=28.12;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:459,0,2459 +chr15 20055067 . C T 741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.569;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:770,60,0 +chr15 20074380 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-1.672;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=12.03;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:293,0,489 +chr15 20075651 . A AT 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.340;DP=41;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:501,0,569 +chr15 20075747 . T A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.470;DP=108;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=6.94;ReadPosRankSum=-2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:778,0,3144 +chr15 20075796 . A C 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.345;DP=144;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:1090,0,3960 +chr15 20078509 . T C 2375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.209;DP=165;FS=5.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,67:165:99:2404,0,3365 +chr15 20078554 . G T 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=1.129;DP=76;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=18.00;ReadPosRankSum=-2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:1396,0,1390 +chr15 20078626 . T A 2907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.378;DP=173;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.435;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,83:173:99:2936,0,2911 +chr15 20079908 . A G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.221;DP=151;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,34:151:99:727,0,4598 +chr15 20080050 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-0.287;DP=140;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:289,0,4463 +chr15 20083130 . A C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=8.279;DP=170;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=2.47;ReadPosRankSum=-7.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,29:160:99:448,0,5143 +chr15 20084937 . C A 2025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=2.642;DP=223;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,74:223:99:2054,0,5756 +chr15 20085031 . A G 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=1.354;DP=203;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=6.09;ReadPosRankSum=-2.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,56:203:99:1264,0,5724 +chr15 20085322 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=6.043;DP=152;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=4.01;ReadPosRankSum=-1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,34:151:99:638,0,4353 +chr15 20085733 . G T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.806;ClippingRankSum=6.905;DP=122;FS=8.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=1.66;ReadPosRankSum=-3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,19:122:99:231,0,4026 +chr15 20085987 . T A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=4.397;DP=198;FS=6.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,40:198:99:774,0,6221 +chr15 20103111 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=-0.697;DP=77;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:351,0,2397 +chr15 20103130 . T A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=-0.115;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,33:86:99:1107,0,1938 +chr15 20103149 . GCCTGCAGCATAAAAATAACAACACAAACAACATTAGAATCAATGGTAGATGATGTCTGAGAGCTGTTTGATGTGACCTGA G 3293.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=1.116;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=30.08;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,83:85:99:3331,257,0 +chr15 20103711 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.234;DP=99;FS=3.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:446,0,3514 +chr15 20103807 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=1.024;DP=114;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,23:114:99:432,0,3482 +chr15 20108016 . T A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-2.283;DP=79;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:997,0,1772 +chr15 20110285 . G C 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=-4.643;DP=92;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:809,0,2418 +chr15 20110352 . T C 1716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;ClippingRankSum=-0.649;DP=118;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=14.55;ReadPosRankSum=3.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:1745,0,2946 +chr15 20110400 . C A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.415;DP=113;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:1743,0,2197 +chr15 20110609 . C G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.557;DP=98;FS=7.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,26:98:99:701,0,2667 +chr15 20111205 . A C 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=1.556;DP=97;FS=5.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=14.11;ReadPosRankSum=-2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,38:97:99:1397,0,2060 +chr15 20116390 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=4.261;DP=74;FS=21.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=4.39;ReadPosRankSum=-2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:353,0,2305 +chr15 20120233 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=2.140;DP=63;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=5.49;ReadPosRankSum=2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:374,0,1785 +chr15 20120251 . G T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.138;DP=66;FS=3.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:567,0,1719 +chr15 20120614 . A G 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.630;DP=63;FS=5.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:839,0,1350 +chr15 20126464 . A G 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 +chr15 20131471 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.964;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=7.27;ReadPosRankSum=2.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,1791 +chr15 20131476 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.667;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:261,0,1791 +chr15 20138197 . A G 202.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:231,0,23 +chr15 20161155 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=2.363;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=15.49;ReadPosRankSum=-2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:276,0,281 +chr15 20161634 . C A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,140 +chr15 20214744 . CT C 2544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.324;DP=146;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,87:144:99:2582,0,1717 +chr15 20216672 . G A 2755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=1.367;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,82:132:99:2784,0,1736 +chr15 20227623 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,284 +chr15 20228198 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,465 +chr15 20483422 . A G 1026.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1055,78,0 +chr15 20502906 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.985;DP=59;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,39:59:99:1399,0,749 +chr15 20504529 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.042;DP=63;FS=5.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:720,0,1474 +chr15 20509988 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.311;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:271,0,545 +chr15 20510045 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:516,0,857 +chr15 20515968 . C T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.342;DP=44;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:807,0,1825 +chr15 20515974 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.485;DP=46;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:807,0,1813 +chr15 20517889 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.064;DP=71;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,41:71:99:1399,0,1070 +chr15 20523540 . C T 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.099;DP=81;FS=2.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:1465,0,1396 +chr15 20535840 . T A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.704;DP=65;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:1157,0,1072 +chr15 20544691 . G A 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-0.019;DP=67;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1180,0,1166 +chr15 20545024 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-1.137;DP=46;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:478,0,900 +chr15 20545072 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.069;DP=43;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:467,0,918 +chr15 20631112 . T A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.761;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:683,0,1448 +chr15 20839217 . GCTGAAAAGAAATACAGTTTCATGAGTCATTGTAAAAATTCTATCAAAACTAATAAATCACGTATGAAATACTACAAAC G 3319.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.272;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,75:80:99:3357,266,0 +chr15 21108877 . TC T 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-1.768;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=13.89;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:440,0,439 +chr15 21404778 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.196;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:257,0,901 +chr15 21890776 . T C 560.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.217;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:587,2,0 +chr15 21893014 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=27.56;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:359,0,90 +chr15 21893062 . A C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:317,0,96 +chr15 21893552 . G T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr15 21893565 . A T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr15 22613218 . CAGGTAAAGTTCACTGACAACCCAGAGCTTTTAAGCACCCTGAATCTGTCAGTGCACTGAATCTCGCTGTTTATGTCCCT C 1281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=2.324;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,39:46:99:1319,0,1049 +chr15 22613402 . CTCGGGTACTGTGAAGTGTAAAGCTTTTATCTGCATTCAGACAGTCTGCCAGTTTGGGTTGAAGGTGTAATATTGTGTTTCTGTCCTTGT C 768.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.127;DP=61;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:806,0,2078 +chr15 22733627 . C CA 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.225;DP=65;FS=1.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:474,0,469 +chr15 22734699 . A AG 946.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.606;DP=90;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:984,0,986 +chr15 22744026 . TCCTGTATAAAAAAAAAAAGGACATTTAACTTTTCTGCAGTGTGATTTCTTTATCATAGACAAGCCCCCTGTAACAACATACAGA T 3574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.115;DP=88;FS=2.132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=25.90;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,85:88:99:3612,291,0 +chr15 22806455 . AACCTGAAACATAATAACCAGATTTTAAAAGGTATCTAGAAATGTGGAAATTGCTACACATTTGTGAGCAGGTCTC A 459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=2.123;DP=15;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=30.65;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:497,0,710 +chr15 22831962 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.213;DP=26;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=28.91;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:780,0,152 +chr15 22865572 . TAC T 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.947;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:454,0,2039 +chr15 22895164 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,137 +chr15 22895491 . T G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.092;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:419,0,382 +chr15 22998392 . GCTGTGAGAGGACCATAGTGAATGTCAGTATCATCTTGCATGTTGTGTGGATATCGAGACAACATAAGGCTGATACATAC G 2745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2783,199,0 +chr15 23037683 . GCTACGGGATGCATGAAAATGCTCATTATTTAGCTTCAATATTAAGTCAGTATCACTAACAAAAACTACAAAGCAACTTAC G 2014.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=1.924;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:99:2052,180,0 +chr15 23077701 . G A 4695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.471;DP=296;FS=0.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=15.86;ReadPosRankSum=2.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,134:295:99:4724,0,5222 +chr15 23092583 . A AT 663.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=1.941;DP=106;FS=10.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=6.26;ReadPosRankSum=-2.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,34:93:99:701,0,1213 +chr15 23143530 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.706;ClippingRankSum=-1.973;DP=52;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:464,0,1295 +chr15 23171065 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.496;DP=34;FS=7.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.410;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:451,0,733 +chr15 23172487 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:245,0,95 +chr15 23379118 . A T 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.503;DP=94;FS=3.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:1275,0,1944 +chr15 23429973 . A C 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-1.629;DP=118;FS=2.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:99:1347,0,2670 +chr15 23998240 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.475;DP=145;FS=1.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,31:145:99:499,0,4085 +chr15 24025538 . G GA 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-3.725;DP=79;FS=11.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:391,0,1774 +chr15 24025621 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-1.385;DP=104;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:393,0,3302 +chr15 24091431 . C CT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.228;DP=244;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,43:237:99:324,0,5493 +chr15 24106803 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:233,0,57 +chr15 24199470 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-1.348;DP=58;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:424,0,1634 +chr15 24443892 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.098;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:261,0,503 +chr15 24445158 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,559 +chr15 24602425 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:482,0,476 +chr15 24603767 . A AT 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.236;DP=142;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,34:134:99:428,0,2569 +chr15 24604803 . T TC 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-0.276;DP=222;FS=3.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=2.99;ReadPosRankSum=2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,47:222:99:700,0,6926 +chr15 24665030 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.500;DP=72;FS=12.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:472,0,1980 +chr15 24708230 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.708;DP=29;FS=6.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=7.34;ReadPosRankSum=2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:241,0,1594 +chr15 24708248 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=2.633;DP=31;FS=6.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:241,0,1594 +chr15 24813693 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=-0.369;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=4.87;ReadPosRankSum=2.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:301,0,1591 +chr15 24816248 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=1.116;DP=42;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.42;ReadPosRankSum=2.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:256,0,1317 +chr15 24816719 . CT C 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-1.216;DP=36;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:272,0,581 +chr15 24835145 . TC T 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.716;ClippingRankSum=-2.412;DP=279;FS=35.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=2.13;ReadPosRankSum=3.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,61:276:99:631,0,22928 +chr15 24840196 . TCTGCTGAAACAAACCCTTAAACGTCAAATGGTTCAAATTCAACAAATAATAAATACACAAACAAACCCTCATACACAC T 15540.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.911;DP=367;FS=3.543;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=27.53;ReadPosRankSum=-3.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,356:362:99:15578,1059,0 +chr15 24842640 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.193;DP=431;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,96:431:99:1901,0,12810 +chr15 24927734 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=16.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:242,0,281 +chr15 24937824 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.395;DP=56;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:484,0,1392 +chr15 24942765 . TCCTGAGTGAAAACAAAGAGAGCAGGAGAATTTCAAACACTACAGCTCTGAGTGGAGGAATGAGAAAAAGCCATCACTCA T 2237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.723;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=35.71;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2275,197,0 +chr15 24975962 . A C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.223;DP=154;FS=13.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,23:154:99:235,0,5235 +chr15 26015339 . TA T 264.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:7:301,7,0 +chr15 26046641 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-0.109;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:450,0,262 +chr15 26720218 . G GA 853.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:64:891,64,0 +chr15 27052279 . AT A 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-2.198;DP=111;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,59:85:99:1419,0,452 +chr15 27713454 . TGGTAAGAGTCATCTAGAGCTGATTTATTTCAGGTTATTTCTCTAACACAGGTGCTATAGATTTTCTTTATTTACTGCA T 763.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=30.14;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:67:801,67,0 +chr15 27754603 . C CA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.576;DP=252;FS=7.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=1.61;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,55:231:99:443,0,4223 +chr15 27755829 . A T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.047;DP=224;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,41:223:99:648,0,7393 +chr15 27756300 . T A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.079;DP=203;FS=12.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,43:202:99:763,0,6344 +chr15 27756508 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.895;DP=225;FS=6.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,41:225:99:426,0,8411 +chr15 27770377 . AAGGTGCATTTTGATTCTGTATCTGAAGCTCCATTTATTTTTTTGTAGTCATGTGGCTGATCATGTAGTTTATGTGTGTTGC A 7305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.442;DP=203;FS=6.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,201:203:99:7343,598,0 +chr15 27788343 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.585;DP=64;FS=5.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:299,0,1842 +chr15 27898458 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-1.079;DP=82;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:398,0,2266 +chr15 28107848 . C G 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.540;DP=283;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,50:283:99:605,0,8677 +chr15 28108289 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.791;DP=320;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,45:320:99:240,0,10546 +chr15 28108863 . AAT A 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.225;DP=176;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,30:149:99:458,0,4192 +chr15 28110154 . T G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-1.952;DP=282;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,42:282:99:350,0,9756 +chr15 28111614 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=1.046;DP=267;FS=8.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=1.91;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,46:266:99:537,0,9473 +chr15 28112669 . G A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.637;DP=309;FS=3.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,54:308:99:799,0,10234 +chr15 28114438 . TTA T 902.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.406;DP=280;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,52:269:99:940,0,9215 +chr15 28114577 . C T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-2.132;DP=236;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,41:236:99:604,0,7974 +chr15 28115913 . G GA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.106;DP=107;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=2.03;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:255,0,1424 +chr15 28118220 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.583;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.587;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:455,0,2712 +chr15 28136146 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-0.074;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:324,0,816 +chr15 28354215 . TTC T 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-1.626;DP=90;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:502,0,1941 +chr15 28355461 . G A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=1.382;DP=87;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:944,0,1907 +chr15 28356044 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.769;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:261,0,820 +chr15 28439092 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-0.730;DP=266;FS=6.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,40:266:99:234,0,10375 +chr15 28501135 . G T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.233;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:428,0,634 +chr15 28735068 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.673;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,756 +chr15 28735137 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.020;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:285,0,957 +chr15 28742976 . C A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-2.104;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:272,0,1396 +chr15 29082094 . AAGGTAAACATTTATGCATATTGACAGTTTTTACAAATTAATACGACTTATTCTGTGGTAAGTCCTGCTGATTCTTTTCC A 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=2.700;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:369,0,1953 +chr15 29508407 . T C 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-1.354;DP=112;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:550,0,7253 +chr15 29508410 . A C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=-0.430;DP=116;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,25:116:99:544,0,7253 +chr15 29511339 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.070;DP=92;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:287,0,2793 +chr15 29511409 . C CA 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.409;DP=103;FS=7.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,29:96:99:509,0,1821 +chr15 29517257 . G GT 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-2.003;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:311,0,1051 +chr15 29682335 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.265;DP=39;FS=5.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:360,0,2240 +chr15 29682345 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.313;DP=39;FS=7.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:356,0,2240 +chr15 29714721 . GAGGTGCTTCTTATTGCTTGTTTTTTTATACAATAGTGTTTATAAGTTCTTTAGTAGTCTTGCTTTCTGCTGTCTTATGGCCTGC G 401.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:6:438,0,6 +chr15 29735567 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-1.036;DP=78;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:461,0,2572 +chr15 30136479 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.749;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:358,0,531 +chr15 30137091 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.695;DP=47;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:293,0,1380 +chr15 30140967 . GACCTGCATGAGAAAATTGGCCATTAAATTATGTTACTTGTAAACAGCATCAACATAAATGTCATGCATTAATGAATGATTTAAAGACTC G 3516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=2.391;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=31.09;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:3554,255,0 +chr15 30141279 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.119;DP=76;FS=6.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:257,0,2452 +chr15 30150648 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.221;DP=72;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:229,0,2123 +chr15 30178240 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=-1.239;DP=50;FS=6.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:291,0,1426 +chr15 30189206 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.870;DP=54;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:267,0,1543 +chr15 30221081 . A AGCACAACCATCAACG 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.483;DP=49;FS=9.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.836;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:554,0,1496 +chr15 30459619 . GC G 7041.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.569;ClippingRankSum=-8.830;DP=292;FS=29.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=24.12;ReadPosRankSum=-5.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,53:258:99:7079,0,7422 +chr15 30459865 . T C 10007.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-1.010;DP=145;FS=3.413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=31.17;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,123:141:44:10036,44,0 +chr15 30459866 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.655;DP=148;FS=7.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,36:148:99:422,0,9210 +chr15 30460004 . T C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=1.929;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:724,0,2879 +chr15 30460013 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=1.822;DP=74;FS=2.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:441,0,3761 +chr15 30483940 . C CA 369.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-1.267;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:11:406,0,11 +chr15 30484629 . GT G 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.336;DP=26;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=11.22;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:329,0,279 +chr15 30534737 . T TC 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.805;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:273,0,178 +chr15 30538407 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=1.768;DP=42;FS=5.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:296,0,1126 +chr15 30538581 . C T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.279;DP=40;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:538,0,859 +chr15 30538776 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.109;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:502,0,648 +chr15 30538941 . G GT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.883;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:319,0,632 +chr15 30539003 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:455,0,391 +chr15 30539018 . C G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:429,0,404 +chr15 30539693 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-1.428;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:572,0,976 +chr15 30539702 . CT C 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-2.152;DP=34;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:482,0,1167 +chr15 30540262 . G A 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=-0.296;DP=73;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,42:73:99:1468,0,1034 +chr15 30540930 . T A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-1.254;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1161,0,1123 +chr15 30541891 . A T 2673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.740;DP=134;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:2702,0,4343 +chr15 30541901 . G A 2595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.324;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:2624,0,5693 +chr15 30811058 . A G 5953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-1.898;DP=283;FS=5.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,175:283:99:5982,0,3754 +chr15 30811940 . G A 8889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.338;DP=435;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,261:435:99:8918,0,6072 +chr15 30813128 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,323 +chr15 30871834 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,99 +chr15 31128242 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.099;DP=18;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=25.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:484,0,152 +chr15 31525181 . T G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,290 +chr15 31581613 . G A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=1.400;DP=44;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:801,0,721 +chr15 31598232 . C CA 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.377;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:460,0,217 +chr15 32045574 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:261,0,58 +chr15 32064292 . T TG 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:253,0,127 +chr15 32129543 . GA G 2463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.337;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,96:137:99:2501,0,594 +chr15 32266403 . A T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=27.65;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:360,0,52 +chr15 32985627 . CT C 701.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.009;DP=54;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:739,0,547 +chr15 32986225 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=32.90;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:373,0,150 +chr15 32986349 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:393,0,325 +chr15 32986810 . T C 834.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.175;DP=24;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=34.76;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:10:862,0,10 +chr15 32986846 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:255,0,1131 +chr15 32988869 . T C 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.733;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:1595,0,1493 +chr15 33056360 . C A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:351,0,666 +chr15 33134604 . C A 4413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=-0.824;DP=268;FS=21.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,122:268:99:4442,0,4952 +chr15 33134669 . C CT 2873.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-1.152;DP=354;FS=12.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,139:317:99:2911,0,3693 +chr15 33135948 . G T 301.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:346,27,0 +chr15 33136929 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:336,0,665 +chr15 33137015 . C G 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.054;DP=33;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:601,0,533 +chr15 33137626 . A AAG 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-2.499;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=7.89;ReadPosRankSum=3.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:274,0,228 +chr15 33138242 . G T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=1.389;DP=43;FS=6.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.86;ReadPosRankSum=2.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:538,0,979 +chr15 33138499 . C G 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=1.356;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:980,0,1615 +chr15 33138634 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.320;DP=50;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:684,0,1119 +chr15 33138940 . G C 585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:614,42,0 +chr15 33139507 . C G 1689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.032;DP=29;FS=2.062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=29.40;ReadPosRankSum=2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:50:1718,50,0 +chr15 33139796 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,281 +chr15 33139924 . T G 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-1.149;DP=47;FS=4.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:1017,0,690 +chr15 33140139 . G A 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-1.609;DP=255;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=3.73;ReadPosRankSum=-2.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,52:255:99:980,0,7859 +chr15 33141715 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.21;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,179 +chr15 33142755 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.28;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:311,0,147 +chr15 33143640 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.32;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:423,0,126 +chr15 33155981 . C CA 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.431;DP=391;FS=12.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=1.24;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,74:380:99:523,0,8437 +chr15 33436772 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.917;DP=90;FS=12.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:574,0,2389 +chr15 33437252 . G T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-2.396;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:422,0,723 +chr15 33437256 . AAT A 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=1.262;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:291,0,854 +chr15 33437312 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.794;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:300,0,914 +chr15 33869709 . A C 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.282;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:963,0,317 +chr15 33870236 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.321;DP=32;FS=3.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:288,0,820 +chr15 33877124 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.708;DP=50;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:329,0,1414 +chr15 33918174 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-3.529;DP=164;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,32:164:99:544,0,5116 +chr15 34182846 . C A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=2.491;DP=14;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=26.41;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:88:398,0,88 +chr15 34196074 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=-2.378;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:415,0,1651 +chr15 34224222 . G A 2453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.087;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=34.56;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,60:71:99:2482,0,489 +chr15 34224225 . C T 2453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.139;DP=69;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,58:69:99:2482,0,467 +chr15 34262323 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=-3.389;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=10.58;ReadPosRankSum=-2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:314,0,612 +chr15 34266283 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=2.489;DP=33;FS=19.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:763,0,411 +chr15 34339318 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.633;DP=51;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:261,0,1518 +chr15 34387760 . GA G 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.534;DP=69;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.330;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:428,0,883 +chr15 34530422 . T A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:320,0,129 +chr15 34634830 . A AAC 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=-2.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=27.80;ReadPosRankSum=2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:60:482,0,60 +chr15 34635133 . GA G 533.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.390;DP=74;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:571,0,1117 +chr15 34635546 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.552;DP=34;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:304,0,882 +chr15 34636038 . G A 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-1.695;DP=72;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1094,0,1418 +chr15 35157989 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.417;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:516,0,478 +chr15 35158929 . C G 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.872;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:771,0,266 +chr15 35411443 . A G 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 +chr15 35411545 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 +chr15 35456100 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.104;DP=76;FS=6.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:876,0,1828 +chr15 35456145 . A G 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.241;DP=79;FS=4.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:945,0,1789 +chr15 35481214 . AGTGAGTCTTTTAACAGAGATAGTTCTGTTTTCCATCTGTCTTGTTTTTTTTTTTCCTCACTTGCCCTTTCTCACTGTTTTCTTATTCTAATTCTCTTTGCTGCCACCAG A 2259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.452;ClippingRankSum=6.756;DP=109;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=20.73;ReadPosRankSum=-4.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,72:107:99:2297,0,19030 +chr15 35483395 . A C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-1.733;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:348,0,176 +chr15 35483714 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:277,0,539 +chr15 35485376 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.842;DP=42;FS=3.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:234,0,2608 +chr15 35485380 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.854;DP=44;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:234,0,2608 +chr15 35490337 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=-0.776;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:444,0,876 +chr15 35491656 . T A 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 +chr15 35491868 . C CAT 202.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr15 35493568 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=-1.354;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:331,0,505 +chr15 35493696 . C T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr15 35714295 . TA T 633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-0.659;DP=30;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:83:671,0,83 +chr15 35714298 . CAAT C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-1.749;DP=39;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:660,0,120 +chr15 35715229 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-1.885;DP=27;FS=6.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:229,0,764 +chr15 35720138 . T TA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.370;DP=14;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:56:238,0,56 +chr15 36157887 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,107 +chr15 36158303 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.460;DP=30;FS=11.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:455,0,582 +chr15 36180189 . A G 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.390;DP=95;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=13.25;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1287,0,1929 +chr15 36181158 . A AAC 805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.526;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:843,0,1289 +chr15 36181160 . C CATTAAACGGCCCCGT 796.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:834,0,1406 +chr15 36214188 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=3.880;DP=53;FS=18.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=6.64;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:380,0,1377 +chr15 36231358 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.188;DP=77;FS=12.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:869,0,1836 +chr15 36231500 . C T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-1.034;DP=62;FS=2.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:929,0,1248 +chr15 36231619 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.596;DP=71;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:721,0,3655 +chr15 36248329 . C T 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.674;DP=261;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,58:261:99:1114,0,8007 +chr15 36248562 . C CA 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.995;DP=110;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,27:109:99:337,0,2193 +chr15 36258394 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.365;DP=50;FS=4.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:346,0,2490 +chr15 36272115 . G C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.441;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:270,0,1146 +chr15 36295373 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.475;DP=55;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:519,0,1404 +chr15 36320745 . C A 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +chr15 36429876 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.594;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:44:503,0,44 +chr15 36431502 . G C 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 +chr15 36431516 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr15 36534521 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=1.485;DP=72;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:363,0,2136 +chr15 36534794 . C T 1741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-2.045;DP=89;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,54:89:99:1770,0,1170 +chr15 36534832 . C T 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.099;DP=92;FS=2.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:859,0,2296 +chr15 36994473 . A C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-1.912;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:379,0,2155 +chr15 37280514 . C T 1167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=-0.693;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1196,87,0 +chr15 37280581 . T C 1020.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1049,75,0 +chr15 37774058 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.104;DP=120;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,21:120:99:236,0,3830 +chr15 37776746 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=-1.605;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,16:87:99:257,0,2670 +chr15 37792642 . C A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.363;DP=89;FS=7.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:339,0,2780 +chr15 38642738 . TA T 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.532;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:375,0,802 +chr15 38665961 . GCT G 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.867;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:295,0,444 +chr15 38825407 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=1.521;DP=43;FS=4.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:312,0,1062 +chr15 39356201 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:242,0,258 +chr15 39515511 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.020;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:275,0,929 +chr15 39517608 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.042;DP=22;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,500 +chr15 39699223 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.182;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:246,0,1168 +chr15 39764452 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=27.51;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:419,0,191 +chr15 39817415 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=2.127;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:322,0,349 +chr15 39817438 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.123;DP=21;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,473 +chr15 39817673 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=1.356;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:488,0,721 +chr15 39817742 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=1.427;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:297,0,1299 +chr15 39867869 . A G 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=18.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:408,0,55 +chr15 39926526 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.991;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:318,0,176 +chr15 40132126 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr15 40197021 . A T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.990;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:379,0,714 +chr15 40197122 . T G 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.597;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:805,0,548 +chr15 40203667 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.676;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:491,0,470 +chr15 40219721 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.739;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:788,0,828 +chr15 40220441 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-2.249;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:251,0,1361 +chr15 40220739 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.661;DP=57;FS=3.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:454,0,1924 +chr15 40220901 . A G 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=2.292;DP=59;FS=5.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:725,0,1249 +chr15 40221017 . T C 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.066;DP=62;FS=5.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1410,0,801 +chr15 40221095 . T C 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.460;DP=44;FS=6.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=17.20;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:785,0,719 +chr15 40221261 . C T 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=2.132;DP=54;FS=7.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=15.68;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:875,0,1039 +chr15 40222077 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=1.551;DP=28;FS=9.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:326,0,1799 +chr15 40226284 . T C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=2.508;DP=51;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:486,0,1268 +chr15 40296015 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-0.681;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:326,0,968 +chr15 40364510 . C T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.082;DP=63;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=13.62;ReadPosRankSum=3.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:886,0,1171 +chr15 40371870 . A T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.148;DP=57;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:983,0,960 +chr15 40476278 . GA G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-2.627;DP=22;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:271,0,610 +chr15 40476658 . G GT 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.099;DP=34;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:336,0,359 +chr15 40800234 . C T 3352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=1.990;DP=224;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,95:224:99:3381,0,4409 +chr15 40800459 . A G 3512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.579;DP=204;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,97:204:99:3541,0,3542 +chr15 40802490 . C A 3849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=2.529;DP=223;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=17.26;ReadPosRankSum=1.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,108:223:99:3878,0,3588 +chr15 40806871 . T A 2864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.388;DP=211;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,84:211:99:2893,0,4242 +chr15 40827250 . T C 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=-0.295;DP=119;FS=2.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,46:118:99:1513,0,2277 +chr15 40869846 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.238;DP=67;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:846,0,1322 +chr15 40873488 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-0.609;DP=42;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:407,0,853 +chr15 41081448 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=29.89;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:47:357,0,47 +chr15 41219678 . C A 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:591,42,0 +chr15 42020961 . T C 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-1.047;DP=90;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1094,0,2321 +chr15 42021941 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.347;DP=34;FS=5.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:536,0,679 +chr15 42022178 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.493;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:556,0,186 +chr15 42023165 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.116;DP=75;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:915,0,1761 +chr15 42023467 . AT A 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=2.414;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:239,0,2527 +chr15 42023688 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=2.252;DP=57;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:401,0,3384 +chr15 42024064 . A G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.013;DP=41;FS=4.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:614,0,839 +chr15 42024207 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-1.571;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:256,0,1405 +chr15 42024723 . T A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=-2.461;DP=60;FS=5.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=6.90;ReadPosRankSum=2.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:442,0,1642 +chr15 42084589 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=-1.346;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:401,0,1738 +chr15 42180738 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.787;DP=59;FS=5.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:514,0,1450 +chr15 42209733 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=-1.813;DP=32;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:498,0,581 +chr15 42341410 . A G 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 +chr15 42362206 . TAA T 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.577;DP=59;FS=2.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:370,0,2018 +chr15 42592481 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.093;DP=49;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:301,0,1915 +chr15 42592483 . A G 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.248;DP=48;FS=2.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:832,0,862 +chr15 42592705 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=1.146;DP=44;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:282,0,1431 +chr15 42759328 . T A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-0.530;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:344,0,709 +chr15 42759339 . A C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:344,0,709 +chr15 42783186 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:297,0,555 +chr15 42949334 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-1.178;DP=50;FS=6.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:272,0,2969 +chr15 42949335 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-3.662;DP=51;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:251,0,3036 +chr15 42949449 . A G 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.574;DP=46;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:653,0,1003 +chr15 43109636 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.227;DP=43;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:834,0,1378 +chr15 43109642 . G T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.212;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:830,0,1378 +chr15 43112574 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.988;DP=53;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:343,0,2504 +chr15 43112575 . C G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=1.526;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:343,0,2504 +chr15 43127872 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:272,0,340 +chr15 43322037 . TCTACAACACAAAATATGATGTGAACAGTGTTGAAAAAGGTGTTCAATTGTGTAAAATCATAAAATTTTAC T 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.942;DP=17;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:510,0,1353 +chr15 43412105 . T C 371.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-1.738;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=28.56;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:397,0,1 +chr15 43696965 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.170;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:315,0,1297 +chr15 43704165 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.299;DP=55;FS=9.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:348,0,1579 +chr15 44192358 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-2.450;DP=20;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=14.64;ReadPosRankSum=-2.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:321,0,174 +chr15 44258315 . T A 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.567;DP=323;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.313;QD=5.15;ReadPosRankSum=2.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,82:323:99:1691,0,9116 +chr15 44268916 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.725;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=7.45;ReadPosRankSum=-2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,1472 +chr15 44268922 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=-1.174;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=12.94;ReadPosRankSum=-2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:99:274,0,1472 +chr15 44728909 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:351,0,526 +chr15 44808468 . C T 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=1.763;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,50:82:99:1631,0,1038 +chr15 44930161 . G T 2251.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2280,163,0 +chr15 45636735 . G C 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 +chr15 45636807 . A G 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-1.579;DP=40;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=26.37;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:1083,0,296 +chr15 45650805 . T A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=-1.287;DP=389;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,63:389:99:797,0,13136 +chr15 45660785 . G GCGGCAAGACCCAT 795.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,26:26:86:833,0,86 +chr15 45699553 . C G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 +chr15 45977705 . G T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr15 46006301 . G T 2690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.741;DP=96;FS=1.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.982;QD=28.03;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,65:95:99:2719,0,717 +chr15 46012136 . T C 6173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.269;DP=221;FS=23.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=27.94;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,166:221:99:6202,0,1267 +chr15 46020944 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:348,0,268 +chr15 46023465 . A T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr15 46024162 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:234,0,581 +chr15 46031497 . GCCTGAAGACAGCGAACATGATCATTTATACATTCAACACGCTCAATAAAACAGAAGACGTGTGTGAGATTCATA G 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=24;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:325,0,732 +chr15 46035075 . C G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.895;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:477,0,463 +chr15 46048721 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.151;DP=21;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=31.95;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:769,0,175 +chr15 46067076 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.062;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:344,0,692 +chr15 46071748 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=-0.520;DP=25;FS=17.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:411,0,521 +chr15 46071775 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=-1.285;DP=40;FS=12.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:526,0,803 +chr15 46072208 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.647;DP=54;FS=9.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:754,0,1055 +chr15 46091559 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:308,0,95 +chr15 46136182 . A T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.478;DP=49;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=19.44;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:981,0,919 +chr15 46140102 . G A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=1.449;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:582,0,487 +chr15 46145134 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.881;DP=37;FS=5.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:288,0,977 +chr15 46145162 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:534,0,561 +chr15 46150182 . A G 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.515;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=26.33;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1055,0,297 +chr15 46152305 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.345;DP=40;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:768,0,515 +chr15 46162131 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=1.267;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:461,0,313 +chr15 46162155 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.56;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,354 +chr15 46162641 . G T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-1.668;DP=48;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:402,0,1217 +chr15 46410558 . A G 201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:230,0,19 +chr15 46410621 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:273,0,357 +chr15 46466009 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.768;DP=185;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,27:185:99:244,0,5904 +chr15 46466079 . TCTGCACACACACACACACACACATTGACTACAGTGTTATGAATGTTGTGTGTGTGATGGTGTGTGTGTGTGTTGATGAAACGCTCGC T 7643.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.950;ClippingRankSum=1.440;DP=209;FS=10.924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=29.93;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,196:208:99:7681,495,0 +chr15 46486024 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.145;DP=89;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:344,0,2592 +chr15 46486395 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-1.478;DP=100;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:324,0,4210 +chr15 46507095 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=-0.667;DP=180;FS=3.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.141;QD=2.19;ReadPosRankSum=3.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,31:180:99:423,0,5668 +chr15 46511337 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.578;DP=126;FS=7.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,25:126:99:393,0,3778 +chr15 46515041 . A G 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=-0.289;DP=207;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,39:207:99:636,0,6360 +chr15 46532976 . TGGTTAGCTCCTCCTCCTCTGATTTCCTGTGCTATATTTGGTCACAGGGGCGTTAACCTGTTAAACTCCTCCCACA T 9704.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.052;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=33.82;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,227:230:99:9742,756,0 +chr15 46533117 . C T 2301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=-0.334;DP=170;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.929;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,75:169:99:2330,0,2982 +chr15 46533309 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.634;DP=183;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,34:182:99:482,0,5573 +chr15 46535997 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=-1.684;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,24:112:99:333,0,3083 +chr15 46566287 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.717;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:239,0,616 +chr15 46570568 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.945;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:315,0,285 +chr15 46573210 . G T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.250;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:791,0,1535 +chr15 46576794 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.722;DP=80;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=5.53;ReadPosRankSum=-1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:471,0,2258 +chr15 46576872 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.287;DP=77;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:565,0,2134 +chr15 46576956 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.264;DP=32;FS=6.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:278,0,793 +chr15 46587116 . A G 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=-0.138;DP=82;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=13.42;ReadPosRankSum=2.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,32:82:99:1129,0,1879 +chr15 46587296 . A G 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-0.665;DP=32;FS=8.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:634,0,513 +chr15 46587301 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.861;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:473,0,707 +chr15 46587939 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-1.144;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:333,0,1417 +chr15 46588029 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.188;DP=36;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:402,0,1163 +chr15 46588040 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-2.141;DP=44;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:251,0,1382 +chr15 46708882 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.748;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=4.23;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:333,0,1948 +chr15 46755211 . A G 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.778;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:36:758,0,36 +chr15 46774472 . A G 3570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;ClippingRankSum=5.157;DP=430;FS=18.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,140:430:99:3599,0,11069 +chr15 46774497 . T C 2521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=8.477;DP=469;FS=22.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:350,119:469:99:2550,0,12904 +chr15 46774557 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=1.842;DP=431;FS=2.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=1.15;ReadPosRankSum=8.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,64:431:99:522,0,13939 +chr15 46781681 . A G 3531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=-4.225;DP=454;FS=9.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,143:453:99:3560,0,11354 +chr15 46795402 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,216 +chr15 46837167 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-1.334;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:418,0,634 +chr15 46862123 . AG A 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.051;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:715,0,866 +chr15 46862783 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.980;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:381,0,2948 +chr15 46862784 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.840;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:381,0,2948 +chr15 46864538 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.805;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,14:82:99:245,0,5415 +chr15 46864541 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-1.693;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.939;QD=2.55;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,15:84:99:245,0,5415 +chr15 46866892 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=1.097;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:267,0,2525 +chr15 46867063 . G A 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.710;DP=87;FS=4.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:972,0,1941 +chr15 46867127 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.427;DP=60;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:282,0,1594 +chr15 46967677 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.21;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:76:395,0,76 +chr15 46969784 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.143;DP=115;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,30:115:99:627,0,3783 +chr15 46970035 . G A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-2.873;DP=118;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=6.81;ReadPosRankSum=3.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,34:118:99:832,0,3051 +chr15 46972546 . G GGT 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.193;DP=71;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:274,0,1065 +chr15 46981594 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.689;DP=110;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,29:109:99:630,0,2826 +chr15 46981689 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.331;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:367,0,5575 +chr15 47034385 . T G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-2.517;DP=53;FS=6.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:405,0,1507 +chr15 47080615 . C CT 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-2.126;DP=22;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:385,0,162 +chr15 47081368 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.372;DP=18;FS=5.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:537,0,109 +chr15 47082683 . C G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr15 47082684 . G T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr15 47082892 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=1.115;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=23.07;ReadPosRankSum=-1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:605,0,1376 +chr15 47082907 . A G 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=1.658;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:606,0,1376 +chr15 47086139 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.124;DP=48;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:802,0,770 +chr15 47086277 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.341;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:368,0,342 +chr15 47099482 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=1.031;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:293,0,663 +chr15 47314211 . T A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-1.508;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:686,0,490 +chr15 47314378 . G T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=-0.184;DP=34;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:840,0,331 +chr15 47407165 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=-0.731;DP=45;FS=3.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:285,0,1265 +chr15 47421370 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,264 +chr15 47422797 . A G 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.922;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:565,0,348 +chr16 38038 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=27.14;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,1:13:99:381,0,419 +chr16 127811 . TGTGTG T 794.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:67:832,67,0 +chr16 154286 . C A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr16 154294 . T C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr16 409600 . G C 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:439,30,0 +chr16 412675 . G A 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-1.866;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=25.25;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,38:54:99:1392,0,362 +chr16 1129399 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,382 +chr16 1213134 . A T 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=1.764;DP=93;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.653;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,62:93:99:2171,0,1015 +chr16 1215425 . C T 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=-2.434;DP=71;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=21.15;ReadPosRankSum=2.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:1530,0,862 +chr16 1225733 . A C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.177;DP=34;FS=5.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:445,0,742 +chr16 1226596 . G A 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-1.743;DP=38;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:976,0,355 +chr16 1227014 . A C 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.331;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:829,0,723 +chr16 1229051 . G C 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.942;DP=55;FS=5.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1057,0,857 +chr16 1229720 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.824;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:257,0,774 +chr16 1229875 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=-1.029;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:754,0,436 +chr16 1231888 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=-1.232;DP=44;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:915,0,560 +chr16 1232962 . C T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.736;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:823,0,509 +chr16 1291182 . G C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=2.908;DP=41;FS=5.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:301,0,1110 +chr16 1291207 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=2.210;DP=41;FS=4.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=13.60;ReadPosRankSum=-3.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:586,0,770 +chr16 1291236 . T G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.552;DP=55;FS=7.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=14.41;ReadPosRankSum=3.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:821,0,1041 +chr16 1303480 . C T 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.574;DP=58;FS=5.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:58:99:1218,0,799 +chr16 1345641 . G C 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:980,66,0 +chr16 1345642 . C A 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:980,66,0 +chr16 1345973 . C A 1195.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.076;DP=32;FS=4.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=30.37;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:1:1221,0,1 +chr16 1346330 . A T 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.133;DP=44;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=34.29;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:38:1537,0,38 +chr16 1346450 . A C 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-0.473;DP=66;FS=11.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,42:66:99:1714,0,840 +chr16 1347125 . G A 1721.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1750,126,0 +chr16 1347194 . T C 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=1.140;DP=69;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1249,0,1106 +chr16 1348496 . T A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=1.374;DP=42;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1015,0,357 +chr16 1348976 . A G 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=1.339;DP=22;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:99:744,0,106 +chr16 1349355 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.764;DP=25;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:558,0,315 +chr16 1353690 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-0.604;DP=35;FS=6.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:608,0,571 +chr16 1357310 . C T 2389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=2.386;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=31.86;ReadPosRankSum=1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,62:75:99:2418,0,197 +chr16 1367143 . G A 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +chr16 1367591 . C T 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 +chr16 1367656 . G A 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 +chr16 1368048 . A G 686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53:758,53,0 +chr16 1385491 . AAGGTGCTCACGCTATCAATGACCACAATTACACTTACTTTGATAAACAGGACGCTTAGGTTACCCTTCATTTAATAATAAATCCCTTTCTTAAAGCATTGCATTATGTGCAGTTTCTCACAATGTGTTCGCGAAGCTAACATCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGC A 2205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=1.574;DP=81;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=27.23;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,63:68:99:2243,0,258 +chr16 1413202 . ACAGGTGAGAACGAGCGCTGCTGATGCCCATTAGTACTGGAGAAGCCCACGCTTACTGTTGTGCTGTTATTTACTCTTT A 4316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=1.698;DP=102;FS=3.054;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:4354,333,0 +chr16 1421898 . T TAC 696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-2.433;DP=60;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:734,0,864 +chr16 1423267 . A C 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=2.442;DP=48;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=13.27;ReadPosRankSum=-2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:665,0,950 +chr16 1423651 . G C 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-1.211;DP=90;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:1535,0,1546 +chr16 1424107 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.788;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:970,0,972 +chr16 1424121 . C A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.822;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:997,0,1095 +chr16 1424332 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=2.009;DP=54;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:472,0,3025 +chr16 1425487 . G T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.428;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:774,0,1244 +chr16 1425599 . A G 2290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.311;DP=116;FS=8.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.525;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:2319,0,1745 +chr16 1493734 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:247,0,323 +chr16 1494070 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,336 +chr16 1495174 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:242,0,52 +chr16 1497777 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=21.70;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:332,0,163 +chr16 1497917 . T G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:305,0,97 +chr16 1519486 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.733;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.17;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,288 +chr16 1930389 . A G 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 +chr16 1930607 . T G 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 +chr16 2290710 . A T 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.052;DP=178;FS=12.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,46:178:99:1115,0,5137 +chr16 2297211 . A G 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.290;DP=135;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=8.40;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,42:134:99:1162,0,3585 +chr16 2297596 . A AT 1143.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-1.161;DP=98;FS=2.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1181,0,1122 +chr16 2503952 . A C 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=-0.584;DP=53;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=28.22;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1524,0,275 +chr16 2920251 . T C 277.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.88;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:306,0,14 +chr16 3076229 . TCA T 1331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.231;DP=127;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:1369,0,1289 +chr16 3076515 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:422,0,253 +chr16 3077929 . A C 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.858;DP=35;FS=9.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=27.02;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:974,0,1160 +chr16 3078171 . A AT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.349;DP=37;FS=25.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:451,0,453 +chr16 3101322 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,214 +chr16 3344600 . T C 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.217;DP=51;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:844,0,864 +chr16 3346995 . T A 9987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.270;ClippingRankSum=-1.920;DP=756;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,233:332:99:10016,0,2497 +chr16 3347052 . G A 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.855;DP=569;FS=20.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,72:318:99:935,0,14097 +chr16 3411255 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.590;DP=48;FS=4.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:924,0,609 +chr16 3411491 . G GT 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.220;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:436,0,746 +chr16 3429553 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=-1.232;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:362,0,344 +chr16 3474317 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=-1.032;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=31.11;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:40:526,0,40 +chr16 3474404 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:338,0,48 +chr16 3672476 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=32.75;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:50:445,0,50 +chr16 3686551 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.710;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:633,0,617 +chr16 3713350 . C CT 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.686;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:370,0,340 +chr16 3833749 . G GA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.740;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:56:244,0,56 +chr16 3932970 . C T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.182;DP=40;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.120;QD=26.69;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1096,0,285 +chr16 3950186 . G A 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.085;DP=69;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=24.13;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,46:68:99:1693,0,619 +chr16 3973039 . A G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=1.641;DP=55;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:526,0,1387 +chr16 3973424 . G T 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.236;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:997,0,638 +chr16 3973753 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:430,0,238 +chr16 3975059 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.921;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:610,0,446 +chr16 3976311 . C G 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.138;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:772,0,864 +chr16 4021033 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-3.170;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:416,0,210 +chr16 4037062 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.067;DP=23;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:477,0,674 +chr16 4041940 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:349,0,634 +chr16 4777867 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=1.098;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=13.81;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:401,0,498 +chr16 5101804 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.904;DP=75;FS=6.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:242,0,2340 +chr16 5113294 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-1.840;DP=64;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.069;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:251,0,1780 +chr16 5458904 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.133;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:423,0,3447 +chr16 5459216 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=2.198;DP=71;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:566,0,1970 +chr16 5485321 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=3.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=13.89;ReadPosRankSum=-3.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:306,0,685 +chr16 5485325 . A C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=23.15;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:99:306,0,685 +chr16 5485890 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:229,0,257 +chr16 5631624 . TA T 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.077;DP=27;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:373,0,328 +chr16 5631702 . CG C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-0.382;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:79:267,0,79 +chr16 5721677 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:291,0,361 +chr16 5777133 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.651;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,357 +chr16 5786922 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.970;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:724,0,724 +chr16 5792158 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.965;DP=45;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:910,0,1695 +chr16 5792167 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.564;DP=44;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:910,0,1695 +chr16 5819577 . GAGGTTCTCTATCCACTCAGGCCTGAATCACATCTGCTGCACCTGTCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATCCACATCTGTATCTCTCTTCATAC G 1679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.125;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,43:47:99:1717,0,437 +chr16 5824135 . C A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=1.981;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=14.08;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:845,0,1116 +chr16 5826655 . CAGGTGTGAAATCTACCCTTCCTAAACACTGAAACATGTCTGTGTAGAGCTGTTCATCTGTATACAGAGTGTTCACTGTGTTTAATCT C 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=2.894;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:557,0,2244 +chr16 5826656 . AGGT A 768.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-2.486;DP=47;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:806,0,2732 +chr16 5826664 . AATCTACCCTTCCTAAACACTGAAACATGTCTGTGTAGAGCTGTTCATCTGTATACAGAGTGTTCACTGTGTTTAATCTAGTGAG A 768.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=-1.777;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=15.69;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:806,0,2732 +chr16 5853356 . C A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.098;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:579,0,234 +chr16 5869291 . T G 491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:520,36,0 +chr16 5975246 . G A 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.205;DP=211;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=7.03;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,61:210:99:1511,0,5665 +chr16 6063995 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=-0.332;DP=43;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:772,0,517 +chr16 6067878 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.528;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:591,0,684 +chr16 6073983 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-2.468;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:308,0,307 +chr16 6373454 . GCCTGTGGTGAAACAGAGAAAAACTGATGATCATCTGTTCTCAATGAGCAAACATTTCTGTAAGAGGCAACTATAACTTAGGAACTATAGGTCAGCTTA G 3380.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=1.424;DP=82;FS=2.456;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3418,345,0 +chr16 6390581 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.900;DP=44;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:673,0,869 +chr16 6393408 . T C 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.478;DP=78;FS=4.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=19.71;ReadPosRankSum=-2.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,48:78:99:1566,0,1057 +chr16 6397355 . T C 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:551,45,0 +chr16 6400368 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.849;DP=61;FS=5.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:498,0,1550 +chr16 6400412 . T A 3933.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3962,283,0 +chr16 6400431 . T C 1265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=-0.822;DP=69;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1294,0,1240 +chr16 6400480 . C T 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.395;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1150,0,1375 +chr16 6400553 . T TA 2682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2720,200,0 +chr16 6400626 . G A 3204.83 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.325;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=24.12;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:3236,238,0 +chr16 6400725 . A C 6278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:6307,440,0 +chr16 6400797 . TA T 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=-3.010;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:1032,0,1614 +chr16 6400799 . A G 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-2.626;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:1032,0,1614 +chr16 6401490 . A AT 445.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:483,39,0 +chr16 6401572 . A T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr16 6403647 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr16 6403659 . T G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr16 6407209 . C T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 +chr16 6424935 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:239,0,131 +chr16 6424998 . T C 414.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=34.52;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:442,0,9 +chr16 6426482 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.850;DP=37;FS=7.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:528,0,678 +chr16 6426611 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.076;DP=30;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:376,0,660 +chr16 6429149 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.407;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:238,0,798 +chr16 6430572 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.471;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,564 +chr16 6479641 . C CA 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.658;DP=151;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=1.63;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,35:148:99:284,0,4042 +chr16 6483197 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.372;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:295,0,855 +chr16 6715611 . G T 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.042;DP=115;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,46:115:99:1523,0,2294 +chr16 6715670 . G A 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.478;DP=122;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:1464,0,2446 +chr16 6715745 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-0.721;DP=120;FS=14.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,32:120:99:706,0,3712 +chr16 6725876 . G A 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.260;DP=151;FS=6.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=7.22;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,44:151:99:1119,0,4058 +chr16 6725989 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.162;DP=126;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:612,0,3738 +chr16 6730501 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-1.180;DP=103;FS=5.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,30:103:99:784,0,2737 +chr16 6733764 . G T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-4.098;DP=51;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:920,0,795 +chr16 6741178 . A C 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-2.281;DP=130;FS=2.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,36:130:99:823,0,3621 +chr16 6741842 . A G 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.177;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,39:141:99:950,0,3883 +chr16 6744947 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.906;DP=153;FS=7.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,39:153:99:253,0,8322 +chr16 6745981 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.486;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,42:194:99:428,0,9009 +chr16 6746392 . C T 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-0.945;DP=192;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=6.73;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,55:192:99:1321,0,5201 +chr16 6749065 . CA C 1036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-0.468;DP=52;FS=9.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1074,0,135 +chr16 6749280 . T C 1823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-1.055;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,54:150:99:1852,0,5670 +chr16 6794159 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:236,0,64 +chr16 6795163 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.529;DP=58;FS=2.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:255,0,1652 +chr16 6800414 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.440;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:524,0,2128 +chr16 6811081 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=3.074;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.669;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:351,0,1926 +chr16 6814755 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.092;DP=72;FS=3.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,22:72:99:586,0,1938 +chr16 6819714 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.424;DP=70;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:586,0,1840 +chr16 6821517 . T G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.718;DP=118;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,27:118:99:497,0,3339 +chr16 6824476 . G T 2045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.202;DP=105;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=19.48;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,62:100:99:2074,0,1323 +chr16 6824512 . G A 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-0.607;DP=96;FS=1.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:1451,0,1874 +chr16 6827893 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.526;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:837,0,1360 +chr16 6829910 . AGTATGCTGGACATTAAAGGGATAGTTCACCCTAAAATAAACATTTGCTGTAATTTTTTTAGCCCTCAGGCAGTTAAAGATGACTTTTGTCTTCAGTAGAACACTAAAAAAAATTTATAGCTGAATCTGTGATCCTTGATGATTTTCGTGATGATGTTTGTGAACCACAG A 2264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.909;DP=87;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=26.03;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,63:84:99:2302,0,3422 +chr16 6829911 . GT G 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.137;DP=82;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:307,0,5567 +chr16 6829914 . TGCTGGACATTAAAGGGATAGTTCACCCTAAAATAAACATTTGCTGTAATTTTTTTAGCCCTCAGGCAGTTAAAGATGACTTTTGTCTTCAGTAGAACACTAAAAAAAATTTATAGCTGAATCTGTGATCCTTGATGATTTTCGTGATGATGTTTGTGAACCACAGGAG T 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.750;DP=87;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:297,0,5567 +chr16 6835752 . AGTGAGCTTTTTGAAGTATTCCCATATAGAAACCTGATAAATTGATATATACTAAAATTACATATACAGTATTTCCATGTAAAATATTTCAATATATGCATTGAGACGTTTGTTTTTATATGTGTTACTATTGGTAATATAAACTTTTGCTTGTTGACAG A 441.48 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=3.470;DP=86;FS=15.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=5.13;ReadPosRankSum=-2.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,73:81:99:3230,0,745 +chr16 6839694 . T A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=1.027;DP=49;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=20.20;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:1018,0,682 +chr16 6841349 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.921;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:486,0,543 +chr16 6842933 . T A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.533;DP=56;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:299,0,1663 +chr16 6843444 . C G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.196;DP=67;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:583,0,1740 +chr16 6843489 . G A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.588;DP=70;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:801,0,1666 +chr16 6844734 . GA G,GAA 338.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,6:13:99:413,165,243,285,0,627 +chr16 6857485 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=-1.809;DP=45;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:244,0,1287 +chr16 6878963 . T C 2023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.435;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=31.13;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,52:65:99:2052,0,227 +chr16 6892586 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-2.265;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:232,0,1029 +chr16 6892899 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:98:282,0,98 +chr16 6894524 . T G 2280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.083;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=34.04;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,58:67:53:2309,0,53 +chr16 6897547 . G GT 396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:434,42,0 +chr16 6913382 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:87:349,0,87 +chr16 6958791 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=-0.576;DP=65;FS=5.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:503,0,1513 +chr16 6963904 . T C 1775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.934;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=34.82;ReadPosRankSum=2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,46:51:34:1804,34,0 +chr16 6964018 . C T 2856.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2885,196,0 +chr16 6969249 . AT A 219 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:12:256,12,0 +chr16 6970411 . G A 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=1.160;DP=48;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=20.37;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:1006,0,1445 +chr16 6971713 . T A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-1.342;DP=19;FS=9.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=26.46;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:531,0,156 +chr16 6972925 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,326 +chr16 6972970 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,228 +chr16 7042937 . C T 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.472;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:972,0,234 +chr16 7043053 . G T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=1.513;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:376,0,248 +chr16 7043492 . C G 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-1.198;DP=34;FS=8.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:989,0,179 +chr16 7044107 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=1.531;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=29.78;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:475,0,329 +chr16 7044790 . C A 1089.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.294;DP=34;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=32.05;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:24:1118,0,24 +chr16 7044879 . G T 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.222;DP=56;FS=3.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=23.39;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,48:56:79:1338,0,79 +chr16 7045234 . C T 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.107;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,33:43:99:1217,0,215 +chr16 7435661 . T TAA 2108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-3.125;DP=289;FS=2.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,96:230:99:2791,0,4606 +chr16 7618603 . C G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.914;DP=71;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:504,0,2474 +chr16 7633043 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.057;DP=35;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:241,0,953 +chr16 7635187 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=-1.388;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:249,0,998 +chr16 7638365 . A C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.423;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:391,0,618 +chr16 7804223 . C A 204.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:233,0,19 +chr16 7862000 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.549;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1119 +chr16 7862001 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.484;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.937;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1111 +chr16 7862326 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.690;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:233,0,1051 +chr16 7867174 . T G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-2.272;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=14.99;ReadPosRankSum=2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:403,0,462 +chr16 7959371 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-1.584;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:248,0,775 +chr16 7978583 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.902;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:315,0,872 +chr16 8034140 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.401;DP=53;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:902,0,944 +chr16 8095141 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-1.010;DP=146;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=2.33;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,26:146:99:369,0,4561 +chr16 8137221 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=3.225;DP=123;FS=4.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=1.67;ReadPosRankSum=-2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,20:123:99:234,0,4090 +chr16 8145568 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-2.461;DP=151;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,25:151:99:324,0,4837 +chr16 8168644 . CT C 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-2.021;DP=72;FS=3.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:450,0,1355 +chr16 8169622 . T G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr16 8383066 . AGAACCCCCTGCAAGACCATACACACAATCCT A 3221.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.238;ClippingRankSum=0.425;DP=263;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.635;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,98:163:99:3259,0,10334 +chr16 8383070 . CCCCCTGCAAGACCAT C 1133.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.795;DP=249;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=4.55;ReadPosRankSum=3.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,51:166:99:1171,0,12395 +chr16 8383087 . CACACAATCCTGAACACCAGATGCAAAACTGAAGCAGTGTTTGAGAATAACGAGAACCAATGGCATTTATAAAGGGGTTGAGGCTCA C 1126.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=-0.351;DP=247;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=4.56;ReadPosRankSum=3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,51:165:99:1164,0,12395 +chr16 8383103 . CCAGATGCAAAACTGAAGCAGTGTTTGAGAATAACGAGAACCAATGGCATTTATAAAGGGGTTGAGGCTCA C 3221.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.096;DP=246;FS=0.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,98:164:99:3259,0,9909 +chr16 8651809 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-0.285;DP=84;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:660,0,2237 +chr16 8659374 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-1.647;DP=76;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:691,0,1948 +chr16 8849967 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,423 +chr16 8876229 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-2.468;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:266,0,530 +chr16 8935584 . C G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.757;DP=49;FS=9.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.462;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:621,0,1109 +chr16 8944955 . A T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.894;DP=56;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:604,0,1207 +chr16 8962272 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:36:269,0,36 +chr16 8963848 . C CA 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=-0.427;DP=156;FS=5.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,31:150:99:280,0,3285 +chr16 8966347 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-2.675;DP=96;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:612,0,2761 +chr16 9162192 . T A 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 +chr16 9350926 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=2.967;DP=39;FS=11.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=7.05;ReadPosRankSum=-3.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:303,0,1613 +chr16 9350927 . T C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-2.670;DP=39;FS=7.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=13.76;ReadPosRankSum=2.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:565,0,1107 +chr16 9558605 . T A 218.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:247,0,24 +chr16 9660276 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,285 +chr16 9666216 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,211 +chr16 9666995 . AT A 671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:51:709,51,0 +chr16 9667337 . A T 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 +chr16 9667787 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.318;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=26.28;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:475,0,160 +chr16 9677757 . G GTTTT 340.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:378,26,0 +chr16 10069854 . T C 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.939;DP=88;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.254;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,31:88:99:1046,0,1961 +chr16 10070047 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-1.989;DP=84;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:359,0,2567 +chr16 10137311 . AACCTGAAAGGACATGAGGAAAAGAGCAGGAGACAGAAGGGAGAAAGAAGATGAGTTATAAAACATGGGCAAAATAAAAGGTAGCTGTGTACTTGAGTCATACTC A 2589.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=1.181;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:99:2627,185,0 +chr16 10166919 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.115;DP=67;FS=2.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.156;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:558,0,1746 +chr16 10728143 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:321,0,185 +chr16 10728245 . A T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr16 10736335 . G C 373.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:402,30,0 +chr16 10736402 . C A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr16 10761197 . T A 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 +chr16 10761304 . C T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.128;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=30.90;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:708,0,174 +chr16 10774385 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr16 10974286 . T C 1074.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1103,78,0 +chr16 10993867 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=12.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,444 +chr16 10993926 . T G 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:564,39,0 +chr16 10994105 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:294,0,303 +chr16 11019956 . A T 367.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:396,30,0 +chr16 11020977 . T A 653.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.945;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=32.65;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:12:681,12,0 +chr16 11027869 . G A 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr16 11134385 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr16 11187662 . G C 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-2.342;DP=38;FS=15.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=31.94;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:98:1242,0,98 +chr16 11206135 . A T 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr16 11318862 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:311,0,280 +chr16 11352944 . TC T 477 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-1.309;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:12:514,12,0 +chr16 11355387 . A C 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=1.621;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=30.72;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:69:612,0,69 +chr16 11368279 . GAGGTCAGTCTTACTGTCATTTCCATTATTGTTTTTCTTACTCCTTTTTTCTGCCCTTTTGCAGTTTTGTTTACAGCAATGTTTTTCTTTGAGCAC G 11875.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=-0.300;DP=354;FS=3.052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=33.55;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,316:324:99:11913,877,0 +chr16 11429106 . G GAAAGAAAA 375.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:25:413,25,0 +chr16 11572177 . GT G 1374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.590;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=25.00;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,44:54:99:1412,0,127 +chr16 11574288 . GA G 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.583;DP=43;FS=11.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:629,0,173 +chr16 11801253 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.833;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=21.02;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:722,0,330 +chr16 11804660 . GCTGCATGAAGAACTAGACATTAATTTCAGCAATGTGAAAACCTAAAGCATTCACTTACATTCACTGTTATTCTTTGAAAATGTCTAC G 584.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.436;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=27.84;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:622,0,513 +chr16 11811271 . G A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=1.204;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=30.36;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1091,0,113 +chr16 11811349 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.564;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:638,0,398 +chr16 11811354 . C A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.428;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:638,0,364 +chr16 11814156 . A T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.855;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:299,0,175 +chr16 11819161 . T G 1258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1287,90,0 +chr16 11819525 . T C 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-1.555;DP=40;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1199,0,184 +chr16 11821338 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.023;DP=29;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:336,0,701 +chr16 11821566 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-1.720;DP=30;FS=9.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:252,0,804 +chr16 11821599 . A G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=1.190;DP=32;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=23.37;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:776,0,382 +chr16 11821778 . G A 1084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-2.011;DP=37;FS=3.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=29.32;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1113,0,183 +chr16 11822076 . G A 624.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:653,48,0 +chr16 11826628 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=-1.113;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:517,0,166 +chr16 11826639 . G C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-2.082;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.628;QD=21.17;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:494,0,277 +chr16 11826747 . G A 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=31.90;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:71:1049,0,71 +chr16 11826824 . G A 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.274;DP=32;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.869;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:808,0,160 +chr16 11827054 . G C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:372,0,474 +chr16 11827064 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=1.977;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=28.65;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:372,0,474 +chr16 11827111 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:270,0,190 +chr16 11942799 . C T 3333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=4.969;DP=195;FS=6.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,106:195:99:3362,0,3089 +chr16 12032646 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-2.731;DP=59;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=8.15;ReadPosRankSum=3.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:509,0,1535 +chr16 12036213 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.088;DP=59;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:357,0,1628 +chr16 12057103 . C T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-1.945;DP=145;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:1073,0,3960 +chr16 12064412 . T C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=1.514;DP=146;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,38:146:99:836,0,8250 +chr16 12084813 . G A 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.073;DP=177;FS=13.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,50:177:99:1269,0,4914 +chr16 12087038 . A C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.380;DP=16;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:243,0,681 +chr16 12087039 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,681 +chr16 12087350 . CA C 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.528;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,31:165:99:392,0,4532 +chr16 12087477 . G C 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-1.144;DP=170;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,45:170:99:1008,0,4736 +chr16 12118619 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.332;DP=105;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:523,0,3172 +chr16 12230318 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.603;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:388,0,1815 +chr16 12244905 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=1.344;DP=75;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:288,0,2241 +chr16 12340820 . G C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:78:474,0,78 +chr16 12341149 . C G 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:714,54,0 +chr16 12341251 . T G 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 +chr16 12386422 . GAGGTAAAGAACTAAAACCAAGTTTTAAAGCAAGTGTTTTGTGTTTCTAAAGATTATATTTCATGACTGACATTCTCTCTTCGTGAA G 2633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=3.937;DP=75;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=31.00;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,66:75:99:2671,0,2959 +chr16 12678817 . ACCTCCT A 208.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:246,0,13 +chr16 12692551 . G C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.881;DP=68;FS=20.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=8.76;ReadPosRankSum=-2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,23:68:99:624,0,3713 +chr16 12694199 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.707;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:346,0,1430 +chr16 12695265 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.146;DP=47;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:515,0,2740 +chr16 12695571 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=2.700;DP=13;FS=21.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=25.44;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:359,0,144 +chr16 12696738 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=1.420;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:249,0,1998 +chr16 12839450 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-1.731;DP=85;FS=13.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:499,0,2344 +chr16 12841467 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.186;DP=71;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:291,0,2026 +chr16 12842191 . C CT 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.444;DP=62;FS=4.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=3.30;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:242,0,921 +chr16 12842716 . A G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=1.107;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:422,0,1404 +chr16 12842722 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=-0.476;DP=47;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:300,0,1488 +chr16 12842962 . G A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=32.92;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:505,0,511 +chr16 12842965 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-2.359;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=23.26;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:505,0,511 +chr16 12843068 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,1:6:99:509,0,511 +chr16 12843257 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.234;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,1016 +chr16 12843454 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.694;DP=24;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:353,0,123 +chr16 12843495 . G C 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.586;DP=48;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:856,0,171 +chr16 12843576 . GA G 1240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.295;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:78:1278,0,78 +chr16 12843636 . G C 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,15:15:57:1278,0,57 +chr16 12843658 . T G 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.250;DP=30;FS=20.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=33.20;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:78:1278,0,78 +chr16 12919856 . C T 1816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=-0.717;DP=67;FS=18.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,53:67:99:1845,0,230 +chr16 13050790 . CA C 246.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:284,27,0 +chr16 13296488 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:419,0,134 +chr16 13304791 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:306,0,231 +chr16 13475951 . A C 2164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.514;DP=80;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,58:80:99:2193,0,514 +chr16 13495890 . C T 2626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.102;DP=86;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,71:86:99:2655,0,212 +chr16 13496071 . A C 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.336;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:543,0,557 +chr16 13498211 . C T 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-1.304;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=25.58;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,29:41:99:1077,0,308 +chr16 13498614 . C T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.811;DP=37;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:995,0,317 +chr16 13500807 . A T 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=2.498;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=24.56;ReadPosRankSum=-3.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1256,0,425 +chr16 13501179 . C T 1985.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.964;DP=54;FS=6.254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:22:2014,22,0 +chr16 13501480 . C G 1234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=2.714;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:1263,0,420 +chr16 13501547 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-1.399;DP=31;FS=8.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=21.90;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:707,0,432 +chr16 13501649 . C A 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=1.478;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=29.83;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:2659,193,0 +chr16 13524527 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.702;DP=84;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:587,0,2482 +chr16 13524567 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.264;DP=64;FS=3.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:506,0,1891 +chr16 13524642 . A T 1942.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-0.549;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=28.21;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1971,138,0 +chr16 13525221 . G A 3081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=1.025;DP=85;FS=4.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,71:85:99:3110,0,151 +chr16 13528664 . T A 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:244,0,25 +chr16 13715541 . T G 4347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.221;DP=148;FS=8.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,112:148:99:4376,0,842 +chr16 13715782 . AT A 1188.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.276;DP=69;FS=11.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,47:66:99:1226,0,217 +chr16 13716023 . T G 9294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.402;ClippingRankSum=-1.104;DP=306;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=30.38;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,241:306:99:9323,0,1124 +chr16 13718066 . T A 10070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;ClippingRankSum=-1.396;DP=352;FS=8.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,265:352:99:10099,0,1891 +chr16 13719617 . A G 9275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.539;DP=325;FS=4.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=28.54;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,243:325:99:9304,0,1871 +chr16 13719719 . TGA T 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:85:238,0,85 +chr16 13724453 . G C 9420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.717;DP=319;FS=5.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=29.53;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,250:319:99:9449,0,1327 +chr16 13725006 . G A 8944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.387;DP=322;FS=0.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=27.78;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,239:319:99:8973,0,1768 +chr16 13736101 . C T 9365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=-1.408;DP=326;FS=5.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,257:326:99:9394,0,1229 +chr16 13736197 . G C 6697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-2.457;DP=219;FS=3.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=30.58;ReadPosRankSum=2.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,181:218:99:6726,0,469 +chr16 13749827 . C T 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=1.030;DP=49;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,36:49:99:1331,0,321 +chr16 13756448 . A G 2510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.600;DP=80;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=31.38;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,67:80:99:2539,0,135 +chr16 13813916 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr16 13813971 . T G 289.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=18;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:318,0,19 +chr16 13814313 . T G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-1.376;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:650,0,232 +chr16 13815402 . C T 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.694;DP=42;FS=5.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=27.57;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1186,0,218 +chr16 13855538 . C T 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1004,69,0 +chr16 13868316 . G A 1572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.429;DP=57;FS=4.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,44:56:99:1601,0,242 +chr16 13876883 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=-2.605;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=17.58;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:415,0,362 +chr16 13876907 . G A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.758;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:719,0,455 +chr16 13892157 . G T 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=1.333;DP=59;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,48:59:99:1828,0,199 +chr16 13892214 . G A 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.619;DP=52;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,40:52:99:1517,0,283 +chr16 14004734 . G A 3579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=-8.607;DP=246;FS=19.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,102:246:99:3608,0,4868 +chr16 14007133 . C T 2071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=5.705;DP=121;FS=10.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:2100,0,2083 +chr16 14007192 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=3.396;DP=83;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:517,0,2299 +chr16 14007806 . A G 7984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.990;DP=271;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,207:271:99:8013,0,1418 +chr16 14008077 . T A 1917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-1.090;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,55:85:99:1946,0,1065 +chr16 14008208 . T C 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=5.023;DP=78;FS=17.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:1164,0,1628 +chr16 14008232 . A C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=4.557;DP=69;FS=7.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=5.87;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:433,0,1894 +chr16 14008527 . T C 2452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.293;DP=99;FS=15.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,69:99:99:2481,0,1447 +chr16 14009204 . A C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=6.041;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=5.30;ReadPosRankSum=-4.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:564,0,5501 +chr16 14009205 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=5.504;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=5.52;ReadPosRankSum=-4.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:564,0,5501 +chr16 14009499 . A T 5456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-0.831;DP=200;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=27.28;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,142:200:99:5485,0,1488 +chr16 14009703 . G T 6338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-0.840;DP=240;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,164:240:99:6367,0,2102 +chr16 14010268 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=5.282;DP=82;FS=12.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=3.55;ReadPosRankSum=-5.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:319,0,2543 +chr16 14010656 . G C 5465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.083;DP=210;FS=7.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=26.03;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,146:210:99:5494,0,1647 +chr16 14012768 . G GAGGCCGTGTT 5932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.101;DP=239;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,162:228:99:5970,0,1856 +chr16 14013067 . TCTGTTGAAAAGAAAAGAAAGCATTAGGAGATACTTAAATTACACGCTACATAATTCACATATTACGAGGACACATATGCGTAC T 7665.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-0.624;DP=172;FS=4.721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:7703,694,0 +chr16 14013293 . A G 4896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-1.650;DP=189;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=25.91;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,132:189:99:4925,0,1369 +chr16 14016104 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=1.482;DP=39;FS=5.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:319,0,1040 +chr16 14082324 . A G 371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:400,30,0 +chr16 14082654 . C T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr16 14083018 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:395,27,0 +chr16 14083020 . A T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr16 14114040 . G A 604.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:633,45,0 +chr16 14117110 . G A 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 +chr16 14376182 . CAGGTGAGACCGATGAGTTGCTCCACAGGTTTTTTAAAAAAACACTCTTCATTTCTCATGATCTCTTTCTTTTCA C 1273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=1.841;DP=38;FS=10.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=33.52;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:99:1311,0,787 +chr16 14463116 . A T 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:261,21,0 +chr16 14498247 . G GT 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.269;DP=19;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:36:299,0,36 +chr16 14543083 . T C 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr16 14617740 . G A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=1.385;DP=44;FS=1.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=30.90;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,36:44:99:1388,0,134 +chr16 14618294 . C G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.350;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=26.70;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:589,0,163 +chr16 14618425 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,226 +chr16 14618793 . G A 1158.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-1.455;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=33.71;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:43:1187,43,0 +chr16 14618857 . G A 964.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.069;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:993,72,0 +chr16 14619679 . T C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:467,36,0 +chr16 14620023 . G C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=2.106;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=19.20;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:393,0,289 +chr16 14620574 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=22.10;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:426,0,210 +chr16 14621583 . T G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.374;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=29.63;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:769,0,99 +chr16 14621676 . G T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.233;DP=30;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:894,0,131 +chr16 14623094 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr16 14623097 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr16 14623442 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.614;DP=20;FS=5.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:631,0,159 +chr16 14625205 . G C 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.308;DP=38;FS=18.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=22.94;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:900,0,467 +chr16 14625483 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=22.21;ReadPosRankSum=2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:317,0,174 +chr16 14634893 . G A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:475,36,0 +chr16 14635052 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:282,0,102 +chr16 14921520 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.764;DP=15;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:38:516,0,38 +chr16 14925652 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr16 14929908 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:444,0,48 +chr16 15198899 . TGGTAAATGAGACGTTCTGCAATGCTTCATTACCATAATTAACCACAAGCTTTGATCAGTATACAGAAGAGAGGCCGTCATCTGTCTTAATTCTATGCAAATACACAGTTAAATGCGTAACAAATATTTGTGCGTGCA T 805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=2.237;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.55;ReadPosRankSum=-2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:32:843,0,32 +chr16 15256239 . T C 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.347;DP=26;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:810,0,142 +chr16 15320667 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-2.309;DP=37;FS=15.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.110;QD=7.70;ReadPosRankSum=-2.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:313,0,972 +chr16 15368143 . AT A 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-1.200;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:654,0,300 +chr16 15369593 . C G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.487;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:299,0,1179 +chr16 15375459 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.560;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:238,0,468 +chr16 15424599 . AG A 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.578;DP=61;FS=5.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:852,0,2687 +chr16 15424601 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.468;DP=60;FS=5.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:852,0,2653 +chr16 15424633 . CT C 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.544;DP=42;FS=5.528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:20:561,20,0 +chr16 15453020 . A G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.545;DP=72;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=7.22;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:548,0,1976 +chr16 15457784 . CCT C 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-2.369;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:882,0,785 +chr16 15623609 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.131;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:360,0,1029 +chr16 15623715 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=14.82;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:369,0,673 +chr16 15626112 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=2.614;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.47;ReadPosRankSum=-2.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:269,0,523 +chr16 15741347 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr16 15775782 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.498;DP=187;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,36:186:99:618,0,5835 +chr16 15821358 . T TA 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=1.395;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:239,0,301 +chr16 15822701 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,274 +chr16 15822757 . TA T 293.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:331,34,0 +chr16 15823048 . C G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.820;DP=27;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=20.21;ReadPosRankSum=-2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:574,0,2106 +chr16 15824011 . C CT 1559.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1597,147,0 +chr16 15953638 . A T 223.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:252,21,0 +chr16 15975948 . G A 1797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.229;DP=175;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,59:175:99:1826,0,3938 +chr16 15996916 . C A 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.360;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:1226,0,2124 +chr16 16023282 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.437;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,658 +chr16 16033408 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +chr16 16042430 . G GACAGTTGGGA 1576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.039;DP=52;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,37:47:99:1614,0,388 +chr16 16149067 . A C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-1.913;DP=75;FS=3.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:652,0,2068 +chr16 16149371 . G A 2150.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2179,154,0 +chr16 16150031 . AT A 1812.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.473;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=30.85;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1850,155,0 +chr16 16150072 . T G 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 +chr16 16678580 . CT C 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=1.961;DP=33;FS=3.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:563,0,279 +chr16 16678706 . C T 3788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=1.514;DP=111;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=34.13;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,96:111:99:3817,0,122 +chr16 16678727 . A C 4218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.133;DP=125;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=33.75;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,108:125:99:4247,0,121 +chr16 16678958 . A AC 1547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.236;DP=63;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=24.57;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,45:63:99:1585,0,440 +chr16 16679081 . T A 1630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1659,117,0 +chr16 16679180 . A T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=5.265;DP=65;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=14.75;ReadPosRankSum=-2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:987,0,1552 +chr16 16679414 . T G 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.570;DP=68;FS=18.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1133,0,2869 +chr16 16679419 . A G 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.794;DP=63;FS=19.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=17.54;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:1133,0,2874 +chr16 16679468 . C T 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=4.015;DP=92;FS=12.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:1582,0,1690 +chr16 16679630 . T G 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=2.719;DP=96;FS=5.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=23.58;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,65:96:99:2292,0,2538 +chr16 16679651 . T A 2252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=5.232;DP=82;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=27.47;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,45:81:99:2281,0,2538 +chr16 16679946 . T TA 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=-3.151;DP=81;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=8.01;ReadPosRankSum=4.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:686,0,1205 +chr16 16680154 . AC A 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.889;DP=112;FS=9.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:110:99:647,0,4069 +chr16 16680321 . T C 1832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.334;DP=92;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=19.92;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,55:92:99:1861,0,1340 +chr16 16691871 . T A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.575;ClippingRankSum=-0.676;DP=144;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,48:144:99:1654,0,3090 +chr16 16691932 . A T 6182.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:6211,439,0 +chr16 16692022 . T TC 3400.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:3827,314,0 +chr16 16692063 . G GC 1078.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:94:1116,94,0 +chr16 16711468 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.06;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,198 +chr16 16711549 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-0.943;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:459,0,605 +chr16 16711628 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.450;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:542,0,758 +chr16 16711651 . C T 1461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1490,111,0 +chr16 16711755 . T A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=-1.283;DP=36;FS=7.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:708,0,518 +chr16 16711905 . T G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-1.432;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:899,0,670 +chr16 16712032 . T A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.691;DP=41;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=29.17;ReadPosRankSum=2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1224,0,600 +chr16 16712034 . C G 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.408;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=31.47;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:1224,0,559 +chr16 16933495 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=1.248;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:375,0,378 +chr16 17268987 . A T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-1.209;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:583,0,629 +chr16 17342342 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:61:240,0,61 +chr16 17345324 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.535;DP=23;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:315,0,490 +chr16 17389540 . C A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.776;DP=143;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,29:143:99:495,0,4311 +chr16 17421338 . G T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.644;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,357 +chr16 17558164 . G T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.738;DP=33;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=22.21;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:761,0,310 +chr16 17558180 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.226;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=23.22;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:841,0,302 +chr16 17750745 . A G 468.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.248;DP=17;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=27.54;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:495,0,4 +chr16 18091486 . A G 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.418;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:663,0,1187 +chr16 18091641 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.311;DP=59;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:273,0,1892 +chr16 18092723 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.811;DP=65;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=6.17;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:429,0,1814 +chr16 18094219 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=1.975;DP=70;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:260,0,2045 +chr16 18108305 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=1.694;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,340 +chr16 18131986 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=1.302;DP=36;FS=5.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:234,0,1017 +chr16 18284284 . CAAAGTTCCGATCCTG C 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-2.621;DP=66;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:258,0,1124 +chr16 18284306 . C T 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.295;DP=49;FS=8.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1054,0,1322 +chr16 18285074 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.725;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.913;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:581,0,3843 +chr16 18320535 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=2.518;DP=91;FS=23.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:241,0,2894 +chr16 18323642 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-0.409;DP=90;FS=5.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:337,0,2829 +chr16 18595824 . G A 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.313;DP=116;FS=3.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:962,0,3104 +chr16 18720635 . T A 2545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=1.402;DP=95;FS=9.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=26.80;ReadPosRankSum=3.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,66:95:99:2574,0,798 +chr16 18721068 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.425;DP=15;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:33:503,0,33 +chr16 18724666 . GCTAAAACAGATTTTTGCACCCCAATCCCCCCCAAAAAAAGAGTAAGAAAAAAAAGGCAGAACTGTTGTACACCCGCAAAAAAATAACACAGCGATTAACATAAAAAAGTATGCCTGGACTTAC G 8619.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-1.166;DP=192;FS=1.816;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=26.15;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,187:192:99:8657,782,0 +chr16 18728424 . T C 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.379;DP=277;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,67:277:99:1564,0,14346 +chr16 18728425 . G T 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.701;DP=274;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,67:274:99:1559,0,14346 +chr16 18732585 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=32.77;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:487,0,123 +chr16 18745721 . T C 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.594;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=5.37;ReadPosRankSum=-1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,44:181:99:1000,0,5478 +chr16 18746281 . C T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-2.357;DP=151;FS=8.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=6.81;ReadPosRankSum=2.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,42:151:99:1057,0,4151 +chr16 18818780 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:269,0,384 +chr16 18977351 . G T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=-0.149;DP=62;FS=5.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:597,0,1351 +chr16 19001046 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.250;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=5.65;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:350,0,1643 +chr16 19001669 . G T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.473;DP=41;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:313,0,1115 +chr16 19002970 . G A 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=1.349;DP=57;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:976,0,1068 +chr16 19003047 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-2.137;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:415,0,1691 +chr16 19003094 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=2.841;DP=47;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:395,0,1530 +chr16 19004299 . C G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=2.233;DP=68;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=6.36;ReadPosRankSum=-2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:461,0,1908 +chr16 19004606 . C G 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=1.502;DP=51;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:651,0,1041 +chr16 19005048 . C A 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.856;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:959,0,665 +chr16 19006908 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.462;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:418,0,407 +chr16 19006961 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,375 +chr16 19025259 . G A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr16 19027116 . C T 566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:595,42,0 +chr16 19049805 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:245,0,55 +chr16 19105777 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:248,0,208 +chr16 19124134 . A C 1740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.275;DP=84;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:84:99:1769,0,1615 +chr16 19124800 . A T 1451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.694;DP=67;FS=3.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1480,0,886 +chr16 19180466 . C T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.424;DP=16;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:476,0,126 +chr16 19181607 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-2.879;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,386 +chr16 19181836 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.534;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:443,0,297 +chr16 19183490 . T G 619.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=34.40;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:10:647,10,0 +chr16 19183552 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.415;DP=17;FS=9.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:364,0,250 +chr16 19223439 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.197;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:453,0,551 +chr16 19223577 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.988;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:328,0,373 +chr16 19256528 . GCCTACCAGGAGAGCAAAATTTCAGTTACAGAAAAACAATTTTTGTTGCAGGCAGCTTATGTAACATCCATGATTACGTA G 15101.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.273;DP=346;FS=3.005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,344:346:99:15139,1203,0 +chr16 19258498 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:47:386,0,47 +chr16 19311182 . GACATCATCATCATCA G 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=1.815;DP=99;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:582,0,2584 +chr16 19311183 . ACATCATCATCATCAT A 2108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.507;DP=98;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,56:80:99:2146,0,616 +chr16 19311198 . T G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=2.018;DP=86;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:571,0,2584 +chr16 19312955 . G T 2001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-2.023;DP=66;FS=19.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=30.33;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,48:66:99:2030,0,1153 +chr16 19314474 . G T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.180;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:63:823,0,63 +chr16 19314861 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=1.880;DP=16;FS=15.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:90:474,0,90 +chr16 19343310 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:292,0,215 +chr16 19363104 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=4.249;DP=178;FS=17.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,28:178:99:270,0,10429 +chr16 19363154 . A T 4600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.467;DP=156;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,121:156:99:4629,0,735 +chr16 19363272 . G T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=4.763;DP=117;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:1209,0,8421 +chr16 19363308 . C T 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.442;DP=133;FS=12.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=16.42;ReadPosRankSum=2.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,44:133:99:2212,0,3005 +chr16 19364271 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-1.043;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,55:269:99:998,0,8337 +chr16 19367297 . C T 4603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=-1.731;DP=250;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,128:250:99:4632,0,4395 +chr16 19406966 . T C 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.412;DP=121;FS=2.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,34:121:99:834,0,3332 +chr16 19527677 . T A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:332,0,258 +chr16 19529366 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:290,0,158 +chr16 19529798 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.113;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:354,0,379 +chr16 19532324 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.683;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:308,0,306 +chr16 19532426 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,215 +chr16 19532881 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,220 +chr16 19533209 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=-1.727;DP=25;FS=6.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.066;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:322,0,564 +chr16 19536356 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:230,0,178 +chr16 19555728 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:244,0,326 +chr16 19610876 . G T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=1.564;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:250,0,450 +chr16 19611325 . T TTA 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:673,44,0 +chr16 19612277 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:379,0,359 +chr16 19612823 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:289,0,383 +chr16 19648374 . T C 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.367;DP=67;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1394,0,898 +chr16 19677127 . T A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.952;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:469,0,444 +chr16 19678217 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.309;DP=51;FS=4.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:243,0,1571 +chr16 19678254 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-1.031;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:910,0,597 +chr16 19678568 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.024;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:351,0,650 +chr16 19678742 . A T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=1.632;DP=27;FS=6.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:582,0,358 +chr16 19688210 . G A 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.231;DP=41;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:633,0,731 +chr16 19699420 . T A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.764;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:714,0,362 +chr16 19699622 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.336;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=21.85;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:487,0,233 +chr16 19699853 . TAA T,TA 256.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,5,10:15:99:455,273,260,151,0,108 +chr16 19704589 . C CTA 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.180;DP=67;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.218;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:663,0,1179 +chr16 19733000 . G T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=1.669;DP=22;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:460,0,309 +chr16 19733353 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=-0.408;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:439,0,422 +chr16 19737509 . GCCTATAAAATGACAGTTATGACCATAAGTATAATTCAAATCTTAATAGCAGCCAAAACTGCAAACACACA G 1425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.306;DP=41;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=34.77;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,34:37:99:1463,0,348 +chr16 19737633 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-1.410;DP=51;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=4.19;ReadPosRankSum=2.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:242,0,1479 +chr16 19744967 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.529;DP=39;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:277,0,912 +chr16 19752520 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.288;DP=18;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:353,0,269 +chr16 19762099 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:311,0,976 +chr16 19774935 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=1.350;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.985;QD=29.83;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:615,0,119 +chr16 19776517 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-2.000;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=30.17;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:72:692,0,72 +chr16 19804369 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 +chr16 19813938 . A G 465.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:494,33,0 +chr16 19816292 . T C 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 +chr16 19816486 . T A 1581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-1.974;DP=48;FS=6.792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=32.95;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,41:45:51:1610,51,0 +chr16 19817467 . C T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 +chr16 19817514 . A G 2231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2260,160,0 +chr16 19886855 . A G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr16 20223252 . C T 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 +chr16 20225609 . G T 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:476,33,0 +chr16 20226982 . T A 509.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:538,39,0 +chr16 20527466 . C CA 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.654;DP=31;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=16.25;ReadPosRankSum=-2.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:39:606,0,39 +chr16 20565609 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:239,0,108 +chr16 20580787 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,106 +chr16 20607216 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.31;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:35:274,0,35 +chr16 20975613 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.08;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:299,0,50 +chr16 20986995 . T G 250.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:11:278,0,11 +chr16 21037581 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.959;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:401,0,296 +chr16 21108780 . C T 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=1.407;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=26.18;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:735,0,232 +chr16 21140406 . G T 581.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.351;DP=18;FS=7.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=32.32;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:22:610,0,22 +chr16 21140519 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:377,0,124 +chr16 21252196 . G T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr16 21264118 . T A 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 +chr16 21291635 . T A 312.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:14:341,14,0 +chr16 21316481 . A C 329.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:4:356,0,4 +chr16 21330959 . C T 374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:403,30,0 +chr16 21495766 . A T 4537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=-0.866;DP=149;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=30.45;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,116:149:99:4566,0,603 +chr16 21495966 . A AT 1732.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-1.215;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.778;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,69:87:99:1770,0,157 +chr16 21496633 . A T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.303;DP=35;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:555,0,729 +chr16 21497988 . A T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.921;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:489,0,286 +chr16 21502070 . G A 2299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.857;DP=75;FS=1.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=30.66;ReadPosRankSum=1.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,63:75:99:2328,0,130 +chr16 21657721 . C A 220.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.55;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:249,0,18 +chr16 21661883 . T A 609.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.854;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=29.04;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:24:638,0,24 +chr16 21663502 . CAGGTGAGCCAAAACAACATACTTTTTATTAACTGCACAGAATGGGATCTTCATGGTCACAGCATTTGTCATCTCATTTTGTTTCGTTTAAT C 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.914;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:99:1032,0,727 +chr16 21663829 . T A 881.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.419;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=29.88;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:910,63,0 +chr16 21664219 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=1.480;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:43:431,0,43 +chr16 21763073 . G T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr16 21763090 . A T 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 +chr16 21820377 . C T 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.737;DP=34;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:913,0,291 +chr16 21821451 . A T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:690,0,284 +chr16 21830015 . A G 215.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:244,0,21 +chr16 21830753 . C G 363.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=33.01;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:391,0,11 +chr16 21930039 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,260 +chr16 22214168 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=1.193;DP=101;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:1405,0,1982 +chr16 22355085 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=-1.387;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:452,0,419 +chr16 22355540 . G GT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.333;DP=28;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:289,0,196 +chr16 22378959 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.374;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:336,0,718 +chr16 22398756 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.271;DP=92;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:501,0,2577 +chr16 22475490 . C T 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 +chr16 22475510 . A G 375.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 +chr16 22594431 . TAGGTACAGTGTCAGTGATTTTACTGTATATCTAAAGCAATGCTGGTGATCTTGTATTAATCTTTTTCATTTCCTCTGC T 5579.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.875;DP=146;FS=1.617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=27.23;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,138:144:99:5617,419,0 +chr16 22758348 . C T 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 +chr16 22782330 . C T 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 +chr16 22877283 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-0.609;DP=40;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:769,0,558 +chr16 22885191 . A T 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-0.341;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:661,0,1405 +chr16 22885239 . C G 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.988;DP=36;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:822,0,454 +chr16 22885516 . A C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-0.731;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:577,0,422 +chr16 22886401 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.720;DP=30;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:245,0,794 +chr16 22887036 . TAG T 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.623;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=29.22;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:534,0,130 +chr16 22887452 . GA G 939.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.758;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:11:976,11,0 +chr16 22890603 . A C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DP=97;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:281,0,3021 +chr16 22898003 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.341;DP=290;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,55:290:99:839,0,9182 +chr16 22900141 . A G 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-2.300;DP=230;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=5.51;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,57:230:99:1296,0,6678 +chr16 22917663 . G A 1387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.912;DP=342;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,74:342:99:1416,0,10267 +chr16 22940120 . C T 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.862;DP=238;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,48:238:99:797,0,7198 +chr16 22958859 . G C 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.444;DP=302;FS=6.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,74:301:99:1597,0,8635 +chr16 22989349 . C A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-0.817;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:533,0,653 +chr16 23001385 . T A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.250;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:758,0,1523 +chr16 23013133 . G A 1410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.014;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:1439,0,1489 +chr16 23123354 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.406;DP=63;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:1165,0,1745 +chr16 23123642 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-2.082;DP=33;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:254,0,1393 +chr16 23123804 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.372;DP=40;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:318,0,1107 +chr16 23124242 . C T 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.615;DP=55;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.863;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:937,0,999 +chr16 23220138 . C T 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.875;DP=71;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:832,0,1276 +chr16 23428314 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-2.202;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.45;ReadPosRankSum=2.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,240 +chr16 23452665 . A G 233.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:262,0,22 +chr16 23509599 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr16 23509601 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr16 23514895 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.920;DP=31;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:715,0,345 +chr16 23525387 . TA T 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;ClippingRankSum=-0.280;DP=19;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=27.62;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:61:562,0,61 +chr16 23525860 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.523;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:402,0,388 +chr16 23527001 . A G 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.626;DP=36;FS=14.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=22.80;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:849,0,439 +chr16 23527200 . T TA 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.646;DP=24;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:281,0,657 +chr16 23527201 . T A 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.919;DP=23;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.167;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:390,0,697 +chr16 23527552 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.022;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:612,0,457 +chr16 23527755 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.06;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:269,0,288 +chr16 23528133 . G A 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.902;DP=23;FS=10.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=22.38;ReadPosRankSum=2.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:543,0,181 +chr16 23528264 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=-0.634;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:398,0,276 +chr16 23528322 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.778;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:513,0,398 +chr16 23528383 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:308,0,320 +chr16 23528523 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:241,0,66 +chr16 23529099 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.380;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=23.30;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:401,0,211 +chr16 23529549 . T C 720.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.180;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=34.32;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:20:749,20,0 +chr16 23529904 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=2.339;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=17.13;ReadPosRankSum=2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:268,0,249 +chr16 23529974 . G T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-1.550;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:536,0,985 +chr16 23529979 . T G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-1.060;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:536,0,985 +chr16 23530140 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.386;DP=27;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=23.66;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:667,0,314 +chr16 23530405 . TA T 879.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:91:917,91,0 +chr16 23565576 . C T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.292;DP=36;FS=1.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=26.49;ReadPosRankSum=-2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:982,0,246 +chr16 23585930 . C T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr16 23608416 . T C 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr16 23633776 . C T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=1.957;DP=47;FS=6.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=33.44;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,40:47:55:1600,0,55 +chr16 23634289 . C T 2990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.950;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,77:100:99:3019,0,481 +chr16 23635822 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.143;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:439,0,176 +chr16 23637445 . G A 2549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.020;DP=88;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,69:88:99:2578,0,370 +chr16 23642019 . C T 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=3.695;DP=41;FS=12.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=20.58;ReadPosRankSum=-2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:872,0,489 +chr16 23642046 . T C 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=2.762;DP=54;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=26.46;ReadPosRankSum=2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:54:99:1457,0,377 +chr16 23644602 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,238 +chr16 23645121 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,559 +chr16 23645122 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,559 +chr16 23645536 . A T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:360,0,139 +chr16 23646041 . G A 533.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.810;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:3:560,3,0 +chr16 23646405 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.246;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,165 +chr16 23646535 . G GA 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-0.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=30.45;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:494,0,169 +chr16 23646560 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.085;DP=14;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=33.27;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:494,0,169 +chr16 23646996 . C A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.240;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:419,0,128 +chr16 23647148 . C T 2342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.066;DP=79;FS=5.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,62:79:99:2371,0,374 +chr16 23662760 . G A 3530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-0.748;DP=96;FS=2.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=31.50;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,84:96:99:3559,0,459 +chr16 23664966 . G A 2219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.414;DP=77;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,60:76:99:2248,0,324 +chr16 23665219 . C T 2144.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.260;DP=51;FS=6.284;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=30.91;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,48:51:80:2173,80,0 +chr16 23665315 . A G 2375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.944;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=30.07;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,64:79:99:2404,0,237 +chr16 23735766 . T G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-1.685;DP=30;FS=15.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=30.59;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:946,0,124 +chr16 23817260 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=1.094;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:256,0,1230 +chr16 23924190 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-1.311;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:458,0,618 +chr16 24151770 . A G 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:48:681,48,0 +chr16 24168697 . A G 1185.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=1.036;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=28.21;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:22:1214,22,0 +chr16 24168706 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=1.220;DP=35;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:661,0,606 +chr16 24174500 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=2.712;DP=48;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=16.50;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:820,0,694 +chr16 24180550 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.741;DP=18;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:338,0,257 +chr16 24525911 . A C 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:649,48,0 +chr16 24525952 . TA T 253.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:291,22,0 +chr16 24525954 . A T 262.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:291,22,0 +chr16 24531902 . T C 1290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1319,93,0 +chr16 24534971 . A G 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 +chr16 24783487 . CCA C 322.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.594;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:16:360,0,16 +chr16 24840199 . A G 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:72:1067,72,0 +chr16 24840208 . T G 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:72:1067,72,0 +chr16 24840388 . C A 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:599,45,0 +chr16 24840616 . G A 706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:735,54,0 +chr16 24840730 . T C 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:720,51,0 +chr16 24840796 . T G 372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 +chr16 24840844 . C T 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +chr16 24840916 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr16 24840975 . G T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:445,36,0 +chr16 24841024 . G A 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:821,60,0 +chr16 24841096 . T C 840.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:869,63,0 +chr16 24876973 . T A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr16 24963304 . A AT 366.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.070;DP=29;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:15:404,0,15 +chr16 24976473 . G A 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 +chr16 25554718 . C CTT 370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:408,32,0 +chr16 25556968 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,174 +chr16 25730636 . GA G 586.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:61:624,61,0 +chr16 25744397 . TGTGAGTGCTGTGCCTTTTTTATGCCACAATTAAGTCTGATGTTATCCCCGGATAATTTCAGAATTATTTTCCTTTATTGTGTGTGTCAG T 2098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=1.663;DP=50;FS=3.372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=35.83;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2136,164,0 +chr16 26031962 . A G 2373.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.950;DP=31;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:18:2402,0,18 +chr16 26031963 . C T 2373.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.250;DP=31;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=29.57;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:22:2402,0,22 +chr16 26032050 . A G 2373.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.790;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=34.91;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,43:45:18:2402,0,18 +chr16 26039238 . T TA 2626.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2714,260,0 +chr16 26073209 . G A 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:607,45,0 +chr16 26112018 . TGA T 537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:575,39,0 +chr16 26114633 . G A 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:78:1142,78,0 +chr16 26140687 . C T 2276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2305,169,0 +chr16 26153402 . TGAAGG T 19371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=455;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,454:454:99:19409,1643,0 +chr16 26153409 . AATTTGAGCTTGACAGACTATGACTGAAATGTATTATGCATATAAACATGCACCGTTTAAGACATTTTAATGCAAATAATTAAAATCATTTTCTCTTTTT A 20008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=2.972;DP=458;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.840;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,454:457:99:20046,1691,0 +chr16 26154478 . G T 825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:854,66,0 +chr16 26154556 . G A 5339.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:5368,385,0 +chr16 26154958 . GT G 6556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-1.696;DP=371;FS=2.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,270:331:99:6594,0,317 +chr16 26161692 . G A 3969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=1.715;DP=101;FS=2.004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,97:101:99:3998,292,0 +chr16 26161974 . T C 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +chr16 26219132 . GGGTAAGGGATACCGTACAGTGAATATTCCATTAAAAAATCATTCAAGTTTTTTGTTCGTGTGAGTGTAAACTTGCTTATTTTGTGAACTTCTTCCA G 12487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.073;DP=322;FS=13.114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.137;QD=33.73;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,318:322:99:12525,928,0 +chr16 26228938 . A C 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 +chr16 26231929 . C T 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:341,24,0 +chr16 26232675 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 +chr16 26261411 . G A 3095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3124,211,0 +chr16 26261420 . A G 3095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:3124,211,0 +chr16 26261537 . A C 1817.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1846,130,0 +chr16 26261576 . T TA 1694.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-0.280;DP=48;FS=4.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=22.15;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1732,132,0 +chr16 26261681 . G GA 849.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:86:901,86,0 +chr16 26261892 . T C 3271.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3300,240,0 +chr16 26262224 . T A 1684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1713,117,0 +chr16 26262229 . A T 1684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1713,117,0 +chr16 26262314 . C G 1971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2000,141,0 +chr16 26262358 . A G 1278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1307,93,0 +chr16 26262395 . A G 503.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.240;DP=25;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=20.14;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7:531,7,0 +chr16 26263956 . A T 2060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2089,147,0 +chr16 26264099 . G C 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 +chr16 26264328 . A T 2221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2250,157,0 +chr16 26264640 . A G 2190.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2219,156,0 +chr16 26264948 . G A 2756.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2785,199,0 +chr16 26264977 . C T 2039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2068,150,0 +chr16 26265089 . G A 1469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1498,111,0 +chr16 26265111 . C T 1923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1952,144,0 +chr16 26265205 . C A 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 +chr16 26265272 . C T 1209.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.116;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1238,87,0 +chr16 26265486 . G A 1383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1412,96,0 +chr16 26265516 . T A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr16 26265563 . C T 950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:979,69,0 +chr16 26265600 . T G 1930.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1959,138,0 +chr16 26265733 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr16 26265739 . A C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:257,18,0 +chr16 26265840 . G A 2626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2655,178,0 +chr16 26265841 . T A 2626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2655,178,0 +chr16 26265996 . G GT 365.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:403,26,0 +chr16 26266002 . C T 374.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:403,26,0 +chr16 26266084 . T C 1797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1826,126,0 +chr16 26266111 . T C 1902.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1931,132,0 +chr16 26266188 . T A 2003.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2032,138,0 +chr16 26266240 . G A 2247.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2276,157,0 +chr16 26266277 . A G 1872.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1901,138,0 +chr16 26266350 . A G 2565.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2594,184,0 +chr16 26266405 . C T 2780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2809,201,0 +chr16 26266451 . C G 3816.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3845,271,0 +chr16 26266534 . C T 4415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:4444,318,0 +chr16 26266551 . A C 4406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4435,316,0 +chr16 26266756 . G A 3669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:3698,262,0 +chr16 26267432 . G A 2769.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2798,199,0 +chr16 26286397 . G A 3673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3702,259,0 +chr16 26286411 . G A 2906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2935,205,0 +chr16 26286481 . G A 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 +chr16 26286495 . T C 250.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:279,0,20 +chr16 26286967 . A G 6031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:6060,436,0 +chr16 26289377 . A T 4335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:4364,334,0 +chr16 26289392 . C A 5001.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:5030,370,0 +chr16 26425005 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr16 26429789 . A G 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1260,93,0 +chr16 26429802 . AG A 878.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:916,85,0 +chr16 26429929 . C CAA 366.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 +chr16 26452758 . GT G 263.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:301,31,0 +chr16 26453019 . CT C 1009.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.503;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=32.57;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1047,100,0 +chr16 26762173 . A C 335.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 +chr16 26815404 . G A 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:697,51,0 +chr16 26817795 . CAGGTGAGAGAATCACACCACATGTTAATGATTCGATATCGCAAAAGCATGCATCTAAAAATACTGTGCTTTAAT C 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.754;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:445,0,3834 +chr16 26824482 . T C 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 +chr16 26828764 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:250,18,0 +chr16 26830878 . G GGT 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr16 26840191 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr16 26840368 . T C 860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:65:889,65,0 +chr16 26847703 . A T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr16 26849552 . C CA 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:336,30,0 +chr16 26885493 . G A 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:688,48,0 +chr16 26895475 . T A 1686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1715,120,0 +chr16 26901608 . A G 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 +chr16 26980391 . T C 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:601,42,0 +chr16 27059046 . A AT 869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:907,69,0 +chr16 27059844 . T C 752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:781,54,0 +chr16 27059890 . A C 666.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:695,48,0 +chr16 27060522 . A T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr16 27071250 . T C 2012.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2041,150,0 +chr16 27228592 . TA T 329.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-1.748;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:25:367,0,25 +chr16 27228597 . T A 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:58:895,58,0 +chr16 27270091 . A G 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:743,51,0 +chr16 27270396 . G A 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 +chr16 27272031 . A G 2482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2511,184,0 +chr16 27275752 . G C 4144.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4173,301,0 +chr16 27304278 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr16 27310469 . G A 2529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2558,181,0 +chr16 27318512 . C T 1234.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1263,90,0 +chr16 27319161 . T C 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr16 27335166 . T C 1947.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1976,138,0 +chr16 27336459 . C T 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 +chr16 27352355 . C T 2633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.646;DP=67;FS=3.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,66:67:99:2662,195,0 +chr16 27360932 . C T 829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:858,63,0 +chr16 27362214 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-1.480;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=30.91;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:430,0,44 +chr16 27363085 . C T 929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:958,66,0 +chr16 27385484 . G A 1360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1389,105,0 +chr16 27388079 . G T 1426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1455,102,0 +chr16 27388318 . G A 1079.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1108,78,0 +chr16 27388483 . C A 936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:965,69,0 +chr16 27388890 . G A 513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:542,39,0 +chr16 27401645 . GT G 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 +chr16 27401669 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 +chr16 27408598 . T A 4128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=-1.596;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=29.73;ReadPosRankSum=1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:4157,304,0 +chr16 27409143 . CT C 516.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-1.129;DP=27;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:10:553,0,10 +chr16 27409460 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr16 27409523 . CTA C 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:489,34,0 +chr16 27414237 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr16 27414287 . T A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +chr16 27414745 . GT G 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr16 27415647 . G A 1046.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1075,78,0 +chr16 27415821 . C G 1862.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1891,138,0 +chr16 27415852 . G A 1806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1835,129,0 +chr16 27415932 . G A 1453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1482,105,0 +chr16 27472662 . G C 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 +chr16 27535959 . A T 1366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:87:1395,87,0 +chr16 27535963 . G GGCGTTC 1357.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:87:1395,87,0 +chr16 27538420 . C T 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:417,30,0 +chr16 27539981 . A T 1657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1686,120,0 +chr16 27588751 . ACATAGTGAGTTTTGAAGAC A 1473.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1511,118,0 +chr16 27588774 . ATTTATTCTGGAAATATTGGCAAAATGTCTTTATTAGCAAAAATCGTATTTTTCATCTTCAG A 1428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.158;DP=33;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1466,115,0 +chr16 27600220 . T G 905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:63:934,63,0 +chr16 27613475 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:730,51,0 +chr16 27614901 . C T 1023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1438,102,0 +chr16 27615093 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:433,33,0 +chr16 27661722 . A T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr16 27685008 . A G 1994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=-0.627;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=34.12;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:2023,138,0 +chr16 27685014 . G T 1979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:2008,138,0 +chr16 27734901 . AAGGTGACTGACACTTTACCTCTCATTCAGCTGCTTTCAGAAGTGAGCTTTAGCCAGTCTTTCACACTCGGGTGCCGCGTTTGCTTTGC A 2360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=1.670;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=34.24;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2398,177,0 +chr16 27737775 . TGGTAAAGTACCACGGTAAAGCTCATTACACACGTGACGAGCCGAAGCAGGAGTTCTGAATGCTGTGTGTTCATCCACA T 2441.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=2.365;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:2479,200,0 +chr16 27741531 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.668;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:272,0,519 +chr16 27795936 . C T 893.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-0.788;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:922,63,0 +chr16 27796873 . GTT G 362.49 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.919;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:14:570,14,0 +chr16 27798137 . A T 968.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:997,72,0 +chr16 27799762 . A T 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 +chr16 27882829 . C CAT 3172.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3210,214,0 +chr16 27889777 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr16 27926596 . T G 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 +chr16 27941201 . C T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr16 28266073 . G A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr16 28317553 . T C 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 +chr16 28321840 . A C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 +chr16 28321970 . C CT 218.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:256,27,0 +chr16 28393809 . TA T 1706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.393;DP=65;FS=1.920;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,57:61:99:1744,144,0 +chr16 28485759 . A T 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 +chr16 28623226 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr16 28623385 . T G 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +chr16 28624239 . A G 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 +chr16 28625360 . G A 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr16 28631565 . T A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 +chr16 28631568 . C T 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:391,27,0 +chr16 28633408 . G A 1617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.953;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=29.72;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1646,117,0 +chr16 28647198 . C T 2068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2097,156,0 +chr16 28671303 . T TC 2342.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2380,174,0 +chr16 28682749 . T A 1863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1892,129,0 +chr16 28682752 . C T 1863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1892,129,0 +chr16 28686168 . G A 1501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1530,111,0 +chr16 28695194 . C CT,CTT 792.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,29,10:39:99:1181,262,146,796,0,758 +chr16 28696545 . C T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1868,129,0 +chr16 28697001 . G T 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:656,45,0 +chr16 28701044 . T C 1680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1709,120,0 +chr16 28708860 . G A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=1.183;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:1000,0,2000 +chr16 28710351 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=-0.227;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:600,0,539 +chr16 28719078 . G C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=7.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:731,0,565 +chr16 28719208 . CAGGTATACATGGTAACACACAACCAGTATTGTGCTCTTATGTAAAACATATAAGCATGATGGGTTGTTTTTGTTTT C 1433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.242;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1471,0,512 +chr16 28719631 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.543;DP=62;FS=7.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:815,0,1358 +chr16 28725776 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=2.043;DP=48;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:830,0,822 +chr16 28727380 . G A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.194;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:867,0,906 +chr16 28727501 . C T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.025;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:776,0,685 +chr16 28731999 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.540;DP=51;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:434,0,1014 +chr16 28760410 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:282,0,108 +chr16 28761286 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.119;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:320,0,287 +chr16 28767274 . C T 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.835;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:979,0,760 +chr16 28767558 . A G 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.838;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.779;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:712,0,781 +chr16 28776420 . G A 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.869;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=17.69;ReadPosRankSum=-2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:736,0,1371 +chr16 28781666 . T A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-1.676;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:529,0,1861 +chr16 28782553 . C T 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.147;DP=86;FS=7.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:1459,0,1473 +chr16 28825646 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=1.050;DP=33;FS=11.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:324,0,812 +chr16 28830675 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=-0.867;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:513,0,986 +chr16 28838848 . C A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.897;DP=51;FS=4.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:891,0,884 +chr16 28850504 . C T 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.959;DP=69;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:1102,0,1287 +chr16 28876554 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=-0.693;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:749,0,715 +chr16 28896596 . A T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=2.630;DP=49;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=18.04;ReadPosRankSum=-2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:912,0,895 +chr16 28897591 . TA T 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.538;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:565,0,654 +chr16 28905986 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr16 28912102 . G T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=1.934;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.798;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1003,0,1341 +chr16 28925781 . G A 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-0.176;DP=88;FS=10.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:1426,0,1523 +chr16 28927249 . G A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.387;DP=59;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1089,0,1055 +chr16 28927253 . G GA 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.160;DP=59;FS=5.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:595,0,652 +chr16 28927399 . T G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.155;DP=39;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=17.46;ReadPosRankSum=2.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:709,0,700 +chr16 28938709 . G A 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.067;DP=69;FS=3.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1508,0,2061 +chr16 28938712 . G A 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.251;DP=69;FS=3.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=21.45;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1508,0,2061 +chr16 28942373 . C T 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-1.075;DP=68;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,36:68:99:1202,0,1156 +chr16 28942730 . G T 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.949;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1980,0,2250 +chr16 28949274 . A G 1445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.872;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1474,0,1383 +chr16 28949343 . G A 1791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.528;DP=94;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,56:94:99:1820,0,1288 +chr16 28951336 . G A 1806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=-0.391;DP=103;FS=6.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1835,0,1459 +chr16 28961657 . C G 1647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=1.014;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=16.81;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1676,0,1577 +chr16 28961825 . C T 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.319;DP=105;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:1501,0,1745 +chr16 28968241 . C A 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.706;DP=67;FS=4.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:967,0,1354 +chr16 29035473 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-2.714;DP=65;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:247,0,2010 +chr16 29038910 . T A 1411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-0.586;DP=78;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:1440,0,1336 +chr16 29040606 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=2.754;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:278,0,1244 +chr16 29043985 . A C 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.133;DP=91;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1592,0,1638 +chr16 29044404 . A G 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.718;DP=109;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1849,0,2015 +chr16 29047455 . G A 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.676;DP=118;FS=2.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:2173,0,2056 +chr16 29052951 . C A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.953;DP=71;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1161,0,1330 +chr16 29053215 . A G 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.030;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1045,0,1006 +chr16 29066304 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=1.969;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:512,0,363 +chr16 29066934 . A T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-1.632;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=14.66;ReadPosRankSum=3.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:468,0,588 +chr16 29068502 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=1.138;DP=39;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:647,0,662 +chr16 29205767 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr16 29312710 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-1.533;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:924,0,1163 +chr16 29349221 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-2.135;DP=60;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:841,0,1189 +chr16 29350000 . TTA T 1072.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=-0.380;DP=49;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:1110,0,767 +chr16 29350560 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-1.166;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=16.28;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:533,0,538 +chr16 29377597 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:338,0,373 +chr16 29378698 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.136;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:419,0,442 +chr16 29387325 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.950;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:585,0,121 +chr16 29399532 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.598;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:475,0,290 +chr16 29399702 . G T 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.865;DP=36;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:897,0,275 +chr16 29428934 . T A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.594;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:328,0,680 +chr16 29429096 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.396;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:251,0,456 +chr16 29435246 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.536;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:440,0,310 +chr16 29444400 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-2.423;DP=56;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=16.71;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:964,0,1042 +chr16 29444447 . C A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.871;DP=42;FS=2.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=25.02;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1079,0,351 +chr16 29444543 . A G 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-0.528;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:952,0,1073 +chr16 29444848 . T G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.762;DP=61;FS=10.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:463,0,3700 +chr16 29444857 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.618;DP=59;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:465,0,3700 +chr16 29444977 . C T 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-1.340;DP=63;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:914,0,1198 +chr16 29445380 . G A 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.998;DP=57;FS=7.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1008,0,1050 +chr16 29451226 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.432;DP=46;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:551,0,1036 +chr16 29574173 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=12.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:246,0,253 +chr16 29596088 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.608;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:323,0,362 +chr16 29596346 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,380 +chr16 29621077 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,220 +chr16 29633160 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=1.313;DP=16;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,262 +chr16 29634513 . GAA G 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.566;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:90:297,0,90 +chr16 29634960 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,177 +chr16 29645959 . GA G 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-0.595;DP=175;FS=4.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:1390,0,1939 +chr16 29652867 . A G 3525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.122;DP=207;FS=6.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=17.03;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,107:207:99:3554,0,3381 +chr16 29656016 . TCTGAAAGAGATGAGGGGACATGAAGATGACACAGCAGGGGAAAACTCCACGTCATTCTTAGTGGTTGTACAGCTGTGTATTTTGTCATCGTGAAACACTCAC T 9888.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=1.866;DP=252;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,225:231:99:9926,683,0 +chr16 29713396 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:269,0,180 +chr16 29717288 . T C 286.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:315,0,13 +chr16 29719065 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:263,0,298 +chr16 29736744 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=4.238;DP=77;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=2.63;ReadPosRankSum=-3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:231,0,2408 +chr16 29742192 . C T 1594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.061;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:1623,0,3751 +chr16 29767256 . A G 2049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.919;DP=117;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:2078,0,2033 +chr16 29783124 . C T 2357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.695;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:2386,0,2621 +chr16 29783411 . G C 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=1.047;DP=111;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,40:111:99:1418,0,5294 +chr16 29784784 . C T 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=1.599;DP=159;FS=7.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,51:158:99:1346,0,3992 +chr16 29784841 . C T 1581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=1.638;DP=118;FS=10.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:1610,0,2504 +chr16 29790582 . C A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=1.198;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=25.17;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:582,0,196 +chr16 29790732 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:291,0,369 +chr16 29791174 . G C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.646;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:408,0,399 +chr16 29791537 . T A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.403;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=30.80;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:75:675,0,75 +chr16 29791568 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=1.189;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:521,0,129 +chr16 29791622 . G T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.62;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:310,0,98 +chr16 29791992 . T G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.317;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:343,0,363 +chr16 29796670 . T C 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.186;DP=39;FS=4.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:891,0,484 +chr16 29797074 . A T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-1.328;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:696,0,970 +chr16 29801692 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.435;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:868,0,614 +chr16 29801900 . C T 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.007;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=20.87;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:863,0,472 +chr16 29803521 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.063;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:657,0,615 +chr16 29835541 . A G 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.070;DP=79;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1530,0,1160 +chr16 29835657 . C G 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.728;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:644,0,549 +chr16 29835760 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.490;DP=45;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:827,0,775 +chr16 29836702 . A T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=-0.292;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:419,0,733 +chr16 29836748 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-1.624;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:280,0,1135 +chr16 29837253 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:329,0,304 +chr16 29845381 . G T 1976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=2.016;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:2005,0,5358 +chr16 29850151 . C T 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.925;DP=111;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:1503,0,2306 +chr16 29855086 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.694;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,131 +chr16 29860759 . A T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:427,0,203 +chr16 29895527 . T A 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.104;DP=57;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=16.73;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:982,0,842 +chr16 29904171 . A T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=1.907;DP=38;FS=8.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=17.84;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:706,0,1463 +chr16 30340975 . G A 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-0.573;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:73:99:1385,0,1099 +chr16 30473784 . G A 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.227;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1178,0,1362 +chr16 30476849 . C T 767.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.065;DP=60;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=12.80;ReadPosRankSum=2.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:805,0,1231 +chr16 30485114 . G T 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-0.295;DP=54;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:1122,0,1656 +chr16 30485120 . T G 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.950;DP=57;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1137,0,2019 +chr16 30492607 . T C 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-0.371;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1142,0,810 +chr16 30498819 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=1.262;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:392,0,394 +chr16 30498870 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.126;DP=39;FS=16.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:677,0,676 +chr16 30598611 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.465;DP=30;FS=8.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:467,0,589 +chr16 30691813 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.563;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:296,0,575 +chr16 30740982 . G T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.688;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.27;ReadPosRankSum=-3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:265,0,416 +chr16 30741271 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.487;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:417,0,657 +chr16 30741756 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:281,0,417 +chr16 30786128 . G A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.289;DP=92;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:1242,0,1795 +chr16 30786400 . T A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:526,0,387 +chr16 30786479 . A C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.673;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:439,0,330 +chr16 30787231 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:293,0,457 +chr16 30787408 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-2.000;DP=14;FS=16.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=23.41;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:356,0,170 +chr16 30790323 . A AT 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=-0.738;DP=36;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:397,0,399 +chr16 30792761 . G T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=1.068;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:453,0,275 +chr16 30793049 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-1.549;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:518,0,509 +chr16 30793167 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.724;DP=23;FS=7.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:316,0,501 +chr16 30794126 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-2.777;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:244,0,208 +chr16 30797306 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=2.646;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:346,0,634 +chr16 30797603 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=1.705;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:377,0,438 +chr16 30804715 . G A 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=1.456;DP=110;FS=4.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1717,0,2303 +chr16 30819095 . G C 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.735;DP=89;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=17.49;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:1585,0,1512 +chr16 30819533 . G A 1314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.166;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1343,0,1157 +chr16 30819646 . G A 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=0.873;DP=63;FS=2.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=17.73;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1145,0,1124 +chr16 30819835 . C T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.059;DP=77;FS=2.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:912,0,1701 +chr16 30820110 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.467;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:998,0,1000 +chr16 30820965 . A C 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=1.283;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:700,0,487 +chr16 30824864 . G A 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.339;DP=46;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:940,0,708 +chr16 30827194 . T A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-2.025;DP=40;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:895,0,1363 +chr16 30846830 . G A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.356;DP=47;FS=14.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=18.27;ReadPosRankSum=2.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:887,0,715 +chr16 30850560 . G A 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.540;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=25.93;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,42:60:99:1584,0,472 +chr16 30854877 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.771;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:908,0,533 +chr16 30855156 . CA C 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.544;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:561,0,437 +chr16 30891873 . T G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:646,0,97 +chr16 30891929 . T C 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.733;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:389,0,283 +chr16 30893209 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.556;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:285,0,304 +chr16 30965210 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-2.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:287,0,216 +chr16 30965240 . A C 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:523,36,0 +chr16 31003864 . C T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.394;DP=44;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:868,0,636 +chr16 31026723 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.181;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:448,0,286 +chr16 31030298 . G C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:430,0,327 +chr16 31064520 . T G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:466,0,830 +chr16 31068115 . G C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.094;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:499,0,338 +chr16 31068628 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=1.658;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=27.59;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:580,0,122 +chr16 31069059 . C T 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.013;DP=41;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:789,0,653 +chr16 31070195 . A AT 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-0.084;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:700,0,454 +chr16 31070311 . A T 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.781;DP=54;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1156,0,711 +chr16 31074636 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.710;DP=62;FS=5.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:966,0,951 +chr16 31089613 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.196;DP=48;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:853,0,890 +chr16 31093631 . T C 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.491;DP=46;FS=6.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.209;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:932,0,684 +chr16 31096858 . G C 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=1.890;DP=52;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,32:52:99:1085,0,676 +chr16 31097056 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-1.449;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=22.51;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:906,0,461 +chr16 31222964 . C A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.771;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:955,0,158 +chr16 31233335 . CGGTGAGAGGACTTAACACTAATAGGATGAAAGTTAAGCCCGTCACTCCTCACTCATTTTCTCTTCTTTTCTCCA C 3103.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=3.073;DP=86;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=26.97;ReadPosRankSum=-2.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,76:83:99:3141,0,1431 +chr16 31258240 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.683;DP=17;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:266,0,642 +chr16 31281942 . T C 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-2.943;DP=98;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,32:98:99:824,0,6469 +chr16 31281944 . A G 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-3.375;DP=98;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,32:98:99:824,0,6469 +chr16 31303783 . GAC G 1481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.780;DP=108;FS=6.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1519,0,1522 +chr16 31304458 . G T 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-2.669;DP=97;FS=6.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1284,0,1764 +chr16 31304659 . G A 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.130;DP=100;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1727,0,1659 +chr16 31319887 . T C 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.274;DP=94;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,56:94:99:1857,0,1280 +chr16 31453313 . C CT 985.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.140;DP=41;FS=3.641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=24.04;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1147,116,0 +chr16 31453502 . AAAAC A 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:99:259,0,1072 +chr16 31454389 . G GT 3618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.945;DP=185;FS=6.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.792;QD=19.56;ReadPosRankSum=3.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,131:172:99:3656,0,530 +chr16 31454653 . A AT 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=2.971;DP=34;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.76;ReadPosRankSum=-3.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:369,0,915 +chr16 31454776 . A T 3176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-1.027;DP=176;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:3205,0,6405 +chr16 31494541 . GA G 383.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.651;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:419,2,0 +chr16 31500957 . T A 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-1.250;DP=53;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:999,0,768 +chr16 31592210 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=1.268;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:357,0,87 +chr16 32920337 . C CA 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.083;DP=127;FS=16.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:99:302,0,2411 +chr16 33674458 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.18;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47:290,0,47 +chr16 33922346 . TCCTCCTCCTCCC T 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.794;DP=20;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:417,0,844 +chr16 34004752 . ACTGTGAGAGAGAAAGACGAATTATATCAATCAATATATACGGCTGTAAAGTTATCAATCTAGTATAGTAGTTTATTATAGTGTGTGAAATCTGTGTTTTGACTTAC A 12167.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.292;DP=243;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=32.72;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,242:243:99:12205,1133,0 +chr16 34037392 . TA T 1043.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.327;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:1081,0,1243 +chr16 34037984 . A AAT 832.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-1.177;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=4.27;ReadPosRankSum=3.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,53:178:99:870,0,5053 +chr16 34038663 . G GT 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-2.600;DP=326;FS=10.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,61:294:99:477,0,5678 +chr16 34081221 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-1.128;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:453,0,1555 +chr16 34081344 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=3.855;DP=43;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:328,0,2779 +chr16 34081353 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=3.782;DP=42;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:327,0,2779 +chr16 34273466 . G C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.728;DP=65;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:1207,0,1166 +chr16 34283589 . A G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.858;DP=60;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:912,0,1117 +chr16 34283820 . TTCACCTGAAATAGGTTAAAAAATAGGATATACAAAAATGTGAAACAAAGTTAAATTTGTTAATCATTGTGAAAAAATTCTAAAAAAAATACTAAAC T 2320.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=1.874;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=28.10;ReadPosRankSum=-2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2358,217,0 +chr16 34340939 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=1.368;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=15.29;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:334,0,387 +chr16 34424959 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=-0.415;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:540,0,514 +chr16 34431223 . C T 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=-0.678;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1962,0,1986 +chr16 34616025 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,419 +chr16 34876765 . CT C 3237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=-0.260;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:3275,317,0 +chr16 34876945 . A T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=-1.738;DP=36;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:724,0,1363 +chr16 34880860 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:363,0,344 +chr16 34897207 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,227 +chr16 34983961 . T C 1554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=1.094;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=27.67;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1583,114,0 +chr16 34983978 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.374;DP=30;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:289,0,937 +chr16 34984111 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=-0.193;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:703,0,1229 +chr16 34984112 . T C 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.465;DP=50;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=27.30;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,36:50:99:1393,0,369 +chr16 34984250 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.209;DP=42;FS=5.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:316,0,1185 +chr16 35001426 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,179 +chr16 35038682 . G GT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.833;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:249,0,516 +chr16 35064276 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-2.011;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=21.85;ReadPosRankSum=1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1230,0,1666 +chr16 35158060 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.276;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:254,0,254 +chr16 35167358 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.644;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:339,0,280 +chr16 35167379 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.306;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:346,0,167 +chr16 35170374 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.119;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:326,0,314 +chr16 35172684 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.740;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:357,0,257 +chr16 35172693 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.600;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:357,0,257 +chr16 35317736 . C T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.913;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:616,0,832 +chr16 35323558 . TCTACAAGACAGAAAGGCACAAGACAAGTCTGAGACAGATTTAATGAGCACAATAACCTTTTCAAACTCACTTAAACATTATGCCACACTTAC T 3647.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=3.352;DP=89;FS=1.939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.355;QD=28.50;ReadPosRankSum=-2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,81:85:99:3685,258,0 +chr16 35332099 . G T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.060;DP=24;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,810 +chr16 35346117 . TCTAAACACAAACAAGGAAATTATTAAGTCATGCAGTGAAATCAGACGACACGAAAACCACTTCAACATGACAAACTTCAAAAACTTGC T 1116.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-0.623;DP=49;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1154,0,735 +chr16 35346118 . CT C 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=-0.882;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:340,0,1641 +chr16 35346120 . AAACACAAACAAGGAAATTATTAAGTCATGCAGTGAAATCAGACGACACGAAAACCACTTCAACATGACAAACTTCAAAAACTTGCCT A 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.131;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:341,0,1596 +chr16 35416114 . C CT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-2.980;DP=290;FS=7.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=1.03;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,56:263:99:337,0,5118 +chr16 35463095 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=1.561;DP=36;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:240,0,975 +chr16 35477660 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.096;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,312 +chr16 35486479 . C T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-0.009;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:677,0,1259 +chr16 35891332 . T A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:294,0,99 +chr16 35891357 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=27.89;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:90:335,0,90 +chr16 35892745 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=2.359;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.06;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,132 +chr16 35909240 . C CA 920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=-0.382;DP=173;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,58:167:99:958,0,2859 +chr16 35959648 . C T 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.174;DP=75;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:705,0,1927 +chr16 35962217 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.605;DP=76;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:407,0,3507 +chr16 36207490 . T C 2584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=1.439;DP=101;FS=11.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=25.59;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,70:101:99:2613,0,795 +chr16 36209994 . A G 1759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.734;DP=137;FS=7.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=12.85;ReadPosRankSum=2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,52:137:99:1788,0,2911 +chr16 36210169 . C T 1848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.427;DP=125;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1877,0,2418 +chr16 36210332 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.861;DP=126;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,36:126:99:907,0,3464 +chr16 36233097 . AAC A 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.387;DP=39;FS=1.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:788,0,519 +chr16 36238513 . A C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr16 36245094 . GTT G 577.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.253;DP=60;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:704,0,1116 +chr16 36245429 . G C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.021;DP=31;FS=5.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,721 +chr16 36326385 . A T 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.011;DP=46;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:889,0,710 +chr16 36341684 . G A 651.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.193;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:16:680,16,0 +chr16 36349682 . A G 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.019;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1059,0,235 +chr16 36356551 . A G 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:537,39,0 +chr16 36396618 . G A 3289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-0.278;DP=196;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,103:195:99:3318,0,3238 +chr16 36398123 . T C 2388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.703;DP=136;FS=6.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:2417,0,6471 +chr16 36398129 . AAGGTATACTGAATGTTTGCTTAAGACATAAACTCACTTTTTTTTGTTTTGTGGTGTTATGGAAATTATGCAATGAACTGTGCTGTTTTGAGT A 5344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=1.598;DP=132;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=30.26;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,118:129:99:5382,0,2045 +chr16 36402015 . C CT 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.039;DP=44;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:320,0,679 +chr16 36402583 . C T 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.654;DP=127;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1923,0,2355 +chr16 36473760 . T TA 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-1.418;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.969;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:283,0,909 +chr16 36605710 . G A 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.573;DP=124;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:1658,0,2539 +chr16 36615946 . T TA 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.548;DP=39;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:476,0,478 +chr16 36616446 . AG A 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.993;DP=37;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:335,0,685 +chr16 36742943 . G C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-1.838;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=16.80;ReadPosRankSum=2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,259 +chr16 36757660 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:370,0,209 +chr16 36757746 . A C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:458,0,232 +chr16 36757869 . G T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.740;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:542,0,153 +chr16 36757887 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=1.362;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=24.70;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:547,0,157 +chr16 36759156 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=23.40;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:309,0,143 +chr16 36875521 . A C 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 +chr16 36875769 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:331,0,333 +chr16 37000544 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.818;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:385,0,704 +chr16 37067502 . C T 2191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.031;DP=314;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,93:314:99:2220,0,14194 +chr16 37067917 . CT C 1559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=1.681;DP=281;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,1:271:99:1597,0,8575 +chr16 37622311 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:345,0,257 +chr16 37844343 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:232,0,391 +chr16 37977818 . A C 236.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:265,0,22 +chr16 37978382 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=20.18;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:230,0,67 +chr16 37979290 . AT A 315.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:353,24,0 +chr16 37979292 . G C 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 +chr16 38014467 . C T 517.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.347;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=34.49;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:1:543,1,0 +chr16 38075286 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.384;DP=124;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,26:124:99:506,0,3758 +chr16 38099965 . T G 2320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.756;DP=194;FS=5.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,71:192:99:2349,0,3992 +chr16 38101779 . G A 1682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=-0.418;DP=188;FS=20.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,62:187:99:1711,0,4693 +chr16 38101806 . C T 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.804;DP=201;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,56:200:99:1338,0,5511 +chr16 38111743 . C T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.082;DP=190;FS=3.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=5.26;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,46:190:99:1028,0,5490 +chr16 38124433 . T C 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.213;DP=149;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,38:149:99:950,0,8247 +chr16 38124434 . G T 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=1.821;DP=150;FS=4.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,38:150:99:950,0,8247 +chr16 38124799 . AT A 3426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=1.089;DP=135;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,84:126:99:3464,0,664 +chr16 38125603 . A AT 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-0.948;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:518,0,472 +chr16 38125747 . C A 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=0.917;DP=75;FS=7.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1284,0,1373 +chr16 38125775 . G GT 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.658;DP=72;FS=26.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:788,0,916 +chr16 38126242 . G C 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.681;DP=81;FS=3.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:1119,0,1681 +chr16 38127429 . TCCTGGTGAGTTTTAAAGACAGAAGAGAAGATCAGCTGAAAATGTAAGTGTAAAGAAACACACGAATCAGCTGAAATGAGCGTCAGA T 2267.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.470;DP=53;FS=6.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=27.16;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2305,192,0 +chr16 38220039 . AACCTGAAGAAAGACATGAAATAAGCTGTAAAAAGACAGTGAAAACCTCCCTCAAACTTTGTCACATTATTCTGCTTTTTATTTTTTTCTCTGTCTTGTCTGT A 1723.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=2.244;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1761,161,0 +chr16 38237963 . G T 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.405;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:862,0,951 +chr16 38885943 . TC T 248.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:286,24,0 +chr16 39184573 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.789;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:531,0,1854 +chr16 39184584 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.343;DP=57;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=4.24;ReadPosRankSum=2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:270,0,1671 +chr16 39235617 . A AT 976.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-2.122;DP=131;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1102,0,1302 +chr16 39324904 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:398,0,202 +chr16 39345079 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.267;DP=42;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:285,0,1544 +chr16 39349549 . T C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.838;DP=49;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:751,0,983 +chr16 39349632 . A G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.287;DP=46;FS=8.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:834,0,762 +chr16 39378496 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:304,0,460 +chr16 39384365 . T C 699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:728,51,0 +chr16 39508255 . G A 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-1.382;DP=127;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:1854,0,6227 +chr16 39508258 . T C 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=-1.129;DP=144;FS=5.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,52:144:99:1854,0,6288 +chr16 39577836 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:89:232,0,89 +chr16 39602257 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-0.996;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:256,0,413 +chr16 39603959 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-1.904;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=24.73;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:597,0,176 +chr16 39693333 . A G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=2.663;DP=81;FS=10.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:650,0,2092 +chr16 39698851 . A T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.643;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,23:69:99:588,0,1659 +chr16 39708925 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.729;DP=66;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:257,0,1943 +chr16 39876595 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.448;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.176;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,249 +chr16 39881067 . T A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.942;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:77:490,0,77 +chr16 39881248 . T A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-1.710;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:504,0,197 +chr16 39894943 . T C 1405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=-0.311;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:1434,0,2195 +chr16 39903340 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-1.052;DP=59;FS=6.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:280,0,1784 +chr16 39913936 . C T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.119;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:641,0,1341 +chr16 39913965 . CT C 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.565;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:428,0,649 +chr16 39916281 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:291,0,374 +chr16 39925110 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr16 39984876 . A C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 +chr16 40051789 . C T 1877.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1906,138,0 +chr16 40066523 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=2.291;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:364,0,658 +chr16 40075445 . G A 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=1.293;DP=67;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1102,0,836 +chr16 40075529 . T C 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.193;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:1012,0,326 +chr16 40079128 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.599;DP=28;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:323,0,608 +chr16 40084753 . C A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,774 +chr16 40084754 . A C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:247,0,774 +chr16 40095740 . T TAA 315.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:353,30,0 +chr16 40144346 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=1.177;DP=28;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:413,0,402 +chr16 40144514 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=1.799;DP=19;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:335,0,252 +chr16 40216060 . G T 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.669;DP=94;FS=10.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,40:94:99:1381,0,1832 +chr16 40680827 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.330;DP=35;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:361,0,801 +chr16 40681000 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.927;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:372,0,432 +chr16 40681126 . A G 1939.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1968,138,0 +chr16 40681132 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.419;DP=46;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:746,0,851 +chr16 40681352 . A G 1311.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1340,96,0 +chr16 40681897 . GA G 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=1.318;DP=34;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:261,0,688 +chr16 40681928 . G A 757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:786,57,0 +chr16 40681939 . A C 770.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:799,57,0 +chr16 40681988 . A AG 264.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:302,27,0 +chr16 40682516 . A T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 +chr16 40682624 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=1.347;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:307,0,592 +chr16 40682663 . A T 444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:473,33,0 +chr16 40682676 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 +chr16 40683395 . TG T 233.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:271,18,0 +chr16 40730077 . C G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=1.399;DP=41;FS=12.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:607,0,699 +chr16 40790286 . TGTAAGTACATACTTTGTGAGGAGACTGTAAATGTGTTTGGTCACCTAAAAAACGAATCCCTTTCTCTCTTAG T 4984.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.336;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=29.02;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,118:122:99:5156,211,0 +chr16 40800695 . AG A 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-1.480;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:37:325,0,37 +chr16 40800785 . T C 705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:51:734,51,0 +chr16 40800790 . T A 705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:51:734,51,0 +chr16 40800836 . T TC 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:255,0,382 +chr16 40801530 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.861;DP=75;FS=7.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:411,0,2340 +chr16 40864010 . G GA 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.124;DP=88;FS=8.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:656,0,1986 +chr16 40864245 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-0.548;DP=77;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:350,0,2298 +chr16 40869654 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.116;DP=78;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:931,0,1836 +chr16 40877489 . G C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.319;DP=78;FS=4.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:608,0,2037 +chr16 40881549 . A T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.260;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:585,0,1743 +chr16 40885247 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.402;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:664,0,792 +chr16 40890496 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.355;DP=58;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:251,0,1771 +chr16 40903400 . G A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.053;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:1018,0,1714 +chr16 40931356 . T A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.155;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:572,0,633 +chr16 40965689 . A G 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 +chr16 40975174 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.198;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:714,0,587 +chr16 40975938 . G C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-1.480;DP=48;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:532,0,1743 +chr16 40976508 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:46:343,0,46 +chr16 40977077 . TAG T 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.467;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:467,0,384 +chr16 40977383 . A G 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.600;DP=66;FS=3.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:955,0,1341 +chr16 40978734 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.749;DP=112;FS=1.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=3.62;ReadPosRankSum=2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:434,0,3356 +chr16 41007712 . G A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.456;DP=40;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:534,0,800 +chr16 41012168 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=1.027;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:269,0,1794 +chr16 41015556 . CT C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:14:235,0,14 +chr16 41020426 . A G 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.588;DP=58;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:808,0,1240 +chr16 41021005 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:330,0,591 +chr16 41045588 . A T 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.658;DP=270;FS=5.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,55:270:99:1212,0,16767 +chr16 41045594 . T A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.720;DP=265;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,55:265:99:1214,0,16767 +chr16 41046811 . T A 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.424;ClippingRankSum=-1.754;DP=273;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,69:272:99:1544,0,7027 +chr16 41047700 . AAGGTAAATTCAAAGAAATAATATTTAGGAGCCAATTACATACAAAGATGTCACCAATGTCACCAAAATGAATTGAATTTTTGATTCTTTTTATATCAGTTACAATCAAATATATTTTTCTAACTCTCTC A 16779.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=1.695;DP=443;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,434:437:99:16817,1254,0 +chr16 41051013 . TGTGAGCAGAAATAAGAGATGATTAAAATCTTTTCCAGGCACTCTTACAGTACTTCAAATAAAGTGTGTATTTCATTGGATTCAG T 12860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=2.149;DP=286;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,284:286:99:12898,1088,0 +chr16 41219357 . A C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.288;DP=29;FS=8.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:427,0,615 +chr16 41610027 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.588;DP=195;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,42:195:99:859,0,6133 +chr16 41610048 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-1.960;DP=184;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.460;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,34:184:99:509,0,5732 +chr16 41851995 . C T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.294;DP=116;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,28:116:99:596,0,3482 +chr16 41852021 . G T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.221;DP=123;FS=3.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,30:123:99:651,0,3549 +chr16 41900921 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:85:238,0,85 +chr16 41912439 . T C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.352;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:525,0,652 +chr16 41914995 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:33:264,0,33 +chr16 41915614 . G A 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-0.289;DP=80;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=16.57;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:1354,0,1481 +chr16 42012996 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.232;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:389,0,449 +chr16 42038839 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=1.693;DP=48;FS=2.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:233,0,1409 +chr16 42039316 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-2.483;DP=74;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:474,0,4394 +chr16 42039322 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-2.429;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:468,0,4394 +chr16 42045310 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.225;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:526,0,2163 +chr16 42048801 . A C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-2.171;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:445,0,1406 +chr16 42048873 . A C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-0.153;DP=44;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:293,0,1612 +chr16 42052639 . GA G 290.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:28:328,28,0 +chr16 42052642 . G A 299.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:328,28,0 +chr16 42063873 . C T 2081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.691;DP=254;FS=0.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,81:254:99:2110,0,6611 +chr16 42102088 . C A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-1.079;DP=200;FS=4.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,52:200:99:1184,0,5461 +chr16 42296533 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr16 42304670 . CA C 738.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.720;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.348;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:15:776,15,0 +chr16 42305405 . T C 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.534;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:791,0,957 +chr16 42305457 . AC A 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.202;DP=45;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:534,0,585 +chr16 42305993 . A C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=1.340;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:290,0,471 +chr16 42307642 . T C 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.273;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:635,0,496 +chr16 42309079 . C CT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=1.754;DP=26;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:277,0,268 +chr16 42309450 . T TTC 634.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.639;DP=24;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:9:671,0,9 +chr16 42309833 . GT G,GTT 214.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.945;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,9,9:20:99:360,170,293,156,0,280 +chr16 42449816 . A T 801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:830,63,0 +chr16 42449900 . C T 381.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:410,30,0 +chr16 42496524 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-2.725;DP=79;FS=3.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=7.30;ReadPosRankSum=2.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:605,0,2061 +chr16 42567808 . C A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.731;ClippingRankSum=3.022;DP=57;FS=19.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:490,0,1359 +chr16 42567862 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=2.442;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=8.65;ReadPosRankSum=2.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:573,0,1583 +chr16 42696516 . G C 322.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=29.36;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:351,0,13 +chr16 42696529 . C G 245.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:12:273,0,12 +chr16 42698224 . C CA 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.345;DP=41;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:541,0,415 +chr16 42819712 . A G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.140;DP=42;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:640,0,830 +chr16 43007603 . GAGGTAACGTTAAAGGGTCTTAAACACCCTTTTTCTGTAACGTTAACGTGTTTGAGTGTGTATGGATAATTGGAACTCTTATATTTTC G 1401.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=1.516;DP=33;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1439,129,0 +chr16 43092808 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=2.537;DP=68;FS=15.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=5.95;ReadPosRankSum=-3.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:433,0,2891 +chr16 43092922 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.361;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:237,0,1391 +chr16 43234170 . T G 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-0.316;DP=196;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:1392,0,11201 +chr16 43234177 . C T 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.563;DP=191;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,53:191:99:1397,0,11201 +chr16 43235622 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.881;DP=116;FS=1.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,28:116:99:668,0,3547 +chr16 43236941 . A AT 1081.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.365;DP=142;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,50:138:99:1119,0,2099 +chr16 43272263 . G T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.844;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=17.39;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:637,0,764 +chr16 43299142 . A C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.071;DP=29;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:267,0,766 +chr16 43680823 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=1.845;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=7.58;ReadPosRankSum=-2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:551,0,1727 +chr16 43695811 . A G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.938;DP=90;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:286,0,2966 +chr16 43739365 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.560;DP=36;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=13.02;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:497,0,1644 +chr16 43747317 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.835;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=8.79;ReadPosRankSum=2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:327,0,2025 +chr16 43761379 . C G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=1.975;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:502,0,521 +chr16 43761611 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.961;DP=38;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,1077 +chr16 43771268 . T G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.632;DP=31;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,862 +chr16 43773850 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.387;DP=55;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:376,0,1539 +chr16 43778080 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.109;DP=52;FS=4.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:457,0,1386 +chr16 43778490 . A T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.251;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:647,0,3896 +chr16 43778491 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.373;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,22:72:99:647,0,3896 +chr16 43779273 . A T 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.487;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,40:109:99:1367,0,2382 +chr16 43779353 . GCTGTGGACATTTTTAAACAAAAGTTCTTTTGTATCAAATGAACAACAGCACAAGATTTTAAATATATCCAGGTGAACTATTAC G 2058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=3.627;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=23.66;ReadPosRankSum=-5.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,65:79:99:2096,0,3991 +chr16 43779545 . G A 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=-1.276;DP=73;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:1002,0,1567 +chr16 43779758 . CCCTTTTAAAAATAAATATGATTTTTTAATGAAAAATAGAACTTCTAATATGTTGGTATACTCTTATCATGTATAAAAAAAGTCCCTTA C 4831.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=2.492;DP=113;FS=1.878;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=27.03;ReadPosRankSum=-1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,108:113:99:4869,371,0 +chr16 43780032 . GCTGGGGATAAAAAGAAACATTGCACATTATTTGAAATTGCTTGAAAAGCCAACGAGATTGTAGAAATTACCAAAAAATCCATTAACATTAAACATTTAC G 2573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=1.883;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=33.43;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,64:77:99:2611,0,2093 +chr16 43781448 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.471;DP=168;FS=0.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,40:168:99:818,0,4910 +chr16 43786717 . T C 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=1.277;DP=67;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:537,0,1717 +chr16 43793117 . C T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.441;DP=83;FS=3.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:693,0,1834 +chr16 44079557 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-0.872;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.556;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,198 +chr16 44239554 . T C 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.363;DP=52;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:824,0,992 +chr16 44239569 . A G 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-1.538;DP=46;FS=6.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:824,0,907 +chr16 44239648 . T G 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.191;DP=54;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:943,0,913 +chr16 44241341 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.474;DP=57;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1066,0,905 +chr16 44242480 . C T 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.657;DP=73;FS=6.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1206,0,1283 +chr16 44256912 . C T 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.893;DP=100;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:1236,0,2095 +chr16 44256990 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.664;DP=82;FS=4.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:486,0,2203 +chr16 44257363 . T C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.371;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:836,0,801 +chr16 44304955 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-0.255;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:351,0,557 +chr16 44352537 . CA C 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.782;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:47:502,0,47 +chr16 44454889 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.074;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:483,0,986 +chr16 44455992 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.514;DP=48;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:424,0,1187 +chr16 44481996 . GAGTCCTAATAGAGCAGACAACACGCGTGCCA G 864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=1.260;DP=37;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=23.37;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:902,0,1102 +chr16 44481999 . TCCTAATAGAGCAGACAACACGCGTGCCATGTGACTATCTATTATGGTTTTGAAGTACCAAAAATAATAATGTCCTGGATTGAACTGGAGCTGTA T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.327;DP=34;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:243,0,1770 +chr16 44482030 . TGACTATCTATTATGGTTTTGAAGTACCAAAAATAATAATGTCCTGGATTGAACTGGAGCTGTA T 864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=1.077;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=25.43;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:902,0,285 +chr16 44496836 . C A 4044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.827;DP=147;FS=7.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,107:141:99:4073,0,736 +chr16 44504004 . GT G 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.289;DP=63;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:357,0,439 +chr16 44643043 . G C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.550;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:352,0,443 +chr16 44665821 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-1.274;DP=41;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:627,0,710 +chr16 44673890 . C A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.941;DP=82;FS=9.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:773,0,3388 +chr16 44673900 . C A 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.277;DP=84;FS=11.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:1360,0,3228 +chr16 44675091 . A G 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=2.280;DP=52;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:658,0,1148 +chr16 44675180 . T A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=2.017;DP=54;FS=4.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=7.61;ReadPosRankSum=2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:439,0,1406 +chr16 44694687 . G C 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.535;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1466,0,1591 +chr16 44702682 . A C 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=1.368;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=18.47;ReadPosRankSum=-2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1303,0,1001 +chr16 44730441 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.230;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:470,0,508 +chr16 44749814 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=32.97;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:325,0,134 +chr16 44750679 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,103 +chr16 44753692 . T TA 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=1.233;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:383,0,815 +chr16 44778808 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.599;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:387,0,590 +chr16 44780667 . T G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.021;DP=31;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:604,0,459 +chr16 44781270 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.539;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:611,0,1228 +chr16 44815419 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=-0.460;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,874 +chr16 44815420 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.328;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,874 +chr16 44815794 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=1.126;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:419,0,456 +chr16 44816046 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,164 +chr16 44841942 . GAA G 1100.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=-2.509;DP=143;FS=9.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:1237,0,2413 +chr16 44842043 . AT A 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-2.134;DP=105;FS=14.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:760,0,1322 +chr16 44842387 . CTA C 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=1.296;DP=134;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,22:131:99:340,0,4741 +chr16 44842546 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:391,0,366 +chr16 44852499 . G A 2514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.171;DP=159;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:2543,0,2915 +chr16 44934724 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.152;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,355 +chr16 44955482 . G A 3172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.153;ClippingRankSum=3.743;DP=172;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=18.45;ReadPosRankSum=-2.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,85:172:99:3201,0,3175 +chr16 44957909 . C T 248.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:277,0,21 +chr16 45056391 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.150;DP=33;FS=11.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:583,0,586 +chr16 45056599 . TGCGA T 228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:20:266,20,0 +chr16 45057860 . G A 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=1.629;DP=30;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=23.49;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:733,0,346 +chr16 45057895 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.620;DP=43;FS=6.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:815,0,764 +chr16 45067987 . C T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=1.274;DP=54;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:912,0,959 +chr16 45070350 . C T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.200;DP=42;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:945,0,472 +chr16 45070362 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.538;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:563,0,790 +chr16 45093113 . G C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:384,0,246 +chr16 45096105 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=-0.328;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=24.99;ReadPosRankSum=2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:478,0,197 +chr16 45097110 . A G 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-1.162;DP=35;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:756,0,476 +chr16 45097319 . T A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.986;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:361,0,702 +chr16 45098512 . T A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr16 45099543 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.168;DP=40;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:534,0,894 +chr16 45100337 . C G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:394,0,351 +chr16 45100397 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:284,0,521 +chr16 45100850 . T A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.758;ClippingRankSum=-2.573;DP=45;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=12.42;ReadPosRankSum=2.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:587,0,2105 +chr16 45100891 . C T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.641;DP=41;FS=6.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:695,0,693 +chr16 45101054 . G A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.671;DP=54;FS=2.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:949,0,959 +chr16 45101235 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-1.091;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:376,0,366 +chr16 45103478 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-0.118;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:249,0,777 +chr16 45103557 . G T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:264,0,537 +chr16 45103903 . T G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.307;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:498,0,592 +chr16 45103910 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=-0.375;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:256,0,1104 +chr16 45104033 . A T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-1.385;DP=26;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:488,0,468 +chr16 45105068 . G C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:644,45,0 +chr16 45105424 . A T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-0.312;DP=34;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:563,0,1477 +chr16 45105560 . T TC 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=19.73;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:274,0,147 +chr16 45105648 . A T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=2.462;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:469,0,447 +chr16 45105718 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:338,0,260 +chr16 45106750 . T A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=-1.724;DP=43;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:710,0,814 +chr16 45108772 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,327 +chr16 45108943 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.066;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:419,0,566 +chr16 45109221 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=-1.718;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,216 +chr16 45109253 . T G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,229 +chr16 45110909 . C G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=23.92;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,176 +chr16 45112115 . C A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr16 45145230 . G A 3152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.532;DP=246;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,103:246:99:3181,0,4692 +chr16 45145335 . G A 3511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.102;DP=229;FS=9.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,99:229:99:3540,0,4457 +chr16 45145449 . G A 3089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.902;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,90:195:99:3118,0,3435 +chr16 45161497 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.995;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:715,0,1250 +chr16 45194765 . G T 2254.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.446;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=31.43;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:2283,164,0 +chr16 45194831 . AATAT A,AAT 913.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=-0.669;DP=47;FS=4.238;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,10,27:39:99:1168,799,927,260,0,226 +chr16 45194920 . A G 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.515;DP=64;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:532,0,1631 +chr16 45195219 . TAC T 4951.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.358;DP=282;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,131:265:99:4989,0,5111 +chr16 45195348 . G A 5011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.674;DP=310;FS=0.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,159:310:99:5040,0,5316 +chr16 45195683 . TG T 3557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.753;DP=262;FS=9.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,127:259:99:3595,0,3646 +chr16 45195966 . G GGAGGA 575.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:16:613,16,0 +chr16 45212158 . T C 7198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-4.638;DP=282;FS=19.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=25.53;ReadPosRankSum=-2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,193:282:99:7227,0,2307 +chr16 45215124 . G A 7527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-2.500;DP=419;FS=0.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,231:419:99:7556,0,6617 +chr16 45225186 . G C 6474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.120;DP=401;FS=9.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=16.15;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,212:401:99:6503,0,6547 +chr16 45227855 . A G 7321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.493;DP=439;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,203:438:99:7350,0,8020 +chr16 45243571 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=27.44;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:385,0,95 +chr16 45243760 . C G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=25.48;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:91:334,0,91 +chr16 45258653 . G T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=-0.358;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=15.44;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:1387,0,1630 +chr16 45258728 . AGTGAGTACTTTAAATAAAAGCCCAGGCATTGATTAATAAAAGAGTAGTGTCATTCCATTAGCAGGTTTTTTTTTCATGCTGTTTTCTTCTTTTTAAG A 4612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=1.770;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=27.73;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,98:101:99:4650,402,0 +chr16 45259108 . C A 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.242;DP=87;FS=8.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1215,0,3705 +chr16 45261310 . G C 1347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-1.163;DP=83;FS=13.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1376,0,1398 +chr16 45265304 . C CT 578.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=1.025;DP=71;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:616,0,973 +chr16 45276715 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,190 +chr16 45278692 . T C 262.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.87;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:291,0,13 +chr16 45278796 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.580;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:280,0,1062 +chr16 45279009 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=2.340;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=16.11;ReadPosRankSum=-2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:447,0,459 +chr16 45280967 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-0.250;DP=25;FS=6.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:470,0,322 +chr16 45294613 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.155;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:326,0,396 +chr16 45447822 . C T 317.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.79;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:346,0,14 +chr16 45449953 . A G 624.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:653,48,0 +chr16 45457418 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-1.412;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:293,0,445 +chr16 45457562 . C A 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:489,36,0 +chr16 45457979 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,398 +chr16 45458147 . T C 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:897,63,0 +chr16 45459790 . C T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:469,33,0 +chr16 45463807 . A T 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 +chr16 45464090 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:338,24,0 +chr16 45464663 . CA C 225.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:263,24,0 +chr16 45464763 . A T 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 +chr16 45464800 . TA T 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 +chr16 45505794 . C A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-0.896;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=25.28;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:458,0,175 +chr16 45508399 . T C 290.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:319,24,0 +chr16 45509464 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:263,0,298 +chr16 45521865 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:290,0,63 +chr16 45521878 . T C 257.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:286,0,21 +chr16 45525043 . A T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=1.034;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:504,0,452 +chr16 45525094 . G T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:373,0,244 +chr16 45529509 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:364,0,246 +chr16 45529558 . T C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.362;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:92:855,0,92 +chr16 45530421 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=1.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:362,0,346 +chr16 45530436 . T A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=1.292;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:364,0,307 +chr16 45530833 . T A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:366,0,514 +chr16 45531000 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-1.209;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:561,0,388 +chr16 45546958 . G A 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1746,123,0 +chr16 45612595 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:250,0,250 +chr16 45614828 . GTCAGGTGAGTTTTGTATATATCATCTAATAAAAGAAAATATGTTTTAGACAACAATGCATTACGTTTTTACTCAAT G 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.269;DP=20;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:345,0,1565 +chr16 45619287 . C T 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 +chr16 45667885 . C A 1528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=1.053;DP=97;FS=5.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:1557,0,3256 +chr16 45674628 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:234,0,58 +chr16 45707389 . C T 1936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1965,144,0 +chr16 45707721 . GCTGCTTAATCAAAGAAAGAGACACAATTCTTGATATCAACTAGGGTTGAGGCTGTGTTCTGTCTGTATTTATACGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTAC G 2864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=2.784;DP=83;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=34.51;ReadPosRankSum=-2.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,69:78:99:2902,0,1370 +chr16 45710465 . T C 2113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2142,154,0 +chr16 45710487 . C T 1959.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1988,141,0 +chr16 45728317 . G T 1895.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1924,138,0 +chr16 45730523 . G A 564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:593,42,0 +chr16 45737202 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr16 45748994 . G A 4419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:4448,322,0 +chr16 45763496 . C T 2211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.670;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=28.12;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2240,163,0 +chr16 45803173 . G A 857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:886,63,0 +chr16 45826688 . T C 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:661,45,0 +chr16 45852856 . TA T 475.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.456;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:29:513,29,0 +chr16 45866194 . T G 2077.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2106,147,0 +chr16 45866293 . T A 1013.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:72:1042,72,0 +chr16 45866405 . G A 2824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2853,202,0 +chr16 45866505 . C T 10520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,235:235:99:10549,707,0 +chr16 45866598 . C T 12565.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=283;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,283:283:99:12594,852,0 +chr16 45867101 . C T 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:736,51,0 +chr16 45867107 . A C 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:51:736,51,0 +chr16 45868115 . G A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 +chr16 45879339 . T G 1708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1737,135,0 +chr16 45891572 . G A 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:484,36,0 +chr16 45978678 . TCTGCAAAGAAAACCAACGTTTCATTATTTGGGTCCATTTAATGTCTGGTTTCAGAAATTTATTTAGACACTCAC T 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=33.65;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:542,0,260 +chr16 45992221 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.379;DP=63;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:319,0,1874 +chr16 46071098 . C A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=1.441;DP=31;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=29.83;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:953,0,178 +chr16 46071236 . C T 2485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2514,172,0 +chr16 46071406 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=1.024;DP=36;FS=11.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:374,0,935 +chr16 46072575 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-1.985;DP=50;FS=2.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:416,0,1345 +chr16 46072674 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-1.375;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,36:114:99:1009,0,3022 +chr16 46072843 . A T 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.850;DP=78;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:78:99:1174,0,1578 +chr16 46073092 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-2.604;DP=113;FS=2.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,38:113:99:885,0,6490 +chr16 46127547 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=1.626;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:367,0,1027 +chr16 46129127 . C G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-3.050;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=28.78;ReadPosRankSum=-2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:575,0,116 +chr16 46129762 . A AT 425.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:620,44,0 +chr16 46132200 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.791;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:348,0,2918 +chr16 46152762 . CACCTTCCGGAAAAAACAGATCTGTCCAACTGTGTTTCTGAATCCAGTTAGCATACAGCAGCATTAATGAAGCCTTTCCAA C 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.229;DP=48;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:531,0,1491 +chr16 46152767 . TCCGGAAAAAACAGA T 715.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.301;DP=46;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:753,0,1122 +chr16 46152785 . GTCCAACTGTGTTTCTGAATCCAGTTAGCATACAGCAGCATTAATGAAGCCTTTCCAAACCTTTCTA G 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-1.870;DP=53;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:758,0,1122 +chr16 46153643 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-2.436;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:524,0,1077 +chr16 46160752 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-2.152;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=4.73;ReadPosRankSum=-2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,8:45:99:241,0,4585 +chr16 46160761 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-2.039;DP=52;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:238,0,4585 +chr16 46188920 . T G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.138;DP=53;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:251,0,1589 +chr16 46202269 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.342;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:313,0,667 +chr16 46220827 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.628;DP=55;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:457,0,1319 +chr16 46237448 . G C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=1.785;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:525,0,914 +chr16 46237465 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=1.120;DP=44;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:287,0,1244 +chr16 46259627 . C T 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.862;DP=202;FS=2.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,51:202:99:1114,0,5798 +chr16 46259994 . T C 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.869;DP=238;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=4.44;ReadPosRankSum=2.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,53:238:99:1084,0,7174 +chr16 46262770 . T C 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=-0.696;DP=290;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,72:290:99:1653,0,8663 +chr16 46276754 . CAGGTATCATTGTTTTATTAGAAAATAAAAGGTGAAACTGATGCTTATTTTGTTTTTTTACATTATTAAAATAACTATGTCTTTTATTTTGA C 3720.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.337;DP=99;FS=2.199;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,96:99:99:3758,339,0 +chr16 46430456 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:492,0,122 +chr16 46667135 . C T 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 +chr16 46667137 . AT A 212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:12:234,12,0 +chr16 46669567 . G T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,916 +chr16 46669656 . GT G 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=30.97;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:347,0,267 +chr16 46669659 . A C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:347,0,267 +chr16 46669798 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.079;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=33.17;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:559,0,39 +chr16 46669892 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=29.16;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:44:349,0,44 +chr16 46670750 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.48;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,128 +chr16 47513524 . TGGCAC T 629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.351;DP=18;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:667,0,100 +chr16 47547620 . T A 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:536,36,0 +chr16 47619640 . T C 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:48:678,48,0 +chr16 48044281 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:256,0,139 +chr16 48063041 . AT A 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.566;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:74:284,0,74 +chr16 48063175 . G T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.677;ClippingRankSum=-1.165;DP=141;FS=10.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,28:141:99:523,0,4458 +chr16 48063233 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=1.826;DP=156;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,28:156:99:472,0,5194 +chr16 48065637 . C G 5084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.235;DP=288;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,139:288:99:5113,0,5091 +chr16 48065649 . A G 1319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.470;ClippingRankSum=0.498;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.087;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,57:227:99:1348,0,5223 +chr16 48273260 . A G 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.098;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=24.66;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:842,0,273 +chr16 48974060 . T A 7780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:7809,571,0 +chr16 48974065 . G C 7780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:7809,571,0 +chr16 49047747 . TA T 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.813;DP=17;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:244,0,121 +chr16 49150080 . C A 285.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:314,24,0 +chr16 49391103 . TA T 2977.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.059;DP=124;FS=1.475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=24.01;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,109:116:99:3023,280,0 +chr16 49391380 . T TG 653.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:49:691,49,0 +chr16 49569797 . CT C 295.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.70;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:10:332,10,0 +chr16 49684814 . G C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=2.975;DP=48;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=8.52;ReadPosRankSum=-2.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:437,0,1544 +chr16 49684828 . T C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=1.353;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=13.34;ReadPosRankSum=-4.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:682,0,1006 +chr16 49684840 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.078;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:243,0,1451 +chr16 49692552 . C A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=3.873;DP=51;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=7.51;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:411,0,2570 +chr16 49707973 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=3.153;DP=34;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:380,0,783 +chr16 49885980 . A T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=22.67;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:391,0,210 +chr16 49908407 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,463 +chr16 49909370 . TA T 506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:544,51,0 +chr16 49910347 . CTT C 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.419;DP=75;FS=19.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:589,0,2263 +chr16 49920341 . ATGTG A 483.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=1.488;DP=19;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:6:520,6,0 +chr16 49921970 . GA G 1403.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.705;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:99:1441,99,0 +chr16 49921972 . G T 2378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2407,170,0 +chr16 49924445 . T TG 532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.512;DP=36;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:33:570,0,33 +chr16 49925184 . T TA 1138.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:89:1176,89,0 +chr16 49927389 . C CT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-1.087;DP=80;FS=9.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:319,0,1270 +chr16 50488216 . G GT 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-2.308;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=4.52;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:286,0,938 +chr16 50493218 . ACTTCAGGGAAAGAAAAAAGTACAGTGCATTACATACTGCACAGTGATTTGATGAAAGTATGAGTGAACGGGTCTTAC A 2669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=2.563;DP=77;FS=2.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=34.67;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,65:77:99:2707,0,3187 +chr16 51609592 . G T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-2.511;DP=300;FS=4.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=5.24;ReadPosRankSum=2.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,72:300:99:1600,0,8847 +chr16 51609989 . C T 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-1.420;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=4.69;ReadPosRankSum=2.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,63:283:99:1356,0,19866 +chr16 51609992 . C A 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=-1.732;DP=276;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=4.79;ReadPosRankSum=2.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,61:276:99:1349,0,19866 +chr16 51609998 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-3.192;DP=272;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.255;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,71:272:99:1570,0,12624 +chr16 51610076 . G T 4339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-3.340;DP=159;FS=7.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=27.29;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,103:159:99:4368,0,3429 +chr16 51610079 . C T 3990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-2.617;DP=159;FS=10.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=25.10;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,102:159:99:4019,0,4111 +chr16 51613641 . A G 3093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.320;DP=81;FS=5.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=28.55;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:3122,232,0 +chr16 51617926 . G A 203.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:232,0,21 +chr16 51617983 . G A 3255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3284,238,0 +chr16 51624855 . C T 12224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.383;DP=406;FS=7.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=30.11;ReadPosRankSum=2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,323:406:99:12253,0,1441 +chr16 51743364 . G T 4166.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:4195,292,0 +chr16 51743367 . C T 4166.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:4195,292,0 +chr16 51749636 . C T 4698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=-0.226;DP=317;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,135:317:99:4727,0,6267 +chr16 51754894 . C T 5899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=1.294;DP=325;FS=12.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,180:314:99:5928,0,4615 +chr16 51795087 . A C 1195.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1224,87,0 +chr16 51901490 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.470;DP=49;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.91;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:906,0,861 +chr16 51907878 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=1.448;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:287,0,237 +chr16 51909652 . CT C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:246,0,117 +chr16 51912088 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.026;DP=26;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:459,0,554 +chr16 51950277 . G C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=4.233;DP=58;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:236,0,1612 +chr16 51950288 . C A 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=4.013;DP=75;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=11.74;ReadPosRankSum=-2.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:909,0,1499 +chr16 51950312 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=2.607;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:511,0,2499 +chr16 51950411 . A G 2962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.983;DP=196;FS=7.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,86:196:99:2991,0,3710 +chr16 51961056 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.527;DP=174;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,35:163:99:662,0,4936 +chr16 51975148 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=5.121;DP=55;FS=27.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:292,0,1551 +chr16 52537990 . G C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.668;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:68:432,0,68 +chr16 52541593 . A T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-2.265;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:41:922,0,41 +chr16 53065473 . A T 834.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.364;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:25:863,25,0 +chr16 53065840 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=3.073;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:448,0,437 +chr16 53065873 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=1.608;DP=38;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1063,0,274 +chr16 53066015 . C G 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.051;DP=35;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=21.14;ReadPosRankSum=-2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:768,0,450 +chr16 53066367 . C CT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-1.705;DP=64;FS=4.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=3.39;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:254,0,1039 +chr16 53067342 . G A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.733;DP=48;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1242,0,468 +chr16 53068209 . T C 1486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1515,111,0 +chr16 53069463 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.431;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:298,0,1109 +chr16 53069644 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.728;DP=25;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:645,0,191 +chr16 53070354 . CT C 298.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.496;DP=14;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:16:336,16,0 +chr16 53071164 . G A 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=-1.630;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:666,0,414 +chr16 53131509 . C G 370.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 +chr16 53150429 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:314,0,720 +chr16 53527152 . G T 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.495;DP=183;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,55:183:99:1381,0,4869 +chr16 53596253 . CCACACACACA C 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=7.809;DP=154;FS=21.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=4.34;ReadPosRankSum=-5.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,31:128:99:706,0,9775 +chr16 53596632 . GT G 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=-0.041;DP=34;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:333,0,332 +chr16 53635144 . TA T 336.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:374,36,0 +chr16 54461635 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:394,0,157 +chr16 54469471 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr16 54546094 . AC A 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.315;DP=21;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:35:345,0,35 +chr16 54553225 . G T 1479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=1.369;DP=39;FS=3.099;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.942;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:73:1508,73,0 +chr16 54559481 . AG A 302.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:340,36,0 +chr16 54637302 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=1.563;DP=47;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:429,0,1256 +chr16 54637355 . T TC 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=1.412;DP=53;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:350,0,1351 +chr16 54638671 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.579;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:417,0,536 +chr16 54638699 . C A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.849;DP=28;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=16.17;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:481,0,425 +chr16 54638746 . A AC 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=13.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:297,0,871 +chr16 54639014 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:379,0,708 +chr16 54639408 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-2.282;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=33.55;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:65:498,0,65 +chr16 54640228 . T TA 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.570;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:365,0,608 +chr16 54641983 . C CAA 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=2.073;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:40:407,0,40 +chr16 54665534 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.320;DP=72;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:245,0,2087 +chr16 54737074 . A C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.148;DP=83;FS=6.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=6.08;ReadPosRankSum=-1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:533,0,2248 +chr16 54737117 . T C 1913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-3.085;DP=438;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:342,96:438:99:1942,0,13428 +chr16 54737607 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=1.223;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:378,0,588 +chr16 54738015 . G T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.927;DP=34;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:434,0,652 +chr16 54738214 . CGGTCGTTGTGGTATTATTAATGTTATTGTTATTAAATTACATTTTTTAGGCTTTTAAACAATTTTTAAAATTCTTTAACGGTTTTTATTTTTTGTTTTGTTCATTTA C 2581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=2.691;DP=22;FS=5.484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,6:22:99:2619,1019,0 +chr16 54739111 . AAGGTAACTTTCCTTAACATCCGATCATTTCGGTGCTGTTTATTATATTTGTAATAACATTTAATGTAATTGATTATAC A 23165.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=3.884;DP=594;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=30.76;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,565:575:99:23203,1674,0 +chr16 54739947 . TTC T 2206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-3.113;DP=420;FS=8.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,99:403:99:2244,0,12051 +chr16 54740171 . A T 406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.989;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:444,0,1759 +chr16 54766989 . A G 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:656,45,0 +chr16 54767074 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.354;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:266,0,789 +chr16 54767128 . T G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr16 54768711 . C T 1582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1611,108,0 +chr16 54768712 . A G 1582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1611,108,0 +chr16 54805127 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=1.775;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:362,0,620 +chr16 54877764 . T C 1665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.648;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1694,117,0 +chr16 54892568 . C T 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.372;DP=80;FS=7.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:1429,0,1311 +chr16 54892580 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.478;DP=67;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:330,0,1881 +chr16 54892649 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-2.337;DP=38;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=5.44;ReadPosRankSum=2.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:235,0,2233 +chr16 54892658 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-3.027;DP=37;FS=9.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=5.80;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:243,0,2233 +chr16 54898238 . G C 1249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1278,90,0 +chr16 54902139 . A T 582.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.648;DP=33;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=17.66;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:19:611,0,19 +chr16 54902270 . A C 761.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:790,54,0 +chr16 54902340 . G A 670.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:699,51,0 +chr16 54902423 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=1.470;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=32.84;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:99:488,0,158 +chr16 54902435 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.423;DP=12;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:488,0,158 +chr16 54902502 . T A 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-2.372;DP=29;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:1365,0,290 +chr16 54902626 . C G 1975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.426;DP=131;FS=6.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,46:69:99:2004,0,569 +chr16 54902669 . A G 1485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.457;DP=89;FS=17.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1514,0,1017 +chr16 54902685 . C T 1862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=1.551;DP=61;FS=35.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=30.54;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,37:51:99:1891,0,395 +chr16 54902750 . G A 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-2.731;DP=69;FS=18.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:1053,0,929 +chr16 54902765 . C A 2347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2376,166,0 +chr16 54902839 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-0.964;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.92;ReadPosRankSum=2.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:415,0,350 +chr16 54902852 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.039;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:378,0,768 +chr16 54903004 . A G 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,17:17:70:660,0,70 +chr16 54903143 . GT G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=3.163;DP=64;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=6.51;ReadPosRankSum=-4.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:454,0,2975 +chr16 54903312 . A C 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:44:533,44,0 +chr16 54903621 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=15.46;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:291,0,319 +chr16 54995467 . A C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.302;DP=37;FS=10.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:453,0,839 +chr16 55373721 . C T 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.330;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:988,0,343 +chr16 55373839 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.990;DP=36;FS=10.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:754,0,507 +chr16 55374648 . C T 1773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.200;DP=97;FS=7.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1802,0,1477 +chr16 55472964 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.501;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=11.47;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:315,0,300 +chr16 55507405 . AGTGAGTCTTTACGGTCACAGCATTACAGATCATCCATTCATTATTATATTATTTTTACTTTAAGGTTACTTGTGTGTTTCTGACTAATTTATTTGTGTTATTCAG A 1290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=1.832;DP=41;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,33:36:99:1328,0,712 +chr16 55515517 . C T 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=-1.144;DP=73;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:1441,0,2165 +chr16 55535441 . ACTGACACTACATAACATACATTTAAAAAGCCCACATGACTATAAAACACAGCTGAACGTCAGAGCTCATGCCTTACAGAACACCAAACTAATCTCAATTACCTAGATGTAAACAGTGCCTAAATACAAGTAGACCTGTTAGATGCATCATGCTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGTGCAAACTCAC A 2836.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=36.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,1:3:99:2874,1034,0 +chr16 55542134 . G A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 +chr16 55564278 . G T 1947.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-1.732;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=32.88;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1976,141,0 +chr16 55568018 . A T 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 +chr16 55572502 . T C 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:24:315,24,0 +chr16 55572536 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,0:1:66:257,0,66 +chr16 55572562 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:270,0,58 +chr16 55572615 . T A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.882;DP=61;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=6.96;ReadPosRankSum=4.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:453,0,698 +chr16 55572638 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=1.204;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=4.41;ReadPosRankSum=2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:293,0,812 +chr16 55572891 . GA G 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:61:687,61,0 +chr16 55573115 . T C 1182.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.040;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.292;QD=28.36;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:46:1211,46,0 +chr16 55573164 . T G 692.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=34.60;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:720,11,0 +chr16 55573835 . A G 3883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3912,280,0 +chr16 55573883 . A G 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=28.04;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:99:666,0,391 +chr16 55575058 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=1.583;DP=66;FS=35.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:913,0,1307 +chr16 55575063 . A T 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.347;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:466,0,2186 +chr16 55575336 . T A 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=-3.511;DP=83;FS=27.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=13.79;ReadPosRankSum=-3.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1173,0,2238 +chr16 55575577 . A G 647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:676,51,0 +chr16 55575934 . A T 2514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.344;DP=63;FS=2.748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=29.97;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,59:61:99:2543,178,0 +chr16 55575994 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-2.610;DP=57;FS=7.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,47:56:99:1901,0,134 +chr16 55595129 . C T 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.565;DP=104;FS=1.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1303,0,4658 +chr16 55603778 . GT G 1445.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.292;DP=79;FS=1.563;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,61:71:44:1523,44,0 +chr16 55604100 . T C 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.690;DP=49;FS=6.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:843,0,1151 +chr16 55604177 . AG A 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-1.777;DP=19;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:57:509,0,57 +chr16 55604588 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.854;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:392,0,432 +chr16 55604690 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.369;DP=42;FS=6.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:649,0,1099 +chr16 55604773 . T C 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=2.011;DP=100;FS=5.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,36:99:99:1158,0,2783 +chr16 55604879 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.921;DP=88;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=2.51;ReadPosRankSum=-2.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:99:249,0,2776 +chr16 55605187 . CTT C 224.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:398,31,0 +chr16 55605428 . A ATT 670.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:708,47,0 +chr16 55605713 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-1.648;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:282,0,1286 +chr16 55605728 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.215;DP=31;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:390,0,730 +chr16 55615317 . TG T 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.34;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:53:296,0,53 +chr16 55615320 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=33.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:53:296,0,53 +chr16 55818001 . C G 323.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.39;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:352,0,15 +chr16 55827735 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:276,0,145 +chr16 55827784 . C G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:397,0,138 +chr16 55829916 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,319 +chr16 55829917 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,319 +chr16 55830021 . G C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=24.60;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:348,0,130 +chr16 56024727 . G A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.397;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=31.75;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1076,0,119 +chr16 56024792 . A C 5331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=6.415;DP=285;FS=35.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=18.71;ReadPosRankSum=-3.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,153:230:99:5360,0,2626 +chr16 56024921 . G A 1780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=-0.361;DP=201;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1809,0,1907 +chr16 56024964 . C T 465.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=11.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=33.23;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:492,0,4 +chr16 56025482 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.753;DP=59;FS=8.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:328,0,1552 +chr16 56026425 . G A 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.320;ClippingRankSum=1.431;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=14.89;ReadPosRankSum=-3.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,50:82:99:1726,0,1207 +chr16 56026565 . G T 1912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-1.674;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=23.33;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1941,0,211 +chr16 56027134 . C T 1491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1520,108,0 +chr16 56028370 . A G 756.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.261;DP=24;FS=10.792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=31.53;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:23:785,23,0 +chr16 56029015 . G A 365.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.474;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=28.08;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:393,0,12 +chr16 56029120 . G A 3377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3406,253,0 +chr16 56058432 . G C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.165;DP=56;FS=7.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:887,0,1059 +chr16 56075795 . G A 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=1.455;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=31.60;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,37:43:57:1387,0,57 +chr16 56100965 . G A 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.272;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.101;QD=22.27;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1231,0,634 +chr16 56108581 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=1.151;DP=49;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:263,0,1461 +chr16 56125222 . GA G 948.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.423;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=22.59;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,32:40:86:986,0,86 +chr16 56125365 . A G 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.148;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:994,0,1062 +chr16 56129044 . C T 5820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.400;DP=215;FS=4.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=27.07;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,162:215:99:5849,0,1118 +chr16 56138410 . A G 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=2.130;DP=55;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1035,0,955 +chr16 56138871 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.372;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:316,0,421 +chr16 56140260 . A T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-1.451;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:600,0,1031 +chr16 56145781 . G C 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-2.676;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:756,0,6043 +chr16 56145784 . G T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-2.895;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,28:105:99:762,0,6043 +chr16 56148195 . CA C 1262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=2.144;DP=84;FS=6.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,43:81:99:1300,0,1250 +chr16 56154755 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr16 56161631 . T C 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.403;DP=259;FS=6.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,58:259:99:1120,0,7406 +chr16 56164952 . T A 1405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.854;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,58:195:99:1434,0,4997 +chr16 56164976 . G A 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.783;DP=203;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.66;ReadPosRankSum=-5.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,64:203:99:1584,0,5116 +chr16 56165105 . A G 3941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.661;DP=262;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,119:261:99:3970,0,4487 +chr16 56178591 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.954;DP=127;FS=11.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,25:126:99:375,0,5551 +chr16 56199832 . C T 2679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.962;DP=147;FS=4.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:2708,0,5509 +chr16 56221718 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-0.808;DP=218;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=2.59;ReadPosRankSum=3.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,41:216:99:592,0,6583 +chr16 56309950 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-4.664;DP=42;FS=6.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:600,0,862 +chr16 56311442 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:44:277,0,44 +chr16 56311512 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:260,0,93 +chr16 56311798 . C T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=2.605;DP=43;FS=6.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:806,0,641 +chr16 56312181 . C T 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.165;DP=46;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=16.69;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:796,0,757 +chr16 56322750 . C T 2170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.588;DP=114;FS=5.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:2199,0,4297 +chr16 56331627 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.974;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:609,0,1290 +chr16 56334524 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.137;DP=76;FS=3.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,31:76:99:1091,0,1568 +chr16 56334537 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.880;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:575,0,2167 +chr16 56340038 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.156;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:410,0,84 +chr16 56351925 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=-0.802;DP=92;FS=7.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=3.36;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:337,0,2911 +chr16 56355051 . C A 3015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-0.299;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=18.17;ReadPosRankSum=-2.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:3044,0,3082 +chr16 56355105 . C T 3088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-1.790;DP=191;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,90:191:99:3117,0,3113 +chr16 56370800 . C T 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.595;DP=122;FS=1.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,74:122:99:2318,0,1561 +chr16 56427435 . G A 398.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=33.21;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:7:426,0,7 +chr16 56442446 . G A 623.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.452;DP=23;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:15:652,0,15 +chr16 56452667 . T C 2152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.403;DP=93;FS=4.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,62:93:99:2181,0,1184 +chr16 56452668 . T C 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.943;DP=95;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.852;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1756,0,1928 +chr16 56478312 . T G 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 +chr16 56480821 . T TA 418.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:456,45,0 +chr16 56497630 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.28;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:92:251,0,92 +chr16 56581362 . T G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:281,0,58 +chr16 56675479 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-1.283;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:328,0,1149 +chr16 56679421 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-0.063;DP=73;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:247,0,2221 +chr16 56726282 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=-1.639;DP=54;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:325,0,1582 +chr16 56808954 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.173;DP=55;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=3.87;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:241,0,1605 +chr16 56809093 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=-0.345;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:400,0,2719 +chr16 56819359 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.911;DP=61;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:230,0,1836 +chr16 56832454 . G A 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-1.174;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1232,0,2188 +chr16 56833951 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:266,0,476 +chr16 56838724 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:265,0,308 +chr16 56841352 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.084;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:551,0,468 +chr16 56841468 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.478;DP=30;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:510,0,547 +chr16 56842725 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-0.675;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=17.56;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:397,0,334 +chr16 56844496 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.002;DP=42;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:574,0,878 +chr16 56893678 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr16 56931574 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.194;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:247,0,507 +chr16 56981985 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.741;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:399,0,611 +chr16 57119428 . A G 224.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.02;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:252,0,10 +chr16 57315272 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-2.353;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:387,0,3608 +chr16 57441552 . C A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=-0.018;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:528,0,1950 +chr16 57442520 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-0.872;DP=81;FS=5.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:274,0,2431 +chr16 57446973 . TA T 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.678;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:378,0,171 +chr16 57564946 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.022;DP=29;FS=8.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:383,0,640 +chr16 57597939 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=28.14;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:394,0,92 +chr16 57692273 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.097;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:284,0,3346 +chr16 57693815 . G C 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.124;DP=72;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:567,0,1997 +chr16 57739052 . A T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=1.099;DP=121;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,27:121:99:521,0,3526 +chr16 57742461 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-3.196;DP=91;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:634,0,2571 +chr16 57835227 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=1.900;DP=57;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:313,0,1541 +chr16 57840679 . GGGTACGAGAGAAGACTAGTTTACCACGTTTTACTACTAACTCTGATCACTGACAGCTGTTTTTGTGCATTATAGAAAATAATATGTGCATTGTTTCTTGTGATGTGAA G 2081.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.722;DP=49;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:2119,202,0 +chr16 57920913 . G A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-1.095;DP=35;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:888,0,876 +chr16 57920914 . C T 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=-1.268;DP=35;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:888,0,876 +chr16 57945885 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=1.183;DP=87;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:86:99:517,0,2509 +chr16 57946168 . T TA 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=-0.369;DP=77;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:764,0,3134 +chr16 57946467 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-0.520;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=29.76;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:683,0,328 +chr16 57946987 . ACACACG A 406.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=-2.123;DP=16;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=25.43;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:17:444,0,17 +chr16 57947055 . A T 3278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=1.109;DP=84;FS=7.706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,75:81:99:3307,238,0 +chr16 57947163 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.218;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,27:130:99:516,0,3982 +chr16 57947317 . A G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.741;DP=30;FS=8.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:407,0,775 +chr16 57950980 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-1.528;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:488,0,2833 +chr16 57953396 . A G 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 +chr16 57958035 . T C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:644,48,0 +chr16 57991267 . CGT C 253.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:291,26,0 +chr16 58024259 . T C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.814;DP=111;FS=12.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,29:110:99:632,0,3077 +chr16 58125300 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.337;DP=181;FS=6.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,31:180:99:365,0,5929 +chr16 58125672 . T C 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.165;DP=48;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.475;QD=30.45;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1490,0,179 +chr16 58126749 . C CA 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-3.612;DP=91;FS=23.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:413,0,2163 +chr16 58126803 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.509;DP=126;FS=5.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,26:126:99:502,0,3806 +chr16 58127003 . T C 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=-0.715;DP=58;FS=5.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=21.63;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:58:99:1283,0,1723 +chr16 58127004 . A G 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=-0.679;DP=56;FS=3.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=22.41;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,34:56:99:1283,0,1723 +chr16 58127136 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=-0.013;DP=103;FS=4.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,25:95:99:631,0,4479 +chr16 58127263 . G A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.462;DP=96;FS=7.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,30:96:99:801,0,2590 +chr16 58127791 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.988;DP=41;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:357,0,3533 +chr16 58129572 . T A 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.333;DP=119;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.975;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,38:119:99:1090,0,6680 +chr16 58129573 . T A 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.454;DP=117;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,37:117:99:1090,0,6680 +chr16 58129912 . CA C 1227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.229;DP=59;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.792;QD=20.81;ReadPosRankSum=2.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1265,0,1573 +chr16 58129916 . A G 1236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.515;ClippingRankSum=-0.493;DP=57;FS=2.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,33:57:99:1265,0,1573 +chr16 58130149 . T C 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:28:714,28,0 +chr16 58130219 . G A 1047.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1076,81,0 +chr16 58130537 . T C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.75;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:39:428,0,39 +chr16 58130946 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.264;DP=158;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,28:158:99:507,0,10503 +chr16 58136810 . G A 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.582;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,47:152:99:1172,0,3931 +chr16 58150632 . C T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.637;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=27.76;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:861,0,159 +chr16 58151268 . C T 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:857,66,0 +chr16 58151287 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-2.373;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:64:606,0,64 +chr16 58153057 . C T 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.276;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:65:939,0,65 +chr16 58155446 . C A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.780;DP=34;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=20.76;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:734,0,435 +chr16 58156785 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=46;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:324,0,265 +chr16 58159512 . T C 1863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.123;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,47:51:66:1892,66,0 +chr16 58191445 . A G 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr16 58194747 . T G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=25.84;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:390,0,117 +chr16 58233295 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.960;DP=43;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:773,0,1077 +chr16 58233563 . C A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-0.305;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:504,0,325 +chr16 58242098 . G A 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=1.040;DP=58;FS=3.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:920,0,1085 +chr16 58242184 . TCTGTAATAGAAAAAGAACATGAGTCAGCTGATTGACGGCTGTCAATCGTGTGCTGAAGGGGGCGTGTCAGAC T 2212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.035;DP=50;FS=4.114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:2250,204,0 +chr16 58245216 . C T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.895;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=19.87;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:843,0,530 +chr16 58247006 . C T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-0.786;DP=47;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1001,0,558 +chr16 58256415 . G T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=1.457;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:723,0,909 +chr16 58275485 . A T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.378;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:586,0,846 +chr16 58275578 . G T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.710;DP=32;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:416,0,930 +chr16 58276803 . A G 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.464;DP=53;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:693,0,1096 +chr16 58278391 . C CA 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-2.370;DP=42;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:643,0,781 +chr16 58279351 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-1.215;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:231,0,891 +chr16 58305094 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:686,0,635 +chr16 58305922 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-0.237;DP=162;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:567,0,4704 +chr16 58309935 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=4.145;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:597,0,1692 +chr16 58310307 . CAG C 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.984;DP=100;FS=8.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,33:91:99:984,0,1427 +chr16 58310954 . C T 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.744;DP=144;FS=12.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,51:144:99:1616,0,3048 +chr16 58311439 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.898;DP=142;FS=3.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,36:142:99:723,0,7330 +chr16 58311449 . C T 2677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=2.432;DP=153;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:2706,0,3824 +chr16 58311797 . C G 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:457,0,133 +chr16 58311940 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-1.052;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:317,0,1528 +chr16 58312097 . C T 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.597;DP=108;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:1410,0,2108 +chr16 58318503 . C T 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.450;DP=245;FS=4.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,71:245:99:1618,0,6120 +chr16 58319257 . C G 2138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=1.379;DP=134;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:2167,0,2159 +chr16 58319281 . G A 1973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-0.123;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:2002,0,2087 +chr16 58319332 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.748;DP=152;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,32:152:99:633,0,4589 +chr16 58319704 . C T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=-1.199;DP=179;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,37:179:99:672,0,5184 +chr16 58324580 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.614;DP=84;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:413,0,2530 +chr16 58331257 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-2.174;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:516,0,206 +chr16 58334322 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=2.150;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:258,0,460 +chr16 58353463 . TA T 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.577;DP=147;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,40:147:99:595,0,2420 +chr16 58353670 . A G 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-0.327;DP=325;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,66:325:99:1064,0,9702 +chr16 58357145 . G A 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.113;DP=367;FS=0.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=5.18;ReadPosRankSum=2.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,90:366:99:1930,0,10319 +chr16 58364979 . T C 2625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.446;DP=483;FS=0.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:362,121:483:99:2654,0,13652 +chr16 58399738 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=1.729;DP=69;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:852,0,1479 +chr16 58399887 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.757;DP=115;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,37:115:99:984,0,2868 +chr16 58401091 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.439;DP=109;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,33:109:99:882,0,2827 +chr16 58402420 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-1.840;DP=88;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=4.74;ReadPosRankSum=2.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:445,0,2515 +chr16 58402505 . C A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-1.004;DP=82;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:635,0,2241 +chr16 58403476 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-2.506;DP=70;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:400,0,2032 +chr16 58404088 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.398;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:266,0,661 +chr16 58455817 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:270,18,0 +chr16 58466497 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=1.158;DP=53;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:251,0,1441 +chr16 58473158 . G T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.322;DP=59;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:387,0,1659 +chr16 58473259 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=-0.376;DP=42;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:272,0,1105 +chr16 58480797 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.451;DP=50;FS=6.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:495,0,1114 +chr16 58531353 . A T 241.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:270,0,22 +chr16 58531741 . G A 2899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=-0.088;DP=376;FS=8.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,115:375:99:2928,0,9910 +chr16 58542949 . G A 2638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=1.707;DP=392;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,112:392:99:2667,0,10612 +chr16 58574323 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 +chr16 58598863 . A G 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-0.561;DP=64;FS=5.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,47:63:99:1729,0,336 +chr16 58598877 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-0.560;DP=56;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:250,0,1659 +chr16 58598947 . A T 2127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:2156,159,0 +chr16 58599079 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.937;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:278,0,1230 +chr16 58599250 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.424;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:253,0,1007 +chr16 58599381 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-2.561;DP=30;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:396,0,641 +chr16 58599596 . T TAC 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.311;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:63:314,0,63 +chr16 58629757 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.982;DP=105;FS=4.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:500,0,3033 +chr16 58633762 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-1.960;DP=100;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=3.43;ReadPosRankSum=2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:371,0,3123 +chr16 58640693 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.729;DP=56;FS=4.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=4.25;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:266,0,1703 +chr16 58641673 . C T 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.102;DP=53;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=31.90;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,44:53:99:1719,0,145 +chr16 58647360 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.350;DP=109;FS=6.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:352,0,5819 +chr16 58648204 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.186;DP=124;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,23:124:99:343,0,3762 +chr16 58648282 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-2.324;DP=92;FS=5.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:265,0,2690 +chr16 58650301 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.512;DP=81;FS=6.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=3.31;ReadPosRankSum=2.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,12:81:99:296,0,5543 +chr16 58650310 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=2.124;DP=89;FS=9.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:297,0,5575 +chr16 58652924 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=1.239;DP=53;FS=10.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:232,0,1576 +chr16 58653026 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.598;DP=86;FS=2.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:410,0,2487 +chr16 58654290 . G A 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.263;DP=114;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1987,0,1939 +chr16 58659863 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.538;DP=100;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:551,0,2890 +chr16 58666182 . A C 480.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=34.34;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:506,0,0 +chr16 58667552 . TA T 252.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.158;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:1:287,1,0 +chr16 58670164 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.500;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:488,0,3056 +chr16 58759659 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=1.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=25.36;ReadPosRankSum=2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:434,0,150 +chr16 58776492 . G A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.575;ClippingRankSum=-0.819;DP=97;FS=6.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=5.22;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:535,0,2718 +chr17 1217 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-2.219;DP=66;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:304,0,1902 +chr17 1572 . C T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-2.118;DP=76;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:615,0,1857 +chr17 6502 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:229,0,196 +chr17 40733 . G T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=27.65;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:443,0,298 +chr17 40740 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;ClippingRankSum=-2.192;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=29.63;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:443,0,298 +chr17 57036 . T C 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-1.354;DP=68;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1319,0,887 +chr17 57101 . AGTGAGTGCTGATGCTGCTGCTGTGTCCTGCTCTGTTCCCTGTAGATCCTCACAGCTCTTCTCCTCCTCCTCAG A 5363.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.913;DP=143;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.052;QD=25.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,140:142:99:6094,459,0 +chr17 57721 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.775;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:335,0,417 +chr17 58451 . G A 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-1.788;DP=79;FS=6.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:975,0,1837 +chr17 58633 . T A 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:512,39,0 +chr17 142767 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=1.672;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:410,0,628 +chr17 156965 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-1.159;DP=28;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:399,0,626 +chr17 156983 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.830;DP=21;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:399,0,622 +chr17 156993 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:609,0,156 +chr17 157022 . T C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:609,0,134 +chr17 157023 . T A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:609,0,134 +chr17 158698 . C A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.039;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:602,0,757 +chr17 163505 . C T 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.149;DP=35;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:629,0,547 +chr17 177684 . G A 5854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=-0.829;DP=341;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,184:340:99:5883,0,5486 +chr17 180355 . C T 5738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=-1.562;DP=344;FS=7.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,170:344:99:5767,0,5836 +chr17 180645 . G A 5009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.868;DP=291;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,159:291:99:5038,0,4490 +chr17 185253 . G A 5714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.798;DP=328;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,179:328:99:5743,0,5233 +chr17 185931 . G A 4709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.322;DP=281;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=16.76;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,137:280:99:4738,0,4935 +chr17 208314 . G A 4125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.472;DP=259;FS=0.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,119:259:99:4154,0,4451 +chr17 212185 . T TCA 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.553;DP=19;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:385,0,189 +chr17 212214 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.161;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,524 +chr17 282213 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.617;DP=40;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:407,0,745 +chr17 285648 . ACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGTCAGAGGTCTGCACAGAGTCCAACCACACCTGTTCTC A 248.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=2.966;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,65:69:99:286,121,0 +chr17 386756 . TA T 243.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:281,27,0 +chr17 454500 . T C 444.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=34.41;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:25:473,0,25 +chr17 511764 . T G 3574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=4.173;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=12.63;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,97:282:99:3603,0,13329 +chr17 511767 . G A 3574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=3.433;DP=278;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=12.86;ReadPosRankSum=1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,93:277:99:3603,0,13319 +chr17 523465 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=6.930;DP=177;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=1.42;ReadPosRankSum=-4.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,29:177:99:279,0,5967 +chr17 523932 . A T 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=4.268;DP=38;FS=13.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=30.35;ReadPosRankSum=-5.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:1444,0,258 +chr17 524260 . T TA 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.290;DP=40;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:505,0,518 +chr17 586581 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,171 +chr17 713250 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=2.021;DP=15;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.021;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:380,0,172 +chr17 713714 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-1.280;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:610,0,113 +chr17 736033 . G T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.632;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.592;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:694,0,1861 +chr17 736331 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=2.373;DP=33;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:99:254,0,1894 +chr17 742812 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=1.129;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:531,0,952 +chr17 758993 . TGA T 2419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=-2.682;DP=147;FS=11.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:2457,0,2921 +chr17 761293 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.579;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,425 +chr17 762448 . TCTGCAGAGCACAATCACTGTTACACACACACTCCTGCTGAACGCATGACTGTAAGCTGAATATGAGTGTGAGAGCGCAC T 8503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:8541,632,0 +chr17 903370 . A T 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 +chr17 904274 . G A 1095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1124,78,0 +chr17 904700 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr17 904739 . T C 618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:647,45,0 +chr17 943268 . CTA C 397.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 +chr17 950245 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=-0.721;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:288,0,2344 +chr17 976817 . G C 3778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-1.158;DP=219;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,105:218:99:3807,0,3664 +chr17 980431 . A G 2689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.996;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,60:92:99:2718,0,848 +chr17 980497 . A G 3731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-1.240;DP=106;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,89:106:99:3760,0,169 +chr17 980550 . A G 2834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.957;DP=90;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.168;QD=31.50;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:2863,0,1427 +chr17 980567 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.351;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:308,0,3648 +chr17 980927 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=2.430;DP=21;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=25.84;ReadPosRankSum=-2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:807,0,1006 +chr17 980942 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-2.264;DP=24;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=32.45;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:807,0,1006 +chr17 981191 . A G 2302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.990;DP=72;FS=4.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,60:72:99:2331,0,138 +chr17 981196 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-1.204;DP=70;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:546,0,2518 +chr17 981336 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=3.008;DP=47;FS=9.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:319,0,1593 +chr17 1067150 . G C 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 +chr17 1072285 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.546;DP=17;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:474,0,311 +chr17 1083604 . T A 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:460,33,0 +chr17 1084096 . G A 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:401,27,0 +chr17 1152061 . G A 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-0.443;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1054,0,909 +chr17 1170220 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.060;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:474,0,1803 +chr17 1171253 . T A 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 +chr17 1172603 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=2.890;DP=22;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:321,0,1135 +chr17 1182906 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.105;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:664,0,145 +chr17 1183352 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-2.051;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=26.63;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:401,0,127 +chr17 1221804 . A G 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:669,51,0 +chr17 1221906 . GC G 1268.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-1.652;DP=49;FS=4.574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1306,124,0 +chr17 1222029 . T C 1163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:90:1192,90,0 +chr17 1222033 . T C 1031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=1.494;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1060,84,0 +chr17 1222378 . T C 2997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3026,217,0 +chr17 1222704 . C T 2671.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2700,184,0 +chr17 1227747 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=1.545;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.75;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:298,0,183 +chr17 1228801 . A G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:40:521,40,0 +chr17 1232641 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.171;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:420,0,505 +chr17 1232882 . T G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.720;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:498,0,498 +chr17 1234695 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=1.505;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=19.51;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:555,0,364 +chr17 1247362 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=1.387;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=15.83;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:424,0,438 +chr17 1247726 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.257;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:537,0,552 +chr17 1311032 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=30.92;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:30:523,0,30 +chr17 1316271 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=23.72;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:384,0,163 +chr17 1317813 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.929;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:578,0,341 +chr17 1330519 . C T 2295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-2.735;DP=93;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,61:89:99:2324,0,756 +chr17 1351614 . C T 2279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-0.690;DP=98;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=23.26;ReadPosRankSum=2.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,64:98:99:2308,0,2401 +chr17 1430483 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr17 1430491 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr17 1502434 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.540;DP=53;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=15.81;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:866,0,911 +chr17 1526311 . G A 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=0.031;DP=84;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1355,0,1455 +chr17 1607105 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:299,0,170 +chr17 1612017 . C A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.64;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:60:295,0,60 +chr17 2210181 . A C 739.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:768,57,0 +chr17 2210477 . G T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr17 2210746 . A C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 +chr17 2238126 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:260,0,299 +chr17 2284211 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.04;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:369,0,326 +chr17 2377674 . C T 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.336;DP=57;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,35:57:99:1230,0,754 +chr17 2377881 . G GA 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.417;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=11.62;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:409,0,347 +chr17 2379063 . G A 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=1.308;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=20.38;ReadPosRankSum=-2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:721,0,466 +chr17 2379954 . T A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.793;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:764,0,610 +chr17 2380978 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-1.469;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:457,0,329 +chr17 2381272 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:455,0,443 +chr17 2381616 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:292,21,0 +chr17 2381855 . G C 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=-1.462;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1183,0,214 +chr17 2382533 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:303,0,303 +chr17 2382574 . T C 249.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:278,0,20 +chr17 2382934 . T C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-1.155;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.214;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:730,0,534 +chr17 2383051 . G A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.925;DP=51;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:1076,0,653 +chr17 2383790 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-1.457;DP=34;FS=10.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:532,0,686 +chr17 2384167 . C G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.731;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:579,0,839 +chr17 2384573 . A T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.110;DP=43;FS=11.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:724,0,709 +chr17 2385364 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.534;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:554,0,1123 +chr17 2385752 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr17 2385755 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr17 2386250 . A C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=1.354;DP=29;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:342,0,661 +chr17 2386373 . A AT 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.477;DP=30;FS=6.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:257,0,473 +chr17 2386799 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:256,0,289 +chr17 2386803 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=32.84;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:99:256,0,289 +chr17 2387067 . G A 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 +chr17 2388122 . T G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:372,0,758 +chr17 2421548 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-0.802;DP=73;FS=7.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:1007,0,1384 +chr17 2433110 . A C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.193;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:525,0,718 +chr17 2476401 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.202;DP=47;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:335,0,1332 +chr17 2512586 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:255,0,664 +chr17 2512592 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,664 +chr17 3543211 . A G 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +chr17 3543298 . G A 904.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:63:933,63,0 +chr17 3544734 . C T 720.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.971;DP=22;FS=2.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.884;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:20:749,20,0 +chr17 3544816 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,274 +chr17 3545498 . T A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.032;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,425 +chr17 3746249 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.818;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:333,0,304 +chr17 3746768 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:277,0,61 +chr17 3844197 . T G 2042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=1.261;DP=186;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,62:186:99:2071,0,4250 +chr17 3866330 . C G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,136 +chr17 4071679 . A C 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr17 4072328 . G C 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +chr17 4076622 . G T 506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:535,42,0 +chr17 4171671 . T C 565.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:594,42,0 +chr17 4171981 . A T 241.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:270,0,20 +chr17 4181452 . G T 544.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:573,39,0 +chr17 4181708 . A T 2313.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:2342,175,0 +chr17 4181723 . TA T 1015.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.802;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1053,0,655 +chr17 4208820 . T C 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:297,21,0 +chr17 4627099 . GTT G 226.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr17 4864505 . T C 4462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.494;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,133:342:99:4491,0,6962 +chr17 4903000 . G C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.269;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:455,0,659 +chr17 5343964 . T C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr17 5344067 . C T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr17 5382371 . A C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.532;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=26.90;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:351,0,48 +chr17 5395617 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:306,0,51 +chr17 5395668 . T C 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:675,51,0 +chr17 5591141 . T C 218.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:247,21,0 +chr17 5646005 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr17 5646006 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr17 5689893 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=1.877;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:627,0,320 +chr17 5695372 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=-1.032;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:43:492,0,43 +chr17 5714414 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.162;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:300,0,589 +chr17 5714919 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,246 +chr17 5725639 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:384,0,614 +chr17 5779205 . C T 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:440,33,0 +chr17 5780026 . A C 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=1.164;DP=59;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1181,0,2112 +chr17 5780261 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-0.285;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:591,0,960 +chr17 5780269 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-0.302;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:591,0,960 +chr17 6047283 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,384 +chr17 6107816 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:297,0,240 +chr17 6134399 . C T 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.451;DP=198;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,58:198:99:1508,0,5247 +chr17 6202060 . C T 1792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-1.858;DP=67;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=26.76;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,46:67:99:1821,0,591 +chr17 6211062 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.693;DP=210;FS=5.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,33:210:99:319,0,9595 +chr17 6211185 . A T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=1.373;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,40:204:99:672,0,6339 +chr17 6211218 . T A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.374;DP=183;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,36:183:99:559,0,5207 +chr17 6242477 . AAGGTCTGAGTCCTGTTTTAGCAGAGTTTATTTATCATTTGAGCTTTGCTGTGACTGGATCTGATCTACCGC A 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:252,0,1349 +chr17 6262799 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.528;DP=30;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:347,0,698 +chr17 6267611 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.097;DP=40;FS=10.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:321,0,988 +chr17 6267776 . C T 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-0.437;DP=73;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:989,0,1533 +chr17 6477670 . G T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-1.426;DP=79;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:538,0,2241 +chr17 6477700 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.683;DP=92;FS=2.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:458,0,2618 +chr17 6478253 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=-0.227;DP=48;FS=5.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:328,0,1390 +chr17 6479268 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.390;DP=74;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:250,0,3183 +chr17 6479341 . A C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=3.050;DP=46;FS=4.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:622,0,1190 +chr17 6479898 . A AGT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-1.214;DP=116;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:248,0,2778 +chr17 6493948 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=-2.090;DP=125;FS=2.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=4.65;ReadPosRankSum=2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:609,0,3451 +chr17 6557371 . G T 1495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-0.503;DP=78;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,46:78:99:1524,0,1078 +chr17 6570385 . G A 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-2.787;DP=91;FS=3.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=5.61;ReadPosRankSum=2.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:539,0,3461 +chr17 6570479 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.393;DP=113;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,28:113:99:637,0,3320 +chr17 6570625 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.898;DP=105;FS=7.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:637,0,2976 +chr17 6572630 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.173;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:395,0,566 +chr17 6573529 . C A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=2.104;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.734;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:383,0,1194 +chr17 6573872 . A C 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.384;DP=76;FS=6.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=15.69;ReadPosRankSum=2.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1221,0,1439 +chr17 6573975 . A C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=1.202;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:566,0,2094 +chr17 6705493 . G T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr17 6708206 . G T 402.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=33.52;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:430,0,10 +chr17 6724332 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:349,24,0 +chr17 6732044 . G A 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:836,60,0 +chr17 6732323 . GT G 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 +chr17 6812940 . A T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr17 6819077 . A T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=2.752;DP=26;FS=21.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:457,0,420 +chr17 6849616 . C T 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 +chr17 6849649 . C A 351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:380,30,0 +chr17 6849664 . A C 366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:395,30,0 +chr17 6849814 . G A 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:75:1096,75,0 +chr17 6849820 . T C 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:75:1096,75,0 +chr17 6856906 . A G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=40.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:484,36,0 +chr17 6856967 . TCTGATAACACAAGTTCACAAACAATCACGATGATTATCTGGTGGCCTTAGAAAAGCTCATCTTTGTGTTCACCTCAC T 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:292,0,722 +chr17 6857067 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:99:292,0,722 +chr17 6881394 . T C 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 +chr17 6881442 . G A 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 +chr17 7069355 . TA T 216.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.348;DP=11;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:251,0,1 +chr17 7110324 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:444,0,456 +chr17 7110342 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=1.162;DP=29;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:507,0,471 +chr17 7379987 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-0.142;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:326,0,557 +chr17 7463561 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:254,0,414 +chr17 7464433 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.091;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:342,0,1695 +chr17 7468437 . A AT 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.429;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:272,0,242 +chr17 7468589 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,378 +chr17 7644974 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.298;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:567,0,461 +chr17 7723021 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:275,0,281 +chr17 7725683 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.199;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:538,0,1111 +chr17 7735024 . T A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.798;DP=34;FS=5.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:520,0,649 +chr17 7735071 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.192;ClippingRankSum=1.121;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:591,0,585 +chr17 7747899 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-1.099;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:388,0,81 +chr17 7840097 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-1.794;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:236,0,287 +chr17 8042463 . TGGTAAGACTTTTCTGTGCAACTAAAACAAGAAATCATAGACACGTAAAGAATTTTTCTCAAGATGCATATGATTATTTCTA T 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:299,0,315 +chr17 8069767 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.514;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:352,0,387 +chr17 8163960 . T G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.177;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:460,0,633 +chr17 8270716 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-1.657;DP=43;FS=10.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:280,0,1146 +chr17 8324211 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.094;DP=31;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:343,0,708 +chr17 8786810 . C CT 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.035;DP=159;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=3.78;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,42:140:99:638,0,2664 +chr17 8797084 . C G 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.639;DP=73;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:874,0,1656 +chr17 8863602 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.109;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:244,0,782 +chr17 9002863 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.817;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=7.42;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:414,0,1397 +chr17 9873242 . G A 2435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-2.059;DP=140;FS=3.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:2464,0,2308 +chr17 9873270 . TG T 970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=-1.569;DP=86;FS=15.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,44:81:99:1008,0,914 +chr17 9912602 . C A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.505;DP=33;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:427,0,802 +chr17 9956186 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.050;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:507,0,696 +chr17 9958467 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=1.356;DP=39;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:599,0,1665 +chr17 10013125 . C A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.620;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:519,0,1646 +chr17 10013126 . A T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.802;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:519,0,1646 +chr17 10014028 . T G 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.748;DP=59;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:844,0,1220 +chr17 10015144 . G C 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-0.584;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,32:69:99:1161,0,1288 +chr17 10016582 . GCCTAAAAATAAAGAAGAAAACATAATAAGTCATATTTTCAGTGCAATTACAAGCATGATTTGTAGCAAAATCAACAAA G 2957.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.735;DP=69;FS=4.046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,65:66:99:2995,253,0 +chr17 10022087 . T C 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.937;DP=62;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:952,0,1111 +chr17 10022656 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.571;DP=43;FS=14.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=5.81;ReadPosRankSum=2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:278,0,1207 +chr17 10026431 . G A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=1.203;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:748,0,769 +chr17 10029323 . T A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=1.767;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:570,0,928 +chr17 10029980 . G T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=2.103;DP=42;FS=4.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:720,0,725 +chr17 10030091 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.287;DP=48;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:615,0,1045 +chr17 10030199 . T C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.759;DP=52;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:709,0,1159 +chr17 10357554 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.122;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:447,0,516 +chr17 10358141 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.513;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:760,0,923 +chr17 10457616 . T C 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.218;DP=111;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:749,0,3467 +chr17 10498155 . G A 2018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.082;DP=181;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,64:181:99:2047,0,3904 +chr17 10552235 . G GGCT 1293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.394;DP=112;FS=2.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:103:99:1331,0,2176 +chr17 10565462 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=2.637;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:249,0,2290 +chr17 10565669 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,403 +chr17 10569310 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.659;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:368,0,589 +chr17 10569616 . A G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:347,0,293 +chr17 10644742 . C T 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.225;DP=86;FS=2.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,31:86:99:1083,0,1946 +chr17 10645546 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=2.806;DP=78;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,14:78:99:241,0,2495 +chr17 10685707 . AG A 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.841;DP=128;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,41:120:99:963,0,1949 +chr17 10685845 . T G 2010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.637;DP=158;FS=8.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,57:157:99:2039,0,3482 +chr17 10866543 . C G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.182;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:449,0,123 +chr17 11023045 . C A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.880;DP=46;FS=6.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:825,0,807 +chr17 11131813 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:465,0,332 +chr17 11240008 . C T 2661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.690;DP=137;FS=7.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:2690,0,2025 +chr17 11240020 . C T 2692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.023;DP=139;FS=5.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:2721,0,2086 +chr17 11241925 . GA G 1361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-1.947;DP=120;FS=4.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1399,0,1359 +chr17 11242391 . ATC A 1279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.255;DP=88;FS=4.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:1317,0,1871 +chr17 11242937 . G T 2999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-2.672;DP=193;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,89:193:99:3028,0,3285 +chr17 11261848 . G A 2045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.881;DP=115;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:2074,0,1968 +chr17 11268326 . A C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,147 +chr17 11269470 . T A 2739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=-0.128;DP=178;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,76:178:99:2768,0,3465 +chr17 11277332 . T A 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.704;DP=109;FS=3.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:1468,0,1951 +chr17 11285572 . C T 204.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:233,0,25 +chr17 11287146 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.88;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:98:357,0,98 +chr17 11335942 . GA G 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.483;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:468,0,161 +chr17 11336190 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.861;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:307,0,2257 +chr17 11336339 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.319;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=11.71;ReadPosRankSum=2.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:356,0,679 +chr17 11336978 . C CA 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.078;DP=39;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:295,0,623 +chr17 11337093 . T C 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=2.416;DP=74;FS=9.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:537,0,2155 +chr17 11337338 . T TA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.759;DP=75;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=4.26;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,41:64:99:685,0,459 +chr17 11337461 . G T 2199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.451;DP=125;FS=2.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:2228,0,2189 +chr17 11340280 . C T 1821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.436;DP=132;FS=4.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1850,0,2468 +chr17 11471866 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:348,0,273 +chr17 11574828 . C G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=1.306;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:540,0,405 +chr17 11580114 . A G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.217;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:441,0,364 +chr17 11580543 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.553;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:346,0,1276 +chr17 11580559 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.716;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:346,0,1275 +chr17 11581217 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:69:240,0,69 +chr17 11581218 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:69:240,0,69 +chr17 11631839 . G C 358.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=32.55;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:386,0,12 +chr17 11644228 . G C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=26.65;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:348,0,95 +chr17 12013742 . C T 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 +chr17 12085684 . G A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=2.881;DP=82;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:626,0,2186 +chr17 12086992 . TCCTGTGAGGAAAAAGACATCACAATGCATTAAGTGTGATCCAGAACAAACTAAATGTTTTGTTAAACTTTATAGGGTTGCTTA T 3961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=1.539;DP=132;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=30.01;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,105:128:99:3999,0,4015 +chr17 12088194 . G A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=1.206;DP=102;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=4.79;ReadPosRankSum=-2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,25:102:99:517,0,3230 +chr17 12088952 . C T 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=1.447;DP=75;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=18.10;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:1386,0,1389 +chr17 12090005 . GGATCACTATAGGAAGGACATTGCATAGCAATA G 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-2.158;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:704,0,4916 +chr17 12090042 . AGAGAATGGCATGGCGTGTGAAACTCACCTCAAGCAACACAACAGAAAGCATGATAGTCAATGTTAAGAAGTAC A 663.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-2.226;DP=99;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=6.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,27:97:99:701,0,4916 +chr17 12091339 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=4.721;DP=69;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:301,0,2098 +chr17 12097139 . G T 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.525;DP=56;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:972,0,994 +chr17 12099994 . TCTGAAAGAGAAAGAAATTAACTAAACAATAAATAAAAATTCAACACAATTTAGTACAGAATGGGCCAAAATCGAAC T 3503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=1.754;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,79:82:99:3541,293,0 +chr17 12103399 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.593;DP=60;FS=5.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:776,0,1241 +chr17 12103454 . C T 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=3.225;DP=67;FS=10.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=15.34;ReadPosRankSum=2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1056,0,1216 +chr17 12161886 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.642;DP=39;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:545,0,817 +chr17 12161987 . G GA 488.73 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-1.773;DP=96;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1746,0,1582 +chr17 12306745 . T C 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.154;DP=75;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,35:75:99:1296,0,1338 +chr17 12306851 . A C 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.762;DP=80;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=11.52;ReadPosRankSum=2.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:950,0,1783 +chr17 12307113 . G C 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.227;DP=89;FS=4.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,50:89:99:1661,0,1400 +chr17 12307288 . G A 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-0.511;DP=70;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.274;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:1213,0,1252 +chr17 12361276 . C A 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.521;DP=59;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1202,0,754 +chr17 12604969 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.472;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:758,0,1653 +chr17 12606260 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.798;DP=66;FS=3.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:994,0,1229 +chr17 12610861 . G T 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.323;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1047,0,1244 +chr17 12610948 . G GA 660.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.522;DP=62;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:732,0,624 +chr17 12611364 . GT G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.086;DP=32;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:242,0,515 +chr17 12611851 . G T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.028;DP=52;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:791,0,1064 +chr17 12612653 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.156;DP=62;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=3.29;ReadPosRankSum=2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:232,0,1706 +chr17 12612923 . AAC A 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.241;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:683,0,891 +chr17 12630932 . C G 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.382;DP=39;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:374,0,993 +chr17 12660620 . G C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=1.898;DP=52;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:777,0,961 +chr17 12682502 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.530;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:309,0,307 +chr17 12683033 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.368;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:286,0,286 +chr17 12691191 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.035;DP=61;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.236;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1051,0,973 +chr17 12693109 . A G 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-0.410;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:835,0,1101 +chr17 12721477 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-1.249;DP=64;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:691,0,1340 +chr17 12721675 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=3.671;DP=47;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:538,0,1100 +chr17 12774397 . G A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.837;DP=61;FS=3.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:501,0,1465 +chr17 12788432 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-1.184;DP=33;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:444,0,636 +chr17 12789437 . G T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.816;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:393,0,390 +chr17 12789798 . T A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-2.127;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:516,0,789 +chr17 12809789 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=1.903;DP=129;FS=7.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=2.45;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,27:123:99:344,0,4451 +chr17 12826983 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=2.378;DP=366;FS=27.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.664;QD=0.55;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:318,48:366:99:230,0,12238 +chr17 12828911 . A G 2652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.101;DP=488;FS=2.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:365,123:488:99:2681,0,13603 +chr17 12882770 . C A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.156;DP=49;FS=2.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:626,0,1075 +chr17 12883459 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-2.189;DP=103;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:343,0,3299 +chr17 12883502 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-0.473;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:461,0,2771 +chr17 12886794 . G GT 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.451;DP=163;FS=5.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,31:147:99:323,0,3272 +chr17 12903538 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=1.632;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:242,0,797 +chr17 12909206 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.475;DP=53;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:451,0,1436 +chr17 12909547 . G T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-0.635;DP=110;FS=5.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,19:109:99:231,0,3290 +chr17 12910472 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.909;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:298,0,2320 +chr17 12915473 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.713;DP=66;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=6.10;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:431,0,1778 +chr17 12960661 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=-1.131;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:272,0,799 +chr17 14318877 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=1.130;DP=43;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:607,0,855 +chr17 14369396 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.477;DP=73;FS=5.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:377,0,1975 +chr17 14369426 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-1.486;DP=85;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:352,0,2390 +chr17 14369494 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.558;DP=79;FS=7.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:483,0,2802 +chr17 14455897 . G T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.551;DP=88;FS=12.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:550,0,2514 +chr17 14456160 . A T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-1.562;DP=78;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:487,0,2144 +chr17 14459944 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;ClippingRankSum=-1.234;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:352,0,2455 +chr17 14460265 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=1.060;DP=76;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.543;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:332,0,2175 +chr17 14461715 . T G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.600;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:492,0,925 +chr17 14542184 . GA G 1025.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.052;DP=155;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,49:153:99:1063,0,2490 +chr17 14578366 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.110;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:297,0,1338 +chr17 14588802 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.538;DP=99;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:308,0,3010 +chr17 14588837 . C A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=2.348;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:841,0,3537 +chr17 14596559 . G C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.481;DP=106;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,30:102:99:790,0,2823 +chr17 14599554 . G T 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.391;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:923,0,2848 +chr17 14625556 . G T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.938;DP=87;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:354,0,4421 +chr17 14635571 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.363;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=1.96;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,25:152:99:326,0,4860 +chr17 14638302 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=1.255;DP=70;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:500,0,1917 +chr17 14638343 . T G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-1.035;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:442,0,2655 +chr17 14638524 . T A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.149;DP=184;FS=5.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,38:184:99:662,0,5712 +chr17 14638557 . C T 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=-1.306;DP=215;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,44:215:99:817,0,6541 +chr17 14655174 . G T 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=-0.931;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1517,0,1698 +chr17 14658719 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.928;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:377,0,1707 +chr17 14658774 . T C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=2.587;DP=70;FS=9.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:626,0,1856 +chr17 14658830 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.917;DP=26;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=28.38;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:766,0,127 +chr17 14662042 . A T 5599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.205;DP=283;FS=11.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.112;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,170:280:99:5628,0,3714 +chr17 14662083 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=-2.665;DP=121;FS=10.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=3.44;ReadPosRankSum=-6.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:444,0,4721 +chr17 14690269 . T C 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.830;DP=226;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,52:226:99:1071,0,6860 +chr17 14700773 . G A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.522;DP=164;FS=12.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,35:164:99:636,0,5459 +chr17 14882860 . T TG 1324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.595;DP=58;FS=4.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,41:57:99:1362,0,356 +chr17 14919630 . G A 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=1.460;DP=69;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1019,0,1098 +chr17 14926020 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.575;DP=71;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:398,0,1856 +chr17 14942071 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.490;DP=72;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:460,0,1915 +chr17 14952931 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.168;DP=77;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:500,0,2155 +chr17 14953439 . A T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.911;DP=72;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:842,0,1675 +chr17 14953659 . C G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.470;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,18:95:99:304,0,2974 +chr17 14954002 . A C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.675;DP=44;FS=4.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:591,0,1004 +chr17 14963706 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:261,0,91 +chr17 14965318 . GA G 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:294,0,329 +chr17 14966086 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.950;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:244,0,813 +chr17 14967386 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,622 +chr17 14998968 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.013;DP=44;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.779;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:307,0,1676 +chr17 15001540 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.630;ClippingRankSum=-0.481;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:452,0,1735 +chr17 15027553 . A G 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.193;DP=72;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1036,0,1409 +chr17 15027622 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=-0.575;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:279,0,1996 +chr17 15057373 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=1.091;DP=46;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=7.39;ReadPosRankSum=-1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:368,0,1133 +chr17 15060754 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,174 +chr17 15061429 . C T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.745;DP=51;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:886,0,922 +chr17 15277055 . G T 841.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:57:870,57,0 +chr17 15286576 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.033;DP=53;FS=7.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:239,0,1700 +chr17 15286815 . A T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 +chr17 15286816 . C T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 +chr17 15287741 . C A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.651;DP=60;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:698,0,1417 +chr17 15288627 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=3.121;DP=59;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.42;ReadPosRankSum=-2.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,10:59:99:230,0,4778 +chr17 15289310 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=2.420;DP=32;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:256,0,1678 +chr17 15297383 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=3.590;DP=31;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,802 +chr17 15298624 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.351;DP=104;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:499,0,3044 +chr17 15301621 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.117;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:336,0,239 +chr17 15306555 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=2.024;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:459,0,1651 +chr17 15306943 . TCTATAAAAAGGTTTAAAATAGATTTATTCAAGTGAAAATGGAAGCAAATGCAGAAAAGGTGGTTGATATCCATAC T 2159.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=2.350;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=26.06;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2197,178,0 +chr17 15312662 . T C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.442;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:525,0,1670 +chr17 15316495 . C G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-0.152;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:458,0,1350 +chr17 15317772 . TCTGCAAATAGACATTAACATGTATTCCCGTTTAATTGAGACTTTATCAGAAGTTCGCTTATCAAGTTACATAC T 1959.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=2.633;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.90;ReadPosRankSum=2.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,52:82:99:1997,0,1031 +chr17 15317774 . TGCAAATAGACATTAACA T 988.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-2.691;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:1026,0,3268 +chr17 15317794 . TATTCCCGTTTAATTGAGACTTTATCAGAAGTTCGCTTATCAAGTTACATACCTTGC T 988.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-2.681;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=12.06;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:1026,0,3179 +chr17 15320961 . C T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=2.889;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,26:106:99:570,0,3026 +chr17 15328222 . T C 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.594;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:859,0,1934 +chr17 15329150 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=2.110;DP=48;FS=5.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:246,0,1412 +chr17 15329384 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.708;DP=85;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:313,0,2687 +chr17 15332256 . A T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=1.418;DP=102;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:588,0,2645 +chr17 15332307 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=1.631;DP=72;FS=3.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:392,0,2431 +chr17 15344381 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-2.491;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:423,0,1244 +chr17 15345187 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.575;DP=69;FS=6.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:252,0,2151 +chr17 15378676 . T C 1016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;ClippingRankSum=1.015;DP=148;FS=23.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=6.87;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1839,0,1656 +chr17 15379290 . A AT 2427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-1.095;DP=372;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,122:343:99:2465,0,5298 +chr17 15500343 . A AG 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.560;DP=22;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:325,0,372 +chr17 15568024 . T A 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 +chr17 15752687 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.450;DP=58;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:627,0,1193 +chr17 15752763 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.287;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:352,0,2758 +chr17 15759903 . C A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-0.864;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:858,0,881 +chr17 15774709 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.037;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:895,0,923 +chr17 15785351 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.265;DP=60;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:271,0,1769 +chr17 15786936 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.236;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:400,0,1939 +chr17 15805371 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.926;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:440,0,718 +chr17 15806676 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=35.66;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:46:430,0,46 +chr17 15923135 . A G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.614;DP=78;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,23:78:99:583,0,2080 +chr17 15938921 . T A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=2.476;DP=176;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,43:176:99:993,0,5141 +chr17 15940949 . A T 2135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.647;DP=186;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,67:186:99:2164,0,4092 +chr17 15941722 . GGGTAAGCATCACAAACATGACAATAACCTAACAGCAGTGTCTAACCAACACATTCTGGTAAACATTCACATGGGTTTGTTCTTGCA G 5779.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=2.275;DP=141;FS=3.012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=33.31;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,125:127:99:5817,519,0 +chr17 15944483 . C T 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.866;DP=173;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,50:173:99:1268,0,4593 +chr17 15948796 . G T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.773;DP=126;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,40:126:99:1090,0,3308 +chr17 15949340 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=3.951;DP=118;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.37;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,26:118:99:544,0,3742 +chr17 15950733 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:233,0,106 +chr17 16033942 . A T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=-0.278;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=15.07;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:601,0,680 +chr17 16034742 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.204;DP=38;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:354,0,973 +chr17 16034772 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.435;DP=34;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:281,0,926 +chr17 16097379 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.205;DP=58;FS=2.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:462,0,1511 +chr17 16106193 . GAGGTGAACCTTCTTTTCCACTGAACCATTTCGCTGGAGGATGTCTGAGTGTGGTTTGATGCACTGTAACATTTATATATTGTTTTTTCTTGT G 2523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=1.237;DP=56;FS=3.332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=33.90;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2561,222,0 +chr17 16115581 . CAAGGTAAGCTTCTATGGGGAAAAACAAGACACATGGTAGACCACAGGAAATAGGGAGTTAATAACACAGGAAATAACCTTTGATATTCAATTTGCTTATGG C 1782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.195;DP=42;FS=2.236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:99:1820,189,0 +chr17 16119565 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-2.036;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.780;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:396,0,1361 +chr17 16119834 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=2.631;DP=64;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:333,0,3084 +chr17 16119963 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.831;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:531,0,1250 +chr17 16122168 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.303;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:288,0,1233 +chr17 16123458 . G A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.280;DP=49;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:663,0,2281 +chr17 16123464 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.321;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:663,0,2296 +chr17 16123707 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.359;DP=39;FS=8.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:305,0,1455 +chr17 16124607 . C CT 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.372;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:301,0,1784 +chr17 16124704 . TA T 819.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.094;DP=31;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:31:874,0,31 +chr17 16139652 . CCA C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,126 +chr17 16604241 . A G 642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:671,48,0 +chr17 16633533 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-2.159;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:275,0,2398 +chr17 16634011 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.186;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:576,0,904 +chr17 16645048 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.448;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:256,0,3584 +chr17 16645494 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-0.377;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:359,0,609 +chr17 16646467 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.887;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:235,0,1154 +chr17 16646605 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=1.822;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:297,0,894 +chr17 17271325 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.979;DP=27;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:333,0,577 +chr17 17272073 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=-0.178;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:508,0,603 +chr17 17730434 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:275,0,216 +chr17 17855688 . C A 644.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.542;DP=18;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=30.50;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14:673,14,0 +chr17 17859330 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:235,0,639 +chr17 17899485 . G T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.100;DP=56;FS=4.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:455,0,2981 +chr17 17899490 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.529;DP=50;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:455,0,2981 +chr17 17900844 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=1.445;DP=47;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:250,0,1367 +chr17 18009870 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.172;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:335,0,1002 +chr17 19254080 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.619;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:453,0,1863 +chr17 19311643 . C CA 1115.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.319;DP=249;FS=12.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,72:236:99:1153,0,4440 +chr17 19979848 . AACCTGAGATGAAAACATTGAATATGACAACCTTTTTTTAACAGATCATTATTGCAACTGGTGGATTGGTTTTCTAAAGACTAAAAGCATCTGATTT A 9345.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.187;DP=204;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,202:204:99:9383,803,0 +chr17 19983639 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,417 +chr17 19983648 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-2.148;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=30.58;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:334,0,417 +chr17 19984031 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-2.362;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:299,0,660 +chr17 19986994 . G A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=-0.443;DP=254;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=3.17;ReadPosRankSum=3.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,52:254:99:834,0,7624 +chr17 19987283 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=1.380;DP=221;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=1.78;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,36:221:99:422,0,7089 +chr17 20014463 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:245,0,63 +chr17 20062679 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.122;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:331,0,1248 +chr17 20073737 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=-1.961;DP=202;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=4.27;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,44:202:99:891,0,6329 +chr17 20352044 . T A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-1.659;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:448,0,450 +chr17 20504317 . T G 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.207;DP=111;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,28:111:99:618,0,3347 +chr17 20505008 . C G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.417;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:502,0,4814 +chr17 20545073 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-1.195;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.73;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:426,0,522 +chr17 20545493 . C A 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.892;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:416,0,442 +chr17 20545582 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-1.359;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:229,0,363 +chr17 20549220 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.214;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=4.16;ReadPosRankSum=2.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:303,0,2841 +chr17 20549401 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-0.662;DP=48;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:250,0,1419 +chr17 20550286 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-0.690;DP=69;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:453,0,1925 +chr17 20550613 . A T 1245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=-1.921;DP=100;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1274,0,2248 +chr17 20555284 . G C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.843;DP=63;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:753,0,1504 +chr17 20618151 . A T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.641;DP=111;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,29:111:99:710,0,3179 +chr17 20626145 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.144;DP=132;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=3.57;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,28:132:99:499,0,3914 +chr17 20626268 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.242;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,27:109:99:601,0,3139 +chr17 20759354 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.502;DP=229;FS=13.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,46:228:99:334,0,13977 +chr17 20819973 . ACTGACCCAAACACATACACACATAAAGATAAAGGCAGAAATAATCACTAATTTCTTGCTTAAAGTTTAGAAAGAATCTCTATAGTCTTAC A 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,1254 +chr17 20822704 . GCCTGAAAAATGTTCACACAGGACATTGTGAGTGAGATTTAGTCTGTGCAGAGTTGTGAGTACAGTGTTTGCACATGAGCATATAAA G 748.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=1.857;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=29.33;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:99:786,0,448 +chr17 21086860 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=-0.742;DP=34;FS=8.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:257,0,1849 +chr17 21086866 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=-0.317;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:257,0,1849 +chr17 21158106 . GCTGGAGGGGAAGGGTTGAAAAGTTAAACAAGTGATCTGACTCAGGGGACGAAGAAAATGTGCTCGAGTAAGTGCGCATGCGTGTGTGTGACTGAC G 659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.262;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=34.72;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:56:697,0,56 +chr17 21705704 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.036;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,140 +chr17 21705900 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr17 21735767 . A C 1839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.515;DP=78;FS=6.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=23.59;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,55:78:99:1868,0,544 +chr17 21741962 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=1.169;DP=99;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,31:98:99:648,0,2441 +chr17 21749703 . G A 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.058;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:1036,0,2144 +chr17 21782829 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.997;ClippingRankSum=-0.666;DP=98;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:304,0,2725 +chr17 21799645 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.248;DP=63;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:280,0,1931 +chr17 22376152 . G A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.493;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,48:158:99:1219,0,4046 +chr17 22377627 . T C 1300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;ClippingRankSum=-4.483;DP=186;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=6.99;ReadPosRankSum=2.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,49:186:99:1329,0,5221 +chr17 22377764 . C T 6345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.760;DP=294;FS=3.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=21.58;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,143:294:99:6374,0,10227 +chr17 22377798 . A G 6345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.280;DP=266;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,123:266:99:6374,0,10306 +chr17 22412353 . GAGGTATTTATTTGATCTCGTAAAGCATCAGACAACATATGATTTTTGAGTAGGTGTGCCCACATTTCAATTATTACATTTTTCCCCAAAT G 753.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=2.415;DP=158;FS=3.033;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:791,314,0 +chr17 22414862 . G A 2170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.549;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:2199,0,2402 +chr17 22417576 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-0.427;DP=53;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:706,0,1089 +chr17 22437520 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=2.824;DP=50;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:788,0,937 +chr17 22449152 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.571;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1066,0,893 +chr17 22449259 . T G 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.713;DP=66;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:812,0,2295 +chr17 22451490 . G A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.311;DP=70;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1238,0,1218 +chr17 22453045 . T A 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.707;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:950,0,1049 +chr17 22460365 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.565;DP=62;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:515,0,1732 +chr17 22479853 . C T 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-1.277;DP=95;FS=10.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,36:95:99:1203,0,1974 +chr17 22480656 . C A 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=1.552;DP=80;FS=11.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:1193,0,1453 +chr17 22482814 . T A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=-0.014;DP=85;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:931,0,1817 +chr17 22483506 . C T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.831;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:1073,0,2040 +chr17 22499075 . C T 2172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.596;DP=150;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:2201,0,2759 +chr17 22517423 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=2.443;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:327,0,1309 +chr17 22517424 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=2.749;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:282,0,1400 +chr17 22517744 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.175;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=17.24;ReadPosRankSum=2.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:597,0,542 +chr17 22559811 . G A 1674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.631;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1703,0,1723 +chr17 22612668 . G A 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.382;DP=45;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:1006,0,1469 +chr17 22634949 . A T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.859;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:679,0,772 +chr17 22635031 . G A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=-0.138;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:934,0,1011 +chr17 22787079 . G A 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.680;ClippingRankSum=0.206;DP=81;FS=7.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,47:81:99:1559,0,1065 +chr17 22882553 . G A 1293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-0.939;DP=73;FS=7.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:73:99:1322,0,1139 +chr17 22905123 . C T 1613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.324;DP=85;FS=5.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,48:85:99:1642,0,1326 +chr17 22933051 . T A 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.735;DP=70;FS=6.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=21.68;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:1546,0,842 +chr17 22946360 . G A 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-1.265;DP=68;FS=5.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,46:68:99:1700,0,572 +chr17 22947224 . CT C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.935;DP=16;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,477 +chr17 23022874 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=1.796;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:365,0,442 +chr17 23030336 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:324,0,384 +chr17 23032180 . C A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:255,0,300 +chr17 23034137 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:268,0,400 +chr17 23042638 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.298;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:294,0,661 +chr17 23050525 . T A 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=-1.195;DP=91;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:1652,0,1535 +chr17 23062438 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.939;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:327,0,659 +chr17 23295272 . TGTAAGAATGCAAGAAACTAATAAAGTGATGATGGCTTGATATTTTTCACATGATATAGCATCATGTCTTGTTTTTTTTTTAG T 1961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=1.657;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=28.57;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1999,173,0 +chr17 23296899 . AAGGTAGCACAGATGGCTGATGTGACTGTAACATCAGAGCTACAAGAACATCATCATGACTCTCTTTTTATTCCATAATTCTGAGATTCAATATGTTTATCACATATTCGT A 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=1.265;DP=29;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=28.09;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:852,0,2310 +chr17 23405580 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.489;DP=19;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:287,0,371 +chr17 23481367 . G A 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.391;DP=228;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,51:227:99:1046,0,6697 +chr17 23541309 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.860;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:255,0,817 +chr17 23757861 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=-0.138;DP=43;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:567,0,905 +chr17 23794682 . C CT 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.111;DP=175;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,32:152:99:304,0,3195 +chr17 23908532 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.684;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:313,0,360 +chr17 24150922 . C T 1454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.318;DP=95;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=15.31;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:1492,0,1725 +chr17 24151930 . G C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-0.888;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:230,0,599 +chr17 24272058 . G A 2146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.937;DP=157;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=13.67;ReadPosRankSum=2.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,61:156:99:2175,0,3329 +chr17 24274795 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=27.68;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:305,0,336 +chr17 24400858 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:280,0,297 +chr17 24428752 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.234;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:523,0,880 +chr17 24429427 . G A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=-2.029;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1089,0,1061 +chr17 24429928 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.027;DP=52;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:834,0,930 +chr17 24431289 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,222 +chr17 24436018 . T C 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=1.023;DP=117;FS=8.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1782,0,2184 +chr17 24436149 . T C 1737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.170;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=16.55;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1766,0,1848 +chr17 24440711 . A ATT 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=-0.199;DP=50;FS=10.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:513,0,772 +chr17 24445956 . T C 7045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-1.438;DP=472;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=14.93;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,200:470:99:7074,0,9144 +chr17 24459209 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:302,0,325 +chr17 24471601 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-0.214;DP=32;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:419,0,711 +chr17 24491233 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.669;DP=31;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:408,0,663 +chr17 24493147 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-1.588;DP=58;FS=4.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:485,0,1512 +chr17 24513002 . T A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=-0.448;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.355;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:717,0,1357 +chr17 24515821 . T G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-1.171;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,40:235:99:571,0,11159 +chr17 24518276 . C T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-1.145;DP=323;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,69:323:99:1248,0,9866 +chr17 24550706 . A G 2615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-1.221;DP=167;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:167:99:2644,0,3041 +chr17 24554742 . C T 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-3.098;DP=92;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:858,0,2372 +chr17 24645793 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=1.197;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:280,0,701 +chr17 24648201 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-2.646;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=13.60;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:545,0,895 +chr17 24663103 . C A 3094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=-2.438;DP=190;FS=1.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=16.29;ReadPosRankSum=2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,85:190:99:3123,0,3549 +chr17 24663315 . A T 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.536;DP=161;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,47:160:99:1088,0,4339 +chr17 24663479 . C A 2794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-1.392;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=17.69;ReadPosRankSum=2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:2823,0,2648 +chr17 24674293 . C CT 305.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:8:342,8,0 +chr17 24683970 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=1.077;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:479,0,1371 +chr17 24684245 . C G 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.659;DP=81;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:678,0,2352 +chr17 24715323 . T A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-1.561;DP=143;FS=6.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,35:143:99:780,0,4162 +chr17 24718942 . A T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=3.085;DP=56;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:966,0,845 +chr17 25015829 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.317;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,394 +chr17 25052705 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.492;DP=28;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:234,0,726 +chr17 25180525 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=2.276;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:291,0,978 +chr17 25182991 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.017;DP=37;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:310,0,970 +chr17 25185116 . G C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr17 25185117 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr17 25233704 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,149 +chr17 25236872 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.757;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:477,0,1809 +chr17 25236875 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.907;DP=37;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:477,0,1799 +chr17 25236970 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.564;DP=37;FS=21.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:657,0,593 +chr17 25270724 . CT C 599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-2.117;DP=81;FS=0.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:637,0,1081 +chr17 25271119 . CA C 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-0.024;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:268,0,843 +chr17 25271911 . C CT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-1.370;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:451,0,1139 +chr17 25277446 . A C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=3.692;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,31:205:99:264,0,6749 +chr17 25281483 . G GT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.417;DP=142;FS=19.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=1.41;ReadPosRankSum=-2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,15:138:99:238,0,3417 +chr17 25286310 . G A 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=-3.330;DP=282;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,64:281:99:1168,0,9630 +chr17 25286447 . A G 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.528;DP=408;FS=12.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,91:407:99:1729,0,11890 +chr17 25372389 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.678;DP=59;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:421,0,1639 +chr17 25391537 . A G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-1.387;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:536,0,1002 +chr17 25452585 . G T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=-0.087;DP=81;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:641,0,2137 +chr17 25463363 . AGCCTTTCAGTCAATCAGACATTTTATTAGAATAGATTTTAAACATTTCTAAAGTGTCTTTGTTAGCATGTGTGAGTGATTGACTT A 294.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=2.368;DP=63;FS=3.085;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=4.68;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:332,128,0 +chr17 25468998 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.062;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:306,0,4359 +chr17 25477857 . G A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.586;DP=223;FS=3.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,53:223:99:1064,0,9420 +chr17 25478015 . C A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.323;DP=268;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,61:268:99:758,0,15508 +chr17 25478369 . C T 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.163;DP=260;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,70:260:99:1662,0,7410 +chr17 25478530 . C A 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.470;DP=274;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,56:274:99:1050,0,8666 +chr17 25481119 . GACCTTGATGGACACGAGAGAGACATAAAAGTCAGAAAAAGAGAATGCAATAGTATTTTTTTGACCCAGTTGCTCCATTTTATCAGGCCACAAATCACTTCAATAAAACTATCCGTTGTTCATTCACTTGTTCTC G 14042.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.265;DP=364;FS=4.816;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,341:345:99:14080,1016,0 +chr17 25667524 . ACTGTAACACAAGAGCACAGAGAAAGATGAACAAGCCTGTGCCCATTTTGATTACTTTGCTTTTAAATTAAACTTAC A 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.935;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=24.58;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:518,0,317 +chr17 25715688 . G GGGCCC 1313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=1.267;DP=71;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:1351,0,1555 +chr17 25716124 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.115;DP=71;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:298,0,2020 +chr17 25728714 . GT G 916.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-1.062;DP=67;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,43:56:99:1039,0,235 +chr17 25729219 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.307;DP=41;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=12.65;ReadPosRankSum=-1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:547,0,926 +chr17 25729293 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-0.960;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:288,0,918 +chr17 26320453 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=1.074;DP=38;FS=7.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:456,0,840 +chr17 26323428 . A C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.833;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:837,0,440 +chr17 26343801 . T A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.071;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=21.11;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:746,0,433 +chr17 26346462 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:365,0,309 +chr17 26426825 . G T 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.704;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=14.88;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:951,0,1203 +chr17 26484462 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.989;DP=61;FS=7.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:377,0,1559 +chr17 26511773 . C A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=-0.472;DP=29;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:516,0,379 +chr17 26531315 . C T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.173;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:1110,0,1429 +chr17 26532268 . G A 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=1.331;DP=76;FS=6.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1178,0,1470 +chr17 26554824 . GA G 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.650;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.329;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:487,0,443 +chr17 26555002 . G A 4960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-2.760;DP=313;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,137:311:99:4989,0,5637 +chr17 26586131 . G A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.787;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:530,0,150 +chr17 26586195 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:288,0,217 +chr17 26623732 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.511;DP=145;FS=7.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,33:145:99:666,0,4256 +chr17 26632668 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.961;DP=193;FS=5.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,37:193:99:611,0,5987 +chr17 26632686 . A C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.131;DP=202;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,40:202:99:652,0,6208 +chr17 26654167 . CT C 1360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.510;ClippingRankSum=-1.046;DP=100;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,56:89:99:1398,0,552 +chr17 26655062 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.299;DP=58;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:325,0,1633 +chr17 26770747 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.662;DP=41;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:279,0,1236 +chr17 27193560 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.961;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:337,0,448 +chr17 27193821 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.857;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:315,0,346 +chr17 27194232 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.364;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:364,0,419 +chr17 27866565 . T C 250.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:5:278,0,5 +chr17 27866925 . G T 8715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=2.115;DP=235;FS=12.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=37.32;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,167:235:99:8744,0,1066 +chr17 27866991 . GTT G 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-1.867;DP=140;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=2.48;ReadPosRankSum=3.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:932,0,3431 +chr17 27867085 . G A 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.572;DP=55;FS=10.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=34.89;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1947,0,467 +chr17 27867114 . T TG 3036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,80:80:73:3074,0,73 +chr17 27867277 . C CA 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=-1.677;DP=179;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=2.01;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,40:167:99:397,0,3320 +chr17 27867773 . AC A 1451.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.952;ClippingRankSum=0.553;DP=243;FS=5.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,70:221:99:1489,0,10979 +chr17 27867796 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-1.766;DP=200;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,53:200:99:1503,0,10979 +chr17 27868024 . TA T 1413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-2.042;DP=162;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=8.73;ReadPosRankSum=-3.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,13:149:99:1451,0,6984 +chr17 27868102 . T G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.931;DP=239;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,57:239:99:524,0,10397 +chr17 27868126 . GA G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-1.691;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,66:266:99:271,0,8696 +chr17 27868235 . G GT 940.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=-0.323;DP=314;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,81:287:99:978,0,5053 +chr17 27868508 . C CTT 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.519;DP=263;FS=8.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,48:232:99:721,0,6739 +chr17 27868658 . T A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=1.347;DP=217;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,39:217:99:415,0,8089 +chr17 27868889 . C A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.255;DP=236;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,49:236:99:934,0,7377 +chr17 27869111 . G A 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-1.235;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,61:277:99:1167,0,8190 +chr17 27869609 . G GT 2055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;ClippingRankSum=-0.907;DP=268;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.226;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,76:258:99:2093,0,12603 +chr17 27869612 . A T 2049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.555;DP=266;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,77:266:99:2078,0,12603 +chr17 27870256 . A T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=1.051;DP=75;FS=13.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:642,0,1977 +chr17 27870364 . T C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-1.747;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,29:116:99:691,0,3409 +chr17 27871899 . A G 1384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1413,96,0 +chr17 27871995 . C T 1974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2003,138,0 +chr17 27872332 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=2.242;DP=84;FS=4.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=2.39;ReadPosRankSum=-2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,15:84:99:229,0,5288 +chr17 27872337 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=1.612;DP=82;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,13:82:99:236,0,5288 +chr17 28129815 . TTGTGTGTG T 387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:40:425,40,0 +chr17 28130417 . CT C 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.849;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:884,0,184 +chr17 28143861 . A AT 1139.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=-1.280;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1177,0,1182 +chr17 28157057 . C T 2056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=2.394;DP=393;FS=5.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,95:393:99:2085,0,11470 +chr17 28157777 . T TA 341.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:379,39,0 +chr17 28669124 . GCCTGCTGTCAAACAAATGATGGGGGACAAATAAAAAAAGTGGAAATATACTCATTTCTTTATATTGTGTCTTTTCTGAACACACATTA G 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=1.856;DP=33;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.20;ReadPosRankSum=-2.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:275,0,5429 +chr17 28669128 . GCTGTCAAACAAATGATGGGGGACAAATAAAAAAAGTGGAAATATACTCATTTCTTTATATTGTGTCTTTTCTGAACACACATTAC G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=2.399;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:271,0,5172 +chr17 28680437 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=1.513;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1387 +chr17 28680440 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=1.010;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:237,0,1387 +chr17 28681764 . TGGTATGAAAGTTACTGTGCTTTTCTGTGCCAAGTTGAAAAATAAAAGTGGATATGCATATATATTTTTTATGTATGTGGATCTCTTCAAAGAATCTCCCTGTGTTTTCAACA T 1435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=2.023;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=27.50;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:99:1473,130,0 +chr17 28694532 . GGGTAAGAAACTAGGCCAATATTTAGGTCTCCTTGGGTTGGATATTGAGTCTGGTGTATTAAATGTGTCCCATGTTTCTGTCA G 1520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=1.994;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=27.53;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,36:38:99:1558,0,664 +chr17 28727737 . C T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.326;DP=54;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:622,0,1195 +chr17 28734318 . G A 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.440;DP=205;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,55:205:99:1215,0,5840 +chr17 28748092 . C T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.729;DP=164;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,40:164:99:894,0,4820 +chr17 28797601 . AAGGTGAGCACTGTGCGTCTTGAGTATTATGCTAAATAAGGGTTTTTATTTTGTCAACTGATGTCTTCATTTTCCGTCTTTC A 7669.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=1.165;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:7707,686,0 +chr17 28797823 . G GCGCTATTCCTTT 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.042;DP=174;FS=5.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,36:162:99:537,0,8227 +chr17 28798005 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.114;DP=205;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,37:204:99:558,0,6512 +chr17 29336125 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.860;DP=30;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:249,0,763 +chr17 29426518 . CCAGGTTTGATTATTACTATGCAGAAAATTAGGAAAAGCAGTTTAGTTTCTCAGGCTAAAATAATGTTACCTGTTTG C 1373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=1.577;DP=41;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=33.51;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,38:41:99:1411,0,276 +chr17 29428224 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.546;DP=41;FS=7.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:331,0,1056 +chr17 29428299 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.566;DP=58;FS=4.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:243,0,1802 +chr17 29857032 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.656;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:322,0,535 +chr17 30470414 . TGGTGAGACCATCAAGACAATCGTGCAGTAAATTTAAGTTGAATGTTATGGTATACATTTAAGTAGCTAAGTATTATTAAAATCATCTTTACCTCTTTA T 1099.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.580;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:96:1137,96,0 +chr17 30525139 . AAGGTGAGACTATTCAAGACAAATGTCTGTGGCGATAGGGTACACTTGGCTTGACAAATGCAAAAATAAAAGTACCCAGTGTAAACTGCAAAATCTCTATC A 1254.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=1.255;DP=29;FS=3.832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:98:1292,98,0 +chr17 30765774 . C CT 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.300;DP=307;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,50:293:99:273,0,6760 +chr17 30785564 . TGGTAAGTGGGTAATAATTATTAGTCAGTCATTTGTAGAGCCTATTAAAAATAAATTAACTAAAAGTTTGTATGGTTTATCCA T 11649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.446;DP=241;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=34.43;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,238:241:99:11687,977,0 +chr17 30919537 . ACG A 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=19.52;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:252,0,145 +chr17 30960475 . GCTAAAAAAAAAAAGATAACATTGTTAACATTTGCAAGATATGAAAAACTTTTTTTTAAATAATCCTGGATTCCTCAAAACCTAC G 3170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=1.731;DP=78;FS=5.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=27.73;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,71:78:99:3208,284,0 +chr17 31038221 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-1.322;DP=57;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:298,0,1673 +chr17 31038575 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.774;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:450,0,1655 +chr17 31039470 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.202;DP=72;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:252,0,2284 +chr17 31080741 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.774;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:424,0,2091 +chr17 31080777 . G C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.992;DP=69;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:274,0,2116 +chr17 31117991 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=1.360;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:245,0,1276 +chr17 31691545 . AACCTGAAATTTCATTAAATACAATCGTTTGTAACTGTTAGCTACTCTCAATGTTTCAACACCTAAACGACAAAACAAATCAACTT A 1876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=1.955;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1914,177,0 +chr17 31777797 . AACCTGAATAAAAAACACACCGGTCATAAATGGACACAATATGTATTATTTAATATGTGATCTTATTATCTTTTCAAT A 790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.561;DP=23;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=34.38;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:64:828,64,0 +chr17 31855258 . C CT 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.908;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:397,0,386 +chr17 31865115 . T A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:460,0,455 +chr17 31865209 . C G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=-1.466;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=25.52;ReadPosRankSum=2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:360,0,124 +chr17 31865317 . A T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.179;DP=40;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:534,0,810 +chr17 31871525 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=1.823;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:378,0,322 +chr17 31890689 . T A 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:726,51,0 +chr17 32572039 . C CA 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=-0.473;DP=62;FS=3.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:383,0,2082 +chr17 32574146 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.023;DP=67;FS=4.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:265,0,2025 +chr17 32614359 . G T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.546;DP=86;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1012,0,1842 +chr17 32614434 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.665;DP=63;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:290,0,1832 +chr17 32706206 . A AT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=3.169;DP=59;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=3.50;ReadPosRankSum=-3.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:244,0,1094 +chr17 32725506 . G T 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.352;DP=399;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,105:397:99:2216,0,11278 +chr17 32730075 . G A 1959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-1.314;DP=353;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,96:352:99:1988,0,11552 +chr17 32737847 . G T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.278;DP=38;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:649,0,685 +chr17 32755229 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=1.289;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:272,0,760 +chr17 32928776 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.941;DP=49;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:365,0,1470 +chr17 32928864 . T G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.937;DP=91;FS=2.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:439,0,3619 +chr17 32938220 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.216;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:99:230,0,1405 +chr17 32939057 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=-1.591;DP=98;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.139;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:348,0,3054 +chr17 32942058 . T G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.650;DP=75;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:317,0,2288 +chr17 32943226 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=1.148;DP=76;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:264,0,2389 +chr17 32958893 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=0.229;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:499,0,4275 +chr17 32984977 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.581;DP=97;FS=10.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:464,0,2830 +chr17 33068102 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.115;DP=73;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:333,0,2261 +chr17 33071583 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.164;DP=74;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:434,0,2006 +chr17 33578841 . GA G 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-0.505;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:49:309,0,49 +chr17 33591864 . G C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.054;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:424,0,471 +chr17 33618587 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.269;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:398,0,1985 +chr17 33628301 . A G 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.897;DP=258;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,62:258:99:1323,0,7583 +chr17 33628342 . A ACAGAG 6396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.564;DP=242;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,175:236:99:6434,0,1539 +chr17 33628578 . T C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-1.531;DP=190;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,41:189:99:772,0,5495 +chr17 33635636 . C T 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.642;DP=224;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,55:224:99:1191,0,8501 +chr17 33660042 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.103;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:244,0,1354 +chr17 33661714 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-0.486;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:691,0,2146 +chr17 33667600 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.790;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:245,0,2019 +chr17 33672081 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=-0.473;DP=57;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:302,0,1744 +chr17 33672232 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=1.565;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:340,0,1169 +chr17 33672516 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.008;DP=65;FS=4.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:251,0,2067 +chr17 33690593 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=1.455;DP=21;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:235,0,500 +chr17 33917412 . CCCTAAAGAAACAAACAGCTTCATAAATGTTCATCTCTAAAGCAACGTGATTAAAGCTGCTATTAGACTCA C 1429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=1.135;DP=42;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=34.04;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,38:42:99:1467,0,635 +chr17 34080965 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.572;DP=94;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,18:94:99:312,0,2936 +chr17 34092601 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.404;DP=67;FS=2.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:521,0,1819 +chr17 34110951 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=1.370;DP=113;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,27:113:99:597,0,3319 +chr17 34111407 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.354;DP=103;FS=3.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:328,0,3257 +chr17 34394618 . C T 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.853;DP=79;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:940,0,1831 +chr17 34406412 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=1.298;DP=54;FS=6.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:448,0,1501 +chr17 34406799 . G T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.707;DP=33;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:343,0,841 +chr17 34406988 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.762;DP=31;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:260,0,845 +chr17 34409334 . A C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.167;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:603,0,480 +chr17 34413733 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=-0.607;DP=202;FS=4.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,35:202:99:506,0,6570 +chr17 34416069 . G C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-1.441;DP=192;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,36:191:99:566,0,6017 +chr17 34416081 . G C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-1.784;DP=176;FS=4.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,31:175:99:472,0,5610 +chr17 34974350 . GT G,GTT 3925.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.594;DP=311;FS=5.337;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:39,168,63:270:99:4449,165,1303,3872,0,6225 +chr17 34977835 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=1.646;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:389,0,585 +chr17 35014921 . A C 254.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:283,0,17 +chr17 35264238 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.284;DP=71;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:291,0,1976 +chr17 35264333 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.635;DP=60;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.125;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:433,0,1455 +chr17 35264388 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.097;DP=54;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:378,0,1450 +chr17 35362751 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.293;DP=71;FS=18.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:255,0,2205 +chr17 35391060 . A C 897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:66:926,66,0 +chr17 35411006 . GCAGGTAACATTTGAATACGCTGTGCAGTTTGGCTAGCGATTCATACTCCTCTGACATTTATGTTTGTTTATGTTT G 2646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.696;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=30.42;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,71:75:99:2684,0,551 +chr17 35413513 . G A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.747;DP=70;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:525,0,3108 +chr17 35415240 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=-1.099;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:451,0,678 +chr17 35415254 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-1.438;DP=37;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:476,0,970 +chr17 35415857 . C T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr17 35416038 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.922;DP=27;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:348,0,1113 +chr17 35417563 . G C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.998;DP=103;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:584,0,2924 +chr17 35425466 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.140;ClippingRankSum=0.589;DP=112;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,19:112:99:292,0,3593 +chr17 36056555 . A G 2027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=-1.332;DP=316;FS=1.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,85:316:99:2056,0,9061 +chr17 37035338 . TG T 400.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.651;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=23.58;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:19:438,19,0 +chr17 37073441 . G A 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.698;DP=169;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,40:168:99:836,0,4957 +chr17 37077416 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-2.025;DP=269;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,44:269:99:491,0,12277 +chr17 37078377 . T A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=-2.795;DP=186;FS=17.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,38:186:99:700,0,5515 +chr17 37078616 . G T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.493;DP=177;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,40:177:99:839,0,5239 +chr17 37107011 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.082;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:244,0,694 +chr17 37107491 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.753;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:392,0,448 +chr17 37119108 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.851;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:391,0,803 +chr17 37126552 . C A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=1.068;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:303,0,786 +chr17 37129697 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.477;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,472 +chr17 37138238 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.117;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:232,0,1488 +chr17 37232006 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr17 37254155 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:265,0,230 +chr17 37379672 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.528;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:675,0,490 +chr17 37399081 . C T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-1.494;DP=67;FS=10.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=14.31;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:987,0,2364 +chr17 37402050 . G T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=1.119;DP=132;FS=5.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,35:132:99:846,0,3807 +chr17 37409222 . A C 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-3.940;DP=105;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:1731,0,3954 +chr17 37409251 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-1.733;DP=160;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:1044,0,5252 +chr17 37453918 . A T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr17 37528691 . G A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=1.343;DP=82;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=13.38;ReadPosRankSum=-2.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:1125,0,1644 +chr17 37529816 . C G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.35;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:239,0,59 +chr17 37530024 . T C 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-1.511;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=25.81;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:596,0,150 +chr17 37530092 . T A 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:803,60,0 +chr17 37530997 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.206;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:423,0,296 +chr17 37738389 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=-1.547;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=5.34;ReadPosRankSum=3.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:498,0,2314 +chr17 37958574 . G A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-1.123;DP=299;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,63:299:99:1214,0,9227 +chr17 37959211 . TA T 745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.829;ClippingRankSum=-0.042;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:783,0,1648 +chr17 37961259 . T C 2029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=-0.655;DP=324;FS=0.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,90:324:99:2058,0,8112 +chr17 38115579 . A C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-0.209;DP=43;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:267,0,4046 +chr17 38115584 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.412;DP=46;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:267,0,4046 +chr17 38133482 . G C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=1.594;DP=59;FS=14.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=6.23;ReadPosRankSum=2.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:396,0,1571 +chr17 38136225 . T A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.364;DP=50;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:457,0,1313 +chr17 38137249 . AGTAAACGCAGCTCTTTTCCTGTTTTTGTTTTTTTTGCCATTTGTTCTTGCCCATCTTACTGTGTTTCTGTCAG A 1057.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=1.453;DP=32;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=33.05;ReadPosRankSum=-1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1095,0,857 +chr17 38138169 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.516;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:305,0,2217 +chr17 38171648 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-3.007;DP=54;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:248,0,2930 +chr17 38171649 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-3.016;DP=53;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:248,0,2930 +chr17 38178740 . AGTAGAGAATAATAATAACAGACATAATACATTTCAGTCTGTTTGTTCTGTGCTGCAGGATGATTAAAGCAATGATTTGTGTTCATCTACTGGTGCAG A 2590.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=1.641;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:2628,222,0 +chr17 38186977 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-0.298;DP=59;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,11:58:99:254,0,1748 +chr17 38189860 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=1.823;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,986 +chr17 38192974 . CT C 399.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=24.99;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:437,17,0 +chr17 38193645 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,535 +chr17 38400058 . AT A 216.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr17 38400061 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr17 38620388 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:70:292,0,70 +chr17 38627063 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=8.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:365,0,698 +chr17 38631575 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-1.214;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:263,0,137 +chr17 38638974 . G T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-1.270;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:722,0,350 +chr17 38682831 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-1.248;DP=22;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:370,0,371 +chr17 38690262 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,289 +chr17 38692564 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.739;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:296,0,209 +chr17 38700990 . A C 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:412,30,0 +chr17 38704914 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,373 +chr17 38713070 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-0.270;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=20.43;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:641,0,1047 +chr17 38721407 . T C 297.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.00;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:325,0,12 +chr17 38751217 . T A 2059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.139;DP=154;FS=6.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,60:154:99:2088,0,3326 +chr17 38752278 . G A 1809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.749;DP=120;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1838,0,2434 +chr17 38754257 . G A 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=1.939;DP=136;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,50:134:99:1297,0,2836 +chr17 38755141 . T C 1964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.595;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,57:142:99:1993,0,4213 +chr17 38756139 . T C 2385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.432;DP=139;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:2414,0,2497 +chr17 38758499 . T A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=1.031;DP=152;FS=6.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,34:151:99:719,0,4638 +chr17 38759539 . A ACTCTG 2609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=1.595;DP=123;FS=3.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:99:2647,174,0 +chr17 38762311 . C A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.763;DP=181;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,46:180:99:984,0,5138 +chr17 38766752 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=1.549;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=15.46;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:492,0,1317 +chr17 38767593 . A C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=-2.316;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:790,0,1259 +chr17 38768248 . T A 1410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=1.020;DP=69;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1439,0,1087 +chr17 38770513 . A C 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.709;DP=20;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=30.44;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:75:637,0,75 +chr17 38772772 . T C 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.239;DP=51;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1045,0,688 +chr17 38822151 . A G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DP=38;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:467,0,932 +chr17 38822202 . A C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.537;DP=46;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:342,0,1275 +chr17 38823666 . GGT G 1448.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=1.990;DP=66;FS=3.112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:41:1486,41,0 +chr17 38825703 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.991;DP=46;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:366,0,1178 +chr17 38827004 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.310;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:317,0,1057 +chr17 38827076 . G T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.253;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:970,0,770 +chr17 38829346 . G A 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.166;DP=43;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=21.92;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:971,0,519 +chr17 38829628 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=-0.235;DP=61;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:723,0,1389 +chr17 38829650 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.081;DP=61;FS=7.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:1007,0,2505 +chr17 38830274 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-0.908;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,3:33:99:1088,0,2013 +chr17 38845824 . A G 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-1.462;DP=57;FS=11.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:948,0,1004 +chr17 38852838 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=1.109;DP=68;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:294,0,2016 +chr17 38856289 . G T 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=1.239;DP=53;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:705,0,1203 +chr17 38880242 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.905;DP=98;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,23:98:99:496,0,2761 +chr17 38880386 . C A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=-0.634;DP=132;FS=1.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,35:132:99:821,0,3686 +chr17 38880953 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.057;DP=82;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:953,0,1944 +chr17 38881013 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=1.299;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:718,0,2775 +chr17 38881520 . G C 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-2.418;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1257,0,1511 +chr17 38908281 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:380,0,205 +chr17 38917214 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.801;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:319,0,430 +chr17 38924229 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-0.724;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:233,0,734 +chr17 38928207 . C T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-1.278;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:437,0,414 +chr17 39090846 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.919;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:269,0,763 +chr17 39095783 . G GA 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-1.509;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:501,0,166 +chr17 39106212 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-0.588;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:408,0,676 +chr17 39108832 . G A 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.154;DP=48;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:762,0,807 +chr17 39128981 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.829;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:470,0,506 +chr17 39352305 . T G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.543;DP=30;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,797 +chr17 39896190 . A T 5995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=2.120;DP=218;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=27.50;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,149:217:99:6024,0,1617 +chr17 39899902 . ACAGGTACACACTTCTTCATTTAATAAAAAGGAGCTTTAATATTAGCAGATTTCTTATGGTTGAGGTGTATTTGCTTTATT A 11833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.699;DP=304;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,254:257:99:11871,1099,0 +chr17 39976237 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=1.087;DP=34;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:564,0,618 +chr17 40275629 . C T 2229.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2258,160,0 +chr17 40275844 . T G 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +chr17 40275891 . C T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr17 40276022 . T A 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:855,60,0 +chr17 40276136 . A T 1743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1772,129,0 +chr17 40276189 . C T 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-1.888;DP=47;FS=5.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:99:1305,0,231 +chr17 40576296 . T C 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.101;DP=37;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:763,0,393 +chr17 40576315 . A G 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.336;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=14.17;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:765,0,393 +chr17 40576440 . T G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:397,0,381 +chr17 40576616 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.899;DP=108;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:352,0,5358 +chr17 40576618 . T TA 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-3.203;DP=114;FS=3.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:500,0,2424 +chr17 40576623 . A C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.027;DP=109;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:429,0,4746 +chr17 40576735 . AT A 2326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-1.048;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=20.77;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:99:2364,0,269 +chr17 40576805 . A C 2218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.921;DP=148;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:2247,0,2446 +chr17 40576880 . C T 769.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:63:798,63,0 +chr17 40580865 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=2.180;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:236,0,130 +chr17 40581087 . A G 1846.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1875,135,0 +chr17 40581455 . G A 2446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=1.553;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=32.96;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2475,172,0 +chr17 40583214 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.980;DP=67;FS=6.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:246,0,2256 +chr17 41035392 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.482;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:487,0,497 +chr17 41048074 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=-0.996;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:566,0,441 +chr17 41061818 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=27.85;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:446,0,306 +chr17 41061827 . T C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=29.84;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:446,0,306 +chr17 41091448 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:256,0,147 +chr17 41317974 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.500;DP=102;FS=6.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:870,0,2567 +chr17 41432203 . G A 2139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.372;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:2168,0,2077 +chr17 41439571 . G A 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.856;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=17.94;ReadPosRankSum=2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1248,0,1019 +chr17 41439707 . T TAC 2195.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.216;DP=110;FS=2.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=19.96;ReadPosRankSum=-2.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,68:100:99:2304,0,773 +chr17 41440497 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.218;DP=91;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:452,0,2727 +chr17 41441920 . G A 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.313;DP=122;FS=7.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:1083,0,6492 +chr17 41441921 . T A 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=-1.399;DP=125;FS=7.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,38:123:99:1083,0,6492 +chr17 41442220 . GA G 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.673;DP=127;FS=8.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,44:120:99:910,0,1186 +chr17 41442420 . A G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.453;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:486,0,1847 +chr17 41442733 . AAT A 2582.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=124;FS=4.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:2620,0,2014 +chr17 41443121 . TA T 440.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-1.149;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:23:478,0,23 +chr17 41581554 . A T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-0.276;DP=71;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:394,0,2043 +chr17 41591712 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.825;DP=50;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=17.54;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:905,0,897 +chr17 41592085 . G GC 1567.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1605,128,0 +chr17 41593038 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-1.394;DP=68;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:910,0,2407 +chr17 41618611 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=2.470;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:673,0,624 +chr17 41686985 . C A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.058;DP=45;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:894,0,640 +chr17 41699505 . T A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=1.401;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:685,0,1355 +chr17 41746793 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.802;DP=40;FS=6.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=15.34;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:642,0,1089 +chr17 41746820 . C T 841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=-0.379;DP=46;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=18.30;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:879,0,696 +chr17 41748759 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.456;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:768,0,718 +chr17 41759899 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-1.179;DP=43;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,9:43:99:296,0,2674 +chr17 41759902 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=-2.092;DP=45;FS=5.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=5.95;ReadPosRankSum=-2.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:296,0,2674 +chr17 41771535 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.122;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:422,0,656 +chr17 41775282 . A G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.381;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:625,0,663 +chr17 41782785 . G A 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.098;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1242,0,460 +chr17 41782825 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.347;DP=42;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:998,0,477 +chr17 41785082 . A T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.177;DP=39;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:952,0,444 +chr17 41801400 . T A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=-0.751;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=26.81;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1503,0,403 +chr17 42120322 . A T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.613;DP=35;FS=10.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:577,0,649 +chr17 42134832 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=1.415;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:355,0,250 +chr17 42160856 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.025;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:397,0,811 +chr17 42161755 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,279 +chr17 42392214 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.337;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:328,0,586 +chr17 42623711 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.244;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:401,0,282 +chr17 42699053 . A G 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=-0.244;DP=29;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:588,0,471 +chr17 42699194 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:556,0,39 +chr17 42973078 . GA G 716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=-0.869;DP=71;FS=0.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,27:70:99:754,0,1199 +chr17 42973154 . C T 3011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.821;ClippingRankSum=0.132;DP=129;FS=2.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=23.35;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,81:116:99:3040,0,977 +chr17 42973799 . A G 808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:60:837,60,0 +chr17 42973806 . C T 764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.520;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:793,57,0 +chr17 42974715 . G T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.295;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:1520,0,1538 +chr17 42974786 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-1.631;DP=123;FS=6.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:661,0,2731 +chr17 42974932 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=4.367;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=13.81;ReadPosRankSum=-2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:401,0,525 +chr17 42974993 . A G 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.318;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=19.48;ReadPosRankSum=-2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:632,0,186 +chr17 42975054 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr17 42975326 . A T 2338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=1.795;DP=100;FS=20.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=23.39;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,62:79:99:2367,0,533 +chr17 42975359 . CA C 715.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-2.614;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=17.04;ReadPosRankSum=2.614 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:25:753,25,0 +chr17 42975466 . T A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 +chr17 42976041 . TA T,TAA 831.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=-1.325;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,20,13:34:99:876,371,922,572,0,1559 +chr17 42976053 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=1.606;DP=42;FS=56.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.61;ReadPosRankSum=-3.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:474,0,1370 +chr17 42976096 . C G 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:454,33,0 +chr17 42976312 . G A,T 629.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,14,2:16:87:666,87,170,627,0,1294 +chr17 42976313 . A T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.315;DP=23;FS=12.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=23.95;ReadPosRankSum=2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:579,0,173 +chr17 42976396 . T TA 914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-1.733;DP=47;FS=5.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=19.46;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:87:952,87,0 +chr17 42976767 . A T 536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:565,39,0 +chr17 42977070 . A G 395.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:6:423,0,6 +chr17 42977444 . G T 3427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3456,241,0 +chr17 42977594 . C A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 +chr17 42977598 . A C 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 +chr17 42977758 . A G 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=2.743;DP=46;FS=8.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=25.76;ReadPosRankSum=-2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:30:1213,0,30 +chr17 42977926 . G T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.318;DP=37;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:686,0,539 +chr17 42977977 . C G 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.093;DP=62;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1394,0,427 +chr17 42977987 . CT C 2638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2676,197,0 +chr17 42978187 . T C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 +chr17 42978188 . C T 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 +chr17 42978230 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.238;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:238,0,454 +chr17 42978550 . T G 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=2.815;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=30.44;ReadPosRankSum=-2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:49:1459,0,49 +chr17 42978551 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=2.815;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.274;QD=30.44;ReadPosRankSum=-2.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:49:1459,0,49 +chr17 42978652 . C G 1492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1521,108,0 +chr17 42978667 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=-4.292;DP=39;FS=5.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.10;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:266,0,1085 +chr17 42979148 . C A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.171;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:58:925,0,58 +chr17 42979163 . C A 2370.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2399,169,0 +chr17 42980014 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-1.003;DP=35;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=8.65;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,144 +chr17 42980470 . T C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr17 43052737 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.785;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,488 +chr17 43057165 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.344;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:379,0,2493 +chr17 43066491 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=3.510;DP=18;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.82;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,398 +chr17 43075139 . T TA 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.488;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.138;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:394,0,614 +chr17 43075258 . C T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=-5.093;DP=257;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,56:257:99:1147,0,7870 +chr17 43076137 . GCCTGTAAGATGAAAGTGGAAATTATATACAAATATACAATTCAAGTAAAAAATAAATAAATTGAAATTGTTAAATATACAAACTTGATAAAAATAAAGACTTA G 5984.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-1.236;DP=383;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.984;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,174:371:99:6022,0,8628 +chr17 43076139 . CTGT C 6780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.936;DP=373;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,192:371:99:6818,0,8812 +chr17 43076143 . AAGATGAAAGTGGAAATTATATACAAATATACAATTCAAGTAAAAAATAAATAAATTGAAATTGTTAAATATACAAACTTGATAAAAATAAAGACTTACCG A 6780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.203;DP=379;FS=4.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.807;QD=17.89;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,193:377:99:6818,0,8812 +chr17 43338786 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.88;ReadPosRankSum=2.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:296,0,353 +chr17 43338991 . T TA 419.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:457,45,0 +chr17 43339761 . T G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=2.001;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=23.26;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:447,0,122 +chr17 43341716 . C T 2225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.375;DP=29;FS=4.210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=24.48;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:99:2254,160,0 +chr17 43342103 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.116;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:292,0,500 +chr17 43342324 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.531;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:316,0,355 +chr17 43342855 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=1.851;DP=50;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:248,0,1446 +chr17 43461293 . C A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.488;DP=62;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:856,0,1255 +chr17 43465868 . C T 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.862;DP=58;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=24.55;ReadPosRankSum=2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,39:58:99:1452,0,603 +chr17 43465940 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=2.317;DP=39;FS=5.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:230,0,2326 +chr17 43465943 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=2.444;DP=41;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:230,0,2326 +chr17 43467847 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.746;DP=89;FS=5.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,29:89:99:783,0,2245 +chr17 43475751 . G A 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.257;DP=36;FS=7.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.182;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:742,0,524 +chr17 43510953 . G C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:434,0,275 +chr17 43514302 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.452;DP=70;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:391,0,2042 +chr17 43521364 . C G 278.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.98;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:307,0,19 +chr17 43548969 . A G 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:492,36,0 +chr17 43549084 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:394,0,118 +chr17 43549306 . A G 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:237,0,24 +chr17 43550258 . T G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:257,0,351 +chr17 43550628 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.634;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,453 +chr17 43551656 . G GT 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.871;DP=35;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:301,0,870 +chr17 43552228 . T A 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 +chr17 43553926 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-2.289;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:305,0,301 +chr17 43554800 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:276,0,104 +chr17 43555892 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:377,0,166 +chr17 43555910 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-2.001;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:472,0,261 +chr17 43557726 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:327,0,373 +chr17 43565046 . T C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.115;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:687,0,939 +chr17 43569988 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-1.727;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=12.79;ReadPosRankSum=-3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:527,0,797 +chr17 43574224 . T C 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-0.643;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:788,0,393 +chr17 43574277 . C A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.174;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=27.59;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:911,0,222 +chr17 43606548 . TA T 568.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:606,57,0 +chr17 43607208 . C T 831.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:860,60,0 +chr17 43607326 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:86:372,0,86 +chr17 43610260 . A C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.095;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:595,0,607 +chr17 43620743 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,378 +chr17 43621115 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.377;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,646 +chr17 43621313 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=-0.596;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,505 +chr17 43645703 . TGTGAGCCCCGAACAATGTCGTTTATCAATACTCAATTGGTTTTCAAACATTGTGTAACTCATTTTCTCTAATAG T 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.550;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=29.46;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:597,0,1413 +chr17 43649533 . GAATAGGTATAAA G 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=19;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:99:719,0,625 +chr17 43649548 . TTTGGACTGATACTTGAAAACGTAAAGGCTTGCAATGTCAGCAAAACACAATGTATTTCTCCTGAAC T 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.953;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=34.09;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:719,0,625 +chr17 43655802 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:374,0,333 +chr17 43656429 . C CA 937.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:89:975,89,0 +chr17 43660325 . G A 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:536,39,0 +chr17 43662106 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.297;DP=50;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:741,0,994 +chr17 43662183 . ACTGACAGACCAATGGCAGAAGGTCAATAAGAAGCACTAGACCAGTCTATTATTAAAATCTGACTAGTTTGTGCTTAC A 2145.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=2.327;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,51:56:99:2183,0,605 +chr17 43662586 . G A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.419;DP=45;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:812,0,825 +chr17 43667749 . T G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.942;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:80:537,0,80 +chr17 43667815 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:345,0,121 +chr17 43705811 . C T 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-1.720;DP=100;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:594,0,2832 +chr17 43705873 . G T 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.064;DP=80;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:607,0,2349 +chr17 43706374 . C CT 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-1.205;DP=48;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:600,0,384 +chr17 43759447 . G C 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.687;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:527,0,793 +chr17 43760875 . C G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.755;DP=28;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:53:939,0,53 +chr17 43766064 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=1.109;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:356,0,136 +chr17 43766220 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=1.308;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=19.03;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:542,0,382 +chr17 43766261 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.692;DP=31;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:542,0,578 +chr17 43896468 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.097;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:285,0,1606 +chr17 43896686 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.207;DP=44;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:521,0,1002 +chr17 43896698 . T A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.168;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:533,0,872 +chr17 43896718 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.461;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:466,0,753 +chr17 43896791 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,171 +chr17 43897289 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-0.320;DP=42;FS=13.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:304,0,1849 +chr17 43897290 . C T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.617;DP=41;FS=11.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:642,0,1257 +chr17 43897303 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.257;DP=38;FS=13.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:502,0,882 +chr17 43897355 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.769;DP=57;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:360,0,1689 +chr17 43902785 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.012;DP=178;FS=6.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,40:178:99:883,0,10841 +chr17 43910097 . C A 3031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=3.782;DP=124;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=24.45;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,83:124:99:3060,0,1074 +chr17 43910140 . C A 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=2.085;DP=98;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1882,0,1366 +chr17 44052465 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr17 44053819 . G T 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=2.706;DP=24;FS=10.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=34.57;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:858,0,180 +chr17 44127272 . A C 1383.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.409;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=34.60;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,35:40:17:1412,0,17 +chr17 44237655 . CA C 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:243,18,0 +chr17 44237776 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:273,0,59 +chr17 44291521 . C CA 745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.329;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:783,0,1198 +chr17 44294261 . G C 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:528,36,0 +chr17 44487867 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=2.282;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:366,0,81 +chr17 44490820 . G T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=-0.087;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:499,0,114 +chr17 44510362 . T C 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.604;DP=32;FS=4.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=28.31;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:934,0,99 +chr17 44521080 . GT G 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.054;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:429,0,176 +chr17 44585823 . T A 606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:635,48,0 +chr17 44586102 . G A 323.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:352,0,13 +chr17 44586924 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:332,0,236 +chr17 45189487 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.155;DP=90;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:492,0,2627 +chr17 45259432 . C T 2070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.740;DP=306;FS=3.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=6.77;ReadPosRankSum=2.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,86:306:99:2099,0,8299 +chr17 45259831 . C T 2099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-7.287;DP=112;FS=17.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=18.75;ReadPosRankSum=4.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,75:112:99:2128,0,3710 +chr17 45259907 . G A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.955;DP=243;FS=2.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=2.65;ReadPosRankSum=4.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,45:243:99:671,0,7527 +chr17 45278100 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.912;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:342,0,1443 +chr17 45278291 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=1.288;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:404,0,1480 +chr17 45317465 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=2.176;DP=31;FS=4.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:289,0,816 +chr17 45516624 . A AG 675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-1.278;DP=54;FS=7.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:713,0,1081 +chr17 45518082 . TTC T 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-1.276;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:427,0,2255 +chr17 45518347 . TA T 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-3.325;DP=37;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:383,0,575 +chr17 45518419 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=-1.101;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:396,0,1670 +chr17 45526959 . C T 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.643;DP=80;FS=4.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:1257,0,1587 +chr17 45533337 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-0.040;DP=44;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:296,0,1223 +chr17 45534337 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.072;DP=79;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:537,0,2145 +chr17 45646539 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.580;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:281,0,465 +chr17 45727678 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.410;DP=40;FS=12.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:604,0,780 +chr17 45823964 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,366 +chr17 45823968 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,366 +chr17 45845324 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.866;DP=36;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:707,0,502 +chr17 45899781 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.552;DP=186;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,38:186:99:661,0,5700 +chr17 45900104 . G GA 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.862;DP=107;FS=4.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:452,0,3841 +chr17 45900794 . C T 1426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.834;DP=228;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,62:228:99:1455,0,6289 +chr17 45900999 . T A 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.889;DP=148;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,46:148:99:1272,0,4099 +chr17 45901334 . T A 1374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-3.200;DP=244;FS=5.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,63:244:99:1403,0,7767 +chr17 45905790 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.274;DP=64;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:354,0,1656 +chr17 45918931 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.699;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:266,0,911 +chr17 45976395 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.083;DP=24;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:361,0,699 +chr17 45976431 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=14.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:252,0,465 +chr17 46122595 . G T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=3.665;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:264,0,418 +chr17 46122637 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=2.900;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=14.51;ReadPosRankSum=-2.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:449,0,1161 +chr17 46122638 . G T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=2.681;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:449,0,1124 +chr17 46154591 . G A 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=1.723;DP=43;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:374,0,1409 +chr17 46155107 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-1.404;DP=35;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:315,0,1193 +chr17 47059378 . A G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr17 47699821 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,307 +chr17 48839810 . T G 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.907;DP=40;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=29.52;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1209,0,416 +chr17 48840218 . C T 2056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=-0.542;DP=67;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,58:67:59:2085,0,59 +chr17 49039628 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.530;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:327,0,216 +chr17 49056276 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=20.89;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,287 +chr17 49061809 . C T 468.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:495,2,0 +chr17 49061895 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.206;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:390,0,268 +chr17 49077816 . TA T 210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:248,21,0 +chr17 49078140 . T C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.311;DP=175;FS=5.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,40:175:99:806,0,7385 +chr17 49115579 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,233 +chr17 49115583 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,233 +chr17 49117515 . C G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:247,0,430 +chr17 49167171 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.199;DP=170;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,47:170:99:1091,0,4570 +chr17 49174994 . G A 1419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-1.025;DP=182;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,58:182:99:1448,0,4778 +chr17 49175913 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.398;DP=88;FS=1.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:597,0,2476 +chr17 49176165 . GA G 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.516;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:569,0,364 +chr17 49252393 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.096;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:437,0,962 +chr17 49258482 . G C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.703;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:269,0,3251 +chr17 49269953 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=1.675;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:341,0,1019 +chr17 49286628 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.437;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:249,0,1703 +chr17 49288034 . C A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=-0.516;DP=46;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:406,0,2021 +chr17 49288234 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=2.894;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:235,0,768 +chr17 49373047 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.549;DP=56;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:252,0,5011 +chr17 49373056 . C G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.717;DP=61;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,12:61:99:252,0,5011 +chr17 49373639 . G A 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-0.122;DP=59;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=25.37;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,40:59:99:1525,0,566 +chr17 49373842 . T TCA 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.159;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:428,0,104 +chr17 49455944 . G A 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 +chr17 49471200 . G A 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.284;DP=87;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1158,0,1874 +chr17 49507667 . C A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr17 49515244 . G T 3464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=1.349;DP=166;FS=7.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=20.87;ReadPosRankSum=2.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,102:166:99:3493,0,2131 +chr17 49524834 . A T 3188.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.258;DP=160;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,94:160:99:3217,0,2341 +chr17 49530975 . G T 2653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=1.072;DP=145;FS=5.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=18.30;ReadPosRankSum=3.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:2682,0,5488 +chr17 49805936 . C A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr17 49806153 . T A 700.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:51:729,51,0 +chr17 49807088 . C A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr17 49807272 . A AC 762.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:800,60,0 +chr17 49807479 . G A 1450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1479,102,0 +chr17 49959969 . T C 929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:958,69,0 +chr17 50044508 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-0.942;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=18.19;ReadPosRankSum=2.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:865,0,710 +chr17 50048727 . AAGGTAAGATCAGATTTTCTAAATCAATGTCTCCGAGTGAAGAATTTCATATTGACAGAATGACCTCTTCTGTTC A 3142.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-0.120;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:3180,257,0 +chr17 50053214 . T C 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.423;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=20.99;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:805,0,498 +chr17 50143849 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,369 +chr17 50151738 . T A 310.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.09;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:339,0,15 +chr17 50156088 . A C 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=1.147;DP=29;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=27.58;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:828,0,169 +chr17 50300014 . C T 4449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=1.790;DP=293;FS=16.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=15.19;ReadPosRankSum=-1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,126:293:99:4478,0,5726 +chr17 50300348 . C T 4673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=1.614;DP=341;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,136:341:99:4702,0,6892 +chr17 50300537 . A G 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.439;DP=219;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,72:219:99:1943,0,5776 +chr17 50314074 . G A 2632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=-3.796;DP=366;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,117:365:99:2661,0,9093 +chr17 50318804 . T A 543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:572,42,0 +chr17 50348818 . A G 4481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=5.988;DP=570;FS=13.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=7.86;ReadPosRankSum=2.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:395,170:565:99:4510,0,15108 +chr17 50384484 . A G 5714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.120;DP=414;FS=4.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,173:391:99:5743,0,6714 +chr17 50389244 . C T 9058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.703;ClippingRankSum=3.957;DP=388;FS=28.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=23.35;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,249:360:99:9087,0,2740 +chr17 50400075 . T G 3108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-2.230;DP=375;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=8.29;ReadPosRankSum=3.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,120:375:99:3137,0,9535 +chr17 50445789 . A G 4994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.319;DP=304;FS=6.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,141:304:99:5023,0,5355 +chr17 50445812 . CT C 246.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:25:284,25,0 +chr17 50445817 . A T 255.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:25:284,25,0 +chr17 50449613 . G A 5372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.396;DP=357;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,157:357:99:5401,0,6509 +chr17 50467157 . C T 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;ClippingRankSum=5.374;DP=356;FS=30.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=5.38;ReadPosRankSum=2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,87:356:99:1944,0,10208 +chr17 50467184 . G A 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=6.178;DP=323;FS=5.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=5.05;ReadPosRankSum=-5.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,78:323:99:1658,0,9375 +chr17 50467577 . A G 4906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-2.504;DP=304;FS=6.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,139:304:99:4935,0,5533 +chr17 50470968 . C T 4666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.704;DP=284;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,131:283:99:4695,0,5074 +chr17 50471474 . C T 7026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;ClippingRankSum=1.707;DP=387;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,195:386:99:7055,0,6748 +chr17 50471557 . G A 4808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=-2.065;DP=322;FS=0.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,143:320:99:4837,0,5797 +chr17 50474486 . G A 4533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.399;DP=302;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.187;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,131:302:99:4562,0,5730 +chr17 50510746 . T TA 888.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-0.616;DP=79;FS=10.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:926,0,661 +chr17 50510986 . T C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.189;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:76:568,0,76 +chr17 50511101 . G C 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-1.650;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=27.70;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1164,0,120 +chr17 50511105 . A G 1697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1726,117,0 +chr17 50511275 . GA G 321.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:35:359,35,0 +chr17 50511316 . C T 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:32:433,32,0 +chr17 50511479 . G A 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-1.333;DP=35;FS=8.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:942,0,334 +chr17 50511767 . C CT 477.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=26.54;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:24:515,24,0 +chr17 50512214 . C G 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=3.361;DP=42;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=22.57;ReadPosRankSum=-2.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:976,0,1785 +chr17 50512236 . T C 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=1.617;DP=38;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=24.94;ReadPosRankSum=-1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:976,0,1751 +chr17 50512239 . T TA 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=2.757;DP=38;FS=7.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:272,0,556 +chr17 50512902 . T TA 2169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.947;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,54:81:99:2207,0,1519 +chr17 50512904 . G A 2178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-1.293;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,55:82:99:2207,0,1518 +chr17 50513208 . A G 2741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.413;DP=113;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=24.26;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,75:111:99:2770,0,956 +chr17 50547556 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:283,0,154 +chr17 50547560 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:283,0,154 +chr17 50547646 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.584;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:599,0,158 +chr17 50641092 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,346 +chr17 50641209 . C T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +chr17 50643054 . T C 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:661,45,0 +chr17 50643349 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=26.08;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:289,0,139 +chr17 50671862 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=2.654;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,259 +chr17 50671997 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.774;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=23.44;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:333,0,134 +chr17 50722781 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr17 50731579 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:393,0,262 +chr17 50815202 . CT C 1005.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.521;DP=132;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:1043,0,1343 +chr17 50817061 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=1.695;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=7.35;ReadPosRankSum=-2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:425,0,1506 +chr17 50817199 . G GT 1063.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=-3.064;DP=119;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=8.94;ReadPosRankSum=2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:1101,0,1632 +chr17 50819714 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.914;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:306,0,748 +chr17 50819716 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:306,0,748 +chr17 50821684 . C A 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:386,27,0 +chr17 50938182 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:305,0,54 +chr17 50956072 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.275;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:399,0,450 +chr17 50956230 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:343,0,520 +chr17 50956860 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:308,0,95 +chr17 50977073 . AC A 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=-1.791;DP=15;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:255,0,217 +chr17 50980273 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.411;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:355,0,487 +chr17 50991218 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:333,0,1012 +chr17 50991230 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.255;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=12.19;ReadPosRankSum=2.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:333,0,1041 +chr17 50996860 . G A 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:244,0,24 +chr17 51008759 . C T 1295.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:93:1324,93,0 +chr17 51013561 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.09;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:53:317,0,53 +chr17 51013576 . G C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:53:317,0,53 +chr17 51018165 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.363;DP=33;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:339,0,832 +chr17 51094218 . G C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-1.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:300,0,940 +chr17 51114199 . G T 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.366;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,33:56:99:1109,0,793 +chr17 51298090 . C T 1811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.043;DP=103;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1840,0,1795 +chr17 51317792 . GT G 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.338;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:513,0,209 +chr17 51318320 . C G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=-0.544;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:245,0,1473 +chr17 51320742 . A AC 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.951;DP=36;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:563,0,637 +chr17 51321112 . G C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.297;DP=67;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:770,0,1525 +chr17 51321790 . TAA T 355.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:58:681,58,0 +chr17 51322225 . A G 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.201;DP=78;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,44:77:99:1478,0,1172 +chr17 51322402 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=1.291;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:431,0,727 +chr17 51323834 . A G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.253;DP=35;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:484,0,915 +chr17 51323869 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:276,0,226 +chr17 51368749 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,221 +chr17 51368753 . G C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,221 +chr17 51482123 . C A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-1.559;DP=26;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=28.41;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:767,0,256 +chr17 51541999 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-1.920;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:566,0,444 +chr17 51542033 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.185;DP=18;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=28.26;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:70:537,0,70 +chr17 51546600 . CTTCTCCTCCTCTGTTGTCGCTGTGGTG C 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.182;DP=77;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:465,0,1777 +chr17 51546714 . GT G 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=-1.273;DP=48;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=29.85;ReadPosRankSum=-2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:99:1470,0,137 +chr17 51546717 . CTTCTCCTCCTCTGTTGTCGCTGTGGTGTT C 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=-1.335;DP=59;FS=10.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=24.28;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:99:1470,0,137 +chr17 51577401 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.914;DP=72;FS=10.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:325,0,2040 +chr17 51606323 . G A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-2.379;DP=140;FS=1.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,32:140:99:647,0,4149 +chr17 51611647 . C T 2566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-2.265;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=30.20;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,70:85:99:2595,0,243 +chr17 51715532 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=-1.250;DP=85;FS=2.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:353,0,2505 +chr17 51731275 . T C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-2.904;DP=109;FS=4.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:818,0,3142 +chr17 51731443 . T C 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=1.150;DP=144;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,34:143:99:742,0,4241 +chr17 51731990 . T C 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.926;DP=80;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1028,0,1582 +chr17 51741448 . G A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=1.894;DP=134;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,34:134:99:804,0,3810 +chr17 51801296 . C A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.645;DP=119;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,20:119:99:271,0,3794 +chr17 51832984 . T C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.243;DP=54;FS=5.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:903,0,994 +chr17 52041615 . T A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.747;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:404,0,424 +chr17 52138442 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.879;DP=27;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.682;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:351,0,594 +chr17 52139005 . G C 855.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:63:884,63,0 +chr17 52139293 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-3.171;DP=44;FS=5.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,9:44:99:374,0,3514 +chr17 52139305 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-1.141;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:374,0,3514 +chr17 52139314 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.002;DP=44;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:766,0,1611 +chr17 52140582 . GC G 1584.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.580;DP=79;FS=6.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1622,0,538 +chr17 52142190 . G T 2536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.609;DP=121;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,76:121:99:2565,0,1552 +chr17 52142457 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-3.032;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:359,0,1029 +chr17 52142490 . C CT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.397;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:243,0,985 +chr17 52142584 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=1.615;DP=40;FS=2.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:562,0,1198 +chr17 52143628 . C T 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.790;DP=68;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1580,0,830 +chr17 52143833 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-2.657;DP=40;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:361,0,1048 +chr17 52143897 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.676;DP=70;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1249,0,4023 +chr17 52246738 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=1.403;DP=32;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:299,0,907 +chr17 52283799 . GT G 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-1.587;DP=50;FS=7.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:458,0,552 +chr17 52348621 . CA C 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-2.113;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=13.86;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:55:259,0,55 +chr17 52458823 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-0.807;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:288,0,554 +chr17 52620420 . C A 1581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=0.186;DP=125;FS=3.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,47:125:99:1610,0,2783 +chr17 52642814 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.634;DP=21;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=23.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:528,0,205 +chr17 53052689 . C A 7362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.735;DP=591;FS=0.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=12.46;ReadPosRankSum=3.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:387,204:591:99:7391,0,26384 +chr17 53052690 . C T 7362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.490;DP=591;FS=0.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,201:582:99:7391,0,26470 +chr17 53081297 . G C 2793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.304;DP=289;FS=0.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,109:289:99:2822,0,14165 +chr17 53168910 . G T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.082;DP=111;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,33:109:99:774,0,2922 +chr17 53169482 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.873;DP=105;FS=1.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:1249,0,2023 +chr17 53169671 . G A 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-1.980;DP=99;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:1663,0,1685 +chr17 53179086 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-0.305;DP=69;FS=3.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:746,0,1106 +chr17 53397395 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:313,0,57 +chr17 53401264 . G C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,164 +chr17 53402134 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:347,0,290 +chr17 53424632 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:408,0,368 +chr17 53426943 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:254,0,342 +chr17 53429842 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.158;DP=36;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:620,0,638 +chr17 53430612 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=22.95;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:579,0,278 +chr17 53430782 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,362 +chr17 53432493 . CTT C 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.684;DP=220;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,37:207:99:704,0,5520 +chr17 53432715 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=2.887;DP=17;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=12.28;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:237,0,849 +chr17 53447370 . T A 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.102;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=33.16;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:40:592,40,0 +chr17 53682353 . G T 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 +chr17 53714313 . C A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.145;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:496,0,880 +chr17 53717261 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:329,0,582 +chr17 53717272 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=2.540;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,582 +chr17 53772751 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr17 53772752 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr17 53775173 . TGGTGTGTTTGAGTAACTGCGCCAATGTGCTTACACTCATCTGATGCTCATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCA T 3464.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.308;DP=82;FS=3.069;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=28.09;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:76:99:3502,302,0 +chr17 53775328 . T C 1425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.486;DP=79;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1454,0,1536 +chr17 53790882 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.584;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:311,0,972 +chr17 53792852 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=-0.784;DP=41;FS=12.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=10.51;ReadPosRankSum=3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:459,0,934 +chr17 53795252 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-1.234;DP=35;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.180;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:361,0,1146 +chr17 53815893 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-1.066;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:645,0,1179 +chr17 53817220 . C T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=-0.353;DP=61;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1071,0,992 +chr17 53829226 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.569;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:453,0,409 +chr17 53829341 . G A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.946;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:36:895,0,36 +chr17 53830687 . T C 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.250;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:668,0,200 +chr17 53851710 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=-0.046;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:360,0,973 +chr17 53893194 . C G 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.259;DP=79;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:1103,0,1582 +chr17 53893950 . T C 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 +chr17 53905533 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:267,0,63 +chr17 53905765 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,163 +chr17 53907075 . G A 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.016;DP=76;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1254,0,1343 +chr17 53908163 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-1.622;DP=36;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=10.49;ReadPosRankSum=2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:406,0,433 +chr17 53909725 . T C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.044;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:887,0,1024 +chr17 53922126 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.197;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:442,0,1462 +chr17 53922209 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.960;DP=43;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:794,0,740 +chr17 53927709 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.768;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1131,0,1147 +chr17 53928676 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.849;DP=62;FS=5.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:868,0,1166 +chr17 53929619 . A G 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-3.940;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=27.44;ReadPosRankSum=-3.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:632,0,922 +chr17 53974381 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-0.648;DP=18;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,217 +chr17 53977085 . C T 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.389;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:771,0,703 +chr18 9212 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.324;DP=97;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:99:385,0,2905 +chr18 15227 . AGTCAGTGACACACACACACACACACAGACGCATGTGTATGTGAGCACAGCTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGCAG A 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.207;ClippingRankSum=0.210;DP=70;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1264,0,5370 +chr18 15228 . GTCAGTGACACACACACACACACACAGACGCATGTGTATGTGAGCACAGCTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGCAGA G 976.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-2.186;DP=70;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:1014,0,5198 +chr18 16397 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.127;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=12.87;ReadPosRankSum=-2.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:453,0,701 +chr18 75089 . TA T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.404;DP=50;FS=9.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:347,0,706 +chr18 78019 . C A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.438;DP=105;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:821,0,2623 +chr18 115380 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-0.668;DP=61;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:247,0,1604 +chr18 117335 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.304;DP=100;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:391,0,2941 +chr18 119415 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=1.219;DP=88;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=5.65;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:525,0,2484 +chr18 129217 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.333;DP=57;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:282,0,1673 +chr18 134164 . AGTAACACGCTTTACACTACTACTGCAGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTCTGACTGTGGTGTTTCCTCAG A 2329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=1.715;DP=73;FS=1.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=31.91;ReadPosRankSum=-2.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,63:68:35:2367,0,35 +chr18 137858 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.377;DP=55;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:281,0,2832 +chr18 151108 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-0.038;DP=61;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:551,0,1530 +chr18 161139 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=1.813;DP=110;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:466,0,3133 +chr18 165020 . AGTGGTGGTGTGTGTGTGGTT A 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=4.368;DP=133;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=4.55;ReadPosRankSum=-3.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,25:133:99:643,0,15198 +chr18 165042 . CAGATGGAGCCAGT C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=3.874;DP=189;FS=9.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=1.09;ReadPosRankSum=-2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,23:139:99:243,0,17430 +chr18 167751 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=2.766;DP=115;FS=8.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,28:115:99:637,0,3225 +chr18 231046 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.939;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,285 +chr18 231106 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.099;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:388,0,341 +chr18 234820 . G T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.372;DP=39;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:340,0,1212 +chr18 266032 . T C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.379;DP=412;FS=5.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:339,73:412:99:842,0,17611 +chr18 266038 . G A 2628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-1.697;DP=404;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,113:403:99:2657,0,13754 +chr18 300916 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.765;DP=72;FS=5.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:323,0,2029 +chr18 320829 . G T 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.609;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.015;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:636,0,698 +chr18 329474 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-0.902;DP=42;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:648,0,790 +chr18 329523 . C T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.553;DP=95;FS=3.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:1258,0,1940 +chr18 346684 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.602;DP=94;FS=3.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:588,0,2456 +chr18 444411 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=-0.394;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:610,0,815 +chr18 449557 . T G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-2.976;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=21.84;ReadPosRankSum=-4.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:727,0,379 +chr18 683342 . A C 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:66:982,66,0 +chr18 683344 . A C 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:66:982,66,0 +chr18 683468 . A G 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:66:982,66,0 +chr18 749229 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=1.922;DP=118;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:463,0,2266 +chr18 1569005 . T G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.626;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:512,0,132 +chr18 1570952 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,313 +chr18 1677146 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.869;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:390,0,730 +chr18 1677155 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.531;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:390,0,730 +chr18 1677538 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,543 +chr18 1680667 . AT A 651.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.822;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=34.31;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:689,17,0 +chr18 1680760 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-4.438;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=11.09;ReadPosRankSum=3.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:372,0,1215 +chr18 1680773 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-4.028;DP=30;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=7.56;ReadPosRankSum=2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:255,0,827 +chr18 1684641 . C A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.168;DP=79;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:426,0,2390 +chr18 2376193 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.119;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:348,0,403 +chr18 2379329 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:260,0,384 +chr18 2449334 . G GA 656.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.207;DP=316;FS=7.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,70:265:99:694,0,4499 +chr18 2482981 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.712;DP=172;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,33:172:99:552,0,5393 +chr18 2485256 . AGTAAGACTCCGATCACATGACAAAACAATTAAAAGCCTTTTATCCTATCAGCTGTTGACTTCTCTGATTTCTCTACAG A 8123.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.916;DP=201;FS=1.667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=25.33;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,195:200:99:8161,588,0 +chr18 2549534 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-1.022;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:362,0,464 +chr18 2688907 . AT A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=-0.173;DP=48;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:248,0,732 +chr18 2715631 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:258,0,343 +chr18 4296331 . A T 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.187;DP=235;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,61:235:99:1495,0,6723 +chr18 4471891 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:394,0,268 +chr18 4474175 . AT A 227.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr18 4474178 . A C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr18 4488794 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.764;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:513,0,508 +chr18 4495769 . GTAACCATGTTCAGACACTTAAAGCAGAGTTTGATATGCATTTTTATTGCAGACTTTATTTGGGGAAGGAAAAATTGATAAAA G 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=6.103;DP=65;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:781,0,5153 +chr18 4508268 . AACCTGAAATGCAGACAATGTTGAAAACTAAAACAAATATTAACTAAAATCTGAATTAATTACTTAATTCATCTGCAGT A 1475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=-1.688;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,43:72:99:1513,0,1005 +chr18 4508271 . CTGAAATG C 958.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=1.561;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:996,0,1561 +chr18 4508279 . CAGACAATGTTGAAAACTAAAACAAATATTAACTAAAATCTGAATTAATTACTTAATTCATCTGCAGTACCT C 958.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.641;DP=74;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:996,0,1569 +chr18 4611101 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,100 +chr18 4647007 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=-0.674;DP=47;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:762,0,843 +chr18 4647079 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-2.561;DP=39;FS=3.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:274,0,971 +chr18 4659826 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=2.489;DP=22;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:246,0,360 +chr18 4660329 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.746;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:315,0,415 +chr18 4664325 . G C 1607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.578;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.390;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,61:187:99:1636,0,4791 +chr18 4664434 . ATG A 1576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-2.325;DP=343;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,7:254:99:1614,0,12513 +chr18 4664447 . T A 2915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-1.169;DP=337;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,111:336:99:2944,0,18465 +chr18 4668001 . C T 1762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.032;DP=384;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,88:383:99:1791,0,14733 +chr18 4668004 . T C 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.125;DP=386;FS=1.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:299,86:385:99:1662,0,14482 +chr18 4673320 . C T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-3.075;DP=283;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=2.94;ReadPosRankSum=2.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,54:283:99:861,0,8683 +chr18 4718873 . G T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.317;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:447,0,217 +chr18 4731872 . CGGTGAGAGAAGACACACACTACACACGTCAGTCACAATCTGTCACTCTCTGCTTCCTGCATTTACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTA C 2703.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.766;DP=381;FS=2.028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,369:374:99:2741,926,0 +chr18 4759562 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=-1.702;DP=52;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:376,0,1430 +chr18 4773119 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.398;DP=27;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1099 +chr18 4773145 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.188;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:384,0,857 +chr18 4773295 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.992;DP=33;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:375,0,731 +chr18 4773306 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-1.286;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:485,0,529 +chr18 4773727 . T C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-0.653;DP=51;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:515,0,1782 +chr18 4773852 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.637;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:385,0,1496 +chr18 4790436 . C A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=1.309;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:489,0,476 +chr18 4920632 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=1.632;DP=64;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:249,0,3334 +chr18 4921317 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.669;DP=66;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:422,0,1715 +chr18 4949110 . C T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-3.408;DP=539;FS=29.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:456,83:539:99:726,0,16961 +chr18 5018398 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=23.86;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:243,0,59 +chr18 5020445 . C A 1099.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.201;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:50:1128,50,0 +chr18 5036498 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,293 +chr18 5052926 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.476;DP=75;FS=14.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:237,0,2321 +chr18 5056573 . T C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=-1.153;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=26.93;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:863,0,250 +chr18 5171013 . GT G 2449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.044;DP=142;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,90:118:99:2487,0,331 +chr18 5172969 . G A 3454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-3.465;DP=188;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=18.38;ReadPosRankSum=3.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,109:188:99:3483,0,2682 +chr18 5173066 . TCTATAATAACAAATAAATATGCATAAATATGTTTTTAAAAAGCATGGATTATAAAAAAATGTGAAGATTAAGTAAACTCATTTAAAAACAAAAAGTAGCCACATAC T 6467.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.861;DP=147;FS=6.231;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=34.57;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,145:147:99:6505,634,0 +chr18 5196418 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.618;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=2.95;ReadPosRankSum=2.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:329,0,5105 +chr18 5231207 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 +chr18 5231245 . A AT 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.409;DP=50;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:696,0,649 +chr18 5231651 . A G 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.340;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1295,0,685 +chr18 5234624 . A C 1603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.743;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=31.84;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1632,120,0 +chr18 5234645 . T C 2462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2491,181,0 +chr18 5584808 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-1.661;DP=26;FS=13.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:494,0,352 +chr18 5587265 . TAA T 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.546;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,112 +chr18 5594830 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:248,0,242 +chr18 5619040 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,340 +chr18 5623600 . C T 3406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-2.446;DP=124;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=27.47;ReadPosRankSum=3.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,89:123:99:3435,0,815 +chr18 5636064 . A G 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.623;DP=227;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,56:226:99:1270,0,7075 +chr18 5777275 . T A 201.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.84;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:230,0,15 +chr18 5788565 . AACACACACACACACACACACACACACAT A 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-1.694;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=7.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:99:556,0,3462 +chr18 5825456 . A G 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=1.652;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:831,0,1416 +chr18 5916402 . C G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.553;DP=26;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:356,0,1154 +chr18 5948645 . G C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=-1.358;DP=430;FS=0.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:363,66:429:99:657,0,14287 +chr18 5986622 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.027;DP=15;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,235 +chr18 6003624 . G C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.418;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:304,0,776 +chr18 6003791 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.200;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:453,0,544 +chr18 6005974 . G C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.175;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:317,0,613 +chr18 6037666 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.282;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.974;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:276,0,954 +chr18 6141202 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-0.045;DP=52;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:244,0,1536 +chr18 6208682 . GA G 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-0.486;DP=60;FS=8.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:396,0,3379 +chr18 6213303 . G A 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-0.484;DP=92;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,36:92:99:1281,0,1873 +chr18 6213339 . C T 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.198;DP=93;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:1401,0,1736 +chr18 6217975 . TCCTGCAACACAAACAACTCAGTGTGAAGGCAGCCGGTCACATCACATCTGATTAAAGCACATCTCTGCTGA T 5065.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=1.134;DP=149;FS=2.253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=34.00;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,140:143:99:5103,405,0 +chr18 6366566 . G A 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:732,57,0 +chr18 6370842 . A C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=2.646;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=12.49;ReadPosRankSum=-3.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:403,0,578 +chr18 6370912 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.691;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:336,0,1577 +chr18 6371012 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.050;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:407,0,1575 +chr18 6371028 . A ACT 900.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-1.150;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:938,0,292 +chr18 6371084 . CT C 869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-1.674;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=25.58;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:62:907,62,0 +chr18 6371136 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.276;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:448,0,477 +chr18 6371191 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-2.647;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:77:388,0,77 +chr18 6371276 . T C 1918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1947,141,0 +chr18 6371463 . A G 1558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=1.510;DP=89;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:1587,0,2951 +chr18 6371472 . T C 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-2.651;DP=83;FS=2.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=15.80;ReadPosRankSum=2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1340,0,3397 +chr18 6371626 . G T 1758.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1787,129,0 +chr18 6411147 . A G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +chr18 6415161 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=23.38;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,170 +chr18 6417495 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-2.534;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.298;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:326,0,205 +chr18 6455525 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,104 +chr18 6457922 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.127;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:242,0,423 +chr18 6459124 . G A 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:356,24,0 +chr18 6459133 . C T 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:356,24,0 +chr18 6461802 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:339,0,288 +chr18 6462695 . T C 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:668,45,0 +chr18 6462704 . T G 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:668,45,0 +chr18 6620022 . G A 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:645,48,0 +chr18 6707427 . C T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 +chr18 6712407 . T A 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.873;DP=99;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:74:1202,0,74 +chr18 6712445 . A G 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.181;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:85:1201,0,85 +chr18 6723146 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr18 6890884 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.617;DP=39;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:231,0,1167 +chr18 6941933 . T C 1485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.094;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1514,0,1608 +chr18 6942087 . T C 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.962;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=31.70;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1740,0,646 +chr18 7030878 . T TTTTTTAAAGAGG 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=417;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,27:27:50:699,0,50 +chr18 7103344 . AGTATGCTTCATGTGTTGCTAAACTGTTCATTTCTATCATTGGTAAGGTTATGTTTTGTTGAATACATTCTTTGATCATTTATTTGCAG A 1463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=2.457;DP=41;FS=5.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,36:40:99:1501,0,411 +chr18 7705618 . CAGGTGCTGAGAGATACATTCTGCATGCAGCTAAAATAAATTCTGTGGTTATGAATGCAGGACGTTGTGTTTGTATGCTTTCCCATCACTCAA C 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.908;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=23.03;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:590,0,3266 +chr18 7708691 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.119;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:344,0,738 +chr18 7709549 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.837;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:364,0,462 +chr18 7709847 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.566;DP=35;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:275,0,968 +chr18 7709884 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.032;DP=38;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:313,0,1218 +chr18 7714706 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-1.720;DP=48;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:294,0,1324 +chr18 7718868 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.797;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:291,0,608 +chr18 7719898 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=-1.005;DP=37;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:499,0,803 +chr18 7728986 . G T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.421;DP=40;FS=6.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:645,0,746 +chr18 7802785 . A T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-1.050;DP=58;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:781,0,1445 +chr18 7831998 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=1.244;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=13.23;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:306,0,407 +chr18 7960085 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.731;DP=76;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:304,0,2349 +chr18 7962459 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=-0.366;DP=95;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:519,0,2754 +chr18 7963519 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.601;DP=104;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:421,0,3200 +chr18 7976226 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.354;DP=109;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=7.71;ReadPosRankSum=-2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:869,0,2760 +chr18 9014448 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-1.699;DP=33;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:566,0,526 +chr18 9758911 . GCTGCGTTAAACACAGAGAGGGAAAGAGAGGGAGAGATGGGGGGGAGAAAAAGATGAGTGGAGAAGGGAAAAAGCTGACCTACAGAATAAATATGTTCAAATAGAAGGCACTTAC G 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=1.552;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=34.48;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:520,0,583 +chr18 10138606 . G GC 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.985;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:428,0,818 +chr18 10138607 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.919;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:428,0,818 +chr18 10151812 . ACTGAAATAAACATAAGAGTCAGCACAAAGATTCAGTTTACTAGTAATGATAAAAATTTAGATAAAAAGGAGGATTGTATAAC A 2630.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.188;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=28.91;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:2668,251,0 +chr18 11317532 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.659;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:510,0,419 +chr18 11358695 . AT A 279.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.134;DP=15;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:11:316,11,0 +chr18 11361524 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.320;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:234,0,671 +chr18 11362997 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:339,0,381 +chr18 11562822 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,145 +chr18 11587716 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=1.945;DP=15;FS=13.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=20.65;ReadPosRankSum=-2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:338,0,390 +chr18 11673403 . A G 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=1.288;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:888,0,1476 +chr18 11702983 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=1.047;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:256,0,2514 +chr18 11725786 . GC G 1268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.381;DP=182;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,64:162:99:1509,0,2018 +chr18 11905497 . GT G 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.253;DP=90;FS=3.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:425,0,1464 +chr18 11906466 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.225;DP=45;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:524,0,1152 +chr18 11908501 . C CT 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-1.444;DP=52;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:240,0,1421 +chr18 11908717 . CTT C 644.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=-0.436;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:783,0,753 +chr18 11909431 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.331;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:311,0,1253 +chr18 12312955 . G T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=13.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:393,0,300 +chr18 12313649 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:403,0,701 +chr18 12313979 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.088;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:363,0,574 +chr18 12320201 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.617;DP=35;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:504,0,650 +chr18 12365682 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.980;DP=27;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,685 +chr18 12516210 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=1.399;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:273,0,468 +chr18 12536631 . T A 206.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:235,0,25 +chr18 12537489 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=2.176;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,258 +chr18 12553348 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.819;DP=29;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:423,0,591 +chr18 12602336 . T C 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.495;DP=46;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:758,0,723 +chr18 12602663 . C T 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.537;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:845,0,843 +chr18 12692810 . C T 1791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=-2.341;DP=245;FS=3.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,73:245:99:1820,0,6609 +chr18 12714673 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.912;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:358,0,311 +chr18 12735222 . GAGGTACACACACTTACAGATAGTGTACCCTTAATCTGTAAAACAAATCATGTACTGGTTTCTTTTTCTCTTCTGT G 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=30.88;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:377,0,1149 +chr18 12802083 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-1.149;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:936,0,2851 +chr18 12803213 . A C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-0.942;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,30:132:99:609,0,4002 +chr18 12827675 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.047;DP=124;FS=2.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,36:124:99:906,0,3472 +chr18 12833084 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-1.251;DP=166;FS=6.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,48:163:99:978,0,7536 +chr18 13431237 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.704;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:255,0,565 +chr18 13930067 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=1.905;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,259 +chr18 14181668 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:329,0,495 +chr18 14196659 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-1.258;DP=50;FS=8.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:432,0,1234 +chr18 14258063 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.109;DP=60;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:425,0,2061 +chr18 14272542 . GAAGGTATGTGGTAAAACTGGTGTTAGGTTTACATAACAGCATCTCGTTTGTTGTTTTCACAGTCTTGACATAAACTTCTCTCTCCC G 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:310,0,953 +chr18 14277692 . G C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.126;DP=27;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:327,0,628 +chr18 14288405 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.201;DP=97;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:99:731,0,2549 +chr18 14291648 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-1.522;DP=34;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:252,0,980 +chr18 14317832 . C CTG 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.107;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:285,0,454 +chr18 14318139 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.557;DP=39;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:558,0,777 +chr18 14319735 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=3.232;DP=37;FS=8.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:274,0,1059 +chr18 14319910 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:277,0,668 +chr18 14357206 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.589;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.263;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:475,0,3929 +chr18 14358958 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.968;DP=152;FS=8.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:499,0,5013 +chr18 14359120 . C T 3815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-1.929;DP=110;FS=3.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=34.69;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,91:110:99:3844,0,162 +chr18 14364438 . T A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=2.326;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,31:113:99:745,0,3001 +chr18 14378187 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.073;ClippingRankSum=0.055;DP=104;FS=3.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,23:104:99:398,0,3196 +chr18 14422640 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.585;DP=111;FS=1.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:506,0,3227 +chr18 14431754 . C T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-0.987;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:927,0,1737 +chr18 14431769 . G T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.130;DP=71;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1124,0,1367 +chr18 14436547 . T C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-0.421;DP=95;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:1053,0,2069 +chr18 14436747 . C T 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.174;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,47:130:99:1579,0,2788 +chr18 14442429 . ACTGCAAACACAAAAAGATTTATGATGATATATTTGCATGAGTGCATTACTGAAGACTATTATTAATACTCAC A 4548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.644;DP=111;FS=2.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=31.28;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,101:105:99:4586,338,0 +chr18 14464544 . G C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.372;DP=52;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:324,0,1272 +chr18 14469803 . C A 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 +chr18 14470432 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-2.431;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:363,0,329 +chr18 14482899 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=1.281;DP=109;FS=4.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:421,0,2603 +chr18 14715198 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:385,0,643 +chr18 14722597 . AAGGTGAGACTCCTGATTCATCGTTTGTGACATTTATAGGTATTAACAAACACTGTACTTCATTTTATATCGTGACCATATTATTT A 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.898;DP=11;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:314,0,513 +chr18 14918285 . CA C 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.218;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:660,0,905 +chr18 14926295 . C T 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 +chr18 15055350 . A G 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.709;DP=50;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:909,0,904 +chr18 15160712 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=-1.769;DP=50;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:321,0,1401 +chr18 15162421 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-1.964;DP=46;FS=5.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:302,0,2745 +chr18 15162427 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-2.163;DP=46;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:302,0,2745 +chr18 15163070 . C T 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2255,160,0 +chr18 15163097 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=1.470;DP=59;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=5.08;ReadPosRankSum=-3.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:328,0,1748 +chr18 15163112 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=4.368;DP=59;FS=6.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:314,0,1646 +chr18 15169222 . G A 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=-0.990;DP=74;FS=7.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1279,0,1221 +chr18 15169814 . A G 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.182;DP=58;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:909,0,1121 +chr18 15169815 . C T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=-0.023;DP=60;FS=3.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:799,0,2500 +chr18 15185266 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.600;DP=111;FS=8.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1849,0,1996 +chr18 15191852 . C A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=1.119;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=17.98;ReadPosRankSum=3.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1125,0,1896 +chr18 15191853 . G A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=1.450;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1125,0,1880 +chr18 15193964 . C T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-2.193;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:656,0,4523 +chr18 15193970 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=-1.769;DP=80;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:659,0,4523 +chr18 15203445 . C T 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=4.370;DP=58;FS=9.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=17.96;ReadPosRankSum=-2.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1070,0,949 +chr18 15203457 . T G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=2.890;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:380,0,1135 +chr18 15246814 . T C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=34.41;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:60:855,60,0 +chr18 15246912 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.495;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:262,0,722 +chr18 15246952 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.746;DP=38;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:265,0,1075 +chr18 15248214 . T A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.634;DP=36;FS=6.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:597,0,641 +chr18 15471412 . CT C 1822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-1.185;DP=212;FS=0.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=8.60;ReadPosRankSum=-2.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,79:195:99:1860,0,2632 +chr18 15471967 . CG C 2887.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.801;DP=268;FS=7.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,128:246:99:2925,0,3128 +chr18 15515742 . G A 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=-0.917;DP=98;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=14.07;ReadPosRankSum=2.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1407,0,3814 +chr18 15563954 . A G 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,532 +chr18 15564175 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.589;DP=23;FS=14.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,397 +chr18 15564286 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:289,0,290 +chr18 15767766 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.070;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.608;QD=23.81;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:552,0,198 +chr18 15768200 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,289 +chr18 15768442 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-1.557;DP=25;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:295,0,543 +chr18 15769238 . A AT 507.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=1.585;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:545,0,1047 +chr18 15770086 . A T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:394,0,211 +chr18 15805129 . T A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-1.747;DP=260;FS=8.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=3.30;ReadPosRankSum=-2.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,52:260:99:886,0,8585 +chr18 15808344 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.425;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,1105 +chr18 15827177 . G C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=1.015;DP=35;FS=9.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:229,0,959 +chr18 15829855 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:406,0,344 +chr18 15838334 . G T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.201;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:731,0,2313 +chr18 15838335 . T G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.399;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:731,0,2314 +chr18 16381515 . G A 3429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.134;DP=516;FS=7.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:368,148:516:99:3458,0,13722 +chr18 16381862 . TGCAGGTAACTTCCTTTTGCGAATTAATTTTTTTTTTCTCAATCAAAAGGTTTGTCGAGCTTTTCACTGTTAATTATATGTGCTTTTGTAA T 9187.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=2.644;DP=354;FS=2.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=25.95;ReadPosRankSum=-11.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,233:316:99:9439,0,3450 +chr18 16381864 . CAGGTAACTTCCTTTTGCGAATTAATTTTTTTTTTCTCAATCAAAAGGTTTGTCGAGCTTTTCACTGTTAATTATATGTGCTTTTGTA C 1690.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-2.573;DP=344;FS=4.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.133;QD=4.91;ReadPosRankSum=11.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,77:315:99:1728,0,13328 +chr18 16382703 . C T 4250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-1.970;DP=335;FS=8.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,124:335:99:4279,0,7359 +chr18 16384314 . T C 2516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.519;ClippingRankSum=-0.012;DP=308;FS=4.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,97:308:99:2545,0,7530 +chr18 16384358 . TC T 6252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.340;ClippingRankSum=-2.489;DP=282;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=22.17;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,10:271:99:6290,0,8166 +chr18 16459502 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:287,0,450 +chr18 16553703 . C A 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.620;DP=95;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:1404,0,1796 +chr18 16578546 . G A 1334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.198;DP=108;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,39:108:99:1363,0,2493 +chr18 16637921 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.637;DP=13;FS=26.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,311 +chr18 16637924 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-2.637;DP=13;FS=26.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,311 +chr18 16757730 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.894;DP=128;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.228;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,23:128:99:357,0,4020 +chr18 16790174 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.068;DP=204;FS=2.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,50:203:99:944,0,5313 +chr18 16798614 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=1.724;DP=86;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.10;ReadPosRankSum=-2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:295,0,2675 +chr18 17067856 . G T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.095;ClippingRankSum=3.933;DP=372;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=2.95;ReadPosRankSum=3.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,73:371:99:1127,0,13488 +chr18 17067868 . TCTGTACAAACCACATATAAATGATCAGTGTAACAAACAACAATATTGTTTCCAGCATCTGATGCAGCACTTAC T 15706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.808;DP=356;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=27.36;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,348:352:99:15744,1160,0 +chr18 17068013 . TCCTGTGTGCGATAAAGAGTCAGCAACCAAATCACCACTTCAGCACCATTTACACTTCATTTGCAGTTTCAACCCAATGAAACCTTAATGGCAGTTTAAAATTCTTAGATCTGCATA T 12813.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=1.674;DP=365;FS=1.035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=31.41;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,322:336:99:12851,974,0 +chr18 17070246 . T C 14441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=375;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,351:351:99:14470,1056,0 +chr18 17166286 . AC A 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.540;DP=60;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:312,0,990 +chr18 17263620 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-1.415;DP=72;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:331,0,2045 +chr18 17276024 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.820;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=7.67;ReadPosRankSum=3.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:473,0,1495 +chr18 17426065 . TA T 279.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:7:316,7,0 +chr18 17430333 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-2.968;DP=197;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=1.02;ReadPosRankSum=2.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,29:196:99:230,0,6268 +chr18 18129449 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.909;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,36:118:99:931,0,3056 +chr18 18160433 . T C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=-1.326;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=28.71;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:832,0,176 +chr18 18437922 . C T 1692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.524;DP=506;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=3.35;ReadPosRankSum=2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:404,101:505:99:1721,0,15335 +chr18 18439887 . T A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-1.937;DP=242;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,40:242:99:527,0,7905 +chr18 18474614 . A C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 +chr18 18497962 . A C 424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:453,33,0 +chr18 18600791 . A G 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.175;DP=32;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=30.46;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1003,0,130 +chr18 18613003 . A C 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr18 18613133 . AG A 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:338,0,303 +chr18 18613242 . G A 1224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1253,87,0 +chr18 18613243 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:362,0,604 +chr18 18613697 . T G 2731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2760,199,0 +chr18 18648310 . TGGTGAGACTCTTTGACTATTCATGAAGGAGGGAACATTTCTATAACAAGATTTATTCATCAAATCAGGTTTATAATCCCTTTTCTCTCTTGTA T 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.891;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=27.39;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:722,0,450 +chr18 18651066 . G GT 347.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.522;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=18.28;ReadPosRankSum=-2.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:9:384,0,9 +chr18 18652057 . A C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:322,0,159 +chr18 18681711 . T TA 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.666;DP=42;FS=15.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:397,0,584 +chr18 18682636 . CTT C 1346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.124;DP=75;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1384,0,1469 +chr18 18767078 . CCGAGGTAACGACATCATCATTTAATCAACATTATAGGAATT C 3112.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.017;DP=111;FS=4.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,82:108:99:3150,0,3050 +chr18 18767080 . GAGGTAACGACATCATCATTTAATCAACATTATAGGAATTTGCGAATATAAAATATTTGGCTGCTCAATGATGTGTTTGGTGAAAAAGCAGAAGTGCAGTTAGTTTGTGTTATCTATGGCCTGTCAGCTTCTTTAATGTGTCTTTATCAACATAAAAATGTCCAC G 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=1.250;DP=113;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,26:111:99:457,0,5686 +chr18 18767121 . GCGAATATAAAATATTTGGCTGCTCAATGATGTGTTTGGTGAAAAAGCAGAAGTGCAGTTAGTTTGTGTTATCTATGGCCTGTCAGCTTCTTTAATGTGTCTTTATCAACATAAAAATGTCCAC G 3112.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.131;DP=106;FS=5.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=29.37;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,78:104:99:3150,0,2410 +chr18 18770302 . CAGGTACATCTTTTTTCGCCTGGTGCTTTAATGACAGATTAAATTCACTTCATTAAACTAAATATAGTAAATATTGAATGTTTTCTTTTTAA C 3245.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.936;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3283,299,0 +chr18 18809687 . T G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 +chr18 18809776 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr18 18813713 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.992;DP=31;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:240,0,473 +chr18 18813865 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.626;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:454,0,455 +chr18 18813882 . T C 754.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:54:783,54,0 +chr18 18880157 . T TA 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr18 19200087 . C CT 719.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-1.009;DP=60;FS=2.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,41:57:99:934,0,318 +chr18 19227662 . CGGTCAGTATTTCCTTCTCAAATGGCTGTCATGTGGACTGTTTACAGAAATAAGGCTAATGGGCATTGCTTAATGTGTCTGGATCTGTTTTGTCTTCATTCATGCA C 3474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=2.044;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,89:92:99:3512,309,0 +chr18 19598230 . TCTGAAAGACAAATAAAAGGTGAATTGAAGGACACAAATAGTTAAATCGCAAACTGATTAACATGGCAATCACTCAC T 3173.72 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.477;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=30.68;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3211,268,0 +chr18 19808493 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-1.591;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:322,0,199 +chr18 20029383 . TGTGAGTGATGTTAACTTACATTAAAGATTTTGTAGCAAAATGCTCTGAATGCTAACTAGCTGACTTTCCATGTTTTCAG T 840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.988;DP=162;FS=1.783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=5.19;ReadPosRankSum=-2.969 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,157:162:99:878,331,0 +chr18 20249014 . AAGGTAACGTTGTGCATGATTGTAGTCGAACGGGTCATTATCTATATTTTGTTCTCACGAGTAATGCAATTGCTATATGACATGTCTTTGTTGACCCTTTCCAATC A 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:417,0,796 +chr18 20270679 . A G 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:24:335,24,0 +chr18 20314376 . AAGGTATACTTACTATAGAATGAGGTGGTAAGTCTGTTTATTTGGGTATGATTACATTTGTAATTGATTTATTTTCTGAAAC A 2707.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=1.448;DP=62;FS=3.382;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:2745,227,0 +chr18 20314550 . GAGGTATGAAAGTATCTTTGCAAAGTGGGATTTTTAAAAAATATAATTTGTTATATATTTCATAGGATTCTTTTCACAC G 2722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=1.679;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=25.26;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:2760,214,0 +chr18 20364764 . CA C 620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-0.483;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:658,0,199 +chr18 20365051 . C T 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-1.491;DP=26;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=30.34;ReadPosRankSum=2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:817,0,140 +chr18 20365340 . CA C 1188.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.825;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:1226,0,111 +chr18 20896581 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.540;DP=157;FS=1.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,31:157:99:586,0,4922 +chr18 21665358 . T A 3122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-1.392;DP=97;FS=3.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=32.19;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,82:97:99:3151,0,185 +chr18 21692933 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=1.294;DP=62;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:589,0,1643 +chr18 21693877 . T C 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.394;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,33:49:99:1228,0,451 +chr18 21717087 . C T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr18 21717139 . C A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr18 21717212 . T G 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr18 21717242 . G T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr18 21718446 . T C 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 +chr18 21803104 . TA T 727.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:76:765,76,0 +chr18 21955324 . G C 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 +chr18 22073944 . CTT C,CT 527.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-1.348;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,19,7:27:99:875,182,150,559,0,489 +chr18 22172942 . A G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.320;DP=70;FS=9.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.294;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:554,0,1813 +chr18 22187653 . T TA 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.214;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:251,0,116 +chr18 22199066 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:99:262,0,322 +chr18 22432467 . A T 943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:972,69,0 +chr18 22432482 . A C 2475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2504,178,0 +chr18 22433160 . C CT 926.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=1.054;DP=312;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,58:195:99:964,0,3733 +chr18 22433225 . TCA T 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:28:297,28,0 +chr18 22433228 . TG T 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:28:297,28,0 +chr18 22433559 . A C 585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:614,42,0 +chr18 22433582 . A G 1061.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1090,75,0 +chr18 22433651 . A T 1161.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.619;DP=45;FS=6.690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1190,81,0 +chr18 22434601 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr18 22434974 . T TCA 519.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 +chr18 22435593 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=3.363;DP=46;FS=58.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=16.52;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:788,0,956 +chr18 22435603 . A G 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=5.094;DP=67;FS=56.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=25.77;ReadPosRankSum=-4.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:1755,0,239 +chr18 22435746 . CA C 5726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=1.201;DP=245;FS=4.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,183:203:99:5764,0,117 +chr18 22435903 . G T 1979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2008,141,0 +chr18 22437308 . A G 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=-1.267;DP=140;FS=4.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:983,0,5043 +chr18 22437477 . T C 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=3.638;DP=141;FS=62.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=7.84;ReadPosRankSum=-2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,30:134:99:1134,0,4073 +chr18 22437488 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.424;DP=166;FS=28.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=1.64;ReadPosRankSum=3.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,24:158:99:300,0,6125 +chr18 22437593 . C G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=4.036;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.92;ReadPosRankSum=-4.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:402,0,1617 +chr18 22437766 . C T 1944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=-1.660;DP=140;FS=8.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1973,0,2970 +chr18 22437853 . T A 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=-2.243;DP=110;FS=5.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=13.61;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:1525,0,1941 +chr18 22756558 . C CA 885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.179;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:944,0,507 +chr18 22756702 . C CT 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=1.285;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:893,0,963 +chr18 22756730 . T TA 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=1.395;DP=80;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:968,0,870 +chr18 23653040 . GA G 1920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-1.298;DP=125;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=15.37;ReadPosRankSum=2.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,81:119:99:1958,0,523 +chr18 24523981 . T G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr18 24718843 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=-0.027;DP=123;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,30:123:99:513,0,3407 +chr18 24727513 . TCTGAAAAACAAAGGTGGGATTGAATGTAAAGCTCAGGTGTAATGCTAACTCCTGGATTTGACTGTGTAAATGTGCAC T 4142.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=3.082;DP=111;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,99:111:99:4180,0,1480 +chr18 24730392 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=-0.848;DP=101;FS=8.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,20:101:99:333,0,3165 +chr18 24855374 . T C 609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:638,45,0 +chr18 24855832 . T C 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:350,24,0 +chr18 24855835 . T C 226.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:255,0,16 +chr18 25343914 . G T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=-2.371;DP=38;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=13.15;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:528,0,2102 +chr18 25562125 . C T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:445,30,0 +chr18 25563370 . T A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=3.187;DP=33;FS=10.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:470,0,724 +chr18 25564220 . T C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr18 25880326 . T A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=-2.825;DP=50;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:901,0,851 +chr18 25880920 . T A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-1.084;DP=52;FS=2.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:812,0,1067 +chr18 25881364 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:268,0,200 +chr18 25881497 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=30.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:305,0,56 +chr18 25881576 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-1.908;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=11.28;ReadPosRankSum=-2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:299,0,564 +chr18 25881662 . AT A 733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.016;DP=31;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:771,0,104 +chr18 25883230 . C G 9229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.866;DP=496;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,282:496:99:9258,0,7418 +chr18 26217825 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-1.985;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=16.11;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:431,0,441 +chr18 26222559 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.634;DP=36;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:647,0,601 +chr18 26231961 . A T 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=-0.494;DP=45;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:999,0,509 +chr18 26401052 . C CT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=1.164;DP=18;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:280,0,119 +chr18 26403079 . A G 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.307;DP=70;FS=3.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1089,0,1327 +chr18 26416387 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-0.983;DP=18;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=24.82;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:475,0,350 +chr18 26416390 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.196;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:475,0,350 +chr18 26620259 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:312,0,286 +chr18 26634205 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.341;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:428,0,354 +chr18 26652398 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,225 +chr18 26668438 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.341;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,465 +chr18 26680986 . T A 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 +chr18 26681741 . C A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=1.835;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=27.40;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:357,0,474 +chr18 26696603 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.592;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:320,0,368 +chr18 26743888 . G T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.801;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=16.28;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:484,0,475 +chr18 26756528 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=-0.190;DP=34;FS=4.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:518,0,638 +chr18 26799063 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.011;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:829,0,867 +chr18 26824825 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.491;DP=49;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:794,0,805 +chr18 26863512 . C A 6789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-0.399;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.118;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,193:300:99:6818,0,3417 +chr18 26863794 . T C 3621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.201;DP=208;FS=2.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,113:208:99:3650,0,3296 +chr18 27012765 . TGGTGAGAAATAGCACAAGCTTCTGTCTTCAAGAAGACTCTAGTTTCCAAAATCTCATCTGTTCTTCTCCCTAAAACCA T 2670.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=2.047;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=28.22;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,58:63:99:2708,233,0 +chr18 27017254 . G A 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.305;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:868,0,286 +chr18 27025471 . A T 205.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:14:234,0,14 +chr18 27029815 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,188 +chr18 27030117 . T TAC 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:303,0,54 +chr18 27232845 . G T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.220;DP=31;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:610,0,457 +chr18 27243313 . G A 278.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:307,0,19 +chr18 27254103 . T TA 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.941;DP=31;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:436,0,483 +chr18 27254175 . G T 2408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=-0.340;DP=130;FS=5.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:2437,0,2139 +chr18 27301824 . A G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.693;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:483,0,339 +chr18 27303264 . A T 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:646,45,0 +chr18 27304026 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,389 +chr18 27304795 . G A 659.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.193;DP=18;FS=5.563;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:15:688,15,0 +chr18 27558749 . G T 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.430;DP=142;FS=7.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,52:142:99:1730,0,3146 +chr18 27573476 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.787;DP=29;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:378,0,634 +chr18 27573506 . C CA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.060;DP=32;FS=3.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:308,0,430 +chr18 27573651 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,451 +chr18 27573734 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.528;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:382,0,371 +chr18 27573891 . C A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.012;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:547,0,2226 +chr18 27574186 . CT C 409.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:447,43,0 +chr18 27575040 . T C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=2.558;DP=28;FS=14.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=23.67;ReadPosRankSum=-2.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:691,0,272 +chr18 27942900 . G A 2838.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2867,202,0 +chr18 27945920 . G A 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.803;DP=53;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1093,0,781 +chr18 27948594 . G A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.885;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:748,0,264 +chr18 27949750 . G T 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-1.135;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=22.73;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:892,0,496 +chr18 28090947 . A G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr18 28090996 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr18 28268567 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.848;DP=22;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:600,0,314 +chr18 28923663 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr18 29118834 . G A 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.289;DP=43;FS=4.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:937,0,540 +chr18 29123744 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,908 +chr18 29141148 . C G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.742;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:624,0,537 +chr18 29354319 . CTT C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:285,0,120 +chr18 29845207 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.267;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:317,0,440 +chr18 29847633 . C T 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=1.728;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:687,0,687 +chr18 29904346 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=21.32;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:348,0,719 +chr18 29904861 . C G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:357,0,327 +chr18 29915117 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.216;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:318,0,355 +chr18 29916516 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:349,0,211 +chr18 29916924 . T A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.86;ReadPosRankSum=2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:394,0,198 +chr18 29917340 . A G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:347,0,49 +chr18 29928800 . A T 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=-0.956;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=23.22;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:841,0,789 +chr18 29930281 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.765;DP=24;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=8.74;ReadPosRankSum=2.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:238,0,575 +chr18 29932702 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.725;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:618,0,314 +chr18 29949862 . T C 385.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.61;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:8:413,0,8 +chr18 29951006 . C A 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 +chr18 29955209 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:277,0,409 +chr18 29961865 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=1.743;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:447,0,233 +chr18 29963841 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.217;DP=31;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:547,0,554 +chr18 29970283 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.495;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:640,0,236 +chr18 29978186 . A G 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr18 29979638 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.678;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:249,0,129 +chr18 30102106 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.625;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:299,0,203 +chr18 30314506 . G A 287.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:316,0,19 +chr18 30422595 . A AAC 1298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-1.048;DP=140;FS=9.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1336,0,1550 +chr18 30448035 . TCTGTAAAGATTTGTTAATATGTCAACATCACACAAACAGACTCGGGAAATCATGAAAAACATTTGAAGAAGCCTCAAGTTTAC T 3377.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=1.193;DP=79;FS=2.109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3415,260,0 +chr18 30453914 . TGTGTGTTATATGAGAATTGGAAAAAAAAAACGTTGTTTGAGTTTTTATTTCAATGTGCTAATTTCCGTTGTTTAATTTCAG T 14235.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=1.407;DP=332;FS=2.121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=28.30;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,320:323:99:14273,1108,0 +chr18 30454384 . G GCA 3591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-3.526;DP=386;FS=4.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.456;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,120:331:99:3629,0,6509 +chr18 30795022 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=24.24;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:416,0,165 +chr18 30795244 . C CT 242.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:280,27,0 +chr18 30964268 . G GT 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr18 30980693 . G A 254.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:283,0,21 +chr18 31095342 . GT G 298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:336,33,0 +chr18 31095475 . T TA 214.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:38:315,38,0 +chr18 31854734 . A T 230.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:259,21,0 +chr18 31957900 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-2.051;DP=28;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:316,0,358 +chr18 31979135 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr18 32210316 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.214;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.725;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:243,0,630 +chr18 32384631 . T C 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.780;DP=34;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:729,0,472 +chr18 32384895 . T A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr18 32388570 . G C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.423;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:765,0,744 +chr18 32393314 . G A 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-1.290;DP=57;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=18.80;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,31:57:99:1100,0,952 +chr18 32441147 . C CT 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=1.600;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.66;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:68:687,68,0 +chr18 32802349 . C T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.488;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,75:342:99:1519,0,10461 +chr18 32802414 . A C 19894.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.350;DP=614;FS=2.891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=32.40;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,604:606:99:19923,1778,0 +chr18 32943899 . G T 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=1.040;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=23.92;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1583,0,1971 +chr18 33327657 . C CAT 225.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr18 33486995 . T A 269.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:298,0,17 +chr18 33539968 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:258,0,296 +chr18 33540929 . T A 1228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1257,90,0 +chr18 33542888 . G A 579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:608,45,0 +chr18 33542904 . A G 466.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:1:492,0,1 +chr18 33582133 . A T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=-0.223;DP=41;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:659,0,617 +chr18 33596010 . G GT 419.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:457,45,0 +chr18 33596903 . A T 634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:663,45,0 +chr18 33749701 . T C 6047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.976;ClippingRankSum=1.613;DP=356;FS=8.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,189:356:99:6076,0,5358 +chr18 33775344 . CA C 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-1.194;DP=66;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:751,0,802 +chr18 33775465 . T TA 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.450;DP=49;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:706,0,529 +chr18 33776036 . A G 2551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=1.033;DP=124;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,76:123:99:2580,0,1536 +chr18 33787911 . TCCTACAGACAGACAAACAATTGAAATATTCAGACTCAAGTTCTGCTCCTCAATTATGCGATGAAGTGAGAACAAGTTTTCA T 4609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:4647,376,0 +chr18 33834337 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:281,0,210 +chr18 33834612 . TA T 1981.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.650;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.65;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:2019,175,0 +chr18 33835419 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.402;DP=84;FS=2.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=2.43;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,14:84:99:232,0,5820 +chr18 33841234 . GACCTGCACACAATGCATACATGTAATTATGACAGACATTCTGAGAAAAAAACCCTGCCATGAAACAAACGTTTTCCTC G 8431.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.946;DP=193;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,181:183:99:8469,733,0 +chr18 33864560 . G A 2524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.090;DP=140;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:2553,0,2479 +chr18 33885818 . A T 206.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:235,0,19 +chr18 33888941 . G A 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.357;DP=83;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,49:83:99:1588,0,1201 +chr18 33981856 . T A 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.654;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1255,0,1258 +chr18 33987223 . G A 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=-1.161;DP=92;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:1334,0,1842 +chr18 34147799 . GT G 2036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-1.064;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,55:142:99:2074,0,2190 +chr18 34179494 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.282;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.352;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:589,0,372 +chr18 34234346 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-1.555;DP=115;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=9.02;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,38:115:99:1066,0,2821 +chr18 34420452 . G T 3731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.432;DP=201;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,118:201:99:3760,0,2663 +chr18 34420845 . A C 1960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=1.097;DP=116;FS=4.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1989,0,2051 +chr18 34421184 . CA C 1682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-1.722;DP=75;FS=1.538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=22.44;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,66:74:71:1730,71,0 +chr18 34424624 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr18 34436482 . C A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.474;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:73:577,0,73 +chr18 34438950 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.168;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=31.88;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:77:634,0,77 +chr18 34987474 . GT G 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.999;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:388,0,386 +chr18 35144203 . GT G,GTT 226.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,5:12:99:307,139,156,199,0,236 +chr18 35207238 . A C 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 +chr18 35285697 . T A 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr18 35541812 . C CAG 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=3.070;DP=20;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=11.34;ReadPosRankSum=-2.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:264,0,365 +chr18 35624248 . TA T 3850.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3888,346,0 +chr18 35624944 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.596;DP=120;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=3.81;ReadPosRankSum=2.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:485,0,3710 +chr18 36636825 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=-2.273;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.597;QD=11.32;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:594,0,1132 +chr18 36665733 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.069;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:866,0,1217 +chr18 37192969 . C T 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.153;DP=137;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,34:136:99:733,0,3693 +chr18 37198941 . CA C 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=-2.236;DP=81;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:406,0,1167 +chr18 37201001 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-2.533;DP=69;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.72;ReadPosRankSum=2.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:492,0,1727 +chr18 37202058 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=1.570;DP=46;FS=6.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:417,0,1123 +chr18 37202093 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=-0.712;DP=48;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:431,0,1276 +chr18 37202418 . C CT 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=-0.644;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:647,0,2517 +chr18 37202629 . T A 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-1.049;DP=59;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:350,0,1769 +chr18 37202638 . C CT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-1.124;DP=58;FS=4.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:265,0,979 +chr18 37212200 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.422;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.618;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:884,0,1572 +chr18 37270725 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.875;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:335,0,1147 +chr18 37271257 . G C 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.811;DP=49;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:629,0,1010 +chr18 37334529 . C CT 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.206;DP=193;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,47:164:99:650,0,3067 +chr18 37483715 . A G 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-1.890;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=22.54;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:772,0,413 +chr18 37483812 . A G 1315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.833;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1344,0,205 +chr18 37483913 . A G 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.206;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:849,0,839 +chr18 37821205 . A T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.811;DP=41;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:460,0,941 +chr18 37822179 . T C 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.181;DP=47;FS=6.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:814,0,786 +chr18 37825182 . GA G 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-1.960;DP=81;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:884,0,920 +chr18 37826414 . AT A 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-0.715;DP=69;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:462,0,859 +chr18 38596676 . T A 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr18 38682926 . A T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.966;DP=46;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=14.67;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:703,0,906 +chr18 38683557 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.043;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:318,0,691 +chr18 38683887 . CT C 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.976;DP=68;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:388,0,751 +chr18 38684521 . G A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.573;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1157,0,3380 +chr18 38684523 . T TA 1225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.235;DP=87;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,35:85:99:1263,0,1160 +chr18 38684621 . T C 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.676;DP=65;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:1185,0,1109 +chr18 39059136 . CA C 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=1.805;DP=42;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:265,0,519 +chr18 39153271 . T A 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.018;DP=219;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,57:219:99:1267,0,5930 +chr18 39176810 . C T 1663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.837;DP=318;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,79:315:99:1692,0,10930 +chr18 39210163 . ACTGGGAAGAGAGAGATAATGACATCAAAACAAACATCACATCAGAATCATACTTGCTCTCAGCACCAAACTCATTTCAACTCAC A 4857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=2.473;DP=113;FS=2.391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=27.04;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,106:109:99:4895,374,0 +chr18 39210346 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.244;DP=29;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:515,0,495 +chr18 39573064 . T A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.223;DP=31;FS=5.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:409,0,680 +chr18 39593540 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=1.134;DP=118;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,30:118:99:681,0,3276 +chr18 39646158 . C T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=1.361;DP=224;FS=0.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=6.66;ReadPosRankSum=-2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,64:224:99:1519,0,6137 +chr18 39650775 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.092;DP=124;FS=4.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:374,0,3862 +chr18 39858798 . C G 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.149;DP=45;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:855,0,696 +chr18 39860647 . TTCAGGTACTGAATCTTTCATCGCCTCTTTCTGTCTTCATTTATTGTCAAGATCTTGTGTTAATATCGGTCTGTTTC T 14138.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=2.435;DP=346;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=33.04;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,344:346:99:14176,1165,0 +chr18 39864680 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=2.221;DP=206;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,52:206:99:1090,0,12855 +chr18 39866118 . G A 4555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-2.085;DP=283;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,151:282:99:4584,0,4367 +chr18 39911979 . T A 1497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=2.860;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:1526,0,2337 +chr18 39912016 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=-0.641;DP=101;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:870,0,2612 +chr18 39920412 . G A 2743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.736;DP=151;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:2772,0,2281 +chr18 39923762 . C T 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=5.895;DP=97;FS=30.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:725,0,2552 +chr18 39924091 . C T 3742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.827;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,106:211:99:3771,0,3771 +chr18 39931409 . C A 2759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=1.069;DP=161;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:2788,0,2697 +chr18 39931573 . G C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.639;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,2:14:99:297,0,478 +chr18 39931930 . C CA 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.142;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:260,0,663 +chr18 39931939 . C G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.261;DP=45;FS=6.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:778,0,824 +chr18 39933295 . T TC 1163.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1207,123,0 +chr18 39933655 . A C 2379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2408,169,0 +chr18 39982616 . G C 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=-2.552;DP=142;FS=8.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,41:139:99:1101,0,6461 +chr18 39982617 . A G 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=-0.700;DP=138;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,31:136:99:645,0,11079 +chr18 39982620 . G A 3971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.039;DP=132;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,101:130:99:4000,0,1954 +chr18 39982656 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.162;DP=41;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=15.36;ReadPosRankSum=-3.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,9:40:99:658,0,11079 +chr18 39982752 . C G 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.365;DP=70;FS=10.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1207,0,1360 +chr18 39982776 . A G 2982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:3011,211,0 +chr18 39983026 . A T 3566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.804;DP=214;FS=1.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,99:214:99:3595,0,3935 +chr18 39983132 . A G 11540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=276;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,276:276:99:11569,831,0 +chr18 39983268 . G A 2939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.699;DP=194;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.462;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,86:194:99:2968,0,3563 +chr18 39983499 . A G 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-1.809;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,43:65:99:1463,0,715 +chr18 39983551 . A T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.192;DP=61;FS=6.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1078,0,1032 +chr18 39983779 . T C 2324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=1.363;DP=141;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:2353,0,2350 +chr18 39983914 . T A 1906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1935,129,0 +chr18 39983915 . T C 1906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1935,129,0 +chr18 39984570 . G GAA 545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:583,40,0 +chr18 41668413 . TA T 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=1.600;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:415,0,525 +chr18 41668726 . GA G 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-0.253;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.29;ReadPosRankSum=3.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:526,0,845 +chr18 42299289 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=2.172;DP=35;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:410,0,840 +chr18 42301550 . T A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.617;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:642,0,770 +chr18 42492644 . T A 1599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.504;DP=166;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,56:166:99:1628,0,3245 +chr18 42502057 . A C 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;ClippingRankSum=3.317;DP=238;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=3.20;ReadPosRankSum=2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,41:236:99:789,0,15131 +chr18 42502064 . A T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=2.695;DP=227;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,43:225:99:784,0,15131 +chr18 42502122 . G T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-1.555;DP=168;FS=19.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=3.87;ReadPosRankSum=3.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,36:167:99:678,0,12722 +chr18 42722292 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.137;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=14.23;ReadPosRankSum=2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:384,0,847 +chr18 42722745 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:311,0,348 +chr18 42723457 . TA T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.880;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:243,0,260 +chr18 42723505 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.853;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,490 +chr18 42764907 . T G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.148;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.259;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:780,0,809 +chr18 42781297 . C A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.138;DP=99;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:335,0,3024 +chr18 42782249 . T C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.332;DP=39;FS=7.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:552,0,1297 +chr18 42782428 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.519;DP=88;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,19:87:99:390,0,3722 +chr18 42782530 . T C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.216;DP=90;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:602,0,2838 +chr18 42782789 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-0.638;DP=48;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:678,0,1187 +chr18 42782810 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-1.770;DP=68;FS=10.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:500,0,1876 +chr18 42825502 . C T 4439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=1.474;DP=218;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,132:217:99:4468,0,2962 +chr18 42949594 . A G 2768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=-1.640;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,80:127:99:2797,0,1567 +chr18 42959880 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=2.017;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=6.87;ReadPosRankSum=-2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:399,0,3192 +chr18 42959893 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.783;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:394,0,3192 +chr18 42968647 . C T 2319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.268;DP=151;FS=14.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:2348,0,2792 +chr18 42974205 . G C 1910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.459;DP=132;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1939,0,2523 +chr18 42975075 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-2.339;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:470,0,1471 +chr18 42975076 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=-2.033;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:470,0,1473 +chr18 42976907 . C T 2959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-0.443;DP=165;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:2988,0,2744 +chr18 42980984 . C CT 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-0.978;DP=61;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:571,0,695 +chr18 42984007 . C A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.515;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=23.88;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:458,0,248 +chr18 42990918 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:377,0,279 +chr18 43014889 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.831;DP=33;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:556,0,579 +chr18 43022702 . GCTACATGAAGACAGAGAGGTGAGTCACTTGAAGGCCACATATGAGGGCGACTACCAAATTACCACAAATACACTGCAGGACTGTCGGGAACTTCAGCGCACTCAAAAACAGGCATGAACACACACGCACACACTCAC G 1523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=3.742;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=31.10;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,36:49:99:1561,0,6983 +chr18 43035295 . TCTACAAACAAAACACAAGACATGTAAATGACTCGGTAAAGACCAAATCTATTCAAGACAGTTAAATCATCAACACTGAGATAATTAGACCACAAATAAAACCCCTAC T 11285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.210;DP=281;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,263:276:99:11323,0,3968 +chr18 43049259 . C T 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-1.679;DP=61;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,33:60:99:1083,0,969 +chr18 43050042 . G A 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.429;DP=75;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.178;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:1367,0,1297 +chr18 43050297 . A G 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=-0.868;DP=73;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:1222,0,1505 +chr18 43054742 . G T 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=1.650;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.952;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:858,0,1214 +chr18 43061011 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-1.393;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:290,0,1220 +chr18 43062437 . G C 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.581;DP=55;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:944,0,1003 +chr18 43070185 . T C 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=1.238;DP=67;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1080,0,1260 +chr18 43070363 . G A 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.044;DP=74;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,31:74:99:1073,0,1436 +chr18 43070381 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.239;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:1106,0,1452 +chr18 43078419 . CAGGTTAGTGCAACCACCCGATTCCTTTTCTTGAGGTTAAAAAACTACTTGTTTGACAAAGTAATGCTTGACTTTCCTT C 3059.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=1.197;DP=74;FS=2.915;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:3097,291,0 +chr18 43079615 . C T 1660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-2.943;DP=87;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=19.09;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1689,0,2291 +chr18 43079699 . AT A 1486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.570;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1524,0,4443 +chr18 43112751 . C T 2578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.163;DP=157;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=16.43;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:2607,0,2671 +chr18 43125286 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-0.038;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:545,0,597 +chr18 43126945 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.817;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.381;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,395 +chr18 43187287 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.263;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:341,0,650 +chr18 43195671 . C T 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-1.516;DP=33;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:919,0,241 +chr18 43200426 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=-0.393;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=24.43;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:639,0,188 +chr18 43207973 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-0.170;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:474,0,488 +chr18 43218450 . G C 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.491;DP=49;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:853,0,809 +chr18 43226521 . C T 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=1.052;DP=69;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1332,0,954 +chr18 43236599 . CTACAAGGTTAGAACGGCT C 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=1.290;DP=60;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:305,0,9256 +chr18 43236603 . AAGGTTAGAACGGCTTTCATGTTGCATGCTAAAGGCCCTTGAATTTAGCATGACGACACTTTAAACTACTTCCTTCCTTCTTTCCTTC A 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=2.408;DP=67;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:311,0,11791 +chr18 43236621 . ATGTTGCATGCTAAAGGCCCTTGAATTTAGCATGACGACACTTTAAACTACTTCCTTCCTTCTTTCCTTC A 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=1.308;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=6.23;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:99:305,0,10865 +chr18 43237108 . C T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-0.429;DP=48;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:957,0,673 +chr18 43237936 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-1.902;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:587,0,193 +chr18 43239675 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.62;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:325,0,358 +chr18 43239799 . TA T 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.642;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:446,0,215 +chr18 43243758 . A G 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.434;ClippingRankSum=0.820;DP=135;FS=0.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,47:135:99:1468,0,3009 +chr18 43283798 . C T 2157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.752;ClippingRankSum=-1.625;DP=300;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=7.19;ReadPosRankSum=2.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,93:298:99:2186,0,7650 +chr18 43291524 . C T 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-0.116;DP=137;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:797,0,8397 +chr18 43293486 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-1.161;DP=142;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,31:142:99:584,0,8798 +chr18 43297095 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,344 +chr18 43308062 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.119;DP=32;FS=12.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:369,0,735 +chr18 43331021 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-1.416;DP=31;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:301,0,919 +chr18 43331304 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=1.296;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:282,0,929 +chr18 43645119 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-1.653;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:361,0,544 +chr18 43645150 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.665;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:604,0,490 +chr18 43645206 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-1.099;DP=33;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:540,0,539 +chr18 43664678 . G C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.119;DP=44;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:295,0,1207 +chr18 43671433 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.251;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:332,0,1175 +chr18 43674475 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.794;DP=44;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:359,0,1471 +chr18 43674921 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=1.693;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=12.62;ReadPosRankSum=-2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:268,0,420 +chr18 43675849 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.755;DP=26;FS=11.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:581,0,587 +chr18 43676504 . T G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.527;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:367,0,523 +chr18 43676635 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=1.584;DP=21;FS=14.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:359,0,367 +chr18 43676856 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.855;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=21.65;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:721,0,1123 +chr18 43985122 . A G 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=-2.763;DP=84;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1684,0,2970 +chr18 43985127 . G T 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-3.274;DP=82;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:1684,0,2970 +chr18 43988248 . C A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.959;DP=75;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:895,0,1678 +chr18 43992494 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.866;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:886,0,1681 +chr18 43992789 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.929;DP=96;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:661,0,2663 +chr18 43992949 . C T 1694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=1.611;DP=108;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1723,0,1930 +chr18 43994071 . T C 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-2.075;DP=93;FS=13.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=8.58;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,30:93:99:826,0,2403 +chr18 43995692 . C T 2270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.199;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=31.54;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,60:71:99:2299,0,175 +chr18 43996948 . C A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.748;DP=67;FS=8.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:1331,0,958 +chr18 43997020 . A C 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.323;DP=72;FS=10.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=20.26;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,44:72:99:1487,0,3602 +chr18 44006012 . T A 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=1.055;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=29.45;ReadPosRankSum=1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:1246,0,139 +chr18 44065023 . C T 3893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.239;DP=448;FS=17.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,147:448:99:3922,0,11203 +chr18 44065715 . G C 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.474;ClippingRankSum=-1.787;DP=308;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=3.84;ReadPosRankSum=5.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1212,0,927 +chr18 44088128 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=24.98;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:278,0,267 +chr18 44088129 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=2.383;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=22.71;ReadPosRankSum=-2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:278,0,267 +chr18 44088156 . A G 464.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=31.16;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:14:493,14,0 +chr18 44091546 . G T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=1.012;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:368,0,532 +chr18 44099455 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.375;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:461,0,291 +chr18 44100260 . T A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=1.826;DP=43;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:616,0,941 +chr18 44100569 . T A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-1.283;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:437,0,140 +chr18 44102034 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-0.528;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:762,0,552 +chr18 44112210 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:69:236,0,69 +chr18 44148990 . TCAGCATTACAGAACTCAAGTCTAGGCTTTATTGTCATTCTGCTACAAGAGAGAAACTAAATGTCGGTCTCAAAGGACCACAGAGCTACATATATAAACAGAAGCAGAAATATGAACA T 862.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=1.273;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=33.72;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,1:15:99:900,388,0 +chr18 44157123 . G C 2991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=1.902;DP=262;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=11.42;ReadPosRankSum=2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,91:261:99:3020,0,5910 +chr18 44159623 . A T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-0.051;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,48:198:99:1084,0,5773 +chr18 44173404 . A G 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.833;DP=240;FS=3.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,77:240:99:2049,0,6146 +chr18 44222040 . G T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-1.227;DP=224;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,51:224:99:995,0,6450 +chr18 44227578 . C A 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-0.729;DP=201;FS=7.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,42:201:99:924,0,10672 +chr18 44227579 . A T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.411;DP=204;FS=9.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.001;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,44:204:99:924,0,10672 +chr18 44228362 . T G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=3.610;DP=89;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:629,0,5386 +chr18 44228365 . T C 3395.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.537;DP=86;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=34.06;ReadPosRankSum=-1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,79:86:11:3423,0,11 +chr18 44228366 . T C 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-2.794;DP=84;FS=4.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,56:84:99:2171,0,2285 +chr18 44228726 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=2.282;DP=34;FS=9.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:290,0,871 +chr18 44228915 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=-0.015;DP=40;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:302,0,1330 +chr18 44229182 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=2.641;DP=54;FS=10.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=14.59;ReadPosRankSum=2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:816,0,3471 +chr18 44229193 . C T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=2.241;DP=58;FS=9.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:785,0,2626 +chr18 44229441 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,146 +chr18 44229863 . C T 2306.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2335,166,0 +chr18 44229949 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=3.951;DP=28;FS=6.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=21.06;ReadPosRankSum=-3.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:618,0,852 +chr18 44229956 . G T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=3.750;DP=25;FS=10.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=23.59;ReadPosRankSum=-3.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:618,0,852 +chr18 44230356 . G A 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:63:882,63,0 +chr18 44230462 . A C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.385;DP=23;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:388,0,389 +chr18 44231567 . C T 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=1.265;DP=74;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:1015,0,1443 +chr18 44231620 . T A 2970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.867;DP=154;FS=2.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:2999,0,4457 +chr18 44231630 . T C 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=-0.168;DP=172;FS=4.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,44:171:99:972,0,8043 +chr18 44231992 . CTT C 3476.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-1.465;DP=55;FS=2.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.871;QD=30.62;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,36:41:99:3787,114,0 +chr18 44235606 . G T 2036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.253;DP=159;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,61:159:99:2065,0,3263 +chr18 44239372 . C T 3000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.371;DP=184;FS=0.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,95:184:99:3029,0,3117 +chr18 44239410 . G A 3545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.720;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.369;QD=16.49;ReadPosRankSum=2.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,107:215:99:3574,0,3707 +chr18 44255722 . C G 3027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.813;DP=210;FS=10.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,95:177:99:3056,0,3070 +chr18 44263669 . G T 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=-1.752;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,60:227:99:1436,0,6383 +chr18 44266727 . T C 5966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.093;DP=193;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=30.92;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,156:193:99:5995,0,570 +chr18 44293883 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-1.029;DP=33;FS=11.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.740;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:386,0,778 +chr18 44299715 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.712;DP=26;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:332,0,706 +chr18 44299718 . G C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.781;DP=26;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:91:813,0,91 +chr18 44299904 . A T 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=16.70;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:388,0,232 +chr18 44365626 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:250,0,804 +chr18 44366258 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr18 44366509 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=1.506;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:379,0,643 +chr18 44366846 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.465;DP=29;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:407,0,599 +chr18 44368692 . A C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:368,0,500 +chr18 44368958 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=17;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,411 +chr18 44369042 . T A 650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:679,48,0 +chr18 44371528 . T A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=1.641;DP=382;FS=2.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,78:382:99:1204,0,16457 +chr18 44372770 . G A 885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=1.107;DP=27;FS=9.556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=32.81;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:40:914,40,0 +chr18 44399552 . C T 2105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.313;DP=326;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,89:326:99:2134,0,8934 +chr18 44399701 . AC A 788.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.210;DP=87;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:826,0,543 +chr18 44400272 . A C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.496;DP=271;FS=7.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=2.31;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,48:271:99:654,0,8787 +chr18 44421651 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.246;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:368,0,470 +chr18 44421956 . T A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.671;DP=17;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=30.57;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:34:548,0,34 +chr18 44443533 . T G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.449;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:365,0,322 +chr18 44445188 . A T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.843;DP=37;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:447,0,870 +chr18 44453567 . A T 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-2.576;DP=81;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:913,0,1643 +chr18 44458911 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.575;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:323,0,1748 +chr18 44459062 . C A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.717;DP=60;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:1203,0,824 +chr18 44459155 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-1.167;DP=57;FS=3.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:449,0,1386 +chr18 44468022 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.539;DP=63;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=6.52;ReadPosRankSum=2.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:439,0,3537 +chr18 44468025 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.361;DP=61;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:439,0,3537 +chr18 44468046 . A C 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-1.011;DP=60;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:759,0,1178 +chr18 44475937 . C G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=-1.149;DP=68;FS=5.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:337,0,1966 +chr18 44525469 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.12;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:375,0,174 +chr18 44525784 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:395,0,398 +chr18 44556427 . A G 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=1.648;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:503,0,598 +chr18 44573271 . C G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.320;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:395,0,358 +chr18 44574259 . A G 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:63:903,63,0 +chr18 44579047 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.575;DP=25;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:99:230,0,1477 +chr18 44579763 . T C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=26.04;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:497,0,159 +chr18 44581117 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=21.62;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:266,0,99 +chr18 44581452 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-1.768;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=26.41;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:398,0,316 +chr18 44581469 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.664;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=30.90;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:399,0,273 +chr18 44583307 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.234;DP=33;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:476,0,414 +chr18 44583326 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.655;DP=31;FS=11.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:467,0,554 +chr18 44619504 . T C 1755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-3.006;DP=100;FS=16.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1784,0,1749 +chr18 44619512 . T A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.293;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:507,0,4572 +chr18 44619649 . A T 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.457;DP=80;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:1262,0,2026 +chr18 44619708 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=-1.348;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.215;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,23:101:99:436,0,3262 +chr18 44619937 . G A 1601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.166;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,48:133:99:1630,0,2885 +chr18 44622345 . C T 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.829;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:740,0,2030 +chr18 44623407 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-0.936;DP=79;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:369,0,2458 +chr18 44628004 . G C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=2.023;DP=66;FS=16.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:437,0,1923 +chr18 44629170 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.251;DP=68;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:314,0,2027 +chr18 44668041 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.580;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:277,0,493 +chr18 44668255 . T G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-0.159;DP=32;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:385,0,768 +chr18 44668809 . C T 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-0.319;DP=34;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:740,0,416 +chr18 44681563 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=1.817;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:524,0,715 +chr18 44759536 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,337 +chr18 44770109 . A AT 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.069;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:623,0,228 +chr18 44770285 . T TA 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=-3.005;DP=51;FS=6.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=7.88;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:439,0,694 +chr18 44770609 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-0.206;DP=55;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:503,0,1401 +chr18 44770980 . GT G 1571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.304;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1609,0,884 +chr18 44776342 . C T 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-0.789;DP=104;FS=4.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1867,0,1575 +chr18 44776705 . T A 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.916;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1612,0,1541 +chr18 44776729 . G A 1809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.380;DP=110;FS=4.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1838,0,1826 +chr18 45038571 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.311;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:379,0,1056 +chr18 45042083 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:90:334,0,90 +chr18 45042192 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=27.78;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:306,0,125 +chr18 45042455 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:240,0,157 +chr18 45042579 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.286;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:364,0,373 +chr18 45042785 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-1.317;DP=28;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:276,0,539 +chr18 45043950 . GT G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-0.013;DP=43;FS=3.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:405,0,2263 +chr18 45103912 . GA G 210.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:245,0,0 +chr18 45107378 . A G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr18 47048924 . CCAGGTAAAGCTGGAGCTCACGCACAACATTTTTAAAAGATATTTCATATTTACGCGTTTGGCAGGTGGCATGTTTTTATCCCTTTCTGGGAACTGCACTCGTGTCTCTGCTGGAGTTTCTTCACCTGTTCAGATGCTGGACCTCAAGTTTATATCATGACGTTTGTCTGCTGTCTGGTTCAAAGGTCAAATTCTGATTCTTTTCTCTCTTCTTT C 2216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=4.000;DP=72;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.915;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,59:65:99:2254,0,1684 +chr18 47056033 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,434 +chr18 47087618 . A G 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 +chr18 47247826 . T A 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.195;DP=139;FS=0.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,46:139:99:1301,0,3513 +chr18 47265713 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,220 +chr18 47303880 . T G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,431 +chr18 47334073 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-0.538;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:280,0,1313 +chr18 47351176 . AT A 2151.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-4.408;DP=178;FS=65.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=12.09;ReadPosRankSum=5.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:2189,0,2450 +chr18 47385795 . G GT 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=-1.059;DP=53;FS=8.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:542,0,563 +chr18 47502551 . A T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-1.399;DP=58;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=17.60;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1049,0,803 +chr18 47716475 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-1.079;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=21.03;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:617,0,328 +chr18 47716723 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-2.493;DP=23;FS=14.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=16.16;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:400,0,363 +chr18 47716734 . A C 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:75:1067,75,0 +chr18 47716795 . C A 2825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:2854,199,0 +chr18 47716850 . A G 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.101;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,29:50:99:993,0,746 +chr18 47717603 . T C 581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:610,45,0 +chr18 47779590 . C G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:317,0,628 +chr18 47779598 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,628 +chr18 47779729 . C T 2396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2425,175,0 +chr18 47784910 . T C 2482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2511,181,0 +chr18 47806650 . A T 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.274;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1210,0,1602 +chr18 47806656 . G A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.879;DP=55;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1214,0,1602 +chr18 47841268 . C G 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 +chr18 47886388 . C T 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.030;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.267;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:947,0,302 +chr18 48077127 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.929;DP=96;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:256,0,2965 +chr18 48085144 . C T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.329;DP=111;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:99:886,0,2838 +chr18 48096296 . A T 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.716;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=18.15;ReadPosRankSum=3.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:1535,0,2046 +chr18 48097287 . T C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-1.004;DP=49;FS=6.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.617;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:860,0,853 +chr18 48097427 . C A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-1.859;DP=107;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:536,0,2355 +chr18 48097536 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.591;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.972;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:427,0,1689 +chr18 48097587 . T G 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-1.768;DP=78;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:606,0,1176 +chr18 48098683 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.22;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,1:8:99:246,0,554 +chr18 48099987 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.023;DP=29;FS=4.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:330,0,1094 +chr18 48116601 . C CT 452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.386;DP=52;FS=6.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:490,0,742 +chr18 48116616 . G A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.145;DP=55;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:774,0,1030 +chr18 48116716 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.778;DP=26;FS=7.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:377,0,514 +chr18 48164237 . C T 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;ClippingRankSum=-1.746;DP=136;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,46:136:99:1191,0,5185 +chr18 48164346 . T C 2210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.530;DP=285;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=7.76;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,86:285:99:2239,0,7657 +chr18 48168632 . T C 2297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.837;DP=282;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,92:282:99:2326,0,8644 +chr18 48272823 . T A 509.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:538,39,0 +chr18 48712816 . G T 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-2.251;DP=107;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:1435,0,2157 +chr18 48713389 . A T 2005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=-2.049;DP=125;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:2034,0,2121 +chr18 48813832 . A AGT 1966.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.920;DP=91;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=21.61;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,64:77:99:2004,0,497 +chr18 48981252 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:288,0,312 +chr18 48982506 . C A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.902;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:581,0,798 +chr18 48982554 . GA G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-0.512;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:267,0,888 +chr18 48982617 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.456;DP=35;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:266,0,1216 +chr18 49004210 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:249,0,450 +chr18 49297761 . C T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.714;DP=80;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:734,0,2156 +chr18 49297805 . A C 2077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.603;DP=185;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,65:185:99:2106,0,6940 +chr18 49298142 . C T 3227.04 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.149;DP=242;FS=0.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,94:241:99:3255,0,5067 +chr18 49298275 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.158;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:271,0,274 +chr18 49349742 . C T 4134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=1.208;DP=259;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,118:259:99:4163,0,4553 +chr18 49356656 . A C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.639;DP=337;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,51:337:99:490,0,11052 +chr18 49370772 . C T 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.322;DP=99;FS=3.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:1410,0,1889 +chr18 49378105 . G C 1920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.173;DP=142;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1949,0,2769 +chr18 49378220 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=1.455;DP=100;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:673,0,2725 +chr18 49382595 . TGGTGTGTTTAGAGCTCATTTCTGATGAGACATTCCTGAATTATATTCTGTCTGTGATGTGTTTCTGCATCTTTTA T 5332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=3.436;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=22.68;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,130:146:99:5370,0,3801 +chr18 49386650 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=-2.064;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:593,0,2177 +chr18 49391205 . ACT A 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.36;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,228 +chr18 49391847 . ATC A 225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:381,33,0 +chr18 49392895 . T C 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.596;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:520,0,309 +chr18 49393265 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=1.661;DP=37;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:702,0,1302 +chr18 49536504 . G A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.743;DP=104;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.867;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1734,0,1830 +chr18 49548753 . A G 1868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.034;DP=107;FS=4.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1897,0,1676 +chr18 49678857 . CAGAGCG C 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.308;ClippingRankSum=-3.413;DP=28;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:253,0,348 +chr18 49778090 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=1.010;DP=24;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:358,0,341 +chr18 49806089 . G GGT 1282.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.362;DP=69;FS=2.428;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:48:52:1320,52,0 +chr18 49806500 . GGT G 560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-0.863;DP=75;FS=3.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=7.48;ReadPosRankSum=2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:598,0,1693 +chr18 49846473 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=-0.967;DP=117;FS=9.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:479,0,3558 +chr18 49854694 . TCTGAAGATGATCACGCACACACACACACATCAGTGACAGAAGAGCAGCGGTACACACTCACACACGCTCACACTCAC T 1423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=1.420;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=34.73;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,34:40:99:1461,0,2035 +chr18 49856564 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-2.276;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:275,0,412 +chr18 49858014 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-1.740;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:262,0,497 +chr18 49861490 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-1.347;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:320,0,378 +chr18 49873668 . G A 4850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.518;DP=270;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,138:270:99:4879,0,4548 +chr19 8726 . TCCTACACAAACACACACACACACAAACACACACACACACACACACAGAGCAGTGTGAGCGGCTGCAGGACAGTGCCACCTGCAGGAGAGTCTGCTGCTCTTCA T 5064.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=1.467;DP=135;FS=3.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=32.68;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,120:135:99:5102,0,1028 +chr19 28653 . CGTAAGTGTGGCCATCCTTTGACAGACATTGAAGATGTTTTCAGATTGTGAGTCTCTAACCCTGACATGTGTCTCTCTGCAG C 1795.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=2.491;DP=46;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,43:46:61:1833,0,61 +chr19 41891 . AGTGTGTGTGCTGCAGCATCTGAACACGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGCGT A 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.540;DP=43;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=6.51;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,1:36:99:317,0,5415 +chr19 42077 . GCAGGTGCGCACACACACACACACACACTCTCTCTTTCACCTGTTCACCTGCTCACACCTGTGCTGCTCTA G 12059.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.035;DP=315;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,308:311:99:12097,1058,0 +chr19 61821 . A AGTGT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-0.246;DP=108;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=1.95;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:306,0,2253 +chr19 64303 . CCCTGAAACACACACGAGGGTTTAATGCTGTGTGTCAGCATCACCTGCACACTGATGTGTGTACGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAACGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTCTGTACTGAAAAACACATA C 4199.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=3.293;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=33.80;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,109:114:99:4237,326,0 +chr19 69051 . T C 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 +chr19 69067 . A G 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:709,51,0 +chr19 74378 . T G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.861;DP=73;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:589,0,1728 +chr19 74390 . T C 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.822;DP=61;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,41:61:99:1453,0,530 +chr19 76732 . G C 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=-1.237;DP=72;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:767,0,1571 +chr19 77116 . T G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr19 78043 . C T 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.621;DP=92;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=19.17;ReadPosRankSum=2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,55:92:99:1792,0,1233 +chr19 78275 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=23.05;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:397,0,155 +chr19 78579 . T C 1474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1503,111,0 +chr19 78657 . T C 983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1012,75,0 +chr19 79098 . A C 2117.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2146,154,0 +chr19 79164 . T C 2322.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2351,175,0 +chr19 79300 . C T 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.463;DP=79;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,50:79:99:1691,0,944 +chr19 79315 . A G 3501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:3530,268,0 +chr19 79645 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-1.702;DP=38;FS=7.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:497,0,753 +chr19 80737 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-1.496;DP=78;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=2.63;ReadPosRankSum=-1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:233,0,2323 +chr19 81587 . C T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-3.586;DP=42;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:738,0,603 +chr19 81628 . T C 2705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2734,208,0 +chr19 82127 . G A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.267;DP=120;FS=0.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,42:120:99:1388,0,2624 +chr19 131744 . AACAGTGTTAGTAGTGTTGTCATAGAGACAGTGTAAGTAGTGTTGTCATAGAG A 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,18:18:99:631,0,909 +chr19 328732 . G A 1785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.266;DP=156;FS=6.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,56:155:99:1814,0,3296 +chr19 341063 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr19 341114 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=1.066;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:697,0,103 +chr19 341151 . G C,T 877.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,5,22:27:99:1006,855,845,156,0,117 +chr19 381740 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.073;DP=24;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=21.07;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:534,0,320 +chr19 384747 . C G 3831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:3860,0,217 +chr19 384748 . A G 3831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:3860,0,219 +chr19 384828 . T C 3830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.025;DP=182;FS=7.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=21.05;ReadPosRankSum=-1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,80:96:99:3859,0,252 +chr19 384832 . G A 3831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.324;DP=190;FS=7.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,84:100:99:3860,0,174 +chr19 384923 . G C 2815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=-1.994;DP=212;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,46:128:99:2844,0,3742 +chr19 384981 . G A 2816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.878;DP=147;FS=14.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=19.16;ReadPosRankSum=2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:2845,0,3808 +chr19 385002 . A C 2817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=2.060;DP=130;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=21.68;ReadPosRankSum=-2.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,57:73:99:2846,0,3739 +chr19 385075 . C T 4555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-4.150;DP=327;FS=7.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,85:206:99:10457,0,6930 +chr19 385120 . T G 4142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-1.288;DP=352;FS=8.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,100:222:99:4171,0,7593 +chr19 385202 . T C 11471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.665;DP=272;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=30.37;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,206:207:99:11500,0,5101 +chr19 385284 . C G 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-3.360;DP=67;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=12.04;ReadPosRankSum=3.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:835,0,786 +chr19 385293 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=2.099;DP=67;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:586,0,1159 +chr19 385314 . GC G 485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:39:523,39,0 +chr19 385319 . T C 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:39:523,39,0 +chr19 426355 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.139;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:472,0,152 +chr19 435832 . G C 1599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.443;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=32.65;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,42:49:52:1628,0,52 +chr19 440697 . C G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-2.454;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,618 +chr19 444253 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.249;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,390 +chr19 486967 . G C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.410;DP=23;FS=9.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:93:675,0,93 +chr19 500087 . G T 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.610;DP=38;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:730,0,518 +chr19 540346 . G A 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-1.666;DP=67;FS=5.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=20.92;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1430,0,1703 +chr19 540350 . A G 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-1.489;DP=65;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,42:65:99:1644,0,656 +chr19 540604 . A C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,573 +chr19 540608 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-2.392;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=19.21;ReadPosRankSum=-2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:278,0,573 +chr19 542705 . CCAGGAGCTGCAGGAGGTCAAAGGTCGCGCAGCCTCCACACAT C 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=3.483;DP=50;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=13.97;ReadPosRankSum=-2.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:736,0,7498 +chr19 560716 . AAGGTGGACAGCGGCTAGCTCACCGCTCGGCTACAATACAAGATGTGTTATGTAAACGCAGCTAGCATCTCCGCTAACCCCTGCGTGTCTGTCTCCTC A 4182.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.636;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,89:91:99:4220,407,0 +chr19 560899 . G A 2934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-0.950;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,81:110:99:2963,0,642 +chr19 617001 . CGT C 891.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=-0.963;DP=45;FS=5.283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:80:929,80,0 +chr19 617104 . TTG T 214.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:252,22,0 +chr19 740134 . CGTGAGACTCCACACACACACACACACACACACACACACACACTCATGTGATGACAGTAAGTGTAGCTGATGCTGGTGTGTGCAG C 1868.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=1.410;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=31.54;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1906,150,0 +chr19 743581 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.490;DP=43;FS=7.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=23.37;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1033,0,340 +chr19 747120 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.278;DP=25;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:262,0,142 +chr19 754350 . TTC T 1061.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.427;DP=37;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=28.70;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1099,0,309 +chr19 754390 . A AAT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-0.308;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:280,0,1579 +chr19 771723 . A AACGCACAGC 231.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:269,17,0 +chr19 777655 . C CA 244.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:282,26,0 +chr19 845459 . C G 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.548;DP=34;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:934,0,173 +chr19 953742 . T A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-1.721;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:385,0,627 +chr19 991084 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:246,0,134 +chr19 1061565 . ACT A 495.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.302;DP=22;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=22.51;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:10:532,10,0 +chr19 1061890 . T A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=1.898;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=21.36;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:370,0,214 +chr19 1071093 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:240,0,115 +chr19 1247610 . CA C 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.345;DP=110;FS=7.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,58:83:99:1066,0,304 +chr19 1248313 . G GT 1530.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1568,152,0 +chr19 1423162 . G A 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr19 1483316 . G A 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 +chr19 1496516 . C CA 511.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:549,54,0 +chr19 1710891 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 +chr19 1711094 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,274 +chr19 1714260 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:83:392,0,83 +chr19 1826154 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-1.256;DP=44;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:652,0,814 +chr19 1828769 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-2.442;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:590,0,925 +chr19 1831405 . C A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.369;DP=51;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:941,0,832 +chr19 1852716 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.983;ClippingRankSum=-1.826;DP=33;FS=11.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:549,0,580 +chr19 1859043 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.164;DP=33;FS=5.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:644,0,494 +chr19 1946185 . CTG C 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:23:246,23,0 +chr19 1950317 . C G 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=-1.162;DP=52;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:940,0,890 +chr19 1955362 . A C 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=-0.561;DP=53;FS=5.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:877,0,942 +chr19 1962354 . A G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=-1.635;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:404,0,486 +chr19 1963162 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.267;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.34;ReadPosRankSum=-2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:327,0,182 +chr19 1963321 . TA T 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=29.37;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:91:331,0,91 +chr19 1964282 . ACACACACACT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:251,0,287 +chr19 1965886 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,334 +chr19 1968052 . A T 2517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-1.313;DP=155;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.995;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:2546,0,2790 +chr19 1971429 . T TA 2131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-1.483;DP=156;FS=6.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:2169,0,3282 +chr19 1971690 . G A 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.454;DP=93;FS=5.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:1254,0,1975 +chr19 1971758 . T G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.374;DP=84;FS=7.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=5.95;ReadPosRankSum=2.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:528,0,1965 +chr19 1972552 . A C 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.828;DP=115;FS=12.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1961,0,1999 +chr19 1972943 . A AT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.164;DP=116;FS=4.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=2.64;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,25:106:99:344,0,2354 +chr19 1973502 . G A 1890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-1.229;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1919,0,1918 +chr19 1973661 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.258;DP=66;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:529,0,1907 +chr19 1974631 . A T 2603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.406;DP=144;FS=0.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:2632,0,2603 +chr19 1981615 . GCTGTGAAACAAATGATTTGATTTAAATTCACTCATGCATCAATAGTTATTTGAATATTCAGATGTCTTCACAGCACCTCAAACTTAAATAACAAAC G 488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=1.661;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,74:79:99:526,186,0 +chr19 1981748 . G A 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-2.034;DP=74;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1250,0,1361 +chr19 1981764 . ACACCTGATCACATCAGAAAAACAATCAACAATTAAATATCCATCATTACTATCTGTAAATCAATAAATCAATTATATAAGGCTGAAAATAGACCCT A 3171.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=2.349;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=33.38;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:99:3209,272,0 +chr19 2016977 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.555;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:258,0,1008 +chr19 2058502 . CACCTGGAGGAGGAGAAGAGGAGCTCAGTTCACAGACCACAGCGGATATATAGGAGTGTATTCATTATAGTGAAAGTCTCTCAA C 2344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=4.312;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=32.54;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,58:66:99:2382,0,2449 +chr19 2060545 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=1.009;DP=50;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:891,0,920 +chr19 2135550 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-1.077;DP=23;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:412,0,380 +chr19 2135663 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.361;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:518,0,658 +chr19 2135856 . C A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-1.480;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=22.51;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:546,0,575 +chr19 2135860 . T A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.194;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=23.53;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:546,0,575 +chr19 2136673 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.560;DP=22;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:409,0,378 +chr19 2136693 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.626;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:393,0,368 +chr19 2137369 . G T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.095;DP=40;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:727,0,1113 +chr19 2155090 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.072;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:311,0,611 +chr19 2158735 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.340;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:597,0,438 +chr19 2158771 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-1.106;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:416,0,465 +chr19 2160150 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-1.693;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:279,0,486 +chr19 2173291 . GTT G 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-1.399;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:417,0,252 +chr19 2185785 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:318,0,804 +chr19 2188203 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=2.355;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:238,0,437 +chr19 2189713 . AAC A 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-0.263;DP=22;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:257,0,255 +chr19 2190349 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,251 +chr19 2198593 . A T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-0.289;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:767,0,1303 +chr19 2198596 . A G 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.259;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:767,0,1303 +chr19 2205821 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=-0.567;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:510,0,375 +chr19 2206920 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.332;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:875,0,525 +chr19 2211936 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-0.207;DP=30;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:541,0,556 +chr19 2256570 . G T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.448;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:348,0,554 +chr19 2397441 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.692;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:329,0,402 +chr19 2397936 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.754;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:407,0,206 +chr19 2401892 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,414 +chr19 2402093 . C A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=22.11;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:382,0,200 +chr19 2442453 . G GCA 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.772;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:310,0,266 +chr19 2458542 . G A 2359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.461;DP=136;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:2388,0,2594 +chr19 2632360 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr19 2735769 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.007;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:361,0,2244 +chr19 2735832 . T A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.948;ClippingRankSum=-0.262;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,33:146:99:639,0,3764 +chr19 2761500 . G A 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:887,78,0 +chr19 2780204 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.634;DP=58;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=5.67;ReadPosRankSum=2.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:357,0,1629 +chr19 2780258 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.671;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:746,0,798 +chr19 2780393 . G C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr19 2780465 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.194;DP=55;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:965,0,2038 +chr19 2780466 . A G 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-0.161;DP=55;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:965,0,2076 +chr19 2786523 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-3.775;DP=23;FS=21.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=25.12;ReadPosRankSum=3.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:606,0,191 +chr19 2786547 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=1.479;DP=37;FS=8.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:457,0,791 +chr19 2786676 . C G 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr19 2786934 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=1.184;DP=49;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:309,0,1295 +chr19 2787108 . A G 788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:817,60,0 +chr19 2791005 . T C 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr19 2791074 . T A 1762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-0.055;DP=57;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=30.93;ReadPosRankSum=2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,48:57:99:1791,0,122 +chr19 2791365 . A G 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.044;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=32.96;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:45:984,0,45 +chr19 2791520 . A C 829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:858,60,0 +chr19 2801319 . T A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.063;DP=131;FS=2.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,48:131:99:1629,0,2796 +chr19 2801601 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.529;DP=136;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:237,0,4865 +chr19 2801624 . T G 4374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:4403,319,0 +chr19 2801743 . CCA C 3241.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3279,227,0 +chr19 2801886 . A C 7568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:7597,547,0 +chr19 2983604 . A G 2642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2671,195,0 +chr19 2983697 . T C 1688.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1717,123,0 +chr19 3081402 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:496,0,114 +chr19 3086852 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.658;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,31:42:99:1126,0,240 +chr19 3370852 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-0.414;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:549,0,577 +chr19 3373452 . G GT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.125;DP=107;FS=5.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=2.43;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:297,0,1884 +chr19 3564708 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.253;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:675,0,517 +chr19 3571939 . G T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=1.759;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:526,0,508 +chr19 3633401 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-2.069;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:837,0,2462 +chr19 3634361 . T A 1889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.720;DP=95;FS=3.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1918,0,1492 +chr19 3634400 . G T 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-1.357;DP=114;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:2145,0,1590 +chr19 3642316 . C T 1605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=-0.708;DP=74;FS=4.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,48:74:99:1634,0,885 +chr19 3646758 . AT A 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.921;DP=21;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:368,0,138 +chr19 3654183 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.394;DP=40;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:720,0,652 +chr19 3700997 . CA C 1110.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.462;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,44:66:99:1148,0,525 +chr19 3718413 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.897;DP=61;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:245,0,2734 +chr19 3829552 . G C 316.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:344,0,10 +chr19 3950822 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.197;DP=29;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:537,0,434 +chr19 3951976 . G A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.198;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.468;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:578,0,559 +chr19 3952804 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:349,0,332 +chr19 3954884 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=1.847;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:286,0,465 +chr19 3957440 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.077;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:450,0,417 +chr19 4251795 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.951;DP=31;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:270,0,788 +chr19 4268805 . A T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-3.058;DP=26;FS=4.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:94:793,0,94 +chr19 4268817 . G A 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1035,75,0 +chr19 4269039 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.528;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,685 +chr19 4269040 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:390,0,669 +chr19 4273176 . G A 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:686,54,0 +chr19 4273194 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:335,0,463 +chr19 4273665 . C T 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 +chr19 4277662 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=30.34;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:362,0,50 +chr19 4277671 . T C 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:444,30,0 +chr19 4278343 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,298 +chr19 4288999 . A C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr19 4289009 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr19 4289110 . A T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.762;DP=22;FS=16.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:602,0,197 +chr19 4289152 . C T 1018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1047,75,0 +chr19 4421579 . T A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.048;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,291 +chr19 4421596 . T A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.952;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:403,0,604 +chr19 4661284 . CTT C 732.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=-2.833;DP=166;FS=5.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=4.41;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,7:147:99:770,0,16142 +chr19 4687974 . A C 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.770;DP=68;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:820,0,1373 +chr19 4708723 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.850;DP=37;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:685,0,524 +chr19 4721176 . A C 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.362;DP=33;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=28.54;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:970,0,120 +chr19 4721213 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=2.282;DP=36;FS=15.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:243,0,975 +chr19 4721306 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,356 +chr19 4721308 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,356 +chr19 4722974 . T G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=1.347;DP=26;FS=2.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:597,0,319 +chr19 4727209 . G C 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.164;DP=112;FS=4.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:573,0,3248 +chr19 4938160 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-1.164;DP=17;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:251,0,316 +chr19 5455313 . TCTGCGAAAGCGGAGGAAGAGAAGAGGACAGGAGGCATTTGATTTGTGTCTGTTAGACGCTCAGGAGGATCAGCACAGATGGATTGTGGGATTGTTTACTCAC T 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=1.992;DP=21;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:274,0,4188 +chr19 5575341 . C T 2229.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.119;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=33.42;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2258,169,0 +chr19 5582749 . A G 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:730,51,0 +chr19 5620784 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=1.232;DP=52;FS=6.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:408,0,1381 +chr19 5625197 . TAA T 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.864;DP=50;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=6.77;ReadPosRankSum=2.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:480,0,1344 +chr19 5625199 . A AT 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-3.010;DP=50;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:530,0,946 +chr19 5633571 . TCTGAGACGGTGAGTAAAGGTAGACCTTCACACTCTGATTGTGACTGAACGCATGTGTAAGACACCCAACATATGTGTGTGTGTGCACGGACTGCATTAAAAGATAC T 13298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.234;DP=300;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=27.99;ReadPosRankSum=2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,297:300:99:13336,1038,0 +chr19 5643900 . G C 6514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.755;DP=404;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,181:403:99:6543,0,7421 +chr19 5644517 . GCTGCAAGCAGACGACCATAATTGTGTTTAAAGAAAGTGTCTATTTGTTATTAAATTAAGTTTGATTTAGCTATGCTGATCTCAC G 16656.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=2.437;DP=387;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,385:387:99:16694,1351,0 +chr19 5652813 . G A 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=6.019;DP=218;FS=4.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=4.33;ReadPosRankSum=-2.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,49:217:99:973,0,6300 +chr19 5654265 . A G 7567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.479;DP=453;FS=5.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,213:453:99:7596,0,7897 +chr19 5682987 . A AT 1199.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=-0.955;DP=178;FS=5.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1451,0,1233 +chr19 5934481 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.843;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:308,0,1677 +chr19 5981346 . TCTGTGAGAGGAAATGCAACAGAAAAGCAGCTAGATAAGTCATCTGTTGGTTTTGATTTCCATCTTGCTATACAAATTTGACATGTTAAAACAGATTTTTAC T 10435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.601;DP=269;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,236:239:99:10473,769,0 +chr19 5987996 . ATACCTGCACATAAATAAAGTCAATATAAATGTTTTGGATCTATTATAGATTTTGTAAGCAATTTTTAAAGTCTTACAACGGTGGACT A 21506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=2.620;DP=488;FS=4.378;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,483:488:99:21544,1725,0 +chr19 5992357 . TCTGTGAGAGGAAATGCAACAGTAATGAAGCCAGATGAGTCGTGTTGATTTTGATTCTAATCTTTCTTTGTAAATATAACATGTTAAATATTTTAC T 14207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=1.122;DP=336;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=32.28;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,318:321:99:14245,1107,0 +chr19 5992855 . AACCTGCACAGACATTTAATCAATGTAAATGTTTTGAATCTTTTATAGATTTTGGAAGTGAATTTTTATAGTGCAAGTCTTACAACTGTGGACTT A 1996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=2.472;DP=274;FS=2.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.282;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,250:253:99:2034,699,0 +chr19 6044652 . AAGGTTGTCGCTGTTAAATAATTGACACTCTAAAGTGGTTTACGGTTACAAGTGTGGGCCATTTTTAACATCCTCATTTGCATCCAC A 1786.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.362;ClippingRankSum=5.575;DP=358;FS=11.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,322:333:99:1824,677,0 +chr19 6204967 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:274,0,351 +chr19 6242376 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.160;DP=46;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:590,0,911 +chr19 6243322 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.603;DP=59;FS=3.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:747,0,1260 +chr19 6309735 . G C 215.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:244,21,0 +chr19 6350090 . G A 1459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1488,111,0 +chr19 6351025 . T A 2660.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=41.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2689,193,0 +chr19 6353042 . T C 2341.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1093,78,0 +chr19 6673113 . A C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:499,0,272 +chr19 6673168 . A C 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:636,48,0 +chr19 6681659 . A G 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr19 6682603 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,214 +chr19 6682815 . A G 506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:535,39,0 +chr19 6699107 . C A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.785;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:688,0,699 +chr19 6708735 . C G 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.274;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:763,0,573 +chr19 6709913 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=1.246;DP=16;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.80;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:425,0,174 +chr19 6710188 . G A 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.403;DP=48;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:787,0,865 +chr19 6713026 . T A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=2.149;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:424,0,445 +chr19 6733508 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=2.346;DP=40;FS=5.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:336,0,1865 +chr19 6733562 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=2.569;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:248,0,728 +chr19 6738932 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=-0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:574,0,527 +chr19 6746294 . T C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=1.778;DP=33;FS=11.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:765,0,428 +chr19 6748220 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=2.315;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:373,0,591 +chr19 6748235 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=1.342;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:384,0,648 +chr19 6748295 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-1.713;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:410,0,663 +chr19 6748340 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-1.815;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:398,0,704 +chr19 6748571 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=-0.687;DP=38;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:653,0,656 +chr19 6748919 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-1.851;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:673,0,356 +chr19 6749963 . C A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.560;DP=42;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:718,0,721 +chr19 6750141 . G T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.718;DP=44;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:373,0,1134 +chr19 6750710 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:312,0,473 +chr19 6839107 . GA G 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=2.562;DP=155;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=3.57;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,39:141:99:591,0,2742 +chr19 6925695 . T A 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-0.951;DP=99;FS=6.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=20.71;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,62:99:99:2079,0,1269 +chr19 6951060 . C T 3390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.107;DP=147;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,94:147:99:3419,0,1781 +chr19 6951201 . T C 3262.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-1.719;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,69:72:99:3291,225,0 +chr19 6951954 . C CGAGT 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-3.002;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:278,0,273 +chr19 6952466 . G A 6490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-1.340;DP=210;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=30.91;ReadPosRankSum=-2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,167:210:99:6519,0,1226 +chr19 6966972 . G A 3222.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.261;DP=161;FS=0.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,97:161:99:3251,0,2256 +chr19 6966987 . T C 3412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.414;DP=165;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,102:165:99:3441,0,2138 +chr19 6968764 . G A 3130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-1.263;DP=172;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,96:172:99:3159,0,2758 +chr19 6974883 . C A 3689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.370;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=20.50;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,112:180:99:3718,0,2265 +chr19 7063601 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,573 +chr19 7063602 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,573 +chr19 7063786 . T C 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 +chr19 7064500 . G GGA 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:336,26,0 +chr19 7065269 . C T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr19 7065597 . T A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=28.10;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:506,0,111 +chr19 7066196 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.695;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:478,0,560 +chr19 7066312 . T A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-0.055;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1071,0,593 +chr19 7067823 . A C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.867;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:295,0,160 +chr19 7067911 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,288 +chr19 7069694 . AT A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-2.855;DP=15;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:243,0,131 +chr19 7185946 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,329 +chr19 7530191 . A G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr19 7583871 . T A 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:353,25,0 +chr19 7583913 . G T 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:34:475,34,0 +chr19 7614009 . C A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=2.316;DP=80;FS=4.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1562,0,1181 +chr19 7614958 . C CTGCACAGAAAAAGA 5024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=1.696;DP=195;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,136:180:99:5062,0,1019 +chr19 7620280 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.753;ClippingRankSum=5.797;DP=112;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=2.50;ReadPosRankSum=-5.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:308,0,3370 +chr19 7620831 . CGTAAGCAGGATGCTAAGGTTTTACTGAATATCATGTTTTGGTACCGTGTTTGAGTGTGTAACTTCTTTATTTTTCTCCTGTGCAG C 9967.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=1.591;DP=224;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,221:223:99:10005,802,0 +chr19 7640721 . C A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=1.501;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:396,0,237 +chr19 7692308 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:256,0,62 +chr19 7802904 . A T 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:51:690,51,0 +chr19 7810710 . A T 9872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.287;DP=362;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,264:362:99:9901,0,2235 +chr19 7931712 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.579;DP=38;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:308,0,1018 +chr19 8078548 . TA T 822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.407;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,37:50:99:860,0,172 +chr19 8104872 . GA G 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.717;DP=50;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:543,0,511 +chr19 8108241 . AT A 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-1.061;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:527,0,888 +chr19 8112084 . T A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.307;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.792;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:643,0,685 +chr19 8150420 . TA T 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.248;DP=31;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:264,0,1681 +chr19 8189016 . GT G 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-0.888;DP=81;FS=8.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:286,0,1365 +chr19 8189094 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.252;DP=45;FS=10.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:347,0,740 +chr19 8189326 . AT A 1857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.108;DP=70;FS=3.438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=26.54;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:1895,189,0 +chr19 8220617 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=-0.137;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:444,0,438 +chr19 8252895 . T A 3167.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.572;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=26.82;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,70:81:5:3195,0,5 +chr19 8371620 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,226 +chr19 8371761 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:268,0,100 +chr19 8425276 . AAGGTAAATCGAGGTCTGCCAGTGAATATCTGCAGTCTCTCCATTCCAGCGTCTCATCTTATTGGCTTTCTTTCATTTC A 4925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.520;DP=128;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,114:116:99:4963,359,0 +chr19 8426266 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=-3.860;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=13.95;ReadPosRankSum=-3.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:377,0,496 +chr19 8443591 . C T 1627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DP=62;FS=2.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,45:62:99:1656,0,358 +chr19 8449567 . T G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.231;DP=69;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=3.29;ReadPosRankSum=3.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:255,0,2124 +chr19 8585476 . A C 201.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:230,0,22 +chr19 9156660 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-1.349;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:382,0,728 +chr19 9600721 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.119;DP=49;FS=7.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:498,0,1421 +chr19 9640458 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-0.185;DP=35;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:807,0,485 +chr19 9641053 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.327;DP=32;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:247,0,944 +chr19 9747598 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.189;DP=79;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:447,0,2343 +chr19 9763049 . ACGG A 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.893;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:273,0,3886 +chr19 9763053 . TCAGTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGTCTCTCTCTTCTTCTGCTTTTAGCATTCACTACATTTGCTCAGTCTGTAATTTGTGTCATCA T 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=1.427;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:268,0,3886 +chr19 9763489 . A T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=2.226;DP=57;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:757,0,2799 +chr19 9778509 . T G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.214;DP=62;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:345,0,1820 +chr19 9779127 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.292;DP=50;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:332,0,1484 +chr19 9779264 . GA G 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.427;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:330,0,2031 +chr19 9779796 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.861;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:233,0,2138 +chr19 9880254 . TGTAGGTGATGCCTCGAACAGTTTTGTGCTCAGAAATAATCTGCCGTGCTCTGTTGAGTTGTATTGTCTGTGTGCTGTACGTTTAG T 3352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.274;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,73:77:99:3390,283,0 +chr19 9897664 . ACT A 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=1.412;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:343,0,1063 +chr19 10082183 . T A 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-0.798;DP=323;FS=8.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,77:323:99:1666,0,9704 +chr19 10875500 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=1.404;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:491,0,948 +chr19 11096213 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr19 11096364 . T C 864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.083;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:893,60,0 +chr19 11096370 . C A 864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.347;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:60:893,60,0 +chr19 11096519 . A C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr19 11479432 . G GA 755.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=-2.638;DP=313;FS=5.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=2.41;ReadPosRankSum=2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,64:262:99:793,0,4024 +chr19 11479842 . G GA 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.555;ClippingRankSum=0.019;DP=361;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,74:339:99:428,0,7085 +chr19 11487520 . G GA 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.640;DP=371;FS=7.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,64:348:99:359,0,7545 +chr19 11504982 . G GA 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-0.049;DP=319;FS=7.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,56:282:99:391,0,5962 +chr19 11721691 . G GT 1224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-3.372;DP=344;FS=6.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,93:325:99:1262,0,6100 +chr19 11822262 . C CA 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.011;DP=139;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.091;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:99:298,0,2439 +chr19 12114656 . AT A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-1.371;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:54:348,0,54 +chr19 12255949 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,169 +chr19 12470023 . G T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.736;DP=34;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:312,0,1043 +chr19 12538644 . C T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.455;DP=107;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:612,0,2983 +chr19 12545331 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=3.000;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:425,0,2635 +chr19 12600976 . C T 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.422;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,44:143:99:1140,0,3721 +chr19 12618486 . A C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-1.461;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:313,0,1382 +chr19 12653138 . A G 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.758;DP=40;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:620,0,666 +chr19 12653427 . A C 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.729;DP=58;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:715,0,1210 +chr19 12653763 . G C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-1.286;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=6.63;ReadPosRankSum=2.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:446,0,1773 +chr19 12654413 . T TA 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.911;DP=53;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:957,0,168 +chr19 12654524 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-1.055;DP=48;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:249,0,3562 +chr19 12655013 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=1.324;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,24:114:99:485,0,3553 +chr19 12752215 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.144;DP=316;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,57:316:99:806,0,9787 +chr19 12756947 . C T 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.895;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,44:203:99:851,0,6169 +chr19 12767409 . G T 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-0.351;DP=193;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,42:193:99:809,0,5871 +chr19 12787227 . C T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-3.175;DP=205;FS=18.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,58:204:99:1450,0,5637 +chr19 12985094 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-0.535;DP=57;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:374,0,1637 +chr19 12985421 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-2.764;DP=96;FS=7.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:281,0,3107 +chr19 13028837 . T G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-0.969;DP=52;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:403,0,1444 +chr19 13035605 . C T 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.392;DP=168;FS=4.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=5.69;ReadPosRankSum=3.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,43:168:99:984,0,4724 +chr19 13242820 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.489;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:322,0,3369 +chr19 13245563 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.604;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,26:94:99:597,0,3121 +chr19 13246939 . A G 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:439,33,0 +chr19 13267493 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.283;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:341,0,1141 +chr19 13277720 . A C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.018;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,29:120:99:599,0,3508 +chr19 13548625 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-0.790;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,34:193:99:440,0,6142 +chr19 13560154 . T A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-1.069;DP=41;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:529,0,893 +chr19 13561778 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-2.149;DP=32;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:425,0,673 +chr19 13735477 . G C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +chr19 13740991 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,249 +chr19 13741296 . T C 2771.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2800,202,0 +chr19 13741334 . C T 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.961;DP=72;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.966;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1196,0,1348 +chr19 14575041 . T TA 335.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=22.39;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:17:373,0,17 +chr19 14840628 . T TA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.559;DP=46;FS=7.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:406,0,628 +chr19 14875618 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:459,0,657 +chr19 14901931 . GA G 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.674;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:346,0,578 +chr19 14902236 . CA C 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.027;DP=44;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.29;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:446,0,505 +chr19 14903526 . AGT A 729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-0.125;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:767,0,937 +chr19 15073948 . C T 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 +chr19 15283231 . T C 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=1.704;DP=70;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=15.90;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:1141,0,1243 +chr19 15454705 . G A 2884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.094;DP=183;FS=4.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,83:183:99:2913,0,3303 +chr19 15468170 . TC T 586.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:624,43,0 +chr19 15468442 . G GT 341.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:379,36,0 +chr19 15508974 . A AGTATGAG 5029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:5067,363,0 +chr19 15518059 . T A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=1.508;DP=99;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:1199,0,1935 +chr19 15519495 . A T 1437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1466,102,0 +chr19 16016239 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.775;DP=30;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:361,0,607 +chr19 16086596 . T TC 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.271;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:379,0,212 +chr19 16255893 . C A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr19 16311926 . A T 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:551,39,0 +chr19 16311935 . A T 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:551,39,0 +chr19 16829510 . G GC 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=3.305;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=15.24;ReadPosRankSum=-3.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:403,0,681 +chr19 16829515 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=2.540;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=23.42;ReadPosRankSum=-3.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:403,0,681 +chr19 16829946 . TA T 389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:427,42,0 +chr19 17155205 . T TA 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.695;DP=189;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,40:170:99:267,0,2638 +chr19 17160313 . G GT 1336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.409;DP=164;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,87:149:99:1577,0,1176 +chr19 17160943 . T C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.492;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:180:99:671,0,5898 +chr19 17160945 . T C 1649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.056;ClippingRankSum=-3.283;DP=175;FS=3.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=9.43;ReadPosRankSum=2.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1678,0,4462 +chr19 17161636 . T TTG 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-1.519;DP=76;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:617,0,2166 +chr19 17178144 . A AT 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=2.033;DP=83;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:766,0,975 +chr19 17178267 . AT A 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.575;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:367,0,218 +chr19 17528662 . A G 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.745;DP=67;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:680,0,2141 +chr19 17528882 . T G 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.077;DP=36;FS=10.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:721,0,651 +chr19 17529958 . C T 2488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.339;DP=78;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=31.91;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,61:78:99:2517,0,293 +chr19 17530079 . A G 2698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-2.926;DP=97;FS=16.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,70:97:99:2727,0,654 +chr19 17530486 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=1.658;DP=17;FS=9.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=22.28;ReadPosRankSum=-1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:407,0,219 +chr19 17531399 . C A 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=2.276;DP=86;FS=4.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1556,0,2131 +chr19 17851154 . A G 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.033;DP=46;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:894,0,705 +chr19 17851924 . TA T 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.755;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:774,0,131 +chr19 17852480 . T C 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.959;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=33.07;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:888,0,181 +chr19 17852642 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=-0.530;DP=37;FS=1.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:276,0,1728 +chr19 17863350 . A C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=1.818;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:383,0,143 +chr19 17863550 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,731 +chr19 17863555 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,731 +chr19 17863699 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,324 +chr19 17864330 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:296,0,95 +chr19 17866258 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.146;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:389,0,309 +chr19 17866711 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,374 +chr19 18147123 . G T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=1.327;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:36:658,0,36 +chr19 18147131 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:36:658,0,36 +chr19 18155936 . A T 223.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:252,21,0 +chr19 18155968 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.600;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,144 +chr19 18156637 . T G 2211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=1.140;DP=69;FS=5.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=32.06;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,53:57:21:2240,21,0 +chr19 18156638 . A T 2211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=1.140;DP=69;FS=5.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=32.06;ReadPosRankSum=-1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,53:57:21:2240,21,0 +chr19 18160533 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.717;DP=29;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:515,0,294 +chr19 18318915 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.520;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=29.74;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:623,0,112 +chr19 18318916 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=1.845;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=31.30;ReadPosRankSum=-1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:623,0,115 +chr19 18321262 . CGGTGAGATGCAAGTTTTTCTACATATCTGCATTATTATCATTATGAATGAAATATTATCTTGTGTGTTTCTGTGTCTCA C 2185.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=1.515;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.467;QD=26.98;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,65:78:99:2223,0,3121 +chr19 18548127 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.797;DP=28;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:421,0,693 +chr19 18552195 . A C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.993;DP=15;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,475 +chr19 18556435 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,467 +chr19 18557676 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-0.472;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:282,0,1812 +chr19 18557682 . A T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.929;DP=35;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=17.74;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:728,0,662 +chr19 18559624 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.038;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:348,0,350 +chr19 18962861 . G A 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=-0.102;DP=69;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1189,0,1151 +chr19 18962979 . G A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.241;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1076,0,1048 +chr19 18963136 . C T 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.718;DP=79;FS=5.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:1072,0,1690 +chr19 18963161 . G A 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.108;DP=82;FS=4.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1167,0,1584 +chr19 19011058 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:98:340,0,98 +chr19 19245644 . GT G 729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.523;DP=56;FS=4.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:767,0,419 +chr19 19365474 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr19 19503970 . TA T 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.021;DP=40;FS=6.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:44:709,0,44 +chr19 20101495 . T C 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 +chr19 20114717 . T TA 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.492;DP=103;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:841,0,965 +chr19 20157608 . CA C 593.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:631,43,0 +chr19 20157611 . A C 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:631,43,0 +chr19 20543747 . T C 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.301;DP=50;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:888,0,899 +chr19 20543867 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:237,0,59 +chr19 20544424 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-1.370;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:254,0,651 +chr19 20595823 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.439;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:447,0,337 +chr19 20656011 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:290,0,361 +chr19 20660286 . C CT 332.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.724;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:4:529,0,4 +chr19 20673027 . C CA 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=-1.170;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:368,0,772 +chr19 20673049 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-2.341;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:366,0,743 +chr19 20679234 . CA C 318.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:356,30,0 +chr19 20734048 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-1.077;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:410,0,358 +chr19 20775607 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-2.279;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:335,0,357 +chr19 20887005 . CA C 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=-0.792;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:480,0,241 +chr19 20908046 . ACTGCAAATGAAAATGGAAAAAATTTACACAAGTATACCGTGCAAGATAATGCAAAAAAATTGCAAAATATCTAAACACTACACAGGAAAAATGTAAAGTTTAATCTGAGTCTTCAGAC A 2239.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.229;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.172;QD=31.70;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,49:53:99:2277,195,0 +chr19 20935980 . TA T 212.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:9:249,0,9 +chr19 20963294 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.356;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:388,0,743 +chr19 21197059 . TA T 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=29.52;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:36:480,0,36 +chr19 21203617 . C CCA 4370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-1.589;DP=145;FS=1.899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=30.14;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,118:122:99:4408,351,0 +chr19 21203736 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.580;DP=126;FS=17.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,34:126:99:852,0,3596 +chr19 21217801 . ACAGGTGAATGTTAAAGGGTTTTTTTATATTTCGTTATGTGGGATAGCTATGTAAACAAACCTTTCTCTTTTCTGATTGGTG A 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=31.67;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:544,0,539 +chr19 22643130 . T A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.382;DP=29;FS=9.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:601,0,390 +chr19 22816453 . GT G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.076;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:243,0,204 +chr19 22849768 . C T 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.551;DP=17;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=20.75;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:390,0,177 +chr19 22858939 . T G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.463;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=16.20;ReadPosRankSum=3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:417,0,458 +chr19 22893670 . T G 2124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.321;DP=145;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:2153,0,2683 +chr19 22894553 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-2.320;DP=60;FS=3.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:516,0,1642 +chr19 22902875 . G A 2991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=-1.052;DP=136;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=22.00;ReadPosRankSum=-2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,89:136:99:3020,0,3811 +chr19 22930838 . G C 2111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=-0.668;DP=128;FS=3.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:2140,0,2256 +chr19 23401485 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.578;DP=39;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:620,0,684 +chr19 23620806 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-1.217;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=21.19;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:558,0,313 +chr19 23623065 . T G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.050;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.161;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,517 +chr19 24388723 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:358,0,200 +chr19 24401893 . C CTT 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.723;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,31:125:99:715,0,4193 +chr19 24406730 . G GT 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.156;DP=47;FS=11.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:500,0,1047 +chr19 24406947 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-1.168;DP=36;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:308,0,909 +chr19 24442409 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:299,0,216 +chr19 24457126 . C T 261.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:290,0,20 +chr19 24457127 . T C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 +chr19 24468240 . T G 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.540;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:896,0,906 +chr19 24490674 . C T 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 +chr19 24519609 . CT C 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.262;DP=63;FS=3.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:691,0,462 +chr19 24519780 . C T 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-0.836;DP=71;FS=2.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:498,0,1411 +chr19 24749424 . GA G 2724.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-1.490;DP=131;FS=12.196;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,102:120:9:2761,9,0 +chr19 24933423 . A T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr19 24975811 . TGGTGAGTGTCACTTTGGCATTGTTATAGTTGCATGACGTTGTGGCATCCACAAAGTAGGTGCTAAACAGTTTTCTTCTCTATCTACA T 8985.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.602;DP=291;FS=3.592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=30.88;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,278:281:99:9023,567,0 +chr19 24976405 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.731;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:251,0,734 +chr19 24976434 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.462;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:340,0,723 +chr19 24977443 . GTTTTT G 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,19:19:99:295,0,2156 +chr19 25388236 . GAGGTACTAAAGTAACCTGTATAGGTTTAATCTGTTTATAAGCTTGTTTAACACTGTACTAAATGAAGAGTACTGTAATAGTGAATCTTAAAATAAACATAAATATTTTGTTCTC G 3639.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=1.470;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=29.08;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:3677,354,0 +chr19 25575421 . G GA 1303.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.717;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=19.46;ReadPosRankSum=3.294 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,52:59:21:1381,21,0 +chr19 25575447 . AT A 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-1.323;DP=74;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:244,0,1046 +chr19 25838168 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:243,0,266 +chr19 26141184 . AG A 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.529;DP=20;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,311 +chr19 26141222 . A C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr19 26141879 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-1.161;DP=54;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:455,0,880 +chr19 26141914 . A C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=-0.586;DP=49;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:472,0,632 +chr19 26179294 . A T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=-0.326;DP=39;FS=7.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:592,0,727 +chr19 26186512 . TA T 349.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.873;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:13:387,0,13 +chr19 26861136 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=-0.620;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:521,0,497 +chr19 27109299 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:348,0,293 +chr19 27158670 . G A 2118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=-0.173;DP=124;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:2147,0,2210 +chr19 27188959 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.857;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:352,0,308 +chr19 27197062 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.783;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:423,0,627 +chr19 27213256 . AAGGTTGGTGAGGATTTTAATGCACTTGATTGATTTTATTTACAGTATCACTAAAAGCATGATGCCTCTGAAC A 1238.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.195;DP=32;FS=3.135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=34.49;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:99:1276,111,0 +chr19 27218214 . GCTCCAAGAGAAAACAGCACATCATGTCACAATACAATAACATCTTTCTTAAATGAAATGATTCAAAAAATTGAAAAGGAGATCATAC G 13549.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=3.612;DP=364;FS=7.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,344:363:99:13587,288,0 +chr19 27226675 . C CT 572.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.722;DP=36;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:38:642,38,0 +chr19 27227860 . G A 2560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-1.187;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:2589,0,2108 +chr19 27227972 . C CA 1177.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-2.041;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1215,0,1715 +chr19 27231914 . CCCTGAAACACAAAAGCCCTTATAGTTTCTGAATCGAAAGGCTGTCAATCTATTATTTACAGCTGATCTGAGTTAGTCACTAA C 7522.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=2.580;DP=208;FS=4.083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,185:190:99:7560,556,0 +chr19 27235535 . G A 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.603;DP=119;FS=3.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:2027,0,2054 +chr19 27294724 . G A 1510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.968;DP=67;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,45:67:99:1539,0,1221 +chr19 27339585 . T C 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 +chr19 27339653 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr19 27340841 . GT G 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.354;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:287,0,54 +chr19 27342238 . T C 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.091;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:702,0,184 +chr19 27343326 . AT A 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.597;DP=17;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:297,0,153 +chr19 27343614 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-2.208;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=10.76;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:577,0,1185 +chr19 27393410 . C A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.077;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:645,0,444 +chr19 27393415 . C CCTTCACTAAACCT 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.509;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=20.96;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:645,0,444 +chr19 27399410 . C T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.419;DP=36;FS=7.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=22.22;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:828,0,388 +chr19 27422315 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.626;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:348,0,373 +chr19 27834556 . A G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:726,0,319 +chr19 27835712 . A G 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-0.906;DP=47;FS=4.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:1306,0,755 +chr19 27923459 . CCACCTTTACGTGTTAAATGGTGCGTTAGTTTATGAGACATGTGAGGTGTTGCTAGTGTTGATAAAATAAAGTTGTTCAGCGATG C 675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=2.646;DP=21;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=32.18;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:713,0,853 +chr19 27950930 . A ACCATTGGTCGCCTATTG 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=3.368;DP=23;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=12.38;ReadPosRankSum=-2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:322,0,2052 +chr19 28439711 . A C 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.791;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=30.18;ReadPosRankSum=3.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:776,0,290 +chr19 28441551 . T A 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.429;DP=94;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1704,0,1700 +chr19 28441757 . A T 1393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=-1.547;DP=91;FS=0.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1422,0,1568 +chr19 28442381 . C T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=-0.838;DP=81;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1399,0,1455 +chr19 28442417 . T C 1639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.761;DP=103;FS=4.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:1668,0,1899 +chr19 28452371 . G A 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.306;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,72:168:99:2494,0,3213 +chr19 28456522 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=1.715;DP=229;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.512;QD=2.96;ReadPosRankSum=3.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,43:229:99:707,0,7168 +chr19 28459738 . A AT 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=1.534;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:414,0,435 +chr19 28613458 . CA C 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.483;DP=40;FS=4.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:645,0,166 +chr19 28767016 . T G 3161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.774;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=17.96;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,90:176:99:3190,0,3040 +chr19 28769495 . G A 3668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=-2.079;DP=213;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,100:211:99:3697,0,3704 +chr19 28769512 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=-3.191;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=17.11;ReadPosRankSum=3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:2252,0,2225 +chr19 28819409 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:473,0,523 +chr19 28930776 . T G 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 +chr19 28937912 . C G 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:438,33,0 +chr19 28938294 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:234,0,67 +chr19 29273511 . G T 5019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=1.837;DP=301;FS=12.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,137:301:99:5048,0,5223 +chr19 29274332 . G A 3417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=1.364;DP=277;FS=21.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.724;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,115:276:99:3446,0,4698 +chr19 29774069 . G A 1985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=-1.109;DP=118;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:2014,0,1972 +chr19 29780455 . T C 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.876;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:681,0,729 +chr19 29781540 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=-1.632;DP=30;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:557,0,472 +chr19 29781831 . C A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.453;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:709,0,675 +chr19 29788031 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.901;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:528,0,883 +chr19 29801884 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-1.083;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:504,0,832 +chr19 29802231 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=-0.638;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:452,0,346 +chr19 29816026 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=7.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:551,0,692 +chr19 29839590 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.256;DP=66;FS=3.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:820,0,1372 +chr19 29845296 . A G 289.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:8:317,0,8 +chr19 30356760 . C CT 980.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.418;DP=102;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:1018,0,1058 +chr19 30391775 . G T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.022;DP=70;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:284,0,2255 +chr19 30510730 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-2.097;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=7.73;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1504 +chr19 30510731 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-1.248;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1504 +chr19 30634341 . TA T 531.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.324;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:569,0,311 +chr19 30636714 . TCTGAAAAAAAAGAAAAGAAAAAATCAATATGGAAAGTGCTCAATTTATGCAACATTTTGAGGAAAGAGGCAAAAGACACATCTCAAACACTCAC T 1639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=2.575;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=32.15;ReadPosRankSum=-1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,47:51:99:1677,0,588 +chr19 30637108 . G A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.523;DP=65;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:997,0,1325 +chr19 30867540 . C G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-0.248;DP=139;FS=1.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,32:139:99:573,0,3850 +chr19 30867759 . A G 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.193;DP=158;FS=9.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,46:158:99:1152,0,4202 +chr19 30879008 . CGGTCAGTGCAACACATTTTTTTTAACTTTTTTGTACTGTAAACAGGTGTCTTTACTAAAATCTAAACTTTCACATATACA C 828.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.055;DP=158;FS=3.012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,154:156:99:866,329,0 +chr19 30883802 . CT C 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.513;DP=70;FS=4.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:850,0,2925 +chr19 31045305 . G A 5225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.450;DP=324;FS=12.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,136:324:99:5254,0,13654 +chr19 31045754 . C T 5158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=1.085;DP=287;FS=1.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,143:286:99:5187,0,5182 +chr19 31063652 . C CT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.980;DP=316;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,54:281:99:249,0,6184 +chr19 31082258 . C T 1656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-1.087;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1685,0,1817 +chr19 31082955 . C T 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.598;DP=96;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1719,0,1879 +chr19 31083118 . G A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=-1.405;DP=69;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.102;QD=15.30;ReadPosRankSum=2.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:1084,0,3248 +chr19 31083124 . G T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-2.957;DP=78;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=13.54;ReadPosRankSum=2.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:1084,0,3200 +chr19 31084710 . G T 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.896;DP=116;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1987,0,2080 +chr19 31098155 . C T 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.045;DP=84;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,49:84:99:1698,0,1286 +chr19 31101867 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.643;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:459,0,425 +chr19 31108875 . C A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=1.255;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:549,0,221 +chr19 31109366 . AGT A 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.973;DP=37;FS=7.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:446,0,757 +chr19 31109813 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.417;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:525,0,472 +chr19 31596778 . C CT 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.406;DP=297;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,44:260:99:413,0,5093 +chr19 31667438 . G C 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.063;ClippingRankSum=0.486;DP=34;FS=17.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=33.90;ReadPosRankSum=-3.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:99:1181,0,218 +chr19 31667440 . A G 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.467;DP=32;FS=16.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=30.88;ReadPosRankSum=-3.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1181,0,227 +chr19 31682289 . G A 2611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-1.617;DP=447;FS=4.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:333,114:447:99:2640,0,12770 +chr19 31714166 . A G 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-1.247;DP=17;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:388,0,222 +chr19 31921944 . T TCCGGAGTACCGGTG 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.564;DP=96;FS=7.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:696,0,2772 +chr19 32130412 . G A 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=1.838;DP=135;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.29;ReadPosRankSum=-5.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:1823,0,2679 +chr19 32325890 . G C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr19 32644359 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.037;DP=66;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:328,0,1836 +chr19 32825193 . GA G 2947.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.348;DP=307;FS=4.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,116:289:99:2985,0,4422 +chr19 32825773 . T TA 2111.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=-0.289;DP=199;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,90:177:99:2149,0,2204 +chr19 32828839 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=5.588;DP=212;FS=4.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=2.02;ReadPosRankSum=-2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,35:212:99:457,0,6856 +chr19 32829318 . T C 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=4.519;DP=225;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,54:225:99:1135,0,6457 +chr19 32836837 . CT C 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=1.139;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=22.61;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:399,0,443 +chr19 32837510 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:317,0,58 +chr19 32838628 . TA T 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.366;DP=30;FS=9.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:304,0,366 +chr19 32839161 . GA G 820.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.390;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:858,0,187 +chr19 32839201 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.830;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.89;ReadPosRankSum=2.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:505,0,805 +chr19 32839297 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.131;DP=33;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:428,0,752 +chr19 32839445 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.346;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1453,0,102 +chr19 32842131 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=1.024;DP=51;FS=6.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:362,0,1374 +chr19 32843359 . G T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.352;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:448,0,866 +chr19 32853991 . G A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-0.019;DP=52;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:738,0,1040 +chr19 32858499 . G T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.304;DP=66;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:838,0,1390 +chr19 32867289 . G T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=1.228;DP=32;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=13.24;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:452,0,620 +chr19 32989491 . T A 659.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.529;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=32.99;ReadPosRankSum=2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:23:688,0,23 +chr19 32989534 . G T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.074;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:550,0,408 +chr19 33035020 . T A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-1.243;DP=180;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,39:180:99:607,0,4800 +chr19 33044092 . C G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.029;DP=53;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:432,0,1400 +chr19 33044812 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.151;DP=36;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:408,0,876 +chr19 33044873 . CA C 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.781;DP=29;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:372,0,445 +chr19 33120975 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=1.206;DP=36;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:236,0,1085 +chr19 33122222 . A T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.549;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:728,0,762 +chr19 33123099 . T TA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.380;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:347,0,281 +chr19 33123146 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.527;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:345,0,578 +chr19 33123566 . A AT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.231;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:271,0,234 +chr19 33123896 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.557;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:555,0,899 +chr19 33136737 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-0.721;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=4.84;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:251,0,1321 +chr19 33176627 . G A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.557;DP=84;FS=5.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:1084,0,1750 +chr19 33183956 . AAT A 270.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:308,25,0 +chr19 33185539 . T C 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=1.011;DP=48;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:829,0,844 +chr19 33186070 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-0.148;DP=54;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1052,0,883 +chr19 33186095 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-2.503;DP=53;FS=18.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:841,0,1058 +chr19 33189055 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=1.200;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.644;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:264,0,341 +chr19 33189337 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:265,0,325 +chr19 33190290 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.634;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,969 +chr19 33190293 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,969 +chr19 33190542 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:264,0,183 +chr19 33191794 . T A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:250,0,482 +chr19 33193663 . C A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.217;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:458,0,365 +chr19 33196302 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:333,0,311 +chr19 33198602 . T C 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=34.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:25:236,0,25 +chr19 33199141 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=24.83;ReadPosRankSum=2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:351,0,126 +chr19 33200340 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:361,0,336 +chr19 33294056 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.465;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:412,0,464 +chr19 33296242 . G A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-1.717;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:1070,0,1714 +chr19 33296309 . A G 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=-0.180;DP=98;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:98:99:1443,0,1916 +chr19 33309431 . G T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=-0.376;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=14.58;ReadPosRankSum=3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:451,0,924 +chr19 33394868 . A C 2873.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:2902,217,0 +chr19 33409050 . G A 1659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.671;DP=87;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,51:79:99:1688,0,908 +chr19 33832551 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:230,0,373 +chr19 33847988 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.705;DP=71;FS=15.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:965,0,1534 +chr19 33849001 . A C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=-6.201;DP=99;FS=7.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,28:98:99:666,0,4167 +chr19 33849091 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=-2.735;DP=50;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=8.08;ReadPosRankSum=-3.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:432,0,2138 +chr19 33849501 . G A 1942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=-1.658;DP=104;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1971,0,1806 +chr19 33858300 . G A 204.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:233,0,25 +chr19 33862746 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:298,0,439 +chr19 33863838 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:425,0,336 +chr19 33869151 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=3.321;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:601,0,1162 +chr19 33871047 . T TA 1774.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.691;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,81:104:99:1988,0,250 +chr19 33871125 . C G 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=1.230;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.904;QD=14.24;ReadPosRankSum=-2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,69:158:99:2292,0,2875 +chr19 33874883 . G A 5116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.975;DP=296;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,142:295:99:5145,0,4713 +chr19 33881110 . A G 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.550;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.526;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:988,0,1107 +chr19 33885507 . C G 1314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.130;DP=76;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:1343,0,1250 +chr19 34013670 . G C 1907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.485;DP=168;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,60:168:99:1936,0,5543 +chr19 34190018 . G C 2181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.530;DP=149;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:2210,0,2941 +chr19 34194087 . AAAGGACATTTGTTTCTGTCTACGCAGCTG A 1054.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.332;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:1092,0,4831 +chr19 34194131 . C T 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=1.021;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,46:153:99:1142,0,4413 +chr19 34194614 . CT C 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.979;DP=67;FS=9.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:474,0,995 +chr19 34213857 . G A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=4.653;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.360;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:941,0,3443 +chr19 34213942 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=2.838;DP=43;FS=12.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=8.69;ReadPosRankSum=4.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:402,0,1084 +chr19 34230732 . T C 232.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:261,0,15 +chr19 34240711 . G GA 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-1.055;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:554,0,304 +chr19 34240875 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.137;DP=38;FS=5.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:245,0,1195 +chr19 34241704 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=1.682;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:292,0,245 +chr19 34241948 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.420;DP=30;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:385,0,904 +chr19 34271073 . CA C 1041.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-0.497;DP=146;FS=7.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1079,0,1482 +chr19 34271465 . G A 3069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.039;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,91:226:99:3098,0,8223 +chr19 34271477 . C CA 2616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.381;DP=228;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,87:217:99:2654,0,3102 +chr19 34271747 . G A 3616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.696;DP=218;FS=4.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,93:217:99:3645,0,4333 +chr19 34272225 . AT A 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-0.503;DP=227;FS=4.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,47:212:99:681,0,4484 +chr19 34274618 . A T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=-3.930;DP=237;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,51:232:99:910,0,6959 +chr19 34274808 . TCCTACAACCAGAAAAAAAATGCTTAGGGAGGTCTTGTCGATGTACCAAACAACAGTACATCTCCATTTAGAATTGATCATGAATTTGTTTTATA T 2067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-2.897;DP=330;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,88:324:99:2105,0,10710 +chr19 34274810 . CT C 8858.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=-3.674;DP=328;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,230:322:99:8896,0,3341 +chr19 34274814 . AACCAGAAAAAAAATGCTTAGGGAGGTCTTGTCGATGTACCAAACAACAGTACATCTCCATTTAGAATTGATCATGAATTTGTTTTATACCACG A 8858.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-4.377;DP=344;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,230:330:99:8896,0,3306 +chr19 34275003 . C A 5295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.386;DP=357;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=14.83;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,151:357:99:5324,0,6899 +chr19 34275091 . T A 300.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.11;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:329,0,19 +chr19 34275725 . A G 360.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.74;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:388,0,11 +chr19 34289384 . G A 4570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.592;DP=318;FS=4.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,149:317:99:4599,0,4862 +chr19 34302575 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.443;DP=138;FS=1.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,25:137:99:359,0,4206 +chr19 34306765 . T G 4838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-0.598;DP=265;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,133:264:99:4867,0,4709 +chr19 34310920 . C T 6836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.096;DP=395;FS=7.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,192:395:99:6865,0,6622 +chr19 34312875 . T G 16745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-9.554;DP=322;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=31.41;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,215:322:99:16774,0,2378 +chr19 34312927 . AACCTGCGGGGGGGGAAAAAAACACCACTTTCTTAAAAAGAGCAAAAAGCCACAGCGCATAATTGGGAAGTTGATCAGCAGACTT A 16736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-2.485;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=28.27;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,331:335:99:16774,0,1688 +chr19 34319473 . G A 5706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-0.832;DP=322;FS=11.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,157:322:99:5735,0,6073 +chr19 34326242 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.076;DP=87;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:433,0,2592 +chr19 34421077 . C G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.024;DP=60;FS=7.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:505,0,1464 +chr19 34446419 . T C 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=1.241;DP=50;FS=8.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:927,0,734 +chr19 34446580 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.264;DP=35;FS=18.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:294,0,2296 +chr19 34446903 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.736;DP=35;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:240,0,998 +chr19 34447000 . CA C 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.286;DP=60;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:672,0,919 +chr19 34500302 . T G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.737;DP=62;FS=2.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:649,0,1397 +chr19 34576457 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:278,0,107 +chr19 34638668 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.020;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1066,0,1120 +chr19 34875852 . G T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.521;DP=62;FS=5.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:768,0,2560 +chr19 34875853 . A G 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.554;DP=61;FS=5.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:768,0,2564 +chr19 34875907 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-1.607;DP=39;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:307,0,1537 +chr19 34875917 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=1.577;DP=38;FS=7.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:315,0,1501 +chr19 34876689 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:277,0,103 +chr19 34876990 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.25;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:306,0,139 +chr19 34877341 . C G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=17.16;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:320,0,305 +chr19 34877364 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.220;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:285,0,259 +chr19 34877583 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.151;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:460,0,243 +chr19 34877647 . A G 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=-1.194;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:719,0,218 +chr19 34878069 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-2.061;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:497,0,206 +chr19 34878594 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,340 +chr19 35066237 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,295 +chr19 35097095 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=1.001;DP=23;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=11.29;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:288,0,544 +chr19 35130298 . A G 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-0.047;DP=102;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:1565,0,1863 +chr19 35136909 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-1.594;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:811,0,3399 +chr19 35139181 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=3.365;DP=64;FS=7.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:328,0,1880 +chr19 35139211 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-2.929;DP=59;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,11:59:99:232,0,3855 +chr19 35140439 . T C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-1.124;DP=61;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:357,0,1750 +chr19 35149144 . CA C 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.531;DP=53;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:512,0,476 +chr19 35149703 . A T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.372;DP=67;FS=5.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:558,0,1779 +chr19 35150961 . C CT 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=2.409;DP=45;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.53;ReadPosRankSum=-2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:376,0,574 +chr19 35201714 . ACTAAAAGTATGAAGAAAAGAAATCAGAGAAATAGTCTATTGTAATATGCAACACTTTAATGTTTGTTGTTTGGATGAATCTAAATGATAAATCTTAC A 1642.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=1.540;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=25.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:99:1680,159,0 +chr19 35212609 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.856;DP=44;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:294,0,1224 +chr19 35253194 . A C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.471;ClippingRankSum=-0.425;DP=120;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:615,0,3610 +chr19 35268749 . T A 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:743,54,0 +chr19 35268764 . G A 621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:650,45,0 +chr19 35270920 . T C 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.633;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=28.49;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:712,0,132 +chr19 35270940 . T C 974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1003,72,0 +chr19 35271136 . A T 831.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:860,60,0 +chr19 35271242 . T C 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 +chr19 35271338 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=16.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=29.25;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:76:467,0,76 +chr19 35271405 . C T 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:950,66,0 +chr19 35271438 . A G 955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:984,69,0 +chr19 35273062 . T C 908.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:937,66,0 +chr19 35273290 . G A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=2.068;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=31.25;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:84:997,0,84 +chr19 35275401 . T A 955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:984,69,0 +chr19 35277659 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.344;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:403,0,132 +chr19 35277680 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:41:409,0,41 +chr19 35280053 . A T 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=1.327;DP=31;FS=6.463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=26.89;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:46:1142,46,0 +chr19 35281825 . T C 1189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1218,93,0 +chr19 35284228 . C T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.367;DP=24;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:685,0,117 +chr19 35287762 . T C 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.612;DP=27;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=28.66;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:802,0,168 +chr19 35288717 . G T 1313.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.618;DP=41;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=32.05;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:16:1342,0,16 +chr19 35290931 . A G 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:850,63,0 +chr19 35291234 . A G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 +chr19 35303779 . A G 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1746,120,0 +chr19 35303788 . C A 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1746,120,0 +chr19 35303858 . CA C 537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:575,45,0 +chr19 35376110 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=-0.079;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:338,0,1039 +chr19 35506962 . C G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr19 35508111 . T A 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:475,33,0 +chr19 35508114 . A C 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 +chr19 35630056 . G T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-2.423;DP=90;FS=4.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:547,0,2564 +chr19 35630108 . T G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.952;DP=68;FS=5.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:443,0,1946 +chr19 35645776 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.071;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=3.24;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:278,0,2402 +chr19 35728879 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.474;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:295,0,1170 +chr19 35728915 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.901;DP=36;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:266,0,844 +chr19 35765660 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-2.069;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,915 +chr19 35765739 . C A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-1.523;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:348,0,1016 +chr19 35766001 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-1.223;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:513,0,1847 +chr19 35768045 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.231;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:231,0,502 +chr19 35780421 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.724;DP=36;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:270,0,983 +chr19 36246687 . G A 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=1.297;DP=42;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:790,0,1766 +chr19 36281739 . A C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.307;DP=38;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:589,0,528 +chr19 36282062 . A G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.795;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:779,0,473 +chr19 36299935 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:346,0,354 +chr19 36553043 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.331;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:404,0,667 +chr19 36553585 . A T 1973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.793;DP=129;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:2002,0,5684 +chr19 36555602 . CCCTGTGGGATATCAAAGAAATGCTTGGCATTATAATGTGATCAAATACATAAACAGAAAATAAAATGGTTTTTATTTATTGTA C 13242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=2.223;DP=298;FS=2.060;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=28.23;ReadPosRankSum=-2.982 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,280:284:99:13280,1021,0 +chr19 36563477 . A G 255.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:284,0,18 +chr19 36588840 . C A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.350;DP=156;FS=13.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,41:156:99:1000,0,4468 +chr19 36589096 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-2.688;DP=123;FS=8.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=4.73;ReadPosRankSum=2.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,31:123:99:610,0,3569 +chr19 36589218 . C G 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=-0.167;DP=211;FS=7.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,65:211:99:1773,0,8311 +chr19 36595506 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:275,0,60 +chr19 36596091 . C A 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-0.701;DP=264;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,73:264:99:1684,0,6888 +chr19 36601372 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:282,0,181 +chr19 36605367 . C G 3427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=1.249;DP=226;FS=0.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,99:226:99:3456,0,4182 +chr19 36614194 . G A 3359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-1.625;DP=212;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,99:212:99:3388,0,3576 +chr19 36618172 . C T 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.011;DP=247;FS=4.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,57:246:99:1183,0,7389 +chr19 36618187 . G A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.532;ClippingRankSum=0.287;DP=212;FS=7.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=3.25;ReadPosRankSum=2.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,46:210:99:717,0,6284 +chr19 36618360 . T G 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=1.208;DP=243;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,54:243:99:1050,0,10008 +chr19 36630543 . C G 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-1.133;DP=118;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,42:118:99:1463,0,2604 +chr19 36630633 . C T 2077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-1.497;DP=134;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=15.51;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:2106,0,2528 +chr19 36630772 . T A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.766;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,25:142:99:342,0,4519 +chr19 36633666 . C A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-2.471;DP=258;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=1.64;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,40:257:99:451,0,8421 +chr19 36644093 . G T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.384;DP=109;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:482,0,3282 +chr19 36646695 . A G 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-0.666;DP=60;FS=2.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:729,0,1355 +chr19 36647782 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:373,0,323 +chr19 36647933 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-0.021;DP=30;FS=8.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:425,0,630 +chr19 36647957 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.758;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:511,0,774 +chr19 36667832 . A G 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.864;DP=111;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,31:110:99:745,0,3039 +chr19 36670140 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.494;DP=104;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,25:104:99:518,0,3037 +chr19 36676819 . T C 1200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-0.224;DP=76;FS=9.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1229,0,1281 +chr19 36676851 . G A 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.811;DP=79;FS=5.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,41:78:99:1276,0,1286 +chr19 36680219 . G T 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=-0.888;DP=82;FS=4.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:1350,0,1418 +chr19 36682510 . C T 1626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.908;DP=101;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1655,0,1652 +chr19 36690535 . A T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-1.483;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=14.34;ReadPosRankSum=2.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:444,0,614 +chr19 36690910 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=2.353;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=12.54;ReadPosRankSum=2.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:279,0,414 +chr19 36692467 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.811;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,414 +chr19 36703807 . C T 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-0.973;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1140,0,1180 +chr19 36703870 . T C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.383;DP=102;FS=4.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:454,0,2976 +chr19 36708186 . G T 1236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.240;DP=66;FS=4.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:1265,0,1013 +chr19 36742375 . G T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=-0.083;DP=73;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1249,0,1348 +chr19 36874103 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.015;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:234,0,944 +chr19 36874267 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.510;DP=27;FS=5.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:510,0,770 +chr19 36874428 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.934;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:292,0,579 +chr19 36874592 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-0.842;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:391,0,658 +chr19 36899372 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:295,0,381 +chr19 36922605 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.123;DP=28;FS=5.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:369,0,577 +chr19 36923019 . T C 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.111;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=31.99;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:59:828,0,59 +chr19 36924319 . T A 930.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.187;DP=21;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:68:959,68,0 +chr19 36925267 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.561;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:511,0,612 +chr19 36926000 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.814;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:500,0,749 +chr19 36926608 . A G 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.653;DP=43;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.340;QD=24.86;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1097,0,354 +chr19 36927519 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:432,0,726 +chr19 36927523 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.956;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,726 +chr19 36927899 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-1.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:334,0,324 +chr19 36928358 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.262;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=15.25;ReadPosRankSum=3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:379,0,382 +chr19 36928391 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:379,0,280 +chr19 36928430 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.523;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:376,0,380 +chr19 36928528 . T C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=-0.643;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:709,0,251 +chr19 36931946 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.836;DP=28;FS=10.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:230,0,684 +chr19 36948757 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-2.019;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:431,0,536 +chr19 36967182 . TC T 1214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-4.016;DP=126;FS=11.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=9.64;ReadPosRankSum=3.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,41:109:99:1301,0,3363 +chr19 36967575 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-1.549;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:392,0,675 +chr19 36967660 . A T 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.281;DP=76;FS=3.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:1365,0,2364 +chr19 36972705 . C A 2336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.178;DP=499;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,115:496:99:2365,0,14262 +chr19 36972863 . G T 2823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.441;DP=448;FS=0.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=6.30;ReadPosRankSum=2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,118:448:99:2852,0,12544 +chr19 36977095 . G A 7207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.456;ClippingRankSum=0.115;DP=543;FS=0.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=13.27;ReadPosRankSum=3.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,238:541:99:7236,0,9567 +chr19 36983371 . G A 3981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.675;DP=124;FS=6.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=32.11;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,104:123:99:4010,0,213 +chr19 36986761 . T C 3338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.288;DP=123;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,90:123:99:3367,0,763 +chr19 36994267 . TCCTAAAAGTAAAAAAAAAGCAAATACAAGTTACTCATCAAACACTTTAGGGTGTAAATAAAGAGTAGATGACAAGCTCCACTAA T 3516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=2.017;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=27.02;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,72:74:99:3554,370,0 +chr19 37007517 . T C 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.798;DP=259;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,67:259:99:1433,0,7550 +chr19 37008097 . G A 3852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-2.746;DP=208;FS=4.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,106:208:99:3881,0,3744 +chr19 37043183 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:34:383,0,34 +chr19 37271598 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=25.12;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:405,0,401 +chr19 37273959 . A G 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.317;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:2332,0,4414 +chr19 37273960 . G A 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=1.089;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:2332,0,4375 +chr19 37281702 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.374;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:499,0,2816 +chr19 37347763 . G C 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-1.435;DP=24;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:442,0,347 +chr19 37348197 . A G 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.294;DP=37;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:735,0,448 +chr19 37362517 . C T 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.937;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=26.58;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,41:55:99:1490,0,361 +chr19 37400881 . A C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.049;DP=36;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:773,0,437 +chr19 37663530 . G C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=28.73;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:373,0,53 +chr19 37739852 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.88;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:267,0,100 +chr19 39050690 . G A 2070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.576;DP=365;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,89:365:99:2099,0,27345 +chr19 39050692 . T G 2070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=1.051;DP=371;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,91:371:99:2099,0,27345 +chr19 39051685 . G A 2372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=1.259;DP=448;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,110:448:99:2401,0,12767 +chr19 39054705 . G A 3074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=1.148;DP=401;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,121:401:99:3103,0,10705 +chr19 39169725 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.152;DP=71;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:409,0,2017 +chr19 39250534 . A G 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.917;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1112,0,1083 +chr19 39335189 . C A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.278;DP=38;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:602,0,703 +chr19 39338735 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.654;DP=76;FS=2.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:362,0,2084 +chr19 39346341 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-1.729;DP=72;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:498,0,1969 +chr19 39348703 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.373;DP=55;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:480,0,1458 +chr19 39353629 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-0.084;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,15:87:99:232,0,2787 +chr19 39378360 . A C 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=-0.381;DP=73;FS=4.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1248,0,1235 +chr19 39384399 . A G 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=2.028;DP=52;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:903,0,2130 +chr19 39384405 . T C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=2.238;DP=52;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:903,0,2070 +chr19 39391033 . CAG C 1016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-1.545;DP=52;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,31:49:99:1054,0,906 +chr19 39391261 . G A 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.148;DP=64;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1104,0,1150 +chr19 39474963 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.040;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:360,0,708 +chr19 39475603 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,143 +chr19 39719964 . G A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.320;DP=52;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:871,0,892 +chr19 39720012 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=1.630;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:442,0,1414 +chr19 39793686 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.448;DP=80;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:529,0,2181 +chr19 39806783 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-1.320;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:281,0,1000 +chr19 39875885 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.272;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:236,0,846 +chr19 39875915 . G A 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-2.245;DP=26;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:311,0,512 +chr19 39876286 . A AT 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.024;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:318,0,319 +chr19 39929504 . G A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +chr19 39934808 . A T 290.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:318,0,12 +chr19 39934876 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:231,0,66 +chr19 39971109 . G A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.596;DP=284;FS=2.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,90:284:99:1743,0,23254 +chr19 39994543 . A C 208.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:237,0,18 +chr19 40005310 . A T 8000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=1.266;DP=475;FS=33.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,271:475:99:8029,0,6808 +chr19 40013486 . C T 5779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.335;DP=355;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.295;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,186:353:99:5808,0,5851 +chr19 40013505 . G T 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.095;DP=380;FS=4.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,88:379:99:1749,0,10980 +chr19 40015847 . C A 1847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=-3.335;DP=278;FS=2.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,75:277:99:1876,0,8045 +chr19 40016094 . T C 3195.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.735;DP=287;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,146:287:99:3224,0,21196 +chr19 40016298 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.898;DP=162;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:611,0,5184 +chr19 40016351 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.846;DP=150;FS=16.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,28:150:99:479,0,4872 +chr19 40022584 . TG T 2990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-0.645;DP=53;FS=6.662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=31.41;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:3028,262,0 +chr19 40022755 . G A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-1.006;DP=264;FS=5.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,43:264:99:602,0,18243 +chr19 40022757 . G A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-2.358;DP=268;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,43:268:99:595,0,18243 +chr19 40022798 . G T 5498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.678;DP=348;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,157:346:99:5527,0,7285 +chr19 40022913 . A T 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.362;DP=259;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,63:259:99:1436,0,7650 +chr19 40023197 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.300;DP=143;FS=3.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,28:143:99:363,0,5305 +chr19 40023260 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.753;DP=104;FS=1.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:723,0,4863 +chr19 40023265 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.235;DP=103;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:572,0,4390 +chr19 40023292 . A T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.208;DP=91;FS=9.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:652,0,3294 +chr19 40023431 . A C 1885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.572;DP=144;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,56:144:99:1914,0,2967 +chr19 40023475 . G T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.947;DP=149;FS=4.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,34:149:99:728,0,4616 +chr19 40023760 . T A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.131;DP=187;FS=4.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,40:186:99:329,0,6250 +chr19 40023979 . C A 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.247;DP=260;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,58:260:99:1109,0,7676 +chr19 40024159 . T G 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.832;ClippingRankSum=-0.274;DP=190;FS=3.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,61:190:99:1619,0,4444 +chr19 40024267 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=-0.105;DP=269;FS=7.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,62:269:99:1208,0,7872 +chr19 40024689 . C T 1911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=-1.012;DP=323;FS=0.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,88:323:99:1940,0,8554 +chr19 40026137 . G A 3361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-1.450;DP=230;FS=1.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,101:230:99:3390,0,4122 +chr19 40026169 . G T 3072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.836;DP=207;FS=0.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,89:207:99:3101,0,3848 +chr19 40040511 . G A 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.736;DP=197;FS=0.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,49:197:99:1080,0,8535 +chr19 40040515 . T C 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-0.860;DP=211;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=8.13;ReadPosRankSum=3.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,66:211:99:1744,0,7659 +chr19 40054668 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-1.006;DP=311;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=3.14;ReadPosRankSum=3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,61:311:99:1005,0,9349 +chr19 40057220 . G C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=4.259;DP=206;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=1.03;ReadPosRankSum=-4.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,30:205:99:241,0,6544 +chr19 40066193 . A G 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.024;DP=199;FS=10.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.022;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:918,0,4930 +chr19 40071276 . G A 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.384;DP=208;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,50:208:99:1025,0,5755 +chr19 40102158 . G C 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.475;DP=310;FS=4.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=6.25;ReadPosRankSum=2.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,84:310:99:1965,0,8553 +chr19 40140160 . G A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=1.182;DP=260;FS=3.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=5.01;ReadPosRankSum=2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,63:260:99:1331,0,7432 +chr19 40143070 . C A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.501;DP=229;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,41:229:99:501,0,8124 +chr19 40143127 . C G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.813;DP=231;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,49:231:99:747,0,8512 +chr19 40145876 . A C 1661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=1.428;DP=309;FS=7.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=5.38;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,76:309:99:1690,0,8892 +chr19 40986792 . A T 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-2.105;DP=290;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,67:290:99:1228,0,8096 +chr19 40987103 . A G 3700.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.773;DP=385;FS=1.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.146;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,114:339:99:3738,0,14215 +chr19 40987106 . G A 4124.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-2.898;DP=371;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=11.12;ReadPosRankSum=2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,117:337:99:4162,0,7651 +chr19 40991352 . A C 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;ClippingRankSum=-1.450;DP=308;FS=31.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,36:126:99:1120,0,1072 +chr19 40994419 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.221;DP=41;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:252,0,1127 +chr19 40994455 . G A 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.483;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=28.28;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1131,0,234 +chr19 40994546 . C T 1289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-1.188;DP=46;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,34:46:99:1318,0,263 +chr19 40994898 . T C 240.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:269,0,20 +chr19 40996228 . G GT 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=1.175;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:60:435,0,60 +chr19 40996716 . G T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.581;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:562,0,1087 +chr19 40996777 . G GT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.498;DP=34;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:337,0,396 +chr19 40998017 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:370,0,373 +chr19 40998074 . T A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=17.71;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:347,0,287 +chr19 40998088 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:260,0,254 +chr19 40998379 . G T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-1.429;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=18.36;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:377,0,333 +chr19 40999120 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.827;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:348,0,218 +chr19 40999697 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=-0.698;DP=58;FS=4.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.225;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:232,0,1782 +chr19 40999945 . G A 4704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.129;DP=291;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,122:291:99:4733,0,12845 +chr19 40999948 . T A 4704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.732;DP=298;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,125:298:99:4733,0,12669 +chr19 41001062 . AT A 315.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.992;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:6:351,6,0 +chr19 41006137 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=1.177;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=22.60;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:435,0,255 +chr19 41006625 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.277;DP=44;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:254,0,1264 +chr19 41006719 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-0.647;DP=27;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:256,0,604 +chr19 41007410 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.769;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,108 +chr19 41007678 . A T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.483;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:698,0,1215 +chr19 41007685 . A G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.348;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:578,0,1435 +chr19 41007701 . T G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.178;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:612,0,799 +chr19 41007902 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:291,0,429 +chr19 41008427 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:299,0,385 +chr19 41008558 . A G 870.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.992;DP=24;FS=7.877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:30:899,30,0 +chr19 41008831 . A G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.784;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:494,0,977 +chr19 41009117 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.467;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:400,0,1792 +chr19 41009894 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=-0.175;DP=23;FS=11.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:310,0,1251 +chr19 41009903 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.129;DP=27;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:310,0,1251 +chr19 41011242 . T G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=2.298;DP=46;FS=9.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:570,0,1326 +chr19 41011255 . T A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=1.725;DP=48;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=13.22;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:663,0,1315 +chr19 41011555 . A C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.162;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:370,0,388 +chr19 41012421 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.335;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=14.76;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:471,0,603 +chr19 41012741 . A T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.613;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1648,0,1406 +chr19 41013033 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.690;DP=79;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=3.68;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:319,0,2453 +chr19 41013157 . GTA G 874.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-2.141;DP=52;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:912,0,759 +chr19 41015372 . A G 1597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=1.644;DP=101;FS=8.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:1626,0,1759 +chr19 41015425 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.784;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:616,0,108 +chr19 41030032 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:322,0,284 +chr19 41041094 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.397;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:591,0,667 +chr19 41042214 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.099;DP=36;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:422,0,802 +chr19 41062202 . T G 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=2.068;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=28.23;ReadPosRankSum=2.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:734,0,126 +chr19 41062733 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-1.997;DP=40;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:715,0,566 +chr19 41080352 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.660;DP=32;FS=14.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:579,0,610 +chr19 41080623 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.893;DP=36;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:313,0,954 +chr19 41081299 . C T 823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:60:852,60,0 +chr19 41081305 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=13.34;ReadPosRankSum=-2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:255,0,340 +chr19 41086983 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.042;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:305,0,1538 +chr19 41106230 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-1.835;DP=63;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:438,0,1743 +chr19 41108117 . A G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=-0.520;DP=92;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:978,0,2110 +chr19 41108163 . G A 3317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-1.053;DP=130;FS=4.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,88:130:99:3346,0,1140 +chr19 41115486 . C A 2320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-1.009;DP=81;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=28.65;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,62:81:99:2349,0,403 +chr19 41117473 . C T 2516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.842;DP=155;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=16.24;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:2545,0,2670 +chr19 41123302 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-2.386;DP=115;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=3.22;ReadPosRankSum=2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:398,0,3627 +chr19 41123443 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.412;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,28:147:99:448,0,4465 +chr19 41139983 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=21.49;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,200 +chr19 41140577 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=-0.038;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:436,0,680 +chr19 41142916 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.069;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,548 +chr19 41148179 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr19 41286007 . T G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=2.621;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:298,0,384 +chr19 41287033 . C T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=-1.866;DP=47;FS=2.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:772,0,832 +chr19 41287201 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.395;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:457,0,895 +chr19 41287202 . C A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=0.718;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:457,0,874 +chr19 41287220 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.231;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=15.73;ReadPosRankSum=-2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:453,0,1233 +chr19 41287289 . TC T 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.723;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=9.72;ReadPosRankSum=3.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:329,0,280 +chr19 41287445 . T C,A 1135.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,17:21:99:1169,1067,2331,163,0,154 +chr19 41287468 . T C 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,25:25:99:1003,0,154 +chr19 41287919 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.936;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:247,0,838 +chr19 41288207 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=1.350;DP=19;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=29.41;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:587,0,112 +chr19 41289904 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.158;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:282,0,289 +chr19 41290008 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-0.609;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:450,0,206 +chr19 41290324 . C T 717.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=30.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:19:746,0,19 +chr19 41290387 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:248,0,465 +chr19 41291339 . C T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr19 41291515 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.113;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.154;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:340,0,346 +chr19 41292233 . GT G 521.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=1.279;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:559,0,111 +chr19 41292282 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,848 +chr19 41300616 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.560;DP=121;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:416,0,3365 +chr19 41308037 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.934;DP=124;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,32:124:99:752,0,10171 +chr19 41308042 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=-1.479;DP=123;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,34:123:99:740,0,10171 +chr19 41501468 . T C 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-0.982;DP=62;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:718,0,1380 +chr19 41512489 . C T 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.164;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=31.38;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:54:907,0,54 +chr19 41850380 . CGGTAAAACACACACAAATATTACAAAAAAAACTATTAAAAAAAATAACAACGTGCTAATGCTAAACACATCCGCA C 4533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=1.701;DP=112;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:4571,360,0 +chr19 41852972 . C T 1396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=-0.594;DP=95;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:1425,0,1638 +chr19 41856356 . G A 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=1.135;DP=83;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1405,0,1471 +chr19 41859566 . G GA 672.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-1.097;DP=41;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=16.41;ReadPosRankSum=-1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:710,0,224 +chr19 41860509 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr19 41954347 . AGTGAGTATCACAACCAACATCCTACAATGAATCTCTTAAGTCCACTTTGTAGCATATAAGTCCATCACCTTTCATTTTTTCAG A 2409.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=1.723;DP=401;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,393:395:99:17873,1333,0 +chr19 41954835 . A G 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=-5.277;DP=374;FS=62.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=4.23;ReadPosRankSum=-1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,175:223:99:1612,0,345 +chr19 41962160 . G GT 3144.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.323;DP=313;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,146:293:99:3182,0,3960 +chr19 41962516 . GT G 4739.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-1.510;DP=352;FS=10.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,178:346:99:4777,0,4989 +chr19 41962833 . T A 4844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-2.524;DP=281;FS=8.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,135:281:99:4873,0,4738 +chr19 41973741 . G C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.351;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:599,0,424 +chr19 41988355 . C T 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:234,0,25 +chr19 41994407 . C T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.770;DP=51;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:602,0,1113 +chr19 41994536 . C A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.878;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:926,0,1129 +chr19 41994926 . G A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-0.750;DP=35;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:699,0,509 +chr19 41995221 . C T 927.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.669;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=33.13;ReadPosRankSum=-2.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:6:955,0,6 +chr19 41995711 . T TC 931.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:969,72,0 +chr19 41999534 . C A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.493;DP=74;FS=9.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:506,0,2124 +chr19 41999613 . C A 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-1.266;DP=82;FS=7.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1290,0,1580 +chr19 42017693 . T C 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=1.878;DP=81;FS=3.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.53;ReadPosRankSum=-1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,54:81:99:1772,0,890 +chr19 42017705 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-0.900;DP=79;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:806,0,1630 +chr19 42040835 . C A 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:531,39,0 +chr19 42087943 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.032;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:274,0,517 +chr19 42120542 . A T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:445,33,0 +chr19 42120618 . C CA 203.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:31:300,31,0 +chr19 42121092 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.122;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=17.25;ReadPosRankSum=-2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:356,0,325 +chr19 42121507 . G GA 388.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:426,30,0 +chr19 42121511 . G A 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 +chr19 42122918 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.977;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,175 +chr19 42123608 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.212;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:368,0,264 +chr19 42123722 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.872;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:275,0,247 +chr19 42124194 . T C 285.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.78;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:314,0,13 +chr19 42124724 . A C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr19 42125438 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:282,0,102 +chr19 42125999 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:284,0,406 +chr19 42126131 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=1.562;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,305 +chr19 42126665 . A C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-1.002;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:336,0,210 +chr19 42126774 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:262,0,108 +chr19 42128264 . C T 876.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:905,66,0 +chr19 42128451 . AT A 533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:571,39,0 +chr19 42138751 . G C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,186 +chr19 42138901 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:354,0,122 +chr19 42141307 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.488;DP=17;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:360,0,205 +chr19 42149194 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=1.861;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:232,0,727 +chr19 42149473 . G C 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr19 42149713 . T C 323.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=32.39;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:352,0,15 +chr19 42150209 . A G 1084.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:81:1113,81,0 +chr19 42151006 . T C 453.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=34.90;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:6:481,0,6 +chr19 42151161 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-1.960;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=23.63;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:430,0,203 +chr19 42151383 . G T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.595;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=15.89;ReadPosRankSum=-1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:616,0,597 +chr19 42178470 . A C 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.216;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:558,0,296 +chr19 42442284 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.244;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:237,0,1611 +chr19 42443198 . C CT 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-2.860;DP=145;FS=18.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,32:136:99:415,0,2851 +chr19 42472986 . A AC 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.803;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:266,0,951 +chr19 42473056 . CT C 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.322;DP=25;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:335,0,242 +chr19 42475901 . A AC 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.634;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:387,0,230 +chr19 42476202 . T G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.765;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:399,0,651 +chr19 42476410 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.442;DP=37;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:238,0,1015 +chr19 42476972 . G T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.857;DP=66;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:430,0,1822 +chr19 42484870 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.472;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:504,0,935 +chr19 42488197 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.925;DP=100;FS=5.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:681,0,2808 +chr19 42505645 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.014;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:299,0,1162 +chr19 42510796 . A G 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=1.048;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:539,0,555 +chr19 42540367 . T C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-1.767;DP=98;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,27:97:99:687,0,2718 +chr19 43242028 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=1.073;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:448,0,1417 +chr19 43252826 . G C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.687;DP=58;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:395,0,1536 +chr19 43260585 . GA G 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.231;DP=49;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:261,0,738 +chr19 43260705 . C A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=2.076;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:447,0,904 +chr19 43261179 . T G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.175;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:449,0,1228 +chr19 43261277 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.537;DP=24;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:322,0,821 +chr19 43262002 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:254,0,415 +chr19 43262160 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:410,0,626 +chr19 43263908 . TA T 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.236;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:431,0,834 +chr19 43263964 . G GA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-2.021;DP=50;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:443,0,579 +chr19 43264750 . T G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=1.033;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=7.46;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:237,0,756 +chr19 43265136 . GT G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.946;DP=52;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:278,0,311 +chr19 43338874 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=1.725;DP=127;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,25:127:99:522,0,8263 +chr19 43338876 . A C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=1.662;DP=130;FS=0.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,26:130:99:517,0,8263 +chr19 43366061 . T C 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.720;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=18.04;ReadPosRankSum=2.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:930,0,1713 +chr19 43366662 . C T 2982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=36.33;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,8:11:99:3011,218,0 +chr19 43367040 . A G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.321;DP=75;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:479,0,2754 +chr19 43368368 . C T 2626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-1.179;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=31.27;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,68:84:99:2655,0,402 +chr19 43369496 . CT C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.176;DP=25;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:246,0,244 +chr19 43369704 . T C 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:502,36,0 +chr19 43369922 . TTA T 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.212;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:265,0,848 +chr19 43370114 . AC A 530.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:25:568,25,0 +chr19 43374653 . C A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-0.860;DP=71;FS=7.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:330,0,2103 +chr19 43393641 . G T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.841;DP=48;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:531,0,966 +chr19 43399146 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=-1.380;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:278,0,1858 +chr19 43420733 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-0.143;DP=57;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:275,0,1698 +chr19 43450742 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.301;DP=70;FS=8.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:275,0,2110 +chr19 43583379 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:251,18,0 +chr19 43585606 . TA T 324.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:362,36,0 +chr19 43599241 . C A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-2.499;DP=149;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:644,0,10051 +chr19 43599302 . C A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=-0.226;DP=147;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:623,0,10050 +chr19 43628551 . C T 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.026;DP=197;FS=5.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,51:194:99:1163,0,5278 +chr19 43749709 . C G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.497;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:371,0,1672 +chr19 43756394 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-2.020;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:325,0,2025 +chr19 43784101 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:264,0,126 +chr19 43793836 . T G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.088;DP=30;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:578,0,479 +chr19 43849319 . T C 2288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.670;DP=609;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:481,127:608:99:2317,0,18205 +chr19 43859091 . CAGGTGATGTAGCTGCTGCTTTCTTTTTTTTTTCCTTTTGTTAAACTATGCATCTTATTAACACTCCATTCCTTTGATAAA C 17109.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.179;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,396:397:99:17147,1338,0 +chr19 43861269 . G C 1289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=-0.469;DP=224;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,60:224:99:1318,0,11497 +chr19 43861998 . TA T 2131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.482;DP=149;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,105:131:99:2169,0,2589 +chr19 43862457 . A T 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.043;DP=175;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,51:174:99:1257,0,4763 +chr19 43935956 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.959;DP=76;FS=3.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:364,0,2181 +chr19 43937346 . TTA T 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.502;DP=45;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:319,0,946 +chr19 43977821 . ACTGCAAAAAAACAAACAAACGATTAGTGGCTCAATAAAATAGAAGTGAATATTTGCAGATTCATTGTTTATTATTTCAGCTTAC A 17586.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=2.096;DP=409;FS=8.831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=29.60;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,406:409:99:17624,1494,0 +chr19 43980629 . T A 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=3.405;DP=384;FS=12.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=2.47;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,68:384:99:978,0,12491 +chr19 44019137 . C T 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=2.568;DP=89;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=18.55;ReadPosRankSum=2.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1679,0,2878 +chr19 44019139 . A C 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=2.568;DP=89;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1679,0,2878 +chr19 44157473 . T A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-2.135;DP=34;FS=14.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:322,0,857 +chr19 44163771 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=3.013;DP=46;FS=23.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:264,0,1314 +chr19 44165196 . TACCTGTATATAGAGAGCACCAATGAGGAAATCCTACATACAAACTACAAACATTCAATACTGTCTGAGTTGATGATCAACTAACTG T 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:260,0,1233 +chr19 44170606 . AT A 214.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:252,0,16 +chr19 44174144 . CACCTAAATAAAAGAGAGACACTTTAAAAACAAGCACTCTACTGGGATGTTCTGTGTAATAAGGCAGAAATGT C 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.068;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,2043 +chr19 44179879 . C CA 209.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:320,33,0 +chr19 44193977 . AT A 1068.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1106,112,0 +chr19 44208659 . AC A 349.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:29:387,29,0 +chr19 44208661 . ACAC A 349.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:387,29,0 +chr19 44210080 . C A 1157.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:84:1186,84,0 +chr19 44214563 . G GA 432.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:470,41,0 +chr19 44215263 . CACACACTCTTTTATGTCCTCTGTAGCGTAAGATAAAACACACTGTAATAACATGCTTGTTTTTTGCCTTTAGAT C 2360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.466;ClippingRankSum=0.250;DP=257;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,85:254:99:2398,0,6505 +chr19 44289111 . A T 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:241,0,25 +chr19 44369482 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.484;DP=61;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:368,0,1691 +chr19 44370945 . G GT 276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 +chr19 44370950 . C T 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 +chr19 44372363 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.740;DP=31;FS=8.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:263,0,908 +chr19 44374893 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,247 +chr19 44376373 . G A 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.310;DP=303;FS=12.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=3.03;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,60:303:99:945,0,9141 +chr19 44401308 . T A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.446;DP=306;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=3.59;ReadPosRankSum=2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,64:306:99:1126,0,9220 +chr19 44404789 . G A 1610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.191;DP=297;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,72:296:99:1639,0,8588 +chr19 44420284 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.542;DP=34;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:447,0,677 +chr19 44444394 . A C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.113;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:322,0,1197 +chr19 44445325 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-1.953;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:77:579,0,77 +chr19 44445771 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,289 +chr19 44446888 . AT A 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-1.087;DP=33;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:421,0,1262 +chr19 44447543 . TC T 632.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.390;DP=62;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:670,0,740 +chr19 44462566 . A G 238.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:267,0,20 +chr19 44489293 . G A 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.182;DP=122;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,36:122:99:918,0,3233 +chr19 44498933 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=1.803;DP=69;FS=19.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:401,0,3147 +chr19 44505088 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-0.408;DP=58;FS=6.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:410,0,1666 +chr19 44515315 . CCAGGTACTTTATATTTAAATTAGGAATGAGATGAGATGTGATGTCATATTGTATGTCTAATTGTAAGTCGATTCTGGCTTCTTCTGT C 4834.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.049;DP=115;FS=3.136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=31.13;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:4872,451,0 +chr19 44519439 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=1.622;DP=78;FS=9.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:534,0,2121 +chr19 44521571 . C T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 +chr19 44521574 . T A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:351,24,0 +chr19 44522160 . A AT 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.135;DP=62;FS=7.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,33:56:99:634,0,481 +chr19 44528147 . CT C 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.979;DP=21;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:292,0,114 +chr19 44529054 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,182 +chr19 44586555 . CCT C 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=1.374;DP=112;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,39:111:99:1332,0,2232 +chr19 44610733 . T C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.479;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,35:160:99:689,0,4871 +chr19 44610808 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.484;DP=151;FS=2.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=1.97;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,25:150:99:326,0,4752 +chr19 44629623 . A G 2503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.294;DP=319;FS=5.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,99:318:99:2532,0,11724 +chr19 44633715 . CTG C 1551.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=-1.367;DP=109;FS=9.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:2:1587,0,2 +chr19 44692749 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.617;DP=266;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,58:266:99:1081,0,10037 +chr19 44693646 . A G 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-1.064;DP=280;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,64:280:99:1252,0,8069 +chr19 44781183 . G GA 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.916;DP=90;FS=4.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:358,0,1547 +chr19 44782050 . A G 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.065;DP=89;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:1044,0,2037 +chr19 44782807 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:90:392,0,90 +chr19 44782988 . AT A 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.693;DP=46;FS=6.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:474,0,1327 +chr19 44783110 . C CA 1609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:99:1647,144,0 +chr19 44783603 . AG A 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.277;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=8.43;ReadPosRankSum=2.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:366,0,806 +chr19 44783975 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=-0.259;DP=29;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:271,0,1105 +chr19 44784923 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-1.535;DP=64;FS=10.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:429,0,1832 +chr19 44786611 . GT G 694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.358;DP=59;FS=4.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.78;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:732,0,757 +chr19 44786719 . T A 1029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-2.273;DP=79;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:1058,0,2016 +chr19 44787621 . G GTT 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=-0.138;DP=30;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:650,0,328 +chr19 44788261 . GTCCTAATATTTCAAATAATTGTAATGCATAAGTTTTTTTTTTTATAATAATGTTGTCAAAAAATAGGGGA G 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.126;DP=41;FS=3.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:530,0,8630 +chr19 44788338 . GGC G 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=-1.351;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=16.68;ReadPosRankSum=-1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:521,0,8630 +chr19 44789126 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.436;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:243,0,1969 +chr19 44820709 . TCTGAATGACAAAACCATATGAGTGAGATGCATAAAGCTGAATAATTTCATCAGAATATCCCGCCTGCCTCAC T 691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.066;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=30.53;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:729,0,490 +chr19 44850055 . TCTGCACAGAAACAGCACTGTTACGCTGCAGCCCAGTAGAGAAACAGTGGATTACTGCTGCTGGTGTGTAGTCTTAC T 1707.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.973;DP=92;FS=12.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:1745,0,4096 +chr19 44850057 . TGCACAG T 1837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.204;DP=91;FS=14.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:1875,0,4090 +chr19 44850065 . AACAGCACTGTTACGCTGCAGCCC A 1837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-1.284;DP=91;FS=14.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:1875,0,4090 +chr19 44850092 . AGAGAAACAGTGGATTACTGCTGCTGGTGTGTAGTCTTACCTAGAGTG A 1837.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.924;DP=101;FS=9.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1875,0,4090 +chr19 44858277 . G A 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=-0.089;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1631,0,983 +chr19 44874462 . T C 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:307,24,0 +chr19 44889794 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=1.924;DP=46;FS=4.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:741,0,799 +chr19 44968441 . G A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-0.555;DP=40;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=17.92;ReadPosRankSum=2.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:745,0,754 +chr19 44972077 . TC T 374.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=28.27;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:23:412,23,0 +chr19 45040894 . T G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.802;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,30:131:99:661,0,3946 +chr19 45041354 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.014;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:414,0,2112 +chr19 45049874 . C T 2392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-2.044;DP=184;FS=2.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=13.00;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,68:166:99:2421,0,3313 +chr19 45088636 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=1.421;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:458,0,630 +chr19 45090630 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=10.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:326,0,231 +chr19 45092363 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.708;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,556 +chr19 45138375 . A T 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:665,45,0 +chr19 45138424 . T G 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:261,21,0 +chr19 45152760 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.760;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,460 +chr19 45153322 . C G 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.434;DP=35;FS=3.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:798,0,411 +chr19 45153343 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.567;DP=39;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:500,0,789 +chr19 45288697 . CAGGTATGTCTACAACTGTGATTTAAGAAACAAAGTTGGTCTAACTTGACTATAGTTGATTTTAAACCATCACTGTTCTCCTCCTCT C 5914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:5952,522,0 +chr19 45325872 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=1.777;DP=54;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:343,0,2654 +chr19 45326070 . CG C 834.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:872,85,0 +chr19 45326183 . T C 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:657,48,0 +chr19 45362352 . T A 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-1.505;DP=311;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.03;ReadPosRankSum=-2.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,68:311:99:1281,0,8999 +chr19 45397985 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=1.459;DP=322;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=1.04;ReadPosRankSum=2.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,46:318:99:362,0,10465 +chr19 45405364 . T G 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=3.116;DP=23;FS=13.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:676,0,140 +chr19 45405909 . A G 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.030;DP=22;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=27.76;ReadPosRankSum=-1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:62:639,0,62 +chr19 45406428 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.645;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:232,0,772 +chr19 45407163 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=2.475;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=19.48;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,294 +chr19 45407329 . AT A 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:25:297,25,0 +chr19 45408604 . T TG 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.922;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:668,0,1867 +chr19 45448836 . G T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.629;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:470,0,856 +chr19 45466549 . GA G 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.555;ClippingRankSum=0.967;DP=40;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:373,0,881 +chr19 45468147 . G T 284.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:313,21,0 +chr19 45470836 . T G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=13.68;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:388,0,428 +chr19 45470918 . AT A 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.350;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:64:401,0,64 +chr19 45471570 . TG T 408.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:446,36,0 +chr19 45471868 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:298,0,230 +chr19 45474573 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=24.67;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,177 +chr19 45477292 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.368;DP=71;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:419,0,1962 +chr19 45477376 . T C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.478;DP=64;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:842,0,1374 +chr19 45480339 . C T 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-2.142;DP=45;FS=3.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.44;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,36:45:99:1398,0,161 +chr19 45480420 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.420;DP=76;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:648,0,1898 +chr19 45482542 . A G 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr19 45482965 . T A 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-0.664;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:962,0,1478 +chr19 45560632 . G A 4514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=3.039;DP=718;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.29;ReadPosRankSum=5.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:525,193:718:99:4543,0,19912 +chr19 45566663 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.676;DP=38;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:311,0,1019 +chr19 45629442 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,105 +chr19 46885449 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.153;DP=220;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,37:220:99:414,0,6959 +chr19 46891402 . GAGGTAAAAGACAGTTTATACACACACAGACACGGGTTTGGTGGTCCGGCATGTGTGTGTGTGATGTGTGTGTGTGTCTTTGTGTAC G 5286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=-2.388;DP=202;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,141:190:99:5324,0,2828 +chr19 46914377 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=-0.022;DP=29;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:392,0,568 +chr19 46935457 . G C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=1.139;DP=112;FS=4.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:319,0,3360 +chr19 46953868 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-4.247;DP=51;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:344,0,3108 +chr19 46954283 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=1.129;DP=64;FS=6.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:287,0,1939 +chr19 47034131 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.792;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:419,0,2588 +chr19 47137543 . ATGTGTGTGCGTGTG A 297.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:29:335,29,0 +chr19 47138005 . C CA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.877;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:257,0,242 +chr19 47285674 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.550;DP=47;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:471,0,1049 +chr19 47285815 . T A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=-0.499;DP=42;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:469,0,907 +chr19 47456467 . C T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-0.012;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:717,0,793 +chr19 47472881 . A G 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=-0.900;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=24.07;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:991,0,304 +chr19 47473735 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.921;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:474,0,418 +chr19 47715308 . G A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=1.357;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:489,0,375 +chr19 47716211 . T C 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 +chr19 47716351 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:268,0,277 +chr19 47716360 . A C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=29.97;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:268,0,277 +chr19 47716524 . A T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=1.641;DP=67;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:824,0,1550 +chr19 47723441 . G T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.853;DP=95;FS=11.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.523;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:455,0,2752 +chr19 47723940 . T A 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 +chr19 47723941 . T C 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 +chr19 47777934 . C T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.074;DP=98;FS=10.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,35:98:99:1145,0,2199 +chr19 47778464 . C A 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.874;DP=92;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:1452,0,1679 +chr19 47778623 . C A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=1.854;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:522,0,851 +chr19 47778684 . CA C 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.758;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.907;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:349,0,349 +chr19 47779243 . A T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.940;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:421,0,2408 +chr19 47890497 . A T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.209;DP=155;FS=3.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,37:154:99:659,0,4322 +chr19 47900651 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-0.392;DP=156;FS=1.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,30:155:99:518,0,4601 +chr19 47905511 . C A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.471;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,33:130:99:776,0,3964 +chr19 47919620 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.596;DP=99;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:435,0,2984 +chr19 48053338 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=1.244;DP=47;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:331,0,1106 +chr19 48208266 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.345;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.46;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:489,0,490 +chr19 48210244 . A C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.975;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:371,0,337 +chr19 48210327 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.306;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:240,0,497 +chr19 48211628 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.596;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:313,0,584 +chr19 48212639 . A C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.552;DP=34;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:328,0,900 +chr19 48214351 . CT C 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.506;DP=28;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:270,0,384 +chr19 48269651 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.104;DP=39;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:384,0,937 +chr19 48271436 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,1:14:99:404,0,450 +chr19 48324743 . G GCA 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.680;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:469,0,532 +chr19 48325456 . GGACATTCTCCAGCACACACTCTCGCACACACACTCTCTTGTGCACACTCTCACTCTCACACACACTCTCAAGCA G 464.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.985;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=23.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:0:499,0,0 +chr19 48325787 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=23.04;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:443,0,200 +chr19 48325865 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-2.419;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:289,0,1043 +chr19 48326640 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-2.306;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:496,0,993 +chr19 48403502 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.377;DP=220;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,37:220:99:421,0,7183 +chr19 48524242 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr19 48680114 . C A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.416;DP=33;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:595,0,523 +chr19 49093447 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.034;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,18:93:99:314,0,2827 +chr19 49095680 . C T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-1.844;DP=227;FS=8.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,67:226:99:1567,0,9855 +chr19 49095855 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=-1.033;DP=146;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,27:146:99:449,0,7158 +chr19 49203355 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.293;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:257,0,895 +chr19 49503486 . T C 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=-2.269;DP=121;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=3.72;ReadPosRankSum=2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:478,0,3638 +chr19 49503769 . T A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.919;DP=67;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:352,0,1966 +chr19 49519707 . T G 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-1.407;DP=242;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,52:241:99:1009,0,7337 +chr19 49521100 . A AT 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.038;DP=133;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:411,0,1866 +chr19 49521731 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.237;DP=140;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,27:139:99:311,0,5496 +chr19 49528855 . G A 2063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-0.634;DP=218;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,70:218:99:2092,0,11300 +chr19 49528858 . G A 2063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.678;DP=210;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,70:210:99:2092,0,11300 +chr19 49530193 . G A 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.523;DP=244;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,56:244:99:1147,0,12478 +chr19 49532901 . G T 1452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.346;DP=265;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,67:262:99:1481,0,9828 +chr19 49533890 . GAC G 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.304;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:342,0,416 +chr19 49535081 . C A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.619;DP=29;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=23.10;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:698,0,342 +chr19 49720949 . A C 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.346;DP=311;FS=3.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,72:311:99:1500,0,9350 +chr19 49721193 . C T 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-1.974;DP=239;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,48:237:99:862,0,7249 +chr19 49723000 . TCTGAGACAGAAGAGGAGACTCAGTGTCAGCTATAATCAGTGTTCAGATCATCATGTGGTAATATCGGTCTCTCTGTAC T 17362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=-0.656;DP=372;FS=2.342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,356:359:99:17400,1405,0 +chr19 49723100 . G A 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=-1.808;DP=391;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=4.18;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,88:391:99:1663,0,13980 +chr19 49724928 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-1.174;DP=381;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,62:381:99:575,0,12443 +chr19 49725331 . TCCTGCACACCACAGAAGAAGAGCAGGTGAGAAAACACTTCCTGCAGAAAACACCTTCCAGCTTCATTGGTCGAGCGGCACGCA T 2108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-2.527;DP=391;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,125:372:99:2146,0,16668 +chr19 49725332 . CCTG C 8055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-0.946;DP=384;FS=0.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,234:369:99:8093,0,6388 +chr19 49725339 . ACCACAGAAGAAGAGCAGGTGAGAAAACACTTCCTGCAGAAAACACCTTCCAGCTTCATTGGTCGAGCGGCACGCACCACG A 8026.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.473;DP=403;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=19.92;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,247:389:99:8064,0,6389 +chr19 49742858 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-0.136;DP=295;FS=17.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,63:295:99:1288,0,9303 +chr19 49750785 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.393;DP=87;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:356,0,2710 +chr19 49750860 . A T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.779;DP=32;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.59;ReadPosRankSum=3.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:527,0,778 +chr19 49750863 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.742;DP=29;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.30;ReadPosRankSum=-2.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:356,0,1214 +chr19 49750872 . A T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=29.96;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:527,0,794 +chr19 49752723 . ACTGAAACACACACACACACACAGGGAGAGAGAGAGAGAGACTCTGAACACACTGCTGCGCACACACAGAGCATGATGGGATATGAAGTGAGGATTCAC A 7781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=1.367;DP=180;FS=6.812;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,175:180:99:7819,695,0 +chr19 49756564 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-1.323;DP=20;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:261,0,750 +chr19 49756576 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.875;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:99:251,0,750 +chr19 49764374 . TG T 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:272,0,743 +chr19 49764376 . TGTGTGTG T 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:272,0,743 +chr19 49768257 . ACGCG A 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=-2.993;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=34.76;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:663,0,453 +chr19 49768265 . ACACTCCTCTGCGGAGACGCG A 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.646;DP=24;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:424,0,655 +chr19 49775588 . C T 1767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.133;DP=466;FS=16.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,99:466:99:1796,0,14101 +chr19 49783816 . G T 2048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.365;DP=339;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=6.04;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,92:338:99:2077,0,8723 +chr19 49783939 . C T 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.144;DP=392;FS=4.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:323,69:392:99:879,0,12015 +chr19 49784688 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-0.215;DP=150;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,28:150:99:433,0,4710 +chr19 49800404 . A G 4460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.729;DP=294;FS=7.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,130:294:99:4489,0,5482 +chr19 49800454 . CACACACACACACACACACACAG C 347.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=32.98;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:83:385,83,0 +chr19 49801007 . G A 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.294;DP=406;FS=0.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=4.44;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:314,92:406:99:1829,0,11789 +chr19 49802601 . G A 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.523;DP=507;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:401,106:507:99:1930,0,15032 +chr19 49803381 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.484;DP=329;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=2.41;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,60:328:99:820,0,10424 +chr19 49803890 . TCTGAAGACAAAACATCCACCATCAGCAGATTTCCCACACTCCCCTTCCCCTTAAAGTGTCTGTAGACTTAC T 14114.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=2.363;DP=325;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,316:323:99:14152,1049,0 +chr19 49804751 . C G 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;ClippingRankSum=0.916;DP=287;FS=3.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,53:287:99:800,0,8731 +chr19 49810396 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-1.703;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,49:215:99:1009,0,5986 +chr19 49810407 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=-1.053;DP=243;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,38:241:99:300,0,7539 +chr19 49813107 . CCCTGAGGAAAGAAGACGAGCAGCGGTCAGTACAGCGCTTCCCCAGATCAGCACACACACACACACACACACACACACACACACTCCTCAGCACACAGAACACACA C 14507.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.451;DP=395;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=29.20;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,365:367:99:14545,1116,0 +chr19 49815177 . T TGA 1112.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:88:1379,88,0 +chr19 49819406 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,320 +chr19 49820069 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.047;DP=90;FS=12.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:231,0,2640 +chr19 49820264 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.731;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:269,0,2458 +chr19 49821042 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.492;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:273,0,2479 +chr19 49852588 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.511;DP=358;FS=5.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,70:356:99:860,0,14375 +chr19 49868466 . T TGATGAA 914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.472;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=26.14;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:40:952,40,0 +chr19 49871744 . A G 1409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1438,102,0 +chr19 49873721 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.481;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:385,0,3032 +chr19 49873753 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.432;DP=63;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:430,0,1779 +chr19 49877229 . A C 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-1.307;DP=166;FS=0.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,37:165:99:745,0,5315 +chr19 49877518 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:250,0,481 +chr19 49877531 . G T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,162 +chr19 49970049 . G C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.756;DP=124;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,28:124:99:577,0,3763 +chr19 49971253 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.014;DP=42;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:308,0,1159 +chr19 49972976 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.718;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:296,0,1159 +chr19 49973511 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.171;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=16.77;ReadPosRankSum=-2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:565,0,1401 +chr19 49973519 . G T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.111;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=16.27;ReadPosRankSum=-3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:565,0,1416 +chr19 49973574 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=1.109;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,441 +chr19 50054542 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.063;DP=47;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:292,0,1301 +chr19 50076582 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-1.517;DP=57;FS=2.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:284,0,3407 +chr19 50076583 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=-1.727;DP=56;FS=2.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:284,0,3407 +chr19 50089711 . A G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.119;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:356,0,1892 +chr19 50139670 . C G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-0.784;DP=86;FS=6.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:454,0,2479 +chr19 50140233 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.101;DP=101;FS=4.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,23:101:99:472,0,2915 +chr19 50177171 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.728;DP=95;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:445,0,2784 +chr19 50184622 . T C 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=-0.419;DP=133;FS=3.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,43:128:99:1412,0,2964 +chr19 50209222 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=-0.542;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:263,0,1709 +chr19 50211388 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-0.689;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:405,0,1153 +chr19 50211474 . C A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.760;DP=64;FS=3.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:514,0,1624 +chr19 50215773 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.372;DP=63;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1249,0,820 +chr19 50234798 . A ATT 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-2.654;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:272,0,278 +chr19 50238473 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=1.044;DP=43;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:271,0,1150 +chr19 50238948 . G T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-1.451;DP=57;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:694,0,1144 +chr19 50246714 . A AGT 210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:248,21,0 +chr19 50248274 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=1.186;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=18.62;ReadPosRankSum=-1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:233,0,226 +chr2 24255 . T TG 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=15;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:302,0,134 +chr2 24258 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=26.03;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:302,0,134 +chr2 334844 . A T 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.628;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1061,0,625 +chr2 334907 . G C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:279,0,548 +chr2 335054 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-1.558;DP=81;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:281,0,2483 +chr2 335961 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:369,0,430 +chr2 345601 . T C 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=-3.298;DP=51;FS=8.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:736,0,1140 +chr2 740216 . A G 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:447,30,0 +chr2 1106184 . T G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.256;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:304,0,170 +chr2 1128514 . TCTGAAAAAACAACAACACAGAAAACAGATTGCAAATCACAATCAGTGCAGTTTTACACACTGTTGTTTGAATAAAATAAATTAAATTAAGCGTAC T 950.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-0.429;DP=38;FS=9.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:989,0,4343 +chr2 1332741 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=1.246;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=23.49;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:404,0,177 +chr2 1409521 . T C 3856.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3885,280,0 +chr2 1529601 . T G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=1.830;DP=51;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:365,0,1287 +chr2 1565636 . A G 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-3.357;DP=69;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=16.62;ReadPosRankSum=2.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1175,0,1190 +chr2 1701941 . C A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr2 1755605 . A C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.915;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=6.53;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:348,0,516 +chr2 1801522 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-1.259;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:340,0,492 +chr2 1803769 . G T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.280;DP=43;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:766,0,703 +chr2 1805567 . T G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.043;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:655,0,339 +chr2 1805633 . T C 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.090;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:776,0,494 +chr2 1806027 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:521,0,518 +chr2 1806051 . G T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-1.364;DP=37;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:502,0,663 +chr2 1823672 . AT A 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.902;DP=44;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=6.31;ReadPosRankSum=-3.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:320,0,449 +chr2 1920895 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.715;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=27.91;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:419,0,265 +chr2 2084835 . CT C 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 +chr2 2335249 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.122;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:368,0,231 +chr2 2368809 . A T 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.687;DP=142;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,48:140:99:1668,0,8014 +chr2 2368925 . T C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=-3.261;DP=232;FS=15.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,45:232:99:770,0,7169 +chr2 2369572 . T G 5557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=-0.969;DP=335;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,174:323:99:5586,0,5032 +chr2 2376478 . TCCTAAAACACACACGGATGAGGCTTTCACATGATGAAGACTTTACATGATGTTTCATCAGCACAACAGAGTTCAGTGTA T 13201.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.490;DP=307;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,286:288:99:13239,1150,0 +chr2 2376581 . C T 4938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-3.912;DP=304;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,160:304:99:4967,0,4914 +chr2 2412623 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-1.858;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=19.20;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:393,0,253 +chr2 2414941 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:555,0,237 +chr2 2416128 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=20.63;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:317,0,210 +chr2 2416173 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,261 +chr2 2424411 . GA G 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.033;DP=23;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.473;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:298,0,265 +chr2 2424490 . C G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=1.517;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:269,0,448 +chr2 2424497 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,448 +chr2 2443102 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:272,0,139 +chr2 2472560 . T C 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=2.739;DP=27;FS=14.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=32.44;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:904,0,137 +chr2 2514302 . G GT 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=-2.157;DP=185;FS=8.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,37:176:99:393,0,3855 +chr2 2899792 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=5.154;DP=190;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,47:171:99:361,0,8682 +chr2 2934060 . AGTTGGTTCTTCCAGTTTTGTTTTTCATTCTTCATTTTTTGCTCCGCACATTGAACCGTTAACTCATGATGAATTTCTCATCTTTCTGCAG A 10939.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=1.445;DP=237;FS=1.962;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,233:237:99:10977,932,0 +chr2 2941314 . C T 2175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=6.281;DP=123;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=17.69;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:2204,0,2302 +chr2 2941350 . G A 2374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.717;ClippingRankSum=-0.536;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=16.72;ReadPosRankSum=-4.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:2403,0,2068 +chr2 2941362 . G A 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-2.819;DP=127;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:2318,0,1994 +chr2 2941598 . G GTA 765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.952;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=26.40;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:803,0,213 +chr2 2941745 . A G 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.186;DP=60;FS=6.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,39:60:99:1443,0,1457 +chr2 2941746 . G A 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.683;DP=62;FS=8.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,39:61:99:1443,0,1457 +chr2 2970263 . T C 669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=-0.397;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,33:123:99:707,0,3431 +chr2 3008464 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-3.824;DP=108;FS=6.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:308,0,3271 +chr2 3024658 . C A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.256;DP=133;FS=6.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,36:133:99:882,0,3578 +chr2 3032557 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-1.090;DP=97;FS=4.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:501,0,2928 +chr2 3034249 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=1.721;DP=122;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:303,0,3814 +chr2 3051648 . GA G 1018.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-2.698;DP=94;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,52:82:99:1056,0,491 +chr2 3051886 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-1.393;DP=111;FS=8.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,23:111:99:461,0,3538 +chr2 3052732 . A T 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:408,29,0 +chr2 3067623 . AAGGTGAGAACGTTTGACTCATTTCCAGAGCTGGATTTGAGCCTCCAGATCTCCTGCTTTAGTTCTAACATTGTTTCTTTTGCCCTC A 4976.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.190;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=27.54;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,108:110:99:5014,418,0 +chr2 3385978 . AGTGAGTGCCCTCCTTTTCCACTTTTGCTTCATGCTTTCGTTTTTGTGTGTTGCTGGCTGATCGTGTGTAATGATGTGGGTGTGATGTGTGCTGTAG A 3739.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=3.382;DP=90;FS=4.280;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=31.69;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,85:90:99:3777,323,0 +chr2 3396506 . T C 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=4.878;DP=199;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,46:199:99:957,0,8336 +chr2 3426095 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:930,66,0 +chr2 3464937 . AT A 9094.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:9132,638,0 +chr2 3465190 . C T 1302.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1331,96,0 +chr2 3567173 . C CTT 1385.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1423,109,0 +chr2 3567352 . A AT 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.370;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=21.08;ReadPosRankSum=-1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:46:480,0,46 +chr2 3771174 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:276,0,103 +chr2 3880471 . T G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,203 +chr2 3881122 . TA T 576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.901;DP=66;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:614,0,309 +chr2 3881171 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-1.592;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:293,0,1123 +chr2 3882029 . T G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:412,0,252 +chr2 3882151 . TTC T 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.507;DP=36;FS=4.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:660,0,801 +chr2 3893339 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=-0.923;DP=26;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:451,0,465 +chr2 3895405 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=1.003;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:448,0,1125 +chr2 3895625 . T G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.724;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:484,0,313 +chr2 3911711 . A T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.904;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:746,0,1680 +chr2 3911714 . C T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.503;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:746,0,1683 +chr2 3913902 . G C 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.579;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:664,0,573 +chr2 3913950 . G A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.983;DP=35;FS=13.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:553,0,750 +chr2 4014021 . T C 226.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=32.32;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:4:253,4,0 +chr2 4014024 . G C 226.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:4:253,4,0 +chr2 4015478 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.583;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:230,0,230 +chr2 4058271 . C T 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.858;DP=67;FS=3.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1767,0,545 +chr2 4059991 . C T 2462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=-1.681;DP=98;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=25.13;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,67:98:99:2491,0,865 +chr2 4063720 . G A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-3.984;DP=55;FS=10.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:822,0,1147 +chr2 4064117 . A G 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=1.686;DP=60;FS=20.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1050,0,984 +chr2 4064658 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,106 +chr2 4096763 . T C 232.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:261,0,22 +chr2 4098288 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:355,0,398 +chr2 4120902 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.830;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:373,0,304 +chr2 4267584 . C A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.939;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:569,0,695 +chr2 4422373 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.015;DP=343;FS=1.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,56:343:99:669,0,11020 +chr2 4547812 . T G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.224;DP=65;FS=6.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:488,0,1784 +chr2 4624926 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.194;DP=26;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=7.91;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:234,0,689 +chr2 4732970 . G T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-1.234;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:372,0,1896 +chr2 4733178 . G C 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-1.224;DP=47;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:1149,0,1266 +chr2 4733317 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.089;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=3.79;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:324,0,3083 +chr2 4734044 . A G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.565;DP=41;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:762,0,653 +chr2 4734474 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.284;DP=50;FS=5.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:306,0,2653 +chr2 4734475 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.375;DP=50;FS=5.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:306,0,2653 +chr2 4734837 . GT G 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.581;DP=83;FS=4.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:511,0,2829 +chr2 4734843 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.168;DP=82;FS=15.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:598,0,3114 +chr2 4736861 . T A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.196;DP=67;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:462,0,3100 +chr2 4737301 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.283;DP=39;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.368;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:396,0,1044 +chr2 4738167 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.132;DP=76;FS=14.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:373,0,2533 +chr2 4738229 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.076;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:330,0,1629 +chr2 4738309 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-1.335;DP=51;FS=5.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:566,0,1462 +chr2 4738516 . A T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=-0.316;DP=79;FS=2.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:568,0,2307 +chr2 4740781 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.462;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=4.00;ReadPosRankSum=3.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,24:111:99:472,0,3376 +chr2 4754429 . G T 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.195;DP=132;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.110;QD=7.35;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,39:132:99:999,0,3527 +chr2 4789483 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:338,0,52 +chr2 4791968 . C CT 865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.839;DP=52;FS=3.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,39:49:99:970,0,99 +chr2 4803966 . C CT 243.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:281,27,0 +chr2 4823906 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.637;DP=63;FS=2.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:293,0,1835 +chr2 4932216 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-0.378;DP=38;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:540,0,1880 +chr2 4932220 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.015;DP=44;FS=2.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:540,0,1873 +chr2 5041188 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.510;DP=35;FS=6.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:244,0,957 +chr2 5049913 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-1.564;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.578;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,561 +chr2 5053077 . C T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.245;DP=70;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=12.00;ReadPosRankSum=2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:868,0,1597 +chr2 5053435 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-1.338;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,17:102:99:290,0,5806 +chr2 5053436 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=-0.082;DP=104;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,18:103:99:282,0,5806 +chr2 5053612 . T G 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.825;DP=158;FS=11.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,40:158:99:894,0,4507 +chr2 5065056 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.835;DP=152;FS=10.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,29:152:99:479,0,4680 +chr2 5065562 . TCTAGAATTACCGCAAAAATTGAGCATTAAGAATTCATATGTACTTCCACTAAAACGCTTTATAATGGTAAGAGCTCAGGGCAATACTAAC T 980.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=1.710;DP=158;FS=3.598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=6.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:1018,346,0 +chr2 5092656 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-3.016;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,246 +chr2 5099379 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.398;DP=64;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:297,0,1341 +chr2 5100368 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.372;DP=53;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:269,0,1576 +chr2 5178953 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,145 +chr2 5356598 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.123;DP=121;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,26:121:99:477,0,3552 +chr2 5448689 . GGGTAAGTCTGATAAGTCACATTTTTTTCAGTTCTGCTTTAAGTAAAGTGCATCATTTCTTATTTAAAATGACTTTTTAAATGAATTCCCATTGTTTTGCCA G 1077.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=1.609;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=33.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1115,0,1213 +chr2 5448868 . AAGGTCGGTAACTGTATTTCAAATTAAAAAGTGCATTGTTAATATGATTAATCGAGCATTGATTGTTTCCTTCAACCATTTCCAC A 1140.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.639;DP=34;FS=2.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=33.55;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,31:34:99:1178,0,576 +chr2 5452392 . CA C 284.43 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,125 +chr2 5452401 . T G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:280,0,212 +chr2 5455564 . CA C 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.206;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.268;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:317,0,103 +chr2 5543861 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-2.080;DP=43;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:659,0,813 +chr2 5551949 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-1.032;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:372,0,722 +chr2 5564051 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=-0.240;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=4.17;ReadPosRankSum=2.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:241,0,1532 +chr2 5566929 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:234,0,355 +chr2 5578632 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:255,18,0 +chr2 5672159 . T A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-1.479;DP=39;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:724,0,644 +chr2 5676264 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.734;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:508,0,1074 +chr2 5694626 . GT G 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.315;DP=98;FS=0.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:552,0,2338 +chr2 5694722 . TC T 547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.328;DP=77;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:585,0,2047 +chr2 5694804 . TCA T 1012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=2.532;DP=111;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=9.12;ReadPosRankSum=-3.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,36:105:99:1050,0,2126 +chr2 5709969 . C A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr2 5716664 . AAGGTAAAAACCAGTGTCAGAACTTAAAGGCACCTTTGATGAAAATCAACTTTTGTAAGCTGTTTGGAAAGAACTGTCTGTGTTTATAGCATGTTCACTGTCCTATTGGGGTGATATAAACACAAGTCTCTTTTTTTATTTCTTGATGTTAAAAT A 347.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=2.905;DP=82;FS=2.285;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=4.24;ReadPosRankSum=-2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,71:74:99:385,140,0 +chr2 5749230 . AC A 2841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=-0.064;DP=130;FS=3.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,87:130:99:2879,0,1008 +chr2 5773836 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.643;DP=40;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:559,0,1575 +chr2 5799236 . TCTGTGCAGAACATCAGTCTGAACTAATAACACTAATAATACAAACACTGAAAAAAAGAGTTTATCTCCATGTATGTTCTGTGGTTATTGTTTTTGTACTGTACTTAC T 531.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,21:22:99:744,0,676 +chr2 5885629 . G A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.670;ClippingRankSum=-1.546;DP=228;FS=3.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,44:228:99:792,0,7190 +chr2 5903563 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.354;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:314,0,478 +chr2 5903670 . AT A 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-1.351;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:336,0,401 +chr2 5976887 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.601;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:322,0,445 +chr2 5976967 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.888;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:240,0,631 +chr2 5981671 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=2.605;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:382,0,360 +chr2 5987118 . T G 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:895,66,0 +chr2 6659489 . A G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr2 6841501 . AAGGTTCTGCTCTTTTACGCTCAATTTTCTGTTTTGAAATGATCGCAGGTAAAGTTTGTATATAAAGTCCCTTCACGTTGTGC A 1523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=1.727;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=29.91;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,38:41:99:1561,0,216 +chr2 6858607 . T C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=22.03;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:535,0,434 +chr2 6858692 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-0.518;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:358,0,1088 +chr2 6859199 . T C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-0.665;DP=37;FS=3.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:528,0,810 +chr2 6862661 . TCCTTAAAGCAGGAAAACAGGTTGGATCAGCACACGCTCCTCATACGAGAATAAATAAATGCAGACGTTCATCCATAGCTCTTCAACTCA T 2184.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-0.214;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:99:2222,177,0 +chr2 6945788 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.268;DP=65;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:295,0,1890 +chr2 6951479 . TCTACATATGATAAAAATAAAGCAAACAAATGAAACTAACCACAAAAAACGCAAAAATAAGTAAAAAATAATACGCTAC T 2319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=7.737;DP=171;FS=12.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,66:171:99:2357,0,55661 +chr2 7404947 . C T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr2 7488265 . TCTAGAGGAAAACAAAACAATAAAACTGAAAAAACGCTAGTTAACTACATGAAAATGAAACTAAAAAAGGAAAGTGAACCCAACACATGC T 2010.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=2.139;DP=98;FS=8.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,65:98:99:2464,0,13265 +chr2 7550152 . CTTTAACAGCAGATGGCGCTCTTGGCTAGTT C 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.482;DP=18;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:268,0,1514 +chr2 7718564 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.825;DP=121;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:278,0,3621 +chr2 8098324 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.746;DP=27;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:249,0,757 +chr2 8437979 . T C 6592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=1.445;DP=564;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:379,185:564:99:6621,0,13549 +chr2 8438459 . T C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=1.243;DP=493;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.488;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:421,72:493:99:584,0,16105 +chr2 8444760 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.136;DP=270;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,37:270:99:231,0,9373 +chr2 8444907 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.435;DP=245;FS=4.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,50:244:99:891,0,7517 +chr2 8445937 . A T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;ClippingRankSum=-2.314;DP=300;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=2.76;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,55:299:99:856,0,9593 +chr2 8590772 . G C 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=-0.179;DP=71;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:1177,0,1159 +chr2 8591800 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-2.917;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=3.22;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:312,0,2616 +chr2 8598640 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.328;DP=99;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=2.25;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:251,0,3092 +chr2 8604550 . C G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.036;DP=94;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:99:237,0,2933 +chr2 8624140 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.096;DP=85;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:263,0,2644 +chr2 8624406 . CG C 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.951;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:316,0,159 +chr2 8624894 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.826;DP=30;FS=3.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:425,0,837 +chr2 9291929 . A T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.515;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:945,0,313 +chr2 9292347 . A T 472.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.248;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:499,0,4 +chr2 9292390 . C T 250.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:279,0,20 +chr2 9369630 . C T 378.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=31.57;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:2:405,0,2 +chr2 9371956 . G GT 796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:834,57,0 +chr2 9372074 . TTG T 365.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:403,29,0 +chr2 9473428 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,105 +chr2 9478687 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.048;DP=296;FS=3.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,53:296:99:815,0,9588 +chr2 9479669 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=-0.074;DP=196;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,33:196:99:488,0,6123 +chr2 9535626 . A G 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:234,0,25 +chr2 9620483 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.796;DP=56;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:499,0,2886 +chr2 9627148 . CCG C 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-0.412;DP=114;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,25:113:99:488,0,4772 +chr2 9627151 . TATGCTATACACCAACTACACCCACTGCTGCTTTACAAGAGCCGTTTGAGGCATTCTGTTTGAGTGTCTGGTTTCCCTTTTGTTGTCTTCGCATAG T 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.543;DP=114;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:491,0,4772 +chr2 9638913 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=29.28;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:321,0,128 +chr2 9646584 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr2 9653127 . ACCAGAAAAAATTTAGGAGCT A 401.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:35:439,35,0 +chr2 9653448 . G A 928.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:957,66,0 +chr2 9653449 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.956;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:380,0,420 +chr2 9656120 . G A 848.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-1.073;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=27.80;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:877,60,0 +chr2 9656495 . A AT 260 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:12:297,12,0 +chr2 9664155 . G A 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=-0.642;DP=47;FS=1.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=30.00;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,40:47:99:1438,0,322 +chr2 9743164 . A G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr2 9743254 . G T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.428;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:577,0,191 +chr2 9771299 . G A 870.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:899,63,0 +chr2 9838875 . G C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr2 9843923 . G T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr2 9856259 . C T 8299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-3.426;DP=303;FS=15.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=27.39;ReadPosRankSum=2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,221:301:99:8328,0,1761 +chr2 9865551 . C CAG 6133.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.914;DP=235;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,162:209:99:6171,0,974 +chr2 9880896 . CCACCTGAGAATGACAAAAGTAGAAGATGAAGTGCTTCGTTTACATAGACCCTCCCTGTATACAAGCACAGTCCGGCCGGTTGTTTT C 2886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=-1.321;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,68:73:99:2924,0,311 +chr2 9881115 . TCCTGTCAATGAAAGACTATGTAAAACGGCTCTATACAGGTATGGGGAAGGTTGCAACTCTGGATTTTTGTTTGTTTA T 7288.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=1.229;DP=166;FS=7.237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=23.66;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,163:165:99:7326,577,0 +chr2 9883037 . TCTAAACAAATAAATGAATGATGACAAATCATTTACTAGTTGAATGGTATTATTGCATTGGCAACCAAGGGCTTCACTACACTGAC T 6750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=1.615;DP=165;FS=2.073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,160:164:99:6788,456,0 +chr2 9883423 . G C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=4.464;DP=51;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=10.86;ReadPosRankSum=-4.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:582,0,1162 +chr2 9940340 . C CA 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.939;DP=292;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=1.59;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,57:268:99:503,0,5749 +chr2 9949761 . A G 658.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.653;DP=21;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:23:687,0,23 +chr2 9958068 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.462;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:415,0,395 +chr2 10133788 . C T 3436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.650;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=28.95;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:3465,244,0 +chr2 10134166 . GA G 8798.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-2.400;DP=302;FS=19.782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=29.13;ReadPosRankSum=2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,281:289:99:8836,853,0 +chr2 10259885 . T A 655.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:684,51,0 +chr2 10328413 . C T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 +chr2 10397024 . A G 2022.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2051,150,0 +chr2 10407471 . AACCTGAAAATAAAGACAGAAGCCGGTTATACTTATTACCAATCAATGGGCTTTAGTTTATTCAGATGATAAGGGAGCAGTACTTC A 1271.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.617;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.65;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:90:1309,90,0 +chr2 10662625 . CCCTAAAACACAATGTGACAGGTGAAGAGCTGATAGTTATTCAGACGGCATCGCATGCAACCAGTGTGAGAAGAGACAGAGCTAA C 1554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=2.820;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=32.55;ReadPosRankSum=-2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:99:1592,142,0 +chr2 10705817 . G A 2307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=-0.068;DP=177;FS=11.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,70:177:99:2336,0,3647 +chr2 10722992 . A T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.106;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:572,0,2975 +chr2 10909147 . A G 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=1.102;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:490,0,689 +chr2 10997262 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=10.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:460,0,129 +chr2 11122133 . A C 2415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.504;DP=140;FS=0.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:2444,0,2423 +chr2 11122651 . A G 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 +chr2 11122737 . G T 1097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1126,81,0 +chr2 11126597 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:256,0,52 +chr2 11127946 . G A 2931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.143;DP=115;FS=3.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:2960,0,3192 +chr2 11128051 . G A 2979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.996;DP=106;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=28.11;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,83:106:99:3008,0,454 +chr2 11128270 . T C 945.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:974,69,0 +chr2 11128484 . T G 6918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:6947,498,0 +chr2 11274502 . T C 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.593;DP=84;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=17.96;ReadPosRankSum=-2.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1537,0,1271 +chr2 11420665 . A AT 445.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:483,42,0 +chr2 11421033 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.869;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:388,0,441 +chr2 11421340 . A C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-0.755;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:842,0,783 +chr2 11421480 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=1.774;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:321,0,1085 +chr2 11422351 . A G 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=1.966;DP=46;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=30.65;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,37:46:99:1438,0,449 +chr2 11422977 . A G 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.044;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.17;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:893,0,492 +chr2 11423172 . C T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.090;DP=39;FS=6.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:774,0,624 +chr2 11423486 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.104;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.099;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:560,0,514 +chr2 11423712 . C T 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:569,39,0 +chr2 11424156 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-1.466;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:379,0,286 +chr2 11424592 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.628;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:362,0,956 +chr2 11424736 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=1.330;DP=49;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:897,0,922 +chr2 11425086 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-1.510;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,20:119:99:282,0,3836 +chr2 11431355 . C A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.350;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,28:98:99:719,0,2570 +chr2 11434382 . C T 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.310;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:1512,0,1651 +chr2 11440003 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-2.345;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:530,0,304 +chr2 11445675 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:564,0,500 +chr2 11452539 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=24.71;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:300,0,92 +chr2 11586057 . A T 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.795;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:334,0,351 +chr2 11597152 . T G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.245;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:419,0,419 +chr2 11601590 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:853,0,314 +chr2 11622558 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.289;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:654,0,640 +chr2 11622726 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.263;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:397,0,389 +chr2 11717321 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.811;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:552,0,658 +chr2 11717566 . A G 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=2.910;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:643,0,672 +chr2 11717752 . C G 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.099;DP=53;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1060,0,768 +chr2 11721799 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=1.359;DP=32;FS=15.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:540,0,577 +chr2 11737169 . G C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.724;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:313,0,490 +chr2 11751776 . C T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.535;DP=72;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1261,0,1335 +chr2 11761504 . C T 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.178;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1829,0,1573 +chr2 11769601 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=10.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,565 +chr2 11769647 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=1.449;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,239 +chr2 11789342 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-0.460;DP=100;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:600,0,2689 +chr2 11793690 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-1.355;DP=50;FS=15.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:358,0,1329 +chr2 11794002 . A T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-1.835;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:619,0,384 +chr2 11794102 . A G 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-1.156;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:595,0,648 +chr2 12063723 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:333,0,456 +chr2 12063741 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.358;DP=24;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.20;ReadPosRankSum=2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,575 +chr2 12142811 . T C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr2 12144244 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr2 12148836 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr2 12590722 . A T 2139.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2168,150,0 +chr2 12592542 . T C 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 +chr2 12592652 . T C 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 +chr2 12828941 . A T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.395;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:551,0,426 +chr2 12828968 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-1.602;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:435,0,519 +chr2 13046612 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.258;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:620,0,481 +chr2 13985493 . C CT 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-3.172;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:250,0,678 +chr2 13985498 . A G,T 233.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-2.331;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,7,7:17:99:403,165,432,153,0,545 +chr2 13985640 . A C 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 +chr2 13985847 . T G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.033;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=23.92;ReadPosRankSum=-1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:674,0,129 +chr2 14125561 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=1.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:332,0,438 +chr2 14331910 . TCCTTAAAATTTAACAAATGGACAAACATCATCACCGACCGCAGATGATTTTAAATGTAATTGTAGGAGTTTGACCCTTA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:99:535,0,176 +chr2 14389792 . A T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=1.313;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:409,0,386 +chr2 14797377 . A G 902.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:931,66,0 +chr2 15211614 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=3.537;DP=150;FS=6.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.107;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,31:150:99:490,0,9963 +chr2 15211771 . C CA 1069.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=-0.184;DP=191;FS=12.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.60;ReadPosRankSum=-2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,60:177:99:1107,0,7898 +chr2 15383447 . CT C 372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=2.360;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:410,0,594 +chr2 16348691 . A T 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:244,0,24 +chr2 16348733 . A C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr2 16348975 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,476 +chr2 16348976 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,476 +chr2 16349085 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:52:826,0,52 +chr2 16349109 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.556;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:286,0,432 +chr2 16349159 . C T 1187.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-2.410;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=33.94;ReadPosRankSum=2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,16:20:14:1216,14,0 +chr2 16535034 . C CA 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-1.543;DP=290;FS=16.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,52:280:99:356,0,6376 +chr2 16535477 . CT C 2171.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.473;DP=142;FS=6.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,90:120:99:2209,0,1113 +chr2 16535731 . C T 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-3.109;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=31.41;ReadPosRankSum=3.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1316,0,154 +chr2 16543714 . G A 7617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-1.500;DP=268;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=28.42;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,200:260:99:7646,0,1220 +chr2 16547270 . C T 9815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-2.151;DP=351;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=27.97;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,261:351:99:9844,0,2015 +chr2 16556240 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.195;DP=21;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=19.51;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:438,0,259 +chr2 16560655 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +chr2 16918215 . TA T 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.361;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:46:323,0,46 +chr2 16918584 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=1.656;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,228 +chr2 16933549 . T A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.344;DP=51;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:233,0,1523 +chr2 17087644 . A T 240.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:268,0,10 +chr2 17087651 . T A 240.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:10:268,0,10 +chr2 17272298 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.538;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:503,0,759 +chr2 17350611 . A C 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-2.399;DP=66;FS=7.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=13.16;ReadPosRankSum=2.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:897,0,2024 +chr2 17350706 . T G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.109;DP=138;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,28:138:99:518,0,9127 +chr2 17351480 . T C 5022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=1.141;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=30.26;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,133:166:99:5051,0,570 +chr2 17360244 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=1.144;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,46:168:99:1088,0,4466 +chr2 17367757 . C CCGTCCA 3400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=-0.733;DP=210;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=16.19;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,105:192:99:3438,0,3166 +chr2 17383219 . A C 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:564,39,0 +chr2 17383334 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=2.725;DP=26;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:229,0,644 +chr2 17383996 . G C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=1.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:495,0,110 +chr2 18214051 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.073;DP=38;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:648,0,641 +chr2 18275694 . TCTAGCAGAAAAATCAAACAGTGATGACTAGGAACAAACACATAAAACTGAGAAAACGCAAAGCATAAGGTTCTTAC T 12706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=-0.274;DP=305;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=32.08;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,293:299:99:12744,854,0 +chr2 18278549 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.393;DP=53;FS=4.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:371,0,1561 +chr2 18281092 . A C 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:477,33,0 +chr2 18282198 . C A 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:522,36,0 +chr2 18282208 . G A 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:522,36,0 +chr2 18282622 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-1.718;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,231 +chr2 18282744 . G T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=-0.192;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:362,0,2306 +chr2 18282753 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.612;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:357,0,2306 +chr2 18282900 . T G 4160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.146;DP=244;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,131:243:99:4189,0,3844 +chr2 18282951 . T C 2770.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=1.169;DP=211;FS=14.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,88:202:99:2924,0,3640 +chr2 18284297 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=22.40;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:297,0,139 +chr2 18473198 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.724;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=13.25;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:333,0,513 +chr2 18473218 . T TC 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.088;DP=24;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:335,0,457 +chr2 18940960 . C CA 237.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.611;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:26:275,0,26 +chr2 18986488 . T G 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.816;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:760,0,1238 +chr2 19215142 . ACTGCAGGGAAATAATGAATAATATTTTAGACCCAAACTAAGGCTAAGTAGCGACAAAGCTGTTGACAGTTCTGGTTAAAGGAAGTTTTGCTCAACGACAGTCACATGCGCCGTGAACACGTGGGCTGTGCTGACTCAC A 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=3.536;DP=23;FS=12.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=29.94;ReadPosRankSum=-2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:726,0,2977 +chr2 19218186 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=4.075;DP=65;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=3.93;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:284,0,1904 +chr2 19220032 . A T 2570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=-0.607;DP=157;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:2599,0,2667 +chr2 19229522 . AAGGTAAGAGAACAGCCTCACACTGGCTATACTGGTTATTTTAAAATGTTAAACTGATTTGTTCTCTCT A 8588.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=2.375;DP=215;FS=1.448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,208:215:99:8626,673,0 +chr2 19460678 . C A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.263;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:591,0,1070 +chr2 19460725 . A AAT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.515;ClippingRankSum=-2.696;DP=36;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=7.02;ReadPosRankSum=2.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:698,0,393 +chr2 19461355 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=1.794;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,268 +chr2 19462086 . G C 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-0.897;DP=264;FS=4.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,61:264:99:1279,0,7854 +chr2 19462210 . TCTGTGGTTAAAATTGGAGTAGCAATAAGTCTAAACAAACTTTGAACAATATTTATATATTTTCTCTACTTTTTACCCCCTCTCGAATGTAC T 10378.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=1.248;DP=241;FS=9.334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,235:241:99:10416,921,0 +chr2 19618715 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.170;DP=66;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:581,0,1622 +chr2 19717654 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=-0.979;DP=42;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:615,0,741 +chr2 19717768 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.924;DP=64;FS=8.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=4.18;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:296,0,1834 +chr2 19752010 . TA T 306.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-0.496;DP=15;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:14:344,14,0 +chr2 19753313 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-2.237;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:327,0,1130 +chr2 19753314 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-2.083;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:282,0,1208 +chr2 20287870 . T C 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=1.330;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:71:99:1568,0,818 +chr2 20295869 . TTG T 1097.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=1.684;DP=80;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1135,0,1391 +chr2 20347805 . T C 1386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-0.810;DP=55;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:1415,0,458 +chr2 20433306 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:324,0,97 +chr2 20471581 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.074;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:371,0,550 +chr2 20471605 . A C 910.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-1.065;DP=52;FS=8.049;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:18:939,18,0 +chr2 20471993 . G A 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 +chr2 20533036 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=-1.071;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=26.46;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:82:478,0,82 +chr2 20537188 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.327;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:519,0,532 +chr2 20537203 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.620;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:623,0,446 +chr2 20538550 . A G 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.664;DP=27;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=25.70;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:722,0,209 +chr2 20542789 . C G 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.030;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:734,0,127 +chr2 20545830 . A T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.548;DP=22;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:96:668,0,96 +chr2 20584167 . A T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr2 20586844 . CCCTGAACACAGACACACACATTACACAACCACATGGAAGACACTCAACCACTCAAGAACAAATCATGAAACTGTAGTAAGTGCCCA C 3367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-0.510;DP=112;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,87:104:99:3405,0,1929 +chr2 20602920 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.286;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:499,0,1710 +chr2 20609665 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.722;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:352,0,293 +chr2 20610925 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.709;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:232,0,2026 +chr2 20622485 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.320;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:435,0,646 +chr2 20623999 . G A 2112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=1.284;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=35.29;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2141,153,0 +chr2 20626968 . C T 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-2.697;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:1255,0,1323 +chr2 20629115 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:323,0,174 +chr2 20629863 . A C 1133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=1.016;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=26.93;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1162,84,0 +chr2 20661044 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=1.640;DP=92;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:332,0,2819 +chr2 20664384 . CGTAAGAAAGCGAAACTAACCTGTATTTAAACATGTTAGGTCACAGAAACACACTTTCTTTCCTGACTGTTTTCTTTTACAG C 1420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.542;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,36:37:99:1520,0,174 +chr2 20712956 . C T 3212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=-0.088;DP=157;FS=7.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=20.46;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,96:157:99:3241,0,2092 +chr2 20718774 . CACCTAAAACACGACAGAATCTTTAGCATATGACCTGCAGTCTTGTATGCACTTTGAATCAGATGTAAATTTGAATGCCACTT C 5776.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.202;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,124:129:99:5814,495,0 +chr2 20752880 . GAGGTCAGGTCTACTCTTCAATCTCTGGCTTTCACCTGCAGTTTGTTTTTGCTCTTCATTCTACATGATTCTTTTGTTTTGC G 1673.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.266;DP=42;FS=3.107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=31.28;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1711,146,0 +chr2 20769390 . T TA 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=2.929;DP=52;FS=10.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:383,0,1699 +chr2 20769698 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.457;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,836 +chr2 20770576 . CT C 1154.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-2.887;DP=169;FS=6.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,55:163:99:1192,0,2658 +chr2 20770648 . GT G 1209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-0.101;DP=94;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,52:78:99:1247,0,528 +chr2 20851244 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=2.938;DP=31;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,866 +chr2 20857126 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=-0.307;DP=22;FS=14.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,481 +chr2 20857415 . CT C 571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.601;DP=36;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.561;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:47:610,0,47 +chr2 20867401 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.266;DP=59;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1081,0,958 +chr2 20872249 . AAGGTAGAGAAAATGTCTGCGCTGGTGAGTTGTGTGTGCTGGTTATGAGATTAAGTTTGTATTTCTTTATTTTTC A 2860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.017;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=30.09;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:2898,187,0 +chr2 21130933 . G A 1938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.543;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,50:71:99:1967,0,782 +chr2 21134145 . T A 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=-1.081;DP=356;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,88:354:99:1753,0,13348 +chr2 21139686 . G A 6718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=-2.476;DP=395;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=17.01;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,187:395:99:6747,0,6878 +chr2 21418386 . C T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=1.732;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:632,0,157 +chr2 21530308 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=28.57;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:67:571,0,67 +chr2 21563011 . CA C 683.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.523;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,49:190:99:721,0,4048 +chr2 21564144 . T A 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-2.010;DP=172;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,45:172:99:963,0,4354 +chr2 21564262 . C T 4714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.022;DP=270;FS=12.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,149:270:99:4743,0,4172 +chr2 21564745 . C T 5040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.021;DP=301;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,159:301:99:5069,0,4947 +chr2 21565343 . A T 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=-0.410;DP=265;FS=8.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,44:265:99:1583,0,10092 +chr2 21568628 . C T 5094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.175;DP=286;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=17.81;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,158:286:99:5123,0,7687 +chr2 21568737 . G A 5676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.144;DP=249;FS=4.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,166:248:99:5705,0,2034 +chr2 21569040 . TCCTGCCGACAAAGAAAATAATGTTATCTGATCTTTAACAAAAAAGGATACACTCAAGATAAATGCATTTTCAAACTTA T 10740.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.043;DP=256;FS=2.995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=28.19;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,254:256:99:10778,775,0 +chr2 21572222 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,104 +chr2 21603808 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=2.570;DP=131;FS=4.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:856,0,3594 +chr2 21627622 . GCCTGAAACACACACACACACACACACACACACAATGATTACACCACCAGAAAACATCCAGGTGCCAGCGGTTTCCACTCGATGCATTGCATTTTCACTCTGTGCGCAACCTATCTTCA G 1093.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.907;ClippingRankSum=11.503;DP=432;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=2.53;ReadPosRankSum=-5.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,343:398:99:1131,0,6301 +chr2 22003037 . T C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=1.034;DP=60;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:837,0,1189 +chr2 22003356 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=2.777;DP=38;FS=7.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=11.36;ReadPosRankSum=-2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:460,0,1128 +chr2 22060317 . GGGTAAATAAAAAACAAAAAAATTAACACTTGATTTCATAATATGTTTGGTTTGTTGTCAATATGGATGTCTTTATGGGTTCTA G 12073.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.172;DP=293;FS=2.223;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=25.69;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,259:262:99:12111,1103,0 +chr2 22065976 . T C 8909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=1.172;DP=497;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,277:497:99:8938,0,7640 +chr2 22075556 . T C 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.158;DP=129;FS=4.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,48:129:99:1507,0,4300 +chr2 22089133 . G A 3600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.162;DP=188;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,109:188:99:3629,0,2733 +chr2 22165478 . GAGGTAAGAGAAACTCAATTATAGTAACTTGCTTTCTTACTAATGAAACTGAAGTAACTGTTATTATTGTTGTTTTCTC G 318.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=1.688;DP=83;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,77:78:99:356,139,0 +chr2 22165711 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-0.243;DP=54;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:969,0,901 +chr2 22172247 . A G 1316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.992;DP=76;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:1345,0,1348 +chr2 22172262 . G A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.361;DP=65;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=16.53;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1103,0,1170 +chr2 22174440 . A T 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-1.802;DP=73;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=17.24;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,42:73:99:1287,0,1015 +chr2 22217527 . C A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=-0.460;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:466,0,734 +chr2 22219486 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-1.480;DP=55;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:530,0,1436 +chr2 22219529 . CT C 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.352;DP=55;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:603,0,821 +chr2 22419765 . C T 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-0.410;DP=60;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1087,0,835 +chr2 22428408 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.200;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:378,0,285 +chr2 22480372 . GAGGTATGTATAGTGCCTTCTTATACTCCTCTAAATCTCATCCAGCAAACATAAATAGCAGATTAATATTGGCGCACATGACCTTCATTGTGCTCTCTC G 932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=3.760;DP=33;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:970,0,2973 +chr2 22751613 . A C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-0.829;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:473,0,530 +chr2 22751751 . A AT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-0.429;DP=27;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:247,0,326 +chr2 22751961 . GA G 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.778;DP=15;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:53:307,0,53 +chr2 22752061 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,291 +chr2 22753806 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=22.11;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:382,0,198 +chr2 22757877 . GCTGATGAGAATAAAGAGATTCATGACAATATTTTATTTATTAGAATTATTTTATTATTAAGATCATGTTCAATTGCTGGTGAATATATTCTGAGGCCAAC G 1552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=-1.051;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,37:39:99:1590,0,163 +chr2 22811445 . T G 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:63:897,63,0 +chr2 22811451 . G A 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:897,63,0 +chr2 22811533 . C G 1438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1467,105,0 +chr2 23021854 . A C 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=-0.763;DP=54;FS=9.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1106,0,737 +chr2 23022064 . T A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-0.237;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:579,0,360 +chr2 23148844 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.670;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=18.27;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:412,0,333 +chr2 23163925 . G A 1598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.785;DP=86;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1627,0,1272 +chr2 23192012 . C A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-1.998;DP=154;FS=8.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,42:154:99:876,0,4829 +chr2 23192117 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=-0.407;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:240,0,1070 +chr2 23231582 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=1.249;DP=31;FS=7.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=25.57;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:821,0,151 +chr2 23599023 . A AGATAATGGTAAG 709.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:47:747,47,0 +chr2 24147344 . T C 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-2.211;DP=88;FS=2.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1652,0,1323 +chr2 24149403 . T A 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.255;DP=77;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:1377,0,1361 +chr2 24156572 . A T 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-0.142;DP=68;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:1254,0,2330 +chr2 24187025 . G A 330.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=33.09;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:359,0,14 +chr2 24220046 . A G 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.278;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:676,0,724 +chr2 24243519 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=2.781;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=14.16;ReadPosRankSum=-3.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:368,0,463 +chr2 24878351 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:245,0,515 +chr2 24878355 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.225;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:298,0,370 +chr2 24878356 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-1.004;DP=15;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=30.58;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:73:487,0,73 +chr2 24878485 . T C 2128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.594;DP=94;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,62:94:99:2157,0,1041 +chr2 24878506 . T C 2709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.306;DP=104;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,72:104:99:2738,0,858 +chr2 24881277 . GCCTGGAGTGAAGACACATACACACAGGGTTCAGCAAACAAGCCAGTAACAACCACACACACAACATCTTGTCTCTTA G 7746.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=3.419;DP=213;FS=4.467;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=32.91;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,207:213:32:8071,32,0 +chr2 24995447 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=-0.146;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:234,0,1000 +chr2 25690079 . GT G 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-1.805;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:341,0,101 +chr2 25691006 . G GT 348.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-1.735;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:30:478,30,0 +chr2 25756471 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=2.025;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:316,0,417 +chr2 25971442 . A G 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.328;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.263;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:699,0,255 +chr2 25992103 . G GT 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-0.659;DP=264;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,56:209:99:447,0,4786 +chr2 25992888 . CCT C 932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=-0.075;DP=284;FS=11.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=3.28;ReadPosRankSum=5.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,80:264:99:970,0,8476 +chr2 25992944 . C CT 991.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=2.619;DP=326;FS=4.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,90:310:99:1029,0,11116 +chr2 26205010 . G A 967.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.847;DP=32;FS=4.806;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:11:995,11,0 +chr2 26205127 . T A 1064.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1093,78,0 +chr2 26344975 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.438;DP=167;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,44:167:99:998,0,4585 +chr2 26431243 . C CT 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=-2.559;DP=69;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=8.89;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:651,0,794 +chr2 26432032 . T TA 531.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:46:569,46,0 +chr2 26447362 . G T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-2.022;DP=67;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:345,0,2089 +chr2 26447393 . C CTA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.405;DP=58;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:268,0,1456 +chr2 26447687 . G GT 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.331;DP=131;FS=5.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:406,0,3440 +chr2 26448137 . CT C,CTT 929.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.134;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,21,36:64:99:1044,653,1042,388,0,606 +chr2 26448485 . C CT 1688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-1.693;DP=141;FS=5.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1726,0,1593 +chr2 26611768 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.911;DP=107;FS=5.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,18:107:99:231,0,3524 +chr2 26615301 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=2.422;DP=69;FS=14.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=3.76;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:288,0,2060 +chr2 26615320 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.619;DP=62;FS=20.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:386,0,1761 +chr2 26619131 . CACCTGACAAACATCAAAAGATTATTGATGAGACGCGGGATGAAGCAGACATCTGCACTTTATAAGCAATAACACTT C 8065.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.780;DP=196;FS=2.345;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=31.12;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,193:196:99:8103,609,0 +chr2 26637693 . AAGGTCATAAGCTTCTTACACACCCACATTAATTCGCAAATTTGCAATCAAATTAAACACGGTACCCTTATGTGCGATTTCCATCTTGT A 4420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=1.730;DP=116;FS=1.815;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=29.93;ReadPosRankSum=-2.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,109:114:99:4458,329,0 +chr2 26649164 . TGGTGAGTGCAAACGAGTGTATAGGTTTGTTTTATAGTCTTTCTGTGACGATAACTTTGTCCAGTTCTGCTACTGAAATATAAGTGATGCAGTTTAAGACTCTGAGGAAGGCTTGTAAATCATGTTAGTCCTAAAATATACACTGTCAGTTTCTAATTGTTGCATTTTAATTTGTCAATCCA T 8312.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-1.505;DP=262;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=31.73;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,242:246:99:8350,676,0 +chr2 26650005 . AAC A 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:255,0,335 +chr2 26747157 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:385,0,49 +chr2 26751490 . GCTGTTTGACACAGAAAGTCTATGATGATGTGTTTGGACAAAGGACATTTTTCACAGTGGTTTTCCACTGAC G 2016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=1.700;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=24.71;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,48:52:99:2054,0,677 +chr2 26772752 . TCCTGGTGGTAGAGTGAAACAGCAATGAACGCACTGAAAAATGTCTCAGTTTCACAGGGGAAATATTTGAGATCTCCTCTTA T 13397.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=3.144;DP=322;FS=3.174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=29.18;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,314:322:99:13435,1056,0 +chr2 26779446 . TCTGAGGGAGGACAGAAATGCAGATGTAAACAAAAGTTCCGCAATGCAAGCAAAAATCTATTAATGTTAATTCTGCAGCATAAGGGTGAC T 12461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=2.074;DP=281;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,279:281:99:12499,1024,0 +chr2 26783677 . A G 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.277;DP=49;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=13.87;ReadPosRankSum=-2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:708,0,1985 +chr2 26784632 . C T 923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:952,66,0 +chr2 26785217 . T A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=1.669;DP=65;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=15.81;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1056,0,1216 +chr2 26786864 . C CG 236.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:274,27,0 +chr2 26829763 . CTT C 4043.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:4081,280,0 +chr2 26829936 . C CT 4797.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=1.277;DP=173;FS=3.408;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=27.73;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:5039,486,0 +chr2 26845832 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.195;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:555,0,147 +chr2 26865801 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,466 +chr2 27478714 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.217;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:350,0,884 +chr2 27525829 . T C 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-2.066;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=12.60;ReadPosRankSum=2.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:633,0,944 +chr2 27526868 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=2.011;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,331 +chr2 27539024 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=8.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:425,0,236 +chr2 27548527 . AGTGAGTGACAACACCCTCAGAAAAAAAGTGTCATATTTATGAAATGCTTGCATGTGTTCACTTATTCTATCTCTCCTTTAG A 12737.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.935;DP=296;FS=1.499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=29.40;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,255:262:99:12775,1060,0 +chr2 27548655 . A T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=-1.809;DP=278;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=2.83;ReadPosRankSum=-1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,55:278:99:815,0,11399 +chr2 27548902 . GT G 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.397;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:26:336,0,26 +chr2 27680681 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.765;DP=248;FS=5.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,48:248:99:789,0,7492 +chr2 27682432 . CT C 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=-4.216;DP=203;FS=4.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=2.12;ReadPosRankSum=3.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,119:188:99:468,0,4012 +chr2 27687430 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.741;DP=11;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,148 +chr2 27688715 . C T 4317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.266;DP=262;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,137:262:99:4346,0,4341 +chr2 27689468 . A T 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.878;DP=126;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:607,0,6879 +chr2 27689925 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.327;DP=224;FS=3.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,49:224:99:848,0,8837 +chr2 27691360 . TC T 3557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.851;DP=188;FS=5.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,111:182:99:3595,0,2332 +chr2 27701424 . G C 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.993;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=33.59;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:1103,0,305 +chr2 27701576 . G C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.340;DP=20;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:353,0,598 +chr2 27701727 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:359,0,45 +chr2 27803580 . T G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-1.973;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:245,0,1031 +chr2 27813110 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=-0.293;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=26.37;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:872,0,256 +chr2 27814132 . G C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.333;DP=40;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:262,0,1112 +chr2 27817770 . A C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:323,0,416 +chr2 27969385 . C A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:373,0,242 +chr2 28049994 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.549;DP=38;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:232,0,1095 +chr2 28134551 . T A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-1.557;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=21.23;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:559,0,311 +chr2 28218003 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.587;DP=64;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:741,0,1471 +chr2 28218743 . T G 2487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=1.669;DP=136;FS=2.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,80:136:99:2516,0,1944 +chr2 28218851 . G A 3256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=-2.466;DP=129;FS=10.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,80:119:99:3285,0,874 +chr2 28239056 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.249;DP=102;FS=14.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:464,0,4180 +chr2 28239143 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.994;DP=115;FS=4.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,28:115:99:566,0,3210 +chr2 29192836 . A G 1706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.298;DP=281;FS=0.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,82:280:99:1735,0,10699 +chr2 29196758 . CGATCTGGTAAACAGAAGCAGACATTTTTTCTATTGTTTCATGTTTTTTTTTTATTT C 2903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=1.391;DP=394;FS=0.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:273,115:388:99:2941,0,16713 +chr2 29196761 . TCTGGTAAACAGAAGCAGACATTTTTTCTATTGTTTCATGTTTTTTTTTTATTTAATTTTTTTTTAATAATATCCTGAC T 9599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-0.458;DP=391;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,258:385:99:9637,0,8071 +chr2 29634872 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-2.294;DP=67;FS=1.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:309,0,2019 +chr2 29692001 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-1.672;DP=31;FS=16.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:357,0,707 +chr2 29827356 . A AT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.532;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:249,0,2042 +chr2 29960840 . T C 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=-1.140;DP=295;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,71:294:99:1433,0,15548 +chr2 29961083 . A C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=-0.257;DP=147;FS=7.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=4.66;ReadPosRankSum=-2.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,35:147:99:713,0,4539 +chr2 29961251 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=-0.557;DP=391;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,54:391:99:401,0,13481 +chr2 29966459 . CGGTAAATATACCACCTATAATGTAAAATACAACCAACCAATGACAAGTTATTGTCAGATCTCCAACTTAATTGTGCAAATCTGCTCTTTTGTTGAA C 2594.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=-0.150;DP=88;FS=2.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=29.48;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,58:63:68:2524,0,68 +chr2 29984303 . T A 1397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.149;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.65;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1426,102,0 +chr2 30005664 . G GAA 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.410;DP=33;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:385,0,426 +chr2 30005894 . C CA 5146.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:5184,359,0 +chr2 30006786 . A AT 563.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.529;DP=60;FS=10.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:604,0,509 +chr2 30034301 . C CT 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.666;DP=151;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,28:134:99:250,0,2871 +chr2 30219310 . TGTAAGTATTGCATTAGTTTCTTTAATAAATTGAGTGTTTTAATGTGATTGCAGACCTCTCTTCTTTTTTCAG T 4461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=1.050;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=31.54;ReadPosRankSum=1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,98:101:99:4499,347,0 +chr2 30269733 . A G 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-0.221;DP=46;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:754,0,821 +chr2 30561487 . T TTA 1452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.401;DP=104;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=13.97;ReadPosRankSum=3.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1490,0,1504 +chr2 30619332 . A G 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.621;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:911,0,1818 +chr2 30622660 . C CG 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-1.190;DP=76;FS=7.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:403,0,1603 +chr2 30622842 . G GA 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=-0.231;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:523,0,268 +chr2 30673983 . C CT 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=1.450;DP=80;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:461,0,874 +chr2 30675231 . GA G 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.495;DP=22;FS=11.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,602 +chr2 30675233 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.758;DP=22;FS=11.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,602 +chr2 30697022 . CGTAAGTGTGCACATTGATCTGCAGGGTTATATAAAAGTAACTCTGAAGTCAACTTAAACTGTCAGAGATTATGCAAATCAAATGTAGAGAGCTCATTCTTGAACTTTGTTCAAGGTCGGCTTGAGAGCTGAAGGACGCCTTTGTTTTGGCTTGGCTGTTTTATGCTCTGTCTCTCTGTTTGTGTGTAG C 3566.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=1.932;DP=87;FS=3.152;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,79:87:99:3604,344,0 +chr2 30700081 . T TA 816.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.265;DP=41;FS=2.483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:42:854,42,0 +chr2 30702155 . CCCTGCCGGAGAGGAAGAGCCACATGAGTGCGGTTTATCTCTTAGACTGGCTTCAGGAAATGGAGACTTTGCACTTA C 2457.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=2.016;DP=67;FS=2.344;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=29.69;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:99:2495,227,0 +chr2 31013774 . T TA 1089.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1127,110,0 +chr2 31014976 . A AT 571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:54:609,54,0 +chr2 31018290 . CT C 548.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=1.503;DP=41;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:586,0,126 +chr2 31143644 . C T 4186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.442;DP=160;FS=9.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=26.17;ReadPosRankSum=2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,110:159:99:4215,0,1286 +chr2 31151002 . A T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 +chr2 31165006 . C A 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.190;DP=166;FS=6.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,43:165:99:995,0,4756 +chr2 31166452 . C T 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=3.533;DP=155;FS=4.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.229;QD=7.50;ReadPosRankSum=-3.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,47:155:99:1190,0,4111 +chr2 31167355 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.518;DP=74;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:243,0,2511 +chr2 31167800 . C T 2180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-1.074;DP=82;FS=8.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=26.59;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,57:80:99:2209,0,581 +chr2 31250975 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,222 +chr2 31334009 . C T 205.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:234,0,21 +chr2 31423897 . C G 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=1.149;DP=49;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=31.83;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,40:49:99:1588,0,165 +chr2 31430447 . G A 1032.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1061,78,0 +chr2 31430496 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr2 31480177 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.433;DP=95;FS=6.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:859,0,2481 +chr2 31480419 . GT G 897.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.877;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:935,0,212 +chr2 31480575 . G A 5483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.010;DP=202;FS=33.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,150:202:99:5512,0,1184 +chr2 31483629 . T C 642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:671,54,0 +chr2 31497971 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:81:518,0,81 +chr2 31499878 . T C 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.787;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:625,0,351 +chr2 31524795 . C T 2024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-0.838;DP=71;FS=6.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=28.52;ReadPosRankSum=2.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,56:71:99:2053,0,284 +chr2 31545263 . T TA 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.733;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:20:814,20,0 +chr2 31548667 . TCTGTAATTAAAGTACACATTGATATCCAGTTGGTTAACTTCATTTGCATAAATTCGGGCTCTAAAGAGAACAGCGAGAGCTTAC T 6486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=2.387;DP=148;FS=1.276;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=28.71;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,138:148:99:6524,548,0 +chr2 31548873 . ACTAAAATCGGATTGTTTCTTATATACATGTGGAAGCCTGAGAGAAATGAAAGTGTGTGCATTTATTATACTTAC A 6494.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.981;DP=154;FS=1.729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=26.81;ReadPosRankSum=-1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,147:152:99:6532,517,0 +chr2 31550831 . TCTGAGCACAAAGTGAAAGAAACAATATTATTGTGCCATCATCAGCTCATGTGTGTATTGATGATTTAAACTCTCACACACACAGACAGAC T 5852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=3.081;DP=152;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=29.29;ReadPosRankSum=-2.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,142:152:99:5890,0,681 +chr2 31569274 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=-0.825;DP=57;FS=4.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:360,0,1622 +chr2 31570330 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-0.631;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:261,0,882 +chr2 31609207 . G GT 315.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:24:353,24,0 +chr2 31983976 . T G 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.912;DP=56;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=21.85;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1252,0,810 +chr2 32091384 . TCTGCAGAGGAACAAAGATTCAGAAATTCAACAGTCTCCATTTTAATAGTATGAGTTTATTGTGACTTGTACTTAC T 6272.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.346;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=30.25;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,150:154:99:6310,451,0 +chr2 32133691 . G A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=1.263;DP=35;FS=5.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=20.36;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:741,0,500 +chr2 32133772 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-1.801;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:489,0,798 +chr2 32207605 . C CA 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=-0.178;DP=42;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:526,0,332 +chr2 32208606 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.090;DP=48;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:406,0,1292 +chr2 32208820 . TA T 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.528;DP=48;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:787,0,372 +chr2 32210147 . C T 580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:609,42,0 +chr2 32223590 . AAAAGAAAAAAAAATAAAAT A 405.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:43:443,43,0 +chr2 32249223 . GCTATAAGAGAAGACAGTCTGAGCTGCACCCACATTTTTCATGTCCTCACAGAAATCAAATCACATAC G 2099.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.906;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,56:61:99:2137,0,550 +chr2 32279934 . G A 2169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.906;DP=81;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,58:81:99:2198,0,589 +chr2 32287805 . G A 2700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=2.274;DP=98;FS=3.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=27.56;ReadPosRankSum=-2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,73:98:99:2729,0,579 +chr2 32302447 . ACTGAAACACAGACACGCAAACAGTTTCCTGGAGGTCATGCAGGTAATTTTAAGTCAATTCTTTTTATAGATTTACAGGTCGTTTTCTGACATCTCTTAC A 2388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=1.483;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:2426,196,0 +chr2 32308580 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=3.633;DP=19;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=14.51;ReadPosRankSum=-3.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:304,0,368 +chr2 32308862 . C A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr2 32308864 . A G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr2 32309950 . G T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.742;DP=41;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=25.43;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:1071,0,356 +chr2 32329347 . A G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 +chr2 32371987 . CA C 1807.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=-1.743;DP=86;FS=7.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=21.02;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,66:86:99:1845,0,256 +chr2 32387826 . CA C 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=1.811;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=13.25;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:289,0,163 +chr2 32388112 . CAT C 271.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr2 32402287 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.493;DP=35;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:264,0,976 +chr2 32498332 . A T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.692;DP=27;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:699,0,165 +chr2 32499074 . A G 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.700;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:717,0,151 +chr2 32527442 . CG C 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=-1.851;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:566,0,565 +chr2 32935541 . A G 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.538;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:702,0,1117 +chr2 33126633 . C T 1492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.534;DP=205;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,60:205:99:1521,0,7386 +chr2 33128142 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.009;DP=106;FS=8.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:412,0,3371 +chr2 33134143 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.655;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:460,0,451 +chr2 33134264 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=1.228;DP=77;FS=11.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:295,0,2626 +chr2 33135710 . G T 1281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.983;DP=71;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1310,0,1381 +chr2 33135733 . T C 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.218;DP=64;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=19.68;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1288,0,1125 +chr2 33137274 . T TA 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.803;DP=75;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:386,0,1371 +chr2 33137605 . A G 880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:909,63,0 +chr2 33138850 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=-2.299;DP=141;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,31:140:99:575,0,4617 +chr2 33139029 . G A 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.315;DP=147;FS=4.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,42:147:99:1211,0,8144 +chr2 33139649 . A G 2396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-2.545;DP=110;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=21.79;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,70:110:99:2425,0,1402 +chr2 33140162 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:286,0,739 +chr2 33185526 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:237,0,189 +chr2 33192980 . CT C 271.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:309,30,0 +chr2 33398315 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-1.114;DP=187;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,30:187:99:268,0,6994 +chr2 33398370 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.711;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,24:139:99:356,0,4615 +chr2 33398414 . A T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.666;DP=144;FS=4.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,34:144:99:726,0,4900 +chr2 33399358 . A G 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.182;DP=148;FS=3.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,44:148:99:1101,0,3925 +chr2 33399576 . A T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.778;DP=140;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:336,0,4426 +chr2 33400196 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=1.144;DP=156;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=2.58;ReadPosRankSum=-2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,26:156:99:430,0,10377 +chr2 33400198 . T A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=1.475;DP=152;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=2.64;ReadPosRankSum=-2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,26:152:99:430,0,10377 +chr2 33403457 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.928;DP=203;FS=2.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,36:203:99:537,0,6566 +chr2 33662434 . TGGTAAGAGTGGACTGCTATGGGTGAATTTTGTTAAGGTTGGTTCAGAATCTTCAGTCTCCTTGTGCTTGTACCTTTTCCA T 498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=1.671;DP=90;FS=6.088;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,86:89:99:536,198,0 +chr2 33686169 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.306;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=3.40;ReadPosRankSum=2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:361,0,3124 +chr2 33686669 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.021;DP=118;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,37:117:99:1052,0,3125 +chr2 33693307 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.947;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,26:172:99:281,0,5719 +chr2 33789806 . C A 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.298;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1073,0,1684 +chr2 33843771 . C CA 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-1.558;DP=41;FS=17.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:256,0,684 +chr2 34645237 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=17.22;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:321,0,275 +chr2 34858525 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.625;DP=52;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:452,0,1384 +chr2 35331100 . CCTACAGGTGAGTCTCAAATCAGAAAAAAAAGCACTGGAAAAAGACCGTTTTATAAATCGAATTGTTTCCGAAACCTTAATTTTAAAACATTTCCTTTCTCTTTACA C 6572.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=3.806;DP=186;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=32.54;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,181:186:99:6610,569,0 +chr2 35331707 . C CT 1842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-0.038;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=37.27;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:75:1880,75,0 +chr2 35332001 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.937;DP=63;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:388,0,2080 +chr2 35582221 . CAGGTCAGTCCGGTGAAATGGTCATTTATTTTGTGCGTTGGCATACCACAAGGAGATCGCCTGTGTGACTTCCCTCTGCTGTTATTCCTCCTCCT C 9603.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=1.164;DP=214;FS=2.150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=27.04;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,211:214:99:9641,897,0 +chr2 35695420 . G A 2667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.176;DP=438;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:322,116:438:99:2696,0,12207 +chr2 35699808 . AT A 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-2.017;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,35:144:99:428,0,7508 +chr2 35699903 . AT A 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-0.333;DP=110;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:479,0,2262 +chr2 35700477 . T TA 1131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.712;ClippingRankSum=-0.275;DP=209;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,49:203:99:1169,0,10827 +chr2 35798328 . C CT 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-1.467;DP=104;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:400,0,1997 +chr2 36385735 . ACTGGGGGAGAACAGATCATTGATTTGGTTTTAAATGTTCCCTTGATGTGCATGAATAACAACAGCATCATGAAGAGAAGAGAACTTAC A 15207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.281;DP=367;FS=1.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=28.77;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,357:367:24:15210,24,0 +chr2 36391744 . CAA C 396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:35:434,35,0 +chr2 36660799 . G C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:310,0,138 +chr2 36661184 . TGTAAGTATTTTATTCATTTAAACATAACATTCAGCGCTTTGTACTTGACCAAGCTGTAAAAACCGAACTGAGCATTGAATTAACTGCGTTTGTCAACTTCTTCAG T 1374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.717;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:99:1412,106,0 +chr2 36662710 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:384,0,238 +chr2 36708990 . T C 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.830;DP=36;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=23.22;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:864,0,889 +chr2 36709932 . T C 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.526;DP=77;FS=5.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1360,0,1306 +chr2 36710381 . T TTA 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.214;DP=50;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:968,0,926 +chr2 36710780 . T G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-0.921;DP=30;FS=6.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:536,0,570 +chr2 36710883 . A T 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-2.132;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1036,0,868 +chr2 36711072 . C A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.418;DP=52;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:656,0,1157 +chr2 36713622 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-2.591;DP=28;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:373,0,571 +chr2 36845379 . GA G 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-1.373;DP=64;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:480,0,713 +chr2 36846662 . A G 6669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=2.565;DP=383;FS=7.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.41;ReadPosRankSum=-3.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,191:383:99:6698,0,7028 +chr2 36854254 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=-1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:336,0,84 +chr2 36859711 . A G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=-0.829;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:439,0,524 +chr2 36860077 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.617;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:561,0,357 +chr2 36866471 . A T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-0.043;DP=98;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:1505,0,1907 +chr2 36866653 . G C 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.602;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:1452,0,1516 +chr2 36866774 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.130;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:816,0,1661 +chr2 36866829 . G A 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.451;DP=76;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:1215,0,1509 +chr2 36866959 . G A 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=2.293;DP=49;FS=5.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:793,0,989 +chr2 36866977 . G T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=2.902;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:644,0,1310 +chr2 36867100 . A T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.578;DP=62;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:386,0,3957 +chr2 36867109 . A T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=1.404;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:386,0,3957 +chr2 36867365 . A T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.290;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:540,0,541 +chr2 36899464 . G C 7591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.088;DP=452;FS=7.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,211:452:99:7620,0,8068 +chr2 36902832 . T C 6463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=-0.767;DP=435;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,197:431:99:6492,0,7472 +chr2 36902890 . A G 6032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=-2.900;DP=424;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,174:414:99:6061,0,7927 +chr2 36903890 . T G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=-1.427;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:273,0,716 +chr2 36905678 . C A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=1.269;DP=66;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=12.59;ReadPosRankSum=-1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:859,0,1390 +chr2 36906430 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=-0.760;DP=42;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:357,0,1262 +chr2 36910655 . A G 5694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=1.860;DP=329;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,164:329:99:5723,0,6007 +chr2 36915940 . G C 6817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=1.366;DP=427;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,195:426:99:6846,0,7489 +chr2 36922514 . A G 6092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.819;DP=343;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,175:343:99:6121,0,5865 +chr2 36922529 . C T 5738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.586;DP=356;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,182:355:99:5767,0,6147 +chr2 36924173 . GAGGTATGTGCTTTAGATAATCATCTGAAATATGCTGCACCTTATGGACCAAGTTAATATTTAGATCTCTTCTGTGTGTTTC G 13314.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=2.434;DP=311;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=35.80;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,309:311:99:13352,1015,0 +chr2 36926894 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.255;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:278,0,846 +chr2 36978902 . TGTACAACATCTGGCCGGATGGGGAACAAAATGAATAATGTGCAGGTCTTGATGCTTGCTTTTCTCTCTGTGTGTTTAG T 4122.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=1.931;DP=126;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,99:124:99:4160,0,8348 +chr2 36982042 . TAGGTAGGATCTCTTTTACAATTCTGTATTCTTTTGTCATCGACACCAGGATGGCTTCATATAATTCTGTGTGTTTGTGTTTAC T 2277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.479;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:2315,0,2661 +chr2 36982044 . GGTAGGATCTC G 2406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.739;DP=141;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:2444,0,2613 +chr2 36982056 . TTTACAATTCTGTATTCTTTTGTCATCGACACCAGGATGGCTTCATATAATTCTGTGTGTTTGTGTTTACAGTG T 2406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.859;DP=141;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:2444,0,2613 +chr2 36984773 . G A 3592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.446;DP=198;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,109:198:99:3621,0,3172 +chr2 36985962 . T C 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=2.565;DP=69;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1225,0,1243 +chr2 36986091 . C T 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.672;DP=100;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1793,0,1826 +chr2 36986491 . GT G 908.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.358;DP=89;FS=8.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:946,0,961 +chr2 37002541 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:264,0,62 +chr2 37023327 . G A 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-0.071;DP=39;FS=9.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:756,0,592 +chr2 37023884 . T TC 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=2.252;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=15.78;ReadPosRankSum=-2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:479,0,369 +chr2 37024585 . C T 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.899;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1152,0,1084 +chr2 37026576 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:328,0,424 +chr2 37026866 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-1.910;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=15.45;ReadPosRankSum=-2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,320 +chr2 37026939 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-1.967;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:432,0,295 +chr2 37027249 . T G 464.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:5:492,0,5 +chr2 37027729 . T TA 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.079;DP=28;FS=3.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:414,0,234 +chr2 37029768 . G C 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 +chr2 37033751 . G T 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-0.403;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,36:65:99:1182,0,995 +chr2 37072496 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.728;DP=46;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:735,0,852 +chr2 37072606 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=2.921;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:390,0,1575 +chr2 37072607 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=2.622;DP=32;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:354,0,1655 +chr2 37073121 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.652;DP=53;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:988,0,821 +chr2 37086592 . T G 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.199;DP=124;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=15.80;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1987,0,2088 +chr2 37086862 . AAC A 2150.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-2.266;DP=125;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:2188,0,2124 +chr2 37107054 . T C 2947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.305;DP=162;FS=7.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=18.20;ReadPosRankSum=3.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,89:157:99:2976,0,2425 +chr2 37176565 . C T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.096;DP=47;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:827,0,820 +chr2 37179526 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.211;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=18.64;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:755,0,664 +chr2 37179565 . A T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.743;DP=43;FS=19.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:719,0,695 +chr2 37180905 . C T 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=1.062;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1095,0,655 +chr2 37182583 . A G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.227;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.085;QD=22.51;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:726,0,360 +chr2 37188947 . CA C 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.454;DP=83;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:561,0,1090 +chr2 37192709 . GCTACGGAAGATATTGGAAATTTAAGACTTTTAATAAATGTTATCATAACTAAGAGCTAAACGCAGCTTAAAATCCTAC G 4842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=1.971;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=32.51;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,111:113:99:4880,335,0 +chr2 37208525 . T C 836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:63:865,63,0 +chr2 37208634 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.246;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:391,0,440 +chr2 37209417 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.515;DP=41;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:255,0,1158 +chr2 37209522 . C A 1239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1268,100,0 +chr2 37221626 . TAC T 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=32.21;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:55:456,0,55 +chr2 37222968 . A T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-1.057;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:729,0,621 +chr2 37225600 . C T 656.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:685,48,0 +chr2 37225974 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=-0.851;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:407,0,874 +chr2 37266838 . C G 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.178;DP=38;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=24.44;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:957,0,330 +chr2 37275644 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.476;DP=40;FS=12.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.862;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:720,0,642 +chr2 37335411 . T G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=1.753;DP=40;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:535,0,776 +chr2 37335501 . G A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.951;DP=36;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=16.02;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:605,0,619 +chr2 37335549 . T C 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.124;DP=48;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=16.54;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:822,0,845 +chr2 37377689 . T A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-1.495;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.939;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:965,0,1539 +chr2 37378760 . A G 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-0.464;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:663,0,948 +chr2 37390304 . G A 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.248;DP=64;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,39:64:99:1296,0,854 +chr2 37406212 . T G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.872;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:301,0,247 +chr2 37406713 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=21.62;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:266,0,125 +chr2 37407107 . C A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-1.303;DP=56;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1224,0,747 +chr2 37425943 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=2.246;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:388,0,383 +chr2 37426017 . G T 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.358;DP=49;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:1291,0,398 +chr2 37438308 . C T 2125.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2154,157,0 +chr2 37442185 . T C 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=16.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:520,0,416 +chr2 37475281 . A G 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=1.222;DP=50;FS=12.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:927,0,802 +chr2 37475544 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-0.390;DP=69;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1222,0,1188 +chr2 37476414 . C A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=-0.952;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:418,0,646 +chr2 37477111 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.332;DP=36;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:630,0,639 +chr2 37478672 . G A 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:732,51,0 +chr2 37479103 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-0.188;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.917;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:621,0,420 +chr2 37479447 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=1.517;DP=30;FS=9.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=16.29;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:517,0,564 +chr2 37479595 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.530;DP=40;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:707,0,623 +chr2 37499340 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:332,0,432 +chr2 37510834 . T A 1233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1262,90,0 +chr2 37510944 . A C 743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:772,57,0 +chr2 37517832 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.621;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:370,0,296 +chr2 37528402 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:256,0,294 +chr2 37532048 . GCAGGCAAGAATTTGTCATTCAGATCTTTCTGTGATAATCTATGCAATTACCTAAATGTGTGATTTTATTTTGTTACTGTTTTCTGGT G 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:341,0,846 +chr2 37535979 . GA G 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 +chr2 37542816 . A G 363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:392,30,0 +chr2 37552426 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:294,0,287 +chr2 37552455 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=-0.694;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=22.38;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:610,0,1165 +chr2 37552465 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.755;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:601,0,1165 +chr2 37552768 . T C 660.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:689,51,0 +chr2 37554836 . T G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:521,39,0 +chr2 37555693 . T C 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr2 37555726 . GACCTGTTGAAAGAAAAGACTTCAGTTTATTCAGTTTAATGTCATTTAAACAGATCATGAAATTCATGATAGCAGGCGAAGTT G 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:381,0,382 +chr2 37572126 . T C 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.082;DP=56;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:882,0,1068 +chr2 37572977 . CCCTACATATCAAATAAAAAGCATATAAAACACACTACTTTAGCATGTCAATTCAGAAAACATAATCTTTAATACTGAGGCTGGCAGATCATTGGTTCCTCA C 2194.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.996;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,44:46:99:2232,228,0 +chr2 37576553 . A G 2272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.801;DP=129;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:2301,0,2104 +chr2 37576570 . C G 1849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.361;DP=114;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1878,0,1947 +chr2 37576710 . A T 2149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.537;DP=107;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:2178,0,1468 +chr2 37576853 . A G 2552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.386;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,79:130:99:2581,0,1766 +chr2 37579779 . A G 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.078;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:1597,0,1656 +chr2 37581469 . G C 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr2 37581945 . G A 1953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.009;DP=111;FS=1.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1982,0,2027 +chr2 37605884 . CG C 563.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=1.486;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:4:599,4,0 +chr2 37606147 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=2.378;DP=41;FS=4.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:421,0,893 +chr2 37606870 . C T 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.588;DP=88;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1355,0,3428 +chr2 37618665 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=1.327;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=28.88;ReadPosRankSum=2.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:548,0,104 +chr2 37618744 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=1.780;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:333,0,282 +chr2 37621226 . C G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-1.410;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=28.76;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:661,0,109 +chr2 37621544 . A C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:260,0,685 +chr2 37621554 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=2.905;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=16.55;ReadPosRankSum=-2.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:260,0,685 +chr2 37651293 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,254 +chr2 37671507 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:44:375,0,44 +chr2 37673507 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.714;ClippingRankSum=0.343;DP=27;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:333,0,584 +chr2 37676411 . G A 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 +chr2 37677076 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,187 +chr2 37683253 . A C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.282;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:511,0,196 +chr2 37692824 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,222 +chr2 37693273 . G C 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr2 37694974 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr2 37711260 . G C 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.034;DP=63;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1004,0,1139 +chr2 37717280 . A G 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.563;DP=62;FS=10.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=17.59;ReadPosRankSum=2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1119,0,1153 +chr2 37718174 . G A 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=1.089;DP=69;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:1255,0,1141 +chr2 37724465 . T G 621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.803;DP=31;FS=2.688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,23:26:34:650,34,0 +chr2 37725218 . T C 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.532;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:858,0,1263 +chr2 37729834 . A AT 3468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=-2.431;DP=344;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,136:333:99:3506,0,5066 +chr2 37731837 . T C 4554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=1.151;DP=378;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,141:377:99:4583,0,7603 +chr2 37736296 . G A 8679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=2.887;DP=319;FS=6.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=27.21;ReadPosRankSum=-2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,231:318:99:8708,0,2149 +chr2 37736329 . T C 8464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=-1.071;DP=382;FS=6.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.437;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,251:381:99:8493,0,4389 +chr2 37736764 . GT G 1233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=1.149;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,53:77:99:1271,0,344 +chr2 37742848 . G C 4192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.253;DP=238;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,129:238:99:4221,0,3939 +chr2 37768003 . G A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:751,0,578 +chr2 37768214 . A G 756.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.180;DP=21;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=30.02;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:20:785,0,20 +chr2 37768216 . G A 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.693;DP=20;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:28:785,0,28 +chr2 37770394 . A T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=1.476;DP=36;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.471;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:752,0,563 +chr2 37770809 . ATT A 297.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=27;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:15:507,15,0 +chr2 37775503 . A C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-1.673;DP=69;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:563,0,3787 +chr2 37775647 . G A 2766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-1.652;DP=136;FS=13.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,85:135:99:2795,0,1662 +chr2 37779634 . T G 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-0.964;DP=99;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:1520,0,1894 +chr2 37781183 . A G 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.621;DP=85;FS=6.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1492,0,1396 +chr2 37790619 . C T 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.919;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:1582,0,1782 +chr2 37790768 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=3.713;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:276,0,1757 +chr2 37804267 . G A 1775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=1.311;DP=110;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1804,0,2129 +chr2 37805096 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.296;DP=80;FS=10.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:368,0,5102 +chr2 37805101 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.095;DP=82;FS=9.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:375,0,5102 +chr2 37809400 . G A 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=-1.695;DP=93;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1731,0,1610 +chr2 37817715 . C T 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.851;DP=114;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1987,0,1871 +chr2 37818533 . A T 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.951;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1146,0,1042 +chr2 37850403 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=-2.039;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:574,0,488 +chr2 37850609 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,328 +chr2 37855037 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.362;DP=34;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:592,0,646 +chr2 37855589 . C T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=1.445;DP=63;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=13.84;ReadPosRankSum=-1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:900,0,1272 +chr2 37855901 . A C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.705;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:740,0,722 +chr2 37857576 . C T 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-1.109;DP=49;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:700,0,1011 +chr2 37857703 . C A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.146;DP=24;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:478,0,370 +chr2 37857904 . G A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=1.897;DP=33;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=21.05;ReadPosRankSum=-1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:723,0,472 +chr2 37858236 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.313;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:68:673,0,68 +chr2 37858771 . T C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=1.304;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=13.83;ReadPosRankSum=2.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:374,0,533 +chr2 37864307 . G A 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=-1.049;DP=120;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:2084,0,1880 +chr2 37876419 . G A 2479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=1.718;DP=193;FS=6.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,76:193:99:2508,0,3838 +chr2 37876494 . T C 7518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:7547,548,0 +chr2 37881216 . AGTCAGTAGCTTTGATGTCCCATAACATAAAGCACGAGCACAAAGAGAGCATAGATCTGAAACTGCTGCTTATCTTTCATCAG A 9941.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.362;DP=220;FS=2.113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,216:219:99:9979,837,0 +chr2 37883763 . G A 4314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=1.241;DP=240;FS=1.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,118:240:99:4343,0,4509 +chr2 37883874 . A G 11580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=285;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,284:284:99:11609,860,0 +chr2 37884191 . G A 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=-2.683;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=11.02;ReadPosRankSum=2.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1693,0,2500 +chr2 37884299 . C CT 1415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-2.097;DP=178;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,103:171:99:1889,0,1415 +chr2 37885223 . A AT 418.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:59:566,59,0 +chr2 37885290 . T A 1522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.140;DP=37;FS=3.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=29.98;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1551,108,0 +chr2 37885540 . G C 2312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-2.092;DP=121;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:2341,0,1820 +chr2 37885742 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-1.318;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:897,0,1825 +chr2 37885745 . C A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-0.901;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:897,0,1825 +chr2 37885849 . C T 2643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.663;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:2672,0,2471 +chr2 37900394 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr2 37901420 . T C 3503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.882;DP=240;FS=0.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,109:238:99:3532,0,4045 +chr2 37905114 . C T 7627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.708;DP=416;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,239:416:99:7656,0,6106 +chr2 37905770 . G A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.480;DP=55;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1011,0,995 +chr2 37906027 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=1.954;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,413 +chr2 37906376 . CT C 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.180;DP=70;FS=3.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:882,0,643 +chr2 37906622 . G T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.114;DP=54;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:773,0,1114 +chr2 37908760 . C T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-1.445;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:88:830,0,88 +chr2 37932697 . C G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.114;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:491,0,792 +chr2 37972056 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.285;DP=40;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:719,0,611 +chr2 37977174 . G C 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=1.680;DP=109;FS=1.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=10.90;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,37:109:99:1216,0,2433 +chr2 37978528 . GT G 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=1.379;DP=53;FS=4.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=14.03;ReadPosRankSum=-2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:781,0,438 +chr2 37978895 . C CA 558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-2.332;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:596,0,598 +chr2 37979083 . C T 1087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.464;DP=59;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1116,0,980 +chr2 37979185 . C T 841.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:870,60,0 +chr2 37992034 . G T 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.273;DP=127;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:2161,0,2280 +chr2 37992123 . G A 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.462;DP=133;FS=13.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,47:133:99:1622,0,2985 +chr2 38009465 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.558;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:555,0,539 +chr2 38045313 . G T 1649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1678,120,0 +chr2 38045666 . T C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.268;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:772,0,1100 +chr2 38059524 . G A 2506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=2.538;DP=165;FS=6.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:2535,0,3008 +chr2 38095193 . A G 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=3.485;DP=120;FS=7.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=8.17;ReadPosRankSum=-3.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,39:120:99:1009,0,3082 +chr2 38548429 . A C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-1.573;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:365,0,207 +chr2 38565574 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:240,0,235 +chr2 38587620 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.650;DP=15;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:71:458,0,71 +chr2 38593565 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:257,18,0 +chr2 38594466 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:76:290,0,76 +chr2 38681000 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,178 +chr2 38701644 . G T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.457;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=25.85;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:416,0,135 +chr2 38701659 . CA C 391.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=1.827;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:35:429,35,0 +chr2 38701728 . T C 1925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=1.827;DP=178;FS=14.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=10.82;ReadPosRankSum=-2.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,50:173:99:1954,0,10855 +chr2 38701742 . C G 1916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=2.020;DP=234;FS=16.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,73:227:99:1945,0,10855 +chr2 38702384 . GCTGTTCACAGTAACACACAACTCATTTTATTAGTTCATGCAATAAGTGACAACACATTAACACACATGAACGCACACACGCAC G 11963.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=1.887;DP=270;FS=2.057;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=28.40;ReadPosRankSum=2.496 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,254:258:99:12001,1158,0 +chr2 38704664 . C A 4030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=1.407;DP=299;FS=0.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,111:299:99:4059,0,13018 +chr2 38704667 . G A 4030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=1.501;DP=283;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,103:283:99:4059,0,12930 +chr2 38710054 . T A 5538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-1.441;DP=379;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,161:378:99:5567,0,7205 +chr2 39354160 . G A 2318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-1.240;DP=123;FS=11.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:2347,0,1701 +chr2 39354422 . C T 1542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.899;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=18.59;ReadPosRankSum=1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,48:83:99:1571,0,1143 +chr2 39379924 . C T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=1.237;DP=60;FS=2.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1003,0,956 +chr2 39379990 . GGA G 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.227;DP=41;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:440,0,648 +chr2 39436498 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-3.330;DP=22;FS=4.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=19.72;ReadPosRankSum=3.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:462,0,1289 +chr2 39436706 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-1.826;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=22.22;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:606,0,1517 +chr2 39436722 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.320;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:606,0,1517 +chr2 39436950 . C CT,CTT 660.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.893;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,24,8:33:99:891,207,121,651,0,757 +chr2 39437296 . A C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:74:465,0,74 +chr2 39437642 . G GTT 566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.436;DP=43;FS=2.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:604,0,1703 +chr2 39438447 . GT G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.263;DP=48;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:277,0,617 +chr2 39438676 . C CT 755.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.652;DP=66;FS=2.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:793,0,830 +chr2 39772212 . T TG 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.402;DP=64;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:466,0,957 +chr2 39772499 . G A 2134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=-0.452;DP=106;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=20.14;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:2163,0,2045 +chr2 39772680 . G C 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.209;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:1541,0,1516 +chr2 39774239 . G A 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.236;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1867,0,1925 +chr2 39898231 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,502 +chr2 39903894 . T A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=1.304;DP=32;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:419,0,665 +chr2 39979314 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:305,0,649 +chr2 39979763 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.001;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=22.90;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:555,0,677 +chr2 39979941 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,939 +chr2 39980011 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:262,0,185 +chr2 39982137 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=-0.259;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:247,0,780 +chr2 39984476 . T G 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:752,51,0 +chr2 39985157 . C T 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.268;DP=85;FS=5.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,32:85:99:1123,0,1900 +chr2 39985299 . T A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-0.976;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:508,0,1508 +chr2 40095161 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.120;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:415,0,1346 +chr2 40164530 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.894;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:681,0,716 +chr2 40266917 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.707;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:542,0,1062 +chr2 40267394 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=17.05;ReadPosRankSum=-2.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:318,0,311 +chr2 40268270 . T C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-2.058;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:555,0,484 +chr2 40268295 . TA T 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.569;DP=29;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:337,0,304 +chr2 40272699 . G GAC 260.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr2 40585769 . A G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.197;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=24.03;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:701,0,263 +chr2 40619509 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.034;DP=47;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:495,0,1062 +chr2 40631159 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-2.377;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:249,0,3290 +chr2 40631174 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=-2.268;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:254,0,3290 +chr2 40632139 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.257;DP=43;FS=10.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:288,0,1183 +chr2 40638408 . T C 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:950,69,0 +chr2 40638546 . G A 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 +chr2 41525159 . G GT 985.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.381;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1023,0,681 +chr2 41525847 . C A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.163;DP=347;FS=23.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,60:346:99:764,0,16751 +chr2 41526990 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.720;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:299,0,4890 +chr2 41527351 . C G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=1.777;DP=61;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:383,0,3893 +chr2 41527352 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=2.171;DP=58;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:389,0,3893 +chr2 41540838 . A C 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.409;DP=68;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:1183,0,1068 +chr2 41543969 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-1.172;DP=50;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:659,0,2370 +chr2 41543972 . A C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.130;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:704,0,2284 +chr2 41544191 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,320 +chr2 41564434 . T C 2470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.621;DP=140;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=17.65;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:2499,0,2554 +chr2 41565329 . G A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.761;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,34:103:99:944,0,2686 +chr2 41570259 . C T 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.201;DP=124;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,50:124:99:1644,0,2409 +chr2 41594680 . A T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr2 41594723 . C A 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 +chr2 41594841 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.077;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=22.77;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:347,0,132 +chr2 41594872 . G A 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 +chr2 41702087 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.656;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:311,0,543 +chr2 41714138 . G A 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=-0.519;DP=55;FS=5.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:1042,0,723 +chr2 41727119 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.638;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:433,0,1975 +chr2 41943049 . A T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.159;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:493,0,110 +chr2 41977884 . G A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.887;DP=71;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:991,0,1204 +chr2 41983022 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=1.403;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:521,0,825 +chr2 42006284 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.713;DP=59;FS=2.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:868,0,1176 +chr2 42020885 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-1.952;DP=34;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:236,0,970 +chr2 42122876 . G C 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.226;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:596,0,360 +chr2 42152221 . A G 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 +chr2 42164423 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.312;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:991,0,962 +chr2 42167904 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=-0.601;DP=36;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:452,0,633 +chr2 42172404 . T A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=1.887;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=30.64;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:825,0,99 +chr2 42176163 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.995;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:464,0,462 +chr2 42182198 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:361,0,329 +chr2 42184691 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-3.008;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,374 +chr2 42185859 . T A 216.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:245,0,21 +chr2 42242676 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,177 +chr2 42253296 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=1.582;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:276,0,413 +chr2 42262232 . A G 2127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2156,160,0 +chr2 42265964 . C T 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-0.952;DP=74;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,44:74:99:1502,0,1019 +chr2 42272196 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.130;DP=72;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:829,0,1623 +chr2 42278282 . G A 236.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:265,0,18 +chr2 42292877 . C T 6688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-4.224;DP=322;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,209:322:99:6717,0,7780 +chr2 42308088 . G A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.320;DP=37;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:680,0,598 +chr2 42325627 . G A 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:384,27,0 +chr2 42325766 . G T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.541;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:527,0,911 +chr2 42325989 . G A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 +chr2 42326000 . T G 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:414,30,0 +chr2 42326166 . A G 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.800;DP=28;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=33.46;ReadPosRankSum=3.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:78:965,0,78 +chr2 42326213 . A C 1131.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:87:1160,87,0 +chr2 42326233 . G T 684.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-2.293;DP=15;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=34.13;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:17:713,17,0 +chr2 42326567 . G C 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-1.076;DP=33;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=31.69;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,27:29:40:1074,0,40 +chr2 42326787 . G A 1024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:75:1053,75,0 +chr2 42326901 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.224;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:457,0,965 +chr2 42326911 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.652;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:538,0,1026 +chr2 42326952 . A T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=1.166;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:837,0,1135 +chr2 42327002 . C T 1230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.518;DP=61;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1259,0,706 +chr2 42327301 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=3.242;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=10.76;ReadPosRankSum=-2.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:265,0,513 +chr2 42327792 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=1.021;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:381,0,365 +chr2 42327885 . T A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.527;DP=36;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:480,0,1770 +chr2 42329967 . T C 3528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=-2.308;DP=223;FS=11.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,97:218:99:3557,0,4115 +chr2 42333660 . G A 5214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-1.546;DP=398;FS=1.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,151:397:99:5243,0,8541 +chr2 42455190 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=1.232;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:366,0,371 +chr2 42455315 . C CT 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.262;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:63:409,0,63 +chr2 42455641 . C A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:279,0,240 +chr2 42497591 . G C 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=-0.860;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:782,0,747 +chr2 42505161 . G A 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-0.533;DP=96;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1697,0,1539 +chr2 42516821 . G A 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.826;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:964,0,963 +chr2 42522707 . G GA 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-1.049;DP=42;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:577,0,359 +chr2 42523488 . C T 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.262;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1412,0,1264 +chr2 42526121 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=2.788;DP=27;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:233,0,799 +chr2 42526364 . C T 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.578;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:879,0,1589 +chr2 42534798 . T C 768.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:797,57,0 +chr2 42593004 . C A 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.448;DP=76;FS=1.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=16.40;ReadPosRankSum=2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,41:76:99:1275,0,1202 +chr2 42593020 . C A 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.017;DP=71;FS=3.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:1169,0,1135 +chr2 42593125 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.514;DP=47;FS=2.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:637,0,966 +chr2 42593595 . T A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.706;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:293,0,316 +chr2 42602873 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-1.418;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:377,0,601 +chr2 42618765 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=-0.750;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:540,0,690 +chr2 42621084 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.731;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:536,0,548 +chr2 42633549 . T C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.299;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:437,0,435 +chr2 42638626 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.705;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:587,0,198 +chr2 42644002 . C A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-1.615;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:368,0,357 +chr2 42650550 . G A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-2.103;DP=42;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:704,0,699 +chr2 42705909 . T G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr2 42706222 . T G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.518;DP=56;FS=11.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:405,0,1612 +chr2 42721208 . T A 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.485;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:870,0,974 +chr2 42724146 . T A 1579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.272;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:1608,0,1658 +chr2 42725957 . G A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.932;DP=60;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1136,0,917 +chr2 42774272 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.838;DP=48;FS=13.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=15.83;ReadPosRankSum=2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:788,0,861 +chr2 42774284 . G T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.118;DP=47;FS=8.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:900,0,698 +chr2 42806049 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-1.202;DP=22;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:300,0,439 +chr2 42825601 . G GA 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.723;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,38:174:99:488,0,4057 +chr2 42847648 . G T 10203.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,253:253:99:10232,768,0 +chr2 42848433 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.611;DP=37;FS=10.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:469,0,820 +chr2 42848466 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.158;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:313,0,99 +chr2 42849176 . T A 3707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=1.220;DP=208;FS=5.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,102:208:99:3736,0,4052 +chr2 42849433 . T TAC 3922.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-1.642;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,124:129:99:4431,365,0 +chr2 42918622 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,421 +chr2 43037714 . G A 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 +chr2 43038165 . C T 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 +chr2 43038374 . T G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr2 43038417 . T A 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 +chr2 43040327 . A C 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr2 43043909 . T C 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.628;DP=108;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:1568,0,2263 +chr2 43043957 . A T 2092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.117;DP=114;FS=3.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:2121,0,1915 +chr2 43044017 . C G 2109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.754;DP=133;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:2138,0,5466 +chr2 43044018 . T A 2109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.800;DP=133;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:2138,0,5422 +chr2 43044171 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=2.624;DP=104;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,21:103:99:337,0,3155 +chr2 43047177 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=2.585;DP=55;FS=9.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:294,0,1641 +chr2 43049846 . C T 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.489;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:1025,0,1250 +chr2 43049892 . G T 2537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2566,186,0 +chr2 43050533 . T C 1134.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:81:1163,81,0 +chr2 43050538 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:449,0,470 +chr2 43050714 . T G 3857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3886,280,0 +chr2 43050734 . C T 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.886;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1133,0,866 +chr2 43054450 . C T 1055.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1084,78,0 +chr2 43058255 . A T 2536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2565,187,0 +chr2 43061388 . G A 1540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.234;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1569,108,0 +chr2 43183726 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:240,0,321 +chr2 43191086 . A T 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 +chr2 43256702 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.093;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:604,0,844 +chr2 43257358 . T C 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-3.125;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=23.30;ReadPosRankSum=3.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:867,0,1030 +chr2 43257769 . T C 967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.722;DP=26;FS=2.764;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=25.23;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:29:996,29,0 +chr2 43260005 . G GAC 1778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=1.012;DP=134;FS=3.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,50:130:99:1816,0,2907 +chr2 43260618 . G A 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=1.802;DP=59;FS=11.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=32.47;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,50:59:99:1944,0,749 +chr2 43380709 . A G 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=-1.289;DP=92;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1693,0,1572 +chr2 43391870 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.736;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=18.64;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1165,0,932 +chr2 43417654 . G A 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=1.065;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.071;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1020,0,947 +chr2 43417698 . A G 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.355;DP=70;FS=4.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1048,0,1265 +chr2 43490148 . GT G 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=2.250;DP=27;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:238,0,1287 +chr2 43490615 . C A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.891;DP=48;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=19.70;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:974,0,1613 +chr2 43491888 . G A 249.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:278,0,16 +chr2 43492013 . G A 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.049;DP=62;FS=4.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1020,0,1003 +chr2 43492295 . C A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.029;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:652,0,233 +chr2 43492860 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-0.539;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:316,0,610 +chr2 43492898 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=1.826;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:537,0,910 +chr2 43493834 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=8.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:326,0,368 +chr2 43494559 . C T 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=2.203;DP=43;FS=20.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=14.16;ReadPosRankSum=-2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:646,0,745 +chr2 43570506 . C A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-2.179;DP=43;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:951,0,475 +chr2 43644320 . C T 2308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.457;DP=143;FS=12.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:2337,0,2292 +chr2 43664730 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-0.173;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:629,0,553 +chr2 43665454 . C CT 1721.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.021;DP=67;FS=2.643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=25.70;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,59:61:99:17152,1215,0 +chr2 43666377 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=5.514;DP=200;FS=18.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=3.61;ReadPosRankSum=-2.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,41:200:99:750,0,6234 +chr2 43666623 . CT C 1220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.184;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=25.43;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,46:48:99:1258,0,305 +chr2 43666712 . G A 4912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-4.814;DP=166;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=29.59;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,128:166:99:4941,0,806 +chr2 43666997 . G A 3585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3614,253,0 +chr2 43667788 . C A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=2.201;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=23.04;ReadPosRankSum=-2.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:443,0,200 +chr2 43667918 . AG A 1386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=4.310;DP=130;FS=32.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:1424,0,1444 +chr2 43667923 . T A 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=5.530;DP=129;FS=52.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1424,0,1444 +chr2 43676284 . G A 439.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=33.84;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:467,0,5 +chr2 43676473 . C T 1251.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1280,90,0 +chr2 43680786 . A G 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-2.585;DP=22;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.272;QD=32.31;ReadPosRankSum=2.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:739,0,274 +chr2 43680793 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=-2.422;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=30.90;ReadPosRankSum=2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:739,0,274 +chr2 43680867 . C T 451.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=34.77;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:479,0,5 +chr2 43684082 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=21.98;ReadPosRankSum=-2.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:336,0,588 +chr2 43688463 . C T 1803.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;ClippingRankSum=-3.119;DP=53;FS=17.325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=34.03;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,48:53:19:1832,19,0 +chr2 43688578 . G A 2933.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-1.731;DP=94;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.779;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,82:93:17:2962,0,17 +chr2 43700135 . G A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-2.866;DP=95;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=13.18;ReadPosRankSum=2.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:1280,0,2189 +chr2 43700260 . GCAGGTCTGAGAAGCTGTCAGTCTCTCTCCTACATAAATGAAGACATGACAAACTTTCTGATTGACTGTTTTCTCTCTCATAT G 6032.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:6070,513,0 +chr2 43702931 . C T 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.584;DP=77;FS=3.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,45:77:99:1513,0,1113 +chr2 43703766 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-2.768;DP=61;FS=5.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:856,0,1280 +chr2 43704027 . G T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-3.001;DP=60;FS=8.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=17.06;ReadPosRankSum=3.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1052,0,1016 +chr2 43704341 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=1.194;DP=61;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=21.24;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1324,0,1835 +chr2 43704496 . A G 794.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:823,57,0 +chr2 43705260 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=3.795;DP=32;FS=8.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.52;ReadPosRankSum=-2.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:397,0,1575 +chr2 43705706 . C CT 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.344;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:467,0,484 +chr2 43707149 . AT A 632.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-1.432;DP=28;FS=4.075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:67:670,67,0 +chr2 43730669 . CACTCTGTATGTTGAACAAACTAAACATTAAAACATCCTAATATGCATGATTTGAAAGGGAA C 1287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=-0.495;DP=80;FS=1.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:1325,0,4005 +chr2 43730674 . TGTATGTTGAACAAACTAAACATTAAAACATCCTAATATGCATGATTTGAAAGGGAAATTCTGCCTATGCACGCAAGGCTGTAGATTGTTTGTAAATATTTCTCTCTCTTTTTCTCCAAG T 1038.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.345;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:1076,0,3611 +chr2 43730734 . CTGCCTA C 1287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.733;DP=78;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:1325,0,4048 +chr2 43730747 . CAAGGCTGTAGATTGTTTGTAAATATTTCTCTCTCTTTTTCTCCAAGGCACGT C 1287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.533;DP=80;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=16.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:1325,0,4097 +chr2 43736268 . GA G 479.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-0.627;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:517,0,762 +chr2 43736502 . TGTAA T 538.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:53:576,53,0 +chr2 43741142 . G A 658.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.193;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:686,8,0 +chr2 43741792 . G T 583.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.919;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=34.35;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:5:611,5,0 +chr2 43765630 . TA T 1529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-0.928;DP=133;FS=4.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1567,0,1417 +chr2 43765825 . CG C 1570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1608,131,0 +chr2 43766175 . G A 1840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=-0.131;DP=123;FS=7.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1869,0,2396 +chr2 43769086 . G A 4125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.941;DP=226;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=18.26;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,128:224:99:4154,0,3234 +chr2 43800881 . G A 2582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.289;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,75:189:99:2611,0,3855 +chr2 43800902 . G C 3672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-0.496;DP=192;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,115:192:99:3701,0,2580 +chr2 43812614 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-1.050;DP=33;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:621,0,432 +chr2 43863159 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.295;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:341,0,913 +chr2 43863962 . T A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=1.444;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,387 +chr2 43866207 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-2.077;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:571,0,532 +chr2 43868489 . AT A 711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=1.065;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=24.54;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:48:749,48,0 +chr2 43879094 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.133;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:466,0,582 +chr2 43971627 . T C 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.979;DP=59;FS=2.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1031,0,961 +chr2 44009711 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=2.422;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=30.61;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:82:518,0,82 +chr2 44016698 . A G 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:746,51,0 +chr2 44048818 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-1.569;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:381,0,389 +chr2 44105805 . G A 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.051;DP=49;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:1043,0,742 +chr2 44106868 . G A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 +chr2 44108954 . AC A 253.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=1.283;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.875;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:3:289,0,3 +chr2 44110558 . CT C 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.615;DP=91;FS=6.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:520,0,1130 +chr2 44265061 . C T 3324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-1.460;DP=187;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,91:186:99:3353,0,3523 +chr2 44265264 . G GCACACA 473.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:30:511,30,0 +chr2 44302072 . A G 4506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=2.703;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=19.02;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,135:230:99:4535,0,3326 +chr2 44323477 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:256,0,318 +chr2 44324747 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.952;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:373,0,522 +chr2 44374202 . G A 2874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=-0.386;DP=186;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=15.46;ReadPosRankSum=2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,98:186:99:2903,0,3068 +chr2 44394897 . G A 2484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.672;DP=137;FS=1.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:2513,0,2215 +chr2 44423507 . TA T 300.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:338,33,0 +chr2 44438839 . C T 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:237,0,25 +chr2 44444851 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.155;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:713,0,685 +chr2 44460030 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.620;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:339,0,443 +chr2 44606676 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.724;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,788 +chr2 44668750 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-1.604;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:246,0,522 +chr2 44669242 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,421 +chr2 44756266 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-1.653;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:312,0,1512 +chr2 44813851 . GCCTGAAGGATATGGTATTGTGTAAAAGAGATTTATTTTATAATAATTCAATGCATGCATTTGAAAAAGTCGATTTTACCCCCCCGACGCAAACTCCTCA G 8235.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=2.424;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,188:190:99:8273,675,0 +chr2 44821275 . T TTCAGC 2387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=3.206;DP=84;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=28.43;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,62:71:99:2425,0,359 +chr2 44821488 . CCCTAACAGAACAAATCAGCCATCAGCGAACATGAACAGCAGTTTAATGTGACTGTGCAGAAAACAGGTAATCTCCTTCAA C 2371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.566;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=33.60;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:99:2409,156,0 +chr2 44830142 . T A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=-0.203;DP=202;FS=0.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=3.95;ReadPosRankSum=2.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,43:201:99:826,0,5866 +chr2 44838583 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.401;DP=180;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,40:180:99:760,0,5500 +chr2 45346759 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-1.102;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:297,0,467 +chr2 45409369 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.154;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:565,0,847 +chr2 45434231 . G C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=1.813;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:233,0,226 +chr2 45438782 . C G 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr2 45438793 . T A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr2 45462206 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.200;DP=53;FS=17.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:465,0,1336 +chr2 45475416 . T A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=-0.041;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:629,0,107 +chr2 45476513 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:255,0,52 +chr2 45487282 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.525;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=27.16;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:653,0,145 +chr2 45487382 . G A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.420;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:804,0,866 +chr2 45487722 . T C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.340;DP=67;FS=5.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:770,0,1417 +chr2 45487808 . C A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=-2.610;DP=37;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:328,0,945 +chr2 45495684 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.540;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,129 +chr2 45496939 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=2.003;DP=12;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=23.06;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:305,0,52 +chr2 45512523 . C T 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 +chr2 45513075 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,154 +chr2 45546514 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.328;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:241,0,1198 +chr2 45546796 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-1.450;DP=68;FS=4.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:235,0,2183 +chr2 45549023 . G T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=-1.624;DP=129;FS=7.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,27:129:99:501,0,3995 +chr2 45565979 . C A 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.983;DP=50;FS=6.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:756,0,1019 +chr2 45711101 . C T 1516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-3.573;DP=134;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=11.32;ReadPosRankSum=3.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,46:134:99:1545,0,2986 +chr2 45711280 . G A 3513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.658;DP=208;FS=6.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,111:208:99:3542,0,3521 +chr2 45719195 . T A 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.521;DP=62;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1228,0,936 +chr2 46100971 . T C 1710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=6.499;DP=279;FS=5.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,72:279:99:1739,0,8048 +chr2 46428085 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=1.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:353,0,361 +chr2 46428258 . CA C 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.023;DP=34;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:537,0,146 +chr2 46430751 . CA C 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.349;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:90:367,0,90 +chr2 46430922 . G A 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.096;DP=83;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1399,0,1406 +chr2 46544999 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,526 +chr2 46807987 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:270,0,96 +chr2 46809038 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:357,0,366 +chr2 47498667 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=3.155;DP=114;FS=8.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,19:114:99:271,0,3933 +chr2 47498874 . GA G 484.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-1.703;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,37:150:99:522,0,3223 +chr2 47503091 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=1.345;DP=186;FS=9.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,39:186:99:711,0,5646 +chr2 47515841 . GCCTGAGAGATGGAGGATCATGCAGAGCAGGAATGAGAAAGTGCTTTCTGGTTGATTGTGTTATTGTGTGGGTTTTGTTTTTA G 7011.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.777;DP=161;FS=8.904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=29.39;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,157:161:99:7049,573,0 +chr2 47540247 . G T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.321;DP=167;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,40:167:99:780,0,4532 +chr2 47641636 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.084;DP=44;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:242,0,1487 +chr2 47641811 . A T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.800;DP=28;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:388,0,610 +chr2 47707182 . GT G 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=-0.041;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:391,0,534 +chr2 47710158 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.444;DP=20;FS=11.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:340,0,984 +chr2 47877269 . AT A 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.217;DP=27;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:250,0,282 +chr2 47877478 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.995;DP=44;FS=8.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:827,0,650 +chr2 47925626 . G T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.994;DP=64;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1028,0,1083 +chr2 47943679 . T TA 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.723;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:435,0,331 +chr2 47944177 . TA T 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.372;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:385,0,117 +chr2 47944255 . T A 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr2 47947493 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.828;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:498,0,992 +chr2 47975440 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.791;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:457,0,166 +chr2 48035380 . TCTGGAAATATATGAAGAATATGTAGAGCTATTATGACAGTGTTCTCTAGCTGAATGATTAACTATTTTCTATGCTTAC T 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.922;DP=18;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:395,0,2028 +chr2 48095104 . T A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 +chr2 48095216 . A T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr2 48095282 . C A 1421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1450,102,0 +chr2 48095372 . A G 1366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1395,93,0 +chr2 48095378 . C T 1366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1395,93,0 +chr2 48095585 . T A 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1142,84,0 +chr2 48095647 . C T 3292.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3321,232,0 +chr2 48095702 . A G 3001.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3030,217,0 +chr2 48096120 . C G 6764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6793,473,0 +chr2 48096201 . G T 2772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2801,199,0 +chr2 48096240 . G A 3088.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3117,219,0 +chr2 48096250 . C T 3088.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:3117,219,0 +chr2 48096529 . T G 3950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3979,279,0 +chr2 48096575 . G A 912.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:941,69,0 +chr2 48096612 . G A 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 +chr2 48096695 . G A 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr2 48097028 . A T 2380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2409,169,0 +chr2 48097403 . T C 1267.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1296,90,0 +chr2 48097448 . G A 1801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1830,126,0 +chr2 48097814 . T A 1305.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1334,93,0 +chr2 48097823 . G T 1305.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:93:1334,93,0 +chr2 48097856 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr2 48097858 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr2 48097952 . T C 3000.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:3029,208,0 +chr2 48097955 . C T 3000.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:3029,208,0 +chr2 48109006 . A G 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:496,36,0 +chr2 48109099 . G T 2432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2461,175,0 +chr2 48109873 . C A 940.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:969,66,0 +chr2 48109890 . T A 945.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:974,66,0 +chr2 48110316 . C T 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 +chr2 48110380 . T C 743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:772,54,0 +chr2 48111183 . T C 491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:520,39,0 +chr2 48111203 . G A 547.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:576,39,0 +chr2 48111286 . G A 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 +chr2 48111295 . T C 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 +chr2 48112039 . G A 573.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:602,42,0 +chr2 48112075 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr2 48203421 . T G 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.650;DP=66;FS=15.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,33:56:99:1186,0,837 +chr2 48212433 . T G 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-1.968;DP=94;FS=1.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:1346,0,1871 +chr2 48213704 . A T 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.648;DP=60;FS=16.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1314,0,1921 +chr2 48213710 . T C 1279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.955;DP=58;FS=12.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1308,0,1921 +chr2 48215623 . C A 1961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.056;DP=92;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,57:92:99:1990,0,1232 +chr2 48219480 . C G 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=1.360;DP=85;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1451,0,1484 +chr2 48259343 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:350,0,136 +chr2 48268070 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.857;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:295,0,367 +chr2 48317794 . G A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=1.939;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.036;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1362,0,1492 +chr2 48331401 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=2.571;DP=45;FS=14.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=7.33;ReadPosRankSum=2.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:358,0,952 +chr2 48333526 . C T 2093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-0.017;DP=128;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:2122,0,2352 +chr2 48418779 . G GA 1716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.987;ClippingRankSum=-1.996;DP=136;FS=15.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,79:123:99:1754,0,969 +chr2 48437636 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=1.457;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:371,0,370 +chr2 48470721 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-2.585;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=12.84;ReadPosRankSum=2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,340 +chr2 48470814 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:347,0,58 +chr2 48470861 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:262,0,290 +chr2 48470938 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.993;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:271,0,249 +chr2 49255729 . AT A 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=2.024;DP=15;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:45:287,0,45 +chr2 49256051 . T C 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +chr2 49257133 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-0.228;DP=26;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:336,0,369 +chr2 49257179 . C A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.903;DP=44;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:464,0,711 +chr2 49311094 . G A 2441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=-0.233;DP=129;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:2470,0,1749 +chr2 49317114 . C T 2711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-1.247;DP=134;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.448;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,81:134:99:2740,0,1796 +chr2 49319211 . T G 2536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.084;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:2565,0,2104 +chr2 49333691 . T C 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=2.003;DP=100;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1726,0,1666 +chr2 49333784 . A G 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-0.733;DP=70;FS=4.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1324,0,1038 +chr2 49339991 . C T 2855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=1.292;DP=152;FS=8.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,87:152:99:2884,0,2296 +chr2 49352856 . G A 4198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.208;DP=262;FS=10.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,133:261:99:4227,0,4249 +chr2 49352936 . G A 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.967;DP=150;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,55:150:99:1815,0,3391 +chr2 49352972 . G T 1636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=-0.124;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=13.09;ReadPosRankSum=-3.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,49:125:99:1665,0,2566 +chr2 49364926 . G C 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.836;DP=46;FS=16.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:782,0,751 +chr2 49368328 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-1.950;DP=19;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:537,0,114 +chr2 49384869 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.463;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:385,0,442 +chr2 49385125 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.252;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:307,0,527 +chr2 49385840 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-2.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:264,0,252 +chr2 49401306 . A C 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.126;DP=45;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.873;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:899,0,709 +chr2 49505096 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.555;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:264,0,209 +chr2 49508737 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr2 49518557 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:293,0,329 +chr2 49570253 . C A 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.038;DP=47;FS=10.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=5.48;ReadPosRankSum=-2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:295,0,1700 +chr2 49571046 . CAT C 3217.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:3255,128,0 +chr2 49571127 . A G 3238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.490;DP=183;FS=16.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,92:183:99:3267,0,3374 +chr2 49571156 . C CA 1480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-1.229;DP=256;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,72:256:99:1518,0,6678 +chr2 49571356 . A G 4971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.178;DP=258;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,154:258:99:5000,0,3642 +chr2 49573965 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=2.473;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:396,0,345 +chr2 49593920 . T G 5545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.008;DP=194;FS=4.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=28.59;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,144:184:99:5574,0,547 +chr2 49594167 . G T 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=-3.828;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:897,0,1679 +chr2 49601648 . T A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-1.734;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:396,0,1708 +chr2 49607161 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-3.964;DP=53;FS=15.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=5.92;ReadPosRankSum=-4.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:342,0,2314 +chr2 49607423 . G T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.742;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:612,0,535 +chr2 49607535 . A G 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.638;DP=69;FS=13.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1452,0,874 +chr2 49627687 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:412,0,364 +chr2 49627818 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-2.081;DP=33;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:414,0,790 +chr2 49628928 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=1.369;DP=40;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:512,0,845 +chr2 49630086 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.876;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:537,0,1289 +chr2 49630484 . A G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.472;DP=31;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:625,0,358 +chr2 49631627 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-0.722;DP=22;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:360,0,413 +chr2 49634428 . A AC 810.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.157;DP=24;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.932;QD=33.78;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:29:848,29,0 +chr2 49847809 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.087;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,385 +chr2 49912126 . T A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.873;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:558,0,103 +chr2 49913020 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.212;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:829,0,177 +chr2 49913950 . GA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.101;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:273,0,464 +chr2 49913953 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,464 +chr2 49915341 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.531;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=22.40;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:297,0,139 +chr2 49916744 . C G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 +chr2 49919862 . T A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.178;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:414,0,313 +chr2 49920189 . C A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.600;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:318,0,470 +chr2 49921675 . A T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:355,0,188 +chr2 50011805 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.218;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:483,0,418 +chr2 50020056 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:448,0,487 +chr2 50020080 . A C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:279,0,417 +chr2 50020207 . G C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,387 +chr2 50021484 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=27.58;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:442,0,346 +chr2 50130258 . C T 1639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.509;DP=86;FS=4.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1668,0,1294 +chr2 50139500 . T A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.725;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=21.65;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:418,0,240 +chr2 50154422 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-1.241;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:411,0,657 +chr2 50166913 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=1.137;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:352,0,516 +chr2 50179229 . GAT G 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.929;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:373,0,679 +chr2 50179440 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.285;DP=75;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:236,0,2652 +chr2 50179947 . G A 2450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=1.317;DP=126;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:2479,0,1716 +chr2 50185944 . G T 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.214;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1619,0,1034 +chr2 50192465 . C T 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.386;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1726,0,1803 +chr2 50206529 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:260,0,99 +chr2 50380183 . A T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.558;DP=33;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:591,0,592 +chr2 50394271 . A G 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=1.156;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.249;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:832,0,799 +chr2 50406503 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.139;DP=18;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:346,0,197 +chr2 50413580 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:385,0,584 +chr2 50414440 . T C 231.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:260,0,18 +chr2 50415125 . C T 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-1.804;DP=46;FS=9.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:1161,0,407 +chr2 50417588 . T C 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.844;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:526,0,626 +chr2 50422236 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.893;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:815,0,488 +chr2 50431229 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:363,0,277 +chr2 50434546 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:368,0,986 +chr2 50434549 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:368,0,989 +chr2 50453589 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.537;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,378 +chr2 50453721 . A AT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.86;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,207 +chr2 50482752 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-1.041;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=24.23;ReadPosRankSum=-1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:755,0,228 +chr2 50501769 . C A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,324 +chr2 50536101 . C T 682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:711,54,0 +chr2 50647405 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.329;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:749,0,676 +chr2 50659285 . A G 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=1.119;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:955,0,363 +chr2 50661394 . CGGTACCCAAACACATACCGGCACTGACTTTCCATTAATATGAGATGACGCATGCAAAAACAGATTTCAGGCAGTTGCTGTGTGCTCTGTGCTTATGTACTCACGGCTGCAGTACTGCTGTGCTGTTTTTTTCA C 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.561;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:99:1308,0,1301 +chr2 50665304 . A T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=-1.225;DP=34;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:523,0,612 +chr2 50670606 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,257 +chr2 50670626 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:395,0,436 +chr2 50670742 . G T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:418,0,304 +chr2 50671858 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:345,0,52 +chr2 50689273 . C T 2167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-0.481;DP=108;FS=4.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,67:108:99:2196,0,1355 +chr2 50799965 . CA C 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.454;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:481,0,108 +chr2 50800091 . G A 2366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.590;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:2395,0,2364 +chr2 50844693 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.544;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:241,0,636 +chr2 50844969 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=-0.102;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:707,0,695 +chr2 50844990 . C T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.863;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:785,0,825 +chr2 50845067 . C A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.445;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:764,0,611 +chr2 50847540 . TG T 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-1.871;DP=53;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:278,0,2372 +chr2 50847807 . T C 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.729;DP=27;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=28.44;ReadPosRankSum=1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:796,0,197 +chr2 50847935 . TA T 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=1.036;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:423,0,117 +chr2 50864503 . C T 215.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:244,0,20 +chr2 50966718 . A C 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1086,75,0 +chr2 50966757 . T C 2252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2281,166,0 +chr2 50968774 . G A 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-0.195;DP=57;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,43:57:99:1652,0,878 +chr2 50968780 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.271;DP=64;FS=4.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:343,0,3532 +chr2 50973279 . T A 2972.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3001,219,0 +chr2 50982316 . T C 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=-0.005;DP=77;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1551,0,1102 +chr2 50982451 . T C 2762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-0.346;DP=70;FS=3.136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=23.75;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:2791,205,0 +chr2 50982454 . T C 3119.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3148,211,0 +chr2 50985324 . A G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.426;DP=55;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1084,0,866 +chr2 50985369 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=1.309;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:759,0,366 +chr2 50987940 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.780;DP=62;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:333,0,1628 +chr2 50988881 . A G 2866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:2895,211,0 +chr2 51004374 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.783;DP=45;FS=6.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:767,0,815 +chr2 51006501 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.652;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:846,0,872 +chr2 51018548 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=19.98;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,186 +chr2 51020525 . G A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr2 51024373 . A C 1287.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1316,96,0 +chr2 51024525 . T A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr2 51347270 . T C 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-1.674;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:464,0,402 +chr2 51541126 . TA T 536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.376;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:574,0,829 +chr2 51541695 . A G 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.059;DP=112;FS=7.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1976,0,1721 +chr2 51582896 . A G 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.283;DP=71;FS=8.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1153,0,1353 +chr2 51609512 . A G 2981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=2.593;DP=137;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=21.76;ReadPosRankSum=2.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,88:137:99:3010,0,1648 +chr2 51663339 . A T 470.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:36:499,36,0 +chr2 51722544 . C T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=1.052;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:585,0,507 +chr2 51737596 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-0.664;DP=55;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:634,0,1183 +chr2 51737677 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-0.817;DP=47;FS=7.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=4.74;ReadPosRankSum=3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:251,0,1337 +chr2 51737999 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.441;DP=36;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=7.30;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:291,0,2325 +chr2 51753898 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:318,0,304 +chr2 51754440 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=-2.119;DP=33;FS=8.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:440,0,713 +chr2 51754987 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.692;DP=31;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:529,0,538 +chr2 51755050 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.528;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:521,0,461 +chr2 51765148 . T A 2471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=-5.583;DP=305;FS=0.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,92:305:99:2500,0,17723 +chr2 52213098 . A G 222.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:251,0,14 +chr2 52217393 . G C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,155 +chr2 52217394 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,155 +chr2 52218831 . C A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.550;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=28.88;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:577,0,120 +chr2 52218861 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:309,0,355 +chr2 52219158 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.150;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:618,0,265 +chr2 52219161 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:618,0,265 +chr2 52319171 . T A 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.751;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,46:79:99:1719,0,2591 +chr2 52319178 . A T 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.490;DP=79;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,45:79:99:1719,0,2591 +chr2 52319328 . A G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.190;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=28.03;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:785,0,316 +chr2 52319498 . A G 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr2 52326999 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.043;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:66:686,0,66 +chr2 52331237 . G A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.153;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1064,0,913 +chr2 52339324 . G A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=1.476;DP=55;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1087,0,809 +chr2 52349478 . T C 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.185;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1065,0,937 +chr2 52352026 . GA G 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.137;DP=29;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:319,0,247 +chr2 52386773 . T G 433.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=33.32;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:4:460,0,4 +chr2 52389641 . G A 2211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=-6.956;DP=295;FS=19.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,90:294:99:2240,0,10035 +chr2 52408726 . G A 8377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.751;DP=485;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,260:485:99:8406,0,7933 +chr2 52411516 . A G 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.910;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1857,0,1623 +chr2 52411680 . T C 2588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-2.739;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,74:113:99:2617,0,1296 +chr2 52518447 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:304,0,256 +chr2 52518687 . A T 577.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.102;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=33.97;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:8:605,8,0 +chr2 52519140 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:45:464,0,45 +chr2 52519236 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=2.758;DP=14;FS=10.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=25.48;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:385,0,132 +chr2 52524731 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=1.562;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:266,0,575 +chr2 52524741 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=1.485;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:266,0,575 +chr2 52525932 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.682;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:290,0,242 +chr2 52526341 . T A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.570;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:749,0,263 +chr2 52670187 . G T 320.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:349,0,14 +chr2 52670304 . G A 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:524,39,0 +chr2 52670338 . G A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 +chr2 52677812 . G A 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 +chr2 52680653 . C T 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 +chr2 52704326 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr2 52704390 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:322,0,49 +chr2 52704405 . A G 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 +chr2 52705183 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-1.565;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=32.10;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:38:574,0,38 +chr2 52705260 . G A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-1.752;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:670,0,105 +chr2 52706176 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:273,0,101 +chr2 52706292 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.594;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=32.58;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:45:517,0,45 +chr2 52707637 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.170;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:507,0,129 +chr2 52708359 . G A 305.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:10:333,0,10 +chr2 52708361 . G A 305.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.91;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:10:333,0,10 +chr2 52709032 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,139 +chr2 52709083 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:337,0,93 +chr2 52709104 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=1.268;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=26.67;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:77:375,0,77 +chr2 52711826 . G T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:313,0,403 +chr2 52712279 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:450,0,248 +chr2 52712443 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:253,18,0 +chr2 52712837 . C T 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:743,51,0 +chr2 52713944 . A T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.401;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:322,0,506 +chr2 52714624 . C A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,244 +chr2 52714811 . T A 259.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:298,30,0 +chr2 52714992 . G A 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:51:722,51,0 +chr2 52715129 . T A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.233;DP=30;FS=5.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:624,0,900 +chr2 52715220 . C T 1171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.690;DP=28;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:1200,0,134 +chr2 52715367 . C T 1312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.732;DP=31;FS=4.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=33.60;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:97:1341,0,97 +chr2 52715820 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=2.281;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:259,0,220 +chr2 52716228 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:347,0,141 +chr2 52760377 . C T 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:417,30,0 +chr2 52839032 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,135 +chr2 52839324 . G A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr2 52840453 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:276,0,56 +chr2 52842353 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:282,0,64 +chr2 52919144 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.486;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:520,0,648 +chr2 52926643 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.481;DP=36;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:528,0,698 +chr2 52935728 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.234;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:675,0,706 +chr2 52938194 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-0.462;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:428,0,444 +chr2 52938608 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:379,0,258 +chr2 52939951 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:319,0,55 +chr2 52940337 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:342,0,126 +chr2 52942481 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.369;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:477,0,160 +chr2 52942484 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:287,0,541 +chr2 52942752 . A G 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:302,21,0 +chr2 52942824 . A G 697.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=25.68;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:15:726,15,0 +chr2 52943394 . C CA 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.227;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:304,0,99 +chr2 52955103 . G T 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.798;DP=41;FS=5.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:1009,0,319 +chr2 53014401 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,332 +chr2 53014403 . C A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.566;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,332 +chr2 53028586 . C T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-0.268;DP=29;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=27.03;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:812,0,211 +chr2 53029034 . C CA 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.916;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:440,0,190 +chr2 53029509 . C CA 1131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.209;DP=62;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.244;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,39:62:99:1169,0,685 +chr2 53029686 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=-1.892;DP=23;FS=26.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:446,0,371 +chr2 53030008 . C A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.812;DP=37;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:603,0,1664 +chr2 53030161 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.408;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:285,0,2591 +chr2 53030610 . G C 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.790;DP=48;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=18.72;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:927,0,783 +chr2 53030859 . G T 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.101;DP=81;FS=9.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,49:81:99:1710,0,1144 +chr2 53030962 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=1.778;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:266,0,2137 +chr2 53031315 . G A 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-2.350;DP=45;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=18.22;ReadPosRankSum=3.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:848,0,1836 +chr2 53031320 . A T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-2.373;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=18.63;ReadPosRankSum=3.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:848,0,1836 +chr2 53031651 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.079;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:345,0,574 +chr2 53032462 . C T 473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:502,36,0 +chr2 53034586 . T A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.198;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=18.55;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1160,0,946 +chr2 53035331 . T TA 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.513;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:420,0,378 +chr2 53035421 . G A 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-0.995;DP=51;FS=4.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1181,0,610 +chr2 53091335 . T A 1776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.071;DP=66;FS=5.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,47:66:99:1805,0,493 +chr2 53091371 . C A 1639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.023;DP=62;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,44:62:99:1668,0,468 +chr2 53091819 . T G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=1.716;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:462,0,397 +chr2 53092810 . T G 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.134;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=16.02;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:797,0,884 +chr2 53093143 . C G 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=1.056;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=22.07;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1198,0,1584 +chr2 53093399 . G A 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.196;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:762,0,716 +chr2 53093542 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-1.133;DP=36;FS=5.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:308,0,950 +chr2 53093632 . T A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.320;DP=37;FS=10.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:693,0,621 +chr2 53094382 . TG T 763.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.573;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:801,0,795 +chr2 53094712 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=2.477;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:783,0,698 +chr2 53094759 . A G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=2.227;DP=44;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:840,0,680 +chr2 53095298 . A T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=-0.404;DP=53;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=19.30;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:1051,0,803 +chr2 53095808 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.461;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:470,0,707 +chr2 53097358 . A T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.758;DP=35;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:504,0,746 +chr2 53098407 . A G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=3.014;DP=21;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=18.85;ReadPosRankSum=-1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:424,0,1280 +chr2 53098758 . T A 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=1.144;DP=71;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,43:66:99:1053,0,769 +chr2 53099070 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.308;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:857,0,776 +chr2 53104431 . C A 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=-1.707;DP=74;FS=7.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=18.48;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:1396,0,1114 +chr2 53178869 . G T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=3.180;DP=35;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=23.59;ReadPosRankSum=-2.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:854,0,295 +chr2 53368759 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:229,0,211 +chr2 53408909 . CAA C,CAAAA 242.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,5:9:99:327,191,267,163,0,217 +chr2 53408954 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=26.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:370,0,92 +chr2 53409134 . G C 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.334;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=28.96;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1042,0,189 +chr2 53410793 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=25.91;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:89:391,0,89 +chr2 53436901 . A C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-1.681;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=21.24;ReadPosRankSum=-1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:368,0,606 +chr2 53437996 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=-0.265;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:383,0,742 +chr2 53806299 . GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT G 289.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:44:327,44,0 +chr2 54261740 . TC T 478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:516,51,0 +chr2 54261821 . GT G 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.522;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:452,0,450 +chr2 54402991 . ACT A 501.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:537,0,2 +chr2 54665595 . A T 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:855,60,0 +chr2 54824994 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-1.133;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:415,0,166 +chr2 54827094 . A C 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:804,57,0 +chr2 55022926 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.416;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:566,0,503 +chr2 55128810 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-1.393;DP=36;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:370,0,917 +chr2 55129336 . T C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr2 55388801 . A AC 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=-2.199;DP=108;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,34:103:99:493,0,2312 +chr2 55429093 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.481;DP=25;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.727;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:234,0,1130 +chr2 55429160 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.268;DP=20;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:255,0,513 +chr2 55430429 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:419,0,210 +chr2 55430463 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:244,0,228 +chr2 55804474 . C A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.320;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:385,0,394 +chr2 55804602 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.313;DP=22;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=28.81;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:662,0,100 +chr2 55842081 . C T 4162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=4.443;DP=245;FS=9.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,115:245:99:4191,0,4285 +chr2 55844121 . C T 5618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.654;DP=325;FS=7.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,175:325:99:5647,0,5164 +chr2 55849590 . G A 2057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=1.176;DP=438;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,103:438:99:2086,0,12928 +chr2 55852212 . A C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=-0.885;DP=182;FS=4.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,46:181:99:433,0,8233 +chr2 55852530 . C T 2285.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-1.052;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=31.58;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2314,163,0 +chr2 55852572 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=2.431;DP=72;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:374,0,4195 +chr2 55852895 . CA C 1307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-2.344;DP=149;FS=6.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1345,0,1145 +chr2 55881535 . A G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=1.540;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:554,0,115 +chr2 55883798 . C A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.783;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:638,0,104 +chr2 55909460 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:250,0,123 +chr2 55912669 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:296,0,130 +chr2 55912832 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,344 +chr2 55913559 . GA G 241.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:23:277,23,0 +chr2 55917129 . G C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:63:321,0,63 +chr2 55964840 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.620;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:522,0,533 +chr2 55966245 . T C 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.632;ClippingRankSum=-0.312;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:944,0,614 +chr2 55967096 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-1.544;DP=75;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1095,0,1489 +chr2 55967629 . T G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=34.12;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:540,0,121 +chr2 55967748 . G A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-0.846;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:1000,0,799 +chr2 55967884 . C G 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-0.293;DP=46;FS=7.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1075,0,794 +chr2 55968064 . A G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.207;DP=43;FS=9.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:774,0,731 +chr2 55968113 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.132;DP=37;FS=6.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:282,0,1041 +chr2 55968951 . C G 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-1.392;DP=64;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,34:64:99:1152,0,1090 +chr2 55969329 . T A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.509;DP=57;FS=6.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:859,0,1131 +chr2 55969356 . G A 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.270;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1383,0,2538 +chr2 55969497 . G T 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=1.024;DP=98;FS=6.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1654,0,1770 +chr2 55993561 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.060;DP=46;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:387,0,1223 +chr2 55996272 . CGG C 229.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:267,22,0 +chr2 55997073 . T A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr2 55997643 . GA G 548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:586,51,0 +chr2 56009795 . G T 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.980;DP=70;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,48:70:99:1829,0,593 +chr2 56012562 . A G 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=-0.062;DP=55;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1210,0,626 +chr2 56051800 . G T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-1.480;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:72:502,0,72 +chr2 56196773 . A T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.019;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:520,0,2015 +chr2 56197332 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=-1.488;DP=46;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=6.21;ReadPosRankSum=2.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:314,0,1285 +chr2 56197472 . T A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-0.376;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:755,0,1599 +chr2 56200730 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:305,0,56 +chr2 56225288 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:274,0,264 +chr2 56254515 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:385,0,294 +chr2 56307219 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:339,0,159 +chr2 56307244 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:231,0,256 +chr2 56339999 . GA G 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr2 56340548 . G GT 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-1.195;DP=22;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:422,0,265 +chr2 56340949 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:296,0,140 +chr2 56341542 . G A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=1.522;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=27.82;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:974,0,238 +chr2 56342131 . C CT 745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.952;DP=25;FS=7.368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:36:783,36,0 +chr2 56342532 . TA T 386.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-2.404;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=19.34;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:29:424,0,29 +chr2 56342720 . A G 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.595;DP=36;FS=4.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=33.13;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:44:1221,0,44 +chr2 56342968 . T G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.012;DP=49;FS=4.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:774,0,819 +chr2 56343018 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.104;DP=54;FS=8.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:400,0,1344 +chr2 56343408 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=1.222;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:238,0,787 +chr2 56343558 . G T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-0.296;DP=61;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:942,0,964 +chr2 56371292 . A G 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.559;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=29.47;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:706,0,107 +chr2 56372360 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:232,0,59 +chr2 56372462 . A G 659.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.306;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=25.79;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:16:688,16,0 +chr2 56372503 . T A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.489;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:368,0,350 +chr2 56372991 . C G 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=1.299;DP=46;FS=5.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=28.30;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,34:43:99:1330,0,165 +chr2 56375011 . C G 1327.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.343;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=34.94;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:36:39:1356,39,0 +chr2 56375023 . A T 1214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=33.75;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:18:1243,18,0 +chr2 56394692 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.973;DP=187;FS=10.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=3.74;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,42:187:99:728,0,5096 +chr2 56405064 . A T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.050;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=24.65;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:472,0,426 +chr2 56405271 . A T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.321;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:574,0,397 +chr2 56405440 . TA T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.896;DP=18;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:324,0,105 +chr2 56405519 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:259,0,229 +chr2 56405693 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:256,0,361 +chr2 56418741 . C T 3455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-0.950;DP=188;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,104:187:99:3484,0,3012 +chr2 56426210 . G A 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-0.800;DP=104;FS=6.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:2018,0,1600 +chr2 56426791 . T C 2282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=1.427;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:2311,0,2213 +chr2 56429811 . T C 2839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-1.042;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,89:163:99:2868,0,2572 +chr2 56431772 . A G 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=2.351;DP=172;FS=12.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,55:172:99:1479,0,4475 +chr2 56446340 . C T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.134;DP=156;FS=1.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,42:156:99:929,0,4084 +chr2 56446923 . A G 2150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.794;DP=122;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:2179,0,2128 +chr2 56447373 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.214;DP=119;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:617,0,4165 +chr2 56447601 . CT C 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.304;DP=82;FS=3.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:290,0,2300 +chr2 56447757 . A T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.266;ClippingRankSum=-0.575;DP=131;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,34:131:99:860,0,3850 +chr2 56447787 . C T 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-2.167;DP=183;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:1118,0,5255 +chr2 56448010 . AG A 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.110;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,45:66:99:1158,0,416 +chr2 56565958 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=20.11;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:350,0,239 +chr2 56588037 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-0.921;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:465,0,193 +chr2 56639888 . C A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=-0.980;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=28.53;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:827,0,138 +chr2 56639986 . C A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.903;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:576,0,248 +chr2 56639988 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:576,0,248 +chr2 56674090 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.876;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:268,0,304 +chr2 56687834 . C A 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=1.346;DP=37;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:909,0,348 +chr2 56743348 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-2.488;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,282 +chr2 56750604 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr2 56765179 . T G 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr2 56779981 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=30.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:271,0,135 +chr2 56779984 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=30.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:271,0,135 +chr2 56791814 . T C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 +chr2 56873674 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:464,0,242 +chr2 56873950 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,429 +chr2 56874215 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:485,0,316 +chr2 56874333 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,412 +chr2 56875000 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 +chr2 56875771 . G C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:242,0,119 +chr2 56887152 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.892;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:744,0,490 +chr2 56912160 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:467,0,425 +chr2 56918538 . A G 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:575,39,0 +chr2 56918539 . C T 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:575,39,0 +chr2 56919799 . A T 244.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:273,0,22 +chr2 56920824 . G A 497.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:50:701,50,0 +chr2 56921836 . AT A 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.227;DP=17;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:42:316,0,42 +chr2 56928315 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-0.156;DP=52;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:844,0,876 +chr2 57005783 . A AT 294.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:332,27,0 +chr2 57026883 . TCTGAGGAGAAACAAGATCTGCATATTTCTGGAAAGTGTAACGCATGCGTGCCGAAAAGGAAATAAGATGTCATAC T 3174.72 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=1.153;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=26.73;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,75:85:99:3212,0,2487 +chr2 57154073 . T C 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:660,45,0 +chr2 57190117 . A G 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:669,45,0 +chr2 57190118 . C T 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:669,45,0 +chr2 57199331 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.870;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:326,0,657 +chr2 57201244 . C T 1151.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DP=30;FS=4.357;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.31;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1180,87,0 +chr2 57203508 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:38:393,0,38 +chr2 57371640 . GCTGTGGGAATAAAGCAGTATAGAAGAGAATCAGTGCATTAAACTAGAGGACAAGTGATAACTGAGAATAGAGAAAGCATTGACTGAC G 19305.24 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.661;DP=508;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,497:508:99:21016,0,1304 +chr2 57371805 . G A 7044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=1.095;DP=392;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,216:391:99:7073,0,13880 +chr2 57526940 . AT A 444.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.383;DP=23;FS=2.643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=19.33;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,19:22:7:481,7,0 +chr2 57527274 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=2.419;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:244,0,627 +chr2 57530684 . AT A 218.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 +chr2 57530810 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=24.05;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:413,0,141 +chr2 57531439 . G GA 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.499;DP=40;FS=4.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:498,0,409 +chr2 57533039 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.921;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:456,0,592 +chr2 57536645 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:380,0,423 +chr2 57557560 . C A 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.431;DP=54;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:1074,0,760 +chr2 57557634 . C A 2554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.877;DP=145;FS=1.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:2583,0,2256 +chr2 57619224 . T G 3215.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.807;DP=127;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,84:127:99:3244,0,3127 +chr2 57630296 . T A 1084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.468;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.574;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1113,0,1244 +chr2 57630480 . G A 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=5.068;DP=51;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.323;QD=31.13;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,38:51:99:1616,0,599 +chr2 57639484 . T C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr2 57645323 . G C 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=4.717;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=12.86;ReadPosRankSum=-4.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:993,0,1556 +chr2 57689417 . C T 3497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.641;DP=192;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=18.22;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,105:191:99:3526,0,3043 +chr2 57698550 . C T 3392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=1.996;DP=166;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,102:166:99:3421,0,2202 +chr2 57701969 . G T 3003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.508;DP=161;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=18.66;ReadPosRankSum=3.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,86:160:99:3032,0,5583 +chr2 57701970 . G T 3003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.332;DP=161;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=18.66;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:3032,0,5583 +chr2 57702518 . A T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.914;DP=77;FS=3.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1068,0,1715 +chr2 57702816 . C A 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.041;DP=82;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,56:82:99:2173,0,727 +chr2 57702990 . C G 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=3.963;DP=74;FS=17.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:1306,0,1329 +chr2 57703389 . G A 1673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.088;DP=57;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=29.36;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1702,0,2147 +chr2 57703408 . G A 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=1.246;DP=77;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=21.69;ReadPosRankSum=-3.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:1698,0,2147 +chr2 57703536 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-3.010;DP=70;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=4.18;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,5:70:99:321,0,7359 +chr2 57703721 . G T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=3.377;DP=19;FS=17.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:563,0,239 +chr2 57704312 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:302,0,92 +chr2 57704786 . TG T 2051.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-1.732;DP=56;FS=3.786;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=29.26;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,54:55:99:2089,155,0 +chr2 57705280 . T A 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1453,102,0 +chr2 57705512 . A G 1647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1676,115,0 +chr2 57705522 . A T 763.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.904;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:53:792,53,0 +chr2 57705679 . GA G,GAA 212.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,4:11:99:297,115,124,210,0,247 +chr2 57705846 . A C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.516;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:747,0,377 +chr2 57706576 . C CCACACA 666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:48:704,48,0 +chr2 57707169 . T C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.310;DP=71;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:1032,0,1485 +chr2 57707188 . C CT 708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.025;DP=76;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:746,0,864 +chr2 57707341 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=1.393;DP=50;FS=10.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:321,0,1445 +chr2 57733275 . G T 6248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.716;DP=365;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,193:364:99:6277,0,6156 +chr2 57745781 . T C 285.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 +chr2 57745802 . C A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 +chr2 57762303 . A AT 2878.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-1.336;DP=119;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=24.19;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,86:113:99:2916,0,408 +chr2 57809831 . T C 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 +chr2 57888898 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr2 57888903 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr2 58048519 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=29.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:241,0,105 +chr2 58048540 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:241,0,105 +chr2 58049497 . A AT 215.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:253,27,0 +chr2 58057354 . AT A 334.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:372,39,0 +chr2 58100787 . G A 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 +chr2 58179150 . A C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr2 58187095 . C G 237.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:266,0,18 +chr2 58187131 . T C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:403,0,52 +chr2 58187239 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=34.68;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:51:375,0,51 +chr2 58187240 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=34.68;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:51:375,0,51 +chr2 58187292 . G A 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:454,36,0 +chr2 58187679 . T A 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.321;DP=27;FS=3.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=26.03;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1096,78,0 +chr2 58188225 . T C 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 +chr2 58189485 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.118;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=31.76;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:80:600,0,80 +chr2 58190337 . T A 345.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=34.59;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:374,0,15 +chr2 58190600 . C CT 345.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:383,13,0 +chr2 58190724 . A T 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-1.576;DP=22;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=34.02;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:887,63,0 +chr2 58190805 . T C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr2 58190915 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=30.13;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:89:450,0,89 +chr2 58190955 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:320,0,102 +chr2 58305593 . G T 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:471,36,0 +chr2 58316278 . T C 811.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:840,60,0 +chr2 58341279 . G A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr2 58343207 . G C 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 +chr2 58343522 . G A 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 +chr2 58414302 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=1.708;DP=81;FS=4.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,15:81:99:244,0,2588 +chr2 58416360 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:444,33,0 +chr2 58416370 . A G 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 +chr2 58417771 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.756;DP=117;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,19:113:99:267,0,3553 +chr2 58418001 . C T 4647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:4676,331,0 +chr2 58418023 . C T 4861.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:4890,352,0 +chr2 58431744 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=23.90;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:315,0,89 +chr2 58431776 . C G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:424,33,0 +chr2 58431886 . T C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 +chr2 58431893 . T C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 +chr2 58433063 . A C 257.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:286,0,16 +chr2 58433072 . A T 257.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:16:286,0,16 +chr2 58436240 . C T 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:439,30,0 +chr2 58687175 . C CA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.379;DP=48;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:247,0,891 +chr2 58688876 . A G 905.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.050;DP=25;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=29.39;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:27:934,27,0 +chr2 58688931 . T C 1202.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=1.856;DP=35;FS=2.483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=34.37;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:20:1231,20,0 +chr2 58688980 . C T 1731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=2.282;DP=44;FS=8.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=32.28;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1760,126,0 +chr2 58689148 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=16.29;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:240,0,208 +chr2 58689208 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=1.670;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,499 +chr2 58689213 . T A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:273,0,499 +chr2 58689734 . T A 1446.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=2.556;DP=39;FS=10.492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:25:1475,25,0 +chr2 58689938 . TTG T 882.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.600;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:76:920,76,0 +chr2 58698407 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=20.20;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:311,0,130 +chr2 58710222 . T A 775.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=-1.135;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:16:804,0,16 +chr2 58710269 . G A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr2 58712164 . A T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.805;DP=23;FS=7.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:646,0,228 +chr2 58712372 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,137 +chr2 58712758 . C G 234.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:263,0,21 +chr2 58719104 . C T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.371;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:754,0,115 +chr2 58719124 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-1.036;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=27.17;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:789,0,118 +chr2 58732729 . A G 412.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=34.36;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:438,0,1 +chr2 58732762 . G T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:672,51,0 +chr2 58735190 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,296 +chr2 58741356 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:349,0,128 +chr2 58759753 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:89:268,0,89 +chr2 59216728 . C T 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.156;DP=48;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:1231,0,383 +chr2 59216749 . G C 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.292;DP=42;FS=2.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1114,0,294 +chr2 59239674 . C A 1360.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.208;DP=43;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:1:1386,0,1 +chr2 59282875 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr2 59493866 . A G 16839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.888;ClippingRankSum=0.498;DP=541;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=31.13;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,461:540:99:16868,0,2510 +chr2 59493872 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=-1.983;DP=507;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=0.45;ReadPosRankSum=3.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:438,69:507:99:255,0,34642 +chr2 59522052 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.363;DP=32;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=33.71;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1107,0,198 +chr2 59522196 . C G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=3.609;DP=33;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=14.81;ReadPosRankSum=-4.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:517,0,699 +chr2 59522367 . A C 2407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.390;DP=84;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=28.66;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,70:84:99:2436,0,158 +chr2 59550418 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr2 59550434 . C G 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 +chr2 59603113 . G T 7437.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-1.719;DP=258;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,225:258:25:7466,0,25 +chr2 59611517 . C T 226.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:255,0,18 +chr2 59619846 . C T 4051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.959;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,119:149:99:4080,0,519 +chr2 59619914 . G GCCATAATGATTTCGTGGCC 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,18:105:99:409,0,3520 +chr2 59623042 . AAGGTGCGTCTCACACACACCTGCAGAAAACCTGAGTGATGTCACTTCCTGTTTCTGAATGCTGTTTCTGTGTC A 3255.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.420;DP=86;FS=2.104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=25.00;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,82:86:99:3293,246,0 +chr2 59623744 . T G 2260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.267;DP=80;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,60:78:99:2289,0,350 +chr2 59630567 . TCTGTGGAGCAAAGTAGAGGGTTAGCGTGCGCAGACACACACACACACACACACACACAGGCACACACAGGGCTGCAGTACAGTAC T 5191.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-0.142;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.71;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,113:117:99:5229,444,0 +chr2 59639593 . G T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-1.863;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=29.15;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:33:553,0,33 +chr2 59660985 . G C 1056.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1085,78,0 +chr2 59661020 . G A 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1095,78,0 +chr2 59677686 . C G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:365,0,275 +chr2 59681378 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr2 59681379 . G C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr2 59699050 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.365;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:232,0,986 +chr2 59699061 . G A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.242;DP=40;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1066,0,284 +chr2 59700677 . AT A 1544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.301;DP=66;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,49:58:77:1582,0,77 +chr2 59709500 . T C 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.092;DP=209;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,50:209:99:1007,0,5888 +chr2 59878210 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.333;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:340,0,182 +chr2 59977427 . T C 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-2.264;DP=42;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.30;ReadPosRankSum=2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:755,0,896 +chr2 60049852 . C T 684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:713,51,0 +chr2 60055448 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr2 60205353 . A C 757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:786,54,0 +chr2 60205658 . C G 1146.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-2.058;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=33.73;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:24:1175,0,24 +chr2 60221215 . T A 288.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:317,24,0 +chr20 30994 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:307,0,376 +chr20 31355 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:257,0,104 +chr20 31732 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,300 +chr20 135340 . GTGTGTGTGTGTT G 935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:78:973,78,0 +chr20 143880 . ACG A 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-3.460;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=16.81;ReadPosRankSum=3.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:676,0,449 +chr20 144795 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.568;DP=33;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:279,0,836 +chr20 172538 . G T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-2.242;DP=45;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:749,0,380 +chr20 172550 . G A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.251;DP=58;FS=7.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1087,0,873 +chr20 173021 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.027;DP=94;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,18:86:99:283,0,2525 +chr20 173887 . TCCTGTGAGAAACACACACACACAGTCATGAACACACACACACACACACACTCTGCTGAAGAAGAGCACTAGTGTCTGGCTCTTATTATCCCGTCCACACA T 5471.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.545;DP=128;FS=3.550;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,121:128:99:5509,456,0 +chr20 180397 . A AAC 457.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:495,42,0 +chr20 201612 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.790;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:462,0,359 +chr20 218747 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.527;DP=118;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,20:118:99:271,0,3703 +chr20 219560 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-1.048;DP=90;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:382,0,2540 +chr20 239845 . G C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:609,0,351 +chr20 239919 . A G 1935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.111;DP=108;FS=5.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1964,0,1877 +chr20 239984 . T C 4874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-1.077;DP=191;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=25.52;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,133:191:99:4903,0,1496 +chr20 250399 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.244;DP=180;FS=7.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,35:173:99:613,0,5304 +chr20 250543 . G GGCTCT 5031.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.166;DP=137;FS=14.502;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=29.12;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,105:117:99:5069,128,0 +chr20 253876 . A T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.525;DP=128;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,42:127:99:1135,0,5062 +chr20 253937 . T C 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=-2.645;DP=69;FS=4.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=14.66;ReadPosRankSum=3.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1040,0,1245 +chr20 253963 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=3.095;DP=94;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:245,0,1911 +chr20 258204 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.272;DP=203;FS=4.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,40:203:99:673,0,6128 +chr20 264492 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.294;DP=221;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,41:215:99:690,0,6799 +chr20 268418 . G C 2795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=1.919;DP=165;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:2824,0,2720 +chr20 298244 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.992;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,419 +chr20 299785 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:279,0,136 +chr20 420139 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=1.199;DP=32;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:290,0,836 +chr20 453662 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.948;DP=83;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:471,0,3036 +chr20 461659 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.471;DP=29;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:281,0,1134 +chr20 463156 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.878;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,579 +chr20 556909 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.447;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:752,0,939 +chr20 572562 . A T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=-0.149;DP=50;FS=4.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:754,0,2764 +chr20 572567 . A T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=-0.544;DP=49;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:754,0,2727 +chr20 574410 . G T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=-0.345;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:589,0,721 +chr20 595183 . G T 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.251;DP=241;FS=10.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,56:241:99:1186,0,7154 +chr20 605917 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=3.838;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=21.51;ReadPosRankSum=-2.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:480,0,669 +chr20 705073 . TGGTGAGTTCTCTGTGTGAGTTTGATTAGCCTCAATCTCTGCAGTTTTACGAATATTTCGTCTTCACTTATTTTGCTGCTGTTTTCA T 1093.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=2.291;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=27.34;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:1131,0,3411 +chr20 735297 . C T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.528;DP=129;FS=0.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,29:129:99:603,0,3813 +chr20 779067 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.340;DP=79;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:302,0,3103 +chr20 799234 . G T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=1.241;DP=102;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:644,0,2796 +chr20 875387 . TCTGTTAAGCAAACGAGAGGAAAAATGAGCCGGGTGACGGTGTTTCTGGAGGTCAGTATGAAAGGGTGAGGGTTTGAAC T 3305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.396;DP=100;FS=2.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=33.06;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,89:92:99:3343,274,0 +chr20 898594 . A G 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-1.986;DP=83;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:457,0,2299 +chr20 906415 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-0.948;DP=90;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:268,0,2820 +chr20 907718 . CGTCCACCTACAAGCAAACGTAATCAGATAATAA C 755.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.105;DP=106;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:793,0,4408 +chr20 907722 . CACCTACAAGCAAACGTAATCAGATAATAAATCCACAGGAAGCATTACGAAGCATGTATCAGAACTGAAGTGTGTTTGT C 2062.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.578;DP=102;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,63:100:99:2100,0,3129 +chr20 907755 . CACAGGAAGCATTACGAAGCATGTATCAGAACTGAAGTGTGTTTGT C 762.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.177;DP=96;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:800,0,4408 +chr20 923779 . A C 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 +chr20 926079 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:233,0,292 +chr20 932800 . A G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.121;DP=37;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:625,0,1108 +chr20 932905 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=-1.442;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,10:45:99:267,0,2352 +chr20 932906 . T C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.082;DP=85;FS=4.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:817,0,1421 +chr20 954949 . C A 388.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:416,0,11 +chr20 954987 . C T 362.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.96;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:390,0,7 +chr20 967131 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.224;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:392,0,671 +chr20 1143264 . A G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=-0.636;DP=49;FS=6.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:728,0,1999 +chr20 1143270 . G T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.463;ClippingRankSum=1.051;DP=51;FS=7.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:991,0,1606 +chr20 1150329 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=34.56;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:443,0,454 +chr20 1150338 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=26.24;ReadPosRankSum=2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:435,0,454 +chr20 1200079 . A C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.866;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,149 +chr20 1213598 . T C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.352;DP=51;FS=2.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=14.17;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:751,0,969 +chr20 1222188 . C G 1292.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:93:1321,93,0 +chr20 1227442 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=-0.581;DP=30;FS=11.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:303,0,714 +chr20 1265432 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:310,0,221 +chr20 1267694 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-2.691;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=5.32;ReadPosRankSum=2.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:390,0,2396 +chr20 1280370 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-1.648;DP=41;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:303,0,1718 +chr20 1280760 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-1.031;DP=45;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:547,0,974 +chr20 1310942 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,452 +chr20 1311402 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.103;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:296,0,919 +chr20 1313740 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.550;DP=21;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:378,0,365 +chr20 1318939 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.354;DP=22;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:317,0,393 +chr20 1319038 . T C 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:338,24,0 +chr20 1340081 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.112;DP=37;FS=6.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:475,0,826 +chr20 1343402 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-0.755;DP=77;FS=5.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:347,0,4791 +chr20 1343408 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.231;DP=81;FS=6.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:347,0,4791 +chr20 1348166 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=-0.805;DP=93;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:268,0,2889 +chr20 1362087 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=1.221;DP=68;FS=4.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:268,0,2102 +chr20 1373171 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=1.617;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:268,0,1086 +chr20 1377544 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.286;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:334,0,376 +chr20 1393468 . C G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:301,0,491 +chr20 1393471 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,491 +chr20 1393623 . C T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-0.817;DP=21;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=24.51;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:543,0,106 +chr20 1465135 . C CCT 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.099;DP=35;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:461,0,548 +chr20 1465239 . CA C 1050.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.886;DP=58;FS=1.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,39:49:65:1088,0,65 +chr20 1465777 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-1.650;DP=45;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:422,0,1391 +chr20 1465850 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=1.754;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:512,0,908 +chr20 1490532 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.321;DP=74;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:353,0,2135 +chr20 1492755 . A C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,188 +chr20 1500081 . C T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.367;DP=69;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:1209,0,1143 +chr20 1541654 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.470;DP=102;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:586,0,2847 +chr20 1547408 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.125;DP=59;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:276,0,1669 +chr20 1583938 . C A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.878;DP=72;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:702,0,1594 +chr20 1907502 . G GC 212.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:250,17,0 +chr20 1907507 . A G 221.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:17:250,17,0 +chr20 1949116 . G A 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=1.660;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1210,0,1943 +chr20 2018834 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=-1.163;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,27:139:99:448,0,4295 +chr20 2044022 . G A 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:303,21,0 +chr20 2101994 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=1.259;DP=31;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,656 +chr20 2306289 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.380;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:439,0,1515 +chr20 2309479 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.050;DP=106;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:448,0,3068 +chr20 2312272 . C A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.105;DP=281;FS=10.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,50:281:99:734,0,8805 +chr20 2314873 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=1.586;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=25.49;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:436,0,164 +chr20 2323400 . C G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:70:235,0,70 +chr20 2341434 . TCTGCACATGCCGTCAGAGATAAAAGATTGAGATTACATCAAAACACATCCTGCTAAACCTCAGAATTAAACATGATTACAGATGCAAGCTTGGAAGGTTTGCAGAC T 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=2.567;DP=34;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:518,0,8930 +chr20 2509003 . T TAC 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=-2.219;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=3.75;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:99:562,0,3271 +chr20 2509951 . C CAT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:244,0,486 +chr20 2528646 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-1.872;DP=80;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:430,0,2888 +chr20 2528648 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.612;DP=80;FS=2.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:384,0,3071 +chr20 2534738 . G T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-1.136;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:369,0,2621 +chr20 2544460 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=1.671;DP=112;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:643,0,2898 +chr20 2544556 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-1.743;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:99:371,0,2961 +chr20 2585257 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=2.654;DP=77;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:503,0,2128 +chr20 2585269 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=1.195;DP=71;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:515,0,1918 +chr20 2645045 . C T 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.878;DP=155;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,47:155:99:1198,0,3945 +chr20 2653172 . G A 1385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-0.025;DP=121;FS=3.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,42:121:99:1414,0,2766 +chr20 2675523 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.984;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,285 +chr20 2699559 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.116;DP=77;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:413,0,2014 +chr20 2699598 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.455;DP=91;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:457,0,2596 +chr20 2709191 . C A 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 +chr20 2709446 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=-0.746;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:276,0,656 +chr20 2747810 . C T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.250;DP=303;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,48:280:99:595,0,8760 +chr20 2748033 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=-0.462;DP=282;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,49:278:99:532,0,8317 +chr20 2752425 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:229,0,58 +chr20 2766702 . G A 7002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.004;DP=422;FS=6.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,219:421:99:7031,0,7237 +chr20 2767787 . C T 7753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-1.088;DP=454;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,239:454:99:7782,0,7723 +chr20 2768232 . C T 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.153;DP=338;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,76:338:99:1400,0,9511 +chr20 2771547 . GAA G 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=-1.253;DP=153;FS=5.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,29:96:99:792,0,1735 +chr20 2771906 . TTA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.015;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:367,0,890 +chr20 2772630 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.494;DP=36;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:464,0,941 +chr20 2773447 . A T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.011;DP=228;FS=11.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,50:227:99:1001,0,7017 +chr20 2773926 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.059;DP=150;FS=4.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,24:150:99:277,0,4867 +chr20 2774112 . C A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.918;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,34:166:99:710,0,5095 +chr20 2774398 . TAA T 1179.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.896;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:1217,0,1945 +chr20 3003417 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=-0.385;DP=72;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:353,0,2098 +chr20 3004013 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=1.902;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,746 +chr20 3004016 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=3.269;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=13.52;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,746 +chr20 3008569 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-1.224;DP=279;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,48:279:99:547,0,8494 +chr20 3009023 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.850;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:449,0,419 +chr20 3009113 . G T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=1.085;DP=112;FS=5.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=4.89;ReadPosRankSum=3.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,26:112:99:576,0,3401 +chr20 3010424 . T TG 2676.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=-0.388;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,11:133:99:2714,0,7119 +chr20 3010426 . T A 2685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=-0.779;DP=137;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,12:136:99:2714,0,7000 +chr20 3010493 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.020;DP=163;FS=1.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,37:163:99:418,0,13022 +chr20 3010839 . A G 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=2.943;DP=73;FS=25.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:691,0,2213 +chr20 3010914 . A G 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.797;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:636,0,273 +chr20 3011225 . T C 3045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.454;DP=231;FS=6.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,89:230:99:3074,0,4715 +chr20 3011255 . A G 3372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=1.281;DP=237;FS=9.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=14.23;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,99:236:99:3401,0,4427 +chr20 3016147 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:54:402,0,54 +chr20 3029919 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=1.164;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:411,0,2703 +chr20 3067886 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.589;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:254,0,783 +chr20 3073914 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.704;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=15.78;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:470,0,474 +chr20 3146713 . G C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.253;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:293,0,442 +chr20 3146759 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:305,0,393 +chr20 3155237 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,390 +chr20 3165187 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,425 +chr20 3179281 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:279,0,428 +chr20 3248200 . T A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-1.811;DP=75;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,29:75:99:1024,0,1627 +chr20 3254020 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=-1.520;DP=163;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=2.89;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,31:163:99:499,0,5066 +chr20 3258143 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-2.309;DP=144;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:614,0,4388 +chr20 3264340 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.311;DP=155;FS=11.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,24:154:99:253,0,4928 +chr20 3284544 . A T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=-0.401;DP=58;FS=2.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:667,0,1433 +chr20 3288630 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.090;DP=55;FS=4.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:243,0,1630 +chr20 3288771 . A C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.627;DP=61;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:836,0,1277 +chr20 3288791 . T C 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=-0.435;DP=50;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1112,0,634 +chr20 3309361 . C G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.121;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:338,0,1624 +chr20 3321060 . GAGGTACGGATCCATCAAATGGATGTAATGAGACGGATTATTTTAGTTTGTTGTAACAAAATTCAGTTTTCTTTGAC G 1643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.755;DP=46;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=31.54;ReadPosRankSum=-2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,40:44:99:1681,0,175 +chr20 3331697 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.347;DP=84;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:393,0,2560 +chr20 3333868 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-1.391;DP=88;FS=8.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=6.24;ReadPosRankSum=2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:577,0,2443 +chr20 3336887 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.355;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:637,0,3113 +chr20 3337207 . GCTGAAAGAAAGAGCATGACATCAGAGAAAAGATCTTGGGCAGAATGAGAATATTGGAAATATCATGTGTCTTGGTAC G 2390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.760;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=30.65;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,63:74:99:2428,0,925 +chr20 3337336 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.416;DP=71;FS=4.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:300,0,2130 +chr20 3339569 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.901;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:302,0,1046 +chr20 3351798 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.324;DP=35;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.22;ReadPosRankSum=-3.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:386,0,1133 +chr20 3351842 . T C 1588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.021;DP=90;FS=4.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.974;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:1617,0,1673 +chr20 3351882 . C G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-1.875;DP=122;FS=3.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:421,0,3974 +chr20 3352785 . C T 2507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.361;DP=81;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=30.96;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,58:81:99:2536,0,888 +chr20 3352798 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.023;DP=76;FS=6.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:399,0,3036 +chr20 3352812 . C T 2294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.467;DP=74;FS=6.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=31.01;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,52:74:99:2323,0,922 +chr20 3353261 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.769;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:435,0,497 +chr20 3353953 . T C 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.712;DP=114;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1377,0,2173 +chr20 3354173 . C G 613.35 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:678,48,0 +chr20 3354207 . T C 934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:963,69,0 +chr20 3354783 . G A 623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:652,48,0 +chr20 3355501 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-3.168;DP=237;FS=6.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,45:237:99:501,0,18091 +chr20 3355502 . A T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-5.630;DP=241;FS=4.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,46:241:99:501,0,18091 +chr20 3355697 . C A 3832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=-0.070;DP=258;FS=8.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,116:258:99:3861,0,9164 +chr20 3355826 . C T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=6.845;DP=169;FS=9.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,43:169:99:968,0,4876 +chr20 3356009 . T C 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-3.911;DP=80;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=12.17;ReadPosRankSum=-2.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1002,0,1700 +chr20 3358400 . TA T 3465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.191;DP=275;FS=4.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,131:251:99:3503,0,5517 +chr20 3382890 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,181 +chr20 3385630 . T G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=-0.602;DP=35;FS=5.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:292,0,950 +chr20 3395869 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.465;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.758;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:230,0,926 +chr20 3479763 . T A 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1682,117,0 +chr20 3633725 . T C 375.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=1.448;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=28.88;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:403,0,8 +chr20 3903958 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.543;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:324,0,1135 +chr20 3930451 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.348;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:238,0,1176 +chr20 3952761 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:263,0,761 +chr20 4034987 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=-0.903;DP=37;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=5.89;ReadPosRankSum=2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:246,0,1120 +chr20 4035343 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.321;DP=48;FS=13.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:264,0,1541 +chr20 4035392 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=1.503;DP=47;FS=4.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:766,0,841 +chr20 4051398 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.193;DP=24;FS=6.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:309,0,495 +chr20 4051516 . A C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:279,0,1269 +chr20 4051517 . C G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:279,0,1269 +chr20 4052118 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.387;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,812 +chr20 4052119 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,804 +chr20 4052283 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.637;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,430 +chr20 4052955 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=1.147;DP=39;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:391,0,1262 +chr20 4053165 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,215 +chr20 4063906 . T TG 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-0.644;DP=65;FS=20.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:401,0,1155 +chr20 4064178 . T A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.410;DP=56;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.013;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:396,0,2367 +chr20 4065966 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.229;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:438,0,2015 +chr20 4066530 . GT G 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=-1.129;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:248,0,603 +chr20 4078878 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-0.436;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=15.43;ReadPosRankSum=-2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:491,0,544 +chr20 4079329 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-1.902;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,415 +chr20 4114096 . T TAAAAGATGTTCTCCCTCAGAAC 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=-0.145;DP=50;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:256,0,1130 +chr20 4162773 . G C 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-1.176;DP=113;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,32:113:99:820,0,3053 +chr20 4164312 . A T 837.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=1.306;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=28.89;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:27:866,27,0 +chr20 4164772 . C G 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-1.050;DP=78;FS=3.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:688,0,2313 +chr20 4165748 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-0.914;DP=52;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:514,0,2348 +chr20 4165766 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-1.560;DP=65;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:377,0,4409 +chr20 4165789 . C T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=-1.115;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:615,0,3807 +chr20 4165859 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-0.803;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:261,0,5220 +chr20 4169344 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;ClippingRankSum=2.303;DP=107;FS=5.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,19:107:99:317,0,7045 +chr20 4169346 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=2.413;DP=108;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:317,0,7045 +chr20 4254566 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-0.249;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:302,0,998 +chr20 4372885 . GAGGTAAAACATGAGCCTCAACTGACATGTGTATCATGATATATTATCAACTGACATCTCAAGAATAAATGTGATGTACATGGTTTATTTCATTCTCTCATTGC G 3038.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.372;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,61:63:99:3076,322,0 +chr20 4373040 . A C 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.525;DP=89;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:1187,0,1827 +chr20 4373091 . A G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=1.009;DP=74;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:900,0,1685 +chr20 4378616 . C A 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.620;DP=114;FS=2.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,41:114:99:1366,0,2522 +chr20 4381011 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:257,0,611 +chr20 4381543 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-0.223;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=9.96;ReadPosRankSum=2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:337,0,667 +chr20 4381719 . C T 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-0.592;DP=64;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,39:64:99:1279,0,892 +chr20 4381914 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.139;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:259,0,2617 +chr20 4381986 . C G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.424;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:353,0,2874 +chr20 4489212 . C A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.385;DP=36;FS=5.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:515,0,752 +chr20 4712948 . AT A 240.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=24.05;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:3:276,0,3 +chr20 4754723 . CA C 1250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=-4.891;DP=130;FS=14.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=9.62;ReadPosRankSum=5.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,30:123:99:1288,0,2038 +chr20 4759318 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=-1.330;DP=261;FS=7.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,50:261:99:816,0,8349 +chr20 4801384 . TCTGAAAGAAAAAAAAACATCAGGTTTGTCTAATATGCTAAGGTATGTTATTAATGTAAAGAAATGTGGTTCTGATTTAAGGCTGATCATTAC T 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-0.303;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:505,0,684 +chr20 4947337 . GCCTGTAAACATCAAATAACGGTTGCCATAGCTCTGCTTCTTTCTTATGAACTGAATGAAATCAACGTGCGTCCTGGCTTA G 2295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=2.872;DP=55;FS=2.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=29.53;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2333,183,0 +chr20 4949077 . T G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr20 4949099 . A C 302.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr20 5093040 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=-1.394;DP=47;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=4.29;ReadPosRankSum=2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:230,0,1215 +chr20 5130870 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-0.813;DP=73;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:425,0,2017 +chr20 5133725 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=29.58;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:324,0,127 +chr20 5133870 . G A 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 +chr20 5135927 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.647;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:286,0,1454 +chr20 5298843 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:247,0,107 +chr20 5371668 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-1.778;DP=68;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:265,0,2120 +chr20 6018009 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:311,0,175 +chr20 6119683 . C T 340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:369,30,0 +chr20 6134677 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.949;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:485,0,1013 +chr20 6135789 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=3.614;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:255,0,1722 +chr20 6137375 . T A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-2.920;DP=18;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:514,0,107 +chr20 6137825 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=2.148;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=16.89;ReadPosRankSum=2.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:383,0,369 +chr20 6137983 . T A 239.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:268,24,0 +chr20 6138038 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:334,0,185 +chr20 6138214 . G T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.221;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:283,0,872 +chr20 6138433 . C A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-2.757;DP=33;FS=9.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=14.42;ReadPosRankSum=2.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:504,0,883 +chr20 6138834 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-2.851;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=3.69;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:246,0,1811 +chr20 6139382 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-2.089;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:346,0,5369 +chr20 6215517 . CA C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=1.044;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:81:246,0,81 +chr20 6516241 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +chr20 6593271 . T C 416.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:3:443,0,3 +chr20 6593329 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.65;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:39:485,0,39 +chr20 6593393 . T C 4599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.092;DP=119;FS=3.106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:4628,331,0 +chr20 6593736 . T C 375.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 +chr20 6593765 . A C 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 +chr20 6686829 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr20 6688424 . T A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 +chr20 6768405 . A AGCATGTAACGTGTG 1058.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.569;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:58:1096,58,0 +chr20 6771366 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.231;DP=92;FS=9.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:246,0,2885 +chr20 7029738 . T A 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.257;DP=244;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,45:244:99:539,0,7645 +chr20 7032604 . G A 3162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.226;DP=147;FS=5.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,86:147:99:3191,0,2248 +chr20 7032946 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-2.098;DP=283;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,46:281:99:556,0,9454 +chr20 7033402 . TA T 603.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=-0.295;DP=41;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:4:639,0,4 +chr20 7039592 . C A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=-2.362;DP=94;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:616,0,2519 +chr20 7066876 . C T 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=1.547;DP=90;FS=2.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=14.03;ReadPosRankSum=-2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1291,0,1554 +chr20 7067020 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.213;DP=60;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:376,0,1508 +chr20 7067109 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.629;DP=68;FS=7.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:319,0,1952 +chr20 7067127 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.235;DP=65;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:520,0,1707 +chr20 7067223 . T C 2155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2184,160,0 +chr20 7337887 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.244;DP=22;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:376,0,283 +chr20 7456785 . T A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=2.077;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=7.62;ReadPosRankSum=-2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,28:95:99:752,0,2537 +chr20 7462489 . TCCTAAAGAGAACATAGAGAAACATCTCTCATGCTGCTGATCTATGGTAGATCGTTTAGAGTTGCCAGGTTGTAGGCAGGTTGTAGTTTTA T 3534.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=2.391;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,81:83:99:3572,308,0 +chr20 7468290 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.910;DP=110;FS=5.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,31:110:99:747,0,2857 +chr20 7510113 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.021;DP=118;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:336,0,3723 +chr20 7526506 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-1.369;DP=78;FS=8.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:278,0,2481 +chr20 7614323 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=1.083;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:506,0,192 +chr20 7616767 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.377;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,200 +chr20 7617305 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,524 +chr20 7625207 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.951;DP=59;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:233,0,1811 +chr20 8144671 . C T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.312;DP=123;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,30:122:99:688,0,5073 +chr20 8144743 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-0.842;DP=163;FS=3.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,36:163:99:729,0,4883 +chr20 8233434 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=1.259;DP=41;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:494,0,856 +chr20 8252583 . GT G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.318;DP=25;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:454,0,904 +chr20 8252589 . T A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.046;DP=28;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:499,0,863 +chr20 8252719 . G T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-1.050;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:653,0,116 +chr20 8252815 . A C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:382,0,265 +chr20 8252847 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:392,0,215 +chr20 8254308 . T TA 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:318,0,441 +chr20 8255271 . G T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.076;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:566,0,535 +chr20 8259453 . T C 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:749,54,0 +chr20 8259973 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-1.624;DP=39;FS=2.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:415,0,997 +chr20 8268166 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.997;DP=69;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:758,0,1497 +chr20 8268171 . C CTACATGTGCAGTT 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.699;DP=69;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:758,0,1489 +chr20 8272596 . A G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.394;DP=42;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:821,0,596 +chr20 8296021 . T G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:237,0,64 +chr20 9283415 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:290,0,254 +chr20 9296789 . T G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.410;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:449,0,444 +chr20 9296807 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.267;DP=23;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:328,0,462 +chr20 9311287 . G T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-1.796;DP=23;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:369,0,366 +chr20 9348899 . C A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr20 9350758 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=26.43;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:319,0,56 +chr20 9351656 . C T 3067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-2.120;DP=190;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,90:190:99:3096,0,3176 +chr20 9356286 . TC T 238.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:276,24,0 +chr20 9356924 . AT A 298.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:4:334,0,4 +chr20 9368067 . T G 1867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.680;DP=110;FS=7.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1896,0,1820 +chr20 9415598 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.75;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:337,0,119 +chr20 9456237 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.981;DP=31;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=14.38;ReadPosRankSum=-2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:474,0,650 +chr20 9469071 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=2.301;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:236,0,658 +chr20 9600654 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=1.209;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:405,0,478 +chr20 9756388 . T A 2175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.028;DP=136;FS=2.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:2204,0,2597 +chr20 9757211 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.539;DP=46;FS=9.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.364;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:795,0,820 +chr20 9757354 . G T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.815;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:520,0,3715 +chr20 9757355 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=-0.457;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=7.69;ReadPosRankSum=2.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:513,0,3715 +chr20 9932697 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:303,0,96 +chr20 9946800 . C T 3201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.622;DP=594;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:448,146:594:99:3230,0,17096 +chr20 10154834 . G A 5914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.627;DP=382;FS=5.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,144:382:99:5943,0,17346 +chr20 10157613 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:258,0,344 +chr20 10728063 . TA T 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=1.016;DP=28;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=7.60;ReadPosRankSum=-2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:250,0,247 +chr20 11284802 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,221 +chr20 11917150 . T TAC 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr20 12389243 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.136;DP=58;FS=13.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:387,0,1687 +chr20 12389776 . G T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.669;ClippingRankSum=-2.556;DP=66;FS=7.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:99:409,0,16706 +chr20 12389779 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=-2.558;DP=72;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,7:62:99:344,0,16706 +chr20 12389853 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.463;DP=195;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,19:175:99:374,0,16706 +chr20 12389854 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.536;DP=191;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,18:171:99:354,0,16706 +chr20 12389893 . T C 5335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.394;DP=106;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,74:102:99:5364,0,497 +chr20 12389932 . A T 3713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.385;DP=83;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=31.95;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:3774,0,1856 +chr20 12389957 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=2.890;DP=112;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:377,0,5122 +chr20 12390040 . T C 3516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.487;DP=231;FS=14.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,107:204:99:3545,0,3574 +chr20 12390137 . G A 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=3.428;DP=99;FS=11.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,62:96:99:2212,0,1243 +chr20 12390182 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.415;DP=47;FS=10.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=8.63;ReadPosRankSum=-4.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:434,0,1183 +chr20 12390415 . T C 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.215;DP=66;FS=17.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=20.12;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1356,0,486 +chr20 12390467 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-3.042;DP=55;FS=28.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=9.69;ReadPosRankSum=-2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:561,0,1147 +chr20 12461566 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-3.037;DP=93;FS=5.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=4.83;ReadPosRankSum=3.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:477,0,2851 +chr20 12464391 . C T 980.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.297;DP=28;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=35.16;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:7:1008,0,7 +chr20 12464529 . T C 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=3.058;DP=84;FS=12.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:681,0,1471 +chr20 12464544 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=1.031;DP=69;FS=10.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=7.08;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:517,0,1863 +chr20 12466859 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.021;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:346,0,2073 +chr20 12553855 . G A 327.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.393;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=25.22;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:356,0,16 +chr20 12844133 . A C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=28.14;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:394,0,92 +chr20 13482950 . G GA 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.326;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:460,0,2083 +chr20 13483145 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.644;DP=105;FS=3.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=2.85;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:328,0,5129 +chr20 13483209 . GT G 998.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.050;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:1036,0,1329 +chr20 13787538 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.333;DP=75;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:239,0,2294 +chr20 13930299 . CA C 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.628;DP=200;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,34:175:99:274,0,9475 +chr20 13943243 . AACCTGTGCCAAAGAACTCAATAGGCTAAGACATAAGGCTCATGACCTGGTCAAATGTGGAAAAAAAATAATATCAAGAGATCAGTAAGACCC A 8382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=1.156;DP=225;FS=1.712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=28.40;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,206:212:99:8981,707,0 +chr20 14550410 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=1.704;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:571,0,1078 +chr20 14574573 . T G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-2.711;DP=46;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:778,0,830 +chr20 14574619 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.723;DP=62;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1065,0,970 +chr20 14574699 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=3.894;DP=46;FS=36.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:347,0,1267 +chr20 14574912 . CAT C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.332;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:525,0,515 +chr20 14575002 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,428 +chr20 14575012 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=20.65;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:276,0,428 +chr20 14575137 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.111;DP=47;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:495,0,1502 +chr20 14575372 . C G 2204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.593;DP=85;FS=3.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,58:76:99:2233,0,875 +chr20 14575389 . C T 5725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.674;DP=132;FS=10.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,84:119:99:5754,0,922 +chr20 14575414 . A G 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=-0.487;DP=179;FS=7.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,50:170:99:1275,0,6322 +chr20 14575467 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.100;DP=236;FS=10.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,45:210:99:354,0,8329 +chr20 14575581 . T C 2550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-0.754;DP=112;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=22.77;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,68:96:99:2579,0,1317 +chr20 14575593 . A G 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-1.759;DP=76;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.21;ReadPosRankSum=-3.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,43:64:99:1488,0,762 +chr20 14586175 . A G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.774;DP=22;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:607,0,137 +chr20 14588057 . T A 1557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=-0.152;DP=50;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1586,0,132 +chr20 14600786 . A G 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.545;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:1476,0,1615 +chr20 14600818 . TA T 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-1.148;DP=95;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:590,0,1120 +chr20 14864006 . G T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-4.640;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=7.79;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:332,0,1033 +chr20 14864043 . T A 1984.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2013,144,0 +chr20 14864121 . G A 1904.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1933,137,0 +chr20 14891939 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-2.063;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:250,0,927 +chr20 14891971 . A G 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1317,96,0 +chr20 14909435 . TGTAAGTCTGCAGTTGTGCATAATCACTCTTGAATTGGAATAATAACAGATCTTCTCCATTAATTATTGTTTGCGTCCAGCTTTTGATTTGTCCAGCTTTTTCTTTTTTGATGTTTTTTTTAAAG T 2751.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=1.550;DP=72;FS=5.716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=27.02;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,69:72:99:2789,204,0 +chr20 15030175 . CT C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-1.866;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:243,0,272 +chr20 15031077 . G GA 585.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-1.441;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:623,0,1041 +chr20 15043509 . ATGTTGG A 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=5.766;DP=137;FS=11.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:530,0,8300 +chr20 15560212 . CT C 1829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.155;ClippingRankSum=4.252;DP=176;FS=33.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=10.40;ReadPosRankSum=-3.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1867,0,3154 +chr20 15952656 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.931;DP=76;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:235,0,2276 +chr20 16680475 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.749;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=2.33;ReadPosRankSum=-1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:312,0,3840 +chr20 16704637 . G C 595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:624,48,0 +chr20 16896358 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:306,0,49 +chr20 16896373 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=30.15;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:390,0,51 +chr20 16896496 . G A 663.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:692,48,0 +chr20 16896649 . G A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:333,27,0 +chr20 16897289 . A G 349.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:378,30,0 +chr20 16897816 . G A 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:555,39,0 +chr20 16898084 . C T 240.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:269,0,21 +chr20 16898187 . G A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:480,33,0 +chr20 16898193 . T C 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:480,33,0 +chr20 16898362 . G C 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 +chr20 16898472 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr20 16898475 . A G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 +chr20 16899351 . G A 355.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:383,0,9 +chr20 16899396 . T C 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:275,21,0 +chr20 16899449 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr20 16899648 . A G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 +chr20 16899675 . A G 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:528,39,0 +chr20 16899996 . C A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr20 16900011 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr20 16900188 . A G 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 +chr20 16900754 . G A 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 +chr20 16987998 . CT C 1198.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.983;DP=40;FS=1.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1236,0,493 +chr20 17864197 . CT C 1894.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.712;DP=244;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,99:239:99:1932,0,2424 +chr20 18234849 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,133 +chr20 18352394 . C T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-2.415;DP=379;FS=2.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:309,69:378:99:967,0,12516 +chr20 18396926 . G T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr20 18438420 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr20 18438426 . G C 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr20 18439726 . C G 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-1.264;DP=40;FS=6.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:654,0,719 +chr20 18464162 . A T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.664;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:99:598,0,2815 +chr20 18464856 . A G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.097;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,33:151:99:656,0,4767 +chr20 18465288 . G A 2552.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-2.887;DP=75;FS=8.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=34.04;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,65:73:0:2578,0,0 +chr20 18465360 . G GAC 517.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.714;DP=28;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:554,9,0 +chr20 18468306 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.437;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,31:169:99:444,0,5297 +chr20 18479107 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.776;DP=151;FS=1.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.229;QD=4.01;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,32:151:99:634,0,4480 +chr20 18486568 . ACTGAAAAACATCATGGGAGATTGGATTTATAATGGAAATAAAAATAAATAAAAAGATAAGAACTGAGCGAGGAATGTACAGTATTCATAC A 5325.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=1.705;DP=138;FS=3.078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:5916,429,0 +chr20 18489946 . C T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.397;DP=137;FS=2.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,35:137:99:778,0,3841 +chr20 18750626 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-0.154;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:480,0,457 +chr20 18792002 . CT C 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.094;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:341,0,215 +chr20 18792936 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,303 +chr20 18846488 . T TA 206.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:244,24,0 +chr20 18855025 . C A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=-1.075;DP=47;FS=6.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:833,0,524 +chr20 19056499 . A G 579.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.452;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=25.18;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:12:607,0,12 +chr20 19067152 . TGTTAAGGTAAGCACTTCACAGTACCGTACAGTAAGCATGCTCAG T 5356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.277;DP=355;FS=1.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,161:333:99:5394,0,6941 +chr20 19067156 . AAGGTAAGCACTTCACAGTACCGTACAGTAAGCATGCTCAGTTTATGCATTTATAAACTTAATTCTTTCAATTTCAGGTTTAACAAAAAATTTGTTTTAT A 5181.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.552;DP=349;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,164:330:99:5219,0,7466 +chr20 19067200 . ATGCATTTATAAACTTAATTCTTTCAATTTCAGGTTTAACAAAAAATTTGTTTTAT A 5356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.176;DP=331;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.618;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,151:312:99:5394,0,6928 +chr20 19070047 . G GA 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-0.070;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:34:427,0,34 +chr20 19147417 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.391;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:419,0,512 +chr20 19150169 . AC A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.979;DP=17;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=24.10;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:447,0,343 +chr20 19347794 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:239,0,64 +chr20 19348726 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=2.047;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.047;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:232,0,223 +chr20 19395815 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=10;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=21.48;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:243,0,63 +chr20 19395894 . C G 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 +chr20 19396051 . C T 482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:511,36,0 +chr20 19502914 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.321;DP=65;FS=3.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:350,0,4100 +chr20 19503034 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-0.931;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:326,0,1917 +chr20 19585462 . TGTACGTACTTTTATCATCATGGTATGAGCGTCACTCGATGTTTTAATAAACGGAATAGCAAACTGTCTTTGTTTTACAG T 1031.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=2.115;DP=30;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=34.39;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1069,0,1387 +chr20 19587815 . GACAGGTGAGACCCCTGGACAGTCATCCCAAACAGGTTAGTCATTGCTTCTGTATTTTAACATGTTTATTGTTACTTCTTATGCTTT G 959.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=3.292;DP=42;FS=11.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=22.85;ReadPosRankSum=-3.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:997,0,3246 +chr20 19604155 . T A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.717;ClippingRankSum=0.635;DP=114;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:515,0,3311 +chr20 19904508 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.966;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:446,0,2315 +chr20 20295124 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.540;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:263,0,99 +chr20 20297379 . G A 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 +chr20 20299112 . T A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-2.303;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:453,0,523 +chr20 20304359 . A T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=1.383;DP=117;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,30:117:99:694,0,4596 +chr20 20304852 . G C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.179;DP=99;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:628,0,2837 +chr20 20399504 . C CT 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.635;DP=191;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=3.93;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,64:170:99:862,0,2213 +chr20 20557182 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,444 +chr20 20557663 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.135;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:312,0,1382 +chr20 20682954 . C G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.851;DP=63;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:265,0,1833 +chr20 20682972 . ACTAAAAAGCAGCCACAATACACATCAATCGATAGCTAGCCAATTAGCCAGCCAACTAACGTCAAACGTGCCAGAGACCGACTGCGTAAATAAAACAACAACAATAACAAACGTAC A 1805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=1.264;DP=93;FS=8.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1843,0,20897 +chr20 20685581 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.085;DP=78;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:382,0,2328 +chr20 20685726 . G A 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:481,39,0 +chr20 20765636 . T C 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=2.054;DP=249;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,55:249:99:1104,0,7739 +chr20 20767071 . A AG 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-1.942;DP=229;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,39:204:99:416,0,5273 +chr20 20767154 . GCACACACACACACACACACACA G 205.24 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=2.556;DP=95;FS=8.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=2.16;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:816,0,711 +chr20 20767222 . C T 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.236;DP=144;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:892,0,7699 +chr20 20889671 . T C 1683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.035;DP=364;FS=6.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,84:364:99:1712,0,11006 +chr20 20973244 . GCCTAAACATTGAAATAACGTTTAACACGAAGATAAATAAACTGTAACGCACTCTCTCAGCAATGTATCGCAATAAGGGATTGTTTATCAA G 712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=1.085;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:99:750,0,778 +chr20 21417638 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.861;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:432,0,877 +chr20 21417726 . TC T 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=2.388;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=15.85;ReadPosRankSum=-2.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:275,0,655 +chr20 21418448 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.322;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:402,0,518 +chr20 21420143 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=-1.835;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:243,0,665 +chr20 21509999 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.199;DP=55;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:606,0,1198 +chr20 21545963 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-0.240;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:488,0,1676 +chr20 21546684 . G GT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.819;DP=50;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:324,0,669 +chr20 21714964 . C T 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-2.177;DP=63;FS=3.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:765,0,1261 +chr20 21719818 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-2.397;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:506,0,747 +chr20 21725320 . C G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-0.500;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:477,0,1643 +chr20 21736074 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-1.856;DP=48;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:331,0,1300 +chr20 21887601 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.282;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:414,0,2563 +chr20 21887865 . G T 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.665;DP=127;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:1420,0,2802 +chr20 21888094 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.031;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:354,0,1643 +chr20 21888159 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=-1.883;DP=57;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=16.45;ReadPosRankSum=3.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:966,0,1025 +chr20 21891174 . T C 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=1.442;DP=153;FS=8.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,39:153:99:836,0,4233 +chr20 21905540 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=-0.898;DP=139;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,39:139:99:994,0,3833 +chr20 21944915 . C T 1332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.686;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,41:120:99:1361,0,2735 +chr20 22160564 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:324,0,279 +chr20 22230537 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.709;DP=20;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=30.59;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:65:640,0,65 +chr20 22238630 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=20.71;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:256,0,126 +chr20 22261574 . G C 2853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.124;DP=162;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.523;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:2882,0,2849 +chr20 22263644 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.971;DP=156;FS=5.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,25:156:99:304,0,5112 +chr20 22450069 . G A 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.133;DP=92;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,34:92:99:1339,0,4180 +chr20 22451983 . G C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.902;DP=65;FS=8.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:274,0,2371 +chr20 22454434 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.547;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:572,0,2219 +chr20 22708652 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=1.141;DP=31;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:436,0,563 +chr20 22708664 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.441;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:421,0,531 +chr20 22720435 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-0.404;DP=44;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:236,0,966 +chr20 22724500 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.822;DP=35;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:269,0,950 +chr20 23010824 . A AT 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=-0.364;DP=44;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=14.52;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:676,0,721 +chr20 23102461 . T C 211.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:240,0,23 +chr20 23104998 . A ATG 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,287 +chr20 23170363 . C T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.278;DP=42;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:699,0,733 +chr20 23170559 . G GT 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.111;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:552,0,303 +chr20 23171538 . TA T 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.234;DP=50;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:372,0,393 +chr20 23192248 . T TA 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.675;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:395,0,305 +chr20 23233379 . T A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.713;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:630,0,2871 +chr20 23365981 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=1.238;DP=96;FS=3.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:257,0,2992 +chr20 23382889 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.916;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.363;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:357,0,2411 +chr20 23435394 . GACCTGTGAAAAAAAACACACACTAAGTATGTAGGGGGGGTCACTATTTGTTTGCATTGAGTTGTGAGAACCTGAGAGT G 1394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=2.313;DP=49;FS=2.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1432,0,4308 +chr20 23609232 . C T 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.164;DP=255;FS=14.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,71:255:99:1516,0,8209 +chr20 23635054 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-1.209;DP=278;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,58:278:99:1063,0,8332 +chr20 23635182 . C T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.573;DP=192;FS=6.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,45:192:99:928,0,5454 +chr20 23643790 . TCTGAAATTAAATGTATACTCCTGAATTAAACAAACACCTATTAAAGGACTCTTGGACATTTTAAAAGATTCAC T 717.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.979;DP=23;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=31.21;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:755,0,952 +chr20 23653494 . G A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-0.551;DP=50;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:320,0,1183 +chr20 23673114 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.954;DP=35;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:278,0,1243 +chr20 23778664 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-0.534;DP=91;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:540,0,2650 +chr20 23809054 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-0.083;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:337,0,2357 +chr20 23811260 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=-0.580;DP=57;FS=6.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:253,0,2264 +chr20 23817327 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-1.075;DP=85;FS=7.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:467,0,2416 +chr20 23817465 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.726;DP=45;FS=1.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.888;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:244,0,1998 +chr20 23818636 . C CT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.066;DP=24;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:318,0,233 +chr20 23835603 . C T 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:626,45,0 +chr20 23835985 . T G 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:675,48,0 +chr20 23839313 . G C 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.469;DP=155;FS=2.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,30:155:99:537,0,4834 +chr20 23839658 . G A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-1.157;DP=145;FS=0.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=6.46;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:965,0,3927 +chr20 23839691 . C T 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-2.057;DP=156;FS=3.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=6.18;ReadPosRankSum=2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,41:156:99:992,0,4467 +chr20 23859850 . C CT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.655;DP=40;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:303,0,500 +chr20 23860252 . TTG T 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.754;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:499,0,733 +chr20 23862002 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.218;DP=43;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.687;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:321,0,2362 +chr20 23868024 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-1.957;DP=65;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.957;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:437,0,1841 +chr20 23868457 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=-3.133;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:290,0,1691 +chr20 23872577 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=-0.809;DP=63;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:514,0,1583 +chr20 23872588 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-0.592;DP=63;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=6.77;ReadPosRankSum=2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:455,0,1673 +chr20 23937425 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.021;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:293,0,698 +chr20 23938655 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-2.137;DP=35;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:387,0,844 +chr20 23956149 . A AT 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=1.657;DP=65;FS=4.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:263,0,1065 +chr20 23979168 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.017;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:423,0,2224 +chr20 24134396 . AG A 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=1.949;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=2.59;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:239,0,1707 +chr20 24310009 . TGTACGTGCATCTCCACTGTTTTTCCGCAGTTCTTGTCTCCGGCTGCTGCAGATCTCTGACCGCTTTGTTGTTGTTTTTCTGTGTGCAG T 3975.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.051;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,96:99:99:4013,288,0 +chr20 24314631 . A G 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-1.551;DP=131;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,43:131:99:1197,0,3350 +chr20 24316610 . G T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.735;DP=89;FS=8.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:493,0,3475 +chr20 24316785 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-1.788;DP=79;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:334,0,3873 +chr20 24848341 . G C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.781;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:451,0,621 +chr20 24848460 . G T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=1.195;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:482,0,769 +chr20 24882291 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-1.460;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:354,0,683 +chr20 25333047 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr20 25371741 . G A 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-0.487;DP=333;FS=0.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,75:333:99:1407,0,9874 +chr20 25478044 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=-0.647;DP=89;FS=5.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,30:89:99:1039,0,1990 +chr20 25481565 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.706;DP=81;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:506,0,2217 +chr20 25489225 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.145;DP=55;FS=3.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:802,0,1074 +chr20 25500109 . G A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=1.193;DP=121;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:99:625,0,3457 +chr20 25500353 . G T 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.896;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,57:149:99:1931,0,3104 +chr20 25501469 . A C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-1.448;DP=127;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,33:126:99:770,0,4426 +chr20 25501629 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-1.415;DP=93;FS=4.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:450,0,3213 +chr20 25502198 . G GT 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.612;DP=27;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.126;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:382,0,203 +chr20 25502717 . AG A 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:314,0,867 +chr20 25579950 . G A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.368;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:781,0,612 +chr20 25581197 . G C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.024;DP=29;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:265,0,809 +chr20 25581717 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.694;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:252,0,698 +chr20 25584416 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.044;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.891;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:298,0,1230 +chr20 25629890 . G T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr20 25653150 . C T 2562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=1.408;DP=339;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,103:338:99:2591,0,8709 +chr20 25655617 . GAC G 2238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.836;DP=253;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,78:232:99:2276,0,6450 +chr20 25658924 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=1.026;DP=46;FS=4.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:531,0,1059 +chr20 25659863 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.160;DP=38;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:509,0,739 +chr20 25660568 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=1.569;DP=51;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=4.27;ReadPosRankSum=-1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:246,0,3169 +chr20 25660569 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=1.882;DP=52;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:249,0,3169 +chr20 25672408 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=1.716;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:446,0,1741 +chr20 25673905 . TCTACAAAATAAAGGATAAAGAGATTAAACGTAAAATGGCATTATTGTCAAAACAGCTTATTTAAATGACCCAATATACAAAAAAAAAAAAAGGTTTCTTAC T 1671.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=3.990;DP=50;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=33.43;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1709,0,2640 +chr20 25674027 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.751;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:297,0,1220 +chr20 25674298 . GACCTATAAGAATGTACCATACAAAATGAGTCACATAAATTAGCACAACAGTAAAAGCATCAGTTACTAGTTTCAACATTTTCGCCT G 1549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=2.374;DP=49;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=31.63;ReadPosRankSum=-2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:99:1587,0,2474 +chr20 25928826 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:482,0,454 +chr20 25936954 . G C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-1.043;DP=128;FS=5.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,23:128:99:344,0,4089 +chr20 25939453 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.354;DP=75;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:320,0,3190 +chr20 25939746 . AT A 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.295;DP=78;FS=5.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:298,0,3724 +chr20 25946611 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.502;DP=61;FS=4.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:243,0,1843 +chr20 25947111 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=-0.016;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:266,0,1081 +chr20 25948646 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.410;DP=42;FS=1.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:229,0,1173 +chr20 25953369 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=1.201;DP=40;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:541,0,803 +chr20 25957705 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,573 +chr20 25990268 . A T 1179.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:84:1208,84,0 +chr20 25990339 . A G 950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:69:979,69,0 +chr20 25990630 . T A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:635,0,372 +chr20 25990794 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.471;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:267,0,400 +chr20 26013923 . TCCTGCAAGAAGCAATATGGTTGCAGTAATTGTGTTAAGTATATGTGATAAGTTTAAAATGAATTTCATATTAGCACTCA T 10713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=1.718;DP=252;FS=3.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=27.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,250:251:99:10751,817,0 +chr20 26032577 . A G 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.066;DP=103;FS=6.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,24:103:99:513,0,2995 +chr20 26053436 . T G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.543;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:405,0,1440 +chr20 26053998 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.429;DP=104;FS=9.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,28:104:99:677,0,2943 +chr20 26054194 . AT A 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-2.009;DP=59;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=5.94;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:388,0,1086 +chr20 26089535 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:322,0,59 +chr20 26374837 . C T 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=1.175;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,43:119:99:1436,0,2680 +chr20 26383502 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.253;DP=122;FS=8.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=4.64;ReadPosRankSum=-2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:594,0,3532 +chr20 26388350 . G A 1667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-1.441;DP=97;FS=11.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1696,0,1681 +chr20 26388432 . G A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.457;DP=105;FS=5.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:1331,0,2396 +chr20 26424107 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-0.301;DP=31;FS=6.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:360,0,622 +chr20 26434086 . C T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-1.624;DP=92;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:1258,0,1767 +chr20 26435092 . A T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.092;DP=49;FS=2.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:684,0,1558 +chr20 26436698 . T C 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.967;DP=52;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:895,0,942 +chr20 26438979 . T G 2647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=2.471;DP=192;FS=4.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,76:192:99:2676,0,3929 +chr20 26508961 . T A 2685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-2.090;DP=84;FS=11.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=31.97;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,71:84:99:2714,0,572 +chr20 26509300 . C A 3863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.054;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=35.37;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:3892,288,0 +chr20 26540875 . C G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=1.092;DP=215;FS=5.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,40:215:99:607,0,6573 +chr20 26552592 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.845;DP=243;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,43:243:99:588,0,7491 +chr20 26561237 . G A 4347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.549;DP=257;FS=6.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,135:257:99:4376,0,7415 +chr20 26563886 . T G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:308,21,0 +chr20 26570493 . T C 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.426;DP=24;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:758,0,108 +chr20 26602143 . G A 595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:624,45,0 +chr20 26714322 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:317,0,49 +chr20 26732389 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-1.110;DP=73;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:73:99:1565,0,2438 +chr20 26732398 . C A 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.127;DP=73;FS=1.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:1500,0,2508 +chr20 26732782 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-2.041;DP=66;FS=2.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:1012,0,1071 +chr20 26733708 . T C 1314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=-0.155;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=22.67;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,38:58:99:1343,0,639 +chr20 26738728 . A G 211.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:240,0,20 +chr20 26836992 . G A 3912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-2.158;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,110:222:99:3941,0,4056 +chr20 26854300 . G C 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr20 26856117 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-1.967;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:377,0,274 +chr20 26856150 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=-2.224;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.99;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:380,0,179 +chr20 26914085 . C G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.678;DP=85;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:554,0,2373 +chr20 26937413 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.090;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,860 +chr20 26937506 . AGTAAGTGTGTGAAATGCATTACACTCTTTGTTTGTTATGGAATATTCTCTGTTAATTTTTATTTTCCTGATAG A 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.493;DP=27;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:485,0,188 +chr20 26946258 . C T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=1.756;DP=18;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:35:619,0,35 +chr20 26946277 . A T 810.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=1.203;DP=26;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:10:838,0,10 +chr20 26946365 . T C 255.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:284,0,16 +chr20 26970614 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.402;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:417,0,3610 +chr20 26971664 . CT C 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.937;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:536,0,167 +chr20 26972770 . T C 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-1.753;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,34:153:99:692,0,4609 +chr20 26972849 . T TC 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-2.520;DP=141;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,36:135:99:681,0,3197 +chr20 26974683 . A AT 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.542;ClippingRankSum=2.794;DP=69;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:617,0,850 +chr20 26977822 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.494;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.352;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:519,0,467 +chr20 26989179 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:475,0,493 +chr20 26989827 . C A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.972;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:625,0,733 +chr20 26990956 . CT C 615.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:22:653,0,22 +chr20 27032385 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.103;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:315,0,1254 +chr20 27032815 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.743;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:354,0,707 +chr20 27051200 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.485;DP=40;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:269,0,1124 +chr20 27069066 . G A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.986;DP=58;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:765,0,1299 +chr20 27118829 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.430;DP=64;FS=8.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:285,0,1975 +chr20 27119159 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=-1.182;DP=23;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:395,0,395 +chr20 27119884 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-1.951;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:478,0,627 +chr20 27131947 . C T 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.261;DP=144;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,41:144:99:985,0,3886 +chr20 27138490 . G GTA 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr20 27142747 . T TTG 328.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 +chr20 27311540 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:233,0,56 +chr20 27327947 . TA T 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-2.025;DP=27;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=8.06;ReadPosRankSum=2.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:255,0,384 +chr20 27328311 . T G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=26.65;ReadPosRankSum=2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:428,0,117 +chr20 27373037 . G A 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:550,42,0 +chr20 27401176 . T G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=24.15;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:463,0,198 +chr20 27423594 . AGTAGGCAACACGCATATCATAATGATGATTAAAATCACAATATAACGCTTTGTGAATTGTTCTTTTTTTGTCCCCCTTTTTTGCAG A 1504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.854;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=32.89;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,37:42:85:1542,0,85 +chr20 27435656 . A ACT 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:336,30,0 +chr20 27570284 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-1.738;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:429,0,406 +chr20 27579960 . GA G 279.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:317,30,0 +chr20 27693664 . T A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.038;DP=42;FS=9.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:738,0,730 +chr20 27693895 . A T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.803;DP=43;FS=7.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:466,0,955 +chr20 27700975 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.810;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:594,0,559 +chr20 27702671 . A T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.134;DP=43;FS=4.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:701,0,778 +chr20 27712171 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=1.897;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:718,0,469 +chr20 28279519 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.188;DP=37;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:264,0,999 +chr20 28296703 . CT C 3017.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.307;DP=368;FS=2.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,124:356:99:3055,0,5955 +chr20 28300384 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.555;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:360,0,1500 +chr20 28346483 . G T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.653;DP=49;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:358,0,1344 +chr20 28350169 . G T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 +chr20 28384007 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:99:262,0,562 +chr20 28384031 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:262,0,562 +chr20 28390654 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.080;DP=39;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:263,0,1888 +chr20 28397000 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.956;DP=51;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:553,0,1142 +chr20 28431477 . A T 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:574,39,0 +chr20 28452706 . G GT 794.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.681;DP=39;FS=5.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:38:832,0,38 +chr20 28530061 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:454,0,613 +chr20 28667783 . G T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=-2.394;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:404,0,644 +chr20 28676300 . AG A 216.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:254,22,0 +chr20 28677429 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.275;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:427,0,593 +chr20 28723666 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-0.160;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:295,0,888 +chr20 28809937 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.192;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:422,0,657 +chr20 28829951 . G C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.794;DP=70;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:390,0,2003 +chr20 28843540 . ACAGGTTTCATGTTTGCTTTGTATTATCACCTGTTTACCTCCAGGTGTTGCGTTGATCATATTGCCTCAACAGCTCGTTTTGTTTGT A 4934.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-2.217;DP=112;FS=9.633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=30.75;ReadPosRankSum=2.573 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,109:112:99:4972,423,0 +chr20 28843647 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.090;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:419,0,2824 +chr20 28853467 . TG T 1317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-2.399;DP=111;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:1355,0,2196 +chr20 28859253 . GTT G 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=3.571;DP=182;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=1.60;ReadPosRankSum=-3.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,21:148:99:328,0,5294 +chr20 28859707 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.311;DP=289;FS=9.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,52:289:99:720,0,11212 +chr20 28860370 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-1.580;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:487,0,1348 +chr20 28861739 . T C 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.666;DP=427;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,102:382:99:2251,0,10492 +chr20 28896247 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.089;DP=245;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,38:244:99:425,0,8160 +chr20 28896979 . T C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=1.757;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:627,0,8246 +chr20 28897196 . T C 6129.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.144;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=33.52;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:99:6158,439,0 +chr20 28897201 . T C 6124.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.628;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:99:6153,439,0 +chr20 28897224 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.348;DP=43;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=5.51;ReadPosRankSum=-2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:265,0,1295 +chr20 28897308 . T C 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.331;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,37:196:99:562,0,7066 +chr20 28897317 . T C 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=2.368;DP=233;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=6.35;ReadPosRankSum=-2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,62:233:99:1507,0,7110 +chr20 28897756 . G T 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=-0.645;DP=392;FS=11.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:315,77:392:99:1097,0,20768 +chr20 28902848 . A AT 294.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=1.273;DP=21;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:26:395,26,0 +chr20 28912449 . A T 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=1.548;DP=35;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:382,0,1338 +chr20 28913418 . T A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.476;DP=47;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:283,0,1316 +chr20 28913641 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.476;DP=87;FS=5.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:293,0,3738 +chr20 28913650 . G GA 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DP=77;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:457,0,1536 +chr20 28915106 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.900;DP=76;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:450,0,2110 +chr20 28915271 . G A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=2.939;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=24.74;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:894,0,269 +chr20 28915410 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.786;DP=69;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:515,0,3772 +chr20 28916909 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=1.058;DP=89;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:628,0,2297 +chr20 28916965 . A G 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.752;DP=102;FS=1.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:1194,0,2079 +chr20 28923112 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.381;DP=94;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:532,0,2715 +chr20 28963944 . C CA 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-1.680;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.829;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:324,0,606 +chr20 29063633 . C G 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-1.146;DP=141;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,37:141:99:855,0,4043 +chr20 29071681 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-2.852;DP=283;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,42:282:99:347,0,9002 +chr20 29250792 . A AAT 632.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.196;DP=45;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:670,0,670 +chr20 29289811 . ATCAGGTCTACAACTTCACACACCATTATATCTATAAACGTTGATTATAAACAGTCCTTTTGTTAAATCTGTTCTCATGTTTGATTTGTGATTTCT A 1290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.448;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=20.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,51:54:99:2052,0,828 +chr20 29295043 . T C 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=1.653;DP=39;FS=8.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=25.43;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:1020,0,416 +chr20 29295441 . GT G 1098.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.536;DP=73;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:71:99:1136,0,607 +chr20 29317383 . T A 3906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=1.954;DP=223;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,107:220:99:3935,0,3747 +chr20 29368098 . C A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.268;DP=194;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,48:194:99:1056,0,5487 +chr20 29379413 . AACCTAAATGCAAAGTGATGCCAATGATAGAATCCAACTCAGATGATCAAAAATATTTTTTCCAAAATGCCCTAAAATGTGATAAACTGT A 5058.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.996;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,108:110:99:5096,472,0 +chr20 29415229 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=-1.337;DP=107;FS=6.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=2.90;ReadPosRankSum=-2.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:339,0,3350 +chr20 29503727 . ATACCTGTGAGGTACAACGTCCCACACTGCGTTAGCATATTTCACAAGCTCTTGAGATGTAAGAACAGCAACGCAAGGTGATCTGACCAGGCCAAACCATAACT A 17197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=1.632;DP=385;FS=6.904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,376:378:99:17235,1472,0 +chr20 29518562 . C T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-0.483;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,37:112:99:1078,0,4824 +chr20 29518563 . A G 2168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=1.135;DP=109;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:2197,0,1702 +chr20 29518754 . AT A 4010.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.520;DP=220;FS=6.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,128:210:99:4048,0,2692 +chr20 29518882 . T C 2878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=1.237;DP=186;FS=5.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:2907,0,2875 +chr20 29558714 . CCCTGGAGAAACAGCACCGCAGCTCACAGAGTATAACGAATTTCCACATAACACTGCAGACTGACAAAATACACACTAGAGATACTTA C 742.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=31.93;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:60:780,60,0 +chr20 29610953 . C CA 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-1.546;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,42:178:99:472,0,2860 +chr20 29646217 . TCTGAACACAAACACATGAGAATTACAAGACTTCCCTTTTTGTAAAACCTCAAGATGTACAATTGATAGTTTGACGCTTAC T 8035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=1.595;DP=182;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=27.99;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,179:181:99:8073,689,0 +chr20 29646523 . C A 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=1.588;DP=154;FS=3.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,32:154:99:632,0,4784 +chr20 29649403 . A G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.647;DP=173;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,34:173:99:564,0,5334 +chr20 29694818 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-1.389;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:421,0,2531 +chr20 29696433 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-1.011;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:403,0,2292 +chr20 29699962 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-0.963;DP=97;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=3.28;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:346,0,4406 +chr20 29700184 . T A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-1.282;DP=93;FS=8.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:435,0,2864 +chr20 29700511 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.871;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:381,0,2445 +chr20 29701050 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.342;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:345,0,1271 +chr20 29704732 . GGTACATGAGGGGTTAAGGCCAAAACAACGCAAAGAAGTACTAGAGCAATAGTATATCACAAAATAATGCTAGAAATATGAGTGGATAT G 1199.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=1.251;DP=62;FS=4.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=19.35;ReadPosRankSum=-2.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1237,0,4676 +chr20 29706340 . GCTGCAATATGAAAAGAAGAAAGACTATTGAGGAAAGCTTTTTACATTTTGGTGTTCAAACTGAATTAATTTAAAAGCTTATAATCGACAC G 591.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=1.692;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:629,218,0 +chr20 29778799 . G C 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=1.526;DP=177;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,48:177:99:1152,0,4873 +chr20 29781798 . A C 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.648;ClippingRankSum=-1.116;DP=218;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,48:218:99:950,0,5987 +chr20 29786629 . C T 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.010;DP=274;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,60:273:99:1160,0,8124 +chr20 29795937 . C T 4747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=-0.357;DP=257;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,68:250:99:4776,0,5320 +chr20 29804219 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:245,0,495 +chr20 29808355 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=-0.089;DP=227;FS=1.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,53:226:99:649,0,10540 +chr20 29861556 . C G 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 +chr20 29863058 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.233;DP=45;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:389,0,1199 +chr20 29865260 . G T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.700;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=4.86;ReadPosRankSum=2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:247,0,1315 +chr20 30057564 . CT C 1393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.176;DP=75;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,59:72:58:1431,0,58 +chr20 30057880 . G C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.590;DP=101;FS=8.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:269,0,3207 +chr20 30059091 . CT C,CTT 4202.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.411;DP=254;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:14,157,42:213:99:4130,535,831,3779,0,5638 +chr20 30059218 . GA G 1102.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-0.319;DP=350;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,69:319:99:1140,0,5946 +chr20 30059941 . CT C 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-1.694;DP=274;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,67:260:99:963,0,5287 +chr20 30903268 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.424;DP=83;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:479,0,2366 +chr20 30915477 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.444;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,33:126:99:736,0,3515 +chr20 30915990 . C CT 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-1.014;DP=92;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,29:88:99:495,0,1621 +chr20 30916776 . G C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.440;DP=67;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:235,0,1969 +chr20 30919457 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.803;DP=33;FS=11.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:268,0,891 +chr20 30943317 . A C 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:234,0,25 +chr20 31003033 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,147 +chr20 31003626 . T C 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.172;DP=46;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,38:45:66:1782,0,66 +chr20 31003685 . TAGGTAACAGCACATCCTTTGTGAAAAATAATTTATTTTTGTGCCATCATTACAAGACAAAATACATTTCAACTGATTTCAGTTGGTTATATTTTTC T,TAGTTGGTTATATTTTTC 1778.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.191;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,40,15:59:99:2012,385,2346,1505,0,7213 +chr20 31007291 . G C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.652;DP=89;FS=8.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,25:87:99:628,0,3135 +chr20 31007435 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=-1.806;DP=27;FS=21.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:269,0,521 +chr20 31008034 . A G 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.091;DP=20;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=32.19;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:29:672,0,29 +chr20 31008235 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=1.415;DP=225;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,36:186:99:649,0,6624 +chr20 31008325 . T G 4878.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-1.324;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=34.82;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,107:112:99:4907,340,0 +chr20 31008362 . G A 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=-0.937;DP=90;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:1234,0,2192 +chr20 31244068 . G C 3320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-1.737;DP=299;FS=15.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=11.11;ReadPosRankSum=5.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,100:299:99:3349,0,6916 +chr20 31253370 . A G 4126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.372;DP=369;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,124:369:99:4155,0,8417 +chr20 31256438 . T G 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=1.664;DP=205;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,41:205:99:725,0,6228 +chr20 31259284 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=1.159;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:289,0,1365 +chr20 31263283 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=-1.110;DP=60;FS=4.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:253,0,1814 +chr20 31296575 . A C 5974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=6.111;DP=721;FS=2.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:492,229:721:99:6003,0,18737 +chr20 31297898 . AGTGAGTTCATTGACAACTATGTGAGTTTGTACTTTTTGCCTGGCTGTTTCTTTTATCACTCTGCTAATTAATTTTGATTATCAACAG A 13538.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.435;DP=401;FS=2.056;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=33.76;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,363:367:99:13576,1127,0 +chr20 31298548 . G A 3181.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-3.142;DP=363;FS=3.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,128:363:99:3210,0,14625 +chr20 31300315 . C T 3652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=2.016;DP=331;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,111:328:99:3681,0,7616 +chr20 31300446 . TGGTATGGATCAGCCTTTTATTTTAACCAAGCTTTTTTTCCAGGCTAGAACTGGTTACTTAAGCTAATTCTTGGTCTATTTACACA T 12200.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.220;DP=307;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=27.46;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,301:305:99:12238,917,0 +chr20 31302182 . GAGGTAAATGTAAAATAAATCCTTATTTCCCCAAACCCATGAACTTATACAGACTTTTTAAAAATATAATATTTTTTCCATAATCATCT G 7902.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-5.572;DP=523;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=15.11;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,207:312:99:7940,0,5937 +chr20 31302185 . GTAAATGTAAAATAAAT G 2234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=4.173;DP=314;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,83:302:99:2272,0,20296 +chr20 31302203 . CTTATTTCCCCAAACCCATGAACTTATACAGACTTTTTAAAAATATAATATTTTTTCCATAATCATCTAGGCT C 2236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=5.060;DP=327;FS=3.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=6.84;ReadPosRankSum=5.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,83:315:99:2274,0,20296 +chr20 31302556 . C T 2726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.977;DP=324;FS=7.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,105:324:99:2755,0,8469 +chr20 31305797 . T A 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-2.895;DP=119;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=8.34;ReadPosRankSum=3.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,37:118:99:1021,0,3162 +chr20 31306082 . C G 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=1.510;DP=206;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,57:206:99:1358,0,5837 +chr20 31306415 . G A 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-2.101;DP=227;FS=17.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,64:227:99:1644,0,6532 +chr20 31307678 . C T 1950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-2.430;DP=239;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,80:239:99:1979,0,8591 +chr20 31307778 . A C 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-1.903;DP=221;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,60:221:99:1394,0,6272 +chr20 31308735 . C T 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=3.791;DP=239;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=7.65;ReadPosRankSum=-2.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,72:238:99:1857,0,6583 +chr20 31455472 . T A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=1.128;DP=76;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:686,0,1928 +chr20 31455635 . C A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-0.012;DP=46;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:567,0,1130 +chr20 31461992 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=-0.034;DP=83;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,27:83:99:709,0,2221 +chr20 31462391 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.902;DP=99;FS=7.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:742,0,2622 +chr20 31462598 . G C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.177;DP=99;FS=8.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.803;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:265,0,3941 +chr20 31462657 . G C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.749;DP=91;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:450,0,3636 +chr20 31469872 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=1.984;DP=79;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:258,0,2543 +chr20 31748726 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.743;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,455 +chr20 31748797 . T C 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.350;DP=79;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.90;ReadPosRankSum=3.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:968,0,3591 +chr20 31748800 . A AG 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=1.357;DP=84;FS=2.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=11.08;ReadPosRankSum=2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:968,0,3633 +chr20 31748863 . G T 4572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.810;DP=121;FS=3.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=32.80;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:4601,322,0 +chr20 31748967 . G A 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.189;DP=106;FS=3.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,42:104:99:1495,0,2148 +chr20 31749129 . T A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.021;DP=156;FS=41.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,36:129:99:676,0,6782 +chr20 31749170 . C T 2956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.641;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:2985,0,2651 +chr20 31749212 . G A 10284.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:10313,731,0 +chr20 31749273 . AT A 2718.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.748;DP=106;FS=4.667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,85:97:53:2756,53,0 +chr20 31749321 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.217;DP=25;FS=9.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:434,0,487 +chr20 32049173 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.529;DP=53;FS=4.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:637,0,1203 +chr20 32083667 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.022;DP=68;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:324,0,1986 +chr20 32083827 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-1.542;DP=31;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:288,0,755 +chr20 32083849 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:278,0,345 +chr20 32157502 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=-0.312;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:313,0,1588 +chr20 32176113 . G A 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.077;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,50:157:99:1397,0,4153 +chr20 32176600 . G A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-2.839;DP=161;FS=1.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=6.05;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,44:161:99:1003,0,4447 +chr20 32184722 . A T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.357;DP=46;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:682,0,921 +chr20 32267809 . G GA 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.167;DP=108;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:427,0,1375 +chr20 32268130 . A T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.468;DP=139;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,33:139:99:709,0,4236 +chr20 32269286 . C A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-1.537;DP=41;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:558,0,847 +chr20 32269350 . A G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.493;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:785,0,791 +chr20 32329883 . G A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.672;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,46:170:99:1066,0,4635 +chr20 32477500 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.363;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:359,0,2387 +chr20 32537274 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-0.869;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=16.24;ReadPosRankSum=2.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:548,0,567 +chr20 32552868 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.735;DP=110;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=4.32;ReadPosRankSum=3.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:503,0,3364 +chr20 32554849 . C T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.080;DP=144;FS=3.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=5.85;ReadPosRankSum=2.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:871,0,4036 +chr20 32559344 . G GA 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.819;ClippingRankSum=-2.092;DP=77;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=2.65;ReadPosRankSum=2.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:242,0,1206 +chr20 32559785 . GT G 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.260;DP=55;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:276,0,934 +chr20 33216069 . A T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.841;DP=88;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:676,0,2265 +chr20 33217201 . AGTACGATATAACAGAGGCATTTTATTTGACTCAAATTTTAGTACGTTGATAATGATTTAATTTTACCCCCTCAG A 4878.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=1.532;DP=114;FS=5.111;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.533;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,110:114:99:4916,419,0 +chr20 33333384 . A T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=-0.433;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.808;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:602,0,2838 +chr20 33334573 . T A 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=-0.051;DP=240;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,59:239:99:1319,0,6487 +chr20 33506295 . A T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.924;DP=75;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:442,0,3992 +chr20 33506296 . G A 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=-0.710;DP=76;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:443,0,3991 +chr20 33506707 . G GA 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-2.123;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,37:175:99:337,0,3798 +chr20 33507088 . T G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.300;DP=195;FS=7.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=1.87;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,32:195:99:393,0,6139 +chr20 33507386 . G A 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.533;DP=229;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,59:229:99:1321,0,6344 +chr20 33510023 . A G 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.123;DP=172;FS=16.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,47:171:99:940,0,9415 +chr20 33514701 . G A 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=1.676;DP=228;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,56:228:99:1256,0,6556 +chr20 33515151 . AC A 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:358,0,45 +chr20 33568499 . AGTCAGTGCAACTGCAAGTTCAAACTTCGATATTTCAACTCTCATGCATATTCCCTAAAATATATATCATGTTATTTTGTGTCCAG A 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:254,0,1286 +chr20 33568737 . AGTAAGTCAACTGAGTTGGACTTAATCAATAGAAAATAAGGTAAACTGTTTCTCAATGATGCTTTCTCCTCAG A 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:343,0,803 +chr20 33617838 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:296,0,93 +chr20 33674325 . A G 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.133;DP=52;FS=6.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:652,0,1044 +chr20 33677648 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.684;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,774 +chr20 33687796 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.372;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:424,0,2174 +chr20 33693478 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.650;DP=59;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:255,0,1722 +chr20 33708375 . A G 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=2.494;DP=59;FS=9.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:963,0,1073 +chr20 33741278 . GAGGTAAACCATTGAATTCCTCTTCCTCAGCTCTCATACATACTTATAACAGCATTACTTCTGTTTAAGAGTGTTCTATGGGTTGAT G 239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:277,21,0 +chr20 33774076 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-2.186;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:292,0,649 +chr20 33774136 . TA T 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.202;DP=33;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:253,0,434 +chr20 33776974 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.141;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:290,0,1238 +chr20 33777127 . A T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-0.660;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:617,0,1134 +chr20 33777515 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=1.186;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:594,0,1836 +chr20 33783707 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.981;DP=51;FS=6.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:392,0,2617 +chr20 33783708 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.741;DP=49;FS=9.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:392,0,2617 +chr20 33814573 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.272;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:540,0,2075 +chr20 33814579 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.070;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:540,0,2055 +chr20 33834442 . G A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.030;DP=80;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:983,0,1686 +chr20 33835197 . A T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-1.007;DP=32;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:509,0,1157 +chr20 33835439 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.245;DP=66;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:317,0,2043 +chr20 33835687 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-2.909;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=5.37;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:259,0,1304 +chr20 33836197 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.306;DP=85;FS=3.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=5.53;ReadPosRankSum=-2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:498,0,2332 +chr20 33884477 . C T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.061;DP=88;FS=2.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,31:88:99:1001,0,1822 +chr20 33887349 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.841;DP=84;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:650,0,2202 +chr20 33934376 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.783;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:386,0,571 +chr20 33940161 . AACAGGTCAGCTTTTACACTTTCAGACAGTCAACCGGACAAGCTGTATTTTCTATTACATGTACTGTGCATTCACTTTGTGCGTGTGTTTGTGTG A 632.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=19;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=33.30;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:58:670,58,0 +chr20 34021325 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.173;DP=42;FS=4.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:384,0,1079 +chr20 34021356 . T A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.092;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:438,0,946 +chr20 34029610 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.726;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:229,0,1045 +chr20 34030583 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-0.218;DP=60;FS=4.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:288,0,1613 +chr20 34032187 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=-0.031;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:456,0,932 +chr20 34048577 . T A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=2.629;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:378,0,622 +chr20 34053486 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.239;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:314,0,516 +chr20 34063746 . G A 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:271,0,22 +chr20 34064106 . C T 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=1.288;DP=137;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,46:137:99:1223,0,6318 +chr20 34064343 . TCTGAAAGAGAAAAGCGAGACACATAGTTAGTGAAACAGAAATAAGAGATTGCATGTGGTTTGTCTAATATTATTGTGTTTGTAC T 5657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=3.106;DP=162;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=34.92;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,151:161:99:5695,0,819 +chr20 34075843 . T C 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.692;DP=129;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,47:129:99:1607,0,2874 +chr20 34076268 . T G 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-0.355;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,44:119:99:1431,0,2556 +chr20 34078937 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.590;DP=164;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,33:160:99:465,0,5464 +chr20 34087833 . C T 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.536;DP=102;FS=8.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:1270,0,2291 +chr20 34088058 . C T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.682;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,44:169:99:1023,0,4709 +chr20 34088164 . C T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.136;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:775,0,8925 +chr20 34092889 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.378;DP=102;FS=7.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:839,0,5885 +chr20 34092895 . C A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.012;DP=99;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:839,0,5885 +chr20 34094478 . G GT 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.745;DP=97;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:334,0,1799 +chr20 34198783 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=-2.435;DP=55;FS=4.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:281,0,1632 +chr20 34205762 . ACTGCAGAAAAAATGCAATAAAGCTATCTTAAAATGCTCACACATAAGCGGGGTCACAATATTTTCCCAGGCAAAGACATTGCTGGTCAC A 1383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=1.454;DP=41;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=33.75;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:99:1421,0,938 +chr20 34363507 . GCAGGTTTGTGTGCATCACATTAATCCAAAAAATTTTGAATGTCTCTTGCTTTTGCTAAGCAACTCTTGTCTTGCTCTT G 12914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.061;DP=330;FS=1.715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,316:321:99:12952,898,0 +chr20 34365099 . A AT 1465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=-0.560;DP=145;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1503,0,1967 +chr20 34365448 . AT A 646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-3.868;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=2.91;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,16:214:99:684,0,6225 +chr20 34403075 . A C 292.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:321,0,13 +chr20 34438107 . CAGGTACTGTACCCTTAAAGTACTAAACCAATACAAATCTGTTTTAAGATTAATTCTGGTCCTAAATGCGTCAATTGTGTGATAACTGT C 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=1.041;DP=27;FS=8.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:751,0,1189 +chr20 34638257 . CAA C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.769;DP=65;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=3.78;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:283,0,1828 +chr20 34638261 . GGTGAGTTTGGCTGGATCTGATGCTACTGTAGCTACTATGTTTTTTTACTGCAGTGTTTCATGTATGCTTGTGTTTT G 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.008;DP=65;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:284,0,1828 +chr20 34638263 . TGAGTTTGGCTGGATCTGATGCTACTGTAGCTACTATGTTTTTTTACTGCAGTGTTTCATGTATGCTTGTGTTTTAGGG T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.321;DP=65;FS=7.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:340,0,3175 +chr20 34672280 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:349,0,157 +chr20 34672438 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.326;DP=26;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:465,0,326 +chr20 34686106 . A G 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.793;DP=49;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:1022,0,1811 +chr20 34803434 . C CA 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.021;DP=322;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=1.05;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,56:277:99:374,0,5800 +chr20 35084366 . GA G 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-1.730;DP=64;FS=4.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:272,0,1909 +chr20 35091429 . G A 2809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.037;DP=370;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,117:370:99:2838,0,9103 +chr20 35093320 . GAA G 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=-0.894;DP=172;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,3:121:99:1031,0,2898 +chr20 35167464 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.925;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:267,0,1010 +chr20 35184108 . C A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.902;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:388,0,1409 +chr20 35268329 . T C 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=-0.720;DP=86;FS=4.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1471,0,1411 +chr20 35319816 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.771;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:581,0,2583 +chr20 35321588 . T C 1575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=1.446;DP=81;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1604,0,1233 +chr20 35321820 . T G 2154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.644;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,63:99:99:2183,0,1265 +chr20 35322025 . T G 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.664;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,46:76:99:1600,0,1043 +chr20 35322301 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.966;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:412,0,3597 +chr20 35322307 . A G 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.396;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:926,0,1655 +chr20 35370771 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr20 35370772 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr20 35453194 . GT G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-1.067;DP=44;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:302,0,529 +chr20 35487211 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-1.055;DP=56;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:404,0,1621 +chr20 35615913 . A C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=2.135;DP=29;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=11.51;ReadPosRankSum=-3.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:362,0,660 +chr20 35616171 . T C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.076;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:855,0,1854 +chr20 35618265 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.157;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:297,0,645 +chr20 35619909 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.171;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:267,0,512 +chr20 35620257 . A G 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=2.025;DP=40;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.642;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:746,0,622 +chr20 35626620 . T A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.122;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,462 +chr20 35707834 . A C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=1.142;DP=27;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:339,0,741 +chr20 35708023 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.725;DP=33;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:296,0,886 +chr20 35719307 . A C 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:422,33,0 +chr20 35967614 . T C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=1.935;DP=134;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=4.43;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,30:133:99:622,0,3902 +chr20 35985528 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=-0.083;DP=108;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,26:108:99:617,0,5543 +chr20 35985529 . T A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=-0.367;DP=105;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,26:105:99:617,0,5543 +chr20 36003966 . C CT 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=0.202;DP=91;FS=9.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:361,0,1247 +chr20 36004507 . G T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=1.090;DP=81;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:452,0,2448 +chr20 36420548 . A AT 2693.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.567;DP=235;FS=9.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,123:224:99:2731,0,2463 +chr20 36420654 . A G 2188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=-0.689;DP=275;FS=0.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,83:274:99:2217,0,7620 +chr20 36420704 . A T 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=-0.473;DP=234;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=8.44;ReadPosRankSum=2.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,71:234:99:2003,0,6496 +chr20 36421021 . T TA 716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-2.055;DP=207;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,56:185:99:754,0,3453 +chr20 36441485 . A C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-0.274;DP=120;FS=2.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:1030,0,3088 +chr20 36445321 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.279;DP=100;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:439,0,3017 +chr20 36445412 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-1.249;DP=83;FS=13.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=2.50;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,15:83:99:236,0,2642 +chr20 36445956 . C CA 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.576;DP=45;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:331,0,249 +chr20 36446365 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.967;DP=82;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:277,0,2515 +chr20 36599985 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.326;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:323,0,355 +chr20 36801962 . A C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-1.537;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:325,0,569 +chr20 36817708 . G GCT 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.025;DP=32;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:348,0,503 +chr20 36824542 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.047;DP=46;FS=3.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:560,0,952 +chr20 36854026 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.333;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:474,0,717 +chr20 36872253 . G C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.989;DP=45;FS=2.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:338,0,1309 +chr20 36941503 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.573;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:445,0,1684 +chr20 36941672 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.578;DP=40;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:342,0,1023 +chr20 37025431 . A C 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1544,105,0 +chr20 37025453 . A G 937.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:966,66,0 +chr20 37322281 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.326;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,830 +chr20 37407764 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.631;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,779 +chr20 37464317 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-2.005;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:400,0,749 +chr20 37493981 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.500;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=9.74;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:262,0,570 +chr20 37543524 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.503;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:356,0,651 +chr20 37546308 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.355;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:267,0,543 +chr20 37760585 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:372,0,421 +chr20 37780055 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.373;DP=36;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:487,0,790 +chr20 37793320 . A C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.160;DP=42;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:283,0,1085 +chr20 37825180 . C T 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=-0.624;DP=88;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1301,0,1841 +chr20 38267435 . T G 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-1.079;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:768,0,179 +chr20 38271153 . GAA G 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.819;DP=22;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:57:518,0,57 +chr20 38407514 . C T 5579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.467;DP=398;FS=1.016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=14.02;ReadPosRankSum=-1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,121:139:99:5608,289,0 +chr20 38407521 . G GT 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.908;DP=512;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,27:166:99:284,0,3938 +chr20 38407617 . A T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=2.730;DP=466;FS=13.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:644,0,5288 +chr20 38407624 . G T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=4.980;DP=349;FS=9.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=1.78;ReadPosRankSum=-3.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:650,0,5288 +chr20 38407672 . C G 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.405;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=27.68;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,35:42:31:2659,31,0 +chr20 38428857 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,313 +chr20 38498513 . C G 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.955;DP=74;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1142,0,1458 +chr20 38506716 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.835;DP=70;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1208,0,1123 +chr20 38612557 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=1.564;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=22.94;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:464,0,244 +chr20 38613365 . T C 310.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=31.02;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:338,0,10 +chr20 38614173 . T C 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:275,0,22 +chr20 38618089 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-1.317;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:261,0,723 +chr20 38618099 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:299,0,641 +chr20 38619998 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:308,0,395 +chr20 38620008 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:308,0,395 +chr20 38628105 . C T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.752;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=30.09;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:931,0,134 +chr20 38694733 . A AT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.445;DP=31;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:287,0,431 +chr20 38837232 . A G 3581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.347;DP=142;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,96:142:99:3610,0,1212 +chr20 38924932 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=-1.110;DP=34;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:553,0,689 +chr20 38929741 . G A 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.872;DP=73;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,44:72:99:1491,0,973 +chr20 38929994 . C T 4196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.719;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,123:194:99:4225,0,2437 +chr20 39281049 . TC T 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.927;DP=68;FS=15.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:613,0,966 +chr20 39281834 . GGA G 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.297;DP=37;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:525,0,742 +chr20 40493365 . G GATTCCAGGCTTTT 3110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:99:3148,157,0 +chr20 40498636 . TGGTATTGATCATGAACGATTTTCTAAATCTTCTCACAAATATTTACTTGTTCATAAAATGGTCTAAAACTAAAAATGTATATATTTTTTTATCCAAA T 2151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.866;DP=357;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=6.03;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,312:313:99:2189,810,0 +chr20 40498934 . ACT A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:248,0,57 +chr20 40507603 . G A 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-0.166;DP=52;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:881,0,2010 +chr20 40507896 . C T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.604;DP=66;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1110,0,1041 +chr20 40511958 . G T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=1.424;DP=62;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:856,0,1325 +chr20 42253748 . CT C 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-1.864;DP=33;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:502,0,1036 +chr20 42254025 . CTA C 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.351;DP=78;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:673,0,2454 +chr20 42301332 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.368;DP=36;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:295,0,812 +chr20 42372897 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.294;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:584,0,643 +chr20 42655820 . G A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.677;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:914,0,430 +chr20 42695621 . G GT 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.132;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:306,0,173 +chr20 42697521 . TA T 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.399;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=11.11;ReadPosRankSum=-2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:304,0,144 +chr20 42720514 . T G 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.201;DP=53;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:1079,0,2055 +chr20 43153413 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=2.489;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:314,0,495 +chr20 43154302 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,178 +chr20 43154483 . T TA 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-2.982;DP=72;FS=5.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=3.47;ReadPosRankSum=2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:287,0,1026 +chr20 43181364 . G C 3780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.363;DP=210;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,107:209:99:3809,0,3645 +chr20 43181436 . C T 2208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.431;DP=131;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=16.86;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:2237,0,2232 +chr20 43183363 . T C 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.572;DP=100;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1736,0,1743 +chr20 43183381 . C T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.667;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1520,0,1451 +chr20 43534421 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr20 43746462 . T G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.885;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:939,0,931 +chr20 43746846 . G GAC 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:295,0,48 +chr20 43974128 . T C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr20 43974246 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.978;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,159 +chr20 44001439 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr20 44028385 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:300,0,232 +chr20 44155183 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=20.41;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:416,0,267 +chr20 44155358 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.041;DP=15;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,171 +chr20 44513872 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr20 44592330 . G T 1643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=-0.801;DP=95;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:1672,0,3541 +chr20 44746612 . T G 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr20 44780696 . CACCTGAAGGCTCATGAAGGCAGCAAAGTGTGATTCCTTTTACATTACTCCAATGCTAAATATACAATAATGGAAGAAATGACACACTCATGATACAATTTCCAGGCACAGAGCTGCGAACGGCGGCCTT C 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=2.822;DP=24;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:386,0,5380 +chr20 44878096 . C A 1653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.828;ClippingRankSum=-0.979;DP=123;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1682,0,2397 +chr20 44991477 . GA G 452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=1.011;DP=60;FS=4.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:506,0,478 +chr20 44991864 . GT G 817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.465;DP=74;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,35:72:99:871,0,687 +chr20 45817513 . T A 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:670,48,0 +chr20 45838962 . G T 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr20 45848046 . GCTGCAACAAAGAAATGCCATGAATGATCTATGTTTGTTCTCCATATTAATCTCTGCATCCTGAAGTGCAGATTGAGAACTGAC G 3306.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=1.453;DP=76;FS=2.347;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=31.96;ReadPosRankSum=-1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,71:74:99:3344,281,0 +chr20 45870027 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.363;DP=26;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:400,0,516 +chr20 45870095 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.456;DP=35;FS=10.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:273,0,1054 +chr20 46426729 . GA G 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-1.088;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:399,0,311 +chr20 46427140 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.687;DP=78;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:342,0,2098 +chr20 46427341 . T A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.873;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:425,0,2154 +chr20 46608334 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.860;DP=55;FS=8.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:348,0,2261 +chr20 46686240 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.176;DP=89;FS=4.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:621,0,2418 +chr20 46743302 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.080;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:369,0,2386 +chr20 46768283 . C G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.338;DP=91;FS=6.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:650,0,2430 +chr20 46845249 . A G 2584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2613,189,0 +chr20 46845332 . C T 1753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1782,126,0 +chr20 46845376 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:326,0,301 +chr20 46982387 . G T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.582;DP=24;FS=16.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=20.66;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:524,0,315 +chr20 46982441 . G A 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:485,36,0 +chr20 46984081 . GT G 751.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.740;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:41:789,41,0 +chr20 46984433 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.270;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:254,0,1460 +chr20 47101759 . A G 751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:780,57,0 +chr20 47133926 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.474;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:445,0,158 +chr20 47232927 . TA T 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=-2.266;DP=47;FS=12.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:313,0,373 +chr20 47237316 . A AG 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:319,0,561 +chr20 47288936 . C A 384.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=32.02;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:412,0,9 +chr20 47326487 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.276;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:266,0,399 +chr20 47525584 . A G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr20 47602286 . G T 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 +chr20 47604694 . G A 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 +chr20 47604822 . G A 780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:809,63,0 +chr20 47662911 . A G 1208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.416;DP=47;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,34:47:99:1237,0,269 +chr20 47669644 . G A 3281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.948;DP=117;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=28.05;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,86:117:99:3310,0,762 +chr20 47669827 . C T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=2.420;DP=77;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:1023,0,3645 +chr20 47669831 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=2.409;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:1023,0,3651 +chr20 47670232 . T C 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=4.172;DP=82;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=15.11;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1267,0,1540 +chr20 47670259 . A G 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=6.097;DP=83;FS=13.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=26.33;ReadPosRankSum=-4.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:2214,0,2787 +chr20 47670266 . A T 2172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=4.967;DP=93;FS=15.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:2201,0,2787 +chr20 47670498 . T A 4117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-0.673;DP=195;FS=22.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=21.12;ReadPosRankSum=2.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,121:194:99:4146,0,2471 +chr20 47670691 . A G 4599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.051;DP=177;FS=15.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,124:175:99:4628,0,1313 +chr20 47726562 . ACAAC A,AAAC 1464.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.039;DP=94;FS=1.699;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=15.58;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:9,13,57:79:99:1556,1414,3374,163,0,172 +chr20 47726943 . AAGAGAGAGAG A 753.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=1.569;DP=68;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:758,0,1402 +chr20 47822351 . A G 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr20 47823075 . GA G 369.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.671;DP=20;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:9:406,0,9 +chr20 47835467 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr20 47844988 . G A 1514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;ClippingRankSum=0.137;DP=91;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:1543,0,1436 +chr20 47850581 . T C 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-1.349;DP=101;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1700,0,1731 +chr20 47860858 . T C 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.670;DP=68;FS=13.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1179,0,2761 +chr20 47860861 . G T 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-0.662;DP=70;FS=12.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1179,0,2713 +chr20 47880327 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:240,0,236 +chr20 48015178 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-0.650;DP=48;FS=13.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:317,0,1971 +chr20 48016492 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=3.458;DP=24;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:305,0,1042 +chr20 48018108 . AT A 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=1.863;DP=50;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:491,0,534 +chr20 48018144 . T TTA 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.855;DP=42;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:458,0,642 +chr20 48038123 . A G 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.897;DP=79;FS=6.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=22.01;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,51:79:99:1767,0,936 +chr20 48111290 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=1.243;DP=57;FS=6.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:256,0,1679 +chr20 48139600 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-1.722;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:268,0,722 +chr20 48175993 . T G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.696;DP=37;FS=7.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:526,0,782 +chr20 48210466 . T TCA 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,16:16:56:527,0,56 +chr20 48211363 . T A 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=3.363;DP=35;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:770,0,470 +chr20 48211629 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:262,18,0 +chr20 48211631 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr20 48213394 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.824;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:392,0,345 +chr20 48213479 . C A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr20 48213480 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr20 48213670 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.193;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=14.91;ReadPosRankSum=2.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:565,0,739 +chr20 48213790 . T TA 535.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-2.037;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:573,0,154 +chr20 48213818 . G C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=28.71;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:57:344,0,57 +chr20 48213970 . G T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:290,0,67 +chr20 48215067 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:61:305,0,61 +chr20 48215490 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.041;DP=48;FS=2.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:827,0,839 +chr20 48216088 . C A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.661;DP=49;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:725,0,1017 +chr20 48217218 . G A 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.540;DP=56;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1281,0,703 +chr20 48217440 . C G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=2.077;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=14.63;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:350,0,403 +chr20 48218276 . G GT 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:331,0,569 +chr20 48218575 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.168;DP=38;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:708,0,711 +chr20 48220006 . TAA T 379.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.134;DP=15;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:1:414,1,0 +chr20 48222148 . G A 754.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:783,54,0 +chr20 48368075 . C CA 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.430;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:265,0,851 +chr20 48368828 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=3.227;DP=43;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:409,0,1136 +chr20 48379292 . T C 1591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.651;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1620,0,1829 +chr20 48379313 . C T 2046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.085;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:2075,0,2070 +chr20 48621781 . T C 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-1.030;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:1328,0,405 +chr20 48659062 . G C 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.372;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=27.65;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:526,0,119 +chr20 48659212 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=29.07;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:348,0,51 +chr20 48659870 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr20 48664849 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,298 +chr20 48665665 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.023;DP=29;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:630,0,303 +chr20 48680704 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:317,0,340 +chr20 48707122 . T C 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.524;DP=43;FS=6.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:728,0,999 +chr20 48707545 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-0.170;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:479,0,454 +chr20 48707951 . A G 1561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.531;DP=87;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:1590,0,1531 +chr20 48709772 . G GT 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-1.160;DP=106;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:736,0,1476 +chr20 48713614 . G A 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.011;DP=90;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=15.04;ReadPosRankSum=-2.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1382,0,1660 +chr20 48723914 . T C 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.804;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=15.91;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1333,0,1422 +chr20 48786755 . GAC G 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-1.504;DP=227;FS=9.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,49:210:99:927,0,5637 +chr20 48786930 . TA T 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-1.646;DP=242;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,63:229:99:927,0,4349 +chr20 48997230 . T A 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:527,39,0 +chr20 49073102 . C CT 483.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.886;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:78:533,0,78 +chr20 49766091 . AT A 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-1.338;DP=151;FS=4.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:487,0,1612 +chr20 49767290 . C G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-0.482;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:486,0,170 +chr20 49782226 . G T 8057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.433;ClippingRankSum=0.563;DP=463;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,266:462:99:8086,0,6855 +chr20 49876311 . T C 7593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.902;DP=452;FS=8.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,237:451:99:7622,0,7730 +chr20 49971800 . T A 5269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.710;DP=276;FS=0.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,157:276:99:5298,0,4271 +chr20 49972473 . G A 3928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-2.963;DP=239;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,109:239:99:3957,0,4396 +chr20 49972575 . G A 4800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=1.409;DP=285;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,137:283:99:4829,0,4754 +chr20 49993590 . T C 5774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.084;DP=321;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,176:321:99:5803,0,5146 +chr20 49993625 . A T 5643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-1.558;DP=310;FS=0.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=18.21;ReadPosRankSum=3.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,157:310:99:5672,0,5597 +chr20 50009261 . G A 2363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.214;DP=163;FS=14.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.460;QD=14.50;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,67:163:99:2392,0,3251 +chr20 50079995 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.551;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:340,0,637 +chr20 50107033 . A T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=1.049;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:642,0,828 +chr20 50118492 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-2.685;DP=34;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:378,0,791 +chr20 50119922 . AT A 863.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:61:901,61,0 +chr20 50121390 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.402;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:706,0,801 +chr20 50121920 . T A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.849;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=15.30;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:426,0,1065 +chr20 50122566 . G T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.452;DP=33;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:565,0,1241 +chr20 50122570 . T A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=-0.220;DP=31;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:565,0,1241 +chr20 50142853 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-2.266;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=17.88;ReadPosRankSum=2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:350,0,268 +chr20 50240199 . A C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr20 50249998 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:460,0,115 +chr20 50250253 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=22.52;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:276,0,138 +chr20 50253035 . C CAG 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.395;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:297,0,262 +chr20 50335910 . A C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=-0.471;DP=63;FS=8.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:871,0,1208 +chr20 50342649 . G A 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.330;DP=61;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,36:61:99:1201,0,850 +chr20 50354677 . A C 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.597;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:825,0,937 +chr20 51333455 . C CG 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.894;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=24.45;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:722,0,745 +chr20 51424344 . T C 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.689;DP=89;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:618,0,2556 +chr20 51424359 . T C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.053;DP=96;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,21:96:99:437,0,3167 +chr20 51424476 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.537;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:254,0,2780 +chr20 51430387 . T C 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.014;DP=303;FS=10.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,64:297:99:1297,0,9123 +chr20 51492253 . AT A 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 +chr20 51492644 . T C 251.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:280,0,17 +chr20 51495775 . A AT 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=-0.245;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:75:411,0,75 +chr20 51748056 . A G 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr20 52039688 . A C 1094.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1123,78,0 +chr20 52039854 . A G 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-0.128;DP=22;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:74:717,0,74 +chr20 52041787 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.713;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:364,0,441 +chr20 52087695 . A G 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr20 52087770 . A C 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 +chr20 52092600 . A C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:290,0,423 +chr20 52092645 . C G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:329,0,366 +chr20 52098419 . G A 1516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=-0.788;DP=99;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1545,0,1563 +chr20 52102024 . G A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.054;DP=112;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,34:112:99:864,0,2800 +chr20 52102105 . G T 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-2.087;DP=122;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:1629,0,2202 +chr20 52102926 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:341,0,93 +chr20 52103101 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:259,0,58 +chr20 52132902 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.441;DP=129;FS=3.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,34:129:99:718,0,3540 +chr20 52137938 . TCTGCAACAACAGAAAGAGAGCATTAGAAATATGCTGAATAAGCTGTAATAAGTGTGATTGGAGTGGGCGTAC T 4383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=1.698;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:4421,331,0 +chr20 52161037 . C T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.833;DP=38;FS=6.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:688,0,659 +chr20 52161090 . C T 269.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:297,0,12 +chr20 52274747 . T C 259.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:288,0,17 +chr20 52535620 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.281;DP=73;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:364,0,2551 +chr20 52535671 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.319;DP=79;FS=3.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:272,0,2416 +chr20 52623962 . TCCTGAAAAACACACACATACACACAGGTCAAACACACTGTCCTCCTGCGGTTACTGGTGATTTGAGCTGATCTTA T 7268.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-0.504;DP=162;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=33.74;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,154:158:99:7306,661,0 +chr20 52627628 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.051;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,32:190:99:440,0,6125 +chr20 52757310 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.377;DP=31;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:506,0,592 +chr20 52761316 . G T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.348;DP=24;FS=11.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:394,0,435 +chr20 52829494 . T TC 738.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.853;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:35:776,0,35 +chr20 52830071 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:308,0,367 +chr20 52830126 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:343,0,428 +chr20 52863959 . A G 1896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.602;DP=110;FS=3.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1925,0,1954 +chr20 52864142 . A G 1839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=-1.350;DP=102;FS=3.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:1868,0,1666 +chr20 52865086 . C A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=1.147;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:798,0,398 +chr20 52865538 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=2.994;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:425,0,844 +chr20 52867041 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=2.208;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:378,0,456 +chr20 52884121 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr20 52885381 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:231,0,299 +chr20 52895759 . G A 3127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-3.516;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,94:176:99:3156,0,2902 +chr20 52895820 . C T 3744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.776;DP=236;FS=3.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,122:235:99:3773,0,4066 +chr20 52899789 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:238,0,65 +chr20 52904752 . C A 17944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=-1.882;DP=618;FS=4.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=29.04;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,478:617:99:17973,0,2627 +chr20 52940090 . G A 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:537,39,0 +chr20 53065660 . T C 265.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:294,0,18 +chr20 53116224 . G GGT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=-1.194;DP=25;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:247,0,486 +chr20 53167144 . T TAC 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:246,0,252 +chr20 53181927 . C T 1338.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1367,96,0 +chr20 53215134 . C A 2301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.535;DP=132;FS=5.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:2330,0,2229 +chr20 53236865 . T C 1785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=1.570;DP=110;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1814,0,1969 +chr20 53281367 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.555;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:402,0,1879 +chr20 53283259 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.578;DP=41;FS=7.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:321,0,1525 +chr20 53319674 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.348;DP=38;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:263,0,1021 +chr20 53373779 . G T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-0.378;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:284,0,824 +chr20 53395522 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.239;DP=38;FS=7.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:526,0,833 +chr20 53406579 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.793;DP=32;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:517,0,570 +chr20 53745964 . G A 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.299;DP=113;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=12.77;ReadPosRankSum=2.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:1471,0,2394 +chr20 53815828 . A G 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.957;DP=78;FS=5.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.819;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:1277,0,1542 +chr20 53834192 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-2.434;DP=35;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:279,0,864 +chr20 53949575 . T C 247.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:276,0,18 +chr20 54162805 . C CA 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.976;DP=50;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:266,0,889 +chr20 54163190 . C CA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.733;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:443,0,414 +chr20 54165016 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=3.183;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=15.72;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,739 +chr20 54165077 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=-1.511;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:376,0,309 +chr20 54253669 . C A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=1.007;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1734,0,1443 +chr20 54253721 . C T 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-0.643;DP=94;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1731,0,1503 +chr20 54254024 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:251,0,114 +chr20 54254088 . AC A 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.505;DP=25;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:424,0,914 +chr20 54254672 . AAG A 1814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.667;DP=87;FS=2.133;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,56:60:99:1852,143,0 +chr20 54255621 . G T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr20 54255886 . G T 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 +chr20 54256028 . A C 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.358;DP=94;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1775,0,1581 +chr20 54256959 . A T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr20 54257119 . C T 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:36:508,36,0 +chr20 54257122 . A G 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 +chr20 54503700 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.869;DP=33;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:242,0,915 +chr20 54504770 . AC A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.058;DP=26;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:283,0,903 +chr20 54505508 . GA G 432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.794;DP=89;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,22:89:99:470,0,2527 +chr20 54544127 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.825;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=7.68;ReadPosRankSum=-3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:251,0,826 +chr20 54544445 . CT C 710.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-1.019;DP=133;FS=4.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:748,0,3242 +chr20 54595390 . C G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr20 54609641 . G A 11211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.454;DP=392;FS=6.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=28.60;ReadPosRankSum=-1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,307:392:99:11240,0,1575 +chr20 54618468 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-0.752;DP=101;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,19:101:99:303,0,5723 +chr20 54678995 . C T 1523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1552,117,0 +chr20 54680531 . G A 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 +chr20 54680731 . T A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=1.133;DP=36;FS=8.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=24.83;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:922,0,323 +chr20 54699557 . C CA 789.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=1.140;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.761;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:32:937,32,0 +chr20 54737389 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.971;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:331,0,314 +chr20 54741397 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,203 +chr20 54746086 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=-0.843;DP=37;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:623,0,544 +chr20 54746225 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.265;DP=32;FS=8.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:408,0,697 +chr20 54778014 . TCCTGTTAATGACAGCATGTTTAAAGCAGCACAAACACACAGCAGACAGAGTGTGTGAACGGGAAGATCATCGTTA T 5550.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.174;DP=175;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=31.72;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,161:173:99:5588,0,1184 +chr20 54803646 . A G 5655.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:5684,418,0 +chr20 54806020 . A T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=-0.577;DP=27;FS=7.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:550,0,358 +chr20 54808861 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.768;DP=93;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1460,0,1233 +chr20 54888759 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-0.071;DP=40;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:475,0,926 +chr20 54892302 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.122;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:330,0,1284 +chr20 54938474 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=-1.350;DP=49;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:825,0,973 +chr20 54949814 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.507;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:599,0,583 +chr20 54965555 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.156;DP=40;FS=4.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:398,0,2217 +chr20 54985625 . C CT 261.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:299,24,0 +chr20 55054909 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:268,0,256 +chr20 55063831 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.527;DP=25;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:336,0,444 +chr20 55068458 . AGTAAGTGCTTCTGTTATTGTTGAAGATGTTGGATGGTTGATGCTGAAGTGTGTGACTCCGTTTGCTCGTTTGGTTTCCGCAG A 781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=1.552;DP=19;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:58:819,58,0 +chr20 55094077 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,125 +chr20 55109830 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-2.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:235,0,423 +chr20 55126667 . C T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr20 55236388 . C T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr20 55236694 . G A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:387,27,0 +chr20 55236911 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr20 55449301 . A C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.038;DP=270;FS=11.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,53:207:99:1461,0,5922 +chr20 55449810 . G A 3317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.371;ClippingRankSum=-2.021;DP=252;FS=5.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,109:250:99:3346,0,4544 +chr20 55638971 . C A 610.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:639,45,0 +chr20 55639688 . C CT 1744.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=-0.334;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:1782,168,0 +chr20 55640562 . C A 1941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1970,138,0 +chr20 55641154 . GT G 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-2.151;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:518,0,284 +chr20 55641378 . A T 1413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1442,102,0 +chr20 55641453 . C CT 361.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-1.736;DP=20;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:399,13,0 +chr20 55641695 . C T 1232.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1261,87,0 +chr20 55643326 . A G 677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:706,48,0 +chr20 55786635 . T C 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=-1.225;DP=251;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,64:235:99:1468,0,6366 +chr20 55786662 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.717;DP=264;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,49:263:99:684,0,7978 +chr21 19443 . ACT A 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:312,0,55 +chr21 24937 . CG C 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:67:294,0,67 +chr21 30806 . G C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.783;DP=23;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:652,0,105 +chr21 30877 . G A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=1.327;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=25.80;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:828,0,244 +chr21 64785 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=-0.955;DP=67;FS=3.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:555,0,1708 +chr21 71633 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.924;DP=89;FS=5.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:713,0,2338 +chr21 122090 . ACTGGGGAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCTCAGTGATGTGCAGCTGTGGACAGCGTCTGGAACACTGCTGCACTCCTGAACTCAC A 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=33.84;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:511,0,524 +chr21 142164 . GAGGTGCAGATATTCTGTAGGACTGGCCAGTTATAGTTCATCGTGTGGCATTAGTGTTCAGATCTGTAGGTCTGTATTTCTGATTGTGTGTTTGTGTTCATGC G 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=2.072;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:250,0,1871 +chr21 154966 . T TGC 222.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:10:259,0,10 +chr21 186905 . C CA 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.244;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:297,0,162 +chr21 187862 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 +chr21 188632 . C G 332.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:361,27,0 +chr21 190048 . T A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.205;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:491,0,491 +chr21 195789 . T A,G 4110.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,43,77:120:99:4506,2801,2682,1720,0,1513 +chr21 195846 . G C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=1.947;DP=39;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=17.30;ReadPosRankSum=-2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:703,0,547 +chr21 212030 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.292;DP=36;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=5.77;ReadPosRankSum=-2.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:236,0,2096 +chr21 212035 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.200;DP=36;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=5.88;ReadPosRankSum=-3.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:240,0,2096 +chr21 212058 . TCTGAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGACGTCACGCACTGCTCCACACACTAGCATTAGCTCACCGCGGCGTGTCAGAC T 1955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=1.518;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,41:46:99:1993,204,0 +chr21 212530 . C A 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.119;DP=87;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:1144,0,1735 +chr21 225793 . A AG 366.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 +chr21 225795 . T A 375.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:404,27,0 +chr21 231728 . G GGT 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.525;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:539,0,116 +chr21 232722 . G C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.936;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:268,0,900 +chr21 249227 . C A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-1.023;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.127;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:1028,0,5699 +chr21 254135 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=27.41;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:92:412,0,92 +chr21 255431 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:69:324,0,69 +chr21 290202 . CT C 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-2.003;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:390,0,736 +chr21 300762 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-1.545;DP=302;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,84:302:99:1849,0,7922 +chr21 325547 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.350;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:359,0,2132 +chr21 328337 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-1.638;DP=37;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:358,0,860 +chr21 339448 . GCTCTCTCT G,GCTCT 288.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,3:9:99:383,134,196,267,0,275 +chr21 367248 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.283;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:518,0,1786 +chr21 369134 . G T 4430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.571;DP=376;FS=6.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,137:376:99:4459,0,7667 +chr21 389147 . G A 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 +chr21 420996 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-0.297;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.891;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:316,0,1201 +chr21 462245 . A AGGACGG 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.171;DP=37;FS=5.855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:21:670,21,0 +chr21 465002 . G C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-1.483;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:429,0,564 +chr21 480034 . G C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-1.058;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:468,0,274 +chr21 480093 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,363 +chr21 481161 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.209;ClippingRankSum=4.601;DP=73;FS=6.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:335,0,2242 +chr21 484986 . C T 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=3.470;DP=375;FS=8.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.389;QD=3.19;ReadPosRankSum=3.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,92:364:99:1223,0,11231 +chr21 538428 . G A 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.503;DP=100;FS=3.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:669,0,2666 +chr21 540400 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=-0.687;DP=85;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:537,0,2302 +chr21 541858 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.027;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:417,0,2399 +chr21 541971 . T A 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-1.540;DP=102;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:2084,0,5502 +chr21 541975 . A G 2517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.532;DP=101;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=24.93;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,75:101:99:2546,0,3136 +chr21 542034 . T A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.295;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:573,0,3260 +chr21 542118 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-1.266;DP=97;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:416,0,3298 +chr21 542568 . T C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-1.254;DP=83;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:525,0,2323 +chr21 543325 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.552;DP=95;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:516,0,2743 +chr21 555342 . T C 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-1.550;DP=103;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=7.42;ReadPosRankSum=2.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:792,0,2621 +chr21 555906 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=1.855;DP=86;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:698,0,2146 +chr21 561217 . C A 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=1.002;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,33:142:99:635,0,4110 +chr21 561334 . T C 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.180;DP=114;FS=4.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:99:596,0,3290 +chr21 561861 . TAG T 1171.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1209,99,0 +chr21 561984 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.316;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:317,0,2373 +chr21 562690 . G A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr21 563398 . A T 1168.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1197,87,0 +chr21 564080 . AG A 1215.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-1.016;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=31.38;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:85:1253,85,0 +chr21 564193 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:266,0,340 +chr21 564218 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,340 +chr21 564286 . TAA T 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.588;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=30.01;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:2299,0,172 +chr21 564484 . G T 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-4.143;DP=42;FS=7.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=17.54;ReadPosRankSum=4.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:765,0,1076 +chr21 565049 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.966;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:237,0,728 +chr21 565147 . C A 650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:679,48,0 +chr21 565670 . T G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.255;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:388,0,2486 +chr21 566205 . AC A 1255.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:1293,104,0 +chr21 567392 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.941;DP=29;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:324,0,1304 +chr21 568225 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-2.133;DP=66;FS=6.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,31:66:99:1092,0,2452 +chr21 568617 . TA T 1796.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=1.111;DP=87;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,66:83:99:1834,0,304 +chr21 568623 . AAG A 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-1.685;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:253,0,2721 +chr21 598967 . GAGGTCTGACACTCGCACACAGACCCCATAATACCAGCTCTGTCAGGGCTCACACAGTAGCCACTCAGTCTAATTGCATTACTGTTTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT G 15861.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.777;DP=382;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=32.61;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,379:382:99:15899,1419,0 +chr21 602146 . A G 3965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,127:139:99:4598,0,185 +chr21 734139 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:248,0,418 +chr21 758098 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-0.455;DP=46;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:571,0,1044 +chr21 774409 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-2.183;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:510,0,651 +chr21 774501 . T G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.310;DP=33;FS=5.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:607,0,461 +chr21 775037 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.364;DP=54;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=4.24;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:257,0,1557 +chr21 821354 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.693;ClippingRankSum=-3.693;DP=23;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=38.00;ReadPosRankSum=-3.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:1298,0,342 +chr21 822418 . C T 2218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=1.568;DP=431;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=5.15;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,105:431:99:2247,0,12523 +chr21 827354 . G C 2266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.268;DP=357;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,96:357:99:2295,0,10084 +chr21 868309 . GCA G 2909.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.187;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.490;QD=21.55;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,89:100:61:2947,61,0 +chr21 868490 . C A 1403.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=2.250;DP=19;FS=11.491;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=35.13;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,15:19:9:1431,9,0 +chr21 868955 . CAA C 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:47:279,0,47 +chr21 941182 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr21 941496 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.868;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:332,0,817 +chr21 941513 . T C 2253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2282,163,0 +chr21 943972 . G A 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-2.489;DP=155;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=1.71;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,24:139:99:302,0,7087 +chr21 943976 . G A 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-1.031;DP=146;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.760;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,33:145:99:618,0,7991 +chr21 1027742 . G T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +chr21 1071957 . C T 2025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2054,161,0 +chr21 1072170 . TG T 1200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.164;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=31.60;ReadPosRankSum=-2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,30:38:99:1238,0,889 +chr21 1072172 . T A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.772;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=31.84;ReadPosRankSum=-2.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,30:38:99:1238,0,800 +chr21 1077345 . G A 2119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.852;DP=279;FS=6.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,84:278:99:2148,0,7534 +chr21 1089593 . T A 2357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-1.659;DP=409;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=5.76;ReadPosRankSum=4.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,104:406:99:2386,0,11558 +chr21 1107772 . T C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=1.168;DP=127;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,26:127:99:510,0,4003 +chr21 1301743 . A T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,240 +chr21 1391248 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-1.706;DP=38;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=6.97;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:293,0,982 +chr21 1395188 . CA C 206.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr21 1722733 . C T 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=-1.687;DP=88;FS=1.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,59:88:99:2036,0,771 +chr21 1724745 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.156;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:243,0,1579 +chr21 1727542 . C T 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=1.426;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=29.33;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:908,0,111 +chr21 1807927 . C CA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.023;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,12:65:99:274,0,3910 +chr21 1809007 . C A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:332,0,240 +chr21 1906090 . T C 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:27:245,0,27 +chr21 1940089 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:399,0,543 +chr21 2008861 . A AAG 570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:47:608,47,0 +chr21 2010038 . G GT 605.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:77:711,77,0 +chr21 2015373 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,367 +chr21 2015377 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:366,0,275 +chr21 2100405 . C T 785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:814,57,0 +chr21 2360303 . C CA 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.860;DP=99;FS=2.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.405;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:345,0,1835 +chr21 2573728 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:270,0,97 +chr21 2595401 . GT G 221.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr21 2595404 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr21 2631086 . C A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr21 2631753 . T C 999.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1028,72,0 +chr21 2631814 . GA G 503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:541,52,0 +chr21 2638673 . G T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=-2.770;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:344,0,224 +chr21 2650389 . G A 907.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:63:936,63,0 +chr21 2677695 . C T 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 +chr21 2733771 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr21 2760539 . C T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr21 2762893 . A T 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 +chr21 2768368 . C G 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 +chr21 2904894 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:239,0,332 +chr21 2911459 . GA G 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.974;DP=37;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:437,0,523 +chr21 2912228 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=4.989;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:251,0,3270 +chr21 2912229 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=4.968;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:251,0,3270 +chr21 2991438 . C T 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1682,120,0 +chr21 3111963 . T C 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr21 3112783 . T G 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:307,24,0 +chr21 3249179 . C T 210.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:2:237,0,2 +chr21 3311928 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-0.961;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:640,0,225 +chr21 3313743 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.460;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:374,0,398 +chr21 3321177 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=1.925;DP=31;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:563,0,469 +chr21 3488302 . C G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=1.285;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:650,0,369 +chr21 3867584 . A G 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.211;DP=46;FS=8.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.382;QD=18.56;ReadPosRankSum=1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:882,0,721 +chr21 3964689 . TTATAAGGGTTTAGAATTTAGCATCATGTTC T 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=1.892;DP=38;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:435,0,4740 +chr21 4021933 . G T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,864 +chr21 4058884 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.731;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:290,0,1227 +chr21 4069724 . C G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:270,0,288 +chr21 4260492 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.340;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:340,0,1984 +chr21 4260810 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=2.259;DP=38;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=8.60;ReadPosRankSum=-3.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,4:38:99:355,0,2412 +chr21 4260814 . TTG T 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=2.268;DP=37;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:402,0,650 +chr21 4315951 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.670;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,240 +chr21 4564097 . AT A 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.098;DP=37;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:546,0,357 +chr21 4774170 . AAGGTACAGTTTTCCACCCTGCAGGCTTATAAATAATGTTAAAAACTCTGATCTTAGTAACAATATATCTCATGTCTGTTCCATCAAAC A 3856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=2.396;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,90:92:99:3894,294,0 +chr21 5025110 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:240,0,447 +chr21 5026160 . A G 1474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1503,111,0 +chr21 5033409 . G A 3090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.499;DP=151;FS=3.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=20.47;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,95:151:99:3119,0,1821 +chr21 5034394 . G C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=1.744;DP=193;FS=3.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,29:193:99:251,0,6084 +chr21 5066983 . C T 3323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.815;DP=201;FS=9.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,107:201:99:3352,0,3358 +chr21 5066998 . C T 3602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=-0.008;DP=205;FS=6.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,114:205:99:3631,0,3140 +chr21 5082638 . C T 12712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.230;DP=187;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,118:186:99:12741,0,1241 +chr21 5082692 . T C 3271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-3.510;DP=162;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=20.20;ReadPosRankSum=2.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,105:160:99:3300,0,3682 +chr21 5082743 . C T 5472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-2.123;DP=220;FS=2.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,166:219:99:5501,0,3719 +chr21 5082774 . T C 4149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=1.488;DP=232;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.252;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,123:232:99:4178,0,6003 +chr21 5082926 . A G 8094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.161;DP=258;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=31.38;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,182:256:99:8123,0,1550 +chr21 5083133 . T C 7629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=1.801;DP=289;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,207:289:99:7658,0,1935 +chr21 5083367 . C T 3300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=-1.743;DP=195;FS=18.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=16.93;ReadPosRankSum=2.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,100:195:99:3329,0,3501 +chr21 5083520 . C T 4576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-1.312;DP=238;FS=0.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,139:238:99:4605,0,3319 +chr21 5083553 . C T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=1.331;DP=276;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,52:275:99:784,0,8586 +chr21 5083652 . C T 5629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=2.063;DP=282;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=19.96;ReadPosRankSum=-2.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,150:282:99:5658,0,8590 +chr21 5083658 . A G 5611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;ClippingRankSum=2.999;DP=270;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=20.78;ReadPosRankSum=-2.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,144:270:99:5640,0,8590 +chr21 5083775 . A G 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=3.506;DP=104;FS=15.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=15.24;ReadPosRankSum=-2.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:1613,0,1885 +chr21 5083822 . T A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=2.415;DP=46;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:332,0,1243 +chr21 5204608 . C CT 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-2.453;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:369,0,490 +chr21 5205604 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DP=68;FS=16.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:964,0,1429 +chr21 5206399 . A C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-2.059;DP=50;FS=10.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:691,0,1119 +chr21 5207338 . G A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-2.541;DP=67;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:939,0,1437 +chr21 5207864 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.149;DP=118;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,22:118:99:392,0,3789 +chr21 5208429 . G GTT 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.259;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:241,0,1316 +chr21 5209097 . T C 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.283;DP=57;FS=7.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:826,0,1187 +chr21 5209861 . T TA 793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.914;DP=51;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:831,0,273 +chr21 5210852 . T C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-1.230;DP=27;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:575,0,590 +chr21 5211741 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=1.129;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:282,0,1090 +chr21 5240799 . AT A 1107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.898;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:1145,0,854 +chr21 5241239 . T G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=1.964;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=7.42;ReadPosRankSum=-2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,2:61:99:488,0,4490 +chr21 5241942 . GT G 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.393;DP=62;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=26.30;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,44:60:99:1668,0,204 +chr21 5242115 . T C 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=-0.030;DP=53;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=29.45;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,39:53:99:1589,0,420 +chr21 5242336 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=2.224;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=20.22;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,228 +chr21 5242814 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.859;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:266,0,1429 +chr21 5242891 . T C 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=1.183;DP=51;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:935,0,776 +chr21 5243086 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=32.70;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:281,0,137 +chr21 5243560 . T C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:510,0,377 +chr21 5244062 . C T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=1.080;DP=42;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:842,0,1525 +chr21 5249743 . A T 483.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=34.52;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:510,0,4 +chr21 5250071 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,226 +chr21 5254550 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,231 +chr21 5254584 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=1.670;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:246,0,260 +chr21 5255463 . A AT 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.452;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:310,0,129 +chr21 5258098 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-0.655;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:78:829,0,78 +chr21 5258463 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.118;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=30.99;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:63:586,0,63 +chr21 5258623 . TA T 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.460;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:512,0,138 +chr21 5259241 . T TA 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:374,0,213 +chr21 5274960 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=25.93;ReadPosRankSum=-1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:495,0,166 +chr21 5275780 . A ACT 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:98:363,0,98 +chr21 5277226 . T A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.189;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:583,0,554 +chr21 5279337 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.716;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:584,0,984 +chr21 5280134 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:343,0,288 +chr21 5310873 . G A 1206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=-1.336;DP=39;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=30.94;ReadPosRankSum=2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,32:39:99:1235,0,121 +chr21 5314875 . C A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.026;DP=66;FS=3.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:505,0,1740 +chr21 5369004 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=1.999;DP=34;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.40;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,2:33:99:246,0,1168 +chr21 5399592 . AAGGTTGATCAGCTGAATTTCAAGATATGCAATCTTTTCGTTCGTGAGAAAGTCTTGCATGGGATTAACAGAACTCTAACTCTCGTTCTC A 1285.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=1.372;DP=247;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,232:235:99:1323,442,0 +chr21 5444917 . A G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-2.355;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=21.08;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:492,0,256 +chr21 5466011 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:421,0,424 +chr21 5466322 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:445,0,360 +chr21 5469505 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=2.262;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:296,0,173 +chr21 5469570 . T G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:250,0,286 +chr21 5476428 . G A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.592;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:1031,0,1534 +chr21 5479550 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=-0.414;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=14.32;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:558,0,695 +chr21 5480229 . A G 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.162;DP=28;FS=1.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:580,0,427 +chr21 5480824 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=2.227;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:396,0,744 +chr21 5481434 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=-3.132;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:470,0,1060 +chr21 5482901 . A G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:21:292,21,0 +chr21 5483011 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:359,0,48 +chr21 5614079 . G A 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=1.386;DP=68;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:1124,0,1182 +chr21 5632254 . G T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.332;DP=52;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:432,0,1290 +chr21 5776655 . GA G 554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:592,57,0 +chr21 5837973 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 6835.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:6983,824,0 +chr21 5838094 . G A 5912.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:5941,365,0 +chr21 5904131 . G A 2480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.193;DP=122;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,76:122:99:2509,0,1504 +chr21 5907674 . A G 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-1.827;DP=70;FS=2.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=7.10;ReadPosRankSum=1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:525,0,2060 +chr21 5910081 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.156;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:242,0,1634 +chr21 5910715 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.061;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:244,0,999 +chr21 5910722 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.387;DP=30;FS=8.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:365,0,836 +chr21 6054442 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,477 +chr21 6054443 . A G 658.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:9:686,9,0 +chr21 6164045 . A G 742.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:771,54,0 +chr21 6285715 . A G 1479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1508,108,0 +chr21 6343142 . T C 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 +chr21 6346398 . A AAC 648.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:686,50,0 +chr21 6346657 . GT G 284.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:322,27,0 +chr21 6568287 . T TTCATCATCA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-2.302;DP=72;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.97;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:323,0,246 +chr21 6680645 . T TA 978.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.834;DP=174;FS=16.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,60:153:99:1016,0,2153 +chr21 6770164 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.253;DP=21;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:269,0,447 +chr21 6770935 . A AT 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.145;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:340,0,380 +chr21 6772127 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.517;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:380,0,630 +chr21 6772195 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=1.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,354 +chr21 6773994 . G GA 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.194;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:334,0,228 +chr21 6774866 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.079;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,461 +chr21 6774924 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.084;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:233,0,912 +chr21 6776075 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,259 +chr21 6776670 . T G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:420,0,306 +chr21 6777132 . A T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.887;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.045;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:405,0,284 +chr21 6777535 . T TA 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:298,0,140 +chr21 6777829 . G A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=1.080;DP=28;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=30.81;ReadPosRankSum=2.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:73:891,0,73 +chr21 7304463 . C T 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-1.513;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=25.88;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,42:62:99:1633,0,548 +chr21 7304580 . A C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.406;DP=55;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:408,0,1534 +chr21 7304728 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-2.086;DP=47;FS=17.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=5.31;ReadPosRankSum=2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:278,0,1385 +chr21 7306426 . C G 1309.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1338,96,0 +chr21 7349317 . T A 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:658,45,0 +chr21 7349745 . C A 331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:360,30,0 +chr21 7351366 . C T 701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:730,51,0 +chr21 7551449 . A AGT 298.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:336,27,0 +chr21 7554420 . AG A 388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:34:426,34,0 +chr21 7844061 . AGTGAGTATAAACTCACGTCATGCATGCTTGTAGTTTTTGATCCCTGACATCAAATGACACTGCATGTTTTTCTGATTTGTTGCATAG A 15239.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=1.656;DP=330;FS=1.723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=27.50;ReadPosRankSum=-1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,325:330:99:15430,1376,0 +chr21 7847166 . C T 9357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=4.558;DP=573;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,263:573:99:9386,0,9894 +chr21 7849046 . A G 209.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:238,0,19 +chr21 7849710 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:308,0,187 +chr21 7850196 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=1.558;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=21.28;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:390,0,199 +chr21 7851581 . T G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.849;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:479,0,400 +chr21 7856098 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:397,0,128 +chr21 7857127 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=1.466;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:349,0,132 +chr21 7862831 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=1.946;DP=31;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=26.19;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:840,0,216 +chr21 7926964 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.80;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:301,0,98 +chr21 7927011 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-1.131;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:540,0,498 +chr21 7947593 . C T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.267;DP=61;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1028,0,1034 +chr21 7954724 . G A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-1.568;DP=57;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:876,0,1137 +chr21 7962026 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:308,0,168 +chr21 7962796 . CT C 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:242,0,210 +chr21 7963115 . G C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr21 7963183 . A C 266.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:295,0,18 +chr21 7963256 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.296;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:338,0,49 +chr21 7963799 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.766;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:332,0,175 +chr21 7964419 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:241,0,461 +chr21 7968580 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,133 +chr21 7970543 . G T 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.214;DP=50;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:902,0,863 +chr21 7972598 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:375,0,55 +chr21 7972729 . A G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.445;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:597,0,751 +chr21 7976299 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.139;DP=33;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:439,0,990 +chr21 7978803 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=-0.476;DP=45;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=12.31;ReadPosRankSum=2.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:582,0,970 +chr21 7981534 . T G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.343;DP=36;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:312,0,926 +chr21 7983852 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.638;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:608,0,563 +chr21 7985277 . A G 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.057;DP=45;FS=6.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=17.64;ReadPosRankSum=-1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:822,0,728 +chr21 8132543 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,364 +chr21 8132600 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.152;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:325,0,375 +chr21 8195920 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:346,0,426 +chr21 8225649 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:425,0,158 +chr21 8225692 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.369;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=25.16;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:456,0,157 +chr21 8578223 . T A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr21 8580186 . T C 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:541,39,0 +chr21 8580649 . G GA 448.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:486,33,0 +chr21 8815852 . C A 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=2.277;DP=71;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:1017,0,1377 +chr21 8830789 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.694;DP=56;FS=3.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1208,0,739 +chr21 8855023 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr21 8856572 . T G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:390,0,92 +chr21 9410994 . GGGTAAAAACTCCAGATTACTATAAACATCACGACTTTAACATTAACATTACTCGCACATTGTGACAATAACAATGAACTGGGTTATATAGAAAGGTGTAGATTTAAAACCAAGGAGTGGTGTATAATCCTTTCTCTTTTTTTCA G 2895.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=1.679;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:2933,224,0 +chr21 9415248 . AT A 274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:312,31,0 +chr21 9425002 . GATTCAC G 1578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1616,116,0 +chr21 9426014 . A T 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 +chr21 9435506 . ACTGTACAGAGTCACAAAAGGATATTGTTAATAAAACATAATGTATACCATTTGTAGGGTTTTGCATATGGAGCAAGAGAAACAAACACTCAC A 4588.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=2.403;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,103:105:99:4626,352,0 +chr21 9515031 . C G 2423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2452,180,0 +chr21 9516564 . G A 2301.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2330,166,0 +chr21 9753957 . A AAC 545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:583,45,0 +chr21 9780685 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=2.942;DP=30;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=12.73;ReadPosRankSum=-2.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:410,0,917 +chr21 9780689 . TCTAAAACACAGACAAAATAAATTAAACATATGACACTTTGGATTAAGAGGTATTTTGTGTTTGACTTCTGAC T 1386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=1.300;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=35.66;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1424,114,0 +chr21 9806770 . TGGTAAAACACAAACAAAAACACAGTGCATTGCTGAATATTAAATGCAAAATAAAGCACAAGGCTTTGTCTTTGCA T 998.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.207;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.489;QD=33.29;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:99:1036,0,615 +chr21 9916666 . AAGGTGTTGACAAACTTTGTTTCTGATGATGTTCAAATTAAATCAGTTGACATTTGACACATATTTGACTACTTGCATGTTGTCT A 3125.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=4.789;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.052;QD=32.56;ReadPosRankSum=-5.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,79:96:99:3163,0,4897 +chr21 9918545 . A G 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.379;DP=85;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,28:85:99:757,0,2197 +chr21 9925984 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.572;DP=54;FS=2.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:260,0,1561 +chr21 9926152 . A G 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.633;DP=56;FS=7.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:937,0,1037 +chr21 9990163 . G T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:38:322,0,38 +chr21 9990165 . T A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=32.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:38:322,0,38 +chr21 9990518 . C CT 2453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-2.114;DP=239;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,119:211:99:2491,0,2009 +chr21 9990627 . CTACAG C 223.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:261,27,0 +chr21 9995172 . GCCTGTAAACAGACGAAGATGCTGTTATTTGTGTGAAGAAATTAGAGGAACATTGTTGCAGGTTTGTTTGCGGTA G 16371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=1.723;DP=388;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=26.48;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,366:367:99:16409,1262,0 +chr21 9999646 . ACTTTGACAAACAGCAGAAATGAAAGTCAGTATCGAAGAAAAGTGCGAATGTGTATAGATGTCAATAGAGAAGAAATTCAC A 11431.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.304;DP=248;FS=2.201;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=34.83;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,235:238:99:11469,1147,0 +chr21 10001598 . G GC 770.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.900;DP=606;FS=12.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:434,106:540:99:808,0,12152 +chr21 10029727 . TCTGCTCAAAGAAAGAGAGACATGTTTAGTTTTGATGTTAATGCAGATGTTTTTGTCGATGTGTTTTAAAATGTTGTTAC T 11218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=-2.087;DP=350;FS=9.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=32.05;ReadPosRankSum=-5.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,272:327:99:11256,0,1893 +chr21 10029730 . GC G 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-1.819;DP=347;FS=11.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=0.79;ReadPosRankSum=5.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,52:347:99:312,0,25246 +chr21 10029732 . TCAAAGAAAGAGAGACATGTTTAGTTTTGATGTTAATGCAGATGTTTTTGTCGATGTGTTTTAAAATGTTGTTACCTGC T 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=-2.310;DP=372;FS=11.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=0.75;ReadPosRankSum=5.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:320,52:372:99:315,0,25246 +chr21 10196987 . G GA 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.455;DP=51;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:472,0,657 +chr21 10200510 . A G 6898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-2.364;DP=173;FS=6.302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=25.83;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,171:173:99:6927,503,0 +chr21 10201477 . G C 4193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.805;DP=130;FS=13.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=32.26;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,111:129:99:4222,0,114 +chr21 10205851 . T TA 1952.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-1.230;DP=192;FS=3.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,82:173:99:1990,0,6953 +chr21 10205852 . T A 2736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.098;DP=192;FS=7.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=14.25;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,89:182:99:3104,0,6248 +chr21 10223703 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:294,0,181 +chr21 10263761 . CT C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-0.093;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:240,0,344 +chr21 10267720 . C T 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.217;DP=45;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:851,0,733 +chr21 10268766 . GT G 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=1.028;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:389,0,1834 +chr21 10269119 . C CT 236.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:274,27,0 +chr21 10305625 . TTG T 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.742;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.447;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:621,0,1070 +chr21 10309582 . A G 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.563;DP=68;FS=18.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1331,0,845 +chr21 10321009 . G A 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.550;DP=72;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,40:72:99:1284,0,1128 +chr21 10382841 . G A 1780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=2.076;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=13.39;ReadPosRankSum=-2.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:1809,0,6027 +chr21 10387487 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-1.309;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:561,0,492 +chr21 10454278 . TCTGGAGAACAAAAAGAAAAAAACAGCTGATGTACACATGCTGTACTCTCGTCAGATCTCTGATTCGAAATTATGCACAGTGATACAAAAGTACCTCCATAC T 639.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:62:677,62,0 +chr21 10501087 . CT C 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.183;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:346,0,889 +chr21 10502741 . G GAT 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=-1.380;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:385,0,259 +chr21 10503895 . C CT 357.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:56:494,56,0 +chr21 11249224 . C CA 304.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.935;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:7:341,7,0 +chr21 11249369 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.983;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:350,0,641 +chr21 11250941 . C A 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.731;DP=71;FS=3.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,48:71:99:1882,0,673 +chr21 11251081 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.885;DP=53;FS=7.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:988,0,897 +chr21 11253039 . G T 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-0.630;DP=72;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:923,0,1547 +chr21 11289186 . G A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.960;DP=37;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:625,0,744 +chr21 11289577 . TAA T 336.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 +chr21 11289950 . A G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr21 11290986 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.184;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:487,0,1246 +chr21 11290994 . C A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.741;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:487,0,1254 +chr21 11291300 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.542;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:282,0,813 +chr21 11291855 . C G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:389,0,203 +chr21 11292459 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,799 +chr21 11292888 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.450;DP=34;FS=11.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:388,0,804 +chr21 11293116 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.615;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:475,0,478 +chr21 11294965 . CA C 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=1.920;DP=20;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:307,0,163 +chr21 11295380 . C T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.352;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:726,0,1077 +chr21 11338747 . AAGGTAAAGTATTTTGTCTAAATTTGTCTGAACACTTACCTGAATTTAAGCCTTATTGTTACTCAATGCAAC A 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=1.805;DP=26;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:580,0,3002 +chr21 11348769 . T G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr21 11352645 . GA G 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=1.190;DP=153;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,36:151:99:416,0,4872 +chr21 11352654 . C CA 1081.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.498;DP=193;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,54:192:99:1119,0,5735 +chr21 11370068 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=1.135;DP=399;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=1.76;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,65:399:99:729,0,13143 +chr21 11390562 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.241;DP=323;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,47:323:99:401,0,10888 +chr21 11407713 . AAGGTATGAAGAACGCAAATGTACCTGAAAGAAAACTATTTATTTGGTTTGCCTTCAACTCTTGTTCTCCATTC A 15521.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=372;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,358:358:99:15559,1227,0 +chr21 11412704 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.118;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:763,0,846 +chr21 11416701 . C T 9128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.112;DP=344;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=26.54;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,239:343:99:9157,0,2657 +chr21 11418367 . AGTAAGCAGCCCACTTATTATTTCACAATACACTGCTCAACTGAAAGTGCTAACTGAAAACGTGATGCGAATGTTTGCTTCAG A 1401.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=4.082;DP=446;FS=0.922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,383:401:99:1439,568,0 +chr21 11428278 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,136 +chr21 11428765 . G GT 2407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2578,253,0 +chr21 11429425 . C CT 4159.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.617;DP=220;FS=5.811;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,175:189:99:4767,390,0 +chr21 11429528 . TCCTGCAAAAAGAAAACATGTTAGATTTACACTTAAACTACAGTATCTGCAAATATCAGATTGAAGTCTAAGCTTGTATAAACTCTCACCTCA T,TCCTCA 13777.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.151;DP=364;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=31.11;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,54,278:333:99:12994,12324,21737,1565,0,1624 +chr21 11448352 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.764;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:507,0,1086 +chr21 11448385 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-0.850;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:481,0,505 +chr21 11448490 . T C 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=1.465;DP=41;FS=8.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,32:41:99:1584,0,450 +chr21 11448514 . C G 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=1.244;DP=41;FS=8.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=28.42;ReadPosRankSum=-1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,32:41:99:1584,0,495 +chr21 11814329 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.268;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:374,0,1293 +chr21 11815749 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,99 +chr21 11820290 . T C 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.281;DP=70;FS=2.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:799,0,1483 +chr21 11857482 . GAACCCTAAAAAGGATTAACAAGCAACATTTTATCA G 2039.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.292;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,58:78:99:2077,0,2657 +chr21 11857485 . CCCTAAAAAGGATTAACAAGCAACATTTTATCAGACTAAAAAACATAATGTGGTCTGTATGCAGTTGGGCTGTGATCGAGCGAGTCAGAGGTGTGCAA C 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.021;DP=88;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=3.66;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:359,0,4995 +chr21 11857520 . CTAAAAAACATAATGTGGTCTGTATGCAGTTGGGCTGTGATCGAGCGAGTCAGAGGTGTGCAA C 2039.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=-1.249;DP=87;FS=4.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:99:2077,0,3028 +chr21 11961495 . AT A 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=-1.362;DP=26;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:527,0,107 +chr21 11962699 . CT C 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=1.012;DP=33;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:258,0,427 +chr21 11963626 . G GT 613.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:651,63,0 +chr21 11964322 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:346,0,255 +chr21 11964399 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-1.033;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:382,0,1269 +chr21 11970349 . CACCTAAAAAGGATTGTGTTTAAAAAGTTGATGTGCCCTGCAATCAGAAGTGGCCGTACGCTTGCTT C 2396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=1.366;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=34.24;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,57:59:99:2687,229,0 +chr21 11977588 . G A 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.264;DP=70;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:1162,0,1039 +chr21 12002537 . T TA 235.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:23:273,23,0 +chr21 12003201 . GA G 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.170;DP=34;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:393,0,401 +chr21 12111069 . C T 1614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.164;DP=284;FS=4.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,71:279:99:1643,0,7978 +chr21 12121962 . T A 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.727;DP=242;FS=16.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,47:242:99:769,0,7498 +chr21 12122246 . G A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.533;DP=182;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,39:181:99:680,0,5437 +chr21 12122962 . C CT 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-1.491;DP=192;FS=2.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,36:175:99:273,0,3850 +chr21 12285248 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:44:334,0,44 +chr21 12468341 . CCCTTCATCAAGAGAAAAACAGTACTATTACTCCTTCAGAAGACAGTGAGATAGATGGTGTTTGAAACGGATGACTTCAGCAGAAATTGTGCCGACATCAAGAAGTTAATTTACACA C 1150.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=2.037;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=26.67;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:99:1188,106,0 +chr21 12579391 . AT A 269.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:307,30,0 +chr21 12846611 . GA G 775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.309;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:813,0,116 +chr21 12846758 . C A 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.188;ClippingRankSum=-1.439;DP=87;FS=5.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:1645,0,1484 +chr21 12847342 . C T 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.912;DP=78;FS=7.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,34:78:99:1192,0,1500 +chr21 12899077 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-2.652;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=21.12;ReadPosRankSum=2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:345,0,214 +chr21 12900594 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-1.323;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=28.54;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:75:542,0,75 +chr21 12901442 . A T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-0.686;DP=30;FS=5.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:505,0,528 +chr21 12908732 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:352,0,557 +chr21 13014799 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-1.681;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:420,0,353 +chr21 13032496 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.804;DP=49;FS=9.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:310,0,1405 +chr21 13040822 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.111;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:434,0,601 +chr21 13041271 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=1.244;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:492,0,751 +chr21 13048124 . C A 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=-1.225;DP=55;FS=5.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:929,0,1017 +chr21 13048535 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=2.045;DP=56;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:923,0,982 +chr21 13048551 . GCTGTGGTGGAGCACCAAAAGGGTTCAGGGGTCAGAGAAATCCAAATGAATCAGAACTGGAGAGGAATAAATGAACTAAC G 1027.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=-1.100;DP=54;FS=7.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,32:53:99:1065,0,909 +chr21 13048552 . CTGTGGTGG C 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.853;DP=53;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:736,0,1246 +chr21 13048561 . AGCACCAAAAGGGTTCAGGGGTCAGAGAAATCCAAATGAATCAGAACTGGAGAGGAATAAATGAACTAACCG A 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-0.745;DP=54;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:736,0,1230 +chr21 13048704 . T C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-1.407;DP=46;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:697,0,835 +chr21 13838647 . T A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=35.02;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:86:562,0,86 +chr21 13914684 . A AT 876.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-1.061;DP=178;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,48:177:99:914,0,4137 +chr21 14300837 . GCCTGTCCATAAAAAGAGAAGTTTATGAGAGAGGTTGCAGAAATCATACACGCTAAAGTCTATAGCAACACTGTGCCTCA G 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:369,0,398 +chr21 15518197 . G GTT 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:241,0,93 +chr21 15519547 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.653;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:424,0,221 +chr21 15519799 . GAGGTTGACTTTTTGTTCCTATTTTTTGTTTGATTAAAGTTGTTGATGCACTCTTTTAATCCTCTACATTCTTCGCAATGAC G 10124.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-1.069;DP=269;FS=2.995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=31.20;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,254:256:99:10162,959,0 +chr21 15538916 . AAGGTAATGAAAGATTCATACTCTAATAGGTAATGCTTCATACATATCTAACCTTTAATAATATGAATGCTTTAC A 26472.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.666;DP=260;FS=1.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=22.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,254:259:99:26510,1937,0 +chr21 15542278 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,222 +chr21 15543761 . T TA 1485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=1.092;DP=119;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1523,0,1136 +chr21 15543946 . TA T 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=1.425;DP=64;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=13.23;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,37:61:99:884,0,567 +chr21 15596988 . C T 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=3.559;DP=132;FS=10.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,42:132:99:1082,0,3294 +chr21 15607286 . C G 3772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-1.072;DP=218;FS=7.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,116:217:99:3801,0,3588 +chr21 15609772 . G A 4209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.250;DP=244;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=17.25;ReadPosRankSum=2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,130:243:99:4238,0,4021 +chr21 15617403 . A C 5105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.686;DP=279;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,141:279:99:5134,0,4932 +chr21 15617684 . G GT 686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.126;DP=55;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:724,0,723 +chr21 15618491 . A G 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-3.133;DP=63;FS=11.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:997,0,1187 +chr21 15619439 . C T 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-0.761;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:1603,0,1846 +chr21 15623193 . G A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.186;DP=72;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1204,0,2667 +chr21 15754357 . A G 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.127;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1220,0,1364 +chr21 15770754 . A AT 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-0.106;DP=52;FS=13.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:474,0,757 +chr21 15770926 . C T 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.134;DP=53;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:1064,0,866 +chr21 15772044 . G A 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=-0.430;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1101,0,947 +chr21 15785593 . C G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:237,0,60 +chr21 15786120 . T G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr21 15831195 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=15.82;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:392,0,369 +chr21 15834025 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.633;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.640;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:493,0,521 +chr21 15834287 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.302;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:547,0,669 +chr21 15838866 . C G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.439;DP=27;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=14.40;ReadPosRankSum=3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:417,0,484 +chr21 15847177 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=2.468;DP=39;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:532,0,1423 +chr21 15849453 . C A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.458;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=27.76;ReadPosRankSum=2.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:861,0,1145 +chr21 15849688 . C A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-2.091;DP=44;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:737,0,978 +chr21 15850748 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:368,0,368 +chr21 15925345 . A C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:450,0,201 +chr21 16080991 . C CA 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-0.221;DP=87;FS=8.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:484,0,1198 +chr21 16081553 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.317;DP=96;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,29:96:99:818,0,2621 +chr21 16082447 . T TA 776.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.617;DP=55;FS=4.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:814,0,398 +chr21 16082497 . G A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-0.222;DP=39;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:779,0,596 +chr21 16082566 . C CA 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=1.194;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:590,0,530 +chr21 16082595 . G C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.290;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:902,0,876 +chr21 16082659 . G T 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.717;DP=44;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=23.95;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:1082,0,463 +chr21 16082711 . T C 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=1.012;DP=49;FS=20.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:857,0,777 +chr21 16083090 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=1.523;DP=46;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:419,0,1321 +chr21 16083114 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.576;DP=40;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:298,0,1457 +chr21 16083285 . T C 1689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=-0.005;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:84:99:1718,0,1942 +chr21 16083451 . AATCC A 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=-0.158;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.93;ReadPosRankSum=-2.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,466 +chr21 16083601 . G A 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-1.096;DP=41;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.149;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:631,0,711 +chr21 16084168 . G GA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:406,0,126 +chr21 16084633 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.288;DP=175;FS=11.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,40:175:99:829,0,5046 +chr21 16096746 . A T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.295;DP=83;FS=4.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:1145,0,1771 +chr21 16099331 . C T 4708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=1.356;DP=200;FS=24.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=23.54;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,113:195:99:4737,0,5106 +chr21 16101864 . TCCTTTAAAAACAGCCAGAGCAAACGAGATTATTTTGGAGATTTGGACCTTTTTAGATCTCTTTCACAGCCTTTACACATTATACACA T 12356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.829;DP=332;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.618;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,299:307:99:12394,899,0 +chr21 16104110 . G T 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-4.002;DP=188;FS=13.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,61:188:99:1752,0,12036 +chr21 16104113 . T A 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=-4.491;DP=188;FS=14.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,57:188:99:1756,0,12036 +chr21 16457955 . GA G 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=19.92;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:44:357,0,44 +chr21 16463372 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=2.262;DP=23;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:253,0,329 +chr21 16503217 . T G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr21 16773674 . TA T 262.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:300,30,0 +chr21 16872058 . A AT 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=1.301;DP=131;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=1.64;ReadPosRankSum=-1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:252,0,2424 +chr21 16896035 . GA G 10291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-10.075;DP=193;FS=11.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=30.52;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,99:180:99:10329,0,803 +chr21 16974677 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.003;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:434,0,302 +chr21 16990726 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:272,0,58 +chr21 17234836 . C T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr21 17731388 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:237,0,155 +chr21 17735542 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr21 17739104 . T C 1561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.225;DP=44;FS=2.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,40:44:37:1590,37,0 +chr21 17740757 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:306,0,218 +chr21 17740771 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=15.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,250 +chr21 17744517 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.262;DP=20;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=28.94;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:607,0,122 +chr21 17749338 . G T 3695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.059;DP=133;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.79;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,98:133:99:3724,0,828 +chr21 17749642 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:233,0,65 +chr21 17753494 . GGCCTGA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=3.694;DP=31;FS=7.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=7.12;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:258,0,1484 +chr21 17772225 . CT C 3696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.694;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,129:162:99:3734,0,365 +chr21 17772995 . AT A 1110.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=-0.082;DP=65;FS=2.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,44:60:99:1148,0,211 +chr21 17773064 . G GT 637.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-1.002;DP=34;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:675,0,195 +chr21 18117030 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=22.67;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:459,0,235 +chr21 18117426 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.489;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:613,0,532 +chr21 18125256 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr21 18132067 . CA C 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=1.273;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.199;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:415,0,660 +chr21 18144884 . G T 1610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=2.324;DP=92;FS=2.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1639,0,1531 +chr21 18169273 . C G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr21 18169835 . T G 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.102;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=29.75;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:53:772,0,53 +chr21 18209018 . A AT 247.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:285,24,0 +chr21 18430359 . A G 1676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.142;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=27.04;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,45:62:99:1705,0,470 +chr21 18434892 . C CA 815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-2.096;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:82:946,82,0 +chr21 18436242 . G A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=-0.458;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=29.79;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:892,0,131 +chr21 18591802 . AC A 8173.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.164;DP=291;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,224:286:99:8211,0,1106 +chr21 18696546 . A T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=-2.179;DP=29;FS=6.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:403,0,1423 +chr21 18696706 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=1.820;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:474,0,464 +chr21 18696808 . TG T 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.830;DP=26;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:267,0,360 +chr21 18696876 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.684;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.74;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:323,0,360 +chr21 18731699 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-1.137;DP=34;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:707,0,496 +chr21 18732205 . T A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-1.090;DP=40;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:515,0,855 +chr21 18734281 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.461;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:463,0,510 +chr21 18736019 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.742;DP=57;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:986,0,953 +chr21 18738909 . G A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.548;DP=43;FS=4.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:739,0,770 +chr21 18743713 . G C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.965;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:290,0,227 +chr21 18862886 . C T 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.144;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,38:64:99:1292,0,943 +chr21 18929373 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.351;DP=39;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:669,0,673 +chr21 18936396 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=1.638;DP=39;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1051,0,711 +chr21 18937858 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.024;DP=28;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:344,0,643 +chr21 18937909 . T C 210.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:239,0,16 +chr21 18938202 . G T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.086;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:690,0,1087 +chr21 18938210 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.353;DP=35;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:305,0,1073 +chr21 18940535 . TA T 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-0.495;DP=24;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:255,0,378 +chr21 18941229 . TA T 542.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.040;DP=51;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:580,0,560 +chr21 18941659 . T A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=1.083;DP=26;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:718,0,232 +chr21 18942143 . G A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.344;DP=56;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:970,0,982 +chr21 18945523 . A T 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.250;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:887,0,871 +chr21 19142129 . C T 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.183;DP=100;FS=5.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.867;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1697,0,1645 +chr21 19222592 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:361,0,283 +chr21 19538889 . TCTGTTTAAACAGAGCAGGCGGAAATTAAAACCAAATTTTGGGACGAATGAACATACCTCTGCACTTTTAACATGTTATATGCATTTTGTAAGCATTCTCAC T 5370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=-1.080;DP=125;FS=1.629;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.512 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,119:125:99:5408,438,0 +chr21 19543287 . T C 5613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.130;DP=336;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,160:336:99:5642,0,5780 +chr21 19543504 . T C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.214;DP=348;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:817,0,682 +chr21 19543682 . C T 5031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.779;DP=352;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,143:352:99:5060,0,7170 +chr21 19548914 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,363 +chr21 19549803 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:254,0,421 +chr21 19549842 . GT G,GTT 338.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.347;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,9,10:20:99:426,224,316,226,0,291 +chr21 19550277 . C A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=-1.276;DP=34;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:968,0,991 +chr21 19550284 . C G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.318;DP=40;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=23.27;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:959,0,991 +chr21 19560353 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,212 +chr21 19561062 . C G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:311,0,182 +chr21 19571676 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.312;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,398 +chr21 19571938 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.531;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=20.21;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:291,0,173 +chr21 19592991 . C T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.021;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:781,0,302 +chr21 19599940 . T C 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=2.344;DP=86;FS=7.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,33:86:99:1191,0,1850 +chr21 19600030 . A T 4237.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:4266,307,0 +chr21 19606191 . G A 2378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.508;DP=146;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:2407,0,2482 +chr21 19609776 . C T 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=2.084;DP=76;FS=10.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:919,0,1770 +chr21 19623582 . A G 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:736,51,0 +chr21 19647418 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 +chr21 19647442 . C G 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 +chr21 19655475 . G T 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 +chr21 19660139 . CCCTGCAACAATACATGTACTTACATCACAACATTAAGCTTTACACATCAGATAAATGCTCAATAATTGTTA C 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.635;DP=19;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=12.30;ReadPosRankSum=2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,167 +chr21 19660222 . A T 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=3.702;DP=40;FS=13.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,32:40:99:1170,0,148 +chr21 19660331 . G A 1640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-3.781;DP=105;FS=11.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:1669,0,1956 +chr21 19660366 . C A 2509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=2.155;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=31.77;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,64:77:99:2538,0,182 +chr21 19662895 . C T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 +chr21 19667577 . C T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr21 19724186 . C G 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 +chr21 19724221 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=2.178;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:31:624,0,31 +chr21 19752849 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:324,0,218 +chr21 19755095 . C T 2705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-2.104;DP=238;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,82:236:99:2734,0,5194 +chr21 19757372 . A T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=5.908;DP=192;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,47:189:99:955,0,5463 +chr21 19757481 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.843;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,39:130:99:1052,0,3556 +chr21 19759441 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:76:356,0,76 +chr21 19848219 . CACCTTATTGAAGCAGAAGAACAAAACAATTCAGCTCTAATTTTCAGCAGGTAAATGTATTCTGTTGTCAGCGGTTCAGTATCAAGTTACTTTTGTAGAATTGTTT C 7799.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=1.167;DP=237;FS=2.025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=32.91;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,215:219:99:7837,589,0 +chr21 20002655 . TCTAAAAAACAAACAACAAAAAAACAATAGTTATTTAATATTTTTAACATAATCTCATCTTCCATCTTTTTCTGAAATGTGACTTAC T 213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=1.662;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:97:251,97,0 +chr21 20126091 . TA T 400.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:43:438,43,0 +chr21 20175126 . GT G 770.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.449;DP=69;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:808,0,806 +chr21 20211127 . G A 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.065;DP=155;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,37:155:99:813,0,4442 +chr21 20775732 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=1.705;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:349,0,405 +chr21 21025348 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=2.618;DP=37;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=13.35;ReadPosRankSum=-3.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:522,0,550 +chr21 21028237 . AT A 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.983;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:318,0,132 +chr21 21030480 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.092;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:434,0,716 +chr21 21054801 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.463;DP=48;FS=4.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:377,0,2193 +chr21 21265205 . TCTGAGAGAGAGAGCAAAACCACAGGTTTGAACAAGTGATAGATATTATTTCTAAGTGGTGTGTCGTTTAC T 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.960;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=26.94;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:603,0,1273 +chr21 21306109 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.079;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:462,0,1377 +chr21 21406323 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=-0.970;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:419,0,880 +chr21 21406338 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=-0.976;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:469,0,827 +chr21 21518130 . T C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:323,0,365 +chr21 21527081 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=1.262;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:395,0,403 +chr21 21529050 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.189;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=28.05;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:79:505,0,79 +chr21 21529081 . G C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-1.714;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=33.75;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:38:602,0,38 +chr21 21530155 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=3.377;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:436,0,422 +chr21 21556589 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.381;ClippingRankSum=-0.575;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:342,0,473 +chr21 21678303 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-0.086;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:297,0,1672 +chr21 21680123 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=10.99;ReadPosRankSum=2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:248,0,417 +chr21 21906230 . G A 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-1.398;DP=108;FS=1.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:899,0,2683 +chr21 21910880 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.092;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,398 +chr21 21962283 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-0.090;DP=98;FS=9.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:434,0,6387 +chr21 21993950 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.889;DP=156;FS=4.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,34:155:99:661,0,4520 +chr21 21994715 . G C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.343;DP=52;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:416,0,1526 +chr21 21996459 . G C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.448;DP=99;FS=11.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:595,0,2773 +chr21 21997120 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=-0.746;DP=122;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,23:122:99:394,0,3844 +chr21 21999343 . T C 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.352;DP=128;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,37:128:99:947,0,3554 +chr21 21999394 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.436;DP=139;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,28:139:99:515,0,4290 +chr21 22000065 . G T 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.253;DP=148;FS=4.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,35:148:99:735,0,4258 +chr21 22000078 . TGTAAGTACTGCCTCACTTATAAAAGTTGCAGAGTGTTTTGTATTGTTGTTTTCTAAAACAGACATTTAAAATTATATTTCAG T 4729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=2.665;DP=135;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=30.86;ReadPosRankSum=-4.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,121:134:99:5240,0,1988 +chr21 22001408 . AAGGTGAGAAACACACTAATGAACAGAAAAACCCTTATTGATTTTTCTATATGATAGTATCTTAAATCTGCTTACATTCTGTTTTCTCTGCTTTTTTT A 6876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=1.330;DP=180;FS=6.438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=32.23;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,147:153:99:6914,606,0 +chr21 22002793 . C CT 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=-1.319;DP=149;FS=11.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=1.73;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,29:138:99:295,0,3049 +chr21 22003512 . C T 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.102;DP=80;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:1226,0,1583 +chr21 22004910 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.383;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:475,0,2099 +chr21 22006603 . TCCTAAAAGAAAAATACATCTCTAAACACTTAAGTGCACTATATAGATAGCGTACAGTATCCGCCGATCAACTCTTA T 2204.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-1.053;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:2242,199,0 +chr21 22039960 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.317;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:295,0,774 +chr21 22082088 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=2.200;DP=95;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:325,0,2867 +chr21 22088610 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.303;DP=96;FS=10.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,21:96:99:359,0,3792 +chr21 22134639 . TC T 1220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.777;DP=114;FS=4.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:1258,0,6716 +chr21 22136056 . G A 1460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=-0.611;DP=228;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,64:228:99:1489,0,6236 +chr21 22155651 . CCCTAAGTCATAAAAAAAAAAAAAAATAGCACAACGGTTAAAAAAACTATAAACTGTAATACAACTATCAAAAAAAGAGAGACCAACTTA C 2555.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=2.373;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:64:99:2593,205,0 +chr21 22450315 . T TCA 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.709;DP=72;FS=15.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:405,0,1406 +chr21 22452320 . T C 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-0.875;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:699,0,2803 +chr21 22452409 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=-1.038;DP=84;FS=5.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:262,0,2712 +chr21 22520980 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.044;DP=74;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:564,0,1814 +chr21 22582740 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=-0.316;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:484,0,2234 +chr21 22612886 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.514;DP=142;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=4.11;ReadPosRankSum=2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,31:142:99:612,0,4203 +chr21 22613026 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=-0.427;DP=156;FS=9.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,34:156:99:701,0,4726 +chr21 22613965 . T G 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.014;DP=157;FS=5.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,47:157:99:1250,0,4215 +chr21 22614725 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.372;DP=119;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:345,0,4002 +chr21 22615260 . G GT 1682.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-0.677;DP=178;FS=2.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,70:166:99:1720,0,2450 +chr21 22615436 . C T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.588;DP=216;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,56:216:99:1312,0,6281 +chr21 22697084 . G T 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.335;DP=244;FS=18.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=4.20;ReadPosRankSum=2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,54:244:99:1053,0,7223 +chr21 22700144 . A G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-0.105;DP=205;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,38:205:99:570,0,6430 +chr21 23693193 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-1.294;DP=54;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:523,0,1453 +chr21 23816071 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.388;DP=56;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:313,0,1706 +chr21 23866719 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.798;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:298,0,1378 +chr21 24314678 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.506;DP=172;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,40:172:99:852,0,5133 +chr21 24322377 . A T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.655;DP=199;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,46:199:99:1096,0,12402 +chr21 24322519 . C CA 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.373;DP=130;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,39:123:99:532,0,2057 +chr21 24323036 . A G 2330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-0.469;DP=83;FS=6.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,61:83:99:2359,0,492 +chr21 24343858 . AT A 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=31.84;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:21:483,21,0 +chr21 24921531 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=-0.512;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:256,0,990 +chr21 24922769 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,416 +chr21 24923342 . C A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.516;DP=30;FS=9.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:395,0,1370 +chr21 24923344 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-0.069;DP=29;FS=13.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:395,0,1380 +chr21 24941446 . C A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-0.620;DP=57;FS=8.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:739,0,1273 +chr21 24941497 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.051;DP=92;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:1288,0,1882 +chr21 24941833 . T C 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=1.044;DP=119;FS=13.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,36:119:99:953,0,2799 +chr21 25081537 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,743 +chr21 25081538 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.694;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:393,0,743 +chr21 25083824 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=28.07;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:337,0,58 +chr21 25134633 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-2.428;DP=39;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:413,0,991 +chr21 25187633 . C A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-1.165;DP=69;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:784,0,1602 +chr21 25191321 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.012;DP=74;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:550,0,2078 +chr21 25197601 . A G 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:48:657,48,0 +chr21 25415243 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.181;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:260,0,1142 +chr21 25415657 . A AT 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.214;DP=48;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.62;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:403,0,2035 +chr21 25415660 . A T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.038;DP=44;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:403,0,2035 +chr21 25416479 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=-0.713;DP=57;FS=6.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:284,0,1802 +chr21 25416696 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=1.515;DP=81;FS=2.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:515,0,2054 +chr21 25451808 . AT A 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.824;DP=123;FS=6.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,29:122:99:518,0,3116 +chr21 25451843 . C CT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.846;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:305,0,1800 +chr21 25455011 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-2.278;DP=36;FS=7.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=14.33;ReadPosRankSum=2.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:544,0,731 +chr21 25785425 . C CT 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.718;DP=131;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,34:125:99:499,0,2429 +chr21 25809438 . C A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.897;DP=255;FS=15.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,53:255:99:949,0,7756 +chr21 25883577 . T TA 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=-0.510;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:650,0,988 +chr21 25886880 . GA G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.939;DP=45;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:255,0,590 +chr21 26027529 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=-1.433;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:486,0,792 +chr21 26065188 . T TA 758.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.093;DP=103;FS=1.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:796,0,998 +chr21 26071228 . T TA 1012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-2.045;DP=181;FS=5.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,57:164:99:1050,0,6285 +chr21 26122718 . TGGTGAGGAAGCTCTTCCATATATAATGCCATAATCATGTTGTGGAGTGTTTCTAAATCTGTCATCTTTCTACTCCTTCCTCA T 16013.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=348;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,338:338:99:16051,1413,0 +chr21 26124393 . GT G 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.882;DP=251;FS=17.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,46:227:99:678,0,3838 +chr21 26125155 . A G 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.181;DP=333;FS=5.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,71:333:99:1338,0,10381 +chr21 26125412 . C A 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=-1.491;DP=332;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,60:332:99:785,0,11585 +chr21 26386253 . TGTATGTGTTTGACTGCTCTCACCAAAGTATTATTTATGCCAGAAATGTCTTGTGTTACCGTTTTGTTTTTATCTGCAG T 15868.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=2.436;DP=358;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=27.38;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,355:357:99:15906,1214,0 +chr21 26593094 . T C 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-2.381;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=33.18;ReadPosRankSum=2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:891,0,112 +chr21 26593095 . T C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=3.402;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=31.51;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:879,0,126 +chr21 26593777 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.270;DP=67;FS=3.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:480,0,1366 +chr21 26593873 . G C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=-1.481;DP=212;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,37:212:99:434,0,6470 +chr21 26594619 . G T 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.825;DP=325;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,76:325:99:1554,0,9500 +chr21 26611139 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.824;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,38:117:99:1005,0,2858 +chr21 26668041 . T A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.013;DP=99;FS=2.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:99:517,0,5460 +chr21 26668042 . G T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-0.035;DP=96;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,21:96:99:517,0,5460 +chr21 26679474 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-1.240;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:302,0,587 +chr21 26699428 . C T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.591;DP=200;FS=7.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,45:200:99:928,0,5973 +chr21 26700561 . G A 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=1.322;DP=252;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,54:252:99:1062,0,7469 +chr21 26709080 . G A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.280;DP=212;FS=15.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,48:212:99:1005,0,6237 +chr21 26718973 . GA G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.884;DP=184;FS=4.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,83:181:99:3270,0,5965 +chr21 26773041 . T TA 1171.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.583;DP=93;FS=0.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:1209,0,1735 +chr21 26774364 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=1.175;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:354,0,662 +chr21 26774665 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.565;DP=55;FS=6.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:240,0,2146 +chr21 26795445 . A T 1816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.326;DP=320;FS=5.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,83:319:99:1845,0,11341 +chr21 26803126 . TCTAGAAGTTAAAAAGGATGTAAATTAAAGTGTTTTGAAAAGCATACATTATTAGCTAGACATTTTGTATGGACTCAC T 3383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.393;DP=85;FS=2.385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=28.32;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,82:85:99:3421,248,0 +chr21 26803559 . TCTGTAGCAACAAAAAGAACCAACATTGTGTCTTTGCTGCACTTTCTGTAATGTGTCCAAAAATGAGAAATGTGTCATAC T 3627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=3.272;DP=123;FS=3.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=29.49;ReadPosRankSum=-1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,87:121:99:3665,0,11379 +chr21 26803675 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=-0.852;DP=119;FS=2.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,26:119:99:571,0,3584 +chr21 26811278 . T G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.931;DP=297;FS=4.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,46:296:99:621,0,19931 +chr21 26821262 . CGGTTAATCTACGCACAGAAATTTACTTAATTTAGAATAAGTGTTGTTTAAACTGCTGATTGTTATGTGTATCTCTGTACA C 12805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=1.889;DP=342;FS=5.384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.26;ReadPosRankSum=-1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,328:342:99:12843,1100,0 +chr21 26823785 . C T 3326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.739;DP=424;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,133:422:99:3355,0,11118 +chr21 26825810 . T A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.914;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:752,0,1253 +chr21 26876889 . TCTGGTGGAATAAATAAGACATTACAGTTTGACATCTACTTTAAAAGTATTCATAAATAAGATTGTGCTTTCTGCTTTGCACACTTAC T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,1296 +chr21 27030724 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=-0.981;DP=43;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:472,0,948 +chr21 27031787 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-1.928;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=16.64;ReadPosRankSum=2.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:361,0,374 +chr21 27032402 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.264;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:258,0,796 +chr21 27274800 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.559;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:49:600,0,49 +chr21 27275057 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-1.610;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:276,0,430 +chr21 27275720 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:257,0,327 +chr21 27851009 . A T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-5.730;DP=344;FS=24.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,54:344:99:463,0,24741 +chr21 27873309 . T TTC 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-2.543;DP=41;FS=10.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:418,0,973 +chr21 27882501 . A T 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.638;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=13.01;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:1199,0,1889 +chr21 27887382 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.700;DP=88;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:676,0,2243 +chr21 27890801 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=5.419;DP=616;FS=0.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=0.47;ReadPosRankSum=5.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:527,89:616:99:316,0,18848 +chr21 27907194 . G A 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=-1.210;DP=318;FS=0.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,74:318:99:1349,0,12045 +chr21 28123639 . A AAG 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.954;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:279,0,504 +chr21 28187504 . G A 1084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-0.687;DP=248;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,56:248:99:1113,0,7231 +chr21 28257649 . G GT 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.973;DP=54;FS=4.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.089;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:253,0,703 +chr21 28294523 . C T 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.755;DP=169;FS=0.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,42:169:99:954,0,4737 +chr21 28401893 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=1.814;DP=72;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:421,0,2061 +chr21 28433560 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.230;DP=70;FS=4.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=14.68;ReadPosRankSum=2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1056,0,1314 +chr21 28708173 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-1.932;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,134 +chr21 28708196 . G C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=-2.293;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:329,0,295 +chr21 28709657 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-1.408;DP=16;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:331,0,153 +chr21 28720690 . T C 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 +chr21 28738419 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr21 28742731 . A G 681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:710,51,0 +chr21 28759504 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=1.341;DP=65;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:436,0,1757 +chr21 28763554 . T A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.416;DP=46;FS=4.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:627,0,945 +chr21 28768093 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=1.578;DP=77;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:342,0,2264 +chr21 28768196 . T C 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=1.484;DP=71;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:1028,0,1300 +chr21 28768540 . A G 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-2.184;DP=56;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=8.87;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:525,0,1814 +chr21 28768702 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=-1.088;DP=56;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:357,0,1674 +chr21 28770721 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.736;DP=105;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:816,0,2587 +chr21 28775377 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-1.364;DP=76;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:913,0,2544 +chr21 28776048 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.732;DP=86;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=5.22;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:477,0,2266 +chr21 28799079 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.496;DP=59;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:333,0,1739 +chr21 28801402 . C CT 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.092;DP=73;FS=11.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:368,0,1218 +chr21 28802113 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.404;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=3.38;ReadPosRankSum=2.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,25:125:99:451,0,3792 +chr21 28802395 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=1.494;DP=149;FS=2.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,28:149:99:358,0,4373 +chr21 28804791 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,147 +chr21 28806287 . C G 1342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.814;DP=97;FS=6.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.916;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,40:97:99:1371,0,1960 +chr21 28821557 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.280;DP=100;FS=5.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=5.23;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:551,0,2683 +chr21 28860520 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.245;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:331,0,2031 +chr21 28914068 . A G 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.708;DP=342;FS=5.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,89:342:99:2011,0,9439 +chr21 28918611 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.356;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:308,0,1330 +chr21 28918833 . G C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.120;DP=42;FS=7.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:405,0,1092 +chr21 28919399 . C G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=1.799;DP=30;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:379,0,811 +chr21 28984396 . G GA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.539;DP=50;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:352,0,761 +chr21 28990667 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.555;DP=64;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:318,0,1802 +chr21 28994439 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-0.275;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:416,0,1305 +chr21 28994526 . T G 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-1.533;DP=62;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:902,0,1103 +chr21 29004714 . CA C 334.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=1.293;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,42:56:99:747,0,178 +chr21 29005022 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.767;DP=89;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:258,0,2630 +chr21 29005114 . G C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=2.000;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:552,0,2739 +chr21 29013509 . C A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.324;DP=90;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:444,0,2629 +chr21 29013967 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.728;DP=46;FS=9.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:331,0,1140 +chr21 29222041 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.892;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:528,0,942 +chr21 29228567 . G A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.317;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.659;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,40:184:99:781,0,7624 +chr21 29279890 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=-0.544;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:492,0,2325 +chr21 29335303 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.416;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:594,0,480 +chr21 29374928 . GCCTGAAGGAGACAAACACTGTAGTATGCACATGTAAAGTGAATGTGAACATCCAGTTTGTGTGTGTATTTA G 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:287,0,1611 +chr21 29539057 . TCTGTGAAAACACATCAGCAACAATTAGAGCTTTATAAAGCACACCTAGCATCAGTCATCTATACAATACTCCCAACTTAC T 16307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=2.981;DP=377;FS=2.305;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=31.31;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,369:372:99:16345,1254,0 +chr21 29539219 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.367;DP=280;FS=4.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,77:280:99:1849,0,7836 +chr21 29651266 . T G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.004;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=27.36;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:40:466,0,40 +chr21 29759367 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.353;DP=86;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:338,0,3679 +chr21 29773418 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=1.524;DP=30;FS=13.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:238,0,1865 +chr21 29773424 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=1.641;DP=32;FS=27.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:238,0,1865 +chr21 29781475 . T C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.352;DP=22;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:30:669,0,30 +chr21 29781743 . A C 2989.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:3018,220,0 +chr21 30000544 . G T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=1.384;DP=67;FS=9.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:479,0,1861 +chr21 30001342 . C CA 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.564;DP=49;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:430,0,2581 +chr21 30029513 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.109;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:229,0,827 +chr21 30773586 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:79:255,0,79 +chr21 30864189 . CCCTATGCGCAACAAGCAGAATTTTAGTGCTCCAGATTTTTTAATAGGTTTCTGCTTATCATTTTGCAGCAAAACTTA C 1404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=2.317;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=29.00;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:99:1442,134,0 +chr21 30865021 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.858;DP=30;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:290,0,746 +chr21 31050849 . TCTGCCAGCAAAGATCAACATTTTGCGATTTAAAAAAAAAACAATCATATTCAGGTAATTTACACAGAAGTATAAATAATAGTAAAATAATGCAC T 6425.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=3.266;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=33.37;ReadPosRankSum=-2.247 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,136:145:99:6463,604,0 +chr21 31113659 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-1.121;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:265,0,1120 +chr21 31155541 . TA T 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.853;DP=24;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:54:523,0,54 +chr21 31155757 . T C 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.102;DP=23;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:290,0,576 +chr21 31156747 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.028;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,580 +chr21 31225363 . G T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.577;DP=74;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:501,0,2011 +chr21 31230127 . T C 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=2.237;DP=204;FS=2.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,41:204:99:637,0,6266 +chr21 31243219 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.646;DP=23;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:275,0,537 +chr21 31523691 . A T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-1.510;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:426,0,3109 +chr21 31525790 . C T 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-1.856;DP=206;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,41:206:99:1410,0,7916 +chr21 31526801 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-1.210;DP=163;FS=0.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,30:163:99:370,0,5240 +chr21 31526850 . C CT 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=-1.239;DP=157;FS=2.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.566;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:317,0,3066 +chr21 31981951 . T A 1206.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.116;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=29.17;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1235,87,0 +chr21 32296712 . T A 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.459;DP=130;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,39:129:99:1004,0,3440 +chr21 32375357 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.440;DP=99;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:389,0,5755 +chr21 32375359 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.431;DP=99;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.986;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:384,0,5755 +chr21 32393814 . A T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.130;DP=77;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:560,0,2044 +chr21 32394951 . C CT 235.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:18:359,0,18 +chr21 32525136 . C T 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 +chr21 32968399 . G T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=0.472;DP=85;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:690,0,4756 +chr21 33330845 . GA G 707.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.776;DP=56;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:745,0,513 +chr21 33690773 . C T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=-0.031;DP=48;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=16.87;ReadPosRankSum=-2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:838,0,846 +chr21 33758713 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.321;DP=65;FS=1.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:399,0,1744 +chr21 33800109 . C G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.358;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:308,0,1655 +chr21 33800112 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.331;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:308,0,1655 +chr21 33801839 . AT A 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 +chr21 33802820 . CCCTGTAATGAAATTTCAGTCAAATCAAGATACAAAAACGTGTATGAATGTAGAAGTATACGCTATATATTTCTCACTCA C 2948.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=-0.287;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,67:71:99:2986,109,0 +chr21 33815351 . A G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.127;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:540,0,1072 +chr21 33817716 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=-0.657;DP=46;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:343,0,1237 +chr21 33853088 . A G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.497;DP=127;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,29:127:99:579,0,4904 +chr21 33881128 . G A 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=1.176;DP=97;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,36:97:99:1244,0,2121 +chr21 33881139 . C G 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.091;DP=96;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:1214,0,2122 +chr21 33883986 . CCCTGTTCAATCACAGCAACACCAATTCTCTTACCGTAACCTTTCCAACCTTACAGAAATATAATGCGCCAAAATCCAAAATGCATTAAGCAGCCACCTTA C 2545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=1.323;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,56:63:99:2583,284,0 +chr21 33887482 . C A 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-4.169;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=21.17;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1108,0,842 +chr21 33891817 . C A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.972;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:598,0,2361 +chr21 34008733 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.829;DP=33;FS=9.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:249,0,903 +chr21 34245691 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.190;DP=86;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:515,0,2218 +chr21 34246205 . T A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.401;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:718,0,3942 +chr21 34246206 . A T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.309;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:718,0,3992 +chr21 34246299 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.533;DP=65;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:259,0,2052 +chr21 34246755 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-2.043;DP=64;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:745,0,1458 +chr21 34285148 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.940;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:427,0,1359 +chr21 34290858 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=27.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:94:412,0,94 +chr21 34321863 . G A 2071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.378;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:2100,0,2083 +chr21 34604457 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-1.594;DP=79;FS=5.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:268,0,2586 +chr21 34605199 . T A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.633;DP=46;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:370,0,1899 +chr21 34605347 . A T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=1.252;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:390,0,5013 +chr21 34607262 . CT C 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=-0.211;DP=87;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:644,0,1064 +chr21 34607589 . G GT 1070.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=-0.247;DP=62;FS=7.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,47:58:99:1160,0,104 +chr21 34607686 . A T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=-0.441;DP=67;FS=8.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:968,0,1360 +chr21 34607769 . A C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.213;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:366,0,1974 +chr21 34607962 . G T 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.388;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1188,0,1123 +chr21 34608395 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=1.091;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:767,0,552 +chr21 34609145 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.470;DP=67;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:273,0,2752 +chr21 34609305 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-1.636;DP=76;FS=13.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:271,0,2423 +chr21 34611821 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-1.044;DP=145;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,26:145:99:392,0,4473 +chr21 34636066 . C A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.502;DP=161;FS=0.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,42:161:99:951,0,4474 +chr21 35312092 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr21 35389320 . C T 3716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-1.789;DP=190;FS=10.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:3745,0,3211 +chr21 35389341 . T C 3703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-2.415;DP=142;FS=11.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:3732,0,3213 +chr21 35389436 . T A 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=-1.315;DP=169;FS=4.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1195,0,5213 +chr21 35389519 . T C 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.225;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=22.16;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:1624,0,7748 +chr21 35389588 . TCG T 1586.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.043;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=31.11;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:1624,0,7887 +chr21 35389642 . A G 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=0.145;DP=55;FS=13.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=29.01;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:1624,0,7673 +chr21 35389688 . G A 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.206;DP=115;FS=16.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:1624,0,7799 +chr21 35389719 . T A 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=-1.073;DP=126;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,9:65:99:1624,0,7758 +chr21 35389720 . C A 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=-2.226;DP=129;FS=5.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,9:68:99:1624,0,7712 +chr21 35389848 . T A 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=2.054;DP=57;FS=6.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1115,0,2200 +chr21 35389888 . A G 2140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=-0.342;DP=87;FS=5.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=24.61;ReadPosRankSum=3.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,52:87:99:2169,0,1187 +chr21 35390021 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.583;DP=53;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:277,0,1641 +chr21 35390270 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=4.329;DP=33;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=12.93;ReadPosRankSum=-3.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:455,0,664 +chr21 35390620 . C G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.030;DP=51;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=8.64;ReadPosRankSum=-3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:469,0,1293 +chr21 35390669 . G A 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=2.923;DP=72;FS=4.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=18.79;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:1381,0,1056 +chr21 35390907 . A G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=1.455;DP=50;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.536;QD=18.06;ReadPosRankSum=2.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:931,0,1553 +chr21 35390913 . A G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=1.226;DP=51;FS=4.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=17.70;ReadPosRankSum=3.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:931,0,1553 +chr21 35708590 . A G 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;ClippingRankSum=-0.885;DP=77;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:603,0,1798 +chr21 35720780 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.387;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:366,0,675 +chr21 35729114 . A T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.194;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:351,0,993 +chr21 35732654 . A G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=-0.657;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:573,0,656 +chr21 35746648 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.326;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:249,0,802 +chr21 35752451 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.213;DP=34;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:385,0,907 +chr21 35757382 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-0.353;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:491,0,873 +chr21 35770999 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.734;DP=172;FS=6.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,35:172:99:650,0,5244 +chr21 35777767 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-1.466;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:310,0,671 +chr21 35778449 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-0.819;DP=39;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:445,0,951 +chr21 35782123 . G C 579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:608,42,0 +chr21 35782995 . TG T 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.979;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:389,0,112 +chr21 35784376 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:252,0,244 +chr21 35784659 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.847;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:287,0,497 +chr21 35787542 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=-0.583;DP=36;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:247,0,990 +chr21 35790003 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=1.523;DP=38;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:308,0,951 +chr21 35867585 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-1.047;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,572 +chr21 35892923 . C CA 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.423;DP=15;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:55:271,0,55 +chr21 35937687 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.206;DP=88;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:472,0,2639 +chr21 35941108 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=2.196;DP=81;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:434,0,5180 +chr21 35941144 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.072;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:304,0,1071 +chr21 36009355 . G T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr21 36009413 . C T 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 +chr21 36059441 . GT G 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:260,0,155 +chr21 36062553 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:375,0,127 +chr21 36118726 . T TA 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-0.190;DP=59;FS=14.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,32:53:99:521,0,517 +chr21 36120467 . C T 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.501;DP=105;FS=5.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,26:105:99:1030,0,4465 +chr21 36120665 . T C 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=-0.228;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:540,0,1954 +chr21 36121040 . TAC T 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=-3.762;DP=132;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=6.11;ReadPosRankSum=2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,33:131:99:844,0,4259 +chr21 36123117 . GT G 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.294;DP=172;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,32:158:99:289,0,4746 +chr21 36129938 . G A 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=-0.734;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,53:155:99:1407,0,5127 +chr21 36130064 . G A 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.548;DP=101;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,62:101:99:1995,0,1310 +chr21 36130250 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.932;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,40:164:99:829,0,4527 +chr21 36149993 . C A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:377,0,285 +chr21 36312895 . CACCTGCAGGCAATAAGGACAATGATTCTGAATTACACTACAGAGTTCACAGCTATCACTTTCATTCCTTTATGATGGATTACAGCTTACTCAGCAGGACCAAGTAACGGATCAGCAAGACAAACTT C 3219.64 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=1.531;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=27.26;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,79:82:99:3257,238,0 +chr21 36384367 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=2.249;DP=60;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:729,0,1284 +chr21 36409988 . A G 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=1.248;DP=62;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=22.66;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,36:53:99:1433,0,490 +chr21 36410092 . A T 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.139;DP=74;FS=6.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,47:59:99:1792,0,261 +chr21 36433562 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-2.112;DP=204;FS=9.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=1.53;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,32:204:99:341,0,6731 +chr21 36433607 . G A 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.281;DP=214;FS=2.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=1.70;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,34:214:99:401,0,7190 +chr21 36433756 . G GT 549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.755;DP=222;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,49:217:99:587,0,4663 +chr21 36509894 . A G 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.931;DP=195;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,38:195:99:688,0,6178 +chr21 36510405 . C CT 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=-2.460;DP=150;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,28:143:99:298,0,3546 +chr21 36513506 . A G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.030;DP=249;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,41:249:99:512,0,8147 +chr21 36742988 . A G 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 +chr21 36751504 . G A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=3.116;DP=79;FS=3.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:934,0,1870 +chr21 37473122 . T C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:467,33,0 +chr21 37607653 . G C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.274;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,1:19:99:235,0,1814 +chr21 37619730 . GT G 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-1.466;DP=39;FS=15.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:259,0,510 +chr21 37688498 . C T 4461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=1.228;DP=270;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,142:270:99:4490,0,4541 +chr21 37699364 . C G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=2.436;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:269,0,417 +chr21 37699979 . T TA 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.614;DP=22;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:33:408,0,33 +chr21 37755292 . G T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=0.634;DP=37;FS=5.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:837,0,1158 +chr21 37902650 . G GT,GTT 3869.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.046;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,151,37:189:99:4836,746,247,3814,0,3734 +chr21 37904686 . T C 344.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:373,30,0 +chr21 37952762 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:533,36,0 +chr21 37952768 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:533,36,0 +chr21 37953089 . G C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=1.604;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:271,0,1209 +chr21 37956476 . AT A 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.119;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:374,0,271 +chr21 37956838 . G GT 933.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:95:971,95,0 +chr21 38029044 . G A 5622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.271;DP=313;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,157:312:99:5651,0,5494 +chr21 38029175 . G A 6512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-0.527;DP=267;FS=0.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=24.39;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,129:267:99:6541,0,9613 +chr21 38029366 . C T 6537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-3.229;DP=424;FS=4.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,197:423:99:6566,0,7426 +chr21 38029539 . G A 1810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-1.356;DP=144;FS=5.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,54:144:99:1839,0,3090 +chr21 38029567 . G T 3093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-2.369;DP=131;FS=0.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:3122,0,3891 +chr21 38029689 . C T 2649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.332;DP=125;FS=3.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=21.20;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,77:125:99:2678,0,3618 +chr21 38029847 . G T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.075;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=30.25;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:966,0,115 +chr21 38136062 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.004;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=30.63;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:44:457,0,44 +chr21 38287987 . C T 2666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.250;DP=229;FS=3.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,80:229:99:2695,0,5182 +chr21 38307241 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-1.778;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:637,0,184 +chr21 38343547 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=1.474;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:458,0,445 +chr21 38343919 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.489;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:286,0,336 +chr21 38345465 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.177;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:333,0,336 +chr21 38347493 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,332 +chr21 38362305 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.370;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:265,0,1112 +chr21 38392446 . CA C 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.657;DP=41;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:428,0,553 +chr21 38404493 . G T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.806;DP=104;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,37:104:99:1261,0,2367 +chr21 38404848 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.768;DP=164;FS=5.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,26:164:99:277,0,5270 +chr21 38405812 . C A 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.774;DP=220;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,59:220:99:1234,0,5718 +chr21 38432940 . C T 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:686,51,0 +chr21 38438840 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.350;DP=67;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:773,0,1512 +chr21 38453276 . AACCTGGTGATACATAGGATAGGTGATAGTACAGATAATCGACCAATAATAACACATCTAATTGAAATGATGTGATTTGAGTTTACTTTTTTTAAAGT A 12513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=282;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,282:282:99:12551,1124,0 +chr21 38715471 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-0.499;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:257,0,1654 +chr21 38724245 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.762;DP=65;FS=5.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=19.53;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1298,0,870 +chr21 38725405 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.408;DP=106;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:327,0,5850 +chr21 38806389 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.039;DP=34;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:242,0,938 +chr21 38809741 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=1.240;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:300,0,833 +chr21 38881947 . T G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=0.007;DP=157;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,32:156:99:592,0,4401 +chr21 38885085 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.224;DP=130;FS=5.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,31:130:99:692,0,3821 +chr21 38944856 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.170;DP=81;FS=3.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:398,0,2260 +chr21 38997181 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-0.969;DP=23;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=23.51;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:569,0,192 +chr21 39001418 . T G 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.727;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.292;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:67:600,0,67 +chr21 39001758 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-1.244;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:334,0,406 +chr21 39004433 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=-1.414;DP=31;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:259,0,799 +chr21 39191445 . A C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.465;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:454,0,351 +chr21 39191879 . A C 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.883;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:841,0,1543 +chr21 39191921 . G T 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.359;DP=73;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1215,0,1344 +chr21 39192092 . A T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.096;DP=43;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.934;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:718,0,1377 +chr21 39201738 . G T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=2.910;DP=99;FS=6.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.389;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:722,0,3781 +chr21 39205373 . C T 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.140;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1773,0,1488 +chr21 39209430 . G T 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.529;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:1453,0,3437 +chr21 39209431 . G T 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-1.279;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:1453,0,3431 +chr21 39311125 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.489;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:247,0,1481 +chr21 39312985 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-1.630;DP=27;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:252,0,415 +chr21 39339636 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.815;DP=74;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:511,0,1967 +chr21 39352485 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.38;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:252,0,98 +chr21 39353316 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,104 +chr21 39353397 . T A 218.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:247,0,24 +chr21 39359531 . T TA 1129.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.236;DP=53;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:1344,102,0 +chr21 39359798 . A T 1403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1432,102,0 +chr21 39360865 . T A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 +chr21 39360872 . C A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:383,27,0 +chr21 39360938 . A T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=34.68;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:54:375,0,54 +chr21 39361240 . AT A 573.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.578;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:611,60,0 +chr21 39361292 . T TG 1644.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-1.734;DP=27;FS=5.836;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=32.47;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:99:1682,116,0 +chr21 39453335 . CT C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.031;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:264,0,253 +chr21 39457181 . TTTACCTGCGAGTAAAAGCTCTCAATTAAAACAGTTATTCCAAATGTGTAAGCATTTTAGTGCGTTCATAGGGC T 828.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=2.558;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=23.02;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:866,0,2453 +chr21 39579378 . C T 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=1.652;DP=166;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,44:166:99:1026,0,4569 +chr21 39583194 . T C 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.244;DP=145;FS=4.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:966,0,3845 +chr21 39608910 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr21 39670519 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.377;DP=61;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:314,0,1666 +chr21 39673037 . G C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.286;DP=52;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:238,0,1537 +chr21 39677316 . G A 2149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-1.716;DP=96;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=22.39;ReadPosRankSum=1.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,62:95:99:2178,0,1078 +chr21 39677500 . C T 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-3.672;DP=74;FS=17.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.576;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1320,0,1261 +chr21 39677779 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.580;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:450,0,1235 +chr21 39677826 . CA C 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=-1.689;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:99:476,0,125 +chr21 39695136 . T G 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-0.527;DP=118;FS=3.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1828,0,2260 +chr21 39951193 . AT A 398.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:29:436,29,0 +chr21 39972055 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:248,0,529 +chr21 40170673 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-0.919;DP=176;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,35:176:99:649,0,5461 +chr21 40225992 . G GA 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.102;DP=44;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:338,0,494 +chr21 40234007 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=1.923;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:303,0,973 +chr21 40235490 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:256,0,424 +chr21 40246896 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.110;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:340,0,1936 +chr21 40250382 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.546;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:303,0,1017 +chr21 40251038 . C G 4194.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:4223,301,0 +chr21 40252100 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.192;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:599,0,808 +chr21 40252222 . A G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr21 40335055 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-2.242;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:333,0,1357 +chr21 40460577 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr21 40467510 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:280,0,339 +chr21 40467513 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:280,0,339 +chr21 40470168 . G A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr21 40474317 . T C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.855;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=16.61;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:510,0,494 +chr21 40474497 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=-0.094;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:450,0,304 +chr21 40475153 . T C 1237.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1266,93,0 +chr21 40477023 . G T 3447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3476,253,0 +chr21 40477107 . G A 2910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2939,214,0 +chr21 40493514 . G T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-1.185;DP=85;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=8.01;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:709,0,2162 +chr21 40522515 . C T 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.437;DP=426;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:333,93:426:99:1785,0,12907 +chr21 40559206 . C CT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-1.967;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:238,0,1338 +chr21 40738669 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=29.65;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:384,0,52 +chr21 40863747 . A C 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 +chr21 41377030 . T C 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-1.158;DP=187;FS=4.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,37:187:99:527,0,6684 +chr21 41377035 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-1.334;DP=180;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,30:180:99:337,0,5982 +chr21 41379547 . G GT 993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.178;DP=222;FS=3.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,66:196:99:1031,0,3175 +chr21 41436138 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:375,0,412 +chr21 41436164 . C G 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.576;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:588,0,521 +chr21 41436245 . T G 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.057;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:796,0,2284 +chr21 41436341 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.776;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:357,0,374 +chr21 41438199 . T A 246.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:275,0,19 +chr21 41438601 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.899;DP=23;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:435,0,324 +chr21 41439013 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-1.014;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:766,0,752 +chr21 41439165 . T G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.636;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=27.47;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:770,0,141 +chr21 41445929 . G A 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.801;DP=54;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:1033,0,1517 +chr21 41503438 . A G 1807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-2.886;DP=67;FS=5.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=26.98;ReadPosRankSum=-2.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,48:67:99:1836,0,491 +chr21 41503520 . T C 4197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:4226,307,0 +chr21 41505761 . G A 2095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=1.181;DP=126;FS=9.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:2124,0,2203 +chr21 41506539 . A T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +chr21 41506695 . A T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr21 41507104 . C T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr21 41507122 . A T 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 +chr21 41509406 . G T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr21 41509424 . G GA 245.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr21 41511978 . T G 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:39:548,39,0 +chr21 41517385 . A T 3118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.549;DP=167;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,96:167:99:3147,0,2381 +chr21 41519566 . C T 5138.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:5167,375,0 +chr21 41520970 . C A 2650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.056;DP=148;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=17.91;ReadPosRankSum=2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:2679,0,2714 +chr21 41548695 . C T 2808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-1.276;DP=208;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.325;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,81:208:99:2837,0,4349 +chr21 41619789 . G C 1455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.228;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1484,0,1451 +chr21 41628376 . AGTAAGCGTCGTTTATTACCATGTTAAGTACTAAGTGCCTCTTCAGTCGTGTAGTAGTGGTGCAGGTTAATATGGCCATCCATTTTCTCCTTTTTCAG A 2009.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.782;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,80:87:99:2102,0,725 +chr21 41632949 . A T 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.117;DP=86;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1314,0,1403 +chr21 41655281 . G C 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=2.679;DP=67;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=17.82;ReadPosRankSum=-1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,37:67:99:1222,0,1116 +chr21 41656664 . C A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.526;DP=65;FS=4.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:984,0,1359 +chr21 41782986 . CT C 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,402 +chr21 41826401 . T C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.436;DP=77;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:887,0,1884 +chr21 41826631 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=2.257;DP=81;FS=6.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:528,0,2459 +chr21 41829194 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr21 41842501 . G A 1342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.830;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=15.26;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:1371,0,1679 +chr21 41883636 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=-0.812;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:325,0,1642 +chr21 41891094 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.147;DP=23;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:360,0,445 +chr21 41913228 . CACACACACACACACACACACACACACACACACAT C 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:18:249,18,0 +chr21 41920078 . T C 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:661,48,0 +chr21 41920348 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,279 +chr21 41920905 . G A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 +chr21 41930845 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.660;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:571,0,555 +chr21 41931207 . T C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.892;DP=36;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:777,0,476 +chr21 41931756 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.579;DP=24;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:357,0,410 +chr21 41932518 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=-0.473;DP=30;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:680,0,320 +chr21 41937806 . A C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:290,21,0 +chr21 41938612 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:259,18,0 +chr21 41938973 . C T 358.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.869;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:439,0,162 +chr21 41984471 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,243 +chr21 42001162 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-1.613;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:299,0,548 +chr21 42101470 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:658,0,245 +chr21 42101992 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.914;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:339,0,302 +chr21 42102290 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,129 +chr21 42103802 . A AT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.096;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:258,0,259 +chr21 42104096 . T C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.665;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:647,0,348 +chr21 42104241 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=26.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:326,0,330 +chr21 42115521 . T C 3681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.045;DP=218;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,115:218:99:3710,0,3851 +chr21 42122173 . CT C 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=1.896;DP=70;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.04;ReadPosRankSum=-2.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,34:68:99:740,0,698 +chr21 42343546 . G T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=-1.105;DP=71;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:1024,0,1366 +chr21 42353645 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=2.301;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:234,0,648 +chr21 42359777 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=3.250;DP=58;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:362,0,1554 +chr21 42585201 . G C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=4.563;DP=103;FS=21.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,27:103:99:628,0,2904 +chr21 42665761 . A C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.518;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:544,0,383 +chr21 42809234 . T A 423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:452,33,0 +chr21 42809263 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.936;DP=22;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:243,0,518 +chr21 42809267 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.289;DP=23;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:230,0,580 +chr21 43069461 . A G 358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:387,30,0 +chr21 43171339 . T G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr21 43237572 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=1.052;DP=31;FS=5.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:504,0,1281 +chr21 43237573 . G A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.250;DP=31;FS=5.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:596,0,1107 +chr21 43240507 . A AT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.348;ClippingRankSum=0.337;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:337,0,3630 +chr21 43241248 . AT A 9088.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:9126,624,0 +chr21 43242626 . G GA 1361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.652;DP=118;FS=11.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1399,0,1410 +chr21 43243392 . A AT 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=2.012;DP=130;FS=6.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1158,0,1227 +chr21 43243942 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=2.131;DP=41;FS=4.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:365,0,1224 +chr21 43244317 . CT C 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-1.028;DP=139;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,28:137:99:576,0,3262 +chr21 43245104 . C T 6004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=-1.574;DP=321;FS=18.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,155:321:99:6033,0,11240 +chr21 43273943 . T C 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-1.994;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=21.76;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1334,0,891 +chr21 43275165 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=1.675;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:293,0,1080 +chr21 43275169 . T C 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=1.244;DP=29;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=27.79;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:834,0,339 +chr21 43289724 . T C 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.271;DP=100;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1823,0,1543 +chr21 43302380 . T A 2239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.369;DP=102;FS=27.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,65:102:99:2268,0,1294 +chr21 43305317 . G C 2087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.359;DP=118;FS=2.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:2116,0,1884 +chr21 43308824 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.642;DP=32;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:568,0,558 +chr21 43525089 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,389 +chr21 43525096 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:232,0,389 +chr21 43594568 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,308 +chr21 43603558 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-1.388;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:718,0,1159 +chr21 43620672 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-2.104;DP=41;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:768,0,582 +chr21 43621905 . C A 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 +chr21 43621952 . G C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=-1.506;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:450,0,254 +chr21 43624293 . C G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.739;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:24:346,24,0 +chr21 43651063 . A C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.578;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:307,0,616 +chr21 43654465 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-0.142;DP=31;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:423,0,649 +chr21 43658185 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=1.148;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:269,0,952 +chr21 43658731 . G C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.669;DP=44;FS=7.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:338,0,1130 +chr21 43660498 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.476;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:374,0,748 +chr21 43660561 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=2.900;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:428,0,647 +chr21 43886046 . T C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr21 43886573 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.235;DP=28;FS=9.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:584,0,397 +chr21 43887141 . C T 1028.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-1.476;DP=27;FS=4.314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=27.39;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1057,78,0 +chr21 43888549 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr21 43889238 . A G 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.903;DP=85;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:1309,0,3565 +chr21 43889489 . G C 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.242;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,53:83:99:1899,0,1039 +chr21 43893430 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=25.63;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:77:387,0,77 +chr21 43893913 . CTTGGGCTCGGTTTCCAGCTGA C 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=1.141;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.36;ReadPosRankSum=-2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,814 +chr21 43897800 . GCA G 3606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=-3.163;DP=156;FS=1.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=23.12;ReadPosRankSum=6.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,99:120:99:3644,0,303 +chr21 44022157 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.092;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.680;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:273,0,160 +chr21 44022214 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.253;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:434,0,278 +chr21 44022569 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:417,0,616 +chr21 44022574 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.193;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:417,0,616 +chr21 44022821 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:386,0,272 +chr21 44023602 . T G 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:384,27,0 +chr21 44023997 . A AGT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.528;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.63;ReadPosRankSum=-2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:337,0,348 +chr21 44024042 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.061;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:420,0,687 +chr21 44024225 . CA C 299.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:337,33,0 +chr21 44027101 . A C 3494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.878;DP=304;FS=6.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=11.50;ReadPosRankSum=-2.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,104:304:99:3523,0,6975 +chr21 44030291 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.680;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=23.80;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:409,0,165 +chr21 44036836 . A G 201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-2.054;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=20.18;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:19:230,0,19 +chr21 44037242 . T A 1754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-2.512;DP=122;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=14.38;ReadPosRankSum=2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1783,0,2337 +chr21 44037289 . G A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:306,21,0 +chr21 44037399 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=1.119;DP=351;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,58:347:99:306,0,14851 +chr21 44037507 . C T 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=7.128;DP=300;FS=16.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,65:300:99:787,0,10727 +chr21 44040885 . C T 5493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.618;ClippingRankSum=0.025;DP=438;FS=16.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,179:438:99:5522,0,8636 +chr21 44041319 . G A 4896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.736;DP=311;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,145:311:99:4925,0,5275 +chr21 44059066 . A C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-1.872;DP=40;FS=16.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=11.32;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:481,0,874 +chr21 44059249 . C G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=2.262;DP=14;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.77;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:403,0,215 +chr21 44059250 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=2.166;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:403,0,215 +chr21 44059377 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.648;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:344,0,221 +chr21 44059402 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.212;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,127 +chr21 44061963 . A T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=2.976;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=30.89;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:79:646,0,79 +chr21 44062715 . CA C 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=2.289;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=12.87;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:256,0,428 +chr21 44067109 . G A 2165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.651;DP=170;FS=11.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,69:170:99:2194,0,3082 +chr21 44148671 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:264,0,564 +chr21 44160465 . T C 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 +chr21 44160467 . G A 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:396,27,0 +chr21 44161869 . C T 2665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.331;DP=170;FS=0.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:2694,0,2721 +chr21 44162600 . C T 3326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.890;DP=226;FS=7.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,100:226:99:3355,0,3907 +chr21 44176515 . GCA G 397.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-1.488;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:8:434,8,0 +chr21 44176746 . A C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-2.041;DP=13;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=28.37;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:43:397,0,43 +chr21 44176763 . C T 337.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.696;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=30.66;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9:365,0,9 +chr21 44183706 . C CCAT 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:50:269,0,50 +chr21 44186752 . G A 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-1.073;DP=167;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,54:167:99:1393,0,4130 +chr21 44203424 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,261 +chr21 44203944 . A T 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=1.582;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,39:72:99:1333,0,1192 +chr21 44206401 . C T 3323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=2.322;DP=317;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=10.49;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,107:316:99:3352,0,7035 +chr21 44210575 . G A 2270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.196;DP=147;FS=3.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:2299,0,2524 +chr21 44314638 . A ATC 376.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:29:414,29,0 +chr21 44314933 . C T 1588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.105;DP=132;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1626,0,3043 +chr21 44317332 . C G 5533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-1.284;DP=411;FS=9.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,162:410:99:5562,0,8367 +chr21 44325735 . T C 2029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.065;DP=147;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,59:147:99:2058,0,2954 +chr21 44326448 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-1.753;DP=58;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:340,0,1592 +chr21 44326469 . G T 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-1.310;DP=81;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:482,0,2120 +chr21 44328848 . A C 5797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-0.082;DP=147;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=31.98;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:5826,430,0 +chr21 44330299 . C G 1784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.121;DP=104;FS=4.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1813,0,3278 +chr21 44336196 . C T 3603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=1.078;DP=202;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,101:202:99:3632,0,3577 +chr21 44336920 . G A 3530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.539;DP=218;FS=1.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,104:218:99:3559,0,3587 +chr21 44345282 . G C 2099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-4.074;DP=108;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:2128,0,3417 +chr21 44349975 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.790;DP=70;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:337,0,2094 +chr21 44350153 . ACACACACACACACACACACACTCT A 646.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:77:684,77,0 +chr21 44356182 . C T 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:72:990,72,0 +chr21 44361942 . G T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=3.873;DP=28;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.706;QD=25.96;ReadPosRankSum=2.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:755,0,147 +chr21 44364225 . G A 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:752,54,0 +chr21 44364298 . T C 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 +chr21 44369578 . G GGGT 3339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.003;DP=171;FS=16.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,96:157:99:3377,0,2418 +chr21 44370611 . G A 3537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=2.043;DP=286;FS=0.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=12.37;ReadPosRankSum=-2.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,109:286:99:3566,0,5872 +chr21 44370837 . G C 3922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.224;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,89:229:99:3951,0,9769 +chr21 44371737 . G A 5301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.004;DP=368;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=14.41;ReadPosRankSum=2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,156:367:99:5330,0,6815 +chr21 44376935 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.235;DP=44;FS=7.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:317,0,1088 +chr21 44378435 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.186;DP=52;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:690,0,941 +chr21 44379348 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-1.644;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,370 +chr21 44380234 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.907;DP=37;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:440,0,893 +chr21 44380536 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:284,0,113 +chr21 44381257 . TACACACACACAC T 571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:55:609,55,0 +chr21 44399276 . C G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:417,0,177 +chr21 44439003 . A T 7075.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:7104,503,0 +chr21 44455033 . A G 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:354,24,0 +chr21 44495007 . C A 3761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=-1.075;DP=305;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=12.33;ReadPosRankSum=2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,109:305:99:3790,0,6836 +chr21 44496639 . G A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr22 121756 . CGTGTGTGT C 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:27:694,27,0 +chr22 228682 . ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-0.196;DP=82;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=2.61;ReadPosRankSum=3.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:251,0,1683 +chr22 310211 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 +chr22 310244 . C G 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr22 389982 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,166 +chr22 443420 . T C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-0.158;DP=103;FS=7.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:481,0,3150 +chr22 565576 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=3.089;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:432,0,434 +chr22 566272 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=2.192;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:396,0,118 +chr22 598039 . A C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-2.354;DP=80;FS=7.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:413,0,2288 +chr22 626712 . G A 4352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=3.129;DP=152;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=28.64;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,116:151:99:4381,0,724 +chr22 709987 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.665;DP=29;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:345,0,676 +chr22 724790 . A G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:436,0,348 +chr22 734168 . T C 3127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-3.645;DP=177;FS=6.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,97:177:99:3156,0,2668 +chr22 734892 . G A 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.860;DP=158;FS=8.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,43:155:99:1040,0,4136 +chr22 736930 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.686;DP=188;FS=3.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,37:188:99:615,0,5831 +chr22 756887 . A G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.530;DP=359;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,61:358:99:570,0,10579 +chr22 776891 . G A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.458;DP=68;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:826,0,1481 +chr22 779518 . AAGGTGCGGCACTGCTGGAAAATCATTCCTATGTTGTTTATTTTCTTGTATTGTAACGCATACCAAATTTGCTATGTACCCATGATGCCGTGCTGTGTTTTTTGCGC A 291.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=1.370;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:64:99:329,117,0 +chr22 793145 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.728;DP=52;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:286,0,1561 +chr22 793157 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.331;DP=62;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:325,0,1893 +chr22 802809 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.042;DP=99;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:750,0,2567 +chr22 805335 . G A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.026;DP=102;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:579,0,2736 +chr22 807473 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.567;DP=110;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=4.14;ReadPosRankSum=2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:484,0,3114 +chr22 808764 . C T 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.515;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,34:120:99:739,0,3122 +chr22 811495 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-3.757;DP=84;FS=17.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:620,0,2245 +chr22 811625 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.700;DP=70;FS=5.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:459,0,1997 +chr22 811651 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.231;DP=79;FS=9.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:421,0,2234 +chr22 814140 . A G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.782;DP=63;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:359,0,1792 +chr22 837307 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-0.675;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:417,0,342 +chr22 840429 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-1.270;DP=84;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=2.78;ReadPosRankSum=2.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,16:84:99:262,0,3892 +chr22 843509 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.186;DP=63;FS=8.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:316,0,1776 +chr22 872847 . TGGTCAGTGATTTTTCATTTTTATTTAAAATTCTTGCAAACAGGAAGTGATGCGTTACGTTGTTCTGCCTCTTCCA T 2192.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=2.868;DP=53;FS=6.234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=22.95;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:2230,177,0 +chr22 875791 . C T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.044;DP=61;FS=5.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:773,0,1328 +chr22 879961 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.545;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:230,0,241 +chr22 899447 . GCTGTTAAAGAGGAGAACAGAGAGAGAAATGAGATGACTCTGCTTTTCTCCATCACTCCATCATCTCTGATCTGCACCCAC G 4626.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=1.862;DP=104;FS=2.464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,99:102:99:4664,416,0 +chr22 915226 . G A 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.351;DP=98;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,31:98:99:875,0,2565 +chr22 915315 . CCCTGAGAGCGTCACCAAAGCACAGGAGAATGATTTGGAGACTTTAACATTGTGGAGTGAAAGAATAAATACAATGAACGTTTAACCATA C 3562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=2.455;DP=96;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=31.46;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,85:91:99:3600,0,925 +chr22 915717 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.037;DP=81;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:523,0,2185 +chr22 918283 . TCTACAAGAGACGGAGTACTCAACAACTCGCAGAACACAAAGGCTAGCTACGCAGAACACACACCAAACACACCATCCCCAC T 5234.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.471;DP=121;FS=2.003;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=28.60;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,117:121:99:5272,424,0 +chr22 929231 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=2.776;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:436,0,2035 +chr22 936273 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.422;DP=74;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:430,0,2227 +chr22 1002221 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr22 1191497 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-1.856;DP=41;FS=16.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:388,0,1701 +chr22 1215453 . G T 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=-3.229;DP=228;FS=16.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,68:227:99:1269,0,5214 +chr22 1233051 . A C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.851;DP=79;FS=11.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=5.91;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:495,0,2095 +chr22 1237173 . T A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr22 1240943 . T C 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.543;DP=104;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,36:104:99:1172,0,2447 +chr22 1255536 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-1.097;DP=76;FS=3.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:558,0,2048 +chr22 1260820 . G C 1385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=1.207;DP=99;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:1414,0,1918 +chr22 1349330 . A G 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.583;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=15.25;ReadPosRankSum=2.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:562,0,710 +chr22 1349339 . A C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-2.733;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=6.58;ReadPosRankSum=3.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:252,0,1835 +chr22 1349694 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:291,0,338 +chr22 1407655 . A G 249.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.36;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:278,0,21 +chr22 1408340 . A G 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.554;DP=29;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:799,0,129 +chr22 1437317 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.12;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:375,0,451 +chr22 1437523 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,533 +chr22 1438012 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=2.637;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:296,0,132 +chr22 1585085 . AT A 726.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.346;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:26:764,26,0 +chr22 1585720 . C T 674.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.552;DP=19;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=23.57;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:21:703,0,21 +chr22 1687776 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-2.040;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=18.12;ReadPosRankSum=3.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,352 +chr22 1693426 . A C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 +chr22 1693511 . T C 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 +chr22 1695499 . C G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 +chr22 1727079 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=1.165;DP=23;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:453,0,310 +chr22 1763114 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:52:291,0,52 +chr22 1886944 . C T 250.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:279,24,0 +chr22 2000310 . C G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-2.282;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=32.34;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:35:481,0,35 +chr22 2012619 . A C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=2.293;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:378,0,244 +chr22 2018071 . A C 479.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=34.27;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:505,0,0 +chr22 2052110 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=1.042;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:260,0,393 +chr22 2060401 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.31;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:96:229,0,96 +chr22 2074164 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.104;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:299,0,549 +chr22 2114083 . A G 206.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=9;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:235,0,25 +chr22 2115445 . A C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.655;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=14.75;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:338,0,371 +chr22 2143666 . C T 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.577;DP=201;FS=4.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,62:201:99:1581,0,5258 +chr22 2155603 . C T 2663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.650;ClippingRankSum=2.171;DP=235;FS=14.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.34;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,85:234:99:2692,0,5148 +chr22 2162145 . C T 5351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=1.208;DP=312;FS=8.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,153:311:99:5380,0,5743 +chr22 2165466 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:310,0,96 +chr22 2179917 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=2.083;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:256,0,883 +chr22 2179927 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=1.658;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:256,0,883 +chr22 2180370 . T G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.265;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.474;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:367,0,357 +chr22 2384543 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.337;DP=71;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:421,0,1867 +chr22 2421866 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:268,0,179 +chr22 2459784 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.694;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:415,0,841 +chr22 2542839 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=1.447;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:237,0,299 +chr22 2596590 . G T 262.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:291,0,19 +chr22 2597218 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:271,0,226 +chr22 2636990 . A G 435.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:1:461,0,1 +chr22 2637020 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:274,0,63 +chr22 2776996 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.289;DP=20;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:290,0,420 +chr22 2823969 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.550;DP=39;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:240,0,1136 +chr22 2826366 . G T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.389;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:680,0,785 +chr22 2899142 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:258,0,95 +chr22 2924232 . G C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=-1.881;DP=59;FS=15.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:272,0,1627 +chr22 2970625 . C T 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.586;ClippingRankSum=-3.566;DP=729;FS=13.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=1.18;ReadPosRankSum=5.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:558,101:659:99:891,0,21942 +chr22 2981665 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.90;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,305 +chr22 2981666 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,305 +chr22 2982031 . A G 358.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=29.85;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:385,0,4 +chr22 2995466 . G T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr22 3023349 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,139 +chr22 3070802 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.009;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=25.09;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:505,0,151 +chr22 3071579 . A C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:383,0,364 +chr22 3074843 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:263,0,58 +chr22 3078352 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,179 +chr22 3107502 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.623;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:240,0,985 +chr22 3108790 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,285 +chr22 3118614 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:282,0,95 +chr22 3159792 . G T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=7.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.890;QD=26.45;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:716,0,183 +chr22 3258369 . T C 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.107;DP=78;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,46:78:99:1505,0,1823 +chr22 3370981 . GA G 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.204;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:514,0,1479 +chr22 3372739 . G A 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.519;DP=158;FS=9.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,47:157:99:1231,0,4079 +chr22 3373110 . AC A 979.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=-0.853;DP=139;FS=0.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:1017,0,3592 +chr22 3373187 . CAA C 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.757;DP=102;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:601,0,1803 +chr22 3397291 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.416;DP=121;FS=15.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,33:121:99:867,0,7052 +chr22 3431682 . G A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.280;DP=106;FS=3.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,33:106:99:867,0,2825 +chr22 3431715 . A T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.240;DP=114;FS=3.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:856,0,2956 +chr22 3433010 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=1.347;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:362,0,2555 +chr22 3449833 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-0.855;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:540,0,1977 +chr22 3470116 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.152;DP=123;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,25:122:99:426,0,3637 +chr22 3888581 . A G 4311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=-0.745;DP=146;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=29.53;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,114:145:99:4340,0,566 +chr22 3946049 . G A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=-0.306;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,46:169:99:1127,0,4564 +chr22 4007851 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.455;DP=221;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=2.94;ReadPosRankSum=-5.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,43:221:99:678,0,6697 +chr22 4007881 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=5.595;DP=204;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=2.21;ReadPosRankSum=2.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,36:204:99:480,0,6258 +chr22 4017724 . C T 4260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=-1.871;DP=324;FS=1.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=13.15;ReadPosRankSum=3.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,124:324:99:4289,0,6601 +chr22 4023598 . C A 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.027;DP=314;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,77:314:99:1736,0,9292 +chr22 4024125 . T C 1661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-2.679;DP=357;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,81:346:99:1690,0,9997 +chr22 4027034 . T C 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=-0.617;DP=364;FS=5.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,84:364:99:1714,0,10466 +chr22 4039967 . C A 3644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.605;DP=268;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=13.60;ReadPosRankSum=3.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,94:268:99:3673,0,13506 +chr22 4039975 . T G 3644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.046;DP=287;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,100:287:99:3673,0,13534 +chr22 4188671 . C CG 509.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:547,40,0 +chr22 4188673 . C T 518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:40:547,40,0 +chr22 4288626 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr22 4324644 . C T 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=2.029;DP=31;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:493,0,564 +chr22 4324674 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.026;DP=27;FS=9.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.40;ReadPosRankSum=-2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:255,0,678 +chr22 4332468 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,227 +chr22 4339569 . T TGC 5903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.512;DP=327;FS=0.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,153:321:99:5941,0,10314 +chr22 4339937 . G A 10338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=2.291;DP=575;FS=15.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,289:575:99:10367,0,16825 +chr22 4343594 . G A 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-1.319;DP=319;FS=7.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,94:319:99:2398,0,8641 +chr22 4343646 . TCCTATAATGCAGGGATTTAAAGTCTTAATACACCACTGGACTCATATCTTAAGTATAACTTTTTGAAATATCACAACATG T 14176.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.149;DP=365;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,351:355:99:14214,1043,0 +chr22 4358463 . T C 400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:429,30,0 +chr22 4410235 . C G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=1.416;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=33.46;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:35:597,0,35 +chr22 4602718 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.888;DP=15;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=27.38;ReadPosRankSum=-1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:439,0,52 +chr22 4602719 . G T 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:575,39,0 +chr22 4603563 . TA T 241.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:279,27,0 +chr22 4603677 . C CT 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-1.523;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:311,0,549 +chr22 4603770 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=20.34;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:252,0,134 +chr22 4603846 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=3.451;DP=67;FS=13.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=5.13;ReadPosRankSum=-3.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:372,0,2033 +chr22 4610166 . A G 2267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-4.198;DP=106;FS=6.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=21.39;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,67:105:99:2296,0,1833 +chr22 4611984 . T C 4699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-1.160;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=27.65;ReadPosRankSum=2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,129:169:99:4728,0,822 +chr22 4614191 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.244;DP=90;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:978,0,1823 +chr22 4616447 . T A 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.963;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:2200,0,2101 +chr22 4618317 . G A 3382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-0.315;DP=246;FS=5.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,100:246:99:3411,0,7701 +chr22 4641648 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.311;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:303,0,642 +chr22 4643485 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.524;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:562,0,755 +chr22 4643512 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=1.022;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:658,0,691 +chr22 4647081 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.131;DP=22;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:391,0,410 +chr22 4698700 . T A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.129;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=21.69;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:679,0,374 +chr22 4698715 . T A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-1.615;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.026;QD=18.76;ReadPosRankSum=2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:741,0,577 +chr22 4703668 . G A 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.403;DP=82;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1359,0,1241 +chr22 4748143 . T G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.366;DP=61;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:497,0,1598 +chr22 4750771 . T A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=2.024;DP=41;FS=9.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:644,0,789 +chr22 4756847 . A G 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.186;DP=63;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,32:63:99:1149,0,1121 +chr22 4756897 . A G 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-2.659;DP=72;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:530,0,2011 +chr22 4756949 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.663;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:500,0,2012 +chr22 4756950 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=-0.240;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:555,0,1967 +chr22 4757119 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=1.528;DP=31;FS=8.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:591,0,513 +chr22 4757193 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.184;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:506,0,919 +chr22 4757209 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.070;DP=46;FS=2.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:407,0,1166 +chr22 4757578 . T C 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.608;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:791,0,1035 +chr22 4757642 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-1.877;DP=56;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,11:56:99:234,0,1794 +chr22 4760858 . A G 786.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-1.598;DP=23;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=34.21;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:23:815,0,23 +chr22 4760966 . GCT G 903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-1.497;DP=68;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:941,0,1342 +chr22 4761383 . C T 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:353,27,0 +chr22 4776452 . T A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.998;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:727,0,698 +chr22 4782138 . C T 251.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:280,0,17 +chr22 4785741 . G T 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=-0.466;DP=104;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1452,0,2170 +chr22 4785777 . G C 2873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.761;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,85:145:99:2902,0,2192 +chr22 4785850 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-2.405;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,43:137:99:652,0,4741 +chr22 4785888 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=3.877;DP=160;FS=8.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:510,0,6433 +chr22 4785961 . T A 3822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-1.119;DP=184;FS=2.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,114:184:99:3851,0,2450 +chr22 4785986 . G A 1952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-1.080;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,58:170:99:1981,0,3965 +chr22 4786093 . T G 2592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=1.097;DP=151;FS=6.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:2621,0,2714 +chr22 4786192 . T C 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.604;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=16.11;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,92:203:99:3315,0,3865 +chr22 4786320 . C A 2325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-1.561;DP=116;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,69:115:99:2354,0,1565 +chr22 4786410 . C G 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=1.710;DP=58;FS=5.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:707,0,1464 +chr22 4786541 . C T 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.449;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:66:1381,66,0 +chr22 4786607 . T C 575.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:6:603,6,0 +chr22 4814683 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.426;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.19;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:232,0,441 +chr22 4857944 . CA C 323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:361,36,0 +chr22 4858068 . CA C 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:238,0,121 +chr22 4875579 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.143;DP=37;FS=10.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:486,0,811 +chr22 4935173 . T A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:305,0,94 +chr22 4935218 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.62;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:321,0,96 +chr22 4935642 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.702;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=23.60;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:453,0,275 +chr22 4938005 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-1.918;DP=53;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:684,0,1617 +chr22 4938299 . T C 3667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-0.272;DP=135;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=27.17;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,97:135:99:3696,0,977 +chr22 4938373 . G GA 624.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.083;DP=119;FS=5.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,33:115:99:662,0,2716 +chr22 5063126 . C T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.631;DP=60;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:757,0,1217 +chr22 5546054 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.666;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:373,0,527 +chr22 5546308 . G C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=1.270;DP=28;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:556,0,380 +chr22 5581166 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.559;DP=40;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:825,0,475 +chr22 5581257 . T C 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.014;DP=62;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:1119,0,1022 +chr22 5584767 . T C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-0.284;DP=45;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:794,0,807 +chr22 5591399 . TA T 1004.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-0.345;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:1042,0,1682 +chr22 5591683 . T G 2343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.259;ClippingRankSum=1.377;DP=156;FS=4.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:2372,0,2865 +chr22 5593299 . G A 3262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.600;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,103:181:99:3291,0,2680 +chr22 5600870 . C A 4903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.861;ClippingRankSum=-1.238;DP=251;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,145:251:99:4932,0,3589 +chr22 5626783 . G C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr22 5626785 . T G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr22 5626874 . T C 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr22 5627175 . A G 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 +chr22 5627363 . T C 580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:609,42,0 +chr22 5628166 . A C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:339,0,89 +chr22 5628911 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.517;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:437,0,362 +chr22 5628964 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=2.462;DP=31;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:464,0,654 +chr22 5634068 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.842;DP=33;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:425,0,774 +chr22 5634204 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-0.096;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:544,0,749 +chr22 5634257 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.560;DP=36;FS=7.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:434,0,795 +chr22 5634425 . A G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-1.425;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.18;ReadPosRankSum=2.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:514,0,627 +chr22 5662281 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.923;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:456,0,434 +chr22 5680153 . G A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-1.396;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:1203,0,1430 +chr22 5680404 . C T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.327;DP=41;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:734,0,707 +chr22 5682252 . G GA,GAA 654.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,12,23:35:99:1153,623,525,314,0,241 +chr22 5682765 . C T 1728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.667;DP=120;FS=18.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1757,0,2253 +chr22 5686184 . C T 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=-0.120;DP=103;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:1342,0,2017 +chr22 5687933 . G A 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.057;DP=143;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,50:143:99:1637,0,3153 +chr22 5687968 . A G 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.079;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,52:138:99:1755,0,2926 +chr22 5697569 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=-0.978;DP=105;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1816,0,1789 +chr22 5779873 . C G 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 +chr22 5839952 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:356,0,348 +chr22 5852460 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,251 +chr22 5998686 . C G 292.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.55;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:321,0,14 +chr22 5998830 . T A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr22 6110898 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=35;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:46:443,0,46 +chr22 6226547 . C T 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 +chr22 6226659 . C T 359.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=32.64;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:387,0,12 +chr22 6238704 . C T 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr22 6247145 . G C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:231,0,99 +chr22 6254219 . C G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,167 +chr22 6254537 . A T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=1.228;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:297,0,494 +chr22 6254657 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.527;DP=27;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,617 +chr22 6259037 . A G 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +chr22 6265912 . T A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr22 6265983 . G T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr22 6266633 . G A 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 +chr22 6449990 . T C 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 +chr22 6450332 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr22 6471954 . A T 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 +chr22 6514490 . A G 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr22 6525987 . T C 673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:702,48,0 +chr22 6557329 . G T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr22 6558522 . C T 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 +chr22 6575353 . A G 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr22 6599165 . AAC A 528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:566,40,0 +chr22 6599287 . C T 700.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:729,57,0 +chr22 6703387 . T C 219.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:248,0,25 +chr22 6906440 . C A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr22 6906441 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr22 6908622 . T A 529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:558,42,0 +chr22 6909747 . A C 819.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:848,60,0 +chr22 6934906 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.311;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:480,0,615 +chr22 6945897 . TCTACAACACAAACACATCGATGAAACACAGATAGAAGATTCAAGAATAATGCTTAAAAGGATTGTTGTATTAC T 4078.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=1.802;DP=150;FS=5.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,108:150:99:4116,0,1549 +chr22 6945899 . TACAACACAAACACATCGATGAAACACAGA T 885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-6.172;DP=148;FS=4.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,39:148:99:923,0,4944 +chr22 6945930 . AGAAGATTCAAGAATAATGCTTAAAAGGATTGTTGTATTACCTTT A 887.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-5.833;DP=155;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,39:155:99:925,0,4944 +chr22 6955962 . GA G 1751.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.406;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,72:109:99:1789,0,828 +chr22 6956121 . C G 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-2.373;DP=277;FS=0.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,82:277:99:2161,0,7729 +chr22 6956350 . A C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.427;DP=100;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:484,0,2937 +chr22 6956449 . G A 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-1.375;DP=94;FS=7.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,29:94:99:807,0,2441 +chr22 6956748 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=1.214;DP=151;FS=3.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:306,0,5015 +chr22 6956987 . A T 4642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=-1.080;DP=292;FS=0.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,131:292:99:4671,0,8276 +chr22 6957046 . GACCTGAGAGATCACAAGAGATTATGTGAGAAACTATAATTAAAATGGATGCAGTGTTAACAGGAAACAAGAACTGTAAAGTATAAAGCATC G 1502.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=2.432;DP=309;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,272:274:99:1540,527,0 +chr22 7530082 . C G 271.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:300,0,14 +chr22 7530257 . G GC 842.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.915;DP=61;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:884,0,555 +chr22 7555237 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-1.688;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:470,0,538 +chr22 7555674 . A T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.52;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:331,0,58 +chr22 7557718 . G T 413.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:441,0,8 +chr22 7557777 . C G 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:952,0,116 +chr22 7557801 . C T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.390;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=32.79;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:91:1012,0,91 +chr22 7558874 . A G 290.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.32;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:319,0,15 +chr22 7558913 . T C 626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:655,48,0 +chr22 7559178 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.064;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:316,0,368 +chr22 7559331 . G GA 665.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-0.866;DP=34;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:703,0,99 +chr22 7560063 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:348,0,171 +chr22 7560396 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,104 +chr22 7580507 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=27.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:383,0,95 +chr22 7596850 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.067;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:876,0,551 +chr22 7601452 . T C 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.037;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.027;QD=27.40;ReadPosRankSum=2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:631,0,148 +chr22 7602480 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.625;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,210 +chr22 7605464 . C G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.619;DP=21;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:599,0,107 +chr22 7605518 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=1.083;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=28.18;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:91:451,0,91 +chr22 7652774 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.415;DP=78;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:353,0,1623 +chr22 7652822 . C T 1004.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1033,72,0 +chr22 7652877 . G A 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:81:1203,81,0 +chr22 7652943 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.109;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:256,0,929 +chr22 7655813 . A C 353.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 +chr22 7832140 . C T 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 +chr22 7832230 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.093;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:230,0,260 +chr22 7832536 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:395,24,0 +chr22 8179275 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.527;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:356,0,527 +chr22 8212306 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-2.357;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:362,0,525 +chr22 8212323 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.902;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:233,0,452 +chr22 8324041 . GA G 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:262,0,278 +chr22 8346302 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,360 +chr22 8352018 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.934;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:303,0,548 +chr22 8362289 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.346;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:489,0,654 +chr22 8608192 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:238,0,815 +chr22 8608194 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.792;DP=21;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:246,0,723 +chr22 8610717 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-1.280;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=23.60;ReadPosRankSum=1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:84:807,0,84 +chr22 8612761 . A C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-1.314;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=5.86;ReadPosRankSum=2.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:251,0,961 +chr22 8777869 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=2.329;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,328 +chr22 8777934 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=2.327;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:365,0,314 +chr22 8930974 . C T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.304;DP=37;FS=7.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:538,0,366 +chr22 8931009 . A G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.366;DP=54;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:726,0,806 +chr22 8931961 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:97:450,0,97 +chr22 8931962 . T G 473.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-0.134;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=26.31;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:501,0,7 +chr22 8932600 . T G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.495;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:422,0,119 +chr22 8932626 . G C 320.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:7:348,0,7 +chr22 8932638 . C T 209.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.19;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:238,0,23 +chr22 9422535 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr22 9431472 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,361 +chr22 9447946 . T G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr22 9462860 . A G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=1.345;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=29.99;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:83:508,0,83 +chr22 9476879 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,303 +chr22 9476882 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,303 +chr22 9477021 . A G 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.679;DP=82;FS=11.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,53:82:99:1793,0,985 +chr22 9477071 . G A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-2.565;DP=52;FS=7.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:774,0,991 +chr22 9477233 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-2.115;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.24;ReadPosRankSum=3.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:384,0,212 +chr22 9837853 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr22 9983531 . T G 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-0.130;DP=51;FS=4.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:1196,0,574 +chr22 10002781 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:280,0,699 +chr22 10003225 . G A 214.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:243,0,22 +chr22 10009843 . T A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.604;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:328,0,435 +chr22 10022630 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:92:436,0,92 +chr22 10022729 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:267,0,217 +chr22 10037465 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,172 +chr22 10150407 . C G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:365,0,246 +chr22 10179101 . T A 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:436,30,0 +chr22 10182816 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:239,0,52 +chr22 10203680 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.382;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:502,0,882 +chr22 10203682 . A G 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.595;DP=34;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=23.40;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:824,0,509 +chr22 10203796 . A G 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-1.273;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:651,0,1204 +chr22 10203799 . A G 1708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-1.267;DP=53;FS=7.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=32.24;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,44:53:99:1737,0,150 +chr22 10234005 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.181;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:235,0,771 +chr22 10245990 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.019;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:495,0,624 +chr22 10258110 . GCCTTCAGAAACGAACAGACTTTATAGTCACCATCATGTGCACTTTAAAACTAGATGTTAACAAAATGCGAACAAACTTTGCGTTCA G 695.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.060;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:99:733,0,625 +chr22 10274485 . C A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=-0.069;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:471,0,963 +chr22 10300951 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=1.331;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,455 +chr22 10307129 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:455,0,429 +chr22 10315908 . AAGGTCAGATAGACACATTTATTCAAACATTTTTCTGATTAATGACATTTTAAACATGTTTTTTGTAATTTGCTTGTATTGGGTTGC A 15295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=345;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,345:345:99:15333,1447,0 +chr22 10322567 . T A 1344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-2.233;DP=186;FS=5.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,53:186:99:1373,0,5352 +chr22 10328691 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.093;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:510,0,763 +chr22 10370978 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=-0.495;DP=113;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=4.13;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,24:113:99:495,0,3494 +chr22 10371990 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.663;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,20:118:99:285,0,3970 +chr22 10372055 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.595;DP=109;FS=10.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:295,0,4841 +chr22 10372446 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.125;DP=78;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:385,0,2278 +chr22 10485835 . CAAAAATGGACCAATGATGACTTGTTTTTGTTGGAACGTCAATATTAATGAATTCATTGTGCTATAACACAAACCGACCTGT C 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.211;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:673,0,1233 +chr22 10591243 . GCCTGTAGAGTTAGAGTTAGCGTTAGGCTGTTCTGTTTTTTTAATCCGCAAGGGGTTGTTGGTTTACCTTA G 3617.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=2.851;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=29.30;ReadPosRankSum=-1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,92:96:99:3655,306,0 +chr22 10625705 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr22 10627537 . TCTGTGAATGTAAAGAAATCACAATTAAACTGACAGCAAATGTCGAGGCAGGTCAGCCAGGAGATGATATTAAAAAGTGCGAGCTAACTTAC T 2620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=2.138;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=31.14;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,63:68:99:2658,0,507 +chr22 10702234 . A C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=-1.111;DP=59;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:817,0,1231 +chr22 10704182 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.930;DP=52;FS=7.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:310,0,1544 +chr22 10707911 . T C 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-1.129;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:502,0,926 +chr22 10712794 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.106;DP=67;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.044;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:452,0,1913 +chr22 10736868 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.723;DP=120;FS=2.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:547,0,3645 +chr22 10739355 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.534;DP=103;FS=3.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,18:103:99:262,0,3503 +chr22 10747313 . T C 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.460;DP=142;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,40:142:99:953,0,3652 +chr22 10747787 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.636;DP=82;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:233,0,4452 +chr22 10766561 . C A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-0.838;DP=119;FS=10.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,19:119:99:247,0,3844 +chr22 10770972 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.639;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,26:135:99:414,0,4020 +chr22 10788878 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-1.225;DP=94;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:395,0,4004 +chr22 10801067 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.094;DP=38;FS=1.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:317,0,1010 +chr22 10811488 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.613;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:294,0,509 +chr22 10821258 . C G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.320;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:319,0,403 +chr22 10827422 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-3.049;DP=79;FS=4.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:234,0,2488 +chr22 10863050 . AAGGTGAGGGAGTTGCTTTATGAAATTAATTATGAATTTAAATGTTTCACATTATGATATTTAAATGAATTGTGGTAAATTTGACACTAGTGTTTCCTATTTTC A 15396.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=1.256;DP=361;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=27.95;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,357:360:99:15434,1219,0 +chr22 10865579 . G C 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-1.210;DP=359;FS=1.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,81:359:99:1576,0,10925 +chr22 10866016 . T C 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-0.497;DP=246;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,52:246:99:973,0,7554 +chr22 10880632 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.844;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=12.78;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,574 +chr22 10880647 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=1.256;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=22.46;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:410,0,197 +chr22 10881448 . CA C 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.743;DP=190;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,40:183:99:476,0,3845 +chr22 10881981 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-2.184;DP=135;FS=5.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,28:135:99:522,0,4191 +chr22 10882264 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=-0.193;DP=180;FS=3.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,31:174:99:486,0,5527 +chr22 10894992 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.702;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:458,0,3636 +chr22 10904720 . G C 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=1.289;DP=108;FS=5.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:761,0,2869 +chr22 10904857 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-0.729;DP=109;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,22:109:99:396,0,3577 +chr22 10976048 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=1.648;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=10.62;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,459 +chr22 11033430 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=1.271;DP=89;FS=0.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=6.17;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:577,0,2531 +chr22 11033945 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.257;DP=77;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:540,0,2198 +chr22 11034849 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.526;DP=91;FS=4.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,27:91:99:708,0,2321 +chr22 11035007 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-0.259;DP=77;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:391,0,2289 +chr22 11035983 . A T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.945;DP=69;FS=2.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:574,0,1860 +chr22 11036695 . T TCC 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.917;DP=49;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:264,0,1487 +chr22 11037016 . A G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.889;DP=37;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:405,0,960 +chr22 11045862 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.463;DP=123;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:311,0,3700 +chr22 11050596 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.365;DP=114;FS=8.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,19:113:99:257,0,3568 +chr22 11063663 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=1.752;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:302,0,1578 +chr22 11114678 . G T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-1.064;DP=91;FS=3.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=5.63;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:541,0,2535 +chr22 11182076 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.731;DP=74;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:537,0,2012 +chr22 11182088 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.109;DP=77;FS=3.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:512,0,2129 +chr22 11233771 . A T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.521;DP=125;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,27:124:99:584,0,7437 +chr22 11234012 . C CA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-2.686;DP=182;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,41:150:99:393,0,2405 +chr22 11552912 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.428;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=2.93;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,26:141:99:441,0,8826 +chr22 11552913 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.682;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,24:135:99:434,0,8826 +chr22 11615605 . CACCTGCACACACACACACACGTACTGACATTATAACATCTGCATCCTTATCAACATCAACGCCATCATAAAGTGTGAGTTTT C 1347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=1.593;DP=38;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=31.97;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:99:1385,0,394 +chr22 11631396 . CACAGGTAACCAGCAAATATAAGTCTGTTTTAAGTCTAAACTGATGGACTGCGCTGAACTTTCTTCCTGATCA C 1080.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-2.125;DP=37;FS=13.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.672;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,31:34:3:1116,0,3 +chr22 11708309 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.855;DP=66;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:398,0,4450 +chr22 11708315 . G T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.209;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:395,0,4450 +chr22 11709269 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.592;DP=96;FS=4.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:547,0,2841 +chr22 11755052 . GCTGTTAAAGAGACAGTCGTCATTAAACATTTAGAGGACAGCATCAGATTATTAATGATTGATTAAGCATCAAAGCATTTTATTGATTAC G 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:449,0,693 +chr22 11829732 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.590;DP=32;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:291,0,849 +chr22 11868932 . CGTAAGTATTTTTGCAAACTTTACAAACACCAAAATAGAATTTATAAATATTACACATAAATTAACTTACTTTTTTTTCCCTCTCCAG C 15984.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=2.271;DP=391;FS=4.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=34.78;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,378:388:99:16017,0,1927 +chr22 11889204 . C T 1736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-4.616;DP=131;FS=69.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,49:131:99:1765,0,2903 +chr22 11983421 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-1.498;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:244,0,1041 +chr22 11983438 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-1.717;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,1109 +chr22 12199921 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.402;DP=53;FS=6.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:348,0,1546 +chr22 12578809 . AT A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.517;DP=94;FS=7.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:283,0,1877 +chr22 12919173 . AGTAAGTCCTAAAGCATAAAATATCTGAATATGTGTTAATGAAATATTGTCAGAGTTTTTCTGATTGATGTCTAACAGGAGAACTCTGTCTAACTGGTTGATTTTGAGTCTAG A 2526.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=1.095;DP=83;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=30.44;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,70:82:99:2564,0,3910 +chr22 12952671 . GAGGTTAGAAAATCCTTTAAAAGAACCAAATTTAAAATAATTCCCACCAAATCATAAACTTTAGATTTGTTATTTTCTCTTTCTTTCTTC G 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-0.133;DP=28;FS=4.607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:99:1189,108,0 +chr22 12960686 . A ATGAGGATCCACAGATT 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=1.547;DP=40;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:618,0,672 +chr22 12960688 . G GCTCC 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:618,0,672 +chr22 13118879 . C CAA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,178 +chr22 13185731 . C CA 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.268;DP=53;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:645,0,408 +chr22 13185911 . C CT 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.843;DP=56;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:482,0,653 +chr22 13187116 . G T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-1.861;DP=64;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:1003,0,1236 +chr22 13241073 . T C 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 +chr22 13695104 . G A 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr22 13855694 . C CA 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.982;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:256,0,815 +chr22 13855752 . G C 1089.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1118,78,0 +chr22 13855861 . A G 745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:774,54,0 +chr22 13856399 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.595;DP=108;FS=2.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=1.96;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:240,0,3662 +chr22 13857577 . C A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.437;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=24.95;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:602,0,186 +chr22 13859527 . G C 3513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.887;DP=93;FS=1.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.728;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,80:85:99:3542,215,0 +chr22 13859550 . GACCTGAAAAATATAACCAACTGAAATCAGTTGAAATGTATTTGGTCTTGTGATGATGACACAAAAATAAATTATTTTTCACAAAGGATGTGCTGTT G 1391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=-0.263;DP=139;FS=17.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.01;ReadPosRankSum=-5.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:1429,0,11049 +chr22 13859569 . ACTGAAATCAGTTGAAATGTATTTGGTCTTGTGATGATGACACAAAAATAAATTATTTTTCACAAAGGATGTGCTGTTAC A 1520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=2.502;DP=125;FS=16.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=12.17;ReadPosRankSum=-2.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:1558,0,4735 +chr22 13859796 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.673;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:424,0,617 +chr22 13860167 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=2.312;DP=188;FS=7.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,32:162:99:522,0,5262 +chr22 14062607 . A T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.483;DP=69;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:685,0,3856 +chr22 14062616 . T G 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.439;DP=73;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,22:73:99:690,0,3856 +chr22 14064033 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.415;DP=69;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:284,0,2121 +chr22 14084278 . G T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-1.145;DP=95;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:776,0,4183 +chr22 14084279 . T G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-1.782;DP=95;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:776,0,4183 +chr22 14087369 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-0.921;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:296,0,920 +chr22 14121881 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,223 +chr22 14148313 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=10;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:57:274,0,57 +chr22 14231968 . AACCTGCAAAAACACATATTTACAAACTGCATGGTGACTGATTTTCCAAAAAAATGTTAGTTTTATGGATAAAAAATGTCAGGTATTTTTCAGGTATATTATTCAGAAACAGTTGGCTTTACAACTCGCTGACATAAAAATCATACGT A 2607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=2.654;DP=88;FS=2.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=29.63;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,70:81:99:2645,0,2376 +chr22 14232985 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=1.317;DP=65;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:295,0,2500 +chr22 14232997 . CAATCTAGTTTGAAGATTAGGATGAATGTAATTTTAATGTTCATTTAACGT C 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.582;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:686,0,2334 +chr22 14233000 . TCTAGTTTGAAGATTAGGATGAATGTAATTTTAATGTTCATTTAACGTTATTTGGATGCAATGTTTGGCATTAAGTCTCAATGCAC T 1573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.011;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=20.71;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,47:74:99:1611,0,1066 +chr22 14233050 . TTTGGATGCAATGTTTGGCATTAAGTCTCAATGCAC T 644.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.905;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.939;QD=8.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:682,0,2334 +chr22 14235409 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.292;DP=71;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:482,0,2033 +chr22 14236096 . A G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.045;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,32:106:99:755,0,2633 +chr22 14236751 . A T 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-2.188;DP=128;FS=3.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,46:128:99:1544,0,2828 +chr22 14238509 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.880;DP=338;FS=5.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,59:338:99:694,0,10477 +chr22 14242603 . A C 3730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=3.479;DP=279;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=13.37;ReadPosRankSum=-3.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,109:279:99:3759,0,6023 +chr22 14242645 . C T 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=2.925;DP=255;FS=18.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,65:255:99:1513,0,7394 +chr22 14250566 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-4.598;DP=65;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:511,0,1733 +chr22 14252739 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.220;DP=73;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:333,0,2279 +chr22 14252771 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.817;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:465,0,2088 +chr22 14268613 . TGTACGTTTTACTTAAGTAGTTTAAAAACACTAATAGCTTAAAAACTTGACTGTTTTTATTGACTCTGGAGGTTTAATTGATTTCTTTCTCTCCACAG T 12900.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.461;DP=319;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=30.53;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,311:315:99:12938,954,0 +chr22 14269396 . GGGTAAGTTTTTAATCACATCCCCTCAGATTTTGTAAAAATGGATTTGATAGTTAAAGTTTCCATGTGTTATCTTTCA G 10373.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.165;DP=283;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=34.44;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,256:263:99:10411,390,0 +chr22 14270143 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.358;DP=24;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:312,0,555 +chr22 14290006 . A T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=-1.077;DP=45;FS=4.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:500,0,912 +chr22 14377843 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.663;DP=41;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:510,0,875 +chr22 14400004 . C A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.043;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:349,0,647 +chr22 14404733 . A G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.307;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:463,0,882 +chr22 14406470 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.267;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:321,0,986 +chr22 14910440 . C CA 246.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:284,27,0 +chr22 15490947 . T A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=1.734;DP=38;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:433,0,861 +chr22 15774639 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.127;DP=112;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,26:112:99:447,0,2945 +chr22 16055104 . CACACACACAT C 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=2.404;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:316,0,258 +chr22 16166871 . TA T 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.216;DP=30;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:399,0,293 +chr22 16174053 . CT C 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.128;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:699,0,133 +chr22 16243981 . C T 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.886;DP=33;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=23.48;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:803,0,1167 +chr22 16243991 . G T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=1.523;DP=38;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:807,0,1167 +chr22 16245044 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.051;DP=60;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:348,0,3751 +chr22 16245049 . C G 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-0.999;DP=64;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:351,0,3751 +chr22 16251198 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.894;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:68:696,0,68 +chr22 16251213 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.98;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:350,0,161 +chr22 16336389 . C A 647.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=34.09;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:23:676,0,23 +chr22 16338351 . T A 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=0.770;DP=77;FS=7.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=16.33;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:1286,0,1356 +chr22 16338545 . T G 3149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-1.286;DP=124;FS=4.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,85:124:99:3178,0,988 +chr22 16338619 . CTT C 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=1.015;DP=89;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1316,0,876 +chr22 16339039 . A G 4402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.097;DP=167;FS=6.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,119:167:99:4431,0,1184 +chr22 16407722 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.504;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,559 +chr22 16502473 . TCTGTTTTTAACAACAACAAAAATTAGCTTTCAGTTTTAACAATTACAATCAAATCCAATTAAAATAAAACAAAAATCCTCTTTAAATAC T 8278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.780;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,179:181:99:8316,748,0 +chr22 16524530 . TTTGAATGAGCTTCTAGGGGTTTAGTAATTTTCTCTTGTGCAATTATAATTAACAGGTAAAC T 1137.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=3.336;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1175,0,1637 +chr22 16524948 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-3.226;DP=49;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=14.93;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:760,0,878 +chr22 16525426 . GAGGTTATGCCATTCTCAATATGTACTGTGTGCAAAGCTGCTAACAGAAATGTTATTATTAAATCATTGCATAAATAAAATGTAGCTAAAATTAAAATCTTAAGAGAATTAATGACCATCTCTTGTGTTATATGTCCATTGC G 1274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.257;DP=63;FS=9.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,36:63:99:1312,0,7448 +chr22 16564934 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:368,0,420 +chr22 16695756 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.021;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:352,0,357 +chr22 16707564 . T TA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.356;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.748;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:352,0,560 +chr22 16759826 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.610;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:391,0,488 +chr22 16766158 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=1.414;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:344,0,526 +chr22 16819595 . G A 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.069;DP=34;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:592,0,595 +chr22 17058783 . G GA 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.639;DP=52;FS=2.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:401,0,661 +chr22 17060419 . A G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.926;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:483,0,746 +chr22 17342813 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:243,0,296 +chr22 17409598 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.629;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=13.41;ReadPosRankSum=2.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:444,0,667 +chr22 17750263 . AT A 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.348;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:421,0,484 +chr22 17755146 . AT A 2300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.576;DP=217;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,72:216:99:2338,0,3586 +chr22 17759549 . C CG 496.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.349;DP=676;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:29:534,0,29 +chr22 17764897 . TGGTGAGATGTCTTTCCAGTCCTACTAAACCCAGACTTCTATTCTGTCAACATTTGTAATGTATTTTCTGTGTGTTTTTCCGTCCA T 17803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=3.218;DP=414;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=27.85;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,406:413:99:17841,1399,0 +chr22 17813988 . CACCTGAAATTATATTTAAAGACAGTTACTTACATGATGATATAGTTCATGACTTTAAACAGATGTAGATATAATTAAAGATGAGAAGAGAATGAGAAGCGT C 6943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=1.928;DP=424;FS=0.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,229:407:99:6981,0,9225 +chr22 17813990 . CCT C 6472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=-1.505;DP=409;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,171:403:99:6510,0,9034 +chr22 17815799 . G A 6133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;ClippingRankSum=-0.428;DP=427;FS=8.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,174:427:99:6162,0,8437 +chr22 17921319 . AGTTAAAAGTACCACACCACCAGAAGAAGCTCTGCTTACCCAG A 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=1.276;DP=107;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,32:107:99:816,0,4649 +chr22 18087541 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,173 +chr22 18087838 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:480,0,136 +chr22 18457313 . AG A 756.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-0.456;DP=43;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:794,0,1573 +chr22 18766258 . CCCTGAGAAAAAAACAAAAAAAAACAAACACTATTTAGTACCACATTGGCCATAAGTTTCATAAAGACTACACTAAATACATA C 15398.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.953;ClippingRankSum=4.513;DP=374;FS=4.494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,341:374:99:15436,1338,0 +chr22 19322296 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.610;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=30.96;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1081,0,111 +chr22 19322354 . A C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-0.890;DP=30;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:81:951,0,81 +chr22 19964009 . T A 1590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.116;DP=224;FS=6.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,65:224:99:1619,0,9835 +chr22 20306603 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=2.198;DP=31;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:232,0,785 +chr22 20455072 . A G 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.277;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=14.84;ReadPosRankSum=-2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:711,0,926 +chr22 20455107 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-2.290;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=14.44;ReadPosRankSum=2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:577,0,655 +chr22 20460018 . GCAGGTATAAAAGTAGCATTAAAACTCCTGCTCATTGATCTTTTAATGCCAATGGTATTTGATGCCAATCTCTAATTGTACCACATTTGTTATCTGCCTA G 1514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.168;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,40:49:99:1552,0,1135 +chr22 20464753 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:304,0,94 +chr22 20469951 . C T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:436,33,0 +chr22 20470520 . G T 1044.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=1.076;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=33.47;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:42:1073,42,0 +chr22 20477793 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.601;DP=57;FS=5.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:549,0,1438 +chr22 20477944 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-1.871;DP=57;FS=2.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:549,0,1471 +chr22 20478031 . A T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.584;DP=63;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:767,0,1407 +chr22 20478393 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=1.126;DP=77;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:652,0,1878 +chr22 20480169 . G T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.621;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,32:67:99:1110,0,1138 +chr22 20482616 . G C 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.627;DP=79;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.304;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:1226,0,1472 +chr22 20482730 . G A 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=1.343;DP=80;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:881,0,1694 +chr22 20494926 . C T 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.199;DP=131;FS=8.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,43:131:99:1204,0,3409 +chr22 20513872 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,264 +chr22 20560165 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=1.202;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:427,0,319 +chr22 20560791 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.676;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:429,0,202 +chr22 20562346 . T G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:307,0,420 +chr22 20610972 . TAA T 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.320;DP=177;FS=2.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,34:177:99:664,0,8335 +chr22 20611393 . C CT 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.114;DP=78;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:705,0,651 +chr22 20611491 . G T 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.379;DP=103;FS=2.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:1641,0,3704 +chr22 20611601 . T C 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.358;DP=124;FS=9.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,36:120:99:1056,0,7131 +chr22 20622157 . T G 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.099;DP=367;FS=0.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:299,68:367:99:1020,0,11618 +chr22 20632575 . TA T 11302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-3.228;DP=131;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=28.14;ReadPosRankSum=-3.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,15:97:99:11340,0,2127 +chr22 20632676 . C CA 4467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-0.550;DP=168;FS=17.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.165;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,131:157:99:4505,0,4277 +chr22 20638259 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.301;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:393,0,702 +chr22 20640006 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,361 +chr22 20646140 . C T 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.188;DP=257;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=7.74;ReadPosRankSum=2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,79:256:99:2018,0,6632 +chr22 20660573 . T TA 813.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.414;DP=218;FS=5.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,59:209:99:851,0,4067 +chr22 20660664 . G T 3247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=-0.271;DP=254;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,97:254:99:3276,0,5387 +chr22 20726880 . T G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.418;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:308,0,1031 +chr22 20727119 . C CA 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.813;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:277,0,1403 +chr22 20727451 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-0.725;DP=108;FS=7.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:520,0,3331 +chr22 20727679 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-1.421;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:325,0,2479 +chr22 20728854 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=1.297;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:468,0,1580 +chr22 20729034 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.660;DP=126;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,28:126:99:384,0,5214 +chr22 20734020 . GCTTCAAAAAAACAAAACAATAAAAACACCACAGTCAGCAACAGCGCAAGCATCTAAACACAAATGTGAATAATCAACACATCTTCATAC G 6298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.067;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=28.81;ReadPosRankSum=-1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,147:150:99:6336,538,0 +chr22 20738108 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=-1.085;DP=164;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,35:163:99:589,0,4773 +chr22 20782600 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.557;DP=50;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:267,0,1419 +chr22 20794592 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-1.740;DP=43;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:258,0,1227 +chr22 20798048 . AC A 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-0.896;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:431,0,212 +chr22 20798050 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.664;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:431,0,212 +chr22 21098502 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-1.468;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:239,0,1416 +chr22 21099359 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.639;DP=51;FS=2.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:261,0,2808 +chr22 21099360 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.349;ClippingRankSum=-1.148;DP=51;FS=2.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:261,0,2808 +chr22 21099683 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.205;DP=63;FS=5.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:454,0,1790 +chr22 21101298 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-2.349;DP=36;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:278,0,1013 +chr22 21103402 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.410;DP=61;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:320,0,1625 +chr22 21109425 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.538;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:347,0,2100 +chr22 21112448 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.326;DP=66;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:461,0,1634 +chr22 21112499 . G T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=2.172;DP=62;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:624,0,1339 +chr22 21271865 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.960;DP=73;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:267,0,2697 +chr22 21272250 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.088;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:310,0,1321 +chr22 21272277 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=-0.647;DP=45;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:262,0,1354 +chr22 21280268 . ACTGCAGAAACACACAGCCTTTTAGTTCCATACCAAAAAAAAGTATATTACCAGGAGGACTGTAAAAAGTAATCGAATTAC A 12333.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=1.380;DP=272;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,269:272:99:12371,955,0 +chr22 21280391 . G A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.519;DP=227;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,61:227:99:1406,0,6198 +chr22 21282236 . CCCTGCGAGATGAGCATGAAAATGATTACTCACAAAGCACAGAGCGAGACGGTCAGATATAATCTTGATCGTGACACTCA C 13937.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.461;DP=327;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,325:327:99:13975,1090,0 +chr22 21285199 . T C 2163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=1.219;DP=486;FS=6.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:371,113:484:99:2192,0,13333 +chr22 21465621 . G A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-1.029;DP=194;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,58:194:99:1477,0,5140 +chr22 21472169 . C CT 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-1.655;DP=150;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,45:140:99:758,0,2568 +chr22 21477216 . AGTGAGATTTTGACCGCACACTGACACCTGTTTTGGAAGAGTAACTTTTTACATGCAGCTTTACTGTTTTCTAG A 619.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=2.627;DP=21;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.292;QD=29.51;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:657,0,129 +chr22 21495273 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.242;DP=40;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:268,0,1077 +chr22 21589510 . T G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.466;DP=46;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:380,0,1130 +chr22 21593881 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=1.017;DP=53;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:398,0,1470 +chr22 21600218 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.784;DP=68;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:293,0,3560 +chr22 21614368 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.951;DP=58;FS=2.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:284,0,1734 +chr22 21625604 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.031;DP=25;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:232,0,640 +chr22 21625765 . T A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:283,0,406 +chr22 21636525 . G T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-2.708;DP=67;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=13.27;ReadPosRankSum=2.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:917,0,1401 +chr22 21674441 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,371 +chr22 21686668 . CACCTAAATGGGAGACTTCTCAAAGTAAAATACAGCTTGTTTTTCAGACGTGAGGTTTTAACAAGAAGGACAGCACACAG C 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.19;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:291,0,555 +chr22 21721128 . C G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.124;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=5.02;ReadPosRankSum=2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:395,0,2126 +chr22 21721622 . C T 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=2.215;DP=86;FS=6.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:711,0,2271 +chr22 21740758 . C T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-1.064;DP=95;FS=11.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:602,0,2557 +chr22 21866643 . C G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.391;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:512,0,561 +chr22 21866920 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.890;DP=28;FS=10.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:232,0,754 +chr22 21867087 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:249,0,379 +chr22 21976893 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.830;DP=26;FS=9.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:384,0,511 +chr22 21977503 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-0.036;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,43:191:99:859,0,5392 +chr22 21983256 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.975;ClippingRankSum=5.692;DP=91;FS=8.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=4.22;ReadPosRankSum=-5.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,14:91:99:412,0,2934 +chr22 21983385 . A G 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.144;DP=124;FS=11.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,35:124:99:831,0,3359 +chr22 21989189 . T TTA 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-1.329;DP=122;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,29:114:99:344,0,3693 +chr22 21997667 . A G 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:544,42,0 +chr22 22114165 . GT G 417.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.397;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:19:455,0,19 +chr22 22390770 . A T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.391;DP=41;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.85;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:514,0,854 +chr22 22578301 . G A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-0.445;DP=119;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=7.65;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,37:119:99:939,0,3113 +chr22 22597331 . TA T 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.505;DP=16;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:42:317,0,42 +chr22 22638224 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.14;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,638 +chr22 22672622 . CGGTAAGCAGATCCTTGTTTTGAGGGGAGGAATGTTAGCGTTTTCACTTCTGATTGAATGGGTTTTGTCTTTTCA C 8722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=3.113;DP=219;FS=1.158;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=30.79;ReadPosRankSum=-1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,208:219:99:8760,726,0 +chr22 22838745 . GGGTAAAGTATTTTACATTGCCGTATTCATACACCAAACCCTTCACAGTTACAGCAAATATGACATTAGTTCACTTTATTGATGTACATTACA G 2117.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=1.136;DP=58;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=29.82;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,52:58:99:2155,0,553 +chr22 23262764 . T TA 211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:249,20,0 +chr22 23262803 . A G 1124.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-1.255;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=25.37;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1153,84,0 +chr22 23418756 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.445;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,25:124:99:358,0,4502 +chr22 23418870 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.086;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:332,0,2069 +chr22 23731739 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.070;DP=65;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:350,0,1798 +chr22 23741043 . C G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.099;DP=63;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:451,0,1672 +chr22 23741357 . C G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.864;DP=38;FS=11.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:341,0,907 +chr22 24151066 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=1.983;DP=46;FS=8.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:239,0,1395 +chr22 24151782 . A T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-1.789;DP=79;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=9.19;ReadPosRankSum=3.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:754,0,1953 +chr22 24152774 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;ClippingRankSum=-4.687;DP=73;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:278,0,2201 +chr22 24161349 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-2.182;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:393,0,1540 +chr22 24194390 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:290,0,233 +chr22 24194511 . A C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,129 +chr22 24231332 . G A 1778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.796;DP=277;FS=11.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,74:276:99:1807,0,7741 +chr22 24234396 . A C 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.538;DP=201;FS=20.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,53:201:99:1228,0,8262 +chr22 24243277 . A T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.569;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,40:203:99:672,0,6526 +chr22 24243294 . A G 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.393;DP=208;FS=5.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,40:208:99:634,0,6570 +chr22 24274352 . G T 1672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-1.441;DP=352;FS=0.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,81:351:99:1701,0,10331 +chr22 24274657 . C T 4324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.881;DP=499;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,162:499:99:4353,0,13008 +chr22 24278157 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=-0.743;DP=28;FS=5.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:317,0,655 +chr22 24278466 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:282,0,377 +chr22 24281407 . A T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=1.390;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,58:299:99:927,0,9345 +chr22 24282330 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=5.067;DP=364;FS=38.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=0.94;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,51:364:99:369,0,12229 +chr22 24288504 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=2.134;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:304,0,807 +chr22 24292958 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.403;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:429,0,769 +chr22 24292981 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.567;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:366,0,656 +chr22 24303362 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,485 +chr22 24303545 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:242,0,421 +chr22 24303707 . A T 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 +chr22 24316844 . G C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.540;DP=68;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:355,0,2039 +chr22 24316955 . T G 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.588;DP=83;FS=4.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,27:83:99:734,0,2134 +chr22 24329406 . T A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.970;DP=134;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,25:133:99:346,0,4783 +chr22 24330677 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=1.540;DP=94;FS=3.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,16:92:99:240,0,2981 +chr22 24332186 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=-0.161;DP=112;FS=9.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:546,0,3370 +chr22 24332789 . C T 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.822;DP=134;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,38:134:99:933,0,3674 +chr22 24332999 . C T 1322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.506;DP=101;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:1351,0,2155 +chr22 24333404 . T C 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-0.628;DP=120;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,39:120:99:940,0,4214 +chr22 24334988 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.318;DP=103;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,22:103:99:445,0,3235 +chr22 24343039 . C A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-0.416;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,27:119:99:583,0,3503 +chr22 24343249 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=-0.300;DP=122;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,31:122:99:671,0,3492 +chr22 24346360 . A G 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.252;DP=78;FS=3.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:861,0,1787 +chr22 24348996 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-1.092;DP=111;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:747,0,3057 +chr22 24349556 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.629;DP=83;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:326,0,2500 +chr22 24352193 . C T 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.744;DP=103;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:1218,0,2326 +chr22 24352329 . G A 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.350;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:592,0,1251 +chr22 24373297 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.032;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,422 +chr22 24383883 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.991;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:297,0,517 +chr22 24386856 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-1.837;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:316,0,368 +chr22 24387024 . A C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.965;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:284,0,212 +chr22 24406493 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:312,0,98 +chr22 24832748 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-1.490;DP=40;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:309,0,1079 +chr22 24954938 . G T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=1.250;DP=95;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.158;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,27:95:99:693,0,2619 +chr22 24969598 . C CT 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-1.448;DP=27;FS=6.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:278,0,261 +chr22 24970610 . C CT 448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.042;DP=61;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:486,0,848 +chr22 24970786 . GA G 1027.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.778;ClippingRankSum=1.143;DP=168;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,54:157:99:1065,0,2200 +chr22 24971129 . AG A 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=1.424;DP=44;FS=4.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:513,0,539 +chr22 24971185 . G A 1945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-1.685;DP=108;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1974,0,1814 +chr22 25196553 . AGTGAGTAGAGGCATGATTTCACCCGTAAGTCCACTCAGAGCAAGAGAATGAGAAGTTTATGTTTACAG A 1130.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.605;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=30.82;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:54:1158,54,0 +chr22 25505327 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:488,0,708 +chr22 25562135 . C T 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-5.259;DP=95;FS=35.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:888,0,2561 +chr22 25567456 . G A 3075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=2.262;DP=217;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,90:216:99:3104,0,4367 +chr22 25581463 . G A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=2.375;DP=192;FS=10.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,35:192:99:716,0,13191 +chr22 25581578 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr22 25582088 . A G 14012.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=1.261;DP=236;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=35.33;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,227:228:99:14041,997,0 +chr22 25582132 . CT C 8693.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.340;DP=234;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.71;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,218:219:99:8731,658,0 +chr22 25609352 . C T 755.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:784,57,0 +chr22 25881189 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:288,21,0 +chr22 25881411 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.238;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:441,0,367 +chr22 25881424 . G C 786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:57:815,57,0 +chr22 25882367 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=-1.060;DP=39;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:419,0,849 +chr22 25882374 . T A 1350.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1379,99,0 +chr22 26046962 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=1.828;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:245,0,515 +chr22 26067419 . C G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.956;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:402,0,387 +chr22 26155264 . T G 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 +chr22 26155293 . G C 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 +chr22 26155313 . T G 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 +chr22 26155439 . G A 995.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1024,75,0 +chr22 26155453 . G C 908.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:937,66,0 +chr22 26155674 . G A 1197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1226,87,0 +chr22 26155726 . G A 1096.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1125,84,0 +chr22 26392553 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.171;DP=67;FS=2.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:516,0,1823 +chr22 26392583 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.476;DP=76;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:548,0,2132 +chr22 26393537 . T A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-0.297;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:502,0,1815 +chr22 26393643 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.006;DP=75;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:556,0,2112 +chr22 26393786 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.624;DP=58;FS=2.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.01;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:261,0,1764 +chr22 26394237 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-2.062;DP=88;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=7.45;ReadPosRankSum=2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:684,0,2430 +chr22 26395015 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.683;DP=77;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:969,0,1741 +chr22 26395177 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-2.017;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:429,0,2702 +chr22 26489078 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,296 +chr22 26518048 . G C 834.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:863,60,0 +chr22 26518148 . A G 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 +chr22 26685909 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.329;DP=65;FS=12.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:527,0,1779 +chr22 26721137 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,376 +chr22 26722045 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=29.64;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:398,0,161 +chr22 26722051 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=28.44;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:398,0,161 +chr22 26725826 . A C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.113;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:364,0,522 +chr22 26738065 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:393,0,620 +chr22 26738067 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=18.24;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:393,0,620 +chr22 26788569 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.129;DP=44;FS=4.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:329,0,1144 +chr22 26812288 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.336;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:261,0,965 +chr22 26836002 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=-1.347;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.20;ReadPosRankSum=2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:409,0,745 +chr22 26855893 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:269,0,526 +chr22 26868601 . TA T 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-1.844;DP=70;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.227;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:686,0,664 +chr22 26871859 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=1.378;DP=47;FS=14.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=5.59;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:291,0,1389 +chr22 26880677 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-0.938;DP=70;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:449,0,1947 +chr22 26889890 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=-1.287;DP=45;FS=9.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:401,0,2959 +chr22 26889893 . G T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=-1.183;DP=44;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:401,0,2959 +chr22 26889990 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.152;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:384,0,1670 +chr22 26890025 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.459;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:260,0,1685 +chr22 26903054 . T C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.930;DP=70;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:533,0,1944 +chr22 26903646 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-0.424;DP=51;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.19;ReadPosRankSum=2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:599,0,1141 +chr22 26914940 . C G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.285;DP=50;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:878,0,825 +chr22 26923764 . C T 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=1.841;DP=203;FS=3.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=6.89;ReadPosRankSum=4.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,57:203:99:1426,0,5573 +chr22 26925912 . C T 1380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-0.681;DP=209;FS=4.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,58:209:99:1409,0,5623 +chr22 26933069 . T A 1281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.391;DP=268;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,62:265:99:1310,0,7854 +chr22 26937775 . T A 2206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=1.603;DP=196;FS=10.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,67:196:99:2235,0,4628 +chr22 26940639 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,457 +chr22 27063891 . T C 3274.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3303,246,0 +chr22 27078661 . G A 3845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3874,285,0 +chr22 27091311 . C G 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:715,51,0 +chr22 27178728 . C A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.156;DP=48;FS=2.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:519,0,2672 +chr22 27200574 . G A 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-2.789;DP=178;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,55:178:99:1389,0,4614 +chr22 27208430 . G A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=2.723;DP=123;FS=1.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=6.48;ReadPosRankSum=-2.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,38:123:99:825,0,2996 +chr22 27226053 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=1.458;DP=57;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:256,0,1685 +chr22 27254634 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.176;DP=44;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:735,0,739 +chr22 27254815 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.796;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:243,0,889 +chr22 27255326 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.283;DP=27;FS=8.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:238,0,681 +chr22 27256405 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:240,0,325 +chr22 27257299 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:418,0,517 +chr22 27322869 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-2.030;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:515,0,934 +chr22 27324201 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=-2.164;DP=28;FS=6.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:252,0,783 +chr22 27326474 . T G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.481;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:329,0,1102 +chr22 27361316 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-0.700;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:339,0,1637 +chr22 27361359 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-2.260;DP=61;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=6.11;ReadPosRankSum=1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:401,0,1643 +chr22 27361575 . G A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.385;DP=74;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:933,0,1577 +chr22 27381981 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.871;DP=67;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:265,0,2001 +chr22 27393576 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:346,0,267 +chr22 27396275 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-1.109;DP=66;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:601,0,1558 +chr22 27398709 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.901;DP=71;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:589,0,1850 +chr22 27398742 . T A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.072;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:443,0,2058 +chr22 27398922 . C T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=-0.872;DP=74;FS=6.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:626,0,1836 +chr22 27408074 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=-1.253;DP=59;FS=12.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:263,0,1748 +chr22 27409687 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.761;DP=71;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:366,0,2028 +chr22 27410512 . T C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.484;DP=57;FS=7.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:731,0,1154 +chr22 27410977 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=2.450;DP=88;FS=4.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=7.99;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:731,0,2172 +chr22 27461532 . C CT 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-1.283;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:429,0,773 +chr22 27461551 . C A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.283;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:560,0,985 +chr22 27461818 . T C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-1.034;DP=30;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:272,0,790 +chr22 27461964 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.960;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:240,0,1567 +chr22 27474146 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-1.622;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:284,0,1259 +chr22 27480118 . T C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.073;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:530,0,445 +chr22 27480169 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:345,0,376 +chr22 27483154 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=1.234;DP=55;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:326,0,1594 +chr22 27552277 . T G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=2.192;DP=54;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:624,0,1253 +chr22 27553508 . A T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=1.127;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:456,0,1331 +chr22 27553924 . TGC T 832.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.687;DP=69;FS=2.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:870,0,1776 +chr22 27554061 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=-0.297;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,14:77:99:250,0,3265 +chr22 27804224 . G C 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 +chr22 27804567 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:265,18,0 +chr22 27804572 . A G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr22 27804725 . G C 846.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:875,63,0 +chr22 27804835 . G A 928.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:957,69,0 +chr22 27805014 . TA T 272.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:310,27,0 +chr22 27805082 . A G 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr22 27805096 . T G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr22 27805158 . A G 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr22 27806045 . A C 557.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:586,42,0 +chr22 27806104 . T TG 343.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:381,36,0 +chr22 27806380 . T G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:521,39,0 +chr22 27806464 . AGG A 503.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:541,37,0 +chr22 27806920 . G A 408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:437,30,0 +chr22 28094449 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr22 28444980 . T G 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:244,0,25 +chr22 28444997 . T A 210.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:239,0,25 +chr22 28725288 . G C 331.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=27.59;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:359,0,12 +chr22 28725306 . A G 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 +chr22 29191005 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,159 +chr22 29934673 . AT A 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.967;DP=46;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:244,0,861 +chr22 30096607 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.037;DP=64;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:454,0,1688 +chr22 30130434 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.821;ClippingRankSum=-0.701;DP=37;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=6.89;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:283,0,948 +chr22 30190452 . C T 2099.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.90;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:99:2128,154,0 +chr22 30190479 . A G 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:57:507,57,0 +chr22 30190741 . G GT 1170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=1.050;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,54:59:61:1362,61,0 +chr22 30191172 . GT G 563.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:601,49,0 +chr22 30191322 . T A 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.920;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1144,0,1541 +chr22 30191324 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-1.627;DP=63;FS=8.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:336,0,3213 +chr22 30191380 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.410;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:236,0,3919 +chr22 30191882 . T A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr22 30191892 . C A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr22 30192303 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.709;DP=51;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:320,0,909 +chr22 30192304 . A C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=1.102;DP=55;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:320,0,909 +chr22 30192898 . A T 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 +chr22 30192972 . G GT 461.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=11.139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=29.93;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:3:497,3,0 +chr22 30192979 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.386;DP=30;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:469,0,434 +chr22 30193101 . T TA 1763.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.056;DP=62;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.45;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,44:48:99:1801,0,99 +chr22 30193102 . T A 1903.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.563;DP=63;FS=2.585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=30.22;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,46:49:22:1932,22,0 +chr22 30193222 . G T 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 +chr22 30193449 . A G 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:678,48,0 +chr22 30194107 . T C 3093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.691;DP=64;FS=11.946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=28.54;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:3122,232,0 +chr22 30194172 . T A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=2.885;DP=97;FS=52.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=14.20;ReadPosRankSum=-3.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1406,0,1095 +chr22 30194175 . G GT 679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-3.174;DP=100;FS=46.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=6.80;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:717,0,1011 +chr22 30194514 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=1.156;DP=111;FS=34.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,25:99:99:571,0,5367 +chr22 30194518 . C CA 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=1.724;DP=110;FS=22.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,29:98:99:582,0,2156 +chr22 30194623 . T A 5563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:99:5592,389,0 +chr22 30194632 . C T 5563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:5592,389,0 +chr22 30194679 . G T 1315.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:94:1344,94,0 +chr22 30194754 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-1.699;DP=107;FS=6.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:915,0,1914 +chr22 30194945 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.235;DP=66;FS=5.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:396,0,2013 +chr22 30195034 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-1.874;DP=163;FS=8.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,29:148:99:293,0,8111 +chr22 30195154 . C T 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=1.262;DP=60;FS=31.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=27.81;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,10:53:99:1697,0,1601 +chr22 30195173 . A T 3620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=6.005;DP=89;FS=52.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=28.47;ReadPosRankSum=-3.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,53:73:99:3649,0,235 +chr22 30195359 . C G 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=1.433;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:69:1544,69,0 +chr22 30195402 . C T 480.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.744;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=34.35;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:507,2,0 +chr22 30195560 . A T 1393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-1.103;DP=81;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:1422,0,1402 +chr22 30195638 . A G 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.417;DP=58;FS=7.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:1115,0,808 +chr22 30195778 . A C 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2353,160,0 +chr22 30195784 . T C 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2353,160,0 +chr22 30195851 . G A 328.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:357,30,0 +chr22 30196149 . T A 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 +chr22 30196151 . T C 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1260,84,0 +chr22 30196827 . A G 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:463,33,0 +chr22 30197093 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.126;DP=50;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:418,0,807 +chr22 30197112 . G A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:510,36,0 +chr22 30197409 . G A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.252;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:704,0,1826 +chr22 30197738 . T C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.442;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:600,0,3303 +chr22 30197917 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-2.708;DP=149;FS=15.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:312,0,4194 +chr22 30198006 . AT A 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-0.402;DP=82;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:461,0,643 +chr22 30198189 . G GAA 1782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1881,125,0 +chr22 30198276 . GTC G 2108.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.517;DP=98;FS=2.434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=21.52;ReadPosRankSum=3.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,51:56:13:2146,13,0 +chr22 30362932 . T A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.078;DP=50;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:801,0,870 +chr22 30395146 . T G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.334;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:453,0,321 +chr22 30405242 . G C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.774;DP=42;FS=16.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:552,0,899 +chr22 30420138 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.486;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:281,0,1072 +chr22 30420200 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.642;DP=32;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:420,0,1066 +chr22 30420201 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-1.839;DP=33;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:258,0,1419 +chr22 30950055 . C T 608.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.123;DP=18;FS=5.315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=33.79;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:636,9,0 +chr22 31065757 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.731;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:274,0,107 +chr22 31087893 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.967;DP=14;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:409,0,53 +chr22 31400267 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=-0.877;DP=42;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:569,0,761 +chr22 31404648 . A C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=-1.008;DP=45;FS=8.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:571,0,979 +chr22 31412618 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=1.028;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:231,0,664 +chr22 31413340 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.506;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:356,0,637 +chr22 31649776 . C A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-1.975;DP=92;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:531,0,2627 +chr22 31649996 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.874;DP=92;FS=11.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=8.55;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:815,0,2472 +chr22 31650765 . T G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=-1.562;DP=24;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.91;ReadPosRankSum=2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:242,0,596 +chr22 31650864 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.378;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.235;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:231,0,602 +chr22 31664057 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-1.092;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:447,0,1760 +chr22 31668097 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.062;DP=44;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:600,0,894 +chr22 31685757 . A C 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.971;DP=77;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:1017,0,1669 +chr22 31881295 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.407;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:246,0,820 +chr22 32004214 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-2.163;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:298,0,175 +chr22 32004378 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.500;DP=24;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:678,0,135 +chr22 32004716 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.692;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:371,0,398 +chr22 32349312 . G A 2666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.265;DP=138;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:2695,0,2025 +chr22 32353188 . G A 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 +chr22 32366932 . G A 2882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-0.586;DP=151;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:2911,0,2251 +chr22 32380681 . GAC G 341.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:379,31,0 +chr22 32381247 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,177 +chr22 32390307 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-0.065;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:505,0,464 +chr22 32393435 . G A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=0.916;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:530,0,320 +chr22 32558977 . TCTAAAAACGAGAAACTTAATGAAGACCACCAAGACTAAGGCTTTCTTTTTAGGAAAAAATGAGTTGATTATGCAC T 12225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.088;DP=271;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,264:266:99:12263,1082,0 +chr22 32596338 . CA C 3215.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.355;DP=215;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,133:200:99:3253,0,1504 +chr22 32718875 . AGTGAGAATTATGTTTAAAATACTAAAACTAATGTGCCTTAATGCATCCATTAATTAGTTAGTTGTTTTTTTCTTCAATCAAATGAGAGAAATGTGATGTTTTATTTAG A 1528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.540;DP=31;FS=2.980;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:99:1566,183,0 +chr22 33049345 . T G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,16:16:99:263,0,3703 +chr22 33049407 . T C 1645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:99:1674,119,0 +chr22 33049458 . T C 1645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:1674,119,0 +chr22 33137869 . A G 625.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:654,45,0 +chr22 33197050 . G A 2589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-0.816;DP=92;FS=3.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,67:92:99:2618,0,638 +chr22 33200822 . A G 1443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=1.430;DP=56;FS=4.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=25.78;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,38:56:99:1472,0,540 +chr22 33200958 . G A 1973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.367;DP=80;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,52:80:99:2002,0,2171 +chr22 33200961 . A C 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-1.160;DP=82;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,52:82:99:2011,0,2171 +chr22 33201574 . G A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.876;DP=32;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:694,0,407 +chr22 33201653 . C G 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.126;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:581,0,466 +chr22 33201702 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.122;DP=27;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:521,0,399 +chr22 33201723 . G T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=-0.290;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:463,0,401 +chr22 33217621 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr22 33217624 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr22 33234485 . C T 2160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=-2.560;DP=64;FS=7.762;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=33.76;ReadPosRankSum=3.560 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,56:62:41:2189,41,0 +chr22 33235330 . G A 702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:731,51,0 +chr22 33246660 . T A 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:566,39,0 +chr22 33247417 . G C 1221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=-1.040;DP=30;FS=3.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1250,87,0 +chr22 33247507 . T C 372.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=33.91;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:401,0,13 +chr22 33501233 . T G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.617;DP=58;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:762,0,1305 +chr22 33501409 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.295;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:325,0,1256 +chr22 33738490 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=-0.471;DP=47;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:628,0,1025 +chr22 33744381 . G T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-1.457;DP=52;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:402,0,1359 +chr22 33772572 . C A 2444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.425;ClippingRankSum=0.160;DP=300;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,95:300:99:2473,0,7935 +chr22 33772648 . C T 1399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.075;DP=182;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,54:182:99:1428,0,5182 +chr22 33772665 . T G 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.108;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:1096,0,4004 +chr22 35040751 . TTA T 272.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:310,23,0 +chr22 35044682 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:252,0,293 +chr22 35095477 . G A 2317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.857;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,63:83:99:2346,0,439 +chr22 35095621 . C T 2387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.827;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=22.32;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,71:107:99:2416,0,1200 +chr22 35095913 . A G 2161.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2190,157,0 +chr22 35096266 . A T 2793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2822,204,0 +chr22 35096339 . A C 2494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2523,186,0 +chr22 35096523 . A AT 1030.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:89:1068,89,0 +chr22 35096572 . AC A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.962;DP=70;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:248,0,2049 +chr22 35096830 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=3.776;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.719;QD=11.93;ReadPosRankSum=-3.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:410,0,1634 +chr22 35096839 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=2.606;DP=37;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:422,0,1634 +chr22 35096983 . A T 3476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3505,261,0 +chr22 35097025 . C A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.135;DP=73;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:668,0,1888 +chr22 35097115 . A T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=3.181;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=11.16;ReadPosRankSum=-2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:285,0,462 +chr22 35097129 . ATT A 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:50:687,50,0 +chr22 35097247 . G A 1185.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1214,87,0 +chr22 35097513 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-2.106;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:298,0,640 +chr22 35097524 . GTA G 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.684;DP=33;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:298,0,711 +chr22 35097663 . C T 2757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.576;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=26.77;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,74:103:99:2786,0,704 +chr22 35097871 . G A 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-0.849;DP=60;FS=2.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:262,0,1557 +chr22 35097874 . A G 2119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2157,138,0 +chr22 35097883 . G A 1449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=1.467;DP=54;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,39:53:99:1487,0,329 +chr22 35097934 . A G 1790.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1819,138,0 +chr22 36012228 . CT C 2036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.602;DP=230;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,86:210:99:2074,0,2900 +chr22 36055505 . G A 3577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.656;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,96:254:99:3606,0,10894 +chr22 36055507 . G A 3577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.440;DP=251;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,96:249:99:3606,0,10882 +chr22 36074120 . A T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.714;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=4.57;ReadPosRankSum=2.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:444,0,5936 +chr22 36074122 . A C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.396;ClippingRankSum=-1.113;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=4.58;ReadPosRankSum=2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:440,0,5936 +chr22 36074258 . GA G 1407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.836;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,56:85:99:1445,0,466 +chr22 36074813 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.540;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:441,0,707 +chr22 36075334 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,400 +chr22 36075597 . A C 267.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.76;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:296,0,18 +chr22 36075636 . A T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-1.669;DP=23;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=20.99;ReadPosRankSum=3.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:511,0,333 +chr22 36077736 . C G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-2.613;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=6.24;ReadPosRankSum=2.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:359,0,1507 +chr22 36078284 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=2.657;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:331,0,1536 +chr22 36251715 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,249 +chr22 36363699 . G C 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr22 37201921 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:270,0,374 +chr22 37287459 . G GGA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.831;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,217 +chr22 37287646 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.398;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:261,0,132 +chr22 37591026 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.103;DP=38;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:548,0,765 +chr22 37631336 . T C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.030;DP=50;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:595,0,1073 +chr22 37635646 . G A 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.376;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:957,0,825 +chr22 37636492 . C A 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.392;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1198,0,1439 +chr22 37636815 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-0.394;DP=46;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:373,0,1201 +chr22 37636837 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.303;DP=40;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:516,0,840 +chr22 37637335 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=4.101;DP=66;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=7.15;ReadPosRankSum=-2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:500,0,4113 +chr22 37637736 . A T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.766;DP=40;FS=4.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:585,0,803 +chr22 37637988 . T A 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.078;DP=66;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:916,0,1264 +chr22 37639924 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.537;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:327,0,508 +chr22 37640625 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:316,0,140 +chr22 37640994 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:292,0,146 +chr22 37642310 . AT A 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.347;DP=49;FS=6.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=6.99;ReadPosRankSum=2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:380,0,1915 +chr22 37642378 . CA C 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.384;DP=36;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:295,0,475 +chr22 37642508 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-1.442;DP=36;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:320,0,1015 +chr22 37642996 . T C 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=-0.750;DP=49;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:785,0,887 +chr22 37643694 . GT G 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-2.693;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:269,0,520 +chr22 37643706 . T G 712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.335;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:750,0,165 +chr22 37644317 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=1.627;DP=32;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:368,0,771 +chr22 37644514 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,793 +chr22 37645099 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.028;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:304,0,579 +chr22 37645369 . C T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.786;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:570,0,104 +chr22 37648823 . G C 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.896;DP=51;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:878,0,892 +chr22 37649182 . C G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.806;DP=45;FS=4.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:630,0,817 +chr22 37660346 . G T 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.317;DP=34;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:721,0,386 +chr22 37660614 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.283;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:238,0,831 +chr22 37796903 . TCA T 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:23:246,23,0 +chr22 37799461 . A T 675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:48:704,48,0 +chr22 37799631 . AT A 334.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:394,30,0 +chr22 37809133 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=2.516;DP=72;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=4.90;ReadPosRankSum=3.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:381,0,2073 +chr22 37855553 . C G 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-0.372;DP=68;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1045,0,1930 +chr22 37880873 . T G 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=-1.421;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:1242,0,1351 +chr22 37882237 . G A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.017;DP=73;FS=6.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:804,0,2551 +chr22 37885127 . A G 1218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.489;DP=58;FS=3.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=21.01;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,36:58:99:1247,0,753 +chr22 37885147 . A T 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.186;DP=58;FS=5.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1211,0,690 +chr22 37888434 . A G 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.574;DP=80;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1399,0,1406 +chr22 37897970 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.68;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:305,0,52 +chr22 37953879 . T C 952.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:981,72,0 +chr22 37964479 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=1.622;DP=24;FS=9.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:398,0,448 +chr22 37969268 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +chr22 37987040 . C A 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-1.378;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=27.67;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:1218,0,465 +chr22 38002271 . G C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.753;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:359,0,417 +chr22 38010594 . T A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.400;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=16.34;ReadPosRankSum=2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:404,0,391 +chr22 38011440 . A C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:324,0,296 +chr22 38011967 . A T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:409,0,244 +chr22 38012785 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:392,0,245 +chr22 38013387 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=3.281;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=14.74;ReadPosRankSum=-2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:264,0,679 +chr22 38013392 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=2.540;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:264,0,679 +chr22 38035796 . G C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.757;DP=53;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:871,0,856 +chr22 38059726 . G A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.570;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1024,0,1076 +chr22 38062209 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.104;DP=30;FS=11.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:519,0,545 +chr22 38062252 . C CT 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.284;DP=32;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:322,0,337 +chr22 38066549 . G GT 2277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-0.671;DP=301;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,113:271:99:2315,0,3588 +chr22 38067872 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:431,0,273 +chr22 38070025 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.533;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:324,0,410 +chr22 38147397 . G A 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=-0.505;DP=93;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1471,0,1487 +chr22 38148591 . A G 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.000;DP=57;FS=22.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,34:57:99:1184,0,798 +chr22 38174122 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=22.27;ReadPosRankSum=2.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:340,0,148 +chr22 38198083 . A C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=22.09;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:448,0,234 +chr22 38404413 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr22 38404475 . G A 271.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:300,24,0 +chr22 38784650 . C G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.569;DP=46;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:571,0,1509 +chr22 38867900 . A C 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-2.024;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:991,0,956 +chr22 38868411 . C A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-1.464;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1362,0,1348 +chr22 38868506 . A G 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=-0.577;DP=38;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:914,0,914 +chr22 38869690 . T C 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.039;DP=58;FS=14.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:901,0,1050 +chr22 38869692 . A G 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.281;DP=59;FS=9.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:936,0,1022 +chr22 38871196 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.198;DP=47;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:631,0,923 +chr22 39065342 . C G 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:749,51,0 +chr22 39378384 . AG A 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:88:353,0,88 +chr22 39405520 . A C 246.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:275,0,22 +chr22 39408494 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.425;DP=32;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:255,0,1061 +chr22 39408705 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.445;DP=82;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:701,0,4478 +chr22 39432091 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:313,0,358 +chr22 39477096 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.406;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:430,0,404 +chr22 39542161 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.060;DP=24;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:295,0,513 +chr22 39543942 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.895;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:450,0,422 +chr22 39543955 . C A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-1.043;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:479,0,453 +chr22 39556286 . C CA 1225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-3.258;DP=361;FS=3.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,88:334:99:1263,0,6777 +chr22 39563646 . TCTGGAAAAACAAAACCTCTAATCAAACTGGTTCAAAACAAGACATTGAACACTTTAGAAGCGTCAGAGTTTCCTCTTAC T 1391.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=354;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,339:339:99:1429,618,0 +chr22 39569659 . C T 6456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.959;ClippingRankSum=1.286;DP=411;FS=21.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,221:411:99:6485,0,6827 +chr22 39572909 . T A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=2.025;DP=314;FS=17.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,72:314:99:1562,0,9666 +chr22 39639396 . A C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=2.183;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:266,0,1582 +chr22 39661877 . A G 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:32:423,32,0 +chr22 39721887 . A G 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.029;DP=158;FS=15.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,44:158:99:1069,0,4238 +chr22 39760106 . G T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.972;DP=140;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,33:140:99:663,0,4019 +chr22 39782103 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=1.059;DP=36;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=5.72;ReadPosRankSum=-2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:234,0,1096 +chr22 39782120 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.877;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=6.22;ReadPosRankSum=2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:252,0,1073 +chr22 39853760 . A G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=2.569;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:637,0,644 +chr22 39858116 . C T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.460;DP=29;FS=8.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:585,0,451 +chr22 39895811 . A G 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:434,36,0 +chr22 40017766 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.485;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:281,0,2714 +chr22 40333886 . TA T 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.393;DP=92;FS=1.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:686,0,1356 +chr22 40334091 . A AT 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.752;DP=32;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:338,0,383 +chr22 40335105 . C T 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.109;DP=270;FS=13.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,77:270:99:1755,0,7084 +chr22 40335477 . C T 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.084;DP=226;FS=1.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,56:226:99:999,0,5992 +chr22 40523150 . TGCAAGTTATATTTTCAGATCGTGCAATGCAGAGTTGGCCTCTGTAAACTCGCTAATAACTTTGTTTTGCTTGTGTTTTGTGCGACAG T 1691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.429;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,52:90:99:1729,0,1859 +chr22 40523152 . CAA C 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-0.312;DP=97;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:90:99:1332,0,2233 +chr22 40523155 . GTTATATTTTCAGATCGTGCAATGCAGAGTTGGCCTCTGTAAACTCGCTAATAACTTTGTTTTGCTTGTGTTTTGTGCGACAGGCA G 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.111;DP=99;FS=1.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:1332,0,2238 +chr22 40526100 . GAGGTCAGTCCTTCTCCTGGCTTAATGCAACATAAGAAATCATTCAGCCTATAAAGTGCTCAGTGTCGTGTTTTATTGAC G 3970.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=2.825;DP=98;FS=4.797;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=31.13;ReadPosRankSum=-2.947 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,93:98:99:4008,314,0 +chr22 40538577 . TCCTGCACATGCACACACAGACACACACACATATGAGCATCTCCACAATGCTTCTAAAGAGTCTGTGAAGAGTTGCTAAACACTCA T 8424.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=-2.104;DP=183;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,173:179:99:8462,762,0 +chr22 40540913 . A AT 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=-1.032;DP=136;FS=15.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=4.44;ReadPosRankSum=7.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,89:116:99:641,0,362 +chr22 40575438 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-1.074;DP=41;FS=5.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:235,0,2464 +chr22 40576192 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-1.647;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:296,0,882 +chr22 40576631 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=1.106;DP=68;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:331,0,3311 +chr22 40577346 . G GT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-2.454;DP=93;FS=19.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:326,0,1635 +chr22 40577877 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr22 40581542 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-1.091;DP=28;FS=12.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1834 +chr22 40624328 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=2.642;DP=335;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=2.50;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,69:333:99:867,0,14862 +chr22 40684597 . G A 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-3.279;DP=418;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,74:418:99:1048,0,13543 +chr22 40697611 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.397;DP=290;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,51:290:99:675,0,8977 +chr22 40736786 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=-0.221;DP=63;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:433,0,1725 +chr22 40787760 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:278,0,214 +chr22 40789912 . TA T 343.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:381,34,0 +chr22 40789975 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.230;DP=53;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:234,0,1618 +chr22 40790054 . G C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.315;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=6.50;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:392,0,1609 +chr22 40790274 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.616;DP=75;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=3.49;ReadPosRankSum=-2.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:290,0,2194 +chr22 40790406 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.443;DP=96;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:576,0,2398 +chr22 40956474 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,210 +chr22 40957690 . T C 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:60:882,60,0 +chr22 40982466 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:89:231,0,89 +chr22 40996232 . A G 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.450;DP=119;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,30:119:99:736,0,3456 +chr22 40998622 . T G 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.592;DP=142;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,30:142:99:562,0,3804 +chr22 41007919 . A AT 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.437;DP=111;FS=2.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,39:106:99:646,0,1600 +chr22 41052861 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.675;DP=115;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=4.03;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,25:115:99:492,0,3356 +chr22 41067336 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=1.131;DP=92;FS=7.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:332,0,2806 +chr22 41073160 . G A 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.836;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:1036,0,2052 +chr22 41073166 . G A 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.874;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:1036,0,2052 +chr22 41076974 . GT G 660.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-0.496;DP=40;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:698,0,168 +chr22 41078240 . A G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.216;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:718,0,1934 +chr22 41123992 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=1.166;DP=86;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=4.46;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:412,0,2470 +chr22 41127220 . C CA 388.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.480;DP=65;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:426,0,4521 +chr22 41128386 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:267,0,50 +chr22 41150350 . G A 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.320;DP=209;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,50:209:99:1061,0,6091 +chr22 41157114 . C T 2315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.335;DP=191;FS=3.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,70:191:99:2344,0,4111 +chr22 41160873 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.528;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:297,0,859 +chr22 41161045 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.331;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.134;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:364,0,609 +chr22 41161098 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.041;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:375,0,351 +chr22 41161123 . T A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.678;DP=21;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:379,0,323 +chr22 41161225 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.041;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:333,0,265 +chr22 41161461 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=1.610;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,383 +chr22 41162053 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.015;DP=41;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:270,0,1188 +chr22 41191610 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.902;DP=65;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:233,0,4148 +chr22 41195821 . A G 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.132;DP=82;FS=1.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:926,0,2108 +chr22 41195867 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.395;DP=109;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:307,0,3791 +chr22 41196079 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.725;DP=94;FS=3.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:380,0,2922 +chr22 41196101 . G A 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.844;DP=83;FS=23.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=16.42;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1391,0,1438 +chr22 41196260 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-2.481;DP=65;FS=11.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.03;ReadPosRankSum=2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:810,0,1898 +chr22 41197605 . A T 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 +chr22 41197803 . T C 309.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=30.92;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:337,0,10 +chr22 41197840 . A T 653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-0.539;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=31.13;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:35:682,35,0 +chr22 41198227 . T C 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.484;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=34.05;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1288,0,285 +chr22 41198473 . A T 1883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-1.644;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1912,138,0 +chr22 41199007 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=1.189;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:485,0,903 +chr22 41255337 . G A 486.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=34.73;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:513,0,4 +chr22 41255577 . C T 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 +chr22 41256336 . T A 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 +chr22 41257603 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=9.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.25;ReadPosRankSum=2.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:439,0,652 +chr22 41265724 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:69:240,0,69 +chr22 41289221 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.112;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:358,0,670 +chr22 41293725 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.639;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:271,0,884 +chr22 41302422 . TA T 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-1.917;DP=61;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:867,0,675 +chr22 41303392 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.171;DP=53;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:370,0,3225 +chr22 41303395 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=-0.423;DP=52;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:381,0,3225 +chr22 41303825 . CT C 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.682;DP=78;FS=6.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:263,0,3972 +chr22 41317673 . A G 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=1.171;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:2118,0,2413 +chr22 41330347 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-1.384;DP=134;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,27:133:99:508,0,4070 +chr22 41338601 . T G 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=2.192;DP=99;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,24:99:99:641,0,6602 +chr22 41338602 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.841;ClippingRankSum=2.496;DP=105;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:630,0,6602 +chr22 41376087 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.742;DP=26;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,539 +chr22 41376767 . T A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-1.358;DP=98;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=4.84;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,23:98:99:503,0,2820 +chr22 41377258 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.160;DP=60;FS=6.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:281,0,3111 +chr22 41377312 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-0.275;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:337,0,2209 +chr22 41377516 . A T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.373;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:485,0,614 +chr22 41379437 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.523;DP=66;FS=5.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:473,0,5039 +chr22 41395893 . A G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr22 41395946 . A T 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:475,36,0 +chr22 41396367 . A C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:42:508,0,42 +chr22 41396372 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:45:450,0,45 +chr22 41397235 . A G 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 +chr22 41397584 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 +chr22 41398202 . A C 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 +chr22 41398254 . G A 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 +chr22 41398456 . A G 318.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=31.81;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:11:346,0,11 +chr22 41398731 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.954;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,449 +chr22 41398905 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,573 +chr22 41398906 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,573 +chr22 41401028 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 +chr22 41410636 . A G 1261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.733;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=27.56;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1290,93,0 +chr22 41430985 . A G 368.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:397,30,0 +chr22 41431339 . T C 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr22 41432717 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.804;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:354,0,544 +chr22 41434704 . T C 605.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:634,45,0 +chr22 41440755 . A T 579.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.106;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=28.99;ReadPosRankSum=-2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:26:608,0,26 +chr22 41453161 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=1.711;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:381,0,938 +chr22 41453171 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=3.191;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=17.64;ReadPosRankSum=-3.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:381,0,932 +chr22 41453296 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:282,0,167 +chr22 41453702 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=2.406;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:330,0,1254 +chr22 41453705 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=1.779;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:330,0,1254 +chr22 41454260 . T A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.278;DP=72;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:544,0,2777 +chr22 41457237 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=2.066;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:363,0,654 +chr22 41457272 . A G 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=3.311;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:753,0,595 +chr22 41464791 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=1.394;DP=41;FS=7.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:462,0,832 +chr22 41470785 . A G 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=2.336;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:745,0,532 +chr22 41470818 . C T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.884;DP=55;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:931,0,935 +chr22 41471478 . T C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.741;DP=79;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:632,0,2107 +chr22 41485923 . G T 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 +chr22 41486102 . A AC 1125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.733;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=37.43;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:75:1163,75,0 +chr22 41486105 . A C 1174.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:80:1212,80,0 +chr22 41486245 . G C 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=2.631;DP=25;FS=17.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:49:767,0,49 +chr22 41489544 . T TA 210.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:248,24,0 +chr22 41489712 . G C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:379,0,493 +chr22 41489812 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-0.410;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=22.04;ReadPosRankSum=-2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:491,0,249 +chr22 41491287 . A G 1192.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1221,90,0 +chr22 41673862 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.89;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,128 +chr22 41681885 . A G 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 +chr22 41681963 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:298,0,321 +chr22 41739167 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=1.422;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:746,0,101 +chr22 41776775 . G A 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.477;DP=61;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:868,0,1091 +chr22 41778275 . C A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-1.145;DP=43;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:636,0,871 +chr22 41844880 . C CT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-1.495;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:244,0,1635 +chr22 41926833 . G A 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.664;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1085,0,1981 +chr22 41926835 . G A 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-1.115;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:1085,0,1937 +chr22 41947656 . A C 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-0.515;DP=86;FS=4.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1579,0,1187 +chr22 41947687 . G A 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-1.024;DP=93;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:1244,0,1836 +chr22 41951059 . C G 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.252;DP=77;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:598,0,1962 +chr22 41951893 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.727;DP=94;FS=3.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:669,0,5097 +chr22 41958413 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-3.354;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:366,0,1428 +chr22 41974515 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=1.439;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:430,0,592 +chr22 41975194 . T C,G 4135.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.762;DP=167;FS=4.068;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,47,60:113:99:4379,2146,2095,2138,0,2125 +chr22 41975325 . A G 13883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=480;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,292:292:99:13912,981,0 +chr22 42053428 . AAGGTACATCGGCAGTCTAATGTTTTCACCTGAACACTGCGTTGCTCTTGAGTCTGAGATGGTTTGGTTTTCTGTACGTC A 2528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=1.678;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:2566,185,0 +chr22 42069143 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.825;DP=74;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.955;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:356,0,2131 +chr22 42073922 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.495;DP=90;FS=3.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:267,0,2776 +chr22 42091260 . GCTGCACATTCCAGCATGATCTCAGAAATATCATTAATATAAAGGTTTATGCCATACAGCAATGTCTGAATCCTAC G 1264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=3.530;DP=40;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=31.62;ReadPosRankSum=-2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1302,0,2865 +chr22 42091897 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.363;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:239,0,1214 +chr22 42096535 . TCTACAAGCAAGATTAACAGTAGTGTTGTCCTTATTGTGGATGAAGATATGTCTAACATTGATCATTATACTGTACACGCTCAC T 1553.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=2.265;DP=40;FS=6.591;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=25.40;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:99:1591,113,0 +chr22 42126291 . T G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.819;DP=29;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:414,0,652 +chr22 42127071 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:65:240,0,65 +chr22 42133278 . A G 1721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=-1.371;DP=254;FS=3.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,74:254:99:1750,0,6675 +chr22 42133803 . T C 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.726;DP=201;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,62:201:99:1572,0,5689 +chr22 42133827 . C T 1601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.393;DP=208;FS=0.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,64:208:99:1630,0,5816 +chr22 42134820 . C A 1499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.173;DP=235;FS=2.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,67:235:99:1528,0,6183 +chr22 42224303 . C A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr22 42259716 . GGGTAGGAGAACAGCACTTGAACATTGCATCTGTGTTTATTTTGTATGTGTTATGTAAGGTTGTCTTTCA G 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=1.195;DP=48;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.414;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:982,0,2843 +chr22 42260623 . T G 1070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-1.326;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1099,0,553 +chr22 42260625 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-1.092;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:675,0,1508 +chr23 95764 . C T 1707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.337;DP=60;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,46:60:99:1736,0,295 +chr23 109179 . A T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.380;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:487,0,157 +chr23 109344 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=26.21;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:500,0,156 +chr23 144830 . A T 825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.908;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=31.76;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:854,60,0 +chr23 252809 . C A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr23 261059 . C G 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=1.807;DP=36;FS=3.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=27.44;ReadPosRankSum=-1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1016,0,185 +chr23 263213 . A G 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:333,24,0 +chr23 263263 . A G 989.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=1.495;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:5:1017,0,5 +chr23 263584 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:311,0,147 +chr23 268277 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.476;DP=40;FS=4.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:516,0,982 +chr23 268799 . A C 2958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.104;DP=84;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=32.58;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,66:84:99:2987,0,990 +chr23 268806 . C A 2958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.233;DP=92;FS=4.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,71:92:99:2987,0,1028 +chr23 269099 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:299,0,816 +chr23 269632 . TC T 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.290;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:303,0,406 +chr23 275090 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=1.826;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=30.98;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:44:400,0,44 +chr23 278909 . G A 350.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.82;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:378,0,12 +chr23 331922 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.189;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=30.57;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:548,0,219 +chr23 332743 . T C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.284;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:59:611,0,59 +chr23 334645 . C T 262.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:16:291,0,16 +chr23 334646 . G T 262.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:291,0,16 +chr23 344798 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=1.910;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,304 +chr23 344999 . G T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.613;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:516,0,273 +chr23 523613 . CCCTACAATTAGGCAACACAACAGCATTATTATCAGACATAAATGTAATATTTTGAATAATGATAAGCTGTAAATATGTTCCTCA C 17521.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.595;DP=439;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=33.45;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,429:431:99:17559,1264,0 +chr23 607869 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-2.293;DP=17;FS=13.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=23.10;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:421,0,251 +chr23 607967 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.482;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:394,0,347 +chr23 608895 . T C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.987;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=21.76;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:507,0,329 +chr23 608908 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-1.286;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=19.18;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:316,0,161 +chr23 611789 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=1.055;DP=48;FS=5.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:381,0,1303 +chr23 612318 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=1.120;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:276,0,869 +chr23 612564 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=3.472;DP=22;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:314,0,453 +chr23 614083 . ACTGATGGAGACACACAGCAGGTCAGACTCATGCACGTTCAGGAGGAACACAGTAAATAAAACAGGTCTTAC A 4291.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=3.590;DP=100;FS=1.890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=25.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,95:100:99:4329,327,0 +chr23 965276 . C A 1090.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1119,81,0 +chr23 965627 . T A 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:308,24,0 +chr23 965674 . T C 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=-0.133;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:803,0,1181 +chr23 965675 . G A 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.102;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:930,0,565 +chr23 965716 . C T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=-0.598;DP=171;FS=21.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=3.36;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:602,0,1754 +chr23 965795 . T C 3802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:3832,262,0 +chr23 965800 . A T 3935.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:3964,271,0 +chr23 965905 . T A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=3.556;DP=42;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=8.16;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:371,0,527 +chr23 966062 . C T 8661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.355;DP=253;FS=14.930;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=34.24;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,220:248:50:8690,50,0 +chr23 966096 . G A 4195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-1.019;DP=124;FS=18.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=33.84;ReadPosRankSum=-2.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,105:119:99:4742,0,222 +chr23 966649 . G A 252.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:281,0,22 +chr23 967880 . C T 2041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2070,138,0 +chr23 967881 . T C 2041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2070,138,0 +chr23 968325 . A T 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=-1.283;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:1366,0,2770 +chr23 968336 . A C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.534;DP=155;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,29:111:99:623,0,7650 +chr23 968346 . C A 2208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=-1.421;DP=210;FS=3.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.514;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:2237,0,4019 +chr23 968424 . TCA T 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=4.501;DP=198;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:740,0,2063 +chr23 969102 . C G 1339.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.628;DP=41;FS=8.195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=32.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:96:1368,96,0 +chr23 969309 . A C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.414;DP=28;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:482,0,450 +chr23 986852 . G GT 256.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:294,24,0 +chr23 987465 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.278;DP=26;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=9.22;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,141 +chr23 987487 . T C 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:709,48,0 +chr23 1582380 . A G 439.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.032;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:12:467,0,12 +chr23 1697740 . A C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=1.199;DP=118;FS=1.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,22:118:99:382,0,3595 +chr23 1736454 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=1.325;DP=84;FS=12.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:321,0,2518 +chr23 1947142 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.456;DP=42;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,478 +chr23 1948767 . T C 203.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:232,0,23 +chr23 2009980 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,364 +chr23 2176355 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.265;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:312,0,2188 +chr23 2233315 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.376;DP=43;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:245,0,1207 +chr23 2273401 . G C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-1.719;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:381,0,1365 +chr23 2442989 . G A 2138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.127;DP=523;FS=5.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.410;QD=4.09;ReadPosRankSum=3.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:408,114:522:99:2167,0,15276 +chr23 2560812 . T A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.387;DP=32;FS=15.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:484,0,648 +chr23 2561554 . G GT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.120;DP=59;FS=6.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=3.76;ReadPosRankSum=-2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:259,0,1303 +chr23 2562208 . C CTT 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=-1.527;DP=130;FS=16.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1778,0,1950 +chr23 2598934 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.953;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:415,0,617 +chr23 2684795 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.318;DP=44;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:722,0,800 +chr23 3421987 . AAC A 1001.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.173;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=22.77;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1039,0,498 +chr23 3516809 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:292,0,374 +chr23 3516810 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=33.42;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:563,0,35 +chr23 3572596 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=1.269;DP=43;FS=8.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:562,0,1535 +chr23 3572615 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.020;DP=85;FS=12.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,15:85:99:230,0,2945 +chr23 3572932 . A G 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.352;DP=158;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,42:158:99:975,0,4454 +chr23 3574607 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.477;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:346,0,579 +chr23 3588961 . A G 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.650;DP=112;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1961,0,5718 +chr23 3588962 . T C 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.846;DP=120;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1961,0,5601 +chr23 3589008 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=2.032;DP=153;FS=5.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,27:153:99:281,0,9620 +chr23 3642990 . G C 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.749;DP=530;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=2.18;ReadPosRankSum=3.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:440,89:529:99:1182,0,17347 +chr23 3643314 . T C 9236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-2.724;DP=345;FS=16.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=26.77;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,243:345:99:9265,0,2849 +chr23 3726749 . GCTTTAAAAGTAACATGTTTACTCATTTTACTTTAAAAGAGTCAACTAATCA G 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.536;DP=65;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=3.53;ReadPosRankSum=2.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:267,0,14838 +chr23 4317120 . G GA 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.525;DP=42;FS=8.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:257,0,542 +chr23 4317348 . TA T 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.896;DP=19;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:330,0,210 +chr23 4318027 . AT A 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.293;DP=31;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=14.64;ReadPosRankSum=-2.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:491,0,1554 +chr23 4397306 . T G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.744;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:38:543,0,38 +chr23 4534682 . G GT 1572.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-1.622;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,48:63:99:1610,0,271 +chr23 4754010 . C CA,CAA 899.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-1.175;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:22,50,32:104:99:1640,388,543,623,0,1107 +chr23 4812513 . GTACCTGCAGAATGACGCATTATGCTTAGTCACGTTTGAAGCATATTTATTATGCATTAAAGTGTGCTTGTGGCT G 3305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.400;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.873;QD=35.34;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,75:77:99:3343,259,0 +chr23 4906488 . GACCTGTGATGGAGAGAGCTGTTTAGCAGCTAGATCCGGTTTCTTTGATCGCATATTAAAGTATCAACATGTAAAATC G 949.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.252;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=30.76;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:99:987,0,594 +chr23 4955662 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-0.500;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=17.02;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:556,0,1034 +chr23 4955674 . G C 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-3.225;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=22.90;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:807,0,848 +chr23 4956124 . C CTG 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.496;DP=15;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=32.25;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:521,0,115 +chr23 4956527 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=2.173;DP=35;FS=5.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:270,0,879 +chr23 4956779 . A AT 491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.402;DP=34;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:529,0,299 +chr23 4972875 . C A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-0.113;DP=67;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:603,0,1682 +chr23 4972901 . GCTACACAAAAGGAAAGGACACTCAGTGTAAAACCATTCTGTCAAGTGTGACAATGACAACAACAACATAAAAGTGTATTAAC G 2309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=1.764;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=35.00;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,55:60:99:2347,0,499 +chr23 4974367 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.230;DP=42;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:516,0,908 +chr23 4979716 . TCCTGATATCAGAGCATACAAAAACAGCATGACTGCATTTATAGTTTCTACTGTAAAGCCTGTGGCCTCAATTGTGTTAAAAGTGATTGTTGTTGTTGTTGTTGGAGAAATTGCTTGTTACTCAAACACATGCACCTGAGGCTCCGCCTA T 2328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=2.595;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,64:90:99:2366,0,8903 +chr23 5257725 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr23 5626084 . A G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:617,0,1234 +chr23 5626086 . T G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.594;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:617,0,1234 +chr23 5626200 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.162;DP=54;FS=16.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:303,0,1558 +chr23 5815660 . A G 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=14;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=31.70;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:43:472,0,43 +chr23 5815843 . G C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.482;DP=19;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:326,0,243 +chr23 5815849 . G A 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:54:757,54,0 +chr23 5815953 . A G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-1.887;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:718,0,980 +chr23 5816103 . T G 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.032;DP=59;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=15.91;ReadPosRankSum=2.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:967,0,1533 +chr23 5816140 . G C 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.605;DP=51;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:787,0,1127 +chr23 5816179 . A G 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.419;DP=47;FS=4.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=19.51;ReadPosRankSum=2.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:945,0,968 +chr23 5816222 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=2.167;DP=44;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:427,0,2016 +chr23 5816284 . C CA 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.494;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.036;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:590,0,511 +chr23 5816528 . TA T 387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:425,39,0 +chr23 6077973 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.410;DP=57;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:493,0,3141 +chr23 6096993 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.743;DP=55;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=5.00;ReadPosRankSum=2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:303,0,1624 +chr23 6108834 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-1.058;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:233,0,2080 +chr23 6119840 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:338,0,208 +chr23 6119970 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=1.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:247,0,577 +chr23 6364637 . T G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.987;DP=29;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:443,0,526 +chr23 6368573 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.308;DP=36;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:488,0,764 +chr23 6374800 . T G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=2.744;DP=30;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:244,0,1710 +chr23 6374809 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=2.016;DP=28;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=7.71;ReadPosRankSum=-2.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:244,0,1710 +chr23 6472516 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.599;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:317,0,647 +chr23 6681405 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=-0.791;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:340,0,1383 +chr23 6691675 . C CT 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.617;DP=48;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:448,0,453 +chr23 6691796 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-2.734;DP=129;FS=5.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,43:128:99:1435,0,3882 +chr23 6724400 . CA C 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-0.881;DP=64;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:391,0,1778 +chr23 6725758 . A T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-0.684;DP=72;FS=2.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:323,0,2288 +chr23 6744596 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-1.115;DP=107;FS=2.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:568,0,3009 +chr23 6744677 . T A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=-1.380;DP=88;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=21.33;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,57:88:99:1905,0,2138 +chr23 6744830 . A C 1714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1743,126,0 +chr23 6744865 . T C 2149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2178,160,0 +chr23 6744881 . A G 2710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2739,199,0 +chr23 6744970 . G T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.004;DP=146;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,41:146:99:983,0,3822 +chr23 6745067 . C G 2128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.446;DP=150;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:2157,0,2951 +chr23 6745087 . C T 2560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.128;DP=150;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:2589,0,2389 +chr23 6747974 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=1.406;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.41;ReadPosRankSum=-1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:244,0,427 +chr23 6747980 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:474,0,111 +chr23 6751091 . A G 2606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2635,196,0 +chr23 6753851 . G A 3518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.268;DP=121;FS=4.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,95:121:99:3547,0,487 +chr23 6755246 . T G 3612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3641,259,0 +chr23 6755273 . A C 2307.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=1.314;DP=58;FS=3.321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=29.11;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2336,168,0 +chr23 6755333 . A G 3186.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3215,228,0 +chr23 6755354 . C A 3629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3658,259,0 +chr23 6757356 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=3.325;DP=91;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:342,0,2678 +chr23 6757386 . T C 1512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.485;DP=82;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1541,0,2823 +chr23 6757392 . T C 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-1.154;DP=73;FS=6.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=20.79;ReadPosRankSum=2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:1546,0,2823 +chr23 6761390 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.446;DP=130;FS=3.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,38:130:99:969,0,3391 +chr23 6761414 . C T 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-1.791;DP=120;FS=4.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.960;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:979,0,2973 +chr23 6761489 . G C 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-0.215;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:2048,0,2080 +chr23 6761939 . C A 1981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.160;DP=120;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:2010,0,1974 +chr23 6764688 . G C 2481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.706;DP=136;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:2510,0,4012 +chr23 6764788 . C T 4042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-1.624;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=29.73;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,106:136:99:4071,0,650 +chr23 6766086 . A G 1995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.058;DP=87;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,57:87:99:2024,0,1024 +chr23 6766365 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=4.062;DP=51;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.74;ReadPosRankSum=-3.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:627,0,1123 +chr23 6766382 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=2.079;DP=44;FS=9.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=12.20;ReadPosRankSum=-3.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:565,0,2292 +chr23 6766385 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=2.179;DP=46;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:565,0,2286 +chr23 6766476 . T G 2284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-1.098;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=26.57;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,61:85:99:2313,0,622 +chr23 6766511 . T C 3184.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.496;DP=122;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,85:121:99:3213,0,923 +chr23 6766646 . T A 2225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-1.613;DP=101;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,65:101:99:2254,0,1255 +chr23 6766776 . A C 1661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.734;DP=121;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1690,0,2419 +chr23 6766800 . T G 1848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=1.172;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1877,0,2282 +chr23 6767065 . A G 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.210;DP=129;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:2222,0,2390 +chr23 6767118 . C A 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.265;DP=153;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,62:153:99:2212,0,3170 +chr23 6767330 . A G 2730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.225;DP=166;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:2759,0,2913 +chr23 6767425 . G T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.124;DP=116;FS=7.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,34:116:99:917,0,3112 +chr23 6767504 . C G 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.432;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:99:1295,0,139 +chr23 6772260 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.215;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:794,0,1419 +chr23 6777735 . C T 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.033;DP=72;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:994,0,1433 +chr23 6785993 . T C 2588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.272;DP=115;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=22.51;ReadPosRankSum=-2.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:2617,0,1416 +chr23 6786035 . G A 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.747;DP=102;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:1537,0,5055 +chr23 6786133 . C G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.230;DP=133;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,36:133:99:944,0,9264 +chr23 6786144 . T A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.937;DP=134;FS=9.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=6.83;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:944,0,9264 +chr23 6786304 . T C 2140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=-0.952;DP=106;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:2169,0,1635 +chr23 6786318 . A G 4241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:4270,298,0 +chr23 6786380 . G T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=-0.775;DP=57;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.24;ReadPosRankSum=2.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1068,0,981 +chr23 6786451 . A AT,ATT 985.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=-1.126;DP=51;FS=5.756;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.214;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,28,9:42:99:1372,170,105,992,0,1062 +chr23 6786589 . G A 1817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=-0.681;DP=121;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1846,0,2117 +chr23 6786598 . T TA 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=-1.293;DP=146;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,38:142:99:554,0,2832 +chr23 6786612 . T C 2428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-2.255;DP=146;FS=6.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:2457,0,2610 +chr23 6786706 . CA C 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.263;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.869;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,37:175:99:383,0,4316 +chr23 6786731 . T C 8884.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-1.621;DP=218;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,217:218:99:8913,641,0 +chr23 6805854 . C G 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 +chr23 6806469 . T C 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.985;DP=90;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,31:90:99:989,0,2049 +chr23 6806564 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.861;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:383,0,1581 +chr23 6812087 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.211;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:620,0,721 +chr23 6812117 . C A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=2.500;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:364,0,354 +chr23 6814590 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:378,0,165 +chr23 6907396 . C A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-1.036;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:442,0,897 +chr23 6949101 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=2.295;DP=108;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,29:108:99:715,0,2974 +chr23 6984175 . G C 918.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.339;DP=101;FS=5.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:956,0,390 +chr23 7575878 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.475;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.42;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,438 +chr23 7576396 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-0.472;DP=61;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:288,0,1235 +chr23 7615431 . T C 979.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.509;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:42:1008,42,0 +chr23 7615563 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:235,0,59 +chr23 7782868 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=-1.423;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:260,0,1626 +chr23 7831239 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.326;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:439,0,126 +chr23 7846730 . TTC T 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-1.509;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:715,0,2240 +chr23 7850265 . C CA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-1.479;DP=42;FS=7.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:269,0,538 +chr23 7850360 . C A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.125;DP=88;FS=5.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,19:87:99:403,0,2692 +chr23 7857637 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.145;DP=181;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,40:181:99:706,0,5319 +chr23 7860354 . CACCTGCATAGGACAAAGCAAAAGCCTGACTGAGTGAAACTATTGCATTTTGCTGAATATCAATATGTGCACAGAAGTGCATCCGAACTT C 10137.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=1.956;DP=236;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.925;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,229:235:99:10175,880,0 +chr23 8807113 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:288,0,313 +chr23 8811171 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=28.10;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:534,0,156 +chr23 9327627 . AGTAAATTAATGAAGTTTAAATTGTAAATACACAAGTATGTGTCTACATAGAGCTAATTTAAATACAATTTGACCGGTTTCTCTGTTTACCGCAG A 3116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=32.38;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:99:3154,1092,0 +chr23 9335415 . G A 3128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=2.685;DP=558;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=5.61;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:420,138:558:99:3157,0,16290 +chr23 9335451 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.560;ClippingRankSum=4.455;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=4.70;ReadPosRankSum=-4.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:362,0,1779 +chr23 9389422 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.933;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=3.54;ReadPosRankSum=3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:453,0,3613 +chr23 9391227 . G A 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr23 9395141 . A AT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.356;DP=52;FS=2.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:266,0,890 +chr23 9504276 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-3.229;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=7.92;ReadPosRankSum=2.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:258,0,904 +chr23 9504400 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.434;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:534,0,2087 +chr23 9506723 . G A 2823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.269;DP=79;FS=2.883;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=31.44;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:2852,227,0 +chr23 9506747 . A T 7014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:7043,490,0 +chr23 9506841 . G A 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-2.391;DP=68;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,37:65:99:1251,0,1002 +chr23 9509453 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.355;DP=83;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:314,0,2536 +chr23 9509647 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=1.310;DP=91;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:566,0,2563 +chr23 9529012 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=-0.652;DP=72;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:588,0,1870 +chr23 9656411 . C CA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.271;DP=95;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:250,0,1807 +chr23 9681617 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=-0.524;DP=119;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.20;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:290,0,3996 +chr23 9681624 . TCTAAAGAGCAGAGACACAGTGAACAAAGAGTTTGTGTATCACAAAGTTCCTGCTGAGAGTATGATAATAGGATTAAAATGGCTGAC T 4687.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=1.685;DP=119;FS=2.936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=34.21;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,117:119:99:4725,414,0 +chr23 9699735 . C T 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.674;DP=137;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,33:137:99:725,0,3835 +chr23 9715129 . C T 1845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=-0.027;DP=109;FS=9.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1874,0,1907 +chr23 9747567 . A C 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=-1.382;DP=99;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1772,0,1614 +chr23 9774963 . G A 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.196;DP=105;FS=6.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1847,0,1694 +chr23 9813172 . G A 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.995;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1192,0,1258 +chr23 9813813 . C T 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.773;DP=105;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1773,0,1732 +chr23 9901643 . C CA 2232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=-0.540;DP=176;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,99:175:99:2270,0,1823 +chr23 9916752 . A G 4623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.938;DP=176;FS=11.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,121:176:99:4652,0,1561 +chr23 9918106 . C A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=24.58;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:397,0,92 +chr23 9918290 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:233,0,67 +chr23 9921552 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,174 +chr23 9923607 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:322,0,99 +chr23 9930110 . T C 3973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=-0.807;DP=248;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=16.02;ReadPosRankSum=3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,109:224:99:4002,0,3760 +chr23 9935523 . C A 2788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=1.503;DP=169;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,88:169:99:2817,0,2852 +chr23 9935651 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=4.392;DP=143;FS=4.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,31:143:99:577,0,8466 +chr23 9935654 . C G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=3.312;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,23:132:99:599,0,8466 +chr23 9935727 . T C 3139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=2.071;DP=189;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,89:189:99:3168,0,3233 +chr23 9943667 . G A 3433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=-2.209;DP=167;FS=10.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=20.56;ReadPosRankSum=2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,100:166:99:3462,0,2236 +chr23 10021348 . A T 221.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:250,0,22 +chr23 10139231 . T C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.641;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:686,0,674 +chr23 10139299 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.684;DP=25;FS=11.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:397,0,337 +chr23 10149684 . T C 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=1.713;DP=50;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:834,0,870 +chr23 10152817 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.972;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:702,0,968 +chr23 10244097 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.581;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:531,0,275 +chr23 10269513 . C T 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:534,36,0 +chr23 10281083 . TCTGATGAAGTAAAATATAAATGAATGTCAATAGGGAACAGATTTCAAGACATTATATTCATAGCTTAATTTGAGAAGCAAGGTGACTGAC T 15375.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.836;DP=339;FS=3.322;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,337:339:99:15413,1238,0 +chr23 10356585 . G A 7206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.869;DP=374;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,218:374:99:7235,0,12201 +chr23 10457102 . TGGTGAGTTTGCTTTCTTGTACTCATCGTAGACATTCGGAATTGAAAATTCAATCCTTAACTCTTGGGTTATGATTGTTGCGATTTTCA T 10949.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-1.260;DP=241;FS=6.923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,227:232:99:10987,1043,0 +chr23 10457412 . AGTAAGTTTACCTCTGAAGAAGAAAGTGCATGCACATTTGAGTAGATTTATTTTGTATGGTTTGTAACAAATATCCTCTCTCCTGCAG A 14213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-0.907;DP=341;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,318:319:99:14251,1096,0 +chr23 10457796 . TA T 3392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-0.868;DP=382;FS=8.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.197;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,145:361:99:3430,0,4927 +chr23 10523730 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-1.191;DP=56;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:1024,0,953 +chr23 10674727 . C T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=1.650;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:533,0,737 +chr23 10674793 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.979;DP=42;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:631,0,797 +chr23 10674839 . G C 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=1.122;DP=40;FS=9.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:762,0,587 +chr23 10677284 . G T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-0.207;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:489,0,523 +chr23 10696992 . T C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr23 10696994 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr23 10697616 . C CGT 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.625;DP=50;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:340,0,1103 +chr23 10802751 . A G 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.108;DP=84;FS=1.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:1347,0,1592 +chr23 10932032 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.472;DP=154;FS=3.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,33:153:99:608,0,4671 +chr23 10932655 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=1.410;DP=95;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:394,0,2902 +chr23 10936057 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,115 +chr23 11102507 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:238,0,62 +chr23 11487459 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:314,0,463 +chr23 11555289 . G T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.921;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=13.37;ReadPosRankSum=2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:456,0,656 +chr23 11878538 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:400,0,314 +chr23 11972314 . G A 1881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.930;DP=98;FS=2.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1910,0,1513 +chr23 12026933 . G A 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=-0.302;DP=82;FS=5.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1367,0,2143 +chr23 12257832 . C T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-1.397;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:696,0,461 +chr23 12257833 . G T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-1.461;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:696,0,461 +chr23 12259155 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-1.154;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,310 +chr23 12259412 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,477 +chr23 12259416 . C G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,477 +chr23 12260944 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.933;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:474,0,547 +chr23 12261307 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:329,0,271 +chr23 12261526 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:337,0,280 +chr23 12524903 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:350,0,261 +chr23 12526358 . C T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=-0.127;DP=36;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:677,0,606 +chr23 12593559 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.859;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:542,0,407 +chr23 12632382 . GA G 211.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr23 12632392 . A T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:249,18,0 +chr23 12632530 . G A 627.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.735;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:8:655,8,0 +chr23 12632598 . A T 1915.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-0.111;DP=80;FS=3.499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=23.95;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:1944,135,0 +chr23 12632647 . C A 641.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.156;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:669,8,0 +chr23 12632923 . G A 1615.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:29:1640,29,0 +chr23 12632932 . C T 1582.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=-1.753;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,34:37:15:1611,0,15 +chr23 12633060 . AT A 767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:64:805,64,0 +chr23 12633168 . A G 3936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3965,277,0 +chr23 12633199 . A G 3078.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:3107,214,0 +chr23 12633269 . A G 365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:394,30,0 +chr23 12633587 . C T 623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:652,45,0 +chr23 12633668 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.672;DP=42;FS=19.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:398,0,707 +chr23 12641131 . A G 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 +chr23 12641553 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-0.589;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:372,0,189 +chr23 12641554 . A T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.589;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:372,0,189 +chr23 12641699 . A G 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 +chr23 12980935 . C CA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-2.420;DP=311;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,51:285:99:268,0,6578 +chr23 13018211 . C A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-0.193;DP=88;FS=12.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:551,0,858 +chr23 13047462 . G A 16646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.363;DP=300;FS=5.638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=28.59;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,259:282:99:16675,1131,0 +chr23 13047527 . G A 5648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.033;DP=306;FS=22.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,170:293:99:5677,0,5277 +chr23 13047626 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-1.141;DP=293;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,44:274:99:551,0,8866 +chr23 13047737 . G T 4146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=1.324;DP=182;FS=0.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,112:165:99:4175,0,1327 +chr23 13047978 . C A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=-1.066;DP=118;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:1287,0,2740 +chr23 13047985 . G A 4445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.116;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=28.75;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,100:106:99:4474,281,0 +chr23 13048102 . G A 5366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-2.266;DP=231;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=23.23;ReadPosRankSum=-5.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,53:221:99:5395,0,8372 +chr23 13048174 . C CAA 5358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.928;DP=218;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.990;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,137:214:99:5396,0,8301 +chr23 13048315 . G T 5981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-2.443;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,47:187:99:6010,0,10643 +chr23 13048393 . G A 5981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=-1.420;DP=269;FS=11.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,47:219:99:6010,0,10571 +chr23 13048503 . C T 5981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-1.092;DP=118;FS=3.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=29.42;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,106:112:99:6010,0,10461 +chr23 13048721 . A C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.087;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=31.68;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:1032,0,451 +chr23 13048745 . A C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.098;DP=38;FS=6.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:1032,0,409 +chr23 13048849 . A G 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=1.021;DP=73;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1424,0,313 +chr23 13048950 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.196;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:594,0,231 +chr23 13048987 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.134;DP=13;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=20.83;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:299,0,130 +chr23 13049334 . C T 4141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-1.583;DP=103;FS=1.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=28.88;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,85:95:99:4170,113,0 +chr23 13049382 . A C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=1.799;DP=106;FS=25.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=4.13;ReadPosRankSum=3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:466,0,3510 +chr23 13049484 . G GA 751.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.451;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:988,0,254 +chr23 13049558 . T C 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.186;DP=91;FS=2.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1285,0,1261 +chr23 13049594 . T C 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=0.837;DP=60;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=23.08;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,36:44:99:1413,0,112 +chr23 13049878 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.544;DP=52;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:483,0,559 +chr23 13049955 . G A 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.573;DP=65;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1335,0,954 +chr23 13049968 . C G 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-3.139;DP=69;FS=8.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=13.90;ReadPosRankSum=2.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:987,0,1064 +chr23 13670701 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.732;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:360,0,626 +chr23 13698016 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:307,0,383 +chr23 13710084 . C T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.330;DP=46;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:744,0,733 +chr23 13733347 . G C 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 +chr23 13733357 . T G 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:393,27,0 +chr23 13737427 . C A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=32.05;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:477,0,46 +chr23 13834406 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,222 +chr23 13918848 . G C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-1.484;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=25.09;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:530,0,277 +chr23 13920893 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,318 +chr23 13945366 . T A 5917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=-0.064;DP=385;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=15.37;ReadPosRankSum=2.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,168:385:99:5946,0,7227 +chr23 13957104 . A C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.069;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:514,0,811 +chr23 13957237 . G T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-0.153;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:474,0,656 +chr23 13958472 . G T 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.621;DP=40;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=20.42;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:845,0,594 +chr23 13958530 . C A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.705;DP=38;FS=2.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.47;ReadPosRankSum=2.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:730,0,1328 +chr23 14053265 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-1.732;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:467,0,298 +chr23 14060983 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:299,0,691 +chr23 14168669 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.177;DP=40;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:708,0,654 +chr23 14169006 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=6.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:429,0,671 +chr23 14295126 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=27.34;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:43:329,0,43 +chr23 14310127 . G A 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.045;DP=130;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,41:130:99:1050,0,3392 +chr23 14342933 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:279,0,104 +chr23 14369683 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,348 +chr23 14371247 . A T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.692;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:349,0,672 +chr23 14373892 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=1.347;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:383,0,303 +chr23 14374254 . T A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.883;DP=51;FS=4.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:445,0,1775 +chr23 14375229 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.223;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:330,0,587 +chr23 14375657 . G T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.044;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:318,0,1940 +chr23 14376844 . T C 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.976;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.212;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:1234,0,1102 +chr23 14846543 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=2.180;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=23.73;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:313,0,113 +chr23 14884102 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.912;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:396,0,1987 +chr23 14892633 . C T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=1.444;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=11.48;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:878,0,1694 +chr23 14900105 . G A 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=-0.244;DP=73;FS=4.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:1008,0,1506 +chr23 14907688 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.423;DP=84;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=4.83;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:434,0,2515 +chr23 14911509 . G T 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-2.102;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,31:101:99:805,0,2700 +chr23 14911609 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-0.352;DP=88;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:590,0,2388 +chr23 14944769 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.624;DP=83;FS=3.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:521,0,2777 +chr23 14945195 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.540;DP=120;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,27:120:99:554,0,3723 +chr23 14958769 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.918;DP=117;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,19:116:99:253,0,3748 +chr23 15104026 . CA C 569.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-0.348;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:607,0,325 +chr23 15110061 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.256;DP=38;FS=3.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:259,0,999 +chr23 15151662 . A C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.182;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:470,0,127 +chr23 15151812 . T C 361.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=32.83;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:389,0,11 +chr23 15152213 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.292;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:314,0,644 +chr23 15152818 . T A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.103;DP=36;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:286,0,892 +chr23 15153513 . A T 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:525,36,0 +chr23 15153946 . T C 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:52:739,52,0 +chr23 15154176 . A G 443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:472,33,0 +chr23 15154903 . T G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.660;DP=21;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:30:701,0,30 +chr23 15155445 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.646;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:393,0,389 +chr23 15155727 . GT G 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.057;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:38:274,0,38 +chr23 15156091 . A G 911.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.819;DP=23;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=32.60;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:2:938,0,2 +chr23 15156123 . A G 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.167;DP=33;FS=8.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=31.39;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:1064,0,159 +chr23 15156173 . C G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-1.397;DP=63;FS=1.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:410,0,1768 +chr23 15156958 . AT A 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-1.051;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:327,0,384 +chr23 15157443 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=1.093;DP=51;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:561,0,935 +chr23 15157492 . A C 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.613;DP=34;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:569,0,348 +chr23 15198098 . T G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=-0.970;DP=37;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:446,0,824 +chr23 15315595 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.232;DP=82;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:449,0,2402 +chr23 15316189 . G T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-1.719;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,27:124:99:567,0,3748 +chr23 15330910 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=3.355;DP=148;FS=10.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,22:148:99:313,0,10124 +chr23 15330912 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=3.219;DP=151;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:313,0,10124 +chr23 15403646 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr23 16443898 . C T 5569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.894;DP=507;FS=17.809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=10.99;ReadPosRankSum=-2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,139:168:99:5598,286,0 +chr23 16443939 . T A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.188;ClippingRankSum=-1.367;DP=563;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=0.66;ReadPosRankSum=1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,44:217:99:398,0,5963 +chr23 16443978 . C CTT,CGT 4186.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.774;DP=188;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,91,22:116:99:5126,736,387,4058,0,3911 +chr23 16444064 . A G 1964.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-1.372;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1993,138,0 +chr23 16445269 . T G 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 +chr23 16445340 . T G 1475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1504,111,0 +chr23 16445391 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.119;DP=27;FS=4.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:312,0,511 +chr23 16445630 . T G 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 +chr23 16445641 . T A 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:523,36,0 +chr23 16446361 . G T 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.046;DP=59;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:782,0,540 +chr23 16446390 . A G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:426,33,0 +chr23 16447612 . T G 458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:487,33,0 +chr23 16447688 . A C 1008.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:72:1037,72,0 +chr23 16447809 . G GA 2955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.484;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,40:48:99:2993,110,0 +chr23 16448100 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=3.665;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=9.99;ReadPosRankSum=-3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:258,0,514 +chr23 16448123 . A G 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:625,42,0 +chr23 16448374 . T C 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:446,30,0 +chr23 16448461 . T A 2246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-1.732;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2275,157,0 +chr23 16448561 . T G 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +chr23 16448563 . T C 255.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:284,0,17 +chr23 16448913 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:99:236,0,337 +chr23 16448979 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.024;DP=50;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:519,0,404 +chr23 16449005 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.363;DP=56;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:259,0,731 +chr23 16449220 . G GA 796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.383;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=28.45;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:44:834,44,0 +chr23 16449681 . A C 7738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-1.404;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:99:7767,548,0 +chr23 16449740 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.300;DP=43;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:255,0,1571 +chr23 16449748 . TA T 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,0:37:99:260,0,8941 +chr23 16449809 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-0.764;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,1:93:99:283,0,5561 +chr23 16449860 . A G 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-0.084;DP=243;FS=20.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,39:166:99:948,0,4817 +chr23 16449986 . C T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-4.957;DP=260;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=4.81;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,49:160:99:1280,0,5737 +chr23 16450032 . T C 4363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=1.778;DP=136;FS=11.397;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=32.09;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,34:44:99:4392,260,0 +chr23 16450051 . A T 5373.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:5402,406,0 +chr23 16450066 . A C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.262;DP=96;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:580,0,881 +chr23 16450108 . TG T 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.778;DP=231;FS=7.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:433,0,2209 +chr23 16450143 . TA T 2544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=-1.031;DP=263;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,65:89:99:2582,0,340 +chr23 16450226 . C T 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 +chr23 16450479 . T C 918.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:947,66,0 +chr23 16450629 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.391;DP=33;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:60:611,0,60 +chr23 16451269 . A C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 +chr23 16451700 . T A 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:27:389,27,0 +chr23 16451722 . G T 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 +chr23 16451768 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-0.562;DP=120;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=3.23;ReadPosRankSum=-2.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:416,0,2526 +chr23 16451804 . A G 2981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=-4.361;DP=240;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,93:160:99:3010,0,2396 +chr23 16451826 . G A 3493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=2.965;DP=283;FS=10.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=12.35;ReadPosRankSum=3.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,97:205:99:3522,0,3429 +chr23 16452091 . A T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=2.037;DP=28;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:612,0,550 +chr23 16452261 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-0.409;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:471,0,2878 +chr23 16452305 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-2.219;DP=13;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:80:258,0,80 +chr23 16452326 . C T 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:271,0,22 +chr23 16452466 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.098;DP=49;FS=6.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:418,0,1310 +chr23 16820320 . TA T 1473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=-0.542;DP=326;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,77:297:99:1511,0,5283 +chr23 16825166 . G A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=-1.936;DP=333;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,70:333:99:1331,0,10029 +chr23 16856816 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=-0.222;DP=52;FS=8.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:374,0,1826 +chr23 16857229 . C A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.141;DP=52;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:886,0,2088 +chr23 16857429 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=-1.790;DP=58;FS=6.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=4.13;ReadPosRankSum=2.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:268,0,1856 +chr23 16857442 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-2.029;DP=63;FS=8.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:278,0,2323 +chr23 16859128 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-1.244;DP=69;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:363,0,2115 +chr23 16859616 . T C 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.434;DP=188;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,43:188:99:870,0,5546 +chr23 16928246 . G T 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.041;DP=40;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:733,0,716 +chr23 17004596 . TCACTGGTAAGTCTGATATTAAACGGTTCTTCATTTGAACGATCAAACTTAAAATAAATGCAATAAAA T 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.741;DP=11;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=31.07;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:99:379,0,747 +chr23 17004667 . TTTTTTTTTATTAAGTTGAACTAGAAAATGCCTTCTTTGTGATCTATAATTGATGTCCTCA T 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:379,0,747 +chr23 17044838 . A AT 1692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-2.492;DP=344;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,101:306:99:1730,0,5625 +chr23 17054238 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.869;DP=38;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:309,0,1032 +chr23 17054356 . TG T 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-2.556;DP=28;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:279,0,461 +chr23 17108424 . A C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=4.305;DP=66;FS=2.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:237,0,2124 +chr23 17108444 . T C 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 +chr23 17125080 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.214;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:236,0,609 +chr23 17127797 . TCTGGAACAAAGAAAAAAATAATAAATGCAACTCAATTTAAATTCAACATATCATCAAACTAAAACTCAC T 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=1.755;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=15.74;ReadPosRankSum=-3.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:352,0,4615 +chr23 17132656 . ACTGCAAAATAGGACATGGTTTCAGAACTTAATATTAAACGTACTTATCTTAACAAATGACTGCATATCTTTAGTAGGAAGCTCATGACAAAC A 1299.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1337,101,0 +chr23 17138192 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.126;DP=30;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:470,0,596 +chr23 17142809 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.024;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:311,0,627 +chr23 17149573 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.326;DP=22;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:259,0,957 +chr23 17150112 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.307;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:307,0,753 +chr23 17168811 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.027;DP=28;FS=10.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:256,0,714 +chr23 17281307 . TAGGTATGAGTTTTCAAGTTTAATTCTTTTTCCATGTAGTTAATATTTAACAATATGATAAACTCTTAC T 3926.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=2.077;DP=109;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=29.24;ReadPosRankSum=2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,93:99:99:3964,0,913 +chr23 17606972 . T C 281.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:309,0,11 +chr23 17628532 . TCTATAAAAGAGATAAAAGTGTCATGTTTGACATTCAAAATATAGATAAATAGACAGATACAGTGGATGCCACTAAGGAGGCAAAAAAGATGATTATAC T 2642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=5.361;DP=79;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=33.45;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,63:79:99:2680,0,5358 +chr23 17629049 . GCCTGTGAGAAGTGAAATGAGTGAACTGTTCTGACTGCTACAAAGATGTTAAATAATAGCACAAATGCTTTCATA G 2829.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=1.569;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=35.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:2867,245,0 +chr23 17955676 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.046;DP=68;FS=9.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:326,0,1983 +chr23 18113474 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=11.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:233,0,542 +chr23 18117726 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.308;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=17.84;ReadPosRankSum=2.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:492,0,633 +chr23 18117739 . T A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.437;DP=26;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=15.91;ReadPosRankSum=2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:442,0,660 +chr23 18153495 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,309 +chr23 18206334 . C G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=2.708;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=14.73;ReadPosRankSum=-1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:426,0,514 +chr23 18289801 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.361;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,38:190:99:677,0,5670 +chr23 18545419 . G T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.461;DP=160;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,32:160:99:543,0,4927 +chr23 18550529 . T A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-1.009;DP=192;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,48:191:99:1079,0,5471 +chr23 18731709 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-0.864;DP=83;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:496,0,2350 +chr23 18733254 . T TG 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=4.215;DP=50;FS=10.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=7.57;ReadPosRankSum=-3.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:435,0,2644 +chr23 18733439 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-0.523;DP=160;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,34:160:99:564,0,5026 +chr23 18743265 . T A 3092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=1.880;DP=728;FS=9.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=4.25;ReadPosRankSum=2.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:570,157:727:99:3121,0,33290 +chr23 18764242 . ATACCTGCATGACAAAACAACAACAAAAAAGGGATGTCAATTTAAATTCAATGAATAGAGAACTTTTTAAAGTTCCGACTCAAAAAAAAATAAAATC A 2380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.472;ClippingRankSum=-0.500;DP=75;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=31.74;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,56:71:99:2418,0,4819 +chr23 18897824 . T C 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.275;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:698,0,669 +chr23 18924421 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.390;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:316,0,670 +chr23 18924433 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=1.074;DP=38;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:461,0,821 +chr23 18927457 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.395;DP=26;FS=7.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:354,0,574 +chr23 18927575 . A G 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=-2.603;DP=42;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=26.54;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1143,0,278 +chr23 18927701 . G C 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-1.270;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=26.82;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:672,0,192 +chr23 18927735 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,304 +chr23 18931093 . T C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.299;DP=49;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:379,0,1358 +chr23 18931549 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-1.184;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,337 +chr23 18933673 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=-0.129;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=14.34;ReadPosRankSum=-2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:401,0,481 +chr23 18934031 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.545;DP=64;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:463,0,1792 +chr23 18934095 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.281;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1107,0,1007 +chr23 18935524 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-1.498;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:521,0,1203 +chr23 18936965 . T C 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.326;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1073,0,367 +chr23 18937866 . T C 2221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-1.715;DP=79;FS=2.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,60:72:99:2250,0,179 +chr23 18939723 . T G 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.441;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=17.86;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,45:64:99:1207,0,438 +chr23 18939749 . A G 2098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.261;DP=71;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,56:71:99:2127,0,307 +chr23 18941564 . T C 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.421;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:97:1319,0,97 +chr23 18944837 . T C 2494.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.763;DP=70;FS=3.889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,63:70:26:2523,26,0 +chr23 18944840 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-1.482;DP=68;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:349,0,2335 +chr23 18948617 . G C 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=1.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=32.25;ReadPosRankSum=-1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1028,0,280 +chr23 18948626 . C A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.460;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:664,0,1050 +chr23 18965784 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.551;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:360,0,2360 +chr23 18965880 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.935;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=4.13;ReadPosRankSum=2.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:276,0,1816 +chr23 19274082 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.107;DP=53;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:421,0,1914 +chr23 19316089 . GACCTACACCACAACAACAGTGTATTACACCAGTGGGGTTCTGATGTTATGGGAGATTAAGACAAATCCCAGTGTTGTCTT G 3880.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.317;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:3918,339,0 +chr23 19770810 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.265;DP=102;FS=4.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=4.86;ReadPosRankSum=3.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,25:102:99:524,0,2940 +chr23 19783036 . TCTATGAAAGAGACAAACAGAGAAATGTCTAAGAATGAAGTCAAGGACAAACCTGTCAGTGGTGTGTCACTCAC T 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.777;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:1057,0,3340 +chr23 19903699 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.107;DP=83;FS=3.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:365,0,1702 +chr23 19916385 . A T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.306;DP=74;FS=4.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:695,0,1934 +chr23 19916402 . T A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=1.256;DP=82;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:1038,0,1806 +chr23 19940477 . TGGTATGAATTATCAGTCTATTAAAGAATTGTTTAGGAGATATTGGACTGTATACTTTCTTTCTCAGGCTATAATTCTTCTTGTGCGCCGGCA T 4581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-2.279;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,99:103:99:4619,378,0 +chr23 20001330 . TCTAAAGAGAAAGAAACCCAACATCAGCGACCGCTTGACAATTACAACTTAGTTTTCATTTGTGTTGCATTAC T 9579.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:9617,954,0 +chr23 20087286 . GGGTATAGATCCTCACCTCTGTATTTGGCTTTAATAATCAATTAAGCTTTTAATTATCTATTATTGGACCCTCTTTGTGCTGTGGTTTTAGAGATCAAACATAAACATCTGCTGTTGTATGTTTATTA G 16701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-0.262;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=30.12;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,395:398:99:16739,1427,0 +chr23 20089217 . CCAGGTATTTGCTGCTGGTTGCCAGTTTTAGATTAAATCTGGTGTATAACTTCCATACTTTATTCAATATCTTCACTCCTA C 13075.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.632;DP=333;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=25.59;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,321:324:99:13113,937,0 +chr23 20089422 . TGGTAAGACTTGCTCTTAATGATCATGCTAATGTTTATTTTGTACTGTAATGCATCTATGTCTGTTGCCCTGTGCACTGCA T 16677.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=-1.043;DP=380;FS=4.466;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=29.67;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,368:379:99:16715,1324,0 +chr23 20104220 . CCGT C 651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.899;DP=100;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:689,0,3187 +chr23 20104224 . AAGTTAAATGAGCTAGTATTAAAAAGTAACTCTTGAGCCAGTGATGTTTTTTATTGAGCTCATGTTTATCATTTTCAG A 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.318;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:448,0,3838 +chr23 20116214 . ACTGAGGGACACAGAGAGGATCACGTCATTACAGAAAAAACACACATGACCTCAAGATTTGAAATGTAGTTCCAC A 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.998;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=34.70;ReadPosRankSum=-1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,39:44:99:1668,0,499 +chr23 20289173 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=1.422;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:564,0,1412 +chr23 20289176 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.921;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:564,0,1396 +chr23 20303647 . TAACACAGGGTTAAAGAGATAGTTTACTTGAAAAAAGAC T 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=27.60;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:534,0,1603 +chr23 20472112 . TCTAAAACAGACGATAAATTTTAGTACACAAATACTCTCTGGAAACAAACATATGAGCTCCACTAAC T 9362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=1.923;DP=222;FS=1.572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=33.92;ReadPosRankSum=-1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,216:222:99:9400,664,0 +chr23 20552983 . T C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-0.307;DP=50;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:531,0,1167 +chr23 20713964 . AGTAAGTCATTCGATATCTTCTCATGTGCATCTGTTTGTGAACGTCACTCAAGCTCACTACATCAAACGCAACACTGTGAATCTGCAG A 26355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.095;DP=444;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,437:438:99:26393,2082,0 +chr23 20718094 . TCTTGAAATTAAAAACAGTACGCTGGTTAGAAATGGGTATGAATATGCAAATGTCGGGTATTTTATATTATAAGAGAACAGTGCTTGTGTATGGCTTAC T 4484.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.622;DP=106;FS=16.833;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,95:106:99:4522,458,0 +chr23 20762848 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.386;DP=38;FS=5.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:303,0,1073 +chr23 20794614 . T TG 1172.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.822;DP=71;FS=3.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.52;ReadPosRankSum=2.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1210,0,1178 +chr23 20796406 . C A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.060;DP=55;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:792,0,1092 +chr23 20805906 . T TG 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.937;DP=60;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:324,0,1472 +chr23 20816288 . AT A 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.417;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:576,0,1176 +chr23 20816290 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.302;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:576,0,1179 +chr23 20944384 . G A 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.229;DP=332;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,88:331:99:1447,0,13245 +chr23 20944692 . C T 2008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.996;DP=388;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,95:386:99:2037,0,10881 +chr23 21131956 . GA G 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=1.684;DP=31;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:371,0,213 +chr23 21559609 . A G 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-0.650;DP=187;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=3.59;ReadPosRankSum=2.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,39:187:99:700,0,12774 +chr23 21559617 . C T 3209.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.608;DP=198;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,89:198:99:3238,0,3617 +chr23 21563585 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-1.262;DP=138;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,32:131:99:704,0,3896 +chr23 21567484 . TG T 5119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.053;DP=191;FS=3.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=26.80;ReadPosRankSum=-2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,136:178:99:5157,0,1231 +chr23 21567488 . A T 5128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:5157,0,1105 +chr23 21567491 . C G 5128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:5157,0,1101 +chr23 21570301 . TGGTAGGAGTCACGGACTTCAATTGATCTCTTAACATCCATGCAGTTGTTATCACATGTAGTCACACTAAATAACTTCAATTTCACCTTCTA T 8486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.537;DP=203;FS=4.709;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,199:203:99:8524,784,0 +chr23 21571080 . TGATTG T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-0.945;DP=31;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:536,0,1461 +chr23 21579052 . T A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=1.832;DP=100;FS=5.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:644,0,2779 +chr23 21600203 . G T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-1.563;DP=114;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:623,0,4490 +chr23 21603278 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.974;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,23:100:99:473,0,2958 +chr23 21607230 . C T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.052;DP=96;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:527,0,2790 +chr23 21611761 . T C 1561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=1.442;DP=101;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.46;ReadPosRankSum=-1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:1590,0,1729 +chr23 21623310 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.326;DP=94;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:474,0,3427 +chr23 21632943 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-1.880;DP=72;FS=3.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:509,0,1984 +chr23 21637803 . A G 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-0.150;DP=127;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,37:126:99:912,0,3449 +chr23 21647979 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.261;DP=104;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:297,0,3292 +chr23 21657181 . C A 1927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.196;DP=151;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,56:150:99:1956,0,3236 +chr23 21671048 . GT G 2350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-1.407;DP=151;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,3:146:99:2388,0,4028 +chr23 21739126 . TA T 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-2.570;DP=23;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:253,0,249 +chr23 21739247 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.869;DP=81;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:349,0,4054 +chr23 21749318 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.189;DP=65;FS=4.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:229,0,2026 +chr23 21749980 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-0.214;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:238,0,642 +chr23 21750212 . G A 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 +chr23 21750690 . G T 1754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=0.047;DP=71;FS=4.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.779;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1783,0,1392 +chr23 21754664 . T A 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 +chr23 21755134 . GT G 513.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.132;DP=47;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:551,0,645 +chr23 21756357 . A AAC 537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:575,41,0 +chr23 21756614 . C T 547.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:576,39,0 +chr23 21756630 . T A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=5.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=31.22;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:29:510,29,0 +chr23 21756788 . C CT 1271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.203;DP=56;FS=3.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:73:1309,0,73 +chr23 21756812 . T G 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.664;DP=40;FS=8.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:1040,0,328 +chr23 21756995 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.812;DP=211;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,33:198:99:414,0,6539 +chr23 21757416 . C T 2447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2476,178,0 +chr23 21763696 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.215;DP=77;FS=3.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:470,0,5359 +chr23 21763697 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.029;DP=77;FS=3.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:470,0,5359 +chr23 21763847 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.562;DP=107;FS=5.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=1.91;ReadPosRankSum=-2.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,18:107:99:233,0,4560 +chr23 21764557 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.753;DP=52;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=5.92;ReadPosRankSum=-2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:336,0,1346 +chr23 21764586 . T C 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.677;DP=41;FS=37.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:674,0,665 +chr23 21764609 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.072;DP=29;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=22.61;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:684,0,708 +chr23 21764611 . T G 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.952;DP=28;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:684,0,708 +chr23 21768276 . CT C 2924.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-2.631;DP=278;FS=6.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,132:263:99:2962,0,2972 +chr23 21795182 . GCTAAAAAAAGAATCATTGAACTGTTAACTTTGATATAACAACACAACTAGAGTGAAGCGCTTACCGAGTAAAATAGTGTTTAC G 449.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.46;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:45:487,45,0 +chr23 21795317 . TCTAGGAACAAAAATGATGACATTTCGAATCCGATTGTACCTCTTTCTAATGTTGATTGAAAGCACTGGGATCTCAC T 530.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.39;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:568,0,693 +chr23 21816103 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.299;DP=252;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,54:251:99:1012,0,12685 +chr23 21816202 . T G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-0.288;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:527,0,3287 +chr23 21816483 . A T 3517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-1.211;DP=298;FS=4.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,103:298:99:3546,0,6674 +chr23 21924569 . ACAGGTGAGACGCAATTCAAACAAACAAGCCATTACATCTAATCCTCCTTCATATTGACAAACACAACCCCTCCCTCTTTCCCCAT A 1667.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=1.485;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=27.48;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1705,148,0 +chr23 21927071 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.341;DP=23;FS=7.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=14.08;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:352,0,458 +chr23 21928338 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.171;DP=33;FS=5.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:539,0,711 +chr23 21928440 . A C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=-0.107;DP=37;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:622,0,685 +chr23 21966608 . GAGGTAATGAGCTGCTGCTGGTATCAATAACCATTAAGATCTAGACTGAATCTATCAATCAATCAATTATTTCCGAACTCATCTTTT G 1098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-1.561;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=27.67;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:96:1136,96,0 +chr23 21999460 . G C 829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:858,60,0 +chr23 22000473 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.296;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=23.23;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:34:307,0,34 +chr23 22000524 . C T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr23 22031562 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.283;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:295,0,615 +chr23 22042578 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=1.030;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:308,0,416 +chr23 22097943 . T C 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 +chr23 22098973 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:43:419,0,43 +chr23 22100272 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:250,0,168 +chr23 22272758 . T A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-1.843;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:716,0,724 +chr23 22324336 . T A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.504;DP=101;FS=2.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:254,0,3171 +chr23 22324542 . G A 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.683;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:1438,0,1309 +chr23 22328615 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.861;DP=65;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:240,0,1961 +chr23 22348703 . TGGTAAGCGGAAACACTGAAATCAATCATTTTTTTGCCATTTGTAAATATGGTAGAATCGATTGTATGTTTTCTGTATGCA T 3212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.017;DP=91;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,76:86:99:3250,0,1701 +chr23 22351598 . G T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-1.759;DP=105;FS=13.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.324;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,30:102:99:767,0,2736 +chr23 22357922 . T TA 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-1.688;DP=144;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,52:138:99:790,0,2182 +chr23 22358503 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.319;DP=184;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,45:184:99:984,0,8472 +chr23 22486657 . T C 1085.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1114,81,0 +chr23 22486777 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 +chr23 22486798 . C T 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:567,39,0 +chr23 22721420 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:355,0,282 +chr23 22722020 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,1028 +chr23 22790838 . C G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=1.098;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:345,0,1262 +chr23 22791124 . TC T 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.837;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:301,0,301 +chr23 22791692 . A G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-1.242;DP=41;FS=4.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:681,0,727 +chr23 22929178 . T A 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.637;DP=89;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:1147,0,3278 +chr23 22929426 . G A 2148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-1.240;DP=248;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,81:247:99:2177,0,6346 +chr23 22929935 . GCCTTGAGAAGGAAAGATCATGTTAGAACAGTCATTACTCAGTAAAATAATGTCAGTATAAATGAATCTCAGTGGTGTTGTGGTATAATTAAATGTCTACTGTATTAGTCTATAGTTGCAGCCACTCCATAAATTACTCA G 914.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=7.114;DP=227;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,141:201:99:952,0,11932 +chr23 22932817 . C CT 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.360;DP=194;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,42:164:99:453,0,3323 +chr23 22937684 . G A 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=-0.485;DP=226;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=8.47;ReadPosRankSum=3.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,74:226:99:1943,0,5802 +chr23 22944719 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.401;DP=31;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:271,0,808 +chr23 22968846 . C T 3089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.897;DP=175;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:3118,0,3082 +chr23 22969037 . CGTGAGTCATTCTGCTGTGGACAGATTTCTATACAAGAGCGCAACTTGCCTGTGTTTGTGATGCACTGTTGCTTTTATCTGCCTTCATTCAG C 16547.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.722;DP=372;FS=3.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,359:360:99:16585,1486,0 +chr23 23079430 . C CA 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.540;DP=64;FS=5.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:561,0,835 +chr23 23079538 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.919;DP=64;FS=4.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:299,0,1826 +chr23 23168575 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.429;DP=67;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:279,0,2012 +chr23 23182936 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-1.526;DP=79;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:576,0,2168 +chr23 23183143 . G A 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-0.625;DP=103;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:1169,0,2105 +chr23 23214025 . T C 3469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.034;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,95:118:99:3498,0,401 +chr23 23217340 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-1.929;DP=187;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,40:187:99:517,0,7769 +chr23 23217679 . C T 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.170;DP=133;FS=3.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,40:133:99:1013,0,3389 +chr23 23220783 . C CT 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.193;DP=117;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=4.66;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,39:110:99:583,0,1709 +chr23 23221359 . CT C 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-3.125;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=3.09;ReadPosRankSum=2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:638,0,730 +chr23 23221689 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.595;DP=47;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:551,0,1236 +chr23 23222080 . G A 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.162;DP=119;FS=3.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,34:119:99:757,0,3264 +chr23 23383193 . GCAGGTACAGAGCCAGGCGTCGAGGGGTTTAGGGGCCATCTGACCGCATCTGAACCCCCCCCTAACCTCTTTTTTTTTCCA G 519.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:99:557,123,0 +chr23 23390637 . A G 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.808;DP=83;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1248,0,1504 +chr23 23412795 . A T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.286;DP=81;FS=3.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:463,0,2161 +chr23 23412957 . C T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.042;DP=133;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,33:132:99:696,0,3643 +chr23 23417288 . G T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.410;DP=86;FS=6.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:597,0,2444 +chr23 23432090 . C A 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.514;DP=82;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:952,0,1803 +chr23 23442228 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-0.049;DP=66;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:522,0,1703 +chr23 23468201 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.533;DP=98;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,24:98:99:559,0,2809 +chr23 23484293 . T A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.172;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:323,0,856 +chr23 23506707 . G C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.606;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:317,0,504 +chr23 23694556 . GCTGGTAAACAAAGATAAAACGTATTTAGATTGTGTATTCAGGAAATTAAATTGCGTTTTTAAAAGCACGTTAAAAGTTTATCATCTTGAGGAATCTGACTTGCAACTTAC G 8123.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=4.646;DP=188;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=31.89;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,179:188:99:8161,697,0 +chr23 23781833 . A C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.360;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:417,0,2742 +chr23 23781960 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=1.000;DP=58;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:502,0,1481 +chr23 23953035 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.231;DP=58;FS=6.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:367,0,1718 +chr23 24041298 . C T 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-1.267;DP=231;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,60:231:99:1225,0,6204 +chr23 24112324 . A C 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=1.619;DP=177;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.254;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,47:177:99:1125,0,4904 +chr23 24112355 . G A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-0.828;DP=152;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,42:151:99:1028,0,4140 +chr23 24117868 . C G 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=-0.787;DP=135;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,41:130:99:1066,0,3404 +chr23 24146964 . C CA 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.006;DP=98;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:259,0,1755 +chr23 24150448 . T C 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.270;DP=172;FS=2.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=3.14;ReadPosRankSum=2.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,32:172:99:569,0,11126 +chr23 24150451 . G T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.623;DP=175;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,32:175:99:569,0,11126 +chr23 24150589 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.724;DP=152;FS=6.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,43:152:99:1056,0,3962 +chr23 24163971 . A G 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.557;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=5.83;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,44:169:99:1014,0,4828 +chr23 24200123 . G T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=1.659;DP=61;FS=2.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:829,0,1342 +chr23 24200708 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-1.291;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:569,0,2603 +chr23 24200906 . CT C 1265.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.184;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:95:1303,95,0 +chr23 24399907 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-2.452;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:326,0,687 +chr23 24425743 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,684 +chr23 24487710 . TA T 243.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:2:279,2,0 +chr23 24489741 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:355,0,505 +chr23 24495059 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=1.184;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:353,0,309 +chr23 24501297 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.335;DP=39;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:258,0,1077 +chr23 24514263 . A G 1835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.987;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:1864,0,2860 +chr23 24514341 . T C 1768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.204;DP=240;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=7.37;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,70:240:99:1797,0,6835 +chr23 24514548 . CT C 1238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-2.099;DP=291;FS=8.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,78:264:99:1276,0,8364 +chr23 24514556 . C A 2105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.714;DP=280;FS=2.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,83:280:99:2134,0,10219 +chr23 24518378 . ACTGAGGAAGAGAGGCAACTTGTAAAGATTATTTTTTACAAAAACTACACATGCCAGGCTATCAAGAGACCACTTAC A 16495.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=1.147;DP=320;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,313:314:99:16533,1293,0 +chr23 24635938 . C CG 335.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:373,30,0 +chr23 24636439 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=4.626;DP=37;FS=8.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:727,0,1272 +chr23 24636444 . C T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=4.600;DP=37;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:727,0,1312 +chr23 24637356 . A C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.095;DP=69;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:313,0,2072 +chr23 24637494 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.317;DP=88;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:287,0,2706 +chr23 24648001 . C G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.343;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:368,0,1642 +chr23 24657405 . G T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-1.567;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.636;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:633,0,1787 +chr23 24726815 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.289;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:374,0,1180 +chr23 24727736 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.582;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:270,0,1145 +chr23 24730948 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.145;DP=48;FS=1.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:364,0,1313 +chr23 24775842 . GCCTATGAAAGTGAGAAGTTGTTTAATGTGCCAACGATTTTGTTCACATACTTGTCAAATTGGTCCCATAAACACACAAAATAAATCGTCAAAATGAAAAACATCAATATCACTGA G 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:263,0,890 +chr23 24791728 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.130;DP=119;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,27:119:99:521,0,3523 +chr23 24803944 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=2.442;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:249,0,962 +chr23 24855857 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.735;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:313,0,501 +chr23 24858094 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,379 +chr23 24879044 . C G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.601;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:310,0,437 +chr23 24882826 . GAGGTCAGGCTCAGTTCTTATTAGTTTTTTAACTGATTTAAGTTCAGTTTAGAGTCATATACTGTGTGTTTTATCCCGC G 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.711;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=31.54;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:605,0,730 +chr23 24940397 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.437;DP=70;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:448,0,1959 +chr23 24951063 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,427 +chr23 24952081 . CA C 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.611;DP=54;FS=5.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:519,0,544 +chr23 24952446 . A AT 560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.433;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:598,0,849 +chr23 24952479 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.330;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:740,0,1363 +chr23 24952839 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-1.239;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:367,0,595 +chr23 24952879 . C A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.992;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,412 +chr23 24956970 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-1.394;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,32:173:99:313,0,8429 +chr23 24959694 . ACTAGCACAGCCGTGGGTTACTACACAACTCTAGAATGCTAGCCAACAAGCATCTAATGAGGGCTTTCTACTCTTATTTTCTACAGGAATGTTATGTTTCCATAC A 6996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=2.742;DP=244;FS=10.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=28.68;ReadPosRankSum=1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,173:233:99:7034,0,19027 +chr23 24982012 . TCCTGTGGAGCCGAGCAGAGACAATATCAGATATCCATTCAAATGGGATGTGATAAAAGTGTGGTTAATGGTTAAACCAA T 6326.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.116;DP=177;FS=1.339;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=32.32;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,145:154:99:6364,109,0 +chr23 24992795 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=2.035;DP=50;FS=2.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:323,0,1330 +chr23 25022666 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.616;DP=50;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:365,0,1317 +chr23 25035330 . C A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-1.166;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:316,0,707 +chr23 25213837 . G T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=1.482;DP=72;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:457,0,1935 +chr23 25213858 . CGGTAAGTAGAAAAGCGTACGAAACAGCTTATGTATAAAGGTAAAATGTGACGCTTCTCGTGTTGTTTTTCTCAACA C 2883.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.605;ClippingRankSum=0.519;DP=82;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=35.75;ReadPosRankSum=-2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,73:82:99:2921,0,1232 +chr23 25257928 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.212;DP=63;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:247,0,2726 +chr23 25264387 . G T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.481;DP=36;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:302,0,912 +chr23 25264399 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=-0.338;DP=35;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:259,0,894 +chr23 25381708 . A C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 +chr23 25381847 . G A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr23 25432722 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:64:229,0,64 +chr23 25437116 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.400;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:681,0,2469 +chr23 25460068 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.785;DP=75;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:530,0,2018 +chr23 25486987 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.395;DP=89;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:377,0,2725 +chr23 25491651 . A G 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.918;DP=121;FS=5.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,35:121:99:841,0,4348 +chr23 25491915 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=1.027;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:249,0,1997 +chr23 25493310 . G A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-1.135;DP=90;FS=8.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:625,0,2509 +chr23 25493994 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=1.382;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:574,0,2371 +chr23 25494488 . C T 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.829;DP=126;FS=6.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,38:125:99:1010,0,3460 +chr23 25497318 . C A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-0.308;DP=72;FS=14.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.144;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:538,0,2036 +chr23 25497973 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.174;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:418,0,2330 +chr23 25498380 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.552;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:348,0,2168 +chr23 25498668 . G T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-1.405;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=4.67;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:528,0,2852 +chr23 25498774 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.100;DP=119;FS=5.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,25:118:99:475,0,3529 +chr23 25503602 . A T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:263,0,102 +chr23 25506138 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.107;DP=82;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:546,0,2461 +chr23 25507884 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.431;DP=119;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:794,0,3307 +chr23 25508537 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-0.014;DP=88;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:524,0,2478 +chr23 25509553 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-1.866;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:401,0,3123 +chr23 25509724 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=-0.073;DP=133;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,46:133:99:1459,0,2861 +chr23 25509917 . G T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.076;DP=117;FS=10.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:924,0,6682 +chr23 25509924 . A T 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.614;DP=119;FS=5.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,33:119:99:907,0,6682 +chr23 25510326 . CAA C 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=-1.088;DP=71;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:385,0,2198 +chr23 25511088 . C CA 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.919;DP=18;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:49:371,0,49 +chr23 25511555 . A G 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=1.006;DP=37;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:818,0,543 +chr23 25511712 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.571;DP=74;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:264,0,3344 +chr23 25511780 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.145;DP=70;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:452,0,2031 +chr23 25512001 . A G 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=-0.154;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:752,0,869 +chr23 25548732 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,338 +chr23 25555991 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.231;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:375,0,379 +chr23 25581114 . C T 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.788;ClippingRankSum=0.781;DP=453;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:356,96:452:99:1613,0,13990 +chr23 25583327 . C T 3028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=1.041;DP=539;FS=4.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:403,136:539:99:3057,0,15377 +chr23 25593779 . C G 3215.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-0.450;DP=486;FS=20.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:351,135:486:99:3244,0,22721 +chr23 25634393 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,680 +chr23 25635360 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,147 +chr23 25711295 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=1.122;DP=63;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:327,0,1908 +chr23 25717670 . GAGGTGATGTTGAGCATGATTTACGTTATTTTGAGAGTGTCCTTCATTAAGCTCTCCACTCAGATTATGTGCTTTTGTTTTGACATAC G 917.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.679;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:99:955,0,536 +chr23 25721994 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.362;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:445,0,770 +chr23 25735403 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.123;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:377,0,546 +chr23 25739111 . C T 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=-0.568;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,43:132:99:1061,0,3088 +chr23 25758230 . G A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.515;DP=116;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,38:116:99:1064,0,2978 +chr23 25777224 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.154;DP=111;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:348,0,3466 +chr23 25801843 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=-0.540;DP=79;FS=1.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=10.29;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:841,0,1554 +chr23 25801969 . C A 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-1.982;DP=93;FS=7.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.33;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:1268,0,1863 +chr23 25802041 . G A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.374;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:1564,0,2132 +chr23 25802116 . TCCTGTACATCATATCAAATCAATTTAAACTAAACTATTTTTTGAGTTTTAGAGACAAGTTTGGGAAGATACACA T 4008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=1.696;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:4046,341,0 +chr23 25806204 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-1.162;DP=85;FS=6.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:537,0,2357 +chr23 25829576 . A C 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.598;DP=68;FS=4.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:819,0,1311 +chr23 25838287 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.975;DP=71;FS=5.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:340,0,2066 +chr23 26022292 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-0.790;DP=112;FS=9.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:648,0,3140 +chr23 26044043 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.484;DP=96;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:482,0,2716 +chr23 26044242 . CAGGTACTGTATATGGGTAAAGAAGACTGTGTAATTAATTATCATTATAACAGATAAATAATGACGACTGACATGTTTGTCA C 4079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.620;DP=129;FS=2.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.597;QD=31.63;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,100:116:99:4117,0,2194 +chr23 26055166 . CT C 340.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-1.391;DP=106;FS=6.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:829,0,807 +chr23 26055311 . GCACACACACACACACACA G 382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:48:420,48,0 +chr23 26058446 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.280;DP=90;FS=2.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:310,0,2649 +chr23 26061666 . GCTGACAAAGAAATGACAGCATGAATGGGCTGGTCACAGAAAAACAATGTGTCCTTTAAAAATAAAAACTGAC G 4805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.258;DP=116;FS=4.276;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=31.12;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,111:116:99:4843,355,0 +chr23 26062084 . GCTGAAGAAAGTGAAAGAACACATCAACCCCAACCTTTGAGACTGGATTACATTACAAGCATTAAAAAGCAGAATAAATGAGCCACAC G 4843.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.675;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=38.80;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,91:93:99:4881,394,0 +chr23 26062425 . G C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-0.629;DP=90;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:274,0,2763 +chr23 26084167 . CA C 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=1.030;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:307,0,156 +chr23 26084570 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-0.839;DP=64;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:853,0,1408 +chr23 26085335 . T C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.154;DP=45;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:530,0,972 +chr23 26148865 . CAGGTACATTAATCATCCTTAAAATGAGATAAGAAGAGCAGAATGTCAAGACTTTTTTTCCTAATGTGATGTTTTTTCTCAACTACTAT C 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.228;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:369,0,420 +chr23 26148867 . GGTAC G 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-1.042;DP=22;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:290,0,547 +chr23 26148873 . TTAATCATCCTTAAAATGAGATAAGAAGAGCAGAATGTCAAGACTTTTTTTCCTAATGTGATGTTTTTTCTCAACTACTATAGAC T 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.050;DP=22;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:290,0,535 +chr23 26152742 . A C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,254 +chr23 26350593 . G GT 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=-1.943;DP=84;FS=4.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:328,0,1513 +chr23 26351883 . T C 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.685;DP=134;FS=3.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=5.79;ReadPosRankSum=-2.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,36:134:99:804,0,4049 +chr23 26362865 . C T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-1.945;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,42:197:99:800,0,5848 +chr23 26380671 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=2.317;DP=40;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=6.82;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:301,0,1068 +chr23 26380711 . CAA C 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=-0.629;DP=33;FS=4.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=6.78;ReadPosRankSum=-2.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,983 +chr23 26382070 . T G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.239;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:685,0,2227 +chr23 26382200 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=1.095;DP=69;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:495,0,2086 +chr23 26387250 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.631;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=17.06;ReadPosRankSum=-1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:506,0,534 +chr23 26398516 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr23 26399845 . A T 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.155;DP=143;FS=4.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,44:143:99:1170,0,3896 +chr23 26451367 . TATCCCATCAGCTTCGTAGAGGAACTGAAGCCGAATAAAGAGC T 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.689;DP=13;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:289,0,1777 +chr23 26465770 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.209;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:354,0,2343 +chr23 26465971 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.505;DP=40;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:566,0,1068 +chr23 26466203 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.476;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:340,0,1026 +chr23 26466394 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-0.391;DP=77;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:401,0,2241 +chr23 26466424 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=-0.485;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:379,0,2060 +chr23 26485891 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.616;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:268,0,1411 +chr23 26526202 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-0.145;DP=44;FS=4.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:333,0,1051 +chr23 26767725 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr23 26781276 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=2.604;DP=86;FS=4.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:458,0,2525 +chr23 26781906 . C CT 771.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-1.687;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:809,0,655 +chr23 26782031 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.817;DP=44;FS=6.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:563,0,998 +chr23 26782572 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.307;DP=55;FS=4.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:309,0,1586 +chr23 26784298 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.649;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:439,0,2690 +chr23 26800783 . C A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.653;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:522,0,2536 +chr23 26805887 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.124;DP=76;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:487,0,2177 +chr23 26833807 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:255,0,432 +chr23 26834764 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=1.072;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:577,0,279 +chr23 26835092 . AT A 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.019;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:247,0,475 +chr23 26840032 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-1.035;DP=92;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,16:92:99:249,0,2942 +chr23 26865722 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.271;DP=94;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:361,0,2841 +chr23 26983722 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=-0.400;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:302,0,1451 +chr23 27292760 . C A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.464;DP=241;FS=2.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=3.43;ReadPosRankSum=4.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,45:241:99:856,0,15216 +chr23 27292762 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.473;DP=242;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=3.45;ReadPosRankSum=3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,48:242:99:864,0,15216 +chr23 27297530 . AAGGTCAGAACGGGTCTTGGTAATAAGTTTAATAATGTTAAACATGTCTTCTATGTTAAATTATGTCTCTTATTATACTTTGTGC A 9618.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=1.335;DP=244;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=31.72;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,233:237:99:9656,692,0 +chr23 27309337 . T C 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=1.107;DP=136;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=4.70;ReadPosRankSum=-2.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,33:136:99:668,0,5726 +chr23 27309839 . G T 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-1.346;DP=122;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,38:122:99:983,0,3072 +chr23 27312188 . C CT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=-1.676;DP=88;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:303,0,2228 +chr23 27312801 . GT G 1715.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.192;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:1753,170,0 +chr23 27315089 . G GT 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.365;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:617,0,2051 +chr23 27315481 . T TC 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.174;DP=24;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:334,0,310 +chr23 27318825 . G GA 358.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:396,39,0 +chr23 27319341 . CA C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-1.950;DP=60;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:267,0,1169 +chr23 27373959 . G A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.229;DP=170;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,41:170:99:948,0,5119 +chr23 27490367 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:281,0,598 +chr23 27685208 . C CA 612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:65:650,65,0 +chr23 27687331 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:266,0,599 +chr23 27688443 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=6.64;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:360,0,1264 +chr23 27695732 . C G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.440;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:878,0,474 +chr23 27739898 . C T 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.758;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:1207,0,1285 +chr23 27749911 . AT A 1018.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.901;DP=44;FS=2.092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,37:41:60:1056,60,0 +chr23 27749983 . G A 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-0.821;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:1187,0,281 +chr23 27752001 . T A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.944;DP=99;FS=12.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:334,0,2641 +chr23 27752029 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.552;DP=92;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:681,0,2474 +chr23 27759133 . G A 1961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-1.641;DP=119;FS=3.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1990,0,2048 +chr23 27801616 . ATAGTCTGCATAAACAGGGGAAAAACACTATTACAG A 9788.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=236;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,230:232:99:9826,0,218 +chr23 27801655 . TGTAAATGATGATACAGAAAATGTAGGAGTGATCAGTAC T 10437.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=1.134;DP=232;FS=2.075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=32.18;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,229:232:99:10475,852,0 +chr23 27817181 . GCTGTGGAAACACATTTAAATGGTTAAAAGTATTCTGGAGGTGTAAAATGTCAGCTTGTGGAATGTTTGAAAACTGCATTGGCTCTGAACAC G 1872.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.161;DP=74;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,48:72:99:1910,0,5495 +chr23 27817559 . AACCTGCATATAGAAAGGAAGATGTGAGGTCACTTCTAAGCCATCAAAAAATGACTAGTATTGCATACATTTGTGCTTTACAATCAT A 3402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=2.586;DP=91;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=27.34;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,83:91:99:3440,0,1254 +chr23 27832148 . A G 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:656,45,0 +chr23 27833202 . G A 1399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.364;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:1428,0,1114 +chr23 27838382 . T A 1663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=-0.962;DP=98;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1692,0,1463 +chr23 27847518 . G T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.279;DP=66;FS=5.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:599,0,2956 +chr23 27847519 . G T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.921;DP=64;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:928,0,2715 +chr23 27862734 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-1.635;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,406 +chr23 27870695 . C G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,193 +chr23 27896450 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=-2.312;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:393,0,438 +chr23 27899109 . A G 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:247,0,23 +chr23 27968845 . T A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-1.286;DP=19;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=31.30;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:76:623,0,76 +chr23 28020559 . GACAGGTGAAGTAGACACCAAGTATACAGTATACATATACAGTTTTGTGTACAATGAGGCAGATTTTAATATTACTGTTTGTTTTTTATACA G 680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.347;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=11.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:99:718,0,593 +chr23 28034587 . G A 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=-0.399;DP=71;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:1375,0,1109 +chr23 28048057 . CCCTGCAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAAATCAGCACACAGGCAAAACACTTTTCAGACATGCAGGAGAAGGATAAACATGCAACTTA C 10702.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=1.348;DP=251;FS=2.403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.356;QD=29.06;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,248:251:99:10740,954,0 +chr23 28249061 . G C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-0.083;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:616,0,610 +chr23 28260544 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr23 28261354 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.843;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:729,0,1213 +chr23 28312857 . T TA 389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:427,36,0 +chr23 28352399 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-1.501;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:317,0,331 +chr23 28423393 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:325,0,307 +chr23 28424771 . C A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.415;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:361,0,250 +chr23 28425027 . A G 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 +chr23 28427688 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-2.007;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:369,0,450 +chr23 28428929 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:272,0,747 +chr23 28443871 . G A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=1.259;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:533,0,539 +chr23 28588303 . G A 5032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.338;DP=333;FS=4.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,143:333:99:5061,0,6360 +chr23 28589744 . G GAA 893.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-7.141;DP=232;FS=8.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=3.85;ReadPosRankSum=-5.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,51:223:99:931,0,6318 +chr23 28620357 . GA G 8745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=2.008;DP=703;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=12.44;ReadPosRankSum=-2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:368,312:680:99:8783,0,9286 +chr23 28623604 . A G 220.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:18:249,0,18 +chr23 28626818 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=2.076;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:280,0,1486 +chr23 28751193 . A G 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=-0.241;DP=161;FS=0.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,60:160:99:1980,0,3365 +chr23 28758582 . G A 2035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.564;DP=117;FS=7.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=17.40;ReadPosRankSum=2.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:2064,0,2033 +chr23 28770989 . T C 3366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-1.846;DP=189;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,94:188:99:3395,0,3431 +chr23 28781428 . G A 3754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.321;DP=251;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,112:251:99:3783,0,4395 +chr23 28784434 . T G 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=1.357;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=8.11;ReadPosRankSum=2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:1001,0,3043 +chr23 28784815 . G T 3674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.201;DP=243;FS=0.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,107:243:99:3703,0,4439 +chr23 28811191 . G A 4121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.324;DP=231;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,116:231:99:4150,0,4229 +chr23 28904287 . A G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.489;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:424,0,2328 +chr23 28926530 . G GT 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=-1.261;DP=90;FS=0.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:692,0,1048 +chr23 29046242 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.887;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,404 +chr23 29201855 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=-0.600;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:436,0,910 +chr23 29605625 . G GT 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.555;DP=88;FS=3.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:423,0,1499 +chr23 30100206 . TA T 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.016;DP=44;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:269,0,534 +chr23 30964957 . G A 778.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:807,57,0 +chr23 30987416 . GGGTATGTTAGACATGTTATCTTCTCAGATTAGTCTTTTGTAAAACTTATTGTAGTTATAGAAAGCAACCTTCCTATGTCTAAGTCTTGTTTCATGTGTGTTTCTCTTCTGCCCACTCCACTA G 6456.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.306;DP=171;FS=4.422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=30.01;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,164:169:99:6494,585,0 +chr23 31005822 . AT A 2718.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=-0.324;DP=241;FS=13.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,149:218:99:2756,0,972 +chr23 31014961 . GCCTGTACAAAAAAAAAAGTGTTTACTCATCAAGCTTTTTTGTCTGTGTAACAGACAGGGATCTAGCTAGGATATTGAAAACACTCA G 7818.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.352;DP=283;FS=1.749;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,250:255:99:7856,759,0 +chr23 31157811 . CA C 1707.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1745,148,0 +chr23 31157857 . G A 1127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1156,81,0 +chr23 31160511 . C T 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 +chr23 31160576 . G T 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 +chr23 31167907 . G A 1206.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1235,87,0 +chr23 31174212 . CA C 449.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:487,48,0 +chr23 31261641 . G T 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr23 31347775 . C A 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 +chr23 31347832 . G T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:469,41,0 +chr23 31350115 . G A 1494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1523,111,0 +chr23 31357292 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr23 31484076 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.603;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:759,0,798 +chr23 31484077 . T A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.516;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=23.57;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:759,0,798 +chr23 31511728 . AT A 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.574;DP=29;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:352,0,330 +chr23 31512579 . TA T 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.373;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:247,0,694 +chr23 31513573 . T C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.436;DP=44;FS=4.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:925,0,1655 +chr23 31514771 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.786;DP=50;FS=10.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:965,0,1975 +chr23 31519470 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.331;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.976;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:759,0,1828 +chr23 31596994 . A G 5518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=-2.858;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=31.47;ReadPosRankSum=2.790 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,117:120:99:5547,415,0 +chr23 31597249 . T TA 704.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-1.174;DP=205;FS=12.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,54:189:99:742,0,3741 +chr23 31619947 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr23 31623265 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,171 +chr23 31660789 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:439,0,148 +chr23 31700397 . T C 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=-0.889;DP=83;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=13.19;ReadPosRankSum=-1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1123,0,1713 +chr23 31700840 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=1.300;DP=24;FS=7.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:589,0,130 +chr23 31702360 . G T 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=-1.543;DP=64;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=19.31;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1264,0,795 +chr23 31843756 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.329;DP=36;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.338;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:429,0,801 +chr23 31881441 . G C 2728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-4.477;DP=167;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=16.34;ReadPosRankSum=3.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,77:167:99:2757,0,2876 +chr23 32001370 . C A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.913;DP=32;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:357,0,748 +chr23 32006577 . G T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.105;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:558,0,850 +chr23 32006730 . AT A 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.646;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:241,0,443 +chr23 32006781 . A C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=1.018;DP=34;FS=7.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=15.20;ReadPosRankSum=-2.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:545,0,639 +chr23 32048697 . G C 1979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.891;DP=144;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:2008,0,2271 +chr23 32140338 . T A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.054;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:672,0,698 +chr23 32151115 . T A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-2.742;DP=54;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:914,0,2085 +chr23 32151118 . T A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-2.262;DP=51;FS=4.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=17.37;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:914,0,2042 +chr23 32151340 . CTG C 1052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=-0.185;DP=69;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.002;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1090,0,891 +chr23 32153906 . GAGGTATTACTTTTTTTTTTTAAAGGGAGGAGTTAAATAAGCACAGATGTGGTATTGCGATATGCATGAAAATTGTAAAAGCAAATGTGTTTATTTTTTTCT G 4701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=1.270;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,121:123:99:4739,396,0 +chr23 32172253 . C G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.035;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:382,0,593 +chr23 32181477 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-1.047;DP=25;FS=10.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:328,0,578 +chr23 32191985 . GT G 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-1.142;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:361,0,267 +chr23 32192032 . G T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.322;DP=24;FS=14.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:369,0,491 +chr23 32201304 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.398;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=9.95;ReadPosRankSum=2.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:267,0,559 +chr23 32201563 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=20.84;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,163 +chr23 32232227 . A C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.815;DP=34;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:476,0,1636 +chr23 32232229 . A T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=-0.842;DP=33;FS=5.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:476,0,1620 +chr23 32257882 . T A 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=-1.596;DP=99;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:1118,0,1781 +chr23 32265674 . CAT C 446.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:484,33,0 +chr23 32272767 . TGGTTTGTATCAGTTGTTTCAACCTTCTTGATGTATTAAGGTTTTGAGTCCCCTTTTTTATGATTGTCATGTTCATCTTAATACTTGCA T 10173.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.922;DP=233;FS=4.813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=29.49;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,209:219:99:10211,941,0 +chr23 32390235 . A C 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 +chr23 32390248 . A C 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 +chr23 32390439 . G T 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-1.080;DP=42;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:786,0,649 +chr23 32394142 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.138;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:541,0,539 +chr23 32438857 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:272,0,311 +chr23 32478177 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=-1.971;DP=58;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:382,0,1710 +chr23 32478197 . T A 1841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.333;DP=69;FS=3.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=26.69;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,48:69:99:1870,0,579 +chr23 32478608 . C CA 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-0.084;DP=62;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:605,0,892 +chr23 32478683 . T C 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.076;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:850,0,2436 +chr23 32478684 . GT G 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.874;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:850,0,2387 +chr23 32478814 . G C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-2.211;DP=51;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1064,0,1564 +chr23 32488765 . TCTGTTTGGAGAAGAGAAGACTGTGCTTTAGTTTCACTCTCATCATTCCGTGTGTGGATGCAGTTGTAGAGATATATCAGAGTCCTAC T 3508.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.231;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=31.59;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:3546,301,0 +chr23 32501299 . A G 1207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.547;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1245,0,1318 +chr23 32548238 . C A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.423;DP=48;FS=14.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:887,0,882 +chr23 32548288 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.152;DP=50;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:644,0,1157 +chr23 32548558 . TA T 220.04 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.510;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:312,0,134 +chr23 32548625 . T TA 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-2.219;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:94:399,0,94 +chr23 32549360 . T C 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:488,33,0 +chr23 32549361 . T G 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:488,33,0 +chr23 32549987 . T A 1133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:84:1162,84,0 +chr23 32593326 . T TA 624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:48:662,48,0 +chr23 32595860 . T TC 924.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.821;DP=49;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,40:43:44:1424,44,0 +chr23 32598067 . G GA 840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:997,100,0 +chr23 32599001 . C CA,CAA 677.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.922;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.976;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,24,12:39:99:987,278,229,560,0,595 +chr23 32599432 . C T 1031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1060,84,0 +chr23 32639132 . G A 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.636;DP=77;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:960,0,1703 +chr23 32639196 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=1.129;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:364,0,2068 +chr23 32639275 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=3.563;DP=52;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:230,0,1637 +chr23 32745827 . C T 5160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-0.682;DP=293;FS=13.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,141:292:99:5189,0,5026 +chr23 32746200 . A T 2610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.289;DP=179;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,74:179:99:2639,0,3595 +chr23 32746634 . TA T 1654.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.765;DP=180;FS=1.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,66:174:99:1692,0,2593 +chr23 32747225 . CA C 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=2.123;DP=147;FS=18.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.414;QD=4.32;ReadPosRankSum=-3.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,39:137:99:673,0,1907 +chr23 32747807 . C A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.583;DP=155;FS=7.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=2.70;ReadPosRankSum=-2.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,16:154:99:447,0,11533 +chr23 32747816 . T A 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=4.316;DP=170;FS=25.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=2.49;ReadPosRankSum=-3.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:461,0,11495 +chr23 32788689 . T A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.872;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:615,0,1238 +chr23 32791920 . A T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.931;DP=44;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:818,0,682 +chr23 32792601 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.935;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:740,0,995 +chr23 32850102 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=1.474;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:720,0,918 +chr23 32858979 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.655;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:516,0,1419 +chr23 33105307 . C G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=-0.054;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:419,0,800 +chr23 33105627 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=1.579;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:236,0,1133 +chr23 33551823 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-1.457;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=23.10;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:421,0,193 +chr23 33571625 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=1.528;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:503,0,589 +chr23 33661758 . CA C 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.435;DP=54;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:416,0,788 +chr23 33840960 . AC A 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.420;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:451,0,324 +chr23 33871146 . C T 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.624;DP=87;FS=12.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:1518,0,1497 +chr23 33934968 . G T 5162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.698;DP=292;FS=0.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,163:292:99:5191,0,4523 +chr23 33942431 . CT C 1556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.952;DP=204;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,79:184:99:1594,0,2044 +chr23 33973653 . T C 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:54:757,54,0 +chr23 33973768 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr23 34148616 . T A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:438,0,607 +chr23 34148618 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:438,0,607 +chr23 34157896 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=1.347;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:345,0,301 +chr23 34157958 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=1.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:350,0,347 +chr23 34161636 . C G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:419,0,125 +chr23 34161665 . T A 1086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1115,81,0 +chr23 34165401 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.154;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=22.66;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:708,0,326 +chr23 34165562 . A G 1657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1686,120,0 +chr23 34165580 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.441;DP=41;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:846,0,552 +chr23 34165809 . A G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=1.402;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:422,0,311 +chr23 34165895 . C T 867.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:896,72,0 +chr23 34166009 . C G 1255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1284,90,0 +chr23 34166087 . A G 1289.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1318,96,0 +chr23 34166183 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=2.003;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=15.34;ReadPosRankSum=-2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:565,0,640 +chr23 34166455 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.207;DP=28;FS=5.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:516,0,503 +chr23 34169139 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr23 34169151 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr23 34286725 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-1.106;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:516,0,462 +chr23 34286726 . A G 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-2.060;DP=28;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=26.28;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:764,0,206 +chr23 34287044 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.246;DP=45;FS=8.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:592,0,965 +chr23 34319834 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:490,0,433 +chr23 34326191 . TGGTGAGTGTTGATGTTTACGTGTTTTTGTTGTCTGTGGCACGTTTTCATTATATACAGTATGTGTTCATTCATGTATGTCCTGTCAATCATTATA T 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=3.485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:96:1248,96,0 +chr23 34354814 . G A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.493;DP=229;FS=18.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.853;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,49:228:99:949,0,6919 +chr23 34616738 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.467;DP=26;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:385,0,510 +chr23 34618927 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=22.70;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:346,0,523 +chr23 34620577 . GT G 479.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.959;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:1:514,0,1 +chr23 35026706 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-1.984;DP=32;FS=12.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:371,0,661 +chr23 35026850 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.090;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,867 +chr23 35187217 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-1.075;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:422,0,609 +chr23 35188963 . A C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=1.110;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:417,0,1055 +chr23 35188964 . AT A 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=1.110;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:417,0,1093 +chr23 35434489 . G A 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.351;DP=63;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1077,0,1122 +chr23 35437939 . C G 1620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1649,114,0 +chr23 35520573 . T C 236.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:265,0,18 +chr23 35520901 . C A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.415;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:565,0,576 +chr23 35520958 . T A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.850;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:695,0,1681 +chr23 35534123 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.774;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:572,0,592 +chr23 35556353 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=1.205;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:707,0,702 +chr23 35570765 . A T 3863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-0.505;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,106:210:99:3892,0,3741 +chr23 35588495 . CCCAA C 578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:48:616,48,0 +chr23 35588976 . C T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.859;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:868,0,875 +chr23 35589053 . C A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=1.216;DP=99;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:379,0,3078 +chr23 35693669 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.872;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:267,0,819 +chr23 35711339 . G GACGAGCTCACTC 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.311;DP=54;FS=12.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:882,0,1005 +chr23 35711342 . G GA 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:882,0,1005 +chr23 35712924 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.342;DP=44;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:679,0,905 +chr23 35713041 . C A 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.414;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=33.28;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1293,0,193 +chr23 35714589 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=2.253;DP=49;FS=6.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:744,0,932 +chr23 35715415 . T TTG 547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-0.104;DP=41;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:585,0,477 +chr23 35716034 . TA T 248.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:15:286,15,0 +chr23 35716217 . GT G 644.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.050;DP=29;FS=3.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:42:682,42,0 +chr23 35743512 . T G 3701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.759;DP=144;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=25.71;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,99:144:99:3730,0,1204 +chr23 35743533 . G A 2087.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2116,150,0 +chr23 35743618 . TCTGCACAGATGGGTCATGAAGACATGTTATCAAACTAATCACACAAATTAATAAATTACTAATAAAATAACACAAAATCATCCATTTTAAAATTTAACCACGTGATCTCAC T 5600.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-1.329;DP=136;FS=8.075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,134:136:99:5638,404,0 +chr23 35743803 . G A 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=3.307;DP=331;FS=67.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=1.82;ReadPosRankSum=4.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,54:330:99:632,0,10464 +chr23 35743824 . A T 15477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=392;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,392:392:99:15506,1174,0 +chr23 35761401 . C T 3859.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3888,280,0 +chr23 35762740 . G A 6830.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-2.292;DP=173;FS=15.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=34.54;ReadPosRankSum=2.364 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,170:172:99:6860,512,0 +chr23 35766427 . T C 13848.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,331:331:99:13877,1005,0 +chr23 35766520 . T C 3312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=-5.740;DP=297;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=11.15;ReadPosRankSum=-5.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,101:295:99:3341,0,5755 +chr23 35766538 . C T 5194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.664;DP=342;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=15.19;ReadPosRankSum=3.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,148:342:99:5223,0,6529 +chr23 35767345 . T C 6272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-2.998;DP=291;FS=214.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,181:291:99:6301,0,3951 +chr23 35767567 . C T 4799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:4828,346,0 +chr23 35831056 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.830;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:244,0,364 +chr23 35835678 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:86:310,0,86 +chr23 35839872 . G A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-1.146;DP=40;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:699,0,499 +chr23 35840438 . G T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=-0.988;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:574,0,626 +chr23 36015082 . T TA 1313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-1.160;DP=176;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,72:169:99:1378,0,1953 +chr23 36016055 . G GCA 509.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:34:547,34,0 +chr23 36033372 . T A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.679;DP=31;FS=9.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=34.15;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:99:1087,0,104 +chr23 36046878 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-1.122;DP=66;FS=5.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:707,0,1555 +chr23 36107742 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.164;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:316,0,2158 +chr23 36138017 . GT G 500.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.022;DP=40;FS=7.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:538,0,372 +chr23 36172649 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:361,0,177 +chr23 36184372 . G GT,GTT 624.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,12,22:34:99:1101,588,493,311,0,243 +chr23 36234117 . T A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr23 36237594 . G T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.394;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:413,0,408 +chr23 36242014 . CT C,CTT 224.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,6:12:99:305,166,194,170,0,196 +chr23 36349015 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.160;DP=47;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:783,0,896 +chr23 36349164 . G GT 1817.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.717;DP=71;FS=2.432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:1900,198,0 +chr23 36349864 . T A 3223.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=-0.800;DP=316;FS=0.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,143:315:99:3252,0,6273 +chr23 36359327 . AGTAAGTGCTGTGTTTCACGGTCAATCTAGTAGTCTTGGAACTTAAAGAAATGAGGTGCTAACAAATGTATTTTCTCCTTTAG A 16170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-0.482;DP=383;FS=2.586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=37.56;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,362:364:99:16208,1276,0 +chr23 36359699 . GAGGTATGTGCCTGACTGGATTCTGAAGATTTTAATGTTATTTCTTTGTAACTTAGTAGTTTTACTGTTATTTT G 1086.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=2.724;DP=229;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,221:229:99:1124,434,0 +chr23 36361151 . G GT 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-0.717;DP=45;FS=4.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:520,0,494 +chr23 36361286 . TA T 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=1.552;DP=40;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:335,0,1408 +chr23 36361748 . G GA 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.623;DP=128;FS=4.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,31:119:99:427,0,2349 +chr23 36361803 . AAGGTAGTTGCTGATTTTAATGTGGCACTCTAGTTTGTTTACAATTTTCCTCCATCTCAAACTTCTTTCTCTCTTCT A 2301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.183;ClippingRankSum=3.415;DP=86;FS=8.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=26.76;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,55:80:99:2339,0,11029 +chr23 36450404 . A G 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr23 36469558 . ATT A,AT 233.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.251;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,11,7:22:99:501,106,218,239,0,266 +chr23 36476976 . C T 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.466;DP=59;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:1143,0,949 +chr23 36533416 . GA G 2731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.950;ClippingRankSum=-0.315;DP=227;FS=4.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,123:204:99:2769,0,3416 +chr23 36691061 . A AT 1367.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1518,146,0 +chr23 36845485 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.227;DP=50;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=6.28;ReadPosRankSum=-3.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:342,0,1459 +chr23 36846236 . C CT 249.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:287,26,0 +chr23 36846950 . CA C 452.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:490,49,0 +chr23 36867747 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-1.091;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:338,0,327 +chr23 36894003 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:307,0,276 +chr23 36980939 . T A 4595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.191;DP=175;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=26.26;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:4624,0,1423 +chr23 36980996 . GA G 3385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.687;DP=275;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=12.31;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,145:226:99:3423,0,3115 +chr23 36981114 . A G 26743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:26772,1884,0 +chr23 36981125 . G T 26735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.640;DP=233;FS=6.168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=33.18;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,207:209:99:26764,1884,0 +chr23 36981208 . A G 3023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.516;DP=370;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,79:333:99:3052,0,9535 +chr23 36981244 . T C 26705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=409;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,382:382:99:26734,1884,0 +chr23 36981421 . T C 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-1.965;DP=236;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=5.77;ReadPosRankSum=2.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,59:219:99:1391,0,8018 +chr23 36981482 . AT A 322.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:32:360,32,0 +chr23 36981486 . A G 331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:32:360,32,0 +chr23 36984272 . C CA 1197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1235,99,0 +chr23 37174602 . G T 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-1.268;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1867,0,1856 +chr23 37183590 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:384,0,216 +chr23 37187997 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.271;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:291,0,421 +chr23 37384826 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=-0.739;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:386,0,487 +chr23 37386655 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=2.053;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:290,0,1757 +chr23 37580963 . TA T 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.648;DP=16;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:274,0,169 +chr23 37583658 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=2.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=15.89;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:346,0,367 +chr23 37583697 . GGGTGAGAACTACACAGATATTAAAGTTTTCAGTCTTTTCTTAATATGCATACGCTGAATCTCCTTTTCCACTCATCTTGGATTTCTA G 815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=1.071;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=29.06;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:80:853,80,0 +chr23 37588759 . A C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr23 37590199 . G C 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr23 37753285 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.012;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:376,0,518 +chr23 37797754 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.240;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:701,0,223 +chr23 37813389 . A T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +chr23 37831868 . A T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=1.217;DP=35;FS=7.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:693,0,516 +chr23 37854253 . T C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=2.290;DP=38;FS=13.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:741,0,1869 +chr23 37854256 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=2.627;DP=40;FS=18.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=17.82;ReadPosRankSum=2.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:741,0,1869 +chr23 37915964 . C T 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 +chr23 38186783 . T C 1283.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.340;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:53:1312,53,0 +chr23 38186925 . G A 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 +chr23 38187091 . G A 436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:465,33,0 +chr23 38187591 . T G 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 +chr23 38244656 . T A 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=-0.078;DP=70;FS=15.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,36:69:99:1173,0,1210 +chr23 38244746 . T A 3548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.081;DP=279;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,104:279:99:3577,0,12964 +chr23 38244807 . A C 4032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.108;DP=271;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=14.88;ReadPosRankSum=2.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,114:271:99:4061,0,5352 +chr23 38355557 . GT G 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.852;DP=47;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:705,0,137 +chr23 38356445 . AT A 679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:717,70,0 +chr23 38920228 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:380,0,360 +chr23 38920595 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.351;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,703 +chr23 38921439 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:296,0,260 +chr23 39049411 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-1.135;DP=86;FS=6.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:703,0,2317 +chr23 39051422 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=3.527;DP=107;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:396,0,3288 +chr23 39051446 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=4.714;DP=96;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,20:96:99:377,0,2941 +chr23 39051464 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=4.140;DP=93;FS=3.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:264,0,2990 +chr23 39051843 . C T 2268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.135;DP=148;FS=3.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:2297,0,2720 +chr23 39052020 . A T 2229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-1.311;DP=141;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:2258,0,2555 +chr23 39052866 . T TTC 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=5.057;DP=63;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=4.92;ReadPosRankSum=-3.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:347,0,1653 +chr23 39052983 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.910;DP=103;FS=12.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,31:103:99:837,0,2749 +chr23 39053029 . A ACT 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=1.354;DP=82;FS=8.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:261,0,2850 +chr23 39053192 . AC A 1202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;ClippingRankSum=-0.778;DP=105;FS=3.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1240,0,1854 +chr23 39053553 . G T 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-2.893;DP=38;FS=12.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=34.20;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:57:1328,0,57 +chr23 39053708 . G T 1653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=1.121;DP=95;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=17.41;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1682,0,1647 +chr23 39053842 . CA C 1042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.302;DP=95;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:1080,0,1286 +chr23 39404094 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=29.83;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:416,0,52 +chr23 39596687 . A C 314.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:28:343,28,0 +chr23 39598116 . T A 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=-0.442;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=33.70;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:47:1073,0,47 +chr23 39598701 . C CT 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.767;DP=26;FS=8.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:510,0,178 +chr23 39599298 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-1.617;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=28.52;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1055,0,192 +chr23 39600125 . GAC G 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:70:241,0,70 +chr23 39673553 . G A 613.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-1.123;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:641,9,0 +chr23 39676496 . A G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr23 39676649 . C T 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 +chr23 39676711 . A G 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 +chr23 39676959 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr23 39677776 . T TA 285.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 +chr23 39678451 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr23 39781483 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=1.902;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:247,0,392 +chr23 39890463 . C CA 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.337;DP=197;FS=4.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,46:167:99:591,0,3004 +chr23 39894774 . G A 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.126;DP=105;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1976,0,1682 +chr23 39896650 . G T 4191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-3.137;DP=152;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=27.58;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,109:151:99:4220,0,1036 +chr23 39902913 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.151;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:408,0,211 +chr23 39903032 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=3.524;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=24.71;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:646,0,218 +chr23 39906436 . T G 1649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.463;DP=58;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=28.44;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1678,0,312 +chr23 39906449 . A G 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-1.034;DP=58;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=20.10;ReadPosRankSum=2.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1194,0,784 +chr23 39911515 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.050;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:1007,0,1349 +chr23 39911585 . A AAC 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.766;DP=49;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:513,0,530 +chr23 39914354 . G C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:398,0,138 +chr23 39946540 . T A 728.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.659;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=34.71;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:16:757,16,0 +chr23 39948206 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr23 39948449 . A T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-0.085;DP=58;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:474,0,1541 +chr23 39948680 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.137;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:423,0,902 +chr23 39948681 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.416;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:378,0,1105 +chr23 39949276 . A C 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:407,36,0 +chr23 39949677 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,235 +chr23 40053403 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:373,0,476 +chr23 40105220 . C A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=-0.059;DP=52;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:451,0,1338 +chr23 40106056 . C G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.312;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:537,0,668 +chr23 40108367 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=8.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,431 +chr23 40108378 . C G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.305;DP=25;FS=6.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:367,0,523 +chr23 40200163 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,209 +chr23 40237742 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:259,0,135 +chr23 40340899 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.42;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:95:230,0,95 +chr23 40342220 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=1.056;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:379,0,797 +chr23 40342236 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.550;DP=30;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:285,0,908 +chr23 40800867 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.689;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:262,0,729 +chr23 40802331 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=1.426;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.947;QD=14.53;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:566,0,728 +chr23 40803698 . G T 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.079;DP=83;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1094,0,1633 +chr23 42656239 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:319,0,131 +chr23 42887690 . AC A 692.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=29.50;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:26:730,0,26 +chr23 42887955 . TG T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,185 +chr23 42887957 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,185 +chr23 43010859 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=3.320;DP=27;FS=29.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.66;ReadPosRankSum=-3.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:478,0,211 +chr23 43062503 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=1.450;DP=35;FS=3.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:529,0,1563 +chr23 43078337 . T G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.816;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:837,0,2742 +chr23 43099629 . C A 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.983;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:712,0,172 +chr23 43099716 . G T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.065;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:703,0,648 +chr23 43099847 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.170;DP=31;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:493,0,1024 +chr23 43099854 . A C 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.694;DP=30;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:493,0,1031 +chr23 43207502 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-0.799;DP=79;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:266,0,2310 +chr23 43207616 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.989;DP=86;FS=7.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=4.10;ReadPosRankSum=2.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:381,0,2478 +chr23 43586275 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=-1.077;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:244,0,1668 +chr23 43626407 . T G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-4.497;DP=118;FS=4.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,23:118:99:415,0,3713 +chr23 43882037 . C G 1803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.712;DP=338;FS=3.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,84:338:99:1832,0,9532 +chr23 43953501 . C CA 532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.714;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=31.34;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:87:570,0,87 +chr23 44159402 . A AT 1033.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:81:1071,81,0 +chr23 44217575 . G GT 364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:56:529,56,0 +chr23 44306280 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.645;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:435,0,676 +chr23 44476474 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.290;DP=85;FS=2.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:420,0,2373 +chr23 44512907 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-0.398;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:839,0,3648 +chr23 44520582 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=1.259;DP=139;FS=2.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,25:139:99:395,0,4091 +chr23 44524425 . C G 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.156;DP=116;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,31:116:99:723,0,3156 +chr23 44524509 . G T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-1.323;DP=127;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,28:127:99:563,0,3585 +chr23 44573752 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.642;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:499,0,683 +chr23 44627533 . G A 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-1.038;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=24.53;ReadPosRankSum=-2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,32:47:99:1181,0,397 +chr23 44631259 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-1.802;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:236,0,829 +chr23 44631766 . T A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=-3.496;DP=55;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:680,0,1125 +chr23 44632441 . A T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.120;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:323,0,616 +chr23 44633022 . GA G 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-1.759;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=20.63;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:388,0,185 +chr23 44633124 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr23 44633130 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr23 44634642 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-1.408;DP=56;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:479,0,1435 +chr23 44635412 . T G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.677;DP=74;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:621,0,1921 +chr23 44635743 . AT A 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=34.12;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:99:242,0,138 +chr23 44635746 . CCCACTTTTGTTTGAATTTCCACTGGATATT C 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:242,0,138 +chr23 44636096 . AGTTTGAATTTCCACTGGATATTCCCGCTTTT A 330.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:35:368,35,0 +chr23 44731810 . C T 12552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;ClippingRankSum=-3.082;DP=689;FS=82.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=18.22;ReadPosRankSum=-3.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,381:686:99:12581,0,11347 +chr23 44755101 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.913;DP=36;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:230,0,953 +chr23 44791587 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.708;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:483,0,1743 +chr23 44855199 . T C 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.148;DP=31;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=20.41;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:661,0,422 +chr23 44871033 . C T 1834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.732;DP=301;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,84:301:99:1863,0,7761 +chr23 44872203 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr23 44884623 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.344;DP=51;FS=4.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:250,0,1418 +chr23 44907881 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-1.271;DP=28;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:347,0,669 +chr23 44908132 . G A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.722;DP=62;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,50:61:99:1905,0,486 +chr23 44908294 . C G 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.588;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1406,0,1480 +chr23 44908403 . T C 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.929;DP=78;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.542;QD=13.74;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:1100,0,1581 +chr23 44908561 . C T 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 +chr23 44908575 . A T 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 +chr23 44908587 . T C 559.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:10:587,10,0 +chr23 44912249 . A G 3713.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:3742,274,0 +chr23 44917738 . G A 2264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.354;DP=100;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,65:100:99:2293,0,1216 +chr23 44921943 . T G 3499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.484;DP=126;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=27.78;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,93:125:99:3528,0,763 +chr23 44922004 . G A 3121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=-1.306;DP=126;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=24.78;ReadPosRankSum=2.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,89:125:99:3150,0,841 +chr23 44922490 . G T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=3.158;DP=55;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:685,0,1211 +chr23 44922545 . A G 1216.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:87:1245,87,0 +chr23 44922635 . T G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=3.283;DP=35;FS=11.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:751,0,507 +chr23 44922647 . T A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=1.550;DP=34;FS=17.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:627,0,799 +chr23 44923483 . T G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr23 44923697 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=6.391;DP=87;FS=0.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:518,0,2355 +chr23 44923780 . T C 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:529,39,0 +chr23 44923936 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr23 44924181 . C T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.127;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=28.89;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:866,0,453 +chr23 44924319 . G T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-2.770;DP=76;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:619,0,2005 +chr23 44924365 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.878;DP=63;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:854,0,2668 +chr23 44924377 . G A 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.248;ClippingRankSum=-0.583;DP=56;FS=3.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:854,0,2740 +chr23 44938564 . A G 1597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1626,117,0 +chr23 44941258 . G T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.500;DP=24;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:651,0,136 +chr23 44941291 . T G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:329,0,310 +chr23 44942921 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.019;DP=33;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:329,0,819 +chr23 44942993 . T C 1116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1145,84,0 +chr23 44945193 . C T 1133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1162,87,0 +chr23 44945214 . A C 1152.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1181,84,0 +chr23 44948011 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.536;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:303,0,788 +chr23 44948020 . A C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:528,0,289 +chr23 44950228 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.066;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=13.16;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:410,0,580 +chr23 44951315 . C T 567.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:596,42,0 +chr23 44952535 . G C 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.227;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1021,0,800 +chr23 44952916 . A T 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:804,57,0 +chr23 44954509 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.172;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:646,0,368 +chr23 44954700 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.089;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:422,0,1311 +chr23 44954763 . G A 1629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1658,120,0 +chr23 44958588 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.336;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:509,0,518 +chr23 44958615 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.094;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:306,0,487 +chr23 44958629 . G T 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1064,78,0 +chr23 44958698 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.937;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:444,0,297 +chr23 44958767 . T A 1063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1092,78,0 +chr23 44960928 . T C 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1095,78,0 +chr23 44964129 . T C 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:746,54,0 +chr23 44964173 . G C 501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:530,39,0 +chr23 44965393 . A G 1443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1472,108,0 +chr23 44965420 . A G 1372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1401,105,0 +chr23 45028418 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=2.445;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:305,0,537 +chr23 45029927 . T G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-0.971;DP=25;FS=4.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:355,0,505 +chr23 45048636 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-1.169;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:727,0,613 +chr23 45061958 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:258,0,424 +chr23 45076447 . G A 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-1.716;DP=59;FS=7.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,37:59:99:1269,0,700 +chr23 45077106 . AC A 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.384;DP=47;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:553,0,993 +chr23 45143938 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-0.605;DP=40;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:284,0,1004 +chr23 45163187 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.519;DP=94;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:470,0,3310 +chr23 45164602 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=1.098;DP=39;FS=2.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:491,0,989 +chr23 45188645 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.595;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:339,0,500 +chr23 45197658 . A G 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 +chr23 45197724 . G A 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 +chr23 45205164 . G T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr23 45205978 . C A 214.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:243,0,19 +chr23 45328132 . C A 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-1.046;DP=69;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:847,0,1529 +chr23 45330450 . C T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.692;DP=58;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:896,0,1073 +chr23 45332427 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-2.158;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:673,0,1142 +chr23 45332600 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-1.414;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:378,0,1324 +chr23 45332615 . G T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=-0.847;DP=60;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:469,0,1551 +chr23 45344117 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.155;DP=47;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:325,0,1239 +chr23 45348726 . C G 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.482;DP=53;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:720,0,1132 +chr23 45356920 . G C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.597;DP=60;FS=4.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:403,0,3321 +chr23 45356929 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.821;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:414,0,3321 +chr23 45365203 . G C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.376;DP=78;FS=3.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.390;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,26:78:99:560,0,2076 +chr23 45382058 . TA T 1043.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.389;DP=277;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,73:257:99:1081,0,5117 +chr23 45474128 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:354,0,258 +chr23 45476133 . T C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=-2.880;DP=74;FS=31.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.60;ReadPosRankSum=-5.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:813,0,1700 +chr23 45479704 . C T 1451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=1.741;DP=69;FS=3.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,44:69:99:1480,0,834 +chr23 45493828 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-1.700;DP=54;FS=13.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=4.87;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:291,0,1535 +chr23 45493843 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=-1.572;DP=65;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:237,0,1916 +chr23 45576366 . G GT 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.829;DP=174;FS=6.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,38:155:99:363,0,2872 +chr23 45585651 . G T 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=-1.314;DP=388;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,89:387:99:1812,0,10959 +chr23 45635676 . T C 731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:760,57,0 +chr23 45635729 . C A 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.299;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,51:86:99:1662,0,1208 +chr23 45651033 . G A 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.185;DP=78;FS=7.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:1384,0,1276 +chr23 45683818 . T C 2039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2068,147,0 +chr23 45756011 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.519;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:311,0,339 +chr23 45756026 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:346,0,384 +chr23 45849352 . T A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.951;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:667,0,640 +chr23 45870325 . C T 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.532;DP=92;FS=7.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1714,0,1457 +chr23 45874616 . G T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=4.316;DP=71;FS=18.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:398,0,3937 +chr23 45884210 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=2.021;DP=44;FS=11.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:675,0,660 +chr23 45885546 . G C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-1.984;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:581,0,576 +chr23 45888567 . A AAG 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.027;DP=27;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:357,0,434 +chr23 45997859 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.156;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:238,0,923 +chr23 46022706 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-1.617;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:309,0,621 +chr23 46048947 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=-0.246;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:399,0,448 +chr23 46105701 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:382,0,282 +chr23 46149578 . C A 2261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=-0.155;DP=149;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:2290,0,2730 +chr23 46161573 . TCTGTTAGCATTAGCAGATAATGTTAATTATCACTATGATCTGATATAATACTGCAGACGTGAGCTAAAGCTGTAC T 7876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.832;DP=176;FS=4.411;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=28.41;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,171:175:99:7914,694,0 +chr23 46185354 . G A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.547;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:984,0,251 +chr23 46191715 . G A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.231;DP=48;FS=18.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=18.00;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:892,0,792 +chr23 46193639 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.668;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:415,0,310 +chr23 46197071 . A C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.455;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:585,0,1186 +chr23 46197788 . A AT 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-1.030;DP=21;FS=10.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,557 +chr23 46200661 . C CTG 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-1.418;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,387 +chr23 46201432 . C T 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-2.873;DP=52;FS=9.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=18.53;ReadPosRankSum=3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:992,0,1551 +chr23 46201433 . T C 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-2.845;DP=50;FS=7.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=19.14;ReadPosRankSum=3.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:985,0,1551 +chr23 46278849 . G T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.103;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1280,0,714 +chr23 46374214 . C T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.464;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:773,0,1438 +chr24 1668 . A G 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.783;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,38:146:99:878,0,4063 +chr24 55098 . C G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.242;DP=75;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:389,0,2038 +chr24 218093 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.727;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:377,0,450 +chr24 225123 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.913;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=12.95;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:326,0,503 +chr24 225361 . C G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.195;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:234,0,754 +chr24 284366 . G C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.972;DP=22;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,465 +chr24 353378 . C T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.620;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:588,0,577 +chr24 425614 . C T 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.701;DP=277;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,62:277:99:1249,0,8254 +chr24 426498 . G A 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.143;DP=230;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,46:229:99:824,0,7224 +chr24 478460 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.502;DP=141;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,26:141:99:398,0,4380 +chr24 481805 . C T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.681;DP=144;FS=9.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,36:144:99:847,0,4295 +chr24 482069 . T A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=-3.599;DP=161;FS=6.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=2.10;ReadPosRankSum=2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,27:161:99:367,0,9990 +chr24 482071 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-3.956;DP=168;FS=8.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.220;QD=2.02;ReadPosRankSum=2.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,27:168:99:367,0,9990 +chr24 483584 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=1.202;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:392,0,2014 +chr24 483585 . A G 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.431;DP=68;FS=4.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1076,0,1246 +chr24 483589 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.037;DP=66;FS=6.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:353,0,2187 +chr24 483720 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=-0.161;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:256,0,3536 +chr24 485502 . AAC A 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.892;DP=85;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:279,0,712 +chr24 485742 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-1.161;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,32:157:99:620,0,4999 +chr24 486578 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=-0.152;DP=119;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:400,0,4863 +chr24 487537 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=-0.061;DP=126;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=1.83;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,22:126:99:259,0,4497 +chr24 489849 . C CT 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-2.585;DP=89;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.210;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:469,0,1419 +chr24 518384 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.276;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:229,0,630 +chr24 521785 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.998;DP=72;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:308,0,2258 +chr24 521814 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.264;DP=82;FS=4.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:252,0,2624 +chr24 534980 . G GCA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.006;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:319,0,1897 +chr24 942469 . G C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:268,0,565 +chr24 948359 . G T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=1.545;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:254,0,819 +chr24 957629 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-0.868;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:367,0,1081 +chr24 958931 . T C 370.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.34;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:6:398,0,6 +chr24 982131 . G A 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-0.005;DP=79;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=20.41;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,48:79:99:1641,0,1085 +chr24 987747 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.040;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:237,0,3140 +chr24 988707 . GCCTGCAAACAACAACAACAGCAGTTCAGATTCTGCCATGCATCAACATCGGTCTCTGCAAGAAGAACAGCGCACACA G 3532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=2.836;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=34.98;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,84:101:99:3570,0,2605 +chr24 997898 . T G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-2.009;DP=53;FS=7.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:625,0,1092 +chr24 1022999 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.662;DP=91;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:588,0,2376 +chr24 1027955 . C T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.043;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:920,0,3760 +chr24 1033856 . T G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-0.352;DP=44;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:915,0,1525 +chr24 1033862 . A G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.108;DP=44;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:915,0,1525 +chr24 1033942 . G A 2814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.539;DP=111;FS=4.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=25.36;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,74:97:99:2843,0,499 +chr24 1033974 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.507;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,26:112:99:494,0,3293 +chr24 1035602 . G A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.508;DP=111;FS=3.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:690,0,2875 +chr24 1035660 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=1.352;DP=66;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1007,0,1092 +chr24 1122615 . C A 1440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.209;DP=88;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:1469,0,1524 +chr24 1123482 . A T 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=-0.780;DP=218;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,54:218:99:1123,0,6504 +chr24 1133229 . G T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=-2.228;DP=261;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.353;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,46:261:99:691,0,17009 +chr24 1133232 . G T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=-2.213;DP=275;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,47:275:99:709,0,17009 +chr24 1133376 . C T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.994;DP=262;FS=5.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=2.35;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,53:262:99:644,0,7799 +chr24 1140616 . G A 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=-1.629;DP=192;FS=0.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,51:191:99:1131,0,7027 +chr24 1163954 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.769;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:230,0,1334 +chr24 1175011 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=-0.287;DP=80;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:533,0,2166 +chr24 1181853 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.127;DP=148;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=5.94;ReadPosRankSum=2.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,40:148:99:908,0,3995 +chr24 1316532 . A G 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-2.201;DP=167;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,36:167:99:678,0,4746 +chr24 1425693 . T TA 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:37:312,0,37 +chr24 1425702 . A T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:31:386,0,31 +chr24 1425932 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=1.837;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:303,0,581 +chr24 1459313 . G C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:295,21,0 +chr24 1459324 . G A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr24 2228990 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.599;DP=42;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:305,0,1132 +chr24 2229003 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.013;DP=47;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=4.61;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:245,0,1325 +chr24 2375966 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:460,0,120 +chr24 2559551 . G A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=1.050;DP=114;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,26:114:99:569,0,3504 +chr24 2559567 . G T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=1.049;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:465,0,3060 +chr24 2754058 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,317 +chr24 3136201 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.677;DP=146;FS=3.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,38:145:99:621,0,4034 +chr24 3240864 . T A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-5.547;DP=132;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,30:132:99:649,0,8284 +chr24 3240871 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-5.555;DP=127;FS=7.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=4.89;ReadPosRankSum=4.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,25:124:99:649,0,8284 +chr24 3241056 . A C 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-1.418;DP=106;FS=0.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:1424,0,2334 +chr24 3241131 . CAA C 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-0.445;DP=60;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:516,0,1564 +chr24 3241621 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.229;DP=64;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:378,0,1808 +chr24 3416602 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,655 +chr24 3491751 . C CAT 989.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.076;DP=56;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1027,0,1277 +chr24 3547578 . C A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=-1.316;DP=128;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,24:128:99:397,0,4162 +chr24 3547982 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=2.663;DP=47;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,9:47:99:419,0,2470 +chr24 3556690 . ATC A 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:399,0,448 +chr24 3556785 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.253;DP=69;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:433,0,2028 +chr24 3604348 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.170;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:277,0,2102 +chr24 4080942 . C G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.611;DP=48;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:687,0,1063 +chr24 4080998 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=3.324;DP=23;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:231,0,625 +chr24 4219640 . TA T 1311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.059;DP=214;FS=0.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,67:203:99:1349,0,2727 +chr24 4501552 . AACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC A 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=3.665;DP=33;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=10.02;ReadPosRankSum=-2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:368,0,1328 +chr24 4505637 . T G 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.026;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:435,0,738 +chr24 4527731 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.794;DP=81;FS=6.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:448,0,2253 +chr24 5061483 . A T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.143;DP=37;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:443,0,897 +chr24 5369475 . T C 1788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=1.448;DP=93;FS=1.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,56:93:99:1817,0,1307 +chr24 5393608 . TG T 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.969;DP=105;FS=3.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1332,0,1611 +chr24 5562550 . G A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr24 5562583 . G T 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 +chr24 5735081 . GT G 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.449;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:247,0,216 +chr24 5924256 . G T 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 +chr24 5978622 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-2.159;DP=28;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=32.71;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:99:944,0,265 +chr24 5983571 . T G 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-2.323;DP=57;FS=15.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1037,0,1085 +chr24 5999856 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:454,0,278 +chr24 6013734 . T A 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.276;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:511,0,465 +chr24 6199810 . T A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.921;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:481,0,193 +chr24 6200241 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:382,0,242 +chr24 6200467 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.264;DP=18;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=20.99;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:406,0,184 +chr24 6200692 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.191;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=25.59;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:668,0,184 +chr24 6200834 . A T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=23.60;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:453,0,190 +chr24 6200902 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,224 +chr24 6201518 . C A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:279,0,229 +chr24 6202326 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr24 6202365 . A G 554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:583,45,0 +chr24 6203632 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:311,0,143 +chr24 6216740 . C A 1781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-0.452;DP=81;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=22.00;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:1810,0,936 +chr24 6217443 . C T 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.522;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1477,0,332 +chr24 6218054 . T A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.309;DP=51;FS=3.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,42:51:99:1629,0,153 +chr24 6219308 . T TTA 1278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1316,100,0 +chr24 6219483 . TA T 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-2.404;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=28.41;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:577,0,146 +chr24 6219485 . T G 577.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-1.897;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=30.41;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:644,0,146 +chr24 6219719 . A T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-2.510;DP=32;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=19.34;ReadPosRankSum=2.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:647,0,923 +chr24 6219732 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.481;DP=27;FS=6.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=22.92;ReadPosRankSum=2.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:647,0,923 +chr24 6219887 . A T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.348;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=17.07;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:438,0,406 +chr24 6219921 . A T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.423;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:557,0,458 +chr24 6220110 . A T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-1.468;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:744,0,1407 +chr24 6220752 . C CT 549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-2.096;DP=52;FS=11.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:587,0,561 +chr24 6236515 . C T 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.621;DP=63;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.134;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,40:63:99:1333,0,773 +chr24 6297623 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.431;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:319,0,579 +chr24 6303243 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=-1.620;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=25.21;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:356,0,101 +chr24 6378261 . C T 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:460,36,0 +chr24 6427928 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.441;DP=47;FS=4.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:837,0,699 +chr24 6445528 . T TA 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-0.248;DP=43;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:461,0,495 +chr24 6445550 . CAT C 1446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.772;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1484,0,1351 +chr24 6445945 . A AT 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;ClippingRankSum=1.070;DP=93;FS=8.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:255,0,1910 +chr24 6446368 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=-4.929;DP=96;FS=14.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=3.79;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:392,0,5330 +chr24 6446369 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-4.559;DP=97;FS=12.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,19:97:99:392,0,5330 +chr24 6446404 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=6.129;DP=132;FS=0.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:931,0,7708 +chr24 6583785 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,167 +chr24 6594655 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:278,0,64 +chr24 6594794 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:39:367,0,39 +chr24 6596091 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.116;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:274,0,418 +chr24 6677075 . G C 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-1.183;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:722,0,623 +chr24 6677243 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.175;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:767,0,1044 +chr24 6677293 . G C 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.433;DP=56;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=13.73;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:797,0,1137 +chr24 6677350 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=1.770;DP=57;FS=7.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,31:57:99:1066,0,929 +chr24 6677429 . C T 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.443;DP=45;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:863,0,839 +chr24 6677442 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.707;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:758,0,914 +chr24 6677504 . T C 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.142;DP=34;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:733,0,446 +chr24 6677621 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:990,70,0 +chr24 6677879 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=2.674;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:346,0,627 +chr24 6677966 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.149;DP=45;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:846,0,617 +chr24 6678022 . A G 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.121;DP=44;FS=4.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:567,0,940 +chr24 6678323 . T C 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 +chr24 6678383 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.644;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:457,0,527 +chr24 6678454 . G A 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1080,78,0 +chr24 6678557 . A G 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:57:821,57,0 +chr24 6678559 . A T 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:57:821,57,0 +chr24 6678628 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-0.310;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:499,0,605 +chr24 6678665 . T C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.018;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:582,0,628 +chr24 6685697 . G A 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:569,39,0 +chr24 6785653 . A G 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:456,33,0 +chr24 6795492 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:229,0,57 +chr24 6804334 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.440;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:652,0,646 +chr24 6841642 . GCCTGAAAGACACACTCAAGCATATCACATTATCATCTCCAGCGCCATCCTCATATTTACAGTCGTTCACAGTCTTTA G 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:518,0,1021 +chr24 7468018 . G A 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 +chr24 7662080 . GA G 535.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.460;DP=28;FS=2.269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:15:573,15,0 +chr24 7783042 . G A 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 +chr24 7975140 . C G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.893;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:299,0,300 +chr24 8023833 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=2.067;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:267,0,622 +chr24 8052905 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:317,0,214 +chr24 8052914 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=32.09;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:317,0,214 +chr24 8053960 . A T 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:282,0,22 +chr24 8055505 . A T 7071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.542;DP=264;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=26.79;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,185:264:99:7100,0,2017 +chr24 8056141 . T C 1526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.076;DP=229;FS=6.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,65:226:99:1555,0,7342 +chr24 8056657 . A G 9388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.232;DP=334;FS=0.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=28.11;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,244:334:99:9417,0,2340 +chr24 8060710 . A G 15309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.077;DP=533;FS=8.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=28.72;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,406:533:99:15338,0,2705 +chr24 8521543 . T TA 4215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.021;DP=240;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=17.57;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,177:239:99:4344,0,852 +chr24 8540132 . G A 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr24 8540939 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.198;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:315,0,569 +chr24 9373637 . A G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.844;DP=115;FS=3.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,25:115:99:467,0,3241 +chr24 9467397 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=20.78;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,141 +chr24 9467566 . C A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr24 9467575 . A T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:264,18,0 +chr24 9476946 . GCCTTCGGGGGGGAAAAAAAAACATCACCACATTTAGTCTTTACACATTCTTGTTTTATGAATGAGGAAATATTAGTGTTAAGTGTGAGATGCCAA G 4947.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.099;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,110:112:99:4985,404,0 +chr24 9479244 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=2.110;DP=106;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,19:105:99:286,0,3324 +chr24 9490157 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=1.749;DP=55;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:324,0,1620 +chr24 10119622 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=1.767;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:348,0,660 +chr24 10120464 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-1.056;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,627 +chr24 10149169 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=13.19;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:292,0,404 +chr24 10215953 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.019;DP=235;FS=8.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,58:233:99:1222,0,6544 +chr24 10216613 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.519;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:247,0,1015 +chr24 10832174 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.684;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:249,0,758 +chr24 10834159 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.152;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:300,0,364 +chr24 10842560 . CT C 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.792;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:583,0,622 +chr24 10848332 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.255;DP=25;FS=6.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:301,0,552 +chr24 11129071 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.763;DP=31;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:270,0,1662 +chr24 11129072 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-2.720;DP=31;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:270,0,1662 +chr24 11225170 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:349,0,214 +chr24 11229385 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,426 +chr24 11239519 . G C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:257,0,136 +chr24 11256063 . C T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=-1.605;DP=142;FS=11.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.092;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:800,0,4102 +chr24 11303080 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-1.368;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:315,0,370 +chr24 11369762 . C G 442.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.668;DP=25;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:1:468,0,1 +chr24 11726970 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 +chr24 11920421 . T G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.942;DP=30;FS=14.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=28.49;ReadPosRankSum=-2.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:883,0,132 +chr24 11920479 . G A 6380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=2.066;DP=167;FS=5.255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,155:165:99:6409,381,0 +chr24 11921643 . C A 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr24 11923998 . C T 1523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-1.300;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=31.61;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1552,111,0 +chr24 11924039 . G A 7038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.930;DP=203;FS=7.566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=34.67;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,164:174:99:7067,413,0 +chr24 11924159 . C T 2854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=4.224;DP=76;FS=134.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=33.40;ReadPosRankSum=2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,64:76:99:2883,0,100 +chr24 11924343 . T A 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:413,30,0 +chr24 11925211 . A T 2396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=-1.466;DP=84;FS=43.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=28.53;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,61:73:99:2426,0,166 +chr24 11950267 . T C 559.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:588,41,0 +chr24 11950272 . T C 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:47:688,47,0 +chr24 11951275 . G T 802.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.237;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=34.87;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:11:830,0,11 +chr24 11951384 . A C 757.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-0.180;DP=22;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=34.44;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:25:786,0,25 +chr24 11951423 . T C 1231.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-0.946;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:87:1260,87,0 +chr24 11951478 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.091;DP=21;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,465 +chr24 12871114 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.828;DP=106;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:385,0,3031 +chr24 12871181 . GCTGCAGGATAACAAAATAACAAAACAGGTGCTATAAAAATAAAAAGGTTGATAATAAAGCAGGATATTCTGGTTGTGCTGACAGAC G 4237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=2.054;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=22.79;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,92:95:99:4275,377,0 +chr24 12874947 . A T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.375;DP=86;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.165;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:379,0,2531 +chr24 12927187 . C T 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-1.186;DP=364;FS=6.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,81:364:99:1551,0,10750 +chr24 13143178 . A T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-2.247;DP=168;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=2.50;ReadPosRankSum=2.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,30:166:99:449,0,7674 +chr24 13159533 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.201;DP=134;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,33:134:99:719,0,3855 +chr24 13917820 . TA T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.520;DP=63;FS=2.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:249,0,1139 +chr24 14138488 . A G 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.753;DP=200;FS=2.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,49:200:99:1091,0,6006 +chr24 14289538 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.031;DP=78;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:306,0,2331 +chr24 14320098 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-1.381;DP=97;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,17:97:99:265,0,3156 +chr24 14446640 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-1.025;DP=71;FS=12.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:340,0,3174 +chr24 14464684 . GC G 2189.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.636;DP=153;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:2227,0,2276 +chr24 14469270 . A AT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-1.225;DP=45;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:243,0,537 +chr24 14481384 . C CGA 610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-2.772;DP=363;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,57:307:99:648,0,8539 +chr24 14524907 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:229,0,431 +chr24 14524908 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:271,0,404 +chr24 14526023 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-1.620;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:423,0,634 +chr24 15123600 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:234,0,350 +chr24 15135684 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,267 +chr24 15978946 . G C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.985;DP=171;FS=1.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:340,0,3658 +chr24 15979022 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.035;DP=117;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:649,0,3500 +chr24 15979025 . A G 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=1.355;DP=116;FS=12.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:582,0,3471 +chr24 16079362 . T G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr24 16369341 . T G 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.344;DP=174;FS=6.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,46:172:99:1088,0,4735 +chr24 16370039 . A G 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.024;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=30.93;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1018,0,113 +chr24 16370077 . A T 2867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=3.564;DP=150;FS=23.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=19.12;ReadPosRankSum=-3.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:2896,0,5317 +chr24 16370078 . G C 2867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=3.978;DP=164;FS=12.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=17.49;ReadPosRankSum=-3.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:2896,0,5317 +chr24 16370359 . T G 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 +chr24 16370666 . G GA 2619.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.785;DP=153;FS=3.445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,115:122:99:3109,312,0 +chr24 16371617 . TA T 2797.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=-2.261;DP=578;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:363,180:543:99:2835,0,8888 +chr24 16371961 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.632;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:33:611,0,33 +chr24 16372184 . T G 374.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:403,27,0 +chr24 16372224 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr24 16372919 . T A 5569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:5598,385,0 +chr24 16372977 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=4.521;DP=31;FS=79.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=9.25;ReadPosRankSum=-2.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:315,0,911 +chr24 16373147 . G T 1324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.249;DP=40;FS=3.871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=33.12;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:61:1353,61,0 +chr24 16407972 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.256;DP=16;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,241 +chr24 16407989 . T TA 239.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.791;DP=16;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:4:275,4,0 +chr24 16409659 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.380;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,521 +chr24 16412352 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=29.20;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:43:437,0,43 +chr24 16747859 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.702;DP=47;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:341,0,1320 +chr24 16748238 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-1.080;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,52:150:99:1405,0,6685 +chr24 16749823 . A T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=-0.227;DP=97;FS=6.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=3.92;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:408,0,3803 +chr24 16754697 . G T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:320,0,417 +chr24 17463805 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.910;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:349,0,2067 +chr24 17547996 . CT C 207.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=38.08;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:0:242,0,0 +chr24 17727197 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-1.431;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:314,0,880 +chr24 17727605 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:279,0,180 +chr24 17728543 . A G 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:629,45,0 +chr24 17763869 . C T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=2.885;DP=164;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=3.93;ReadPosRankSum=-2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,39:156:99:672,0,6811 +chr24 17764326 . C CT 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.895;DP=218;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=1.83;ReadPosRankSum=-2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,46:208:99:436,0,4394 +chr24 17764949 . C CT 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.024;DP=191;FS=0.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,39:176:99:460,0,3249 +chr24 17913886 . CA C 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=1.775;DP=19;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:321,0,212 +chr24 18994925 . T C 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.659;ClippingRankSum=-2.647;DP=497;FS=5.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.050;QD=1.26;ReadPosRankSum=3.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:420,76:496:99:656,0,16237 +chr24 18995640 . G A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.475;DP=411;FS=4.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=1.50;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:348,63:411:99:646,0,25370 +chr24 18995650 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=-6.013;DP=305;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=2.02;ReadPosRankSum=5.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,31:305:99:645,0,25370 +chr24 19106631 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=-0.701;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:322,0,1250 +chr24 19303704 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=0.811;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:346,0,1753 +chr24 19325619 . T A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.145;DP=72;FS=5.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:638,0,1842 +chr24 19340367 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.503;DP=59;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:295,0,1827 +chr24 20255805 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.859;DP=48;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:261,0,2635 +chr24 20256965 . T TA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.388;DP=70;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:238,0,1294 +chr24 20258354 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.646;DP=135;FS=21.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,29:135:99:567,0,4035 +chr24 20258775 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.082;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:99:513,0,3400 +chr24 20809012 . TCTGTGATAAAAGAAGAACATTAAAAGAACAATCCTCTCTCTTTGTTTTCGTCGGTATTATAAAAGAAGACTTATAAGCCTCAC T 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=2.404;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=27.31;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:365,0,2038 +chr24 20937448 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.107;DP=72;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:231,0,2914 +chr24 21019976 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-1.104;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:455,0,2098 +chr24 21146006 . C A 1769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.904;DP=434;FS=6.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:331,91:422:99:1798,0,12891 +chr24 21147753 . A T 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=1.775;DP=325;FS=5.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,64:324:99:1036,0,9296 +chr24 21157894 . G A 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.391;DP=349;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,92:349:99:2171,0,9983 +chr24 21160708 . TGGTAAGAGACCCAATCTAAGCTTACATGAAGACTACAACAAAATATGACATTAATGAACATGTCCTGCTCCACA T 10767.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-1.275;DP=329;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,291:301:99:10805,0,902 +chr24 21160830 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.694;DP=319;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,56:318:99:730,0,10438 +chr24 21161218 . G A 2047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.959;DP=356;FS=9.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,90:356:99:2076,0,10156 +chr24 21163075 . A G 1511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=-0.306;DP=264;FS=1.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,70:264:99:1540,0,7324 +chr24 21174763 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-0.413;DP=102;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=2.00;ReadPosRankSum=2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,18:101:99:232,0,3147 +chr24 21174811 . C A 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.980;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,30:109:99:711,0,3503 +chr24 21179345 . C A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-1.880;DP=163;FS=1.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,39:162:99:811,0,4701 +chr24 21179897 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.114;DP=61;FS=7.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:264,0,1872 +chr24 21184707 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.584;DP=37;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.142;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:234,0,1060 +chr24 21253216 . TCCTGAATTAAAAAAAATATATATGCAAACACTTAAAAAAAAGGTGTACAGAATTAACATATAGATATTAAAAACAATGTCTTCTAAAATCAA T 4965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=2.687;DP=135;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=26.44;ReadPosRankSum=-4.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,120:130:99:5003,0,310 +chr24 21254466 . G A 1315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.454;DP=174;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,51:173:99:1344,0,4791 +chr24 21254916 . T A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.411;DP=171;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,41:171:99:932,0,5031 +chr24 21259143 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.454;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:288,0,3416 +chr24 21501843 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=1.420;DP=77;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,14:77:99:252,0,2452 +chr24 21506231 . G GT 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-0.414;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:255,0,2033 +chr24 21506511 . CACCTGTTCAAAAGAAAAAAATGTAAGAACAAAAAAATTTCGATTTAGGAATGAGGAATTCGTTTAGGAATGAGTTT C 2967.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=2.344;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=27.01;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:3005,271,0 +chr24 21506674 . C G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.335;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,25:109:99:521,0,4478 +chr24 21512117 . C A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.815;DP=66;FS=4.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:363,0,1919 +chr24 21525550 . T C 3149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.505;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=31.50;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,83:100:99:3178,0,257 +chr24 21561681 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.487;DP=133;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,33:133:99:746,0,3925 +chr24 21599812 . G A 633.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.205;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:11:661,11,0 +chr24 21602815 . C A 549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:578,42,0 +chr24 21614357 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:231,0,111 +chr24 21763171 . G A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.499;DP=141;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:842,0,4023 +chr24 21769875 . C T 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=2.090;DP=150;FS=9.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,43:150:99:1042,0,3946 +chr24 21783430 . G C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-1.361;DP=176;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,39:176:99:747,0,5225 +chr24 21790273 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.578;DP=170;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=4.08;ReadPosRankSum=2.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:721,0,5166 +chr24 21791372 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.089;DP=150;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,33:149:99:658,0,4628 +chr24 21807418 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.098;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:258,0,706 +chr24 21814930 . G GT 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-1.045;DP=100;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:707,0,1029 +chr24 21819120 . C A 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-2.033;DP=217;FS=5.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,60:216:99:1392,0,5852 +chr24 21819191 . G A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-1.237;DP=218;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,44:218:99:765,0,6696 +chr24 21820791 . G A 1930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=1.857;DP=263;FS=0.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,77:263:99:1959,0,7377 +chr24 21825824 . GCTGCGGACACAAAAATGATGATCAATGACAGAACAAAACACCAGCAAACCACACACATTCACTAACACACCACACACACTTACTGTCATCATCCTTCATTTAGGAGTGTAAAAGATCAAGAGAACAGTAGTGTTAGCGTCACTTGTCAAGTACGTAATCTTATAGTTCCAAAATACTTGTTATTGTGTATTGCAAGTATAAATAAATGCAGTATAGTCCTTTTGTTGTCATTAAAGGAGGGATTGTATACTCAC G 10752.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=3.516;DP=266;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,258:265:99:10790,797,0 +chr24 21829205 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.727;DP=158;FS=42.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:509,0,4957 +chr24 21831050 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.662;DP=206;FS=7.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,41:206:99:701,0,6265 +chr24 21837368 . C A 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=-1.711;DP=230;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,53:229:99:1122,0,6676 +chr24 21837379 . G T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-1.810;DP=234;FS=3.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,52:233:99:1063,0,6871 +chr24 21867305 . CT C 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.110;DP=215;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,38:212:99:494,0,8161 +chr24 21971334 . TA T 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:49:294,0,49 +chr24 21972653 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:251,0,441 +chr24 21979380 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.062;DP=102;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,30:102:99:752,0,2742 +chr24 21979781 . A T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.691;DP=57;FS=11.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:770,0,1997 +chr24 22058345 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.897;DP=51;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:374,0,1413 +chr24 22110357 . C G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.952;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:542,0,516 +chr24 22110492 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.354;DP=38;FS=8.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:314,0,1018 +chr24 22146576 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.705;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,24:128:99:388,0,4038 +chr24 22147152 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-0.016;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:573,0,3301 +chr24 22183496 . C T 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.315;DP=183;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,50:183:99:1142,0,4793 +chr24 22185436 . T C 1298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.304;DP=135;FS=4.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1327,0,4589 +chr24 22186015 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.230;DP=37;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:230,0,1097 +chr24 22209039 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.600;DP=61;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=7.91;ReadPosRankSum=2.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:511,0,1596 +chr24 22229646 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.534;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:318,0,956 +chr24 22289137 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.168;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:340,0,785 +chr24 22328268 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-2.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=18.78;ReadPosRankSum=2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:310,0,223 +chr24 22328412 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.802;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:466,0,1787 +chr24 22328682 . T C 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.187;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:719,0,973 +chr24 22338393 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.731;DP=70;FS=5.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:409,0,2025 +chr24 22346722 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.017;DP=104;FS=2.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:263,0,3277 +chr24 22407585 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:340,0,134 +chr24 22407624 . C A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=25.34;ReadPosRankSum=2.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,131 +chr24 22572023 . ACTGGAAGACACAAATACAGTCATGTGGAGAAATCAAGACTTCTTTACAGTAAATATTCAAAAGACCGTAACAGAAATCTCTTAC A 2407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.205;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=29.79;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2445,198,0 +chr24 22575763 . ACTGACAAATGTAAAGACCACTAGTATTACTTTAAATGCTTCAAATGAAAGTGACTTCAAACAAACCAAATTGCTGCTCAC A 2343.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.211;DP=58;FS=2.269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,55:58:1:2378,1,0 +chr24 22575910 . CCCTGGATAAACAGTAGACGCTCCTTGCATTCGTTTACATACACAAATCATACACATATTGATCATATCAACAGGCTTTA C 1992.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=2.643;DP=87;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=22.90;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,67:79:99:2030,0,4045 +chr24 22679597 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.274;ClippingRankSum=0.058;DP=276;FS=1.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,54:276:99:494,0,10685 +chr24 23349479 . G C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-0.148;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:418,0,2384 +chr24 23352476 . CCCTGTGAAAACACGAATGATGTTGGTGTAAAAGGGTGGAGAAAGTGTTGGGATTCAGGATTGGTGAGGGATTGTCTTA C 5624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-0.932;DP=129;FS=1.965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,123:127:99:5662,431,0 +chr24 23357178 . AT A 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.898;DP=11;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.34;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:31:272,0,31 +chr24 23851636 . C A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.456;DP=159;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,34:159:99:661,0,4788 +chr24 23851999 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.262;DP=112;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:511,0,5585 +chr24 23852293 . GA G,GAA 471.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.673;DP=62;FS=1.833;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,24,14:45:99:633,194,418,389,0,668 +chr24 23853077 . C CT 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=-1.028;DP=144;FS=4.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:398,0,2079 +chr24 23854095 . C G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.128;DP=150;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,35:149:99:705,0,4366 +chr24 23855880 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.142;DP=104;FS=6.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:953,0,2815 +chr24 23859867 . C A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.932;DP=119;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,32:119:99:749,0,3294 +chr24 23860943 . A T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.329;DP=80;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:454,0,2112 +chr24 23910845 . G C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.476;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:697,0,2555 +chr24 23910953 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=-0.682;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:448,0,3337 +chr24 23911196 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.630;DP=116;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,31:116:99:760,0,3236 +chr24 24298784 . AACCTGAAAGAGAATTTAACAGCATAAAATAAAACAGTAGCCCCAACAAAACTTTATGTTCAGTAAGTGCCAT A 944.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=1.589;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=26.36;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:79:982,79,0 +chr24 24367563 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.375;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:271,0,473 +chr24 24367627 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.026;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:289,0,664 +chr24 24415928 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.488;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:284,0,1152 +chr24 24424087 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.927;DP=38;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:233,0,1145 +chr24 24425380 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=-2.187;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:709,0,1012 +chr24 24425455 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-1.928;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=11.99;ReadPosRankSum=-2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:508,0,1163 +chr24 24446417 . C A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.708;DP=76;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:456,0,2881 +chr24 24447086 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-0.184;DP=156;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,26:155:99:257,0,6121 +chr24 24447161 . C T 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.093;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,47:139:99:1581,0,3299 +chr24 24451050 . G C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.664;DP=65;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:394,0,2533 +chr24 24459331 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-1.804;DP=87;FS=2.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:329,0,2623 +chr24 24459491 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.450;DP=77;FS=7.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:399,0,2193 +chr24 24463812 . G A 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.873;DP=111;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,35:111:99:927,0,2951 +chr24 24465879 . C G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.633;DP=113;FS=7.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,25:113:99:531,0,3344 +chr24 24490756 . A C 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.504;DP=98;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:1123,0,2297 +chr24 24503593 . C T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.061;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=12.25;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:812,0,1332 +chr24 24539906 . C CT 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.412;DP=78;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:540,0,1198 +chr24 24540017 . C G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-2.399;DP=110;FS=12.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=4.30;ReadPosRankSum=2.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:501,0,3408 +chr24 24540145 . CCA C 725.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.646;DP=101;FS=1.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:763,0,1678 +chr24 24544154 . GT G 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.717;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:683,0,202 +chr24 24627880 . A C 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=-0.654;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:617,0,631 +chr24 24636015 . T G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.144;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:362,0,2036 +chr24 24656139 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.404;DP=16;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=30.80;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:82:521,0,82 +chr24 24656434 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:285,0,431 +chr24 24656461 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.485;DP=21;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:237,0,494 +chr24 24658900 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.034;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:274,0,498 +chr24 24660707 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.603;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:414,0,720 +chr24 24668185 . TCTGAGGAAAAACAAAACAAAATTAAAACACAGAAGAGAGAAATGTAGAGATGCAGTAAACCTCTTAATCATTTTCTGCATGCATTTGTCCTTACTTAC T 1247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.350;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,30:32:99:1285,0,222 +chr24 24668416 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.029;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:310,0,449 +chr24 24710338 . CACCTGCAGGTAAAAAAATGGACTTGGCATTAATTTAGTTCTTCAAAATAACTGAACAAACATATAATTAAACACACTCACTA C 6706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.983;DP=192;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=34.93;ReadPosRankSum=-1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,164:168:99:6744,480,0 +chr24 24716601 . T C 3642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.663;DP=223;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,103:223:99:3671,0,3726 +chr24 24718725 . T G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=-5.707;DP=90;FS=9.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=7.75;ReadPosRankSum=-6.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,29:90:99:726,0,2298 +chr24 24719087 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.317;DP=170;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=2.47;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,30:170:99:448,0,5448 +chr24 24720714 . A C 1505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=1.529;DP=66;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=22.81;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,40:66:99:1534,0,1847 +chr24 24720715 . G A 1505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=1.531;DP=69;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=21.82;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,42:69:99:1534,0,1847 +chr24 24729629 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-2.690;DP=85;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:577,0,2830 +chr24 24733669 . A G 2591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-2.231;DP=117;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,76:117:99:2620,0,1401 +chr24 24734866 . G C 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.322;DP=119;FS=9.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,38:119:99:1024,0,3024 +chr24 24737676 . C T 1511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.993;DP=118;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,44:118:99:1540,0,2559 +chr24 24772443 . TAA T 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=1.408;DP=148;FS=2.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1751,0,1554 +chr24 24773019 . G A 3091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=-1.384;DP=537;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:396,140:536:99:3120,0,14887 +chr24 24783770 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:327,0,138 +chr24 24895745 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.902;DP=49;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:620,0,1176 +chr24 24896318 . G A 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.465;DP=76;FS=7.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1183,0,1396 +chr24 25069750 . C G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.648;DP=121;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,31:120:99:685,0,3325 +chr24 25071168 . C G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-0.844;DP=59;FS=1.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:418,0,1659 +chr24 25308656 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-1.527;DP=45;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:311,0,1258 +chr24 25310451 . GGA G 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=-1.619;DP=77;FS=8.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:795,0,1505 +chr24 25310812 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.232;DP=68;FS=3.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:456,0,1864 +chr24 25336855 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.645;DP=41;FS=7.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:320,0,2272 +chr24 25339374 . TGGTAGGTGAAGTCACTTTTAAAAATCGTATCTGATGTATATTGTCTTATTGCAGTATAATTATCTTTTGCA T 1094.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=2.308;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:99:1132,0,1086 +chr24 25340004 . C CT 532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:60:607,60,0 +chr24 25341400 . GTT G 787.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-1.019;DP=44;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:36:1048,0,36 +chr24 25341507 . CA C,CAA 1663.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-2.685;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:11,48,36:95:99:2105,643,973,1132,0,1604 +chr24 25342028 . G GGA 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=-2.740;DP=75;FS=18.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.90;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:730,0,1321 +chr24 25404903 . C A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=1.349;DP=63;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:681,0,1418 +chr24 25538870 . GAGGTACAGACACATTTCAACATACTATACACAATACCATGAATCGTGTGGTCCTCAACTGATATGACATATGTACATATATGTTA G 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=2.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:537,0,1639 +chr24 25548293 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.582;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:234,0,636 +chr24 25595678 . GT G 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.430;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:246,0,554 +chr24 25595710 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.120;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:250,0,1041 +chr24 25636184 . C CTGAGGCAGGTGTACTCAAG 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,23:23:99:544,0,2160 +chr24 25660814 . AGTGAGTAAACAAACAGTCATGTCCTTCTCATCTCAAAGCCTTTCATTCATTTGAGTATGATTGCAG A 3264.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=1.368;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=30.54;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:3302,251,0 +chr24 25841013 . TACAGGTGAGGAAAAAGTTTACGCATCAGTGGAATAAAATAGCTGATATTTTGTTTTATCTTTTTTCTTGTTCAGTTTTATTTAATTTTCACTCCAAAGTGTGCTGCTGTACTAA T 2539.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.164;DP=62;FS=3.874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:2577,211,0 +chr24 25845960 . TCTGAATAATATAAACATCAAAGAAAATAGTTTTAAAGGATTTCTGACAACACCACACACAATATGCTGTAAGCCGTCCACTCCAAAACATTTAC T 1911.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=2.282;DP=49;FS=2.204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=26.13;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,45:49:23:1949,23,0 +chr24 25976930 . ATT A,AT 214.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.331;DP=22;FS=2.430;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,10,6:20:99:422,107,305,219,0,791 +chr24 26209993 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.753;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:442,0,402 +chr24 26246988 . AAGGTGTGTAGCCGTGAATTTGAATACACAGCATGACTGAAACTGAACTCCTTTCTCATTATTGTCTAAATCTAACATC A 2990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=1.279;DP=82;FS=1.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,77:82:99:3028,263,0 +chr24 26431908 . A T 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.523;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=34.38;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:30:1197,0,30 +chr24 26436695 . A G 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.617;DP=48;FS=26.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=17.87;ReadPosRankSum=-2.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:886,0,678 +chr24 26446711 . T G 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.727;DP=37;FS=31.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1065,0,272 +chr24 26446802 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=2.527;DP=33;FS=28.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=7.45;ReadPosRankSum=-2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,870 +chr24 26739920 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:383,0,238 +chr24 26745939 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=1.302;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=24.93;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:452,0,104 +chr24 26783064 . CCA C 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.824;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:387,0,429 +chr24 26783165 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:238,0,151 +chr24 26783193 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,137 +chr24 26783234 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:273,0,53 +chr24 26783345 . A AT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:276,0,146 +chr24 26784773 . T G 289.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:318,0,19 +chr24 26784788 . G C 285.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:314,0,19 +chr24 26785135 . T C 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 +chr24 26785230 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:85:304,0,85 +chr24 26825573 . A C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr24 26828564 . T C 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.069;DP=29;FS=8.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=22.51;ReadPosRankSum=-1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:681,0,361 +chr24 26828703 . T G 2228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=-1.609;DP=74;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=30.12;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,58:74:99:2257,0,285 +chr24 26846132 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.07;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,147 +chr24 26848684 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:353,0,162 +chr24 26850944 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.64;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,110 +chr24 26852165 . G GT 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=27.61;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:99:338,0,202 +chr24 26852198 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.922;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:338,0,202 +chr24 26852599 . C G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.09;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:281,0,49 +chr24 26853090 . A G 209.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:238,0,21 +chr24 26853163 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.08;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:269,0,93 +chr24 26853310 . T C 247.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:276,0,17 +chr24 27076444 . CA C 1630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=-1.640;DP=192;FS=0.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,73:181:99:1668,0,2305 +chr24 27173115 . TCCTGTTCACAAGCACCACAGTGAGAACCAGTCTAAGCTGCTGCCACAGATATTATTTGTGTTCTGTTTTAATCTAGAGAGGGAAAAAA T 1436.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=32.19;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1474,130,0 +chr24 27221003 . CAGGTTTGTCTATGCTCTGTAAACGGTGTCTGTTTTTAAGATCTGGGTTCATTATTAACTCTACTTACTAACTTTTT C 1108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=3.162;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=34.65;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1146,0,1104 +chr24 27236373 . A G 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.126;DP=31;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:600,0,483 +chr24 27236448 . A T 376.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.158;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=28.93;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:404,0,12 +chr24 27236673 . G A 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.193;DP=38;FS=5.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:965,0,283 +chr24 27278898 . G GA 2104.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.648;ClippingRankSum=-1.593;DP=237;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,111:213:99:2224,0,2168 +chr24 27280579 . AACCTACAAAGAGAGACCGGCATAATAAACACCCACAATCTGACATTAAAACCTGCCATGCAAAAAACCCTATCCAAACATT A 2001.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.426;DP=419;FS=9.488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,404:407:99:2039,725,0 +chr24 27438879 . T A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr24 27547219 . TA T,TAA 419.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.413;DP=26;FS=3.358;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,8,12:21:99:501,338,533,193,0,244 +chr24 27560446 . G A 1588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=-2.031;DP=86;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=18.47;ReadPosRankSum=3.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,51:86:99:1617,0,1198 +chr24 27596651 . C A 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.120;DP=80;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1381,0,1414 +chr24 27608699 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.932;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:370,0,2238 +chr24 27608735 . G A 2428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-3.619;DP=72;FS=3.865;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=33.73;ReadPosRankSum=3.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,64:70:82:2457,82,0 +chr24 27807319 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.223;DP=53;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:407,0,1384 +chr24 27812667 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.196;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:471,0,2373 +chr24 27815705 . GT G 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=2.088;DP=46;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:450,0,271 +chr24 27819543 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-1.127;DP=95;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:414,0,2917 +chr24 27841183 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.816;DP=117;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:99:494,0,5620 +chr24 27878993 . AAGGTATACTGCTGCAAAAGTGACATCACATTTTTGACTGTTGCAGTTTCAGATATTGTGTTGTCGCATAATATTTTTGGTTTGATTAT A 2155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=1.630;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,51:75:99:2193,0,8126 +chr24 27891114 . AT A 1164.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1202,118,0 +chr24 28052934 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=-0.442;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:408,0,1721 +chr24 28063397 . A G 1670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.978;DP=55;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=30.38;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1699,0,228 +chr24 28065170 . T A 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=1.288;DP=51;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1483,0,215 +chr24 28066631 . T C 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=1.162;DP=52;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=27.09;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1437,0,315 +chr24 28068645 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-2.033;DP=50;FS=13.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:292,0,1463 +chr24 28070994 . T C 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.217;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:698,0,824 +chr24 28093378 . C CA 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.062;DP=46;FS=2.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:452,0,588 +chr24 28109256 . TCTGTAGAGGAAAATAAACATAAGAACATGCCAAAACCGCTGGGAGATCTTTATTTTTTAATTCGTTTTTAC T 7904.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=2.856;DP=185;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,181:185:99:7942,652,0 +chr24 28114763 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-1.723;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:247,0,757 +chr24 28115718 . C CT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.858;DP=58;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=3.62;ReadPosRankSum=-2.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,3:50:99:247,0,5197 +chr24 30360913 . T G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 +chr24 30524086 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.408;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:369,0,1453 +chr24 30524087 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.408;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:369,0,1518 +chr24 30524434 . A G 1069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1098,78,0 +chr24 30524549 . A G 366.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=33.36;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:395,0,13 +chr24 30578878 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=2.437;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:563,0,436 +chr24 30599607 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=1.305;DP=36;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:309,0,930 +chr24 30600070 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-1.187;DP=32;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:406,0,857 +chr24 31139047 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 +chr24 31140274 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.832;DP=104;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:388,0,4029 +chr24 31147037 . GCTGAAACAAAGAGAGGTGAAGTCAGAGACGCATCAAGCATGGGTGGATCATTGTGCGTTTGACCTCAATCTTAC G 5963.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=134;FS=4.418;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=31.52;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:6001,523,0 +chr24 31165371 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=1.614;DP=91;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:272,0,2826 +chr24 31198439 . CTT C,CT 1786.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.436;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,63,18:82:99:2718,359,197,1883,0,1701 +chr24 31203996 . T A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=-1.938;DP=185;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,37:185:99:587,0,5541 +chr24 31204028 . GCTGCTGAGGGAGAAAAGCATCCAAAATATTACCGAAATACAAGTTTGGTGCTATTTGTGCTCCATAATTTCCAGGTATATGATTTGGCTTAC G 1518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=-0.654;DP=209;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,56:196:99:1556,0,8535 +chr24 31204031 . GCTGAGGGAGAAAAGCATCCAAAATATTACCGAAATACAAGTTTGGTGCTATTTGTGCTCCATAATTTCCAGGTATATGATTTGGCTTAC G 5289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=-3.299;DP=204;FS=1.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=25.93;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,131:193:99:5327,0,3924 +chr24 31225276 . GGTAAAA G 1089.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=2.232;DP=85;FS=17.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:99:1127,0,2286 +chr24 31225487 . AAGGTGAGCTTCTGACACTTCTAAAATCTAAAATAATGCTATGTAGTTGATCTTTTTAATAGTTCGTTTGTATTTTTGGTGATC A 4740.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.672;DP=99;FS=3.100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:4778,402,0 +chr24 31252024 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.853;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:271,0,485 +chr24 31252156 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-0.148;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:250,0,796 +chr24 31252355 . AT A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.634;DP=22;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:348,0,157 +chr24 31252414 . A C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:377,0,607 +chr24 31263745 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-1.067;DP=33;FS=7.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:548,0,617 +chr24 31344392 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.58;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:314,0,143 +chr24 31404694 . T A 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=-0.779;DP=50;FS=8.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=21.64;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1110,0,701 +chr24 31428116 . A G 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=1.304;DP=44;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=28.04;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:1262,0,289 +chr24 31432353 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-2.011;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:327,0,230 +chr24 31435957 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:262,0,344 +chr24 31437257 . GAA G 331.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:13:358,13,0 +chr24 31449569 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:470,0,124 +chr24 31678947 . AT A 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=-0.792;DP=34;FS=4.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:411,0,437 +chr24 31685431 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-2.387;DP=78;FS=5.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,45:78:99:1453,0,1104 +chr24 31695881 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:239,0,59 +chr24 31699524 . A AG 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.255;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=27.85;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:35:455,0,35 +chr24 31700726 . G GTA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.101;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:238,0,197 +chr24 31703426 . CGTGAGTAAAAGCTGCATTCGCCATTTGTCAGTCTGTGTGTCAGTCGTCGGTGAGCCGCCTCATTTTTCTGTCATGTTTTGAAG C 6627.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.733;DP=156;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=28.40;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:6665,572,0 +chr24 31705946 . TA T 238.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:276,28,0 +chr24 31706002 . T A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=-1.637;DP=23;FS=5.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=24.42;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:590,0,171 +chr24 31706759 . AT A 574.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.648;DP=33;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,27:31:22:737,22,0 +chr24 32799078 . C A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=1.531;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=21.85;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:356,0,175 +chr24 32799504 . T G 284.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:313,0,19 +chr24 32803145 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=-0.838;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.274;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:269,0,967 +chr24 32803232 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.929;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:395,0,779 +chr24 32803247 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-3.366;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:410,0,934 +chr24 32871425 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.848;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:263,0,1103 +chr24 32875008 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.131;DP=46;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:376,0,1239 +chr24 33109359 . GCCTGCAGATCATTAAAACAACACACTCTGAAAGAGACAGACAAAATATATGTTCTTTATACAGGAGTCTAGTGTACTCA G 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=2.307;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:504,0,6958 +chr24 33153406 . TA T 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:477,0,1092 +chr24 33153703 . T C 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=-0.697;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,35:153:99:714,0,6215 +chr24 33154568 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=2.533;DP=54;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:498,0,1410 +chr24 33155057 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.603;DP=53;FS=7.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:280,0,1676 +chr24 33155205 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.672;DP=54;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=4.31;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:261,0,2183 +chr24 33155409 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.830;DP=49;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:560,0,1148 +chr24 33155745 . C CT 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.233;DP=26;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:260,0,2156 +chr24 33155904 . T TA 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-0.852;DP=32;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:641,0,320 +chr24 33230710 . C A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.341;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,35:141:99:796,0,4011 +chr24 33279176 . ACTGCAAAGACTCAAGAATTAAATCAGGACCCCCAAAAGTGTTTACTTTAAAGCCAAAGTTCTTCTTTCCTAC A 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-1.246;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=21.80;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:386,0,294 +chr24 33322422 . TCTACAAGAGAACGGAAGAAGGGTTTAAAATCAAAACAAAACCTACCAAATGACTGCAGGGGCAGGAAAGCTCCTCAC T 254.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:33:292,33,0 +chr24 33381955 . T C 7574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-4.277;DP=286;FS=0.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=26.49;ReadPosRankSum=3.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,208:286:99:7603,0,1756 +chr24 33395909 . T A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-1.115;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:416,0,412 +chr24 33723570 . ACC A 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.552;DP=29;FS=19.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:275,0,426 +chr24 33723679 . G GC 10119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.570;DP=495;FS=2.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=20.44;ReadPosRankSum=-1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,376:459:99:10157,0,507 +chr24 33741518 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr24 33753741 . C T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr24 33852522 . C T 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.670;DP=88;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,64:88:99:2512,0,609 +chr24 33852681 . A C 3952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=1.206;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,120:227:99:3981,0,3818 +chr24 33852958 . T C 2819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.788;DP=126;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=22.38;ReadPosRankSum=-2.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,82:122:99:2848,0,791 +chr24 33854504 . A T 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.346;DP=110;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,32:110:99:833,0,3838 +chr24 33855360 . G GA 1045.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:77:1083,77,0 +chr24 33855627 . G A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.494;DP=248;FS=6.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,54:248:99:983,0,7282 +chr24 33855660 . T C 3197.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=-1.271;DP=288;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,99:288:99:3226,0,6493 +chr24 33864088 . GCTAAAGTTGAAAGTAAAACAAGCATTAATATTTCATTTTCAAAAGAAACTCTCTGGCGTCTCCATTGTGTCAGTACTGGGAGCGATTCAGAC G 8171.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=1.505;DP=333;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,214:288:99:8209,0,2973 +chr24 33864090 . TAAAGTTGAAAGTAAAACAAGCATTAATATTTCATTTTCAAAAGAAACTCTCTGG T 1691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-1.051;DP=313;FS=0.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,71:287:99:1729,0,10058 +chr24 33864146 . GTCTCCATTGTGTCAGTACTGGGAGCGATTCAGACCTCA G 1697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.953;DP=334;FS=0.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,77:308:99:1735,0,10058 +chr24 34532844 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-2.014;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=27.30;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:71:547,0,71 +chr24 34568827 . T C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:24:346,24,0 +chr24 34568961 . G A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.861;DP=49;FS=2.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:596,0,1019 +chr24 34662013 . TA T 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=-0.913;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:389,0,263 +chr24 34662330 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.28;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:85:261,0,85 +chr24 34714578 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:417,0,259 +chr24 34716482 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 +chr24 34716509 . T C 239.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 +chr24 34928906 . C A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 +chr24 34959960 . A C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.416;DP=47;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=12.44;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:613,0,991 +chr24 34960441 . CA C 882.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-0.630;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,49:84:99:954,0,536 +chr24 34960860 . G T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.834;DP=249;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.389;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,44:249:99:625,0,9134 +chr24 34965414 . A G 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.486;DP=276;FS=2.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,54:276:99:936,0,8424 +chr24 34965686 . G A 932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.364;DP=291;FS=5.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,60:291:99:961,0,8891 +chr24 35028675 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.534;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:338,0,1399 +chr24 35099594 . A G 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.428;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=28.12;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:1031,0,212 +chr24 35099739 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=2.355;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:230,0,430 +chr24 35099772 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:238,0,389 +chr24 35100292 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.398;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:239,0,734 +chr24 35185676 . A C 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 +chr24 35413026 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.205;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:356,0,481 +chr24 35414163 . G A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:421,36,0 +chr24 35414936 . A G 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:559,39,0 +chr24 35414980 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.683;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:300,0,287 +chr24 35415047 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr24 35415049 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr24 35415592 . CA C 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.156;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:50:295,0,50 +chr24 35416208 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=29.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:99:278,0,234 +chr24 35417072 . A T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-2.751;DP=25;FS=2.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:792,0,298 +chr24 35417079 . A T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-2.608;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:792,0,288 +chr24 35418745 . C A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.411;DP=41;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:478,0,971 +chr24 35419122 . AT A 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.869;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:311,0,266 +chr24 35832569 . A AT 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.087;DP=77;FS=2.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:308,0,1072 +chr24 35875486 . G C 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr24 36010811 . A C 4121.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.271;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=34.64;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,108:119:85:4150,85,0 +chr24 36017104 . T C 4537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.827;DP=265;FS=9.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=17.12;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,139:264:99:4566,0,4461 +chr24 36017227 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=2.080;DP=150;FS=16.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.25;ReadPosRankSum=2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,37:150:99:815,0,4317 +chr24 36022135 . G A 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.417;DP=155;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=9.09;ReadPosRankSum=4.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,51:155:99:1437,0,3930 +chr24 36022231 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=3.431;DP=143;FS=31.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=1.49;ReadPosRankSum=-2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,22:142:99:242,0,4592 +chr24 36071197 . G A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.500;DP=168;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=5.93;ReadPosRankSum=2.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,44:168:99:1024,0,4691 +chr24 36102434 . C CAA 230.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr24 36102607 . ATT A 209.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr24 36162574 . A G 1404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1433,102,0 +chr24 36168666 . G A 1692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1721,120,0 +chr24 36168819 . C T 1034.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1063,75,0 +chr24 36477290 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=1.000;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:886,0,1747 +chr24 36498967 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.785;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:731,0,1955 +chr24 36498977 . T C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.311;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:686,0,2014 +chr24 36657102 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.643;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:1503,0,2448 +chr24 36657116 . C G 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-1.480;DP=102;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.45;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,35:102:99:1094,0,2128 +chr24 36657438 . T A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.099;DP=36;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:456,0,833 +chr24 36658031 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=-0.696;DP=78;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:708,0,2045 +chr24 36658094 . C T 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.396;DP=74;FS=9.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1254,0,1309 +chr24 36658273 . T A 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.854;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1828,0,1825 +chr24 36658389 . T A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.632;DP=48;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:660,0,1034 +chr24 36711682 . C A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.881;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:617,0,1133 +chr24 36885704 . C A 2313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-1.697;DP=162;FS=5.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,67:162:99:2342,0,3133 +chr24 36887356 . A G 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-1.620;DP=97;FS=6.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1715,0,4009 +chr24 36887441 . A C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:373,0,692 +chr24 36887641 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=1.944;DP=50;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:246,0,1537 +chr24 37018358 . G GTA 4775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.972;DP=228;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=20.95;ReadPosRankSum=2.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,48:211:99:4813,0,4971 +chr24 37018422 . T A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=1.004;DP=237;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=2.69;ReadPosRankSum=2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,59:236:99:665,0,13957 +chr24 37053758 . C A 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.289;DP=148;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,54:148:99:1857,0,2811 +chr24 37118756 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.444;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:259,0,433 +chr24 37175577 . GT G 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.534;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:394,0,445 +chr24 37175708 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.076;DP=93;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:556,0,2725 +chr24 37177777 . T C 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.571;DP=90;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:659,0,2974 +chr24 37216975 . C T 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.144;DP=75;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:1098,0,1364 +chr24 37232314 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-0.946;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:453,0,1326 +chr24 37524882 . G GA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:254,0,238 +chr24 37525726 . G GT 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.838;DP=94;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:342,0,1426 +chr24 37750400 . G GA 804.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.807;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.41;ReadPosRankSum=2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:1:839,1,0 +chr24 37750456 . AAAT A 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:366,0,113 +chr24 37801155 . A T 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr24 37895774 . TCCCCCC T 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=1.813;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:272,0,249 +chr24 37895864 . A G 4379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=-3.057;DP=256;FS=6.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,126:256:99:4408,0,4304 +chr24 37922670 . TGGTATGAAGACAACAATACAGTTTACATTTGATTTCAAGCACAGATCATCAGCTAGCCGTGTTTAATTGTGCCTTTTTCTCCA T 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:597,0,410 +chr24 38016474 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 +chr24 38137609 . T C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 +chr24 38138575 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr24 38138595 . C G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:259,18,0 +chr24 38214318 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.533;DP=24;FS=11.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:371,0,406 +chr24 38216633 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.154;DP=136;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:609,0,850 +chr24 38216765 . A G 360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:389,30,0 +chr24 38217441 . A AC 437.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 +chr24 38301327 . A T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:277,0,58 +chr24 38312177 . C T 727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:756,51,0 +chr24 38312432 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 +chr24 38313501 . T A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.217;DP=40;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:720,0,707 +chr24 38314002 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:423,0,1030 +chr24 38315341 . A G 445.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=34.30;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:2:472,2,0 +chr24 38364588 . C G 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.365;DP=91;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:1182,0,1958 +chr24 38364600 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.445;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1055,0,1891 +chr24 38375619 . T C 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=1.765;DP=70;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=21.97;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:1566,0,852 +chr24 38378654 . A AC 1057.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.226;DP=40;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:1095,0,370 +chr24 38379070 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr24 38379213 . T G 1453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-1.102;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,38:50:99:1482,0,281 +chr24 38379491 . GA G 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=1.751;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=20.09;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:680,0,248 +chr24 38379835 . T G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 +chr24 38380010 . T A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 +chr24 38380229 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:395,0,690 +chr24 38381458 . A G 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 +chr24 38382083 . A T 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 +chr24 38382089 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 +chr24 38382404 . T A 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.967;DP=50;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:817,0,993 +chr24 38382439 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-0.462;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:391,0,448 +chr24 38466835 . G T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr24 38466907 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.361;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:78:458,0,78 +chr24 38563214 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr24 38716641 . T C 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.475;DP=69;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,32:69:99:1084,0,1219 +chr24 38770783 . TGC T 5417.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:5455,478,0 +chr24 38789701 . A G 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=1.180;DP=33;FS=4.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:74:1068,0,74 +chr24 38789947 . G T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.818;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:376,0,699 +chr24 38807909 . A G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=1.217;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:621,0,641 +chr24 38815073 . T A 370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:31:408,31,0 +chr24 38853908 . A T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.526;DP=50;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:942,0,843 +chr24 38857208 . A T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-0.372;DP=69;FS=2.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:920,0,1293 +chr24 38860820 . A C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.623;DP=42;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:818,0,671 +chr24 38888222 . C T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.549;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:828,0,273 +chr24 38889420 . AG A 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:268,0,126 +chr24 38923929 . T A 3860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.945;DP=204;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,117:204:99:3889,0,3110 +chr24 38923971 . G A 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.353;DP=194;FS=12.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,102:194:99:3315,0,3340 +chr24 38924145 . G C 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-0.208;DP=128;FS=35.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=5.42;ReadPosRankSum=-3.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,32:127:99:722,0,3711 +chr24 38935164 . T C 2699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.220;DP=197;FS=6.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,110:182:99:2728,0,2471 +chr24 38941043 . A T 3453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=3.566;DP=218;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=15.84;ReadPosRankSum=4.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,95:211:99:3482,0,3919 +chr24 38941213 . T C 9720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:231:99:9749,695,0 +chr24 38942244 . CTAGTTTTTAACAGTGGATGGCGCTCTAGAA C 363.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:58:401,58,0 +chr24 38943048 . A T 2843.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2872,202,0 +chr24 38943277 . T C 783.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:52:812,52,0 +chr24 38944155 . C A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=4.697;DP=92;FS=23.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,28:92:99:746,0,7736 +chr24 38944156 . T A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=4.722;DP=92;FS=23.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,28:92:99:746,0,7736 +chr24 38944649 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:448,0,426 +chr24 38945096 . G C 655.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:48:684,48,0 +chr24 38945562 . AAT A 1327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=1.094;DP=42;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,1:38:99:1365,0,1404 +chr24 38945583 . T TA 2684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=1.141;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=29.51;ReadPosRankSum=-2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:99:2722,209,0 +chr24 38946053 . T C 436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:465,33,0 +chr24 38946656 . T C 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:621,42,0 +chr24 38946709 . A C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr24 38946745 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr24 38948126 . A T 3179.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-2.658;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,95:160:99:3208,0,2318 +chr24 38963805 . C A 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 +chr24 38964177 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr24 38997413 . C A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:79:421,0,79 +chr24 38998250 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:277,0,450 +chr24 39009574 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-2.018;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:83:501,0,83 +chr24 39034626 . C A 1282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1311,96,0 +chr24 39058234 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=1.776;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:422,0,546 +chr24 39072555 . A T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.444;DP=35;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:945,0,322 +chr24 39073233 . T C 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.207;DP=21;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=26.75;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:590,0,164 +chr24 39108148 . ACAGGTACAGCACCGATGCTTGTTGATGACTTTTATTTCATATGTGAGGGTCAAAATTGTGTCTGTGTGTTT A 750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=27.75;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:61:788,61,0 +chr24 39113617 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:43:271,0,43 +chr24 39118176 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=1.902;DP=18;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=20.82;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:403,0,237 +chr24 39128570 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:270,0,57 +chr24 39132534 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:297,0,52 +chr24 39134546 . G C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,101 +chr24 39174137 . G T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-2.268;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=29.57;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:1004,0,167 +chr24 39180584 . T A 386.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=29.75;ReadPosRankSum=-2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:26:415,0,26 +chr24 39182852 . C G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:398,0,160 +chr24 39182897 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.857;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:685,0,101 +chr24 39190878 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.270;DP=30;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:548,0,498 +chr24 39191818 . C T 15321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.074;DP=820;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.133;QD=18.69;ReadPosRankSum=3.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:388,430:818:99:15350,0,31757 +chr24 39193702 . C A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.07;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:315,0,91 +chr24 39194711 . G A 251.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:280,0,20 +chr24 39194809 . GTA G 215.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr24 39394185 . A AGGATCTGTATAAGCG 915.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:953,66,0 +chr24 39445514 . T TTA 880.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:918,60,0 +chr24 39445544 . GA G 269.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=16;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:9:306,9,0 +chr24 39445982 . T G 1935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.403;DP=88;FS=5.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,56:88:99:1964,0,1137 +chr24 39446165 . T A 1732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.295;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=23.10;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,49:75:99:1761,0,910 +chr24 39446356 . T TA 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-1.551;DP=28;FS=6.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:526,0,585 +chr24 39446391 . C T 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=-1.886;DP=59;FS=5.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:991,0,939 +chr24 39446561 . T G 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.527;DP=100;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1793,0,1716 +chr24 39602528 . CCCTGCAAGACAAAACCAAACTCAACCTCAGAAAATATACAATCCATAAACACAGAAATATTAATAAAATATA C 4512.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.632;ClippingRankSum=-0.223;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=20.81;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,98:103:99:4550,364,0 +chr24 39797688 . G A 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:241,0,25 +chr24 39798473 . G A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr24 39798533 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:233,0,476 +chr24 39799927 . C G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=-1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=21.41;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:328,0,179 +chr24 39805556 . A C 11623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=-0.062;DP=616;FS=0.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=18.87;ReadPosRankSum=2.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,359:615:99:11652,0,9005 +chr24 39858338 . G T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr24 39862331 . G A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.670;DP=50;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:833,0,864 +chr24 39878029 . A T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-1.010;DP=53;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=25.54;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,37:52:99:1382,0,369 +chr24 39878042 . AACCTATCAAATCAAATCAAACAGCAGCAATCACAACCAAACCATTATCCGACAATTCCACAGCGTTTCAAATCGGGCATCTGCTCAAATATGCACTGT A 1719.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.139;DP=53;FS=3.372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=32.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1757,139,0 +chr24 39890624 . A AT 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.011;DP=50;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:385,0,1115 +chr24 40064232 . G C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-1.838;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,390 +chr24 40064345 . A T 1955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=-0.828;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:1984,108,0 +chr24 40064410 . C T 2216.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:2245,160,0 +chr24 40064539 . C T 692.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:16:721,16,0 +chr24 40064698 . T C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-1.212;DP=19;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:481,0,204 +chr24 40064723 . A T 280.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:309,0,19 +chr24 40065241 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:236,0,586 +chr24 40065916 . GAC G 910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=1.536;DP=28;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:59:948,0,59 +chr24 40066330 . T G 1215.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:83:1244,83,0 +chr24 40066336 . A G 1215.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:83:1244,83,0 +chr24 40066447 . A T 1215.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:83:1244,83,0 +chr24 40066530 . T C 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.925;DP=13;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=33.53;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:32:726,0,32 +chr24 40066721 . T C 3717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.740;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.56;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,9:12:99:3746,225,0 +chr24 40066842 . T C 3723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-1.217;DP=102;FS=7.986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=20.36;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:3752,231,0 +chr24 40066968 . G C 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=-0.557;DP=62;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:1252,0,2643 +chr24 40067035 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=1.372;DP=73;FS=9.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:488,0,5331 +chr24 40067037 . A C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=1.103;DP=74;FS=11.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:485,0,5331 +chr24 40067347 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=13;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:260,0,97 +chr24 40131911 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.452;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:285,0,531 +chr24 40328306 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=21.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:330,0,154 +chr24 40328795 . CT C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.833;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:250,0,527 +chr24 40329652 . G A 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.587;DP=75;FS=7.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:1258,0,1093 +chr24 40330192 . G GCT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-1.155;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:276,0,849 +chr24 40403272 . A C 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:801,54,0 +chr24 40403276 . T A 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:801,54,0 +chr24 40413954 . A C 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-3.501;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:83:1142,0,83 +chr24 40414009 . T C 1400.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.219;DP=67;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:12:1428,0,12 +chr24 40414053 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=-1.203;DP=19;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=15.72;ReadPosRankSum=-3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,302 +chr24 40514473 . G C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.567;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:69:463,0,69 +chr24 40523852 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,322 +chr24 40534747 . C G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:245,0,323 +chr24 40535293 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:313,0,164 +chr24 40607402 . C G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=0.769;DP=23;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:424,0,387 +chr24 40613915 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,160 +chr24 40644779 . G C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-3.191;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:318,0,343 +chr24 40645848 . C G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-3.213;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:325,0,364 +chr24 40655582 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.042;DP=48;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:897,0,764 +chr24 40666178 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-0.836;DP=35;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:456,0,1664 +chr24 40666726 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,261 +chr24 40678478 . C A 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.252;DP=36;FS=5.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=22.08;ReadPosRankSum=1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:823,0,766 +chr24 40681164 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:365,0,51 +chr24 40684585 . C T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=2.414;DP=61;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1060,0,836 +chr24 40689608 . T C 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.117;DP=36;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=23.13;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:861,0,415 +chr24 40726689 . T C 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.318;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:541,0,385 +chr24 40727205 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,206 +chr24 40727206 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,206 +chr24 40727299 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,174 +chr24 40727799 . A C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=2.017;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:832,0,103 +chr24 40728570 . GT G 337.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:11:374,11,0 +chr24 40728950 . A G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:87:427,0,87 +chr24 40729835 . A T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr24 40730308 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=1.102;DP=19;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:326,0,379 +chr24 40730772 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.506;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,450 +chr24 40750913 . C G 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=3.475;DP=111;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=14.02;ReadPosRankSum=-2.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:1585,0,4142 +chr24 40751507 . T C 4491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=1.160;DP=145;FS=27.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,114:145:99:4520,0,651 +chr24 40775658 . G A 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-1.280;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1111,0,1246 +chr24 40776085 . G A 2035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.184;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:2064,0,1649 +chr24 40781021 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.987;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:603,0,204 +chr24 40783581 . GGTC G 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-1.588;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,320 +chr24 40849537 . T G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.490;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:561,0,936 +chr24 40934289 . A T 2036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.550;DP=93;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=21.90;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,60:93:99:2065,0,1122 +chr24 40936983 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=27.20;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:92:409,0,92 +chr24 40939623 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,134 +chr24 40940123 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:259,0,256 +chr24 40940173 . C G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.251;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=22.87;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,201 +chr24 40958603 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=2.154;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=19.09;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:410,0,778 +chr24 40958981 . A AAT 1416.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:97:1454,97,0 +chr24 41107242 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=25.23;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:331,0,530 +chr24 41107265 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:421,0,379 +chr24 41129312 . CGGTGGACATTCATTTACAGCACTTCTGCCACAATCATGTGTATAATTGATGCATGAATAAGATGAAGGGACACAATATCATGTATGTCTGCATGTTTTTAA C 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=1.362;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:98:1248,98,0 +chr24 41138286 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr24 41188645 . C CTG 769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.127;DP=29;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:807,0,164 +chr24 41212018 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.604;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:298,0,376 +chr24 41212722 . C CA 221.43 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:68:362,0,68 +chr24 41224352 . GAGGTTTGTCGGTAGACTGTGCATATACGCCATTGCAAAGAGATTTATTATAAAATAAAGGTTTTATGCAAATATAAGGTTGTCTGTTTCTTCTTTTTAT G 432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=29.16;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:99:470,0,3474 +chr24 41224571 . A T 2337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=5.865;DP=294;FS=9.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.508;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,96:294:99:2366,0,7144 +chr24 41236294 . G A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.546;ClippingRankSum=0.350;DP=114;FS=3.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,34:114:99:922,0,2957 +chr24 41240431 . C T 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 +chr24 41307981 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:303,0,54 +chr24 41360504 . C T 277.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.89;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:306,0,13 +chr24 41364146 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.129;DP=213;FS=1.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=1.25;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,32:213:99:295,0,6762 +chr24 41366068 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=1.724;DP=182;FS=0.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,32:182:99:415,0,5704 +chr24 41431510 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.442;DP=120;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:381,0,3881 +chr24 41526380 . T C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr24 41690568 . A C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:242,0,61 +chr24 41712821 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:345,0,122 +chr24 41712914 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:279,0,63 +chr24 41720487 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:284,0,221 +chr24 41740391 . A T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=1.709;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:315,0,214 +chr24 42050494 . C T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr24 42195931 . G A 1319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.246;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,38:46:89:1348,0,89 +chr24 42230050 . T A 214.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:243,0,23 +chr24 42232384 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-1.783;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:684,0,519 +chr24 42232850 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.282;DP=22;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=25.67;ReadPosRankSum=-1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:593,0,186 +chr24 42233324 . A C 282.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.43;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:311,0,18 +chr24 42235009 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.496;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:277,0,1045 +chr24 42235365 . A T 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:690,48,0 +chr24 42241361 . CCTCCTGAAAAACACAGGGACAAACAAAACATCATGAGGAAATCATG C 8434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-7.421;DP=304;FS=21.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=27.75;ReadPosRankSum=2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,216:290:99:8472,0,2601 +chr24 42241363 . TCCTGAAAAACACAGGGACAAACAAAACATCATGAGGAAATCATGTTTCAAATGCAATGCTTTAATGTCTGAGTCCTATCGTTTACTTA T 1298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=-0.143;DP=297;FS=23.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,64:284:99:1336,0,9645 +chr24 42241409 . TTCAAATGCAATGCTTTAATGTCTGAGTCCTATCGTTTACTTA T 8434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-3.777;DP=292;FS=24.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=28.89;ReadPosRankSum=-2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,216:283:99:8472,0,1863 +chr24 42241747 . CACCTAACGAAACAAAATTAAATGATGTGAACTACTCTTTAATCTTTGCAAAATGTGTGAAGAGAAAATGCCTGATTTTCAGTAGCTT C 15980.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.598;DP=448;FS=2.843;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,391:393:99:16018,1192,0 +chr24 42242815 . CCCTTTAAGTATGAAGGAAAGCATTTTAAGTCATTAGTCTTAAATTAATCTAATGTAAATAACATAATAGGAAATGATCATTCACGGTTA C 16189.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.624;DP=365;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,349:350:99:16227,1433,0 +chr24 42244005 . A G 3308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=9.106;DP=361;FS=100.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=9.17;ReadPosRankSum=-6.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,120:361:99:3337,0,9349 +chr24 42244628 . G T 6171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.324;DP=193;FS=5.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,156:193:99:6200,0,607 +chr24 42246087 . C T 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-2.688;DP=257;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=4.28;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,55:257:99:1129,0,7950 +chr24 42246720 . C T 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=-3.288;DP=55;FS=45.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=16.45;ReadPosRankSum=3.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:933,0,1003 +chr24 42247548 . C T 8224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=6.222;DP=350;FS=12.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=23.50;ReadPosRankSum=-4.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,232:350:99:8253,0,4073 +chr24 42247593 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=5.339;DP=74;FS=26.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:794,0,3817 +chr24 42267000 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.412;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:314,0,2939 +chr24 42267108 . A T 3590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3619,265,0 +chr24 42267114 . C A 3530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:3559,262,0 +chr24 42270533 . C T 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.335;DP=77;FS=31.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=14.63;ReadPosRankSum=-4.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:1155,0,1466 +chr24 42270784 . A G 215.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:22:244,22,0 +chr24 42271629 . G A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.358;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:871,0,977 +chr24 42271692 . C T 4451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.051;ClippingRankSum=-8.309;DP=254;FS=5.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=17.53;ReadPosRankSum=7.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,123:254:99:4480,0,4018 +chr24 42304780 . G A 3156.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3185,214,0 +chr24 42304783 . G A 3156.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:3185,214,0 +chr24 42305994 . C G 229.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:258,0,22 +chr24 42321052 . A G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:739,54,0 +chr24 42321085 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-3.230;DP=20;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=27.94;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:587,0,107 +chr24 42349963 . G T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-2.494;DP=28;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=26.56;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:772,0,170 +chr24 42376882 . A G 582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:611,45,0 +chr24 42379592 . G C 276.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:305,24,0 +chr24 42380125 . T C 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:309,21,0 +chr24 42380130 . G A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr24 42380283 . G A 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr24 42381294 . G C 765.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.042;DP=25;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=30.61;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:10:793,0,10 +chr24 42386963 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr24 42428781 . T G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr24 42461277 . A G 2116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2145,154,0 +chr24 42461310 . G A 1814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1843,126,0 +chr24 42505238 . CCTCCTGAACAACACAAGG C 3107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-1.722;DP=92;FS=2.611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3145,231,0 +chr24 42505258 . TATTGACAAAAACAGTATGCAAAATAGAATATATAGTGCATGGATGTGCCAGAAAAGCACTCA T 3107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.747;DP=92;FS=2.611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=33.78;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3145,231,0 +chr24 42505532 . A G 3532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3561,241,0 +chr24 42505534 . T C 3532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3561,241,0 +chr24 42509706 . G T 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.351;DP=25;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=32.31;ReadPosRankSum=2.053 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:30:836,30,0 +chr24 42530400 . A T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=28.37;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:94:397,0,94 +chr24 42531447 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:274,0,120 +chr24 42531545 . C G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,105 +chr24 42531618 . C G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:338,0,164 +chr24 42532963 . G T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-1.440;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=27.13;ReadPosRankSum=-3.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:598,0,154 +chr24 42537103 . G T 363.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=33.00;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:391,0,12 +chr24 42540533 . G C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.826;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:488,0,35 +chr24 42618626 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:348,0,90 +chr24 42618679 . C G 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-0.211;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=23.94;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:555,0,199 +chr24 42623097 . G C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.896;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,299 +chr24 42623104 . ACTACACACAGACACACAAACATTAATCCTGATACATCATCTATGATCATCATATTCAGACTGTGCTCAC AACACACAGACACACAAACATTAATCCTGATACATCATCTATGATCATCATATTCAGACTGTGCTCAC,A 429.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,4:11:99:513,203,299,338,0,547 +chr24 42623107 . ACACACAGACACACAAACATTAATCCTGATACATCATCTATGATCATCATATTCAGACTGTGCTCACG A 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.246;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,299 +chr24 42623813 . A C 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=-0.085;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:569,0,324 +chr24 42639382 . A G 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 +chr24 42864855 . AAC A 350.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:388,36,0 +chr24 43484128 . G A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.652;DP=80;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=20.57;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,49:79:99:1674,0,993 +chr24 43507002 . T C 1561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.034;DP=81;FS=6.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,48:81:99:1590,0,1165 +chr24 43508003 . G A 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-1.124;DP=98;FS=6.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1911,0,2337 +chr24 43525775 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=2.813;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=13.62;ReadPosRankSum=-2.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:682,0,955 +chr24 43546130 . C T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=-0.226;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:554,0,347 +chr24 43551803 . TA T 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.870;DP=42;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:453,0,451 +chr24 43551844 . TA T 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.298;DP=30;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:477,0,1259 +chr24 43551853 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=1.750;DP=33;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=13.60;ReadPosRankSum=-1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:477,0,1259 +chr24 43552118 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-1.125;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:783,0,830 +chr24 43563441 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.889;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=15.96;ReadPosRankSum=2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:475,0,534 +chr24 43604028 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-1.753;DP=21;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:495,0,233 +chr24 43617113 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.427;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:277,0,811 +chr24 43620180 . C T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.048;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:837,0,448 +chr24 43671163 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-1.670;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:238,0,223 +chr24 43680312 . C T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr24 43688608 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:240,0,226 +chr24 43762975 . T A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-1.447;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:504,0,209 +chr24 43763869 . TATACAC T 496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:534,45,0 +chr24 43764024 . G A 1486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.769;DP=52;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:1515,0,1042 +chr24 43774276 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=1.055;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:425,0,212 +chr24 43808942 . G A 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-1.510;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1207,0,727 +chr24 43809874 . A T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.041;DP=34;FS=14.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:674,0,527 +chr24 43811193 . C G 2068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.532;DP=78;FS=5.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,58:78:99:2097,0,504 +chr24 43828452 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:384,0,383 +chr24 43829675 . G T 1098.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1127,81,0 +chr24 43837112 . T G 2710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=-0.701;DP=151;FS=4.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=17.95;ReadPosRankSum=2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:2739,0,2243 +chr24 43837184 . C A 5278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.218;DP=292;FS=5.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,163:291:99:5307,0,4451 +chr24 43838338 . G T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr24 43838339 . T G 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:295,21,0 +chr24 43848320 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.574;DP=29;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:513,0,506 +chr24 43848753 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.752;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:616,0,1153 +chr24 43858649 . G T 7992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=2.178;DP=609;FS=26.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=13.12;ReadPosRankSum=-9.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,241:608:99:8021,0,11755 +chr24 43862465 . G A 282.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:10:310,0,10 +chr24 43868146 . T A 204.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:11:232,11,0 +chr24 43875433 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.181;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:410,0,269 +chr24 43890371 . TGGTGAGCGACCCACTGATCCCTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTTTGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTAATGCCTCTGTGTTCTTCA T 3276.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=2.393;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=32.64;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,84:86:99:3314,297,0 +chr24 43907428 . CGGTCAGACACACACACACACACACACACACACACACGCTCCCTTATGGATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCA C 7131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=3.370;DP=220;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=32.42;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,202:220:99:7169,0,370 +chr24 43909097 . G A 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.804;DP=62;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:981,0,949 +chr24 43909347 . A AAC 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.669;DP=106;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:735,0,1271 +chr24 43922038 . G A 2901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=-0.815;DP=157;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,97:157:99:2930,0,1934 +chr24 43926149 . G A 2981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=1.103;DP=177;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,105:177:99:3010,0,2337 +chr25 2100 . TGGCAAGTGTCTCTCTGAGTGTGTGTGCGCATGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCA T 10359.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-2.173;DP=233;FS=1.380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=32.84;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,223:232:99:10397,843,0 +chr25 4843 . T TTG 510.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.531;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=30.05;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:16:548,16,0 +chr25 115369 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr25 171263 . C T 2167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2196,160,0 +chr25 253553 . AGAGTGT A 481.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:44:519,44,0 +chr25 254113 . T G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:484,39,0 +chr25 267872 . AGGAGGT A 235.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:273,22,0 +chr25 269738 . G A 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 +chr25 275991 . C T 741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:770,57,0 +chr25 291380 . AACACACACACACACACACATAGTCAGATTAGTTTCTGTCTCTCTGCTCTGACCACAGGTGTATGGGCAGACTGAGGGACACACACAGATGCTTCTGTCATCATGAATATAAAGCTCTACTGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTTTGTACTACACACACACACACACAC A 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=1.552;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,1:19:99:419,0,7100 +chr25 298484 . T G 7241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:7270,491,0 +chr25 298485 . A T 7241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:7270,491,0 +chr25 299308 . G A 6212.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:6241,469,0 +chr25 303895 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:360,0,53 +chr25 306520 . AGT A 1058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=2.341;DP=51;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=20.76;ReadPosRankSum=-2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:48:1096,0,48 +chr25 467441 . GT G 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-0.348;DP=31;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:268,0,296 +chr25 470643 . G GA 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-1.187;DP=16;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:21:332,0,21 +chr25 502229 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=44;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:59:370,0,59 +chr25 1139311 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=1.922;DP=44;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:866,0,605 +chr25 1141768 . A G 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.516;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1362,0,1149 +chr25 1146066 . C A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.080;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:719,0,777 +chr25 1150042 . G T 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-3.135;DP=42;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:714,0,658 +chr25 1150779 . G A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=1.933;DP=36;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=15.94;ReadPosRankSum=2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:602,0,653 +chr25 1150859 . G A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.138;DP=38;FS=10.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:553,0,765 +chr25 1151323 . G A 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:726,51,0 +chr25 1151325 . CCAGCAGCAGCTG C 600.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:46:638,46,0 +chr25 1151450 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=1.200;DP=29;FS=15.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:514,0,500 +chr25 1153237 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=-0.711;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:624,0,965 +chr25 1153281 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.457;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:299,0,360 +chr25 1153300 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.872;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:282,0,248 +chr25 1153603 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-1.514;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.51;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:375,0,341 +chr25 1153690 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.455;DP=33;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:623,0,451 +chr25 1155408 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.074;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:384,0,546 +chr25 1162223 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=22.60;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:322,0,134 +chr25 1207971 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=2.000;DP=24;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.37;ReadPosRankSum=-2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:397,0,379 +chr25 1207989 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=2.025;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=13.92;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,285 +chr25 1208105 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.231;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:826,0,1103 +chr25 1208320 . C T 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:527,36,0 +chr25 1372597 . TCA T 422.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:36:459,36,0 +chr25 1483361 . G T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.290;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:689,0,662 +chr25 1483366 . A T 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.730;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=27.80;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1624,114,0 +chr25 1571124 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr25 1759222 . T A 301.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:27:330,0,27 +chr25 2591698 . GAGGTGAGAATGGCTATATTTGTGATTATTTAGGTTGTTAGATACCATTTTTACTTTTTCCTTTCTACTTTTTCTGTTGCTCATTT G 1293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=1.593;DP=38;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=34.05;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:99:1331,0,1099 +chr25 2646557 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.276;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:270,0,485 +chr25 2866811 . G C 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.423;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:726,0,861 +chr25 2866883 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.232;DP=43;FS=6.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:651,0,739 +chr25 2866934 . T C 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=1.436;DP=62;FS=4.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1070,0,1019 +chr25 2964346 . G A 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.551;DP=64;FS=5.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1143,0,1006 +chr25 2973855 . C A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.785;DP=39;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:525,0,785 +chr25 2982344 . T TA 935.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=1.285;DP=75;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=12.48;ReadPosRankSum=-3.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:973,0,758 +chr25 3013722 . T G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.718;DP=42;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:741,0,698 +chr25 3014759 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=1.937;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:899,0,577 +chr25 3017119 . TA T 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 +chr25 3028402 . C T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.038;DP=62;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:534,0,1537 +chr25 3165197 . CACCTGTATGAGAGAAAAAGCAGATAAACATGCTGCAGTAAAATAACAAAAACACAACTCAAATAGTTTGATTCAATTTCTTG C 1734.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=3.153;DP=64;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=27.11;ReadPosRankSum=-2.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,52:59:99:1772,0,1141 +chr25 3176988 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=28.07;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:337,0,55 +chr25 3186785 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr25 3186964 . C A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-1.323;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=27.81;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:74:501,0,74 +chr25 3261780 . T C 1298.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1327,102,0 +chr25 3269699 . C G 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 +chr25 3272133 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr25 3284857 . G A 2119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.980;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,63:95:99:2148,0,1054 +chr25 3284875 . A G 2240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.100;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=25.46;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,61:88:99:2269,0,720 +chr25 3301603 . T C 2491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.143;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,65:93:99:2520,0,728 +chr25 3301963 . T A 6566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-1.523;DP=245;FS=6.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,173:245:99:6595,0,1858 +chr25 3302150 . C T 8434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.336;DP=298;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,204:298:99:8463,0,6214 +chr25 3302155 . C G 8442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-0.400;DP=302;FS=1.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,206:302:99:8471,0,6092 +chr25 3302301 . A C 4228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4257,298,0 +chr25 3354882 . T C 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.226;DP=283;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,70:282:99:1502,0,8103 +chr25 3357297 . C T 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=-1.123;DP=242;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,67:241:99:1466,0,6414 +chr25 3357719 . G T 2744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=2.827;DP=191;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,35:191:99:2773,0,11233 +chr25 3357791 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.688;DP=236;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,48:236:99:249,0,19532 +chr25 3358110 . T C 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.211;DP=130;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,36:130:99:876,0,4777 +chr25 3360369 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-0.425;DP=25;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:300,0,567 +chr25 3361025 . G A 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DP=204;FS=0.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,61:204:99:1349,0,5280 +chr25 3370171 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=1.097;DP=322;FS=11.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,51:322:99:497,0,16969 +chr25 3406974 . AGTGAGTATCCTTCATTTCCTGCCCTGAGAACCGATCTTATAGATGTTTATAACCTCTCATTTTCATCACAG A 4420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=1.699;DP=104;FS=4.372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:4458,340,0 +chr25 3413089 . T A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-0.727;DP=88;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=6.33;ReadPosRankSum=-1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:585,0,2399 +chr25 3522073 . C T 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.018;DP=84;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:1637,0,1367 +chr25 3527961 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.098;DP=50;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:721,0,970 +chr25 3529240 . G A 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=34.47;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:752,60,0 +chr25 3530650 . T TG 830.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:60:868,60,0 +chr25 3533849 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.048;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:568,0,706 +chr25 3533926 . ACTAAAAGAGAGTGGATTTTCTGGTAAATGGGTGATTTATTGATTTATTAGGATGTACAATGAGTAGAATTGTGCTTGTGAACCAC A 687.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.824;DP=32;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=21.49;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:99:725,0,729 +chr25 3556088 . G A 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=-2.084;DP=133;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=7.25;ReadPosRankSum=2.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,38:133:99:992,0,3662 +chr25 3563741 . GCTTAGAGAAAAACAAGAGCTTTATGAAGAATCCAAATCAAGTGGAGTGCATGGGTCTACATTGAGTCTAAAGATCTTCAGCACTGAC G 12726.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.336;DP=283;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,275:278:99:12764,1126,0 +chr25 3563952 . C CTTTTT 513.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:18:551,18,0 +chr25 3633782 . G T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-0.403;DP=52;FS=19.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:965,0,1949 +chr25 3633785 . T C 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-1.093;DP=54;FS=15.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:965,0,1890 +chr25 3644697 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.356;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:442,0,368 +chr25 3673741 . TCCTGTCATCACATTATATATGAACTCAAGCGTTTATTCTATTACACAGACAAGACGACTGGTCATCTCAAAAATAGATGAAGGATAAAAAGTAAGTACTGCAATTTAGTCAGTCTTTAGTTTTTGAAACTAAACATTAAATCATTTCAATCAAA T 2456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=4.307;DP=70;FS=9.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=34.99;ReadPosRankSum=-2.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,63:70:99:2494,0,1884 +chr25 3739006 . A C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=-0.493;DP=128;FS=5.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,31:126:99:694,0,3764 +chr25 3739995 . GT G 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.003;DP=127;FS=7.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,39:117:99:510,0,5420 +chr25 3740316 . T G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=3.566;DP=95;FS=6.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:357,0,3928 +chr25 3740683 . T C 1162.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:84:1191,84,0 +chr25 3767348 . G A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-1.147;DP=110;FS=5.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1856,0,1696 +chr25 3767368 . TCTGCAATGCACAAGACACTACAGTTATTCCTGATTTAATATAAATATCCCCTCAAGTCTCCAATGGTGGTCTGTACTCAC T 4807.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.067;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,103:105:99:4845,451,0 +chr25 3773940 . A AT 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-0.231;DP=108;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,26:101:99:342,0,2071 +chr25 3781068 . C A 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.575;ClippingRankSum=-0.161;DP=106;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:789,0,2585 +chr25 3781386 . C G 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=-0.058;DP=123;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=6.76;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,36:123:99:860,0,3203 +chr25 3811533 . TCCTGAAACATCAGTCAATCAGTGTGCAGGGTGTTTTTTGTTTATTTCAGATATGATTTGAGATATTGTTAGCATCTCA T 1959.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.872;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=28.08;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,48:52:13:1997,13,0 +chr25 3835509 . G A 1988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=-1.634;DP=139;FS=18.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,56:139:99:2017,0,2829 +chr25 3851216 . G GCACTGGTCAGCCGGGC 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.213;DP=47;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:505,0,1658 +chr25 3853104 . A C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=1.015;DP=34;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,881 +chr25 3938448 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=1.032;DP=16;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=31.05;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:97:525,0,97 +chr25 3938459 . C CA 531.91 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:15:552,0,15 +chr25 3938850 . T G 359.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:388,30,0 +chr25 3940456 . T G 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:523,36,0 +chr25 3943807 . A AT 1863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=6.387;DP=213;FS=9.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=8.75;ReadPosRankSum=-6.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,66:212:99:1901,0,10874 +chr25 4434313 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:318,0,427 +chr25 4469141 . G A 401.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:429,0,6 +chr25 4469213 . C T 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 +chr25 4676370 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.535;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:486,0,325 +chr25 4850329 . TA T 564.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.628;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:32:602,32,0 +chr25 4863356 . G T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-0.197;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:599,0,765 +chr25 4863695 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:99:248,0,103 +chr25 4863715 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,14:14:82:519,0,82 +chr25 4864117 . C G 695.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:724,51,0 +chr25 4872370 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.462;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:387,0,408 +chr25 4872391 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.517;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:445,0,441 +chr25 4877830 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.155;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:254,0,750 +chr25 4996334 . T A 2478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2507,187,0 +chr25 5020863 . TGGTAAGTGTGGTTTCCTCAAACCTTTAGATGCTTTCTACTGTGTAATGTACATTTTATTGATTTATTTTTTCACTCTTTCCA T 1331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.716;DP=220;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,210:211:99:1369,497,0 +chr25 5029832 . TTTGAGGTTAGCCA T 9963.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=1.170;DP=286;FS=2.288;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=34.84;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,263:266:99:10001,737,0 +chr25 5029848 . GATTTCATGTCCTGGAATTTTAGATTGTGTGTACTGTGGTGTACAAACCTGGCCAGCACTGCAGACTGCAGTTTAAAGGTCATTTGTTTTTTTCC G 11844.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=1.145;DP=264;FS=1.964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=31.70;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,260:264:99:11882,1119,0 +chr25 5038560 . G GT 2478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.590;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2606,273,0 +chr25 5043845 . GCCTTAAGAAAGTGACAGTGTGTGTCTGATTTAACTAACTGCTCGTTTTTGGGTGAACAATCATTTCTACATGATTTCAAATAAAGTAATAAATCTGCTGAAGTCATTTAAGGTCTTA G 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:438,0,1199 +chr25 5068128 . C CA 255.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:293,27,0 +chr25 5068285 . C T 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:454,33,0 +chr25 5068807 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr25 5069127 . A G 290.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:319,24,0 +chr25 5070144 . CT C 1961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1999,137,0 +chr25 5235895 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.441;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:308,0,941 +chr25 5253671 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.913;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:238,0,1017 +chr25 5315897 . G A 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 +chr25 5316086 . G C 663.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:692,48,0 +chr25 5316240 . A G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:739,54,0 +chr25 5316297 . A G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr25 5316650 . T C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr25 5327713 . T G 833.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=30.02;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:862,60,0 +chr25 5327847 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr25 5349829 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:353,0,272 +chr25 5356697 . AAGGCAAATATAACTTTAACCTGCGGTGCATGGCGATTTTGATCAATCATTCTCACTAGAAACAGAATGTCAATCTTTTACCCCATGCTTTCAGTGCTGTGCTTGTTTTCTGC A 1160.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.156;ClippingRankSum=0.470;DP=40;FS=6.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=29.02;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:99:1198,0,3495 +chr25 5361478 . GAGGTGAGGAAGTGAAAACACCGATCTGCTGGGGATTTTTTGTGTGCGTGTAGTGTTTGCTAACAGACTGTAACTCTTTATC G 1135.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=3.774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:94:1173,94,0 +chr25 5386587 . C T 3042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.592;DP=200;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,79:199:99:3071,0,8456 +chr25 5386590 . C G 3042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.406;DP=196;FS=2.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,80:195:99:3071,0,8402 +chr25 5389707 . AG A,ATATGATGATCGGAAGG 534.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=3.789;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,143,0:148:99:6214,231,1478,850,0,415 +chr25 5389709 . TAAGAAGCTTCAGTATGGCCATCTAGTGGCGAATGACGGTTAAAGCACAATAAATATGTGTTGTCGTGTGTGACCTGATGCTGACTTTGTATTTACTGCTCCAACAGA T 638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=5.017;DP=150;FS=1.303;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,141:150:99:676,256,0 +chr25 5423680 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:288,0,124 +chr25 5600997 . CCT C 251.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:289,0,22 +chr25 6225803 . C G 2248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.147;DP=119;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:2277,0,1818 +chr25 6226179 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=1.992;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,418 +chr25 6226273 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-1.614;DP=66;FS=16.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,26:65:99:669,0,2248 +chr25 6226275 . T C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-1.181;DP=71;FS=15.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:669,0,2288 +chr25 6226393 . G A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.493;DP=87;FS=16.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:1125,0,2369 +chr25 6226395 . G A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=-1.482;DP=83;FS=14.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:798,0,4371 +chr25 6226538 . T G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=5.044;DP=74;FS=3.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=7.20;ReadPosRankSum=-3.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:561,0,2109 +chr25 6226641 . A G 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.069;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,38:83:99:1347,0,1528 +chr25 6226808 . T G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=4.061;DP=49;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=5.75;ReadPosRankSum=-2.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:310,0,1688 +chr25 6226862 . G A 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.700;DP=71;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=14.11;ReadPosRankSum=4.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:1030,0,1459 +chr25 6227096 . G C 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=-0.277;DP=64;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1111,0,982 +chr25 6227129 . A G 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-1.266;DP=59;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1031,0,1092 +chr25 6227420 . AG A 342 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.496;DP=17;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:12:379,12,0 +chr25 6227774 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=2.205;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=30.69;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:68:550,0,68 +chr25 6228197 . T G 875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:904,66,0 +chr25 6228226 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=1.965;DP=31;FS=5.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=20.93;ReadPosRankSum=-2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:677,0,1384 +chr25 6228236 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=2.628;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.930;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:685,0,1384 +chr25 6228369 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=8.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:312,0,237 +chr25 6228454 . G T 635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:664,48,0 +chr25 6228467 . T C 1036.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1065,78,0 +chr25 6228568 . C T 2159.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2188,157,0 +chr25 6228751 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-1.138;DP=74;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:370,0,3280 +chr25 6228804 . G A 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.638;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1389,0,1309 +chr25 6228805 . A G 3706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3735,260,0 +chr25 6228944 . C T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:694,51,0 +chr25 6228953 . TC T 376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:38:414,38,0 +chr25 6228971 . C T 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1203,87,0 +chr25 6229078 . A C 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.711;DP=98;FS=4.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1729,0,1729 +chr25 6229124 . C T 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.535;DP=86;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:1368,0,1575 +chr25 6229177 . T A 2725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2754,207,0 +chr25 6229241 . G GT 751.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=1.502;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=20.32;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:96:877,96,0 +chr25 6229250 . A T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.652;DP=47;FS=6.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:649,0,719 +chr25 6252650 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=18.62;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,189 +chr25 6265550 . A G 4374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.184;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.83;ReadPosRankSum=2.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,118:210:99:4403,0,6923 +chr25 6265554 . C T 4395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=-1.269;DP=219;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=20.07;ReadPosRankSum=3.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,123:219:99:4424,0,6923 +chr25 6271944 . T G 3727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3756,280,0 +chr25 6279296 . T A 6816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-2.467;DP=402;FS=9.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=16.96;ReadPosRankSum=2.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,208:393:99:6845,0,6646 +chr25 6281871 . G A 4649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=1.411;DP=342;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,133:329:99:4678,0,6817 +chr25 6285784 . C T 5775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-0.343;DP=353;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,165:353:99:5804,0,6209 +chr25 6297113 . AACAGGTACTGAACGCATTGGAAATCATTTCACTCGGTCGTGTTACAACTTACACAAACATGGATGACAGTTTACTCTCTTTCCCC A 13597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.414;DP=356;FS=1.596;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,350:356:99:13635,1116,0 +chr25 6322401 . C T 240.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:269,0,15 +chr25 6375474 . AT A 1842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1880,182,0 +chr25 6403212 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:645,0,28 +chr25 6408353 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.091;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:504,0,631 +chr25 6409816 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.215;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:615,0,1411 +chr25 6409817 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.207;DP=36;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:615,0,1424 +chr25 6410033 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.363;DP=26;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:460,0,366 +chr25 6411168 . G T 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 +chr25 6411226 . C G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr25 6440073 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-1.681;DP=45;FS=4.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:288,0,1201 +chr25 6441714 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=1.415;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:436,0,1069 +chr25 6441738 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=1.781;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=12.48;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:415,0,774 +chr25 6441739 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=1.501;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:587,0,653 +chr25 6441826 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-1.774;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:260,0,395 +chr25 6441861 . T C 472.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=33.74;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:1:498,0,1 +chr25 6441862 . T C 503.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.496;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=29.20;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:4:530,4,0 +chr25 6556908 . AT A 2030.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2068,203,0 +chr25 6645443 . C G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:334,27,0 +chr25 6718582 . GCTAGAAGAGCATTAGCAAGACATTCATCACAAAAGCAAAATCACAACAGCAGCAGGTGGAGAGCGTAAACAGTGCAAGAGTGTGGAGACTGAC G 2280.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=2.352;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=29.10;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2318,220,0 +chr25 6753223 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=-1.835;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=7.92;ReadPosRankSum=2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:361,0,1115 +chr25 6754153 . AT A 724.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.493;DP=42;FS=5.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:19:762,0,19 +chr25 7639241 . G A 1601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.673;DP=78;FS=3.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,48:78:99:1630,0,1005 +chr25 7639388 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;ClippingRankSum=-1.570;DP=85;FS=8.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:370,0,2292 +chr25 7652365 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=1.893;DP=37;FS=11.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:450,0,862 +chr25 7705299 . A G 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.534;DP=51;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:863,0,1658 +chr25 7718350 . G T 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.142;DP=73;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,40:72:99:1272,0,1122 +chr25 7719232 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.998;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:671,0,460 +chr25 7719282 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=1.109;DP=35;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:669,0,550 +chr25 7723001 . A T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.059;DP=33;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=26.93;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:917,0,282 +chr25 7723344 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=2.901;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:314,0,585 +chr25 7723585 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-1.388;DP=21;FS=9.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:657,0,198 +chr25 7723615 . TA T 822.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=1.346;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=29.38;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:27:860,0,27 +chr25 7724564 . G A 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.483;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1164,0,228 +chr25 7724667 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=-1.270;DP=40;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:1184,0,235 +chr25 7725023 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-1.300;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:623,0,966 +chr25 7725910 . A AGT 523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:561,44,0 +chr25 7733183 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,130 +chr25 7743908 . T C 335.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 +chr25 7747974 . C T 1665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.683;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1694,0,1734 +chr25 7755154 . G A 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.904;DP=83;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1483,0,1308 +chr25 7802459 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.969;DP=56;FS=6.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:600,0,1239 +chr25 7811662 . C CA 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.906;DP=86;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:290,0,1752 +chr25 7815663 . T A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.129;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:445,0,493 +chr25 7816397 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=22.41;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:342,0,397 +chr25 7816407 . T A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.41;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:342,0,397 +chr25 7823589 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.719;QD=23.24;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:400,0,159 +chr25 7826999 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=23.99;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:412,0,163 +chr25 7843426 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:233,0,403 +chr25 7877933 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.423;DP=17;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:466,0,148 +chr25 7877963 . T C 464.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:493,36,0 +chr25 7878601 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.527;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:582,0,312 +chr25 7888171 . TCCTACACACACACACACCAAACAACATCCATCATACTCCACTACAAAACACACGATGACTGCTCTTCAGAACTGA T 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=34.98;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:562,0,129 +chr25 7890947 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:262,0,102 +chr25 7891430 . T C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr25 7894287 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,242 +chr25 7913096 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=1.129;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:555,0,141 +chr25 7917851 . A T 3335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.704;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,99:173:99:3364,0,2655 +chr25 7937440 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=1.530;DP=24;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:435,0,474 +chr25 7939895 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-1.898;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:376,0,162 +chr25 7940088 . C A 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr25 7940742 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,146 +chr25 7941900 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,137 +chr25 7979153 . GAAA G 213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:20:251,20,0 +chr25 7980552 . AT A 301.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.401;DP=16;FS=11.139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:11:338,11,0 +chr25 7980961 . TA T 590.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.459;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:628,0,706 +chr25 7987034 . CTGGTGG C 224.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:262,22,0 +chr25 8128531 . A C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 +chr25 8142384 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=21.21;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:304,0,173 +chr25 8153756 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=1.936;DP=14;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=16.70;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,301 +chr25 8155562 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,226 +chr25 8155567 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:257,0,422 +chr25 8156052 . A C 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=-2.079;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=18.76;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1060,0,790 +chr25 8170185 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-2.432;DP=52;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:868,0,1060 +chr25 8178920 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.103;DP=44;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:332,0,1203 +chr25 8182508 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,323 +chr25 8246599 . C T 2356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.445;DP=156;FS=5.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:2385,0,2929 +chr25 8251890 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-0.572;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:392,0,2036 +chr25 8251900 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-1.606;DP=52;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:321,0,1725 +chr25 8296071 . T C 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.392;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:804,0,2135 +chr25 8309071 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=2.089;DP=67;FS=7.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:581,0,1641 +chr25 8309097 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.224;DP=65;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:421,0,1599 +chr25 8309152 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=2.187;DP=58;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=9.00;ReadPosRankSum=2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:550,0,1452 +chr25 8311098 . T C 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-1.582;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:1185,0,1510 +chr25 8318436 . T C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=1.013;DP=52;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:871,0,2088 +chr25 8318514 . T G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=1.758;DP=48;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:332,0,1265 +chr25 8444426 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.200;DP=42;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:252,0,1169 +chr25 8457053 . GCCTGACGCACAGGCATGCGCGCGCACACACAGAGACATTAATTAGACAAACATGATCATTCAGATAAATACATTTAGTAAAGAATCACGAGTTCTGA G 1436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.900;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=28.17;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,42:49:99:1474,0,791 +chr25 8585213 . A C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr25 8590211 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=-2.201;DP=18;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=24.49;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:469,0,215 +chr25 8590327 . A G 1652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.217;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=26.23;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,44:63:99:1681,0,507 +chr25 8590420 . A G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=2.598;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:939,0,1467 +chr25 8590773 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-3.123;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=25.05;ReadPosRankSum=2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:404,0,160 +chr25 8590774 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-2.488;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,368 +chr25 8625388 . G C 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 +chr25 8631453 . A C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.425;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:301,0,526 +chr25 8631580 . T C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr25 8659822 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.331;DP=20;FS=9.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=28.54;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:599,0,267 +chr25 8659870 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.760;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:445,0,299 +chr25 8660252 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:381,0,407 +chr25 8670485 . AGTCAAACTAATGTGTGCTGTATATGAATAGCTATGAAAGTCCAGGTCTTGTGTGTTCCTCCAGGCT A 685.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.066;DP=19;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=32.83;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:723,0,514 +chr25 8676730 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.876;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:294,0,716 +chr25 8709105 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:368,0,340 +chr25 8709123 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:281,0,311 +chr25 8734924 . C A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=1.545;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=26.65;ReadPosRankSum=-2.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:508,0,288 +chr25 8736561 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.332;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=29.03;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:667,0,113 +chr25 8739184 . G T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr25 8739311 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:306,0,54 +chr25 8740565 . T C 847.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:876,63,0 +chr25 8740832 . G A 539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:568,39,0 +chr25 8741738 . G A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr25 8746266 . G C 211.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:240,0,21 +chr25 8751902 . TC T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:286,0,248 +chr25 8752804 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.467;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:319,0,445 +chr25 8826687 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=1.022;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:366,0,382 +chr25 8855882 . A T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr25 8855905 . G A 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 +chr25 8860379 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=1.323;DP=47;FS=8.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:683,0,947 +chr25 8867507 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-0.465;DP=53;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=5.43;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:316,0,1555 +chr25 8870197 . ACTGCAATCAAAACAAAAACACGAGTTTAAGGAGCCGAGGAGGATTAGCATAATAAGCGGACGTTTATCTCCAAAACTGCAGAAAAAGCGAAAC A 1659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=3.898;DP=46;FS=1.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:99:1697,0,2571 +chr25 8885590 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-1.076;DP=53;FS=1.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:415,0,1383 +chr25 8890446 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=-0.529;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:459,0,786 +chr25 8893561 . G A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.892;DP=70;FS=5.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:605,0,1871 +chr25 8893845 . CA C 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.585;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:252,0,498 +chr25 8901022 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=1.106;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:462,0,506 +chr25 8914881 . G T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-1.134;DP=47;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:511,0,1115 +chr25 8920008 . G A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=-0.762;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1038,0,967 +chr25 8967622 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.852;DP=40;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:708,0,686 +chr25 8970681 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.214;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:422,0,866 +chr25 9033951 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=1.234;DP=77;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:384,0,2049 +chr25 9136686 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.045;DP=57;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:393,0,1632 +chr25 9149822 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=-0.410;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:436,0,492 +chr25 9149913 . C T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.790;DP=43;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:746,0,794 +chr25 9163638 . T C 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.821;DP=40;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:605,0,782 +chr25 9175035 . AAGGTGAGGCTTTAACATTACTGAATCAGCTCTTTTGCATCAGCTTTCTGCATCCGGTCACTGTGTTTTCTGT A 1333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-0.025;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=33.34;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:99:1371,0,1603 +chr25 9177127 . T A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.933;DP=56;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:781,0,1127 +chr25 10540684 . C T 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 +chr25 10608593 . A C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-1.004;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:42:418,0,42 +chr25 10705212 . C T 9904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.480;DP=578;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:293,277:570:99:9933,0,9509 +chr25 10813879 . C T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.519;DP=57;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.038;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:987,0,1047 +chr25 10814171 . CAA C 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.748;DP=67;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:627,0,563 +chr25 10856804 . A G 2639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:2668,196,0 +chr25 10876890 . T C 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=2.755;DP=69;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:921,0,1447 +chr25 10881319 . G T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=0.380;DP=101;FS=6.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:1147,0,2055 +chr25 10887193 . G A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-1.823;DP=88;FS=0.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:533,0,2516 +chr25 10887373 . C G 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-1.360;DP=82;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1218,0,2909 +chr25 10889242 . G A 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.960;DP=105;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,40:105:99:1366,0,2149 +chr25 10953061 . C T 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.302;DP=87;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1145,0,1774 +chr25 10991789 . A T 2063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2092,153,0 +chr25 10992022 . A T 2702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2731,205,0 +chr25 11008397 . G GT 1312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.088;DP=122;FS=9.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,32:35:34:1350,0,34 +chr25 11016212 . A G 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.467;DP=108;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1771,0,1969 +chr25 11071475 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,309 +chr25 11156080 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr25 11156081 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:308,21,0 +chr25 11156624 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr25 11615045 . C G 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 +chr25 11674283 . G GA 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.677;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:279,0,834 +chr25 12139322 . G A 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=30.50;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:32:548,32,0 +chr25 12598855 . TCGCGGTTAGTACATCTCCTCCTTTTACTTTACTATATTAGTTTATATTATTAATTATTTACATTTAA T 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.386;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=3.95;ReadPosRankSum=2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:515,0,4528 +chr25 12600714 . CAGGTAAACATTCACCGCCTAATTAATCTGCATAAAATGATAGAAAATGCATTAAGAGAATAAAAGTGCTTATTTCAAAATGTTTTCCCTCTT C 6294.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.329;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=31.07;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,153:156:99:6332,572,0 +chr25 12604241 . C T 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=1.256;DP=117;FS=7.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,40:117:99:1154,0,6060 +chr25 12604416 . T G 2530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.839;DP=112;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=22.60;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,74:112:99:2559,0,1231 +chr25 12610784 . G A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-2.159;DP=81;FS=6.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:1066,0,1706 +chr25 12613754 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=1.991;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=31.75;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:441,0,1408 +chr25 12613828 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.135;DP=54;FS=6.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:277,0,3144 +chr25 12613863 . GT G 1501.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-1.313;DP=64;FS=1.954;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,50:58:7:1538,7,0 +chr25 12614184 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.911;DP=41;FS=11.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=7.58;ReadPosRankSum=-2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:339,0,1046 +chr25 12615067 . A G 1524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-0.300;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,42:74:99:1553,0,2488 +chr25 12615943 . C A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-3.639;DP=63;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:328,0,1902 +chr25 12617854 . G T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-2.655;DP=74;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:871,0,1710 +chr25 13097261 . T A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-0.404;DP=68;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:797,0,1564 +chr25 13097273 . G A 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.567;DP=57;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:975,0,1075 +chr25 13097448 . A AT 1968.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2006,134,0 +chr25 13097670 . CT C 656.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.319;DP=67;FS=5.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,28:62:99:694,0,764 +chr25 13131627 . AAGGTGTCAGCTTTGTCACAAACCTCACCTTACGTTAGTCTTTACTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTGAAAGTAATTTATATATTTCCTTGC A 1891.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=292;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,282:282:99:1929,681,0 +chr25 13131821 . TGGTGGGTATTTTGTTCTTACATGGCTATCAACAGTTATTTAAACAAATGTAATTGTATGTTAAAAAATGCATATTAAGTAAGTCTTTTTAAAAGCA T,TGCA 704.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.116;DP=77;FS=2.125;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,31,34:69:99:1441,409,1572,407,0,1789 +chr25 13132065 . AAGGTGAGATTTAAACAGCTTTTTTTCATAAGCTAACAGTATATACCAGTTTGGCTATCAGTCAAAATGTCTATATACCTAACCAAAATATGAGAGGTGCAGTTGTCGTTTTTAATGTGAATAAAACATTTAGATGTTTTTTTATGTGTGCTGCTGTTTTC A 3942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.377;DP=291;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,117:288:99:3980,0,7753 +chr25 13132066 . AGGTG A 5552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-2.389;DP=286;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.960;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,166:283:99:5590,0,6388 +chr25 13132071 . AGATTTAAACAGCTTTTTTTCATAAGCTAACAGTATATACCAGTTTGGCTATCAGTCAAAATGTCTATATACCTAACCAAAATATGAGAGGTGCAGTTGTCGTTTTTAATGTGAATAAAACATTTAGATGTTTTTTTATGTGTGCTGCTGTTTTCAG A 5563.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-1.939;DP=286;FS=5.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,164:285:99:5601,0,6388 +chr25 13139616 . CT C 230.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=18;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:10:267,10,0 +chr25 13141808 . CT C 1192.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.088;DP=88;FS=4.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,52:83:99:1230,0,720 +chr25 13153751 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-2.228;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.80;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,384 +chr25 13155192 . C A 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=-0.363;DP=103;FS=16.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:978,0,5445 +chr25 13203130 . T A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=1.002;DP=33;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:646,0,484 +chr25 13203172 . AT A 685.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.415;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:723,0,739 +chr25 13203173 . T TC 585.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-0.704;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:623,0,1182 +chr25 13206729 . G GT 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.876;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:531,0,533 +chr25 13541412 . A T 564.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.66;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:24:593,0,24 +chr25 13959122 . GT G 486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.371;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:524,0,99 +chr25 13959494 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr25 13959651 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:288,21,0 +chr25 13960757 . G A 1033.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1062,75,0 +chr25 13960821 . C T 623.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:51:865,51,0 +chr25 13963958 . G A 2045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2074,150,0 +chr25 13991658 . T C 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 +chr25 13994714 . CA C 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.031;DP=24;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:271,0,270 +chr25 14080786 . GCTGCATCAAACACACACACACACACACACAAACATGACAATGCAAATTGACATCTGAAACACCACCTCACTTCCAAACAGAAACCGGTACTCTCATGCCCTCTGCTGGTGAGTAAGCGCAATAAATCCAGAATTAACATTGAAGGAATCTTTTTTTACTCAAAATCTCTCTGAAATGTACTCTAATGTCCTAAATCCAGTTCAGAGTTGAAAAAGATCCAAAACCACAACATTAC G 6045.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.808;ClippingRankSum=4.694;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=32.33;ReadPosRankSum=1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,165:185:99:6083,0,6724 +chr25 14090931 . TAGAGAG T 288.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:39:326,39,0 +chr25 14100593 . T TA 203.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:29:241,0,29 +chr25 14100600 . C A 536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:565,39,0 +chr25 14101669 . T C 2507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2536,184,0 +chr25 14102291 . GTT G 326.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:364,30,0 +chr25 14103814 . TG T 805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.124;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:83:843,83,0 +chr25 14106335 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,1:2:52:283,0,52 +chr25 14121411 . AT A 218.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:15:256,0,15 +chr25 14122097 . G A 1931.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1960,150,0 +chr25 14664637 . ACGTGGTGCGTTCTAAACCAGTGACAT A 6045.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.646;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:6083,504,0 +chr25 14664666 . TCAGTCTTGTGTCTTTTATCTGTAACCCACACCATCATTCTGCTCTTCACTTTGCA T 6045.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.011;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=29.44;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,133:135:99:6083,504,0 +chr25 14676195 . GAATCTACAAGAATACACGCAAACAGCTCC G 1400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=1.899;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1438,0,743 +chr25 14676227 . TTAAAAAATCATCATCAGTAAAGCTCACAAATAAAACAGTTCATGAAGAAGTCTAACTCAC T 1400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=1.899;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,34:36:99:1438,0,743 +chr25 14676420 . CTCACT C 2063.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=1.663;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.594;QD=30.69;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2101,186,0 +chr25 14676428 . AAAGACAGAATGTCAAAAATATATTAAGGTTTTCCTCAGAGAATGTGTCAATTCTGGTTCATTTTTAAGACACACTGAAGAGCATCTGTAC A 2153.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.728;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:2191,192,0 +chr25 14682483 . ACACCTGCGTGCCATTCACATACTGGTCTTATTATTTCATCTTATCTTATATTATGAATCAATACTGTATATATGAGCAGGAATGAG A 230.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=2.333;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=4.81;ReadPosRankSum=-2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:97:268,97,0 +chr25 14691004 . GCTTAAAGAACACATTTGAATGTACAAGACTGCTTTTTTACAAGTAAGAAAAAATTAGATATAACTTTAGGATGTACTTAC G 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=2.255;DP=37;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:452,0,10562 +chr25 14771852 . A AT 899.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:98:1025,98,0 +chr25 14772874 . C CT 264.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:43:395,43,0 +chr25 14999083 . TTA T 810.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:58:848,58,0 +chr25 15305898 . T A 1158.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1187,93,0 +chr25 15571211 . C CT 366.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:404,39,0 +chr25 15642035 . T A 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 +chr25 15705296 . A AT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-0.050;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:55:344,0,55 +chr25 15705603 . A AT 332.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-0.510;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:24:370,24,0 +chr25 16004835 . CT C 833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:871,75,0 +chr25 16669563 . G GA 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-0.604;DP=106;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:472,0,1811 +chr25 17032878 . T TCTG 952.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 +chr25 17038300 . G GACCCC 3352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3390,236,0 +chr25 17044304 . G A 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 +chr25 17044343 . CT C 369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:407,40,0 +chr25 17310457 . GT G 359.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=23.99;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:15:397,15,0 +chr25 17328626 . CA C 935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-1.243;DP=43;FS=3.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=21.76;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:81:973,81,0 +chr25 17664238 . C T 3958.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:3987,295,0 +chr25 17666029 . A AT 397.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:435,36,0 +chr25 17666846 . TTG T 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:74:1034,74,0 +chr25 17690214 . CAGGTGGGTGAATTTGACATTGGCGGGAAGTTGTTATTGCATCACTGTGTACTGATATGTGCCTGGGTCACGTTTCT C 12514.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.925;DP=299;FS=4.735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.584;QD=30.24;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,289:299:99:12552,1075,0 +chr25 17693470 . C T 10014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,241:241:99:10043,725,0 +chr25 17696376 . C CA 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.898;DP=325;FS=8.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,62:315:99:510,0,6956 +chr25 17697242 . CGTTAGTTACTCACTCTACCAACCAATTCATTACCCCTTTTCAAATAGCGTTAATTAAGACACTAACAATTTTTACCTTAACGTTTATAG C 16578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=1.313;DP=379;FS=2.022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=33.71;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,374:378:99:16616,1258,0 +chr25 17697724 . G A 11740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.720;DP=284;FS=3.041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=31.47;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,283:284:99:11769,852,0 +chr25 17710154 . TCCTAAAGACATGAGCTGTGAGAGATCGAAGCATCCACCACAATAAACAAACACAAAGATAGAAAATAATAATA T 1024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.946;DP=30;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=34.16;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1062,0,1542 +chr25 17712402 . A T 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.385;DP=23;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:671,0,139 +chr25 17712452 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.440;DP=37;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:660,0,663 +chr25 17713769 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-1.517;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.047;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:298,0,462 +chr25 17731454 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=3.736;DP=46;FS=5.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.184;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:369,0,1229 +chr25 17734459 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.687;DP=44;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:682,0,842 +chr25 17735179 . G A 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.628;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:851,0,715 +chr25 17735391 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=2.996;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:233,0,1074 +chr25 17765837 . C T 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-0.951;DP=91;FS=3.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1464,0,1624 +chr25 17771027 . C T 3299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.922;ClippingRankSum=2.910;DP=120;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=27.50;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,89:119:99:3328,0,755 +chr25 17773634 . C T 6765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:6794,525,0 +chr25 17774735 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.052;DP=64;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:491,0,3157 +chr25 17775875 . TG T 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-0.024;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:319,0,316 +chr25 17775960 . G A 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=-0.987;DP=67;FS=8.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1049,0,1170 +chr25 17780460 . T G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-0.767;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:571,0,489 +chr25 17801716 . C A 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=2.825;DP=31;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=29.06;ReadPosRankSum=2.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:929,0,103 +chr25 17801922 . C T 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-1.361;DP=67;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1202,0,1230 +chr25 17831353 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.452;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:534,0,623 +chr25 17831691 . A T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.284;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:509,0,507 +chr25 17831777 . G T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.659;DP=26;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:579,0,358 +chr25 17831808 . T C 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.875;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:631,0,601 +chr25 17832640 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-1.259;DP=40;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:755,0,590 +chr25 17832733 . A AT 489.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:527,50,0 +chr25 17833085 . G C 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.454;DP=39;FS=4.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:478,0,940 +chr25 17834544 . C G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.109;DP=55;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=6.18;ReadPosRankSum=-3.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:368,0,3304 +chr25 17834780 . C A 268.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:297,0,15 +chr25 17834856 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-2.565;DP=28;FS=17.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:359,0,627 +chr25 17835175 . C G 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.086;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:914,0,824 +chr25 17853182 . TCTGCAGTGAAGAAAACACACGACAATTTAAACACATTTAAAAGTGAATTATTCTAATTCAAACTAACGTTAAAATTCTAATTAATGTCTGTATAAAAAAAAGAAAAAC T 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=2.162;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:99:635,0,901 +chr25 17918219 . T A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.797;DP=48;FS=10.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:795,0,885 +chr25 17922357 . G C 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.444;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:1624,0,1205 +chr25 17932172 . C CTA 1163.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=3.316;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1201,0,451 +chr25 17933123 . A T 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=1.392;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:1346,0,1198 +chr25 17953321 . T C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.260;DP=53;FS=9.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:790,0,2165 +chr25 17955109 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=1.323;DP=33;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=12.30;ReadPosRankSum=-1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:99:434,0,1777 +chr25 17955115 . G GGACATC 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=1.048;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:434,0,1860 +chr25 17963369 . G A 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=1.191;DP=56;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:987,0,930 +chr25 17968142 . TGTGAGTCGCATTCCCCCACCACATCAATAATTCTGGTTTTCAACTCTCCACACTGACATTGGTTCTCTTGGCAG T 2266.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.452;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=34.10;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:99:2304,191,0 +chr25 18236606 . T C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr25 18379117 . C T 3903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-0.757;DP=63;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,41:63:99:3932,0,516 +chr25 18379132 . A G 3903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=-0.106;DP=64;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,50:64:99:3932,0,458 +chr25 18379447 . A G 2890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=1.340;DP=165;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,88:164:99:2919,0,2779 +chr25 18379643 . T TA 269.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=24.50;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:306,0,7 +chr25 18379749 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=1.417;DP=48;FS=4.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=15.97;ReadPosRankSum=2.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:795,0,876 +chr25 18381447 . G A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.375;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:825,0,776 +chr25 18388431 . GCCTGTTGAAATCATACAGTGGTTAAGGAGAGAGAAAGAGCCGGAGGAGAAAGTGCTGGAAACCAATCTCA G 2262.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.903;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=34.28;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,58:62:99:2300,132,0 +chr25 18391238 . G T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.132;DP=64;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1416,0,2018 +chr25 18411311 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.973;DP=38;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:650,0,682 +chr25 18412861 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=1.160;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:514,0,346 +chr25 18421207 . AAGGTAAAGATCACTCTTTTGTTGCACGTTTTCTAAATCTTTCACAATTTCTCCATATTAAATCATATTGAATCTCGTTCTCC A 1094.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.129;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=32.12;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,27:29:99:1132,0,416 +chr25 18423952 . C G 294.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:323,0,17 +chr25 18427369 . T A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.199;DP=56;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:648,0,1134 +chr25 18431025 . C T 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.852;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:941,0,748 +chr25 18431135 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.287;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.907;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:675,0,848 +chr25 18442156 . AGCT A 1194.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.479;DP=65;FS=15.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1232,0,2317 +chr25 18442157 . GCTGATACAAGGAAAGCGAATAGGATTAGATTTAAGTTTGCTCTATATATAATGTCAAAAAGTGTTTCAATGCAATACTGAC G 1148.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.296;DP=65;FS=15.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1186,0,2397 +chr25 18442161 . ATACAAGGAAAGCGAATAGGATTAGATTTAAGTTTGCTCTATATATAATGTCAAAAAGTGTTTCAATGCAATACTGACG A 1194.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.283;DP=65;FS=13.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:1232,0,2317 +chr25 18443343 . C T 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.933;DP=51;FS=3.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:796,0,866 +chr25 18443481 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.592;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:702,0,1098 +chr25 18449622 . T C 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=-0.063;DP=54;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1145,0,694 +chr25 18450056 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-2.253;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:496,0,2180 +chr25 18454792 . A G 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.970;DP=51;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:907,0,939 +chr25 18457196 . G T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.394;DP=40;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:828,0,574 +chr25 18457258 . G A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-2.108;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1197,0,660 +chr25 18457281 . C T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.429;DP=53;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,36:53:99:1340,0,483 +chr25 18465048 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.264;DP=32;FS=5.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:544,0,588 +chr25 18472938 . T C 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=2.229;DP=62;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.527;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1177,0,972 +chr25 18478063 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.843;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:745,0,584 +chr25 18540201 . G T 1244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-1.794;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.801;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1273,0,2127 +chr25 18541190 . G T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.472;DP=56;FS=12.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:781,0,934 +chr25 18947625 . CATGCTAAAGGAACAATACAGAATTCAGGTCAAATGATGATAGATAAATAAATATTCAGTA C 365.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:31:403,31,0 +chr25 18983330 . T C 4796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:4825,349,0 +chr25 19048241 . G A 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 +chr25 19048258 . A G 593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:622,42,0 +chr25 19048293 . G GA 269.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:349,35,0 +chr25 19062084 . T A 1553.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1582,108,0 +chr25 19062549 . TTG T 1072.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1110,87,0 +chr25 19062580 . T C 2322.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2351,169,0 +chr25 19062795 . G GA 4640.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.420;DP=201;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,171:173:99:4678,463,0 +chr25 19063080 . C T 10593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,242:242:99:10622,748,0 +chr25 19063972 . A C 3798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:3827,271,0 +chr25 19063983 . T C 3798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3827,271,0 +chr25 19064221 . A G 3988.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:4017,290,0 +chr25 19064255 . G GT 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.589;DP=85;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,54:68:99:961,0,141 +chr25 19064404 . G T 11239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=267;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,267:267:99:11268,807,0 +chr25 19064691 . G A 6294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:6323,436,0 +chr25 19071089 . C T 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:564,39,0 +chr25 19071095 . G T 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:564,39,0 +chr25 19125353 . T C 1880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1909,129,0 +chr25 19178180 . T TA 272.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:380,41,0 +chr25 19178543 . A G 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1081,78,0 +chr25 19179532 . A G 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 +chr25 19180361 . G A 882.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-1.576;DP=22;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:911,63,0 +chr25 19202634 . G A 1042.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1071,75,0 +chr25 19210591 . C T 733.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:762,54,0 +chr25 19377829 . A AT 311.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:349,33,0 +chr25 19386940 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr25 19398336 . A G 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:683,48,0 +chr25 19412010 . A G 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr25 19416435 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr25 19417279 . T A 787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:816,60,0 +chr25 19425587 . G A 738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:767,54,0 +chr25 19425605 . G A 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 +chr25 19451590 . G A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr25 19451977 . C A 1014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1043,72,0 +chr25 19452493 . C A 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:60:850,60,0 +chr25 19452755 . C T 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr25 19452823 . C T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr25 19452873 . C T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:351,24,0 +chr25 19453475 . T TA 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr25 19453766 . T C 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 +chr25 19453797 . GT G 226.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:10:263,10,0 +chr25 19454903 . T TA 1638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1676,158,0 +chr25 19457914 . A G 1095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1124,84,0 +chr25 19463236 . TGTAAGTGTTTGATCACAGCTACAGATGAATAGATAGTTGCCACTTATGCAAAGACCTGAACTTAATGAATACTTCTTATTTTTTTCAG T 10174.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=2.429;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=26.06;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,243:245:99:10212,839,0 +chr25 19467101 . T A 2297.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2326,166,0 +chr25 19467953 . G T 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1868,132,0 +chr25 19478689 . C A 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:574,39,0 +chr25 19478697 . A G 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:574,39,0 +chr25 19506472 . C T 4892.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:4958,408,0 +chr25 19506493 . A G 5789.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:5818,420,0 +chr25 19508919 . AAGGTGAATGACTCTGACTCTCAGCACTGAAGTTCAGCATCTCGGTGTCACTGACTAAACTGTGTGTTTGTTGAC A 5173.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-1.523;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=32.61;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:5211,479,0 +chr25 19511740 . C G 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +chr25 19669153 . C A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:510,36,0 +chr25 19695141 . G A 1869.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1898,135,0 +chr25 19695506 . G A 1002.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1031,72,0 +chr25 19703251 . C G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr25 19704324 . G A 881.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:910,66,0 +chr25 19706605 . C T 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr25 19708540 . G A 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 +chr25 19854066 . G C 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:739,54,0 +chr25 19864769 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr25 20021926 . G A 534.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:563,39,0 +chr25 20037974 . C T 1612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1641,117,0 +chr25 20046827 . A G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.188;DP=39;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:504,0,852 +chr25 20052704 . GCCTGATAAAGCAATATTACACATGAGGAAACATGGTTTTACGGAAAGTCTTGTGATTAGTGTGCATCAGCATATCTCAGA G 2480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=1.604;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=31.40;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,70:77:99:2518,0,971 +chr25 20075665 . G GA 741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:779,75,0 +chr25 20078425 . GCCTTTAAAACACACATTAATACAAACTCAAGGAGAAGAAGCGTCAAACGATCTTCTTATTCAAATGGTAGAGAGCTTA G 2527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.921;DP=71;FS=2.508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=29.39;ReadPosRankSum=-1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,61:64:99:2565,184,0 +chr25 20090074 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr25 20157674 . G C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=6.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:368,0,451 +chr25 20157741 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.436;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,386 +chr25 20233628 . A T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.423;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=22.55;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:592,0,207 +chr25 20233631 . A AGCTCAACTT 554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.282;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=22.19;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:592,0,210 +chr25 20245798 . T G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=1.581;DP=35;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:303,0,3352 +chr25 20245804 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.968;DP=35;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:297,0,3352 +chr25 20247644 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.682;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.187;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:472,0,676 +chr25 20308505 . T C 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=2.555;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:786,0,883 +chr25 20314721 . A C 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.944;DP=65;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,26:65:99:895,0,1338 +chr25 20328665 . G A 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-1.659;DP=80;FS=11.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,49:80:99:1622,0,1003 +chr25 20328737 . A G 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.471;DP=75;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,53:75:99:1917,0,544 +chr25 20335917 . C A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.515;DP=59;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:679,0,1324 +chr25 20338202 . T TCTCTGCTCTTCGAGTGGC 2308.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2346,168,0 +chr25 20339479 . A G 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.074;DP=56;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.243;QD=15.50;ReadPosRankSum=2.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:896,0,1011 +chr25 20348051 . G A 1238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1267,90,0 +chr25 20355434 . G C 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=1.290;DP=68;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1360,0,1016 +chr25 20355584 . T G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.343;DP=49;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:368,0,1354 +chr25 20395362 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=1.070;DP=32;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:383,0,688 +chr25 20421639 . T G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.069;DP=28;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:518,0,489 +chr25 20421751 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.354;DP=42;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.819;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:668,0,740 +chr25 20423299 . GA G 604.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-1.103;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=26.29;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:64:642,64,0 +chr25 20424080 . T A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.805;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=15.40;ReadPosRankSum=-2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:444,0,554 +chr25 20425509 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:400,0,802 +chr25 20425733 . A C 664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:693,51,0 +chr25 20425957 . C T 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:607,42,0 +chr25 20426499 . A C 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=20.62;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:523,0,373 +chr25 20449340 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:252,0,390 +chr25 20519040 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-0.282;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:577,0,185 +chr25 20526905 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:361,0,345 +chr25 20539605 . C A 844.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:873,60,0 +chr25 20581654 . A G 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.405;DP=186;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,91:169:99:3051,0,2919 +chr25 20587845 . G C 8702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=1.452;DP=458;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=19.00;ReadPosRankSum=2.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,258:458:99:8731,0,7223 +chr25 20703735 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=16;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.24;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:33:384,0,33 +chr25 20723322 . GCTGTAGACACACCGAGACAGCATCGGCACTCTGCTTAAAACACCAAAACCAAAAACTCTTTGACATGGTTTTCTACGTAC G 6315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-1.111;DP=153;FS=5.483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,145:153:99:6353,536,0 +chr25 21021445 . G C 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:526,36,0 +chr25 21238705 . G T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr25 21238955 . G A 732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:761,54,0 +chr25 21373701 . T TA 278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:316,35,0 +chr25 21668372 . CA C 281.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:13:319,0,13 +chr25 21762104 . C A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.676;DP=40;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:794,0,552 +chr25 21781192 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=1.733;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:718,0,439 +chr25 21785943 . CT C 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-0.892;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:573,0,164 +chr25 21786254 . C A 2048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-2.007;DP=157;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.039;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,60:157:99:2077,0,3306 +chr25 21796183 . ATACCTGTTAAATGTAGAGAGTGTGAAATATAAATGATGCGAGTGAATTAAATGTAAAAACATCACTGTCAGGTGTACACT A 6482.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=1.267;DP=150;FS=3.281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:6520,563,0 +chr25 21809869 . CT C 392.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:430,45,0 +chr25 21824112 . A G 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=1.367;DP=79;FS=6.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:1165,0,1609 +chr25 21824888 . G T 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=-0.073;DP=80;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:1089,0,1521 +chr25 21883592 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-1.340;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.426;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:279,0,422 +chr25 21926968 . A T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=1.186;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:331,0,566 +chr25 21947020 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:337,0,512 +chr25 22182606 . G GA 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.701;DP=33;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:465,0,330 +chr25 22779043 . A G 598.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:627,45,0 +chr25 22822103 . CT C 212.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:250,21,0 +chr25 22881375 . G C 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=-1.090;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=5.49;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,7:107:99:923,0,1520 +chr25 22948006 . G C 1290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1319,96,0 +chr25 23214688 . G T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +chr25 23359432 . GA G 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=4.134;DP=172;FS=8.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=2.40;ReadPosRankSum=-2.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,39:169:99:450,0,3104 +chr25 23577590 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.137;DP=45;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:580,0,890 +chr25 23583470 . TA T 1212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.915;DP=71;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,46:65:99:1251,0,242 +chr25 23700316 . CAT C 2011.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=-1.879;DP=230;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,72:230:99:2049,0,6771 +chr25 23701042 . A ATGTATATG 493.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:31:531,31,0 +chr25 23701397 . T C 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=5.528;DP=42;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=16.52;ReadPosRankSum=2.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:722,0,739 +chr25 23701563 . G A 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=7.654;DP=88;FS=105.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:1043,0,2081 +chr25 23703335 . C G 2682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.809;DP=191;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,81:191:99:2711,0,3561 +chr25 23703436 . G GTA 3472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-1.150;DP=257;FS=0.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,96:253:99:3510,0,5732 +chr25 23705817 . G T 5017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.553;ClippingRankSum=-0.252;DP=320;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,125:319:99:5046,0,13546 +chr25 24174290 . T TA 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.311;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:42:253,0,42 +chr25 24248300 . CT C 1037.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-1.166;DP=92;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:1075,0,178 +chr25 24294272 . G A 4153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=2.195;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=15.44;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,115:269:99:4182,0,5273 +chr25 24315431 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.414;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:594,0,2469 +chr25 24341491 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:338,0,165 +chr25 24359393 . C T 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=2.261;DP=141;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=6.12;ReadPosRankSum=2.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,37:141:99:891,0,3993 +chr25 24359405 . C T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=2.523;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=4.05;ReadPosRankSum=2.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:612,0,4386 +chr25 24764288 . CT C 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.940;DP=62;FS=5.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:506,0,630 +chr25 25756823 . ACTGTGGAGACACACAGAATCTCGTGAATCAATTTACTTTTAGGTAAAAGCACTTTAGGAGACCATGTCTGTTTTAATTATTTCTATCAAATTGCCATTTTTAAAGCTTTGACTGTTCAATTAC A 1771.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=2.433;DP=307;FS=7.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,304:306:99:1809,686,0 +chr25 26125050 . T C 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.854;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=26.92;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:809,0,212 +chr25 26182435 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.981;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.457;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:461,0,258 +chr25 26353266 . G A 543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:572,42,0 +chr25 26411371 . A AT 497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.471;DP=39;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:535,0,323 +chr25 26680732 . T C 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1020,75,0 +chr25 26692223 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:379,0,194 +chr25 26692281 . T G 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 +chr25 26692331 . C T 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr25 26699600 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,99 +chr25 26773066 . C T 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 +chr25 26773072 . A G 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:431,30,0 +chr25 27097417 . T C 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:564,39,0 +chr25 27097428 . A T 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:564,39,0 +chr25 27279793 . C A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=1.799;DP=24;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:30:685,0,30 +chr25 27301952 . C T 493.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.488;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:520,0,4 +chr25 27302050 . T C 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr25 27687531 . TAGGTACTTTCCCCAGACAAAACATTGTTCATATGACCTTAGTTTAGGTCAACAGCAAAGATAATTGCTACTTGTCCAATGACTGTGCAAGATTATATTAAAGTACAGTTAGGCTCATTGAACCACATACTCCATTATCGTCCCCACCTGTTTCCAC T 1449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=4.684;DP=51;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=28.43;ReadPosRankSum=-3.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1487,0,5075 +chr25 27687954 . CAGGTTAGTCATAAGGTAAAACCTCCAAACAGAGTGCTTCATAAGCTTGTAGAGTACTTGGTGCTAGCAAACAATTTATGCTCTTTTA C 1198.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=2.889;DP=42;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=28.54;ReadPosRankSum=-1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1236,0,3538 +chr25 27689762 . CAGGTTTGTACATCCTGAATCTAGAAATTATATACAGTATAATCAATTCCCAGACAACTCTGAACAACATCAGTGTGTATGTAA C 1615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.262;DP=55;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,46:55:99:1653,0,2970 +chr25 27690175 . AGTGAGTCCACAATGCATACTTTTGTTCTGTTATAACGTTGCCAAAAACACTAATTCATAACTTACTGTCTTTTCAG A 1687.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=-0.146;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,41:48:99:1725,0,1639 +chr25 27695975 . TCTAAAGTGAAGCAGATGTCATTGAATGTTCTTGTATCCTTCAGGAACCCAATTATTATAAAATGTAACAGCCTTTCAC T 1454.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.121;DP=34;FS=2.285;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:99:1492,124,0 +chr25 27709148 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=1.129;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:350,0,1823 +chr25 27709177 . ACTAAAAATAGACAATTATATATTAATTGAACAATTATGCATTTAGTAGAATTTTATTTTGTCATAACTGCTGTATCGAGTGCTATCTTAC A 2943.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=1.681;DP=67;FS=3.209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,66:67:99:2981,251,0 +chr25 27709269 . T G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-2.125;DP=67;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:328,0,1966 +chr25 27744556 . GA G 2807.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.401;DP=244;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,111:234:99:2845,0,2996 +chr25 28367772 . G A 1769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.384;DP=47;FS=6.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:1798,0,235 +chr25 28367825 . G A 1691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=-0.281;DP=66;FS=14.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=25.63;ReadPosRankSum=-1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:1720,0,420 +chr25 28367943 . A T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.314;DP=48;FS=4.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:519,0,813 +chr25 28368104 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.588;DP=47;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:263,0,1006 +chr25 28368151 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-2.472;DP=19;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:318,0,341 +chr25 28368362 . G T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr25 28369536 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:264,0,98 +chr25 28582127 . A T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.313;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=30.49;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:699,0,292 +chr25 28583083 . T TTTGTTATTTGA 1060.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:73:1098,73,0 +chr25 28678524 . A AT 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.087;DP=73;FS=15.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:764,0,950 +chr25 28678956 . GA G 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.630;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:348,0,483 +chr25 28679219 . C CA 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.895;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:638,0,728 +chr25 29139649 . GA G 386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:424,39,0 +chr25 29140436 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.382;DP=38;FS=4.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:593,0,686 +chr25 29140483 . C G 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.154;DP=42;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:555,0,813 +chr25 29140689 . AAGGTGAGACGAACGAAATCTATTTTTTTCTTTTAGCACGCACCGCATGTCTTCTCTCTTTCTCCCATTCTTTAACACAATTTGCAATTTC A 1128.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=2.593;DP=32;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=35.33;ReadPosRankSum=-2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1166,0,871 +chr25 29146482 . C CA 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=-1.126;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:382,0,1022 +chr25 29146485 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.052;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:382,0,1024 +chr25 29199631 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=-0.772;DP=43;FS=10.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:311,0,1335 +chr25 29199983 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:251,0,310 +chr25 29202448 . G A 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.541;DP=99;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:1347,0,2064 +chr25 29226146 . ACTGCAATCACAAGGTCATTCCCATGTAGAAGTTATAATATTGACTTCCATCTGTGTTCTTCAGTAACTGAGTGTGCTTAC A 2634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.962;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=32.41;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,68:70:99:2878,0,834 +chr25 29251503 . G A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.105;DP=60;FS=5.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:469,0,1652 +chr25 29251569 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.895;DP=40;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:370,0,1074 +chr25 29251932 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=3.151;DP=47;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:344,0,1317 +chr25 29257181 . G A 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.168;DP=57;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:989,0,941 +chr25 29266423 . C T 1029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.068;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1058,0,1145 +chr25 29284561 . T A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.990;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:715,0,628 +chr25 29457201 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=9.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:356,0,540 +chr25 29457340 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.377;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:346,0,625 +chr25 29507700 . TA T 1196.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=-0.873;DP=162;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,59:150:99:1234,0,1763 +chr25 29507826 . GTA G 965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.061;DP=167;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=5.78;ReadPosRankSum=2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,42:149:99:1003,0,5364 +chr25 29528055 . G A 3469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=-1.144;DP=290;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,115:290:99:3498,0,5597 +chr25 29582063 . C CTG 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,486 +chr25 29625700 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=-1.432;DP=34;FS=5.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:604,0,1281 +chr25 29643604 . GCAGGTAAATGTATGGGGGATGAAGATTTTGGGGGCTGGATTTGAAATATAATTGTAAATACTTGTTTTTTGTTTTGGTCAAT G 1724.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=1.652;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1762,151,0 +chr25 29656894 . G C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.558;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:476,0,498 +chr25 29855851 . GT G 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.696;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,40:189:99:346,0,4712 +chr25 29938702 . T C 7027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.763;DP=262;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=26.82;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,188:262:99:7056,0,1826 +chr25 29938723 . A G 8360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.031;DP=311;FS=0.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=26.88;ReadPosRankSum=-1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,221:311:99:8389,0,2293 +chr25 29938828 . G A 8191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.432;DP=290;FS=2.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,221:290:99:8220,0,1399 +chr25 29938984 . G C 7408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=-0.348;DP=266;FS=3.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=27.85;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,198:266:99:7437,0,1507 +chr25 29939263 . T G 6074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=1.917;DP=226;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=26.88;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,163:225:99:6103,0,1488 +chr25 29946816 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:328,0,150 +chr25 30652292 . C G 1810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.592;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1839,0,2262 +chr25 30683838 . C T 1847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.368;DP=103;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1876,0,1610 +chr25 30687333 . T C 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-1.288;DP=88;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=21.61;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,56:88:99:1930,0,1105 +chr25 30687438 . C T 1611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.181;DP=93;FS=3.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1640,0,1602 +chr25 30692442 . G A 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.597;DP=37;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=31.53;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:99:1195,0,112 +chr25 30692577 . T G 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 +chr25 30696241 . T A 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:694,54,0 +chr25 30700743 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.564;DP=31;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:283,0,368 +chr25 30701619 . CT C 701.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=-2.675;DP=79;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:739,0,1026 +chr25 31134846 . G A 5733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.376;DP=383;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,181:382:99:6273,0,6652 +chr25 31211048 . C A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=1.194;DP=170;FS=5.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,44:170:99:1011,0,4858 +chr25 31289064 . A T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-0.292;DP=30;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:409,0,672 +chr25 31317045 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.198;DP=36;FS=5.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:446,0,828 +chr25 31317972 . TGTACGTTATCAGTGATTTAGAAATATTCATTCAAAATCGAATTGTCTTTAAAGTATGATTCATAAAATCCATGATTTGATACCTTTCAG T 1752.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1790,168,0 +chr25 31320375 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-2.012;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:286,0,842 +chr25 31321525 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.313;DP=40;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:653,0,949 +chr25 31333723 . C A 5114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=1.792;DP=384;FS=3.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,147:383:99:5143,0,8150 +chr25 31335700 . A G 4961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-0.608;DP=346;FS=5.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,151:346:99:4990,0,6420 +chr25 31362481 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-0.966;DP=24;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:334,0,582 +chr25 31373206 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.903;DP=25;FS=10.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:231,0,660 +chr25 31380768 . A C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.535;DP=32;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:682,0,539 +chr25 31381193 . G A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=1.677;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:585,0,859 +chr25 31968736 . C CCT 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-0.474;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:78:613,0,78 +chr25 32088593 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=26.05;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:393,0,137 +chr25 32090372 . T C 1225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:84:1254,84,0 +chr25 32090382 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=1.308;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:414,0,726 +chr25 32090555 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.788;DP=31;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:443,0,154 +chr25 32090676 . A G 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-2.538;DP=36;FS=9.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=27.66;ReadPosRankSum=-2.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:1024,0,1560 +chr25 32090718 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=-3.895;DP=93;FS=16.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=10.71;ReadPosRankSum=4.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:1024,0,1532 +chr25 32090797 . C T 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.516;DP=251;FS=38.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,36:167:99:977,0,10290 +chr25 32090805 . C T 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.422;DP=240;FS=55.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,33:155:99:921,0,10293 +chr25 32090955 . A G 2228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:2257,158,0 +chr25 32091058 . A T 391.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.579;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=28.00;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:13:420,0,13 +chr25 32120782 . T A 5308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=1.000;DP=888;FS=4.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=5.98;ReadPosRankSum=2.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:660,225:885:99:5346,0,26399 +chr25 32124985 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 +chr25 32129048 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=1.061;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:239,0,766 +chr25 32167334 . A T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=-1.179;DP=330;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,61:330:99:904,0,10576 +chr25 32229373 . T C 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=1.424;DP=150;FS=1.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,33:149:99:670,0,4231 +chr25 32232576 . G T 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.025;DP=217;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,48:217:99:959,0,6436 +chr25 32233814 . C T 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.791;DP=169;FS=5.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,53:169:99:1435,0,5062 +chr25 32233825 . G A 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=1.114;DP=173;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,56:173:99:1465,0,5013 +chr25 32233950 . G T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.468;DP=212;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,41:212:99:699,0,6492 +chr25 32233969 . G C 2294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.206;DP=203;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,91:161:99:3375,0,2467 +chr25 32234463 . T A 1429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-0.692;DP=142;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,53:142:99:1458,0,7431 +chr25 32235031 . A T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=-0.182;DP=145;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,41:145:99:973,0,4380 +chr25 32236312 . A C 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-0.036;DP=44;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:630,0,855 +chr25 32236944 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.566;DP=205;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,40:205:99:679,0,6403 +chr25 32237099 . T C 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.649;DP=281;FS=2.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,70:281:99:1501,0,7959 +chr25 32237326 . C T 1335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.782;DP=215;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,64:215:99:1373,0,10499 +chr25 32237456 . A T 2346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=-3.399;DP=208;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,72:208:99:2375,0,4507 +chr25 32237544 . G T 1455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=1.577;DP=175;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,55:175:99:1484,0,5455 +chr25 32237599 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.383;DP=80;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:297,0,4329 +chr25 32256909 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=2.409;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:444,0,1125 +chr25 32256928 . C G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.425;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=16.63;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:444,0,1130 +chr25 32258067 . A G 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.271;DP=77;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:1328,0,1439 +chr25 32258255 . T A 2469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.332;ClippingRankSum=-1.049;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=28.72;ReadPosRankSum=-3.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,56:84:99:2498,0,491 +chr25 32258312 . A T 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.290;DP=61;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1377,0,1158 +chr25 32258684 . G T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=1.974;DP=80;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:1335,0,1514 +chr25 32258711 . C T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.183;DP=53;FS=4.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:641,0,1267 +chr25 32258898 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-2.743;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:274,0,519 +chr25 32259033 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.717;DP=23;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:508,0,555 +chr25 32260073 . GAGGTGAGTTTTACTGCTGATAAAGTAGCTAGGTAAACTATCAGGAAAGGTCTTATGTCTTTGTGTCATCAACTTC G 11263.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-1.791;DP=303;FS=1.932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=29.05;ReadPosRankSum=2.572 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,262:266:99:11301,821,0 +chr25 32261678 . T C 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.924;DP=141;FS=4.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:1406,0,3788 +chr25 32262679 . T C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-1.277;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:433,0,503 +chr25 32262728 . C A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.197;DP=30;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:538,0,468 +chr25 32265399 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.531;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:322,0,2367 +chr25 32398770 . T G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=2.407;DP=39;FS=6.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:602,0,752 +chr25 32401927 . GT G 239.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:277,26,0 +chr25 32452002 . T C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=-0.655;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:621,0,1088 +chr25 32457677 . C T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=1.068;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:685,0,1545 +chr25 32468004 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=20.20;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:311,0,154 +chr25 32470353 . T A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.767;DP=93;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:427,0,2745 +chr25 32474081 . CCCTGACGAAAACAAAATGAGCATACATTTATTATTACAGCTAAATTATGCATCAAAACAATTTCCAAACTTGATCATGAGGTGATCTA C 3432.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=1.688;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=36.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:3470,248,0 +chr25 32475800 . T C 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=1.667;DP=77;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1036,0,1564 +chr25 32475818 . TCTGCATAATAAGACGTGATGCATTATGAGAGTTTCTGTTTTGATAACAAAGGGAGACTGCAGTAACTTTTAGTCAGTTTTTACGTGAACGTTAATTAC T 2471.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=1.361;DP=59;FS=3.496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,57:59:99:2509,233,0 +chr25 32487319 . A T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.265;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,28:37:99:1073,0,229 +chr25 32499566 . A G 432.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=33.27;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:3:459,3,0 +chr25 32549943 . G T 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.556;DP=279;FS=4.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,72:279:99:1641,0,8040 +chr25 32556200 . CGTAAGACGCACTCAGAAAATATCCTTGAGATCAGTTGTTTGGGTGATCACTTTTTTAAACTCTTCCTTAATGTGGCTCTCCAG C 11861.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=3.206;DP=320;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=31.36;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,298:319:99:12800,0,5182 +chr25 32556438 . C T 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=-0.069;DP=301;FS=7.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=4.03;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,72:301:99:1241,0,8564 +chr25 32607003 . A G 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.255;DP=180;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,55:180:99:1395,0,4886 +chr25 32611961 . A C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.577;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:484,0,1273 +chr25 32633323 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.983;DP=81;FS=5.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:360,0,4764 +chr25 32725594 . CCCTACAGACGATCAAACAGGCTCAACATCCAACACTGTAAATGCACTAAACCTTTATAAAAAGAGCGGTAAATCATCACAGA C 572.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=1.509;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=26.03;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:610,0,1108 +chr25 32808684 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-0.512;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=14.77;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:427,0,556 +chr25 32810359 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=-2.976;DP=115;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:425,0,6749 +chr25 32810360 . T A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.753;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:434,0,6794 +chr25 32879113 . A G 3690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.415;DP=188;FS=12.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,110:188:99:3719,0,2742 +chr25 32882593 . ACTGCAAAACCAATTCAAAATGTCAGCAAAATACATGATTTACAATGAGAATGACGGAACAGTCAGCTGAAATGAAGCATACTCAC A 10239.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-1.573;DP=232;FS=6.617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=31.17;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,220:226:99:10277,731,0 +chr25 33217861 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.158;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:405,0,1407 +chr25 33219428 . T A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.109;DP=83;FS=7.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:472,0,2213 +chr25 33220591 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-2.269;DP=72;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:337,0,2156 +chr25 33231203 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=-0.584;DP=61;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:470,0,1562 +chr25 33233476 . C T 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.584;DP=77;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1085,0,1583 +chr25 33240884 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=1.682;DP=63;FS=11.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1184,0,810 +chr25 33254610 . G A 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-1.475;DP=68;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,22:68:99:611,0,1713 +chr25 33261964 . GCTGTGGGAAAACAGCAGCAGTCAACCTGACTTTGCTCCCTCATATCGTTTAAGCATTACGTAATCATCTCTCATAC G 5876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=1.901;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=30.24;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,137:139:99:5914,490,0 +chr25 33294398 . C A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.586;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:279,0,919 +chr25 33300004 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.195;DP=37;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:229,0,2319 +chr25 33300014 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.240;DP=38;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:229,0,2319 +chr25 33305177 . C G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.413;DP=31;FS=9.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,837 +chr25 33345110 . C CT 1793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=1.105;DP=172;FS=4.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=10.43;ReadPosRankSum=-2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1831,0,1842 +chr25 33345307 . G T 1739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-1.456;DP=268;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,76:268:99:1768,0,7118 +chr25 33347710 . TCTAAAGAGAAAGCAAAAACACATGTACTTTCTGACTCCACACATGCACTTTTCTGACTTATTTGAGTTTTGAATGAGATTATTGAGAAGTGTGTGTCCATTTCAGGCACCCGTACTGAC T 8160.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=3.491;DP=198;FS=1.627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,192:198:99:8198,590,0 +chr25 33356132 . G A 200.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:229,0,22 +chr25 33371965 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.028;DP=26;FS=6.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:260,0,2043 +chr25 33372013 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=1.173;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:294,0,1032 +chr25 33373077 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.371;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:516,0,470 +chr25 33373089 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.614;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:540,0,372 +chr25 33377685 . T G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.952;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.28;ReadPosRankSum=-2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:461,0,432 +chr25 33497378 . A AAC 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=-0.782;DP=94;FS=6.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:348,0,3491 +chr25 33497426 . A AT 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-1.989;DP=105;FS=4.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:99:332,0,1808 +chr25 33497971 . C CT 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.879;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:603,0,492 +chr25 33498584 . C CT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.899;DP=32;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:320,0,372 +chr25 33583197 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr25 33721965 . CT C 293.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.639;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:19:331,0,19 +chr25 33739733 . T G 779.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.030;DP=152;FS=30.137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,90:99:99:808,172,0 +chr25 33739734 . G GA 762.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.189;DP=159;FS=30.137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,90:99:99:800,165,0 +chr25 34062433 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:402,0,201 +chr25 34094525 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:291,0,392 +chr25 34465846 . G T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr25 34827066 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-2.353;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:753,0,633 +chr25 35034592 . G C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:287,0,415 +chr25 35065347 . C T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=0.214;DP=441;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:360,79:439:99:957,0,14232 +chr25 35067177 . TGTGAGTATGGCAGTGTTTAAATGCACTTATTAAGGGGTTTGTACCTGAGATATAACCGTGTGTTTCATCACAG T 16384.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.175;DP=389;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,387:388:99:16422,1174,0 +chr25 35201306 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-1.682;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:296,0,255 +chr25 35201488 . G A 947.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:976,69,0 +chr25 35202800 . G GT 679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:717,66,0 +chr25 35328652 . C T 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=-0.136;DP=74;FS=14.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1056,0,1448 +chr25 35331839 . T C 2851.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=0.817;DP=71;FS=6.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:2880,208,0 +chr25 35331845 . G A 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.994;DP=76;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=20.08;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:1554,0,1081 +chr25 35334538 . T C 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.059;DP=55;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:958,0,991 +chr25 35335055 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.149;DP=89;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:247,0,2784 +chr25 35335100 . C G 2277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.140;DP=84;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=27.12;ReadPosRankSum=1.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,61:84:99:2306,0,580 +chr25 35335247 . T C 3537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3566,256,0 +chr25 35343609 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:387,0,197 +chr25 35458930 . GT G 223.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:261,29,0 +chr25 35462597 . G A 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.180;DP=127;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.957;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,39:127:99:1012,0,3328 +chr25 35465382 . C T 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.699;DP=176;FS=14.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,44:176:99:875,0,10475 +chr25 35466954 . C T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-0.422;DP=130;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,31:129:99:650,0,3515 +chr25 35470141 . G A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-2.111;DP=132;FS=5.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=4.88;ReadPosRankSum=2.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,32:132:99:672,0,3683 +chr25 35471661 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-3.090;DP=140;FS=4.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=2.28;ReadPosRankSum=2.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:348,0,4103 +chr25 35471879 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-2.893;DP=105;FS=3.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:405,0,6746 +chr25 35499435 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=1.290;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:499,0,495 +chr25 35499746 . C A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.537;DP=74;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:595,0,1843 +chr25 35511812 . A G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.007;DP=110;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,27:110:99:614,0,3087 +chr25 35520340 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-0.652;DP=84;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:359,0,2334 +chr25 35544194 . T A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr25 35662984 . A T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.624;DP=58;FS=7.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:834,0,1363 +chr25 35663194 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.860;DP=45;FS=3.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:285,0,1610 +chr25 35663320 . T C 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.112;DP=53;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:937,0,935 +chr25 35665247 . A G 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-1.376;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.968;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:913,0,1392 +chr25 35669038 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:396,0,392 +chr25 35669419 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.840;DP=64;FS=14.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:318,0,3305 +chr25 35669516 . A T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-2.177;DP=75;FS=5.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:343,0,3431 +chr25 35671421 . TA T 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.020;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:283,0,395 +chr25 35671902 . G GA 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.383;DP=43;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:458,0,344 +chr25 35672452 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-0.561;DP=46;FS=6.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:387,0,1242 +chr25 35694920 . T C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.019;DP=88;FS=12.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:606,0,2296 +chr25 35695386 . A G 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.407;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:975,0,2445 +chr25 35764075 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.429;DP=125;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,28:125:99:542,0,3567 +chr25 35765559 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.008;DP=62;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:279,0,1803 +chr25 35765775 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-2.003;DP=106;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:628,0,2964 +chr25 35773803 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=-1.680;DP=167;FS=2.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,32:153:99:643,0,4621 +chr25 35782282 . G C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.394;DP=125;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:615,0,3543 +chr25 35798261 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=2.698;DP=33;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:367,0,789 +chr25 35815217 . C T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.757;DP=145;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,36:145:99:791,0,4139 +chr25 35839308 . G T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=1.720;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:504,0,1002 +chr25 35857983 . C T 1699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.200;ClippingRankSum=-0.153;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,72:269:99:1728,0,7348 +chr25 35860651 . G T 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.651;DP=286;FS=3.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,70:286:99:1420,0,8202 +chr25 35865294 . C T 2155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-2.034;DP=270;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=7.98;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,84:270:99:2184,0,7254 +chr25 35865426 . AAT A 669.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.211;DP=19;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=28.19;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:27:707,27,0 +chr25 35865627 . A AT 458.08 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.456;DP=30;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:0:455,0,0 +chr25 35865747 . C A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.961;DP=80;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:599,0,2101 +chr25 35865782 . C A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.695;DP=53;FS=7.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:801,0,1111 +chr25 35990888 . C A 1511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=-3.005;DP=57;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=26.52;ReadPosRankSum=2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1540,0,251 +chr25 35995188 . C T 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-1.179;DP=63;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1067,0,962 +chr25 35997687 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:282,0,258 +chr25 35998042 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=2.574;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:464,0,1193 +chr25 35998134 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.985;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:403,0,452 +chr25 35999036 . T C 202.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:11:230,0,11 +chr25 35999494 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.952;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:445,0,540 +chr25 36000140 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=2.324;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:244,0,454 +chr25 36000255 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=3.127;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,333 +chr25 36001095 . A AC 1315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:99:1353,99,0 +chr25 36001115 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=-1.266;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:455,0,696 +chr25 36001455 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=3.367;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:380,0,489 +chr25 36001636 . C T 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.622;DP=48;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=28.41;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,34:48:99:1392,0,840 +chr25 36001637 . C T 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.919;DP=48;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=28.41;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,34:48:99:1392,0,840 +chr25 36001749 . CT C 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.540;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:278,0,159 +chr25 36003865 . AGTGAGTCTGAGTGTTTTCTCAGCGTCTGCAGGTGCCGCAGTGAATGAAGGATGTTCTTCTCTCCCACAG A 1059.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=5.138;DP=59;FS=14.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=17.96;ReadPosRankSum=-4.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1097,0,12755 +chr25 36014853 . C CT 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-1.262;DP=26;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:283,0,274 +chr25 36017373 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.296;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,543 +chr25 36087026 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=1.540;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=31.82;ReadPosRankSum=2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:51:601,0,51 +chr25 36092295 . C A 1211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-0.666;DP=69;FS=4.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.602;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1240,0,1240 +chr25 36092655 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=3.200;DP=61;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:524,0,3499 +chr25 36095529 . T C 2096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.180;DP=83;FS=6.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=25.26;ReadPosRankSum=-2.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:99:2125,0,756 +chr25 36099567 . ATAGGTAAAGTAGGATGGATATTT A 3982.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.615;DP=93;FS=3.153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=28.89;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:4020,343,0 +chr25 36099591 . CCTAACTAATTAATCAGTATTATGTCTCAAATGCTGTAGTTTAACTTTCTGTCTCTTACTCT C 3886.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=-1.466;DP=89;FS=2.217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,86:89:99:3924,335,0 +chr25 36135386 . T G 1993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.818;DP=112;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:2022,0,1814 +chr25 36135441 . CCCTGCACAGAAAACCATTTAAAATGTCAAGATATACTTTCTGAATGTGTAGAAAGTGAACAGAGAAACTCA C 4820.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=1.667;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:4858,401,0 +chr25 36137933 . G A 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.738;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:994,0,1263 +chr25 36153640 . ACTGAAAAACAAATGCACGATTACCCTCACTGTAGCATTACCAGTGCTGTAAGACATCTGCCAGAAGCCACACATAAACTCAC A 3204.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.685;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:3242,251,0 +chr25 36279243 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.591;DP=26;FS=12.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:402,0,473 +chr25 36305529 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-0.936;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,509 +chr25 36309437 . C A 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=31.11;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:32:492,32,0 +chr25 36315997 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=1.735;DP=45;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:241,0,1257 +chr25 36332717 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:377,0,362 +chr25 36333649 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.222;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:292,0,222 +chr25 36334991 . GT G 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-1.799;DP=39;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:484,0,392 +chr25 36335326 . G A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-1.613;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=30.78;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:44:490,0,44 +chr25 36335817 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.427;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:365,0,628 +chr25 36394992 . AC A 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:250,0,298 +chr25 36397020 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=-0.482;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:508,0,513 +chr25 36433165 . C A 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 +chr25 36661031 . TTC T 485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:523,37,0 +chr25 36661077 . T TTA 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:489,32,0 +chr25 36661870 . T G 491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:520,36,0 +chr25 36661999 . T C 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=2.063;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.42;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:562,0,152 +chr25 36662374 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.646;DP=33;FS=3.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:265,0,1101 +chr25 36662450 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:299,0,529 +chr25 36668232 . G A 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.146;DP=78;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,44:78:99:1451,0,1176 +chr25 36707990 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=1.111;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:284,0,375 +chr25 36724583 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.134;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:297,0,446 +chr25 36745701 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.905;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:275,0,447 +chr25 36749758 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.077;DP=27;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:480,0,490 +chr25 36754456 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.733;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=18.88;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:368,0,273 +chr25 36757758 . T G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.047;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:545,0,339 +chr25 36819992 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:300,0,276 +chr25 36990712 . T C 1300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.921;DP=77;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1329,0,1236 +chr25 36990878 . C T 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:51:739,51,0 +chr25 36990953 . G C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=1.010;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:675,0,763 +chr25 36993291 . G A 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.337;DP=86;FS=5.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:1476,0,1524 +chr25 36994262 . GT G 323.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:361,24,0 +chr25 36998135 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:42:429,0,42 +chr25 37041916 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-0.777;DP=50;FS=4.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,28:29:99:1654,0,1214 +chr25 37041957 . C T 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-3.738;DP=53;FS=14.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=30.66;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:1653,0,1214 +chr25 37041991 . A T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=-2.601;DP=84;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:1648,0,1214 +chr25 37042064 . A T 4361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.246;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,13:100:99:4390,0,2650 +chr25 37042126 . A AC 4320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-0.637;DP=122;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=28.30;ReadPosRankSum=3.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,60:79:99:4358,0,2650 +chr25 37042241 . G T 4347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=1.457;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=28.29;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,62:63:99:4376,0,2650 +chr25 37102880 . GCTGTTGGATGAAGTCATGATGCTTTTTAGTGAATCTGAACCTAAACAAGTTTTTTTACAGTAAAGATTTGCTCTTAC G 727.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=2.462;DP=21;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=34.65;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:765,0,615 +chr25 37106364 . ACACCTGAGATAGGAGTGTCGTCTCCATTAATAAAACAATCTCATCAGCATCTTTAATACTGCTTTACACACAGACTGAAACT A 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.474;DP=18;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=24.54;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:479,0,1069 +chr25 37116351 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:298,0,388 +chr25 37116367 . CGCCTGTGAAACAGACACATCCACTCATAAGCATGACTCCATTTCCCGTGTATTCATTTGGTAATGTTTGCACGT C 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.933;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=27.47;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:99:669,0,1189 +chr25 37128029 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,213 +chr25 37171218 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.313;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:241,0,173 +chr25 37235551 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=1.522;DP=42;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:514,0,1134 +chr25 37236079 . T C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=1.398;DP=60;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.748;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:497,0,2553 +chr25 37256098 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=20.84;ReadPosRankSum=-1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,153 +chr25 37262578 . C A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:310,0,178 +chr25 37278742 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:278,0,207 +chr25 37279045 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.380;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.102;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:545,0,983 +chr25 37286608 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.950;DP=30;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:825,0,240 +chr25 37289969 . G C 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.639;DP=61;FS=7.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:783,0,1238 +chr25 37290065 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.518;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:751,0,984 +chr25 37321769 . G A 651.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.953;DP=20;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=32.59;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:26:680,0,26 +chr25 37322887 . TA T 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.493;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:454,0,138 +chr25 37323081 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-1.600;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=20.77;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:319,0,169 +chr25 37323098 . T A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.56;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:311,0,137 +chr25 37454390 . C T 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.022;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:902,0,657 +chr25 37456134 . A G 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.770;DP=54;FS=7.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:901,0,930 +chr25 37465188 . A C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.961;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:424,0,351 +chr25 37494916 . C T 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:39:561,39,0 +chr25 37540091 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr25 37558639 . T C 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 +chr25 37575317 . T C 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.958;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1023,0,872 +chr25 38223106 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr25 38256906 . A G 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-1.804;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:581,0,1061 +chr25 38259510 . AGTGAGTGTGTGCATGCATCAATGCTCCACTTATGTGTGGTGTTTTCTTCATCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTCAG A 2385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=2.409;DP=103;FS=11.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=23.16;ReadPosRankSum=-3.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:2423,0,11374 +chr25 38259638 . C G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-0.255;DP=100;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=7.74;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,32:100:99:802,0,3007 +chr25 38262513 . C A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.452;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=7.20;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,36:122:99:907,0,3314 +chr25 38263673 . C G 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.759;DP=72;FS=7.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.658;QD=9.39;ReadPosRankSum=2.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:704,0,1868 +chr25 38329479 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.348;DP=43;FS=14.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:240,0,1196 +chr25 38333113 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.828;DP=59;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:531,0,1464 +chr25 38357515 . C T 1979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=1.579;DP=310;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,87:310:99:2008,0,8278 +chr25 38357550 . GGGTACGCTCACACACACACACACACATATCAGTGAACATCAATACTGTCAAACACACTCCGCTCACCTCAGGCTTCCTGAATGTA G 1695.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=4.008;DP=295;FS=1.612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=5.75;ReadPosRankSum=-2.207 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,261:267:99:1733,496,0 +chr25 38363562 . C T 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-4.663;DP=245;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=6.43;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,70:245:99:1603,0,12780 +chr25 38363606 . GGGTGAGGAGAGCTTCAGAAACGGCAGCATCTTCATCATCATCATCATCACCCTCATCATTATTGTACTTCTCCATCCTCA G 18240.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-1.196;DP=291;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,290:291:99:18278,1422,0 +chr25 38364752 . AAGGTAAAATCTGATCCAGGGTCAGCTCTGAGTGTGTCTGCAGTGTGTAGCAGTGGCATCTTTGAGCCTGTGTGTGTCTGTGTGTGC A 14243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=2.716;DP=339;FS=13.507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=33.29;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,325:329:99:14281,986,0 +chr25 38364856 . C T 2075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.030;DP=345;FS=1.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,92:345:99:2104,0,9630 +chr25 38366898 . AGTGTGT A 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-1.926;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:386,0,270 +chr25 38368024 . CT C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.103;DP=143;FS=11.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,36:133:99:541,0,2313 +chr25 38368582 . CT C 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.040;DP=100;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:540,0,1682 +chr25 38404844 . C T 2826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-3.527;DP=382;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,113:382:99:2855,0,10366 +chr25 38412812 . G C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.465;DP=43;FS=12.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=11.41;ReadPosRankSum=3.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:519,0,689 +chr25 38413068 . C T 1520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=-1.513;DP=339;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,76:339:99:1549,0,10328 +chr25 38414858 . G A 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-1.857;DP=305;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,82:303:99:1901,0,8505 +chr25 38435823 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=-0.304;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:325,0,1148 +chr25 38435891 . C G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.346;DP=86;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:542,0,2355 +chr25 38435947 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=-0.360;DP=91;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:610,0,2460 +chr25 38436127 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=-0.414;DP=136;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,39:136:99:986,0,3553 +chr25 38438689 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=1.010;DP=115;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,21:115:99:302,0,3696 +chr25 38439879 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.182;DP=146;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,25:146:99:342,0,4506 +chr25 38440815 . TCTGACCAACACAAACACACCGGTCAGCTACACTAATGCACACACACACACACACACACACACACAGACACACACACACACTCATCAAACACACTCGCACAGACATCAGACAC T 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=3.253;DP=56;FS=4.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=9.30;ReadPosRankSum=-3.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,49:54:99:558,0,703 +chr25 38447143 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=2.411;DP=268;FS=0.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=1.18;ReadPosRankSum=-5.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,39:268:99:345,0,8831 +chr25 38448918 . C T 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 +chr25 38448984 . CGTGCGTGTATGTGTGTTTGCACACATATTTTTGCGAGTATGTATGTGT C 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=3.330;DP=24;FS=10.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=11.95;ReadPosRankSum=-2.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:324,0,1801 +chr25 38449244 . T A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=1.135;DP=38;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:485,0,1223 +chr25 38450863 . G A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-1.291;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,27:95:99:665,0,2441 +chr25 38450977 . A G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.847;DP=79;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:604,0,2119 +chr25 38462582 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:300,0,498 +chr25 38475369 . GACCTGCAGGAAACACATTCAGACGCTGTAACAGGTCGCTTGACTAACACAGGGTAAATATGGGATAGAGACGTGTACAC G 1402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=1.920;DP=37;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=23.53;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,34:37:99:1440,0,413 +chr25 38477081 . TCTAGAAGAGCACAGGATAATCAGAAGGAAACCCACAGACTCAGAGCTGCAGAAACACAGAGATGTTCTTAC T 1840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.652;DP=43;FS=4.293;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=33.37;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1878,136,0 +chr25 38489918 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.91;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:339,0,133 +chr3 47350 . C T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr3 379746 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.920;DP=72;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:446,0,2384 +chr3 380424 . A AT 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.791;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:595,0,596 +chr3 382978 . C G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.301;DP=41;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:272,0,1190 +chr3 393433 . A AT 2070.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=-0.666;DP=249;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,72:234:99:2108,0,11620 +chr3 393741 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=2.431;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:477,0,1225 +chr3 399913 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=5.256;DP=144;FS=31.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.43;ReadPosRankSum=-3.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,13:144:99:810,0,4917 +chr3 405604 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.234;DP=39;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:271,0,1022 +chr3 420824 . C T 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.247;DP=309;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,64:309:99:1031,0,9230 +chr3 423363 . C T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.744;DP=180;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=2.92;ReadPosRankSum=3.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,34:180:99:554,0,5815 +chr3 426983 . G T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=-0.558;DP=113;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=2.61;ReadPosRankSum=2.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,24:113:99:323,0,5849 +chr3 566388 . A G 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 +chr3 566499 . C G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=2.246;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:306,0,1303 +chr3 566790 . A G 699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:728,51,0 +chr3 567050 . T C 623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:45:652,45,0 +chr3 716780 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.680;DP=25;FS=10.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:456,0,937 +chr3 716789 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.263;DP=22;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:456,0,937 +chr3 719597 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.482;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:686,0,346 +chr3 719693 . C G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.776;DP=80;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:564,0,2568 +chr3 719948 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=2.601;DP=106;FS=14.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,24:106:99:481,0,3047 +chr3 891205 . A T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr3 968817 . G A 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 +chr3 1019584 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=1.953;DP=25;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:312,0,577 +chr3 1020356 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=2.532;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,375 +chr3 1778687 . C G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr3 1800095 . A G 239.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:268,0,22 +chr3 1903403 . ACACACACACACACACACACACACACACACACACAC A 781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:95:895,95,0 +chr3 1965111 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr3 2097342 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=3.422;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=20.45;ReadPosRankSum=-3.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:560,0,565 +chr3 2097627 . TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACACACACACACACACACACACACACACA T 544.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:99:683,139,0 +chr3 2309799 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,136 +chr3 2991660 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr3 2991757 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,229 +chr3 2991809 . C T 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:318,24,0 +chr3 2992033 . A G 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 +chr3 3154926 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.436;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,24:158:99:252,0,5466 +chr3 3155590 . C A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=2.976;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=14.19;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:312,0,586 +chr3 3156606 . TA T 782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-1.625;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:820,93,0 +chr3 3156634 . T C 1542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=1.511;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=32.14;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:1571,134,0 +chr3 3157166 . T A 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 +chr3 3157436 . T A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +chr3 3157465 . T C 574.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:603,42,0 +chr3 3158589 . C A 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=-0.544;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,47:190:99:1143,0,5728 +chr3 3159071 . G A 1083.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.896;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=26.29;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1112,84,0 +chr3 3159273 . T C 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=1.349;DP=44;FS=13.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:793,0,464 +chr3 3159282 . T A 1417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1446,102,0 +chr3 3175524 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr3 3188448 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr3 3189704 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.718;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=15.64;ReadPosRankSum=-2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:341,0,809 +chr3 3189724 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-1.780;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:341,0,809 +chr3 3189823 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=-0.811;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:482,0,549 +chr3 3189958 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.421;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,261 +chr3 3191206 . G A 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.673;DP=30;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:357,0,780 +chr3 3333660 . G T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr3 3533967 . G A 3296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=1.853;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=30.81;ReadPosRankSum=-2.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,85:100:99:3325,0,130 +chr3 3534069 . C T 1723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1752,123,0 +chr3 3535918 . G GA 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.427;DP=34;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:20:954,0,20 +chr3 3628181 . C G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr3 3630489 . A T 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 +chr3 3661586 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=26.17;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,330 +chr3 3661587 . A G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:447,0,330 +chr3 3734784 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr3 3843477 . T A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr3 3845854 . T C 214.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:243,0,19 +chr3 3845901 . A T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 +chr3 3852211 . T A 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:490,36,0 +chr3 3868878 . C A 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-1.039;DP=69;FS=3.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.92;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,36:69:99:1196,0,1190 +chr3 3868897 . G T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=1.223;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:474,0,2006 +chr3 3869526 . A T 664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:693,48,0 +chr3 3870150 . T C 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 +chr3 3870161 . T A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 +chr3 3870306 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr3 3870362 . A T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr3 3871820 . A T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:83:238,0,83 +chr3 3871948 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:268,0,59 +chr3 3872046 . G T 996.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-1.456;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=32.45;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1025,72,0 +chr3 3872390 . A C 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:420,30,0 +chr3 3872571 . A G 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:367,27,0 +chr3 3872674 . AT A 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.894;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:384,0,235 +chr3 3872739 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=1.130;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:235,0,1629 +chr3 3872743 . T TA 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.112;DP=23;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.350;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:367,0,802 +chr3 3872749 . T G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.231;DP=21;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:235,0,1629 +chr3 3872983 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.290;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:283,0,109 +chr3 3873216 . A C,T 1705.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,29,23:52:99:1939,874,791,1066,0,999 +chr3 3873380 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:266,0,53 +chr3 3873542 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.741;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,141 +chr3 3873581 . G A 1126.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1155,84,0 +chr3 3873735 . A T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.777;DP=60;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:280,0,1555 +chr3 3881418 . A G 265.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:294,0,16 +chr3 3891079 . TCTGAGAAAAAACAAATCAAGGTGTTACATAGGACTCAAGTCTGAAATCTGCAGCTATGATTGTCTCCCGGCACAC T 2472.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.152;DP=57;FS=4.135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=21.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2510,210,0 +chr3 4170612 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:99:303,0,457 +chr3 4522635 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:230,0,61 +chr3 4641279 . A C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 +chr3 4641289 . T C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:357,24,0 +chr3 4655299 . A C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=1.250;DP=20;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=25.24;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:533,0,248 +chr3 4655492 . A G 1776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=1.828;DP=74;FS=10.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=24.01;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,47:54:48:1805,0,48 +chr3 4657208 . T A 367.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:396,0,13 +chr3 4923529 . G A 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 +chr3 5074717 . G A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.382;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:702,0,3074 +chr3 5089445 . CGGTGAGATTATGCAAACCTCCATCTGACATGATGAAGGATCTGAGTGTGACGTTTGTCTGATATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTA C 4658.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.742;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=26.53;ReadPosRankSum=-2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:4696,349,0 +chr3 5103543 . C G 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr3 5732310 . G A 6691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.759;DP=322;FS=3.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,206:322:99:6720,0,5909 +chr3 5739223 . C T 5406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.582;DP=331;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,180:329:99:5435,0,5380 +chr3 5743779 . GCTGAAATCAACAACATTCACACACTCATACGGTCACATCACACAGGAGGAATAGGAGTACAGTACTGGTCAGACTCTCTCAC G 14937.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-1.777;DP=392;FS=5.537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=27.40;ReadPosRankSum=2.310 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,321:324:99:14975,1437,0 +chr3 5791627 . C T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.967;DP=120;FS=16.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=6.36;ReadPosRankSum=3.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:791,0,7758 +chr3 5791699 . T C 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.649;ClippingRankSum=-3.143;DP=347;FS=29.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,100:331:99:1710,0,13217 +chr3 5864043 . C T 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-0.460;DP=200;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,57:200:99:1286,0,5195 +chr3 5865487 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.009;DP=183;FS=8.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,37:183:99:599,0,5367 +chr3 5921178 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 +chr3 5977484 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr3 6142240 . C A 3097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.441;DP=446;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.104;QD=6.95;ReadPosRankSum=2.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,128:445:99:3126,0,11885 +chr3 6508726 . TCCTAAAAAGTAAACAATTAGACAGATATTTAAAAGGGAACATAAATGGTAGGTATATCCTGGATGTTATGGAACCCAGCCTA T 4487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=1.697;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=26.93;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:4525,366,0 +chr3 6518963 . G T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.565;DP=110;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,33:110:99:799,0,4032 +chr3 6575296 . G GA 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=-0.701;DP=203;FS=4.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,40:172:99:266,0,3449 +chr3 6575648 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=1.040;DP=265;FS=0.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=3.13;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,51:265:99:857,0,8279 +chr3 6733172 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.31;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:62:328,0,62 +chr3 6737790 . T A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr3 6764846 . T A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr3 6771931 . T A 3649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3678,253,0 +chr3 7006870 . C CA 1852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-4.175;DP=300;FS=12.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,103:264:99:1928,0,5021 +chr3 7007605 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=-1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,227 +chr3 7013155 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=21.80;ReadPosRankSum=-1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,138 +chr3 7300046 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.142;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:319,0,574 +chr3 7414210 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.772;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:278,0,252 +chr3 7491751 . T C 251.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:280,0,22 +chr3 7496607 . A C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.878;DP=57;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:735,0,1305 +chr3 7499291 . T C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 +chr3 7500149 . A T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr3 7501151 . T C 559.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:3:586,3,0 +chr3 7503440 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:235,0,129 +chr3 7510431 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:67:237,0,67 +chr3 7510528 . G A 387.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:414,0,4 +chr3 7514042 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:302,0,344 +chr3 7514289 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.964;DP=20;FS=12.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:404,0,295 +chr3 7514523 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=-2.131;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:998,0,883 +chr3 7514967 . G T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.821;DP=31;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:465,0,629 +chr3 7602097 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.065;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:327,0,708 +chr3 7602109 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.888;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:327,0,755 +chr3 7602178 . T A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-1.094;DP=35;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=20.36;ReadPosRankSum=4.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:741,0,635 +chr3 7735653 . T C 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=2.940;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:831,0,613 +chr3 8218027 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.275;DP=30;FS=7.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:648,0,447 +chr3 8256500 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.036;DP=28;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,433 +chr3 8256591 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=2.439;DP=30;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:505,0,375 +chr3 8266464 . G GT 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:313,0,339 +chr3 8267863 . T A 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.907;DP=221;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,44:220:99:736,0,6750 +chr3 8277739 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=2.031;DP=36;FS=11.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:297,0,1715 +chr3 8277740 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=1.830;DP=37;FS=11.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:297,0,1715 +chr3 8434992 . C A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.611;DP=170;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,34:170:99:643,0,5526 +chr3 8436047 . A G 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-0.081;DP=297;FS=1.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,55:297:99:743,0,9012 +chr3 8436489 . G C 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.067;DP=270;FS=3.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,67:270:99:1470,0,7956 +chr3 8436577 . G GT 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.540;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:264,0,1606 +chr3 8451419 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,228 +chr3 8580920 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.398;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:365,0,407 +chr3 8580977 . T A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.920;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:941,0,327 +chr3 8581068 . A G 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.228;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=28.72;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:976,0,164 +chr3 8581142 . A G 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.080;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:1135,0,269 +chr3 8595568 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.390;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:696,0,351 +chr3 8595608 . T G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=-0.771;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:545,0,571 +chr3 8666793 . C T 377.07 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:375,0,16 +chr3 8716334 . T C 518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:547,39,0 +chr3 8716688 . A G 724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:753,54,0 +chr3 8716729 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-1.604;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:234,0,468 +chr3 9822352 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.706;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:371,0,606 +chr3 9822388 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-1.014;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:472,0,297 +chr3 9822390 . C T 1025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1054,72,0 +chr3 9851812 . C T 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.165;DP=65;FS=10.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1027,0,1176 +chr3 9852215 . G T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.612;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:362,0,352 +chr3 9852498 . T C 820.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:849,60,0 +chr3 9867528 . C T 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.415;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=28.18;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:789,0,172 +chr3 9870822 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=20.44;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:478,0,270 +chr3 9870849 . A G 1705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1734,126,0 +chr3 9876360 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=-0.698;DP=37;FS=3.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:388,0,827 +chr3 9876468 . T C 1127.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1156,84,0 +chr3 9877442 . G C 1557.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1716,127,0 +chr3 10018345 . T G 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-1.460;DP=127;FS=0.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,35:127:99:871,0,3450 +chr3 10035315 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.655;DP=114;FS=13.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:613,0,2966 +chr3 10035336 . C T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.926;DP=127;FS=3.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,33:127:99:616,0,3212 +chr3 10035441 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=-0.897;DP=111;FS=10.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,27:111:99:558,0,3182 +chr3 10046001 . T C 2921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2950,213,0 +chr3 10046019 . G A 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-0.869;DP=56;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:977,0,964 +chr3 10054039 . C T 1609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1638,120,0 +chr3 10057290 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.729;DP=54;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:415,0,1453 +chr3 10059475 . T C 731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:760,54,0 +chr3 10062915 . A G 794.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:823,60,0 +chr3 10063008 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.922;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:265,0,139 +chr3 10063605 . T C 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 +chr3 10063942 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.517;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:747,0,138 +chr3 10064760 . G GTT 1077.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.516;DP=88;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1343,0,1373 +chr3 10064880 . AT A 866.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.192;DP=167;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,44:156:99:904,0,2718 +chr3 10065100 . C T 3742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-0.743;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=31.19;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,100:120:99:3771,0,204 +chr3 10077974 . G T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=2.037;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.52;ReadPosRankSum=-2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:254,0,143 +chr3 10078033 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-1.078;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=28.63;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:744,0,718 +chr3 10078036 . A C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=-0.547;DP=31;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:426,0,1265 +chr3 10078255 . G GGT 1441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.925;DP=60;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=24.03;ReadPosRankSum=1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1479,0,474 +chr3 10087573 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:317,0,227 +chr3 10088228 . G A 637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:666,48,0 +chr3 10093571 . T C 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1086,78,0 +chr3 10095316 . G C 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.901;DP=25;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1000,72,0 +chr3 10109805 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.230;DP=29;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:403,0,529 +chr3 10133921 . C G 551.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:580,45,0 +chr3 10133934 . C A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:354,27,0 +chr3 10225158 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-1.953;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:271,0,1080 +chr3 10243636 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.377;DP=272;FS=5.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,42:272:99:448,0,10978 +chr3 10243778 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.082;DP=199;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,36:199:99:494,0,6219 +chr3 10535653 . AAGGTAACCAAACATCCACTCAATACACAGCGCGATCCGAATGCGTGCGCGATCCTCAACGCCTGTTTGATTTCCAC A 3825.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=1.617;DP=109;FS=7.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=27.02;ReadPosRankSum=-3.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,93:104:99:3863,0,2458 +chr3 10829643 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,137 +chr3 10995075 . T TA 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.217;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:352,0,1115 +chr3 10995333 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.563;DP=67;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:251,0,2021 +chr3 10995975 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.596;DP=23;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=14.42;ReadPosRankSum=2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:360,0,127 +chr3 10997723 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=-1.511;DP=77;FS=4.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=3.45;ReadPosRankSum=2.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:294,0,2165 +chr3 11065527 . C G 2348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=1.742;DP=329;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,97:327:99:2377,0,8649 +chr3 11264445 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:401,0,253 +chr3 11475799 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-1.198;DP=49;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:368,0,1245 +chr3 11477348 . A T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.420;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:428,0,639 +chr3 11477951 . A C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=-0.535;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:292,0,524 +chr3 11491538 . C A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-3.712;DP=48;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.81;ReadPosRankSum=2.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:691,0,926 +chr3 11493922 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.083;DP=39;FS=9.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:238,0,1440 +chr3 11535932 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.300;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:499,0,831 +chr3 11539120 . TGGTCTGGCTTCACTTTTATCAGACATCACAGAGATTTCTGCTTCTCTGATATTGCCTTGTGTTTATTTCTGCTCTGAATAATGTATGTGCGGTCTGATATTGTCTTGTGTTTATCTCTGCTTTA T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=34.59;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:314,0,844 +chr3 11645020 . T G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.370;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:76:347,0,76 +chr3 11645182 . A G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.471;DP=23;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=17.73;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:436,0,283 +chr3 11646953 . A T 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 +chr3 11648042 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr3 11648532 . T G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=1.001;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:467,0,166 +chr3 11648586 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.659;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:377,0,568 +chr3 11827310 . A T 1433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-1.218;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=26.55;ReadPosRankSum=3.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,39:50:99:1462,0,339 +chr3 11829618 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-1.704;DP=73;FS=2.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:623,0,1932 +chr3 11831407 . G A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=-1.018;DP=67;FS=2.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=12.89;ReadPosRankSum=2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:892,0,1814 +chr3 11838620 . A T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-2.434;DP=49;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:807,0,881 +chr3 11838857 . T C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.195;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:621,0,802 +chr3 11897654 . A T 240.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:269,17,0 +chr3 11897656 . A T 231.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:269,17,0 +chr3 11969007 . C T 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=1.505;DP=178;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,47:178:99:1101,0,5005 +chr3 11975517 . CA C,CAA 251.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-0.066;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,10,7:19:99:363,133,204,230,0,334 +chr3 12383963 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:233,0,2837 +chr3 12384100 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.506;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:233,0,2837 +chr3 12384109 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.013;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,8:51:99:233,0,2837 +chr3 12494957 . TCCTGATCAAATAGTACAATTCGAGAGGTATAGAGGTAAAAAAAAAATCAAGAGCTGCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTA T 621.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:53:659,53,0 +chr3 12595339 . C T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-1.411;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,27:82:99:708,0,2071 +chr3 12679183 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.829;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:268,0,1491 +chr3 12782068 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,129 +chr3 12791654 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-2.549;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=17.57;ReadPosRankSum=2.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:450,0,928 +chr3 12796246 . C T 1008.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1037,78,0 +chr3 12796361 . A T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.895;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=16.26;ReadPosRankSum=2.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:516,0,491 +chr3 12798400 . T C 1430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1459,105,0 +chr3 12804181 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr3 12805630 . G A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:440,33,0 +chr3 12806890 . A C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr3 12864255 . C T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 +chr3 12964870 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=-0.981;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:254,0,1932 +chr3 12974442 . A G 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=1.434;DP=30;FS=4.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=34.06;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:40:1050,0,40 +chr3 12982856 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-2.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=16.62;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:344,0,674 +chr3 12983015 . G T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=2.656;DP=58;FS=9.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:450,0,915 +chr3 12983016 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=2.251;DP=58;FS=9.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:416,0,1279 +chr3 12983070 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.546;DP=23;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=15.56;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:386,0,117 +chr3 12983357 . T G 1860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.603;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:1889,0,910 +chr3 12983668 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=2.815;DP=62;FS=1.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=3.38;ReadPosRankSum=-2.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:238,0,1261 +chr3 12983792 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:316,0,267 +chr3 13227200 . T G 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 +chr3 13229234 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=2.958;DP=26;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:390,0,491 +chr3 13229301 . G A 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:668,48,0 +chr3 13233689 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.078;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:615,0,99 +chr3 13237368 . C T 2635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2664,193,0 +chr3 13237396 . A G 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.372;DP=56;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=32.91;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,49:56:49:1871,0,49 +chr3 13238432 . A G 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.619;DP=53;FS=6.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=23.77;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,36:53:99:1288,0,458 +chr3 13238506 . T C 1593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1622,123,0 +chr3 13258875 . C T 215.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.84;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:244,0,15 +chr3 13279070 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.539;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.964;QD=21.48;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:780,0,400 +chr3 13283777 . A G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=-1.143;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:577,0,178 +chr3 13283812 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:930,66,0 +chr3 13287862 . A T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr3 13287909 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr3 13304291 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:79:339,0,79 +chr3 13361801 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.256;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,175 +chr3 13361812 . G C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,266 +chr3 13362677 . C A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.028;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:541,0,366 +chr3 13363891 . G C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.634;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:455,0,281 +chr3 13364022 . C A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.065;DP=34;FS=18.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:525,0,495 +chr3 13364074 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.815;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,404 +chr3 13365157 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.533;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:413,0,328 +chr3 13365248 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,346 +chr3 13365535 . A T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:451,0,370 +chr3 13366095 . A T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-0.586;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:570,0,465 +chr3 13366247 . T G 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:646,48,0 +chr3 13366427 . C A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=1.187;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=29.55;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:43:442,0,43 +chr3 13449133 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.911;DP=114;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,23:114:99:452,0,3640 +chr3 13473037 . CACCTGTAAGCCAACATTGATGATCATCATGTGTACTATCAGAAAAGCTCAGAAAACACAAACTAGTAAAGAGTGGAGAAAAGTTAAATTGGGATGAATATCA C 4167.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=1.800;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,110:133:99:4205,0,2484 +chr3 13607247 . A C 3707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-1.331;DP=261;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,107:261:99:3736,0,5206 +chr3 13607474 . A G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.543;DP=99;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:441,0,3664 +chr3 13607643 . A G 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=2.847;DP=40;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.116;QD=33.04;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:1350,0,392 +chr3 13607993 . G A 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-0.523;DP=142;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,44:142:99:1173,0,3778 +chr3 13875500 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-2.195;DP=95;FS=2.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:411,0,3018 +chr3 13875726 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.283;DP=73;FS=12.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:478,0,2013 +chr3 13876870 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.376;DP=68;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:331,0,2108 +chr3 13952351 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr3 13979645 . G C 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr3 13980206 . T A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=-0.506;DP=21;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:631,0,197 +chr3 13980573 . G A 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:810,57,0 +chr3 13980605 . A C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-0.822;DP=19;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=27.04;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:34:731,0,34 +chr3 13980784 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-2.282;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:605,0,509 +chr3 13991981 . A G 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:244,0,25 +chr3 14158662 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=1.202;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:305,0,401 +chr3 14158826 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:331,0,294 +chr3 14160045 . A G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr3 14165894 . G C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr3 14238302 . TGGTGAGTTTTTGCATGTGATATTTTCCACTCTTTATGCATACTGATGGAAATAGCCATGGCTCTTCTTTTGTGTATTTCA T 3946.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=3.185;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=30.62;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,87:91:99:3984,302,0 +chr3 14292197 . A G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.139;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=31.83;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:633,0,107 +chr3 14292398 . A C 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.848;DP=34;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=32.05;ReadPosRankSum=2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:66:1118,0,66 +chr3 14292657 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr3 14296759 . T C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.800;ClippingRankSum=0.827;DP=79;FS=2.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:671,0,1667 +chr3 14296807 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-2.192;DP=130;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,29:130:99:579,0,3808 +chr3 14299324 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.812;DP=182;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,31:182:99:407,0,5780 +chr3 14690515 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-0.008;DP=62;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:375,0,1302 +chr3 14694183 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.158;DP=105;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:770,0,2770 +chr3 14700681 . A G 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-1.149;DP=105;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,28:105:99:623,0,2858 +chr3 14708859 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.660;DP=60;FS=4.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:380,0,1684 +chr3 14719690 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.147;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:324,0,2068 +chr3 14719772 . G A 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-1.172;DP=73;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:981,0,1417 +chr3 14719832 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.198;DP=68;FS=3.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:319,0,1891 +chr3 14731822 . CTT C 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr3 14741693 . G A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-1.159;DP=63;FS=18.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:535,0,1543 +chr3 14784851 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-1.153;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:550,0,793 +chr3 14793257 . T A 410.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=34.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:438,0,10 +chr3 14798215 . AAC A 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.215;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=24.45;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:893,0,254 +chr3 14807808 . C T 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=-0.414;DP=91;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:1435,0,3908 +chr3 14808118 . C A 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-2.071;DP=63;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1063,0,1096 +chr3 14818984 . A G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-0.227;DP=51;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:326,0,1491 +chr3 14819343 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=1.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:229,0,438 +chr3 14820219 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=1.411;DP=64;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:374,0,1728 +chr3 14820241 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.131;DP=71;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:338,0,2076 +chr3 14854053 . G T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=1.536;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:609,0,713 +chr3 14860528 . C T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.281;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:557,0,865 +chr3 14937347 . C A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.287;DP=183;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,47:177:99:944,0,6183 +chr3 14937659 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-2.573;DP=308;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=2.19;ReadPosRankSum=3.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,53:308:99:703,0,9628 +chr3 14965312 . C A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.013;DP=91;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:628,0,3323 +chr3 14966067 . A G 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.213;DP=100;FS=5.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,33:100:99:892,0,2430 +chr3 14967217 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-1.042;DP=98;FS=3.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:353,0,3123 +chr3 14977022 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.416;DP=109;FS=5.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,26:109:99:537,0,3051 +chr3 14977065 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=-1.263;DP=116;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,21:115:99:338,0,3401 +chr3 14996170 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.573;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:234,0,1240 +chr3 14996203 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=2.438;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:235,0,1318 +chr3 14996496 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.021;DP=48;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:676,0,1014 +chr3 15007911 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.927;DP=105;FS=8.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:411,0,6001 +chr3 15007912 . A T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.976;DP=104;FS=8.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:419,0,6001 +chr3 15010610 . T C 1666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-0.337;DP=189;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,63:189:99:1695,0,4570 +chr3 15012711 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=-1.555;DP=141;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,26:141:99:337,0,3613 +chr3 15012777 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=-0.268;DP=112;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:328,0,3515 +chr3 15018793 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=-0.628;DP=99;FS=4.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=7.49;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:770,0,2499 +chr3 15021239 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-0.955;DP=104;FS=3.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:236,0,2809 +chr3 15073400 . GCTGAGAGAACATTTAGCACTCTTAAAACACACTCTTCACAACCTGAAATATAAATCAAGCCTCTGTGTATTCAAAAGCATGGGATTTTATGTGGGACTTAC G 13316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.983;DP=295;FS=2.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=33.91;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,292:295:99:13354,1119,0 +chr3 15075440 . G C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=-0.062;DP=31;FS=38.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=19.15;ReadPosRankSum=-3.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:622,0,356 +chr3 15090752 . T C 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.540;DP=72;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:1009,0,1556 +chr3 15090835 . AAGCTCTCAAAGACTTTACCTTAAACAGCCAAGAAATTCCCACCTTGTTG A 1338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=2.470;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,48:80:99:1376,0,2060 +chr3 15094659 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-1.191;DP=65;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:281,0,1837 +chr3 15224780 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:259,0,366 +chr3 15226213 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,325 +chr3 15227053 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.354;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:250,0,741 +chr3 15227560 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.016;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:432,0,852 +chr3 15242362 . GCTGTCGATAAATAAAAGTTAATTGCAATTCTCTTATCCAAATTAAGCTCCTTTGTTAAAATCTCTAC G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.53;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:258,0,493 +chr3 15254108 . GCTAAAAGAAACACAAAATGTTCGACCTTAAAAAGAAACATGATTTGAAAAGATCCAGACTAAATAGTGCTTCGTGTGAACGGGTAC G 2533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.070;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=28.58;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2571,216,0 +chr3 15264372 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=1.298;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:684,0,1396 +chr3 15275471 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:290,0,212 +chr3 15292021 . C A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:346,0,835 +chr3 15295275 . C G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=1.550;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=17.24;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:373,0,348 +chr3 15317280 . G A 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.111;DP=418;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:324,94:418:99:1822,0,12212 +chr3 15401121 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=-3.215;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=25.69;ReadPosRankSum=3.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:465,0,160 +chr3 15423666 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=-1.974;DP=90;FS=9.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:690,0,2358 +chr3 15425836 . C T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.511;DP=93;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:642,0,2497 +chr3 15426471 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.959;DP=87;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:319,0,2593 +chr3 15427419 . A T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.012;DP=43;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:614,0,949 +chr3 15428490 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=3.540;DP=68;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:254,0,4379 +chr3 15439777 . C T 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-1.569;DP=191;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,63:191:99:1624,0,4540 +chr3 15440287 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-2.058;DP=255;FS=9.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,63:255:99:1022,0,9625 +chr3 15466922 . C CA 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.153;DP=32;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:360,0,340 +chr3 15473106 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.237;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:432,0,1899 +chr3 15483386 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.134;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:299,0,3194 +chr3 15483613 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.614;DP=45;FS=2.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:309,0,1182 +chr3 15486764 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DP=56;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:458,0,3843 +chr3 15493157 . G C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=-1.981;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:367,0,2285 +chr3 15493193 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.815;DP=74;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:268,0,2106 +chr3 15505100 . G GCCCCGGTGGCCAAGCCCA 7063.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=280;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,195:269:99:7101,0,2350 +chr3 15505335 . CAG C 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.010;DP=139;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,2:129:99:867,0,5450 +chr3 15505886 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=2.586;DP=239;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,39:239:99:455,0,12486 +chr3 15505934 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.084;DP=222;FS=18.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,39:221:99:591,0,6965 +chr3 15506149 . C A 3897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.339;DP=242;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,108:242:99:3926,0,4538 +chr3 15558168 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-1.252;DP=64;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:240,0,1909 +chr3 15578598 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-2.104;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:267,0,1124 +chr3 15585327 . T C 1648.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1677,120,0 +chr3 15588839 . C G 1508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1537,114,0 +chr3 15588911 . G A 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.493;DP=39;FS=2.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:743,0,653 +chr3 15588932 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:261,0,1315 +chr3 15588944 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.691;DP=49;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:320,0,1353 +chr3 15592066 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-1.011;DP=58;FS=7.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:500,0,1430 +chr3 15592163 . C T 1801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1830,123,0 +chr3 15592168 . T C 1801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1830,123,0 +chr3 15592255 . T G 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.672;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=21.19;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:1342,0,848 +chr3 15592351 . C CT 818.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.285;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:856,0,1548 +chr3 15592493 . A G 4001.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:4030,307,0 +chr3 15592531 . A G 1715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1744,129,0 +chr3 15592728 . G C 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.915;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:726,0,619 +chr3 15592825 . CA C 940.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:97:978,97,0 +chr3 15592916 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.042;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,418 +chr3 15592970 . GT G 575.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:43:613,43,0 +chr3 15592975 . T C 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:613,43,0 +chr3 15593057 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.144;DP=40;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:419,0,3959 +chr3 15593063 . G A 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.122;DP=49;FS=6.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=26.14;ReadPosRankSum=-2.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1309,0,1325 +chr3 15593086 . A G 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-2.050;DP=49;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:859,0,925 +chr3 15593122 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=1.104;DP=48;FS=3.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:250,0,1413 +chr3 15595205 . G C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.488;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:565,0,660 +chr3 15595317 . GT G 336 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:12:373,12,0 +chr3 15595424 . A T 1589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-3.253;DP=37;FS=5.282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=31.44;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:49:1618,49,0 +chr3 15595462 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.316;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:530,0,3253 +chr3 15595572 . T C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 +chr3 15595576 . A G 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 +chr3 15607646 . T A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-1.721;DP=18;FS=11.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:409,0,232 +chr3 15607699 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.543;DP=30;FS=13.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:253,0,864 +chr3 15610913 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=3.413;DP=60;FS=3.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:768,0,1417 +chr3 15623478 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-2.077;DP=199;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=5.34;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:1090,0,5372 +chr3 15624187 . G A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.504;DP=150;FS=10.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,40:150:99:814,0,5212 +chr3 15639146 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:243,0,1185 +chr3 15639250 . A C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:352,0,329 +chr3 15642057 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.463;DP=43;FS=7.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.02;ReadPosRankSum=-2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:330,0,1119 +chr3 15642090 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-1.279;DP=44;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:718,0,760 +chr3 15648154 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=27.43;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:330,0,125 +chr3 15650182 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=2.259;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:389,0,1607 +chr3 15652904 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.736;DP=49;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:700,0,2215 +chr3 15652907 . C A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.660;DP=50;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:700,0,2215 +chr3 15664054 . GA G 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-1.408;DP=16;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:274,0,114 +chr3 15665121 . C CT 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=-1.446;DP=261;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,61:251:99:424,0,8099 +chr3 15665316 . GCA G 10133.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=4.036;DP=141;FS=9.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=31.10;ReadPosRankSum=-3.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,7:133:99:10171,0,3037 +chr3 15688092 . C G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.119;DP=45;FS=6.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:250,0,1909 +chr3 15693576 . G A 1924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-2.395;DP=242;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,74:242:99:1953,0,8554 +chr3 15693822 . C A 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=-1.895;DP=281;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,58:280:99:1006,0,8572 +chr3 15729764 . A T 2950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=1.097;DP=386;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=7.64;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,116:386:99:2979,0,10202 +chr3 15754562 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=1.362;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:284,0,858 +chr3 15774047 . A G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.107;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:1598,0,2483 +chr3 15774048 . C A 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.412;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=20.13;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1598,0,2483 +chr3 15774676 . C CA 731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.164;DP=69;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:769,0,759 +chr3 15774727 . G A 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-1.525;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:1585,0,1539 +chr3 15776052 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-1.349;DP=53;FS=7.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:968,0,857 +chr3 15776157 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.174;DP=82;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:343,0,4316 +chr3 15776309 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.329;DP=43;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:706,0,771 +chr3 15779000 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.792;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,587 +chr3 15779188 . C A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.396;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=17.65;ReadPosRankSum=-2.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:593,0,594 +chr3 15779290 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.734;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:813,0,849 +chr3 15779512 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-1.139;DP=26;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:230,0,712 +chr3 15779604 . A T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=-1.614;DP=16;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=27.74;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:472,0,363 +chr3 15780301 . T A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=1.355;DP=44;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:727,0,708 +chr3 15780942 . C T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.304;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:748,0,721 +chr3 15781541 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.436;DP=29;FS=9.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:327,0,660 +chr3 15847523 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,139 +chr3 15847528 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=31.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:278,0,139 +chr3 15851640 . C T 6767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.784;DP=403;FS=7.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,211:403:99:6796,0,6842 +chr3 15851652 . C T 7019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=-0.612;DP=418;FS=3.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,218:418:99:7048,0,7083 +chr3 15852674 . G A 916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-1.734;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=29.63;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:69:945,69,0 +chr3 15853101 . G A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.820;DP=51;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:925,0,2041 +chr3 15861272 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.230;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:451,0,1258 +chr3 15861867 . G A 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.733;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:1607,0,2145 +chr3 15865490 . C T 1374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.088;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.883;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1403,0,2106 +chr3 15895746 . C T 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=1.851;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1176,0,1428 +chr3 15901422 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.259;DP=80;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=3.57;ReadPosRankSum=2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:314,0,2731 +chr3 15901464 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.065;DP=77;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:431,0,2203 +chr3 15901857 . T G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.356;DP=56;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:444,0,1444 +chr3 15901972 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.280;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:322,0,1072 +chr3 15902736 . A G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=1.117;DP=47;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:834,0,865 +chr3 15902851 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=-0.267;DP=35;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:307,0,1012 +chr3 15903296 . T C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.032;DP=76;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:379,0,2226 +chr3 15903426 . T A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.910;DP=47;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:583,0,968 +chr3 15903555 . AT A 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:345,0,284 +chr3 15903561 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:345,0,284 +chr3 15904456 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,410 +chr3 15905054 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.234;DP=80;FS=7.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:571,0,2148 +chr3 15939596 . T G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr3 15939669 . C G 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:492,36,0 +chr3 15939760 . T C 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr3 16009063 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.078;DP=58;FS=3.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:436,0,1646 +chr3 16009387 . CCCTGGAGGACGAGATGGAAAGATGATGATTATGTAGGATGCATATTCCAGCTAAACATGCTGATTGACAGTGGAGAGATGTCAAACGGGTCTTA C 9207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=2.765;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=29.84;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,230:236:99:9245,690,0 +chr3 16028030 . TCTATCAAAAAGCAAAAAAAAAAACTTTAAATAACATCACTGAGAGAGAAATGTTTAATCAATATCCTATTTCAGTTTAC T 7699.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=2.515;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=29.14;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,194:197:99:7737,563,0 +chr3 16031145 . T A 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.634;DP=195;FS=10.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,58:195:99:1470,0,8343 +chr3 16078173 . AG A 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=2.372;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,275 +chr3 16092925 . TCTGAAAAGCAAAACAAAGAGCGTGAGATTGTTTACATTTCTAGAGCATCAGGAATCTCAGCATTTAGTATAGCAACTGCACAGATGACTCCCAC T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:340,0,294 +chr3 16135983 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=2.435;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=7.17;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:315,0,1069 +chr3 16160402 . T A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr3 16212139 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:244,0,294 +chr3 16284457 . T C 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=2.154;DP=120;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,42:120:99:1384,0,2686 +chr3 16299092 . G GT 619.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-0.328;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:657,0,774 +chr3 16299409 . A T 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=2.107;DP=84;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:1419,0,1492 +chr3 16299782 . C A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=-0.007;DP=104;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,39:104:99:1398,0,3458 +chr3 16299909 . A AC 582.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-1.015;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:620,0,137 +chr3 16319584 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=1.602;DP=109;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:724,0,2945 +chr3 16325573 . T C 1837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.343;DP=130;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1866,0,2505 +chr3 16325766 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.490;DP=110;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,32:110:99:834,0,3019 +chr3 16332158 . G A 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.756;DP=93;FS=15.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.628;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,31:93:99:1037,0,2116 +chr3 16337942 . C A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=-1.581;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,22:73:99:485,0,1819 +chr3 16349082 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.328;DP=145;FS=6.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:415,0,4444 +chr3 16358838 . T A 3769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.028;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,100:147:99:3798,0,1275 +chr3 16366320 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.717;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:471,0,285 +chr3 16367210 . A G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.025;DP=56;FS=1.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:1084,0,1964 +chr3 16389720 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,144 +chr3 16489158 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.268;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:488,0,894 +chr3 16491447 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.694;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:307,0,640 +chr3 16542273 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.132;DP=44;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:338,0,1186 +chr3 16581376 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.452;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,31:93:99:825,0,2352 +chr3 16592627 . T C 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-2.023;DP=26;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=27.26;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:737,0,166 +chr3 16596883 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.922;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:669,0,1329 +chr3 16596957 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.752;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:670,0,1265 +chr3 16597008 . A C 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.282;DP=56;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:618,0,1332 +chr3 16631354 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.262;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:545,0,1415 +chr3 16631899 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.775;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:693,0,1503 +chr3 16633048 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,264 +chr3 16633652 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:334,27,0 +chr3 16634103 . G C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.736;DP=20;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:476,0,642 +chr3 16634476 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.892;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:441,0,698 +chr3 16635241 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:412,0,408 +chr3 16635930 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,343 +chr3 16692884 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.411;DP=181;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,50:181:99:1243,0,5143 +chr3 16702545 . A C 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.716;DP=207;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,54:207:99:1264,0,5873 +chr3 16727196 . TA T 691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.385;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=23.06;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:99:729,0,312 +chr3 16727207 . A T 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:818,0,333 +chr3 16727696 . G A 255.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:284,22,0 +chr3 16727701 . AG A 246.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:284,22,0 +chr3 16728823 . T A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.390;DP=95;FS=11.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:478,0,2976 +chr3 16729261 . T A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.478;DP=174;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,49:174:99:1271,0,4941 +chr3 16913261 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-1.025;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:236,0,373 +chr3 16942292 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.787;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:304,0,462 +chr3 16978075 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-2.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:236,0,253 +chr3 16979548 . T C 246.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:275,0,14 +chr3 17168070 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:319,0,229 +chr3 17168071 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:319,0,229 +chr3 17169065 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,467 +chr3 17291857 . T C 2827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=-0.112;DP=397;FS=0.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,117:397:99:2856,0,10476 +chr3 17294598 . TA T 1178.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.753;DP=214;FS=14.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,60:186:99:1216,0,4226 +chr3 17304069 . TTTAAGGTAAAGGCGTTTTTCTCGTTTTTGAAGAACTTAAGCTTTATCTG T 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.088;DP=48;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:244,0,1910 +chr3 17304072 . AAGGTAAAGGCGTTTTTCTCGTTTTTGAAGAACTTAAGCTTTATCTGTCAGCTGAATATTGAAAAAGGTTCATCTCTGTTGTTGTGTTGCTTTTCTT A 1095.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.040;DP=47;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1133,0,867 +chr3 17304121 . AGCTGAATATTGAAAAAGGTTCATCTCTGTTGTTGTGTTGCTTTTCTT A 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.654;DP=43;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=4.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:247,0,1910 +chr3 17323949 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:428,30,0 +chr3 17324348 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=1.610;DP=18;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,456 +chr3 17324453 . G T 647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:49:676,49,0 +chr3 17324981 . A AT 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.326;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:306,0,184 +chr3 17376965 . T C 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.577;DP=137;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=16.02;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:2223,0,2597 +chr3 17377044 . T C 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-0.321;DP=58;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1075,0,952 +chr3 17377091 . T C 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=1.215;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:645,0,1031 +chr3 17377437 . T A 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.319;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1153,0,2290 +chr3 17377442 . A G 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-2.952;DP=59;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1093,0,2342 +chr3 17378023 . G GA 530.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:568,0,147 +chr3 17378036 . A C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.927;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:402,0,653 +chr3 17378094 . C T 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.119;DP=130;FS=7.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,49:129:99:1594,0,2673 +chr3 17378456 . A G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.743;DP=158;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:509,0,4953 +chr3 17380977 . C T 2798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.321;DP=203;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,85:203:99:2827,0,4919 +chr3 17381006 . G A 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=-0.796;DP=83;FS=11.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1025,0,1712 +chr3 17381053 . C G 343.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:372,30,0 +chr3 17381078 . T G 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.399;DP=64;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,39:64:99:1356,0,836 +chr3 17412956 . T C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.184;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:639,0,157 +chr3 17412999 . A G 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.236;DP=65;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:1829,0,353 +chr3 17413203 . A G 1252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1281,96,0 +chr3 17413409 . G GA 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.706;DP=87;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1058,0,733 +chr3 17413484 . A G 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 +chr3 17419796 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:409,0,283 +chr3 17452474 . A T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,170 +chr3 17467787 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=1.080;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:338,0,568 +chr3 17598983 . T A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=1.231;DP=21;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=23.27;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:517,0,199 +chr3 17599623 . T C 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr3 17599629 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:385,27,0 +chr3 17618013 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=1.493;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:243,0,226 +chr3 17626422 . A T 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 +chr3 17626494 . G A 2705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.586;DP=187;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,80:187:99:2734,0,3511 +chr3 17627317 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=1.294;DP=62;FS=6.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:698,0,1863 +chr3 17627347 . A G 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:855,0,815 +chr3 17627695 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=18.29;ReadPosRankSum=-2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,220 +chr3 17630839 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:356,0,220 +chr3 17637082 . T C 1939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-1.947;DP=136;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=14.26;ReadPosRankSum=4.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1968,0,2736 +chr3 17637107 . C T 2333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-0.695;DP=146;FS=7.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:2362,0,2572 +chr3 17637255 . G GT 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=1.560;DP=145;FS=15.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,40:127:99:668,0,2301 +chr3 17637303 . T A 2236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=3.766;DP=159;FS=12.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=14.07;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,66:159:99:2265,0,2902 +chr3 17637423 . T G 3100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.314;DP=149;FS=24.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,95:149:99:3129,0,1776 +chr3 17638171 . A C 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.113;DP=48;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:946,0,592 +chr3 17638567 . GAA G,GAAA 247.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,11:14:99:373,295,508,117,0,107 +chr3 17662185 . G A 2792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.782;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,85:227:99:2821,0,4594 +chr3 17668866 . T C 1482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1511,120,0 +chr3 17668884 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-1.401;DP=48;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:288,0,2629 +chr3 17668928 . A C 4180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=1.775;DP=142;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=29.44;ReadPosRankSum=-1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,107:142:99:4209,0,715 +chr3 17669000 . C T 3328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.804;DP=177;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,103:177:99:3357,0,2571 +chr3 17669029 . G A 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-0.159;DP=99;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1871,0,1418 +chr3 17669080 . A G 422.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:451,33,0 +chr3 17672720 . C CA 342.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.302;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:20:415,20,0 +chr3 17672939 . A G 1793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.157;DP=72;FS=3.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=24.91;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,49:72:99:1822,0,607 +chr3 17672986 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,190 +chr3 17700220 . C T 1833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.189;DP=122;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1862,0,3175 +chr3 17716959 . T C 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-2.168;DP=209;FS=4.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=8.26;ReadPosRankSum=2.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,67:209:99:1755,0,5313 +chr3 17731983 . C T 1696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.626;DP=202;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,66:201:99:1725,0,5137 +chr3 17736675 . C T 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.797;DP=186;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,55:186:99:1347,0,4891 +chr3 17737263 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.397;DP=32;FS=5.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:399,0,782 +chr3 17759673 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-0.703;DP=34;FS=4.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:240,0,915 +chr3 17788645 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.218;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=4.03;ReadPosRankSum=2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:234,0,1482 +chr3 17789618 . T A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.864;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:379,0,554 +chr3 17790965 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:326,0,232 +chr3 17798559 . A G 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.702;DP=110;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,27:110:99:632,0,3135 +chr3 17798965 . C T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-0.062;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:927,0,1830 +chr3 17808560 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=1.284;DP=55;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:429,0,1481 +chr3 17809650 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:271,0,227 +chr3 17826829 . A AT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-0.467;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:337,0,1587 +chr3 17832965 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.127;DP=57;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:240,0,1709 +chr3 17834503 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.669;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:367,0,359 +chr3 17834541 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.999;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=25.27;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:660,0,181 +chr3 17834629 . CCT C 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.134;DP=13;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:325,0,165 +chr3 17835060 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.478;DP=37;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:240,0,1161 +chr3 17915241 . T A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-2.189;DP=119;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=5.26;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,31:119:99:654,0,3372 +chr3 17915436 . TC T 1119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-3.833;DP=242;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,69:233:99:1157,0,4597 +chr3 17915931 . C A 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-1.538;DP=224;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,67:224:99:1516,0,5464 +chr3 18030822 . C T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.779;DP=39;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:784,0,632 +chr3 18031410 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,105 +chr3 18105404 . T C 1929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=1.841;DP=115;FS=4.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1958,0,2070 +chr3 18105673 . CT C 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=-0.061;DP=138;FS=4.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:682,0,1279 +chr3 18106240 . GA G 15555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.420;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=37.29;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,93:133:99:15593,0,185 +chr3 18128304 . C T 2348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-1.123;DP=274;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,86:273:99:2377,0,6699 +chr3 18129792 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=2.242;DP=268;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=1.50;ReadPosRankSum=3.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,37:267:99:429,0,19697 +chr3 18129801 . A G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=1.513;DP=300;FS=8.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,43:299:99:427,0,19697 +chr3 18134167 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.698;DP=72;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:524,0,2085 +chr3 18134190 . C T 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.201;DP=108;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:921,0,2844 +chr3 18215146 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-1.034;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:335,0,725 +chr3 18292111 . G A 326.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:355,0,15 +chr3 18298754 . G T 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:379,27,0 +chr3 18298796 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:312,0,130 +chr3 18298836 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=32.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46:390,0,46 +chr3 18299181 . T A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.10;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:55:443,0,55 +chr3 18299193 . T G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:55:443,0,55 +chr3 18299588 . C A 221.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:250,0,22 +chr3 18299972 . A G 554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:583,42,0 +chr3 18300167 . G A 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-1.398;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=31.09;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:70:619,0,70 +chr3 18302912 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr3 18302936 . C T 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 +chr3 18304756 . C G 666.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:695,51,0 +chr3 18308992 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.428;DP=43;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:381,0,1169 +chr3 18309034 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.099;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:376,0,1894 +chr3 18334453 . C A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr3 18342238 . G A 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 +chr3 18360767 . T TG 671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:709,54,0 +chr3 18385041 . G T 333.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=33.39;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:362,0,14 +chr3 18395360 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.077;DP=51;FS=13.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:269,0,1490 +chr3 18395408 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-1.363;DP=44;FS=12.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:339,0,1199 +chr3 18436899 . A C 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=-0.017;DP=72;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:1158,0,3265 +chr3 18436901 . C G 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.011;DP=76;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,31:76:99:1158,0,3283 +chr3 18462939 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.020;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,27:161:99:297,0,4811 +chr3 18462960 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.411;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,22:127:99:277,0,3809 +chr3 18473356 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,427 +chr3 18539424 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-1.417;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:276,0,924 +chr3 18539445 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-1.404;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:318,0,909 +chr3 18542408 . CATTCTGAAACAGGACAGAAATGATTTTAAGATAATAACATATAAACCTTTGGACA C 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.171;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:788,0,343 +chr3 18542466 . TTCAGCATATTAACCTCAC T 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.684;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:788,0,445 +chr3 18550403 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=2.208;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:480,0,495 +chr3 18572675 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,398 +chr3 18574837 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-1.478;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:396,0,742 +chr3 18582350 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.829;DP=34;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:245,0,924 +chr3 18596455 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:345,0,99 +chr3 18596555 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-1.147;DP=88;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:603,0,2254 +chr3 18597036 . CCCTAAGAAGATATGGAAATTAACTTCTGAATAATTGTGCTTTTGCTATAAATGAAACATACTGTATGTAAAAAAAACTAATAGTTTGTGCATGTGTGTCTCATGTCCTGTTATGGTTAATGAAATTATGAGTGTATAAAAGCGTAGTGGTAAGGACCATCACAAA C 721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.121;ClippingRankSum=1.463;DP=167;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,29:166:99:759,0,81443 +chr3 18600918 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.534;DP=115;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,36:115:99:913,0,2916 +chr3 18609870 . GCTTCAAAACAAAGACACAGGTTCAGTGCATGTTCATGACCAACAATTTCACTTTTTTTGTGGAAAACGTCCATGTAGTTTACAATAACTATGGTTTAAAC G 508.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=2.389;DP=123;FS=3.040;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=4.14;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:546,222,0 +chr3 18618352 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:428,0,214 +chr3 18624793 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:290,0,401 +chr3 18625465 . T A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.267;DP=27;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:468,0,451 +chr3 18625521 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.344;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:260,0,734 +chr3 18627079 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-1.368;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:337,0,359 +chr3 18658060 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-1.704;DP=150;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,25:150:99:336,0,8100 +chr3 18658485 . T C 1892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.861;DP=152;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,56:152:99:1921,0,3564 +chr3 18658690 . T A 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.666;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:1581,0,1603 +chr3 18658775 . A C 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.201;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:99:761,0,3389 +chr3 18659042 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-1.301;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:230,0,1464 +chr3 18660457 . T A 2389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.395;DP=126;FS=9.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:2418,0,1919 +chr3 18660776 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.558;DP=27;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=26.21;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:736,0,232 +chr3 18660917 . T G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=-1.021;DP=52;FS=7.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:384,0,1484 +chr3 19056794 . A AAT 225.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:9:262,9,0 +chr3 19062834 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=-0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,389 +chr3 19063823 . T C 1155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:88:1184,88,0 +chr3 19067769 . G C 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.131;DP=188;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,44:188:99:952,0,5692 +chr3 19077765 . A T 2176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-1.959;DP=345;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,104:342:99:2205,0,10871 +chr3 19082257 . C T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.673;DP=400;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,80:399:99:1430,0,12048 +chr3 19086691 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=-0.742;DP=109;FS=4.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,34:109:99:584,0,4227 +chr3 19088863 . C T 1665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=-0.130;DP=393;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=4.24;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,88:393:99:1694,0,11354 +chr3 19089216 . C T 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.154;DP=489;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=3.24;ReadPosRankSum=3.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:400,89:489:99:1613,0,32087 +chr3 19089225 . G A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-0.172;DP=484;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:395,89:484:99:1629,0,32087 +chr3 19089617 . GGGTGAGCAGAACTACTTCTCTTATAATAAGAACACCTTTGTATTTTATTTGCATCTCATCATGTCTTCTGGTGTTTTACA G 12132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=-0.302;DP=306;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=33.75;ReadPosRankSum=-1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,297:298:99:12170,934,0 +chr3 19089861 . A G 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-1.758;DP=346;FS=0.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=3.95;ReadPosRankSum=3.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,72:324:99:1395,0,9725 +chr3 19161505 . G T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.164;DP=50;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:583,0,1179 +chr3 19176769 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.398;DP=64;FS=9.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=3.59;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:258,0,1934 +chr3 19176800 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.007;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:238,0,2205 +chr3 19185643 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.092;DP=77;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:244,0,2314 +chr3 19190263 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.475;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:245,0,822 +chr3 19514458 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.068;DP=78;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:324,0,2448 +chr3 19527808 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.373;DP=54;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:395,0,1428 +chr3 19536652 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=1.170;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:629,0,943 +chr3 19537776 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=1.131;DP=31;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,817 +chr3 19537997 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=1.193;DP=50;FS=4.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:292,0,2760 +chr3 19538050 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.762;DP=31;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:253,0,897 +chr3 19538447 . A C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=2.278;DP=36;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:292,0,1039 +chr3 19540305 . T A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-1.388;DP=47;FS=4.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:725,0,935 +chr3 19540726 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-1.068;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:491,0,382 +chr3 19540743 . T G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.396;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=21.59;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:460,0,247 +chr3 19569627 . G A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.074;DP=106;FS=3.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,25:106:99:517,0,4302 +chr3 19573196 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=1.402;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:282,0,1099 +chr3 19578041 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=1.104;DP=94;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=3.90;ReadPosRankSum=3.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,20:94:99:395,0,2831 +chr3 19584969 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-1.037;DP=119;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:337,0,3659 +chr3 19589752 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=1.155;DP=115;FS=8.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:385,0,3502 +chr3 19597330 . C T 2114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.388;DP=123;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:2143,0,2198 +chr3 19604153 . G GC 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=-0.649;DP=67;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:764,0,812 +chr3 19604630 . G C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-1.459;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.106;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:282,0,1772 +chr3 19604754 . CT C 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.094;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:382,0,173 +chr3 19644029 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.170;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:276,0,887 +chr3 19644161 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=-0.363;DP=33;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:333,0,784 +chr3 19683732 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.449;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:307,0,1005 +chr3 19701292 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=-1.457;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=15.29;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:380,0,682 +chr3 19705181 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:369,0,271 +chr3 19706122 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:328,0,264 +chr3 19841747 . T C 4251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.982;ClippingRankSum=0.470;DP=262;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,135:262:99:4280,0,4836 +chr3 19849629 . C G 1962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.619;DP=286;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,81:286:99:1991,0,7768 +chr3 19856491 . C T 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.416;DP=274;FS=6.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,62:272:99:1201,0,8068 +chr3 19857013 . C A 3123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.549;ClippingRankSum=-3.919;DP=190;FS=4.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,92:188:99:3152,0,3565 +chr3 19857941 . C T 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.004;DP=232;FS=9.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,53:231:99:1098,0,6984 +chr3 19858174 . G T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=-0.465;DP=273;FS=8.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,57:273:99:1065,0,8383 +chr3 19859058 . C A 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.863;DP=265;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,56:265:99:1016,0,10517 +chr3 19859735 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.712;ClippingRankSum=-1.924;DP=187;FS=13.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=1.85;ReadPosRankSum=3.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,30:187:99:375,0,5873 +chr3 19859845 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=-1.133;DP=122;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,30:122:99:586,0,3443 +chr3 19859944 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=1.126;DP=67;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=12.49;ReadPosRankSum=-2.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:865,0,1551 +chr3 19860489 . A AG 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.803;DP=165;FS=23.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,32:164:99:398,0,4889 +chr3 19860519 . A C 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=1.069;DP=181;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,41:181:99:660,0,6888 +chr3 19893346 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-0.283;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:492,0,124 +chr3 19902683 . G T 1503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.663;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,47:75:99:1532,0,944 +chr3 19908514 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=1.140;DP=55;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:407,0,1432 +chr3 19916249 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.209;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:290,0,678 +chr3 19931955 . TACACACACACACACACACACACACACACAC T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.751;DP=52;FS=8.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:925,0,4706 +chr3 19931996 . A G 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-0.898;DP=40;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=24.07;ReadPosRankSum=-4.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:991,0,4533 +chr3 19932309 . A G 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=-1.316;DP=168;FS=3.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,43:168:99:903,0,7595 +chr3 19932707 . G A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.395;DP=243;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,56:243:99:1157,0,7178 +chr3 19932905 . T C 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.639;DP=204;FS=0.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,56:204:99:1365,0,5771 +chr3 19940575 . G A 3687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-2.101;DP=209;FS=0.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,114:205:99:3716,0,3237 +chr3 19964109 . C T 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-0.404;DP=301;FS=2.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,58:300:99:938,0,9254 +chr3 19971116 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.605;DP=422;FS=5.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:357,64:421:99:534,0,13311 +chr3 19973102 . G C 2157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=-1.188;DP=421;FS=7.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,104:421:99:2186,0,12090 +chr3 19998247 . T C 1545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.490;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=31.34;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:71:1574,71,0 +chr3 19998248 . T C 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.717;DP=39;FS=9.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=28.53;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1141,0,343 +chr3 19998399 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.542;DP=80;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:238,0,2512 +chr3 20003461 . CCCTGGAACAGGAAAGGGTGGATGATGCACTTATTCAAAGAATTTTTTTGCATAGATGGAAATAAATCTACCACGTA C 17165.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=2.615;DP=520;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=33.01;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,508:518:99:17203,0,1395 +chr3 20059624 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:281,0,309 +chr3 20115149 . C CT 210.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:248,24,0 +chr3 20644566 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.298;DP=40;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:708,0,709 +chr3 20644798 . G A 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.687;DP=84;FS=5.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,33:84:99:1176,0,1812 +chr3 20644879 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.936;DP=93;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:471,0,3295 +chr3 20645081 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.060;DP=98;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:298,0,3115 +chr3 20663604 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-0.575;DP=89;FS=2.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:422,0,2537 +chr3 20663679 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.098;DP=97;FS=4.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:495,0,2750 +chr3 20876489 . T C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 +chr3 20889769 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:390,0,226 +chr3 20908072 . A T 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:500,39,0 +chr3 21043102 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,331 +chr3 21074434 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.762;DP=24;FS=6.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:259,0,1296 +chr3 21076561 . A G 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=1.259;DP=51;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:934,0,768 +chr3 21076573 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-1.497;DP=55;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=5.12;ReadPosRankSum=2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:310,0,1472 +chr3 21091679 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=1.259;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:348,0,1262 +chr3 21101318 . T G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-1.259;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:437,0,1398 +chr3 21110743 . A AGTGATTT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:96:297,0,96 +chr3 21113522 . TCTGCAATGCAAACATACACTTATGGTTTAAAATGACTTGAAAATGCTAAAGACTCTAAAACCAGTTTGATTGACCATGTAGATTTGTGAC T 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=33.39;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:438,0,714 +chr3 21165124 . A C 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=-1.833;DP=181;FS=1.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,45:180:99:871,0,4879 +chr3 21166748 . G A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.275;DP=231;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,56:231:99:1204,0,6580 +chr3 21176687 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=-0.804;DP=162;FS=5.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=5.44;ReadPosRankSum=2.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,43:161:99:910,0,4389 +chr3 21209836 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr3 21338629 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.406;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:361,0,984 +chr3 21338787 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.566;DP=72;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:434,0,2135 +chr3 21338871 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.280;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=5.78;ReadPosRankSum=2.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:346,0,1596 +chr3 21339129 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.971;DP=99;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:419,0,2935 +chr3 21345050 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr3 21353802 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.106;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:299,0,91 +chr3 21354331 . A T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-1.046;DP=64;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:332,0,2697 +chr3 21354521 . T G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.591;DP=62;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,11:61:99:535,0,2177 +chr3 21354841 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:339,0,2707 +chr3 21354857 . A G 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.597;DP=42;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:783,0,1879 +chr3 21354957 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-2.745;DP=67;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:383,0,3508 +chr3 21360488 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.959;DP=78;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:311,0,2313 +chr3 21371531 . A G 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.404;DP=67;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:515,0,1765 +chr3 21377620 . AGCT A 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=-0.560;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:433,0,3189 +chr3 21377624 . AACAGGAGATACAGACACATTAACACACGTCAGACAAACACGTCGCTCACAGACTAATGTGTAGACACTTAC A 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.304;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=5.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:452,0,3189 +chr3 21455464 . CT C 529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.242;DP=245;FS=4.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,49:225:99:567,0,4773 +chr3 21462771 . G C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.050;DP=36;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:369,0,1084 +chr3 21465734 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.636;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:265,0,796 +chr3 21471869 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.455;DP=72;FS=4.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:259,0,2149 +chr3 21472458 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=-1.049;DP=127;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,23:127:99:309,0,4030 +chr3 21494995 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.900;DP=61;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:303,0,1831 +chr3 21495015 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.366;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=5.05;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:291,0,1560 +chr3 21495932 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.605;DP=113;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,22:113:99:387,0,3478 +chr3 21496552 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.137;DP=132;FS=3.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=1.73;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,22:132:99:256,0,4217 +chr3 21500688 . G C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.645;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:273,0,2740 +chr3 21561265 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=-0.352;DP=83;FS=5.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:402,0,2321 +chr3 22267574 . T TTC 1052.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=-2.426;DP=124;FS=9.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,43:121:99:1090,0,3194 +chr3 22272269 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-0.774;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:279,0,1324 +chr3 22293080 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.093;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:444,0,2262 +chr3 22357189 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=1.603;DP=63;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:382,0,1822 +chr3 22359698 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=2.196;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:323,0,2323 +chr3 22365827 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.598;DP=86;FS=5.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:399,0,2397 +chr3 22367634 . C G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.482;DP=58;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:342,0,1771 +chr3 22368157 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.092;DP=53;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:679,0,1134 +chr3 22371783 . C CT 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.547;DP=70;FS=7.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:261,0,1556 +chr3 22371829 . T G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-1.282;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:718,0,2045 +chr3 22372326 . CT C 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.215;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.18;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:260,0,675 +chr3 22373820 . GA G 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.678;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:263,0,645 +chr3 22743514 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,246 +chr3 22747388 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:256,0,269 +chr3 22747961 . C A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:501,0,158 +chr3 22747996 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.817;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:691,0,187 +chr3 22751858 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,417 +chr3 22755319 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:376,0,125 +chr3 22760243 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.406;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:382,0,401 +chr3 22760573 . T G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=2.416;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=20.58;ReadPosRankSum=-2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,208 +chr3 22761964 . A C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.296;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:555,0,713 +chr3 22761989 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-1.848;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,515 +chr3 22791766 . A T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.775;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.504;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:523,0,311 +chr3 22791778 . G C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:406,0,277 +chr3 23081491 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.647;DP=56;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=5.51;ReadPosRankSum=-1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:337,0,1606 +chr3 23085802 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-1.065;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:382,0,1297 +chr3 23103343 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.464;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:261,0,2741 +chr3 23105275 . CT C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:357,0,132 +chr3 23105623 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=1.827;DP=56;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:259,0,1692 +chr3 23253384 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.880;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:267,0,1803 +chr3 23517177 . CAGGTGCGTTTTAACAAAAAGATAACATGAAAATAATCAAATATACTAATAGAAAATATAGGCACACGGTTATAGGACACACAAAGGATAAATGGGTGTAAAATGCATCTTTCCTTTCTCTTTTTATCA C 20547.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=2.115;DP=542;FS=1.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,528:541:99:20585,1904,0 +chr3 23517361 . AGTGAGTTTGCTAGTTTGAGGAAATGGTCATTTGACAGATATAAATCTGTTTTCACATATTAAATCTACTCCAATCTTCTGTACTTTAG A 15990.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=4.044;DP=432;FS=2.718;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=34.48;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,417:427:99:16028,512,0 +chr3 23519670 . CGTAAGTGCACAGATCTTCTCGGATTCCACTACATTTTTTTTTAAACAAAATGTGAATAATTTTACACAATTACTTCTTACAATTTTTAG C 16795.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=1.192;DP=397;FS=14.002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,394:396:99:17885,1308,0 +chr3 23525324 . T C 1991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=3.115;DP=467;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:361,105:466:99:2020,0,12836 +chr3 23528761 . GT G 4809.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=-0.272;DP=384;FS=9.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,209:341:99:4847,0,2201 +chr3 23622916 . G GA 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-0.815;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:418,0,570 +chr3 23734803 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=1.330;DP=130;FS=4.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,26:129:99:416,0,3870 +chr3 23753035 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.189;DP=84;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=2.91;ReadPosRankSum=-2.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:273,0,2522 +chr3 23753082 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.840;DP=76;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=4.88;ReadPosRankSum=2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:399,0,1942 +chr3 23811034 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.503;DP=131;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=2.03;ReadPosRankSum=1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,29:130:99:294,0,6933 +chr3 23811105 . T C 2597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-1.455;DP=125;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:2626,0,2539 +chr3 23814128 . GA G 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.206;ClippingRankSum=0.788;DP=190;FS=0.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,48:179:99:726,0,3196 +chr3 23865884 . C T 1208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.276;DP=251;FS=4.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,59:251:99:1237,0,7405 +chr3 23972476 . C A 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.677;DP=33;FS=18.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:985,0,108 +chr3 23972867 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-1.055;DP=62;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:249,0,1922 +chr3 23996824 . CT C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=2.042;DP=46;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.075;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:251,0,582 +chr3 24033864 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=11.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:404,0,279 +chr3 24037716 . G T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;ClippingRankSum=1.292;DP=201;FS=1.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,49:201:99:830,0,5865 +chr3 24038776 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;ClippingRankSum=-1.942;DP=236;FS=6.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,47:235:99:652,0,7021 +chr3 24045137 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.164;DP=60;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:405,0,1692 +chr3 24401456 . AT A 757.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:79:796,79,0 +chr3 24401923 . TGCGTGC T 574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:612,45,0 +chr3 24505775 . G T 16607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,398:398:99:16636,1198,0 +chr3 24507303 . CAGGCACTGCTCTCACCGTTTAATGTGAAAATGTCACTTTAGGATCTTGTCTCAACTTTTGATTTTGTGTGCATTT C 11205.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.547;DP=305;FS=2.841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,268:278:99:11243,837,0 +chr3 25074703 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=1.879;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:413,0,575 +chr3 25074809 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,127 +chr3 25098203 . T TA 345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.519;DP=18;FS=9.031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:23:443,23,0 +chr3 25371502 . TA T 863.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.509;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=23.34;ReadPosRankSum=-1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:94:901,94,0 +chr3 25372075 . GACCTGGAAGAAAAAACTAGAGTCAAGCTGGGATTGGCAAATAGATCTGGACCAGAGCCATACCCTTTAGAGGGGCTTGTAAAAAAGGACAGAACTTGTGGCAGTTAAACCACAGCTCATGTATCTCACCAATTGGATTT G 11592.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=3.271;DP=346;FS=7.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=33.51;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,283:336:99:11630,0,7132 +chr3 25374203 . CACCTGAATTGGCAGAAAAAAAAACAAATTAGCCAGAGTACACCATTAAAAGCATTTCAAAAGTAAATAAGGTTTGATCCCACTCCT C 12216.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.188;DP=287;FS=3.376;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,284:285:99:12254,1076,0 +chr3 25374433 . ACTAAAAAAAAAAAATAAACAAGACAATTAAACATGTTCATTGTAAGAAACTGATTCGGATATGCTTCACTTTACTGAACTTAC A 14477.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=336;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,334:336:99:14515,412,0 +chr3 25382422 . AT A 873.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=-0.259;DP=54;FS=1.952;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,42:47:4:927,4,0 +chr3 25538105 . G GT 320.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:358,23,0 +chr3 26671220 . AACCTGCGGAGATCAATCAACGAGCAACTTGTTTGACAATAACGCTTCAAAATAACAGAATTCTTCAAATATACAAAACTAAATGTGTAACTC A 2436.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=433;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,393:393:99:2474,902,0 +chr3 26792555 . G GT 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-1.144;DP=102;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:380,0,1377 +chr3 26877417 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,516 +chr3 26877418 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=-0.791;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=26.69;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:482,0,151 +chr3 26877551 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:313,0,139 +chr3 27983771 . C CT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.946;DP=54;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:238,0,720 +chr3 28137189 . A AT 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.432;DP=101;FS=1.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:359,0,1490 +chr3 30102289 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-1.532;DP=65;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:262,0,4496 +chr3 30102457 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.647;DP=104;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=3.24;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:365,0,3541 +chr3 30102469 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.629;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=1.97;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:241,0,3424 +chr3 30291881 . CT C 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.841;DP=56;FS=5.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:617,0,778 +chr3 30347850 . CAGGTATATTGGCTTTGTTCTCTCAGAAGGAGATGTGGTTTGGCATTGCTGAAGGTCATCCAAATTCAATTGTGTTTCTT C 1832.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=1.714;DP=211;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:189:99:1870,379,0 +chr3 30354139 . C CA 746.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-2.357;DP=66;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:784,0,697 +chr3 30399115 . ACTAACAGACAGATAAAGTAACTGACATTCAATCATATTCATCTGATTAACGTTAGACAGCAGTCTAGCATGCTAACAAGCTCCCTGTGCAAGTCATCTGCAATGCCATGTAAAATACAGATTTTGTGACTGCGAGGTGTATCAGACACAATCATCTTAC A 9856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=2.797;DP=233;FS=5.459;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=24.83;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,224:233:99:9894,801,0 +chr3 30654014 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,140 +chr3 30662130 . TGA T 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-1.555;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:595,0,460 +chr3 30849339 . CA C 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.153;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:386,0,321 +chr3 30855927 . A G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-0.321;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:531,0,389 +chr3 31041592 . TA T 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.789;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:519,0,740 +chr3 31080713 . CCCTGCCAGACCATTTACACTAGTTAAAACATGCAACTTCTTAAACTAAAAACACTTAAACAACTTGTGTTCGGTTCTTG C 1680.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.873;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=29.27;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1718,149,0 +chr3 31098403 . TGA T 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-1.288;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:298,0,380 +chr3 31195172 . T C 258.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:287,0,21 +chr3 31195295 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.651;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:304,0,602 +chr3 31220565 . CT C 2153.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=-1.412;DP=247;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,111:210:99:2191,0,2351 +chr3 31220721 . G GA 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.170;DP=72;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:333,0,995 +chr3 31277702 . T A 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-1.453;DP=104;FS=1.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1421,0,2220 +chr3 31279613 . G C 2032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.769;DP=156;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,62:155:99:2061,0,3059 +chr3 31863136 . TA T 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.474;DP=316;FS=6.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,60:291:99:636,0,6498 +chr3 31863453 . AT A 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.787;DP=73;FS=7.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:543,0,943 +chr3 31936420 . TCCTAGAATCAAAATCAACTTCCATCACTGCAGTGCGCTTACTTATGCATACTATATATGCATGAAGGAGAGCTCCTTA T 16229.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.758;DP=366;FS=3.283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,344:345:99:16267,1368,0 +chr3 31941244 . C A 1679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=-4.307;DP=356;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=4.72;ReadPosRankSum=2.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,83:354:99:1708,0,9741 +chr3 31952135 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,324 +chr3 31959863 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.024;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:334,0,692 +chr3 31985939 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-0.014;DP=42;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:328,0,1129 +chr3 32016937 . T TA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.296;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:336,0,701 +chr3 32017188 . G GA 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-1.504;DP=79;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:498,0,1363 +chr3 32054176 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.411;DP=58;FS=7.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:264,0,1797 +chr3 32062115 . CA C 976.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.154;DP=296;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,73:296:99:1014,0,7461 +chr3 32194566 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-0.287;DP=58;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:400,0,1526 +chr3 32195617 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=1.068;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:235,0,1369 +chr3 32195685 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-0.035;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:258,0,1410 +chr3 32237263 . G GAAAC 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.179;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:99:652,0,5932 +chr3 32243020 . T G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.615;DP=41;FS=15.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:537,0,834 +chr3 32243291 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,404 +chr3 32257092 . T C 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.487;DP=50;FS=35.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1311,0,721 +chr3 32257121 . T G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=-2.773;DP=44;FS=24.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=15.56;ReadPosRankSum=-4.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:713,0,757 +chr3 32272656 . G T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 +chr3 32272670 . T G 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 +chr3 32365182 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:378,0,389 +chr3 32431807 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=-1.797;DP=123;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.26;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,24:123:99:306,0,3750 +chr3 32447663 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.537;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:845,0,1347 +chr3 32494596 . G GA 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.845;DP=276;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,58:249:99:491,0,5452 +chr3 32524399 . T C 2334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.804;DP=318;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=7.34;ReadPosRankSum=-2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,95:318:99:2363,0,8127 +chr3 32537450 . GA G 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.450;DP=121;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,32:95:99:632,0,1179 +chr3 32540907 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.185;DP=85;FS=5.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:362,0,2451 +chr3 32541254 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-0.962;DP=94;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:367,0,2728 +chr3 32552704 . G T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.038;DP=124;FS=3.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:573,0,4912 +chr3 32560609 . GCAGGTAAGTGCATGCTATCATTACCACTGTATGTGATGTGTCTTTTATGTGGCAATCTCCCTCTAATGGATGCTGCATCTCCA G 1516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.022;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:99:1554,166,0 +chr3 32572061 . C T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.007;DP=135;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,37:135:99:866,0,3485 +chr3 32572154 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.643;DP=107;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:499,0,2883 +chr3 32573689 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-0.607;DP=142;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,44:142:99:1174,0,3667 +chr3 32594776 . G GT 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-1.324;DP=83;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:353,0,1491 +chr3 32621349 . T A 2257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.861;DP=315;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,93:315:99:2286,0,8088 +chr3 32621542 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.132;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,38:179:99:685,0,5458 +chr3 32622693 . C T 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.202;DP=149;FS=18.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,41:149:99:1044,0,4040 +chr3 32649283 . ACAGGTATAATCAATCACACTTCTGTTTACACTCATTTGTTCAGTTGCTGAAGTTTGATCTCTCTGTTT A 1668.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=1.372;DP=60;FS=3.388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1706,143,0 +chr3 32667501 . AGTAAGACAATGCTATCCTCAGAATAAACCTAAAATGTCACTTGTTGATATAATAATCATATAATGATTCTTCTTTTCTCTTATCCAG A 15458.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.448;DP=405;FS=4.318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=30.50;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,394:405:99:15496,1156,0 +chr3 32674981 . CCCTACAGTCAGAAGGAACACCTGCATTTATTTTCAACATTTGGCCACAAAACATCAGATATAACTTAGGATTTCTTCCTTTCCAGGTAAATGTGTAGATTTATATA C 9115.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-1.931;DP=217;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,210:216:99:9153,774,0 +chr3 32677281 . TCTGCATGGGGAATATATAAAAAAAATACAAAAGTAAGACACATGATGATTTAGTTTTCTCCTATTACTGCATTATTCTAACTTTTTTTTAGTGTAC T 10532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.506;DP=242;FS=2.237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,239:242:99:10570,884,0 +chr3 32724203 . CT C 982.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=1.174;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1020,0,131 +chr3 32733062 . T G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-0.024;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:366,0,1791 +chr3 32766399 . C A 626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:655,45,0 +chr3 32790720 . T A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.625;DP=96;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,28:96:99:667,0,2549 +chr3 32794829 . G GGATTT 1400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-1.428;DP=95;FS=1.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:1438,0,1536 +chr3 32794835 . G T 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=-1.337;DP=93;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=15.16;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:1438,0,1536 +chr3 32961781 . T C 265.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:294,0,15 +chr3 32961786 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,101 +chr3 32987332 . TCAGGTGCGTATATATAGAGAAGATACATTTTTCATTTGTCCCTAGCTCATGTGCATCTGTAAAAAAAAAAGTGTTTCTTGTTTGTGCTCTA T 3615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=1.692;DP=90;FS=3.267;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=27.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:3653,277,0 +chr3 33002945 . CATTGTGAGTTCCACCCAGATATTCCAGTAA C 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-0.966;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:478,0,966 +chr3 33002978 . TCTGTAAATGAATGGATACTGGACCGACTTGTGCTCTTTCATGCAG T 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.094;DP=24;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:478,0,966 +chr3 33078491 . GGGTAACTCGTAAACTTGAATAAATCTCAGTGTTGATTGTATGTATTTCAATCTTTTCTGATTTTGTCCCGCCATTTTTCTCTCTGTAAACGTATA G 2942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=2.299;DP=80;FS=7.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=30.11;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,71:80:99:2980,0,1719 +chr3 33098515 . C CTG 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.352;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:344,0,172 +chr3 33202795 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.593;DP=120;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,34:120:99:829,0,3259 +chr3 33586100 . GGGTGAGAGATATGCTCACCCTTGATAACTGTTGAATGCAAATATGTGAGATTTATTTAGATTTTTTCCATTTCTCTCCCTTCCCATA G 1029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-0.040;DP=202;FS=6.223;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,190:196:99:1067,372,0 +chr3 34016472 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.166;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:339,0,3043 +chr3 34257377 . C CA 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.660;DP=176;FS=11.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,44:169:99:758,0,4524 +chr3 34265415 . CA C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.010;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:276,0,2448 +chr3 34265421 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.393;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:278,0,2448 +chr3 34265428 . ACTGTAAATTACAAATAATTTAATCACACGACAGCTGTTACCACTGAAATCTGAACAGATTTAGACTTGACTCACTCAC A 1510.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-3.354;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=30.83;ReadPosRankSum=3.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,39:47:99:1548,0,1071 +chr3 34267214 . A T 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-0.443;DP=79;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:777,0,5165 +chr3 34322626 . TGGTAGCATATTTCATTTTCTTTTCTTTGTTTATTTTTTACTGCCAAAGAGAACCCTTTAGTAACAATTGTTTACATTTTTTTTTACTTTTTGGCAACA T 8847.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-0.011;DP=259;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=34.16;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,239:246:99:8885,687,0 +chr3 34364005 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.495;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:334,0,1732 +chr3 34540882 . TA T 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.265;DP=162;FS=9.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,39:159:99:546,0,3349 +chr3 34889963 . ACCTGTACAAAACAAGACATTTTTTTAAATTTCATGCTATGTGGTTGTGAGATAAAAATGTTAGTCAGTGAGTGCAGCACAAAATCAGGGCTTG A 7927.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.927;ClippingRankSum=1.378;DP=203;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=33.67;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,182:197:99:7965,0,2355 +chr3 35411114 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.768;DP=20;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:357,0,119 +chr3 35500440 . TGTAAGTGTCTATATCAACAAATGTCAAAAAGGTAAAGTGTTTTTGACCTTGGAAAGCTAAAACTGTATTGTGACCACAG T 435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=1.139;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=5.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,77:79:99:473,180,0 +chr3 35502378 . GAGGTAAAAATTAAATTGACAGATTGACCCACCAAACTGTCAATTTTGTTAAATGATGTCTGGCATCAACTAAATTTTCAATTACATTTTTTCC G 2925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=2.489;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=33.63;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,82:85:99:2963,288,0 +chr3 35503531 . G GA 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-1.317;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:266,0,2010 +chr3 35615486 . C CA 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-0.036;DP=85;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:309,0,1383 +chr3 35616031 . AT A 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.904;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:816,0,695 +chr3 35616313 . CT C 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-1.057;DP=151;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:254,0,2576 +chr3 35885788 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,183 +chr3 35935288 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.920;DP=44;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:384,0,1130 +chr3 35943183 . GCTGCAACAAATAATCAGAAATTCTTTTCAGTCAAGTATTGCACATAAATATCCTCAAATGTTTCATACCTGAATGATTTTAAATGATCTTAC G 1922.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=1.459;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=35.00;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,47:52:99:1960,0,1256 +chr3 36124199 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.043;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:278,0,1111 +chr3 36173281 . A G 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=2.529;DP=283;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,57:283:99:917,0,8989 +chr3 36173441 . G A 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-3.139;DP=257;FS=5.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,58:257:99:1204,0,7677 +chr3 36209371 . A C 1416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-3.033;DP=261;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,68:261:99:1445,0,8795 +chr3 36248146 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.835;DP=72;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:392,0,2180 +chr3 36248321 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-1.687;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:300,0,826 +chr3 36283067 . C CT 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.911;DP=88;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,23:78:99:341,0,1207 +chr3 36322515 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.267;DP=42;FS=7.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=6.68;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:309,0,1131 +chr3 36348272 . G C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.660;DP=98;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:588,0,2773 +chr3 36445575 . T A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 +chr3 36448282 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,515 +chr3 36448284 . G GGTGT 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=2.475;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:379,0,169 +chr3 36448487 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-1.078;DP=25;FS=13.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:233,0,647 +chr3 36461283 . TCTGAAAGTGGAGCATGTGTGATGGTGACATGTCTATCTATTGGAGATCTATTATGATTTATTGGAGTAATGCAAATGGAATGAGCTTAC T 1773.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=1.655;DP=47;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=28.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:2060,149,0 +chr3 36597945 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.844;DP=60;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:340,0,1718 +chr3 37130556 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-0.010;DP=53;FS=4.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.912;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:308,0,1527 +chr3 37578721 . T A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.465;DP=48;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:382,0,1340 +chr3 37578732 . C G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=-0.068;DP=53;FS=6.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:428,0,1456 +chr3 37662896 . G A 2047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.860;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,85:300:99:2076,0,8575 +chr3 37663736 . G GT 1270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.601;DP=404;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,98:366:99:1308,0,7348 +chr3 37681974 . C CGA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.520;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:254,0,3294 +chr3 37683501 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.462;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:354,0,1081 +chr3 37746290 . A G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.283;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=28.41;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:426,0,44 +chr3 37746388 . G T 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 +chr3 37752287 . A T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 +chr3 37753881 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.715;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:288,0,193 +chr3 37772368 . G A 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=1.090;DP=153;FS=3.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,36:153:99:777,0,9816 +chr3 37783948 . C T 1733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=1.280;DP=220;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,67:218:99:1762,0,5952 +chr3 38645130 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.845;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:239,0,997 +chr3 38651020 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=-0.308;DP=67;FS=8.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:332,0,1973 +chr3 38665541 . T C 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:247,0,23 +chr3 38675839 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.195;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:511,0,2053 +chr3 38759478 . G C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.219;DP=111;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,20:111:99:289,0,3433 +chr3 38908099 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:375,0,282 +chr3 38909489 . C T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:304,21,0 +chr3 39110129 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.425;DP=54;FS=12.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:279,0,1512 +chr3 39179021 . TCTACAAACAGAGAGATGGAGAAAAACAAAGAGAAAACAAGATAAGTGCATGAAATATTTGCAATTTAGAGTTAAAATTCCAGTTTGGAGAATTTATAC T 2328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=2.055;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=33.75;ReadPosRankSum=-1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,63:69:99:2366,0,876 +chr3 39179202 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.721;DP=51;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.141;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:243,0,1591 +chr3 39232992 . T C 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=1.018;DP=121;FS=4.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,36:121:99:938,0,3350 +chr3 39233769 . GA G 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-0.949;DP=272;FS=8.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,66:240:99:1058,0,4835 +chr3 39234102 . C A 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.300;DP=302;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,83:302:99:1947,0,8182 +chr3 39308851 . C A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=1.544;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:478,0,2006 +chr3 39309749 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.049;DP=81;FS=5.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.119;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:467,0,2448 +chr3 39553884 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-2.296;DP=24;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:279,0,542 +chr3 39563683 . T C 2238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=1.317;DP=463;FS=2.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=4.84;ReadPosRankSum=2.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,107:441:99:2267,0,12941 +chr3 39565569 . G C 2719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.536;DP=392;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,111:392:99:2748,0,11044 +chr3 39607873 . C G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.848;DP=84;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,27:84:99:710,0,2194 +chr3 39651376 . CCA C 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-1.228;DP=80;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:456,0,2316 +chr3 39659212 . G A 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.882;DP=144;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,43:144:99:1026,0,3639 +chr3 39673061 . A C 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=1.051;DP=111;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=7.15;ReadPosRankSum=2.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:822,0,3048 +chr3 39677561 . G A 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-0.567;DP=114;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:1202,0,2540 +chr3 39680480 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.416;DP=98;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:436,0,2837 +chr3 39682727 . T G 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=-0.317;DP=43;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=7.51;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:360,0,713 +chr3 39683507 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=4.747;DP=74;FS=25.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=3.90;ReadPosRankSum=-3.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:317,0,2167 +chr3 39959980 . G A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-1.453;DP=43;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:604,0,892 +chr3 39966837 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.833;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:257,0,1593 +chr3 39988171 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.087;DP=92;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:395,0,5512 +chr3 39988177 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.169;DP=89;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:395,0,5512 +chr3 40201892 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-0.199;DP=51;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:310,0,1513 +chr3 40201934 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-0.350;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=32.37;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:708,0,201 +chr3 40202030 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,275 +chr3 40202084 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.782;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:480,0,956 +chr3 40213509 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=1.073;DP=125;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,21:125:99:292,0,4053 +chr3 40223829 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=1.849;DP=131;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,26:131:99:471,0,4047 +chr3 40251155 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.817;DP=26;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.451;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:321,0,563 +chr3 40262967 . TCCTGAAAAACGAGAGACAGCGAGTTGTTACAGTATCTTTGACCTTGATTCAGTTTTACAAAATCAAACCAAACTCA T 11701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-1.023;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=35.79;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,214:215:99:11739,989,0 +chr3 40285001 . TGGTTAGTATTGTAATATCCATCCATCCATCTATATTTTGTTTGTTAATAATGCTAATACAATGTTTGTATTGTTTTGCA T 3101.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.871;DP=90;FS=4.498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=34.46;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,84:88:99:3139,277,0 +chr3 40289665 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.601;DP=41;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:551,0,883 +chr3 40439124 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.234;DP=100;FS=2.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,29:99:99:772,0,2569 +chr3 40474518 . A T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.772;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=12.02;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:437,0,720 +chr3 40481076 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=1.041;DP=35;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:463,0,799 +chr3 40522892 . CCCTGTAATGCAAGGACACAAGCGTTACATTTTGTGAACTACTTGAGAAAGTTCTCAGTTTGGGTCAGAATCAAACTAATCGGTCTTCTCA C 13938.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=2.239;DP=316;FS=2.824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,312:314:99:13976,1207,0 +chr3 40576214 . C T 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=-0.654;DP=344;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,75:343:99:1473,0,10541 +chr3 40803930 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=1.573;DP=156;FS=4.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,24:153:99:263,0,4689 +chr3 40812174 . TGTGAGTATTGCCTATCAAATCACTGACCACTAAAACTCAAAAATACTCAATTATTCTTTTCATCTCACCAG T 5407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=1.812;DP=122;FS=4.500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=26.87;ReadPosRankSum=-2.958 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,115:120:99:5445,495,0 +chr3 40812494 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.509;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,30:149:99:536,0,4590 +chr3 40821489 . G T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.089;DP=108;FS=1.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,33:106:99:876,0,2714 +chr3 40877780 . TCTGTAACAGCATGATGACAACTCAAATCACAATCACTTCACAGATAAAAAGCTGATCTGCACACAGTGAAGGGATGTAC T 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=-0.945;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:600,0,1051 +chr3 40894640 . A C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.895;DP=40;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:335,0,1051 +chr3 40894733 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.074;DP=34;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:337,0,889 +chr3 40895033 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr3 40922438 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.053;DP=89;FS=13.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:443,0,2585 +chr3 41642728 . G C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=2.527;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:445,0,1447 +chr3 41699915 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.854;DP=58;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:262,0,1753 +chr3 41716701 . GAGGTCTGTTTACAATATATACTTTGCTGTATTGATGTTTCAGGTTTTAGATAGTTTTTTTTAACTTGTGCTTTTCTTTTGTTTCACTCAAT G 4902.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=1.259;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,138:145:99:4940,625,0 +chr3 41912514 . GA G 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=2.144;DP=325;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.777;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,2:321:99:943,0,11736 +chr3 41917407 . G GA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=2.351;DP=374;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:406,0,182 +chr3 41917661 . TGGTAAGTATACCAAAACATTTTTACATATATTGGTATTAAAACTGAAAAGGATCATTGAGAATAGAAACTAATGGTTTTTGTTTCTTCATTGCA T 14206.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=1.647;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=27.89;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,325:331:99:14244,1227,0 +chr3 41918689 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.585;DP=50;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.459;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:239,0,1500 +chr3 41919070 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=-0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:329,0,789 +chr3 41919071 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.409;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:329,0,747 +chr3 41921277 . G C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=1.197;DP=314;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,54:314:99:727,0,10447 +chr3 42016985 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.558;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:377,0,2694 +chr3 42053006 . G A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.535;DP=77;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1079,0,1579 +chr3 42081407 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-1.100;DP=83;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:292,0,2409 +chr3 42106524 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:288,0,333 +chr3 42828475 . GCTGTTAGGAAATAAAGAAACAGAAAGAATGTCAAAATGTATCATTTTGAACACGCATACAGAAACAAACACACACAGCCAGCAATTTAC G 2986.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=1.683;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=34.75;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:3024,233,0 +chr3 43559707 . ACTGAAACACAGAGAGCGAGAGAACAGAGTGAGTCTCTGTTGTTGTTCCTCAGTCTCCTGTGGTTTGAGTTCCTAC A 2805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=2.107;DP=91;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=30.83;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,82:91:99:2843,0,975 +chr3 43655259 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:271,0,254 +chr3 43655376 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:411,0,128 +chr3 44041085 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=33.93;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:35:700,0,35 +chr3 44041091 . T C 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=34.17;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:35:700,0,35 +chr3 44043050 . G A 555.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=34.74;ReadPosRankSum=-1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:27:584,0,27 +chr3 44043195 . G T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:242,18,0 +chr3 44043329 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-1.999;DP=18;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:269,0,372 +chr3 44043545 . T C 658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:51:687,51,0 +chr3 44043576 . C T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr3 44315631 . C CA 435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:35:473,35,0 +chr3 44317194 . A G 3477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.180;DP=275;FS=16.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,55:243:99:3506,0,6405 +chr3 44317386 . G A 3477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-1.636;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=21.26;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,35:36:99:3506,0,6425 +chr3 44317732 . A T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.121;DP=57;FS=62.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=5.21;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:325,0,1687 +chr3 44317844 . C G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.982;DP=143;FS=51.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.988;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,25:134:99:407,0,4523 +chr3 45411241 . C CT 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-0.478;DP=230;FS=5.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,51:207:99:531,0,3655 +chr3 46837457 . G GT 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.166;DP=135;FS=8.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:329,0,902 +chr3 46838302 . G GT 566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=-2.052;DP=235;FS=13.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,58:188:99:604,0,3118 +chr3 46839575 . G GT 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.844;DP=278;FS=12.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=2.09;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,61:239:99:618,0,4299 +chr3 46844127 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,385 +chr3 46844141 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=-1.523;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:265,0,303 +chr3 46844574 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,228 +chr3 47005230 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr3 47021149 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-1.032;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=30.63;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:37:549,0,37 +chr3 47344747 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-2.282;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:49:448,0,49 +chr3 47344751 . A G 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:577,39,0 +chr3 47498540 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-0.625;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:243,0,929 +chr3 47973365 . GT G 430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:468,45,0 +chr3 48060975 . CGTGAGTATCATCTTTGACATTGCTATTTGACATTTTTTTTATTGGTTTGTGTGTAGAGGTAATCACTAGGCTGTTCTTTTAAACTCAATAG C 1561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.755;ClippingRankSum=5.468;DP=423;FS=5.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=3.69;ReadPosRankSum=-4.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,391:423:99:1599,0,2299 +chr3 48061970 . TA T 4879.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.019;DP=211;FS=5.127;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=23.13;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,180:195:99:4972,444,0 +chr3 49744905 . AT A 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:301,0,203 +chr3 49753914 . T C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-0.058;DP=38;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:662,0,699 +chr3 50031876 . T TA 750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:788,54,0 +chr3 50279892 . GT G 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.629;DP=41;FS=8.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:674,0,138 +chr3 50281163 . T A 1556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1585,108,0 +chr3 50282784 . C T 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:99:2353,163,0 +chr3 50282797 . C G 2324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:2353,163,0 +chr3 50282865 . A C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.600;DP=61;FS=7.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:378,0,1363 +chr3 50311103 . TG T 1074.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:1112,85,0 +chr3 50719622 . G A 1524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1553,108,0 +chr3 50719738 . C T 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:825,57,0 +chr3 50719950 . G A 3807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3836,271,0 +chr3 50719980 . C T 1905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1934,135,0 +chr3 50834272 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 +chr3 50835060 . A C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr3 50839046 . G A 1253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1282,90,0 +chr3 50868021 . C A 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:592,42,0 +chr3 51709849 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr3 52748385 . G GC 210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:248,21,0 +chr3 52941605 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:316,0,58 +chr3 53196418 . G A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.475;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:1014,0,215 +chr3 53196520 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-0.917;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=24.57;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:839,0,883 +chr3 53196523 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.842;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=24.27;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:829,0,883 +chr3 53201528 . G T 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.083;DP=45;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:974,0,559 +chr3 53241073 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,123 +chr3 53241209 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.606;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:392,0,96 +chr3 53282367 . C T 313.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=31.39;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:342,0,14 +chr3 53286100 . G T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.709;DP=35;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=29.71;ReadPosRankSum=3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1068,0,170 +chr3 53298460 . A G 1866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-1.252;DP=57;FS=12.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=32.75;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:84:1895,0,84 +chr3 53298472 . GCTAGAGAAAAGAAATTCAAAGTTGTGGTCATCTGACAGCTTTTAGAGTTTCAAATAGTGCAAGACCAAC G 2520.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.152;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=33.00;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2558,205,0 +chr3 53309183 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 +chr3 53312039 . T TA 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.949;DP=43;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:289,0,642 +chr3 53335393 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:237,0,350 +chr3 53337427 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.896;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:460,0,170 +chr3 53369441 . G C 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.294;DP=34;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=30.38;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1061,0,116 +chr3 53685932 . T C 10647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,252:252:99:10676,773,0 +chr3 53686012 . G A 11437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.550;DP=285;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=33.56;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,284:285:99:11466,858,0 +chr3 53690932 . T C 12331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=-1.380;DP=316;FS=3.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=30.78;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,304:305:99:12360,902,0 +chr3 53691078 . G C 10012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;ClippingRankSum=-0.009;DP=386;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,275:374:99:10041,0,2033 +chr3 53691117 . C T 14636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=361;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,356:356:99:14665,1074,0 +chr3 53712931 . C CA 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.265;DP=95;FS=5.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,57:77:99:930,0,1708 +chr3 53969935 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.963;DP=95;FS=3.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,20:95:99:391,0,2932 +chr3 54085982 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:304,0,1092 +chr3 54088432 . CT C 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:296,0,168 +chr3 54160694 . A G 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:282,0,22 +chr3 54167438 . A C 5058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=-2.573;DP=298;FS=1.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,144:298:99:5087,0,5256 +chr3 54170514 . C T 5637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.358;DP=291;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,165:291:99:5666,0,4683 +chr3 54171522 . CACCTAAAAAAGGATTGGTAATTGATCATTTCCATGTGGGAACAACGGGACCTATGCAAGGCAACAGTAAACCAGATATAATTGTTGATACTT C 9843.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.014;DP=226;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=28.66;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,210:213:99:9881,961,0 +chr3 54175239 . A G 6326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=-1.015;DP=377;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,195:377:99:6355,0,6534 +chr3 54175350 . GCCTATGTGAGAGAGTATGTGGACCGTTGACAAGAAGATCACAGAGAAACTGTTTAAACAATCACATGCCATTTTATATA G 824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-2.539;DP=289;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,55:272:99:862,0,10960 +chr3 54175353 . TATGTGAGAGAGTATGTGGACCGTTGACAAGAAGATCACAGAGAAACTGTTTAAACAATCACATGCCATTTTATATAC T 7645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-0.060;DP=280;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,209:270:99:7683,0,2765 +chr3 54175433 . CTT C 7645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=-1.222;DP=290;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,209:271:99:7683,0,2761 +chr3 54176241 . TCTGGCAAAATGTAAGAACAACATAAGACCACTGCAACTGTATTATCTTTGAAAGCTGTATATGCATGACCCACATTAAAAGCTTGGTTTGTTTTAAATCAGACTCAC T,TTTATCTTTGAAAGCTGTATATGCATGACCCACATTAAAAGCTTGGTTTGTTTTAAATCAGACTCAC 3462.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.628;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,79,115:197:99:5972,2396,4012,1178,0,2771 +chr3 54176284 . TATCTTTGAAAGCTGTATATGCATGACCCACATTAAAAGCTTGGTTTGTTTTAAATCAGACTCACTA T 3950.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.218;DP=205;FS=7.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,119:202:99:3988,0,4811 +chr3 54178134 . C T 11435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=1.073;DP=412;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,303:412:99:11464,0,2566 +chr3 54178357 . A G 5778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-5.560;DP=263;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.001;QD=21.97;ReadPosRankSum=3.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,169:261:99:5807,0,3126 +chr3 54326021 . A C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.131;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:416,0,375 +chr3 54467556 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.102;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,315 +chr3 54467574 . C G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=1.240;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:399,0,122 +chr3 54467772 . T G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-2.062;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:358,0,432 +chr3 54468774 . T A 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:514,36,0 +chr3 54468801 . T C 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:697,51,0 +chr3 54468891 . TG T 659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-1.304;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=26.39;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:697,0,127 +chr3 54468943 . A G 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.397;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1005,0,115 +chr3 54468997 . A G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-1.434;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:548,0,121 +chr3 54469086 . G C 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 +chr3 54469165 . C T 1121.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-1.034;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=32.55;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:31:1150,31,0 +chr3 54483902 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:276,0,345 +chr3 54483938 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.463;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:404,0,441 +chr3 54483958 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=1.723;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:459,0,416 +chr3 54484123 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:239,0,67 +chr3 54521064 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=1.526;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=23.59;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:500,0,150 +chr3 54533343 . A G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:476,0,164 +chr3 54533476 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=25.70;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:388,0,131 +chr3 54541411 . C T 642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:671,48,0 +chr3 54725474 . G A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr3 54746660 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:325,0,356 +chr3 54747781 . G T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.417;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:499,0,259 +chr3 54751390 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.913;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:468,0,308 +chr3 54751495 . C G 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 +chr3 55285989 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:345,0,676 +chr3 55286694 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.626;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:1243,0,360 +chr3 55290199 . T G 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.173;DP=54;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:918,0,861 +chr3 55393336 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=2.533;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,160 +chr3 55413017 . G A 1796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.101;DP=101;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1825,0,1653 +chr3 55419013 . AAGGTACGGCTTCGTAAACAATATTTTAGAAACTCTTTTGGTGTAATTCAATTAATTTTGCCCCTCAACTCCATTTC A 3409.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.425;DP=90;FS=4.575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=33.12;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,81:85:99:3447,251,0 +chr3 55419123 . C T 1741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-0.313;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,50:87:99:1770,0,1291 +chr3 55437797 . T C 5452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-1.663;DP=347;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,172:326:99:5481,0,5495 +chr3 55441448 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.946;DP=228;FS=10.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,39:228:99:582,0,7590 +chr3 55443125 . C T 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.821;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,34:57:99:1184,0,804 +chr3 55443322 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=2.470;DP=144;FS=29.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,23:144:99:270,0,4838 +chr3 55450369 . G T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.337;DP=134;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=3.65;ReadPosRankSum=-4.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,28:134:99:517,0,4033 +chr3 55453460 . G T 1312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-3.518;DP=86;FS=10.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:1341,0,1600 +chr3 55454531 . T C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.047;DP=182;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,38:182:99:694,0,5743 +chr3 55455550 . TCCTGAAAAGAAGCTCAAGTCAGACCACTTGTTTTCTAGAAGGGAGCTCTGAAAAGGCAAAGTAACTCA T 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.787;DP=131;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,41:130:99:1058,0,10879 +chr3 55455552 . CTGAAAAGAAGCTCAAGTCAGACCACTTGTTTTCTAGAAGGGAGCTCTGAAAAGGCAAAGTAACTCACT C 3221.60 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-0.215;DP=132;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=24.41;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,88:132:99:3259,0,4589 +chr3 55466276 . AG A 505.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=1.761;DP=33;FS=8.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:30:543,0,30 +chr3 55466423 . C A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=1.566;DP=39;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=24.87;ReadPosRankSum=-2.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:998,0,510 +chr3 55467029 . T C 1132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1161,78,0 +chr3 55467034 . C T 1132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:78:1161,78,0 +chr3 55467184 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:275,0,545 +chr3 55467344 . G A 2213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:52:2242,52,0 +chr3 55467553 . C G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=1.115;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=26.60;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:507,0,108 +chr3 55468123 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.583;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:305,0,1519 +chr3 55468214 . C A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.098;DP=37;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:557,0,839 +chr3 55468248 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=1.060;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:329,0,326 +chr3 55468413 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.895;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:324,0,667 +chr3 55469448 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=3.026;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:923,0,1738 +chr3 55469484 . A T 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=2.856;DP=75;FS=8.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=11.60;ReadPosRankSum=-2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:898,0,1778 +chr3 55469502 . C T 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=3.842;DP=69;FS=8.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,27:69:99:956,0,1488 +chr3 55520710 . TAA T,TA 1024.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,36,11:52:99:1600,277,251,1060,0,960 +chr3 55602613 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.78;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:296,0,57 +chr3 55602618 . C T 581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:610,42,0 +chr3 55635946 . T A 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 +chr3 55636302 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:373,0,84 +chr3 55645446 . A C 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:237,0,24 +chr3 55651094 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=3.295;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:275,0,461 +chr3 55687282 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.246;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:419,0,943 +chr3 55687432 . T C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.008;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:443,0,3510 +chr3 55688469 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.053;DP=37;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:278,0,991 +chr3 55688490 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.835;DP=36;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:326,0,943 +chr3 55706125 . C T 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.405;DP=68;FS=4.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,35:68:99:1100,0,1219 +chr3 55708373 . T TCCCATTTCGAGCTCTTCTCCA 1538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.230;DP=94;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:1576,0,1362 +chr3 55717958 . GAGGTCAGTAGAACAACATGTGTGACATAACACACATGCACACAGCCTTCTGATTGGTTTGCACCTTTCATATGCTTTTTATGTTCTC G 3901.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=1.516;DP=96;FS=2.124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=29.44;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,93:96:99:3939,327,0 +chr3 55724120 . A G 1541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1570,111,0 +chr3 55965814 . A G 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=1.094;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.900;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:435,0,1884 +chr3 55965882 . T A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=-2.500;DP=444;FS=33.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=1.17;ReadPosRankSum=2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:377,66:443:99:549,0,18996 +chr3 55965888 . C T 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-2.290;DP=478;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:399,79:478:99:943,0,19067 +chr3 55972190 . A G 4209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.751;ClippingRankSum=-10.689;DP=507;FS=130.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,160:504:99:4238,0,12874 +chr3 55972240 . TCTGCAGGAAATACAACAAACCAAATTAGTTTATAGCCACTATGAAAGTATCAAACTTGAGAACAACTGTTGATAGCGCTCAC T 16047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=4.955;DP=381;FS=8.211;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=28.09;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,370:381:99:16085,1259,0 +chr3 55974794 . C T 4514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=-0.543;DP=269;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,124:269:99:4543,0,4989 +chr3 55979333 . A G 2786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-3.975;DP=304;FS=41.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.103;QD=9.17;ReadPosRankSum=3.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,102:303:99:2815,0,8098 +chr3 55979422 . TCTGCAGGAAACACAACAAACCAAATTAGTTTACAGCCACTACGAAAGTATCAAACTTGAGAACAACTGTTGATAGCGCTCAC T 9677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=3.339;DP=312;FS=32.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=31.02;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,233:262:99:9715,0,5856 +chr3 55983317 . A G 19294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.914;ClippingRankSum=-1.556;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=25.77;ReadPosRankSum=3.129 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,46:50:99:19323,1484,0 +chr3 55983320 . T C 19294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.410;DP=71;FS=2.187;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=30.33;ReadPosRankSum=3.246 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,52:59:99:19323,1484,0 +chr3 55983386 . C T 1730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=1.343;DP=304;FS=18.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,73:304:99:1759,0,9063 +chr3 55983421 . GGGTAAGCTGACATAGATTACAGATGTTTTTAAGAAAGTCTTTAGGTATCCATGCTGTGTGTCGATATAACCCTACTCTTGTGTCCTCTCACA G 18499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.674;ClippingRankSum=-0.864;DP=415;FS=4.688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.006;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,382:392:99:18537,1445,0 +chr3 55999424 . G GT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.818;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:238,0,510 +chr3 56094275 . C CTGTTTTGACAATGACCTCCAGTGTGT 1121.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.063;DP=71;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1159,0,1223 +chr3 56349895 . T C 511.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.508;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=31.99;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:26:540,0,26 +chr3 56350479 . C T 1046.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1075,75,0 +chr3 56353133 . G T 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-2.141;DP=50;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:841,0,920 +chr3 56459851 . T C 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.090;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:555,0,568 +chr3 56628909 . G A 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=3.239;DP=106;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:905,0,2603 +chr3 56628963 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=1.991;DP=95;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:396,0,2470 +chr3 56636543 . A T 2002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.583;DP=118;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:2031,0,1739 +chr3 56819350 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.850;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:303,0,483 +chr3 56820317 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.538;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:679,0,749 +chr3 56821160 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.729;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=20.43;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:682,0,452 +chr3 56902635 . A G 4311.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.328;DP=106;FS=7.608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=33.42;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,101:106:99:4340,304,0 +chr3 56903996 . C T 4032.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:4061,286,0 +chr3 56904140 . T C 1393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:84:1422,84,0 +chr3 56904246 . T A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-0.047;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=11.22;ReadPosRankSum=2.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:623,0,1225 +chr3 56904343 . C T 687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:716,51,0 +chr3 56904439 . T A 2897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2926,205,0 +chr3 56904560 . T A 1335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:96:1364,96,0 +chr3 56904575 . G A 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:81:1095,81,0 +chr3 56904802 . A G 2027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.693;DP=132;FS=2.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:2056,0,2412 +chr3 56904859 . C CT 2116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2283,214,0 +chr3 56905097 . C CTT 2237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2275,164,0 +chr3 56905217 . A C 3228.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.865;DP=166;FS=9.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,96:166:99:3256,0,2475 +chr3 56905266 . C T 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-0.406;DP=156;FS=8.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:2398,0,3060 +chr3 56905503 . G T 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:527,39,0 +chr3 56905635 . A T 4379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4408,313,0 +chr3 56905930 . T C 3277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3306,238,0 +chr3 56906262 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-1.077;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:394,0,382 +chr3 56906334 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-0.573;DP=31;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:562,0,1097 +chr3 56906781 . G A 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 +chr3 56906851 . G T 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:574,42,0 +chr3 56910246 . T C 470.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:499,36,0 +chr3 56910342 . T A 786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.743;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=30.99;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:815,60,0 +chr3 56910447 . G T 2091.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:2120,144,0 +chr3 56963971 . T C 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 +chr3 56984915 . GA G 2684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.175;DP=94;FS=5.344;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:2722,260,0 +chr3 56993864 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.264;DP=53;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:766,0,1077 +chr3 57047189 . T A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr3 57083374 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr3 57162710 . G A 5506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:5535,388,0 +chr3 57162718 . A G 5506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:5535,388,0 +chr3 57162760 . T C 4252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4281,301,0 +chr3 57162849 . A T 2855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.253;DP=168;FS=5.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:2884,0,3025 +chr3 57162874 . C A 2690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=-1.380;DP=164;FS=10.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:2719,0,2999 +chr3 57162944 . C T 2594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=-0.558;DP=162;FS=5.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:2623,0,2977 +chr3 57162971 . T C 7049.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:7078,508,0 +chr3 57163035 . A G 3056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.299;ClippingRankSum=0.592;DP=113;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=27.05;ReadPosRankSum=5.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,81:112:99:3085,0,702 +chr3 57163077 . G T 4263.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:4292,319,0 +chr3 57163116 . T A 4458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4487,325,0 +chr3 57163276 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.343;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:334,0,571 +chr3 57163302 . G T 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:737,51,0 +chr3 57163357 . C T 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 +chr3 57163462 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=2.786;DP=107;FS=11.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=6.04;ReadPosRankSum=3.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:674,0,3101 +chr3 57163566 . A T 4113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4142,301,0 +chr3 57163734 . G A 2335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2364,166,0 +chr3 57163767 . G A 765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:794,63,0 +chr3 57163826 . C G 1515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1544,108,0 +chr3 57163848 . G A 2438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2467,178,0 +chr3 57163953 . C T 3117.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3146,217,0 +chr3 57164003 . A G 365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:394,30,0 +chr3 57164295 . C A 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,19:19:34:647,0,34 +chr3 57164312 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:324,0,1087 +chr3 57164416 . G C 3837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3866,285,0 +chr3 57164458 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.733;DP=20;FS=15.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:239,0,400 +chr3 57164698 . A G 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 +chr3 57164705 . G A 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 +chr3 57164899 . C A 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:825,57,0 +chr3 57164904 . C G 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:825,57,0 +chr3 57165039 . A G 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2659,187,0 +chr3 57165337 . T C 822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:851,60,0 +chr3 57165396 . A T 709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:738,54,0 +chr3 57165477 . A C 954.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:983,69,0 +chr3 57165524 . T C 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1203,84,0 +chr3 57166038 . A C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-1.206;DP=61;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1064,0,1072 +chr3 57166149 . T C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=-0.407;DP=83;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:704,0,4525 +chr3 57166156 . A G 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=-0.252;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:99:708,0,4525 +chr3 57166267 . TA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.858;DP=30;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:313,0,1638 +chr3 57166271 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.549;DP=32;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:313,0,1638 +chr3 57166368 . T C 964.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:6593,478,0 +chr3 57166735 . G A 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-1.124;DP=86;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:995,0,2020 +chr3 57166745 . C T 2780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2809,195,0 +chr3 57220441 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.286;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,376 +chr3 57220675 . T C 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:694,51,0 +chr3 57220693 . T C 633.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:378,0,123 +chr3 57234689 . C A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:378,0,135 +chr3 57267270 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr3 57267278 . C A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:310,21,0 +chr3 57268716 . G C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr3 57280801 . A G 587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:616,42,0 +chr3 57281459 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,185 +chr3 57282049 . T A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr3 57282101 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:229,0,66 +chr3 57303510 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr3 57303516 . C A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr3 57303712 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,141 +chr3 57303761 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:233,0,62 +chr3 57303970 . T C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:644,45,0 +chr3 57306138 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=23.20;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:469,0,231 +chr3 57318362 . A T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr3 57319940 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:406,0,127 +chr3 57320122 . T C 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr3 57320339 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=23.49;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:404,0,161 +chr3 57320352 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.67;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:375,0,196 +chr3 57321322 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:290,0,298 +chr3 57323574 . T C 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:720,51,0 +chr3 57328534 . G A 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:559,42,0 +chr3 57375264 . C G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr3 57375277 . A C 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 +chr3 57517697 . C G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.619;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.186;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:526,0,164 +chr3 57522872 . A G 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 +chr3 57564716 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:354,0,206 +chr3 57566102 . G C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=10;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.78;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:246,0,65 +chr3 57566128 . A G 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:39:551,39,0 +chr3 57566184 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:265,0,130 +chr3 57616745 . T A 773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:802,57,0 +chr3 57766739 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.660;DP=39;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:691,0,707 +chr3 57773235 . T C 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.409;DP=69;FS=3.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1218,0,994 +chr3 57773777 . GAT G 1634.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1672,123,0 +chr3 57853793 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.872;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:450,0,1320 +chr3 57853795 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.995;DP=30;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:450,0,1316 +chr3 57857883 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:466,0,286 +chr3 57929746 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.468;DP=32;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:795,0,278 +chr3 57941577 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:516,0,257 +chr3 57949694 . G T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.708;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=14.77;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:427,0,531 +chr3 57950259 . T C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=2.778;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:619,0,578 +chr3 57950298 . C A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.879;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=19.36;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:609,0,450 +chr3 57951206 . C G 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.239;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:704,0,563 +chr3 57992013 . T A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.974;DP=43;FS=15.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=13.44;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:606,0,1672 +chr3 57992015 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=2.084;DP=43;FS=15.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=13.44;ReadPosRankSum=2.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:606,0,1661 +chr3 57993054 . C A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-2.088;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=22.72;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:687,0,371 +chr3 57994167 . A T 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 +chr3 57994241 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr3 57995711 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-2.721;DP=42;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:356,0,1068 +chr3 57996074 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-0.318;DP=24;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.969;QD=23.45;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:591,0,177 +chr3 57996410 . C T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.770;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=24.92;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:701,0,202 +chr3 57996511 . A G 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-1.346;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1347,0,740 +chr3 57996596 . T A 1023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:78:1052,78,0 +chr3 57997385 . T G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.639;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:655,0,764 +chr3 57997566 . C A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.797;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:494,0,415 +chr3 58237373 . A C 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=2.732;DP=119;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,34:119:99:1021,0,6884 +chr3 58237377 . C T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=2.866;DP=121;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=8.20;ReadPosRankSum=-2.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,37:121:99:1021,0,6884 +chr3 58237421 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.090;DP=77;FS=3.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:445,0,2339 +chr3 58237436 . T A 1912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.126;ClippingRankSum=-1.082;DP=70;FS=3.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=27.33;ReadPosRankSum=-5.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,52:70:99:1941,0,480 +chr3 58237455 . AC A 1601.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=1.423;DP=64;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=25.03;ReadPosRankSum=-2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,45:63:99:1639,0,424 +chr3 58237616 . C A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.141;DP=52;FS=9.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:404,0,1408 +chr3 58237637 . T TA 1213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.578;DP=52;FS=7.965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,44:49:48:1251,48,0 +chr3 58237797 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=-1.388;DP=108;FS=42.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=2.20;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:266,0,3579 +chr3 58276850 . T C 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=1.138;DP=94;FS=3.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:625,0,2816 +chr3 58279853 . G T 2821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-1.493;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,84:126:99:2850,0,1380 +chr3 58459878 . T A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=2.463;DP=54;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=12.01;ReadPosRankSum=-2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:677,0,1164 +chr3 58580735 . CT C 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 +chr3 58582446 . T C 903.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:932,66,0 +chr3 59005342 . C T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=1.120;DP=25;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:665,0,423 +chr3 59013769 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=12.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,334 +chr3 59013796 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:399,0,277 +chr3 59013881 . C A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.165;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:437,0,310 +chr3 59026329 . A C 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 +chr3 59026627 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.230;DP=66;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:332,0,1933 +chr3 59027641 . G A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=-0.366;DP=101;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:1564,0,1885 +chr3 59027728 . C T 1843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.051;DP=102;FS=3.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1872,0,1541 +chr3 59038120 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=6.409;DP=266;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,47:266:99:742,0,17534 +chr3 59038123 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=6.150;DP=269;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=2.65;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,44:269:99:742,0,17534 +chr3 59163677 . A T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:319,0,275 +chr3 59374009 . C T 769.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:798,57,0 +chr3 59452841 . A T 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:234,0,23 +chr3 59504075 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=14.76;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:294,0,379 +chr3 59568124 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.277;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:417,0,683 +chr3 59674167 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-1.029;DP=75;FS=12.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,19:75:99:460,0,3714 +chr3 59675604 . A T 1252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.915;DP=93;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=13.47;ReadPosRankSum=-1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:1383,0,1512 +chr3 59948299 . A AT 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.704;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:367,0,197 +chr3 59948383 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.440;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:412,0,662 +chr3 60283241 . A AT 387.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-0.771;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:25:425,25,0 +chr3 60288287 . G GA 627.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:68:689,68,0 +chr3 60347974 . C T 12244.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:12273,877,0 +chr3 60352511 . GA G 1562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=3.458;DP=78;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=20.04;ReadPosRankSum=-2.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,55:67:99:1600,0,1224 +chr3 60352534 . A T 2888.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.562;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:2917,149,0 +chr3 60449445 . A T 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr3 60467800 . GT G 420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:458,45,0 +chr3 60476528 . A G 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:612,42,0 +chr3 60479725 . GACATATGATGATCCACACTGGAGAGAAACCACACACATGTACACAGTGTGGAAAGAGTTTCACACAGTCATCATCGCTTAATAA G 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-2.203;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=11.24;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:262,0,1688 +chr3 60480142 . G T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=1.951;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:883,0,858 +chr3 60480206 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.475;DP=46;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:503,0,807 +chr3 60480332 . T A 949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:978,69,0 +chr3 60512272 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=1.317;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.57;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,380 +chr3 60528642 . T G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr3 60529523 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:87:285,0,87 +chr3 60530243 . G C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr3 60530595 . T G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr3 60534550 . G C 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=30.74;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:32:520,0,32 +chr3 60536483 . T C 203.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:232,21,0 +chr3 60536642 . A G 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:534,42,0 +chr3 60541883 . T C 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:385,27,0 +chr3 60541891 . A G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:255,18,0 +chr3 60555428 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.49;ReadPosRankSum=-2.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:235,0,397 +chr3 60584289 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:630,48,0 +chr3 60590661 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:18:255,18,0 +chr3 60590670 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr3 60616129 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=2.173;DP=24;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:313,0,448 +chr3 60633583 . A T 1121.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1150,84,0 +chr3 60633752 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.304;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:624,0,398 +chr3 60633764 . A G 1336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:93:1365,93,0 +chr3 60636433 . T G 400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:429,30,0 +chr3 60637228 . A G 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:510,39,0 +chr3 60637305 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.867;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.09;ReadPosRankSum=2.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:277,0,388 +chr3 60637621 . AT A 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr3 60637627 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr3 60642174 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:321,0,552 +chr3 60663966 . C T 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 +chr3 60917030 . T G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr3 61137534 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.244;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.391;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:239,0,370 +chr3 61159334 . G A 2463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=-0.826;DP=131;FS=2.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:2492,0,4423 +chr3 61159563 . ATGCTGGGACAGGCTCTTTTACAGGTGCTAGTACAGGGACAGACTCCTTCACAGTTTCTGG A 5372.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.842;DP=186;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:5410,621,0 +chr3 61187012 . G T 5760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=-0.239;DP=360;FS=3.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,164:360:99:5789,0,6425 +chr3 61187080 . C CCTG 845.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,25:25:58:883,0,58 +chr3 61194638 . T C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=28.40;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:511,0,121 +chr3 61195464 . CA C 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.381;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:408,0,469 +chr3 61206041 . A G 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.091;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:708,0,746 +chr3 61210630 . C A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=-0.820;DP=48;FS=4.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=23.08;ReadPosRankSum=2.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1136,0,623 +chr3 61211717 . T G 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:720,51,0 +chr3 61215982 . C A 3664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=-1.601;DP=149;FS=9.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=24.60;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,105:148:99:3693,0,1036 +chr3 61217855 . A T 1238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.733;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1267,109,0 +chr3 61223200 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:318,0,275 +chr3 61223224 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.683;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,282 +chr3 61239901 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr3 61239908 . G T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 +chr3 61241030 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.749;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,189 +chr3 61243672 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=1.270;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:318,0,246 +chr3 61243747 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:304,0,250 +chr3 61264618 . CT C 574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:612,66,0 +chr3 61264736 . C T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.277;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:952,0,906 +chr3 61273487 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.102;DP=39;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:606,0,633 +chr3 61311132 . C T 1965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=-0.619;DP=112;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1994,0,1549 +chr3 61311338 . CG C 556.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,28:28:44:857,0,44 +chr3 61311867 . AT A 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-1.290;DP=49;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:584,0,613 +chr3 61312934 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=-1.984;DP=39;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:506,0,840 +chr3 61314651 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.438;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:315,0,2603 +chr3 61314903 . G GT 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-2.155;DP=40;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:390,0,445 +chr3 61314911 . A T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.307;ClippingRankSum=-0.259;DP=37;FS=7.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:496,0,715 +chr3 61380348 . CCAGGTAAGGATCATGTGATTACTCTCATTTGCGTGTATGAACTTTTATGACGTTGTGTTAAATTAGTATAGATTTCTTTTTGAAACTGTTACCTAATATTTGTGTACGGTTCTCAATTAAAGTCATCTATCACA C 1277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=1.314;DP=47;FS=11.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=27.19;ReadPosRankSum=-2.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1315,0,1411 +chr3 61390978 . T A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-1.155;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=30.27;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:83:997,0,83 +chr3 61431003 . AG A 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr3 61440158 . GT G 925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:94:963,94,0 +chr3 61440237 . C CT 770.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:808,78,0 +chr3 61440618 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:279,0,51 +chr3 61452372 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=25.61;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:438,0,164 +chr3 61617670 . CT C 517.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.444;DP=38;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:25:555,0,25 +chr3 61622222 . TCTGACACACAAAACAACACAGAAGACAACAAGATCTGTTCACCATCAGACTTTTCATTTTTGGGTGAACGATCCCTTAAACATGACATTTTTTCCTAACAAAATTAAAAGGAAGCCCGGGAGGAGGCGTACTGCGCTCCAAGTTCACCAATTAGGATGACTTTCAGCGTTCATTGTTATCAAGGACTAAGGAAAGAATCTATATACACACACAAAC T 7476.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=2.861;DP=165;FS=1.533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=29.29;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,157:165:99:7514,648,0 +chr3 61792945 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:306,0,138 +chr3 61802955 . T TA 2009.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=-2.776;DP=294;FS=11.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,119:275:99:2157,0,2943 +chr3 61888811 . C A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=-0.411;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:516,0,1869 +chr3 61889268 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.248;DP=50;FS=2.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:337,0,1366 +chr3 61889859 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.222;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:272,0,2311 +chr3 61894285 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=-0.039;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:429,0,2771 +chr3 61894626 . CT C 624.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.189;DP=22;FS=2.831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:29:662,29,0 +chr3 61896045 . A T 245.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:274,0,20 +chr3 61896119 . C T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr3 61896546 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=1.522;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:281,0,1077 +chr3 61899226 . G A 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:476,36,0 +chr3 61899600 . A C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:265,0,102 +chr3 61967794 . A G 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr3 61968466 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.231;DP=21;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:255,0,1003 +chr3 61973540 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.352;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:400,0,217 +chr3 61975137 . G T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=34.80;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:585,0,111 +chr3 61980230 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr3 61981418 . T C 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:509,36,0 +chr3 61981425 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:290,0,133 +chr3 62005862 . A AAC 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=1.727;DP=95;FS=12.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=2.40;ReadPosRankSum=-2.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:265,0,1976 +chr3 62006353 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.030;DP=51;FS=7.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:450,0,1387 +chr3 62006760 . T C 1219.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:87:1248,87,0 +chr3 62007300 . T A 359.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:7:387,0,7 +chr3 62007696 . T C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.142;DP=108;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,27:108:99:622,0,3180 +chr3 62085003 . T G 722.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:751,54,0 +chr3 62085082 . G A 597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:626,45,0 +chr3 62166246 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:267,0,64 +chr3 62327784 . A C 323.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:351,0,12 +chr3 62717995 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=4.038;DP=45;FS=9.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=14.86;ReadPosRankSum=-3.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:697,0,1880 +chr3 62719965 . A AGT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.155;DP=61;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:256,0,249 +chr3 62901424 . C G 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:368,24,0 +chr3 62901988 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-1.504;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:411,0,262 +chr3 62902171 . T A 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 +chr3 62950663 . G C 2189.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=1.237;DP=56;FS=9.780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=36.57;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:2218,117,0 +chr3 62986999 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.158;DP=20;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:233,0,442 +chr3 63052613 . CATCTAGCATGCAACAAACACCATCA C 6668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=3.915;DP=166;FS=4.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=29.34;ReadPosRankSum=-4.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,157:166:99:6706,0,2590 +chr3 63052640 . TGCGCACACAACACACGTCAGCCTACTACAGCGTATATCTATATGACATATATTCATGCATTCAAAAACAAATAAGCTCTTAAAACCGGGGAGATCCGTCACACATCTTCATTATCTGCAACATTTACAACTCAC T 6668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=2.543;DP=173;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,155:173:99:6706,0,2476 +chr3 63132241 . C G 1132.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1161,84,0 +chr3 63132290 . G A 1154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1183,84,0 +chr3 63178186 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.098;DP=142;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:574,0,6993 +chr3 63178928 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr3 63178930 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:262,18,0 +chr3 63180137 . C T 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-2.200;DP=207;FS=12.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,58:207:99:1137,0,7308 +chr3 63180281 . G A 1889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-1.161;DP=163;FS=11.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=11.59;ReadPosRankSum=-2.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,60:163:99:1918,0,4001 +chr3 63184374 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.871;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:299,0,1635 +chr4 11804 . G C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.900;DP=40;FS=18.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:316,0,1086 +chr4 11853 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.288;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:348,0,1212 +chr4 27719 . AT A 3202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.625;DP=292;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,155:251:99:3240,0,2691 +chr4 40020 . G T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.124;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:99:718,0,8001 +chr4 41790 . A G 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.334;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:763,0,1063 +chr4 99492 . ACTGCAGGAGAAACAGCAGATGATCAGCACACTAACCTCAGCAGATACTGCACAGCCCCACTACAGGTTTCTCAC A 1023.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=1.101;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=33.02;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:99:1061,0,426 +chr4 360316 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.161;DP=193;FS=5.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,40:193:99:728,0,5916 +chr4 367309 . T C 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=-0.841;DP=185;FS=11.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,57:184:99:1456,0,4582 +chr4 369361 . G C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.595;DP=139;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,25:139:99:367,0,4440 +chr4 373815 . A G 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.079;DP=161;FS=4.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,44:161:99:987,0,4512 +chr4 376582 . A G 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.485;DP=189;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,46:189:99:906,0,5633 +chr4 378012 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-1.348;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,28:196:99:251,0,6578 +chr4 379134 . G C 2495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.593;DP=163;FS=3.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:2524,0,2803 +chr4 381521 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;ClippingRankSum=-0.048;DP=196;FS=4.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,37:196:99:345,0,5647 +chr4 443138 . A G 2211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.394;DP=109;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,66:109:99:2240,0,1935 +chr4 444105 . G GGT 4149.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-2.078;DP=342;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=12.13;ReadPosRankSum=-2.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,153:277:99:4187,0,3306 +chr4 453871 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:289,0,124 +chr4 458009 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:244,0,203 +chr4 458242 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-0.905;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1230,0,2721 +chr4 458249 . C T 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.361;DP=67;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1230,0,2671 +chr4 471090 . CA C 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.740;DP=141;FS=5.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1472,0,1228 +chr4 473271 . G A 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=4.770;DP=96;FS=22.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=14.61;ReadPosRankSum=-3.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:1431,0,1887 +chr4 553932 . AGT A 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-1.971;DP=59;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:261,0,1610 +chr4 558225 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=1.407;DP=49;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:257,0,1438 +chr4 568440 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.943;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:475,0,576 +chr4 568644 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-1.235;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:333,0,1218 +chr4 577057 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-1.030;DP=67;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:394,0,1945 +chr4 581862 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=-0.618;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:751,0,1105 +chr4 587275 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:327,0,372 +chr4 613056 . A G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=1.163;DP=126;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:361,0,3302 +chr4 613181 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.391;DP=191;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,25:188:99:291,0,12911 +chr4 613183 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.116;DP=194;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,28:191:99:285,0,12911 +chr4 630492 . T A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.664;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:444,0,451 +chr4 630645 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.237;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:297,0,1134 +chr4 647411 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.236;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:300,0,959 +chr4 648306 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.807;DP=47;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=11.12;ReadPosRankSum=2.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:551,0,1090 +chr4 649488 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.650;DP=49;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:436,0,1254 +chr4 650783 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=1.011;DP=47;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:319,0,1561 +chr4 652703 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=1.538;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:405,0,724 +chr4 653088 . T A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.381;DP=38;FS=2.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:688,0,780 +chr4 653204 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.544;DP=42;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:342,0,1045 +chr4 757157 . C A 2262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.230;DP=132;FS=2.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:2291,0,2194 +chr4 812585 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.242;DP=46;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:515,0,984 +chr4 814198 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.413;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:242,0,957 +chr4 814669 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.817;DP=51;FS=6.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:361,0,1338 +chr4 816212 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=2.086;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:325,0,1395 +chr4 869402 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=-0.324;DP=161;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,34:158:99:452,0,4815 +chr4 872498 . A G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-0.862;DP=96;FS=1.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:621,0,3132 +chr4 872675 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.992;DP=142;FS=2.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,28:142:99:331,0,5446 +chr4 873528 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.187;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,28:121:99:556,0,3435 +chr4 873565 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.964;DP=112;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:501,0,3372 +chr4 919862 . C CAG 970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=-0.782;DP=114;FS=4.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,42:63:99:1008,0,460 +chr4 920248 . GATAAA G 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=2.823;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=3.15;ReadPosRankSum=-2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,3:131:99:453,0,24666 +chr4 920254 . GAGAGAGAGAGA G 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.635;ClippingRankSum=7.287;DP=164;FS=14.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=2.54;ReadPosRankSum=-4.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,28:164:99:454,0,24666 +chr4 1406416 . A G 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.618;DP=121;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=6.04;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,31:121:99:759,0,9135 +chr4 1406417 . A G 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-1.743;DP=121;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=6.04;ReadPosRankSum=2.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,31:121:99:759,0,9135 +chr4 1423736 . AT A 1422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.758;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,53:67:99:1460,0,605 +chr4 1424167 . A T 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.767;ClippingRankSum=-1.137;DP=44;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:875,0,557 +chr4 1484449 . CGTACGTCCTGTTTACCTGTGTTTGTGCATGCTCATTCTGCTGTTCGTCTGATTGTTCATTAGTTATGTGTGTTTTACAG C 3813.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.401;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=30.44;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,81:83:99:3851,316,0 +chr4 1486815 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=-2.274;DP=102;FS=20.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:490,0,3045 +chr4 1496939 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-1.150;DP=96;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:305,0,2917 +chr4 1507374 . G A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-1.670;DP=105;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1849,0,1848 +chr4 1515093 . T C 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=-0.675;DP=129;FS=3.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,35:129:99:865,0,3551 +chr4 1543280 . C A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=-1.041;DP=99;FS=17.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,24:99:99:530,0,2653 +chr4 1587720 . T G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=1.450;DP=94;FS=7.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:355,0,3049 +chr4 1593875 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.010;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:234,0,1739 +chr4 1606908 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-1.566;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:407,0,1424 +chr4 1616373 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.941;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:335,0,1325 +chr4 1635357 . A G 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.736;DP=77;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1060,0,1654 +chr4 1638562 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.106;DP=115;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:2252,0,1385 +chr4 1645083 . T TG 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-1.326;DP=29;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:360,0,604 +chr4 1647622 . T G 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.640;DP=37;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:717,0,581 +chr4 1647909 . G A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.233;DP=46;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:734,0,933 +chr4 1682387 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.895;DP=24;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:431,0,413 +chr4 1682643 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-2.176;DP=109;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:499,0,3217 +chr4 1737041 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:291,0,100 +chr4 1741765 . G A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.326;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=25.70;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:825,0,254 +chr4 1906673 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-0.332;DP=59;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:422,0,1611 +chr4 1909814 . C G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.158;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=21.29;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:454,0,225 +chr4 1915999 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=2.406;DP=279;FS=1.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=2.62;ReadPosRankSum=2.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,61:274:99:760,0,8163 +chr4 1916047 . C A 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-1.854;DP=236;FS=12.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,60:235:99:919,0,6173 +chr4 1916245 . G A 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.464;DP=294;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,67:294:99:1146,0,8180 +chr4 1917008 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.361;DP=320;FS=5.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,60:318:99:897,0,9129 +chr4 1962311 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=-2.507;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:339,0,334 +chr4 1964481 . T G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:354,0,93 +chr4 2211314 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:302,0,203 +chr4 2380696 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=13;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:362,0,124 +chr4 2382280 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.839;DP=41;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:260,0,1121 +chr4 2405877 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.933;DP=58;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:519,0,1558 +chr4 2478961 . T A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.674;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:480,0,932 +chr4 2526476 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.299;DP=25;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:421,0,420 +chr4 2540044 . T G 279.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:5:307,0,5 +chr4 2542961 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.090;DP=33;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:548,0,629 +chr4 2618581 . G GA 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.137;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:478,0,480 +chr4 2618652 . T A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.439;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:618,0,773 +chr4 2618906 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=2.725;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:257,0,586 +chr4 2619030 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.934;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:521,0,381 +chr4 2620043 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-1.234;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:407,0,810 +chr4 2620823 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-1.444;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:270,0,1296 +chr4 2620827 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-2.257;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:279,0,1296 +chr4 2620969 . T G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-1.546;DP=35;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:319,0,925 +chr4 2621071 . A AT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.244;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:451,0,867 +chr4 2621335 . A AT 840.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-1.222;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:878,0,881 +chr4 2621612 . A T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-1.510;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:458,0,873 +chr4 2621617 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:458,0,873 +chr4 2622173 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=1.364;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:386,0,585 +chr4 2622482 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.521;DP=39;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=16.58;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:675,0,615 +chr4 2622801 . A G 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-0.032;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:733,0,1298 +chr4 2623228 . T A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.179;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:864,0,902 +chr4 2624465 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.586;DP=64;FS=4.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:306,0,1846 +chr4 2633073 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.156;DP=35;FS=8.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:383,0,758 +chr4 2638516 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.290;DP=37;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:576,0,693 +chr4 2645007 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.054;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:634,0,1166 +chr4 2645111 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=1.013;DP=52;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:964,0,804 +chr4 2658841 . G A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.194;DP=45;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:667,0,801 +chr4 2658904 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-0.243;DP=46;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:763,0,619 +chr4 2737731 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-2.060;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:233,0,1902 +chr4 2737740 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.634;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:631,0,1006 +chr4 2798336 . A AAC 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-2.409;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:260,0,798 +chr4 2798556 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.203;DP=55;FS=11.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:361,0,1535 +chr4 2799022 . G GA 316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.913;DP=37;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=8.56;ReadPosRankSum=-2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:354,0,254 +chr4 2816222 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-1.368;DP=131;FS=4.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,25:131:99:361,0,3694 +chr4 2819265 . C A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-0.645;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:737,0,1030 +chr4 2828103 . G A 2891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-1.021;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=29.81;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,77:97:99:2920,0,401 +chr4 2852983 . C T 2578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.105;DP=86;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,70:86:99:2607,0,287 +chr4 2860386 . T C 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.603;DP=61;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1320,0,753 +chr4 2860474 . G A 2392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=-0.940;DP=85;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,68:84:99:2421,0,271 +chr4 3870836 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.954;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=13.60;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:341,0,346 +chr4 3873680 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=29.80;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:356,0,49 +chr4 3978810 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.529;DP=48;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:403,0,877 +chr4 3983909 . G GT 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.771;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:394,0,365 +chr4 4107528 . T C 1925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=2.534;DP=152;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,55:152:99:1954,0,3532 +chr4 4110696 . G A 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-2.618;DP=272;FS=17.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,63:272:99:1412,0,15473 +chr4 4230900 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-2.003;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:43:341,0,43 +chr4 4230979 . G A 1063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.226;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=22.63;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:75:1092,75,0 +chr4 4231015 . T A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:510,36,0 +chr4 4413381 . ACTGTTGAGCGAGAGGAAGGTTTAGTGTGATTGTATGGTGATTTAGAATTCAGGCGGAGATAGTTAAAGGTCAATTCTCAC A 3734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=1.691;DP=85;FS=4.523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:3772,285,0 +chr4 4413504 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.398;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:579,0,2193 +chr4 4585606 . C CA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.810;DP=31;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:336,0,340 +chr4 4585742 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.261;DP=52;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:759,0,1171 +chr4 4587331 . A G 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 +chr4 4587346 . T G 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:618,42,0 +chr4 4625088 . G A 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-1.069;DP=57;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.340;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:850,0,1055 +chr4 4626280 . G A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-2.235;DP=60;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:857,0,2785 +chr4 4626529 . GACCTGTAAATGTAAGATTCTAGATTTAAAGCAGTATTTTTTAAAACCCTATTAAATGACTTTAAAAGCAAATAAAGAACAC G 2816.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.976;DP=91;FS=4.432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=30.95;ReadPosRankSum=-1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,82:87:99:2854,211,0 +chr4 4626636 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=1.578;DP=108;FS=8.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,34:108:99:899,0,2771 +chr4 4686632 . C T 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.676;DP=112;FS=6.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.331;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,41:112:99:1398,0,2438 +chr4 4696009 . G A 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-2.025;DP=148;FS=2.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,60:148:99:2069,0,3054 +chr4 4696057 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.984;DP=147;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:2252,0,2796 +chr4 4723147 . T C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.112;DP=82;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:915,0,1830 +chr4 4794995 . C T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.698;DP=125;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,40:124:99:1068,0,3096 +chr4 4803712 . GT G 1418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.900;DP=120;FS=14.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,45:120:99:1456,0,2477 +chr4 4839550 . A AT 202.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr4 4899071 . T TA 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=1.172;DP=68;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:332,0,1193 +chr4 4899277 . AT A 489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=2.082;DP=27;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=18.14;ReadPosRankSum=-2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:38:527,0,38 +chr4 4915838 . AACCTGCCATAGAGCACACACAGCAGCACATCAGGACAGAAGAGTGTAAGGTAACACGATGACAATGAGAATACAAAAGGGGGAAATATTT A 7598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.564;DP=175;FS=4.720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,171:175:99:7636,662,0 +chr4 5129731 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.155;DP=70;FS=9.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:406,0,1956 +chr4 5129908 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=-0.772;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:572,0,2189 +chr4 5142909 . C G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.810;DP=71;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:287,0,2987 +chr4 5175376 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=1.237;DP=67;FS=5.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:528,0,1666 +chr4 5195708 . G A 1858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.427;DP=273;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,79:273:99:1887,0,7254 +chr4 5198354 . C T 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-1.826;DP=56;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:944,0,905 +chr4 5198481 . TC T 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.473;DP=49;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:338,0,1006 +chr4 5203628 . TCTGTAAATATCAAAATTAGCAGTAAATTCTTAAAATAACACAATCTTACAGAAACGGAGCTTGTATTTAGCTTCCTAAATGCTGAC T 4635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=3.249;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=35.06;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,111:116:99:4673,337,0 +chr4 5212370 . CTTTT C 236.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:28:274,28,0 +chr4 5212375 . T A 245.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:28:274,28,0 +chr4 5212973 . G A 1789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=-0.098;DP=192;FS=4.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,58:192:99:1818,0,11195 +chr4 5221318 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.494;DP=59;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:760,0,1272 +chr4 5324782 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.417;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:267,0,459 +chr4 5324863 . A T 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.400;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:322,0,136 +chr4 5464305 . TAG T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=25.36;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:367,0,143 +chr4 5516929 . TGTAAGTGTTAACACTTCTGACGATTCTTAGTTTTAACAATGTTTCATATCTCAAAACTTCTCTCACTCTAAATGTGATGCAG T 6783.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.338;DP=152;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=36.15;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,146:151:99:6821,564,0 +chr4 5617072 . C CA 426.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:464,44,0 +chr4 5621161 . G T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,203 +chr4 5638886 . T A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.872;DP=114;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:745,0,3245 +chr4 5638972 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-2.025;DP=78;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=5.51;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:458,0,2203 +chr4 5641581 . G A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=-0.807;DP=133;FS=1.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,34:133:99:842,0,3791 +chr4 5651220 . T C 5073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-9.219;DP=193;FS=34.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=26.29;ReadPosRankSum=7.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,139:193:99:5102,0,1314 +chr4 5651997 . C T 2339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.621;DP=456;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,109:455:99:2368,0,13193 +chr4 5653887 . C T 2328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=-1.142;DP=400;FS=2.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,102:398:99:2357,0,11178 +chr4 5654418 . G A 3142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.164;DP=506;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:369,136:505:99:3171,0,14168 +chr4 5667604 . C A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=1.922;DP=40;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:424,0,914 +chr4 5681955 . G A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.988;DP=36;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:456,0,810 +chr4 5698750 . TCTGAGAGCAAAAAGACCATCAGAAAACAGTCTCACACCATAACACTCTGTGATTTGACCAAACACTCAC T 2061.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=2.961;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=34.94;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,47:51:99:2099,0,920 +chr4 5699298 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.334;DP=95;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:541,0,2642 +chr4 5708991 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=2.010;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:236,0,664 +chr4 5711697 . G C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.197;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,716 +chr4 5762053 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=1.248;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:405,0,408 +chr4 5762400 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.301;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:455,0,351 +chr4 5809866 . A AT 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.701;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:338,0,340 +chr4 5810361 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=1.870;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:285,0,466 +chr4 5811490 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.029;DP=74;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:638,0,1890 +chr4 6028532 . G C 1849.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=3.554;DP=47;FS=10.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=31.27;ReadPosRankSum=2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,41:47:9:1877,0,9 +chr4 6032380 . CT C 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:67:411,0,67 +chr4 6036213 . C CA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.095;DP=34;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:415,0,343 +chr4 6126107 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=2.785;DP=32;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:506,0,1615 +chr4 6541420 . G A 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-2.184;DP=138;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:2251,0,2423 +chr4 6541436 . A G 2391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-1.536;DP=146;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:2420,0,2629 +chr4 6549398 . C T 3622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.247;DP=209;FS=0.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=17.33;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,116:207:99:3651,0,3059 +chr4 6573598 . GA G 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.134;DP=56;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:460,0,563 +chr4 6574207 . CT C 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.396;DP=86;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:305,0,1282 +chr4 6587675 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr4 6605542 . C T 6380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.768;DP=405;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.500;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,180:405:99:6409,0,7569 +chr4 6609714 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-2.435;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=21.80;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:377,0,437 +chr4 6611680 . ACCTCTACACTGATTGCTCAGAAGGCCCTACGATGCTCTGATTGGTCACGTACCTCTACACTGATTGGTCAGATGGCTCTACTATGCTCTGATAGGTCACATG A 1259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=-1.576;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=33.00;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:1297,0,3244 +chr4 6613516 . A C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:359,0,116 +chr4 6837691 . A G 1345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1374,107,0 +chr4 6837727 . G A 1002.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1031,75,0 +chr4 6906218 . C T 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:522,36,0 +chr4 6906510 . T C 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:479,33,0 +chr4 6906538 . T C 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 +chr4 7014803 . T C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-1.101;DP=29;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:628,0,384 +chr4 7040519 . ACTACAAGACGTAACACTTGATTAGAAACCATAAACACATGTATAAAACATCATATAGGTGGAAAGAGAGTTTAC A 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.199;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:726,0,767 +chr4 7194574 . T C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.656;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:403,0,270 +chr4 7199259 . C A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.256;DP=44;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:535,0,980 +chr4 7206802 . G C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.072;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:319,0,1065 +chr4 7206854 . G T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.915;DP=45;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:642,0,941 +chr4 7226004 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.953;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:922,0,1006 +chr4 7226151 . G C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=1.372;DP=48;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=15.06;ReadPosRankSum=-2.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:751,0,1865 +chr4 7226155 . C CT 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-0.866;DP=48;FS=7.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:350,0,891 +chr4 7226403 . G GT 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.350;DP=69;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.432;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:438,0,619 +chr4 7228318 . T TA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.623;DP=70;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:415,0,918 +chr4 7229356 . T C 1721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=1.036;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1750,0,1683 +chr4 7247907 . T G 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.770;DP=87;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1456,0,1369 +chr4 7254646 . G T 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.377;DP=110;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:1487,0,2039 +chr4 7257254 . GTACACCTGAGAGAT G 1034.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-2.451;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1072,0,1827 +chr4 7257260 . CT C 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=2.150;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:67:99:982,0,4198 +chr4 7257262 . GAGAGATAACATTAAAGTAAGACTTCGGTCATGACGCATCATTTGCAAAGGACATAAACTTCTATTACATACTGAGATTGTAAGTTCTACCA G 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=1.406;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:982,0,4289 +chr4 7257271 . CATTAAAGTAAGACTTCGGTCATGACGCATCATTTGCAAAGGACATAAACTTCTATTACATACTGAGATTGTAAGTTCT C 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=-1.679;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:650,0,4147 +chr4 7284827 . C T 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.779;DP=77;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.226;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:77:99:1347,0,1385 +chr4 7451537 . A G 2259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=1.457;DP=175;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,67:175:99:2288,0,3786 +chr4 7455969 . G A 2290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=4.952;DP=146;FS=6.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=15.69;ReadPosRankSum=-2.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:2319,0,5693 +chr4 7478756 . G A 2805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=-1.520;DP=208;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=13.49;ReadPosRankSum=2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,84:208:99:2834,0,4016 +chr4 7478830 . G A 2220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.319;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:2249,0,2863 +chr4 7496180 . C A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:562,0,211 +chr4 7497450 . G A 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=-1.178;DP=43;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:793,0,686 +chr4 7497543 . G A 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.056;DP=62;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1090,0,1099 +chr4 7520881 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:278,0,56 +chr4 7548072 . TA T 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=3.065;DP=48;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=8.14;ReadPosRankSum=-2.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:428,0,892 +chr4 7638639 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.176;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:359,0,668 +chr4 7638866 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:326,0,412 +chr4 7640640 . A AT 235.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:19:273,19,0 +chr4 7643566 . T C 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:613,45,0 +chr4 7975098 . T TTG 229.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:267,21,0 +chr4 8536043 . T G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=11.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:293,0,397 +chr4 8669014 . TCCTGTGCAAAACCAACACATCTGTGATCTACATCCACACTGACTCATTCACAACTACACACAAAAACCCAGCAAA T 718.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=3.062;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=23.18;ReadPosRankSum=-2.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:756,0,4202 +chr4 9062115 . C CT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=-2.434;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:249,0,662 +chr4 9711403 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.050;DP=35;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:537,0,681 +chr4 9763814 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:269,0,394 +chr4 9809041 . TGGTATCATACAAACACACTAATATGCATAGCCTTATTTAATATTATGCAGTATAGCATCTCATTCTTGCATCATGTATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCTA T 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=-0.574;DP=28;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:532,0,5032 +chr4 9814630 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.734;DP=35;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:429,0,828 +chr4 9818816 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-1.002;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:998,0,959 +chr4 9822365 . TGTAAGCAAGACATTCATATTTAATATAATGCAAATTCTGGGTCCATAAAGCGTATGTAATGTGTTTTGTGTTCCAG T 2410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=1.174;DP=65;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,58:65:99:2448,0,228 +chr4 10263837 . TA T 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.709;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:335,0,153 +chr4 10423019 . A ACAACAGC 3272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.282;DP=164;FS=6.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,93:150:99:3310,0,2197 +chr4 10545190 . GAGGTGAAACATGCAAGGTTTGTATCAACACTGTTTTTATACTTTATTTATTTTCATCAAGAGTGCATCTCTGTGC G 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:266,0,992 +chr4 10640838 . TCTGGAGACAAAGAACGAAGGCAATATTAAAACCGAATGTCCCCAAAACAAGTGTATCTGAAGGCCTGCAGTTGTTAGATCGGTGCTTGCTCTTAC T 1423.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=1.691;DP=291;FS=2.058;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,253:257:99:1461,561,0 +chr4 10797983 . GT G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.099;DP=16;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=16.36;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:21:299,0,21 +chr4 10801549 . TCCTACAAAGAAAACAAAAGGTGTTTTTAATGCACAGACTTCTTTGGAAATTGCAAGCGCTACTGTTAAATCTGCTTA T 5610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=1.647;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=33.00;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,158:169:99:5648,0,347 +chr4 10802347 . GCTGCAAAAGACAAAATAAGATCACAAACGATATCAGGATTATGAATGTAATGATGATATGTAAGAAAGACATGAATGAGAGATTTAC G 8269.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=1.081;DP=186;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=30.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,183:186:99:8307,639,0 +chr4 10869759 . GT G 920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-0.110;DP=67;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,39:66:99:958,0,676 +chr4 10874653 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=2.460;DP=58;FS=5.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:538,0,3266 +chr4 11011646 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=-0.249;DP=27;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:387,0,242 +chr4 11097705 . CT C 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=3.090;DP=117;FS=17.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:521,0,2113 +chr4 11098640 . T C 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.353;DP=47;FS=13.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=18.91;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:917,0,771 +chr4 11384529 . TCTAAATTTGAATAAGCACTTATAAGTTCAAGAGCATTCATTAAACATATCATTACTCCATTAATGAGGTTAGTCAAACTCACATAC T 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:99:501,0,470 +chr4 11780516 . GAA G 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:321,0,484 +chr4 11780789 . A G 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.083;DP=59;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1032,0,994 +chr4 11782831 . C G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.467;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:524,0,386 +chr4 11819158 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=24.37;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:345,0,534 +chr4 11819731 . C A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.062;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:477,0,585 +chr4 11843912 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,216 +chr4 11878296 . T A 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:670,48,0 +chr4 11878304 . T C 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:48:670,48,0 +chr4 11878427 . T TA 569.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.619;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:70:742,70,0 +chr4 11879766 . T TAC 1060.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-1.907;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,48:55:99:1098,0,122 +chr4 11883370 . C CT 932.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:67:970,67,0 +chr4 11965340 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=2.264;DP=54;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:630,0,1193 +chr4 11980975 . G A 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.624;DP=116;FS=1.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=17.23;ReadPosRankSum=2.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:2027,0,2103 +chr4 11981056 . AT A 546.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.917;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.119;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:5:583,5,0 +chr4 11981805 . G C 1654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-0.258;DP=131;FS=6.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,50:131:99:1683,0,2800 +chr4 11981884 . GA G 1620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-2.626;DP=126;FS=7.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1658,0,1225 +chr4 11982157 . G A 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.712;DP=200;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,87:200:99:3315,0,7837 +chr4 11982160 . A G 3286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.136;DP=196;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,84:196:99:3315,0,7803 +chr4 11989026 . TCCTGTAGATCCAATGCAAATACATATTTACAGACTATTCATCCATTTTTCAATGCAAGATTAAAACACAGGACAGATACTTA T 4541.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=2.474;DP=113;FS=2.525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=28.04;ReadPosRankSum=-2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,110:113:99:4579,332,0 +chr4 11993671 . C T 2625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.508;DP=163;FS=5.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,76:162:99:2654,0,2787 +chr4 11994210 . C T 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-1.400;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1511,0,1334 +chr4 12001862 . T C 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.218;DP=147;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:2214,0,2903 +chr4 12002262 . A T 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-1.136;DP=160;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.382;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:2951,0,2913 +chr4 12008602 . C A 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:307,24,0 +chr4 12011501 . G A 3839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.483;DP=228;FS=3.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,107:228:99:3868,0,4016 +chr4 12017966 . C T 2734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.149;DP=170;FS=0.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,78:170:99:2763,0,2983 +chr4 12020770 . G A 3368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=-0.161;DP=243;FS=0.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,110:242:99:3397,0,4210 +chr4 12021067 . CA C 1170.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-1.022;DP=72;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=16.26;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,35:70:99:1208,0,1190 +chr4 12021727 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.932;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,133 +chr4 12032438 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-1.297;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:449,0,585 +chr4 12033221 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,322 +chr4 12036024 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=-3.360;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=16.41;ReadPosRankSum=4.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:422,0,420 +chr4 12036098 . T G 1164.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:81:1193,81,0 +chr4 12036103 . C A 1164.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1193,81,0 +chr4 12036258 . G C 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=4.969;DP=102;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.146;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,31:102:99:815,0,2773 +chr4 12036418 . A C 2843.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2872,202,0 +chr4 12041286 . G A 3345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=-0.677;DP=195;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,102:194:99:3374,0,3469 +chr4 12041510 . G A 2873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=-0.422;DP=164;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,87:164:99:2902,0,2741 +chr4 12098570 . G A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=1.056;DP=46;FS=7.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=29.95;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1406,0,1046 +chr4 12098911 . A AT 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.844;DP=42;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:454,0,374 +chr4 12099146 . CT C 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.851;DP=35;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:324,0,615 +chr4 12099842 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-1.067;DP=40;FS=9.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:825,0,1319 +chr4 12100293 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.253;DP=42;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:753,0,1371 +chr4 12120899 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=2.037;DP=46;FS=8.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:640,0,948 +chr4 12120935 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=2.325;DP=39;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:313,0,1056 +chr4 12121852 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.814;DP=42;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:376,0,1033 +chr4 12127521 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.736;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:439,0,741 +chr4 12143866 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.869;ClippingRankSum=1.670;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:506,0,923 +chr4 12147422 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.837;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:658,0,819 +chr4 12166988 . C T 1692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.965;DP=87;FS=9.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.238;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,52:87:99:1721,0,1177 +chr4 12197349 . G A 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.582;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1296,0,718 +chr4 12481340 . C A 2584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.534;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=13.19;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,76:196:99:2613,0,4087 +chr4 12482869 . T C 4148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.115;DP=243;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,114:243:99:4177,0,4324 +chr4 12484767 . C T 2572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.663;DP=154;FS=8.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:2601,0,2741 +chr4 12489178 . C CA 3921.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:4307,426,0 +chr4 12489330 . AT A 1024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-1.754;DP=51;FS=7.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=20.09;ReadPosRankSum=2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,43:49:99:1062,0,167 +chr4 12522189 . C T 1768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.291;DP=102;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1797,0,1900 +chr4 12523692 . C T 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-1.780;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1502,0,1338 +chr4 12524009 . C G 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.987;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:1499,0,1957 +chr4 12525440 . AT A 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=-1.796;DP=101;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=3.51;ReadPosRankSum=4.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:392,0,1994 +chr4 12525513 . T G 1245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=-1.755;DP=93;FS=22.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:1274,0,1969 +chr4 12636265 . C T 2324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=2.776;DP=286;FS=3.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=8.13;ReadPosRankSum=-5.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,91:285:99:2353,0,7643 +chr4 12636298 . T C 2489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.765;ClippingRankSum=5.721;DP=299;FS=2.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,93:299:99:2518,0,7997 +chr4 12656281 . G A 2215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.614;DP=153;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,63:153:99:2244,0,3038 +chr4 12657803 . C G 1684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=1.059;DP=115;FS=6.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:1713,0,2342 +chr4 12660275 . G A 1875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.236;DP=103;FS=6.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1904,0,1553 +chr4 12660624 . T C 2452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.338;DP=158;FS=2.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:2481,0,2686 +chr4 12662369 . A G 2611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=1.223;DP=136;FS=14.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:2640,0,4934 +chr4 12664226 . CGTAAGTGACCTAAAAACCTGTTCATGCCTGTTCATTCGCTGCACCACATAACCGATGCTCTCCTCTTTCAG C 8223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=4.481;DP=188;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,181:188:99:8261,636,0 +chr4 12666054 . G A 2780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.265;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,82:193:99:2809,0,3629 +chr4 12692706 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-1.153;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:421,0,691 +chr4 12693107 . G A 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=-0.801;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:696,0,627 +chr4 12696470 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.278;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:755,0,656 +chr4 12696542 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.168;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:330,0,617 +chr4 12705450 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-2.919;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:706,0,1080 +chr4 12767180 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=2.313;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:484,0,364 +chr4 12772305 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-0.390;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:459,0,725 +chr4 12775116 . T TTGTTCCTGATC 941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-1.037;DP=54;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:979,0,874 +chr4 12793929 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,303 +chr4 12794119 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.147;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:453,0,374 +chr4 12794179 . C G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-1.721;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:254,0,413 +chr4 12794604 . C G 213.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:242,0,18 +chr4 12795006 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=1.299;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:251,0,874 +chr4 12795327 . C A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=1.493;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=19.00;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:997,0,773 +chr4 12817916 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.932;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:299,0,127 +chr4 12970335 . T C 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-1.528;DP=43;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:780,0,677 +chr4 12970533 . A T 1546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-2.298;DP=75;FS=12.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=20.62;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:1575,0,2112 +chr4 12970621 . T A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-0.742;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:750,0,879 +chr4 12970711 . T A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-2.827;DP=48;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:866,0,860 +chr4 12970836 . C T 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.490;DP=101;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=14.28;ReadPosRankSum=2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:1471,0,2010 +chr4 12971195 . T A 2101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.040;DP=109;FS=3.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:2130,0,1672 +chr4 12985565 . T C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.123;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:860,0,486 +chr4 13008492 . C T 3468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-1.586;DP=212;FS=3.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,100:210:99:3497,0,3521 +chr4 13008653 . T A 2763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.923;DP=175;FS=5.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,84:174:99:2792,0,2862 +chr4 13027776 . AT A 572.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=2.273;DP=46;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:610,0,404 +chr4 13029371 . C T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=2.154;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:686,0,1914 +chr4 13313683 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.481;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:455,0,981 +chr4 13314806 . G A 400.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-2.282;DP=14;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=28.58;ReadPosRankSum=2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:10:428,0,10 +chr4 13315610 . G A 3589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3618,250,0 +chr4 13425841 . G C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.478;DP=30;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:498,0,464 +chr4 13439605 . T C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=2.071;DP=58;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:547,0,1494 +chr4 13515187 . T C 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.238;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=31.19;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:808,0,103 +chr4 13515257 . TAA T 317.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:44:544,44,0 +chr4 13515493 . C T 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.000;DP=50;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:735,0,1087 +chr4 13521981 . G A 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=1.556;DP=94;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:1562,0,1715 +chr4 13536185 . A G 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.841;DP=96;FS=10.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,33:96:99:998,0,2013 +chr4 13551144 . A G 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.768;DP=65;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1170,0,1251 +chr4 13551393 . G A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:27:365,27,0 +chr4 13551402 . A G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:365,27,0 +chr4 13551471 . T A,C 1883.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,24,30:54:99:2050,1091,1022,972,0,946 +chr4 13552030 . T A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=3.548;DP=44;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=14.06;ReadPosRankSum=-3.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:647,0,751 +chr4 13711525 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:461,0,205 +chr4 13711532 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.650;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=28.85;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:461,0,205 +chr4 13777569 . C T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr4 13801884 . G GC 361.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:399,29,0 +chr4 13801886 . T A 370.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:29:399,29,0 +chr4 13965462 . T A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.278;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:828,0,615 +chr4 13978486 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:384,0,396 +chr4 13982166 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-1.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,1408 +chr4 13982172 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.132;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:249,0,1401 +chr4 13982741 . G T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:309,0,310 +chr4 13982767 . A AT 327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:365,35,0 +chr4 13983220 . T G 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-1.693;DP=61;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:684,0,1295 +chr4 13983370 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-2.132;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:233,0,1031 +chr4 13986155 . A G 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=1.995;DP=66;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1164,0,1118 +chr4 13988430 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.409;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:713,0,720 +chr4 13988553 . C G 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.842;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=13.53;ReadPosRankSum=-2.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:556,0,740 +chr4 13991228 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.184;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:481,0,795 +chr4 13994329 . G A 4950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=-0.062;DP=385;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=12.86;ReadPosRankSum=3.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,143:385:99:4979,0,8346 +chr4 13994559 . TGTGAGTCATGCATGCATGCATTCAAATGTACCTTCTAATTATACACAGCGGGCATTACATGTCTATGGACATCAGTTCAAAAATAATCTCTTTTAATTTCAG T 11805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=2.637;DP=301;FS=7.036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=28.57;ReadPosRankSum=-2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,289:294:99:11843,852,0 +chr4 13994824 . GAGGTAGGTGCCTTTTCTCTTCTGCATGAAGCTGTAATTAAAAAAAAAAGTGATTTAAGTGCAAGACAAATATGAATAAACACCATGTTTTGTGACTAACCT G 10382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.353;DP=310;FS=2.034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=33.49;ReadPosRankSum=-2.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,280:284:99:10420,816,0 +chr4 14001604 . A G 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.795;DP=117;FS=10.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1816,0,2006 +chr4 14003141 . G T 2218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=-0.676;DP=118;FS=3.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:2247,0,2113 +chr4 14008319 . G A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-1.581;DP=68;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=17.22;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1199,0,1221 +chr4 14013542 . C T 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.623;DP=79;FS=3.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1424,0,1363 +chr4 14014158 . T C 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.428;DP=75;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1214,0,1372 +chr4 14022904 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=1.583;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:540,0,696 +chr4 14029420 . A G 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-0.120;DP=57;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1067,0,1003 +chr4 14031574 . ACAGGTCAGGGTTAATTATATAATTATATATGCTTATAGTGCATCATAAAGTTCTGTATGATTTTACTTTTTTTTTTTGGCTTATGTGAT A 1739.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=1.480;DP=56;FS=6.646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=31.07;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:1777,147,0 +chr4 14033500 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.780;DP=43;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:366,0,1171 +chr4 14037508 . C T 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-0.709;DP=139;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,44:139:99:1782,0,3213 +chr4 14037532 . T A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.007;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.808;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,42:133:99:944,0,7177 +chr4 14038571 . G T 2433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.436;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:2462,0,2458 +chr4 14040692 . C T 2634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.310;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:2663,0,3004 +chr4 14040736 . C T 3007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=-1.111;DP=181;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,100:181:99:3036,0,2862 +chr4 14041939 . C T 3554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=1.353;DP=206;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,111:206:99:3583,0,3389 +chr4 14042037 . T C 8459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:8488,608,0 +chr4 14042355 . T C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=4.387;DP=76;FS=8.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=15.51;ReadPosRankSum=-3.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:1207,0,1503 +chr4 14042391 . C T 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-1.911;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=33.10;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:988,0,246 +chr4 14042501 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.200;DP=59;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:661,0,1408 +chr4 14042692 . C A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.083;DP=35;FS=10.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:652,0,579 +chr4 14043360 . C A 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=1.235;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:874,0,817 +chr4 14044382 . CT C 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.354;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:292,0,321 +chr4 14044621 . T C 1020.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:75:1049,75,0 +chr4 14044930 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=1.283;DP=41;FS=9.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:638,0,1794 +chr4 14044978 . T A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.761;DP=53;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:617,0,1325 +chr4 14048252 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=-1.063;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:484,0,872 +chr4 14054896 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.157;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,693 +chr4 14056957 . A AT 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-1.132;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:329,0,1105 +chr4 14057473 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.684;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:312,0,410 +chr4 14058325 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.682;DP=34;FS=29.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:531,0,1374 +chr4 14058326 . T G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.087;DP=34;FS=29.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:531,0,1374 +chr4 14058530 . C CA 657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.653;DP=66;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:702,0,792 +chr4 14060685 . G T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=1.042;DP=55;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:624,0,1133 +chr4 14069153 . G A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.665;DP=38;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:752,0,527 +chr4 14071770 . C A 2096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.209;DP=141;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=14.87;ReadPosRankSum=3.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:2125,0,2478 +chr4 14072821 . C CT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.245;DP=119;FS=9.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=2.01;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:276,0,2336 +chr4 14074635 . C T 2282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.510;DP=148;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.622;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:2311,0,2427 +chr4 14075949 . A G 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-2.209;DP=93;FS=0.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:1441,0,1749 +chr4 14076049 . C CT 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.365;DP=62;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:281,0,2295 +chr4 14123386 . G GT 1577.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-1.430;DP=218;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,95:216:99:1615,0,9880 +chr4 14123398 . C T 5634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=-1.871;DP=222;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=25.38;ReadPosRankSum=2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,120:222:99:5663,0,6114 +chr4 14123469 . GT G 1852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.660;DP=214;FS=10.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,82:197:99:1890,0,2541 +chr4 14123704 . T C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=4.572;DP=144;FS=4.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,37:144:99:855,0,4215 +chr4 14123740 . A C 4218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-3.484;DP=132;FS=6.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=31.96;ReadPosRankSum=3.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,103:132:99:4247,0,1873 +chr4 14123749 . C T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=4.481;DP=143;FS=5.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:1001,0,8275 +chr4 14123903 . T A 2839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=-1.197;DP=167;FS=0.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,80:167:99:2868,0,2746 +chr4 14124053 . CAA C,CA 322.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.274;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,11,7:19:99:518,164,165,288,0,273 +chr4 14124393 . T G 3385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-1.103;DP=186;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,92:184:99:3414,0,3398 +chr4 14125512 . C CA 2131.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=-2.158;DP=160;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:2530,0,2226 +chr4 14146949 . C T 2073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.790;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:2102,0,2263 +chr4 14147270 . TA T 1983.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-1.392;DP=131;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:2021,0,2281 +chr4 14147418 . C T 4013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=0.401;DP=94;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=27.19;ReadPosRankSum=-2.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,64:94:99:4042,0,313 +chr4 14147669 . A G 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.611;DP=88;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1715,0,1407 +chr4 14147965 . C CA 1286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-1.672;DP=114;FS=19.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1324,0,1719 +chr4 14162019 . A G 3287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.467;DP=202;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,99:201:99:3316,0,3373 +chr4 14164832 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.171;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.67;ReadPosRankSum=-2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:309,0,3205 +chr4 14166884 . G A 2716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.520;DP=175;FS=4.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,79:174:99:2745,0,3086 +chr4 14168279 . TA T 342.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.873;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:13:380,0,13 +chr4 14200882 . A G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr4 14283551 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=1.277;DP=51;FS=6.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:355,0,1436 +chr4 14284540 . C CT 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.502;DP=45;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:669,0,218 +chr4 14285756 . TTG T 1220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.594;DP=42;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=29.07;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,31:41:99:1258,0,219 +chr4 14285968 . G GT 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=-1.189;DP=67;FS=5.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:504,0,772 +chr4 14286171 . C CT 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.827;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:718,0,733 +chr4 14485872 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=-0.740;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=15.55;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:1008,0,1121 +chr4 14555855 . G T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.769;DP=84;FS=3.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1021,0,1850 +chr4 14555978 . C G 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=-0.550;DP=106;FS=1.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,37:106:99:1178,0,2362 +chr4 14556076 . A C 1824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.721;DP=128;FS=1.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1853,0,2355 +chr4 14721467 . C T 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-0.147;DP=74;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,42:74:99:1407,0,1192 +chr4 14882622 . G GA 546.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:584,39,0 +chr4 14997019 . T A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.334;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:699,0,930 +chr4 15005161 . AGTGAGTGTGGAACATTGATAGCATTTTGAACACAGTCAATGTAACCTTACACTTTTGAGGCATTTGGATGCAAAGACTTTTTAGTTACATGCACGCTTCTGTCTTTATAG A 1636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.933;DP=47;FS=2.559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=34.82;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:88:1674,88,0 +chr4 15050151 . G GGGTGAGC 13307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,300:300:99:13345,942,0 +chr4 15063535 . ACTGAGGAAGAGACAAATAATAGTTGGCAATGGTTATGATTAGCACTGCAGATACAATGGAGACATTTGCTCAC A 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=2.807;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=28.92;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:471,0,1906 +chr4 15388405 . G A 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.208;DP=94;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.459;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:1644,0,3314 +chr4 15388589 . A G 2114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.938;DP=155;FS=13.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,60:155:99:2143,0,3350 +chr4 15388771 . T TA 1207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.031;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1245,0,3344 +chr4 15407336 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.940;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:440,0,696 +chr4 15407347 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-1.177;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:378,0,714 +chr4 15437161 . G A 2846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.382;DP=190;FS=6.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,82:190:99:2875,0,3590 +chr4 15437217 . T A 2581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-1.138;DP=187;FS=4.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,81:187:99:2610,0,3094 +chr4 15437745 . T TG 1219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-1.311;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:1257,0,2117 +chr4 15437760 . T A 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-2.058;DP=134;FS=2.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=12.55;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1710,0,3127 +chr4 15604530 . C CG 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.566;DP=125;FS=24.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:530,0,1427 +chr4 15789762 . TGGTGAGCCACCAACATACTATCAGTAACAGCCCATGACACTGTCAGTATAAAAATAAAATTAAAAAATTTCTACA T 1326.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.462;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:99:1364,117,0 +chr4 15962539 . CAAAACACGATTTAAAATTACACAAATCCAATTCGTAACTTT C 1122.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.284;DP=95;FS=2.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1160,0,3918 +chr4 15962854 . TCCA T 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=3.138;DP=49;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=8.85;ReadPosRankSum=-2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,10:49:99:471,0,6654 +chr4 15962858 . TTTCATAACTTCAAAACACGATTCAAAAATACACAAATC T 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=4.103;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=7.00;ReadPosRankSum=-2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:471,0,6654 +chr4 16693598 . G A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr4 16729455 . CT C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-1.271;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:276,0,227 +chr4 16776255 . A T 3125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.856;DP=185;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,88:185:99:3154,0,3341 +chr4 16984031 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.056;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:874,0,1033 +chr4 17067304 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=-0.794;DP=32;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:724,0,391 +chr4 17187720 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:274,0,473 +chr4 17202368 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:247,0,390 +chr4 17269724 . C G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.908;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:451,0,334 +chr4 17269822 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:422,0,399 +chr4 17303566 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.985;DP=41;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=15.26;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:654,0,766 +chr4 17317303 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.497;DP=43;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:552,0,1857 +chr4 17349162 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.283;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:282,0,906 +chr4 17484646 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,160 +chr4 17496341 . TC T 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:271,0,418 +chr4 17498363 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.220;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.28;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:373,0,260 +chr4 17498699 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:236,0,97 +chr4 17499487 . AG A 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-0.765;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:309,0,1139 +chr4 17499890 . A T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=-0.464;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:457,0,528 +chr4 17500547 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.403;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:371,0,448 +chr4 17510235 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.117;DP=49;FS=5.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:606,0,2491 +chr4 17510241 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=1.345;DP=48;FS=5.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:606,0,2437 +chr4 17517095 . TGGTATGAGAGCTTACCACTCAATTACACTAGAAAAATGTCATGATTTGGACAGTGCAAGTTTATTCACTGTGATTCCTCTCTATGTA T 2589.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.670;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.060;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2627,238,0 +chr4 17560477 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:70:241,0,70 +chr4 17568283 . A C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.651;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:453,0,363 +chr4 17569528 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=1.181;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=30.29;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:79:634,0,79 +chr4 17571577 . G C 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1007,75,0 +chr4 17573743 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=-0.551;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:608,0,359 +chr4 17574119 . G C 1349.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:96:1378,96,0 +chr4 17574129 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.158;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=26.83;ReadPosRankSum=-1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:860,0,206 +chr4 17575380 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.348;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:545,0,651 +chr4 17578662 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.250;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:491,0,687 +chr4 17661100 . T A 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-0.311;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:898,0,960 +chr4 17661148 . GT G 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.472;DP=70;FS=5.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:760,0,717 +chr4 17662158 . T TA 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-1.613;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=27.24;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:21:473,0,21 +chr4 17662173 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:28:369,0,28 +chr4 17662958 . TCTATTGGGAGAACGTAGATGGTGTTAGAAAAGGTCGCTTTCGCGAACGGAGAGACGTCCGAGCCGCGAAACATTTAC T 2640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.998;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=31.82;ReadPosRankSum=2.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,62:81:99:2678,0,7854 +chr4 17663055 . T C 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=-1.561;DP=78;FS=9.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:1206,0,1138 +chr4 17663104 . G A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-1.892;DP=95;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:1503,0,1637 +chr4 17663367 . C G 2066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.886;DP=133;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:2095,0,2292 +chr4 17685123 . C G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-2.546;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:337,0,138 +chr4 17789131 . G T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.417;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=12.82;ReadPosRankSum=2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:323,0,506 +chr4 17810044 . C G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.493;DP=30;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:563,0,549 +chr4 17827482 . C T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:694,51,0 +chr4 17834799 . G T 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr4 17841083 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,171 +chr4 17907935 . AACCTTTTGAGAGAAACAGTGATCAGAAAGCGAGCCGGGCAACATAACACATCAAAATGTTCGTGATAATATGAGGACTGTTTTACACCCACATT A 2596.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.678;DP=65;FS=3.148;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=33.79;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:2634,208,0 +chr4 17921138 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,155 +chr4 17922491 . GA G 2363.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.425;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:2401,242,0 +chr4 18056252 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=-0.668;DP=22;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.471;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:450,0,276 +chr4 18056268 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-1.082;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=23.04;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:512,0,199 +chr4 18199136 . C T 201.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:230,0,21 +chr4 18331688 . C CAT 2220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.363;DP=156;FS=10.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:2258,0,2208 +chr4 18470176 . TTG T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.181;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,447 +chr4 18701746 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.162;DP=34;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:393,0,789 +chr4 18701794 . G C 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.656;DP=44;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:907,0,652 +chr4 18983576 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.146;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:381,0,1067 +chr4 18983597 . CT C 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.640;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:494,0,606 +chr4 18983938 . G A 1767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=3.303;DP=120;FS=5.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=14.73;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:1796,0,2384 +chr4 18985903 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.386;DP=60;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:1043,0,2215 +chr4 18985906 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.565;DP=60;FS=7.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:1043,0,2189 +chr4 19004161 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.103;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:637,0,587 +chr4 19011312 . CACCTGCAGAGAAAATCAGATTTCAGATATCTTTGATGCAAAAACCTATTAATCAGGAGTGATGTAAGAACTAGAAACAATT C 1327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.584;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=26.96;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:99:1365,113,0 +chr4 19033355 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=-0.803;DP=23;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:55:417,0,55 +chr4 19033634 . AT A 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.026;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:336,0,769 +chr4 19033679 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.929;DP=34;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:493,0,554 +chr4 19034161 . G GT 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-0.998;DP=30;FS=8.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:300,0,396 +chr4 19034628 . G GT 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.610;DP=34;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:331,0,490 +chr4 19036655 . CA C 643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.784;DP=64;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:681,0,712 +chr4 19085666 . C G 2017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-2.170;DP=147;FS=6.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=13.73;ReadPosRankSum=2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,60:147:99:2046,0,2867 +chr4 19201691 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.249;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:382,0,332 +chr4 19202761 . A AC 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.047;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:324,0,205 +chr4 19203617 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:355,0,219 +chr4 19238955 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.626;DP=34;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=24.61;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:865,0,336 +chr4 19239074 . G GA 428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:466,32,0 +chr4 19408230 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:358,0,333 +chr4 19413057 . G GCT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-1.445;DP=21;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:256,0,378 +chr4 19413758 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.754;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:444,0,411 +chr4 19414892 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:292,0,221 +chr4 19441730 . T TA 277.08 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:20:327,0,20 +chr4 19442601 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.304;DP=31;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:440,0,686 +chr4 19838480 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.572;DP=30;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:408,0,633 +chr4 19838546 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.734;DP=35;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=11.82;ReadPosRankSum=2.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:442,0,725 +chr4 19838945 . C T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=2.918;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:748,0,718 +chr4 19839082 . G A 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.172;DP=43;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=30.11;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1680,0,354 +chr4 19923301 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:295,0,249 +chr4 19923662 . G GA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-1.680;DP=47;FS=4.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:395,0,534 +chr4 19924220 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-1.557;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=21.04;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:470,0,283 +chr4 19924565 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=1.200;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=23.55;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:923,0,478 +chr4 20225520 . G GTT 392.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:620,48,0 +chr4 20247876 . G A 1350.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1379,96,0 +chr4 20248030 . T TA 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=1.133;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,38:44:43:789,0,43 +chr4 20259374 . G GATA 249.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:19:287,19,0 +chr4 20425254 . G C 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:649,51,0 +chr4 20658034 . A C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,306 +chr4 20688724 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=-1.513;DP=38;FS=7.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:325,0,1054 +chr4 20894509 . T C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.401;DP=48;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:669,0,1005 +chr4 20898429 . A C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:87:400,0,87 +chr4 20919211 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:232,0,141 +chr4 20920706 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:274,0,56 +chr4 20969094 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=1.844;DP=37;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:613,0,669 +chr4 20976495 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.525;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:681,0,538 +chr4 21172266 . C T 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 +chr4 21235150 . C T 2415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.474;DP=148;FS=2.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:2444,0,2623 +chr4 21249046 . T A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=2.669;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=14.99;ReadPosRankSum=-2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:448,0,538 +chr4 21249264 . T G 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.393;DP=81;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,44:81:99:1457,0,1327 +chr4 21249283 . A G 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.989;DP=83;FS=7.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1421,0,1451 +chr4 21249452 . A G 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-1.363;DP=40;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.77;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1139,0,273 +chr4 21251718 . GCTGAGATACACGGAAGTACATAATTGATATGATGCAAATAAATTAGATAGAATCAAATCCCCTACATTTTAGATTTATTAACAGCATAC G 4142.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.224;DP=123;FS=8.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,110:117:99:4180,0,485 +chr4 21254937 . T A 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.030;DP=78;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1560,0,2523 +chr4 21254938 . C T 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.334;DP=80;FS=4.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:1560,0,2523 +chr4 21255745 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=1.366;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:978,0,836 +chr4 21256970 . T A 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.809;DP=62;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1217,0,998 +chr4 21263347 . A T 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.275;DP=62;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1061,0,1067 +chr4 21263793 . C A 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-0.450;DP=59;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1172,0,870 +chr4 21270800 . T C 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=2.588;DP=58;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1143,0,1826 +chr4 21270803 . C T 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=3.445;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1143,0,1826 +chr4 21289034 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:266,0,62 +chr4 21290004 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.161;DP=38;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:326,0,1084 +chr4 21291613 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=1.859;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:389,0,784 +chr4 21295094 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.964;DP=44;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:897,0,588 +chr4 21299796 . T G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.875;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:511,0,440 +chr4 21301209 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.854;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=23.40;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:426,0,186 +chr4 21354719 . C A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-0.450;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:709,0,761 +chr4 21361486 . T A 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.509;DP=119;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:99:1300,0,2621 +chr4 21376020 . G A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.159;DP=107;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1743,0,1828 +chr4 21413817 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.676;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:505,0,507 +chr4 21415982 . G A 7554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.309;DP=407;FS=2.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=18.56;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,240:407:99:7583,0,5480 +chr4 21418487 . T TC 1243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.423;DP=57;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=21.82;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1281,0,1401 +chr4 21419017 . AT A 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-1.346;DP=49;FS=6.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:462,0,500 +chr4 21419377 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-0.825;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:776,0,509 +chr4 21419633 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=-2.454;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:281,0,338 +chr4 21419861 . A AT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.871;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:383,0,152 +chr4 21420366 . A T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.292;DP=49;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:890,0,897 +chr4 21420815 . G A 2250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=1.093;DP=109;FS=6.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,67:109:99:2279,0,1438 +chr4 21421056 . G A 1806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-1.147;DP=66;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,47:66:99:1835,0,494 +chr4 21567362 . T C 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.365;DP=42;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:718,0,706 +chr4 21577290 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=-0.477;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:642,0,758 +chr4 21588927 . T G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.345;DP=32;FS=5.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:458,0,631 +chr4 21590390 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=-1.664;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:254,0,424 +chr4 21590816 . T A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,365 +chr4 21590941 . CTG C 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.631;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=16.07;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:423,0,454 +chr4 21644837 . C T 3366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.803;DP=199;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=16.92;ReadPosRankSum=4.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,93:199:99:3395,0,3581 +chr4 21649386 . A G 2823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=2.199;DP=144;FS=15.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,83:144:99:2852,0,2201 +chr4 21670088 . G A 2101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.920;DP=135;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:2130,0,2363 +chr4 21674602 . T A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-3.383;DP=102;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:1007,0,4624 +chr4 21674603 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-3.531;DP=104;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:1007,0,4624 +chr4 21690208 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:259,0,61 +chr4 21722027 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.899;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:318,0,354 +chr4 21808999 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=2.174;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:232,0,389 +chr4 22708729 . G A 343.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=28.60;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:371,0,10 +chr4 22710522 . G T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.402;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:686,0,487 +chr4 22817853 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=3.602;DP=91;FS=5.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:245,0,3110 +chr4 22819150 . G GT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-2.015;DP=109;FS=11.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=1.84;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:238,0,1990 +chr4 22820757 . A ATG 2515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-1.858;DP=304;FS=36.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,89:242:99:2553,0,4629 +chr4 22848925 . G A 4427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=-2.450;DP=291;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,141:290:99:4456,0,4564 +chr4 24147518 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,273 +chr4 24171470 . GT G 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.800;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:244,0,500 +chr4 24177151 . C T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.884;DP=97;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.458;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1450,0,1561 +chr4 24192811 . C A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=2.072;DP=59;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:353,0,1567 +chr4 24192836 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=2.947;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:349,0,1418 +chr4 24193158 . G T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.077;DP=90;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:1519,0,1576 +chr4 24337168 . TCA T 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.574;DP=31;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:323,0,637 +chr4 24339249 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-2.887;DP=57;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:257,0,1726 +chr4 24516444 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:533,42,0 +chr4 24694865 . T A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.119;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=16.57;ReadPosRankSum=1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:890,0,934 +chr4 24720326 . A T 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 +chr4 24725099 . G A 1886.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1915,129,0 +chr4 24734513 . G A 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.399;DP=68;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,34:68:99:1178,0,1230 +chr4 24774544 . CGTAAGTTTGACTTCAGCATGTTTTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTTGTAATTATCAGTTCCGTTTTCAG C 5034.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=1.202;DP=136;FS=3.007;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,132:136:99:5072,387,0 +chr4 24777251 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.036;DP=45;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:391,0,1161 +chr4 24791720 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,254 +chr4 24814906 . G T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-1.141;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=22.57;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:773,0,409 +chr4 24818341 . A G 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-2.678;DP=53;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=16.58;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:907,0,950 +chr4 24821557 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.078;DP=37;FS=5.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:512,0,1592 +chr4 24821632 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.964;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:480,0,906 +chr4 24821735 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-2.046;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:297,0,754 +chr4 24826857 . A G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=2.195;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:770,0,584 +chr4 24829851 . G A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.174;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:931,0,956 +chr4 24838567 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.18;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47:310,0,47 +chr4 24842334 . G GA 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.594;DP=51;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:629,0,752 +chr4 24937299 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr4 24948671 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-1.309;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,187 +chr4 24948932 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:405,0,96 +chr4 24949202 . T A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.224;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:442,0,441 +chr4 24995365 . A T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-0.668;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:289,0,423 +chr4 25020752 . T A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-0.124;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=25.59;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:540,0,147 +chr4 25033556 . A C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.847;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:561,0,561 +chr4 25033942 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.376;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:353,0,485 +chr4 25033969 . G T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=-0.361;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:512,0,584 +chr4 25039594 . C T 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.191;DP=36;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:782,0,392 +chr4 25099494 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.206;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:542,0,447 +chr4 25103731 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=32.67;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:453,0,525 +chr4 25106702 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,620 +chr4 25106703 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,620 +chr4 25107224 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,291 +chr4 25115850 . G A 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.746;DP=74;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=17.21;ReadPosRankSum=2.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1302,0,1274 +chr4 25116203 . G T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=1.544;DP=59;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,37:59:99:1261,0,766 +chr4 25119854 . C T 1576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.918;DP=88;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:1605,0,1492 +chr4 25126768 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:387,0,777 +chr4 25130991 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.136;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:715,0,415 +chr4 25131039 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.319;DP=40;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:710,0,603 +chr4 25136577 . T A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-2.023;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=21.36;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:669,0,378 +chr4 25136690 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:272,0,139 +chr4 25137663 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-2.140;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=21.39;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,299 +chr4 25137957 . A T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=1.890;DP=20;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:435,0,300 +chr4 25152377 . T G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=1.093;DP=46;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:633,0,904 +chr4 25154540 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.126;DP=42;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:728,0,731 +chr4 25162632 . C A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=1.568;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:606,0,602 +chr4 25162754 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=1.429;DP=39;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:399,0,1188 +chr4 25162817 . GGGTGAGTGCATCTTAGCCATTGAATACATTTTGGGATTGCTCGGTTTTGCTGATGGAGGTCAGAGGGTTGTTGACATCAGAGCTGTTGTTTGTGGTGTGTTTA G 1112.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=1.280;DP=35;FS=8.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=31.79;ReadPosRankSum=-1.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:99:1150,0,754 +chr4 25166880 . G T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:295,0,340 +chr4 25167371 . T A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-1.219;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:612,0,895 +chr4 25167646 . A T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.013;DP=33;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:430,0,695 +chr4 25168146 . T TA 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=-0.331;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:446,0,1329 +chr4 25168148 . T A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.214;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:446,0,1330 +chr4 25456668 . TC T 825.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.044;DP=62;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:863,0,825 +chr4 25456711 . G T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-0.392;DP=54;FS=3.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:763,0,1145 +chr4 25457200 . T G 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.441;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:894,0,985 +chr4 25457403 . CA C 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.437;DP=46;FS=2.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:430,0,522 +chr4 25457662 . C T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-0.499;DP=53;FS=5.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:732,0,836 +chr4 25457987 . T A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=-0.327;DP=74;FS=15.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:861,0,1469 +chr4 25458049 . T A 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.330;DP=54;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:912,0,871 +chr4 25458399 . A T 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=2.647;DP=69;FS=8.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,34:69:99:1208,0,1261 +chr4 25458680 . G A 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.369;DP=86;FS=10.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1527,0,1574 +chr4 25475467 . G A 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.631;DP=78;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=21.00;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,49:78:99:1666,0,1016 +chr4 25476896 . A C 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.279;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:936,0,912 +chr4 25476962 . T C 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.555;DP=70;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1335,0,993 +chr4 25517549 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:230,0,441 +chr4 25643602 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=1.139;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=20.30;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:353,0,203 +chr4 25643649 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:301,0,346 +chr4 25768669 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:259,0,372 +chr4 26118697 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr4 26227380 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.623;DP=14;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:79:382,0,79 +chr4 26227448 . C T 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 +chr4 26401634 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-0.316;DP=37;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:318,0,1014 +chr4 26410158 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.362;DP=81;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:1460,0,1449 +chr4 26410395 . A G 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.712;DP=79;FS=5.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1398,0,1342 +chr4 26411638 . C G 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=1.310;DP=79;FS=4.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1366,0,1355 +chr4 26445463 . C T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.191;DP=46;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:1004,0,647 +chr4 26548913 . C A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:304,0,259 +chr4 26597643 . T G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,250 +chr4 26924043 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=1.361;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=27.24;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:573,0,389 +chr4 26924045 . T C 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=1.526;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=27.24;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:573,0,389 +chr4 26924944 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-1.087;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:412,0,248 +chr4 27242718 . A T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.949;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=22.49;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:568,0,255 +chr4 27251376 . C A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=30.72;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:612,0,106 +chr4 27252533 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.237;DP=26;FS=9.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:324,0,570 +chr4 27253619 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=-2.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,259 +chr4 27502329 . C G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.826;DP=42;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:646,0,825 +chr4 27505909 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.094;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=13.82;ReadPosRankSum=2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:512,0,737 +chr4 27520967 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-1.610;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:504,0,899 +chr4 27526168 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=2.123;DP=38;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:438,0,869 +chr4 27527592 . G A 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.462;DP=51;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:884,0,951 +chr4 27528806 . G A 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.251;DP=54;FS=3.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:863,0,886 +chr4 27543139 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=1.021;DP=52;FS=11.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:443,0,1329 +chr4 27589181 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=3.522;DP=39;FS=15.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:273,0,1086 +chr4 27645228 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-1.082;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:361,0,521 +chr4 27670325 . C A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.142;DP=71;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1079,0,1365 +chr4 27676371 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=1.740;DP=38;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:256,0,1133 +chr4 27677519 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-2.434;DP=43;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=11.20;ReadPosRankSum=3.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:510,0,941 +chr4 27689408 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.593;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=21.91;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:598,0,299 +chr4 27689779 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-1.141;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:451,0,625 +chr4 27690567 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=2.083;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=24.21;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:343,0,128 +chr4 27730139 . A C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.31;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,188 +chr4 27734138 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:280,0,281 +chr4 27753295 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.484;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:272,0,529 +chr4 27762115 . CTG C 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.466;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:334,0,123 +chr4 27780200 . G A 335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:364,30,0 +chr4 27939324 . T C 529.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=1.504;DP=15;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=32.25;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:3:556,3,0 +chr4 27942581 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.936;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,536 +chr4 28027506 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=34.75;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:98:341,0,98 +chr4 28027510 . A C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-0.348;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=26.06;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:98:341,0,98 +chr4 28027659 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr4 28028050 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr4 28028553 . TA T 377.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-0.248;DP=15;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:8:414,8,0 +chr4 28028834 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=1.086;DP=18;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:436,0,44 +chr4 28032870 . A T 849.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:878,63,0 +chr4 28032906 . A C 403.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.134;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=28.79;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:12:431,12,0 +chr4 28128995 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.28;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:33:301,0,33 +chr4 28143939 . T G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr4 28146265 . C T 905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:934,66,0 +chr4 28146345 . T C 725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:754,54,0 +chr4 28160246 . G A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr4 28175885 . T C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:75:443,0,75 +chr4 28282928 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,149 +chr4 28473803 . C T 524.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.810;DP=15;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=34.95;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:550,0,1 +chr4 28474012 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:259,0,346 +chr4 28485702 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:508,0,396 +chr4 28486977 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=1.113;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:517,0,518 +chr4 28487595 . G C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,526 +chr4 28995415 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.798;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:503,0,1504 +chr4 28996677 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.988;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:339,0,388 +chr4 29159276 . T C 557.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:586,42,0 +chr4 29173877 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=12;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:91:232,0,91 +chr4 29174201 . A G 317.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.696;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=26.49;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:346,0,16 +chr4 29174207 . A G 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr4 29174372 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.637;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:267,0,144 +chr4 29174762 . T G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:263,0,61 +chr4 29282332 . T G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.133;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:528,0,149 +chr4 29282561 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,100 +chr4 29282761 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=1.791;DP=15;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,217 +chr4 29282800 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=16.34;ReadPosRankSum=-2.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,267 +chr4 29282959 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=17.91;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,170 +chr4 29531989 . G A 359.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.72;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:2:386,0,2 +chr4 29569351 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.365;DP=11;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,297 +chr4 29569356 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=11;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,217 +chr4 29641701 . C T 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.048;DP=113;FS=5.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1930,0,2009 +chr4 29661273 . C T 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.174;DP=112;FS=8.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:1631,0,2239 +chr4 29661370 . G A 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-1.688;DP=150;FS=5.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,56:150:99:1962,0,3295 +chr4 29997872 . G A 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 +chr4 30124757 . C CT 410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:448,36,0 +chr4 30125751 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr4 30212342 . A G 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:446,30,0 +chr4 30305339 . T C 287.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:316,0,18 +chr4 30771641 . G C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,277 +chr4 31149038 . C A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:354,0,254 +chr4 31302036 . C A 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 +chr4 31324135 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.503;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=31.30;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:623,0,127 +chr4 31337196 . T C 246 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +chr4 31337210 . C T 294.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:323,0,15 +chr4 31391125 . A G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 +chr4 31499846 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.179;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:273,0,53 +chr4 31582258 . T A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:440,33,0 +chr4 31582463 . G T 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 +chr4 31647605 . G T 2473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=-1.732;DP=59;FS=9.258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=34.05;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:2502,176,0 +chr4 31778318 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.467;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:90:434,0,90 +chr4 31805658 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:269,0,61 +chr4 32116679 . A G 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 +chr4 32116695 . A T 225.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:254,21,0 +chr4 32118928 . C T 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:631,48,0 +chr4 32119030 . G A 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 +chr4 32233492 . T C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 +chr4 32747485 . C A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr4 33040509 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:229,0,61 +chr4 33145652 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.98;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:268,0,100 +chr4 33148427 . T G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.808;DP=57;FS=8.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:385,0,2003 +chr4 34154328 . A G 344.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=31.36;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:373,0,13 +chr4 34154358 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:318,0,51 +chr4 34188865 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:70:241,0,70 +chr4 34249126 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:303,0,132 +chr4 34249154 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=25.91;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:391,0,124 +chr4 34459168 . T G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr4 34460686 . T A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr4 34470699 . C T 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr4 34470842 . C A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 +chr4 34474399 . A T 376.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=34.18;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:404,0,12 +chr4 34621361 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:298,0,96 +chr4 34622491 . A T 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.771;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=23.37;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:99:1418,0,4115 +chr4 34622535 . A G 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-2.884;DP=59;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=23.56;ReadPosRankSum=-2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:1418,0,4202 +chr4 34622567 . C T 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=1.726;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:1418,0,4299 +chr4 34622573 . C T 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.088;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=19.04;ReadPosRankSum=3.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:1418,0,4222 +chr4 34622681 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.285;DP=72;FS=4.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:251,0,5936 +chr4 34622782 . T A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.263;DP=39;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:372,0,651 +chr4 34682598 . G T 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 +chr4 34837889 . T C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 +chr4 34837912 . A G 422.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:448,0,1 +chr4 34838088 . G A 887.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=2.154;DP=25;FS=10.969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=28.14;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:27:916,27,0 +chr4 34838193 . T A 4689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:4718,328,0 +chr4 34838265 . AG A 1602.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=1.032;DP=56;FS=12.497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,48:54:9:1639,9,0 +chr4 34838636 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr4 34838729 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.898;DP=33;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:402,0,478 +chr4 34839082 . C T 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-1.734;DP=26;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=33.64;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:903,66,0 +chr4 34839121 . C T 3522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3551,247,0 +chr4 34841139 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.894;DP=25;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=28.03;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:60:729,0,60 +chr4 34841676 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:345,0,213 +chr4 34841824 . C A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.907;DP=46;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:609,0,1103 +chr4 34841890 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.733;ClippingRankSum=-0.350;DP=79;FS=64.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:577,0,2244 +chr4 34841955 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=2.221;DP=249;FS=32.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,41:246:99:510,0,9136 +chr4 34857573 . T G 230.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:259,0,18 +chr4 34899394 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:341,0,271 +chr4 34899547 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:391,0,136 +chr4 34900212 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,194 +chr4 35086118 . T A 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 +chr4 35086159 . T A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr4 35088296 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:34:319,0,34 +chr4 35088404 . G A 665.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-1.197;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:15:694,15,0 +chr4 35088736 . A T 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:720,48,0 +chr4 35088737 . A T 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:720,48,0 +chr4 35094912 . C T 3190.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:3219,226,0 +chr4 35095007 . A C 4623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:4652,328,0 +chr4 35279109 . C G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:303,0,57 +chr4 35644126 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,130 +chr4 35644330 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=1.448;DP=18;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:259,0,246 +chr4 35644641 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.722;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,317 +chr4 35644857 . C A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.903;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:510,0,437 +chr4 36115254 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.211;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,713 +chr4 36291173 . C A 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 +chr4 36292322 . G T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.483;DP=42;FS=7.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:575,0,789 +chr4 36292418 . T TA 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.445;DP=23;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=10.38;ReadPosRankSum=2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:276,0,576 +chr4 36292710 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:252,0,371 +chr4 36293956 . CT C 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=1.200;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:315,0,237 +chr4 36346612 . G T 299.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:328,0,13 +chr4 36346698 . A G 244.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:273,0,15 +chr4 36346947 . G T 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:769,54,0 +chr4 36347488 . C T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr4 36409956 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:233,0,52 +chr4 36570613 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr4 36578395 . A G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr4 36646651 . T G 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:28:434,28,0 +chr4 36646729 . A G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.441;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=29.94;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:68:597,0,68 +chr4 36646840 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-2.509;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:648,0,934 +chr4 36647018 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=29.30;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:96:314,0,96 +chr4 36647121 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-1.639;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.014;QD=24.10;ReadPosRankSum=2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:462,0,168 +chr4 36647333 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.761;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:90:384,0,90 +chr4 36647406 . G C,T 224.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,3:9:97:335,115,97,222,0,213 +chr4 36647884 . A T 364.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:393,0,13 +chr4 36648102 . C T 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 +chr4 36714264 . C G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr4 36857898 . T G 280.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:309,24,0 +chr4 37243326 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,233 +chr4 37501022 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.915;DP=48;FS=18.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:303,0,1189 +chr4 37501073 . A G 2508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2537,181,0 +chr4 37502046 . G T 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 +chr4 37502869 . A G 1041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:78:1070,78,0 +chr4 37502881 . G A 357.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,1:2:20:386,20,0 +chr4 37504614 . T C 210.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=21;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:239,0,23 +chr4 37504661 . A T 251.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:280,0,16 +chr4 37572382 . C T 378.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:407,30,0 +chr4 37572452 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 +chr4 37574216 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr4 37576534 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr4 37649553 . C G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.370;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:356,0,95 +chr4 37693469 . A C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.087;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:592,0,115 +chr4 37881461 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.783;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:527,0,621 +chr4 37881527 . A G 570.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=26.61;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:597,2,0 +chr4 38079623 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:232,0,58 +chr4 38079936 . A G 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 +chr4 38104838 . C T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr4 38578678 . C T 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 +chr4 38616927 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,334 +chr4 38796781 . C G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr4 38946923 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 +chr4 38946984 . G C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:855,60,0 +chr4 38949069 . T C 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:999,75,0 +chr4 38949143 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr4 38952172 . T C 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:681,51,0 +chr4 38952277 . G T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:243,18,0 +chr4 38953011 . A T 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:466,33,0 +chr4 39122459 . G C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.320;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:309,0,447 +chr4 39122747 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.479;DP=20;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,444 +chr4 39122839 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.194;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:275,0,496 +chr4 39461221 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:256,0,685 +chr4 39574003 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.741;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,376 +chr4 39574265 . A G 704.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:733,51,0 +chr4 39574616 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.819;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:425,0,571 +chr4 39574654 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.913;DP=32;FS=11.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:955,0,183 +chr4 39574875 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-1.318;DP=34;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:376,0,804 +chr4 39575070 . A G 449.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:1:475,0,1 +chr4 39575084 . A T 523.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:6:551,6,0 +chr4 39575127 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.467;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=21.30;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:433,0,162 +chr4 39575457 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=1.385;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:473,0,470 +chr4 39575535 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.694;DP=28;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,699 +chr4 39575737 . T A 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:613,42,0 +chr4 39575754 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.212;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:231,0,512 +chr4 39575855 . C A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.283;DP=29;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:748,0,831 +chr4 39575879 . G A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-0.921;DP=34;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=21.26;ReadPosRankSum=2.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:751,0,831 +chr4 39575989 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=-0.056;DP=35;FS=5.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:415,0,864 +chr4 39576010 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.754;DP=39;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:544,0,743 +chr4 39576178 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-0.310;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:677,0,510 +chr4 39576474 . A G 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.898;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:68:688,0,68 +chr4 39576665 . A T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.255;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1162 +chr4 39576666 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.534;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:459,0,1159 +chr4 39576861 . T C 973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1002,69,0 +chr4 39576891 . A G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.381;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:674,0,195 +chr4 39576998 . G T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=2.684;DP=20;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=13.09;ReadPosRankSum=-2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:290,0,410 +chr4 39577261 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:467,0,473 +chr4 39577320 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=-1.082;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:363,0,502 +chr4 39577551 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:255,0,168 +chr4 39577779 . GTC G 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-0.960;DP=40;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:647,0,1042 +chr4 39577941 . T G 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.314;DP=34;FS=9.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:915,0,246 +chr4 39578156 . G T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.591;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,823 +chr4 39578157 . G T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.091;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:429,0,823 +chr4 39578298 . A T 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 +chr4 39669221 . C T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr4 39669328 . T C 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.383;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=32.80;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:39:1045,0,39 +chr4 39669353 . A T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:80:528,0,80 +chr4 39669559 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=-1.186;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:363,0,838 +chr4 39669761 . C A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-1.900;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:700,0,237 +chr4 39669812 . T A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-2.074;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:804,0,214 +chr4 39669958 . C T 1000.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.074;DP=29;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=34.50;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:3:1027,0,3 +chr4 39670047 . A G 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=2.025;DP=31;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=31.99;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1020,0,127 +chr4 39670058 . C A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.652;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:639,0,478 +chr4 39670129 . C A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=2.550;DP=43;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=29.27;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:99:1287,0,103 +chr4 39670683 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.126;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,912 +chr4 39671101 . T C 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=1.602;DP=44;FS=13.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:896,0,591 +chr4 39671682 . T TA 513.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.788;DP=31;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.58;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:40:626,40,0 +chr4 39672590 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:31:308,0,31 +chr4 39998462 . C T 7476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.491;DP=467;FS=59.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=16.01;ReadPosRankSum=3.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,201:411:99:7505,0,7758 +chr4 39998635 . T A 2339.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:99:2368,167,0 +chr4 39998650 . G C 2294.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:2323,164,0 +chr4 39998716 . CA C 3092.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:99:3130,226,0 +chr4 39998735 . AG A 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.242;DP=55;FS=18.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:892,0,1698 +chr4 39998737 . T A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=1.102;DP=60;FS=13.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:892,0,1698 +chr4 39998814 . G A 16287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.419;ClippingRankSum=-3.250;DP=488;FS=14.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=33.38;ReadPosRankSum=5.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,224:433:99:16316,0,13713 +chr4 39998844 . A G 16254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-2.614;DP=525;FS=43.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=30.96;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,271:472:99:16283,0,13715 +chr4 39998937 . A G 5073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;ClippingRankSum=1.702;DP=185;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=27.43;ReadPosRankSum=3.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,149:154:99:5102,0,13394 +chr4 39998970 . A G 2422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,50:50:99:2451,0,14741 +chr4 39999066 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.401;DP=66;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:467,0,333 +chr4 40294750 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.933;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:291,0,389 +chr4 40317796 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-2.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,177 +chr4 40317828 . G GT 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-2.003;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:251,0,252 +chr4 40441267 . G C 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:488,33,0 +chr4 40521716 . G A 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 +chr4 40666277 . A T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.047;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:584,0,390 +chr4 40804556 . C T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr4 40836686 . A G 712.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:741,51,0 +chr4 40836713 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:415,0,627 +chr4 40836715 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=1.196;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,906 +chr4 40910433 . C A 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 +chr4 40910452 . G A 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 +chr4 40911359 . A G 375.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:404,30,0 +chr4 41053820 . C T 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 +chr4 41159408 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-1.445;DP=20;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:292,0,425 +chr4 41175720 . A G 948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.250;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=28.75;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:34:977,34,0 +chr4 41175780 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=-1.743;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.10;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:43:669,0,43 +chr4 41175820 . T TC 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-1.086;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:94:358,0,94 +chr4 41274525 . A G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.426;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:703,0,106 +chr4 41275006 . C T 259.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:288,0,21 +chr4 41493704 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:349,0,137 +chr4 41888817 . T C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr4 41969851 . A G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr4 42341932 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr4 42342169 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:243,0,65 +chr4 42343175 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:277,0,63 +chr4 42842558 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.000;DP=13;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:274,0,176 +chr4 43337710 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=1.910;DP=23;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,328 +chr4 43475292 . C T 211.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:240,0,25 +chr4 43853469 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr4 43854378 . C A 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 +chr4 44112699 . A T 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 +chr4 44234036 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,334 +chr4 44293294 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=-0.060;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=19.51;ReadPosRankSum=-2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:516,0,327 +chr4 44578861 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:92:257,0,92 +chr4 44578940 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:300,0,123 +chr4 44755773 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=13;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:275,0,58 +chr4 44756145 . C A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:392,0,758 +chr4 44756187 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-2.416;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=22.74;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:392,0,758 +chr4 44756513 . C T 780.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-1.313;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=33.95;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:21:809,21,0 +chr4 44804953 . T C 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr4 44994519 . C A 1009.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.156;DP=24;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=35.60;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:82:1038,82,0 +chr4 45056999 . T G 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:39:517,39,0 +chr4 45057002 . T C 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:517,39,0 +chr4 45058454 . C CTA 988.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1026,69,0 +chr4 45374991 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr4 45388688 . A C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr4 45627126 . C G 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.373;DP=59;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:1264,0,919 +chr4 45628495 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.543;DP=21;FS=17.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:300,0,876 +chr4 45628496 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=17.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:300,0,880 +chr4 45632518 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.581;DP=46;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:389,0,964 +chr4 46509453 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:46:333,0,46 +chr4 46509454 . A C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:46:333,0,46 +chr4 46718670 . G A 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr4 46732436 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.340;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:381,0,377 +chr4 47517748 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.573;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:521,0,539 +chr4 47517784 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-2.601;DP=24;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=10.07;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:270,0,421 +chr4 47517995 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.454;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:500,0,1041 +chr4 48074699 . G A 793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:822,60,0 +chr4 48074790 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.760;DP=92;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:546,0,1694 +chr4 48076773 . A T 1905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.498;DP=69;FS=5.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=27.62;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,46:60:99:1934,0,1743 +chr4 48076779 . A G 5060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:5089,359,0 +chr4 48076902 . A C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.957;DP=61;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:647,0,826 +chr4 48076914 . GT G 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.537;DP=30;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=14.79;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:481,0,169 +chr4 48077049 . G T 822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:851,60,0 +chr4 48080069 . G T 2906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:99:2935,211,0 +chr4 48080083 . G A 2862.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.79;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:99:2891,208,0 +chr4 48080124 . A T 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=1.194;DP=189;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=5.37;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,44:163:99:1043,0,5371 +chr4 48080150 . T C 2105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.534;DP=319;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,80:261:99:2134,0,7176 +chr4 48080251 . A G 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-5.025;DP=169;FS=71.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=8.30;ReadPosRankSum=-4.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,51:155:99:1431,0,4025 +chr4 48080347 . T G 956.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:985,69,0 +chr4 48081338 . CT C 342.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.488;DP=28;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7:379,7,0 +chr4 48081362 . A G 593.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=33;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:7:621,7,0 +chr4 48081869 . T C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr4 48081870 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr4 48082567 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.250;DP=188;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,32:155:99:606,0,4834 +chr4 48082605 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.783;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:549,0,178 +chr4 48082606 . C G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=1.021;DP=24;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:325,0,487 +chr4 48082851 . A T 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 +chr4 48083296 . C G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=33.58;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:61:364,0,61 +chr4 48083422 . T A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.934;DP=34;FS=10.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:590,0,585 +chr4 48083781 . C T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.856;DP=145;FS=1.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:801,0,4128 +chr4 48083933 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=1.471;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:876,0,1133 +chr4 48084118 . T C 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:804,60,0 +chr4 48084414 . C T 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.368;DP=25;FS=22.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=28.51;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:741,0,139 +chr4 48084626 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=-1.442;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:591,0,4369 +chr4 48355619 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,443 +chr4 48493937 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr4 48494244 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr4 48631269 . G T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:238,0,65 +chr4 48631307 . A G 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 +chr4 49158603 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=1.296;DP=13;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:333,0,58 +chr4 49280007 . G C 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr4 49683807 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.479;DP=34;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=9.43;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:349,0,126 +chr4 49694700 . T C 2949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2978,208,0 +chr4 49694724 . T C 1800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1829,126,0 +chr4 49695216 . T G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.448;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:49:450,0,49 +chr4 49695219 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.423;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:49:450,0,49 +chr4 49695655 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr4 49695656 . A G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:252,18,0 +chr4 49995925 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr4 50141625 . AC A 252.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.044;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:7:289,0,7 +chr4 50141685 . T A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:81:444,0,81 +chr4 50141742 . A G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 +chr4 50141805 . T C 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-2.916;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:523,0,160 +chr4 50141858 . T A 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:645,45,0 +chr4 50549064 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=11;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=25.07;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:304,0,57 +chr4 50598036 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=1.413;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:288,0,1631 +chr4 50598116 . T A 1941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1970,142,0 +chr4 50706127 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:287,0,62 +chr4 50802025 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-3.018;DP=48;FS=6.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=4.54;ReadPosRankSum=3.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,2091 +chr4 50802029 . A G 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=3.383;DP=65;FS=8.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=17.23;ReadPosRankSum=-3.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1148,0,597 +chr4 50802033 . C A 2054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2083,141,0 +chr4 50843874 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr4 50843959 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=16.77;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:263,0,51 +chr4 50844416 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:277,0,49 +chr4 50887047 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:304,0,176 +chr4 50887581 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.984;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,308 +chr4 50918319 . G A 648.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=34.13;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:676,8,0 +chr4 50918440 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.866;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:322,0,814 +chr4 50936952 . A C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-0.099;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:535,0,552 +chr4 50937141 . G A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=1.588;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=27.03;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:623,0,103 +chr4 50937396 . A G 685.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-1.187;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:12:713,12,0 +chr4 50937934 . G A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr4 51179219 . G C 370.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=33.73;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:399,0,13 +chr4 51179255 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:267,0,49 +chr4 51179960 . G A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 +chr4 51179998 . A G 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:500,36,0 +chr4 51180060 . C T 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 +chr4 51180559 . A G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr4 51181001 . G A 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr4 51181077 . T A 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr4 51364675 . T G 1029.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.320;DP=26;FS=9.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=25.69;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:26:1058,0,26 +chr4 51364794 . A C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=1.010;DP=36;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:608,0,1400 +chr4 51364797 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.983;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:608,0,1449 +chr4 51364862 . T C 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=1.364;DP=38;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:801,0,465 +chr4 51364929 . A T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.123;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:549,0,345 +chr4 51365081 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=1.681;DP=28;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:345,0,503 +chr4 51365147 . C G 569.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.792;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:607,0,801 +chr4 51365468 . A G 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.363;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:1224,0,293 +chr4 51365857 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-2.224;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:553,0,606 +chr4 51366086 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.419;DP=28;FS=16.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:549,0,396 +chr4 51366119 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.689;DP=31;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:252,0,1389 +chr4 51366140 . C G 1839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.738;DP=44;FS=3.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=32.00;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:1868,0,215 +chr4 51366228 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-1.095;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:439,0,2417 +chr4 51366414 . A C 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-2.130;DP=28;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:761,0,182 +chr4 51366544 . G T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.045;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:66:766,0,66 +chr4 51366667 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.029;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:367,0,983 +chr4 51366673 . TA T 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=-1.431;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:367,0,989 +chr4 51366761 . GT G 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-1.286;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:651,0,292 +chr4 51367192 . AC A 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.300;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=6.10;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:275,0,388 +chr4 51367230 . T A 2658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=1.977;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:78:2687,0,78 +chr4 51367271 . T G 2664.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.873;DP=31;FS=2.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=29.52;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,15:20:6:2692,6,0 +chr4 51367308 . C T 1801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=1.482;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:99:1830,0,257 +chr4 51367379 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-2.176;DP=144;FS=13.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:485,0,2353 +chr4 51367423 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-1.702;DP=37;FS=6.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=7.18;ReadPosRankSum=-3.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:294,0,593 +chr4 51367532 . A C 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-0.076;DP=33;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=32.27;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:1228,0,490 +chr4 51367539 . C T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=1.210;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:731,0,1132 +chr4 51367549 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=2.343;DP=63;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=3.28;ReadPosRankSum=-3.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:235,0,2573 +chr4 51367692 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=2.478;DP=109;FS=14.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1107,0,947 +chr4 51367924 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.666;DP=21;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,366 +chr4 51380692 . G A 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 +chr4 51387368 . C T 816.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:845,66,0 +chr4 51390541 . C T 1358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1387,99,0 +chr4 51391471 . C T 1086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1117,81,0 +chr4 51395903 . T G 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 +chr4 51414600 . C G 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 +chr4 51536522 . A T 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 +chr4 51537010 . C G 244.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:273,0,16 +chr4 51537029 . A G 283.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:4:310,0,4 +chr4 51537197 . G T 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr4 51664494 . C A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr4 51664495 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr4 51855588 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.850;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=32.25;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:97:641,0,97 +chr4 51856490 . G C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,134 +chr4 51972912 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=2.993;DP=29;FS=6.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:763,0,262 +chr4 51975410 . T G 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:425,33,0 +chr4 52078304 . A G 527.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=1.504;DP=19;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:553,0,1 +chr4 52138121 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=14.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.68;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:265,0,101 +chr4 52182760 . T G 588.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:617,45,0 +chr4 52436067 . A T 311.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=31.14;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:8:339,0,8 +chr4 52436172 . G A 1112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.706;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1141,78,0 +chr4 53050351 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,154 +chr4 53050354 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.62;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,154 +chr4 53183865 . T C 487.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:1:513,0,1 +chr4 53188772 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.133;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,182 +chr4 53285565 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-2.239;DP=15;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=22.18;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:361,0,49 +chr4 53286833 . C T 6991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:7020,470,0 +chr4 53286834 . C T 6991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:7020,470,0 +chr4 53617435 . T G 205.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:234,0,19 +chr4 53798387 . T C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=29.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=31.30;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:70:623,0,70 +chr4 53940864 . T C 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr4 53940893 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:55:241,0,55 +chr4 54044023 . C T 1044.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1073,75,0 +chr4 54061755 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=-0.034;DP=24;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.70;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,456 +chr4 54061767 . A T 845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:874,63,0 +chr4 54341682 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:344,0,182 +chr4 54341775 . G A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr4 54481387 . A G 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 +chr4 54618161 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr4 54690568 . C T 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:238,0,25 +chr4 54691538 . T C 292.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:321,0,14 +chr4 54784719 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,139 +chr4 54839033 . G A 363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:392,33,0 +chr4 54890979 . A G 1428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1457,102,0 +chr4 54891056 . T C 1258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1287,93,0 +chr4 54891339 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.739;DP=45;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:321,0,1282 +chr4 54906079 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr4 54968940 . A T 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr4 54982220 . G A 3410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=3.076;DP=101;FS=24.177;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.292;QD=33.77;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,83:91:85:3439,85,0 +chr4 54982266 . T G 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=3.583;DP=45;FS=32.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.422;QD=27.57;ReadPosRankSum=-3.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:99:1269,0,322 +chr4 54982398 . T G 377.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=31.46;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:7:405,0,7 +chr4 55039610 . A G 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:484,36,0 +chr4 55039638 . G A 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:484,36,0 +chr4 55039756 . C T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:395,27,0 +chr4 55235899 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-2.339;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,258 +chr4 55236177 . G C 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 +chr4 55236278 . G A 1360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1389,99,0 +chr4 55236326 . A T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=2.179;DP=33;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:847,0,245 +chr4 55350900 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.566;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:435,0,282 +chr4 55350907 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=23.93;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:435,0,282 +chr4 55566711 . T C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.091;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:411,0,645 +chr4 55567501 . A T 321.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.19;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:350,0,14 +chr4 55582976 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.398;DP=13;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:275,0,138 +chr4 55639146 . T G 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 +chr4 55782410 . G A 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:678,51,0 +chr4 55782436 . A G 2221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2250,157,0 +chr4 56370518 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr4 56437006 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:409,0,745 +chr4 56477707 . C T 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 +chr4 56479897 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:256,18,0 +chr4 56479902 . A C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr4 56530626 . C G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:329,0,169 +chr4 56707623 . C G 3722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-2.384;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,101:139:99:3751,0,929 +chr4 56707770 . C A 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-2.089;DP=69;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=23.61;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:43:99:1657,0,103 +chr4 56707837 . A G 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.714;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:1657,0,119 +chr4 56707921 . T C 1628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:70:1657,0,70 +chr4 56708350 . C A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-2.753;DP=106;FS=8.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=2.54;ReadPosRankSum=3.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,9:60:99:298,0,3482 +chr4 56733985 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.092;DP=35;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:517,0,620 +chr4 56734107 . A T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=2.583;DP=27;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=21.40;ReadPosRankSum=-2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:606,0,1315 +chr4 56734117 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=2.335;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=25.67;ReadPosRankSum=-2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:99:593,0,1315 +chr4 56734136 . G C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-2.415;DP=24;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=23.45;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:591,0,1315 +chr4 56734146 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-2.391;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:591,0,1315 +chr4 56734327 . C T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.764;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.73;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,2:15:99:1060,0,351 +chr4 56734407 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.056;DP=70;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:235,0,2745 +chr4 56734570 . T C 2083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.642;DP=47;FS=4.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:42:2112,0,42 +chr4 56734620 . A C 2083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=-0.444;DP=26;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=26.51;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:50:2112,0,50 +chr4 56734819 . A T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.255;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:32:681,0,32 +chr4 56734836 . A C 331.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.89;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:16:360,0,16 +chr4 56734944 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=31.76;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:345,0,263 +chr4 56734965 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-2.404;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:345,0,263 +chr4 56735130 . C A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.218;DP=61;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:428,0,2336 +chr4 56735133 . C A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.471;DP=63;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:428,0,2336 +chr4 56735324 . C T 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.283;DP=27;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=34.60;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:1087,0,245 +chr4 56735331 . T G 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.001;DP=28;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=31.16;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:1087,0,247 +chr4 56735643 . G T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.206;DP=21;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:593,0,155 +chr4 56735817 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.434;DP=24;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=24.45;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:72:615,0,72 +chr4 56736015 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-2.074;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=16.63;ReadPosRankSum=2.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,212 +chr4 56736086 . T C 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.427;DP=30;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=30.39;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:49:940,0,49 +chr4 56736162 . T C 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-1.949;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=26.14;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:891,0,529 +chr4 56736267 . G C 2868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2897,201,0 +chr4 56736351 . G T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.054;DP=37;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:350,0,1329 +chr4 56736426 . T C 1200.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.237;DP=19;FS=6.107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,15:18:15:1229,15,0 +chr4 56736785 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.691;DP=14;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.875;QD=28.91;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:433,0,50 +chr4 56736906 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=1.106;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:306,0,99 +chr4 56737064 . G C 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.608;DP=38;FS=14.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:1106,0,329 +chr4 56737119 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.039;DP=26;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:551,0,686 +chr4 56737339 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.467;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:99:246,0,557 +chr4 56737411 . A G 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-1.469;DP=40;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,28:37:99:1117,0,415 +chr4 56737657 . G A 1354.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.437;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=33.87;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:62:1383,62,0 +chr4 57053142 . T A 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.552;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1065,0,211 +chr4 57053229 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=16.30;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,287 +chr4 57144615 . T C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr4 57302492 . A C 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:475,33,0 +chr4 57704608 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.731;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:277,0,97 +chr4 58001057 . A G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr4 58001856 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:373,0,164 +chr4 58088299 . A C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr4 58088727 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=1.480;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:31:436,0,31 +chr4 58088759 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.48;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:303,0,51 +chr4 58088979 . G A 704.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.020;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.66;ReadPosRankSum=2.981 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,19:31:19:733,19,0 +chr4 58089427 . G C 554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:583,42,0 +chr4 58089481 . T G 284.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:313,0,15 +chr4 58089511 . C T 372.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=33.91;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:401,0,13 +chr4 58089903 . T C 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:821,57,0 +chr4 58089975 . T A 905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:934,66,0 +chr4 58090096 . C T 913.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:942,66,0 +chr4 58090256 . G T 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:46:581,46,0 +chr4 58090756 . A C 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:566,42,0 +chr4 58090820 . A C 504.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.116;DP=15;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=33.65;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:0:530,0,0 +chr4 58091403 . A C 757.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.141;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:20:786,0,20 +chr4 58091411 . C A 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=34.77;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:980,66,0 +chr4 58091831 . G C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:418,0,331 +chr4 58091875 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-2.435;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:234,0,335 +chr4 58092432 . A C 530.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.060;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=20.42;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:14:592,14,0 +chr4 58092433 . A C 942.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:81:1149,81,0 +chr4 58093307 . T C 489.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=34.94;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:516,0,4 +chr4 58096080 . G A 619.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.731;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=32.62;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:24:648,0,24 +chr4 58099247 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-1.701;DP=20;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=25.54;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:62:539,0,62 +chr4 58103108 . A C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr4 58198796 . G C 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:241,0,25 +chr4 58204818 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:259,0,58 +chr4 58204919 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:334,0,52 +chr4 58248863 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr4 58258977 . C CT 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:508,50,0 +chr4 58260516 . C T 561.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:618,45,0 +chr4 58269653 . G A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 +chr4 58270201 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr4 58270856 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr4 58271391 . G A 354.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:383,0,13 +chr4 58271487 . C G 228.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:257,0,18 +chr4 58271669 . C A 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 +chr4 58468029 . T C 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:529,36,0 +chr4 58468054 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:308,0,101 +chr4 58469842 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,160 +chr4 58469845 . A G 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:350,24,0 +chr4 58507202 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.875;QD=31.21;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:434,0,50 +chr4 58507592 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-3.473;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:714,0,1002 +chr4 58543091 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-1.057;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=23.90;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:554,0,183 +chr4 58577184 . AC A 884.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=-2.000;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=30.06;ReadPosRankSum=2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:922,0,673 +chr4 58577186 . TCTCCTCTTTAATCCTCAGATCTTCAC T 884.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.216;DP=26;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=34.03;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:922,0,678 +chr4 58582741 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:229,0,377 +chr4 58623305 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=-1.264;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:420,0,201 +chr4 58623621 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.475;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:445,0,234 +chr4 58809773 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=-1.467;DP=27;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:464,0,166 +chr4 58874647 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.910;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,248 +chr4 59286625 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=-2.409;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:341,0,363 +chr4 59292417 . G A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=-0.110;DP=29;FS=8.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:525,0,457 +chr4 60109136 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=1.555;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:264,0,379 +chr4 60109552 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;ClippingRankSum=-3.323;DP=57;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=8.08;ReadPosRankSum=3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:489,0,3442 +chr4 60109560 . T G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-3.142;DP=63;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=7.31;ReadPosRankSum=3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:489,0,3442 +chr4 60109813 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-2.644;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:302,0,898 +chr4 60112547 . A AT 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=1.108;DP=101;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:281,0,2498 +chr4 60128518 . GC G 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=1.636;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:246,0,758 +chr4 60182886 . CCT C 2473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=-1.732;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,65:66:99:2511,0,188 +chr4 60182889 . GCAGTGGAAAGTGTTGTTAGAAACAAAACTTGCCTGAAATAATGCTAGAGAATGCTTTTAGAGTTCAACTCACA G 2473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-1.732;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,64:65:99:2511,0,188 +chr4 60250172 . GAGGTAAAACCCTTCCTGCATCCCAGCAGGCGCCCAGTTGTTTATTTAAAGCGATTATAGTTCACATCAATACTGCTGTTTTGTCGC G 13317.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=1.601;DP=310;FS=2.108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,306:309:99:13355,1109,0 +chr4 60270978 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,344 +chr4 60273355 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.657;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:385,0,383 +chr4 60588469 . T C 400.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=33.40;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:428,0,6 +chr4 60630373 . A T 2721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-2.330;DP=196;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,79:195:99:2750,0,4420 +chr4 60640145 . G T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr4 60665058 . A G 4750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=8.922;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=20.93;ReadPosRankSum=-3.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,144:226:99:4779,0,2743 +chr4 60666753 . G C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=1.516;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=25.74;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:440,0,122 +chr4 60667272 . G A 1810.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=-0.356;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=28.72;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,45:50:13:1839,13,0 +chr4 60669463 . T C 200.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:229,0,25 +chr4 60688132 . G A 2045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2074,144,0 +chr4 60688153 . G T 1384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1413,99,0 +chr4 60688972 . A G 667.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:696,48,0 +chr4 60688984 . G T 658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:687,48,0 +chr4 60689364 . C T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:357,27,0 +chr4 60689893 . G A 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-2.361;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:36:990,36,0 +chr4 60690275 . C A 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:659,45,0 +chr4 60690281 . A C 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:659,45,0 +chr4 60690531 . A G 1991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-1.905;DP=53;FS=2.603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=35.34;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:2020,114,0 +chr4 60691774 . C T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr4 60691874 . TC T 200.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr4 60694125 . G A 201.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:16:230,0,16 +chr4 60694687 . A C 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 +chr4 60695674 . G GT 219.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:257,27,0 +chr4 60696000 . A G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:415,30,0 +chr4 60696008 . G A 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 +chr4 60704183 . T G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-2.270;DP=14;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=28.91;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:43:433,0,43 +chr4 60704235 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-0.267;DP=23;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=12.34;ReadPosRankSum=-3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:312,0,438 +chr4 60704253 . T G 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.140;DP=32;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=18.74;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:628,0,448 +chr4 60717322 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=2.764;DP=22;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:487,0,292 +chr4 60717416 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.585;DP=31;FS=20.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=8.22;ReadPosRankSum=3.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:283,0,783 +chr4 60737926 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=2.148;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=18.54;ReadPosRankSum=-2.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:566,0,614 +chr4 60741342 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=32.07;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:56:417,0,56 +chr4 60741343 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:56:417,0,56 +chr4 60743028 . G C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.05;ReadPosRankSum=-2.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:295,0,154 +chr4 60743220 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.264;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:481,0,239 +chr4 60753442 . T C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.260;ClippingRankSum=-3.289;DP=90;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,26:90:99:691,0,2274 +chr4 60759455 . C T 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=-3.025;DP=97;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=15.99;ReadPosRankSum=4.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:1579,0,1841 +chr4 60760087 . A C 2303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-2.643;DP=114;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.759;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,69:114:99:2332,0,1444 +chr4 60760185 . T G 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=4.124;DP=86;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:1466,0,1491 +chr4 60760356 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=2.720;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:588,0,601 +chr4 60760558 . G A 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.280;DP=42;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:1046,0,363 +chr4 60760893 . C T 1686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=2.789;DP=84;FS=4.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=20.08;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:1715,0,3050 +chr4 60760990 . G A 2225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=1.945;DP=81;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=27.48;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,59:79:99:2254,0,403 +chr4 60779362 . A T 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:536,39,0 +chr4 60793119 . T C 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 +chr4 60797448 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-3.065;DP=17;FS=10.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=23.22;ReadPosRankSum=2.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:423,0,196 +chr4 60800771 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=1.727;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=10.87;ReadPosRankSum=-2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:300,0,570 +chr4 60803636 . T G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-1.809;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:290,0,854 +chr4 60819767 . G T 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.243;DP=36;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=22.80;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:849,0,476 +chr4 60819769 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.080;DP=37;FS=3.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:466,0,1416 +chr4 60821116 . A G 361.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=32.90;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:2:388,0,2 +chr4 60850564 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=16.77;ReadPosRankSum=3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:263,0,301 +chr4 60850576 . GA G 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.875;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:33:364,0,33 +chr4 60931507 . T G 336.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:365,0,13 +chr4 60931586 . TA T 392.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:430,42,0 +chr4 60931788 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:291,0,66 +chr4 60931789 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:291,0,66 +chr4 60931879 . C T 262.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:291,0,22 +chr4 60931952 . T G 1081.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.963;DP=64;FS=4.314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1110,78,0 +chr4 60932050 . T C 1412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=1.863;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:66:1441,66,0 +chr4 60932351 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=2.268;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=34.38;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:915,0,107 +chr4 60932373 . A C 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=3.489;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=24.25;ReadPosRankSum=-2.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:780,0,9267 +chr4 60932378 . GACCTGTCAACAATTCAAAACGTGTAAAACTCATTGTTTTATTCAGTGATGATTTAATACCCATACATTCAATTGGTAAGGCCTTT G 742.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=4.933;DP=53;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.309;QD=14.01;ReadPosRankSum=-3.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:780,0,9621 +chr4 60933153 . A T 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 +chr4 60933434 . G A 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 +chr4 60943120 . C G 298.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:327,0,19 +chr4 60944850 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=28.43;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:98:341,0,98 +chr4 60946640 . A T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=1.085;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=27.43;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:55:522,0,55 +chr4 60993240 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:86:458,0,86 +chr4 60993423 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.667;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=26.74;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:456,0,165 +chr4 60993922 . A T 291.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.43;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:320,0,16 +chr4 60999849 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=32.37;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:514,0,163 +chr4 60999876 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=27.53;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:514,0,163 +chr4 61058962 . T C 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr4 61059223 . G A 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr4 61158042 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=1.909;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:350,0,136 +chr4 61166762 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=30.91;ReadPosRankSum=-1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:430,0,50 +chr4 61166793 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:84:317,0,84 +chr4 61241385 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,339 +chr4 61251157 . TC T 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.036;DP=23;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:349,0,276 +chr4 61252031 . TCTGGAGGAAAGCAGGGCTTTAAAATCAGGTAAATCATTTACATTAGCTATGTATAGCCGCAGATGCTAGCTCAC T 1155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.681;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:99:1193,0,908 +chr4 61263183 . A C 458.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=29.05;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:2:485,2,0 +chr4 61264476 . T TCC 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.79;ReadPosRankSum=-1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:473,0,297 +chr4 61297762 . T A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-1.585;DP=75;FS=9.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1288,0,851 +chr4 61370300 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr4 61370818 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.469;DP=36;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:392,0,856 +chr4 61370842 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.596;DP=37;FS=16.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:386,0,838 +chr4 61435731 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=1.496;DP=34;FS=8.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:418,0,744 +chr4 61438088 . G T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.129;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:434,0,444 +chr4 61438263 . A G 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:586,0,287 +chr4 61439378 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.298;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:515,0,598 +chr4 61439480 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=-3.159;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:273,0,1238 +chr4 61439651 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.018;DP=37;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:462,0,672 +chr4 61442102 . A G 2038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2067,144,0 +chr4 61442231 . C T 1869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.364;DP=73;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,51:71:99:1898,0,503 +chr4 61442336 . A G 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=-0.017;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,53:75:99:2027,0,547 +chr4 61442591 . C G 2412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2441,175,0 +chr4 61442627 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.876;DP=74;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:297,0,1782 +chr4 61442711 . T TC 292.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:330,23,0 +chr4 61442719 . C T 301.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:23:330,23,0 +chr4 61443706 . A G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr4 61830460 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=1.412;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:409,0,280 +chr4 61832762 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.307;DP=42;FS=7.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.896;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:820,0,555 +chr4 61840511 . G T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.671;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=24.74;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:820,0,295 +chr4 61854079 . C A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr4 61856380 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-2.266;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=22.30;ReadPosRankSum=1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:385,0,155 +chr4 61857144 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.931;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:320,0,97 +chr4 61932560 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.32;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:378,0,170 +chr4 61933094 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,167 +chr4 61940149 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=19.18;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:316,0,203 +chr4 61949882 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:273,0,58 +chr4 61951192 . T G 591.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:25:620,0,25 +chr4 62015582 . TGTACGTCTCACACACACACACACACACACACACACACACTACAGACAGTGAGCGTGAGTGTGTGTGTTTCTGTCTGCAG T 1790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.173;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1828,152,0 +chr4 62032762 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=-0.077;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,45:215:99:901,0,6564 +chr4 62035311 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=3.230;DP=73;FS=13.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=4.60;ReadPosRankSum=-2.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:364,0,2107 +chr4 62037500 . T C 2403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.236;DP=89;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,65:89:99:2432,0,573 +chr4 62037551 . C T 3621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.374;DP=138;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=26.24;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,97:138:99:3650,0,1099 +chr4 62038628 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.570;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=24.36;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:491,0,192 +chr4 62043516 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-1.467;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:476,0,250 +chr4 62044117 . T C 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-2.074;DP=36;FS=3.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1000,0,164 +chr4 62044153 . AGTGAGTGTCCTCTTCATCTTCATCTTCATCTTCATCATCAGCTGTGTCCTGCAGAGCTGCTGTTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAG A 1322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=1.355;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,44:51:99:1360,0,2134 +chr4 62044391 . ACAGGTGACGGAGAGTGTGTCCATGTGTGTGAGTGTGTGCGCGTGTTTTCATGTGTGTGTGAGTGTGTGTGCGCATGTATTCATGTGTGTGTGTGTGTGTG A 1012.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=1.583;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=30.39;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:99:1050,105,0 +chr4 62047193 . G A 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=-0.032;DP=44;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=30.95;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:91:1390,0,91 +chr4 62047841 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-2.194;DP=21;FS=12.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=29.51;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:65:648,0,65 +chr4 62048768 . C G 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.903;DP=33;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:941,0,205 +chr4 62048780 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.018;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:281,0,873 +chr4 62049312 . G T 1308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.196;DP=48;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=27.27;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:1337,0,292 +chr4 62050300 . C A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-0.317;DP=54;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=34.75;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,48:54:99:1905,0,307 +chr4 62050405 . A G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.397;DP=88;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:563,0,2225 +chr4 62050507 . G T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.190;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:635,0,870 +chr4 62051716 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-1.237;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:341,0,411 +chr4 62052152 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr4 62052187 . A G 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:500,36,0 +chr4 62052188 . G C 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:500,36,0 +chr4 62052462 . C T 938.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:967,69,0 +chr4 62052849 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=-1.135;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=28.89;ReadPosRankSum=2.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:606,0,114 +chr4 62055877 . C A 1520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.030;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=30.68;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1549,120,0 +chr4 62057416 . A T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 +chr4 62057594 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-4.588;DP=66;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:280,0,2049 +chr4 62057696 . TGAACATCTGGAGAACCACAGACAAAAA T 934.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:80:972,80,0 +chr4 62057800 . A T 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:447,33,0 +chr4 62058504 . A G 1255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1284,96,0 +chr4 62058623 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=2.268;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:568,0,330 +chr4 62058624 . T G 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=2.268;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=26.99;ReadPosRankSum=-2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:568,0,330 +chr4 62059754 . G A 10956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-1.242;DP=362;FS=5.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,284:362:99:10985,0,1478 +chr4 62060103 . T G 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.444;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=18.58;ReadPosRankSum=5.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1812,0,3159 +chr4 62060104 . G T 1791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=-2.771;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=18.10;ReadPosRankSum=4.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1820,0,3159 +chr4 62060703 . C T 6889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=-0.350;DP=277;FS=12.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,204:277:99:6918,0,1645 +chr4 62060810 . G A 5759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-1.107;DP=236;FS=9.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=24.41;ReadPosRankSum=4.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,160:236:99:5788,0,1939 +chr4 62060889 . C T 1387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;ClippingRankSum=0.775;DP=159;FS=12.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=8.73;ReadPosRankSum=-3.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,39:159:99:1416,0,4114 +chr4 62060921 . G A 2935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=7.727;DP=193;FS=16.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,86:193:99:2964,0,3168 +chr4 62063598 . C T 2435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.019;DP=110;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=22.14;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,73:110:99:2464,0,1144 +chr4 62065887 . G A 3285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=2.428;DP=73;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,50:73:99:3314,0,423 +chr4 62068833 . G A 3395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.903;DP=130;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=26.12;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,92:130:99:3424,0,942 +chr4 62080135 . G A 4025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.861;DP=126;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.95;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,108:126:99:4054,0,115 +chr4 62080203 . C A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=2.170;DP=123;FS=16.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,23:123:99:335,0,3800 +chr4 62083285 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr4 62083420 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.034;DP=31;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=20.70;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:670,0,414 +chr4 62085985 . G T 366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:395,30,0 +chr4 62086698 . G T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-4.176;DP=44;FS=3.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=19.02;ReadPosRankSum=3.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:865,0,202 +chr4 62093954 . GT G 2546.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=2.333;DP=106;FS=7.380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=24.03;ReadPosRankSum=-2.411 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,61:63:99:2584,192,0 +chr4 62093957 . C G 2555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=31.74;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:99:2584,192,0 +chr5 82133 . T A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=2.192;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,2:19:99:391,0,228 +chr5 177666 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.016;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:390,0,365 +chr5 245644 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.757;DP=30;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:354,0,691 +chr5 250623 . GAGGTATGTGCCCGCTGCGACTCCTGTCTTTGGCTGATTGTGTCTGTAATTTAATCGAGCGTTCTGTGTTCGTGTCTGCTTTGTTGTGATTTTTCCGTC G 573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=4.023;DP=30;FS=18.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=19.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:611,0,6334 +chr5 250865 . T C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=-0.274;DP=163;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:565,0,4752 +chr5 250939 . G T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=-0.840;DP=160;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,36:160:99:688,0,4685 +chr5 278301 . T C 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.813;ClippingRankSum=-0.698;DP=196;FS=0.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,42:196:99:787,0,5395 +chr5 279784 . TGTGAGTATCAGCAGAACACACTGAGCATTGATTATTGATTATTGATCAGGAGTGACCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCAG T 10104.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-3.180;DP=275;FS=4.984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=30.45;ReadPosRankSum=1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,216:223:99:10142,671,0 +chr5 279880 . G A 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.045;DP=268;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,58:268:99:1101,0,8959 +chr5 282935 . AACACACACACACACACACAC A 200.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:54:364,54,0 +chr5 284271 . ACTCT A 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-1.083;DP=18;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:499,0,151 +chr5 298566 . G C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-1.047;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:281,0,971 +chr5 307970 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.543;DP=56;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:269,0,1585 +chr5 336190 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr5 472631 . GT G 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=-0.417;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:798,0,1637 +chr5 513731 . A T 3168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.606;DP=173;FS=5.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=18.32;ReadPosRankSum=2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:3197,0,3111 +chr5 544125 . G T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.932;DP=74;FS=12.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=6.71;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:525,0,1907 +chr5 601901 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.976;DP=61;FS=2.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:356,0,1693 +chr5 610693 . A G 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.850;DP=41;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:672,0,691 +chr5 632096 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.342;DP=35;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:400,0,791 +chr5 633891 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-1.288;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:272,0,426 +chr5 675330 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.509;ClippingRankSum=-0.931;DP=213;FS=8.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,38:210:99:541,0,6109 +chr5 823983 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=25.13;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,125 +chr5 826166 . C T 3749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3778,256,0 +chr5 826171 . G T 3360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.742;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=30.46;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:3389,244,0 +chr5 861029 . TAGGTCAGTGTGGCTCTGTGGTGTCTGCAGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGATGGGATCTGCTGTGTATGGC T 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=24.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:336,0,1244 +chr5 1225049 . C T 1644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.909;DP=225;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,68:225:99:1673,0,5853 +chr5 1253491 . TA T,TAA 205.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,6,4:10:99:503,151,117,231,0,200 +chr5 1253662 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-0.097;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=13.04;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:550,0,813 +chr5 1284038 . CT C 2630.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=1.055;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=25.30;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,88:92:99:2668,265,0 +chr5 1357811 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.81;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:302,0,133 +chr5 1357847 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=24.58;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:397,0,131 +chr5 1400739 . C A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr5 1401519 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.034;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:345,0,93 +chr5 1401593 . C T 342.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=31.09;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:370,0,12 +chr5 1410306 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.041;DP=20;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:521,0,146 +chr5 1410336 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.754;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,186 +chr5 1424538 . T C 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-4.147;DP=83;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=16.48;ReadPosRankSum=-2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:1396,0,1434 +chr5 1429170 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=2.437;DP=38;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=15.07;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:601,0,742 +chr5 1436828 . T C 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=1.296;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=32.39;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:75:1162,0,75 +chr5 1436879 . G A 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-0.072;DP=68;FS=5.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=29.72;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,56:68:99:2049,0,151 +chr5 1485720 . C G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-1.227;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=29.78;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:68:475,0,68 +chr5 1547571 . A AT 884.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:922,87,0 +chr5 1548877 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr5 1552128 . G A 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 +chr5 1557705 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr5 1567020 . T A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.354;DP=92;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:800,0,2277 +chr5 1567031 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.046;DP=92;FS=5.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,30:91:99:770,0,2251 +chr5 1770887 . GCTGCAAACATGAGGCAGATCCATCATCTTTCTGTCTGAACAGTGACATGCTGAACAGTGTGTGCGCGTGTGTGTTGTAC G 3089.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=2.384;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=26.98;ReadPosRankSum=-2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3127,236,0 +chr5 1971668 . G A 1112.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.829;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:21:1141,0,21 +chr5 2098860 . G A 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:433,33,0 +chr5 2102043 . G GA 272.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:310,30,0 +chr5 2107165 . T TAC 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:405,0,192 +chr5 2156460 . A C 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:76:1046,76,0 +chr5 2156494 . TGA T 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.330;DP=30;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:650,0,301 +chr5 2156605 . C CT 832.91 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-1.647;DP=90;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,55:87:99:1060,0,951 +chr5 2156700 . G T 3434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3463,250,0 +chr5 2157010 . CT C 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.650;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.050;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:60:395,0,60 +chr5 2176764 . G T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr5 2176766 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr5 2190818 . G A 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 +chr5 2194804 . C G 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 +chr5 2194960 . C G 945.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:974,69,0 +chr5 2243460 . C A 372.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=31.02;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:400,0,10 +chr5 2243518 . A G 390.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:417,0,4 +chr5 2260723 . C T 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.959;DP=26;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=32.45;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:46:872,0,46 +chr5 2260776 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-1.102;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:369,0,240 +chr5 2261380 . C A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.420;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:509,0,261 +chr5 2262625 . ATG A 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.159;DP=37;FS=7.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=13.97;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:63:554,0,63 +chr5 2370057 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.752;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:548,0,127 +chr5 2432071 . A G 299.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:328,0,17 +chr5 2524016 . G T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-1.029;DP=52;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:378,0,1568 +chr5 2564923 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=1.218;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,683 +chr5 2581522 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-0.013;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:263,0,1932 +chr5 2707459 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.742;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:481,0,229 +chr5 3069855 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr5 3171268 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:352,0,345 +chr5 3560850 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-1.133;DP=51;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:583,0,1070 +chr5 3562889 . GT G 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.546;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:63:303,0,63 +chr5 3590450 . C T 1899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.448;DP=297;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=6.40;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,84:297:99:1928,0,7697 +chr5 3626534 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=3.440;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:276,0,681 +chr5 3626554 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=3.112;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=9.84;ReadPosRankSum=-2.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:294,0,683 +chr5 3673804 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.065;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:397,0,115 +chr5 3931937 . C T 3656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-1.975;DP=308;FS=8.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,109:308:99:3685,0,6800 +chr5 3931970 . G A 4300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.067;DP=360;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,130:360:99:4329,0,10096 +chr5 3944793 . G A 3599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.365;DP=262;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,112:262:99:3628,0,6625 +chr5 3944895 . A G 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=-3.634;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,36:152:99:765,0,4447 +chr5 3954573 . CGG C 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=1.501;DP=20;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:495,0,1436 +chr5 3954576 . TATGAAAGCGCACACACTCTCTTCACTCCCTCTGTTTTTGGGGAAGCAGTTTCACAGGTGGTTTTGTCTGTGCAG T 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=1.859;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=19.04;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:399,0,1547 +chr5 3959961 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,103 +chr5 4017182 . C T 302.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=30.23;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9:330,0,9 +chr5 4032093 . G T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=1.085;DP=96;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:441,0,2714 +chr5 4058974 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.024;DP=124;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,29:124:99:577,0,3657 +chr5 4130708 . A T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=2.037;DP=18;FS=9.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=31.43;ReadPosRankSum=-1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:36:594,0,36 +chr5 4130790 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.047;DP=71;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:857,0,3141 +chr5 4130796 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=-1.086;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:488,0,3825 +chr5 4130824 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-0.955;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:295,0,1433 +chr5 4131120 . T A 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=4.379;DP=48;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=27.93;ReadPosRankSum=-4.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,37:45:99:1369,0,135 +chr5 4131130 . G A 2316.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2345,160,0 +chr5 4131220 . G C 5010.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=-2.312;DP=201;FS=1.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,127:140:58:5039,58,0 +chr5 4131292 . T G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 +chr5 4131706 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-3.267;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:551,0,2138 +chr5 4131707 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-3.267;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:585,0,1076 +chr5 4131745 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.226;DP=48;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=15.52;ReadPosRankSum=2.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:773,0,804 +chr5 4131758 . G A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.522;DP=49;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:803,0,778 +chr5 4261411 . T TA 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.216;DP=148;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,81:138:99:1605,0,1212 +chr5 4301271 . T C 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.591;DP=192;FS=9.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,41:191:99:899,0,10738 +chr5 4301274 . C A 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.316;DP=197;FS=12.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,43:196:99:891,0,10738 +chr5 4351504 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.009;DP=68;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:272,0,2767 +chr5 4351505 . C A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-1.349;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:397,0,2471 +chr5 4351611 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.874;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:303,0,884 +chr5 4446449 . C A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.139;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.726;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,38:203:99:504,0,10631 +chr5 4447446 . C T 3911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.415;DP=309;FS=26.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,112:309:99:3940,0,7431 +chr5 4456586 . G T 2860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-3.868;DP=169;FS=7.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:2889,0,2898 +chr5 4743370 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=1.092;DP=46;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:549,0,988 +chr5 4743511 . T A 1380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-1.435;DP=72;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.079;QD=19.18;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,39:72:99:1409,0,2364 +chr5 4743514 . C G 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.753;DP=73;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:1374,0,2365 +chr5 4743661 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.417;DP=68;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:275,0,2104 +chr5 4743676 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.536;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:358,0,2273 +chr5 4754103 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.415;DP=90;FS=8.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1106,0,1946 +chr5 4754136 . C T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.761;DP=105;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:1567,0,1987 +chr5 4765400 . G A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr5 4765569 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr5 4765958 . C T 2278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2307,163,0 +chr5 4767856 . AC A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:267,0,918 +chr5 4769054 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,174 +chr5 4772981 . ATT A,ATTT 380.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.863;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,11,6:19:99:496,113,257,379,0,488 +chr5 4883494 . T C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:421,0,85 +chr5 4893973 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=28.83;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:403,0,50 +chr5 5025879 . G T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-0.554;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:567,0,401 +chr5 5151591 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,147 +chr5 5572952 . AT A 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.467;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:58:337,0,58 +chr5 5576376 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,208 +chr5 5676756 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.494;DP=80;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:292,0,3270 +chr5 5685994 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr5 5699374 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr5 5699415 . G A 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:320,24,0 +chr5 6292649 . GT G 907.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:70:945,70,0 +chr5 6512503 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-0.025;DP=120;FS=8.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.391;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,20:120:99:249,0,3996 +chr5 6811798 . CA C 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.272;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:239,0,560 +chr5 6811810 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:440,0,346 +chr5 6831388 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=-1.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,443 +chr5 6930663 . G A 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.440;DP=61;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1040,0,1037 +chr5 6937454 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.796;DP=18;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:458,0,202 +chr5 6945567 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.966;DP=50;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:546,0,1142 +chr5 6961647 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-1.506;DP=29;FS=6.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:359,0,598 +chr5 6961666 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-1.914;DP=30;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:338,0,750 +chr5 6962470 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=1.452;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:280,0,516 +chr5 6962692 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,233 +chr5 6963739 . A T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.087;DP=55;FS=4.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:906,0,909 +chr5 6964350 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:263,0,62 +chr5 7013688 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-1.594;DP=44;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:270,0,1156 +chr5 7025790 . T A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr5 7030951 . C T 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.243;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1286,0,1303 +chr5 7031655 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.021;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:375,0,863 +chr5 7031897 . T A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.521;DP=44;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:687,0,843 +chr5 7032040 . A T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.292;DP=29;FS=8.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:411,0,1303 +chr5 7032043 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.706;DP=28;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:411,0,1296 +chr5 7033149 . G A 2894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-1.445;DP=149;FS=5.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:2923,0,2470 +chr5 7033156 . G A 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=-0.324;DP=156;FS=2.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,38:156:99:791,0,7384 +chr5 7033260 . G T 2365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.117;DP=166;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=14.25;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,68:166:99:2394,0,3146 +chr5 7033296 . T G 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-3.341;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,38:126:99:948,0,3348 +chr5 7049666 . C G 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=-0.821;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:712,0,1294 +chr5 7148833 . C A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=-0.270;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:508,0,2849 +chr5 7150320 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.234;DP=93;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:274,0,2951 +chr5 7182787 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-2.176;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:269,0,485 +chr5 7183834 . CT C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=14.17;ReadPosRankSum=-2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:264,0,138 +chr5 7241060 . T A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr5 7851141 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.043;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:442,0,885 +chr5 7875302 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=2.416;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=20.25;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:332,0,206 +chr5 7889436 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:324,0,548 +chr5 7889523 . C A 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 +chr5 7889798 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.307;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:253,0,457 +chr5 7890029 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:253,0,344 +chr5 7890398 . T A 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:408,30,0 +chr5 7891611 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:314,0,875 +chr5 8066685 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=2.281;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.08;ReadPosRankSum=-2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:282,0,446 +chr5 8139246 . A G 7239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:7268,530,0 +chr5 8139284 . G A 4087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.322;DP=152;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,115:152:99:4116,0,783 +chr5 8178227 . C T 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 +chr5 8304411 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.831;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:329,0,6787 +chr5 8304414 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.248;DP=103;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,17:103:99:364,0,6786 +chr5 8311366 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.890;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=2.96;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:244,0,2266 +chr5 8311444 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.356;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:537,0,2445 +chr5 8340850 . T G 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr5 8340851 . G C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr5 8345282 . A T 235.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:19:264,19,0 +chr5 8351747 . G A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr5 8671127 . AC A 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.849;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:64:323,0,64 +chr5 8671553 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr5 8671650 . GA G 239.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:275,3,0 +chr5 8672621 . G C 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 +chr5 8672807 . A G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.112;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.052;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:489,0,230 +chr5 8672939 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.068;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:301,0,241 +chr5 9038253 . CT C 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=-0.868;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:8:356,0,8 +chr5 9129034 . G A 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=1.133;DP=41;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1150,0,279 +chr5 9129061 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.198;DP=59;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:773,0,2891 +chr5 9129064 . C G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.182;DP=62;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:773,0,2884 +chr5 9137985 . C T 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=-0.941;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.205;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:1307,0,1529 +chr5 9138013 . C G 4664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4693,340,0 +chr5 9334361 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=1.016;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:387,0,396 +chr5 9350019 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:339,0,260 +chr5 9364306 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.232;DP=96;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:403,0,2704 +chr5 9390224 . A G 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.686;DP=139;FS=2.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=5.19;ReadPosRankSum=3.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,33:139:99:749,0,4010 +chr5 9415636 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=2.362;DP=98;FS=5.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=2.92;ReadPosRankSum=3.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:314,0,2939 +chr5 9416984 . ACAGGTAACACAAACAACCACAATAACACACAACGGCATAATGCACTGGATGATGTCCTAATTCTCCTTTGTGTTGATTTC A 3867.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=2.399;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=28.20;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,95:97:99:3905,317,0 +chr5 9442940 . G T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.975;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:352,0,565 +chr5 9539032 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.221;DP=47;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:258,0,1389 +chr5 9556850 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:252,0,96 +chr5 9815763 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=1.465;DP=20;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.44;ReadPosRankSum=2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:78:597,0,78 +chr5 9815820 . G A 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-2.719;DP=41;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:743,0,606 +chr5 9845507 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,377 +chr5 9845510 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,377 +chr5 9918242 . T TTG 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.176;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:986,0,748 +chr5 9918815 . G GC 410.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:448,29,0 +chr5 9995562 . AC A 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.953;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:310,0,813 +chr5 10011702 . A G 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.065;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:999,0,1718 +chr5 10011764 . C T 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=-1.122;DP=78;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:901,0,1546 +chr5 10014462 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.047;DP=88;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:331,0,2292 +chr5 10018493 . C T 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.289;DP=81;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1335,0,1397 +chr5 10029980 . G T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.296;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1357,0,1123 +chr5 10031198 . G A 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.529;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,32:63:99:1096,0,1115 +chr5 10050386 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.132;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:348,0,2349 +chr5 10050440 . T C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-1.202;DP=72;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:939,0,1692 +chr5 10052612 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=3.753;DP=69;FS=10.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:563,0,4129 +chr5 10052615 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=4.076;DP=73;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:563,0,4129 +chr5 10090497 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-0.705;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:274,0,2167 +chr5 10101120 . T C 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 +chr5 10114027 . T C 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 +chr5 10229537 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr5 10425691 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-0.333;DP=25;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=26.59;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:693,0,181 +chr5 10434529 . A G 2273.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2302,165,0 +chr5 10434536 . C T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.665;DP=55;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1007,0,911 +chr5 10434674 . A G 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.201;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,37:62:99:1213,0,832 +chr5 10607128 . C G 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.403;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:795,0,666 +chr5 10607278 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.041;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:715,0,512 +chr5 10607349 . C T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.047;DP=51;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:903,0,824 +chr5 10607469 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.158;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=26.93;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:486,0,302 +chr5 10607478 . G T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.065;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:486,0,293 +chr5 10953316 . C CT 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=3.538;DP=42;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:641,0,1403 +chr5 10961626 . A G 280.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.20;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:309,0,19 +chr5 11404827 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.396;DP=20;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:386,0,48 +chr5 12379353 . A T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.460;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:442,0,555 +chr5 12449408 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.215;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=12.53;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:617,0,979 +chr5 12450070 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=-0.478;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:498,0,566 +chr5 12628873 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.071;DP=43;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:463,0,761 +chr5 12629082 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.054;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:711,0,896 +chr5 12926390 . GA G 307.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=1.240;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=18.11;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:15:345,15,0 +chr5 13218866 . G A 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.721;DP=78;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:1257,0,1443 +chr5 13451600 . T C 822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:851,63,0 +chr5 13717881 . A C 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 +chr5 13732838 . C T 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=1.554;DP=153;FS=2.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=8.90;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,51:153:99:1390,0,3799 +chr5 13769766 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=1.732;DP=24;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:506,0,312 +chr5 13820797 . G A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=2.450;DP=35;FS=5.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=22.79;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:826,0,402 +chr5 13820870 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.255;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:322,0,579 +chr5 13823101 . G T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-1.155;DP=40;FS=6.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:646,0,727 +chr5 13828864 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,141 +chr5 13829569 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.540;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,135 +chr5 13830440 . T A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.187;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=24.42;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:541,0,188 +chr5 13874587 . T C 1337.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1366,99,0 +chr5 13874637 . G T 2143.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2172,160,0 +chr5 13926570 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.686;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:550,0,508 +chr5 13926851 . C A 1094.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:78:1123,78,0 +chr5 13926864 . G C 1094.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1123,78,0 +chr5 14067457 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=-0.704;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:538,0,1828 +chr5 14067480 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.909;DP=93;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:336,0,4366 +chr5 14177643 . G A 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.086;DP=118;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:2036,0,2109 +chr5 14182235 . C T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=-0.117;DP=38;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.956;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:701,0,703 +chr5 14235910 . CTT C,CT 241.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,8:15:99:466,207,187,209,0,166 +chr5 14237255 . T C 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 +chr5 14239549 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=-0.236;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:347,0,962 +chr5 14240069 . A G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.325;DP=40;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:649,0,724 +chr5 14303605 . CA C 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-1.844;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:599,0,453 +chr5 14305313 . C CT 208.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:246,20,0 +chr5 14305317 . C A 217.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:20:246,20,0 +chr5 14306418 . G A 1869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=1.635;DP=83;FS=2.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=22.53;ReadPosRankSum=-0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,53:83:99:1898,0,1086 +chr5 14306557 . C T 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.058;DP=84;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=17.96;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,46:84:99:1537,0,1438 +chr5 14306653 . T A 1344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.122;DP=75;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:1373,0,1336 +chr5 14315325 . G A 1749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=2.203;DP=94;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1778,0,1471 +chr5 14372047 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.579;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:265,0,398 +chr5 14372612 . TA T 238.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:276,27,0 +chr5 14377327 . AC A 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:292,0,479 +chr5 14396487 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,290 +chr5 14397541 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-0.277;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:429,0,897 +chr5 14416983 . C G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-1.439;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:396,0,511 +chr5 14495553 . T TA 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr5 14511124 . A C 1640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-0.091;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=28.56;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:99:1669,117,0 +chr5 14511332 . C CA 1210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.315;DP=81;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1248,0,875 +chr5 14511561 . C T 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-2.372;DP=115;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:2223,0,1859 +chr5 14517836 . G C 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.277;DP=128;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:2200,0,2119 +chr5 14537769 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.513;DP=36;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:489,0,732 +chr5 14538649 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.637;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:394,0,453 +chr5 14538760 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:281,0,140 +chr5 14615437 . T A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=31.84;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:32:665,0,32 +chr5 14674625 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.035;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:358,0,370 +chr5 14749238 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:356,0,355 +chr5 14749559 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=2.637;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.48;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,146 +chr5 14750815 . G C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:350,0,172 +chr5 14760692 . A T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.091;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:513,0,682 +chr5 14763464 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.798;DP=66;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:548,0,1659 +chr5 14768411 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:338,0,99 +chr5 14849640 . C CT 1045.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.776;DP=91;FS=4.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,58:64:99:1328,110,0 +chr5 14849749 . G A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.145;DP=51;FS=7.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:974,0,854 +chr5 14858343 . TCC T 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.567;DP=54;FS=10.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:599,0,1022 +chr5 14890351 . A G 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.175;DP=55;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1055,0,805 +chr5 14890454 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-1.214;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=23.09;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:998,0,364 +chr5 14907207 . A AT 842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:86:880,86,0 +chr5 14910917 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,367 +chr5 14989275 . C A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.708;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:520,0,942 +chr5 14997762 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=1.847;DP=21;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=19.80;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:444,0,258 +chr5 15043378 . A G 1676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1705,120,0 +chr5 15043424 . G C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=22.37;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:498,0,232 +chr5 15271361 . G C 906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:935,66,0 +chr5 15271409 . A G 2174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2203,160,0 +chr5 15280100 . C T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=1.050;DP=65;FS=11.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,23:65:99:775,0,1502 +chr5 15280168 . A G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=1.019;DP=60;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:840,0,1199 +chr5 15761167 . G A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr5 15764348 . A G 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:355,24,0 +chr5 15764356 . T C 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 +chr5 16010601 . G GTT 1684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=-1.196;DP=235;FS=4.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,73:186:99:2136,0,3659 +chr5 16011848 . A AT 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-0.774;DP=182;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1545,0,1645 +chr5 16013413 . TA T 2506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.836;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=27.55;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2544,243,0 +chr5 16097567 . GT G 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.377;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:430,0,817 +chr5 16099345 . G A 2930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.214;DP=178;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,84:178:99:2959,0,3012 +chr5 16099612 . G A 2283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.715;DP=150;FS=13.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:2312,0,2664 +chr5 16100791 . C T 2041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.695;DP=149;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,60:149:99:2070,0,3009 +chr5 16102043 . GCCTGTTGTTGTT G 202.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:240,27,0 +chr5 16102057 . T C 211.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:240,27,0 +chr5 16182226 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-0.454;DP=111;FS=9.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,37:111:99:1052,0,2763 +chr5 16232555 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:39:249,0,39 +chr5 16232556 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:39:249,0,39 +chr5 16232865 . T TA 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.574;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:322,0,337 +chr5 16233136 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=-2.059;DP=57;FS=2.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=14.15;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:835,0,1062 +chr5 16351894 . T C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-2.599;DP=36;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:592,0,532 +chr5 17158613 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=2.446;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:379,0,555 +chr5 17269075 . C T 2341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.136;DP=143;FS=8.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:2370,0,2517 +chr5 17582943 . C T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.248;DP=38;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:699,0,638 +chr5 17584448 . C A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.604;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:419,0,317 +chr5 17585962 . C A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=1.056;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:654,0,1024 +chr5 17588145 . TC T 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.454;DP=24;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:294,0,195 +chr5 17612558 . A G 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:521,36,0 +chr5 17613732 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=-3.620;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=19.93;ReadPosRankSum=3.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:387,0,310 +chr5 17638396 . G A 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 +chr5 17696086 . A T 257.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:286,0,22 +chr5 17720367 . TCTGTGGAAAACAGCAAAATTATATTTTCATAAATTATCTAAACATTATTATTATTTTATTTCATCATTTATAATTACATTTGTCTTCTGAACTACAAAGATCCTTGTACATCAAATAGAAAAAAAGCAAAACAATGGTCAAAGTAC T 19689.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.685;DP=423;FS=2.218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,420:423:99:19727,1747,0 +chr5 17720562 . C CT 1042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-2.187;DP=435;FS=25.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:314,94:408:99:1080,0,8828 +chr5 17927651 . G GT 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.414;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:384,0,255 +chr5 18040208 . A C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.804;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,511 +chr5 18047031 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.985;DP=22;FS=6.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:392,0,393 +chr5 18047051 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.006;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:428,0,493 +chr5 18112016 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,385 +chr5 18112018 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,385 +chr5 18140944 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-1.092;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,178 +chr5 19530007 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.668;DP=127;FS=2.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,33:127:99:767,0,3574 +chr5 19530451 . A G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-1.425;DP=228;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,46:224:99:602,0,9216 +chr5 19531057 . A G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.035;DP=172;FS=4.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,35:172:99:612,0,5313 +chr5 19531514 . G GT 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-0.379;DP=50;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:454,0,554 +chr5 19580106 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.758;DP=160;FS=4.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,40:158:99:905,0,4569 +chr5 19591461 . G C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-3.815;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:621,0,1677 +chr5 19592003 . G GT 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.474;DP=74;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:479,0,1264 +chr5 19592016 . A T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.453;DP=66;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:540,0,2219 +chr5 19593691 . T A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.901;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:488,0,646 +chr5 19596507 . G GA 458.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-0.055;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:30:604,30,0 +chr5 19597269 . AG A 208.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:246,18,0 +chr5 19598319 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.870;DP=26;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.451;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:348,0,552 +chr5 19599314 . AT A 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-1.280;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:87:393,0,87 +chr5 19651238 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.682;DP=117;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:731,0,5461 +chr5 19652186 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=-1.341;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:460,0,2893 +chr5 19671196 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:328,0,255 +chr5 19673482 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=2.047;DP=45;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:353,0,1167 +chr5 19688154 . TCTGGGGCAAAAATTGAAATGATAAGTTTCAAATATGTAAACACTGTAATAAATATGAGTTATTTAAAAAGAATAATAAGGTATTTATGTATTTCTCTGTTGTTTTTTTAAAAATGTACTGTGATATTAACAGATTTTGTGTAC T 1723.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.644;DP=39;FS=3.869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1761,134,0 +chr5 19827276 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:406,0,227 +chr5 20607781 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:94:235,0,94 +chr5 20611344 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-1.755;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:377,0,336 +chr5 20719186 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=1.812;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:347,0,1224 +chr5 20719204 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=2.351;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=15.94;ReadPosRankSum=-2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:347,0,1224 +chr5 20726323 . T C 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:36:699,0,36 +chr5 20726342 . A G 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=36.51;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:36:699,0,36 +chr5 20726356 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=29.40;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:381,0,375 +chr5 20726469 . T C 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=33.30;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:661,0,425 +chr5 20727444 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.261;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:370,0,745 +chr5 20731953 . GCCTAGAAGCCCACATTTTGATCACTCACAGACACAGAATTGT G 1860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.578;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1898,165,0 +chr5 20732000 . ATGTCCCATTACATAAATAATATACTTATAAATTCTACATTAAACTTACTTTG A 1817.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1855,163,0 +chr5 20791426 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-2.004;DP=84;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:306,0,2570 +chr5 20805768 . A C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-1.080;DP=39;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:340,0,1021 +chr5 20821973 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.266;DP=61;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:280,0,1760 +chr5 21079760 . C CTA 276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 +chr5 21110609 . C A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-1.120;DP=44;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:315,0,1240 +chr5 21143207 . AAGGTGGTTCAGCAGCATGTATTTTCTTCACATTTTAACACATTATTCTAATTTGATGGTCTGACAGTAAGAAATCCTGTATTTGC A 1735.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-0.885;DP=48;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,41:44:72:1773,0,72 +chr5 21150166 . AAGGTTAGATTTAATAACAAAACAACTGCAATTGCTCATGAGCTGTAGCGGTCAGAGGTTTTTTTCTACTAC A 2225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.074;DP=52;FS=7.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=30.95;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2263,203,0 +chr5 21169109 . A AT 1223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-1.517;DP=60;FS=1.677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.169;QD=20.40;ReadPosRankSum=2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,45:51:95:1947,95,0 +chr5 21220475 . AT A 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:551,55,0 +chr5 21221412 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=6.043;DP=58;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=17.88;ReadPosRankSum=-2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1065,0,874 +chr5 21221889 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=1.064;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:335,0,384 +chr5 21234776 . GGGTTCGTATCACATGTAATCGGAGATAGTGATTTACAGGTTAAAATGCATAGAGCCTACTTGAATTTCTTGTCTTTCTTTTCTGAA G 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=1.309;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=31.43;ReadPosRankSum=-2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:823,0,506 +chr5 21275666 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.541;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:253,0,822 +chr5 21577887 . TA T 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.155;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:540,0,163 +chr5 21583958 . GCTGGTGCACAGAACACAGAATGCAAAATAGATCATTATGAATAAACATTTTAGAAGATATTAAACAAGAGTGATGATTCTTATTGGAATAC G 1980.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.167;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,40:43:99:2018,0,258 +chr5 21672437 . A C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.510;DP=52;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:263,0,1506 +chr5 21685781 . AT A 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.604;DP=27;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:77:443,0,77 +chr5 21736524 . CT C 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.852;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:398,0,370 +chr5 21899839 . ACTGTAAAAGGAATGAGAAAGTAAGATAATGGATCAGAGATCTTAAACAGTGGAACAGATGTTTTTATACTGAC A 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=2.706;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=31.69;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:893,0,126 +chr5 21972135 . G GT 1011.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-1.237;DP=134;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,47:129:99:1049,0,2135 +chr5 22184850 . G A 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.614;DP=261;FS=6.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,62:261:99:1231,0,7510 +chr5 22200737 . T C 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-0.334;DP=184;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,50:184:99:1136,0,5077 +chr5 22201435 . T TA 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.931;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:502,0,918 +chr5 22227480 . G GA 673.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=-0.108;DP=144;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,42:134:99:711,0,2426 +chr5 22263294 . C CA 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.532;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:296,0,512 +chr5 22263475 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-2.645;DP=51;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:230,0,1792 +chr5 22645522 . GT G 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.840;DP=145;FS=9.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.938;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,32:131:99:416,0,2513 +chr5 22646443 . G GA 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=-1.340;DP=120;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,30:104:99:494,0,1704 +chr5 22724300 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.257;DP=43;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:287,0,1090 +chr5 22949525 . TGGTAAGATGATGCCTGCTGCACACCTCGGTCAAACCCCCAATATAACCCCTTTGACCCATATGTCATTTCTGAACATTGGATACAGTATGGTTGTTTAATCTTTTATAAGAGGATCTGTTTGTGTGCGCA T 4728.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=1.115;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,111:114:99:4766,460,0 +chr5 23657534 . TCCTGCATACCCAGAAACACAAAAACTACATGAAAAAAAATCCATTCAACAGCTGGCGGAGAAGGAAAAACACACAGTGTTCA T 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=24.27;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:377,0,1868 +chr5 23667568 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:343,0,97 +chr5 23795604 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.986;DP=46;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:731,0,885 +chr5 23795717 . C G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.300;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:459,0,626 +chr5 23795978 . GT G 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.102;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:434,0,465 +chr5 23796233 . G T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.851;DP=30;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:521,0,524 +chr5 23796293 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.271;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:404,0,578 +chr5 23796578 . A G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=2.079;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:523,0,638 +chr5 23796671 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=2.957;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:327,0,1289 +chr5 23796680 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=2.746;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:282,0,1371 +chr5 23816220 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=2.208;DP=18;FS=12.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:333,0,328 +chr5 23816244 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:235,0,447 +chr5 23816268 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:329,0,357 +chr5 23828523 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.853;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:291,0,484 +chr5 23853078 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=1.470;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,539 +chr5 23880654 . T C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.241;DP=42;FS=2.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:813,0,645 +chr5 23893936 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.723;DP=45;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:397,0,1201 +chr5 23897951 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.53;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,107 +chr5 23955888 . G GT 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=1.006;DP=206;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,47:176:99:566,0,3352 +chr5 23955930 . AC A 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=4.835;DP=169;FS=18.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=1.77;ReadPosRankSum=-2.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,30:165:99:336,0,8585 +chr5 23955933 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=5.642;DP=171;FS=31.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=1.81;ReadPosRankSum=-2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,36:169:99:338,0,8585 +chr5 23956432 . T TG 2209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=-1.554;DP=157;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.198;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,67:156:99:2247,0,2883 +chr5 23956888 . GT G 1196.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.432;DP=165;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1234,0,1766 +chr5 23957021 . T A 5026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-1.657;DP=274;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,130:274:99:5055,0,10843 +chr5 23957171 . A G 4566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=1.115;DP=286;FS=6.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,126:286:99:4595,0,5521 +chr5 24248198 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,100 +chr5 24248927 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=1.792;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,254 +chr5 24258676 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:326,0,165 +chr5 24267394 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-1.408;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:371,0,158 +chr5 24298311 . A T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=-1.261;DP=37;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=17.02;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:658,0,604 +chr5 24335547 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.966;DP=212;FS=10.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,46:212:99:923,0,6401 +chr5 24348321 . A G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.038;DP=149;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,36:147:99:802,0,4298 +chr5 24356881 . T A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.047;DP=142;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,27:142:99:439,0,4251 +chr5 24377108 . T A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=-0.959;DP=285;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,44:284:99:496,0,9571 +chr5 24377128 . C G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.079;DP=339;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,57:338:99:728,0,11205 +chr5 24377348 . T A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.744;DP=224;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,41:224:99:554,0,7710 +chr5 24377555 . A G 1322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=2.156;DP=446;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:358,88:446:99:1351,0,12694 +chr5 24380431 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.169;DP=359;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,58:359:99:624,0,11643 +chr5 24382218 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.365;DP=363;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:312,51:363:99:351,0,11849 +chr5 24632650 . CCAGGTTCTTCCAGACTGCTCTGTTTACATCCTCCATCTCTGCTTAATAACACACGAGTCACTGAAGTATGTGTGTTTTGTTTGTTTCTG C 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=1.751;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:680,0,2648 +chr5 25031528 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.286;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=15.46;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:322,0,339 +chr5 25066156 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.753;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:395,0,568 +chr5 25182590 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.789;DP=50;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:362,0,1375 +chr5 25188236 . T G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.990;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:370,0,926 +chr5 25283277 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.415;DP=77;FS=9.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:401,0,2270 +chr5 25284818 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.520;DP=112;FS=7.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:356,0,3513 +chr5 25284860 . G A 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-3.854;DP=108;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,29:108:99:689,0,3119 +chr5 25303738 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=-1.789;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,26:118:99:573,0,3567 +chr5 25305032 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.959;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=15.41;ReadPosRankSum=2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:660,0,816 +chr5 25311099 . C G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.964;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:289,0,900 +chr5 25321744 . T C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=-0.698;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:951,0,252 +chr5 25331152 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-1.172;DP=46;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:389,0,1113 +chr5 25331185 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=-1.561;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:341,0,1334 +chr5 25338876 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-1.577;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:821,0,869 +chr5 25346774 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.749;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:289,0,2224 +chr5 25358810 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=2.000;DP=125;FS=5.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:703,0,3514 +chr5 25363912 . G C 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=-0.432;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,41:142:99:966,0,3951 +chr5 25458341 . A G 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.095;DP=81;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:754,0,2036 +chr5 25458611 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=-0.676;DP=72;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:382,0,2125 +chr5 25461676 . A T 1765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.479;DP=86;FS=6.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,51:77:99:1794,0,886 +chr5 25461679 . T TCCCA 1765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.229;DP=83;FS=6.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=21.27;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,46:72:99:1803,0,886 +chr5 25464000 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=1.189;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=3.36;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:233,0,1813 +chr5 25557530 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,305 +chr5 25563138 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.029;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:370,0,475 +chr5 25571656 . T C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=23.61;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:406,0,160 +chr5 25571713 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-2.236;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:497,0,177 +chr5 25572178 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:383,0,313 +chr5 25575213 . T C 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.496;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=21.38;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:755,0,515 +chr5 25592746 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.403;DP=54;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:643,0,1876 +chr5 25592749 . G T 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.363;DP=56;FS=5.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=23.76;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,37:56:99:1359,0,609 +chr5 25593102 . T G 2323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-0.216;DP=71;FS=3.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,62:71:58:2352,0,58 +chr5 25595318 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.059;DP=36;FS=3.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:536,0,1339 +chr5 25626627 . A C 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.881;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=21.59;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,31:49:99:1086,0,617 +chr5 25627050 . G T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.388;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:558,0,805 +chr5 25627410 . AAC A 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=-0.795;DP=42;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:424,0,650 +chr5 25627500 . GT G 2244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.413;DP=70;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=32.07;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,54:70:99:2282,0,140 +chr5 25627591 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=1.531;DP=48;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:393,0,1359 +chr5 25627670 . C T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=1.852;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:785,0,666 +chr5 25630323 . A T 1879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-2.050;DP=60;FS=5.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=31.33;ReadPosRankSum=-1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,51:60:73:1908,0,73 +chr5 25630368 . T C 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.885;DP=30;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=33.06;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:48:1020,0,48 +chr5 25630486 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.317;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:254,0,371 +chr5 25630793 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=30.07;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:359,0,54 +chr5 25630815 . T G 364.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=33.12;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:392,0,9 +chr5 25631365 . AT A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.387;DP=26;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:243,0,252 +chr5 25631518 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=1.077;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:283,0,954 +chr5 25632595 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:320,0,574 +chr5 25634148 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-0.702;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.038;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:618,0,191 +chr5 25634413 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.124;DP=58;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:313,0,2100 +chr5 25634587 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=-0.041;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:686,0,1739 +chr5 25634596 . C T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=1.483;DP=41;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:686,0,1737 +chr5 25634820 . G T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-1.083;DP=61;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.717;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:242,0,1846 +chr5 25634882 . G A 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-1.814;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:937,0,3443 +chr5 25634889 . T G 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-2.149;DP=74;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:937,0,3354 +chr5 25637974 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.053;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:275,0,1565 +chr5 25640622 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.030;DP=40;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.363;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:273,0,1116 +chr5 25643191 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.505;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,15:81:99:243,0,2614 +chr5 25663002 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-1.110;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=19.40;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:552,0,374 +chr5 25668478 . C G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.083;DP=32;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.18;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:578,0,480 +chr5 25668483 . A AC 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=1.451;DP=29;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=10.37;ReadPosRankSum=-2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:338,0,276 +chr5 25668603 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.997;DP=44;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:723,0,727 +chr5 25668655 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.479;DP=37;FS=3.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=13.29;ReadPosRankSum=2.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:520,0,706 +chr5 25677897 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-1.860;DP=109;FS=4.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=3.70;ReadPosRankSum=3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:432,0,3325 +chr5 25679229 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-1.170;DP=51;FS=7.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:800,0,1046 +chr5 25679314 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=2.088;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:311,0,2143 +chr5 25679592 . G T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=3.145;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=17.68;ReadPosRankSum=-3.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:824,0,1520 +chr5 25679596 . T G 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=2.758;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=18.60;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:828,0,1595 +chr5 25679815 . T A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.034;DP=45;FS=18.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:643,0,1850 +chr5 25681621 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.116;DP=98;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.184;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:487,0,2868 +chr5 25684619 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=1.761;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:310,0,3081 +chr5 25700482 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.111;DP=263;FS=10.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.94;ReadPosRankSum=-2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,57:263:99:1065,0,11067 +chr5 25700487 . A G 1426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-4.697;DP=264;FS=38.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=5.40;ReadPosRankSum=3.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,66:264:99:1455,0,10030 +chr5 25701169 . G A 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-2.576;DP=275;FS=13.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,82:274:99:2036,0,12885 +chr5 25709367 . T C 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.471;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,73:341:99:1296,0,9995 +chr5 25725333 . C G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.246;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:397,0,817 +chr5 25728821 . G GA 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.351;DP=285;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,50:245:99:636,0,5353 +chr5 25729425 . A T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 +chr5 25730234 . A G 3587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.560;DP=199;FS=4.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.798;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,108:199:99:3616,0,3335 +chr5 25730376 . A AG 4438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-1.766;DP=181;FS=2.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.901;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,127:176:99:4476,0,1151 +chr5 25730476 . T G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=4.393;DP=99;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=4.21;ReadPosRankSum=-3.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:445,0,3214 +chr5 25730607 . G A 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.372;DP=54;FS=2.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:960,0,917 +chr5 25730663 . GT G 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=1.917;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=36.59;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:1057,0,400 +chr5 25732001 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.358;DP=24;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:518,0,279 +chr5 25732052 . C T 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-1.855;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1006,0,984 +chr5 25732106 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.116;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.045;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:246,0,399 +chr5 25732763 . G A 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr5 25742834 . G A 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.258;DP=52;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=27.84;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:1476,0,351 +chr5 25743165 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=1.083;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:663,0,1169 +chr5 25743256 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=2.123;DP=61;FS=4.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:386,0,1865 +chr5 25756505 . A G 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.357;DP=219;FS=7.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,50:219:99:1004,0,6473 +chr5 25758381 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.646;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:371,0,657 +chr5 25759338 . G C 3101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-1.273;DP=189;FS=9.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,94:189:99:3130,0,3322 +chr5 25759356 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-1.464;DP=186;FS=4.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,34:186:99:451,0,5632 +chr5 25760198 . A G 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.501;DP=197;FS=6.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,43:197:99:885,0,5984 +chr5 25760938 . TTA T 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.667;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:363,0,197 +chr5 25766156 . AT A 1795.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.336;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,79:119:99:1833,0,1788 +chr5 25766203 . A G 3974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-2.134;DP=97;FS=4.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,70:95:99:4003,0,361 +chr5 25798057 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=2.446;DP=118;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:1565,0,2421 +chr5 25798185 . G T 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.970;DP=75;FS=7.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:1338,0,1352 +chr5 25798223 . G T 1388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.638;DP=88;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1417,0,1629 +chr5 25798997 . G GA 2064.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.057;DP=165;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,95:161:99:2170,0,1593 +chr5 25800921 . TGA T 1350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.026;DP=123;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1388,0,1767 +chr5 25802066 . C T 2420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.140;DP=137;FS=6.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:2449,0,2410 +chr5 25802651 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.494;DP=142;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,27:142:99:447,0,4677 +chr5 25802772 . A G 2606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=-3.932;DP=222;FS=2.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=11.74;ReadPosRankSum=3.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,78:222:99:2635,0,4941 +chr5 25803073 . G A 3227.04 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-0.139;DP=292;FS=11.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,98:292:99:3255,0,6818 +chr5 25803097 . G A 3490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-2.390;DP=298;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,105:298:99:3519,0,6751 +chr5 25803396 . C T 4904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.785;DP=292;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,140:292:99:4933,0,5121 +chr5 25804221 . GT G 2153.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.646;DP=151;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,91:145:99:2191,0,1265 +chr5 25804296 . G T 6257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-0.915;DP=216;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,156:216:99:6286,0,1420 +chr5 25804304 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.040;DP=225;FS=4.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,32:224:99:250,0,10105 +chr5 25804475 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.549;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:494,0,476 +chr5 25807668 . A T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.565;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:720,0,2478 +chr5 25807676 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.954;DP=55;FS=2.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:720,0,2429 +chr5 25808821 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.55;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:61:310,0,61 +chr5 25817366 . C T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.344;DP=79;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,26:78:99:752,0,2025 +chr5 25819428 . A G 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.465;DP=90;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1583,0,1480 +chr5 25822342 . T G 2134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-2.161;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=15.03;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:2163,0,3893 +chr5 25822370 . A C 1824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.781;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1853,0,3493 +chr5 25822445 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=1.744;DP=66;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1022,0,1247 +chr5 25848715 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-1.085;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:357,0,455 +chr5 25850617 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=18.04;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:389,0,266 +chr5 25850630 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:360,0,281 +chr5 25852867 . A T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.207;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:581,0,579 +chr5 25852928 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.311;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:390,0,577 +chr5 25853075 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-3.204;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=24.20;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:367,0,391 +chr5 25853455 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.785;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:294,0,1069 +chr5 25853458 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:294,0,1071 +chr5 25854106 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:229,0,359 +chr5 25854248 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=-1.418;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:301,0,529 +chr5 25854253 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:466,0,190 +chr5 25868294 . CT C 2803.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.513;DP=121;FS=1.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,71:116:99:2841,0,3086 +chr5 25868396 . CT C 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=-1.405;DP=110;FS=6.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=7.77;ReadPosRankSum=3.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:892,0,2200 +chr5 25868577 . G A 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-1.848;DP=359;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,90:359:99:2079,0,10437 +chr5 25868732 . T G 1606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-2.189;DP=225;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,64:225:99:1635,0,6452 +chr5 25868791 . C T 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-1.559;DP=231;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,66:231:99:1633,0,6250 +chr5 25869143 . G A 5791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.811;DP=225;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=25.74;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,158:224:99:5820,0,1570 +chr5 25877452 . A T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.158;ClippingRankSum=0.642;DP=282;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,43:282:99:441,0,10673 +chr5 25877716 . G C 5480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-1.160;DP=295;FS=1.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,149:295:99:5509,0,8332 +chr5 25877719 . T G 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.635;DP=305;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.423;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,69:305:99:1352,0,15811 +chr5 25877886 . C T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.769;DP=258;FS=8.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,65:258:99:1505,0,7588 +chr5 25877937 . T C 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-1.422;DP=271;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,65:271:99:1413,0,8024 +chr5 25878250 . T A 4222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-1.437;DP=257;FS=31.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,120:257:99:4251,0,6947 +chr5 25878259 . C T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.718;DP=275;FS=16.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,67:275:99:1369,0,12813 +chr5 25878478 . TCCTGCAATGAGCACAGACCATCCGTGTGTTTAGATGTAAATAATGAAGTCGCATTGAAAATGACAGTTTAGCTAAAGTCAAACACAAA T 1594.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.127;DP=401;FS=1.903;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,373:377:99:1632,614,0 +chr5 25879372 . A T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.934;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=27.77;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:82:417,0,82 +chr5 25881911 . A G 5891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=-0.131;DP=397;FS=32.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,168:397:99:5920,0,7808 +chr5 25886895 . A T 5083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-1.527;DP=349;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,153:349:99:5112,0,6806 +chr5 25889177 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=1.054;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:283,0,331 +chr5 25889483 . CT C 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.182;DP=46;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:399,0,421 +chr5 25890294 . G C 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.643;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:756,0,1212 +chr5 25909527 . G A 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.027;DP=52;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=34.63;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,45:52:52:1829,0,52 +chr5 25910187 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.667;DP=66;FS=6.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:277,0,2032 +chr5 25913808 . T A 1500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-1.307;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=28.32;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1529,0,275 +chr5 25914446 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr5 25914482 . C A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr5 25918355 . C T 9658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=1.296;DP=346;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,257:345:99:9687,0,1966 +chr5 25928524 . AC A 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.507;ClippingRankSum=-0.824;DP=201;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,94:186:99:2299,0,2829 +chr5 25956938 . T C 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 +chr5 25957228 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,258 +chr5 25999426 . GAA G 1012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.059;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:1331,0,756 +chr5 25999569 . G A 2091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.656;DP=113;FS=1.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:2120,0,1880 +chr5 26000014 . C A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.498;DP=200;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,55:200:99:1287,0,5524 +chr5 26000245 . G A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.474;DP=185;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,32:185:99:679,0,12285 +chr5 26000254 . G A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=1.341;DP=193;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=3.23;ReadPosRankSum=-2.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,36:193:99:651,0,12285 +chr5 26000659 . G C 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.536;DP=174;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,47:172:99:1078,0,4865 +chr5 26000696 . G A 2968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-2.979;DP=183;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,85:183:99:2997,0,3201 +chr5 26000716 . A G 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.502;DP=182;FS=9.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,47:182:99:1079,0,5258 +chr5 26001082 . G A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.405;DP=170;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:517,0,5297 +chr5 26002159 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=-0.416;DP=138;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:99:677,0,4013 +chr5 26002434 . G T 2287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.077;DP=132;FS=5.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:2316,0,2410 +chr5 26179692 . G GA 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.238;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:700,0,604 +chr5 26180683 . G A 4184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.941;DP=239;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,124:239:99:4213,0,4392 +chr5 26180883 . G GA 4073.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.115;DP=268;FS=0.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,167:249:99:4115,0,1875 +chr5 26181141 . A G 7070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.984;ClippingRankSum=-1.994;DP=274;FS=10.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,189:274:99:7099,0,2057 +chr5 26181254 . GCTGTGGAATAGAGAAAACAGACAGTCATCCGAGTTTGCAATACTTCATAAGAATGGCACTTTACTACACAAGTCACGGCTAAAAGGGTAC G 12342.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-1.001;DP=301;FS=2.862;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=31.89;ReadPosRankSum=2.716 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,292:301:99:12380,849,0 +chr5 26181393 . G A 10118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=0.173;DP=402;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,278:400:99:10147,0,3116 +chr5 26183377 . TCTGCAATATTGTTTTGAAGTTACTTAGGCATCTCATAAGCATGATTGTAATTGTGTACAATGAAGTTATGCATTATTTTTTTAGATCTTATAAATGTATGATTTGCTTAAGGGCACTTAC T 18091.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=3.406;DP=404;FS=1.435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=30.90;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,396:403:99:18129,1497,0 +chr5 26190857 . C T 1833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.102;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.430;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1862,0,1931 +chr5 26191094 . C T 2238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=1.795;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:2267,0,1739 +chr5 26191141 . A T 2095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-2.280;DP=120;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:2124,0,2018 +chr5 26193892 . A C 1562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.124;DP=87;FS=2.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,49:87:99:1591,0,1364 +chr5 26200473 . T G 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=1.145;DP=70;FS=6.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,41:70:99:1432,0,1055 +chr5 26200736 . C CT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.870;DP=29;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:258,0,552 +chr5 26201427 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-1.473;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:341,0,220 +chr5 26204428 . TCTGGGTTGACAGAAATGAAGAAATATATTTAGATTTTAGTTGACCTGCACCCTAGTTATCAGAGATTTCCGGGATCTTAC T 1212.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=1.284;DP=33;FS=2.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=34.48;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,30:33:10:1249,0,10 +chr5 26211050 . A G 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.374;DP=34;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=28.02;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:981,0,151 +chr5 26212868 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.415;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:848,0,817 +chr5 26213230 . G C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.875;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:454,0,505 +chr5 26236395 . C A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.331;DP=50;FS=4.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:564,0,1261 +chr5 26244686 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr5 26257632 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.486;DP=42;FS=7.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:250,0,1154 +chr5 26265156 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:261,0,513 +chr5 26425769 . T TA 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=1.811;DP=36;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:349,0,524 +chr5 26425843 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.247;DP=66;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:301,0,1941 +chr5 26426343 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.218;DP=81;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:749,0,3799 +chr5 26426429 . A C 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=1.293;DP=71;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=17.05;ReadPosRankSum=2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1239,0,2924 +chr5 26426432 . C A 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=1.581;DP=72;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=16.82;ReadPosRankSum=2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1239,0,2959 +chr5 26426496 . A T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-3.112;DP=72;FS=12.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.288;QD=8.71;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:655,0,1832 +chr5 26426546 . GT G 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.999;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:99:332,0,5749 +chr5 26426790 . T C 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.066;DP=98;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,30:97:99:638,0,2985 +chr5 26426911 . G A 3158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.420;DP=80;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,51:80:99:3187,0,692 +chr5 26426948 . C T 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.444;DP=123;FS=5.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1847,0,3353 +chr5 26447179 . A G 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=1.088;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,32:129:99:740,0,3850 +chr5 26462985 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=-1.060;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,29:127:99:491,0,3752 +chr5 26464314 . A G 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 +chr5 26486132 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-1.810;DP=30;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:308,0,1749 +chr5 26486609 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,382 +chr5 26488845 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.791;DP=28;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:631,0,324 +chr5 26537939 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.480;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:260,0,839 +chr5 26537972 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-0.206;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:338,0,656 +chr5 26542524 . AT A 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.891;DP=62;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:823,0,338 +chr5 26542678 . TA T 1082.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=1.974;DP=257;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,74:240:99:1120,0,4010 +chr5 26543315 . ACTAAAAAAAAAAAAAAAAATTAATTTAGATTTATGCATATTTACCAGCCAAAACAATTCATCTAGTACGATGGATCTCTCAC A 15098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=1.738;DP=384;FS=7.422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=23.63;ReadPosRankSum=1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,375:384:99:15136,1100,0 +chr5 26544483 . CA C 3505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.139;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=36.77;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,42:63:42:3543,0,42 +chr5 26544520 . G T 2001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-2.087;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.318;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,58:86:99:2030,0,1510 +chr5 26544710 . G GT 973.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.444;DP=85;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,49:77:99:1011,0,541 +chr5 26545246 . C T 3616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=-1.266;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,38:170:99:3645,0,3953 +chr5 26545314 . TA T 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.089;DP=131;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=5.20;ReadPosRankSum=4.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:719,0,6192 +chr5 26545991 . G A 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=2.002;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,36:153:99:793,0,5595 +chr5 26546515 . T G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.128;DP=159;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,26:159:99:327,0,5214 +chr5 26546583 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.861;DP=147;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,28:147:99:465,0,4583 +chr5 26555877 . C G 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.735;DP=61;FS=7.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:782,0,1330 +chr5 26556275 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.508;DP=67;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=6.55;ReadPosRankSum=2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:467,0,1828 +chr5 26556305 . T TA 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-1.918;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:679,0,743 +chr5 26556858 . A AT 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-0.909;DP=128;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,42:119:99:664,0,2016 +chr5 26565122 . A T 301.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:10:329,0,10 +chr5 26565130 . G A 301.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:329,0,10 +chr5 26570832 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-0.411;DP=72;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:333,0,2044 +chr5 26578096 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.772;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:415,0,1827 +chr5 26584148 . C A 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:496,36,0 +chr5 26681382 . C A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-1.063;DP=59;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:408,0,2743 +chr5 26681391 . T A 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.240;DP=62;FS=6.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:1134,0,1013 +chr5 26681510 . T C 1911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-2.262;DP=69;FS=3.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.152;QD=27.71;ReadPosRankSum=2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,51:69:99:1940,0,413 +chr5 26715052 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:337,0,295 +chr5 26715194 . T C 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.717;DP=39;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:923,0,490 +chr5 26715343 . TAA T 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.872;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:452,0,707 +chr5 26715466 . TCCTGTTTAAAAGTTAAAAAACCATAAGTATTGTGATTAACCATAATACAATTTACAAACACACACACACATATTTCCATTTATCTTA T 2256.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=2.885;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=32.71;ReadPosRankSum=-2.918 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,58:61:99:2294,190,0 +chr5 26717533 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.015;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:388,0,886 +chr5 26719269 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-0.689;DP=28;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:727,0,243 +chr5 26724408 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-1.905;DP=43;FS=2.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:388,0,1095 +chr5 26726783 . A T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.110;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=22.10;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:846,0,507 +chr5 26726796 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=1.088;DP=42;FS=10.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:325,0,1074 +chr5 26726957 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.857;DP=53;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=15.39;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:844,0,1064 +chr5 26727076 . ACTGTGGAGATCATCATCAATGTGGGGAAAATACAAAGCACAAGCGCATACAAATGTTTCACAAACACTCAC A 1776.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=1.473;DP=44;FS=3.716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=33.36;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1814,165,0 +chr5 26727203 . G A 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.686;DP=45;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=24.93;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1150,0,417 +chr5 26731957 . T C 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.055;DP=68;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,33:68:99:1178,0,1105 +chr5 26733708 . C G 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-1.373;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:1006,0,1238 +chr5 26737401 . T A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=-0.921;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:471,0,574 +chr5 26744606 . A G 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 +chr5 26746476 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.699;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:322,0,2382 +chr5 26746727 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-1.970;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:479,0,1355 +chr5 27000626 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:499,0,279 +chr5 27000651 . A G 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.574;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:679,0,345 +chr5 27002581 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,900 +chr5 27005131 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.407;DP=56;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:350,0,1642 +chr5 27006863 . C T 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.289;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.365;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1167,0,1266 +chr5 27006951 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.356;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.724;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:410,0,496 +chr5 27007007 . A T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-1.246;DP=32;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:557,0,606 +chr5 27007165 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-1.546;DP=49;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:251,0,1488 +chr5 27007479 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.921;DP=101;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,30:100:99:705,0,2596 +chr5 27008210 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.913;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:366,0,2789 +chr5 27008853 . A G 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=2.019;DP=99;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=11.76;ReadPosRankSum=-2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:1192,0,2380 +chr5 27009444 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.643;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:354,0,349 +chr5 27009504 . T G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:401,0,673 +chr5 27009538 . G C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.543;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:401,0,254 +chr5 27010055 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.647;DP=58;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:706,0,1995 +chr5 27010179 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.820;DP=47;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:347,0,1309 +chr5 27010711 . T TC 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=-0.209;DP=56;FS=6.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:297,0,1179 +chr5 27010766 . C CA 1610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.555;DP=66;FS=6.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=24.41;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:1648,0,162 +chr5 27010819 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-2.055;DP=62;FS=3.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=7.67;ReadPosRankSum=-2.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:504,0,1687 +chr5 27010864 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.036;DP=63;FS=3.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:845,0,2675 +chr5 27011152 . A T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.441;DP=94;FS=1.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,26:94:99:649,0,3577 +chr5 27020025 . C T 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.582;DP=141;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1556,0,2869 +chr5 27225049 . C T 13008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=2.008;DP=631;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=20.62;ReadPosRankSum=3.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,381:631:99:13037,0,8940 +chr5 27226805 . G T 9849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=1.068;DP=478;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,285:477:99:9878,0,6782 +chr5 27252016 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.623;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:231,0,598 +chr5 27257777 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.287;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:397,0,476 +chr5 27263864 . G A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-1.119;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:796,0,791 +chr5 27338262 . TC T 2265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-2.855;DP=140;FS=0.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=16.18;ReadPosRankSum=3.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,88:129:99:2303,0,1863 +chr5 27371171 . C T 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:247,0,22 +chr5 27371884 . T C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=32.45;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:42:515,0,42 +chr5 27372897 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.610;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=21.07;ReadPosRankSum=2.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:534,0,315 +chr5 27378533 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.541;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:406,0,2409 +chr5 27397932 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.508;DP=38;FS=8.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:529,0,822 +chr5 27399441 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.054;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=21.49;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,202 +chr5 27404845 . A T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.168;DP=52;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1002,0,581 +chr5 27410310 . G A 1420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.950;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:1449,0,1530 +chr5 27414350 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-0.157;DP=45;FS=11.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:416,0,2051 +chr5 27415019 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.749;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:537,0,2024 +chr5 27424870 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.582;DP=74;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:444,0,3496 +chr5 27434964 . A T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.684;DP=79;FS=9.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:411,0,2327 +chr5 27435063 . T A 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.429;DP=75;FS=14.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:1319,0,1296 +chr5 27435075 . C T 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-0.043;DP=69;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:911,0,1511 +chr5 27435093 . C T 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.518;DP=64;FS=8.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,34:64:99:1144,0,1092 +chr5 27440474 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.918;DP=76;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.87;ReadPosRankSum=1.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:550,0,2175 +chr5 27453190 . G A 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.699;DP=123;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1828,0,2174 +chr5 27455276 . C A 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-2.143;DP=63;FS=3.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:920,0,1240 +chr5 27455306 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.033;DP=65;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:1056,0,1147 +chr5 27456675 . AAGGTACAGTACTTTTACAACATGGAAAAATTCATTTAAATGTCAGCTTTACCTAGTCTGATTCCCATAACCATCTCTTTAC A 3376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=1.130;DP=86;FS=2.194;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=33.86;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,83:86:99:3414,273,0 +chr5 27457100 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.939;DP=80;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:376,0,2535 +chr5 27457186 . C CA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.844;DP=48;FS=1.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:431,0,594 +chr5 27457197 . T A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=1.312;DP=46;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:299,0,1796 +chr5 27458005 . A AT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-2.469;DP=33;FS=11.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=8.54;ReadPosRankSum=2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:319,0,413 +chr5 27708081 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,146 +chr5 27711001 . C T 255.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:284,0,19 +chr5 27720094 . C G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.510;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:471,0,500 +chr5 27722285 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.893;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:488,0,637 +chr5 27722311 . A T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-1.971;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=13.27;ReadPosRankSum=2.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:466,0,697 +chr5 27724459 . T G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:272,0,186 +chr5 27725545 . G C 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-1.815;DP=38;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=26.02;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:1017,0,359 +chr5 27725628 . T C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.888;DP=29;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:860,0,129 +chr5 27725725 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=3.123;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:331,0,198 +chr5 27726820 . A C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.177;DP=50;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:414,0,1318 +chr5 27748111 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.959;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:404,0,318 +chr5 27779537 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:91:334,0,91 +chr5 27785041 . C T 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.448;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1468,0,1541 +chr5 27807269 . T A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-1.331;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:499,0,494 +chr5 27839381 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-0.363;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:340,0,850 +chr5 27839411 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.091;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,706 +chr5 27844223 . A T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.049;DP=64;FS=7.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:896,0,1249 +chr5 27845228 . T G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.795;ClippingRankSum=0.151;DP=86;FS=2.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:432,0,2340 +chr5 27847285 . C T 2440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.525;DP=96;FS=15.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=25.42;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,65:96:99:2469,0,896 +chr5 27847357 . A G 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-4.492;DP=52;FS=8.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:788,0,1048 +chr5 27847650 . G T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:283,0,228 +chr5 27851213 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.813;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:273,0,885 +chr5 27855642 . T A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-1.693;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:406,0,402 +chr5 27862712 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.799;DP=77;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:366,0,2330 +chr5 27862770 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.993;DP=68;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:272,0,2146 +chr5 27877339 . A T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.775;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:642,0,757 +chr5 27907732 . A AT 434.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:46:493,46,0 +chr5 27908645 . G A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=1.414;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:857,0,1223 +chr5 27908666 . G T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.720;DP=50;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:404,0,1379 +chr5 27909260 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.154;DP=37;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:289,0,1091 +chr5 27909537 . CA C 1779.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.220;DP=104;FS=9.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,69:99:99:1817,0,1344 +chr5 27909547 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-1.436;DP=113;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,24:113:99:465,0,5359 +chr5 27909851 . GA G 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:673,67,0 +chr5 27919810 . T A 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.750;DP=46;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=17.30;ReadPosRankSum=-1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:824,0,708 +chr5 27928745 . G A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-2.534;DP=80;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:865,0,1718 +chr5 27933791 . C T 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.312;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,56:191:99:1315,0,5010 +chr5 28000549 . G C 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=2.327;DP=118;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:1511,0,2425 +chr5 28013880 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.843;DP=144;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,32:144:99:634,0,4371 +chr5 28013970 . C T 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=-2.216;DP=138;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,34:138:99:712,0,3967 +chr5 28110625 . CCT C 2368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.096;DP=90;FS=5.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,69:85:99:2406,0,216 +chr5 28110739 . C T 1710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-1.717;DP=84;FS=6.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,53:82:99:1739,0,1209 +chr5 28331953 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=2.985;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:385,0,546 +chr5 28341969 . A G 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.008;DP=59;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1288,0,765 +chr5 28366186 . GT G 1128.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1166,112,0 +chr5 28366416 . CT C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.849;DP=17;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.763;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:78:283,0,78 +chr5 28366515 . T G 1009.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.138;DP=30;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.728;QD=33.67;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:5:1037,0,5 +chr5 28380808 . T C 1214.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1243,87,0 +chr5 28395838 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:99:230,0,99 +chr5 28397158 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.063;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:76:521,0,76 +chr5 28398333 . A T 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr5 28398950 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:291,0,66 +chr5 28399443 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:404,0,290 +chr5 28399482 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.515;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=23.32;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:448,0,211 +chr5 28399586 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=23.73;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:92:313,0,92 +chr5 28400209 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.856;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:555,0,159 +chr5 28400887 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=2.430;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,414 +chr5 28401466 . C A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-1.237;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:485,0,479 +chr5 28428275 . A T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr5 28434834 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-1.472;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:240,0,1340 +chr5 28434835 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-0.528;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:240,0,1340 +chr5 28438122 . G C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.853;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:489,0,261 +chr5 28443762 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-3.365;DP=69;FS=1.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=3.26;ReadPosRankSum=-2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:253,0,2058 +chr5 28443783 . A C 1514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=3.348;DP=78;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=19.42;ReadPosRankSum=-3.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:1543,0,4366 +chr5 28449798 . C T 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.325;DP=236;FS=1.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.692;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,53:235:99:1107,0,7072 +chr5 28450264 . AAT A 2097.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=-1.474;DP=100;FS=2.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=20.98;ReadPosRankSum=3.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:99:99:2135,0,1657 +chr5 28451671 . A C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.345;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:939,0,203 +chr5 28453770 . C T 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=1.466;DP=52;FS=7.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=28.67;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,40:52:99:1519,0,288 +chr5 28461368 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.533;DP=57;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:691,0,2581 +chr5 28461372 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.726;DP=55;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:691,0,2570 +chr5 28461493 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.897;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:549,0,2887 +chr5 28465551 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.006;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=5.34;ReadPosRankSum=3.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:429,0,2232 +chr5 28469714 . T A 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 +chr5 28471022 . T A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr5 28473007 . GA G 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.501;DP=22;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:275,0,174 +chr5 28473517 . TA T 527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:565,55,0 +chr5 28500821 . C T 1334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=1.576;DP=43;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.388;QD=31.04;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1363,0,138 +chr5 28502602 . G A 1884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-0.949;DP=66;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,51:66:99:1913,0,282 +chr5 28502635 . C T 1596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.069;DP=57;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=28.01;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1625,0,203 +chr5 28503684 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.181;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:253,0,2479 +chr5 28503958 . C A 1912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.641;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=28.55;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,50:67:99:1941,0,418 +chr5 28509753 . A T 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.423;DP=20;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=32.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:683,0,28 +chr5 28509806 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.855;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.67;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,159 +chr5 28510128 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=-0.514;DP=38;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:279,0,1132 +chr5 28510221 . T C 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=1.682;DP=34;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:65:1048,0,65 +chr5 28529319 . C T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr5 28529594 . CAT C 1313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.834;DP=45;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=29.19;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,33:45:99:1351,0,343 +chr5 28530387 . T A 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.859;DP=65;FS=5.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,38:65:99:1295,0,971 +chr5 28565866 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.270;DP=49;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:830,0,919 +chr5 28571639 . G GGA 221.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:259,17,0 +chr5 29042858 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:270,0,60 +chr5 29044041 . C T 259.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:288,0,16 +chr5 29044189 . T G 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 +chr5 29054415 . GCAGGTAAGTCACACATTTTTAAAACTTTCTTTAGATTATTCCAGACATTTCTTCTAACTACACCTTTTTTTGCGTCACAAAATGTTTTTCAACTC G 2068.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.289;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:2106,161,0 +chr5 29054699 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.275;DP=46;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:354,0,1194 +chr5 29131521 . G A 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.185;DP=60;FS=5.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1060,0,1002 +chr5 29183091 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.516;DP=52;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:970,0,819 +chr5 29183570 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=1.399;DP=34;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:345,0,902 +chr5 29184265 . G A 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=1.048;DP=82;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.69;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,44:81:99:1479,0,1359 +chr5 29184403 . A G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.281;DP=36;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:631,0,675 +chr5 29185166 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.315;DP=49;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:706,0,2034 +chr5 29185290 . G T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.026;DP=55;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.847;QD=13.63;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:778,0,1147 +chr5 29388693 . C G 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +chr5 29511251 . GA G 356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:394,40,0 +chr5 29511524 . C G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-1.570;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:576,0,167 +chr5 29512098 . T C 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=1.795;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,39:61:99:1430,0,1619 +chr5 29512107 . G T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=1.975;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=25.03;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,36:56:99:1430,0,1619 +chr5 29548929 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=1.626;DP=22;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=30.13;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:29:691,0,29 +chr5 29567410 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.215;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:844,0,281 +chr5 29567601 . T A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:510,0,164 +chr5 29567940 . A C 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.481;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:578,0,316 +chr5 29569298 . G GT 251.29 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.058;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:540,0,100 +chr5 29596027 . G A 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.999;DP=46;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=29.84;ReadPosRankSum=2.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1401,0,206 +chr5 29639106 . G A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-1.692;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=28.47;ReadPosRankSum=1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:94:797,0,94 +chr5 29642842 . T C 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.180;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:1486,0,532 +chr5 29642858 . C T 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.585;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=25.07;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1332,0,456 +chr5 29642932 . G GT 1075.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1197,119,0 +chr5 29643176 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.250;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:564,0,267 +chr5 29687197 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=30.89;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:57:368,0,57 +chr5 29687281 . GGCAGGTGAGCTGCTGCTTTACACGTGTTCCAATTTATTAATAAGAAGGAAAAATCACATGCTAACTAATTCTGTTTACTGAAAATTTC G 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=1.552;DP=16;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=28.48;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:493,0,601 +chr5 29777215 . T G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=19.70;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:304,0,219 +chr5 29777860 . T TA 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-3.244;DP=33;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=8.02;ReadPosRankSum=2.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:302,0,411 +chr5 29778497 . A G 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.718;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=26.77;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:858,0,611 +chr5 29923517 . T C 2399.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-1.153;DP=65;FS=8.860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,58:65:19:2428,19,0 +chr5 29923632 . C T 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.960;DP=57;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,46:57:99:1792,0,225 +chr5 29923807 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.182;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:475,0,130 +chr5 29936213 . G GT 782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:820,69,0 +chr5 29936229 . C T 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:805,54,0 +chr5 29936453 . A G 577.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:606,42,0 +chr5 29936494 . A T 738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:767,54,0 +chr5 29936614 . C T 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1369,99,0 +chr5 29936755 . A C 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 +chr5 29937325 . ACT A 406.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:444,31,0 +chr5 29937952 . G T 720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:749,51,0 +chr5 29938077 . G T 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:645,45,0 +chr5 29938103 . G A 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 +chr5 29939086 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 +chr5 29951151 . AT A 1758.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=1.548;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=21.71;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,65:81:99:1796,0,139 +chr5 29951313 . G A 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=3.314;DP=56;FS=13.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1402,0,477 +chr5 29951634 . T C 1737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1766,126,0 +chr5 29951755 . T A 2332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.383;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=33.81;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,60:69:59:2361,0,59 +chr5 30000157 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr5 30000158 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr5 30021964 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:261,0,97 +chr5 30078063 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=25.18;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:406,0,123 +chr5 30134825 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:301,0,136 +chr5 30134877 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,141 +chr5 30135058 . C G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.454;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:394,0,280 +chr5 30135575 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.196;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=26.72;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:429,0,131 +chr5 30137167 . T G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.283;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.06;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:419,0,138 +chr5 30137358 . G T 239.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:268,0,22 +chr5 30149819 . C T 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 +chr5 30150726 . G C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr5 30163943 . A T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr5 30167413 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,136 +chr5 30199269 . C CT 3182.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-1.866;DP=295;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,189:256:99:4198,0,784 +chr5 30209110 . ACTGACAAACAACAAAACACACAACTGAGACTCACTGCTTCCTTCTGTTCCGCAAGAATAATGACTGACAGTCTGAGTTAC A 14351.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.714;DP=339;FS=3.232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=34.56;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,320:339:99:14389,1127,0 +chr5 30214070 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-2.231;DP=42;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=19.45;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:845,0,466 +chr5 30215361 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.866;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:550,0,156 +chr5 30215703 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:473,0,691 +chr5 30216051 . T A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.071;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:80:551,0,80 +chr5 30217407 . C T 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.833;DP=45;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1304,0,190 +chr5 30219278 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.260;DP=26;FS=5.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:67:694,0,67 +chr5 30220723 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:47:391,0,47 +chr5 30220847 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.417;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=26.94;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:540,0,165 +chr5 30221067 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=-0.637;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:684,0,490 +chr5 30221167 . A G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.555;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:904,0,791 +chr5 30221172 . A T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.186;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=28.25;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:904,0,791 +chr5 30221288 . A C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.024;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:622,0,670 +chr5 30221321 . A T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-0.042;DP=32;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=27.24;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:900,0,254 +chr5 30221546 . T C 11883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=-2.870;DP=318;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=27.49;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,272:315:99:11912,179,0 +chr5 30221680 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr5 30222003 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,323 +chr5 30222068 . T A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=24.20;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:367,0,133 +chr5 30222521 . G T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,213 +chr5 30222848 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,206 +chr5 30230445 . G C 10720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.202;DP=339;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=31.62;ReadPosRankSum=2.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,280:339:99:10749,0,833 +chr5 30241805 . A T 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=8.398;DP=215;FS=54.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=3.35;ReadPosRankSum=-6.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,41:215:99:749,0,13926 +chr5 30241808 . T A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=8.105;DP=211;FS=46.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.33;ReadPosRankSum=-7.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,37:211:99:731,0,13926 +chr5 30263431 . C T 4474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=6.225;DP=252;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=17.76;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,123:251:99:4503,0,4661 +chr5 30263502 . C T 2705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.413;DP=172;FS=9.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,80:171:99:2734,0,2969 +chr5 30391670 . C A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr5 30393099 . G GA 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-1.896;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:412,0,124 +chr5 30397373 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:76:279,0,76 +chr5 30397478 . G A 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.109;DP=32;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:899,0,203 +chr5 30411974 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=1.714;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=31.93;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:29:571,0,29 +chr5 30421425 . T C 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-1.543;DP=47;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,39:47:99:1612,0,278 +chr5 30421426 . C T 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=-1.065;DP=48;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=33.00;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1612,0,278 +chr5 30508888 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=27.40;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:357,0,84 +chr5 30508899 . A G 323.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.39;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:352,0,16 +chr5 30510230 . G T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.066;DP=19;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=34.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:32:681,0,32 +chr5 30511217 . C T 770.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.685;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:12:798,0,12 +chr5 30554844 . T C 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.064;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=26.62;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:667,0,194 +chr5 30556176 . A G 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=2.959;DP=57;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=34.91;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,35:57:99:2018,0,1335 +chr5 30556190 . G A 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=4.551;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=33.72;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:2018,0,1317 +chr5 30565914 . C T 1480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-0.696;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1509,0,1649 +chr5 30583905 . G A 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.214;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1251,0,183 +chr5 30583959 . A G 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.871;DP=48;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1491,0,122 +chr5 30587184 . C T 1937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-2.711;DP=57;FS=1.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=34.00;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,50:57:44:1966,0,44 +chr5 30607630 . T G 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:457,33,0 +chr5 30607648 . A C 372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 +chr5 30634620 . C T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr5 30768901 . T C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:303,21,0 +chr5 30769132 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:292,21,0 +chr5 30987380 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:80:403,0,80 +chr5 30987468 . C A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.084;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=27.32;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:520,0,327 +chr5 31010283 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-1.667;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=32.11;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:542,0,35 +chr5 31436848 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:305,0,305 +chr5 31437395 . T C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.765;ClippingRankSum=-0.269;DP=40;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:484,0,845 +chr5 31437443 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.127;DP=46;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:615,0,928 +chr5 31728965 . CAGGTAGGAAACGCGCCAGGATCACTCTGTAACGTTACGTGCTGTCACTCGACTTAAAGTTTTCAAGCAGGTTGGTGTGTTAACCTTGTTTAAACACCTTGTTGTT C 8595.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.070;DP=193;FS=6.272;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=34.82;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,191:193:99:8633,753,0 +chr5 31848201 . GA G 1955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.209;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,68:75:93:1993,93,0 +chr5 32065050 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.500;DP=64;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:589,0,1796 +chr5 32065345 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=2.555;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:290,0,1943 +chr5 32065375 . T C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-0.436;DP=48;FS=14.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:884,0,785 +chr5 32147022 . G GT 824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-0.654;DP=172;FS=13.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,49:154:99:862,0,2839 +chr5 32276284 . T G 694.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:723,54,0 +chr5 32568242 . A G 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 +chr5 32568263 . G A 405.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,14:14:26:434,0,26 +chr5 32568967 . A G 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.618;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:1615,0,522 +chr5 32568974 . T C 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.144;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=30.15;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:1615,0,523 +chr5 32569088 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-3.424;DP=165;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:475,0,4005 +chr5 32569180 . C A,G 5008.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.590;DP=210;FS=2.562;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:13,34,109:156:99:5465,4054,4281,1122,0,1039 +chr5 32569267 . G A 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.304;DP=76;FS=4.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.679;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,35:60:99:1193,0,927 +chr5 32904635 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=1.150;DP=37;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:252,0,1926 +chr5 32905418 . T TG 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.783;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:515,0,529 +chr5 32905618 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.924;DP=53;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:474,0,1345 +chr5 33228008 . A C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.123;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:423,0,830 +chr5 33228449 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.320;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:329,0,408 +chr5 33228557 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=2.060;DP=42;FS=7.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:252,0,1226 +chr5 33358885 . A G 1324.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1353,96,0 +chr5 33360214 . TA T 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:41:253,0,41 +chr5 33374136 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr5 33451018 . AAGGTGAAAATGCCCTGTTTATGGGCTTGACTAAATCCCATATATTTTTATGATTGTGTTGTTTTGGGGTGGTTAGCCATGTTTACCTTGATTCTGGTC A 1686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=1.891;DP=46;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=32.69;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,42:46:99:1724,0,435 +chr5 33468454 . GCTGCCATTAACAGCGATAGAGAGTCAGACTGAATTTAATTTGCTTACTTCATTGAGAAGGATGAGCTGTTAC G 1477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=2.307;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=28.98;ReadPosRankSum=-2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,40:44:99:1515,0,119 +chr5 33521136 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=4.027;DP=175;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,29:175:99:355,0,5746 +chr5 33533344 . TCCTGCGATCGTCAATGCCAGTCAGAAATGTGAAGCTTAAGACCCTCAACATAATCCTGCTAAGTCTTCACTTA T 10682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=1.668;DP=272;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=33.06;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,267:271:99:10720,871,0 +chr5 33539011 . T A 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=2.059;DP=203;FS=6.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,51:203:99:1143,0,5827 +chr5 33690265 . T G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr5 33690859 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:235,0,453 +chr5 33691081 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr5 33698742 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:244,0,374 +chr5 33717540 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=-0.122;DP=59;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:250,0,1872 +chr5 33819681 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.157;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:319,0,456 +chr5 33846779 . T C 27383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=634;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,633:633:99:27412,1902,0 +chr5 33847145 . C T 17664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.401;DP=436;FS=68.477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=32.08;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,420:436:99:17693,1264,0 +chr5 33847314 . T C 5492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.248;DP=134;FS=2.964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=29.08;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,132:134:99:5521,387,0 +chr5 33853337 . A G 3860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3889,281,0 +chr5 33854003 . TGTGAGCAACAGAAGATGACAAATATACCACCGAGGAATGGTACACTTATAAAATATGAATCTATTAAGTTTCTGTATATGCTTACAAAAG T 15926.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=1.123;DP=371;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=31.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,367:370:99:16696,1274,0 +chr5 33854168 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.106;ClippingRankSum=-0.557;DP=380;FS=99.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=0.64;ReadPosRankSum=3.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,50:377:99:273,0,13145 +chr5 33855101 . A G 8764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=1.006;DP=506;FS=12.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,265:504:99:8793,0,8946 +chr5 33862089 . T C 24149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.710;DP=602;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=28.91;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,599:600:99:24178,1757,0 +chr5 33862400 . C T 10342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-0.995;DP=271;FS=6.433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,268:270:99:10371,777,0 +chr5 33867439 . T C 301.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=30.19;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:330,0,14 +chr5 33870740 . G A 14621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=7.759;DP=392;FS=32.004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,363:392:99:14650,709,0 +chr5 33870752 . A G 11594.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=5.189;DP=347;FS=59.940;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=33.41;ReadPosRankSum=-4.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:36,310:346:99:11623,235,0 +chr5 33887112 . A T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr5 33903699 . C T 7811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=-10.326;DP=453;FS=1.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=17.24;ReadPosRankSum=4.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,233:450:99:7840,0,8094 +chr5 33905839 . TCCTGTGTGTAAAATGGGAAAATATTATGTATGATTTGAAACCAAATTAACAATCACTCTTATATAGAAATTACAAAGAATCCCTA T 18479.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=407;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,407:407:99:18517,1493,0 +chr5 33907311 . A T 2894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=3.352;DP=228;FS=34.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,88:228:99:2923,0,4764 +chr5 33910022 . C T 4937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=1.446;DP=643;FS=0.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:452,188:640:99:4966,0,17944 +chr5 33920343 . A G 17406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=409;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,409:409:99:17435,1234,0 +chr5 33920355 . C A 6457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=-3.616;DP=393;FS=137.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,177:393:99:6486,0,7386 +chr5 33921552 . TCTGTAGAAAGAAAAAATATTATCTGTATCATATCATAAAGACGGTTATTCATCAGGTTTTATTATTTTTTGATTCTTAC T 15905.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.185;DP=397;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=26.96;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,387:390:99:15943,1147,0 +chr5 33923727 . T A 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-2.720;DP=369;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,29:367:99:925,0,13347 +chr5 33923738 . A G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.477;ClippingRankSum=5.742;DP=437;FS=42.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=1.94;ReadPosRankSum=-4.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:361,74:435:99:877,0,14425 +chr5 33924504 . T C 731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=13.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=34.85;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:69:760,69,0 +chr5 33924509 . CCTGTTA C 722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=9.031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:69:760,69,0 +chr5 33924683 . A T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=30.43;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:363,0,45 +chr5 33925185 . A T 7549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-3.996;DP=180;FS=20.507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,174:180:99:7578,523,0 +chr5 33937142 . G A 2724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=-3.607;DP=370;FS=28.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,109:370:99:2753,0,10180 +chr5 33937242 . GCCTTTTACATGAACACAAATCTCCATTAGACTCTTTTTTTTTAATACACTTTGAAACTGTTGTTCTGTTGCTCA G 9027.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=2.107;DP=204;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=24.64;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,194:204:99:9065,939,0 +chr5 33937443 . TCTACAACATGGAAGCAACAAGATAAATGTATTGGAAGATGCTTTCAACTATATTAATGACATTGCGCAACAGAAAGCAAAAAACGAAGCCATTATGCTTTTAC T 27500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=1.591;DP=678;FS=2.993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,663:665:99:27538,1956,0 +chr5 33937640 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.052;ClippingRankSum=6.834;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=3.96;ReadPosRankSum=-6.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,28:122:99:511,0,7289 +chr5 33937646 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=3.902;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=5.25;ReadPosRankSum=-3.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,7:92:99:511,0,7289 +chr5 33938882 . C T 2720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-2.860;DP=162;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=16.79;ReadPosRankSum=4.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:2749,0,2849 +chr5 33964572 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-0.453;DP=32;FS=15.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:517,0,580 +chr5 33971988 . G GTTTTTTCTCCTTTCCTTCC 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=2.043;DP=37;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:285,0,730 +chr5 33992074 . A C 6550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.105;DP=331;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,193:331:99:6579,0,4895 +chr5 33992095 . A G 5963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.366;DP=324;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,180:324:99:5992,0,5167 +chr5 33998412 . TA T 866.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.593;DP=28;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=30.95;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:904,0,219 +chr5 33999313 . C G 839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:61:868,61,0 +chr5 33999375 . CT C 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-0.522;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=20.04;ReadPosRankSum=-2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:57:438,0,57 +chr5 33999397 . T A 982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.144;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=33.90;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:70:1011,70,0 +chr5 34017795 . A AC 540.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-1.931;DP=57;FS=3.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:578,0,792 +chr5 34018407 . G T 1475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.991;DP=55;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1504,0,421 +chr5 34018524 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.804;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:362,0,517 +chr5 34018770 . T C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-2.255;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:1076,0,1074 +chr5 34018834 . A T 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.034;DP=79;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:1464,0,1513 +chr5 34018932 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=1.312;DP=45;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=13.71;ReadPosRankSum=-2.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:645,0,2280 +chr5 34114014 . C G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=1.816;DP=49;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:713,0,2255 +chr5 34116099 . A G 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.316;DP=71;FS=6.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:1319,0,1222 +chr5 34116572 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.165;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,331 +chr5 34117687 . T G 284.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:313,20,0 +chr5 34117944 . C T 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.040;DP=78;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:528,0,2285 +chr5 34120722 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=1.639;DP=119;FS=12.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,23:119:99:402,0,3542 +chr5 34409831 . C T 6840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-0.532;DP=354;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,207:352:99:6869,0,4887 +chr5 34410292 . G GTT 922.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=-1.176;DP=219;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,49:218:99:960,0,6385 +chr5 34416071 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-1.036;DP=48;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:309,0,2821 +chr5 34416076 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-1.138;DP=44;FS=3.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:302,0,2821 +chr5 34416293 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=-0.903;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:438,0,722 +chr5 34416336 . A AAT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=1.670;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:282,0,485 +chr5 34419871 . A T 3130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.828;DP=121;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,86:119:99:3159,0,838 +chr5 34424509 . A G 1817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-1.680;DP=78;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=23.30;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,52:78:99:1846,0,860 +chr5 34425471 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=1.052;DP=95;FS=10.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=6.09;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,25:95:99:607,0,2605 +chr5 34434099 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.202;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:315,0,451 +chr5 34436291 . C T 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.120;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=17.35;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1017,0,982 +chr5 34446351 . T C 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=1.276;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:698,0,793 +chr5 34448645 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-2.281;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,366 +chr5 34453221 . TAGGTATGTGGTACAATGGCAGTCATGTAGCCTTTTTTGGCACAGTTTATTGTGCTTTTAGCATTAACATGTAATGTTTTTAATGTTTTTTAA T 591.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.496;DP=14;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:58:629,58,0 +chr5 34476349 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.027;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:392,0,478 +chr5 34480954 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:454,0,347 +chr5 34483046 . C G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:394,0,445 +chr5 34485305 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.947;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:374,0,959 +chr5 34486400 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.577;DP=39;FS=8.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:321,0,1078 +chr5 34500859 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=1.818;DP=49;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:257,0,1325 +chr5 34504775 . T C 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.551;DP=221;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,61:220:99:1473,0,6253 +chr5 34506569 . C T 4448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=-2.453;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,131:237:99:4477,0,3844 +chr5 34508302 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=-0.324;DP=168;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:795,0,4982 +chr5 34508381 . T A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=2.203;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,29:129:99:554,0,7003 +chr5 34550284 . G T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.849;DP=49;FS=9.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=27.73;ReadPosRankSum=2.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1387,0,274 +chr5 34637685 . C T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.924;DP=187;FS=7.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,45:187:99:982,0,5473 +chr5 34637703 . G A 3248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.551;DP=187;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,99:187:99:3277,0,3260 +chr5 34639886 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.199;ClippingRankSum=0.410;DP=46;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:673,0,909 +chr5 34856769 . G T 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.360;DP=42;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=22.26;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:963,0,969 +chr5 34857127 . T TA 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-3.013;DP=34;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=15.20;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:554,0,296 +chr5 34857538 . A T 344.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=31.30;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:372,0,9 +chr5 34887410 . GCTGAAAAAAGGAAAGTTCTGCTCATTTAAAAGTCCACAAAACTGTCATTGGAGTTACTTGCAGAGTTCTGCTTTTAC G 1574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.014;DP=55;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1612,0,3981 +chr5 34895801 . G C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=3.462;DP=42;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:230,0,1887 +chr5 34901308 . G T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.205;DP=53;FS=15.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:967,0,851 +chr5 34909767 . C T 277.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:306,0,13 +chr5 34910786 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.372;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:366,0,280 +chr5 34913375 . C A 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 +chr5 34915723 . GCTGGACAAACAGAATGGAAAATAGCATTTATTATTCTCACTTTAATTACACAATGAAAAGAAAGAAAAATGTAAACACCACCAACAGTAACAACCACAAAGCAGCTCATGACCAAC G 3328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=1.921;DP=97;FS=1.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=34.32;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,88:97:99:3366,0,1531 +chr5 34920346 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=2.371;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:368,0,449 +chr5 34925666 . G A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.831;DP=32;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:602,0,705 +chr5 34934021 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:259,0,501 +chr5 34965212 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.622;DP=78;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=6.39;ReadPosRankSum=2.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:527,0,2173 +chr5 34965551 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.726;ClippingRankSum=-0.524;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:324,0,2505 +chr5 34965782 . C G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:441,0,433 +chr5 34966086 . TA T 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.770;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:362,0,589 +chr5 34966115 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.783;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:685,0,470 +chr5 34967166 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.832;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:648,0,1412 +chr5 34967171 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=-1.268;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:648,0,1441 +chr5 34967331 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-4.155;DP=49;FS=16.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:328,0,2109 +chr5 34967341 . G C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-0.444;DP=47;FS=4.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:658,0,1469 +chr5 34971481 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=1.398;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:366,0,362 +chr5 34971928 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.448;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:254,0,782 +chr5 34972418 . T C 229.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:258,0,22 +chr5 34973356 . C G 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.124;DP=35;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:930,0,325 +chr5 34978590 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.921;DP=39;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:293,0,971 +chr5 35152189 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.477;DP=27;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,606 +chr5 35152971 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=3.354;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=7.68;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:274,0,816 +chr5 35153288 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:388,0,167 +chr5 35153775 . C G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.612;DP=21;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:315,0,610 +chr5 35155137 . G A 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.011;DP=47;FS=6.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:786,0,1309 +chr5 35179680 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.566;DP=76;FS=7.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,43:76:99:1453,0,1119 +chr5 35224529 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-0.391;DP=53;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:442,0,1323 +chr5 35286545 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=36.34;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:54:417,0,54 +chr5 35286548 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:54:417,0,54 +chr5 35291583 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:483,0,250 +chr5 35351369 . T G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.167;DP=31;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:575,0,459 +chr5 36025696 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-1.933;DP=27;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.234;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:540,0,360 +chr5 36034072 . C G 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.549;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:872,0,664 +chr5 36069194 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=-1.211;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:487,0,588 +chr5 36069225 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-1.964;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:603,0,582 +chr5 36084416 . T A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.660;DP=50;FS=11.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=20.86;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1071,0,631 +chr5 36137211 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.478;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:815,0,526 +chr5 36147384 . G A 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-1.343;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:611,0,596 +chr5 36150423 . C A 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.286;DP=55;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=21.27;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1198,0,758 +chr5 36150524 . T C 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.215;DP=35;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:684,0,600 +chr5 36160379 . AG A 788.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:82:826,82,0 +chr5 36160404 . C CG 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=3.293;DP=40;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=6.17;ReadPosRankSum=-1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:284,0,1011 +chr5 36191911 . GAA G 1813.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,70:75:48:2301,48,0 +chr5 36192022 . A T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-1.015;DP=81;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,46:81:99:1567,0,1285 +chr5 36193216 . G GT 566.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.139;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:57:704,57,0 +chr5 36196429 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:54:266,0,54 +chr5 36226939 . G A 4746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.305;DP=243;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,141:242:99:4775,0,3499 +chr5 36231973 . C T 3663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.692;DP=188;FS=3.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,110:188:99:3692,0,2737 +chr5 36233946 . C T 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.184;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1354,0,755 +chr5 36234339 . C A 2910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-1.861;DP=136;FS=14.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.461;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:2939,0,3748 +chr5 36234340 . T A 2804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-2.808;DP=134;FS=14.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,80:133:99:2929,0,4027 +chr5 36240385 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.517;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:251,0,625 +chr5 36240469 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-2.475;DP=40;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:666,0,653 +chr5 36240527 . A G 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.055;DP=33;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:639,0,480 +chr5 36242106 . G A 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-0.157;DP=63;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,44:63:99:1470,0,468 +chr5 36251839 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.964;DP=52;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:854,0,953 +chr5 36252117 . A C 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-1.346;DP=60;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:1008,0,1078 +chr5 36252148 . G A 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.763;DP=68;FS=3.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1123,0,1311 +chr5 36253348 . G C 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.158;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:30:1710,0,30 +chr5 36253908 . A G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.217;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:877,0,913 +chr5 36254649 . G A 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-1.024;DP=53;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:1193,0,608 +chr5 36255175 . C T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.330;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:822,0,415 +chr5 36255206 . T C 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-1.216;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=22.45;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:769,0,419 +chr5 36255883 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-2.172;DP=36;FS=7.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:265,0,946 +chr5 36255900 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.016;DP=38;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=8.15;ReadPosRankSum=-2.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:338,0,2044 +chr5 36255926 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=2.928;DP=41;FS=4.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:479,0,963 +chr5 36448226 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-0.769;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:500,0,542 +chr5 36505056 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-1.341;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:392,0,455 +chr5 36610436 . A C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:365,0,349 +chr5 36616101 . A G 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=1.425;DP=90;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1596,0,1464 +chr5 36616116 . G A 1764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.885;DP=101;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1793,0,1603 +chr5 36616459 . C T 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.378;DP=80;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,48:80:99:1559,0,1101 +chr5 36742377 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=11.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:398,0,324 +chr5 36742757 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.281;DP=59;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1092,0,997 +chr5 36743321 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=1.077;DP=45;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=14.48;ReadPosRankSum=-3.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:680,0,2012 +chr5 36743568 . C CA 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-1.785;DP=39;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:423,0,645 +chr5 36753585 . G A 2037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.560;DP=80;FS=10.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,54:80:99:2066,0,724 +chr5 36804194 . G A 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-0.079;DP=84;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=21.24;ReadPosRankSum=2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,54:84:99:1812,0,992 +chr5 36820774 . A T 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=1.206;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=22.35;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:855,0,498 +chr5 36820989 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.607;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:392,0,657 +chr5 36821384 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.769;DP=34;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:646,0,859 +chr5 36822147 . C G 1585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.937;DP=75;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,47:75:99:1614,0,1006 +chr5 36822823 . TG T 824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-1.178;DP=72;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:862,0,868 +chr5 36829491 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.158;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:239,0,464 +chr5 36829705 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,492 +chr5 36830031 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-2.406;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=21.27;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:560,0,314 +chr5 36870847 . CGGT C 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=3.528;DP=33;FS=2.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=8.63;ReadPosRankSum=-3.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:322,0,666 +chr5 36871545 . G T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:383,27,0 +chr5 36874785 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,175 +chr5 36876642 . AACCTGAAAAGAGAGCGCTTACACTTTTAGTATGCAAACTCTTTTTGTCAAGACTGAAGATTTACATATAAGCCACACTT A 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=2.452;DP=22;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=26.90;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:629,0,2753 +chr5 36889272 . G T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.871;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:531,0,571 +chr5 36889857 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=1.175;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:345,0,628 +chr5 36891928 . C G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-0.427;DP=42;FS=1.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:554,0,967 +chr5 36892249 . A G 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-0.078;DP=52;FS=8.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1356,0,486 +chr5 36893069 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-0.087;DP=35;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:403,0,817 +chr5 36893483 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.453;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:561,0,524 +chr5 36893579 . T C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.281;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:623,0,624 +chr5 36895069 . T G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-2.166;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:363,0,1044 +chr5 36895258 . G T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.110;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:471,0,812 +chr5 36895344 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.269;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:289,0,608 +chr5 36896041 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.917;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=7.05;ReadPosRankSum=2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:275,0,971 +chr5 36897429 . C G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=-0.027;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:339,0,1164 +chr5 36898274 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-0.364;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:477,0,497 +chr5 36919713 . G A 355.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=29.65;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:383,0,6 +chr5 37019599 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.582;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:264,0,566 +chr5 37019789 . G C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.86;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,149 +chr5 37019790 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,149 +chr5 37022189 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.807;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:279,0,553 +chr5 37022268 . T G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:346,0,258 +chr5 37081703 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr5 37102769 . A G 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-1.793;DP=64;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=26.75;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,45:64:99:1740,0,509 +chr5 37102955 . T A 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.118;DP=56;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=20.50;ReadPosRankSum=-1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1176,0,711 +chr5 37103049 . G A 1719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.638;DP=70;FS=5.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=24.57;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,47:70:99:1748,0,837 +chr5 37103223 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.650;DP=19;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=28.57;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:571,0,114 +chr5 37104593 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.029;DP=24;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:354,0,462 +chr5 37180235 . A C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=24.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:42:248,0,42 +chr5 37180317 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:302,0,53 +chr5 37233072 . C T 302.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:6:330,0,6 +chr5 37299873 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=27.24;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:464,0,129 +chr5 37301272 . G T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=2.301;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=24.91;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:651,0,262 +chr5 37301634 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=24.06;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:57:317,0,57 +chr5 37331755 . C T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.231;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=26.45;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:716,0,165 +chr5 37372243 . T A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.311;DP=51;FS=4.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:716,0,497 +chr5 37573432 . G T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.468;DP=38;FS=4.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=22.10;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:868,0,445 +chr5 37573561 . T A 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.783;DP=111;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1698,0,1780 +chr5 37582828 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=1.031;DP=81;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:390,0,2348 +chr5 37585188 . CTG C 543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-1.129;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:581,0,359 +chr5 37868089 . C CT 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.998;DP=31;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:263,0,457 +chr5 37868415 . C T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.851;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,26:97:99:650,0,2690 +chr5 37868956 . T A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.835;DP=73;FS=5.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:495,0,2063 +chr5 37869313 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-1.392;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:589,0,472 +chr5 37929192 . G T 1170.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=1.053;DP=62;FS=6.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.476;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1208,0,1702 +chr5 37929193 . T A 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=1.125;DP=62;FS=5.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=19.01;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1207,0,1743 +chr5 37929362 . GT G 740.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-2.586;DP=56;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:43:778,0,43 +chr5 38016760 . C G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:273,0,420 +chr5 38022585 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:247,0,233 +chr5 38136545 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.063;DP=111;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,20:111:99:320,0,3475 +chr5 38158449 . G A 1906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=2.036;DP=103;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1935,0,1502 +chr5 38170437 . C T 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=1.175;DP=134;FS=7.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:816,0,3760 +chr5 38177652 . A G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.868;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:545,0,2694 +chr5 38186921 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.272;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:301,0,2098 +chr5 38197498 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.327;DP=100;FS=6.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:514,0,2928 +chr5 38206351 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.103;DP=52;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:700,0,1107 +chr5 38226795 . A T 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=1.199;DP=154;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:2216,0,2404 +chr5 38227176 . G A 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.104;DP=152;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,44:151:99:1162,0,4091 +chr5 38227315 . A G 2545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=-1.025;DP=147;FS=2.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:2574,0,2669 +chr5 38227327 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.853;DP=122;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:2252,0,2247 +chr5 38227493 . T A 1772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.074;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1801,0,1770 +chr5 38228206 . A C 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.678;DP=210;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,45:210:99:876,0,6523 +chr5 38228808 . CG C 1058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.498;DP=203;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,50:199:99:1096,0,5437 +chr5 38229788 . C T 11833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-1.256;DP=179;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=32.93;ReadPosRankSum=-2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,108:177:99:11862,0,275 +chr5 38229918 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=-2.291;DP=143;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=4.63;ReadPosRankSum=2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,40:143:99:690,0,5851 +chr5 38231055 . C T 2529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=-0.389;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,77:120:99:2558,0,1385 +chr5 38231677 . C A 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-3.465;DP=274;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,84:273:99:1519,0,7315 +chr5 38255805 . A C 3222.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=1.838;DP=501;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:364,137:501:99:3251,0,14069 +chr5 38264250 . G T 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=1.538;DP=440;FS=10.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:350,90:440:99:1558,0,13602 +chr5 38294268 . C T 2155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=-0.768;DP=346;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=6.23;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,91:346:99:2184,0,9834 +chr5 38300273 . CA C 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:350,0,150 +chr5 38300539 . A G 2206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-1.675;DP=297;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=7.43;ReadPosRankSum=2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,73:297:99:2235,0,24989 +chr5 38300551 . T C 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.089;DP=299;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=7.34;ReadPosRankSum=3.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,69:297:99:2222,0,24989 +chr5 38300874 . AG A 1251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-3.986;DP=314;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,101:299:99:1289,0,5631 +chr5 38300984 . A G 1265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-1.854;DP=233;FS=6.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,59:233:99:1294,0,7214 +chr5 38301111 . T A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.353;DP=248;FS=2.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,43:248:99:608,0,8151 +chr5 38401973 . A AGATTGTGTC 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.232;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:317,0,368 +chr5 38495836 . CGGTGAGAGCTGTGTTTGAGTTTAATGCGTGCGCTTGTATTCATTTTGATGTATTAGCTATTATCATAGTTGTATGTGCTTGTATACACTA C 3027.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.447;ClippingRankSum=13.379;DP=375;FS=67.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=8.07;ReadPosRankSum=-11.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,153:348:99:3065,0,103887 +chr5 38498966 . C CT 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=-1.277;DP=165;FS=14.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,54:151:99:670,0,1780 +chr5 38500396 . C CA 2582.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-0.537;DP=638;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:445,186:631:99:2620,0,12057 +chr5 38511638 . AGTAAGTACTTGCATGAATCTTAACACTACTACAATGGCAACTGCATATTTTTTTATACGTTTGGACTCAACCGTAAATCACAATCTTCCTTTTTTCTCCACAG A 16063.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=1.074;DP=391;FS=9.577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=32.59;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,388:391:99:16101,1171,0 +chr5 38524301 . ACTTTATTGCAAGAGAAGAGAAATATTATTTCGTTGCACAGCTAAAACAGAAGGTTTTGGACGCGCACGAACAGTCTGTCAC A 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-1.323;DP=20;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:787,0,739 +chr5 38897003 . G T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=-1.358;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:477,0,190 +chr5 38897833 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:305,0,97 +chr5 38899063 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:423,0,407 +chr5 38912844 . C A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.101;DP=42;FS=4.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=15.57;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:682,0,760 +chr5 38917117 . A G 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.852;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:2251,0,2057 +chr5 38919502 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:278,0,100 +chr5 38921682 . C T 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.730;DP=101;FS=7.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1729,0,1687 +chr5 38980864 . T G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-0.257;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:727,0,531 +chr5 39006608 . G A 1695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.523;DP=92;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1724,0,1698 +chr5 39014009 . C T 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.999;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:1386,0,1467 +chr5 39023461 . G A 1504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-0.260;DP=86;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1533,0,1337 +chr5 39118047 . TGTAAGAATTTCAAAAGCCTTGTAAAAATGTGCCAAACGGCCTCGACGCGGATAATCTGTGTTTTTTATCCACAG T 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=3.069;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.85;ReadPosRankSum=-2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:353,0,16364 +chr5 39309907 . TA T,TAA 2373.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.403;DP=158;FS=6.888;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,79,47:133:99:2617,723,1020,2042,0,2678 +chr5 39358539 . GT G 702.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-1.317;DP=30;FS=3.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:67:740,67,0 +chr5 40298004 . G A 1296.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.434;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=29.26;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:94:1325,94,0 +chr5 40298178 . A C 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.788;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:1009,0,730 +chr5 40298358 . A G 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.346;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1145,0,343 +chr5 40298475 . AG A 408.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.302;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:446,17,0 +chr5 40298513 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:238,0,101 +chr5 40299985 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:428,0,123 +chr5 40302312 . A G 253.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.75;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:282,0,13 +chr5 40306231 . C T 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 +chr5 40414718 . GCTTGGGAACACAGACATTTTATGTTTGCTTCACAATTGCTAAATCAGAAAAAAAAGTTGCTGACAGGATACTAGCAGGTAC G 4249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=1.752;DP=99;FS=5.892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,91:99:99:4287,372,0 +chr5 40696405 . T G 250.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:279,0,18 +chr5 41114342 . AT A 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:246,0,177 +chr5 41279928 . C CA 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.326;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:311,0,189 +chr5 41632668 . T C 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.080;DP=37;FS=5.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=15.07;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:586,0,728 +chr5 41665188 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=-0.305;DP=32;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:303,0,1757 +chr5 41687526 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.482;DP=37;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:309,0,1892 +chr5 41694486 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=1.435;DP=53;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:240,0,1567 +chr5 41694871 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.161;DP=54;FS=4.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:443,0,1422 +chr5 41854963 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-1.683;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:410,0,688 +chr5 41916209 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.338;DP=99;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:425,0,3021 +chr5 41916869 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.058;DP=120;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:586,0,3500 +chr5 41917019 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.646;ClippingRankSum=-0.419;DP=117;FS=5.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,27:115:99:513,0,3315 +chr5 41917241 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.106;DP=109;FS=13.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:316,0,3418 +chr5 41917565 . C G 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-2.005;DP=123;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,29:123:99:584,0,3532 +chr5 42126165 . G A 1959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.764;DP=342;FS=0.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,89:342:99:1988,0,9348 +chr5 42130553 . C CT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=1.023;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=3.33;ReadPosRankSum=-1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:372,0,675 +chr5 42132630 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.175;DP=61;FS=2.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:697,0,1317 +chr5 42469581 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.733;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:241,0,401 +chr5 42555211 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.163;DP=45;FS=4.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:348,0,1232 +chr5 42583459 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.222;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:546,0,1560 +chr5 42583462 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.665;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:546,0,1556 +chr5 42723975 . T TA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=-0.320;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:240,0,1138 +chr5 42727914 . G A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.378;DP=59;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.291;QD=14.17;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:864,0,1196 +chr5 42748106 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.445;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:434,0,658 +chr5 42748958 . TA T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-0.734;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:342,0,331 +chr5 42749316 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.479;DP=34;FS=5.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:328,0,941 +chr5 42879290 . C CA 792.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.493;DP=47;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:830,0,1526 +chr5 43067498 . G A 1834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.338;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1863,0,1829 +chr5 43070284 . CT C 1056.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=2.539;DP=127;FS=7.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,42:127:99:1094,0,3064 +chr5 43117307 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,286 +chr5 43134913 . TGGTGAGACCACTTTGTTCCATAAAGAGACTTGAACATTTACATTGACATTAACAGTTGCTGTTCAATCAATTTGAGTGAATAACCGCAAAAATTTTGATTTTCTTGATTTCA T 18309.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=1.033;DP=409;FS=2.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=22.13;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,404:408:99:18347,1485,0 +chr5 43225583 . G A 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 +chr5 43225651 . A T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:357,27,0 +chr5 43260360 . C T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-1.127;DP=88;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,31:88:99:1060,0,2063 +chr5 43413813 . C T 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=-0.297;DP=358;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,74:358:99:1406,0,10800 +chr5 43448586 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.426;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:366,0,2145 +chr5 43453080 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.296;DP=71;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:264,0,2189 +chr5 43453571 . C A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=1.029;DP=33;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:392,0,786 +chr5 43454458 . T C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.954;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:433,0,743 +chr5 43454459 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=1.430;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:271,0,1645 +chr5 43454791 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=1.719;DP=31;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:276,0,2026 +chr5 43454809 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.453;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:276,0,2026 +chr5 43456734 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.283;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:238,0,845 +chr5 43458462 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.484;DP=44;FS=8.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:231,0,1123 +chr5 43458904 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.570;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:295,0,791 +chr5 43460237 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.223;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:402,0,997 +chr5 43461560 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=-0.277;DP=46;FS=6.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:427,0,1098 +chr5 43496973 . G GA 558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.399;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:596,0,424 +chr5 43497385 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.745;DP=82;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:360,0,2482 +chr5 43504149 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.494;DP=158;FS=5.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,30:158:99:497,0,4818 +chr5 43504322 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.454;DP=187;FS=7.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,32:187:99:397,0,12256 +chr5 43506705 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.822;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,22:123:99:285,0,7561 +chr5 43521571 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.468;DP=113;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,27:113:99:599,0,3338 +chr5 43647584 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:236,0,420 +chr5 43685588 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=1.581;DP=318;FS=2.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,47:318:99:399,0,10127 +chr5 43685726 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-2.385;DP=258;FS=19.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,40:258:99:311,0,9383 +chr5 43686683 . A T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.333;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=4.19;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,44:184:99:929,0,5198 +chr5 43713274 . C T 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.450;ClippingRankSum=8.848;DP=318;FS=11.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=2.11;ReadPosRankSum=-6.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,56:317:99:700,0,10059 +chr5 43713946 . G A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-3.036;DP=330;FS=6.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,62:330:99:955,0,10148 +chr5 43741960 . G A 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.720;DP=277;FS=3.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,60:277:99:877,0,7652 +chr5 43742114 . GCTGAGAGACAAAAACAGAAGAGCATTGAAACATCGACCATCACATAAAGCCGTGAGTTCAGTTTAAATCTCCTCCGCTTAC G 13663.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=1.599;DP=303;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=32.92;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,290:299:99:13701,1158,0 +chr5 43742205 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=-2.187;DP=312;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,54:312:99:705,0,9377 +chr5 43781658 . G GA 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.427;DP=94;FS=10.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:273,0,1907 +chr5 43782282 . CT C 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.568;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:495,0,1529 +chr5 43782495 . G GT 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=-3.561;DP=97;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=6.14;ReadPosRankSum=2.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:633,0,986 +chr5 43783474 . C A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-1.293;DP=125;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,27:125:99:516,0,3606 +chr5 43909445 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:239,0,410 +chr5 43952153 . G T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.029;DP=30;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:437,0,525 +chr5 43952234 . T C 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:45:630,45,0 +chr5 44151957 . T G 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=1.230;DP=25;FS=12.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.348;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:721,0,162 +chr5 44151971 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.950;DP=23;FS=13.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=26.95;ReadPosRankSum=-1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:648,0,209 +chr5 44153231 . A G 651.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.964;DP=20;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=32.57;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:679,8,0 +chr5 44154566 . A G 293.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.65;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:322,0,18 +chr5 44453572 . TA T 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-2.248;DP=305;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,60:294:99:788,0,7685 +chr5 45481646 . G C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-1.581;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:316,0,1555 +chr5 46759651 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=-1.830;DP=23;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=17.86;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:439,0,621 +chr5 46801927 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:356,0,350 +chr5 46901628 . G T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,212 +chr5 46941469 . G GT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.933;DP=20;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:254,0,393 +chr5 47073457 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=2.664;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:469,0,162 +chr5 47158393 . T C 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.120;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=30.27;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:69:664,0,69 +chr5 47160321 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.78;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:316,0,59 +chr5 47358506 . AT A 396.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-1.335;DP=20;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:22:434,0,22 +chr5 47359446 . T G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.142;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:631,0,625 +chr5 47397484 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.330;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:478,0,725 +chr5 47402145 . G GA 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.055;DP=48;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:366,0,709 +chr5 47430103 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=2.111;DP=42;FS=4.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=11.42;ReadPosRankSum=2.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:508,0,874 +chr5 47513034 . CAGGTATGTTGTATCCTAGTCAAGCATTACTCATTAGTCATAATAACTCCTGTGTTTGTCTAATGTGTGAATCTGTCTTAA C 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=29.36;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:419,0,787 +chr5 47514106 . GGGTGAGGGAGGGATTTCTTTTAAACTTAAAAGTGTATTATACTGGAGGTATGAAATGCTAAATTATCATCCTCTGTTGTA G 653.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:53:691,53,0 +chr5 47549951 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.775;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:414,0,903 +chr5 47549953 . A C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-0.348;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:414,0,922 +chr5 47677862 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:275,0,93 +chr5 47722167 . T C 1154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1183,81,0 +chr5 47745394 . G C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=-1.555;DP=28;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:369,0,552 +chr5 47757965 . C T 2237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=1.323;DP=98;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=22.83;ReadPosRankSum=-2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,69:98:99:2266,0,1874 +chr5 47809889 . TA T 355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:393,37,0 +chr5 47810288 . GT G 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-0.988;DP=33;FS=9.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:256,0,540 +chr5 47810294 . T A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-1.291;DP=30;FS=9.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:355,0,635 +chr5 47811974 . G T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr5 47812314 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:322,0,57 +chr5 47862727 . A G 276.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:305,0,19 +chr5 47889325 . G C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.950;DP=87;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:686,0,2266 +chr5 47905148 . A G 232.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:261,0,21 +chr5 47908667 . C T 218.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:1:244,1,0 +chr5 47918520 . G C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=26.48;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:293,0,51 +chr5 48066974 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr5 48102316 . C A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-0.053;DP=61;FS=25.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=11.77;ReadPosRankSum=-6.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:746,0,1482 +chr5 48102641 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=-5.538;DP=74;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=7.12;ReadPosRankSum=3.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:555,0,2012 +chr5 48102723 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=-2.709;DP=181;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,32:181:99:509,0,6008 +chr5 48102814 . CA C 4889.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.054;DP=17;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=22.23;ReadPosRankSum=2.549 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,10:16:99:4927,356,0 +chr5 48103697 . A G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-0.482;DP=250;FS=6.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,58:246:99:747,0,10223 +chr5 48104109 . T A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-1.320;DP=55;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=34.12;ReadPosRankSum=4.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,45:55:99:1905,0,345 +chr5 48104110 . G A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.070;DP=54;FS=5.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=34.75;ReadPosRankSum=4.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,45:54:99:1905,0,404 +chr5 48104267 . A AG 859.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-0.057;DP=45;FS=14.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.191;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:897,0,1586 +chr5 48104272 . A G 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.499;DP=43;FS=11.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:897,0,1586 +chr5 48104720 . G A 1617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.640;DP=221;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,67:221:99:1646,0,6742 +chr5 48104960 . G A 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=1.365;DP=264;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=4.73;ReadPosRankSum=4.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,61:264:99:1277,0,7636 +chr5 48105352 . C T 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=2.072;DP=254;FS=3.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,62:253:99:1096,0,16450 +chr5 48105374 . T A 3920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-1.534;DP=263;FS=20.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,92:260:99:3949,0,11443 +chr5 48105897 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.926;DP=209;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,54:209:99:844,0,8991 +chr5 48106085 . G C 4999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.925;DP=318;FS=0.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,143:317:99:5028,0,5692 +chr5 48696848 . G A 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=-2.256;DP=263;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,81:262:99:2118,0,6766 +chr5 49645981 . G C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-0.711;DP=73;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:430,0,2461 +chr5 49696827 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.158;DP=81;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:654,0,2095 +chr5 49707130 . G C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-0.613;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,26:94:99:639,0,2681 +chr5 49732780 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-1.343;DP=102;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:629,0,5301 +chr5 49733653 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.695;DP=129;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,34:126:99:820,0,3492 +chr5 49736512 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-1.285;DP=156;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,29:156:99:466,0,4755 +chr5 49751761 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.436;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:266,0,1611 +chr5 49759519 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.309;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:233,0,1112 +chr5 49759538 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.265;DP=39;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:317,0,1091 +chr5 49812523 . C T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=1.759;DP=38;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:543,0,788 +chr5 49833301 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=2.063;DP=35;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:270,0,929 +chr5 49833354 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.663;DP=34;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:288,0,817 +chr5 49891440 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.177;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=20.58;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,222 +chr5 49893122 . G A 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-1.616;DP=316;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,80:316:99:1782,0,8926 +chr5 49903874 . C T 3188.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=3.050;DP=282;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=11.31;ReadPosRankSum=3.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,96:282:99:3217,0,6499 +chr5 49937227 . G A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=1.100;DP=267;FS=10.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,58:267:99:1160,0,8104 +chr5 49937247 . T A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.543;DP=252;FS=22.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,57:252:99:1184,0,7574 +chr5 49943867 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.264;DP=50;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:794,0,969 +chr5 49945392 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,129 +chr5 49947266 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.299;DP=67;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:460,0,1772 +chr5 49947477 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.921;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:461,0,926 +chr5 49949631 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.464;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:263,0,2470 +chr5 49950562 . A C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.074;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:433,0,1191 +chr5 49952583 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=-2.192;DP=66;FS=8.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:285,0,1849 +chr5 49957794 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=1.226;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:447,0,1495 +chr5 49957795 . A T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.954;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:447,0,1494 +chr5 49966001 . A AT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.359;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:280,0,695 +chr5 49988736 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=-1.356;DP=99;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:308,0,3065 +chr5 49991330 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.580;DP=70;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.386;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:244,0,2177 +chr5 50025401 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-1.051;DP=109;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:413,0,3267 +chr5 50455531 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.117;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=4.02;ReadPosRankSum=2.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:229,0,2164 +chr5 50514755 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.335;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:257,0,865 +chr5 50583460 . T A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=-0.349;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:284,0,994 +chr5 50585818 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.946;DP=70;FS=7.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:510,0,1872 +chr5 50585845 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=1.602;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:654,0,1278 +chr5 50593997 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=1.442;DP=35;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:282,0,1028 +chr5 50605622 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.681;DP=51;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:279,0,1460 +chr5 50608047 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.355;DP=51;FS=8.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:399,0,1319 +chr5 50618285 . G A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=-0.557;DP=69;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:469,0,1974 +chr5 50621399 . A G 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.767;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1300,0,1170 +chr5 50621432 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-2.128;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:323,0,2023 +chr5 50624720 . T C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-0.529;DP=36;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:740,0,445 +chr5 50624750 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=-0.522;DP=34;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:575,0,797 +chr5 50629138 . T C 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=1.743;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:999,0,3117 +chr5 50629144 . A G 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=1.344;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=13.87;ReadPosRankSum=3.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:999,0,3108 +chr5 50682515 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=-0.390;DP=69;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:468,0,1904 +chr5 50768939 . C CA 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-1.319;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,35:127:99:459,0,3692 +chr5 50769990 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.427;DP=110;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,19:110:99:253,0,3433 +chr5 50770430 . C CA 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.128;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,24:98:99:315,0,2287 +chr5 50775258 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.594;DP=154;FS=5.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:400,0,4999 +chr5 50777124 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.045;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:268,0,1315 +chr5 50777475 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.952;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=7.06;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:339,0,1193 +chr5 50778428 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-0.914;DP=141;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=2.84;ReadPosRankSum=-2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,27:141:99:429,0,4323 +chr5 50802991 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=-0.749;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:271,0,850 +chr5 50803012 . G C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.294;DP=41;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:334,0,1035 +chr5 50810615 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-2.300;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:234,0,1104 +chr5 50811498 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.767;DP=63;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:299,0,1771 +chr5 51527921 . T A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-2.004;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,35:149:99:1014,0,4299 +chr5 51529643 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.689;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:256,0,987 +chr5 51940166 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.037;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:240,0,479 +chr5 52507286 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.239;DP=47;FS=7.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:252,0,1378 +chr5 52538111 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.121;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:264,0,1105 +chr5 52561092 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-0.506;DP=75;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,19:75:99:435,0,2972 +chr5 52565375 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.153;DP=76;FS=3.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:621,0,1993 +chr5 52565716 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.473;DP=77;FS=5.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:364,0,2336 +chr5 52579257 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=1.345;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:763,0,1063 +chr5 52581755 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.904;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:895,0,1292 +chr5 52582110 . GGGTTTGTGTGGCTTTCAATTCACTGTTTGCTCAGTGCTGTCACATTTTTTAGATACAAAATTCAATCCGATCAATCGTGTACCAATTATTAATTTCTATTTTTAA G 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=1.242;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=34.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,52:55:99:2299,0,234 +chr5 52583796 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.657;DP=46;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:380,0,1185 +chr5 52767695 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr5 52857307 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,1:14:99:259,0,2328 +chr5 52857322 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.531;DP=18;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,1:17:99:259,0,2171 +chr5 52857491 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:254,0,1295 +chr5 52860905 . G T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.794;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:366,0,357 +chr5 52886720 . GCCTGTAAACACACACAACACATTCAGTAAAATAAGGTATCAGTTTGAATTAATCACCTTCGGTAACTCTGAAATGACTGTAATGTCATAGTTAACCATA G 1243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=2.432;DP=34;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=29.86;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:99:1281,0,1111 +chr5 52886908 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.315;DP=49;FS=5.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:714,0,1009 +chr5 52898021 . C T 332.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:361,0,15 +chr5 52902238 . G A 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 +chr5 52902634 . A G 406.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=33.90;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:434,0,6 +chr5 52902816 . T C 662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:691,54,0 +chr5 52902919 . T C 2284.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.183;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,58:61:99:2313,175,0 +chr5 52913222 . T A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.228;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:908,0,1506 +chr5 52913252 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.373;DP=58;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:333,0,1685 +chr5 52917112 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.666;DP=66;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:349,0,1855 +chr5 52922685 . A T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.727;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=13.05;ReadPosRankSum=2.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:511,0,761 +chr5 52926564 . T G 1349.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:97:1378,97,0 +chr5 52926625 . G C 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:455,33,0 +chr5 52926714 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-2.964;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=19.99;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:348,0,251 +chr5 52926890 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-1.183;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.455;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:270,0,998 +chr5 52926922 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.601;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:495,0,590 +chr5 52927147 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.749;DP=51;FS=2.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:328,0,2063 +chr5 52927234 . A G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-1.505;DP=45;FS=2.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:426,0,1217 +chr5 52927294 . T A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.702;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=26.87;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1076,0,322 +chr5 52927377 . C T 1240.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:1269,101,0 +chr5 52927532 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-1.904;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:552,0,290 +chr5 52927540 . G A 1039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1068,72,0 +chr5 52927626 . G A 1467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1496,102,0 +chr5 52927655 . T A 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.739;DP=26;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:500,0,449 +chr5 52928260 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.634;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:231,0,442 +chr5 52928832 . T A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.981;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:247,0,842 +chr5 52929093 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=-2.945;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=16.41;ReadPosRankSum=2.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:537,0,489 +chr5 52929182 . G A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-0.201;DP=68;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:911,0,1401 +chr5 52929225 . A AG 1679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.122;DP=64;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,47:64:99:1717,0,384 +chr5 52929317 . A G 2880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2909,202,0 +chr5 52929368 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.172;DP=80;FS=3.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:450,0,2317 +chr5 52929426 . C T 1433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.227;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:1462,0,1522 +chr5 52929454 . C A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.239;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:894,0,1666 +chr5 52929517 . G T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-1.447;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=17.60;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:521,0,798 +chr5 52929852 . TAA T 236.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:678,52,0 +chr5 52929917 . C T 997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1026,72,0 +chr5 52929949 . G T 1702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1731,123,0 +chr5 52935200 . A C 203.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:232,0,20 +chr5 53118054 . C T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr5 53118642 . C CT 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 +chr5 53120718 . T G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-0.444;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=11.35;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:278,0,485 +chr5 53247507 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr5 53451325 . C T 2624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-2.194;DP=326;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,102:326:99:2653,0,8792 +chr5 53592799 . A C 679.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:708,48,0 +chr5 53592871 . A G 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:579,39,0 +chr5 53592880 . G A 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:579,39,0 +chr5 53592940 . A G 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:534,36,0 +chr5 53592999 . G T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=1.315;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:415,0,330 +chr5 53593218 . C T 1635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1664,117,0 +chr5 53593569 . T C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.370;DP=35;FS=4.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:951,0,201 +chr5 53596945 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr5 53600629 . T G 4726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4755,340,0 +chr5 53600688 . C T 3546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.732;DP=115;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,93:114:99:3575,0,354 +chr5 53600736 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.797;DP=121;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,24:120:99:412,0,3758 +chr5 53607783 . C G 1999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-1.962;DP=63;FS=5.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,50:63:99:2028,0,1065 +chr5 53607784 . A C 1999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=-0.696;DP=61;FS=3.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=32.78;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,48:61:99:2028,0,998 +chr5 53607838 . G A 1150.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1179,81,0 +chr5 53626895 . A C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:393,0,495 +chr5 53627399 . G T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=-0.916;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:318,0,591 +chr5 53716161 . T A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.083;DP=48;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:294,0,1442 +chr5 53717461 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.667;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:253,0,935 +chr5 53739575 . A T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.352;DP=38;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:363,0,910 +chr5 53744159 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.579;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:459,0,796 +chr5 53853165 . A T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 +chr5 53926811 . C T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 +chr5 54728674 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:417,0,114 +chr5 54728744 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,238 +chr5 54730799 . A G 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr5 54739607 . A G 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:488,36,0 +chr5 54756945 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,266 +chr5 54760788 . C G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr5 54766010 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=-1.562;DP=106;FS=3.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:371,0,3358 +chr5 54786397 . A G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.681;DP=101;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:561,0,3070 +chr5 54820984 . T G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=1.226;DP=67;FS=7.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:507,0,1828 +chr5 54940513 . C G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.110;DP=44;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:552,0,962 +chr5 54941964 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.014;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:234,0,1246 +chr5 54950822 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.669;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=4.51;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:267,0,2548 +chr5 54952931 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.651;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:474,0,817 +chr5 54952932 . T A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.589;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:474,0,817 +chr5 54953823 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.315;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:329,0,422 +chr5 54954514 . TA T 511.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:549,48,0 +chr5 54954991 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.879;DP=52;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:280,0,1581 +chr5 54955336 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.181;DP=28;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:262,0,704 +chr5 55149968 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-2.251;DP=186;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,35:186:99:591,0,7657 +chr5 55150066 . C T 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.266;DP=328;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,69:327:99:1331,0,10270 +chr5 55150516 . A C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.149;DP=336;FS=3.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=0.99;ReadPosRankSum=2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,47:336:99:361,0,11272 +chr5 55150612 . CACCTGCAATATAAATGATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACTTCAACAAAGCTTTAAAATGGCTTAAATGACTT C 9190.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=1.211;DP=232;FS=1.619;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=29.72;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,219:225:99:9228,661,0 +chr5 55153129 . T A 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.644;DP=136;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,32:136:99:696,0,3959 +chr5 55163195 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=1.567;DP=94;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:450,0,2678 +chr5 55164902 . A T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.461;DP=60;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:496,0,1580 +chr5 55207008 . T TA 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.702;DP=88;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:691,0,1341 +chr5 55208353 . A G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.196;DP=211;FS=8.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,47:211:99:946,0,6335 +chr5 55208371 . C T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.203;DP=230;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,52:230:99:1045,0,6793 +chr5 55208827 . G A 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.025;DP=207;FS=6.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,56:207:99:1394,0,5807 +chr5 55216572 . G C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.451;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,23:107:99:450,0,3246 +chr5 55216693 . G C 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.850;DP=118;FS=9.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,25:118:99:512,0,3726 +chr5 55228883 . A C 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.228;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,41:124:99:1111,0,3114 +chr5 55228970 . T C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.042;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,33:104:99:902,0,2755 +chr5 55230529 . G C 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.539;DP=125;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,41:125:99:1115,0,3120 +chr5 55230624 . TA T 882.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-1.951;DP=84;FS=1.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:920,0,764 +chr5 55377454 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:268,0,388 +chr5 55516516 . T C 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=-0.783;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=29.35;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:674,0,111 +chr5 55519179 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=13.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:300,0,638 +chr5 55519497 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.257;DP=57;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:308,0,1728 +chr5 55519765 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=-0.139;DP=48;FS=6.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=6.31;ReadPosRankSum=2.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:331,0,1338 +chr5 55521764 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.063;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:292,0,1251 +chr5 55522460 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.176;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=15.72;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:374,0,360 +chr5 55534847 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.219;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:250,0,1329 +chr5 55538371 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.842;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=12.83;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:580,0,937 +chr5 55540843 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.298;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:464,0,840 +chr5 55545564 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.763;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:299,0,1317 +chr5 55549846 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.250;DP=44;FS=7.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:288,0,1206 +chr5 55753066 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.073;DP=50;FS=4.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:427,0,1841 +chr5 55760671 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=-0.421;DP=50;FS=4.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:331,0,1346 +chr5 56068014 . A C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=10.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,139 +chr5 56068945 . C CA 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-1.426;DP=23;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:306,0,156 +chr5 56069506 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:348,0,660 +chr5 56070954 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.864;DP=38;FS=7.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:332,0,972 +chr5 56075203 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.227;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:483,0,890 +chr5 56078595 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.412;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:295,0,902 +chr5 56501140 . C G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.503;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:256,0,890 +chr5 56516870 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:249,0,453 +chr5 56607641 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=1.031;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:328,0,610 +chr5 56622814 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.847;DP=34;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:311,0,827 +chr5 56698392 . T C 1298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=-0.671;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=27.63;ReadPosRankSum=2.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:1327,0,273 +chr5 56698540 . T G 1282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1311,93,0 +chr5 56719348 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-2.047;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:230,0,204 +chr5 56733608 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=1.034;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:286,0,727 +chr5 56869509 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.106;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:309,0,95 +chr5 56981200 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.290;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:245,0,1792 +chr5 57132739 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.637;DP=60;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:447,0,1464 +chr5 57276109 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=-0.562;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:363,0,646 +chr5 57282872 . G T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=1.342;DP=72;FS=2.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:459,0,2048 +chr5 57282896 . C A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.451;DP=71;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:382,0,2073 +chr5 57299485 . GCTGTACACAAACAAAATAACTCCATTGAAATCAGAATTGACATTTCTTTCACTCCTGATATTAAGTATGGTAACTCAC G 3420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.688;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=26.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:3458,262,0 +chr5 57330519 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.066;DP=45;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:257,0,1341 +chr5 57342239 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=1.630;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.66;ReadPosRankSum=-1.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:368,0,1664 +chr5 57360994 . G T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-2.241;DP=39;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:589,0,834 +chr5 57367866 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=1.030;DP=20;FS=11.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:251,0,442 +chr5 57677680 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.277;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:390,0,394 +chr5 57682921 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-0.195;DP=57;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:346,0,1643 +chr5 57683186 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.126;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:362,0,609 +chr5 57722391 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=1.332;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:386,0,1623 +chr5 57794319 . A T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-1.743;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:354,0,946 +chr5 57916920 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=1.512;DP=120;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,24:120:99:375,0,3355 +chr5 57917245 . A G 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=1.548;DP=71;FS=9.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=7.46;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:558,0,1807 +chr5 57918136 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-0.192;DP=89;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:404,0,2731 +chr5 57921546 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.048;DP=64;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:309,0,1854 +chr5 57922683 . A C 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.406;DP=37;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:281,0,1062 +chr5 58324207 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-0.439;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:331,0,2369 +chr5 58361479 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.051;DP=341;FS=2.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,58:341:99:607,0,20835 +chr5 58367697 . C T 1892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-1.156;DP=370;FS=11.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,90:361:99:1921,0,10252 +chr5 58411687 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=-0.652;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:271,0,247 +chr5 58414287 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.228;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:245,0,133 +chr5 58493490 . G T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.781;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=28.39;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:96:738,0,96 +chr5 58515837 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:248,0,446 +chr5 58603244 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.901;DP=31;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:611,0,442 +chr5 58611377 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.444;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.22;ReadPosRankSum=-2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:275,0,478 +chr5 58667820 . C G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,336 +chr5 58681615 . C CT 328.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:408,44,0 +chr5 58685057 . C CT 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.387;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:251,0,252 +chr5 58688392 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-0.489;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:247,0,1265 +chr5 58715291 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,332 +chr5 58762559 . C T 772.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-3.017;DP=243;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,46:236:99:810,0,6983 +chr5 58762598 . G A 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.760;DP=391;FS=4.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,78:391:99:1243,0,11882 +chr5 58793282 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=2.312;DP=74;FS=3.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:618,0,1879 +chr5 58795627 . TA T 1109.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:94:1147,94,0 +chr5 58796283 . C A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.334;DP=22;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:328,0,666 +chr5 58796305 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.380;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:470,0,745 +chr5 58796370 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.950;DP=36;FS=6.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:233,0,1105 +chr5 58926115 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,416 +chr5 58984752 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-1.465;DP=45;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:331,0,1249 +chr5 59008694 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:268,0,91 +chr5 59065015 . T C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.266;DP=141;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,31:141:99:622,0,4300 +chr5 59065280 . T C 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.324;DP=167;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,43:167:99:1000,0,4857 +chr5 59075535 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,141 +chr5 59087189 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.122;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:291,0,748 +chr5 59093792 . C T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.163;DP=64;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:917,0,1255 +chr5 59099109 . A T 203.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:232,0,25 +chr5 59100787 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.230;DP=42;FS=2.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:513,0,911 +chr5 59111579 . G T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=-2.588;DP=84;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:350,0,3365 +chr5 59111590 . A T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-1.735;DP=91;FS=3.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:550,0,3208 +chr5 59127017 . C G 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.125;DP=442;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:341,101:442:99:2049,0,13121 +chr5 59139694 . G A 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=-0.579;DP=418;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:325,93:418:99:1911,0,12631 +chr5 59146196 . A C 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.827;DP=317;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,59:317:99:936,0,16509 +chr5 59245284 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:283,0,61 +chr5 59566425 . T C 443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:472,33,0 +chr5 59836832 . C T 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 +chr5 59836863 . A G 844.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:873,63,0 +chr5 59895770 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=1.694;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:246,0,342 +chr5 59910674 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.760;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:269,0,456 +chr5 59921863 . C T 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-1.255;DP=161;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,46:161:99:1020,0,5185 +chr5 59921882 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=2.509;DP=146;FS=11.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,23:146:99:296,0,9675 +chr5 59921883 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=2.244;DP=148;FS=11.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,23:148:99:296,0,9675 +chr5 59922196 . C CT 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.056;DP=113;FS=4.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:267,0,2146 +chr5 59926091 . A C 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.027;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.488;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,41:184:99:808,0,5455 +chr5 60001983 . TAC T 296.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:27:329,27,0 +chr5 60159294 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,275 +chr5 60160421 . A G 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.347;DP=60;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=15.81;ReadPosRankSum=2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:977,0,2558 +chr5 60160487 . CCAGGTGATCAGTTTAACACTTTATACAGGCAACAGCTATTGAGTAGATTCATAAACAAAGATAAGCATCATTTTTGTTTGGTGTCTGTTTG C 2626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.887;DP=78;FS=5.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=33.68;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,62:72:99:2664,0,897 +chr5 60165085 . A C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-0.356;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:375,0,2894 +chr5 60165513 . G A 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.782;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1965,0,1184 +chr5 60165674 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.516;DP=46;FS=7.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:395,0,2482 +chr5 60165680 . A C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.261;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:335,0,2882 +chr5 60165976 . G A 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 +chr5 60168561 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.791;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:663,0,3954 +chr5 60228399 . G A 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=2.433;DP=61;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1163,0,713 +chr5 60228458 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=2.054;DP=32;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=18.56;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:622,0,1082 +chr5 60228462 . C A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=2.362;DP=31;FS=11.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:622,0,1082 +chr5 60299946 . TG T 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=25.52;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:318,0,303 +chr5 60299951 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=24.15;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:318,0,303 +chr5 60300000 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr5 60315627 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.279;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:363,0,455 +chr5 60316422 . A T 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:531,36,0 +chr5 60316427 . A G 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:531,36,0 +chr5 60316592 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.906;DP=35;FS=3.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:330,0,927 +chr5 60316868 . T A,C 1353.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,27,13:40:99:1539,437,357,1109,0,1081 +chr5 60316884 . T C 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.981;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:522,0,1060 +chr5 60318041 . G A 1517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1546,111,0 +chr5 60328158 . C A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.249;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:484,0,932 +chr5 60332141 . C T 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.422;DP=86;FS=9.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=17.71;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1551,0,1288 +chr5 60332452 . T C 2894.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2923,208,0 +chr5 60334463 . G A 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1682,120,0 +chr5 60344469 . G C 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.442;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:823,0,809 +chr5 60529303 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.623;DP=49;FS=1.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:325,0,1355 +chr5 60548820 . A C 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.450;DP=58;FS=3.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:841,0,1171 +chr5 60548953 . T A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=-0.177;DP=67;FS=10.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:451,0,1865 +chr5 60548978 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-1.935;DP=51;FS=8.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:238,0,1555 +chr5 60549710 . T TA 570.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.169;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:608,0,754 +chr5 60549939 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-1.322;DP=45;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.528;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:311,0,2718 +chr5 60549945 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-1.897;DP=44;FS=7.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:311,0,2718 +chr5 60550120 . A T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=1.450;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:906,0,1413 +chr5 60550198 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-1.080;DP=38;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=6.49;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:275,0,2268 +chr5 60550208 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-2.991;DP=38;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=6.57;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:278,0,2268 +chr5 60550722 . A C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.105;DP=78;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:440,0,2416 +chr5 60550761 . T G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.506;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:424,0,1710 +chr5 60550793 . A C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.392;DP=49;FS=3.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:784,0,1057 +chr5 60550868 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-1.511;DP=53;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.598;QD=15.22;ReadPosRankSum=2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:835,0,1016 +chr5 60559918 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-1.799;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:246,0,897 +chr5 60573037 . C G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.916;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=17.51;ReadPosRankSum=2.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:939,0,897 +chr5 60574198 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:287,0,328 +chr5 60691554 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.351;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:275,0,2774 +chr5 60736970 . A T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr5 60778214 . C T 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.329;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:1253,0,307 +chr5 60778327 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.245;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:519,0,552 +chr5 60779966 . C A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.257;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=14.41;ReadPosRankSum=2.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:547,0,748 +chr5 60780083 . A T 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-1.685;DP=35;FS=3.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=23.74;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:859,0,857 +chr5 60790692 . CACCTGACAACACATTAACAGCACATTAACATGCGTCCGCGCAGCTCGTAGCAACAAAGGTGCGCGTGCTGCAAAAATAAACTAAGATCCACCATAGAACGG C 5601.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=2.950;DP=139;FS=2.190;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=29.07;ReadPosRankSum=-2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,136:139:99:5639,493,0 +chr5 60799893 . GCCTGAACACACACGCAAACACACATTCAGCATCTCTTACCGTGCATCAGCTGATTTATGGCTGAATTGTGGATGTCTTA G 3746.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=4.623;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=33.16;ReadPosRankSum=-2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,91:113:99:3784,0,5651 +chr5 60809926 . C A 2152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=1.562;DP=105;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.702;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,66:105:99:2181,0,1321 +chr5 60897137 . C A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-1.032;DP=51;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:784,0,915 +chr5 60900041 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.431;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:731,0,699 +chr5 60900305 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:287,0,115 +chr5 60959688 . G A 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 +chr5 61078952 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=1.244;DP=30;FS=9.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=18.73;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:590,0,1154 +chr5 61078961 . A G 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.781;DP=31;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=18.12;ReadPosRankSum=2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:590,0,1157 +chr5 61095779 . T G 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.405;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:825,0,336 +chr5 61118194 . C T 2159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=-1.844;DP=109;FS=4.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=19.81;ReadPosRankSum=2.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:2188,0,1394 +chr5 61142789 . G A 1958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.384;DP=101;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1987,0,1379 +chr5 61148009 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.051;DP=51;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:1044,0,667 +chr5 61178150 . G A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.868;DP=83;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:1219,0,1558 +chr5 61178165 . C T 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.981;DP=84;FS=4.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1242,0,1600 +chr5 61178725 . G T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,129 +chr5 61179761 . C T 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-2.283;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=31.48;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:99:1004,0,324 +chr5 61181596 . G C 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 +chr5 61231911 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:233,0,66 +chr5 61235035 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.610;ClippingRankSum=-0.316;DP=45;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.048;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:603,0,1835 +chr5 61242479 . T C 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:456,33,0 +chr5 61248021 . T A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.370;DP=50;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:830,0,1022 +chr5 62036963 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.107;DP=59;FS=7.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:496,0,1521 +chr5 62037059 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.577;DP=45;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:297,0,1247 +chr5 62343658 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.202;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:229,0,1765 +chr5 62528217 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.076;DP=85;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:480,0,2517 +chr5 62553134 . G GT 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=1.050;DP=46;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:598,0,324 +chr5 62553177 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-0.209;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:421,0,659 +chr5 62557554 . TCTGAGGCAAAGTCAAGAATTACAAAAAAACACTCATCAATAGTCTTTCATATAAAACTGAACCTTCCTAC T 443.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=31.00;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:43:481,43,0 +chr5 62678571 . G GT 312.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:350,33,0 +chr5 62678603 . C A 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:413,33,0 +chr5 62762077 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=-0.660;DP=84;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,22:77:99:547,0,2285 +chr5 62762131 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.580;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:282,0,495 +chr5 62828590 . G C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=1.372;DP=54;FS=11.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:351,0,1560 +chr5 62828621 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.363;DP=62;FS=6.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:252,0,1920 +chr5 62861921 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-0.093;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:603,0,1431 +chr5 62861951 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.615;DP=61;FS=3.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:463,0,1733 +chr5 62874910 . A T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.272;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:692,0,954 +chr5 62949393 . A T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-1.955;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:633,0,399 +chr5 62949406 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=1.244;DP=27;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:439,0,516 +chr5 62954696 . T G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=-2.362;DP=128;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,25:128:99:448,0,4000 +chr5 62954930 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.841;DP=127;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,34:127:99:818,0,3615 +chr5 62954972 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.770;DP=134;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:683,0,4021 +chr5 62965219 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.706;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:321,0,332 +chr5 62987398 . A T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.718;DP=63;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:342,0,1901 +chr5 62987447 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.874;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:356,0,1429 +chr5 63105250 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.581;DP=35;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:328,0,926 +chr5 63105634 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-1.438;DP=63;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:435,0,1705 +chr5 63109702 . GT G 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=1.232;DP=55;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:318,0,662 +chr5 63110118 . TTC T 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.164;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:288,0,877 +chr5 63166880 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-1.365;DP=42;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:502,0,927 +chr5 63565911 . T C 257.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:286,0,20 +chr5 63584007 . A G 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:528,36,0 +chr5 63688278 . T A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=1.281;DP=91;FS=6.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,27:91:99:713,0,2469 +chr5 63713213 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.451;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:499,0,2258 +chr5 63818285 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.973;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:291,0,2056 +chr5 63842497 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.809;DP=89;FS=6.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:597,0,2517 +chr5 63852090 . A G 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.431;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,34:131:99:794,0,3775 +chr5 63883470 . C G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.593;DP=39;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:626,0,665 +chr5 64401685 . T G 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 +chr5 64401702 . A C 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 +chr5 64452302 . C T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=-1.034;DP=116;FS=2.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,25:116:99:476,0,3178 +chr5 64455338 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-1.156;DP=150;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,38:150:99:795,0,4166 +chr5 64465640 . CT C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.890;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:285,0,113 +chr5 64522121 . T C 2087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=1.788;DP=103;FS=4.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,76:103:99:2116,0,706 +chr5 64534937 . C T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-0.266;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:596,0,1038 +chr5 64535076 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.869;DP=44;FS=6.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:709,0,707 +chr5 64562239 . C CAGAAGAGAAA 754.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:55:792,55,0 +chr5 64567108 . G T 910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.241;DP=26;FS=3.160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=33.42;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:32:939,32,0 +chr5 64571024 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.702;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:292,0,1069 +chr5 64615343 . G T 3539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3568,265,0 +chr5 64615978 . AT A 1303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=2.187;DP=68;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,49:68:99:1341,0,312 +chr5 64629297 . G C 885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:914,69,0 +chr5 64634684 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:245,0,166 +chr5 64646763 . G C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:394,0,329 +chr5 64646798 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=-1.142;DP=27;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=7.73;ReadPosRankSum=2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:237,0,1380 +chr5 64694005 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr5 64727834 . G A 6979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=-0.517;DP=260;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,193:260:99:7008,0,1372 +chr5 64742620 . C A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.471;DP=206;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=3.00;ReadPosRankSum=2.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,39:206:99:647,0,6490 +chr5 64745244 . G C 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.366;DP=164;FS=10.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,51:164:99:1335,0,4306 +chr5 64745340 . C T 6045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=1.406;DP=203;FS=6.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,144:202:99:6074,0,3422 +chr5 64764504 . A G 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-0.468;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,49:196:99:1155,0,5704 +chr5 64764570 . T C 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.141;DP=172;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,43:171:99:963,0,5022 +chr5 64785646 . C T 1749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-2.222;DP=249;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,73:249:99:1778,0,6662 +chr5 64785680 . G A 6041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-1.757;DP=239;FS=9.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,160:239:99:6070,0,2171 +chr5 64786372 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=4.258;DP=149;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,25:148:99:337,0,5035 +chr5 64786533 . T C 2038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=2.423;DP=94;FS=5.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=21.69;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,58:94:99:2067,0,1251 +chr5 64864522 . AAGGTCAGTTCTGTGTGCTTGGGACTACTTTTTTGTGTTGCTCAATCTGACTGTTCCTTTGGTTGTTAT A 11098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=2.453;DP=315;FS=14.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=31.67;ReadPosRankSum=3.235 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,266:275:99:11136,843,0 +chr5 64870177 . GT G,GTT 1653.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.095;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,15,69:87:99:1832,1619,2368,333,0,338 +chr5 64871569 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=28.10;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:48:253,0,48 +chr5 64872321 . CT C 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=2.420;DP=30;FS=6.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=17.59;ReadPosRankSum=-2.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:565,0,204 +chr5 64872556 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=4.188;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:381,0,474 +chr5 64872924 . C T 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=-3.998;DP=40;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=27.27;ReadPosRankSum=3.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1119,0,334 +chr5 64872994 . TC T 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=-0.419;DP=52;FS=13.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=9.51;ReadPosRankSum=3.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:532,0,892 +chr5 64874005 . C T 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.407;ClippingRankSum=-3.876;DP=34;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=30.46;ReadPosRankSum=3.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:99:1064,0,120 +chr5 64874492 . G T 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=-2.620;DP=59;FS=3.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1276,0,745 +chr5 64875996 . C A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-1.150;DP=99;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,20:98:99:389,0,3115 +chr5 64876646 . C A 15786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=287;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,286:286:99:15815,1089,0 +chr5 64876649 . A C 15786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=290;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,289:289:99:15815,1089,0 +chr5 64933133 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.971;DP=149;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,29:149:99:487,0,4437 +chr5 64937478 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.577;DP=157;FS=5.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,29:157:99:473,0,4808 +chr5 64939873 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-0.533;DP=115;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,24:115:99:424,0,3363 +chr5 64946027 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.402;DP=168;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.014;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,32:168:99:419,0,5173 +chr5 64946317 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.432;DP=195;FS=8.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,33:194:99:433,0,6076 +chr5 64993818 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-1.672;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:264,0,753 +chr5 64993896 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:254,0,142 +chr5 64993897 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:344,0,54 +chr5 64994768 . CCTTACCTATTTTATAAAGAAAATGATTAAACCCATAATATTGGTTGAGCAGGATCAGATATCTGAAACAATATGTTAATAGTA C 948.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.931;DP=28;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.525;QD=33.88;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:99:986,0,910 +chr5 65352355 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.678;DP=15;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,291 +chr5 65533163 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-1.684;DP=91;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,30:91:99:844,0,2289 +chr5 65553630 . A T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.074;DP=71;FS=3.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:390,0,2053 +chr5 65566304 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-1.441;DP=81;FS=3.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:269,0,2380 +chr5 65634631 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 +chr5 65634632 . T G 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:349,24,0 +chr5 65763359 . G A 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +chr5 65768192 . C T 934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:963,72,0 +chr5 65770992 . G A 444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:473,33,0 +chr5 65771817 . T C 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 +chr5 65771949 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr5 65950017 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.586;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:460,0,605 +chr5 66051497 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.993;DP=77;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:408,0,2153 +chr5 66058726 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=-1.452;DP=48;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:309,0,1368 +chr5 66059104 . A AT 430 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.070;DP=19;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:12:467,0,12 +chr5 66059467 . CA C 540.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.315;DP=25;FS=9.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:17:567,0,17 +chr5 66062874 . G C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.829;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:260,0,1392 +chr5 66069859 . CTGATGT C 277.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:315,26,0 +chr5 66495973 . TCTGTGTAGAAATCATAATTTTTAAAAAAAAGTGTTCAATGAATATATGAAAACACTCCCCTGACAATGACTGCAGGCCCAC T 14098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.934;ClippingRankSum=0.834;DP=353;FS=5.025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=27.39;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,334:343:99:14136,1117,0 +chr5 66894936 . C G 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:30:409,30,0 +chr5 66895826 . AT A 210.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:245,0,0 +chr5 66937144 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=-0.041;DP=61;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:337,0,1715 +chr5 67004540 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,131 +chr5 67005376 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,211 +chr5 67473240 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-1.387;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:676,0,687 +chr5 67473386 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.164;DP=30;FS=7.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=29.03;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:899,0,499 +chr5 67474028 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=1.383;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:481,0,538 +chr5 67474149 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=1.889;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=18.17;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:537,0,1029 +chr5 67474467 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:261,0,277 +chr5 67474520 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-2.147;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=19.49;ReadPosRankSum=2.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:496,0,299 +chr5 67474575 . G C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:245,0,204 +chr5 67478544 . G A 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-1.160;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1094,0,745 +chr5 67530488 . G GA 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-3.840;DP=387;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=0.80;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,61:356:99:346,0,8343 +chr5 67571503 . AT A 558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.894;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:596,0,902 +chr5 67620931 . T C 208.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:237,0,22 +chr5 67844850 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.868;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:455,0,331 +chr5 67877341 . G A 1558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.749;DP=94;FS=2.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:1587,0,1607 +chr5 67877974 . C A 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.771;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:854,0,1171 +chr5 67878735 . A T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.393;DP=33;FS=3.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:431,0,750 +chr5 67878950 . G T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.879;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:420,0,367 +chr5 67878961 . CT C 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-1.970;DP=23;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:275,0,274 +chr5 67880700 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.801;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:468,0,732 +chr5 67936271 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:233,0,65 +chr5 67937706 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-1.280;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:262,0,358 +chr5 67989594 . TA T 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.191;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:415,0,1698 +chr5 68354388 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:265,0,450 +chr5 68396587 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-1.499;DP=61;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:351,0,1699 +chr5 68396624 . CCCTGTGAACAGAGAGACACAATGACTTACAGACGCGTCATCACTCAACCCCGGTGGACACAAAATACAGAGGGAGGTCTGGCTTTCATTACACA C 221.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=2.368;DP=64;FS=2.962;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=3.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:259,111,0 +chr5 68433061 . AGTAAGCATTTTGATAGTGATTTATAATAGAAGATAATAGTTATTTGAGTATTAAACTGTTATAATTATACTAGTGGTAATGATTTATAACACAAACTCATCTTTCATTACAG A 1844.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=2.741;DP=43;FS=2.578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=32.23;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,40:43:99:1882,162,0 +chr5 68602746 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.377;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:244,0,882 +chr5 68659589 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-1.001;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=21.09;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:450,0,245 +chr5 68665365 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.322;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=3.19;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:382,0,3498 +chr5 68667991 . T TA 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.229;DP=94;FS=2.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:356,0,1432 +chr5 68668567 . A T 2219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=1.200;DP=206;FS=6.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,70:204:99:2248,0,4643 +chr5 68668690 . G A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.275;DP=228;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,63:228:99:1398,0,5933 +chr5 68669117 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.199;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,26:124:99:338,0,4645 +chr5 68669134 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.030;DP=108;FS=17.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=2.57;ReadPosRankSum=-2.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:306,0,4240 +chr5 68674525 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-1.414;DP=125;FS=7.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=11.40;ReadPosRankSum=2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,44:125:99:1453,0,2738 +chr5 68679988 . C T 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-0.065;DP=145;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=11.15;ReadPosRankSum=3.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,49:145:99:1645,0,3319 +chr5 68684891 . C T 1449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.650;DP=127;FS=3.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:1478,0,2559 +chr5 68684954 . A G 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.814;DP=135;FS=4.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,48:134:99:1585,0,3037 +chr5 68688468 . A T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.561;DP=84;FS=4.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=8.09;ReadPosRankSum=2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,28:84:99:708,0,2062 +chr5 69009847 . G T 2778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-2.729;DP=165;FS=6.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,88:165:99:2807,0,2855 +chr5 69010218 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=3.289;DP=64;FS=25.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:598,0,1603 +chr5 69010795 . A G 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=-0.556;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=16.34;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:1744,0,1958 +chr5 69010987 . G A 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.147;DP=93;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:942,0,5131 +chr5 69011113 . A G 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.071;DP=73;FS=13.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,43:73:99:1466,0,1104 +chr5 69014531 . GT G 2750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.467;DP=168;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,104:161:99:2788,0,2768 +chr5 69166985 . AAGGCAAGATGGAGAACTCCTGTTTATGCTCGTGTTTAGAGAGAATTGTGGTGATTCTGATTTGATTGTTGTGGTTGTAAT A 2932.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2970,244,0 +chr5 69260366 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=1.061;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:373,0,131 +chr5 69329032 . A G 2785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=-1.033;DP=134;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=20.79;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,63:75:93:2814,0,93 +chr5 69351957 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.895;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:515,0,471 +chr5 69353568 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.789;DP=18;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:482,0,159 +chr5 69372483 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.808;DP=45;FS=4.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:806,0,752 +chr5 69436777 . C A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.527;DP=36;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:446,0,780 +chr5 69449921 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.143;DP=46;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:795,0,769 +chr5 69462399 . G T 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.733;DP=58;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1133,0,2046 +chr5 69462401 . A C 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.116;DP=59;FS=2.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1133,0,2046 +chr5 69462505 . C T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=-1.802;DP=59;FS=2.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=14.83;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:903,0,1125 +chr5 69476337 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.741;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:546,0,1129 +chr5 69476983 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=1.166;DP=56;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:710,0,1145 +chr5 69487364 . G A 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.046;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:726,0,962 +chr5 69672175 . CA C 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-2.362;DP=92;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:683,0,1154 +chr5 69801775 . C CA 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-2.753;DP=160;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,35:141:99:454,0,2197 +chr5 69805938 . G A 6374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.784;DP=345;FS=1.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,192:345:99:6403,0,5494 +chr5 70183196 . CA C 679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:717,63,0 +chr5 70183263 . CA C 349.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr5 70183265 . A T 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr5 70232455 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.923;DP=32;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:572,0,568 +chr5 70262153 . GCCTACAAATAACAAAAAAGCAAACAAAGACACATTATTAATGCGTGCTGATTTTAAACCACTTCAACAAATCTCTTGAAATAAACGATGTA G 3740.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=1.863;DP=91;FS=3.807;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=32.48;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,85:91:99:3778,138,0 +chr5 70266571 . G T 824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:853,60,0 +chr5 70266642 . T C 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 +chr5 70282627 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.053;DP=18;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:296,0,305 +chr5 70283502 . T TA 591.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=1.281;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:31:629,31,0 +chr5 70283559 . C A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr5 70284885 . AT A 894.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=1.316;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:37:932,37,0 +chr5 70311497 . A G 494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:523,39,0 +chr5 70318442 . GCTGCAGCAGACAGAGAATAGAGTCTAAATATACAGCTTCACGTGTAGACGTCTGACTTTATGAAGCAGAAGGTTTTAC G 1924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-0.697;DP=48;FS=6.887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1962,138,0 +chr5 70456127 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:92:516,0,92 +chr5 70459539 . T C 6803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=-2.931;DP=301;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,188:296:99:6832,0,3571 +chr5 70478139 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:259,18,0 +chr5 70478145 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr5 70521662 . G GTA 233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr5 70729970 . C G 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 +chr5 70810221 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.161;DP=54;FS=6.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:350,0,2977 +chr5 70813949 . C T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-0.501;DP=70;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:967,0,1335 +chr5 70855746 . CT C 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=1.035;DP=81;FS=3.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:487,0,998 +chr5 70856214 . CAT C 1679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1717,123,0 +chr5 70856518 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.058;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,534 +chr5 70876720 . C T 651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:680,48,0 +chr5 70876735 . TC T 225.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:263,21,0 +chr5 70876812 . T C 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:526,36,0 +chr5 70877222 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr5 70877381 . C A 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:836,63,0 +chr5 70877760 . T C 1044.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1073,75,0 +chr5 70878292 . T C 1698.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1727,129,0 +chr5 70919491 . A G 7638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:7667,532,0 +chr5 71058719 . C T 1151.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1180,87,0 +chr5 71083661 . C A 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr5 71083662 . A T 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 +chr5 71084239 . TC T 491.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:529,36,0 +chr5 71228843 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:257,18,0 +chr5 71288864 . G A 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 +chr5 71293437 . C A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 +chr5 71304678 . TA T 269.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.48;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:306,6,0 +chr5 71304814 . A T 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:630,45,0 +chr5 71357649 . ACTTCAAACGAGAGAGAGAAAAAACAACTTTCAAAATGAGGAGACGCGAACTCTTCGGATAAATTTACACTATTGTGAATGATAAGAAGACTTCTGTATAGTATTTATGGCAGTGACAGATCTTAC A 610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.593;DP=26;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:648,0,2622 +chr5 71460155 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,134 +chr5 71671349 . A C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.230;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:448,0,684 +chr5 71673654 . C T 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.710;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=25.59;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1103,0,297 +chr5 71673723 . T C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.893;DP=37;FS=4.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:766,0,472 +chr5 71683033 . G T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=2.810;DP=49;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:635,0,1029 +chr5 71683774 . G T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=1.371;DP=39;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:847,0,577 +chr5 71684300 . T G 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.256;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:994,0,1309 +chr5 71719049 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.412;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:542,0,917 +chr5 71719057 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.174;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:542,0,917 +chr5 71719348 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr5 71721847 . G C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=2.528;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:52:902,0,52 +chr5 71738060 . G C 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.885;DP=65;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,42:65:99:1441,0,765 +chr5 71752846 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:231,0,185 +chr5 71798528 . CA C 283.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:321,30,0 +chr5 71800744 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.935;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:406,0,328 +chr5 71803278 . A C 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.399;DP=33;FS=6.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:973,0,208 +chr5 71803390 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=2.609;DP=29;FS=20.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:544,0,846 +chr5 71803391 . C A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=1.822;DP=25;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=21.07;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:555,0,846 +chr5 71803591 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=1.318;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:470,0,169 +chr5 71803629 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-1.610;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.098;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:369,0,241 +chr5 71803833 . G GA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.106;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:254,0,194 +chr5 71804390 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:471,0,312 +chr5 71805591 . T A 2319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.875;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,63:93:99:2348,0,802 +chr5 71808092 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-3.091;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:424,0,340 +chr5 71810478 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.861;DP=26;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=26.95;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:729,0,564 +chr5 71810485 . A T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.539;DP=26;FS=6.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=25.22;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:684,0,654 +chr5 71811037 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=3.225;DP=19;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:348,0,753 +chr5 71811039 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=3.091;DP=18;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:348,0,753 +chr5 71811133 . AT A 325.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.736;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:14:363,14,0 +chr5 71811168 . A T 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:752,54,0 +chr5 71811749 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=1.081;DP=49;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:264,0,1428 +chr5 71816683 . G A 6719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.085;DP=361;FS=13.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=18.61;ReadPosRankSum=-1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,203:361:99:6748,0,5713 +chr5 71821208 . T C 3463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.425;ClippingRankSum=1.318;DP=271;FS=12.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=12.78;ReadPosRankSum=2.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,101:271:99:3492,0,5588 +chr5 71880849 . G A 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=-1.417;DP=56;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1152,0,2307 +chr5 71880856 . G C 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.812;DP=59;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1152,0,2307 +chr5 71881578 . C A 1300.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=1.083;DP=33;FS=5.509;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=29.70;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1329,93,0 +chr5 71881655 . C CT 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.715;DP=14;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:242,0,173 +chr5 71881794 . A G 993.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1022,72,0 +chr5 71881814 . G A 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1000,72,0 +chr5 71881868 . AT A 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.817;DP=31;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:256,0,204 +chr5 71882027 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.225;DP=36;FS=5.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:494,0,1141 +chr5 71882171 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=1.555;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:277,0,376 +chr5 71882589 . C A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.309;DP=41;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=27.53;ReadPosRankSum=2.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1157,0,260 +chr5 71883032 . G GTGTA 369.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:407,29,0 +chr5 71883461 . G A 238.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:267,0,16 +chr5 71883799 . A C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-1.217;DP=24;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:447,0,398 +chr5 71884861 . C T 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=1.141;DP=93;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.682;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:1325,0,1692 +chr5 71891322 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:268,0,642 +chr5 71891433 . T A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.094;DP=35;FS=6.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:1009,0,236 +chr5 71903401 . C A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.345;DP=98;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1566,0,1749 +chr5 71998235 . A AC 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.483;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.08;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:635,0,481 +chr5 71998911 . T A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=3.434;DP=28;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:613,0,743 +chr5 71999940 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr5 72000434 . AT A 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=1.441;DP=26;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:299,0,309 +chr5 72000827 . G A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=1.488;DP=57;FS=9.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1103,0,861 +chr5 72020943 . C T 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.941;ClippingRankSum=0.800;DP=77;FS=1.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:1211,0,1342 +chr5 72032447 . C A 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.843;DP=70;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:1117,0,1230 +chr5 72057314 . GA G 2434.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:2472,218,0 +chr5 72080058 . T A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr5 72085760 . T C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr5 72119449 . G A 200.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:229,21,0 +chr5 72147260 . G T 5436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.694;DP=255;FS=3.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,165:255:99:5465,0,2978 +chr5 72147279 . G A 7091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=1.388;DP=292;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=24.29;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,196:292:99:7120,0,2550 +chr5 72150735 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=1.184;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:373,0,328 +chr5 72151950 . AGGCTAGTTTTTAACAGCAGATGGCACTCTAGGGTAGTGTTTAACAGCAGATGCCGCTCTAGGCTAGTGTTTAACAGCAGATGGTGCTCTAGGCTAGTGATTAAAAGCAGATGGCGCTCTG A 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=19.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:248,0,1287 +chr5 72153013 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:258,0,105 +chr5 72165146 . G T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=1.676;DP=41;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=25.75;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,29:41:99:1084,0,293 +chr5 72167489 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.457;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:280,0,376 +chr5 72172525 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.976;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=19.60;ReadPosRankSum=-2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:479,0,323 +chr5 72176231 . C T 974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1003,72,0 +chr5 72217177 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:318,0,361 +chr5 72222044 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:238,0,409 +chr5 72228789 . T G 749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:778,57,0 +chr5 72228818 . C T 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:721,51,0 +chr5 72362219 . TCTAGATGTGGTGTTAAAGAGAAATAAACATTACAAAAAATATATGTGCATCTCACAAATGTTTATTCCGAGTCTGGGGTTTCTTAC T 18257.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.295;DP=412;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,408:411:99:18295,1484,0 +chr5 72452833 . T C 2025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2054,157,0 +chr5 72454773 . A G 5263.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:5292,374,0 +chr5 72463432 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr5 72473479 . G A 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1381,99,0 +chr5 72474396 . T C 810.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:839,66,0 +chr5 72478769 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.801;DP=48;FS=10.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:389,0,1257 +chr5 72486701 . T C 364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:393,30,0 +chr5 72509756 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=17.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:294,0,51 +chr5 72510323 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr5 72514546 . A C 1018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1047,72,0 +chr5 72535703 . C T 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 +chr5 72535779 . G T 2939.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2968,208,0 +chr5 72535827 . C T 4269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:4298,310,0 +chr5 72537317 . A G 577.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:606,45,0 +chr5 72584636 . G A 3208.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3237,237,0 +chr5 72585138 . G A 3515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3544,256,0 +chr5 72589408 . G C 702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:731,54,0 +chr5 72592510 . A G 4052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4081,301,0 +chr5 72601395 . G T 1079.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1108,75,0 +chr5 72649278 . T A 948.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:977,72,0 +chr5 72649516 . T TA 2071.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2424,246,0 +chr5 72657454 . G A 827.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:856,60,0 +chr5 72657560 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:352,27,0 +chr5 72664938 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=-0.878;DP=53;FS=7.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:357,0,1470 +chr5 72664950 . A C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.808;DP=67;FS=5.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:600,0,1698 +chr5 72666617 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-2.022;DP=111;FS=39.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,20:111:99:308,0,3390 +chr5 72673200 . A G 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 +chr5 72673300 . A T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.829;DP=21;FS=19.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=27.80;ReadPosRankSum=2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:612,0,426 +chr5 72673305 . C A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-3.031;DP=22;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=26.53;ReadPosRankSum=2.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:612,0,473 +chr5 72687824 . A AT 245.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:316,32,0 +chr5 72721160 . G A 2146.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2175,163,0 +chr5 72746124 . T C 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:528,36,0 +chr5 72746126 . G A 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:528,36,0 +chr5 72751107 . A G 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=2.550;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1127,0,1159 +chr5 72755145 . C A 432.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=33.27;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:3:459,3,0 +chr5 72761698 . A T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=3.191;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:378,0,338 +chr5 72762527 . A T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.277;DP=47;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1071,0,617 +chr5 72771206 . C T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=1.225;DP=54;FS=5.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1068,0,811 +chr5 72776046 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=1.449;DP=26;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:333,0,580 +chr5 72801461 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr5 72815950 . T G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=-0.588;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:899,0,900 +chr5 72817913 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-3.674;DP=69;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:512,0,4194 +chr5 72817919 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=-3.305;DP=71;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=6.81;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:512,0,4194 +chr5 72820173 . C T 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=2.547;DP=74;FS=8.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:970,0,1607 +chr5 72823038 . C T 2319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-1.592;DP=142;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:2348,0,2389 +chr5 72918167 . G A 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:445,33,0 +chr5 72918249 . A C 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 +chr5 72923961 . CA C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.930;DP=20;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:31:266,0,31 +chr5 72923982 . G GT 453.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=1.214;DP=25;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:64:601,64,0 +chr5 72936201 . T A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr5 72957221 . G T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr5 72957387 . TACCTGATTGGGGAAGAATGATGAATGTTAAAGCGGATGCTTGTTTTCTCTGGCGGCAGGATTAAAGTGGCAGAACTC T 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.290;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=34.29;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:483,0,738 +chr5 72957676 . T C 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:485,33,0 +chr5 72957849 . AACCTGTGCAAATACATGGATGAGCAACTTATTAGTGATTGTTCTTGAGCACTGAGCACACTGAGTGATTTACAC A 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=2.606;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=32.99;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:631,0,862 +chr5 72990564 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:289,0,488 +chr5 73379495 . GTC G 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.138;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:457,0,476 +chr5 73583547 . TA T 216.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:20:249,20,0 +chr5 73587207 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr5 74752100 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.859;ClippingRankSum=2.169;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.99;ReadPosRankSum=-2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:478,0,474 +chr5 74756101 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,214 +chr5 74756187 . AT A 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:81:328,0,81 +chr5 74854492 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.969;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=14.08;ReadPosRankSum=2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:690,0,857 +chr5 74854937 . A T 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.729;DP=82;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1194,0,1574 +chr5 74854955 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.090;DP=66;FS=6.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:1008,0,1190 +chr5 74932827 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.462;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:705,0,567 +chr5 74933243 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=1.421;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:426,0,758 +chr5 74935592 . T A 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 +chr5 74982120 . G C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:335,0,125 +chr5 74983116 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.099;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,619 +chr5 74986930 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=1.093;DP=56;FS=3.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:848,0,925 +chr5 75025912 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,124 +chr5 75057879 . C T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.458;DP=73;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=15.33;ReadPosRankSum=2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1147,0,1307 +chr5 75060302 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.379;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:829,0,659 +chr5 75072955 . TTCATCA T 406.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:44:444,44,0 +chr5 75078593 . C T 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-1.447;DP=75;FS=6.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1031,0,1498 +chr5 75097368 . T A 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 +chr5 75124007 . GAAGTCAATGGTTACTGGTTTACAATACTATAA G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:43:255,0,43 +chr5 75130582 . TA T 465.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:43:503,43,0 +chr5 75130969 . A T 411.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=33.38;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:3:438,0,3 +chr5 75138109 . C T 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=-1.177;DP=178;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.763;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,58:169:99:1707,0,3247 +chr5 75153161 . C T 2534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.944;DP=150;FS=7.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:2563,0,2551 +chr5 75158030 . G A 2878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=-1.112;DP=200;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,99:199:99:2907,0,3387 +chr5 75158576 . G A 2686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-1.857;DP=137;FS=0.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=19.61;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,83:137:99:2715,0,1776 +chr5 75172741 . T C 3407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.749;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.111;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,95:190:99:3436,0,3558 +chr5 75179380 . T A 609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:638,45,0 +chr5 75180839 . G T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr5 75181156 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.168;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:390,0,696 +chr5 75182332 . G A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.117;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:727,0,745 +chr5 75182943 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-1.491;DP=24;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.66;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:308,0,518 +chr5 75245744 . A G 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:697,48,0 +chr5 75245835 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:240,0,130 +chr5 75245884 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-0.667;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:466,0,486 +chr5 75245971 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.016;DP=36;FS=7.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:567,0,689 +chr5 75257589 . C A 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:275,21,0 +chr5 75259154 . G T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-1.250;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:556,0,99 +chr5 75259442 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:412,0,552 +chr5 75259697 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.113;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:492,0,473 +chr5 75266926 . T A 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-1.156;DP=73;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,37:64:99:1092,0,954 +chr5 75267158 . A T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=-2.376;DP=78;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:608,0,2097 +chr5 75267208 . C A 991.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.620;DP=77;FS=13.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:1226,0,1227 +chr5 75272224 . C T 2323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.979;DP=81;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=28.69;ReadPosRankSum=1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,65:81:99:2352,0,243 +chr5 75272253 . A G 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.713;ClippingRankSum=0.418;DP=88;FS=8.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:558,0,2200 +chr5 75278028 . C T 2862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.955;DP=167;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,83:167:99:2891,0,2926 +chr5 75281384 . G A 1658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.120;DP=120;FS=10.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:1687,0,2335 +chr5 75281555 . A G 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=-4.469;DP=90;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:90:99:1169,0,1626 +chr5 75283194 . GT G 1830.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-1.259;DP=130;FS=3.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1868,0,1946 +chr5 75284311 . G A 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=-0.068;DP=120;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1899,0,3274 +chr5 75284791 . C G 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.467;DP=56;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1025,0,1028 +chr5 75286281 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-1.071;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.190;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:715,0,1075 +chr5 75286703 . T A 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-2.809;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=26.26;ReadPosRankSum=2.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:99:954,0,202 +chr5 75288013 . T A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=2.834;DP=85;FS=2.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=3.89;ReadPosRankSum=2.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:359,0,2584 +chr5 75288247 . G A 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-1.067;DP=109;FS=8.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1753,0,1863 +chr5 75288745 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:229,0,156 +chr5 75308910 . C T 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.104;DP=51;FS=5.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:841,0,961 +chr5 75310572 . G A 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.088;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1567,0,1543 +chr5 75311302 . G A 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.519;DP=83;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1479,0,1219 +chr5 75316352 . C T 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-1.486;DP=123;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1756,0,2318 +chr5 75316755 . G A 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=1.088;DP=95;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:1527,0,1740 +chr5 75317666 . G A 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=1.561;DP=76;FS=4.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,29:75:99:990,0,1551 +chr5 75318712 . C T 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.596;DP=101;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:1201,0,2265 +chr5 75320362 . T C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=-0.711;DP=81;FS=6.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:626,0,2479 +chr5 75320588 . T G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-0.046;DP=37;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=14.64;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:570,0,772 +chr5 75369967 . C CT 219.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:257,27,0 +chr5 75418393 . G T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=-0.170;DP=69;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:815,0,1554 +chr5 75420873 . C T 1669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=-0.659;DP=66;FS=11.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=25.30;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,43:66:99:1698,0,1700 +chr5 75420875 . C T 1677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.259;DP=68;FS=8.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,45:68:99:1706,0,1700 +chr5 75421025 . C T 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=1.107;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=15.67;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:1266,0,1450 +chr5 75422779 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.305;DP=73;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:1131,0,1238 +chr5 75469594 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.074;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:546,0,383 +chr5 75474532 . A C 633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:662,48,0 +chr5 75476287 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:292,0,244 +chr5 75476341 . C T 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:529,39,0 +chr5 75476429 . T C 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:675,51,0 +chr5 75476716 . T C 721.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:750,54,0 +chr5 75476795 . A C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr5 75563678 . G T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr5 75573232 . T G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.312;ClippingRankSum=5.257;DP=139;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=11.29;ReadPosRankSum=-2.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:1598,0,2261 +chr5 75573292 . C T 3008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=4.800;DP=161;FS=13.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,62:160:99:3037,0,7475 +chr6 1742 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.134;DP=77;FS=2.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:467,0,2031 +chr6 2686 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.329;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:241,0,1016 +chr6 11735 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-1.045;DP=69;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:381,0,3773 +chr6 11740 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.282;DP=63;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:381,0,3773 +chr6 12789 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.153;DP=42;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:324,0,2191 +chr6 12795 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.456;DP=41;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:314,0,2191 +chr6 12906 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.041;DP=68;FS=3.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:457,0,1832 +chr6 17588 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-1.182;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:821,0,1243 +chr6 18017 . T C 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.154;DP=72;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:811,0,1605 +chr6 22809 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-0.345;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:556,0,1125 +chr6 22980 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.088;DP=42;FS=5.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:335,0,1066 +chr6 38985 . G C 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.056;DP=97;FS=1.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:1305,0,1899 +chr6 39001 . G A 1926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=1.603;DP=96;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,59:96:99:1955,0,1258 +chr6 39276 . G A 2753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=-0.526;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=25.74;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,74:106:99:2782,0,808 +chr6 39357 . A C 2418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.142;DP=119;FS=7.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,77:119:99:2447,0,1311 +chr6 39829 . A G 4850.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:4879,352,0 +chr6 40105 . A G 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=-0.524;DP=141;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,41:141:99:1034,0,3692 +chr6 40599 . C T 3864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:3893,283,0 +chr6 41027 . G T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.477;DP=131;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,40:130:99:1001,0,3236 +chr6 41294 . T C 5112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:5141,387,0 +chr6 42277 . A G 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.387;DP=138;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,51:137:99:1730,0,2853 +chr6 43451 . C T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.118;DP=123;FS=5.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:1600,0,2463 +chr6 44172 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.734;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:271,0,1077 +chr6 44331 . TGC T 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.065;DP=17;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:378,0,108 +chr6 50852 . GAGGTGAGAGACGCGGTTATCACTCGTAAACACTGCGGTCATTCATCCAGCCTGTGTTTGAACCTGTGTGTGTGTGTGTGTTC G 3007.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=1.902;DP=72;FS=2.801;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=38.22;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:3045,274,0 +chr6 51067 . AGTAAGAGCCGCCCCCCTCCACTGGACCCTCAGGTGTGCTCGGGTATGCTCAGGTGTGTGTTCTGCTTCTCCACAG A 2157.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=2.303;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=34.80;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,51:62:99:2195,0,2564 +chr6 51152 . A G 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=1.813;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=14.62;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:847,0,6406 +chr6 55238 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.380;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:497,0,567 +chr6 56009 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:300,0,1054 +chr6 67545 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.502;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:455,0,565 +chr6 69535 . C G 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.111;DP=100;FS=0.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1179,0,2060 +chr6 71958 . CA C 441.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.740;DP=14;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=31.53;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:8:478,0,8 +chr6 71961 . ACACACACG A 441.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:8:478,0,8 +chr6 87095 . GAGGTAAAGACACTCCTGCAGCACATGCTCTGAGTGTGTGGTGTTACTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC G 1583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=1.100;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=25.54;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,53:61:99:1621,0,1488 +chr6 110716 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.897;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:351,0,1518 +chr6 152319 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.830;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:564,0,1071 +chr6 153543 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=1.424;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:247,0,990 +chr6 156381 . G T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.654;DP=57;FS=8.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:445,0,1511 +chr6 158731 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=-0.391;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:449,0,1767 +chr6 158772 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-2.703;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:232,0,1122 +chr6 217839 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.009;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=24.20;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:488,0,200 +chr6 223434 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.255;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:302,0,509 +chr6 313383 . T C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.270;DP=37;FS=7.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:453,0,858 +chr6 444204 . CGGTACGGGAGTGTTTAATACTCTGAACACCGCACTGATGATTACTGCATGATGACTGACACACTGTCTGACCAATCACA C 4713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=1.791;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=30.37;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,110:112:99:4751,401,0 +chr6 451459 . T TG 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.158;DP=17;FS=9.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:308,0,129 +chr6 910471 . GA G 381.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:26:419,0,26 +chr6 912173 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-2.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:378,0,126 +chr6 912246 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=-0.957;DP=22;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:28:718,0,28 +chr6 927190 . G C 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.190;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=29.50;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1444,0,190 +chr6 935764 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-0.589;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=31.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:59:1126,0,59 +chr6 1262026 . C T 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.681;DP=64;FS=6.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,50:64:99:1911,0,276 +chr6 1269463 . C T 1383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.339;DP=53;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,37:53:99:1412,0,442 +chr6 1269799 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.452;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:442,0,365 +chr6 1271077 . A T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.416;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=14.59;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:320,0,398 +chr6 1272615 . GC G 1029.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.323;DP=32;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=32.18;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,29:32:31:1067,0,31 +chr6 1274517 . G A 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.297;DP=28;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=33.92;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:86:978,0,86 +chr6 1274554 . C A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=31.05;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:35:526,0,35 +chr6 1274758 . T C 686.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-0.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=34.34;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:18:715,18,0 +chr6 1275406 . C G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-0.263;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:466,0,367 +chr6 1275556 . T TA 420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:458,45,0 +chr6 1443576 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.712;DP=53;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:262,0,1526 +chr6 1533040 . G T 2406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.962;DP=89;FS=4.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=27.04;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,63:88:99:2435,0,609 +chr6 1533101 . T G 1950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-0.877;DP=71;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,52:71:99:1979,0,417 +chr6 1533188 . A C 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.685;DP=52;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=31.84;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,42:52:99:1684,0,199 +chr6 1601720 . A G 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-1.740;DP=66;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,42:66:99:1452,0,798 +chr6 1614551 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-4.506;DP=58;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.06;ReadPosRankSum=-4.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:496,0,1357 +chr6 1616180 . TGAAACATCAAGAACACACACAGTCAATCTTCAGCTTTAATGCTGGATCATGGAAGAGGAGCAGAAGCGCTTCATACCC T 4076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:4114,389,0 +chr6 1635298 . A G 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1086,78,0 +chr6 1635594 . A T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:78:416,0,78 +chr6 1635738 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=1.096;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:270,0,281 +chr6 1636644 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:245,0,66 +chr6 1637102 . A C 370.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:399,27,0 +chr6 1644542 . T C 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=1.907;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=31.76;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,48:55:99:1775,0,259 +chr6 1652504 . A T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-1.023;DP=45;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:886,0,648 +chr6 1652516 . C A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.496;DP=48;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.156;QD=21.70;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,31:48:99:1070,0,566 +chr6 1659544 . G A 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:743,51,0 +chr6 1659554 . T C 714.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:743,51,0 +chr6 1671620 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,394 +chr6 1672065 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,472 +chr6 1672068 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=22.12;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,472 +chr6 1690166 . G A 1073.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1102,78,0 +chr6 1690184 . T C 1105.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.299;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1134,84,0 +chr6 1707866 . C T 3655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-4.991;DP=154;FS=5.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=23.74;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,103:154:99:3684,0,3665 +chr6 1707968 . G A 16661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-2.654;DP=464;FS=38.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=32.15;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,395:459:99:16690,0,134 +chr6 1710812 . C A 791.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:820,57,0 +chr6 1711078 . C A 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:42:601,42,0 +chr6 1711085 . T C 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:601,42,0 +chr6 1711177 . G T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.517;DP=38;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:766,0,1248 +chr6 1711184 . T C 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.958;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=26.24;ReadPosRankSum=2.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:894,0,531 +chr6 1711264 . A T 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=2.078;DP=76;FS=10.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,44:76:99:1552,0,1137 +chr6 1711445 . C A 4837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-2.026;DP=152;FS=6.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=31.83;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,123:152:99:4866,0,496 +chr6 1711462 . T A 10563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:10592,731,0 +chr6 1711539 . T C 4026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.880;ClippingRankSum=-1.413;DP=172;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=23.41;ReadPosRankSum=4.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,113:172:99:4055,0,4224 +chr6 1711548 . C T 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.126;DP=159;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,53:159:99:1457,0,9023 +chr6 1715389 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=23.73;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:313,0,141 +chr6 1720238 . GT G 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.537;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:399,0,110 +chr6 1721747 . C T 649.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.251;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:27:678,0,27 +chr6 1721848 . T C 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.644;DP=28;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:69:800,0,69 +chr6 1738136 . G A 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.063;DP=33;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.499;QD=27.63;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:940,0,180 +chr6 1739142 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.350;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=29.94;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:597,0,113 +chr6 1739243 . T C 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 +chr6 1739986 . A G 200.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:229,0,19 +chr6 1740122 . A T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:272,0,264 +chr6 1741731 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=28.21;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:395,0,84 +chr6 1741791 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.240;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=30.05;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:479,0,314 +chr6 1741803 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:479,0,314 +chr6 1743647 . G T 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.402;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:926,0,160 +chr6 1750973 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.919;DP=17;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=30.80;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:37:669,0,37 +chr6 1750976 . G T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.919;DP=17;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:37:669,0,37 +chr6 1755877 . C T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=1.236;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=23.73;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:574,0,177 +chr6 1865333 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.139;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:358,0,201 +chr6 1865417 . G T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.312;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:680,0,540 +chr6 1904340 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=1.806;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:246,0,883 +chr6 1904421 . C T 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-2.913;DP=52;FS=7.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,41:52:99:1600,0,196 +chr6 1905212 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.933;DP=42;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:301,0,1157 +chr6 1954487 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-0.722;DP=84;FS=4.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:857,0,1666 +chr6 1959246 . G A 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.526;DP=89;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:1030,0,2023 +chr6 1962650 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-2.309;DP=57;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:523,0,1448 +chr6 1967914 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.087;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:230,0,677 +chr6 1968482 . A G 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.239;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:500,0,289 +chr6 1970418 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.215;DP=49;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:489,0,2792 +chr6 1970928 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.174;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,1928 +chr6 1970933 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-1.425;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:261,0,1928 +chr6 1975339 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.253;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:286,0,464 +chr6 1975584 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-1.129;DP=82;FS=5.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:275,0,3020 +chr6 1975744 . T A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=-2.814;DP=82;FS=3.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:343,0,4486 +chr6 1977486 . G GT 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.425;DP=113;FS=10.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,30:110:99:375,0,2262 +chr6 2168178 . A T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.126;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=11.85;ReadPosRankSum=-2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:431,0,509 +chr6 2181048 . C T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.631;DP=47;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:689,0,722 +chr6 2192906 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=30.34;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:362,0,148 +chr6 2193485 . A G 624.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=26.01;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:23:653,23,0 +chr6 2193490 . A G 590.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=1.897;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=32.82;ReadPosRankSum=-1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:22:619,0,22 +chr6 2193968 . T TA 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:369,0,185 +chr6 2194961 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.230;DP=41;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:231,0,1225 +chr6 2198195 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.027;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:675,0,1152 +chr6 2198367 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.308;DP=70;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:509,0,1853 +chr6 2240226 . A G 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.312;DP=88;FS=2.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:1035,0,2053 +chr6 2280626 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-1.789;DP=24;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=11.78;ReadPosRankSum=-2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:311,0,521 +chr6 2313354 . T C 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-1.609;DP=26;FS=12.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:522,0,358 +chr6 2351386 . G T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.055;DP=33;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:599,0,1423 +chr6 2356156 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.603;DP=30;FS=6.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:360,0,1261 +chr6 2356194 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.542;DP=29;FS=6.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:260,0,1189 +chr6 2361099 . GCAGGTGCACCTCTGAATGTTAAAGCTTTGGTCTGTCTCCAGTGTTTCAGGGTTTGCTCAAAGCGCTGAGCTGTTTTCTGTGTGTCTC G 1418.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=1.623;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1456,124,0 +chr6 2407640 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:342,0,377 +chr6 2420210 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-1.220;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:376,0,254 +chr6 2422209 . C A 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 +chr6 2424458 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:407,0,404 +chr6 2428975 . C T 1871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.341;DP=61;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=30.68;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,51:61:90:1900,0,90 +chr6 2949446 . A C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.307;DP=56;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:524,0,1460 +chr6 2949875 . A T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=1.313;DP=49;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:710,0,2308 +chr6 2950147 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.988;DP=45;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:274,0,1284 +chr6 2951645 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.135;DP=51;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:299,0,1431 +chr6 3000762 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=3.303;DP=40;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:473,0,828 +chr6 3004070 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.951;DP=66;FS=6.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:230,0,1989 +chr6 3030143 . G A 1000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.052;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:1029,0,1720 +chr6 3062856 . G A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.334;DP=58;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=13.24;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:796,0,1218 +chr6 3062895 . T C 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.033;DP=56;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:904,0,1008 +chr6 3080639 . A T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-1.601;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=17.12;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:559,0,552 +chr6 3081301 . G A 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-0.559;DP=52;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:1069,0,747 +chr6 3101823 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.213;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:297,0,1293 +chr6 3102042 . T A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.129;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:642,0,375 +chr6 3102315 . C T 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-1.511;DP=57;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:851,0,1206 +chr6 3102659 . T A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.913;DP=64;FS=8.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1197,0,1140 +chr6 3126372 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.656;DP=20;FS=13.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=12.99;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,687 +chr6 3126942 . C G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.700;DP=35;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:473,0,1635 +chr6 3127440 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.488;DP=47;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:345,0,1308 +chr6 3128263 . C A 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-0.279;DP=48;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:802,0,889 +chr6 3199927 . A T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr6 3205888 . A G 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=-0.451;DP=67;FS=3.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:806,0,1444 +chr6 3211889 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.203;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:453,0,1997 +chr6 3212332 . T G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.607;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:249,0,1532 +chr6 3276807 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:235,0,60 +chr6 3281211 . A C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-1.503;DP=23;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:552,0,576 +chr6 3289422 . ACAGGTGAACACGGGAGGGGGGAAACACTCTATACAGCATTTAGATCTGTTATTGATATATTTGTTTTTGTTTTGTT A 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=2.143;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=31.99;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:613,0,370 +chr6 3294661 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.441;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,24:84:99:594,0,2275 +chr6 3298447 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.225;DP=50;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.212;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:557,0,1108 +chr6 3316381 . T A 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-1.669;DP=104;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=14.71;ReadPosRankSum=2.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:1558,0,2025 +chr6 3316554 . A T 6732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=-1.489;DP=417;FS=7.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,190:417:99:6761,0,16580 +chr6 3319208 . A G 5606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.526;DP=365;FS=0.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,162:365:99:5635,0,6726 +chr6 3321800 . C A 2798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.444;DP=454;FS=1.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,118:453:99:2827,0,13122 +chr6 3348140 . C T 2824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.244;DP=31;FS=2.817;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=30.37;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,7:12:92:2853,92,0 +chr6 3348183 . T C 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.861;DP=128;FS=11.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:1326,0,981 +chr6 3348189 . C T 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-0.053;DP=139;FS=12.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:1140,0,2053 +chr6 3348276 . A C 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=-0.816;DP=123;FS=9.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=10.08;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:1268,0,965 +chr6 3348307 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=-1.996;DP=67;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=7.34;ReadPosRankSum=-3.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:520,0,963 +chr6 3348611 . A C 1011.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:73:1040,73,0 +chr6 3349309 . C A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr6 3349419 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=31.81;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:42:410,0,42 +chr6 3349660 . T G 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:99:1453,102,0 +chr6 3349704 . C T 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:99:1453,102,0 +chr6 3349774 . A T 1424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:99:1453,102,0 +chr6 3349912 . A G 587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:42:616,42,0 +chr6 3351876 . A G 1446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1475,110,0 +chr6 3352040 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:41:491,0,41 +chr6 3367667 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:241,0,116 +chr6 3367675 . G T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.84;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:99:241,0,116 +chr6 3368911 . C T 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr6 3492519 . C G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=-1.038;DP=209;FS=9.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,37:209:99:522,0,6884 +chr6 3497292 . AGTATGAGTTCATCTTTGATTGTGCTGTTTACCCATGAATGTGGGATACGGGAGTAATGTTTCATTGTCATTGCAG A 10951.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.495;DP=320;FS=2.221;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=34.22;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,289:292:99:10989,1036,0 +chr6 3498976 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=3.407;DP=190;FS=26.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,39:190:99:704,0,11535 +chr6 3498982 . T G 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=3.292;DP=180;FS=42.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=4.62;ReadPosRankSum=-4.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:180:99:859,0,5388 +chr6 3502845 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr6 3507990 . T A 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=1.010;DP=68;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=15.26;ReadPosRankSum=2.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1066,0,1209 +chr6 3519563 . T A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=3.185;DP=127;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,38:125:99:664,0,2701 +chr6 3519586 . G C 3070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=1.758;DP=144;FS=4.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,95:144:99:3099,0,1623 +chr6 3519626 . G A 3464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=2.841;DP=142;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,97:142:99:3493,0,981 +chr6 3519921 . TC T 1906.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=1.118;DP=141;FS=6.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1944,0,1899 +chr6 3523475 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.465;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:255,0,918 +chr6 3525187 . T C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.034;DP=33;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:686,0,506 +chr6 3525224 . A T 917.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:66:946,66,0 +chr6 3525869 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,481 +chr6 3527507 . G A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr6 3529346 . G T 5084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=-1.409;DP=184;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=27.63;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,132:184:99:5113,0,1263 +chr6 3539508 . T A 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.418;DP=185;FS=5.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,41:185:99:805,0,5655 +chr6 3653224 . G C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.798;DP=79;FS=4.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:1076,0,1662 +chr6 3668041 . T C 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.189;DP=84;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:1219,0,1605 +chr6 3673731 . CAGGTTTGTATCTGGAACATACACATTTATTGATTCGAAGAAGTGCTTAGCTAATACTGCTGCTAATGGGTTTTTTATTGCTTTCCTCTGCTCTCCAT C 2706.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=3.237;DP=77;FS=2.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,65:77:99:2744,0,3723 +chr6 3679833 . C CT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=1.128;DP=228;FS=4.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=0.92;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,38:210:99:247,0,4740 +chr6 3682418 . A T 4459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=-0.474;DP=259;FS=0.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,122:259:99:4488,0,4586 +chr6 3689488 . CAG C 495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-1.466;DP=202;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,33:189:99:533,0,6350 +chr6 3689726 . C CT 900.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.951;DP=128;FS=4.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1234,0,2213 +chr6 3693215 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=-1.581;DP=79;FS=8.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:296,0,2547 +chr6 3693526 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.491;DP=44;FS=4.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=24.52;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,30:44:99:1107,0,384 +chr6 3694007 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.811;DP=76;FS=4.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:252,0,2399 +chr6 3694154 . C T 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-1.522;DP=89;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:1187,0,1583 +chr6 3694190 . C G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.996;DP=76;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:429,0,2147 +chr6 3694211 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.989;DP=77;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=5.66;ReadPosRankSum=-2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:464,0,2070 +chr6 3694243 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=1.873;DP=82;FS=6.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=5.11;ReadPosRankSum=3.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:447,0,2346 +chr6 3695962 . GCTACAGAAACACACCAAACATTCAACGCAGCTTCATCGTAAAATGCACTGCACATCAATAGCCGTGTGTGGCTTTTAGCTATTAGTTTAAAGTGTTTAC G 6778.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-1.033;DP=160;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,156:160:99:6816,540,0 +chr6 3710318 . A T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=4.957;DP=83;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:604,0,2104 +chr6 3710336 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=1.038;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=5.25;ReadPosRankSum=-2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:522,0,2650 +chr6 3713304 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.675;DP=100;FS=9.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:529,0,2923 +chr6 3726207 . A C 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr6 3749712 . G A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.228;DP=71;FS=6.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,29:71:99:1015,0,1410 +chr6 3759394 . G T 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.702;DP=73;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1199,0,1247 +chr6 3761793 . G A 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=-2.184;DP=67;FS=7.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1597,0,523 +chr6 3763953 . T C 2344.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2373,175,0 +chr6 3763974 . T C 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.367;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1054,0,927 +chr6 3764230 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.213;DP=47;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:501,0,1063 +chr6 3764242 . C T 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.115;DP=59;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:1079,0,886 +chr6 3764269 . T C 1880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.540;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,54:76:99:1909,0,520 +chr6 3764354 . G A 2239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2268,166,0 +chr6 3772115 . T C 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:458,33,0 +chr6 3772568 . T C 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr6 3772609 . C T 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:554,39,0 +chr6 3773243 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:364,0,353 +chr6 3775093 . T TC 320.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:34:358,34,0 +chr6 3775408 . C T 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 +chr6 3776057 . G A 1493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.914;DP=103;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=14.50;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:1522,0,1886 +chr6 3776117 . T A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.137;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:428,0,390 +chr6 3827540 . C A 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.148;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1192,0,629 +chr6 3828370 . C G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr6 3829330 . C G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=21.91;ReadPosRankSum=2.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:335,0,177 +chr6 3831696 . A C 741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:770,57,0 +chr6 3832258 . A G 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 +chr6 3833933 . G A 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.662;DP=50;FS=6.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:870,0,810 +chr6 3834132 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-1.654;DP=84;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:441,0,2504 +chr6 3834159 . T C 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.370;DP=86;FS=1.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1572,0,1243 +chr6 3837402 . A T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.308;DP=112;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,35:112:99:931,0,2881 +chr6 3855218 . G A 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=2.124;DP=91;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,32:91:99:1082,0,2016 +chr6 3856813 . A C 280.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:309,0,17 +chr6 3971249 . C A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr6 3979179 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=-1.765;DP=40;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.14;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:234,0,1384 +chr6 3984595 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.129;DP=33;FS=5.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=19.69;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:678,0,435 +chr6 3998232 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.366;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:366,0,1306 +chr6 3998235 . A T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-1.846;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:366,0,1304 +chr6 4012288 . CAGGTCAGTTCAGTTCAGCTCAGCTTAGTTCCCTCTTTACATTCATTTCTGATTCACAAACACTCATCCTGTTTTTAACTCT C 1633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-1.377;DP=41;FS=6.986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:89:1671,89,0 +chr6 4015769 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=1.737;DP=43;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:706,0,883 +chr6 4019593 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=-1.275;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,446 +chr6 4035688 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:259,0,129 +chr6 4048605 . CA C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.394;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:240,0,1093 +chr6 4051249 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=1.768;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:362,0,961 +chr6 4051259 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.122;DP=35;FS=10.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:410,0,1226 +chr6 4051366 . C A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=1.140;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:442,0,890 +chr6 4052584 . C T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.674;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:759,0,539 +chr6 4053502 . AG A 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-0.668;DP=50;FS=10.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:706,0,972 +chr6 4054839 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.174;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,21:102:99:385,0,3017 +chr6 4057897 . G T 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=1.010;DP=73;FS=3.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1320,0,1315 +chr6 4064842 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.687;DP=61;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:246,0,1827 +chr6 4087157 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=1.065;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:390,0,1320 +chr6 4113988 . ACAGGTGAGGACACGGTGGCTGGTTTACAGAGCCGTGAATCTGAATCCAGGTTCAGACCGTTTCCTGTTTGTCCTG A 1356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.116;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:99:1394,134,0 +chr6 4118481 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.266;DP=42;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:902,0,307 +chr6 4118719 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:379,0,282 +chr6 4121443 . C CT 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.180;DP=26;FS=7.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:373,0,412 +chr6 4173595 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.247;DP=20;FS=16.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:337,0,353 +chr6 4180540 . G T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:381,0,87 +chr6 4181793 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:460,0,656 +chr6 4194189 . G T 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-1.422;DP=25;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:845,0,296 +chr6 4194552 . C A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.684;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:683,0,568 +chr6 4194690 . G T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.669;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:649,0,380 +chr6 4196566 . C G 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.993;DP=38;FS=1.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:663,0,663 +chr6 4199414 . A T 801.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.482;DP=27;FS=6.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=29.70;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:5:829,0,5 +chr6 4209490 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=1.532;DP=45;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:365,0,1153 +chr6 4222295 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.991;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:576,0,560 +chr6 4222367 . T C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-0.218;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:466,0,478 +chr6 4226902 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.648;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=13.53;ReadPosRankSum=2.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:583,0,854 +chr6 4232335 . C A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.013;DP=43;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:939,0,523 +chr6 4233008 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.634;DP=30;FS=9.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:252,0,795 +chr6 4240214 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,301 +chr6 4240754 . C CAA 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-0.412;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.534;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:357,0,538 +chr6 4241128 . GT G 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.994;DP=35;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:472,0,280 +chr6 4275053 . G GT 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-1.383;DP=35;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:469,0,1364 +chr6 4275054 . G T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.560;DP=36;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:469,0,1363 +chr6 4429423 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:356,0,54 +chr6 4430605 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:259,0,63 +chr6 4433167 . CCACCAT C 493.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:44:531,44,0 +chr6 4434535 . G T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=1.875;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=30.22;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:965,0,115 +chr6 4435098 . A C 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-1.453;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:932,0,226 +chr6 4768055 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:310,0,345 +chr6 4768407 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.185;DP=35;FS=13.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:496,0,760 +chr6 4769757 . G C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=-0.204;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:370,0,948 +chr6 4770429 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=1.152;DP=36;FS=3.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=12.88;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:492,0,798 +chr6 4771882 . C A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.374;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:839,0,742 +chr6 4772239 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,367 +chr6 4775869 . A C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:452,0,246 +chr6 4776583 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.290;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:400,0,489 +chr6 4777400 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.551;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=21.28;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:624,0,336 +chr6 4778098 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.408;DP=28;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:339,0,611 +chr6 4780052 . AT A 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:38:452,0,38 +chr6 5311249 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:475,0,146 +chr6 6148540 . C T 4954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.656;DP=328;FS=10.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.188;QD=15.11;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,141:327:99:4983,0,6253 +chr6 6190256 . C T 13623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-1.090;DP=281;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=27.19;ReadPosRankSum=3.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,171:281:99:13652,0,2365 +chr6 6192800 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-0.677;DP=35;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:575,0,597 +chr6 6198024 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.197;DP=41;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:652,0,781 +chr6 6415575 . C T 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.548;DP=123;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:123:99:1567,0,2608 +chr6 6456796 . C G 3780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.131;DP=231;FS=4.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,110:231:99:3809,0,3862 +chr6 6456953 . C T 4146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=1.488;DP=232;FS=0.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,118:232:99:4175,0,4142 +chr6 6458730 . G A 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-1.099;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:2494,0,2589 +chr6 6704066 . T C 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=-0.460;DP=159;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,63:159:99:2222,0,3183 +chr6 6708101 . C T 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=1.389;DP=264;FS=0.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,68:264:99:1527,0,7524 +chr6 6712199 . GA G 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=-0.274;DP=123;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=1.76;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,24:115:99:254,0,2344 +chr6 6712220 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.668;DP=117;FS=8.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,30:116:99:669,0,3603 +chr6 6712492 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-2.378;DP=131;FS=11.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,26:130:99:261,0,8819 +chr6 6712507 . CT C 1541.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.360;DP=122;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1579,0,2443 +chr6 6719753 . G A 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.027;DP=74;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1311,0,1236 +chr6 6719798 . C A 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-0.419;DP=86;FS=7.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:1580,0,1464 +chr6 6722155 . TGGTATCCAGCATTTATTTGACTATATCGATGCCTTTCCATCATCTTCGAGAGCATTATGAAATTTCTTGATTGTTCTTAATACAGCATAAATTGTTTTGGGACATAGAACAGTTTGGCTGTTGTTCTTTCTTCATTTCTCA T 5251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=2.738;DP=149;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,123:149:99:5289,0,7568 +chr6 6750137 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:50:434,0,50 +chr6 6852938 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.374;DP=78;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.939;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:396,0,2277 +chr6 6883474 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.039;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:565,0,161 +chr6 6883617 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:261,0,99 +chr6 6884165 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.903;DP=37;FS=1.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:241,0,1121 +chr6 6890135 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.419;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:388,0,569 +chr6 6890153 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:433,0,743 +chr6 6906698 . G A 2464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.697;ClippingRankSum=1.921;DP=125;FS=0.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=19.72;ReadPosRankSum=9.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:2493,0,1934 +chr6 6914178 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.677;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:347,0,1659 +chr6 6916632 . CT C 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.079;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:336,0,837 +chr6 6916813 . T G 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=-2.382;DP=102;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,33:102:99:845,0,3024 +chr6 6930288 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.758;DP=117;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:763,0,2927 +chr6 7024570 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=-0.066;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:300,0,745 +chr6 7046464 . G T 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.268;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:959,0,527 +chr6 7050455 . A T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-1.967;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:614,0,713 +chr6 7166494 . A G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.431;DP=34;FS=4.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:602,0,562 +chr6 7189724 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=-1.312;DP=49;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:649,0,998 +chr6 7190267 . G A 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.312;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:736,0,1425 +chr6 7193063 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=1.007;DP=36;FS=12.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:275,0,972 +chr6 7274921 . G T 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.281;DP=61;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:1016,0,1088 +chr6 7285160 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=1.110;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:453,0,1562 +chr6 7292077 . C T 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.970;DP=86;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:1408,0,1507 +chr6 7301341 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.217;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:646,0,1224 +chr6 7307728 . A T 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-0.595;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:735,0,493 +chr6 7331262 . AG A 971.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.412;DP=39;FS=1.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=24.92;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,30:38:99:1009,0,150 +chr6 7331680 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=-0.808;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:755,0,1244 +chr6 7331732 . G A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.172;DP=78;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:534,0,1975 +chr6 7370011 . C A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.163;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=31.29;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:94:1674,0,94 +chr6 7370053 . C T 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.065;DP=31;FS=12.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=29.96;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:1158,0,181 +chr6 7370808 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=2.174;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.43;ReadPosRankSum=-2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,437 +chr6 7371123 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=-0.218;DP=27;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=27.32;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:766,0,456 +chr6 7371317 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.269;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:334,0,589 +chr6 7371549 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-1.321;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:243,0,2455 +chr6 7374064 . C A 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.628;DP=61;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1157,0,1057 +chr6 7374261 . A T 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=-0.403;DP=54;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1050,0,687 +chr6 7374717 . A T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,551 +chr6 7374729 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:287,0,551 +chr6 7375815 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=3.165;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=20.27;ReadPosRankSum=-3.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,535 +chr6 7376918 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.112;DP=29;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=23.03;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:696,0,435 +chr6 7376955 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:405,0,511 +chr6 7377330 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.784;DP=65;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:352,0,1866 +chr6 7377428 . T C 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.297;DP=66;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:1256,0,1050 +chr6 7383461 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.087;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:808,0,318 +chr6 7416153 . A T 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.840;DP=51;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:985,0,1418 +chr6 7419564 . A G 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.418;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:887,0,629 +chr6 7422513 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-2.020;DP=37;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:498,0,829 +chr6 7426152 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.745;DP=62;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:578,0,3282 +chr6 7426155 . A G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.718;DP=62;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:578,0,3282 +chr6 7445552 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.447;DP=80;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:709,0,2058 +chr6 7546956 . C T 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.649;DP=263;FS=0.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=6.38;ReadPosRankSum=3.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,72:262:99:1707,0,7385 +chr6 7550246 . T G 1575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.898;DP=256;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,67:255:99:1604,0,7277 +chr6 7565039 . A G 11540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=286;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,286:286:99:11569,858,0 +chr6 7573892 . A AACACAC 439.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:11:476,11,0 +chr6 7588856 . TCCTGAGAAAAAAACAACACATGCACACATTAATGGAAAAACAGATTTAAAGGGCAAACCTCGCTATTCTTGCCGTTTGAAATGAGGCAGATGTTTAA T 2391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.175;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=33.69;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,62:66:99:2429,0,676 +chr6 7614181 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.057;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:249,0,1006 +chr6 7630306 . TCTGTTGAAGACAATGACACATTCAGTCATGAATGACAGCCAGTTTCACACGACTTTTGTGCAGTTCATGTTGCTACACTCTTACTACATCGCAGAACGTCAGAAAATGTTGCTTAC T 19912.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.066;DP=462;FS=2.874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=23.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,459:461:99:19950,1596,0 +chr6 7630451 . G T 3929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;ClippingRankSum=-0.208;DP=477;FS=0.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:311,147:458:99:3958,0,11159 +chr6 7643187 . TCTGAGAAAGAGATAATGGATTATTAATTAATGAAACATCAACAGATTACATCACATTGATAACCCATCAGAAGCTCAC T 814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=2.097;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=32.59;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:87:852,87,0 +chr6 7666836 . C A 2186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.993;DP=400;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:300,99:399:99:2215,0,11593 +chr6 7669399 . C T 1713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=1.956;DP=364;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,87:364:99:1742,0,10609 +chr6 7678158 . A G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.128;DP=239;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,47:238:99:826,0,7341 +chr6 7803609 . C G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr6 7865892 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-0.364;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:638,0,663 +chr6 7866053 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.821;DP=33;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:320,0,1111 +chr6 7866457 . A G 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-0.681;DP=32;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=32.68;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:1296,0,598 +chr6 7866697 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-1.262;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:392,0,746 +chr6 7866763 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-1.395;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:425,0,567 +chr6 7866900 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=34.47;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:304,0,251 +chr6 7868407 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=1.032;DP=56;FS=5.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:729,0,1276 +chr6 7875744 . A G 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.356;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:587,0,1220 +chr6 7880036 . G A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.229;DP=67;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:780,0,1373 +chr6 7882328 . ACTGCACACAAACACATTAACATATAGGTTCTCCATCTAAAATCATAACGTAACAAAAAATTTGAGTACGCCTCACAGATCAACAATGCTCTTAC A 1722.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=1.477;DP=41;FS=2.175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=34.63;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:99:1760,155,0 +chr6 7892021 . C T 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.124;DP=44;FS=10.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,29:44:99:993,0,463 +chr6 7907116 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=-1.376;DP=36;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:617,0,635 +chr6 7907129 . G A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-1.535;DP=35;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:626,0,625 +chr6 7927149 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.606;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:448,0,432 +chr6 7927261 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-1.137;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:397,0,746 +chr6 7927654 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=-0.304;DP=27;FS=10.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:698,0,179 +chr6 7980801 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-1.142;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:326,0,479 +chr6 7980819 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=1.304;DP=25;FS=11.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:234,0,1439 +chr6 7980827 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=2.361;DP=26;FS=14.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:231,0,1439 +chr6 8019121 . G A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-1.760;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,47:128:99:1566,0,2778 +chr6 8022863 . A T 223.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:252,0,18 +chr6 8022942 . TC T 244.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:282,28,0 +chr6 8024292 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr6 8024311 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr6 8024556 . G C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 +chr6 8038270 . G T 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.498;DP=159;FS=12.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,49:159:99:1301,0,4909 +chr6 8038465 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=-4.912;DP=111;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=7.07;ReadPosRankSum=4.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,26:111:99:813,0,3349 +chr6 8038734 . C T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.329;DP=111;FS=4.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:752,0,5336 +chr6 8038955 . C A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.446;DP=214;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,51:214:99:1005,0,6213 +chr6 8048022 . C T 3724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.747;ClippingRankSum=-0.438;DP=351;FS=4.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,140:340:99:3753,0,6927 +chr6 8053677 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.360;DP=287;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,72:287:99:1435,0,8187 +chr6 8055339 . TGTAAGAAACATCTTTATTTACATACTATTAATTAGTATAAGTTGGCCTTTTTTTATAGATGAAGTTTTTTAATGAAATGGACACTTCACTTTTTCACCTGCAG T 5164.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=2.436;DP=402;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=12.85;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,375:377:99:16249,1333,0 +chr6 8055534 . C A 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.274;DP=391;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:315,75:390:99:1241,0,12266 +chr6 8057971 . G A 3981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=3.374;DP=291;FS=6.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=13.68;ReadPosRankSum=-2.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,120:291:99:4010,0,5534 +chr6 8060852 . AAGGTGAACATCCATACGACATAACACCGCAGATACTGACACGCGTTACATTCAGATAAAGATTAAATGAATTTTTATCAC A 11984.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=-0.588;DP=308;FS=18.538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=37.95;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,301:307:99:12022,1093,0 +chr6 8062278 . TA T 1213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.321;DP=83;FS=6.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,46:64:99:1251,0,281 +chr6 8084588 . A G 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.383;DP=120;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:2223,0,2090 +chr6 8087565 . C CA 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-0.199;DP=94;FS=3.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.085;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:442,0,1562 +chr6 8095485 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-0.223;DP=54;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:315,0,1704 +chr6 8095517 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.081;DP=52;FS=9.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:351,0,1447 +chr6 8099412 . TGGTAAGACTGAATCTTCTGGACTGATGAAGCAGTTTCAACAGAAGCCATTCAGAGCGTTCCTGTCTCATCATCTGTTTCACTCTTGCA T 2876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=1.682;DP=69;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,68:69:99:2914,235,0 +chr6 8103153 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=3.984;DP=57;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=4.98;ReadPosRankSum=-3.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:312,0,4256 +chr6 8103156 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=3.930;DP=60;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:306,0,4256 +chr6 8103159 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-3.277;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:409,0,2596 +chr6 8131144 . T G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-0.517;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:444,0,431 +chr6 8149604 . G A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=-0.212;DP=39;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:761,0,614 +chr6 8178611 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:376,0,235 +chr6 8178737 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,206 +chr6 8183052 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=1.313;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,289 +chr6 8183980 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=1.376;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:362,0,492 +chr6 8193776 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:476,0,240 +chr6 8205702 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:98:283,0,98 +chr6 8241931 . T A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr6 8255234 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.377;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,594 +chr6 8258199 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,254 +chr6 8271479 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.199;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:623,0,527 +chr6 8360414 . T G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.162;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=19.03;ReadPosRankSum=-2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:561,0,934 +chr6 8360415 . A G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.209;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:561,0,934 +chr6 8360508 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.321;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:350,0,559 +chr6 8368808 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.546;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:462,0,502 +chr6 8382308 . C A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.455;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:537,0,526 +chr6 8382353 . G T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.384;DP=32;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:463,0,661 +chr6 8459698 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,179 +chr6 8463627 . G A 450.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=34.66;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:478,0,7 +chr6 8463783 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:293,0,49 +chr6 8487890 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:381,0,122 +chr6 8487944 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-1.076;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=27.92;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:76:475,0,76 +chr6 8542546 . C A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=33.25;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:394,0,229 +chr6 8542551 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.775;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=28.14;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:394,0,229 +chr6 8545377 . G C 578.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=32.49;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:23:607,23,0 +chr6 8550614 . C G 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr6 8550629 . G A 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 +chr6 8562140 . A C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=1.530;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:444,0,392 +chr6 8566359 . T C 1724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1753,126,0 +chr6 8566393 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.157;ClippingRankSum=0.595;DP=53;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:294,0,1793 +chr6 8566410 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.081;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.238;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:293,0,1676 +chr6 8568690 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-0.533;DP=53;FS=6.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:445,0,1811 +chr6 8569608 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.536;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:432,0,323 +chr6 8598926 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,301 +chr6 8606864 . CCCTGAAAGACAAAATACTTTTGACTATAACATGCATCTAAAAAAAGACAAAATAACAGTACATGTGTGCGGTATTCTTA C 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=2.606;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=30.37;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:584,0,1943 +chr6 8628213 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:301,0,54 +chr6 8628507 . G A 208.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:237,0,19 +chr6 8628680 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 +chr6 8631482 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.283;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:235,0,1020 +chr6 8659436 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.209;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:336,0,2790 +chr6 8664777 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.420;DP=23;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:250,0,544 +chr6 8665218 . GA G 244.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.303;DP=24;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:328,0,200 +chr6 8665736 . T C 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.186;DP=82;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:1390,0,1312 +chr6 8672740 . G A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.168;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1098,0,1364 +chr6 8672785 . G A 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=-0.049;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:945,0,1289 +chr6 8682858 . G C 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.878;DP=77;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:1006,0,1657 +chr6 8688573 . CG C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=1.078;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:243,0,1224 +chr6 8688575 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.553;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:243,0,1224 +chr6 9085953 . T C 2601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.119;DP=200;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.251;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,78:200:99:2630,0,4182 +chr6 9087198 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.184;DP=113;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,18:113:99:260,0,6888 +chr6 9087199 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=-0.514;DP=113;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,18:113:99:260,0,6888 +chr6 9088001 . C T 2379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-0.700;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,67:154:99:2408,0,3022 +chr6 9114539 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.482;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:758,0,1784 +chr6 9114541 . A G 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-1.230;DP=47;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:758,0,1806 +chr6 9127824 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=1.346;DP=64;FS=2.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:902,0,1278 +chr6 9133013 . T C 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.976;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:841,0,934 +chr6 9143387 . T G 1818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.913;DP=88;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=20.67;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,55:88:99:1847,0,1102 +chr6 9143541 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=-2.391;DP=54;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:661,0,1158 +chr6 9143687 . G A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.121;DP=44;FS=7.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=20.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:926,0,548 +chr6 9187208 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.907;DP=65;FS=6.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:330,0,1938 +chr6 9187560 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=3.280;DP=97;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,18:97:99:301,0,2902 +chr6 9187713 . A G 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-0.943;DP=110;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,32:105:99:793,0,2741 +chr6 9194216 . G A 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=2.108;DP=155;FS=4.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,61:155:99:2068,0,3153 +chr6 9198819 . C T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.242;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=28.77;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:64:920,0,64 +chr6 9279549 . G A 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 +chr6 9332742 . A T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=-0.436;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:483,0,570 +chr6 9335434 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.122;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:293,0,1221 +chr6 9342688 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.262;DP=40;FS=2.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:910,0,485 +chr6 9415956 . G GA 316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-1.026;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:386,0,206 +chr6 9416263 . AG A 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.086;DP=37;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:421,0,365 +chr6 9438392 . G A 1951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-1.350;DP=426;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=4.58;ReadPosRankSum=3.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,96:426:99:1980,0,12888 +chr6 9500627 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.946;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:407,0,2471 +chr6 9512739 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.360;DP=92;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:374,0,2835 +chr6 9554171 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,201 +chr6 9563900 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.312;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:309,0,512 +chr6 9571256 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.682;DP=43;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:255,0,1205 +chr6 9582156 . A C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=2.329;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,571 +chr6 9616254 . A ATT 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.452;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:512,0,486 +chr6 9617014 . A G 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.020;DP=121;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,33:121:99:786,0,3399 +chr6 9617230 . A T 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.042;DP=179;FS=10.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,43:179:99:995,0,5532 +chr6 9618148 . C T 1747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-1.270;DP=142;FS=5.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,54:141:99:1776,0,2856 +chr6 9618523 . G A 2815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-0.069;DP=194;FS=3.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,82:194:99:2844,0,3754 +chr6 9619255 . A G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.910;DP=139;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,35:139:99:770,0,4093 +chr6 9619736 . G GT 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.892;DP=143;FS=2.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,36:118:99:543,0,2165 +chr6 9656557 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:243,0,300 +chr6 9662437 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:260,0,415 +chr6 9662495 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:390,0,236 +chr6 9866333 . T C 2443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.490;DP=151;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:2472,0,2639 +chr6 9879768 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=-1.325;DP=114;FS=3.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:333,0,3574 +chr6 9879844 . C T 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.937;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,61:156:99:2084,0,3251 +chr6 9891860 . A C 2112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.991;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:2141,0,2790 +chr6 9908576 . GTC G 211.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:249,0,25 +chr6 9908833 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:231,0,135 +chr6 9909463 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,145 +chr6 9909956 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:266,0,138 +chr6 9910002 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:369,0,131 +chr6 9911565 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=12;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:237,0,93 +chr6 9921544 . AT A 2501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.753;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.200;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,106:175:99:2539,0,1384 +chr6 9926277 . AT A 2801.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.055;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=27.47;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2849,259,0 +chr6 9926402 . T C 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-1.814;DP=83;FS=7.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:911,0,2810 +chr6 9966955 . G A 4439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=-1.180;DP=245;FS=17.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,125:245:99:4468,0,4478 +chr6 9967091 . C T 5352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-1.627;DP=132;FS=3.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=33.14;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:5381,388,0 +chr6 9967412 . C T 4452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.299;DP=194;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,127:194:99:4481,0,2336 +chr6 9967546 . GA G 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-2.532;DP=146;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,32:141:99:453,0,3709 +chr6 10081940 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:93:373,0,93 +chr6 10082240 . C A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-2.798;DP=59;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:768,0,1327 +chr6 10083365 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-0.052;DP=136;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=5.15;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,37:135:99:729,0,5213 +chr6 10087965 . C T 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=-0.866;DP=83;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:1356,0,1528 +chr6 10088529 . A T 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.217;DP=88;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:1476,0,2351 +chr6 10088541 . A T 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.538;DP=93;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:1488,0,2491 +chr6 10088640 . T A 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=1.412;DP=85;FS=0.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:1523,0,1498 +chr6 10088793 . C T 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-0.945;DP=83;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:1231,0,1532 +chr6 10089054 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.056;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:311,0,2742 +chr6 10093104 . T C 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-1.062;DP=66;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:1181,0,2231 +chr6 10093734 . C T 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.276;DP=64;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1083,0,1059 +chr6 10094178 . G A 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.768;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=21.61;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1433,0,846 +chr6 10095021 . C T 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.106;DP=62;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1126,0,1068 +chr6 10156250 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.871;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:351,0,749 +chr6 10159763 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=-2.035;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:285,0,2094 +chr6 10159772 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=-2.319;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:285,0,2094 +chr6 10202313 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=20.81;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:382,0,252 +chr6 10210481 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:359,0,261 +chr6 10309761 . A T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.550;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.822;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:438,0,411 +chr6 10312284 . T G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,137 +chr6 10360729 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,217 +chr6 10458455 . G C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:277,0,198 +chr6 10492619 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-1.620;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=23.21;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:330,0,138 +chr6 10493139 . T TA 571.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=1.055;DP=21;FS=6.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:15:609,0,15 +chr6 10502044 . G A 3292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=-3.254;DP=174;FS=9.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,56:79:99:3321,0,336 +chr6 10502071 . A G 3291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.696;DP=166;FS=9.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,76:83:99:3320,0,350 +chr6 10502127 . C T 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-3.044;DP=190;FS=5.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=6.84;ReadPosRankSum=2.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:1328,0,2929 +chr6 10502190 . T C 3516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.179;DP=85;FS=7.610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=36.28;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,41:45:99:3545,244,0 +chr6 10502231 . C T 3516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.639;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=31.27;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,12:14:99:3545,244,0 +chr6 10502359 . G GA 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.385;DP=39;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:253,0,441 +chr6 10502384 . CA C 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.462;DP=36;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:275,0,287 +chr6 10625361 . T A 457.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:486,33,0 +chr6 10632129 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.376;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:372,0,589 +chr6 10632408 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=3.542;DP=63;FS=8.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=4.63;ReadPosRankSum=-2.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:320,0,1906 +chr6 10633386 . TCCTGAAATTAAAAGGAAAAGGGTGTCAAACTACAACTTGAATGATCAGGCTGGATCCAAGTGAGATAGAATTCTGATATAA T 5666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=1.910;DP=136;FS=3.011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,121:123:99:5704,540,0 +chr6 10633512 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=5.015;DP=107;FS=11.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=4.60;ReadPosRankSum=-3.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:520,0,2798 +chr6 10633524 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=4.876;DP=99;FS=11.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=3.07;ReadPosRankSum=-2.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:332,0,2936 +chr6 10639051 . G T 473.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=33.85;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:500,2,0 +chr6 10639106 . A T 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:439,33,0 +chr6 10652361 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=1.415;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:261,0,402 +chr6 10652983 . C T 5821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=-0.462;DP=326;FS=3.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=17.86;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,161:326:99:5850,0,6128 +chr6 10653187 . G A 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.686;DP=356;FS=0.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=2.43;ReadPosRankSum=2.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,63:355:99:893,0,11113 +chr6 10662154 . C T 5967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.343;DP=349;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,182:348:99:5996,0,5953 +chr6 10663679 . T C 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=-1.931;DP=391;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=4.03;ReadPosRankSum=3.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,86:390:99:1603,0,10938 +chr6 10666882 . C A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.20;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:237,0,152 +chr6 10693483 . T G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=-0.711;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:466,0,619 +chr6 10694559 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.910;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,298 +chr6 10723733 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.186;DP=93;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:614,0,2585 +chr6 10729198 . G A 3244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=-0.353;DP=191;FS=1.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,101:191:99:3273,0,3270 +chr6 10741903 . G A 5586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.452;DP=318;FS=4.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,156:318:99:5615,0,5974 +chr6 10764848 . C G 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.282;DP=81;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:1210,0,1573 +chr6 10782983 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.099;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:482,0,143 +chr6 10801097 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,147 +chr6 10801099 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,147 +chr6 10801446 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:296,0,131 +chr6 10821732 . A T 5611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=1.143;DP=319;FS=2.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,156:318:99:5640,0,5822 +chr6 10821860 . A G 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.835;DP=305;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,90:305:99:2292,0,8400 +chr6 10822178 . GCCTGTGCAAAATAATAAGATTTGTTAAGCGAGTCCATCTCATCGTAAGAAAATGCGTATTCGCCAAATCAGCCTTA G 14548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.847;DP=379;FS=2.406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=27.60;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,371:374:99:14586,1061,0 +chr6 10874532 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.430;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:373,0,673 +chr6 10897078 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-0.009;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:702,0,1902 +chr6 10897081 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.540;DP=54;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:443,0,2319 +chr6 10981251 . CAACAA C 418.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.26;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:27:456,0,27 +chr6 10981903 . A C 3590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=1.403;DP=301;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,108:301:99:3619,0,6762 +chr6 10988393 . G T 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.121;DP=44;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=13.15;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:607,0,933 +chr6 10989077 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.105;DP=47;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:376,0,1277 +chr6 10989589 . A G 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:571,42,0 +chr6 11002065 . C T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=1.401;DP=95;FS=4.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:828,0,5302 +chr6 11009620 . C T 225.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:254,0,22 +chr6 11027011 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:268,0,366 +chr6 11039914 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=1.870;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:302,0,432 +chr6 11058427 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,333 +chr6 11138033 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:348,0,315 +chr6 11164936 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,230 +chr6 11165377 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.674;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:431,0,660 +chr6 11168735 . C T 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.137;DP=32;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=28.43;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:938,0,157 +chr6 11173027 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-0.606;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:706,0,560 +chr6 11175205 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:248,0,364 +chr6 11176452 . A T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:284,0,168 +chr6 11177111 . T C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=-1.286;DP=22;FS=15.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:409,0,556 +chr6 11177307 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.549;DP=19;FS=7.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:253,0,480 +chr6 11187774 . T A 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.031;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1020,0,858 +chr6 11187859 . A G 1386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.260;DP=55;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,37:55:99:1415,0,521 +chr6 11192920 . G A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.938;DP=44;FS=11.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1271,0,210 +chr6 11193219 . G C 1416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=2.197;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=27.25;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:1445,0,376 +chr6 11193656 . G A 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.241;DP=78;FS=4.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1419,0,1221 +chr6 11196321 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.611;DP=59;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=10.98;ReadPosRankSum=2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:676,0,2898 +chr6 11196406 . C G 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.471;DP=70;FS=3.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=19.33;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,39:69:99:1381,0,2188 +chr6 11196530 . C T 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-1.373;DP=80;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:1293,0,1316 +chr6 11196782 . G A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.755;DP=53;FS=3.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:798,0,967 +chr6 11203034 . G T 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=-0.324;DP=64;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1157,0,1008 +chr6 11206299 . C T 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.660;DP=63;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,36:63:99:1119,0,940 +chr6 11206382 . G T 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.688;DP=51;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:932,0,1140 +chr6 11210721 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-1.003;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:282,0,1421 +chr6 11210908 . C A 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.154;DP=47;FS=4.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:836,0,1844 +chr6 11210910 . C T 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.088;DP=47;FS=8.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:836,0,1823 +chr6 11223431 . C G 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.034;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:782,0,712 +chr6 11233734 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.860;DP=66;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:376,0,3882 +chr6 11241663 . C T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.980;DP=41;FS=6.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:920,0,1540 +chr6 11246010 . G A 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.511;DP=54;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=15.14;ReadPosRankSum=-1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:846,0,953 +chr6 11254898 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.338;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.723;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:335,0,2058 +chr6 11254998 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.204;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:908,0,691 +chr6 11325087 . C T 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-0.901;DP=82;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1437,0,1386 +chr6 11325910 . C A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.023;DP=60;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:760,0,1322 +chr6 11325926 . G T 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.335;DP=63;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:777,0,2012 +chr6 11326136 . AT A 744.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.338;DP=64;FS=3.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:782,0,1356 +chr6 11415377 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:60:404,0,60 +chr6 11423772 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,206 +chr6 11618607 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,251 +chr6 11676005 . G GT 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=-0.572;DP=125;FS=21.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=2.15;ReadPosRankSum=-2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,20:115:99:306,0,6784 +chr6 11676734 . G A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=1.947;DP=230;FS=0.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,48:230:99:803,0,6972 +chr6 11677118 . A T 1440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-2.042;DP=204;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,60:204:99:1469,0,5352 +chr6 11702501 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-0.867;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,23:120:99:377,0,3652 +chr6 11702925 . T G 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.497;DP=197;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=3.96;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,42:197:99:808,0,5827 +chr6 11708862 . C G 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.391;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,45:164:99:1078,0,4601 +chr6 11892590 . G A 1930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.702;DP=281;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,80:281:99:1959,0,7768 +chr6 11893010 . G A 1658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=1.144;DP=214;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,70:213:99:1687,0,7297 +chr6 11893202 . G A 2533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-4.554;DP=343;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=7.39;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,103:342:99:2562,0,8701 +chr6 11912372 . T C 2417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.175;DP=300;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,98:300:99:2446,0,12754 +chr6 11913841 . C T 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=1.220;DP=301;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,73:301:99:1563,0,8655 +chr6 11914474 . A ACT 877.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-1.458;DP=163;FS=5.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,51:160:99:1347,0,4843 +chr6 11921871 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.475;DP=32;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.032;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:610,0,770 +chr6 11944641 . C G 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-0.806;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=25.53;ReadPosRankSum=2.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:692,0,207 +chr6 11948609 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.587;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:255,0,897 +chr6 11948701 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=1.617;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:315,0,929 +chr6 11949603 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.810;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:403,0,240 +chr6 11964839 . TCTGCAAATACGTAAAAGAGATGAGTGACGTCAATGTAAAATTGGACTTTTTTTTAAACGTGTAATAAAGGGTCATAC T 967.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.530;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=24.81;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1005,0,764 +chr6 11984640 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.056;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:339,0,706 +chr6 12001954 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.591;ClippingRankSum=1.609;DP=37;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:486,0,746 +chr6 12104638 . T C 374.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:403,27,0 +chr6 12104644 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,107 +chr6 12113305 . C G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.430;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:280,0,885 +chr6 12124758 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.952;DP=39;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:281,0,991 +chr6 12375266 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.04;ReadPosRankSum=-2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:302,0,395 +chr6 12377017 . ACAGGTAGGCTAAGTATCATTGGAATTTAGATGGATCTACATTTTTAAAAGACATAATATAATAACTTTTCAATTTTCTCAC A 1326.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.271;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:99:1364,119,0 +chr6 12415843 . C T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.510;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=8.33;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:870,0,2519 +chr6 12463104 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.628;DP=80;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:343,0,3060 +chr6 12578291 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:269,0,505 +chr6 12705092 . A AT 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.235;DP=69;FS=7.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:370,0,1589 +chr6 12707144 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.979;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:255,0,1171 +chr6 12707572 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:233,0,59 +chr6 12710348 . A C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-1.807;DP=34;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:446,0,731 +chr6 12710399 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.708;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:517,0,1026 +chr6 12715496 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-0.693;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:565,0,1511 +chr6 12715854 . C A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.876;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:694,0,1906 +chr6 12715898 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.704;DP=78;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:458,0,2173 +chr6 12763617 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.012;DP=47;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:292,0,1355 +chr6 12779936 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-0.709;DP=95;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,16:94:99:258,0,2989 +chr6 12785279 . G C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.535;DP=37;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:358,0,935 +chr6 12789237 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=-0.116;DP=54;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:336,0,1479 +chr6 12881614 . T A 2528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=-4.443;DP=126;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.07;ReadPosRankSum=2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:2557,0,1746 +chr6 12887735 . C T 6801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.355;DP=230;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=29.57;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,182:230:99:6830,0,877 +chr6 12896569 . G A 7373.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.655;DP=212;FS=5.628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=34.78;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,188:212:2:7400,2,0 +chr6 12896863 . GA G 1096.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.277;DP=82;FS=5.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=13.37;ReadPosRankSum=2.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,45:71:99:1134,0,1278 +chr6 12901949 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.230;DP=47;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=30.46;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,38:47:99:1460,0,151 +chr6 12905829 . G T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:464,0,708 +chr6 12907446 . AT A 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=2.762;DP=43;FS=8.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=8.11;ReadPosRankSum=-2.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:386,0,2426 +chr6 12907463 . T A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=-0.024;DP=28;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=22.38;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:655,0,737 +chr6 12907939 . T A 2251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.673;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,59:72:99:2280,0,191 +chr6 12910874 . G A 2411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.068;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=32.57;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,57:60:99:2440,172,0 +chr6 12934945 . G C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr6 12936436 . C T 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:57:850,57,0 +chr6 12940000 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.943;DP=38;FS=4.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=31.97;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:48:1243,0,48 +chr6 12946254 . C T 3172.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-1.148;DP=81;FS=1.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,76:81:99:3201,186,0 +chr6 12949276 . C T 1823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.091;DP=41;FS=7.291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:99:1852,126,0 +chr6 12949286 . C T 1823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=-0.096;DP=39;FS=8.486;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=33.13;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:99:1852,126,0 +chr6 12949500 . C A 1550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-2.464;DP=43;FS=2.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=32.54;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,38:42:40:1579,40,0 +chr6 12949932 . A G 1541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.230;DP=44;FS=2.020;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,39:43:32:1570,32,0 +chr6 12957860 . C T 292.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:321,0,17 +chr6 12959563 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.775;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:563,0,194 +chr6 12995523 . C T 1191.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=1.849;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:53:1220,53,0 +chr6 13003021 . A T 609.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=36.41;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:16:638,0,16 +chr6 13014059 . A G 525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:554,39,0 +chr6 13019933 . CA C 562.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:600,49,0 +chr6 13020084 . T TA 597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-1.619;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=23.91;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:38:635,38,0 +chr6 13020507 . G GA 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=2.208;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:74:350,0,74 +chr6 13020608 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:338,0,52 +chr6 13020798 . G A 845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-1.252;DP=25;FS=3.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:28:874,28,0 +chr6 13021040 . T C 654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:683,48,0 +chr6 13021518 . C G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=1.713;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:93:422,0,93 +chr6 13024533 . T A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-2.464;DP=27;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:514,0,450 +chr6 13046171 . C T 1750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.499;DP=54;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,46:54:87:1779,0,87 +chr6 13046294 . G GT 357.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-0.567;DP=26;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:0:410,0,0 +chr6 13046398 . G GT 932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.633;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:970,0,405 +chr6 13046401 . A G 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=-0.152;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=29.43;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:970,0,402 +chr6 13046637 . T TA 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.651;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:68:547,0,68 +chr6 13046948 . G A 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.498;DP=46;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,37:46:99:1394,0,293 +chr6 13047133 . C A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-2.137;DP=46;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1224,0,232 +chr6 13047490 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=31.56;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:407,0,54 +chr6 13047588 . G A 290.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:319,0,13 +chr6 13047745 . C T 773.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.857;DP=22;FS=2.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:20:802,20,0 +chr6 13047855 . A C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.741;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=32.14;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:671,0,28 +chr6 13049596 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=25.28;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:281,0,105 +chr6 13049729 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=27.45;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:440,0,135 +chr6 13049796 . G A 334.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:363,0,16 +chr6 13052157 . C G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:309,21,0 +chr6 13052158 . T C 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:309,21,0 +chr6 13053997 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.142;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=28.54;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:599,0,183 +chr6 13054943 . CA C 529.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.375;DP=30;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:4:565,0,4 +chr6 13056156 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=-0.897;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=30.48;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1095,0,116 +chr6 13100968 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.564;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:384,0,696 +chr6 13101628 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=1.262;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:304,0,674 +chr6 13102032 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-1.060;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:329,0,323 +chr6 13111368 . G A 3168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=1.122;DP=472;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:340,132:472:99:3197,0,12902 +chr6 13114559 . G A 13237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=1.692;DP=696;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,399:694:99:13266,0,10107 +chr6 13131449 . C T 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-1.584;DP=310;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,63:309:99:1103,0,9886 +chr6 13141732 . A T 1944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-3.435;DP=308;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,87:308:99:1973,0,8097 +chr6 13148895 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.038;DP=44;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.684;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:374,0,1213 +chr6 13149517 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.242;DP=49;FS=6.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:524,0,1120 +chr6 13150886 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.422;DP=40;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:231,0,1129 +chr6 13162953 . G C 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.178;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=29.17;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1516,0,180 +chr6 13163386 . T C 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.108;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:579,0,1013 +chr6 13163449 . A G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.195;DP=54;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:626,0,1233 +chr6 13255515 . C A 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 +chr6 13257109 . G A 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 +chr6 13284956 . G A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.969;DP=35;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=29.79;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1071,0,145 +chr6 13300889 . T TA 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-0.269;DP=54;FS=6.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=7.40;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:645,0,546 +chr6 13301241 . G T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.154;DP=81;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=11.36;ReadPosRankSum=2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:948,0,4923 +chr6 13315739 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-1.379;DP=157;FS=1.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,25:157:99:270,0,5099 +chr6 13315905 . AACCTGTGGGAAATGAAAGAAACTGGTGATATCGCTACTCAATAAGCCAACCCCAAAACCAAACCAAAACCTGAAGCTATTTGCTTGTAAAGGCTAATGGGGAACTC A 7995.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=2.961;DP=178;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=32.17;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,175:178:99:8033,685,0 +chr6 13693506 . G T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=-0.583;DP=453;FS=33.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:379,74:453:99:839,0,14878 +chr6 13878113 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-1.446;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:311,0,392 +chr6 13921065 . TA T 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.373;DP=231;FS=7.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,38:220:99:394,0,4861 +chr6 13942817 . G GA 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-0.018;DP=110;FS=0.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.226;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,28:109:99:506,0,2583 +chr6 13944175 . AACCTATTTAAAACATGTGTTAATAGTGCTTGCTGGCTCAAAAAAGGGAATATAAAGAGTTTTGCTTCTATAACATACTG A 5029.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=1.702;DP=117;FS=4.517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=25.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:5067,430,0 +chr6 13945508 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=2.447;DP=58;FS=9.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1090,0,873 +chr6 13997874 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.743;DP=89;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:255,0,2854 +chr6 13998835 . C G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=1.318;DP=111;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:697,0,3001 +chr6 13998955 . G GT 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.362;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1424,0,1665 +chr6 14007324 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.881;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:261,0,2821 +chr6 14150827 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=28.38;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:312,0,53 +chr6 14962203 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.899;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:460,0,531 +chr6 15030812 . T A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.093;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:364,0,476 +chr6 15110107 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.017;DP=38;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:262,0,1056 +chr6 15157231 . A C 8272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=2.294;DP=489;FS=0.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,244:478:99:8301,0,8056 +chr6 15200920 . T A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,0:6:99:670,0,320 +chr6 15200987 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=17;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:411,0,677 +chr6 15201115 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.823;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:234,0,431 +chr6 15203660 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.796;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:376,0,297 +chr6 15204467 . C T 1566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1595,108,0 +chr6 15204556 . A G 1105.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:78:1134,78,0 +chr6 15204582 . A G 343.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.474;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:3:370,0,3 +chr6 15506275 . GCCTGAAAGTAAATGTTCACAAATATATAGTGAGTTGCAAATCTGGAAGAAAGCAGATTTAAATGTAATTTTTTTAACTAATTATTTGAACGGTTCA G 573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=2.854;DP=26;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=22.07;ReadPosRankSum=-2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:611,0,5578 +chr6 15949516 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=-0.541;DP=25;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:710,0,154 +chr6 15951653 . C A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-1.152;DP=37;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:948,0,344 +chr6 15963265 . G C 1643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=1.061;DP=93;FS=10.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1672,0,1518 +chr6 15963514 . C T 1497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-1.357;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1526,0,1625 +chr6 15963848 . A AT 926.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-1.473;DP=44;FS=11.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:964,0,1528 +chr6 15964074 . G T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=1.635;DP=50;FS=10.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:834,0,948 +chr6 16053768 . C T 1706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.230;DP=81;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,51:81:99:1735,0,1021 +chr6 16080796 . G A 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.781;DP=78;FS=5.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,44:78:99:1420,0,1204 +chr6 16087443 . G A 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=1.916;DP=80;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1603,0,1135 +chr6 16199620 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.015;DP=38;FS=2.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:454,0,849 +chr6 16199775 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=1.283;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:675,0,594 +chr6 16396001 . GT G 5910.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=2.372;DP=317;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=18.65;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,238:307:99:5948,0,1131 +chr6 17371565 . G T 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 +chr6 17371597 . T A 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:484,33,0 +chr6 17569537 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.749;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:362,0,516 +chr6 17653895 . A G 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:477,36,0 +chr6 17653972 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.275;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:709,0,1330 +chr6 17654116 . A C 1039.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=2.198;DP=32;FS=22.184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=32.49;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:36:1068,36,0 +chr6 17654446 . A T 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:618,42,0 +chr6 17655666 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.245;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:357,0,1597 +chr6 17655744 . C A 7078.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:7107,496,0 +chr6 17655825 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:296,0,509 +chr6 17656447 . T C 2578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.192;DP=103;FS=7.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=25.04;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,66:76:99:2607,0,574 +chr6 17656463 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=2.470;DP=78;FS=11.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:250,0,4100 +chr6 17656465 . A T 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-3.977;DP=77;FS=17.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,48:64:99:1911,0,775 +chr6 17753298 . G C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 +chr6 17851223 . C G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr6 17853326 . C CAT 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.283;DP=23;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=20.90;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:518,0,397 +chr6 17855956 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.666;DP=16;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:255,0,64 +chr6 17999369 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.906;DP=63;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:484,0,1613 +chr6 18210051 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-0.725;DP=36;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:459,0,801 +chr6 18540192 . T G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.394;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:415,0,560 +chr6 18655548 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.197;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:406,0,283 +chr6 18656343 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:272,0,308 +chr6 18672530 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-2.565;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:462,0,812 +chr6 18684625 . T A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.192;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:491,0,405 +chr6 18684700 . TA T 1022.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1060,103,0 +chr6 18684818 . T G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.608;DP=33;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:446,0,715 +chr6 18733323 . C G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-1.246;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=23.05;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,227 +chr6 19062117 . C T 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:1086,0,1841 +chr6 19062122 . C CT 1079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.743;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1117,0,670 +chr6 19062624 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.420;DP=50;FS=2.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=12.94;ReadPosRankSum=2.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:675,0,1439 +chr6 19062995 . A C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.493;DP=22;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:582,0,274 +chr6 19063416 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-1.762;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:670,0,1275 +chr6 19171024 . C T 1520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.248;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1549,0,1312 +chr6 19171255 . G A 2494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.937;DP=116;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,75:115:99:2523,0,1340 +chr6 19171459 . G A 2595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=-0.599;DP=115;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:2624,0,1480 +chr6 19172004 . T A 2666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.216;DP=142;FS=2.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=18.78;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:2695,0,2525 +chr6 19172131 . G A 2239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=-0.733;DP=135;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:2268,0,2276 +chr6 19172344 . T A 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.799;DP=116;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,44:116:99:1530,0,2429 +chr6 19172576 . C A 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=-1.442;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,39:111:99:1336,0,2495 +chr6 19172601 . A G 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.220;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,38:129:99:909,0,3460 +chr6 19172966 . T C 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.017;DP=177;FS=0.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,60:177:99:1976,0,4307 +chr6 19173948 . T C 5697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=-0.027;DP=181;FS=6.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,151:180:99:5726,0,252 +chr6 19173995 . T G 2057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=-1.111;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,63:175:99:2086,0,3724 +chr6 19174014 . C G 3013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.830;DP=166;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,92:166:99:3042,0,2609 +chr6 19176953 . G T 6153.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:6182,451,0 +chr6 19179019 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.481;DP=108;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,32:108:99:808,0,2858 +chr6 19179080 . C G 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-0.642;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,45:152:99:1102,0,3950 +chr6 19181642 . T C 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.560;DP=160;FS=5.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:1203,0,4186 +chr6 19183877 . G A 2397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.192;DP=151;FS=2.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:2426,0,2542 +chr6 19184527 . A T 5032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=2.693;DP=162;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=31.07;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,131:160:99:5066,0,440 +chr6 19185176 . T C 4582.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.946;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=34.20;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,119:134:5:4610,5,0 +chr6 19185212 . G A 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.200;DP=139;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,45:139:99:1227,0,3578 +chr6 19185233 . T C 2758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=1.017;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,82:137:99:2787,0,1818 +chr6 19185993 . A T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.805;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,42:126:99:1127,0,3202 +chr6 19189309 . A G 4661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=1.204;DP=151;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=30.87;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,123:151:99:4690,0,478 +chr6 19189348 . A C 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.766;DP=147;FS=9.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=4.61;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,35:147:99:706,0,4099 +chr6 19189387 . T C 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.830;DP=188;FS=2.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,50:188:99:1171,0,5196 +chr6 19191444 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-1.034;DP=155;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,35:155:99:721,0,4463 +chr6 19191562 . T A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=1.187;DP=171;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,38:171:99:739,0,5000 +chr6 19191922 . C T 2685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.848;DP=92;FS=3.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=29.19;ReadPosRankSum=1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,69:91:99:2714,0,448 +chr6 19192176 . G T 6645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6674,473,0 +chr6 19192474 . A G 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.048;DP=112;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:833,0,3130 +chr6 19192522 . A G 5067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-2.703;DP=144;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=31.31;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,126:144:59:5096,0,59 +chr6 19192725 . G GT 776.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.046;DP=182;FS=6.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1125,0,2147 +chr6 19192834 . T A 2935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.173;DP=150;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=19.57;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:2964,0,2314 +chr6 19193169 . TA T 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=1.376;DP=71;FS=7.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,26:66:99:498,0,934 +chr6 19193257 . T C 5185.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:5214,373,0 +chr6 19193598 . G A 2893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-1.164;DP=131;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=22.09;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,85:131:99:2922,0,1589 +chr6 19193757 . CT C 1494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.589;DP=170;FS=4.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,66:153:99:1532,0,2168 +chr6 19193797 . A G 4141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=-0.321;DP=154;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,99:154:99:4170,0,1524 +chr6 19194166 . C T 4716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-0.087;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=27.91;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,124:169:99:4745,0,1073 +chr6 19194214 . C T 3000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.790;DP=156;FS=3.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:3029,0,2453 +chr6 19194323 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.219;DP=160;FS=21.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,24:159:99:235,0,4957 +chr6 19194431 . T G 6154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:6183,421,0 +chr6 19194440 . T A 6154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:6183,421,0 +chr6 19194542 . T C 8018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:8047,583,0 +chr6 19194696 . T C 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=-1.294;DP=188;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,56:188:99:1421,0,4981 +chr6 19194868 . T C 2163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.401;DP=129;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:2192,0,2267 +chr6 19195049 . A T 3651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3680,262,0 +chr6 19195099 . A G 1545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=-0.542;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:1574,0,1705 +chr6 19195318 . T C 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.543;DP=154;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,61:154:99:2146,0,3279 +chr6 19195438 . TA T 4641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=1.234;DP=159;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=29.19;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4679,454,0 +chr6 19195498 . A G 3589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=-0.019;DP=196;FS=5.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,100:196:99:3618,0,3371 +chr6 19195518 . A T 2913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.497;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,81:171:99:2942,0,3022 +chr6 19195563 . T G 2919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=-2.509;DP=168;FS=3.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,83:168:99:2948,0,3137 +chr6 19195681 . A C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=4.799;DP=76;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=4.44;ReadPosRankSum=-3.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:366,0,2363 +chr6 19195690 . T C 3249.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3278,233,0 +chr6 19195816 . A C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=-0.835;DP=99;FS=10.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:428,0,3096 +chr6 19195952 . T C 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-1.552;DP=19;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=31.23;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:31:694,31,0 +chr6 19196044 . A T 4426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:4455,314,0 +chr6 19196050 . T C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-2.108;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,28:107:99:613,0,3039 +chr6 19212499 . GA G 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.621;DP=56;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:299,0,1108 +chr6 19212518 . A T 2210.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2239,157,0 +chr6 19212666 . A G 2169.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2198,157,0 +chr6 19251124 . T C 2173.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2202,157,0 +chr6 19256078 . A T 2542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.852;DP=63;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,62:63:99:2571,184,0 +chr6 19285863 . G A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=1.200;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:501,0,356 +chr6 19286145 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:292,0,473 +chr6 19286230 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:311,0,524 +chr6 19298129 . C A 4729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.648;ClippingRankSum=-0.820;DP=276;FS=17.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,143:268:99:4758,0,4004 +chr6 19298163 . CAGGTGGGTATGCCAGTATTTTGCTGAGTGCAGCTTAAATAAAAAAAGTGTACCTTAACGCATCGTGTGTGTTTTTAA C 8495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-1.022;DP=271;FS=17.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,222:245:99:8533,0,289 +chr6 19303241 . C T 1647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.401;DP=228;FS=6.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,68:228:99:1676,0,5893 +chr6 19304162 . C A 1642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=-0.298;DP=264;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,75:264:99:1671,0,7088 +chr6 19355812 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.385;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,540 +chr6 19356376 . C A 292.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:321,0,19 +chr6 19357313 . A T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.808;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:330,0,1267 +chr6 19357314 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.444;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:330,0,1269 +chr6 19357639 . T C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:272,0,418 +chr6 19363844 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:325,0,283 +chr6 19364098 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:317,0,172 +chr6 19366091 . A T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.249;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,27:84:99:746,0,2192 +chr6 19366597 . A G 1574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.492;DP=84;FS=5.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:1603,0,1552 +chr6 19367139 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-0.672;DP=94;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:587,0,2876 +chr6 19367151 . C T 1803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.347;DP=89;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.111;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,53:89:99:1832,0,1269 +chr6 19368089 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.986;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,473 +chr6 19368842 . A AT 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.98;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:245,0,180 +chr6 19368870 . CA C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:266,0,192 +chr6 19368887 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,180 +chr6 19369481 . A G 2929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.412;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,74:81:99:2958,101,0 +chr6 19371846 . G A 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.678;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=16.50;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1249,0,1403 +chr6 19378380 . G A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-1.528;DP=27;FS=4.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:728,0,208 +chr6 19379366 . ACAGGTCAGTATTAACAAATAGCTTTTTGCACTTTAATGTAAGAAATCAGCACATTATGACCTTGTTTTTTTATCCTTGTAAAAT A 3446.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.165;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=31.39;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:3484,286,0 +chr6 19381244 . C A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.800;DP=65;FS=5.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:500,0,1781 +chr6 19383638 . C A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.230;DP=77;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:931,0,1830 +chr6 19385147 . G A 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.907;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:1282,0,1242 +chr6 19385753 . A T 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.799;DP=91;FS=3.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:1527,0,1709 +chr6 19545849 . T A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.243;DP=259;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,46:258:99:728,0,8565 +chr6 19548948 . G C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-0.635;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:229,0,1204 +chr6 19570187 . A T 634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:663,48,0 +chr6 19651195 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr6 19705972 . T C 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-2.275;DP=187;FS=4.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.900;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,67:187:99:2173,0,4550 +chr6 19706013 . C CT 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.876;DP=170;FS=5.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:386,0,2392 +chr6 19706338 . C CT 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=-3.859;DP=91;FS=21.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=4.06;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:407,0,1767 +chr6 19781669 . G T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-1.193;DP=57;FS=3.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:570,0,1419 +chr6 19953443 . T C 326.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.69;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:355,0,14 +chr6 19953817 . T C 1665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=1.623;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=32.66;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,45:51:30:1694,0,30 +chr6 20031661 . T A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.140;DP=62;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:465,0,1577 +chr6 20031910 . C A 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.445;DP=117;FS=19.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,40:117:99:1355,0,2806 +chr6 20032284 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=3.408;DP=93;FS=4.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:473,0,2566 +chr6 20033205 . T G 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=1.336;DP=81;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:924,0,1896 +chr6 20044829 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.034;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:471,0,493 +chr6 20082281 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.625;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:232,0,1659 +chr6 20198975 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.554;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:237,0,3126 +chr6 20199195 . T A 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=-0.990;DP=103;FS=6.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1767,0,1872 +chr6 20199236 . G A 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.566;DP=82;FS=23.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1413,0,1462 +chr6 20199318 . G T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.621;DP=36;FS=7.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:294,0,691 +chr6 20199332 . C CA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=4.007;DP=48;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=4.81;ReadPosRankSum=-3.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:268,0,1193 +chr6 20199771 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.285;DP=99;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:599,0,2761 +chr6 20209748 . G A 233.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:262,0,16 +chr6 20210027 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-2.829;DP=56;FS=8.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:322,0,1576 +chr6 20238062 . C T 1973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.440;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=23.87;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2002,141,0 +chr6 20246973 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.172;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:377,0,637 +chr6 20252718 . TA T 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.109;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:357,0,368 +chr6 20252736 . G T 983.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-0.378;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=25.89;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,32:37:21:1012,0,21 +chr6 20261131 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=19.98;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:288,0,122 +chr6 20261452 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.179;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:551,0,806 +chr6 20261731 . T C 1438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1467,105,0 +chr6 20296129 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=-0.485;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:241,0,599 +chr6 20365944 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-1.402;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=14.84;ReadPosRankSum=2.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:518,0,645 +chr6 20367623 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=1.341;DP=68;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:810,0,1581 +chr6 20367725 . T G 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.102;ClippingRankSum=-0.588;DP=75;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:529,0,2371 +chr6 20369413 . T C 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=-0.023;DP=61;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:729,0,1321 +chr6 20388289 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.221;DP=40;FS=7.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:302,0,1103 +chr6 20402855 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.119;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:369,0,654 +chr6 20452134 . G A 749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:778,54,0 +chr6 20577573 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.764;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:288,0,882 +chr6 20604663 . CTT C 780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.092;DP=41;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:818,0,680 +chr6 20772152 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.423;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:372,0,514 +chr6 20772207 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.534;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:306,0,449 +chr6 20811839 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.622;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=17.24;ReadPosRankSum=-1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:580,0,603 +chr6 20815619 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr6 20895247 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.424;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,220 +chr6 20903304 . AGTACGATATCTGCCCTTCCAATATGTTCGAAATCAAACAGAATCGTCAGCTTTCCATCGATGATAATTACATTGTTTGTTTTACAG A 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=30.27;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:340,0,1170 +chr6 20904771 . A G 2165.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.080;DP=57;FS=18.069;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,52:56:75:2194,75,0 +chr6 20904877 . T A 4308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4337,298,0 +chr6 20905505 . G GT 204.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:242,23,0 +chr6 20905546 . T C 1447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1476,105,0 +chr6 20905606 . C T 2342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.386;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=34.45;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,58:63:99:2371,105,0 +chr6 20905681 . A G 2892.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2921,205,0 +chr6 20905930 . A G 3336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.084;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=33.04;ReadPosRankSum=-1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:3365,238,0 +chr6 20905970 . T C 2658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-1.349;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=32.50;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,63:65:99:2687,190,0 +chr6 20906329 . C T 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.821;DP=71;FS=15.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:99:1289,0,239 +chr6 20906336 . T TA 1175.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.473;DP=85;FS=7.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:6:1212,0,6 +chr6 20906441 . A G 1060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=2.275;DP=50;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:36:1089,36,0 +chr6 20906450 . C G 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=2.105;DP=39;FS=4.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=18.87;ReadPosRankSum=-2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:99:764,0,118 +chr6 20906612 . T A 3315.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3344,237,0 +chr6 20906632 . T A 2967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2996,208,0 +chr6 20906695 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr6 20906702 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr6 20908298 . C G 1617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1646,114,0 +chr6 20908724 . G T 4690.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.281;DP=163;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,119:122:99:4719,349,0 +chr6 20908755 . G A 2817.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2846,205,0 +chr6 20908834 . T A 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 +chr6 20908956 . T C 3411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3440,249,0 +chr6 20909027 . C T 1071.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1100,78,0 +chr6 20909165 . G C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=16.60;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:244,0,180 +chr6 20909218 . T G 3353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:3382,232,0 +chr6 20909280 . T C 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.363;DP=86;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=22.31;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,48:56:88:1947,0,88 +chr6 20909592 . C T 1291.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1320,96,0 +chr6 20909616 . A C 2027.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:2056,141,0 +chr6 20909739 . T G 5493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5522,379,0 +chr6 20909775 . T C 4296.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.799;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=33.83;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:4325,304,0 +chr6 21030537 . C A 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.012;DP=70;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1267,0,1232 +chr6 21033833 . TAA T 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.300;DP=32;FS=7.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:498,0,346 +chr6 21386556 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,183 +chr6 21404268 . C T 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.692;DP=68;FS=2.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1350,0,991 +chr6 21478442 . A T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.470;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:681,0,116 +chr6 21560403 . T A 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr6 21560415 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:52:270,0,52 +chr6 21566558 . T C 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.759;DP=105;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:1271,0,2230 +chr6 21578190 . TCTGAAACACACAATTTATCAGAACTGATTCATAGGTTCTCTTCATGCACTGATAGAAAATAAAAATAAGCAGATTTAAAAAGACAGAAC T 4552.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=2.405;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=26.32;ReadPosRankSum=-2.428 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,109:111:99:4590,337,0 +chr6 21639957 . A G 3536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=30.22;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:99:3565,262,0 +chr6 21639978 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:294,0,439 +chr6 21640764 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=1.030;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=21.42;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:371,0,366 +chr6 21640780 . A G 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.896;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=26.68;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:99:736,0,1339 +chr6 21640781 . A G 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.189;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.079;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:99:730,0,1339 +chr6 21645091 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-0.152;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:237,0,862 +chr6 21662752 . GAGGTGATACCAGTAACATGAGTGTTCATATCATCCATGTAATCTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAAGTAAAAATCAAGTGACTTAATATCAACTGGTCTTTATTCTATTTGTAC G 2974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=1.682;DP=76;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,68:69:99:3012,228,0 +chr6 21663480 . T A 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.122;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:838,0,1291 +chr6 21667213 . A G 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-0.997;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:830,0,2404 +chr6 21724151 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-1.889;DP=26;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:495,0,390 +chr6 21724163 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-1.505;DP=25;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=17.43;ReadPosRankSum=-2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:464,0,387 +chr6 22452229 . TA T 211.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-0.967;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=13.23;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:22:249,0,22 +chr6 22455667 . CCCTGTAAATGAACCCATACACACAAAGGACATGTTACAGTGTACAAACACGCTGATGAGTGGAAGGCTAGTTTCAATAGGTTCTAATTTACAGTAAAATACACATCATTTTATTA C 2705.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=2.106;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,58:62:99:2743,227,0 +chr6 22458147 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.385;DP=64;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:251,0,1958 +chr6 22827748 . GC G 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.318;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:99:682,0,1086 +chr6 22827750 . AGGTCAAATGCCGTTTCTTAGAGCATTCCTTCAGTTTATTGATTGTATTTTAATCTGACAGGTCTGTAATGTCTTTGTTCAC A 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.761;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=26.94;ReadPosRankSum=-1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:603,0,905 +chr6 23156400 . CT C 1474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.345;DP=72;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,56:69:99:1512,0,224 +chr6 23210696 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=3.539;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=5.78;ReadPosRankSum=-3.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:317,0,2357 +chr6 23211115 . G A 3947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.387;DP=356;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=11.09;ReadPosRankSum=3.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,120:354:99:3976,0,8236 +chr6 23216759 . T C 3339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.954;ClippingRankSum=0.116;DP=404;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=8.27;ReadPosRankSum=2.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,128:404:99:3368,0,10167 +chr6 23221006 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:456,0,266 +chr6 23256589 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,525 +chr6 23256590 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,525 +chr6 23256804 . TA T 263.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:301,30,0 +chr6 23267403 . G T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.880;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:339,0,326 +chr6 23267485 . C A 1235.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1264,90,0 +chr6 23267713 . T G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:82:462,0,82 +chr6 23267901 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:339,0,297 +chr6 23267917 . A C 544.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.810;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:2:571,2,0 +chr6 23268473 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.345;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:85:502,0,85 +chr6 23268662 . C T 494.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=30.43;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7:522,7,0 +chr6 23268758 . T C 445.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=34.27;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:473,0,7 +chr6 23268947 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.286;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=22.52;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:366,0,171 +chr6 23269220 . A T 626.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.731;DP=19;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:27:655,0,27 +chr6 23280829 . ACTAAGATAACATATACCATAAATAACAAGAGTGTGAACCAGTTCACGTTATTAATGATTAGTATCTTAATGTTTAATGTGTATTAAAAACAAAAAC A 2671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=2.368;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=30.98;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2709,226,0 +chr6 23282702 . T G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.247;DP=59;FS=2.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:489,0,3339 +chr6 23286861 . T A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=1.523;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:730,0,1244 +chr6 23377876 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-0.148;DP=171;FS=5.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,28:171:99:360,0,5622 +chr6 23377921 . G T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.300;DP=187;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=7.17;ReadPosRankSum=3.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,54:187:99:1369,0,5061 +chr6 23378956 . C A 1482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.204;DP=113;FS=2.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:1511,0,2729 +chr6 23400527 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.762;DP=51;FS=2.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=6.41;ReadPosRankSum=-2.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:355,0,1503 +chr6 23491772 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.048;DP=37;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:414,0,847 +chr6 23540455 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.025;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:350,0,595 +chr6 23541426 . GT G 306.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=1.203;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:8:343,8,0 +chr6 23545858 . T G 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-1.167;DP=116;FS=4.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,41:116:99:1404,0,4252 +chr6 23546620 . G A 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.247;DP=146;FS=10.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,35:146:99:787,0,4326 +chr6 23546792 . A G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-1.961;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=3.62;ReadPosRankSum=2.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,29:143:99:550,0,4440 +chr6 23560023 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.467;DP=60;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:253,0,1947 +chr6 23560073 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.722;DP=59;FS=11.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:328,0,1755 +chr6 23561243 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=-2.838;DP=30;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:349,0,697 +chr6 23614547 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=1.837;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=13.52;ReadPosRankSum=2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:488,0,688 +chr6 23680790 . G A 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-1.671;DP=53;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:940,0,2025 +chr6 23702723 . C A 384.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:2:411,0,2 +chr6 23702894 . A T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 +chr6 23726989 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.369;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:265,0,3715 +chr6 23727028 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=1.212;DP=40;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:257,0,1114 +chr6 23727042 . T A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.242;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:593,0,687 +chr6 23727339 . A AT 1168.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1206,102,0 +chr6 23727385 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.222;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:580,0,400 +chr6 23727418 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:433,0,280 +chr6 23778015 . T G 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=2.346;DP=58;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=21.34;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1266,0,1676 +chr6 23786293 . T TA 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.567;DP=34;FS=14.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:297,0,513 +chr6 23789532 . CTT C 3324.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:4531,340,0 +chr6 23804406 . C T 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-0.775;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:993,0,2881 +chr6 23805209 . A G 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.290;DP=40;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:555,0,820 +chr6 23867918 . G A 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:632,48,0 +chr6 23868248 . T C 922.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:951,66,0 +chr6 23868803 . A G 2963.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:2992,218,0 +chr6 23868881 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=1.527;DP=106;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:335,0,3083 +chr6 23869050 . T G 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=1.041;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=22.38;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:99:1304,0,142 +chr6 23988542 . T A 544.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:582,60,0 +chr6 23988614 . G A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DP=21;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:489,0,157 +chr6 23989082 . G A 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;ClippingRankSum=-4.472;DP=33;FS=42.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=23.05;ReadPosRankSum=3.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:789,0,399 +chr6 23989125 . G C 1531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.061;DP=44;FS=2.157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=34.81;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,40:44:41:1560,41,0 +chr6 23989314 . A G 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.017;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,55:88:99:1871,0,1128 +chr6 23989438 . G T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr6 23989439 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr6 23989732 . G A 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 +chr6 23989842 . G T 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 +chr6 23990297 . G T 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 +chr6 23990308 . T TA 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-0.826;DP=34;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:450,0,117 +chr6 23990490 . G T 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.134;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:1037,0,1449 +chr6 23990493 . G A 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.105;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:1037,0,1449 +chr6 23990847 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=-0.895;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1065,0,1339 +chr6 23990932 . G T 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:51:715,51,0 +chr6 23990957 . G A 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:479,36,0 +chr6 23991030 . G A 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.397;DP=72;FS=23.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:851,0,1500 +chr6 23991117 . A C 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-3.071;DP=120;FS=10.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.144;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1944,0,1379 +chr6 23992023 . C A 678.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=-0.258;DP=63;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:734,0,797 +chr6 23992097 . A C 1909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=1.645;DP=161;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:1938,0,1529 +chr6 23992153 . G T 1325.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:97:1354,97,0 +chr6 23992613 . A G 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 +chr6 23992677 . T A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.948;ClippingRankSum=0.578;DP=36;FS=10.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=20.66;ReadPosRankSum=3.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:772,0,184 +chr6 23992715 . G C 764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:793,57,0 +chr6 23992863 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:317,0,387 +chr6 23992876 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.536;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:317,0,387 +chr6 23992954 . A T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.219;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:479,0,987 +chr6 23992976 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.264;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=15.54;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:479,0,987 +chr6 23993624 . G T 610.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:709,54,0 +chr6 23993636 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,5:5:99:399,0,238 +chr6 23994011 . A G 5482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:5511,391,0 +chr6 23994130 . A G 2479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.282;ClippingRankSum=1.535;DP=75;FS=45.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=33.06;ReadPosRankSum=-1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,63:74:99:2508,0,113 +chr6 23994161 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.578;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=13.16;ReadPosRankSum=-2.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:252,0,278 +chr6 24014732 . A T 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;ClippingRankSum=0.905;DP=181;FS=3.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,44:181:99:949,0,5069 +chr6 24032649 . TGGTGCGTTACAGAATTGAAACCACATAAGTGTGGTTTAGGTTCTTTCATTTAATCATTTATTATTCAGTAATCATAAGTGTTGATGTTTCTGTATCACA T 14796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=3.178;DP=352;FS=3.829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,326:332:99:14834,1198,0 +chr6 24039377 . ACTGTAAAGTACGACAACCAAAAATGTAAGAAAAAGAACCCATTACAAGAATGAGAATAAACAACATCAACAAAAAAACATAC A 1388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=1.597;DP=33;FS=2.210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:99:1426,126,0 +chr6 24048072 . A T 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.365;DP=41;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:535,0,898 +chr6 24158587 . T C 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:524,36,0 +chr6 24158689 . C G 333.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:362,27,0 +chr6 24159598 . T C 779.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:808,57,0 +chr6 24159702 . G C 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 +chr6 24159988 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr6 24160058 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 +chr6 24169740 . T A 1084.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.207;DP=31;FS=2.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=34.98;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:1:1110,0,1 +chr6 24169797 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.820;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=24.32;ReadPosRankSum=-1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:28:466,0,28 +chr6 24171280 . T C 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:57:835,57,0 +chr6 24171288 . T A 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:835,57,0 +chr6 24171850 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=-4.196;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=17.62;ReadPosRankSum=4.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:874,0,818 +chr6 24172817 . C G 4968.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:4997,358,0 +chr6 24173831 . T A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr6 24173957 . T A 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 +chr6 24175148 . G T 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.438;DP=82;FS=11.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1252,0,1652 +chr6 24176083 . T G 1171.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1200,84,0 +chr6 24750219 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.462;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:304,0,750 +chr6 25473324 . T A 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 +chr6 25473408 . G A 213.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr6 26266608 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.677;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:663,0,1317 +chr6 26266609 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=-0.512;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:663,0,1317 +chr6 26268048 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-1.657;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:559,0,859 +chr6 26583768 . CA C 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=4.827;DP=215;FS=0.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=3.45;ReadPosRankSum=-3.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,54:202:99:779,0,4056 +chr6 26583800 . CT C 719.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=3.280;DP=215;FS=7.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=3.35;ReadPosRankSum=-2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:757,0,3883 +chr6 26596679 . ACTTGATGAGGTAAAGAAAAAAAAACATAATCGACTTAAAGGTTTACAAAACATCTGCTATAAACATCAAAAATTGCTTTATACTAAC A 13544.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=0.418;DP=383;FS=4.669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,377:381:99:13582,1095,0 +chr6 26741244 . A C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.554;DP=29;FS=6.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:444,0,1149 +chr6 26814783 . A C 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-2.840;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.964;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:1087,0,1260 +chr6 26919670 . T C 1748.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1777,126,0 +chr6 26919712 . A G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.633;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:604,0,853 +chr6 26921177 . G A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.610;DP=53;FS=4.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:1203,0,597 +chr6 26942672 . A G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.767;DP=53;FS=2.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:780,0,839 +chr6 27217868 . ATAGGTAGGAATCATTTCTGTGGATAAACAATGGACATAATATTGCTGTCACATATTGAATGTTGTTTTCTTTTTCTGTTT A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=2.424;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:283,0,3337 +chr6 27323438 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.569;DP=35;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:634,0,613 +chr6 27323470 . A C 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.424;DP=53;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:974,0,880 +chr6 27323589 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-1.680;DP=24;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:410,0,482 +chr6 27355047 . TGGTAGTTATTGAATATTACAGCATTCATTCTAAAATGTAAAGAGTGACAAGATTGATAATGATGATTTCTGTTGTACGTTGCA T 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.683;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:254,0,1394 +chr6 27524503 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=1.892;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:449,0,359 +chr6 27583584 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=2.004;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=29.31;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:761,0,105 +chr6 27584135 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:356,0,53 +chr6 27584333 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=20.36;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:415,0,277 +chr6 27584347 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.109;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:452,0,287 +chr6 27593238 . GA G 1714.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-1.467;DP=101;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1752,0,1205 +chr6 27615092 . A T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.460;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,793 +chr6 27615093 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-1.116;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,793 +chr6 27623419 . C T 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.256;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=25.33;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,38:54:99:1396,0,434 +chr6 27626667 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.906;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:601,0,1278 +chr6 27631129 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.760;DP=52;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,33:52:99:1131,0,660 +chr6 27705890 . C A 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-3.816;DP=206;FS=11.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,47:206:99:906,0,6179 +chr6 27706078 . GAGGTGAGTAAAAGCACAAGTGGTAGAGATGCCATAGTCAAAAAATAGTACTCTTTTTAATTTATTGCTCAACTCTTGCAACAACCATAATTCTCTTTCC G 12561.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.718;DP=301;FS=1.644;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=28.94;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,295:301:99:12599,1102,0 +chr6 27745365 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-2.066;DP=62;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,37:62:99:1174,0,798 +chr6 28142276 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.162;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:389,0,890 +chr6 28219350 . G T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.611;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:815,0,622 +chr6 28275715 . A C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.605;DP=52;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:450,0,1282 +chr6 28275767 . A T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=-0.265;DP=46;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:522,0,947 +chr6 28275962 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.225;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:572,0,606 +chr6 28323160 . G A 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.389;DP=43;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:917,0,521 +chr6 28400159 . A G 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-1.441;DP=52;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.597;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:832,0,968 +chr6 28401447 . A G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=3.343;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:436,0,609 +chr6 28931269 . A G 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.368;ClippingRankSum=4.140;DP=89;FS=5.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=5.83;ReadPosRankSum=-4.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:547,0,2404 +chr6 28936576 . C T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=6.161;DP=170;FS=15.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=4.29;ReadPosRankSum=-4.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:757,0,11498 +chr6 28940878 . C G 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=3.256;DP=151;FS=20.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,52:151:99:1246,0,5447 +chr6 28996318 . C A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.519;DP=58;FS=11.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1003,0,955 +chr6 29003488 . A G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.839;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=30.51;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:58:608,0,58 +chr6 29006765 . C A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=1.247;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:383,0,216 +chr6 29014592 . GTACCTTGAACATCAGAGAAAACGCATGAAAAAAAAGCGTACTTTTTAGATCTCATATCTAGTTCCAATATGTTTA G 694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=2.729;DP=26;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:99:732,0,1446 +chr6 29034427 . T G 2776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=-1.487;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,83:129:99:2805,0,1621 +chr6 29049774 . GCTGAAGAAGAAAAAAATTATTAAACAATAACTAAGACAACAACTTATCCAAGAAAATTAATGCAGAAAGGTGGCGTAC G 4846.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=2.114;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,109:111:99:5012,412,0 +chr6 29105410 . TGTAAGTTATCAAAGCTATCATTAATGGAGATATGTGAAGAAAATCTTAAATGTTGCAATTTGTGATTTCAG T 10223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.938;DP=226;FS=6.782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=34.50;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,214:225:99:10261,927,0 +chr6 29108103 . TGTAAGTGGCACATCAGTTCGGATCTCTTAAGTGCTTTTTTTTAATGGCAATGTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCTCTGCAG T 17340.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=1.723;DP=396;FS=3.123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=32.97;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,394:395:99:17951,1365,0 +chr6 29116848 . G T 3406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.357;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,93:193:99:3435,0,3490 +chr6 29180581 . T A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.534;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:549,0,591 +chr6 29180764 . G T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.250;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=23.45;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:638,0,612 +chr6 29180789 . T A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.028;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:525,0,354 +chr6 29180955 . G C 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.172;DP=55;FS=2.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:1094,0,829 +chr6 29181440 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=1.051;DP=56;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:815,0,1082 +chr6 29181842 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.238;DP=32;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=10.49;ReadPosRankSum=-2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:364,0,757 +chr6 29181992 . T G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.950;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:420,0,1919 +chr6 29181994 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-1.534;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:420,0,1919 +chr6 29426121 . T C 334.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=33.49;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:363,0,16 +chr6 29506476 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,450 +chr6 29506478 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,450 +chr6 29507489 . AATAATTACTTCACAACATAAAGTTTTCAGTGCTAAAAGACCTCGAGTATGACCATTAATAACCCATAATGCTATTATTTTAGGAG A 1480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.634;DP=309;FS=0.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,73:307:99:1518,0,14291 +chr6 29507657 . AAGGTATATTTATTTAATGAAAGTAAAAAAAAAAAGCTTTTAAAACATCCGCTGTGGGTTGAAACAATTGACAACCAAAATGTGTAAATAAAGATGAATTACTAAGGTATTACCACATTAC A 27666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.684;DP=432;FS=4.169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,409:410:99:27704,1873,0 +chr6 29507799 . T G 9754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=-0.649;DP=382;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,261:382:99:9783,0,3277 +chr6 29508353 . T TA 3323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-6.649;DP=333;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,141:332:99:3361,0,8230 +chr6 29508967 . T G 599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:628,45,0 +chr6 29578044 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=-0.298;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:378,0,1117 +chr6 29795178 . C A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:323,0,330 +chr6 29796543 . A AT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.905;DP=30;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:259,0,575 +chr6 29796557 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.551;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=14.24;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:484,0,741 +chr6 29828081 . T C 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.380;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:598,0,618 +chr6 29829208 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.582;ClippingRankSum=0.301;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:352,0,683 +chr6 29833667 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,137 +chr6 29833948 . T G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=26.56;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:347,0,99 +chr6 29847848 . C T 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:480,36,0 +chr6 29862539 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:286,0,136 +chr6 29865404 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,103 +chr6 30122166 . C T 2254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-1.808;DP=118;FS=3.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:2283,0,1901 +chr6 30129953 . G A 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=-2.782;DP=79;FS=1.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=17.29;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1394,0,2616 +chr6 30132564 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:95:236,0,95 +chr6 30139209 . G A 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-2.875;DP=82;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.075;QD=14.14;ReadPosRankSum=2.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1188,0,1596 +chr6 30143496 . G A 1919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-1.331;DP=111;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1948,0,1992 +chr6 30183824 . C T 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.409;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:855,0,311 +chr6 30269050 . C T 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.728;DP=41;FS=9.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:790,0,599 +chr6 30284625 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-1.032;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:658,0,336 +chr6 30284762 . T TA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.113;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:244,0,455 +chr6 30318528 . T A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=1.610;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:297,0,819 +chr6 30318537 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=1.377;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:297,0,819 +chr6 30319106 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.919;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:257,0,117 +chr6 30319283 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=1.902;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:466,0,240 +chr6 30319976 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.537;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:587,0,99 +chr6 30321348 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:57:331,0,57 +chr6 30321771 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:411,0,295 +chr6 30323242 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:384,0,203 +chr6 30360474 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,181 +chr6 30361639 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:349,0,317 +chr6 30364405 . C A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.706;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:330,0,336 +chr6 30367149 . A G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-1.767;DP=29;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:650,0,337 +chr6 30367221 . T A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.93;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:441,0,145 +chr6 30367733 . C G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-1.352;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:360,0,398 +chr6 30367900 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:349,0,169 +chr6 30370286 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.198;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:424,0,1534 +chr6 30370450 . C A 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-1.598;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:666,0,1133 +chr6 30374507 . T A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.960;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,32:50:99:1097,0,610 +chr6 30375643 . T G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=-0.079;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:637,0,672 +chr6 30380122 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.727;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:347,0,459 +chr6 30380142 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=1.275;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:350,0,415 +chr6 30411518 . G C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.888;DP=21;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:319,0,425 +chr6 30411561 . A T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=2.362;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:310,0,480 +chr6 30413567 . G A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.417;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:664,0,226 +chr6 30545223 . T A 2333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-2.633;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:2362,0,1923 +chr6 30761918 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,157 +chr6 30878058 . T TA 540.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:59:578,59,0 +chr6 30974164 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:388,0,201 +chr6 31028326 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.178;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:349,0,914 +chr6 31044606 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=22.42;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:387,0,208 +chr6 31109837 . C T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.184;DP=225;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,50:225:99:1008,0,6818 +chr6 31120096 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.003;ClippingRankSum=1.502;DP=40;FS=13.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:298,0,1069 +chr6 31120187 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-0.078;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:363,0,1579 +chr6 31120290 . A G 1872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=1.116;DP=47;FS=7.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,33:45:99:1901,0,162 +chr6 31120313 . A G 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=1.278;DP=63;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:586,0,2367 +chr6 31120399 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.895;ClippingRankSum=-3.564;DP=83;FS=5.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:371,0,2317 +chr6 31120553 . C T 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.022;DP=110;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:110:99:1014,0,2846 +chr6 31120618 . T A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.842;DP=42;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:565,0,1106 +chr6 31120940 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.313;DP=88;FS=5.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:509,0,5517 +chr6 31123377 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:59:249,0,59 +chr6 31123378 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:59:249,0,59 +chr6 31283072 . GAA G 848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.922;DP=43;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.756;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:99:1115,0,115 +chr6 31283990 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.597;DP=91;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:416,0,2576 +chr6 31284011 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-2.038;DP=83;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:246,0,4565 +chr6 31303834 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.520;DP=85;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:675,0,2246 +chr6 31314723 . T A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.175;DP=89;FS=3.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,22:89:99:473,0,2370 +chr6 31316277 . T C 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=-0.298;DP=65;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:910,0,1200 +chr6 31464384 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=1.068;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,461 +chr6 31497200 . A T 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:330,24,0 +chr6 31777111 . TCTGAACATGACGTTAAAGACTAGACAAGTGCTGTTCTTGACATGATTGCGAATAGATGAAATTAAATACAAAAAATGTCGATGAAAACACACAGGTAAAGGATAC T 2270.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=1.666;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.88;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:2308,173,0 +chr6 31785023 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-1.588;DP=89;FS=7.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:314,0,2570 +chr6 32078342 . A T 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.151;DP=154;FS=3.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=7.54;ReadPosRankSum=2.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,45:154:99:1190,0,4122 +chr6 32095306 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,340 +chr6 32398709 . CA C 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=1.767;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:476,0,99 +chr6 33243665 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:275,0,98 +chr6 33244338 . T G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:367,0,164 +chr6 33247598 . ACAGGTAAGCCTCTTAGAACATCGCTATTTGATCGATAGACATCCAACCTCTTAACTCCAGCCCCAAACGCAATGTGTATACAAACAATTCATTTGATTGCGAGAAGCCCATTAACCAAGTCTGTGAAGAGGCGCGTTCCTTTGAGGTTGCATCACATCCATTGATTTATCTTTCCTTTGATTG A 8548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=2.425;DP=207;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,204:206:99:9155,775,0 +chr6 33256068 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.332;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:599,0,438 +chr6 33361121 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-1.205;DP=31;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:317,0,675 +chr6 33361302 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.562;DP=29;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.090;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:384,0,674 +chr6 33363811 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=-0.951;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:298,0,2170 +chr6 33363947 . C A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-1.647;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:651,0,3531 +chr6 33540618 . T G 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 +chr6 33572567 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:79:249,0,79 +chr6 33579257 . G GA 363.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:25:401,25,0 +chr6 33579260 . G T 372.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:25:401,25,0 +chr6 33609908 . TCTAGGGGAGAAAGAAGAGAGATTTAATACGGAAAAGCACACTTTGGCAGGGGTCACTTTAATAAAGCATTAACACAC T 1048.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=2.498;DP=402;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=2.61;ReadPosRankSum=-3.924 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,365:373:99:1086,451,0 +chr6 33618610 . T C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.152;DP=76;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:454,0,2148 +chr6 33624782 . ACTAGAACACAAAGAGACAAAGCATGAAGCAAAAGTAAAAGCACTGAAGACTGGCTAGGAATAAAGATGTCATTTATAATAATTTAGCTTATATGAATATCAC A 5440.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=2.094;DP=123;FS=2.106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,118:123:99:5478,453,0 +chr6 33642958 . A G 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.499;DP=46;FS=4.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:698,0,872 +chr6 33645350 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,341 +chr6 33733699 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.790;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:365,0,208 +chr6 33762215 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.695;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:572,0,1020 +chr6 33773155 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-0.905;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:433,0,589 +chr6 34380617 . G A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=-1.831;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=4.49;ReadPosRankSum=2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,38:156:99:728,0,5378 +chr6 34381144 . TTA T 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.393;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,1:92:99:331,0,3154 +chr6 34437524 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.377;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:354,0,291 +chr6 34612476 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,127 +chr6 34641020 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:289,0,446 +chr6 34644647 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=1.280;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,612 +chr6 34644661 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-0.167;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:451,0,614 +chr6 34681974 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.496;DP=37;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:256,0,1007 +chr6 34682504 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-1.952;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:232,0,669 +chr6 34682707 . A T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.847;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:401,0,780 +chr6 34682853 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.575;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:581,0,906 +chr6 34683321 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.952;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:382,0,825 +chr6 34684257 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.489;DP=50;FS=8.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.485;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:448,0,1291 +chr6 34684401 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.738;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:275,0,771 +chr6 34823724 . T A 2081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=-0.326;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,61:149:99:2110,0,3163 +chr6 34825010 . T C 2609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=1.569;DP=151;FS=9.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=17.28;ReadPosRankSum=-2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:2638,0,2669 +chr6 34880855 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:396,0,95 +chr6 34880918 . A C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:254,0,261 +chr6 34881087 . T A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:395,0,262 +chr6 34890041 . G A 1673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.492;DP=576;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:460,113:573:99:1702,0,16590 +chr6 34976954 . CT C 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.182;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.850;QD=16.17;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:66:296,0,66 +chr6 34998473 . C A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.332;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:527,0,1478 +chr6 35015774 . G C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:560,0,603 +chr6 35015878 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-1.453;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:460,0,910 +chr6 35016470 . A C 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-2.074;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=28.28;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:802,0,150 +chr6 35016921 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-1.091;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:365,0,576 +chr6 35016939 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.684;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,332 +chr6 35017927 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-1.856;DP=44;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:597,0,980 +chr6 35018455 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.304;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:314,0,442 +chr6 35019571 . A C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:418,0,117 +chr6 35023547 . T C 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-0.257;DP=43;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:664,0,764 +chr6 35037344 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-0.487;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:300,0,1207 +chr6 36329946 . G GT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=-1.418;DP=67;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:488,0,824 +chr6 36330487 . GCTGTTGGGTAAACGAGAAAATAGATTAAGTTCAACTTAAATTATTTTAGCTCCTTAAACGTCTTTATTTTATTGCATTAGTTACATAAAGAGAATGCAAGGTGCATTTTCTGAAAGGTTTTAACTCTGGCGACTTAC G 11348.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=4.068;DP=275;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=32.56;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,256:275:99:11386,556,0 +chr6 36667364 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-1.582;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:289,0,417 +chr6 36731689 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=1.171;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:563,0,367 +chr6 36731698 . T A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=1.623;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:563,0,357 +chr6 36737583 . A G 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=1.620;DP=27;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=25.77;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:724,0,223 +chr6 36821563 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=1.446;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:464,0,1801 +chr6 36825062 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,454 +chr6 37255425 . G GA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.933;DP=175;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=1.35;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,37:163:99:274,0,3062 +chr6 37367839 . A T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.962;DP=93;FS=3.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:581,0,2185 +chr6 37400254 . CT C 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.399;DP=31;FS=10.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:844,0,423 +chr6 37400256 . GCGCAATAGAAATATGCTGATTAGAGATCTGATAGGTTTTTTCAATAACGGTCAACTAAAAGCTTCTCTCACCA G 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.457;DP=32;FS=13.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=25.21;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:844,0,735 +chr6 37427362 . C CAACA 257.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:20:295,20,0 +chr6 37651111 . AGTACGCACGACAACTCTTCATTGTGCTCATGTATTTATTTCTGTTTATTAATGCCACCCTTGAGGCCACTCGTCTTGTTTTGTCCTTTTTCTCTTGCAG A 10614.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=1.023;DP=234;FS=7.950;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=32.50;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,232:234:99:10652,874,0 +chr6 37678882 . AT A 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=2.450;DP=58;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:584,0,648 +chr6 38436545 . G T 211.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:240,0,19 +chr6 38584551 . G A 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 +chr6 38789542 . G GT 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.172;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:691,0,1105 +chr6 38789772 . T A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.290;DP=48;FS=1.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:415,0,2608 +chr6 38827256 . CCAGGTCAAACGCGCGGATTCCCCACAACAACTATTTTTAGCATCTGGATAGTTCTTTGTTGTTTGAAGAGTATTTTCCTTGTTCATT C 2810.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=3.147;DP=93;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,78:92:99:2848,0,4470 +chr6 38833193 . C CT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=-0.348;DP=27;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:305,0,258 +chr6 38883971 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,222 +chr6 38885424 . A AT 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.599;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=21.13;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:312,0,336 +chr6 38886103 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=1.449;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:478,0,576 +chr6 38908242 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.186;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:447,0,885 +chr6 38951884 . TCTGAAAGACAAACACAGCCAGATAGCTATCTTACTATCATTAAACGTGGAAGCACTGCCGTGTGTTTAAGTGTCTGTAAGAC T 1552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.303;DP=72;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1590,0,12623 +chr6 39119318 . T A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.573;DP=31;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:563,0,574 +chr6 39121031 . GT G 500.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=1.169;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=11.64;ReadPosRankSum=-2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:538,0,1832 +chr6 39240398 . CTGCAACAAGAAATAATAACAAATCAGACACTTATCTAACACGAGCTG C 5170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:5208,625,0 +chr6 39240449 . TTACGAGATTTCGAGACAGAGATTGATTTATCTGAATATTTACCAGAG T 5170.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:5208,625,0 +chr6 39295457 . TGGTAAAGTGCTCTTACACACCATAGTTTTAGATCATCATCAAGTTTGTTGAATCGATCTGAAATCTTTTCTTTTTTTCTA T 14009.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=0.653;DP=361;FS=7.648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.69;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,353:361:99:14047,1204,0 +chr6 39295759 . AGTAAAGAGGAAAAGTTTAATTCTTGTATTTCATAGGGCATTAAATACAGTCACTGATTCTAATTCCTCTATATTTAG A 5633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.253;DP=188;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,146:182:99:5671,0,9086 +chr6 39296294 . GA G,GAA 1021.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,32,10:42:99:1069,221,182,951,0,1165 +chr6 39309018 . GT G 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.155;DP=37;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:434,0,415 +chr6 39309152 . C CA 421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=2.691;DP=61;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.91;ReadPosRankSum=-2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:467,0,896 +chr6 39309420 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-1.783;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:719,0,612 +chr6 39323244 . G GT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.348;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:290,0,385 +chr6 39441175 . G GA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.744;DP=139;FS=17.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,29:133:99:329,0,2896 +chr6 39448949 . CCCTAATATGAAGAAATAAGTGAAACATGTCACTAAATCTAATTCAAGTGTAACATCATATTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTA C 11102.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.303;DP=264;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,258:262:99:11140,884,0 +chr6 39462350 . AG A 592.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-2.068;DP=20;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=29.64;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:63:630,0,63 +chr6 39471862 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.204;DP=46;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:597,0,1855 +chr6 39508493 . C A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.314;DP=48;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:901,0,843 +chr6 39544717 . T A 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-1.082;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:99:1197,0,111 +chr6 39544827 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=1.713;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:412,0,988 +chr6 39552623 . TCCTGCAAGAGCGAGTAACATGATAATGCTGCAATGCCAAAACTACTGTAATCCAACTTGTGGCATATTCAAATTTA T 3281.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=1.048;DP=76;FS=3.367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:3319,287,0 +chr6 39564426 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.158;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=21.49;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:458,0,252 +chr6 39564434 . G GA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.515;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=14.09;ReadPosRankSum=-1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:319,0,133 +chr6 39565727 . C CA 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.056;DP=21;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=20.32;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:41:464,0,41 +chr6 39567512 . T TA 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.312;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=14.55;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:85:241,0,85 +chr6 39567629 . CA C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:79:264,0,79 +chr6 39570648 . GCTAAAATGTGTAAAAACAACAATTGAGATTCTCTGCAAATAAGCCAATCTAATTTCACAGAGAACACTGGTTCAAGAAGGCTCTTAC G 1323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=2.116;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.030;QD=33.94;ReadPosRankSum=-2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:99:1361,0,1643 +chr6 39589815 . G A 272.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:301,24,0 +chr6 39592506 . T A 3055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=1.286;DP=108;FS=7.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,78:108:99:3084,0,774 +chr6 39592607 . T C 10332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=1.931;DP=347;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=29.78;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,264:347:99:10361,0,1885 +chr6 39600270 . C T 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-1.094;DP=61;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1278,0,786 +chr6 39603117 . C T 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.794;DP=63;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1277,0,817 +chr6 39613286 . A G 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-0.089;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:1044,0,737 +chr6 39614237 . C T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=1.721;DP=45;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:738,0,1951 +chr6 39627414 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DP=34;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:437,0,708 +chr6 39629563 . C T 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.611;DP=65;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1108,0,1119 +chr6 39631096 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.816;DP=42;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:876,0,518 +chr6 39631378 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-2.931;DP=19;FS=12.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:263,0,416 +chr6 39670691 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=2.914;DP=29;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:313,0,685 +chr6 39670857 . GGTGT G 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=4.049;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:333,0,1126 +chr6 39762599 . T G 310.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:339,0,16 +chr6 39790450 . G A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.154;DP=45;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:970,0,493 +chr6 39796356 . A C 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.877;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1014,0,901 +chr6 39796669 . T C 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.213;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=17.70;ReadPosRankSum=2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:807,0,643 +chr6 39831384 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=-1.155;DP=81;FS=5.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:445,0,2275 +chr6 39848481 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=1.367;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:864,0,768 +chr6 39892367 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,153 +chr6 39906916 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=23.57;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:429,0,212 +chr6 39928111 . T A 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.358;DP=90;FS=1.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.178;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:1444,0,3929 +chr6 39937574 . G A 2871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.428;DP=94;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,76:94:99:2900,0,334 +chr6 39975406 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=2.286;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:255,0,478 +chr6 39975505 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-1.905;DP=20;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=30.54;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:47:639,0,47 +chr6 39976027 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,901 +chr6 39976035 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:249,0,901 +chr6 39980055 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-1.531;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:258,0,1421 +chr6 39989434 . TCCTGTATTTAGCAATATAAACAACTCAAAATAGCAGATATATATATGAAAACAATGTATCTTTGTGAGCTGAATATTATACTTA T 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:668,0,137 +chr6 39996231 . T C 8302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=2.014;DP=434;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,247:434:99:8331,0,6862 +chr6 39996347 . A T 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=-0.259;DP=87;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1451,0,1476 +chr6 40020992 . AGT A 2060.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.685;DP=112;FS=3.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:2098,0,2218 +chr6 40021134 . C T 1631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.707;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,47:74:99:1660,0,1672 +chr6 40147270 . GC G 216.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:19:254,19,0 +chr6 40151138 . T C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.207;DP=43;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.077;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:806,0,1664 +chr6 40188823 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-1.291;DP=30;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=19.83;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:623,0,425 +chr6 40192661 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.709;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:63:566,0,63 +chr6 40210627 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-0.607;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:376,0,593 +chr6 40356288 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:253,0,103 +chr6 40360770 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-1.132;DP=32;FS=14.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:252,0,904 +chr6 40361991 . C T 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-0.465;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,43:73:99:1453,0,1067 +chr6 40365053 . G A 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-0.710;DP=72;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,47:72:99:1661,0,827 +chr6 40385937 . G A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr6 40392692 . ACTGTAAAAAGGCAAGAAATATATATAAATAAAACATTATTACACTTCTAGACAACACTAATAAACAAAGGCAATGATACACATACACAC A 1107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=1.614;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:90:1145,90,0 +chr6 40474500 . GA G 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=2.439;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:342,0,290 +chr6 40502355 . AAGGTACAAAATATCTTGAGTTCTTTTTTATGCCTCTGTCAAATTTGTAGACATATTTTTCTTTTTTTCAAT A 2165.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=2.140;DP=70;FS=6.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=30.94;ReadPosRankSum=-3.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,52:65:99:2203,0,4255 +chr6 40503783 . TCCTGTAACAACAGCAGACACTTAAAACAGCACATGTAAATCAGATTTTGAGTAACGTTGGTACGTTACATTCGTCGTTTCGAGCCTTCGTAAATTTATAAACCGTGACTAA T 8540.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.653;DP=226;FS=4.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,204:225:99:8578,0,1893 +chr6 40509120 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.818;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:289,0,343 +chr6 40509269 . TA T 1583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-1.231;DP=138;FS=3.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1621,0,1321 +chr6 40535076 . G A 206.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:235,0,21 +chr6 40536989 . T C 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 +chr6 40559994 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.322;DP=38;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:290,0,1011 +chr6 40560118 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.461;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:301,0,1249 +chr6 40578688 . T A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=-2.849;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:428,0,256 +chr6 40582689 . T A 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=2.372;DP=130;FS=3.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,39:123:99:770,0,2761 +chr6 40585662 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:236,0,65 +chr6 40594641 . G C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=26.37;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:582,0,158 +chr6 40597050 . A T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=-0.283;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:281,0,872 +chr6 40599555 . G T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.368;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:320,0,544 +chr6 40619743 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.899;DP=23;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:443,0,367 +chr6 40620197 . T A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.378;DP=32;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:551,0,621 +chr6 40620398 . TC T 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.629;DP=40;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:503,0,522 +chr6 40621506 . CAG C 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=22.67;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:400,0,138 +chr6 40624455 . T C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-0.037;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:724,0,110 +chr6 40625573 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.482;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:297,0,116 +chr6 40638401 . G GA 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-0.182;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:282,0,469 +chr6 40638828 . CTG C 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.111;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:450,0,620 +chr6 40639034 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=27.83;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:98:390,0,98 +chr6 40639097 . T TA 214.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:252,24,0 +chr6 40648020 . T G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-2.460;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:904,0,232 +chr6 40648402 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=2.499;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:333,0,1019 +chr6 40650672 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.069;DP=38;FS=5.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:234,0,1063 +chr6 40652042 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.612;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:374,0,578 +chr6 40693752 . TA T 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=3.672;DP=102;FS=7.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=2.60;ReadPosRankSum=-2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,24:98:99:302,0,4836 +chr6 40693776 . A T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-1.099;DP=69;FS=7.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=4.37;ReadPosRankSum=-3.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,5:69:99:330,0,4836 +chr6 40693851 . G A 2781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=-0.593;DP=167;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,76:167:99:2810,0,2954 +chr6 40694286 . T C 6969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.549;DP=392;FS=0.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,211:391:99:6998,0,6697 +chr6 40697242 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.08;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:259,0,97 +chr6 40701246 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,174 +chr6 40701329 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.500;DP=44;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=11.93;ReadPosRankSum=-2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:553,0,1040 +chr6 40755514 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=1.357;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:424,0,430 +chr6 40755622 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-0.673;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:537,0,606 +chr6 40758256 . C T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.317;DP=37;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:580,0,628 +chr6 40763596 . G T 1411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=2.837;DP=93;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.493;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:1440,0,1685 +chr6 40768479 . ACAGGTATGAGCCCACAAACATTATGCTATTTCTAATGAATCTCCGTAAATCTAATCATTTGGTGTCTTT A 5803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=2.882;DP=216;FS=5.388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.516;QD=26.87;ReadPosRankSum=2.484 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,136:144:99:5841,423,0 +chr6 40769977 . C T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=1.086;DP=88;FS=7.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:1073,0,1986 +chr6 40771526 . G A 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-2.096;DP=202;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=5.87;ReadPosRankSum=2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,52:200:99:1213,0,5567 +chr6 40771676 . C T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.760;DP=61;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:574,0,1495 +chr6 40833739 . AACCTAAAGCTCAGACAAATGATAAGTGGAAGTGTTGCTTAAGAAAAACTCACTTCATATTATACAAGTATTATATGCTTTTTT A 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=1.371;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=26.87;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:521,0,1799 +chr6 40835748 . CCCTAGATCACCACGTATAGTAAGTTATAATATGTATGTTTACAGTTGGTATGTGCACAACTGGAGAAACAAAGTATTGGAATTTGACATAAGTTTTGTGAGTGTACCAGA C 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.727;DP=19;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:679,0,674 +chr6 40877777 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.705;DP=84;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1022,0,1933 +chr6 40898701 . AT A 563.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.743;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:601,60,0 +chr6 40954761 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-2.412;DP=75;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:301,0,2227 +chr6 40959182 . GCTTCAAATACAGATTAATCATTAATCATAATCACATCCCTCCATAATTTACCACAGCTACAAACTGTCGTTATCTACAATAATTTACTGTACACATGACGCAAACACTAC G 2409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.725;DP=64;FS=4.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,59:64:99:2447,0,1888 +chr6 41011043 . TA TAA,T 848.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.788;DP=80;FS=2.884;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,52,15:69:99:1825,272,224,1675,0,2319 +chr6 41011608 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.347;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:467,0,778 +chr6 41013204 . A T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=-0.036;DP=238;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,50:238:99:964,0,7144 +chr6 41013481 . A AG 437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-0.565;DP=52;FS=8.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:475,0,596 +chr6 41013691 . A T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-3.567;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=27.93;ReadPosRankSum=2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:894,0,531 +chr6 41014673 . G A 436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:465,33,0 +chr6 41015138 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr6 41015221 . C G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr6 41015689 . T A 1315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=2.293;DP=354;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,76:354:99:1344,0,10544 +chr6 41046443 . GA G 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.433;DP=69;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:419,0,1146 +chr6 41046689 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.510;DP=75;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:232,0,2370 +chr6 41288704 . G A 1432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-0.901;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,42:67:99:1461,0,891 +chr6 41366801 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=6.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:463,0,325 +chr6 41372537 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:357,0,297 +chr6 41377830 . G C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:430,0,258 +chr6 41382264 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=33.25;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:51:261,0,51 +chr6 41391371 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.678;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,29:126:99:639,0,6553 +chr6 41391377 . A C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.341;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:86:99:494,0,7499 +chr6 41391628 . TA T 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=1.768;DP=15;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:79:262,0,79 +chr6 41428515 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:290,0,98 +chr6 41429855 . A C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:289,0,136 +chr6 41429869 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:288,0,215 +chr6 41432305 . T C 882.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.261;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=31.93;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:27:911,27,0 +chr6 41432435 . GA G 1127.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.213;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1165,115,0 +chr6 41433215 . A C 1776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.469;DP=82;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=21.67;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,51:82:99:1805,0,1500 +chr6 41433377 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.993;ClippingRankSum=-0.430;DP=73;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:321,0,2241 +chr6 41435213 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.309;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.785;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:373,0,743 +chr6 41437223 . C A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.415;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:540,0,546 +chr6 41441436 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.223;DP=31;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:399,0,684 +chr6 41446017 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-0.344;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.51;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:243,0,895 +chr6 41467062 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:317,0,335 +chr6 41486608 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.580;DP=83;FS=5.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:421,0,2419 +chr6 41534992 . C T 1712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.184;DP=106;FS=0.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.421;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1741,0,1850 +chr6 41651502 . G T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.453;DP=68;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:390,0,1932 +chr6 41659469 . T A 1585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.133;DP=79;FS=16.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1614,0,1074 +chr6 41686356 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=3.916;DP=58;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=5.74;ReadPosRankSum=-3.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:361,0,3471 +chr6 41686359 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=3.927;DP=57;FS=4.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=5.84;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:361,0,3471 +chr6 41686754 . T A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.477;DP=51;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:660,0,1089 +chr6 41687608 . CT C 856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.236;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:894,0,479 +chr6 41687841 . T A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-0.883;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:529,0,721 +chr6 41687893 . C G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.316;DP=44;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:774,0,773 +chr6 41689498 . T TA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.435;DP=34;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:363,0,838 +chr6 41689805 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.839;DP=105;FS=9.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,22:105:99:416,0,3271 +chr6 41690930 . C A 271.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:300,24,0 +chr6 41690999 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=1.173;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=18.27;ReadPosRankSum=-2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:412,0,342 +chr6 41691155 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.109;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=17.55;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:660,0,615 +chr6 41692751 . C A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.695;DP=63;FS=3.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:867,0,1313 +chr6 41693056 . G GT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.091;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:300,0,371 +chr6 41693112 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=-0.576;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:462,0,591 +chr6 41693875 . T G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=2.147;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:237,0,984 +chr6 41694067 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=1.034;DP=49;FS=22.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=8.71;ReadPosRankSum=-2.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:455,0,2290 +chr6 41754670 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.996;DP=36;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:303,0,932 +chr6 41766449 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.540;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,734 +chr6 41766497 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-1.517;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,522 +chr6 41766527 . C G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.934;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:385,0,522 +chr6 41767275 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-1.323;DP=28;FS=8.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:431,0,539 +chr6 41927048 . T G 5477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.668;DP=320;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,169:319:99:5506,0,5323 +chr6 41927324 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.028;DP=282;FS=3.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=2.09;ReadPosRankSum=2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,48:282:99:617,0,8959 +chr6 41963783 . G A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 +chr6 41969696 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.594;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:316,0,597 +chr6 41969894 . C T 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.892;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:798,0,616 +chr6 41974165 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.677;DP=40;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:700,0,702 +chr6 41974219 . C T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.155;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:701,0,705 +chr6 41986049 . G C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:260,0,158 +chr6 42221493 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:257,0,401 +chr6 42223099 . T C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr6 42234192 . GCTGGGGGAAATGATAGAATCCAAAATTATTATAATATACAGAGCTATCCAAAATTTTATAATATACAGAGCTACCATTATTATGCTGCATTTAGTATAGGAAACATAC G 1945.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1983,164,0 +chr6 42286798 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.229;DP=149;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,27:149:99:405,0,4514 +chr6 42287287 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.504;DP=154;FS=1.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.57;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,24:153:99:270,0,4646 +chr6 42301674 . CATTT C 938.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.504;ClippingRankSum=4.297;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=13.04;ReadPosRankSum=-3.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:976,0,1996 +chr6 42302132 . T C 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.454;DP=171;FS=4.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,54:171:99:1465,0,4966 +chr6 42306046 . C G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=2.421;DP=246;FS=9.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,41:246:99:470,0,7623 +chr6 42306171 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.638;DP=201;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,30:201:99:249,0,6556 +chr6 42341604 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-1.611;DP=129;FS=6.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,21:129:99:249,0,6449 +chr6 42341607 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-1.047;DP=127;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,18:127:99:249,0,6449 +chr6 42341976 . G A 3952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.103;DP=219;FS=11.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,110:219:99:3981,0,3901 +chr6 42342006 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-2.521;DP=224;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=1.50;ReadPosRankSum=2.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,35:224:99:364,0,7337 +chr6 42348005 . T C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=1.224;DP=47;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:453,0,2026 +chr6 42348011 . C CA 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.275;DP=49;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:696,0,628 +chr6 42348523 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.508;DP=51;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:325,0,1493 +chr6 42348561 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.406;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=4.59;ReadPosRankSum=2.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:276,0,1627 +chr6 42348702 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.817;DP=53;FS=9.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:324,0,1538 +chr6 42410468 . A C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,326 +chr6 42425866 . T A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.591;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:445,0,408 +chr6 42435926 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.769;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:400,0,376 +chr6 42529737 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:312,0,97 +chr6 42604947 . G A 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.482;DP=129;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,46:129:99:1558,0,2853 +chr6 42621390 . ATTTTCTGAACTTTAATACTTTCAATTCCAATGTTCATTAATATGCAAATCCTCAGATCTAAATTATGACATCTTGCAGG A 1839.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.722;DP=156;FS=19.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,57:155:99:1877,0,6798 +chr6 42622014 . GTC G 1534.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1572,125,0 +chr6 42845470 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.360;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=10.96;ReadPosRankSum=2.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:335,0,669 +chr6 42846022 . GAA G,GAAA 284.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-1.366;DP=36;FS=5.315;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.472;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,8,14:27:99:461,223,706,173,0,327 +chr6 42846837 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:274,0,421 +chr6 42864433 . C A 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=1.995;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=16.23;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1132,0,1214 +chr6 42864881 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.744;DP=51;FS=7.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:229,0,1540 +chr6 42865566 . A C 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-0.080;DP=70;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:865,0,3080 +chr6 42865567 . C A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=1.175;DP=70;FS=3.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:865,0,3033 +chr6 42883408 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:372,0,375 +chr6 42947536 . C T 1871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=1.896;DP=109;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=17.17;ReadPosRankSum=-2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1900,0,1908 +chr6 42951538 . C A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.297;DP=44;FS=2.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:459,0,994 +chr6 42951610 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.453;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:335,0,897 +chr6 42956688 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.217;DP=50;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:442,0,1329 +chr6 43008126 . C T 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.062;DP=229;FS=4.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=5.13;ReadPosRankSum=2.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,54:229:99:1204,0,6946 +chr6 43009422 . C A 6036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.187;DP=342;FS=5.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,185:342:99:6065,0,5644 +chr6 43023281 . A T 4308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=-2.467;DP=319;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,73:315:99:4337,0,8130 +chr6 43163804 . C G 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=1.193;DP=62;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1120,0,956 +chr6 43169524 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.193;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:718,0,1012 +chr6 43182807 . G GA 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.168;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=26.30;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:37:537,0,37 +chr6 43185432 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.635;DP=27;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:412,0,495 +chr6 43193797 . G A 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.340;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:947,0,1219 +chr6 43196338 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.324;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:303,0,2207 +chr6 43196379 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-2.198;DP=67;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:255,0,1962 +chr6 43200338 . A G 1109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.415;DP=69;FS=6.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,32:69:99:1138,0,1254 +chr6 43217406 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.895;DP=45;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:342,0,1196 +chr6 43364101 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:339,0,370 +chr6 43405723 . C CT 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.780;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:432,0,550 +chr6 43531284 . C A 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=-1.159;DP=43;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:959,0,1068 +chr6 43531909 . G A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.266;DP=52;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:694,0,1152 +chr6 43556307 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-1.010;DP=69;FS=8.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:297,0,1984 +chr6 43587019 . C T 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=2.007;DP=85;FS=3.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:1252,0,1423 +chr6 43835638 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,356 +chr6 43837739 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:333,0,309 +chr6 43938628 . A C 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:412,0,525 +chr6 43938696 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-1.078;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:237,0,686 +chr6 44095173 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-1.373;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:247,0,1147 +chr6 44118548 . A G 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=1.720;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:1106,0,1041 +chr6 44125843 . CT C 709.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.755;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=26.29;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:747,0,129 +chr6 44126615 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.280;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:293,0,430 +chr6 44126746 . C CA 364.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=-0.950;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,17:20:1:435,1,0 +chr6 44176180 . A T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-2.325;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:982,0,988 +chr6 44176218 . A G 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-1.137;DP=54;FS=5.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:547,0,2488 +chr6 44176333 . A AG 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:415,0,732 +chr6 44178052 . C T 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.008;DP=58;FS=3.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:1027,0,1599 +chr6 44178079 . A C 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.475;DP=58;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,28:58:99:997,0,1016 +chr6 44211239 . C A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.513;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:636,0,537 +chr6 44858588 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=1.029;DP=117;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:377,0,3705 +chr6 44860910 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-0.811;DP=96;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=2.09;ReadPosRankSum=2.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,16:96:99:229,0,3035 +chr6 44862573 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.150;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:371,0,3497 +chr6 44887663 . C T 3171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.884;DP=182;FS=3.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,91:182:99:3200,0,3310 +chr6 44914548 . CA C 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=2.180;DP=54;FS=11.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:466,0,655 +chr6 44915877 . T G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.115;DP=68;FS=5.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.048;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:563,0,1763 +chr6 44916008 . C T 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-1.357;DP=100;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,34:100:99:1153,0,2223 +chr6 45129624 . T G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.423;DP=17;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:342,0,245 +chr6 45308450 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=31.75;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:83:314,0,83 +chr6 45781953 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:315,0,232 +chr6 45799878 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.058;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:456,0,925 +chr6 45824976 . G A 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.276;ClippingRankSum=1.257;DP=166;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,45:165:99:952,0,7422 +chr6 45824977 . C T 2437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=-1.790;DP=167;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=14.60;ReadPosRankSum=2.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,74:167:99:2466,0,4618 +chr6 45837745 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.032;DP=134;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,29:134:99:572,0,3745 +chr6 45837757 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.443;DP=135;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,27:135:99:485,0,4085 +chr6 45837841 . C A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.074;DP=139;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,28:139:99:502,0,4098 +chr6 45838003 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=2.174;DP=185;FS=8.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,34:184:99:481,0,5609 +chr6 45870157 . TGGTAAGTCAAATATTATAAGACTGAATATTCAAGTCAATTTTAGATTAAAGTGCACATATATTTTTTTTCTTTTGCTTTAAA T 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.47;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:257,0,1609 +chr6 45874149 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.758;DP=79;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:392,0,2454 +chr6 45874377 . A AT 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.327;DP=44;FS=7.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:340,0,345 +chr6 45876107 . C CT 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.202;DP=284;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,60:244:99:693,0,4910 +chr6 45876503 . C T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.785;DP=363;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,80:359:99:1002,0,11737 +chr6 45879174 . A T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr6 45886191 . C T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-1.550;DP=257;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,60:257:99:1258,0,12865 +chr6 45889792 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.094;DP=34;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:271,0,907 +chr6 45908014 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.774;DP=28;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:258,0,681 +chr6 45944423 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.079;DP=26;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:344,0,741 +chr6 46180744 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.532;DP=108;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=2.60;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:309,0,52 +chr6 46180787 . T C 311.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:340,0,16 +chr6 46180897 . A AT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1091 +chr6 46180905 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.259;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,1094 +chr6 46182091 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.788;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=9.18;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:276,0,229 +chr6 46182622 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-1.637;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:473,0,125 +chr6 46183900 . GT G 1935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.008;DP=103;FS=1.527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,74:83:99:1980,115,0 +chr6 46184059 . G A 977.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1006,69,0 +chr6 46184084 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr6 46184646 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.348;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=31.58;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:35:990,35,0 +chr6 46258039 . AAGGTAAAGTAATGCTTTTCTTTTAACTTGTATTCTTTTTTTGAGATTTATGTGTATAATGTGCACATATTGACTGTTTTCC A 599.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=27.25;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:47:637,47,0 +chr6 46333616 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr6 46333617 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr6 46333743 . T G 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 +chr6 46348344 . TGGTAAGACCCAAGCGTGTGCACTTGATTCAAATCAGACTAATTTGTTACTTTCATAAAACCTAGTTTAGGTTGGATTTTTAGTGATAAATGTTGTTTATTTTCATTGATTAATTTTTCTTTTGTTTGTTTCA T 9369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.588;DP=246;FS=2.456;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,243:246:99:9407,865,0 +chr6 46351296 . G GA 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.391;DP=213;FS=12.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,41:204:99:325,0,4417 +chr6 46353199 . C T 3433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-0.652;DP=236;FS=0.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,104:236:99:3462,0,4317 +chr6 46353790 . G C 3056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.001;DP=239;FS=0.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,90:239:99:3085,0,5212 +chr6 46354727 . C T 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-3.023;DP=266;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,70:266:99:1570,0,11480 +chr6 46357739 . C T 4701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-1.235;DP=344;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,136:343:99:4730,0,7044 +chr6 46360220 . C T 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.741;DP=259;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,63:256:99:1342,0,7412 +chr6 46364645 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.682;DP=42;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:283,0,1378 +chr6 46371410 . C A 2361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=1.300;DP=298;FS=6.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=7.93;ReadPosRankSum=2.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,92:298:99:2390,0,7750 +chr6 46827526 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-1.109;DP=360;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,64:360:99:867,0,11520 +chr6 46830944 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.104;DP=234;FS=3.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,40:234:99:383,0,8345 +chr6 46831016 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.152;DP=238;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,41:238:99:575,0,7589 +chr6 46831058 . A C 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=1.605;DP=210;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,45:210:99:805,0,6701 +chr6 46831189 . A G 3852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.443;DP=234;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,120:234:99:3881,0,4096 +chr6 46831549 . C T 3884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-1.047;DP=216;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,117:216:99:3913,0,3661 +chr6 46840361 . C A 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-0.601;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:1615,0,2515 +chr6 46857830 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:393,0,399 +chr6 46971414 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:350,0,363 +chr6 47397985 . G T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-1.546;DP=105;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,35:105:99:1049,0,5474 +chr6 47397986 . A C 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-1.275;DP=105;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,35:105:99:1049,0,5474 +chr6 47398967 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=1.219;DP=47;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:245,0,3343 +chr6 47398974 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.332;DP=46;FS=8.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,9:46:99:254,0,3343 +chr6 47399172 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.512;DP=59;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:484,0,1628 +chr6 47433593 . T TC 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:90:357,0,90 +chr6 47750721 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=1.061;DP=75;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:403,0,3658 +chr6 47751950 . G A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr6 47756995 . G C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.311;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,19:105:99:249,0,3102 +chr6 47757303 . C A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.978;DP=106;FS=5.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:640,0,6057 +chr6 47760369 . G T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-0.494;DP=116;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:435,0,3403 +chr6 47776188 . G A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.776;DP=64;FS=2.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1103,0,1102 +chr6 47781292 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=2.326;DP=58;FS=4.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:384,0,1640 +chr6 47796855 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=-0.056;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,30:145:99:510,0,4372 +chr6 47806039 . A T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-1.523;DP=156;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=4.18;ReadPosRankSum=2.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,33:156:99:680,0,5004 +chr6 47806193 . CA C 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=1.077;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:617,0,212 +chr6 47806473 . T A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.230;DP=33;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:466,0,889 +chr6 47826134 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:83:341,0,83 +chr6 47832126 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,221 +chr6 47992943 . A ACC 282.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:23:320,23,0 +chr6 47999131 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=1.359;DP=25;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:336,0,534 +chr6 48005612 . CA C 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.913;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:375,0,242 +chr6 48005695 . A C 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.970;DP=52;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:692,0,1100 +chr6 48005745 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.164;DP=82;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:252,0,3286 +chr6 48006393 . G C 1438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.597;DP=113;FS=6.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,42:113:99:1467,0,2538 +chr6 48006678 . G T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.775;DP=106;FS=11.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=7.34;ReadPosRankSum=2.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:806,0,8172 +chr6 48006684 . C T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.520;DP=101;FS=11.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,29:101:99:806,0,8172 +chr6 48007461 . T C 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 +chr6 48007990 . G T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.578;DP=54;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:438,0,1514 +chr6 48008589 . G A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.227;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:727,0,385 +chr6 48009440 . G A 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=2.736;DP=129;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,46:129:99:1568,0,2815 +chr6 48010555 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-2.922;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,30:122:99:649,0,7567 +chr6 48012721 . G A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-2.059;DP=93;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=5.64;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:553,0,2607 +chr6 48104327 . G T 2127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=-0.872;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=17.16;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:2156,0,2012 +chr6 48109042 . G A 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.588;DP=91;FS=5.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,55:91:99:1854,0,1260 +chr6 48133828 . AAGGTAGGAGATTCAACACTAAATCTAATGCTTTAATAATTTGCTCATTCAGTTAACATCAAAATGCAAACCAGTAGTATATTGATGTGTTTTGCAGTCGTTTTAATCAGTATGATCTCTTAATC A 756.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=1.619;DP=143;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,140:142:99:794,326,0 +chr6 48139621 . T TA 221.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:259,26,0 +chr6 48139785 . GT G 925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:97:963,97,0 +chr6 48178966 . G A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-0.543;DP=54;FS=4.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:687,0,1761 +chr6 48181978 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=1.543;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:292,0,470 +chr6 48182640 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.848;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:231,0,606 +chr6 48230897 . T C 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.404;DP=27;FS=2.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=28.84;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:71:807,0,71 +chr6 48238786 . C A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.734;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:462,0,576 +chr6 48253246 . A T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.172;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:673,0,375 +chr6 48254457 . G A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.728;DP=34;FS=7.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:636,0,1205 +chr6 48293411 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-1.892;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:370,0,1354 +chr6 48301120 . GCAGGTATATGGATTCAAGAGCACTGTTTTATTGCAGTCTTAAACTGCCATGTTATGACTTTTGTGTATGT G 2222.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=1.670;DP=56;FS=3.332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=34.07;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2260,176,0 +chr6 48301337 . T A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-1.122;DP=40;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:765,0,599 +chr6 48303612 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.488;DP=34;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:583,0,471 +chr6 48319110 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-2.031;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:316,0,337 +chr6 48320559 . TA T 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-2.620;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:56:297,0,56 +chr6 48320864 . T A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=-1.155;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:932,0,309 +chr6 48321227 . A C 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:384,27,0 +chr6 48324067 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-0.173;DP=56;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:701,0,1353 +chr6 48324089 . G T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.432;DP=47;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:579,0,1082 +chr6 48324258 . G GA 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.287;DP=80;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:453,0,1311 +chr6 48324492 . T G 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-2.428;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1370,0,1485 +chr6 48325096 . G A 1889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.107;DP=75;FS=6.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,50:75:99:1918,0,696 +chr6 48365061 . A G 333.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=33.39;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:362,0,14 +chr6 49001416 . G T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.068;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:486,0,415 +chr6 49001826 . C T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.629;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:843,0,777 +chr6 49036307 . C T 8304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.261;ClippingRankSum=0.790;DP=439;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=18.92;ReadPosRankSum=3.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,241:439:99:8333,0,7428 +chr6 49041847 . A G 1576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.680;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1605,0,1090 +chr6 49042625 . CT C 639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.686;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=6.33;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:87:99:677,0,1978 +chr6 49042636 . T A 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.237;DP=109;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1184,0,2026 +chr6 49042918 . G A 3005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.035;DP=223;FS=12.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,84:223:99:3034,0,4935 +chr6 49043301 . G C 3967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.431;DP=179;FS=4.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,100:179:99:3996,0,2869 +chr6 49043358 . T C 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=31.81;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:55:892,0,55 +chr6 49043716 . GGGTACGTTTGCTTCTACTGCGTTTGGTGAAGCATTAAAAGGGCTGCAGAACATCTAAATCTTCATTTTGCTGTTTTACA G 15869.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=1.517;DP=364;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=34.83;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,360:364:99:15907,1305,0 +chr6 49047001 . G C 7368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.779;DP=316;FS=23.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.203;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,206:316:99:7397,0,13069 +chr6 49047124 . G A 20859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.059;DP=261;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,110:261:99:20888,0,2954 +chr6 49047899 . TA T 1496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1534,124,0 +chr6 49048081 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr6 49048204 . T C 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=1.379;DP=41;FS=15.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:672,0,844 +chr6 49048739 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=2.976;DP=20;FS=5.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:79:645,0,79 +chr6 49049295 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.153;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:502,0,537 +chr6 49049637 . T A 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:658,45,0 +chr6 49049820 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:56:249,0,56 +chr6 49050117 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=1.101;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:682,0,1431 +chr6 49055770 . TCTATAAACACACGAGTGAGGATCAGTTAACTTCATAGTTATGCTCAATGAACCGAGAAATACAATGTGTTAAATAC T 942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.653;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=30.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:99:980,0,598 +chr6 49056701 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=-0.931;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:719,0,1062 +chr6 49261459 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:89:387,0,89 +chr6 49308829 . T C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.990;DP=36;FS=10.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=21.94;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:818,0,414 +chr6 49309322 . T G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.158;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:426,0,235 +chr6 49310262 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.68;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:295,0,50 +chr6 49310938 . C A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 +chr6 49311151 . G A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:239,18,0 +chr6 49311762 . C T 204.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:233,0,21 +chr6 49313343 . A T 907.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:936,63,0 +chr6 49313352 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,303 +chr6 49313902 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:349,0,305 +chr6 49317452 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-1.625;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:307,0,216 +chr6 49331758 . C A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.128;DP=40;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:461,0,882 +chr6 49333078 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.794;DP=15;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:80:477,0,80 +chr6 49333114 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.67;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:310,0,172 +chr6 49333167 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:301,0,825 +chr6 49333175 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:301,0,825 +chr6 49455183 . A G 2585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=1.392;DP=417;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,110:417:99:2614,0,12094 +chr6 49457923 . A G 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.853;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:480,0,568 +chr6 49466890 . G A 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:471,33,0 +chr6 49468882 . A G 5508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.525;DP=378;FS=21.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,160:378:99:5537,0,7003 +chr6 49469081 . G T 6212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.045;DP=426;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,181:425:99:6241,0,8122 +chr6 49469123 . C T 6138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=-5.372;DP=442;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,181:442:99:6167,0,8389 +chr6 49473492 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-1.087;DP=39;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:416,0,948 +chr6 49473554 . C A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-2.323;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:585,0,576 +chr6 49473697 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.640;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:471,0,1511 +chr6 49473710 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=-0.234;DP=50;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:250,0,1441 +chr6 49473919 . G A 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.956;DP=59;FS=10.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:810,0,1280 +chr6 49474598 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:390,0,504 +chr6 49475237 . C A 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.209;DP=136;FS=12.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,41:136:99:1077,0,3710 +chr6 49475337 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=1.115;DP=91;FS=9.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:263,0,6213 +chr6 49475616 . T C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-0.769;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:741,0,909 +chr6 49475730 . G A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.868;DP=117;FS=3.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1743,0,2170 +chr6 49484437 . G A 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.133;ClippingRankSum=-1.540;DP=86;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.008;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,59:85:99:1976,0,700 +chr6 49486998 . T G 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-0.935;DP=106;FS=6.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.654;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1858,0,1527 +chr6 49506359 . A C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=2.659;DP=35;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=21.45;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:779,0,418 +chr6 49529115 . G C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr6 49529268 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr6 49530134 . G C 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:397,27,0 +chr6 49530144 . G A 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:397,27,0 +chr6 49588448 . C G 2124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=1.368;DP=179;FS=10.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,64:179:99:2153,0,3974 +chr6 49588553 . A T 1814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.518;ClippingRankSum=-1.001;DP=133;FS=3.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:1843,0,5187 +chr6 49588554 . C A 1814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-1.598;DP=137;FS=4.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,50:137:99:1843,0,5249 +chr6 49589177 . G A 11901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:11930,825,0 +chr6 49589392 . C T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-1.745;DP=58;FS=9.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,36:57:99:1248,0,720 +chr6 49589597 . G GT 2435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.377;DP=186;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,112:183:99:2494,0,1643 +chr6 49589925 . C T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.761;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,34:140:99:779,0,10687 +chr6 49602728 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:508,0,237 +chr6 49604498 . G A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.198;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:764,0,346 +chr6 49607077 . T G 1759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1788,129,0 +chr6 49607455 . A G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.575;DP=44;FS=9.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:780,0,639 +chr6 49674735 . G A 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.472;DP=56;FS=7.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1041,0,1572 +chr6 49677800 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:232,0,61 +chr6 49678074 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.408;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,183 +chr6 49688906 . T C 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.423;DP=48;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:882,0,863 +chr6 49688954 . T A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=1.345;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:780,0,620 +chr6 49689900 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 +chr6 49690253 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=34.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:54:394,0,54 +chr6 49690748 . G A 2054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=-0.306;DP=63;FS=6.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.108;QD=32.62;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,49:63:99:2083,0,624 +chr6 49691282 . A T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-2.185;DP=38;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:448,0,928 +chr6 49691398 . C T 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.542;DP=54;FS=5.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:803,0,1103 +chr6 49691613 . C G 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.043;DP=55;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:1145,0,789 +chr6 49692154 . CG C 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.977;DP=33;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:369,0,380 +chr6 49696025 . T C 9328.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:9357,700,0 +chr6 49701353 . G T 3823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=1.571;DP=288;FS=20.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,114:288:99:3852,0,5882 +chr6 49712341 . A G 2471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.128;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=28.41;ReadPosRankSum=3.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,63:87:99:2500,0,614 +chr6 49730477 . C T 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=-3.494;DP=153;FS=15.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=6.19;ReadPosRankSum=2.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,40:153:99:975,0,4194 +chr6 49732698 . A AT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.813;DP=74;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:265,0,1400 +chr6 49743670 . TCTAGAAATGAAAGACATTTTACAAAGAATTAAGTGCTTTGAGAGCTGTTTCATTAAGCAGTACATGCAGTAGAGTGTATTTAAAACATAC T 526.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.798;DP=99;FS=2.088;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,92:96:99:564,198,0 +chr6 49748256 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,101 +chr6 49751627 . G A 1807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=-0.021;DP=88;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,54:88:99:1836,0,1290 +chr6 49762394 . AG A,AGG 785.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.229;DP=56;FS=1.951;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,22,21:49:99:891,470,706,427,0,729 +chr6 49763472 . C A 1913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-0.878;DP=104;FS=4.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=18.40;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1942,0,1837 +chr6 49813628 . C T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.515;DP=76;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,46:76:99:1505,0,1014 +chr6 49841042 . A T 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:510,39,0 +chr6 49957728 . C CT 3188.01 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-6.334;DP=646;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:452,168:620:99:3225,0,11170 +chr6 50010570 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-1.196;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:385,0,990 +chr6 50340716 . C A 2708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=4.654;DP=412;FS=11.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,114:412:99:2737,0,11151 +chr6 50351924 . G T 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 +chr6 50353597 . G A 4214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;ClippingRankSum=0.420;DP=370;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,139:370:99:4243,0,7645 +chr6 50359803 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,162 +chr6 50364872 . G C 2179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.227;DP=138;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:2208,0,2492 +chr6 50404185 . G T 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=1.006;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:1311,0,1730 +chr6 50404395 . T C 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.070;DP=83;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1150,0,1661 +chr6 50404422 . C T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.809;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:948,0,1693 +chr6 50405135 . A C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.401;DP=95;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,25:95:99:568,0,2583 +chr6 50405226 . G A 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.198;DP=115;FS=0.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:1576,0,2295 +chr6 50636649 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-0.984;DP=28;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:259,0,729 +chr6 50683324 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-1.379;DP=63;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:915,0,1214 +chr6 50684140 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=2.085;DP=49;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:676,0,855 +chr6 50686538 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-1.013;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:394,0,460 +chr6 50687826 . A G 424.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.869;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=32.65;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8:452,8,0 +chr6 50687880 . G T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=1.692;DP=47;FS=5.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:307,0,1173 +chr6 50702727 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.165;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:337,0,294 +chr6 50958618 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:93:239,0,93 +chr6 51481839 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.266;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:483,0,816 +chr6 51499396 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=1.467;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:425,0,168 +chr6 51500023 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.331;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:282,0,501 +chr6 51500068 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.471;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.177;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:282,0,206 +chr6 51502883 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=1.230;DP=43;FS=10.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:591,0,1301 +chr6 51502892 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.684;DP=52;FS=4.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:271,0,2201 +chr6 51513727 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=-1.340;DP=64;FS=4.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:258,0,1948 +chr6 51518921 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-1.059;DP=50;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:403,0,1337 +chr6 51521798 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.623;DP=43;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:618,0,790 +chr6 51528674 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-1.131;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:276,0,1386 +chr6 51529807 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-0.542;DP=53;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:272,0,1605 +chr6 51530530 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.279;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=6.43;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:414,0,1682 +chr6 51530916 . T A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-2.595;DP=51;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=13.29;ReadPosRankSum=2.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:706,0,1071 +chr6 51534624 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.551;DP=42;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:329,0,1102 +chr6 51543722 . G A 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.373;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=25.45;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:919,0,332 +chr6 51545454 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.481;DP=41;FS=7.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:490,0,950 +chr6 51546068 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=-0.071;DP=58;FS=8.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:317,0,2419 +chr6 51581874 . G T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.238;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=13.01;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:731,0,1022 +chr6 51720649 . GCA G 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.863;DP=103;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:330,0,3080 +chr6 51721159 . C T 5775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=1.380;DP=283;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=20.41;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,172:283:99:5804,0,3949 +chr6 51759653 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.164;DP=44;FS=6.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:401,0,1189 +chr6 52022958 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=2.013;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:235,0,1246 +chr6 52022967 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=2.667;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:235,0,1246 +chr6 52175272 . A G 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.226;ClippingRankSum=-0.500;DP=125;FS=14.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=4.57;ReadPosRankSum=-2.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,29:125:99:600,0,3937 +chr6 52175963 . C CA 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=-0.215;DP=264;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,52:220:99:390,0,4030 +chr6 52292957 . G T 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.349;DP=238;FS=8.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,46:237:99:790,0,7442 +chr6 52293026 . T G 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-1.494;DP=283;FS=1.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,58:283:99:1028,0,8717 +chr6 52426593 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:352,27,0 +chr6 52472120 . GA G 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.439;DP=69;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:599,0,1358 +chr6 52615946 . C T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-1.960;DP=174;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,39:174:99:842,0,5326 +chr6 52742651 . T A 8141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-4.727;DP=456;FS=6.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,245:456:99:8170,0,9339 +chr6 52773823 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:381,0,257 +chr6 53177730 . A C 6645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:6674,497,0 +chr6 53177798 . T C 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:500,39,0 +chr6 53205561 . G GT 3602.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:3640,342,0 +chr6 53205642 . A C 6426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.606;DP=292;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=22.01;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,234:264:99:6455,284,0 +chr6 53205778 . T A 19672.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:19701,1362,0 +chr6 53205802 . C CG 19663.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:19701,1362,0 +chr6 53205844 . G C 3461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3490,261,0 +chr6 53205902 . G GA 4861.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.132;DP=191;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=25.45;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,168:170:99:4899,502,0 +chr6 53205924 . A G 10516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:10545,757,0 +chr6 53206065 . C CT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.926;DP=289;FS=3.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,47:263:99:276,0,6027 +chr6 53206227 . G GT 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DP=275;FS=8.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,58:257:99:513,0,5287 +chr6 53206367 . GA G 9767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=294;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,283:283:99:9805,857,0 +chr6 53206568 . C CT 1223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1423,133,0 +chr6 53226669 . C T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 +chr6 53294294 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:277,0,310 +chr6 53435368 . C CT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-0.514;DP=265;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,49:245:99:344,0,4239 +chr6 53435632 . C CT 811.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-2.596;DP=280;FS=13.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,70:243:99:849,0,4133 +chr6 53435952 . C CA 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.206;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:379,0,404 +chr6 53436223 . G GA 935.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=1.717;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=6.93;ReadPosRankSum=-2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1197,0,1644 +chr6 53482778 . G A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +chr6 53482801 . G A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 +chr6 53940011 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:360,0,530 +chr6 53942402 . A C 1785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:99:1814,130,0 +chr6 53942503 . T C 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.216;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:985,0,990 +chr6 53942560 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:230,0,133 +chr6 53942979 . T A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.690;DP=26;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=23.30;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:634,0,225 +chr6 53943153 . T C 2230.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.635;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=33.80;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,36:42:49:2259,49,0 +chr6 53943373 . T A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.474;DP=25;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=27.06;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:35:914,0,35 +chr6 53943745 . A T 1073.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:79:1102,79,0 +chr6 53953691 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:294,0,218 +chr6 54045265 . T G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr6 54045294 . G T 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 +chr6 54045466 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.322;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=29.67;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:414,0,136 +chr6 54045469 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.537;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:414,0,136 +chr6 54048344 . AT A 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr6 54048362 . T C 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 +chr6 54048725 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:92:335,0,92 +chr6 54062323 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.845;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=24.16;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:439,0,166 +chr6 54072537 . G A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.656;DP=56;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:939,0,927 +chr6 54106729 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.782;DP=64;FS=5.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:744,0,1440 +chr6 54107370 . G C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.594;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,569 +chr6 54120001 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.560;DP=38;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:464,0,834 +chr6 54121352 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:346,0,129 +chr6 54122928 . C T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.386;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:249,0,240 +chr6 54123636 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.867;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:274,0,418 +chr6 54123921 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.487;DP=30;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:392,0,1682 +chr6 54132636 . A G 3389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=1.843;DP=463;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.423;QD=7.32;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,135:462:99:3418,0,12429 +chr6 54203859 . A T 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=-0.402;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,36:98:99:1193,0,2175 +chr6 54219149 . C T 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.514;DP=130;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,48:130:99:1565,0,2876 +chr6 54279680 . T A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.289;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:617,0,285 +chr6 54279872 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-1.080;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:241,0,1071 +chr6 54280006 . T C 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.793;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=14.87;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:876,0,1110 +chr6 54281611 . CTT C 834.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:62:872,62,0 +chr6 54630992 . A C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.136;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:832,0,2572 +chr6 54631014 . G T 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-0.460;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:892,0,2407 +chr6 54631015 . T A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-0.743;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:892,0,2407 +chr6 54653477 . TGTGAGTAACCTGAAGTCTTGTAACGAGGGAAATTTTGCAATGTTTACGTTATTATTCATGACGTCGTCTGTATGTTATTATTACCAG T 956.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=1.375;DP=31;FS=3.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=30.86;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,29:31:99:1198,0,543 +chr6 54992694 . CCATCTGATTCTCAATATTGTAGTTCAGACTT C 295.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:333,25,0 +chr6 54993096 . TCCA T 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,0:9:99:292,0,2163 +chr6 54993100 . TCAAATTCTCAATATTGTAGTCCAGACTCCATTAGATTCTCAATATTGTAGTCCAGACTCCATCAGATTCTCAATATTGTAGTCCAGACTC T 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=3.665;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=12.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:292,0,1990 +chr6 55005510 . GCCGGCA G 1076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1114,122,0 +chr6 55182603 . GA G 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.099;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:91:337,0,91 +chr6 55268217 . TCTGCATAACCACACAAAGCAATGGAATGAACTACAGTCAGAAATTTCCACCAAATAGAAAAGGATGTATATAAAGGCCTTAC T 8067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.490;DP=381;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,236:372:99:8105,0,6866 +chr6 55268218 . CTGCATAACCACACAAAGCAATGGAATGAACTACAGTCAGAA C 4272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.257;DP=381;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,129:370:99:4310,0,10518 +chr6 55268262 . TTCCACCAAATAGAAAAGGATGTATATAAAGGCCTTACCATC T 4645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.138;DP=387;FS=4.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=12.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,137:378:99:4683,0,10465 +chr6 55273636 . GCCTGAGGAGACAAGCGGTTTAAGAAGATGATCAGGATTTGATATTTCAGGCTTATTGAATCCTGTATTAAAACAAACAGACATTGTGCTCA G 5035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=4.109;DP=117;FS=1.603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=29.84;ReadPosRankSum=-1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,111:117:99:5073,398,0 +chr6 55298068 . GACCTACAGAGGAAGGAAAGAGAAGAAAATGACCTGTAGGAATGTGACTGAATATGTACGAGAAAGCGTTAGTAAAACAGTTCAGCTT G 5537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=2.411;DP=128;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=29.22;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:5575,419,0 +chr6 55694892 . AGTGAGTTTACACTCCAACACAAATAAACCACACAGTTTTATACAAAGACATGCATTAAAAAGCTTGTTTCTCTTGCTATTTTAG A 5015.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.955;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:5053,432,0 +chr6 55695067 . CGGTAAAATGACCTAATTATTAGTTCAAACGGCTTCTCTGATAAACAAACTCAAAGCAGATAAGCCTTATCTCTAATGCAGCTGTGTTTACCAGAGATGCAAAGATACGAGGAGTGTTTTGTTCTTCTCTGTTTCA C 6035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=1.823;DP=146;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=36.21;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,139:146:99:6073,539,0 +chr6 56148979 . G C 1648.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=33.39;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:99:1677,117,0 +chr6 56148981 . G T 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.39;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:99:1682,117,0 +chr6 56149044 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.668;DP=23;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:83:494,0,83 +chr6 56149100 . T A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:43:454,0,43 +chr6 56149167 . A C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=1.588;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:48:931,0,48 +chr6 56149234 . C T 3049.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:3078,220,0 +chr6 56149283 . G A 2628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.531;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=33.70;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:2657,227,0 +chr6 56149610 . G T 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 +chr6 56149793 . T TA 1119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1157,119,0 +chr6 56150944 . GAA G 733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=1.103;DP=64;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:898,0,953 +chr6 56815169 . C A 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr6 57454645 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,328 +chr6 57454666 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=22.25;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:451,0,233 +chr6 57570262 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.119;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:319,0,336 +chr6 57572612 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:432,0,278 +chr6 57572759 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:345,0,294 +chr6 57581191 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=1.263;DP=73;FS=19.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1324,0,1274 +chr6 57581233 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-2.923;DP=48;FS=9.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:312,0,1326 +chr6 57581713 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=2.276;DP=52;FS=4.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:285,0,1481 +chr6 57582226 . A C 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=2.725;DP=63;FS=6.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,39:63:99:1333,0,798 +chr6 57582466 . TAC T 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.259;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:400,0,781 +chr6 57582641 . G A 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.767;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:850,0,1031 +chr6 57583460 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.492;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:249,0,996 +chr6 57583513 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.630;DP=33;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:477,0,1608 +chr6 57583874 . G T 2254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=1.227;DP=124;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:2283,0,1949 +chr6 57584269 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-0.246;DP=26;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:336,0,354 +chr6 57590533 . C A 2106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.138;DP=112;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:2135,0,1678 +chr6 57605001 . G A 3029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-0.089;DP=162;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=18.70;ReadPosRankSum=3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,97:162:99:3058,0,2130 +chr6 57670601 . C T 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=1.148;DP=53;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:954,0,1924 +chr6 57670634 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=1.906;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=19.01;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1055,0,848 +chr6 57683543 . T A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.213;DP=26;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=27.53;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:97:744,0,97 +chr6 57738322 . G C 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=2.016;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:557,0,533 +chr6 57738368 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=2.822;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:448,0,383 +chr6 57738389 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=2.654;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=17.20;ReadPosRankSum=2.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:269,0,265 +chr6 57740599 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=2.959;DP=29;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=9.03;ReadPosRankSum=-2.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:290,0,1580 +chr6 57740684 . A G 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.550;DP=55;FS=2.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1151,0,747 +chr6 57740751 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=-2.760;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:350,0,452 +chr6 57740972 . C A 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-1.023;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1112,0,435 +chr6 57795157 . T A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.088;DP=24;FS=11.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=21.82;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:552,0,824 +chr6 57796880 . A G 885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:914,66,0 +chr6 57805105 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.350;DP=62;FS=2.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,42:61:99:1298,0,465 +chr6 58258000 . C T 1799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1828,129,0 +chr6 58822195 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.683;DP=49;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:297,0,2995 +chr6 58822196 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.693;DP=50;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:297,0,2995 +chr6 58858825 . G A 1481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.428;DP=124;FS=4.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:1510,0,2545 +chr6 58864707 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.718;DP=140;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,43:139:99:1024,0,3484 +chr6 59094223 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-3.544;DP=40;FS=12.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.09;ReadPosRankSum=3.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:392,0,2057 +chr6 59094226 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-1.749;DP=43;FS=19.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:400,0,2057 +chr6 59148537 . G A 2994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=1.451;DP=135;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=22.18;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,89:135:99:3023,0,1460 +chr6 59148573 . C T 2494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.962;DP=120;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,73:120:99:2523,0,1621 +chr6 59148806 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=2.393;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:552,0,388 +chr6 59148910 . A C 2226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.598;DP=77;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,49:77:99:2255,0,1554 +chr6 59148983 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.330;DP=67;FS=3.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:592,0,1822 +chr6 59149221 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.105;ClippingRankSum=0.830;DP=50;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=6.36;ReadPosRankSum=-4.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:346,0,2988 +chr6 59149223 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.916;ClippingRankSum=0.305;DP=47;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.76;ReadPosRankSum=-3.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:346,0,2988 +chr6 59149244 . T A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=4.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=18.18;ReadPosRankSum=-5.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:828,0,1804 +chr6 59149248 . G A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.602;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=17.77;ReadPosRankSum=-4.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:828,0,1816 +chr6 59149349 . T C 3056.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.464;DP=71;FS=3.741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:3085,218,0 +chr6 59149388 . C T 4097.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:4126,287,0 +chr6 59150040 . T TA 2169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.383;DP=77;FS=4.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=28.18;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,65:77:99:2207,0,116 +chr6 59150105 . G A 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.947;DP=107;FS=25.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=16.08;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:1749,0,4331 +chr6 59150142 . G T 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.934;DP=85;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:1282,0,1668 +chr6 59150177 . A AGT 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=3.396;DP=87;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=5.40;ReadPosRankSum=-3.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:507,0,1779 +chr6 59219925 . AT A 248.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:286,24,0 +chr6 59354172 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,388 +chr6 59354363 . AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:59:489,59,0 +chr6 59354423 . T C 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:59:489,59,0 +chr6 59354625 . G T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:395,27,0 +chr6 59354627 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr6 59355027 . C T 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-1.146;DP=66;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,42:65:99:1400,0,786 +chr6 59375098 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:285,0,173 +chr6 59375484 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:309,0,102 +chr6 59375909 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:318,0,137 +chr6 59376120 . A T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.330;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:519,0,602 +chr6 59376438 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.983;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:447,0,195 +chr6 59376712 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:293,0,103 +chr6 59382557 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:303,0,50 +chr6 59539068 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.98;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:51:303,0,51 +chr6 59648335 . T C 3461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-2.847;DP=161;FS=0.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=21.50;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,104:161:99:3490,0,1659 +chr6 59658966 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=2.826;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:341,0,289 +chr6 59737182 . G C 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.068;DP=55;FS=8.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=31.94;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1785,0,343 +chr6 59737287 . T C 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.993;DP=33;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:695,0,415 +chr7 101313 . C G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.986;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:318,0,379 +chr7 605659 . C A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr7 636002 . C CTA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-2.228;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:240,0,121 +chr7 644640 . C CT 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.17;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:239,0,260 +chr7 645887 . AT A 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=12.61;ReadPosRankSum=2.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:239,0,159 +chr7 645995 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:397,0,164 +chr7 646143 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-1.733;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:312,0,511 +chr7 646144 . GT G 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.324;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:312,0,511 +chr7 661959 . A C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr7 700429 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=1.533;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:281,0,1629 +chr7 718578 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=1.273;DP=20;FS=8.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,469 +chr7 729370 . A G 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.708;DP=260;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,61:260:99:1264,0,12391 +chr7 739421 . A G 7844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.497;DP=220;FS=7.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,31:219:99:7873,0,9601 +chr7 739823 . G GT 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.625;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:272,0,2515 +chr7 746873 . T C 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 +chr7 859489 . CCCTGCAGAGCACAGATGAAGTTGAGTGTAAAGTTTTCTGCTCACACTGGTGTAATGGTCACAGTGCTGTGCTGATGACTTA C 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:257,0,805 +chr7 1023148 . A G 208.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.84;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:237,0,15 +chr7 1023395 . T TTG 226.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:264,17,0 +chr7 1506170 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:360,0,355 +chr7 1525072 . G C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.322;DP=25;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:353,0,481 +chr7 1525728 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.038;DP=44;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:366,0,1197 +chr7 1568756 . G A 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 +chr7 1602061 . C CT 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-1.055;DP=45;FS=12.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:319,0,548 +chr7 1648585 . G A 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.349;DP=111;FS=1.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1654,0,1680 +chr7 1654725 . T A 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=1.046;DP=38;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:59:757,0,59 +chr7 1654777 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-0.381;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:653,0,178 +chr7 1661959 . A G 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:742,57,0 +chr7 1670202 . A G 1234.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1263,90,0 +chr7 1670252 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.738;DP=42;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:306,0,1201 +chr7 1671514 . A T 1409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1438,102,0 +chr7 1684190 . GCGCGTA G 289.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:26:327,26,0 +chr7 1704759 . GCA G 228.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr7 1708434 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-2.057;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:231,0,1584 +chr7 1711022 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.058;DP=32;FS=3.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:420,0,724 +chr7 1725348 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.789;DP=160;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,25:160:99:241,0,5066 +chr7 1725426 . C T 8784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-1.618;DP=290;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,233:290:99:8813,0,919 +chr7 1726465 . A C 8174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.205;DP=271;FS=4.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=30.17;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,220:271:99:8203,0,697 +chr7 1733109 . G A 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.823;DP=391;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=1.53;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,59:385:99:635,0,12788 +chr7 1733136 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.591;DP=401;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,63:401:99:682,0,13092 +chr7 1747368 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.159;DP=272;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,47:272:99:645,0,8611 +chr7 2637184 . T TTGA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:268,0,114 +chr7 2651151 . GATGTAGTTGTGTTTGATGATGTAGTTGTGTTTGATGATGTAGTTGTGTTTGATGATGTAGTTGTGTTTGATA G 6706.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=5.022;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,44:56:99:6744,406,0 +chr7 2654406 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,0:84:99:541,0,11457 +chr7 2754156 . TCTGCATAAACAGAGGAGAAAACTATTCAAATGCAGTTCAGAAATATACAGTGATTCTAGGAGCATAACCAGATCTTAC T 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.783;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:99:943,0,378 +chr7 3596019 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr7 3596117 . C T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr7 4104429 . A AT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.634;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:256,0,361 +chr7 4104742 . C G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.526;DP=120;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=3.79;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:483,0,4637 +chr7 4106037 . T G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.389;DP=43;FS=6.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:510,0,1532 +chr7 4106218 . C T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:469,33,0 +chr7 4106230 . A G 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:514,36,0 +chr7 4107313 . TC T 823.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.436;DP=44;FS=9.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=18.72;ReadPosRankSum=3.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:861,0,269 +chr7 4110338 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=-1.059;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:677,0,2471 +chr7 4110520 . C T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.935;DP=137;FS=4.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:878,0,3522 +chr7 4209797 . T TTC 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.857;DP=30;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:278,0,651 +chr7 4262342 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-1.358;DP=140;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,26:139:99:460,0,4515 +chr7 4280804 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=-0.582;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:558,0,5145 +chr7 4432503 . G T 223.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:252,21,0 +chr7 4442768 . A T 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 +chr7 4442782 . C T 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:669,48,0 +chr7 4651241 . T C 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:715,48,0 +chr7 5955903 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=38.00;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:65:246,0,65 +chr7 5955911 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:65:246,0,65 +chr7 6225894 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-2.840;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=16.41;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:258,0,255 +chr7 6245019 . G A 1603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.550;DP=58;FS=8.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.060;QD=27.65;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,43:58:99:1632,0,390 +chr7 6249271 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=2.011;DP=17;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:231,0,342 +chr7 6360488 . CAGAATCAAGTATTCCAGAGAGCAGTTTAATGATGGTAAAAAAAACATACCTTGAAATGTCATAACTGACCAATA C 975.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.491;ClippingRankSum=-3.345;DP=58;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:1013,0,6018 +chr7 6361024 . AACATACCTTGGAATGTTGCGACTGACCAATCAGAATCAAGTACTCCAAGGAGCCGTGTAATAATGGCGAATT A 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=2.736;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:468,0,7708 +chr7 6363224 . G C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.849;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=21.21;ReadPosRankSum=-2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:410,0,116 +chr7 6364747 . A AC 297.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.159;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=21.23;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:1:332,1,0 +chr7 6536948 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:309,0,215 +chr7 6664421 . ACTGAAAAAAAATGACAGTAATAGTAACACAATTTTTCATGACTACATGTAATATTAATAAGAATTTCCTCAC A 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.071;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:391,0,1244 +chr7 6664558 . C T 284.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:22:313,22,0 +chr7 7029610 . T A 340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:369,30,0 +chr7 7463153 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-2.079;DP=146;FS=3.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,23:146:99:246,0,4687 +chr7 7472064 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.641;DP=53;FS=4.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:338,0,1418 +chr7 7489623 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-2.302;DP=51;FS=10.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:238,0,3276 +chr7 7502384 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.300;DP=64;FS=4.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:271,0,1780 +chr7 7564759 . ATGCAGAG A 1107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1145,109,0 +chr7 7574271 . C T 1672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.027;DP=313;FS=11.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,77:313:99:1701,0,8907 +chr7 7578260 . C G 2787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=1.740;DP=373;FS=0.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,111:373:99:2816,0,10262 +chr7 7712090 . AT A 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.226;DP=85;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=13.19;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,48:81:99:1158,0,814 +chr7 7712132 . A AT 1547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.382;DP=84;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=18.43;ReadPosRankSum=-2.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:1585,0,1906 +chr7 7735996 . C T 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.003;DP=120;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=16.39;ReadPosRankSum=2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1995,0,1695 +chr7 7742012 . A C 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.510;DP=84;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:1473,0,1502 +chr7 7750534 . C A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.585;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=25.74;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:749,0,165 +chr7 7750555 . A C 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.817;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:523,0,159 +chr7 7752845 . A AT 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.793;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:286,0,105 +chr7 7753971 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.037;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:273,0,141 +chr7 7852963 . AT A 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-3.387;DP=93;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:280,0,1739 +chr7 7853700 . T TA 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.975;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:447,0,561 +chr7 7854846 . A T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-1.607;DP=85;FS=6.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:477,0,2438 +chr7 7855022 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.234;DP=98;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:429,0,2979 +chr7 7916010 . G A 3951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.363;DP=469;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,151:468:99:3980,0,11802 +chr7 7936394 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:406,0,244 +chr7 7936738 . G A 752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:781,57,0 +chr7 7936808 . T C 448.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.736;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:474,0,0 +chr7 7936832 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.196;DP=24;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:395,0,390 +chr7 7937072 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.722;DP=56;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=5.01;ReadPosRankSum=-2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:309,0,357 +chr7 7937243 . T C 1144.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-1.409;DP=58;FS=2.638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.098;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:12:1172,12,0 +chr7 7939549 . C A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.379;DP=47;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:979,0,738 +chr7 7940153 . T C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.867;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:855,57,0 +chr7 7940156 . T C 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.867;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:855,57,0 +chr7 7940222 . A G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.536;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:504,0,109 +chr7 7940300 . GTT G,GT 1566.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=-2.821;DP=153;FS=11.529;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=10.24;ReadPosRankSum=3.011 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:10,26,57:93:99:2065,1287,1629,391,0,404 +chr7 7940514 . C A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.659;DP=45;FS=11.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:1142,0,1222 +chr7 8305797 . T TC 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=1.475;DP=98;FS=3.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=2.54;ReadPosRankSum=-2.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,16:98:99:286,0,6668 +chr7 8419363 . A C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.839;DP=83;FS=3.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:556,0,2176 +chr7 8425107 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-1.514;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:338,0,2758 +chr7 8439806 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.228;DP=81;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:472,0,2277 +chr7 8440004 . C G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-0.764;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,18:95:99:285,0,2847 +chr7 8452078 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=3.178;DP=70;FS=3.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:584,0,4040 +chr7 8452084 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=3.967;DP=72;FS=5.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:584,0,4040 +chr7 8452130 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=1.814;DP=76;FS=6.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:239,0,3150 +chr7 8452141 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.478;DP=80;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:321,0,3359 +chr7 8851400 . G A 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:574,45,0 +chr7 9027766 . T C 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 +chr7 9179839 . AT A 2017.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.991;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,3:107:99:2055,0,2693 +chr7 9179912 . C T 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=-0.304;DP=111;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=10.78;ReadPosRankSum=2.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1225,0,5160 +chr7 9180727 . C T 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=-1.237;DP=191;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,61:191:99:1618,0,4936 +chr7 9181213 . G A 2241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=2.313;DP=386;FS=0.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,98:386:99:2270,0,11364 +chr7 9186929 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=1.729;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=20.66;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:524,0,324 +chr7 9187546 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.376;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:414,0,1178 +chr7 9187548 . T A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-0.894;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:414,0,1185 +chr7 9222924 . C T 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=4.156;DP=39;FS=19.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=30.46;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:99:1216,0,189 +chr7 9222956 . T A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=2.950;DP=19;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=27.51;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:551,0,117 +chr7 9264130 . C T 735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:764,51,0 +chr7 9264131 . T G 735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:764,51,0 +chr7 9296376 . A T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=1.194;DP=18;FS=3.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=32.65;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:29:616,0,29 +chr7 9296663 . T C 990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1019,72,0 +chr7 9320976 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-1.093;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:248,0,940 +chr7 9321609 . C T 1507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.754;DP=71;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:1536,0,2878 +chr7 9321618 . G A 1507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-2.407;DP=79;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:1536,0,2878 +chr7 9321828 . A C 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.367;DP=88;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,35:88:99:1432,0,3797 +chr7 9321834 . T A 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=1.031;DP=88;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:1432,0,3809 +chr7 9405830 . C G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=3.442;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=20.38;ReadPosRankSum=-2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:395,0,246 +chr7 9500658 . A C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:88:232,0,88 +chr7 9501751 . C CT 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.180;DP=85;FS=9.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:441,0,1033 +chr7 9501868 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.126;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=2.41;ReadPosRankSum=3.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:264,0,3204 +chr7 9697926 . T A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.460;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=16.49;ReadPosRankSum=-2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:391,0,542 +chr7 10080325 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.255;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:300,0,1698 +chr7 10086021 . G C 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=2.338;DP=236;FS=9.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,57:235:99:1139,0,8003 +chr7 10100818 . C G 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=1.370;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:654,0,607 +chr7 10100851 . AT A 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=-0.938;DP=39;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:377,0,634 +chr7 10100985 . T A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.134;DP=83;FS=4.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=6.46;ReadPosRankSum=2.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:564,0,3603 +chr7 10101062 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.727;DP=79;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:594,0,5902 +chr7 10101071 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=1.376;DP=74;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:590,0,5902 +chr7 10101472 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:294,0,477 +chr7 10101529 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=1.087;DP=35;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:553,0,467 +chr7 10101629 . A G 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=25.77;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:99:929,0,165 +chr7 10101633 . A G 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:929,0,161 +chr7 10106921 . G T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-2.630;DP=64;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:395,0,1714 +chr7 10291365 . G GT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.250;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:248,0,887 +chr7 10665290 . TG T 248.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:286,30,0 +chr7 10680637 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-2.213;DP=39;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:558,0,774 +chr7 10680808 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.581;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:376,0,753 +chr7 11500130 . A G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=1.381;DP=63;FS=7.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:441,0,1610 +chr7 11584540 . T C 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-1.082;DP=110;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:1408,0,2405 +chr7 11618697 . G A 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.245;DP=117;FS=1.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:1563,0,2178 +chr7 11672756 . G A 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.630;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=17.19;ReadPosRankSum=2.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1816,0,1500 +chr7 11692769 . A T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.964;DP=67;FS=4.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=15.24;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1049,0,2983 +chr7 11693497 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.092;DP=64;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:594,0,2280 +chr7 11694057 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=2.720;DP=31;FS=9.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,2308 +chr7 11729572 . A G 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=-0.422;DP=86;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1486,0,1353 +chr7 11729618 . C A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-2.235;DP=104;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1734,0,1805 +chr7 11729942 . C G 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=1.910;DP=70;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=16.84;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1207,0,1098 +chr7 11822296 . A AAC 680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-2.106;DP=138;FS=0.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:718,0,2677 +chr7 11822893 . T C 1990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-0.584;DP=114;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.108;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:2019,0,2098 +chr7 12029115 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-1.347;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,312 +chr7 12196514 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.245;DP=131;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,23:131:99:351,0,4223 +chr7 12196598 . T G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.941;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,35:215:99:441,0,11834 +chr7 12208233 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.997;DP=61;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:308,0,1760 +chr7 12210651 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.588;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,847 +chr7 12212231 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.993;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:334,0,1845 +chr7 12212233 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.022;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:342,0,1845 +chr7 12391386 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.546;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:68:261,0,68 +chr7 12404552 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=24.09;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:245,0,56 +chr7 12405846 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,452 +chr7 12407699 . T C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr7 12409835 . TG T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:324,0,204 +chr7 12409971 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:86:230,0,86 +chr7 12882714 . G A 1545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.305;DP=125;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,46:125:99:1574,0,2856 +chr7 12961514 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=1.791;DP=27;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:267,0,238 +chr7 13665965 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=27.80;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:334,0,410 +chr7 13666525 . A AT 326.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 +chr7 13667655 . A AG 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=27.57;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:892,0,102 +chr7 13670159 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.559;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:389,0,785 +chr7 13670794 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-0.123;DP=56;FS=4.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:286,0,1581 +chr7 13670824 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=1.546;DP=52;FS=7.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:234,0,1430 +chr7 14180913 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.238;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:450,0,216 +chr7 14280791 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:387,0,249 +chr7 14311836 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.884;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:290,0,866 +chr7 14453263 . C G 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.168;DP=57;FS=3.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.754;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:976,0,1453 +chr7 14453494 . C A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=1.445;DP=50;FS=2.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:457,0,1308 +chr7 14453537 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.863;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:310,0,1837 +chr7 14453586 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=1.009;DP=53;FS=10.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:251,0,1631 +chr7 14453623 . A C 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.205;DP=45;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1035,0,496 +chr7 14462060 . A T 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=1.338;DP=52;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,36:52:99:1394,0,442 +chr7 14479049 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 +chr7 14509406 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.757;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:322,0,2225 +chr7 14509415 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.874;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:322,0,2225 +chr7 14535286 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.567;DP=44;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.594;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:278,0,1228 +chr7 14542327 . T C 1774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.702;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=29.98;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1803,128,0 +chr7 14542335 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.716;DP=37;FS=7.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:436,0,937 +chr7 14542463 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.117;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:243,0,1051 +chr7 14869307 . C G 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=-0.185;DP=36;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:851,0,359 +chr7 15080399 . G A 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-0.893;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.376;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:848,0,719 +chr7 15081111 . C G 1916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.055;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=25.76;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1945,0,138 +chr7 15081246 . A G 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=-0.610;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1270,0,369 +chr7 15081668 . G T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.724;DP=22;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=30.58;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:66:701,0,66 +chr7 15081783 . G A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.344;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:561,0,347 +chr7 15081990 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=1.633;DP=24;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=27.99;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:700,0,151 +chr7 15082086 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.802;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:779,0,182 +chr7 15233197 . G A 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-2.402;DP=79;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1446,0,1369 +chr7 15236215 . T G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.009;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=28.88;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:577,0,127 +chr7 15236277 . G T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.076;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=28.45;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:1024,0,254 +chr7 15236324 . C A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.692;DP=33;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=20.57;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:707,0,535 +chr7 15236471 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.888;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:259,0,925 +chr7 15236529 . C A 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.575;DP=81;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:1232,0,1490 +chr7 15236966 . TA T 594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=1.243;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:632,0,141 +chr7 15237084 . CA C 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.272;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:94:407,0,94 +chr7 15238821 . G T 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.337;DP=42;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.666;QD=30.64;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:91:1315,0,91 +chr7 15238838 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.766;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=6.06;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:319,0,1205 +chr7 15238976 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.352;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:303,0,1530 +chr7 15240427 . A T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=1.707;DP=49;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:742,0,932 +chr7 15241415 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:88:376,0,88 +chr7 15243787 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.447;DP=43;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=26.88;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1184,0,299 +chr7 15243976 . G A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.066;DP=41;FS=6.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:820,0,625 +chr7 15243988 . A G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.334;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:848,0,562 +chr7 15245422 . T G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:322,0,310 +chr7 15245474 . A G 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.488;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:641,0,545 +chr7 15245677 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-1.992;DP=21;FS=7.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,674 +chr7 15245678 . T C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.705;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.53;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:568,0,186 +chr7 15246265 . A AT 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=1.473;DP=17;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:357,0,466 +chr7 15246270 . G T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=1.591;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=21.92;ReadPosRankSum=-1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:357,0,466 +chr7 15246969 . G A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.055;DP=46;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:822,0,787 +chr7 15248410 . T A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=1.154;DP=22;FS=22.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:499,0,706 +chr7 15248415 . T G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=1.606;DP=23;FS=21.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:499,0,706 +chr7 15248764 . C G 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.135;DP=43;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:848,0,832 +chr7 15250271 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=2.203;DP=33;FS=13.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:241,0,1399 +chr7 15250335 . T C 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:544,0,629 +chr7 15250423 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.146;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:355,0,497 +chr7 15251778 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.155;DP=434;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:356,75:431:99:867,0,14602 +chr7 15300869 . T G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.715;DP=64;FS=5.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1043,0,1375 +chr7 15300924 . C A 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-0.050;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:890,0,1346 +chr7 15416864 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=1.089;DP=63;FS=8.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:332,0,1812 +chr7 15692337 . C G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr7 15929625 . A C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=24.05;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:365,0,84 +chr7 15936264 . T G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:328,0,138 +chr7 16372727 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:294,0,630 +chr7 16423544 . G A 207.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:236,0,18 +chr7 16424908 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.549;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,477 +chr7 16588688 . C CA 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.431;DP=83;FS=2.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:504,0,1390 +chr7 16647403 . C A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.293;DP=90;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:621,0,2181 +chr7 16665004 . G GA 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.915;DP=43;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:538,0,154 +chr7 16955190 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-0.359;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:304,0,852 +chr7 17357079 . TCTAATGGGAACAAGAACAATTAGTCAAAGGTCTGTCTCATGATCTCAGCAAGATGCATACATATGTGTGGTGTTCTTCCTAC T 5287.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.062;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=32.62;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:5325,481,0 +chr7 17364621 . TCTGTTAAACAAACAAATATACAAAGTCAACACAAGCTTTAAAATAAACATTCAAGTCTGAATAGGATTATGAACAGGTCAGATTTCATGTGAAACATGCTTTAATGCTTAC T 601.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=2.387;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=7.52;ReadPosRankSum=-2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:639,213,0 +chr7 17733315 . G T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.885;DP=68;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:544,0,1764 +chr7 17781803 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.292;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:586,0,2079 +chr7 17784620 . CGGTACACACATTAGCATCCATTAGACTGAACAGAGTGTTCCCGGCATTCCTAATGCGAGTCTTGTGCTTCTCTGAACA C 3294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=3.350;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=29.46;ReadPosRankSum=-3.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,85:91:99:3332,0,491 +chr7 17803054 . G A 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.605;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,42:156:99:1032,0,4382 +chr7 18013534 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.577;DP=38;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:551,0,756 +chr7 18016524 . C T 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:632,45,0 +chr7 18022853 . T TG 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=1.614;DP=20;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:62:340,0,62 +chr7 18022955 . T A 1335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1364,96,0 +chr7 18023023 . T A 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:709,54,0 +chr7 18023220 . T C 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 +chr7 18024017 . T C 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 +chr7 18025141 . G GT 680.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:718,63,0 +chr7 18025978 . AAC A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=1.351;DP=29;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:447,0,625 +chr7 18026472 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=-1.323;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:82:541,0,82 +chr7 18316705 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr7 18316708 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr7 18678912 . A G 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr7 18679773 . G A 612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:641,45,0 +chr7 18680344 . C T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr7 18680438 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,180 +chr7 18680533 . A T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.67;ReadPosRankSum=-1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,170 +chr7 18680727 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:234,0,338 +chr7 18680863 . C G 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:351,24,0 +chr7 18680984 . CT C 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.276;DP=25;FS=7.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:380,0,163 +chr7 18681394 . A G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr7 18682039 . A T 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 +chr7 18687802 . A G 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:857,60,0 +chr7 18720502 . A T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr7 18732967 . A G 480.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=34.34;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:506,0,0 +chr7 18735739 . A G 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr7 18735757 . T C 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 +chr7 18735847 . G C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.092;DP=31;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:497,0,580 +chr7 18737345 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.066;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:341,0,316 +chr7 18741322 . A T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-1.006;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=16.85;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:601,0,553 +chr7 18741406 . A G 1145.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1174,87,0 +chr7 18743092 . T C 431.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:458,0,3 +chr7 18747268 . T C 207.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:236,0,17 +chr7 18751774 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 +chr7 18751858 . G T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr7 18753096 . GA G 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.036;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:37:510,0,37 +chr7 18754336 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 +chr7 18817393 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-1.216;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=15.39;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:336,0,375 +chr7 18817426 . A T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=1.148;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:327,0,330 +chr7 18900414 . T C 396.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=33.03;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:424,0,8 +chr7 18902889 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,110 +chr7 18941481 . T C 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.066;DP=32;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=27.40;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:905,0,197 +chr7 18943724 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=1.523;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:305,0,281 +chr7 18951421 . A G 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:532,0,375 +chr7 19001380 . C G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.228;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:469,0,326 +chr7 19001681 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,294 +chr7 19001783 . C A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:392,0,160 +chr7 19003754 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=26.40;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:58:345,0,58 +chr7 19003765 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=26.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:242,0,67 +chr7 19009381 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:351,0,52 +chr7 19035274 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-1.660;DP=26;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:342,0,559 +chr7 19036010 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,169 +chr7 19040499 . G A 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 +chr7 19189362 . A G 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=1.567;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:746,0,850 +chr7 19189534 . GT G 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.740;DP=178;FS=7.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,38:175:99:434,0,8352 +chr7 19189772 . GC G 2014.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:2052,169,0 +chr7 19190474 . G GT 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.190;DP=89;FS=7.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:241,0,1590 +chr7 19216159 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.264;DP=28;FS=10.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:342,0,1069 +chr7 19216181 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.596;DP=24;FS=16.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:325,0,557 +chr7 19277111 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.635;DP=40;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:293,0,1039 +chr7 19317342 . CA C 430.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:468,45,0 +chr7 19353535 . C T 2707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-0.739;DP=316;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,102:316:99:2736,0,8188 +chr7 19361807 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=1.886;DP=178;FS=35.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,43:178:99:324,0,10270 +chr7 19362433 . C T 4254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=1.014;DP=316;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,115:316:99:4283,0,7023 +chr7 19379739 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.556;DP=62;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:243,0,1902 +chr7 19381547 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.735;DP=42;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:497,0,957 +chr7 19381924 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.131;DP=50;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:481,0,961 +chr7 19382047 . T C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.488;DP=45;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:747,0,958 +chr7 19677863 . TA T 262.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:300,30,0 +chr7 19678772 . CA C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=1.139;DP=18;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:250,0,134 +chr7 19694530 . CT C 318.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:356,24,0 +chr7 19696867 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-2.119;DP=102;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,22:102:99:296,0,2874 +chr7 19773593 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=-0.615;DP=60;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:333,0,1704 +chr7 19773686 . TA T 704.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.014;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:34:742,0,34 +chr7 19773900 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.754;DP=69;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:254,0,4829 +chr7 19773975 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.606;DP=40;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:333,0,1680 +chr7 19809468 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.900;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:558,0,1506 +chr7 19833475 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-2.591;DP=76;FS=5.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:455,0,2349 +chr7 19834134 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.229;DP=45;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:419,0,1110 +chr7 19834233 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-2.648;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:386,0,2567 +chr7 19834256 . T C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-1.707;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=12.08;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:584,0,1018 +chr7 19835301 . G T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.833;DP=122;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,20:122:99:234,0,3801 +chr7 19920369 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=-1.186;DP=26;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:349,0,925 +chr7 20134602 . T G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=1.758;DP=45;FS=10.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.066;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:292,0,1250 +chr7 20175480 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.083;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:255,0,1096 +chr7 20282936 . T C 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.752;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=23.34;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:775,0,326 +chr7 20282997 . T C 320.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=32.02;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:348,0,10 +chr7 20283708 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=3.002;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:316,0,386 +chr7 20571264 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:249,0,342 +chr7 20643681 . C CA 1115.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.251;DP=183;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,62:177:99:1153,0,3097 +chr7 20653620 . AGTAAGACATGTAATATGTAACGAGTGTGTAAAAATGAGTATGTGTACCAGTCGAAAGTGACCCAGAGACTTGTGTTGATGCTTGAAAGCAG A 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=33.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:309,0,852 +chr7 20653778 . G C 923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:952,69,0 +chr7 20657600 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-1.809;DP=50;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:524,0,2640 +chr7 20657615 . G C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.330;DP=48;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:508,0,3199 +chr7 20657623 . A T 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-1.190;DP=60;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1117,0,1859 +chr7 20657655 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-1.230;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:462,0,1524 +chr7 20677807 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=34.62;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:409,0,48 +chr7 20684254 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.124;DP=20;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:533,0,149 +chr7 20710261 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.022;DP=99;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:351,0,2845 +chr7 20712462 . A G 3081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.131;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=15.11;ReadPosRankSum=2.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,88:204:99:3110,0,3772 +chr7 20712486 . G A 2709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=-0.992;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=13.62;ReadPosRankSum=2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,83:199:99:2738,0,3872 +chr7 20712717 . A T 2376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.602;DP=148;FS=0.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:2405,0,2632 +chr7 20713068 . T C 3119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-1.059;DP=231;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,89:231:99:3148,0,4978 +chr7 20713111 . C T 3083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=-0.759;DP=209;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,90:209:99:3112,0,4053 +chr7 20713260 . A T 3146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.006;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,90:203:99:3175,0,3695 +chr7 20715694 . C CT 742.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-1.724;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:780,0,740 +chr7 20735506 . T C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.420;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=18.64;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:606,0,466 +chr7 20787750 . TCCTGAAAAGAAAAAACATTATCATTGCCTGTCTTTAGTTATTAAACTGAAACATGTTAAACCTTAACATTTA T 6635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.143;DP=157;FS=3.094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:6673,516,0 +chr7 20792813 . G C 1716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.317;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:1745,0,2532 +chr7 20794722 . G A 3504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-0.597;DP=200;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,100:200:99:3533,0,3639 +chr7 20848368 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:285,0,407 +chr7 20916774 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:287,0,216 +chr7 20976040 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-1.148;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:317,0,327 +chr7 20984321 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr7 20984322 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr7 21001580 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=1.418;DP=30;FS=8.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:603,0,417 +chr7 21004457 . C T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.446;DP=44;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:748,0,754 +chr7 21015456 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-2.278;DP=39;FS=6.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:288,0,2566 +chr7 21015465 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=-2.279;DP=45;FS=5.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:293,0,2540 +chr7 21035428 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.156;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:78:421,0,78 +chr7 21136510 . CTT C 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=2.003;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:336,0,527 +chr7 21146111 . T C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-3.480;DP=56;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=13.17;ReadPosRankSum=3.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:766,0,2632 +chr7 21146117 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-2.291;DP=57;FS=7.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=12.94;ReadPosRankSum=2.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:766,0,2665 +chr7 21184166 . T G 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.523;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.752;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,29:46:99:1006,0,601 +chr7 21436283 . G A 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.250;DP=75;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:1214,0,1411 +chr7 21451398 . T TA 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=-1.962;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:353,0,596 +chr7 21460539 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=4.283;DP=220;FS=16.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=3.84;ReadPosRankSum=-3.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,33:220:99:872,0,15003 +chr7 21460548 . A G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=5.179;DP=233;FS=2.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=3.54;ReadPosRankSum=-3.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,49:233:99:854,0,15003 +chr7 21808871 . A G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 +chr7 21950628 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-1.023;DP=41;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:358,0,1090 +chr7 22079818 . A C 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +chr7 22258705 . G GT 381.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=1.759;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:12:511,12,0 +chr7 22261003 . A G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=-1.066;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:713,0,935 +chr7 22261162 . C CT 849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.983;DP=26;FS=10.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=32.68;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:887,0,428 +chr7 22931315 . G A 4052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.747;DP=244;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=16.61;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,112:244:99:4081,0,4510 +chr7 22939716 . A G 3504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.359;DP=252;FS=1.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,104:251:99:3533,0,4966 +chr7 22940292 . G A 3853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=1.131;DP=278;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=13.86;ReadPosRankSum=2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,112:278:99:3882,0,5607 +chr7 22946501 . AT A 721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=-1.735;DP=159;FS=27.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,46:152:99:759,0,2837 +chr7 23112800 . A C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:71:258,0,71 +chr7 23489336 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.935;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:325,0,453 +chr7 23490840 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-2.359;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=23.81;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:314,0,137 +chr7 23491418 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=1.589;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:332,0,341 +chr7 23614549 . A G 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:621,45,0 +chr7 23745378 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-1.222;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:251,0,823 +chr7 23745681 . C A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=-0.495;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:765,0,446 +chr7 23746359 . T A 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.531;DP=54;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1190,0,1899 +chr7 23746368 . G C 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.448;DP=55;FS=7.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:1191,0,1899 +chr7 23793582 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.082;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=23.08;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:513,0,176 +chr7 23799253 . T A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-1.101;DP=52;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.055;QD=21.42;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:1142,0,641 +chr7 23842620 . TTACGGTAAGAACTG T 4122.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=1.047;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:4160,359,0 +chr7 23842637 . CTCAATGGGTTTCATAACAAGAGCTAATACCTTTTCATTACATGCATTTTTCACTTTTTCTAAGCATTATTTAATTTGTGTTAACA C 4079.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=1.729;DP=93;FS=6.219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=32.13;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,90:93:99:4117,357,0 +chr7 23842839 . TGTGAGTACTTTTCATGCCTTCACGTAACATTAGTGAGGCTCAATAGTGTGTATGTAATTGTTTTTTGTGAATGTGTGGTGACTGATTTACGTGATCTTGTGCGGCAG T 8856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.488;DP=193;FS=1.400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=31.98;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,185:193:99:8894,825,0 +chr7 23850807 . C CA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=1.613;DP=21;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:58:339,0,58 +chr7 23862093 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.701;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:519,0,148 +chr7 23926792 . CA C 3849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-0.293;DP=259;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,175:229:99:3887,0,716 +chr7 23926937 . C G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=4.671;DP=155;FS=9.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,25:149:99:508,0,4868 +chr7 23926983 . A AT 3825.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=-4.724;DP=173;FS=1.317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=22.11;ReadPosRankSum=4.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,142:151:99:4124,369,0 +chr7 23927163 . A G 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.585;DP=191;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,55:181:99:1383,0,4763 +chr7 23927561 . C T 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-2.564;DP=203;FS=7.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,53:180:99:1380,0,5023 +chr7 23927589 . C T 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-2.625;DP=214;FS=10.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.483;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,45:183:99:1032,0,5366 +chr7 23956089 . T C 1942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-0.548;DP=109;FS=7.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1971,0,2022 +chr7 23956504 . C A 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.324;DP=168;FS=6.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,67:168:99:2318,0,3353 +chr7 23971708 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-2.473;DP=36;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:321,0,876 +chr7 23972019 . A T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.655;DP=41;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:568,0,903 +chr7 23973353 . AT A 264.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.639;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:15:302,0,15 +chr7 23979951 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-0.860;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:373,0,909 +chr7 23979978 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=-0.968;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:444,0,881 +chr7 23981443 . A G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-1.668;DP=51;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:494,0,2329 +chr7 23981446 . A AT 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=-2.069;DP=48;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.247;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:494,0,2329 +chr7 23981621 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.147;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:320,0,1348 +chr7 23983255 . AGTATGGCTACTAGAAGTCTTTTTTTTGTGTGTGTAAACCTCTTTAGCTCTGTCGTGTCAGGTAGTTTAATTGTTTTTCTTATTTCTCAG A 10155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.971;DP=327;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,313:320:99:10204,0,1125 +chr7 23987066 . A T 4492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.055;ClippingRankSum=-0.099;DP=373;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,140:373:99:4521,0,6776 +chr7 23987795 . C G 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.025;DP=166;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,70:166:99:2512,0,3301 +chr7 24017582 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=-2.293;DP=48;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=7.93;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:409,0,1896 +chr7 24017718 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-1.188;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:271,0,1764 +chr7 24017721 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.727;DP=53;FS=10.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:475,0,1697 +chr7 24018034 . T G 1773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.221;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1802,0,1478 +chr7 24018224 . C T 1726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.136;DP=97;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1755,0,1565 +chr7 24041046 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:357,0,659 +chr7 24059003 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:394,0,254 +chr7 24063486 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:349,0,161 +chr7 24063632 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.418;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:390,0,361 +chr7 24065775 . C G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:248,0,640 +chr7 24151579 . A AAATCTAT 752.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,22:22:99:790,0,978 +chr7 24171576 . TA T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.680;DP=37;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:323,0,344 +chr7 24708845 . A G 327.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.79;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:356,0,14 +chr7 24917163 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,131 +chr7 24917532 . T C 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:281,21,0 +chr7 24918891 . C CA 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-1.723;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:349,0,280 +chr7 24920424 . TA T 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.529;DP=42;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:364,0,1237 +chr7 24920480 . C CA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=1.424;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:339,0,820 +chr7 24923729 . TA T 1598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.182;DP=69;FS=3.445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,61:68:82:1636,82,0 +chr7 25054712 . A AGC 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.095;DP=33;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=25.90;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:892,0,380 +chr7 25137585 . G GT 223.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:261,24,0 +chr7 25178367 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=4.476;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:261,0,1449 +chr7 25180811 . T A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.104;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=22.58;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1067,0,559 +chr7 25234216 . T TAA 272.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:310,20,0 +chr7 25234625 . CT C 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.247;DP=91;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:779,0,868 +chr7 25234742 . AAT A 827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.456;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=21.78;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:865,0,134 +chr7 25235844 . A AT 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-2.829;DP=93;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:779,0,1060 +chr7 25258201 . AAGGTGACTATTCGTCCACATTTTCAGAAATCGCTTGCTAGATTTGCAGAAATCAACTTTCTTTTTTTTGTC A 10095.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=3.857;DP=289;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=34.93;ReadPosRankSum=-3.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,263:278:99:10133,144,0 +chr7 25264001 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=1.971;DP=65;FS=1.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:563,0,1577 +chr7 25267862 . TCCTGGAGCAGAAGAGAGCACGTGTTATCTCCAGAACAAGCAAATGGTGAACCAAACCGCTTTCTAGGACACTCA T 5108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=5.090;DP=170;FS=3.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=30.05;ReadPosRankSum=-2.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,149:163:99:5146,0,1203 +chr7 25273322 . TCTGACAAACACACATAAACACAGAACTGTGAAGACAAGAGCTTTATAGGCGTCAAACACTGACACTGTGCTTACACTGAC T 6888.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-1.172;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,148:150:99:6926,631,0 +chr7 25378004 . T C 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.493;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,40:63:99:1421,0,822 +chr7 25378991 . A C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=1.140;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:343,0,327 +chr7 25402767 . TAG T 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-1.012;DP=48;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=5.79;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:315,0,1659 +chr7 25524634 . AACCTGCAAAACAAGTAAATCACAGTCAGTTACAGGACAATAGGCGATAACAATTCAGTTTAACTGCCAAATAATAGCTAACTTAAGAAACCATGGCAGGGTGATTTACAGT A 16367.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.085;DP=367;FS=2.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,364:367:99:16405,1456,0 +chr7 25529798 . G A 11009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.644;DP=548;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.562;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,336:548:99:11038,0,6792 +chr7 25562888 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.231;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:340,0,957 +chr7 25627206 . T TA 830.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.877;DP=107;FS=4.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:868,0,2092 +chr7 25638776 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.527;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:366,0,544 +chr7 25638916 . T C 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-1.318;DP=34;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=18.46;ReadPosRankSum=2.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:656,0,1039 +chr7 25639995 . GA G 1490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.971;ClippingRankSum=-0.911;DP=171;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=8.72;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:1528,0,3520 +chr7 25783472 . G C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.889;DP=51;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.934;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:710,0,970 +chr7 25788466 . C A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.216;DP=45;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=17.48;ReadPosRankSum=2.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:815,0,816 +chr7 25810994 . A G 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-1.435;DP=52;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:1103,0,1652 +chr7 25811525 . G C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.973;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:676,0,703 +chr7 25839889 . C A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:342,0,214 +chr7 25840074 . CT C 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.958;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:306,0,361 +chr7 25883017 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.268;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:405,0,1542 +chr7 25883018 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.186;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:405,0,1541 +chr7 26123372 . G A 215.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:244,0,21 +chr7 26132988 . TA T 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:263,0,114 +chr7 26170533 . G GA 1937.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=-4.004;DP=252;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=7.69;ReadPosRankSum=2.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,87:234:99:1975,0,3464 +chr7 26171506 . C T 2586.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2615,187,0 +chr7 26203646 . G A 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.898;DP=84;FS=9.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:1218,0,1719 +chr7 26226929 . C A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-1.862;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:821,0,746 +chr7 26226947 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-2.563;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:758,0,721 +chr7 26459412 . G T 1881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.015;DP=94;FS=16.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,57:94:99:1910,0,1294 +chr7 26459871 . C CT 706.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.970;DP=53;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,34:48:99:854,0,238 +chr7 26513817 . A T 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=3.684;DP=72;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1137,0,1216 +chr7 26513844 . G A 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-3.122;DP=68;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=16.79;ReadPosRankSum=3.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1170,0,1808 +chr7 26725704 . A AT 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.778;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:660,0,1352 +chr7 26726031 . T C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=2.277;DP=43;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:790,0,746 +chr7 26726309 . C A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.550;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:1324,0,1093 +chr7 26726443 . C T 372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 +chr7 26823362 . TCCTGCGCACAGAGGAGAACTCATGTTATGCAGTTACAGAGGGTGTTTAATGATGCATATGTCCCTTCTAAAGATAAGATGGTACTCA T 5458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=1.469;DP=152;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,141:152:99:5496,0,596 +chr7 27004717 . T C 3210.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.128;DP=281;FS=5.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,95:281:99:3239,0,6552 +chr7 27007258 . AAC A 4173.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-1.377;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,117:233:99:4211,0,4107 +chr7 27007802 . T G 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=2.369;DP=62;FS=3.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=16.35;ReadPosRankSum=2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,2:61:99:1042,0,2021 +chr7 27042942 . AAGGCATGTCTCCATACTTCCATCCTCCATGCAGCATATTAAAAATGGCAGCAAATTTTAACAATATTTGCATTTTCATGC A 13055.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.605;DP=312;FS=2.225;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,309:312:99:13093,1086,0 +chr7 27043969 . T G 15146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.786;DP=299;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=31.15;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,147:299:99:15175,0,3455 +chr7 27137538 . G GT 2491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.429;DP=161;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:2529,0,2705 +chr7 27152317 . CT C 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.317;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:474,0,512 +chr7 27168033 . G A 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.054;DP=146;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,44:145:99:1118,0,3873 +chr7 27172511 . C CA 1870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1908,173,0 +chr7 27173215 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.386;DP=26;FS=17.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:399,0,490 +chr7 27202399 . G C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=1.488;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:474,0,437 +chr7 27268604 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=2.209;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:265,0,422 +chr7 27269211 . A G 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=1.832;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:622,0,324 +chr7 27272861 . C T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.649;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:819,0,1561 +chr7 27389021 . C T 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-2.345;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1048,0,1068 +chr7 27392554 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr7 27394447 . C T 4022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=1.506;DP=273;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,118:272:99:4051,0,5010 +chr7 27492552 . C T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.846;DP=42;FS=6.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:852,0,599 +chr7 27492755 . CA C 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.307;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:316,0,245 +chr7 27493948 . T A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.198;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:588,0,570 +chr7 27494201 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,269 +chr7 27504092 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:368,0,279 +chr7 27504305 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.065;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:248,0,839 +chr7 27515129 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:325,0,102 +chr7 27515219 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-0.295;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:339,0,164 +chr7 27515237 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=1.678;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.65;ReadPosRankSum=2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:328,0,316 +chr7 27515354 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-0.444;DP=31;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:260,0,785 +chr7 27520659 . A G 1343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-1.666;DP=67;FS=6.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,41:67:99:1372,0,908 +chr7 27522038 . G A 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-0.163;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.148;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:969,0,1287 +chr7 27522871 . T G 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.486;DP=29;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=33.47;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:999,0,298 +chr7 27523111 . G A 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.933;DP=36;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:667,0,649 +chr7 27523409 . G A 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-1.530;DP=68;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1148,0,1210 +chr7 27524027 . A T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.830;DP=61;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1022,0,1071 +chr7 27524219 . A G 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-1.259;DP=54;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:810,0,1069 +chr7 27534208 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.657;DP=55;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:678,0,1112 +chr7 27558751 . C A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,895 +chr7 27559260 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr7 27560449 . A T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=1.051;DP=154;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,49:148:99:1399,0,3855 +chr7 27584119 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:315,0,131 +chr7 27586147 . G A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.635;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.74;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:670,0,174 +chr7 27586295 . A T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.537;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:412,0,314 +chr7 27588368 . C A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=9.94;ReadPosRankSum=2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:237,0,484 +chr7 27595688 . G A 1244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.056;DP=82;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1273,0,3163 +chr7 27598266 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=1.491;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:808,0,1628 +chr7 27636548 . C CA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.978;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=5.61;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:357,0,947 +chr7 27636978 . G GA 5069.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.003;DP=406;FS=0.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,220:383:99:5107,0,4047 +chr7 27637118 . CAA C 2760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-2.388;DP=343;FS=44.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=8.05;ReadPosRankSum=3.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,102:342:99:2798,0,11050 +chr7 27637734 . GA G 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-2.386;DP=52;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=5.76;ReadPosRankSum=-2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:337,0,375 +chr7 27643342 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,171 +chr7 27707707 . C A 2506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=-0.518;DP=194;FS=3.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,72:193:99:2535,0,4163 +chr7 27707819 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;ClippingRankSum=3.018;DP=129;FS=16.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,32:123:99:531,0,4303 +chr7 27710748 . G A 4513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.176;DP=286;FS=7.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,127:286:99:4542,0,11105 +chr7 27742693 . A C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-1.289;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:709,0,518 +chr7 27830080 . T TA 709.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:747,57,0 +chr7 27832075 . A AAC 729.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:767,54,0 +chr7 27855330 . G A 7796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.295;DP=453;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=17.21;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,240:452:99:7825,0,7684 +chr7 27862233 . C T 5401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=-0.223;DP=352;FS=0.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,151:352:99:5430,0,6752 +chr7 27863376 . A T 407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:436,30,0 +chr7 27863681 . G A 2069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.502;DP=95;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,59:95:99:2098,0,1265 +chr7 27954011 . C T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.014;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:612,0,699 +chr7 27991174 . A T 2239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.671;DP=116;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,67:116:99:2268,0,1758 +chr7 28017689 . A AT 1509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.975;DP=159;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1547,0,1623 +chr7 28017730 . C A 2101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-2.456;DP=125;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:2130,0,2176 +chr7 28018279 . T G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.018;DP=33;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:655,0,569 +chr7 28020189 . CA C 628.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:666,45,0 +chr7 28032889 . G A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.633;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:490,0,499 +chr7 28136219 . TCAGGTAAGATGCACCTCATTTGTCAATGAAAGTTTGGAATTGGAAGCAACCCTTGGCCCAATTGTGTTTATTTTTGAGTTCACCATGTGATTTC T 994.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=2.421;DP=181;FS=7.360;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,170:172:99:1032,382,0 +chr7 28136493 . CATGCAGGTAAACTGGAGAATTTGTTCATTCATCAGACTTCAGTTGTATCAGTGAAGTTTTCCAACTCATGTTTAATGCA C 8115.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=2.170;DP=254;FS=1.922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=31.95;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,219:223:99:8153,613,0 +chr7 28143883 . GTTTT G 844.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=1.004;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=32.10;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,19:20:8:1195,0,8 +chr7 28144032 . G A 1510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-0.562;DP=84;FS=7.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,46:84:99:1539,0,1369 +chr7 28144239 . GT G,AT 6547.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.742;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=30.88;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,110,92:203:99:6132,3600,5650,3059,0,6863 +chr7 28169339 . AAGGTATCAAATCAACCATTCATAATAGATTGTGTTTTATTTTAGGAGATTTCTGGGAAAATGAGATCAGTACACTGCAGC A 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=410;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,1:5:99:633,0,307 +chr7 28326112 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:349,0,261 +chr7 28344061 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=-1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:270,0,522 +chr7 28344062 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,522 +chr7 28446574 . G A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.677;DP=76;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:955,0,1442 +chr7 28575472 . CT C 708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.859;DP=47;FS=5.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:746,0,114 +chr7 28576641 . C G 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.607;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1282,0,1401 +chr7 28580318 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.381;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:594,0,1230 +chr7 28580319 . C A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:594,0,1230 +chr7 28826404 . T TC 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:325,0,318 +chr7 28827896 . T TA 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.190;DP=33;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:276,0,286 +chr7 29012376 . A T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.212;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:667,0,1597 +chr7 29326150 . T A 2806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2835,190,0 +chr7 29342733 . G A 3884.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:3913,286,0 +chr7 29344203 . T C 678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:707,51,0 +chr7 29344254 . G T 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=34.20;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:32:507,32,0 +chr7 29344272 . T C 1155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1184,90,0 +chr7 29355808 . T C 2640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2669,202,0 +chr7 29446135 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.049;DP=46;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:335,0,1198 +chr7 29743262 . AT A 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:551,54,0 +chr7 29744605 . C G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:436,0,115 +chr7 29766312 . TCTGAGGAACACCAAGATGATGGAGGTTAGTTTCGGTGCGAAAACACACAGGGGCATATGTGAATAAAAAGAGTGAGTGACTTAC T 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:252,0,498 +chr7 29905983 . AAT A 323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:361,31,0 +chr7 29907862 . G A 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.368;DP=94;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1301,0,1263 +chr7 29933442 . C T 1394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.069;DP=86;FS=0.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:86:99:1423,0,1627 +chr7 29933487 . C T 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.012;DP=81;FS=5.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:1253,0,1415 +chr7 29936246 . A G 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=-0.319;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:954,0,1010 +chr7 29941167 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.295;ClippingRankSum=0.936;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=17.08;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:609,0,554 +chr7 29959542 . TA T 231.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.474;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:5:268,5,0 +chr7 29961904 . TA T 233.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:271,27,0 +chr7 30011826 . AACCTGAAAATGGAAAGAAAAACAAATCTGTTAATTATCGTGTCTCAATTTAGTTCATTTGAATAAGCTTACCAAAACTTGCCACTT A 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:631,0,579 +chr7 30012699 . TCTAGGGAGAAACACATTAGAAGAACAATTAGTAATTGTGCTGATGCCTAATGCTGACTGATGATGTGCATGAACATGACGACGGGAGCAGAC T 3404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=2.813;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=32.26;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,78:81:99:3442,293,0 +chr7 30015356 . A G 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-3.343;DP=59;FS=3.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1057,0,1109 +chr7 30110381 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.230;DP=49;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:723,0,1769 +chr7 30110460 . C T 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.719;DP=71;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,34:71:99:1139,0,1180 +chr7 30173223 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,205 +chr7 30370772 . G A 1446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.906;DP=79;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.144;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,45:79:99:1475,0,1150 +chr7 30378453 . A G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.765;DP=56;FS=5.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:612,0,1295 +chr7 30379075 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.097;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=15.65;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,28:58:99:936,0,953 +chr7 30395164 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:257,18,0 +chr7 30398167 . T A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 +chr7 30432813 . C CA 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.210;DP=44;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:282,0,843 +chr7 30446303 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,328 +chr7 30474541 . T A 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=2.036;DP=60;FS=5.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:932,0,1002 +chr7 30490155 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:329,0,101 +chr7 30522961 . A C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=2.108;DP=33;FS=35.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=13.33;ReadPosRankSum=-2.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:468,0,1194 +chr7 30526184 . G A 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-2.223;DP=91;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=21.36;ReadPosRankSum=4.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,60:91:99:1972,0,1013 +chr7 30566043 . G A 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.367;DP=53;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=17.75;ReadPosRankSum=2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:969,0,832 +chr7 30566132 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-2.459;DP=66;FS=7.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=3.66;ReadPosRankSum=2.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:270,0,2480 +chr7 30567952 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.922;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:908,0,1022 +chr7 30568186 . G A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.528;DP=68;FS=3.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,35:68:99:1137,0,1241 +chr7 30618197 . G A 205.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:234,0,24 +chr7 30646938 . T C 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.446;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:1115,0,2146 +chr7 30688177 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.095;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:332,0,821 +chr7 30889787 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.814;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:308,0,1186 +chr7 31032374 . A G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-2.425;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=21.80;ReadPosRankSum=2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:486,0,227 +chr7 31293487 . AAGGTGTGAACGGTCATCTGCGTGTGTTGGTTGTGTGTTTGTGGACAGCTTTTTAATCCTGTCTTCTGTCTTTCACGCACAC A 5072.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.699;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:5110,528,0 +chr7 31297213 . C T 805.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:834,60,0 +chr7 31297218 . C T 805.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:60:834,60,0 +chr7 31305406 . A G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.180;DP=31;FS=11.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:627,0,459 +chr7 31305516 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:45:413,0,45 +chr7 31305550 . A G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,155 +chr7 31417146 . ACTGCAGAAAATAATCAGATGAGAAAAATCAGGACAGATTCGGTATTCAAAATCATTAAGGCTGTACGTGTGAAAGTAAAAAGGTGTCAGTTTGTTGTTTAC A 996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.589;DP=25;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=31.12;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:84:1034,84,0 +chr7 31512767 . T C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.546;DP=105;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:777,0,6134 +chr7 31513160 . TCTGCATGATTTATTCAGAGATTCATATCAAATGCATTTATGCAGCGCATATGCTTGTGAGTGAATGCTGCTTGAGTTTCTCAC T 9047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.768;DP=212;FS=3.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.716;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,211:212:99:9085,786,0 +chr7 31548038 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.900;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:417,0,2632 +chr7 31550180 . A G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-1.679;DP=98;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,28:98:99:713,0,2589 +chr7 31606480 . A AAT 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr7 31607320 . CCCTGTCAATGTACACCAGAAAGACCAGCGTCACAATAACACTCCATTTTCATTAAGTGCTGCCTACAGTTGCAGTTTTTACTGTA C 1119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=-0.424;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:99:1157,106,0 +chr7 31667022 . TCTACAAAAAAAGTAGTTGTTTTAGTTAACCATTTGAATTTAGATTGATTATTTAGAGATGAAAAAAAATAAATCAGAC T 9870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.163;DP=206;FS=2.118;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,200:203:99:9908,926,0 +chr7 31746047 . T A 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.458;DP=47;FS=4.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:796,0,819 +chr7 31828442 . G A 2126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.172;DP=187;FS=7.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,65:187:99:2155,0,4369 +chr7 31830310 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.936;DP=44;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:251,0,1146 +chr7 31869807 . G T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=0.640;DP=53;FS=8.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:626,0,1234 +chr7 31879829 . TCCTGTACATAAAGAAAAGAAAAACCTTTAGGAGACCAGTAACACCTCAATTATAACTGTACAATGAAATAGTTCACACA T 8941.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.377;DP=246;FS=6.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=32.48;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,229:231:99:8979,675,0 +chr7 31880033 . TCCTTCACATACACAATTTCAGCACATCAAACAAACACACAAGACATGCCAACTCTGAATTTCCATGAGCAGGGATATATCGTAGTCGCA T 13191.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=1.352;DP=306;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=31.45;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,291:293:99:13229,1191,0 +chr7 31889500 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.510;DP=94;FS=8.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:513,0,2703 +chr7 31891226 . T A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.958;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:365,0,952 +chr7 31892695 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:236,0,144 +chr7 31893499 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr7 31895895 . TCCTGGTAAGGCATAATAAAGGTATACAGTAAGTTTACGAAAACCAAACGTGAAGTAAATGAGTTTAGTTCAGAGAATAAAGATTTA T 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.101;DP=268;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,250:252:99:766,0,139 +chr7 31899335 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.027;DP=57;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:435,0,1579 +chr7 31915326 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=-1.156;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,30:115:99:742,0,3217 +chr7 31963365 . AAGGTTCGTGTCTTTTATTTGGCACCAAGCAGCTTATGAACGTAAACAACAACGTGCTGCCACACACTCCTTTGTTTCCTTTTTAC A 1512.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.623;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.314;QD=31.21;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1550,135,0 +chr7 31966319 . TGTAAGTGCTGATTTTTGTGATCCCTGATGGAATTTGTGTGATCTTCAGAAGATAACGCTTGCCTTTTTTCCATCTGATTTCTAG T 1896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.648;DP=44;FS=3.112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=28.73;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1934,142,0 +chr7 31975722 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=1.233;DP=93;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:496,0,2648 +chr7 31977725 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=-0.161;DP=59;FS=2.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:420,0,1478 +chr7 31988877 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-1.125;DP=62;FS=2.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:739,0,2472 +chr7 32008488 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.477;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:746,0,1229 +chr7 32258148 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-1.557;DP=92;FS=7.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:403,0,2615 +chr7 32258402 . GCCTACAAACAAACACCCATCAGTGACACATAAAAATATCCAGACATCAAGGTACAGTGAAGCCAGTATGATTTCATAAAGTAAATAAACCAA G 3859.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=1.753;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=30.30;ReadPosRankSum=-2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,84:88:99:3897,314,0 +chr7 32260164 . TCTGCAATAACAATAATAAATATACTGAAGTATTCCTTTTATTGCAATGCATTCGGTAATATTTCTTTGTGACATAAATAC T 4243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.184;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=31.52;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:4281,362,0 +chr7 32442562 . T G 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=1.335;DP=190;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,54:189:99:1279,0,5016 +chr7 32673645 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.862;DP=56;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:423,0,1444 +chr7 32702287 . C G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=-0.350;DP=60;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:491,0,1592 +chr7 32721303 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=1.354;DP=75;FS=12.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:461,0,4347 +chr7 32721306 . A T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=1.424;DP=73;FS=12.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:461,0,4347 +chr7 32726111 . G T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.356;DP=81;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:415,0,2327 +chr7 32727196 . GA G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.106;DP=26;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:243,0,272 +chr7 32765843 . A G 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.803;DP=147;FS=4.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,43:147:99:1109,0,4140 +chr7 32766017 . T C 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.888;DP=59;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:278,0,2556 +chr7 32766967 . TAA T 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.097;DP=61;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:642,0,1069 +chr7 32767455 . C T 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-1.171;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,53:192:99:1290,0,5526 +chr7 32768015 . G C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-3.163;DP=188;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,36:188:99:602,0,5958 +chr7 32768574 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.927;DP=144;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=2.30;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,26:144:99:360,0,4664 +chr7 32774100 . GCCTAATGAGGAAATGAAAGCAGCTCAAGTTTTTTCAAGTTTGAAAAATATGTTCATTTACTTCAATGATGGGTGTAACTTGCTTTTGATGTGGTAATGAAAATAAAGTATATTGCGCGTTAATCAAGGCTAATTATCATGAGCCCTGCTAATGACTAATGCTTTCATGTGATTTCTCCCTCTCCAGATTATTGCTTAACACTTGATTCTTA G 937.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.525;ClippingRankSum=7.335;DP=179;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=5.24;ReadPosRankSum=-4.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,142:169:99:975,0,8289 +chr7 32775304 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.62;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:310,0,92 +chr7 32830512 . A C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.894;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:411,0,610 +chr7 32833125 . CTT C 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-2.421;DP=56;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:469,0,1706 +chr7 32835859 . TA T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.474;DP=61;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:241,0,1162 +chr7 32838903 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=-1.928;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:654,0,2785 +chr7 32838992 . T A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.653;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:524,0,1818 +chr7 32937839 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.355;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=3.92;ReadPosRankSum=3.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:275,0,1872 +chr7 32960200 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.943;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:284,0,283 +chr7 33242657 . C T 2251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.254;DP=134;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:2280,0,2169 +chr7 33791910 . A T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.197;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:472,0,596 +chr7 33792365 . C CT 597 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:71:718,71,0 +chr7 33792646 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.674;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:313,0,1773 +chr7 33792664 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-1.317;DP=68;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:368,0,1938 +chr7 33793636 . G T 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.646;DP=51;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:712,0,1104 +chr7 34049142 . G A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-1.506;DP=39;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:1126,0,310 +chr7 34049837 . A C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,442 +chr7 34050128 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=1.087;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:408,0,788 +chr7 34057171 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.176;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:274,0,873 +chr7 34076694 . C T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.417;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:570,0,453 +chr7 34076715 . C G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-0.059;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:510,0,507 +chr7 34078281 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr7 34079680 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.228;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:324,0,451 +chr7 34080351 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,517 +chr7 34082453 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:471,0,202 +chr7 34147096 . T A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.083;DP=52;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:648,0,1174 +chr7 34147977 . C CT 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.617;DP=33;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:408,0,393 +chr7 34148142 . CT C 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.249;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:281,0,228 +chr7 34167665 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.840;DP=23;FS=10.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,539 +chr7 34170363 . C A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-2.167;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:549,0,600 +chr7 34178327 . T G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.466;DP=52;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:450,0,1389 +chr7 34195005 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.840;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:284,0,937 +chr7 34195006 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-2.098;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:284,0,937 +chr7 34243555 . C A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.545;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:535,0,584 +chr7 34255298 . A T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-1.479;DP=39;FS=9.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=16.35;ReadPosRankSum=2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:666,0,730 +chr7 34255536 . C A 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=1.553;DP=36;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:625,0,667 +chr7 34258296 . TG T 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=1.350;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=27.42;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:33:476,0,33 +chr7 34319520 . A AT 4620.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-1.426;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=30.98;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:4658,320,0 +chr7 34422403 . G GA 580.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:77:723,77,0 +chr7 34427482 . T A 534.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:563,39,0 +chr7 34509508 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,251 +chr7 34535344 . TCTGACAGAGACAAAAATGAATAAAATAGCACCACCATGCCTTATTAATCACTCAAATTAATTACTATTGGGCACAATGGGCACTCATGTGGTAC T 1233.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=1.609;DP=29;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:99:1271,102,0 +chr7 34583218 . A ATG 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:80:306,0,80 +chr7 34611507 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr7 34652718 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-0.081;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:244,0,1282 +chr7 34652832 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.010;DP=53;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:356,0,1334 +chr7 34678972 . TA T 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 +chr7 34680595 . GT G 8012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-7.812;DP=131;FS=25.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=31.94;ReadPosRankSum=5.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,36:114:99:8050,0,893 +chr7 34680708 . T TG 839.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-1.274;DP=289;FS=4.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,67:285:99:877,0,10858 +chr7 34777775 . GT G 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.083;DP=32;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:378,0,376 +chr7 35007142 . C CA 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.717;DP=134;FS=4.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,40:124:99:660,0,2260 +chr7 35450025 . GT G 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.525;DP=50;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:583,0,300 +chr7 35450561 . TA T 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.226;DP=40;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:449,0,202 +chr7 35576353 . G T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.268;DP=95;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,30:95:99:795,0,2403 +chr7 35580541 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.764;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:353,0,3080 +chr7 35584372 . AT A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.967;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:21:250,0,21 +chr7 35600348 . C CT 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.188;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:301,0,775 +chr7 35660514 . T TA 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.741;DP=31;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:297,0,581 +chr7 35660594 . T TCA 864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-2.727;DP=81;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,30:74:99:933,0,1464 +chr7 35684486 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.019;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:470,0,537 +chr7 35684567 . A G 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=-1.139;DP=44;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:682,0,631 +chr7 35756777 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-1.904;DP=35;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:573,0,679 +chr7 35756856 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:486,0,364 +chr7 35756980 . TCA T 717.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:62:756,62,0 +chr7 35757154 . T G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.427;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:289,0,1404 +chr7 35757213 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=1.012;DP=63;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:451,0,1784 +chr7 35812009 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.563;DP=58;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:560,0,1490 +chr7 35943054 . A C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-1.514;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:315,0,1944 +chr7 36231128 . TC T 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=1.771;DP=83;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:338,0,2007 +chr7 36250479 . A T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=-0.423;DP=70;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:567,0,1829 +chr7 36264083 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=1.286;DP=102;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:246,0,3216 +chr7 36276335 . GT G 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.137;DP=38;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:503,0,1123 +chr7 36276345 . T C 486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-1.767;DP=36;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:524,0,1206 +chr7 36281657 . TA T 360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:398,39,0 +chr7 36282636 . G GT 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,680 +chr7 36546084 . C T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.076;DP=230;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,57:230:99:1312,0,6750 +chr7 36549423 . CAT C 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.723;DP=118;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,25:113:99:577,0,3898 +chr7 36652328 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.354;DP=38;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:324,0,1055 +chr7 36666360 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:301,0,337 +chr7 36738473 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=2.171;DP=38;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:261,0,1095 +chr7 37802573 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-1.268;DP=141;FS=1.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=3.45;ReadPosRankSum=2.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,29:141:99:514,0,4367 +chr7 37803848 . T C 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=-0.387;DP=180;FS=4.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,38:180:99:716,0,5237 +chr7 37945553 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.078;DP=116;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:445,0,3469 +chr7 37945681 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=1.056;DP=50;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:267,0,1479 +chr7 37947642 . T TG 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.180;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,30:61:99:651,0,1280 +chr7 38342867 . C T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.948;DP=81;FS=3.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:896,0,1813 +chr7 38353950 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=-0.127;DP=112;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:352,0,3318 +chr7 38359664 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=1.537;DP=67;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:268,0,1767 +chr7 38782325 . GA G 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.375;DP=96;FS=1.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:385,0,1744 +chr7 38782468 . A C 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-0.300;DP=86;FS=1.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.170;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:781,0,2176 +chr7 38913058 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-1.575;DP=38;FS=8.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:269,0,1100 +chr7 38926070 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.885;DP=78;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:349,0,2199 +chr7 38978389 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.170;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.200;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,35:146:99:707,0,4132 +chr7 39156288 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.533;DP=16;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:409,0,173 +chr7 39156495 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.412;DP=18;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:331,0,220 +chr7 39156663 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=2.362;DP=40;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:559,0,776 +chr7 39159181 . A C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.322;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=26.05;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:393,0,49 +chr7 39254589 . GA G 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.997;DP=37;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:327,0,487 +chr7 39254713 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.335;DP=46;FS=2.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:682,0,1062 +chr7 39260477 . G A 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.975;DP=60;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,35:60:99:1196,0,870 +chr7 39290569 . A G 306.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=30.69;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:335,0,16 +chr7 39486492 . C T 1844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-1.158;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,54:140:99:1873,0,2959 +chr7 39655560 . TATCCTTTTCAGTGTAGCAGTGTGCATTATTCAGTCAATCTATTTTCAAAGCTGCAGATTGTAAGTAACTTCCAGATTCTCCTTAACCACTTGCAGA T 921.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.653;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:959,0,4569 +chr7 39656359 . GA G 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.149;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:663,0,1252 +chr7 39659528 . G A 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=-0.581;DP=88;FS=0.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1500,0,1555 +chr7 39784575 . C A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.256;DP=35;FS=5.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:461,0,772 +chr7 39928343 . T TA 1448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.577;DP=123;FS=4.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.772;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1486,0,1453 +chr7 39928799 . A G 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=1.779;DP=121;FS=33.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=5.39;ReadPosRankSum=-2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,28:121:99:680,0,6661 +chr7 39928805 . A T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=3.760;DP=107;FS=33.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=6.04;ReadPosRankSum=-2.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:674,0,6661 +chr7 39933541 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:236,0,55 +chr7 39974368 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.176;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:359,0,362 +chr7 39984154 . C G 8143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.082;DP=447;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,227:447:99:8172,0,8155 +chr7 40096165 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.206;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:424,0,287 +chr7 40101513 . TACCTGAATAAACATAAGGATGGCAACTTTGTCATATGTTTCTGTGATTTCAGATGCTTGCATAAATTACTAAGTAAAAACAGAAGGAAA T 1861.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=1.664;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=30.85;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:1899,163,0 +chr7 40147941 . G GACT 5453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-0.190;DP=341;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,132:277:99:5491,0,5687 +chr7 40149123 . C T 1382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=3.822;DP=222;FS=28.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,60:222:99:1411,0,6126 +chr7 40152068 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=1.873;DP=38;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=5.55;ReadPosRankSum=-2.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:239,0,1096 +chr7 40165178 . GCAGGTGAGATGTATAAGCATAAAGCATGACATCATCAGCTGCCTGTTGTATTGGTTCTGAAACCTTTTAATCTGTCTCCTTTA G 5167.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.713;DP=136;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:5205,434,0 +chr7 40169163 . C T 1925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=2.020;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1954,0,2063 +chr7 40175708 . C CA 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=1.178;DP=139;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=1.70;ReadPosRankSum=-1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,29:125:99:273,0,2589 +chr7 40176047 . G A 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-2.707;DP=79;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1297,0,1333 +chr7 40176517 . A G 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.251;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=29.49;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:972,0,208 +chr7 40176541 . A G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=1.957;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:528,0,548 +chr7 40176670 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.366;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:428,0,574 +chr7 40176678 . A G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-1.561;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:553,0,531 +chr7 40177201 . TA T 1009.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.102;DP=80;FS=2.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:1047,0,634 +chr7 40186061 . T TA 997.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.032;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,45:71:99:1055,0,591 +chr7 40196512 . GCCTGAAGAGAGGATAAAAAACATGAACAAATAAACAGCTGGCTATAAAACAGCCAAATGTCCTTTATTAGTATTCTGGAGAAAATGCCTCGTGTTTTTA G 4170.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=2.555;DP=118;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=33.00;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,108:112:99:4208,0,313 +chr7 40744852 . G C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,336 +chr7 40785329 . G A 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.277;DP=214;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.989;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,59:214:99:1426,0,5942 +chr7 40821699 . C T 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=-0.315;DP=267;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,55:267:99:909,0,8188 +chr7 40842483 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.230;DP=126;FS=3.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,20:126:99:237,0,4048 +chr7 40845068 . C A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-2.110;DP=40;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=6.79;ReadPosRankSum=2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:300,0,1101 +chr7 40850701 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.298;DP=116;FS=6.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,19:116:99:270,0,3834 +chr7 41070157 . A T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=1.416;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:99:645,0,2874 +chr7 41070942 . T A 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=1.410;DP=126;FS=8.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=2.63;ReadPosRankSum=-1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,23:126:99:369,0,3988 +chr7 41137538 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.273;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:860,0,944 +chr7 41137576 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:301,0,377 +chr7 41137817 . T C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.340;DP=150;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,36:150:99:794,0,4334 +chr7 41435999 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:291,0,758 +chr7 41436005 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:291,0,808 +chr7 41446769 . G GT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-1.516;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:44:303,0,44 +chr7 41474539 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-2.032;DP=55;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=25.03;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1405,0,354 +chr7 41483422 . G A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.290;DP=136;FS=11.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,32:136:99:635,0,7395 +chr7 41486950 . G C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.555;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,449 +chr7 41490341 . C A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-2.091;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:454,0,734 +chr7 41497056 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:256,0,61 +chr7 41533161 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=-0.215;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:259,0,902 +chr7 41556009 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,254 +chr7 41891751 . T C 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.392;DP=63;FS=7.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1136,0,1211 +chr7 41971303 . A AT 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-0.679;DP=51;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:621,0,881 +chr7 41978321 . GT G 769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.497;DP=57;FS=3.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:807,0,2357 +chr7 41978326 . G A 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.216;DP=58;FS=5.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:807,0,2326 +chr7 41995016 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.873;DP=56;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:305,0,1671 +chr7 42048715 . AT A 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=1.220;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:243,0,294 +chr7 42105865 . C CA 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.235;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,33:50:99:632,0,327 +chr7 43539901 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:341,0,588 +chr7 43661385 . G C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.503;DP=88;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:454,0,2399 +chr7 44157480 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=1.858;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:386,0,1402 +chr7 44630512 . A G 1043.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=1.065;DP=27;FS=3.023;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=37.18;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:73:1072,73,0 +chr7 44630564 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.029;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:232,0,786 +chr7 44633724 . T A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.217;DP=34;FS=7.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=28.08;ReadPosRankSum=3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:983,0,717 +chr7 45457785 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-2.219;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=26.73;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:349,0,84 +chr7 45592316 . T C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.826;DP=35;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:468,0,815 +chr7 45612115 . GA G 311.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=1.614;DP=17;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:23:349,0,23 +chr7 45613053 . GT G 387.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.347;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:425,13,0 +chr7 45614255 . T G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.097;DP=32;FS=19.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:413,0,1020 +chr7 45616840 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.992;DP=40;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:287,0,1744 +chr7 45663902 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.185;DP=155;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,26:155:99:376,0,5188 +chr7 45664568 . A AAT 325.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=1.107;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=21.68;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:362,0,9 +chr7 45665758 . T TG 570.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=1.393;DP=45;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=12.68;ReadPosRankSum=3.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:608,0,271 +chr7 45703635 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-1.275;DP=362;FS=6.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,55:362:99:461,0,12254 +chr7 45703988 . A G 2943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.218;DP=230;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,86:230:99:2972,0,4979 +chr7 45762089 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=-0.180;DP=105;FS=1.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:324,0,3227 +chr7 45779784 . C A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.843;DP=105;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:503,0,3084 +chr7 45779927 . GCTGCAGAAAATATTAAAGAATGCAATCAGGCATAATTATCAATTTATCATATTATATTTCCAAAAAAGATATACATCATCACGCCAACACATTTAC G 2132.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=1.261;DP=103;FS=2.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,79:100:99:2170,0,1253 +chr7 45954713 . T TA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.530;DP=38;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:323,0,606 +chr7 45954868 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=2.629;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=17.54;ReadPosRankSum=-2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:572,0,577 +chr7 46455716 . G C 16602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.270;DP=420;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=24.05;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,419:420:99:16631,1230,0 +chr7 46582433 . C A 1159.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.619;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1188,81,0 +chr7 46776859 . C T 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=1.704;DP=35;FS=14.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:99:1014,0,163 +chr7 47573309 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 +chr7 47585530 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.560;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:246,0,1638 +chr7 48040862 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=1.364;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:378,0,589 +chr7 48338854 . C CT 576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.014;DP=59;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:759,0,281 +chr7 48340720 . A C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=-0.726;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:461,0,1168 +chr7 48720903 . AG A 328.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:366,30,0 +chr7 48767430 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.129;DP=63;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:448,0,1685 +chr7 48870179 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=-1.726;DP=76;FS=5.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:281,0,2271 +chr7 48870884 . A G 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.055;DP=46;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.496;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:781,0,830 +chr7 48871973 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:285,0,61 +chr7 49492205 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.460;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:439,0,406 +chr7 49493958 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.508;DP=38;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:501,0,821 +chr7 49496043 . TA T 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.948;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:39:373,0,39 +chr7 49496512 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-0.668;DP=33;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:315,0,1060 +chr7 49500840 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:246,0,186 +chr7 49710268 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-0.348;DP=73;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:307,0,2328 +chr7 49710349 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.423;DP=70;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,13:70:99:230,0,2159 +chr7 49717861 . T TTA 313.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 +chr7 49760589 . G GT 1063.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1363,139,0 +chr7 49810137 . G GA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-1.776;DP=18;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.511;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:317,0,100 +chr7 49835093 . C G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.852;DP=169;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,29:168:99:377,0,5345 +chr7 49835291 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.452;DP=136;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:271,0,4120 +chr7 49840524 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.883;DP=82;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:253,0,6561 +chr7 49840799 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-1.899;DP=80;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=4.61;ReadPosRankSum=2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:397,0,2231 +chr7 49940372 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-0.472;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:230,0,693 +chr7 50178611 . G GT 210.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:15:278,0,15 +chr7 50179826 . A C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:318,0,763 +chr7 50190613 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-1.695;DP=41;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:339,0,1001 +chr7 50250298 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.325;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:308,0,827 +chr7 50277883 . GGGTAGGCCGTCCTATCTTTGAACTTCGGAAGCACACGATATTGTGAAATATGCCACCTTCTTGCTACATATTTATTTTTTATTGTACA G 2295.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=2.188;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=31.28;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,51:55:99:2333,206,0 +chr7 50333066 . T TAC 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.261;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:595,0,737 +chr7 50511833 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,864 +chr7 50783199 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:281,0,373 +chr7 51078732 . G C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.540;DP=54;FS=6.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:480,0,1439 +chr7 51078764 . G T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=-0.317;DP=58;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:389,0,1628 +chr7 51091170 . C G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.302;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:318,0,902 +chr7 51096689 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-1.701;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:293,0,1046 +chr7 51685155 . G GA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.657;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:347,0,1632 +chr7 51685839 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.858;DP=21;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:252,0,498 +chr7 51729686 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.386;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:340,0,1453 +chr7 51753395 . A T 288.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.02;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:4:315,4,0 +chr7 51761710 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.486;DP=53;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:277,0,3167 +chr7 51761719 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.538;DP=51;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:251,0,3167 +chr7 51775576 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.203;DP=43;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:291,0,1119 +chr7 51805431 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.939;DP=44;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:325,0,2350 +chr7 51814585 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.026;DP=88;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:99:335,0,2713 +chr7 51817028 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.416;DP=119;FS=2.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,20:119:99:242,0,3706 +chr7 51833215 . T A 214.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:243,0,23 +chr7 51857426 . T C 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.323;DP=144;FS=1.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,43:144:99:1050,0,4908 +chr7 51857441 . AAGGTAAATCATATCCATCTTATTCGTCTGTAGTAAATACATGATGTTCTTTTGCTAGAGGTCCATGGGTCTTAATGCGCTGGGTGCTTATTCCCCCAC A 7257.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.262;DP=164;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=34.74;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,162:164:99:7295,596,0 +chr7 51864931 . G T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.980;DP=290;FS=2.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,42:290:99:343,0,9680 +chr7 51932912 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.436;DP=32;FS=3.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:374,0,779 +chr7 51934172 . T G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=1.992;DP=21;FS=12.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.89;ReadPosRankSum=2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:257,0,429 +chr7 51934350 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.264;DP=67;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:587,0,1798 +chr7 51938414 . G T 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.936;DP=94;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:1336,0,1823 +chr7 52002637 . A T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:450,0,280 +chr7 52005021 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=-0.172;DP=38;FS=8.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:237,0,1014 +chr7 52101264 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.184;DP=86;FS=10.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,15:86:99:269,0,5914 +chr7 52101272 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=-1.001;DP=88;FS=10.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:269,0,5914 +chr7 52101550 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.783;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:312,0,5323 +chr7 52110238 . TCTCACCTGTGAAAGAGCAACAGTTCATCACACGGACTCTGCAAGACTTCAATATCACATCGTCTAAGCATTTTCATAGG T 4435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.042;DP=129;FS=1.734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=34.39;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,107:112:99:4473,324,0 +chr7 52110333 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-0.238;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:327,0,3425 +chr7 52111236 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.528;DP=128;FS=0.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,33:128:99:695,0,3573 +chr7 52111548 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-2.107;DP=85;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:653,0,4304 +chr7 52113658 . G A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=1.473;DP=114;FS=0.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.086;QD=4.98;ReadPosRankSum=2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:99:596,0,3304 +chr7 52166145 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.366;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,29:123:99:612,0,3602 +chr7 52221398 . T A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.200;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:334,0,1579 +chr7 52375817 . T C 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.183;DP=45;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:605,0,825 +chr7 52376240 . C A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.346;DP=89;FS=6.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,29:89:99:799,0,2259 +chr7 52376667 . T G 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.615;DP=95;FS=6.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1339,0,1994 +chr7 52378367 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;ClippingRankSum=-2.277;DP=217;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,38:217:99:348,0,15252 +chr7 52381298 . C A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=1.199;DP=206;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,41:205:99:682,0,6228 +chr7 52382286 . TACCTGAGAAGACAATAGGCAGAAGTCAATGTATCATGACTGTCCAGGAATTGAATTATTCTTGTTTAGATTTTTGATTTGAATTCATAAACTACTG T 8153.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=1.652;DP=175;FS=3.404;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:8276,731,0 +chr7 52431395 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-2.152;DP=161;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=1.77;ReadPosRankSum=2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,27:161:99:314,0,5019 +chr7 52623749 . T C 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=1.049;DP=406;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:320,86:406:99:1588,0,12947 +chr7 52626087 . C A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=-1.855;DP=273;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,61:271:99:1280,0,8183 +chr7 52648414 . C T 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.616;DP=316;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,69:316:99:1302,0,9586 +chr7 52648625 . A AT 458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.604;DP=251;FS=4.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,51:225:99:496,0,4740 +chr7 52648633 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=-2.293;DP=248;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,44:238:99:519,0,7392 +chr7 52649141 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-1.846;DP=77;FS=17.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=3.43;ReadPosRankSum=2.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:292,0,2368 +chr7 52649398 . C T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.413;DP=259;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,48:259:99:708,0,8430 +chr7 52701235 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.112;DP=66;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:343,0,1892 +chr7 52703039 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=-0.489;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=6.61;ReadPosRankSum=-2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:319,0,1229 +chr7 52703747 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=1.361;DP=66;FS=7.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:444,0,1820 +chr7 52923222 . C T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 +chr7 52929174 . C A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:296,0,296 +chr7 52930291 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=-0.328;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:417,0,388 +chr7 52930379 . G C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.706;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:587,0,380 +chr7 53098132 . G C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.702;DP=52;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:621,0,1236 +chr7 53098240 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=1.039;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:464,0,909 +chr7 53098262 . C A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=1.062;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:509,0,862 +chr7 53099091 . G A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.822;DP=83;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,26:82:99:628,0,2013 +chr7 53135399 . A G 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 +chr7 53139675 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr7 53140064 . TG T 402.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 +chr7 53140069 . G T 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:440,30,0 +chr7 53142018 . G C 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 +chr7 53164974 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.123;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:347,0,1272 +chr7 53168859 . A G 405.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:23:434,23,0 +chr7 53186634 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.474;DP=62;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:544,0,1666 +chr7 53204579 . TCCTGCAGTAAACAAACATGGGCATGAACAAGCGGAGTCAAGCTGGACGAATCTGAAACCAAGTTGTCAAACGGCTGCATGGTGCGCTGCGTGACCAAACACTGTAAACTACTGTCACCAGTGTTCACAAAACCTGCTTCGACTAAAAGTTCCCCTGAATAAAAACAAA T 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=2.048;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=15.86;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,3987 +chr7 53212206 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.850;DP=23;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:505,0,385 +chr7 53248920 . C G 1965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.154;DP=266;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=7.39;ReadPosRankSum=-2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,80:266:99:1994,0,14499 +chr7 53268944 . G A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.780;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=27.04;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:99:1137,0,253 +chr7 53269770 . A AC 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-1.453;DP=32;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=29.09;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:65:968,0,65 +chr7 53277584 . C G 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.038;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:653,0,1973 +chr7 53462446 . C T 672.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:701,51,0 +chr7 53462516 . G T 1633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1662,120,0 +chr7 53462579 . T C 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 +chr7 53609661 . C CA 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.680;DP=92;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:540,0,1499 +chr7 53630394 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.170;DP=85;FS=9.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:299,0,2606 +chr7 53740129 . AAC A 1535.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-4.461;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=16.88;ReadPosRankSum=2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,51:59:15:1573,0,15 +chr7 53744087 . T A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr7 53887281 . T C 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.562;DP=91;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:1168,0,2038 +chr7 53972284 . GTTT G,GTTTT 226.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=1.504;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,5,9:15:99:337,192,464,149,0,149 +chr7 53972310 . AT A 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=3.924;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=13.33;ReadPosRankSum=-3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:477,0,279 +chr7 53973287 . C CA 1197.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.739;DP=187;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,47:178:99:1235,0,8740 +chr7 53973291 . T A 1206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-1.495;DP=178;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,47:178:99:1235,0,8740 +chr7 54044171 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.674;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:321,0,1093 +chr7 54195158 . T C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=1.362;DP=97;FS=10.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:446,0,2950 +chr7 54198239 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.495;DP=137;FS=4.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:1007,0,3702 +chr7 54202842 . CAGGTATAACACTCGGTGCCAACACGCTGTACAAATACCGCTATTCTTTTGGGCATGTCTGATTGTCTGACTTGCATTTTATTTTATTTTTTTTCTTTAA C 5768.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=1.706;DP=134;FS=3.571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=26.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:5806,426,0 +chr7 54206310 . GT G 1365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-1.183;DP=88;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,58:82:99:1403,0,275 +chr7 54224360 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.138;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:515,0,547 +chr7 54224465 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.112;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:241,0,498 +chr7 54229167 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-0.085;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:268,0,546 +chr7 54240466 . AAGGTATGAGGATTGTTGATAGGAAAATTTGTTGGGTTGAAATCGTGTTGTGCATGATGGTACTGCTGTGTGTTC A 840.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.648;DP=31;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:878,0,528 +chr7 54277640 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:317,0,233 +chr7 54285543 . GA G 502.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:540,54,0 +chr7 54290728 . A T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.416;DP=42;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=15.95;ReadPosRankSum=-2.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:698,0,783 +chr7 54290793 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=-1.310;DP=48;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=12.33;ReadPosRankSum=-1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:620,0,1081 +chr7 54292612 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.179;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:261,0,1860 +chr7 54293504 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-0.710;DP=55;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:313,0,1439 +chr7 54296845 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.626;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:256,0,1226 +chr7 54355873 . A T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.002;DP=142;FS=5.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.106;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,37:141:99:831,0,3959 +chr7 54356565 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=1.478;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:448,0,2661 +chr7 54365137 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.149;DP=83;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:464,0,2249 +chr7 54372894 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.459;DP=92;FS=3.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:515,0,5154 +chr7 54382706 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.076;DP=89;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:598,0,2182 +chr7 54391853 . G A 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=-0.572;DP=159;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,43:159:99:1060,0,4538 +chr7 54422283 . G T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.406;DP=65;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:743,0,1356 +chr7 54582586 . G GA 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=2.099;DP=203;FS=9.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=2.54;ReadPosRankSum=-2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,52:188:99:553,0,3931 +chr7 54583170 . G GA 629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-3.097;DP=293;FS=6.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=2.15;ReadPosRankSum=2.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,64:273:99:667,0,5752 +chr7 54583470 . CAA C 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-1.231;DP=182;FS=4.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,56:146:99:1811,0,2490 +chr7 54583749 . AT A 1397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.691;DP=165;FS=3.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,85:130:99:1625,0,554 +chr7 54646164 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:232,0,435 +chr7 55000191 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:89:347,0,89 +chr7 55005233 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=1.531;DP=27;FS=13.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:340,0,596 +chr7 55016764 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.476;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:452,0,2772 +chr7 55220161 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-1.642;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:232,0,990 +chr7 55220994 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.317;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:270,0,775 +chr7 55221033 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=1.199;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:284,0,834 +chr7 55221559 . A AT 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.773;DP=60;FS=3.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:654,0,976 +chr7 55222099 . TC T 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.623;DP=43;FS=7.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:321,0,481 +chr7 55235290 . C CT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-1.103;DP=71;FS=4.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:254,0,1057 +chr7 55236415 . G T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.112;DP=115;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,36:115:99:935,0,2909 +chr7 55265772 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.972;DP=152;FS=9.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,35:152:99:754,0,4539 +chr7 55265850 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=-0.862;DP=146;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,26:146:99:399,0,4441 +chr7 55282615 . C G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=2.959;DP=149;FS=5.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,27:148:99:407,0,4499 +chr7 55284618 . C T 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=-2.719;DP=101;FS=4.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,32:101:99:1081,0,5769 +chr7 55294193 . G A 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.307;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,44:157:99:1021,0,4168 +chr7 55294241 . A G 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-1.273;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,34:120:99:783,0,3047 +chr7 55377437 . G A 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.092;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=8.04;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,41:128:99:1057,0,3209 +chr7 55444910 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.732;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:821,0,3677 +chr7 55789653 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.329;DP=113;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,28:113:99:650,0,3174 +chr7 55790002 . C A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.320;DP=168;FS=0.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:750,0,4832 +chr7 55790934 . T C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-2.478;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:639,0,1054 +chr7 55794529 . G T 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=-0.090;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:1189,0,2270 +chr7 55795432 . A G 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.023;DP=176;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,51:176:99:1330,0,4888 +chr7 55795804 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.324;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:614,0,2446 +chr7 55796986 . T C 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.129;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,43:154:99:1034,0,3959 +chr7 55797049 . T C 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.366;DP=169;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=5.96;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,44:168:99:1035,0,4768 +chr7 55892170 . A C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.275;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:705,0,4531 +chr7 55892171 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.624;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:705,0,4531 +chr7 56068488 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.148;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:420,0,598 +chr7 56207281 . C G 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=5.803;DP=68;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=13.95;ReadPosRankSum=-4.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:977,0,1325 +chr7 56220954 . AGTAAGCTGATAAGATTATTGTTGTAATTATAGTTATATACGAGTATAAAAATAGCAATAAACATCTCGGGTATGTCCTGTCATCCCCCTATTATGTTTTTAG A 11335.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.433;DP=279;FS=3.438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,262:279:99:11373,1035,0 +chr7 56222549 . T C 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 +chr7 56222551 . GATTAAAAC G 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 +chr7 56222562 . T C 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 +chr7 56222564 . ATAC A 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 +chr7 56222568 . T G 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 +chr7 56222571 . AT A 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,0:4:99:1189,489,0 +chr7 56222574 . TTTCTTTGCTTTAG T 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,0:5:99:1189,489,0 +chr7 56227698 . C CT 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=1.349;DP=53;FS=10.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.52;ReadPosRankSum=-3.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:893,0,632 +chr7 56280625 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr7 56281072 . G C 610.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.735;DP=42;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:13:639,13,0 +chr7 56281143 . A T 906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:935,66,0 +chr7 56590799 . A AT 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.153;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:284,0,1125 +chr7 56785265 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.673;DP=47;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:402,0,1126 +chr7 56839090 . T A 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.033;DP=68;FS=13.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,22:68:99:623,0,1752 +chr7 56919303 . G T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=-1.117;DP=112;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,27:111:99:508,0,4316 +chr7 56919429 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.058;DP=107;FS=4.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:314,0,3999 +chr7 56920010 . T A 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.408;DP=119;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,40:119:99:1320,0,2825 +chr7 56923008 . A G 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=-1.049;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:823,0,2252 +chr7 56970266 . G GA 832.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=-0.356;DP=61;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,40:61:99:913,0,469 +chr7 57383048 . A C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.286;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:373,0,335 +chr7 57396554 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=-2.474;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:230,0,1206 +chr7 57411966 . AT A 383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:421,42,0 +chr7 57415618 . C CA 389.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.868;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:427,17,0 +chr7 57425692 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.284;DP=86;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:656,0,2342 +chr7 57425703 . CACCTGGAAAAAACACAACGATGTACAAATAGTATTGTGGCAGCCAGAACATGGTATTAATGGATTACAGGATTACGTCAAACTCTCACTT C 3412.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.953;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=34.75;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:3450,298,0 +chr7 57427996 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.560;DP=82;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:401,0,2453 +chr7 57430714 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=-0.096;DP=77;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:261,0,2312 +chr7 57659501 . C T 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-0.525;DP=85;FS=2.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,46:85:99:1523,0,1418 +chr7 57661374 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.455;DP=94;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,20:94:99:422,0,2819 +chr7 57661468 . A G 1384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-1.248;DP=101;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:1413,0,2147 +chr7 57661656 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=2.919;DP=64;FS=12.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=6.43;ReadPosRankSum=-3.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:440,0,1750 +chr7 57661674 . C T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=-0.956;DP=59;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:793,0,1352 +chr7 57662061 . G A 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.509;DP=63;FS=12.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:810,0,3177 +chr7 57662067 . A T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.524;DP=61;FS=14.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:810,0,3138 +chr7 57662706 . A G 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.687;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,33:102:99:860,0,2596 +chr7 57662838 . C A 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.995;DP=93;FS=2.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:1146,0,2277 +chr7 57662875 . T G 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-1.147;DP=71;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,38:71:99:1304,0,1175 +chr7 57662952 . C A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=1.743;DP=80;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=6.83;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:575,0,2239 +chr7 57663093 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.668;DP=113;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:326,0,3466 +chr7 57663583 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-2.339;DP=107;FS=4.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:820,0,2979 +chr7 57663959 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.018;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:365,0,3467 +chr7 57664287 . G A 1344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.806;DP=88;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1373,0,1660 +chr7 57664455 . C T 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.831;DP=89;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1525,0,1701 +chr7 57664530 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.772;DP=95;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:365,0,2965 +chr7 57664578 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.773;DP=117;FS=1.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:750,0,3175 +chr7 57664746 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-1.925;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:512,0,3541 +chr7 57664771 . A C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=-0.739;DP=125;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,28:123:99:597,0,3507 +chr7 57665799 . T C 2229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.198;DP=122;FS=3.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.28;ReadPosRankSum=3.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:2258,0,2246 +chr7 57668877 . A C 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-1.073;DP=54;FS=10.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:984,0,1002 +chr7 57669051 . T G 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.344;DP=93;FS=5.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:1385,0,1645 +chr7 57669516 . G A 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-2.735;DP=90;FS=26.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=11.84;ReadPosRankSum=3.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,32:90:99:1094,0,1951 +chr7 57669794 . GA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.851;DP=61;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:350,0,569 +chr7 57670560 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.172;DP=64;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:461,0,1748 +chr7 57671348 . T A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.893;DP=64;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:474,0,1637 +chr7 57672149 . A T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.693;DP=63;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:553,0,1619 +chr7 57672618 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=1.222;DP=62;FS=3.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:447,0,2221 +chr7 57672743 . AT A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.237;DP=72;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:320,0,2050 +chr7 57690425 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-0.549;DP=74;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:814,0,1738 +chr7 57690593 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.123;DP=70;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:397,0,2894 +chr7 57723812 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.059;DP=88;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:443,0,2567 +chr7 57730428 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.097;DP=111;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,24:111:99:456,0,3184 +chr7 57730612 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=2.881;DP=51;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:262,0,2323 +chr7 57730839 . C T 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=2.052;DP=76;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:1306,0,1391 +chr7 57730998 . G C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=-0.346;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:309,0,1373 +chr7 57731139 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.032;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:546,0,280 +chr7 57731208 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=1.336;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:322,0,430 +chr7 57731575 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=-0.444;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:327,0,1540 +chr7 57731804 . T G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.323;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:370,0,4414 +chr7 57736779 . C G 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.758;DP=340;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,63:340:99:886,0,10241 +chr7 57737103 . A C 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=1.844;DP=206;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,65:201:99:2079,0,11166 +chr7 57740625 . C G 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.456;DP=276;FS=0.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,77:276:99:1816,0,8060 +chr7 57743452 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=-0.139;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:478,0,608 +chr7 57744383 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=1.850;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:292,0,912 +chr7 57744733 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:297,0,886 +chr7 57744734 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.921;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:297,0,884 +chr7 57747067 . C T 2540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=1.202;DP=174;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=14.60;ReadPosRankSum=-1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,72:174:99:2569,0,3654 +chr7 57747123 . G T 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=2.256;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=17.78;ReadPosRankSum=2.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:3051,0,2948 +chr7 57747840 . T G 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.428;DP=235;FS=4.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,54:235:99:1180,0,7182 +chr7 57747950 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.031;ClippingRankSum=0.042;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,46:164:99:966,0,4485 +chr7 57791782 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.214;DP=47;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:257,0,1421 +chr7 57792194 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.540;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:270,0,685 +chr7 57792505 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.715;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:327,0,1061 +chr7 57847468 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:321,0,54 +chr7 58027854 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.436;DP=98;FS=11.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=2.95;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:317,0,3127 +chr7 58028296 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.178;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=3.07;ReadPosRankSum=3.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:369,0,3498 +chr7 58029968 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.516;DP=71;FS=5.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:333,0,2177 +chr7 58030141 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=3.478;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:571,0,1694 +chr7 58032316 . A G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.849;DP=49;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=7.18;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:380,0,3185 +chr7 58032992 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.639;DP=49;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:289,0,1503 +chr7 58033183 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.183;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:262,0,1205 +chr7 58033351 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.518;DP=59;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:261,0,1853 +chr7 58034317 . C A 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.411;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1211,0,1578 +chr7 58034494 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=-0.025;DP=62;FS=4.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:351,0,1673 +chr7 58041651 . A C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.068;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:676,0,1151 +chr7 58041788 . T G 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=1.686;DP=37;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:529,0,782 +chr7 58056829 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.402;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:374,0,973 +chr7 58276901 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.202;DP=52;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:412,0,1435 +chr7 58289409 . T C 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.175;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:700,0,533 +chr7 58311309 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.116;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:316,0,989 +chr7 58312718 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.559;DP=47;FS=7.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:321,0,1254 +chr7 58328471 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.442;DP=48;FS=2.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:242,0,1389 +chr7 58369223 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:301,0,326 +chr7 58463640 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=10.67;ReadPosRankSum=-2.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:231,0,442 +chr7 58501300 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:269,0,409 +chr7 58874440 . C CA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.105;DP=81;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:347,0,1536 +chr7 58934057 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,182 +chr7 58970803 . T G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.132;DP=26;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:390,0,398 +chr7 59030845 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.858;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:318,0,1549 +chr7 59123694 . G T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=1.116;DP=33;FS=6.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:287,0,890 +chr7 59124664 . GA G 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.015;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:331,0,972 +chr7 59131272 . TA T 1219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-2.018;DP=145;FS=6.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,53:138:99:1257,0,2158 +chr7 59131958 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.050;DP=223;FS=13.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,54:223:99:756,0,11662 +chr7 59132039 . TC T 696.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=1.290;DP=201;FS=5.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,46:200:99:734,0,14834 +chr7 59132041 . A T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.558;DP=202;FS=5.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,47:202:99:728,0,14834 +chr7 59154989 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.370;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:252,0,915 +chr7 59157965 . G T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.746;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:431,0,477 +chr7 59164069 . A G 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=1.108;DP=171;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=4.12;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,37:171:99:732,0,5275 +chr7 59167582 . T G 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=-0.725;DP=159;FS=10.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,35:159:99:641,0,4856 +chr7 59172978 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:302,0,171 +chr7 59178679 . G A 3308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-1.791;DP=184;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,92:182:99:3337,0,3318 +chr7 59181122 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.525;DP=186;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,37:186:99:642,0,5732 +chr7 59206877 . C A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-1.129;DP=176;FS=1.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,29:176:99:420,0,11845 +chr7 59208271 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.174;DP=124;FS=4.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:394,0,3879 +chr7 59208283 . A T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.305;DP=116;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,23:116:99:415,0,3563 +chr7 59459342 . C G 1633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.488;DP=93;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:1662,0,1620 +chr7 59459772 . A AT 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=1.175;DP=81;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:332,0,1855 +chr7 59459899 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.525;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:365,0,2031 +chr7 59460361 . AT A 845.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.165;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,36:54:99:883,0,392 +chr7 59460400 . C T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=1.298;DP=56;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:476,0,2401 +chr7 59461085 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=1.399;DP=65;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=22.01;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1459,0,1154 +chr7 59462279 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-2.306;DP=75;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:524,0,2140 +chr7 59463346 . T C 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-1.177;DP=54;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:643,0,1215 +chr7 59464066 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=14;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:398,0,212 +chr7 59964472 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-0.173;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:388,0,567 +chr7 59965891 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-1.618;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:675,0,2259 +chr7 59973017 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.989;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:272,0,2424 +chr7 60030577 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.084;DP=88;FS=2.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:503,0,2458 +chr7 60052364 . T G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.129;ClippingRankSum=-0.224;DP=73;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:446,0,2053 +chr7 60096090 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=2.166;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:265,0,102 +chr7 60096120 . A C 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 +chr7 60125782 . A T 1985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.723;DP=468;FS=6.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:364,104:468:99:2014,0,13903 +chr7 60140545 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=3.196;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:429,0,512 +chr7 60619344 . AGTACGTCTTACTCACTGAGGGGGTTATTTGCTAAAACATGTGTTAAAAAGTTTGTTTTAACTTTGTGTAATGTTTTGGTCAG A 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=1.540;DP=20;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.496;QD=27.79;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:593,0,818 +chr7 60621598 . T C 1486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.733;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=30.42;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:99:1515,105,0 +chr7 60621609 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.377;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:341,0,708 +chr7 60627070 . T A 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=1.247;DP=438;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:332,103:435:99:1943,0,12747 +chr7 60733663 . CT C 554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.436;DP=51;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:592,0,560 +chr7 60734918 . T G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.298;DP=46;FS=15.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:394,0,1247 +chr7 60734974 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-2.155;DP=50;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:244,0,1488 +chr7 60871981 . A AT 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.772;DP=46;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:680,0,768 +chr7 60880206 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=1.422;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:249,0,724 +chr7 60892772 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.382;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:395,0,578 +chr7 60892865 . T G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.571;DP=26;FS=9.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:402,0,1069 +chr7 60892867 . A C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-1.669;DP=23;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:402,0,1081 +chr7 60933819 . G T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.420;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:453,0,2881 +chr7 60934183 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-1.959;DP=51;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:465,0,1571 +chr7 60934254 . G T 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-1.322;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=17.10;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:661,0,1208 +chr7 60934877 . T G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.081;DP=92;FS=3.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:511,0,3716 +chr7 61062555 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,386 +chr7 61125827 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.720;DP=100;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,32:100:99:856,0,2595 +chr7 61281327 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.704;DP=96;FS=6.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:547,0,2779 +chr7 61295400 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.734;DP=93;FS=5.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:386,0,2840 +chr7 61406033 . T G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr7 61630924 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=12.93;ReadPosRankSum=2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:248,0,375 +chr7 61639704 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,262 +chr7 61643592 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:298,0,394 +chr7 61753139 . A G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.630;DP=54;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:431,0,1426 +chr7 61753346 . C A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.522;DP=89;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:723,0,2545 +chr7 61756145 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.286;DP=104;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:287,0,3283 +chr7 61960244 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-2.192;DP=50;FS=4.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:274,0,1500 +chr7 61966554 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=1.519;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:592,0,1944 +chr7 61970418 . A C 2536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2565,184,0 +chr7 61989708 . A C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.756;DP=66;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:399,0,1790 +chr7 62036085 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=2.321;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:446,0,1867 +chr7 62057276 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.216;DP=50;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:259,0,1393 +chr7 62059460 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.610;DP=73;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=3.00;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:247,0,3638 +chr7 62059463 . A G 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.337;DP=73;FS=4.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:1286,0,1149 +chr7 62059490 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-0.811;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:281,0,2015 +chr7 62070672 . A G 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=1.309;DP=51;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:748,0,920 +chr7 62123409 . A T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.116;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:529,0,1039 +chr7 62337426 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.818;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:282,0,327 +chr7 62361869 . A C 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 +chr7 62361917 . G T 298.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.21;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:17:327,17,0 +chr7 62363232 . C T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:445,30,0 +chr7 62363239 . C A 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:445,30,0 +chr7 62425681 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:310,0,287 +chr7 62620142 . G A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-2.476;DP=122;FS=2.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,30:121:99:767,0,3397 +chr7 62620238 . G A 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=1.196;DP=117;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,33:117:99:761,0,3108 +chr7 62630498 . C T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.114;DP=127;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,32:127:99:717,0,3617 +chr7 62630534 . C T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-3.513;DP=132;FS=7.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:890,0,3645 +chr7 62631731 . G A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-0.161;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,37:140:99:647,0,4006 +chr7 62638195 . T C 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.412;DP=126;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,38:126:99:953,0,3103 +chr7 62643432 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=-0.002;DP=148;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,48:148:99:1208,0,3752 +chr7 62646341 . A G 2347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.995;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:2376,0,3642 +chr7 62646347 . C A 2353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.193;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:2382,0,3642 +chr7 62649939 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.072;DP=72;FS=5.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:642,0,1880 +chr7 62652271 . A T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=1.348;DP=44;FS=2.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:371,0,1500 +chr7 62845511 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.081;DP=46;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:542,0,1070 +chr7 62847668 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-1.085;DP=44;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:540,0,929 +chr7 62848302 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DP=56;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:304,0,1639 +chr7 62849562 . AC A 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.899;DP=30;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:481,0,416 +chr7 62849807 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-2.356;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,542 +chr7 62850593 . A C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=-0.127;DP=19;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,484 +chr7 62852620 . G T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=1.575;DP=37;FS=7.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:437,0,897 +chr7 62854297 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=24.86;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:426,0,167 +chr7 62855107 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,152 +chr7 63058058 . C T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:336,24,0 +chr7 64015046 . A G 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:527,39,0 +chr7 64100775 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.850;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:519,0,597 +chr7 64100967 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:286,0,562 +chr7 65356929 . G T 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-1.486;DP=143;FS=8.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,48:141:99:1598,0,3188 +chr7 65446491 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.669;DP=31;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:398,0,666 +chr7 65555930 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:249,18,0 +chr7 65586048 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=1.492;DP=58;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1088,0,901 +chr7 65603058 . G T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.494;DP=53;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:448,0,1409 +chr7 65623892 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=1.438;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.482;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:302,0,1391 +chr7 65624545 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.776;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:340,0,1036 +chr7 65625345 . T G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.903;DP=33;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=13.02;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:458,0,712 +chr7 65632630 . C G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.265;DP=37;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:231,0,1048 +chr7 65632722 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-0.234;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:440,0,922 +chr7 65632785 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-1.257;DP=32;FS=6.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:241,0,855 +chr7 65674316 . TCTGTAAATAACGTGTTTTGATGTATTGTCACGCAAACAAGATCTTTTCTGAAGTTTTACCATCTAAAAAAAACAAGATAAAGTTGTACCATAC T 1609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=2.625;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,44:47:99:1862,0,480 +chr7 65674939 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.474;DP=67;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=6.15;ReadPosRankSum=-2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:440,0,1955 +chr7 65675803 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-1.009;DP=65;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:233,0,1919 +chr7 65681076 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.159;DP=53;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:278,0,1611 +chr7 65691940 . G GT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=0.958;DP=277;FS=4.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=0.82;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,56:257:99:265,0,6664 +chr7 65692106 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.357;DP=79;FS=8.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:673,0,2159 +chr7 65718760 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.629;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:241,0,882 +chr7 65726130 . CCCTTTAACACAAAATGTAGACAACGTCAGAGCAACCTGGTGAACATCAAAACGTGTTGAGTATGACTGACTGTGTATTGCCTCA C 1751.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.133;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=33.28;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1789,155,0 +chr7 65850439 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:230,0,428 +chr7 66011132 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.976;DP=34;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:245,0,965 +chr7 66014380 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=0.230;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:252,0,2929 +chr7 66016916 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=-0.347;DP=55;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:307,0,1661 +chr7 66019664 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-0.663;DP=22;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,268 +chr7 66020739 . T C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:243,18,0 +chr7 66020771 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:285,0,299 +chr7 66020774 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:243,0,428 +chr7 66396841 . T TG 220.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 +chr7 66653815 . T A 693.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.154;DP=40;FS=8.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:731,0,284 +chr7 66821232 . A AT 620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-1.040;DP=235;FS=5.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,60:208:99:658,0,8152 +chr7 66821918 . C CT 1640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.034;DP=248;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,86:224:99:1678,0,2889 +chr7 66822045 . G GA 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-1.913;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,36:141:99:468,0,4923 +chr7 66834880 . T A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.191;DP=35;FS=12.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:409,0,819 +chr7 66835740 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.309;DP=78;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:566,0,1872 +chr7 66856290 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.354;DP=64;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:841,0,1394 +chr7 66954049 . G A 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.422;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:689,0,1190 +chr7 66961458 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=-3.153;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,264 +chr7 66965237 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.499;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:271,0,1110 +chr7 66965826 . C A 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.808;DP=45;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:592,0,1337 +chr7 67000028 . A G 2988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.569;DP=406;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,120:406:99:3017,0,10740 +chr7 67015322 . C T 3777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.615;DP=319;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,111:319:99:3806,0,7293 +chr7 67030383 . C T 3975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=1.377;DP=338;FS=0.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,125:337:99:4004,0,6932 +chr7 67033902 . C CA 1327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.246;DP=145;FS=6.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1365,0,1407 +chr7 67095269 . C A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr7 67096828 . GA G 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.270;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:276,0,494 +chr7 67112887 . G C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:372,0,353 +chr7 67113498 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.205;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:487,0,359 +chr7 67114473 . T C 239.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 +chr7 67114508 . A T 392.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:459,34,0 +chr7 67114749 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.471;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:363,0,1076 +chr7 67114756 . G T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.092;DP=28;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:488,0,892 +chr7 67114772 . T A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.231;DP=26;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=17.99;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:496,0,446 +chr7 67114827 . A AT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.909;DP=16;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:78:248,0,78 +chr7 67116156 . T A 216.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr7 67116235 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr7 67288444 . A T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-1.409;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:474,0,4164 +chr7 67288449 . C A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.345;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:487,0,4164 +chr7 67305465 . AAGGTGCTTCACTTCATCCATCATGCGTTGTCGGAATTTATTTTCTGTGTTATTCATTTACTCTCTTATTGTGTTTATTTATTTTGC A 4200.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.897;DP=96;FS=2.132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=26.79;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,85:88:99:4238,448,0 +chr7 67321515 . GAAGGTAACATGCAATATGGAGGATATGGATAATATGCAACTTGAATGATGAGAGTCCTAATGTGTTTTTTTTTTTCTTTTGAACTC G 6144.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-3.254;DP=164;FS=11.069;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=27.43;ReadPosRankSum=2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,134:143:99:6182,501,0 +chr7 67325991 . C T 1395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.110;DP=128;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,45:128:99:1424,0,2610 +chr7 67328564 . GA G 3411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.375;DP=192;FS=4.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,129:176:99:3449,0,849 +chr7 67328610 . TA T 1544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=2.485;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1582,0,1475 +chr7 67329002 . AAG A 3204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=2.357;DP=278;FS=58.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.794;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,91:271:99:3242,0,6700 +chr7 67332553 . GCTGGGAGAATTGAGAGGTTAAACCAACTGTACACCAACTAAACTTTAACAAACGCCTTCAATAGAAACAGTCAGCCATAC G 10726.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=1.745;DP=352;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,334:340:99:10764,947,0 +chr7 67410910 . C A 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr7 67478515 . A G 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:439,33,0 +chr7 67938300 . C CA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-1.552;DP=48;FS=8.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:362,0,574 +chr7 67938398 . GT G 1197.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-2.118;DP=112;FS=5.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1235,0,1203 +chr7 67947621 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:270,0,62 +chr7 67978302 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.702;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:295,0,1110 +chr7 67978354 . C G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.071;DP=39;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:572,0,831 +chr7 68111117 . C T 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=1.201;DP=24;FS=3.074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=33.09;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:51:881,51,0 +chr7 68111693 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-3.224;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:270,0,316 +chr7 68111776 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=1.033;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:620,0,374 +chr7 68111835 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-3.065;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,329 +chr7 68131008 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:230,0,90 +chr7 68131738 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-2.653;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:477,0,893 +chr7 68543764 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,303 +chr7 68773905 . G T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.606;DP=56;FS=6.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:491,0,1490 +chr7 69123099 . GCCTGTTAAAAAAAAAAATAATAATCACAGAATTTTTCATTTAGCACATAAACTGTTTTTATATTACTGTACGAGTCTGGACAGGGCCTGAAAGTGTAGATCCAAA G 2833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=2.481;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,67:72:99:2871,254,0 +chr7 69217941 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.231;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:521,0,151 +chr7 69219167 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:372,0,206 +chr7 69220152 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,300 +chr7 69220575 . C A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:317,0,181 +chr7 69220711 . T G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.519;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:428,0,447 +chr7 69220785 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.943;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:332,0,324 +chr7 69220871 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:327,0,260 +chr7 69493760 . T C 1641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=7.823;DP=331;FS=9.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=4.96;ReadPosRankSum=3.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,79:331:99:1670,0,10036 +chr7 69516628 . CTT C 264.44 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.118;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:313,0,132 +chr7 69530355 . T C 8149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.834;DP=490;FS=5.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,248:490:99:8178,0,8084 +chr7 69798894 . T TAA 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.065;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:537,0,108 +chr7 69800321 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=2.298;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:422,0,525 +chr7 69800328 . G T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:427,0,525 +chr7 69833044 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.723;DP=59;FS=9.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1091,0,966 +chr7 69849690 . GT G 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.180;DP=25;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=19.15;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:516,0,123 +chr7 69850286 . CA C 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:255,0,102 +chr7 69896668 . GCTGGAACACACAGTTAGCCGCTCATGGTTGTCTGCAGTTCTTCATATGTTACATGTTATAGTGGAGAGTTTAC G 691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.235;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:729,0,1822 +chr7 69896769 . C G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=-0.560;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:386,0,370 +chr7 69912507 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:351,0,489 +chr7 70371093 . G T 3567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=-1.926;DP=145;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=24.61;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,97:145:99:3596,0,1203 +chr7 70376551 . A G 3483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-0.507;DP=209;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.401;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,107:209:99:3512,0,3612 +chr7 70377045 . AAT A 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.157;DP=97;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:302,0,3131 +chr7 70377357 . G A 2394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=-1.461;DP=146;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:2423,0,2690 +chr7 70377971 . A T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:485,0,615 +chr7 70378139 . C G 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-0.175;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=30.69;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:642,0,106 +chr7 70379094 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:328,0,351 +chr7 70379355 . T G 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:534,39,0 +chr7 70380348 . G T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=1.164;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:364,0,344 +chr7 70381102 . C A 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.212;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:712,0,1028 +chr7 70400010 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.343;DP=39;FS=10.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:438,0,995 +chr7 70494198 . A G 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.233;DP=102;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:1486,0,1909 +chr7 70496904 . A C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=1.337;DP=91;FS=5.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:396,0,2627 +chr7 70648257 . GT G 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=1.736;DP=105;FS=3.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,33:95:99:617,0,954 +chr7 70648380 . CT C 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.788;DP=95;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:329,0,1786 +chr7 70648996 . GTT G 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-1.359;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:316,0,189 +chr7 70649443 . T TA 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.280;DP=68;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=7.01;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,43:61:99:759,0,299 +chr7 70649707 . G C 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.277;DP=178;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,49:178:99:1173,0,4901 +chr7 71196830 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.065;DP=33;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:483,0,493 +chr7 71201402 . T C 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 +chr7 71313480 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr7 72102446 . T A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-2.834;DP=65;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:273,0,1079 +chr7 72306434 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:39:496,0,39 +chr7 72306569 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:33:444,33,0 +chr7 72552173 . A C 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.185;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:2069,0,2074 +chr7 72645962 . C CA 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.328;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,35:125:99:539,0,2444 +chr7 72657996 . TTACAAATGTAAA T 236.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:31:274,31,0 +chr7 72818680 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-1.159;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:499,0,812 +chr7 72818764 . A AT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.049;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:247,0,609 +chr7 73844410 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-0.638;DP=25;FS=18.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:331,0,675 +chr7 73844517 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=1.248;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:521,0,318 +chr7 73846986 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:230,0,63 +chr7 73847006 . T C 330.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=33.09;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:359,0,14 +chr7 73976022 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:277,0,59 +chr7 73982722 . ACTGAGACACAGAAAGAGCAGGTTGAGAATGAAGAACGAATCTCATGATTAAGGAGCAGATTGAAGTGTGTGTGCTCTTAC A 3567.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.953;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=29.60;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:3605,259,0 +chr7 73983327 . G A 1359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-1.333;DP=71;FS=8.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,41:71:99:1388,0,1111 +chr7 73992857 . G A 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.204;DP=108;FS=3.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:1564,0,2136 +chr7 74357162 . T C 2688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=1.943;DP=298;FS=7.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,97:282:99:2717,0,8424 +chr7 74357187 . T C 2033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=1.140;DP=303;FS=3.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,95:294:99:2062,0,10350 +chr7 74357367 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=2.670;DP=94;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=6.07;ReadPosRankSum=-2.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:599,0,3881 +chr7 74357380 . T C 2552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=-0.831;DP=102;FS=10.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=25.03;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,63:101:99:2581,0,1529 +chr7 74357383 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-2.677;DP=111;FS=5.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:495,0,4282 +chr7 74580693 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=-1.044;DP=50;FS=8.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:638,0,2527 +chr7 74580696 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-1.808;DP=51;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:638,0,2548 +chr7 74594680 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.240;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:267,0,2418 +chr7 74610041 . A G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=1.165;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:703,0,1427 +chr7 74644812 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.629;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=22.32;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:720,0,899 +chr7 74668842 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr7 74736264 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=-0.099;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:311,0,380 +chr7 74753440 . A G 308.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:337,0,13 +chr7 74756832 . TG T 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.181;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:368,0,225 +chr7 74839940 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:371,0,125 +chr7 75007006 . G C 4078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=1.252;DP=163;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=25.02;ReadPosRankSum=3.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,111:163:99:4107,0,1359 +chr7 75007018 . C T 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.249;DP=162;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,64:162:99:2146,0,3271 +chr7 75014541 . G C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-1.569;DP=171;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,48:171:99:855,0,7243 +chr7 75014674 . G T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-2.631;DP=94;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:1261,0,3402 +chr7 75015371 . A AT 923.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=-2.278;DP=167;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,51:167:99:961,0,3582 +chr7 75015898 . G GA 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.917;DP=93;FS=11.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:669,0,872 +chr7 75111942 . T C 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:592,42,0 +chr7 75111966 . G A 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:598,42,0 +chr7 75112125 . T C 610.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:639,45,0 +chr7 75112230 . A G 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:766,54,0 +chr7 75364108 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.549;DP=32;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:280,0,788 +chr7 75420310 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-1.351;DP=33;FS=10.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:541,0,562 +chr7 75455348 . C G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.210;DP=49;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:372,0,1347 +chr7 75457909 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.586;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:318,0,932 +chr7 75463158 . T A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-1.469;DP=94;FS=5.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:401,0,5852 +chr7 75463159 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-1.384;DP=94;FS=5.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:401,0,5852 +chr7 75468831 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=-0.814;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,19:112:99:262,0,3641 +chr7 75484261 . C CT 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.165;DP=166;FS=3.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=3.25;ReadPosRankSum=2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,48:153:99:732,0,2390 +chr7 75555942 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.537;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:365,0,1356 +chr7 75555954 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=-1.734;DP=53;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:624,0,1330 +chr7 75708140 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-0.142;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:601,0,356 +chr7 75723667 . G A 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=0.558;DP=99;FS=15.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:1451,0,1910 +chr7 75733564 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:387,0,126 +chr7 75737187 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:315,0,328 +chr7 75750265 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-0.381;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:458,0,356 +chr7 76059246 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=2.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=16.48;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:259,0,250 +chr7 76406353 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:273,0,60 +chr7 76575445 . A G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 +chr7 76619784 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.322;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:342,0,1078 +chr7 76654234 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.031;DP=111;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,28:111:99:667,0,3216 +chr7 76654395 . GC G 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-0.716;DP=120;FS=7.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,29:117:99:557,0,2988 +chr7 76654975 . T TA 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-3.947;DP=87;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,28:83:99:413,0,1490 +chr7 76686670 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.826;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:346,0,1399 +chr7 76692630 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.290;DP=56;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:240,0,1640 +chr7 76693281 . G T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.843;DP=52;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:479,0,2813 +chr7 76696308 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.306;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:378,0,1175 +chr7 76724075 . TCTGAAGAGAAAACAACAACGTTCAGTCATTTTGAGCATGGAAAAGTCAGTCTGAGTGTCAAACATGGCAGTTGCTGTTCTCAGATCAGTGTTTAC T 16211.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.812;DP=362;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=28.58;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,359:362:99:16249,1423,0 +chr7 76784928 . GC G 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.764;DP=56;FS=9.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:247,0,1615 +chr7 76787622 . G C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.199;DP=67;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:290,0,2136 +chr7 76788778 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.981;DP=80;FS=6.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,14:80:99:253,0,4446 +chr7 76823327 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=-1.140;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:301,0,352 +chr7 76834215 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=2.264;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,393 +chr7 76834227 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:288,0,400 +chr7 76839843 . G C 2356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-0.603;DP=84;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,57:84:99:2385,0,2151 +chr7 76849380 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:243,0,169 +chr7 76859954 . A T 381.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.159;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:441,0,10 +chr7 76860059 . G C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=1.286;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:351,0,379 +chr7 76960758 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.022;DP=30;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:284,0,721 +chr7 76961237 . CT C 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.566;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:280,0,104 +chr7 76964423 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=1.827;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=20.78;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:340,0,210 +chr7 76965022 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:372,0,397 +chr7 76971870 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.152;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,364 +chr7 76972595 . A T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.728;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,26:98:99:702,0,5652 +chr7 76988267 . C T 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.838;DP=141;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:1592,0,2920 +chr7 76990660 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.512;DP=120;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,22:120:99:314,0,3763 +chr7 77013256 . A G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=-3.108;DP=204;FS=10.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,35:203:99:508,0,12575 +chr7 77013263 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-3.373;DP=192;FS=6.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,28:191:99:512,0,12575 +chr7 77018329 . C A 3297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.139;DP=187;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,94:187:99:3326,0,4250 +chr7 77018831 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.055;DP=148;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,24:147:99:277,0,4678 +chr7 77022187 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.777;DP=200;FS=0.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:1230,0,5794 +chr7 77026104 . A G 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.235;DP=116;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,31:113:99:1270,0,6986 +chr7 77029841 . A AGT 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-2.028;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=2.33;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,32:140:99:477,0,3304 +chr7 77047809 . GCAGGTCAGAGTGTGTTTCTGTCTGCCTGTGTGTTATCATTCAGCGTGTGTGTTATTATAGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGCA G 5126.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.128;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=31.52;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,104:106:99:5164,417,0 +chr7 77095292 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.545;DP=271;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,70:270:99:1570,0,7484 +chr7 77096472 . G A 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.316;DP=273;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,64:273:99:1217,0,7518 +chr7 77097509 . C T 1905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.666;ClippingRankSum=-1.603;DP=310;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,91:308:99:1934,0,7856 +chr7 77098437 . CTG C 2810.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=22.71;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,1:8:99:2848,164,0 +chr8 102807 . A T 1528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.831;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=23.52;ReadPosRankSum=2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,45:65:99:1557,0,486 +chr8 136269 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.556;DP=35;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:668,0,458 +chr8 145499 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,104 +chr8 250727 . C G 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.762;DP=113;FS=3.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,32:113:99:813,0,3040 +chr8 267722 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=-0.383;DP=91;FS=7.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:690,0,2304 +chr8 268540 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=1.850;DP=76;FS=3.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:565,0,2029 +chr8 268561 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.672;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:685,0,4416 +chr8 268622 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-1.115;DP=88;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.20;ReadPosRankSum=2.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:750,0,2203 +chr8 271307 . A C 2892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-2.472;DP=104;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,79:104:99:2921,0,495 +chr8 289573 . G T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.547;DP=154;FS=0.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,38:154:99:677,0,4183 +chr8 289716 . G A 2304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.382;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:2333,0,2359 +chr8 289833 . C T 1068.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.349;DP=74;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1106,0,1369 +chr8 290142 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=3.706;DP=91;FS=4.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=6.05;ReadPosRankSum=-2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:579,0,2454 +chr8 290172 . C T 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=-1.899;DP=121;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,48:121:99:1594,0,2463 +chr8 290328 . C G 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.711;DP=138;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1972,0,2470 +chr8 290973 . C T 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-1.024;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1473,0,1514 +chr8 291054 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.447;DP=108;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:374,0,7049 +chr8 291063 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-0.634;DP=106;FS=3.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:99:375,0,7049 +chr8 292110 . TC T 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.279;DP=81;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:348,0,1924 +chr8 313118 . G T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=1.013;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:314,0,948 +chr8 316178 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.905;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:233,0,291 +chr8 318741 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,799 +chr8 319110 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.280;DP=40;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:247,0,1040 +chr8 319319 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=-0.011;DP=51;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:308,0,1395 +chr8 333183 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:294,0,204 +chr8 333617 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.467;DP=39;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:564,0,727 +chr8 333753 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=1.194;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:467,0,266 +chr8 340612 . C G 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=1.599;DP=42;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:675,0,702 +chr8 356409 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.222;DP=37;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:232,0,1010 +chr8 367569 . T C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.585;DP=44;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:602,0,841 +chr8 367652 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.415;DP=50;FS=2.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:332,0,1893 +chr8 377559 . T G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.739;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:378,0,454 +chr8 387096 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=1.204;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:268,0,1751 +chr8 393152 . G A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.381;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:780,0,1295 +chr8 393197 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.345;DP=54;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:323,0,1498 +chr8 397802 . A T 348.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=31.69;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:376,0,7 +chr8 398157 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.743;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:289,0,1374 +chr8 398158 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.487;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:401,0,1199 +chr8 413046 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.125;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:625,0,3885 +chr8 413894 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=-1.246;DP=79;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.597;QD=10.53;ReadPosRankSum=2.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:860,0,1821 +chr8 442437 . T C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.215;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:411,0,394 +chr8 446440 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,158 +chr8 446444 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,158 +chr8 447332 . C T 7848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.485;DP=311;FS=27.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,223:311:99:7877,0,1990 +chr8 447520 . C A 636.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=31.26;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:21:665,21,0 +chr8 448343 . G A 1662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.808;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,46:56:99:1691,0,165 +chr8 452203 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.979;DP=15;FS=12.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:325,0,103 +chr8 458493 . G A 2815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-1.197;DP=204;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=13.80;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,86:204:99:2844,0,3721 +chr8 461067 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.435;DP=66;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:230,0,1976 +chr8 461367 . C T 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-3.438;DP=94;FS=3.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.273;QD=16.28;ReadPosRankSum=2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:1559,0,1587 +chr8 461570 . A G 259.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:18:288,0,18 +chr8 461675 . G T 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.078;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,42:70:99:1383,0,936 +chr8 467713 . GGCAGGTAACGTCTGCATGACTGCTCTCCCCCGCCGCATGCCCGCGCTCACTCTGCTTCTGCTCT G 6873.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=3.392;DP=236;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=29.13;ReadPosRankSum=-4.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,200:236:99:7556,0,8212 +chr8 471222 . C A 255.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:284,0,16 +chr8 471645 . C G 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.417;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,55:256:99:997,0,7305 +chr8 473187 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.805;DP=27;FS=9.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:407,0,454 +chr8 473296 . ACACAC A 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.077;DP=36;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:363,0,554 +chr8 479247 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.266;DP=45;FS=11.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.074;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:633,0,908 +chr8 485305 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:303,0,358 +chr8 489970 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.042;DP=56;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:802,0,999 +chr8 494600 . T TAC 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:71:259,0,71 +chr8 498254 . C T 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-2.364;DP=85;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1131,0,1728 +chr8 499800 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=4.299;DP=29;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=15.16;ReadPosRankSum=-3.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:468,0,400 +chr8 500040 . C T 2651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-1.834;DP=95;FS=10.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=27.91;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,74:95:99:2680,0,427 +chr8 505542 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.206;DP=97;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:415,0,3021 +chr8 505599 . T G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=1.270;DP=155;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,33:155:99:612,0,4475 +chr8 539841 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:82:244,0,82 +chr8 542302 . TGA T 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr8 579893 . TA T 214.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:30:252,0,30 +chr8 579975 . C T 997.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.187;DP=19;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=32.33;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:72:1026,72,0 +chr8 581030 . G C 1383.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-2.533;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=30.08;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:2:1410,0,2 +chr8 581123 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=-0.423;DP=49;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:307,0,978 +chr8 581127 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.047;DP=47;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:594,0,541 +chr8 581471 . G C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr8 581687 . T C 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:310,21,0 +chr8 581804 . G T 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1:1:21:310,21,0 +chr8 581897 . G T 280.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:25:309,25,0 +chr8 581925 . TA T 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=34.10;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:85:276,0,85 +chr8 581964 . A G 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:55:757,55,0 +chr8 582024 . C T 2112.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2141,150,0 +chr8 582140 . T C 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=1.516;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=28.15;ReadPosRankSum=-1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:41:1098,0,41 +chr8 582243 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:256,0,271 +chr8 582620 . G A 1241.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:92:1270,92,0 +chr8 582664 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.141;DP=33;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:381,0,750 +chr8 583040 . A C 1983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:90:2012,90,0 +chr8 583166 . C T 1980.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.087;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:87:2009,87,0 +chr8 583265 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.521;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,444 +chr8 583422 . C G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:260,18,0 +chr8 583436 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:260,18,0 +chr8 584401 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-1.224;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:326,0,1062 +chr8 584429 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=-0.787;DP=42;FS=12.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:530,0,896 +chr8 585924 . C T 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.601;DP=53;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:994,0,751 +chr8 595174 . A G 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.050;DP=36;FS=7.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:735,0,858 +chr8 644610 . G T 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 +chr8 657570 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:278,0,55 +chr8 661134 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:363,0,54 +chr8 661773 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-2.069;DP=19;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,283 +chr8 661809 . T G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.076;DP=16;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:85:486,0,85 +chr8 662335 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=1.027;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,272 +chr8 662849 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:293,0,96 +chr8 697695 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=22.08;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:249,0,220 +chr8 733761 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=1.248;DP=22;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:403,0,406 +chr8 773416 . ATG A 836.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.295;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:874,0,995 +chr8 773989 . T C 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:555,39,0 +chr8 775005 . T G 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:63:881,63,0 +chr8 776002 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-1.101;DP=24;FS=7.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:415,0,835 +chr8 776003 . C A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:415,0,835 +chr8 776249 . C CTT 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-1.395;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:406,0,566 +chr8 777745 . TA T 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.753;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:267,0,403 +chr8 986373 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=-2.346;DP=100;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,32:100:99:740,0,2502 +chr8 992951 . C T 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.355;DP=106;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:1607,0,1958 +chr8 993255 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:318,0,57 +chr8 1120115 . C G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:273,0,395 +chr8 1134211 . C T 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.115;DP=66;FS=8.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:1149,0,1203 +chr8 1135185 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.118;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:907,0,1140 +chr8 1139451 . A AT 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.208;DP=28;FS=12.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:275,0,586 +chr8 1139532 . T A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.155;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:433,0,623 +chr8 1182018 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:280,0,184 +chr8 1182436 . C T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:244,18,0 +chr8 1198853 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.416;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:343,0,540 +chr8 1202411 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.195;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=27.40;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:768,0,562 +chr8 1279972 . T A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-2.620;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=28.67;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:401,0,209 +chr8 1280005 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:401,0,209 +chr8 1280624 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.98;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,109 +chr8 1281868 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=1.746;DP=44;FS=8.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:883,0,530 +chr8 1283091 . G A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.343;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:669,0,1298 +chr8 1288166 . G A 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=-1.618;DP=58;FS=7.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:924,0,747 +chr8 1291617 . C T 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 +chr8 1292938 . A C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:95:233,0,95 +chr8 1295924 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.943;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.24;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:288,0,287 +chr8 1298850 . TA T 303.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:341,36,0 +chr8 1327746 . G A 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-5.118;DP=226;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=6.44;ReadPosRankSum=4.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,62:226:99:1483,0,6083 +chr8 1333305 . C T 4016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-1.931;DP=256;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,113:256:99:4045,0,4861 +chr8 1335743 . T A 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=1.181;DP=84;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:1226,0,1439 +chr8 1335822 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.366;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=15.11;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:678,0,1487 +chr8 1335826 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.960;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=17.56;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:678,0,1517 +chr8 1343122 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,172 +chr8 1358634 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-1.273;DP=47;FS=6.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:551,0,1003 +chr8 1908294 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-2.007;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:362,0,351 +chr8 1964663 . A G 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:18:267,18,0 +chr8 1964883 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:99:577,0,121 +chr8 1964887 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:99:577,0,121 +chr8 1964939 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=1.951;DP=49;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:577,0,121 +chr8 1965460 . G C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=1.556;DP=63;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:264,0,1001 +chr8 1965477 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.328;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:270,0,957 +chr8 2145973 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:281,0,265 +chr8 2435295 . G C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-2.501;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:351,0,684 +chr8 2504107 . A G 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.306;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=27.29;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:1120,0,309 +chr8 2534579 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=21.21;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:516,0,278 +chr8 2591801 . G A 5025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=1.889;DP=402;FS=3.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=12.50;ReadPosRankSum=2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,148:402:99:5054,0,8514 +chr8 2603069 . C G 2382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.987;DP=316;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,95:289:99:2411,0,7225 +chr8 2655997 . C T 271.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.696;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:300,0,16 +chr8 2656757 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:274,0,103 +chr8 2656774 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.98;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:268,0,101 +chr8 2662376 . C T 4665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.585;ClippingRankSum=0.759;DP=559;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:386,172:558:99:4694,0,15043 +chr8 2666492 . C CT 651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;ClippingRankSum=0.352;DP=113;FS=5.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,34:99:99:689,0,1495 +chr8 2673912 . T C 5604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.486;DP=657;FS=10.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=8.53;ReadPosRankSum=3.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:443,213:656:99:5633,0,16548 +chr8 2684861 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-0.329;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,23:103:99:500,0,3232 +chr8 2685208 . T A 2322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-0.243;DP=143;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:2351,0,2519 +chr8 2693210 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=-0.738;DP=235;FS=10.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,42:235:99:642,0,7354 +chr8 2710512 . G T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.823;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:447,0,3314 +chr8 2724133 . A G 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.381;DP=50;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:927,0,804 +chr8 2724163 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.040;DP=75;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:254,0,2337 +chr8 2724781 . A C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.099;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:429,0,1685 +chr8 2729991 . G A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-1.905;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:560,0,1085 +chr8 2735856 . G T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.206;DP=79;FS=6.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:710,0,2104 +chr8 2749750 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-1.768;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:276,0,1516 +chr8 2760858 . G T 4944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.513;DP=257;FS=0.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,147:257:99:4973,0,3870 +chr8 2763708 . ACTGAAACACAAGAGAGATGGGGAGTTATTGAAATGCTAAGATTCTGACTTGCATAAATGAAATGAAAACTTCTACCACTTAC A 12316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=2.433;DP=322;FS=6.743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=21.42;ReadPosRankSum=-2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,293:295:99:12354,1061,0 +chr8 2766633 . G A 3551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=1.551;DP=288;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=12.33;ReadPosRankSum=2.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,106:286:99:3580,0,6143 +chr8 2772071 . T A 1016.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1045,72,0 +chr8 2772115 . T A 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:681,48,0 +chr8 2772570 . A G 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 +chr8 2772583 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr8 2772637 . A G 1720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1749,117,0 +chr8 2777546 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.477;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:325,0,522 +chr8 2782448 . C G 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-2.854;DP=80;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=12.18;ReadPosRankSum=-2.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1003,0,1600 +chr8 2782474 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=4.661;DP=66;FS=7.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=5.51;ReadPosRankSum=-1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:392,0,3956 +chr8 2782477 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=4.451;DP=72;FS=7.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:392,0,3956 +chr8 2895306 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.037;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:465,0,231 +chr8 2915626 . A AG 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.334;DP=61;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:452,0,447 +chr8 2955080 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,263 +chr8 2964853 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.402;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:260,0,390 +chr8 2968253 . A G 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.987;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:556,0,516 +chr8 2968372 . A G 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.95;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:99:706,0,130 +chr8 2968374 . A G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=19;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:705,0,156 +chr8 2968483 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,14:14:99:705,0,156 +chr8 2968578 . C G 1188.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:90:1217,90,0 +chr8 2968632 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.347;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:283,0,901 +chr8 2968718 . G GC 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.482;DP=56;FS=10.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:424,0,211 +chr8 2969051 . A G 1082.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.208;DP=38;FS=5.528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:75:1111,75,0 +chr8 2969074 . T C 1661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.908;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1690,123,0 +chr8 2969492 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,287 +chr8 2970246 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.975;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:321,0,359 +chr8 2970258 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=2.245;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:311,0,379 +chr8 3072360 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=15.98;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:236,0,209 +chr8 3072697 . GA G 261.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-1.086;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:23:299,0,23 +chr8 3077351 . TA T 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:256,0,420 +chr8 3254203 . G T 1730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.544;DP=142;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,54:142:99:1759,0,2811 +chr8 3258917 . A T 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=1.054;DP=133;FS=17.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,46:131:99:1477,0,2847 +chr8 3266816 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.250;DP=57;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:331,0,1815 +chr8 3267074 . T A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=1.511;DP=47;FS=9.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:494,0,3405 +chr8 3269808 . T TG 781.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.157;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:819,0,1503 +chr8 3696259 . T C 1349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-0.290;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=17.09;ReadPosRankSum=3.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:1378,0,2925 +chr8 3696262 . A C 1349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.057;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1378,0,2958 +chr8 3713794 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=2.612;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:330,0,2200 +chr8 3713994 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.907;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:660,0,1875 +chr8 3716142 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.549;DP=48;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=8.64;ReadPosRankSum=-2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:443,0,1004 +chr8 3716161 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=1.381;DP=40;FS=6.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:460,0,741 +chr8 3716262 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.646;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:396,0,404 +chr8 3716287 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.585;DP=34;FS=9.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:320,0,832 +chr8 3717970 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=-0.008;DP=57;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=13.54;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:800,0,1168 +chr8 3718017 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=-0.382;DP=44;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:297,0,1359 +chr8 3718232 . G C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.824;DP=47;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:753,0,904 +chr8 3719623 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=34.47;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:304,0,191 +chr8 3733629 . A G 2002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.502;DP=185;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,62:185:99:2031,0,4176 +chr8 3733659 . A T 2401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.726;DP=195;FS=0.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,71:195:99:2430,0,4287 +chr8 3758487 . C T 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.410;DP=160;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,58:160:99:1972,0,3581 +chr8 3761606 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=4.149;DP=120;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=3.96;ReadPosRankSum=-2.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:503,0,7327 +chr8 3761609 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=3.768;DP=122;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,25:122:99:503,0,7327 +chr8 3764640 . A G 2703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.370;DP=179;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,80:179:99:2732,0,3241 +chr8 4149821 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-2.272;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:400,0,434 +chr8 4245320 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:86:330,0,86 +chr8 4300602 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,173 +chr8 4568903 . T A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.251;DP=43;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1091,0,327 +chr8 4599151 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.961;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:348,0,407 +chr8 4599272 . G T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=1.080;DP=30;FS=3.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:620,0,402 +chr8 4599328 . G T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.384;DP=32;FS=5.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:492,0,1288 +chr8 4599597 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=3.098;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,263 +chr8 4600332 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:473,0,353 +chr8 4600383 . G A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.296;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:814,0,465 +chr8 4601075 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.129;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:411,0,469 +chr8 4642926 . T C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:930,66,0 +chr8 4643113 . T A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-1.363;DP=36;FS=7.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:652,0,599 +chr8 4646477 . A G 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=1.550;DP=117;FS=20.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=8.49;ReadPosRankSum=-2.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,37:117:99:1022,0,2931 +chr8 4646529 . C A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.928;DP=72;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=5.09;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:395,0,2124 +chr8 4649201 . G T 2438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.909;DP=153;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=15.94;ReadPosRankSum=4.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:2467,0,2674 +chr8 4649820 . G A 4105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.068;DP=196;FS=3.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=20.95;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,120:196:99:4134,0,2659 +chr8 4656118 . A G 2880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.593;DP=176;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,83:175:99:2909,0,2894 +chr8 4672524 . G C 3098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-1.202;DP=178;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,91:178:99:3127,0,2941 +chr8 4687198 . C A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-1.571;DP=103;FS=6.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:1238,0,2332 +chr8 4687219 . G A 2866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.321;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,85:135:99:2895,0,1665 +chr8 4693435 . C A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.781;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=6.13;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:844,0,3429 +chr8 4694488 . C T 3686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.464;DP=183;FS=0.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,111:182:99:3715,0,2377 +chr8 4719430 . C T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.379;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:776,0,1452 +chr8 4719435 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.118;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.131;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:776,0,1452 +chr8 4726523 . T A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=1.844;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:806,0,520 +chr8 4735514 . A G 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.356;DP=40;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1173,0,175 +chr8 4778318 . A T 215.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:244,21,0 +chr8 4789394 . A C 1485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.085;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=28.57;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1514,0,316 +chr8 4789565 . CAT C 1459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.904;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=22.46;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1497,0,1021 +chr8 4822407 . T A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-3.293;DP=71;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:886,0,1588 +chr8 4822834 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=-0.667;DP=55;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:327,0,1603 +chr8 4831046 . G A 4895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.005;DP=182;FS=13.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=26.90;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,128:181:99:4924,0,1320 +chr8 4882722 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-1.504;DP=122;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,20:121:99:400,0,8112 +chr8 4888463 . T A 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.946;DP=138;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=5.32;ReadPosRankSum=2.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,34:138:99:762,0,3849 +chr8 4907059 . G A 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=-1.138;DP=146;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,52:146:99:1693,0,2965 +chr8 4907576 . G C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-1.351;DP=79;FS=3.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:724,0,2027 +chr8 4907671 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.620;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:735,0,1360 +chr8 4907721 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=1.407;DP=47;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:398,0,1263 +chr8 4907833 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-3.016;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,229 +chr8 4907976 . C A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.155;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:657,0,2143 +chr8 4908266 . AT A 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-1.517;DP=73;FS=2.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:501,0,4089 +chr8 4908268 . A C 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-1.251;DP=73;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:501,0,4089 +chr8 4908564 . G T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=1.066;DP=121;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:460,0,5528 +chr8 4908707 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-1.238;DP=80;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:647,0,2861 +chr8 4909582 . C T 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=1.125;DP=84;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,48:84:99:1666,0,1324 +chr8 4910166 . A AT 3488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3526,236,0 +chr8 4910709 . G C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=-0.304;DP=79;FS=7.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=3.54;ReadPosRankSum=2.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:308,0,5655 +chr8 4911034 . G A 3416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.221;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,68:101:99:3445,0,1636 +chr8 4911174 . C T 2635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.878;DP=143;FS=2.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:2664,0,3731 +chr8 4942688 . T C 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-1.463;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=30.35;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:99:787,0,188 +chr8 4942863 . T A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=-0.178;DP=48;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:718,0,960 +chr8 4950117 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=1.707;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=5.68;ReadPosRankSum=2.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:335,0,1530 +chr8 4957812 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-1.122;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:393,0,459 +chr8 4958121 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.568;DP=66;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:308,0,1891 +chr8 4962098 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=1.364;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:329,0,1830 +chr8 4962223 . G T 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=1.489;DP=69;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:1039,0,1340 +chr8 4962382 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=2.187;DP=51;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:240,0,1515 +chr8 4971179 . A G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.509;DP=176;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=18.37;ReadPosRankSum=-2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,100:176:99:3261,0,2545 +chr8 4971470 . G A 2309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.208;DP=206;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,73:206:99:2338,0,6435 +chr8 4971479 . C T 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=-0.174;DP=206;FS=6.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,54:206:99:1100,0,8633 +chr8 4977979 . AAGGTGATATTATGTCTGTTCTTCAGTATAATGATCAATTTAGCAGAAACCATGCTGAAACCATGCAGTGCTAACCAGATATTCTTGTCTTCC A 8139.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=1.713;DP=196;FS=3.156;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=28.32;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,181:182:99:8177,621,0 +chr8 4980211 . AGTAAATCACTTCTACCTTAATCTTCCTAACAAACTGTTAATAAAGCTTGTCCGCTCCGTAATTTTGTTGTCTTTCTGTTTTGTTTTTTTCCACAG A 8787.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=2.088;DP=229;FS=1.259;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=23.55;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,211:221:99:8825,635,0 +chr8 4988397 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:253,0,450 +chr8 4988738 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.731;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:318,0,2377 +chr8 4989019 . G A 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-1.579;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.114;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1323,0,2223 +chr8 4991444 . T G 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.547;DP=109;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:798,0,2966 +chr8 4994455 . G T 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.821;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,41:114:99:1389,0,2483 +chr8 4997498 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=1.484;DP=20;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.269;QD=27.44;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:577,0,117 +chr8 5012554 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-0.597;DP=62;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:401,0,1939 +chr8 5015357 . G C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-0.981;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:356,0,1848 +chr8 5021813 . T A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.368;DP=63;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:710,0,1439 +chr8 5022086 . TA T 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.313;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:461,0,912 +chr8 5022379 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.207;DP=68;FS=5.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.923;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:317,0,2090 +chr8 5022827 . T C 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.793;DP=53;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:853,0,793 +chr8 5022930 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=-2.051;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:968,0,2032 +chr8 5024174 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.251;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:610,0,819 +chr8 5024603 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=-2.523;DP=96;FS=2.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,31:96:99:788,0,3935 +chr8 5025278 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.832;DP=50;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:515,0,2729 +chr8 5025289 . T A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.683;DP=49;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:509,0,2729 +chr8 5025451 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.144;DP=38;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:277,0,1153 +chr8 5025576 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.437;DP=54;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=13.92;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:780,0,1092 +chr8 5025965 . C A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.343;DP=64;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=16.72;ReadPosRankSum=-2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1098,0,1211 +chr8 5026039 . C G 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.972;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:927,0,876 +chr8 5026165 . A G 1584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-1.636;DP=61;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,41:61:99:1613,0,562 +chr8 5026177 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.426;DP=61;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:420,0,1783 +chr8 5026433 . G T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-0.232;DP=57;FS=11.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:1063,0,1004 +chr8 5062739 . T A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.520;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=30.14;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:631,0,356 +chr8 5063158 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=2.374;DP=47;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=4.53;ReadPosRankSum=-2.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:241,0,1368 +chr8 5063437 . C A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.270;DP=51;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=10.54;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:566,0,1197 +chr8 5063801 . T A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.053;DP=49;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:594,0,1432 +chr8 5064042 . T G 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.210;DP=103;FS=1.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:1551,0,1998 +chr8 5066546 . T A 2798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2827,208,0 +chr8 5066574 . C T 1867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.111;DP=62;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=30.13;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,51:62:99:1896,0,129 +chr8 5066701 . C A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-0.468;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,33:97:99:1095,0,2186 +chr8 5066807 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-0.389;DP=105;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:369,0,3216 +chr8 5067589 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-2.557;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:338,0,1106 +chr8 5067611 . T C 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-3.230;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=27.26;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,36:50:99:1391,0,373 +chr8 5068958 . C A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=1.838;DP=70;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:509,0,4141 +chr8 5068960 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=2.078;DP=69;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:497,0,4141 +chr8 5069009 . A C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.028;DP=56;FS=11.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:379,0,1480 +chr8 5069435 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-1.510;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:624,0,1972 +chr8 5069535 . G C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.142;DP=85;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:1030,0,1829 +chr8 5069615 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;ClippingRankSum=0.264;DP=69;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=7.78;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:565,0,1821 +chr8 5072513 . T C 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.242;DP=78;FS=9.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:681,0,1995 +chr8 5072592 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=1.206;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:531,0,1449 +chr8 5072616 . G A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=2.059;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:755,0,1237 +chr8 5077271 . C A 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=2.594;DP=59;FS=3.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=12.83;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:785,0,1308 +chr8 5077445 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=2.025;DP=57;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:323,0,4676 +chr8 5077446 . G C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=1.778;DP=57;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:323,0,4676 +chr8 5077455 . C T 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-0.311;DP=60;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1028,0,1823 +chr8 5079609 . G A 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=1.961;DP=71;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1262,0,1304 +chr8 5091609 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=1.169;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:369,0,1626 +chr8 5095815 . G A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-1.679;DP=64;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:862,0,1384 +chr8 5175492 . C G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=1.072;DP=42;FS=3.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:300,0,1164 +chr8 5175638 . C G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.436;DP=29;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:256,0,1154 +chr8 5175657 . A T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.646;DP=41;FS=3.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:449,0,1201 +chr8 5179808 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.276;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:261,0,545 +chr8 5180051 . G A 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.746;DP=55;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1447,0,366 +chr8 5265866 . C T 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr8 5266291 . C T 314.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=31.42;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:342,0,10 +chr8 5299933 . C A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr8 5302952 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=23.18;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:260,0,100 +chr8 5330590 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.773;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:419,0,413 +chr8 5331476 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=1.216;DP=62;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:278,0,1777 +chr8 5335563 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.342;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:336,0,998 +chr8 5335650 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-1.845;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:366,0,756 +chr8 5342714 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.827;DP=69;FS=5.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:500,0,1798 +chr8 5358386 . G A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=2.108;DP=73;FS=6.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:737,0,1604 +chr8 5366121 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-2.017;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:254,0,801 +chr8 5402968 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=1.037;DP=59;FS=3.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:681,0,2218 +chr8 5418712 . A G 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=2.320;DP=53;FS=12.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:784,0,1121 +chr8 5419182 . C T 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.714;DP=74;FS=10.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=17.98;ReadPosRankSum=2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1359,0,1349 +chr8 5419761 . A C 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=-0.797;DP=83;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:1456,0,1406 +chr8 5429860 . C A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=4.728;DP=69;FS=3.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=6.84;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:500,0,1737 +chr8 5444919 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.636;DP=57;FS=4.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=3.89;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:250,0,2007 +chr8 5445552 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.098;DP=46;FS=2.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:342,0,1320 +chr8 5447164 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.950;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:250,0,1039 +chr8 5447753 . CTGTGTGTGTGTGTG C 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=33;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:99:272,0,1853 +chr8 5448845 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.440;DP=35;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:654,0,579 +chr8 5463275 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.310;DP=68;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:988,0,1336 +chr8 5472069 . A G 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.275;DP=79;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:622,0,2098 +chr8 7464193 . T A 800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:57:829,57,0 +chr8 7472163 . G A 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr8 7472166 . T C 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:283,21,0 +chr8 7557514 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.246;DP=21;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:364,0,418 +chr8 7558387 . T A 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.442;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=24.77;ReadPosRankSum=2.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1217,0,380 +chr8 7592088 . G A 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:585,45,0 +chr8 7592261 . T C 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=-3.322;DP=114;FS=9.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,11:63:99:1208,0,3397 +chr8 7592279 . T C 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-3.803;DP=97;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:1208,0,3317 +chr8 7592345 . A T 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.034;DP=52;FS=8.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:1208,0,3262 +chr8 7592458 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.194;DP=46;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:319,0,711 +chr8 7592898 . T C 214.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:243,0,18 +chr8 7593022 . T A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr8 7867710 . T A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr8 7885198 . CT C 1881.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1919,131,0 +chr8 7972959 . T C 3183.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3212,232,0 +chr8 8029179 . AC A 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr8 8044340 . GT G 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.314;DP=50;FS=8.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,35:41:26:758,0,26 +chr8 8045221 . C T 8017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:8046,577,0 +chr8 8053048 . TCTGTAAATAAAAGCAGTTGGTTGAGGAACAGGTATTGAATGCAGTAATCATAAAGCATCATCTATGAACTCAC T 11505.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-1.460;DP=238;FS=2.201;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=32.84;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,235:238:99:11543,907,0 +chr8 8063281 . G A 1563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1592,123,0 +chr8 8063364 . G A 5404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:5433,391,0 +chr8 8080865 . C T 1407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1436,105,0 +chr8 8102551 . T C 1985.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2014,144,0 +chr8 8106465 . C A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 +chr8 8106540 . A T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr8 8211268 . CAT C 323.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:361,25,0 +chr8 8256438 . T A 2163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.732;DP=49;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:2192,150,0 +chr8 8312635 . A C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr8 8312834 . A T 733.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:762,54,0 +chr8 8317015 . A AT 562.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.980;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:68:649,68,0 +chr8 8317710 . T A 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:556,39,0 +chr8 8319039 . C CT 280.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:318,33,0 +chr8 8349672 . C T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 +chr8 8351341 . C T 944.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:973,69,0 +chr8 8354401 . A T 814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:57:843,57,0 +chr8 8388236 . T C 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:757,60,0 +chr8 8428144 . A T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr8 8428752 . A T 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 +chr8 8429587 . AT A 770.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:79:808,79,0 +chr8 8827238 . C T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.281;DP=43;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:772,0,702 +chr8 8829092 . G A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:351,27,0 +chr8 8829458 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=13.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,834 +chr8 8830026 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-1.030;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:435,0,1044 +chr8 8831022 . C CT 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=20.56;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:70:284,0,70 +chr8 8831389 . T A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.611;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=27.14;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:571,0,245 +chr8 8831602 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=1.838;DP=34;FS=7.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.081;QD=15.17;ReadPosRankSum=-2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:544,0,691 +chr8 8831698 . C T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.538;DP=39;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=20.58;ReadPosRankSum=-2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:831,0,1196 +chr8 8831699 . C T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.109;DP=41;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:831,0,1196 +chr8 8832824 . A T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.498;DP=38;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:480,0,896 +chr8 8881348 . C T 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.370;DP=67;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:1188,0,1194 +chr8 8898433 . G GA 654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:60:692,60,0 +chr8 8971250 . T G 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.640;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1336,0,834 +chr8 9231390 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-1.773;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:401,0,449 +chr8 9396575 . G T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=-1.010;DP=35;FS=1.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:692,0,565 +chr8 9474575 . GAGGTGAAAATTCATGACAGATTTCTCACATTTTTTTAATGGTAACAGTGAGTCAAAATACTGATGAAAAGTGTCTTTTC G 3795.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.118;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=31.98;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,92:94:99:3833,301,0 +chr8 9574461 . G GT 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.493;DP=61;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:298,0,1983 +chr8 9589032 . G A 1487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1516,111,0 +chr8 9589059 . CT C 1944.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1982,150,0 +chr8 9589152 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.310;ClippingRankSum=5.497;DP=53;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=5.64;ReadPosRankSum=-3.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:327,0,1508 +chr8 9591785 . A AAC 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=-0.041;DP=24;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=30.70;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:68:774,0,68 +chr8 9592798 . TA T 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.932;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=7.18;ReadPosRankSum=2.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:260,0,685 +chr8 9593097 . C G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=2.492;DP=45;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:331,0,1276 +chr8 9594250 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.204;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:229,0,624 +chr8 9596292 . C T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 +chr8 9596303 . A G 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 +chr8 10339124 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:290,0,336 +chr8 10339302 . A G 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 +chr8 10966818 . AT A 452.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.945;DP=21;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:29:490,29,0 +chr8 10967468 . G T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr8 10972575 . C CAA 233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 +chr8 10976676 . GT G 220.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:258,27,0 +chr8 11368321 . TA T 234.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:272,27,0 +chr8 11479070 . G A 2613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-1.377;DP=69;FS=1.896;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=30.89;ReadPosRankSum=2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,64:69:99:2642,115,0 +chr8 11479216 . A G 3333.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=1.690;DP=75;FS=2.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=28.58;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,72:75:99:3362,229,0 +chr8 11479225 . T C 3333.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.400;DP=73;FS=3.072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=26.94;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:3362,229,0 +chr8 11497291 . C T 3201.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=2.263;DP=81;FS=2.172;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=34.84;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,78:81:99:3230,234,0 +chr8 11501937 . GT G 899.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.744;DP=57;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,40:54:99:937,0,141 +chr8 11502086 . GT G 1629.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-1.732;DP=59;FS=3.090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=27.62;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:1667,164,0 +chr8 11502296 . T C 4730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.719;DP=118;FS=2.806;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,116:118:99:4759,343,0 +chr8 11502483 . A T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=27.80;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:575,0,253 +chr8 11504964 . C A 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:732,54,0 +chr8 11521458 . A G 733.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:762,54,0 +chr8 11522937 . A T 2317.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2346,166,0 +chr8 11536802 . C G 454.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:483,36,0 +chr8 11545589 . T C 582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:611,45,0 +chr8 11545877 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:357,0,53 +chr8 11555349 . G A 234.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:263,0,21 +chr8 11590698 . AT A 280.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:318,22,0 +chr8 11591226 . AT A 2132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=1.418;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:2170,202,0 +chr8 11595345 . G A 985.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1014,72,0 +chr8 11595633 . TA T 315.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:353,24,0 +chr8 11595639 . C T 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 +chr8 11596532 . A AAC 203.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:4:369,0,4 +chr8 11598193 . CAT C 359.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.393;DP=12;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=29.98;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:21:397,21,0 +chr8 11599602 . T G 811.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-1.514;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=33.82;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:25:840,25,0 +chr8 11640445 . T A 1715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.222;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=31.22;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,43:46:93:1744,93,0 +chr8 11650835 . C T 566.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=37.38;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:593,2,0 +chr8 11663256 . C T 1554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=2.142;DP=44;FS=2.444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=30.10;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:83:1583,83,0 +chr8 11697473 . AGTCAGTACTGCATTATGTTCAACTCGTTCCAGAAAATGTCGTAGTCAGTTCGTTGACTCACATATTTCTGCTCGTGTTTTCACAG A 9835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.989;DP=258;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=31.69;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,247:258:99:9872,0,377 +chr8 11702232 . C A 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=1.856;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=31.02;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:40:990,0,40 +chr8 11702280 . G A 1638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=1.264;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=34.14;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:64:1667,64,0 +chr8 11702345 . G T 1587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1616,103,0 +chr8 11728797 . GCAA G 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,22:22:99:691,0,111 +chr8 11746847 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=29.52;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:47:353,0,47 +chr8 11748775 . G A 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 +chr8 11748988 . C CT 523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:561,42,0 +chr8 11810155 . C T 215.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:11:243,11,0 +chr8 11810825 . G A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr8 12085294 . A T 577.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.868;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=34.66;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:6:605,6,0 +chr8 12086587 . T A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr8 12086602 . G T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:309,21,0 +chr8 12092149 . G GA 402.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=20.14;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:26:476,26,0 +chr8 12095453 . C A 571.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=33.41;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:4:598,4,0 +chr8 12106485 . C A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr8 12199475 . C G 759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:788,54,0 +chr8 12200749 . A G 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:550,39,0 +chr8 12234725 . T C 2304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=-0.185;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2333,174,0 +chr8 12262914 . AT A 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.372;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:62:428,0,62 +chr8 12263809 . C T 420.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=35.19;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:448,0,6 +chr8 12264235 . T G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=24.23;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:319,0,131 +chr8 12264291 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=1.323;DP=17;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:649,0,196 +chr8 12647147 . C A 740.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-1.085;DP=22;FS=8.073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=33.67;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:21:769,21,0 +chr8 12649461 . A T 575.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=30.34;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:602,2,0 +chr8 12667652 . A G 2149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2178,160,0 +chr8 13452645 . T TACCATG 4212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4250,297,0 +chr8 13464513 . T TA 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr8 13464514 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr8 13610994 . A G 5381.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-2.106;DP=134;FS=5.884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=35.30;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,131:134:99:5410,385,0 +chr8 13638446 . AAGGTAACACTTGCTGCCTCTGTACAACTCTTCTCCAGTTCCGTGTGTTCATTTCATATCTTACACTTCTGCTTACTTTATTTTC A 2516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=1.583;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=32.38;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2554,217,0 +chr8 13676147 . TA T 1339.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-1.708;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:1377,145,0 +chr8 13676224 . GT G 2296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:2334,217,0 +chr8 13705325 . T TG 247.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:285,24,0 +chr8 13706820 . C T 318.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.89;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:347,0,15 +chr8 13852690 . G A 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 +chr8 13868979 . TA T 4265.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-1.711;DP=167;FS=8.048;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,141:146:99:4303,426,0 +chr8 13872930 . C T 8240.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:8269,593,0 +chr8 13881819 . T C 1493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1522,114,0 +chr8 14052067 . G T 335.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=33.59;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:364,0,16 +chr8 14114213 . T C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 +chr8 14114232 . A G 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 +chr8 14115166 . C T 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 +chr8 14148211 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=2.027;DP=24;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:305,0,528 +chr8 14519742 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-1.694;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:334,0,484 +chr8 14661255 . C T 969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:998,72,0 +chr8 14688140 . CT C 1619.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=70;FS=3.865;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=23.14;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:1657,166,0 +chr8 14688184 . CA C 1374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1412,101,0 +chr8 14688188 . A T 1383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1412,101,0 +chr8 14688633 . AT A 8114.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-1.061;DP=297;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=27.32;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,273:279:99:8152,803,0 +chr8 14729256 . CA C 711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:74:749,74,0 +chr8 14892518 . T A 3124.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3153,223,0 +chr8 14956754 . C T 1177.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1206,84,0 +chr8 14957154 . A T 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 +chr8 14970981 . CT C 592.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-0.651;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.354;QD=22.80;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:44:630,44,0 +chr8 15020567 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=3.416;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:348,0,272 +chr8 15078068 . C A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 +chr8 15105065 . C T 687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:716,51,0 +chr8 15108636 . G A 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:442,30,0 +chr8 15108642 . G T 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:442,30,0 +chr8 15124179 . G T 391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:420,30,0 +chr8 15315120 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 +chr8 15372050 . A C 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 +chr8 15394844 . AAGGTAATTGCCATTCTGACTTTAAAAAAAAAGAAAAGTTTCCTACTGCAGTTTAATGACATTCACCAC A 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=2.606;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=26.61;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:463,0,1469 +chr8 15484960 . G A 1595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1624,117,0 +chr8 15487271 . T G 996.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1025,69,0 +chr8 15498119 . G A 1023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1052,72,0 +chr8 15595713 . T A 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:632,45,0 +chr8 15597835 . AC A 3315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-1.480;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=28.58;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:3353,323,0 +chr8 15793691 . T G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 +chr8 15803036 . T TA 228.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:266,29,0 +chr8 16016103 . C CT 215.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:253,24,0 +chr8 16019595 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.517;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,218 +chr8 16523887 . CT C 1858.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-2.336;DP=67;FS=7.728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=27.74;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:1896,165,0 +chr8 16573633 . C T 9894.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-1.021;DP=255;FS=1.604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,248:254:99:9923,727,0 +chr8 16632415 . C A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-0.468;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:50:529,0,50 +chr8 16633679 . A T 7365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-2.422;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=33.33;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,178:189:99:7394,470,0 +chr8 16634408 . GA G 2912.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.420;DP=199;FS=8.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,127:178:99:2950,0,874 +chr8 16635083 . GA G 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-1.806;DP=61;FS=9.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:479,0,389 +chr8 16901609 . C T 3290.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.276;DP=77;FS=7.874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:76:99:3319,223,0 +chr8 16908193 . A T 2618.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-1.952;DP=79;FS=10.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=33.15;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,70:79:17:2647,0,17 +chr8 16944877 . T TTG 1409.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.526;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,41:47:24:1447,0,24 +chr8 16952851 . C T 1009.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1038,72,0 +chr8 16952871 . G T 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:835,57,0 +chr8 17001518 . G A 1321.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1350,93,0 +chr8 17001538 . G A 1159.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-0.658;DP=33;FS=5.465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.661;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:8:1187,8,0 +chr8 17038096 . C CA 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.04;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:53:285,0,53 +chr8 17040610 . T C 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr8 17107576 . GGACCTGAAAGAGATAAGATGGCATTATGGGTGCCCAAATAAATTGATGCATGTTTCAGATGTAAGATGTCTATAGACGGATTAAGTACT G 8841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.768;DP=244;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=32.33;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,208:228:99:8879,0,4727 +chr8 17116494 . C T 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:457,33,0 +chr8 17116702 . C CT 599.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:637,54,0 +chr8 17129283 . G GA 296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:334,33,0 +chr8 17135436 . T TA 948.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.545;DP=42;FS=3.641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:82:1024,82,0 +chr8 17199981 . AGTAAGCCTGACTCTCATACATTTAGATTTACACTATATATGTTTTTAAATCAGAAAACCGGTCTTTCATCAG A 1181.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.040;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=31.29;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,29:31:99:1219,0,229 +chr8 17202256 . C G 1533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.416;DP=42;FS=2.356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=24.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:75:1562,75,0 +chr8 17206912 . C G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=2.132;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=30.49;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:81:577,0,81 +chr8 17211368 . T A 240.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:269,0,22 +chr8 17213116 . A T 2435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.329;DP=69;FS=2.235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=31.62;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,65:68:99:2464,197,0 +chr8 17223457 . T A 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:737,51,0 +chr8 17223758 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:309,0,50 +chr8 17232834 . G GA,GAA 526.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.523;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=14.62;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,21,8:31:99:785,191,134,504,0,514 +chr8 17241343 . TCTACGGAGGGAGAAAAATAAGATATTATTCACGATGTGAAAATATGACTATCACCACTATGTTTTTACACAGAGATGACACACATCTGGCCTAC T 1429.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.523;DP=33;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1467,125,0 +chr8 17249156 . C CT 7849.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.999;DP=217;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=30.21;ReadPosRankSum=2.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,211:217:99:7887,631,0 +chr8 17288784 . CTT C,CT 664.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.900;DP=42;FS=2.623;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,15,23:40:99:1032,537,492,393,0,284 +chr8 17575117 . C A 3228.29 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.179;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:3257,258,0 +chr8 17575201 . C G 2728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2757,205,0 +chr8 17583215 . C T 1647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.384;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=34.12;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1676,120,0 +chr8 17676815 . CT C 554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:32:592,32,0 +chr8 17678602 . TCA T 499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:38:537,38,0 +chr8 17694453 . TCCTGAGAAAGAATAGCAAATTATTTCAGACACTTTAAGATGTCTTCCTTTTTGACATATATAAATGTAAATATAAAAATAAATGCGTATAAATATGCTAACATTTTATTCTGAAACGTGACTGATTTA T 2943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=3.285;DP=91;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,78:89:99:2981,0,3856 +chr8 17697273 . ACTGAAATAAAGACGGTTCGTTATGAAGGGTTTAATGTGAACACTCAGCAGGGATCTTGTTGATGAATGTCCAGCATTCCTAC A 3884.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.593;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,84:87:99:3922,352,0 +chr8 17712030 . A AT 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:499,42,0 +chr8 17916123 . CT C 1404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1442,139,0 +chr8 17921708 . C T 2861.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.916;DP=79;FS=1.800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,74:79:99:2890,142,0 +chr8 17926540 . C A 1967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=1.843;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=28.14;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:33:1996,33,0 +chr8 17926547 . C T 1967.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=1.022;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=26.22;ReadPosRankSum=-2.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,46:49:33:1996,33,0 +chr8 18054896 . CCTGGGAACAAAATCTGGAGCAAGTAGATCTGGATTAGTA C 388.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:4:424,0,4 +chr8 18302003 . TGTAAGTAACTACATAATATTTGAAAAAATGTATTAATTTGTCTCTTCTTTTACTGGCAATTGTTATGTTTACATTACAG T 2233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=3.292;DP=61;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=31.38;ReadPosRankSum=-2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,54:61:99:2271,0,1372 +chr8 18307023 . C A 1925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-1.109;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=31.11;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1954,138,0 +chr8 18307119 . A G 775.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.173;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=27.92;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:804,57,0 +chr8 18307168 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:383,27,0 +chr8 18307176 . A T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:383,27,0 +chr8 18307609 . AGTTCTAATAAACCGAAAATATAAGT A 1252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=1.317;DP=43;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=29.13;ReadPosRankSum=-2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,39:43:99:1290,0,2068 +chr8 18307637 . TATTTAACGGTTTGATCCTAAAATGTTTCAATTGTTGTGCATTTTAGAAGAACTTAC T 1252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=3.742;DP=46;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1290,0,2068 +chr8 18309756 . AC A 246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr8 18407333 . T C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-1.427;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=29.51;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:884,0,108 +chr8 18419422 . T C 1507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.140;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=27.93;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1536,108,0 +chr8 18436410 . G T 662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:691,51,0 +chr8 18436601 . G A 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:831,60,0 +chr8 18437389 . C T 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:690,48,0 +chr8 18437777 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=1.870;DP=22;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:317,0,468 +chr8 18503149 . T C 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:726,51,0 +chr8 18503824 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.863;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:30:575,0,30 +chr8 18506863 . G T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr8 18526498 . T C 640.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=35.14;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:668,8,0 +chr8 18545328 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 +chr8 18550257 . C T 11086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.351;DP=292;FS=4.636;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,273:292:99:11115,614,0 +chr8 18551390 . C A 13623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.303;DP=353;FS=0.976;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=29.11;ReadPosRankSum=3.619 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,327:343:99:13652,984,0 +chr8 18554549 . GAC G 9069.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.414;DP=256;FS=0.881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=29.14;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,216:241:99:9107,130,0 +chr8 18555540 . G GT 4567.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-1.569;DP=177;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=25.81;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,151:171:18:4605,0,18 +chr8 18555649 . A T 15837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.439;DP=178;FS=5.256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=27.21;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,169:173:99:15866,1122,0 +chr8 18718159 . G A 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 +chr8 18726582 . A T 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:591,45,0 +chr8 18726865 . C T 677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:706,54,0 +chr8 18730947 . C T 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 +chr8 18764462 . C T 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr8 18775480 . TCTGAGATCATTTGCTGAGGAAACATTTCTTCTTATTACATATGCTTGAATGAAAAAAACAGACACATGCATTTTGCTTGTGCCATTCCGACAGCATACTGTAAAAAGGATAC T 482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=1.444;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:520,0,281 +chr8 18875784 . C G 3955.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.712;DP=101;FS=8.131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=32.03;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,96:101:99:3984,290,0 +chr8 18883598 . A C 3487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-0.981;DP=99;FS=2.968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,89:99:67:3516,67,0 +chr8 18886544 . G T 3193.69 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.405;DP=80;FS=2.619;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=31.39;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3222,232,0 +chr8 18887061 . G A 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 +chr8 18914425 . T G 345.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:374,0,13 +chr8 18939865 . T A 284.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:313,0,15 +chr8 18972852 . C A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr8 19031486 . CCCTAATGAAACAATCCCAAACGACCACATGATGACACAAATGTTTGCACACCAAAACCAAAGTAAATCTGGAATTCAGTA C 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.077;DP=14;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:381,0,1635 +chr8 19037526 . CA C 1076.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.171;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,70:86:99:1184,0,165 +chr8 19065081 . C T 1425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-1.612;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=32.40;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:82:1454,82,0 +chr8 19074225 . T C 2617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2646,178,0 +chr8 19074786 . C T 2192.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.361;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2221,163,0 +chr8 19087571 . G GA 2404.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:2442,167,0 +chr8 19109179 . C T 3585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3614,264,0 +chr8 19115459 . A AT 857 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-1.511;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:12:894,0,12 +chr8 19118586 . G T 1141.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.388;DP=32;FS=2.455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=31.72;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:6:1169,6,0 +chr8 19121362 . G GTA 1750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.021;DP=59;FS=7.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=29.67;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:1788,0,231 +chr8 19121652 . C T 1726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=1.041;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=33.40;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,45:49:55:1755,55,0 +chr8 19135561 . A G 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.348;DP=46;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=30.23;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,38:46:99:1419,0,116 +chr8 19161278 . A T 1797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=1.955;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=34.07;ReadPosRankSum=-2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1826,129,0 +chr8 19167191 . T C 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 +chr8 19171498 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:355,24,0 +chr8 19171505 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 +chr8 19171610 . G A 2401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.314;DP=59;FS=6.247;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=26.44;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,57:59:99:2430,172,0 +chr8 19172251 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-2.637;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:259,0,120 +chr8 19172268 . G A 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:414,30,0 +chr8 19362067 . T C 2921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.723;DP=77;FS=1.909;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,73:77:99:2950,178,0 +chr8 19365902 . T C 687.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.055;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=32.75;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:23:716,0,23 +chr8 19367222 . CT C 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.379;DP=44;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,31:41:99:758,0,107 +chr8 19409134 . GA G 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.929;DP=33;FS=9.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:49:672,0,49 +chr8 19459262 . T C 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 +chr8 19460335 . T TAC 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.667;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:31:491,0,31 +chr8 19573237 . G A 1047.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-0.969;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=33.79;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:7:1075,7,0 +chr8 19722213 . C A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:38:443,0,38 +chr8 19722485 . CA C 209.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:244,0,0 +chr8 19754348 . T G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=27.91;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:391,0,87 +chr8 19754364 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:285,0,57 +chr8 19776075 . CA C 758.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-1.538;DP=31;FS=5.082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:30:796,30,0 +chr8 19808985 . ACAAACACATATACACACACACACACACACACG A 3511.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-1.643;DP=169;FS=10.218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,111:121:99:3549,196,0 +chr8 19881067 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr8 19887938 . G T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.254;DP=18;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:352,0,84 +chr8 19940606 . G A 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:275,21,0 +chr8 20154408 . A G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=1.888;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=34.03;ReadPosRankSum=-1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,83:95:21:3263,0,21 +chr8 20154522 . T C 4197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.292;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.206;QD=30.74;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,102:109:99:4226,248,0 +chr8 20155830 . TA T 350.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.556;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.302;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:14:388,0,14 +chr8 20156232 . C CA 455.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-0.293;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=15.19;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:27:607,27,0 +chr8 20156563 . T TA 1249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-0.807;DP=39;FS=2.191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=32.04;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:33:1287,33,0 +chr8 20524999 . A G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr8 20608142 . C T 473.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.744;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.80;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:4:500,4,0 +chr8 20611896 . GT G 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=2.991;DP=30;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=23.29;ReadPosRankSum=-2.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:736,0,125 +chr8 20733419 . AT A 312.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:350,33,0 +chr8 20734231 . AC A 205.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:7:242,0,7 +chr8 20835018 . A AT 266.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:1:301,0,1 +chr8 20835123 . C CT 727.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 +chr8 20882907 . C T 329.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=29.96;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:357,0,7 +chr8 20909808 . G C 568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:597,45,0 +chr8 20909940 . G T 571.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:600,42,0 +chr8 20964397 . AT A 625.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-1.253;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:3:661,3,0 +chr8 20986336 . GCCAGGTACATCACACACCCTTGTCTTTTTATGCTAACCACTGTCATAAACCTACGTCAGAAGTATCATTCATGGGCTGCTCTATGAATAAAACTCATCTCCTGTTACTC G 7063.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=2.347;DP=225;FS=11.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=31.39;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,203:213:99:7101,0,652 +chr8 20988399 . CAA C 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=3.464;DP=27;FS=8.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=12.40;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:531,0,190 +chr8 20988652 . AT A 4548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.816;DP=184;FS=3.512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,162:179:99:4586,316,0 +chr8 20989982 . C CAA 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.608;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:363,0,338 +chr8 20990043 . TA T 894.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.798;DP=46;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:932,0,122 +chr8 20990116 . G GA 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.967;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:38:332,0,38 +chr8 21009230 . T TC 683.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:49:957,49,0 +chr8 21097133 . T TA 841.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-2.006;DP=50;FS=6.368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.878;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,44:46:89:1001,89,0 +chr8 21097392 . CA C 2197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=-0.267;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=32.46;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:2235,151,0 +chr8 21097635 . AT A 1371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=1.127;DP=89;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,58:75:99:1411,0,161 +chr8 21097878 . A AAG 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=1.667;DP=16;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=30.48;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:34:525,0,34 +chr8 21411134 . T C 3211.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-1.244;DP=83;FS=4.959;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,79:83:99:3240,238,0 +chr8 21411229 . TGGTGCGCTCATTCTGAATAGTCTGGATGAGGATTACATACATGTATTATATTTACATGCACAACGTCTTACATGATCCAATGTCTGTCTTCTGCA T 4058.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=1.803;DP=88;FS=2.583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=27.89;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,84:87:99:4096,410,0 +chr8 21414257 . A ATCT 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=2.577;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:656,0,169 +chr8 21606389 . T C 1461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1490,105,0 +chr8 21677938 . T C 414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:443,30,0 +chr8 21679187 . GCTGCAATGTAAAAAGAAGGAAATTAATTAACAAAGTTGGACTTACTGTACATTTACTTATTTATCCATGTACATCTCCCAC G 1479.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=2.314;DP=36;FS=2.653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=24.00;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1517,111,0 +chr8 21679536 . C T 1342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=-1.628;DP=33;FS=3.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:96:1371,96,0 +chr8 21744055 . AAGGTAAAATGGCTGAAATCTGCATCAGCACTGTTTTGTGAATATGGAAACCGATTTTCAAATATAAAAATAATCATTGCTAATGCGATGTGATGTTCAATCCTGC A 16796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=419;FS=3.105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=34.04;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,418:419:99:16834,1484,0 +chr8 21747743 . AGTAAGTGCTATAAAGACAGCAACTGTCAGCAAATTGCTTGCTTTTTATAGCTGATCAAAAGTAATGATCTTTCTGTCTTTTTTTGCCAG A 20819.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.430;DP=455;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=27.71;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,454:455:99:20857,1741,0 +chr8 21751819 . CGTGAGTCTTTGACAAGTCTTAATTTCTTACAGACTGTGTAAAGTAAAAATATGAAATATGTTAACATTTTTGTGTCTTCTCAATAAAG C 2289.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=1.722;DP=355;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=6.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,343:344:99:2327,803,0 +chr8 21751961 . AGTGAGTGTCCACAATTTGGTGGTAACACAGTTTGAAATCTCAGTACTTAAATGGTTTGGTTAACCATTGTTATTTATAATAG A 15574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-2.023;DP=431;FS=2.312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.702;QD=33.00;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,409:412:99:15781,1208,0 +chr8 21783458 . C CT 6410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.374;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=28.93;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:6448,430,0 +chr8 21783835 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.416;DP=103;FS=5.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.632;QD=1.95;ReadPosRankSum=2.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,15:103:99:229,0,6503 +chr8 21783890 . A G 6609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-1.719;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=30.79;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,22:31:54:6638,54,0 +chr8 21783900 . A G 6574.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=-0.680;DP=47;FS=1.648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,29:36:21:6603,21,0 +chr8 21783916 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=1.149;DP=65;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,9:65:99:256,0,6503 +chr8 21783993 . A G 6550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=1.950;DP=106;FS=2.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=27.70;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,78:97:80:6579,0,80 +chr8 21784125 . A G 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.624;DP=68;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1067,0,2512 +chr8 21784169 . A G 2840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-0.165;DP=111;FS=17.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,76:110:99:2869,0,1102 +chr8 21784171 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=5.184;DP=112;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=2.81;ReadPosRankSum=-4.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:343,0,3421 +chr8 21784393 . A G 2460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=2.464;DP=77;FS=8.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=31.96;ReadPosRankSum=-2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,49:76:99:2489,0,716 +chr8 21784438 . A G 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.874;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:902,0,921 +chr8 21784467 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.244;DP=88;FS=4.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:271,0,3088 +chr8 21787346 . TCAA T 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=2.491;DP=140;FS=15.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=2.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:361,0,167 +chr8 21788554 . G GT 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.174;DP=197;FS=3.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,51:172:99:501,0,2425 +chr8 21789784 . C T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.633;ClippingRankSum=3.966;DP=25;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=31.95;ReadPosRankSum=-4.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:827,0,1143 +chr8 21862382 . AGTGAGTCGCTTTTGTGTCACTTTTGACTTTTCTCATTTTGCTTTCGGCACACATGTCTTAGTCAAAAAAAAGCAAAGCGATTATGTGTGACTTCATGTTTTTCTCCTTTTGCTCTGAGCAG A 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=2.162;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=26.81;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:99:635,0,757 +chr8 21906381 . G T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=2.895;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=33.67;ReadPosRankSum=-2.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:870,0,259 +chr8 21906382 . A T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=3.004;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=31.18;ReadPosRankSum=-3.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:870,0,271 +chr8 21933569 . GGGTGAGCAAGCTTAAGACAGGGGAAAAAGTCAGGTAAAATAACTCCTGTATCTATTTTGATAACCTATATGAAATTTCTTTAAA G 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:250,0,825 +chr8 22890928 . TA T 603.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:641,63,0 +chr8 22892148 . G A 633.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:13:662,13,0 +chr8 22894841 . C T 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 +chr8 22900786 . A T 658.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=24.11;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:16:687,16,0 +chr8 22937263 . T C 2233.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2262,160,0 +chr8 22943032 . T A 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1067,75,0 +chr8 22945984 . C T 284.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:313,21,0 +chr8 22946868 . A G 790.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:819,57,0 +chr8 22947333 . G A 424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:453,33,0 +chr8 22947358 . T C 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 +chr8 22949259 . C T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:672,45,0 +chr8 22949268 . G T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:672,45,0 +chr8 22949425 . T A 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:629,45,0 +chr8 22949546 . T C 1766.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1795,126,0 +chr8 22949596 . A C 2584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2613,184,0 +chr8 22949872 . A G 2757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2786,199,0 +chr8 22950026 . T A 1045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1074,75,0 +chr8 22952995 . C CT 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.961;DP=28;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:456,0,145 +chr8 22953043 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.868;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:432,0,311 +chr8 22954087 . C T 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:831,63,0 +chr8 22963525 . A G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=1.686;DP=25;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=26.91;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:701,0,143 +chr8 22965624 . T G 2516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2545,178,0 +chr8 22967481 . A T 2496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.188;DP=68;FS=8.278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=34.96;ReadPosRankSum=-1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,63:68:99:2525,104,0 +chr8 22967489 . A G 3252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3281,223,0 +chr8 22970012 . A C 2195.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2224,156,0 +chr8 22970108 . G A 1203.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1232,87,0 +chr8 22970162 . A G 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 +chr8 22970194 . C A 220.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:249,0,24 +chr8 22970218 . A G 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:566,42,0 +chr8 22970414 . T A 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 +chr8 22970419 . T C 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:525,36,0 +chr8 23107632 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr8 23111124 . A G 1148.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1177,87,0 +chr8 23111244 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +chr8 23111823 . T A 1548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1577,111,0 +chr8 23111856 . A C 843.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:872,63,0 +chr8 23111914 . C G 837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:60:866,60,0 +chr8 23111922 . A C 837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:866,60,0 +chr8 23112036 . A G 762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:791,57,0 +chr8 23115634 . G C 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:721,51,0 +chr8 23115648 . C T 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 +chr8 23119437 . G A 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:398,27,0 +chr8 23129916 . C CA 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.381;DP=293;FS=11.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,54:284:99:346,0,6264 +chr8 23130319 . A C 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1369,108,0 +chr8 23130498 . T A 2028.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2057,159,0 +chr8 23130723 . A T 4406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:4435,325,0 +chr8 23133400 . ACTGGACACAGTTTAGAATACATCATTACTAAATCACAAAAACACCACCACACAAGTCAAAATCAAGCAGGAGAGTTTCACAC A 13684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=1.957;DP=349;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=29.71;ReadPosRankSum=-1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,329:333:99:13722,1002,0 +chr8 23133635 . T C 4171.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=1.373;DP=106;FS=3.721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:4200,310,0 +chr8 23139928 . G T 4615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-0.389;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=30.52;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,111:117:99:4644,298,0 +chr8 23146225 . A G 11280.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=268;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,268:268:99:11309,817,0 +chr8 23152221 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr8 23161987 . C T 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:887,63,0 +chr8 23215424 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.206;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:618,0,117 +chr8 23216863 . A T 1811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-1.827;DP=51;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=29.44;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,45:51:32:1840,0,32 +chr8 23217074 . A AC 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=2.783;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:274,0,271 +chr8 23240986 . A G 842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:871,60,0 +chr8 23248830 . T A 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 +chr8 23347143 . C A 747.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-1.531;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=33.99;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:20:776,0,20 +chr8 23347344 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,105 +chr8 23347838 . AT A 275.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:313,31,0 +chr8 23347883 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=1.902;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:454,0,239 +chr8 23348899 . CA C 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=1.371;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:59:294,0,59 +chr8 23350474 . A T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr8 23350574 . CGTAAGAAGCTTTCCTTTTTGTCTATGTATGCAGGGGACATGAAGTTATAATACATGACTAATACATGTAATTGTTTGTTTGCAG C 2491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=7.710;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=23.73;ReadPosRankSum=-3.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,66:105:99:2529,0,16522 +chr8 23351889 . C T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:534,0,367 +chr8 23352217 . A AT 451.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:489,35,0 +chr8 23356447 . C G 976.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=34.88;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,25:28:3:1003,3,0 +chr8 23356513 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:349,0,223 +chr8 23356574 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-1.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:252,0,260 +chr8 23356637 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=19.05;ReadPosRankSum=2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:314,0,207 +chr8 23356781 . C G 1059.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.069;DP=30;FS=5.999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:3:1086,3,0 +chr8 23357219 . T A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=1.845;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:440,0,156 +chr8 23357405 . A T 360.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.81;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:388,0,5 +chr8 23364464 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.368;DP=25;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=28.75;ReadPosRankSum=2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:747,0,135 +chr8 23364801 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:385,0,81 +chr8 23365521 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,103 +chr8 23374936 . A C 7280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=4.001;DP=222;FS=15.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=32.80;ReadPosRankSum=-3.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,162:221:99:7309,0,1078 +chr8 23378181 . T C 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=1.942;DP=139;FS=19.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=11.26;ReadPosRankSum=-3.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,50:139:99:1594,0,3075 +chr8 23378559 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=-1.854;DP=87;FS=14.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:266,0,2599 +chr8 23384135 . A G 4215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.014;DP=168;FS=20.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=25.09;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,115:168:99:4244,0,1454 +chr8 23396837 . C T 409.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=34.15;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:0:435,0,0 +chr8 23434398 . G A 210.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:239,0,19 +chr8 23434443 . G A 425.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=32.73;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:452,0,3 +chr8 23434490 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.085;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=32.72;ReadPosRankSum=1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:33:519,0,33 +chr8 23456972 . T C 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:444,33,0 +chr8 23466977 . C CG 430 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-1.475;DP=21;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:12:467,0,12 +chr8 23472290 . A ATTGGGTGGATGCATAGCGGGAGGATGGATG 390.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=20;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:16:428,0,16 +chr8 23592511 . G T 393.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=32.77;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:420,0,4 +chr8 23607730 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr8 23859137 . CA C 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.287;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:36:499,0,36 +chr8 23893418 . A AT 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:40:383,0,40 +chr8 23893497 . T TA 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.085;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:50:325,0,50 +chr8 23952919 . GA G 210.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:248,24,0 +chr8 23954223 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr8 23954674 . T A 1141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1170,78,0 +chr8 23955318 . C CA 286.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:394,41,0 +chr8 23956057 . A AT 1734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1782,173,0 +chr8 23962422 . G A 3968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.557;DP=130;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=30.53;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,109:130:99:3997,0,645 +chr8 23962833 . T C 5135.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5164,379,0 +chr8 23971524 . ATT A 2778.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,71:78:99:2816,126,0 +chr8 23972641 . CA C 2190.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-1.185;DP=100;FS=1.297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,82:95:30:2228,30,0 +chr8 23972795 . T TA 1641.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-0.583;DP=73;FS=1.736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=22.49;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,59:66:66:1679,66,0 +chr8 24032779 . T TTA 325.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.616;DP=21;FS=2.762;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=15.50;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:7:362,7,0 +chr8 24034491 . A AT 914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.208;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=28.59;ReadPosRankSum=-2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:52:952,52,0 +chr8 24035437 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr8 24035730 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=24.05;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:413,0,166 +chr8 24047252 . TC T 2470.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2508,245,0 +chr8 24048340 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.756;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:285,0,4910 +chr8 24057031 . AT A 367.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:405,39,0 +chr8 24064206 . CT C 1099.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.147;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:24:1137,0,24 +chr8 24068244 . CCAGGTACAAACAAAGCATCACATCAGTACCACAATGACTGCATTACAAATACACACAATACAGTCAGCTCTCACTGTGCCAAAAGCTCAAGGTGTTCTTGCACGG C 11110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.152;DP=270;FS=2.215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=31.89;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,266:270:99:11148,947,0 +chr8 24068586 . C T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.006;DP=68;FS=8.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.089;QD=19.29;ReadPosRankSum=5.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,42:68:99:1340,0,1205 +chr8 24068733 . CT C 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.483;DP=48;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:321,0,459 +chr8 24068761 . CT C 712.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.435;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:48:750,48,0 +chr8 24068858 . C CAA 622.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:51:660,51,0 +chr8 24105338 . G A 1494.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1523,103,0 +chr8 24113809 . G A 1323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-1.516;DP=38;FS=2.258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=34.84;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:35:1352,35,0 +chr8 24233104 . AT A 2703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=-0.744;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,103:120:99:2741,0,365 +chr8 24233674 . TTA T 4182.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=1.053;DP=123;FS=16.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=34.01;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,104:123:99:4220,0,260 +chr8 24400809 . G A 2203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.124;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,60:77:99:2232,0,342 +chr8 24406662 . T C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=1.986;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=17.37;ReadPosRankSum=-2.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:532,0,537 +chr8 24406925 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=1.631;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:402,0,375 +chr8 24407420 . T TA 506.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-1.135;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:16:563,0,16 +chr8 24407543 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=2.749;DP=33;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:560,0,288 +chr8 24407883 . TC T 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=2.525;DP=42;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:485,0,469 +chr8 24407897 . A C 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=2.304;DP=33;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=14.08;ReadPosRankSum=-3.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:493,0,660 +chr8 24408427 . C T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=-0.721;DP=36;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:903,0,401 +chr8 24410097 . GA G 865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=1.951;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:54:903,0,54 +chr8 24433794 . T TTC 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.452;DP=38;FS=9.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:740,0,116 +chr8 24493045 . T C 7424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=1.730;DP=221;FS=4.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=33.60;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,177:221:99:7453,0,2176 +chr8 24500332 . T A 12490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.320;DP=355;FS=8.406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.653;QD=33.73;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:35,320:355:99:12519,286,0 +chr8 24527783 . CGA C 620.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:658,51,0 +chr8 24528074 . A T 341.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:4:368,4,0 +chr8 24528269 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr8 24528282 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr8 24534636 . T C 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:439,30,0 +chr8 24536865 . C T 2015.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2044,147,0 +chr8 24536920 . G T 2310.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2339,166,0 +chr8 24543671 . T A 966.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:995,72,0 +chr8 24543695 . G A 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-0.867;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:803,57,0 +chr8 24543873 . C T 789.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.441;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=29.58;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:15:818,0,15 +chr8 24543932 . C G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:270,0,64 +chr8 24544576 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:361,0,144 +chr8 24544595 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:361,0,144 +chr8 24544765 . G T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:79:434,0,79 +chr8 24544777 . C T 322.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:351,0,15 +chr8 24545387 . T C 255.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:284,0,22 +chr8 24552126 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=-0.397;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:470,0,39 +chr8 24559414 . TA T 275.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:313,30,0 +chr8 25639445 . A T 761.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.867;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=33.12;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:17:790,0,17 +chr8 25640687 . CT C 490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.124;DP=43;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:528,0,224 +chr8 25742173 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:273,0,60 +chr8 25743048 . G GT 281.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=23.43;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:4:317,4,0 +chr8 25745369 . G A 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr8 25791290 . C T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 +chr8 25825382 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.986;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=28.22;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:1044,0,236 +chr8 25880686 . G A 2427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=1.871;DP=73;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=33.26;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,64:73:51:2456,0,51 +chr8 25895492 . G GA 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-0.217;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:90:288,0,90 +chr8 25895719 . C A 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.791;DP=43;FS=7.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=31.02;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,33:43:99:1362,0,563 +chr8 25896464 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=4.116;DP=38;FS=20.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=16.55;ReadPosRankSum=-3.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:657,0,669 +chr8 25900636 . G C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=2.646;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:306,0,296 +chr8 25938474 . G A 3066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.589;DP=104;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=29.49;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,86:104:99:3095,0,271 +chr8 25943116 . C A 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-0.323;DP=49;FS=5.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:1447,0,239 +chr8 25969465 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:311,0,98 +chr8 25969502 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,126 +chr8 26043205 . G A 461.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=32.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:488,0,4 +chr8 26070664 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.237;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:553,0,316 +chr8 26074182 . A T 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 +chr8 26074312 . T C 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 +chr8 26133792 . C T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.881;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,36:42:57:1382,0,57 +chr8 26144421 . A T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.318;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=32.34;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:675,0,28 +chr8 26145435 . A T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:46:570,0,46 +chr8 26145551 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:88:413,0,88 +chr8 26146007 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.191;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=33.04;ReadPosRankSum=-1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:28:755,0,28 +chr8 26146127 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=1.501;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=31.42;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:65:751,0,65 +chr8 26149913 . TGTAATGTGTACTACAATGTTGGTGGATTTTTTCATAATGTGATACAAGTCATTAATAATAAGTTCAATTAATTTACCTGCAG T 7422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.994;DP=171;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=29.80;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,165:171:99:7460,596,0 +chr8 26150608 . T TA 2121.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.513;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,75:92:99:2159,0,175 +chr8 26150807 . A G 2279.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.460;DP=61;FS=2.366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=29.51;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,56:61:87:2308,87,0 +chr8 26153454 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:424,0,85 +chr8 26154128 . T C 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 +chr8 26156752 . A T 2084.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=2.020;DP=55;FS=2.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2113,108,0 +chr8 26164027 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:260,18,0 +chr8 26176445 . C T 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 +chr8 26183008 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.933;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:348,0,177 +chr8 26183124 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=28.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:315,0,55 +chr8 26205474 . G C 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.710;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.236;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:502,0,197 +chr8 26207495 . C T 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-1.236;DP=37;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1149,0,203 +chr8 26221394 . A G 268.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:297,24,0 +chr8 26252868 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr8 26277601 . G A 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.107;DP=26;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=32.11;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:46:863,0,46 +chr8 26305032 . G A 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.780;DP=28;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:87:889,0,87 +chr8 26419162 . G GA 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.667;DP=18;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:75:318,0,75 +chr8 26443005 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.337;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:576,0,235 +chr8 26446911 . G A 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.957;DP=67;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,35:63:99:1147,0,997 +chr8 26666709 . TCTGAAGCACAGACAGTTTGTTAGCAGTACAACTCATAAAATATCATTAATAACCAAAGAATAAACTACAAATCACAAAAGGGAGCTCAC T 9701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-1.357;DP=223;FS=2.164;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,207:223:99:9739,815,0 +chr8 27075795 . ACTATAAGAGAGAAAGAAAGACTCAATTAATCTTCTCGCCTGTATAATTGCACAGTTGACAGCTGGGAAGAGTGGTAGTATTTCATTCGCTTAGGAAGATGACATGACTATTAATTAC A 679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.598;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=35.88;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:717,0,787 +chr8 27221334 . GA G 2140.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.568;DP=126;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,84:113:99:2178,0,411 +chr8 27279768 . G GT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.596;DP=87;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:314,0,1513 +chr8 27919232 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 +chr8 28058320 . C T 3133.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=1.224;DP=79;FS=6.012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=30.75;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,74:77:99:3162,223,0 +chr8 28058487 . C T 4481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=2.104;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,53:61:99:4510,111,0 +chr8 28058488 . C A 4434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=2.026;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,54:62:64:4463,64,0 +chr8 28058559 . C T 1784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.049;DP=71;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=25.14;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:1813,0,971 +chr8 28058783 . A AT 797.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.449;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:38:835,38,0 +chr8 28058820 . G A 1911.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=-0.706;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=30.12;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:99:1940,145,0 +chr8 29120996 . G GA 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-2.040;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=1.37;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,35:161:99:269,0,3310 +chr8 29316751 . GA G 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.315;DP=49;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:626,0,347 +chr8 29318280 . G GT 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.586;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:38:665,0,38 +chr8 29380932 . TA T 1537.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=1.665;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,63:92:99:1575,0,408 +chr8 29558196 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=1.358;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:439,0,209 +chr8 30436479 . C T 288.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:317,0,19 +chr8 30443363 . T TA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-0.739;DP=25;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:250,0,252 +chr8 30613134 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=3.415;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=15.99;ReadPosRankSum=-2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:364,0,374 +chr8 30621169 . T A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.343;DP=64;FS=3.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,43:64:99:1477,0,568 +chr8 30621423 . CT C 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.263;DP=36;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:629,0,151 +chr8 30622667 . A AAT 621.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.019;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:659,0,387 +chr8 30667473 . G A 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-1.448;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,52:71:99:1867,0,461 +chr8 30750946 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=21.44;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,136 +chr8 30755456 . C A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr8 30773740 . C T 508.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.085;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:8:536,8,0 +chr8 30918060 . GA G 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-1.563;DP=51;FS=13.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:64:893,0,64 +chr8 30918136 . GA G 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=-0.802;DP=33;FS=16.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:457,0,156 +chr8 31007462 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:267,0,53 +chr8 31169947 . GT G 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.866;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:246,0,262 +chr8 31172847 . C G 381.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=34.73;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:410,0,13 +chr8 31207929 . G T 577.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-0.913;DP=18;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=32.10;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:25:606,0,25 +chr8 31226093 . G C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.146;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:375,0,249 +chr8 31272183 . G A 361.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:24:390,0,24 +chr8 31418616 . AAGGTGGATGAGATCATCAGAAATGCTCTTCTACTGCCAAAAAAATCAGCTTTTTGTTGACTGTTTTCAATCTGGTCTCTCTGTGTGTTC A 1118.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=2.627;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=32.42;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:99:1156,0,1590 +chr8 31442585 . A T 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=-1.881;DP=35;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:962,0,262 +chr8 31442693 . T C 944.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.352;DP=25;FS=3.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:37:973,37,0 +chr8 31442953 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,325 +chr8 31442954 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,325 +chr8 31479228 . GGGTACCTCACTATTATCAAACTGTGATCTACATTAACCTTTACTGTGTTAAAAAGTTGATTTGCTCTGTTCTGGTGTGGCCACA G 794.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=2.342;DP=56;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=14.19;ReadPosRankSum=-3.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:832,0,11088 +chr8 31578479 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-1.006;DP=23;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:693,0,102 +chr8 31579833 . T A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=4.282;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:561,0,700 +chr8 31592510 . G A 4446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-1.422;DP=149;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=29.84;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,116:147:99:4475,0,598 +chr8 31675106 . G GA 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-0.766;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:31:756,0,31 +chr8 31795094 . G GA 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=-0.783;DP=31;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:436,0,107 +chr8 31993816 . AAC A 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.454;DP=31;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:364,0,244 +chr8 32216395 . GCTTTGGGAAGAAAAGAAGAAGCAATATTAATACCCCGTGCAAATGTAGGTGTTGATAAGAGTGTGGTGAAGAGGAGGTGATCTACTCAC G 3175.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.942;DP=80;FS=1.904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=30.08;ReadPosRankSum=-2.934 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,72:76:99:3213,250,0 +chr8 32223282 . T TA 1794.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1950,192,0 +chr8 32224357 . G T 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=1.037;DP=271;FS=8.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,59:270:99:1000,0,7874 +chr8 32229836 . G A 5621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.571;DP=195;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.584;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,149:195:99:5650,0,2529 +chr8 32234474 . A AG 283.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 +chr8 32236214 . G A 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 +chr8 32254806 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=3.462;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=13.85;ReadPosRankSum=-3.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:333,0,832 +chr8 32254815 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=23.44;ReadPosRankSum=-2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:99:333,0,831 +chr8 32290220 . A T 11003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.400;ClippingRankSum=0.246;DP=349;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=31.53;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,283:348:99:11032,0,851 +chr8 32290839 . G T 5495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=-0.639;DP=204;FS=6.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=26.94;ReadPosRankSum=4.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,139:203:99:5524,0,1625 +chr8 32291110 . T G 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=4.205;DP=76;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=9.27;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:733,0,2327 +chr8 32304850 . TA T 242.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:280,27,0 +chr8 32698967 . C T 604.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=24.19;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:6:632,6,0 +chr8 32699297 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.506;DP=21;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:565,0,150 +chr8 32743682 . A G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 +chr8 32747817 . T A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 +chr8 32748464 . C T 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.655;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:99:1899,0,100 +chr8 32790141 . C T 221.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:250,21,0 +chr8 32878219 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.385;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,440 +chr8 32878579 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.042;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=29.47;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:34:559,0,34 +chr8 33229590 . C T 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.622;DP=69;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=23.01;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,45:68:99:1616,0,794 +chr8 33260189 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=1.139;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.877;QD=16.73;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:413,0,392 +chr8 33260202 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=1.602;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:537,0,444 +chr8 33273484 . G A 370.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=33.73;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:399,0,13 +chr8 33650180 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-0.337;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:527,0,276 +chr8 33884282 . G T 6754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DP=221;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,175:220:99:6783,0,785 +chr8 34779124 . G T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=-1.335;DP=162;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:579,0,4974 +chr8 35223846 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-1.912;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:256,0,1777 +chr8 35226379 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-2.019;DP=80;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:301,0,2510 +chr8 35232024 . G A 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.581;DP=88;FS=1.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:632,0,2305 +chr8 35791191 . A G 366.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=33.29;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:10:394,0,10 +chr8 38611988 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.507;DP=58;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,11:58:99:230,0,1851 +chr8 38913868 . G A 951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:980,72,0 +chr8 38932290 . A G 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr8 38932292 . A T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr8 38932411 . A T 1291.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1320,90,0 +chr8 38932434 . C T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.237;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=34.71;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,36:39:44:1382,0,44 +chr8 38932602 . A G 1596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1625,114,0 +chr8 38932716 . C A 2157.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2186,154,0 +chr8 38932979 . C T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr8 38933210 . T C 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 +chr8 38933233 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=2.115;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:367,0,199 +chr8 38934079 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=2.045;DP=41;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=6.51;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,774 +chr8 38934080 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-3.364;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.26;ReadPosRankSum=3.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:367,0,662 +chr8 39738386 . ACACG A 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=1.803;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:463,0,370 +chr8 39925353 . C T 1915.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1944,141,0 +chr8 39926606 . T G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.826;ClippingRankSum=-0.615;DP=143;FS=29.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=4.22;ReadPosRankSum=-3.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,29:130:99:631,0,4184 +chr8 39926691 . G C 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.344;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:1087,0,2176 +chr8 39926731 . C A 638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:667,48,0 +chr8 39928202 . C T 1900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1929,132,0 +chr8 39928795 . A T 3312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:3341,229,0 +chr8 39928799 . T G 3312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3341,229,0 +chr8 39929543 . A T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.118;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:620,0,165 +chr8 39929594 . G T 227.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=10;FS=8.451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:11:255,11,0 +chr8 40114323 . A C 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:234,18,0 +chr8 40141206 . A G 1193.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=1.625;DP=62;FS=9.031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=19.26;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:5:1221,5,0 +chr8 40141215 . T C 1199.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=2.192;DP=33;FS=12.330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:13:1228,13,0 +chr8 40141306 . C A 15086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=2.098;DP=493;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.473;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,334:337:99:15115,1098,0 +chr8 40141426 . C T 3990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=1.595;DP=160;FS=7.542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=24.94;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,96:98:99:4019,283,0 +chr8 40141431 . A G 4211.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.540;DP=145;FS=7.767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=29.05;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,90:92:99:4240,286,0 +chr8 40141455 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=2.262;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:71:291,0,71 +chr8 40148703 . G GTC 1465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=4.675;DP=106;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=13.83;ReadPosRankSum=-3.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1503,0,1024 +chr8 40199646 . C T 233.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:262,0,19 +chr8 41013701 . A G 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 +chr8 41478086 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=1.344;DP=14;FS=11.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=25.20;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:381,0,124 +chr8 41802500 . GA G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.876;DP=19;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:243,0,210 +chr8 41803044 . TA T 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.453;DP=19;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:278,0,166 +chr8 41819982 . C CA 901.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=-0.794;DP=60;FS=2.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,43:57:99:1079,0,203 +chr8 41821862 . AC A 1345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.627;DP=53;FS=19.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=25.39;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,41:53:99:1383,0,220 +chr8 42034364 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.931;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:304,0,94 +chr8 42060805 . A G 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 +chr8 42063634 . G A 476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:505,36,0 +chr8 42063876 . C G 1114.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-0.042;DP=50;FS=3.289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:42:1143,42,0 +chr8 42191347 . C G 3340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.196;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=28.55;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,91:117:99:3369,0,562 +chr8 42191616 . T TAA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.420;DP=43;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:538,0,312 +chr8 42191711 . GT G 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=-0.151;DP=41;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=7.63;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:350,0,325 +chr8 42191858 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-2.246;DP=35;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:273,0,952 +chr8 42192423 . G T 2984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.589;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.989;QD=26.89;ReadPosRankSum=1.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,79:111:99:3013,0,839 +chr8 42525785 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:389,0,341 +chr8 42525826 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=2.141;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:561,0,148 +chr8 42526925 . G A 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.546;DP=55;FS=10.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:1122,0,701 +chr8 42620237 . GA G 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=1.327;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:20:468,20,0 +chr8 42620436 . A G 897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:926,63,0 +chr8 42620758 . T A 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr8 42621111 . A T 1086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1115,78,0 +chr8 42621283 . A G 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1096,81,0 +chr8 42621386 . G T 612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:641,45,0 +chr8 42621425 . C CT 231.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:269,24,0 +chr8 42621660 . A C 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 +chr8 42621710 . A T 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:850,60,0 +chr8 42621859 . A C 949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:978,70,0 +chr8 42621954 . AT A 374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:412,33,0 +chr8 42622342 . T C 1533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1562,111,0 +chr8 42622527 . A C 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=-1.204;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=29.11;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:50:1080,50,0 +chr8 42622588 . A G 1004.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1033,75,0 +chr8 42622688 . G A 580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:609,42,0 +chr8 42622784 . T C 1255.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1284,93,0 +chr8 42623222 . A G 3178.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3207,229,0 +chr8 42623975 . A T 2645.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2674,204,0 +chr8 42627246 . T C 2419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2448,178,0 +chr8 42627321 . A C 1880.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1909,135,0 +chr8 42627480 . T C 1695.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1724,123,0 +chr8 42785179 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr8 42785231 . C T 336.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:365,30,0 +chr8 43500645 . AAGGTCAGTCTTGGAAGAGGTCTGATTCTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCATTTAAAACATTTATCTCTCTTTTTGTCTTCATATTCTCACTC A 6356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=1.491;DP=151;FS=3.452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=32.91;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,144:151:99:6394,473,0 +chr8 43501255 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,253 +chr8 43501256 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=23.68;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:265,0,98 +chr8 43501292 . A G 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=2.250;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=31.04;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:77:618,0,77 +chr8 43501401 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-2.849;DP=37;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=15.05;ReadPosRankSum=2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:585,0,824 +chr8 44070728 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:278,0,138 +chr8 44131478 . T C 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 +chr8 44939390 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:293,0,99 +chr8 44947853 . A ATC 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:255,0,95 +chr8 44948032 . G A 230.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:259,0,13 +chr8 45027460 . A G 246.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:275,0,16 +chr8 45030235 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.86;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:63:333,0,63 +chr8 45137459 . T C 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.633;QD=26.03;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:653,0,138 +chr8 45194740 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,182 +chr8 45421280 . G GA 1214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=1.802;DP=50;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=24.29;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1339,0,706 +chr8 45422264 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=3.684;DP=45;FS=11.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=6.24;ReadPosRankSum=-3.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:309,0,2383 +chr8 45439640 . G A 2502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.650;DP=93;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,79:93:78:2531,0,78 +chr8 45522987 . G A 2616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-1.938;DP=100;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=26.17;ReadPosRankSum=2.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,72:100:99:2645,0,639 +chr8 45794509 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=1.152;DP=28;FS=9.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:475,0,526 +chr8 45794530 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-0.437;DP=47;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:820,0,794 +chr8 45794633 . C T 258.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:287,0,19 +chr8 45794893 . A C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.209;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:275,0,242 +chr8 45795167 . T C 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.245;DP=97;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:1368,0,1812 +chr8 45795288 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:300,0,384 +chr8 45795896 . G A 5616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.301;DP=171;FS=3.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:5645,0,1108 +chr8 45795943 . T C 2940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.434;DP=259;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,85:196:99:2969,0,6224 +chr8 45838192 . ATG A 849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=3.444;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=12.68;ReadPosRankSum=-2.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:887,0,911 +chr8 45838375 . A AT 816.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=-0.913;DP=51;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,34:46:99:854,0,170 +chr8 45913260 . C G 1167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1196,81,0 +chr8 45913261 . A C 1167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1196,81,0 +chr8 46171488 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:331,0,45 +chr8 46310613 . T A 286.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:315,0,19 +chr8 46321436 . AT A 500.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.185;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=33.38;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:36:538,0,36 +chr8 46321658 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.752;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=28.21;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:41:395,0,41 +chr8 46321758 . A G 909.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.324;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:7:937,0,7 +chr8 46321997 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.749;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,281 +chr8 46321999 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.118;DP=14;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:372,0,55 +chr8 46396937 . A G 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.334;DP=25;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=30.95;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:43:802,0,43 +chr8 46459446 . TGTGAGTCCTGACTGATTGTTATTATTACATTTAGTTTTTTTCCCCAACTAAATTCTGCCACTCTTTTTTTGCTTGTGTATTAAATGTCGGTTGTCCTGACAG T 4221.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.844;DP=123;FS=2.168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=34.32;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,120:123:99:4259,384,0 +chr8 46490950 . C G 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 +chr8 46504228 . G A 973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.317;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1002,72,0 +chr8 46529582 . A T 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-0.080;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=31.40;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:1190,0,425 +chr8 46529585 . T A 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-1.093;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=32.27;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1190,0,407 +chr8 46529693 . T A 1638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1667,117,0 +chr8 46530213 . G A 1937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.631;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=29.81;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,52:65:99:1966,0,220 +chr8 46530941 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-0.347;DP=49;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:241,0,1482 +chr8 46531565 . G A 1356.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1385,99,0 +chr8 46533171 . A G 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.271;DP=63;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.127;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,51:63:99:1962,0,188 +chr8 46533216 . A G 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.169;DP=62;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=29.45;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,50:62:99:1854,0,199 +chr8 46534060 . T G 1149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.299;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1178,84,0 +chr8 46534090 . A T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.675;DP=33;FS=11.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:74:1068,0,74 +chr8 46535036 . C T 613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:642,45,0 +chr8 46535045 . T A 613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:45:642,45,0 +chr8 46604935 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr8 46604942 . A T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:259,18,0 +chr8 46799410 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:86:324,0,86 +chr8 46799924 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:429,0,214 +chr8 46835195 . TCTAAGAGACGGAAAGCAACAAATGCAATTTGTATTAATATTATTACAGTAATATTAGTGTTCACCAGGGTCACAATAAGCTATATAAAGCAAAATATGCCATGACGTAC T 1056.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.285;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=31.39;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:1094,0,236 +chr8 47138006 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:246,0,373 +chr8 47485632 . GCCTGACAAAACAGAAGACTTGTAATATCAAATAGACATTCAAGAAATAGGTAGAATTTTTACAGAATTCATTA G 2228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.670;DP=66;FS=5.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=33.77;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,56:61:99:2266,0,564 +chr8 47511150 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr8 47918125 . T C 4110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.262;DP=93;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:4139,0,6679 +chr8 47918216 . T C 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=1.414;DP=73;FS=7.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,54:73:99:674,0,8654 +chr8 47918341 . T C 3516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.655;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=31.76;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,65:69:99:3545,254,0 +chr8 47918404 . T C 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.770;DP=68;FS=7.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:562,0,2015 +chr8 47918408 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.689;DP=69;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:401,0,2070 +chr8 47921660 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:63:274,0,63 +chr8 47928750 . CCCTATAAAGGAACAATATGAAAAATCAACTCATTCACAGCCAGCTCACACAAATGAGCGGAGAGTCCAAAGTAGAGCATA C 1441.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=3.414;DP=267;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.223;QD=5.40;ReadPosRankSum=-3.434 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,252:259:99:1479,574,0 +chr8 48373619 . T A 9637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.658;DP=372;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=25.91;ReadPosRankSum=3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,255:372:99:9666,0,3037 +chr8 48418956 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.430;DP=79;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:229,0,2491 +chr8 48467072 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.654;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:293,0,2092 +chr8 48482197 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.021;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:402,0,604 +chr8 48534036 . G T 4837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=1.105;DP=166;FS=3.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=29.14;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,125:166:99:4866,0,931 +chr8 48914636 . A AT 281.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:319,30,0 +chr8 49053014 . A G 1480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-0.558;DP=57;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:1509,0,577 +chr8 49053291 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.762;DP=78;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:338,0,4627 +chr8 49081929 . GCCTACGAATTAAAGTGATTTCAAAGATTAGCATATTGTTCAGACACTGACATAAACTTGGATTTATTAGTATTGTATGTATTGCCAAAGAAACAAAGTTAAGATACTTA G 1189.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=2.598;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1227,0,1630 +chr8 49300176 . C CA 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.427;ClippingRankSum=-1.280;DP=463;FS=10.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:321,89:410:99:594,0,7726 +chr8 49300296 . T G 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=-6.409;DP=59;FS=18.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,33:57:99:1122,0,1184 +chr8 49300297 . C T 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=-6.489;DP=59;FS=25.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.099;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1115,0,1184 +chr8 49300791 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=2.496;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:241,0,1105 +chr8 49300991 . T G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=-1.006;DP=386;FS=30.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,58:384:99:528,0,12136 +chr8 49303205 . CCCTAAAATTCAAGAAAAGCATCCATCAGTCAAAAAAGCAGCTTCCAATTTAATTTACTGACTGATGCTCAGGCATCACCAAAAGCATA C 4428.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:4466,438,0 +chr8 49303586 . C T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-2.498;DP=411;FS=14.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=2.28;ReadPosRankSum=3.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:339,72:411:99:966,0,12738 +chr8 49388926 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.633;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:520,0,1360 +chr8 49734538 . T G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr8 49815650 . A T 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.220;DP=314;FS=20.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,68:314:99:1304,0,9414 +chr8 49864558 . C CA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.659;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,34:149:99:393,0,3137 +chr8 49880644 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.576;DP=190;FS=15.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,39:189:99:714,0,5489 +chr8 49914835 . T TA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=1.282;DP=40;FS=5.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:250,0,709 +chr8 50023782 . C A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=1.542;DP=146;FS=4.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,23:146:99:332,0,9558 +chr8 50023786 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=1.442;DP=141;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=2.20;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,23:141:99:338,0,9558 +chr8 50076335 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.295;DP=72;FS=5.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:487,0,2003 +chr8 50106541 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:300,0,493 +chr8 50706354 . T TA 323.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:37:368,37,0 +chr8 50768532 . AAGGTAAGACTTAAAAATCTTAATATTCATCAAAAAGCGAAGTGAATGATTACTAATAAATCACATGCGACCTCTTTC A 1505.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-0.510;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=24.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1543,127,0 +chr8 50775561 . G A 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:533,36,0 +chr8 50821111 . A T 1329.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1358,96,0 +chr8 51058695 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr8 51058738 . G T 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 +chr8 51061686 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr8 51061695 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 +chr8 51064963 . C T 689.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:718,51,0 +chr8 51069832 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 +chr8 51072846 . G A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr8 51074438 . C A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr8 51074990 . C A 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr8 51075020 . G A 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:477,33,0 +chr8 51352985 . AG A 374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=1.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:31:412,31,0 +chr8 51352988 . T A 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:31:412,31,0 +chr8 51465212 . A G 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 +chr8 51465369 . C A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr8 51466994 . G A 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 +chr8 51467822 . G A 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 +chr8 51467931 . T C 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 +chr8 51467947 . T A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 +chr8 51467981 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 +chr8 51468116 . C A 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 +chr8 51479693 . A C 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 +chr8 51479719 . C CA 277.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:315,30,0 +chr8 51480668 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:260,18,0 +chr8 51480699 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.380;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,182 +chr8 51480787 . T C 1441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:99:1470,99,0 +chr8 51480797 . C T 856.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.908;DP=24;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=35.81;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:885,60,0 +chr8 51480917 . A T 618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:49:647,49,0 +chr8 51480998 . GA G 407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:36:445,36,0 +chr8 51481431 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=13.28;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:254,0,141 +chr8 51482251 . C T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 +chr8 51482494 . T C 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:470,33,0 +chr8 51485091 . C G 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:630,48,0 +chr8 51569542 . A G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 +chr8 51569549 . A G 1006.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 +chr8 51569771 . CAT C 299.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:337,30,0 +chr8 51571502 . TA T 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.633;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:430,0,144 +chr8 51576285 . G A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 +chr8 51581619 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr8 51664985 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 +chr8 51665275 . TG T 1700.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1738,130,0 +chr8 51706158 . G A 1276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1305,96,0 +chr8 51706182 . C T 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 +chr8 51996330 . G T 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1086,78,0 +chr8 52006706 . A AC 9025.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.738;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=26.69;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,207:209:99:9198,616,0 +chr8 52006712 . G A 9934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,223:223:99:9963,680,0 +chr8 52006988 . CA C 6310.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.040;DP=225;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,204:214:99:6348,618,0 +chr8 52007029 . T TG 717.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.360;DP=101;FS=2.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,38:56:99:755,0,358 +chr8 52010217 . CA C 822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.268;DP=42;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=19.59;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,32:40:67:860,0,67 +chr8 52010957 . T TTG 343.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.738;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=24.54;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3:379,0,3 +chr8 52012425 . G A 1319.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1348,93,0 +chr8 52012702 . G A 581.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:610,42,0 +chr8 52016559 . C T 14528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=359;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,359:359:99:14557,1092,0 +chr8 52020619 . A G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:343,24,0 +chr8 52020887 . CT C 548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:586,52,0 +chr8 52021291 . A G 726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:755,54,0 +chr8 52021335 . A T 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 +chr8 52022566 . C A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 +chr8 52024956 . C A 3860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3889,276,0 +chr8 52027310 . C T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 +chr8 52047542 . A C 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1020,72,0 +chr8 52080766 . T A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 +chr8 52081019 . CT C 257.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:295,27,0 +chr8 52081047 . T C 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 +chr8 52082247 . A G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:651,48,0 +chr8 52082521 . A C 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 +chr8 52115239 . A T 939.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:968,75,0 +chr8 52127140 . G T 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:656,45,0 +chr8 52127369 . G A 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:435,33,0 +chr8 52127632 . T G 710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:739,51,0 +chr8 52127903 . G A 520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:549,39,0 +chr8 52127986 . A T 653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:682,48,0 +chr8 52128790 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr8 52128904 . A T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:338,24,0 +chr8 52128918 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:290,21,0 +chr8 52129075 . G T 637.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-1.335;DP=19;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=33.57;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:23:666,0,23 +chr8 52129093 . C G 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:903,66,0 +chr8 52129237 . T G 513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:542,39,0 +chr8 52129266 . C T 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:524,39,0 +chr8 52129293 . C T 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:658,48,0 +chr8 52145269 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.394;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.771;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:266,0,736 +chr8 52281249 . C A 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 +chr8 52432017 . G A 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 +chr8 52569141 . A T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 +chr8 52573362 . T A 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 +chr8 52575180 . C A 279.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:308,0,17 +chr8 52575455 . A T 249.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:278,0,22 +chr8 52576204 . T G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.58;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:264,0,106 +chr8 52577067 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:280,0,66 +chr8 52613152 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr8 52613435 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=1.545;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:616,0,406 +chr8 52613869 . C T 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr8 52614153 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:344,0,288 +chr8 52615209 . GA G 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.673;DP=28;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:376,0,285 +chr8 52615336 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-2.670;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=32.25;ReadPosRankSum=2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:66:512,0,66 +chr8 52624363 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.990;DP=110;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,29:110:99:691,0,3115 +chr8 52632606 . T A 1921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.425;DP=68;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,51:68:99:1950,0,413 +chr8 52644356 . T A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:408,0,202 +chr8 52647703 . C G 3308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3337,237,0 +chr8 52647722 . C T 4408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4437,316,0 +chr8 52756176 . G GA 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.334;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:319,0,420 +chr8 53216141 . A G 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-0.311;DP=58;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:1082,0,1056 +chr8 53216272 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.691;DP=37;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:616,0,706 +chr8 53216427 . T C 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=-0.550;DP=62;FS=1.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,43:62:99:1644,0,526 +chr8 53216614 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=2.488;DP=23;FS=7.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:476,0,728 +chr8 53216641 . A T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=2.233;DP=22;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:399,0,822 +chr8 53217978 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=2.065;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=21.56;ReadPosRankSum=-2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:783,0,468 +chr8 53218308 . G T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=1.426;DP=37;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=21.48;ReadPosRankSum=2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:823,0,1155 +chr8 53218309 . AG A 785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.163;DP=38;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=20.68;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:823,0,1155 +chr8 53218370 . G T 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=2.117;DP=42;FS=10.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=27.26;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,31:42:99:1173,0,265 +chr8 53218673 . C T 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.621;DP=31;FS=4.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=30.09;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:93:1381,93,0 +chr8 53218905 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,326 +chr8 53222270 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:434,0,239 +chr8 53228889 . C T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=4.455;DP=47;FS=23.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=19.29;ReadPosRankSum=-3.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:935,0,2171 +chr8 53231260 . T A 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=-0.941;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=27.85;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,44:61:99:1727,0,421 +chr8 53231605 . T G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-1.926;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.894;QD=15.22;ReadPosRankSum=2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:576,0,678 +chr8 53232021 . C A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr8 53232955 . A G 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.570;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=28.22;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1016,0,184 +chr8 53233095 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.331;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=30.24;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:875,0,489 +chr8 53235298 . C G 1235.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:99:1264,99,0 +chr8 53235395 . CA C 1226.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=30.89;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:99:1264,99,0 +chr8 53235540 . A T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.091;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:552,0,1351 +chr8 53235573 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=1.018;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:552,0,1315 +chr8 53235833 . A AC 370.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:408,30,0 +chr8 53236228 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=-1.501;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:322,0,335 +chr8 53236715 . T C 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=-1.878;DP=58;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,36:57:99:1250,0,659 +chr8 53236811 . T C 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-1.050;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1060,0,361 +chr8 53431404 . T G 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:882,63,0 +chr8 53433636 . A G 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:657,48,0 +chr8 53593319 . G GAC 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:251,0,53 +chr8 53598659 . C T 6450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=1.536;DP=185;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=34.87;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,169:185:99:6479,231,0 +chr8 53606452 . CACCTGTGTGCAAAAACAGGCCTCTGTGAGTTCATCTGTTTACAGCCAAACACAGACAACTAATCAAAGAATTAATCATTTTAATTAATGCAAGACTT C 8031.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=1.243;DP=177;FS=3.237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,176:177:99:8069,708,0 +chr8 53608888 . T C 6024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.869;DP=167;FS=1.079;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=27.84;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,153:167:99:6053,231,0 +chr8 53636792 . GCACCTAGGTTTTAAACACATGCATCAGATGCAGTACCATCATAATTACCCATCATGCCACGATAACCGGATGAAAAGTCT G 3035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:3073,251,0 +chr8 53653517 . T G 233.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:262,0,22 +chr8 53709853 . T C 1379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1408,102,0 +chr8 53711256 . CA C 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=30.16;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:369,0,148 +chr8 53711422 . T G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr8 53719478 . T C 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.227;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=23.99;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:412,0,316 +chr8 53719484 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=32.94;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:412,0,316 +chr8 53719828 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-2.855;DP=13;FS=12.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:321,0,124 +chr8 53724045 . G A 1584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.633;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=31.12;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1613,129,0 +chr8 53735129 . C T 335.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:364,27,0 +chr8 54000265 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=1.317;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:392,0,992 +chr8 54000269 . A G 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.526;DP=36;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:825,0,181 +chr8 54055436 . C T 205.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:234,0,21 +chr8 54055633 . T C 785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.387;DP=20;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=25.69;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:814,57,0 +chr8 54200065 . T A 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 +chr8 54203657 . G A 557.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-0.373;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=32.81;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:25:586,0,25 +chr8 54203914 . C T 696.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:725,51,0 +chr8 54213525 . G A 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 +chr8 54219504 . A C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.774;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:326,0,128 +chr8 54228241 . T C 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:445,33,0 +chr8 54229991 . T C 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 +chr8 54290849 . T A 2786.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=1.357;DP=79;FS=5.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,71:79:15:2815,15,0 +chr8 54293824 . G T 3545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.315;DP=90;FS=2.130;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,87:90:99:3574,262,0 +chr8 54294153 . G A 2481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.465;DP=69;FS=1.647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=29.05;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,62:68:69:2510,69,0 +chr8 54294213 . T C 2188.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=1.161;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=28.03;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:2217,120,0 +chr8 54294240 . G A 2242.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=1.670;DP=57;FS=2.788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=28.45;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:57:99:2271,166,0 +chr8 54304909 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=3.269;DP=17;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=11.87;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:230,0,381 +chr8 54307961 . T C 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.671;DP=58;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=30.81;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,45:58:99:1815,0,718 +chr8 54307964 . G A 1786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-1.234;DP=54;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=33.09;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,41:54:99:1815,0,707 +chr8 54308228 . G A 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=2.080;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=30.49;ReadPosRankSum=-2.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:99:1148,0,103 +chr8 54315942 . C A 2630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=1.396;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,67:72:99:2659,123,0 +chr8 54320318 . G A 1236.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.277;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:99:1265,109,0 +chr8 54321231 . T A 2449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=-0.493;DP=81;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=30.24;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,67:81:99:2478,0,200 +chr8 54323697 . C T 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=-0.607;DP=104;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,87:104:99:3264,0,180 +chr8 54346123 . G T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=2.848;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,510 +chr8 54346130 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=2.524;DP=14;FS=8.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=18.98;ReadPosRankSum=-2.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:294,0,510 +chr8 54348453 . T C 2190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.486;DP=66;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=33.19;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,57:66:63:2219,0,63 +chr8 54349056 . G T 1920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.435;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.67;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,53:66:99:1949,0,259 +chr8 54359603 . G T 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.247;DP=43;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=30.16;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:43:83:1325,0,83 +chr8 54361218 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=2.342;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:806,0,102 +chr8 54361376 . T C 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=2.509;DP=30;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:838,0,177 +chr8 54364169 . G A 1856.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.364;DP=56;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=33.16;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:0:1882,0,0 +chr8 54386485 . T C 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:349,27,0 +chr8 54386984 . T C 1256.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1285,90,0 +chr8 54387082 . G A 2237.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.490;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=30.43;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,47:50:81:2266,81,0 +chr8 54387092 . C T 2227.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.389;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:71:2256,71,0 +chr8 54387455 . A T 1439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1468,101,0 +chr8 54421198 . A G 1878.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.066;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=33.54;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,50:56:8:1906,0,8 +chr8 54626021 . A G 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.112;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:378,0,824 +chr8 54626036 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.049;DP=29;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:305,0,1083 +chr8 54626471 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.655;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:434,0,1118 +chr8 54730437 . G T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 +chr8 54976904 . GTGCAACAGCTTGACATTTTATGATGTTTCACAAATGATATTATAATTTTCTTTTATTGTTTGCTA G 12048.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-1.227;DP=255;FS=3.185;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=32.82;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,254:255:99:12130,1136,0 +chr8 54976973 . CAAACCATTTTAACCCTGTATTTGTAATCTTTTAGGAGGT C 11055.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.094;DP=275;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,273:275:99:11093,1129,0 +chr8 55062885 . A C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.926;DP=18;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:419,0,163 +chr8 55062945 . T C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=2.708;DP=32;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:490,0,740 +chr8 55063063 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.074;DP=62;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:507,0,1068 +chr8 55063164 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.305;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:381,0,488 +chr8 55118753 . G GATCTTTAGAGTCTTTTGCGGGATCTTTAGAGTCTTTTGCGGGATC 1037.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=-0.324;DP=42;FS=9.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=24.71;ReadPosRankSum=-3.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:1075,0,566 +chr8 55130760 . GT G 210.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-0.348;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:245,0,0 +chr8 55176223 . TC T 1650.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-2.123;DP=126;FS=11.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=13.10;ReadPosRankSum=2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,74:96:99:1688,0,221 +chr8 55176248 . GT G 4101.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.229;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=34.03;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:4139,399,0 +chr8 55176250 . GTGTGTGTGTGT G 2215.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=1.361;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,94:96:99:3988,301,0 +chr8 55179607 . C T 14377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=359;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,359:359:99:14406,1078,0 +chr8 55236398 . C T 11037.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=286;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,285:285:99:11066,841,0 +chr8 55236482 . T A 8942.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:228:99:8971,685,0 +chr8 55248353 . T C 590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:619,42,0 +chr8 55248362 . G A 590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:619,42,0 +chr8 55265202 . G A 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:449,36,0 +chr8 55282021 . A T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:245,18,0 +chr8 55282022 . T A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:245,18,0 +chr8 55282073 . C T 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 +chr8 55301635 . C T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 +chr8 55314571 . G A 213.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.56;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:242,0,15 +chr8 55321100 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:315,0,49 +chr8 55326895 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-1.197;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=31.40;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:77:562,0,77 +chr8 55348137 . A G 612.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.714;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=32.44;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:16:641,16,0 +chr8 55350739 . AGTAAGCCCTCAACCACAGCTATAATGCTCAATATCCATCTGTTCGCTTGTTTAATGGTTAGTTTCCTCTGTGTTTGTGTGTGCAG A 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=34.22;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:927,0,1155 +chr8 55354810 . CCAATATCAGTCTCTCAGAGCAAACAAAGCAGAAGATCCTTCACTCAGAGCAAACAAAACT C 1055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,1:4:99:1093,0,125 +chr8 55355867 . G A 559.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:588,45,0 +chr8 55356119 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr8 55357777 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:29:309,0,29 +chr8 55359795 . G A 925.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=1.280;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=33.04;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:12:953,0,12 +chr8 55359860 . G GT 787.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DP=47;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:825,0,240 +chr8 55359928 . G A 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=5.364;DP=49;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=18.14;ReadPosRankSum=-5.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:917,0,715 +chr8 55364751 . A AAT 292.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:330,27,0 +chr8 55364957 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:287,0,55 +chr8 55365554 . G A 450.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=32.18;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:3:477,3,0 +chr8 55366005 . CA C 576.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=-0.125;DP=29;FS=2.269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:13:614,13,0 +chr8 55366014 . A T 870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.952;DP=30;FS=6.576;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=29.02;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:43:1062,43,0 +chr8 55382143 . A T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:303,21,0 +chr8 55396617 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.830;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:248,0,379 +chr8 55397579 . GA G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:277,0,54 +chr8 55398427 . G A 557.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=34.87;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:584,2,0 +chr8 55403048 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.093;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,544 +chr8 55405558 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 +chr8 55405611 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 +chr8 55408219 . T A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 +chr8 55408343 . T C 3297.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-1.142;DP=91;FS=1.649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.87;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,83:91:93:3326,93,0 +chr8 55545621 . G A 1879.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.083;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=34.81;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,50:54:80:1908,80,0 +chr8 55550189 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.405;DP=42;FS=3.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:86:1324,0,86 +chr8 55550398 . A T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr8 55556010 . CGT C 939.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=1.648;DP=122;FS=22.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:977,0,1735 +chr8 55556112 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=-1.092;DP=83;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:245,0,3108 +chr8 55556212 . T G 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=16;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:99:1283,0,2237 +chr8 55556222 . T C 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=26.02;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:1283,0,2222 +chr8 55556280 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=-1.839;DP=135;FS=15.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:1283,0,2237 +chr8 55557098 . A T 797.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=1.552;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:13:826,0,13 +chr8 55557107 . A T 822.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=-0.057;DP=23;FS=3.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=27.41;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:24:851,24,0 +chr8 55558047 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=24.57;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:495,0,193 +chr8 55558398 . T C 1169.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-1.096;DP=34;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=34.41;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:27:1198,0,27 +chr8 55558696 . C A 1403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.714;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=27.15;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1432,99,0 +chr8 55558835 . T C 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:489,36,0 +chr8 55559010 . A G 1342.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-1.733;DP=32;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=25.76;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1371,93,0 +chr8 55559084 . T G 946.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=31.25;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:975,66,0 +chr8 55667158 . CG C 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=17;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=15.57;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:55:355,0,55 +chr8 55764021 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=2.850;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=25.49;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:436,0,119 +chr8 55785604 . A G 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 +chr8 55785651 . G A 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:413,30,0 +chr8 55789692 . A T 1456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.964;DP=42;FS=1.969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=34.68;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,38:42:39:1485,39,0 +chr8 55805646 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.481;DP=38;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:304,0,1003 +chr8 55856476 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=23.81;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:314,0,401 +chr8 56081058 . TATGAAGATG T 487.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=1.504;DP=20;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=24.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:38:525,38,0 +chr8 56085422 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,1:3:47:244,0,47 +chr8 56085427 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,1:3:47:244,0,47 +chr8 56085674 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=3.179;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=14.94;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:312,0,1206 +chr8 56085679 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=3.096;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=14.94;ReadPosRankSum=-3.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:312,0,1200 +chr8 56085933 . A G 876.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:63:905,63,0 +chr8 56151694 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=20.71;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:256,0,709 +chr9 30926 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=2.331;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:291,0,905 +chr9 50485 . G A 1782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=2.327;DP=40;FS=10.726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=26.90;ReadPosRankSum=1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:99:1811,123,0 +chr9 54872 . A G 2052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.096;DP=489;FS=3.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:382,107:489:99:2081,0,19544 +chr9 152372 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=2.571;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:433,0,930 +chr9 165331 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=2.410;DP=46;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=7.52;ReadPosRankSum=-2.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,10:46:99:374,0,3500 +chr9 165335 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=2.915;DP=53;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=6.39;ReadPosRankSum=-2.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:367,0,3500 +chr9 166158 . G T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.892;ClippingRankSum=0.086;DP=83;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:470,0,3854 +chr9 167211 . A C 2420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=-1.417;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=14.24;ReadPosRankSum=2.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,70:170:99:2449,0,3310 +chr9 181244 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=1.261;DP=58;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.183;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:442,0,1632 +chr9 184612 . TGGTAATCACACACTCGACTCTTCTAACATGTATTTGCTGGATCTTAATATAACTTTAATCTGACTTTGTGATCCACTCA T 3991.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.930;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=25.68;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,92:94:99:4029,295,0 +chr9 210140 . C T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.701;DP=146;FS=5.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,39:145:99:894,0,3987 +chr9 210772 . CGTACGTCTCCTCATACACCCAGATCCTGAAGCAGACATCTTAATGCTGTGAATCTGTTATTAACGTCTGTCAGTTTCCTCTTCAG C 6381.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=1.543;DP=168;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=31.05;ReadPosRankSum=-0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,166:168:99:6419,528,0 +chr9 217346 . G A 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=1.126;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:868,0,1634 +chr9 227908 . GA G 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:252,0,251 +chr9 229593 . C T 4912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-0.492;DP=370;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,142:369:99:4941,0,7752 +chr9 230878 . C T 2135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=-1.733;DP=276;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,86:276:99:2164,0,7150 +chr9 230895 . T A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.526;DP=242;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,64:242:99:1453,0,6757 +chr9 231203 . TAG T 2145.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2183,189,0 +chr9 247146 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.778;DP=16;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:241,0,788 +chr9 251022 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.177;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:325,0,201 +chr9 251118 . G T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:71:458,0,71 +chr9 251130 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=28.81;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:43:374,0,43 +chr9 271716 . A C 1425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=-1.049;DP=77;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,45:77:99:1454,0,972 +chr9 271740 . G A 1754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.779;DP=114;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=15.39;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1783,0,1798 +chr9 289511 . C CGTG 261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:20:299,20,0 +chr9 326494 . C A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.517;DP=74;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:512,0,2143 +chr9 327394 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=1.799;DP=33;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:252,0,926 +chr9 332604 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.240;DP=122;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,27:121:99:391,0,3122 +chr9 381661 . G T 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.202;DP=51;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,41:51:99:1502,0,177 +chr9 381732 . ACAGGTCATCATCCCTGCAGTCATACACCGACACACACACGCTCGTGCGCAGAACATCTTCACTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG A 2974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=2.381;DP=71;FS=3.030;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=26.12;ReadPosRankSum=-2.414 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:3012,230,0 +chr9 400744 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=-1.804;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,20:112:99:322,0,3572 +chr9 402879 . C T 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.306;DP=95;FS=2.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:787,0,2435 +chr9 404637 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=-0.888;DP=90;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:309,0,2621 +chr9 412926 . A C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-2.558;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=6.41;ReadPosRankSum=-4.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:259,0,1085 +chr9 413010 . G A 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:48:678,48,0 +chr9 418830 . C A 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.907;DP=171;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,46:171:99:1040,0,4613 +chr9 422863 . C T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.979;DP=169;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,39:169:99:792,0,4868 +chr9 423420 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.154;DP=96;FS=2.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=4.66;ReadPosRankSum=2.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:476,0,2672 +chr9 427380 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-2.213;DP=213;FS=0.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,50:211:99:905,0,5631 +chr9 427659 . AACTCACCTGCACACACACCATTCACTGGTTCATCATCCTCCTCCTCTGCTCCTCCTTCATCATCGTCTGCTCT A 7661.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.902;DP=184;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,156:160:99:7699,695,0 +chr9 429900 . G GAC 221.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:13:259,13,0 +chr9 431792 . ACT A 402.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 +chr9 444024 . G T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.615;DP=138;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,35:138:99:781,0,3719 +chr9 453791 . GGGTAGGGCGCGCTCGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGACCTGAATGTGTGTGTGTGTTCTCTCCACA G 18310.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.238;ClippingRankSum=1.244;DP=435;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=35.07;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,421:435:99:18348,1543,0 +chr9 457372 . C A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.046;ClippingRankSum=0.930;DP=318;FS=17.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=3.01;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,93:305:99:984,0,10855 +chr9 458857 . A G 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.326;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:973,0,210 +chr9 458908 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-2.815;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:389,0,1307 +chr9 458958 . A G 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.483;DP=61;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,30:61:99:1062,0,1113 +chr9 459840 . C T 1745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-0.413;DP=255;FS=2.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.953;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,77:254:99:1774,0,5650 +chr9 459935 . AGCCGCAGGTAGGCC A 6034.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.491;DP=252;FS=8.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.547;QD=23.95;ReadPosRankSum=-3.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,171:243:99:6072,0,2903 +chr9 459938 . CGCAGGTAGGCCACCGCACGGCATGCTGGGAGTCAGCTGTACGTACCAAAGAGTGTTAAACTCTGCTTCACTGTCTGCCCCG C 1375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-0.923;DP=258;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=5.33;ReadPosRankSum=3.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,67:237:99:1413,0,7371 +chr9 459952 . CGCACGGCATGCTGGGAGTCAGCTGTACGTACCAAAGAGTGTTAAACTCTGCTTCACTGTCTGCCCCG C 6034.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.731;DP=249;FS=7.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,161:230:99:6072,0,2887 +chr9 461593 . TA T 584.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-0.020;DP=34;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:622,0,183 +chr9 462355 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.535;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:300,0,491 +chr9 464286 . T TTACAGTAATGATACTCG 946.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,1:2:99:9012,568,0 +chr9 468315 . TACACACACACACACACACGCACACACACACACACACAC T,TACACAC 355.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=5.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,6:13:99:799,355,749,444,0,332 +chr9 489989 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.365;DP=15;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,302 +chr9 489997 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.365;DP=15;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,302 +chr9 494709 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.964;DP=32;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:236,0,823 +chr9 495679 . G T 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=1.681;DP=71;FS=8.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1176,0,1358 +chr9 495709 . C T 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=-2.529;DP=64;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:873,0,1257 +chr9 513172 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.535;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:367,0,1570 +chr9 524718 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:309,0,56 +chr9 526588 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=2.298;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:282,0,205 +chr9 568744 . T C 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.935;DP=67;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,32:67:99:1201,0,1267 +chr9 568998 . G A 682.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=38.34;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:18:711,18,0 +chr9 569016 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=4.042;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=7.91;ReadPosRankSum=-3.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:234,0,756 +chr9 569244 . T C 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.649;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.693;QD=14.13;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:1568,0,2058 +chr9 575141 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.115;DP=73;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:400,0,1914 +chr9 583795 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=2.502;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:452,0,2947 +chr9 586209 . C G 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.941;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:1479,0,1828 +chr9 588682 . C T 1926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.542;DP=139;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1955,0,2719 +chr9 597095 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.233;DP=68;FS=6.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=12.23;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:860,0,2364 +chr9 610067 . G A 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-1.168;DP=87;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:1513,0,1471 +chr9 697597 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=1.359;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:495,0,1405 +chr9 697619 . C A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.568;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:388,0,1289 +chr9 701001 . A AAC 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=-0.951;DP=68;FS=2.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:281,0,1414 +chr9 707445 . C G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.349;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:572,0,2009 +chr9 717679 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=-0.427;DP=70;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:282,0,4226 +chr9 726631 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-0.575;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:244,0,2566 +chr9 743920 . TA T 504.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:542,52,0 +chr9 882130 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:329,0,275 +chr9 901053 . T G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=1.726;DP=54;FS=4.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:303,0,1481 +chr9 956707 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:455,0,671 +chr9 1011400 . T A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.830;DP=62;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=6.50;ReadPosRankSum=2.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:431,0,2731 +chr9 1167647 . C G 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=-0.705;DP=44;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:775,0,1038 +chr9 1167669 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.919;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:398,0,384 +chr9 1181119 . G C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.110;DP=70;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:266,0,2170 +chr9 1186156 . A T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.354;DP=47;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:408,0,1207 +chr9 1192690 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.278;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:241,0,1700 +chr9 1197662 . A G 281.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:310,0,19 +chr9 1197670 . A G 315.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=31.59;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:344,0,16 +chr9 1197770 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=-1.226;DP=48;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:260,0,1418 +chr9 1252306 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-2.606;DP=68;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:562,0,1627 +chr9 1256419 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=-0.607;DP=63;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:767,0,1362 +chr9 1256488 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-1.912;DP=68;FS=4.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:395,0,1745 +chr9 1263753 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.499;DP=77;FS=5.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:369,0,2258 +chr9 1363789 . C A 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=32.54;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:1279,0,287 +chr9 1363853 . C T 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.543;DP=54;FS=8.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1279,0,329 +chr9 1363985 . A G 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.593;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.091;QD=33.14;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:1155,0,244 +chr9 1364012 . C A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.365;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=30.90;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:99:1155,0,244 +chr9 1364161 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=29.34;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:90:351,0,90 +chr9 1575703 . C CTA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=1.461;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:244,0,168 +chr9 1576331 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:269,0,52 +chr9 1587797 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.864;DP=48;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:653,0,993 +chr9 1662948 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-1.159;DP=75;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:265,0,2383 +chr9 1668898 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.530;DP=94;FS=12.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:269,0,2992 +chr9 1670597 . T TC 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.466;DP=32;FS=3.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:279,0,565 +chr9 1671344 . T G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.810;DP=47;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:412,0,1276 +chr9 1929575 . T C 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-4.378;DP=54;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:857,0,1003 +chr9 1929898 . T G 1638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.307;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:1667,0,2172 +chr9 1932993 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.372;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:256,0,399 +chr9 1939608 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.220;DP=24;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:326,0,611 +chr9 1939895 . CA C 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:57:245,0,57 +chr9 1939943 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=2.747;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:388,0,234 +chr9 1958777 . T A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.091;DP=33;FS=5.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:518,0,678 +chr9 1996545 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,348 +chr9 2021478 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.038;DP=106;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:459,0,3194 +chr9 2023186 . A G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-0.011;DP=114;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,30:103:99:762,0,2861 +chr9 2336164 . A T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=-1.791;DP=97;FS=6.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,30:97:99:776,0,2414 +chr9 2342700 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.55;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:81:414,0,81 +chr9 2378752 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,207 +chr9 2378850 . C G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:396,0,517 +chr9 2379962 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=1.129;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:457,0,1022 +chr9 2381970 . T G 850.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.158;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=26.62;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:879,63,0 +chr9 2382798 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:287,0,56 +chr9 2383974 . C T 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 +chr9 2389822 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.839;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,567 +chr9 2389856 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.290;DP=23;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:257,0,495 +chr9 2400983 . A C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.416;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:359,0,528 +chr9 2418748 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.125;DP=48;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:345,0,1288 +chr9 2424812 . A G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.373;DP=21;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:356,0,440 +chr9 2454387 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:246,0,460 +chr9 2478490 . C T 475.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=33.99;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:2:502,2,0 +chr9 2479850 . CA C 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 +chr9 2480704 . T A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=-0.092;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:419,0,388 +chr9 2480862 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.119;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:550,0,327 +chr9 2493650 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.762;DP=31;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:253,0,809 +chr9 2510051 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=19.32;ReadPosRankSum=2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:434,0,249 +chr9 2552322 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.387;DP=71;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:270,0,2090 +chr9 2552628 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,322 +chr9 2775139 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.797;DP=41;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:606,0,715 +chr9 2776564 . T TA 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:267,0,501 +chr9 2777813 . C T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr9 3123605 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=1.992;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=17.61;ReadPosRankSum=-2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:398,0,278 +chr9 3123949 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=1.378;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:269,0,336 +chr9 3131427 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,785 +chr9 3131429 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,785 +chr9 3306938 . G A 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.029;DP=178;FS=9.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,57:178:99:1552,0,4663 +chr9 3394197 . G C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-1.188;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:294,0,2504 +chr9 3445218 . T C 1890.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1919,144,0 +chr9 3459683 . G T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.333;DP=53;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:466,0,1371 +chr9 3471366 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-0.844;DP=57;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:350,0,1651 +chr9 3471511 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.364;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:250,0,1369 +chr9 3473391 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-0.312;DP=54;FS=23.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:895,0,921 +chr9 3534393 . A T 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:238,0,25 +chr9 3534716 . A G 763.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:792,57,0 +chr9 3535118 . T C 663.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:692,48,0 +chr9 3535186 . G A 670.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=26.80;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:698,8,0 +chr9 3535268 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 +chr9 3535683 . A T 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:522,36,0 +chr9 3536110 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr9 3536478 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr9 3602102 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.878;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:762,0,3073 +chr9 3605913 . T A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-2.148;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:365,0,359 +chr9 3616260 . T C 204.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=34.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:233,0,23 +chr9 3911372 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-1.140;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:456,0,448 +chr9 3911386 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.264;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:349,0,616 +chr9 3911520 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-2.023;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=11.59;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:376,0,667 +chr9 3912703 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=1.169;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:447,0,688 +chr9 3915470 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.166;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:773,0,887 +chr9 3915489 . C G 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.273;DP=54;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:767,0,1076 +chr9 4385461 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.091;DP=66;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:526,0,1684 +chr9 4385761 . A G 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.042;DP=69;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=17.53;ReadPosRankSum=-2.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1238,0,1134 +chr9 4397366 . T G 1959.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1988,141,0 +chr9 4397386 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=-0.767;DP=51;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:322,0,1435 +chr9 4737324 . A T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.541;DP=100;FS=3.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:495,0,1533 +chr9 4737366 . T C 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-1.905;DP=41;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=25.73;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1083,0,186 +chr9 4737807 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-1.140;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:317,0,451 +chr9 4737980 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,222 +chr9 4739075 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.007;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:378,0,376 +chr9 4739452 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.372;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:268,0,873 +chr9 4775448 . A T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr9 5048234 . GT G 583.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-0.248;DP=21;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=27.80;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:61:621,61,0 +chr9 5050389 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-2.535;DP=47;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:548,0,1021 +chr9 5350994 . G A 271.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:300,0,18 +chr9 6164530 . C CT 670.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.601;DP=112;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,35:102:99:708,0,1590 +chr9 6166105 . GA G 822.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:860,85,0 +chr9 6579921 . A G 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 +chr9 6700263 . CT C 840.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-0.931;DP=84;FS=8.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:878,0,906 +chr9 6955510 . G A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:746,51,0 +chr9 6955511 . T A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:746,51,0 +chr9 6956439 . T G 793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:822,60,0 +chr9 7122294 . G A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.552;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:871,0,311 +chr9 7122306 . A G 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.207;DP=37;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:858,0,423 +chr9 7130699 . C A 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=1.083;DP=90;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.962;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:1404,0,1649 +chr9 7134606 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=2.315;DP=29;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:389,0,648 +chr9 7263305 . A G 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:24:336,24,0 +chr9 7280014 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=1.675;DP=37;FS=10.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:519,0,1637 +chr9 7280018 . C A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=1.074;DP=38;FS=9.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:519,0,1626 +chr9 7446897 . G GA 331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:369,36,0 +chr9 7447286 . G A 245.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:274,0,22 +chr9 7452144 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.790;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:341,0,480 +chr9 7497946 . GA G 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-1.265;DP=95;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.56;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,32:85:99:850,0,2223 +chr9 7542786 . A AT 209.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:247,23,0 +chr9 7543732 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.774;ClippingRankSum=3.566;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,875 +chr9 7544842 . G T 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-1.984;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=31.63;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1072,0,127 +chr9 7545313 . A G 292.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:11:320,0,11 +chr9 7559723 . G A 244.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:273,0,16 +chr9 7559739 . A C 237.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:11:265,0,11 +chr9 7559836 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-0.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:382,0,85 +chr9 7563999 . TCCTGAAATCAACAGAAATAACAATATGAAATGTGCAGTATTAAATCAGTTCATAAACATTACAAGAGCCCTTTCTCTCTTA T 17193.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.710;DP=393;FS=3.016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=29.58;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,390:392:99:17231,1367,0 +chr9 7571087 . A C 206.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.55;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:235,0,19 +chr9 7611186 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.429;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.143;QD=16.72;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:396,0,359 +chr9 7616938 . T A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:531,0,310 +chr9 7616953 . G T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.145;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:686,0,365 +chr9 7629504 . C T 1682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-0.543;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,45:59:99:1711,0,338 +chr9 7642466 . T A 1794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.860;DP=65;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:1823,0,331 +chr9 7646040 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.447;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,291 +chr9 7655665 . A G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:289,21,0 +chr9 7655741 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=25.68;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,210 +chr9 7656211 . C T 202.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:231,0,22 +chr9 7656297 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:264,0,64 +chr9 7658503 . T A 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 +chr9 7660693 . A AAT 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.996;DP=21;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:21:563,0,21 +chr9 7662643 . T C 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:882,66,0 +chr9 7662709 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:441,0,85 +chr9 7662898 . T G 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 +chr9 7662961 . T A 201.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:230,0,23 +chr9 7663086 . G C 382.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=31.86;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:410,0,9 +chr9 7663109 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:41:250,0,41 +chr9 7672221 . G A 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:553,39,0 +chr9 7672533 . A C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.196;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:401,0,124 +chr9 7675080 . T TG 395.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:433,33,0 +chr9 7704428 . C T 8058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-3.271;DP=281;FS=5.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,210:281:99:8087,0,1590 +chr9 7704695 . G A 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=2.821;DP=178;FS=27.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,54:178:99:1293,0,4543 +chr9 7705006 . A G 1558.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1587,114,0 +chr9 7719968 . A G 1175.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.777;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=27.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1204,84,0 +chr9 7720076 . G A 9440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-1.076;DP=227;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,226:227:99:9469,680,0 +chr9 7720160 . T C 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 +chr9 7720193 . G T 13642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.198;DP=330;FS=5.879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=31.61;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,326:329:99:13671,966,0 +chr9 7720589 . G A 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-1.733;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=32.58;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:999,72,0 +chr9 7720592 . C G 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=29.10;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:72:999,72,0 +chr9 7766992 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=25.78;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:44:286,0,44 +chr9 7769654 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=25.80;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:312,0,92 +chr9 7770124 . C A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:346,0,133 +chr9 7770510 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:277,0,141 +chr9 8023608 . G A 689.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.063;DP=20;FS=7.225;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=34.45;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:12:717,12,0 +chr9 8065897 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-2.899;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=25.70;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:388,0,118 +chr9 8106222 . C A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:363,0,165 +chr9 8110017 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.495;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:720,0,255 +chr9 8110317 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.803;DP=20;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:69:594,0,69 +chr9 8204920 . T TA 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-2.101;DP=26;FS=8.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:90:424,0,90 +chr9 8473423 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=-1.113;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=13.52;ReadPosRankSum=2.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:461,0,653 +chr9 8473461 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.878;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:290,0,544 +chr9 8473599 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.714;DP=67;FS=6.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:305,0,2065 +chr9 8474274 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.351;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:420,0,1131 +chr9 8474589 . T TC 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=-0.022;DP=29;FS=18.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=12.99;ReadPosRankSum=3.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:414,0,463 +chr9 8474654 . A C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.144;DP=67;FS=3.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1207,0,1179 +chr9 8474823 . G A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=1.726;DP=70;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:798,0,1544 +chr9 8492930 . A G 1475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.618;DP=95;FS=6.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:1504,0,2590 +chr9 8492935 . C T 2920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=1.471;DP=99;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.324;QD=29.50;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,76:99:99:2949,0,525 +chr9 8493213 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.050;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:480,0,3034 +chr9 8494454 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-1.422;DP=73;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:243,0,2341 +chr9 8494846 . G T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.448;DP=66;FS=2.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=14.09;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:958,0,1169 +chr9 8501713 . T G 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 +chr9 8674607 . T C 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=2.451;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=15.38;ReadPosRankSum=-2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:459,0,468 +chr9 8675341 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=1.446;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:443,0,844 +chr9 8675478 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.450;DP=62;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1055,0,1022 +chr9 8676485 . GA G 305.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=23.52;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:28:343,28,0 +chr9 8676532 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-1.249;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:252,0,1669 +chr9 8689188 . T A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=1.416;DP=76;FS=3.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,31:76:99:1024,0,1575 +chr9 8705909 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.489;DP=78;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:295,0,2366 +chr9 8902211 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.670;DP=63;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:261,0,1832 +chr9 8907084 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-1.511;DP=82;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:646,0,2101 +chr9 8928612 . C CAGGATTTGT 831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=1.520;DP=36;FS=8.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=23.10;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:869,0,165 +chr9 8934018 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-1.591;DP=66;FS=5.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:290,0,1949 +chr9 8939184 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.133;DP=40;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:312,0,1061 +chr9 8955190 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=1.019;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:271,0,1856 +chr9 8959720 . T A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-0.139;DP=105;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:453,0,5035 +chr9 8974940 . G C 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.711;DP=99;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:99:421,0,2870 +chr9 9028626 . TA T 863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.778;DP=61;FS=1.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:46:901,0,46 +chr9 9029961 . A T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-1.072;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:330,0,2357 +chr9 9178079 . A AT 870.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:98:946,98,0 +chr9 9305983 . G T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:307,21,0 +chr9 9305990 . C T 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 +chr9 9325665 . T A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 +chr9 9405435 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.215;DP=233;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,43:227:99:697,0,7083 +chr9 9799288 . G GA 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.273;DP=59;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:543,0,756 +chr9 9799509 . GT G 1088.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=-0.905;DP=166;FS=9.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,54:149:99:1126,0,1903 +chr9 9800362 . TCA T 533.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=-2.397;DP=124;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=4.30;ReadPosRankSum=2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:571,0,2053 +chr9 9805771 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=20.62;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,131 +chr9 9892218 . A T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=-2.009;DP=177;FS=4.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,34:177:99:569,0,9424 +chr9 9938808 . A AT 1103.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.119;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1141,0,1686 +chr9 9953183 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.229;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:293,0,3929 +chr9 9953395 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.308;DP=88;FS=3.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:710,0,2402 +chr9 9957080 . A G 3844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-0.411;DP=202;FS=5.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,114:202:99:3873,0,3248 +chr9 9957905 . T C 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.153;DP=297;FS=18.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.282;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,73:297:99:1600,0,8793 +chr9 9958771 . AT A 692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.876;DP=332;FS=2.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=2.09;ReadPosRankSum=-2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,63:325:99:730,0,9318 +chr9 9959251 . G A 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=-0.468;DP=283;FS=1.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,66:283:99:1420,0,8744 +chr9 9964198 . C T 9254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=-0.622;DP=508;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,288:507:99:9283,0,7367 +chr9 10063296 . G A 2980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.631;DP=566;FS=5.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:423,142:565:99:3009,0,15647 +chr9 10174749 . A T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.887;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=25.82;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:493,0,147 +chr9 10181977 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:260,0,249 +chr9 10463836 . T A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-1.606;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=27.60;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:387,0,81 +chr9 10978442 . G A 6141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=-0.174;DP=337;FS=12.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,189:337:99:6170,0,5114 +chr9 10980237 . G A 11331.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.732;DP=286;FS=3.574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=29.92;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,270:271:99:11360,808,0 +chr9 10984732 . A G 872.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=2.568;DP=26;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=33.54;ReadPosRankSum=-2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:11:900,0,11 +chr9 10998165 . C T 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.421;DP=71;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:1168,0,1272 +chr9 11003232 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.471;DP=74;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:240,0,4124 +chr9 11003550 . TAGGTAATTGTGTGGGAGGTCATCATGAATGTATTATGTATTCGAAAGCGATTCATCTAATGTGATTTTCTCTCTC T 3266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=1.514;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=31.72;ReadPosRankSum=-2.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,83:88:99:3304,0,436 +chr9 11003979 . ATT A 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.645;DP=30;FS=9.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:450,0,491 +chr9 11004056 . G T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.072;DP=28;FS=6.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:632,0,302 +chr9 11004145 . A G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 +chr9 11521270 . T TA 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.289;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:285,0,193 +chr9 11522028 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-1.822;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:442,0,421 +chr9 11522217 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.778;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:242,0,761 +chr9 11523183 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=2.409;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:365,0,334 +chr9 11523282 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.124;DP=33;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:468,0,682 +chr9 11689723 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=13;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,175 +chr9 11689728 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:243,0,175 +chr9 11855968 . A C 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=1.176;DP=45;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=16.51;ReadPosRankSum=3.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:771,0,1579 +chr9 11855969 . C A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=1.131;DP=45;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=16.51;ReadPosRankSum=3.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:771,0,1582 +chr9 11858763 . T C 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=1.984;DP=40;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:861,0,531 +chr9 11858968 . G A 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=1.586;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=27.02;ReadPosRankSum=2.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1352,0,926 +chr9 11859034 . G A 2094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=2.915;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,55:77:99:2123,0,516 +chr9 11888711 . A G 5536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.093;DP=345;FS=7.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,178:345:99:5565,0,5994 +chr9 11892483 . ACGGAGATCATCTCCAGCTCACACCGACTGATAATACACTGGAATTTAGGGCTCAGATGAACCTCTGACTCACCTCACC A 1476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=-0.400;DP=302;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,70:286:99:1514,0,11996 +chr9 11902755 . C A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.013;DP=245;FS=5.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,47:245:99:792,0,7754 +chr9 11908646 . C G 4551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.316;DP=243;FS=3.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,137:243:99:4580,0,3871 +chr9 11928866 . T A 3626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.319;DP=220;FS=10.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,102:209:99:3655,0,3883 +chr9 11931017 . C A 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.221;DP=90;FS=29.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.168;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:90:99:1140,0,2896 +chr9 11931048 . C G 5268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.491;DP=138;FS=14.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:5297,0,1733 +chr9 11931102 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=3.011;DP=186;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,43:186:99:818,0,5409 +chr9 11941930 . T G 932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=-1.103;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,46:187:99:961,0,5516 +chr9 11947857 . T A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.760;DP=190;FS=12.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,37:190:99:651,0,6045 +chr9 11951697 . TCTAGCAAAGAAAAAAAAACACATAATAAATTTTAGGACACTGCCCTAAAATCTAAAACTAAAAAAAGTCCATCACAAACAAAAATCATTAC T 8422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.715;DP=216;FS=3.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=26.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,202:203:99:8460,712,0 +chr9 11952679 . C T 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-1.189;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.947;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1221,0,953 +chr9 12539560 . C A 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=-1.045;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=20.50;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,57:95:99:1976,0,1363 +chr9 12539577 . A G 1674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.305;DP=93;FS=1.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.026;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1703,0,1486 +chr9 12541933 . G A 1596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.195;DP=91;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1625,0,1513 +chr9 12542040 . TCTTGGAATGAAAAAAAATATACATTTATGGACCATAAATCATAAATAAACCAGAATGCAATGATGCAACCTGACCTGTACTTAC T 4036.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.726;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=30.02;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,87:91:99:4074,350,0 +chr9 12717446 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.965;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:293,0,440 +chr9 12728317 . G A 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 +chr9 12731275 . A G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.419;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:677,0,727 +chr9 12739587 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.993;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:721,0,491 +chr9 12739730 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.676;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:500,0,510 +chr9 12740382 . C A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=2.236;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:300,0,961 +chr9 12741199 . CTG C 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.817;DP=22;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:346,0,460 +chr9 12767746 . C A 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-0.134;DP=53;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:889,0,950 +chr9 12867625 . T TG 799.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DP=33;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=24.23;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:837,0,741 +chr9 12868489 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.025;DP=21;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:243,0,378 +chr9 12868904 . T G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.102;DP=23;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:405,0,1067 +chr9 12868914 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.830;DP=27;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=13.95;ReadPosRankSum=-2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:405,0,1071 +chr9 12870504 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=1.463;DP=40;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:690,0,707 +chr9 12874427 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.595;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:623,0,824 +chr9 12879133 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.295;DP=35;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.137;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:763,0,378 +chr9 12896613 . A G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-0.902;DP=41;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:705,0,758 +chr9 12925021 . G A 3019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=1.537;DP=165;FS=0.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:3048,0,6397 +chr9 12929091 . G T 4644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.437;DP=259;FS=2.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,131:259:99:4673,0,4587 +chr9 12938288 . T A 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.591;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:873,0,850 +chr9 12967183 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=-0.760;DP=61;FS=3.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:899,0,2598 +chr9 12967186 . C T 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=-0.903;DP=62;FS=3.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:899,0,2568 +chr9 12969595 . C T 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.484;DP=73;FS=4.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1238,0,1157 +chr9 12969606 . G A 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.331;DP=74;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1234,0,1133 +chr9 12969690 . C T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.317;DP=61;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:822,0,1236 +chr9 12973319 . A G 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.303;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1085,0,735 +chr9 13141036 . T A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=1.170;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:684,0,318 +chr9 13388423 . AT A 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.778;DP=17;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:74:258,0,74 +chr9 14313844 . TGGTGAGTTTATGTAATTAAGCAACAGACCGACATTCTACAAAAAAAGTTGTTTATGATCTGTATTTCTGTTTTTA T 1881.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=1.093;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=32.39;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1919,175,0 +chr9 14314673 . C CT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.569;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:453,0,160 +chr9 14367652 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-1.153;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:263,0,1732 +chr9 14367655 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.805;DP=29;FS=6.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:263,0,1732 +chr9 14644007 . C T 2843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.582;DP=100;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=28.44;ReadPosRankSum=2.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,80:100:99:2872,0,300 +chr9 14644740 . T TA 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-1.055;DP=33;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=25.66;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:884,0,424 +chr9 14651119 . C CA 335.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:373,36,0 +chr9 14719365 . G T 1678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1707,120,0 +chr9 14719461 . G A 653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:682,51,0 +chr9 14719479 . T A 1343.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1372,99,0 +chr9 15076783 . C T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 +chr9 15251846 . C T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 +chr9 15643397 . ACTGAAGCATATGAGGGGTCAGAAACATGTAAACTACTGAAACATGAGAACAAATCATTTTAAAGGGAAATTTAC A 15374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-0.153;DP=374;FS=3.609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=32.07;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,355:362:99:15412,1027,0 +chr9 15645095 . G T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 +chr9 15650115 . TG T 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;ClippingRankSum=5.167;DP=290;FS=12.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=1.38;ReadPosRankSum=6.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,153:224:99:438,0,1360 +chr9 15805499 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.094;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:252,0,458 +chr9 15922317 . G A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr9 15923875 . T A 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.801;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:997,0,1297 +chr9 15923906 . CT C 218.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=15;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:5:255,0,5 +chr9 15924006 . C T 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-1.722;DP=77;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:1375,0,1392 +chr9 15924772 . C T 1136.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.487;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=38.45;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:7:1164,7,0 +chr9 15924800 . T G 3541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3570,249,0 +chr9 15925003 . ACC A 241.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:279,22,0 +chr9 15925009 . T C 250.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:22:279,22,0 +chr9 15926411 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.797;DP=34;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:274,0,726 +chr9 15926444 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=1.331;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:498,0,280 +chr9 15961369 . A C 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 +chr9 15961392 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 +chr9 15962209 . C T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 +chr9 16185593 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:235,0,819 +chr9 16448655 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.827;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=29.05;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:65:522,0,65 +chr9 16451420 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.18;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:260,0,118 +chr9 16459659 . A G 3566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.547;DP=112;FS=3.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,97:112:68:3595,0,68 +chr9 16688569 . C G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.592;DP=19;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:393,0,91 +chr9 16688686 . T C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.369;DP=20;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=20.99;ReadPosRankSum=-1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:448,0,206 +chr9 16915659 . C CT 242.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:280,27,0 +chr9 16915726 . AT A 218.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=19.90;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:5:255,5,0 +chr9 16916528 . A C 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 +chr9 16916780 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.857;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=29.60;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:709,0,106 +chr9 17115752 . C T 361.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.91;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:389,0,5 +chr9 17128227 . T C 698.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1253,84,0 +chr9 17128230 . T C 1269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1298,87,0 +chr9 17156143 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.417;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=27.57;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:552,0,159 +chr9 17156695 . C A 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-0.238;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1144,0,113 +chr9 17156769 . G A 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.789;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1370,0,322 +chr9 17156803 . A G 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.515;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=25.56;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:923,0,325 +chr9 17156878 . C T 1803.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1832,126,0 +chr9 17156879 . G A 1803.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1832,126,0 +chr9 17157031 . G T 777.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:78:806,78,0 +chr9 17157226 . T A 340.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.00;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:369,0,13 +chr9 17157238 . T C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 +chr9 17157549 . C T 1367.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.020;DP=41;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=33.35;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:10:1395,0,10 +chr9 17157640 . G A 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 +chr9 17158060 . A G 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.921;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=29.35;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:938,0,178 +chr9 17158300 . T A 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1007,72,0 +chr9 17158367 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=1.217;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:452,0,898 +chr9 17158376 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-1.200;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:441,0,911 +chr9 17158424 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=23.06;ReadPosRankSum=2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,128 +chr9 17158623 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 +chr9 17158691 . C A 669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:698,48,0 +chr9 17158697 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=2.720;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:257,0,304 +chr9 17158988 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.534;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:554,0,981 +chr9 17158995 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.364;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:475,0,1111 +chr9 17159116 . G T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:301,21,0 +chr9 17159430 . GT G 360.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:398,27,0 +chr9 17159440 . C T 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 +chr9 17159999 . G A 726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:755,57,0 +chr9 17160262 . A G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.544;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:854,0,287 +chr9 17160586 . A G 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.078;DP=30;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=32.26;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:996,0,340 +chr9 17160595 . G A 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-0.692;DP=27;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:996,0,342 +chr9 17160679 . T C 797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=1.404;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=27.33;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:826,60,0 +chr9 17289278 . C T 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:480,36,0 +chr9 17294495 . T G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.07;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,128 +chr9 17305272 . C CT 313.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:351,36,0 +chr9 17562199 . C CT 627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=42;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:737,0,127 +chr9 17599799 . G T 3798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.712;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=30.88;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,99:123:99:3827,0,427 +chr9 17677542 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.700;DP=109;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.435;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,26:109:99:553,0,3098 +chr9 17679792 . G A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=1.389;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,32:128:99:723,0,3686 +chr9 17701646 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=1.221;DP=102;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:578,0,2829 +chr9 17709680 . G A 2582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.983;DP=92;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,68:92:99:2611,0,569 +chr9 17776286 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.137;DP=91;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:462,0,2694 +chr9 17835662 . C T 2367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.925;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=26.60;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,63:89:99:2396,0,693 +chr9 17847429 . GAGGTGACGTAAAATTCCAACTACACTCCCTAAAATATTTTCAGTCACTGTAAAACAAAGAGCATCACTAAATGTCTCTCCAC G 4498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=1.699;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=34.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:4536,330,0 +chr9 17847848 . CAGGTAGGAAAATGTTTATTATTCAAGCTTCTTTTGCTAAAAAGTAATTTATTGTACTCTTATATATCTTTTTTTGAATAAAT C 4815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=2.818;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,122:126:99:5249,399,0 +chr9 17850557 . T C 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.131;DP=48;FS=4.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=29.14;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,36:48:99:1427,0,287 +chr9 17850988 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-1.030;DP=23;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:342,0,416 +chr9 17851266 . C A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 +chr9 17851517 . T G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=2.486;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:482,0,130 +chr9 17865073 . C A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:272,0,253 +chr9 17865195 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,255 +chr9 17894494 . A T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.311;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:89:434,0,89 +chr9 17940755 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-1.031;DP=16;FS=9.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:450,0,126 +chr9 17940932 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:468,0,121 +chr9 17941038 . A T 413.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:441,0,8 +chr9 17942063 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:486,0,234 +chr9 17943670 . G T 301.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=30.19;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:330,0,16 +chr9 17944303 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:268,0,64 +chr9 17947566 . C T 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.336;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=30.39;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:77:940,0,77 +chr9 17949987 . T G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 +chr9 17962584 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:331,0,50 +chr9 17964594 . GA G 583.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:621,54,0 +chr9 17965559 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-2.451;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.871;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:566,0,356 +chr9 17965814 . T TAA 284.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:23:322,23,0 +chr9 18054993 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:240,0,63 +chr9 18079297 . C T 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-0.306;DP=26;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=25.53;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:692,0,221 +chr9 18116789 . C T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.061;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=26.88;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:942,0,187 +chr9 18184632 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,137 +chr9 18204510 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=1.030;DP=30;FS=3.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=28.56;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:885,0,173 +chr9 18205593 . G C 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=-1.115;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:912,0,134 +chr9 18237771 . C T 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=1.682;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=28.89;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:1126,0,242 +chr9 18298212 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-0.903;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:666,0,198 +chr9 18425026 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:437,0,238 +chr9 18471809 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:386,0,127 +chr9 18471891 . A G 269.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.90;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:297,0,11 +chr9 18520225 . C CT 241.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:22:279,0,22 +chr9 18521389 . A T 660.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:688,8,0 +chr9 18560760 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,102 +chr9 18990645 . T A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 +chr9 19113805 . A C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.089;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:703,0,202 +chr9 19338985 . CTCAGGTTTGTCATTTTTTTACATTTCTATTTCAACCAATAAGCTTTTTTAGCCTGAGTAATAATAACCCTCTGAATATGCATT C 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=2.205;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:683,0,506 +chr9 19350902 . G A 2951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.162;DP=164;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,91:164:99:2980,0,4869 +chr9 19430646 . G A 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.157;DP=68;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1108,0,1097 +chr9 19430924 . C T 1464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.112;DP=86;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:1493,0,1534 +chr9 19431063 . T G 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.294;DP=53;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=15.92;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:872,0,840 +chr9 19431438 . C A 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.708;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1239,0,1242 +chr9 19431898 . T G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.989;DP=45;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:318,0,1225 +chr9 19431920 . A G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=1.612;DP=50;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:710,0,1107 +chr9 19432832 . A T 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-1.826;DP=68;FS=3.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1312,0,959 +chr9 19433070 . T C 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-0.566;DP=55;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:881,0,978 +chr9 19433631 . G A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.863;DP=43;FS=9.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:760,0,830 +chr9 19722267 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 +chr9 20102530 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr9 20102531 . C A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 +chr9 20196373 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.159;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:234,0,346 +chr9 20196382 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,346 +chr9 20196496 . G T 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.674;DP=42;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=29.90;ReadPosRankSum=-1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1284,0,140 +chr9 20197018 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-2.313;DP=17;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:317,0,166 +chr9 20197212 . A G 1401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=1.337;DP=39;FS=4.649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1430,102,0 +chr9 20197558 . G T 1231.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.668;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:16:1260,16,0 +chr9 20198005 . G A 1187.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.005;DP=32;FS=2.982;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=32.38;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:45:1216,45,0 +chr9 20337882 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=1.279;DP=36;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:252,0,2081 +chr9 20337883 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.761;DP=37;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:252,0,2081 +chr9 20338228 . T TA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.263;DP=25;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:308,0,232 +chr9 20348475 . TCTGATCACAACCAAGCAGATGCAGATGTTGAGGTCAAATTAAAGGCTATAAAGTGTGTTTACAGCCATTTTGACATCTCTTAC T 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=2.178;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=31.47;ReadPosRankSum=-2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:669,0,981 +chr9 20383288 . CAGCACTG C 1265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-1.782;DP=87;FS=7.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:1303,0,2162 +chr9 20383292 . ACTGAGAAAACAACACAAAGTCATTATAAGCCTGATTATATTGCACAGTTAATCAAACCATGAGAGGATGATAGTGAAACACCATGTAC A 1182.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.173;DP=87;FS=6.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:1220,0,2389 +chr9 20383299 . AAACAACACAAAGTCATTATAAGCCTGATTATATTGCACAGTTAATCAAACCATGAGAGGATGATAGTGAAACACCATGTAC A 1266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-1.330;DP=79;FS=4.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:1304,0,2144 +chr9 20383413 . G A 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=-0.790;DP=79;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=17.33;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1397,0,1372 +chr9 20391191 . A G 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.359;DP=74;FS=12.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:978,0,1475 +chr9 20391262 . T C 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.126;DP=97;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=16.54;ReadPosRankSum=3.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1633,0,1694 +chr9 20391738 . G T 2051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.959;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=33.09;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,53:62:82:2080,0,82 +chr9 20392334 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,291 +chr9 20393763 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:271,0,100 +chr9 20395008 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:87:346,0,87 +chr9 20396374 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.48;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:303,0,59 +chr9 20396527 . T A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.31;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:344,0,101 +chr9 20396547 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=26.29;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:94:370,0,94 +chr9 20396619 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:68:640,0,68 +chr9 20396785 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:320,0,168 +chr9 20398315 . G T 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:247,0,22 +chr9 20408578 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,102 +chr9 20427889 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:233,0,61 +chr9 20483026 . G T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=28.73;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:373,0,55 +chr9 20514389 . C G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.25;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:306,0,96 +chr9 20514455 . G T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 +chr9 20514464 . C T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:261,18,0 +chr9 20533146 . T A 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:801,54,0 +chr9 20533149 . C T 772.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:801,54,0 +chr9 20533390 . A G 763.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:792,57,0 +chr9 20541016 . T C 4383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=2.534;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=28.65;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,98:153:99:4412,0,1424 +chr9 20541025 . T C 2982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-1.011;DP=183;FS=7.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,86:183:99:3011,0,5169 +chr9 20546616 . C T 3900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.147;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=31.51;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:3929,280,0 +chr9 20560445 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.888;DP=24;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:243,0,595 +chr9 20560544 . C A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=34.76;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:654,0,114 +chr9 20560551 . T C 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-0.632;DP=18;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=34.76;ReadPosRankSum=-1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:654,0,114 +chr9 20584600 . G A 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 +chr9 20585411 . C A 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 +chr9 20585565 . A G 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 +chr9 20621373 . T C 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chr9 20621421 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 +chr9 20694805 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 +chr9 20697294 . C T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +chr9 20698975 . T A 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 +chr9 20699156 . GTC G 224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:262,21,0 +chr9 20708595 . G A 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:579,42,0 +chr9 20780430 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.041;DP=22;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:415,0,304 +chr9 20780558 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.627;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:263,0,229 +chr9 20805430 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=10;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:275,0,56 +chr9 20811374 . T A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 +chr9 20829417 . C G 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-2.544;DP=91;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:1069,0,1700 +chr9 20829474 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-1.426;DP=113;FS=14.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:521,0,3614 +chr9 20829534 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=3.807;DP=65;FS=13.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:719,0,1351 +chr9 20874190 . T G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 +chr9 21107848 . T G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-1.938;DP=38;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:727,0,605 +chr9 21111379 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.063;DP=62;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:401,0,1723 +chr9 21174692 . A T 1718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-1.095;DP=66;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.04;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:99:1747,0,513 +chr9 21193891 . C T 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.685;DP=54;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:936,0,939 +chr9 21518534 . G T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:381,0,912 +chr9 21518535 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.029;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:381,0,910 +chr9 21528944 . T C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=4.238;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=16.74;ReadPosRankSum=-2.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:497,0,496 +chr9 21529511 . TGGTGAGTAAAGTTTAATGAGAGTCAGAGTTGACTGTGATTGTGTGTATCAGTGTATTTGTCCTGTCTTCA T 3512.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.523;DP=90;FS=1.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,82:88:22:3900,0,22 +chr9 21529714 . T C 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=-0.436;DP=80;FS=3.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=27.43;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,57:80:99:2223,0,553 +chr9 21533257 . G A 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.197;DP=74;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.243;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,31:74:99:1092,0,1510 +chr9 21560041 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.914;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:549,0,613 +chr9 21563801 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:313,0,866 +chr9 21567123 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-2.011;DP=39;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:420,0,955 +chr9 21591247 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.801;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:445,0,1223 +chr9 21796909 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=1.727;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.18;ReadPosRankSum=-2.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:808,0,1299 +chr9 21796930 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.664;DP=63;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:802,0,1393 +chr9 21840287 . C T 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-2.489;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=34.20;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:849,0,818 +chr9 21857659 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.348;DP=52;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:363,0,1397 +chr9 21889455 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.599;DP=121;FS=4.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:264,0,3829 +chr9 21893180 . T A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.267;DP=59;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:933,0,1134 +chr9 21893550 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=1.056;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,20:116:99:254,0,3870 +chr9 21905791 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.487;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:267,0,2244 +chr9 22069251 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:264,0,255 +chr9 22069500 . A G 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.722;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=28.63;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:48:860,0,48 +chr9 22075165 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 +chr9 22197717 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.837;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:231,0,1598 +chr9 22200191 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:418,0,243 +chr9 22253167 . C T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.366;DP=37;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:437,0,840 +chr9 22258016 . A C 893.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:922,66,0 +chr9 22293903 . G T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.371;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:467,0,2121 +chr9 22293934 . AAGGTATATCTACATTCAATCATGACGTTCTGTAATTTCAGTTTGCTTTAATGTTTGTACTACATATATCTTGCACTAAATCATTTGC A 3307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=1.596;DP=78;FS=6.541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=33.45;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:3345,265,0 +chr9 22300507 . CCCTGCAATAAAGCCAGTGGAGTTATAAAAAATCCATAACAAATCTTAACACAGTATTAAGAACTGTGTATTCATTA C 14259.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.819;DP=335;FS=3.992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=34.29;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,310:315:99:14297,980,0 +chr9 22301858 . G A 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.553;DP=216;FS=3.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,65:216:99:1641,0,7667 +chr9 22303163 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:89:302,0,89 +chr9 22329219 . T A 931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=1.930;DP=53;FS=22.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:960,0,1000 +chr9 22329360 . T A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.093;DP=58;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:1081,0,1055 +chr9 22333075 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.605;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:255,0,2179 +chr9 22378743 . A G 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:559,42,0 +chr9 22380579 . G A 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-1.087;DP=74;FS=10.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1158,0,1386 +chr9 22382617 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.611;DP=93;FS=4.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:600,0,2570 +chr9 22384897 . C T 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.378;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=22.46;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:949,0,302 +chr9 22390508 . A G 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.038;DP=80;FS=8.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:440,0,3842 +chr9 22390625 . GA G 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-0.541;DP=53;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:390,0,464 +chr9 22395009 . G A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.494;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.295;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:662,0,1585 +chr9 22406180 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-2.776;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:328,0,674 +chr9 22412317 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.026;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.07;ReadPosRankSum=2.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:273,0,708 +chr9 22422438 . G C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.757;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:406,0,1845 +chr9 22430862 . C G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-1.799;DP=55;FS=5.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:230,0,1788 +chr9 22437020 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.756;DP=102;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,19:102:99:278,0,3159 +chr9 22437163 . G T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.854;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,23:120:99:793,0,5168 +chr9 22437398 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.617;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:406,0,2616 +chr9 22437797 . C T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-1.920;DP=77;FS=13.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:644,0,2037 +chr9 22438031 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.195;DP=71;FS=12.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:590,0,1993 +chr9 22438048 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.312;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:318,0,2573 +chr9 22463503 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.775;DP=110;FS=7.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,18:109:99:248,0,3596 +chr9 22463592 . A AG 1224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-1.976;DP=148;FS=4.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:1262,0,2462 +chr9 22464017 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.375;DP=102;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:506,0,3050 +chr9 22470383 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=2.658;DP=100;FS=8.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:360,0,3169 +chr9 22486970 . T A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.591;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,40:133:99:910,0,3161 +chr9 22487241 . C T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.202;DP=88;FS=5.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:774,0,2351 +chr9 22505066 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-1.187;DP=111;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=3.34;ReadPosRankSum=2.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:399,0,3440 +chr9 22509652 . T G 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=-0.491;DP=63;FS=5.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,35:63:99:1139,0,1386 +chr9 22512226 . C A,T 1596.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-2.436;DP=133;FS=5.336;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:17,39,77:133:99:2940,1488,2704,193,0,1313 +chr9 22512553 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=4.137;DP=76;FS=4.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=3.31;ReadPosRankSum=-2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:280,0,2347 +chr9 22524599 . G C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=1.779;DP=49;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:286,0,1434 +chr9 22531161 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-1.186;DP=49;FS=10.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:293,0,1437 +chr9 22569441 . T G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.836;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:235,0,704 +chr9 22592174 . TC T 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:294,0,51 +chr9 22598410 . C CT 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.129;DP=44;FS=4.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:550,0,554 +chr9 22598891 . A G 331.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.10;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:359,0,12 +chr9 22600159 . T G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.191;DP=35;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:392,0,852 +chr9 22844211 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.391;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:493,0,498 +chr9 22844244 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.230;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:494,0,471 +chr9 22844356 . CAGGTTTTGAAGTATACAAGTTACAGTCGTTAATGATTTTGTTTGACCTGTTGTCTTCCTCAGTCTGTTGGCTTCCCTCATTAGTTTTTCATGCTCTGCT C 739.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=4.302;DP=40;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=18.49;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:777,0,7266 +chr9 22850001 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=-1.403;DP=30;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:242,0,846 +chr9 22853995 . A G 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.676;DP=421;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=4.02;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:329,91:420:99:1719,0,12580 +chr9 22857541 . A C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.028;DP=114;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=5.36;ReadPosRankSum=2.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,32:114:99:639,0,4250 +chr9 22858007 . A T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:381,0,373 +chr9 22858305 . TCCTGCAGTTATAGAGATTGTTTAAATGGCCATGTTTATTGTCAACAGTTTTCAAAGTGTCAAGAATTGCAAAATTCTAACGTA T 7555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.680;ClippingRankSum=5.969;DP=283;FS=47.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=26.70;ReadPosRankSum=-4.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,199:281:99:7593,0,27580 +chr9 22858434 . G A 1766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.457;DP=278;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,75:277:99:1795,0,7668 +chr9 22858463 . ACTGGTGATGAAAATCAATAAAGAATTTATAAAATTATAATGTTTCGAAAACTGTAATCCTTTTCAAACAAATGAAGATAGCGTCCCAC A 9616.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.749;DP=258;FS=4.250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=32.01;ReadPosRankSum=3.525 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,236:248:99:9654,722,0 +chr9 22858597 . C T 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-0.890;DP=253;FS=1.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=5.01;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,62:252:99:1297,0,7156 +chr9 22858834 . T G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.286;DP=171;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:458,0,5375 +chr9 22860238 . G A 5050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-1.783;DP=288;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,171:288:99:5079,0,4595 +chr9 22864795 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.258;DP=214;FS=2.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,42:213:99:662,0,8784 +chr9 22933077 . C A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.443;DP=101;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:507,0,2840 +chr9 22938320 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.094;DP=117;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,33:117:99:841,0,6150 +chr9 22952370 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.968;DP=63;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:249,0,1858 +chr9 22964589 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.118;DP=32;FS=5.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:293,0,822 +chr9 23004795 . AT A 1062.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.770;DP=44;FS=6.160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=24.15;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:85:1100,85,0 +chr9 23009244 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.516;DP=166;FS=5.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,29:165:99:392,0,4983 +chr9 23009909 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=-1.882;DP=84;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:400,0,2605 +chr9 23124746 . C A 1739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.758;DP=433;FS=8.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:340,93:433:99:1768,0,13202 +chr9 23150193 . A G 2338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.869;ClippingRankSum=7.278;DP=339;FS=4.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=6.90;ReadPosRankSum=-8.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,99:339:99:2367,0,9579 +chr9 23150366 . T C 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=-0.509;DP=404;FS=1.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=1.92;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,69:404:99:805,0,12817 +chr9 23150529 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.624;DP=268;FS=6.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,47:268:99:496,0,8562 +chr9 23155292 . T C 4780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.519;ClippingRankSum=5.457;DP=307;FS=10.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=15.57;ReadPosRankSum=-5.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,141:295:99:4809,0,5406 +chr9 23155651 . A G 11351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.702;DP=374;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,300:371:99:11380,0,927 +chr9 23190770 . GT G 474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:53:512,53,0 +chr9 23191043 . T G 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.600;ClippingRankSum=2.365;DP=182;FS=19.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,62:182:99:2027,0,4320 +chr9 23191570 . G A 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.230;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,55:169:99:1497,0,4453 +chr9 23195202 . G A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 +chr9 23215569 . GACCTGAAAATAATTATTTTTTAGTGATTTATTTTTTCCCCATCTCCATTTTATTTTGGTTTAATTTTTAAGAATGTTAATTGAAATTTTAGTTTT G 10666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=2.532;DP=255;FS=7.541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=32.34;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,250:255:99:10704,800,0 +chr9 23220204 . T A 834.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:863,60,0 +chr9 23220767 . G A 1204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.880;DP=341;FS=8.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,69:341:99:1233,0,10745 +chr9 23238222 . G A 1810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=-2.811;DP=363;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,86:362:99:1839,0,10819 +chr9 23238425 . GCTGTAGTGGAAGAAAAGCCAGTACTGTGATTTAGCATTACAGATTCAAATAAAGTATATATTTTTAGTTTTGTATGTTGTATTGAGCTCAC G 14193.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=2.318;DP=369;FS=1.525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=31.79;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,346:353:99:14231,1023,0 +chr9 23245939 . C T 1370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.194;DP=306;FS=4.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,70:305:99:1399,0,8969 +chr9 23246402 . G A 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.548;DP=283;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,56:282:99:950,0,8728 +chr9 23265361 . A G 2694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;ClippingRankSum=3.812;DP=173;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=15.58;ReadPosRankSum=-4.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:2723,0,2998 +chr9 23265624 . ACTGAAGTGCAACATGAGTCTGTTACTTTCAAGTTTATCAGACAACAACATTTTAACAGTCAAAAAATTATTATCTTATAATCCTCAAAATTTAAATTAC A 2249.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.114;DP=39;FS=4.289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=30.49;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:99:2287,413,0 +chr9 23265853 . G A 29721.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-1.230;DP=725;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=31.28;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,718:724:99:29750,2162,0 +chr9 23272581 . G A 1425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.182;DP=193;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=7.39;ReadPosRankSum=-2.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,57:193:99:1454,0,5166 +chr9 23273061 . G A 4877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.885;ClippingRankSum=-0.413;DP=317;FS=5.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=15.39;ReadPosRankSum=2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,165:316:99:4906,0,5330 +chr9 23331904 . A C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-1.635;DP=267;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=2.09;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,47:267:99:585,0,12753 +chr9 23332128 . GCTGTAGTGAAAAAGAAGTCTGTTATTTTCAAGTTTATTAAGCAGAAAACTTCACGCTCAAAACTGCATTAATCTGTATCTTATATAAGCTTAACATTGGGCTCAC G 7811.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.451;DP=445;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,232:424:99:7849,0,9684 +chr9 23332129 . CTGTAGTGAAAAAGAAGTCTGTTATTTTCAAGTTTATTAAGCAGAAAACTTCACGCTCAAAACTGCATTAATCTGTATCTT C 6558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=1.469;DP=440;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,187:424:99:6596,0,11867 +chr9 23332212 . ATAAGCTTAACATTGGGCTCACCATG A 6556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.360;DP=447;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,187:430:99:6594,0,12340 +chr9 23343448 . G A 7445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.227;DP=404;FS=3.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,205:404:99:7474,0,7268 +chr9 23351569 . T C 3331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=4.281;DP=299;FS=19.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=11.14;ReadPosRankSum=-3.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,103:299:99:3360,0,6417 +chr9 23670333 . C T 2419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.567;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=30.25;ReadPosRankSum=-1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,65:80:99:2448,0,237 +chr9 23670376 . C G 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-2.039;DP=75;FS=1.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1199,0,1204 +chr9 23672083 . C G 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=-0.393;DP=103;FS=0.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1772,0,1752 +chr9 23681303 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.024;DP=63;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=4.84;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:333,0,1925 +chr9 23780902 . A G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.093;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:608,0,822 +chr9 23780989 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.270;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:387,0,623 +chr9 23831017 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.411;DP=69;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:381,0,1987 +chr9 23834688 . ACAGGTAATGTGCCAGTCTTCTTAACATTGACTTATATTGTGGAAGATCGTTCTCACACCTCACATTTGGTCATG A 4440.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.393;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=34.19;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,95:97:99:4478,392,0 +chr9 23834789 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.452;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:445,0,3050 +chr9 23835091 . A G 1732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=-0.257;DP=108;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:1761,0,2024 +chr9 23838760 . G A 2478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.829;DP=252;FS=15.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,94:251:99:2507,0,14349 +chr9 23838812 . AG A 2930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-4.218;DP=283;FS=15.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=10.36;ReadPosRankSum=4.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,104:283:99:2968,0,17915 +chr9 23838817 . C T 2941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.752;ClippingRankSum=-4.878;DP=278;FS=15.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=10.58;ReadPosRankSum=3.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,103:278:99:2970,0,17915 +chr9 23839259 . G A 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.950;DP=412;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:309,103:412:99:2251,0,11742 +chr9 23839487 . C T 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.324;DP=390;FS=11.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,89:390:99:1767,0,11325 +chr9 23842278 . ACTGAACAACGGGACAAACATGTTAAAATGATCTCCTTATTGAGAGATGCCTTCTGCTGAGGAAGTGTTTGTAGTGTATCAATCTAGCAGACGTTAAACAGATATCTGAATGCAGAATGTTGCAGTAACCCAATTAAACTCAAGCAGTGCAGACAGATGATTACCAAGACCTTACACAGCTGTTGTGTGAGTTGTGAGCCTAC A 14924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=2.496;DP=401;FS=1.182;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=26.83;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,361:372:99:14962,1125,0 +chr9 23868507 . A T 6742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.891;DP=365;FS=6.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=18.47;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,185:365:99:6771,0,6540 +chr9 23885273 . A G 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.027;DP=323;FS=0.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.508;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,65:323:99:1178,0,10116 +chr9 23887290 . G A 2095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.783;DP=489;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,108:489:99:2124,0,15004 +chr9 23889105 . G T 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.317;DP=297;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,76:297:99:1771,0,8192 +chr9 23889120 . T C 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.095;DP=293;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,73:293:99:1644,0,8506 +chr9 23889836 . G A 1654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.038;DP=403;FS=11.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,87:403:99:1683,0,12312 +chr9 23890858 . C T 1204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=-0.467;DP=259;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,60:259:99:1233,0,7693 +chr9 23891286 . A G 2037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=-2.341;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=7.52;ReadPosRankSum=2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,78:271:99:2066,0,7572 +chr9 23894781 . T TAGTC 11485.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.027;DP=280;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=31.33;ReadPosRankSum=1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,257:258:99:11523,802,0 +chr9 23898034 . G T 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=1.026;DP=219;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,58:219:99:1419,0,6458 +chr9 23898857 . A T 1806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.670;DP=344;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,83:344:99:1835,0,10325 +chr9 23898893 . G A 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.519;DP=346;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=4.92;ReadPosRankSum=3.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,82:346:99:1731,0,10216 +chr9 23901739 . G A 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.064;DP=246;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,63:246:99:1466,0,7028 +chr9 23906999 . G A 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-0.163;DP=291;FS=1.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,67:291:99:1421,0,8908 +chr9 23914119 . C G 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.249;DP=270;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,58:269:99:1109,0,7993 +chr9 23936615 . A T 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=-1.932;DP=56;FS=4.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,40:56:99:1366,0,427 +chr9 23939631 . TCCTAATAATAAGAAATAAGGAAGTGAAATCAAATGTTGTCTGAGCAGACAAGAAAAAAAAAACATACTAATGCCTTTGACATATACTGG T 2883.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.349;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=27.62;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:99:2921,271,0 +chr9 23939805 . ACTGCACACAAGAGACACATGTTAAGGAGACATTCCCTTCACCCTTTCAGAGAGATCTCAGGACATCTAC A 3112.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.812;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=27.11;ReadPosRankSum=-2.411 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,67:70:99:3150,273,0 +chr9 23971197 . G A 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-0.959;DP=48;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:813,0,843 +chr9 23972182 . TG T 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-1.484;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:349,0,309 +chr9 24037329 . AGTAGGTTTCATAACCTTACATTCTGAAGTGTACGTAAAATGAATGATTCTTGAGTCTTTTTCTCTCCAATCAACCCTTTCAG A 5421.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.173;DP=124;FS=1.556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,117:124:99:5459,462,0 +chr9 24066697 . TCTGTGACAGAAAGATCAAGTTTAACTAAACACTGTTTACGAAACACACACACAACAACAACAACAACAATAAAAGCTGAATTAACGTTCATAATTGTGACATTTTCTTCCACAAAC T 4378.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=1.475;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=30.84;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,97:100:99:4416,360,0 +chr9 24174575 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-2.817;DP=27;FS=16.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:418,0,308 +chr9 24174791 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.968;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:238,0,336 +chr9 24174847 . T G 1277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:95:1306,95,0 +chr9 24175009 . A G 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:569,42,0 +chr9 24268058 . C CA 1423.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1461,142,0 +chr9 24273243 . AAT A 472.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:510,37,0 +chr9 24776010 . AACCTGCAAAAGCAGAATAGAGAAATAAGTCACATTTGCCTGCCTCAGGTGCTAAATACACAGACTGGATCATT A 1947.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=4.467;DP=359;FS=1.495;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=5.43;ReadPosRankSum=-3.839 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,317:324:99:1985,781,0 +chr9 24814799 . G T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr9 24817241 . A T 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:649,48,0 +chr9 24849813 . TCTAAGACACAGAACAGACATGCTCAAGCTATCTGAACAGACACATGTAACATAAATGGCACACATTCTGTTGTTAGTCCGCTTTGTGCTAAACGCTTCATTCATCACTAGGATTCTCTCAC T 1837.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=2.097;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=35.09;ReadPosRankSum=-1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1875,168,0 +chr9 24862188 . C CT 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.310;DP=41;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:394,0,538 +chr9 25226307 . GT G 479.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.659;DP=41;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:529,0,323 +chr9 25234865 . CTT C 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.457;DP=63;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:542,0,1893 +chr9 25235141 . A AAC 1083.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-2.358;DP=85;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1121,0,993 +chr9 25250804 . G A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-0.221;DP=112;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:99:702,0,2537 +chr9 25420798 . T C 958.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=28.47;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:987,69,0 +chr9 25982808 . C CT 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.585;DP=25;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:268,0,270 +chr9 25983669 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.595;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:341,0,336 +chr9 26200517 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-2.513;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=14.88;ReadPosRankSum=2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:430,0,477 +chr9 26200973 . G T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:504,0,136 +chr9 26201039 . C A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 +chr9 26205562 . T C 2480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.233;DP=141;FS=1.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:2509,0,2711 +chr9 26214334 . GCTGTAAATAAAGTTTAAGTTAAGCTCTTTAACGTTAATGTGAATATTTCGACCAGGGCTATTAATGAAAGAGTCTCTCAC G 10924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,245:245:99:10962,956,0 +chr9 26379472 . T C 1779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.587;DP=92;FS=6.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1808,0,1112 +chr9 26379479 . GT G 586.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-1.470;DP=111;FS=6.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:624,0,1762 +chr9 26379492 . G A 2361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=-1.376;DP=122;FS=7.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:2390,0,1555 +chr9 26381339 . G GA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=-0.710;DP=38;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:431,0,412 +chr9 26415867 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.139;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:545,0,828 +chr9 26415973 . A T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.738;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:945,0,1774 +chr9 26416246 . G A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.791;DP=61;FS=5.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1098,0,980 +chr9 26420633 . C T 1956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-1.127;DP=97;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,59:97:99:1985,0,1295 +chr9 26859160 . T A 3795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.446;ClippingRankSum=-0.665;DP=209;FS=4.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.169;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,113:200:99:3824,0,2920 +chr9 26861408 . A C 3649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-1.335;DP=221;FS=4.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,105:221:99:3678,0,3753 +chr9 26864302 . T C 3776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.034;DP=218;FS=1.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,109:218:99:3805,0,3851 +chr9 26870163 . C CT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=-0.589;DP=111;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,28:105:99:282,0,2063 +chr9 26870954 . C CT 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.122;DP=47;FS=5.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=5.95;ReadPosRankSum=-2.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:317,0,605 +chr9 27119807 . A C 4380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.693;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.761;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,128:277:99:4409,0,4818 +chr9 27124824 . G A 5364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-1.771;DP=306;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,148:305:99:5393,0,5032 +chr9 27129188 . AT A 6033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=4.156;DP=218;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,70:212:99:6071,0,21377 +chr9 27129192 . CTCTTCTCTTCTCTTCTCTT C 6033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=4.749;DP=222;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,70:222:99:6071,0,21979 +chr9 27129297 . T C 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-0.541;DP=175;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,75:175:99:1615,0,28308 +chr9 27145151 . A G 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.164;DP=109;FS=11.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:1490,0,2302 +chr9 27157440 . C CT 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-1.358;DP=87;FS=4.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:321,0,1548 +chr9 27158109 . C CA 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.741;DP=118;FS=9.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=1.96;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:269,0,2972 +chr9 27158220 . G C 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.953;DP=106;FS=5.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.882;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,32:106:99:783,0,2970 +chr9 27158689 . GTT G 2218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.161;DP=121;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:2256,0,2277 +chr9 27158990 . G GA 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.147;DP=109;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,38:95:99:824,0,1689 +chr9 27995380 . C T 267.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=17;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:296,0,19 +chr9 28440996 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.502;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:768,0,1278 +chr9 28774795 . A C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.830;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,814 +chr9 28781093 . A G 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.585;DP=39;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:815,0,558 +chr9 28795827 . G C 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.309;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1441,0,1426 +chr9 28795936 . C A 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-0.289;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1175,0,1284 +chr9 28795953 . C G 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-1.186;DP=65;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:1016,0,1347 +chr9 28796079 . C A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=-0.054;DP=71;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=11.02;ReadPosRankSum=-2.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:811,0,1647 +chr9 28796148 . G A 1638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.119;DP=101;FS=3.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:1667,0,1818 +chr9 28796242 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.010;DP=50;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:779,0,925 +chr9 28796664 . T A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.825;DP=40;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.44;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:886,0,1727 +chr9 28796669 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.186;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:875,0,1727 +chr9 28796745 . A T 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.425;DP=45;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:914,0,696 +chr9 28796786 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=-2.123;DP=25;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,589 +chr9 28829566 . C T 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 +chr9 28829614 . G A 705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:734,54,0 +chr9 28894172 . G C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-1.558;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:753,0,776 +chr9 28894242 . C A 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.453;DP=87;FS=1.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1105,0,1917 +chr9 28895600 . TA T 269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:307,21,0 +chr9 28917790 . T C 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.318;DP=50;FS=11.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1286,0,363 +chr9 29193617 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:309,0,362 +chr9 29265495 . T C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.249;DP=37;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:323,0,1000 +chr9 29266248 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-1.989;DP=89;FS=10.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:675,0,2454 +chr9 29268204 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.117;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=8.04;ReadPosRankSum=-2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:374,0,1072 +chr9 29296675 . C T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.401;DP=108;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:554,0,3217 +chr9 29301847 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.554;DP=135;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:682,0,3911 +chr9 29374900 . A AT 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.683;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:53:805,0,53 +chr9 29374989 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.815;DP=70;FS=17.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:272,0,2170 +chr9 29378876 . C CA 1247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-2.033;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,52:71:99:1285,0,274 +chr9 29639680 . A T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.595;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:359,0,768 +chr9 29639783 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.940;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:313,0,594 +chr9 29646478 . T G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.588;DP=30;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:438,0,632 +chr9 29649504 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=1.387;DP=43;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:628,0,532 +chr9 29649584 . GCCTGGGAGCACATGAAAGACAAATAGATTACATGGAAGTAATGTGTTAGATAAATAATATTTTTTAAACAATCCTA G 780.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=1.561;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:72:818,72,0 +chr9 29904242 . A T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=1.006;DP=75;FS=3.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:773,0,3557 +chr9 29904243 . T G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.815;DP=75;FS=3.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:773,0,3557 +chr9 29971087 . T G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=1.186;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:340,0,2790 +chr9 29971174 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=1.110;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:524,0,1965 +chr9 30528752 . T G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.158;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:391,0,3292 +chr9 30528761 . T G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-0.741;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:386,0,3292 +chr9 31038307 . T C 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 +chr9 31040464 . A G 784.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.087;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:13:813,0,13 +chr9 31040492 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.813;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:758,0,134 +chr9 31045177 . A AT 1099.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=2.292;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=18.33;ReadPosRankSum=-2.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1164,0,123 +chr9 31045786 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=2.477;DP=81;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=4.02;ReadPosRankSum=-2.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,8:81:99:354,0,5879 +chr9 31046164 . G A 2695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=-1.541;DP=107;FS=2.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,75:107:99:2724,0,1405 +chr9 31047477 . C T 4149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=1.302;DP=135;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,112:135:99:4178,0,284 +chr9 31145846 . A T 1896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.094;DP=266;FS=13.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=7.13;ReadPosRankSum=6.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,75:266:99:1925,0,7346 +chr9 31279034 . G T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=1.034;DP=64;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=5.86;ReadPosRankSum=-2.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:403,0,3950 +chr9 31408984 . C T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.325;DP=37;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:543,0,753 +chr9 31662030 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=2.965;DP=44;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:281,0,1234 +chr9 31818482 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:328,0,321 +chr9 32024039 . T C 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-0.143;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1256,0,1153 +chr9 32319041 . C CT 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-2.123;DP=124;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:875,0,1650 +chr9 32620180 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:249,18,0 +chr9 32730120 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.752;DP=29;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=16.99;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:521,0,110 +chr9 32730157 . A T 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:482,33,0 +chr9 32730242 . A T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.738;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:42:462,0,42 +chr9 33129639 . C CA 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=-1.274;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,31:126:99:430,0,2591 +chr9 33133190 . AGTAAACCTAACCTAACTATCTAAGAAATACTAGCTGCTAACAAATACTATTCAGAAATTGCTCTATGAGATAGAATTGCTTATGAGATTAAATATTTCGGGATCTCTTTTGCAG A 3927.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.315;ClippingRankSum=0.694;DP=111;FS=2.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,95:106:99:3965,0,2111 +chr9 33320780 . GT G 835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-2.120;DP=199;FS=10.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,54:169:99:873,0,3060 +chr9 33322442 . ATACCTTCAAGAGATCGAAGAAAACAAAGGTCAGTTTTGGGAAAATCAACAGGACGCATCTGGAGGACGGAGGAGTCCAATTCT A 11683.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.016;DP=328;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=28.92;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,312:315:99:11721,902,0 +chr9 33349690 . TCCTAAAACACAAACCCATTAGCGACATCATCAAAATGAGTTTAACACCATGCTAGATAATGACAGCTTCCACACATTCAATCACA T 900.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-0.976;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=34.64;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:938,0,2132 +chr9 33684970 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=1.412;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:295,0,650 +chr9 33785965 . C A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.920;DP=117;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:729,0,3251 +chr9 33926115 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-1.102;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:436,0,1711 +chr9 33926456 . TG T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.173;DP=42;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:240,0,1119 +chr9 33926530 . A T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=-0.525;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:544,0,976 +chr9 34014681 . G GA 1432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.370;DP=134;FS=0.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,44:129:99:1470,0,2371 +chr9 34280712 . A G 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:356,24,0 +chr9 34324193 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-1.709;DP=242;FS=16.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,42:241:99:563,0,8186 +chr9 34385679 . TA T 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=-1.388;DP=182;FS=10.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,41:167:99:691,0,2778 +chr9 34741859 . ACTGTAGAACAAAATGTAGGTTAAGCGAAGTGTCATAACAGCTAATAGATAGTATATGAAATTATGACAAGCATATGAAAGTATACCCAC A 10413.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=1.901;DP=237;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=36.24;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,233:237:99:10451,755,0 +chr9 34819142 . AGTAAGTCTTGAACCCCTAACGTTCACCTGAATCTTTTTATGACTAATGGTCTCAGGTAACAAAAACTGATCACAATTAATACGTTTCTGTTCTCTCTCTCCACAG A 3891.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.447;ClippingRankSum=4.117;DP=132;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=29.48;ReadPosRankSum=-2.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,95:131:99:3929,0,12411 +chr9 35060302 . T C 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:850,60,0 +chr9 35061977 . G A 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.417;DP=55;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:989,0,235 +chr9 35073750 . C CA 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-1.265;DP=124;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=2.47;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:343,0,2473 +chr9 35078835 . C T 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.533;DP=96;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,55:96:99:1880,0,1474 +chr9 35083971 . G A 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 +chr9 35084240 . A T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.711;DP=61;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1078,0,1066 +chr9 35085060 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,133 +chr9 35088678 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=1.536;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:450,0,337 +chr9 35091779 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-1.091;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:425,0,568 +chr9 35110488 . T G 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.696;DP=37;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:543,0,773 +chr9 35111116 . G T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:391,0,253 +chr9 35112204 . C A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.463;DP=24;FS=10.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,892 +chr9 35119186 . C A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-1.493;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:361,0,469 +chr9 35125669 . T G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-0.094;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:546,0,542 +chr9 35128693 . C G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.556;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:338,0,480 +chr9 35135482 . G T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 +chr9 35136077 . G C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,234 +chr9 35141460 . G C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=1.510;DP=64;FS=3.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:863,0,1669 +chr9 35160709 . G A 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=1.179;DP=72;FS=6.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:1189,0,1267 +chr9 35210018 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-1.076;DP=35;FS=7.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:581,0,675 +chr9 35213637 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=1.359;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.264;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:405,0,396 +chr9 35218455 . T C 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.367;DP=55;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=20.41;ReadPosRankSum=3.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1151,0,1546 +chr9 35229410 . C T 2326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-1.967;DP=143;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=16.27;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:2355,0,4075 +chr9 35229775 . TCTGCAGAATTATGAGCAGGAATGGGATTTGAGTCTGTGCTTCTGATTTCAGGATCATGCACTTAATGATTTAAGCAACGTCTGTTTAC T 6624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.658;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=30.31;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:8609,687,0 +chr9 35248671 . C T 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.905;DP=74;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:1197,0,1263 +chr9 35248866 . A T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-2.442;DP=60;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1057,0,847 +chr9 35255076 . G A 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-0.964;DP=64;FS=2.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:880,0,1296 +chr9 35267598 . A G 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.113;DP=61;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=13.49;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:851,0,1196 +chr9 35317666 . A G 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.898;DP=72;FS=2.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1005,0,1189 +chr9 35321671 . G A 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-1.031;DP=82;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1177,0,2812 +chr9 35322212 . T TTG 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-1.743;DP=41;FS=5.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:314,0,1496 +chr9 35323061 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.413;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:332,0,1999 +chr9 35323227 . T G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.181;DP=82;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:550,0,2487 +chr9 35323547 . A AAC 792.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-2.042;DP=61;FS=5.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,37:56:99:830,0,886 +chr9 35324057 . A C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.748;DP=54;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:770,0,1130 +chr9 35324209 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 +chr9 35324877 . C T 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.598;DP=88;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:1043,0,2053 +chr9 35326367 . TA T 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.971;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:350,0,858 +chr9 35344180 . T C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.594;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:398,0,1580 +chr9 35344237 . A C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.757;DP=34;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:354,0,877 +chr9 35345480 . C G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-1.319;DP=94;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:289,0,2645 +chr9 35351780 . T A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.209;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:556,0,1761 +chr9 35356272 . G A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.846;DP=106;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=8.18;ReadPosRankSum=2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,33:106:99:895,0,2771 +chr9 35356740 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.691;DP=104;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,33:104:99:864,0,2801 +chr9 35360041 . G T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-2.505;DP=52;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:389,0,1813 +chr9 35360305 . C T 810.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-2.361;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=31.54;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:20:839,0,20 +chr9 35360621 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.758;ClippingRankSum=3.936;DP=29;FS=13.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=7.41;ReadPosRankSum=-3.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:243,0,792 +chr9 35371254 . T A 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-1.166;DP=68;FS=8.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:1401,0,945 +chr9 35379210 . T G 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=3.116;DP=107;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1693,0,1969 +chr9 35380871 . G A 1391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.212;DP=106;FS=0.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:1420,0,2323 +chr9 35381484 . C A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.117;DP=90;FS=5.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1125,0,1974 +chr9 35394701 . C A 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.132;DP=112;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:1452,0,2278 +chr9 35394719 . T A 1674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.364;DP=124;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=13.51;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1703,0,2619 +chr9 35399416 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,265 +chr9 35399444 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:320,0,324 +chr9 35409213 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.456;DP=41;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:256,0,1792 +chr9 35409897 . C T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.345;DP=32;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=18.68;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:626,0,451 +chr9 35409938 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:473,0,289 +chr9 35410138 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.224;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,204 +chr9 35620451 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.510;DP=27;FS=11.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=16.73;ReadPosRankSum=-2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:480,0,496 +chr9 35837562 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:235,0,57 +chr9 35848378 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=-2.203;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:247,0,1177 +chr9 35848619 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.860;DP=45;FS=7.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:288,0,1244 +chr9 35851927 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-0.757;DP=49;FS=9.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:467,0,1248 +chr9 35851938 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=-0.707;DP=47;FS=2.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:568,0,1070 +chr9 35873783 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,419 +chr9 35873930 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.631;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:257,0,1755 +chr9 35874022 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-2.177;DP=20;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:256,0,358 +chr9 35874033 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,128 +chr9 35874098 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.927;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:377,0,449 +chr9 35874600 . A C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-1.128;DP=40;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=16.64;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:694,0,615 +chr9 35883930 . A T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.455;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=15.14;ReadPosRankSum=-1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:664,0,786 +chr9 35891700 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.352;DP=62;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1208,0,2447 +chr9 35902777 . T A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.190;DP=59;FS=5.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1064,0,1086 +chr9 35909944 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=-1.552;DP=72;FS=18.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,13:72:99:238,0,2362 +chr9 35910208 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=-1.167;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,35:118:99:844,0,3113 +chr9 35910253 . C G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-2.615;DP=119;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:626,0,3465 +chr9 35915822 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.341;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:359,0,761 +chr9 35915828 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:359,0,813 +chr9 35933788 . CGGTGAGCCTTCCCCTGCGGCCAGACATTGATTCAGAGCATTTCTCGTTGAGTGCAGAAGTGAAGCTTTTAAAACCAATTAAAGACTTGCTTCTTAACATATATAACATGATAAATAAACCAACGCTTTTGGTTTCTGCTTTTTTCA C 4712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=2.432;DP=123;FS=3.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=33.82;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,112:118:99:4750,0,511 +chr9 35934270 . ACAGGTCAGAAATTAGTCTTTTGTTTTGTAAGAATTATTTTATGTTGATGAACTTGACTAACACACTGTTTTAATTG A 5375.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.956;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,134:139:99:5413,398,0 +chr9 35936415 . C T 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=-1.170;DP=113;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1679,0,1895 +chr9 35938758 . G A 2300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.072;DP=141;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:2329,0,3647 +chr9 35939169 . C T 2648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-0.431;DP=162;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:162:99:2677,0,2704 +chr9 35939535 . C T 2541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=1.037;DP=144;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:2570,0,2393 +chr9 35939558 . C T 2280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.010;DP=128;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:2309,0,2447 +chr9 35971272 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=2.123;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:386,0,410 +chr9 35986071 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,336 +chr9 35989020 . G A 2964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=1.277;DP=182;FS=0.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=16.29;ReadPosRankSum=3.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,94:182:99:2993,0,3065 +chr9 35991164 . G A 2270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.059;DP=142;FS=8.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:2299,0,2481 +chr9 35991320 . T C 3638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.966;DP=146;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.085;QD=24.92;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,101:146:99:3667,0,1136 +chr9 35993402 . C T 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.485;DP=120;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:2214,0,1958 +chr9 35993475 . TGTACGCTTCATAAACAAAAACACTCAGTTGTATGTATTGTGTGTATTTTATTTTCAGCCTGTTTTCAATCTTTCTAATGCTCTGTGCAG T 5675.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=1.697;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=33.96;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:5713,537,0 +chr9 35998436 . C A 3538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=1.479;DP=218;FS=8.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=16.23;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,100:218:99:3567,0,3979 +chr9 35998560 . T A 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=2.202;DP=142;FS=7.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,36:142:99:880,0,9315 +chr9 35998561 . C T 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=2.163;DP=142;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,35:142:99:880,0,9315 +chr9 35999011 . AT A 2241.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.947;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=26.37;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:2279,223,0 +chr9 35999574 . G A 5333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.191;DP=260;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=20.51;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,159:260:99:5362,0,4203 +chr9 36023034 . A G 5097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.400;ClippingRankSum=-1.116;DP=328;FS=5.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,149:326:99:5126,0,5329 +chr9 36040950 . G T 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-0.012;DP=339;FS=3.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,79:339:99:1637,0,9612 +chr9 36140726 . CA C 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 +chr9 36141762 . G T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:92:340,0,92 +chr9 36182241 . G A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.700;DP=24;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=26.49;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:664,0,143 +chr9 36186307 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:260,0,1086 +chr9 36204676 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,249 +chr9 36852173 . C A 243.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:272,0,22 +chr9 36891397 . A T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=-1.932;DP=141;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,21:140:99:285,0,9638 +chr9 36926418 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:372,0,215 +chr9 36965499 . GGGTAAAAAAAAGCATTTGCTATGGTAGAGATCATCTAAGCACATGGTGTTCTGATCATTCACATTGTCTTCTCTCACA G 12382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.577;DP=289;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=29.24;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,270:273:99:12420,1039,0 +chr9 37579831 . A C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:68:239,0,68 +chr9 37591641 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:343,0,96 +chr9 37712038 . G T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:276,0,284 +chr9 37797972 . T TA 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=28.82;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,1:5:99:476,0,671 +chr9 37797995 . T C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=1.184;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:507,0,670 +chr9 37798163 . T C 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:825,60,0 +chr9 37798217 . T A 2797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=2.185;DP=60;FS=1.431;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.794;QD=33.78;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,52:60:61:2826,61,0 +chr9 37798437 . T TA 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.137;DP=107;FS=3.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,32:104:99:663,0,2429 +chr9 37798900 . T C 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.070;DP=289;FS=4.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=3.04;ReadPosRankSum=2.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,55:279:99:906,0,10073 +chr9 37798945 . T C 6426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.404;ClippingRankSum=0.586;DP=233;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=27.58;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,162:226:99:6455,0,1591 +chr9 37799097 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.503;DP=66;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:287,0,2075 +chr9 37799117 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.589;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:324,0,434 +chr9 37946386 . GA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=-0.592;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:53:273,0,53 +chr9 37948076 . A AG 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=1.630;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:257,0,977 +chr9 37948077 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=1.359;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:257,0,1014 +chr9 37948912 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.712;DP=36;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=17.41;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:655,0,651 +chr9 37998708 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,523 +chr9 38001215 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=-0.353;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:713,0,711 +chr9 38012256 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=25.49;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:436,0,366 +chr9 38012857 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=8;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:95:471,0,95 +chr9 38012858 . A G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=32.23;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:426,0,135 +chr9 38012898 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.546;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:273,0,96 +chr9 38013047 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=30.93;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:99:502,0,219 +chr9 38013063 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:383,0,424 +chr9 38013540 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=1.728;DP=32;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:283,0,799 +chr9 38019755 . T C 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=1.036;DP=153;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,46:153:99:1160,0,4065 +chr9 38026351 . A C 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.018;DP=162;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.978;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,47:162:99:1150,0,4313 +chr9 38026479 . G A 1230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.876;DP=150;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,48:150:99:1259,0,3823 +chr9 38070115 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 +chr9 38298836 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=-0.075;DP=47;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:756,0,850 +chr9 38324762 . C G 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.052;DP=71;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1202,0,1186 +chr9 38324948 . C A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.867;DP=34;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:647,0,502 +chr9 38327511 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-1.426;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:368,0,898 +chr9 38343863 . A G 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.443;DP=51;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:1006,0,2008 +chr9 38343869 . C T 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=1.203;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:1006,0,2008 +chr9 38346271 . C T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-1.550;DP=57;FS=6.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=28.42;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,44:57:99:1648,0,307 +chr9 38346404 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.056;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=22.15;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:449,0,238 +chr9 38390504 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:231,0,57 +chr9 38419381 . AT A 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.046;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:558,0,376 +chr9 38439539 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=-0.673;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:316,0,1043 +chr9 38484244 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.444;DP=62;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:465,0,1531 +chr9 38504532 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.602;DP=70;FS=7.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:567,0,1897 +chr9 38504704 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.129;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:521,0,941 +chr9 38505259 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.221;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:576,0,1127 +chr9 38530105 . A C 2507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=1.412;DP=88;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=28.50;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,66:88:99:2536,0,541 +chr9 38533212 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=1.990;DP=61;FS=5.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:523,0,1540 +chr9 38533467 . A C 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=1.060;DP=76;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:1302,0,2208 +chr9 38533646 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-2.376;DP=84;FS=15.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:508,0,2926 +chr9 38558787 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:273,0,99 +chr9 38559690 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.368;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:307,0,298 +chr9 38571911 . T A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-1.012;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:501,0,2040 +chr9 38615736 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.588;DP=64;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:472,0,1680 +chr9 38802133 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.476;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:329,0,1913 +chr9 38891236 . C A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.676;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:484,0,3232 +chr9 38891633 . TAA T 744.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.539;DP=40;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:782,0,329 +chr9 38892436 . T A 1988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.610;DP=111;FS=4.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:2017,0,1910 +chr9 38892723 . G A 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-1.698;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:901,0,1033 +chr9 38892743 . G A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.207;DP=59;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1031,0,1087 +chr9 38908850 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-1.858;DP=65;FS=5.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:371,0,1804 +chr9 38909648 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-1.564;DP=60;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:293,0,1743 +chr9 38924613 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:369,0,54 +chr9 39082046 . ACT A 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-1.469;DP=162;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,36:160:99:787,0,5133 +chr9 39082723 . GT G 844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-1.129;DP=83;FS=9.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=10.18;ReadPosRankSum=2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,33:81:99:882,0,1981 +chr9 39082812 . C T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=1.019;DP=104;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1430,0,2296 +chr9 39095061 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=-1.106;DP=175;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,44:175:99:953,0,4899 +chr9 39113637 . ACAGGTTTGTTGAAATCAAAACTTCCCCCAAAACGTCCAGTCTCTGCATTTGTGAAGAAAAAAAACATCTTCTGTAACTCCTG A 3555.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.179;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=31.96;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,80:84:99:3593,240,0 +chr9 39116474 . A T 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.607;DP=89;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,33:89:99:1150,0,2116 +chr9 39176651 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,409 +chr9 39210961 . AC A 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.058;DP=66;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:513,0,3640 +chr9 39210963 . G T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=1.175;DP=68;FS=5.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:525,0,3640 +chr9 39211435 . G A 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.495;DP=162;FS=11.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,40:162:99:916,0,4785 +chr9 39213375 . TGTAAGTACTACAGTCAGAGTATGTTTTAGTTGGGACTTTTAAGATGTTATCATTAATTTGATCATGTTTTTTTGTTTGCAG T 4987.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.449;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=31.81;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,116:119:99:5025,418,0 +chr9 39257810 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=-2.468;DP=39;FS=16.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=12.05;ReadPosRankSum=-4.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:498,0,862 +chr9 39257825 . C A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-2.839;DP=49;FS=20.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:738,0,949 +chr9 39259840 . A G 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.094;DP=71;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:560,0,1920 +chr9 39293000 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=-1.010;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:311,0,3740 +chr9 39342557 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.502;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:341,0,2320 +chr9 39342723 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.027;DP=59;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:496,0,1567 +chr9 39343086 . G T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-1.451;DP=98;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:520,0,2844 +chr9 39370502 . AAGGTGAGTGCTATCCATCAACGAACACCTCCAACATTTGTTTGTTTGTCAGATTAAAGCTTGTGTGCTGTTCTTTTCATT A 1185.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.657;DP=193;FS=7.534;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,183:185:99:7707,551,0 +chr9 39404686 . AT A 741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.267;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=28.53;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:779,75,0 +chr9 39428292 . G A 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=1.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=27.62;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:691,0,145 +chr9 39434437 . A T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.645;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:697,0,251 +chr9 39434446 . G A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.362;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:697,0,253 +chr9 39438876 . A C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-2.756;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,164 +chr9 39441228 . A G 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.937;DP=33;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=29.84;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1013,0,233 +chr9 39459269 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-1.391;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:277,0,1913 +chr9 39569519 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.368;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:316,0,578 +chr9 39608781 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:245,0,253 +chr9 39672419 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-1.183;DP=78;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:561,0,2196 +chr9 39673162 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.656;DP=93;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:767,0,5178 +chr9 39673163 . C A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.605;DP=93;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:767,0,5178 +chr9 40043456 . TA T 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.134;DP=89;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:255,0,1614 +chr9 40044496 . G A 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.456;DP=32;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=29.46;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:971,0,411 +chr9 40044955 . A ATC 291.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:53:779,53,0 +chr9 40045037 . T A 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.098;DP=71;FS=4.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:1131,0,1255 +chr9 40045168 . G T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.284;DP=95;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:354,0,2999 +chr9 40046864 . GA G 1540.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.803;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=30.21;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1578,154,0 +chr9 40047744 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:253,18,0 +chr9 40085440 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=1.455;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:288,0,487 +chr9 41785258 . A G 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.728;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=6.71;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,38:137:99:947,0,3810 +chr9 41808034 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=-1.056;DP=96;FS=9.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:269,0,2884 +chr9 41813768 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.063;DP=106;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,21:106:99:381,0,3252 +chr9 41818403 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.414;DP=61;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:243,0,1838 +chr9 41824363 . T A 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.133;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1002,0,1700 +chr9 41854917 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=4.586;DP=55;FS=2.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:279,0,1603 +chr9 41865847 . T C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-2.557;DP=64;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1064,0,1146 +chr9 41898656 . A G 8224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.721;DP=208;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=33.95;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,197:208:99:8253,556,0 +chr9 41898822 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=1.073;DP=24;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=19.66;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:500,0,304 +chr9 41923371 . A T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.018;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=18.39;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:635,0,520 +chr9 42155679 . TGTGCGTTTTCTTTTGCTTGTATGATAAAGGCATTTCAGTACTGTTTGGCTTTCCTAGGGTTCATATCCTCGATGTGTTTTTCTTGTTTCAG T 1575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=1.858;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=31.51;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:99:1614,0,2401 +chr9 42155837 . AAGGTACAGTTGATCTAGAGTCAATATCTATAATTACTTTAAAATGTTACTTTTTTAATGCAACATTTCCCCATAC A 1278.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.407;DP=34;FS=5.828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:99:1316,113,0 +chr9 42160949 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=1.342;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:301,0,753 +chr9 42176306 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.225;DP=112;FS=1.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:639,0,3180 +chr9 42369397 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.119;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:339,0,2539 +chr9 42454865 . G T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-0.053;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=23.99;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:436,0,134 +chr9 42536369 . C G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.607;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:443,0,894 +chr9 42681597 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=-1.315;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:343,0,421 +chr9 42699837 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=-0.879;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:475,0,594 +chr9 42732316 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.144;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:913,0,1312 +chr9 42732643 . A C 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.711;DP=80;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1053,0,1654 +chr9 42734668 . G A 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-1.489;DP=83;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:1185,0,1604 +chr9 42814007 . T C 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.678;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:800,0,1403 +chr9 42818200 . TA T 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.134;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:69:455,0,69 +chr9 42825060 . GCTGTGTAACAAAACAAAAAAACAAACAAACATGGCACAGACAAGTCATGATCAGATATTCATTTAAATATTCACTGAGGTTTCCATTATGAAAGAGAGCAAAGTTTAGCAACAGAATAAC G 1382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=1.712;DP=52;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=26.59;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:1420,0,4652 +chr9 42850840 . ACTAAAAACATGGAATATTAAATTTGTTAGTGTTTTCTTGACATGTATTGAATGGTCAACCTCATTAAGAAACATAC A 1315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=1.625;DP=33;FS=3.291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1353,108,0 +chr9 43029563 . G A 4307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=1.410;DP=243;FS=9.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,122:243:99:4336,0,4273 +chr9 43032331 . T C 5399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=2.256;DP=341;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=15.84;ReadPosRankSum=-2.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,158:341:99:5428,0,5594 +chr9 43046338 . T C 3754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.929;DP=234;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=16.05;ReadPosRankSum=3.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,108:234:99:3783,0,4012 +chr9 43172884 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.184;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:309,0,532 +chr9 43201759 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,297 +chr9 43301175 . A G 219.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:248,0,25 +chr9 43430718 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,318 +chr9 43431067 . G T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:311,0,171 +chr9 43431782 . T A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:485,0,353 +chr9 43433936 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=-0.677;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:578,0,923 +chr9 43494004 . A T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=4.941;DP=56;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=13.50;ReadPosRankSum=-3.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:784,0,1180 +chr9 43494087 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=3.292;DP=43;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:324,0,1095 +chr9 43494972 . G T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=-0.281;DP=103;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:527,0,3030 +chr9 43689197 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=1.197;DP=54;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:304,0,1410 +chr9 43731284 . CCCTAAGCATGAGAACAGGGTGAACGTGAAAAAAAAAATGAGTGGGCAAAGTTTTAATGTTATTTGAGCTATTTGGAAACAAGTAACTTG C 14413.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-1.050;DP=338;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,312:317:99:14451,1309,0 +chr9 43732357 . A G 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-1.223;DP=485;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:409,75:484:99:745,0,15683 +chr9 43733965 . CCCTGTCAAAACACTACATTTGAATTATGTGGTCTTTAAAAGAAAAGTTTTGCAAGAAAAATTGACAATGACGTAACCCTATA C 17410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.503;DP=569;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,565:569:99:17448,1578,0 +chr9 43734064 . G T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.254;DP=471;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=1.79;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:394,76:470:99:871,0,14811 +chr9 43737215 . A T 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=-0.033;DP=543;FS=7.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=2.09;ReadPosRankSum=4.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:449,94:543:99:1164,0,16762 +chr9 43737456 . CCCTGAAAAGCATTTAAGGTAGTGCTGAAGTTTAGCTGACCTATTACAATAGATTAAAATATTTATGTAGATGTACAGATTTGCTTAGCATCACCCA C 16595.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=1.561;DP=448;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=31.57;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,413:417:99:16633,1212,0 +chr9 43743093 . C CCTGGTGACCCATTCGA 21520.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=553;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,519:519:99:21558,1498,0 +chr9 43769321 . A T 1087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.014;DP=448;FS=18.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:368,80:448:99:1116,0,14574 +chr9 43801909 . C A 4495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.593;DP=226;FS=0.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=19.89;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,135:226:99:4524,0,3109 +chr9 43803271 . ACTGGAGAATGAAAAAGAACAACTTTAAAGTTACTTAAATGCAAACGAAACGACTTTTTTCATCTGTTAGCCTAAGTTACGCAACTACTGCTAGAATCATCTTTATAACGTTGCCTGGAGCAAATTAATATCAGCTGAATTATATATTAAACCCAACAAAACATGTTTAC A 7879.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=3.112;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=32.56;ReadPosRankSum=-1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,201:210:99:7917,587,0 +chr9 43807283 . G A 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.404;DP=424;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,85:423:99:1381,0,13192 +chr9 43808835 . C A 2387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.083;DP=312;FS=7.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,92:312:99:2416,0,8230 +chr9 43812683 . T G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.352;DP=285;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,50:281:99:696,0,8604 +chr9 43848514 . G T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=1.162;DP=69;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:433,0,1929 +chr9 43848673 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-1.593;DP=49;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:236,0,1518 +chr9 43980752 . C T 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-2.018;DP=344;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,86:344:99:1917,0,9996 +chr9 43988162 . C T 1933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=-2.153;DP=263;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,77:263:99:1962,0,7015 +chr9 44013843 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.273;DP=40;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:268,0,1127 +chr9 44017143 . A T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.479;DP=42;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:554,0,901 +chr9 44106220 . AT A 421.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:459,45,0 +chr9 44106738 . A C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.152;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:332,0,378 +chr9 44109484 . A C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=1.121;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:495,0,563 +chr9 44111231 . T C 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.381;DP=50;FS=13.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:764,0,1521 +chr9 44113479 . A G 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.023;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:796,0,808 +chr9 44120339 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.033;DP=49;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:364,0,1357 +chr9 44128627 . G T 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=1.430;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=22.76;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:711,0,340 +chr9 44146947 . CT C 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.517;DP=27;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:319,0,316 +chr9 44223674 . C CTG 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=4.225;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=3.79;ReadPosRankSum=-3.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:390,0,3174 +chr9 44223860 . C T 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.354;DP=77;FS=6.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1383,0,1174 +chr9 44226330 . C T 2613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=-0.620;DP=133;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,81:133:99:2642,0,1767 +chr9 44685525 . T G 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-0.375;DP=107;FS=10.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:2069,0,1519 +chr9 44873070 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=1.218;DP=333;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=3.81;ReadPosRankSum=5.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,71:329:99:1298,0,9985 +chr9 44950156 . T G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:58:249,0,58 +chr9 45115332 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.809;DP=40;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:338,0,1047 +chr9 45148630 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.048;DP=37;FS=7.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:453,0,886 +chr9 45154085 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=-0.250;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:255,0,1173 +chr9 45155873 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=1.591;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:352,0,469 +chr9 45155875 . G C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=23.13;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:352,0,469 +chr9 45157232 . CT C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=2.333;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:80:264,0,80 +chr9 45158753 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.31;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,104 +chr9 45357895 . T TA 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=2.229;DP=99;FS=3.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,28:96:99:551,0,2133 +chr9 45357929 . CT C 1189.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=-0.910;DP=104;FS=12.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1227,0,1003 +chr9 45359068 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-0.045;DP=292;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.365;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,45:291:99:432,0,9102 +chr9 45423184 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=20.71;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:401,0,233 +chr9 45457896 . T C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.502;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:580,0,467 +chr9 45554822 . G C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.247;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:364,0,389 +chr9 45556068 . CTG C 204.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=9;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:242,0,24 +chr9 45789649 . GA G 778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=1.135;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:816,0,126 +chr9 45789772 . C T 3452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.384;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=17.18;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,100:201:99:3481,0,3548 +chr9 45831055 . A G 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=-0.518;DP=291;FS=5.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,70:290:99:1432,0,8489 +chr9 45937952 . C A 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=1.222;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:927,0,920 +chr9 45938120 . A T 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.047;DP=70;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:1208,0,1861 +chr9 45960888 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.461;DP=54;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=13.16;ReadPosRankSum=2.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:739,0,1123 +chr9 45968979 . G T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=30.48;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:394,0,49 +chr9 47606386 . TA T 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.291;DP=46;FS=3.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:514,0,445 +chr9 47855835 . A G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 +chr9 47873742 . C CA 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.430;DP=81;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:641,0,686 +chr9 47873961 . GTT G 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.308;DP=112;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:1088,0,990 +chr9 47890593 . T A 1697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=-2.267;DP=98;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=17.32;ReadPosRankSum=2.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1726,0,1542 +chr9 48510019 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.462;DP=30;FS=6.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:307,0,784 +chr9 48511426 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.712;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:353,0,1091 +chr9 48511427 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.694;DP=26;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:465,0,500 +chr9 48514389 . A T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.471;DP=32;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:578,0,615 +chr9 48514412 . G T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-1.759;DP=38;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=13.78;ReadPosRankSum=2.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:552,0,809 +chr9 48514965 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=22.14;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:316,0,210 +chr9 48515737 . G C 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.938;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,22:72:99:583,0,1792 +chr9 48564863 . TCTGGAAAAAGAAAAACAAGTGGAGACGTATCCATTTGCACACACACATGCTAATTCTGAGATTGGTTTTAGGGATAATTGATGTGTAC T 2597.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=1.672;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2635,239,0 +chr9 48583591 . T C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=-0.460;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:469,0,617 +chr9 48849117 . T A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.495;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:803,0,833 +chr9 49027255 . C T 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.321;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:1773,0,4209 +chr9 49027262 . T C 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.482;DP=106;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:1773,0,4284 +chr9 49027309 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.915;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:907,0,681 +chr9 49064513 . T C 3913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.768;DP=231;FS=14.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,120:231:99:3942,0,4150 +chr9 49115580 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-1.136;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:316,0,1102 +chr9 49120056 . T TG 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:91:345,0,91 +chr9 49153883 . C T 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 +chr9 49182935 . C T 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.441;DP=448;FS=3.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=3.19;ReadPosRankSum=3.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:362,86:448:99:1456,0,14311 +chr9 49242641 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.863;DP=29;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:404,0,582 +chr9 49249763 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:266,0,492 +chr9 49275018 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.613;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:260,0,531 +chr9 49285131 . A T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=1.063;DP=46;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:280,0,1337 +chr9 49292890 . A G 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=1.127;DP=266;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,69:266:99:1576,0,7553 +chr9 49293352 . C A 3307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.577;DP=228;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,96:228:99:3336,0,4382 +chr9 49297492 . C A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=-2.908;DP=236;FS=16.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,46:224:99:894,0,13074 +chr9 49300689 . G A 2602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.753;DP=219;FS=9.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,81:218:99:2631,0,4528 +chr9 49347499 . A T 5022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-0.910;DP=276;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,153:276:99:5051,0,4444 +chr9 49347847 . G T 3999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.676;DP=227;FS=0.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,112:227:99:4028,0,4103 +chr9 49526663 . C A 1174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1203,84,0 +chr9 49616866 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.293;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=17.69;ReadPosRankSum=-1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:559,0,445 +chr9 49616920 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.370;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:362,0,532 +chr9 49617034 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.128;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:257,0,950 +chr9 49621098 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.599;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:373,0,368 +chr9 49621122 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.070;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:423,0,550 +chr9 49627394 . C T 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:943,72,0 +chr9 49627460 . G A 651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:680,51,0 +chr9 49627583 . C T 999.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1028,72,0 +chr9 49627601 . A T 978.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1007,72,0 +chr9 49627739 . C T 1326.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1355,105,0 +chr9 49627922 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.999;DP=25;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=25.91;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:676,0,161 +chr9 49630211 . C T 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.150;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=30.56;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:34:943,34,0 +chr9 49630760 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.506;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:564,0,156 +chr9 49716852 . G T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 +chr9 49717505 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-2.219;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=25.73;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:337,0,348 +chr9 49928437 . G A 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 +chr9 50506873 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,256 +chr9 50511445 . CT C 234.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.283;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:16:272,0,16 +chr9 50511768 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.799;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:373,0,1573 +chr9 50521530 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-1.100;DP=52;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:377,0,2389 +chr9 50524233 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-2.137;DP=37;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:277,0,1010 +chr9 50526081 . C G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.256;DP=47;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:284,0,1380 +chr9 50526765 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.869;DP=34;FS=8.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:242,0,927 +chr9 50527227 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.091;DP=40;FS=5.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:271,0,1392 +chr9 50527332 . G C 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.667;DP=45;FS=4.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:583,0,961 +chr9 50811969 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.676;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:465,0,495 +chr9 50819478 . A C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.589;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:409,0,818 +chr9 50826388 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 +chr9 50830254 . G A 208.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:237,0,18 +chr9 50847660 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:276,0,123 +chr9 51061694 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=-0.398;DP=50;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:248,0,1450 +chr9 51344151 . G C 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.941;DP=50;FS=5.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:701,0,1052 +chr9 51348158 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.722;DP=57;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:369,0,1860 +chr9 51482635 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.690;DP=76;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:416,0,2237 +chr9 51491524 . G A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.577;DP=94;FS=8.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:569,0,2693 +chr9 51498646 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.296;DP=68;FS=4.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:267,0,2077 +chr9 51502802 . T A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 +chr9 51509377 . T A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.914;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,330 +chr9 52577463 . A AGCAATGGC 599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.181;DP=58;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:637,0,1352 +chr9 52597133 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.983;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:753,0,1313 +chr9 52597207 . A ACGGACCAGGACTTCCGC 677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=1.787;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:715,0,1296 +chr9 52604903 . C CA 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.909;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:338,0,1106 +chr9 52607336 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:345,0,1289 +chr9 53195449 . TCA T 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:247,0,159 +chr9 53478134 . G A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-1.559;DP=84;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:1271,0,1623 +chr9 53481334 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.959;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,323 +chr9 53481734 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.060;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:615,0,458 +chr9 53481763 . C G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.079;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:468,0,376 +chr9 53530429 . C T 3228.29 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.671;DP=24;FS=3.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=29.45;ReadPosRankSum=-1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,15:17:99:3256,232,0 +chr9 53530585 . G A 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-3.169;DP=123;FS=7.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:1495,0,2181 +chr9 53531277 . A G 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 +chr9 53531310 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:276,0,189 +chr9 53532100 . C G 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.396;DP=49;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:1081,0,540 +chr9 53532162 . C G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-1.221;DP=34;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:523,0,674 +chr9 53532274 . G C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.401;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=22.99;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:396,0,422 +chr9 53532505 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=-3.728;DP=130;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:566,0,1252 +chr9 53532547 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.177;DP=69;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:312,0,1630 +chr9 53532717 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:310,0,104 +chr9 53839692 . C G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=1.902;DP=18;FS=23.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,422 +chr9 53861677 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=2.803;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:258,0,643 +chr9 54032656 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=34.70;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:74:524,0,74 +chr9 54032665 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:74:524,0,74 +chr9 54036707 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:373,0,373 +chr9 54130278 . G A 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.279;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:921,0,1613 +chr9 54171619 . AT A 911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.102;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=34.67;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:949,0,219 +chr9 54171624 . T C 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.837;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:99:949,0,219 +chr9 54171762 . CA C 1871.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-0.670;DP=76;FS=1.521;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,66:74:59:1909,59,0 +chr9 54186316 . C G 974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1003,72,0 +chr9 54192643 . C T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.261;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=25.03;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:604,0,481 +chr9 54198077 . G A 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.248;DP=41;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.282;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:732,0,744 +chr9 54200041 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.149;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:674,0,893 +chr9 54200098 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-2.058;DP=49;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:283,0,1417 +chr9 54211921 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=2.060;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=13.19;ReadPosRankSum=-2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:292,0,1007 +chr9 54211927 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=2.013;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:292,0,1007 +chr9 54222569 . T A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:408,0,205 +chr9 54245399 . T TTC 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,201 +chr9 54322574 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:260,0,409 +chr9 54505595 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-1.581;DP=26;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:253,0,619 +chr9 55102818 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.717;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:548,0,1546 +chr9 55332437 . A G 2299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.079;DP=284;FS=6.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,89:284:99:2328,0,13601 +chr9 55336128 . AAC A 1633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=-3.568;DP=243;FS=8.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=6.72;ReadPosRankSum=2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,58:173:99:1671,0,3352 +chr9 55336221 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=-1.319;DP=47;FS=7.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:261,0,1436 +chr9 55336480 . A G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=-1.465;DP=61;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:713,0,1562 +chr9 55337893 . T TCA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-1.238;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:339,0,1615 +chr9 55338831 . A C 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=-0.744;DP=62;FS=5.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=16.27;ReadPosRankSum=2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1037,0,1456 +chr9 55364148 . G A 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 +chr9 55750458 . T C 5577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=1.169;DP=222;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.064;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,153:222:99:5606,0,1798 +chr9 55767170 . G A 9591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.449;DP=341;FS=20.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,257:341:99:9620,0,1778 +chr9 55769303 . A T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 +chr9 55906930 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:415,0,170 +chr9 55931758 . T G 238.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:267,21,0 +chr9 55931806 . A C 864.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:893,69,0 +chr9 55946687 . G C 211.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:240,0,25 +chr9 56284099 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=2.115;DP=223;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,34:223:99:321,0,7002 +chr9 56300064 . G A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.030;DP=90;FS=5.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,32:90:99:1095,0,2052 +chr9 56323568 . A G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,276 +chr9 56326041 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.462;DP=25;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:430,0,461 +chr9 56333820 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.929;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:585,0,1073 +chr9 56333822 . T C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=1.369;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:585,0,1064 +chr9 56351096 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-1.075;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:484,0,671 +chr9 56355752 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.795;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:334,0,335 +chr9 56366577 . T TC 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=2.245;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:343,0,299 +chr9 56367025 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=1.109;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,469 +chr9 56429029 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.542;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:239,0,775 +chr9 56434083 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-1.154;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:350,0,423 +chr9 56435269 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.194;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:286,0,952 +chr9 56435270 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.613;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:286,0,947 +chr9 56680087 . AAC A 525.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.735;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:22:563,22,0 +chr9 56710395 . T A 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:446,30,0 +chr9 56710644 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:57:481,0,57 +chr9 56710711 . C G 764.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:58:793,58,0 +chr9 56710869 . G A 1761.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:99:1790,134,0 +chr9 56710886 . A C 1752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:99:1781,131,0 +chr9 56711068 . A C 492.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:625,22,0 +chr9 56713058 . T G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-1.670;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:373,0,466 +chr9 56714036 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.264;DP=51;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:296,0,1859 +chr9 56714117 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=1.805;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:232,0,468 +chr9 56715251 . A G 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 +chr9 56747766 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:297,0,224 +chr9 56748866 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.779;DP=37;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:506,0,972 +chr9 56748867 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.391;DP=37;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:505,0,878 +chr9 56749042 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=27.06;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:353,0,130 +chr9 56750347 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=-3.383;DP=59;FS=5.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:483,0,1549 +chr9 56750664 . AT A 1643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.050;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1681,0,1675 +chr9 56750843 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.281;DP=163;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,31:162:99:463,0,5136 +chr9 56751142 . G A 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=4.348;DP=61;FS=5.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=14.24;ReadPosRankSum=-2.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:897,0,2646 +chr9 56751583 . T TA 1446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.506;DP=122;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1484,0,849 +chr9 56753930 . T C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=4.088;DP=49;FS=13.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=14.42;ReadPosRankSum=-2.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:735,0,3510 +chr9 56754341 . CA C 2553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=1.476;DP=128;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:2591,0,1202 +chr9 56763246 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.032;DP=24;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:237,0,417 +chr9 56766478 . T G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.548;DP=36;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.338;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:509,0,872 +chr9 57062167 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.049;DP=37;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:348,0,1038 +chr9 57160475 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.115;DP=29;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:299,0,656 +chr9 57198624 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.384;DP=38;FS=3.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:307,0,989 +chr9 57198660 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.693;DP=49;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:445,0,1224 +chr9 57211901 . G T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.810;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:519,0,834 +chr9 57211961 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-1.485;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:436,0,1158 +chr9 57240993 . A G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=-0.027;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:383,0,497 +chr9 57360024 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.190;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:414,0,1514 +chr9 57517769 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.813;ClippingRankSum=-1.415;DP=50;FS=9.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:651,0,974 +chr9 57816294 . G GCA 2045.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-2.584;DP=204;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,69:177:99:2083,0,3431 +chr9 57929159 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-1.801;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:365,0,537 +chr9 57945530 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-1.280;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:399,0,276 +chr9 57971471 . T C 3153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.141;DP=116;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,83:116:99:3182,0,939 +chr9 57971654 . T A 1856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.502;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,49:67:99:1885,0,409 +chr9 57977778 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:513,0,795 +chr9 57977881 . ACT A 1102.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=-0.790;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1140,0,396 +chr9 57981942 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.600;DP=36;FS=3.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=27.33;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:1012,0,144 +chr9 57982148 . C T 1575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.260;DP=54;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=29.18;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,42:54:99:1604,0,271 +chr9 57982673 . T TC 1529.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1567,126,0 +chr9 57984903 . C T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-0.830;DP=40;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=23.82;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:981,0,280 +chr9 57985290 . A G 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-1.405;DP=33;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:65:699,0,65 +chr9 58106954 . TGA T 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-2.717;DP=174;FS=2.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=1.53;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,36:169:99:304,0,4876 +chr9 58149372 . GAC G 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.112;DP=95;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:253,0,1264 +chr9 58175149 . G A 2008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.961;ClippingRankSum=-1.492;DP=528;FS=9.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:425,103:528:99:2037,0,32633 +chrM 2285 . G A 10814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,259:259:99:10843,779,0 +chrM 2421 . C T 10759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=254;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,254:254:99:10788,765,0 +chrM 3938 . A G 3701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:3730,268,0 +chrM 3962 . T C 4258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:4287,307,0 +chrM 4530 . A T 15504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=376;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,369:369:99:15533,1110,0 +chrM 4666 . C T 13592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=321;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,321:321:99:13621,969,0 +chrM 7986 . G A 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1081,78,0 +chrM 8059 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 +chrM 9081 . G A 591.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:620,45,0 +chrM 9816 . T A 4563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:4592,319,0 +chrM 10677 . T C 10335.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,244:244:99:10364,734,0 +chrM 10770 . G A 16050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=-1.699;DP=311;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=28.11;ReadPosRankSum=1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,310:311:99:16079,1108,0 +chrM 10780 . C T 15654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=346;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,346:346:99:15683,1081,0 +chrM 10963 . C T 982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1011,75,0 +chrM 11617 . A T 6460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:6489,467,0 +chrM 12975 . T C 12134.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=279;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,279:279:99:12163,850,0 +chrM 14534 . G A 8207.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:8236,600,0
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/cloudmap_zf_hom_mapping_test1_output.html Mon Oct 13 08:42:19 2014 -0400 @@ -0,0 +1,274 @@ +<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> + <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en"> + <head> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" /> + <meta name="generator" content="Galaxy rgToolFactory.py tool output - see http://g2.trac.bx.psu.edu/" /> + <title></title> + <link rel="stylesheet" href="/static/style/base.css" type="text/css" /> + </head> + <body> + <div class="toolFormBody"> + +<div class="infomessage">Galaxy Tool "cloudmap_zf_hom_mapping" run at 13/10/2014 13:41:03</div><br/> +<div class="toolFormTitle">cloudmap log output</div> + +<pre> + +Loading required package: methods + +Loading required package: grid + +Loading required package: lattice + +Loading required package: survival + +Loading required package: splines + +Loading required package: Formula + +Attaching package: 'Hmisc' + +The following object(s) are masked from 'package:base': + + format.pval, round.POSIXt, trunc.POSIXt, units + + +</pre> + +<div class="toolFormTitle">Other images and outputs</div> +(Click on a thumbnail image to download the corresponding original PDF image)<br/> +<div><table class="simple" cellpadding="2" cellspacing="2"> +<tr> +<td><a href="allchrs.pdf"><img src="allchrs.png" title="Click to download a PDF of allchrs.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called allchrs.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr1.pdf"><img src="chr1.png" title="Click to download a PDF of chr1.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr1.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr10.pdf"><img src="chr10.png" title="Click to download a PDF of chr10.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr10.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr11.pdf"><img src="chr11.png" title="Click to download a PDF of chr11.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr11.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr12.pdf"><img src="chr12.png" title="Click to download a PDF of chr12.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr12.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr13.pdf"><img src="chr13.png" title="Click to download a PDF of chr13.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr13.pdf"/></a></td> +</tr> +<tr> +<td><a href="chr14.pdf"><img src="chr14.png" title="Click to download a PDF of chr14.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr14.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr15.pdf"><img src="chr15.png" title="Click to download a PDF of chr15.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr15.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr16.pdf"><img src="chr16.png" title="Click to download a PDF of chr16.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr16.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr17.pdf"><img src="chr17.png" title="Click to download a PDF of chr17.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr17.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr18.pdf"><img src="chr18.png" title="Click to download a PDF of chr18.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr18.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr19.pdf"><img src="chr19.png" title="Click to download a PDF of chr19.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr19.pdf"/></a></td> +</tr> +<tr> +<td><a href="chr2.pdf"><img src="chr2.png" title="Click to download a PDF of chr2.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr2.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr20.pdf"><img src="chr20.png" title="Click to download a PDF of chr20.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr20.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr21.pdf"><img src="chr21.png" title="Click to download a PDF of chr21.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr21.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr22.pdf"><img src="chr22.png" title="Click to download a PDF of chr22.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr22.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr23.pdf"><img src="chr23.png" title="Click to download a PDF of chr23.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr23.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr24.pdf"><img src="chr24.png" title="Click to download a PDF of chr24.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr24.pdf"/></a></td> +</tr> +<tr> +<td><a href="chr25.pdf"><img src="chr25.png" title="Click to download a PDF of chr25.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr25.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr3.pdf"><img src="chr3.png" title="Click to download a PDF of chr3.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr3.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr4.pdf"><img src="chr4.png" title="Click to download a PDF of chr4.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr4.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr5.pdf"><img src="chr5.png" title="Click to download a PDF of chr5.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr5.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr6.pdf"><img src="chr6.png" title="Click to download a PDF of chr6.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr6.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr7.pdf"><img src="chr7.png" title="Click to download a PDF of chr7.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr7.pdf"/></a></td> +</tr> +<tr> +<td><a href="chr8.pdf"><img src="chr8.png" title="Click to download a PDF of chr8.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr8.pdf"/></a></td> + +<td><a href="chr9.pdf"><img src="chr9.png" title="Click to download a PDF of chr9.pdf" hspace="5" width="200" + alt="Image called chr9.pdf"/></a></td> + +<td> </td><td> </td><td> </td><td> </td> +</tr></table></div> + +<div class="toolFormTitle">Other log output</div> + +<pre> + +## Toolfactory generated command line = Rscript - /Volumes/ngs/database/files/012/dataset_12474.dat None + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + +null device + + 1 + + +</pre> + +<div class="toolFormTitle">All output files available for downloading</div> + +<div><table class="colored" cellpadding="3" cellspacing="3"><tr><th>Output File Name (click to view)</th><th>Size</th></tr> + +<tr><td><a href="allchrs.pdf">allchrs.pdf</a></td><td>87.1 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr1.pdf">chr1.pdf</a></td><td>7.8 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr10.pdf">chr10.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr11.pdf">chr11.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr12.pdf">chr12.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr13.pdf">chr13.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr14.pdf">chr14.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr15.pdf">chr15.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr16.pdf">chr16.pdf</a></td><td>8.1 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr17.pdf">chr17.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr18.pdf">chr18.pdf</a></td><td>7.6 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr19.pdf">chr19.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr2.pdf">chr2.pdf</a></td><td>7.8 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr20.pdf">chr20.pdf</a></td><td>7.6 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr21.pdf">chr21.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr22.pdf">chr22.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr23.pdf">chr23.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr24.pdf">chr24.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr25.pdf">chr25.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr3.pdf">chr3.pdf</a></td><td>7.8 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr4.pdf">chr4.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr5.pdf">chr5.pdf</a></td><td>7.5 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr6.pdf">chr6.pdf</a></td><td>7.7 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr7.pdf">chr7.pdf</a></td><td>7.6 KB</td></tr> +<tr><td><a href="chr8.pdf">chr8.pdf</a></td><td>8.0 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="chr9.pdf">chr9.pdf</a></td><td>7.9 KB</td></tr> +<tr><td><a href="cloudmap_zf_hom_mapping.Rscript">cloudmap_zf_hom_mapping.Rscript</a></td><td>27.8 KB</td></tr> +<tr class="odd_row"><td><a href="cloudmap_zf_hom_mapping_error.log">cloudmap_zf_hom_mapping_error.log</a></td><td>340 B</td></tr> +<tr><td><a href="cloudmap_zf_hom_mapping_runner.log">cloudmap_zf_hom_mapping_runner.log</a></td><td>781 B</td></tr> +</table></div><br/> +</div></body></html> +
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/test1_out.log Mon Oct 13 08:42:19 2014 -0400 @@ -0,0 +1,53 @@ +## Toolfactory generated command line = Rscript - /Volumes/ngs/database/files/012/dataset_12474.dat None +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1 +null device + 1
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/cloudmap_zf_hom_mapping/tool_dependencies.xml Mon Oct 13 08:42:19 2014 -0400 @@ -0,0 +1,18 @@ +<?xml version="1.0"?> +<tool_dependency> + <package name="ghostscript" version="9.10"> + <repository changeset_revision="9345d2740f0c" name="package_ghostscript_9_10" owner="devteam" prior_installation_required="True" toolshed="https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu" /> + </package> + <package name="graphicsmagick" version="1.3.18"> + <repository changeset_revision="2fd4eb971ba5" name="package_graphicsmagick_1_3" owner="iuc" prior_installation_required="True" toolshed="https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu" /> + </package> + <readme> + +**What it Does** + +This tool is part of an update to the CloudMap pipeline (Minevich et al. 2012) to incorporate homozygosity mapping in zebrafish. This tool facilitates the mapping of zebrafish mutants from WGS or RNA-Seq data using bulk segregant homozygosity mapping. As input it takes a VCF list of variants (usually quality filtered for Q200 with WT SNPs/indels removed). This file is produced when running the CloudMap zebrafish pipeline. It plots an adjusted homozygosity ratio such that a high ratio indicates mapping region. It outputs an HTML file with combined and individual chromosome plots as PDFs. The adjusted homozygosity ratio is calculated as described in: + +IN SUBMISSION + + </readme> +</tool_dependency>